Türkiye denizlerinde bulunan Akdeniz ve İndo-Pasifik kökenli denizanalarının filogenetiği
Phylogenetic of the Mediterranean and Indo-Pasific orgin jellyfish in Turkish waters
Yazar: BURCU ÖZBALCILAR
Danışman: PROF. DR. CEMAL TURAN
Mustafa Kemal Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Su Ürünleri Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2012
Konu: Su Ürünleri = Aquatic Products

Özet:
Bu çalışmada, Türkiye denizlerinde bulunan Atlantik ve İndo-Pasifik kökenli, Cassiopea andromeda, Rhizostoma pulmo ve Aurelia aurita türlerinin filogenetik ilişkileri belirlenmiştir. Bu türlerin, mtDNA 16S rDNA geni PCR ile çoğaltıldıktan sonra, restriksiyon parçası uzunluk polimorfizmi (RFLP) yöntemi ile BsurI, AluI, Hin6I, RsaI olmak üzere 4 polimorfik sınırlama enziminin muamelesi sonucu toplam genin uzunluğu ortalama olarak 1851 baz çifti uzunluğunda bulunmuştur. PCR-RFLP yöntemi ile tüm türlerde toplam 5 haplotip gözlenmiştir. C. andromeda, R. pulmo ve A. aurita türlerinin birbirlerinden genetik olarak farklılıklarını test etmek için, yapılan haplotip frekansları Monte Carlo X2 analizi sonucunda tüm türlerin haplotip frekanslarının birbirlerinden istatiksel olarak önemli derecede farklı olduğu bulunmuştur (P<0.001). Çalışmada, türlerin içerisinde haplotip çeşitliliği; R. pulmo'da 0.6927, A. aurita'da 0.7138 bulunurken C. andromeda'da haplotip bakımından bir çeşitlilik gözlemlenmemiştir.Türler arasındaki filogenetik ilişkiyi gösteren Neigbour joining soy ağacına göre, Akdenize Kızıldenizin'den Süveyş Kanalı yolu ile gelen ve lessepsiyen bir tür olan C. andromeda türü Atlanto-Mediterranean kökenli R. pulmo ve A. aurita türlerinden genetik olarak farklı olduğu tespit edilmiştir. C. andromeda'nın haplotip ve genetik çeşitlilik değerlerinin sıfır olması bu türün yakın bir geçmişte genetik bir darboğaz geçirdiğinin işaretidir.

Abstract:
In this study after mitochondrial DNA 16S rDNA was amplificated by polymerase chain reaction, restriction fragment length polymorphism (PCR-RFLP) assay was used to analyse the phylogenetic relationships among the Indo- Pasific and Atlantic jellyfish Cassiopea andromeda, Rhizostoma pulmo, Aurelia aurita species. 4 polymorfic restiction enzyme, BsurI, AluI, Hin6I, RsaI were used respectively. The complete gene lengt mean length is found 1851 bp by the result of the amplification the mtDNA 16S rDNA by PCR. A total of 5 haplotypes were detected by PCR- RFLP method from all species. To determine genetics differences between C. andromeda, R. pulmo and A. aurita Monte Carlo (X2) pairwise analyse was used and haplotype frequences of all species were found significantly different statistically (p<0.001). In this study, haplotype diversity between species was determined 0.6927 in R.pulmo, 0.7138 in A. Aurita; no haplotype diversity was observed in C. andromeda.According to Neigbour joining tree which shows phlogenetic relationship between species, inhabited in the Red Sea and the Indo-Pacific, entered to the Mediterranean via the Suez Canal C. andromeda was found genetically different from the Atlantic origin species R. pulmo and A. Aurita. None haplotype and genetic diversity values belong C. andromeda signs that this species has had a genetic bottleneck recently.