Streptomyces suşlarında farklı genetik manipülasyonların antibiyotik ve enzim üretimi yönünden başarı düzeyinin araştırılması
Investigation of success level of genetic manipulations on antibiotic and enzyme production of streptomyces strains
Yazar: FATMA ESEN SARIGÜLLÜ
Danışman: PROF. DR. ÖMER ÇOLAK
Çukurova Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Biyoloji Ana Bilim Dalı
Derece: Doktora, 2013
Konu: Biyoloji = Biology ; Mikrobiyoloji = Microbiology
Dizin: Antimikrobiyal ajanlar = Antimicrobial agents ; Enzim üretimi = Enzyme production ; Genetik transformasyon = Genetic transformation

Özet:
Çukurova Üniversitesi'nin 5 farklı bölgesinden alınan toprak örneklerinden 
toprakta yaygın olarak bulunan 14 Streptomyces suşu izole edildi. Bu suşlardan S35, 
S47, S48, S50'nin Staphylococcus aureus, Bacillus subtillis ve Pseudomonas 
aeruginosa test organizmalarına karşı antibakteriyal aktivite gösterdiği tespit 
edilmiştir. Bu suşların antibakteriyal etkinliği üç farklı besi ortamında 
değerlendirilmiş ve farklı besin ortamlarının Streptomyces suşlarının antibiyotik 
üretme yeteneğini artırabileceği ya da azaltabileceğini tespit edilmiştir. Diğer bir 
araştırmamızda antibiyotik üretim özelliğinin plazmidle taşındığı belirlendi. S47 ve 
S48 izolatlarından izole edilen plazmidler elektroporasyon yöntemiyle antibiyotik 
üretmeyen S40 suşuna aktarılma çalışması yapıldı. Rejenerasyon besiyerinden 
seçilen 250 suş içinden 37 sinin antibiyotik üretim özelliği kazandığı fakat bu 
suşlardan 9'unun bu özelliği koruduğu bulunmuştur. Diğer bir araştırmamızda da 
S40, S47, S48 suşlarının 7 gün sonundaki ksilanaz aktivitesi sırasıyla 50,92 U/mL, 
49,51 U/mL, 47,79 U/mL tespit edilmiştir. Yüksek ksilanaz aktivitesi gösteren bu 
suşlar arasında gerçekleştirilen protoplast füzyon çalışması sonucu farklı koloni 
morfolojsi gösteren 9 suş seçilmiştir. (40-48)R2 ve (47-48)R3 suşlarının ksilanaz 
aktivitesi ebeveyn suşlara göre sırasıyla %25,9 ve % 31,9 oranında arttığı tespit 
edilmiştir. Protoplast füzyon tekniğiyle enzim aktivitesinin geliştirilebileceği 
gösterilmiştir.

Abstract:
Soil samples were collected from five different areas of University of 
Çukurova and 14 different Streptomyces strains were isolated. S35, S47, S48 and S50 
of these strains were found to be have an antibacterial activity against test organisms 
which are Staphylococcus aureus, Bacillus subtillis and Pseudomonas aeruginosa. 
The antibacterial activity of these three strains were tested at three different medium 
and these results indicated that different mediums can increase or decrease the ability 
of antibiotic production of Streptomyces strains. In other research indicated that, the 
antibiotic production activity is found to be related with having plasmids. The 
plasmids that isolated from S47 and S48 strains, were transferred to S40 strain which 
has not antibacterial activity, by electroporation method. 37 of 250 strains that 
selected from regeneration medium, became having antibiotic production activity, 
but only 9 of these strains protected this property. In other research, the xylanase 
activity (at the end of the seventh day) of S40, S47 and S48 strains were found as 
50,92U/mL, 49,51U/mL and 47,79U/mL respectively. After doing the protoplast 
fusion among these strains which have the highest xylanase activity, 9 strains which 
have different colony morphologies, were selected. The xylanase activity of (40-48) 
R2 and (47-48) R3 strains were increased in comparison with their parents, by 25,9% 
and 31,9% respectively. This study also indicated that the enzyme activity can be 
improved by protoplast fusion technique