hakansabunis/tr-academic-research-agent-index huggingface dataset:
Atmosferik Ortamda Schiff Bazı Pd(II) Kompleksi ile CO2’nin Kimyasal Dönüşümü
Chemical Conversion of CO2 with Schiff Base Pd(II) Complex in Atmospheric Ambient
Yazar: Aytar, Emine
Dergi: Afyon Kocatepe Üniversitesi Fen Ve Mühendislik Bilimleri Dergisi, Vol. 22 No. 6, 2022
Anahtar kelimeler: Küresel Isınma,Schiff Bazı,CO2,Epoksit,Halkalı Karbonat ; Global Warming,Schiff Base,CO2,Epoxide,Cyclic carbonates

Karbon dioksit (CO2) küresel ısınmaya sebep olan başlıca sera gazı olarak kabul edilmektedir. CO2 bol bulunan, ucuz, yanmaz ve toksik olmayan özelliği ile organik sentezlerde karbon kaynağı (C1) olarak dikkat çekmektedir. Ancak CO2 'nin kinetik olarak eylemsiz olma durumu ve termodinamik kararlılık sebebiyle verimli bir şekilde kullanımı zordur. Bu nedenle kimya endüstrisinde CO2 kullanımı sınırlanmaktadır. Bu zorluk etkili ve seçici bir katalizör yardımı ile giderilebilmektedir. CO2’nin formik asit, metan, metanol, amid, karbonat vb. gibi değerli kimyasallara başarılı bir şekilde dönüşümü bilinmektedir. Bu dönüşümler içerisinde özellikle CO2 ve epoksitlerin siklokatılma ile halkalı karbonat sentezi en umut verici olanlarından biri olarak kabul edilmektedir. Bu çalışmada, Schiff bazı ligand ve Pd(II) kompleks sentezi gerçekleştirildi. Bileşiğin yapısı elementel analiz, NMR (1H ve 13C) spektroskopisi, FT-IR spektroskopisi ve UV–vis spektroskopisi yöntemleri ile aydınlatıldı. Daha sonra CO2’nin epiklorhidrin ile halkalı karbonata dönüşümünde Schiff bazı Pd(II) bileşiği katalizör olarak kullanılarak hem atmosferik ortamda hemde reaktör ortamında etkinlikleri araştırıldı. Schiff bazı Pd(II) katalizörünün her iki ortamda da dönüşüme etkisi incelendi.

Carbon dioxide (CO2) is considered to be the major greenhouse gas causing global warming. CO2 draws attention as a carbon source (C1) in organic synthesis with its abundant, cheap, non-flammable and non-toxic properties. However, it is difficult to utilize CO2 efficiently due to kinetic inertness and thermodynamic stability of CO2, which limits the utilization of CO2 in the chemical industry. This difficulty can be overcome with the help of an effective and efficient catalyst. Despite the difficulties, CO2 has been successfully converted into valuable chemicals such as formic acid, methane, methanol, amide, carbonates, etc. Mainly, synthesis of cyclic carbonate by cycloaddition of CO2 and epoxides is considered one of the most promising ways of utilization. In this study, Schiff base ligand and Pd(II) complex synthesis were carried out. The structure of the compound was characterized by elemental analysis, NMR (1H ve 13C) spectroscopy, FT-IR spectroscopy, and UV-vis spectroscopy, methods. Then, the efficiency of the Schiff base Pd(II) compound was used as a catalyst in the conversion of CO2 with epichlorohydrin to cyclic carbonate, both in the atmospheric environment and in the reactor environment. The effect of the Schiff base Pd(II) catalyst on the conversion in both environments was investigated.
Kaya Tuzu ile Deniz Tuzu Stresinin Buğday (Triticum vulgare L.) ve Arpa (Hordeum vulgare L.) Üzerindeki Etkileri
Effects of Rock Salt and Sea Salt Stress on Wheat (Triticum vulgare L.) and Barley (Hordeum vulgare L.)
Yazar: Kara, Ali; Varol, Tuğçe; Elveren, Müjgan; Osma, Etem
Dergi: Afyon Kocatepe Üniversitesi Fen Ve Mühendislik Bilimleri Dergisi, Vol. 23 No. 3, 2022
Anahtar kelimeler: Structural Biology ; Yapısal Biyoloji ; Antioxidant activity,Wheat,Electrolyte leak,Salt stress ; Antioksidan aktivite,Buğday,Elektrolit sızıntı,Tuz stresi

