Endotelyal nitrik oksit sentaz (eNOS) gen polimorfizmlerinin varikoselle ilişkisi ve bu polimorfizmlerin eENOS geni mRNA ekspresyonuna etkisi
The relationship betweeen endothelial nitric oxide synthase (eNOS) gene polymorphisms and varicocele and the effect of these polymorphisms on enos gene mRNA  expression
Yazar: ÇİĞDEM YÜCE KAHRAMAN
Danışman: YRD. DOÇ. ŞENER TAŞDEMİR
Atatürk Üniversitesi / Tıp Fakültesi / Tıbbi Genetik Ana Bilim Dalı
Derece: Tıpta Uzmanlık, 2013
Konu: Genetik = Genetics
Dizin: Gen ifadesi = Gene expression ; Polimorfizm-genetik = Polymorphism-genetic ; RNA-haberci = RNA-messenger ; Varikosel = Varicocele ; eNOS = eNOS

Özet:
ÖZET
Varikosel spermatik vendeki venlerin patolojik dilatasyonudur. Varikosel, sekonder erkek infertilitesinin en sık görülen nedenlerindendir.
Varikosel patofizyolojisinde rolü olan NO `nun eNOS genince üretildiği ve bu gen üzerinde polimorfik değişiklikler olduğu bilinmektedir. Çalışmamızda sık görülen üç eNOS polimorfizmi (T-786C, G894T, 4b/a) ve eNOS geni mRNA ekspresyonuyla varikosel arasındaki ilişki ayrıca eNOS geni mRNA ekspresyonunun bu polimorfizmlerle ilişkisinin araştırılması amaçlanmaktadır. 
Çalışmamızda 102 varikoselli hasta ve 100 kontrol grubunda eNOS gen G894T, T786C, 4a/b polimorfizmleri incelenmiştir. Çalışmamızın ikinci basamağı olan ekspresyon çalışması için hasta grubundan 24, kontrol grubundan 17 örnek seçilmiştir. Bu örnekler polimorfizm alt grupları göz önüne alınarak seçilmiştir. Bu alt gruplar 4 tanedir: 1. alt grup hiçbir polimorfizmi taşımayanlar, 2. 3. ve 4. alt gruplar ise üç polimorfizmlerden sadece birini taşıyanlardan oluşmaktadır.
 G894T polimorfizmi için hastalarda GG %52,9, GT %40,2, TT %6,9 ve kontrol grubunda ise GG %67, GT %30, TT %7 genotip oranları bulunmuştur. T786C polimorfizmi için hastalarda TT %52, TC %38,2, CC %9,8 ve kontrol grubunda ise TT %50, TC %33, CC %17 genotip oranları bulunmuştur. 4b/a polimorfizmi için hastalarda bb %76,5, ab %22,5, aa %1 ve kontrol grubunda ise bb %63, ab %31, aa %6 genotip oranları bulunmuştur. T786C polimorfizmi için ne genotipik ne de allelik frekanslarda hasta ve kontrol grubu arasında anlamlı fark bulunmamıştır. 4b/a polimorfizmi için hem allelik hem genotipik frekanslar kontrol grubunda istatistiki olarak anlamlı düzeyde fazla çıkmıştır. Bu polimorfizmin, varikosel oluşumu için koruyucu olabileceğini düşünmekteyiz. G894T polimorfizmi için allelik frekans değil ancak genotipik frekans hasta grubunda istatistiki olarak anlamlı düzeyde fazla çıkmıştır. Bu polimorfizm NO düzeyini azaltarak hastalardaki varikosel oluşumuna katkıda bulunabilir. Hasta ve kontrol grup ekspresyonları alt grup ayırt etmeksizin kıyaslandığında, hastalarda eNOS geni ekspresyonu artmış ve istatistiki olarak anlamlı bulunmuştur. Varikoselli hasta grubu ekspresyonundaki bu artışın vasküler yapının korunması açısından dilatator kompensatuvar bir mekanizma olabileceğini düşünmekteyiz. Çalışmamıza göre hasta ve kontrol grupları ayrı ayrı polimorfizm alt gruplarına göre incelendiğinde anlamlı bir fark bulunmadı. Bu sonuçlara göre polimorfizmlerin ekspresyon düzeyine etkisi olmadığı görülmüştür.

Abstract:
SUMMARY
	Varicocele is the pathological dilatation of veins in spermatic veins. Varicocele is the most common cause of secondary male infertility.
	Nitric oxide (NO) which has a role on varicocele pathophysiology is synthesized by eNOS gene and some genetic polymorphisms are found in this gene. In our study we aimed to explain the relationship between varicocele and three common eNOS gene polymorphisms (T786C, G894T, 4b/a) , eNOS gene mRNA expressions, also the relationship between this polymorphisms and eNOS gene mRNA expressions.
	We investigated eNOS T786C,  G894T, 4b/a polymorphisms in 102 patients with varicocele and 100 healthy controls. In the second step of our study (expression study) we chose 24 patients and 17 controls. These samples were choosen in respect to polymorphism subgrups. The subgroups were four in number: the first subgroup which has no polymorphism, the other subgroups (2.3.4. subgroups) have only one of the three polymorphism types.
	GG  %52,9, GT %40,2, TT %6,9 genotype percents were found in patients and GG %67, GT %30, TT %7 in control group that has G894T polymorphism. TT %52, TC %38,2, CC %9,8 genotype percents were found in patients and TT %50, TC %33, CC %17 in control group that has T786C polymorphism. bb %76,5, ab %22,5, aa %1 genotype percents were found in patients and  bb %63, ab %31, aa %6 in control group that has 4b/a polymorphism. There was no statistically difference neither in allelic nor genotypic frequencies between patient and control group according to the T786C polymorphism. 4b/a polymorphism was statistically higher in allelic and genotypic frequencies in control group than patient group. We thought that this polymorphism may have a protective effect for the occurence of varicocele. G894T polymorphism was statistically higher in genotypic frequencies in patient group than control group but not in allelic frequencies. This polymorphism may contribute varicocele occurence by lowering the level of NO. When we compared patient and control group expressions regardless of the subgroups, the eNOS gene expression was statistically higher in patient group. This may be a kind of dilatator compensatory mechanism to protect vasculer anatomy in varicocele. There was no statistically difference in the patient and control group expressions in respect to different polymorphism subgroups. These results shows us that there is no effect of polymorphisms on expression level.