Tiyosemikarbazon türevlerinin DNA etkileşimlerinin ve antimikrobiyal aktivitesinin incelenmesi
DNA interaction and antimicrobial activity study of thiosemicarbazone derivatives
Yazar: NSER AHMED MASSOUD MOHAMMED
Danışman: PROF. DR. FATMA KANDEMİRLİ
Kastamonu Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Genetik ve Biyomühendislik Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2016
Konu: Biyomühendislik = Bioengineering ; Genetik = Genetics

Özet:
Kanser hastalığının tedavisi için kullanılan kemoterapi büyük gelişmeler göstermiştir, ve araştırmacılar bu hastalıkla mücadele etmek için bugüne kadar görülmemiş ve daha etkili ilaçlar geliştirmektedirler.
Tiyosemikarbazon ve Tiyosemikarbazidler, biyolojik uygulamalarda geniş bir yelpazeye sahiptir. Dana timüs DNA'sı ile üç farklı izatin tiyosemikarbazon çinko kompleksi etkileşimi, UV spektrofotometrisi çalışmaları kullanılarak incelendi. 1H-Indol-2,3-Diyone-3-(N-Fenil Tiyosemikarbazon), 1 H-Indol-2,3-Dione- 3- [N-(4-Nitrofenil)-Tiyosemikarbazon] ve 1H-Indol-2,3-Dione- 3- (N-Benzil Tiyosemikarbazon) ligandlarının çinko kompleksleri ile CT-DNA arasındaki etkileşimler, UV spektrofotometresi kullanılarak ve DNA konsantrasyonunun 0 μl'den 30 μl'ye arttırılması ile gerçekleştirilmiştir. Bu çalışmalar, komplekslerin DNA'ya kenetlenme çalışmalarına bağlı olarak küçük oluklar içerisinden bağlandığını doğruladı. Buna ek olarak, DNA bağlanma çalışmalarını yürütmek, tüm moleküllerin DNA (Protein Data Bank'dan indirilmiş) ile etkileşimlerinde en çok tercih edilen modunu elde etmek için Discovery Studio 3.5 programı kullanılmıştır. İzatin Tiyosemikarbazonların türevleri ve metal komplekslerinin 16 bakteri ve 1 fungi türlerine karşı etkisi in vitro olarak değerlendirildi. Sonuçlar, çalışılan bileşiklerin beş tip test edilmiş bakteriye karşı farklı antibakteriyal aktivite ve in vitro olarak test edilen bazı bakteri türlerine karşı seftriakson ile iyi bir sinerjistiğe sahip olduğunu göstermiştir. Bu metal komplekslerin ligandlara kıyasla, bazı bakteri türlerine karşı, artan bir aktiviteye sahip olması ligandların geçiş metallerin koordinasyonuna katılmasından kaynaklanabilir.

Abstract:
The chemotherapy for cancer disease has had enormous developments and researchers still as yet trying to develop new and more effective drugs to fight this illness.
Thiosemicarbazone and Thiosemicarbazides take possession of a wide range of biological applications. The interaction of three different isatin thiosemicarbazone zinc complexe with calf thymus DNA were examined by using UV spectrophotometry studies. Interaction of 1H-Indole-2,3-Dione-3-(N-Phenyl Thiosemicarbazone, 1H-Indole-2,3-Dione-3-[N-(4 Nitrophenyl)- Thiosemicarbazone and 1H-Indole-2,3-Dione-3-(N-Benzyl Thiosemicarbazone) zinc complexes with CT-DNA was carried out by increasing concentration of DNA from 0 to 30μl by using UV spectrophotometer study. These studies confirmed that, the complex binds to DNA through the minor groove according to the docking studies, in addition, all molecules were used to carry out DNA binding study with DNA (downloaded from Protein Data Bank) using Discovery Studio 3.5 to obtain the most favored binding mode of the ligands within the DNA. Isatin thiosemicarbazones derivatives and its metal complexes were evaluated in vitro against 16 types of bacteria and one type of fungi. Results shown that the studied compounds have different antibacterial activities against five types of tested bacteria, and it may have a good synergism with ceftriaxone against some types of bacteria which tested in vitro. According to the results obtained it was observed that metal complexes might had a heightened activity compared to the ligand against some types of tested bacteria.