Azerbaycan'ın farklı süt ürünlerinden probiyotik  bakteri izolasyonu ve tanımlanması
Identification of probiotic bacteria from different dairyproducts of Azerbaijan
Yazar: KAMALA MAMMADOVA
Danışman: PROF. DR. MEHMET BURÇİN MUTLU
Eskişehir Teknik Üniversitesi / Lisansüstü Eğitim Enstitüsü / Biyoloji Ana Bilim Dalı / Temel ve Endüstriyel Mikrobiyoloji Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2019
Konu: Biyoloji = Biology ; Mikrobiyoloji = Microbiology

Özet:
Yaptığımız çalışmada Azerbaycan'ın farklı yörelerine ait geleneksel olarak
hazırlanmış 6 adet peynir ve 1 adet kesmik örneğinin mikrobiyolojik özelliklerine
bakılmıştır. Örneklerden izole edilen laktik asit bakterileri (LAB) morfolojik ve
biyokimyasal testlere tabi tutulmuştur. Çalışmamızda kültür bağımsız yöntemler
kapsamında mikrobiyal çeşitliliği belirlemek amacıyla toplam DNA ekstraksiyonu ve
fluoresan in situ hibridizasyon (FISH) deneyleri yapılmıştır. DNA ekstraksiyonu sonucu
oluşan amplifikasyon ürünleri Illumina MiSeq platformu kullanılarak dizilenmiştir.
Kültür bağımlı yöntem olarak 16S rRNA PCR ve plazmid DNA izolasyonu yapılmıştır.
İzolatların SDS-PAGE yöntemi ile protein profilleri incelenmiştir. Rastgele seçilmiş
izolatların antimikrobiyal aktivite yetenekleri agar kuyu difüzyon yöntemiyle belirlenmiş
ve en büyük aktivite gösteren 12 izolat seçilerek diğer testlere tabi tutulmuştur. İzolatların
probiyotik özelliklerini belirlemek için farklı sıcaklık, farklı pH ve farklı tuz
konsantrasyonlarında üreme yeteneği incelenmiştir. İzolatların antibiyotik
dirençliliklerini belirlemek amacıyla Kirby-Bauer disk difüzyon yöntemi kullanılmış ve
sonuç olarak farklı antibiyotiklere karşı farklı dirençlilik gösterdikleri belirlenmiştir.
İzolatların biyofilm oluşturma yeteneği Kongo Kırmızılı Agar yöntemi ile belirlenerek,
seçilen 12 izolatın tümünde biyofilm oluşturma yeteneği saptanmıştır.

Abstract:
In this study, microbiological properties of 6 traditionally prepared cheese and 1
kesmik sample of different regions of Azerbaijan were examined. The lactic acid bacteria
(LAB) isolated from the samples were subjected to morphological and biochemical tests.
In our study, total DNA extraction and fluorescence in situ hybridization (FISH)
experiments were performed to determine microbial diversity within culture independent
methods. The amplification products resulting from DNA extraction were sequenced
using the Illumina MiSeq platform. As culture dependent method, 16S rRNA PCR and
plasmid DNA were isolated. The protein profiles of the isolates were examined by SDSPAGE method. Antimicrobial activity capabilities of randomly selected isolates were
determined by agar well diffusion method and 12 isolates with the greatest activity were
selected and subjected to other tests. To determine the probiotic properties of the isolates,
reproductive ability at different temperatures, pH and salt concentrations were
investigated. The Kirby-Bauer disk diffusion method was used to determine the antibiotic
resistance of the isolates and as a result, they showed different resistance to different
antibiotics. Biofilm formation ability of isolates was determined by Congo Red Agar
method and biofilm formation ability was determined in all 12 isolates.