hakansabunis/tr-academic-research-agent-index huggingface dataset:
Istranca (Yıldız) Dağları,  Kırklareli / Dereköy Bölgesinde Ornitolojik Gözlemler
Ornithologıcal Observations in Strandzha Mountains, Kırklareli-Dereköy
Yazar: Kaya, Mustafa
Dergi: Iğdır Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Dergisi, Vol. 13 No. 4, 2023
Anahtar kelimeler: Structural Biology ; Yapısal Biyoloji ; Kuş,Göç,Istranca Dağı,Kırklareli ; Bird,Migration,Strdanzha Mountains,Kırklareli

Bu araştırma, Kırklareli’ne bağlı Dereköy ve Karadere Köyü sınırları içerinde kalan ve Bulgaristan sınırında yer alan Istranca (Yıldız) Dağları’nda yapılan bu çalışmada, Istranca Dağlarının Ornitofaunasının ve Göç hareketliliğinin araştırılması amaçlanmıştır. Bu amaçla bölgede Mart 2020 – Şubat 2021 tarihleri arasında aylık periyotlar halinde nokta gözlem ve hat boyu gözlem yöntemi kullanılarak 60 günlük gözlem yapılmıştır. Gözlemler sonucu 134 kuş türü tespit edilmiştir. Tespit edilen 99 türe üreme kodu verilmiştir. Tespit edilen 134 kuş türünden süzülen göçmen türlerden 22’sinin Mart 2020 – Haziran 2020 tarihleri arasında, 23’ünün ise Ağustos 2020 – Kasım 2020 tarihleri arasında araştırma sahası ve yakın çevresi üzerinden göç ettikleri tespit edilmiştir. Tespit edilen türlerde 62  tür (%46.26) yerli tür (Y), 48 tür (% 35.82) YG yaz göçmeni (YG), 14 tür (% 10.44) kış göçmeni (KG), 10 tür (% 7.46) ise transit geçen tür (T) olarak tespit edilmiştir. Kuşların statüleri IUCN, CITES, BERN, MAK’a göre değerlendirilmiştir. Tespit edilen bu kuş türlerine ait detaylı bilgiler bir tablo halinde verilmiştir. Elde edilen sonuçlar, çalışma alanının kuşlar için üreme, barınma, beslenme alanı ve önemli kuş göç yolları üzerinde olduğunu ortaya çıkarmıştır.

This study was performed on Strandzha (Yıldız) Mountains along Bulgarian border including the area within the borders of Dereköy and Karadere of Kırklareli province. A total of 134 bird species were recorded during 60 days observation study carried monthly from March 2020 to February 2021. Among the recorded species, 134 (73.88%) were determined to breed in the region. 22 species were observed to migrate over and near the study region between March 2020 and June 2020 and 23 species from August 2020 to November 2020. Among the recorded species, 62 (%46.26) were native, 48 (35.82%) were summer migrant, 14 (10.44%) were winter migrant, and 10 (7.46%) were transit. Detailed information about the recorded species are presented as a data table. The results showed that the study area, lying over important bird migration routes, served as an important breeding, nesting and feeding area for birds.
Çeltik (Oryza sativa L.)’de Farklı Vermikompost Uygulamalarının Bazı Bitkisel Özellikler Üzerine Etkisi
Effect of Different Vermicompost Applications on Some Plant Characteristics in Paddy (Oryza sativa L.)
Yazar: Yıldırım, Gözde Hafize; Yılmaz, Nuri
Dergi: Iğdır Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Dergisi, Vol. 13 No. 4, 2023
Anahtar kelimeler: Agricultural Engineering ; Ziraat Mühendisliği ; Greenhouse,Paddy,Vermicompost ; Çeltik,Sera,Solucan gübresi

