hakansabunis/tr-academic-research-agent-index huggingface dataset:
Kazı makinelerinin seçiminde çok kriterli karar verme yöntemlerinin uygulanabilirliği
Applicability of multi-criteria decision making methods in the selection of excavation machines
Yazar: İREM TEMİZ
Danışman: YRD. DOÇ. DR. GÜLBEN ÇALIŞ
Ege Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / İnşaat Mühendisliği Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2017
Konu: İnşaat Mühendisliği = Civil Engineering

Özet:
İnşaat ve imalat sektöründeki gelişmelerle birlikte kazı makineleri de gelişmekte ve farklı amaçlara yönelik pek çok kazı makinesi üretilmektedir. Ancak, piyasada farklı nitelik ve maliyete sahip pek çok kazı makinesinin mevcut olması, kazı makinesi seçim sürecini zorlaştırmaktadır. Bu nedenle, çok sayıda kriterin göz önüne alınmasını gerektiren kazı makinesi seçim probleminin çözümünde, analitik bir şekilde alternatiflerin sıralanmasını sağlayan çok kriterli karar verme yöntemlerinin kullanılması önerilmektedir. Bu tez çalışmasının amacı, bir alan çalışması ile çok kriterli karar verme yöntemlerini karşılaştırmaktır. Bu kapsamda, İzmir ilindeki bir inşaat firmasının ekskavatör seçim problemi alan çalışması olarak ele alınmıştır. Literatürden yararlanılarak belirlenen değerlendirme kriterleri; satınalma bedeli, motor gücü, hidrolik pompa debisi, çalışma ağırlığı, yakıt tüketimi, servis olanakları, elden çıkarma durumu, yedek parça durumu ve operatörün konforudur. Firma tarafından belirlenen 4 alternatif, AHP, PROMETHEE, ELECTRE ve TOPSIS yöntemleri kullanılarak sıralanmıştır. Çalışma sonucunda elde edilen sonuçlar ve çözüm aşamaları da dikkate alınarak çok kriterli karar verme yöntemleri karşılaştırılmıştır.

Abstract:
Along with the developments in the construction and manufacturing sector, a broad array of excavation machines are produced for different purposes. However, numerous excavation machines are available in the market with different qualities and costs makes the selection process difficult. For that reason, multi-criteria decision making methods are proposed to solve excavation machine selection problem which takes into account multiple criteria, by analitically ranking the alternatives. The aim of this thesis is to compare the multi criteria decision making methods via a case study. Within this scope, an excavator selection problem was carried out for a construction company in Izmir as the case study. Assessment criteria, which are taken from the literature, were defined as purchasing cost, engine power, hydraulic pump flow rate, operating weight, fuel consumption, service conditions, secondary market, spare part conditions and comfort of operator. AHP, PROMETHEE, ELECTRE and TOPSIS methods were used to rank the 4 alternatives defined by the decision makers. The multi criteria decision making methods were compared with respect to the solution steps and results obtained from the case study.
FDG-konjuge manyetik nanoparçacıkların biyoafinitelerinin in vitro/in vivo olarak incelenmesi
In vitro/in vivo bioaffinity determination of FDG conjugated magnetic nanoparticles
Yazar: VOLKAN YASAKÇI
Danışman: PROF. DR. PERİHAN ÜNAK
Ege Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Nükleer Bilimler Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2017
Konu: Kimya = Chemistry

