hakansabunis/tr-academic-research-agent-index huggingface dataset:
HER2/neu genine özgü dual color FISH progbu hazırlanması
Producing the fluoresans in situ hybridization probe of HER2/neu gene
Yazar: HASAN AYDIN
Danışman: PROF. DR. AYŞEGÜL TOPAL SARIKAYA ; YRD. DOÇ. DR. ZEYNEP AKDESTE
Yıldız Teknik Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Biyomühendislik Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2008
Konu: Biyomühendislik = Bioengineering
Dizin: FISH = FISH ; Meme neoplazmları = Breast neoplasms

Özet:
Meme kanseri, kadınlarda gözlenen en yaygın ölüm nedenidir. Bu hastalıga karsı uygulanacaktedavinin basarısının arttırılmasında, tümörün biyolojik davranısının belirlenmesi ve yapısınagöre tiplendirilmesi önemli bir olgudur. Bu yaklasım ile meme kanserinde birçok prognostikve biyolojik farklılıklar üzerine çalısmalar yapılmakta ve uygun tedavinin belirlenmesi içinyeni tanı testleri gelistirilmektedir.Bu tez çalısmasında, meme kanserli hastalara uygulanan, özellikle HER2 antijenine özgügelistirilmis Herceptin isimli ilacın etkinligini önceden tahmin etmemizi saglayacak cerbB2(HER2/neu) genine ait fluoresans in situ hibridizasyon probunun elde edilebilirligi ve eldeedilen bu probların uygulanabilirligi gösterildi.Ayrıca, E.coli BAC kolonilerinde kültüre edilen, insan erbB2 geninin ve bu genin olasısayısal anormalligini karsılastırabilecegimiz 17. kromozomun sentromerik bölgesininizolasyonu için yöntem gelistirildi. Elde edilen DNA zincirlerinin fluoresans isaretlenmesindekullanılabilecek yeni metodlar (WGA kiti, DOP PCR, Nick translasyonu kiti) karsılastırıldı;izole edilen DNA'nın miktar tayininde kullanılan picogreen yöntemi ile gelenekselyöntemlerin sonuçlarının farklılıkları incelendi.Anahtar kelimeler: FISH, Floresan in situ hibridizasyon, Meme kanseri, HER2/neu.

Abstract:
Breast cancer is the most commonly observed cause of death in women. An important matterin increasing the effectiveness of the treatment to be applied is the classification of the tumoraccording to it's biological behavior and morphology. In this way several prognostic andbiological differences concerning breast cancer can be defined. New diagnostic techniques arenow being developed to determine appropriate treatments to be implemented.In this study, we show the possibility of producing and applicability the fluoresans in situhybridization probe of cerbB2 gene which provides us to predict efficiency of Herceptin.Herceptin, which binds to HER2 antigen, is used for adjuvant treatment of breast cancer.Also, the isolation technique of human erbB2 gene, which is cultured in E.coli BAC colonies,and of 17. chromosome?s centromere domain is improved. New methods for fluorescencelabeling DNA strains (WGA kits, DOP PCR, Nick translation kits) are compered anddifferences of results of picogreen methods, which is used for DNA quantification andtraditional methods are analyzed.Key words: FISH, Fluorescent in situ hybridization, Breast cancer, HER2/neu
Fotovoltaik sistemlerin binalarda kullanılması
Building integrated photovoltaic systems
Yazar: ESER KORYÜREK
Danışman: YRD. DOÇ. DR. SÜLEYMAN HAKAN SEVİLGEN
Yıldız Teknik Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Makine Mühendisliği Ana Bilim Dalı / Enerji Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2008
Konu: Enerji = Energy ; Makine Mühendisliği = Mechanical Engineering

