hakansabunis/tr-academic-research-agent-index huggingface dataset:
Sosyal ağ analizinin hastalık biyobelirteçlerinin belirlenmesinde kullanımı
The use of social network analysis in disease biomarker detection
Yazar: HATİCE YAĞMUR ZENGİN
Danışman: PROF. DR. ERDEM KARABULUT
Hacettepe Üniversitesi / Sağlık Bilimleri Enstitüsü / Biyoistatistik Bilim Dalı
Derece: Doktora, 2018
Konu: Biyoistatistik = Biostatistics
Dizin: Biyobelirteçler = Biomarkers ; Biyoistatistik = Bioistatistics ; Hastalık = Disease ; Sosyal ağlar = Social networks ; Sınıflandırma = Classification ; İstatistik = Statistics ; İstatistiksel analiz = Statistical analysis ; İstatistiksel yöntemler = Statistical methods

Özet:
Özellikle son yıllarda, hastalığa özgü biyobelirteçlerin belirlenmesi amacıyla yapılan çalışmalarda sosyal ağ analizinin kullanımı ilgi uyandırmaktadır. Özellik seçim (feature selection) sürecinin bir adımı olarak sosyal ağ analizinin yer aldığı melez (hybrid) yöntemler ile hastalığa özgü biyobelirteçlerin belirlenmesi problemine farklı bir bakış açısı getirilmektedir. Bu tez çalışmasında, "Sosyal Ağ Özellik Seçimi (SocialNetworkFeature Selection, SNFS)" olarak adlandırılan melez yöntemin farklı aşamalarında kullanılan boyut indirgeme, kümeleme ve topluluk belirleme yöntemleri kısaca incelenmiş; erişime açık genomik mikrodizi veri setleri kullanılarak, SNFS'nin adımlarında yer alan bu yöntemlerin farklı kombinasyonları, Destek Vektör Makinesi (DVM) sınıflayıcısının sınıflama başarımına etkileri açısından karşılaştırılmıştır. Aynı zamanda, SNFS kullanılarak DVM sınıflayıcısından elde edilen sınıflama başarımındaki değişimlerin incelenmesi amacıyla bir benzetim çalışması yapılmıştır.
Sonuç olarak, R'da uygulanan SNFS yönteminin DVM sınıflayıcısının sınıflama başarımını ciddi oranda iyileştirdiği ve yüksek boyutlu veriler söz konusu olduğunda SNFS ile boyut indirgemenin sınıflama başarımı üzerinde olumlu etkisi olduğu görülmüştür.

Abstract:
Especially, in recent years, the use of social network analysis has gained interest in biomarker discovery studies. Hybrid approaches involve social network analysis as a step of the feature selection process bring a different perspective to identify disease-specific biomarkers. In this thesis, dimension reduction, clustering and community detection methods used in the different steps of the hybrid approach called "SocialNetworkFeature Selection (SNFS)" were briefly reviewed; the different combinations of these methods in the steps of SNFS were compared by using open access genomic microarray data sets in terms of the effects on classification performance of Support Vector Machine (SVM) classifier. In addition, a simulation study was conducted to examine the changes in classification performance obtained
from SVM classifier with the use of SNFS.
In conclusion, it had been seen that SNFS approach applied in R improves the classification performance of SVM classifier tremendously and dimension reduction with SNFS has positive effects on classification performance in case of highdimensional data.
Vihuela eserlerinin klasik gitarla çalınması üzerine bir araştırma
A research about playing vihuela pieces on classical guitar
Yazar: ERKAN MEHMET KARAGÜLLE
Danışman: PROF. DR. AHMET ABDURRAHMAN KANNECİ
Hacettepe Üniversitesi / Güzel Sanatlar Enstitüsü / Piyano Ana Sanat Dalı
Derece: Sanatta Yeterlik, 2018
Konu: Müzik = Music
Dizin: Klasik gitar = Classical guitar ; Vihuela = Vihuela

