hakansabunis/tr-academic-research-agent-index huggingface dataset:
İstanbul ili Adalar ilçesinde hobi bahçeleri ve peyzaj alanlarında yetiştirilen süs bitkilerinde tospovirüslerin saptanması
The detection of tospoviruses in ornamental plants in hobby gardens and landscaping areas in Adalar district of Istanbul province
Yazar: FATMA ŞAFAK
Danışman: YRD. DOÇ. DR. MUHARREM ARAP KAMBEROĞLU
Çukurova Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Bitki Koruma Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2017
Konu: Ziraat = Agriculture

Özet:
Bu çalışma, İstanbul ili Adalar İlçesinde (Büyükada, Heybeliada, Kınalıada, Burgazada) hobi bahçeleri ve peyzaj alanlarında yetiştirilen süs bitkilerinde Tomato Spotted Wilt Virus (TSWV), Iris Yellow Spot Virus (IYSV) ve Impatients Necrotic Spot Virus (INSV) varlığının saptanması amacıyla, 2015 ile 2016 yılları arasında yürütülmüştür. Arazide yapılan survey çalışmalarında simptomolojik olarak şüpheli süs bitkileri ile simptom göstermeyen süs bitkilerinden doku örnekleri alınmuştır. Toplanan 150 adet süs bitkisi örneği öncelikle ELISA yöntemi ile testlenmiş ve örneklerin hiçbirinde TSWV ve INSV enfeksiyonu saptanmamıştır. IYSV ile bulaşık olduğu belirlenen örnekler ise, RT-PCR çalışmalarında kullanılmış ve IYSV-465c; IYSV-239f primer çifti ile yapılan RT-PCR çalışmaları sonucunda agaroz jel elektroforezde (%1.5'luk) 240 bp büyüklüğe sahip band gözlenmiştir. bunlardan Pittosporum tobira ve Hydrangea macrophylla 'nın IYSV ile bulaşık olduğu moleküler olarak ortaya konulmuştur.

Abstract:
This study was conducted in order to detect Tomato Spotted Wilt Virus (TSWV), Irish Yellow Spot Virus (IYSV) and Impatients Necrotik Spot Virus (INSV) in ornamental plants growing hobby gardens and landscaping areas in Adalar district (Büyükada, Heybeliada, Kınalıada and Burgazada) of Istanbul provınce between 2015 and 2016. During the surveys carried out in the field, the samples were collected from simptomatologically suspicious ornamental plants and the ornamental plants which did not show symptoms. All of the collected samples (150) were firstly tested by ELISA method and the samples were not found to be infected with TSWV and INSV. The samples were detected to be infected with IYSV by ELISA and they were used in RT-PCR studies. At the end of the RT-PCR studies using the IYSV-465c;IYSV-239f primer pair, a band with a size of 240 bp was observed in the agarose gel electrophoresis (1.5%) and bunlardan Pittosporum tobira ve Hydrangea macrophylla were found to be infected with IYSV molecularly.
Bacillus sp. 'den tannaz üretimi ve enzim  karakterizasyonu
Tannase production and enzyme characterization from Bacillus sp.
Yazar: ESRA SÜNDÜZ YİĞİTTEKİN
Danışman: PROF. DR. SADIK DİNÇER
Çukurova Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Biyoloji Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2017
Konu: Biyoloji = Biology