Bu çalışmada kaya tuzu ile deniz tuzunun buğday ve arpa gelişimi üzerindeki etkileri kıyaslanmıştır. Çalışma için 650 g toprağa 4 g arpa ve 5 g buğday tohumu ekilerek üzerleri 100 g toprak ile kaplanmıştır. Çimlenen buğday ve arpalara 50, 100 ve 250 NM olacak şekilde farklı konsantrasyonlarda bir kez kaya tuzu ile deniz tuzu çözeltisi verilmiştir. Bitkiler yetiştirilme sürecinde tarla kapasitesine uygun sulanarak, 15 gün yetiştirildikten sonra hasat edilmiştir. Hasadı yapılan örneklerde elektrolit sızıntı miktarı ile antioksidan aktiviteleri (CAT, SOD, POD) belirlenmiştir. Kontrol örnekleri ile deniz ve kaya tuzunun uygulandığı örnekler arasındaki ilişki SPSS 22 İstatistik Paket Programı’nda istatistiksel olarak değerlendirilmiştir. Örnekler arasında anlamlı farklılıklar olduğu tespit edilmiştir. Sonuç olarak, farklı tuz konsantrasyonlarının uygulandığı örneklerde konsantrasyon artışına bağlı olarak bitkilerin elektrolit sızıntı ile antioksidan aktivitelerinde önemli ölçüde artış gözlenmiştir.

In this study, the effects of rock salt and sea salt on wheat and barley growth were compared. For the study, 4 g barley and 5 g wheat seeds were planted in 650 g soil and covered with 100 g soil. Rock salt and sea salt solution were given to germinated wheat and barley once at different concentrations of 50, 100 and 250 NM. The plants were irrigated according to the field capacity and harvested after 15 days of growing. The amount of electrolyte leakage and antioxidant activities (CAT, SOD, POD) were determined in the harvested samples. The relationship between the control samples and the samples, to which sea and rock salt was applied, was statistically calculated with SPSS 22 Statistical Package Program. Significant differences between the samples were found out. As a result, in the samples where different salt concentrations were applied a significant increase was observed in the electrolyte leakage and antioxidant activities of the plants due to the increase in concentration.
Metalik Madenlerde Topuk Boyutlarındaki Değişimin Gerilme Dağılımına Etkisi
Effect Of Pillar Size Change on Stress Distribution in Metalliferous Mines
Yazar: Yetkin, Mustafa Emre
Dergi: Afyon Kocatepe Üniversitesi Fen Ve Mühendislik Bilimleri Dergisi, Vol. 22 No. 6, 2022
Anahtar kelimeler: Mining Engineering ; Maden Mühendisliği ; Topuk boyutu,Sayısal analiz,Gerilme dağılımı,Metalik maden ; Pillar size,Numerical analysis,Stress distribution,Metalliferous mine

Yeraltı metal madenciliğinde cevher kazanımı sırasında tavanın etkili bir şeklide desteklenmesi ve güvenliğin sağlanması amacıyla üretim alanında cevherlerden oluşan topuklar bırakılmaktadır. Topuk boyutlarının optimum seviyelerde olması cevher kazanımı açısından önemli hale gelmektedir. Gereğinden fazla boyutlarda bırakılacak olan topuk cevher kaybına sebebiyet verecek ve işletmeyi ekonomik yönden olumsuz etkileyecektir. Ayrıca, olması gerekenden az boyutlarda bırakılan topuk ise çalışılan bölgeyi iş güvenliği açısından daha tehlikeli hale getirecektir. Yapılan çalışmada, Phase2D sayısal modelleme programında farklı boyutlarda modellenmiş olan topuklar etrafında meydana gelen gerilmeler hesaplanmış ve topuklar etrafında oluşan gerilme dağılımı dikkate alınarak optimum topuk boyutları önerilmiştir.

