hakansabunis/tr-academic-research-agent-index huggingface dataset:
pTOLT vektörünün modifikasyonu ve UnaG floresans proteininin Escherichia coli de üretilmesi
Modification of pTOLT vector and production of UnaG fluorescent protein in E.coli
Yazar: ERMAN KORKMAZ
Danışman: PROF. DR. İSA GÖKÇE
Gaziosmanpaşa Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Biyomühendislik Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2016
Konu: Biyokimya = Biochemistry ; Biyomühendislik = Bioengineering ; Biyoteknoloji = Biotechnology
Dizin: DNA-rekombinant = DNA-recombinant

Özet:
Japon tatlı su yılan balığı (Anguilla japonica) türünün kas lifleri omurgalıda tanımlanan ilk floresan proteinini (UnaG) bulundurmaktadır. Floresan proteinleri kendi kendilerine ışık üretmezler fakat aydınlatıldıklarında parlaklık gösterirler. UnaG şaşırtıcı bir şekilde konjuge olmayan bilirubine yüksek afinite ve spesifik bir şekilde bağlanarak floresan özellik göstermektedir. Bu çalışmada UnaG floresan protein geni pTOLT vektörüne klonlanlanmış ve küçük ölçekte protein üretimi gerçekleştirilmiştir. Bu sistemle pTOLT vektörü icersindeki TolAIII geninde bulunan iki adet sistein farklı amino asitlere çevrilerek bu vektörün fonksiyonelliği artırılmıştır. pTOLT vektör sisteminde füzyon kısım olan TolAIII proteinininde bulunan iki adet sistein aminoasiti "QuikChange" Site Directed Mutagenesis yoluyla değiştirilmiştir. Bu çalışma ile ülkemizde UnaG floresan proteininin rekombinant DNA teknolojisiyle çok miktarda ve düşük maliyetli bir şekilde üretilmesi ve moleküler çalışmalarda kullanımının sağlanılması hedeflenmiştir. Ayrıca ülkemizde bu alanlarda yapılan çalışmaların eksikliğinin giderilmesi ve bu tarz çalışmaların yapılabileceğinin gösterilmesi de amaçlanmıştır. Böylelikle ülkemizde geleceğin teknolojisi olan bu alanda çalışmaların giderek artması beklenmektedir.

Abstract:
The Japanese freshwater eel (Anguilla japonica)'s muscle fibres produce the first fluorescent protein (UnaG) identified in a vertebrate. Fluorescent proteins do not produce light themselves, but glow when illuminated. Surprisingly, UnaG protein becomes fluorescent via noncovalent, high-affinity, high-specificity binding to unconjugated bilirubin. In this study UnaG fluorescent protein gene cloned to pTOLT vector it was followed protein production were performed on a small scale. The functionality of this vector increased by two cysteine which in the TolAII gene within the pTOLT vector converted to different amino acid. For this operation "QuikChange" Site Directed Mutagenesis method is used. With this work we will try to produce a fluorescent protein by recombinant DNA technology in our country, large and low cost UnaG fluorescent protein will be used in molecular study. To correct the deficiency studies in this field in our country and it is aimed at showing this kind of work can be done. Thus, biotechnology field which technology of future and several studies carried about in this area will gradually increase.
Atık Çay'dan elde edilen ekstrakt ile yünlü ve pamuklu kumaşların boyanma özelliklerinin incelenmesi
Ihvestigation of dyeing properties of wool and cotton fabrics with waste tea extract
Yazar: SARAY ÖZLEM YUMUŞAK
Danışman: PROF. DR. ADEM ÖNAL
Gaziosmanpaşa Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Organik Kimya Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2016
Konu: Kimya = Chemistry

