hakansabunis/tr-academic-research-agent-index huggingface dataset:
Manisa ili atmosferik polenlerinin volumetrik yöntemle analizi
Volumetri̇c analysis of atmospheric pollens in Manisa
Yazar: ECE BULUÇ
Danışman: PROF. DR. AYKUT GÜVENSEN
Ege Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Biyoloji Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2016
Konu: Biyoloji = Biology

Özet:
Bu çalışmada Manisa ili atmosferik polen dağılımı 01 Şubat 2014 - 31 Ocak 2016 tarihleri arasında Lanzoni VPPS 2010 cihazı kullanılarak volumetik yöntemle araştırılmıştır. Çalışma süresince elde edilen polenlerin günlük, aylık ve yıllık dağılımları tespit edilmiş ve meteorolojik faktörlerle ilişkisi araştırılmıştır. İki yıllık çalışma süresince Manisa atmosferinde 46 taksona ait toplam 17.201 polen/m3 adet polen gözlemlenmiştir. Tanımlanan taksonlardan 30'u odunsu, 16'sı otsu taksonlara aittir. Çalışmanın ilk yılında 8.080 polen/m3 adet polen, ikinci yılında 9.121 polen/m3 adet polen tespit edilmiştir. Toplam polen sayısının %72.36'sını odunsu taksonlar, %13.16'sını Poaceae, %12.82'sini diğer otsu taksonlar ve %1.66'sını tanımlanamayan polenler oluşturmuştur. Atmosferde polenleri baskın olarak görülen odunsu taksonlar sırasıyla Quercus spp. (%19.02), Pinaceae (%17.24), Olea europaea (%15.57), Cupressaceae/Taxaceae (%7.80), Platanus orientalis (%2.51), Casuarina equisetifolia (%1.32), Morus spp. (%1.20), otsu taksonlar ise sırasıyla Poaceae (%13.16), Urticaceae (%2.08), Chenopodiaceae/Amaranthaceae (%2.06), Plantago spp. (%1.97), Rumex spp. (%1.34), Asteraceae (%1.18), Apiaceae (%1.01)'dir.

Abstract:
In this study, airborne pollen distribution in the city of Manisa was investigated volumetrically from 01 February 2014 to 31 January 2015 using Lanzoni VPPS 2010. During the study period daily, monthly and annualy distribution of obtained pollen were identified and the relations with the meteorological factors were investigated. During two years-studying period a total of 17.201 pollen grains/m³ which belonged to 46 taxa were observed. Out of these, 30 taxa belonged to the arboreal and 16 taxa to the non-arboreal taxa. In the first year of research, 8.080 pollen grains/m³, in the second year of research 9.121 pollen grains/m³ were recorded. Total pollen grains consist of 72.36% arboreal, 13.16% Poaceae, 12.82% other non-arboreal plants and 1.66% unidentified pollen grains. Dominating taxa in the arboreal plants followed the trend as; Quercus spp. (19.02%), Pinaceae (17.24%), Olea europaea (15.57%), Cupressaceae/Taxaceae (7.80%), Platanus orientalis (2.51%), Casuarina equisetifolia (1.32%), Morus spp. (1.20%) and for non-arboreal representatives these were Poaceae (13.16%), Urticaceae (2.08%), Chenopodiaceae/Amaranthaceae (2.06%), Plantago spp. (1.97%), Rumex spp. (1.34%), Asteraceae (1.18%), Apiaceae (1.01%).
Teranostik gadolinyum nanoparçacıkların tasarımı ve in vitro uygulamaları
Desing of theranostic gadolinium nanoparticles and their in vitro applications
Yazar: FIRAT BARIŞ BARLAS
Danışman: PROF. DR. SUNA TİMUR
Ege Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Biyokimya Ana Bilim Dalı
Derece: Doktora, 2016
Konu: Biyokimya = Biochemistry ; Biyoteknoloji = Biotechnology ; Onkoloji = Oncology

