Salmonella serotiplerinde plazmit profillerinin araştırılması
Plasmid profile analysis of salmonella serotypes
Yazar: MEHSETİ BAYRAMOVA
Danışman: PROF.DR. BİRSEL ERDEM
Ankara Üniversitesi / Sağlık Bilimleri Enstitüsü / Mikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
Derece: Doktora, 2007
Konu: Mikrobiyoloji = Microbiology

Özet:
Salmonella infeksiyonları dünyada hala yaygın ve önemli saglık problemi olarakgörülmektedir. Salmonella serotiplerinin incelendigi arastırmalarda kökenleri tiplendirmek içinkullanılan yöntemlerden birisi plazmit profil analizidir. Bu yöntem her bir kökenin tasıdıgıplazmit sayısını ve bu plazmitlerin büyüklüklerini belirlemeye yönelik bir yöntemdir.Bu çalısmada, Türkiye'de soyutlanmıs olan Salmonella enterica kökenlerinin plazmitprofillerinin belirlenmesi ve her bir Salmonella enterica serotipindeki (Salmonella enterica ser.Paratyphi B, Salmonella enterica ser. Typhimurium, Salmonella enterica ser. Choleraesuis,Salmonella enterica ser. Hadar, Salmonella enterica ser. Typhi ve Salmonella enterica ser.Enteritidis) profillerin birbiriyle karsılastırılması amaçlanmıstır.Çalısmada, çesitli klinik örneklerden izole edilen 220 Salmonella kökeninin plazmitprofilleri, Kado ve Liu tarafından tanımlanan yöntemde küçük degisiklikler yapılarakincelenmistir.ncelenen Salmonella kökenlerinin 165'nin (%75) farklı büyüklükte (1,0-180 kbç) vedegisik sayıda plazmit bulundurdugu belirlenmistir. Plazmit profil analizi sonucundaS.Paratyphi B kökenlerinde dokuz, S.Typhimurium kökenlerinde yirmi iki, S.Enteritidiskökenlerinde yirmi dokuz, S.Choleraesuis, S.Hadar ve S.Typhi kökenlerinde ise üç farklıplazmit profilleri belirlenmistir. S.Typhimurium kökenlerinde 90 kbç büyüklügünde plazmitinve S.Enteritidis kökenlerinde ise 57 kbç büyüklügünde plazmitin en sık görülen plazmitoldugu belirlenmistir.Plazmit profil analizi ile Salmonella serotiplerinin içerdikleri plazmitlerin serotipdenserotipe farklılık gösterdigi anlasılmıstır.Plazmit profil analizinin Salmonella serotiplerinin kökenlerini alt tiplere ayırmak içinkolay ve yararlı bir yöntem oldugu kanısına varılmıstır.Anahtar Sözcükler: Plazmit profil analizi, Salmonella Paratyphi B, Salmonella Typhimurium,Salmonella Choleraesuis, Salmonella Hadar, Salmonella Typhi, Salmonella Enteritidis

Abstract:
The Salmonella infections are still seen as the most common and important health problemall around the world. In researches of Salmonella serotypes, one of the methods of straintyping is plasmid profile analysis. This method determines the numbers and molecular weightof plasmids in each strains.The aim of this study is to determine the plasmid profiles of Salmonella enterica strainsisolated in Turkey and to compare the profiles of each Salmonella enterica serotype(Salmonella enterica ser. Paratyphi B, Salmonella enterica ser. Typhimurium, Salmonellaenterica ser. Choleraesuis, Salmonella enterica ser. Hadar, Salmonella enterica ser. Typhive Salmonella enterica ser. Enteritidis).In the study, the plasmid profiles of 220 Salmonella strains isolated from various clinicalsamples have been analyzed by the method of Kado and Liu with minor modifications.It has been observed that 165 Salmonella strains (75%) have different sizes (1,0-180 kbp)and numbers of plasmid. As a consequence of plasmid profile analysis, nine plasmid profilesin S.Paratyphi B strains, twenty two plasmid profiles in S.Typhimurium strains, twenty nineplasmid profiles in S.Enteritidis strains and three different plasmid profiles in S.Choleraesuis,in S.Hadar and in S.Typhi strains were detected. It has been observed that theS.Typhimurium strains have 90 kbp plasmid and S.Enteritidis have 57 kbp in common.It has been found that the plasmids contained in Salmonella serotypes differ from serotype toserotype.It is believed that the plasmid profile analysis is an easy and beneficial method to separatethe strains of Salmonella serotypes into sub-types.Keywords: Plasmid profile analysis, Salmonella Paratyphi B, Salmonella Typhimurium,Salmonella Choleraesuis, Salmonella Hadar, Salmonella Typhi, Salmonella Enteritidis