hakansabunis/tr-academic-research-agent-index huggingface dataset:
In vitro kuşullarda akvaryum bitkisi Shinnersia rivularis'in çoğaltımı
In vitro propagation of aquarium plant Shinnersia rivularis
Yazar: ESRA KAYA
Danışman: PROF. DR. MEHMET KARATAŞ
Karamanoğlu Mehmetbey Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Biyoloji Bölümü / Biyoloji Ana Bilim Dalı / Hidrobiyoloji Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2015
Konu: Biyoloji = Biology

Özet:
Shinnersia  rivularis, Asteraceae familyasına ait Meksika kökenli bir akvaryum bitkidir. Akvaryumlarda oluşturdukları güzel görünümleriyle oldukça fazla tercih edilmektedir. Bu çalışmanın amacı ise in vitro koşullarda S. rivularis bitkisinin çoğaltımıdır. Bitkilerden alınan parçalar öncelikle çamaşır suyu ve H2O2 ile sterilizasyon işlemleri gerçekleştirilmiştir. En iyi sterilizasyon H2O2 ile sağlanmıştır. Steril edilen bitkilerden yaprak, sürgün ucu, 1.koltuklatı, 2.koltuklatı, 1.boğum arası ve 2, boğum arası eksplantlarıyla farklı oranlarda BAP, TDZ ve BAP+NAA içeren katı MS ortamlarına aktarılmıştır. En iyi sürgün rejenerasyonu 0,80 mg/l TDZ içeren ortamda sürgün ucu eksplantından elde edilmiştir. Eksplanta başına sürgün sayısı en fazla 49,60 adet olarak 0,80 mg/l TDZ içeren ortamdan 2.koltukaltı eksplantından elde edilmiştir. Sürgün uzunluğu en fazla (2,00 cm), 0,10 mg/l BAP içeren ortamda 1.boğum arası eksplantında rastlanmıştır. Bitkiler her ortamda köklendiği için köklendirme çalışmalar yapılmamıştır. Çoğaltımı yapılan bitkiler farklı pH'larda kavanozlarda dört hafta bekletilmiştir. Bitkilerin gelişimi için en iyi pH 7,00 olduğu gözlenmiştir.

Abstract:
Shinnersia  rivularis, belongs to Asteraceae family is an aquatic plant  native to  Mexico. The plant has been used in the aquariums due to its ornamental appearance. The objective of this study is to propagate plants under in vitro conditions. Plant twigs were at first surface sterilized with commercial bleach or H2O2 and H2O2 was found more suitable for sterilization.  Lead, shoot tip, 1st and 2nd nodal stem, 1st and 2nd internode explants were cultured on MS solidified medium supplemented with different concentrations of BAP, TDZ or BAP+NAA.  Maximum shoot regeneration frequency was achieved from shoot tip explant cultured on MS medium containing 0.80 mg/l  TDZ. Maximum number of 49.60 shoots per explants were scored from 2nd nodal stem explant cultured on MS medium containing 0.80 mg/l  TDZ. Maximum longer shoots (2.0 cm) were obtained from 1st nodal stem explant cultured on MS medium containing 0.0 mg/l BAP. Rooting experiment were not done due to direct rooting observed in the all regeneration medium. Regenerated plantlets were acclimatized in the jars at different pH levels and showed best growth at pH 7.0.
Sanayi atık sularından Cr(III) iyonlarının titanyum oksit - silika nanopartiküler fotokatalistle uzaklaştırılması
Removal of Cr(III) ions from industrial waste waters with titanium oxide-silica nanoparticles photocatalyst
Yazar: VEYSEL DOĞAN ÖZKAN
Danışman: YRD. DOÇ. DR. AYSEL ÇİMEN
Karamanoğlu Mehmetbey Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Kimya Ana Bilim Dalı / Fizikokimya Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2015
Konu: Kimya = Chemistry

