SARS-CoV-2 enfeksiyonu geçirmiş bireylerde reenfeksiyon insidansının araştırılması
Reinfection incidence of COVID-19 in a tertiary university hospital
Yazar: MERVE ATILGAN ALA
Danışman: DOÇ. DR. ÖZLEM GÖKSEL
Ege Üniversitesi / Tıp Fakültesi / Göğüs Hastalıkları Ana Bilim Dalı
Derece: Tıpta Uzmanlık, 2022
Konu: Göğüs Hastalıkları = Chest Diseases
Dizin: Aşılama = Vaccination ; Aşılar = Vaccines ; Bulaşıcı hastalıklar = Communicable diseases ; COVID 19 = COVID 19 ; Enfeksiyonlar = Infections ; Korona virüs enfeksiyonları = Coronavirus enfections ; Korona virüsler = Coronaviridae ; SARS virüsü = SARS virus ; İnsidans = Incidence

Özet:
Giriş ve Amaç: COVID-19 hızla tüm dünyayı etkilerken, yeniden enfekte olduğu saptanan hastalar endişe uyandırıcı olmuş, reenfeksiyonun sıklığı, hastalık şiddeti, risk faktörleri ile ilgili çalışmalara ihtiyaç duyulmuştur. Çalışmamızın primer amacı, Ege Bölgesinde refere bir üniversite hastanesinde COVID-19 hastalığı tanısı almış geniş bir hasta kohortunda bir yıllık reenfeksiyon insidansını belirlemektir. Çalışmamızın sekonder amacı ise, reenfekte olan hastalarda, hastalığın tekrar gelişmesinde etkili olan kişisel veya çevresel faktörleri saptayabilmek ve reenfeksiyonun ağırlık düzeyini belirlemektir.
Gereç ve Yöntem: Çalışmamıza Ege Üniversitesi Tıp Fakültesi Hastanesinde 18 Mart – 30 Kasım 2020 tarihleri arasında COVID 19 tanısı almış 5336 hasta katılmıştır. Hastalar reenfeksiyon açısından taranmıştır. İlk enfeksiyondan 90 gün sonra tekrarlayan PCR pozitifliği saptanan hastalara Teletıp ile ulaşılmış, klinik ve epidemiyolojik olarak reenfeksiyon kriterlerini karşılayan hastaların verileri toplanmıştır.
Bulgular: Kohortumuzda 39 hastada reenfeksiyon geliştiği belirlenmiş ve 1 yıllık reenfeksiyon insidansı %0.73 [% 95 güven aralığı (CI) 0.53-0.99] olarak hesaplanmıştır. Belirlenen tarihler arasında ilk enfeksiyonlarını geçiren 607 hastanemiz çalışanı içinde 13 hasta reenfeksiyon tanısı almış ve 1 yıllık reenfeksiyon insidansı %2.14 [% 95 güven aralığı (CI) 1.25-3.66] olarak hesaplanmıştır. Hastanemiz çalışanı olanlarda 1 yıllık reenfeksiyon insidansı diğer gruba göre 3.9 kat daha fazla bulunmuştur (p<0.001). Hastaların en fazla Nisan 2021'de (n=12, %30.8) reenfekte olduğu saptanmıştır. Reenfeksiyon tanısını 1 yıldan sonra alan hastalarla birlikte 74 hasta çalışmaya dahil edilmiştir. Hastaların 42 (%56.8) 'si kadındır ve katılımcıların ortalama yaşı 35.8 ± 11.9 yıldır. Hastaların 37 (%50)'sinde komorbidite yoktur. İlk enfeksiyon ile reenfeksiyon arasındaki interval süre ortalama 265.9 ± 120 gündür. Hastalığın ilk enfeksiyonda çoğunlukla asemptomatik ya da hafif şiddette geçirildiği saptanmış (n=57, %77), bu hastaların %94.7'si reenfeksiyonlarında da hastalığı asemptomatik veya hafif şiddette geçirmiştir. Reenfeksiyonda hastalığı asemptomatik veya hafif geçiren hasta sayısı ilk enfeksiyona göre daha fazladır (p<0.05). İlk enfeksiyondan sonra uzamış semptomlar en sık nefes darlığı (n=16, %21.7) ve yorgunluktur (n=10, %13.6). Ateş yüksekliği, nefes darlığı ve tat-koku kaybı semptomlarının reenfeksiyonda ilk enfeksiyona göre daha az görüldüğü saptanmıştır (p<0.05). Hastane yatış durumları karşılaştırıldığında ilk enfeksiyonda hastaların %17.6'sının, reenfeksiyonda ise %9.5'inin yatış ihtiyacı olduğu görülmüştür (p=0.109). Evde izolasyon kurallarını uygulayan hastaların %13.5'inde, evde izolasyon kurallarını uygulamayan hastaların %52.4'ünde ev halkına bulaş olduğu saptanmıştır (p<0.05). Reenfeksiyon öncesi tam doz aşılama 31 hastaya (%41.9) uygulanmış, reenfeksiyon son aşıdan ortalama 96 ± 56 gün sonra gelişmiştir. Tam doz aşı olanların reenfeksiyonlarında ateş, öksürük ve nefes darlığı semptomlarından en az biri diğer gruba göre daha düşük bulunmuştur (%41.9'a karşılık %65.1, p<0.05). Reenfeksiyonda nefes darlığı görülme oranı en az bir kez aşılanan hastalarda (%5,9) hiç aşılanmayanlara (%25) göre daha düşük bulunmuştur (p<0.05). Hastalardan ikisi enfeksiyonu üç kez geçirmiştir. Reenfeksiyon tanısı alan 66 hasta ayaktan takip edilmiş, 5 hasta hastane yatışı sonrası taburcu olmuş, 3 hasta ölmüştür.
