中華民國與捷克關係
中華民國與捷克關係是指中華民國與捷克共和國之間的關係。捷克斯洛伐克與中華民國於1930－1949年有官方外交關係，斷交後直至1990年代，於對方首都互設具大使館功能的代表機構。採行「一個中國」政策，但大致維持與兩岸政府平衡接觸交往，並堅持以和平方式解決兩岸爭議。近年來，在經貿、文教、科技、觀光等領域交流頻繁，雙邊實質關係穩定。哈維爾在捷克總統任內及卸任後，對中華民國採取友好態度，雙方政府官員與國會議員至今亦常互訪。
1930年2月12日，中華民國與捷克斯洛伐克共和國建立公使級外交關係。
1931年，於首都布拉格設立中華民國駐捷克斯洛伐克共和國公使館，並派駐公使，初期由駐波蘭公使兼任。
1939年，納粹德國佔領捷克斯洛伐克後（蘇台德區問題），原公使停派，改調駐羅馬尼亞。兩國中斷外交關係期間，捷克斯洛伐克外交承認滿州國，滿州國並派駐公使。
1941年8月26日，中華民國外交承認位於英國首都倫敦的捷克斯洛伐克流亡政府，並在英國設立公使館，由駐荷蘭公使兼任。
1944年7月25日，公使館升格為中華民國駐捷克斯洛伐克共和國大使館，並派駐大使，初期由駐荷蘭大使兼任。1945年7月30日，大使館正式復館。
1949年10月1日，中華人民共和國成立於北京；10月3日，捷克斯洛伐克社會主義共和國予以承認並改與其建交。中華民國便宣布斷交閉館。當時中華民國尚能有效統治中國大陸部分地區，因此國民政府遷台後雙方就無官方關係。
1950－1990年代的冷戰期間，中華民國在意識形態和制度上均偏向以美國、英國為首的資本主義陣營，復加上以蘇聯為首的共產集團國家的封閉，使雙方幾乎沒有往來。 1971年10月25日，身為共產陣營成員及蘇聯衛星國之一的捷克斯洛伐克社會主義共和國投票支持中華人民共和國加入聯合國。（即中國代表權問題、《聯合國大會2758號決議》）
1989年11月，天鵝絨革命後，促進了捷克斯洛伐克社會主義共和國的民主化與政權和平移轉，並改國號為捷克斯洛伐克聯邦共和國。1993年1月1日，斯洛伐克宣布獨立，聯邦體制瓦解。在捷克轉型為民主國家並重新對外開放後，雙方始恢復往來。
1997年7月，捷克，中華民國政府捐贈2萬美元協助賑災。
2019年1月14日，布拉格市長賀吉普透過Twitter表示，有意與北京重新協商在2016年3月簽署的姐妹市協定中，有關一個中國政策和台灣屬於中國領土的條款；18日，在受訪時指出，布拉格與北京締結姐妹市的「一中條款」是中方當時開出的條件，但北京與其它姐妹市並沒有包含這樣的條款，實在看不出保留的必要性。只要決定廢止這個條款，他會和北京協商，如果談判失敗只好退出姐妹市協定。10月7日，布拉格市政會議宣布解除與北京的姊妹市關係，但仍須市議會表決，預料會順利通過。12月12日與24日，布拉格市議會與臺北市議會先後通過締結為姊妹市。2020年1月13日，台北市長柯文哲與布拉格市長賀吉普於簽署姊妹市協定。14日，與布拉格締結為姊妹市的上海宣布立即解除關係並暫停一切官方往來。
2020年4月1日，對於2019冠状病毒病疫情在全球擴散，中華民國總統蔡英文宣布捐贈1,000萬片口罩給疫情嚴重的國家。外交部指出，其中700萬片給捷克在內的9個欧洲联盟成员国以及瑞士與英國、300萬片給美國、100萬片給中華民國的邦交國。對於台灣另捐贈呼吸器等醫療物資給捷克，捷克外交部長佩崔切克表示謝意，布拉格市長賀吉普並稱讚台灣是患難見真情的朋友。同日，雙方駐處發表《台捷防疫合作聯合聲明》。8日，賀吉普將印有中華民國與捷克国旗，並寫上「來自台灣的問候，送給我們在捷克的英雄」字樣的部分呼吸器箱子，親自轉交給布拉格皇家維諾赫拉迪大學醫院院長。16日，捷克眾議院舉辦口罩捐贈儀式，由議長主持，並在Facebook發文感謝台灣。6月4日，捷克部分政黨在眾議院提案，要求通過決議對於台灣的援助表達感謝，但另一派的政黨拒絕支持，因此「感謝台灣」提案未能通過。
