Yeni naftalimit türevlerinin biyolojik aktivitesi
Biological activity of new naphthalimide derivatives
Yazar: GÖZDE GÜLBOY
Danışman: PROF. DR. BURAK ÇOBAN
Zonguldak Bülent Ecevit Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Kimya Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2023
Konu: Biyokimya = Biochemistry

Özet:
Naftalimit türevleri antitümör, antiprotozoal, antibakteriyel ve antiviral ajanlar için çekirdek iskele görevi sağladığından farmakolojik öneme sahip aromatik heterosiklerdir. DNA'ya bağlanma özelliği sayesinde antiproliferatif etki göstererek etki eder. Son yıllarda birçok literatür özeti hazırlanmış ve naftalimitlerin yapı aktivite ilişkileri incelenmiştir. Yapılan çalışmalarda naftalimit halka sisteminin DNA baz çiftleri arasına interkalasyon yaparak bağlandığı ve halkanın çeşitli noktalarından yapılan sabstitüsyonlarla çeşitli aktiviteler elde edildiği anlaşılmıştır.
Bu çalışmada, naftalimit iskeleti anhidrit oksijeni üzerinden diaminopridin halkasını amin kollarından birinden bağlayarak elde ettiğimiz 2-(2-amino-4-bromo-pridin)-1H-benzo[de]isoquinoline-1,3(2H)-dione (G1) ve pridin azotu üzerinden alkilleyerek elde ettiğimiz katyonik bileşik (G2) sentezlenmiştir. Elde edilen bileşiklerin karakterizasyonu FT-IR, 1H-NMR, 13C-NMR, ESI-MS analiz yöntemleriyle gerçekleştirilmiştir. DNA etkileşimleri üzerinde çalışılmıştır. Bileşiklerin DNA etkileşimleri UV-Vis titrasyonu, floresans, yarışmalı floresans, viskozimetri ve agaroz jel elektroforezi metotlarıyla çalışılmıştır.
Çalışma sonuçlarında anlaşıldığı üzere G1 bileşiğinin DNA ile etkileşimi zayıftır ve büyük ihtimalle kısmi interkalasyon olarak etki etmektedirler. Fakat katyonik bileşiğin (G2) ise spektrofotometrik yöntemlerle yapılan çalışmalarda DNA'ya interkalasyon yaptığı tespit edilmiştir. Bileşikler agaroz jel elektroforezinde plazmit DNA'ya hasar vermemiştir.

Abstract:
Naphthalimide derivatives are aromatic heterocycles of pharmacological importance as they provide core scaffolding for antitumor, antiprotozoal, antibacterial and antiviral agents. Thanks to its ability to bind to DNA, it acts by showing an antiproliferative effect. In recent years, many literature summaries have been prepared and the structure-activity relationships of naphthalimide have been examined. In the studies, it was understood that the naphthalimide ring system was connected by intercalating between DNA base pairs and various activities were obtained with the substitutions made from various points of the ring.
In this study, 2-(2-amino-4-bromo-pyridine)-1H-benzo[de]isoquinoline-1,3(2H)-dione (G1) and the cationic compound (G2), which we obtained by alkylating over pyridine imine, was synthesized. Characterization of the obtained compounds was performed by FT-IR, 1H-NMR, 13C-NMR, ESI-MS analysis methods. DNA interactions have been studied. DNA interactions of compounds were studied by UV-Vis titration, fluorescence, competitive fluorescence, viscosimetry and agarose gel electrophoresis methods.
As understood in the results of the study, the interaction of G1 compound with DNA is weak and they probably act as partial intercalation. However, it has been determined that the cationic compound (G2) intercalates with DNA in studies with spectrophotometric methods. Compounds did not damage plasmid DNA in agarose gel electrophoresis.