Myelodisplastik Sendrom (MDS) tanılı hasta grubu ile kontrol grubu arasında FOG1 geninin ekspresyon paterninin karşılaştırılması
Comparison of expression pattern of FOG1 gene between patients with Myelodysplastic Syndrome (MDS) and control group
Yazar: ELZA BALAKISHIYEVA
Danışman: DR. ÖĞR. ÜYESİ ÖMER SALİH AKAR
Ondokuz Mayıs Üniversitesi / Lisansüstü Eğitim Enstitüsü / Moleküler Tıp Ana Bilim Dalı / Moleküler Tıp Bilim Dalı
Derece: Doktora, 2022
Konu: Genetik = Genetics
Dizin: Gen ifadesi = Gene expression ; Genler = Genes ; Hematopoez = Hematopoiesis ; Lösemi = Leukemia ; Miyelodisplastik sendromlar = Myelodysplastic syndromes

Özet:
Myelodisplastik sendromlar "MDS"; periferik kanda değişik derecelerde sitopeni, hematopoetik hücrelerde morfolojik ve fonksiyonel anormalliklerle karakterize, Akut Lösemiye ilerleyiş riski yüksek, kemik iliğinin klonal olan hematolojik maligniteleridir. MDS'li hastalarda genellikle anemi, trombositopeni ve nötropeni şikayeti ile tanı alırlar. Hastaların yaklaşık %25-30 kadarı AML'ye ilerlemekte ve lösemi nedeniyle kaybedilmektedir. Bununla birlikte, AML dönüşümü yanında, MDS ile ilişkili anemi, trombositopeni ve nötropeni de bu hastalarda mortaliteye yol açmaktadır. Yüksek riskli MDS'de akut lösemiye gidiş bazı kaynaklarda 0,2-1,1 yıl ve medyan sağ kalım 0,4-1,2 yıl olarak belirtilmektedir.
FOG1 (ZFPM1) eritroid ve megakaryositik hücre farklılaşmasında önemli bir rol oynayan bir transkripsiyon düzenleyicisidir. Temel kofaktör olan bu gen GATA ailesinin üyeleri olan GATA1, GATA2 ve GATA3 transkripsiyon faktörleri ile bir heterodimer oluşturarak etkinlik gösterir. Hematopoetik sistemde, eritrositlerin, megakaryositlerin, eozinofillerin ve mast hücrelerinin farklılaşması için GATA1 gereklidir.
MDS ve lösemide, daha önce belirlenmemiş genetik değişikliklerin belirlenmesi hastalığın tanısı, prognozunun ve terapötik seçeneklere yanıtın tahmin edilmesi ve yeni tedavi hedeflerinin tespiti açısında büyük önem taşımaktadır. Birçok çalışmada GATA1 ve FOG1'in hematopoez için kritik olarak birbirlerine bağımlı oldukları gösterilmiştir. FOG1, GATA1 ile heterodimer oluşturup hematopoezde işlev gördüğü için FOG1 geni ekspresyon değişikliklerinin MDS patogenezi üzerinde etkisi olabileceği düşünülmüş ve bu hipotezi test etmek üzere bu çalışma planlanmıştır. 
Çalışmamızda tanısı klinik ve laboratuvar verileri zemininde doğrulanmış 55 MDS hastası ve anemisi olmayan 55 sağlıklı kişinin periferik venöz kan örneklerinden elde ettiğimiz FOG1 (ZFPM1) / ACTB (kontrol gen) gen ekspresyon sonuçlarını karşılaştırılmış. MDS hasta grubunda FOG1 gen ekspresyonu sağlıklı gruba göre istatistiksel olarak düşük bulunmuştur (p<0.05). 
Sonuç olarak, çalışmamızda elde edilen veriler ışığında FOG1 geninin ekspresyonunun MDS hastalarında düşük olduğu bulunmuştur.

Abstract:
Myelodysplastic syndromes "MDS"; it is a clonal hematological malignancy of the bone marrow, characterized by cytopenia at varying degrees in the peripheral blood, morphological and functional abnormalities in hematopoietic cells, with a high risk of progression to Acute Leukemia. Patients with MDS are usually diagnosed with anemia, thrombocytopenia and neutropenia. Approximately 25-30% of patients progress to AML and die from leukemia. However, in addition to AML transformation, MDS-related anemia, thrombocytopenia and neutropenia also cause mortality in these patients. Progression to acute leukemia in high-risk MDS is reported as 0.2-1.1 years and median survival as 0.4-1.2 years in some sources.
FOG1 (ZFPM1) is a transcriptional regulator that plays an important role in erythroid and megakaryocytic cell differentiation. This gene, which is the main cofactor, acts by forming a heterodimer with the GATA1, GATA2 and GATA3 transcription factors, which are members of the GATA family. In the hematopoietic system, GATA1 is required for the differentiation of erythrocytes, megakaryocytes, eosinophils, and mast cells.
In MDS and leukemia, the identification of previously undetected genetic changes is of great importance for the diagnosis of the disease, predicting the prognosis and response to therapeutic options, and identifying new treatment targets. Many studies have shown that GATA1 and FOG1 are critically interdependent for hematopoiesis. Since FOG1 forms a heterodimer with GATA1 and functions in hematopoiesis, it was thought that FOG1 gene expression changes may have an effect on the pathogenesis of MDS, and this study was planned to test this hypothesis.
In our study, we compared the FOG1 (ZFPM1) / ACTB (control gene) gene expression results obtained from peripheral venous blood samples of 55 MDS patients whose diagnosis was confirmed on the basis of clinical and laboratory data and 55 healthy individuals without anemia. FOG1 gene expression was found to be statistically lower in the MDS patient group than in the healthy group (p<0.05).
In conclusion, in light of the data obtained in our study, the expression of the FOG1 gene was found to be low in MDS patients.