hakansabunis/tr-academic-research-agent-index huggingface dataset:
Eğirdir Koşullarında Yetiştirilen Starkspur Golden Delicious Elma Çeşidinde Kontrollü Atmosfer Depolama İçin Uygun Atmosfer Bileşiminin Belirlenmesi
Determination of Optimum Controlled Atmosphere Gas Composition for Starkspur Golden Delicious Apple Cultivar Grown in Egirdir Conditions
Yazar: Eren, İsa; Onursal, Cemile Ebru; Çalhan, Özgür; Seçmen, Tuba; Güneyli, Atakan; Erkan, Mustafa; Akol, Süleyman
Dergi: Bahçe, Vol. 45 No. (Özel Sayı 1) 7. Ulusal Bahçe Bitkileri Kongresi, 2016
Anahtar kelimeler: Agricultural Engineering (Other) ; Ziraat Mühendisliği (Diğer) ; Elma,muhafaza,kalite,kontrollü atmosfer ; apple,storage,quality,controlled atmosphere

Bu çalışmada Eğirdir bölgesinde yetiştiriciliği yoğun şekilde yapılan Starkspur Golden Delicious elma çeşidinde kontrollü atmosferde (KA) depolama için uygun gaz bileşiminin belirlenmesi amaçlanmıştır. Optimum zamanda hasat edilen meyveler KA’de 0°C sıcaklık ve 3 farklı atmosfer bileşiminde (K-1: %1 CO2 + %2 O2; KA-2: %2 CO2 + %2 O2; KA-3: %3 CO2 + %2 O2) ve normal atmosfer (NA) koşullarında muhafazaya alınmıştır. Depolama süresince 2’şer ay arayla alınan meyve örneklerinde ve 20°C’de 7 gün raf ömrü için bekletilen örneklerde kalite analizleri yapılmıştır. NA koşullarında oldukça yüksek oranda su kaybı olduğu görülmüştür. KA koşullarının her üçü de su kaybını oldukça sınırlandırmıştır. Benzer şekilde etilen üretimi ile solunum hızının baskılanmasında da KA koşullarından NA depolamaya göre daha etkili sonuçlar alınmıştır. KA2 ve KA-3 koşulları diğer ortam koşullarına göre meyvelerde kalitenin korunmasında daha etkili olmuştur. NA depolama koşullarında depolanan meyvelerin meyve eti sertlik değerlerinde muhafaza periyodu boyunca düşüş gözlenirken KA depolama koşullarında genellikle bu değerler korunmuştur. Meyve eti sertlik değerlerinin korunmasında KA-3 uygulaması ön planda çıkmıştır.

This study was conducted for the purpose of determining the gas composition suitable for storing in controlled atmosphere (CA) the apple variety "Starkspur Golden Delicious", which is widely produced in Eğirdir region. Fruits were harvested at optimum harvest date than stored in CA at 3 different atmosphere compositions (C-1: 1% CO2 + 2% O2; CA-2: 2% CO2 + 2% O2; CA-3: 3% CO2 + 2% O2) and under regular atmosphere (RA) conditions at 0oC. Quality analyses were performed on the fruit samples taken every other 2 months during storage and on the samples kept for shelf life for 7 days at 20°C. The rate of water loss under RA conditions was very high. All three of the CA conditions considerably limited water loss. Likewise, in terms of ethylene production and respiration rate inhibition, storage under CA conditions produced more effective results than that under RA conditions. Compared to other ambient conditions, CA-2 and CA-3 conditions had a higher effect on maintaining quality of fruits. The fruit flesh firmness values of the fruits stored under RA conditions decreased during storage. However, under CA storage conditions, those values were generally maintained. CA-3 stood out in maintaining fruit flesh firmness values.
Bazı Yenidünya Çeşitlerinde Meyve Kalitesi Üzerine Taç Yönünün Etkileri
Effects of Canopy Orientation on Fruit Quality of Some Loquat Cultivars
Yazar: Polat, Atila Aytekin; Turunç, Pınar
Dergi: Bahçe, Vol. 45 No. (Özel Sayı 1) 7. Ulusal Bahçe Bitkileri Kongresi, 2016
Anahtar kelimeler: Agricultural Engineering (Other) ; Ziraat Mühendisliği (Diğer) ; Eriobotrya japonica,meyve özellikleri,sürgün büyümesi ; Eriobotrya japonica,fruit characteristics,shoot growth

