hakansabunis/tr-academic-research-agent-index huggingface dataset:
Üçlü-faz ayırma tekniği ile saflaştırılan selülazın enkapsülasyonu, karakterizasyonu ve ın vitro kullanılabilirliği
Encapsulation, characterisation and in vitro useability of cellulase purified with three-phase partitioning technique
Yazar: DERYA ÇAMURLU
Danışman: PROF. DR. SEÇİL ÖNAL
Ege Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Biyokimya Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2019
Konu: Biyokimya = Biochemistry
Dizin: Enkapsülasyon = Encapsulation ; Faz ayrışması = Phase separation ; Kalsiyum aljinat = Calcium alginate ; Kitosan = Chitosan ; Selülaz = Cellulase ; Trichoderma = Trichoderma ; İn vitro = In vitro

Özet:
Bu tez çalışmasında, ticari arenada sıklıkla kullanılan Trichoderma reesei selülazının üçlü-faz ayırma (TPP) metodu ile saflaştırılması ve kalsiyum aljinat jelde enkapsülasyonu çalışılmıştır. Bu iki temel deneme tüm değişkenleriyle optimize edilmiş ve sonuçta hem saflaştırma hem de enkapsülasyon çalışmaları için optimum koşullar belirlenmiştir. 
	 T. reesei selülazının saflaştırılmasında ideal TPP koşulu; %50 (w/v) amonyum sülfat doygunluğu, 1:1 (v/v) enzim: t-bütanol oranı, pH 4,5 ve 0,1 mg protein olarak belirlenmiştir. Optimum koşullarda selülaz enzimi, %113 aktivite verimi ve 1,42 saflaştırma katı ile başarı ile saflaştırılabilmiştir. 
	Enkapsülasyon çalışmaları neticesinde ise ticari selülaz enziminin immobilizasyonu için optimum koşullar; 0,5 mg enzim (protein miktarı) ve %2 (w/v) aljinat, %0,5 (w/v) kitosan içeren 0,15 M CaCl₂, 3 saat immobilizasyon, %2,0 (v/v) glutaraldehit ile 2 saat çapraz bağlama olarak belirlenmiştir. Bu optimum koşullarda Selülaz enzimi %53 aktivite verimi ile başarı ile immobilize edilmiştir. TPP orta fazında deriştirilen selülaz enzimi ise belirlenen optimum koşullarda %10 aktivite verimi ile immobilize edilebilmiştir.

Abstract:
In this thesis, the purification of Trichoderma reesei cellulase which is frequently used in commercial arena by three-phase partitioning (TPP) method and encapsulation in calcium alginate gel was studied. These two basic experiments were optimized with all variables, and finally optimum conditions for both purification and encapsulation studies were determined. 
	Ideal TPP condition for the purification of T. reesei cellulase was determined as; 50% (w/v) ammonium sulfate saturation, 1:1 (v/v) enzyme: t-butanol ratio, pH 4.5 and 0.1 mg of the protein. Under optimum conditions, the cellulase enzyme was successfully purified with 113% activity yield and 1.42 purification fold. 
	As a result of the encapsulation studies, optimum immobilization conditions for commercial cellulase enzyme were determined as; 0.5 mg enzyme (protein amount) and 2% (w/v) alginate, 0.5% (w/v) chitosan in 0.15 M CaCl2, 3 hours, 2.0% (v/v) glutaraldehyde 2 hour cross-linking time. The cellulase enzyme was successfully immobilized with 53% activity yield with this optimum conditions. The cellulase enzyme, which was concentrated in the middle phase of TPP, could be immobilized with 10% activity yield under these optimal conditions.
Batı Anadolu'daki Terra sigillata ve kırmızı astarlı seramikler: Terminoloji, üretim merkezleri ve kronoloji
Terra sigillata and red slip wares in West Anatolia: Terminology, production centers and chronology
Yazar: HAKAN AYCAN
Danışman: PROF. DR. RAFET GÜL GÜRTEKİN DEMİR
Ege Üniversitesi / Sosyal Bilimler Enstitüsü / Arkeoloji Ana Bilim Dalı / Klasik Arkeoloji Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2019
Konu: Arkeoloji = Archeology
Dizin: Astar = Lining ; Batı Anadolu = West Anatolia ; Geç Roma = Late Rome ; Kronoloji = Chronology ; Roma Dönemi = Roman Period ; Roma İmparatorluğu = Roman Empire ; Seramikler = Ceramics ; Terimler = Terms ; Terra sigillata = Terra sigillata ; Üretim = Production

