hakansabunis/tr-academic-research-agent-index huggingface dataset:
Kalkan balığı (Psetta maxima) solungaç dokusu glutatyon redüktaz enziminin karakterizasyonu ve bazı pestisitlerin inhibisyon kinetiğinin incelenmesi
Characterization of glutathione reductase enzyme from the gill tissue of turbot (Psetta maxima) and examination of inhibition kinetics of some pesticides
Yazar: ÖMER TAŞ
Danışman: DOÇ. DENİZ EKİNCİ
Ondokuz Mayıs Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Tarımsal Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2017
Konu: Biyokimya = Biochemistry ; Biyoteknoloji = Biotechnology

Özet:
Bu çalışmada, önemli fonksiyonlarda görev alan glutatyon redüktaz (Glutatyon: NADP+ oksidoredüktaz, E.C. 1.8.1.7: GR) enzimi kalkan balığı solungaç dokusundan saflaştırılmıştır. Saflaştırma işleminde homojenatın hazırlanmasının ardından amonyum sülfat çöktürmesi ve diyaliz işlemi yapılmıştır. Kalkan balığı solungaç dokusu glutatyon redüktaz enzimi için optimum iyon şiddeti, pH ve substrat miktarı araştırılmıştır. Bu değerler soya tohumu glutatyon redüktaz enzimi için sırasıyla 300 mM KH2PO4, 6.5 ve 0.2 mM olarak bulunmuştur. Pestisitler insan veya hayvanlarda hastalıklara sebep olabilecek taşıyıcıların; gıda, tarımsal ürünler ve hayvan yemlerinin üretimi, işlenmesi, depolanması ve pazarlanması sırasında bu uygulamaları olumsuz etkileyecek her türlü zararlının kontrol altına alınması amacıyla kullanılan maddelerdir. Bu çalışmada doğada bulanan pestisitlerden atrazin, karbaril, karbofuran, oksamil, propoksur, simazin, tebukonazol'ün saflaştırılmış kalkan balığı solungaç dokusu glutatyon redüktaz enzim aktivitesi üzerine inhibitör etkileri araştırılmıştır. Bu pestisitlerin her birinin enzim aktivitesi üzerinde inhibisyon etkisi gösterdiği tespit edilmiştir. Bu pestisitler için I50 değerleri hesaplanmıştır. Kalkan balığı solungaç dokusu GR enzimi için bu pestisitlerin I50 değerleri sırasıyla 18.728 µM, 14.395 µM, 19.716 µM, 17.854 µM, 16.709 µM, 14.281 µM ve 9.516 µM olarak hesaplanmıştır.

Abstract:
In this study, glutathione reductase (Glutathione: NADP+  	oxireductase, E.C. 1.8.1.7: GR), an enzyme involved in significant functions, has been isolated from gill tissue of turbot fish. Following the preparation of homogenate, dialysis were performed for purification. Optimum ionic strenght, pH and substrate amounts were examined for gill tissue of turbot fish glutathione reductase enzyme, and found to be 300 mM KH2PO4, 6.5 ve 0.2 mM, respectively. Pesticides are substances that are used to take under control vectors which may cause human or animal diseases; and pests which can adversely affect some processes such as producdion, processing, storage and marketing of food, agricultural products, animal feed. In this study, inhibitory effects of some of the common pesiticides in nature, atrazine, carbaryl, carbofuran, oxamyl, propoxur, simazine and tebuconazole on the purificated gill tissue of turbot fish glutathione reductase enzyme have been investigated. Each of the pesticides showed inhibitory effect on enzyme activity. I50 values of these pesticides for gill tissue of turbot fish GR enzyme were calculated as 18.728 µM, 14.395 µM, 19.716 µM, 17.854 µM, 16.709 µM, 14.281 µM and 9.516 µM respectively.
Çakal (Prunus spinosa L.),karaca (Prunus domestica L.) ve üryani (Prunus domestica L.) eriklerinin fiziksel, kimyasal ve  antioksidan özellikleri
Physical, chemical and antioxidant properties of blackthorn (Prunus spinosa L.), karaca (Prunus domestica L.) and uryani (Prunus domestica L.) plums
Yazar: BERAT ÖZZENGİN
Danışman: DOÇ. DR. İLKAY KOCA
Ondokuz Mayıs Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Gıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2017
Konu: Gıda Mühendisliği = Food Engineering

