Marmara denizinden izole edilen bakterilerin polisiklik aromatik hidrokarbonları (PAH) parçalama yeteneklerinin araştırılması
A study on the degradation ability of the bacteria isolated from the sea of marmara in polycyclic aromatic hydrocarbons (PAH)
Yazar: PELİN SALİHA ÇİFTÇİ
Danışman: DOÇ. DR. GÜLŞEN ALTUĞ
İstanbul Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Su Ürünleri Temel Bilimleri Ana Bilim Dalı / Deniz Biyolojisi Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2008
Konu: Su Ürünleri = Aquatic Products
Dizin: Bakteri izolasyonu = Bacterial isolation ; Marmara Denizi = Marmara Sea ; Petrol = Petroleum

Özet:
Bu çalışmada, Marmara Denizi kıyısal alanında marina, petrol istasyonu, balıkçı barınağı ve limanlar arasından seçilen dört istasyondan alınan örneklerden izole edilen bakterilerin petrol hidrokarbonlarını parçalama yeteneğini belirlemek ve ortamın su kalitesini ile ilişkilendirmek amaçlanmıştır. Seçilen istasyonlarda bakteriyolojik kirlilik yükünü belirlemek için indikatör bakteri, bakteri bolluğunu belirlemek için, kültür edilebilir toplam mezofilik aerobik bakteri, kimyasal ve biyolojik su kalitesini belirlemek için nitrit azotu, nitrat azotu, fosfor ve klorofil-a analizleri yapılmıştır.Temmuz 2007-Haziran 2008 tarihleri arasında aylık olarak alınan yüzey suyu örneklerinde, fekal ve toplam koliform analizleri için membran filtrasyon tekniği kullanılmıştır. Toplam kültür edilebilir bakteri bolluğunu belirlemek için Marine Agar'a yayma ekim metodu kullanılmış, besin tuzu ve klorofil-a analizleri spektrofotometrik yöntemle yapılmıştır. API 20 E ve API 50 CHB ile tanısı yapılan toplam 122 adet izolattan Bacillus subtilis, Serratia marcescens, Enterococcus faecalis, Pseudomonas aeruginosa, Pseudomonas oryzihabitans, Vibrio fluvialis, Esherichia coli, Burkholderia cepacea, Aeromonas hydrophila, Citrobacter frenduii, Providencia sp., Klebsiella ornitholytica, Klebsiella oxytoca, Proteus mirabilis, Enterobacter sakazakii, Eikenella corrodens türleri seçilerek Batman petrol rafinerisinden sağlanan Batman ham petrolü ile Minimum İnhibisyon Konsantrasyonu (MIC) testleri yapılmıştır. MIC değerleri belirlenen izolatlar ve bu izolatların karışık kültürleri 30 gün boyunca çalkalamalı etüvde 150 rpm de inkübe edilmiş 72 saat aralıklarla petrol katmanı kalınlığı ve pH değerleri kaydedilerek izolatların petrol hidrokarbonlarını kullanma yetenekleri incelenmiştir.Sonuç olarak çalışma alanının yıl boyunca fekal ve toplam koliform bakımından ulusal ve uluslar arası limit değerlerin üstünde olduğu, besin tuzu ve klorofil-a değerlerinin yüksek olduğu tespit edilmiştir. Çalışma alanından izole edilen bakteriler arasından E. sakazakii biyolojik iyileştirme çalışmalarında kullanılabilecek aday tür olarak birinci sırada kaydedilirken, bunu sırasıyla E. feacalis, E. corrodens ve P. aeruginosa'nın tekli kültürleri ve P. aeruginosa+ B. subtilis+E. coli'nin bulunduğu karışık kültür, P. aeruginosa+B. subtilis+V. fluvialis' in bulunduğu karışık kültür, K. oxytoca+P. oryzihabitans+ P. mirabilis+E. sakazakii+E. corrodens` in bulunduğu karışık kültür izlemiştir. K. oxytoca, A. hydrophila, C. frenduii, Providencia sp., B. cepacea'nın ise petrol parçalama yeteneklerinin düşük olduğu bulunmuştur. Petrol hidrokarbonlarını kullanma özelliği gösteren bakterilerin petrolü hangi fraksiyonlarına parçaladıklarının analitik tespitinin yapılacağı ileri analizlerde kullanılmak üzere stoklanması bu yönde gelecekteki çalışmalarımız için temel veri oluşturmuştur.

Abstract:
In this study, the aim was to determine the ability of bacteria isolated from seawater samples collected in 4 stations selected between ports, fishing harbors, oil stations and marinas of Marmara Sea coastal area. Indicator bacteria, total mesophilic aerobic culturable bacteria, nutrients and chlorophyll a analyses were also realized in order to determine bacteriological pollution bacteria abundance and chemical and biological water quality of the stations respectively.Membrane filtration technique was used for feacal and total coliform analyses of surface seawater samples that were monthly sampled between July 2007 and June 2008. Marine agar and spread culture method was used in order to determine total culturable bacteria abundance. Nutrients and chlorophyll a analyses were carried out by spectrophotometric method. Bacillus subtilis, Serratia marcescens, Enterococcus faecalis, Pseudomonas aeruginosa, Pseudomonas oryzihabitans, Vibrio fluvialis, Esherichia coli, Burkholderia cepacea, Aeromonas hydrophila, Citrobacter frenduii, Providencia sp., Klebsiella ornitholytica, Klebsiella oxytoca, Proteus mirabilis, Enterobacter sakazakii, Eikenella corrodens were selected between a total of 122 isolates were identified by API 20 E and API 50 CHB.. Minimum Inhibition Concentration (MIC) tests were effected on selected species with Batman crude oil obtained from Batman oil refinery. Isolates for which MIC values were determined and mixed cultures of these isolates were incubated in a shaking incubator at 150 rpm during 30 days and the ability of the isolates to degrade oil hydrocarbons was investigated by recording the oil layer thickness and the pH values in 72 hours intervals.The results show that the studied areas have feacal and total coliform bacteria values higher than national and international limit values. The species E. sakazakii was recorded as the best candidate species between bacteria isolated from the studied area for bioremediation studies followed by single cultures of E. feacalis, E. corrodens and P. aeruginosa and mixed culture of P. aeruginosa+ B. subtilis+E. coli, mixed culture of P. aeruginosa+B. subtilis+V. fluvialis, and mixed culture of K. oxytoca+P. oryzihabitans+ P. mirabilis+E. sakazakii+E. corrodens. Low oil degradation abilities were found for K. oxytoca, A. hydrophila, C. frenduii, Providencia sp., B. cepacea The stocking of bacteria able to degrade oil hydrocarbons constitute basic data for our further studies intended to analytically determine which fractions of the oil was degraded by these bacteria.