Fermente sucuktan izole edilen enterococcus suşlarındanantibiyotik direnç genlerinin pzr ile araştırılması
Research of antibiotic resistance genes in enterococcus strainsisolated from traditional fermented sausage
Yazar: İBRAHİM HAKAN FALAK
Danışman: DOÇ. DR. BANU ÖZDEN TUNCER
Süleyman Demirel Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Gıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2019
Konu: Gıda Mühendisliği = Food Engineering

Özet:
Enterococcus faecium ve Enterococcus faecalis bazı gıdalarda organaleptik
özellikleri iyileştirmektedir. Bunun yanında bu suşlar lipolitik ve esterolitik aktivite,
sitrattan yararlanma ile uçucu aromatik bileşikleri sentezleme gibi özellikleri ile
fermente et ürünlerinin olgunlaştırılması sırasında diğer laktik asit bakterileri ile
birlikte starter kültür olarak da kullanılır. Günümüzde bazı araştırmacılar
Enterococcus cinsi bakterileri hala GRAS (Generally Recognised As Safe) olarak
kabul etmemektedir. Enterokokların pek çoğu probiyotik olarak kullanılabilecek
kadar zararsız bakteriler olmakla birlikte bazıları ciddi hastalıklara neden
olabilmektedir. Özellikle Enterococcus faecium ve Enterococcus faecalis gibi
türlerin, insanlarda bazı önemli enfeksiyonlara yol açtıkları ve antibiyotik dirençlilik
gibi çeşitli patojenite özellikleri içerdikleri bilinmektedir. Antibiyotiğe dirençli bu
suşların gıda yoluyla insan bağırsak florasında bulunan diğer bakterilerin
antibiyotik direnci kazanmasına yol açabileceği düşünülmektedir. Bu yüksek lisans
tez çalışmasında, doğal fermente sucuk örneklerinden izole edilmiş 25 adet
Enterococcus suşunun (24 adet E. faecium ve 1 adet E. feacelis) temini sağlanarak
polimeraz zincir reaksiyon (PZR) tekniği ile antibiyotik direnç genlerinin varlığı
araştırılmıştır. Öncelikle Enterococcus suşlarının genomik DNA'ları izole edilmiştir.
Genomik DNA'larının varlığı % 1,5 agaroz jel elektroforezinde saptanmıştır.
Enterococcus suşlarında eritromisin (ermA, ermB, ermC), tetrasiklin (tetM, tetL),
siprofloksasin (gyrA), streptomisin (strA, strB, aadA, aadE), vankomisin (vanA,
vanB), gentamisin [(aac(6')aph(2''), aac(3'')II, aac(3'')IV)], antibiyotik direnç
genlerinin varlığı spesifik primerler kullanılarak PZR çalışmaları ile araştırılmıştır.
PZR analizi sonucunda ermA, ermB, ermC, tetM, tetL, gyrA, strA, strB, aadA, aadE,
vanA, vanB, aac(6')aph(2''), aac(3'')II, aac(3'')IV genlerinin tüm izolatlarda varlığı
saptanamamıştır.

Abstract:
Enterococcus faecium and Enterococcus faecalis improve organoleptic properties in
some foods. In addition, these strains used as a starter culture along with other
lactic acid bacteria during fermentation of the fermented meat products due to
their some properties such as the use of citrat and the synthesis of volatile
aromatic compounds, lipolytic and esterolytic activity. Nowadays, some
researchers do not accept Enterococcus as GRAS (Generally Recognized As Safe).
Some of them can cause serious illnesses, with many being harmless bacteria that
can be used as probiotics. It is known that especially species such as Enterococcus
faecium and Enterococcus faecalis to cause some important infections in humans.
These antibiotic resistant strains are thought to lead to antibiotic resistance by
other bacteria found in the human intestinal flora via food. In this master thesis
study, 25 Enterococcus strains (24 E. faecium and 1 E. feacelis) isolated from
natural fermented sausage samples by means of the polymerase chain reaction
(PCR) technique developed the presence of antibiotic resistance genes has been
investigated. Primarly, genomic DNAs of Enterococcus strains were isolated. The
presence of genomic DNAs was determined by 1.5% agarose gel electrophoresis. In
Enterococcus strains, Erythromycin (ermA, ermB, ermC), tetracycline (tetM, tetL),
ciprofloxacin (gyrA), streptomycin (strA, strB, aadA, aadE), vancomycin (vanA,
vanB), gentamycin [(aac(6')aph(2''), aac(3'')II, aac(3'')IV] antibiotic resistance
genes were investigated by PCR studies using specific primers. As a result of PCR
analysis, ermA, ermB, ermC, tetM, tetL, gyrA, strA, strB, aadA, aadE, vanA, vanB,
aac(6')aph(2''), aac(3'')II, aac(3'')IV genes could not be detected in all isolates.