Biber (Capsicum annuumL.) Genotiplerinin SSR Markörleri ile Genetik Karakterizasyonu
Biber (Capsicum annuumL.) Genotiplerinin SSR Markörleri ile Genetik Karakterizasyonu
Yazar: Karakurt, Yaşar; Güvercin, Damla; Cesur, Ezgi
Dergi: Ege Üniversitesi Ziraat Fakültesi Dergisi, Vol. 57 No. 2, 2019
Anahtar kelimeler: Engineering ; Mühendislik ; SSR,Capsicum,Biber,Moleküler markör

Amaç: Biber (Capsicum annuum) genotiplerinin SSRmarkörleri ile genetik karakterizasyonuyapılmıştır.Materyal ve Metot:Çalışmadakullanılan biber çeşitleri Akdeniz Bölgesinde yer alan Antalya ilindeki çeşitlifide şirketlerinden temin edilmiştir. Toplamda 10 çeşit biber fidesi ve 10 SSRprimeri ile PCR çalışmaları yürütülmüştür. Bulgular: SSR markörleriile yapılan UPGMA analizleri sonucunda biber çeşitleri 2 ana gruba ayrılmıştır.Birinci ana grup iki alt gruba ayrılmıştır. İlk alt grupta Vezir, Üçburun,Acıburun, Yükselince, Anadol, Serenad, Hayfa Şili yer almaktadır. İkinci altgrupta ise Jalomex yer almaktadır. İkinci ana grupta Ergenekon ve Kanyon genotipleriyer almaktadır. Vezir- Üçburun ve Yükselince- Anadol çeşitleri benzer gruplarolup incelenen SSR bölgeleri bakımından benzer özellik göstererek birliktegruplanmıştır. Ergenekon- Kanyon, Serenad- Hayfa Şili kendi aralarındabenzerlik gösteren diğer gruptur. En uzak benzerlik Jalomex ve Ergenekonarasında olup, ikinci uzak benzerlik Jalomex- Kanyon arasındadır. Toplam allelsayısının 162, spesifik allel sayısının 60 olduğu ve bant büyüklüğünün ise 164ile 294 bç arasında değiştiği belirlenmiştir. Polimorfik bilgi içeriği (PBİ)0,04 ile 0,89 arasında değişim göstermiştir. Sonuç:Türkiye’deki bibertürlerine ait SSR bulgularımız, bölgede bundan sonraki ıslah çalışmalarındaebeveyn seçiminde bir basamak oluştururken, biber genotiplerinin yayılmaalanlarının belirlenmesinde, genetik koleksiyonların karşılaştırılmasında,  biber genotiplerinin karakterizasyonundakullanılabilir.

Amaç: Biber (Capsicum annuum) genotiplerinin SSRmarkörleri ile genetik karakterizasyonuyapılmıştır.Materyal ve Metot:Çalışmadakullanılan biber çeşitleri Akdeniz Bölgesinde yer alan Antalya ilindeki çeşitlifide şirketlerinden temin edilmiştir. Toplamda 10 çeşit biber fidesi ve 10 SSRprimeri ile PCR çalışmaları yürütülmüştür. Bulgular: SSR markörleriile yapılan UPGMA analizleri sonucunda biber çeşitleri 2 ana gruba ayrılmıştır.Birinci ana grup iki alt gruba ayrılmıştır. İlk alt grupta Vezir, Üçburun,Acıburun, Yükselince, Anadol, Serenad, Hayfa Şili yer almaktadır. İkinci altgrupta ise Jalomex yer almaktadır. İkinci ana grupta Ergenekon ve Kanyon genotipleriyer almaktadır. Vezir- Üçburun ve Yükselince- Anadol çeşitleri benzer gruplarolup incelenen SSR bölgeleri bakımından benzer özellik göstererek birliktegruplanmıştır. Ergenekon- Kanyon, Serenad- Hayfa Şili kendi aralarındabenzerlik gösteren diğer gruptur. En uzak benzerlik Jalomex ve Ergenekonarasında olup, ikinci uzak benzerlik Jalomex- Kanyon arasındadır. Toplam allelsayısının 162, spesifik allel sayısının 60 olduğu ve bant büyüklüğünün ise 164ile 294 bç arasında değiştiği belirlenmiştir. Polimorfik bilgi içeriği (PBİ)0,04 ile 0,89 arasında değişim göstermiştir. Sonuç:Türkiye’deki bibertürlerine ait SSR bulgularımız, bölgede bundan sonraki ıslah çalışmalarındaebeveyn seçiminde bir basamak oluştururken, biber genotiplerinin yayılmaalanlarının belirlenmesinde, genetik koleksiyonların karşılaştırılmasında,  biber genotiplerinin karakterizasyonundakullanılabilir.