hakansabunis/tr-academic-research-agent-index huggingface dataset:
Over kanserli hastalarda EMSY gen ve proteininin araştırılması
Investigation of EMSY gene and protein in patients with ovarian cancer
Yazar: JÜLİDE ALTINIŞIK
Danışman: PROF. DR. ALİ NUR TURGUT ULUTİN
İstanbul Üniversitesi / Sağlık Bilimleri Enstitüsü / Tıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
Derece: Doktora, 2008
Konu: Tıbbi Biyoloji = Medical Biology

Özet:
2003 yılında Hughes-Davies ve ark tarafından 11q13.5 bölgesine haritalanan EMSY geninin, sporadik meme kanserlerinde %13, over kanserlerinde %17 sıklıkla çoğaldığı ileri sürülmüştür. EMSY geni, 1322 amino asitten oluşan EMSY proteinini kodlar ve bu protein BRCA2'nin 3. eksonuna bağlanarak BRCA2-GAL4 füzyon proteininin etkinliğini baskılar. Sporadik meme ve over kanseri vakalarında EMSY geninin çoğalması sonucunda çok fazla miktarda EMSY proteini üretilmektedir. Fazladan üretilen bu proteinlerin BRCA2 ile etkileşerek hasarlı DNA'yı tamir etmesine engel olduğu ileri sürülmektedir. 
Çalışmada, 50 over tümöründe EMSY gen ifade artışı gerçek zamanlı PZR yöntemi ile, EMSY protein artışı Western Blot yöntemi kullanılarak araştırılmıştır. 
50 hastanın 6 tanesinde (%12) EMSY  gen ifade ve EMSY protein artışı saptanmıştır. Over tümörleri histolojik yapıların göre değerlendirildiğinde, seröz tipteki tümörlerde ifade artış sıklığı %12.5, müsinöz tip tümörlerde %14.3 bulunmuştur.
Sporadik over kanserlerinde EMSY gen ifade artışının bir risk etmeni olmadığı sonucuna varılmıştır.

Abstract:
EMSY gene, mapped to 11q13.5 by Hughes-Davies et al. was suggested to be amplified in sporadic breast and ovarian cancer with a frequency of %13 and %17, respectively. EMSY gene encodes EMSY protein of 1322 amino acids and this protein binds to exon 3 of BRCA2 and suppresses the activation of BRCA2-GAL4 fusion protein. In sporadic breast and ovarian cancer cases EMSY gene is amplified and excessive EMSY protein is created. This excess protein interacts with BRCA2 and prevents it from repairing damaged DNA.
In our study, EMSY gene overexpression and excessive EMSY protein was investigated with Real Time PCR and Western Blotting, respectively.
EMSY overexpression and increased EMSY protein was detected in 6 (%12) of 50 patients. The frequency of overexpression of the EMSY gene was found %12.5 and %14.3 in serous and mucinous types of epithelial ovarian tumors when evaluated with respect to the histological types of the tumors.
We conclude that EMSY overexpression is not a risk factor for sporadic ovarian cancers
Deprem sırasında şevlerde oluşan yatay deplasmanların Newmark yöntemi ile belirlenmesi
Determination of lateral displacement in slopes using Newmark analysis
Yazar: ÖZGÜN GÜNDOĞDU
Danışman: YRD. DOÇ. DR. İLKNUR BOZBEY
İstanbul Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / İnşaat Mühendisliği Ana Bilim Dalı / Geoteknik Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2008
Konu: İnşaat Mühendisliği = Civil Engineering

