Çeşitli Klinik Enfeksiyonlardan Elde Edilen Staphylococcus aureus Izolatlarında Insersiyon Sekansı IS256’nın Biofilm Oluşumu Üzerine Etkisi
Çeşitli Klinik Enfeksiyonlardan Elde Edilen Staphylococcus aureus Izolatlarında Insersiyon Sekansı IS256’nın Biofilm Oluşumu Üzerine Etkisi = The Role of Insertion Sequence IS256 In Biofilm Formation
Yazar: Us, Ebru; Tekeli, Alper; Dolağçı, İştar; Karahan, Z. Ceren; Sancak, Banu; Hasçelik, Gülşen
Dergi: Ankara Üniversitesi Tıp Fakültesi Mecmuası, Vol. 62 No. 2, 2014
Anahtar kelimeler: Biyofilm, S. aureus, İcaA, İcaD, IS256

Ica (intersellüler adezyon) operonunu kodlayan enzimler tarafından polisakkarit intersellüler  adezin (PIA) üretimi, stafilokoklardaki biofilm gelişiminin şu ana kadar en iyi anlaşılmış  mekanizmasıdır. IS256, ica operonuna geri dönüşümlü olarak eklenmek suretiyle ica operonu  ekspresyonunu ve sonrasında da biyofilm oluşumunu etkileme kapasitesine sahip mobil bir  elemandır. Bu çalışmanın amacı 1998-2004 yılları arasında çeşitli klinik örneklerden elde edilen  207 Staphylococcus aureus izolatında insersiyon sekansı IS256’nın biofilm oluşumu üzerine etkisini  araştırmaktır. 1998-2004 yılları arasında Ankara ve Hacettepe Üniversitelerinde yatan hastalara ait  çeşitli klinik örneklerden elde edilen 207 S. aureus izolatı (kan, kateter, solunum yolu örnekleri,  steril vucut sıvıları, yara, balgam, idrar, püy) çalışmaya dahil edildi. Çalışılan suşların 28’i (%13.5)  metisilin duyarlı (MSSA),133’ü (%64.2) metisilin dirençli (MRSA), 46’sı (%22.2) ise hetero-VISA  (vankomisine heterojen olarak orta duyarlı S. aureus) suşlarını içeren izolatlar idi. Stafilokok kültürlerinden  genomik DNA ekstrakte edildikten sonra amplifikasyon kalıbı olarak kullanıldı. Biyofilm  genleri (icaA, icaD) ve IS256 yı saptamak amacıyla simpleks PCR lar yapıldı. 207 suş içinde icaA  pozitifliği %89.4 (185 izolat), icaD pozitifliği %97.1 (201 izolat), biofilm genlerinin her ikisinin de  pozitifliği: %88.9 (184 izolat), sadece birinin pozitifliği %8.7 (18 izolat) oranında bulundu.Biyofilm  genleri (ica) MRSA ve hVISA izolatlarında, MSSA izolatlarına göre daha yüksek oranda saptandı(p<  0.001). IS256 pozitifliği hVISA suşlarında MRSA’dan, MRSA suşlarında ise MSSA’dan daha yüksek  oranda tesbit edildi (p < 0.001) Biyofilm pozitiflik prevalansı IS256 içeren suşlarda anlamlı derecede  yüksek bulundu (p < 0.001), bu da S. aureus’un klinik izolatlarında IS256’nın ica operonu ekspresyonunu  etkileyerek biyofilm oluşumuna yol açtığını düşündürdü.

Ica (intersellüler adezyon) operonunu kodlayan enzimler tarafından polisakkarit intersellüler  adezin (PIA) üretimi, stafilokoklardaki biofilm gelişiminin şu ana kadar en iyi anlaşılmış  mekanizmasıdır. IS256, ica operonuna geri dönüşümlü olarak eklenmek suretiyle ica operonu  ekspresyonunu ve sonrasında da biyofilm oluşumunu etkileme kapasitesine sahip mobil bir  elemandır. Bu çalışmanın amacı 1998-2004 yılları arasında çeşitli klinik örneklerden elde edilen  207 Staphylococcus aureus izolatında insersiyon sekansı IS256’nın biofilm oluşumu üzerine etkisini  araştırmaktır. 1998-2004 yılları arasında Ankara ve Hacettepe Üniversitelerinde yatan hastalara ait  çeşitli klinik örneklerden elde edilen 207 S. aureus izolatı (kan, kateter, solunum yolu örnekleri,  steril vucut sıvıları, yara, balgam, idrar, püy) çalışmaya dahil edildi. Çalışılan suşların 28’i (%13.5)  metisilin duyarlı (MSSA),133’ü (%64.2) metisilin dirençli (MRSA), 46’sı (%22.2) ise hetero-VISA  (vankomisine heterojen olarak orta duyarlı S. aureus) suşlarını içeren izolatlar idi. Stafilokok kültürlerinden  genomik DNA ekstrakte edildikten sonra amplifikasyon kalıbı olarak kullanıldı. Biyofilm  genleri (icaA, icaD) ve IS256 yı saptamak amacıyla simpleks PCR lar yapıldı. 207 suş içinde icaA  pozitifliği %89.4 (185 izolat), icaD pozitifliği %97.1 (201 izolat), biofilm genlerinin her ikisinin de  pozitifliği: %88.9 (184 izolat), sadece birinin pozitifliği %8.7 (18 izolat) oranında bulundu.Biyofilm  genleri (ica) MRSA ve hVISA izolatlarında, MSSA izolatlarına göre daha yüksek oranda saptandı(p<  0.001). IS256 pozitifliği hVISA suşlarında MRSA’dan, MRSA suşlarında ise MSSA’dan daha yüksek  oranda tesbit edildi (p < 0.001) Biyofilm pozitiflik prevalansı IS256 içeren suşlarda anlamlı derecede  yüksek bulundu (p < 0.001), bu da S. aureus’un klinik izolatlarında IS256’nın ica operonu ekspresyonunu  etkileyerek biyofilm oluşumuna yol açtığını düşündürdü.