臺北文化體育園區
臺北大巨蛋（，或稱：臺北文化體育園區，官方名稱：徵求民間參與興建暨營運臺北文化體育園區-大型室內體育館開發計畫案），是臺灣臺北市信義區一座興建中的都市開發區，位於光復南路、忠孝東路與市民大道之間，並且隔著忠孝東路與國父紀念館對望，體育園區坐落於松山菸廠原址（現部分區域已經劃為松山文創園區），由臺北市政府以BOT模式交由遠雄集團旗下的遠雄巨蛋公司興建與營運。主體為一座室內棒球場，即俗稱的巨蛋。為了跟早已經落成的臺北小巨蛋（）做出區隔，因此稱為臺北大巨蛋。園區設置的項目除巨蛋外，另有商業用途的商場、影城、飯店、辦公大樓、旅館等附屬設施。
由1991年到2002年，歷經 :
1991年11月10日，臺北市立棒球場上萬觀眾坐等1991年中華職棒總冠軍賽第七場（味全龍對統一獅）在此開賽，行政院院長郝柏村也坐在觀眾席內；不料天降大雨，中華職棒宣布延賽，觀眾齊聲高喊「我們要巨蛋」，郝柏村因此指示興建不受風雨影響的室內體育場。
1993年，配合爭取主辦1998年亞洲運動會，李登輝政府將巨蛋列入國家重大建設，規劃在關渡興建台北巨蛋；但關渡開發計畫遲未推動，台北巨蛋隨之停擺。
1995年，台北文化體育園區的基地，為台灣省菸酒公賣局松山菸廠舊址。臺北市政府成立「巨蛋催生小組」，首次規劃在松山菸廠興建巨蛋。
1995年12月26日，臺北市政府聘請棒球球星王貞治擔任巨蛋催生小組最高榮譽顧問，時任臺北市市長陳水扁頒贈巨蛋催生小組最高榮譽顧問聘書給王貞治；陳水扁在頒贈聘書典禮上說，巨蛋興建完工後，將每年或每二年舉辦「台北盃」世界棒球錦標賽，提升棒球水準。
1996年1月，時任臺北市副市長陳師孟與時任臺灣省副省長吳容明協調，規劃利用松山菸廠興建大巨蛋；但臺灣省虛級化推動後，臺北市政府與臺灣省政府的合作停擺。
1996年7月20日，臺北市政府巨蛋催生小組決議於臺北市立棒球場原址興建巨蛋；但在1998年陳水扁連任市長失敗後暫停。松山菸廠停止運作後，廠區移交台北市政府管理。松山菸廠18公頃基地全數作為台北大巨蛋園區之用，並開始進行後續關廠與土地移交作業。 2002年7月9日，「台北文化體育園區籌備處」成立，臺北市政府教育局局長李錫津擔任首任執行長。
文化園區部分隸屬臺北市政府文化局管轄，佔地約8公頃，以發展台北市藝術文化為目標；體育園區隸屬臺北市政府體育局管轄（體育局成立前為臺北市政府教育局），佔地約10公頃。
臺北大巨蛋採用民間興建營運後轉移模式（BOT）公開招標，原預計於2015年底就能完工啟用，後因停工導致時程延後，目前預計2022年完工啟用。
2003年12月26日上網公告辦理招商，2004年3月19日前計有3家廠商向台北市政府提出書面疑義，相關疑義均分別以正式函文回覆各家廠商並公告於工程會網站補充說明，該案2004年4月15日在工程會公告補充說明，其中領標人請求釋疑事項均於公告中，說明「本案開發之總樓地板面積上限為96,000 坪（約 316,800 平方公尺），其中大型室內體育館之樓地板容積應不小於35,000坪（約115,500 平方公尺）」，「『96,000 坪開發總樓地板面積』之定義為法定容積面積」。，截標2016年日期4月30日。
2004年5月，遠雄企業團大都市建設與日本竹中工務店等協力廠商合組的「台北企業巨蛋聯盟」獲選臺北市政府甄審委員會議選為BOT案最優申請人，開始與臺北市政府議約。 2004年9月，竹中工務店等廠商聲明退出台北企業巨蛋聯盟，並向臺北市政府表明申請計畫內的興建內容及設計為其智慧財產權，任何人不得使用。遠雄在2005年要求變更協力廠商，當年九月馬市府宣布BOT流標，想和遠雄解約，結果被執政的民進黨公共工程委員會擋下。2006年6月，臺北市政府同意大都市建設變更協力廠商為Populous公司。