2020年5月20日，中華民國總統蔡英文連任就職，捷克參議院副議長，以及布拉格市長賀吉普表達祝賀。
2020年10月12日，總統蔡英文受邀在第24屆開幕發表視訊演說，是中華民國現任總統首次參與該論壇。
2020年11月11日，捷克參議院議長韋德齊連任，總統蔡英文、副總統賴清德，以及立法院長游錫堃表達祝賀。
2021年3月11日，中華民國與捷克以「政府對政府」的合作模式捐贈捷克政府自动化高階口罩生產線供防疫之用，由中華民國外交部長吳釗燮與捷克參議院議長韋德齊共同主持線上啟用儀式並剪綵，次長Martina Tauberová代表政府接收並表示感謝。
2021年4月2日，臺灣太魯閣號列車發生事故，造成重大傷亡，捷克參議院議長韋德齊、外交部長佩崔切克均表達哀悼之意。
2021年7月26日，捷克政府的內閣會議決定將捐贈疫苗給包括台灣在內的12個國家，其中台灣將獲贈3萬劑疫苗，藉此回報台灣在疫情期間捐贈口罩及口罩機等防疫物資來協助捷克防疫，為繼立陶宛在6月22日宣布捐贈2萬劑AZ疫苗、斯洛伐克在7月15日宣布捐贈1萬劑疫苗之後，第三個宣布贈台疫苗的歐盟成員國。8月29日，捷克捐贈的3萬劑莫德納疫苗運抵臺灣。
2021年10月6日，中華民國國慶活動在美國雙橡園提前舉行，捷克駐美國大使親自參加，是在場唯一的非中華民國邦交國駐美國大使。28日，、駐法國大使館分別邀請中華民國駐美國代表蕭美琴、駐法國代表吳志中出席捷克國慶酒會，並與捷克駐美國大使柯蒙尼契克、駐法國大使會面。
1994年，捷克在聯合國大會的總辯論中提出「會籍普遍化原則」，間接呼應中華民國參與聯合國。
1995年10月，捷克總統哈維爾在第50屆聯合國大會記者會中發言支持中華民國加入聯合國。
1997、1998、1999、2001年，捷克在聯合國大會的總辯論中，為中華民國參與聯合國案執言。
2006年4月，捷克眾議院過半數議員連署支持台灣取得世界衛生大會觀察員資格，並有意義、制度化參與世界衛生組織（WHO）。
2009年5月8日，擔任歐盟輪值主席國的捷克發表聲明歡迎中華台北受邀以參加第62屆世界衛生大會（WHA）。
2019年5月，55名捷克眾議院議員、捷克參議院副議長等25名議員、布拉格市長賀吉普分別連署致函WHO呼籲邀請台灣出席WHA。
2020年5月，捷克參議院外交、國防暨安全委員會以及衛生暨社會政策委員會通過支持臺灣參與WHO與WHA的決議案，這是捷克國會相關委員會近年來首度通過支持台灣參與WHO的決議案。
2021年4月，捷克參議院以58比0通過支持臺灣參與WHA所有會議、機制和活動的決議案。
僅列舉部分名單：
中華民國：總統夫人曾文惠、前總統李登輝、前副總統呂秀蓮、立法院副院長洪秀柱、總統府資政彭明敏、劉兆玄、胡為真、江宜樺、總統府國策顧問詹啟賢、陳唐山、政務委員楊世緘、外交部長胡志強、歐鴻鍊、吳釗燮、國防部長蔣仲苓、財政部長李述德、經濟部長杜紫軍、科技部長吳政忠、銓敘部長朱武獻、外交部政務次長徐斯儉、關稅總局長簡良機、國際貿易局長林義夫、黃志鵬、衛生署長陳建仁、環境保護署長陳重信、勞工委員會主任委員陳菊、文化建設委員會主任委員陳其南、翁金珠、盛治仁、國家科學委員會主任委員劉兆玄、李羅權、國家發展委員會主任委員龔明鑫、研究發展考核委員會主任委員朱景鵬、國家通訊傳播委員會主任委員蘇蘅、臺灣聯合大學系統總校長曾志朗、台北市長柯文哲。