Özet:
Bu çalışmada deprem etkisi altındaki şevlerde oluşabilecek kalıcı deplasmanlar incelenmiştir. Bu amaçla öncelikle statik durumdaki şev stabilitesi ve daha sonra deprem etkisi ile birlikte şev stabilitesi konularına değinilmiştir. Statik ve depremli durumlar için mevcut stabilite analiz metodları özetlenmiştir.Deplasman hesapları için yapılan analizlerde Türkiye'de oluşmuş farklı büyüklüklerdeki ve farklı tarihlerde oluşmuş 50 adet deprem kaydı kullanılmıştır. Elde edilen veriler üzerinde literatürde önceden sunulmuş deplasman bulmaya yönelik Newmark yöntemine dayalı eşitlikler ile yapılan hesaplamalar sonucunda tüm veri kümesi değerlendirilmiştir.Kullanılan deprem kayıtları değişik büyüklüklere, uzaklıklara, derinliklere ve maksimum ivmelere sahip depremlerden oluşmaktadır. Bu şekilde depremlere ait tüm bu değişkenlerin bir şevde oluşabilecek deplasmanlara etkileri incelenmiştir. Bunun yanında depremlerin kayıt içeriğine özgü karakteristik parametreleri de çalışma içersinde yer almaktadır.Bu çalışma sonucunda şevlerde deprem etkiyle oluşabilecek kalıcı deplasmanları belirlemede Newmark yöntemi ve bunu temel alan çalışmaların günümüzde oldukça önemli bir yeri olduğu görülmüştür. Analizler sonucunda bu çalışmaya özgü olarak elde edilen formüller ve bunlara bağlı bazı yaklaşımlar deplasman hesaplamalarında oldukça pratik sonuçlar vermektedir. Elde edilen sonuçların spesifik olarak herhangi bir şevdeki deplasmanları hesaplamaktan ziyade mikrobölgeleme gibi çalışmalarda ekili olarak kullanılabilir.

Abstract:
In this study, permenant slope displacements due to seismic loading are investigated. In this context, static slope stability and seismic slope stability analyses are summarised and different approaches used are given.This study uses Newmark?s method in calculation of the slope displacements. For displacement analyses, 50 strong motion records from Turkish earthquakes are used. Data which is used contains values from different earthquakes with different magnitude, distance, depth and peak accelerations. It is necessery to analyze effects of these factors to displacement of the slope.The data is also analyzed in order to find the characteristics of the earthuake motion. The data obtained is then used to derive formulations for calculation of slope displacements. The results obtained are compared with the methods in the literature.The results of the study reveal that slope displacements calculated by Newmark?s method can be used in microzonation studies.
Dmitri Schostakovih'in Op.107 No:1 Mi Bemol Majör Viyolonsel Konçertosu'nun yapısal ve teknik açıdan incelenmesi
The structural and technical evulation of Dmitri Shostakovich?s op.107 No.1 E flat major Violoncello Concerto
Yazar: ZEYNEP GÖZDE ÖCAL
Danışman: PROF. SEVİL GÖKDAĞ
İstanbul Üniversitesi / Sosyal Bilimler Enstitüsü / Müzik Ana Sanat Dalı / Yaylı Çalgılar Sanat Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2008
Konu: Müzik = Music
Dizin: Bestekarlar = Composers ; Besteler = Compositions ; Konçerto = Concerto ; Müzik = Music ; Müzik eserleri = Music works ; Schostakovih, Dmitri = Schostakovih, Dmitri ; Viyolonsel = Cello ; Yaylı çalgılar = String instruments ; Çalgılama teknikleri = Instrumentation techniques

Özet:
Bu tezin konusu, 25.09.1906 ? 09.08.1975 yılları arasında yaşamış olan 20. yüzyılın ünlü Rus bestecisi Dmitri Dimitryevich Shostakovich'dir. Altı bölümden oluşan tezin içeriği; hayatı, başlıca yapıtları, aldığı unvan ve ödülleri, 20. yüzyıl müziğine genel bakış ve Birinci Viyolonsel Konçerto'sunun ayrıntılı analizidir. Bestecinin 20. yüzyıl müzik tarihindeki konumu ve yüzyıl müziğine katkıları yanında, geliştirdiği özgün besteleme teknikleri üzerinde durulmuş ve aldığı eleştirilerin, bestelerine yaptığı etkiler vurgulanmıştır.

