hakansabunis/tr-academic-research-agent-index huggingface dataset:
Sonlu boyutlu minkowski uzaylarında fokal eğriler ve fokal yüzeyler
Focal curves and focal surfaces in finite dimensional minkowski space
Yazar: HAKAN ŞİMŞEK
Danışman: DOÇ. DR. MUSTAFA ÖZDEMİR
Akdeniz Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Matematik Ana Bilim Dalı
Derece: Doktora, 2016
Konu: Matematik = Mathematics
Dizin: Kongrüans = Congruence ; Lorentz geometrisi = Lorentz geometry ; Lorentz uzayı = Lorentz space ; Lorentz yüzeyleri = Lorentz surfaces ; Minkowski uzayı = Minkowski space

Özet:
Bu tezde, sonlu boyutlu Lorentz-Minkowski uzaylarında fokal eğriler ve fokal yüzeyler ele alınmıştır. Null olmayan bir regüler eğrinin fokal eğrisi ve fokal eğriliklerinin geometrik özellikleri incelenmiş ve spacelike ve timelike yüzey üzerindeki null olmayan bir eğrinin Darboux çatısı vasıtasıyla yarı-küresel evolütleri araştırılmıştır. Daha sonra bir parçası spacelike bir parçası timelike olan karışık yüzeylerin fokal yüzeyleri, tekillik teorisi vasıtasıyla uzaklık kare fonksiyon ailesinin çatallanma küme-si olarak tanımlanarak geometrisi incelenmiştir. Bununla birlikte hiperbolik m-uzayda hiperyüzeylerin evolütleri sunulmuş ve bu evolütler vasıtasıyla hiperyüzeyler ile hiperküreler ya da eşuzaklık hiperdüzlemlerin değmesi çalışılmıştır. Daha önce yapılmamış olan normal doğru kongruansları ile üretilen fokal yüzeyler Minkowski 3-uzayında belirlenerek geometrisi incelenmiştir. Dahası spacelike ve timelike yüzeyler üzerinde bir takım önemli eğriler aynı uzayda tanıtılıp elde edilen fokal yüzeyler yardımıyla bazı yeni özellikleri sunulmuştur. Son olarak Minkowski 3-uzayında yapılan Backlund ve Tamamlanabilme teoremleri 2n-1 boyutlu Minkowski uzaya genişletilerek bazı yeni ilginç sonuçlar elde edilmiştir.

Abstract:
In this thesis, focal curves and focal surfaces in the finite dimensional Minkowski spaces are handled. The geometric properties of focal curves and focal curvatures of a non-null regular curve are examined and by means of the Darboux frame of a non-null curve on the spacelike and timelike surface, its pseudo-spherical evolutes are investigated. Then, in terms of the singularity theory, the focal surfaces of mixed surfaces whose one part is spacelike and the other part is timelike are analyzed by defining as the bifurcation set of the family of distance squared function. Besides, the evolutes of hypersurfaces in hiperbolic m-space are presented and the contact of hypersurfaces with hyperspheres or equidistant hyperplanes are studied via these evolutes. The focal surfaces generated by normal line congruences, which has not been done before, are described in the Minkowski 3-space and their geometry is studied. Moreover, by defining some important curves on spacelike and timelike surface in the same space, their some new properties are presented by the aid of the focal surfaces obtained. Lastly, by generalizing the Backlund and integrability theorems done in the Minkowski 3-space, new interesting results are gotten.
Yakın çift sistem u SGE'nin yüksek çözünürlüklü tayflarındaki disk kaynaklı salma ve/veya soğurma yapılarının modellenmesi
Modeling of accretion disk-originated absorbtion and/or emission features in the high resolution spectra of the close binary system U SGE
Yazar: ÖZLEM TAŞPINAR
Danışman: DOÇ. DR. HİCRAN BAKIŞ
Akdeniz Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Uzay Bilimleri ve Teknolojisi Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2016
Konu: Astronomi ve Uzay Bilimleri = Astronomy and Space Sciences

