Prostat kanserlerinde GADD45gama metilasyon düzeyinin yüksek çözünürlüklü erime analizi ile belirlenmesi ve apoptoz ile olası korelasyonun değerlendirilmesi
Determination of GADD45gamma methylation by high resolution melting analysis in prostate cancer and evaluation of the possible correlation with apoptosis
Yazar: OZGE CAN
Danışman: DOÇ. DR. VİLDAN CANER
Pamukkale Üniversitesi / Sağlık Bilimleri Enstitüsü / Tıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2013
Konu: Onkoloji = Oncology ; Tıbbi Biyoloji = Medical Biology ; Üroloji = Urology
Dizin: Apoptozis = Apoptosis ; DNA = DNA ; Gen ifadesi = Gene expression ; Genler = Genes ; Genler-Bcl-2 = Genes-Bcl-2 ; Metilasyon = Methylation ; Neoplazmlar = Neoplasms ; Prostat neoplazmları = Prostatic neoplasms

Özet:
Prostat kanseri tüm dünyada erkeklerde en yaygın tanı alan kanser türlerinden biridir ve sıklıkla ölümle sonuçlanmaktadır. Prostat kanserinin patogenezi net olarak aydınlatılamamış olmakla birlikte, önemli hücresel mekanizmalardaki düzensizlikler hastalığın patogenezinde rol oynamaktadır. ''Growth Arrest DNA Damage-Inducible 45'' (GADD45), bu mekanizmalarda yer alan önemli bir gen ailesidir ve GADD45alfa, GADD45beta, GADD45gama olmak üzere 3 üyeden oluşmaktadır. 
Hem hematolojik malignensiler hem de solid tümörlerde GADD45gama ekspresyonunda önemli ölçüde azalma olduğu ve kanserli dokularda GADD45gama  metilasyon düzeyinin daha yüksek olduğu belirlenmiştir. Ancak, prostat kanserlerinde sözkonusu genin ekspresyon ve metilasyon durumları hakkında detaylı bilgi bulunmamaktadır. 
Bu çalışmanın amacı, benign prostat hiperplazi (BPH)'li (60 olgu) ve prostat kanserli (56 olgu) doku örneklerinde GADD45gama'nın metilasyon ve ekspresyon  durumlarını belirlemek, metilasyon ile ekspresyon profili arasındaki korelasyonu değerlendirmek, ve GADD45gama'nın metilasyon ve ekspresyon profillerinin apoptozla olan ilişkisini belirlemektir.
Çalışma sonucunda literatürle uyumlu olarak, hematolojik malignensilerin aksine diğer solid tümörlerde olduğu gibi prostat kanserlerinde GADD45gama metilasyon sıklığının düşük olduğu, bunun aksine BPH'li doku örneklerinde metilasyon sıklığının daha yüksek olduğu belirlendi (p=0.000). Her iki grupta da GADD45gama metilasyonu ve protein ekspresyonu arasında korelasyon yoktu. Bcl-2 ve Bcl-xL ekspresyonu açısından her iki olgu grubu arasında anlamlı fark bulundu (sırası ile p=0.000 ve p=0.003). Prostat kanserli olgularda GADD45gama ekspresyonunda anlamlı artış gözlenmesine rağmen, GADD45gama ekspresyon durumu ile apoptoz arasında anlamlı bir ilişki bulunmadı. 
Bu çalışmada prostat kanserinde GADD45gama metilasyon sıklığının düşük olduğu, prostat kanserinde apoptoz regülasyonunun çok daha karmaşık bir mekanizma ile sağlandığı ve GADD45gama'nın tek başına kanser hücrelerini apoptotik sürece yönlendirmediği bulundu.




Anahtar kelimeler: Prostat kanseri, GADD45, Bcl-2, Bcl-xL, apoptoz, DNA metilasyonu, HRM

Abstract:
Prostate cancer (PCa) is one of the most common cancer type wordwide in men and it often leads to death. It is believed that deregulation of important cellular mechanisms is involved in the pathogenesis of PCa although the exact mechanism of its pathogenesis has not been clearly elucidated. ''Growth Arrest DNA Damage-Inducible 45''(GADD45) is one of the most important gene family in these mechanisms and consists of 3 members: GADD45alpha, GADD45beta, GADD45gamma.
It has been reported that there was a significantly reduced expression in GADD45gamma and methylation of the gene is present at very high frequencies in both solid tumors and hematological malignencies. But, there is no detailed information on protein expression and methylation profiles of the gene in PCa. 
The aims of this study are to detect the methylation and protein expression profiles of GADD45? in benign prostate hyperplasia (BPH) (60 patients) and PCa (56 patients), to examine the correlation between methylation and protein expression profiles, and also to evaluate whether apoptosis is related to these profiles. 
In this study, the methylation frequency for GADD45gamma was quite low in PCa compared with BPH (p=0.000). This was consistent with the literature with the reported the frequency of the gene in solid tumors was lower than in hematological malignencies. In both groups, there was no correlation between GADD45? methylation and protein expression. It was found that there was a significant difference between Bcl-2 and Bcl-xL expressions in both groups (p=0.000 and p=0.003, respectively). It was not found a significant relation between GADD45? expression status and apoptosis although GADD45gamma expression was higher in PCa than that in BPH.  
In summary, we found that the methylation frequency of GADD45gamma was not common in PCa, the regulation of apoptotic pathways is more complex than we expected, and GADD45? is not the only key factor for the cells to direct into the apoptotic process.




Key words: Prostate cancer, GADD45, Bcl-2, Bcl-xL, apoptosis, DNA methylation, HRM