hakansabunis/tr-academic-research-agent-index huggingface dataset:
Lantana camara L. bitkisinin olgunlaşmamış meyvelerinin ikincilmetabolitlerinin araştırılması ve biyolojik özelliklerinin incelenmesi
Determination of secondary metabolites of unripe fruits of Lantana camara L. plant and investigating in vitro biological properties
Yazar: HİLAL KAVUZ
Danışman: PROF. DR. YURDANUR AKGÜL
Ege Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Kimya Ana Bilim Dalı / Organik Kimya Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2023
Konu: Kimya = Chemistry
Dizin: Antioksidan aktivite = Antioxidant activity ; Verbenaceae = Verbenaceae

Özet:
Bu çalışmada Lantana camara L. bitkisinin olgunlaşmamış meyvelerinin ana bileşenlerinin izole edilmesi ve spektroskopik yöntemlerle aydınlatılması amaçlanmıştır. Sırasıyla olgunlaşmamış meyvelerden metanol, heksan, diklorometan, bütanol ekstraktları elde edilmiştir. İTK kontrolleri sonrasında metanol ve su ekstreleri üzerinde izolasyon ve saflandırma işlemleri kromatografik yöntemler kullanılarak gerçekleştirildi. Çalışmalarımız sonucunda 5 ana bileşik izole edildi. İzole edilen bileşiklerin molekül yapıları spektroskopik yöntemler (1H-NMR, 13C-NMR, HSQC, COSY) ve literatür verileri kullanılarak tanımlanmıştır.
Bileşik 1 (Theveside) saf elde edilirken bileşik 2 α-glikoz, β-glikoz, α-fruktoz, β-fruktoz ve  ketoz karışımı olarak izole edildi. Bileşik 4, alfa galaktoz, bileşik 5 ise alfa -beta galaktoz olduğu tespit edildi. (%33.66 ve  %66.33) Bileşik 3'ün yapı aydınlatma çalışmaları maddi yetersizlikler nedeni ile tamamlanamadı.
Bitkinin metanol ekstresinin antimikrobiyal ve antioksidant aktiviteleri EGEMATAL üzerinden hizmet alımı ile gerçekleştirildi. Metanol ekstresi DPPH yöntemine göre en yüksek aktivitenin (%88.85) 2000µg/mL konsantrasyondaki ekstrakta, en düşük aktivitenin (%2.96) 50µg/mL konsantrasyonda hazırlanan  ekstrakta olduğu görülmüştür.

Abstract:
In this study, it was aimed to isolate the major components of the unripe fruits of the Lantana camara L. plant and to elucidate by spectroscopic methods. Methanol, hexane, dichloromethane, butanol extracts of unripe fruits were obtained sequentially. After TLC controls, isolation and purification processes on methanol and water extracts were performed using chromatographic methods. As a result of our studies, 5 main compounds were isolated. The molecular structures of the isolated compounds were defined using spectroscopic methods (1H-NMR, 13C-NMR, HSQC, COSY) and literature data.
Compound 1 (Theveside) was obtained pure, while compound 2 was isolated as a mixture of α-glucose, β-glucose, α-fructose, β-fructose and ketose. Compound 4 was determined to be alpha galactose, and compound 5 was found to be alpha-beta galactose. (33.66% ve  66.33%)  Building lighting works of Compounds 3 could not be completed due to financial insufficiencies.
Antimicrobial and antioxidant activities of the methanol extract of the plant were carried out by purchasing service from EGEMATAL. According to the methanol extract DPPH method, it was observed that the highest activity (88.85%) was in the extract at 2000µg/mL concentration, and the lowest activity (2.96%) was in the extract prepared at 50µg/mL concentration.
Atıksudan krom giderimi için maya hücrelerinin kullanılması
Use of yeast cells for chromium removal from wastewater
Yazar: BATIN EGE ARSAL
Danışman: PROF. DR. HÜSNİYE TANSEL YALÇIN
Ege Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Çevre Bilimleri Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2023
Konu: Mikrobiyoloji = Microbiology ; Çevre Mühendisliği = Environmental Engineering
Dizin: Ağır metal kirliliği = Heavy metal pollution ; Metal nanopartiküller = Metal nanoparticles