Özet:
Anadolu, sahip olduğu coğrafi ve jeopolitik konumuyla her zaman önemli bir yere sahip olmuştur. Batı Anadolu ise, coğrafi pozisyonuyla birçok avantaja sahiptir. Batı Anadolu konumu itibarıyla Akdeniz dünyasında kilit noktalardan biri haline gelmiştir. Anadolu erken dönemlerden itibaren seramik üretiminde önemli bir bölge olmuştur. Bölgede yüzyıllar boyunca süregelen seramik üretimi sonucunda köklü bir gelenek meydana gelmiştir. Bu noktada Batı Anadolu'da Geç Hellenistik ve Roma İmparatorluk Dönemlerindeki kaliteli seramik gruplarından doğu sigillatalar ve kırmızı astarlı seramikler ön plana çıkmaktadır. Tarihsel süreçte önemli bir konuma sahip olan Küçük Asya'nın Roma Dönemiyle birlikte önemli bir eyalet haline gelmesi, bölgenin seramik üretiminde büyük rol oynamıştır. Küçük Asya topraklarında Geç Hellenistik Dönem'den itibaren, imparatorluk topraklarına ve ötesine yayılım göstermiş kaliteli seramikler üretilmiştir. Roma Dönemiyle birlikte büyük bir endüstri haline gelmiş olan seramik üretimi, dönem ekonomisinde önemli bir yere sahiptir. Bu nedenle, dönemin kaliteli seramikleri, Batı Anadolu'daki bölgelerin ticari ilişkileri hakkında bilgiler sunmaktadır.

Abstract:
Anatolia always had an important place with its geographical and geopolitical position. Western Anatolia has many advantages with its geographical position. West Anatolia has become one of the key positioins in the Mediterranean world. The Anatolian region has a long and important history in ceramic production since the prehistoric times. At this point, eastern sigillatas and red-slipped ceramics among the high-quality fine ceramic groups during the Late Hellenistic and Roman Imperial Periods in Western Anatolia. The fact that Asia Minor, which had an important position in the historical process, became an important province within the Roman Period played an important role in the ceramic production of the region. The ceramics production, which has become a major industry in the Roman Period, has an important place in the economy of the period. For this reason, fine ceramics provide information about the commercial relations of the regions in Western Anatolia.
Sürdürülebilir yağış suyu yönetimine ilişkin peyzaj planlama önerileri: Bornova çayı havzası örneği
Landscape planning recommendations in terms of sustainable stormwater management: The case of Bornova stream catchment
Yazar: MERVE ÖZEREN ALKAN
Danışman: PROF. DR. ŞERİF HEPCAN
Ege Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Peyzaj Mimarlığı Ana Bilim Dalı / Peyzaj Mimarlığı Bilim Dalı
Derece: Doktora, 2019
Konu: Peyzaj Mimarlığı = Landscape Architecture