Özet:
Bu çalışmada yeryüzünde en bol bulunan yenilenebilir enerji kaynağı olan güneş enerjisinin elektrik enerjisi üretiminde kullanımı ve bu teknolojinin binalar üzerine uygulanmasıyla ısı ve elektrik ihtiyacının karşılanması konusu ele alınmıştır. Çalışma dahilinde dünyadaki ve Türkiye'deki güneş enerjisi potansiyeli incelenmiş, fotovoltaik üreteçlerin yapısı, çalışma prensibi, çeşitleri ele alınarak; fotovoltaik sistemlerin tasarım esasları incelenmiştir. Ayrıca binalar üzerindeki uygulamalar, bu uygulamaların tasarım ölçütleri, sistem boyutlandırmaları ve maliyet analizi irdelenmiştir. Uygulamalar ve örnek tasarımlar PV*SOL isimli fotovoltaik tasarım simülasyonu kullanılarak incelenmiştir. Bunun yanında dünyadan ve Türkiye'den çeşitli fotovoltaik sistem uygulama örneklerine değinilmiş, fotovoltaik sistemlerin geleceği ve bazı ülkelerde PV sistemlere yapılan devlet desteklerinden bahsedilmiştir.Örnek uygulama maliyet açısından incelendiğinde PV sistemlerin günümüzde halen pahalı bir elektrik üretim yöntemi olduğu ortaya çıkmıştır. Dünyadaki elektrik artışı, gelecekte olması muhtemel şebeke elektriği fiyatları ve PV sistem maliyetlerindeki düşüş gönünde bulundurulduğunda yakın bir gelecekte PV sistemlerin ekonomik anlamda kullanılabilir olacağı ortaya çıkmıştır.Anahtar Kelimeler: PV, fotovoltaik, güneş enerjisi, elektrik, yenilenebilir.

Abstract:
This study was carried out in order to examine the usage of sunlight energy ,which is the most common energy source on the Earth, to produce electricity and in order to observe the applications of the system on the buildings to produce the required heat and electric energy. In the study the sun energy potential of Turkey and the world are were researched. Also the structure, working prenciple, types of photovoltais cells and the design parameters of photovoltaic systems were studied. Also a referance application was designed at the end of the study by the PV*SOL simulation programme and the cost accounting was made. Some examples were given about the photovoltaic systems in Turkey and in the world. Plus, the future of phptpvpltaic systems and government subsidies were mentioned.When the sample project was examined, it came in view that the PV systems are still an expensive method for electricity production. But when we take into acount the increase in grid electricity prices and the decrease in PV system costs, it is clear that PV systems will be economically usable in close future.Key words: PV, photovoltaic, solar energy, electricity, renewable.
Görüntü işlemede morfolojik teknikler
Morphological image processing methodologies
Yazar: HAKAN EMRAH OLGUN
Danışman: YRD. DOÇ. İBRAHİM EMİROĞLU
Yıldız Teknik Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Matematik Mühendisliği Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2008
Konu: Bilgisayar Mühendisliği Bilimleri-Bilgisayar ve Kontrol = Computer Engineering and Computer Science and Control ; Matematik = Mathematics

Özet:
ÖZETMorfoloji kelimesi genel olarak canlıların, şekil ve yapıları ile uğraşan biyoloji dalına itafen kullanılmaktadır. Bu tez içerisinde aynı kelime matematiksel morfoloji bağlamı kapsamında imge bileşenlerinin ayrıştırılması sırasında kullanılan bir araç olarak karşımıza çıkacaktır. Bunun dışında bu çalışma kapsamı içerisinde, imge ön işleme ve işleme sonrasında kullanılan morfolojik filtreleme, inceltme ve budama gibi bir çok morfolojik teknik ilgi alanımıza girecektir.Matematiksel morfolojinin dili kümeler teorisidir. Matematiksel morfoloji içerisindeki kümeler bir imge içerisindeki nesneler olarak düşünülebilir. İşte bu yüzden bu çalışma içerisinde matematiksel bir altyapı oluşturması açısından öncelikle kümeler teorisi ve mantık operasyonları ile ilgili bilgi verilmiştir. Daha sonra ise ikili ve gri-ölçümlü imgelerde ayrı ayrı, yayma, aşındırma, açma, kapama gibi imge işleme yöntemleri ele alınmıştır.Bir çok imge işleme sonucunda girdi ve çıktı yine imge olarak karşımıza çıkmaktadır. Ancak bu çalışma içerisinde konu edilen morfolojik yöntemlerde girdi yine bir imge iken çıktı ise imgenin bileşenlerinin özelliklerinden oluşan matematiksel bir ifade veya küme olacaktır. Bu anlamda morfolojik imge işleme, imgenin anlamlandırılması ya da imge içerisinden anlamın ayrıştırılmasında bir dönüm noktasıdır.Anahtar kelimeler: Morfolojik imge işleme, inceltme, budama, yayma, aşındırma, açma, kapama yöntemleri, Granülometri.