Özet:
Bu araştırmada vihuela eserlerinin bestelendikleri kilise modlarında klasik gitarla çalınması hedeflenmektedir. 
"Giriş" kısmında vihuela transkripsiyonlarındaki eksen farklılıkları tespit edilerek, vihuela eserlerinin  yazıldıkları kilise modlarında icra edilmesi ile ilgili problem durumu ortaya konmuştur. "Yöntem" kısmında araştırmada hangi yöntemlerle kaynak tarandığı ve bulgulara ulaşıldığı açıklanacaktır. Ardından "Kavramsal Çerçeve" kısmında araştırmanın problem durumunda sorulan soruların çözümüne yönelik olarak, kilise modları, Guido´nun hexachord sistemi, vihuela, vihuela repertuvarı, vihuela akordu, hayali akort ve vihuela tablaturu konuları açıklanmıştır. "Bulgular ve Yorumlar" kısmında örneklem olarak ele alınan eserlerin yazıldıkları kilise modları ile hayali akortları dikkate alınarak yeniden transkripsiyonları yapılmıştır. Son olarak araştırmanın "Sonuç ve Öneriler" kısmında, elde edilen bulgular ışığında ulaşılan sonuçlara yer verilerek, klasik gitar icracısı, öğretmeni ve öğrencilerinin yararlanabileceği bazı öneriler getirilecektir.

Abstract:
This research aims to play vihuela pieces on classical guitar in their original church modes.
In the first part, tonic differences on vihuela transcriptions will be identified and problem state about performing vihuela works which are written in their own church modes will be put forth.The second part will cover the methods of scanning sources to reach findings of the research.Then, explanations will take place about church modes, Guido's hexachord system, vihuela, vihuela repertoire, vihuela tuning, imaginary tuning and vihuela tablature due to questions asked in the problem state.The third part will include the findings with their interpretation about the transcriptions of vihuela works that are chosen as samples in consideration of their original church modes and imaginary tunings. Finally, there will be results about the findings obtained, along with suggestions for classical guitar performers, teachers and students to benefit.
Türkiye'de sağlık harcamalarının belirleyicileri
The determinants of healthcare expenditure in Turkey
Yazar: CEVAT TOSUN
Danışman: PROF. DR. NECMİDDİN BAĞDADİOĞLU
Hacettepe Üniversitesi / Sosyal Bilimler Enstitüsü / Maliye Ana Bilim Dalı / Maliye Bilim Dalı
Derece: Doktora, 2018
Konu: Ekonomi = Economics ; Maliye = Finance
Dizin: Finansman = Financing ; Sağlık harcamaları = Health expenditures ; Sağlık hizmetleri = Health services

Özet:
Daha iyi bir sağlık statüsü için devletlerin reform sürecinde olduğu veya bu sürecin tartışıldığı bir alan olan sağlık piyasasında, gelir ve nüfus yapısında yaşanan değişimler, teknolojik ilerlemeler ve artan beklentiler başta olmak üzere birçok farklı unsurdan etkilenerek farklılaşan sağlık harcamaları artan bir trende sahiptir. Ülkelerin gelişmişlik seviyesinden bağımsız olarak artan sağlık harcamaları, kamu bütçesi üzerine de bir yük getirmektedir. Türkiye'deki sağlık harcamaları da bu global eğilimden izole kalmamıştır. Bu gelişmeler Türkiye açısından sağlık harcamalarını belirleyen faktörlerin analizini gerekli kılmaktadır. Türkiye için sağlık harcamalarının belirleyicilerini, sağlık harcamaları analizinde bir nevi anahtar değişken olarak kabul edilen iktisadi ve demografik faktörler çerçevesinde zaman serisi yöntemiyle analiz eden bu çalışma, 1979-2016 yılları arasını Ekonomik Kalkınma ve İşbirliği Örgütü'nden (OECD) alınan verilerle analiz etmektedir. Ampirik bulgular, kişi başına düşen sağlık harcamalarındaki değişikliği, analiz edilen verilerle güçlü bir şekilde açıklamakta ve sağlık malının gelir esnekliğine ilişkin teorik çerçevede değerlendirilen sonuçlara Türkiye açısından katkılar sunmaktadır.