Çalışmada, ülkemizin Doğu Akdeniz Bölgesinde (Dörtyol, Hatay) yetiştirilen bazı yerli ve yabancı yenidünya çeşitlerinin meyve kalitesi üzerine taç yönünün (Kuzey, Güney, Doğu, Batı) etkileri belirlenmiştir. Denemede, ‘Hafif Çukur Göbek’ (HÇG), ‘Golden Nugget (GN)’, ‘Sayda’, ‘Lapta-B2’, ‘Baduna-5’, ‘Ottowianni’ ve ‘Şampiyon’ çeşitleri değerlendirilmiştir. Araştırma materyali çeşitler, yenidünya çöğür anacına aşılı bir yıllık fidanlar olarak 1997 yılında 6 x 6 m ara ile kuzey-güney yönünde dikilmiştir. Meyve özellikleri ve yıllık sürgün büyümesi belirlenmiştir. Meyve kalitesini belirlemek için, her çeşitten toplam 120 meyve alınmış (her yöneyden 30 meyve) ve bunlarda; meyve ağırlığı (g), meyve iriliği(mm), tohum ağırlığı(g), tohum sayısı (adet), meyve eti/tohum oranı (%), suda çözünebilir kuru madde oranı (SÇKM) (%), titre edilebilir toplam asitlik (%) ve pH belirlenmiştir. İncelenen bütün özellikler bakımından çeşitler arasında önemli farklılıklar bulunmuştur. Ayrıca, çeşitlerin meyve boyu, tohum sayısı, tohum ağırlığı, meyve eti/tohum oranı, SÇKM ve asit içeriği, tacın baktığı yön tarafından önemli ölçüde etkilenmiştir.

In the study, the effect of canopy orientation (North, East, South, and West) was determined on fruit quality of some local and foreign loquat cultivars grown at Dortyol (Hatay), in the Eastern Mediterranean Region of Turkey. Seven loquat cultivars were evaluated: ‘Hafif Çukurgöbek’ (HÇG), ‘Golden Nugget’ (GN), ‘Sayda’, ‘Lapta-B2’, ‘Baduna-5’, ‘Ottowianni’, and ‘Şampiyon’. One-year-old plants grafted on seedling rootstocks were planted at 6 × 6 m in 1997, kept in South-North oriented rows. Fruit characteristics and annual shoot growth were evaluated. To evaluate fruit quality, 120 fruits (30 fruits from each side of the canopy) from each cultivar were collected and fruit weight (g), fruit size (mm), seed weight (g), seed number, flesh/seed ratio (%), total soluble solids (TSS) (%), titratable acidity (%) and pH were determined. There were significant differences among the cultivars for all traits tested. Fruit length, seed number, seed weight, flesh/seed ratio, TSS, and titratable acidity were significantly affected by canopy orientation.
Lâpseki Yöresinde Şeftali ve Nektarin Yetiştirilen Toprakların Verimlilik Durumlarının İncelenmesi
Determining Nutritional Status of Peach and Nectarine Soils Grown in Lâpseki Region
Yazar: Soyergin, Serap; Ekinci, Neslihan; Gür, Engin
Dergi: Bahçe, Vol. 45 No. (Özel Sayı 1) 7. Ulusal Bahçe Bitkileri Kongresi, 2016
Anahtar kelimeler: Agricultural Engineering (Other) ; Ziraat Mühendisliği (Diğer) ; Şeftali,nektarin,toprak,verimlilik ; Peach,nectarine,nutrient status,soil analysis