Abstract:
The subject of this thesis is the twentieth. century's most famous Russian composer, Dmitri Dimitryevich Shostakovich who lived between 25.09.1906- 09.08.1975. The thesis's outlook contains six parts; The life of the composer, his compositions, his achievements, the general outlook of the twentieth century's music and the detailed analysis of the First Cello Concerto. Beside the composer's position and his contributions to the twentieth century music; it is also highlighted on the original composition tecniques developed by him and the effects of the critisim which reflected on his compositions.
Resveratrol ve klorimipramin'in HL-60 lösemi hücre kültürlerinde gemsitabin sitotoksisitesi üzerine etkileri
In HL-60 leukemia cell culture, the effects of resveratrol and chlorimipramine on gemcitabine cytotoxicity.
Yazar: BURCU BİLTEKİN
Danışman: PROF. DR. AYHAN BİLİR
İstanbul Üniversitesi / Sağlık Bilimleri Enstitüsü / Histoloji ve Embriyoloji Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2008
Konu: Histoloji ve Embriyoloji = Histology and Embryology

Özet:
Çalışmamızda, antioksidan özelliği bilinen Resveratrol'ün, antineoplastik etkileri yeni ortaya çıkmaya başlayan bir trisiklik antidepresan olan Klorimipramin'in ve antineoplastik ilaç olarak kullanılan Gemsitabin'in ayrı ayrı ve bir arada kullanıldığında HL-60 lösemi hücre kültürlerinde sitotoksik etkileri araştırıldı.İlaçlar, 200,100,10 ve 1 µM'lık dozlarda 24,48 ve 72 saatlik sürelerle hücrelere uygulandı. Hücre çoğalma indeksi ve S fazında bulunan hücre oranları immünohistokimyasal boyalarla saptandı.Gemsitabin'in etkisinin zaman bağımlı olduğu Klorimipramin ve Resveratrol'ün ise doz bağımlı etkileri olduğu saptandı. Kombine uygulamalar sonunda kombinasyon gruplarının tek tek uygulamalara göre ilave veya sinerjistik bir sitotoksisite meydana getirmedikleri saptandı.Sonuç olarak; Gemsitabin, Klorimipramin ve Resveratrol'ün tek tek uygulamaları sonunda kontrol gruplarına göre anlamlı sitotoksik etki meydana getirdikleri, S fazı hücre oranlarını değiştirdikleri görülmüştür. Ancak birlikte uygulandıklarında ilave veya sinerjistik etki oluşturmadıkları saptanmıştır.Anahtar kelimeler: HL-60, Resveratrol, Klorimipramin,Gemsitabin, hücre kültürü.Bu çalışma, İstanbul Üniversitesi Bilimsel Araştırma Projeleri Birimi tarafından desteklenmiştir. Proje No: 849

Abstract:
In our study, cytotoxic effects of resveratrol which antioxidant features are well known, a tricyclic antidepressant, clomipramine which antineoplastic features were recently discovered and gemcitabine that is used as an antineoplatic drug were evaluated together and individually in culture of HL-60 leukemia cells.Drugs were treated in doses of 1, 10, 100 and 200 µM at 24 48 and 72 hours. Cell proliferation index and rates of S-phase cells were counted after immunhistochemical staining.Time depended effects of gemcitabine, dose depended effects of chlorrimipramine and resveratrol were documented. After combined treatment, in combination groups there were no synergetic or additional effects when compared to individual treatment of drugs.In conclusion, individual treatment of gemcitabine, chlorimipramine and resveratrol showed remarkable cytotoxic effects and caused changes in rates of S-phase cells compared to control groups. However, when they applied together additional or synergetic effects were not detected.Key Words:HL-60, Resveratrol,Chlorimipramine,Gemcitabine, Cell culture.The present work was supported by the Research Found of Istanbul University. Project No:849
Sayısal mammografi görüntülerinin iyileştirilmesi
Enhancement of mammography images
Yazar: ALİ ÜLGEN
Danışman: PROF. DR. OSMAN NURİ UÇAN
İstanbul Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Biyomedikal Mühendisliği Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2008
Konu: Biyomühendislik = Bioengineering ; Elektrik ve Elektronik Mühendisliği = Electrical and Electronics Engineering

