Hastanemizde klinik örneklerden izole edilen cutibacterium türlerinin antibiyotiklere duyarlılıklarının agarda dilüsyon ve disk difüzyon duyarlılık yöntemleri ile belirlenmesi /
Yazar: NAZMİYE ÜNLÜ
Danışman: PROF. DR. NURVER ÜLGER
Marmara Üniversitesi / Tıp Fakültesi / Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
Derece: Tıpta Uzmanlık, 2021
Konu: Mikrobiyoloji = Microbiology
Dizin: Antibiyotikler = Antibiotics ; Cutibacterium = Cutibacterium ; Hastaneler = Hospitals ; Mikrobiyal duyarlılık testleri = Microbial sensitivity tests ; İlaçlara direnç = Drug resistance ; İlaçlara direnç-bakteriyel = Drug resistance-bacterial

Özet:
Marmara Üniversitesi Pendik Eğitim ve Araştırma Hastanesi'nde izole edilmiş,
enfeksiyon etkeni olan Cutibacterium türlerine ait izolatların neden olduğu klinik
tabloların irdelenmesi, antibiyotiklere duyarlılıklarının belirlenmesi, agarda dilüsyon
yöntemi ile disk difüzyon yöntemi sonuçlarının karşılaştırılması amaçlanmıştır.
Ocak 2015-Nisan 2021 tarihleri arasında laboratuvarımıza gelen, klasik
yöntemler ve MALDI-TOF MS ile tanımlanan Cutibacterium türlerine ait 45 izolatın
ampisilin, ampisilin-sulbaktam, meropenem, tetrasiklin, vankomisin ve klindamisine
duyarlılıkları anaerop bakteriler için referans yöntem olan agarda dilüsyon yöntemi ile
belirlenmiştir. At kanı ile zenginleştirilmiş fastidious anaerop agarda aynı
antibiyotikler için üç farklı inkübasyon süresi (20, 30 ve 40 saat) uygulanarak disk
difüzyon yöntemi ile duyarlılık çalışılmıştır.
İzolatların %46,7'si (n=21) doku, %22,2'si (n=10) cilt apsesi, %20'si (n=9)
beyin apsesi, %6,7'si (n=3) batın içi apse, %2,2'si (n=1) kemik apsesi, %2,2'si (n=1)
plevra örneğinden izole edilmiştir. 45 izolatın %71,1'i (n=32) Cutibacterium acnes,
%26,7'si (n=12) Cutibacterium avidum, %2,2'si (n=1) Cutibacterium granulosum
olarak tanımlanmıştır. Agarda dilüsyon yöntemi sonuçlarına göre Cutibacterium acnes
ve Cutibacterium granulosum türlerine ait izolatların tümü test edilen antibiyotiklere
duyarlı bulunmuştur. Cutibacterium avidum izolatlarının %33,3'ünde (4/12)
klindamisin direnci saptanmış olup test edilen diğer antibiyotiklere direnç
saptanmamıştır. 20. saat inkübasyon sonunda disk difüzyon inhibisyon zon kenarları
belirsiz ve üreme silik olduğundan okunabilirlik açısından uygun bulunmamıştır. 30.
ve 40. saatler arasında okunabilirlik açısından fark görülmemiştir. İzolatlarımız,
klindamisin haricinde test edilen tüm antibiyotiklere duyarlı bulunduğundan tahmini
sınır değerlerini belirlemek mümkün değildir. Klindamisin için agarda dilüsyon
sonuçlarının disk difüzyon zon çapı değerleri ile korelasyonunun iyi olduğu
görülmüştür. Cutibacterium türlerinde en çok direnç saptanan antibiyotiklerden biri
olan klindamisin için, disk difüzyon ve agarda dilüsyon yöntemi sonuçları arasında
korelasyonun iyi bulunması sevindiricidir.
Çalışmamızın, daha fazla sayıda ve daha fazla çeşitliliğe sahip direnç profili
olan izolatlar ile yapılacak çalışmalara kaynak oluşturması açısından verilerimizin
kıymetli olduğunu düşünüyoruz.
Anahtar kelimeler: Cutibacterium türleri, agarda dilüsyon, disk difüzyon

Abstract:
The aims of this study were to evaluate the clinical presentations of Cutibacterium
species which were thought to be an infectious agent, isolated in Marmara University
Pendik Training and Research Hospital, to determine their susceptibility to antibiotics,
and to compare the results of the agar dilution method and disk diffusion method.
The susceptibility to ampicillin, ampicillin-sulbactam, meropenem,
tetracycline, vancomycin and clindamycin of 45 isolates belonging to Cutibacterium
species identified by classical methods and MALDI-TOF MS, which send to
microbiology laboratory between January 2015 and April 2021, were determined by
agar dilution method, which is the reference method for anaerobic bacteria. The same
antibiotics were tested by disk diffusion method by applying three different incubation
times (20, 30 and 40 hours) on fastidious anaerobic agar enriched with horse blood.
Isolates were recovered from various locations: 46.7% (n=21) tissue, 22.2%
(n=10) skin abscess, 20% (n=9) brain abscess, 6.7% (n=3 ) intra-abdominal abscess,
2.2% (n=1) bone abscess, 2.2% (n=1) pleural sample. Overall, 71.1% (n=32), 26.7%
(n=12), 2.2% (n=1) of the isolates were identified as Cutibacterium acnes,
Cutibacterium avidum, Cutibacterium granulosum, respectively. According to the
results of the agar dilution method, all isolates of Cutibacterium acnes and
Cutibacterium granulosum species were susceptible to the tested antibiotics.
Clindamycin resistance was detected in 33.3% (4/12) of Cutibacterium avidum
isolates, and no resistance was found to other tested antibiotics. At the end of the 20th
hour incubation, the disk diffusion zone edges were unclear and the growth was hazy,
so it was not eligible for readability. There was no difference in readability between
the 30th and 40th hours. Our isolates were susceptible to all tested antibiotics except
clindamycin so we could not suggest tentative zone diameter breakpoints. We found a
good agreement between agar dilution and disk diffusion for clindamycin. It is
pleasing to find a good correlation between the results of disk diffusion method and
agar dilution for clindamycin, one of the antibiotics with the highest resistance in
Cutibacterium species.
We think that our data is valuable in terms of being a source for studies to be
conducted with isolates with a greater number and diversity of resistance profiles.
Keywords: Cutibacterium species, agar dilution, disk diffusion