Özet:
Bu çalışmada, toprak örneklerinden izole edilen Bacillus sp. suşlarından tannaz enzimi izolasyonu ve karakterizasyonu gerçekleştirilmiştir. Bu bakterilerin tannaz enzimi üretimi %1 tannik asit-%2.5 agar içerikli besiyerinde 37°C'de 96 saatlik inkübasyondan sonra mikroorganizmaların etrafında oluşan şeffaf zonlarla saptanmıştır. Bacillus sp. 2.11'den izole edilen enzim en iyi aktivite gösterdiği için bu suş çalışmada kullanılmıştır. Bacillus sp. 2.11'nin VITEK-2 Compact Sistem ile Bacillus coagulans olduğu belirlenmiştir.
Bacillus coagulans suşundan üretilen tannazın SDS-PAGE analizinde molekül ağırlıkları 17 kDa, 14 kDa ve 5 kDa olan 3 band tesbit edilmiştir. Bacillus coagulans ekstraselüler tannaz enzimi optimum aktivitesini 30°C ve pH 4.2'de göstermiştir. Bacillus coagulans ekstraselüler enzimi 80°C'de 15 dakika süreyle aktivitesini %64.80 koruyabilmiştir. Bacillus coagulans enzim aktivitesi, 1mM HgCl2 ile (%74.7) aktivitesini koruyabilmiş, 1mM ve 5mM MnCl2 ve 5mM FeCl2 (%0) ile önemli derecede inhibe olmuştur. Bu sonuçlara göre, Bacillus coagulans enzimi sahip olduğu karakteristik özelliklerden dolayı endüstriyel alanda kullanımının uygun olduğu önerilebilir.

Abstract:
In this study, the tannase enzyme from Bacillus sp. strains isolated from soil samples were produced and characterized. Tannase production of these strains were determined by production of clear zones around the colonies on the 1% tannic acid- 2.5% agar containing medium, after 96 hours incubation at 37°C. The enzymes isolated from Bacillus sp. 2.11 strain used in this study because they showed the best activity. Bacillus sp. 2.11 was determined to be Bacillus coagulans by the VITEK-2 Compact System.
Three bands with molecular weights of 17 kDa, 14 kDa and 5 kDa were detected by SDS-PAGE analysis of the tannase produced from Bacillus coagulans strain. Bacillus coagulans showed extracellular tannase enzyme optimum activity at 30°C and pH 4.2. The Bacillus coagulans extracellular enzyme was able to maintain its activity for 64 minutes at 80 °C for 15 minutes. The enzyme activity of Bacillus coagulans was able to maintain its activity with 1mM HgCl2 (74.7%) and was significantly inhibited by 1mM and 5mM MnCl2 and 5mM FeCl2 (0%). According to these results, Bacillus coagulans due to the characteristics of the enzyme, it can be suggested that industrial use is appropriate.
Mersin Körfezi'nde (Kuzey doğu Akdeniz) avlanan balon balıklarının (Lagocephalus sceleratus, Lagocephalus spadiceus, Lagocephalus suezensis) besin bileşenleri, ağır metal ve tetrodotoksin (TTX) düzeylerinin belirlenmesi
Determination of nutritional properties, heavy metal and tetrodotoxin (TTX) levels of pufferfish (Lagocephalus sceleratus, Lagocephalus spadiceus, Lagocephalus suezensis) caught from Mersin Bay (Northeastern Mediterranean)
Yazar: ALİ RIZA KÖŞKER
Danışman: PROF. DR. FATİH ÖZOĞUL
Çukurova Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Su Ürünleri Avlama ve İşleme Teknolojisi Ana Bilim Dalı
Derece: Doktora, 2017
Konu: Su Ürünleri = Aquatic Products

Özet:
Bu çalışmada; Mersin Körfezi'nden yakalanan balon balığı türlerinin (Lagocephalus sceleratus, Lagocephalus spadiceus ve Lagocephalus suezensis) besinsel kompozisyon, yağ asidi profili, tetrodotoksin (TTX) içerikleri ve metal düzeylerindeki mevsimsel ve eşeysel farklılıklar araştırılmıştır.
Balon balıkları Aralık 2015 ile Ekim 2016 tarihleri arasında yakalanmıştır. Balon balığı türlerinin kas dokularında besinsel kompozisyon, yağ asidi ve metal analizleri yapılmıştır. Gonad, karaciğer, bağırsak, deri ve kas dokularında ise Q-TOF LC/MS cihazı kullanılarak TTX düzeyleri belirlenmiştir. 
Yapılan analizler sonucunda incelenen balon balıklarının içerdikleri protein oranları ve doymamış yağ asidi profilleri açısından besinsel kalitelerinin yüksek oldukları belirlenmiştir. Yapılan metal analizleri sonucunda, incelenen balon balığı türlerinin kas dokularının makro ve eser element düzeyleri açısından zengin olduğu, ancak yasal limitlerin üzerinde Pb ve Cd içerdikleri belirlenmiştir. TTX düzeylerinin; L. sceleratus türünde 0.69 ile 35.60 µg/g aralığında, L. suezensis türünde 0.67 ile 3.09 µg/g aralığında olduğu belirlenmiştir. Bu türlerin toksik ve tüketilmelerinin sakıncalı olduğu belirlenmiştir. L. spadiceus türünün ise ölçülebilir düzeyde TTX içermediği ve toksik olmadığı belirlenmiştir.

