Babak kedua kualifikasi Liga Eropa UEFA 2012–13
Babak kedua kualifikasi Liga Eropa UEFA 2012–13 adalah pelengkap bagi artikel Liga Eropa UEFA 2012–13 pada bagian babak kedua kualifikasi.
Seluruh waktu mengacu pada CEST (UTC+2).
Seluruh proses pengundian untuk babak kualifikasi dan play off dilaksanakan di markas UEFA di Nyon, Switzerland.
Pertandingan dapat dilaksanakan pada Selasa atau Rabu daripada hari Kamis dengan memperhatikan terjadinya konflik penjadwalan.
Setiap babak memainkan sepasang pertandingan kandang-tandang. Hasil dari kedua pertandingan akan dijumlahkan untuk menentukan hasilnya. Jika terjadi hasil imbang, maka ditentukan dari jumlah gol tandang, dimana klub yang mampu mencetak gol lebih banyak saat bermain di kandang lawan menjadi pemenangnya. Jika masih imbang, maka pertandingan kedua dilanjutkan dengan perpanjangan waktu, dalam dua babak masing-masing 15 menit. Jika kedua klub mencetak gol pada masa perpanjangan waktu sehingga hasilnya imbang, maka klub tandanglah yang menjadi pemenang. Jika tidak terjadi gol maka pemenang ditentukan dengan adu penalti.
Babak kedua kualifikasi ini diikuti oleh 80 klub. terdiri atas 37 pemenang babak pertama dan 43 klub yang langsung lolos ke babak kedua. 40 klub pemenang babak kedua akan mengikuti babak ketiga kualifikasi bergabung dengan 18 klub lain yang langsung lolos ke babak ketiga.
Dalam pengundian setiap babak, klub peserta disusun berdasarkan koefisien klub UEFA tahun 2012, kemudian dibagi menjadi dua yaitu klub unggulan dan non-unggulan. Setiap klub unggulan akan bertanding melawan non-unggulan, dimana penentuan kandang-tandang dilakukan secara acak. Untuk mempersingkat waktu maka pengundian untuk babak kedua kualifikasi dilakukan sebelum hasil pertandingan babak pertama diketahui.
Untuk memudahkan proses pengundian maka UEFA membagi peserta menjadi 8 grup sehingga dapat menghidarkan tim dari asosiasi yang sama bertemu di babak kedua.
"Bnei Yehuda menang 3–0 secara agregat."
"Rosenborg menang 4–3 secara agregat."
"Dila Gori menang 5–2 secara agregat."
"Servette menang 5–1 secara agregat."
"Ruch menang 6–1 secara agregat."
"Metalurh menang 11–2 secara agregat."
"2–2 secara agregat. KuPS menang melalui gol tandang"
"Gomel menang 2–1 secara agregat."
"Aktobe menang 5–4 secara agregat."
"Twente menang 6–1 secara agregat."
"Elfsborg menang 2–1 secara agregat."
"Vojvodina menang 5–1 secara agregat."
"Rapid menang 5–1 secara agregat."
"Anzhi menang 5–0 secara agregat."
"Aalesund menang 6–1 secara agregat."
"Anorthosis menang 6–1 secara agregat."
"Kalmar menang 6–1 secara agregat."
"1–1 secara agregat. Mura 05 menang melalui gol tandang"
"2–2 secara agregat. Asteras Tripolis menang 4–2 melalui adu penalti."
"1–1 secara agregat. Ried menang melalui gol tandang"
"Tromsø menang 1–0 secara agregat."
"1–1 secara agregat. Young Boys menang 4–1 melalui adu penalti."
"Gent menang 4–2 secara agregat."
"APOEL menang 3–0 secara agregat."
"Lech Poznań menang 2–1 secara agregat."
"3–3 secara agregat. Zeta menang melalui gol tandang"
"Vitesse menang 7–5 secara agregat."
"Viktoria Plzeň menang 5–1 secara agregat."
"Spartak Trnava menang 4–2 secara agregat."
"Hajduk Split menang 2–1 secara agregat."
"Red Star Belgrade menang 7–6 secara agregat."
"1–1 secara agregat. Videoton menang melalui gol tandang"
"Legia Warsaw menang 7–3 secara agregat."
"Eskişehirspor menang 3–1 secara agregat."
"Slaven Belupo menang 10–2 secara agregat."
"St Patrick's Athletic menang 3–2 secara agregat."
"Sarajevo menang 3–2 secara agregat."
"Admira Wacker Mödling menang 6–2 secara agregat."
"AIK menang 2–1 secara agregat."
"Mladá Boleslav menang 4–0 secara agregat."