Farklı Colchicum spp türlerine ait toprakların karbon ve azot mineralizasyonları ile mikrobiyal parametrelere etkisi
Effect of different Colchicum species soils on carbon and nitrogen mineralizations and microbial parameters
Yazar: İPEK EKİCİ
Danışman: PROF. DR. SADIK DİNÇER
Çukurova Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Biyoloji Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2020
Konu: Mikrobiyoloji = Microbiology

Özet:
Bu çalışmada, Türkiye'de doğal olarak yetişen biri endemik üç Colchicum spp (Acı çiğdem, Colchicaceae) türünün bazı toprak özellikleri ve mikrobiyotalarının kıyaslanması amaçlanmıştır. Toprakların karbon mineralizasyonu C. variegatum'da daha yüksek olup diğer iki örnekle aralarında anlamlı farklar vardır (P<0,05). Karbon mineralizasyon oranında C. balansae toprağı diğer iki topraktan anlamlı derecede farklıdır (P<0,05). Azot mineralizasyon oranı bakımından da her üç toprak arasında P<0,001 düzeyinde fark vardır. 
Metagenom analizinde her üç toprakta da üç domen'in temsilcilerine rastlanılmıştır. Bakteri domeni, C. variegatum, C. balansae ve C. triphyllum topraklarında, dominant filum olarak sırasıyla %47,084, %52,648 ve %55,847 oranında Actinobacteria, cins olarak da Solirubrobacter spp. %3.305, Micromonospora spp. %4,817 ve Rubrobacter spp. %7.648 oranında tespit edilmiştir. Arkea Domeni olarak C. variegatum toprağında %40 oranında Nitrosocosmicus ve %40 tuzcul Halobacter tespit edilmiş olup C. balansae'de dominant Arkea %14 ile Thermococcaceae ve C. triphyllum'da ise dominant Arkea %50 oranında Nitrosocosmicus ve diğer iki toprak örneğinde rastlanılmayan Nitrososphera'ya % 33 oranında rastlanılmıştır. Ökaryot domeninde ise, C. variegatum toprağında dominant mikroorganizma olarak %9 oranında Saccaromycetales, C. balansae'de %45 oranında Cryptococcus neoformans var. grubii H99 ve C. triphyllumʼda ise %41 oranında Saccaromycetales tespit edilmiştir. 
Bu çalışma, toprakların biyolojik ve kimyasal analiz sonuçlarındaki farklılığın, yapılan metagenom analizle mikroorganizma çeşitliliği ve yoğunluğundaki farklarla senkronize çalıştığını göstermektedir.

Abstract:
In this study, one of the three naturally grown in Turkey endemic Colchicum (Colchicacea) species intended to compare some of the soil characteristics and microbiota. The carbon mineralization rate of C. balansae soil is significantly different from the other two soils (P <0.05). There is a difference of P <0.001 between all three soils in terms of nitrogen mineralization rate.
Representatives of three domain were found in all three soils in metagenome analysis. Bacterium domain contains Actinobacteria 47.084%, 52.648% and 55.847%, respectively, as the dominant phylum in C. variegatum, C. balansae and C. triphyllum soils and as for the genus, Solirubrobacter spp. 3.305%, Micromonospora spp 4.817% and Rubrobacter spp 7.648%. As Arkea domein, 40% Nitrosocosmicus and 40% halophilic Halobacter have been detected in C. variegatum soil, while C. balansae has dominant Arkea with 14%, Thermococcaceae and C. triphyllum has dominant Arkea with 50% Nitrosocosmicus and Nitrososphera, which is not found in the other two soil samples, It was found at a rate of 33%. In the Eukaryotic domain, there is 9% Saccaromycetales as the dominant microorganism in C. variegatum soil, and Cryptococcus neoformans var. grupii H99 at a rate of 45% in C. balansae. 41% Saccaromycetales were detected in and C. triphyllum.
This study shows that the difference in biological and chemical analysis results of soils works synchronously with differences in microorganism diversity and density by metagenomic analysis.