hakansabunis/tr-academic-research-agent-index huggingface dataset:
Çeşitli çevresel örneklerden mayaların izolasyonu, identifikasyonu ve organik solvent toleransının belirlenmesi
Isolation, identification of yeasts from various environmental samples and determination of organic solvent tolerance
Yazar: İHSAN CEM GÜNAY
Danışman: DOÇ. DR. HÜSNİYE TANSEL YALÇIN
Ege Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Biyoloji Ana Bilim Dalı / Temel ve Endüstriyel Mikrobiyoloji Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2019
Konu: Biyokimya = Biochemistry ; Biyoloji = Biology ; Mikrobiyoloji = Microbiology
Dizin: Maya hücreleri = Yeast cells ; Maya öldürücüler = Yeast killer ; Maya özütü = Yeast extract ; Mayalanma =   ; Mayalar = Yeasts

Özet:
Çalışmamızda 2017 başlarında Çeşme açıklarında gerçekleşen yük gemisi kazası sonucu ham petrol kontaminasyonun en çok gerçekleştiği Paşa Limanı, Ildır, Ilıca Yıldız Burnu'ndan deniz suyu ve deniz kenarı sediment örnekleri ile gemi trafiğinin olduğu İzmir Üçkuyular İskelesi'nden örnekler alınmıştır. Toplanan örneklerden 49 adet maya izole edilmiştir. Bu izolatlardan 25 tanesinin genotipik olarak tanılaması 5,8 ITS-PCR ile yapılmıştır.Dizi analizi sonucunda, 7 tanesi Geotrichum candidum, 6Candida tropicalis, 6 Torulaspora delbrueckii, 2 Pichia kudriavzevii, 1Pichia sp., 1 Galactomyces candidum, 1 Debaryomyces hansenii, 1  tanesi ise Saccharomyces cerevisiae olarak tanılanmıştır.Tanısı yapılan maya strainlerinin n-heptan, siklohekzan, benzen ve kloroform organik solventlerine karşı toleransı belirlenmiştir.Candida tropicalis (Ü1, Ü2, ICS4, ICS 5, IB2S3, IB3S4), Torulaspora delbrueckii(PW1, PW2, PW6, PW8, PW9, PW12), Pichia kudriavzevii(Ü9), olarak tanılanan 13 maya strainin  n-heptana, Torulaspora delbrueckii olarak tanılana PW1 numaralı strainin ise  siklohekzana da tolerans gösterdiği bulunmuştur. Benzen ve kloroform varlığında, büyüme gösteren maya straini belirlenmemiştir.

Abstract:
In our study, sea water and seacoast sediment samples were taken from Pasha Port, Ildır, Ilıca Yıldız Burnu where the crude oil contamination occurred most frequently as a result of cargo vessel accident in Çeşme in early 2017 and samples were taken from İzmir Üçkuyular Pier where there is ship traffic flow. 49 yeasts were isolated from the collected samples. Genotypic identification of 25 of these isolates was made by 5.8 ITS-PCR. As a result of sequence analysis, 7 of the products were identified as Geotrichum candidum, 6 Candida tropicalis, 6 Torulaspora delbrueckii, 2 Pichia kudriavzevii, 1Pichia sp., 1 Galactomyces candidum, 1 Debaryomyces hansenii and 1 of the PCR productswas identified asSaccharomyces cerevisiae. The tolerance skills to organic solvents; n-heptane, cyclohexan, benzene and chloroform of identified yeast strains were determined. Yeast strains tolerant to n-heptane; Candida tropicalis (Ü2, ICS4, ICS5, IB2S3, IB3S4), Torulaspora delbrueckii (PW1, PW2, PW6, PW8, PW9, PW12), Pichia kudriavzevii(Ü9),Geotrichum candidum (U1). The strain PW1, which is identified as Torulaspora delbrueckii, was also found to tolerate cyclohexane. In the presence of chloroform and benzene, no organism growth was determined
Çoklu frekans seçimli metal dedektör
Multi-frequency selective metal detector
Yazar: BAYCAN AKÇAY
Danışman: PROF. DR. AYDOĞAN SAVRAN
Ege Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Elektrik-Elektronik Mühendisliği Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2019
Konu: Elektrik ve Elektronik Mühendisliği = Electrical and Electronics Engineering

Özet:
Bu tezde; özel veya kamusal alanların güvenliğinin sağlanması için kullanılan Geçit Tipi Metal Dedektörleri' nin, hatalı metal tespiti ve elektromanyetik gürültülerden arındırılmalarını sağlamak amacıyla, bir Çoklu Frekans Seçimli Metal Dedektör tasarlanmıştır.

