宮崎大学
1949年（昭和24年）に設置の旧宮崎大学と1974年（昭和49年）設置の旧宮崎医科大学が統合し、2003年（平成15年）10月に誕生した。教育学部（教育文化学部）、農学部、工学部、地域資源創成学部は木花キャンパス（宮崎市学園木花台西、）、医学部は清武キャンパス（宮崎市清武町、）にある。スローガンは「世界を視野に、地域から始めよう」、学長は池ノ上克。
旧宮崎大学の前身となる旧制専門学校および師範学校の校地は宮崎市中心部の各所に点在していた。このため、旧宮崎大学は1972年8月にキャンパスの移転・統合を決定し、1980年代後半に宮崎学園都市の主要施設として宮崎市南部の木花地区に移転・統合した。
2003年10月、旧宮崎大学と旧宮崎医科大学が統合し、新「宮崎大学」となる。
2016年（平成28年）4月の新学部「地域資源創成学部」の設置、および教育文化部の改組（教育学部への改称）、農学部増員、工学研究科の改組が申請されており、2015年（平成27年）8月に認可された。
教育学部の直接のルーツは、旧制の宮崎師範学校と宮崎青年師範学校に求められる。これらの学校はさらに、1884年（明治17年）設立の宮崎県尋常師範学校と1922年（大正11年）設立の宮崎県実業補習学校教員養成所までその淵源を辿ることができる。
戦後の学制改革の中で、1949年、宮崎師範学校と宮崎青年師範学校をもとに宮崎大学に学芸学部が設置された。1966年（昭和41年）、学芸学部は教育学部に改称。さらに1999年（平成11年）には教員養成を主な目的としない（いわゆるゼロ免課程の）地域文化課程・生活文化課程・社会システム課程の3課程が設置され、学部名を「教育文化学部」に改称。2008年（平成20年）に地域文化課程・生活文化課程・社会システム課程が統合の上、人間社会課程が設置された。大学院は、1994年（平成6年）に教育学研究科が設置（修士課程）され、2008年（平成20年）には教職大学院（専門職学位課程）として、教職実践開発専攻が設置された。
2016年（平成28年）4月の改組が認可され、人間社会課程の募集を停止し、学部名を「教育学部」に改称した上で、教員養成に特化することとなる。
農学部のルーツは、旧制の宮崎農林専門学校さらに遡って1924年（大正13年）設立の宮崎高等農林学校がルーツである。この宮崎農林専門学校を母体に1949年、宮崎大学に農学部が設置された。1967年（昭和42年）に宮崎大学の中ではいちばん早く大学院農学研究科（修士課程）が設置されている。
2007年には、農学・工学を連携・融合させた農学工学総合研究科(博士後期課程)を設置し、2010年には、医学・獣医学を連携・融合させた医学獣医学総合研究科(博士課程)を設置した。
1988年（昭和63年）から、九州内のいくつかの大学とともに鹿児島大学大学院連合農学研究科（博士課程）に参加し、1990年（平成2年）には、獣医学科を設置する周辺大学とともに山口大学大学院連合獣医学研究科（博士課程）に参加したが、2007年度より農学工学総合研究科（博士後期課程）の設置に伴い鹿児島大学大学院連合農学研究科から離脱、2010年度より医学獣医学総合研究科（博士課程）の設置に伴い山口大学大学院連合獣医学研究科から離脱した。
1944年（昭和19年）2月に宮崎県高等工業学校として設立し、同年8月に改称した宮崎県工業専門学校が、工学部のルーツである。1949年に宮崎大学工学部として学芸学部や農学部と同時に設置された。大学院工学研究科は1976年（昭和51年）に修士課程（1997年より博士前期課程）が、1996年（平成8年）に博士後期課程が設置されていたが、2007年博士後期課程は農学工学総合研究科設置に伴い廃止された（これに伴い、博士前期課程は修士課程となった）。
