Merkezi sinir sistemi enfeksiyonu ön tanısı ile izlenen hastalardaki etkenlerin dağılımı ve beyin omurilik sıvısı multipleks PCR panelinin klinik yararlılığının değerlendirilmesi
Distribution of microorganisms in patients followed up with a diagnosis of central nervous system infection and evaluation of clinical usefulness of Cerebrospinal fluid multiplex PCR panel
Yazar: ELİF ÖZGE DAMAR MIDIK
Danışman: PROF. DR. AYŞE BATIREL
Sağlık Bilimleri Üniversitesi / İstanbul Kartal Dr. Lütfi Kırdar Eğitim ve Araştırma Hastanesi / Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı / Enfeksiyon ve Klinik Mikrobiyoloji Bilim Dalı
Derece: Tıpta Uzmanlık, 2024
Konu: Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji = Infectious Diseases and Clinical Microbiology

Özet:
ÖZET
Amaç: Multipleks PCR Menenjit/Ensefalit (ME) paneli son yıllarda kullanıma girmiştir ve Merkezi Sinir Sistemi (MSS) enfeksiyonu olan hastalarının hızlı tanısında ve yönetiminde önemli bir yere sahip olduğu düşünülmektedir. Biz bu çalışmada hastanemizin Enfeksiyon Hastalıkları Kliniğinde MSS enfeksiyonu tanısı ile takip ettiğimiz hastalardaki etkenlerin dağılımını, klinik özelliklerini, kullanılan ampirik ve hedefe yönelik tedavi süreçlerini değerlendirmeyi ve Multipleks PCR (M- PCR)'ın bu hastaların tedavilerinin yönetimine ve sağkalıma katkısını araştırmayı amaçladık.
Gereç yöntem: Hastanemiz Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Kliniğinde 01 Ocak 2012 – 01 Ocak 2024 tarihleri arasında yatırılarak tedavi edilen MSS enfeksiyonu tanılı hastalar dosya kayıtları ve hastane elektronik bilgi sistemi üzerinden retrospektif olarak incelendi. Hastalar klinik özelliklerine ve saptanan etkene göre "akut bakteriyel menenjit", "akut meningoensefalit" ve "kronik meningoensefalit" olarak üç tanı grubuna ayrıldı. Tanı amaçlı Multipleks PCR ME paneli çalışılan ve çalışılmayan hastaların demografik özellikleri, kullanılan ampirik ve hedefe yönelik antimikrobiyal tedavi süreleri, hastanede kalış süresi ve mortalite oranları karşılaştırıldı.
Bulgular: Toplam 150 hastanın değerlendirildiği bu çalışmada Multipleks PCR ME paneli hastaların %62'sinde (n=94) çalışılmış ve etken saptanma oranı %51 (n=48) bulunmuştur. Sıklık sırasına göre; %13,8 (n=13) Streptecoccus pnemoniae, %11,7 (n=11) Herpes simpleks virüs-1, %6,4 (n=6) Listeria monocytogenes en sık saptanan etkenler olarak gözlenmiştir.
Tüm hastalar değerlendirildiğinde, M-PCR ME paneli çalışılan grupta medyan ampirik tedavi süresi beş günden (IQR 1-10) iki güne (IQR 1-5,75) kısalmıştır (p<0.001). Seftriakson kullanım süresinin ise 10 günden (IQR 5-14) beş güne (IQR 2-10) kısaldığı görülmüştür (p<0.001). M-PCR ME paneli çalışılan grupta %69 oranında antimikrobiyal tedavi spektrumunun daraltılması (de-eskalasyon) kararı verilmiş ve bu oran M-PCR ME paneli çalışılmayan gruba göre istatistiksel anlamlı olarak daha yüksek bulunmuştur (p=0,0001). Akut bakteriyel menenjit tanı grubundaki hastalarda ise M-PCR ME paneli çalışılan grupta asiklovir kullanım süresinin 5,5 günden (IQR 3-10) bir güne (IQR 1-2,75) kısaldığı gözlenmiştir (p<0,003). M-PCR ME paneli çalışılan ve çalışılmayan gruplar arasında hastanede kalış süresi, toplam antimikrobiyal kullanım süresi, ve 14 ve 30 günlük mortalite oranları karşılaştırıldığında istatistiksel anlamlı fark saptanmamıştır.
Sonuç: Çalışmamız Multipleks PCR ME panelinin MSS enfeksiyonu tanılı hastalarda gereksiz antimikrobiyal kullanımını azalttığını, böylelikle antimikrobiyal yönetişim açısından olumlu katkı sağladığını göstermektedir.
Anahtar kelimeler: Multipleks PCR, menenjit, ensefalit, Merkezi Sinir Sistemi enfeksiyonu, menenjit/ensefalit panel

Abstract:
ABSTRACT
Objective: Multiplex PCR Meningitis/Encephalitis (ME) panel has been used in recent years and is thought to have an important place in the rapid diagnosis and treatment of patients with Central Nervous System (CNS) infection. In this study, we aimed to evaluate the distribution of microorganisms, clinical characteristics, empirical and targeted treatment durations used in the patients we followed with a diagnosis of CNS infection in the Infectious Diseases Clinic of our hospital, and to investigate the contribution of Multiplex PCR (M-PCR) to the management and survival of these patients.
Materials and Methods: Patients diagnosed with CNS infection who were hospitalized and treated in the Infectious Diseases and Clinical Microbiology Clinic
of our hospital between 01 January 2012 and 01 January 2024 were retrospectively examined through the patients' file records and the hospital electronic information system. The patients were divided into three diagnostic groups as "acute bacterial meningitis", "acute meningoencephalitis", and "chronic meningoencephalitis" according to their clinical characteristics and the detected microorganism. Demographic characteristics, duration of empiric and targeted antimicrobial treatment used, duration of hospital stay and mortality rates of patients who were and were not studied with a Multiplex PCR ME panel for diagnostic purposes were compared.
Results: In this study where a total of 150 patients were evaluated, Multiplex PCR ME panel was performed in 62% (n = 94) of the patients and the agent detection rate was found to be 51% (n = 48). In order of frequency; the most frequently detected agents were 13.8% (n=13) Streptecoccus pneumoniae, 11.7% (n=11) Herpes simplex virus-1, 6.4% (n=6) Listeria monocytogenes.
In the M-PCR ME panel study group, the median empirical treatment duration decreased from 5 (IQR 1-10) days to 2 (IQR 1-5.75) days (p<0.001). It was observed that the duration of ceftriaxone use decreased from 10 (IQR 5-14) days to five (IQR,2-10) days (p<0.001). In the group in which the M-PCR ME panel was performed, a decision to narrow antimicrobial therapy spectrum (de-escalation) was made in 69% of cases, and this rate was found to be significantly higher than in the group in which the M-PCR ME panel was not performed (p = 0.0001). In patients in the acute bacterial meningitis group, it was observed that the duration of acyclovir use was shortened from 5.5 (IQR, 3-10) days to one (IQR 1-2.75) day in the M-PCR ME panel study group (p<0.003). No statistically significant difference was found between the group in which the M-PCR ME panel was performed and that in which the M-PCR ME panel was not performed, when the duration of hospital stay, total antimicrobial use, and 14- and 30-day mortality rates were compared.

Conclusion: Our study shows that the Multiplex PCR ME panel reduces unnecessary antimicrobial use, thus making a positive contribution to antimicrobial stewardship in patients diagnosed with CNS infection.
Keywords: Multiplex PCR, meningitis, encephalitis, Central Nervous System infection, meningitis/encephalitis panel