Kasa invaze olmayan mesane kanseri hastaları ve sağlıklı kişilerde üriner mikrobiyota özellikleri
Characteristics of the urinary microbiota in non muscle invasive bladder cancer patients and healthy people
Yazar: MUHAMMED SELÇUK ÖZER
Danışman: DOÇ. DR. OZAN BOZKURT
Dokuz Eylül Üniversitesi / Tıp Fakültesi / Üroloji Ana Bilim Dalı
Derece: Tıpta Uzmanlık, 2022
Konu: Üroloji = Urology
Dizin: Biyobelirteçler-tümör = Biomarkers-tumor ; Hematüri = Hematuria ; Kanser hastaları = Cancer patients ; Mesane hastalıkları = Urinary bladder diseases ; Mesane neoplazmları = Urinary bladder neoplasms ; Mikrobiyota = Microbiota ; Üriner sistem = Urinary tract

Özet:
Üriner sistem mikrobiyotasındaki disbiyozun mesane kanserinin patogenezinde rol oynayabileceği düşünülmektedir. Mesane kanseri hastalarının doku ve idrar örneklerini sağlıklı bireylerin doku ve idrar örnekleriyle karşılaştırarak disbiyoza neden olan bakterileri bulmayı amaçladık. 
Kasa invaziv olmayan mesane kanserli 12 erkek hastadan ve demografik özellikleri benzer 12 sağlıklı bireyden ilk idrar, orta akım idrar ve doku örnekleri toplandı. İdrar ve doku örnekleri bakteriyel 16s Ribozomal RNA'nın V3-V4 bölgeleri kullanılarak analiz edildi. Mikrobiyota özellikleri mesane kanseri grubu ve kontrol grubu arasında karşılaştırıldı. Çalışma 217S075 sayılı TÜBİTAK Projesi kapsamında desteklenmiştir.
Mesane kanseri grubu hem doku hem de idrar örneğinde sağlıklı gruba göre çok daha zengin mikrobiyota çeşitliliğine sahip olduğu tespit edildi (p<0.05). Mesane kanseri doku örneklerinde Escherichia Shigella (p<0.001), Staphylococcus (p<0.001), Delftia (p=0.001), Acinetobacter (p<0.001), Corynebacterium (p<0.001) ve Enhydrobacter (p<0.001) göreceli bolluğunda anlamlı artış saptandı. Öte yandan, mesane kanseri idrar örneklerinde Escherichia Shigella (p<0.001), Ureaplasma (p<0.001), Lactobacillus (p=0.005), Stenotrophomonas (p<0.001), Streptococcus (p<0.001), Corynebacterium (p<0.001) ve Prevotella (p=0.039) göreceli bolluğunda anlamlı artış saptandı. Mesane kanseri doku örneklerinde disbiyoza neden olan 6 şüpheli bakteriden 5'inin mesane kanseri idrar örneklerinde disbiyoza neden olduğu tespit edildi.
Çalışmamız, endoürolojik müdahale öyküsü olmayan ve bu nedenle kontaminasyon riski olmayan hastalarla yapılan ilk çalışmadır. Mesane kanseri hastaları ve sağlıklı bireyler arasında mikrobiyota çeşitliliği ve içeriği farklı olduğu tespit edildi. Sonuçlarımız mikrobiyota disbiyozuna dayalı yeni tanı ve tedavi seçenekleri için çalışmaların yapılmasının önünü açmaktadır.

Abstract:
Dysbiosis in the microbiota of the urinary system could play a role in the pathogenesis of cancer. We aimed to find the bacteria that cause dysbiosis by comparing the tissue and urine samples of bladder cancer patients with the tissue and urine samples of healthy individuals.
First voided urine, mid-stream urine, and tissue samples were collected from 12 male patients with nonmuscle invasive bladder cancer and age-matched 12 healthy individuals.  Urine and tissue samples were analyzed using the V3-V4 regions of bacterial 16s Ribosomal RNA. The microbiota contents were compared between the bladder and control cancer groups. The study was supported within the scope of TÜBİTAK Project No. 217S075.
The bladder cancer group has a much wider variety of microbiota in both tissue and urine samples than the healthy group (p<0.05). Tissue samples of bladder cancer were characterized by a significantly increased abundance of Escherichia Shigella (p<0.001), Staphylococcus (p<0.001), and Delftia (p=0.001), Acinetobacter (p<0.001), Corynebacterium (p<0.001) and Enhydrobacter (p<0.001). On the other hand, urine samples of bladder cancer were characterized by a significant increase in the abundance of Escherichia Shigella (p<0.001), Ureaplasma (p<0.001), Lactobacillus (p=0.005), Stenotrophomonas (p<0.001), Streptococcus (p<0.001), Corynebacterium (p<0.001) and Prevotella (p=0.039). It was found that five of six suspected bacteria that cause dysbiosis in the bladder cancer tissue samples, also cause dysbiosis in the bladder cancer urine samples.
To our knowledge, it is the first study conducted with patients with a history of no endourological intervention and therefore no risk of contamination. Microbiota variety and content were different between bladder cancer patients and healthy individuals. These results pave the way for studies to be conducted for new diagnostic and treatment options based on microbiota dysbiosis.