医学部は、1974年（昭和49年）設立の宮崎医科大学がそのルーツである。設置の前年1973年（昭和48年）に、創設準備室が宮崎大学内に設置されていた。いわゆる1県に1医科大学を設置するという政府方針によって作られた大学である。1977年（昭和52年）に附属病院が、1980年（昭和55年）に大学院医学研究科（博士課程）が設置された（修士課程は2003年に設置）。博士課程は2010年の医学獣医学総合研究科設置に伴い廃止となり、修士課程は医科学看護学研究科へ改称された。
2003年（平成15年）全国的な大学統合の流れの中で、宮崎大学と統合し宮崎大学医学部となったが、部活動などは旧宮崎大学と統合されず、そのまま存続するものがほとんどだった。
2005年度の入学試験からは地元枠を設け、地元宮崎県出身者約10人が入学した。
2016年（平成28年）に設置。地域経済活性化と地域振興を実現する人材の育成を目的とする。
応用生物科学科がJABEE認定を受けている。
同窓会の名誉会長に、自民党旧江藤亀井派会長であった江藤隆美が、長年の会長職在任を経て、就任している。
日本技術者教育認定機構 (JABEE) 認定に力を入れており、2005年度までに土木環境工学科、物質環境化学科、電気電子工学科、機械システム工学科、情報システム工学科（情報システム専修コースのみ）で認定を受け、2010年度に材料物理工学科も認定を受けた。他学科についても認定有効期間を更新しており、すべての学科がJABEE認定されている。
全国的に進級が厳しい医学部として知られており、1学年38人もの留年生を出した年もある。現在は緩和されたものの留年者は各学年とも毎年のように15人程度出ており依然として進級は厳しいといえる。また、すべての単位が取り消されるという単位取り消し型の留年方式を取っているため、留年した年もすべての講義に出席しなくてはならなかったが、2005年度の2年生からは単位制が導入された。なお、ここ数年でこれらの印象は薄まり、4年以上の臨床科目は卒業試験も含めて落第者がいないとされる（2005年度4年留年生は5名）。
2006年の入試から推薦入学を実施。宮崎県内の高校出身者による地域枠と一般枠とからなる。
宮崎大学の学園祭は清花祭（きよかさい、清武と木花の合成語）と称され、11月中旬の3日間に渡り開催される。2005年に旧宮崎大学の宮大祭と旧宮崎医科大学のすずかけ祭を統合して開始された。初日（金曜日）は旧宮崎大学時代から続くみこしパレードが宮崎市中心部の橘通りなどを練り歩く。2日目・3日目（土曜日・日曜日）は各キャンパスで模擬店や展示発表が行われる。最後は打ち上げ花火（木花キャンパス）で学園祭を締める。
宮崎交通のバスを利用する。木花キャンパスの最寄りバス停は宮崎大学、清武キャンパスの最寄りバス停は大学病院前。宮崎駅・宮交シティからのバスは大きく分けて3経路が運行されているが、早朝の便を除きいずれも宮崎大学・大学病院前のバス停に停車する。
所要時間は宮崎駅から40～55分、宮交シティから25～40分。
鉄道駅からは、木花キャンパスへは日南線木花駅より2.2km、清武キャンパスへは日豊本線清武駅より2.8kmの距離となる。
2012年3月末に退職した教育文化学部の40歳代の男性准教授が、複数の女子学生に対し半裸写真を撮影させ、卒業論文に掲載させ提出させるなどのセクハラ行為をしていたことが、同年6月28日に公表された。この准教授が既に退職していて懲戒処分ができなくなっているため、懲戒解雇に相当するとして、退職金の不支給を決めた。准教授側は当案件について否定し、退職金と慰謝料を求めて大学側を提訴する意向を示した。元准教授は2012年4月より都留文科大学にて教授として勤務していたが、同大学は7月18日に当案件を理由に同月31日付での解雇を決定した。
その後、元准教授は、2012年事実無根として大学を提訴した。2014年、一審の宮崎地裁は准教授の訴えを棄却したものの、福岡高裁宮崎支部は准教授の訴えを認めセクハラ行為がなかったことを認定し大学に約313万円の支払いを命じた。2016年、最高裁判所もこの判決を支持し大学側の上告を退け、准教授の勝訴が確定した。大学は文科省からの打診に応じる形で第三者機関を設置し検証を進めている。