hakansabunis/tr-academic-research-agent-index huggingface dataset:
Gallik asitin apoptotik etkisinin belirlenmesi
The determi̇nati̇on of apoptoti̇c effect of galli̇c aci̇d
Yazar: EBRU TURHANLAR
Danışman: YRD. DOÇ. ASUMAN DEMİROĞLU ZERGEROĞLU
Gebze Yüksek Teknoloji Enstitüsü / Mühendislik ve Fen Bilimleri Enstitüsü / Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2014
Konu: Biyoloji = Biology ; Onkoloji = Oncology

Özet:
İlk defa 1960 yılında keşfedilen Malignant Mezotelyoma (MM), dünya üzerinde yaygınlığı gittikçe artan, teşhisi zor ve ilaç tedavisine dirençli bir kanser türüdür. Bugüne kadar tedaviye yönelik etkin ajanların yetersizliği bu alandaki çalışmaları hızlandırmaktadır. Bu tez çalışmasında, birçok meyvede bulunan ve bazı kanserlerde anti-proliferatif ve apoptotik olduğu belirtilen gallik asitin (GA) MM hücrelerindeki apoptotik etkisi araştırılmıştır. Öncelikle GA'nın MM hücrelerine etkisi morfolojik olarak incelenmiştir. Ardından, GA'nın apoptotik etkisini belirlemek amacıyla DNA merdivenlenmesi analizi yapılmış ve kaspaz 8 ve 9 moleküllerinin enzimatik aktiviteleri ve protein seviyeleri incelenmiştir. İlaveten GA aracılığıyla düzenlenen apoptozun stresle aktive olan sinyal yolaklarıyla bağlantısı araştırılmıştır. Son olarak GA'nın p53 ve PARP protein seviyelerine etkisi belirlenmiştir. 
	Sonuçlarımız doğrultusunda GA, 100 µM dozda zamana bağlı olarak iç ve dış apoptotik yolağın aktivasyonuna neden olmuştur. Her iki apoptotik yolağın aktivasyonunda JNK yolağının değil p38 yolağının katkısının olduğu tespit edilmiştir. P53 aktivasyonunun GA ile indüklenen hücrelerde p38 yolağı bağlantılı olabileceği düşünülmektedir.
Anahtar Kelimeler: Gallik Asit, Apoptoz, Malignant Mezotelyoma, Kaspaz.

Abstract:
Malignant Mesothelioma (MM), discovered by Wagner and his friends in 1960, is a type of cancer, which has poor diagnosis and resistance to drug therapy. Insufficiency of effective agents in therapy has accelerated research in this field. In this thesis, we investigated, in MM, the apoptotic effects of gallic acid (GA), which is found in many fruits and has been known to have anti-proliferative and apoptotic effects in some cancers. Firstly, the effect of GA on MM cells was investigated morphologically. Then, to determine the apoptotic effects of GA, a DNA fragmentation analysis was performed and the protein levels and enzymatic activities of caspase-8 and caspase-9 were analyzed. In addition, we searched the connection between the GA-coordinated apoptosis and the stress-activated signalling pathways. Finally, we determined the effect of GA on the p53 and PARP protein levels.
	According to our results, GA, in 100 µM dose and time-dependently, caused the activation of both intrinsic and extrinsic apoptotic pathways. We established that p53 signalling pathway but not JNK pathway contributed to the activation of these two apoptotic pathways. We think that the p53 activation in GA-induced cells might be linked with the p38 signalling pathway.
Key Words: Gallic Acid, Apoptosis, Malignant Mesothelioma, Caspase.
İlk oluşum anındaki evreni temsil eden dalga fonksiyonun wheeler de-witt denklemini çözerek bulması
Finding of the wave function whi̇ch represents universe at the first occurence of the moment by using wheeler de-wi̇tt equation
Yazar: NAZİRE CİHANNUR TATAS
Danışman: YRD. DOÇ. YÜCEL ENGİNER
Gebze Yüksek Teknoloji Enstitüsü / Mühendislik ve Fen Bilimleri Enstitüsü / Matematik Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2014
Konu: Matematik = Mathematics

