hakansabunis/tr-academic-research-agent-index huggingface dataset:
Vero hücrelerinde ısıya dayanıklı sığır vebası aşı üretimi
Production of a thermostable vero-cell adapted rinderpest vaccine
Yazar: Kabaklı, Özden; Çalışkan, Elvin; Güngör, A. Burak; Yöndem, Süreyya; Demirhan, İlkay
Dergi: Etlik Veteriner Mikrobiyoloji Dergisi, Vol. 21 No. 1, 2010
Anahtar kelimeler: Veterinary Surgery ; Veteriner Cerrahi ; Canlı aşı,ısıya dayanıklı,sığır vebası,stabilite,vero hücre.,Özden KABAKLI,Elvin ÇALIŞKAN,A. Burak GÜNGÖR,Süreyya YÖNDEM,İlkay DEMİRHAN,2010,Etlik Veteriner Mikrobiyoloji Dergisi ; Live vaccine,rinderpest,stability,thermostability,vero cells.

Vero hücrelerinde üretilen bir sığır vebası aşısının termostabilitesi %5 laktalbumin hidrolizat ve %10 sukrozdan oluşan stabilizatör ve 74 saat süren liyofilizasyon protokolu ile gerçekleştirildi. Stabilizatör ve liyofilizasyon protokolu +37ºC, +42ºC, +45ºC ve +56ºC’deki hızlandırılmış stabilite testi ile test edildi ve bu verilerden Arhenius eğrisi yapıldı. Bu metotla üretilen liyofilize sığır vebası aşısı minimum gerekli infektif titre olan 10-2.5 DKID50 /ml titreyi +37ºC’de 30 günden fazla sürdürmüştür. Aşının aktivitesi sığırlarda antikor titresi ile test edildi. Sulandırılmış aşının stabilitesi üç farklı dilüent ile test edildi. Sonuç olarak aşı virusunun 1 molar magnezyum sülfat solüsyonu ve normal fizyolojik tuzlu su ile sulandırıldığında, +37°C gibi yüksek ısıya sahip bir ortamda 4 saatten daha fazla infektif titresini koruduğu belirlendi.

The thermo stability of a rinderpest vaccine produced on vero cells were evaluated using 5% lactalbumin hydrolysate–10% sucrose as a stabilizer and a lyophilization protocol that is takes 74 hours. The stabilizer and lyophilization schedules were examined using accelerated stability testing at +37ºC, +42ºC,+45ºC and +56ºC, and an Arrhenius plot was based on from these data. A lyophilized rinderpest vaccine was maintained the minimum required dose of 10-2.5 TCID50 /ml more than 30 days at +37ºC. The biological activity of the vaccine by measured with antibody titration in cattle. The stability of the reconstituted vaccine was examined using three different diluent preparations. Finally, the infectivity of vaccine was stable even at high temperatures up to 4 h after reconstitution with magnesium sulphate molar solution or normal physiological saline.
Ege Bölgesi kültür balıklarında Gram pozitif bakteri infeksiyonlarının incelenmesi
Investigation of Gram positive bacterial infections in culture fisheries in the Aegean Region
Yazar: Gürpınar, Saadet; Savaşan, Serap
Dergi: Etlik Veteriner Mikrobiyoloji Dergisi, Vol. 21 No. 1, 2010
Anahtar kelimeler: Veterinary Surgery ; Veteriner Cerrahi ; Balık hastalıkları,Gram pozitif bakteri,identifikasyon,izolasyon.,2010,Saadet GÜRPINAR,Serap SAVAŞAN,Etlik Veteriner Mikrobiyoloji Dergisi ; Fish diseases,Gram positive bacteria,identification,isolation.