Sonuç: SARS-CoV-2 reenfeksiyonu; insidansı düşük, hastane çalışanlarında daha sık görülen, çoğunlukla ilk enfeksiyona göre daha hafif seyirde bir durum olarak saptanmıştır. Bununla birlikte reenfeksiyon ile ilişkili mortalite ve pnömoni gelişen olgular göz önünde bulundurulduğunda daha önce SARS-CoV-2 ile enfekte olmuş olsalar bile tüm uygun kişiler aşılanmalı ve tüm bireyler maske takma ve sosyal mesafe gibi genel korunma önlemlerine dikkat etmelidir.

Abstract:
Background and Aims: While Coronavirus disease 2019 (COVID-19) continues to affect the whole world rapidly, reinfected patients have been a concern. Further research is needed on reinfection frequency, disease severity, and risk factors. The primary aim of our study was to determine the one-year incidence of reinfection in a large cohort of patients diagnosed with COVID-19 in a reference university hospital in the Aegean region. The secondary aim of our study were to determine the individual or environmental factors that influence recurrence of the disease in reinfected patients and the severity of reinfection.
Material and Methods: 5336 patients with a diagnosis of COVID-19 in Ege University Medical Faculty Hospital between March 18th and November 30th, 2020 were enrolled in our study. Patients were screened for reinfection. Telemedicine was performed to patients with recurrent PCR positivity 90 days after the first infection. The data of patients who met the criteria of reinfection clinically and epidemiologically was collected retrospectively. 
Results: In our cohort, 39 patients were diagnosed with reinfection and the one-year incidence of reinfection was calculated as 0.73% [95% confidence interval (CI) 0.53-0.99]. Among 607 healthcare workers who had their first infection between selected dates above, 13 patients were diagnosed with reinfection and the 1-year incidence of reinfection was calculated as 2.14% [95% confidence interval (CI) 1.25-3.66]. The 1-year incidence of reinfection in healthcare workers was 3.9 times higher than other group (p<0.001). The rate of reinfection was higher in April 2021 than the other months (n=12, 30.8%). A total of 74 patients with clinical or epidemiological evidence of reinfection, including those who were reinfected after one year, were included in the study. Among them 42 (56.8%) were female, 26 (35.2%) were hospital workers, and the mean age was 35.8 ± 11.9 years. There was no comorbidity in 37 (50%) of the patients The mean interval between initial infection and reinfection was 265.9 ± 120 days. It was determined that the disease was mostly asymptomatic or mild in the first infection (n=57, 77%), and 94.7% of these patients had asymptomatic or mild disease in their reinfection. The number of patients with asymptomatic or mild disease in reinfection is higher than first infection (p<0.05). The most common prolonged symptoms after the first infection were dyspnea (n=16, 21.7%) and fatigue (n=10, 13.6%). Fever, dyspnea and loss of taste and smell were less common in reinfection than first infection (p<0.05). It was observed that 17.6% of the patients in the first infection and 9.5% of the patients in the re-infection needed hospitalization (p=0.109). Transmission to household members were identified in 13.5% of the patients who self-isolated at home and in 52.4% of the patients who were not self-isolated at home (p<0.05). It was determined that full dose vaccination was administered to 31 patients (41.9%) before reinfection, and reinfection developed after an average of 96 ± 56 days from the last vaccination. One or more of the symptoms of fever, cough and dyspnea were found to be lower in reinfections of those who received the full dose vaccine compared to the other group (41.9% vs. 65.1%, p<0.05). The incidence of dyspnea in reinfection was found to be significantly lower in patients who were vaccinated at least once (5.9%) than those who were never vaccinated (25%). Two of the patients had the infection three times. 66 patients diagnosed with reinfection were followed up as an outpatient and 5 patients were discharged after hospitalization, 3 patients were died.
Conclusions: SARS-CoV-2 reinfection has a low incidence in our population, but greater incidence was found in healthcare workers. The clinical presentation was milder when compared to primary infection. However, considering the potential risk of reinfection related mortality and pneumonia, all eligible persons should be vaccinated, even if they have been previously infected with SARS-CoV-2 and all individuals should pay attention to the general prevention measures like to wearing mask and social distance.