1995年6月，行政院長連戰訪問捷克，先後會見捷克總理克勞斯、總統哈維爾。
2001年11月，中華民國總統夫人吳淑珍訪問捷克，受到總統哈維爾的款待，並親自為吳淑珍推著輪椅逛博物館。
捷克：總統夫人、、前副總理、助理副總理馬克思（Arnost Marks）、國家銀行總裁、外交部次長、財政部次長瑞林卡（Ladislav Zelinka）、內政部次長、文化部次長、、衛生部次長、斯拉摩（Petr Slama）、工業暨貿易部次長庫普卡（Václav Kupka）、霍沃卡（Milan Hovorka）、諾瓦特（Tomáš Novotný）、巴托（Vladimír Bartl）、汪德拉謝克（Marek Ondrousek）、民航局長卜羅賀（Jindich Ploch）、投資暨商業發展局長、競爭保護局主席、參議院副議長、、、、參議院外交委員會主席冉托斯基（M. Zantousky）、、參議院外交國防暨安全委員會主席、、、參議院官員公務活動常務委員會主席、參議院衛生暨社會政策委員會主席、、參議院國家經濟農業暨交通委員會主席、參議院公共行政區域發展暨環境委員會主席、眾議院副議長、、、眾議院外交委員會主席施瓦岑貝格、眾議院預算委員會主席索布卡、眾議院憲法暨法律委員會主席、通訊傳播委員會主席、捷克科學院長、中波西米亞州長、維索基納州長、布拉格市長賀吉普。
2004年11月19日，捷克前總統哈維爾夫婦應中華民國總統陳水扁及台灣民主基金會邀請抵台訪問6天。訪問期間，會晤總統陳水扁並被授予景星勳章、款宴；會晤副總統呂秀蓮、發表演說、接受國立政治大學贈予名譽文學博士學位，並與藝文界人士座談。
2019年10月9日，捷克參議院議長柯佳洛出席駐捷克臺北經濟文化辦事處在布拉格舉辦的國慶酒會，並表示計畫在隔年初訪台，時間預定在2020年中華民國總統選舉後。捷克总统與總理以影響對中華人民共和國關係為由反對（以下權稱中國），則表明無意干涉。但柯佳洛於2020年1月20日猝逝，中華民國外交部表達深切哀悼之意，並要求駐捷克代表柯良叡向家屬致哀，外交部長吳釗燮也親自致電捷克駐台代表Patrick Rumlar表示哀悼。1月31日，吳釗燮代表中華民國總統蔡英文前往駐台北的捷克經濟文化辦事處，在弔唁簿上留言致哀。2月19日，《路透社》披露中國駐捷克大使館在1月20日向捷克總統府發函表態，若參議院議長柯佳洛按原計畫2月率團訪問台灣，中國將施壓捷克企業。3月初，新任參議院議長韋德齊證實，在柯佳洛的遺物中發現中國施壓的信；捷克總理巴比斯亦證實，中國駐捷克大使张建敏曾致函威脅捷克政府以阻止柯佳洛訪台，稱捷克將為此付出慘痛代價，讓巴比斯無法接受，要求撤換張建敏。4月26日，捷克電視台播出的「」專訪節目中，柯佳洛的妻子薇拉（Vera Kubera）與女兒溫杜拉（Vendula Vinšová）說出柯佳洛被施壓的細節，指出捷克總統府與中國駐捷克大使館曾不斷威脅他取消訪台，甚至還寄出內容涉及家人安危的威脅信。柯佳洛猝逝前三天，在中國大使館的農曆新年晚宴上還曾警告妻子「千萬別吃中方提供的餐食飲料」。薇拉還強調，柯佳洛到死前都堅持訪台。29日，參議院議長韋德齊表示，如果最後決定訪問台灣，不是為了報復，而是展現捷克的國格與對自由民主的重視。對此，捷克外交部長佩崔切克則表示，訪台的影響大家都很清楚，不建議、但也不會阻止。