İdiyopatik dilate kardiyomiyopatili çocuklarda plazmada mikro rna profillemesi
Micro rna profiling study in plasma of children with idiopathic dilated cardiomyopathy
Yazar: MEHMET ENES COŞKUN
Danışman: PROF. DR. MEHMET KERVANCIOĞLU
Gaziantep Üniversitesi / Tıp Fakültesi / Çocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı
Derece: Tıpta Uzmanlık, 2012
Konu: Çocuk Sağlığı ve Hastalıkları = Child Health and Diseases
Dizin: Kardiyomiyopatiler = Cardiomyopathies ; Mikro RNA = Micro RNA ; Çocuk hastalıkları = Child diseases ; Çocuklar = Children

Özet:
Giriş ve Amaç: Dilate kardiyomiyopati (DKMP) çocukluk çağında en sık görülen kardiyomiyopati tipidir. Büyük kısmının etyolojisi ise idiyopatiktir. MikroRNA'lar (miRNA) proteinlerin sentezinin regülasyonunda rol alan hem hücre içinde hem de dolaşımda bulununabilen RNA'lardır. Bu çalışma çocukluk çağındaki DKMP hastalarının plazmadaki miRNA ekspresyonlarını sağlıklı çocuklarınkilerle kıyaslayarak çocukluk çağı DKMP'si için plazmada bir biyomarker belirleyebilmek amacıyla yapıldı.Gereç ve Yöntem: Çalışmaya Ocak-Eylül 2011 tarihleri arasında Gaziantep Üniversitesi Tıp Fakültesi Çocuk Sağlığı ve Hastalıkları polikliniklerine başvuran 23 DKMP'li hasta ve 26 sağlıklı çocuk alındı. Bütün çocukların ekokardiyografik ölçümleri yapıldı. Kan örnekleri alınıp plazmalarındaki 379 tane miRNA'nın ekspresyon seviyeleri RT-PCR yöntemiyle araştırıldı. miRNA ekspresyon seviyeleri DKMP ve kontrol grubu arasında kıyaslandı.Bulgular: Çalışma gruplarında bakılan 379 miRNA'dan 4 tanesinde tam ekspresyon tespit edildi. Ekspresyonu bütün çalışma gruplarında toplam %20'nin üstünde olan 35 miRNA'dan 12 tanesinin ekpsresyonunda DKMP ve kontrol grubu arasında istatistiksel olarak anlamlı fark tespit edildi. DKMP grubunda kontrol grubuna kıyasla miR-518f, miR-454'ün ekpresyon seviyelerinde artma ve miR-618, miR-857-3p, miR-205, miR-194, miR-302a, miR-147, miR-544, hsa-miR-99b, miR-155, miR-218'in ekspresyon seviyelerinde azalma tespit edildi (p<0,05).Sonuç: miR-618, miR-875-3p ve miR-205 çalışmada kontrol grubuna kıyasla DKMP grubunda anlamlı fark bulunan ve ekpresyonu en fazla tespit edilen miRNA'lardır. Bu veriler daha sonra bu konuda yapılacak çalışmalar için seçilecek miRNA havuzunun belirlenmesinde ve araştırma sonuçlarının yorumlanmasında faydalı olacaktır.

Abstract:
Introduction and Aim: Dilated cardiomyopathy (DCMP) is the commonest cardiomyopathy in children, and most of its etiology is idiopathic. Micro RNAs have a role in the regulation of protein synthesis. They are found both in cells and circulation. In this study we aimed to define a biomarker for childhood DCMP by comparing the plasma expression levels of microRNAs between children with DCMP and controls.Materials and Methods: This study was performed on 23 children with DCMP and 26 healthy children who were admitted to pediatric outpatient clinic of University of Gaziantep between January and September 2011. Echocardiographic measurements of all children were done. Blood samples were taken, and expression levels of 379 microRNAs were searched in each plasma. The miRNA expression levels of DCMP group and control group were compared.Results: Four miRNAs out of 379, which were studied, showed complete expression in all children. The expression levels of 12 miRNAs out of 35 whose expression levels were higher than %20 in whole study group (DCMP and control groups) were significantly different in the DCMP group compared to the controls. The expression levels of miR-518f and miR-454 were higher, and miR-618, miR-857-3p, miR-205, miR-194, miR-302a, miR-147, miR-544, hsa-miR-99b, miR-155, miR-218 were lower in the DCMP group compared to the controls.Conclusion: This study showed that miR-618, miR-875-3p, and miR-205 are miRNAs that show expression the most, and are significantly different in the DCMP group compared to the controls. These findings could be useful for further studies in determining the miRNA pool and in interpretation of resultant data.