Beyaz peynirlerde bozulmaya neden olan Yarrowia lipolytica ve Debaryomyces hansenii'nin fenotipik ve genotipik identifikasyonu
The phenotypic and genotypic identification of cheese spoiler Yarrowia lipolytica and Debaryomyces hansenii isoleted from white cheese
Yazar: HÜSNİYE TANSEL ÖZTÜRK YALÇIN
Danışman: PROF.DR. FÜSUN UÇAR
Ege Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Biyoloji Ana Bilim Dalı
Derece: Doktora, 2007
Konu: Biyoteknoloji = Biotechnology ; Mikrobiyoloji = Microbiology
Dizin: Beyaz peynir = White cheese ; Polimeraz zincirleme reaksiyonu = Polymerase chain reaction

Özet:
Farklı beyaz peynirlerde bozulmaya neden olan 92 maya suu izoleedilmi ve bu izolatların identifikasyonları Barnett ve ark.'na (2000)göre yapılmıtır. Tanılanan izolatların 8 genusa ait 13 farklı tür olduusaptanmıtır. En yaygın olarak bulunan izolatlar Debaryomyces hansenii(%32,6), Kluyveromyces marxianus (%18,5) ve Yarrowia lipolytica(%17,4) olarak tanılanmıtır. Tanılanan dier genuslar ise Pichia,Torulaspora, Candida, Williopsis, Galactomyces'dir. Fenotipiktanılamada en sık rastlanan bozulma etkeni türler olarak belirlenen D.hansenii ve Y. lipolytica türleri, 5,8 S ribozomal DNA' daki türespesifik internal transcribed spacer (ITS) bölgesinin PCR amplifikasyonu(ITS-PCR) ile de genotipik olarak karakterize edilmitir. Yapılangenotipik tanılama sonucunda, 15 Y. lipolytica straini ve 25 D. hanseniistraini sırayla 360bp ve 640bp uzunluunda karakteristik tek bir bantoluturmulardır.Biyokimyasal ve fizyolojik karakteristiklere dayalı konvansiyonelmetodlar kullanıldıında, tanılama uzun zaman almakta ve çounluklayanlı sonuçlanabilmektedir. Bu çalımadaki D. hansenii'nin 5 straini ileVIY. lipolytica'nın bir straini'nin konvansiyonel metodlarla yanlıtanılanması yukarıda belirtilen tezi dorulamaktadır. O nedenle ITSPCR,konvansiyonel metodlara göre daha hızlı, güvenilir, tekrarlanabilirve daha ekonomiktir.Anahtar Kelimeler: D. hansenii, Y. lipolytica, identifikasyon, ITS-PCR

Abstract:
92 yeast strains causing spoilage on different kinds of white cheesewere isolated and the isolates were identified according to Barnett et al(2000). It was determined that the identified isolates represented 13species belonging to 8 genera. The most prevalent isolates belonged tothe species Debaryomyces hansenii (%32,6), Kluyveromyces marxianus(%18,5) and Yarrowia lipolytica (%17,4). Other genera encountered werePichia, Torulaspora, Candida, Williopsis, Galactomyces. D. hansenii andY. lipolytica found to be the most frequent spoiling agent species atphenotypic identification were genotypically characterized with PCRamplification of the species-specific internally transcribed spacer (ITS)of 5,8 S ribosomal DNA (ITS-PCR). ITS-PCR resulted in singlefragments of 360 and 640 bp respectively, from 15 strains of Y.lipolyticaand 25 strains of D. hansenii.Use of identification systems based on biochemical andphysiological characteristics takes longer time and often results inVIIImisidentifications. In this study, false identification of 5 strains of D.hansenii and 1 strain of Y. lipolytica using conventional methodsconfirmed the above mentioned statement. As a consequence, ITS-PCRwas found to be more rapid, reliable, easy to perform and cost effectivethan biochemical approach.Keywords: D. hansenii, Y. lipolytica, identification, ITS-PCR