Özet:
Bu tez çalışmasının amacı, dual mod lenf nodu görüntüleme ve hipertermi özellikleri olan bir teranostik ajan oluşturulmasıdır. Bu amaç ile demir oksit içerikli manyetik nanoparçacıklar (MNP) sentezlenmiş, sentezlenen MNP'lerin stabilitelerini arttırmak, sitotoksisitelerini azaltmak ve kanser hücrelerine afinitelerini daha seçici hale getirmek için Hyaluronik Asit (HA) ile yüzey modifikasyonu yapılmış ve Florodeoksiglukoz (19FDG) molekülü ile konjuge edilerek kanser hücrelerindeki afiniteler arttırılmaya çalışılmıştır. Sentezlenen MNP'lere daha sonra floresans özellikte optik işaret olan Indocyanine Green (ICG) bağlanarak optikçe izlenir hale getirilmiştir. Ayrıca iodojen yöntemi kullanlarak 131I radyoişaretleme yapılmış, moleküle terapi ve izlenebilirlik özelliği kazandırılmıştır. Radyoişaretlemesi yapılan molekülün in vitro hücre kültürü çalışmaları ve biyoafinite testleri PC-3 insan prostat kanseri hücreleri ve MCF7 insan meme kanseri hücreleri üzerinde yapılmıştır. Sprague Dawley sıçanlar ile in vivo hayvan organ tutulum çalışması yapılmıştır. Erkek ve dişi sıçanlar üzerinde, etik kurallar çerçevesinde üç farklı proses denenmiştir. Elde edilen sonuçlar, FDG konjuge Fe3O4 nanoparçacıkların kanser hücrelerine tutulumu arttırdığı ve bu parçacıkların MRI ile kanser hücrelerinde görüntüleme ve hipertermi ile terapi için uygun özelliklerinden dolayı teranostik ajan olabileceklerini göstermektedir.

Abstract:
The aim of this thesis is created a theranostic agent with dual mode lymph node imaging and hyperthermia. For this purpose, magnetic nanoparticles (MNP) which contained iron oxide were synthesized and the surface of MNP was modified with Hyaluronic Acid (HA) to increase the stability, to reduce cytotoxicity and to enhance their selective affinity for cancer cells. In addition, the modified molecule was conjugated with Fluorodeoxyglucose (19FDG). The synthesized FDG-MNPs were optically screened by binding fluorescence-specific optical signal Indocyanine Green (ICG). Additionally, the molecule was radiolabeled with 131I using the iodogen method so, molecule has been given therapy and traceability. The radiolabeled molecule's in vitro cell culture studies and bioaffinity assays were performed on PC-3 human prostate cancer cells and MCF7 human breast cancer cells. Sprague Dawley rats were studied for in vivo animal organ involvement. Three different processes have been tested on male and female rats in the framework of ethical rules. The results demonstrate that FDG conjugated Fe3O4 nanoparticles enhance the involvement of cancer cells and that these particles may be a theranostic agent due to their favorable properties for imaging with hyperthermia and imaging in cancer cells with MRI.
Beyin hücrelerinin adezyonunda kullanım potansiyeli olan yeni fonksiyonel yüzeylerin hazırlanması
Preparation of novel functional surfaces which have potential for the adhesion of brain cells
Yazar: FATMA ÖZTÜRK KIRBAY
Danışman: DOÇ. DR. DİLEK ODACI DEMİRKOL
Ege Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Biyokimya Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2017
Konu: Biyokimya = Biochemistry

Özet:
Bu çalışma, farklı gruplara sahip 2 monomerin ve beyin hücrelerinin seçimli adezyonuna olanak sağlayan bir peptidin kullanımını temel almaktadır. Monomerlerden bir tanesi floresan özellik taşıyan rodamin (RD) diğeri ise fonksiyonel grup olarak serbest amino grubuna sahiptir  (RF). Bu iki monomer indiyum kalay oksit ile modifiye edilmiş cam (ITO) yüzeyler üzerine elektrokimyasal polimerizasyonla biriktirilmiştir. Yüzeyler kopolimer ile kaplandıktan sonra ArginilGlisilAspartik asit (RGD) isimli tripeptid 1-etil-3-(3-dimetilaminopropil)karbodiimid (EDC) kullanılarak karboksil gruplarından amino grubu içeren yüzeye kovalent olarak bağlanmıştır. Oluşturulan seçimli yüzey, integrin avb3 reseptör pozitif hücre hattı olan Glioblastoma (U87-MG) için adezyon platformu olarak kullanılmıştır. İnsan keratinosit (HaCaT) hücreleri ise kontrol grubu olarak seçilmiştir. Yüzeyin kopolimer ve RGD ile modifikasyonunun izlenmesi için elektrokimyasal ve mikroskobik teknikler kullanılmıştır. Sonuç olarak, tasarlanan P(RF-co-RD)/RGD platformu U87-MG hücrelerinin 10 ile 104 hücre/mL aralığında elektrokimyasal dedeksiyonuna olanak sağlamıştır. Ayrıca ek bir boyama işlemine gerek kalmadan hücrelerin floresan görüntülenmesi gerçekleştirilebilmiştir. Bu bağlamda hem elektrokimyasal hem de floresan görüntülemeye olanak sağlayan seçimli bir yüzey başarılı bir şekilde gerçekleştirilmiştir.