2006年10月3日，台北企業巨蛋聯盟籌設的公司「遠雄巨蛋事業股份有限公司」與臺北市政府簽約辦理「臺北文化體育園區─大型室內體育館臺北大巨蛋BOT案」簽約，由時任臺北市市長馬英九與遠雄企業團董事長趙藤雄代表簽約。簽約後開始起算50年特許期。
2007年9月，行政院核定「臺北文化體育園區─大型室內體育館臺北大巨蛋BOT案」與附屬事業均為國家重大建設。 2010年12月9日 大巨蛋通過臺北市都市設計審議。
2011年5月26日 有條件通過環評，2011年6月16日都審原則同意。
2011年6月30日 取得建築執照，依照合約需3年內完工，2011年11月16日完成融資。
2012年4月17日 動工。
2014年11月13日 臺北大巨蛋舉行上樑典禮。
2014年11月13日 國際棒球總會IBAF在官網發表專文介紹臺北大巨蛋。
2017年11月 大巨蛋屋頂封頂。
2020年8月7日 臺北市政府都發局正式同意復工。
台北市警消2021年12月21日9時獲報，忠孝東路4段的大巨蛋工地一名年約30餘歲男性工人從地下2樓墜至地下4樓，導致左腿變形。
大巨蛋室內棒球場中外野，左右外野，本壘後方，全壘打牆高3.5公尺，符合IBAF的建議規範和美國大聯盟1958年訂定的規格，使用國際認證的最新人工草皮，投手丘可以升降隱藏。棒球場改裝後也可以做為足球場，球門位在本壘和中外野，但需另外更換成FIFA認證的足球用人工草皮。
大巨蛋為配合建築基地先天條件限制（東西寬，南北窄），因此設計成橢圓形而非正圓形，蛋體樓地板總面積3萬5,000坪，鋼構總重6萬5,000噸，屋頂總重1萬3,260噸（屋頂為固定式不能打開），屋頂和帷幕外牆包覆可以防火隔熱隔音的淡灰色純鈦金屬板，球場地面至室內屋頂最高點總高度72.5公尺（地上62公尺，地下10.5公尺），球場區共地上六層地下二層，球場地面位於地下深度10.5公尺處的B2層，採用下沉設計以降低量體壓迫感，蛋體室內跨距長230公尺寬170公尺，為全球室內巨蛋非對稱最大跨距的建築，並且是全球唯一整個巨蛋都採圓形鋼管構造，內部視野壯觀開闊沒有樑柱無死角。
大巨蛋平時開放9個主要大型出入口，疏散避難時可增至52個緊急逃生口，球場四角高處定點備有4座大範圍全自動感應滅火放水鎗（水柱射程97公尺）和排煙灑水設備，球場裝潢座椅皆採用防燃材料，並設消防車專用通道可迅速直達球場層與地下室進行救災。
大巨蛋室內棒球場內野區看臺分成（內野下層13,423席、內野中層9,209席、內野VIP層1,570席、內野上層7,179席），外野區看臺分成 (外野下層3,826席、外野中層5,034席、外野VIP層334席），舉行棒球比賽時看臺總共可容納40,071名觀眾座位（內野看臺31,381席、外野看臺8,690席）（棒球比賽總席數不含外野下層打擊淨空區504席），座位分成（一般席、VIP席、行動不便者席、輔助者席、記者席、活動席），使用符合人體工學的最新日本KOTOBUKI進口座椅，座椅顏色採黑灰白三色不規則交錯設置，以營造觀眾滿席的熱烈氣氛，走道和座椅間皆保持適當距離不會擁擠，VIP包廂區總共36間（內野20間、外野16間，包廂共約500個座位），並規畫完善的場邊球員休息區、球員更衣室、球團會議室、牛棚打擊練習區和後援投手練習區，球場本壘後方2樓有視野最佳的現場轉播記者室，B2層有專為比賽結束後聯訪的記者會採訪室（可容納媒體記者約50名），大巨蛋東側B1、B2另設臺灣棒球博物館，地下停車場有汽車位2,300個（B5層）、機車位3,800個（B5層）、遊覽車位55個（B4層）、TV轉播車位2個（B4層）、裝卸車位44個（B4層）、計程車等候車位60個（B3層）。