Bu araştırma, farklı solucan gübresi uygulamasının ve dozlarının, çeltik bitkisinde bazı bitkisel özelliklere etkisinin belirlenmesi amacıyla yapılmıştır. Çalışmada yapraktan ve topraktan olmak üzere iki farklı uygulama ve dört farklı doz; (0.5-1-2-3 litre sıvı gübre/100 litre su) üç farklı çeltik çeşidinde (Osmancık-97, Aslı ve Terme Baldo) uygulanmıştır. Çalışma serada ve 21.9 litrelik (35 cm çap 30 cm yükseklik) plastik saksılarda (30 tohum/saksı) kurulmuştur. Deneme tesadüf parsellerinde faktöriyel deneme desenine göre 3 tekrarlı olarak yürütülmüştür. Çalışma sonucunda bitki boyu 41.81-57.19 cm, sap sayısı 19.33-26.67 adet, bitki yaş ağırlığı 70.00-113.33 g., salkım sayısı 18.00-25.67 adet, salkım yaş ağırlığı 1.88-4.23 g., salkım kuru ağırlığı 0.10-0.31 g., salkım boyu 7.17-11.64 cm., sap yaş ağırlığı 6.63-28.33 g, sap kuru ağırlığı 6.17-13.88 g, yaprak sayısı 3.03-3.73 adet, yaprak yaş ağırlığı 11.93-25.00 g., yaprak kuru ağırlığı 11.70-19.38 g, gövde çapı 3.78-5.69 mm ve salkımda tane sayısı 33.93-52.33 adet olarak tespit edilmiştir. Elde ettiğimiz bulgulara göre, solucan gübresinin çeltik bitkisinde bazı bitkisel özelliklerin artmasına neden olduğu ancak yapraktan ya da topraktan yapılan uygulama şekillerinin ise etkili olmadığı görülmüştür.

The study was conducted to determine the effects of different applications and doses of worm manure on some plant characteristics of paddy. Two different applications, foliar and soil, and four different doses (0.5-1-2-3 liters of liquid fertilizer/100 liters of water) were applied in three different paddy varieties (Osmancık-97, Aslı and Terme Baldo). The study was conducted in a greenhouse in 21.9-liter (35 cm diameter x 30 cm height) plastic pots (30 seeds/pot). The trial was carried out in a factorial experiment design with three replications in randomized plots. As a result of the study, plant height was determined to be 41.81-57.19 cm, stem number was 19.33-26.67, plant fresh weight was 70.00-113.33 g, panicle number was 18.00-25.67, panicle fresh weight was 1.88-4.23 g, panicle dry weight was 0.10-0.31 g, panicle length was 7.17-11.64 cm, stem fresh weight was 6.63-28.33 g, stem dry weight was 6.17-13.88 g, leaf number was 3.03-3.73, leaf fresh weight was 11.93-25.00 g, leaf dry weight was 11.70-19.38 g, stem diameter was 3.78-5.69 mm, and the number of grains per panicle was 33.93-52.33. According to the findings, worm manure increased some plant characteristics in paddy plants, but the application methods, foliar or soil, were not effective.
(𝓕,𝒉) Üst Sınıfı Aracılığıyla (𝝍,𝝋) Zayıf Büzülme Dönüşümleri Üzerine Bir Çalışma
A Study on (𝝍,𝝋) Weakly Contractive Mapping via (𝓕,𝒉) Upper Class
Yazar: Yolacan, Esra
Dergi: Iğdır Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Dergisi, Vol. 13 No. 3, 2023
Anahtar kelimeler: Mathematical Sciences ; Matematik ; fixed point,Branciari metric space,(F,h) Upper class ; sabit nokta,Branciari metrik uzayı,(F,h) Üst Sınıfı

Branciari, metrik uzaydaki iki terimli üçgen eşitsizliğini üç terimli dörtgen eşitsizliğiyle yer değiştirerek yeni bir mesafe fonksiyonu oluşturmak için metrik kavramını yeniden yapılandırdı. Tanımlanan bu fonksiyon literatürde dikdörtgensel metrik ya da genelleştirilmiş metrik olarak adlandırılır. Ansari tarafından ortaya konulan üst sınıf dönüşümü temel alınarak Branciari metrik uzayında üst sınıf tip II aracılığıyla zayıf büzülmeli dönüşümlerin bir genellemesi verildi. Sonraki aşamada ise bir çizge vasıtasıyla Branciari metrik uzayında grafik zayıf büzülmeli dönüşümler için yeni sabit nokta sonuçlarını ispat etmek amacıyla burada bir uygulama verildi. Son olarak çalışılan dönüşüm için ana sonuçlarımızı destekleyen bir örnek gösterildi.