Abstract:
This thesis involves two monomer which has different groups and a peptide which provides selective adhesion of brain cells. One of the monomers has a fluorescent amino acid (RD) and the other has a free amino group (RF) as a functional group. These two monomers were deposited by electrochemical polymerization on indium tin oxide modified glass (ITO) surfaces. After the surfaces were coated with the copolymer, arginylglycineaspartic acid (RGD) was covalently bound to the amino group-containing surface from the carboxyl groups via 1-ethyl-3- (3-dimethylaminopropyl) carbodiimide (EDC). The prepared selective surface was used as an adhesion platform for an integrin avb3 receptor positive cell line, Glioblastoma (U87-MG). Human keratinocytes (HaCaT) cells were selected as the control group. Electrochemical and microscopic techniques were used to analyzed the modification of the surface with the copolymer and RGD. As a result, the designed P (RF-co-RD) / RGD platform allows for electrochemical detection of 10 to 104 cells / mL of U87-MG cells. Also, fluorescence imaging of cells could be performed without the need for an additional staining procedure. In this context, a selective surface that allows both electrochemical and fluorescence imaging were successfully accomplished.
Ege bölgesindeki düşük entalpili jeotermal kaynakların değerlendirilmesi için toprak sıcaklıklarının tahminlenmesi
Prediction soil temperatures to evaluate low enthalpy geothermal resources assessment in Aegean region of Turkey
Yazar: DENİZ YENER
Danışman: PROF. DR. ÖNDER ÖZGENER ; DOÇ. DR. LEYLA ÖZGENER
Ege Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Güneş Enerjisi Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2017
Konu: Enerji = Energy

Özet:
Bu tezde, düşük entalpili jeotermal kaynaklar için, toprak sıcaklıkları, zamanın ve derinliğin fonksiyonu olarak tahminlenmiştir. Tahminler özellikle toprak kaynaklı ısı pompaları ve toprak hava ısı eşanjörlerine yöneliktir. Toprağın termal davranışı,mevsimsel değişimler, nem oranı gibi pek çok etmene bağlıdır. Ek olarak eksiksiz sıcaklık verilerine ulaşmak oldukça zordur. Bu durum ise doğru tasarım parametrelerinin belirlenmesini güçleştirmektedir.Bu sebeplerden dolayı, matematiksel bir tahminleme modeli geliştirildi. Tahminler İzmir Meteoroloji İstasyonu'ndan alınan Ege Bölge'si illeri için 1960-2014 yılları arasındaki 5-10-20-50-100cm derinliklerdeki sıcaklık değerleriyle karşılaştırıldı. Hata yüzdeleri Afyonkarahisar %19, %17.5, %16.8, %18, %19, Aydın %14.5, %13.9, %12.5, %12.5, 10.5%, Denizli %11, %10.6, %8, %7.7, %5.9, İzmir %11.33, %12.26, %8.54, %11.14, %10.96, Kütahya %20, %14.1, %12.6, %16, %15.7, Manisa %13.43, %12.03, %8.5, %9.4, %8.7, Muğla %15, %15.3, %11.9, %12.2,%12.2 ve Uşak %17.5, %16, %13.95, %14.86, %15 olarak belirlendi.Özetle bu tezde  hava ve toprak sıcaklığı arasındaki bağ incelenmiştir.

Anahtar sözcükler:Toprak sıcaklığı, sıcaklık çeşitliliği, enerji verimliliği, jeotermal enerji, ısı değiştiriciler.

