실리콘층의 노출부를 포함하는 패턴을 플라즈마 에칭에 의해 형성할 때, 부생성물의 제거와 잔류 불소의 제거를 패턴에 손상을 주지 않고 행할 수 있는 기판의 클리닝 방법 및 기판의 클리닝 장치를 제공한다. 기판 상의 패턴을 플라즈마 에칭에 의해 형성한 후에, 기판의 표면을 클리닝하는 기판의 클리닝 방법으로서, 기판을 HF 가스 분위기에 노출하여 부생성물을 제거하는 부생성물 제거 공정과, 수소 가스와, 탄소와 수소를 구성 원소로서 포함하는 화합물의 가스와, 희가스를 포함하는 클리닝 가스를 플라즈마화하여 기판에 작용시키고, 상기 기판에 잔류한 불소를 제거하는 잔류 불소 제거 공정을 구비하고 있다.