Özet:
Bu çalışmada, atık çay (Camellia sinensis)' ın tekstil boyamacılığında kullanılabilirliği incelendi. Bu amaçla; pamuk ve yün kumaşların bir kısmı Önal-1 mordan sisteminde bekletilirken bir kısmı bekletilmedi. Boyama işlemler için AlK(SO4)2·12H2O , CuSO4•5H2O , FeSO4•7H2O mordanları yardımıyla ön, birlikte ve son mordanlama yöntemleri kullanılarak gerçekleştirildi. Genellikle yüksek haslık değerlerine sahip boyamalar elde edilirken, renk şiddetleri açısından da yün kumaşların pamuk kumaşlardan daha iyi sonuç verdiği tespit edildi. Atık çayın yün ve pamuk numuneleri boyamak için uygun bir boyar madde kaynağı olduğu belirlendi.
Atık çay ile daha önce Atılgan ve ark., tarafından atık çayın ahşap numune üzerinde ki boyama özellikleri incelenmiştir. Tutak,M. tarafından da bazı bitkilerin (atık çay) pamuk numune üzerindeki boyama özellikleri incelenmiştir.
Yapmış olduğum çalışma daha önce yapılmadığı için tamamen orijinal olup bundan sonra ki çalışmalara kaynak teşkil edecek özelliktedir.

Abstract:
In this study, we examined the availability of dyeing with waste tea in textile. Fort his purpose, some parts of cotton and wool stared in the system of Önal-1 purple and the others not stored. Dyeing transactions were performed by using the front, together and final methods of mordant with the help of  AlK(SO4)2·12H2O , CuSO4•5H2O and FeSO4•7H2O. Usually, it was detected that,; when obtaining the high fastness valnes dyeing the wool fabric gave beter results than cotton fabrıc also in terms of the color ıntensıty. It was determined that waste tea is a proper dye supply for dyeing the samples of cotton and wool. Waste tea was examined by Atılgan and his colleagues in terms of the dyeing features on sample of waste tea wood. Dyeing properities on cotton samples were examined by Tutak,M. which obtained from same plants (waste tea). Thus, our work we have done is completely original because it hasn't done before and it will be a resource fort he next works.
Diatomit katkılı sıva harcının tarımsal yapılarda kullanılabilme olanakları
Possible use of diatomite-amended plasters in agricultural structures
Yazar: SERKAN YAZAREL
Danışman: PROF. DR. SEDAT KARAMAN
Gaziosmanpaşa Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Tarımsal Yapılar ve Sulama Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2016
Konu: Ziraat = Agriculture
Dizin: Diatomit = Diatomite ; Ponza = Pumice

Özet:
Bu çalışmada doğal bir puzolan olan diatomitin sıva harcı yapımına uygunluğunun belirlenmesi yanında, tarımsal yapılarda kullanılabilme olanaklarının araştırılması amaçlanmıştır.  İncelenen agrega (kum ve ponza) ve puzolan üzerinde gerçekleştirilen deney sonuçlarına göre agrega ve puzolanların sıkışık ve gevşek birim ağırlıkları, özgül ağırlık ve su emme miktarı, organik madde miktarı, aşınma dayanımı gibi agrega ve puzolanın önemli özellikleri araştırılmış, malzemelerin standartlara uygun olduğu belirlenmiştir. Yapılan taze (birim ağırlık ve yayılma deneyi ) ve sertleşmiş (birim ağırlık, kılcal su emme, toplam su emme miktarı, eğilme ve basınç dayanımı ve  buhar geçirgenlik deneyleri) sıva harcı deneylerinden elde edilen sonuçlara göre, buhar geçirgenlik ve dayanım testleri sonucunda, pomza ve diatomitin tarımsal yapılarda kullanılabilirliği uygun görülmüştür. Ülkemizde önemli miktarlarda üretim yapılan ponza ve diatomitin ile hazırlanacak sıvalarda, malzemelerin yüksek su tutma kapasitesi göz önünde bulundurulmalı ve diğer agrega ve bağlayıcı malzemeler ile uygunluğu konusunda araştırmalar yapılmalıdır.

