İdiyopatik jeneralize epilepsi tanılı hastalarda mirna alt tiplerinin ekspresyon düzeylerinin incelenmesi /
Yazar: ALİŞAN BAYRAKOĞLU
Danışman: DOÇ. DR. FERDA USLU
Bezm-i Alem Vakıf Üniversitesi / Tıp Fakültesi / Nöroloji Ana Bilim Dalı
Derece: Tıpta Uzmanlık, 2023
Konu: Nöroloji = Neurology

Özet:
Giriş:
İdiyopatik jeneralize epilepsiler (İJE) tüm epilepsilerin yaklaşık üçte birini
kapsamakta olup, bunların büyük kısmı da çocukluk ya da ergenlik dönemlerinde
başlar. İJE tanısında kullanılan herhangi bir biyobelirteç bulunmamaktadır. Daha
önce birçok epilepsi hastasında miRNA alt tipleri olan miR-146a, miR-155 ve miR-
132 bakılmış olup kontrol grubuna göre istatistiksel olarak ekspresyon seviyelerinin
farklılık gösterdiği saptanmıştır. Çalışmamızda İJE hastalarında miR-132, miR-146a
ve miR-155'in ekspresyon düzeyleri incelenmiş ve olası aday biyobelirteç
potansiyellerinin belirlenmesi amaçlanmıştır.

Yöntem: 
Bu amaçla çalışmaya İJE tanılı 46 hasta ve 50 sağlıklı kontrol dahil edilmiştir.
Sırasıyla; miR-132, miR-146a ve miR-155'in ekspresyon düzeyleri qRT-PZR
yöntemiyle incelenmiştir. Bu işlem için U6 snRNA housekeeping gen olarak
değerlendirilmiştir. İstatistiksel analizlerde ilk olarak verilerin dağılımına Shapiro-
Wilk testi ile bakılmış, normal olmayan dağılım gösteren gruplara Mann Whitney
testi yapılmıştır. p<0,05 değeri istatistiksel olarak anlamlı kabul edilmiştir. Ayrıca,
incelenen tüm miRNA'ların biyobelirteç potansiyellerinin tespiti için ROC analizi ile
AUC değerleri hesaplanmıştır.  

Sonuç:
miR-132 ekspresyon seviyesi hastalarda kontrollere oranla istatistiksel olarak yüksek
anlamlılık gösterilmiştir (p<0,0001). ROC analizinde AUC değeri 0,727 olarak
belirlenmiştir. miR-146a ekspresyon seviyesi hastalarda kontrollere oranla
istatistiksel olarak yüksek anlamlılık tespit edilmiştir. (p<0,0001). ROC analizinde AUC değeri 0,760 olarak belirlenmiştir. miR-155 ekspresyon seviyeleri ise hastalarda kontrollere oranla istatistiksel olarak yüksek anlamlılık belirlenmiştir
(p<0,0001). ROC analizinde AUC değeri 0,879 olarak tespit edilmiştir.   

Tartışma:
Çalışmada ayrıntılı olarak analiz edilen üç miRNA ekspresyon seviyeleri bakımından
istatistiksel olarak ileri derece anlamlı bulunmakla birlikte, ayrıca AUC değerlerinin
0,700'den yüksek olması biyobelirteç olarak uygun adaylar olabileceklerini
göstermektedir. İlerleyen dönemde bu miRNA'ların biyobelirteç potansiyelleri daha
büyük hasta/sağlıklı gruplarıyla incelenmeli ve özellikle AUC değeri açısından en
kuvvetli bulunan miR-155 ve hedefi olan genler hastalığın etiyopatogenezi açısından
dikkate alınmalıdır.

Abstract:
Introduction:
Idiopathic generalized epilepsies (IGE) comprise approximately one-third of all
epilepsies, and the majority of these begin in childhood or adolescence. There is no
biomarker used in the diagnosis of IGE. The miRNA subtypes miR-146a, miR-155
and miR-132 were examined in many epilepsy patients before, and it was found that
the expression levels differed statistically compared to the control group. In our
study, the expression levels of miR-132, miR-146a and miR-155 in IGE patients
were examined and it was aimed to determine possible candidate biomarker
potentials.

Method:
For this purpose, 46 patients with IGE and 50 healthy controls were included in the
study. Respectively; The expression levels of miR-132, miR-146a and miR-155 were
examined by qRT-PCR method. For this process, U6 snRNA was evaluated as a
housekeeping gene. In the statistical analysis, the distribution of the data was first
examined with the Shapiro-Wilk test, and the Mann Whitney test was applied to the
groups with non-normal distribution. A p value of <0.05 was considered statistically
significant. In addition, AUC values were calculated by ROC analysis to determine
the biomarker potentials of all examined miRNAs.

Conclusion:
The expression level of miR-132 was statistically significant in patients compared to
controls (p<0.0001). In the ROC analysis, the AUC value was determined as 0.727.
MiR-146a expression level was statistically higher in patients compared to controls.
(p<0.0001). In the ROC analysis, the AUC value was determined as 0.760. MiR-155
expression levels were statistically higher in patients compared to controls
(p<0.0001). In the ROC analysis, the AUC value was determined as 0.879.

Discussion:
Although the three miRNAs analyzed in detail in the study were found to be highly
significant in terms of expression levels, their AUC values higher than 0.700 also
indicate that they may be suitable candidates as biomarkers. In the future, the
biomarker potentials of these miRNAs should be examined with larger
patient/healthy groups, and especially miR-155, which is the strongest in terms of
AUC value, and its target genes should be considered in terms of the
etiopathogenesis of the disease.