Ceylanpınar Tarım İşletmesi siyah alaca sığır popülasyonunda süt verimi ile ilgili genetik parametrelerin bayesian ve REML yöntemleriyle tahmini
Prediction of genetic parameters related to milk yields of holstein friesian population reared in the Ceylanpınar Agricultural State Farm by bayesian and REML methods
Yazar: ADNAN ÜNALAN
Danışman: PROF.DR. ZEYNEL CEBECİ
Çukurova Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Zootekni Ana Bilim Dalı
Derece: Doktora, 2002
Konu: Ziraat = Agriculture
Dizin: Genetik parametreler = Genetic parameters ; REML = REML ; Siyah alaca sığırlar = Holstein friesian cattles ; Süt verimi = Milk yield ; Zootekni = Zootechnics

Özet:
Bu çalışmada, Ceylanpınar Tarım İşletmesi Siyah Alaca sığır populasyonundan 1990-1997 (8 yıl) yılları arasında elde edilen toplam 4807 süt verim kaydı kullanılmış ve süt verimleri ile ilgili varyans unsurları, kalıtım derecesi ve hayvanların damızlık değerleri Bayesian ve Kısıtlanmış Maksimum Olabilirlik (REML) yöntemleri kullanılarak tahmin edilmiştir. REML tahminleri hem boğa modeli altında (SAS Institute 1987, Sürüm 6.03), hem de hayvan modeli altında (DFREML Ver. 3.0 J3) yapılmıştır. Analizlerde, sabit etki olarak yıl-mevsim etkisi, kovaryetler olarak ise buzağılama yaşı ve laktasyon sırası alınmıştır. Süt veriminin kalıtım derecesi tahminleri boğa modeli altında REML yöntemi ile 0.28, hayvan modeli altında DFREML yöntemi ile 0.43 olarak bulunmuştur. Bayesian tahminleri için Gibbs örneklemesi yöntemi kullanılmış ve kalıtım derecesi 0.27 olarak hesaplanmıştır. Analizler, 305 gün süt verimleri üzerinde yıl-mevsim, laktasyon sırası ve buzağılama yaşının istatistiksel olarak önemli faktörler olduğunu göstermiştir (sırasıyla p<0.01, p<0.05 ve p<0.01). Tahmin edilen damızlık değerlerine göre boğalar sıralandığında, boğa modeli altında REML ve Bayesian tahminlerinin benzer sonuç verdiği (Kendall'ın tau korelasyon katsayısı 0.997), ancak hayvan modeli altında yapılan REML tahminleri ile diğer iki yöntemden elde edilen boğa sıralanışların farklı (Kendall' in tau korelasyon katsayıları 0.744 ile 0.745) olduğu görülmüştür. Ayrıca, ineklerin damızlık değer tahminleri ile ortalama verimleri arasındaki sıra korelasyonunun da oldukça düşük (Kendall' ın tau korelasyon katsayısı 0.377) olduğu bulunmuştur.Anahtar Kelimeler: REML, Bayesian, Siyah Alaca, Genetik Parametre, Süt Verimi

Abstract:
In the present study, 4807 lactation milk yield records obtained from Holstein Friesian population reared in the Ceylanpinar Agricultural State Farm between 1990 and 1997 were used for the estimation of variance components, heritability and breeding values of animals by Bayesian and Restricted Maximum Likelihood (REML) methods. REML estimates were obtained using both the animal (with DFREML Ver. 3.0 P) and the sire models (with SAS Institute 1987, Release 6.03). In the analyses, year-season was assumed to be a fixed effect and calving age and lactation number were covariates. REML estimates of heritability for lactation milk yield using the sire model and using the animal model were 0.28 and 0.43 respectively. Bayesian estimates were obtained using Gibbs sampling and heritability was calculated as 0.27. Analyses showed that year-season, lactation number and age at calving (linear) significantly affected 305-day milk yield (p<0.01, p<0.05 and p<0.01 respectively). When sires were ranked according to estimated breeding values, REML and Bayesian estimates using the sire model were almost identical (Kendall's tau correlation coefficient was 0.997). However, REML estimates using the animal model by DFREML were different (Kendall's tau correlation coefficients were between 0.744 and 0.745) from the other methods. In addition, the rank correlation between estimated breeding values and mean milk yields of cows was quite low (Kendall's tau correlation coefficient was 0.377).Key Words: REML, Bayesian, Holstein Friesian, Genetic Parameter, Milk Yield