Özet:
Bu çalışma konjüge bağlı TiO2-SiO2 yüzeyi emdirme metodu ile hazırlandı. XRD, FTIR 

ve SEM ölçümlerine dayanarak, silika substrat üzerinde titanyum büyümesinin, çapraz 

bağlı Ti-O-Si nin arasına TiO2 fazının sabitlenmesiyle oluştuğu görüldü. Hazırlanan 

TiO2–SiO2 katalizör Cr(III) ağır metalinin bozulmak suretiyle giderilmesi bakımından 

kayda değer bir fotokatalitik etki gösterdi. Reaksiyon zamanı, kalsinasyon sıcaklığı, 

çözelti konsantrasyonu ve katalizör miktarı gibi parametreler detaylı bir şekilde 

incelendi. Katalitik performansın, katalizör, konsantrasyon ve reaksiyon zamanına 

önemli bir şekilde bağlı olduğu bulundu. Sentezlenen katalizör, X-ray difraksiyon 

analizi (XRD), taramalı elektron mikroskobu (SEM), FTIR gibi yüzey analizi 

ölçümlerini içeren tekniklerle karakterize edildi. Işıkla bozulma (fotodegredasyon) 

yöntemi kullanılarak atık sulardan Cr(III) iyonlarının uzaklaştırılması gerçekleştirildi.

Abstract:
TiO2/SiO2 was prepared by means of the impregnation method. Based on the results of 

XRD, FTIR and SEM measurements, the growth of titania on the silica substrate seems 

to occur by anchoring of the TiO2 phase through Ti–O–Si cross-linking bonds. The 

prepared TiO2–SiO2 catalyst demonstrated a remarkable photocatalytic activity toward 

degradation of Cr(III). The effect of reaction time, calcination temperature and time, 

amount of catalyst and solution concentration on the structural and chemical properties 

of the catalyst was investigated in details. The catalytic performance was found to 

depend essentially on the catalyst and target concentrations and the reaction time. The 

synthesized catalyst was characterized by a variety of techniques including surface area 

measurement, X-ray diffraction analysis (XRD), scanning electron microscopy (SEM) 

and Fourier transform infrared spectroscopy (FTIR) measurements. The characterization 

of prepared TiO2–SiO2 catalyst, its photocatalytic performance and applications of 

wastewater containing Cr(III) are presented and thoroughly discussed.
Makarnalık buğdayda gpc-B1 geni bakımından melez hatların elde edilmesi ve tanımlanması
Obtaining and identifying of hybrid lines for Gpc-B1 gene in durum wheat
Yazar: LEYLA NUREFŞAN GÜNDÜZ
Danışman: DOÇ. DR. ÖZLEM ATEŞ SÖNMEZOĞLU
Karamanoğlu Mehmetbey Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Biyoloji Ana Bilim Dalı / Moleküler Biyoloji Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2016
Konu: Biyoloji = Biology ; Biyoteknoloji = Biotechnology
Dizin: Makarnalık buğday = Durum wheat ; Triticum durum = Triticum durum

Özet:
Son yıllarda başta demir ve çinko olmak üzere mikro besin elementi ve protein bakımından yetersiz beslenme oranı oldukça artmıştır. Bu nedenle buğday gibi temel besin maddelerinin mikro besin elementlerince zenginleştirilmesi gerekmektedir. Makarnalık buğdayda son yıllarda besin değerinin arttırılmasına yönelik çalışmalarda kullanılan en önemli gen bölgelerinden biri protein ve mikro besin elementi miktarında artış sağlayan Gpc-B1 lokusudur. 
Bu çalışmada farklı anaçlardan elde edilmiş üç adet ileri geri melez ıslah hattına (TMB1, TMB2 ve TMB3), protein oranının arttırılması ve mikro besin element (Fe, Mn ve Zn) içeriklerinin yükseltilmesi amacıyla Gpc-B1 geninin aktarılması hedeflenmiştir. Bu amaçla Gpc-B1 genine sahip olduğu bilinen UC1113-Gpc-B1 hattı melezlemelerde gen kaynağı olarak kullanılmıştır. F1 generasyonunda hedeflenen gen bölgelerini taşıyan melez bitkileri markör destekli seleksiyon yöntemi ile moleküler markörlerle taranarak belirlenmiştir. Bununla birlikte; sarı pasa dayanıklılığı sağlayan Yr-36 geni Gpc-B1 alleliyle bağlantılı olduğu için; Gpc-B1 geninin aktarıldığı hatlara Yr-36 geni de aktarılmıştır.

