Clostridium difficile pozitif hastalarda norovirüs insidansının ELİSA ve moleküler yöntemlerle karşılaştırılması
Comparison of norovirus incidence with ELİSA and molecular methods inclostridium difficile positive patients
Yazar: HANİFE ŞURA ASLAN
Danışman: PROF. DR. ZEYNEP ARZU İLKİ
Marmara Üniversitesi / Sağlık Bilimleri Enstitüsü / Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2020
Konu: Mikrobiyoloji = Microbiology
Dizin: Clostridium difficile = Clostridium difficile ; Enzime bağlı immünosorbent testi = Enzyme-linked immunosorbent assay ; Moleküler analiz = Moleküler analysis ; Nörovirüs = Norovirus ; Polimeraz zincirleme reaksiyonu = Polymerase chain reaction

Özet:
AMAÇ: Yapılan bu çalışmadaki amaç, Clostridium difficile toksin pozitif hasta
örneklerinde norovirüs varlığını iki farklı yöntemle, ELISA ve Moleküler
yöntemlerle saptamaktır.
GEREÇ VE YÖNTEM : Ocak 2019, Mart 2020 tarihleri arasında, Clostridium
difficile toksin (CerTest, GDH + Toksin A+B (BIOTEC, İspanya)) hızlı tanı kiti ile
pozitif bulunmuş 82 hasta örneği çalışmaya dahil edildi. Bu örneklerde iki yöntemle
norovirüs varlığı araştırılmıştır. Çalışmanın ilk aşamasında ELISA (RIDASCREEN
Norovirüs kiti (R-Biopharm, Darmstdt, Almanya)) ile norovirüs antijeni aranmıştır.
İkinci aşamasında ise aynı örneklerde gerçek zamanlı RT-PZR yöntemi (Corbett
Rotor-Gene 6000 HRM ) kullanılarak nükleik asit aranmıştır.
BULGULAR: Çalışmaya dahil edilen toplsm 82 örnekte ELISA ile norovirüs
pozitifliği %3,7 (n:3) olarak bulunmuştur. Aynı örneklerin gerçek zamanlı RT-PZR
sonucunda ise norovirüs pozitifliği %8, 5 (n:7) olarak değerlendirilmiştir. RT-PZR
referans alındığında, ELISA testinin duyarlılığı %63,6, özgüllüğü %100 olarak tespit
edilmiştir.
SONUÇ : Çalışmamızda C. difficile toksin pozitif hastalarda % 8,5 oranında
norovirüs ile koenfeksiyon görülmüş, bu azımsanmayacak oran literatürle uyumlu
gözükmektedir. Klinisyenler özellikle uzun süreli yatış hikayesi, immun yetmezliği
olan C.difficile toksin pozitif hastaları için olası norovirus enfeksiyonunu da akla
getirmelidir. Uzun süren, tedavi etmekte zorluk yaşanan ishalli hastalarda,
enteropatojenler arası etkileşimleri düşünmek, farklı tanı arayışlarına girmek ve
tedaviyi buna göre yönlendirmek önemlidir.

Abstract:
Objective: The aim of this study is to detect the presence of norovirus in Clostridium
difficile toxin positive patients with two different methods, ELISA and Molecular
methods.
Material and methods: Between January 2019 and March 2020, 82 patient samples
found positive with the Rapid Diagnostic Kit of Clostridium difficile toxin (CerTest,
GDH + Toxin A + B (BIOTEC, Spain)) were included. In these examples, norovirus
was investigated by two methods. The first stage of the study was to search for
norovirus antigen by ELISA (RIDASCREEN Norovirus kit (R-Biopharm,
Darmstadt, Germany)). In the second stage, nucleic acid was searched in the same
samples using the real-time RT-PCR method (Corbett Rotor-Gene 6000 HRM).
Results: Norovirus positivity was found as 3,7% (n: 3) by ELISA in a total of 82
samples included in the study. Norovirus positivity in real-time RT-PCR of the same
samples was evaluated as 8,5% (n: 7). When the RT-PCR is taken as reference, the
sensitivity of the ELISA test was 63,6% and the specificity was 100%.
Conclusion: In our study, co-infection with norovirus was observed with a rate of
8,5% in C. difficile toxin positive patients, and this rate is consistent with the
literature. Clinicians should consider possible norovirus infection, especially for
C.difficile toxin positive patients with immunodeficiency. It is important to consider
interactions between enteropathogens, to search for different diagnoses and to direct
treatment accordingly in patients with long-lasting diarrhea.