hakansabunis/tr-academic-research-agent-index huggingface dataset:
Amomyum iyon seçici elektrot geliştirilmesi
Amomium ion selective electrode development
Yazar: ERDEM KARATAŞ
Danışman: PROF. DR. İBRAHİM YILMAZ
Karamanoğlu Mehmetbey Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Kimya Ana Bilim Dalı / Analitik Kimya Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2018
Konu: Kimya = Chemistry

Özet:
Bu çalışmada, yapılarında indazol grubu bulunan tripodal reseptör sentezlenerek karakterize edilmiştir. Karakterizasyon işlemlerinde 1H NMR, IR, elementel analiz gibi enstrümental yöntemler kullanılmıştır. Daha sonra, bu iyonoforlar kullanılarak amonyum iyon-seçici PVC membran elektrot geliştirilmiştir. Geliştirilen elektrotun, ömrü, cevap süresi, optimum çalışma aralığı, tayin sınırı, seçicilik katsayısı, çalışılabilir pH aralığı gibi bazı karakteristik özellikleri belirlenmiştir. Elektrotların amonyum iyonuna seçicilik gösterdiği ve eğimin 58.43  0.27 mV/pNH4 olduğu bulunmuştur. Elektrotların çalışma aralığı 1.0x10-1-3.9x10-5 M olarak bulunmuştur. Elektrotların cevap süresi yaklaşık 15 saniye ve ömürlerinin 2 aydan fazla olduğu belirlenmiştir. 

Hazırlanan elektrotların farklı iyonlara karşı seçicilikleri sabit bozucu yöntemi ve ayrı çözelti yöntemi ile tayin edilmiştir. Elektrodların gerçek bir numunenin analizinde kullanılabilirliği araştırılmış ve idrar ve kan gibi gerçek numunelere uygulanarak doğruluğu standart ekleme yöntemi ile kanıtlanmıştır.

Abstract:
In this study, a tripodal receptor containing indazole group was synthesized and characterized. In the characterization of the receptor, IR, 1H NMR spectral techniques and elemental analysis were used. After characterization, ammonium ion selelctive PVC membrane electrode was developed by using synthesized compound. The life time, response time, linear range, detection limit, selectivity coefficient and suitable pH range of the electrode were detemined. Membrane electrode synthesized during the course of this work exhibited high selectivity towards Ammonium ion over a wide variety of other cations and yielded nernstian slope of 58.43  0.27 mV/pNH4. The lineer range of the electrodes were found to be in 1.0x10-1-3.9x10-5 M. The response time of the electrodes were determined as 15 seconds and life time of the electrodes more than 2 months. Selectivity coefficients of the electrodes were calculated by using seperate solution method and fixed interference method. 

The applicability of the electrodes to real samples that contain ammonium were tested. For this reason, the electrodes were successfully applied for the determination of ammonium in urine and blood samples and accuracy of the proposed electrodes were conﬁrmed by standart addition method and results were evaluated statistically.
Bazı bitki türlerinin soğan sak nematodu (Ditylenchus dipsaci) soğan ırkına konukçuluk durumlarının belirlenmesi
Determination of hosting ability of some plant species to stem and bulb nematode (Ditylenchus dipsaci) onion race
Yazar: GAMZE ÇALIŞ
Danışman: DR. ÖĞR. ÜYESİ ELİF YAVUZASLANOĞLU
Karamanoğlu Mehmetbey Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Biyomühendislik Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2018
Konu: Biyomühendislik = Bioengineering ; Parazitoloji = Parasitology