Branciari reorganized the notion of metric to attain a novel distance function by replacing the triangular inequality with the quadrilateral inequality. The reorganized metric function was said rectangular metric in some resources, or general metric in some others. Ansari introduced a more general function so-called upper class. Inspired and motivated by this facts, we give an extansion of weakly contractive mapping via upper class type II in the setting of Branciari metric space. An application is given here to prove new fixed point results for graphic weakly contractive mappings in Branciari metric space endowed with a graph. Moreover, we derive an example in support of our main results.
Kademeli Bir Dalgıç Pompa Performansının Deneysel ve Sayısal Olarak Karşılaştırılması
Experimental and Numerical Comparison of the Multistage Submersible Pump Performance
Yazar: Doğan, Sercan; Yağmur, Sercan
Dergi: Iğdır Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Dergisi, Vol. 13 No. 4, 2023
Anahtar kelimeler: Mechanical Engineering ; Makine Mühendisliği ; DalgıçPompa,HAD,Difüzör,RealizableK-ε ; SubmersiblePump,CFD,Diffuser,RealizableK-ε

Bu çalışmada bir dalgıç pompa performansının deneysel ve sayısal analiz çalışmaları yapılmıştır. Öncelikle performans deneyleri firmada bulunan test düzeneğinde en verimli çalışma noktası 140 m3/h debi olan dört kademeli bir pompa ile yapılmıştır. Daha sonra Hesaplamalı Akışkanlar Dinamiği ile aynı pompanın dört kademeli modeli için sayısal çalışmalar yapılmıştır. Çalışmada farklı debiler için pompaya ait basma yüksekliği ve verim değerleri hesaplanmıştır. Ayrıca, sayısal analiz sonuçları için pompa kesitinde meydana gelen hız ve basınç değişimleri görsel olarak sunulmuştur. Sonuç olarak, dalgıç pompa optimum çalışma noktası olan 140 m3/h debide, deneysel ve sayısal sonuçlar arasındaki fark basma yüksekliğinde yaklaşık %3.15 mertebesinde iken, verimde %9 civarındadır. Literatüre kazandırılan sonuçlar verim ve basma yüksekliği eğrilerinin birbirleri benzerliği nedeniyle ticari ve akademik çalışmalarda doğrulama amaçlı kullanılacak niteliktedir.

In this study, experimental and numerical analysis studies of a submersible pump performance were carried out. First of all, the performance tests were carried out with a four-stage pump with the most efficient operating point of 140 m3/h in the test setup in the company. Then, numerical studies were made for the four-stage model of the same pump with Computational Fluid Dynamics. In the study, the head and efficiency values of the pump were calculated for different flow rates. In addition, the velocity and pressure changes in the pump section are presented visually for the numerical analysis results. As a result, at 140 m3/h flow rate, which is the optimum operating point of the submersible pump, the difference between the experimental and numerical results is about 3.15% in head, while it is around 9% in efficiency. The results brought to the literature are of the quality to be used for validation in commercial and academic studies due to the similarity of efficiency and head curves.
Kalkon Türevlerinin Antikanser Mekanizmaları
Anticancer Mechanisms of Chalcone Derivatives
Yazar: Yıldız, Yaren; Arı, Ferda
Dergi: Iğdır Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Dergisi, Vol. 13 No. 3, 2023
Anahtar kelimeler: Structural Biology ; Yapısal Biyoloji ; Flavonoid,Chalcones,Anti-Cancer,Cytotoxicity ; Flavanoid,Kalkonlar,Anti-Kanser,Sitotoksisite

