Manyetik rezonans görüntülemede saptanan modic dejenerasyonların derin öğrenme teknikleriyle analizi
Analysis of modic degenerations detected in magnetic resonance imaging with deep learning techniques
Yazar: MEHMET YÜKSEK
Danışman: DOÇ. DR. HARUN ARSLAN ; DR. ÖĞR. ÜYESİ ADEM YOKUŞ
Van Yüzüncü Yıl Üniversitesi / Tıp Fakültesi / Radyoloji Ana Bilim Dalı
Derece: Tıpta Uzmanlık, 2022
Konu: Radyoloji ve Nükleer Tıp = Radiology and Nuclear Medicine
Dizin: Bel ağrısı = Back pain ; Derin öğrenme = Deep learning ; Evrişimli sinir ağları = Convolutional neural networks ; Makine öğrenmesi = Machine learning ; Manyetik alanlar = Magnetic fields ; Manyetik rezonans görüntüleme = Magnetic resonance imaging ; Omurga = Spine ; Sinir ağları = Nerve net ; Spinal hastalıklar = Spinal diseases ; Yapay zeka = Artificial intelligence

Özet:
Bu çalışmamızda, manyetik rezonans görüntülemede(MRG) saptanan modic dejenerasyon bulgularının  derin öğrenme teknikleri kulllanılarak analiz edilmesi amaçlanmıştır.
Gereç ve Yöntem: 2016-2021 yıllarında Lomber MRG tetkiki uygulanan, yaşları 19-86 arasında değişen 125'i kadın ve 182'si erkek toplam 307 hastada sagittal T1, sagittal ve aksiyel T2 ağırlıklı lomber MRG görüntüleri incelendi. Modic dejenerasyonlar(MD) sinyal değişikliklerine göre kategorize edilip işaretlendi. Çalışmamız sınıflandırma ve segmentasyon olmak üzere birbirinden bağımsız iki aşamadan oluşmaktadır. Kategorize edilen veriler ilk aşamada DenseNet-121, DenseNet-169, VGG-19 gibi ESA(evrişimli sinir ağı) mimarileri ile sınıflandırılmıştır. Daha sonraki aşamada ise işaretlenen resimler üzerinden resim işleme programlarıyla ESA mimarisi olan U-Net ile segmentasyon yapılarak maskeler çıkarılmıştır.
Bulgular: Sınıflandırma aşamasında Modic-1, Modic-2, Modic-3 dejenerasyonlarda başarı oranı sırasıyla DenseNet-121'de %98, %96, %100 , DenseNet-169'da %100, %94, %100 , VGG-19'da %98, %92, %97 bulunmuştur. Segmentasyon aşamasında U-Net mimarisi ile  başarı oranı %71 bulunmuştur.
Sonuç: Bel ağrısı etiyolojisinde yer alan modic dejenerasyonların MRG bulgularının derin öğrenme mimarileriyle değerledirilmesi  teşhis kolaylılığı sağlayarak radyoloji hekiminin iş yükünü önemli ölçüde azaltabilir.

Abstract:
In this study, we aimed to analyze the modic degeneration findings detected in magnetic resonance imaging (MRI) by using deep learning techniques.

Material and Method:  Sagittal T1, sagittal and axial T2-weighted lumbar MRI images were analyzed in a total of 307 patients, 125 female and 182 male, aged between 19-86 years, who underwent Lumbar MRI examination in 2016-2021. Modic degenerations (MD) were categorized and marked according to signal changes. Our study consists of two independent stages, namely classification and segmentation. The categorized data were first classified with CNN(convolutional neural network) architectures such as DenseNet-121, DenseNet-169, VGG-19. In the next stage, masks were removed by segmentation with U-Net, which is the CNN architecture, with image processing programs on the marked images.
Results: At the classification stage, the success rates in Modic-1, Modic-2, Modic-3 degenerations were 98%, 96%, 100% in DenseNet-121, 100%, 94%, 100%  in DenseNet-169, in VGG-19 98%, 92%, 97% respectively found. In the segmentation phase, the success rate was 71% with the U-Net architecture.

           Conclusion: Evaluation of MRI findings of modic degenerations in the etiology of low back pain with deep learning architectures can significantly reduce the workload of the radiologist by providing ease of diagnosis.