Meme kanserinde brca-1 ve brca-2'de sık görülen nokta mutasyonların ( polimorfizm ) bölgemizde görülme sıklığı
The frequency of the point mutation ( polymorphism) in brca 1 and brca 2, common in breast cancer
Yazar: MUSTAFA ZANYAR AKKUZU
Danışman: DOÇ. DR. MEHMET KÜÇÜKÖNER
Dicle Üniversitesi / Tıp Fakültesi / İç Hastalıkları Ana Bilim Dalı
Derece: Tıpta Uzmanlık, 2016
Konu: Onkoloji = Oncology
Dizin: Genler = Genes ; Meme neoplazmları = Breast neoplasms ; Mutasyon = Mutation ; Neoplazmlar = Neoplasms ; Polimeraz zincirleme reaksiyonu = Polymerase chain reaction ; Polimorfizm-genetik = Polymorphism-genetic

Özet:
ÖZET
Giriş ve Amaç: Meme kanseri dünyada kadınlar arasında en sık görülen
malign tümör olup, tüm kadın kanserlerinin yaklaşık %25'ini oluşturmaktadır. Her
yaş grubunda görülebilmesine karşın genç yaşta ailesel olguların dışında nadir olarak
görülmektedir. BRCA 1, 2 mutasyonları, nokta mutasyonlarından dolayı oluşan
meme kanserlerinin çoğunluğunu ve genel meme kanserlerinin %3'ünden sorumlu
tutulmaktadır. BRCA 1 ve BRCA 2 genlerinde kodlama bölgeleri boyunca dağılan
yüzlerce farklı mutasyon bildirilmiştir. Biz çalışmamızda meme kanserinde genetik
yatkınlığı belirlemek için sık olarak tespit edilen BRCA 1 (rs16942, rs1799966) ve
BRCA 2 (rs144848, rs1799944) genlerine ait polimorfik nokta mutasyonlarının
bölgemizdeki sıklığını PCR özgül belirleme grubundan Hibridizasyon Prob
Yöntemiyle "LightCycler" PCR cihazı kullanılarak belirlemeyi ve bu mutasyon
oranlarının ER pozitifliği, HER 2 durumu, Evre , Grade ve yaş ile ilişkili olup
olmadığını saptamayı amaçladık.
Materyal ve Metod: Araştırmamızda Dicle Üniversitesi Tıp fakültesi
Onkoloji Bilim Dalında genç yaş (44 yaş altı) grubu kadınlarda meme kanseri tanısı
almış 96 adet hasta çalışmaya alındı. Parafine gömülü tümör dokulardan genomik
DNA izolasyonu yapıldı ve DNA saflığı ile konsantrasyonu yapıldı. Sonra bu
tüplerden BRCA 1 ve BRCA 2 genlerindeki polimorfizm mutasyonları Real-Time
PCR ile belirlendi. Ülkemizde yapılmış çalışmalardan en sık saptanmış olan 4 nokta
mutsayonu çalışmada değerlendirildi. Bu hastalara ait yaş, grade, ER, HER- 2
reseptör durumu ve Evre gibi parametreler çıkarıldı. SPSS 21.0 bilgisayar programı
kullanılarak çalışmanın istatiksel değerlendirilmesi yapıldı. p≤0.05 istatiksel olarak
anlamlı kabul edildi.