Özet:
Teranostik tedavi, kanser araştırmalarında eş zamanlı görüntüleme ile tedaviye aynı anda izin veren son yılların en umut vaadetmekte olan yöntemlerinden biridir. Bu çalışmada gadolinyum nanopartiküller (GdNp) ve protoporfirin IX'lar (PpIX) aynı anda yüksek kimyasal stabilite ve enkapsülasyon verimine sahip olan niozomlar ile enkapsüle edilerek (Gd-PpIX-Ni) yeni bir teranostik tedavi ajanı oluşturuldu. GdNP ve PpIX'ların iyi birer radyoterapi (RT) yoğunlaştırıcı ajan oldukları bilinmektedir. Aynı zamanda porfirin türevleri en çok çalışılan fotodinamik terapi (FDT) ajanlarındandırlar. Yapmış olduğumuz araştırmada insan tip II alveolar (ATII) akciğer kanserli epitel hücre hatları (A549), insan kanserli yumurtalık hücre hatları (HeLa) ve insan sağlıklı akciğer epitel hücre hatları (WI38) üzerinde RT ve FDT'nin kombine uygulamaları (multimodal treatment) denenmiş ve hücre görüntüleri manyetik rezonans (MR) cihazı ve floresans mikroskop altında (dual imaging) alındı. Boyut ve zeta potansiyel bağımlı karakterizasyon çalışmaları dinamik ışık saçılımı metodu (DLS) ve atomik kuvvet mikroskopu (AFM) ile yapılmış olup çalışma boyunca hücre canlılığı MTT metodu ile ölçüldü. Sonuç olarak hazırlanmış olunan 100 nm'den daha küçük partikül boyutuna sahip teranostik niozomal veziküllerin kanser için yeni bir bakış açısı olan kombine tedavi ve çoklu görüntüleme çalışmalarının aynı anda yapılmasına olanak sağlayan uygun bir kargo sistemi olabileceği kanaatine varıldı.

Abstract:
Theranostic therapy is one of the most promising technology in cancer research, which simulteniously allows treating and real-time monitoring of cancer. In the present study, a novel material has been developed for theranostic approach. Gadolinium nanoparticles (GdNP) and Protoporphyrin IX (PpIX) both have encapsulated with niosomes (Gd-PpIX-Ni). Here nisome has been used for the encapsulation of Gd-PpIX-Ni due to the fact that nisomes possess high biocompatiblity, physical and chemical stability. GdNp and PpIX are good sensitizer for radio therapy (RT) and PpIX is one of the more studied agent for photodynamic therapy (PDT). Treatment was performed by the combination of PDT and RT, by using human alveolar type-II (ATII)-like cell lines (A549), human cervical cancer cell line (HeLa) and Human alveolar epithelium cell line (WI38). Cell lines were monitored by fluorescence microscopy and magnetic resonance imaging (MRI). Characterization of sizes and zeta potential of vesicles were carried out by dynamic light scattering (DLS) and atomic force microscopy (AFM). MTT method was used viability of cell. Our results showed that Gd-PpIX-Ni are homegenious and consistent less than 100 nm. In conclusion, Gd-PpIX-Ni can be considered as good candidates to for PDT and RT treatment in theranostic approches.
Fasulye ıslah programında genitör olarak kullanılabilecek genotiplerin  agromorfolojik ve moleküler karakterizasyon ile belirlenmesi
Determination of genotypes as a genitor in bean breeding programmes by agromorphological and molecular characterization
Yazar: TANSEL KAYGISIZ AŞÇIOĞUL
Danışman: PROF. DR. DURSUN EŞİYOK
Ege Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Bahçe Bitkileri Ana Bilim Dalı
Derece: Doktora, 2016
Konu: Ziraat = Agriculture