   Geçit Tipi Metal Dedektörleri' n de kullanılan tekli frekans yöntemi, cihazların elektromanyetik gürültülere karşı bağışıklığını azaltmakta, hatalı metal tespitine neden olmakta ve birbirlerine yakın mesafede çalışmalarına izin vermemektedir.

   Birden fazla frekans ile çalışabilen metal dedektörü tasarımı için sayısal ve analog işaret işleme devreleri ile denemeler yapılmış, sonuçları karşılaştırılmış ve karşılaşılan güçlükler 
belirtilmiştir. 

Anahtar sözcükler: Sayısal işaret işleme, Analog işaret işleme, Frekans seçimi.

Abstract:
In this thesis, a Multi-Frequency Selective Metal Detector is designed to ensure that the Walk-Through Metal detectors, which are used to ensure the security of public and private spaces, are free from electromagnetic noises, and faulty metal detection.

   The Single Frequency Method used in Walk-Through Metal Detectors reduces the immunity of the devices against electromagnetic noise, causes faulty metal detection, and does not allow them to work close to each other.
   
   For the design of the metal detector which can work with more than one frequency, experiments are made with both analog and digital signal processing circuits, the results are compared, and the difficulties encountered are discussed.

Keywords: Digital signal processing, analog signal processing, frequency selection.
Otofaji inhibitörü chloroquine uygulamasının, ipek böceği Bombyx mori'nin larval-pupal metamorfoz sürecinde, posterior ipek bezine olan etkilerinin araştırılması.
Investigation the effects of autophagy inhibitor chloroquine in posterior silk gland of silkworm Bombyx mori, during larval-pupal metamorphosis.
Yazar: NURCAN GÜRLER
Danışman: DOÇ. DR. NESRİN EBRU GÖNCÜ
Ege Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Biyoloji Ana Bilim Dalı / Zooloji Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2019
Konu: Biyoloji = Biology

Özet:
Holometabol böceklerde larval-pupal metamorfoz sırasında larvaya özgü doku ve organların dejenrasyonu programlı hücre ölümü yolu ile gerçekleşmektedir. İpek böceği, Bombyx mori'de bulunan ve larvaya özgü bir doku olan posterior ipek bezinin dejenerasyonu, hemolenfteki ekdisteroid seviyesinin artışına bağlı olarak otofaji ve apoptoz mekanizmalarının birlikteliği ile meydana gelir. Posterior ipek bezi ile yapılan çalışmalarda, otofajik hücre ölümünün prepupal dönemde görüldüğü, apoptozisin ise pupa aşamasının erken safhasında meydana geldiği belirtilmektedir.
Yapılan çalışmada, larval-pupal metamorfoz sürecinde ipekböceği Bombyx mori posterior ipek bezinde otofajinin rolü araştırılmıştır. Bu amaçla, 5. larval evrenin 7. ve 8. günlerinde otofaji inhibitörü olan klorokuin iki farklı dozda uygulanmış ve posterior ipek bezine olan etkileri incelenmiştir. Uygulamalar sonrasında Bradford yöntemi ile posterior ipek bezindeki total protein miktarı ve lizozomal bir enzim olan asit fosfatazın aktivitesi belirlenmiştir. Hematoksilen & eozin boyama ile boyanan posterior ipek bezine ait kesitler ışık mikroskobu altında incelenerek larval-pupal metamorfoz sırasında posterior ipek bezinde meydana gelen morfolojik değişimler gösterilmiştir.

