東京農業大学
日本で初めて設立された私立の農学校であり、2017年度まで農学を専門に扱う日本で唯一の大学であった。東京農工大学、農業者大学校、日本の各道府県にある農業大学校とは名称が類似しているが特に関係はない。
農大の前身である東京農学校の初代学長横井時敬は「稲のことは稲に聞け、農業のことは農民に聞け」や「農学栄えて農業亡ぶ」といった言葉を残した。これは観念論を排して実際から学ぶ姿勢を重視し、学問のための学問ではない「実学主義」を重視することを表している。現在も農大は「実学主義」を教育理念とし、「人物を畑に還す」（昨今の国際化社会に伴い、「人物を世界の畑に還す」とする場合もある。）と「農業後継者や地域社会の担い手の育成」を最大目標としている。
2018年度に新潟食料農業大学が開学するまで、日本唯一の農学専門大学であった。現在では従来の農学に加え、生命科学、環境科学、情報科学の分野も扱っている。環境問題へ積極的に取り組むことも目的としている。
応用生物科学部菌株保存室には細菌や酵母などの微生物約7000株が保存されている。これは世界有数の菌株コレクションである。
2004年6月には、河野友宏応用生物科学部バイオサイエンス学科教授らの研究グループが世界で初めて卵子だけで哺乳類（マウス）を発生（単為発生）させることに成功したと科学雑誌『ネイチャー』に発表した。
校門に掲げられた校標や大学のパンフレットで使われている「東京農業大学」の文字は棟方志功によるものである。また、応援歌の一つに『青山ほとり』があり、「大根踊り」として世間に知られている。
明治時代、北海道開拓に携わった榎本武揚は「日本の力を高めるためには、国内農業の発展が不可欠」「日本の農業発展のためには、農民の教育が必須」と考えて、1891年に徳川育英会育英黌に農業科を設立した。設立地付近である東京地下鉄飯田橋駅A4番出口前に「東京農業大学開校の地」という碑が存在している。
1893年には徳川育英会育英黌から農業科が独立して私立東京農学校となるも、経営悪化から、大日本農會の下での経営となった。大日本農會付属私立東京農学校、大日本農會付属東京高等農学校と改称した後、1903年に専門学校令による認可を経て、1925年に大学令に基づく東京農業大学となる。
なお、2009年時点で、農学系大学は国公私立あわせて51校もある。1943年まで、農学系大学は、東京帝国大学、北海道帝国大学、京都帝国大学、九州帝国大学と農大のみであり、私立で唯一「農学博士」の学位授与を行っていた。
1898年より、渋谷常磐松町の常磐松御料地内に校舎を構えていたが、第二次世界大戦の際、空襲により校舎を焼失したことから、1946年、世田谷区の陸軍機甲整備学校跡地に移転。現在の世田谷キャンパスとなる。
新制大学以降後は短期大学および大学院の設置、厚木キャンパス（神奈川県厚木市）、北海道オホーツクキャンパス（網走市）の開設などを行うなどし、2011年に創立120周年を迎える。
スクールカラーは松葉緑（まつばみどり）である。この色は、かつて、農大があった渋谷常磐松にあった老松（常磐松）の葉の緑色に由来している。
1893年の私立東京農学校として独立した際、稲穂の向かい合った円の中心に「農」の一文字を入れたものを校章とした。
その後、1911年に私立東京農業大学となった際、大学部本科の角帽に「農大」の校章を入れて以来、この校章を使用している。
東京農業大学学歌は、1925年5月、国文学者尾上柴舟に作詞を、作曲家山田耕筰に作曲を依頼し、翌1926年9月25日に発表された。以来、農大の学歌として歌い継がれてきている。
農学部は、1925年の旧制農大創立以来、農大に設置されている学部であり、最も歴史がある。戦後長らく世田谷キャンパスに設置されていたが、1998年、農場を併設する厚木キャンパスへ移転した。
農学科は農学部設立と同時に設置された農大一歴史がある学科である。
畜産学科は1947年4月1日に千葉農学部専門部畜産科として設置され、1949年2月21日農学部畜産学科となった。
バイオセラピー学科は2006年4月1日に設置された。
なお、平成30年度から学科の改組が予定されており、農学科、動物科学科、生物資源開発学科、デザイン農学科の四学科へとなる予定である。
設置される研究室はそれぞれ、農学科においては作物学研究室、園芸学研究室、植物育種学研究室、植物病理学研究室、農業環境学研究室、ポストハーベスト学研究室、動物科学科においては動物生殖学研究室、動物遺伝学研究室、動物生理学研究室、動物栄養学研究室、動物衛生学研究室、動物行動学研究室、生物資源開発学科においては、植物多様性学研究室、野生動物学研究室、昆虫学研究室、薬用資源学研究室、遺伝資源利用学研究室、デザイン農学科においては、生物機能開発学研究室、食機能科学研究室、食資源利用研究室、生活デザイン農学研究室、社会デザイン農学研究室である。なお、現在在学中の学生においては学科、カリキュラムとともに次年時以降も維持される予定である。