Kanser; hücrelerin kontrolsüz çoğalmalarına, immün sistemin gözetiminden kaçmalarına ve uzaktaki dokuları istila ederek yayılmalarına yol açan, metabolik değişiklikler geçirdikleri bir süreçtir. Hayatı boyunca her beş kişiden biri, yaşamının bir döneminde kansere yakalanmaktadır. Geliştirilmiş olan tüm tedavi yöntemlerine rağmen, hala kanserin neden olduğu ölümler gelişmiş toplumlarda ikinci sırada yer almaktadır. Kemoterapik tedavilerde kanser hücresinin farklı metabolik yolaklarına etki eden çok çeşitli ilaçlar kullanılmaktadır. Anti-neoplastik özelliği ile bilinen paklitaksel ve dosetaksel gibi birçok bitkisel kökenli anti-kanser ilaç klinikte kullanılmaktadır.  Bitkisel kökenli kemoterapötik ajanların çeşitli kanser türlerine karşı tedavi olanakları araştırılmaya devam edilmektedir. Son dönemlerde yapılan çalışmalarda, kanser tedavisinde farklı moleküler yolakları hedefleyebilen flavonoid bazlı bileşikler sentezlenmiştir. Flavonoid ailesine ait olan kalkonlarında farklı biyolojik etkilerinin yanı sıra anti-kanser aktiviteye sahip oldukları belirlenmiştir. Kalkon bileşiklerinin etki mekanizmasını ortaya çıkarmak için bilimsel araştırmalar devam etmektedir. Bu derlemede, kalkon türevlerinin anti-proliferasyon, apoptoz indüksiyonu, mikrotübül polimerizasyonu, anti-anjiyogenezis ve hücre döngüsünün durdurulması gibi mekanizmalar yoluyla anti-kanser rollerinden bahsedilmektedir.

Cancer; It is a process in which cells undergo metabolic changes that cause them to proliferate uncontrollably, escape the surveillance of the immune system, and spread by invading distant tissues. One out of every five people will develop cancer at some point in their life. Despite all the treatment methods that have been developed, deaths caused by cancer still rank second in developed societies. A wide variety of drugs are used in chemotherapy treatments that affect different metabolic pathways of cancer cells. Many herbal anti-cancer drugs such as paclitaxel and docetaxel, which are known for their anti-neoplastic properties, are used in the clinic. Treatment possibilities of herbal chemotherapeutic agents against various types of cancer continue to be investigated. In recent studies, flavonoid-based compounds that can target different molecular pathways in cancer treatment have been synthesized. It has been determined that chalcones, which belong to the flavonoid family, have anti-cancer activity as well as different biological effects. Scientific research continues to reveal the mechanism of action of chalcone compounds. In this review, the anti-cancer roles of chalcone derivatives through mechanisms such as anti-proliferation, apoptosis induction, microtubule polymerization, anti-angiogenesis and cell cycle arrest are discussed.
Co+2/Klor İleri Oksidasyon Prosesi Vasıtasıyla Bemacid Blue Giderimi, Reaktif Radikallerin Tespiti ve Kinetik Çalışmalar
Bemacid Blue Removal by Co+2/Chlorine Advanced Oxidation Process, Detection of Reactive Radicals and Kinetic Studies
Yazar: Türkyılmaz, Mehmet
Dergi: Iğdır Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Dergisi, Vol. 14 No. 1, 2023
Anahtar kelimeler: Environmental Engineering ; Çevre Mühendisliği ; Reactive chlorine radicals,Bemacid Blue,BMG kinetic,Co+2 ion activation ; Bemacid Blue,BMG kinetik,Co+2 iyon aktivasyonu,Reaktif klor radikalleri