Bu çalışma Lâpseki yöresinde yetiştirilen nektarin ve şeftali topraklarının verimlilik özelliklerinin toprak analizleriyle belirlenmesi amacıyla ele alınmıştır. Bu amaçla Lâpseki ilçesinde yoğun olarak nektarin ve şeftali yetiştiriciliği yapılan bölgeden 28 şeftali ile 15 adet nektarin bahçesinden alınan toprak örnekleri analiz edilerek değerlendirilmiş, tahmini verim, gübreleme ve bahçelerle ilgili bazı bilgi ve gözlemler kaydedilmiştir. Toprak örnekleri 0-30 ve 30-60 cm derinliklerden alınmıştır. Analizler sonucunda elde edilen bulgulara göre şeftali ve nektarin bahçe toprakları genellikle tınlı ve killi tınlı bünyede, nötr ve hafif alkalin reaksiyonda, kireçsiz ya da az kireçli olup, tuzluluk çoğunlukla orta düzeydedir. Organik madde üst ve alt toprakların %75’inde yetersizdir. Alt ve üst topraklarda demir ve çinko çoğunlukla yetersiz iken diğer tüm makro ve mikro besinler genellikle yeterli düzeydedir.

This experiment was carried out to determine fertility status of soils in which peach and nectarine orchards in Lapseki region. For this purpose, soil samples were taken from 28 peach and 15 nectarine orchards and based on analyses estimation were made about yield, fertilizing as well as information’s and observations were recorded. Soil samples once a year at two depths (0-30 and 30-60 cm) were taken. In view of the findings based on soil analyses the results are summarized as below: The texture of the soils analyzed was generally loamy and clay loamy, the calcium carbonate contents of the sols were generally low even some units had no calcium carbonate at all. Soil salinity was mostly mid-level. The soil reaction was generally neutral or slightly alkaline. Seventy-five percent of the organic matter in the top and sub-soils were insufficient level. Although there were some deficiencies of iron and zinc, all of the macro and micro nutrients were generally at sufficient levels in the soils.
Kocayemiş’in (Arbutus unedo L.) Doku Kültürü İle Üretimi
Micropropagation of Strawberry Tree (Arbutus unedo L.)
Yazar: Fidancı, Ayşe
Dergi: Bahçe, Vol. 45 No. (Özel Sayı 1) 7. Ulusal Bahçe Bitkileri Kongresi, 2016
Anahtar kelimeler: Agricultural Engineering (Other) ; Ziraat Mühendisliği (Diğer) ; kocayemiş,köklenme,ortam,sitokinin,oksin ; Strawberry tree,rooting,media,auxin

Akdeniz ekosisteminin karakteristik türlerinden biri olan kocayemiş, diğer adı ile dağ çileği ülkemizde doğal yayılış gösteren türlerden birisidir. Ekonomik açıdan yetiştiricisini memnun edecek bir tür olarak ilgi beklemekte olan bu tür yeterince tanınmamaktadır. In vitro’da;  sürgün ucu (3-5 mm), lateral gözler ve üzerinde genellikle bir göz bulunan nodlar olmak üzere üç tip eksplant kullanılmıştır. Sürgün ucu kültüründe kararmalar meydana gelmiştir.  Yan gözlerde de kararma ve geç, cılız gelişme olduğu görülmüştür. Üzerinde genellikle bir göz bulunan nodlarda (10-15 mm) ise en iyi gelişme görülmüş ve bu eksplant tipinden gelişen mikro sürgünler ile sitokinin ve oksin doz denemeleri yapılmıştır. Köklendirme çalışmaları in vitro ve in vivo’da yapılmıştır. In vitro’da 3 ortam ve IBA’in 2 dozu kullanılmıştır. In vitro’da en yüksek köklenme %86,7 oranında K/3 tipinde, makro elementlerin yarıya indirgendiği MS ortamında ve 5 mg/L IBA dozunda oluşmuştur. En düşük köklenme ise K/1 tipinde %25 oranında MS ortamında ve 2 mg/L IBA dozunda gerçekleşmiştir. In vivo’da mikro sürgünlerin dip kısımları IBA’in 500 ve 1000 ppm dozlarına 10 saniye batırılmış ve nemli perlit içeren plastik kaplara dikilmiştir. In vivo’da ise en yüksek köklenme %58,3 oranında 1000 ppm IBA dozunda K/1 ve Esenköy tiplerinde meydana gelmiştir.