Özet:
Bu tezde, tayfında Hα salması gösterdiği bilinen Algol türü sistemlerden seçilen U Sge çift sisteminin yüksek çözünürlüklü tayfsal gözlemleri yapılmış ve salma yapıları analiz edilmiştir. Sistemin tayfları ve literatür ışık eğrisi analiz edilerek, sistemin duyarlı yörünge parametreleri ve mutlak parametreleri belirlenmiştir. Buna göre, baş bileşen B7-8 tayf türünden bir anakol yıldızı ve yoldaş bileşen G2 tayf türünden bir dev yıldızdır. Soğuk yoldaş bileşen Roche şişimini doldurmuş ve sıcak baş bileşene madde aktarmaktadır. Hem bileşenlerin hem de akan bu maddenin etkileri sistemin Hα çizgilerinde kendisini göstermektedir. Tüm bu etkilerin belirlenmesi amacıyla sistemin Hα çizgileri LTE yaklaşımını kullanan SHELLSPEC kodu ile modellenmiştir. U Sge sisteminin etrafındaki yapı, çok düşük yoğunluklu bir disk, akan madde ve bu maddenin baş bileşene doğrudan çarpmasıyla oluşan sıcak leke ve yoldaş bileşenin aktivitesinin katkısından oluşmaktadır. Ayrıca, sistemdeki tüm bu etkiler kısa zaman ölçeklerinde değişkenlik göstermektedir.

Abstract:
In this thesis, high-resolution spectroscopy of the short-period Algol-type system U Sge which is known to exhibit Hα emission has been done and the emission structures have been analysed. The astrophysical parameters of the system have been obtained by means of analysing the spectral and photometric data. Accordingly, the primary component is a B7-8 spectral type main-sequence star, while the secondary component is a G2 spectral type giant. The cool secondary component has filled its Roche lobe and thus transferring material onto the hot primary component. The affects of both components and the transferring material were detected in the Hα lines. In order to determine these effects, the SHELLSPEC code which uses LTE approximation has been used. The circumstellar structure around U Sge is due to very low density disk, transferring material, a hot spot where the transferring material from the secondary hits and the activity from secondary itself. Moreover, all of these effects on the system show short time scale variations.
Pichia pastoris alkol dehidrogenaz (ADH3) promotoru üzerine çalışmalar
Studies on Pichia pastoris alcohol dehydrogenase (ADH3) promoter
Yazar: FİDAN ERDEN KARAOĞLAN
Danışman: PROF. DR. MEHMET İNAN
Akdeniz Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Gıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı
Derece: Doktora, 2016
Konu: Gıda Mühendisliği = Food Engineering

Özet:
Pichia pastoris, biyoteknoloji, ilaç endüstrisi ve akademik araştırmacılar tarafından yaygın olarak tercih edilen ökaryotik bir ekspresyon sistemidir. Son zamanlarda, P. pastoris üzerine, hem endüstriyel ölçekte hem de araştırma laboratuvarları tarafından yapılan çok sayıda çalışma bulunmaktadır. Ancak, hala P. pastoris metabolizmasında açıklığa kavuşmamış veya tam olarak bilinmeyen mekanizmalar vardır. Bunlardan biri de etanol metabolizmasının düzenlenmesidir. P. pastoris'in etanol metabolizmasında rol alan başlıca ADH genleri önceki çalışmamızda tarafımızdan tanımlanmış ve karakterize edilmiştir. Bu genlerden, etanol tüketiminden sorumlu olduğu belirlenen ve etanol içeren besiyerinde yüksek seviyede ekspres olan ADH3 geninin promotoru üzerine moleküler düzeyde bir çalışma bulunmamakta ve ADH3 promotorunun regülasyonu bilinmemektedir.
Bu çalışmada P. pastoris ADH3 promotorunda silme analizleri ile aktivasyonundan ve represyonundan sorumlu düzenleyici DNA bölgeleri araştırılmıştır. Promotor aktivitesini arttırıcı aktivatör bölgeleri ilave edilmesi ve promotor aktivitesini azaltıcı represör bölgelerin silinmesi ile beş farklı sentetik promotor oluşturulmuş ve en yüksek aktiviteye sahip sentetik promotor fermentör koşullarında doğal ADH3 promotoru ile karşılaştırılmıştır.
ANAHTAR KELİMELER: Pichia pastoris, ADH3 promotoru, sentetik promotor, promotor analizi, fermentasyon