5月20日，捷克參議院以50比1票數通過決議，譴責中國對有意訪台的時任議長柯佳洛有所施壓，並指出捷克國會議員訪問台灣符合捷克長期的外交利益，支持議長在企業代表的陪同下訪問台灣。6月9日，參議院議長韋德齊宣布他將與政治、企業和科學界人士在8月30日訪問台灣。24日，韋德齊在捷克《》的影音專訪表示「台灣是一個事實獨立而且自由的國家」。8月12日，美國國務卿蓬佩奧於捷克參議院發表演說，對於也在現場並即將訪台的議長韋德齊，蓬佩奧表示支持，直呼「不錯嘛！」（good on him）。20日，欧洲议会「對中國關係代表團」團長比蒂科夫與副團長發表聯合聲明，支持韋德齊訪臺，完成已故議長柯佳洛訪臺的遺願。25日，由2名歐洲議會議員領銜，並獲歐洲議會友臺小組主席、美國聯邦參議員魯比歐，以及德國、法國、英國、立陶宛、愛沙尼亞、斯洛伐克、加拿大、澳洲等68名跨國國會議員連署發表聯合聲明，強力支持韋德齊訪臺，並譴責中國施壓已故議長柯佳洛要求切勿訪臺的蠻橫干預。中国驻捷克大使馆對韋德齊訪台表示反對，而韋德齊則回應「此次出访是延续前总统哈维尔與前外交部长丁斯特比爾建立的外交传统，也就是捍衛自由與民主。捷克与民主国家合作，不管他人同意与否。」
2020年8月30日，韋德齊夫婦率領89人的訪問團搭乘中華航空包機直飛台灣訪問6日，由外交部長吳釗燮前往桃園國際機場迎接，有鑑於2019冠状病毒病疫情，全團登機前都提供核酸檢測的陰性證明。韋德齊是捷克訪臺層級最高的現任政治人物，此行除會見總統蔡英文，以及政府高層官員，並前往國立政治大學與立法院發表演說，接受立法院長游錫堃頒贈國會外交榮譽一等獎章與紀念議事槌，出席臺捷經貿投資論壇，以及台美日歐共同舉辦的重組供应链論壇等。蔡英文也追贈已故議長柯佳洛特種大綬卿雲勳章表達最高敬意，由韋德齊代表接受，原規劃一同訪臺的柯佳洛妻子薇拉因為健康因素無法參與，但透過影片表示感謝。對於中國外交部長王毅表示「在臺灣問題上挑战一个中国原则…中国政府和中国人民决不会听之任之、坐视不管，一定要让其为自己的短视行为和政治投机付出沉重代价。」「中方必须要告诉捷克参议长：你过线了！」的談話，捷克外交部長派提賽克回應將召見中國大使要求提出解釋，並言「這趟行程一定會影響我們與中國的關係，但我認為這（番言論）已經過頭了。」韋德齊則表示「我們是一個自由的國家，尋求與所有國家保持良好的關係，我相信，無論部長的聲明如何，將來都是如此。讓我再度重申一次，此行絕不是要在政治上與任何人對抗。」「大家都是自願訪問台灣，認為這是正確的事。」「我當然不高興也不太喜歡這樣的表達方式，每個國家都有對一個中國原則的理解方式，我個人認為此次訪問台灣沒有違反捷克與中國的協定。」斯洛伐克總統-{zh-hans:恰普托娃; zh-hant:恰普托娃; zh-tw:查普托娃;}-、斯洛維尼亞總理-{zh-hans:扬沙; zh-hant:揚沙; zh-tw:楊薩;}-、捷克籍歐盟執委會副主席、德國外交部長馬斯、法國外交部發言人、-{zh-hans:美国国家安全委员会; zh-hant:美國國家安全會議;}-皆表態聲援捷克。9月4日，訪問團結束行程搭機離台。
