Metallotiyonein promotor bölge polimorfizminin toksik metal ve iz element düzeylerine etkisi
Effect of metallothionein promoter region polymorphism on toxic metal and trace element levels
Yazar: ZELİHA KAYAALTI
Danışman: PROF.DR. TÜLİN SÖYLEMEZOĞLU
Ankara Üniversitesi / Sağlık Bilimleri Enstitüsü / Adli Toksikoloji ve Adli Kimya Ana Bilim Dalı
Derece: Doktora, 2007
Konu: Adli Tıp = Forensic Medicine ; Genetik = Genetics
Dizin: Metaller = Metals ; Otopsi = Autopsy ; Polimorfizm-genetik = Polymorphism-genetic

Özet:
Bu çalısmanın amacı, toplumumuzdaki MT2A kor promotor bölgesi polimorfizmoranını belirlemek ve bu polimorfizmin otopsi böbrek dokusunda iz elementdüzeyleri ve toksik metal birikimi üzerine etkisi olup olmadıgını arastırmaktır.Çalısmanın ilk kısmında, 308 bireyde metallotiyonein 2A kor promotor bölge ?-5upstream?deki AG tek nükleotid polimorfizmi (SNP) arastırıldı. zole edilenDNA'ların MT2A promotor bölgesi, PCR teknigi ile çogaltılarak, 241 bpuzunlugundaki oligonükleotid amplifiye edildi. PCR ürünü BsgI restriksiyon enzimiile kesildi. Toplumumuzdaki MT2A kor promotor bölge ?-5 upstream? deki teknükleotid polimorfizmin genotip frekansları; % 87 homozigot tipik, %12.3heterozigot ve %0.65 homozigot atipik genotip olarak belirlendi.kinci bölümde ise; otopsi olgularından alınarak, metallotiyonein 2A kor promotorbölge ?-5 upstream?deki AG tek nükleotid polimorfizmi belirlenmis olan 114böbrek örneginin Cd, Pb, Zn ve Cu konsantrasyonları ölçüldü ve polimorfik özelliklemetal düzeyi arasında korelasyon olup olmadıgı arastırıldı. Sonuç olarak;metallotiyonein 2A kor promotor bölge ?-5 upstream?deki AG tek nükleotidpolimorfizm ile böbrek dokularındaki Pb, Zn ve Cu arasında herhangi bir korelasyonbulunmazken, Cd konsantrasyonu ile oldukça yüksek pozitif korelasyon tespit edildi(p=0.002). Böbrek doku örneklerindeki ortalama Cd konsantrasyonu; 95.54 ppmiken, homozigot tipik bireylerde; 87.72 ppm, heterozigot bireylerde; 151.24 ppm vehomozigot bireyde ise 153.09 ppm olarak belirlendi.Anahtar Kelimeler: Gen Polimorfizmi, Metallotiyonein, Metaller, MT2A, Otopsiörnekleri

Abstract:
The aim of this study is to determine the polymorphism of MT2A core promoterregion in our population and investigate whether this polymorphism has an effect ontrace element levels and toxic metal accumulation in the kidney tissue from autopsymaterial.In the first part of this study the polymorphism of the gene for MT2A, were analyzedin 308 subjects. AG single nucleotide polymorphism (SNP) was investigated in theindividuals? MT2A core promoter region in the ?-5 upstream?. The MT2A promoterregion of the isolated DNAs, were amplified with the PCR technique and 241 bpoligonucleotide were produced. The amplified oligonucleotides were cut with BsgIrestriction enzyme. The genotype frequencies of the SNP in the societies? MT2Acore promoter region were determined as follows; 87% homozygote typical, 12.3%heterozygote and 0.65% homozygote atypical genotype.After the determination AG SNP in the MT2A, the Cd, Pb, Zn and Cuconcentration of the 114 kidney samples were measured and the correlation betweenthe polymorphic characteristics and metal level were investigated. As a result; nocorrelation was found between the AG SNP in the MT2A and the Pb, Zn and Culevels in the kidneys but a highly positive correlation was detected with the Cdconcentration (p=0.002). While the average Cd concentration of the kidney tissuesamples was 95.54 ppm, it was determined that the homozygote typical individualshave had 87.72 ppm, heterozygote individuals have had 151.24 ppm and homozygoteatypical individuals have had 153.09 ppm.Key words; Autopsy tissue, Gene polymorphism, Metallothionein, MT2A, Metals;