Abstract:
The present thesis was conducted to investigate the availability of diatomite (a natural pozzolan) for making plaster mortar and possible uses in agricultural structures. Based on results of the tests carried out on investigated aggregate (sand and pumice) and pozzolan, compacted and loose unit weights, specific weight, water absorption, organic matter content, abrasion resistance of aggregates and pozzolan were investigated and materials were found to comply with the relevant standards. Test results on fresh (unit weight and slum test) and hardened (unit weight, capillary water absorption, total water absorption, tension and compression resistance, vapor diffusion test) characteristics revealed that pumice and diatomite could be used in agricultural structures. In plasters to be made with abundant pumice and diatomite sources, high water holding capacity of the materials should be taken into consideration and further researches should be carried out about their compliance with the other materials.
Ordu ve Samsun illerinde bulunan bazı sert kenelerdeki (Acari: Ixodıdae) Rickettsia, Borrellia ve Francisella varlığının moleküler yöntemlerle tespiti
Moleculer detection of Rickettsia, Borrellia and Francisella in some ticks (Acari: Ixodidae) from Samsun and Ordu region
Yazar: FEYZANUR YILDIRIMTEPE
Danışman: PROF. DR. İSA GÖKÇE ; PROF. DR. ŞABAN TEKİN
Gaziosmanpaşa Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Biyoloji Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2016
Konu: Biyoloji = Biology
Dizin: Borrelia burgdorferi = Borrelia burgdorferi ; Keneler = Ticks ; Ordu = Ordu ; Riketsiya enfeksiyonları = Rickettsia infections ; Samsun = Samsun ; Türkiye = Turkey

Özet:
Bu çalışmada, Ordu ve Samsun illerinde hayvan ve insan üzerinde parazitlenen sert kenelerdeki Rickettsia, Francisella ve Borrelia türlerinin varlığının araştırılarak bunların Rickettsia, Francisella ve Borrelia bulaştırma potansiyellerinin belirlenmesi amaçlanmıştır. Bu amaçla 2006-2013 yılları arasında Ordu ve Samsun illerinden toplanmış 313 kene örneğinin tür teşhisleri ve DNA izolasyonu yapıldıktan sonra Rickettsia, Francisella ve Borrelia türlerinin varlığı polimeraz zincir reaksiyonu (PCR) yöntemi kullanılarak test edilmiştir. Çalışmamız neticesinde 313 kenenin 14'inde (%4,47) Rickettsia türü bakteriler saptanmış olup Borrellia ve Francisella türlerinin varlığına rastlanmamıştır. riketsiya pozitif örneklerin DNA dizileme sonuçlarının NCBI BLAST analizine göre; Hyalomma marginatum türünde Rickettsia aeschlimannii, Dermacentor marginatus türünde Rickettsia raoultii ve Rickettsia slovaca varlığı tespit edilmiştir.

Abstract:
In this study, the existence of Rickettsia, Francisella and Borrelia was surveyed using molecular techniques in 313 collected samples from 2006 to 2013 of ticks that replicate in human and animal cells. The investigation was accomplished by using polymerase chain reaction (PCR). Results showed that Borrellia and Francisella were not detected whereas Rickettsia species were detected in 14 (4,47%) hard ticks. The sequencing and BLAST analysis results indicated that the species of Rickettsia in hard ticks Hyalomma marginatum, Dermacentor marginatus were Rickettsia aeschlimannii, Rickettsia raoulti, Rickettsia slovaca.
Yeni sentezlenmiş bazı kinolin bileşiklerinin  
antiproliferatif ve sitotoksik aktivitelerinin  
in vitro olarak belirlenmesi
Determination of in vitro antiproliferative and cytotoxic activities of some newly synthesized quinolines derivatives
Yazar: ÖNEM YÜCE ŞAHİN
Danışman: PROF. DR. ŞABAN TEKİN
Gaziosmanpaşa Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Biyoloji Ana Bilim Dalı
Derece: Doktora, 2016
Konu: Biyoloji = Biology