Özet:
Bu tez çalışması kapsamında daha önce izolasyonu yapılmış maya izolatları kullanılmıştır. Bu izolatlar içerisinde en çok manyetitit nanotaneciğin bağlandığı izoalat seçilmiş ve bu izolatın moleküler tanılanması sonucunda Yarrowia lipolytica olduğu belirlenmiştir. Y. lipolytica TEM YLB suşu ile atıksudan krom giderimi incelenmiştir. Y. lipolytica TEM YLB hücrelerinin yüzeylerine demir oksit bazlı manyetit nanotanecikler tutturulmuş ve taramalı elektron mikroskobunda gösterilmiştir. Manyetit nanotaneciklerinin bağlanması için optimum şartlar, pH 5.5 asetat tamponunda, 0.001 ppm manyetit miktarı ve kaynama süresi 2 dakika olduğunda gerçekleşmiştir. Hazırlanan potasyum dikromat içeren suni atık su numunesinde optimum parametrelere göre hazırlanan modifiyeli maya hücrelerinin kromu %87.2 oranında giderdiği bulunmuştur. Bitkisel kaynaklı nanotanecikler ile modifiyeli maya hücrelerinde yapılan çalışmalarda ise en yüksek krom giderim oranı %94.08 olarak bulunmuştur.

Abstract:
In this thesis, previously isolated yeast isolates were used. Among these isolates, the isolate with the most magnetite nanoparticles was selected, and as a result of molecular identification of this isolate, it was determined to be Yarrowia lipolytica. Chromium removal from wastewater was investigated by Y. lipolytica TEM YLB strain. Iron oxide-based magnetite nanoparticles were attached to the surfaces of Y. lipolytica TEM YLB cells and demonstrated in scanning electron microscopy. Optimum conditions for binding of magnetite nanoparticles were realized in pH 5.5 acetate buffer, 0.001 ppm magnetite content and boiling time of 2 minutes. The chromium of the modified yeast cells prepared according to the optimum parameters in the artificial wastewater sample containing potassium dichromate was 87%. It was found that it resolved by 2 percent. In studies conducted with plant-derived nanoparticles and modified yeast cells, the highest chromium removal rate was found to be 94.08%.
Metamalzeme tabanlı akustik enerji hasatlayıcı geliştirilmesi
Development of a metamaterial based acoustic energy harvester
Yazar: ÇAĞRIHAN ÇELEBİ
Danışman: DR. ÖĞR. ÜYESİ BARIŞ OĞUZ GÜRSES
Ege Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Makine Mühendisliği Ana Bilim Dalı / Makine Mühendisliği Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2023
Konu: Makine Mühendisliği = Mechanical Engineering

Özet:
Akustik metamalzemeler, akustik dalgaları yönlendirme ve manipüle etme konusunda sıradışı özellikleri olan yapay malzemelerdir. Lokal rezonans akustik metamalzeme, ince bir levha üzerinde kütle-yay şeklinde periyodik olarak dizilmiş bir dizi rezonatörden oluşmaktadır. Akustik metamalzeme üzerinde oluşturulan kusur durumu akustik ve elastik dalgaların sahip olduğu enerjiyi hapsetmek ve hasatlamak için kullanılabilir. Akustik metamalzemenin kusur modunda sahip olduğu enerjiyi hasatlama özelliği dışında yüksek bir ses yalıtım özelliği de bulunmaktadır. Bu tez çalışmasında, akustik metamalzemenin kusur noktasındaki gerinim enerjisi bir piezoelektrik materyal ile hasatlanmıştır. Hasatlama performansı farklı rezonatör yarıçapları için incelenmiştir. Her bir rezonatör yarıçapı için akustik metamalzemenin ses iletim kaybı, maksimum çıkış voltajı ve maksimum çıkış gücü sayısal olarak incelenmiştir. Tez çalışmasının içeriğine uygun olarak iki boyutlu fononik kristallerin iletim kaybı ve kusur modu özellikleri de sayısal olarak incelenmiştir. Elde edilen sonuçlar literatürdeki sonuçlarla karşılaştırılmış ve aralarında iyi bir korelasyon olduğu görülmüştür.

