Klinik E.coli İzolatlarında Virulans Faktor Genlerinin ve Geniş Spekturumlu Beta Laktamazların Araştırılması
Investigation of Virulence Factor Genes and Extended Spekturum Beta Lactamases in Clinical E.coli Isolates
Yazar: Özad Düzgün, Azer; Akyıldız, Esma; Saral, Ayşegül; Köse, Tuba
Dergi: Gümüşhane Üniversitesi Fen Bilimleri Dergisi, Vol. 10 No. 1, 2019
Anahtar kelimeler: Engineering ; Mühendislik ; Resistance,E.coli,Virulence ; Direnç,E.coli,Virulans

Bu çalışmanın amacı, 83 klinik E.coli izolatında pap, hly,cnf, sfa,aer ve afa virulansgenlerinin ve geniş spekturumlu beta laktamaz direnç genlerinin varlığınıaraştırmaktır.  83 E. coli izolatında sfa, pap,hly, cnf, aerve afa virülansgenleri ve TEM, SHV, CTX-M1 ve CTX-M9 geniş spekturumlu beta laktamaz genleri polimerzincir reaksiyonu (PZR) metodu ile araştırılmıştır. 83 izolatın, sefiksim,trimethoprim/sulfametaksazol, piperasilin/tazobaktam, amoksisilin/klavulanikasit, ampisilin, seftriakson, sefuroksim, sefuroksim aksetil, siprofloksasin,fosfomisin, gentamisin ve seftazidime karşı direnç oranları sırasıyla;%65, %54,%19, %38, %74, %75, %72, %75, %68, %2, %30, %49 olarak belirlenmiştir. CTX-M1,araştırılan genişlemiş spektrumlu beta-laktamaz (GSBL) genleri arasında 83suşun 51’inde belirlenmesiyle en sık görülen GSBL olmuştur. TEM tipi betalaktamaz 33 suşta, CTX-M9 ve SHV 1 izolatta tespit edilmiştir. İzolatlarda enyaygın virülans geni, 40 suşta tespit edilmesiyle aer geni, bunu izolatların 15'inde tespit edilen cnf geni takip etmiştir. Sfa, pap, afavehlyvirulans genleri sırasıyla izolatların %15.6'sında, %15.6'sında,% 9.6'sında ve %12.04’ünde görülmüştür. Ayrıca 83 E.coliizolatında on farklı virulans faktör gen paterni tespitedilmiştir. Virulans gen kombinasyonları, 27 suştaaer, 6 suştacnf-sfa-pap, 1suştaaer-pap, 2 suştaaer-afa, 6 suştaafa,3 suştasfa, 9 suştaaer-cnf-hly, 4 suştasfa-pap, 1 suştahly-papve1 suştapap olarak gözlemlenmiştir. Sonuçolarak, İYE ile ilişkili bakteriyel patojenitenin araştırılması daha iyi birtıbbi müdahaleye katkı sağlayacaktır.

The aim of this studywas to investigate the presence of pap, hly, cnf, sfa, aer and afa virulans genesand extended-spectrum beta lactamase resistance genes in 83 clinical E.coliisolates. In 83 E. coli isolates, sfa, pap, hly, cnf, aer and afa virulencegenes and TEM-SHV, CTX-M1 and CTX-M9 wide spectrum beta-lactamase genes wereinvestigated by polymerase chain reaction (PCR) method. Resistance rates of 83isolates to cefixim, trimethoprim/sulfamethoxazole, piperacillin/tazobactam,amoxicillin/clavulanic acid, ampicillin, ceftriaxone, cefuroxime, cefuroximeaxetil, ciprofloxacin, fosfomycin, gentamicin and ceftazidime antibiotics were65%, 54%, 19%,38, 74%, 75%, 72%, 75%, 68%, 2%, 30%, 49%, respectively. CTX-M1was the most common extended spectrum beta-lactamase (ESBL) among the ESBLgenes investigated in 51 of 83 strains. TEM type beta-lactamase was detected in33 strains, CTX-M9 and SHV 1 isolates. The most common virulence gene was aergene and detected in 40 strains, followed by the cnf gene detected in 15 of theisolates. The pap, hly, afa and sfa genes were determined in 15.6%, 12.04%,9.6% and 15.6% of the isolates, respectively. In addition, 10 differentvirulence factor gene patterns were observed in 83 E.coli isolates. Virulencegene combinations were observed in 27 strains of aer, 6 strains of cnf-sfa-pap,1 strains of aer-pap, 2 strains of aer-afa, 6 strains of afa, 3 strain of sfa,9 strain of aer-cnf-hly, 4 isalates of sfa-pap, 1 strain of hly-pap and 1strains of pap genes. In conclusion, investigating bacterial pathogenicityassociated with UTI will contribute to better medical intervention.