Süt işletmelerinden izole edilen Staphylococcus aureus suşlarında icaA ve icaD genleri ve biyofilm üretiminin tespiti
Detection of icaA, icaD genes and biofilm production by Staphylococcus aureus strains isolated from milk processing facilities
Yazar: FADİMANA KAYA
Danışman: DOÇ. DR. EMRAH TORLAK
Necmettin Erbakan Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2016
Konu: Mikrobiyoloji = Microbiology

Özet:
Staphylococcus aureus önemli bir gıda kaynaklı patojendir ve çoğunlukla gıda zehirlenmelerinin birincil sebebidir. Zehirlenmeye neden olan gıdaların başında süt ve süt ürünleri gelmektedir.  Bu çalışmada süt işletmelerinden alınan çevresel örneklerden izole edilen S. aureus suşlarında interselüler adhezyon genlerinin (icaA ve icaD genleri) varlığı ve biyofilm üretme kapasiteleri araştırılmıştır. Çevresel örneklerden izole edilen toplam 42 S. aureus suşunda icaA ve icaD genlerinin varlığı polimeraz zincir reaksiyonu (PCR) kullanılarak belirlenmiştir. PCR ürünleri agaroz jel elektroforezi ile değerlendirildiğinde, 42 S. aureus suşundan 35'i (%83,3) her iki gen için pozitif, 7 S. aureus suşu (%16,7) ise negatif olarak bulunmuştur. S. aureus suşlarının biyofilm üretme yeteneği konvansiyonel mikrotitrasyon plak yöntemi kullanılarak değerlendirilmiş ve biyofilm üretme yeteneklerine göre güçlü, orta, zayıf ve biyofilm üretmeyen olarak sınıflandırılmıştır. S.aureus suşlarından 39'u güçlü, bir suş orta ve bir suş zayıf biyofilm üreticisi olarak sınıflandırılmıştır. Bir suşun ise biyofilm üretme yeteneğine sahip olmadığı belirlenmiştir. Biyofilm üretme yeteneğine sahip 41 S. aureus suşundan 35'i icaA ve icaD genini bulunduruken 6 suşun bu genleri bulundurmadığı tespit edilmiştir. Bu çalışmanın sonuçları, S. aureus suşlarının biyofilm üretme yeteneği ile icaA ve icaD genleri arasında anlamlı bir ilişki olduğunu göstermiştir.

Abstract:
Staphylococcus aureus is an important foodborne pathogen and is mostly primary cause of food poisoning. It is found in milk and dairy products of the foods that cause poisoning. In this study, biofilm production capacity and the presence of intercellular adhesin genes (icaA and icaD genes) in S. aureus strains that isolated from environmental samples taken from milk processing facilities were investigated. The presence of icaA and icaD genes in a total of 42 S. aureus strains that isolated from environmental samples were determined by polymerase chain reaction (PCR). When the PCR products were evaluated by agarose gel electrophoresis, 35 (83,3%) out of 42 S. aureus strains were both positive for icaA and icaD genes, 7 (16,7%) of S. aureus strains were both negative for icaA and icaD genes. Biofilm production ability of S. aureus strains were evaluated by conventional microtiter plate method and according to their biofilm production ability, S. aureus strains were classified as strong, moderate, weak and no ability to produce. Of the 39 out of 42 S. aureus strains were classified as strong biofilm producers, one strain was classified as moderate biofilm producer and one strain was classified as weak biofilm producer. It was found that the one S. aureus strain has no ability to produce biofilm. While 35 out of 41 S. aureus that have biofilm production ability were both positive icaA and icaD genes, 6 of S. aureus strains were both negative. The results of current study showed that there was a significant relationship between icaA, icaD genes and biofilm production ability of S. aureus strains.