Abstract:
Acoustic metamaterials are artificial materials with unusual properties for guiding and manipulating acoustic waves. A local resonance acoustic metamaterial consists of an array of resonators arranged periodically in a mass-spring pattern on a thin plate. The defect state created in the acoustic metamaterial can be used to trap and harvest the energy of acoustic and elastic waves. The acoustic metamaterial has a high sound insulation property in addition to its ability to harvest energy in defect mode. In this thesis, the strain energy at the defect point of the acoustic metamaterial was harvested with a piezoelectric material. The harvesting performance is investigated for different resonator radii. For each resonator radius, the sound transmission loss, maximum output voltage, and maximum output power of the acoustic metamaterial are numerically analyzed. In accordance with the content of the thesis work, the transmission loss and defect mode properties of two- dimensional phononic crystals have also been numerically investigated. The results were compared with those in the literature and found that there is a good correlation between them.
Rotorlu yağlı tip bir vakum pompası için makine öğrenimi algoritması kullanan IoT destekli kestirimci bakım uygulaması geliştirilmesi
Developing an IoT supported predictive maintenance application using machine learning algorithm for a rotor oily vacuum pump
Yazar: EYÜP YILDIRIM
Danışman: DR. ÖĞR. ÜYESİ MUSTAFA ENGİN
Ege Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Mekatronik Mühendisliği Ana Bilim Dalı / Mekatronik Mühendisliği Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2023
Konu: Mekatronik Mühendisliği = Mechatronics Engineering

Özet:
Bu tezde vakum pompası mekanizması incelenmiş ve çalışma performansını etkileyen parametreler belirlenmiştir. Bu parametrelerden toplanan veriler ile makine öğrenme modeli oluşturulmuş, IoT destekli kestirimci bakım uygulaması yapılmıştır. Kestirimci bakım uygulaması sayesinde, pompa vakum performansının azalması engellenmiş ve tam zamanında bakım yapılarak küçük arızalar büyümeden giderilip, bakım maliyetleri azaltılmıştır.
Vakum pompasının çalışma performansını etkileyen parametreler titreşim, basınç, akım, sıcaklık ve nem değerleridir. Pompanın sağlıklı çalışma durumundan arıza yapana kadar ki periyotda sensörlerden toplanan verilerdeki değişimler incelenmiş ve arıza sebepleri ile ölçüm sonuçları gruplandırılmıştır. 
Makine öğrenmesi algoritması olarak k-NN en yakın komşular algoritması kullanılmıştır. Gruplandırılmış veriler algoritmada öğretici ve test verileri olarak kullanılmıştır. Pompadan toplanan veriler makine öğrenme algoritmasında işlenip pompanın durumu izlenmiş, meydana gelebilecek muhtemel arıza ve çözümleri için kullanıcıya bilgi gönderilmiştir.

Abstract:
In this thesis, the vacuum pump mechanism was examined and the parameters affecting the working performance were determined. A machine learning model was created with the data collected from these parameters. Then and IoT supported predictive maintanence application, the decrease in the vacuum performance of the pump has been prevented. By performing just in time maintenance minor faults are eliminated before they grow and maintenance cost reduced.
The parameters affecting the working performance of the vacuum pump are vibration, pressure, current, heat and humidity. Data were collected with sensors in the periods from the healty working conditions of the pump to the failure of the pump. The changes in the data were examined and the reasons for the failures and the measurement results were grouped.
The k-NN nearest neighbors algorithm was used as the machine learning algorithm. Grouped data were used as tutorial data in the algorithm. The data collected from the pump was processed in the machine learning algorithm and the pump status was monitored. An e-mail sent to user for malfunctions and solitions.
Mobil kenar bilişim platformlarında kaynak modelleme ve çizelgeleme için fırsatlardan faydalanma
Exploiting opportunities for resource modeling and scheduling in mobile edge computing platforms
Yazar: ÖNEM YILDIZ
Danışman: PROF. DR. RADOSVETA İVANOVA SOKULLU
Ege Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Elektrik-Elektronik Mühendisliği Ana Bilim Dalı
Derece: Doktora, 2023
Konu: Elektrik ve Elektronik Mühendisliği = Electrical and Electronics Engineering