Özet:
Meyve ve sebzeler fitokimyasal içerikleri nedeniyle insan sağlığı ve beslenmesinde önemli bir yer tutmaktadır.  Bu meyvelerden biri olan erik tüm dünyada yayılım göstermektedir. Yabani olarak veya kültüre alınmış olarak birçok çeşidinin ülkemizde yetiştiği bilinmektedir. Bu çalışma, ülkemizde yabani olarak yetişen 3 farklı eriğin fiziksel, kimyasal ve antioksidan özelliklerini belirlemek amacıyla yapılmıştır. Bunun için Kastamonu'dan 25'er farklı lokasyondan hasat edilen çakal eriği (Prunus spinosa L.), karaca erik (Prunus domestica L.) ve üryani eriği (Prunus domestica L.) örnekleri analiz edilmiştir. Çalışma sonunda; çakal eriğinin kalsiyum (807.99±411.87 mg/kg), magnezyum (188.1±68.40 mg/kg), demir (6.79±5.42 mg/kg), çinko (8.24±2.74 mg/kg), bakır (1.75±0.51 mg/kg), mangan (1.44±0.72 mg/kg), toplam fenolik madde (4406.77±2472.98 mg/kg) ve toplam antosiyanince (645.7±198.86mg/kg) zengin olduğu, yüksek antioksidan aktivite gösterdiği (FRAP, 149.13±87.76 mmol/g; EC50, 0.61±0.58 mg/ml), karaca eriğin de potasyumca (2760.91±515.36 mg/kg) zengin olduğu saptanmıştır. Analiz edilen eriklerin fiziksel ve kimyasal özelliklerinin birbirinden istatistiksel açıdan farklı olduğu tespit edilmiştir (p<0.05). Tüm eriklerde toplam fenolik madde, antosiyanin içerikleri ile antioksidan özellikleri arasında önemli korelasyon saptanmıştır.

Abstract:
Fruits and vegetables have an important place in human health and nutrition due to their phytochemical contents. One of these fruits, plum spread all over the world. It is known that many species are grown in our country as wild or cultured. This study was carried out to determine the physical, chemical and antioxidant properties of 3 different plums growing wild in our country. For this, the samples of blackthorn (Prunus spinosa L.), karaca (Prunus domestica L.) and uryani (Prunus domestica L.) plums taken from 25 different locations were analyzed from Kastamonu. At the end of study; it is determined that the blackthorn plum was rich in calcium (807.99±411.87 mg/kg), magnessium (188.1±68.40 mg/kg), iron (6.79±5.42 mg/kg), zinc (8.24±2.74 mg/kg), copper (1.75±0.51 mg/kg), manganese (1.44±0.72 mg/kg), total phenolics (4406.77±2472.98 mg/kg), total anthocyanins (645.7±198.86 mg/kg), and had high antioxidant activity levels (FRAP, 149.13±87.76 mmol/g; EC50, 0.61±0.58 mg/ml), besides the karaca plum was high in potassium (2760.91±515.36 mg/kg) content. The physical and chemical properties of the plums analyzed were statistically different (p <0.05). The significant correlation was determined among the total phenolics, anthocyanin contents and antioxidant activities in all plums.
En'am ve Bakara sureleri özelinde Kur'an'da Mekkî-Medenî bütünlüğü
Maccan and Madinan integrity in the Qur'an specific to chapter al-Baqara and al-An'am
Yazar: MUSTAFA SAİT KAPLAN
Danışman: YRD. DOÇ. DR. RECEP DEMİR
Ondokuz Mayıs Üniversitesi / Sosyal Bilimler Enstitüsü / Temel İslam Bilimleri Ana Bilim Dalı / Temel İslam Bilimleri Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2017
Konu: Din = Religion
Dizin: Bakara suresi = Bakara sura ; Bütünlük = Integrity ; En`am suresi = En`am sura ; Kur'an-ı Kerim = Koran ; Mekki = Mekki ; Mekki sureler = Meccan suras ; Sure = Sura ; İslamiyet = Islam

Özet:
Kur'ân-ı Kerîm'in ortak mesaj içeren ayetleri belirli bir konu başlığı altında yer almaz. Bilakis bu ayetler, farklı yerlerde birbirinden uzak şekilde bulunur. Dolayısıyla Kur'ân'ı doğru bir şekilde anlama dağınık halde bulunan bu ayetleri bütüncül bir şekilde incelemeye bağlıdır. İşte biz bunu başarma adına geliş zamanları farklı olan ancak ortak mesaj içeren ayetleri inceledik. Bir yüksek lisans çalışmasının sınırlarını korumak adına En'am ve Bakara sureleri özelinde çalıştık. Çalışmamızın sonunda ulaştığımız sonuç iman, ibadet ve muamelat alanlarında Mekke ve Medine'de gelen ayetler zaman, mekan ve muhataplar değişmesine rağmen bütünlük oluşturmaktadır. Bu ayetleri kesin çizgilerle birbirinden ayırmak mümkün görünmemektedir.

