Şizofreni ilişkili potansiyel miRNA'ların comt geni ile olası ilişkisinin in vitro model oluşturularak araştırılması
Investigation of the possible association of schizophrenia-associated potential miRNAs with the comt gene by creating an in vitro model
Yazar: ONUR TONK
Danışman: DOÇ. DR. NURAY ALTINTAŞ ; DR. ÖĞR. ÜYESİ ONUR TOKGÜN
Manisa Celal Bayar Üniversitesi / Sağlık Bilimleri Enstitüsü / Tıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2022
Konu: Tıbbi Biyoloji = Medical Biology
Dizin: Genler = Genes ; Genler-COMT = Genes-COMT ; Mikro RNA = Micro RNA ; Şizofreni = Schizophrenia

Özet:
Amaç: Çalışmamızda TargetScan veritabanından ve literatüratür taramasından belirlediğimiz miRNA'ların (miR-30a-5p, miR-30e-5p ve miR-34a-5p) COMT geni ile bir ilişkisinin olup olmadığınının in vitro ortamda araştırılması amaçlanmıştır.
Gereç ve Yöntem: Şizofreni hücreleri olarak SH-SY5Y insan nöroblastom hücre hattı kullanılmıştır. Çalışmamızda miRNA mimik transfeksiyonu, RNA ekstraksiyonu, miRNA ve mRNA ters transkripsiyonu, RT-qPCR analizi, protein ekstraksiyonu, immunoblotlama analizi ve istatiksel analiz metodları kullanılmıştır. RT-qPZR araştırılmaları 2-ΔΔCT yöntemi kullanılarak analiz edilmiştir. 
Bulgular: Çalışmamızda miR-30a-5p, miR-30e-5p ve miR-34a-5p'nin COMT genindeki rolü araştırılmış ve miRNA mimik transfeksiyonu yapılan SH-SY5Y hücrelerinde miR-30a-5p ve miR-34a-5p transfeksiyonu sonucunda COMT geni ekspresyon seviyesinde anlamlı bir değişiklik gözlemlenmedi fakat miR-30e-5p transfeksiyonu sonucunda COMT geni ekpresyon seviyesinin anlamlı derecede azaldığı gözlemlendi.
Sonuçlar: Çalışmamız miR-30a-5p, miR-30e-5p ve miR-34a-5p'nin COMT genine olan etkisi ile ilgili yapılan ilk çalışma olması nedeniyle yüksek özgün değere sahiptir. Çalışmamız sonucunda miR-30e-5p COMT genini baskılamakta olduğu sonucuna varılmıştır. TargetScan database verilerine göre seçmiş olduğumuz miR-30e-5p'nin COMT genine doğrudan bağlanabileceği ve potansiyel bir terapötik strateji olabileceği düşünülmektedir. 

Anahtar Kelimeler: Şizofreni, miRNA, COMT

Abstract:
Aim: In our study, it was aimed to investigate in vitro whether the miRNAs (miR-30a-5p, miR-30e-5p and miR-34a-5p) that we determined from the TargetScan database and literature review have a relationship with the COMT gene.
Material and Method: : The SH-SY5Y human neuroblastoma cell line was used as schizophrenia cells. MiRNA mimic transfection, RNA extraction, miRNA and mRNA reverse transcription, RT-qPCR analysis, protein extraction, immunoblotting analysis and statistical analysis methods were used in our study. RT-qPCR studies were analyzed using the 2-ΔΔCT method
Results: In our study, the role of miR-30a-5p, miR-30e-5p and miR-34a-5p in the COMT gene was investigated and the COMT gene expression level was investigated in miRNA mimic transfected SH-SY5Y cells as a result of miR-30a-5p and miR-34a-5p transfection. no significant change was observed, but it was observed that COMT gene expression level decreased significantly as a result of miR-30e-5p transfection.
Conclusion: Our study has a high specificity because it is the first study on the effect of miR-30a-5p, miR-30e-5p and miR-34a-5p on the COMT gene. As a result of our study, it was concluded that miR-30e-5p suppresses the COMT gene. According to the TargetScan database data, it is thought that the miR-30e-5p we selected can directly bind to the COMT gene and be a potential therapeutic strategy.

Key Words: Schizophrenia, miRNA, COMT