Özet:
Bu tez çalışmasında, farklı türde uygulama kullanıcıları için minimum gecikme talepleri göz önüne alındığında, mevcut ağ yapısının bu talepleri karşılaması sorunu için optimum çözümünün nasıl yapılacağı incelenmiştir.
Tez kapsamında, katmanlı bir ağ tasarımını ele almaktadır. Bu tasarım, ölçeklenebilir bir hücresiz ağın Mobil Kenar Bilişim (MEC) teknolojisiyle entegre edilerek 5G teknolojisini desteklemektedir. Hücresiz ağdaki kullanıcı taleplerinin MEC ağına erişimi ve MEC ağına iletilen taleplerin işlenmesi ve yönlendirilmesi süreçlerini birleştiren bir sistem tasarımı gerçekleştirilmiştir. Kullanıcıların talep ettikleri uygulama türlerini dikkate alan, kenar ağdaki sunucuların anlık yük miktarı ve yine kenar ağdaki sunucular arası bağlantı yoğunluğunu dikkate alan bir çözüm sunulması için çalışılmıştır. Bu bağlamda, derin öğrenme tabanlı bir hibrid algoritma tasarlanmıştır.
Hibrit algoritmanın tasarlanan sisteme uygulanmasıyla, kenar ağ sunucularındaki hesaplama yükü ve backhaul bağlantılarının yükü dengelenmiştir ve kullanıcıların hizmet deneyimi iyileştirilmiştir. Ayrıca bu tasarım, cihaz yoğunluğunun yüksek olduğu sistemlerde, mevcut kaynakların öğrenme algoritmalarıyla akıllı bir şekilde yönetilmesine imkân sağlayacak ve ağdaki tüm kullanıcılar için iyileştirilmiş bir hizmet verilmesine yardımcı olacaktır.

Abstract:
This thesis investigates the optimal solution for addressing the challenge of meeting minimum latency requirements for users of different application types within the existing network infrastructure.
The scope of the thesis focuses on a layered network design that integrates a scalable cellular network with Mobile Edge Computing (MEC) technology to support 5G capabilities. A system design is implemented that combines the access of user requests from the cell-free network to the MEC network and the processing and routing of these requests within the MEC network. The solution takes into account the application types requested by users and considers the real-time workload of edge servers and the connectivity density between them. To achieve this, a hybrid algorithm based on deep learning is designed.
By applying the hybrid algorithm to the designed system, the computation workload of edge servers and the load on backhaul connections are balanced, resulting in an enhanced user experience. Furthermore, this design enables intelligent management of available resources using learning algorithms in high-density systems, leading to improved services for all users in the network.
3B In Vitro dinamik kan-beyin bariyeri modelinde epigenetik mekanizmaların incelenmesi
Investigation of epigenetic mechanisms in a 3D In Vitro dynamic blood-brain barrier model
Yazar: DİLARA LAL LAL
Danışman: DOÇ. DR. AYLİN ŞENDEMİR
Ege Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Biyomühendislik Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2023
Konu: Biyomühendislik = Bioengineering