Anahtar Kelimeler: Bütünlük, En'am, Bakara, Sure

Abstract:
Verses of the Qur'an which are containing common massage don't take part under a certain subject in the Qur'an. Rather than the verses of the Qur'an, take different place in the Qur'an. Therefore, to understand the Qur'an in a correct way depends on analysis these verses which are spread in the Qur'an a holistic way. In this study we examined verses which are contain common massage but with different time. To protect scope of master thesis we studied on chapter al-Baqara and al-An'am in the Qur'an. End of the study we reached there is integrity between verses which are belong to time of Macca and Madina, despite the change of time, place and addressees in areas of faith, worship and treatment. It does not seem possible to separate these verses from each other with certain lines.

Key Words: Integrity, al-Baqara, al-An'am, Chapter
İkinci dereceden çok değişkenli polinom sistemlerine 
dayanan imzalama algoritmalarının bileşenlerinin  
analizi ve açık kaynak kodlu uygulamaları
Efficiency analysis of signature schemes based on multivariate quadratic polynamials and open source implementation
Yazar: EMRE ENGİN
Danışman: DOÇ. DR. SEDAT AKLEYLEK
Ondokuz Mayıs Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Bilgisayar Mühendisliği Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2017
Konu: Bilgisayar Mühendisliği Bilimleri-Bilgisayar ve Kontrol = Computer Engineering and Computer Science and Control

Özet:
Bu tez çalışmasında kuantum sonrası kriptografi için önerilen çok değişkenli polinom sistemlerini kullanan elektronik imza protokollerinin hem anahtar boyutunu azaltma hem de açık kaynak kodlu uygulamaları konularında çalışılmıştır. Bu kapsamda UOV, Rainbow, Cyclic Rainbow, Hadamard Rainbow ve Rainbow-NSV  elektronik imza protokollerinin matematiksel altyapılarındaki tercihlerinin avantajları üzerine durulmuştur. UOV elektronik imza protokolünün yapısından başlanmak üzere, algoritmaların tasarımı analiz edilmiştir. UOV ve Rainbow imza şemalarının yapılarından dolayı üç polinom çarpımı yapılmakta olduğu için bu işlemin de hızlandırılmasına çalışmıştır. İmzalama protokollerinde kullanılan anahtar boyutlarını indirebilmek için özel matris formlarından faydalanılmıştır. Son olarak da UOV elektronik imza protokolünden başlanmak üzere Rainbow elektronik imza protokolüne doğru gidecek bir yol haritası ile LibreSSL kütüphanesi üstünde uygulama modüllerinin oluşturulması üzerine çalışılmıştır.

Abstract:
In this paper, electronic signature protocols using multivariate quadratic polynomial systems proposed for post-quantum cryptography have been studied both in terms of key size reduction and open source code applications. In this context, the advantages of the preferences of UOV, Rainbow, Cyclic Rainbow, Hadamard Rainbow and Rainbow-NSV electronic signature protocols in their mathematical backgrounds are emphasized. Starting from the construction of the UOV electronic signature protocol, the design of the algorithms has been analyzed. It has been  tried to  speed  up this  process  due to structure of UOV and Rainbow signature schemes  because three polynomial  multiplication is being done. Special matrix forms have been used to reduce key sizes used in signing protocols. Finally, starting from the UOV electronic signature protocol, a roadmap to the Rainbow electronic signature protocol and the creation of application modules on the LibreSSL library have been studied.
Metanol benzin, etanol benzin ve metanol etanol benzin karışımlarının buji ile ateşlemeli bir motorun performans ve egzoz emisyonlarına etkilerinin incelenmesi
Effects of methanol/gasoline, ethanol/gasoline and methanol/ethanol/gasoline blends on a spark ignition engine performance and emissions
Yazar: ORHAN GÜRSEL
Danışman: DOÇ. DR. HAKAN ÖZCAN
Ondokuz Mayıs Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Makine Mühendisliği Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2017
Konu: Enerji = Energy ; Makine Mühendisliği = Mechanical Engineering