Özet:
Dünyanın birçok ülkesinde kadınlar arasında önde gelen ölüm nedenlerinde biri göğüs kanseridir. Çağdaş tanı ve tedavi yöntemleri sayesinde meme kanseri hastalığında önemli derecede ilerleme kaydedilmiş, son 10 yılda standart görüntüleme teknolojisi ve analog mamografi cihazları kullanılarak erken teşhis konulması sayesinde meme kanserine bağlı ölümlerde azalma görülmüştür. Klinik uygulamalarda yeni teknoloji olarak artık dijital mamografi kullanılmaktadır. Bu teknolojinin yüksek uzaysal ve kontrast çözünürlüğüne gereksinimi dolayısıyla, çok düşük piksel ve düşük sinyal-gürültü oranına ihtiyaç duyar. Dijital versiyonun analog mamografiye oranla çok daha üstün bir dinamik aralığı ve doğrusallığı vardır. Dijital mamografi bize analogda olmayan kontrast ayarı, dijital arşiv ve CAD (Computer Aided Diagnosis) gibi ilave kolaylıklar sağlamaktadır. Bu özellikleri kullanarak mamogramların benign (iyi huylu tümör), malign (kötü huylu tümör) veya normal olarak sınıflandırılmasının üstesinden gelmek ve analiz yapmak mümkündür

Abstract:
Breast cancer remains a leading cause of cancer deaths among women in many parts of the world. Contemporary diagnosis and treatment of breast cancer has noticeably improved the outcome of disease, reducing death rates over the last decade by earlier detection using standard breast imaging technology, film-screen X-ray mammography. Digital mammography is the new technology most certain to see clinical use, but it has been a long time coming. With its high spatial and contrast resolution requirements, mammography demands very small pixels and a high signal-to-noise ratio. The digital version of the technology has superior dynamic range and linearity compared to film, leading to better contrast resolution. Digital mammography provides additional features not available with standard film-screen mammographic imaging such as contrast enhancement, digital archiving, and computer-aided diagnosis. To analysis mammograms and overcome classification of benign, malign and normal ones, selection the best features from the images for classification and extraction should be done
İş Hukukunda sözleşmenin iradi devrinin esasları ve uygulaması
The principles and practice of voluntary transfer of rights and obligations arising from a contract under employment law
Yazar: MEHMET ANIL ARSLANOĞLU
Danışman: YRD. DOÇ. DR. ALİ KEMAL SAYIN
İstanbul Üniversitesi / Sosyal Bilimler Enstitüsü / Çalışma Ekonomisi ve Endüstri İlişkileri Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2008
Konu: Çalışma Ekonomisi ve Endüstri İlişkileri = Labour Economics and Industrial Relations
Dizin: Devir = Turnover ; Devir sözleşmesi = Contract of transfering ; Sözleşmeler = Contracts ; İş hukuku = Labour law ; İş sözleşmesi = Employment contract ; İşveren = Employer ; İşyeri devri = Workplace transferring

Özet:
İş Hukukunda Sözlesmenin iradi Devrinin Esasları ve Uygulaması? baslıklı buçalısmamızda, is hukukunda önemli sorunları gündeme getiren isveren degisikligihallerinden bir tanesi incelenmeye çalısılmıstır.iş hukukunun daha çok tekdüze ve katı olan hukuki yapısının gelismeye açık veyenilikçi bir anlayısa dönüsmeye baslaması ile gittikçe yaygınlasan ve çalısmahayatında görülen ihtiyaçların bir sonucu olarak beliren iradi devir, is hukukundagörülen üçlü is iliskilerinden bir tanesidir. Bu sekilde is sözlesmesinin isveren tarafıdegismektedir. iş sözlesmesinden kaynaklanan bütün hak, alacak ve borçlar kuralolarak devralan isverene geçmektedir. Ancak is sözlesmesinin hukuki niteligindenkaynaklanan sebeplerle, devir ile isçi tarafının degismesine olanak bulunmamaktadır.

