Ankilozan spondilit'te mikroRNA ekspresyonu ve etklili epigenetik mekanizmaların incelenmesi
MicroRNA expression and epigenetic mechanisms in anklyosing spondilitis
Yazar: AYBERK TÜRKYILMAZ
Danışman: PROF. DR. PINAR ATA
Marmara Üniversitesi / Tıp Fakültesi / Tıbbi Genetik Ana Bilim Dalı
Derece: Tıpta Uzmanlık, 2018
Konu: Moleküler Tıp = Molecular Medicine
Dizin: Epigenez-genetik = Epigenesis-genetic ; Gen ifadesi = Gene expression ; Mikro RNA = Micro RNA ; RNA = RNA ; Spondilit-ankilozan = Spondylitis-ankylosing ; Tedavi = Treatment

Özet:
Amaç: AS tanılı hastalar ile sağlıklı kontrollerde, periferik kan mononükleer hücrelerinde T ve B hücre farklılaşması/uyarımı ile ilişkili mikro RNA'ların ekspresyon düzeylerini belirleyerek hastalık etyolojisi ile ilişkisinin açıklanmasını, hastalık tanısında biyobelirteç ve tedavide hedef molekül olma potansiyelinin saptanmasını amaçladık. 
Gereç ve Yöntem: Çalışmaya AS tanılı 50 hasta ile 50 sağlıklı gönüllü dahil edildi. Dahil edilme ve dışlanma kriterleri göz önünde bulundurulduktan sonra, hastaların periferik kan mononükleer hücreleri ayrıştırılarak RNA izolasyonu, cDNA sentezi ve kantitaif real-time PCR yöntemi ile ekspresyon analizi gerçekleştirildi. Hastaların klinik bulguları, hastalık aktivitesi düzeyleri uygun laboratuvar ve ölçüm parametreleri ile kaydedildi. 
Bulgular:  T ve B hücre farklılaşması/uyarımı ile ilişkili mikro RNA'ların hasta ve sağlıklı kontrol grubunda çalışılması sonrası miR-142-5p ve miR-143'ün ekspresyon düzeyinin iki grup arasında anlamlı farklılık gösterdiği saptandı (p<0.05). Anlamlı farklılık bulunan miRNA'ların ekspresyon düzeyi; hastalık aktivitesini gösteren BASDAI, BASMI, BASFI skorlamaları, ESH düzeyi, HLA-B27 durumu, ekstraspinal bulgu varlığı ve semptom süresi ile istatistiksel olarak anlamlı bir korelasyon bulunamadı. Yüksek CRP seviyeleri olan hastalarda miR-143 ekspresyon düzeyi anlamlı olarak daha yüksek bulundu (p<0.05).
Sonuç: Güncel literatürde AS ile ilgili miRNA ekspresyon çalışmaları sınırlı olmakla birlikte benzer etyolojiyi paylaşan, otoimmün ve inflamatuar süreçlerin ön planda sorumlu olduğu hastalıklarda miR-142-5p ve miR-143'ün  etyolojide önemli rol alabileceği belirilmiştir. Çalışmamızda ekspresyon düzey farklılıkları anlamlı bulunan miR-142-5p ve miR-143'ün etiyolojide etkili ve özellikle miR-142-5p'nin tanısal biyobelirteç ve hedef tedavi molekülü olabileceği düşünülmüştür.  Hedef genlerin mRNA ekspresyon analizleri ve hücre kültürü çalışmalarıyla araştırılması durumunda anti-miR moleküller tedavi seçeneği olabileceklerdir. 

Anahtar Sözcükler: mikroRNA, ankilozan spondilit, epigenetik, anti-miR tedavi

Abstract:
Objective: We aimed to determine the expression levels of micro RNAs associated with T and B cell differentiation / stimulation in peripheral blood mononuclear cells and their relationship with the etiology of the disease in ankylosing spondylitis patients and healty controls. So the potential to be a biomarker and a target molecule for diagnosis of the disease and in the treatment respectively.
Material and methods: Fifty patients with AS and 50 healthy controls were included in the study. After considering the inclusion and exclusion criteria, first, peripheral blood mononuclear cells were isolated and RNA isolation, cDNA synthesis and quantitative real-time PCR expression analysis were performed. Then clinical findings and levels of disease activity were recorded using appropriate laboratory and measurement parameters.
Results: At the patient and healthy control group, after detection of micro-RNAs associated with T and B cell differentiation / stimulation, the expression level of miR-142-5p and miR-143 was found significantly different (p<0.05). When compared to BASDAI, BASMI, BASFI scores, ESR level, HLA-B27 status, extraspinal signs and symptom duration, the level of expression of miRNAs was not statistically correlated. The expression of miR-143 was significantly higher in patients with high CRP levels (p<0.05).
Conclusion: At the current literature although there is limited data about miRNA expression associated to AS itself, miR-142-5p and miR-143 expressions were found important for the diseases sharing similar etiology with it. We think that miR-142-5p and miR-143 may play a role in the etiology of disease, especially miR-142-5p may be a diagnostic biomarker and a target molecule for the treatment. It might be an opportunity for the treatment if further researches using  mRNA expression assays and cell culture analysis could be done. 

Key words: microRNA, ankylosing spondylitis, epigenetics, anti-miR treatment