Özet:
Bu tezde saf benzin, metanol-benzin, etanol-benzin ve metanol-etanol-benzin karışımlarının motor performansı ve egzoz emisyonlarına etkisi deneysel olarak araştırılmıştır. Testler, tam gaz kelebeği açıklığında, 1200 d/d ve 1800 d/d arasındaki çeşitli motor devirlerinde yapılmıştır. Test yakıtları, metanol, etanol ve metanol-etanol ile saf benzinin karıştırılmaları ile elde edilmiştir. Bu karışımlar en fazla hacimce %15  metanol ve/veya etanol içerecek şekilde hazırlanmıştır.
Sonuçlar, alkol-benzin karışımlarının kullanımının, hidrokarbon (HC), karbon monoksit (CO) ve azot oksit (NOx) emisyonlarını düşürürken, motor fren gücünü, fren özgül yakıt tüketimini (föyt), fren ısıl verimliliğini, hacimsel verimliliği ve yanma verimliliğini arttırdığını göstermiştir. Tüm motor devri ve karışım oranlarında, motor freni gücünde, fren özgül yakıt tüketiminde (föyt), fren ısıl veriminde, hacimsel ve yanma verimlerinde, metanol-etanol-benzin karışımları için ortalama artış sırasıyla % 4.63,% 4.91,% 1.46,% 13.5 ve % 0.27 olarak hesaplanmıştır. Tüm hızlar ve tüm karışım oranlarında metanol-etanol-benzin karışımları için CO, HC ve NOx emisyonlarındaki ortalama azalma ise sırasıyla % 17.56,% 16.02 ve% 8.17 olarak gerçekleşmiştir. Yukarıda listelenen tüm parametrelerdeki değişiklikler, benzindeki alkol karışım oranlarına bağlı olarak önemli ölçüde değişiklik göstermiştir.

Abstract:
In this thesis, the effects of pure gasoline and alcohol blends, e.g., methanol-gasoline, ethanol-gasoline and methanol-ethanol-gasoline, on the engine performance and exhaust emissions were experimentally investigated. Tests were performed at full-throttle valve opening with varying engine speeds between 1200 and 1800 rpm. The test fuels obtain
The results show that the use of alcohol-gasoline blends increased the engine brake power, brake specific fuel consumption (BSFC), brake thermal efficiency (BTE), volumetric efficiency and combustion efficiency, while hydrocarbon (HC), carbon monoxide (CO) and nitrogen oxides (NOx) emissions decreased. The calculated average increase in engine brake power, BSFC, BTE, volumetric and combustion efficiencies within all engine speed and all blends rates were 4.63%, 4.91%, 1.46%, 13.5% and 0.27% for methanol-ethanol-gasoline blends, respectively. The calculated average reduction for all speeds and all blends rate in CO, HC and NOx emissions was 17.56%, 16.02% and 8.17% for methanol-ethanol-gasoline blends, respectively. The changes in all the parameters listed above vary considerably depending on the alcohol mixture ratios in the gasoline.
Yaşlı kolorektal kanserli hastalarda tedavi seçenekleri ve tedavi komplikasyonlarının değerlendirilmesi
Evaluation of treatment options and treatment complications in elderly colorectal cancer diseases
Yazar: SERDAR TURAN
Danışman: PROF. DR. GÜZİN DEMİRAĞ
Ondokuz Mayıs Üniversitesi / Tıp Fakültesi / İç Hastalıkları Ana Bilim Dalı
Derece: Tıpta Uzmanlık, 2017
Konu: Onkoloji = Oncology
Dizin: Kanser hastaları = Cancer patients ; Kolorektal neoplazmlar = Colorectal neoplasms ; Komplikasyonlar = Complications ; Neoplazmlar = Neoplasms ; Tedavi = Treatment ; Yaşlılar = Aged ; İlaç tedavisi = Drug therapy ; İlaç tedavisi-kombine = Drug therapy-combination ; İlaç yan etkileri ve istenmeyen reaksiyonlar = Drug-related side effects and adverse reactions