Abstract:
P.pastoris is widely used as an eukaryotic expression system by biotechnology, pharmaceutical industry and academic researchers. Recenty, there are a number of studies on P. pastoris at laboratory and industrial scale. However, some mechanisms of P.pastoris are still unknown or not clear. One of these unexplored mehcanisms is the regulation of ethanol metabolism. ADH genes which involves in P.pastoris ethanol metabolism were indentified and characterized in our previous study. The gene responsible for consumption of ethanol was determined as the ADH3 gene and it was highly expressed on ethanol as subtrate source. However, the regulation of the ADH3 promoter at molecular level is not known yet.
In this study, regulatory DNA regions that are responsible for activation and repression of the ADH3 promoter of P. pastoris were investigated by deletion analyses. Five different synthetic promoter were constructed by adding up-regulatory sites and deletion of down-regulatory sites and the best synthetic promoter which had highest activity was compared with the native ADH3 promoter at fermentor scale.
KEYWORDS: Pichia pastoris, ADH3 promoter, synthetic promoter, promoter analysis, fermentation
Pseudo-Skymnos'un "periegesis" adlı eseri ışığında akdeniz havzası hellenistik dönem tarihi coğrafyası ve kentleri
Historical geography and cities in the hellenistic period of mediterranean area in the light of Pseudo-Skymnos'"periegesis"
Yazar: ŞENKAL KİLECİ
Danışman: DOÇ. DR. NİHAL TÜNER ÖNEN
Akdeniz Üniversitesi / Akdeniz Uygarlıkları Araştırma Enstitüsü / Akdeniz Eski Çağ Araştırmaları Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2016
Konu: Coğrafya = Geography ; Eski Çağ Dilleri ve Kültürleri = Ancient Linguistics and Cultures ; Tarih = History
Dizin: Akdeniz = Mediterranean ; Akdeniz havzası = Mediterranean basin ; Helenistik Dönem = Hellenistic Period ; Mitoloji = Mitology ; Tarihi coğrafya = Historical geography ; Tarihi kentler = Historical urbans ; Yunan mitolojisi = Greek mythology ; Şiir = Poem

Özet:
Antik kaynakların okunup sentezlenmesinin ardından kaleme alınan ve Nikomedes'e atfedilen periegesis, iambik trimeter vezniyle ve didaktik yanıyla ön plana çıkmaktadır. Eserin şairi bilinmediği için ele alınan bazı filolojik çalışmalar sonrasında, 1846 yılında August Meineke'nin önerisi üzerine yazarının Pseudo-Skymnos olarak adlandırılmasında karar kılınmıştır. Eser, MÖ ca. 135 civarına tarihlenmekteyse de üzerine çeşitli görüş ve varyasyonlar bulunmaktadır. Şiir 138 satırlık bir giriş (prologos) ve şairinin iki kıta olarak adlandırdığı Avrupa ve Asya'nın coğrafî unsurlar açısından lakonik tasvirini içermektedir. Söz konusu eser kolonizasyon ve göç hareketlerine ışık tutacak şekilde çoğunlukla kent kuruluşları ile kentlerin ve diğer coğrafî unsurların (ada, dağ, deniz, göl, nehir vb.) konumlarına yoğunlaşsa da mitoloji ve kültürel ögelerin de bulunduğu manzum bir yeryüzü tasviridir. 
Bu çalışma ise Karl Müller'in 980 satırlık güvenilir tamamlamasından örnek alınarak metin içerisinde geçen coğrafya (kent, ada, dağ, deniz, göl, nehir vb.) ve mitolojiye ait unsurların eserle birlikte incelenip analiz edilmesini ve yorumlanmasını amaçlamaktadır.

