ESBL(genişlemiş spektrumlu beta-laktamaz) üreten enterik bakterilerde fosfomisin duyarlılığının araştırılması
Investigation of phosphomycin susceptibility in enteric bacteriaproducing ESBL (extended spectrum beta-lactamases)
Yazar: GİZEM SOYDAN
Danışman: PROF. DR. CANDAN ÖZTÜRK
Mersin Üniversitesi / Tıp Fakültesi / Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
Derece: Tıpta Uzmanlık, 2020
Konu: Mikrobiyoloji = Microbiology
Dizin: Bakteriler = Bacteria ; Beta laktamazlar = Beta lactamases ; Enterobacteriaceae = Enterobacteriaceae ; Fosfomisin = Fosfomycin ; Mikrobiyal duyarlılık testleri = Microbial sensitivity tests

Özet:
Son yıllarda klasik antibiyotiklere direnç geliştiren bakterilerin artması
nedeniyle, fosfomisin; yeniden önem kazanan antibiyotikler arasına girmiştir.
Fosfomisin birçok bakteri üzerine bakterisidal etkinliği olan bir moleküldür. GSBL
üreten bakteriler, özellikle nozokomiyal infeksiyonlarda sık izole edilen
patojenlerdir ve tedavilerinde sıklıkla dirençle karşılaşılmaktadır. Fosfomisinin
etki spektrumu içerisinde bu bakterilerin de bulunması nedeniyle, tedavide bir
alternatif olarak görülmektedir. Fosfomisinin yeniden kullanıma girmesiyle,
fosfomisin için güvenilir ve tekrarlanabilir sonuçların alındığı duyarlılık test
yöntemleri oluşturmak önemlidir. Bu çalışmada, GSBL üreten enterik bakterilerin
fosfomisine olan duyarlılıklarının tespitinde; disk difüzyon, agar dilüsyon ve
otomatize Microscan yöntemlerinin kullanılabilirliklerinin belirlenmesi amaçlandı.
Çalışmaya Mayıs 2019- Kasım 2019 tarihleri arasında Mersin Üniversitesi Tıp
Fakültesi Hastanesi Tıbbi Mikrobiyoloji laboratuvarına gönderilen örneklerde
üreyen, GSBL enzimi üreten 120 Enterobacterales (89 E. coli ve 31
K.pneumoniae) suşu dâhil edildi. Agar dilüsyon yöntemi ile; E.coli izolatlarından
4'ü, K.pneumoniae izolatlarından da 7'si fosfomisine dirençli olarak
kaydedilmiştir.Çalışmada, disk difüzyon ve Microscan metotlarının referans
yönteme göre kategorik uyum, büyük ve küçük hata oranları hesaplandı. Disk
difüzyon ve Microscan yöntemlerinin E.coli suşları açısından referans yöntem ile
kategorik uyumu yüksek ve hata oranları düşük bulundu. Sonuçta; E. Coli için
fosfomisin direncinin tespitinde referans yöntem olan ağar dilüsyon yöntemi ile
Microscan ve disk difüzyon yöntemi arasında büyük oranda uyum olduğu, agar
dilüsyon yöntemine göre maliyet ve işgücü açısından kullanım kolaylığı sağlayan
disk difüzyon yöteminin güvenilir bir yöntem olarak kullanılabileceği görüldü.
K.pneumoniae türlerinde ise agar dilüsyonun halen altın standart olduğu, ancak
bu imkanı olmayan laboratuvarlarda Microscan otomatize sistem kullanılabilirse
de, sonuçların dikkatli yorumlanması gerektiği sonucuna ulaşıldı.

Abstract:
In recent years, because of the increase in bacteria developing resistance to
classical antibiotics, phosphomycin; has become one of the most important
antibiotics. It is a broad spectrum molecule active on many bacteria, including
multi-drug resistant Gram-negative bacteria. Enteric bacteria producing ESBL are
frequently isolated pathogens, especially in nosocomial infections, and resistance
is often encountered in their treatment. The presence of these bacteria in the
spectrum of action of phosphomycin has enabled it to be used as an alternative
to treatment. Because of the re-use of phosphomycin, it is important to establish
susceptibility testing methods for phosphomycin with reliable, and reproducible
results. In this study, in determining the sensitivity of ESBL producing enteric
bacteria to fosfomycin; It was aimed to determine the usability of disk diffusion,
agar dilution and automated Microscan methods. 120 Enterobacterales (89 E.
coli and 31 K. pneumoniae) strains that reproduced in the samples sent to Mersin
University Hospital Medical Microbiology laboratory between May 2019 and
November 2019 were produced. By agar dilution method; 4 of E.coli isolates and
7 of K.pneumoniae isolates were recorded as resistant to fosfomycin. In the
study, categorical fit, major and minor error rates were calculated according to
the reference method of disc diffusion and Microscan methods. In terms of E.coli
strains of disc diffusion and Microscan methods, the categorical compatibility with
the reference method was high and the error rates were low. After all; For E. Coli,
it was observed that there was a great agreement between the agar dilution
method and Microscan and disc diffusion method, which is the reference method
in determining the phosphomycin resistance, and the disk diffusion method,
which provides ease of use in terms of cost and labor, can be used as a reliable
method.It was seen that the method can be used as a reliable method. In
K.pneumoniae species, it was concluded that although the agar dilution is still the
gold standard but Microscan automated system can be used in laboratories
without this possibility, the results should be interpreted with caution.