Çeşitli hayvan dışkılarında Salmonella etkenlerinin konvansiyonel ve moleküler yöntemlerle saptanması
Detection of Salmonella strains from animal faeces by conventional and molecular methods
Yazar: SEYİT CANPOLAT
Danışman: PROF.DR. MEHMET AKAN
Ankara Üniversitesi / Sağlık Bilimleri Enstitüsü / Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
Derece: Doktora, 2007
Konu: Biyoloji = Biology ; Mikrobiyoloji = Microbiology ; Veteriner Hekimliği = Veterinary Medicine

Özet:
Bu çalmada, 109 tavuk sürüsüne ait 388 adet kloakal svap örnei, 27 koyun sürüsünden 107adet ve srlardan ise 106 adet dk olmak üzere toplam 601 adet örnek Salmonella varlyönünden incelenmitir.%zolasyon çalmalarnda, ön zenginletirme için Tamponlanm Peptonlu Su (TPS),selektif zenginletirme için Tetrathionat broth (TTB) ve izolasyon için selektif besiyeri olanXylose Lysine Tergitol 4 (XLT4) agar kullanlmtr. Salmonella üpheli bulunan kolonilerinidentifikasyonu, biyokimyasal ve serolojik yöntemlerle gerçekletirilmitir.Çalmada, incelenen 109 broyler sürünün 11 (%10,09)'inden Salmonella izolasyonuyaplmtr. 3880 klokal svaptan hazrlanan 388 (10 kloakal svap 1 örnek) adet örnektenidentifiye edilen 12 (%3,09) adet Salmonella izolatnn 9 (%75)'u B serogrubu, 3 (%25)'ü deD serogrubu olarak tespit edilmitir. Srlardan toplanan 106 adet dk örneinden yaplanekimler sonucu 1 (%0,94) adet B serogrubuna ait Salmonella izolasyonu yaplmtr. 27koyun sürüsüne ait 107 adet koyun dk örneinden yaplan incelemede Salmonella tespitedilememitir.Biyokimyasal ve serolojik testler sonucunda Salmonella izole edilen örneklerintetratiyonat buyyon kültürleri ile IroB gen spesifik primerlerle PCR gerçekletirilmi vesonuçta kültür ile pozitif elde edilen tüm örneklerde Salmonella cinsine özgün 606 bpbüyüklüünde PCR ürünleri saptanmtr.Sonuç olarak bu çalmada, hayvan dklarndan ve kloakal svaplardan Salmonellaetkenlerinin kültür ile prevalans saptanmtr. Ayrca, Salmonella izole edilen tüm örneklerinPCR yöntemi ile de benzer sonuç vermesi, PCR'nun Salmonella etkenlerinin dklardaaratrlmasnda rutin tehis amacyla uygulanabilirliini ortaya koymutur.Anahtar Kelimeler: %zolasyon, dk, hayvan, PCR, Salmonella.

Abstract:
In this study, 388 cloacal swab samples were collected from 109 poultry flocks, 106 bovinefaecal samples and 107 faecal samples were collected from 27 sheep herds. Total of 601faecal samples of different animals were examined for the existence of Salmonella spp. in thisstudy.For the isolation of Salmonella, nonselective preenrichment by TPS was followed byselective enrichment by TTB and plating on selective agar XLT4. Suspect colonies wereconfirmed biochemically and serologically.Salmonella was isolated in 11(10.09 %) of the 109 broiler flocks tested. Of the 12(3.09 %) Salmonella strain identified from 388 (10 swabs/sample) poultry cloacal swapsamples, 9 (75 %) were detected as serogroup B, and 3(25 %) were detected as serogroup D.From the total of 106 bovine faecal samples, 1 (0.94 %) was isolated as Salmonella serogroupB. Salmonella was not isolated from 107 sheep feacal samples collected from 27 sheep herds.Isolates taken from tetrathionate cultures and determined as Salmonella spp. afterbiochemical and serological tests were also tested by PCR with primers specificallyamplifying 606 bp portion of iroB gene. In all of the Salmonella positive cultures Salmonellaspp. specific PCR products were detected.In this study, prevalence of Salmonella strains in animal feacal and cloacal swabsamples was determined by using conventional technique. As a result, PCR technique is foundto be useful for routine examinations of Salmonella in animal faecal samples since allSalmonella spp. isolated samples were confirmed by PCR.Key Words: Animal, isolation, faeces, PCR, Salmonella.