Mamografi görüntülerinde mikrokalsifikasyonların görünürlüğünün iyileştirilmesi ve sınıflandırılması için yeni yaklaşımlar
The new approaches for the classification of microcalcifications in the visibility-enhanced mammogram images
Yazar: AYŞE AYDIN YURDUSEV
Danışman: DOÇ. DR. MAHMUT HEKİM ; DR. ÖĞR. ÜYESİ CANAN ORAL
Tokat Gaziosmanpaşa Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Mekatronik Mühendisliği Ana Bilim Dalı
Derece: Doktora, 2019
Konu: Elektrik ve Elektronik Mühendisliği = Electrical and Electronics Engineering ; Mekatronik Mühendisliği = Mechatronics Engineering ; Mühendislik Bilimleri = Engineering Sciences

Özet:
Bu tez çalışmasında, mamogramlardaki mikrokalsifikasyonların görünürlüğünü arttırmak için yeni bir piksel atama temelli uzamsal filtreye sahip bir bilgisayar destekli teşhis (CAD) sistemi önerilmektedir. CAD sisteminin bir parçası olarak kullanılan uzamsal filtre, önce ilgilenilen merkez piksel ile 8 komşusu arasındaki farkların mutlak değerlerini toplamakta ve bu toplam değeri ilgilenilen merkez pikseline atamaktadır. Bu işlemler görüntünün her pikseli için tekrarlanmaktadır. Önerilen filtrenin CAD sistemine katkısının karşılaştırılmasında adilliği sağlamak için filtrelenmiş görüntülere kontrast germe uygulanmıştır. Yaygın olarak kullanılan ortalama, standart sapma, entropi, enerji, çarpıklık ve kurtoz temel istatiksel parametreleri kullanılarak filtreli kontrast-germeli bu görüntülerden özellik vektörleri elde edilmiştir. Elde edilen bu özellik vektörleri hem mikrokalsifikasyon içeren mamogramları tespit etmek ve hem de mikrokalsifikasyonları sınıflandırmak için destek vektör makineleri, çok katmanlı algılayıcı sinir ağı ve lineer diskriminant analizi temelli sınıflandırıcı modellere giriş olarak kullanılmıştır. Önerilen filtrenin mikrokalsifikasyonların tespit edilmesinde ve tespit edilen mikrokalsifikasyonların sınıflandırılmasında CAD sistemine olan etkisini değerlendirmek için literatürde temel olarak kullanılan Laplace, Gabor, Top-hat ve Gauss yüksek geçiren filtreleri ile karşılaştırılmıştır. Gerçekleştirilen sınıflandırma çalışmalarında, önerilen filtre mikrokalsifikasyon içeren mamogramların tespitinde ve mikrokalsifikasyonların sınıflandırılmasında diğer filtrelerden daha yüksek başarı oranlarına ulaşmıştır. Dolayısıyla, bu karşılaştırma, önerilen filtrenin mamogramlardaki mikrokalsifikasyonların görünürlüğünü arttırdığını göstermiştir. Sonuç olarak, önerilen uzamsal filtre mamografilerdeki mikrokalsifikasyonların görünürlüğünün belirginleştirilmesinde ve bu filtreye sahip CAD sistem tanısal karar destek mekanizması olarak meme kanserinin analizinde kullanılabilir.

Abstract:
In this thesis, we proposed a new computer aided diagnosis (CAD) system which has the pixel assignment-based spatial filter to enhance the visibility of microcalcifications in mammograms. The proposed filter used as a part of the CAD system, first sums the absolute values of the differences between the center pixel of interest and its 8-neighbors, and then assigns this summed value to that center pixel of interest. This process was repeated for each pixel of the image. Then, the contrast stretching was applied to the filtered-images in order to ensure the fairness in the comparison of the contribution of the proposed filter to the CAD system. The feature vectors were extracted from the filtered-contrast stretched-images by using the widely used and well-known statistical parameters which are mean, standard deviation, entropy, energy, skewness and kurtosis. The extracted feature vectors were applied to the inputs of support vector machines, linear discriminant analysis and multilayer perceptron neural network classifiers in order to detect the mammograms with microcalcifications as absent/present and to classify the detected microcalcifications as benign and malignant. In order to evaluate the effect of the proposed filter on the success of detection and classification, it was compared to widely used Laplace, Gabor, Top-hat and Gaussian high pass filters. In the implemented experiments, the comparison showed that this filter provided higher contribution to the success of detection and classification than the others, and hence enhanced the visibility of microcalcifications in mammograms. Finally, it can be concluded that the proposed filter can contribute to the development of the state-of-art methodologies and can be used with a CAD system as a diagnostic decision support mechanism in the analysis of mammograms.