Mitokondriyal MOTS-C geni nükleotit varyasyonlarının nonalkolik yağlı karaciğer hastalığı etyopatogenezi ile ilişkisi
The associ̇ati̇on of mi̇tochondri̇al MOTS-C gene nucleoti̇de vari̇ati̇ons wi̇th the eti̇opathogenesi̇s of non-alcoholi̇c fatty li̇ver di̇sease
Yazar: AYÇA ÖNAL
Danışman: DOÇ. DR. FATİH EREN
Marmara Üniversitesi / Sağlık Bilimleri Enstitüsü / Tıbbi Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2018
Konu: Genetik = Genetics ; Tıbbi Biyoloji = Medical Biology
Dizin: DNA = DNA ; Genetik varyasyon = Genetic variation ; Genler = Genes ; Karaciğer hastalıkları = Liver diseases ; Karaciğer yağlanması = Fatty liver ; Mitokondriler = Mitochondria

Özet:
Amaç: 2015 yılında mtDNA'ya ait yeni bir gen keşfedilmiştir. Bu genin fonksiyonel
ürünü olan MOTS-c peptidinin deneysel hayvan modellerinde insülin direncini ve
obeziteyi azalttığı bildirilmiştir. MOTS-c genindeki herhangi bir varyasyonun
nonalkoliksteatohepatit (NASH) etyopatogenezindeki temel mekanizma olan insülin
direncinden sorumlu olabileceği düşünülebilir. Bu çalışmamızın amacı MOTS-c
genindeki olası tüm varyasyonların NASH ile muhtemel ilişkisini araştırmaktır.
Gereç ve Yöntem: Bu çalışmaya 100 NASH tanılı hasta ve 100 sağlıklı kontrol
alındı ve bireylere ait periferik kanlardan DNA izolasyonu yapıldı. MOTS-c genin
(GenBank: KP715230.1) amplifikasyonu için Primer3 programı kullanılarak
primerler tasarlandı. ABI3500 sekans cihazında sanger yöntemine göre tüm MOTS-c
geni dizilendi. Varyasyon (mutasyon/polimorfizm) analizi için NCBI/BLAST
programı kullanıldı. Bulgular: Sekans analiz sonuçlarına göre yalnızca bir hastanın
MOTS-c geninde mutasyon tespit edilmiştir. Kontrol grubunda ise herhangi bir
varyasyona rastlanmamıştır. Sonuçlar: mtDNA oldukça varyant olmasına rağmen
MOTS-c geninin büyük ölçüde korunmuş olduğu saptanmıştır. Literatürde ilk kez
NASH hastalarında stop kodonunu, glisin aminoasidine dönüştüren nonsinonim
MOTS-c geni mutasyonu tespit edilip; "GenBank" ve "MİTOMAP"e yeni bir
mutasyon olarak rapor edilmiştir. Bu mutasyon normalinden daha uzun bir nonfonksiyonel
peptid oluşumuna neden olabilir. Bu durumda iskelet kaslarında, MOTSc'nin
non-fonksiyonel türevi AMPK yolağını aktive edemez ve kan glikoz seviyeleri
artıp insulin direnci gelişebilir. Saptadığımız mutasyonun daha geniş serilerde
araştırılmasında fayda olduğunu düşünmekteyiz. Bu mutasyonun MOTS-c peptid
üretimi üzerine etkileri in vitroda deneysel olarak incelenebilir.
Anahtar Kelimeler: NASH, MOTS-c Geni, Varyasyon, Mitokondriyal DNA,
NAYKH

Abstract:
Objective: In 2015, a new gene called as MOTS-c was found in 12S rRNA region of
mtDNA. It has been reported MOTS-c peptide reduces insulin resistance and obesity
in experimental animal models. So we thought that a variation in the MOTS-c gene
may be responsible for insulin resistance in nonalcoholic steatohepatitis (NASH). In
this study, we aimed to find all possible MOTS-c gene variations in NASH and
associate them with NASH. Methods: DNA was isolated from the peripheral blood
of 100 NASH patients and 100 healthy controls. Suitable primers were designed by
using the Primer3 program for amplification of the MOTS-c gene (GenBank:
KP715230.1). MOTS-c gene sequencing was performed based on sanger method by
using Applied Biosystems 3500 Genetic Analyzer. NCBI / BLAST program was
used for analysis of variation. Results: According to the sequence analysis results, a
variation was detected in the MOTS-c gene of one patient. There is no variation was
found in the control group. Conclusion: We found that the MOTS-c gene is quite
conserved, although mtDNA is highly variant. We detected a mutation which
converts stop codon to glycine aminoacid in the MOTS-c gene of one NASH patient.
This mutation may result a non-functional peptide formation longer than MOTS-c. In
this case, nonfunctional peptide can not activate AMPK pathway so blood glucose
levels may increase and insulin resistance may develop in skeletal muscles. This
mutation should be researched in wider NASH groups and the effect of this mutation
on MOTS-c gene production should experiment in vitro.
Keywords: NASH, MOTS-c Gene, Variation, Mitochondrial DNA, NAFLD