For the purpose of effectively supporting the roof and ensuring safety during ore recovery in underground metal mining, pillars composed of ores are left in production area. Optimum pillar sizes are becoming important for ore recovery. The pillar that will be left in more than necessary dimensions will cause loss of ore and will negatively affect the company economically. In addition, the pillar that is left in smaller sizes than it should be will make the working area more dangerous in terms of work safety. In the study, stresses occurring around pillars modeled in different sizes are calculated in Phase2D numerical modeling program and optimum pillar sizes are proposed considering the stress distribution that are occured surround of pillars.
Laktik Asit Bakterilerinin (LAB) Citrobacter spp. İzolatlarına Karşı Antimikrobiyal ve Antibiyofilm Aktivitelerinin Değerlendirilmesi
Evaluation of Antimicrobial and Antibiofilm Activities of Lactic Acid Bacteria (LAB) Against Citrobacter spp. Isolates
Yazar: Korcan, Safiye Elif; Erdoğmuş, Sevim Feyza; Erik, Mine; Ünal, Arzu; Kenar, Beytullah
Dergi: Afyon Kocatepe Üniversitesi Fen Ve Mühendislik Bilimleri Dergisi, Vol. 23 No. 1, 2022
Anahtar kelimeler: Antibiotic resistance,Biofilm,Citrobacter spp.,Lactic Acid Bacteria ; Antibiyobiyotik direnci,Biyofilm,Citrobacter spp.,Laktik Asit Bakterileri

Bu çalışmanın amacı; Citrobacter izolatlarına karşı laktik asit bakterilerinin antimikrobiyal ve antibiyofilm aktivitelerini belirlemektir. Bu çalışmada kullanılan Citrobacter izolatları (C1, C2, C3) BD PhoenixTM otomasyon sistemi ile Citrobacter braakii olarak tanımlanmıştır. Biyofilm oluşumu Kongo kırmızılı agar ve mikrotitrasyon plak metodu kullanılarak incelenmiştir. Antibiyogram test sonuçlarına göre, tüm izolatlar amfisilin ve amoksilin-klavulanata karşı dirençli bulunmuştur. Antimikrobiyal aktivite test sonuçları laktik asit bakterilerinden elde edilen ekstraktların (Lactococcus lactis (L1), Lactobacillus fermentum (L2), Enterococcus faecalis (L3), Lactobacillus casei (L4), Lactobacillus plantarum (L5), Enterococcus faecium (L6), Lactobacillus curvatus (L7), Enterococcus durans (L8) Lactococcus garviae (L9), Enterococcus faecalis (L10)) Citrobacter braakii üzerinde antimikrobiyal ve antibiyofilm etkinliğinin olduğu saptanmıştır. En yüksek antimikrobiyal etki C2 izolatı üzerinde ve en düşük etki C3 izolatı üzerinde belirlenmiştir. Antibiyofilm test sonuçlarına göre L1, L2, L4, L6, L7, L8 ekstraktlarının en yüksek dozlarının tüm Citrobacter izolatlarında biyofilm oluşumunu engellendiği görülmüştür.