大巨蛋室內棒球場的其它多用途使用方式，例如舉辦演唱會時含架設球場平面區座位最大可到5萬席、展覽場約706攤、尾牙宴約700桌等。室內不受外界氣候冷熱和風雨影響，並有空調設備可供專心舒適的觀看比賽表演，全區空調均溫可達攝氏24度風速每秒1公尺以下，能依照不同活動的性質調整節能模式。音響採用日本專業TOA Type C喇叭系統，將會在大巨蛋屋頂中央設置33組陣列式喇叭，並於內野觀眾席加設45個單點補強音響，提供高清晰的3D環場音效。球場燈光採用國際奧會指定的運動照明品牌Musco Lighting，共設置456具燈光照明設備。中外野上方設有巨型LED多媒體計分板主螢幕（長約33公尺寬約18公尺），左右外野上方則設有次螢幕（長約14.5公尺寬約9公尺）。
無黨籍台北市長柯文哲上任後（2014年12月25日），認為過去北市府執行的多件BOT案藉BOT之名，對財團行大讓利之實，鎖定大巨蛋、松菸文創、三創園區、美河市和雙子星五大案優先處理，重談回饋機制、提高權利金，成立廉政委員會調查，也多次表示「如果這不是弊案，什麼才叫弊案？」。但後續台北市長柯文哲2016年5月18日在北市府召開的BOT制度研討會中，主動為5大弊案「正名」，要求大家改稱「5大案」。從2015年3月市府成立廉政透明委員會查案開始，至今查了一年多，仍沒有具體而重大的「弊」端。。
2015年1月13日下午，松菸公園催生聯盟、松菸護樹志工團、台灣護樹團體聯盟召開聯合記者會，指出大巨蛋BOT案的多項弊端，並呼籲臺北市政府主動公佈相關資料。
2015年1月16日，台北市長柯文哲召開專案會議，要求副市長鄧家基、法務局長楊芳玲和顧問洪智坤成立調閱小組，檢視大巨蛋BOT案合約內容與歷屆會議記錄，若有違法之處就移交政風處處理。責成交通局、捷運局，針對大巨蛋在緊急狀況下的疏散路線重新規劃安全、可行的路線。另外宣布，台北田徑體育場為世大運主場館備案定點，保證世大運與巨蛋脫鉤，不會發生趙藤雄指稱巨蛋不完工世大運會跳票的情形。
2015年1月17日柯文哲聘用的廉政委員徐嶔煌則宣稱遠雄花費288億元興建，卻只有80億用在大巨蛋場館，其他208億全部都是商場建設，市府只獲得權利金0元、公告地價1%的租金6,700萬，市府當初買地借了140億，每年利息粗估2億，每年市府至少虧損1.3億，相反的遠雄50年預估可收入7,300億元，2014年6月4日，自由時報並報導認為這塊土地至少值2,000億。
2015年6月10日，台北市廉政透明委員會今天進行5大案結案報告，會後宣布大巨蛋案和美河市案移送法務部調查，三創案、松菸文創案則送監察院調查，雙子星案查無不法、無人送司法調查。 2016年1月19日台北市廉委會決議大巨蛋案將再移送總統馬英九等人給法務部偵辦，並嗆聲說如果法務部不辦，就將在2016年5月20日後2次移送。法務部政務次長陳明堂表示，法務部沒有辦理具體訴訟的權責，無權受理，如果台北市政府要提出告發，依法應該要向檢察官或司法警察官提出。
大巨蛋BOT案於2006年3月與遠雄簽約，自簽約起算特許年限50年，2010年通過台北市都市設計審議， 隔年有條件通過環評，並取得建照後，在2012年4月動工，原定2015年底完工，但因遠雄辦理工期展延，從郝市府延宕至柯市府，柯市府在2015年5月勒令遠雄停工中。大巨蛋停工行政訴訟還在進行中，律師葉慶元說，假若遠雄打贏了，大巨蛋遲延完工恐就不是遠雄的錯，北市府會「輸很大」；行政訴訟時間多在一年至一年半，推估柯市府近期不會提解約。 2015年1月21日，市府發新聞稿，台北市政府發言人林鶴明今天表示，針對大巨蛋爭議，台北市長柯文哲晚間與遠雄巨蛋事業董事長趙藤雄見面後，雙方達成共識，將重新議約，遠雄承諾年底前完工。。