Özet:
Kan-beyin bariyeri (KBB), merkezi sinir sisteminde kan ve beyin arasındaki dengeyi korumak için hayati bir yapıdır. Biyomolekül değişimi, iyon dengesi, besin dağıtımı ve toksik kontrollü molekül geçişi, KBB'nin normal işlevinden kaynaklanmaktadır. KBB'nin yapısı ve yapısındaki hücrelerin fonksiyonel davranışlarının incelenmesi hastalıkların anlaşılabilmesi için oldukça önemi araştırma alanını temsil eder. Bu nedenle, in vitro KBB modelleri, uygun tedaviler için araştırmayı kolaylaştırabilir. KBB'nin fizyolojik özellikleri in vitro tam olarak modellenememiştir. Dinamik kültür şartlarını sağlayarak kan damarı akışının simüle edilmesi için çip platformunun kullanılması planlanmıştır. Beyin kılcal damarlarının fizyolojik olarak maruz kaldığı kan akışını, kayma gerilimini modelleyebilmek amacıyla dinamik kültür koşulları sağlanmıştır. Mekanik etki uygulanmamış hücrelerden elde edilen sonuçlarla ve laminar akış uygulanan hücrelerden elde edilen sonuçlar incelenmiştir. Beyin mikrosvasküler endotel hücreleri üzerindeki mekanik uyaranların etkilerini inceleyebilmek amacıyla immünofloresans boyamalar ve epigenetik analizler gerçekleştirilmiştir. Mekanik uyarı altında KBB'de sıkı bağlantı proteinlerinin ekspresyonun artışı fizyolojik koşullara daha yakın KBB modelinin simüle edildiği bulunmuştur.

Abstract:
The blood-brain barrier (BBB) is a vital structure in the central nervous system to maintain the balance between blood and brain. Biomolecule exchange, ion balance, nutrient distribution and toxic controlled molecule migration are due to the normal function of the BBB. Examination of the structure of the BBB and the functional behavior of the cells in its structure represents a very important research area for the understanding of diseases. Therefore, in vitro BBB models can facilitate the search for suitable treatments. The physiological properties of BBB have not been fully modeled in vitro. It is planned to use the chip platform to simulate blood vessel flow by providing dynamic culture conditions. Dynamic culture conditions were provided in order to model the blood flow and shear stress to which the brain capillaries are physiologically exposed. The results obtained from cells without mechanical effect and the results obtained from cells with laminar flow were examined. In order to examine the effects of mechanical stimuli on brain microsvascular endothelial cells, immunofluorescence staining and epigenetic analyzes were performed. It was found that increased expression of tight junction proteins in BBB under mechanical stimulation simulated a BBB model closer to physiological conditions.
%7 Ni katkılı Mg tozlarının mekanik öğütme süresine bağlı olarak elektrik alan tekniği ile sinterlenmesi ve bazı mekanik özelliklerinin deneysel olarak incelenmesi
Sintering of Mg powders with %7 Ni addition using electric field technique depending on mechanical milling time and experimental investigation of some mechanical properties
Yazar: ERHAN ZENGİN
Danışman: PROF. DR. RASİM İPEK
Ege Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Makine Mühendisliği Ana Bilim Dalı / Makine Mühendisliği Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2023
Konu: Makine Mühendisliği = Mechanical Engineering
Dizin: Magnezyum = Magnesium ; Nikel = Nickel

Özet:
Bu tez kapsamında; deneysel parametreler Mg-Ni faz diyagramından yararlanılarak, katı halde olan saf magnezyum ve saf nikel tozlarının mekanik öğütme ve elektrik alan destekli sinterleme yöntemiyle, mikroyapı ve mekanik özelliklerinin deneysel araştırılması yapılmıştır. Deneyde %93 Mg tozu ve %7 Ni tozu 20, 40 ve 60 dakika mekanik öğütülmüştür. Mekanik öğütme işlemi sonrası Mg7Ni toz numuneleri 300 ve 350°C de elektrik alan yöntemiyle sinterlenmiş ve sırasıyla yüzey hazırlama, yoğunluk, XRD, SEM-EDS Haritalama, basma dayanımı ve sertlik değerleri ile ilgili bilgiler toplanmış ve analiz edilmiştir.
Ni, Mg tane ve partikülleri içerisinde büyük oranda çözünmediği, magnezyum partikülleri etrafında yer aldığı gözlenmiştir. Gözeneklilik Mg-Ni partikülleri etrafında oluştuğu, bu yapının özellikle Mg partiküllerinin oldukça iyi sinterlendiği, Ni katkılı yapının basma dayanımı yanında özellikle gevrek yerine sünek şekil değişimini arttırdığı tespit edilmiştir. Basma dayanımı ve süneklik artışı, iyi bağlanmış Mg partikülleri etrafında yer alan Ni kaynaklı olduğu düşünülmektedir.