Özet:
Bu tez çalışmasının amacı erken evren safhasını Wheeler De-Witt denklemini  çözerek incelemektir. Wheeler De-Witt denklemi evrenin dalga fonksiyonunu, bağımsız  değişken olan evrenin yarıçap fonksiyonu ve de inflatona  bağlı kabul eder. Evrenin dalga fonksiyonu ise bağımlı değişkendir. Yani, Wheeler De-Witt denklemi kısmı türevli bir diferansiyel denklemdir. Bu çalışmada evrenin yarıçap fonksiyonunun skalar alana göre birinci dereceden türevi sabit kabul edilir ve yarıçap fonksiyonunun sıfır ile bir aralığındaki ve de birden büyük olduğu değerlere göre dalga fonksiyonu çözülmeye çalışılır.

Abstract:
Aim of this thesis is to analysis the phrase of early universe by using Wheeler De-Witt equation. Wheeler De-Witt equation accepts the wave function of the universe is dependent to the radius function of universe and the inflaton which are the independent variables. As for the wave function of the universe, it is a dependent variable. So Wheeler De-Witt equation is a partial differential equation. İn this work, the radius of the universe function's first order derivation is assumed to be constant acording to inflaton. And wave function is tried to solved as radius function's valiues both between zero and one and grater than one.
Cl-387,785'in malignant mezotelyoma hücrelerinde anti-karsinojenik özelliklerinin incelenmesi /
Yazar: FATMA SAĞIR
Danışman: YRD. DOÇ. DR. ASUMAN DEMİROĞLU ZERGEROĞLU
Gebze Yüksek Teknoloji Enstitüsü / Mühendislik ve Fen Bilimleri Enstitüsü / Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2014
Konu: Biyoloji = Biology

Özet:
Bu tez çalışmasında, epidermal büyüme faktörü reseptörü (EGFR) inhibitörü olan CL-387,785 (CL) 'in mezotelyal ve malignant mezotelyoma (MM) hücreleri (Met5A, SPC212) proliferasyonuna, MAPK, PI3K/AKT yolakları ve aşağı akımındaki moleküllere etkisi incelenmiştir. Bu kapsamda, Epidermal büyüme faktörü (EGFR), ekstrasellüler düzenlenen protein kinaz (ERK), stres aktifleyici protein kinaz/ c-Jun N-terminal kinaz (SAPK/JNK) ile p38 protein kinaz (p38 MAPK) ve Protein kinase B (PKB/AKT)  moleküllerinin protein; ELK-1, JUN, STAT1, STAT3 ve STAT5A moleküllerinin mRNA düzeyinde araştırılması planlanmıştır.
Bu araştırma sonucunda, CL her iki hücre üzerinde konsantrasyona ve zamana bağımlı anti-proliferatif etki göstermiştir. EGFR fosforilasyonunun 100 nM ve üzerindeki konsantrasyonlarda, tamamiyle inhibe edildiği belirlenmiştir. ERK ve AKT fosforilasyonu aynı konsantrasyonun üzerinde engellenirken; toplam ERK ve AKT seviyelerinde değişim gözlenmemiştir. İlaveten stresle aktif olan diğer MAPK moleküllerinden JNK ve p38 'in fosforilasyon ve toplam protein seviyelerinde de değişiklik olmadığı tespit edilmiştir. Bu sonuçlara ek olarak, Jun, ELK-1 ve STAT1 mRNA seviyelerinde 6 saat içinde azalma belirlenirken, STAT3 ve STAT5a gen ifadelerinde herhangi bir anlamlı değişim belirlenmemiştir.

Anahtar Kelimeler: Kanser, Mezotelyoma, EGFR, İnhibitör, CL 387,785, Sinyal 
İletimi.

Abstract:
In this study, we aim to evaluate the effects of EGFR inhibitor, CL-387,785, in  mesothelioma and malign mesothelioma cell lines Met5A and SPC212 respectively. 
Firstly, alteration of cell proliferation was investigated. Then, protein profiles of EGFR, ERK, JNK, p38 MAPK and PKB/AKT and finally, gene profiles of transcription factors including ELK-1, JUN, STAT1, STAT3 ve STAT5A were analyzed. Our results showed that CL inhibited proliferation of both cell lines at concentration and time dependent manner. It also reduced EGFR, ERK and AKT phosphorylations at 100 ng>. However, CL did not affect JNK and p38 protein phosphorylations and expressions. mRNA analysis indicated that c-jun and ELK-1 and STAT1 levels were down regulated in 6 hours, although STAT3 and STAT5A levels remain unchanged.

