Skleroderma'da dönüştürücü büyüme faktörü (tgf-b1) geninde polimorfizm çalışmaları
Studies of polymorphism on the transforming growth factor (tgf-b1) in scleroderma
Yazar: UMUT BÜYÜK
Danışman: PROF.DR. AYŞEGÜL TOPAL SARIKAYA
İstanbul Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2006
Konu: Dermatoloji = Dermatology ; Moleküler Tıp = Molecular Medicine

Özet:
Skleroderma (SSc) nadir görülen kronik otoimmün bir hastalıktır. Skleroderma deri ve içorganlarda fibroza neden olur. Sertleşmenin temel nedeninin kollajen gibi hücreler arasımatriks proteinlerinin aşırı derecede sentezlenmesi ve birikimi olduğu belirtilmiştir.Hastalığın etiyolojisinde yer alan genetik faktörlerden biri de sitokin düzeylerindekideğişimleridir. Bu sitokinlerden biri olan Dönüştürücü Büyüme Faktörü-Î²1 ?TransformingGrowth Factor-Î²1? (TGF-Î²1) özellikle epitel ve bağdokusu hücrelerinde anlatımı yapılan vefibroblast hücrelerinde kollajen sentezini uyaran hücreler arası sinyal proteinidir. TGF-Î²1proteinini kodlayan genin yapısındaki değişimlerin genin anlatımını etkilediği ve fibrotikfenotipin oluşumuna katkıda bulunduğu yönünde güçlü kanıtlar vardır. TGF-Î²1 geninde 7tane polimorfik bölge belirlenmiştir.Bu tez çalışmasında SSc hastası 43 kadın ve 75 sağlıklı kadın kullanarak TGF-Î²1 geni kodon10 (lösin-prolin) ve kodon 25 (arjinin-prolin) polimorfizmlerinin, Türk toplumunda hastalığınpatogenezine olan katkısı araştırılmıştır. Polimorfizim bölgelerindeki değişen alleller, alleleözgü nükleotidlerle mutasyon belirleme tekniği (ARMS-PCR) kullanılarak belirlenmiştir.Yapılan deneyler sonucu Kodon 10 bölgesi için 43 SSc hastasının 14'ünün (% 33) CC,13'ünün (% 30) TC ve 16 (% 37) sının TT genotipleri, normal kontrol grubundaki 75 bireyin23'ünün (% 29) CC, 30'unun (% 40) TC ve 22'sinin (%3 1) TT genotipleri taşıdığı saptandı.Hastalıkla bu bölgedeki polimorfizm arasında anlamlı bağlantı kurulamamıştır (p= 0,529).Kodon 25 bölgesi için 43 SSc hastasının 36'sının (% 84) GG, 7'sinin(% 16) GC genotipleri,sağlıkı kontrol grubundaki 75 bireyin 68'inin (% 91) GG ve 7'sinin (% 9) GC genotipleritaşıdığı saptandı. Bu bölgenin de hastalıkla anlamlı bir ilişkisi belirlenmedi (p=0,375).

Abstract:
Scleroderma (SSc) is a rare seen chronic otoimmune disease. Scleroderma causes fibrosis inskin and organs. The main cause of hardness is over-expression and accumulation ofintracellular matrix proteins like collagen. One of the genetic factors in disease etiology is thelevel of cytokine alternations. Transforming Growth Factor-Î²1 (TGF-Î²1), one of the cytokinsexpressed especially in epitel and connective tissue cells, and induced collagen expression infibroblast cells, is a intercellular signal protein. There are some strong evidence provingvariations in the gene coding TGF-Î²1 protein that affect gene expression and contribute tofibrotic phenotype formation. Seven polymorphic regions have been identified in TGF-Î²1gene.In this study, 43 women SSc patients and 75 healthy women are used for detecting thecontribution of codon 10 (leucine-proline) and codon 25 (arginine-proline) polymorphisms inTGF-Î²1 gene to understand pathogenesis of disease in Turkish population. Amplificationrefractory mutation system (ARMS)-PCR is used to detect the variations of allels in thepolymorphic regions.As a result of this study, for codon 10 region, 14 of 43 SSc patients (33 %) has CC allel, 13of them (30 %) has TC and 16 of them (% 37) has TT genotypes, in healthy control grup, 23of 75 individuals (% 29) has CC, 30 of them has (% 40) TC ve 22 of them (% 31) has TTgenotypes. A significant correlation between this polymorphic region and disease is not found(p= 0,529). For codon 25 region, 36 of 43 SSc patients (% 84) has GG, 7 of them (% 16)has GC genotypes, in healthy control grup, 68 of 75 individuals (% 91) has GG and 7 ofthem (% 9) has GC genotypes. This region also doesn?t have an association with disease(p=0,375).