Abstract:
ABSTRACTThe word morphology commonly denotes a branch of biology that deals with the form and structure of animals and plants. We use the same word in this MS thesis, in the context of mathematical morphology as a tool for extracting image components.The language of mathematical morphology is set theory. As such, morphology offers a unified and powerful approach to numerous image processing problems. Sets in mathematical morphology represent objects in an image. In this MS thesis we will develop and illustrate several important concepts in mathematical morphology. In order to achieve this, cover some preliminary concepts of set theory and logic operations will be covered, then image processing methods such as erosion, dilation, opening, closing will be covered for binary and gray-scale images.The material in this MS thesis begins a transition from a focus on purely image processing methods, whose input and output are images, to processes in which the inputs are images, but the outputs are attributes extracted from those images. Tools like morphology and related concepts are a cornerstone of the mathematical foundation that is utilized for extracting "meaning" from an image.Keywords: Morphological image processing, erosion, dilation, filterin, pruning, thining, opening, closing methords, granulometry.
Çizgi takip robotunun modellenmesi ve denetleyici tasarımı
Modelling of a line following robot and controller design
Yazar: ONUR AKBATI
Danışman: PROF. DR. GALİP CANSEVER
Yıldız Teknik Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Elektrik Mühendisliği Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2008
Konu: Elektrik ve Elektronik Mühendisliği = Electrical and Electronics Engineering
Dizin: Robot denetim = Robot control ; Robot kinematiği = Robot kinematics ; Çizgi = Line

Özet:
Günümüzde hızla ilerleyen robot teknolojilerinde sıklıkla karşılaşılan bir problemde tekerlekli araçların konum kontrolüdür. Bu tez çalışmasında tekerlekli araçların kontrol probleminin bir çeşidi olan çizgi takibi ele alınmıştır.Konu üzerine yapılan literatür araştırmalarında bu konuyla ilgili yapılmış az sayıda akademik çalışmanın bulunmuş olması çalışmayı daha da cazip hale getirmiştir.Bu çalışmada öncelikle ikisi hareketi sağlamak üzere, toplam dört adet tekerlek içeren bir aracın matematiksel modeli oluşturulmuştur. Bu modelin doğruluğu değişik metotlar ile kontrol edilerek, sistemin işleyişinde hata olarak tanımlanacak terimler belirlenmiştir.Çalışmanın ilerleyen kısımlarında oluşturulan bu hata terimlerinin sıfırlanması için değişik kontrol metotları denenmiş, bunların simülasyonu için MATLAB ve SIMULINK yazılımları kullanılarak, elde edilen sonuçlar kıyaslanmıştır.Son olarak yapılan uygulama ile kullanılan kontrol metotlarından biri gerçek ortam şartları altında uygulama ile test edilmiştir.Anahtar Kelimeler: Çizgi takibi, konum kontrolü, araç kontrolü

Abstract:
One of today?s frequently encountered problem in Robotic Technologies is position control. In this study, we deal with line-following which is one kind of position control problem.Finding less solutions in the literature research about this study made it more attractive.In this study, first of all, we formed the mathematical model of a totally four wheeled vehicle twice of which is used for motion. Then the correctness of the model is checked with different methods and the error terms are defined.In the following parts of study, to cancel the error terms, different control methods tested, simulation of these methods are done in MATLAB environment and then the resuts are compared.At last, one of the control method used is tested under real physical conditions with an application.Keywords: Line following, position control, cart control
Çelik - kompozit katmanlı zırh malzemelerinin dinamik modellenmesi
Dynamic modelling of the steel-composite layered armour plate materials
Yazar: HİLAL KEMAL ŞENYILMAZ
Danışman: PROF. NECATİ TAHRALI
Yıldız Teknik Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Makine Mühendisliği Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2008
Konu: Makine Mühendisliği = Mechanical Engineering ; Savunma ve Savunma Teknolojileri = Defense and Defense Technologies