2015年3月13日，台北市政府發文，大巨蛋施工延宕，要求遠雄建設改善。如今已屆改善期限。台北市副市長鄧家基2015年6月16日向媒體提出兩點說明：整體公共安全仍是重點，絕對不能放棄；另外，大巨蛋未依約限期改善並取得使用執照，依照BOT合約管理，市府將通知融資機構，全力善後。
2016年4月13日,針對台北市長柯文哲下午在議會質詢時間，指遠雄大巨蛋「朝解約的方向處理」。遠雄集團發言人楊舜欽第一時間回應表示，請市府依照BOT合約規範，雙方終止契約、市府鑑價買回。，遠雄集團董事長趙藤雄當天6時前往北市府，與市長柯文哲當面會談大巨蛋問題，在1小時會面後，雙方達成解約共識。台北市副市長鄧家基表示「遠雄開價370億元要市府買回大巨蛋，後續須由律師和遠雄議定」，「有憑證的合理支出該給就給」，大巨蛋的下一步，將交由第三方鑑價並由北市府買回， 2016年4月18日，台北市長柯文哲昨至議會向民進黨團報告，並以「涉及談判」為由，拒絕媒體旁聽，，柯市府從原來的「因遠雄過失而解約（不用賠償）」的強硬立場，大幅讓步到「合意解約（必須鑑價買回大巨蛋並賠償遠雄初估約370億的損失）」，議員因而對合意解約一案全一致地投下反對票，討不到錢為大巨蛋焦頭爛額的柯文哲，情緒激動哽咽、捶桌透露無奈批「遠雄背後有馬英九來撐腰」。。
2016年5月19日，市府上午再度發函遠雄，要求遠雄改善違反《建築法》、施工進度嚴重落後等違約情事，若遠雄不肯配合，將依契約第19.4.2條與21.1.3條等相關規定辦理。經查，這兩項條文都是甲方直接終止大巨蛋契約，這也間接證實兩方日前達成的「合意解約」共識接近破局。
市府要求遠雄在7月8日前具體表明是否願意改善大巨蛋公安、9月8日完成復工程序及提出趕工計畫，否則將解約。遠雄5日回函市府，表示始終堅持履約，但需雙方共同合作，而非蓄意刁難。副市長鄧家基今天上午回應遠雄回函，認為遠雄回函的18頁公文沒有提出具體復工及趕工計畫，通篇都是要求要立即復工；對此北市府感到遺憾，將成立終止契約小組，若遠雄在9月8日前仍未完成改善，將啟動解約。 2016年9月8日，遠雄趕在限期改善到期前，向市府送出同意書，承諾盡速完成建照變更、向台灣建築中心完成防火避難性能認可審查、向北市府都發局、環保局遞件送審，完成法定程序。發言人楊舜欽表示，遠雄願意「讓步」。柯文哲次強調，不是放棄終止契約，而是保留終止契約的權利，在遠雄釋出善意下，暫時不行使終約的權利，仍會繼續監督行為，希望遠雄即刻改善大巨蛋相關公安問題。
2016年5月24日，下午4點，台開集團董事長邱復生召開臨時記者會，邱復生說，大巨蛋拖延的後果難以想像，台開願意來做這件事，並不等於台開要「接手大巨蛋」，或是擁有大巨蛋。只是開啟第一個敲門機制，將提出計畫給台北市政府，其他各企業集團也可提出計畫，若遠雄集團會在三個月內改善，也是美事一樁。。
2015年1月21日，柯文哲見趙藤雄，討論包括監察院在2009年提出的39項糾正案、工程逾期與罰則等3大問題，將重新議約。台北市政府發言人林鶴明表示，關於遠雄請求事項，台北市政府有4點回應：1. 遠雄必須依照市府公布的移樹SOP進行移樹作業；2.地下連通道會施作，但修改成新的設計圖，並會全力幫遠雄和護樹團體進行協調；3.捷運國父紀念館站「5號出入口」及「通風井」移設連通案因工期緊迫，遠雄儘速提出細部設計規劃，市府答應儘速協助解決；4.遠雄承諾大巨蛋將在今年底完工，台北市政府將盡力協助。。
2015年5月20日，台北市政府勒令遠雄全面停工。 同月22日，因台北市政府貿然停工可能會導致板南線崩塌，而核准遠雄針對大巨蛋靠近捷運南港線一側的大底工程先行提出報備施工。同月25日，台北市政府繼續核准遠雄進行大巨蛋全區大底工程並於7月31日前完工。遠雄後續提出仲裁，但原訂於6月22日的第一次會議卻臨時因遠雄方仲裁人辭職而延期。2016年3月24日 - 大巨蛋工期展延仲裁結果出爐，遠雄以土方運棄條件變更為由，提出工期展延459天，最後獲得展延110天，其他尚有工期延伸申請中。