Abstract:
In this study; the seasonal and sexual differences in nutritional composition, fatty acid profile, tetrodotoxin (TTX) contents and metal levels of pufferfish species (Lagocephalus sceleratus, Lagocephalus spadiceus ve Lagocephalus suezensis) caught from Mersin Bay were investigated. 
The pufferfish were caught between December 2015 and October 2016. Nutritional composition, fatty acid and metal analysis were performed on muscle tissues of pufferfish species.  TTX levels in gonad, liver, intestine, skin and muscle tissues were determined using Q-TOF LC / MS.
As a result of the analysis, it was determined that the nutritional properties of the pufferfish were high in terms of protein content and unsaturated fatty acid profiles. According to the metal analysis, the pufferfish species were high in terms of macro and trace elements in the muscle tissues but Pb and Cd were above legal limits. TTX levels of L. Sceleratus and L. suezensis ranged from 0.69 to 35.60 μg/g and 0.67 to 3.09 μg/g, respectively. Consequently, these species are toxic and not to be consumed due to their TTX content whereas L. spadiceus contained TTX below the detection limit and was not toxic.
Farklı et yumuşatma tekniklerinin, dana karkaslarından elde edilen Musculus transversus abdominis (karnın enine kası) kaslarının bazı kalite kriterlerine etkisi
The effect of different meat tenderizing methods on obtained from cows of Musculus transversus abdominis in some quality criteria
Yazar: LUTFİ ALP TOKGÖZ
Danışman: YRD. DOÇ. HAKAN BENLİ
Çukurova Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Gıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2017
Konu: Gıda Mühendisliği = Food Engineering

Özet:
Bu çalışmada, düşük kalite parça etlerin katma değerini arttırma amacıyla Holstein (siyah alaca) ırkı tosunlardan elde edilen, M. transversus abdominis kaslarına enzim ile yumuşatma, mekanik yumuşatma, marinasyon sıvısı ile yumuşatma ve kontrol grubu olmak üzere 4 farklı yumuşatma tekniği uygulanmıştır. Uygulanan bu yumuşatma yöntemlerinin, pişirilmiş et yumuşaklığına olan etkileri, Warner-Bratzler Shear Force (WBSF), Tekstür Profil Analizi (TPA) ve duyusal analizlerle belirlenmiştir. Mekanik yumuşatma yönteminin, 3.86kg ile en düşük (p <0.05) WBSF değerlerine sahip olduğu belirlenmiştir. Enzim ile yumuşatma yönteminin, 96.79N ile en düşük TPA sertlik değerine sahip olduğu belirlenmiştir (p<0.05). Duyusal analiz bulguları (tercih testi, basit sıralama testi) incelendiğinde, "enzim ile yumuşatma" ve "mekanik yumuşatma" yöntemleri kabul edilebilirlikleri ve beğeni seviyeleri ile enstrümantal yöntemleri destekler nitelikte farklılıklar gösterdikleri belirlenmiştir. Sonuç olarak, bu çalışma ile Türkiye koşullarında yetiştirilen Holstein (siyah alaca) ırkı tosunlardan elde edilen M. transversus abdominis kaslarının parça et olarak fajita ürününe işlenebileceği ortaya konulmuştur. Bu parça etlerin, katma değeri yüksek bir ürün olarak değerlendirilebileceği ve bu şekilde ülke ekonomisine katkı sağlanabileceğinin mümkün olduğu görülmüştür.

