본 발명은 주로 쌀에서 유래하는 고단백 식물성 물질의 무기(중금속) 및 유기(아플라톡신, 곰팡이 등) 오염물질을 감소시키는 절차에 관한 것이다. 식물성 원료에 상기 절차를 적용하면 보건 당국이 설정한 법적 한계보다 훨씬 낮은 수준의 오염 물질을 나타내는 파생물을 얻을 수 있다. 본 발명에서 제시한 절차에 따라, 비타민 및 영양 보조제, 유아용 분유, 스포츠 영양, 임상 영양, 동물 사료 원료 등에 사용할 수 있는 고품질의 단백질 유도체를 얻을 수 있다.