Edirne ili ara konaklarında Echinococcus granulosus antijen B polimorfizminin araştırılması
Investigation of Echinococcus granulosus antigen bpolymorphism in intermediate hosts in edirne province
Yazar: TANER TARLADAÇALIŞIR
Danışman: PROF. DR. NERMİN ŞAKRU
Trakya Üniversitesi / Tıp Fakültesi / Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
Derece: Tıpta Uzmanlık, 2022
Konu: Mikrobiyoloji = Microbiology
Dizin: Antijenler = Antigens ; Dizi analizi = Sequence analysis ; Echinococcus granulosus = Echinococcus granulosus ; Edirne = Edirne ; Genotip = Genotype ; Polimorfizm-genetik = Polymorphism-genetic

Özet:
Echinococcus granulosus insanlarda ve birçok çiftlik hayvanında kistik ekinokokkoz
etkenidir ve dünyada geniş bir dağılıma sahiptir. Kistik Ekinokokkoz, endemik bölge olan
Türkiye'de hala önemli bir halk sağlığı sorunudur. Bu çalışmanın amacı; Edirne İli ara
konaklarından elde edilen E.granulosus izolatlarının genotiplendirilmesi ve antijen B
polimorfizminin araştırılmasıdır.
Haziran 2020 ile Mayıs 2021 tarihleri arasında, Edirne İli'ndeki çeşitli hastanelerde
opere edilen veya PAIR işlemi uygulanan hastalardan 12 adet, aynı süre içinde kesimhanedeki
hayvanlardan toplanan 63 kist hidatik materyali olmak üzere toplam 75 hidatik kist materyali
çalışmaya alındı. Genotip belirleme amacıyla 12S rRNA gen bölgesi PCR ile çoğaltıldı.
Ardından seçilen örneklere mitokondriyal CO1ve ND1 gen bölgelerinin dizi analizi yaptırıldı.
Sonuçlar bölgede G1 (evcil koyun suşu), G2 (Tazmanya koyun suşu) ve G3 (manda suşuna)
olmak üzere 3 farklı genotip bulunduğunu gösterdi. Antijen B polimorfizminin belirlenmesi
için AgB1 ve AgB2 gen bölgelerine PCR-SSCP uygulandı ve ardından seçilen örneklere dizi
analizi yaptırıldı. Analiz sonuçları ve filogenetik çalışmalar her iki gen bölgesinde de
polimorfizm olduğunu gösterdi.
Mevcut çalışma Edirne İli'nde E. granulosus'un G1 genotipinin (evcil koyun suşu)
baskın genotip olduğunu, ikinci sıklıkta ise G3 genotipinin (manda suşu) olduğunu
göstermektedir. Yapılan çalışma, Türkiye'de G2 genotipinin (Tazmanya koyun suşu)
bulunduğunu gösteren ilk rapordur. Buna ek olarak G3 genotipinin (manda suşu) Trakya
Bölgesinde varlığını gösteren ilk rapordur. Ayrıca mevcut çalışma ile Trakya bölgesinde ilk kez
gerçekleştirilmiş olan antijen B polimorfizmi çalışması, bölgede antijen B polimorfizmini
belgeleyen ilk rapordur. Çalışma sonuçları Türkiye ve Dünya çapında; KE'den korunma ve
kontrol programlarına katkı sağlayacaktır.
Bu çalışma Trakya Üniversitesi Bilimsel Araştırma Projeleri Koordinasyon Birimi
tarafından desteklenmiştir.

Abstract:
Echinococcus granulosus is the causative agent of cystic echinococcosis in humans and
livestock. It has a wide distribution in the world. Cystic Echinococcosis is still an important
public health problem in Turkey, which is an endemic region. The aim of this study; Genotyping
of E.granulosus isolates obtained from Edirne province intermediate hosts and investigation of
antigen B polymorphism.
A total of 75 hydatid cyst materials were included in the study between June 2020 and
May 2021. Hydatid cyst materials were collected from 12 humans from various hospitals in
Edirne and 63 from animals in the slaughterhouse during the same period. The results showed
that there are 3 different genotypes in the region, these are G1 (domestic sheep strain), G2
(Tasmanian sheep strain) and G3 (buffalo strain). PCR-SSCP was applied to AgB1 and AgB2
gene regions to determine the antigen B polymorphism, and then sequence analysis was
performed on the selected samples. The results showed polymorphism in both gene regions.
The present study shows that domestic sheep strain (G1) of E. granulosus is the
dominant genotype in Edirne Province, while buffalo strain (G3) is the second most common.
The study is the first report showing the existence of the Tasmanian sheep strain (G2) in Turkey.
In addition, it is the first report showing that the buffalo strain (G3) has been found in the Thrace
region. The antigen B polymorphism study, which was carried out for the first time in Thrace
region with the present study, is the first report documenting antigen B polymorphism in Edirne
Province. The results of the study will contribute to the prevention and control programs of CE
in Turkey and worldwide.
This study was funded by Scientific Research Projects Coordination Unit of Trakya
University Project number: 2020/80.