Bu araştırmada, Ege Bölgesi kültür balıklarındaki Gram pozitif bakteri infeksiyonlarının belirlenmesi amaçlanmıştır. Ege Bölgesi’nde bulunan çeşitli balık çiftliklerinden canlı olarak sağlıklı ve hasta olmak üzere, rutin teşhis laboratuvarına getirilen 150 kültür balığının fiziksel ve bakteriyolojik olarak incelenmesi sonucu toplam 101 adet izolat elde edildi. Bu izolatların 10 adeti (%9.9) Gram negatif kok ve basil, 91 adeti (%90.1) ise Gram pozitif kok-kokoid olarak belirlendi. Gram pozitif kok-kokoid tarzı 91 adet mikroorganizma Staphylococcus spp. (%43), Lactococcus lactis (%35.1), Enterococcus avium (%3.2), Enterococcus feacalis (%17.5), Listeria spp. (%1), Aerococcus viridans (%10.9), Aerococcus urinae (%5.4), Streptococcus pyogenes (%7.6) Streptococcus agalactiae (%14.2) olarak identifiye edildi. S. agalactia, sağlıklı balıkların %10.4’ünden izole edilirken, %7.8 oranında hasta balıklarda izole edilmiştir. S. pyogenes ise, sağlıklı balıkların %6.2’sinden izole edilirken, hasta balıkların %3.9’undan izole edilmiştir.

Aim of this study was, to define Gram positive bacterial infections at culture fisheries in the Aegean Region. In this research, 150 live culture fish taken from various fish farms on Aegean Region were classified as healthy or diseased. After analyzing of 150 culture fish at routine identification laboratories, 101 bacteria were isolated. Ten (9.9%) of these bacteria were identified as Gram negative cocci and bacilli, 91 (90.1%) of them were identified as Gram positive cocci-coccoid. These 91 Gram positive cocci-coccoid bacteria were identified as Lactococcus lactis (35.1%), Enterococcus avium (3.2%), Enterococcus feacalis (17.5%), Listeria spp. (1%), Aerococcus viridans (10.9%), Aerococcus urinae (5.4%), Streptococcus pyogenes (7.6%) and Streptococcus agalactiae (14.2%). S. agalactia were isolated from 10.4% of healthy fish as well as they were isolated from 7.8% of diseased fish. Also S. pyogenes was isolated from 6.2% of healthy fish and 3.9% of diseased fish.
Bir gıda patojeni: Cronobacter sakazakii
A food pathogen: Cronobacter sakazakii
Yazar: Kasımoğlu Doğru, Aylin
Dergi: Etlik Veteriner Mikrobiyoloji Dergisi, Vol. 21 No. 1, 2010
Anahtar kelimeler: Veterinary Surgery ; Veteriner Cerrahi ; Cronobacter sakazakii,gıda,yeni doğan,2010,Etlik Veteriner Mikrobiyoloji Dergisi,Aylin KASIMOĞLU DOĞRU ; Cronobacter sakazakii,food,infant.

Cronobacter sakazakii, yeni doğanlarda menenjit, septisemi ve enterokolite neden olan fırsatçı bir patojendir. Etken, Enterobacteriaceae familyasında yer alan, Gram-negatif çubuk şeklinde bir bakteridir. C. sakazakii farklı kaynaklardan izole edilmesine rağmen, enfeksiyonlar toz bebek mamalarıyla ilişkilendirilmiştir. C. sakazakii enfeksiyonlarından korunabilmek için, etkenin üreme, canlı kalma, inaktivasyon koşulları gibi özellikleri ile izolasyon ve identifikasyon yöntemlerinin bilinmesi önemlidir.

Cronobacter sakazakii is an opportunistic pathogen causing meningitis, septicemia and enterocolitis in neonates. The organism is a Gram-negative rod within the family Enterobacteriaceae. Although the pathogen was isolated from different sources, its infections have been linked with powdered infant formulas. It is important to know growth, survival, and inactivation conditions of C. sakazakii and its isolation and identification methods for preventative purposes.
UHT süt ve peynir örneklerinde aflatoksin M1 varlığının belirlenmesi
Detection of aflatoxin M1 in UHT milk and cheese samples
Yazar: Gücükoğlu, Ali; Çadırcı, Özgür; Özpınar, Necati
Dergi: Etlik Veteriner Mikrobiyoloji Dergisi, Vol. 21 No. 2, 2010
Anahtar kelimeler: Veterinary Surgery ; Veteriner Cerrahi ; Necati ÖZPINAR,Özgür ÇADIRCI,Ali GÜCÜKOĞLU,Aflatoksin M1,ELISA,peynir,UHT süt.,2010,Etlik Veteriner Mikrobiyoloji Dergisi ; Aflatoxin M1,cheese,ELISA,UHT milk.

