Irak'ın güney bölgelerindeki hastalarda çoklu ilaca dirençli bakterilerin neden olduğu idrar yolu enfeksiyonları ile TLR4 gen polimorfizmi arasındaki ilişki
The association between TLR4 gene polymorphism and urinarytract infections caused by multidrug resistant bacteria among Iraqi patients in south regions
Yazar: AKRAM RADHI SALIM ALZHERE
Danışman: PROF. DR. SEÇİL AKILLI ŞİMŞEK
Çankırı Karatekin Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Biyoloji Ana Bilim Dalı / Biyoloji Bilim Dalı
Derece: Doktora, 2024
Konu: Biyoloji = Biology

Özet:
ÇalıĢmamızda, fonksiyonel gen polimorfizmleri (TLR4 rs7873784 ve TLR4-
rs11536889) ile idrar yolu enfeksiyonlarında (ĠYE) çoklu ilaca dirençli (ÇĠD) bakteri 
geliĢtirme duyarlılığı arasındaki iliĢkinin değerlendirilmesi amaçlanmıĢtır. Bu amaç 
doğrultusunda, Temmuz 2022 ile Ocak 2023 tarihleri arasında Irak'ın güneyindeki ThiQar vilayetinde bulunan Al-Rifai Genel Hastanesi'nden yaĢları 10 ile 75 arasında 
değiĢen kadın ve erkeklerden toplam 350 idrar örneği toplanmıĢtır. Toplanan 150 
(%42,9) örnek bakteri üreme kültürü için pozitif sonuç gösterirken, 200 (%57,1) örnek 
bakteri üreme kültürü için negatif sonuç göstermiĢtir. Ġdrar yolu enfeksiyonlarında çoklu
ilaca dirençli bakterilerden muzdarip hastaların cinsiyetinin frekans dağılımında
kadınlar (%67) erkeklerden (%33) daha yüksek değerlere sahip olmuĢtur. ĠYE'ye neden 
olan ÇĠD bakteriyel patojenleri; 44(%44) Escherichia coli, 33(%33) Staphylococcus 
aureus, 10(%10) Klebsiella pneumoniae ve 13(%13) Proteus mirabilis olarak 
sıralanmıĢtır. Ayrıca, BlaCTX-M geni E. coli'de 36 (%81,8), K. pneumonia'da 10 
(%100,0) ve P. mirabilis'te 4 (%30,8), BlaSHV geni E. coli'de 13 (%29,5), K.
pneumonia'da 10 (%100,0) ve P. mirabilis'te 13 (%100,0), BlaAMPC geni E. coli'de 40 
(%90,9), K. pneumonia'da 10 (%100,0) ve P. mirabilis'te 4 (%30,8), BlaTEM geni tüm 
gram-negatif bakteri izolatlarında ve son olarak mecA, ermA ve ermC genleri S.aureus
izolatlarının tamamında 33 (%100,0) görülmüĢtür. Ġdrar yolu enfeksiyonu olan hastalar 
ve sağlıklı kontroller arasında TLR4-rs7873784 SNP ve TLR4-rs11536889 SNP 
genotipleri ve alellerinin karĢılaĢtırılmasında, homozigot CC ve heterozigot GC 
genotiplerinin önemli risk faktörleri olduğu tespit edilmiĢtir. Bu veriler, homozigot CC 
ve GC genotiplerine sahip hastalarda diğer genotiplere kıyasla hastalık geliĢme 
olasılığının daha yüksek oluğunu göstermiĢtir.

Abstract:
The aim of this study was to evaluate the relationship between functional gene 
polymorphisms (TLR4 rs7873784 and TLR4- rs11536889) and susceptibility to develop 
multidrug-resistant (MDR) bacteria in urinary tract infections (UTIs). For this purpose, 
a total of 350 urine samples were collected from men and women aged between 10 and 
75 years from Al-Rifai General Hospital in Thi-Qar province in southern Iraq between 
July 2022 and January 2023. While 150 (42.9%) of the collected samples showed 
positive results for bacterial growth culture, 200 (57.1%) samples showed negative 
results for bacterial growth culture. In the frequency distribution of the gender of 
patients suffering from multidrug-resistant bacteria in urinary tract infections, females 
(67%) had higher values than males (33%). The MDR bacterial pathogens causing UTI 
were Escherichia coli (44%), Staphylococcus aureus (33%), Klebsiella pneumoniae
(10%) and Proteus mirabilis (13%). In addition, BlaCTX-M gene was 36 (81.8%) in E. 
coli, 10 (100.0%) in K. pneumonia and 4 (30.8%) in P. mirabilis, BlaSHV gene was 13 
(29.5%) in E. coli, 10 (100.0%) in K. pneumonia and 13 (100.0%) in P. mirabilis, 
BlaAMPC gene was 40 (90.9%) in E. coli, 10 (100%) in K. pneumonia 10 (100.0%) 
and P. mirabilis 4 (30.8%), BlaTEM gene was found in all gram-negative bacterial 
isolates and finally mecA, ermA and ermC genes were found in 33 (100.0%) S. aureus
isolates. In the comparison of TLR4-rs7873784 SNP and TLR4-rs11536889 SNP 
genotypes and alleles between patients with urinary tract infections and healthy 
controls, homozygous CC and heterozygous GC genotypes were found to be significant 
risk factors. These data showed that patients with homozygous CC and GC genotypes 
were more likely to develop the disease compared to other genotypes.