hakansabunis/tr-academic-research-agent-index huggingface dataset:
Parçacık tabanlı sıkıştırılamaz gerçek zamanlı sıvı simülasyonu
Particle based incompressible real time liquid simulation
Yazar: MURAT KANCAOĞLU
Danışman: YRD. DOÇ. DR. CENGİZ GÜNGÖR
Ege Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Uluslararası Bilgisayar Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2014
Konu: Bilgisayar Mühendisliği Bilimleri-Bilgisayar ve Kontrol = Computer Engineering and Computer Science and Control

Özet:
Sıvı simülasyonu, genellikle oyun ve grafiksel multimedya ürünlerinde sıkça görülen bir olgudur. Ancak sıvı için tasarlanan bu modeller, simülasyonun doğası gereği, karmaşık işlemlerden uzak, gerçeği andıran hilelerden ibarettir. Bu tez, sıvının hacimsel olarak simülasyonunu hedeflemiştir. Bunun için yapılan çalışmalardan bahsedilmiştir. Sıvının davranışı, maddeye bağlı olarak çeşitlilik gösterir. Bu simülasyonda, Navier-Stokes denklemi ile simüle edilen, homojen dağılmış ve sıkıştırılamaz olan sıvı tasarımı yapılmıştır.
	Simülasyonlarda hedeflenenler, sistemin sadece istenilen değerleri gerçekçi olarak verebilmesidir, yani sıvı simülasyonu, sıvının moleküler düzeyde simülasyonu değildir. Bu nedenle bazı veriler alınamaz veya alınan değerler hata oranı içerebilir. Tezin konusu olan simülasyon, sıvının tanecik olarak varsayılmasıyla elde edilmiştir. Simülasyonda verinin daha az yer kaplamasını sağlayacak bir yöntem test edilmiştir.

Abstract:
Liquid simulations are mostly seen on video games and multimedia applications. But, models designed for these applications, due the nature of simulation, does not contain complex calculations and consist of realistically cheats. This thesis is targeted to simulate liquid as a volume and contains some researches about it. Liquids behaivor varies due its matter. In this simulation, homogeneous and incompressible liquid is designed using equations called Navier-Stokes.
	Expectation in simulations are about getting requested values accurately. This means, liquid simulation is not about simulating in molecular level. Thus, it is not possible to obtain some values and calculated values may contain error rates. Simulation in this thesis will assume liquid as particles. A new method for simulation is tested for reducing memory usage.
İzmir – Karaburun yöresi mikrotoponimleri ve dil incelemesi
Microtoponymy of İzmir's Karaburun and language study
Yazar: SALİH KÖSE
Danışman: YRD. DOÇ. DR. İBRAHİM ŞAHİN
Ege Üniversitesi / Sosyal Bilimler Enstitüsü / Türk Dili ve Lehçeleri Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2014
Konu: Dilbilim = Linguistics ; Türk Dili ve Edebiyatı = Turkish Language and Literature
Dizin: Adbilimi = Onomastic ; Coğrafi adlar = Geographical names ; Dil özellikleri = Language features ; Yer adları = Place names ; İzmir-Karaburun = İzmir-Karaburun

Özet:
"İzmir – Karaburun Yöresi Mikrotoponimleri ve Dil İncelemesi" adlı bu tez, Ege Üniversitesi Bilmsel Araştırma Projeleri Koordinatörlüğü tarafından desteklenen, Karaburun ilçesinin köylerinden derlenen toplam 1363 silikyeradı (mikrotoponim) üzerine yapılmış bir silikyeradı (mikrotoponimi) çalışmasıdır.
Tezin giriş bölümü Karaburun ilçesinin tarihi ve coğrafyası ile ilgili bilgileri içermektedir. Tezin birinci bölümünde Karaburun ilçesinin toponimik stratigrafisi belirlenmiş; tarihî kaynaklar esas alınarak silikyeradları, ortaya çıktıkları döneme göre sınıflandırılmıştır. İkinci bölümde silikyeradları adbilimin alt türlerine göre sınıflandırılmıştır (Oykonimler, Oronimler, Horonimler, Dromonimler, Urbonimler, Agronimler, Hidronimler ve Drimonimler). Üçüncü bölümde tezde geçen silikyeradları leksik-semantik açıdan incelenmiş, adlandırmalarda kullanılan kelimelerin anlamları ve adların veriliş sebepleri ortaya konmuştur. Tezin dördüncü bölümünde tezde geçen silikyeradları üzerinde fonetik incelemesi ve morfolojik inceleme yapılmıştır. Son bölümde tezde geçen silikyeradlarında kullanılan coğrafi terim niteliğinde olan ve coğrafi terim niteliğinde olmayan kelimelerin bir sözlükçesi hazırlanmıştır. Sonuç kısmında elde edilen bilgi ve bulgulardan yola çıkılarak genel bir değerlendirme yapılmıştır.