韋德齊返回捷克後，在機場受到民眾迎接，其中有以捷克文書寫「我們是台灣人」（）的標語，呼應韋德齊訪台期間在立法院演說時以中文說出「我是台灣人」這句話。韋德齊隨後前往參議院向捷克民眾報告訪台成果，並言「接下來就看政府要築的是障礙還是橋」。9月6日，對於捷克總統齊曼批評訪台之舉「像個男孩般挑釁中國」，將不會邀請韋德齊參加捷克的高層外交政策官員會議，以及總理巴比斯批評此行將政治與商業混為一談，並違反一中原則，現在捷克正等著中國的反應，也不欣賞韋德齊自認能「拉直捷克共和國的脊椎」。韋德齊在與巴比斯同台接受美國有线电视新闻网（CNN）專訪時，反駁齊曼的「3個謊言」。第1個是齊曼僅說「不建議去台灣」，並沒有表示「不准」，第2個是齊曼對會議的見解有錯，韋德齊最後說「最令我遺憾的第3個謊言，是指控我稱『台灣是一個獨立國家』，這不是真的，我在台灣就已經說過，我不會干涉（統獨議題），這是捷克政府的事。」受到訪台事件影響，捷克鋼琴製造商佩卓夫表示，確實有中國客戶因此為由，臨時取消總值530萬捷克克朗（約700萬新臺幣）的訂單，並擔心雙邊關係惡化恐影響未來在中國的銷售。後已恢復對中國的業務。
1991年7月4日，中華民國與捷克斯洛伐克達成相互設處協議。
1991年8月7日，中華民國於捷克首都布拉格設立具大使館功能的駐捷克台北經濟文化辦事處（Taipei Economic and Cultural Office in the Czech Republic）。
1993年11月18日，捷克也於中華民國首都台北市設立類似功能的捷克經濟文化辦事處（Czech Economic and Cultural Office），是東歐各國中首先在台設處的國家。
2013年，駐捷克辦事處代表中華民國政府捐贈捷克5萬美元，協助在6月發生的重建。
2019年3月，駐捷克代表汪忠一出席國際貿易司舉辦的會談，卻遭到中華人民共和國駐捷克大使張建敏以捷克總統齊曼日後訪問中國行程要脅，迫使捷克工貿部委婉請汪忠一離席。對此，捷克總理巴比斯於4月10日表示，工貿部長將離職。
歐洲申根區給予持有載明身分證字號的中華民國護照之中華民國公民可以申根區免簽證入境，停留日數與申根區合併計算，每6個月期間內總計可停留90天。
捷克公民持有歐盟護照者也可以免簽證的方式入境中華民國，停留最多90天。
此外，兩國每年皆提供特定名額的18－26歲青年為期1年的度假打工簽證（皆必須未曾取得此種簽證）。
有鑑於2019冠状病毒病疫情，中華民國外交部的國外旅遊警示分級表將捷克歸類為橙色警示：避免非必要旅行（2021年8月12日更新）；衛生福利部的國際旅遊疫情建議等級表已將各國家與地區歸類為第三級警告：避免至當地所有非必要旅遊（2020年3月21日更新）。
經濟部國際貿易局於首都布拉格設立駐捷克代表處經濟組。
2020年，捷克是中華民國第41大貿易夥伴、第45大進口夥伴、第35大出口夥伴。出口至捷克的金額為5億2,078萬3,801美元，年增14.602%。自捷克進口的金額為3億6,994萬4,720美元，年增1.467%。貿易呈現出超（盈餘）1億5,083萬9,081美元，年增67.909%；2019年，捷克是中華民國第45大貿易夥伴、第41大進口夥伴、第39大出口夥伴。中華民國則是捷克第24大進口夥伴、第51大出口夥伴，在亞洲經濟體排名第8、11。
2020年，中華民國是捷克進口金屬切割机與金屬成型機第5大進口來源（佔4.30%），次於德国（32.87%）、意大利（10.76%）、日本（8.92%）、美国（7.54%）。
