Arteiyo-venöz fistül trombozu gelişen ve gelişmeyen kronik böbrek yetmezliği olan hastalarda metilentetrahidrofolat redüktaz, protrombin,faktör v ve plazminojen aktivatir inhibitör tip 1 gen polimorfizmlerinin araştırılması
Researching methylenetetrahydrofolate reductase, prothrombin, factor v and plasminogen activator inhibitor type 1 gene polymorphisms in chronic renal failure patients with developing and non-developing arterio-venous thrombosis
Yazar: ELİF FUNDA EMİROĞULLARI
Danışman: PROF.DR. YUSUF ÖZKUL
Erciyes Üniversitesi / Sağlık Bilimleri Enstitüsü / Tıbbi Genetik Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2007
Konu: Moleküler Tıp = Molecular Medicine ; Nefroloji = Nephrology
Dizin: Kan pıhtılaşma faktörleri = Blood coagulation factors ; Metilentetrahidrofolat = Methylenetetrahydrofolate ; Polimeraz zincirleme reaksiyonu = Polymerase chain reaction ; Protrombin = Prothrombin

Özet:
Metilentetrahidrofolat redüktaz (MTHFR), folat döngüsünde önemli bir rol oynar ve homosisteinmetabolizmasına katkıda bulunur. MTHFR genindeki bazı mutasyonlar, MTHFR geninin enzimaktivitesinde azalmaya neden olabilir. MTHFR enzim eksikligi, plazma homosistein düzeyindekiartısla, homosistein düzeyindeki artıs da vasküler hastalıklarla iliskilidir. MTHFR geninde yaygınolarak C677T ve A1298C polimorfizmleri görülür. Faktör V protrombinin trombine dönüsümünüsaglayan ve homeostazda rol oynayan önemli bir kofaktördür. Faktör V genindeki G1691A mutasyonuvenöz tromboza yatkınlık sebebidir. Tromboza yol açan bir diger faktör de Protrombin G20210Amutasyonudur. Protrombin geninin 20210. nükleotidindeki guaninin adenine degisimi karacigerdendaha fazla protrombin sentezlenmesine yol açtıgından trombin olusumu artar. Protrombin venöztrombozun yaygın sebeplerinden biri olmasına ragmen etkisi Faktör V Leiden mutasyonuna göre dahaılımlıdır. Fibrinolitik sistemde homeostazın düzenlenmesinde rol oynayan bir diger enzim deplazminojen aktivatör inhibitör 1 (PAI-1)'dir. PAI-1 geninde birçok polimorfizm tanımlanmısolmasına ragmen bunlar içinde 4G/5G polimorfizmi en yaygın polimorfizmdir. Bu çalısmada fistültıkanma nedeni bilinmeyen kronik böbrek yetmezligi olan 31 kisi hasta grubu ve fistül tıkanmasıgörülmeyen 51 kisi kontrol grubu olarak kullanıldı. Daha sonra gruplardan periferal kan örneklerialınarak DNA izole edildi. MTHFR C677T, Protrombin G20210A, Faktör V Leiden G1691A ve PAI-1 4G/5G polimorfizmleri PCR (polimeraz zincir reaksiyonu)-RFLP (restriksiyon fragment uzunlukpolimorfizmi) yöntemleri ve MTHFR A1298C mutasyonu da hem PCR-RFLP hem de Real Time PCRyöntemi kullanılarak belirlendi. Yapılan analizler sonucu hasta ve kontrol grubunda protrombinG20210A mutasyonu tespit edilemedi. PAI-1 4G heterozigot genotip trombotik risk ile iliskilidir(O.R= 4,271). Hasta ve kontrol grubunda MTHFR C677T, A1298C, Faktör V G1691A ve ProtrombinG20210A mutasyonları açısından bir fark bulunamadı.

Abstract:
Methylenetetrahydrofolate reductase (MTHFR) plays an important role in the folate cycle andcontribures to the metabolism of the aminoacid homocysteine. It catalyses the reduction of 5,10-methylenetetrahdrofolate reductase to 5- methylenetetrahdrofolate reductase, thus generating theactive form of folate required for remethylation of homocysteine to methionine. Some of the mutationsin the MTHFR gene cause a decrease in MTHFR activitiy. Deficiency of MTHFR associated with anincrease in plasma homocysteine level, which in turn is associated with an increased risk of vasculardisease. Particularly C677T and A1298C mutations in MTHFR gene are two common polymorphisms.Factor V is a major factor in hemostasis by converting prothrombin to thrombin. Factor V leiden(G1691A) mutation has been recognized as the most prevalent genetic risk factor for venousthrombosis. Other common rsk factor for for venous thrombosis is Prothrombin 20210 GAalteration which causes a gain of function in the coagulation system with an increase of prothrombinlevels associated with an increased potential to form thrombin. Although prothrombin G20210Amutation is one of the most common inherited risk factor of venous thrombosis, the prothromboticpotential of prothrombin G20210A is significantly milder than that verified for the factor V Leiden.Plasminogen activator inhibitor 1 (PAI-1) regulates the fibrinolytic system. A few polymorphisms ofthe PAI-1 gene have been discovered, the 4G/5G polymorphism being the most frequently studied inassociation with thrombotic events. In this study 31 chronic renal failure patients with developingarterio-venous thrombosis and 51 chronic renal failure patients with nondeveloping arterio-venousthrombosis are chosen. DNA was extracted from peripheral blood samples of the patients and controls.MTHFR C677T, Prothrombin G20210A, Factor V Leiden G1691A, PAI-1 4G/5G polymorphismswere identified by PCR (polymerase chain reaction)-RFLP (restriction fragment length polymorphism)methods. MTHFR A1298C mutation was identified by PCR-RFLP and real time PCR method. Nosubjects with prothrombin G20210A mutation were found. Our data indicated that carrying PAI-1 4Gallele in heterozygous state have an effect on the thrombotic risk in chronic renal failure patients(O.R= 4,271). MTHFR C677T, MTHFR A1298C, Factor V Leiden G1691A and ProthrombinG20210A mutations were not significantly different in patients and control groups