Küçük hücreli dışı akciğer kanserli hastalarda EGFR gen mutasyon ve amplifikasyonlarının RT PCR ve FISH analizleri ile belirlenmesinin hastalık tanısındaki öneminin araştırılması
Significance investigation of EGFR gene mutations and amplifications identified by RT PCR and FISH analysis in disease diagnosis on non small cell lung cancer patients
Yazar: BUKET DOĞRUOĞLU
Danışman: DOÇ. DR. HAKAN SAVLI
Kocaeli Üniversitesi / Sağlık Bilimleri Enstitüsü / Tıbbi Genetik ve Moleküler Biyoloji Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2014
Konu: Biyoloji = Biology ; Genetik = Genetics
Dizin: Akciğer neoplazmları = Lung neoplasms ; Epidermal büyüme faktörü = Epidermal growth factor ; FISH = FISH ; Karsinoma-küçük hücreli olmayan-akciğer = Carcinoma-non small cell-lung ; Neoplazmlar = Neoplasms ; Polimeraz zincirleme reaksiyonu = Polymerase chain reaction

Özet:
Akciğer kanseri, 20.yüzyılın başlarında nadir görülen bir hastalık iken, sigara içme alışkanlığındaki artışa paralel olarak sıklığı giderek artmış ve dünyada en sık görülen kanser türü haline gelmiştir. Bütün kanserlerde olduğu gibi, akciğer kanserleri de onkogenleri ve tümör süpresör genleri etkileyen genetik değişiklikler sonucu meydana gelmektedir. Epidermal büyüme faktörü reseptörü genleri, tirozin kinaz aktivitesine sahip transmembran proteinidir ve bu proteini kodlayan genin amplifikasyonları ve mutasyonları başta küçük hücreli dışı akciğer kanseri (KHDAK) ve pek çok epitelyal kanser türünde araştırılmaktadır. Mutasyon analizi ve gen kopya sayısının belirlenmesi günümüzde, tümör hücrelerinde EGFR statüsünün tespit edilmesinde kullanılmaktadır. 
Çalışmamızda, 50 olgunun 47'sine FISH yöntemi ile EGFR amplifikasyon analizi, 49'una Real-time PCR yöntemiyle EGFR mutasyon analizi yapılmıştır. Çalışma sonucunda, 4 olguda (%8.5) oranında EGFR gen amplifikasyonu, 10 olguda (%20.4) oranında EGFR mutasyonu saptanmıştır. EGFR mutasyonlarının 7'si ekzon 19'da, 2'si ekzon 20'de ve 1'i ekzon 21'de olarak saptanmıştır. Mutasyonu bulunmayan 4 hastamızda, EGFR amplifikasyonu pozitif bulunmuştur. Bu iki yöntemden elde edilen bilgilerin, KHDAK'lerin de EGFR tirozin kinaz inhibitorleri ile hedefe yönelik tedavilerin geliştirilmesi için bir gösterge olduğunu düşünmekteyiz.

Abstract:
The frequency of lung cancer increased in parallel to the increased smoking habits and became the world's most common cancer, while it was a rare disease during early 20th century. As all cancer types, lung cancer occurs as a result of changes in the oncogenes and tumor suppressor genes. EGFR (Epidermal Growth Factor Receptor), is a a transmembrane protein with tyrosine kinase activity and amplifications and mutations of this protein-encoding gene have been studying in non small cell lung cancer (NSCLC) particularly, as in many epithelial cancer types. Mutation analysis and gene copy number determination, are used in the detection of EGFR status of tumor cells recently. 
In our study, we performed EGFR amplification analysis by FISH technique in 47 of 50 patients and EGFR mutation with Real-Time PCR analysis in 49 of 50 patients. As a result, EGFR gene amplification has been idenified in 4 cases (8.5%) and EGFR mutation has been identified in 10 cases (20.4%). EGFR mutations were seen in exon 19 in 6 cases, in exon 20 in 2 cases and in exon 21 in 1 case.
We think that the information obtained from these two methods may be used as an an indicator for the development of targeted therapies with EGFR tyrosine kinase inhibitor in NSCLC.