연료 전지 발전 장치(9)의 공기 송풍기(18)는 정상 작동 중에 폐쇄되어 있는 밸브(46)를 통해 연료 전지 스택(10)의 냉각제 유동장(27), 냉각제 펌프(35) 및 열 교환기(40) 외부로 물을 배출시키도록 사용된다. 물 제거는 연료 전지 스택이 (낮은 증기압을 유지시키는 것과 같이) 물 제거를 보조하고 공기 펌프를 위한 동력을 제공하도록 연료 전지 스택이 계속 작동되고 있는 셧다운 과정의 일부로서 일어난다. 어큐뮬레이터(33)로 유동하는 물은 셧다운 과정 동안 밸브(29)에 의해 차단된다. 