The aim of this research was to evaluate the antimicrobial and antibiofilm effects of LABs against Citrobacter isolates. In this study, Citrobacter isolates (C1, C2, C3) which were identified as Citrobacter braakii with the BD PhoenixTM automation system. Biofilm formation investigated by Congo red agar method and microtiter plate method. Acording to antibiogram test results, all isolates was resistance to ampicillin, amoxicillin-clavulanate. Antimicrobial activity test results revealed that extracts of LABs (Lactococcus lactis (L1), Lactobacillus fermentum (L2), Enterococcus faecalis (L3), Lactobacillus casei (L4), Lactobacillus plantarum (L5), Enterococcus faecium (L6), Lactobacillus curvatus (L7), Enterococcus durans (L8) Lactococcus garviae (L9), Enterococcus faecalis (L10)) extracts have an antimicrobial effect on Citrobacter braakii. The highest antimicrobial effect determined on C2 isolate and the lowest effect determined on C3. According to antibiofilm test results, it was observed that high doses of L1, L2, L4, L6, L7, L8 extracts inhibited biofilm formation in all Citrobacter isolates.
Işık Yayan Diyot Dizisi ile Işık Mikroskobunda Faz-Kontrast Görüntüleme
Phase-Contrast Imaging at Optical Microscope with a Light Emitting Diode Array
Yazar: Köksal, Nur Efşan; Çankaya, İlyas; Şengün Ermeydan, Esra
Dergi: Afyon Kocatepe Üniversitesi Fen Ve Mühendislik Bilimleri Dergisi, Vol. 23 No. 2, 2022
Anahtar kelimeler: Engineering ; Mühendislik ; Optical microscope,LED array,Phase-contrast imaging,32x32 LED matrix,oblique illumination ; Işık mikroskobu,LED dizisi,Faz-kontrast görüntüleme,32x32 LED Matris,eğik aydınlatma

Bu çalışmada, aydınlık-alan, karanlık-alan ve diferansiyel faz-kontrast görüntülerini aynı anda elde edebilen tek-kameralı bir görüntüleme sistemi, programlanabilir bir ışık yayan diyot (LED) dizisi aracılığıyla farklı aydınlatma modelleri ile birlikte kullanılmıştır. Kullanılan LED dizisi, aydınlatma açılarının esnek bir şekilde modellenmesine olanak sağlamıştır. Sol-sağ, üst-alt ve eğik aydınlatmaların etkisi, hem yanak epitel hücresinde hem de soğan zarı hücresinde detaylı olarak gözlemlenmiştir. Aydınlık-alan, karanlık-alan ve diferansiyel faz-kontrast görüntüleri, 32x32 LED dizisinin desenleri değiştirilerek herhangi bir hareketli parça olmadan elde edilmiştir. Bu nedenle, kullanılan sistem basittir, düşük maliyetlidir ve geleneksel ışık mikroskobu ile uyumludur.

In this study, a single-camera imaging system that can simultaneously acquire bright-field, dark-field and differential phase-contrast images is used with different illumination patterns through a programmable light-emitting diode (LED) array. The LED array allows flexible modeling of illuminationangles. The effect of left-right, top-bottom and oblique illumination was observed in detail both in the cheek epithelial cell and in the onion membrane cell. Bright-field, dark-field and differential phasecontrast images are obtained without any moving parts by changing the patterns of 32x32 LED array. Therefore, the system used is simple, low-cost and compatible with the conventional light microscopy.
Batı Anadolu’daki Bazı Kömürlü Miyosen Yaşlı Sahaların (Seyitömer – Tunçbilek – Değirmisaz – Çamalan / Kütahya) Jeolojik ve Tektonik Korelasyonu
Geological and Tectonic Correlation of Some Miocene Aged Coal Fields (Seyitömer - Tunçbilek - Değirmisaz - Çamalan / Kütahya) in Western Anatolia
Yazar: Özburan, Muzaffer
Dergi: Afyon Kocatepe Üniversitesi Fen Ve Mühendislik Bilimleri Dergisi, Vol. 23 No. 1, 2022
Anahtar kelimeler: General Geology ; Genel Jeoloji ; Western Anatolia,Coal,Seyitomer,Tuncbilek,Degirmisaz,Camalan (Alabarda) ; Batı Anadolu,Kömür,Seyitömer,Tunçbilek,Değirmisaz,Çamalan (Alabarda)