Özet:
Tez çalışması kapsamında, İzmir kentinde yer alan 48,13 km2 yüzölçümü olan Bornova Çayı Havzası'nda yüzey akışa geçen yağış suyu miktarı hesaplanarak arazi kullanım kararlarının yüzey akış miktarı üzerine etkisi ortaya konulmuştur. 
Yüzey akışa geçen yağış suyu miktarının tespitinde "Eğri Numarası Yöntemi" (NRCS Curve Number (CN) Method)'ni temel alan "Eğim Entegrasyonlu CN Hesaplama Yöntemi" (The Modified NRCS CN Method) kullanılmıştır. Arazi kullanım kararlarının yüzey akış miktarı üzerine etkisinin saptanmasında ise; 1/25.000 ölçekli İzmir Büyükşehir Bütünü Çevre Düzeni Planı'nda ilan edilen arazi kullanım kararları çerçevesinde Bornova Çayı Havzası için arazi kullanım değişim senaryoları kurgulanmıştır. 
Araştırma sonucunda havzada 2.717.841,34 m3 suyun yüzey akışa geçtiği, kötümser arazi kullanım değişim senaryosunun hayata geçmesi durumunda yüzey akış suyu hacminin %8,3 oranında artacağı, iyimser arazi kullanım değişim senaryosunun hayata geçmesi durumunda ise; %0,4 oranında düşeceği sonucu elde edilmiştir. Havzada yağış sularının sürdürülebilir yönetimini sağlamak üzere yasal, yönetsel, ekonomik, sosyo-kültürel, teknolojik öneriler ile peyzaj planlama süreçlerine ilişkin öneriler sunulmuştur.

Abstract:
In this study the amount of runoff volume in the Bornova Stream Catchment, which has a surface area of 48.13 km2 in the city of Izmir, was calculated and the effect of land use decisions on the surface runoff was revealed.
The Modified NRCS CN Method, which is based on the NRCS Curve Number Method, was used to determine the runoff volume. In determining the effect of land use decisions on surface runoff; land use change scenarios have been designed for the Bornova Stream Catchment within the framework of land use decisions of the 1/25.000 scaled Izmir Metropolitan Area Master Plan.
As a result of the study, it was calculated that the runoff volume of the Bornova Stream Catchment is 2.717.841.34 m3. It is concluded that the runoff volume will increase by 8,3% if the pessimistic land use change scenario is implemented and if the optimistic land use change scenario is implemented, this rate will decrease by 0,4%. Landscape planning proposals were supported by providing legal, administrative, economic, socio-cultural and technological suggestions to ensure the sustainable stormwater management in the catchment.
Eğitim kalitesi ve ekonomik büyüme: Türkiye üzerine bir uygulama
Education quality and economic growth: an application on Turkey
Yazar: GÖKÇE ATLIHAN
Danışman: PROF. DR. AYKUT LENGER
Ege Üniversitesi / Sosyal Bilimler Enstitüsü / İktisat Ana Bilim Dalı
Derece: Doktora, 2019
Konu: Ekonomi = Economics ; Eğitim ve Öğretim = Education and Training
Dizin: Ekonomik büyüme = Economic growth ; Eğitim ekonomisi = Education economy ; Eğitim kalitesi = Education quality ; Kalite = Quality ; Türk ekonomisi = Turkish economy

Özet:
Tezde, eğitim kalitesi ile ekonomik büyüme ilişkisi ve eğitim kalitesinin belirleyicileri ekonometrik yöntemlerle analiz edilmiştir. İlk olarak söz konusu alanda literatür taraması yapılmış ve analiz öncesinde Türk eğitim sisteminin yapısı incelenmiştir. İlk modelde Türkiye'de 1501 liseyi kapsayan bir analizle ortaöğretimde eğitim kalitesinin belirleyicileri araştırılmıştır. Okul türünün, öğretmen kalitesinin, okulun araştırma ve sosyal imkanlarının ve yerleşim yerinin eğitim başarısında en önemli unsurlar olduğu sonucu ortaya çıkmıştır. Sonrasında 81 ili kapsayan iki farklı eğitim kalite endeksi oluşturulmuştur. Beşeri sermaye göstergesi olarak eğitim kalite endeksi kullanılmış ve il bazlı kişi başı gayri safi yurt içi hasıla (GSYH) üzerindeki etkisi araştırılmıştır. Çalışmada mekânsal bir etki beklendiği için çalışma mekânsal ekonometrik analiz yöntemleriyle de tahmin edilmiştir. Sonuçlar Türkiye'de ekonomik büyümenin eğitim kalitesiyle ilişkili olduğunu ve mekânsal etkinin bulunduğunu ortaya koymaktadır.