Abstract:
This periegesis, which has been synthesised from the ancient sources and written to a bithynian king Nicomedes, reveals itsels with its didactic style and poetic meter called iambic trimeter. For its poet is unknown, in 1846 it is suggested by August Meineke, due to some philological studies, that this poem should better be named as Pseudo-Skymnos, which is decided on so. Although the work is dated around 135 BC, there are various opinions and variations on it. The poem contains a prologue in 138 verses, and as its poet mentioned, of two continents, Asia and Europe, geographical description in a laconic style. This work is, in a way to shed light on colonisation and movement of migration, a poem of depiction of earth that focuses not only on city foundations, and the positionings of both cities and geographical elements such as mountains, islands, seas, lakes, river etc., but also mythological and cultural elements. 
This study is based on Karl Müller's edition which is a trustworthy compilation with 980 verses, and aims to analise and comment together with the geographical (such as city, mountain, island, sea, lake, river etc.) and mythological elements.
Yüz ve kol transplantasyon ve travma hastalarında fonksiyonel gelişimin doğrusal olmayan metodlarla analizi
Assessing functional recovery of face and arm transplantation and trauma patients with nonlinear methods
Yazar: ÇAĞDAŞ TOPÇU
Danışman: DOÇ. DR. ÖMER HALİL ÇOLAK
Akdeniz Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Elektrik-Elektronik Mühendisliği Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2016
Konu: Elektrik ve Elektronik Mühendisliği = Electrical and Electronics Engineering ; Fiziksel Tıp ve Rehabilitasyon = Physical Medicine and Rehabilitation
Dizin: EMG =

Özet:
Karmaşıklık ölçütüyle yüz ve kol nakil ve replantasyon hastalarının fonksiyonel gelişimi incelenmiştir. Yüz ve kol nakil ve kol replantasyon hastalarıyla sağlıklı bireylerden elektromiyografi (EMG) verisi fonksiyonel elektriksel uyarım stratejileri ve rehabilitasyon mekanizmalarının anlaşılması için toplanmıştır. Nakil ve replantasyon hastalarının fonksiyonel hareketlerinin ve fasial duygusal ifadelerinin geliştirilmesi için bilişsel nörorehabilitasyon yöntemleri kullanılmıştır. Rehabilitasyon süreci yüzey EMG işaretinin bulanık entropisiyle incelenmiş ve sağlıklı bireylerin sonuçlarıyla karşılaştırılmıştır. Bilişsel rehabilitasyon sonrasında hastalardaki fonksiyonel ve motor gelişim tatmin edicidir.

Abstract:
We assessed functional recovery of face and arm transplantation and arm replantation patients with measures of complexity. We collected surface electromyography (EMG) data from full face and arm transplantation, arm replantation patients and healthy individuals for determining strategy of functional electrical stimulation (FES) and for understanding mechanisms of rehabilitation. Cognitive neurorehabilitation methods used to improve functional movements and facial expressions of the transplantation and replantation patients. Rehabilitation processes was investigated with Fuzzy entropy (FuzzyEn) of surface EMG signals and compared with results of healthy individuals. In the patients, the functional and motor recovery after cognitive rehabilitation are satisfactory.
Gemi kaptanının işveren vekilliği
Employer's representati̇ve characteri̇sti̇c of the shi̇pmaster
Yazar: YUNUS ALHAN
Danışman: YRD. DOÇ. DR. İLKNUR ULUĞ CİCİM
Akdeniz Üniversitesi / Sosyal Bilimler Enstitüsü / Özel Hukuk Ana Bilim Dalı / Özel Hukuk Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2016
Konu: Hukuk = Law
Dizin: Donatan = Shipowner ; Gemi kaptanları = Shipmasters ; Temsil = Representation ; Türk Ticaret Kanunu = Turkish Commercial Code ; Türk iş hukuku = Turkish labor law ; İş Kanunu = Labour Law ; İş hukuku = Labour law ; İşveren vekili = Acting employer

