Genomik değişikliklerden yararlanarak korpus kallozum anomalileri ile ilişkili genlerin saptanması
Identification of genes associated with corpus callosum abnormalities using genomic changes
Yazar: TÜLAY ÖNCÜ
Danışman: PROF. DR. SULTAN CİNGÖZ
Dokuz Eylül Üniversitesi / Sağlık Bilimleri Enstitüsü / Temel Tıp Bilimleri Bölümü / Tıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2014
Konu: Çocuk Sağlığı ve Hastalıkları = Child Health and Diseases
Dizin: Corpus callosum = Corpus callosum ; Epilepsi = Epilepsy ; Genler = Genes ; Genom = Genome ; Malformasyonlar = Abnormalities ; Polimeraz zincirleme reaksiyonu = Polymerase chain reaction

Özet:
Korpus kallozum beynin sağ ve sol hemisferlerini birbirine bağlayan sinir ağlarından oluşan bir yapıdır. Bu iki hemisfer arasındaki duyusal, motor ve bilişsel bilginin iletilmesinde rol oynamaktadır. Korpus kallozumun yapısındaki değişikliklerin sıklıkla psikiyatrik ve gelişimsel bozukluklar ile birlikte olduğu belirtilmektedir. Populasyonda prevelansı 0.3% ve 0.7% aralığında değişmektedir. Korpus kallozum displazileri izole olabileceği gibi çok sayıda genetik anomali, metabolik hastalık ve enfeksiyonla birlikte de gözlenebilmektedir. En yaygın görülen klinik tablo epileptik nöbetlerle birlikte mental retardasyon, konuşmada gecikme, görme ve beslenme problemleridir.  Korpus kallozum anomalileri pek çok çevresel ve genetik etken sonucu oluşabilmektedir. Herhangi bir sendromla bağlantısı olmayan, korpus kallozum displazilerine yol açan aday genler üzerinde çalışmalar devam etmektedir. Yapılan çalışmalar sonucunda AKT3, CEP170, SDCCAG8, ADSS, C1orf100, C1orf101, DISC1, GAP43, ZBTB20 ve ZNF238 genlerinin korpus kallozum anomalileriyle ilişkili aday genler olabileceği ileri sürülmüştür. ZNF238 geni nöronal proliferasyonda, göçte ve gelişmekte olan serebral korteksin farklılaşmasında dikkate değer bir rol oynamaktadır. Bu çalışmada 61 hastada ZNF238 geninin tüm ekzonları PCR ile çoğaltılarak DNA dizi analizleri gerçekleştirildi. 18 hastada daha önceden tanımlanmış dört SNP, bir hastada 3'UTR bölgesinde daha önce tanımlanmamış bir nükleotid değişikliği saptandı. Bu değişikliklerin ZNF238 proteini üzerinde yapısal ve fonksiyonel anlamda önemli olduğu düşünülmektedir. Protein düzeyinde yapılacak çalışmalarla bu olgunun desteklenmesi gerekmektedir.

Abstract:
The corpus callosum is a structure composed of neuronal networks which connects the right and left hemispheres of the cerebrum. It plays a role in the transmission of sensory, motor and cognitive information between these two hemispheres. Changes in the structure of the corpus callosum are often indicated with psychiatric and developmental disorders. Its prevalence changes in the range of 0.3-0.7% in the population. Dysplasia of the corpus callosum can be isolated or can also be observed with many genetic abnormalities, metabolic disorders and infection. The most common clinical features are mental retardation with epileptic seizures, speech delay, vision and feeding problems. Corpus callosum abnormalities may occur as a result of many environmental and genetic factors. The studies continues on genes that lead to dysplasia of the corpus callosum and are not associated with any syndrome. As a result of the studies, AKT3, CEP170, SDCCAG8, ADSS, C1orf100, C1orf101, DISC1, GAP43, ZBTB20 and ZNF238 genes are candidate genes which are associated with abnormalities of the corpus callosum. ZNF238 gene plays a significant role in neuronal proliferation, migration and differantiation in the developing cerebral cortex. In this study involving 61 patients, all exons of ZNF238 genes were amplified by PCR (Polymerase Chain Reaction) and then were performed DNA sequence analysis. Four SNPs, which are previously identified, were detected in 18 patients and also a nucleotid changes at 3'UTR region which is previously nondefined, was found in one patient. These changes on ZNF238 protein is thought to be structurally and functionally significant. It must be supported by studies about the protein level.