Türkiye denizlerinde bulunan sübye (Sepia officinalis L. 1758) popülasyonlarının genetik analizi
Genetic analyse of the common cuttlefish (Sepia officinalis L. 1758) populations on the Turkish seas
Yazar: DENİZ YAĞLIOĞLU
Danışman: PROF. DR. CEMAL TURAN
Mustafa Kemal Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Su Ürünleri Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2007
Konu: Su Ürünleri = Aquatic Products

Özet:
Bu çalısmada, Türkiye Denizleri'nde bulunan Sübye (Sepia officinalis)populasyonlarının genetik yapısı mtDNA PCR-RFLP yöntemi kullanılarak analizedilmistir. Çalısmada kullanılan örnekler Akdeniz'den (skenderun Körfezi ve Antalya),Ege Denizi'nden (zmir Körfezi) ve Marmara Denizi'nden avlanmıstır.MtDNA'nın ND 5/6 geni PCR yöntemi ile çogaltılarak altı sınırlama enzimi(BsurI, AluI, Bsh1236I, Hin6I, RsaI, XhoI) ile kesilmistir. RFLP sonucunda 120 sübyebireyinde toplam 7 haplotip saptanmıstır. Populasyonlar arasında herhangi bir haplotippaylasımı bulunmadıgı görülmüstür. Haplotiplerin evrimsel uzaklık degerlerinebakıldıgında, en fazla uzaklıgın (0.029684) Antalya Körfezi populasyonunun ikibireyinde tespit edilen ABCBBA genotipiyle, Marmara Denizi populasyonunun 25bireyinde tespit edilen BAAACA genotipi arasında oldugu tespit edilmistir.Populasyonlar içi ortalama haplotip çesitliligi 0.1075, nükleotid çesitliligi0.000818 olarak bulunmustur. Populasyonlar arası ortalama nükleotid çesitliligi0.010208, ortalama nükleotid farklılıgı ise 0.009390 olarak bulunmustur.Populasyonlar arası genetik uzaklık degerlerine bakıldıgında, en yüksek degerinskenderun Körfezi Populasyonu ile Marmara Denizi Populasyonu arasında (0.015279),en düsük degerin ise, Ege Denizi Populasyonu ile Antalya Körfezi Populasyonu(0.003786) arasında oldugu görülmektedir. Monte-Carlo (X2) kili Karsılastırma Analizisonucu bütün populasyonlar arasında önemli derecede genetik farklılıklar oldugubelirlenmistir (P<0.001). UPGMA soy agacında Antalya ve Ege populasyonlarınınbirbirlerine en yakın taksonomik iliskiyi gösterdigi ve skenderun KörfeziPopulasyonu'nun da bu populasyonlara en uzak taksonomik iliskiyi gösterdigi tespitedilmistir.2007, 48 sayfaAnahtar Kelimeler: Türkiye denizleri, sübye, populasyon genetigi, MtDNA, ND 5/6geni, PCR-RFLP,

Abstract:
In this study, the genetic structure of common cuttlefish (Sepia officinalis)populations from Turkish Seas were analysed with mtDNA PCR-RFLP method.Samples were catched from Mediterraean Sea, (Iskenderun Bay and Antalya) AegeanSea (Izmir Bay) and Marmara Sea.The complete NADH 5/6 gene of mtDNA amplified by PCR were digested withsix restriction enzymes, BsurI, AluI, Bsh1236I, Hin6I, RsaI, XhoI. As a result, a total ofseven haplotypes were detected from 120 individuals. No haplotype sharing wasobserved among populations. The highest evolutionary distance was observed betweenthe ABCBBA and BAAACA haplotypes detected in the Antalya Bay and Marmara Seapopulations respectively.The average haplotype diversity and nucleotid diversity within populations were0.1075 and 0,000818 respectively. The average nucleotid diversity and nucleotidedivergence between populations were 0.010208 and 0.009390 respectively.The highest genetic divergence was observed between Iskenderun Bay andMarmara Sea Populations (0.015279), and the lowest genetic divergence was observedbetween Aegean Sea and Antalya Bay populations (0.003786). In Monte Carlo (X2)pairwise comparisons highly significant differences between all populations (P<0.001)were observed. In UPGMA dendrogram, Antalya and Aegean samples clustered as aclosest taxa and Iskenderun Bay samples clustered as most divergent taxa.2007, 48 pagesKey Words: Turkish seas, common cuttlefish, population genetics, MtDNA, ND 5/6gene, PCR-RFLP.