Akciğer kanserli hastalarda siklin D1 (CCND1)gen polimorfiziminin araştırılması
Investigation of cyclin D1 (CCND1) gene polymorphism in patients with lung cancers
Yazar: SUAT ÇAKINA
Danışman: YRD. DOÇ. DR. TEVFİK GÜLYAŞAR
Trakya Üniversitesi / Sağlık Bilimleri Enstitüsü / Biyofizik Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2009
Konu: Biyofizik = Biophysics
Dizin: Akciğer = Lung ; Polimorfizm-genetik = Polymorphism-genetic

Özet:
Amaç: Bu çalışma akciğer kanseri teşhisi konmuş hastalarda Siklin D1(CCND1) gen polimorfizimini araştırmak ve bu polimorfizimin akciğer kanserinin gelişimindeki rolünü belirleyerek erken teşhis ve tedaviye kliniksel katkı sağlayabilmek amacıyla planlandı.Gereç ve yöntem: Sağlıklı 58 bireyden oluşan kontrol grubundan ve Trakya Üniversitesi Tıp Fakültesi Onkoloji polikliniğine başvuran akciğer kanseri teşhisi konulan radyoterapi ve kemoterapi tedavisi görmemiş 75 hastadan alınan kan örneklerinden Vivantis DNA izolasyon kiti ile DNA'ları elde edildi. Elde edilen DNA' lardan CCND1 geninin 4. eksonundaki A870G gen polimorfizimini içeren bölge özgün primerlerle PZR ( polimeraz zincir reaksiyonu) metoduyla çoğaltıldı. Daha sonra PZR ürünleri MspI restriksiyon enzimi ile kesildi, %.2,5' luk agaroz jel ile elektroforez cihazında yürütülüp ultraviyole (UV) ışığı altında incelendi.Bulgular: Hasta grubundaki A870G genotip dağılımı (AA = 33.3%, AG = 49.3% ve GG = 17.4% ) kontrol grubu ile karşılaştırıldığında (AA =25.9%, AG= 53.4% ve GG = 20.7%) istatistiksel olarak anlamlı bir fark görülmemiştir (p>0.05). Hasta grubu içersinde AA+AG/GG genotipi ile metastaz (M) durumuna göre incelendiğinde M0 (metastaz yok; AA+AG= 74.4%, GG= 25.6%) ve M1(metastaz var; AA+AG= 91.7%, GG=8,3%) arasında anlamlı istatistiksel biri ilişki görüldü (p<0.05)Sonuç: Çalışmamızdaki bulgular istatistiksel olarak (?2) değerlendirildiğinde metastazın gelişimine A alelinin G aleline karşılık daha fazla katkı yaptığı saptanmıştır (p<0,05). Bu durum hastalığın M0 ve M1 evrelerinde A alelinin artmasıyla paralellik gösterir.Anahtar Kelimeler: akciğer kanseri, siklin d1, polimorfizm

Abstract:
Objectices: In this study, we aimed to investigate the CCND1 gene polymorphism in lung cancer patients, and this polymorphism that is determined a role of lung cancer develop may contributes to early diagnosis and treatment.Material and methods:Consisting of 58 healthy individuals from the control group and Trakya University Faculty of Medicine Oncology clinics applied to diagnose 75 lung cancer patients. None of the lung cancer patients had received radiation and or chemotherapy.DNA was extracted from whole blood samples of study groups by Vivantis blood DNA kits. The CCND1 G/A polymorphism at nucleotide 870, codon242 in exon 4, was detected with the polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism (PCR-RFLP). After PCR product were digested with the restriction enzyme MspI. The restriction digest products were analyzed through electrophoresis on 2.5% agarose gel by UV.Results:We did not find significant gene frequency of A870G between the patients (AA = 33.3%, AG = 49.3% ve GG = 17.4% ) and the controls (AA =25.9%, AG= 53.4% ve GG = 20.7%) (p>0.05). In the patients groups, we find significant gene frequency of AA+AG/GG between MO (metastas (-) ; AA+AG= 74.4%, GG= 25.6%) and M1 ( metastas (+); AA+AG= 91.7%, GG=8,3%) (p<0.05).Conclusion:Working as our statistical findings (?2) is evaluating the development of metastases contribute to the A allel than G allel (p<0.05). Stages of the illness in this case, M0 and M1 indicates a parallel increase in A allel.Key words: lung cancer, cyclin d1, polymorphism