Küçük hücreli akciğer kanseri hücre dizilerinde fibulin-3'ünepitelyal mezenkimal geçiş ve kanser kök hücre fenotipi üzerine etkisinin araştırılması
The effects of fibulin-3 on epithelial mesenchimal transition andcancer stem cell phenotype in small cell lung cancer cells
Yazar: EGE RIZA KARAGÜR
Danışman: PROF. DR. HAKAN AKÇA
Pamukkale Üniversitesi / Sağlık Bilimleri Enstitüsü / Tıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
Derece: Doktora, 2020
Konu: Tıbbi Biyoloji = Medical Biology
Dizin: Akciğer hastalıkları = Lung diseases ; Akciğer neoplazmları = Lung neoplasms ; Fenotip = Phenotype ; Fibulin 3 = Fibulin 3 ; Hücre dizisi = Cell line ; Karsinoma = Carcinoma ; Karsinoma-küçük hücreli olmayan-akciğer = Carcinoma-non small cell-lung ; Kök hücreler = Stem cells ; Neoplazm kök hücreleri = Neoplastic stem cells

Özet:
Küçük hücreli akciğer kanseri (KHAK) yüksek ölüm oranı, erkan metastaz ve
proliferasyon hızıyla agresif fenotiple karakterizedir. İnvazyonda ve metastazda başlatıcı
bir rolü olan epitelden mezenkimale geçiş (EMT) halihazırda aydınlatılmamış
belirsizliklere sahiptir. Fibulin-3 ekstraselüler matriksin yapısında ve stabilizasyonuna
dahil olmaları nedeniyle, fibulinler doku organogenezi, vaskülojenez, fibrojenez ve tümör
oluşumunda rol oynar. Biz bu çalışmada KHAK'lerinde Fibulin-3'in, EMT ve EMT ile
yakından ilişkili kök hücre fenotipi için düzenleyici bir rolünün olup olmadığını moleküler
mekanizmalarıyla tespit etmeyi amaçladık. Fibulin-3 ekspresyon vektörü kullanılarak
Fibulin-3 ifadesi düşük N417 hücre dizilerinde ve Fibulin-3 ekspresyon seviyesi yüksek
H82 hücre dizilerinde shRNA C infeksiyonuyla Fibulin-3 baskılanarak Fibulin-3'ün hücre
proliferasyonu, EMT, kök hücre fenotipi üzerine etkisi qPCR, Western Blot, mikroarray
analizleri ve biyoenformatik çalışmalarla araştırıldı.
Çalışmada Fibulin-3'ün hücre proliferasyonunu baskıladığını ve KHAK hücrelerinde
EMT sürecinde mezenkimal belirteçleri ve EMT transkripsiyon faktörlerini baskılayarak
KHAK hücre dizilerinde kök hücre fenotipinde rol oynayan belirteçleri baskıladığını
gösterdik. Ayrıca kök hücre fenotipinde rol oynayan belirteçlerin downrugülasyonuyla
KHAK'inin agresifliğini düşürdüğünü gösterdik.

Abstract:
Small cell lung cancer (SCLC) is characterized by an aggressive phenotype with
a high mortality rate, early metastasis, and proliferation rate. The mesenchymal transition
through the epithelium (EMT), which is an initiating factor in invasion and metastasis,
has currently unclear. Fibulins are involved in tissue organogenesis, vasculogenesis,
fibrogenesis and formation, including the structure and stabilization of the fibulin-3
extracellular matrix. We aimed to determine with its molecular mechanisms that Fibulin-
3 does not have a regulatory role for the cell stem phenotype closely related to EMT and
EMT in these SCLCs. The effect of Fibulin-3 expression vector on Fibulin-3 proliferation,
EMT, cell phenotype by suppressing Fibulin-3 by shRNA C infection in N417 cell lines
with low expression of Fibulin-3 and H82 cell lines with high Fibulin-3 expression level
qPCR, Western Blot, microarray analysis and bioinformatics studies.
In the study, we showed that Fibulin-3 does not suppress cell proliferation and
does not suppress post-EMT mesenchymal markers and EMT transcription in SCLC
cells, and not markers that play a role in stem cell phenotype in SCLC sequences. We
have also shown that downregulation of markers that play a role in the stem cell
phenotype reduces the aggressivity of SCLC.