Biberlerde kök ve kökboğazı yanıklığı etmeni Phytophthora capsici'ye karşı bazı biyokontrol ajanların etkinliklerinin belirlenmesi
Determination of the efficacy of some biocontrol agents against  Phytophthora capsici, the causal agent of root and crown rot in peppers
Yazar: SEDA ÇALIKOĞLU
Danışman: DOÇ. DR. MÜRSEL ÇATAL
Akdeniz Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Bitki Koruma Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2022
Konu: Ziraat = Agriculture
Dizin: Biber = Pepper ; Kök = Root ; Kök boğazı çürüklüğü = Root crown rot

Özet:
Ülkemizde biber üretim alanlarında Phytophthora capsici'nin sebep olduğu kök ve kökboğazı yanıklık veya çürüklük hastalığı üretimde kalite, verim ve ekonomik kayıplara sebep olmaktadır. Biberlerde oldukça ciddi olan bu hastalığın kimyasal fungisit kullanarak kontrolü oldukça zor hatta imkânsız ve çevre sağlığına zararlıdır. Bu çalışmada Antalya bölgesinden toplanan toprak ve bitki köklerinden elde edilen ve tanımlanması yapılan 12 adet farklı bakteri türüne ait antagonist özellik gösteren izolatların Phytophthora capsici'ye karşı engelleyici yada baskılayıcı etkileri laboratuvar (in vitro) ve iklim odası saksı (in vivo) çalışmalarında belirlenmiştir. 
Çalışmada Bacillus toyonensis, Enterobacter cloacae, Pseudomonas chlororaphis, Alcaligenes faecalis, Bacillus thuringiensis, Citrobacter freundii, Serratia fonticola, Achromobacter xylosoxidans, Bacillus cereus, Pseudomonas koreensis, Bacillus mojavensis, Lelliottia amnigena bakterilerinin 3 farklı dozları etmene karşı denenmiştir. İki farklı yöntem kullanılarak yapılan laboratuvar denemelerinde P. chlororaphis, C. freundii ve B. thuringiensis izolatları P. capsici'ye karşı %70 oranının üzerinde engelleme sağlamıştır. Kontrollü şartlarda yapılan saksı denemelerinde ise P.chlororaphis, A. faecalis, S. fonticola, L. amnigena, B. thuringiensis, C. freundii, B.cereus ve B.toyonensis izolatları %75 oranının üzerinde etkili bulunmuştur. 
Sonuç olarak; laboratuvar ve saksı denemelerinde en etkili bulunan bakteri izolatlarının biber yetiştiriciliğinde P. capsici'nin kontrolünde biyokontrol ajanı olarak kullanılabilme potansiyellerinin oldukça yüksek olduğu belirlenmiştir. Bu bakteri izolatları Phytophthora yanıklık hastalığı ile mücadelede etkili ve fungisitlere alternatif seçenek olabilir.

Abstract:
Root and crown rot or Phytophthora blight disease caused by P. capsici causes significant quality, yield and economic losses in pepper production areas of the country. It is hard or impossible to control this highly serious disease by using conventional fungicides. In this study, 12 different bacterial isolates belonging to different species were isolated from the soil and plants from Antalya region controlled and identified. The inhibitory and suppressive effects of these possible antagonistic bacterial isolates to P. capsici were determined in laboratory (in vitro) and in a climate chamber (in vivo) studies were determined.
In the study, 3 different doses of Bacillus toyonensis, Enterobacter cloacae, Pseudomonas chlororaphis, Alcaligenes faecalis, Bacillus thuringiensis, Citrobacter freundii, Serratia fonticola, Achromobacter xylosoxidans, Bacillus cereus, Pseudomonas koreensis, Bacillus mojavensis, Lelliottia amnigena isolates were tested against the pathogen. In the laboratory assays conducted by using 2 different methods, the isolates of P. chlororaphis, C. freundii ve B. thuringiensis were found to be up to 70 % effective against P. capsici. In the growth chamber pot trials, the isolates of P.chlororaphis, A. faecalis, S. fonticola, L. amnigena, B. thuringiensis, C. freundii, B.cereus ve B.toyonensis were determined to be over 75 % effective to the pathogen.  
As a result,  the bacterial isolates determined as possible antagonistic in both the laboratory and growth chamber assays in the study have high potential to be used as biocontrol agents against P.capsici in pepper production. These bacteria may be a efficient tools alternative to fungicides to control Phytophthora blight in pepper production.