Hacettepe Üniversitesi Hastanelerindeki klinikörneklerden elde edilen acınetobacter baumannıı complex'in klorheksidin ve kolistin duyarlılıklarınınbelirlenmesi
Determination of sensitivity of acinetobacter baumanniicomplex to chlorhexidine and colistin obtained from clinical samples at Hacettepe University Hospitals
Yazar: ABDULLAH TOZLUYURT
Danışman: PROF. DR. CUMHUR ÖZKUYUMCU
Hacettepe Üniversitesi / Tıp Fakültesi / Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
Derece: Tıpta Uzmanlık, 2023
Konu: Mikrobiyoloji = Microbiology
Dizin: Antimikrobiyal ajanlar = Antimicrobial agents ; İlaçlara direnç-mikrobiyal = Drug resistance-microbial

Özet:
Acinetobacter baumannii complex (ABC)'in 2006'lı yıllarda yara yeri enfeksiyonu 
olarak ilk olgunun ortaya çıkmasından sonra tüm dünyaya yayılarak ve artan oranda 
antimikrobiyal direnç profilinin ortaya çıkması, WHO (Dünya Sağlık Örgütü)'nun bu
patojeni hedef tahtasına oturtmasını sağlamıştır. Neden olduğu enfeksiyonun tedavisi
yeni tedavi modaliteleri piyasaya sürülmesinin ardından gelişen direnç nedeniyle
komplike bir duruma dönüşmüştür. Hem kromozomal hem de hareketli genetik 
yapılar olması bakımından, çok yetenekli bir patojene ile yıllardır maruz 
kalmaktayız. Bu çalışmanın amacı, ABC izolatlarında kolistin ve klorheksidin 
arasında çapraz direncin olup olmadığı ve kolistine karşı direnç profilini ortaya 
çıkartmaktır. Dolayısıyla, çalışma; kan kültürü, BAL, DTA gibi bölgelerde
enfeksiyon yapan ABC'nin izole edilmesi, kolistin ve klorheksidin duyarlılık
profilinin ortaya çıkarılması ve klonal varlığının çeşitliliğinin tesbiti üzerine
dayanmaktadır. Çalışmaya dahil edilen 100 A. baumannii izolatı için, EUCAST
(EUROPEAN COMMITTE ON ANTIMICROBIAL SUSCEPTIBILITY TESTING)
klinik eşik ve sıvı mikrodilüsyon önerilerine göre kolistin ve klorheksidin duyarlılık
profili belirlenmiştir. 15 izolatta kolistin direnci, on yedi izolatta ise 17 klorheksidin
orta duyarlı izolat bulunmuştur. Yalnız bir 1 izolatta, hem klorheksidin orta
duyarlılık hem de kolistin direnci saptanmıştır. A. baumannii dışında yapılan diğer
bakterilerle pleiotropik direncin araştırılması için yapılan in-vitro deneylere göre, A. 
baumannii'de kolistin direncinin, klorheksidinin maruziyetiyle kazanmasının
uyumun maliyeti olabileceğini ifade edebilmesi için ileri deneylere gereksinim
vardır. Ayrıca kolistin direnci olan ABC izolatı için, PFGE (Pulsed Field Gel 
Electrophoresis) yapılmış olup yedi farklı klon saptanmıştır. Bu çalışma klorheksidin
ile kolistin arasındaki ilişkiyi A. baumannii'de inceleyen ilk çalışma olup, başta İç
Hastalıkları Yoğun Bakım Ünitesinde, klorheksidin azalmış duyarlılığın ve kolistin
direncinin diğer yataklı bakım servislerine göre daha yüksek olduğu, kolistin dirençli 
enfeksiyon etkenlerinin tek bir klondan kaynaklanmayıp yedi farklı klondan
kaynaklandığı ortaya çıkarılmıştır.

Abstract:
Acinetobacter Baumannii Complex (ABC) covers all over the
world soonafter the emergence of the first case occured as a wound site infection
in 2006 andthe emergence of an mounting number of antimicrobial compound with 
which the pathogens concerned could fight, which enabled WHO (World Health 
Organization) to locate this pathogen on the first rank. The treatment of the infection 
has become complicated due to the resistance that was developed following the 
introduction of new treatment modalities. Therefore, after isolation and identification 
of the agent, it is vital to reveal an accurate antibiogram resistance profile, however 
another problemthat need to be overcome is that it is necessary to wait every other 
day for the antibiogram testing. We have been exposed to a highly skilled pathogen 
for years, given that both chromosomal and mobile genetic elements exploited. The 
aim of this study was to identify pathogen of interest, decipher susceptibility patterns
to antimicrobials and elaborate if there was in exist a cross-resistance between the
chlorhexidine and colistin in. ABC. Accordingly, The study was composed in the
isolation of ABC that infects in part of the body such as blood culture, lavage fluid,
tracheal aspirate material, on the detection of the susceptibility profile of colistin and
chlorhexidine and determination of the diversity of clonal presence. The colistin and
chlorhexidine resistance profiles were determined according to 100 isolates of A.
baumannii, EUCAST clinical margin and broth microdilution guidelines. The
colistin resistance was found in 15 isolates and chlorhexidine intermediate
susceptibility was found in 17 isolates. In an isolate, both chlorhexidine intermediate 
sensitivity and colistin resistance were detected. According to in-vitro experiments 
thus far conducted to investigate pleiotropic resistance in other pathogensother than 
A. baumannii, it is stated that the colistin resistance in A. baumannii may befitnesscost with exposure to chlorhexidine. Among the A. baumannii isolates showing 
resistance to colistin, the number of 7 different clones were detected by performing 
PFGE (Pulsed Field Gel Electrophoresis). These thesis is the first study to examine 
the relationship between chlorhexidine and colistin. In this thesis, it has been
revealed that bacteria in especially the Internal Diseases Intensive Care Unit have 
decreased sensitivity to chlorhexidine and colistin resistance is higher than other 
inpatient care units one, and ones conferring resistance to colistin do not originate 
from a single clone, however from seven different clones.