Abstract:
In this study, the muscles of M. transversus abdominis obtained from Holstein variety steers were treated with enzyme tenderizing, mechanical tenderizing, tenderizing with marinating fluid and control group. The effects of these tenderizing methods on cooked meat tenderness were determined by Warner-Bratzler Shear Force (WBSF), Texture Profile Analysis (TPA) and sensory analysis. It was determined that the mechanical tenderizing method had the lowest WBSF value of 3.85 kg (p <0.05). It was also determined that the enzyme tenderizing method had the lowest TPA hardness value of 96.79N (p <0.05). When the findings of the sensory analysis (preference test, simple ranking test) were examined, it was determined that "enzyme tenderizing" and "mechanical tenderizing" methods supported the results of the instrumental methods in the acceptability and appreciation levels. In conclusion, this study showed that M. transversus abdominis muscles obtained from Holstein variety steers grown in Turkey can be processed into fajita products. It has been seen that this segment of meat may be regarded as a value added product and in this way it can contribute to the country's economy.
SnS, SnSe ve GeS bileşiklerinin basınç altında elektrik ve lineer optik özelliklerinin incelenmesi
Investigation of electrical and linear optical properties under pressure SnS, SnSe and GeS compounds
Yazar: İSMAİL OĞUZHAN
Danışman: PROF. DR. SÜLEYMAN ÇABUK
Çukurova Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Fizik Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2017
Konu: Fizik ve Fizik Mühendisliği = Physics and Physics Engineering

Özet:
Bu tezde, değiş tokuş-korelasyon etkileri için yerel yoğunluk yaklaşımlı (LDA) yoğunluk fonksiyoneli teorisi (DFT) kullanarak SnS, SnSe ve GeS bileşiklerinin ortorombik  fazda örgü parametreleri,  atomik konumları, elektronik band yapısı, durum yoğunluğu (DOS) ve optik özellikleri basınç altında incelendi. Bu bileşiklerin kuazi-parçacık bant yapısı değiş tokuş-korelasyonun öz uyumu için G0W0 yaklaşımıyla hesaplandı.  Bant yapısı ortam basıncında Brillouin bölgesindeki (Γ-Z→Γ-Y) noktasında 0,644 eV   (SnS), (Γ-Y→ Γ-Y) noktasında 0,503 eV (SnSe)  ve (Γ-Z→ Γ) noktasında 1,027 eV (GeS)  dolaylı bir bant aralığı göstermektedir.  Aynı zamanda, G0W0 + serbest parçacık yaklaşımını (IPA) kullanarak basınç altında 0-30 eV aralığında enerjinin bir fonksiyonu olarak dielektrik fonksiyonunun reel ve sanal kısımları belirlendi. Soğurma katsayısı, enerji kayıp fonksiyonu, kırılma indisi, yansıma ve sönüm katsayısı gibi bazı optik sabitler dielektrik fonksiyonunun reel ve sanal kısmından hesaplandı. Elde edilen sonuçlar mevcut deneysel ve teorik değerlerle karşılaştırıldı.

Abstract:
In this thesis,  the lattice parameters,  atomic positions, electronic energy band structure, density of states (DOS) and optical properties of SnS, SnSe ve GeS compounds  in the  orthorhombic  phase were investigated by using density functional theory (DFT) within the local density approximation (LDA) for exchange-correlation under pressure. The quasipartice band structures for these compounds are computed with G0W0 approximation for the exchange-correlation self-energy. The band structure shows an indirect band gap 0.644 eV   (SnS) at (Γ-Z→Γ-Y) point, 0.503 eV (SnSe) at (Γ-Y→ Γ-Y) point, and 1,027 eV (GeS)    at  (Γ-Z→ Γ)  point in the Brillouin zone at ambient pressure. We have also determined the real and imaginary part of the dielectric function as a function of the energy in the range 0-30 eV using G0W0 + Independent Particle Approximation (IPA) under pressure. Some optical constants such as the absorption coefficient, energy-loss function, refractive index, reflectivity, and extinction coefficient were computed from the real and imaginary part of the dielectric function. The obtained results were compared with the available experimental and theoretical values.
Yenidoğan yoğun bakım ünitesinde yatış süresi tahminlenmesine bağlı kateter kullanım planı optimizasyonu
Cateter usage planning optimization according to estimation of length of stay in newborn intensive care unit
Yazar: CANSU DAĞSUYU
Danışman: PROF. DR. ALİ KOKANGÜL
Çukurova Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Endüstri Mühendisliği Ana Bilim Dalı
Derece: Doktora, 2017
Konu: Endüstri ve Endüstri Mühendisliği = Industrial and Industrial Engineering