Özet:
Soğan, günlük diyette sıkça tüketilir ve dünya da en çok yetiştirilen sebzeler arasında
üçüncü sırada yer alır. Türkiye'de geniş bir üretim alanına sahiptir. Soğan
yetiştiriciliğinde önemli oranda verim kaybına neden olan ve soğan sak nematodu
olarak adlandırılan Ditylenchus dipsaci (Kühn), karantinaya tabi olan ve soğan
dışında 500 bitki türünde 30'dan fazla ırk ile temsil edilen mikroskobik bir bitki
paraziti nematoddur. Bu nematod ile mücadele için konukçu spektrumunun bilinmesi
büyük bir öneme sahiptir.
Bu çalışmada 28 bitki çeşidinin 4 farklı araziden alınan soğan sak nematodu
populasyonuna karşı konukçuluğu denenmiştir ve nematodun bitkiler üzerine etkileri
kayıt altına alınmıştır. Ülkemizde çoğunlukla yetiştiriciliği yapılan fasulye, bezelye,
çavdar, pırasa, sarımsak ve tütünün mükemmel konukçu, nohut, domates, biber,
hıyar, kabak, kavun, marul, havuç, pancar, patates, soğan, lale, ıspanak, karalahana,
çilek buğday, mısır, patlıcan, yonca ve yulafın orta konukçu olduğu belirlenmiştir.
Bu çalışma soğan sak nematodu ile mücadelede konukçu olan bitkilerle konukçu
olmayan bitkilerin rotasyona sokularak verim kaybının en aza indirilmesine ve
üretim aşamalarında daha bilinçli ve etkin önlemlerin alınmasına yardımcı olacaktır.

Abstract:
Onion is consumed intensively by human and the third place among the mostly
grown plant species. It has a wide production area in Turkey. Ditylenchus dipsaci
(Kühn) named as stem and bulb nematode and causes significant yield losses on
onion, is a plant parasitic nematode subject to quarantine regulations and has more
than 30 races breeding on 500 plant species. Determination of host spectrum has a
big impact on control applications.
In this study, 28 plant species were tested to stem and bulb nematode isolated from 4
different location and effect of the nematode on plant species were recorded. The
plant species mostly grown in Turkey; bean, pea, rye, leek, garlic and tobacco were
good host and chick pea, tomatoes, pepper, cucumber, zucchini, melon, lettuce,
carrot, beet, potatoes, onion, spinach, Savoy cabbage, strawberry, wheat, maize, egg
plant, medicago and oat was medium host to tested 4 populations of stem and bulb
nematode. This study will provide useful information for control of the nematode
using non host plants and reduce the yield loss. Therefore more effective and
conscious control would be provided.
Ortaokul 6. sınıf fen bilimleri dersi elektriğin iletimi ünitesinin öğretiminde 5e modelinin öğrenci başarısına ve tutumuna etkisinin araştırılması
Researching the influence of 5e model on students successand attitudes by teaching the science subjecttransmission of electricity on secondary school 6th grade students
Yazar: YASİN UYSAL
Danışman: DOÇ. DR. MURAT YILDIZ ; DR. ÖĞR. ÜYESİ SERHAT AYDIN
Karamanoğlu Mehmetbey Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Fen Bilimleri ve Teknolojileri Ana Bilim Dalı / Fen Bilimleri ve Teknolojileri Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2018
Konu: Eğitim ve Öğretim = Education and Training

Özet:
Bu çalışmada ortaokul 6. sınıf Fen Bilimleri dersinde 5E modeli esas alınarak Elektriğin İletimi Ünitesinin öğrencilerin başarısı ve tutumları üzerine etkileri araştırılmıştır. Araştırma 2017-2018 eğitim öğretim yılı Karaman Yavuz Selim Ortaokulunun 6. sınıfındaki 48 öğrenci ile yürütülmüştür. Uygulama öncesinde deney ve kontrol gruplarının başarı durumlarını karşılaştırmak için Elektriğin İletimi konusu ile ilgili bir başarı testi hazırlanıp uygulanmıştır. Deney grubunda 5E öğrenme modeline göre dersler işlenmiş, kontrol grubunda ise geleneksel öğretim yöntemi ile işlenmiştir. Uygulama sonucu yapılan analizlerde 5E modelinin uygulandığı deney grubu öğrencilerinin geleneksel öğretim yönteminin uygulandığı kontrol grubu öğrencilerine göre daha başarılı olduğu ve konuya karşı daha olumlu tutumlar geliştirdikleri sonucuna ulaşılmıştır.