Abstract:
In recent days, insufficient nourishment ratio has been increased in terms of proteins and micro nutrient elements; primarily iron and zinc. For this reason, there is a need for basic food crops like wheat to be enriched with micro nutrient elements. Gpc-B1 locus located in the short arm of chromosome 6B is one of the most important studied genes in recent research in durum wheat.
In this study, it is aimed to transfer Gpc-B1 gene to three advanced breeding lines (TMB1, TMB2 and TMB3) from different parents in order to increase protein amount and micro nutrient elements (Fn, Mn and Zn). It was known that UC113-Gpc-B1 line had Gpc-B1 gene and thus it was used as gene source. Hybrid plants that have the targeted gene in F1 generation were determined using molecular markers by marker assisted selection. Since Yr-36 gene that provides resistance to yellow rust was associated with Gpc-B1 allele, it was also transferred to the lines together with Gpc-B1 gene.
Ayrancı ve Yeşildere (Karaman) yörelerinde yetişen 
makromantarların belirlenmesi
Determination of macrofungi growing in Ayrancı and Yeşi̇ldere regions (Karaman)
Yazar: AHMET ÇETİNKAYA
Danışman: PROF. DR. ABDULLAH KAYA
Karamanoğlu Mehmetbey Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Biyoloji Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2016
Konu: Botanik = Botany

Özet:
Bu çalışma Ayrancı ve Yeşildere (Karaman) yörelerinde yetişen makromantarlar üzerinde gerçekleştirilmiştir. 2014-2015 yılları arasında bölgede gerçekleştirilen arazi çalışmaları sonucunda 335 makromantar örneği toplanmıştır. Ekolojik özellikleri not edilen ve doğal ortamında resimlenen örnekler laboratuvar ortamına taşınıp kurutularak fungaryum materyali haline getirilmiştir. Gerekli teşhis işlemleri sonucunda 13 takım, 37 familya ve 56 cinse ait 73 takson tanımlanmıştır. Bunlardan 29 tanesi Ascomycota, 44 tanesi ise Basidiomycota bölümü içinde yer almaktadır.
Tanımlanan taksonlardan 8 tanesi, Hymenogaster bulliardii Vittad. (Strophariaceae), Hymenoscyphus caudatus (P. Karst.) Dennis (Helotiaceae), Nectria peziza (Tode) Fr. (Nectriaceae), Nemania serpens (Pers.) Gray (Xylariaceae), Orbilia auricolor (A. Bloxam) Sacc. (Orbiliaceae), Parascutellinia violacea (Velen.) Svrček (Pyronemataceae), Terfezia albida Ant. Rodr., Mohedano & Bordallo (Pezizaceae) ve Thecotheus lundqvistii Aas (Ascobolaceae) Türkiye‟den ilk kez kaydedilmiştir.

