hakansabunis/tr-academic-research-agent-index huggingface dataset:
Beşinci kuşak ve sonrası Türk bestecilerinin çoksesli koro eserlerinin ritmik ve melodik yönden incelenmesi
The research of the polyphonic choral works of the fifth generation and later Turkish composers in terms of rhythm and melody
Yazar: ARDA ÖZMEN
Danışman: DR. İSMAİL LÜTFÜ EROL
Başkent Üniversitesi / Sosyal Bilimler Enstitüsü / Kompozisyon Ana Sanat Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2013
Konu: Müzik = Music
Dizin: Bestekarlar = Composers ; Besteler = Compositions ; Ezgi = Melody ; Koro = Choir ; Müzik eserleri = Music works ; Ritim = Rhythm ; Çok sesli müzik = Polyphonic music

Özet:
Bu çalışma, çağdaş Türk bestecilerinin ürettikleri özgün eserlerin ritmik ve
melodik açıdan dilini anlamayı hedeflemektedir. Araştırmanın amaçları arasında eserin
metnin, melodi ve ritim ile besteci tarafından nasıl ilişkilendirildiği konusu da yer
almaktadır. Bu bağlamda, bu çalışmada, çağdaş Türk bestecilerinin çokseli koro eserlerinde
melodik ve ritmik yönden kullandıkları teknikler ve sistemler üzerine incelemeler
yapılmıştır.Araştırmanın örnekleminde, çalışma evreninden seçilmiş 6 çoksesli koro eseri
bulunmaktadır.Eserlerin melodik ve ritmik açıdan incelenmesinde kullanılan yöntem, John D.
White?ın Mikro analiz yöntemidir. Söz konusu mikro analiz yöntemi, yukarıda sözü geçen
eserlerde araştırmanın amacına uyarlanarak kullanılmıştır.Yapılan analizlerin sonucunda elde edilen verilerin, bestecilere, yorumculara ve araştırmacılara yararlar sağlayacağı düşünülmektedir.


Anahtar Kelimeler: Çağdaş Türk Bestecileri, Çağdaş Türk Koro Müziği, John D.White? ın Mikro analiz yöntemi, Melodi ve Ritim.

Abstract:
This study aims to understand the language of original works that contemporaryTurkish composers have produced in terms of rhtym and melody. Among the aims of thestudy, there is also the issue that how the work, text, melody and rhythm are connected bythe composer. Within this context, in this study, there have been researches on techniques
and systems that contemporary Turkish composers have used in their polyphonic choralworks in terms of rhythm and melody.In the sample of the research, there are six polyphonic choral works chosen fromthe target population of the study.The method that is used in the research of works in terms of melody and rhythm,is John D. White's micro- analysis method. The micro- analysis method in question, hasbeen used by being adapted for the aim of the research in the works that have been
mentioned above.It is thought that the data obtained at the end of the analyses made will provide
help for composers, performers and researchers.


Key Words: Contemporary Turkish Composers, Contemporary Turkish ChoirMusic, John D. White's micro- analysis method, Melody and Rhythm.
Kanser sınıflandırmada mikroRNA ve mRNA anlatım bilgilerinin entegrasyonu
Integrating microRNA and mRNA expression data for cancer classification
Yazar: ONUR ALTINDAĞ
Danışman: DOÇ. DR. HASAN OĞUL
Başkent Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Bilgisayar Mühendisliği Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2013
Konu: Bilgisayar Mühendisliği Bilimleri-Bilgisayar ve Kontrol = Computer Engineering and Computer Science and Control ; Biyomühendislik = Bioengineering ; Genetik = Genetics
Dizin: Biyobelirteçler-tümör = Biomarkers-tumor ; Gen ifadesi = Gene expression ; Meme kanseri =   ; Mikro RNA = Micro RNA ; Neoplazmlar = Neoplasms ; RNA = RNA ; RNA-haberci = RNA-messenger ; Veri madenciliği = Data mining ; Yapay zeka = Artificial intelligence ; Çoklu sınıflandırma = Multi classification