Abstract:
This thesis deals with the prediction of soil temperature's as a function of time and depth. And present study especially related to earth to air heat exchangers and heat pumps. Values, especially near the surface, depend on futures such as seasonal weather variations, thermal conductivity, etc.The main issue is that despite values are significantly important, can not be reached easily.Hence mathematical model is developed for soil temperatures prediction.Measured data between 1960 and 2014 that was taken from the Izmir State Meteorological Station, and predicted soil temperatures at  different depths which are 5-10-20-50-100cm were compared for each. The maximum percentage errors obtained as 19%, 17.5%, 16.8%, 18%, 19% for Afyonkarahisar, 14.5%, 13.9%, 12.5%, 12.5%, 10.5% for Aydin, 11%, 10.6%, 8%, 7.7%, 5.9% for Denizli, 11.33%, 12.26%, 8.54%, 11.14%, 10.96% for Izmir, 20%, 14.1%, 12.6%, 16%, 15.7% for Kutahya, 13.43%, 12.03%, 8.5%, 9.4%, 8.7% for Manisa,15%, 15.3%, 11.9%, 12.2%, 12.2% for Mugla and 17.5%, 16%, 13.95%, 14.86%, 15% for Usak respectively.This thesis describes to relationship between air and soil temperature. 

Keywords: Soil temperature, temperature variations, energy efficiency, geothermal energy, heat exchangers.
Doğrusal olmayan sistemlerin model öngörülü kontrol yöntemi ile kontrolü
Control of nonlinear systems with model predictive control method
Yazar: HAZİN İNCİ
Danışman: PROF. DR. AYDOĞAN SAVRAN
Ege Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Elektrik-Elektronik Mühendisliği Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2017
Konu: Bilgisayar Mühendisliği Bilimleri-Bilgisayar ve Kontrol = Computer Engineering and Computer Science and Control ; Elektrik ve Elektronik Mühendisliği = Electrical and Electronics Engineering ; Mühendislik Bilimleri = Engineering Sciences

Özet:
Günümüzde, endüstride, yüksek hızlı, yüksek kaliteli ve yüksek verimli üretim gereksinimlerinin karşılanması için gelişmiş kontrol sistemi tasarımlarına ihtiyaç artmıştır. Model öngörülü kontrol yöntemi sistem modeline dayalı bir kontrol tekniğidir ve son yirmi yılda yoğun bir şekilde gerçekleştirilmiş olan akademik ve endüstriyel uygulama çalışmaları ile etkinliği kanıtlanmıştır.
MPC yönteminin pek çok çeşidi vardır. Bu tez çalışmasında, doğrusal MPC yöntemlerinden, Dinamik Matris Kontrol(DMC), Model Algoritmik Kontrol(MAC) ve Genelleştirilmiş Öngörülü Kontrol(GPC) tasarımları yapılarak benzetim ve uygulama çalışmaları gerçekleştirilmiştir.
Tasarımı gerçekleştirilen her üç MPC yöntemi ile de etkileşimli iki tanklı bir sıvı seviye siteminin doğrusal ve doğrusal olmayan modeli kullanılarak benzetim çalışmaları yürütülmüştür. Ayrıca gerçek sistem üzerinde uygulama çalışması gerçekleştirilmiştir. Gerçekleştirilen bu çalışmalar ile tasarlanan MPC yapılarının performans nitelikleri karşılaştırmalı olarak gösterilmiştir.

Anahtar sözcükler: Model öngörülü kontrol, dinamik matris kontrol, model algoritmik kontrol, genelleştirilmiş öngörülü kontrol.

Abstract:
Nowadays, it is required well-developed control systems to meet high speed, high quality and more efficient production requirements in industry. Model predictive control (MPC) method is a method based on system model and it proved its efficiency by means of huge amount of academic studies and industrial applications for last two decades.
There are much kind of MPC methods. In this thesis, it is performed simulation studies and practical applications with Dynamic Matrix Control (DMC), Model Algorithmic Control (MAC) and Generalized Predictive Control (GPC) methods. 
It is performed several simulation studies by using linear and nonlinear models of a coupled two tank system. These methods are also applied to control the actual system. The performance of the designed MPC methods are comparatively shown with these studies.

Keywords: Model predictive control, dynamic matrix control, model algorithmic control, generalized predictive control.
Ayrık dinamik sistemlerin kaotik doğrusal dönüşümleri ve matematiksel modellemesi
Mathematical modelling and chaotic linear transformation of discrete dynamical systems
Yazar: DENİZ ELMACI
Danışman: YRD. DOÇ. DR. NURŞİN ÇATAK
Ege Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Matematik Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2017
Konu: Matematik = Mathematics

