Sapanca Gölü (Sakarya) Havzası Toprak ve Sedimentlerinden Streptomyces Cinsi Bakterilerin İzolasyonu, Karakterizasyonu ve Teşhisi
Sapanca Gölü (Sakarya) Havzası Toprak ve Sedimentlerinden Streptomyces Cinsi Bakterilerin İzolasyonu, Karakterizasyonu ve Teşhisi
Yazar: Özdemir, Kerem; Ünal, Dilara Hande
Dergi: Bitlis Eren Üniversitesi Fen Bilimleri Dergisi, Vol. 8 No. 3, 2019
Anahtar kelimeler: Streptomyces,16S rDNA

Buçalışmada, Sakarya ili sınırlarında bulunan Sapanca Gölü havzası toprak vesedimentlerinden Streptomyces cinsibakterileri izole edilerek karakterizasyon ve teşhisi yapılmıştır. Toplam 6farklı lokaliteden alınan 12 toprak numunesinin fiziko-kimyasal analizleriyapılmış ve pH’larının 6,12 ile 7,58 değerleri arasında olduğu saptanmıştır.Saflaştırılan 60 Streptomyces izolatıhavasal, misel ve difüziye pigment rengi esas alınarak 4 ana gruba ayrılmıştır.Streptomyces izolatlarına,antibiyotik duyarlılığı, degredasyon aktivitesi, büyüme, azot ve karbon kaynağıkullanımı testleri uygulanmıştır. Tüm izolatların fenotipik ve biyokimyasalkarakterleri belirlenerek IDENTAX bilgisayar programına bu veriler aktarılmış,cins içerisindeki pozisyonları belirlenerek teşhisleri yapılmıştır. Teşhisedilenler türler arasında Streptomyces cyaneus, Streptomyces filipinensis,Streptomyces exfoliatus, Streptomyces chromogenus, Streptomyces chromofuscus,Streptomyces griseoruber, Streptomyces antibioticus, Streptomyces lydicus,Streptomyces lavendulae ve Streptomyces purpureus türleribulunmaktadır. Teşhisleri tamamlanan Streptomycesizolatlarının test sonuçları MVSP 3.2 bilgisayar programı ile birbirleriarasındaki benzerlik dendogramları oluşturulmuştur. Renk kümelerini temsilenseçilen 4 suşun DNA izolasyon ve dizi analizleri yapılmış ve 27F ile 1492Revrensel primerleri kullanılarak 16S rDNA geni kısmi olarak PCR ileçoğaltılmıştır. Bu dört bakterinin GenBank veri tabanındaki türlerle olanakrabalık dereceleri ve genetik pozisyonları dendogramlar şeklinde ortayakonmuştur.

Buçalışmada, Sakarya ili sınırlarında bulunan Sapanca Gölü havzası toprak vesedimentlerinden Streptomyces cinsibakterileri izole edilerek karakterizasyon ve teşhisi yapılmıştır. Toplam 6farklı lokaliteden alınan 12 toprak numunesinin fiziko-kimyasal analizleriyapılmış ve pH’larının 6,12 ile 7,58 değerleri arasında olduğu saptanmıştır.Saflaştırılan 60 Streptomyces izolatıhavasal, misel ve difüziye pigment rengi esas alınarak 4 ana gruba ayrılmıştır.Streptomyces izolatlarına,antibiyotik duyarlılığı, degredasyon aktivitesi, büyüme, azot ve karbon kaynağıkullanımı testleri uygulanmıştır. Tüm izolatların fenotipik ve biyokimyasalkarakterleri belirlenerek IDENTAX bilgisayar programına bu veriler aktarılmış,cins içerisindeki pozisyonları belirlenerek teşhisleri yapılmıştır. Teşhisedilenler türler arasında Streptomyces cyaneus, Streptomyces filipinensis,Streptomyces exfoliatus, Streptomyces chromogenus, Streptomyces chromofuscus,Streptomyces griseoruber, Streptomyces antibioticus, Streptomyces lydicus,Streptomyces lavendulae ve Streptomyces purpureus türleribulunmaktadır. Teşhisleri tamamlanan Streptomycesizolatlarının test sonuçları MVSP 3.2 bilgisayar programı ile birbirleriarasındaki benzerlik dendogramları oluşturulmuştur. Renk kümelerini temsilenseçilen 4 suşun DNA izolasyon ve dizi analizleri yapılmış ve 27F ile 1492Revrensel primerleri kullanılarak 16S rDNA geni kısmi olarak PCR ileçoğaltılmıştır. Bu dört bakterinin GenBank veri tabanındaki türlerle olanakrabalık dereceleri ve genetik pozisyonları dendogramlar şeklinde ortayakonmuştur.