Abstract:
This study was carried out on the macrofungi growing in Ayrancı and Yeşildere (Karaman) regions. Three hundred and thirty five macrofungi samples were collected during field trips between 2014 and 2015. Ecological properties were noted and they were photographed at their natural habitat. Transfering the samples to the lab, they were dried and prepared as fungarium materials. As a result of necessary idendification processes, 73 taxa belonging to 13 orders, 37 families and 56 genera were determined. Twenty nine of them belong to Ascomycota and 44 belong to Basidiomycota.
Eight, Hymenogaster bulliardii Vittad. (Strophariaceae), Hymenoscyphus caudatus (P. Karst.) Dennis (Helotiaceae), Nectria peziza (Tode) Fr. (Nectriaceae), Nemania serpens (Pers.) Gray (Xylariaceae), Orbilia auricolor (A. Bloxam) Sacc. (Orbiliaceae), Parascutellinia violacea (Velen.) Svrček (Pyronemataceae), Terfezia albida Ant. Rodr., Mohedano & Bordallo (Pezizaceae) and Thecotheus lundqvistii Aas (Ascobolaceae), of the determined taxa, are recorded for the first time from Turkey.
Germanyum nano yapılar ve  bodıpy boya molekülleri arasındaki enerji ve elektron transfer süreçlerinin incelenmesi
Investigation of energy and electron transfer  
processes between germanium nanostructures and bodipy molecules
Yazar: AYŞEGÜL ŞAHİN
Danışman: YRD. DOÇ. DR. SABRİYE AÇIKGÖZ
Karamanoğlu Mehmetbey Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / İleri Teknolojiler Ana Bilim Dalı / Metalurji ve Malzeme Mühendisliği Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2016
Konu: Metalurji Mühendisliği = Metallurgical Engineering

Özet:
Yarı iletken nano yapılar ve floresan boya molekülleri arasındaki fotonik etkileşimler tek zamanlı foton sayma tekniği ile incelenmiştir. Yarı iletken nano yapılar Germanyum altlıklar kullanılarak çift hücreli anodizasyon yöntemi ile üretildi. Organik BODIPY boya molekülü floresan molekül olarak tercih edildi. BODIPY boya molekülleri yarı iletken yüzeyine aminopropyl triethoxysilane (APTES) moleküler bağlayıcı yardımıyla kovalent olarak bağlandı. Nano yapılı Germanyum altlıkların yüzey morfolojisi floresan yaşam ömrü görüntüleme mikroskobu tarafından görüntülendi. Ters piramitler şeklindeki oyuklar içinde sınırlandırılan floresan boya moleküllerinin ışıma şiddetinin Purcell etkisi nedeniyle arttığı gözlemlenmiştir. Ayrıca, zaman uyumlu floresan yaşam ömrü ölçümleri yarı iletken ve boya moleküllerinin ara yüzeylerinde elektron ve enerji transferlerinin meydana geldiğini göstermiştir.

Abstract:
Photonic interactions between semiconductor nanostructures and fluorescent dye molecules were investigated by time correlated single photon counting technique. Semiconductor nanostructures were produced by double cell electrochemical anodization using germanium substrates. Organic BODIPY dye molecule was preferred as a fluorescent molecule. BODIPY dye molecules were covalently attached to semiconductor surface through aminopropyl triethoxysilane (APTES) molecular linker. Surface morphology of nanostructured germanium substrates were monitored via fluorescence lifetime imaging microscope. It is observed that the fluorescence intensity of dye molecules confined in inverted pyramidal cavity increases due to Purcell effect. Moreover, time-resolved fluorescence lifetime experiments show that electron and energy transfer processes occurs in semiconductor and fluorescent molecule interfaces.
Biyo-malzeme duyarlı güneş pili
Bio-material sensitized solar cell
Yazar: SERDAL MUTLU
Danışman: YRD. DOÇ. DR. ÖZLEM ATEŞ SÖNMEZOĞLU ; DOÇ. DR. SAVAŞ SÖNMEZOĞLU
Karamanoğlu Mehmetbey Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Biyoloji Ana Bilim Dalı / Moleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2016
Konu: Biyoteknoloji = Biotechnology ; Enerji = Energy
Dizin: Buğday = Wheat ; DNA = DNA