Özet:
Çalışmada yerel fasulye popülasyonlarında morfolojik, agronomik ve moleküler karakterizasyonların yapılarak oluşturulabilecek fasulye ıslah programlarında kullanılabilecek popülasyonların belirlenmesi amaçlanmıştır. Bu amaç ile başta Ege ve Marmara Bölgeleri olmak üzere Türkiye' nin farklı bölgelerinde yetiştirilen ve Dünya' nın farklı ülkelerinden getirilen toplam 55 oturak fasulye popülasyonu incelenmiştir. Popülasyonlar, bitki, çiçek, bakla ve tohum olmak üzere toplam 53 morfolojik ve agronomik özellik bakımından incelenmiş ve halen yetiştirilen çeşitler ile karşılaştırılarak aralarındaki farklılıklar ortaya konmuştur. Yapılan değerlendirmede popülasyonlar arasında bitki başına düşen bakla ve tohum verimi, bakla şekli ve tohum şekli, bin dane ağırlığı yönünden istatiksel anlamda farklılıklar görülmüştür. Popülasyonlar arasında, taze, kuru fasulye veya her iki tüketim şekline uygun genotipler belirlenmiştir. Bitki gözlemlerinden elde edilen her iki yıla ait veriler kullanılarak temel bileşen analizleri uygulanmış, birinci yılda varyasyonun %79.98'ü 7 faktör grubunda yer alırken ikinci yılda oluşan 7 faktör grubu varyasyonun %82.24'ünü temsil etmiştir. Elde edilen faktör grupları kullanılarak popülasyonların birbirlerine olan genetik uzaklıkları dendogramlarda gösterilmiştir. 32 SRAP markör kombinasyonu kullanılarak yapılan moleküler analizler sonucunda varyasyonun %83.03'ü 4 faktör grubunda yer almış ve genotiplerin genetik uzaklıkları %61 ile %98 arasında değişmiştir.

Abstract:
Investigation was carried out to determinate morphologic, agronomic and molecular traits of local bean populations which can be used in bean breeding programmes. For this purpose, local bean poulations and commercial cultivars collected from different regions of Turkey and the World. Fifty three morphologic and agronomic traits related with plant, flower, pod and seed properties of local dwarf beans were investigated and compared with the commercial  cultşvars.  Statistically significant variability was observed on the pods and seed yield per plant, pod and seed chracteristics and 1000 seed weight for both two years. There are several bean genotypes identified that can be used for fresh, dry consumption or both. Results of two years revealed that seven principal component axes. Seven factor groups represented 79.98% and 82.24% of the total variance for two years. In order to visualize genetic relationships among genotypes hierarchical clustering were performed using factor scores. Molecular traits recorded with 32 SRAP combination on all bean genotypes. The result of molecular traits 83.03% of total variance has taken place in 4 factor groups and genetically differences were changed between %61-%98 among bean genotypes.
Yanıt yüzey metodolojisine bayesçi lineer regresyon yaklaşımları
Bayesian linear regression approach in response surface methodology
Yazar: ELİF KOZAN
Danışman: PROF. DR. ONUR KÖKSOY
Ege Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / İstatistik Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2016
Konu: İstatistik = Statistics

Özet:
Bu tez kapsamında, süreç-dışı kalite geliştirme yaklaşımlarında önemli bir yaklaşım olan Yanıt Yüzey Metodolojisi ve önsel dağılım bilgisinin kullanılarak tahmin işleminin daha etkin yapıldığı Bayesçi Lineer Regresyon yaklaşımları birlikte ele alınarak farklı tahmin ediciler için sonuçlar karşılaştırılmıştır. Bu aşamada, yanıt yüzeylerde Bayesçi regresyon tahmin edicisi olarak daha önceden kullanılmamış olan bir tahmin edicinin sonuçları incelenmiştir. Uygulama bölümünde WINBUGS paket programından yararlanılmıştır.
Yanıt yüzey modellerinde, klasik regresyon uygulaması yerine, Bayesçi regresyon yaklaşımının uygulanmasının temel sebeplerinden biri, yanıt fonksiyonu ile ilgili belirsizliği önsel olasılık dağılımları aracılığı ile açıklayarak daha gerçekçi bir model elde etme çabasıdır. 
 Bayesçi yaklaşımda bilinmeyen parametre rasgele değişken olarak alındığından, bu yaklaşım günlük hayat problemlerine daha iyi cevap verebilmektedir. Ayrıca, literatürde yer alan çalışmalar sonucunda, önsel dağılım bilgisi ile tahmin işleminin daha güçlü ve gerçeğe yakın olduğu görülebilmektedir. Yanıt yüzey metodolojisinde Bayesçi regresyon sayesinde klasik regresyon yolu ile elde edilen sonuçlardan daha gerçekçi alternatif sonuçlar elde edilebildiği görülmektedir.

