Antimikrobiyel aktiviteye sahip enterokok suşlarının 
moleküler düzeyde tanımlanması ve antibiyotik dirençlilik düzeylerinin saptanması
Molecular identi̇fi̇cati̇on of anti̇mi̇crobi̇al enterococcus spp. 
and determi̇nati̇on of anti̇bi̇oti̇c resi̇stance level
Yazar: ESRA ŞENTÜRK
Danışman: DOÇ. DR. PINAR ŞANLIBABA
Ankara Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Gıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2017
Konu: Gıda Mühendisliği = Food Engineering ; Mikrobiyoloji = Microbiology

Özet:
Bu çalışmada Ankara'daki çeşitli market, kasap ve pazarlardan temin edilen 503 adet
farklı gıda örneğinden, 459 tanesinde enterokoklar için şüpheli koloni morfolojisi
gözlemlenmiştir. Bunlardan 165'i 05-41 mm arasında değişen tür içi antibakteriyel
inhibisyon zonu oluşturmuştur. 165 izolatın tamamı pH 9,6'da, % 6,5 NaCL'de ve 10-
45 oC'de gelişim özelliği göstermiştir. Gr (+), katalaz (-) ve eskulin hidrolizi (+) olarak
da tanımlanan 165 izolat, muhtemel Enterococcus spp. olarak belirlenmiştir. 140 izolat
α-hemolitik, 12 izolat β-hemolitik ve 13 izolat ise γ-hemolitik yapı göstermiştir.
İndikatör suşa karşı en yüksek inhibisyon zonu oluşturan 100 enterokok izolatı seçilmiş
ve bu suşlara API20 Strep test kitleri uygulanarak tür düzeyinde tanımlama yapılmıştır.
16S rDNA dizi analizleri sonucunda 100 enterokok suşunun 61'i E. faecium ve 39'u E.
faecalis olarak belirlenmiştir. Tür düzeyinde tanımlamada API20 Strep test kitleri ile
elde edilen başarı oranının % 68 olduğu saptanmıştır. Et ve fermente et ürünlerinde
baskın tür olarak E. faecium, peynir örneklerinde ise E. faecalis tanımlanmıştır.
Enterococcus suşlarının antibiyotik duyarlılık düzeylerinin belirlenmesinde 12
antibiyotik diski kullanılmıştır. Enterococcus suşlarının tamamı streptomisin ve
vankomisine karşı duyarlılık gösterirken, nalidiksik aside karşı % 100 dirençlilik
göstermiştir. Enterococcus suşlarının antibiyotik dirençlilikleri; kanamisine % 99,
rifampine % 81, ampisiline % 60, eritromisine % 37, siprofloksasine % 34, tetrasikline
% 9, penisilin G'ye % 8, kloramfenikole % 3 ve gentamisine % 2 olarak belirlenmiştir.
Çalışmamızda E. faecalis suşlarının E. faecium suşlarına oranla daha fazla dirençlilik
fenotipi gösterdiği belirlenmiştir.

Abstract:
In this study, suspicious colony morphology for Enterococcus was observed in 459 out
of 503 different food samples from bazaars, butchers and markets in Ankara. Among
them 165 isolates showed in-species antibacterial inhibition zones ranging from 05-41
mm. All the isolates had showed optimal growth at pH 9.6, 6.5% NaCL and 10-45°C.
Also identified as Gr(+), catalase(-) and esculin hydrolysis(+) they were determined as
possible Enterococcus spp. Out of 165 isolates, 140 isolates were α-hemolytic, 12
isolates β-hemolytic and 13 isolates γ-hemolytic. Among them, 100 enterococcal
isolates with the highest inhibition zone against indicator strain were selected and
identified using API20 Strep kits. As a result of 16S rDNA sequence analysis, 61 of the
100 enterococci strains were identified as E. faecium and 39 as E. faecalis.
Identification at the species level, the success rate achieved with API20 Strep test kits
was found as 68%. While E. faecium was the dominant species in meat and fermented
meat products, E. faecalis strains were dominant in cheese samples. To determine the
antibiotic susceptibility level of Enterococcus strains, 12 antibiotic discs were used.
While all Enterococcus strains were susceptible to streptomycin and vancomycin, they
showed 100% resistance against nalidixic acid. Antibiotic resistance of Enterococcus
strains was found as; kanamycin 99%, rifampin 81%, ampicillin 60%, erythromycin
37%, ciprofloxacin 34%, tetracycline 9%, penicillin G 8%, chloramphenicol 3% and
gentamicin 2%. In our study, it was determined that E. faecalis strains showed more
resistance phenotype than E. faecium strains.