Ailesel akdeniz ateşi (FMF) hastalığında sitokin sinyal supresör 3 (SOCS-3) geninin metilasyon profili
Cytokine signal suppressor 3 (SOCS-3) gen methylation profilein family mediterranean fever (FMF) disease
Yazar: YEŞİM SIDAR DUMAN
Danışman: DR. ÖĞR. ÜYESİ HANDE KÜÇÜK KURTULGAN
Sivas Cumhuriyet Üniversitesi / Tıp Fakültesi / Tıbbi Genetik Ana Bilim Dalı
Derece: Tıpta Uzmanlık, 2023
Konu: Genetik = Genetics
Dizin: Ailesel akdeniz ateşi = Familial mediterranean fever ; Genler = Genes ; Metilasyon = Methylation ; Sitokinler = Cytokines

Özet:
Ailesel Akdeniz Ateşi (FMF), tekrarlayan ateş, karın ağrısı, eklem bulguları ile karakterize, erizipel benzeri döküntünün eşlik edebildiği yaygın otoinflamatuar bir hastalıktır. Klinik özellikler vakalar arasında ve/veya genotipe göre değişkenlik gösterebilmektedir. Sitokin sinyal supresör genleri (SOCS), sitokin sinyali ve inflamatuar sürecin önemli bir düzenleyicisidir.  Bu çalışmada SOCS-3 genindeki metilasyon profilinin, FMF hastalığının klinik şiddeti ve MEFV varyantları ile ilişkisini incelemeyi, olgular arasındaki klinik farklılığa ışık tutmayı amaçladık.                                                                                                                                               
Çalışmaya, 70 FMF hastası ve 30 sağlıklı gönüllü olmak üzere toplam 100 birey dahil edildi. Hasta grubu MEFV varyantlarına göre alt gruplara ayrıldı. Hasta ve kontrol grubunun periferik kan örneklerinden elde edilen DNA'lar real-time metilasyon-spesifik PCR yöntemiyle amplifiye edildi. Sonuçlar kantitasyon standartları baz alınarak değerlendirildi.
Hasta grubunda SOCS-3 geni metilasyon değerleri kontrol grubuna göre istatistiksel olarak daha yüksek saptandı (p<0.001). MEFV varyantları ile ilişkili genin metilasyon düzeyleri arasında da anlamlı farklılık mevcuttu (p<0.001). Metilasyon değeri ile şiddet skoru arasında pozitif bir korelasyon vardı. Ayrıca eklem tutulumu ile metilasyon düzeyleri karşılaştırıldığında istatistiksel olarak anlamlı bulundu (p<0.001). 
Bu çalışmadan elde edilen veriler ışığında SOCS-3 gen metilasyon seviyesinin MEFV varyantları ve hastalığın şiddeti ile ilişkili olduğunu düşünmekteyiz.

Abstract:
Familial Mediterranean Fever (FMF) is a common autoinflammatory disease characterized by recurrent fever, abdominal pain, joint manifestations, which may be accompanied by an erysipelas-like rash. Clinical features may vary between cases and/or according to genotype. Cytokine signal suppressor genes (SOCS) are significant regulators of cytokine signalling and inflammatory processes. In this study, we aimed to examine the relationship between the methylation profile in the SOCS-3 gene, the clinical severity of disease FMF and MEFV variants, and to shed light on the clinical differences between the cases.
A total of 100 individuals, including 70 FMF patients and 30 healthy volunteers, were included in the study. The patient group was divided into subgroups according to MEFV variants. DNAs obtained from peripheral blood samples of the patient and control groups were amplified by real-time methylation-specific PCR method. The results were evaluated on the basis of quantitation standards.
The methylation levels of the SOCS-3 gene were found to be statistically significantly higher in the patient group (p<0.001). There was also a significant correlation between MEFV variants and methylation levels of SOCS-3 gene (p<0.001). Methylation levels were found to be higher in cases with joint involvement (p<0.001).
In the light of the data obtained from this study, we believe that the level of SOCS-3 gene methylation is associated with MEFV variants and the severity of the disease.