İnsanda antibiyotik dirençli idrar yolu enfeksiyonu olan hastalardan izole edilen bakteri türleri
Species of bacteria isolated from patients with antibiotic-resistant urinary tract infection in human
Yazar: SUHAD SUBHI WAZIR AL-AZZAWI
Danışman: DOÇ. DR. MEHMET SEZGİN
Çankırı Karatekin Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Biyoloji Ana Bilim Dalı / Biyoloji Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2023
Konu: Biyoloji = Biology

Özet:
Bu çalışmanın amacı, insan vücudunda dağılım gösteren ve idrar yolu enfeksiyonu (İYE) hastalığına neden olan yaygın bakteri türlerini taramaktır. Irak'ın Bağdat kentindeki iki hastaneden 2020-2021 yılları arasında toplam 140 İYE vakası toplanmıştır. Son zamanlarda İYE'yi tedavi etmek için kullanılan yirmi antibiyotik, insan İYE hastalığında dağılım gösteren yedi yaygın bakteri türü tarafından direnç açısından test edilmiştir. Çoklu ilaç direnci (MDR) testi, 7 bakteri türünden hangisinin 21 antibiyotiğe direnç gösterebileceğini tahmin etmek için uygulanmıştır. Antibiyotiklere karşı bakteri direncinin nedenini keşfetmek için biyofilm oluşumu yapılmıştır. Escherichia coli, Klebsiella pneumoniae, Pseudomonades aeruginosa, Proteus mirabilis, Serratia marcescens, Staphylococcus saprophyticus ve Staphylococcus aureus olmak üzere yedi bakteri türünün insanlarda İYE'ye neden olan yaygın bakteri türleri olduğu bulunmuştur. Kadınların erkeklere kıyasla İYE enfeksiyonuna daha yatkın olduğu tespit edilmiştir. İYE enfeksiyonu olan kadın ve erkekler arasında anlamlı farklılıklar kaydedilmiştir (p<0.05). En yüksek yaş 70.75±0.95 ile Staphylococcus aureus ile enfekte iken, en düşük yaş 20.83±2.32 ile E. coli ile enfekte olarak bulunmuştur. Bu çalışmada en yüksek direnç oranları Clindamycin ve Cephalexin'e (%100), Cefepime, Imipenem, Amikacin, Gentamicin, Ciprofloxacin ve Tigecycline'e (%97,5) karşı gözlenmiştir. Öte yandan, en düşük direnç oranı Linezolid (%10), Teikoplanin (%12,5) ve Ampisilin (%20) için tespit edilmiştir.  Escherichia coli ve Proteus mirabilis bakterilerinin 17 izolatında çoklu ilaç direnci MDR tespit edilirken, diğer bakteri türleri 5'ten az antibiyotiğe dirençli olarak tespit edilmiştir. Biyofilm oluşumu, izole edilen bakterilerin %75'inin güçlü biyofilm oluşumuna sahip olduğunu, %17,5'inin ise orta düzeyde biyofilm oluşumuna sahip olduğunu göstermiştir. İYE hastalarında yaygın olarak görülen dirençli bakteri türlerini tedavi etmek için yeni antibiyotiklerin üretilmesi gerekmektedir.

Abstract:
The aim of this study screening the common types of bacteria distributed in human body causing urinary tract infection (UTI) disease. A total of 140 cases of UTI were collected from two hospitals in Baghdad, Iraq through the years 2020-2021. Twenty on antibiotics that used to tear UTI recently were tested for resistance by the seven common types of bacteria distributed in human UTI disease. Multi drug resistance (MDR) test was applied to estimate which of the 7 types of bacteria able to resistance the 21 antibiotics. Biofilm formation was done to discover the cause of bacteria resistance to the antibiotics. Seven types of bacteria include Escherichia coli, Klebsiella pneumoniae, Pseudomonades aeruginosa, Proteus mirabilis, Serratia marcescens, Staphylococcus  saprophyticus ve Staphylococcus  aureus were found to be the common types of bacteria causing UTI in human. The study was found that females were found to be more suitable to UTI infection than the males. Significant differences were recorded between males and females with UTI infection (p<0.05). The highest age found to be infected with Staphylococcus aureus as 70.75±0.95 while the lowest age found to be infected with E. coli as 20.83 ± 2.32 with significant differences. The highest resistance rates were observed to Clindamycin and Cephalexin as (100%), Cefepime, Imipenem, Amikacin, Gentamicin, Ciprofloxacin, and Tigecycline as (97.5%). On the other hand, the lowest resistance rate was detected for Linezolid (10%), Teicoplanin (12.5%), and Ampicillin (20%). Multidrug resistance MDR was detected in 17 isolates of E. coli and Proteus mirabilis bacteria, while other types of bacteria were detected as resistance to less than 5 antibiotics. Biofilm formation showed 75% of isolated bacteria were strong biofilm formation while 17.5% of them were moderate with biofilm formation. New antibiotic needs to produce to treat the resistance common types of bacteria distributed in UTI patients.