Mısırda Sap ve Koçan Çürüklüğü Etmeni Stenocarpella maydis (Berkeley) Sutton’ in TaqMan ® Probe Yöntemi ile Tanısı
Mısırda Sap ve Koçan Çürüklüğü Etmeni Stenocarpella maydis (Berkeley) Sutton’ in TaqMan ® Probe Yöntemi ile Tanısı
Yazar: Sağlam, Asuman; Tosun, Necip
Dergi: Ege Üniversitesi Ziraat Fakültesi Dergisi, Vol. 55 No. 2, 2017
Anahtar kelimeler: Engineering ; Mühendislik ; Stenocarpella maydis,,Bitki Karantinası Yönetmeliği,,Real-time PCR,mısır,sapçürüklüğü

Mısırda fideyanıklığı ve koçan çürüklüğüne sebep olan fungal etmen Stenocarpella maydis Afrika, Amerika, Asya ve İtalya, Fransa,Portekiz gibi birçok Avrupa ülkesinde yayılım halinde olup ülkemizde henüzvarlığı bilinmemektedir (OEPP/EPPO, 2006) Diplodia sap ve koçan çürüklüğüolarak da bilinen hastalığa sebep olan fungal etmenin 2013 yılı mısır hastalıklarıçalışma grubu toplantı raporunda ABD, Ontaria ve Kanada’da 200670.094-304816.595ton (7.9 ve 12.0 milyon buşel) mısır kaybına yol açtığı bildirilmiştir (Grabow,2017). Sağlıklı tohum kullanımının hastalıklamücadelede en önemli strateji olduğu etmen için tek zorluk tohumdan güvenilirve hızlı tanıyı sağlayacak bir metodun varlığıdır (Barrocas et. al, 2012). Buyıkıcı hastalığın tanısında hızlı, güvenilir ve doğru sonuca ulaşmamızısağlayan PCR (polimeraz zincir reaksiyon) temelli yöntemler etmenin ekim öncesitespitini sağlamakta fungisit ile mücadelesi mümkün olmayan etmenin yerleşim veyayılımını önlemektedir. Stenocarpella maydis’in PCR temelli tanısı dünyada yaygın uygulamaya sahip olupyöntem ülkemizde henüz uygulamada değildir. Bu amaçla yürütülen bu çalışma ileBitki Karantinası Yönetmeliği EK2/A listesinde yeralan ülkemizde varlığıbilinmeyen fungal patojen Stenocarpella maydis (Berkeley)Sutton’e ait izolatın TaqMan ® probe yöntemi ile tanısına dair metot validasyonugerçekleştirilmiş olup hazırlanan protokol ile çeşitli özel ve resmi araştırmakuruluşlarının çalışmalarına katkı sağlanması, böylece etmenin ülkemize giriş,yerleşim ve yayılımının önlenmesi hedeflenmiştir.

Mısırda fideyanıklığı ve koçan çürüklüğüne sebep olan fungal etmen Stenocarpella maydis Afrika, Amerika, Asya ve İtalya, Fransa,Portekiz gibi birçok Avrupa ülkesinde yayılım halinde olup ülkemizde henüzvarlığı bilinmemektedir (OEPP/EPPO, 2006) Diplodia sap ve koçan çürüklüğüolarak da bilinen hastalığa sebep olan fungal etmenin 2013 yılı mısır hastalıklarıçalışma grubu toplantı raporunda ABD, Ontaria ve Kanada’da 200670.094-304816.595ton (7.9 ve 12.0 milyon buşel) mısır kaybına yol açtığı bildirilmiştir (Grabow,2017). Sağlıklı tohum kullanımının hastalıklamücadelede en önemli strateji olduğu etmen için tek zorluk tohumdan güvenilirve hızlı tanıyı sağlayacak bir metodun varlığıdır (Barrocas et. al, 2012). Buyıkıcı hastalığın tanısında hızlı, güvenilir ve doğru sonuca ulaşmamızısağlayan PCR (polimeraz zincir reaksiyon) temelli yöntemler etmenin ekim öncesitespitini sağlamakta fungisit ile mücadelesi mümkün olmayan etmenin yerleşim veyayılımını önlemektedir. Stenocarpella maydis’in PCR temelli tanısı dünyada yaygın uygulamaya sahip olupyöntem ülkemizde henüz uygulamada değildir. Bu amaçla yürütülen bu çalışma ileBitki Karantinası Yönetmeliği EK2/A listesinde yeralan ülkemizde varlığıbilinmeyen fungal patojen Stenocarpella maydis (Berkeley)Sutton’e ait izolatın TaqMan ® probe yöntemi ile tanısına dair metot validasyonugerçekleştirilmiş olup hazırlanan protokol ile çeşitli özel ve resmi araştırmakuruluşlarının çalışmalarına katkı sağlanması, böylece etmenin ülkemize giriş,yerleşim ve yayılımının önlenmesi hedeflenmiştir.