Abstract:
In this thesis, the relationship between educational quality and economic growth and the determinants of educational quality were analyzed by using econometric methods. Firstly, the literature was reviewed and the structure of the Turkish Education System was scrutinized. The initial empiric model in the study covers 1501 high schools and investigates the determinants of education quality in Turkish secondary education. It is concluded that the type of school, the quality of teachers, the research and social facilities of the school and the residential area are the most important factors in the success of education. In the next chapter, two different education quality indexes covering 81 provinces were designed. The educational quality index was used as an indicator of human capital and its effect on GDP per capita was investigated. Since a spatial effect is expected, the study was also estimated by spatial econometric analysis methods. Results suggest that economic growth is related to the quality of education in Turkey and the spatial effect is found.
İnsan gözünün yapısal ve işlevsel özelliklerinin 3 boyutlu modellenmesi ve görmenin interaktif simülasyonu
3D modeling of structural and functional characteristics of human eye and interactive simulation of vision
Yazar: MERVE EVREN
Danışman: PROF. DR. ERSİN OĞUZ KOYLU
Ege Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
Derece: Doktora, 2019
Konu: Biyoteknoloji = Biotechnology ; Biyoteknoloji = Biotechnology

Özet:
Bu tezde insan gözünün yapısal ve işlevsel özelliklerini tanımlayan üç boyutlu web tabanlı interaktif modeller oluşturulması, görme ile ilgili mekanizmaların bilgisayar ortamında canlandırılmalarının gerçekleştirilmesi ve elde edilen materyal ile bir eğitim modülü hazırlanması amaçlanmıştır.
Bu amaçla, elde edilen verilerden yola çıkılarak gözün fizyolojik anatomisi, retina hücreleri, görme yolları ve görme korteksi alanları üç boyutlu olarak modellenmiştir. Göz optiğinin temel ilkeleri, mercekler ve çalışma mekanizmaları, fototransdüksiyon, görme keskinliği, renkli görme ve kırma kusurları ile ilgili iki ve üç boyutlu canlandırmalar yapılmış; göz kaslarının interaktif modeli ile dokuz farklı göz hareketi sanal ortamda görsel olarak temsil edilmiştir.
Hazırlanan tüm görsel materyalden web tabanlı interaktif eğitim modülü hazırlanmıştır. Hazırlanan eğitim modülüne bilgisayar ve mobil cihazlar üzerinden erişim sağlanmıştır. Eğitim modülüne erişim sağlayan kişilerin geri bildirimlerini almak üzere bir anket hazırlanmış, sisteme entegre edilmiştir. Tez çalışmasını takip eden süreçte, interaktif öğrenmenin uzun dönem yanıtlarının takip edilmesi planlanmıştır.

Abstract:
The main objective of this thesis is to develop three dimentional web based interactive models that capture structural and functional characteristics of human eye as well as digital animation of mechanisms of vision. The models and other artifacts created as partof this work are used to put together an educational process and related modules.
The physiological anatomy of the eye, retinal cells, visual pathways and visual cortex are modeled in three dimensions. The main principles of eye optics, eye lens and its mechanisms, phototransduction, visual acuity, color vision and refractive errors are captured in two and three dimensional animations. Virtual, interactive presentations of eye muscles as well as nine diffferent eye movements are also developed.
A web based interactive educational system is built using the visual models and other material conceived as part of this work. The educational modules are designed to provide mobile access in addition to web browsers. A survey designed to capture user feedback is integrated into the system. The survey results as well as on-going user feedback collected by the system shall be analysed to evaluate effectiveness of interactive educational methods as part of a post thesis study.
Ege Üniversitesi Fen Fakültesi Kimya Bölümü araştırma laboratuvarlarında atık yönetimi
The waste management at the chemistry research laboratories of Ege University Faculty of Science
Yazar: ASLIHAN KARAER
Danışman: PROF. DR. HAYATİ TÜRKMEN
Ege Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / İş Güvenliği Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2019
Konu: Kimya = Chemistry

