Eskişehir'de tıp fakültesi hastanesi'nde vankomisin dirençli enterokokların moleküler epidemiyolojik analizi
The molecular epidemiologic analysis of vancomycin resistant enterococci in a university hospital in eskişehir
Yazar: BUKET YAYLA
Danışman: PROF.DR. GÜL DURMAZ
Eskişehir Osmangazi Üniversitesi / Tıp Fakültesi / Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
Derece: Tıpta Uzmanlık, 2007
Konu: Mikrobiyoloji = Microbiology

Özet:
Bu çalısmada bir yıllık bir zaman dilimi içinde ESOGÜTıp Fakültesi Hastanesi yogun bakım ünitesi hastalarında, haftada bir kezalınan sürveyans kültürleriyle VRE gastrointestinal sistem tasıyılıgınınarastırılması ve elde edilen VRE izolatlarının direnç genotiplerinin ve genetikyakınlıklarının belirlenmesi amaçlanmıstır. Çalısma süresince çesitli klinikörneklerden patojen olarak soyutlanan VRE susları da çalısmaya dahiledilmistir. Susların identifikasyonu VITEK 2 Compact Sistem GP kartları ile,antibiyotik duyarlılıkları VITEK 2 Compact Sistem AST kartları ve E-testyöntemi kullanılarak belirlenmistir. Glikopeptid direnç genotipi saptamadamultiplex PCR, klonal iliskinin belirlenmesinde ise PFGE yöntemlerikullanılmıstır. Sürveyans kültürlerinin % 4,8'inde (58/1200), klinik örneklerdenizole edilen enterokok izolatlarının % 0,5'inde (3/529) VRE saptandı. Bususların tümü E. faecium olarak tanımlandı. E-test ile susların tümündevankomisin ve teikoplanin MİK degerleri 256 mg/L üzerinde bulundu. Suslarınhiçbirinde quinopristin-dalfopristin ve linezolid direncine rastlanmadı.Moleküler testlerle susların hepsinin van A genotipinde oldugu ve tek birklondan köken aldıkları saptandı. Aynı dönemde VREenfeksiyonu/kolonizasyonu saptanan hastaların büyük bölümü (5/7) pediatriYBÜ hastalarıydı. Hastanemizde ilk olarak 2002 yılında kolonizan olarak 2VRE susunun tanımlanmasını takiben 2005 yılında alınan sürveyanskültürlerinde % 5,9 (25/420) oranında VRE saptanması ve bizim bulgularımızhastanemizde VRE enfeksiyonlarının karsımıza çıkmaya devam edeceginidüsündürmektedir. Bu nedenle VRE tespiti ve yayılımın önlenmesikonusunda etkin enfeksiyon kontrol uygulamaları bu sorunun gelecektekiboyutunu belirlemede anahtar rol oynayacaktır.Anahtar Kelimeler:Enterokok, VRE, multiplex PCR, PFGE.

Abstract:
The aim of this study is to investigategastrointestinal carriage of VRE at one year period in patients that admitted tointensive care units at Eskisehir Osmangazi University Medical Faculty Hospitalby taking surveillance cultures weekly, and to determine the genotypes ofvancomycin resistance and clonal relationship in VRE strains. During the studyperiod VRE strains isolated from various clinical specimens were also includedin the study. The isolated strains were identified to species level by VITEK 2Compact System GP cards, and antimicrobial susceptibility testing wasdetermined by VITEK 2 Compact System AST cards and E test method.Determination of glycopeptide resistance genotypes were performed bymultiplex PCR and, clonal relations were defined by PFGE method. The ratiosof VRE in surveillance cultures and among enterococci isolates of clinicalspecimens were was 4.8% (58/1200) and 0.5% (3/529) respectively. All of theVRE strains were identified as E.faecium. MICs of vancomycin and teicoplaninwhich were tested by E test method were greater than 256 mg/L for all isolates.No strain was found resistant to quinopristin-dalfopristin and linezolid. t wasdetected all strains which tested by molecular methods had van A genotype andshowed relation with one clonal type. At the same period, most of the patients(5/7) who had VRE colonization were in pediatric intensive care unit. After 2VRE strains were defined as colonizan in our hospital in 2002, detection of VREratio as 5,9 % (25/420) in surveillance cultures in 2005 and our results made usconsidered that VRE infections will go along in our hospital. Therefore, effectiveinfection control applications about VRE detection and preventing, VREtransmisson will play a key role in determining the wideness of this problem atthe future