Özet:
Gen ifade verilerinden kanserli doku örneklerinin sınıflandırılması günümüz biyokimyasının en önemli problemlerindendir. Bu problemi zor kılan en önemli durum, tipik bir mikroseri deneyindeki çok yüksek miktarda gen sayısına (mRNA) karşılık çok az sayıda örnek bulunmasıdır. Yapılan son araştırmalarda öznitelik seçimi yöntemlerinin bu sorunu aşmada önemli rolü olduğu raporlanmaktadır.  Bunun yanı sıra kanserli doku saptamada mikroRNA ifade biçimlerinin de önemli bir bilgi değeri taşıdığı belirtilmektedir.  Bu çalışmada bu iki bulgunun kapsamlı bir şekilde ele alınmasıyla mikroRNA-mRNA entegrasyonu üzerinde öznitelik seçimi yöntemlerinin etkisi değerlendirilmiştir. Çalışmamızın sonucunda bu entegrasyonun etkili bir öznitelik seçim stratejisinin de yardımıyla uygulanan sınıflandırıcıların tahmin doğruluğunu önemli ölçüde arttırdığı ispatlanmıştır.

Abstract:
Classifying cancer samples from gene expression data is one of the central problems in current systems biomedicine. The problem is challenging due to the small number of samples in comparison to the number of genes (mRNAs) in a typical microarray experiment. Recent reports suggest that feature selection may help to manage the problem. Furthermore, microRNA expression profiles have shown to provide valuable knowledge in detecting cancer signatures. In this study, we present the results of a comprehensive study to assess the effect of feature selection and microRNA-mRNA data integration in cancer type prediction from microarray expression data. We prove that this integration can significantly improve prediction accuracy with a proper feature selection strategy.
Yeni medya ortamlarında üre-tüketicilik ve katılım olgusu: Ekşi Sözlük ve Okan Bayülgen'in Talk Show'unda etkileşim
Prosumer and the fact of participation at new media: The concept of interaction at Ekşi Sözlük and The Talk Show of Okan Bayülgen
Yazar: ERDEM ALPER TURAN
Danışman: DOÇ. DR. GÜNSELİ BAYRAKTUTAN
Başkent Üniversitesi / Sosyal Bilimler Enstitüsü / Halkla İlişkiler ve Tanıtım Ana Bilim Dalı / Halkla İlişkiler ve Tanıtım Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2013
Konu: İletişim Bilimleri = Communication Sciences

Özet:
Dijitallik, etkileşimsellik, katılım ve kullanıcı türevli içerik üretimi gibi başlıca özellikleri ile geleneksel medyadan ayrılan yeni medya ortamlarının erişim ve kullanım olanaklarının artması, gündelik yaşam pratiklerinin bu ortamlar dolayımıyla siber uzama taşınmasına yol açmıştır. Bu durum, izleyicilerin medya metinleri karşısındaki konumunu ve izleme alışkanlıklarını da etkilemiştir. İzleyiciden kullanıcıya dönüşüme yol açan bu etki, sosyal medya kullanımı ile eş zamanlı izleme pratiklerinin oluşmasına yol açmıştır. Yeni medya ortamlarının, kullanıcıya sağladığı katılım, etkileşim ve kullanıcı türevli içerik üretimi özellikleri; eş zamanlı izleme pratiklerinin izleme eyleminden alınan hazzı arttırmasını sağlamakta ve döngüsel bir biçimde katılıma teşvik etmektedir. Gerçekleşen katılım, aynı zamanda televizyon metinlerine yönelik bir geribildirim mekanizması olarak önem taşımaktadır.
Bu çalışmada, yaşanan dönüşüm süreci ve eş zamanlı izleme pratikleri, katılım ve etkileşime açık yapısal özellikler taşıyan talk show türü üzerinden ele alınmıştır. Bu doğrultuda, katılım olgusu Okan Bayülgen?in sunduğu Muhallebi Kralı ve Medya Kralı programları hakkında Ekşi Sözlük?te yer alan kullancı türevli içerikler üzerinden incelenmiştir.

