Hematolojik malignensilerde konvansiyonel sitogenetik, moleküler ve moleküler sitogenetik uygulamalar
Conventional cytogenetics, molecular and moleccular cytogenetics aplications in hematological malignancies
Yazar: BARBAROS YİĞİT
Danışman: YRD. DOÇ. DR. PINAR ASLAN KOŞAR
Süleyman Demirel Üniversitesi / Sağlık Bilimleri Enstitüsü / Tıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2013
Konu: Tıbbi Biyoloji = Medical Biology
Dizin: FISH = FISH ; JAK 2 = JAK 2 ; Kan hastalıkları = Hematologic diseases ; Lenfoma = Lymphoma ; Lösemi = Leukemia ; Neoplazmlar = Neoplasms ; Sitogenetik = Cytogenetics

Özet:
Hematolojik malignensiler, kemik iliği kökenli hücrelerin sorumlu olduğu neoplazmalardır. Son yıllarda yapılan çalışmalar, hematolojik malignensilerin büyük çoğunluğunun, sayısal ve yapısal kromozomal anomaliler içerdiğini göstermektedir. Bu malignensilerdeki spesifik gen düzeyindeki değişiklikler, hastalığın tanısının konmasında ve prognozunun değerlendirilmesinde önemlidir. Çalışmamızın amacı bu tip genetik değişikliklerden bazılarının hematolojik malignensilerin etiyoloji ve prognozundaki etkisini değerlendirmektir.
Çalışmamıza, 2012?2013 yılları arasında Süleyman Demirel Üniversitesi Tıp Fakültesi İç Hastalıkları Anabilim Dalı Hematoloji Bilim Dalı?na başvuran Hematolojik Malignensi ön tanısı ya da tanısı almış 110 hasta dahil edildi. Akut Miyeloid Lösemi (AML), Kronik Miyeloid Lösemi (KML), Kronik Lenfoblastik Lösemi (KLL), Miyelodisplastik Sendrom (MDS), Kronik Miyeloproliferatif Hastalık (KMPH), Malign Plazma Hücreli Neoplazma (MPHN) ve lenfoma olmak üzere yedi hematoloji hasta grubundan alınan kemik iliği kültüründe üç farklı test uygulandı. Hastalara ait örneklerde sayısal ve yapısal kromozomal değişiklikleri sitogenetik kromozom analizi ve Floresan In Situ Hibridizasyon (FISH) yöntemleriyle gözlenirken JAK-2 V617F mutasyonu ise Real Time PCR (RT-PCR) yöntemi ile incelendi. 
İncelenen mutasyonlar arasında, KML için t(9;22); AML için t(15;17); MDS?de del(5q) ve del(7q); lenfoma, KLL ve MPHN?de del(13q14) ve del(17p13) mutasyonlarının önemli olduğu belirlendi. RT-PCR analizlerine göre JAK-2 V617F mutasyonunun KMPH alt gruplarında %43?ten %92?ye kadar değişen oranlarda etkili olduğu belirlendi. 
Elde ettiğimiz bulgular ışığında, hematolojik malignensili hastaların, rutinde çalışılan mevcut genetik analizlerine ek olarak belirlediğimiz mutasyonların da incelenmesinin, hastalığın tanı ve prognozunun değerlendirilmesi açısından faydalı olacağını düşünmekteyiz.

Anahtar kelimeler: Hematolojik malignensiler, Moleküler sitogenetik, Floresan In Situ Hibridizasyon (FISH), Moleküler genetik, JAK-2 mutasyonu

Abstract:
Hematological malignancies are neoplasms of bone marrow derived cells. Recent studies show that, most of these malignancies contains numerical and structural chromosomal abnormalities. This specific gene level changes are crucial at diagnosis and prognosis evaluation of these diseases. Our study aims to investigate some of these genetic changes and their effect on the etiology and prognosis of hematological malignancies.   
110 patients who applied to the Suleyman Demirel University, Medical Faculty, Internal Diseases Division, Department of Hematology within 2012-2013 years and prediagnosed/diagnosed with malignancy were included to our study. Three different analyses applied to the cultured bone marrow tissue samples of seven groups of hematology patients who suffered from Acute Myeloid Leukemia (AML), Chronic Myeloid Leukemia (CML), Chronic Lymphoblastic Leukemia (CML), Myelodysplastic Syndrome (MDS), Chronic Myeloproliferative Disease (CMPD), Malignant Plasma Cell Neoplasm (MPCN) and Lymphoma diseases. Numerical and structural chromosomal changes were observed via cytogenetic chromosome analyses and Florescent in Situ Hybridization (FISH) method while JAK-2 V617F mutation via Real-Time PCR (RT-PCR) method from bone marrow tissue samples of patients. 
Some mutations were found important in particular diseases such as t(9;22) mutation for CML, t(15;17) for AML; del(5q) and del(7q) for MDS; del(13q14) and del(17p13) mutations for lymphoma, CLL and MPCN. JAK-2 V617F mutations were found effective on CMP disease subgroups at rates changing from 43% up to 92% according to the RT-PCR results. 
Our findings shows that, indicated mutations should also be added to the routine genetic analyses of patients with hematological malignancies in order to improve evaluation of diagnosis and prognosis of this diseases.


Keywords: Hematological malignancies, molecular cytogenetics, Florescent in Situ Hybridization (FISH), molecular genetics, JAK-2 mutation