出口至捷克的主要項目為：特定用途機器之零件與附件；電話機與其他傳輸或接收聲音、圖像或其他資料之器具；車輛之零件與附件；記憶、錄音或錄影裝置；自動資料處理機、磁性或光學閱讀機；鋼鐵製螺釘、螺栓、螺帽、鉚釘或墊圈；手工具、、老虎钳、夹子、砧、手提鍛爐、磨輪；熱軋之不鏽鋼條與桿、印制电路板、小客車與其他主要設計供載客之機動車輛、集成电路；機器自行車與自行車裝有輔助動力者、邊車；特定用途器具之零件、电容器；競技運動或戶外遊戲用物品與設備、游泳池與袖珍游泳池；其他塑料製品與其他材料制成品、不織布、出口未超過5萬新臺幣之小額報單與其他零星物品、車用之電氣照明或信號設備、蓄電池、診斷或實驗用有底襯之試劑或配製試劑、其他鋼鐵製品、醫學用儀器與用具、其他铝製品；二極管、發光二極管、晶体管與類似半导体器件、光敏半導體裝置；空氣泵或真空泵、空氣或其他氣體压缩机與风扇；電路開關或連接器、手用扳手與扳鉗等。
自捷克進口的主要項目為：小客車與其他主要設計供載客之機動車輛；光学显微镜以外之顯微鏡、繞射器具；電話機與其他傳輸或接收聲音、圖像或其他資料之器具；車用之電氣照明或信號設備、車輛之零件與附件、醫學用儀器與用具、；示波器、频谱分析仪、供計量或偵測游離輻射之器具；电动机與发电机；、；新橡膠氣胎；自動資料處理機、磁性或光學閱讀機；推土機、平地机、整平機、刮土機、鏟土機、挖掘機、鏟斗機、與壓路機；空氣泵或真空泵、空氣或其他氣體壓縮機與風扇；電容器、電路開關或連接器、具有獨立功能之電機與器具；物品用栓塞、旋塞、阀與類似用具；水蒸汽或其他蒸汽發生锅炉或過熱水鍋爐、具有特殊功能之機器與機械用具、木材、控電或配電用板或櫃；絕緣電線、電纜與其他絕緣電導體；金屬或用磨石、研磨料與拋光物達成磨光作用之機床；金屬加工工具機、金屬或金屬碳化物加工用壓床；進口未超過5萬新臺幣之小額報單與其他零星物品、玻璃纤维及其製品；涡轮喷气发动机、螺旋槳推動用渦輪機與其他燃氣渦輪機；製造半导体、積體電路與平面顯示器用之機器與器具、零件與附件；離心分離機、液體或氣體過濾與淨化機具等。
根據中華民國經濟部投資審議委員會統計，截至2020年，捷克前往臺灣總投資金額為110.8萬美元，計有26件；臺商赴捷克總投資金額約1億6,000萬美元，計有31件。是臺商前往欧洲联盟投資第4大投資國，僅次於德国、荷兰、英国；另根據統計，臺商赴捷克總投資金額為11億7,770萬美元，計有35件，為捷克創造近1萬7,000個工作機會。
1995年，臺商開始前往捷克投資，多為資通訊產業，包括鴻海科技集團（位居捷克第6大公司、第2大出口商）、宏碁、華碩、英業達集團、緯創資通、和碩聯合科技、奇偶科技、正文科技、致伸科技、群光電子、達方電子等。目前在捷克尚未有臺灣的金融機構。
台灣漢翔航空工業與捷克沃多喬迪航空合製，首架飛機於1999年12月舉行出廠典禮。
2003年1月12日，成立捷克台灣商會。
2015年7月，台灣鴻海科技集團董事長郭台銘與捷克總理索布卡簽署合作備忘錄，成為推動工業4.0合作夥伴。針對生產自動化、、車用電子、大數據資料處理中心等，在捷克設立研發與設計中心，計劃在3年內投資25億捷克克朗（約1.1億美元）；鴻海亦與捷克主要頂尖大學合作，投資37億捷克克朗（約1.6億美元）於人力資源開發領域，可為捷克創造2,000個就業機會。2016年9月，鴻海與捷克合資成立的SafeDX大數據公司啟用。該公司股權已於2020年9月被鴻海全數收購，未來將積極發展新能源车等領域。
中華民國與捷克的科技交流是東歐國家中最早的，自1991年蘇聯解體後即開始接觸。2006年10月，設立駐捷克代表處科技組，並數個中東歐國家。2007年，舉辦首屆台捷科技日，至2019年已舉辦第六屆。
目前尚有舉辦臺捷經濟諮商會議，至2020年已舉辦第4屆；臺捷民間聯席會議，至2019年已舉辦第17屆。
每年3月，台灣區電機電子工業同業公會（電電公會）均組團前往捷克第2大城布爾諾參加捷克國際電機電子展，該展是中、東歐最大商展。
