Amasya (Suluova) çeltek kömür madeni atık alanlarında yetişen bazı bitkilerin kök bölgesinden fosfor çözen bakterilerin izole edilmesi ve biyokimyasal özelliklerinin belirlenmesi
Isolation of phosphorus-solving bacteria from the root region of some plants growing in celtek coal waste areas of Amasya (Suluova) and determination of the biochemical properties
Yazar: BİRKAN EMEKTAR
Danışman: DR. ÖĞR. ÜYESİ İDRİS BEKTAŞ
Amasya Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Biyoloji Ana Bilim Dalı / Mikrobiyoloji Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2023
Konu: Mikrobiyoloji = Microbiology

Özet:
Bu  çalışmada  Amasya  ili  Suluova  Çeltek  kömür  madeni  atık  alanlarında  yetişen  bazı  bitkilerin rizosfer bölgesinden fosfor çözücü bazı bakterilerin izolasyonu, tanısı ve bakterilerin biyokimyasal özellikleri  belirlenmiştir.  Yapılan  izolasyon  çalışmasında  fosfor  çözen  14  bakteri  izolatı  elde edilmiştir. Bakterilerin fosfor çözme indeksleri 3.21 -1.2 arasında değiştiği belirlenmiştir. Yüksek miktarda fosfor çözen be14 izolatının sentezlediği organik asitlerin belirlenmesine yönelik yapılan GC-MS analizinde izolatın %14.24 oranında asetik asit salgıladığı belirlenmiştir. İzolatlar arasında be1 izolatı 796,16 ppm ile en yüksek miktarda İAA ürettiği tespit  edilmiştir. En düşük miktarda ise 140,91 ppm ile  be15  izolatı  İAA  üretmiştir.  İzolatların  CAS agar  besiyeri  kullanılarak  siderofor üretme indekslerinin belirlenmesinde siderofor üretme indeksi en yüksek 3,3 değeri ile be6 izolatı tespit edilirken en düşük  siderofor üretme indeksi 1,1 ile be1 izolatı belirlenmiştir. İzolatlar arasında be24  izolatı  ise  6,6  indeks  ile  en  yüksek  miktarda  proteaz  aktivite  gösterdiği  tespit  edilmiştir. Mikroorganizmaların  amilaz  aktivitelerinin  belirlenmesinde  be12  izolatı  5,3  indeks  değeri  ile  en yüksek miktarda amilaz aktiviteye sahip olduğu tespit edilmiştir. be9 izolatı ise 2,1 indeks  değeri ile en  yüksek  miktarda  kitinaz  enzim  aktivitesi  gösterdiği  tespit edilmiştir.  Yapılan  bu  çalışmada MALDİ-TOF  analizi  ile  bakteri  izolatlarının  tür  düzeylerinde  teşhisleri  yapılmıştır.  Tanılama sonuçlarına göre  14  izolat  ;Bacillus  mojavensis(2),  Bacillus  amyloliquefaciens  ssp.plantarum(2), Bacillus  subtilis  ssp.subtilis(2),  Bacillus  atrophaeus (2), Bacillus  vallismortis(2),  Bacillus amyloliquefaciens ssp amyloliquefaciens, Staphylococcus kloosii, Bacillus cereus, ve Acinetobacter calcoaceticus  olarak  tanılanmıştır.  Yapılan  bu  çalışma  ile  izole  dilen  ve  tanımlanan  bakteri izolatlarının biyokimyasal özellikleri ile bitkilerin maden sahasına adapte olup gelişmesine katkı sağladığı  düşünülmektedir.  Bu  çalışma  aynı  zaman  maden  sahaları  ile  ilgili  çalışmalara  kaynak oluşturabilmesi bakımdan önemli görülmektedir.

Abstract:
In the fact of this  research ,isolation of some phosphorus-solving bacteria from the rhisozphere of various plant species that grow species in the Suluova Çeltek coal mine field of Amasya, and the diagnosis of them and the biochemicals properties of bacteries were identified. In this isolation study that was made ;14 bacterial isolates that dissolve phosphorus were obtained. It was also determined that the phosphorus dissolution indexes of bacteria varied between 3.21 to 1.2. In the analysis of GC-MS that was made to specify the organic acids synthesized by the be14  isolate , which dissolves high quantitys of phosphorus , it was determined  that isolate excreted acetic acid at a rate of 14.24%. It was established that among the isolates the be1 isolate produced the highest quantity of IAA with 796.16 ppm; however  the lowest quantity of IAA with 140.91 was produced by the be15 isolate. By using CAS  agar medium of isolates ,to determine the indexes of the production of siderophor the be6 isolate was identified with a highest siderophore production index  of 3.3;conversely  with the lowest siderophore production index  of 1.1 the be6 isolate was defined. Among the isolates , ıt was determined that the be24 isolate indicated the highest quantity of protease activity with an index number of 6.6. Additionally, it was identified that the be12 isolate produced the highest quantity of amylese with a 5.3 index  , to illustrate the amylese activities of microorganisms . On the other hand, the be9 isolate indicated the highest quantity of chitinase  enzyme activity with an index  of 2.1 In the fact of this research work, through the agency of Maldi-Tof analysis , the identification of bacteria isolates was made in the grades of species. Taking all these into consideration ; 14 isolates were identified  as  ;  Bacillus  mojavensis(2),  Bacillus  amyloliquefaciens  ssp.  Plantarum(2),  Bacıllus subtilis  ssp subtilis (2) , Bacillus atrophaeus(2) , Bacillus vallismortis(2), Bacillus amyloliquefaciens ssp amyloliquefaciens, Staphylococcus kloosii, Bacillus cereus and Acinetobacter calcoaceticus . In the light of facts above , it may be thought that, through the agency of biochemical properties  the isolated  and  defined  isolates    contribute  the  evolution  of  the  plants'    adoption  to  minefield. Additionally, this research can be considered as an essential source for he studies of minefield.