Abstract:
In this study, Response Surface Methodology, an essential approach off-line quality improvement, and Bayesian Linear Regression, an approach which uses the prior information to make a more efficient inference, are considered together. Results for different estimators compared. In this context, results for an estimator are examined which seems to be not used before as an estimator for Bayesian regression with response surfaces in the literatüre.
In response surface models, one of the main reasons for using the Bayesian Regression rather than Classic Regression, is to achieve a better model by explaining the uncertainty of the response function with prior distributions. 
Bayesian approach can give better answers to daily life problems since it takes the unknown parameter as a random variable. Also, the studies in the literature shows that the estimation becomes more powerful and realistic while using the prior distribution information. By using Bayesian regression, in response surface moethodology, it seems that more realistic results can be obtained by comparison with the results derived using classic regression.
Araç klimalarında yeni soğutucu akışkanlar kullanımının termodinamik ve deneysel analizi
Thermodynamic and experimental analysis of using of the new refrigerants at vehicle air conditioning units
Yazar: HAKAN YALDIRAK
Danışman: PROF. DR. ALİ GÜNGÖR ; YRD. DOÇ. DR. ÖZAY AKDEMİR
Ege Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Makine Mühendisliği Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2016
Konu: Makine Mühendisliği = Mechanical Engineering

Özet:
Bu tez çalışmasında bir minibüs klima cihazı  tasarlayarak, iki farklı soğutucu akışkanın, R-1234yf ve R-134a'nın bu soğutma sistemindeki performanslarının değerlendirilmesi amaçlanmıştır.İklimlendirme sistemlerinde kullanılan soğutucu akışkanlar, düşük küresel ısınma potansiyeline sahip, alternatif soğutucu akışkanlara olan ihtiyaç ve bu akışkanlara olan geçiş süreci, yapılan yasal düzenlemeler ışığında, incelenmiştir.Yeni geliştirilmiş olan R-1234yf soğutucu akışkan hakkında detaylı bilgi, literatürde yer alan çalışmalar ışığında verilerek, soğutma uygulamalarındaki kullanımı ortaya konmuştur. Sekiz farklı buharlaştırıcı sıcaklığı ve dört farklı yoğuşturucu sıcaklığı için ideal çevrim analizleri gerçekleştirilerek, kullanılacak olan dört soğutucu akışkanın, R-134a, R-1234yf, R-1234ze ve R-407C, bu şartlarda gösterecekleri performanslar değerlendirilmiştir.
Bir minibüs iç hacmi büyüklüğünde bir kabin ele alınarak, bu kabin için bir soğutma yükü analizi yapılmıştır ve Hesaplama sonucunda belirlenen 9 kW soğutma kapasitesine sahip bir sistem için, soğutma çevrimi analizleri bahsedilen soğutucu akışkanlar için gerçekleştirilecek, soğutma ekipmanlarının seçimi için gerekli hesaplamalar yapılmıştır. R-134a ve R1234yf soğutkanları için bu ana ekipmanların seçimi bu sonuçlar doğrultusunda gerçekleştirilmiştir.
Tezin sonunda tüm bulgular değerlendirilerek, R-1234yf'nin R134a soğutucu akışkanı ile çok yönlü karşılaştırmalar yapılmıştır.

Abstract:
In this thesis, it was aimed to design an Minibus air conditioning unit. In this context, utilization of two different refrigerants, R-1234yf and R-134a were assessed, theoretically.The need for low GWP refrigerants and the transition to these refrigerants were explained in a chronological order, while the legislations and restrictions were also considered.
The new refrigerant R-1234yf was explained in more detail and its utilization in refrigeration applications was presented. Ideal cycle analyses of     R-134a, R-1234yf, R-1234ze and R-407C, were performed at eight different evaporating and four condensing temperatures. Their performances were assessed and compared with each other.
Cooling load calculations were made for a volume of a minibus cabinnet and subsequently, the cooling cycle analyses of these four refrigerants at a cooling load of 9 kW were made for these two refrigerants. The main components of the system using R-1234yf and R134a were selected according to the results of the cycle analysis.
Finally, the findings were assessed and the performance of R-1234yf was compared to R134a multifaceted.
Sevkiyat süreçlerinde araç yükleme probleminin genetik algoritma yaklaşımı ile çözümü ve bir uygulama
The solution of vehicle loading problem in consigment processes with genetic algorithm approach and an application
Yazar: MURAT ESMERAY
Danışman: YRD. DOÇ. DR. AYDIN KOÇAK
Ege Üniversitesi / Sosyal Bilimler Enstitüsü / İşletme Ana Bilim Dalı / İşletme Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2016
Konu: İşletme = Business Administration
Dizin: Algoritmalar = Algorithms ; Genetik algoritmalar = Genetic algorithms ; Lojistik = Logistics ; Lojistik yönetim = Logistic management ; Sevkiyat = Dispatching ; Yükleme problemi = Loading problem