応用生物科学部は、1998年に農学部を改組して設置された。
バイオサイエンス学科は、1998年の学部改組の際に新設された。
生物応用化学科は1945年4月1日に農学部農芸化学科として設置され、1949年に農業化学科、1954年に農芸化学科と改称し、1998年に生物応用化学科となった。
醸造科学科は日本唯一の醸造・微生物専門教育学科であり、1953年1月31日に農学部醸造学科として設置され、1998年に醸造科学科となった。
栄養科学科は1961年農学部栄養学科として設置され、1968年に栄養学専攻および管理栄養士専攻の専攻分離を実施し、1998年に栄養科学科となった。
生命科学部は、2017年に応用生物科学部を一部改組して設置予定である。 
バイオサイエンス学科は、応用生物科学部に既存であった学科が移籍する形で設置される。
ただし一部の研究室は新設である。
分子生命化学科および分子微生物学科は新設である。
地域環境科学部は1998年に農学部を改組して設置された。
森林総合科学科は1947年4月1日に千葉農学部専門部林業科として設置され、1949年2月21日に農学部林学科に改組し、1998年に森林総合科学科となった。
生産環境工学科は1905年に農商務省より開墾及耕地整理技術員講習を委託されたことを起点とし、1945年4月1日に農学部農業土木科として設置され、1949年2月21日に農学部農業工学科に改組し、1998年に生産環境工学科となった。
造園科学科は、1924年に発足した東京高等造園学校を1942年4月1日に農大が合併し、専門部造園科として設置され、1949年2月21日に農学部緑地学科に改組後、1956年農学部造園学科に改称、1998年に造園科学科となった。
国際食料情報学部は1998年に農学部を改組して設置された。
国際農業開発学科は1926年11月に発足した植民研究会を前身に、1937年12月27日に専門部農業拓殖科として設置後、開拓科と改称されたが、第二次世界大戦の敗戦後、GHQの命令の下、文部省の命令により、1947年3月31日廃止された後、1956年に農学部農業拓殖科として復活。1991年に農学部国際農業開発学科に改称後、学部再編により国際食料情報学部に設置された。
食料環境経済学科は1936年に当時の農学科で農業経済学を担当していた教員や勉強していた学生を中心に社会科学系の学科創設運動が始まり、1938年12月16日に農学部農業経済学科として設置され、1998年に食料環境経済学科となった。
国際バイオビジネス学科は1998年に生物企業情報学科として設置され、2005年に国際バイオビジネス学科となった。
生物産業学部、1989年のオホーツクキャンパス開設に際し設置された。
学部開設時、生物生産学科、食品科学科、産業経営学科の3学科が設置され、2006年にアクアバイオ学科が新設された。また、食品科学科は2010年4月に食品香粧学科に改組された。農学研究科は1953年3月31日に農学専攻および農業経済学専攻が設置されたことにより設置された。その後、1957年に農芸化学専攻、1986年に畜産学専攻、林学専攻および食品栄養学専攻、1990年に醸造学専攻、農業工学専攻、造園学専攻、国際農業開発学専攻および環境共生学専攻、2002年にバイオサイエンス専攻および国際バイオビジネス学専攻が設置された。環境共生学専攻のみ博士後期課程を設置し、他の各専攻は博士前期課程と博士後期課程を設置している。
生物産業学研究科は1993年に修士課程生物産業学専攻として設置後、1995年、同専攻を博士前期課程とし、博士後期課程が新設された。
東京農業大学は、世田谷キャンパス内に各種学校（83条校）の「東京農業大学成人学校」を設置していたが、平成22年4月から東京農業大学傘下の組織「グリーンアカデミー」として活動を開始。平成23年4月からは東京農業大学エクステンションセンターと組織を一体化。
この学校は、生涯学習専門機関として50歳以上の人を対象にした学校である。「園芸・造園」という農大色を出した講座（園芸造園本科・園芸造園専科）と「健康」に関する講座（健康増進Aコース・健康増進Bコース）を行っており、現在は科名変更し「グリーンアカデミー本科」「グリーンアカデミー専科」「生活健康科」としている。
本学卒業生である豊山勝男（大相撲・時津風元理事長）は日本相撲協会を定年退職後に夫妻で通い始めた。