Anahtar Kelimeler: Ekşi Sözlük, Sosyal Medya, Okan Bayülgen, Talk Show, Üre-Tüketicilik, Katılım.

Abstract:
The increase of usage and access opportunities of new media with its features such as digitalisation, interactionism, participation and user differentiable content production caused the movement of daily life practices toward cyber space. This situation also affected the position of audiences before media texts and their watching habits. The process of transformation from audience to user generated by this impact also caused the development of watching practices concurrently. The participatory, interactionist and user differentiable content production features of new media increase the pleasure in watching activities and encourage participation in a circular way. The existing participation is also very important as a feedback aimed at television texts at the same time.
In this thesis, this transformation process and concurrent watching practices are analysed by the kind of talk show which has participatory and interactionist structural features. In this context, the fact of participation is anlysed with the programs of Muhallebi Kralı and Medya Kralı presented by Okan Bayülgen and the user differentiable contents appear in Eksi Sözlük.

Key Words: Ekşi Sözlük, Social Media, Okan Bayulgen, Talk Show, Prosumer, Participation
Üretim akış analizi ve hücresel imalat uygulaması
Production flow analysis and cellular manufacturing application
Yazar: BEKİR VOLKAN AĞCA
Danışman: YRD. DOÇ. DR. YUSUF TANSEL İÇ
Başkent Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Makine Mühendisliği Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2014
Konu: Makine Mühendisliği = Mechanical Engineering

Özet:
Bu çalışmada yedek parça imalatı yapan bir fabrikadaki mevcut üretim akışı incelenerek üretimde zaman kayıplarının tespit edilmesi amaçlanmış, en aza indirilmesi için fabrikadaki mevcut geleneksel makine yerleşimi yerine, hücresel imalat prensiplerine uygun olarak yeni bir yerleşim planı önerilmiştir.
Tez kapsamında ilk olarak fabrikada üretilen parçaların; kodları, imalat süreleri, proses sıraları ve üretildiği makine numaraları gibi veriler elde edilerek MS Excel programına aktarılmış ve kayıt altına alınması sağlanmıştır. Daha sonra bu veriler,  Derece Sırası Kümeleme-DSK (Rank Order Clustering-ROC) tekniği ile birlikte kullanılarak, mevcut yerleşim planının hücresel yerleşim planına dönüştürülmesi gerçekleştirilmiştir. Parça-makine ilişki matrisinin çok büyük olması nedeniyle DSK tekniğinin uygulanabilmesi amacıyla MATLAB programında bir yazılım geliştirilmiştir. Geliştirilen bu yazılım sayesinde DSK tekniğinin 45 adet makine ve 876 adet parçadan oluşan parça-makine ilişki matrisine uygulanabilmesi sağlanmıştır. Çalışmanın son aşamasında ise elde edilen yeni hücresel imalat yerleşim planı, firmadaki mevcut yerleşim planıyla karşılaştırılarak; hücresel imalata geçiş sonrasında çevrim süresi, malzeme taşıma süresi, hazırlık süresi gibi ölçütlerde elde edilebilecek iyileşmeler ortaya konmuştur. Bu iyileşmelerde hücresel imalatın firmaya taşıma süresinde büyük miktarda azaltmalar sağladığı böylece aynı zaman diliminde daha fazla ürün imalatına imkan verdiği görülmüştür.

