Meme kanserli hastalarda TIMP 2 gen polimorfizmlerinin araştırılması
Investigation of TİMP 2 gene polymorphisms in breastcancer pati?ents
Yazar: U.GÖKSEN ARSLAN
Danışman: DOÇ. DR. RECEP ÖZMERDİVENLİ
Düzce Üniversitesi / Sağlık Bilimleri Enstitüsü / Tıbbi Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2012
Konu: Genetik = Genetics ; Tıbbi Biyoloji = Medical Biology
Dizin: Meme kanseri =  ; Restriksiyon fragman uzunluğu polimorfizmi = Restriction fragment length polymorphisms

Özet:
Dünyada meme kanseri, kadınlarda görülen kanser türleri arasında ilk sırada, kanser
nedeniyle oluşan ölümlerde ise akciğer kanserinden sonra ikinci sırada yer almaktadır.
Türkiye?demevcut verilere göre, doğu bölgelerimizde 20/100.000, batı bölgelerimizde
ise 40-50/100.000 oranında bir sıklığın olduğu tahmin edilmektedir. Proteolitik enzimler
olan MMP?ler temel olarak hücre membranındaki ve hücreler arası matrikste bulunan
kolajen, elastin, jelatin ve proteoglikan gibiproteinlerin yıkımında görev alırlar. Hücre
büyümesinde, farklılaşmasında, göçünde, apoptozis gibi biyolojik süreçlerde rol
almasının yanı sıra son yıllarda yapılan araştırmalarda tümör oluşumu ve metastaz gibi
süreçlerinde de görev aldığı bulunmuştur. MMP?ler, hücre dışı matriks bileşenlerini
parçalayarak, tümör invazyonunu kolaylaştırdığı böylece metastaz riskini
arttırabilmektedir. TIMP?ler ise MMP enzimlerinin özgül ve doğal inhibitörleri olan
proteinlerdir. Öncelikli görevleri MMP'leri baskılamak ve aktivasyonlarını
düzenlemektir. MMP ve TIMP?ler arasındaki bu dengenin bozulması patolojik
süreçlerin ortaya çıkmasına sebep olabilir.
En çok araştırılan TIMP2 proteini, ilk kez melanom hücrelerinden izole edilmiştir. 21
kDa ağırlıkta non-glikolize bir proteindir. TIMP2 geni; 17q25.3 kromozomu üzerinde
yer alır ve 5 ekzon içerir ve 83 kb uzunluğundadır.
Bu çalışmada TIMP2 (-418) G/C ile TIMP2 (303) G/A polimorfizmlerinin Türk
toplumundaki meme kanseri hastalarında etkin rol oynayıp oynamadığı RFLP
yöntemiyle incelendi.
Yapılan istatistiksel analizler sonucunda meme kanseri hastaları ile kontrol grubu
arasında istatistiksel olarak anlamlı bir fark bulunamamıştır. Fakat TIMP2 (303) GA
genotipi, meme kanserine yakalanma riskini 1,486 kat (p=0.519), TIMP2 (-418) CC
genotipinin meme kanserine yakalanma riskini 3,719 kat arttırdığı bulunmuştur
(p=0,519).
Anahtar kelimeler: Meme kanseri, polimorfizm, TIMP2.

Abstract:
The breast cancers were placed in first rank among other cancer types in women, and
second rank after lung cancer in terms of death in the World. It is estimated that this
cancer has 20/100.000 frequency in east region and 40-50/100.000 frequency west
region according to present data in Turkey.MMPs, proteolytic enzymes involve in the
breakdown of proteins located in the cell membrane and intercellular matrix such as
collagen, elastin, proteoglycans, and gelatin. In addition to cell growth, differentiation,
migration, and apoptosis, MMPs involve in tumor formation and metastasis according
to researches in recent years.MMPs facilitatetumor invasionbybreaking downthe
components ofthe extracellular matrix, then increasethe risk of metastasis.The TIMPs
are proteins which are specific and natural inhibitor for MMPs. Its primary tasks
regulate the activation of MMPs by suppress. The destruction of the balance between
MMPs and TIMPs, may lead the emergence of pathological processes.
TIMP2, most widely researched was firstly isoleted from melanoma cells.It is 21 kDa
and non-glicolised protein.TIMP-2 located on q25.3 region of chromosome 17 and has
5 exon and 83 kb long.
In this study, the effect of TIMP2 (-418) G/C and TIMP2 (303) G/A polymorphisms in
breast cancer patients in Turkish population were analyzed by RFLP.
In conclusion, the statistically significantdifference was foundbetween the control group
and patients withbreast cancer.However it is found that TIMP2(303)GAgenotype
increases the risk of developing breast cancer at 1.486fold (p=0519), TIMP2(-418) CC
genotype increases the risk of developing breast cancer at 3.719-fold (p=0.519).
Key Words: Breast cancer, polymorphism, TIMP2.
3