Özet:
Bu çalışmada, mor ötesi bölgede etkin bir soğurmaya sahip çift sarmallı buğday (Triticum durum L.) ve nohut bitkisi (Cicer arietinum L.) DNA'sı ışığı soğuran tabaka olarak kullanılarak biyo-malzeme duyarlı güneş pilleri (Biyo-DGP) üretilmiştir. Bitki DNA'ları tek başına ve geleneksel boya duyarlı güneş pillerinde kullanılan rutenyum kompleks (N719) boyası ile birlikte eş-duyarlaştırıcı olarak kullanılmıştır. Üretilen güneş pillerinin fotovoltaik performansı akım-gerilim karakteristiği ve IPCE analizleri yardımıyla incelenmiştir. Buğday ve nohut DNA'sının titanyum dioksit (TiO2) yarıiletken yüzeyine iyi tutunduğu ve hem TiO2'nin hem de N719 boyasının soğurma özelliliğini arttırdığı saptanmıştır. En yüksek verimlilik değeri, buğday DNA'sı, nohut DNA'sı ve N719 boyalarının birlikte kullanıldığı üçlü eş-duyarlaştırıcılı Biyo-DGP için % 6,83 olarak elde edilmiştir. Bunun yanında, sadece N719 boyası kullanılarak üretilen güneş pili verimlilikleri (% 3,83) ile kıyaslandığında, hem buğday DNA'sı ile N719   (% 4,89) hem de nohut DNA'sı ve N719 (% 6,61) eş duyarlaştırıcılı Biyo-DGP'lerin verimlilik değerlerinin de akım yoğunluğunun artmasına bağlı olarak arttığı tespit edilmiştir.  Sonuç olarak, nohut ve buğday DNA'larının yüksek verimlilik elde edilen diğer sentetik boyar maddeler ile boya duyarlı güneş pillerinde hem eş-duyarlaştırıcı hem de enerji bariyeri olarak kullanılabileceği tespit edilmiştir.

Abstract:
In this study, biomaterial sensitized solar cells (Bio-SSC) were fabricated by using the double helix wheat (Triticum durum L.) and chickpea (Cicer arietinum L.) plants DNA as absorbing layers having effective absorption in ultraviolet region. Plant DNAs were used as alone and co-sentisizer with ruthenium complex dye which is used in the conventional dye sensitized solar cells. The photovoltaic performance of the obtained solar cells were investigated by current-voltage characteristic and IPCE analysis. It was clearly observed that wheat and chickpea DNA were well adsorbed onto the TiO2 semiconductor surface as well as they increased the absorbtion ability of both TiO2 and N719 dye. The highest efficiency value was obtained as 6.83% in Bio-SSC with triple co-sensitized including wheat DNA, chickpea DNA and N719 dyes. Moreover, when compared to only-N719 dye sensitized solar cell efficiency (3.83%), it was determined that the efficiency values of both N719-wheat DNA (4.89%) and N719-chickpea DNA (6.61%) co-sensitized Bio-SSCs increased depending on the increasing current density. As a result, wheat and chickpea DNA can be used in dye-sensitized solar cell as both co-sensitizer and energy barrier with other high-efficient synthetic dyes.
Makarnalık buğdayda Lpx-B1 geni bakımından melez hatların elde edilmesi ve taranması
Obtaining and identifying of hybrid lines for Lpx-B1 gene in durum wheat
Yazar: RAMAZAN ÖZBEY
Danışman: DOÇ. DR. ÖZLEM ATEŞ SÖNMEZOĞLU
Karamanoğlu Mehmetbey Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Biyoloji Ana Bilim Dalı / Moleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2016
Konu: Biyoloji = Biology ; Biyoteknoloji = Biotechnology
Dizin: Makarnalık buğday = Durum wheat ; Triticum durum = Triticum durum

Özet:
Makarnalık buğdayının kalitesini belirleyen temel kriter makarna üretimine uygunluk derecesi, yani makarnalık kalitesidir. Kaliteli bir makarnanın renginin parlak sarı olması istenmektedir. Makarnalık buğdaydan elde edilen son ürünlerin kalitesi tanenin protein miktarı ve kuvveti, sarı pigment içeriği ve lipoksijenaz (LOX) gibi sarı rengi olumsuz yönde etkileyen oksidatif enzimlerin aktiviteleri ile doğrudan ilişkilidir. Renk kalitesi yüksek makarna üretebilmek için kullanılan durum buğdayının pigment içeriğinin yüksek, LOX enzim aktivitesinin düşük olması gerekmektedir. 