2016年5月23日，柯文哲親自拍講大巨蛋影片po上於臉書和youtube表示,在去年2015年會勘後發現遠雄不按圖施工，依建築法第58條勒令停工以後，市府秉持著「公安不打折」的最高原則，希望遠雄能改善公安，目的就是希望這是一個安全的大巨蛋。對此遠雄集團發言人楊舜欽回應，強調大巨蛋公安本來就沒有問題，是歷經5年5個月102次的審查才拿建照，中間還有1,000多位的工程專家，試算巨蛋園區的安全模擬係數，就算柯市長再討厭前朝也不能污蔑專業！楊舜欽說，柯市府還竟然找一個在日本民間企業已經退休的人，花了好幾百萬用了幾個小時，運作了一套連日本自己都沒用過的軟體，只為了把不安全的帽子套在遠雄頭上，再加上利用社會輿論打壓企業，這不僅是對遠雄不公平，更嚴重是欺騙市民！。
2016年5月6日，臺北市議會工務部門質詢，對於台北市都發局長林洲民「如果公安 7 項標準與違反建築法規施工項目的 79 項都改善，然後經過減量新型設計之後，就可以復工」的答詢，議員提出「依建築法第58條勒令停工以後，理論上應該就是回歸到沒有按圖施工這件事情，也就是違反建築法第 58 條的相關規定去解決處理」、「7 項公安標準裡面有些是逃生避難等，這跟建造圖根本沒有關係，這跟建築法第58條也沒有任何關係啊！」、「公安的問題是不是能夠由公正的第 3 方重新做一個檢視，這樣子大家都能夠接受。而不是像他們(遠雄)所說私設刑堂或是球員兼裁判等，這樣才能夠解決問題嘛！」
2016年6月12日 遠雄在6月6日向法院聲請大巨蛋停止停工處分，遠雄表示，面對颱風季和水浮力潛變問題，工程安全最優先，隨後再面對各項訴訟。 2016年7月22日，法院裁定 大巨蛋可部分復工，北市府要求遠雄集團在台北大巨蛋案中應予停工，遠雄提出行政訴訟反擊，聲請撤銷停工處分。台北高等行政法院昨裁定，因人命無價，考量大巨蛋工程停工後，已完成工程有鏽蝕、坍塌問題，且若遇強颱或強震，有可能導致結構及坍塌危險，威脅民眾生命安全，遠雄可針對有坍塌、公安風險等處部份復工，但駁回遠雄擬全面復工的聲請；仍可抗告。至於撤銷停工處分的本案訴訟，尚審理中。
2016年8月10日，台北市都發局昨（9）日同意遠雄大巨蛋部分復工，但項目從上周申請時的28項降至19項。遠雄企業團昨天表示，遠雄與市府達到維持巨蛋公安的共識，讓巨蛋分階段局部復工，這就是善意，遠雄上周依裁定書提出復工細部工項申請時，就開始籌備機具和工料，集團國內外總動員，希望儘早進場復工。
2016年12月21日，大巨蛋安檢議題獲得重大突破，市府與遠雄公司合意之大巨蛋安檢仲裁機關－－內政部營建署台灣建築中心，日前完成「防火性能避難審查」，審議結果牽涉到動線調整和變更，要求遠雄新增10座樓梯及減少100多席停車位。另營業面積也因此被砍了4,000坪；如果大巨蛋近期復工要「有解」，估計遠雄將多付出70億元代價。事實顯示，市府當年堅持的七項公安標準中的三項已獲得第三方機構的背書。2015年2月17日，臺北市政府成立公共安全體檢小組，參考日本巨蛋防救災的模擬標準。同年4月19日公佈安全全體檢結果，針對大巨蛋提出7項公安基準，要求大巨蛋改善。。北市府認定公安設施與疏散動線有重大疏失，提出拆蛋，或留蛋拆周邊商業設施二選一。遠雄不服，回嗆一面牆都不能拆！
2015年6月11日，新黨市議員陳彥伯在台北市議會質詢時，要求副市長林欽榮以當初成立巨蛋安檢小組的檢驗標準，去針對台大醫院、台北101等地方，看安檢能不能通過？卻遭林欽榮回絕，引起陳彥伯不滿，大聲回嗆「叫你拿同樣標準去看其他建物就不敢，難怪郝龍斌罵你們是俗辣！」一旁的台北市長柯文哲趕緊緩頰，這就是週六(13日)要辦巨蛋研討會的原因，他說「如果標準要下修，我們就下修」。