The strawberry tree (Arbutus unedo L.) is native to the Mediterranean region that also widely distributed in Turkey. Its farming can be profitable, but it is not well known enough in our country. In this study, shoot tip (3-5 mm), axillary bud and nod with usually one bud (10-15 mm) as explant were used. Severe browning was observed in shoot tip culture of A. unedo. The micro-shoots of axillary bud explants were also occurred browning, late sprouting, weak development and opening in color. The micro-shoots originated from nodes showed the best improvement and cytokine and auxin dose trials were established them. In vitro and ex vitro rooting experiments were carried out in three different media and two concentrations of IBA. The highest rooting rate with 86,7%  was obtained the micro-shoots originated from K/3 type in MS medium added 5 mgl-1 IBA and ½  macro elements in vitro, while K/1 type showed the lowest rooting rate with 25% in MS medium added 2 mgl-1 IBA. 500 and 1000 ppm concentrations of IBA were used at ex vitro rooting. The micro-cuttings in height 2-3 cm were soaked in IBA solution for 10 s and then they were planted in plastic jars containing perlite. K/1 and Esenköy types had have the highest rooting rate of rooting with 58,3% in 1000 ppm IBA concentration.
Vejetasyon Sıcaklık Eşiği 10℃’ye Göre Türkiye’de Standart Soğuklama Süreleri
Vegetation Effective Temperature Threshold of 10℃ in Turkey by Chilling Hours
Yazar: Özaydın, Kadir Aytaç; Küden, Ayzin; Küden, Ali; Asar, Murat; Peşkircioğlu, Meral
Dergi: Bahçe, Vol. 45 No. (Özel Sayı 1) 7. Ulusal Bahçe Bitkileri Kongresi, 2016
Anahtar kelimeler: Agricultural Engineering (Other) ; Ziraat Mühendisliği (Diğer) ; Chilling hours,The threshold temperature of 10oC,vegetation,plants need to chilling hours,grape ; Soğuklama süresi,10°C derece eşik sıcaklık,vejetasyon,soğuklama ihtiyacı,üzüm

Kışın yaprağını döken çok yıllık bitkiler dinlenme dönemlerinde soğuklama ihtiyaçlarını karşılamaya çalışırlar. Bitkinin dinlenme döneminde yeteri kadar soğuklama ihtiyacını karşılayamaması durumunda vejetasyon döneminde gelişim sorunları ortaya çıkmaktadır. Etkili sıcaklık eşiği bitkilerin gelişmelerinde etkili iklim parametresi olarak incelenmektedir. Bitkilerin vejetasyona başlamaları ve tekrar dinlenme dönemine geçmelerinde belirli sıcaklıklar etkili olmaktadır. Etkili sıcaklık eşiği tür ve çeşide göre değişebilmektedir. Örneğin üzümün vejetasyonu için 10°C eşik değerinin en etkili iklim parametresi olduğu kabul edilmektedir. Bazı bitkilerin soğuklama ihtiyaçlarının hangi lokasyonlarda karşılanabildiği ve eşik değerinin doğruluğu taban veriler ile incelenebilir. Bu amaç ile lokasyonlar bazında vejetasyon tarihleri ile soğuklama sürelerine ait veriler tablo olarak hazırlanmıştır. Hazırlanan tablo bitkilerin karakteristik soğuklama isteğini araştırmak için kullanılabilecek bir taban veridir.

Temperate fruit trees satisfy their chilling requirements during the rest period.  In case the plant could not get sufficient chilling, some problems will occur during the vegetation period. The effective temperature threshold is an effective climatic parameter on plant development. The initiation of the plant vegetation and entering to the dormancy period, specific temperatures are effective. Effective temperature threshold can vary according to the type and variety. For example, the threshold temperature of 10°C for grape vegetation period is considered to be the most effective climatic parameter. The chilling requirements of some plants can be satisfied in which locations can be investigated with the threshold accuracy base data. With this purpose the vegetation dates concerning the locations and chilling requirements are given in a table.  This table is a plant data base that can be used to investigate the chilling requirements of the plants.
Hasat Sonrası Salisilik Asit Uygulamasının Dr. Jules Guyot Armut Çeşidinde Muhafaza ve Raf Ömrü Kalitesi Üzerine Etkileri
The Effects of Postharvest Salicylic Acid Treatment on Storage and Shelf-Life Quality of Dr. Jules Guyot Pear Cultivar
Yazar: Onursal, Cemile Ebru; Güneyli, Atakan; Seçmen, Tuba; Eren, İsa; Koyuncu, Mehmet Ali; Erbaş, Derya
Dergi: Bahçe, Vol. 45 No. (Özel Sayı 1) 7. Ulusal Bahçe Bitkileri Kongresi, 2016
Anahtar kelimeler: Agricultural Engineering (Other) ; Ziraat Mühendisliği (Diğer) ; Armut,salisilik asit,depolama,kalite ; Pear,salicylic acid,storage,quality

