Mesane kanserli vakalarda DNA tamir genlerinden XRCC1, XRCC3, XPD, XPG, APE1, hOGG1 gen polimorfizmlerinin araştırılması
Analysis of XRCC3, hOGG1, XPD, XRCC1, XPG and APE1 gene polymorphisms in patients with bladder cancer
Yazar: KAMİL FEHMİ NARTER
Danışman: PROF. DR. TURGAY İSBİR
İstanbul Üniversitesi / Sağlık Bilimleri Enstitüsü / Moleküler Tıp Ana Bilim Dalı
Derece: Doktora, 2008
Konu: Moleküler Tıp = Molecular Medicine ; Üroloji = Urology
Dizin: DNA onarım kalitesi = DNA repair quality ; DNA onarım testi = DNA repair test ; Gen sıklığı = Gene frequency ; Mesane = Urinary bladder ; Mesane neoplazmları = Urinary bladder neoplasms ; Neoplazmlar = Neoplasms ; Onarım = Repair ; Polimeraz zincirleme reaksiyonu = Polymerase chain reaction

Özet:
Mesane kanseri sigara içimi ile oluşan en önemli idrar yolu kanserlerindendir. Serbest oksijen radikalleri sayesinde DNA hasarına sebep olmaktadır. DNA tamir kapasitesindeki değişikliklerİ ile malign tümörler gelişebilir. Çalışmamızda mesane kanserli hastalarda DNA tamir genlerinden XRCC1, XRCC3, XPD, XPG, APE1, hOGG1 gen polimorfizmlerini incelemeyi amaçladık. 84 mesane kanserli ve 45 sağlıklı bireyde Polimeraz Zincirleme Reaksiyonu, Restriksiyon Fragmanı Uzunluk Polimorfizmi ve agaroz jel elektroforezi teknikleri kullanılarak, hOGG1 Ser326Cys, XPD Lys751Gln, XRCC3 Thr241Met, XRCC1 Arg194Trp, APE1 Asp148Glu ve XPG Asp1104His polimorfizmleri araştırılmıştır. Çalışmamızda hasta ve kontrol grubunda XRCC3 genotip dağılımı açısından anlamlı fark gözlenmiş (p:0,003) ve T allelinin kontrol grubunda 4.87 kat koruyuculuk oluşturduğu tespit edilmiştir (p:0,002). Ayrıca hasta grubunda hOGG1 genotip dağılımının kontrol grubuna göre anlamlı olarak farklı şekilde dağılım gösterdiği (p:0,003) ve CYS/CYS genotipinin hasta grubunda istatistiksel olarak anlamlı şekilde yüksek olduğu tespit edilmiştir (p:0,022). Diğer polimorfizmleride kontrol ve çalışma grubu arasında istatistiksel anlamlılık saptanmamıştır. Cinsiyet, yaş grupları, sigara, XRCC3C, XRCC3T, hOGG1SER ve hOGG1CYS alleleri arasında yapılan lojistik regresyon analizinde XRCC3T alleli etkili olarak tespit edilmiştir (p<0,001). Ayrıca APE gen polimorfizmi AA genotipi (P:0,01) ve A alleli taşıyanlar (P:0,040) değişici epitelyum hücreli kanser grubunda adeno kanseri grubuna gore istatistiksel olarak anlamlı şekilde yüksek bulunmuştur. Bu sonuçlara göre XRCC3 T allelinin koruyucu olduğu, hOGG1 CYS/CYS genotipinin ise hastalık gelişme riskini arttırdığı tespit edilmiştir.

Abstract:
Bladder Cancer is one of the most important cancer related to urinary system.In our study we aimed to investigate the role of DNA repair gene polymorphisms hOGG1, XRCC1, XRCC3, XPD,XPG and APE1 in bladder cancer. Ser 326Cys in hOGG1 gene, Lys751Gln in XPD gene,Thr241Met in XRCC3 gene, Arg 194Trp in XRCC1 gene,Asp148Glu in APE1 gene and Asp1104His in XPG gene polymorphisms were examined in 84 patients with bladder cancer and 45 control subjects by using Polymerase Chain Reaction (PCR) , Restriction Fragment Length Polymorphism (RFLP) , and agarose gel electrophoresis techniques. When the contribution of the XRCC3 genotype for that disease was analysed we found that the genotype distribution is statistically significantly different between the control group and patients (p=0.003) and the T allele has 4.87 times protective affect for the control group (p=0.002). As a result of our study, when we analysed our group according to hOGG1 gene contribution to interindividual variation in Bladder Cancer, we found that patients with CYS/CYS genotype have a higher risk for Bladder Cacer (p=0..22) and the genotype distribution is statistically significantly different between the control group and patients (p=0.003).When logistic regression analyse was performed between age, gender, smoking, XRCC3C, XRCC3T, hOGG1Ser, hOGG1CYS, we found that XRCC3T allele has the affect on the development of bladder cancer(p<0.001). We also found that the ratio of the patients with AA genotype (p=0.01) and the A allele (p=0.04) are statistically significantly more in cancer group with transitional epithelium cell then in cancer with adenocancer. With all these findings we found that the T allele in XRCC3 gene has protective and hOGG1 CYS/CYS genotype has detrimental affect on bladder cancer risk.