تروریسم در اندونزی
تروریسم در اندونزی () به عمل تروریستی بر روی اماکن یا حمله به شهروندان اندونزی یا خارجی‌ها اطلاق می‌شود. این عمل تروریستی همیشه دولت جمهوری اندونزی یا خارجی‌ها را در اندونزی، به‌طور مشخص بازدیدکنندگان غربی و به‌طور ویژه آن‌هایی که از آمریکا و استرالیا به اندونزی می‌روند را هدف قرار داده‌است.
در ژوئن سال ۲۰۱۵ اندونزی از لیست سیاه مالی کشورهای غیر همکار یا تروریسم (NCCTs) بر اساس اینکه اندونزی در جنگ سراسری علیه منابع مالی تروریستی و پولشویی همکاری می‌کند، خارج شد. این به اندونزی همان وضعیت سایر کشورهای عضو G-20 را می‌دهد.
از قدیم شبه نظامیانی که به صورت سیاسی مخالف دولت اندونزی هستند مسؤلیت حملات تروریستی در اندونزی را بعهده داشته‌اند. جنبش‌های جدایی طلبانه که در اندونزی عمل می‌کند مانند «دارالاسلام» (اندونزی)، «فرتیلین» (شبه نظامیان جدایی‌طلب تیمور شرقی در جریان اشغال تیمور شرقی)، «گراکان آسه مردکا» و «ارگانیساسی پاپوآ مردکا» به‌طور معمول مسئول عملیات تروریستی در اندونزی مانند بمبگذاری، تیراندازی در اندونزی هستند. عملیات‌های تروریستی اخیر در اندونزی می‌تواند توسط گروه تروریستی اسلامی متحد با القاعده بنام «جامعه اسلامیه» یا داعش انجام شده باشد.
تا سال ۲۰۰۳ تعدادی از اهداف غربی مورد هدف قرار گرفت. قربانیان شامل هم خارجی‌ها ـ به‌طور خاص توریستهای غربی ـ و هم شهروندان اندونزی بودند. تروریسم در اندونزی در سال ۲۰۰۰ با بمبگذاری در محل صرافی‌های جاکارتا، که با چهار حمله دیگر دنبال شد، افزایش یافت. در این عملیات‌ها، در سال ۲۰۰۲ تنها ۲۰۲ نفر (شامل ۱۶۴ توریست بین‌المللی) در شهر پر رفت‌وآمد کوتا در بالی کشته شدند. هشدارهای سایر کشورها در مورد تهدیدات سفر به اندونزی باعث خراب شدن صنعت توریسم و سرمایه‌گذاری‌های خارجی در اندونزی شد. هر چند که بعداً اکثر اعضای کلیدی و رهبران تروریست‌ها مانند سامودرا امروزی، ابودجانا، اظهری حسین و نورالدین تاپ دستگیر و کشته شدند ولی هسته‌های تروریستی در اندونزی به صورت فزاینده‌ای رشد داشته‌است.
از سال ۲۰۱۱ بنظر می‌رسد که تهاجمات تروریستی به اهداف خارجی‌های غربی و افراد مقیم در کشور به تهاجم به افسران پلیس تغییر کرده‌است. پلیس اندونزی موفق به نابودی هسته‌های تروریستی و یک گروه تروریستی جدید که به «هسته سیربون» معروف بود و افسران پلیس را هدف قرار می‌دادند شد. در ۱۵ آوریل ۲۰۱۱ هر بمبگذار انتحاری خودش را در یک مسجد در یک مجموعه پلیس در شهر سیربون در غرب جاوا در حین نماز جمعه منفجر کرد. بمبگذار کشته و ۲۸ نفر از مردم زخمی شدند. همین هسته تروریستی به دو عمل تهاجمی در سولو متهم است که یکی یک بمبگذار انتحاری در یک کلیسا در ۲۵ سپتامبر ۲۰۱۱ و دیگری تیراندازی به یک پلیس در ۱۷ آوت ۲۰۱۲ می‌باشد. این عملیات‌ها نسبت به عملیات‌های قبلی گروه تروریستی جماعه اسلامیه به‌خوبی آماده‌سازی و برنامه‌ریزی نشده بود.
اگر چه تعداد عملیات‌های تروریستی هم در تعداد و هم در کیفیت کاهش داشته‌است ولی برخی تهدیدات تروریستی مانند پاسو، سولاوسی غربی همچنان باقی است، ناحیه پولو قبلاً یک منطقه مورد مناقشه بین مسلمانان و مسیحیان بوده‌است. در ۱۶ اکتبر ۲۰۱۲ پلیس اندونزی در روستای تامانیکا در حکومت پاسو در سولاوسی مرکزی، اجساد دو گروه پلیس را کشف کرده که سه روز قبل به قتل رسیده بودند. قربانیان در یک مأموریت تحقیقاتی در محل احتمالی آموزش تروریستی در جنگل‌های منطقه پاسا ناپدید شده بودند.
عملیات مشابهی که مقامات اندونزی، به‌طور خاص افسران پلیس را هدف قرار داد در پاپوآ اتفاق افتاد، هر چند که این عملیات به هسته‌های تروریستی اسلامی مربوط نمی‌شد ولی جنبش جدایی‌طلبانه ارگانیساسی پاپوآ مردکا مسئول انجام آن بود. در ۸ آوریل ۲۰۱۲ یک هواپیمای تریگانا PK-YRF در حین فرود در باند فرود مولایا در پونجاک جایا در پاپوآ توسط یک تیرانداز ناشناس هدف قرار گرفت. یک روزنامه‌نگار اهل پاپوآ بنام کوگویا ۳۵ ساله در یک تیراندازی کشته شد. در ۲۷ نوامبر سال ۲۰۱۲ سه پلیس که در یک پست پلیس در جایاویه یا در پاپوآ حضور داشتند در یک تهاجم توسط یک گروه ناشناس کشته شدند. پلیس جنبش جدایی‌طلب پاپوآ را مسئول این عملیات می‌داند.