Çalışmada, hasat sonrası farklı dozlarda salisilik asit (SA) uygulamasının Dr. Jules Guyot armut çeşidinin depolama ve raf ömrü kalitesi üzerine etkileri araştırılmıştır. Bu amaçla, meyveler hasattan sonra 0, 1, 2 ve 4 mM %0.01 Tween-20 içeren SA çözeltisine 5 dakika süre ile daldırılmıştır. Uygulamalardan sonra meyveler 0°C’de ve %90±5 oransal nemde 3 ay süre ile depolanmıştır. Depolama periyodu süresince aylık alınan meyve örneklerinde; ağırlık kaybı, meyve kabuk rengi, sertlik, suda çözünebilir kuru madde ve titre edilebilir asit miktarı, solunum hızı ve etilen üretimi analizleri yapılmıştır. Uygulamaların raf ömrü kalitesine etkilerini belirlemek amacıyla aylık alınan örnekler 20℃'de 5 gün süreyle bekletildikten sonra kalite analizleri tekrarlanmıştır. SA uygulamalarının kontrol uygulamasına göre; etilen üretimini ve solunum hızını azalttığı, meyve eti sertliğinin, kabuk renginin ve titre edilebilir asitlik miktarının korunmasında daha etkili olduğu belirlenmiştir. Çalışma sonucunda 4 mM SA uygulaması kalite özelliklerinin korunmasında en etkili uygulama olmuştur.

The effects of different postharvest salicylic acid (SA) doses on storage and shelf-life quality of “Dr. Jules Guyot” pear variety were investigated. Fruits were immersed in 0, 1, 2, and 4 mM of salicylic acid, containing 0.01% Tween-20, for 5 minutes. After treatments, fruits were stored for 3 months at 0℃ and 90±5% relative humidity. During the storage period, monthly taken fruit samples were analyzed for fruit quality parameters which are: weight loss, fruit peel colour, firmness, total soluble solid and titratable acidity, respiration rate and ethylene production. To determine the effects of treatments on shelf life; fruit samples held for 5 days at 20°C and the same analyses were conducted. SA treatments significantly reduced respiration rate and ethylene production, maintained fruit firmness, skin colour and titratable acidity effectively compared with control group. 4 mM dose of salicylic acid was the most effective treatment for maintaining fruit quality.
Slovenya Fındıklarında Genetik Çeşitlilik
Genetic Diversity in Slovenian Hazelnuts
Yazar: Öztürk, Süleyman Can; Öztürk, Saniye Elvan; Uncu, Ali Tevfik; Solar, Anita; Doğanlar, Sami; Frary, Anne
Dergi: Bahçe, Vol. 45 No. (Özel Sayı 1) 7. Ulusal Bahçe Bitkileri Kongresi, 2016
Anahtar kelimeler: Agricultural Engineering (Other) ; Ziraat Mühendisliği (Diğer) ; AFLP Çoğaltılmış fragment uzunluk polimorfizmi,SSR basit dizi tekrarları,moleküler markörler ; AFLP amplified fragment length polymorphism,SSR simple sequence repeats,molecular marker