Abstract:
Remodeling or completely elimination of larvae-specific tissues and organs in holometabolous insects occur with programmed cell death during larval-pupal metamorphosis. The degeneration of the posterior silk gland, which is a larval-specific tissue in the silkworm, Bombyx mori, occurs with interaction of autophagy and apoptosis mechanisms due to an increase in the level of ecdysteroid in the hemolymph. Studies in the posterior silk gland showed that, while autophagic cell death occurs during prepupal stage, apoptosis is observed in the early phase of pupa stage. 
In this study, the role of autophagy in silkworm, Bombyx mori posterior silk gland was investigated during larval-pupal metamorphosis. For this purpose, two different doses of chloroquine which is an autophagy inhibitor,  was applied  during  the day 7 and 8 of the  fifth larval stage  and then its effects on posterior silk gland was examined.  The total protein amounts of the posterior silk gland were determined by Bradford protein assay and the activities of the lysosomal enzyme acid phosphatase was detected. The posterior silk gland tissue sections which were stained with hematoxylin eosin were observed under light microscope and, morphological changes in the posterior silk gland during larval-pupal metamorphosis were shown.
Akusto-optik elastografi esaslı doku mekaniği görüntülemesi
Acousto-optic elastography based tissue mechanics imaging
Yazar: AYLA BURÇİN ŞİŞLİ
Danışman: PROF. DR. MEHMET ENGİN
Ege Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Biyomedikal Teknolojiler Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2019
Konu: Elektrik ve Elektronik Mühendisliği = Electrical and Electronics Engineering

Özet:
Koherent ışık teknikleri kullanan akusto-optik elastografi alanındaki bazı görüntüleme yöntemleriyle malzemelerin mekanik davranışları değerlendirilerek doku elastikliği belirlenebilmektedir. İlgili tümörü karakterize eden özelliklerden birisi de tümör dokusu elastikliğinin civardaki sağlıklı dokuya göre farklı olmasıdır. Bu tez çalışması ex-vivo koşullarda gerçekleştirilmiştir. Lazerle aydınlatılan tavuk göğsü (insan dokusu benzeri olarak) ve lezyon benzeri malzemeler piezoelektrik aygıtı ile titreştirilerek görüntüler alınmıştır. Bu dokuların titreşim özelliklerinin analizi ile karakteristik özellikleri çıkarılmaya çalışılmıştır. Bu çalışma, cilt kanserinin en tehlikeli ve en çok ölümle sonuçlanan türü 'malign melanom (MM)'un erken, doğru, güvenli ve ekonomik teşhisi için bir ön çalışma niteliği taşımaktadır. Tezin amacı, MM cilt kanserinin tanısına yardımcı olabilecek, doku elastikliğini belirleyen akusto-optik esaslı bir sistemin geliştirilmesidir. Çalışma, lezyon benzeri 4 farklı sertlikte malzeme için 2 farklı DC güç beslemesinde ve 3 farklı derinlik durumunda gerçekleştirilmiştir. İkincil beneklenme deseni esaslı olan bu çalışmada elde edilen görüntülere çapraz korelasyon ve DFT uygulanması ile elde edilen sonuçlar incelenmiş ve önerilen yöntemin belirli durumlarda pigmente lezyonun tespiti ve fiziksel karakterizasyonu için uygulanabileceği görülmüştür.

Abstract:
Tissue elasticity can be determined by evaluating the mechanical behavior of materials with some imaging methods in the field of acousto-optic elastography using coherent light techniques. One of the properties that characterize the tumor of interest is that the tumor tissue elasticity is different from the surrounding healthy tissue. This thesis study was performed ex-vivo. Laser-illuminated chicken breast (similar to human tissue) and lesion-like materials were pulsed with a piezoelectric device and then the images were taken. The characteristics of these tissues were tried to be extracted by the analysis of their vibration properties. This study is a preliminary study for the early, accurate, safe and economic diagnosis of 'malignant melanoma (MM)', the most dangerous and most fatal type of skin cancer. The aim of the thesis is to develop an acousto-optic based system that determines tissue elasticity, which can help diagnosis of MM skin cancer. The study was performed under 3 different depth conditions with 2 different DC power supply for 4 lesion-like materials with different rigidness. The results obtained by cross-correlation and DFT of the images obtained in the secondary speckle pattern based study were examined and it was seen that the proposed method can be applied for the determination and physical characterization of pigmented lesion under certain situations.
Cephe özellikleri açısından İzmir konutlarında cumba ve çıkma
Projection characteristics of facade in İzmir houses
Yazar: YASEMİN BARBOROS
Danışman: PROF. DR. İNCİ KUYULU ERSOY
Ege Üniversitesi / Sosyal Bilimler Enstitüsü / Sanat Tarihi Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2019
Konu: Mimarlık = Architecture ; Sanat Tarihi = Art History
Dizin: Balkon sistemleri = Balcony systems ; Cephe tasarımı = Facade design ; Cephe özellikleri = Facade properties ; Evler = Houses ; Konut = Dwelling house ; Konut mimarisi = Housing architecture ; Mimari özellikler = Architectural characteristics ; Çıkma = Projection ; İzmir = Izmir