Özet:
Bu çalışma özel bir hastanenin yenidoğan yoğun bakım ünitesinde yürütülmüştür. Yoğun bakım ünitesinde yenidoğanların yatış süresi üzerinde etkili olan parametreler belirlenmiştir. Yatış süresi üzerinde etkili olan parametrelere göre yatış süresi regresyon ve biharmonic spline iterpolasyon modelleri ile modellenmiştir. Yatış süresi, yenidoğanların ilk yatış günü MCH ve HCT değerlerine bağlı olarak biharmonic spline interpolasyon modeli ile yüksek güvenilirlikle tahminlenmiştir. Yatış süresine göre yenidoğan hastalara uygulanacak optimum kateter planlar tek ve çok amaçlı matematiksel modeller ile belirlenmiştir. Çalışma kapsamında enfeksiyon minimizasyonu, ek süre maksimizasyonu ve maliyet minimizasyonu amaç fonksiyonları dikkate alınmıştır. Bu amaçlar dikkate alınarak tek amaçlı ve çok amaçlı genetik algoritma modelleri ile de optimum/etkin çözümler elde edilmiştir.

Abstract:
This study is conducted in newborn unit of intensive care in private hospital. Effective parameters have been determined in intensive care unit for newborns. Length of stay is modeled with regression and biharmonic spline interpolation models according to the parameters of hospitalization.  Length of stay is forecasted high reliably with biharmonic spline interpolation model with the values of first day of length of stay of newborns, MCH and HCT. Optimum catheter plans for newborn patients are determined with single or multi objective mathematical models according to length of stay. Infection minimization, additional time maximization and cost minimization objective functions are taken into account for this study. According to those objectives optimum/ effective solutions are obtained with single and multi-objective genetic algorithm models.
Şani divanı (İnceleme-metin)
Şani divani (Analysis – text)
Yazar: AHMET TUNA TUNÇ
Danışman: PROF. DR. İ. ÇETİN DERDİYOK
Çukurova Üniversitesi / Sosyal Bilimler Enstitüsü / Türk Dili ve Edebiyatı Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2017
Konu: Türk Dili ve Edebiyatı = Turkish Language and Literature
Dizin: 16. yüzyıl = 16. century ; Divan edebiyatı = Divan literature ; Edebiyat = Literature ; Edebiyat = Literature ; Eski Türk edebiyatı = Old Turkish literature ; Türk edebiyatı = Turkish literature ; Şairler = Poets ; Şani = Şani

Özet:
Bu çalışmada hangi yüzyılda yaşadığını tam olarak belirleyemediğimiz Şânî'nin divanının çeviri yazılı metni hazırlanmış, daha sonra Şânî Divanı'nın biçim, içerik, dil ve anlatım özelliklerinin incelemesine çalışılmıştır. Böylece onun edebî kişiliği hakkında bazı ipuçları elde edilmiştir.
Şânî'nin şiirlerinden medrese eğitimi de görmüş mutasavvıf bir şair olduğu anlaşılmaktadır. Şiirlerinde beşeri aşkla birlikte tasavvufî özellikler de görülür.
Şânî'nin dili, yaşadığı devirde oluşmaya başlayan Klasik Osmanlı Türkçesiyle birlikte daha çok Eski Anadolu Türkçesine ait dil özelliklerini göstermektedir.
Daha önce üzerinde herhangi bir akademik çalışma yapılmamış olan Şânî ve Şânî Divanı'nın bu çalışmayla incelenmesine gayret edilmiştir.


Anahtar sözcükler: Şâni, Şânî Divanı, divan şiiri, divan.

