Antalya ili biber yetiştiriciliğinde sorun olan Cucumber mosaic virus (CMV) ve tomato spotted wilt virus (TSWV) etmenlerinin yaygınlığının belirlenmesi ve bu etmenlerin serolojik, moleküler ve biyolojik karakterizasyonu
Determination of prevalence and serological, molecular and biological characterization of Cucumber mosaic virus (CMV) and Tomato spotted wilt virus (TSWV) problem on pepper growing in Antalya
Yazar: NİHAN GÜNEŞ
Danışman: PROF. DR. MUSTAFA GÜMÜŞ ; PROF. DR. SEMİH ERKAN
Ege Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Bitki Koruma Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2016
Konu: Mühendislik Bilimleri = Engineering Sciences

Özet:
Bu çalışmada 2015 yılı vejetasyon döneminde Antalya ili Kumluca, Demre,
Serik ve Aksu ilçelerinde örtü altında ve açık alanda üretimi yapılan biber
bitkilerinde enfeksiyona neden olan Cucumber mosaic virus ve Tomato spotted
wilt virus adlı viral etmenlerinin yaygınlığının belirlenmesi ve etmenlerin
serolojik, moleküler ve biyolojik karakterizasyonun gerçekleştirilmesi
hedeflenmiştir. Bu amaç için Kumluca ilçesinden 62, Demre ilçesinden 42, Serik
ilçesinden 26 ve Aksu ilçesinden 18 virüs benzeri belirti gösteren örnek
toplanmıştır. Uygulanan DAS-ELISA testi sonucunda toplanan 148 biber
örneğinin 11‟inde (%7.34) CMV ve 53‟ünde (%35.81) TSWV enfeksiyonu
olduğu saptanmıştır. Serolojik yöntemin sonuçları değerlendirilerek biyolojik
testler yürütülmüştür. DAS-ELISA testi sonucunda pozitif bulunan örnekler
CMV‟nin RNA 1 ve RNA 3; TSWV‟nin S RNA, M RNA ve L RNA segmentine
ait bazı bölgelerine spesifik primerler kullanılarak RT-PCR testi ile çoğaltılmıştır.
CMV izolatının farklı gen bölgelerinin gen bankasındaki diğer izolatlarla
benzerlik oranları %90-96 arasında bulunurken, TSWV izolatının %92-98
arasında değişmiştir. TSWV izolatı Türkiye, İtalya ve İspanya‟da biber
bitkilerinde Tsw dayanıklılığını kıran izolatlar ile %92-97 arasında değişen oranda
benzerlik göstermiştir.

Anahtar kelimeler: Cucumber mosaic virus (CMV), Tomato spotted wilt
virus (TSWV), DAS-ELISA, RT-PCR

Abstract:
This study was conducted to determine the prevalence and serological,
molecular and biological charachterization of Cucumber mosaic virus and Tomato
spotted wilt virus that cause infections in pepper plants growing in greenhouses
and open fields during vegetation period of 2015 in Antalya province including
Kumluca, Demre, Serik and Aksu districts. 62 samples from Kumluca, 42 samples
from Demre, 26 samples from Serik and 18 samples from Aksu were collected
from plants having virus-like symptoms. Out of collected 148 pepper samples 11
(%7.34) described as CMV and 53 (%35.81) as TSWV as a result of DAS-ELISA
test. After the evaluation of the results from serological tests, biological assays
were carried out by the selected virus isolates. Some regions on RNA 1 and
RNA 3 of CMV; S RNA, M RNA and L RNA of TSWV of DAS-ELISA positive
samples were amplifed by RT-PCR with specific primers. Similarity rates of
different regions of CMV isolate varied between %90-96 identity with other
isolates and TSWV isolate varied between %92-98. TSWV isolate showed
identity varied between %92-97 with Tsw resistance breaking isolates from
Capsicum plants in Turkey, Italy and Spain.

Keywords: Cucumber mosaic virus (CMV), Tomato spotted wilt virus
(TSWV), DAS-ELISA, RT-PCR