Bu çalışmanın amacı, daha önce protein kalitesi iyileştirilmiş makarnalık buğday geri melez ıslah hatlarının (TMB2 ve TMB3) lipoksijenaz enzim aktivitelerinin düşürülmesidir. LOX enzim aktivitesi oldukça düşük olan Gediz-75 makarnalık buğday çeşidi melezlemelerde gen kaynağı olarak kullanılmıştır. F1 generasyonunda hedeflenen gen bölgesini (Lpx-B1.1) taşıyan bitkiler markör destekli seleksiyon yöntemi ile SSR markörleri kullanılarak seçilmiştir.

Abstract:
The basic criteria which determines durum wheat quality is its suitability for pasta processing, that is pasta making quality. Bright yellow color is a desired property in pasta products. Durum wheat pasta making quality is influenced by protein content and quality, yellow pigment content, and oxidative enzymes such as lipoxygenase (LOX) which affect adversely bright yellow color. Thus, wheat cultivars that are high in yellow pigments but low in LOX enzyme activity should be preferred for the production of pasta with high color quality. 

The aim of this study was to reduce lipoxygenase activities of the backcross durum wheat lines (TMB2 and TMB3) that were previously improved for their protein quality. Gediz-75 wheat with low LOX enzyme activity was used as the gene source. In F1 generation, plants carrying the targeted gene region (Lpx-B1.1) were selected using SSR markers by marker assisted selection method.
Bazı tıbbi bitkilerin farklı ekstraksiyon koşullarında elde edilen özütlerinin antimikrobiyal etkilerinin belirlenmesi ve karşılaştırılması
Determi̇nati̇on and compari̇son of anti̇mi̇crobi̇al effects of extracts obtai̇ned at di̇fferent extracti̇on condi̇ti̇ons of some medi̇cal plants
Yazar: ÜMMÜHAN ÜNLÜ
Danışman: YRD. DOÇ. DR. AYTAÇ KOCABAŞ
Karamanoğlu Mehmetbey Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Biyoloji Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2016
Konu: Biyoloji = Biology

Özet:
Tüm dünyada tıbbi açıdan önemli bulunan bitkiler halk arasında kullanılmaktadır ve doğal olarak yetişen bazı bitkilerin sahip olduğu antimikrobiyal etkileri yıllardır bilinmektedir. Yapılan çalışmalar, bitkisel materyallerin içindeki fitokimyasal bileşiklerin güçlü antioksidan ve antimikrobiyal aktiviteye sahip olduğunu göstermektedir. Dolayısıyla bu çalışmada, Karaman ili bölgesinde yetişen Alkanna orientalis, Anchusa officinalis, Cruciata taurica, Delphinium peregrinum, Euphorbia macroclada, Moltkia coerulea, Myosotis ramosissima, Ranunculus argyraeus, Veronica multifida ve Vicia canescens ssp. gregaria olmak üzere 10 farklı bitkinin antioksidan ve antimikrobiyal aktivitesi araştırıldı. Bitkilerin gövde kısımları kurutulup öğütüldükten sonra su ve hekzan kullanılarak ekstraksiyonları yapıldı. Özütlerin antimikrobiyal aktiviteleri Bacillus subtilis, Bacillus licheniformis, Staphylococcus aureus ATCC 29213, Escherichia coli ATCC 43895, Proteus vulgaris, Enterococcus faecalis, Agrobacterium tumefaciens ve Klebsiella pneumonia bakterilerine karşı test edildi. Cruciata taurica su özütü DPPH metoduna göre en düşük EC50 değerine sahiptir. Hatta, bu özüt en yüksek fenolik içerik miktarına da sahiptir. Buna karşılık, en yüksek antimikrobiyal aktiviteyi A.tumefaciens'e karşı 14mm inhibisyon zonu ile Alkanna orientalis su özütü göstermiştir.