Abstract:
The thesis which supported by Ege University Coordination of Scientific Research Projects, "Microtoponymy of İzmir's Karaburun and Language Study" is a microtoponymy study which scopes of 1363 place names was compiled from Karaburun's villages.
The introduction to the thesis contains information about the history and geography of Karaburun district. In the first chapter of this thesis toponymical stratigraphy of place names was made on the basis of historical sources and these names were classified according to period they appeared. In the second chapter of the study, place names were classified according to sub-types of toponymy as Oykonims, Oronims, Horonims, Dromonims, Agronims, Hidronims, Drimonims and Urbomims. The lectical and semantic meanings of names and sources have been analyzed in the third chapter of this study. In this part the sources of names has given too. Names in the fourth chapter of the thesis were analyzed grammatically and phonetical. In the last chapter of the study, glossary of geographic terms and the other words prepared. In conclusion general assessment was made in the light of the obtained information and findings.
Görevdeş ağlarda itme-çekme tabanlı video akışlandırma uygulamaları için çıkarsamaya dayalı alternatif yol seçimi
Inference based alternative path selection for P2P video streaming applications
Yazar: MUZAFFER ERDEM KARAYER
Danışman: YRD. DOÇ. DR. MÜGE SAYIT
Ege Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Uluslararası Bilgisayar Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2014
Konu: Bilgisayar Mühendisliği Bilimleri-Bilgisayar ve Kontrol = Computer Engineering and Computer Science and Control

Özet:
Görevdeş ağlarda video akışlandırma uygulamalarında kullanıcı memnuniyetinin sağlanması için birçok çalışma mevcuttur. Bu çalışmaların başında video alınan yolların seçimi bulunmaktadır. Ancak bu çalışmalar proaktif yol seçimlerine dönük yaklaşımlar içermemektedir. Bu boşluğu doldurmak için bu tez kapsamında görevdeş ağlarda yapılan video akışlandırma uygulamalarına yönelik evrimsel bir proaktif yol seçimi geliştirilmiştir. 
Video akışlandırma uygulamalarının kalitesini arttırmak içinkayıp video parçalarının telafisine yönelik çalışmalar da bulunmaktadır. Tez kapsamındaçıkarsamaya dayalı skor tabanlı bir yeniden gönderim sistemi geliştirilmiştir. Önerilen yaklaşım, literatürdeki benzer çalışmalar ile karşılaştırılmış ve sonuçlar raporlanmıştır.Önerilen yöntemler Network Simulator – 3 simülasyon ortamında test edilmiştir. Test sonuçlarında önerilen algoritmaların sistem performansında iyileştirme sağladıkları görülmüştür.

Abstract:
There are several researches in P2P Video Streaming Systems to provide user satisfaction. The outstanding researches focus onpath selection of video packets. But these studies don't implement proactive path selection aproach.In order to fill this gap, i introduce an evolutionary proactive path selection method for P2P video streaming systems.
There are some studies about retransmission of lost video packets in order to increase the quality of the received video. In this thesis, we introduce a score based retransmission system which is based on inference. The proposed approach is compared with similar studies in the literature and the results are given.
The proposed methods are tested on Network Simulator – 3 simulation platform. The experimental results show that proposed algorithmsimprovethe performance of P2P video streaming applications. We believe that the studies given in this thesis may guide the researchers studyingP2P video streaming systems.
Betonarme kiriş-kolon birleşim noktalarının güçlendirilmesi
Strengthening of R.C. beam-column joints
Yazar: ÖMER BURAK ERTEM
Danışman: ÖĞR. GÖR. EMRE ERCAN
Ege Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / İnşaat Mühendisliği Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2015
Konu: İnşaat Mühendisliği = Civil Engineering