Abstract:
This study aims to determine the reasons of time loss on production flow process of a factory in which replacement parts are manufactured. It offers a new layout which is suitable for cellular manufacturing principles instead of the current traditional layout in order to minimize the time losses.
Firstly, the data related to each product, including codes, duration of manufacturing, order of processes and machinery was recorded on a spreadsheet. Afterwards, cellular manufacturing principles were applied to the current layout by using obtained data with the Rank Order Clustering (ROC) technique. As the part –machine relationship matrix typically has a large dimension; new software was developed in order to use ROC method on MATLAB. By means of this software, ROC technique could be applied to the part-machine matrix covering 45 machines and 876 parts.
As a result, this study puts forward the improvements which could be made in terms of duration of transportation, set-up time and cycle time by replacing the cellular manufacturing layout with the traditional layout.
Azami genlik algılı yüksek çözünürlüklü zaman-frekans analizi
Maximum amplitude sensitive high resolution time-frequency analysis
Yazar: YUSUF GÖRKEM ÇELİK
Danışman: PROF. DR. SÜLEYMAN GÖKHUN TANYER
Başkent Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Elektrik ve Bilgisayar Mühendisliği Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2014
Konu: Elektrik ve Elektronik Mühendisliği = Electrical and Electronics Engineering
Dizin: Zaman-frekans analizi = Time-frequency analysis ; Zaman-frekans dağılımları = Time-frequency distributions ; Zaman-frekans gösterim teknikleri = Time-frequency projection techniques

Özet:
Çalışmada, sayısal ses işaretlerinin incelenmelerinde sıklıkla kullanılan literatürde mevcut farklı tür zaman-frekans analizleri incelenmiş ve kısa zamanlı Fourier dönüşümü temel alınarak yüksek zaman ve frekans çözünürlüklü yeni bir zaman frekans analiz yöntemi geliştirilmiştir. 
Fourier dönüşümündeki zaman belirsizliği problemine karşılık kısa zamanlı Fourier dönüşümü (KZFD) yöntemi ortaya çıkmıştır. KZFD'de aynı anda hem yüksek zaman çözünürlüğü hem de yüksek frekans çözünürlüğü elde etmek mümkün olamamaktadır. Buradan yola çıkılarak, bu çalışmada, KZFD'nin farklı zaman pencerelerindeki üstünlükleri kullanılarak sentezleme yöntemiyle aynı anda yüksek zaman ve frekans çözünürlüğü sunan Azami Genlik Algılı Yüksek Çözünürlüklü Zaman - Frekans Analizi (AGA–ZFA) yöntemi önerilmiş ve MATLAB® kullanılarak geliştirilen program ile analiz işlemleri gerçeklenmiştir.
Geliştirilen yöntemin başarımının nicel olarak ölçümü gerçekleştirilerek AGA–ZFA yöntemi, literatürde mevcut ZFD yöntemleriyle karşılaştırılmıştır. Sayısal sonuçlar zaman frekans analizinde, geliştirilen yöntemin diğer yöntemlere oranla %52'ye kadar iyileştirme sağladığını göstermiştir.

Abstract:
Various time-frequency analysis methods for digital audio signals proposed in literature are examined. A new high resolution time-frequency analysis method based on Short-Time Fourier Transform (STFT) is proposed.
Short-Time Fourier Transform (STFT) has been developed to overcome the time ambiguity problem introduced by Fourier Transform. Unfortunately, STFT offers constant value for the multiplication of the time and frequency resolutions, namely; time resolution degrades the same amount if the frequency resolution is improved. There is a need for better time-frequency analysis when both time and frequency resolution is to be improved which should have better resolution factors than STFT.
In this work, Maximum Amplitude Sensitive High Resolution Time-Frequency Analysis method is proposed for improved resolution in both time and frequency domains. It is based on the well known STFT, taking the advantages of STFT in varying time windows with synthesizing technique to present high resolution. The novel method is implemented in MATLAB® software development environment.
The performance of method is measured and compared with the methods proposed in literature. The numerical results show that an improvement of %52 is possible in time-frequency analysis.
Anti-CD62P biyosensör ile platelet aktivasyonunun ölçülmesi
Measurement of platelet activation with anti-CD62P biosensor
Yazar: MÜNİRE SARAL
Danışman: DOÇ. DR. MUSTAFA KOCAKULAK
Başkent Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Biyomedikal Mühendisliği Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2014
Konu: Bilim ve Teknoloji = Science and Technology ; Biyomühendislik = Bioengineering ; Mühendislik Bilimleri = Engineering Sciences

