Meme kanserinde RHO-kinaz gen polimorfizmi ile metastaz arasındaki ilişkinin araştırılması
Investigation of association between the RHO-kinase gene polymorphism and metastasis in breast cancer
Yazar: MEHMET EMİN KALENDER
Danışman: DOÇ. DR. ALPER SEVİNÇ
Gaziantep Üniversitesi / Tıp Fakültesi / İç Hastalıkları Ana Bilim Dalı / Tıbbi Onkoloji Bilim Dalı
Derece: Tıpta Yan Dal Uzmanlık, 2009
Konu: Onkoloji = Oncology
Dizin: Genler = Genes ; Meme neoplazmları = Breast neoplasms ; Neoplazmlar = Neoplasms ; Polimorfizm-genetik = Polymorphism-genetic ; Rhokinaz = Rhokinase ; Türk toplumu = Turkish society

Özet:
Bu çalışmanın amacı, Türk popülasyonunda Rho-kinaz enzimleri olan ve metastaz biyolojisinde etkinlikleri bilinen ROCK-1 ve ROCK-2 gen polimorfizmleri ile meme kanserinin metastaz yapma özelliği arasındaki muhtemel ilişkiyi araştırmaktır.Bu çalışmada, en az 5 yıl süreyle metastaz gelişmemiş meme kanseri olan hastalar (n=92), metastaz gelişmiş meme kanserli hastalar (n=101) ve herhangi bir hastalığı olmayan, sağlıklı bayan gönüllüler (kontrol grubu, n=128) çalışmaya alındı. Hastalardan ve kontrol grubundan alınan kan örneklerinden DNA izolasyonları yapıldı ve NCBI SNP data base (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/SNP/ snp_ref.cgi?locusId=6093)' den alınan primer ve problar ile LightCycler (Roche, Almanya) cihazıyla floresan PCR yöntemi kullanılarak erime eğrisi analizi yapıldı.ROCK-1 geni ekzon 6 ve ekzon 31 bölgelerinde kontrol grubu ile hasta grupları arasında anlamlı fark gözlenmemiştir (p>0.05). ROCK-2 geni Thr431Asn polimorfizmi için Thr-Thr, Thr-Asn ve Asn-Asn genotip frekansları kontrol grubuna göre karşılaştırıldığında nonmetastatik grupta anlamsız (p>0.05) bulunurken, metastatik grupta anlamlı farklılık saptanmıştır (p<0.05). Thr ve Asn allel frekansları bakımdan kontrol ve nonmetastatik grup arasında anlamlı bir ilişki bulunmazken (p>0.05), metastatik grupta anlamlı ilişki saptanmıştır (p<0.05). Kontrol grubu ile karşılaştırıldığında kemik, karaciğer ve akciğer metastazlarında Thr431Asn polimorfizmi genotip ve allel frekanslarında anlamlı ilişki olduğu belirlenmiş (p<0.05) ve metastatik gruplarda Thr-Thr genotipinin ve Thr allelinin anlamlı olarak yüksek, Thr-Asn genotipinin ve Asn allelinin anlamlı olarak düşük olduğu saptanmıştır (p<0.05).Bu araştırma meme kanserinde ROCK-1 ve ROCK-2 gen polimorfizmlerinin rolünü araştıran ilk çalışmadır. Elde edilen veriler ışığında ROCK2 genindeki Thr431Asn polimorfizminin, meme kanserinde metastaz gelişimini önceden tahmininde bir belirleyici olarak kullanılabilmesi mümkün görünmektedir.Anahtar Kelimeler: Meme kanseri, Rho-kinaz, ROCK2, Polimorfizm

Abstract:
The aim of the study was to evalute the relationship between breast cancer metastasis and ROCK-1 and ROCK-2 gene polymorphism in Turkish population.In this study, we enrolled patients with breast cancer without metastasis at least 5 years (n=92), metastatic breast cancer patients (n=101), and voluntary healthy women, with no disease (n=128). DNA has been isolated from blood samples of patients and control group. And meelting curve analyses has been made with PCR method at LightCycler (Roche, Germany) equipment with primary and probes from NCBI SNP data base (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/SNP/ snp_ref.cgi?locusId=6093).The frequency of Thr-Thr, Thr-Asn, and Asn-Asn genotype of ROCK2 gene?s Thr431Asn polymorphism was compared with control group and there was no statistical significance with non-metastatic group (p>0.05), but there was a statistical significance in the metastatic group (p<0.05). For Thr and Asn allel frequency, there was no statistical significance between control and non-metastatic group (p>0.05), but there was a statistical significance in the metastatic group (p<0.05). When compared with control group, there was a statistical significance in bone, liver, and lung metastasis for genotype and allel frequency of Thr431Asn polymorphism (p<0.05). The frequency of Thr-Thr genotype and Thr allel was significantly high, the frequency of Thr-Asn genotype and Thr allel was significantly lower in the metastatic group (p<0.05). At analyses of Arg83Lys polymorphism of ROCK2 gene, Lys-Lys genotype has not been seen and there was no statistically meaningful difference between groups (p>0.05).This research is the first project that evaluate the role of ROCK-1 and ROCK-2 gene polymorphisms in breast cancer. In the light of these findings, it is possible that the Thr431Asn polymorphism of ROCK-2 gene can be use as a marker for the early predictor of metastasis at breast cancer.Key words: Breast cancer, Rho-kinase, ROCK2, Polymorphism.