Giardiasis tanılı hastalardan izole edilen giardia intestinalis suşlarının polimeraz zincir reaksiyonu-restriksiyon fragment length polymorphism (PCR-RFLP) yöntemi ile genotiplerinin araştırılması
Inverstigation of genotypes of giardia intestinalis strains isolated from patients with giardiasis by polmerase chain restriction-fragment length polymorphism (PCR-RFLP)method
Yazar: NURDAN GÜNGÖR
Danışman: DR. ÖĞR. ÜYESİ ERDENER BALIKÇI
Kocaeli Üniversitesi / Sağlık Bilimleri Enstitüsü / Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2021
Konu: Mikrobiyoloji = Microbiology ; Parazitoloji = Parasitology
Dizin: Genotip = Genotype ; Giardia = Giardia ; Giardiasis = Giardiasis ; Polimeraz zincirleme reaksiyonu = Polymerase chain reaction

Özet:
Amaç: Bu çalışmada; Kocaeli Üniversitesi Araştırma ve Uygulama Hastanesi
Mikrobiyoloji Laboratuvarına parazit şüphesi ile gönderilen ve giardiasis tanısı konulan
hastaların dışkı örneklerinde saptanan G. intestinalis suşlarının genotiplerinin belirlenmesi
ve bölgesel olarak hangi genotipin yaygın olduğunun saptanması amaçlanmıştır.
Yöntem: Kocaeli Üniversitesi Araştırma ve Uygulama Hastanesi Mikrobiyoloji
Laboratuvarına Şubat 2020- Aralık 2020 tarihleri arasında parazit şüphesi ile gönderilen
1356 dışkı örneği nativ Lugol ve formol etil asetat çöktürme yöntemleri uygulanarak ışık
mikroskobunda incelenmiştir. Mikroskobik inceleme ile Giardia intestinalis saptanan dışkı
örneklerinden QIAamp Fast DNA Stool Mini Kit kullanılarak DNA izolasyonu yapılmıştır.
Beta giardin gen bölgesinin 753 bp'lık uzun parçası PCR ile çoğaltılmıştır. Oluşan PCR
ürünleri HaeIII (BsuRI) restriksiyon enzimi ile muamele edilerek RFLP yöntemi
uygulanmıştır.
Bulgular: Çalışmamıza dahil edilen 36 giardiasis tanılı hastaların (hastanın) dışkı
örneklerinin 29'unda B genotipi (%80,4) 7'inde A genotipi (%19,6) olduğu saptanmıştır.
Semptomatik 35 hastanın 29'unda B genotipi, 6'sında A genotipi, asemptomatik bir hastada
ise A genotipi saptanmıştır.
Sonuç: Bu tez çalışmasında B genotipi baskın olarak saptanmıştır.
Anahtar Kelimeler: Giardia intestinalis, Giardiasis, Beta giardin, PCR-RFLP,
İnsan

Abstract:
Objective: In this study; It was aimed to determine G. intestinalis genotypes by applying
PCR-RLPF method in stool samples of patients diagnosed with giardiasis from the stool
samples sent to the Microbiology Laboratory of Kocaeli University Research and
Application Hospital with suspicion of parasites, by applying the PCR-RFLP method in the
stool samples and to determine which genotype is common locally.
Method: 1356 stool samples sent to Kocaeli University Research and Application
Hospital Microbiology Laboratory with suspicion of parasites between February and
December 2020 were examined under a light microscope by applying native Lugol and
formol ethyl acetate precipitation methods. DNA isolation was performed using the QIAamp
Fast DNA Stool Mini Kit from stool samples detected with G. intestinalis by microscopic
examination. The 753 bp long fragment of the beta giardin gene region was amplified by
PCR. RFLP method was applied by treating PCR products with HaeIII (BsuRI) restriction
enzyme.
Results: In the stool samples of 36 giardiasis patients included in our study, 29 (80.4%)
had B genotype and 7 (19.6%) had A genotype. Of the 35 symptomatic patients, 29 had B
genotype, 6 had A genotype, and an asymptomatic patient had A genotype.
Conclusions: In this thesis study, B genotype was determined as dominant.
Keywords: Giardia intestinalis, Giardiasis, Beta giardin, PCR-RFLP, Human