Irak, Al-Muthanna eyaletinde Hepatit B virüsünün moleküler ve immünolojik araştırılması
Molecular and immunological investigation of Hepatitis B virus in Al-Muthanna province, Iraq
Yazar: MUDHAFAR SAUD DAKHIL ALSHAHER
Danışman: DR. ÖĞR. ÜYESİ AYŞEGÜL OĞLAKÇI İLHAN
Çankırı Karatekin Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Biyoloji Ana Bilim Dalı / Moleküler Biyoloji Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2023
Konu: Biyoloji = Biology
Dizin: Hepatit B virüsü = Hepatitis B virus ; İnterlökin 35 = Interleukin 35

Özet:
Hepatit B virüsü (HBV) enfeksiyonu Irak'ta önemli bir halk sağlığı sorunudur. Kronik 
HBV enfeksiyonu, karaciğer sirozu (LC) ve hepatoselüler karsinom (HCC) için bir risk 
faktörüdür, ancak HBV ile ilişkili hastalıkların ilerlemesinde yer alan mekanizmalar 
hakkında çok az şey bilinmektedir. Konak immün yanıtının, HBV enfeksiyonu olan 
hastaların klinik sonuçları ile ilişkili olduğu bilinmektedir. Sitokinler gibi 
immünomodülatör faktörler, HBV ile ilişkili hastalıkların ilerlemesinde ve tedavisinde 
rol oynarlar. İnterlökin-35 (IL-35) yeni tanımlanmış bir inhibitör sitokindir. IL-35'in 
enflamasyonu kontrol edebileceği ve böylece HBV karaciğer hasarını sınırlayabileceği 
vurgulanıyor. Bu nedenle IL-35'in hepatit B hastalığına yönelik yeni tedaviler için bir 
hedef olma olasılığını artırmaktadır. Çalışmaya Al-Muthanna Eyaletinde HBV 
enfeksiyonu olan 120 hasta (84 kronik hepatit ve 36 akut hepatit) ile 30 sağlıklı kontrol 
grubu dahil edilmiştir. Bu gruplarda IL-35 serum seviyeleri ölçülmüş ve viral DNA 
amplifikasyonu yapılmıştır. Bulgulara göre, HBV hastalarında IL-35 seviyelerinin 
sağlıklı kontrollere göre anlamlı şekilde azaldığı bulunmuştur. HBV enfeksiyonu olan 
hastaların serum örneklerinden 10 viral DNA ekstrakte edilmiştir. HBV genomundan 
polimeraz geninin amplifikasyonu ve genin Sanger dizilimi için bir PCR protokolü 
tasarlanmıştır. Diziler, filogenetik analiz ve genetik çeşitliliğin karakterizasyonu için 
HBV referans dizileriyle hizalanmıştır. Popülasyonlar, HBV genotip frekans 
dağılımlarında heterojenlik göstermektedir. Altı HBV genotipi tanımlanmıştır (A, B, C, 
D, E ve H). En sık rastlanan genotip D (%47) olurken, C genotipi sıklık oranı (%4 ile) en 
az gözlenen genotip olmuştur. Ek olarak, hastaların çoğunluğu farklı genotipik 
kombinasyonlarla karışık HBV genotipleri (iki, üç, dört veya beş) göstermiştir. Sonuç 
olarak, HBV genotiplerinden D'nin, Al-Muthanna Eyaletinden Iraklı HBV hastalar 
arasında en yaygın genotip olduğu bulunmuştur. Sonuç olarak, bu çalışma HBV 
enfeksiyonunun halk sağlığı üzerindeki etkisini ve bu enfeksiyonun mekanizmalarının 
anlaşılmasına yönelik yapılan bir çalışmanın temel bulgularını içermektedir.

Abstract:
Hepatitis B virus (HBV) infection is an important public health problem in Iraq. Chronic 
HBV infection is a risk factor for liver cirrhosis (LC) and hepatocellular carcinoma 
(HCC), but little is known about the mechanisms involved in the progression of HBV￾related diseases. It is known that the host immune response is associated with the clinical 
outcomes of patients with HBV infection. Immunomodulatory factors such as cytokines 
play a role in the progression and treatment of HBV-related diseases. Interleukin-35 (IL￾35) is a newly identified inhibitory cytokine. It is emphasized that IL-35 can control 
inflammation and thus limit HBV liver damage. Therefore, it raises the possibility of IL￾35 to be a target for new treatments for hepatitis B disease. 120 patients with HBV 
infection (84 chronic hepatitis and 36 acute hepatitis) and 30 healthy control groups in 
Al-Muthanna State were included in the study. Serum levels of IL-35 were measured in 
these groups and viral DNA amplification was performed. According to the findings, IL￾35 levels were found to be significantly lower in HBV patients compared to healthy 
controls. 10 viral DNAs were extracted from serum samples of patients with HBV 
infection. A PCR protocol has been designed for amplification of the polymerase gene 
from the HBV genome and Sanger sequencing of the gene. Sequences were aligned with 
HBV reference sequences for phylogenetic analysis and characterization of genetic 
diversity. Populations show heterogeneity in HBV genotype frequency distributions. Six 
HBV genotypes have been identified (A, B, C, D, E, and H). The most common genotype 
was D (47%), while the frequency rate of C genotype was the least observed genotype 
(4%). In addition, the majority of patients showed mixed HBV genotypes (two, three, 
four or five) with different genotypic combinations. As a result, HBV genotype D was 
found to be the most common genotype among Iraqi HBV patients from Al-Muthanna 
Province. In conclusion, this study includes the impact of HBV infection on public health 
and the main findings of a study to understand the mechanisms of this infection.