Özet:
Kinolin türevleri son yıllarda farmakolojik özellikleri bakımından dikkat çeken moleküller arasında yer almaktadır. Bu çalışmada yeni sentezlenmiş 20 kinolin türevi bileşiğin C6 (sıçan beyin tumoru), HeLa (insan serviks karsinom) ve HT29 (insan kolon karsinom) hücreleri üzerindeki sitotoksik aktiviteleri Hücre proliferasyon ve Laktat dehidrogenaz (LDH) sitotoksisite testleriyle araştırılmıştır. Kontrol kanser ilacı 5 fluorourasilden (5FU) daha etkin antiproliferatif ve sitotoksik aktiviteye sahip bazı kinolin bileşiklerinin etki mekanizmaları hücre migrasyon, Topoizomeraz I inhibisyon, DNA degredasyon ve TUNEL (Terminal deoxynucleotidyl transferase-mediated dUTP nick end-labeling) testleriyle incelenmiştir. Çalışma sonucunda SO13 ve SO18 kodlu bileşiklerin yüksek antiproliferatif, düşük sitotoksisite ve hücre migrasyonunu durdurucu aktiviteye sahip oldukları belirlenmiştir. Topoizomeraz I inhibisyon test sonuçları, bileşiklerin Topoizomeraz I aktivitesini bloke ettiklerini gösterirken, TUNEL ve DNA bantlaşma testleri bileşiklerin apoptozu uyardıklarını göstermiştir. Bu sonuçlar test edilen yeni kinolin bileşiklerinin antikanser ilaç potansiyeline sahip aday moleküller olmakla birlikte bunların ilaç potansiyellerinin tam olarak ortaya konması ileri preklinik ve farmakolojik çalışmaların yapılmasını gerektirmektedir.

Abstract:
In recent years, quinoline derivatives are remarkable molecules with their pharmacological properties. In this study newly synthesized quinoline molecules cytotoxic activities were tested by cell proliferation and LDH cytotoxic activity tests against C6 (rat brain tumor cells), HeLa (human cervix carcinoma) and HT29 (human colon carcinoma) cell lines. Quinoline derivatives which has exhibited more antiproliferative and cytotoxic activities than control cancer drug 5-fluorouracil (5-FU) were examined by cell migration, topoisomerase I inhibition, DNA degradation and TUNEL (Termal deoksinucleotidyl transfer asemediated UTP nickendliabling) tests. Results showed that; quinoline derivatives coded SO13 and SO18 exhibited high antiproliferative and low cytotoxic activities and inhibits cell migration. Topoisomerase I inhibition test results showed that; both of these molecules inhibit topoisomerase I activity; TUNEL and DNA laddering assays showed both of these compounds induce apoptosis. These results revealed that these newly synthesised quinoline derivatives have potentials to use as anticancer drugs and required any further preclinical and pharmacological studies.
Farklı tip sırık domates çeşitlerinin açık alan ve tül sera performanslarının belirlenmesi
Determination of performances of different type intermediate tomato varieties in open field and screenhouse
Yazar: SONER ÖNDER
Danışman: DOÇ. DR. NECDETTİN SAĞLAM
Gaziosmanpaşa Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Bahçe Bitkileri Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2016
Konu: Ziraat = Agriculture
Dizin: Domates = Tomato

Özet:
Bu çalışma 2015 yılı Nisan-Kasım ayları arasında Gaziosmanpaşa Üniversitesi Tarımsal Uygulama ve Araştırma Merkezi arazisinde yürütülmüştür. Bu çalışmanın amacı; farklı sırık domates tiplerinin Tokat yöresinde açık alan ve tül seradaki performanslarını ve tül seranın verim ve kalite üzerine etkilerini belirlemektir. Tohum ekimi 20 Nisan 2015 tarihinde yapılmıştır. Fideler 20 Mayıs 2015 tarihinde açık alan ve tül seraya dikilmiştir. Deneme tesadüf bloklarından bölünmüş parseller deneme desenine göre 3 tekerrürlü olarak yürütülmüştür.