Abstract:
In our study, headed " The Principles and Practice of Voluntary Transfer of Rightsand Obligations Arising from a Contract under Employment Law", one of the changeof employer cases which brings up major problems in employment law is analysed.Voluntary Transfer of Rights and Obligations Arising from a Contract has becomewidespread by employment law's monotonous and tough legal structure starting toturn out to be open to developments and innovative. It also appears as the result ofthe requirements of work life and is one of the trio employment relationships seen inemployment law. This way, the employer changes. In principle, all the rights,receivables and debts arising from the employment contract pass to the transfereeemployer. However, it is not possible for the employee to change because of thereasons arising from the legal character of the employment contract.
Tedarik zinciri yönetiminde tedarikçinin yönettiği stok ve bir uygulama
Vendor managed inventory in supply chain management and an application
Yazar: NEBİ YÖRÜK
Danışman: DOÇ. DR. ŞAKİR ESNAF
İstanbul Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Endüstri Mühendisliği Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2008
Konu: Endüstri ve Endüstri Mühendisliği = Industrial and Industrial Engineering
Dizin: Tedarik zinciri yönetimi = Supply chain management

Özet:
Bu çalışmada, geleneksel tedarik zinciri yönetimi modeline bir alternatif olarak geliştirilen tedarikçinin yönettiği stok sistemi incelenmiştir. TYS sisteminin faydalarını anlayabilmek için öncelikle tedarik zinciri, stok ve stok modelleri hakkında literatür çalışmaları derlenmiştir. Ardından TZY sistemi içerisinde yer alan yeni modellerden bahsedilmiş ve bu modellerden bir tanesi olan TYS sistemi detaylı olarak analiz edilmiştir.Çalışmanın daha iyi anlaşılması için geleneksel sistemde yer alan ekonomik sipariş miktarı modeli incelenmiş ve ESM modelinin TYS sistemi altında nasıl sonuçlar ortaya koyduğu beyaz eşya sektöründe yapılan bir uygulama ile aktarılmıştır.Çalışmanın sonucunda TYS sisteminin müşteriler için iyi bir dış kaynak kullanımı olduğu ve tedarikçi için de, elde bulundurma maliyetlerinin artmasına rağmen toplam sistem maliyetlerinde düşme sağladığı gözlemlenmiştir.

Abstract:
In this study, vendor managed inventory, as an alternative to traditional supply chain management model, is presented. To achieve the benefits of VMI system, firstly a literature research is been carried out for supply chain management, inventory and inventory control systems. Then, some new models in supply chain management are discussed and one of these models such as VMI, is analyzed widely.To be able to understand this study clearly, the economic order quantity model in traditional supply chain model is analyized and then the results of EOQ model under VMI is discussed with an application in white good industry.As a result of this study, it is been observed that, VMI system is better for the customer to outsource their operations and altough inventory holding cost is increased for the supplier, but the total system cost is reduced.
Özel istihdam bürolarının işgücü piyasasının düzenlenmesindeki karşılaştırmalı rolü
The comparative role of private employment agencies on the regulation of the labour market
Yazar: BUĞRAHAN ERKAN
Danışman: DOÇ. DR. TEKİN AKGEYİK
İstanbul Üniversitesi / Sosyal Bilimler Enstitüsü / Çalışma Ekonomisi ve Endüstri İlişkileri Ana Bilim Dalı / Endüstri İlişkiler ve İnsan Kaynakları Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2008
Konu: Çalışma Ekonomisi ve Endüstri İlişkileri = Labour Economics and Industrial Relations
Dizin: Geçici iş = Temporary  work ; Özel istihdam büroları = Private labour offices ; İstihdam danışmanlığı = Employment service ; İstihdam kurumları = Employment agencies ; İş ve İşçi Bulma Kurumu = Association of Work and Workman Foundation

Özet:
Bu çalışma, özel istihdam bürolarının işgücü piyasalarındaki etkinliklerinin Türkiye ile Avrupa Birliği ülkeleri açısından karşılaştırmasını amaçlamaktadır. Bu karşılaştırma, özel istihdam bürolarının bu ülkelerdeki istihdama etkilerini de ortaya çıkarmıştır. Çalışmada özel istihdam bürolarıyla ilgili bir alan araştırması yapılarak özel istihdam büroları, özel istihdam bürolarına başvuran adaylar ve özel istihdam bürolarının müşterisi olan firmalar incelenmiştir.