Abstract:
In this study, Şânî whom we can't exactly determine in wichh century he lived, the translated writen text of his divan has been workedon, after that Şânî Divan has been analyzed in term of style, context, language and expression. Thus, we have found same clues on this literary personality.
It is also understood from his poems that Şani is a mystic poet who studied at madrasah. Mystic features with human love are seen in his poems.
The language that Şani used shows the characteristics of Old Anatolian Turkic with the Classical Ottoman Turkic which started to form in the period that he lived.
With this study, Şânî and Şânî Divan, which has not been subject of any academic study previously, has been ardently analysed.


Keywords: Şânî, Şânî Divan, divan poetry, divan
Biyogaz enerji santrallerinde baca gazı analizlerinin incelenmesi ve emisyon salınımlarının kararlı hale getirilmesi
Investigation of flue gas analyses in biogas power plants and stabilisation of exhaust emissions
Yazar: METEHAN ÇINAR
Danışman: PROF. DR. ÖZEN KILIÇ
Çukurova Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Maden Mühendisliği Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2017
Konu: Maden Mühendisliği ve Madencilik = Mining Engineering and Mining

Özet:
Bu tez çalışmasında, Adapazarı İli Pamukova İlçesi'nde bulunan Biosun Katı Atık ve Enerji Üretim A.Ş. tesisinde üretilen yakıt bileşimi ortalama %55 metan ve %45 CO2 olan biyogaz ve biyogazın yanma gazı emisyonları incelenmiştir. Üretimi yapılan biyogaz, gaz motorları tarafından yakılmakta ve yanma sonucu kükürtdioksit, azot monoksit, azot dioksit, karbon monoksit ve toz ortaya çıkmaktadır. Tez çalışması kapsamında, biyogazın yanması sonucu meydana gelen gaz emisyonlarının yasal limitleri aşmaması için gerekli tüm önlemlerin, biyogaz üretim prosesi başlangıcından, biyogazın yanma sonrasına kadarki süreçte alınması yönünde incelemeler yapılmıştır.

Abstract:
In this thesis study, it has been reviewed and investigated the biogas which is fuel composition composed of an average of 55% methane and 45% CO2, and its flue gas emissions at the Biosun Katı Atık ve Enerji Üretim A.Ş. Pamukova, Adapazarı. The produced biogas is burned in the gas engines and occurred combustion gases such as sulfur dioxide, nitrogen monoxide, nitrogen dioxide, carbon monoxide and dust. In this study, the stabilization of gas  emissions that comes from the  exhaust gases, and take necessary precautions in order not to exceed the legal regulation limits, throughout the process from biogas production to combustion stages was investigated.
Ekolojik ve sürdürülebilir mimarlıkta ekolojik değerlendirme yöntemleri
Ecological evaluation methods in ecological and sustainable architecture
Yazar: PINAR EMEL
Danışman: YRD. DOÇ. DR. ÖZLEM ŞENYİĞİT
Çukurova Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Mimarlık Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2017
Konu: Mimarlık = Architecture

Özet:
Bu çalışmada, ekolojik mimarlık ilkelerine uygun bina tasarımında yönlendirici kriterler ve dünya çapında kabul edilmiş ekolojik sertifikasyon sistemleri incelenmiştir. Bu bağlamda Türkiye'den ve Dünya'dan ekolojik ve sürdürülebilir bina örnekleri sertifikasyon sistemleri dikkate alınarak belirlenen kriterler çerçevesinde analiz edilmiştir. Ekoloji ve sürdürülebilirlik kavramlarına dair tespit edilen, toplanan kriter ve verilerin örnekler özelinde değerlendirilmesi, elde edilen bilgilerin tasarım sürecine yansıtılması ve veri olarak kullanılması amaçlanmıştır.

Abstract:
In this study, guiding criteria in building design which conforms to ecological architectural principles and ecologically certified systems which are accepted around the world are examined. In this context, ecological and sustainable building samples from Turkey and the World were analyzed within the framework of criteria determined by considering the certification systems. It is aimed to evaluate the collected criteria and data about the concepts of ecology and sustainability in terms of examples, to reflect the obtained information to the design process and to use it as data.