Abstract:
Health care expenditure has a highly increasing trend, distinguished through the effects of many different factors including changes in the income and population structure, technological progress and growing great expectations in the healthcare market, a field where states are in the process of reforming for a better health status or this process is debated. Increased health care expenditure, regardless of the development level of countries, also imposes a burden on the public budget. Health care expenditure in Turkey is no longer isolated from this global trend. These developments necessitate analysing the factors which determine health care expenditure in terms of Turkey. This study through the method of time-series analysis, within the scope of economic and demographic factors accepted as a sort of key factor in health care expenditure analysis examines the determinants of health care expenditure for Turkey with the data obtained from the Organization for Economic Cooperation and Development (OECD) between 1979 and 2016. Empirical results with the analysed data have acutely clarified the changes in health care expenditure per person and provided a great contribution to the results evaluated within the theoretical framework relating to the income elasticity of the health care in terms of Turkey.
Üç boyutlu yonga-üstü-ağ (3B-YÜA) mimarileri için eşleme yöntemleri
Mapping methods for three dimensional network-on-chip (3D-NOC) architectures
Yazar: YİĞİTCAN NALCI
Danışman: DOÇ. DR. SÜLEYMAN TOSUN
Hacettepe Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Bilgisayar Mühendisliği Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2018
Konu: Bilgisayar Mühendisliği Bilimleri-Bilgisayar ve Kontrol = Computer Engineering and Computer Science and Control

Özet:
Teknolojinin ilerlemesi ve uygulamaların ihtiyaçlarının artması ile yonga içindeki çekirdek sayısı hızlı bir artış göstermiştir. Bu durum tasarımcıları Yonga üstü Ağ (YüA) modeli gibi yeni iletişim teknolojileri icat etmeye yöneltmiştir. Bütünleşmiş devre üretimindeki gelişmeler, üç boyutlu YüA (3B YüA) uygulamalarına da olanak sağlamıştır. 3B YüA mimarilerinin avantajları 2B karşılığına göre fazladır. 3B YüA'lar daha düşük alana, daha yüksek verim ve performansa ve daha az enerji tüketimine sahiptir. Ancak 3B YüA mimarileri otomasyon algoritmalarından yoksundurlar. Önemli tasarım sorunlarından birisi de verilen uygulama bileşenlerini örgü tabanlı 3B YüA mimarisi üzerine eşleme problemidir. Bu tez çalışmasında, örgü tabanlı 3B YüA mimariler için bir sezgisel eşleme algoritması olan CastNet3D yöntemi önerilmiştir. CastNet3D algoritması, uygulamada birbiriyle çok iletişim kuran düğümleri, aralarında yatay bağlantılara göre daha hızlı ve daha az enerji tüketen dikey bağlantılar olacak şekilde yerleştirmeye çalışmaktadır. Ayrıca eşleme problemi için geliştirilen benzetimli tavlama (BT) tabanlı SA3D algoritması da sezgisel yöntemi meta sezgisel yöntem ile karşılaştırmak için önerilmiştir. CastNet3D algoritması SA3D ve iki adet 2B YüA algoritması ile birçok kıstasa göre karşılaştırılmıştır. Alınan sonuçlar CastNet3D'nin çok kısa sürede enerji tüketimi açısından daha iyi eşlemeler elde ettiğini göstermiştir.