Çalışmada Bemacid Blue (BB) sentetik tekstil boyasının gideriminde oksidant olarak kullanılan klorun Co+2, Ultraviyole-C (UV-C) ve görünür ışık ile kombinasyonları oluşturularak en etkili proses seçilmiş ve optimizasyonu yapılmıştır. Deneyler sonucunda boya giderim verimi ve işletme maliyeti göz önüne alındığında Co+2/Klor prosesi seçilmiş ve C0: 50 mg/L BB (0.84mM), pH:3, klor: 0.8mM ve Co+2: 50µM 20 dk reaksiyon süresi optimum şartlarında %97.78 giderim verimine ulaşılmıştır. Proseste %46.1 katkı ile •OH en etkin ve baskın radikaldir, ancak reaktif klor radikallerinin (•Cl2-, •Cl ve •ClO (RCS – Reactive Chlorine Species)) %51.68 toplam katkı ile BB gideriminde etkin bir rol oynadığı belirlenmiştir. Optimum şartlarda gerçek tekstil atık suyu ile yapılan çalışmalar sonucunda, dalga boyu taramasında oluşan 1 ve 2 nolu ana piklerde sırasıyla %83.2 ve %88.6 oranında azalma gerçekleşerek etkin bir boya giderimi sağlanmıştır. Bununla birlikte, Behnajady–Modirshahla–Ghanbery (BMG) modeli için korelasyon katsayısı değeri (R2=0.9999), birinci ve ikinci derece modellerden daha yüksek olduğundan BB’nun Co+2/Klor prosesi ile giderimini açıklayan en iyi modeldir.

In the study, the most effective process was selected and optimized by creating combinations of chlorine, which is used as an oxidant in the removal of BB synthetic textile dye, with Co+2, UV-C and visible light. Considering the dye removal efficiency and operating cost as a result of the experiments, the Co+2/Chlorine process was chosen. Under optimum operating conditions (C0: 50 mg/L BB (0.84mM), pH:3, chlorine: 0.8mM and Co+2: 50 µM 20 min reaction time), 97.78% removal efficiency was achieved. In the process, •OH is the most active and dominant radical with 46.1% contribution. However, it was determined that reactive chlorine radicals (•Cl2-, •Cl and •ClO) played an active role in BB removal with a total contribution of 51.68%. As a result of the studies carried out with real textile wastewater under optimum conditions, an effective dye removal was achieved by reducing the main peaks 1 and 2 in wavelength scanning, respectively, by 83.2% and 88.6%. However, since the correlation coefficient value (R2=0.9999) for the Behnajady–Modirshahla–Ghanbery (BMG) model is higher than the first and second order models, it is the best model to explain the removal of BB by the Co+2/Chlorine process.
6 Şubat 2023 Depremlerinde Gözlenen Betonarme Binalardaki Sorunların Hiyerarşik Bir Üçgen ile Açıklanması
Explanation of the Problems in Reinforced Concrete Buildings Observed in the February 6th, 2023 Earthquakes with a Hierarchical Triangle
Yazar: Mertol, Halit
Dergi: Iğdır Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Dergisi, Vol. 13 No. 4, 2023
Anahtar kelimeler: Civil Engineering ; İnşaat Mühendisliği ; Kahramanmaraş,Earthquake,Reinforced concrete building,Hierarchical triangle,Reasons of collapse ; Kahramanmaraş,Deprem,Betonarme bina,Hiyerarşik üçgen,Yıkılma nedenleri

Ülkemiz 6 Şubat 2023 tarihinde, saat 04:17’de merkez üssü Kahramanmaraş’ın Pazarcık ilçesi olan Mw=7.7 büyüklüğünde bir depremle sarsılmıştır. Yaklaşık dokuz saat sonra, saat 13:24’te, bu sefer merkez üssü Kahramanmaraş’ın Elbistan ilçesi olan Mw=7.6 büyüklüğünde ikinci bir deprem oluşmuştur. Depremlerin çevresinde bulunan 11 şehir afet bölgesi kapsamına alınmıştır. Çevre, Şehircilik ve İklim Değişikliği Bakanlığı’nın verilerine göre bölgede 582000 bağımsız bölüm ve 202000 binanın acil yıkılacak, ağır hasarlı veya yıkık olduğu saptanmıştır. Bu makalede, deprem bölgesine yapılan, depremin olduğu gün başlayan ve 5 gün süren incelemeler neticesinde, betonarme binalarda yıkılmaya neden olan sorunlar hiyerarşik bir üçgen şeklinde, önem sırasına göre anlatılmıştır. Yetersiz kenetlenme boyu, etriye uçlarının 135° derece bükülmemesi, malzeme ile ilgili sorunlar, kolon ve kiriş uç bölgelerinde sarılma bölgelerinin bulunmaması, güçlü kiriş-zayıf kolon, vb. sorunların yıkımların önemli bir kısmını oluşturduğu gözlemlenmiştir. Yıkılan yapıların, yapıldıkları dönemde yürürlükte olan deprem yönetmeliklerinin şartlarını yerine getirmediği görülmüştür.

