Mide kanserınde GKN1 ve GKN2 genleri tanıya uygun belirteç midir? Moleküler yöntemlerle araştırılması
Are GKN1 and GKN2 genes distinctive diagnostic markers for gastric  cancer? A molecular investigation
Yazar: AMER ABDULLAH HASAN
Danışman: YRD. DOÇ. DR. MEHRİ İĞCİ
Gaziantep Üniversitesi / Sağlık Bilimleri Enstitüsü / Tıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2013
Konu: Genetik = Genetics ; Onkoloji = Oncology
Dizin: Biyobelirteçler-tümör = Biomarkers-tumor ; Gen ifadesi = Gene expression ; Mide neoplazmları = Stomach neoplasms ; Mutasyon = Mutation ; Neoplazmlar = Neoplasms

Özet:
Mide kanseri birçok ülkede yüksek görülme ve ölüm oranına sahiptir. Intestinal 
tümörlerin evrimi gastrit ile başlayan ve ardından mukozal atrofi, intestinal metaplazi, 
displazi ve karsinom ve metastatik yayılma ile karakterizedir. Yeni tanımlanmış 
mitojenik Gastrokin 1 (GKN1) ve Gastrokin 2 (GKN2) genleri normal midede yüksek 
bir şekilde ifade edilmektedir ve yüzeyel mide epitelinde bulunurlar. GKN1 mide 
mukozal epitel hücrelerinin homeostazının sağlanmasında önemli bir rol oynar. GKN1 
ve GKN2'nin kopya sayısındaki belirgin kayıp ve gen ifadesindeki azalma mide adenom 
karsinomlarda sık sık gözlenmiştir. Bu çalışmada kanser alttürüne, cinsiyet, yaş klinik 
özelliklerine göre gruplandırılmış 47 mide kanseri hastasının normal ve tümör dokusu 
gen ifade analizi, SSCP tekniği ve Sanger dizilemesi ile incelenmiştir. Hem GKN1 hem 
de GKN2 gen ifadelerinin azaldığı gözlenmiştir ve istatistiki olarak yüksek oranda 
anlamlı bulunmuştur (Wilcoxon signed rank testi; p < 0,05). Gen taramasının sonucunda 
mutasyon görülmemiştir. Gastrokin genlerinin etkinliğini yitirmesinde mutasyonların 
rol sahibi olmadığı anlaşılmaktadır. Sonuç olarak; Gastrokin genlerinin mRNA 
ifadesindeki azalma mide kanseri ile doğrudan ilişkili ve cinsiyet, yaş ve kanser 
alttipinden bağımsızdır. GKN genlerinin aşağı yönlü düzenlenmesi kanserin ilk 
aşamalarında gerçekleşiyor olabilir. Bu ön bulguların epigenetik analiz, miRNA analizi, 
western blot ve immünohistokimya gibi ileri tekniklerle doğrulanması gerekmektedir. 
 
Anahtar Kelimeler: Mide kanseri, GKN1, GKN2, gen ifade analizi, mutasyon taraması.

Abstract:
Gastric cancer (GC) has high incidence and mortality rate in several countries and is still 
one of the most frequent and lethal diseases. The evolution of intestinal tumors is 
characterized by progression of several sequential steps that start with gastritis and then 
progresses to mucosal atrophy, intestinal metaplasia, dysplasia and carcinoma with 
subsequent metastatic dissemination. Novel mitogenic and motogenic Gastrokine1 (GKN1) 
and Gastrokine 2 (GKN2) genes that are highly expressed in normal stomach epithelium 
and plays an important role in maintaining the integrity and homeostasis of stomch mucosal 
epithelial cells. Significant loss of copy number and mRNA transcript of GKN1 and GKN2 
gene expression were frequently observed in all type of gastric cancer. In this study, 47 
paired samples that were grouped according to the types of gastric cancer and the clinical 
characteristics of the patients, including gender and average of age were investigated with 
gene expression analysis, SSCP technique and nucleotide sequencing. Both GKN1 and 
GKN2 genes were observed significantly reduced. (Wilcoxon signed rank test; p<0,05). As 
a result of gene screening; no mutation (no different genotype) was detected. It is 
considered that gen mutations are not the cause of inactivation of gastrokines. In 
conclusion; the mRNA expression level of gastrokine genes was decreased regardless the 
gender, age or cancer type of patients. Down-regulation of GKN genes seems to occur at the 
initial steps of cancer development. This preliminary data must be confirmed by further 
analysis like immunohistochemistry, epigenetic analysis, miRNA analysis, and western 
blot. 
 
Keywords: Gastric cancer, GKN1, GKN2, expression analysis, mutation screening.