Key Words: Cancer, Mesothelioma, EGFR, Inhibitor, CL 387,785, Signal 
Transduction Pathway
Lityum iyon piller için nano yapılı katot aktif maddesinin sentezlenmesi.
Nano structured cathode active material synthesis for lithium ion batteries
Yazar: MEHBARE DOĞRUSÖZ
Danışman: PROF. DR. ALİ ATA ; YRD. DOÇ. DR. REZAN DEMİR ÇAKAN
Gebze Yüksek Teknoloji Enstitüsü / Mühendislik ve Fen Bilimleri Enstitüsü / Malzeme Bilimi ve Mühendisliği Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2014
Konu: Metalurji Mühendisliği = Metallurgical Engineering

Özet:
Lityum iyon piller gündelik hayatımızda cep telefonları ve taşınabilir bilgisayarda yaygın olarak kullanılmaktadır. Lityum iyon piller sahip oldukları yüksek enerji yoğunluğu ve çok uzun süre şarj-deşarj edilebilme özelliği nedeniyle tercih edilmektedir. Lityum iyon pillerde kapasiteyi sınırlayan asıl malzeme katot aktif maddesidir. Katot aktif maddesi olarak LiCoO2 1994 yılından bu yana kullanılmaktadır. Ancak nanoteknolojideki son gelişmeler, yeni sentezleme yöntemlerinin uygulanması ile katot aktif maddesinin de nano ölçekte üretilerek kapasitenin artırılabileceğini göstermiştir. Bu tez çalışmasında sol-jel, birlikte çöktürme ve sükroz yakması yöntemleri ile nano ölçekte tabakalı LixMnyNizO2 yapıları sentezlenmiştir. Bu yapılarda Li2MnO3 fazı oluşturularak kapasiteyi artırıcı etkisi incelenmiştir. İkili yada üçlü katı fazlar içeren yapılar XRD, SEM, TEM yöntemleri kullanılarak kristal yapısı ve tane boyutu araştırılmıştır. Ayrıca CV, kronopotansiyometri ve empedans ölçümleri yapılarak elektrokimyasal karakterizasyonu yapılmıştır.

Anahtar Kelimeler: Lityum iyon pil, Nano yapı, Katot Aktif Maddesi

Abstract:
Li ion batteries are used widely in daily life by laptops and computers. Lithium ion cells generally are preferred for mobile applications because of their high energy density and high charge-discharge capability. The discahrge capacity is restricted by cathode side of lithium ion cells. LiCoO2 has been used as a cathode active material since 1994. However the recent nanotechnological developments and novel synthesis methods show that nano scale products can have greater discharge capacity. In this study nano scale layered LixMnyNizO2 are synthesised by using sol-gel, co-precipitation and sucrose combustion methods. In this structure Li2MnO3 phase is formed that inrease the discharge capacity. Formed binary and ternary solid phases are investigated with XRD, TEM and SEM tecniques. Also CV, Chronopotensiometry and impedance tests are applied for electrochemical caracterization of materials.

Key Words: Lithium ion battery, Nano- structured materials, Cathode 
active materials
Gemi inşaatında yalın üretim ve değer akış haritalaması
Lean production and value stream mapping in shipbuilding
Yazar: ERDOĞAN ERGÜNEŞ
Danışman: DOÇ. DR. RAMAZAN KAYNAK
Gebze Yüksek Teknoloji Enstitüsü / Sosyal Bilimler Enstitüsü / İşletme Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2014
Konu: İşletme = Business Administration
Dizin: Değer akışı haritalama = Value stream mapping ; Gemi inşaat sektörü = Shipbuilding sector ; Gemi inşaatı = Shipbuilding ; Gemi inşaatı endüstrisi = Shipbuilding industry ; Yalın üretim = Lean production ; Üretim = Production ; Üretim süreci = Production process