Abstract:
This study aims to compare efficiency of private employment agencies in Turkey and European Union countries. This comparison reveals effects of private employment agencies to employment in these countries. A field survey is done in this survey for analyse the private emloyment agencies, job candidates who apply to private employment agencies and clients firms of private employment agencies.
Yeniden yapılanma bağlamında Türkçe öğretiminde metin çalışmaları
Corcerning the reconstraction Turkish text exercises
Yazar: KAMER EĞİLMEZ
Danışman: PROF. TÜLİN POLAT
İstanbul Üniversitesi / Sosyal Bilimler Enstitüsü / Türkçe Eğitimi Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2008
Konu: Eğitim ve Öğretim = Education and Training
Dizin: Türkçe eğitimi = Turkish education ; Türkçe metinler = Turkish texts ; Yapılandırmacı öğretim yöntemi = Constructivist teaching method ; Yöntemler = Methods

Özet:
Bu çalışma Milli Eğitim Bakanlığı tarafından 2005?2006 Eğitim-Öğretim yılından itibaren ilköğretim birinci kademede, ardından 2006?2007 Eğitim Öğretim yılından itibaren de ilköğretim ikinci kademede uygulamaya sokulan Öğrenci Merkezli Eğitim Modeli ve bu bağlamda Türkçe derslerinde yapılan değişiklik ve düzenlemelerin eğitim sistemimize yansımalarını saptamak, olanaklarını ve sınırlılıklarını gözler önüne sermek amacını taşımaktadır.Çalışmamızın merkezinde eğitim olgusu olduğundan eğitimin tanımı, işlevi, eğitimde amaç ve yöntemin gerekliliği ve önemi üzerinde durulmuştur. Çalışmanın çıkış noktasını Yeniden Yapılanmanın yönlendirici ilkesi olan Öğrenci Merkezli Eğitim Modeli oluşturmaktadır. Tam Öğrenme, Çoklu Zeka, Oluşturmacılık gibi Öğrenci Merkezli Eğitim Kuramları tanıtılmış ve bu kuramların Türkçe öğretim programlarına metin çalışmaları bağlamında ne derece yansıtılıp yansıtılmadığı irdelenmiştir. Bunu saptamak amacıyla ilköğretim birinci ve ikinci kademe Türkçe ders kitapları incelenmiş, modelin pratikte hayat bulup bulmadığına bakılmıştır.Çalışmanın sonunda Yeniden Yapılandırılan Türkçe ders kitaplarında yer alan metin çalışmaları incelenmiş olumlu yönleri örneklerle vurgulanmış ve eksik yönlerine dikkat çekilmiştir; ders kitaplarından seçilen metinler üzerinde yeni metin çalışmaları uygulanmıştır.

Abstract:
The aim of this study is to discuss the Student Centred Educational Model introduced and applied by the Ministry of Education at primary and secondary levels in 2005 ? 2006 and 2006-2007 Education and Teaching Semesters respectively, and to determine reflections, possibilities and limits of changes and reconstruction of Turkish Lessons to our educational system.Since the education as an aspect forms the centre of the study, description and use of education, aim in education, necessity and importance of methodology are superimposed.Student Centred Educational Model which is the directing principle of Reconstruction forms the starting point of the study. Theories of Student Centred Education like Mastery Learning, Multiple Intelligences, Constructivism are introduced and extend of their involvement in Text Studies in Turkish Education Programs are examined. Turkish Lessons Books of Primary and secondary levels are examined and practical application of the model is analyzed.At the end of the study, texts in the Reorganised Turkish Lecture Books are examined, positive points are superimposed by examples and incomplete parts are brought into the attention; new text studies are applied on the selected texts from the lecture books.