Özet:
19. yüzyılda İzmir,  Levanten topluluklar, Ermeni, Rum ve Yahudi azınlıklar, gayri Müslüm Osmanlı tebaası, Kırım ve Balkanlar'dan gelen göçmenlerle kozmopolit bir yapıya kavuşmuştur. Kentin kozmopolit yapısı farklı kültürleri temsil eden mimari eserlerin meydana gelmesini sağlamıştır. 
Çalışma konumuz olan cumba ve çıkmalar ise bu kozmopolit yapının etkileri ile oluşan konutların en önemli mimari unsurlarıdır. 
Bu çalışmada amaç, bugüne kadar çeşitli araştırmalara konu olmuş İzmir konutuna çıkma açısından bakarak yeniden değerlendirmektir. Bir diğer amacımız ise her geçen gün yok olmakta olan İzmir'in eşsiz tarihi yapılarının ve İzmir'i İzmir evi yapan cumba ve çıkmalarının belgelenmesini sağlamaktır.
Çalışmamızda 19.yüzyıl-20.yüzyıl başına tarihlenen 82 adet konut ele alınmıştır. Söz konusu konutların genel fotoğrafları ile birlikte cumba ve çıkmalarının ayrıntılı fotoğrafları çekilip, çizimleri yapılarak zengin bir katalog oluşturulmaya çalışılmıştır. Değerlendirme bölümünde cumba ve çıkmalar konum, malzeme, form ve süsleme bakımından ayrıntılı olarak incelenmiştir. Elde edilen veriler sıralanarak çalışma sonlandırılmıştır.

Abstract:
Izmir has acquired a cosmopolitan identity in the 19th century as a result of Levantine communities, Armenian, Greek and Jewish minorities, non-muslim Ottoman people and immigrants from Crimea and the Balkans living together. Architectural works that are representative of various cultures came into existence thanks to the cosmopolitan nature of the city.
Projectings, which are in the focus of this study, are the most prominent architectural elements of the buildings that were influenced by the cosmopolitan nature of the city.
This study aims to analyze the widely studied Izmir houses from a projecting focused standpoint. Another aim of this study is to document the peerless historical Izmir houses which are slowly fading away, and the projectings which are the most prominent elements of Izmir houses.
82 houses which are dated to 19th and early 20th century are analyzed in this study. A comprehensive catalogue is created with the drawings and detailed photographs of the aforementioned buildings and their projectings. Projectings are analyzed in detail with regards to their position, material, form and ornamentation in the review chapter. The study ends with the presentation of the acquired data in the conclusion chapter.
Güney Ege'de Fethiye Körfezinde doğal ve yapay radyonüklit dağılımının incelenmesi
Distributions of  the natural and anthopogenic radionuclides from Fethiye Gulf in the South Aegean
Yazar: OĞUZHAN DERVİŞAĞAOĞLU
Danışman: PROF. DR. GÜNSELİ YAPRAK
Ege Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Nükleer Bilimler Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2019
Konu: Fizik ve Fizik Mühendisliği = Physics and Physics Engineering