Slovenya kendi Avrupa fındığı Corylus avellana L. genotiplerini ve yabani tiplerini bulunduran dünyadaki fındık üreticilerinden biridir. Slovenya fındık kaynaklarının moleküler genetik açısından gösterdiği çeşitlilik araştırılmalı ve bu fındık çeşitliliğinin potansiyelleri geliştirilmelidir. Bu amaçla, Slovenya’nın geniş coğrafik alanını temsil eden 57 Slovenya fındık tipi ve Slovenya dünya koleksiyonundan 45 fındık çeşidi, 11 seçici AFLP primer çifti ve 50 SSR primer çifti ile taranmıştır. Toplamda, 512 polimorfik SSR fragmenti ve 532 polimorfik AFLP fragmenti analiz edilmiştir. Slovenya fındık çeşitleri ve tipleri, AFLP verisinin hoc istatistiği ve Neigbor-joining algoritması (r=0.96) ile analizi sonucunda üç kümeye ayrılmıştır. Benzer olarak, SSR verisi (r=0.96) Neigbor-joining algoritması ile üç kümeye ayrılmıştır. SSR verileriyle 28 fındık tipi, AFLP verileriyle 33 fındık tipi Slovenya fındık çekirdek koleksiyonu için seçilmiştir. Seçilen çekirdek koleksiyon, en yüksek genetik çeşitliliği en az birey ile temsil etmektedir ve seçilen fındıklardan 18 tanesi her iki çekirdek koleksiyonunda ortak olarak bulunmaktadır. Slovenya fındık çeşitliliğinin çalışılması, ilgilenilen agronomik ve biyokimyasal özelliklerin genetik haritalanması ve tanımlanması için ilk adımdır.

Slovenia is the one of the hazelnut producers in the world and has its own European hazelnut (Corylus avellana L.) genotypes and wild types. Slovenian hazelnut resources should be examined for their molecular genetic diversity and their potential for improvement of hazelnut. For this reason, 102 Slovenian hazelnuts representing a wide geographic range of the country were screened with 11 pairs of selective AFLP primers and 50 pairs of SSR primers. In total, 512 polymorphic SSR fragments and 532 polymorphic AFLP fragments were found. Diversity analysis of the Slovenian hazelnut genotypes indicated that they were classified to three clusters according to hoc statistics and Neighbor-joining algorithms (r= 0.96) for AFLP data. Similarly, three clusters were observed for the SSR data using the Neighbor joining algorithm (r= 0.96). A total of 28 individuals with SSR data and 33 individuals with AFLP data were selected for core collections of Slovenian hazelnut genotypes. These core collections represent a maximum of genetic diversity in a minimum number of individuals and 18 of them were present in both core collection datasets. Examination of Slovenian hazelnut diversity is a first step toward identification and genetic mapping of agronomic and biochemical traits of interest.
SSR Markörleri İle Amasya Elmasının İskelet Haritasının Oluşturulması
Construction of the Reference Genetic Linkage Map of Amasya Apple by Microsatellite (SSR) Markers
Yazar: Motalebipour, Elmira Ziya; Çoban, Nergiz; Khodaeiaminjan, Mortaza; Topçu, Hayat; Güney, Murat; Özongun, Şerif; Atay, Ayşe Nilgün; Kafkas, Salih
Dergi: Bahçe, Vol. 45 No. (Özel Sayı 1) 7. Ulusal Bahçe Bitkileri Kongresi, 2016
Anahtar kelimeler: Agricultural Engineering (Other) ; Ziraat Mühendisliği (Diğer) ; Apple,SSR,reference map,microsatellite ; Elma,SSR,iskelet harita,mikrosatellit

Bu çalışmada ‘Amasya’ elmasının SSR markörleri ile iskelet haritasının oluşturulması amaçlanmıştır. Bu amaçla Amasya elması içerisinden seçilen ‘Kaşel-41’ çeşidi ile ‘Williams Pride’ çeşitlerinin melezlenmesinden oluşan F1 popülasyonu çalışmanın materyalini oluşturmuştur. SSR primer çiftlerinin taranması sonucunda 699 primer çiftinden 417 adedi açılım göstermiş ve bunlardan 207 adet ortak SSR markörü olarak 96 melez bireyde analiz edilerek iskelet harita oluşturulmuştur. Amasya elmasının iskelet haritasının oluşturulmasında açılım gösteren 207 markör, 17 bağlantı grubuna dağılım göstermiştir. Bu harita 1351 cM uzunluğunda olup, markör yoğunluğu 12.2 ve markörler arası ortalama uzaklık ise 6.5 cM olarak saptanmıştır. Böylece elmada şimdiye kadarki en iyi SSR markörleri ile iskelet harita bu çalışma ile oluşturulmuştur. Yeni SSR markörleri ve farklı markör yöntemlerinin kullanılması, ileriki zamanlarda yapılacak genetik haritalama çalışmalarında yüksek yoğunluklu harita elde edilmesinde fayda sağlayacaktır.