Özet:
Bu çalışmada, hasarlı veya hasarsız mevcut binalarda betonarme kolon-kiriş birleşim noktasının farklı CFRP(Carbon-fiber-reinforced polymer) ve capraz çelik ankrajlarla güçlendirilmesi ve dayanım,davranış,rijitlik ve enerji tüketümine etkileri araştırılmıştır.
Tez çalışması deneysel olarak gerçekleştirilmiştir. Birinci olarak hedef,referans ve güçlendirilecek elemanların iç demir dizaynları güçlendirme çeşidine göre hazırlanmıştır ve güçlendirilecek zayıf deney elemanlarına CFRP ve çapraz çelik ankrajlarla güçlendirme uygulanmıştır. Deney içerisinde CFRP ile güçlendirilmiş düğüm noktaları ve çapraz çelik ankrajlarla güçlendirilmiş düğüm noktaları ayrı olarak hazırlanmış ve bir adet deney elemanına da hem CFRP hemde çapraz ankraj uygulanarak, elemanlar birbirleriyle karşılaştırılması sağlanmıştır. Güçlendirme kolon-kiriş bölgesini esas alarak yapılmıştır. Güçlendirme uygulanmış elemanlar ile referans elemanlar karşılaştırılmış ve hedef elemana yakın davranış göstermelerine değinilmiştir. 
Böylece hasarlı yada hasarsız betonarme yapılarda kolon ve kiriş birleşim yerlerinin CFRP ve çapraz çelik ankrajlarla güçlendirilmesi konusunda dayanım, uygulanabilirlik, rijitlik ve enerji tüketimi bakımından değerlendirmeler yapılmıştır. Hedef elemana yakınlıkları ve uygulanılabilirlikleri tartışılmıştır.

Abstract:
In this study, to strengthen the damage or undamaged existing reinforcing concrete beam-column joints with CFRP and crosswise steel anchorage.
The study of thesis was performed experimental. First of all, experimental specimens which was designed according to strengthening type, were strengthened with CFRP and crosswise steel anchorage. On the joints, there are two type of strengthening. First is strengthening with CFRP and second is crosswise steel anchorage. Two of them was designed separately for comparing each other. Strengthened specimens and reference specimens compared each other and then we investigated to reach target specimen's treatment.
Thereby, some evaluations were made on especially in terms of strength, applicability, stiffness and energy consumption about the damage or undamaged existing reinforcing concrete beam-column joints with CFRP and cross steel.
Fonksi̇yonel manyeti̇k nanoparçacIklarin üreti̇mi̇ ve karakteri̇zasyonu
Production and characterizaton of functional 
magnetic nanoparticles
Yazar: SERTAÇ YAMAN
Danışman: PROF. DR. İBRAHİM AVGIN
Ege Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Elektrik-Elektronik Mühendisliği Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2015
Konu: Biyomühendislik = Bioengineering ; Elektrik ve Elektronik Mühendisliği = Electrical and Electronics Engineering

Özet:
Bu çalışmada ortak çöktürtme metodu kullanarak Minitab istatistiksel analiz programından faydalanılarak girilen başlangıç koşulları değişken sayısına (pH ve Sıcaklık)  bağlı olarak üretim koşullarının senteze etkileri incelenmeştir. Sonraki adımlarda üretilen ve karakterize edilen nano parçacıkların fonksiyonel hale getirilerek manyeto-optik ve biyomedikal çalışmalara uygun hale getirilmiştir. 
Bu çalışmanın merkezinde manyetik alana duyarlı fonksiyonel nano parçacıkların sentezlenmesi bulunmaktadır. Üretilen nano parçacıkların yapısal, boyut dağılımı ve manyetik özellikleri, X-ışınları difraksiyonu (XRD), Dynamic Light Scattering (DLS), Vibrating Sample Magnetometer (VSM) cihazları ve Lineer dikroizm ölçüm sistemi kullanılarak karakterize edilmiştir.

Abstract:
In this study, according to Minitab statistical software, using the method of Co-precipitation by changing the initial conditions (pH and temperature) to investigate the effects of processing conditions on the synthesis. The next steps, synthesized and characterized nano particles will be made available by being functional for magneto-optic and biomedical application. 
In this thesis focus on magnetic-sensitive functional magnetic nanoparticle. To determine structural, size distribution and magnetic properties of the produced nanoparticles characterized by using X-ray diffraction (XRD), Dynamic Light Scattering (DLS), Vibrating Sample Magnetometer (VSM) and Linear dikroism measurement setup.
Işık yayan organik diyotların performns ve karakteristiklerinin incelenmesi
Investigation of performance and characteristics of organic light emitting diode
Yazar: SHIRIN SIYAHJANI
Danışman: DOÇ. DR. ŞULE ERTEN ELA
Ege Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Güneş Enerjisi Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2015
Konu: Enerji = Energy

