Helicobacter pylori
Helicobacter pylori, yang sebelumnya disebut Campylobacter pylori, adalah sebuah bakteri mikroaerofil Gram-negatif yang biasanya ditemukan di lambung. Bakteri tersebut diidentifikasikan pada 1982 oleh ilmuwan Australia Barry Marshall dan Robin Warren yang menemukan bahwa bakteri itu hadir pada orang dengan gastritis dan ulkus peptikum kronis, kondisi yang sebelumnya tidak diyakini memiliki penyebab mikroba. "H. pylori" juga terkait dengan perkembangan ulkus duodenum dan kanker lambung. Namun, lebih dari 80% dari individu yang terinfeksi dengan bakteri tidak menunjukkan gejala, dan mungkin memainkan peran penting dalam ekologi perut alami.
Lebih dari 50% dari populasi dunia memiliki "H. pylori" di saluran pencernaan bagian atas mereka. Infeksi ini lebih umum di negara-negara berkembang, dan kejadian menurun di negara-negara Barat. Bentuk heliks "H. pylori" ini (dari hal itu nama genus berasal) diperkirakan telah berevolusi untuk menembus lapisan bermukus perut.
Sampai 85% dari orang yang terinfeksi "H. pylori" tidak pernah mengalami gejala atau komplikasi. Infeksi akut mungkin muncul sebagai gastritis akut dengan sakit perut atau mual. Jika ini berkembang menjadi gastritis kronis, gejala, jika ada, seringkali adalah gejala dari dispepsia non-ulkus: sakit perut, mual, kembung, bersendawa, dan kadang-kadang muntah atau tinja berwarna hitam.
Individu yang terinfeksi dengan "H. pylori" memiliki risiko seumur hidup 10 sampai 20% untuk mengembangkan ulkus peptikum dan risiko 1 sampai 2% untuk menderita kanker lambung. Peradangan pada antrum pilorus lebih cenderung menyebabkan ulkus duodenum, sedangkan radang corpus (tubuh lambung) lebih cenderung menyebabkan tukak lambung dan karsinoma lambung. Namun, "H. pylori" mungkin berperan hanya dalam tahap pertama yang mengarah ke peradangan kronis yang umum, tapi tidak di tahap lebih lanjut yang mengarah ke karsinogenesis. Sebuah meta-analisis yang dilakukan pada tahun 2009 menyimpulkan pemberantasan "H. pylori" mengurangi risiko kanker lambung pada orang yang terinfeksi sebelumnya, menunjukkan keberadaan yang terus-menerus dari "H. pylori" merupakan faktor risiko relatif 65% untuk kanker lambung; dalam hal risiko absolut, peningkatannya dari 1,1% menjadi 1,7%.
"H. pylori" telah dikaitkan dengan polip kolorektal dan kanker kolorektal. Bakteri ini mungkin juga terkait dengan penyakit mata.
Rasa sakit biasanya terjadi saat perut kosong, antara waktu makan dan di pagi hari, tapi bisa juga terjadi di lain waktu. Gejala ulkus yang kurang umum termasuk mual, muntah, dan kehilangan nafsu makan. Perdarahan juga bisa terjadi; perdarahan berkepanjangan dapat menyebabkan anemia yang menyebabkan rasa lemah dan kelelahan. Jika perdarahan berat, hematemesis, hematochezia, atau melena bisa terjadi.
"H. pylori" adalah bakteri Gram negatif berbentuk heliks (digolongkan sebagai batang melengkung, bukan spiroket) yang panjangnya sekitar 3 μm dengan diameter sekitar 0.5 μm. "H. pylori" dapat didemonstrasikan di jaringan dengan pewarnaan Gram, pewarnaan Giemsa, pewarnaan hematoksilin-eosin, pewarnaan perak Warthin-Starry, pewarnaan oranye akridin, dan mikroskop fase-kontras. "H. pylori" dapat membentuk biofilm dan dapat berubah dari bentuk spiral menjadi kokoid yang viabel namun tidak dapat dikultur.
"H. pylori" memiliki empat sampai enam flagela di tempat yang sama; semua spesies "Helicobacter" lambung dan enterohepatik sangat motil karena memiliki flagela. Filamen flagelar karakteristik dari "Helicobacter" terdiri dari dua flagelin yang dapat dikopolimerisasi, FlaA dan FlaB.
"H. pylori" adalah mikroaerofil—yaitu, ia membutuhkan oksigen, namun pada konsentrasi lebih rendah daripada di atmosfer. "H. pylori" mengandung hidrogenase yang dapat menghasilkan energi dengan mengoksidasi hidrogen molekuler (H) yang dibuat oleh bakteri usus. "H. pylori" menghasilkan oksidase, katalase, dan urease.
"H. pylori" memiliki lima famili protein membran luar utama. Famili terbesar meliputi adhesin yang sudah dikenal dan putatif. Keempat famili lainnya adalah porin, transporter besi, protein terkait flagela, dan protein yang tidak diketahui fungsinya. Seperti bakteri Gram negatif lainnya, membran luar "H. pylori" terdiri dari fosfolipid dan lipopolisakarida (LPS). Antigen O dari LPS dapat difukosilasi dan meniru antigen golongan darah Lewis yang ditemukan di epitel lambung. Membran luar juga mengandung glukosida kolesterol, yang terdapat pada beberapa bakteri lainnya.
H. pylori terdiri dari strain-strain yang beragam, dan ratusan genom telah sepenuhnya disekuensing. Genom strain "26695" terdiri dari sekitar 1,7 juta pasangan basa, dengan sekitar 1.576 gen. Pan-genom, yang merupakan gabungan dari 30 strain yang sudah diurutkan, mengkodekan 2.239 famili protein (kelompok ortolog atau "orthologous groups", OG). Di antara mereka, 1248 OG dilestarikan di semua 30 strain, dan mewakili "inti universal". 991 OG yang tersisa adalah "genom aksesori" di mana 277 OG adalah unik (yaitu, OG ada hanya dalam satu strain).