Köpek gençlik hastalığı virus izolasyonu, H proteini kodlayan gen bölgesinin karakterizasyonu ve seroepidemiyolojisi
Canine distemper virus isolation, characterization of H protein coding region and seroepidemiology
Yazar: ELVİN ÇALIŞKAN
Danışman: PROF. DR. İBRAHİM BURGU
Ankara Üniversitesi / Sağlık Bilimleri Enstitüsü / Viroloji Ana Bilim Dalı
Derece: Doktora, 2007
Konu: Veteriner Hekimliği = Veterinary Medicine
Dizin: Filogenetik = Phylogenetic

Özet:
Bu çalısmada, sahada sirküle etmekte olan CDV' nin moleküler epidemiyolojik yöntemler ileH proteini kodlayan gen bölgeleri arasındaki farklılıkların degerlendirilmesi amaçlanmıstır.Bunun yanısıra CD yönünden pozitif oldugu belirlenen olgulardan toplanan kan serumörneklerinde CD' na özgü nötralizan antikorların varlıgının arastırılması ve elde edilecekCDV izolatları ile referens sus Onderstepoort arasında çapraz nötralizasyon farklarıincelenerek, nötralizasyon düzeylerinin karsılastırılması da amaçlanmıstır.Çalısmada, CD yönünden pozitif 51 olgu kullanıldı. Olguların genelinin 0-6 aylık yas grubunadahil oldugu belirlenmistir. Olgularda, en sık saptanan klinik tablo siddetli bir solunumsistemi enfeksiyonu olup, bu tabloya sindirim ve sinir sistemi enfeksiyonlarının da eslik ettigibelirlenmistir.Çalısmada,17 olgudan saha virusunun H proteinini kodlayan gen bölgesine ait dizinlerdegerlendirildi. Degerlendirmede, saha suslarının cografi yerlesim içerisinde monofiletik birgrup olarak kümelestikleri ve ülkemize özgü bir genotipin olustugu sonucuna ulasılmıstır.Bununla birlikte, yerli susun kendi içinde tiplendirilebilecek kadar çesitlilik gösterdigi vesahada en az 3 farklı genotipin sirküle etmekte oldugu saptanmıstır. Saha viruslarının, digercografyalara ait suslar ve ası susları ile genetik yakınlık düzeyleri karsılastırıldıgında, Kuzeyve Dogu Avrupa grubu suslara daha yüksek oranda yakınlık gösterdigi ve ası virusundanbagımsız oldugu belirlenmistir.Virus izolasyon çalısmaları sonucunda, 3 farklı olgudan, sirkülasyondaki saha virusununizolasyonu gerçeklestirildi. CDV izolatlarının identifikasyonu RT-PZR ve Direktmmunfloresan Testi ile yapıldı.Olgulardan alınan kan serum örneklerinde, ası susu Onderstepoort ve saha izolatına karsıgelisen nötralizan antikor titre düzeylerinin karsılastırılmasında, saha izolatına karsı dahagüçlü bir antikor yanıtının gelistigi saptanmıstır.

Abstract:
In this study, the characterization of H protein encoding region of CDV field isolates wereperformed with molecular epidemiological methods for elucidation of genetic diversityamong other wild-type CDV strains and vaccine virus. Besides, the presence of CDV spesificserum neutralizing antibodies, found in the serum samples obtained from CDV positive caseswas aimed to investigate.The disease was characterised mainly by severe respiratory symptoms and central nervoussystem symptoms. It is found that, among clinical samples collected form CDV positive casesnasal swabs had higher viral nucleic acid detection rates than other specimens.Comparison of the nucleotide and deduced amino acid sequences of the H- protein of theCDV field isolates obtained from 17 cases revealed that, recent isolates are closely related,and clustered as a separate monophyletic group in the same geographical localisation.Furthermore generation of a genotype belong to our country was concluded. A least 3different genotypes are cocirculating in the field. Local CDV strains are independent fromvaccine viruses, besides local field strains were found to be more closely related to Northernand Eastern Europe lineage.Virus isolation was accomplished from 3 different cases. Identification of probable CDVisolates were performed by using Reverse Transcriptase Polymerase Chain Reaction andDirect Immunofluorescence assay.In cross neutralization tests, serum neutralizing antibody titres aganist the CDV field isolateswere found consistently higher than against the CDV vaccine strain.