Abstract:
In this study, 6th grade students' achievement and attitudes were investigated based upon 5E model on science lesson, the unit transmission of the electricity. The study was implemented with 48 sixth grade students, who studied in Karaman Yavuz Selim Secondary School during 2017-2018 academic year. Before the implementation an achievement test was applied to compare the achievement levels of the control and experimental group students on the subject: transmission of the electricity. In experimental group lessons were performed based upon 5E model but in control group traditional teaching methods were used. The analyses that are made at the end of the implementation showed that the experimental group in which 5E model applied was more succesfull and developed more positive attitudes towards lesson when compared with the control group in which traditional teaching methods were used.
Graf teorisinin bazı uygulamaları ve çapraz (crossed) çarpım grafı
Some applications of graph theory and crossed product graphs
Yazar: HASİBE ALTUNBAŞ
Danışman: DOÇ. DR. EYLEM GÜZEL KARPUZ
Karamanoğlu Mehmetbey Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Matematik Ana Bilim Dalı / Cebir ve Sayılar Teorisi Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2018
Konu: Matematik = Mathematics

Özet:
Bu tez beş ana bölümden oluşmaktadır. Birinci bölümde, graf teorisinin tarihçesinden bahsedilerek grafın fen bilimlerindeki uygulama alanları incelenmiştir. İkinci bölümde ise grafın tanımı ve grafın bazı temel özellikleri hakkında bilgi verilmiştir.
Üçüncü bölümde, ilk olarak grup sunuşu, serbest grup, direkt çarpım, yarı-direkt çarpım ve çapraz (crossed) çarpım grupları ile ilgili temel bilgilerden bahsedilmiştir. Daha sonra bu çarpım gruplarının sunuşları ve örnekleri verilmiştir.
Dördüncü bölümde,sonlu iki devirli grubun çapraz çarpım grubu ve bu grubun sunuşu göz önünde bulundurularak yeni bir graf   tanımlanmıştır. Daha sonra bu grafının bazı spektral özellikleri (çapı, girth, derece dizisi, maksimum ve minimum dereceleri,baskınlık sayısı, klik sayısı ve kromatik sayısı vb.) incelenmiştir ve ilgili sonuçlar ispatlanmıştır. Çapraz çarpımın bazı özel durumlarında elde edilen direkt çarpım ve yarı-direkt çarpım grupları için de graf örnekleri elde edilmiştir. Bu bölümün son kısmında ise, elde edilen yeni grafın komşuluk matrisi, derece matrisi, ilişki matrisi ve bu grafa izomorf olan başka bir graftan söz edilmiştir.
Son bölümde, önceki bölümlerde elde edilen sonuçların bir değerlendirmesi yapılmıştır.

Abstract:
This thesis consists of five main chapters. In the first chapter,by mentioning the history of graph theory it has been investigated the application areas of graph in science. In the second chapter, it has been given some information about the definition of graph and  the basic properties of graph .
In Chapter 3,firstly, it has been given general information about group presentation, free group,direct product, semi-direct product and crossed product of groups. Later,it has been given presentations and examples of these product ofgroups.
In Chapter 4, by considering a presentation of crossed product of two finite cyclic groups, it has been defineda new graph . Then, it has been investigated some spectral properties of this graph   (diameter, girth, maximum and minimum degrees, degree sequence, domination number, chromatic and clique numbers) and proventhe reletad results of this graph. Also, according to some special cases of crossed product structure, it has been obtained examples of graph of direct product and semi-direct product of groups. At the end of this section, by using this new graph, it has been mentionedabout adjacency matrix, degree matrix, relaation matrix of this graph and another new graphwhich is isomorphic to the given graph.
In the last chapter, the results which are obtained from previous chapters have been summarized.
Aspergillus terreus ksilanolitik sisteminin batık ve katı kültürde hücre dışı proteinlerinin karşılaştırılmalı proteomik analizi
Comparative proteomics analysis of extracellular proteins of Aspergillus terreus xylanolytic system in submerged and solid-state
Yazar: İBRAHİM SAVRAN
Danışman: YRD. DOÇ. DR. AYTAÇ KOCABAŞ
Karamanoğlu Mehmetbey Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Biyoloji Ana Bilim Dalı / Temel ve Endüstriyel Mikrobiyoloji Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2018
Konu: Mikrobiyoloji = Microbiology
Dizin: Aspergillus terreus = Aspergillus terreus ; Proteinler = Proteins

