Çanakkale ve Tekirdağ İlleri Kanola Üretim Alanlarında Önemli Virüs Hastalıklarının Tanılanması ve Karakterizasyonu
Çanakkale ve Tekirdağ İlleri Kanola Üretim Alanlarında Önemli Virüs Hastalıklarının Tanılanması ve Karakterizasyonu
Yazar: Karanfil, Ali; Korkmaz, Savas
Dergi: Ege Üniversitesi Ziraat Fakültesi Dergisi, Vol. 57 No. 1, 2019
Anahtar kelimeler: Engineering ; Mühendislik ; Benzerlik,Filogenetik,Klonlama,RT-PCR

Amaç:Bu çalışma Çanakkale ve Tekirdağ illeri kanola üretim alanlarındaki bazı virüshastalıklarının tespiti ve moleküler karakterizasyonu amacı ile yürütülmüştür.Materyalve Metot: Kanola bitkileri görsel olarak incelenmiş, virüs ve virüs-benzerisimptom gösteren bitkilerden örnekler toplanmıştır. Toplanan örnekler turnipmosaic virus (TuMV), cucumber mosaic virus (CMV) ve cauliflower mosaic virus (CaMV)'ünvarlığının belirlenmesi amacı ile DAS-ELISA ile testlenmiştir. Enfektelibulunanlar içerisinden her bir virüs için 2 izolat seçilerek RT-PCR ileistenilen gen bölgeleri çoğaltılmış, klonlanmış ve sekanslanmıştır. Elde edilensekans dizileri kullanılarak çoklu dizi ve filogenetik analizlergerçekleştirilmiştir.Bulgular:Testlemeler sonucunda 16 örnek TuMV ile 3 örnek ise CMV ile enfekteli olarakbulunmuştur. Bir örnekte ise CMV ve TuMV karışık enfeksiyonu tespit edilmiştir.Toplanan örneklerin hiçbirisinde CaMV enfeksiyonuna rastlanılmamıştır. İzolatlarınmoleküler karakterizasyonları sonucunda TuMV izolatlarının dünya izolatları ile%78-94 ve 88-98, CMV izolatlarının ise %75-98 ve 80-100 oranında sırası ile ntve aa düzeyinde benzerlikler gösterdiği tespit edilmiştir. Filogenetikanalizler sonucunda ise TuMV izolatlarının Asian BR ve CMV izolatlarının ise IAgruplarında yer aldığı belirlenmiştir.Sonuç: Gerçekleştirilen bu çalışma ile kanola üretimalanlarında TuMV ve CMV enfeksiyonu tespit edilerek, moleküler olarakkarakterize edilmiştir.

Amaç:Bu çalışma Çanakkale ve Tekirdağ illeri kanola üretim alanlarındaki bazı virüshastalıklarının tespiti ve moleküler karakterizasyonu amacı ile yürütülmüştür.Materyalve Metot: Kanola bitkileri görsel olarak incelenmiş, virüs ve virüs-benzerisimptom gösteren bitkilerden örnekler toplanmıştır. Toplanan örnekler turnipmosaic virus (TuMV), cucumber mosaic virus (CMV) ve cauliflower mosaic virus (CaMV)'ünvarlığının belirlenmesi amacı ile DAS-ELISA ile testlenmiştir. Enfektelibulunanlar içerisinden her bir virüs için 2 izolat seçilerek RT-PCR ileistenilen gen bölgeleri çoğaltılmış, klonlanmış ve sekanslanmıştır. Elde edilensekans dizileri kullanılarak çoklu dizi ve filogenetik analizlergerçekleştirilmiştir.Bulgular:Testlemeler sonucunda 16 örnek TuMV ile 3 örnek ise CMV ile enfekteli olarakbulunmuştur. Bir örnekte ise CMV ve TuMV karışık enfeksiyonu tespit edilmiştir.Toplanan örneklerin hiçbirisinde CaMV enfeksiyonuna rastlanılmamıştır. İzolatlarınmoleküler karakterizasyonları sonucunda TuMV izolatlarının dünya izolatları ile%78-94 ve 88-98, CMV izolatlarının ise %75-98 ve 80-100 oranında sırası ile ntve aa düzeyinde benzerlikler gösterdiği tespit edilmiştir. Filogenetikanalizler sonucunda ise TuMV izolatlarının Asian BR ve CMV izolatlarının ise IAgruplarında yer aldığı belirlenmiştir.Sonuç: Gerçekleştirilen bu çalışma ile kanola üretimalanlarında TuMV ve CMV enfeksiyonu tespit edilerek, moleküler olarakkarakterize edilmiştir.