Abstract:
Medicinally important plants are used among general public all over the world and antimicrobial effects of some naturally grown plants have been known for years. Performed studies showed that phytochemical compounds found in plant materials have intense antioxidant and antimicrobial activity. Therefore, in this study, antioxidant and antimicrobial activities of ten different plant species being of Alkanna orientalis, Anchusa officinalis, Cruciata taurica, Delphinium peregrinum, Euphorbia macroclada, Moltkia coerulea Myosotis ramosissima, Ranunculus argyraeus, Veronica multifida and Vicia canescens ssp. gregaria grown in Karaman province were investigated. After being dried and grinded, extractions of stem parts of plants were carried out by using water and hexane. Antimicrobial activities of extracts were tested against Bacillus subtilis, Bacillus licheniformis, Staphylococcus aureus ATCC 29213, Escherichia coli ATCC 43895, Proteus vulgaris, Enterococcus faecalis, Agrobacterium tumefaciens and Klebsiella pneumonia. Cruciata taurica water extract had the minimum EC50 value with respect to DPPH method. It also has the highest total phenolic content. On the other hand, Alkanna orientalis water extract showed the highest antimicrobial activity with 14mm inhibition zone against A.tumefaciens.
Fabrication of germanium micro and nanostructures by laser induced electrachemical anodization method
Germanyum mikro ve nano yapıların darbeli lazer içeren elektrokimyasal anodizasyon yöntemi ile üretilmesi
Yazar: EMİN ÖZÜNAL
Danışman: YRD. DOÇ. DR. SABRİYE AÇIKGÖZ
Karamanoğlu Mehmetbey Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / İleri Teknolojiler Ana Bilim Dalı / Metalurji ve Malzeme Mühendisliği Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2016
Konu: Metalurji Mühendisliği = Metallurgical Engineering

Özet:
Farklı şekil ve boyutlara sahip mikro ve nano yapılı yarıiletkenler 0.01 Ω-cm dirençli Antimon (Sb) katkılı ve kristal yönelimi (100) olan n tipi Germanyum(Ge) plakanın elektrokimyasal anodizasyonu ile hazırlanmıştır. Ge plakalar oda sıcaklığında içerisinde HF:C2H5OH (1:3) elektrolit çözeltisi bulunan çift elektrokimyasal asit hücresinde aşındırıldı. Anodizyon koşullarını iyileştirmek için, anodizasyon süresi, akım yoğunluğu, aydınlatma yönü ve aydınlatma kaynağı gibi çeşitli parametrelerin elde edilen nano yapılar üzerinde etkileri incelendi. Ge plakalar  katot ve anot yönünden halojen lamba, lazer gibi farklı ışık kaynakları tarafından  aydınlatıldı. Anot yönünden farklı aydınlatma kaynaklarını kullanılması ile nano-piramit, nano-çubuk, nano-koni ve nano-plaka gibi farklı Ge yüzey morfolojilerinin elde edilebileceği gösterildi. En homojen ve sürekli Ge nano piramit yapısı 30mA/cm2 akım yoğunluğunda 45 dakika 470 nm lazer ile aydınlatılarak hazırlanan numunede elde edilmiştir. Ge nano piramitlerin 400-600 aralığında foto ışıma yaptığı gözlemlenmiştir.

Abstract:
Semiconductor micro and nanostructures with different shapes and sizes are prepared by electrochemical anodization of n-type Sb doped (100) oriented germanium (Ge) wafers with resistivity of 0.01 Ω-cm. Ge wafers are etched in an electrochemical double cell with a HF:C2H5OH (1:3) electrolyte solution at room temperature. The effects of various parameters such as the illumination source, illumination side, current density, anodization time on the obtained Ge nanostructures are investigated in order to optimize anodization conditions. Ge wafers are illuminated by different light sources such as halogen lamp, laser from anode and cathode side.  It is demonstrated that different Ge surface morphologies such as nano-pillars, nano-rods, nano-sheets and nano-pyramids can be obtained using different anode side illumination source. The most uniform and continuous Ge nanopyramid array is obtained at the current density of 30mA/cm2 for 45 min under 470nm laser illumination. It is observed that Ge nanopyramids exhibit a broad photoluminescence band between 400 and 600 nm.