Özet:
Günümüzde rekabetin pek çok farklı boyutundan bahsedilebilmektedir ve bu yoğun rekabetçi ortamda rakipler arasındaki benzer süreçlerde yaratılan küçük farklılıklar olumlu sonuçları beraberinde getirebilmektedir. Üretim işletmelerinde gerçekleşen üretim maliyetlerinin birbirine yakın olması bu işletmeleri üretimin haricindeki süreçlerde de iyileştirme yapma zorunluluğuna itmektedir. Bu süreçler içerisinde ise lojistik temelli stratejiler önemli yer tutmaktadır. Lojistik yönetiminde kullanılan modern strateji ya da yöntemler ele alındığında ise sevkiyat yönetimi kavramı öne çıkmaktadır.
Bu nedenle bu çalışmada lojistik süreçlerinde ciddi maliyet avantajları sağlayabilecek sevkiyat yönetimi uygulamalarından araç yükleme problemi ile bu problemin çözümünde önemli bir optimizasyon yeteneği sağlayan genetik algoritma yöntemi bir arada ele alınmıştır.

Abstract:
Today many different dimensions of competition can be stated and within that highly  competitive conditions small differences that can be created in similar processes between competiors may lead to favorable results. Production costs of the production companies are so close to each other. Because of that fact production companies have to improve their processes besides production too. Within these processes logistics based ones have a major part.  The concept of consignment management becomes prominent between these modern strategies and techniques used logistics management
Because of that reason as one of the consignment management applications that can create important cost advantages in logisitcs processes, vehicle loading and genetic algorithm that can provide an important optimization ability for the solution of that problem are considered together.
BİS, FOUR Skalası ve Glasgow Koma Skalasının prognoz tahminindeki önemi
The predictive value of BİS, FOUR Scale and Glasgow Coma Scale on prognosis
Yazar: TARIK ÖZTÜRK
Danışman: PROF. DR. KUBİLAY DEMİRAĞ
Ege Üniversitesi / Tıp Fakültesi / Anesteziyoloji ve Reanimasyon Ana Bilim Dalı
Derece: Tıpta Uzmanlık, 2016
Konu: Anestezi ve Reanimasyon = Anesthesiology and Reanimation

Özet:
GİRİŞ VE AMAÇ:
Glasgow Koma Skalası (GKS) en yaygın şekilde bilinç durumunu değerlendirmek için kullanılan araçtır. Full Outline of Unresponsiveness (FOUR) Skor GKS'nın kısıtlı kaldığı konuları düşünülerek geliştirilen ve yoğun bakım hastalarında kullanışlı bulunan yeni bir skaladır. Bizim amacımız FOUR Skor'un komatöz hastalarda tutarlı mortalite tahmini yapıp yapamadığını saptamak ve Bispektral indeks kullanarak FOUR Skor'un GKS ile performansını kıyaslamak.
METOD:
Herhangi bir kafa travması sonrası ya da nörolojik şikayetleri olan 18 yaşın üzerinde düşük bilinç seviyesinde olan hastalar çalışmaya dahil edildi.
SONUÇLAR:
65 hastanın hepsi bu çalışmaya dahil edildi. Mortalite tahmin değeri Eğri Altı Alan
(EAA) GKS için 0.843±0.05 (0.74-0.94), FOUR Skor için 0.826±0.05 (0.71-0.93), BİS için 0.856±0.05 (0.74-097).
TARTIŞMA:
Bu yeni koma skalası (FOUR Skor) GKS'ından daha üstün değildir. Ancak,
GKS, BIS and FOUR Skor kombinasyonu ilk 24 saat mortalite tahmini yapmada değerlidir.

