Akut pankreatit hastalarında malat1 ve H19'un hastalığın tanısını ve şiddetini belirlemede etkinliklerinin değerlendirilmesi
Evaluation of the effectiveness of malat1 and H19 indetermining the diagnosis and severity of the disease inpatients with acute pancreatitis
Yazar: HAFİZE TUĞBA KARAHAN
Danışman: PROF. DR. ALPASLAN TANOĞLU ; DOÇ. DR. ESRA GÜZEL TANOĞLU
Sağlık Bilimleri Üniversitesi / Hamidiye Uluslararası Tıp Fakültesi / İç Hastalıkları Ana Bilim Dalı / İç Hastalıkları Bilim Dalı
Derece: Tıpta Uzmanlık, 2023
Konu: Gastroenteroloji = Gastroenterology ; Moleküler Tıp = Molecular Medicine ; İç Hastalıkları = Internal diseases
Dizin: Moleküler genetik = Molecular genetic ; RNA = RNA

Özet:
AMAÇ: Akut pankreatit, karın ağrısına yüksek serum amilaz ve lipaz düzeylerinin eşlik ettiği inflamatuvar bir hastalıktır. Dünya genelinde hastaneye yatış gerektiren en yaygın gastrointestinal hastalıklardan biridir ve insidansı giderek artmaktadır. Çalışmamızda akut pankreatit progresyonundaki süreçlerde rol oynadığı düşünülen MALAT1 ve H19'un hastalığın tanısını ve şiddetini belirlemede aday biyobelirteç olarak kullanıp kullanılmayacağını araştırmayı amaçladık.
GEREÇ VE YÖNTEM: Çalışmamıza 01.09.2022 ile 01.06.2023 tarihleri arasında Sağlık Bilimleri Üniversitesi Şehit Prof. Dr. İlhan Varank Eğitim ve Araştırma Hastanesi İç Hastalıkları polikliniğine başvuran sağlıklı gönüllüler ve İç Hastalıkları servisinde akut pankreatit tanısı ile yatırılıp tedavi edilen hastalar dahil edilmiş olup, çalışmamız prospektif klinik çalışmadır. Çalışmaya dahil edilen hastaların amilaz (U/L), lipaz (U/L), glukoz (mg/dL), total kolesterol (mg/dL), LDL-K (mg/dL), trigliserit (mg/dL), üre (mg/dL), kreatinin (mg/dL), sodyum (mEq/L), potasyum (mEq/L), hemoglobin (g/dL), hematokrit (%), lenfosit (103/UL), trombosit (103/UL), nötrofil (103/UL), lökosit (103/UL), nötrofil/lenfosit oranı, CRP (mg/L), albumin (g/dL), CRP/albumin oranı, platelet/lenfosit oranı, PCT(Prokalsitonin) (μg/L), AST (U/L), ALT (U/L), LDH (U/L) değerleri dahil edildi. Alınan numunelerden 24 saat içinde RNA izolasyonu yapıldı. Ardından cDNA sentezi ve kantitatif real time PZR ölçümü yapılarak sağlıklı ve hasta gruplarında MALAT1 ve H19'un ekspresyon düzeyleri tespit edildi. Kullanılan laboratuvar parametreleri; hastaların servis takibi esnasında gönderilen tetkiklerden arta kalan serumlardan elde edildi. Verilerin istatistiksel açıdan anlamlılık düzeyi p<0,05 olarak kabul edildi. Verilerin değerlendirilmesinde IBM SPSS 21 ve MedCalc istatistik paket programı kullanılmıştır.
BULGULAR: Çalışmamıza 87 hasta ve 87 sağlıklı gönüllü dahil edildi. Katılımcıların %42,5'i kadın iken %57,5'i erkekti. Hastaların yaş ortalaması 48,4±15 ve ortalama yatış süresi 8,9±6,6 gündü. Katılımcıların tamamında karın ağrısı olup; %98,9'unda görüntüleme yöntemi olarak bilgisayarlı tomografi (BT) kullanılmıştı ve %59,7'sinde etiyoloji idiyopatikti. Hastaların Ranson yatış skoruna göre %87,4'ü hafif şiddetliydi, BISAP skoruna göre %97,7'si hafif şiddetliydi. Hasta grupta CAO ve NLO'nun Ranson yatış skoru, Ranson 48.saat skoru ve BISAP skoruyla ilişkisi incelendiğinde anlamlı ilişki saptandı (p<0,05). Ranson skoru ve BISAP skoru yüksek olan hastalarda CAO ve NLO düzeyi yüksek gözlendi. Hasta ve sağlıklı grup arasında H19 düzeyinde anlamlı farklılık saptanmaz iken (p>0,05), MALAT1'in ifade düzeyinde hastalarda sağlıklı gruba göre anlamlı oranda artış olduğu saptandı (p<0,05). Hasta grupta MALAT1'in ekspresyonu yüksek saptandı. Hasta grupta H19 ve MALAT1 ekspresyon düzeyi ile CRP, PCT, WBC, NLO, PLO, CAO, laktat, BMI, RANSON Yatış Skoru, RANSON 48.Saat Skoru, BISAP Skoru ve yatış süresi arasında anlamlı bir ilişki saptanmadı (p>0,05). Hastalarda akut pankreatit etiyolojisine göre H19 ve MALAT1 ekspresyon düzeyinde ortalama fark anlamlı saptanmadı (p>0,05). Hastalarda gelişen semptomlara göre H19 ve MALAT1 ekspresyon düzeyinde ortalama fark anlamlı saptanmadı (p>0,05). Hastalarda H19 ekspresyon düzeyi ortalamasının antibiyotik ihtiyacı gelişme durumuna göre anlamlı fark saptanmadı (p>0,05). Benzer şekilde hastalarda MALAT1 ölçüm değeri ortalamasının antibiyotik ihtiyacı gelişme durumuna göre anlamlı fark saptanmadı (p>0,05). YBÜ yatış ihtiyacı gelişen hastalarda H19 ekspresyon düzeyinde YBÜ yatış ihtiyacı gelişmeyen hastalara göre anlamlı fark saptandı (p<0,05). YBÜ yatış ihtiyacı gelişen hastalarda MALAT1 ekspresyon düzeyinde, YBÜ yatış ihtiyacı gelişmeyen hastalara göre anlamlı fark saptanmadı (p>0,05).