Özet:
Ksilanaz ve ksilanolitik enzim sisteminde yer alan diğer enzimler özellikle lignoselülozik  biyokütlenin hidroliz edilerek alternatif karbon kaynağı olarak kulllanılabilmesine olanak sağlamaktadır. Dolayısıyla bu enzim sistemi, sürdürülebilir enerji kaynaklarını kullanarak biyoyakıt ve değerli kimyasalların üretimini hedefleyen biyorafineri sistemlerinin en önemli bileşenlerinden birini oluşturmaktadır. Optimize edilen kültür ortamlarının proteom analizleri nanoHPLC-ESI-MS/MS tekniğiyle gerçekleştirilmiştir. Proteom analizleri sonucunda elde edilen veriler, katı kültür ortamında üretilen toplam protein miktarının batık kültürde üretilen miktarın iki katına karşılık geldiğini göstermiştir. Katı kültürde lignoselülozik materyallerin parçalanmasında görev alan yardımcı enzimlerin çeşitliliği batık kültüre kıyasla daha fazladır. Bunun yanında batık kültürde enzimlerin bireysel miktarları daha yüksek bulunmuştur.

Abstract:
The xylanase and other enzymes involved in the xylanolytic enzyme systems allow the lignocellulosic biomass to be hydrolyzed and used as an alternative carbon source. Therefore, this enzyme system constitutes one of the most important components of the biorefinery systems targeting the production of biofuels and valuable chemicals using sustainable energy sources. Proteom analysis of optimized culture media was performed by nanoHPLC-ESI-MS/MS technique. The data obtained from proteom analysis showed that amount of the total protein produced in solid state culture correspond to 2-fold of the total protein produced in submerged culture. Diversity of accessorize enzymes in solid state culture responsible for degradation of lignocellulosic materials was found to be higher than the accessorise enzymes in submerged culture. Besides, the individual amount of enzymes was higher in submerged culture.
Şiddet, iktidar ve totalitarizm kavramları çerçevesinde Gezi olaylarının incelenmesi
Review of Gezi events within the scope of violence, power and totalitarism
Yazar: RABİA GİZEM ÇALIŞ
Danışman: DR. ÖĞR. ÜYESİ ERDİNÇ KİNEŞÇİ
Karamanoğlu Mehmetbey Üniversitesi / Sosyal Bilimler Enstitüsü / Sosyoloji Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2018
Konu: Sosyoloji = Sociology ; Tarih = History
Dizin: Arendt, Hannah = Arendt, Hannah ; Gezi Parkı = Gezi Park ; Otorite = Authority ; Sosyal hareketler = Social movements ; Sosyal olaylar = Social events ; Totaliterizm = Totalitarism ; İktidar = Government ; Şiddet = Violence

