Kandidemilerin hızlı tanısında pozitif kan kültür şişelerinden direkt identifikasyon ve duyarlılık testlerinin değerlendirilmesi
Evaluation of rapid identification and antifungal susceptibility testing of yeasts in positive blood cultures
Yazar: EGEMEN GÖKBOLAT
Danışman: DOÇ. DR. YASEMİN ÖZ
Eskişehir Osmangazi Üniversitesi / Tıp Fakültesi / Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
Derece: Tıpta Uzmanlık, 2015
Konu: Mikrobiyoloji = Microbiology
Dizin: Antifungal ajanlar = Antifungal agents ; Antifungal duyarlılık testleri = Antifungal sensitivity tests ; FISH = FISH ; Kan testleri = Hematologic tests ; Kandida = Candida ; İlaç alerjisi = Drug hypersensitivity

Özet:
Kandidemiler günümüzde mortalitesi en yüksek nozokomiyal enfeksiyonlardan birisi olmuştur. Tanı ve tedavideki gecikmeler mortaliteyi anlamlı oranda arttırmaktadır. Bu çalışmada, Eskişehir Osmangazi Üniversitesi Tıp Fakültesi, Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı laboratuvarında klinik kan kültür örneklerinden izole edilen ve Candida enfeksiyonlarından başlıca sorumlu olan beş farklı Candida türü (n=60)  ile iki kalite kontrol izolatı (C. krusei ATCC 6258 ve C. parapsilosis ATCC 22019) kullanılarak kan kültürü simülasyonları yapılmıştır. Plus Aerobic/F, Peds Plus/F ve Mycosis IC/F şişeleri sinyal süresi açısından karşılaştırılmıştır. Mycosis IC/F şişesi en hızlı sinyal veren şişe olarak bulunurken, en yavaş sinyali Peds Plus/F şişesi vermiş ve aradaki süre farkı anlamlı bulunmuştur (p<0.001). C. tropicalis en hızlı, C. glabrata ise en yavaş sinyal veren izolat olmuş ve süre farkları anlamlı bulunmuştur (p<0.001). Pozitif sinyal veren şişelerden direkt ve klasik yöntemlerle tanımlama ve antifungal duyarlılık testleri uygulanmıştır. Yapılan tanımlama testlerinden CHROMagar Candida, klasik API 20C AUX testi ve peptit nükleik asit in situ hibridizasyon (PNA-FISH) testlerinin her birinin doğruluk oranı %100 olarak bulunmuştur. Direkt API testinin doğruluğu ise %98.4 bulunmuştur. Germ tüp testi direkt yapıldığında %85.5 doğruluk, indirekt yapıldığında ise %95.2 doğrulukla sonuç vermiş ve aradaki fark istatistiksel olarak anlamlı bulunmamıştır (p>0.05). Duyarlılık testleri broth mikrodilüsyon, Etest ve disk difüzyon testleri olmak üzere üç farklı yöntemle, hem direkt kan kültür şişesinden hem de klasik olarak katı besiyeri pasajından uygulanmıştır. Buna göre testlerin direkt ve klasik yoldan uygulanmaları arasındaki esansiyel ve kategorik uyum oranları hesaplanmıştır. Mikrodilüsyon yönteminin hem esansiyel hem de kategorik uyumları diğer iki teste göre daha yüksek bulunmuştur.

Abstract:
Candidemia is a nosocomial infection that has became one of the highest mortality ratings recently. Delays of diagnosis and treatment increase mortality rates significantly. In this study, 60 strains of Candida spp (five common strains of mainly responsible for Candida infections) selected  which were isolated from clinical blood cultures at Eskisehir Osmangazi University School of Medicine, Department of Clinical Microbiology and simulated a blood culture model. Quality control was ensured by testing C. krusei ATCC 6258 and C. parapsilosis ATCC 22019 isolates.
Mycosis IC/F had significantly shorter time to detection compared to Peds Plus/F (p<0.001). Mean time to positive yeast detection for C. tropicalis was the fastest, whereas C. glabrata was the slowest (p<0.001). Identification and antifungal susceptibility tests were performed with directly and conventional methods by positive blood culture bottles. CHROMagar Candida, conventional API 20C AUX and PNA-FISH tests have excellent accuracy (%100). Direct API has %98.4 accuracy. The accuracy rates were %85.5 and %95.2 for direct and indirect germ tube tests respectively (p>0.05). We have performed broth microdilution, Etest and disc diffusion methods as susceptibility testing. Among these, we found microdilution as the most compatible test in terms of essential and categorical agreement.