Non-fonksiyonel hipofiz adenomu patogenezinin transkriptom analizleri ile incelenmesi
An investigation of non-functioning pituitary adenoma pathogenesis by transcriptome analysis
Yazar: NİSA DEVRİM
Danışman: YRD. DOÇ. DR. DENİZ SÜNNETÇİ AKKOYUNLU
Kocaeli Üniversitesi / Sağlık Bilimleri Enstitüsü
Derece: Yüksek Lisans, 2018
Konu: Genetik = Genetics
Dizin: Adenomlar = Adenoma ; Gen ifadesi = Gene expression ; Hipofiz bezi = Pituitary gland ; Hipofiz hastalıkları = Pituitary diseases ; Hipofiz neoplazmları = Pituitary neoplasms ; Mikrodizilim analizi = Microarray analysis

Özet:
Non-Fonksiyonel Hipofiz Adenomu Patogenezinin Transkriptom Analizleri ile
İncelenmesi
Amaç: Hipofiz adenomlarının yaklaşık %25-30 'unu non-fonksiyonel hipofiz
adenomları oluşturmaktadır. Non -fonksiyonel hipofiz adenomlarının %40 'ı invazyon
gösterirler. İmmünohistokimyasal çalışmalar, moleküler biyoloji teknikleri ve in vitro
çalışmalar non-fonksiyonel adenomların daha detaylı sınıflandırılmasına olanak
sağlamıştır. Amacımız; Non-Fonksiyonel hipofiz adenomları patogenezinin gen ağları
ve yolak analizleriyle mRNA düzeyinde araştırılmasıdır.
Yöntem: Çalışmamızda, Kocaeli Üniversitesi Tıp Fakültesi Nöroşirürji Anabilim
Dalı'na başvuran non-fonksiyonel hipofiz adenomu tanısı almış 45 tümör dokusu, 8
normal hipofiz dokusunda gen ekspresyonu mikroarray çalışması yapıldı. IPA analiziyle
non-fonksiyonel hipofiz adenomları ile ilgili sinyal yolakları ve PPE (protein-protein
etkileşimi) ağları oluşturarak tümör oluşumuna sebep olan anahtar genler tespit edildi.
Bulgular: Yaptığımız mikroarray analizleri sonucunda 2698 genin ekspresyon
değişikliği saptandı. Bu genlerden 270'nin ekspresyonun arttığı, 2428'nin ekspresyonun
azaldığı tespit edildi. Ekspresyonun en çok arttığı gen CASKIN2, ekspresyonun en çok
azaldığı gen S100A7A olarak bulundu. PPE ağında saptanan anahtar genler şunlardı:
CCND1, BRCA1, HNF1A, POU5F1, GATA4, SOX2, NUPR1ve FOXA1.
Sonuç: Yapılan bu mikroarray analizi sonucunda CCND1, BRCA1, HNF1A,
POU5F1, GATA4, SOX2, NUPR1ve FOXA1 genleri ileride yapılacak çalışmalara
araştırılması gereken birer potansiyel biyobelirteç adayı olarak belirlendi. Elde ettiğimiz
çalışmamız non-fonksiyonel hipofiz adenomlarının tanı ve tedavisinde yol gösterici
olabilir.
Anahtar kelimeler: Non-fonksiyonel hipofiz adenomları, mikroarray, gen ekspresyonu

Abstract:
An Investigation of Non-Functioning Pituitary Adenoma Pathogenesis by
Transcriptome Analysis
Objective: Approximately 25-30% of pituitary adenomas are non-functional
pituitary adenomas. Forty percent of non-functioning pitüitary adenomas are invasive.
Immunohistochemical studies, molecular biology techniques and in vitro studies have
allowed more detailed classification of non-functioning adenomas. Our aim was to
investigate the pathogenesis of non-functioning pituitary adenomas is to be investigated
at mRNA level by gene networks and pathway analysis.
Method: In our study, gene expression microarray was performed in 8 normal
pituitary tissues and 45 tumors samples obtained from patients with non-functioning
pituitary adenomas diagnosed from Kocaeli University Faculty of Medicine
Neurosurgery Department. Using IPA analysis, we identified signaling pathways and
PPI (protein-protein interaction) networks to identify the key genes associated with nonfunctioning
pituitary adenomas.
Result: 270 up-regulated, 2428 down-regulated DEGs were identified in nonfunctioning
pituitary adenoma samples compared to normal pituitary tissues. CCND1,
BRCA1, HNF1A, POU5F1, GATA4, SOX2, NUPR1 ve and FOXA1.
Conclusions: CCND1, BRCA1, HNF1A, POU5F1, GATA4, SOX2, NUPR1 and
FOXA1 were found to have potential for use as diagnostic biomarker for nonfunctioning
pituitary adenomas. Our study may shed light on the diagnosis and
treatment of non-functioning pituitary adenomas.
Key Words:Non-functioning pitüitary adenomas, microarray, gene expression