Türkiye’de birçok sahada, ekonomik öneme sahip çökeller depolanmıştır. Bu sahalardan bazıları Kütahya ilinde olup, Seyitömer, Tunçbilek, Değirmisaz ve Çamalan (Alabarda) çalışmanın konusunu oluşturur. Sahalar, kömür içerikli çökelleriyle Batı Anadolu’nun ekonomik öneme sahip Miyosen çökellerinin depolanma alanlarındandır. Kömür içerikleri, bu sahaların tek benzer yönü olmayıp tektonik, stratigrafik, sedimantolojik ve kömür jeokimyası açısından da benzer ve farklı yönleri söz konusudur. Elde edilen sonuçlar, Seyitömer, Tunçbilek ve Çamalan sahalarının nispeten benzer tektonik rejim unsurlarını barındırdığını Değirmisaz sahasının ise faylarının uzanımı ve karakterleri bakımından bunlardan ayrıldığını göstermiştir. Ayrıca çalışmada, tektonizma faktörünün daha fazla olmak üzere, yüksek ısı akısı ile birlikte sahalardaki kömürleşme derecesini etkilediği sonucuna varılmıştır.

Economically important sediments have been deposited at many sites in Turkey. Some of these fields are in Kütahya province and Seyitömer, Tunçbilek, Değirmisaz and Çamalan (Alabarda) fields are the subject of the study. The fields constitute some of the storage areas of the coal-bearing deposits and the economically important Miocene deposits of Western Anatolia. Coal content is not the only similarity of these fields they also have similarities and differences in terms of tectonics, stratigraphy, sedimentology and coal geochemistry. The results obtained showed that Seyitömer, Tunçbilek and Çamalan areas contain relatively similar tectonic regime elements, while Değirmisaz area differs from them in terms of the direction and characterize of the faults. In addition in the study, it was concluded that the high heat flow, mainly the tectonism factor, affects the degree of coalification in the fields.
İHA ile Derin Öğrenme Algoritmaları Kullanılarak Hasarlı Yapıların Tespit Edilmesi
Detection of Damaged Structures Using Deep Learning Algorithms with UAV
Yazar: Maraş, Erdem Emin; Sarıyıldız, Halil İbrahim
Dergi: Afyon Kocatepe Üniversitesi Fen Ve Mühendislik Bilimleri Dergisi, Vol. 23 No. 2, 2022
Anahtar kelimeler: Photogrammetry and Remote Sensing ; Fotogrametri ve Uzaktan Algılama ; Deep Learning,Remote Sensing,Convolutional Neural Network,UAV ; Derin Öğrenme,İHA,Uzaktan Algılama,Evrişimsel Sinir Ağı

Bu araştırmada, hasarlı yapıların hızlı ve güvenilir bir şekilde tespit edilebilmesi için derin öğrenme algoritmalarında evrişimsel sinir ağı mimarisinin bir modeli olan Mask Region-based Convolutional Neural Network (Mask R-CNN) modeli kullanılarak hasar tespiti yapılmaya çalışılmıştır. Eğitim alanı olarak 2010 yılında Haiti’de meydana gelen 316.000 insanın öldüğü, 280.000 civarı yapının hasar gördüğü 7.0 büyüklüğündeki deprem bölgesi seçilmiştir. Bölgede 5 cm ve 7 cm çözünürlüğe sahip insansız hava aracı görüntüleri çalışmada kullanılmıştır. Görüntüler ilk aşamada üç sınıfta “hasarlı”, “az hasarlı” ve “hasarsız” olarak eğitilip test edilmiştir. İnsansız hava aracı verileri ile yapılan test işleminde ise yapılar %58.62 oranıyla bulunmuş ve bulunan yapılar %83.53 genel doğrulukla sınıflandırılmıştır. İkinci aşamada görüntüler “hasarlı” ve “hasarsız” olarak iki sınıfta etiketlenip eğitim ve test işlemi gerçekleştirilmiştir. İnsansız hava aracı verileri ile yapılan test işleminde ise yapılar %74.50 oranıyla bulunmuş ve bulunan yapılar %95.12 genel doğruluk oranıyla sınıflandırılmıştır.

