Metastatik kolorektal karsinomlarda tümör dokusunda K-ras gen mutasyonun RT-PCR ve DNA dizi analizi yöntemleri ile tespiti ve klinik parametreler ile ilişkisi
Detection of K-ras gene mutation in tumour tissue in metastatic colorectal carcinomas by RT-PCR And DNA sequence analysis and its association with clinical parameters
Yazar: GAZİ ÇÖMEZ
Danışman: PROF. DR. CELALETTİN CAMCI
Gaziantep Üniversitesi / Tıp Fakültesi / İç Hastalıkları Ana Bilim Dalı
Derece: Tıpta Uzmanlık, 2010
Konu: Onkoloji = Oncology
Dizin: Kolorektal neoplazmlar = Colorectal neoplasms

Özet:
Anti-EGFR (epidermal büyüme faktörü reseptörü) tedavilerine yanıt verecek hastaların belirlenmesinde prediktif faktör K-ras gen mutasyonudur. Bu mutasyon varlığının gösterilmesi, hastaların prognozu ve moleküler hedeflenmiş tedavilerin cevabı açısından çok önemlidir. Bu çalışma RT-PCR ve DNA dizi analizi yöntemleri ile mutasyonların tespiti yapılacak ve klinikopatolojik parametrelerle olan ilişkilerinin değerlendirilmesi amaçlandı.Çalışmaya 40 Metastatik Kolorektal Kanserli hasta alındı. DNA dizi analizi yöntemiyle kodon 12'de 11 hastada, kodon 13'de ise 2 hastada ve RT-PCR yöntemiyle ise kodon 12'de 8 hastada K-ras gen mutasyonu saptandı. Mutasyon saptanan ile saptanmayan olgular RT-PCR ve DNA dizi analizi yöntemleri ile kıyaslandığında aralarında istatiksel olarak anlamlı ilişki yoktu (p=0.505, p=0.906). K-ras gen mutasyonun varlığı genel sağkalımı istatiksel olarak etkilemediği görüldü (p=0.564, p=0.536). Mutasyon saptanan olgular ile çeşitli klinopatolojik paremetreler arasındaki ilişki istatiksel olarak değerlendirildi ve anlamlı ilişki saptanmadı.Sonuç olarak saptanan mutasyonların en sık görülen mutasyonlar olması ve de mutasyon tarama yöntemimiz olan RT-PCR ile DNA dizi analizi sonuçlarımız arasında %72 uyum olması çalışmanın hassasiyetini ortaya koymaktadır. Klinikopatolojik parametreler üzerinde, K-ras gen mutasyonu varlığını ortaya çıkarmak için daha geniş çalışma grublarında araştırma yapılması gerekmektedir

Abstract:
The predictive factor in determining the patients who will respond to Anti-EGFR (epidermal growth factor receptor) treatments is K-ras gene mutation. This mutation is of great importance in terms of showing its existence, prognosis of patients and respond of molecular targeted therapies. This study aimed to detect mutations by RT-PCR and DNA sequence analysis, and to assess associations with clinicopathological parameters.40 Metastatic Colorectal Cancer patients were included in the study. With DNA sequence analysis, K-ras gene mutation was detected in codon 12 and codon 13 in 11 and 2 patients, respectively. Also, with RT-PCR method, this mutation was detected in codon 12 in 8 patients. When the cases with or without mutation were compared with RT-PCR and DNA sequence analysis, there was not a statistically significant correlation between them (p=0.505, p=0.906). It was seen that the existence of K-ras gene mutation did not statistically influence general survival (p=0.564, p=0.536). The association between cases in which mutation was detected and various clinicopathological parameters was assessed and a significant association was not detected.In conclusion, that the detected mutations are the most frequently encountered ones, and there?s a congruence of 72% between the results obtained by RT-PCR and DNA sequence analysis (which are mutation scanning methods) reveal the precision of the study. In order to introduce the existence of K-ras gene mutation, researches in broader study groups should be carried out on clinicopathological parameters.