Abstract:
The number of cores in the chip has shown a rapid increase with the advancement of technology and the increased needs of applications. This led designers to invent new communication technologies such as Network-on- Chip (NoC) paradigm. Advances in integrated circuit fabrications even allowed three-dimensional NoC (3D-NoC) implementations. 3D-NoC architectures have more advantages than its 2D counterpart. 3D-NoCs have a lower area, higher efficiency and performance and lower energy consumption. However, they lack the design automation algorithms. An important design problem for a given application is mapping it on 3D-NoC topology. In this thesis, we propose a heuristic mapping algorithm, called CastNet3D, for mesh-based 3D-NoCs. The algorithm tries to utilize vertical links for communicating nodes as much as possible since they are faster and less energy consuming than horizontal ones. Simulated annealing based algorithm (SA3D) for the mapping problem is also proposed to compare the heuristic method with the metaheuristic method. CastNet3D has been compared against SA3D and two 2D-NoC algorithms on several benchmarks. The results show that CastNet3D obtains better mappings in terms of energy consumption most of the time in a very short time.
Sanat eyleminde özne/bellek-nesne/mekan ilişkisi
Subject/memory-object/space relations in act of art
Yazar: MUSTAFA LEVENT YAZICI
Danışman: DR. ÖĞR. ÜYESİ ŞİNASİ TEK
Hacettepe Üniversitesi / Güzel Sanatlar Enstitüsü / Heykel Ana Sanat Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2018
Konu: Güzel Sanatlar = Fine Arts
Dizin: Bellek = Memory ; Mekan = Space ; Nesne = Object ; Nesne ilişkileri = Object relations ; Sanat = Art ; Sanat eylemi = Art action

Özet:
"Sanat Eyleminde Özne/Bellek-Nesne/Mekân İlişkisi" adlı bu çalışmada, genel olarak bellek-mekân ilişkisinin sanat eylemine yansımaları, hem dışardan (tümel) hem içerden (tikel) bakılarak sorgulanmıştır. Bu kapsamda: Birinci bölümde; iki bakışın sonucunda oluşacak kavramların (özne-nesne) tanımları, aralarındaki diyalektik ilişki ve bu ilişkinin sanat eylemine yansımaları genel olarak incelenmiştir. İkinci bölümde; belleğe ve sanat eylemine dışardan (tümel bağlamda)  bakılmış bellek ve sanat eylemi, mekânın içinde incelenmiştir. Bu bağlamda; sanatta bellek ve mekân ilişkisi, insan ve dünya ölçeğinde incelenmiş ve aralarındaki diyalektik ilişkinin yarattığı yerinden edilmenin sanat eylemine yansımaları araştırılmıştır. Üçüncü bölümde ise eylemin (sanat eylemi) belleğine içerden (tikel bağlamda) bakılmış; belleğin ve sanatsal eyleminin mekânı incelenmiştir. Sonuç olarak, hem mekânın belleğine hem de belleğin mekânına bakılarak Sanat Eyleminde Bellek ve Mekân İlişkisi sorgulanmıştır.

Abstract:
In this study called "Subject/Memory - Object/Space Relations in Act of Art", the reflections of the relation between memory and space upon art act have been questioned both externally (plenary) and internally (particularly). In this context, the definitions of the concepts (subject-object) that will occur as a result of the two perspectives, the dialectical relationship between them and the reflections of this relation to the act of art are generally examined in the first chapter. In the second chapter, memory and act of art, which is looked at from the outside (in planery context) is examined in the space. In this context, the relationship between memory and space in art has been examined in human and world scale and the reflection of the displacement created by the dialectical relationship between them has been investigated. In the third chapter, the memory of the action (act of art) is examined from inside (in particular context) and the space of memory and artistic action is examined. As a result, the relation between memory and space was questioned in the act of art by looking at both the memory of space and the space of memory.
Cu(II) iyonlarının gerçek zamanlı tayini için MIP temelli qcm sensörün hazırlanması
MIP based qcm sensor for real time detection of Cu(II) ions
Yazar: NİHAN AYDOĞAN
Danışman: DOÇ. DR. AYŞE MÜGE ANDAÇ ÖZDİL
Hacettepe Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Çevre Mühendisliği Ana Bilim Dalı / Çevre Mühendisliği Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2018
Konu: Çevre Mühendisliği = Environmental Engineering

