Laktik asit bakterilerinin Salmonella biyofilmi üzerine inhibisyon etkisi
Inhibition effect of lactic acid bacteria on Salmonella biofilm
Yazar: ŞEYMA GÖKSEL
Danışman: PROF. DR. MUSTAFA AKÇELİK
Ankara Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Biyoloji Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2021
Konu: Biyoloji = Biology

Özet:
Bu çalışma kapsamında Türkiye'de geleneksel olarak üretilen fermente gıdalardan ve insan kaynaklı materyallerden izole edilerek probiyotik özellikleri tanımlanan; Lactobacillus plantarum M16 (plantarisin üreticisi), Lactobacillus sake M17 (sakasin üreticisi), Pediococcus acidilactici M20 (pediosin üreticisi), Bifidobacterium langum M23 (bifidosin A üreticisi), Bifidobacterium bifidum M24 (bifidosin B üreticisi) ve  Pediococcus pentosaceus M46 (bakteriyosin benzeri antimikrobiyal bileşik üreticisi) suşlarının Salmonella Typhimurium'da biyofilm oluşumu ve olgun biyofilmlerin eradikasyonu üzerine etkinlikleri belirlenmiştir. Probiyotik suşların kültür filtratlarının S. Typhimurium'a karşı denenmesi sonucunda, doğal suş ve mutantlarda (dam ve seqA) biyofilm oluşumunun tamamen engellendiği tespit edilmiştir. Aynı filtratların olgun biyofilm yapıları üzerinde denenmesi sonucunda ise, olgun biyofilm yapılarının özellikle uygulamanın ilk 6 saatinde istatistiki açıdan anlamlı düzeylerde (p<0.05) eradike edildiği saptanmıştır. Söz konusu kültür filtratlarında belirlenen antibiyofilm aktivitesinin kaynağının araştırılması amacı ile, kültür filtratları nötralize edilerek ve nötralize kültür filtratlarına proteinaz K muamele edilerek ayrı ayrı denemeler gerçekleştirilmiştir. Bu çalışmalardan elde edilen veriler; her iki uygulama sonucunda da başlangıçta belirlenen antibiyofilm aktivitelerinin istatistiki açıdan anlamlı bir şekilde düştüğünü (p<0.05) göstermiştir. Bu veriler ışığında, Türkiye kökenli probiyotik suşlarında tanımlanan çok güçlü antibiyofilm aktivitelerinin, büyük oranda bu suşların ürettiği bakteriyosinlerden ileri geldiği yorumu yapılmıştır.

Abstract:
In this study, the effectiveness of the strains Lactobacillus plantarum M16 (plantaricin producer), Lactobacillus sake M17 (sakasin producer), Pediococcus acidilactici M20 (pediocin producer), Bifidobacterium langum M23 (bifidocin A producer), Bifidobacterium bifidum M24 (bifidocin B producer) and Pediococcus pentosaceus M46 (bacteriocin like antimicrobial substance producer) which are isolated from human-sourced materials and fermented foods produced traditionally in Turkey and whose probiotic properties are defined  on biofilm formation and eradication of mature biofilms in Salmonella Typhimurium have been determined. As a result of testing the culture filtrates of probiotic strains against S. Typhimurium, it was determined that biofilm formation in  wild type strains and mutants (dam and seqA) was completely prevented. As a result of testing the same filtrates on mature biofilm structures, it was determined that mature biofilm structures were eradicated at statistically significant levels (p <0.05), especially in the first 6 hours of the application. In order to investigate the source of antibiofilm activity determined in the said culture filtrates, separate trials were carried out by neutralizing the culture filtrates and treating the neutralized culture filtrates with proteinase K. The data obtained from these studies; showed that the antibiofilm activities determined at the beginning decreased in a statistically significant way (p <0.05) as a result of both applications. In light of this data, it is concluded that the strong antibiofilm activities of  Turkey originated probiotic strains were  largely come forward  from bacteriocins produced by these strains.