Özet:
AMAÇ: Samsun ili ve çevresindeki 65 yaş ve üstü kolorektal kanser tanısı ile
takipli hastalarda tanı yaşı, kemoterapi başlamadan önceki vücut kitle indeksi,
performans durumu, eşlik eden hastalıklar, evresi, tümörün derecesi gibi
klinikopatolojik özellikleri değerlendirmek; kemoterapi alan yaşlı hastalarda uygulanan
tedavi rejimlerini ve gelişen yan etkileri değerlendirmek; performans durumu, eşlik
eden hastalıklar, obesitenin sağkalıma etkisini araştırmaktır.
GEREÇ VE YÖNTEM: Çalışmaya Ekim 2005 ile Aralık 2015 tarihleri
arasında Tıbbi Onkoloji bölümüne başvuran yeni tanı almış, tedavi ve takipleri
merkezimizde yapılan kolorektal kanserli hastalar dahil edildi. Bu hastalara ait dosyalar
ve hastane veri tabanı retrospektif olarak incelendi.
İstatistiksel analiz SPSS programı (versiyon 24.0) ile yapıldı. Ön planda tanımlayıcı
veriler kullanıldı. Veriler ortalama ve ortalamanın standart sapması şeklinde sunuldu.
Sağ kalım analizlerinde Kaplan-Meier yöntemi ve gruplar arası karşılaştırmada Student
T testi kullanıldı. P<0.05 değeri istatistiksel olarak anlamlı kabul edildi.
SONUÇ: Toplam 105 hasta çalışmaya dahiledildi. Kadın cinsiyet, obesite, <12
adet lenf nodu çıkarılması, sol kolon ve rektum yerleşimli hastalarda genel sağkalım
daha düşüktü ancak istatistik olarak anlamlı değildi. Bunun yanında yaş, ek hastalık,
performans durumu, tedaviye başlama zamanının iki aydan uzun olması genel
sağkalımla ilişkili bulunmadı. Kötü differansiye adenokarsinom ve operasyon öncesi
CEA >5 mg/L istatistisel olarak anlamlı kötü prognostik faktördü. 65 yaş ve üstü
hastalarda kemoterapilere bağlı gelişne yan etkilerin sıklığı literatürle benzerdi.
TARTIŞMA: Kolorektal kanser hastalarında yaş ile kemoterapi yan etkileri
arasında ilişki yoktur. Yaşlı hastalarda kemoterapi verilirken ek hastalık, performans
durumu, kognitif fonksiyonları göz önünde bulundurulmalıdır. Tek başına kronolojik
yaş tedavi almasına engel değildir.
Anahtar Kelimeler: Kolorektal kanser, yaşlı hasta, kemoterapi
komplikasyonları

Abstract:
DAHA SONRA DOLFURULUCAKTIR
N,n' – bissalisiliden – 2,3 – diaminopiridin ile 
 bakır(II)'nin spektrofotometrik yöntemle tayini
Spectrophotometric determination of copper (II) with N,n′- 
bissalicylidene-2,3-diaminopyridine
Yazar: KONUL BABAYEVA
Danışman: PROF. DR. MÜBERRA ANDAÇ
Ondokuz Mayıs Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Kimya Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2017
Konu: Kimya = Chemistry

Özet:
Bu çalışmada, yeni bir reaktif olan N, N'-bissalisiliden-2,3-diaminopiridin (H2IF)'in ilk defa kullanılması ile bakır(II) tayini için yeni, seçici ve oldukça hassas bir spektrofotometrik yöntem geliştirildi. Bakır ile ligantın oluşturduğu kompleksin λmax değeri 414 nm'de ölçüldü. Deneysel koşullar optimize edildiğinde 6.35 -318 μg L-1 bakır derişimi aralığında Beer yasasına uygunluk gözlendi. Kompleksin molar absorptivite katsayısı 1.46 x 105 L mol-1 cm-1 olarak hesaplandı. Tayin ve gözlenebilme sınırları sırasıyla 6.38 μg L-1 ve 21.27 μg L-1 olarak bulundu. 63.5 μg L-1 bakır(II) içeren standart bir çözelti için hesaplanan bağıl standart sapma (n = 5)% 0,62 olarak bulundu. Yabancı iyonların girişim etkileri incelendi ve elde edilen sonuçların istatistiksel değerlendirmesi sunuldu. Geliştirilen metodun akış enjeksiyon analizi uygulamaları gerçekleştirildi. Spektrofotometrik ve akış enjeksiyon spektrofotometrik metot su örneklerinde bakır tayini için uygulandı. Yöntemlerin güvenilirliği ve doğruluğu, atık su standardının analizi ile test edildi.

