Klinik  örneklerden soyutlanan gram negatif anaerop bakterilerin  antibiyotik duyarlılık paternleri
Antibiotic susceptibility patterns of gram-negative anaerobic bacteria isolated from clinical samples
Yazar: ALİCAN BİLDEN
Danışman: PROF. DR. SELAHATTİN ATMACA
Dicle Üniversitesi / Sağlık Bilimleri Enstitüsü / Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
Derece: Doktora, 2020
Konu: Mikrobiyoloji = Microbiology
Dizin: Anaerobik bakteriler = Anaerobic bacteria ; Antibiyotikler = Antibiotics ; Gram negatif anaerobik bakteriler = Gram negative anaerobic bacteria ; Gram negatif bakteriler = Gram negative bacteria ; Mikrobiyal duyarlılık testleri = Microbial sensitivity tests ; Teşhis = Diagnosis ; Teşhis testleri = Diagnostic tests ; İlaçlara direnç = Drug resistance ; İlaçlara direnç-bakteriyel = Drug resistance-bacterial

Özet:
Amaç:Anaeropbakteriler  vücudun  normal  flora  elemanı  olmasına  karşın,  bağışıklık sisteminin  zayıflamasıyla  enfeksiyona  neden  olabilirler.  Bu  bakterilerin  izolasyonları  ve identifikasyonları  güç olduğu  içinçoğu  laboratuvarda  yapılmamaktadır.  Bu  sebeple  çoğu zaman anaerop  bakteriler  göz  ardı  edilebilmektedir.Bunun  sonucu  olarak  da  gelişen antibiyotik direnç durumları tespit edilememektedir.Bizim bu çalışmadaki amacımız, anaerop bakterilerin  antibiyotik  direnç  profillerinin  bilinmesinin  tedavinin  seyri  açısından  gerekli olduğunu ve belirli periyodlarda antibiyotik duyarlılık testlerinin yapılması gerektiğini ortaya koymaktır.Gereç ve Yöntem:Çalışmaya, 11.06.2019 -04.03.2020tarihleri arasında Dicle Üniversitesi Tıp  FakültesiTıbbi  Mikrobiyoloji  AD.  Bakteriyoloji/Kültür  laboratuvarına, çeşitli  klinik birimlerden anaerop kültür istemiylegönderilmiş372 numune dahil edilmiştir. Bu numuneler, ilk  olarak  bakteri  izolasyonu  için Brucellakanlı  agara  ekildi.İzole  edilen  bakterilerin identifikasyonlarıMALDI-TOF  MS  ile  yapıldıktan  sonra  antimikrobiyal  duyarlılık profillerinin belirlenmesi için E –test yöntemi kullanıldı.Bulgular:İzole edilen 17 Bacterioidestüründe  antimikrobiyal  direncin  en yüksekolduğu antibiyotiklersırasıyla % 100 oranındapenisilin(P),  % 41,2oranındaklindamisin (CM)ve % 35,3oranındaise  amoksisillin-klavulanik  asid  (AMC)olarak  belirlendi.İzole edilen 22 Prevotellatüründe iseantimikrobiyal  direncin  en yüksekolduğu  antibiyotikler% 45,5oranındapenisilin(P) ve % 27,3 oranındamoksifloksasin (MX)olarak belirlendi. Yine izole edilen    1 Dialister    pneumosintesbakterisinde    sadecemetronidazol    (MZ)direnci gözlemlenirken,  1 Veillonellaparvulabakterisindeise penisilin(P),imipenem(IP)ve piperasillin-tazobaktam (TPZ)antibiyotiklerine karşı direnç gözlemlenmiştir. Son olarakdaizole edilen 4Fusobacteriumtüründeise hiçbir antibiyotiğe karşı direnç gözlemlenmemiştir.
Sonuç:Çalışmamızda izole edilen Gram-negatifanaeropbakterilerin büyük çoğunluğunun penisilin, klindamisin, moksifloksasin, metronidazol ve amoksisillin-klavulanik aside karşı bir direnç geliştirdiği veya bu antibiyotiklere karşı artan bir dirence sahip olduğugörülmüştür.

Abstract:
Aim:Although  anaerobic bacteria are the normal flora of the body, they  can cause infection with  the  weakening  of  the  immune  system.Isolation  and  identification  of  these  bacteria  are difficult and not performed in most laboratories.For this reason, anaerobic bacteria can often be  ignored.As  a  result,  antibiotic  resistance  situations  that  develop  cannot  be  detected.We carried  out  this  study  to  reveal  that  anaerobic  bacteria  are  important,  that  knowing  antibiotic resistance  profiles  is  necessary  for  the  courseof  treatment,  and  that  antibiotic  susceptibility tests should be performed at certain periods.Material and Method:Between 11.06.2019 -04.03.2020 dates,Dicle University Faculty of Medicine  Medical  Microbiology  Department  to  the  Bacteriology  /  Culture  laboratory  372 samples  were  sent  with  the  request  of  anaerobe  culture  from  various  clinical  units.These samples were  first inoculated on Brucellablood  agar for bacteria isolation.After identifying the  isolated  bacteria  with  MALDI-TOF  MS,  the  E-test method  was  used  to  determine  the antimicrobial susceptibility profiles.Results:Antibiotics  with  the  highest  antimicrobial  resistance  were  determined  as  100% penicillin  (P),  41.2%  clindamycin  (CM)  and  35.3%  amoxicillin-clavulanic  acid  (AMC), respectively in  17  isolated Bacterioidesspecies.Antibiotics  with  the  highest  antimicrobial resistance  in  the  22  isolated Prevotellaspecies  were  determined  as  45.5%  penicillin  (P)  and 27.3%  moxifloxacin  (MX).Again,  only  metronidazole  (MZ)  resistance  was  observed  in 1 Dialister  pneumosintesbacteria,  whereas  resistance  was  observed  against  penicillin  (P), imipenem (IP) and piperacillin-tazobactam (TPZ) antibiotics in 1 Veillonella parvulabacteria.Finally, resistance was observed against any antibiotic in 4 Fusobacteriumspecies isolated.Conclusion:It  was  observed  that  the  majority  of  the Gram-negativeanaerobic  bacteria isolated   in   our   study   developed   resistance   to   penicillin,   clindamycin,   moxifloxacin, metronidazole  and  amoxicillin-clavulanic  acid,  or  had  an increased  resistance  to  these antibiotics, and were also sensitive to the remaining antibiotics.