Özet:
Bu yüksek lisans tezinde, kaotik bir dönüşüm olan Arnold'ın CAT dönüşümü (ACM), Γ : T2 → T2 dönüşümü tarafından 2 boyutlu torus olarak tanımlanan T2 üzerinde incelendi. ACM, bir yazı içerisine gizlenmiş şifre, resimlerin ve yazıların şifrelenmesi, filigran ve resim üzerindeki onaysız değişikliklerin takibi gibi çeşitli alanlarda kullanılmaktadır. Resimlerin dönüşümü piksellerin rastgele sıralanmasıyla gerçekleşmektedir. Dönüşüm belirli sayıda tekrar edildikten sonra, asıl resme tekrar ulaşılabilmektedir.
Bu çalışmada CAT dönüşümünün periyodikliği incelendiği için, Fibonacci serisiyle olan bağlantısı tartışıldı. Bu bağlamda, resimlerin şifrelenmesi önerilen bir algoritma ile gösterildi. Ayrıca CAT dönüşümünün periyodu incelendi ve periyodun değiştirilmesi için bir algoritma önerildi. Önerilen
algoritmadan elde edilen periyot ile ACM'nin genel periyodu karşılaştırıldı. Bunun yanı sıra, CAT dönüşümü tabanlı ses şifreleme algoritması müzik notaları için kullanıldı.

Abstract:
In this thesis Arnold's CAT Map (ACM), dened by the mapping Γ : T2 → T2, is a chaotic transformation of 2-dimensional toral automorphism T2. There are many applications of ACM in various research areas such as: steganography, encryption of images, texts and watermarks. The transformation of an image is achieved by the randomized order of pixels. After a nite number of repetitions of the transformation, the original image reappears. 
This study concerns about the periodicity of ACM and its relation to the Fibonacci series is discussed. In this regard, encryption of images is
demonstrated together with a proposed algorithm. Moreover, the periodicity of ACM is discussed and an algorithm to change the period of ACM is suggested. The resultant period obtained from the new algorithm is compared with the period obtained from the usual ACM. Additionally, CAT transformation based on an audio encryption algorithm is used for musical notes.
İklim değişikliği ve sürdürülebilir kalkınma; Bireysel düzeyde kapasite geliştirilmesine ilişkin İzmir üzerine bir çalışma
climate change and sustainable development; A study on the individual level capacity development on İzmir
Yazar: LEYLA NUR YARAN
Danışman: DOÇ. DR. MENEVİŞ UZBAY PİRİLİ
Ege Üniversitesi / Sosyal Bilimler Enstitüsü / İktisat Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2017
Konu: Ekonomi = Economics ; Kamu Yönetimi = Public Administration
Dizin: Ekonomi politikaları = Economic policies ; Ekonomik kalkınma = Economic development ; Farkındalık = Awareness ; Kapasite arttırımı = Capacity increase ; Karbondioksit salınımı = Carbondioxide emission ; Kyoto Protokolü = Kyoto Protocal ; Sürdürülebilir kalkınma = Sustainable development ; Sürdürülebilir çevre = Sustainable environment ; İklim değişikliği = Climate change ; İzmir = Izmir

Özet:
Bugün iklim değişikliği toplumdaki her bireyin ilgisini çeken çok önemli bir kü-resel tehdit olarak gündemde yer almaktadır. Çevre sorunları içinde en önemlisi iklim değişikliği  olgusu ve buna bağlı olarak gezegenimizin yüzey  ısısının artmakta olmasıdır. Sanayi  devriminden bu yana  ısının ortalama  1.5 ile 2 derece arasında arttığı  tahmin edilmektedir. İklim değişikliğinin olumsuz  etkileri hayatımızın her alanını doğrudan etkilemektedir. Bu amaç doğrultusunda, tez çalışması kapsamında, iklim değişikliğinin etkilerine karşı oldukça duyarlı olan ülkemizde bilinç konusundaki  ihtiyaçların ve eksikliklerin belirlenmesinin önemi göz önüne alınıp toplumdaki bilinç ve farkındalık düzeyinin belirlenmesi amaçlanmıştır. Bu konunun seçilmesindeki sebep, günümüzde en büyük sorunlardan biri olan küresel ısınmanın günden güne artmasıdır. Bu amaçla; İzmir'de bireysel düzeyde kapasite saptama ve geliştirmeye yönelik bir çalışma gerçek-leştirilmiştir.
Anahtar Sözcükler: İklim, İklim Değişikliği,Çevre, Sürdürülebilir Kalkınma, Düşük Karbonlu Ekonomi, Anket Çalışması, Farkındalık ve Bilinç Düzeyi.