Özet:
Bu yüksek lisans çalışmasında, sabit HTL ve ETL kalınlıklanırda, aktif tabakanın(EL)kalınlığını değiştirerek, OLED aygitina ait optiksel ve elektriksel değişimler tespit edilmiştir. Daha sonra, elde edilen sonuçlar değerlendirilerek optimize ışık verimi için uygun OLED yapısı belirlenmiştir. Bu amaçla, ITO/PEDOT:PSS(35nm)/ Ir(mppy)3(%6wt%):PBD(%24):TPD(%9):PVK(%61)/LiF(0,7 nm)/Al(100nm)konfigürasıyonunda, farklı aktif tabaka kalınlıklarına sahip, dört tür OLED aygıtı hazırlanmıştır. dönü kaplama tekniğiyle,farklı dönme hızlarında kapalanan aygıtların aktif tabakalarına ait kalınlıklar, profilometre ile belirlenmiştir. Üretilen OLED aygıtlarının akım yoğunluğu-gerilim, dalga boyuna göre elektrolüminesans, gerilim-lüminesans ve akım yoğunluğu-elektrik alan analizleri gerçekleştirilmiştir. Elde edilen sonuçlar tartışılmış ve her bir analiz sonucunun, birbiriyle olan uyumluluğu irdelenmiştir. sonuçta, yukarıdaki kofigürasiyonda hazırlanan yeşil renk fosforesans OLED için EL tabaka kalınlığı tespit edilmiştir(56nm). Islak kaplama tekniğiyle hazırlanan aygıtlarda, en iyi değerler, 2,8mA altında, 3,6V'luk açma kapama gerilimi ve 575,5cdm-2'lik ışıma olarak belirlenmiştir.

Abstract:
In this Msc thesis,polymer based organik light emitting diode (OLED)with various active layer thickness have been fabricated and characterized. OLEDs were configured in a structure of ITO/PEDOT:PSS(35nm)/Ir(mppy)3(%6wt%):PBD(%24):TPD(%9):PVK(%61)/LiF(0.7nm)/Al(100nm).Emissive layer of TPD:PBD:PVK:Ir(mppy)3 was deposited with thickness ranging of 91nm, 56nm, 42nm and 35nm. Thicknesses of the active layers of coated with spin coater have been determined by using profilometer. After that,thicknesses of active layer were optimized for efficient phosphorescent OLED device by determining the optical and electrical parameters.From the current density, luminance, voltage characteristics of OLED,proper thickness of the organic layer (56nm)was able to determined. The solution processed OLED device exhibited a turn-on voltage of 3.6V and maximum luminance of 575.5 cdm-2 at 2.8mA.
Sporda profesyonelleşme ve toplumsal hareketli̇li̇k: Türki̇ye'de futbol örneği̇
Professionalization in sport and social mobility: The case of soccer in turkey
Yazar: SAFTER ELMAS
Danışman: YRD. DOÇ. DR. MEHMET ERSİN ALTIPARMAK ; DOÇ. DR. AHMET TALİMCİLER
Ege Üniversitesi / Sağlık Bilimleri Enstitüsü / Sporda Psiko-Sosyal Alanlar Ana Bilim Dalı / Sporda Psikososyal Alanlar Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2015
Konu: Sosyoloji = Sociology ; Spor = Sports

Özet:
Bu araştırmanın amacı, toplumsal bir kurum alanı olarak profesyonel futbolun toplumsal dikey hareketlilikle olan ilişkisini incelemektir. Bu çerçevede, profesyonel futbol kariyerine yönelen bireyler için toplumsal dikey hareketliliğin uzun ve kalıcı mı yoksa kısa ve geçici mi olduğu anlaşılmaya çalışılmaktadır. Bu süreçte, toplumsal hareketlilik sayesinde elde edilen ekonomik sermaye, habitus ve toplumsal statünün bireylerde nasıl etki yarattığı göz önünde bulundurulacaktır. Bu çalışmada, bireylerin toplumsal dikey hareketlilik konusunda deneyimlerini derinliğine ve çok boyutlu anlamak için yöntem olarak niteliksel araştırma yöntemi belirlenmiştir. Veri toplama araçları olarak bireysel görüşme ve odak grup görüşmeleri oluşturulmuştur. 8 bireysel görüşme ve 1 odak grup görüşmesi (8 kişi) yapılmıştır. Araştırmada elde edilen veriler niteliksel içerik analizi yöntemiyle analiz edilmiştir. Analiz sonucunda üç farklı tema ortaya çıkmıştır: 1) futbola yönelik toplumsallaşmada sosyal ajanlar: geçiş, 2) profesyonelleşme ve yukarı dikey hareketlilik: dönüşüm, 3) profesyonellikte ve sonrasında sorunlar ve geriye dönüş: düşüş. Sonuç olarak profesyonel futbol kariyerinin sistematik ve yapısal sorunları sebebiyle  kalıcı toplumsal dikey hareketlilik imkanı tanımadığı ortaya konmuştur.