Yetiştirme sistemine göre; ortalama meyve ağırlığı en fazla 80,48 g/meyve ile tül sera uygulamasından elde edilmiştir. En fazla toplam verim 16,71 kg/m2 ile tül sera uygulamasında tespit edilmiştir.
Çeşitlere göre; ortalama meyve ağırlığı en fazla 171,00 g/meyve ile Asya Fı ve 163,52 g/meyve ile Gülpembe Fı çeşitlerinde belirlenmiştir. En yüksek toplam verim değeri 24,96 kg/m2 ile Merkür Fı çeşidinde saptanmıştır.

Yetiştirme sistemi x çeşit interaksiyonuna göre ise ortalama meyve ağırlığı en fazla 174,50 g/meyve ile Açık Alan x Asya Fı kombinasyonunda belirlenmiştir. En yüksek toplam verim 29,61 kg/m2 ile Tül Sera x Merkür Fı kombinasyonunda tespit edilmiştir.

Abstract:
This study was conducted out at Agricultural Application and Research Center of Gaziosmanpasa University between April-November, 2015. Aim of this study was to determine the performances of different intermediate tomato types in open field –screenhouse on yield and quality.

The seeds were sown on April 20th, 2015. Seedlings were planted out in open field and screenhouse in May 20th, 2015. The experiment was a split plots and in randomized complete block design with three replications.

According to growing system; maximum average fruit weight was obtained in screen house application with 80,48 g/fruit. Maximum total yield was determined in screen house application with 16,71 kg/m2.
According to varieties; average fruit weight maximum was determined in Asya Fı with 171,00 g/fruit and Gülpembe Fı variety with 163,52 g/fruit. Maximum total yield value was determined in Merkür Fı variety with 24,96 kg/m2. 

According to growing system x variety interaction; maximum average fruit weight was found out in combination of open field x Asya Fı with 174,50 g/fruit. Maximum total yield was detected in combination of screen house x Merkür Fı with 29,61 kg/m2.
Türkiye'de asgari kabul ücretinin belirleyicileri
Determinants of reservation wages in Turkey
Yazar: MURAT İSTEKLİ
Danışman: YRD. DOÇ. DR. SERAP BARIŞ
Gaziosmanpaşa Üniversitesi / Sosyal Bilimler Enstitüsü / İktisat Ana Bilim Dalı / İktisat Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2016
Konu: Ekonomi = Economics
Dizin: Asgari ücret = Minimum wage ; Ücret = Wage ; İstihdam = Employment ; İş arama = Job search ; İş gücü arzı = Labour supply ; İşsizlik = Unemployment

Özet:
Asgari kabul ücreti, bireyin çalışmaya razı olacağı en düşük ücret düzeyini göstermektedir. Bu ücret düzeyi bireysel emek arz eğrisinin başlangıç noktasını temsil etmektedir. Bu çalışma, işsiz bireylerin asgari kabul ücreti üzerinde etkili olan faktörleri tespit etmeyi amaçlamaktadır. Bu amaca uygun olarak hazırlanan anket, Türkiye'nin farklı bölgelerinde bulunan 15 ilde, Türkiye İş Kurumu'na başvuran işsiz bireylere uygulanmıştır. Yapılan toplam anket sayısı 2162'dir. İllerde yapılan anket sayısı belirlenirken ilin temsil ettiği bölgede yaşayan işsiz sayısı ve bunların kadın erkek olarak dağılımları göz önüne alınmıştır. Analizde iki aşamalı en küçük kareler yöntemi kullanılmıştır. Çalışma sonucunda, işsiz bireylerin asgari kabul ücretinin sosyal, demografik ve ekonomik belirleyicileri tespit edilmiştir. Elde edilen bulgular ile çeşitli politika önerileri geliştirilmeye çalışılmıştır. Ayrıca çalışmanın Türkiye'deki emek arzının yapısının anlaşılmasına yardımcı olacağı düşünülmektedir.