2016年5月6日，台北市議會質詢，周柏雅議員質詢:「建築執照是臺北市政府發的，原先投資計畫的審議、規劃設計的審查、施工過程的監管、環評等等，都須經市政府層層把關。如今，大巨蛋出現這麼多問題，臺北市政府是不是也應該追究所有參與都市計畫、環評、審照、發照、施工管理等等代表行使公權力放水的公務員？」,市府回答:「有關是否追究所有參與都市計畫、環評、審照、發照、施工管理等等代表行使公權力放水的公務員一節，經洽本府相關權管單位表示本案相關程序皆依法行政，並無公務員違失情形。」
2015年6月16日，台北市環保局召開環境影響評估審查委員會，審查大巨蛋的散場管理和緊急避難，遠雄巨蛋總經理湯佳峰、建築師羅興華等人出席。在會中遠雄表示，遠雄疏散模擬比照國際，完全依法執行，並指北市府安檢小組電腦模擬數據失真，不合常理，應屬無效。遠雄建議北市府應循序修法，且要一體適用，不溯既往，且將安檢小組的意見回歸營建署辦理。而環評委員說，遠雄所做疏散評估並未說明面臨地震及停電狀況，究竟該如何因應。另大巨蛋周圍交通情況已改變，遠雄是否因應預期未來交通改變的疏散計畫。也有委員提到，市府及遠雄提的模擬並不清楚究竟哪種比較接近真實，建議應該在相同的基準來重新模擬。現場也有委員怒斥，大型運動場所疏散是嚴肅議題「開發商是草菅人命」遠雄及北市府做的模擬疏散還是太樂觀，未把災難心理學也考慮在內。最後遠雄補充說明，如果要提高安全性，還是必須要有統一數據或情境來模擬，究竟是採5萬人或14萬人，或步行是採每秒1.2公尺還是1.5公尺計算，或是跑到戶外或是地界。若以市府計算基準，全台北市沒有一個地方是安全，這根本就是不存在的狀況，遠雄與市府可重做模擬，但應有一致的情境標準。
2016年6月19日，市議會在審議柯市府第二預備金的支用情形，日前遭發現動支混亂，議員紛紛要求局處逐條解釋動支的正當性。就在近期，議會教育委員會更否決在柯文哲授意下動用的一筆279萬元費用，該筆項目涉及大巨蛋公共安全體檢作業，遭議員質疑是分拆多筆小額、且用限制性招標的方式規避監督，有圖利特定廠商之嫌，已移送監察院調查。議會各委員會開始逐條審視柯市府的第二預備金動支正當性，經上週教育委員會與體育局的溝通下，發現一筆名為「台北文化體育園區—大型室內體育館開發計劃案公共安全體檢作業」，共花費二備金279萬元，遭議員質疑是由市府人員前往日本，找與遠雄拆夥的前工程協力廠商「竹中工務店」成員吉田克之、濱田信義等人，來做大巨蛋的人流與安全模擬。不過，顯然教育文化委員會的議員無法接受該說法。委員會召集人陳彥伯表示，柯市府講究公開透明，卻用旁門左道來規避法律。大巨蛋安全體檢，市府將採購項目與金額分成3筆分包採購案，又用限制性招標的方式指定給日本人，陳彥伯說：「全世界只有日本人能做巨蛋安全體檢？顯見市府因人設事。」他認為市府明顯圖利特定廠商，全案已移送監察院調查，希望市府配合調查。
2016年7月19日，台北市副市長林欽榮率相關局處、「大巨蛋安全體檢小組」召開記者會，提出「市府版」大巨蛋公安解決方案，包括減少商業面積、容留人數從十四萬人降到九萬人、增加半戶外避難空間。林欽榮強調，無論遠雄要復工或是未來要交由第三方接手興建，均應以此方案為基本。  2016年7月28日，趙藤雄在遠雄企業團副總經理蔡宗易和遠雄巨蛋公司經理楊舜欽陪同下，前往北市府拜會副市長鄧家基，商談大巨蛋案台北市副市長鄧家基今天表示，遠雄企業團董事長趙藤雄接受北市府的大巨蛋7項公安基準，但要求應由第三方公證機構審查，雙方屬意由台灣建築中心審查。會後趙藤雄先接受媒體訪問，他表示，今天雙方誠懇釐清這一年多來的問題，第一項就是市府一直強調的公安問題，他保證百分之百沒有問題。市府提出的7項公安基準，其中3項由台灣建築中心審查，4項是北市都發局審查，他認為應將此4項一起交給台建中心審。鄧家基稍後受訪時則說，公安是基本要求，但趙藤雄認為他有達到標準，因此回去會再模擬未來可能的因應方案，也拿了一份市府版的公安建議方案回去研究。至於容留人數管制，如果符合公安基準，是未來可以探討的項目。