In the study, damage detection was tried to be done using Mask Region-based Convolutional Neural Network (Mask R-CNN) model, which is a model of convolutional neural network architecture in deep learning algorithms in order to detect damaged structures quickly and reliably. The 7.0 magnitude earthquake zone, which occurred in Haiti in 2010, in which 316,000 people died and 280,000 buildings were damaged, was chosen as the training area. Unmanned aerial vehicle images with a resolution of 5 cm and 7 cm used in the study. In the first stage, the images were trained and tested in three classes as “damaged”, “slightly damaged” and “undamage”. In the test process with unmanned aerial vehicle data, the structures were found with a rate of 58.62% and the structures found were found with an overall accuracy of 83.53%. In the second stage, the images were labeled in two classes as “damaged” and “undamaged” and training and testing was carried out. In the test process with unmanned aerial vehicle data, the structures were found with a rate of 74.50% and the structures found were classified with an overall accuracy of 95.12%.
Koçpınar/Siirt Kili Kullanarak Atık Sulardan Kristal Violet Boyar Maddesinin Uzaklaştırılmasında Adsorpsiyon Yönteminin İzoterm ve Termodinamik Hesaplamaları
Isotherm and Thermodynamic Calculations of Adsorption Method for Removal of Crystalline Violet Dyestuffs from Wastewater Using Koçpınar/Siirt Clay
Yazar: Kul, Ali Rıza; Benek, Veysel
Dergi: Afyon Kocatepe Üniversitesi Fen Ve Mühendislik Bilimleri Dergisi, Vol. 23 No. 3, 2022
Anahtar kelimeler: Physical Chemistry ; Fiziksel Kimya ; adsorpsiyon,izoterm,kil,boyar madde,termodinamik ; adsorption,thermodynamic,clay,Dyestuff,isotherm

Araştırmamızda, kanserojen etkisi de bilinen boyar maddelerden biri olan kristal viyoletin sulu çözeltilerden Siirt/Koçpınar kili ile uzaklaştırılması çalışıldı. Birinci aşamada kil modifikasyona maruz bırakılmadan doğal şekliyle (KO) kullanıldı, ikinci aşamada ise aynı işlemler HNO3 ile aktifleştirilen Siirt/Koçpınar kili (KA) ile tekrar edildi. Adsorpsiyon neticesinde veriler D-R, Langmuir ve Freundlich izoterm modellerine uygulandı. Hesaplamalar sonucunda en iyi verim, 0.4 g adsorbent dozajı ile pH 5 ortamında elde edildi. Çalışma neticesinde optimum koşullarda KO adsorbenti için % 59.48, KA adsorbentin de %  83.97 giderim sağlandı. Korelasyon katsayısının 0.99’dan büyük olarak hesaplandığı Freundlich izoterm modeli, çalışmamızın uygun olduğu izoterm modeli oldu.  Ayrıca D-R izoterm modeli için bulunan D-R adsorpsiyon serbest enerjisi, hem doğal hem de aktifleştirilmiş kil için 8 kJ/mol değerinden küçük bulundu. Bu sonuç adsorpsiyon işleminin fiziksel olduğunu gösterdi. Termodinamik hesaplamalar neticesinde hesaplanan Gibbs serbest enerji değerlerinin sıfırdan küçük çıkması bizlere çalışmamızın istemli meydana geldiğini gösterdi.