Abstract:
The aim of this study is to explore the relationship between social upward mobility and professional soccer which is a social institution. In this context, if the social upward mobility is long and lasting or short and temporary for individuals who run professional soccer career is tried to be understood. Within this period, economic capital, habitus and social status which are obtained by means of social upward mobility how have an impact upon individuals is considered. In this research, qualitative research method was used to understand individuals' experiences deeply and multiple in the matter of social upward mobility. The main data gathering techniques were individual and focus group interviews. 8 individual interviews and one (with eight individuals) focus group interviews were conducted. Data was analysed by qualitative content analyse. As a result, three different themes were obtained: 1) social agents in socialization towards soccer: transition, 2) professionalization and social upward mobility: transformation, 3) during and after the professional career having problems and return to beginning: fall down. In conclusion, because of the fact that professional soccer career has systematic and structural issues it hasn't enabled lasting social upward mobility was revealed.
Bazı kendilenmiş şeker mısır hatlarının şeker içeriklerinin belirlenmesi ve ilgili moleküler markörler ile taranması
Determination of sugar content of some inbread sweet corn lines and screening with ssr markers
Yazar: GİZEM ÇİVİ
Danışman: PROF. DR. MUZAFFER TOSUN
Ege Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Tohumluk Bilimi ve Teknolojisi Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2015
Konu: Biyoteknoloji = Biotechnology ; Ziraat = Agriculture

Özet:
Çalışmada, Amerikan Tarım Bakanlığı'ndan temin edilen 26 kendilenmiş tatlı mısır hattı ile Ege Üniversitesi Ziraat Fakültesi Tarla Bitkileri Bölümü tarafından geliştirilen 23 adet kendilenmiş tatlı mısır hattı kullanılmıştır. Denemede toplam farklı 49 adet kendilenmiş tatlı mısır hattı 2015 yılında latis deneme deseninde ekilmiştir. Bitkiler 4-5 yapraklı dönemde iken DNA izolasyonu için yaprak örnekleri alınmıştır. Koçanların hasadından sonra tanelerdeki toplam şeker içerikleri Luff- Schoorl metodu ile tayin edilmiştir. Aynı zamanda tatlı mısırda şeker içeriğini kontrol eden genlerin bazılarına ait 9 adet SSR markörü kullanılarak 49 bitkiden oluşan kendilenmiş tatlı mısır populasyonunda moleküler tarama yapılmıştır.
  Çalışmada kullanılan 49 adet kendilenmiş tatlı mısır hattındaki toplam şeker içeriği % 16,84 ile % 0.66 arasında değişmiştir. Çalışmamızda tatlı mısırın şeker içeriği ile ilişkili su geni için umc1031, sh1 geni için phi44, sh2 geni için umc2276 ve ea1 geni için phi328175 markörlerinin daha uygun oldukları belirlenmiştir. Ayrıca, at dişi mısırların şeker oranı en fazla % 4.0 olduğundan, çalışmamızdaki kendilenmiş hatlardan 24 adedinin toplam şeker içeriği bu değerden daha yüksek bulunmuştur. Bu genotiplerin hibrit şeker mısır çeşitlerinin geliştirilmesinde ebeveyn olarak kullanılabilecekleri sonucuna varılmıştır.

