Et ürünlerinde insanlar için patojen olan zoonoz bakterilerin tespiti ve antibiyotik dirençlerinin belirlenmesi
Detection of zoonotic human bacterias in meat products and determination of their antibiotic resistance
Yazar: RASHA HAMEED SAEED ALSAEDI
Danışman: DOÇ. DR. ÖZGÜR KUZUKIRAN ; PROF. DR. AYHAN FİLAZİ
Çankırı Karatekin Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Biyoloji Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2023
Konu: Biyoloji = Biology
Dizin: Antibiyotik dirençliliği =   ; Gerçek zaman = Real time ; Kontaminasyon =   ; PCR =   ; Salmonella = Salmonella ; Staphylococcus aureus = Staphylococcus aureus ; Zoonoz = Zoonoses

Özet:
Sağlıklı bir yaşamın devamlılığı için beslenmek gerekmektedir. Tüketilen besinlerin 
bileşimi bu noktada önem kazanmaktadır. Hayvansal besinler vücudumuz için gerekli 
besin miktarlarının çoğunu dengeli miktarlarda içermektedir. Bu açıdan bakıldığında 
hayvansal besinler içinde en önemlisi ettir. Öte yandan üretimlerinden soframıza gelene 
kadarki süreçlerde patojen mikroorganizmalarla bulaşma riski taşımaktadırlar. Patojen 
bakterilerin neden olduğu enfeksiyonların büyük bir kısmı gıda kaynaklıdır. Bu 
enfeksiyonlara neden olan zoonoz bakteriler içinde en önemlileri ise Salmonella ve 
Staphylococcus aureus'tur. Bu iki etkenden S. aureus ürettiği ısıya dayanıklı toksinler 
nedeniyle ortamdan uzaklaştırılsa bile zehirlenmelere neden olabilmektedir. Dolayısıyla 
tüketilecek etler soframıza geldiği anda üzerinde canlı bakteri olmasa bile sağlık 
açısından risk oluşturmaktadır. Öte yandan enfeksiyonların sağaltımında kullanılan 
antibiyotiklerin uygunsuz kullanımları nedeniyle direnç gelişmektedir. Antibiyotiklere 
dirençli bakterilerin neden olduğu enfeksiyonlar insanlığın geleceğindeki en önemli 
sorunların başında gelmektedir. Yapılan bu çalışma ile tüketime sunulan sığır, koyun, 
hindi ve tavuk etlerinden 25'er adet olmak üzere toplam 100 örnek toplanmıştır. Bu 
örneklerde Salmonella ve Staphylococcus aureus genleri ile hem yaygın olarak kullanılan 
hem de depo antibiyotik olarak kullanılan sınıflandırılan toplam 9 antibiyotiğe karşı 15 
gen bölgesi taranmıştır. Bu amaçla real time PCR kullanılmıştır. Pozitif örneklerden DNA 
ekstraksiyonu yapılarak Sangers sekans ile dizilenmiştir. Sonuçta tavuk ve kuzu 
örneklerinin %80'inde Salmonella ve yine tavuk örneklerinin %72'sinde S. aureus tespit 
edilmiştir. Tavuk ve hindi örneklerinin tamamında antibiyotik direnci saptanmıştır. En 
fazla sayıda antibiyotiğe karşı direnç sığır örneklerinde (araştırılan 9 antibiyotiğin 8'ine 
karşı direnç) tespit edilmiştir

Abstract:
Nutrition is necessary for the continuity of a healthy life. The composition of the foods 
consumed becomes important at this point. Animal originated foods contain most of the 
nutrients necessary for our body in balanced amounts. From this point of view, meat is 
the most important one among the animal foods. On the other hand, they carry the risk of 
contamination with pathogenic microorganisms in the processes from farm to fork. The 
majority of infections caused by pathogenic bacteria are foodborne. The most important 
zoonotic bacteria causing these infections are Salmonella and Staphylococcus aureus. S. 
aureus can cause poisoning even if it is removed from the environment due to the heatresistant toxins it produces. Therefore, the meat to be consumed poses a health risk even 
if there is no live bacteria on it as soon as it comes to our table. On the other hand, 
resistance is developing due to the inappropriate use of antibiotics in the treatment of 
infections. Infections caused by bacteria resistant to antibiotics are one of the most 
important problems in the future of humanity. In this study, a total of 100 samples, 25 of 
each group, were collected from beef, sheep, turkey and chicken meat offered for 
consumption. In these samples, Salmonella and Staphylococcus aureus genes and 15 gene 
regions were screened against a total of 9 antibiotics classified both widely used and used 
as depot antibiotics. For this purpose, real time PCR was used. DNA was extracted from 
positive samples and sequenced with Sangers sequencing. As a result, Salmonella was 
detected in 80%of chicken and lamb samples and S. aureus was detected in 72%of 
chicken samples. Antibiotic resistance was detected in all chicken and turkey samples. 
The greatest number of antibiotic resistance was detected in cattle samples (8 out of 9 
investigated antibiotics).