Acınetobacter ile ilişkili kateter enfeksiyonlarında antibiyotik kilit tedavi modelinin değerlendirilmesi ve biyofilm 
ilişkili genlerin araştırılması
Acinetobacter infections associated with antibiotic catheter lock therapy model and the evaluation of biofilm-associated genes of investigation
Yazar: SİNEM SOLMAZ
Danışman: PROF. DR. MELTEM YALINAY ÇIRAK
Gazi Üniversitesi / Tıp Fakültesi / Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
Derece: Tıpta Uzmanlık, 2015
Konu: Mikrobiyoloji = Microbiology
Dizin: Acinetobacter = Acinetobacter ; Antibiyotikler = Antibiotics ; Antienfektif ajanlar = Anti infective agents ; Biyofilmler = Biofilms ; Enfeksiyon = Infection ; Genler = Genes ; Kateterizasyon = Catheterization ; Kolistin = Colistin ; Rifampin = Rifampin

Özet:
Acinetobacter baumannii, hastane salgınlarına yol açan önemli bir nozokomiyal patojendir. Bu patojenlerin biyofilm oluşturması önemli bir virülans faktörüdür. Bu çalışmada, A. baumannii izolatlarında biyofilm oluşumu ve şiddeti
ile ilgili genlerinin varlığı ile kateter ilişkili enfeksiyona sebep olan izolatlara in
vitro olarak uygulanan antibiyotik kilit tedavi modellerinde etkin antibiyotiğin
dozunun ve süresinin bulunması hedeflenmiştir. Bakteriyel izolatlar, Gazi
Üniversitesi Tıp Fakültesi Hastanesi Mikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji
Laboratuvarında 2012 - 2014 tarihleri arasında yatan hastaların kateter içi ve
kateter dışı örneklerinden izole edildi. Mikrotitrasyon-plak yöntemi kullanılarak
yapılan absorbans ölçümlerinde izolatların %16,6'sında zayıf biyofilm,
%31,6'sında orta kuvvetli biyofilm, %51,6'sında kuvvetli biyofilm oluşumu
saptandı. Biyofilm oluşumuna katkısı olduğu düşünülen bap, bfmR ve csuE
genleri PZR yöntemi ile araştırıldı. Biyofilm oluşum şiddeti ile genler arasındaki
ilişki incelendiğinde kuvvetli ve orta kuvvetli biyofilm yapan suşların 45
tanesinde (%90) bap geni varlığı, 48 tanesinde (%96) bfmR geni varlığı, 40
tanesinde (%80) csuE geni varlığı saptandı. Kateter ilişkili enfeksiyona neden
olan iki izolatta uygulanan in vitro antibiyotik kilit tedavi modelinde kolistin ve
tigesiklin tek başına ve bir izolatta da rifampisin ile kombine olarak kullanıldı.
Çalışmadaki, tüm antibiyotik konsantrasyonlarında A. baumannii biyofilminin 3-
5. günde ortadan kaldırıldığı, uygulanan kombinasyonlarda (kolistin-tigesiklin,
kolistin-rifampisin, tigesiklin-rifampisin) ise kataterlerin 1-3. günde steril
oldukları gösterildi. Kombinasyonlar, A. baumannii kolonizasyonun
giderilmesinde antibiyotiklerin tek başına kullanıldığı konsantrasyonlardan daha
etkili olarak saptanmıştır.

Abstract:
Acinetobacter baumannii is a nosocomial pathogen which causes major
hospital outbreaks. Biofilm production of these pathogens is an important
virulence factor. This study aimed to determine the presence of genes related to
biofilm formation and its severity in A. baumannii isolates and to investigate
efficient antimicrobial agents, the optimal concentration and treatment duration
for the antibiotic lock technique in catheter-related infections. Bacterial strains
were isolated from the catheter-related and catheter-non releated samples of the
patients that were submitted to the Clinical Microbiology Laboratory of Gazi
University Medical Faculty Hospital between 2012 and 2014. According to the
absorbance measurements related to microtitration plate technique, 16,6% strains
were weak, 31,6% were moderate and 51,6% were strong in terms of biofilm
production. bap, bfmR and csuE genes that contribute to biofilm formation were
analyzed by PCR method. When the relationship between the biofilm formation
severity and genes were examined, strong and moderate biofilm forming strains of
the 45 (90%) out of 60 isolates were found to have bap gene, 48 of them (96%)
were bfmR gene, 40 of them (80%) were csuE gene. Colistin and tigecycline and
combination of these antibiotics with ripampin were used in vitro antibiotic lock
therapy model that applied to strains causing catheter-related infection in two
isolates. In this study, all of the antibiotic treatments effectively removed A.
baumannii biofilm within 3-5 days, though combinations (colistin-rifampin,
colistin-tigecycline, tigecycline-rifampin) eradicated the biofilm 1-3 days. The
combinations were significantly more effective in eliminating A. baumannii
colonization in biofilms than each of the single antibiotics.