Kolon kanseri ve tükürük mikrobiyom ilişkisi
Association of colon cancer and saliva microbiome
Yazar: DENİZ CAN GÜVEN
Danışman: PROF. DR. ÖMER DİZDAR
Hacettepe Üniversitesi / Tıp Fakültesi / İç Hastalıkları Ana Bilim Dalı / Medikal Onkoloji Bilim Dalı
Derece: Tıpta Uzmanlık, 2018
Konu: Mikrobiyoloji = Microbiology ; Onkoloji = Oncology
Dizin: Ağız florası = Mouth flora ; Gastrointestinal mikrobiyom = Gastrointestinal microbiome ; Kolon neoplazmları = Colonic neoplasms ; Kolorektal neoplazmlar = Colorectal neoplasms ; Mikrobiyota = Microbiota ; Neoplazmlar = Neoplasms ; Tükürük = Saliva

Özet:
Amaç: Bu araştırmada kolorektal kanser (KRK) hastalarının tükürük örneklerinde Fusobacterium nucleatum (Fn), Porphyromonas Gingivalis (Pg) ve Streptococcus gallolyticus subspecies gallolyticus (Sg) varlığı ve miktarının incelenmesi ve sağlıklı kontrollerle karşılaştırılması amaçlandı. Gereç ve Yöntem:  Çalışmaya KRK tanısı yeni konmuş olup henüz herhangi bir tedavi almamış hastalar dahil edildi. Elli yaş üzeri, kanser öyküsü olmayan bireyler kontrol grubuna dahil edildi. Fn, Sg ve Pg suşlarının saptanması ve kantifikasyonu için 16S rRNA ile polimeraz zincir reaksiyonu (PCR) analizleri yapıldı ve elde edilen veriler hastalar ve kontrol grubunda karşılaştırıldı. Bakteri miktarları log10 kopya/ml birimi ile raporlandı. Bulgular: Çalışmaya 71 hasta 77 kontrol olmak üzere toplam 148 kişi dahil edilerek tükürük örneği alındı. Hasta ve kontrol grubunun mikrobiyolojik ve klinik verileri analiz edildi. Hasta ve kontrol grubundan elde edilen tükürük örneklerinde total bakteri miktarı benzerdi (7,51±0,50 vs 7,45±0,62 log10 kopya/ml, p=0,549), iki grupta Fn (%97,2 vs %96,1 p>0,99), Sg (%31 vs %27,3 p=0,619) ve Pg (%76,1 vs %75,3 p=0,917) saptanma oranları benzerdi. Kantitatif analizde ise hastaların tükürük örneklerinde Fn ve Sg miktarı kontrol grubundan daha yüksek bulundu. Ortalama Fn miktarı hastaların tükürük örneklerinde 6,89±1,07 log10 kopya/ml, kontrollerde ise 6,35±0,78 log10 kopya/ml idi (p=0,001). Ortalama Sg miktarı hastaların tükürük örneklerinde 4,12±0,99 log10 kopya/ml, kontrollerde ise 3,15±0,58 log10 kopya/ml idi (p<0,001). Tükürük Pg miktarı iki grupta benzerdi. Tümörün yerleşimi (sağ vs sol kolon) ve evresine (Evre 1-2-3 vs evre 4) göre yapılan karşılaştırmalarda Fn, Sg ve Pg saptanma oranları ve miktarı benzerdi. Mikrosatellit instabilite (MSİ) (+) olan grupta Fn ve Sg miktarının MSİ (-) gruba göre anlamlı derecede daha düşük olduğu görüldü [Fn için sırasıyla 6,15 (4,35-7,96) vs 7,03 (5,18-8,97) log10 kopya/ml p=0,036; Sg için sırasıyla 3,44 (3,18-3,92) vs 4,13 (3,48-7,44) log10 kopya/ml, p=0,022]. ROC eğrisi analizi ile yapılan değerlendirmede, tükürük Sg miktarının KRK'yi öngörmede tanısal değeri olduğu görüldü (AUC: 0,84 %95 GA 0,72-0,96 p<0,001). Sınır değer 3,32 log10 kopya/ml olarak belirlendiğinde, bunun üzerinde Sg miktarının KRK için %82 duyarlılık ve %76 özgüllüğü olduğu görüldü Sonuç: Araştırmamızda, kolorektal kanser hastalarının tükürük örneklerinde Fn ve Sg miktarı kontrol grubundan daha yüksek bulundu. Bu bulgu KRK'nin etiyo-patogenezi, KRK açısından yüksek riskli grupların belirlenmesi, tarama çalışmaları ve KRK'yi önlemeye yönelik ağız ve diş eti sağlığına yönelik çalışmalar için önemli olabilir.

Abstract:
Aim: The aim of this study was to examine the presence and amount of Fusobacterium nucleatum (Fn), Porphyromonas gingivalis (Pg) and Streptococcus gallolyticus subspecies gallolyticus (Sg) in saliva samples of colorectal cancer (CRC) patients in comparison with healthy controls. Material and Method:  Patients with newly diagnosed CRC who have not yet received any treatment were included in the study. Control group consisted of individuals over 50 years of age without a prior diagnosis of malignancy. Polymerase chain reaction (PCR) analyzes were performed with 16S rRNA for identification and quantification of Fn, Sg and Pg strains. Bacterial quantities were reported in log10 copies/ml saliva units. Results: A total of 148 subjects including 71 patients and 77 controls were included in the study. The total amount of bacteria in the saliva samples from the patient and control group were similar (7,51±0,50 vs 7,45±0,62 log10 copies/ml, p=0,549). Detection rates of Fn (97,2% vs 96,1%  p>0,99), Sg (31% vs 27,3% p=0,619) and Pg (76,1% vs 75,3% p=0,917) were similar in two groups. Mean Fn amount was higher in patient saliva samples compared with controls (6,89±1,07 vs 6,35±0,78 log10 copies/ml, p=0,001). Mean Sg amount was higher in patient saliva samples (4,12±0,99 vs 3,15±0,58 log10 copies/ml, p<0,001). Saliva Pg amount was similar in two groups. The frequency and amount of Fn, Sg, and Pg were similar in the comparison of tumor localization (right vs left colon) and stage (stage 1-2-3 vs stage 4). Fusobacterium nucleatum and Streptococcus gallolyticus subspecies gallolyticus were found to be significantly lower in the microsatellite insability (MSI) (+) group than in the MSI (-) group [6,15 (4,35-7,96)  vs 7,03 (5,18-8,97) log10 copies/ml p=0,036 for Fn; 3,44 (3,18-3,92) vs 4,13 (3,48-7,44) log10 copies/ml, p=0,022 for Sg, respectively]. Evaluation of the salivary Sg amount by ROC curve analysis found to have diagnostic value for CRC (AUC: 0,84 %95 GA 0,72-0,96 p<0,001). Quantity of Sg above 3,32 log10 copy/ml was the best predictor cutoff value for CRC with 82% sensitivity and 76% specificity. Conclusion: In this study, the salivary samples of colorectal cancer patients had higher amounts of Fn and Sg than the control group. This finding may be important for etiopathogenesis of CRC, identification of high-risk groups for CRC, screening of CRC and studies of oral and gingival health for CRC prevention.