Abstract:
Reservation wage is the minimum wage level at which a person is willing to accept work. This wage level represents the starting point of the individual labor supply curve. This study aims to determine the factors which have an effect on an unemployed person's reservation wage. The survey prepared for this purpose was provided to unemployed individuals who applied to the Turkish Labor Agency in 15 cities located in different regions of Turkey. The total number of surveys applied was 2,162. When the number of surveys to be applied in each city was determined, the number of unemployed people living in the region represented by the city was taken into consideration, as was their distribution by gender. The two-stage least squares method was used in the analysis. As a result of the study, the social, demographic and economic determinants of unemployed people's reservation wages were determined. An attempt has also been made to develop various policy recommendations. In addition, it is thought that this study will also help provide a better understanding of labor supply in Turkey.
İsoindol, pirazol, oksazol ve kalkon birimi içeren bileşiklerin sentezi, karakterizasyonu ve biyolojik aktivitelerinin incelenmesi
Synthesis, characterization, antimicrobial and anticancer activities of compounds includes isoindol, pyrazol, oxazolo and chalcone units
Yazar: HÜSEYİN ERDOĞAN
Danışman: YRD. DOÇ. DR. MELİHA BURCU GÜRDERE
Gaziosmanpaşa Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Kimya Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2016
Konu: Kimya = Chemistry

Özet:
Bu çalışmada isoindol, pirazol, oksazol ve kalkon birimi içeren yeni hibrit bileşiklerin sentezi amaçlandı. Bunun için önce siklopentadien'e maleik anhidrit katılarak anhidrit türevi (3) elde edildi. Anhidrit (3)'ün 4'-aminoasetofenon ile reaksiyonundan çıkış bileşiği olan (3aR,4S,7R,7aS)-2-(4-asetilfenil)-3a,4,7,7a-tetrahidro-1H-4,7-metano-isoindol-1,3(2H)-dion (5) bileşiği hazırlandı. Bileşik 5'e ilgili aldehit türevlerinin (6a-d) bazik ortamda katılmasıyla isoindol birimi içeren kalkon türevleri (7a-d) sentezlendi. Kalkon türevlerinin (6a-d) önce AcOH içerisinde hidrazinyum hidrat ile muamele edilmesiyle pirazol türevleri (8a-d), devamında pirazol türevlerine (8a-d) asetaldehit oksim katılarak hedef bileşikleri (9a-d) sentezlendi. Elde edilen bileşiklerin yapıları spektroskopik metotlar (NMR, IR) kullanılarak aydınlatıldı. Sentezlenen bileşiklerin (7a-d ve 8a-d) 2 Gram pozitif, 3 Gram negatif ve 1 mantar olmak üzere 6 farklı insan patojeni mikroorganizmaya karşı antimikrobiyal aktiviteleri incelendi. Ayrıca sentezlenen kalkon (7a-d) ve pirazol (8a-d) türevlerinin antikanser aktiviteleri C6 (fare beyin kanser) hücresine karşı test edildi. Bileşik 7c, 8b ve 8c bileşikleri yüksek aktivite gösterdi.

Abstract:
In this study, the synthesis of novel hybrid compounds containing isoindole, pyrazole, oxazole and chalcone units was aimed. For this, firstly, the anhydride derivative cyclopentadiene and maleic anhydride were firstly removed to obtain the anhydride derivative (3) was obtained by addition of maleic anhydride to cyclopentadiene. The starting compound, (3aR,4S,7R,7aS)-2-(4-Acetylphenyl) -3a, 4,7,7a-tetrahydro-1H-4,7-methanoisoindole-1,3-dicarboxylic anhydride (2H)-dione, (5) was synthesized from the react.on of anhydride 3 with 4-aminoacetophenonen. The chalcone derivatives (7a-d) containing the isoindole unit were synthesized by addition of the corresponding aldehyde derivatives (6a-d) to the 5 in basic medium. Then, the target compounds (8a-d) were synthesized by addition of hydrazinium hydrate to 7a-d in AcOH, and addition of acetaldehyde oxime to pyrazole derivatives (8a-d) gave the oxime derivatives (9a-d).  The structures of the obtained compounds were clarified using spectroscopic methods (NMR, IR). The antimicrobial activities of the synthesized compounds against 6 different human pathogen microorganisms; 2 Gram positive, 3 Gram negative and 1 fungus, were examined. In addition, the anticancer activities of the synthesized chalcone and pyrazole derivatives were tested against C6 (mouse brain cancer) cells. Compounds 7c, 8b and 8c showed high activity
Tokat ili bağlarında asma ur hastalığının (Agrobacterium spp.)  belirlenmesi ve tanılanması
Identification and determination grape crown gall di̇sease (Agrobacterium spp.)  i̇n vi̇neyard of  
Tokat province
Yazar: HACI DURAK
Danışman: PROF. DR. RÜSTEM CANGİ ; PROF. DR. YUSUF YANAR
Gaziosmanpaşa Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Bahçe Bitkileri Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2016
Konu: Ziraat = Agriculture
Dizin: Asma = Grapevine

