Sığırlardan izole edilen trichophyton verrucosum suşlarının kültür yöntemi ile  identifikasyonu ve MALDI TOF-MS ile doğrulanması
Identification of trichophyton verrucosum strains isolated from cattle by culture type and validation by MALDI TOF-MS
Yazar: ÖZCAN BALIBAY
Danışman: PROF. DR. OSMAN YAŞAR TEL
Harran Üniversitesi / Sağlık Bilimleri Enstitüsü / Mikrobiyoloji (Veterinerlik) Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2019
Konu: Mikrobiyoloji = Microbiology ; Veteriner Hekimliği = Veterinary Medicine
Dizin: Dermatofitler = Dermatophytes ; Kültür = Culture ; Kültür teknikleri = Culture techniques ; Kütle spektrometri = Mass spectrometry ; Mantar hastalıkları = Mycoses ; Sığırlar = Cattles ; Trichophyton = Trichophyton ; Veteriner hekimlik = Veterinary medicine

Özet:
Trichophyton verrucosum, sığır dermatofitozuna neden olan en önemli etkendir. Deri
lezyonları, genç sığırlarda gelişmede gerileme, süt sığırlarında sütte azalma, derinin
ekonomik değerinin azalması gibi önemli sorunlara neden olmaktadır. Etken
tanımlamada direkt mikroskobik inceleme ve kültür, geleneksel konvansiyonel
yöntemlerdir. Standart konvansiyonel yöntemler zaman alıcı olması ve kesin sonuçlar
vermemesinden dolayı duyarlılığı ve özgüllüğü yüksek, hızlı yeni tanı yöntemlerine
ihtiyaç bulunmaktadır. Bu çalışmada sığırlardan Trichophyton verrucosum izolasyonu
ve MALDI TOF-MS ile doğrulanması amaçlanmıştır. Dermatofitoz şüpheli 100 adet
sığırdan alınan deri kazıntısı ve kıl örnekleri direkt mikroskopi yöntemi ile incelenmiş
ve 52 (%52)'si pozitif bulunmuştur. Numunelerin kültür yöntemi ile incelenmesi
sonucunda 63(%63)'ünde dermatofit izole edilmiş ve bunların 52 (%52)'si
T.verrucosum olarak identifiye edilmiştir. Bütün Trichophyton verrucosum izolatlarının
7950-7954 arasında MALDI TOF-MS spektrum pikleri saptanarak, doğrulanmıştır.
Sonuç olarak, Şanlıurfa bölgesinde sığırlarda T. verrucosum'un yaygın olduğu, MALDI
TOF-MS tekniğinin T.verrucosum'un teşhisinde geleneksel yöntemlere göre başarılı bir
şekilde kullanılabileceği belirlendi.

Anahtar kelimeler: Trichophyton verrucosum, sığır, MALDI TOF-MS

Abstract:
Trichophyton verrucosum, is the most important causative agent for cattle
dermatophytosis. It causes skin lesions, growth retardation in young cattle, decline in
milk production, reduction economic value of leather. Direct microscopy and culture are
conventional methods for agent identification. Standard conventional methods are time
consuming and they might not be very definitive and therefore it is needed the new and
fast diagnostic techniques that have high sensitivity and specificity. In this study, the
isolation of Trichophyton verrucosum from cattle and confirmation with MALDI TOFMS
of the isolated strains were aimed. Skin scrapings and hair samples collected from
100 were examined by direct microscopy and 52 (52%) of them were found as positive.
At the end of cultural studies, 63 (63%) dermatophytosis agents were isolated and 52 of
them were identified as T.verrucosum. All Trichophyton verrucosum isolates showed
MALDI TOF-MS peaks between 7950 and 7954 and these results confirmed the
Trichophyton verrucosum isolation.
As conclusion, it was determined that Trichophyton verrucosum infection was common
in Şanlıurfa Region and MALDI TOF-MS technique could be used sucessfully
compared to conventional techniques for diagnosis of T.verrucosum.

Keywords: Trichophyton verrucosum, cattle, MALDI TOF-MS