Özet:
Sunulan tez kapsamında, ilk kez Cu(II) iyonları laboratuvar koşullarına gerek kalmadan pahalı cihazlar olmadan moleküler baskılama yöntemi ile nanoteknolojinin yüksek duyarlılık ve seçicilik özellikleri birleştirilerek, gerçek zamanlı Cu(II) iyonları tayini için gravimetrik bir nanosensör hazırlanmıştır. Böylece, 100 nm boyut aralığında, poli (Hidroksietil-Metakrilat) (pHEMA) temelli Cu(II) iyonu baskılanmış [Cu(II)-MIP] nanopartiküller sentezlenmiştir. Sentezlenen Cu(II)-MIP nanopartiküllerin yapısal karakterizasyonu taramalı elektron mikroskobu (SEM), zeta boyut dağılımı analizi ve FTIR spektroskopisi gibi çeşitli yöntemlerle yapılmıştır. Cu(II)-MIP nanopartiküller sulu çözeltilerde Cu(II) iyonlarının gerçek zamanlı tespiti için QCM nanosensörüne adapte edilmiştir. QCM nanosensör etkinliğini, başlangıç iyon derişimi ve seçicilik gibi parametreler ile araştırılmıştır. Sonuçlar, QCM nanosensörünün 0,15 µM- 1,57 µM'lik geniş bir aralıkta bile Cu(II) iyonları için yüksek seçicilik ve duyarlılığa sahip olduğunu göstermiştir. QCM nanosensörünün seçiciliği Co (II), Ni (II), Zn (II) ve Fe (II) iyonlarının yarışmalı adsorpsiyonu ile belirlenmiştir. Bu tez çalışmasında, Cu(II)-MIP nanopartiküllerin QCM nanosensöre uyarlanmasıyla çevresel kirleticilerin gerçek zamanlı tespitinde ucuz ve kolay uygulanabilir yeni bir strateji geliştirilmiştir.

Abstract:
Within the scope of the presented thesis, it was aimed to prepare gravimetric nanosensors for the determination of Cu(II) ions in real time by combining the high sensitivity and selectivity properties of nanotechnology with the molecular printing method without expensive devices and the necessity of laboratory conditions. Thus, poly(hydroxyethyl-methacrylate) (pHEMA) based Cu(II) ion imprinted [Cu(II)-MIP] nanoparticles were prepared in the size range of 100 nm. These Cu(II)-MIP nanoparticles were characterized in structure by the methods, such as scanning electron microscopy (SEM), zeta size distribution analysis and FTIR spectroscopy. Cu(II)-MIP nanoparticles were then adapted to QCM nanosensor for the real time detection of Cu(II) ions in aqueous solutions. The parameters of initial ion concentration and selectivity were investigated to obtain the optimum conditions of QCM nanosensor efficiency. The results showed that QCM nanosensor has high selectivity and sensitivity for Cu(II) ions even in a wide range of 0,15 µM - 1,57 µM. The selectivity of the QCM nanosensor was shown by competitive adsorption of Co(II), Ni(II), Zn(II) and Fe(II) ions. The results are promising for developing a new strategy in the detection of environmental contaminants by combining ion imprinted polymers (IIPs) and nanosensors.
Viyana Satım Sözleşmesine (CISG) göre ayıptan doğan sorumluluk
Liability for defect according to united nations convention on contracts for the international sale of goods
Yazar: AYA AKASHI
Danışman: PROF. DR. ERKAN KÜÇÜKGÜNGÖR
Hacettepe Üniversitesi / Sosyal Bilimler Enstitüsü / Özel Hukuk Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2018
Konu: Hukuk = Law
Dizin: Ayıplı mal = Defective goods ; Hukuki sorumluluk = Legal responsibility ; Japon hukuku = Japanese law ; Kanunlar 6098 sayılı = Laws 6098 numbered ; Türk borçlar hukuku = Turkish law of obligations ; Viyana Satım Sözleşmesi = Vienna Sales Convention

Özet:
Viyana Satım Sözleşmesi (CISG), işyerleri farklı devletlerde bulunan taraflar arasındaki mal satımı sözleşmelerine, bu devletlerin akit devletlerden olması halinde veya milletlerarası özel hukuk kurallarının akit bir devletin hukukuna atıf yapması halinde uygulanan sözleşmedir. CISG, 1980 yılında Viyana'da kabul edilip 01.01.1988 tarihinde yürürlüğe girmiştir. Japonya 2009 yılında, Türkiye ise 2011 yılında bu sözleşmeye taraf olmuştur.
Bu çalışmada, Viyana Satım Sözleşmesi (CISG), 6098 sayılı Türk Borçlar Kanunu ve Japon Medeni Kanunu'na göre ayıptan doğan sorumluluğa ilişkin düzenlemelerinin incelenip karşılaştırılmaktadır.

