Flow sitometri ile bazı ıspanak aksesyonlarının çekirdek DNA içeriklerinin belirlenmesi
Determination of nuclear DNA content of some spinach accessions by flow cytometer
Yazar: ÖZCAN YAVAŞ
Danışman: DOÇ. DR. MURAT DEVECİ
Namık Kemal Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Bahçe Bitkileri Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2017
Konu: Ziraat = Agriculture
Dizin: Bitki fizyolojisi = Plant physiology ; Bitki ıslahı = Plant breeding ; Sitogenetik = Cytogenetics

Özet:
Bu araştırmanın amacı, ülkemiz koşullarında kışlık sebze olarak performanslarının belirlenmesi için yurt içi ve yurt dışından elde edilmiş olan 53 ıspanak (Spinacia olercea L.) aksesyonunun flow sitometri ile ilk defa ploidi düzeylerini belirlemektir. Araştırma verilerine göre; Çekirdek DNA içerikleri arasında ıspanak aksesyonlarının istatistiki olarak önemli (P<0.01) olduğu saptanmıştır. Araştırmada kullanılan ıspanak aksesyonlarının ortalama çekirdek DNA içeriği 2,225 pg/2C ile 2,059 pg/2C arasında değişmektedir. En yüksek ortalama 2.225 pg ile PI 222270 aksesyon numaralı Esfenaj çeşidi olduğu belirlenmiştir. En düşük değerin 2.059 pg PI 531451 nolu aksesyon numaralı Matador çeşidi olduğu belirlenirken, bu aksesyonu aynı önem grubunda bulunan PI 499373 aksesyon numaralı Godir çeşidi takip etmiştir. Ispanak çekirdek DNA içerikleri genelde 0.003 ile 0.096'lık bir standart sapma ile birbirine oldukça yakın olduğu gözlenmiştir. Elde edilen bu sonuçlardan populasyonların saf olup, başka tür ve varyeteye ait bitki içermediği sonucuna varılmıştır. Ispanağın çekirdek DNA analiz sonuçlarına göre çalışılan tüm ıspanak aksesyonlarının aynı ploidi seviyesine sahip olduğu şeklinde düşünülmüştür. Çekirdek DNA içeriği bakımından farklılık gösteren bazı bitkilerin kromozom sayıları 2n=12 olarak saptanmış ve dolayısıyla diploid oldukları belirlenmiştir. Bu nedenle çalışmada kullanılan aksesyonların tamamının diploid olduğu kabul edilmiştir. 2C DNA içeriklerine göre Ward metodu ile yapılan kümeleme analizi sonuçlarına göre iki ana küme altında sekiz farklı kümenin oluştuğu görülmüştür. Aksesyonların kümelenmesi çoklu karşılaştırma testi benzer şekilde gerçekleşmiştir.
Bu veriler sonucunda yapılan çalışmaya konu olan 53 ıspanak aksesyonu ile ileride yapılacak ıslah çalışmalarında araştırmacılara önemli bir zaman ve emek sağlayacaktır.

Abstract:
The aim of this research is to determine the core DNA content of 53 spinach (Spinacia olercea L.) accesions obtained from domestic and abroad sources for the flow cytometry. Ploidy levels of accesions were determined and chromosome numbers were counted within the varition group (P <0.01). The average core DNA content of spinach accesions used in the study ranged between 2.225 pg / 2C and 2.059 pg / 2C. The highest average core DNA content (2.225 pg) was obtained from PI 222270 Esfenaj variety while the lowest value (2.059 pg) was obtained from PI 222270 Matado variety, followed by PI 499373 Godir variety. The core DNA contents of accesions were shown to be relatively stable with standart deviation of 0.003 to 0.096. Results indicate that genotypes were consistent with the same ploidy levels within the group. Because of the numbers of genotypes that differ in nuclear DNA content was measured as 2n=12, they indicate that all accesions are expected to be diploid. For this reason, it is assumed that all of the accesions used in the study are diploid. According to the clustering analysis results of the 2C DNA contents by the Ward method, it was observed that eight sub clusters were formed under two main clusters. The clustering of axioms was performed in a similar manner to the multiple comparison test. As a result, this data will save time and labor convenience in the breeding study to be done with the 53 spinach occasions which is the study subject.