Phenotypic and genotypic investigation of metallo beta lactamase in 
acinetobacter strains isolated from clinical samples
Klinik örneklerden izole edilen acinetobacter spp.kökenlerinde metallo beta laktamaz varlığının fenotipik ve genotipik olarak araştırılması
Yazar: SAADET MERVE OCAK
Danışman: DOÇ. DR. BURÇİN ÖZER
Mustafa Kemal Üniversitesi / Sağlık Bilimleri Enstitüsü / Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2013
Konu: Mikrobiyoloji = Microbiology
Dizin: Acinetobacter = Acinetobacter ; Beta laktamazlar = Beta lactamases ; Fenotip = Phenotype ; Genotip = Genotype

Özet:
Acinetobacterlerin olusturdukları infeksiyonlarda antibiyotiklere olan dirençleri
önemli bir sorun haline gelmistir. Karbapenemlere dirençli olan Acinetobacter
kökenlerinin diğer antimikrobiyallere karsı da oldukça dirençli olmaları infeksiyon
hastalıklarının tedavisini güçlestirmektedir.
Bu çalısmada klinik örneklerden izole edilen Acinetobacter kökenlerinde
metallo beta laktamaz (MBL) varlığının fenotipik ve genotipik yöntemlerle
arastırılması amaçlandı. Çalısmaya 150 Acinetobacter spp. kökeni dahil edildi.
Kökenlerin antimikrobiyal duyarlılıkları otomatize sistemle, metallo beta laktamaz
üretimi E-test yöntemiyle arastırıldı. IMP ve VIM genlerinin saptanması için polimeraz
zincir reaksiyonu (PZR) yöntemi kullanıldı.
Çalısmamızdaki kökenlerin %94'ünün Acinetaobacter baumannii %6'sının A.
Iwofii olduğu tespit edildi. Kökenlerin en duyarlı olduğu antibiyotiklerin sırasıyla
gentamisin (%41,3), amikasin (%36,7), imipenem (%25,3) olduğu saptandı.
Seftriakson (%92), levofloksasin (%84,7), seftazidim (%84), piperasilin/tazobaktam
(%84) ise en dirençli oldukları antibiyotiklerdi. Kökenlerin 67 (%44,7) 'si E-test
yöntemiyle MBL pozitif olarak bulundu. MBL pozitif bulunan kökenlerin imipeneme,
meropeneme, seftazidime, seftriaksona, gentamisine, pipeasilin/tazobaktama daha
dirençli olduğu saptandı. PZR yöntemiyle arastırılan blaIMP-1, blaIMP-2, blaVIM-1 ve
blaVIM-2 genleri hiçbir kökende tespit edilmedi.
MBL genlerinin ortaya çıkması ve bakteriyel patojenler arasındaki yayılımları
antimikrobiyal tedavilerin etkisini azaltmaktadır. Bu nedenle MBL'lerin ve onları
kodlayan genleri tasıyan kökenlerin saptanması tedavide kullanılabilecek antibiyotik
seçiminde faydalı, daha etkili tedavi yöntemleri için de yol gösterici olacaktır.

Anahtar Kelimeler: Acinetobacter, metallo beta laktamaz, IMP, VIM

Abstract:
The resistance of Acinetobacter strains to antibiotics has become major problem
in infections caused by them. Acinetobacter strains which are resistant to carbapenems,
also have higher resistance to the other antimicrobials. So this condition impedes the
treatment of infectious diseases.
In this study it was aimed to investigate the presence of metallo beta lactamase
(MBL) in Acinetobacter strains isolated from clinical samples with fenotypic and
genotypic methods. 150 Acinetobacter strains were included into the study.The
antimicrobial susceptibilities of the strains were determined with automated system,
production of metallo beta lactamase were investigated with E test method. Polimerase
chain reaction (PCR) method was used for determining the blaIMP and blaVIM genes
In our study, it was determined that 94% of strains were Acinetaobacter
baumannii, 6% of strains were A. Iwofii. The antibiotics which the strains were mostly
susceptible to, were detected as gentamicin (41,3%), amikacin (36,7%), and imipenem
(25,3%). Ceftriaxone (92%), levofloxacin (84,7%), ceftazidime (84%),
piperacillin/tazobactam (84%), were the antibiotics to which the strains were the most
resistant. 67 (44,7%) of the strains were found MBL positive with E test nethod. And
thsese strains were detected more resistant to imipenem, meropenem, ceftazidime,
ceftriaxone. blaIMP-1, blaIMP-2, blaVIM-1 and blaVIM-2 genes were detected in no strain
with PCR method.
The emergence of MBL genes and spread among the bacterial pathogens
reduces the effect of antimicrobial treatments. Therefore detecting MBLs and the
strains that carry the genes encoding MBLs will be helpful in the selection of
antibiotics that can be used in treatment, and also will be a guide for more effective
treatments.
Key Words: Acinetobacter, metallo beta laktamase, IMP, VIM