SONUÇ: Bu çalışmada akut pankreatit hastalığının progresyonundaki süreçlerde rol oynadığı düşünülen lncRNA'lardan MALAT1'in hastalarda sağlıklı gruba göre anlamlı oranda arttığı ve hastalığın tanısını belirlemede aday biyobelirteç olarak kullanılabileceği, H19'un hasta ve sağlıklı grup arasında anlamlı ekspresyon değişimine uğramadığı tespit edildi. Hastalığın şiddetinin belirlenmesinde ise iki grup arasında MALAT1 ve H19'un anlamlı değişime uğramadığı tespit edildi.
Anahtar Kelimeler: Akut pankreatit, uzun kodlamayan RNA, MALAT1, H19, RealTime PZR

Abstract:
OBJECTIVE: Acute pancreatitis is an inflammatory disease accompanied by abdominal pain and high serum amylase and lipase levels. It is one of the most common gastrointestinal diseases requiring hospitalization worldwide and its incidence is increasing. In our study, we aimed to investigate whether MALAT1 and H19, which are thought to play a role in the progression of acute pancreatitis, can be used as candidate biomarkers in determining the diagnosis and severity of the disease.
MATERIALS AND METHODS: Our study was conducted between 01.09.2022 and 01.06.2023 by Health Sciences University Martyr Prof. Dr. Healthy volunteers who applied to the Internal Medicine outpatient clinic of İlhan Varank Training and Research Hospital and patients who were hospitalized and treated with a diagnosis of acute pancreatitis in the Internal Medicine service were included, and our study is a prospective clinical study. Amylase (U/L), lipase (U/L), glucose (mg/dL), total cholesterol (mg/dL), LDL-C (mg/dL), triglyceride (mg/dL), urea of the patients included in the study (mg/dL), creatinine (mg/dL), sodium (mEq/L), potassium (mEq/L), hemoglobin (g/dL), hematocrit (%), lymphocyte (103/UL), platelet (103/ UL), neutrophil (103/UL), leukocyte (103/UL), neutrophil/lymphocyte ratio, CRP (mg/L), albumin (g/dL), CRP/albumin ratio, platelet/lymphocyte ratio, AST (U/ L), ALT (U/L), LDH (U/L) values were included. RNA was isolated from the samples taken within 24 hours. Then, cDNA synthesis and quantitative real-time PCR measurement were performed to determine the expression levels of MALAT1 and H19 in healthy and patient groups. Laboratory parameters used; It was obtained from the serum left over from the tests sent during the follow-up of the patients. The statistical significance level of the data was accepted as p<0.05. IBM SPSS 21 and MedCalc statistical package program were used to evaluate the data.
RESULTS: 87 patients and 87 healthy volunteers were included in our study. While 42.5% of the participants were women, 57.5% were men. The average age of the patients was 48.4±15 years and the average length of stay was 8.9±6.6 days. All participants had abdominal pain; Computed tomography (CT) was used as the imaging method in 98.9%, and the etiology was idiopathic in 59.7%. 87.4% of the patients were mildly severe according to the Ranson hospitalization score, and 97.7% were mildly severe according to the BISAP score. When the relationship between CAO and NLR and Ranson admission score, Ranson 48th hour score and BISAP score was examined in the patient group, a significant relationship was detected (p<0.05). High CAO and NLR levels were observed in patients with high Ranson score and BISAP score. While no significant difference was detected in the H19 level between the patient and healthy groups (p>0.05), a significant increase in the expression level of MALAT1 was found in the patients compared to the healthy group (p<0.05). Expression of MALAT1 was detected to be high in the patient group. In the patient group, no significant relationship was detected between H19 and MALAT1 expression levels and CRP, PCT, WBC, NLO, PLO, CAO, lactate, BMI, RANSON Hospitalization Score, RANSON 48th Hour Score, BISAP Score and length of stay (p>0.05). The average difference in H19 and MALAT1 expression levels in patients according to the etiology of acute pancreatitis was not found to be significant (p>0.05). There was no significant difference in the expression level of H19 and MALAT1 according to the symptoms developed in the patients (p>0.05). No significant difference was detected in the average H19 expression level in the patients according to the development of antibiotic need (p>0.05). Similarly, no significant difference was detected in the average MALAT1 measurement value in patients according to the development of antibiotic need (p>0.05). A significant difference was detected in the H19 expression level in patients who required ICU admission compared to patients who did not require ICU admission (p<0.05). No significant difference was detected in the MALAT1 expression level in patients who required ICU admission compared to patients who did not require ICU admission (p>0.05).
CONCLUSION: In this study, it was determined that MALAT1, one of the lncRNAs thought to play a role in the progression of acute pancreatitis, increased significantly in patients compared to the healthy group and could be used as a candidate biomarker in determining the diagnosis of the disease. H19 did not undergo a significant expression change between the patient and the healthy group. It was determined that MALAT1 and H19 did not change significantly between the two groups in determining the severity of the disease.
Keywords: Acute pancreatitis, long non-coding RNA, MALAT1, H19, Real Time PCR