Özet:
Bu çalışmada Arendt'in modernizm, şiddet, iktidar, otorite ve totalitarizm kavramları eserleri üzerinde yapılan okumalarla anlaşılmaya çalışılmıştır.Daha sonrasında ise bu kavramlar, 2013 yılı Haziran ayında İstanbul'da başlayan ve tüm ülkeye yayılan Gezi olaylarıyla ilgili iki farklı gazetenin internet sitesinde yer alan haberler üzerinde tematik analizi yöntemi uygulanarak aranmış ve söz konusu haberler Arendt felsefesiyle yine onun gözünden değerlendirilmiştir.Analizler sonucunda Arendt'in de öngördüğü şekilde iktidar şiddet ilişkisi, şiddetin iktidarın yokluğunda ortaya çıktığı, devletin sahip olduğu şiddet araçlarının karşısında durabilecek bir güç olmadığı, kamusal alanın nasıl kurulduğu ve bu kamusal alanda farklı kesimden insanların ve de özellikle kadınların nasıl temsil edildiği ve olayların başından sonuna kadar totalitarizmin izleri ortaya konulmaya çalışılmıştır.

Abstract:
In this study Arendt's conceptof violence, power, authority, totalitarism were tried to be understood by reading her artefacts. 
Hannah Arendt, who lived in a time that technology reached to very high level, and witnessed two World Wars, tried to understand modernizm and the conditions that created modern human being in the light of what she had been through. How the violence arose out of devastating and transofrmative events, demolished public area was tried to be shown and the link between modernizm, violonce, power and totalitarism to be found out. 
Later on those concepts are sought in two different newspapers under topic of Gezi Events that occured on June 2013 in Istanbul and spread over to the whole country by using content analysis method and the articles were evaluatued according to Arendt's approach. 
It was tried to be proven that; as a result of the analysis like Arendt has foreseen; the realationship between power and violonce, violence's arising in the absence of power, there is no power that is strong enought to stand against the instruments of state power, how the public area is established, and how various people- especially women- are represented, and traces of totalirism from the begining of the events
Amonyum tayini için potansiyometrik sensör geliştirilmesi
Development of potentiometric sensor for determination of ammonium
Yazar: AYŞE NUR TOKMAK
Danışman: PROF. DR. İBRAHİM YILMAZ
Karamanoğlu Mehmetbey Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Kimya Ana Bilim Dalı / Analitik Kimya Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2018
Konu: Kimya = Chemistry
Dizin: Analitik kimya = Analytical chemistry ; Biyosensörler = Biosensors

Özet:
İki aşamalı olarak planlanan bu çalışmanın ilk aşamasında, yapılarında indazol grubu bulunan iyonofor I ve iyonofor II kodlu bileşikler sentezlenerek karakterize edilmiştir. Karakterizasyon işlemlerinde 1H NMR, IR, elementel analiz gibi enstrümental yöntemler kullanılmıştır. İkinci aşamasında ise, bu iyonoforlar kullanılarak amonyum iyon-seçici PVC membran elektrotlar geliştirilmiştir. Geliştirilen elektrotların, ömrü, cevap süresi, optimum çalışma aralığı, tayin sınırı, seçicilik katsayısı, çalışılabilir pH aralığı gibi bazı karakteristik özellikleri belirlenmiştir. Elektrotların amonyum iyonuna seçicilik gösterdiği ve eğimin 59,4±0,6 mV/pNH4 olduğu bulunmuştur. Elektrotların çalışma aralığı 1,0x10-1-1,0x10-4 M olarak bulunmuştur. Elektrotların cevap süresi yaklaşık 15 saniye ve ömürlerinin 2 aydan fazla olduğu belirlenmiştir. 
Hazırlanan elektrotların farklı iyonlara karşı seçicilikleri sabit bozucu yöntemi ve ayrı çözelti yöntemi ile tayin edilmiştir. Elektrodların gerçek bir numunenin analizinde kullanılabilirliği araştırılmış, idrar ve kan gibi gerçek numunelere uygulanarak doğruluğu standart ekleme yöntemi ile kanıtlanmıştır.

