Çocukluk çağı erken başlangıçlı jeneralize epilepsilerde genetik ve fenotipik özelliklerin incelenmesi
Investigation of genetic and phenotypic features in childhood early-onset generalized epilepsies
Yazar: SAFİYE GÜNEŞ SAĞER
Danışman: DR. ÖĞR. ÜYESİ ELİF SİBEL ASLAN
Biruni Üniversitesi / Lisansüstü Eğitim Enstitüsü / Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı / Tıbbi Genetik Bilim Dalı
Derece: Doktora, 2024
Konu: Genetik = Genetics

Özet:
Epilepsi bireyler arasında farklılıklar gösteren, beyinde anormal ve aşırı elektriksel aktivite nedeniyle ortaya çıkan, tekrarlayan nöbetlerle karakterize bir nörolojik durumdur. Epilepsinin kesin etiyolojisi halen belirsizliğini korurken, çevresel ve genetik faktörlerin sinerjik etkileşiminden kaynaklandığına düşünülmektedir. Genetik faktörler, epilepsiye yatkınlığı arttıran gen mutasyonlarıdır. Jeneralize epilepsiler daha çok genetik nedenlerle ilişkilidir. Bu çalışmada, erken başlangıçlı jeneralize epilepsi hastalarının genetik alt yapısı sınıflandırılmamış epilepsi hastalarıyla karşılaştırıldı.16 GEFS+ ve 17 sınıflandırılmamış epilepsi hastasının DNA'sı tüm gen dizileme platformları aracılığıyla dizilendi. Gözlemlenen epilepsi ile ilişkili varyantlar biyoinformatik araçlarla analiz edildi. GABRB1, DNM1, PNKP, SCN1A, TRAPPC6B, CACNA1H, CHRNB2, ADGRV1, SCN9A, SCN1B, CACNA1A, SLC6A1, GRIA4, DNM1L, GRIN2B, KCNH5, TCF20, TRIT1, CDH23 ve DEPDC5 genlerinde önemi bilinmeyen, muhtemel patolojik ve patolojik olarak sınıflandırılan çeşitli varyantlar saptandı. Muhtemel patolojik ve patolojik varyantlar, özellikle GRIA4, CACNA1A, DNM1L, PNKP, GRIN2B, KCNH5, TCF20, SLC6A1, TRIT1 ve CDH23 genlerinde gözlemlendi. Sonuç olarak epilepsi, hastaların genetiği de dahil olmak üzere çeşitli etmenlerden etkilenen çok faktörlü bir hastalıktır. Epilepsi veya epilepsi ile ilişkili sendromlarla ilişkili genler ve bu genlerdeki varyantlar, bu hastalık gruplarının etiyolojisini daha iyi anlamak, daha iyi tedavi sağlamak ve yaşam standardını ve hayatta kalma oranını

Abstract:
Epilepsy is an interindividually varying neurological condition marked by recurrent seizures caused by abnormal and excessive electrical activity in the brain. The precise aetiology of epilepsy remains uncertain, however, it is believed to arise from a synergistic interplay of hereditary and environmental variables. Genetic factors encompass gene mutations that augment the susceptibility to epilepsy. Generalized epilepsies are mostly related to genetic causes. In this study, the genetic background of patients with early-onset generalized epilepsy was compared with patients with unclassified epilepsy. 16 GEFS+ and 17 unclassified epilepsy patients' DNA were sequenced through whole exome sequencing platforms. Observed epilepsy-associated variants were analyzed by bioinformatic tools. Several variations that are classified as variant of unknown significance, likely pathologic and pathologic in GABRB1, DNM1, PNKP, SCN1A, TRAPPC6B, CACNA1H, CHRNB2, ADGRV1, SCN9A, SCN1B, CACNA1A, SLC6A1, GRIA4, DNM1L, GRIN2B, KCNH5, TCF20, TRIT1, CDH23, and DEPDC5 genes were identified. Likely pathologic and pathologic variants were especially observed in GRIA4, CACNA1A, DNM1L, PNKP, GRIN2B, KCNH5, TCF20, SLC6A1, TRIT1, and CDH23 genes. In conclusion, epilepsy is a multifactorial disease that is affected by several issues including the genetics of the patients. The genes and the variants in these genes associated with epilepsy or epilepsy-associated syndromes have pivotal roles in further understanding the aetiology of these groups of diseases enabling better treatment and increased standard of living and survival.