Abstract:
Today climate change is on the agenda as a very important global threat attrac-ting every individual in society. The most important environmental problem is the oc-currence of climate change, which in turn increases the surface temperature of our pla-net. Since the industrial revolution, it is estimated that the average temperature increases between 1.5 and 2 degrees. The negative effects of climate change are directly affecting every aspect of our lives. For this purpose, in the scope of the thesis study, it is aimed to determine the level of consciousness and awareness in the society considering the im-portance of determining the needs and deficiencies of consciousness in our country which is very sensitive to the effects of climate change. The reason for the election of this subject is the increase in global warming, which is one of the biggest problems to-day. For this purpose; A study was conducted to determine and develop capacity at the individual level in İzmir.
Asmada (Vitis vinifera L.) mapk genlerinin real-time PCR ile ifade analizi
Expression analysis of mapk genes in Vitis vinifera using real-time PCR
Yazar: ASHKAN HODAEI
Danışman: DOÇ. DR. BİRSEN ÇAKIR AYDEMİR
Ege Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Bahçe Bitkileri Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2017
Konu: Biyoteknoloji = Biotechnology ; Ziraat = Agriculture

Özet:
MAPK genleri, tüm ökaryot canlılarda evrimsel süreçte korunmuşlardır. Genel olarak, MAPK'lar sitokinez, farklılaşma, çoğalma, hücre gelişimi, abiyotik ve biyotik yanıt, patojen savunması ve hormonal tepkiler gibi temel fonksiyonlarda önemli rol oynayan çok yönlü protein ailesidir.
Bu çalışmada, tanelerde farklı gelişim dönemlerinde, yapraklar, ve sülüklerden toplam RNA'lar izole edilmiş, ve bu RNA'lardan cDNA sentezi gerçekleştirilmiştir. VvMAPKK ve VvMAPKKKK alt ailelerine ait genlerin ifade analizi için bu genlere özgü toplam 12 primer (5 MAPKK, 7 MAPKKKK) dizayn edilmiş ve bu primerler kulanılarak Real-time PCR analizi gerçekleştirilmiştir.
VvMAPKK ve VvMAPKKKK genlerinin ifadeleri farklı tane gelişim dönemlerinde regüle olmuş, olgunlaşma döneminde bütün genlerin ifade düzeylerinde azalma gözlemlenmiştir. VvMAPKK ve VvMAPKKKK genlerinin ifade profilleri ile, meyvede tam olgunlaşma döneminde, hücre gelişimi ve farklılaşmasının baskılanması arasındaki korrelasyon saptanmıştır. Bu genlerin tanelerin büyüme ve gelişme dönemlerinde fitohormonlar ile bağlantılı yolaklarda rol oynayabileceği düşünülmektedir.
Sonuç olarak, bu çalışma VvMAPKK ve VvMAPKKKK proteinlerinin gelişim dönemlerinde üstlendikleri roller ve yer aldıkları fizyolojik olayların belirlenmesi açısından bir ön bilgi sağlamaktadır.

Abstract:
MAPK genes are evolutionary highly conserved ancient cascades in all eukaryotes. Generally, MAPKs as a versatility protein family, control cell's fate by playing important roles in prominent functions including cytokinesis, differentiation, proliferation, cell development, abiotic and biotic responses, pathogen defense, hormonal responses. Moreover, these ubiquitous proteins have crosstalk ability with different pathways and also within each other which makes the study of them so complicated.
In this research, total RNA from berries, leaves, clusters and tendrils during different developmental stages were extracted and after purification and cDNA synthesis their relative expression were analyzed with totally 12 primers (5 MAPKKs and 7 MAPKKKKs) using Real-time PCR.
The expression of both VvMAPKK and VvMAPKKKK sub-family genes was regulated by growth and development in berries and downregulated during the ripening stage which can be related to decreased level of cell-development and cell-proliferation and consequently, decreased level of extra-cellular signals.
All together this work provides a background to research about physiologic roles of VvMAPKKs and VvMAPKKKKs in different development stages. Besides, these proteins can play a role in the production of phytohormones, and different related cascades.