Tunceli'de yayılış gösteren ruminant hayvanlardaki anaerobik fungusların moleküler tanımlanması
Molecular identification of anaerobic fungi in ruminant animals distributed in Tunceli
Yazar: MURAT ÜSTÜNTAŞ
Danışman: DR. BÜLENT KAR
Munzur Üniversitesi / Lisansüstü Eğitim Enstitüsü / Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2022
Konu: Biyoteknoloji = Biotechnology
Dizin: Anaerobik = Anaerobic ; DNA dizileme = DNA sequencing ; Filogenetik = Phylogenetic ; Mantarlar = Fungi

Özet:
Anaerobik Gut Funguslar (AGF) herbivor hayvanların sindirim kanalının bir parçası
olan rumen içerisinde bulunan mikroorganizmalar arasında sahip olduğu fibrolitik enzim
aktivitesi ve biyoteknolojik potansiyeli oldukça yüksek bazı enzimlerinden dolayı oldukça
önemli bir gruptur. Aynı zamanda AGF'ların zorunlu anaerobik özelliği bu
mikroorganizmaların kültüre alınma çalışmalarını da değerli olduğunu göstermiştir.
Günümüzde AGF'ların cins düzeyinde yeni keşifleri devam ederken bu
mikroorganizmaların bazı endsüstriyel alanlarda da çalışma sahaları genişlemektedir. Bu
çalışmada Türkiye'de bulunan kültür koleksiyonuna ek olarak bugüne kadar çalışmamış bazı
coğrafi bölgelerden olan Tunceli iline ait kırsal alanlardan elde edilen rumen dışkı
örneklerinden AGF izolasyonu ve tanımlanması yapılmıştır. Bu tanımlama işlemi hem
morfolojik hem de moleküler düzeyde gerçekleştirilmiştir. Moleküler düzeyde tanımlama
yapılırken bu mikroorganizmaların internal transcribed spacer (ITS) bölgesi tercih
edilmiştir. Elde edilen ITS agaroz jel görüntülemesinden sonra polimeraz zincir reaksiyonu
(PZR) ürünlerinin dizi analizi yapılmıştır.Sekans analizi ve morfolojik gözlemler sonucu
AGF'ların MUBAM_AGF 1,2,3,4,5,6,11 ve 12 stok numarası verilerekNeocallimastix
sp.,MUBAM_AGF 7,8 ve 10 stok numaralı Orpinomyces sp. ve MUBAM_AGF 9 stok
numarası verilerek kültüre alınmıştır. Sonuç olarak Tunceli bölgesinde ilk defa yapılan bu
çalışma ile hem fungus kültür koleksiyonu hem de bu canlılarla ait DNA kütüphanesi
oluşturulmuştur.

Abstract:
Anaerobic Gut Fungus (AGF herbivores is an important group among the
microorganisms in the part of the society, some of the enzymes with fibrolytic enzyme
activity and biotechnological potential. At the same time, the anaerobic feature of AGFs is
an application used in culturing these scanners. Today, AGFs are new in their classes. These
passengers can visit the trainings and use the fields in some industrial usage areas. In addition
to the culture collection in Turkey in this study, AGF isolation and samples were made from
the samples from the samples that did not work. This process was performed both
morphologically and at the molecular level. ITS) preferred site. After the obtained ITS
agarose gel, polymerase chain reaction (PCR) sequence analysis was performed. Sequence
analysis and logical observations, stock of AGFs MUBAM_AGF,3,4,5,6,11 and 12 were
selected k 1,2 Neocallimasti sp., MUBAM_AGF 7,8 and 10 stock images Orpinomyces sp.
and MUBAM_AGF 9 stock images were cultured into modelk. As a result, both the
mushroom culture collection and the DNA collection study of these living things with this
one, which was done for the first time in the Tunceli region.