Bu çalışma, Erzincan ilinde tüketime sunulan UHT süt ve peynir örneklerinde aflatoksin M1 (AFM1) varlığını ve düzeylerini belirlemek amacıyla yapılmıştır. Bu amaçla, 36 UHT süt, 18 beyaz peynir, 17 kaşar peyniri, 10 tulum peyniri, 10 eritme peyniri ve 9 dil peyniri olmak üzere toplam 100 örnek çalışma materyali olarak kullanılmıştır. Örnekler ELISA yöntemiyle analiz edilmiştir. Analiz edilen UHT süt ve peynir örneğinin 67’sinde (%67) farklı düzeylerde AFM1 tespit edilmiş ve örneklerin 13’ünde (%13) Türk Gıda Kodeksi Gıda Maddelerindeki Bulaşanların Maksimum Limitleri Hakkında Tebliğ’de belirtilen düzeylerden yüksek bulunmuştur. AFM1 tespit edilen UHT süt numunelerinin %5.6’sı, beyaz peynir numunelerinin %5.6’sı, kaşar peyniri numunelerinin %29.4’ü ve dil peyniri numunelerinin %55.5’inin yasal limitleri aştığı saptanmıştır. Sonuç olarak, analiz edilen örneklerin bazılarında AFM1 seviyesinin limit sınırlarının üstünde olduğu belirlenmiş ve AFM1’in halk sağlığına olan zararlı etkileri göz önüne alındığında analiz edilen değerlerin daha aşağılara çekilmesine yönelik uygulamaların gerekli olduğu düşünülmektedir.

This study was undertaken to determine the presence and levels of aflatoxin M1 (AFM1) in UHT milk and cheeses consumed in the province of Erzincan. For this purpose, a total of 100 samples containing 36 UHT milk, 18 white cheese, 17 kashar cheese, 10 tulum cheeses, 10 processed cheeses and 9 dil cheeses were used as the study material. The cheese samples were purchased randomly from different markets. The samples were analyzed by ELISA method. Different levels of AFM1 were detected in 67 (67%) of the 100 UHT milk and cheese samples tested, and in 13 of the samples (13%) the amount of AFM1 was found over the levels permitted by the Turkish Food Codex. Among these, 5.6% of UHT milk, 5.6% of white cheese, 29.4% of kashar cheese and 55.5% of dil cheese exceeded the Turkish safety limits. It was therefore concluded that, the aflatoxin contain of the some investigated samples exceed the tolerance levels. AFM1 has hazardous effect for the public health for this reason the AFM levels must be decreased.
Ege Bölgesi’ndeki sığırların süt ve dışkı örneklerinden Escherichia coli O157:H7 izolasyonu ve verotoksinlerinin belirlenmesi
Isolation of Escherichia coli O157:H7 in milk and feaces of cattle in Aegean Region and determination of their verotoxin
Yazar: Çiçek, Erdem; Savaşan, Serap
Dergi: Etlik Veteriner Mikrobiyoloji Dergisi, Vol. 21 No. 2, 2010
Anahtar kelimeler: Veterinary Surgery ; Veteriner Cerrahi ; Erdem ÇİÇEK,Serap SAVAŞAN,E. coli O157:H7,izolasyon,sığır,verotoksin,2010,Etlik Veteriner Mikrobiyoloji Dergisi ; Cattle,E. coli O157:H7,isolation,verotoxin.

Escherichia coli O157:H7 serotipi; insan patojeni olarak ilk kez 1982 yılında ABD’de meydana gelen iki ayrı hemorajik kolitis salgını sonucu tanımlanmaya başlamıştır ve en sık izole edilen enterik patojenlerden biridir. E. coli O157:H7 ile infekte olan kişiler asemptomatik olabilir veya kanlı yada kansız diare, hemorajik kolitis (HC), hemolitik üremik sendrom (HUS) ve trombotik trombositopenik purpura (TTP) semptomları gösterebilir. Shiga-benzeri toxin üreten E. coli (STEC), Vero toxin-üreten E.coli (VTEC) olarak da adlandırılır. İnfeksiyonu gıda kaynaklıdır ve sığırlar STEC infeksiyonunun birincil rezervuarı olarak kabul edilmektedir. STEC infeksiyonlarının patogenezinde rol alan en önemli virülens faktörleri, şigatoksinler, hemolizin, intimin yapışma faktörü, pO157 plazmidi ve tip III sekresyon sistemi olarak belirtilmektedir. Bu çalışmada, incelenen 150 süt ve 150 dışkı örneğinden 2’si süt ve diğer 2’si ise dışkı örneklerinden olmak üzere 4 (%1.3) E. coli O157:H7 izole edildi. Süt örneklerinden izole edilen suşlardan 1’inin VT1 ürettiği belirlendi.