Özet:
Bu çalışmada, 5 kilogramlık TNT patlaması karşısında çelik ? kompozit katmanlı zırh malzemelerinin davranışı incelenmiştir. Çalışmanın ilk bölümünde zırh çeliği tek başına modellenmiş, patlama karşısında meydana gelen deplasman ve deformasyon hızı bulunmuştur. Daha sonra aynı kalınlıktaki çelik üzerine rijit olarak bağlanmış kompozit malzemenin deplasmanı ve deformasyon hızı lif yönüne bağlı olarak incelenmiştir. Son bölümde çelik ve en uygun lif yapısına sahip kompozit plakalar arasına polistiren köpük yerleştirilerek testler tekrar edilmiş, polistiren köpüğün farklı kalınlıkları için kompozit katmanda oluşan deplasman ve deformasyon hızları bulunmuştur.Elde edilen veriler ışığında mayın patlamasına karşı yalnız çelik malzemeler yerine istenen değerlere bağlı olarak çelik ? kompozit veya çelik ? elastomer köpük ? kompozit katmanlı malzemelerin kullanılmasının oluşan deplasman ve deformasyon hızı bakımından daha uygun olduğu sonucuna varılmıştır.Anahtar Kelimeler: Mayın patlaması, çelik ? kompozit katmanlı zırh malzemeleri, dinamik analiz

Abstract:
In this study, the behaviour of the steel-composite layered armour plate materials against 5 kilogram TNT explosion is examined. In the first part of the study, armoured steel plate is modelled alone then displacement and the velocity of deformation is obtained. Afterwards displacement and deformation velocity of composite material fastened as rigid to the steel in the same thickness depending on fibrous direction is investigated. In the last part the tests are repeated by embedding the polystrene foam between steel and composite plates which have the most conformable fibrous structure and displacement and deformation velocity which come into existence in the composite layer for different polystrene thickness is obtained.According to the obtained data it has been concluded that the usage of steel-composite or steel - elastomer foam - composite layered materials against mine explosion in terms of originated displacement and deformation velocity is more suitable than usage of steel materials.Keywords: Mine explosion, steel-composite layered armour plate materials, dynamic analysis
Elektrik enerjisi üretimi amacıyla kullanılan değişik tipteki yakıt pillerinin teknik ve ekonomik etüdü
Technical and economical analysis of different types of fuel cell used for electrical energy generation
Yazar: MEHMET ÇOLAKOĞLU
Danışman: DOÇ. DR. ŞÜKRÜ BEKDEMİR
Yıldız Teknik Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Makine Mühendisliği Ana Bilim Dalı / Enerji Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2008
Konu: Makine Mühendisliği = Mechanical Engineering ; İşletme = Business Administration
Dizin: Yakıt hücreleri = Fuel cells

Özet:
Günümüzde artan enerji ihtiyacı ve var olan kaynakların tükenmesi sebebi ile farklı enerji üretim metotlarının geliştirilmesine ihtiyaç duyulmaktadır. Bu ihtiyaç karşısında yakıt pilleri oldukça ümit vaat eden bir teknoloji olarak karşımıza çıkmaktadır. Bu durumu analiz edebilmek için öncelikle değişik tipteki yakıt pillerinin yapısı ve her tip için bu yapıyı oluşturan elemanlar ve son dönemdeki teknolojik gelişimleri incelendi. Daha sonra yine her yakıt pili tipi için performans ve bu performansları etkileyen sıcaklık, basınç, katalizör etkisi, yakıt saflığı gibi etkenler göz önüne alınarak, performans değişimleri matematiksel olarak ifade edildi. Elde edilen veriler ile değişik tipteki yakıt pillerinin sahip oldukları avantaj ve dezavantajları ortaya konuldu. Yakıt pillerinin sahip oldukları bu avantaj ve dezavantajların ışığında uygulama olasılığının yüksek olduğu alanlar belirlenerek ticarileşmelerinin önündeki engeller incelendi.

