Antalya ili marul üretim alanlarında mirafiori marul iri damar virüsünün belirlenmesi
Detection of mirafiori lettuce big vein virus in lettuce growing areas of Antalya province
Yazar: EMİNE ERDAŞ
Danışman: DOÇ. DR. HANDAN ÇULAL KILIÇ
Isparta Uygulamalı Bilimler Üniversitesi / Lisansüstü Eğitim Enstitüsü / Bitki Koruma Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2022
Konu: Ziraat = Agriculture
Dizin: Antalya = Antalya ; Gerçek zamanlı polimeraz zincir reaksiyonu (RT-PCR) = Reverse transcription polimerase chain reaction ; Kantitatif = Quantitative ; Marul = Lettuce ; Marul iri damar virüsü = Mirafiori lettuce big vein virus ; Virüsler = Viruses

Özet:
Bu çalışma 2019-2021 yılları arasında Antalya ili marul üretim alanlarında mirafiori marul iri damar virüsü (mirafiori lettuce big vein virus: MiLBVV)'nün belirlenmesi amacıyla yürütülmüştür. 
Arazi çalışmalarında 240 marul örneği toplanmış ve bütün örnekler MiLBVV'ye spesifik antiserumlar kullanılarak double antibody sandwich enzyme linked immunosorbent assay (DAS-ELISA) yöntemiyle testlenmiştir. Testlenen bitki örneklerinin 44 adedinin MiLBVV ile enfekteli olduğu tespit edilmiştir. Testlenen örneklerdeki hastalık oranı ise %18.33 olarak belirlenmiştir. 
DAS-ELISA'da pozitif çıkan 44 örnekten, absorbans değeri yüksek olan 29 adet bitki örneği total RNA izolasyonu ve reverse transcription polimerase chain reaction (RT-PCR) çalışmalarında kullanılmıştır. RT-PCR çalışmalarında, MiLBVV'ye spesifik primer çiftleri kullanılmış ve MiLBVV'nin 469 bp'lik kılıf protein gen bölgesi çoğaltılarak agaroz jelde UV altında görüntülenmiştir. Agaroz jel elektroforezde MiLBVV'ye özgü beklenen seviyede bant gözlemlenmiştir.
Vektör fungus olan Olpidium spp.'nin oluşturduğu spor yapılarının belirlenmesi için marul bitkilerinin enfekteli kökleri trypan blue solüsyon çözeltisi ile boyanmış ve vektör fungusun sporları tespit edilmiştir.
Bu çalışma ile Antalya ili marul üretim alanlarında MiLBVV'nin varlığı ilk kez ortaya konulmuştur.

Abstract:
This study was conducted for detection of mirafiori lettuce big vein virus (MiLBVV) in the fields where the lettuce production in Antalya province in 2019-2021 years.
A total 240 plant samples were collected from fields and all samples were tested for MiLBVV using specific antiserum in a double antibody sandwich enzyme linked immunosorbent assay (DAS-ELISA). 44 samples were found to be infected with MiLBVV.  MiLBVV infection ratio was determined in %18.33 of field samples.
29 samples with a high absorbance value out of 44 samples that tested positive as a result of the DAS-ELISA test were used for total RNA isolation and Reverse Transcription Polimerase Chain Reaction (RT-PCR) studies. In RT-PCR studies, specific primer pairs were used for MiLBVV and 469 bp fragments of MiLBVV representing the coat protein region was amplified and observed under the UV light. The respected size of band for MiLBVV was observed on agarose gel electrophoresis. 
In order to determine the fungal structures of the vector fungus Olpidium spp. for lettuce roots were stained in trypan blue solution and examined the fungal spore structures with a light microscope.
In this study, the presence of MiLBVV was revealed for the first time in lettuce production areas in Antalya province.