Escherichia coli O157:H7 was first identified as a human pathogen following two geographically separate outbreaks of hemorrhagic colitis in the United States in 1982. E. coli O157:H7 was one of the most frequently isolated enteric pathogen. Persons infected with E. coli O157:H7 may be asymptomatic or symptoms such as diarrhea, bloody diarrhea, hemorrhagic colitis (HC), hemolytic-uremic syndrome, and thrombotic thrombocytopenic purpura may be observed. Infections caused by Shiga-like toxin-producing E. coli (STEC), also known as Vero toxin-producing E. coli (VTEC), in humans is food-borne and infected cattle act as a primer reservoir for STEC infection. The most important virulence factors which act role in the pathogenesis of STEC infections are reported as shiga toxins, hemolysin, intimin adherence factor and type III secretion system. In this study, 4 (1.3%) E. coli O157:H7, two of them were from milk samples and the other two from faeces samples were isolated from 150 milk samples and 150 faeces samples. We determined that one strain isolated from milk samples produced VT1.
Klorprifos’un ratlarda ince bağırsak üzerine etkisi ve kuersetin ve kateşin’in koruyucu rolü
Chlorpyrifos induced small intestine toxicity in rats and protective role of quersetin and catechin
Yazar: Özmen, Feriha; Uzun, Fatma Gökçe; Demir, Filiz; Ulusoy, Yavuz
Dergi: Etlik Veteriner Mikrobiyoloji Dergisi, Vol. 21 No. 2, 2010
Anahtar kelimeler: Veterinary Surgery ; Veteriner Cerrahi ; Yavuz ULUSOY,Filiz DEMİR,Fatma Gökçe UZUN,Feriha ÖZMEN,2010,Kateşin,klorprifos,kuersetin,histopatoloji,ince bağırsak.,Etlik Veteriner Mikrobiyoloji Dergisi ; Catechin,chlorpyrifos,histopathology,quercetin,small intestine.

Bu çalışmada organofosfatlı bir pestisit olan ve yaygın olarak kullanılan klorprifos’un ratların ince bağırsakları üzerine olumsuz etkileri ve kuersetin ve kateşin’in bağırsakları koruyucu özelliği araştırıldı. Bu amaçla erkek ratlara klorprifos (5.4 mg/kg 1/25 LD50), kateşin (20 mg/kg), kuersetin (20 mg/kg), kateşin(20 mg/kg) + klorprifos (5.4 mg/kg 1/25 LD50) ve kuersetin (20 mg/kg) + klorprifos (5.4 mg/kg 1/25 LD50) kombinasyonları oral olarak dört hafta süre ile uygulandı. Uygulamadan dört hafta sonra ratların ince bağırsak dokuları histopatolojik incelemeler için alındı ve ışık mikroskobunda kontrol grubu ile kıyaslamalı olarak incelendi. Kateşin ve kuersetin uygulanan gruplar ile kontrol grubu ratların ince bağırsak dokularında histolojik olarak farklılık gözlenmedi. Klorprifos uygulanan ratların ince bağırsak dokusunda villuslarda atrofi, nekroz ve muskular mukozada ödem gözlendi. Kateşin + klorprifos ve kuersetin + klorprifos uygulanan gruplarda mikroskobik bulguların hafif şiddette olduğu gözlendi. Sonuç olarak kateşin ve kuersetinin, klorprifosun meydana getirdiği hasarı azalttığı tespit edildi.

