Kekkei genkai
Kekkei genkai utama Klan Hyuuga adalah yang berasal dari ibu , yaitu . Selain itu, klan ini memiliki jutsu-jutsu khusus, seperti "Jyuuken" yang dapat menghentikan aliran chakra, , dan lain-lain. Byakugan adalah satu dari tiga doujutsu terhebat, selain Sharingan dan Rinnegan. Selain itu, Ao, seorang pengawal Mizukage kelima, memiliki kekkei genkai Byakugan dari seorang Hyuuga.
Klan Uchiha memiliki mata dan . Mangekyou Sharingan dapat dibangkitkan melalui rasa kehilangan yang sangat besar karena kehilangan orang yang paling dicintainya. Klan ini adalah salah satu klan yang membangun Konoha dan klan spesialis jurus api. Klan ini merupakan salah satu klan terkuat di Konoha sebelum Itachi dan Tobi membantai seluruh anggota klan ini kecuali Sasuke Uchiha. Sharingan dapat meniru jurus musuh, seperti yang dilakukan Kakashi. Mata Mangekyou Sharingan dari pengguna klan Uchiha dapat melakukan banyak jurus yang khas melalui mata tersebut sesuai kemampuannya, sedangkan mata Mangekyou Sharingan yang bukan dari pengguna asli tidak dapat melakukan banyak jurus melalui mata tersebut dan lama menggunakannya bersifat terbatas. Selain itu pula ada kekuatan Eternal Mangekyou Sharingan (永遠の万華鏡写輪眼, "Eien no Mangekyō Sharingan"). Eternal Mangekyō menggabungkan desain dari transplanter dan Mangekyō asli yang dicangkokkan dengan Mangekyō baru ( idealnya dari saudara kandung ). Kemampuan Mangekyō berbasis kepada mereka yang memiliki tehnik ini agar menjadi lebih kuat dan mereka tidak lagi mengalami efek negatif dan efek samping dari penggunaan. Menurut Madara, Eternal Mangekyō Sharingan adalah bukti bahwa seorang Uchiha akan terus mencari sesuatu meskipun mengalami kerugian besar. Selain teknik yang unik, tampaknya ada beberapa varian dari Eternal Mangekyō Sharingan, salah satunya adalah "tomoe lurus" (直巴, "Choku Tomoe"), yang tampaknya memberikan kelincahan pengguna dalam bergerak ketika bertarung.
Setiap anggota Klan Inuzuka selalu menggunakan anjing dalam pertempuran. Anjing-Anjing ini disebut ninken. Ninken juga termasuk hewan panggilan("summoning technique"). Contohnya milik kiba. Juga, setiap klan ini memiliki tanda seperti taring di sebelah mulutnya. Jurus khas klan ini adalah "Gatsuuga".
Klan ini dapat memanipulasi tulang di dalam tubuhnya yang disebut . Klan ini menggunakan tulang sebagai senjata. Klan ini sangat buas, sehingga klan ini pernah menyerang Kirigakure, namun gagal. Saat dikepung oleh pasukan Kirigakure, mereka menolak mundur dan saling bunuh untuk bersenang-senang. Akhirnya, hanya satu orang yang bertahan, yaitu Kimimaro, yang menjadikannya anggota terakhir klan ini. Kimimaro dipungut oleh Orochimaru dan menjadi salah satu pengawalnya.
Klan ini dapat memanipulasi . Anggota klan ini adalah Haku dan ibunya.
dibuat dari elemen tanah dan air berbasis chakra. Elemen kayu adalah elemen yang mampu membentuk sel-sel mahkluk hidup. Pengguna elemen ini adalah Hashirama Senju. Madara Uchiha, Danzou Shimura, dan Yamato mampu menggunakan elemen ini karena mengambil sel-sel Hashirama. Zetsu juga dibuat dari sel-sel Hashirama.
dibuat dari elemen api dan tanah berbasis chakra. Pengguna elemen ini Mei Terumi, Son Goku dan Roushi.Dan cucu tsucikage 3 onoki
dibuat dari elemen air dan petir berbasis chakra. Pengguna elemen ini adalah Darui (salah satu pengawal Raikage). Pada film , Hiruko mencuri kekkei genkai ini dari seorang shinobi misterius.
dimiliki oleh Deidara dan Garin, seorang shinobi dari Iwagakure
dibuat dari elemen api, angin, dan tanah, menjadikannya satu-satunya contoh perkembangan kekkei genkai, yaitu . Kekkei genkai ini dimiliki oleh Muu dan Oonoki, Tsuchikage Kedua dan Ketiga. Elemen ini memungkinkan penggunanya memanipulasi molekul, sehingga dapat mengubah sesuatu menjadi debu.
dimiliki oleh Hagoromo Outsutsuki, pencipta dunia shinobi. Rinnegan adalah salah satu dari 3 doujutsu terkuat, selain Byakugan dan Sharingan. Pengguna Rinnegan dapat melakukan beberapa jutsu, antara lain , dan lain-lain. Madara dapat membangkitkan Rinnegan karena Madara memasukkan sel-sel Hashirama ke dirinya, namun baru bangkit saat dirinya sudah tua, sehingga menempatkan matanya pada Nagato/Pain saat dia kecil tanpa disadarinya.