Özet:
Bu çalışmanın amacı platelet aktivasyonunun kuvars kristal mikroterazi sistemlerle (QCM) daha hızlı, uygulaması kolay, hassas ve etkin bir şekilde ölçülmesidir. Gerçek zamanlı algılama özelliği ile anlık veri alınması mümkün hale gelmektedir. QCM'in klinik teşhiste son yıllarda kullanımı artarak devam etmektedir ve bu çalışma ile platelet aktivasyonunun ölçümüne alternatif bir yöntem geliştirilmiştir.
Çalışmanın ilk aşamasında gümüş elektrotlu piezoelektrik kristal yüzeylerin modifikasyonu gerçekleştirilmiştir. Kristal yüzeyinin temizlenmesi işleminin ardından yüzeye sistamin immobilizasyonu yapılmıştır. Bu işlemlerden sonra sistamin üzerine bifonksiyonel gluteraldehit bağlanması gerçekleştirilmiştir.
Çalışmanın ikinci aşamasında gluteraldehit bağlanmış yüzeylere platelet aktivasyonunu tanıyan ligand bağlanması sağlanmıştır. Hazırlanan kan örnekleri kullanılarak platelet aktivasyonunun varlığı anti-CD62P immobilize edilmiş kuvars kristaller ile belirlenmiştir. Bu şekilde, tasarlanan kristalin biyosensör olarak kullanılması ile platelet aktivasyonunu tanıyan yeni bir yöntem geliştirilmiştir.

Abstract:
The aim of this study is measurement of platelet activation faster, more accurately, more effectively and easily applicable by using quartz crystal microbalance systems (QCM). The real-time detection makes the instantaneous data acqusation possible. The usage of QCM increases in clinical diagnosis recent years and in this study an alternative method to the measurement of platelet activation is developed.
In the first phase of the study, the modification of the silver electrode piezoelectric crystal surface is performed. Clearence of the crystal surface and cystamine immobilization to this surface is carried out respectively. After these processes, bindind of bifunctional  glutaraldehyde to cysteamine is done.
In the second phase of the study, binding of platelet activation sensitive ligands to glutaraldehyde bonded surfaces are perfomed. The presence of platelet activation is determined by using blood samples with anti-CD62P immobilized quartz crystals. By using this designed crystal as a biosensor a new method to recognize the activation of platelets is developed.
Türkiye'de müzik eleştirmenliği
Music criticism in Turkey
Yazar: PETEK GÜNGÖR
Danışman: PROF. ALİ SEVGİ
Başkent Üniversitesi / Sosyal Bilimler Enstitüsü / Müzik Bilimleri Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2014
Konu: Müzik = Music
Dizin: Eleştirmenler = Critics ; Müzik = Music ; Türk müziği = Turkish music

Özet:
Ülkemizde sanat kurumları ve sanat etkinlikleri dikkate alındığında "müzik eleştirmenliği" konusundaki çalışmaların ve yayınların sayıca azlığından yola çıkılarak yapılan bu çalışmada; eleştirinin tanımları, müzikte eleştirinin işlevi ve tarihsel süreci, Cumhuriyet Dönemi itibariyle müzik eleştirmenleri ve yayınları, ülkemizde müzik eleştirmenliğinin durumu ve eleştiri yaklaşımlarına yer verilmiştir.
Araştırmada,  literatür taramasının yanı sıra; "müzik eleştirmenliği" başlığında müzik yazarlarına, bestecilere, şeflere ve icracılara görüşme yöntemi uygulanarak bulgulara ulaşılmıştır.
Araştırma sonucunda, Türkiye'de müzik eğitimi veren kurumlarda yer almayan müzik eleştirmenliği alanının "mesleki alan" haline dönüştürülmesiyle sanat dünyasına olumlu katkılar sağlanabileceği, müzik eleştirmenlerinin ancak objektif, bilgi tabanlı ve tecrübeye dayanan eleştiri üslubu ile sanatçı, sanatsever ve müzik sanatı üzerinde yapıcı, yönlendirici, geliştirici etkiler bırakabileceği tespit edilmiştir.

