Kolorektal kanser etyopatogenezinde TNF süper ailesi 4 ile ilişkili mikroRNAların araştırması
Investigation of TNF superfamily 4 associated microRNAs in colorectal cancer etiopathogenesis
Yazar: DİLARA SÖNMEZ ZOR
Danışman: PROF. DR. İLHAN YAYLIM
İstanbul Üniversitesi / Sağlık Bilimleri Enstitüsü / Moleküler Tıp Ana Bilim Dalı / Moleküler Tıp Bilim Dalı
Derece: Doktora, 2023
Konu: Biyokimya = Biochemistry ; Moleküler Tıp = Molecular Medicine
Dizin: Etyopatogenez = Etiopathogenesis ; Kinürenik asit = Kynurenic acid ; Kinürenin = Kynurenine ; Kolorektal neoplazmlar = Colorectal neoplasms ; Mikro RNA = Micro RNA ; Neoplazmlar = Neoplasms ; Triptofan = Tryptophan ; Tümör nekroz faktörleri = Tumor necrosis factors

Özet:
Kolorektal kanser üzerine yapılan araştırmalarda tümör hücreleri transkripsiyon, translasyon ve sinyal transdüksiyonlarının kontrolü ile immün sistemden kaçış mekanizmaları geliştirdikleri kanıtlanmıştır. Bu nedenle yeni immün teröpatik hedeflerin belirlenmesi için, bağışıklık hücrelerinde, tümör mikro çevresinde ve metabolizmasında gerçekleşen değişiklikleri ve bunların regülasyonu birlikte araştırılmalıdır. Bizde çalışmamızda kolorektal kanserlerde, immün kontrol noktalarından OX40/OX40L ve OX40L'I hedefleyen miR-138-5p ile miR-181a-5p arasındaki ilişki ile IDO-1'I hedefleyen miR-153-3p'nin triptofan, kinurenin ve kinurenik asit 	üzerine etkisini araştırmayı hedefledik. Bu kapsamda kolon, polip ve kontrol gruplarına ait plazmalarda miR-138-5p, miR-181a-5p ve miR-153-3p ekpresyon seviyelerine kantitatif gerçek zamanlı polimeraz zincir reaksiyonu (qPZR) ile triptofan, kinurenin ve kinürenik asit düzeylerine yüksek performanslı sıvı kromotografisi (HPLC) ve sOX40/sOX40L seviyeline ise Enzim bağlı immünosorbent deneyi (ELİSA) yöntemi ile belirlenmiştir. Elde edilen bulgulara göre Gruplar arasında miR-138-5p, miR-181a-5p ve miR-153-3p ekspresyon düzeyleri incelendiğinde miR-138-5p anlamlı bir fark bulunamamışken miR-181a-5p ve miR-153-3p ekspresyonları istatistiksel olarak anlamlıdır (sırasıyla p=0,089; p=0,047, p=0,0021). Ayrıca HPLC analizi sonucu triptofan seviyesi gruplar kendi içinde incelenmiş olup, istatistiksel olarak anlamlı bulunmuştur (p=0,006).  KRK'li hastalara ait KYN ve KYNU düzeyleri yükseldikçe ile miR-138-5p, miR153-3p ve miR-181a-5p ifadeleri arttıkça tümör yarıçapında anlamlı artış gözlemlenmiştir (KYN; p=0,0002, KYNU; p<0,0001, miR-138-5p; p<0,0001, miR153-3p; p=0,0001, miR-181a-5p; p=0,0136). Ek olarak sOX40L düzeyinin yukarı-regülasyonu sonucu tümör çapı anlamlı bir şekilde azalma tespit edilmiştir (p=0,0003). Ayrıca tümör agresifliğiyle pozitif orantılı olan KYNA seviyesi ileri evre hastalarda erken evre hastalara nazaran anlamlı şekilde yüksektir (p=0,038).
Anahtar Kelimeler: Kolorektal Kanser, OX40/OX40L, Triptofan, Kinürenin, Kinürenik Asit, mikroRNA
Bu çalışma, İstanbul Üniversitesi Bilimsel Araştırma Projeleri Birimi tarafından desteklenmiştir. Proje No: Project No. TDK-2019-35003

Abstract:
In research on colorectal cancer, it has been proven that tumor cells develop escape mechanisms from the immune system by the control of transcription, translation and signal transductions. Therefore, changes in immune cells, tumor microenvironment and metabolism and their regulation should be investigated together to identify new immune therapeutic targets. In our study, we aimed the effect of relationship between miR-138-5p targeting OX40/OX40L and OX40L and miR-181a-5p and miR-153-3p targeting IDO-1 on tryptophan, kynurenine and kynurenic acid in colorectal cancers. In this context, the expression levels of miR-138-5p, miR-181a-5p and miR-153-3p in plasmas of colon, polyp and control groups were determined by quantitative real-time polymerase chain reaction (qPCR), tryptophan, kynurenine and kynurenic acid levels were determined by high performance liquid chromatography (HPLC) and sOX40/sOX40L levels were determined by Enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA) method. According to the findings, when the expression levels of miR-138-5p, miR-181a-5p and miR-153-3p were examined between the groups, no significant difference was found for miR-138-5p, while the expressions of miR-181a-5p and miR-153-3p were statistically significant. (p=0.089, p=0.047, p=0.0021, respectively). In addition, tryptophan level was statistically significant between the groups as a result of HPLC analysis (p=0.006). As KYN and KYNU levels of patients with KRK increased and miR-138-5p, miR153-3p and miR-181a-5p expressions increased, a significant increase was observed in tumor radius ( KYN; p=0.0002, KYNU; p<0.0001, miR-138-5p; p<0.0001, miR153-3p; p=0.0001, miR-181a-5p; p=0.0136). In addition, a significant reduction in tumor diameter was detected as a result of up-regulation of sOX40L level (p=0.0003). In addition, CGNA level, which is positively correlated with tumor aggressiveness, is significantly higher in advanced patients than in early stage patients (p=0.038).
Key Words: Colorectal Cancer, OX40/OX40L, Tryptophan, Kynurenine, Kynurenic Acid, microRNA
The present work was supported by the Research Fund of Istanbul University. Project No. TDK-2019-35003