On February 6th, 2023, at 04:17, our country was struck by an earthquake with a magnitude of Mw=7.7. The epicenter was Pazarcık, Kahramanmaraş. About nine hours later, at 13:24, a second earthquake with a magnitude of Mw=7.6 occurred in Elbistan, Kahramanmaraş. After the earthquakes, 11 cities in the region were declared as disaster zones. According to the data of the Ministry of Environment, Urbanization and Climate Change, it has been determined that 582 thousand independent sections and 202 thousand buildings in the region are to be demolished immediately, heavily damaged or demolished. In this article, as a result of the investigations made in the earthquake effected regions, which started on the day of the earthquake and lasted for 5 days, the problems that caused the collapse of reinforced concrete buildings were explained in a hierarchical triangle, in the order of importance. Insufficient development length, end of the stirrups not bent at 135°, problems with the materials, lack of confinement regions at the ends of columns and beams, strong beam-weak column, etc. It has been observed that these problems constitute a significant part of the collapses. It was determined that the collapsed structures did not meet the requirements of the earthquake regulations in effect at the time they were built.
Cu Nanoparçacık İçeren Polikaprolakton Nanofiberlerin Antimikrobiyal Aktiviteleri
Antimicrobial Activities of Polycaprolactone Nanofibers Containing Cu Nanoparticles
Yazar: Sakir, Menekse; Kiremitler, Nuri Burak; Ceylan, Ahmet
Dergi: Iğdır Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Dergisi, Vol. 13 No. 3, 2023
Anahtar kelimeler: Chemical Engineering ; Kimya Mühendisliği ; Cu nanoparçacık,Polikaprolakton,Staphylococcus aureus,Escherichia coli,Antimikrobiyal aktivite ; Cu nanoparticles,Polycaprolactone,Staphylococcus aureus,Escherichia coli,Antimicrobial activity

Askorbik asit ve CTAC yardımı ile ıslak kimyasal yöntem kullanılarak Cu nanoparçacıkların sentezi başarılı bir şekilde gerçekleştirildi. Elektron mikroskobu ile morfolojileri karakterize edilen nanoparçacıkların 578 nm civarında bir absorbans bandına sahip olduğu görüldü. Polikaprolakton (PCL) içerisine homojen bir şekilde dağıtılan Cu nanoparçacıklar ile elektroeğirme yöntemiyle ortalama 624±216 nm çapında nanofiberler elde edildi. PCL/Cu nanofiberlerin Staphylococcus aureus ve Escherichia coli bakterileri ile Candida albicans türü üzerindeki antimikrobiyal aktiviteleri incelendi. Nanolifler, sahip oldukları yüksek yüzey alanı sayesinde kontrol örnekleri ile kıyaslanabilir bir antimikrobiyal zon çaplarına sahip oldukları görüldü. Elde edilen PCL/Cu nanofiberlerin açık yaralarda kullanılan yara bandı veya bandaj gibi malzemelere, tıbbi tekstil ürünlerine entegre edilerek antimikrobiyal aktivitenin engellenmesi açısında faydalı olacağı düşünülmektedir.