In our research, it was tried to remove crystal violet, one of the dyestuffs known to be carcinogenic, from aqueous solutions with Siirt/Koçpınar clay. In the first stage, the clay was used in its natural state (KO) without being modified, and in the second stage, the same processes were repeated with Siirt/Koçpınar clay (KA) activated with HNO3. As a result of adsorption, the data were applied to D-R, Langmuir and Freundlich isotherm models. As a result of the calculations, the best efficiency was obtained in pH 5 environment with 0.4 g adsorbent dosage. As a result of the study, 59.48% removal was achieved for KO adsorbent and 83.97% for KA adsorbent. The Freundlich isotherm model, in which the correlation coefficient was calculated as greater than 0.99, showed that our adsorption study was suitable for this model. In addition, the D-R adsorption free energy found for the D-R isotherm model was found to be less than 8 kJ/mol for both natural and activated clay. This result showed that the adsorption process is physical. The negative Gibbs free energy values calculated as a result of thermodynamic calculations showed us that our work occurred spontaneously.
Travma Sonrası Stres Bozukluğu (TSSB) Tedavisine Yönelik Moleküler  Hedefler ve Yeniden Konumlandırılan İlaçlar
Molecular Targets and Repositioned Drugs For the Treatment of Post  Traumatic Stress Disorder (PTSD)
Yazar: Kubat Oktem, Elıf
Dergi: Afyon Kocatepe Üniversitesi Fen Ve Mühendislik Bilimleri Dergisi, Vol. 23 No. 2, 2022
Anahtar kelimeler: Engineering ; Mühendislik ; PTSD,systems biology,drug repositioning,Bioinformatics ; TSSB,Travma sonrası stres bozukluğu,biyoinformatik,ilaç yeniden konumlandırma,sistem biyolojisi

Travma sonrası stres bozukluğu (TSSB), fiziksel hasar veya kaygı gibi zihinsel şok içeren bir kazayı takiben görülen travmanın neden olduğu zihinsel bir hastalıktır. Toplumda yaygın olmasına rağmen, TSSB'nin prognozu ve optimal terapötikleri sınırlıdır. Erken müdahale için moleküler hedefler belirsiz kaldığından, daha iyi bir TSSB patogenezinin moleküler temellerinin anlaşılması hastalık prognozunun zorluklarını karşılamak ve bu moleküler hedeflere yönelik teşhis ve tedavi için gereklidir. Strese maruz bırakılan farelerin iki farklı dokusundan elde edilen mikrodizi verilerinin işlenmesi ve analiziyle yapılan bu çalışmada, her iki tip doku için de anlatımı farklılık gösteren genler tespit edilmiş, bu genlerin zenginleştiği yolizleri bulunmuş, bu genlerin protein protein etkileşim ağları ve bu ağlardaki hub proteinler tespit edilmiştir. Bu hastalıkta anlatımı farklılık gösteren genlerin etkilerini tersini çevirmeye yönelik her iki farklı tip doku için de ayrı ayrı yapılan ilaç yeniden konumlandırma çalışmalarının karşılaştırılması sonucunda; vorinostat, homoharringtonin ve QL-XII-47 TSSB’yi iyileştirmek için yeni ilaç adayları olarak önerilmiştir. Bu ilaçlardan vorinostat’ın, hücrede HDAC1, HDAC2, HDAC3, HDAC6, HDAC7ve HDAC8 genlerini hedef aldığı tespit edilmiştir.

Post-traumatic stress disorder (PTSD) is a mental illness caused by trauma following an accident involving physical injury or by mental shock such as anxiety. Although it is common in the population, the prognosis and optimal therapies for PTSD are limited. Because the molecular targets for early intervention remain unclear, a better understanding of the molecular basis of the pathogenesis of PTSD is essential to address the challenges of disease prognosis and to diagnose and treat these molecular targets. In this study, performed by processing and analyzing microarray data from two different tissues of mice exposed to stress, genes with differential expression for the two tissue types were identified, the signaling pathways in which these genes are enriched were found, the protein-protein interaction networks of these genes and the hub proteins in these networks were determined. As a result of comparing the drug repositioning studies performed separately for the two different tissue types to reverse the effects of differentially expressed genes, vorinostat, homoharringtonine, and QL-XII -47 were proposed as novel drugs for the treatment of PTSD. Vorinostat, one of these drugs, was also found to target HDAC1, HDAC2, HDAC3, HDAC6, HDAC7, and HDAC8 genes in the cell.