Özet:
Bu çalışma ile, Tokat ili bağ alanlarında asma ur hastalığının belirlenmesi ve hastalık etmeni Agrobacterium spp.'nin tanılanması amaçlanmıştır. 2015 yılında Tokat ili Merkez, Erbaa, Zile, Niksar, Pazar ve Turhal ilçelerinde bulunan bağ alanları incelenmiş ve hastalıklı asmalardan ur örnekleri alınmıştır.  6 ilçede, 49 köydeki 238 bağda tarama yapılmış olup, iki dönemde toplam 297 adet ur örneği alınmıştır. Hastalıklı omcalardaki urlu dokulardan yapılan izolasyonlar sonucu toplam 150 adet bakteri elde edilmiştir. Elde edilen izolatlara klasik tanılama testleri (Gram Reaksiyon, Oksidaz, PDA+CaCO3 Besi Yerinde Asit Temizleme, %2 NaCl İçeren Besi Yerinde Gelişme, Demir Amonyum Sitrat Kullanımı) ve tanıyı destekleyici PCR (Polimeraz Zincir Reaksiyonu) analizi yapılmıştır. Yapılan testler sonucu, 150 izolattan 149 tanesi gram negatif, 141 tanesi oksidaz pozitif, 55 tanesi PDA+CaCO3 besi yerinde pozitif, 148 tanesi %2 NaCl içeren besi yerinde pozitif, 93 tanesi demir amonyum sitrat kullanımı testinde pozitif sonuç vermiştir. 120 adet izolat ile yapılan PCR çalışmasında ise, 43 izolat 224 bp büyüklüğünde bant oluşturarak Agrobacterium spp. olarak tanılanmıştır. 

Anahtar Kelimeler:  Vitis vinifera, Asma ur hastalığı, Agrobacterium spp., tanı, Narince üzüm çeşidi

Abstract:
Determination of grape crown gall disease in vineyard of Tokat province and identification of disease agent Agrobacterium spp. were aimed by this study. In 2015, vineyards in Central, Erbaa, Zile, Niksar, Pazar and Turhal districts of Tokat were surveyed and infected plant samples with crown gall were collected. Total of 238 vineyards in 49 villages in the 6 districts were surveyed and in two survey periods 297 gall samples were collected. 150 bacterial isolates were isolated from the galls samples. Classic bacteriological techniques (Gram reaction, oxidase, acid purification in PDA+CaCO3 medium, growth in medium including %2 NaCl, use of ferric ammonium citrate) and PCR (Polymerase Chain Reaction) were applied to isolates. Based on the results, 149 of 150 isolates were Gram negative, 141 isolates were oxidase positive, 55 isolates were positive in PDA+CaCO3 medium, 148 isolates were positive in medium including %2 NaCl, 93 isolates were positive in use of ferric ammonium citrate. 43 of 120 isolates were identification as Agrobacterium spp. by 224 bp in PCR

Keywords: Vitis vinifera, grape crown gall disease, Agrobacterium spp.,  identification, Narince grape cultivar