Özet:
Günümüzde rekabetin en önemli unsurlardan biri maliyet diğeri ise teslim
süresidir. Bu nedenle teslim süresi ve maliyetin düşürülmesi son derece önemlidir.
Özellikle proje bazlı üretim yapan ve zaman, maliyet baskısı son derece yüksek olan
gemi inşaatı sektörü için.
Gemi inşaatı geniş bir ekipman parkı, malzeme, çelik konstrüksiyon, boru,
makine, mobilya gibi birçok farklı uzmanlık gerektirir. Bu nedenle çok komplike bir
sektördür. Bu çalışmada öncelikle 1950 yılında Japonya Toyota fabrikasında doğan bir
üretim felsefesinden bahsedilmiştir.
Bu çalışmanın amacı Yalın felsefin gemi inşaatı sektöründe uygulanabilirliğini ile
ilgili araştırma yapılmıştır. Değer akışı haritaları çizilerek mevcut durum ile gelecek
durum karşılaştırılmıştır.
Bu çalışmanın sonucunda mevcut durum üzerinde yapılacak bazı iyileştirmeler ile
teslim süresi ve işçilik maliyetinde önemli ölçüde iyileştirmeler olacağı görülmüştür.


Anahtar Kelimeler: Yalın Üretim, Değer Akış Haritalaması, Gemi Đnşaatı Üretim Süreci

Abstract:
In today's the most important part of competition is delivery time and cost.
Therefore it is so important to decrease the delivery time and cost. Especially those two
components are more important for ship building industry which is project based and
high pressure of time and budget.
The production of vessels requires a wide range of equipment, materials and
specialized services such as steel construction, piping, machinery, carpenter..ect.
Therefore it is so complicated. In this study firstly lean manufacturing philosophy that
was raised in Toyata factory in Japan in 1950 was explained.
The purpose of this study is to investigate the way of applying lean philosophy in
ship building industry. In order to gain this purpose value stream mapping was used.
Current and future condition map was crated and compared
The result of this study after compere actual value mapping with future value
mapping there is significant improvement on delivery time and labor cost.



Key Words: Lean Manufacturing, Value Stream Mapping, Ship Construction Process
Güç hatları üzerinden iletişim ile akıllı priz kontrolü sağlayabilecek gömülü sistem donanım tasarımı
Embedded system design of smart plug control with power line communication
Yazar: ÖNER HATİPOĞLU
Danışman: DOÇ. DR. ERKAN ZERGEROĞLU
Gebze Yüksek Teknoloji Enstitüsü / Mühendislik ve Fen Bilimleri Enstitüsü / Elektronik Mühendisliği Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2014
Konu: Elektrik ve Elektronik Mühendisliği = Electrical and Electronics Engineering
Dizin: Elektronik haberleşme = Electronic communication

Özet:
Günümüz evleri, akıllı ev sistemlerinin kullanılması ile beraber güvenlik, konfor ve teknoloji açısından giderek gelişmektedir. Benzer olarak akıllı şebekelerin kurulması, elektrik enerjisinin dağıtımı ve tüketiminde daha akıllı kontrol tekniklerinin uygulanmasını sağlamaktadır. Alt yapıdaki bu gelişmeler ve ev içi akıllı uygulamaların birleşmesi ile kullanılan enerjinin verimliliği, izlenilebilirliği ve kontrol edilebilirliği ön plana çıkmaktadır. 
Bu çalışmada akıllı evlerin alt yapısının kurulmasında kullanılabilecek ve güç hatları üzerinden haberleşmenin sağlandığı yeni bir akıllı ev uygulaması olan iPlug sistem tasarımı üzerine çalışılmıştır. Tasarımı yapılan iPlug sistemi, mevcut evlerin minimum maliyet ile akıllı evlere dönüştürülmesini, ev içi cihazların kontrolünün yapılamasını ve ev içi güç tüketiminin izlenebilmesini sağlamaktadır. Tez çalışmasının içeriği iPlug sisteminin tasarlanması, sistemin performansının incelemesi ve elde edilen bulguların paylaşılması olarak belirlenmiştir.