Abstract:
United Nations Convention on Contracts for the International Sale of Goods (CISG) applies to contracts of sales of goods between parties whose places of business are in different states when the states are contracting states or when the rules of private international law lead to the application of law of a contracting state. This convection was signed in 1980 and came into force at 01.01.1988. Japan became a party to this convection in 2009 and Turkey in 2011.
In this study, regulations relating to warranty against defects according to United Nations Convention on Contracts for the International Sale of Goods (CISG), Turkish Code of Obligations and Japanese Civil Code will be examined and compared.
Kuyucak jeotermal rezervuarının nümerik modeli
Numerical modeling of kuyucak geothermal reservoir
Yazar: TUĞÇE YARGICI
Danışman: DR. ÖĞR. ÜYESİ LEVENT TEZCAN
Hacettepe Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Jeoloji (Hidrejeoloji) Mühendisliği Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2018
Konu: Jeoloji Mühendisliği = Geological Engineering

Özet:
Türkiye'de jeotermal enerji üretimine olan ilgi ve yatırımlar artarken, sürdürülebilir kaynak yönetimi daha fazla önem kazanmaya başlamıştır. Bu bağlamda, sağlıklı bir jeotermal kaynak yönetiminin yapılabilmesi için nümerik jeotermal rezervuar modeli önemli ve etkin bir araçtır.
Tez kapsamında; Aydın ili Kuyucak İlçesi civarında bulunan ve jeotermal elektrik üretimi amaçlı 30 yıllık süre ile işletilmesi planlanan rezervuarın kavramsal modeli, jeolojik ve hidrojeolojik veriler değerlendirilerek ortaya konmuş, oluşturulan kavramsal model, FEFLOW programına aktarılarak nümerik olarak test edilmiştir.
Jeolojik katmanlar ve yapısal elemanlar programa aktarılmış, hidrolik ve ısıl parametreler ve kavramsal modeli temsil eden sınır koşulları tanımlanmıştır. Kararlı koşullar altında model çalıştırılarak, doğal durum modeli ortaya konmuştur. Doğal durum modeli sonuçları, kuyulara ait statik sıcaklık verileri ve hidrolik yük değerleri kullanılarak kalibre edilmiştir. Kalibrasyon sonucunda mevcut durumu temsil eden bir jeotermal rezervuar modeli ortaya konmuştur.
Model sonuçları, kabul edilebilir ve yönetilebilir bir jeotermal rezervuar modeli ortaya konduğunu gösterse de, işletme parametrelerinin daha hassas tahmin edilebilmesi için, uzun süreli işletme verileriyle yapılacak olan kararsız model kalibrasyonun da tamamlanması faydalı görülmüştür.

Anahtar Kelimeler: Jeotermal Rezervuar Modeli, Nümerik Model, Jeotermal Enerji, Hidrojeoloji, Jeotermal Kavramsal Model

Abstract:
The increasing interest to geothermal investments in Turkey brings more attention to the sustainable resource management. Numerical modeling is a powerful and significant tool in order to achieve efficient geothermal reservoir management.
In project scope, the conceptual model of the geothermal field located in Aydın Kuyucak region was developed with interpretation of geological and hydrogeological data deriving from field and drilled wells. The geothermal resource is planned to be operated 30 years for electricity generation. The conceptual model was tested through numerical modelling using FEFLOW software.
The methodology includes transferring geological layers, tectonic elements, hydraulic and thermal properties to software and defining the boundary conditions. The natural state modeling was conducted in order to present the current situation and the results were calibrated using the observed static temperature values and hydraulic heads gathering from well logs.
A managable and acceptable geothermal reservoir model of the field was achieved at the end of the study. In order to get more accurate results, a transient model run is recommended before using the model for operation scenarios.