Elma Mozaik Ilarvirusu Türkiye ve Ukrayna İzolatlarının Moleküler Karakterizasyonu
Elma Mozaik Ilarvirusu Türkiye ve Ukrayna İzolatlarının Moleküler Karakterizasyonu
Yazar: Canik, Didem; Ertunç, Filiz; Gospodaryk, Alina; Budzanivska, İrena; Polischuk, Valery
Dergi: Journal of Agricultural Sciences, Vol. 17 No. 2, 2010
Anahtar kelimeler: Elma Mozaik Ilarvirus, Türkiye, Ukrayna

<!--  /* Font Definitions */  @font-face {font-family:"Cambria Math"; panose-1:2 4 5 3 5 4 6 3 2 4; mso-font-charset:162; mso-generic-font-family:roman; mso-font-pitch:variable; mso-font-signature:-1610611985 1107304683 0 0 159 0;}  /* Style Definitions */  p.MsoNormal, li.MsoNormal, div.MsoNormal {mso-style-unhide:no; mso-style-qformat:yes; mso-style-parent:""; margin:0cm; margin-bottom:.0001pt; mso-pagination:widow-orphan; font-size:12.0pt; font-family:"Times New Roman","serif"; mso-fareast-font-family:"Times New Roman";} .MsoChpDefault {mso-style-type:export-only; mso-default-props:yes; font-size:10.0pt; mso-ansi-font-size:10.0pt; mso-bidi-font-size:10.0pt;} @page Section1 {size:612.0pt 792.0pt; margin:70.85pt 70.85pt 70.85pt 70.85pt; mso-header-margin:35.4pt; mso-footer-margin:35.4pt; mso-paper-source:0;} div.Section1 {page:Section1;} -->  Özet Ülkemiz elma ve fındık üretimini kısıtlayan en önemli etmenlerden biri de Elma mozaik ilarvirusu’(ApMV) dur. Etmenin vejetatif olarak aşı ve polen ile yayılması, etkili bir kimyasal mücadelesinin olmaması, ülkemizde gerek yumuşak çekirdekli ve gerekse de fındık ekim alanlarında giderek yayılmasına neden olmaktadır.  Ele alınan bu çalışma kapsamında ülkemiz fındık ve elma ekim alanlarında,  hastalığa ait izolatlar toplanmış ve patojenin varlığı, DAS-ELISA ve RT-PCR çalışmaları ile ortaya konmuştur. 2008 ve 2009 yıllarında Ukrayna’nın elma üretim alanlarında örnekleme yapılmış ve toplanan bu izolatlar, A.Ü.Bitki Koruma Bölümünde koleksiyondaki ApMV izolatları ile karşılaştırılmıştır. Enfekteli örneklerden total RNA izolasyonu ve RT-PCR analizinde Menzel et al. (2002)’ın yöntemi uygulanmış ve 262 bp uzunluğunda PCR ürünü elde edilmiştir. Tüm PCR ürünleri, HinfI, BamHI, AvaII, EcoRI, SspI, RsaI, HindIII, HincII enzimleri enzimatik kesime maruz bırakılmış ve bunlardan sadece AvaII BamHI, HinfI, SspI enzimleri PCR ürününü kesmiştir. Yapılan filogenetik analiz sonucunda Türk izolatlarının 9 genotipe ayrıldığı tesbit edilmiştir. Yapılan analiz sonucunda Turk izolatlarının değişken oldukları, buna karşılık Ukrayna elma izolatlarının oldukça benzer oldukları belirlenmiştir. Her iki ülkeye ait elma izolatları sekansları karşılaştırıldığında ise benzer oldukları saptanmıştır.

<!--  /* Font Definitions */  @font-face {font-family:"Cambria Math"; panose-1:2 4 5 3 5 4 6 3 2 4; mso-font-charset:162; mso-generic-font-family:roman; mso-font-pitch:variable; mso-font-signature:-1610611985 1107304683 0 0 159 0;}  /* Style Definitions */  p.MsoNormal, li.MsoNormal, div.MsoNormal {mso-style-unhide:no; mso-style-qformat:yes; mso-style-parent:""; margin:0cm; margin-bottom:.0001pt; mso-pagination:widow-orphan; font-size:12.0pt; font-family:"Times New Roman","serif"; mso-fareast-font-family:"Times New Roman";} .MsoChpDefault {mso-style-type:export-only; mso-default-props:yes; font-size:10.0pt; mso-ansi-font-size:10.0pt; mso-bidi-font-size:10.0pt;} @page Section1 {size:612.0pt 792.0pt; margin:70.85pt 70.85pt 70.85pt 70.85pt; mso-header-margin:35.4pt; mso-footer-margin:35.4pt; mso-paper-source:0;} div.Section1 {page:Section1;} -->  Özet Ülkemiz elma ve fındık üretimini kısıtlayan en önemli etmenlerden biri de Elma mozaik ilarvirusu’(ApMV) dur. Etmenin vejetatif olarak aşı ve polen ile yayılması, etkili bir kimyasal mücadelesinin olmaması, ülkemizde gerek yumuşak çekirdekli ve gerekse de fındık ekim alanlarında giderek yayılmasına neden olmaktadır.  Ele alınan bu çalışma kapsamında ülkemiz fındık ve elma ekim alanlarında,  hastalığa ait izolatlar toplanmış ve patojenin varlığı, DAS-ELISA ve RT-PCR çalışmaları ile ortaya konmuştur. 2008 ve 2009 yıllarında Ukrayna’nın elma üretim alanlarında örnekleme yapılmış ve toplanan bu izolatlar, A.Ü.Bitki Koruma Bölümünde koleksiyondaki ApMV izolatları ile karşılaştırılmıştır. Enfekteli örneklerden total RNA izolasyonu ve RT-PCR analizinde Menzel et al. (2002)’ın yöntemi uygulanmış ve 262 bp uzunluğunda PCR ürünü elde edilmiştir. Tüm PCR ürünleri, HinfI, BamHI, AvaII, EcoRI, SspI, RsaI, HindIII, HincII enzimleri enzimatik kesime maruz bırakılmış ve bunlardan sadece AvaII BamHI, HinfI, SspI enzimleri PCR ürününü kesmiştir. Yapılan filogenetik analiz sonucunda Türk izolatlarının 9 genotipe ayrıldığı tesbit edilmiştir. Yapılan analiz sonucunda Turk izolatlarının değişken oldukları, buna karşılık Ukrayna elma izolatlarının oldukça benzer oldukları belirlenmiştir. Her iki ülkeye ait elma izolatları sekansları karşılaştırıldığında ise benzer oldukları saptanmıştır.