Abstract:
In the first stage of this work which was planned in two stages, ionophore I and ionophore II compounds containing indazole group were synthesized and characterized. In the characterization of the ionophores, IR, 1H NMR spectral techniques and elemental analysis were used. In the second stage, ammonium ion selelctive PVC membrane electrodes were developed by using synthesized compounds. The life time, response time, linear range, detection limit, selectivity coefficient and suitable pH range of the electrodes were detemined. Membrane electrodes synthesized during the course of this work exhibited high selectivity towards Ammonium ion over a wide variety of other cations and yielded nernstian slope of 59,4±0,6 mV/pNH4. The lineer range of the electrodes were found to be in 1,0x10-1-1,0x10-4 M. The response time of the electrodes were determined as 15 seconds and life time of the electrodes more than 2 months. Selectivity coefficients of the electrodes were calculated by using seperate solution method and fixed interference method. 
The applicability of the electrodes to real samples that contain ammonium were tested. For this reason, the electrodes were successfully applied for the determination of ammonium in urine and blood samples and accuracy of the proposed electrodes were conﬁrmed by standart addition method and results were evaluated statistically.
Farklı LED (ışık yayan diyot) kaynaklarının bazı mikroorganizmaların toplam protein ve fosfoprotein profilleri üzerine etkisinin protein elektroforez yöntemi ile belirlenmesi
Determination of effects of different LED (light emitting diode) sources on total protein and phosphoprotein profiles of some microorganisms by protein electrophoresis method
Yazar: SERAP GÖNEK
Danışman: YRD. DOÇ. DR. AYTAÇ KOCABAŞ
Karamanoğlu Mehmetbey Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Biyoloji Ana Bilim Dalı / Temel ve Endüstriyel Mikrobiyoloji Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2018
Konu: Biyoloji = Biology ; Mikrobiyoloji = Microbiology
Dizin: Antimikrobiyal aktivite = Antimicrobial activity

Özet:
Işık yayan diyotlar kullanılarak yapılan bu çalışmada amaç ışığın mikroorganizmaların büyüme tipi ve süreci üzerine etkisinin protein elektroforez yöntemi ile araştırılmasıdır. Bu doğrultuda mikroorganizmalar uygun kültür ortamlarına aşılanmış ve ışıksız veya ışıklı olarak farklı süre inkübe edilmiştir. İnokülasyon üç biyolojik tekrar olarak gerçekleştirilmiştir. Katı besiyeri üzerindeki koloni boyutları ve morfolojileri her gün fotoğraflanmıştır.
Çalışmanın sonunda ışık olmadan yetiştirilen mikroorganizmaların ışık altında yetiştirilen mikroorganizmalara kıyasla kısa inkübasyon sürelerinde daha büyük koloni boyutlarına ulaştığı gözlenmiştir. Mikroorganizmalar, beş günün sonunda yalnızca ışık olmadan yetiştirilen besiyeri ortamında tüm yüzeyi kaplamıştır. Her iki koşulun toplam protein ve fosfoprotein sonuçları farklılık göstermiştir. Işık olmadan yetiştirilen mikroorganizmaların protein profillerinin, ışık altında yetiştirilen mikroorganizmaların protein profillerinden yoğunluk olarak daha fazla olduğu görülmüştür. Bu nedenle, ışığın mikroorganizmaların protein profillerini etkilediği ve büyümeyi yavaşlattığı sonucuna varılmıştır.

Abstract:
The aim of this study, which used the LED sources is to investigate the effect of light on growth type and duration of microorganisms by using protein electrophoresis method. For this purpose, microorganisms were inoculated to appropriate culture media and exposed to LED sources for different periods. Inoculation was performed in three biological replicates. Colony sizes and morphologies on the agar medium were photographed every day.
At the end of the study, it was observed that microorganisms grown without light reached larger colony sizes during short incubation periods compared to microorganisms grown under light. After five days, only the microorganisms grown without light covered the entire surface of the agar medium. Meanwhile, protein concentrations and SDS-PAGE profiles of both conditions were found to be similar. For this reason, it has come to the conclusion that the light have slowed down the microorganisms growth without affecting the protein profiles.