Hemolitik üremik sendrom tanılı hastalardan izole edilen shiga toksin üreten escherichia coli izolatlarının o serotiplerinin ve toksin varyantlarının klinik durumla ilişkisinin araştırılması
Investigation of the relationship between o serotypes and toxin variants of shiga toxin producing escherichia coli isolated from patients with hemolytic uremic syndrome and clinical status
Yazar: ELİF OKUMUŞ
Danışman: PROF. DR. AYNUR KARADENİZLİ
Kocaeli Üniversitesi / Tıp Fakültesi / Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
Derece: Tıpta Uzmanlık, 2021
Konu: Mikrobiyoloji = Microbiology
Dizin: Escherichia coli = Escherichia coli ; Hemolitik üremik sendrom = Hemolytic uremic syndrome ; Retrospektif çalışmalar = Retrospective studies ; Shigellalar = Shigella ; Toksinler = Toxins

Özet:
Hemolitik Üremik Sendrom Tanılı Hastalardan İzole Edilen Shiga Toksin Üreten Escherichia coli İzolatlarının O Serotiplerinin ve Toksin Varyantlarının Klinik Durumla İlişkisinin Araştırılması
Giriş ve Amaç
    STEC komplike olmayan ishalden, hemorajik kolite, Hemolitik Üremik Sendrom'a kadar değişen farklı klinik durumlara yol açmaktadır. STEC çeşitli serotiplere ve toksin varyantlarına sahiptir. STEC'in serotipler ve toksin profillerinin belirlenmesi, hastalığa neden olma potansiyellerini tahmin etmek ve epidemiyolojik değişiklikleri öngörmek için büyük önem taşımaktadır. Bu çalışmada HÜS hastalarından izole edilen STEC izolatlarının O serotip ve Stx gen profilinin saptanması, bu profilin hastanın klinik ve laboratuvar verileriyle ilişkisinin araştırılması amaçlanmıştır. 
Gereç ve Yöntem
    Shiga toksini pozitif tespit olan 46 hastadan alınan dışkı örnekleri SMAC ve CT-SMAC ağara ekim yapılarak STEC izolatları tespit edilmiştir. STEC izolatından kaynatma yöntemi ile DNA izolasyonu yapılmıştır. O serotiplendirme ve toksin varyantlarının belirlenmesi PZR yöntemi ile belirlenmiştir. Klinik veriler klinik bilgi formları aracılığı ile toplanmıştır. Verilerin analizi SPSS programı kullanılarak gerçekleştirilmiştir.

Bulgular
Shiga toksini pozitif olan 46 STEC hasta içerisinde en sık saptanan O serotip O145 (%32,6)'tir. Hastaların %50'sinde Stx2a tespit edilmiş olup, Stx2a varyantının tespit edildiği hastalar, diğer varyantların tespit edildiği hastalar ile karşılaştırılmıştır. Stx2a tespit edilen hastalarda istatistiksel olarak anlamlı düzeyde makroalbuminüri gelişmiştir (p=0,01). Stx2a tespit edilen hastalarda gastrointestinal şikayetlerin başlamasıyla başvuru arasında geçen süre daha kısa olarak saptanmıştır (p=0,00). Stx2a tespit edilen hastalarda hastanede yatış süresi daha uzun bulunmuştur (p=0,01).  Kanlı ishali olanlarda lökositoz ve transfüzyon ihtiyacı daha fazla olarak tespit edilmiştir (p<0,05). Makroalbuminürisi olan, HÜS'e bağlı hipertansiyon gelişen, diyaliz ihtiyacı olan veya nörolojik komplikasyonu olan hastalarda hastanede yatış süresi daha uzun olarak saptanmıştır (p<0,05). Başvuru sonrası antibiyotik kullanım durumunda diyaliz ihtiyacı ve nörolojik komplikasyonlara daha sık rastlanılmıştır (p<0,05).Başvuru sonrası antibiyotik kullanım durumunda ishal süresi daha kısa, hastanede yatış süresi daha uzun olarak tespit edilmiştir (p<0,05).
Sonuç
    Bu çalışma STEC ilişkili HÜS'te serotiplerin ve toksin varyantlarının dağılımı ve bunların klinik profil ile ilişkisine dair ilk çalışmadır. Toksin varyantının belirlenmesi hastaların klinik profilini etkilemektedir. HÜS tanılı hastalarda Stx varyantlarının belirlenmesi hastaların klinik prognozu için haber vericiolduğunu düşünmekteyiz.

Abstract:
Investigation of the Relationship Between O Serotypes and Toxin Variants of Shiga Toxin Producing Escherichia coli Isolated from Patients with Hemolytic Uremic Syndrome and Clinical Status
Introduction and Purpose    
    STEC leads to different clinical situations ranging from uncomplicated diarrhea to hemorrhagic colitis and Hemolytic Uremic Syndrome. STEC has a variety of serotypes and toxin variants. The determination of serotypes and toxin profiles of STEC has great importance to predict their potential to cause disease and to predict epidemiological changes. In this study, it was aimed to determine the O serotype and Stx gene profile of STEC isolates isolated from HUS patients and to investigate the relationship of this profile with the clinical and laboratory data of the patients.
Materials and Methods
    Stool samples taken from 46 patients with positive Shiga toxin were inoculated on SMAC and CT-SMAC agar to determine STEC isolates. DNA isolation was performed from STEC isolates by boiling method. O serotyping and determination of toxin variants were determined by PCR method. Clinical data were collected through clinical information forms. The analysis of the data was carried out using the SPSS program.
Results
    Among the 46 Shiga toxin positive STEC patients, O145 (32.6%) was the most frequent serotype detected. Stx2a was detected in 50% of the patients, and the patients in whom the Stx2a variant was detected were compared with the patients in whom other variants were detected. Statistically significant macroalbuminuria developed in patients with Stx2a (p = 0.01). The time between the onset of gastrointestinal complaints and admission was found shorter in patients with Stx2a (p = 0.00). The duration of hospitalization was found longer in patients with Stx2a (p = 0.01). Leukocytosis and need for transfusion were found to be higher in those with bloody diarrhea (p <0.05). 
The duration of hospitalization was found to be longer in patients with macroalbuminuria, hypertension due to HUS, in need of dialysis, or neurological complications (p <0.05). In the case of antibiotic use after admission, the need for dialysis and neurological complications were observed more frequently (p <0.05). In case of antibiotic use after admission, the duration of diarrhea was shorter and the duration of hospitalization was longer (p <0.05).
Conclusion
    This study is the first study on the distribution of serotypes and toxin variants in STEC-associated HUS and their relationship with the clinical profile. Determination of the toxin variant affects the clinical profile of the patients. Determining the Stx variants in patients with a diagnosis of HUS may inform the clinical prognosis of the patients.