Abstract:
Today's homes are developing in terms of technology, security and comfort with the use of smart home systems. Also, the establishment of smart grids ensure the implementation of intelligent control techniques in distribution and consumption of electrical energy. Thus, the efficiency, traceability and controllability of the usage energy are highligted with the merge of the developments in infrastructure and the smart home applications.
In this work, the iPLUG sytem, a new smart home application, which is used in the establishment of the smart home structure and is provided the communciation on power line, is studied. The iPlug system provides that converting the existing homes to smart homes with minimum cost-up, controling the inhouse devices and monitoring the power consumption. The content of thesis includes iPlug system design, system performance analysis and the sharing of the obtained datas.
Day kazan siklonu performansının HAD ile incelenmesi
Evaluation of CFB boiler cyclone's performance with CFD
Yazar: MEHMED AKİF PAKSOY
Danışman: YRD. DOÇ. DR. SALİH ÖZEN ÜNVERDİ
Gebze Yüksek Teknoloji Enstitüsü / Mühendislik ve Fen Bilimleri Enstitüsü / Makine Mühendisliği Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2014
Konu: Enerji = Energy ; Makine Mühendisliği = Mechanical Engineering

Özet:
Bu çalışmada bir DAY kazan siklonunun performansı HAD ve matematiksel modellerin beraber kullanımını öngören hibrit bir model ile incelenmiştir. Bu yeni modelde matematiksel modellerin yetersiz kaldığı noktalarda HAD metodundan faydalanılmış, HAD metodunun zayıf kaldığı noktalarda da matematiksel modellerden faydalanılmıştır. Bu kapsamda birinci adımda bir DAY kazan siklonunun performansı matematiksel modeller ile hesaplanmıştır. İkinci adımda ise HAD analizleri ve matematiksel modeller beraber kullanılarak tekrar siklon performansı hesaplanmıştır. Sonuçlar karşılaştırıldığında ikinci adımda (hibrit model) ile bulunan siklon performansının matematiksel modellere göre daha doğru sonuç verdiği görülmüştür.

Abstract:
In this work, performance of a CFB boiler cyclone is evaluated with a hybrid model which uses CFD and mathematical models together. In this new model CFD method is used to model weak points of mathematical models and mathematical models are used to model weak points of CFD. In this scope, as the first step, a CFB boiler cyclone's performance is calculated by mathematical models. In the second step, efficiency of the cyclone is recalculated by using CFD analysis together with mathematical models. When the results are compared, it is shown that cyclone performance found in the second step (hybrid model) is more accurate than those predicted by mathematical models.
Güç hatları üzerinden iletişim ile akıllı priz kontrolü ve medya aktarımı sağlayabilecek sistem tasarımı.
System design of smart plug control and media transfer with power line communication.
Yazar: YETİŞKAN ELİAÇIK
Danışman: DOÇ. DR. ERKAN ZERGEROĞLU
Gebze Yüksek Teknoloji Enstitüsü / Mühendislik ve Fen Bilimleri Enstitüsü / Bilgisayar Mühendisliği Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2014
Konu: Bilgisayar Mühendisliği Bilimleri-Bilgisayar ve Kontrol = Computer Engineering and Computer Science and Control

Özet:
Günümüz akıllı evlerindeki araştırmalar, güvenlik, konfor ve enerji yönetimi alanlarına odaklanmıştır. Ayrıca, ev içindeki birçok cihazın birbiriyle haberleşmesi, kontrol etmesi nedeniyle akıllı ev sistemleri, multimedya sistemleri ile de haberleşen sistemler haline gelmiştir. Bu tez çalışması ile Beaglebone adı verilen gömülü sistem ile mevcut evlerin ev içi elektrik hattı alt yapısında herhangi bir değişiklik gerektirmeden, güç hatları üzerinden haberleşme ile akıllı evlere dönüştürülmesini ve bu sistem ile bağlı cihazların uzaktan kontrolünü sağlayarak enerji tüketimini azaltan, iPLUG isimli bir sistem tasarımı üzerinde çalışılmıştır. Tez çalışması, iPLUG sistemi ile elektrik hattı üzerinden medya transferi, bağlı cihazların kontrolü, enerji tüketimin ölçülmesi ve bu sistemin performansının incelenmesi sonucundaki çıktıların paylaşılması şeklindedir.