中華民國教育部每年提供台灣獎學金給捷克大學部及研究所學生赴臺攻讀學位，以及華語文獎學金給捷克高中畢業以上年青人赴台灣的大學華語中心研習華語文，外交部每年則提供台灣獎助金給捷克大學助理教授、、博士候選人前往台灣進行學術研究；也提供台灣學生研習獎學金、斯拉夫研究夏令營獎學金。兩國的數十所大學亦簽署交流合作協議。截至2017年，台灣在捷克的留學生有120人；捷克在臺灣的留學生有35人。
2019年6月，成立捷克臺灣協會，並與中華民國政府合作設立捷克首間繁體中文學校，協助臺僑子女與外籍人士提升中文能力，以及對臺灣文化的認識與瞭解。
2003年6月，台灣參加「布拉格劇場設計四年展」，但中華人民共和國堅持須更名為「台灣，中國」，未獲主辦單位接受，其代表於參展後提前離去，中華人民共和國大使館並赴捷克外交部及文化部抗議。
2007年11月，與捷克國家博物館合作，在國立台灣博物館展出《波希米亞偶的家－捷克懸絲偶戲展》，捷克文化部次長亦抵台參加開幕式。
2009年2月，《捷克珍寶－影像聚珍特展》於國立台灣博物館展出。
2011年6月，捷克新藝術運動代表人物－慕夏的作品於台北國立故宮博物院及高雄美術館展出《慕夏大展－新藝術．烏托邦》。
2014年12月，布拉格亞洲影展舉辦台灣電影專題，放映《南方小羊牧場》、《白米炸彈客》、《行動代號：孫中山》、《冰毒》、《共犯》、《迴光奏鳴曲》等6部影片。其中，《行動代號：孫中山》獲選為開幕片。
2019年3月，布拉格市長賀吉普、維索基納州長、布爾諾副市長，以及南波希米亚州、中波希米亚州、利贝雷茨州副州長等近80人前往臺灣出席「臺北智慧城市展」，並設置捷克國家館。
2013年，李昂著作的《殺夫》及《迷園》、白先勇的《台北人》、黃春明的《兒子的大玩偶》、劉克襄的《小鼯鼠的看法》等書籍發行捷克文版本。
2014年10月，中華民國國家圖書館與亞非研究所簽署合作備忘錄，並成立全球第10個台灣漢學中心。
有鑑於2019冠状病毒病疫情影響，外籍觀光客前往捷克皆大幅衰退。根據捷克觀光局統計，截至2020年，亞洲觀光客排名，分別是韓國的4萬2,414人次（2019年有38萬7,563人次）、中國大陸的3萬8,855人次（2019年有60萬9,727人次）、臺灣的2萬5,981人次（2019年有19萬1,336人次）、日本的2萬5,301人次（2019年有14萬7,760人次）。中國大陸與韓國有直航客機飛往捷克，臺灣與日本則尚無直航客機。
2019年8月，布拉格舉辦同志驕傲節（Prague Pride），身為亞洲第一個同性婚姻合法化的國家，中華民國也首度以駐捷克臺北經濟文化辦事處名義組團參與同志大遊行，在中，是唯一來自亞洲，約有30名台灣留學生和僑胞參與。
2018年1月，根據中華人民共和國（以下簡稱對岸）向國際刑警組織申請的紅色通報，於首都布拉格市郊逮捕8名涉及跨國電信詐騙的中華民國籍嫌犯，其利用網路電話向對岸民眾詐騙達100萬歐元（約新台幣3,500萬）。對岸向捷克提出引渡受審的要求，捷克高等法院採信對岸「公平審判」和「不判死刑」的保證，於2019年6月裁定將嫌犯遣送至對岸。嫌犯委請辯護律師向捷克有關部門提出後續救濟。7月，捷克內政部長透過Twitter證實，這些嫌犯將得到「」。此舉等於回絕對岸的引渡要求，反駁法院先前的裁定，辯護律師說，捷克政府相信他們在對岸將受到非人道待遇。
資料截至2019年12月8日 兩國無直航班機，可經由（不計航點遠近）：持有中華民國國際駕駛執照可在捷克駕車。