TRPM7 kanalı gen polimorfizmleri ile Behçet hastalığı arasındaki ilişkinin araştırılması
Investigation of the association between TRMP7 gene polymorphisms and Behçet's disease
Yazar: HASARİ PULAT
Danışman: PROF. DR. A. TUNCAY DEMİRYÜREK
Gaziantep Üniversitesi / Sağlık Bilimleri Enstitüsü / Farmakoloji Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2012
Konu: Genetik = Genetics
Dizin: Behçet sendromu = Behcet syndrome ; Genler = Genes ; Hastalık = Disease ; Polimorfizm-genetik = Polymorphism-genetic

Özet:
Transient Reseptör Potansiyel Katyon Kanalı (TRP), Subfamilya M, Üye 7 (transient receptor potansiyel melastanin 7, TRMP 7), iyon kanalları TRP ailesinin hemen hemen bütün hücrelerde bulunan bir üyesidir ve magnezyum, kalsiyum ve divalent eser metal iyonlarına karşı geçirgendir. Magnezyum eksikliği ve değişmiş TRPM7 ekspresyonu/aktivitesi, Behçet Hastalığında önemli faktörlerden olan endoteliyal disfonksiyon, vasküler reaktivite, proliferasyon, inflamasyon ve fibrozise katkıda bulunmaktadır. Bu çalışmanın amacı, Türk toplumunda Behçet Hastaları ve TRPM7 gen polimorfizmleri arasındaki muhtemel bir ilişkiyi araştırmaktır.Benzer yaş ve cinsiyette toplam 121 Behçet Hastası ve 175 sağlıklı kontrol bireyleri bu çalışmaya dahil edilmiştir. Katılımcıların genomik DNA'sı BioMark 96.96 dinamik array sistemi ile analiz edilmiştir. Genotip ve allel frekanslarındaki farklılıkların önemliliğinin hesaplanması amacı ile Ki kare testi (Yates düzeltmesi ile) veya Fisher'in kesin ki kare testi kullanıldı.Hastalarda, TRPM7 geni rs55924090'nin (Ile459Thr) genotip ve allel frekansı dağılımı Behçet hastalarında kontrollere göre önemli derecede farklı bulundu; AA genotipi %96.8 karşılık % 65.4; AG genotipi % 0.0 karşılık %33.8 ve GG genotipi %3.2 karşılık %0.8; A alleli %96.8 karşılık %82.3 ve G alleli %3.2 karşılık %17.7 (p<0.0001). Yine TRPM7 geni rs34181677 (Thr201Ser) polimorfizminin C allelinde bir artış (hastalarda %16.5'a karşılık kontrollerde %9.1) ve G alleli frekansında azalış (hastalarda %83.5'a karşılık kontrollerde %90.9, p=0.0101) vardı. Fakat Behçet Hastalığı ve TRPM7 geni rs62021060 polimorfizmi arasında belirgin bir ilişki bulunmadı. Bu çalışmada rs77165588 ile ilişkili polimorfizm yoktu.Sonuçta, bildiğimiz kadarı ile, mevcut vaka kontrol çalışması Behçet Hastalığı riskinde TRPM7 gen varyasyonlarının potansiyel katılımını araştıran ilk çalışmadır. Bizim verilerimiz TRPM7 geninde genetik polimorfizmlerinin, Türk toplumunda Behçet Hastalığına bireysel duyarlılığını etkileyebileceğini göstermiştir. Bu çalışma ile BH patogenezi açısından yeni bir gen bölgesi belirlenmiştir.

Abstract:
Transient Receptor Potential Cation Channel, Subfamily M, Member 7 (transient receptor potential melastatin 7, TRPM7) is a ubiquitously expressed member of the TRP family of ion channels, and is permeable to magnesium, calcium and divalent trace metal ions. Magnesium deficiency and altered TRPM7 expression/activity may contribute to endothelial dysfunction, vascular reactivity, proliferation, inflammation, and fibrosis which are also important factors in Behçet?s disease. The aim of this study was to investigate a possible association between TRPM7 gene polymorphisms and Behçet?s patients in a Turkish population.A total of 121 patients with Behçet?s disease and 175 healthy controls with similar age and sex were included to this study. Genomic DNA from the participants was analyzed by a BioMark 96.96 dynamic array system. For calculation of the significance of differences in genotype and allele frequencies, the chi-square test (with Yates? correction) or Fisher?s exact test was used.The distribution of genotype and allele frequencies of the TRPM7 gene rs55924090 (Ile459Thr) in patients Behçet?s disease were significantly different from controls; AA genotype 96.8% vs. 65.4%; AG genotype 0.0% vs. 33.8%; and GG genotype 3.2% vs. 0.8%; A allele 96.8% vs. 82.3%; and G allele 3.2% vs. 17.7% (p<0.0001). There was also an increase in C allele (16.5% in patients vs. 9.1% in controls) and decrease in G allele frequencies (83.5% in patients vs. 90.9% in control, p = 0.0101) of the TRPM7 gene rs34181677 (Thr201Ser) polymorphism. However, no marked association was found between TRPM7 gene rs62021060 polymorphism and Behçet?s disease. There was no polymorphism related to rs77165588 in this study.In conclusion, to the best of our knowledge, the present case-control study is the first to examine the potential involvement of TRPM7 gene variations in the risk of incident Behçet?s disease. Our data showed that genetic polymorphisms in TRPM7 gene may modify individual susceptibility to Behçet?s disease in the Turkish population. This study also provided a new gene region for the pathogenesis of BD.