Hepatosellüler karsinomda epitelial-mezenkimal transizyon sürecinde C-met sinyalizasyonu ve lncRNA hotair'ın  ilişkisinin araştırılması
Investigation of the relationship of C-MET signalization and lncRNA hotair in epithelial-mesenchymal transition of hepatocellular carcinoma
Yazar: HANDE TOPEL
Danışman: PROF. DR. SAFİYE NEŞE ATABEY
Dokuz Eylül Üniversitesi / Sağlık Bilimleri Enstitüsü / Tıbbi Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
Derece: Doktora, 2019
Konu: Tıbbi Biyoloji = Medical Biology
Dizin: Genler = Genes ; Karsinoma = Carcinoma ; Karsinoma-hepatoselüler = Carcinoma-hepatocellular ; Kaveolin = Caveolin ; RNA = RNA

Özet:
Amaç: Bu çalışmada hepatosellüler karsiomda (HCC) epitelial-mezenkimal
transizyon (EMT) sürecinde c-Met tirozin kinaz reseptörü ile lncRNA HOTAIR'in olası
ilişkisinin araştırılması hedeflenmiştir.
Yöntem: Araştırmada kantitatif PCR, immünblotlama, floresan işaretleme,
konfokal/floresan görüntüleme, gerçek zamanlı hücre proliferasyon, motilite ve
invazyon analiz sistemi, akış sitometrik hücre döngüsü analiz yöntemleri kullanılmıştır.
Bulgular: İnsan HCC hücre hatlarında c-Met ekspresyon/aktivasyon ve HOTAIR
ekspresyon seviyeleri belirlenmiş, HOTAIR ekspresyonu ile c-Met aktivasyonu arasında
ters korelasyon olduğu belirlenmiştir. Çalışmamızda; (I)HCC hücrelerinde ligand
bağımlı ve bağımsız c-Met aktivasyonunun HOTAIR ekspresyonunu baskıladığı ve c-
Met aktivitesinin engellenmesinin HOTAIR ekspresyonunu geri çevirdiği; (II)HOTAIR
knock-down edildiğinde c-Met ile karşılıklı haberleşerek ligand-bağımsız c-Met
aktivasyonunda rol alan Caveolin-1 ekspresyonunun arttığı; (III)HCC'de HOTAIR aşırıekspresyonunun
c-Met ve Caveolin-1 ekspresyonunu/aktivasyonunu baskıladığı;
(IV)HOTAIR'ın c-Met transdüksiyonunda rol alan Src-kinaz ve Erk1/2'nin aktivasyonunu
baskılayarak c-Met sinyalizasyonu ile regule edilen motilite ve invazyon kapasitesinin
kaybedilmesine ve proliferasyonun baskılanmasına neden olduğu; (VI)HOTAIR aşırı
ekspresyonunun hücre adhezyon moleküllerinin ekspresyonunun regule ederek HCC
hücrelerinin adhezyon-bağımsız sağkalıma katkı sağladığı saptanmıştır.
Sonuç: Sonuç olarak tez çalışması literatürde ilk kez kanserde c-MET/Caveolin-
1/HOTAIR moleküler ilişkisini ve HCC'deki fonksiyonunu tanımlamıştır.
Anahtar kelimeler: HCC, lncRNA, Caveolin-1, c-Met

Abstract:
Objective: The aim of this study is to investigate the possible relationship
between c-Met tyrosine kinase receptor and lncRNA HOTAIR in hepatocellular
carcinoma (HCC).
Methods: Quantitative PCR, immunoblotting, immunofluorescent staining,
confocal and fluorescence imaging, real-time cell proliferation, motility and invasion
analysis system, flow cytometric cell cycle analysis methods were used in the study.
Results: c-Met expression and activation, HOTAIR expression levels were
determined in HCC cell lines and an inverse correlation was found between HOTAIR
expression and c-Met activation. In this study, ligand-dependent and independent c-
Met activation in HCC cells suppresses HOTAIR expression and, inhibition of c-Met
tyrosine kinase activity reverses HOTAIR expression. HOTAIR knock down increased
gene expression of c-Met and Caveolin-1 which is a scaffolding protein which activates
c-Met signaling ligand independently. HOTAIR overexpression in HCC cells supress c-
Met and Caveolin-1 expression and activation. HOTAIR inhibits the activation of Src
kinase and Erk1/2 kinases involved in c-Met transduction; and reduce motility, invasion
and proliferation. HOTAIR overexpression contributes to the adhesion-independent
survival of HCC cells by reducing expression of cell tp ECM adhesion molecules.
Conclusion: In conclusion, the thesis study described the c-Met/Caveolin-
1/HOTAIR molecular reciprocal interaction and its function in HCC for the first time.
Key words: HCC, lncRNA, Caveolin-1, c-Met