IL6 ve IL1B genlerindeki belirli varyantların otizmle ilişkisinin incelenmesi
Investigation the relationship between IL6 and IL1B genes variations with autism
Yazar: KÜBRA ÇİĞDEM PEKKOÇ
Danışman: DOÇ. DR. DOÇ. DR. HAKAN ULUCAN
İstanbul Üniversitesi / Sağlık Bilimleri Enstitüsü / Genetik Ana Bilim Dalı / Genetik Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2016
Konu: Genetik = Genetics ; Moleküler Tıp = Molecular Medicine ; Psikiyatri = Psychiatry
Dizin: Genetik = Genetics ; Genler = Genes ; Otizm spektrum bozukluğu = Autism spectrum disorder ; Polimorfizm-genetik = Polymorphism-genetic

Özet:
Otistik bozukluk, sosyal ve iletişimsel sorunları yaşamları boyunca süren çocukları ve
erişkinleri içine alan, özellikle erkeklerde (4:1) daha sık görülen yaygın nörogelişimsel
bir bozukluktur. Otizmin etiyolojisi tam olarak açıklığa kavuşturulamamıştır. Otizm ile
ilişkili olabilecek immün sistem gibi başka sistemlerin de varlığı söz konusudur.
Yapılan çalışmalar sitokin seviyesindeki değişimlerin otizmle ilişkili olabileceğini
göstermiş olup, IL6 ve IL1B genleri otizmle immünolojik yönden bağlantılı olabilecek
önemli sitokin genlerindendir.
Bu çalışmanın amacı; otizmli ve sağlıklı kontrollerin oluşturduğu çocukların perifer
kanından DNA eldesi ve Real-Time PCR yöntemiyle, ilgili sitokinleri kodlayan IL6 ve
IL1B genlerindeki SNP değişimine bakılarak literatürde daha önce bildirilmemiş olan
gen polimorfizmlerinin otizmle ilişkisinin ortaya konulmasıdır.
Yaptığımız çalışmada otizmle ilişkili olduğu düşünülen IL1B geni rs1143634
polimorfizmi için genotip oranları değerlendirildiğinde; otizmli hasta ve kontrol grubu
arasında anlamlı bir fark saptanmıştır (p<0,05). IL6 geni rs1800796 polimorfizmi için
genotip oranları değerlendirildiğinde, otizmli hasta grubu ve kontrol grubu arasında ise
anlamlı bir fark saptanmamıştır (p>0,05).
Çalışmamız, otizm ile sitokin kodlayan IL6 geni rs1800796 ve IL1B geni rs1143634
polimorfizmleri arasındaki ilişki konusunda bilinen ilk çalışma olup IL1B genindeki
polimorfizmin otizmdeki ilişkisini göstermiş olduk. Bu çalışma Türk toplumunda
yapılmış olup yüksek etnik çeşitlilik gösteren toplumumuzda çalışmanın daha farklı
etnik gruplarda ve daha fazla bireyde yapılması IL6 geni rs1800796 varyantıyla otizm
arasındaki olası bir ilişkiyi de gösterebilir. Bu iki sitokinde ve diğer sitokinlerde
incelenecek diğer gen varyantlarıyla otizm arasındaki başka bilinmeyen ilişkiler de
ortaya konabilir. Diğer genetik ve epigenetik faktörlerin etkisini inceleyen çalışmalar
hastalığın olası mekanizmalarını daha detaylı anlamamızı sağlayacaktır

Abstract:
Autistic disorder contains children and adults who have social and communicational
problems throughout their life and is a widespread neuro-developmental disorder which
is mostly seen among men (4:1). Ethiology of autism is not clarified yet. Presence of
other systems such as the immune system is a subject that could be related to autism.
Research has showed that variations in the level of cytokines may be related to autism
and IL6 and IL1B genes are also important cytokine genes that may be related to autism
in an immunological way.
In the purpose of our research will be accomplished autistic children and healthy
control group will be selected and from their DNA isolation from peripheral blood and
fluorescent method with Real-Time PCR device applied and formerly established SNP
(Single Nucleotide Polymorphism)'s analysis achieved by revealing the unreported
literature of the relationship between gene polymorphism and autism
In our study we found statistical difference between autism patients and control group
when we evaluated genotype rates for IL1B rs1143634 polymorphism which is related
to autism (p<0,05). However, there was no significant difference between autism patient
and control group when genotype rates were evaluated for IL6 gene (rs1800796)
polymorphism (p>0,05).
Our study is the first to show the relationship between autism and IL6 gene rs1800796
and IL1B gene rs1143634 polymorphisms. This study is conducted in Turkish
population therefore studying in a population that shows high ethnic diversity and by
studying with more different ethnic groups and more people may show the possible
association between IL6 gene rs1800796 variant and autism. Other unknown relations
between gene variants and autism can be found by examining the other gene variants in
these two cytokines and different cytokines. Studies that investigate the impact of
genetic and epigenetic factors will provide us knowledge understand the probable
mechanisms of the disorder.