（※印のある機関は、東京農業大学の附属機関ではなく、学校法人東京農業大学の附属機関である。）
世田谷・厚木・オホーツクキャンパスにある各学部学科については、略称が次の通り定められており、学内の掲示物はじめ学校関係者の会話などではこの略称が使われることがある。
農大のサークル活動は、世田谷・厚木・オホーツクとキャンパスがそれぞれ離れているため、キャンパスごとに設置されているサークルが異なっている。
農大でのサークル活動は、1904年10月25日の農友会臨時大会で、学術部、文芸部、娯楽部、運動部が設立されたことからその歴史が始まる。このうち、文芸部と学術部を前身とする講演部は、2009年時点でも存続している。サークル活動で特筆すべき事項として「全學應援團」がある。全學應援團は、1931年6月19日に「東京農業大學全學學生應援團」として設立され、1948年2月16日に今の「全學應援團」となった。また、農大における応援団はその名の通り、全学生によって組織されている自治団体であり、他校のように運動競技応援一辺倒ではなく、学術部門に関する応援も行っている。通常の応援団業務は、「全學應援團リーダー部」「全學應援團吹奏楽部」「全學應援團チアリーダー部」の3団体が行っている。また、全學應援團設立時、「応援団の旗を日本一立派なものにしよう」と考え近衛師団の鎗を応援団旗の旗竿にしようと陸軍省に申請したところ、陸軍大臣より下付された歴史がある。近衛師団の鎗を旗竿として下付されたのは農大のみであり、常磐松時代の戦災により旗は焼失したものの、旗竿は今なお現存している。また、各サークルのうち、講演部は毎年12月に弁論大会として「農林水産大臣杯争奪全日本学生弁論大会」を主催している。農村調査部のように元々は学科の研究室を母体として発足したサークルなどもある。
サークル活動とは別に、同好会も数多く設置されている。
農大の学園祭は「収穫祭」と呼ばれており、毎年、文化の日（11月3日）あたりに行われ、例年、15万人以上が来場する。
キャンパスごとに独立して開催されており、2014年の場合、世田谷キャンパスでは「第123回収穫祭」、厚木キャンパスでは「第15回収穫祭」、オホーツクキャンパスでは「第26回収穫祭」として開催されている。
収穫祭では、野菜の無料配布をはじめ、利き酒大会、鮭の掴み取りなどの農大ならではのイベントが開催されている。
収穫祭の運営は、「収穫祭実行本部」「宣伝隊本部」「ステージ企画本部」「文化学術展本部」「模擬店本部」「体育祭本部」の計6本部で運営されており、「収穫祭実行本部」「ステージ企画本部」は農友会総務部、「宣伝隊本部」は全學應援團、「文化学術展本部」「模擬店本部」は農友会文化団体連合会、「体育祭本部」は農友会体育団体連合会がそれぞれ担当している。また、本部に準じる団体として「収穫祭環境対策委員会」があり本部と同じく運営に携わっている。
各本部は各学科ごとに構成されている「学科統一本部」と活動を共にする。
トレーニングルーム
17号館内の「カフェテリアグリーン」、17・18号館内の「レストランすずしろ」、食と農の博物館内の「カフェ・プチ・ラディッシュ」、グリーナカデミーホール内の「グリーン・アカデミー・ホール・レストラン」の4つがあり、いずれも学生・教職員以外の一般人の利用も可能となっている。また、常磐松会館内には東京農業大学生活協同組合の店舗があり、テイクアウト専用の「一番飯」と、スパゲッティ・カレー専門店の「アミ」がある。
本部棟内に「レストランけやき」がある。
3号館内の「レストラン・ジャングルポケット」（第一食堂）と、7号館内の「レストラン・クリオネ」（第二食堂）の2店舗がある。学生会館として、「常磐松会館」「常磐松会館別館」「常磐松学生会館」の3棟ある。
従来、「常磐松会館」と「常磐松会館別館」の2棟が学生会館として利用され、会館がサークルの部室として、別館が同好会の部室として利用されてきた。別館の老朽化が著しいことから、2008年に「常磐松学生会館」が建設され、同好会の部室が学生会館に移転した。また、常磐松会館には、東京農業大学生活協同組合の店舗が入っており、学生・教職員以外の一般人の利用も可能となっている。
学生会館が1棟ある。
学生会館が1棟ある。
キャンパスに隣接して、桜丘寮、若草寮、青雲寮、育英寮の4つが設置されている。また、農友会の野球部、相撲部、ボクシング部、レスリング部、剣道部の各部は、キャンパスの外れに合宿所を持っている。一般に学内と思われているが、夜は閉門され学外とされている。
農業に関する専門的な教育・研究を行っているため、日本各地に農場を設置して実習や研究を実施している。
世界各地にある農業大学を中心に18の大学と姉妹校協定を結んでいる。