다중 빔 스캐닝 전자 현미경 검사 시스템이 개시된다. 다중 빔 스캐닝 전자 현미경 검사 시스템은 전자 소스 및 빔릿 제어 메커니즘을 포함할 수 있다. 빔릿 제어 메커니즘은 전자 소스에 의해 제공된 전자를 이용하여 복수의 빔릿들을 생성하고 복수의 빔릿들 중 하나를 시간 인스턴스에서 타겟을 향해 전달하도록 구성될 수 있다. 다중 빔 스캐닝 전자 현미경 검사 시스템은 또한 타겟으로부터 후방산란된 전자에 적어도 부분적으로 기초하여 타겟의 이미지를 생성하도록 구성된 검출기를 포함할 수 있다.