Şanlıurfa ilinde yetiştirilen halep keçilerinde TLR2 genindeki polimorfizm ve sütteki somatik hücre sayısı arasındaki ilişkinin araştırılması
Investigating the polymorphism of TLR2 gene and its association with somatic cell count i̇n the milk of aleppo goats raised i̇n Şanlıurfa province
Yazar: SULTAN GÖLLÜ ELDEN
Danışman: PROF. DR. FARUK BOZKAYA
Harran Üniversitesi / Sağlık Bilimleri Enstitüsü / Genetik Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2024
Konu: Veteriner Hekimliği = Veterinary Medicine

Özet:
Tezin amacı Şanlıurfa ilinde yetiştirilen Halep keçilerinde Toll-benzeri-reseptör 2 (Toll-Like-Receptor 2; TLR2) genindeki polimorfizmin araştırılması ve tespit edilen polimorfizm ile bu keçi ırkından elde edilen sütlerdeki somatik hücre sayısı arasında ilişki olup olmadığının belirlenmesidir. Şanlıurfa ilinde Halep keçisi yetiştiriciliği yapan 5 çiftlikte bulunan 100 halep keçisinden doğumların başlamasından sonra birer aylık arayla iki kez 50 ml süt örneği toplandı. Süt örneklerinin 25 ml'si DNA izolasyonu yapmak amacıyla, diğer 25 ml'si somatik hücre sayısının belirlenmesi amacıyla kullanıldı. TLR2 geninin 442 bç'lik kısmı PCR işlemi ile çoğaltıldıktan sonra PCR ürünleri VspI enzimi ile muamele edildi. Kesim ürünlerinin %2'lik agaroz jel elektroforezinde incelenmesi sonucu GG, GA ve AA şeklinde üç genotip gözlendi. Genotiplenen örneklerden 95'i GG, dördü GA ve biri ise AA genotipine sahip olduğu gözlendi, G allelinin frekansının 0.97, A allelinin frekansı 0.03 olarak hesaplandı. Keçi sütündeki gerçek somatik hücre sayısı bakımından genotip ortalamaları arasındaki fark istatiksel olarak önemsiz bulunurken logaritmik düzeltme sonrasında istatistiksel farkın önemli olduğu ve A allelini taşıyan bireylerin sütlerindeki somatik hücre sayısının daha düşük olduğu bulundu. TLR2 geninin G/A polimorfizminin SCC üzerinde önemli bir etkisi olduğu belirlendi. Yapılan çalışma ile bu ırkta söz konusu polimorfizmin somatik hücre sayısı ile ilişkisinin belirlenmesi durumunda bu polimorfizm somatik hücre sayısı ve mastitis direnci yönünden ıslah çalışmaları amacıyla damızlık seçimi için yapılan seleksiyonda kullanılmak üzere belirteç olarak kullanılabilir.

Abstract:
The aim of this thesis was to investigate the polymorphism in Toll-Like-Receptor 2 (TLR2) gene in Aleppo goats raised in Şanlıurfa province and to determine whether there is a relationship between the detected polymorphism and somatic cell count in the milk obtained from this goat breed. In Şanlıurfa province, 50 ml milk samples were collected from 100 Aleppo goats in 5 farms in Aleppo goat breeding in Şanlıurfa province twice at one-month intervals after the births started. Twenty-five ml of the milk samples were used for DNA isolation and the other 25 ml were used for somatic cell count determination. After 442 bc of TLR2 gene was amplified by PCR, PCR products were treated with VspI enzyme. Three genotypes as GG, GA and AA were observed by analyzing the cut products in 2% agarose gel electrophoresis. It was observed that 95 of the genotyped samples had GG, four had GA and one had AA genotype, the frequency of the G allele was 0.97 and the frequency of the A allele was 0.03. The difference between the genotype averages in terms of the actual somati ccell count in goat milk was    statistically insignificant, but after logarithmic correction, the statistical difference was found to be significant and the number of somatic cells in the milk of individuals carrying the A allelewaslower. G/A polymorphism of TLR2 gene wasfoundtoave a significanteffect on SCC. If the relationship between this polymorphism and somatic cell count is determined in thisbreed, this polymorphism can be used as a marker to be used in selection for breeder selection for breeding studies in terms of somatic cell count and mastitis resistance.