Endometrial kanserde PI3K/AKT/mTOR sinyal yolağını etkileyen miRNA'ların araştırılması
Investigation of miRNAs that affect PI3K / AKT / mTOR signaling pathway in endometrial cancer
Yazar: HASAN ÖZ
Danışman: PROF. DR. NECMİYE CANACANKATAN ; DR. ÖĞR. ÜYESİ ŞERİFE EFSUN ANTMEN
Mersin Üniversitesi / Sağlık Bilimleri Enstitüsü / Eczacılık Biyokimya Ana Bilim Dalı
Derece: Doktora, 2023
Konu: Biyokimya = Biochemistry

Özet:
Endometrial kanser dünya genelinde kadınlar arasında oldukça yaygınlık gösteren bir kanser tipidir. PI3K/AKT/mTOR sinyal yolağının düzensizliği birçok kanser tipinin patogenezinde rol oynamaktadır. Bu çalışmada PI3K/AKT/mTOR yolağını etkileyen miR-7-5p, miR-17-5p, miR-21-5p, miR-145-5p, miR-155-5p, miR-206, miR-221-3p ve miR-222-3p' nin endometrial kanserde in siliko analizleri ve ekpresyon düzeyleri araştırılmıştır. Bu çalışmaya endometrioid adenokarsinom tanısı almış Grade 1 (n=16), Grade 2 (n=16) ve Grade 3 (n=16) arşiv dokuları ile endometrial kanser tanısı almamış Kontrol 1 (n=16) sekretuar faz ve Kontrol 2 (n=16) proliferatif faz sağlıklı endometrium arşiv dokuları dahil edilmiştir.
İn siliko analizlerle miRNA'lar ile hedef genleri arasındaki moleküler etkileşimler incelendi. İn siliko analizlerle miR-7-5p'nin hedefleri PIK3CD, PIK3R3, PIK3CB ve AKT3, miR-17-5p'nin hedefleri PIK3R1 ve AKT3, miR-21-5p'nin hedefi PIK3R1, miR-125b-5p'nin hedefi PIK3C2B, miR-145-5p'nin hedefi AKT3, miR-155-5p'nin hedefleri PIK3CA ve PIK3R1, miR-206'nın hedefi PIK3C2A, miR-221-3p ve miR-222-3p'nin hedefi PIK3R1 ve miR-223-3p'nin hedefi PIK3C2A olarak belirlendi.
miRNA ekspresyon analizleri RT-PCR yöntemi kullanılarak yapıldı. miR-7-5p ve miR-206'nın ekspresyonları Kontrol 1 ve Kontrol 2'ye göre Grade 1, Grade 2 ve Grade 3 'de (p<0,05). miR-145-5p ekspresyonu Grade-1'de Kontrol-1 ve Kontrol-2'ye göre Grade-2 ve Grade-3'te Kontrol-2'ye (p<0,05) göre azaldığı gözlendi. miR-17-5p ve miR-222-3p'nin ekspresyonlarının Kontrol-1 ve Kontrol-2'ye göre Grade 1, Grade 2 ve Grade 3 'de arttığı saptandı (p<0,05). miR-221-3p ekspresyonun Grade-1 ve Grade-3'te Kontrol-1 ve Kontrol-2'ye göre, Grade-2'de ise Kontrol-1'e göre arttığı tespit edildi (p<0,05). miR-21-5p ve miR-155-5p ekspresyon düzeylerinde gruplar arasında istatiksel olarak anlamlı farklılık gözlenmedi. Sonuç olarak; Endometrial Kanserde PI3K/AKT/mTOR sinyal yolağında etkinliği tespit edilen miRNA'lar moleküler hedefe yönelik tedavi ve tanı stratejilerinin geliştirilmesine katkı sağlayacaktır.

Abstract:
Endometrial cancer is a very common type of cancer among women worldwide. Irregularity of the PI3K/AKT/mTOR signaling pathway plays a role in the pathogenesis of many cancer types. In this study, In silico analysis and expression levels of miR-7-5p, miR-17-5p, miR-21-5p, miR-145-5p, miR-155-5p, miR-206, miR-221-3p and miR 222-3p, which affect the PI3K/AKT/mTOR pathway, were evaluated in endometrial cancer. In this study, Grade-1 (n=16), Grade-2 (n=16) and Grade-3 (n=16), archival tissues diagnosed with endometrioid adenocarcinoma, Control-1 (n=16) secretory phase and Control-2 (n=16) proliferative phase healthy endometrial archival tissues without endometrial cancer were included.
In silico analyses examined molecular interactions between miRNAs and target genes. In silico analysis identified that miR-7-5p targets PIK3CD, PIK3R3, PIK3CB and AKT3, miR-17-5p targets PIK3R1 and AKT3, miR-21-5p targets PIK3R1, miR-125b-5p targets PIK3C2B, miR-145-5p targets AKT3, miR-155-5p targets PIK3CA and PIK3R1, miR-206 targets PIK3C2A, miR-221-3p and miR-222-3p target PIK3R1, miR-223-3p targets PIK3C2A.
miRNA expression analysis was performed by the RT-PCR method. The expressions of miR-7-5p and miR-206 were higher in Grade-1, Grade-2, and Grade-3 than in Control-1 and Control-2 (p<0.05). It was observed that miR-145-5p expression decreased in Grade-1 compared to Control-1 and Control-2, and decreased in Grade-2 and Grade-3 compared to Control-2 (p<0.05).
It was determined that the expressions of miR-17-5p and miR-222-3p increased in Grade-1, Grade-2 and Grade-3 compared to Control-1 and Control-2 (p<0.05). It was determined that miR-221-3p expression increased in Grade-1 and Grade-3 compared to Control-1 and Control-2, and in Grade-2 compared to Control-1 (p<0.05). No statistically significant difference was observed between the groups in the expression levels of miR-21-5p and miR-155-5p. In conclusion; miRNAs detected to be active in the PI3K/AKT/mTOR signaling pathway in Endometrial Cancer will contribute to the development of molecular targeted treatment and diagnostic strateg.