Abstract:
Present research in smart home are focused on security, comfort and energy management. In addition, many devices in the home are control and communicate with each other, as well smart home systems should communicate with other multimedia systems in the home. In this thesis, using the Beagleboned named embedded system, current homes transform into smart homes without any modification in-house powerline infrastructure with power line communication and, supplying with the remote control of the connected devices ensuring that reduces energy consumption system has been working which is called iPLUG. Thesis work includes design, performance analysis and sharing the obtained data of iPLUG system, which has capability of media transfer and power control and consumption of connected devices via power line.
Çamaşır makinesi program seçim düğmesinde kullanıcıların kalite algısını etkileyen temel faktörleri belirleme
Identifying basic factors affecting users' perception of quality in washing machine program selector
Yazar: MUAZ SALİH KURNAZ
Danışman: DOÇ. DR. MEHMET GÖKTÜRK
Gebze Yüksek Teknoloji Enstitüsü / Mühendislik ve Fen Bilimleri Enstitüsü / Bilgisayar Mühendisliği Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2014
Konu: Bilgisayar Mühendisliği Bilimleri-Bilgisayar ve Kontrol = Computer Engineering and Computer Science and Control
Dizin: Kullanıcı tatmini = User satisfaction ; Kullanım etkinliği = Use efficiency

Özet:
Tüketici elektroniğinde fonksiyonelite ve dayanıklılık esasları hemen hemen tüm üründe aynı seviyeye ulaşmış ve daha önceleri göz önünde bulundurulmayan birtakım ayırdedici değişikliklerin ortaya çıkmasına yol açmıştır. Ayrıca teknolojik tasarımın hızla ilerlemesiyle insanların kontrol edeceği değişken sayısı artmış, buna karşın insanların algısal kapasitesinde herhangi bir ilerleme olmamıştır. Dolayısıyla teknolojik olarak kapsamlı ve detaylı ürünlerde kullanılabilirlik sorunu ve kalite algısı gözlemlenmiştir.
Yapılan bu çalışmada döner düğme ve çevre birimlerini kullanan tüketicilerin kalite algısınınsayısallaştırılması hedeflenmektedir. Bu amaçla ön çalışmada oldukça önemli olduğu anlaşılmış olan döner düğme ve çevre birimleri ile algısal kalite ilişkisi ve kullanılabilirliği incelenmektedir. 
Hazırlanmışolan deney prototipi, üzerine farklı döner düğme başlarının takılabileceği bir şaft ve bu şaftın arkasında, normal şartlarda kullanıcının alması beklenen haptik geribildirimleri yaratabilecek olan DC motor,tork sensörü, kontrol ünitesi ve deney yazılımından oluşmaktadır.
Döner Düğme özelliklerin çıkarılması için bilgisayar destekli ölçme sistemi gerçekleştirilmiş, bu özellikler kütüphane olarak saklanmıştır. Hazırlanan senaryolar, kullanıcı etkileşim laboratuvarı şartlarında belirli bir kullanıcı grubu ile test edilmiş, elde edilen veriler ve geri bildirimler analiz edilmiştir.

Abstract:
In consumer electronics, functionality and durability basis reach same level almost all product and this causes some new distinctive changes. Also, number of variants controlled by humans is increased by technological movement, although there is no improvement in the human sensory capacity. Therefore, the quality perception and utilization problems of techonologically comprehensive goods are monitored. 
This study focuses to numerize the consumer quality perception who uses rotary knob and peripherals. To do that, rotary knob, which is shown very important by pre-studies, peripherals and utilization is examined. 
Prepared experiment prototype is constructed with a shaft installed with  different rotary knob title, DC engine, which is created by users' haptic feedback, torque sensor, control unit, and experiment software. 
In order to show the properties of rotary knob, computer supported measurement system is created supported and these properties are kept in a library. 
Prepared scenarios are analyzed with the datas and feedbacks which are collected from a particular user group under user interaction laborator circumstances.