Abstract:
Within the scope of this thesis; Experimental parameters: Using the Mg-Ni phase diagram, experimental investigation of the microstructure and mechanical properties of solid pure magnesium and pure nickel powders was carried out by mechanical grinding and electric field-assisted sintering method. 93% Mg powder and 7% Ni powder were milled mechanically for 20, 40 and 60 minutes. After the mechanical grinding process, Mg7Ni powder samples were sintered by the electric field method at 300 and 350°C, and information about surface preparation, density, XRD, SEM-EDS Mapping, compressive strength and hardness values were collected and analyzed, respectively.
It was observed that it was largely insoluble in Ni and Mg grains and particles and was located around magnesium particles. It has been determined that porosity occurs around Mg-Ni particles, that this structure, especially Mg particles, is sintered very well, and that the Ni-doped structure increases the compressive strength as well as the ductile deformation, especially instead of brittle. The increase in compressive strength and ductility is thought to be due to Ni located around well-bonded Mg particles.
Notobasis syriaca L. cass bitkisinin ikincil bileşenlerinin araştırılması
Investigation of secondary compounds of Notobasis syriaca L. cass
Yazar: EZGİ KESKİNOĞLU
Danışman: PROF. DR. YURDANUR AKGÜL
Ege Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Kimya Ana Bilim Dalı / Organik Kimya Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2023
Konu: Kimya = Chemistry
Dizin: Antimikrobiyal aktivite = Antimicrobial activity ; Antioksidan aktivite = Antioxidant activity ; Asteraceae = Asteraceae

Özet:
Bu çalışmada, Asteraceae familyasına ait Notobasis Syriaca L. cass bitkisinin toprak üstü kısmı üzerinde yapılan fitokimyasal çalışmalar sonucunda toplamda 5 bileşik çeşitli kromatografik yöntemler kullanılarak izole edildi. İzole edilen bileşiklerin yapıları 1H-NMR ve 13C-NMR spektroskopik yöntemleri, kimyasal türevlendirme ve literatür verileri (SCI-Finder veri tabanı) kullanılarak aydınlatıldı.
Deneysel çalışmalarımız sonucunda sakkaroz (1) saf elde edilirken, bileşik 3: α-D-fruktoz, β-D-glikoz, α-D-glikoz karışımı olarak izole edildi. Bileşik 2,4 ve 5'in yapıları aydınlatılamadı.
Bitkinin MeOH ekstresinin antimikrobiyal ve antioksidant aktiviteleri EGEMATAL üzerinden gerçekleştirildi. MeOH ekstresi DPPH yöntemine göre 84,1 µmol AAE/g en yüksek aktiviteyi gösterirken, 3,2 µmol AAE/g ile en düşük aktiviteyi gösterdiği saptanmıştır.

Abstract:
In this study, as a result of phytochemical studies on the aerial part of 
Notobasis Syriaca L. cass plant belonging to the Asteraceae family, a total of 5 compounds were isolated using various chromatographic methods. The structures of the isolated compounds were elucidated using 1H-NMR and 13C-NMR spectroscopic methods, chemical derivatization and literature data (SCI-Finder database).
As a result of our experimental studies, sucrose (1) was obtained in pure form. Compound 3: was isolated as a mixture of α-D-fructose, β-D-glucose, α-D-glucose. The structures of compounds 2,4 and 5 could not be elucidated.
According to the DPPH method, while the MeOH extract showed the highest activity at 84.1 µmol AAE/g, it was determined that it showed the lowest activity with 3.2 µmol AAE/g.