Diyabetik ayak enfeksiyonlu hastalarda sürüntü kültürü ile derin doku kültürünün karşılaştırılması ve antimikrobik duyarlılık durumu
Comparison of microbiological results of deep tissue culture and superficial swab culture in patients with diabetic foot infections and the status of antimicrobial susceptibility
Yazar: SEVGİ YILMAZ
Danışman: PROF. DR. İLHAN ÖZGÜNEŞ
Eskişehir Osmangazi Üniversitesi / Tıp Fakültesi / Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Bakteriyoloji Ana Bilim Dalı
Derece: Tıpta Uzmanlık, 2017
Konu: Klinik Bakteriyoloji ve Enfeksiyon Hastalıkları = Clinical Microbiology and Infectious Diseases
Dizin: Antibiyotikler = Antibiotics ; Ayak = Foot ; Diabetes mellitus = Diabetes mellitus ; Doku kültürü = Tissue culture ; Enfeksiyon = Infection ; Yaralar ve yaralanmalar = Wounds and injuries ; İlaçlara direnç = Drug resistance ; İlaçlara direnç-mikrobiyal = Drug resistance-microbial

Özet:
Bu çalışmada diyabetik ayak enfeksiyonlu 40 hastanın sürüntü kültürü (SK) ile derin doku kültürü (DDK) arasındaki ilişkiye bakılarak, patojenlerin antimikrobik duyarlılıkları incelendi. 2015-2016 arasında, hastalardan lezyona uygun yöntemle sürüntü ve derin doku kültürü alındı. Üreme olan örneklerde mikrobiyolojik tanımlama yapıldı. Biyopsiden sonra başlanan ampirik antibiyoterapi mikrobiyolojik sonuçlara göre değerlendirildi ve gerekli olgularda tedavi değişikliği yapıldı. Çalışmanın istatistiksel analizi IBM SPSS Statistics (V22.0) programı kullanılarak yapıldı. Çalışmadaki hastaların yaş ortalaması 58,9 yıl, ortalama diyabet süresi 16,7 yıl, ortalama kan şekeri 278,5 mg/dl olarak bulundu. Lezyonları topuk ve parmaklarda yoğunlaşan hastaların %35'ine ampütasyon yapıldı. Wagner evre 2 ve üzeri çalışmaya alınan olguların %22,5'i evre 2, %57,5'i evre 3, %15'i evre 4, %5'i evre 5'ti. 25 (%62,5) hastada SK ile DDK'ünde aynı sonuçlar raporlandı. 26 (%65) hastanın SK, DDK'ündeki patojenleri içeriyordu. Monomikrobiyal üreme oranları aynı idi. Hem SK hem DDK'lerinde polimikrobiyal üreme oranı %12,5, patojen bakteri üremesi olan hasta başına düşen mikroorganizma sayısı 1,2 ve en çok izole edilen patojen S. aureus idi. DDK'ündeki stafilokoklar metisiline, E. faecalis suşları ampisiline ve tüm Gram (+) koklar vankomisine duyarlıydı. Enterobacteriaceae suşlarının hepsi meropeneme duyarlıydı. A. baumannii suşları amikasin ve imipeneme dirençli, kolistine duyarlıydı. P. aeruginosa suşlarının ise %40'ı meropeneme duyarlıydı. Sonuç olarak; uygun debritman yapıldıktan sonra alınan SK sonuçlarıyla tedavi başlanabileceği, tedaviye yanıtsız hastalarda DDK alınmasının ve ampirik antimikrobiyal tedavinin hastaların klinik ve tıbbi öyküsünün dikkate alınarak başlanılmasının uygun olduğu düşünüldü.
Anahtar Kelimeler: Diyabetik ayak enfeksiyonu, sürüntü kültürü, derin doku kültürü

Abstract:
In this study; the relation between deep tissue culture (DTC) and superficial swab culture (SSC) in 40 patients with diabetic foot infections were analysed and the antimicrobial susceptibility status of the pathogens were evaluated. The cultures of deep tissue biopsy specimens and swab samples were collected simultaneously from all patients between 2016 and 2017. Positive cultures were identified microbiologically. Empirical antibiotic that is started after procedure was reevaluated according to microbiological results and treatmeant change was considered when necessary. Statistical analysis was performed with IBM SPSS Statistics V22.0. In this study, mean age was 58.9 years. Mean duration of diabetes was 16.7 years and mean blood glucose was 278.5 mg/dl. Patients' lesions were mostly on the heel and toes. 35% of the patients were undergone amputation. Wagner grade ≥2 wounds were included to the study. 22.5% of these wounds were grade 2 while 57.5% was grade 3 and 15% was grade 4. The percentage of grade 5 wounds were 5%. The same microbiological results were reported in 25 (62.5%) patients' SSC and DTC. Superficial swab culture of 26 (65%) patients was including the pathogens in DTC. Monomicrobial infection rates were the same. Polymicrobial infection rate in both SSC and DTC was 12.5% and S. aureus was the most commonly isolated pathogen. The average number of isolates per culture positive sample was 1.2. Staphylococci were sensitive to methicillin, E. faecalis species were sensitive to ampicillin, all Gram-positive cocci were sensitive to vancomycin in the DTC. Meropenem was efficient against Enterobacteriaceae family. A. baumannii species were sensitive to colistin, but resistant to amikacin and imipenem. 40% of P. aeruginosa species were sensitive to meropenem. In conclusion, our data shows that treatment could be started according to the result of superficial swab culture that is taken after debridement surgery. If the patient is unresponsive to treatment, DTC should be taken. Empirical antimicrobial therapy should be started considering patients' medical history and clinical examination.
Key Words: Diabetic foot infections, superficial swab culture, deep tissue culture.