This study aimed to construct reference genetic map of ‘Amasya’ apple cultivar with SSR markers. With this aimed, the cross between selected ‘Kaşel-41’ from ‘Amasya’ apple cultivar and ‘Willams Pride’ cultivar establishes this study's materials. As a result of screening 699 SSR pairs of primer in 96 hybrid individuals showed 417 polymorphisms. A reference map was constructed by using 207 common SSR markers. The reference genetic map was 1351 cM long , average marker number 12.17 with a mean marker density of 6.52. Thereby producing the densest SSR-based reference map currently reported for apple. In the future genetic mapping and genomic studies, use of the new SSR markers and other marker methods will be useful to obtain high density map.
Cevizde Yeni SSR Markörlerin Geliştirilmesi
Development of Simple Sequence Repeat (SSR) Markers from Walnut (Juglans regia L.)
Yazar: Topçu, Hayat; Ikhsan, Adi Surya; Sütyemez, Mehmet; Çoban, Nergiz; Güney, Murat; Kafkas, Salih
Dergi: Bahçe, Vol. 45 No. (Özel Sayı 1) 7. Ulusal Bahçe Bitkileri Kongresi, 2016
Anahtar kelimeler: Agricultural Engineering (Other) ; Ziraat Mühendisliği (Diğer) ; Ceviz,Juglans regia,SSR,mikrosatellit ; Walnut,Juglans regia,SSR,microsatellite

Bu çalışmada ceviz için yeni SSR markörlerin geliştirilmesi amaçlanmıştır. Bunun için Maraş-18 ceviz çeşidi DNA’sı kullanılarak oluşturulan genomik kütüphane dört farklı motif ile (CA, GA, AAC ve AAG) zenginleştirilmiştir. Sekansı yapılan 620 klondan 276 adet primer çifti dizayn edilmiştir. Öncelikle gradient PCR ile her bir primer çiftinin DNA’ya bağlanma sıcaklıkları belirlenmiştir. Bant veren 247 SSR primer çifti 15 ceviz çeşidinde analiz edilerek polimorfizm durumları belirlenmiştir. Toplam 185 primer çifti polimorfizm göstermiş olup bunların 80 tanesi (%44.4) GA kütüphanesinden elde edilmiştir. En az polimorfik primer çifti (14 adet) ise AAC kütüphanesinden elde edilmiştir. CA ve AAG kütüphanelerinden ise benzer oranda polimorfizm elde edilmiştir. Sonuç olarak, cevizde bundan sonra yapılacak genetik kaynakların karakterizasyonu, genetik haritalama, popülasyon genetiği gibi çalışmalarda kullanmak üzere çok sayıda yeni SSR markörleri geliştirilmiştir.

In this study, it was aimed to develop SSR markers for walnut. Genomic libraries enriched with CA, GA, AAC and AAG repeats were constructed using genomic DNA of Juglans regia cv. Maraş-18 to develop SSR markers for walnut. A total of 624 clones were sequenced and 276 primer pairs were designed. Amplification of SSR primer pairs was tested by gradient PCR to determine their optimum annealing temperatures, 247 generated PCR products, and 185 polymorphic loci were obtained by characterizing 15 walnut cultivars. A total of 185 primer pairs showed polymorphism and 80 of them obtained from GA-enriched library. The least polymorphism  (14 primer) obtained from AAC-enriched library. CA and AAG enriched libraries produced similar polymorphism rates. As a result, the new SSR primer pairs developed in this study can be used in different genetic studies in walnut such as characterization of genetic resources, construction of genetic linkage maps, and population genetics.