In this study we investigated that chlorpyrifos which is a widely used an organophosphorous pesticide induced small intestine toxicity and protective role of quersetin and catechin. For this reason, chlorpyrifos (5.4 mg/kg 1/25 LD50), catechin (20 mg/kg), quercetin (20 mg/kg), catechin (20 mg/kg) + klorprifos (5.4 mg/kg 1/25 LD50) and quercetin (20 mg/kg) + chlorpyrifos (5.4 mg/kg 1/25 LD50) were given to male rats orally for four weeks. At the end of fourth week, histopathological changes in the small intestine tissues were investigated using light microscope comparatively with control group. At the end of the 4th week, there were no histopathological changes between the catechin-treated and quercetin-treated groups compared to the control group. After four weeks of chlorpyrifos exposure shortening and necrosis in intestinal villi and edema in muscular mucosa were observed in the small intestine tissues. Milder histopathological changes were observed in animals co-treated with catechin plus chlorpyrifos or quercetin plus chlorpyrifos. As a result, it appears that catechin and quercetin moderated chlorpyrifos-induced toxicity.
Sığır ve koyun brusellozisinin serolojik teşhisinde konvansiyonel testler ile Kompetitif-ELISA’nın karşılaştırılması
Comparison of conventional tests with Competitive-ELISA in serological diagnosis of bovine and ovine brucellosis
Yazar: Dakman, Asiye; Küçükayan, Uğur; Ülker, Ufuk; Müştak, H. Kaan
Dergi: Etlik Veteriner Mikrobiyoloji Dergisi, Vol. 21 No. 2, 2010
Anahtar kelimeler: Veterinary Surgery ; Veteriner Cerrahi ; H. Kaan MÜŞTAK,Ufuk ÜLKER,Uğur KÜÇÜKAYAN,Asiye DAKMAN,Brucella,Kompetatif-ELISA,koyun,sığır.,2010,Etlik Veteriner Mikrobiyoloji Dergisi ; Brucella,cattle,Competitive-ELISA,sheep.

Bu çalışmada Brucella S19 genç aşısı ile aşılanan danalar ile Brucella spp. ile infekte sığırlar ve Brucella Rev1 genç aşısı ile aşılanmış kuzular ile Brucella spp. ile infekte koyunlara ait kan serumları; konvansiyonel testler ve Kompetatif-ELISA (C-ELISA) ile incelenerek, oluşan humoral immun yanıt değerlendirilmiştir. Doğal infekte sığırların %94’ü Rose Bengal Plate Test (RBPT), %98’i Serum Aglütinasyon Test (SAT), %92’si Komplement Fikzasyon Test (CFT) ve %95’i C-ELISA ile pozitif bulunmuştur. Aşı yapılan danalara ait antikor titrelerinde test zamanlarına göre testler arasında farklılıklar meydana gelmiştir. Doğal infekte koyunların %91.16’sı RBPT, %91.16’sı SAT, %85.63’ü CFT ve %86.74’ü C-ELISA ile pozitif bulunmuştur. Sonuç olarak brusellozisin teşhisinde, C–ELISA’nın özellikle CFT’ye alternatif olarak kullanılabileceği gösterilmiştir.

In this study, blood sera from calves vaccinated with Brucella S19 vaccine and cattle infected by Brucella spp. and lambs vaccinated with Brucella Rev1 vaccine and sheep infected by Brucella spp. were tested with conventional tests and Competitive-ELISA (C-ELISA) in order to evaluate the humoral immune response. In naturally infected cattle group, 94% with Rose Bengal Plate Test (RBPT), 98% with Serum Agglutination Test (SAT), 92% with Complement Fixation Test (CFT) and 95% with C-ELISA were found positive. Differences between the tests were found in antibody titers on the basis of testing times. In naturally infected sheep group, 91.16% with RBPT, 91.16% with SAT, 85.63% with CFT and 86.74% with C-ELISA were found positive. It was concluded that, in the diagnosis of brucellosis C-ELISA could be used as an alternative test especially to CFT.
Laktasyon dönemindeki Merinoslarda ve Ile de France × Akkaraman melezlerinde yapağı iz element (Fe, Cu, Zn, Mn, Co, Se) düzeyleri
Wool trace element (Fe, Cu, Zn, Mn, Co, Se) levels in lactation period in Merinos and Ile de France × Akkaraman sheeps
Yazar: Bektaş, Gizem Işıl; Altıntaş, Arif
Dergi: Etlik Veteriner Mikrobiyoloji Dergisi, Vol. 21 No. 2, 2010
Anahtar kelimeler: Veterinary Surgery ; Veteriner Cerrahi ; Arif ALTINTAŞ,Gizem Işıl BEKTAŞ,2010,Akkaraman × Ile de France melezi,iz element,koyun,merinos,yapağı.,Etlik Veteriner Mikrobiyoloji Dergisi ; Akkaraman × Ile de France hybrid,merinos,sheep,trace element,wool.