Abstract:
In this study, anovel, selective and highly sensitive spectrophotometric method has been developed for the determination of copper(II) by using a new chromogenic reagent N,N′-bissalicylidene-2,3-diaminopyridine (H2IF). The absorbance is measured at λmax 414 nm. Experimental conditions were optimized and Beer's law was observed in the concentration range 6.35- 318 µg L-1 of copper. The molar absorptivity of the complex was calculated and found to be 1.46 x105 L mol-1 cm-1. The detection and quantification limits were calculated and found to be 6.38 µg L-1 and 21.27 µg L-1 respectively. The calculated relative standard deviation (n=5) was 0,62 % for a standard solution including 63.5 µg L-1copper(II). The interference effects of the common ions have been studied and the statistical assessment of the obtained results is presented. The developed spectrophotometric and flow injection spectrophotometric methods were applied for determination of copper in water samples. The reliability and accuracy of the developed methods were proved by the analysis of waste water standard.
Yüksek tuz toleransına sahip fasulye genotipinde tolerans ile ilgili transkripsiyon faktörlerinin belirlenmesi
Determi̇nati̇on of transcri̇pti̇on factors related to tolerances i̇n bean genotype wi̇th hi̇gh salt tolerances
Yazar: GÖKHAN GÖKDEMİR
Danışman: DOÇ. DR. MUSA KAVAS
Ondokuz Mayıs Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Tarımsal Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2017
Konu: Biyoteknoloji = Biotechnology

Özet:
Apetala2-ethylene-responsive element binding factor (AP2-ERF) süperailesi gelişimsel ve fizyolojik olarak önemli rollere sahiptir. Fasulye genomunun dizilemesi tamamlandığından dolayı AP2-ERF genlerinin hepsinin tanımlanması mümkün hale gelmiştir. Bu çalışmada biyoinformatik analizler ile 180 AP2-ERF süperailesi geni bulunmuş ve bu genlerden PvAP2-ERF31 geninin karakterizasyonu yapılmıştır. PvAP2-ERF gen ailesinin yerel hizalama ve filogenetik analizleri, intron/exon yapısı, genlerinin kromozomlar üzerindeki dağılımı ve motif tahmini yapılmıştır. Ayrıca PvAP2-ERF genlerinin promotor yapıları ve miRNA hedefleri, gen ontolojisi ve fonksiyonel anlamlandırma işlemleri gerçekleştirilmiştir. AP2-ERF proteinleri arasındaki etkileşimler, amino asitlerin fiziksel ve kimyasal karakteristikleri analiz edilmiştir. Ek olarak PvAP2-ERF genlerinin ekspresyo seviyeleri in silico ve qRT-PCR analizi ile değerlendirilmiştir. Biyoinformatik analizler sonucunda PvAP2-ERF31 geni Gateway klonlama sistemiyle klonlanıp Agrobacterium ile tütüne aktarılmıştır. T1 Transgenik tütün adaylarının moleküler ve fizyolojik analizler yapılmıştır. T1 transgenik adaylar 200 mM NaCl içeren ortamlarda stres testine tabi tutulmuş ve transgenik tütün adayları sağlıklı bir şekilde çimlenmiş ve büyümüştür.

Abstract:
Apetala2-ethylene-responsive element binding factor (AP2-ERF) superfamily has developmental and physiologically important roles. Since the sequencing of the bean genome is complete, it has become possible to identify all of the AP2-ERF genes. In this study, 180 AP2-ERF superfamily genes by bioinformatic analysis were identified and among these genes, PvAP2-ERF31 gene was characterized. Distribution of genes on chromosomes, intron / exon structure, local alignment and phylogenetic analysis of the PvAP2-ERF gene family and motif prediction were done. In addition, gene ontology and functional annotation, promoter structures and miRNA targets of PvAP2-ERF genes were performed. Interactions between AP2-ERF proteins, physical and chemical characteristics of amino acids have been analyzed. In addition, the expression levels of PvAP2-ERF genes were assessed by in silico and qRT-PCR analysis. As a result of bioinformatics analysis, PvAP2-ERF31 gene was cloned by Gateway cloning system and transferred to Agrobacterium to tobacco. Molecular and physiological analyzes of T1 transgenic tobacco candidates were carry out. T1 transgenic candidates were done stress test in medium containing 200 mM NaCl and transgenic tobacco candidates were germinate and grown up as a healty.