Abstract:
In this study we evaluated 26 sweet corn inbred lines which is obtained from the U.S. Department of Agriculture and  23 sweet corn inbred lines developed by Ege University, Faculty of Agriculture, Field Crops Department. In total 49 different sweet corn inbred lines were planted with lattice experimetal design in 2015. The leaf samples were taken when they were within 4-5 leaf stage for DNA isolation. After harvesting of the corn cobs, total sugar content in the kernel were measured by Luff-Schoorl method. At the same time, moleculer screenings were carried out by using 9 SSR marker which is related to sugar content genes in 49 inbred sweet corn lines.
  The total sugar content were ranged from 0,66 % to 16,84 % in 49 sweet corn inbred lines. For genes which are related to the sugar content of sweet corn was determined to  more suitable umc1031 primer for su gene, phi44 primer for sh-1 gene, umc2276 primer for sh-2 gene and phi328175 primer for ea-1 gene. In addition to, since dent corn sugar content is the most 4.0 %, the total sugar content of 24 inbred lines in this study were found higher than 4.0 %. We concluded that these genotypes can be used as parental genotypes for improved of hybrid sweet corn cultivars.
Hipoksinin kanser kök hücrelerine etkisinin incelenmesi
The hypoxia effect on cancer stem cells
Yazar: CANSU GÖRGÜN
Danışman: YRD. DOÇ. DR. AYLİN ŞENDEMİR ÜRKMEZ
Ege Üniversitesi / Sağlık Bilimleri Enstitüsü / Kök Hücre Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2015
Konu: Biyomühendislik = Bioengineering ; Biyoteknoloji = Biotechnology
Dizin: Hücre hipoksisi = Cell hypoxia ; Neoplazm kök hücreleri = Neoplastic stem cells

Özet:
Hipoksi, oksijen eksiği olarak tanımlanan bir ortamdır ve kanser kök hücrelerinin karakterinin devamlığını sağlaması nedeniyle tümörlerde önemli bir role sahiptir. Bu çalışmanın amacı, kanser kök hücrelerinin 2 boyutlu (2B) ve 3 boyutu (3B) kültürlerde hipoksik şartlar altında davranışlarını ve karakterlerini incelemektir. Çalışmada, CD133 yüzey proteini ile karakterize edilmiş olan osteosarkoma kanser kök hücreleri, manyetik aktiflenmiş hücre ayırım (MACS) tekniği ile osteosarkoma kanser kök hücrelerinden izole edilmiştir. Kontrol grubu olarak da satın alınmış olan osteosarkoma kanser kök hücre hattı (OKKH, Celprogen Inc.) kullanılmıştır. OKKH, CD133+ ve CD133- hücreler 3 gün boyunca hipoksik (%1 O2) ve normoksik (%21 O2) koşullarda kültive edilmiştir. 3B model için bakteriyel selüloz doku iskelesi kullanılmıştır. Hücrelerin 3 boyutlu morfolojileri SEM analizi ile incelenmiş, kantitatif PCR, ALP aktivitesi ve immünohistokimyasal boyama ise kanser kök hücrelerinin 2B ve 3B olarak hipoksik şartlar altında karakterlerinin incelenmesi için uygulanmıştır. Hücre canlılığı 3. ve 7.günlerde MTT analizi ile gösterilmiştir. Bu çalışma, kanser kök hücre davranışını ve in vitro tümörigenezin çalışılması için bir 3B hipoksik tümör model olarak da tanımlanabilir.
Bu tez projesi Aliye Üster Vakfı tarafından desteklenmiştir.

Abstract:
Hypoxia is known as a condition, which is characterized by the lack of oxygen. The hypoxia effect on tumors has a critical important role on maintenance of cancer stem cell phenotype . The aim of this study is to investigate the hypoxia effect on cancer stem cells on 3 dimensional (3D) in vitro culture models. In this study, osteosarcoma stem cells, which are characterized by CD133 surface protein, were isolated from osteosarcoma cell line (SaOs-2) by magnetic-activated cell sorting (MACS) technique. As a control group; osteosarcoma stem cell line (OSCs, Celprogen Inc.) was used. OSCs, CD133+ and CD133- cells were cultivated under hypoxic (1% O2) and normoxic conditions (21% O2) for 3 days. For the 3D model, bacterial cellulose scaffold was used as the culture substrate. 3D morphologies of cells were examined by scanning electron microscopy (SEM); RT-PCR, ALP activity and immunocytochemistry staining were used to demonstrate conservation of the cancer stem cell phenotype in 3D environment under hypoxic conditions. Also cell viability was shown by MTT assay on 3. and 7. culture days. This study is seen as an introduction to develop a 3D hypoxic cancer stem cell based tumor model to study CSC behaviour and tumorigenesis in vitro under.
This thesis project was supported by Aliye Üster Foundation.