Abstract:
When art institutions and art activities in Our Country are considered, this study is carried out based on the few number of the studies and publications on "music criticism"; and the descriptions of criticism, function and historical process of criticism in music, music critics and publications by the Republic Period, the status of music criticism in our country, and criticism approach are given place.
In the research, besides literature reviewing; findings are reached under the title of "music criticism" by applying interview method to writers, composers, conductors and performers.
Following the research, it is established that by transforming the field of music criticism into "professional field", which does not take place in the institutions in Turkey that give music education, positive contributions to the world of art could be obtained, that only objective, knowledge-based, and experience based method of the music critics will have constructive, directing, and improving influences on the performer, art-lover, and on the art of music.
Trombosit hücre membranına annexın v bağlanmasının piezoelektrik algılayıcılar ile ölçülmesi
Annexin v binding detection on platelet cell membrane with piezoelectric biosensor
Yazar: BUĞRA AYAN
Danışman: DOÇ. DR. MUSTAFA KOCAKULAK
Başkent Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Biyomedikal Mühendisliği Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2014
Konu: Biyokimya = Biochemistry ; Biyomühendislik = Bioengineering ; Mühendislik Bilimleri = Engineering Sciences

Özet:
Trombositler hemostazın sağlanmasında görev alan kan hücreleridir. Trombositler endotel dışına çıktığında ya da yabancı bir yüzeyle etkileştiğinde pıhtılaşma kaskadı devreye girer. Trombositlerin agregasyona uğramadan önceki formları oldukça önemli olup, apoptosis öncesi hakkında bilgi vermesi teşhis ve tedavi süreçlerini dolayısı ile hastanın hayatını doğrudan etkilemektedir. Bu amaçla erken trombosit apoptosisi tespiti hayati öneme sahiptir. 

Bu çalışmanın amacı, trombosit aktivasyonu ve erken trombosit apoptosisini hassas, hızlı ve ucuz olarak ölçebilen bir sistem geliştirmektir. Bu amaçla piezoelektrik kristallerin yüzey temizliği, hidrofilik yüzey eldesi işlemlerinin ardından sistamin ve glutaraldehit immobilizasyonu yapılarak uzatma kolu oluşturulmuştur. Erken trombosit apoptosisi tanıyıcı molekülü olan Annexin V immobilizasyonu sonrası farklı trombosit sayısı içeren kan derişimlerinde deneyler yapılmıştır. Farklı derişimler Annexin V biyosensörleri ve farklı derişimlerdeki kan süspansiyonlarındaki frekans değişimi Annexin V konsantrasyonu ve trombosit sayısıyla orantılıdır. Bu sonuç AFM ve SEM görüntüleriyle de desteklenmiştir. Geliştirilen piezoelektrik biyosensörle mevcut sistemlere göre hızlı, hassas ve ucuz bir sistemdir.

Abstract:
Platelets are blood cells that ensure hemostasis. When platelets get out of endothelium or get in interaction with another surface the coagulation cascade steps in. Form of platelets just before they expose to aggregation are so critical and they provide information on pre-apoptosis situation, which directly affects the diagnosis and treatment processes and thus the life of patient. Therefore, detection of early platelet apoptosis is of vital importance. 

The aim of this study is to develop a system which is capable of measuring the early platelet apoptosis and platelet activation in an accurate, fast and economic manner. To that end, after surface cleaning of piezoelectric crystals and obtaining a hydrophilic surface an extension arm was developed by sistamine and glutaraldehide immobilization. After immobilization of Annexin V which is responsible for detection of early platelet apoptosis several tests were conducted with blood concentrations with different platelet numbers. The said different concentrations are proportional to the Annexin V biosensors and the change in frequency at blood suspensions with different concentrations to the Annexin V concentration and the number of platelets; which results were also supported with AFM and SEM images. The piezoelectric biosensors newly developed provide a more accurate, economic and faster system in comparison with the existing systems.