내연 기관의 제어 장치에 관한 것으로, EGR 의 영향을 받지 않고 고정확도로 목표 토크를 실현하는 것을 가능하게 한다. 목표 토크 설정 수단에 의해 내연 기관의 목표 토크를 설정하고, 목표 EGR 률 설정 수단에 의해 목표 EGR 률을 설정한다. 그리고, 목표 토크 보정 수단에 의해, EGR 이 토크에 미치는 영향을 보정하기 위한 보정 계수를 목표 EGR 률과 공기량에 기초하여 산출하고, 상기 보정 계수에 의해 목표 토크를 보정한다. 목표 공기량 산출 수단은, 보정된 목표 토크로부터 목표 공기량을 산출한다. 제어 수단은, 보정 목표 토크로부터 산출된 목표 공기량과 목표 EGR 율에 기초하고, 통 내의 공기량 및 EGR 율을 조정하기 위한 복수의 액츄에이터 각각의 동작을 제어한다.