Özet:
Granit, volkanik ve metamorfik kayaçların aşınarak (hava ve su etkisiyle) mekanik yolla kıyıya taşınması sonucu oluşan kıyı sedimentleri (plaj çökelleri, dalgalara ve akıntılara karşı direnç gösteren mineral birikintileridir ve bu çökellerin mineralojik ve radyolojik özelliklerinin jeolojik kökeninin yanı sıra jeolojik taşınma ve ayırma işlemlerini yansıttığı öne sürülmektedir. 
Bu çalışmada, Fethiye Körfezi  kıyı çökellerinde  (20 halk plajından sağlanan plaj kumları) radyometrik analizler gerçekleştirilerek, kıyı çökellerinin kaynağı ve taşınım proseslerinin incelenmesi hedeflenmiştir. Plaj kumlarındaki toryum, uranyum ve potasyum gama spektrometre sistemi kullanılarak değerlendirilmiştir. Elde edilen eTh/eU ve  eTh/K oranları, plaj kumlarının taşınması ve orijini üzerine önemli bilgiler sağlamıştır. Ayrıca, Fethiye Körfezi çevresinde 100 km boyunca, plaj kumlarının örneklenmesi, bu turistik bölgenin radyoaktivite seviyesinin radyolojik risk açısından değerlendirilmesini sağlamıştır.

Abstract:
Sediments are produced through weathering and erosion of either igneous or metamorphic rocks, are transported  to the cost  by winds and rivers, and finally deposited on beaches by the action of waves and currents. The composition of mineral and the radiological characteristic of the beach sand is then related to the source region and also to several other processes during the sedimentation cycle such as sorting and transportation.
In the present study, natural gamma radiation of beach sand deposits was measured along the coast of Fethiye Gulf (20 public beach), with the aim of studying the provenance and transport processes of sediments in this area. Concentrations of thorium, uranium and potassium in the beach sands were evaluated using gamma-ray spectrometry. The interpretations of eTh/eU and eTh/K ratios provide important information on the history of sorting processes for beach sands. Furthermore, the beach sand sampling  along the 100 km around the Fethiye Gulf allowed for evaluation of the radioactivity levels in terms of radiological risk assessments in this touristic region.
Manisa ili çekirdeksiz üzüm bağlarında ölükol hastalığı etmeni Phomopsis viticola izolatlarının bakırlı bileşiklere karşı duyarlılıkları üzerinde araştırmalar
Studies of the sensitivity level of dead-arm (Phomopsis viticola) disease against copper compounds on seedless grapes in Manisa province
Yazar: ZELİHA TALAN
Danışman: DR. ÖĞR. ÜYESİ NEDİM ÇETİNKAYA
Ege Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Bitki Koruma Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2019
Konu: Ziraat = Agriculture

Özet:
Phomopsis viticola, dünyanın bağ yetiştiriciliği yapılan bölgelerinde, asmanın çubuk ve yapraklarında zarara neden olan ölükol hastalığının etmenidir. Son yıllarda üreticiler ölükol hastalığının yönetiminde kullanılan geleneksel bakırlı bileşiklerin etkinliğinde azalma olduğunu bildirmişlerdir. Bu çalışmada          P. viticola'nın 29 farklı lokasyona ait izolatları bakır sülfat ve bakır hidroksit duyarlılığı açısından test edilmiştir. P. viticola izolatları Manisa (Turgutlu, Salihli, Alaşehir, Sarıgöl lokasyonlarını kapsayan 50 farklı bağdan 29 izolat elde edilmiştir)'daki Sultani Çekirdeksiz (Vitis vinifera L.) bağ alanlarında hastalık belirtilerinin görüldüğü çubuklardan elde edilmiştir. Etmenin duyarlılığını test edebilmek için miselyal gelişim alanı ölçülmüş ve bu değerlerden EC50 ve MIC değerleri hesaplanmıştır. 29 izolatın minimum engelleyen konsantrasyon (MIC) değerleri bakır sülfat için 1 ile 6 mM, bakır hidroksit için ise 10 ile 20 mM arasında bulunmuştur. İncelenen izolatlarda miselyal gelişimi %50 engelleyen konsantrasyon (EC50) bakır sülfat için ortalama 2.1 mM olarak hesaplanmıştır. Gözlemlenen 29 izolattan elde edilen sonuçlarda 7 izolatta duyarlılık azalışı ve 13 izolatta da duyarlılık saptanmıştır. Elde edilen sonuçlara göre bakır sülfat bakır hidroksitten daha iyi bir etki göstermiştir.