松菸護樹志工團、松菸公園催生聯盟，自2006年起訴求「要公園返巨蛋」致力於反對興建大巨蛋，直到之後以游藝為首逐漸訴求轉變為「拆除黑心巨蛋，找回森林公園！」，
2014年4月21日，松菸巨蛋附近道路拓寬工程，遠雄公司進行經由北市府行文同意之行道樹移植工程，而引發台灣護樹團體聯盟暴力抗爭；23日～25日，雙方因而發生多次衝突，之後護樹志工開始夜宿，遠雄集團也於26日起暫停施工，演變成長期抗爭。
2014年6月6日，松菸公園催生聯盟到廉政署前舉行記者會，指控大巨蛋自招標開始即涉嫌充斥甄審委員接受遠雄飲宴、收賄，台北市長郝龍斌等相關首長護航等。
2014年7月，監察委員黃煌雄、葛永光費時5年8個月的調查與列管，指出台北大巨蛋四項開發爭議：㈠體育園區變更為商業特區；㈡大巨蛋不符國際賽場標準；㈢為拓寬道路粗暴移植老樹；㈣不專業工程會阻市府處分。
2014年8月6日，台北市政府召開「研商大巨蛋基地光復南路路型調整方案會議」，但會議上並未取得共識。
2014年8月13日，台北市政府寄出勸導單，要求護樹團體於15日以前自行拆除帳篷，否則視為廢棄物處理。8月22日深夜，護樹團體帳篷遭警方拆除。23日清晨，在台灣護樹團體聯盟發言人潘翰疆帶領下，30多人堵住北市信義分局三張犁派出所出入口，要求警方歸還物品。警方舉牌警告無效，在開出罰單後，同意發還查扣物件，群眾才退出派出所。
2014年11月26日，台北市政府文化局否決護樹團體所提出的「國父紀念館周圍老樹與建物一同納入文化景觀」申請案。
2014年12月底～2015年1月初，公民團體向臺北市長柯文哲送出陳情書，使得此議題再起。 1月8日，與公民團體見面討論後，柯文哲表示考慮不做地下道以化解移樹爭議。
2015年1月13日上午，遠雄集團召開記者會，直指只為幾棵樹就改變巨蛋工程的決策是錯誤的。
2015年1月14日，台北市長柯文哲公開護樹爭議是因為巨蛋地下道開挖，而且他反對開挖地下道。因為這個地下道從巨蛋端80公尺到出口只剩6公尺，並自認依據流體力學阻力一定會塞住，先天設計不良，根本無法施展地下道疏散人群的功能。
2015年2月6日凌晨，體育局長楊忠和以民國103年10月16日公園字第10335060400號函及103年12月1日北市工公園字第10336473600號函、間復103年12月1日遠巨字第1030268號函為依據，核發准許移樹的公文，遠雄便依該公文前往移樹進行斷根工程，護樹團體和施工人員雙方爆發衝突；市府指稱遠雄未照雙方同意的移樹的SOP進行，已緊急要求暫緩並要體育局廢止該份公文。
2017年5月1日，對護樹團體提案讓全民i-Voting大巨蛋去留，怎麼看？柯文哲表示，「照程序走」。柯說，有時候有各種聲音，i-Voting也是個方法。但要充分討論後才投票，過去投票最大的問題就是大家都不知道細節，那投票是憑感覺的，希望資訊充分揭露、充分討論再投票，照程序就可以。
2017年5月23日，為阻止柯市府與遠雄進行黑箱通過的移樹斷根工程，松菸護樹志工團連續六天發動護樹行動，20日與遠雄工人爆發體衝突。
2017年5月20日，為了保護大巨蛋旁的33棵樹，一位自稱「暗魔人」的張姓男子不只闖進工地肉身擋怪手，還在現場跳起奇怪的自創舞，甚至抱著怪手對它法式舌吻，男子自稱這些都是行動藝術，但現場工人想笑又不敢笑，手拉手圍起人牆，就怕男子被怪手打到有個閃失。