Abstract:
BACKGROUND AND AIM:
The Glasgow Coma Scale (GCS) is the most widely used tool for the
evaluation of the level of consciousness. The Full Outline of
Unresponsiveness (FOUR) Score is a new coma Scale that was developed
considering the limitations of the GCS, and has been found to be useful in
an intensive care setting. Our aim was to determine whether the Full
Outline of UnResponsiveness (FOUR) score is an accurate predictor of
mortality in comatose patients and to compare its performance to GCS
using with Bispektral indeks.
METHODS:
All patients older than 18 years who presented with an poor level of
consciousness, after any trauma to the head or with neurological
complaints were included in this study.
RESULTS:
A total of 65 patients were included in the study. Area under the curve
(AUC) values in predicting to mortality for GCS was 0.843±0.05 (0.74-
0.94), 0.826±0.05 (0.71-0.93) for FOUR Score and 0.856±0.05 (0.74-097)
for BIS.
DİSCUSSION:
The new coma Scale, FOUR Score, is not superior to the GCS. However,
the combination of the GCS, BIS and FOUR Score is a valuable tool that
can be used for predicting to mortality in first 24 hours.
Türkiye'nin sayısal fitocoğrafya haritası
Digital phytogeographical map of Turkey
Yazar: ÖMER FARUK ÜRKÜP
Danışman: DOÇ. DR. BİNTUĞ ÖZTÜRK
Ege Üniversitesi / Sağlık Bilimleri Enstitüsü / Farmasötik Botanik Ana Bilim Dalı / Farmasötik Botanik Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2016
Konu: Botanik = Botany

Özet:
"TÜRKiYE'NiN SAYISAL FiTOCOĞRAFYA HARiTASI"
Flora araştırmalarının biyoçeşitlilikten beslenen tüm disiplinler içinde 
doğal kaynak araştırmalarının en önemlilerinde olduğu bilinmektedir. Her
dönem ve disiplin, kendi bilgi birikimi ve teknolojisiyle, elde edilen değerli
örnekleri ve bunlara ait bilgileri derlemeye, kayıt altına almaya, korumaya ve
yönetmeye çabalamıştır. Günümüzde bu çabaya bilgisayarlar, yazılımlar,
veritabanları, dijital kameralar, GPS sistemleri ve internet de dahil olmuştur.
Bu çalışmada, Türkiye Florası‟nda doğal yayılış gösteren bitki
taksonlarına ait ana kaynaklarda yer alan lokalitelerin bir veritabanına
kaydedilmesi ve bu bilgilerin, web tabanlı coğrafi bilgi sistemi servisleri
üzerinden yönetilmesi ve sunulması amaçlanmıştır.
11.707 taksona ait 100.000 den fazla lokalite bilgisi yanında, bu 
taksonların yayılış alanlarının tümünü klasik fiziki bir haritaya kaydetme 
olanağı bulunmamaktadır. Bu bağlamda çalışmamız Türkiye Florası 
Bitkileri‟nin tamamının sayısal bir fiziki harita üzerinde gösterilebilip 
sorgulanabildiği tamamlanmış Türkiye‟nin ilk sayısal fitocoğrafya haritası 
olma niteliğindedir.

Abstract:
"DIGITAL PHYTOGEOGRAPHICAL MAP OF TURKEY"
It has been known that flora researches are one of the most important 
researches of the natural resources. Every period and discipline, with their 
own knowledge and technology, have made effort for collecting, chaining, 
conserving and managing of the valuable samples obtained and the 
information of them. Today, this effort has included computers, software, 
databases, digital cameras, GPS systems and the Internet. 
In this study, it is aimed to record the localities of main sources 
belonging to plant taxa showing natural distribution in Flora of Turkey to a 
database and to manage and present this information through web based 
geographic information system services.
Besides the information of more than 100,000 localities belonging to 
11,707 taxa, there is no possibility to record all the distribution areas of these 
taxa in a classical physical map. In this context, our study is the first digital 
phytogeography map of Turkey which is completed and can be displayed on 
a numerical physical map of Flora of Turkey plants.