Abstract:
Cane and leaf blight of grapevines caused by the fungus P.viticola is an important disease in several viticultural regions of the world. In the recent years growers have reported a reduction in efficacy of copper compounds traditionally used to control cane and leaf blight. In this study, 29 isolates of P. viticola were tested for copper sulphate and copper hydrokside. The all isolates of P. viticola were isolated from infected cane (Vitis vinifera L. cv 'Sultana Seedless') obtained from vineyards in Manisa (Turgutlu, Salihli, Alasehir, Sarıgol (50 different locations screened and they were isolated 29 locations )) province. Copper sensitivity testing was done by measuring mycelial area and calculating EC50 and MIC values. Minimum inhibitory concentration (MIC) values for 29 isolates were found to range from 1 to 6 mM for copper sulphate to 10-20 mM for copper hydroxide. The mean of concentrations inhibiting 50% of growth (EC50) values for the studied isolates were 1.1 mM for copper sulphate. Results showed that of 29 isolates screened, 7 isolates were tolerant to copper sulphate and 13 isolates were sensivity to copper sulphate. According to results copper sulphate has shown a beter effect than copper hydroxide.
Narsisizm ve bağlanma stillerinin üniversite öğrencilerinde ilişki bağlanımını yordamadaki rolü
The role of Narcissism and attachment styles in prediction of relationship commitment in university students
Yazar: MİRALEM GÜR
Danışman: DR. ÖĞR. ÜYESİ MUSTAFA ÖZEKES
Ege Üniversitesi / Sosyal Bilimler Enstitüsü / Eğitim Bilimleri Ana Bilim Dalı / Rehberlik ve Psikolojik Danışmanlık Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2019
Konu: Eğitim ve Öğretim = Education and Training ; Psikoloji = Psychology
Dizin: Bağlanma = Attachment ; Bağlanma stilleri = Attachment styles ; Kişilik özellikleri = Personality traits ; Narsisizm = Narcissism ; Narsist Kişilik Envanteri = Narcissistic Personality Inventory ; Üniversite öğrencileri = University students

Özet:
Bu araştırmanın amacı, narsisizm ve bağlanma stillerinin üniversite öğrencilerinde ilişki bağlanımını yordanadaki rolünü araştırmaktır. 
Araştırmanın örneklemini, 2017-2018 eğitim-öğretim yılında Ege Üniversitesi'nde beş fakültede lisans düzeyinde eğitim gören ve romantik ilişkisi olan 322 öğrenci oluşturmaktadır. Araştırmada veri toplama araçları olarak, Kişisel Bilgi Formu, Narsistik Kişilik Envanteri, İlişki Ölçekleri Anketi ve İlişki İstikrarı Ölçeği kullanılmıştır. 
Araştırmanın bulguları, bağlanma stillerinden, kayıtsız bağlanma stilinin ilişki bağlanımını negatif ve İlişki İstikrarı Ölçeği alt boyutlarından olan seçeneklerin niteliğini değerlendirmeyi pozitif yönde yordadığı; saplantılı bağlanma stilinin ilişki yatırımının anlamlı bir yordayıcısı olduğu yönündedir. Narsisizm ile ilişki bağlanımı arasında anlamlı bir ilişki bulunmamış, ancak narsisizmin İlişki İstikrarı Ölçeği alt boyutlarından seçeneklerin niteliğini anlamlı bir şekilde yordadığı belirlenmiştir.

Abstract:
The aim of this study is to determine the role of narcissism and attachment styles in prediction of relationship commitment in university students.
In the present study, a sample was consisted of 322 university students who have a romantic relationship in 2017-2018 academic year, Ege University. The data were collected by Personal Information Form, Narcissistic Personality Inventory, Relationship Scales Questionnaire and the Investment Model Scale.
The results revealed that dissmissive attachmnet style was found as a significant and negative predictor of relationship commitment and positive predictor of the quality of alternatives. The significant predictor of investment(one of subscale of investment model scale) is preoccupied attachment style and narcissism total score is a significant and positive predictor of the quality of alternatives.