Böbrek nakli yapılan hastalarda ameliyat öncesi ve sonrası görülebilecek enfeksiyon etkenlerinin araştırılması
Investigation of infections agents in the renal transplant recipients at pretransplant and posttransplant period
Yazar: SUZAN DİNKÇİ
Danışman: PROF. DR. AKGÜN YAMAN
Çukurova Üniversitesi / Sağlık Bilimleri Enstitüsü / Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
Derece: Doktora, 2020
Konu: Mikrobiyoloji = Microbiology
Dizin: Bakteriler = Bacteria ; Böbrek hastalıkları = Kidney diseases ; Böbrek nakli = Kidney transplantation ; Böbrek yetmezliği-kronik = Kidney failure-chronic ; Enfeksiyonlar = Infections ; Enfeksiyonlar = Infections ; Mantarlar = Fungi ; Preoperatif dönem = Preoperative period ; Transplantasyon = Transplantation ; Virüsler = Viruses

Özet:
Böbrek transplantasyonu böbrek yetmezliğinin en önemli ve başarılı tedavi yöntemidir. Transplantasyon sonrasında özellikle ilk 6 ayda enfeksiyonlar sıkça görülmektedir. 
Bu çalışmada Çukurova Üniversitesi Balcalı Hastanesi Organ Nakli Merkezinde kadavra ve canlı donörden böbrek nakli yapılan 45 hasta incelenmiştir. Yapılan incelemede ameliyattan 1 hafta önce ve 1, 3, 6 ay sonra alınan; idrar, kan, solunum yolu  ve yara örneklerinin kültürlerinde üreyen etkenler, kanda real time PCR yöntemiyle çalışılan CMV ve BKV DNA'sı; ayrıca idrar sitolojisinde tespit edilen bakteri, virus ve mantar etkenlerinin araştırılması amaçlanmıştır.
Nakil öncesi idrar kültürü yapılan 19 hastanın tamamında üreme olmadığı görülmüştür. Nakilden sonra ise en sık E. coli 7(%31.81), K. pneumoniae ve C. nonalbicans 5(%22.72) ve E. faecalis 4(%18.18)  üremiştir.
Ameliyat öncesinde hastaların 42'sinden kan kültürü yapılmıştır. Bunlardan 40(%95.2)'ında üreme görülmemiş, sadece 2(%4,8)'sinde (Oligella ureolytica ve KNS )üreme olmuştur. Nakil sonrasında kan kültüründe en sık S. hominis 4(%36.36), S. epidermidis 3(%27.27), P. aeruginosa ve A. baumannii 2(%18.18) üremiştir.
Nakilden 3 ve 6 ay sonra gereklilik durumunda 9 hastanın solunum yolu  örneklerinin kültüründe ise en sık A. baumannii 4(%44.44),  K. pneumoniae 3(%33.33) , A. fumigatus ve C. albicans 1(%11.11) üremiştir. Hastaların 10(%22.22)'unda M. tuberculosis kültürü yapılmış ve pozitiflik elde edilmemiştir.
Nakil sonrasında yara kültürü yapılan 10 hastada en sık A. baumannii 3(%30),  K. pneumoniae ve S. epidermidis 2(%20), C. krusei 1(%10) ürediği görülmüştür. 
Nakilden sonra real time PCR yöntemiyle çalışılan 38 hastanın 11(%28.94)'inde BK virus pozitifliği,  41 hastanın 25(%60.98)'inde CMV virus pozitifliği tespit edilmiştir.    
İdrar sitolojisi bakılan 31 hastanın 11(%35.49)'inde decoy hücresi pozitifliği saptanmıştır. Decoy hücresi pozitifliği ve negatifliği ile CMV ve BKV DNA pozitiflikleri ve negatiflikleri karşılaştırıldığında, özellikle BK virusun erken sitopatik etkisinin araştırılması açısından idrar sitolojisinin önemli bir yöntem olduğu görülmüştür. 
İmmunsupresif tedavinin yoğun olarak uygulandığı 1-6. aylar arasında görülen viral enfeksiyonların (BKV ve CMV) ve bunlara eşlik eden fırsatçı enfeksiyonların böbrek transplantasyonu yapılan alıcılar için gerek böbrek kaybı gerekse hastanın hayatını kaybetmesi açısından risk oluşturduğu görülmüştür.

Anahtar Kelimeler: Böbrek transplantasyonu, Bakteri, Virus, Mantar.

Abstract:
Renal transplantations is the most important and successful treatment of renal failure. Infections are frequently observed especially in the first 6 months after transplantation.
In this study, 45 patients who underwent renal transplantation from cadaver and live donor in Çukurova Üniversity Balcalı Hospital Organ Transplantation Center were examined. In the examination, 1 week before the operation and 1, 3, 6 months after; CMV and BKV DNA studied with real time PCR method in the blood. The factors that reproduce in the cultures of urine, blood, respiratory tract and wound samples were investigated. In addition, it is aimed to investigate the bacteria, virus and fungal agents detected in urine cytology.
It was seen that there was no reproduction in all 19 patients who had urine culture before transplantation. After transplantation  E. coli 7(31.81%), K. pneumoniae and  C. nonalbicans 5(22.72%) and E. faecalis 4(18.18%) most often reproduced.
Before the operation, blood culture was taken from 42 of the patients. No reproduction was observed in 40 (95.2%) of these, only 2 (4.8%) of bacteria were grown. One of the reproducing bacteria is Oligella ureolytica and the other one is KNS. After transplantation S. hominis 4(36.36%), S. epidermidis 3(27.27%), P. aeruginosa and A. baumannii 2(18.18%) were most common in blood culture.
In the culture of samples taken from the respiratory tract of 9 patients, if necessary, 3 and 6 months after the transplant; A. baumannii 4 (44.44%), K. pneumoniae 3 (33.33%), A. fumigatus and C. albicans 1 (11.11%) were most common reproduced. In 10 (22.22%) patients, M. tuberculosis culture was performed and no positivity was obtained. 
It was observed that A. baumannii 3(30%), K. pneumoniae and S. epidermidis 2(20%), C. krusei 1(10%) were most common reproduced in ten patients who underwent wound culture after transplantation.
After transplantation, 11 (28.94%) BK virus positivity was found in 38 patients and CMV virus positivity was found in 25 (60.98%) of 41 patients.
 Decoy cell positivity was found in 11 (35.49%) of  31 patients whose urine cytology was examined. When comparing the positivity and negativity of decoy cell seen in urine cytology with CMV and BKV DNA positivity and negativities studied with real time PCR method, it was found that urine cytology is an important method especially for investigating the early cytopathic effect of BK virus. Viral infections (BKV and especially CMV infection) and accompanying opportunistic infections, which appear between the 1st and 6th months when immunosuppressive therapy is applied intensively, have been found to pose a risk for both kidney loss and patient death. 

Key words: Kidney transplantation, Bacteria, Virus, Fungu