The synthesis of Cu nanoparticles was carried out successfully using the wet chemical method with the help of ascorbic acid and CTAC. It was observed that the nanoparticles, whose morphology was characterized by electron microscopy, had an absorbance band of around 578 nm. Nanofibers with an average diameter of 624±216 nm were obtained by electrospinning with Cu nanoparticles homogeneously dispersed in polycaprolactone (PCL). Antimicrobial activities of PCL/Cu nanofibers on Staphylococcus aureus and Escherichia coli bacteria and Candida albicans were investigated. The nanofibers were found to have an antimicrobial zone diameter comparable to the control samples, thanks to their high surface area. The obtained PCL/Cu nanofibers are thought to be useful in preventing antimicrobial activity by integrating into materials such as band-aids or bandages used in open wounds, and medical textiles.
Eber Gölü Prokaryotik Çeşitliliğinin Metagenomik Çalışmasıyla Karakterizasyonu
Characterization of Prokaryotic Diversity in Eber Lake through Metagenomic Analysis
Yazar: Pat, Fahri; Fidan Pedük, Sultan; Akçay, Neşe; Kızıl Pat, Hatice Kübra; Arıcan, Ercan
Dergi: Iğdır Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Dergisi, Vol. 14 No. 1, 2023
Anahtar kelimeler: Structural Biology ; Yapısal Biyoloji ; Hydrobiology ; Hidrobiyoloji ; Prokaryotik çeşitlilik,metagenomik,ekoloji,16s rRNA,İllumina dizileme ; metagenomics,ecology,prokaryotic diversity,illimina Sequencing,16s rRNA

Eber Gölü, Türkiye'de göçmen kuşların geçiş rotası üzerinde yer almakta ve sazlık alanları sayesinde birçok kuş türüne doğal üreme ve yaşam alanı sağlamaktadır. Ülkemizde bu kadar önemli bir göl olmasına rağmen prokaryotik çeşitlilik konusunda yeterli çalışma olmadığı görülmüştür. Metagenomik analiz DNA izolasyonu ile elde edilen mikroorganizmaların türlerini, genetik yapılarını, fonksiyonel rollerini ve insan ile ekolojik sağlık üzerindeki etkilerini belirlemeyi mümkün kılmaktadır. Yeni nesil dizileme (YND), birçok DNA veya RNA örneğinin eşzamanlı olarak yüksek hızda ve yüksek hassasiyetle dizilenmesini mümkün kılan, modern bir DNA/RNA dizileme teknolojisidir. Bu çalışmamızda Eber Gölü'ne ait 16S ribozomal DNA (rDNA) (V3-V4 bölgeleri) dizilerinin metagenomik analizi için yüksek verimli YND yöntemleri kullanılmıştır. Prokaryotik çeşitliliği incelemek amacıyla MOTHUR yazılımı kullanılarak Illumina NovaSeq teknolojisi ile elde edilen dizi verileri analiz edilmiştir. Analizler sonucu Proteobacteria, Verrucomicrobia, Bacteroidetes ve Actinobacteria Şubelerinin baskın olduğu ortaya çıkarılarak Eber Gölü'ndeki prokaryotik çeşitlilik detaylı bir şekilde karakterize edilmiştir.

Eber Lake is located on the migration route of birds in Turkey and provides natural breeding and habitat for many bird species thanks to its reed areas. Despite being such an important lake in our country, there has been insufficient research on prokaryotic diversity. Metagenomic analysis enables the determination of the species, genetic structures, functional roles, and their effects on human and ecological health of microorganisms obtained through DNA isolation. Next-generation sequencing (NGS) is a modern DNA/RNA sequencing technology that allows for the simultaneous high-speed and high-precision sequencing of many DNA or RNA samples. In this study, we used high-throughput NGS methods for metagenomic analysis of 16S ribosomal DNA (rDNA) (V3-V4 regions) sequences from Eber Lake. The obtained sequence data using Illumina NovaSeq technology was analyzed with MOTHUR software to investigate prokaryotic diversity. The analysis revealed that the Proteobacteria, Verrucomicrobia, Bacteroidetes, and Actinobacteria phyla were dominant, and the prokaryotic diversity in Eber Lake was characterized in detail.