Çalışmada, Ankara Polatlı ilçesine bağlı TİGEM tarım işletmesinde birbirine yakın yaşta, aynı bakım-besleme ve hijyen şartlarındaki 30 baş Merinos ve 30 baş Akkaraman × Ile de France (G2 melezi) koyundan materyal olarak yararlanılmıştır. Laktasyonun ilk ayında (Mart) iki ırktan 30’ar adet olmak üzere, toplam 60 adet yapağı örneği hayvanların sırt-yan bölgelerinden dipten kesilerek toplanmıştır. Alınan yapağı örnekleri mikrodalga fırında yakılmış ve Mn, Co ve Se analizleri GF-AAS ile Fe, Cu, Zn, analizleri FL-AAS cihazı ile gerçekleştirilmiştir. Merinoslarda ve Akkaraman melezlerinde yapağı iz element ortalama değerleri (ppm) sırasıyla Cu için 19.35±15.16 ve 12.18±9.86; Zn için 68.46±13.19 ve 73.35±15.62; Fe için 107.69±87.47 ve 94.39±65.91; Se için 7.07±4.96 ve 3.75±1.89; Mn için 3.31±2.02 ve 4.26±1.80; Co için 1.22±2.68 ve 0.36±0.63 olarak hesaplanmıştır. Laktasyondaki her iki ırkta da yapağı Cu, Zn, Fe ve Co düzeyleri normal, Se düzeyi yüksek, Mn düzeyleri ise düşük bulunmuş ve yapağı değerlerinin özellikle Se ve Mn açısından rasyon iz element içeriğini tam olarak yansıttığı ve Akkaraman melezlerinin özellikle Cu, Zn ve Co yetersizliklerine meyilli oldukları kanaatine varılmıştır. Çalışma sonunda; Merinos yapağılarının özelikle Cu ve Se yönünden Ile de France × Akkaraman melezlerine ait değerlerden önemli düzeyde yüksek olduğu (p

Ankara Polatlı in TIGEM the Merinos and Ile de France × Akkaraman (G2 hybrid) sheep which has close together in age, nutrition and the maintenance of hygienic conditions, 30 pieces from Merinos and 30 pieces from Ile de France × Akkaraman (G2 hybrid) at the beginning of lactation wool samples were collected. Received wool, feed and water samples were digested with the appropriate method in microwave oven; Fe, Cu and Zn analysis FL-AAS, Se, Mn and Co analysis were also in GF-AAS. Mean values of trace elements in Merino and Akkaraman hybrids wool (ppm), respectively for Cu 19.35±15.16 and 12.18±9.86; for Zn 68.46±13.19 and 73.35±15.62; for Fe 107.69±87.47 and 94.39±65.91; for Se 7.07±4.96 and 3.75±1.89; for Mn 3.31±2.02 and 4.26±1.80; for Co 1.22±2.68 and 0.36±0.63 were calculated. In lactation both races wool Cu, Zn, Fe and Co levels in normal, Se levels high and Mn levels were lower and wool Mn and Se levels correctly reflects the ration of Se and Mn content was concluded. At the end of study, Merino wool especially in terms of the Cu and Se (respectively 19.35±15.16 and 7.07±4.96 ppm) was significantly higher than (p
Sığır karkas orijinli Escherichia coli O157 izolatlarının rastgele çoğaltılmış polimorfik DNA-polimeraz zincir reaksiyonu ile genotiplendirilmesi
Genotyping of beef carcass isolates of Escherichia coli O157 by random amplified polymorphic DNA-polymerase chain reaction
Yazar: Onuk, Ertan Emek; İnat, Gökhan; Fındık, Arzu; Çelikel, İnci Ülkü; Çiftci, Alper
Dergi: Etlik Veteriner Mikrobiyoloji Dergisi, Vol. 21 No. 2, 2010
Anahtar kelimeler: Veterinary Surgery ; Veteriner Cerrahi ; Escherichia coli O157,genotyping,primer annealing temperature,RAPD-PCR. ; Alper ÇİFTCİ,İnci Ülkü ÇELİKEL,Arzu FINDIK,Ertan Emek ONUK,Gökhan İNAT,Escherichia coli O157,genotiplendirme,primer bağlanma ısısı,RAPD-PCR.,2010,Etlik Veteriner Mikrobiyoloji Dergisi

