Patateste Virüslerin PCR ve ELISA Teknikleri İle Belirlenmesi ve Başarıyı Etkileyen Faktörler / Identification of Potato Viruses By PCR and ELISA and Factors Effecting the Success
Patateste Virüslerin PCR ve ELISA Teknikleri İle Belirlenmesi ve Başarıyı Etkileyen Faktörler / Identification of Potato Viruses By PCR and ELISA and Factors Effecting the Success
Yazar: Boston, Hidayet; Haliloğlu, Kamil
Dergi: Atatürk Üniversitesi Ziraat Fakültesi Dergisi, Vol. 34 No. 1, 2010

ÖZET: Bu derlemede patatesin farklı aksamlarında ve vektörlerde virüslerin belirlenmesinde moleküler bir tanı tekniği olan polimer zincir reaksiyonu (PCR) ve serolojik bir tanı tekniği olan enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA) yönteminin kullanımındaki avantaj ve dezavantajlar ile PCR çalışmalarında dikkat edilmesi gereken hususlar değerlendirilmiştir. Dormansisi kırılmış yumrularda, mikro-yumrularda ve yeşil yaprak örneklerinde ELISA&rsquo;nın, dormant yumrular ve afitler de ise PCR`ın kullanılması önerilmiştir. Diğer taraftan, PCR çalışmalarında başarıya etki eden inhibitör maddelerin eleminasyonu, RNA ekstraksiyonunda kullanılacak yöntem ve pirimer seçimi gibi faktörlerin göz önünde tutulması duyarlı ve güvenilir bir tanımlama için gerekli olduğu ortaya konulmuştur.Anahtar kelimeler: patates, virüs, PCR, ELISAIdentification of Potato Viruses By PCR and ELISA and Factors Effecting the Success SUMMARY: Advantages and disadvantages of polymerase chain reaction (PCR) and enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA) applications for detection of viruses in different plant tissues and vectors as well as factors affecting PCR applications were discussed in this review. It has been suggested to use ELISA in green leaves, micro-tubers, tubers having broken dormancy if more samples are available; and to use PCR technique in dormant tubers and aphids. In addition, paying attention to parameters such as elimination of inhibitors influencing the success of PCR, RNA extraction method, primer selection are necessary steps for sensitive and reliable detection.Key words: Potato, virus, PCR, ELISA

ÖZET: Bu derlemede patatesin farklı aksamlarında ve vektörlerde virüslerin belirlenmesinde moleküler bir tanı tekniği olan polimer zincir reaksiyonu (PCR) ve serolojik bir tanı tekniği olan enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA) yönteminin kullanımındaki avantaj ve dezavantajlar ile PCR çalışmalarında dikkat edilmesi gereken hususlar değerlendirilmiştir. Dormansisi kırılmış yumrularda, mikro-yumrularda ve yeşil yaprak örneklerinde ELISA&rsquo;nın, dormant yumrular ve afitler de ise PCR`ın kullanılması önerilmiştir. Diğer taraftan, PCR çalışmalarında başarıya etki eden inhibitör maddelerin eleminasyonu, RNA ekstraksiyonunda kullanılacak yöntem ve pirimer seçimi gibi faktörlerin göz önünde tutulması duyarlı ve güvenilir bir tanımlama için gerekli olduğu ortaya konulmuştur.Anahtar kelimeler: patates, virüs, PCR, ELISAIdentification of Potato Viruses By PCR and ELISA and Factors Effecting the Success SUMMARY: Advantages and disadvantages of polymerase chain reaction (PCR) and enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA) applications for detection of viruses in different plant tissues and vectors as well as factors affecting PCR applications were discussed in this review. It has been suggested to use ELISA in green leaves, micro-tubers, tubers having broken dormancy if more samples are available; and to use PCR technique in dormant tubers and aphids. In addition, paying attention to parameters such as elimination of inhibitors influencing the success of PCR, RNA extraction method, primer selection are necessary steps for sensitive and reliable detection.Key words: Potato, virus, PCR, ELISA