Bulgular: Çalışmamızda elde ettiğimiz verilere göre 96 olgumuzdan BRCA
1 genine ait rs16942 de 14 (%14.5) adet homozigot (GG), 55 (%57.3) adet
heterozigot (AG); rs1799966 da 18 (%18.75) adet homozigot (GG) 46 (%47.9) adet
heterozigot (AG); BRCA 2 genine ait rs144848 de 9 (%9.37) adet homozigot (TT),
25 (%26.04) adet heterozigot (GT); rs1799944 de 2 (%2.08) adet homozigot (GG), 3
(%3.12) adet heterozigot (AG) hastada nokta mutasyonu saptadık. Bu oranların
ülkemizin diğer bölgelerinde yapılmış çalışma oranlarından biraz yüksek olduğu
iii
görüldü. Bu nokta mutasyonları ile; Grade ilişkisi karşılaştırıldığında ortalama p
değeri 0.464, ER pozitifliği ile karşılaştırıldığında ortalama p değeri 0.647, .HER 2
pozitifliği ile karşılaştırıldığında ortalama p değeri 0.833, 35 yaş üstü hastalarla
kıyaslandığında ise ortalama p değeri 0.358 olarak bulundu.
Sonuç: Bölgemizde BRCA 1-2 deki polimorfizm mutasyon oranları yüksek
sıklıkta görülmektedir. Bu nedenle de bölgemiz de erken yaşta meme kanser li
vakalara ve aile bireylerine genetik taramaların yapılması gereklidir.
Anahtar Kelimeler: BRCA-1; BRCA-2; meme kanseri; nokta mutasyon,
polimorfizm, LightCycler PCR

Abstract:
ABSTRACT
Introduction: Breast cancer, the most frequent malign tumor in the world,
constitutes approximately 25% of all women cancers. Although it can be seen in all
age groups, breast cancer, except familial cases rarely seen at an early age. BRCA
1,2 mutations are held responsible for the most of breast cancers, develop due to
point mutations and 3% of overall breast cancers. Hundreds of different mutations
are reported in BRCA 1 and BRCA 2 genes spreading throughout the decoding
zones.In our research, we aim to designate the frequency of polymorphic point
mutations belonging to BRCA 1 (rs16942, rs1799966) and BRCA 2 (rs144848,
rs1799944) genes in our region , ascertained frequently, in order to identify genetic
susceptibility in breast cancer by using the "LightCycler" PRC device with the
method of Hibridization Prob from the group of PRC specific identification and
determine the relationship of those mutation rates with ER positive, the state of HER
2 , stage, grade and age.
Materials and Method: In our research 96 patients, diagnosed breast
cancer among the young women group (under the age of 44) are taken to the study in
Diyarbakır Dicle University, Faculty of Medicine -Departman of Oncology.
Genomic DNA isolation from the the paraffin-embedded tumor tissues is done and
DNA purity and concentarion is held. Then polymorphism mutations in BRCA 1
and BRCA 2 genes from those test tubes are defined with Real -Time PRC. Four
points mutation , the most frequent one which is confirmed in researches in our
country is evaluated in our research. Some parameters are assigned as age, grade,
ER, the state of HER 2 and stage belongig to those patients. Statistical evaluation of
the reseach is practiced by using SPSS 21.0 computer programme. p≤0.05 is
accepted meaningful statistically.
Results: According to the data aquired from our study we found out
14(14,5%) homozygotes (GG), 55(57,3%) heterozygotes(AG) in rs16942;
18(18,75%) homozygotes(GG), 46(47,9%)heterozygotes (AG) in rs1799966 belong
to BRCA1 gene; 9(9,37%) homozygotes (TT), 25(26,04%) heterozygotes (GT) in
rs144848; 2(2,08%) homozygotes (GG), 3(3,12%) heterozygotes (AG) in rs1799944
belong to BRCA 2 gene, point muations among the patients out of 96 cases. These
v
rates are higher than the study rates made in other regions in our country. It is found
out that when comparing point mutations and Grade relation, aproximate p value is
0.464 , when comparing point mutations and ER positiveness aproximate p value is
0.647 and when comparing point mutations and HER 2 positiveness p value is
0.358.
Conclusion: In our region the rate of polymorphism mutations in
BRCA 1-2 is seen in high-frequency. For this reason it is essential to make a genetic
screening to the early aged-cancerous patients and their family members.
Key Words: BRCA-1 BRCA-2; breast cancer; point mutation,
polymorphism, LightCycler PCR.