Eugenol’ün Fusarium culmorum Üzerindeki Etkilerinin İncelenmesi
Investigation of the Effects of Eugenol on Fusarium culmorum
Yazar: Yörük, Emre; Sefer, Özlem; Sezer, Ayşe Server; Konukcu, Zeynep; Develi, Elif Sedef
Dergi: Iğdır Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Dergisi, Vol. 8 No. 2, 2017
Anahtar kelimeler: Structural Biology ; Yapısal Biyoloji ; Antifungal,FcStua,FcMgv1,Linear growth rate,qPCR ; Antifungal,Doğrusal büyüme oranı,FcStua,FcMgv1,qPCR

Fusarium culmorum küçük daneli tahıllarda ekonomik kayıplara yol açan hastalık etmenlerinden birisidir.Bu çalışmada, arttırılmış eugenol konsantrasyonlarına (0, 200, 400, 800 µg mL-1) maruz bırakılmış F. culmorumF15 izolatında spor üretimi ve doğrusal büyüme oranı belirlendi. İlaveten, eugenol uygulanmış ve uygulanmamışfungal kültürlerde aseksüel üreme ve hücre çeperi yapısının oluşumunda elzem olan FcMgv1 ve FcStuA genlerininanlatımı da test edildi. Üremeyi engelleyen minimum konsantrasyon 400 µg mL-1 eugenol olarak belirlendi.Kontrol ve deney setleri karşılaştırıldığında, spor üretimi ve doğrusal büyüme oranında bilimsel olarak anlamlıazalma belirlendi (p<0.01). Gerçek zamanlı polimeraz zincir reaksiyonu (qPCR) analizlerinde, β-tubulin endojenkontrol olarak kullanıldı ve FcMgv1 ve FcStuA genlerinin anlatımı Eva-Green florofor boyası kullanılarak saptandı.Gen anlatımındaki oransal değişimlerde bilimsel olarak anlamlı farklılıklar (p<0.01) saptandı. Normalizasyonbulguları FcMgv1 ve FcStuA genlerindeki oransal değişimlerin sırasıyla +4.35±0.25 and +2.04±0.13 olduğunugösterdi. qPCR bulguları ayrıca ters transkripsiyon PCR (RT-PCR) analizleri ile doğrulandı. Akridin orange/Etidyum bromür dual boyamasında hücrelerde geç apoptoza rastlanmıştır. Çalışmadan elde edilen bulgulareugenolün potansiyel antifungal etkilere sahip olduğunu ve F. culmorum’un neden olduğu başak yanıklığı ilemücadelede kullanılabileceğini göstermiştir. Bu çalışma saf eugenol bileşiğinin F. culmorum üzerindeki fenotipikve transkriptomik etkilerinin değerlendirilmesini açısından özgün bulgular sunmaktadır.

Fusarium culmorum is one of the causal agents lead to economic loses in small grain cereals. Inthis study, alterations in spore production, and linear growth rates in F. culmorum 15 isolate subjected to increasedconcentrations of eugenol (0, 200, 400, 800 µg mL-1) were examined. Additionally, the and expression of FcMgv1and FcStuA genes which are essential in asexual stage and cell wall structure formation were also examined testedin F. culmorum eugenol treated and non-treated fungal cultures. F15 isolate subjected to increased concentrations ofeugenol (0, 200, 400, 800 µg mL-1). Minimum inhibitory concentration was determined as 400 µg mL-1 eugenol.In comparison of control and experiment sets, there were significantly different (p<0.01) the decrease in sporeproduction and linear growth rate (LGR) were significantly different (p<0.01). In real time polymerase chainreaction (qPCR) analysis, β-tubulin was used as endogenous control and the expression of FcMgv1 and FcStuAgenes were determined by using cDNAs converted from total RNAs of control and experiment sets were usedin Eva-Green fluorophore dyebased real time PCR to examine the FcMgv1 and FcStuA expression. Significantdifferences (p<0.05) were also determined in fold changes in gene expression. Normalization results showed thatfold changes in FcMgv1 and FcStuA genes were as +4.35±0.25 and +2.04±0.13, respectively. qPCR results werealso confirmed via reverse transcription PCR (RT-PCR) analysis. The late apoptosis was detected in the cells byusing acridine orange/ethidium bromide staining. Findings obtained from this study showed that eugenol have thepotential antifungal effects and it could be used in struggling with head blight disease caused by F. culmorum via itsin vitro antifungal effects. This study presents the original data on about is first report to evaluatinge the phenotypicand transcriptomic effects of pure eugenol compound on F. culmorum.