Doğu Anadolu kırmızısı ve melezi sığırlarda prolaktin geni polimorfizmi
Polymorphism of prolactin (PRL) gene in the East Anatolian red cattle and their crosbreds
Yazar: ZEYNEP SÖNMEZ
Danışman: YRD. DOÇ. DR. MEMİŞ ÖZDEMİR
Atatürk Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Zootekni Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2013
Konu: Genetik = Genetics

Özet:
Bu araştırmada Türkiye'de gen kaynağı olarak korunan ?Doğu Anadolu Kırmızısı? ırkı yerli sığırlar ile Erzurum ve civarında yetiştirilen Doğu Anadolu Kırmızısı Melezi sığırların Prolaktin gen lokusu bakımından genotipik yapılarının incelenmesi, ilgili genler bakımından sürülere ait genotip ve allel frekanslarının dağılımı, gruplar arası ve gruplar içi varyasyonların ortaya konulması amaçlanmıştır. Çalışmada, PCR-RFLP yöntemi kullanılarak yerli Doğu Anadolu Kırmızı ırkının saf ve melezisığırlarında Prolaktin genine ait 3 farklı ekzon bölgesi incelenmiş ve prolaktin genine ait gen ve genotip frekansları belirlenmiştir. Analizde 1. ekzon bölgesi için HaeIII, 3.ekzon ve 4. ekzonbölgeleri için RsaI restriksiyon enzimleri kullanılmıştır.PCR-RFLP analizi sonucunda PRL geni 1.ekzon bölgesinde tüm populasyonlar genelinde monomorfik bulunmuştur. PRL geni 3.ekzon bölgesinde AA, AB ve BB genotip frekansları DAK populasyonunda sırasıyla, 0.59, 0.34 ve 0.07, Melez populasyonda sırasıyla 0.49, 0.44. ve 0.07, tüm populasyon genelinde 0.55, 0.38 ve 0.07 olarak bulunurken, 4.ekzon bölgesinde AA, AG ve GG genotip frekansları DAK populasyonunda sırasıyla, 0.01, 0.51 ve 0.48, Melez populasyonda sırasıyla 0.00, 0.92 ve 0.08, tüm populasyon genelinde 0.01, 0.57 ve 0.42 olarak tespit edilmiştir. İncelenen tüm bireyler ele alındığında 3.ekzon bölgesinde A alleli gen frekansı 0.74, 4.ekzon bölgesinde A alleli gen frekansı ise 0.29 olarak bulunmuştur. Prolaktin lokuslarında gözlenen genotip frekanslarının populasyonlar arasındaki dağılımı 3. Ekzon bölgesinde homojen olarak bulunmuştur ve populasyonların Hardy-Weinberg dengesinde (p>0.05) olduğu gözlenirken, 4.ekzon bölgesinde genotiplerin dağılımının heterojen (p<0.01) ve populasyonların Hardy-Weinberg dengesinde olmadıkları görülmüştür.DAK populasyonunda 3.ekzon bölgesi için hesaplanan gözlenen heterozigotluk (Ho), beklenen heterozigotluk (He) değerlerinden düşük bulunurken, bu değerler 4.ekzon bölgesi için yüksek bulunmuştur. Diğer incelenen Melez populasyonu ve populasyon genelinde gözlenen heterozigotluk oranları beklenen değerlerinden yüksek bulunmuştur. Ekzon 3 ve 4 bölgeleri için DAK populasyonunda hesaplanan FIS değerleri sırasıyla 0.072 ve -0.290 ve melez populasyonda -0.082 ve -0.846 olarak bulunmuş, populasyon genelinde ise -0.010 ve -0.600 olarak hesaplanmıştır. Ekzon 3 ve 4 bölgeleri için FIT değeri -0.006 ve -0.539 olarak tespit edilmiştir. Ekzon 3 ve 4 bölgeleri için FST değeri 0.003 ve 0.039 olarak tespit edilmiştir. Bu değerlere göre 3.ekzon bölgesinde genetik farklılaşma önemsiz bulunurken (p>0.05), 4.ekzon bölgesi için DAK ve Melez populasyonlar arasında genetik farklılaşmanın önemli (p<0.05) düzeyde olduğu tespit edilmiştir.Anahtar Kelimeler: Prolaktin, Polimorfizm, DAK, PCR-RFLP.

Abstract:
In this study, we aimed to investigate the characterization of prolactin gene locus in the native