EndoS2의 돌연변이체는 야생형 EndoS2의 서열(서열번호 1)에 하나 이상의 돌연변이를 포함하고, 상기 하나 이상의 돌연변이는 잔기 133-143, 잔기 177-182, 잔기 184-189, 잔기 221-231, 및/또는 잔기 227-237 내에 위치하는 펩티드 영역에 존재하며, 상기 EndoS2의 돌연변이체는 야생형 EndoS2의 것에 비해 가수분해 활성이 더 낮고, 글리코실전이반응 활성이 더 높다. EndoS2의 돌연변이체를 사용하여 공학적으로 조작된 당단백질을 제조하는 방법은 활성화된 올리고사카라이드를 당단백질 수용체에 커플링시키는 단계를 포함한다. 활성화된 올리고사카라이드는 글리칸 옥사졸린이다.