COVID-19 şüphesi olan hastalarda SARS-COV-2 hızlı antijen testinin çalışılması ve sonuçların SARS-COV-2 PCR test sonuçları ile karşılaştırılması
The study of the SARS-COV-2 rapid antigen test in patients with suspected COVID-19 and the comparison of the results with the results of the SARS-COV-2 PCR test
Yazar: MUHAMMET ÇAĞRI YILDIZ
Danışman: PROF. DR. HARUN AĞCA
Bursa Uludağ Üniversitesi / Tıp Fakültesi / Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
Derece: Tıpta Uzmanlık, 2023
Konu: Mikrobiyoloji = Microbiology
Dizin: COVID 19 = COVID 19 ; Polimeraz zincirleme reaksiyonu = Polymerase chain reaction ; SARS virüsü = SARS virus ; Teşhis testleri = Diagnostic tests

Özet:
Bu çalışma, Türkiye Cumhuriyeti Sağlık Bakanlığı olası COVID-19 
vaka sorgulama kılavuzuna göre; kombine nazofaringeal/orofaringeal sürüntü 
örneklerinde RT-PCR ile hızlı antijen test sonuçlarının karşılaştırılması 
amacıyla yapıldı.
Çalışmada, 28 Ekim 2021-14 Kasım 2021 tarihleri arasında, Bursa 
Uludağ Üniveristesi Sağlık Uygulama ve Araştırma Merkezi Acil Pandemi 
Polikliniğine, SARS-CoV-2 RT-PCR testi (Biospeedy, Bioeksen, İstanbul, 
Turkiye) yaptırmak için başvurmuş olan 200 hastadan kombine 
nazofaringeal/orofaringeal (kombine burun boğaz sürüntüsü) sürüntü örnekleri
alındı. Semptomları bir haftadan kısa sürenler çalışmaya dahil edildi. Bursa 
Uludağ Üniversitesi Sağlık Uygulama ve Araştırma Merkezi Tıbbi Mikrobiyoloji 
Anabilim dalı içindeki PCR laboratuvarında Mö-screen korona antijen testleri
(möLab, QIAGEN, Almanya) çalışıldı ve SARS-CoV-2 RT-PCR testi Ct değeri 
(döngü eşiği) ile hızlı antijen test sonuçları arasındaki uyum karşılaştırıldı. Hızlı 
antijen test sonuçları pozitif ya da negatif olarak kaydedildi. Pozitif sonuçlar,
test bandındaki renk yoğunluğuna göre güçlü, orta, zayıf olarak tecrübeli, tek 
kişi tarafından değerlendirildi. İki yüz katılımcının seksen tanesinin her iki testi
pozitifti. Yüz yirmisinin negatifti. Duyarlılık (80/80) ve özgüllük (120/120) %100 
olarak bulundu. Zayıf pozitif olarak değerlendirilen 19 sonucun Ct değer aralığı 
18,9-30,37, orta pozitif olarak değerlendirilen 38 sonucun Ct değer aralığı 
16,56-28,48, güçlü pozitif olarak değerlendirilen 23 sonucun Ct değer aralığı 
14,03-23,66 olarak bulundu. Ct değerleriyle hızlı antijen testinin pozitifliği 
arasında, istatistiksel olarak anlamlı, ters bir korelasyon bulundu (r değeri -
0,706, p < 0,001).
Sonuç olarak SARS-CoV-2 PCR testi ile Mö-screen korona antijen 
testinin uyumunun yüksek olması nedeniyle; okullar, bakım evleri gibi kalabalık 
alanlarda, NAAT'ların kısıtlı olduğu veya bulunmadığı yerlerde Mö-screen 
korona antijen testi kullanımının uygun olduğu değerlendirildi.

Abstract:
This study was conducted in accordance with the possible COVID-19 
case investigation guidelines of the Ministry of Health of the Republic of 
Turkey; in order to compare the rapid antigen test results with RT-PCR in 
combined nasopharyngeal/oropharyngeal swab samples.
In the study, combined nasopharyngeal/oropharyngeal swab samples 
were obtained from 200 patients who applied to Bursa Uludağ University 
Health Application and Research Center Emergency Pandemic Outpatient 
Clinic between October 28, 2021 and November 14, 2021 for the SARS-CoV2 RT-PCR test (Biospeedy, Bioeksen, Istanbul, Turkey). Whose symptoms 
lasted less than a week were included in the study. Bursa Uludağ University 
Health Application and Research Center, Medical Microbiology PCR 
laboratory performed Mo-screen Corona antigen tests (moLab, QIAGEN, 
Germany) and SARS-CoV-2 RT-PCR test and the Ct values (cycle threshold) 
were determined. Antigen test results were compared with RT-PCR. Rapid 
antigen test results were recorded as positive or negative. The positive results 
were evaluated by a single experienced person as strong, medium and weak 
according to the color intensity in the test band. Eighty of the two hundred 
participants had both tests positive. One hundred and twenty of them were 
negative in both tests. Sensitivity (80/80) and specificity (120/120) were found 
to be 100%. The Ct value range of 19 results evaluated as weakly positive was 
18,9-30,37, the Ct value range of 38 results evaluated as moderately positive 
was 16,56-28,48, and the Ct value range of 23 results considered as high 
positive was 14,03-23,66. A statistically significant inverse correlation was 
found between Ct values and the positive intensity of the rapid antigen test (r 
value -0,706, p < 0,001).
In conclusion, due to the high compatibility of the SARS-CoV-2 PCR 
test and the Mö-screen corona antigen test, Mö-screen corona antigen test is 
usable in crowded areas such as schools, and nursing homes, and where 
NAAT tests are limited or unavailable.