Özet:
Bu tez kapsamında Ege Üniversitesi Fen Fakültesi Kimya Bölümü Araştırma Laboratuvarları'nda sürdürülebilir verimli atık yönetim basamakları mevcut yönetmelik ve literatüre göre incelenmiş, bölüm çapında atık yönetimi konusunda yapılan uygulamalardan bahsedilmiştir. Atıkların tanımlanması, etiketlenmesi, toplanması, geçici depolanması, nihai bertarafı ve geri kazanım faaliyetlerinin uygulanabilirliği tartışılmıştır. Ayrıca bölümün araştırma laboratuvarında kullanılan kimyasalların farklı türde ve miktarlarda olmasından dolayı anorganik kimya araştırma laboratuvarları örnek alınmıştır. Anorganik kimya araştırma laboratuvarlarında ortalama olarak yıllık kullanılan kimyasalların geri kazanım miktarı ve ekonomik girdisinin ne kadar olduğu tezde verilmiştir. Elde edilen sonuçlar incelendiğinde araştırma laboratuvarlarında oluşan atıkların doğru atık kodu ve atık tanımının yapıldığı ve atıkların depolanması konusunda gerekli önlemlerin alındığını, bununla birlikte anorganik kimya araştırma laboratuvarında geri kazanılan çözücülerin bölüm ekonomisine %82,57 oranında katkı sağladığı gözlenmiştir.

Abstract:
Within the scope of this thesis, the sustainable efficient waste management steps are researched according to current regulations and literature in Ege University Faculty of Science Chemistry Department Research Laboratories, the applications made about waste management in the department are mentioned. The definition of waste, labeling, collection, temporary storage, ultimate disposal and the practicality of recycling activities are discussed. Moreover, because of that the different types and quantities of chemicals used in the research laboratory of the department, inorganic chemistry research laboratories were taken as examples. In inorganic chemistry research laboratories, averagely the recovery amount of chemicals annual used and how much its economic input are given in the thesis. When the obtained results are examined, the accurate waste code and waste definition of waste generated in research laboratories and taking necessary measures for the storage of waste, in addition to this, the 82.57% contribution to the department economy of the solvents recovered in the inorganic chemistry research laboratory were observed.
Topolojik uzaylarda G-metotlar üzerine
G-methods on topolojical spaces
Yazar: FARUK GÜRCAN
Danışman: DOÇ. DR. AYŞEGÜL ÇAKSU GÜLER
Ege Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Matematik Ana Bilim Dalı / Matematik Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2019
Konu: Matematik = Mathematics

Özet:
Bu tez esas olarak beş bölümden oluşmaktadır
Birinci bölümde tez konusu tanıtılarak bu konuyla ilgili bazı çalışmalar hakkında bilgiler verilmiştir.
İkinci bölümde tezin okuyucular tarafından kolay anlaşılması için bazı temel tanım ve teoremlere değinilmiştir. 
Üçüncü bölüm 2003 yılında Connor ve Grosse-Erdmann tarafından ℝ üzerinde tanımlanan G-metot kavramını daha genel olarak herhangi bir küme üzerinde tanımlayan Shou Lin ve Li Liu'nun 2016 yılında yapmış oldukları çalışma incelenmiştir. G-açık küme, G-komşuluk, G-topoloji ve G-süreklilik kavramları verilmiş. Bu kavramlarla ilgili bazı temel özellikleri incelenmiştir. 
Dördüncü bölümde Li Liu tarafından 2018 yılında yayınlanan çalışma ele alınmıştır. G-çekirdek açık küme, G-çekirdek komşuluk, G-çekirdek yığılma noktaları verilmiş. Bunlarla ilgili bazı temel özellikleri ve teoremleri ele alınmıştır.  
Tezin son bölümünde ise, kalıtsal sınıf yardımıyla bir kümenin G-kapanış tanımı genelleştirilerek G^*-kapanış kavramı tanımlanmış bu kavramın temel özellikleri incelenmiştir. Söz konusu kavram kullanılarak G-bağlantılılık ve G-bileşen gibi önemli topolojik kavramlara daha geniş bir bakış açısı getirilmiştir.