Bu çalışma, sığır karkas orijinli 32 adet Escherichia coli O157 izolatının iki farklı random primerin (M13 ve ERIC2) kullanıldığı rastgele çoğaltılmış polimorfik DNA-polimeraz zincir reaksiyonu (RAPD-PCR) metodu ile genotiplendirilmesi ve farklı primer bağlanma ısılarının (32, 36, 38 ve 40°C) RAPD bant paternleri üzerine etkisinin değerlendirilmesi amacıyla yapılmıştır. İzolatlar M13 primeri ile 7, ERIC2 primeri ile 5 farklı genotip içerisinde dağıldı. Çalışmada kullanılan primer bağlanma ısılarının RAPD bant paternlerinin çeşitliliğini dikkate değer bir şekilde etkilemediği görüldü. Sonuç olarak E. coli O157 izolatları arasındaki çeşitliliklerin belirlenmesinde M13 primerinin daha uygun olduğu ve epidemiyolojik çalışmalarda kullanılabilir olduğu belirlendi.

This study was performed to genotype 32 E. coli O157 isolates originating from bovine carcasses by random amplified polimorphic DNA-polymerase chain reaction (RAPD-PCR) methods using two different random primers (M13 and ERIC2) and to evaluate the effect of the different (32, 36, 38 and 40°C) annealing temperatures on RAPD band patterns. Isolates were distributed into 7 and 5 different genotypes using M13 and ERIC2 primers, respectively. It was observed that different annealing temperatures used in this study had not considerable effect on RAPD band variability. In conclusion, it was determined that M13 primer was more convenient to detect genetic variability among E. coli O157 isolates and was useful in epidemiological studies.
Kedi ve köpeklerde üropatojenik Escherichia coli infeksiyonları
Uropathogenic Escherichia coli infections in cats and dogs
Yazar: İzgür, Müjgan; Babacan, Orkun
Dergi: Etlik Veteriner Mikrobiyoloji Dergisi, Vol. 21 No. 2, 2010
Anahtar kelimeler: Veterinary Surgery ; Veteriner Cerrahi ; E. coli,kedi,köpek,üropatojenik.,2010,Müjgan İZGÜR,Orkun BABACAN,Etlik Veteriner Mikrobiyoloji Dergisi ; Cat,dog,E. coli,uropathogenic.

Üriner sistem infeksiyonlarına neden olan Escherichia coli suşları üropatojenik E. coli (UPEC) veya ekstraintestinal patojenik E. coli (ExPEC) olarak isimlendirilirler. Üropatojenik E. coli’ler insan ve hayvanlarda özellikle de kedi ve köpeklerde fırsatçı patojen olarak çeşitli hastalıklara neden olurlar. E. coli üriner sistem infeksiyonlarında en sık rastlanan patojendir. Üropatojenik E. coli’lerin bilinen genel özelliklerinin yanı sıra patogeneziste rol oynayan virülens faktörleri, serum direnci ve antijenik özellikleri bulunmaktadır.

Escherichia coli strains that cause urinary tract infections are named as uropathogenic E. coli (UPEC) or extraintestinal pathogenic E. coli (ExPEC). Uropathogenic E. coli is an opportunistic pathogen in human and animals especially in dogs and cats. E. coli is the most commonly isolated agent from urine of dogs and cats with urinary system infection. Besides the general features of known, uropathogenic E. coli has serum resistance, virulence factors and antigenic factors. These factors also play a role in pathogenesis.