Gastrointestinal sistem kanserlerinde metilentetrahidrofolat redüktaz geni 677 CT, 1298 AC ve metiyonin sentetaz geni 2756 AG polimorfizmlerinin incelenmesi
The investigation of MTHFR 677 CT,1298 AC and MTR 2756 AG polymorphisms in gastrointestinal cancer
Yazar: NAZİFE TAŞÇIOĞLU
Danışman: PROF.DR. YUSUF ÖZKUL
Erciyes Üniversitesi / Sağlık Bilimleri Enstitüsü / Tıbbi Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2005
Konu: Gastroenteroloji = Gastroenterology ; Onkoloji = Oncology ; Tıbbi Biyoloji = Medical Biology

Özet:
Metilentetrahidrofolat redüktaz (MTHFR) ve metiyonin sentetaz (MTR) genleri folatmetobolizmasının anahtar rolü oynayan genlerindendir. MTHFR geninde 677CâT ve1298AâC, MTR' de ise 2756 AâG polimorfizmleri en yaygın görülenpolimorfizmlerdir. Çalışmamızda gastrointestinal sistem kanserli 64 hastanın (41 kolonve 23 mide karsinomlu vaka) ve 40 sağlıklı kontrolün periferal kan örnekleri alınarakDNA izolasyonu yapıldı. MTHFR geninde 677CâT ve 1298AâC, MTR' de2756AâG polimorfizmleri PCR ve RFLP analizi yapılarak belirlendi. 64 G S kanserlihastada MTHFR 677CC, 677CT, 677TT genotipleri sırasıyla 26(%41), 31(%48),7(%11); kontrol grubunda ise 15(%37.5), 23(%57,5), 2(%5) olarak tespit edildi.MTHFR 1298AâC polimorfizmi 64 G S kanserli hasta arasında 34(%53)'ü 1298AC ve29(%45,5)'u 1298AA; 40 sağlıklı kontrol arasında 20(%50)'si 1298AC ve 20(%50)'si1298AA bulundu. Sadece bir hasta 1298AâC polimorfizmi açısından 1288CC(homozigot mutant) bulundu ancak bu sonuç istatiksel bir değer ifade etmemektedir.MTR 2756 AâG polimorfizmi 64 G S kanserli hastada 8(%5)' i 2756GG, 23(%45)'i2756AG, 33(%50)'ü 2756AA olarak; 40 sağlıklı kontrolde ise 4(%10)'ü 2756GG,16(%40)' sı 2756AG, 20(%50)' si 2756AA tespit edildi.Bu bulgular GS kanserlerinde MTHFR 677CâT ve MTR 2756AâGpolimorfizmlerinin çok önemli olduğunu işaret etmektedir. Fakat bu genlerinpolimorfizimlerinin folat düzeyleriyle ilişkilerinin incelendiği daha geniş hastagrubundaki çalışmaların bizim görüşümüzü destekler nitelikte olacağı kanısındayız.Anahtar kelimeler: MTHFR, MTR, folat

Abstract:
Both methylenetetrahydrofolate reductase (MTHFR) and methionine synthases (MTR)are genes play key role in folate metobolism. The most common polymorphisms areMTHFR 677CâT , 1298AâC substitions and 2756AâG polymorphism of MTR.In Our study, peripheral blood samples we obtained from 64 GIS cancer?s cases and 40controls, DNA was extracted from these samples. MTHFR 677CâT, 1298AâC andMTR 2756AâG variant alleses were determined by PCR-RFLP assay. Frequencies ofMTHFR 677CC, 677CT and 677TT genotypes were 26(%41), 31(%48) and 7(%11) inthe GIS cancer?s cases and 15(%37,5), 23(%57,5) and 2(%5) in the controls.Frequencies of MTHFR 1298AA and 1298AC genotypes were 29(%45,5), 34(%53) inthe GIS cancer?s cases and 20(%50), 20(%50) in the controls, respectively. For MTHFR1298, we found homozygous mutant only one case of G S cancer?s but this findinghaven?t any statistical value. Frequencies of MTR 2756AA, 2756AG, 2756GGgenotypes were 33(%50), 23(%45) and 8(%5) in the G S cancer?s cases and 20(%50),16(%40) and 4(%10) in the controls, respectively.In our study MTHFR 677CâT and MTR 2756AâG polymorphisms are veryimportant sign for GIS carcinomas at the result. But the possible association of this genepolymoprhisms with the folate levels, merits further study in larger populations and wethink that this further studies will support our idea.Key words: MTHFR, MTR, folate