Kolorektal kanserler,adenomlar ve poliplerde gerçek zamanlı polimeraz zincir reaksiyonu ile yüksek riskli insan papillomavirüs tiplerinin araştırılması
İnvestigation of high-risk human papillomavirus types by real-time polymerase chain reaction in colorectal cancers,adenomas,polyps
Yazar: MELİKE ÇAĞLAR
Danışman: DOÇ. DR. AYFER BAKIR
Sağlık Bakanlığı / Ankara Etlik Şehir Hastanesi / Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
Derece: Tıpta Uzmanlık, 2024
Konu: Mikrobiyoloji = Microbiology

Özet:
Amaç: Kolorektal karsinom dünyada en sık görülen kanserlerden biridir.
Kolon karsinomu oluĢumunda çeĢitli risk faktörleri rol oynayabilir. Viral
enfeksiyonlardan insan papillomavirus (HPV)'ün kolorektal kanser (KRK)
geliĢimine neden olabileceği rapor edilmekle birlikte KRK ile HPV enfeksiyonu
arasında kesin bir iliĢki hala kanıtlanamamıĢtır. Bu çalıĢmanın amacı, KRK'lar,
kolon adenom ve poliplerinde HPV DNA varlığını araĢtırmaktır.
Gereç ve Yöntem: 1 Ekim 2022-30 Nisan 2023 tarihleri arasında, Etlik ġehir
Hastanesi Patoloji Laboratuvarında saklanan formalinle sabitlenmiĢ parafine gömülü
103 kolorektal karsinom, 270 adenom ve polip, 49 normal kolorektal doku olmak
üzere toplam 422 kolorektal doku örneği incelendi. Doku örnekleri deparafinizasyon
sonrası DNA ekstraksiyonuna tâbi tutuldu. Yüksek ve orta düĢük riskli HPV tipleri,
gerçek zamanlı polimeraz zincir reaksiyonuyla araĢtırıldı.
 Bulgular: Bu çalıĢmaya dahil edilen 422 olgunun medyan yaĢı 62
(ÇAA: 54−70, aralık: 23−90) yıldı ve bunların 256'sı (%60,7) erkekti. Genel olarak,
incelenen örneklerin %1,2'sinde (5/422) HPV DNA tespit edildi. KRK örneklerinin
%2,9'u (3/103) HPV DNA için pozitiflik gösterirken, kolorektal adenom ve polipli
örneklerinin %0,7'si (2/270) HPV DNA için pozitifti (p=0,13). Tüm normal
kolorektal dokular, HPV DNA açısından negatifti. Kanserli ve normal kolon doku
örnekleri arasında HPV DNA varlığı arasındaki fark istatistiksel olarak anlamlı
değildi (p=0,55). BeĢ pozitif olgunun tamamı tekli enfeksiyon olup, ikisi HPV 16
(%40), ikisi HPV 42 (%40), birisi ise HPV 54 (%20) pozitifti. KRK'lı olguların
%1,9'unun yüksek riskli (HPV16), %0,97'sinin orta ve düĢük riskli HPV tipiyle
(HPV 42), benign tümörlü olguların ise %0,7'sinin orta ve düĢük riskli HPV tipiyle 
ix
(HPV 42, HPV 54) enfekte olduğu belirlendi. Pozitif örneklerin 3'ü rektum, 2'si
transvers kolon tümör dokusunda saptandı. KRK'lı HPV pozitif 3 hastadan 2'si SCC
(rektum yerleĢimli), 1'i adenokarsinom (transvers kolon yerleĢimli) histolojisine
sahipti. Benign tümörlü HPV pozitif 2 hastadan 1'i tubuler adenom (transvers kolon),
diğeri ise hiperplastik polip (rektum yerleĢimli) histolojisindeydi.
 Sonuç: Bu çalıĢmada HPV pozitifliği, KRK'lı dokularda %2,9, kolon adenom
ve polipli hastalarda %0,7 oranında bulundu. Bu sonuçlar, çalıĢma grubundaki
hastalarda HPV enfeksiyonunun yaygın olmadığını göstermektedir. Her ne kadar
HPV pozitifliği, kontrol grubuna göre anlamlı farklılık göstermese de kolon tümör
dokularında, yüksek, orta ve düĢük riskli HPV tiplerinin varlığı, HPV'nin malign
tümör geliĢimi ile iliĢkili olabileceğini düĢündürebilir.
 Anahtar Kelimeler: Ġnsan papillomavirus, kolorektal kanser, adenokarsinom,
tübüler adenom, hiperplastik polip, PCR

Abstract:
Objective: Colorectal carcinoma is one of the most common cancers in the
world. Various risk factors may play a role in the formation of colon carcinoma.
Although it has been reported that human papillomavirus (HPV), one of the viral
infections, can cause the development of colorectal cancer (CRC), a definitive
relationship between CRC and HPV infection has still not been proven. The aim of
this study was to investigate the presence of HPV DNA in CRCs, colon adenomas
and polyps.
Materials and Methods: Between October 1, 2022 and April 30, 2023, a
total of 422 colorectal tissue samples, including 103 formalin-fixed paraffinembedded colorectal carcinomas, 270 adenomas and polyps, and 49 normal
colorectal tissues stored in the Etlik City Hospital Pathology Laboratory were
examinated. Tissue samples were subjected to DNA extraction after
deparaffinization. High- and intermediate-low-risk HPV types were investigated by
real-time polymerase chain reaction.
Results: The median age of 422 cases included in this study was 62 (IQR:
54−70, range 23−90) years, and 256 of them (60.7%) were men. Overall, HPV DNA
was detected in 1.2% (5/422) of the samples examined. While 2.9% (3/103) of CRC
samples were positive for HPV DNA, 0.7% (2/270) of colorectal adenoma and polyp
samples were positive for HPV DNA (p=0.13). All normal colorectal tissues were
negative for HPV DNA. The difference in the presence of HPV DNA between
cancerous and normal colon tissue samples was not statistically significant (p=0.55).
All five positive cases were single infections; two were positive for HPV 16 (40%),
two were positive for HPV 42 (40%), and one was positive for HPV 54 (20%). 1.9%
of the cases with CRC had a high-risk HPV type (HPV 16), 0.97% had a medium 
xi
and low-risk HPV type (HPV 42), and 0.7% of cases with benign tumors had a
medium and low-risk HPV type (HPV 42, HPV 54) and were determined to be
infected. Three of the positive samples were detected in the rectum and two in the
transverse colon tumor tissue. Of the 3 HPV-positive patients with CRC, 2 had SCC
(located in the rectum) and 1 had adenocarcinoma (located in the transverse colon)
histology. Of the 2 HPV-positive patients with benign tumors, one had the histology
of tubular adenoma (transverse colon), and the other had the histology of
hyperplastic polyp (located in the rectum).
Conclusion: In this study, HPV prevalence was found to be 2.9% in CRC
tissues and 0.7% in patients with colon adenomas and polyps. These results show
that HPV infection was not common in the patients in the study group. Although the
prevalence of HPV does not differ significantly compared to the control group, the
presence of high-, medium-, and low-risk HPV types in colon tumor tissues may
suggest that HPV may be associated with the development of malignant tumors.
 Keywords: Human papillomavirus, colorectal cancer, adenocarcinoma,
tubular adenoma, hyperplastic polyp, PCR