Ntera2 hücre hattında retinoik asit'in hippo yolağında görevli AMOT, LATS1 ve LATS2 gen ekspresyonlarına etkisinin araştırılması
Investigation of the effect of retinoic acid in ntera2 cell line on AMOT, LATS1 AND LATS2 genes expressions in the hippo pathway
Yazar: BİLGE TELLİ
Danışman: DOÇ. DR. ÖZLEM İZCİ AY
Mersin Üniversitesi / Sağlık Bilimleri Enstitüsü / Tıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2021
Konu: Tıbbi Biyoloji = Medical Biology
Dizin: Drosophila melanogaster = Drosophila melanogaster ; Gen ifadesi = Gene expression ; Hücre dizisi = Cell line ; Meyve sineği = Fruit flies ; Sinyal nakli = Signal transduction ; Tretinoin = Tretinoin

Özet:
Hippo yolu ilk olarak yirmi yıl önce doku büyümesi için Drosophila melanogaster'de tanımlanmış ve son birkaç yıl içinde hem Drosophila melanogaster hem de memelilerde yoğun olarak incelenen bir konu haline gelmiştir. Hippo yolu, hücre proliferasyonunu inhibe ederek, apoptozu teşvik ederek ve kök/progenitör hücre farklılaşmasını düzenleyerek, organ boyutunun ve tümörogenezin düzenlenmesinde anahtar bir rol oynamaktadır. Bu çalışmada NTera2 hücre hattına DMSO ve (5 µM, 10 µM, 15 µM) RA ile muamele sonucunda Hippo yolu düzenleyicisi olan Angiomotin (AMOT) ve Hippo yolu bileşeni olan Large Tumor Suppressor1/2(LATS1/2)'de meydana gelen gen ekspresyon düzey değişimleri Real-Time PCR cihazı yöntemi ile saptandı. Çalışmamızda AMOT, LATS1 ve LATS2 genlerinin doz grupları ile kontrol grubuna göre ekspresyon seviyeleri incelendi. Ayrıca çalışmamızdaki genlerin ekspresyon seviyeleri arasındaki korelasyon tüm deney gruplarında araştırıldı. Genlerin ekspresyon seviyeleri kontrol grubuna göre kıyaslanarak istatistiksel olarak değerlendirildi. İstatistiksel olarak anlamlılık düzeyi p<0,05 olarak kabul edilmiştir. Araştırma sonucunda AMOT (pc = 0,248), LATS1(pd =0,872) ve LATS2 (pe = 0,234) genlerinin ekspresyon seviyeleri tüm gruplar topluca kıyaslandığında istatistiksel olarak anlamlı değildi. Genlerin ekspresyon seviyesindeki korelasyon incelendiğinde AMOT-LATS2 arasında istatistiksel olarak anlamlı bir ilişki bulundu. (r = 0,982, p<0,0001). Diğer yandan AMOT-LATS1(r =-0,043, p=0.878) ve LATS1-LATS2(r = 0,033, p=0.907) genleri arasındaki korelasyon istatistiksel olarak anlamsızdı. Sonuç olarak, RA dozuna bağlı olarak RA'nın AMOT ve LATS2 ile ilişkili olabileceğini ve böylece Hippo yolunun düzenlenebileceğini düşünmekteyiz. Ayrıca gelecekte Hippo yolu ve RA yolunu birlikte inceleyen çalışmaların oldukça ilgi çekici olacağını düşünmekteyiz.

Abstract:
The hippo pathway was first described for tissue growth in Drosophila melanogaster two decades ago and has become a subject of intense study over the past few years in both Drosophila melanogaster and mammals. The hippo pathway plays a key role in regulating organ size and tumorigenesis by inhibiting cell proliferation, promoting apoptosis, and regulating stem/progenitor cell differentiation. In this study, the gene expression level changes in AMOT, which is the regulator of the Hippo pathway, and LATS1/2, which is the component of the Hippo pathway, as a result of treatment of the NTera2 cell line with DMSO and (5 µM, 10 µM, 15 µM) RA were determined by the Real-Time PCR method. In our study, the expression levels of AMOT, LATS1 and LATS2 genes were examined compared to dose groups and control group. In addition, the correlation between the expression levels of the genes in our study was investigated in all experimental groups. Expression levels of genes were statistically evaluated by comparing them with the control group. The statistical significance level was accepted as p<0.05. As a result of the study, the expression levels of AMOT (pc = 0.248), LATS1(pd =0.872) and LATS2 (pe = 0.234) genes were not statistically significant when all groups were compared as a whole. When the correlation in the expression level of the genes was examined, a statistically significant correlation was found between AMOT-LATS2 (r = 0.982, p<0.0001). On the other hand, the correlation between AMOT-LATS1(r =-0.043, p=0.878) and LATS1-LATS2(r = 0.033, p=0.907) genes was statistically insignificant. In conclusion, we think that RA may be associated with AMOT and LATS2 depending on the RA dose, and thus Hippo pathway may be regulated. In addition, we think that future studies examining the Hippo pathway and the RA pathway together will be very interesting.