Özet:
Türk Ticaret Kanunun 1088-1118 maddelerinde belirtildiği üzere kanun tarafından donatanı temsil yetkisi verilmiş olan gemi kaptanın buna binaen sahip olduğu geminin bağlama limanında veya seferde olmasına göre değişkenlik gösteren yetkileri ve bununla bağlantılı olarak görev ve sorumlulukları vardır. Başta TTK ve diğer kanunlarda önemli bir statüye sahip olan kaptanın İş Hukuku açısından hukuki statüsünün belirlenmesi gerekmektedir. Genel olarak Donatanı/deniz işverenini gemide temsil eden kişi olması sebebiyle kaptanın işveren vekili olarak değerlendirilmesi uygun olacaktır. Bu durum kaptanın gemi adamı olduğu gerçeğini değiştirmez. Kaptan iş hukukunun gemi adamlarına/işçilere tanıdığı haklardan yararlanacak ve yükümlülüklere tabi olacaktır.



Anahtar Kelimeler: Türk Ticaret Kanunu, İş Kanunu, Deniz İş Kanunu, Kaptan, Donatan, Temsil, İşçi, İşveren, İşveren Vekili

Abstract:
As pointed out in article 1088-1118 of Turkish Commercial Law, the shipmaster that has been given the authority to represent the shipper possesses certain authorities that vary depending on the status of vessel whether being in the port or on the voyage with other duties and responsibilities related to those authorities. Featuring an important position according to Turkish Trade Law and other relevant laws, the master's legal status should also be clearly pointed out in respect of Labor Law. In general, master should be considered as the representative of the employer since he is the person representing the shipper/owner on board. This doesn't change the fact that the master is a seaman. The master shall benefit from the rights that the labor law entitles the seamen/workers and shall be subject to the obligations thereof.


Keywords: Turkish Commmercial Code, Labor Code, Maritime Labor Code, Ship Master, Freighter, Representation, Labor, Employer, Representative Of The Employer
Lökosit ayırımında kullanılabilecek kan filtre medyasının melt-blown tekniği ile poliester-poliamid karışım polimerlerinden üretim parametrelerinin belirlenmesi
Determination of production parameters of polyester-polyamide mixing by melt-blown technique which can be used to blood filter media of leukocytes filtration
Yazar: FİRDEVS MERT
Danışman: DOÇ. DR. NUMAN HODA
Akdeniz Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Kimya Ana Bilim Dalı
Derece: Doktora, 2016
Konu: Kimya = Chemistry

Özet:
Günümüzde gelişmiş ülkeler kan tranfüzyonunda tam kan yerine hastanın ihtiyacı olan kan bileşenini kullanmaktadır. Tam kanı bileşenlerine ayırmak için birçok metot kullanılmaktadır ve bunlardan en yaygın kullanılanı ise filtrasyon metodudur. Lökosit filtrasyonunda amaç, hastalara eritrosit transfüzyonu için kan torbalarındaki lökositlerin sayısını azaltmaktır. Lökosit filtreleri aynı zamanda kandaki lökosit sayısını azaltarak hastanın doğrudan tedavisini gerçekleştirmek amacıyla da geliştirilmiştir. Bu yöntem romatoid artrit (eklemlerde iltihap şeklinde meydana gelen romatizmal hastalıklar), ülseratif kolit (kalın bağırsağın iç yüzeyini tutan inflamasyon gelişmesi sonrası karın ağrısı, ishal gibi hastalıktır) gibi hastalıklar için de tedavi yöntemi olarak kullanılmaya uygundur. Lökosit ayırmada kullanılan filtreler üzerinde yapılan araştırmalarda filtrasyon mekanizmasının eleme ve adhezyon etkisiyle sürdüğü görüşü öne sürülmektedir. Bu tez çalışmasında, PBT ve PA-12 lif katmanları kullanılarak adhezyon etkisiyle tam kandan lökosit hücrelerini spesifik olarak ayıracak filtreler geliştirildi. Her iki polimerin kullanılması ile oluşturulan filtredeki katman sayısı ve gözenek boyutlarının optimizasyonu yapılarak yüksek performanslı lökosit filtresi üretimi gerçekleştirildi. Filtre üretiminde kullanılan lif katmanlarını oluşturmak için melt blown tekniği kullanıldı.

