Konvansiyonel yöntemle sonuç alınamayan veya normal karyotip gözlenen akut lenfoblastik lösemi olgularının fısh yöntemi ile retrospektif incelenmesi
Retrospective investigation of acute lymphoblastic leukemia cases with no conventional results or normal karyotype by fish method
Yazar: BENGİSU GÖKKAYA
Danışman: PROF. DR. AYHAN DEVİREN
İstanbul Üniversitesi / Sağlık Bilimleri Enstitüsü / Genetik Ana Bilim Dalı / Genetik Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2018
Konu: Genetik = Genetics
Dizin: FISH = FISH ; Neoplazmlar = Neoplasms ; Prekürsör hücreli lenfoblastik lösemi-lenfoma = Precursor cell lymphoblastic leukemia-lymphoma ; Sitogenetik = Cytogenetics

Özet:
Akut lenfoblastik lösemi (ALL) malign, olgunlaşmamış lenfoid hücrelerin birikimi ile karakterize bir hastalıktır.  ALL tüm neoplazilerin ~%1'ini oluşturur ve yetişkin lösemi vakaları içinde ~%20 oranında gözlenir. ALL'de spesifik kromozom anomalileri prognoz ve tedaviyi belirlemede önemli rol oynar. Sitogenetik ve FISH tekniklerinin gelişmesi lökomojenezde genetiğin rolünün anlaşılmasını sağlamıştır. Sitogenetik açıdan ALL vakalarında malign hücre populasyonlarında kromozom kazanımı taşıyan anomaliler birinci sıradadır. Anormal karyotip, çocuk hastalarda %80, erişkinlerde %75 gözlenme oranına sahiptir. ALL'de klasik sitogenetik analizi düşük mitotik indeks ve kemik iliğinde metafaz üretiminin zorluğu nedeniyle problemli olabilir. Florokromla işaretlenmiş DNA spesifik parçanın kromozom üzerindeki belli bir bölgeye bağlanmasına dayanan bir teknik olan FISH, metafazda konvansiyonel bantlama tekniği ile belirlenen sayısal ve yapısal kromozom anomalilerini farklı olarak interfaz hücrelerinde de belirleme olanağı sağlar.Çalışmamızda klasik konvansiyonel inceleme ile karyotip analizi yapılmış olan 10 olgunun kemik iliği ve kontrol grubunu oluşturan 5 sağlıklı bireyin perifer kanları FISH yöntemi ile incelenmiştir. Bu yöntem ile az sayıda metafaz ile normal karyotip sonucu bulunan ve değerlendirilecek metafaz bulunamayan olgularda ALL FISH paneli ile cMYC, p16, E2A(TCF3), hiperdiploidi, TEL/AML1 (EVT6/RUNX1), MLL(KMT2A), BCR/ABL, IGH bölgelerinin incelenmesi ve tedavi ve prognoz üzerindeki etkilerinin araştırılması amaçlanmıştır. Çalışmamız süresince TEL/AML1 ve BCR/ABL translokasyonları gözlenmemiştir. Diğer tüm bölgeler için gözlenen anomali ortalamaları sırasıyla %12, %5, %12, %2, %5, %6, %6 ve %13'tür. Bulduğumuz oranlar istatistiki olarak değerlendirildiğinde yalnızca cMYC anlamlı bulunmuştur. Fakat olgular uyguladığımız paneldeki gen bölgeleri bakımından değerlendirildiğinde farklı genetik anomalilere rastlanılmıştır. Sonuç olarak elde ettiğimiz bulgular yalnızca FISH yönteminin hastalığın ilerleyişi açısından yetersiz kalacağını ve konvansiyonel sitogenetik ile desteklenmesi gerektiğini kanıtlamıştır.

Abstract:
Acute lymphoblastic leukemia (ALL) is a disease which characterized by the accumulation of malignant, immature lymphoid cells. ALL represents < 1% of all neoplasms and < 20% of the leukemia cases in adults. Specific chromosomal abnormalities have determined the prognostic significance of ALL and are now used in risk stratification for treatment. The development of cytogenetics and fluorescence in situ hybridization (FISH) techniques has improved the understanding of the role of genetics in leukemogenesis. The majority of cases of ALL carry acquired chromosome abnormalities in their malignant cell population. Classical cytogenetic analysis of ALL may be problematical due to the low mitotic index and difficulties in metaphase preparation from bone  marrow culture. FISH is a process by which specific fragments of DNA are labeled with a fluorochrome and are then allowed to attach to a particular location on a chromosome. FISH is a technique which complements conventional cytogenetic banding analysis by allowing the study of numerical or structural chromosomal abnormalities of cells in interphase as well as metaphase. During our study, translocations were not observed. The average anomalies observed for all other regions are 12%, 5%, 12%, 2%, 5%, 6%, 6% and 13% respectively for cMYC,P16,E2A,choromosomes 4,10,17,MLL and IGH regions. We found statistically, only cMYC was meaningful with our results. However, when we evaluate genes in the panel, we have encountered different genetic anomalies. The results we have obtained have proved that only the FISH method is insufficient in terms of disease progression and should be supported by conventional cytogenetics