Bazı Kimyasalların Etkisi Altında Escherichia coli’nin OmpF - OmpC Porin Protein Sentezi ve Bu Sentezde EnvZ, RpoS, H-NS, AcP’ın Rolünün Belirlenmesi
The Role of EnvZ, RpoS, H-NS, AcP and Synthesis of OmpC-OmpF Porin Proteins of Escherichia coli Under Effect of Some Chemicals
Yazar: Darcan, Cihan; Yılmaz, Hülya
Dergi: Erzincan Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Dergisi, Vol. 11 No. 2, 2018
Anahtar kelimeler: Engineering ; Mühendislik ; Porin,Dezenfektan kimyasallar,Escherichia coli,Porin ; Disinfectan chemicals,Escherichia coli,Porin

Escherichia coli’nin dış membranındabulunan OmpC ve OmpF porin proteinleri, stres koşullarına karşı korunmasındaönemli yer tutar. Bu çalışmada dezenfektan özellikli çeşitli kimyasalmaddelerin E. coli’nin OmpC ve OmpFporin protein sentezini nasıl etkilediği araştırılmıştır. E. coli’de, formaldehit, klor,etanol, çamaşır suyu, H2O2 ve Sodyum Dodesil Sülfatın(SDS) belirlenen konsatrasyonları besiyerine eklenerek, ompC ve ompF genleri yerine raportör gen olarak eklenen β-galaktosidaz’ın aktivitesi spektrofotometrik olarak ölçülmüş ve eldeedilen sonuçlar kontrol grupları ile karşılaştırılmıştır. Sonuç olarakçalışılan kimyasal maddelerin E. coli’ninbüyümesini oldukça yavaşlattığı, ancak yinede üremenin gerçekleştiğibelirlenmiştir. E. coli’de OmpFsentezinin formaldehit, etanol ve SDS ilave edildikten 2 saat sonra oldukçaazaldığı, çamaşır suyu ve klor ilavesinde biraz azaldığı ve H2O2ilave edildiği zaman ise değişmediği tespit edilmiştir. OmpC sentezindeise klor, formaldehit, H2O2 ilave edildiğinde %50oranında azaldığı belirlenirken, çamaşır suyunda yaklaşık 2 kat ve SDS ilaveedilen örneklerde ise 1.5 katlık bir artış belirlenmiştir. Ayrıca hem OmpC hemde OmpF porin proteininin sentezinde RpoS, Pta, EnvZ ve H-NS proteinlerininrollerinin olduğu belirlenmiştir. Ancak moleküler mekanizmaları henüzaydınlatılamamıştır.

OmpC and OmpF porin proteins, located on theouter membrane of Escherichia coli,play an important role in protection against stress conditions. In this study, it was investigated how various chemical substances as adisinfectant affect E. coli OmpC andOmpF porin protein synthesis. The activity of β-galactosidase, added as areporter gene in place of ompC and ompF genes, was measuredspectrophotometrically by adding formaldehyde, chlorine, ethanol, bleach, H2O2and Sodium Dodecyl Sulfate (SDS), used as disinfectants in E. coli. The results were compared with control groups. As a result, it was determined that the studied chemical substancesslowed down the growth of E. coli atthe added concentrations, but continued to multiply. It was determined that theOmpF synthesis in E. coli decreasedconsiderably after 2 hours from the addition of formaldehyde, ethanol and SDS,decreased slightly during the addition of bleach and chlorine, and did notchange when H2O2 was added. In the OmpC synthesis, whenchlorine, formaldehyde, and H2O2 were added, it wasdetermined to decrease by 50% compared to the untreated state, while theincrease was found as a 1.5 time in the cases where SDS was added and about 2times in the bleach. In these alterations, it has been determined that theroles of RpoS, Pta, EnvZ, and H-NS proteins on both OmpC and OmpF porin proteinsynthesis but have not yet been elucidated by their molecular mechanisms.