특별한 원료를 추가하지 않고 냉장 보존 중의 유산균의 생존율을 향상시킨 발효유를 제조할 수 있는 발효유 제조 방법을 제공한다. 본 발명에 따른 발효유 제조 방법으로는 원료유를 조제하고 필요에 따라 균질화한 후에 원료유를 살균한 후, 발효 온도의 근처까지 냉각하고 원료유에 유산균 스타터를 접종하여 원료유를 발효시키고 발효유를 얻는다. 그리고 이 발효유를48~52℃1분간 이상에서 지지한 후에20~30℃, 5분간 이상에서 지지한 후, 냉장 보존 온도까지 냉각한다.