Abstract:
This thesis essentially consists of five chapters
In the first chapter, the topic of the thes is is introduced and information is given about some studies on this subject.
In the second chapter, some basic definitions and theorems are mentioned in order to make the readers understand easily.
In the third chapter, the study of Shou Lin and Li Liu in 2016 which was the generalization of G-method concept on any set that is defined on ℝ by Connor and Grosse-Erdmann in 2003 was investigated. The concepts of G-open set, G-neighborhood, G-topology and G-continuity are given and some of their basic properties are examined.
In the fourth chapter, Li Liu's study published in 2018 is discussed. Morever the definitions G-core open set, G-core neighborhood set, G-core accumalation points are given. Some basic properties and theorems are discussed.
In the last chapter of the thesis, G^*-closure concept is defined by generalizing the definition of G-closure of a cluster with the help of hereditary class, basic features of this concepts examined
Anlamsal sosyal ağa dayalı e-öğrenme içeriklerinin değerlendirilmesi ve kalite değerlerinin ölçülmesi
Evaluation of e-learning contents based on semantic social network and measurement of their quality values
Yazar: MEHMET ALİ BİLİCİ
Danışman: DOÇ. DR. VECDİ AYTAÇ
Ege Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Bilgisayar Mühendisliği Ana Bilim Dalı / Bilgisayar Mühendisliği Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2019
Konu: Bilgisayar Mühendisliği Bilimleri-Bilgisayar ve Kontrol = Computer Engineering and Computer Science and Control
Dizin: Elektronik öğrenme = Electronic learning ; Uzaktan öğrenme = Distance learning ; Çevrimiçi öğrenme = Online learning

Özet:
İnternet teknolojilerinin hızla gelişmesi, internet üzerindeki veri boyutunun artmasına ve kaliteli içeriğe erişimin zorlaşmasına neden olmaktadır. Bu veri karmaşası içerisinde, istenilen bilgiyi getirmek için yeni yaklaşımlara ihtiyaç duyulmaktadır.

Öneri sistemleri ve anlamsal web teknolojilerinin bir arada kullanımı, özellikle sosyal ağlarda, bilgi filtreleme için kayda değer iyileşmeler sağlamıştır. Bu çalışma kapsamında, öneri sistemlerinin soğuk başlangıç, veri seyrekliği, ölçeklenebilirlik gibi kronik sorunlarını çözmek için anlamsal web teknolojileri kullanılarak melez öneri yöntemleri geliştirilmiştir. Bu yöntemler, e-öğrenme alanında kullanılarak, öğrenenler için içeriklerin kalite değerleri tahminlenmiştir.

Bu tez çalışmasında öğrenen, öğrenme nesnesi ve öğrenme alanı için üç adet ontoloji tasarlanmıştır. İçerik tabanlı ve işbirlikçi filtreleme kullanılarak melez yöntemler geliştirilmiştir. Daha sonra, melez yöntemler bir araya getirilmiş ve elde edilen çıktı kümesi öğrenme patikasına göre iyileştirilmiştir. Çıktı kümesiyle, öğrenme nesnelerinin kalite değerleri elde edilmiştir. Bu çalışmada geliştirilen melez öneri yöntemi, e-öğrenme içeriklerinin öğrenenler için kalitelerinin ölçülmesinde kullanılmıştır.

Abstract:
The rapidly development of Internet technologies cause to increase the size of the data on the Internet and to become difficult access to quality content. Within this data complexity, the new approaches are needed to bring the desired information.

The combination of recommender systems and semantic web technologies has made significant improvements for information filtering, especially in social networks. In this study, the hybrid recommendation methods have been developed by using semantic web technologies to solve the chronic problems of recommender systems such as cold start, data sparsity, scalability. Using these methods in the domain of e-learning, the quality values of the contents have been estimated for the learner.

In this thesis, three ontologies have been designed for the learner, the learning object and the learning domain. The hybrid methods have been developed using content-based and collaborative filtering. Then, the hybrid methods have been combined and the output set has been improved according to the learning path. The quality values of the learning objects have been obtained using the output set. The hybrid recommendation method developed in this study, has been used to measure the quality of e-learning contents for learners.