Mide kanseri ve e-kaderin (CDH1) geni polimorfizmleri arasındaki ilişki
The relationship between stomach cancer and e-cadherin (CDH1) gene polymophisms
Yazar: FIRAT ASLAN
Danışman: DR. ÖĞR. ÜYESİ NECAT ALMALI ; DR. ÖĞR. ÜYESİ ZEHRA KAYA
Van Yüzüncü Yıl Üniversitesi / Tıp Fakültesi / Genel Cerrahi Ana Bilim Dalı
Derece: Tıpta Uzmanlık, 2021
Konu: Genel Cerrahi = General Surgery
Dizin: Cadherinler = Cadherins ; Genler = Genes ; Mide hastalıkları = Stomach diseases ; Mide neoplazmları = Stomach neoplasms ; Neoplazmlar = Neoplasms ; Polimorfizm-genetik = Polymorphism-genetic

Özet:
Mide kanseri tüm dünyada yaygın görülen bir kanser olmakla beraber ülkemizde en sık görülen 6. kanser türüdür ve Türkiye'nin özellikle Doğu Anadolu bölgesinde sık görülmektedir. CDH1 geni hemen hemen tüm epitel dokularda ifade olan bir adezyon protein olan E-kaderin glikoproteinini kodlar. CDH1 polimorfizmleri ile mide kanseri arasındaki ilişki üzerine literatürde Türkiye dışında diğer bazı toplumlarda araştırmalar yapılmıştır. Bu çalışmanın amacı, Türkiye'nin Doğu Anadolu Bölgesinde mide kanserli hastalar ve sağlıklı kontroller arasında CDH1 polimorfizmlerinin (rs16260, rs13689, rs9929218) allel/genotip frekanslarını belirlemek ve mide kanseri yatkınlığı ile ilişkisini araştırmaktır. Literatürde rs13689 ve rs9929218 için mide kanserinde çalışmaya rastlanılmamış olup, rs16260 için ise mide kanserinde Türkiye'de hiç çalışma yapılmamıştır. Bu çalışma 2019-2021 yılları arasında 105 hasta ve 105 sağlıklı kontrol grubu üzerinde gerçekleştirilmiştir. Polimorfizmlerin genotiplemesi gerçek zamanlı polimeraz zincir reaksiyonunun (qPZR) kullanılarak TaqMan Assay yöntemiyle yapılmış ve sonuçlar istatistiksel analizler yapılarak belirlenmiştir. Mide kanseri riski sigara, vücut kitle indeksi (VKİ), aile öyküsü, biomasss maruziyeti, çay tüketimi, otlu peynir tüketimi ve reflü öyküsü gibi demografik faktörler ile anlamlı olarak ilişkili bulundu (p<0.05). Ayrıca SNP'lerden sadece rs13689 için hem T alleli (OR=4,03) hem de TT genotipi varlığında mide kanseri riskinin arttığı tespit edilmiştir  (p<0,0001). Çalıştığımız diğer iki SNP (rs16260 CC genotipi ve rs9929218 GG genotipi) için ise hastalarda sigara içilmesi durumunda bu genotiplere sahip kişilerde hastalığa yatkınlık riskinin olabileceği görülmüştür  (sırasıyla p=0,038, p=0,02). Mide kanserinde rs13689 ve rs9929218 Dünya'da ilk defa, rs16260 ise Türkiye'de ilk defa bu çalışma ile literatüre kazandırılmış olup, sonuçların doğruluğu için daha fazla çalışmaya ihtiyaç duyulmaktadır.

Abstract:
Although gastric cancer is a common cancer all over the world, it is the 6th most common cancer type in our country and is frequently seen in the eastern anatolia region of Turkey. The CDH1 gene encodes the E-cadherin glycoprotein, an adhesion protein expressed in almost all epithelial tissues. There have been studies in the literature on the relationship between CDH1 polymorphisms and gastric cancer in some societies other than Turkey. The aim of this study was to determine the allele/genotype frequencies of CDH1 polymorphisms (rs16260, rs13689, rs9929218) and to investigate their relationship with gastric cancer susceptibility among gastric cancer patients and healthy controls in the Eastern Anatolia Region of Turkey. In the literature, no study has been found in gastric cancer for rs13689 and rs9929218, and no studies have been conducted in Turkey for rs16260 in gastric cancer. This study was carried out on 105 patients and 105 healthy control groups between 2019-2021. Genotyping of polymorphs was done by TaqMan Assay method using real-time polymerase chain reaction (qPCR) and the results were determined by statistical analysis. Gastric cancer risk was found to be significantly associated with demographic factors such as smoking, body mass index (BMI), family history, biomasss exposure, tea consumption, otlu cheese consumption and reflux history (p<0.05). In addition, the risk of gastric cancer was found to be increased in the presence of both the T allele (OR=4.03) and the TT genotype for only rs13689 among the SNPs (p<0.0001). For the other two SNPs we studied (rs16260 CC genotype and rs9929218 GG genotype), it was observed that there may be a risk of disease susceptibility in patients with these genotypes in case of smoking (p=0.038, p=0.02, respectively). In gastric cancer, rs13689 and rs9929218 have been brought to the literature for the first time in the world, and rs16260 for the first time in Turkey, with this study, more studies are needed for the accuracy of the results.