2017年5月24日，台北市政府日前同意遠雄可以先行施作移樹工程，引發松菸護樹盟等環團抗議，並且不斷前往施工現場，不惜以肉身阻擋，與現場工人們引爆多場肢體衝突，場面驚險。其中，一位自稱「按摩人」的張姓男子不僅在場跳舞，更對挖土機「喇舌」，特殊行徑引發網友的熱議，連朱學恒也不解轉發影片。
大眾捷運法第45-3條規定捷運系統所有相關設施的兩側都有禁建、限建，距離必須超過50公尺，台灣高速鐵路和高雄捷運都採這標準。但遠雄大巨蛋卻預定往下挖22.6公尺，距離深度有16到18公尺的捷運板南線為12.7公尺距離。新北市土木技師公會理事長余烈表示：「隧道沿線50公尺範圍內你想要挖地下室，一定要提出所謂的安全影響評估報告書，連高鐵局都不敢像捷運局這麼大膽，都委請第三公正單位去審查。」
2015年5月21日，余烈出面反對大巨蛋貿然停工，因大底若未完工，只遇到大雨或地震都會讓捷運變形、滲水，除非市府現在要求遠雄將地下5層樓，回填到3層樓，否則現在停工板南線更危險。余烈表示北市府讓大巨蛋停工的同時，應該也要做出補救辦法，否則板南線會撐不住，應該要將大巨蛋跟商業大樓地下5層，回填到地下3層樓。
2015年4月29日，捷運局表示在進行捷運板南線軌道巡查時，便發現有2至5公分的裂縫脫開，於是就在巨蛋工地和捷運周邊設置300多個監測器，由東工處、土建處及工管處監控，每2天都會至現場觀測。媒體報導大巨蛋工程影響到捷運板南線安全，甚至導致裂縫變大。台北市捷運局23日對此澄清指出，雖部分監控數值超出正常值，但仍在控制範圍之內，不會影響捷運安全，而即日起將定期對外公布鄰近大巨蛋捷運軌道的最新監測數據。
遠雄配合停工後，市府、遠雄和技師公會代表開會，達成共識。遠雄最快1個月把大底完成，但強調做完此部分後即會停工。余烈表示若遠雄能配合在20天內趕完大底，期間又沒遇到大地震，捷運板南線應該還安全，但若遠雄不願做，他仍會呼籲不要搭板南線。
2015年2月初，台北市環保局曾針對大巨蛋進行環境影響評估，發現大巨蛋施工造成松菸古蹟及歷史建築部分沉陷量監測值達警戒值及行動值，基地周邊道路交通服務水準下降，當時便要求遠雄就古蹟及歷史建築維護、疏散計畫及緊急避難等事項，提出環境影響調查報告及因應對策，更對遠雄開罰150萬元。
2015年4月，台北市環保局召開環境影響評估審查委員會，遠雄總經理湯佳峯等人出席，說明大巨蛋的環境影響調查報告及因應對策，會議歷時約3個多小時。在會中審查委員砲聲隆隆，委員范正成指出遠雄提供的報告數據有誤，認為做這麼大的計畫，不應出錯；委員劉益昌說，遠雄資料準備不齊，口頭報告不斷補充，「要寫進書面報告才算，不然今天講的都是廢話」；委員屠世亮則說，遠雄報告倉促交出，1500多頁要委員在一週內看完，他對此很不滿。 針對大巨蛋工程對松菸古蹟造成毀損，遠雄報告認為松菸古蹟確實出現若干損害，但並非毀損，也沒有公安疑慮，已做44項改善作為，「就技術觀點，本公司已盡力」。 6月台北市文化局代表會同遠雄代表及捷運局相關單位到場會勘，並沿臺北紅點設計博物館1樓外牆，逐步上2樓台北文化基金會辦公室了解龜裂情況。遠雄大巨蛋表示，灌漿工程先減壓，不論何種原因造成裂縫，遠雄一定修到好。對於大巨蛋施工造成松菸古蹟損害，北市文化局提起民事訴訟求償167萬元，臺灣臺北地方法院2015年6月度開庭。遠雄聲稱工程沒問題，煙囪傾斜是因地震、豪雨等天災造成；文化局的律師表示，松菸全區都有毀損，市府已派員評估整體損壞狀況。
2015年10月20日，台北市文化局表示，遠雄已提出松菸古蹟修復工程，將分五區五期修繕，且獲文資委員會通過，預計每期3至6個月，但市府盼遠雄2年內完成松菸古蹟修復整個修復進度，2年的完工時程表尚待與遠雄討論。不過，第一期修復工程將於10月下旬啟動，紅點博物館場館可望在12月修復完成，工程進行期間，監測計畫仍持續，以確保古蹟安全無虞。