Abstract:
Nowadays, in develop countries transfusion of the blood components are required by the patients instead of the whole blood.Many methods are used toseperate the whole blood andfiltration of blood is commonly used method. The purpose of the leukocyte filration is to decrease the level of leukocyte in blood while keeping the eritrosite level high prior to transfussion.   Because, it has been reported that during blood component transfusion therapy, leukocytes can cause manyadverse reactions, including nonhemolytic febrile transfusion reaction with high fever and vomiting, platelet refractoriness, grafted versus host disease, and transmission of viruses, such as cytomegalovirus and HIV. It is proposed that the most effecting factors in the mechanism of the filtration of leukocyte are mechanical sieving and adhesion. So, in this thesis, it is used two different nonwoven layers composed of two different polymers (PBT and PA-12) which both of them causes adhesion. The optimization is performed regarding the numbers of layers causing sieving and adhesion. To get nonwoven polymer layers melt blown technique is utilized.
Döşemealtı(Antalya),Ermenek(Karaman),Bucak(Burdur) ve çevresindeki traverten kayaçlarda ayrışma ve ayrışmanın kayaçların mühendislik özelliklerine etkileri
The weathering on travertine in Döşemealtı(Antalya), Bucak(Burdur), Ermenek (Karaman) and the effects of the weathering on the engineering properties of the rocks
Yazar: MUZAFFER ORHAN
Danışman: YRD. DOÇ. DR. YASEMİN LEVENTELİ
Akdeniz Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Jeoloji Mühendisliği Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2016
Konu: Jeoloji Mühendisliği = Geological Engineering

Özet:
Özellikle estetik görünümü nedeniyle, tufa ve travertenin yüzey kaplama malzemesi olarak kullanımı büyük ölçüde artmış ve daha fazla tercih edilir hale gelmiştir. Bununla birlikte, tufa ve traverten gibi boşluklu kayaçlarda karşılaşılan sorunların başında "ayrışma" gelmekte ve ayrışmanın bu tip kayaçların yapı malzemesi (kaplama, dolgu yada riprap gibi) olarak kullanılmasına etkisi de önem kazanmaktadır. Bu çalışmada; atmosfer koşullarına ve kıyı bölgelerinde tuzlu ortama maruz kalan bu kayaçlardaki ayrışmanın, kayaçların mühendislik davranışına etkileri laboratuar deneyleri ile araştırılmıştır. Döşemealtı (Antalya), Ermenek (Karaman) ve Bucak (Burdur)'dan olmak üzere üç farklı lokasyondan alınan kaya bloklarından karot numuneler hazırlanmıştır. Numunelerin birim hacim ağırlığı, porozitesi, ağırlıkça ve hacimce su emme oranları, tek eksenli basınç dayanımları, suda dağılmaya karşı duraylılığı ve P dalgası hızları belirlenmiştir. Sonrasında, NaCl, Na2SO4 ve MgSO4 tuzlarında bekletildikten sonra aynı parametreler tekrar belirlenmiştir. Parametrelerin karşılaştırılması sonucunda; gerek atmosfer koşullarının gerek tuzlu ortamın tufa ve travertenlerin mühendislik özellikleri üzerinde olumsuz etkiye neden olduğu görülmüştür.

Abstract:
Due to the particular aesthetic appearance, tufa and travertine usage as surfacing stone greatly increased and they have become even more preferred. However, one of the most important problems for the porous rocks such as tufa and travertine is "weathering". So, the effects of weathering for this type of rock when used as construction materials (surfacing, landfill or riprap, etc.) have become a significant problem, too. In this study; effects of weathering in these rocks, when exposed to atmospheric conditions and saline environment in the coastal areas, to the engineering behavior of rocks have been investigated by laboratory experiments. The core samples were prepared from the rock blocks taken from three different locations; Döşemealtı (Antalya), Ermenek (Karaman) and Bucak (Burdur). Unit weight, porosity, water absorption ratios by weight and volume, uniaxial compressive strength, slake durability and P-wave velocities of the samples were determined. Then, after curing in NaCl, Na2SO4 and MgSO4 salts, the same parameters were determined again. As a result of comparison of the parameters; it has been shown that both atmospheric conditions and saline environment have adverse effects on engineering properties of tufa and travertine.