Streptococcus thermophilus ve Lactobacillus delbrueckii subsp. bulgaricus izolatlarının plazmitlerinin nükleotit dizilenmesi ve bazı aroma metabolit kapasitelerinin belirlenmesi
Plasmids sequence of Streptococcus thermophilus and Lactobacillus delbrueckii subsp. bulgaricus isolates and determination of some aroma metabolite capacities
Yazar: FADİME YAZDIÇ
Danışman: DOÇ. DR. İSMAİL AKYOL
Kahramanmaraş Sütçü İmam Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Biyomühendislik ve Bilimleri Ana Bilim Dalı
Derece: Doktora, 2017
Konu: Biyomühendislik = Bioengineering

Özet:
Yoğurt, St. thermophilus ve Lb. bulgaricus izolatlarının sütte sinerjitik olarak gelişmesiyle
oluşan fermente bir süt ürünüdür. Yoğurtta, karakteristik aroma tadını veren metabolitler
kromozom veya plazmitlerde bulunan genler tarafından kodlanmaktadır. St. thermophilus (95) ve
Lb. bulgaricus (14) izolatının moleküler, biyokimyasal ve mikroskobik tanımlamaları tez
çalışmasında yapılmıştır. Bu izolatların plazmit içerikleri ve plazmit stabilitesi belirlenmiştir.
Ayrıca BioLb89 izolatından saflaştırılan doğal p89 plazmitinin bütün nükleotit dizilemesi
yapılmıştır. 5899 bç uzunlukta plazmit dizileme işlemi kesme enzimleri ve PCR amplifikasyonu ile
oluşturulan 10 farklı fragmentin nükleotit dizilemesi yapılarak tamamlanmıştır. Fragmentlerin
dizilemesi pUC18 veya pJET1.2 vektörlerine klonlanarak ve Sanger dizileme metodu ile
gerçekleştirilmiştir. Tanımlamaları yapılan toplam 109 izolatın aroma metabolitleri (format,
pirüvat, laktat, asetaldehit, 3-hidroksi-2-bütanon, etanol, 2,3-bütandiol) üretim potansiyellerinin
tespiti, dört farklı ortamda (SM17, anaerobik SM17, aerobik MRS, anaerobik MRS, LM17
besiyerleri ve süt) belirlenmiştir. St thermophilus izolatlarında, besi ortamı olarak süt
kullanıldığında, format, pirüvat, laktat, asetaldehit, 3-hidroksi-2-bütanon, etanol ve 2,3-bütandiol
metabolitlerinin miktarları sırası ile 1.2 mg/L, 1.3 mg/L, 5.2 mg/L, 1.3 mg/L, 6.5 mg/L, 42.4 mg/L
ve 33.0 mg/L olarak tespit edilmiştir. Lb. bulgaricus izolatlarında, bu metabolitlerin miktarları
sırası ile 1.4 mg/L, 0 mg/L, 0.1 mg/L, 13 mg/L, 6 mg/L, 48 mg/L ve 28.2 mg/L olarak tespit
edilmiştir.

Abstract:
Yogurt is a fermented dairy product formed by the synergistic development of St.
thermophilus and Lb. bulgaricus species. Metabolites give characteristic aroma taste for yogurt and
metabolite encoded genes are located on chromosomes or plasmids. Molecular, biochemical and
microscopic descriptions of St. thermophilus (95) and Lb. bulgaricus (14) isolates were performed
in this thesis. The plasmid content and plasmid stability of these isolates were determined. In
addition, the entire nucleotide sequence of the native p89 plasmid purified from the BioLb89
isolate was sequenced. 5899 bp long entire plasmid sequence was completed by performing
sequencing of 10 different fragments generated by restriction enzymes and PCR amplification.
Sequencing of the fragments was performed by cloning into the pUC18 or pJET1.2 vectors and by
the Sanger sequencing method. Detection of potentials aroma metabolite (format, pyruvate, lactate,
acetaldehyde, 3-hydroxy-2-butanone, ethanol, 2,3-butanediol) productions of identified 109 isolates
was determined in four different media (SM17, anaerobic SM17, LM17 medium and milk) for St.
thermophilus and three different media (aerobic MRS, anaerobic MRS and milk) for Lb.
bulgaricus. When milk was used as medium in St. thermophiles isolates, the amounts of formate,
pyruvate, lactate, acetaldehyde, 3-hydroxy-2-butanone, ethanol and 2,3-butanediol metabolites
were 1.2 mg/L, 1.3 mg/L, 5.2 mg/L, 1.3 mg/L, 6.5 mg/L, 42.4 mg/L and 33 mg/L respectively. In
Lb bulgaricus isolates, the amounts of these metabolites were 1.4 mg / L, 0 mg / L, 0.1 mg / L, 13
mg / L, 6 mg / L, 48 mg / L and 2 28.2 mg / L respectively.