Abstract:
Nowadays development in different type energy generation methods is required depending on consuming resources and increased energy necessity. Fuel cells appear promising technology for this requirement. In order to analyse this situation first of all structures of the different fuel cell type are studied with components and the state of the art development of cell components.After that for all types of fuel cell performance is investigated with effects of temperature, pressure, catalyst, purity of fuel etc. Performance changes are expressed by mathematical method. Advantages and disadvantages of fuel cells are determined with obtained data. Considering this advantages and disadvantages of fuel cells application areas are determined and then barriers for commercialization are studied.
Kayıt dışı ekonomi ve vergi kaybı
The tax revenue loses and informal economy
Yazar: CANAN ERMİŞ
Danışman: PROF. DR. NEVİN COŞAR
Yıldız Teknik Üniversitesi / Sosyal Bilimler Enstitüsü / İktisat Bölümü / İktisat Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2008
Konu: Ekonomi = Economics

Özet:
Bu gün kayıt dışı ekonomi hem gelişmiş ülkelerde hem de gelişmekte olan ülkelerde önemli bir toplumsal sorun olarak gündeme gelmektedir. Kayıt dışı ekonomik faaliyetler kamu finansmanının en önemli kalemi olan vergi gelirlerinde büyük bir aşınmaya neden olmaktadır. Kamu gelirlerinde kayıplara neden olan kayıt dışı ekonomi makro ekonomik göstergelerin sağlıklı olmasını engellediğinden dolayı uygulanılan ekonomi politikalarınında başarısını olumsuz yönde etkilemektedir.Bu tez çalışmasında Türkiye' de çok büyük boyutlara ulaşan kayıt dışı ekonomi irdelenmiştir. Çalışmanın amacı kayıt dışı ekonomiyi tüm yönleriyle inceleyip, kayıt dışı ekonomik faaliyetlerin oluşmasının nedenlerini ortaya koymak ve devletin kayıt dışı ekonomi nedeniyle uğradığı vergi kaybını tespit etmeye çalışmaktır.Bu çalışmada kayıt dışı ekonominin vergisel boyutuna ağırlık verilmiştir. Fakat kayıt dışı ekonomi sadece vergi kaybına neden olmamaktadır, bunun dışında kayıt dışı ekonomi verimlilik artışı sağlanması, adil rekabet ortamının yaratılması, doğru iktsadi politikaların oluşturulması ve ekonominin gerçek büyüme potansiyelinin yakalanmasını da engellemektedir. Bu nedenle çalışmanın son bölümlerinde kayıt dışı ekonomi ile mücade için çözüm önerileri sunulmuştur ve dünyadaki kayıt dışı ekonomi ile mücadelede kullanılan yöntemlerden örnekler verilmiştir.Anahtar Kelimeler : Kayıt Dışı, Vergi Kaybı

Abstract:
Today, informal economy comes in order as an important social problem in both developed and developing countries. Informal economic activities cause a huge depriciation in tax incomes, the most important item of the public finance. By causing losses in public revenues and preventing a healty look in economic indicators, informal economy also effects the successes of the economic policies in a negative way.In this thesis project, the informal economy reaching to large amounts in Turkey is considered. The aim of this study is to analyse informal economy in all points, to figure out the reasons of formation of the informal economical activities and to confirm the tax losses of the government as a result of informal economyThe tax dimension of the informal economy is emphasized in this study. But the informal economy does not cause only tax revenue losses; besides, it prevents the rise in efficiency, the formation of the fair competititon atmosphere and also catching up the real growth potential of the economy. For these reasons, the solutions of the struggle with the informal economy and also the examples of methods used in the world for the struggle with the informal economy are submitted in the last parts of the study.Keywords : İnformal Economy, Tax Revenue Losses
Gemi üretiminde yer seçim eğilimleri ve küme yapıları; Tuzla özel sektör tersaneler bölgesi örneği
Locational behaviour and cluster structures of the ship building industry, the case of Tuzla shipyards cluster
Yazar: SERKAN ÇELİK
Danışman: YRD. DOÇ. DR. YİĞİT EVREN
Yıldız Teknik Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Şehir ve Bölge Planlama Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2008
Konu: Şehircilik ve Bölge Planlama = Urban and Regional Planning

Özet:
Sanayi kümeleri ekonomik coğrafya, işletme ve planlama yazınının en popüler konularından biri olagelmiştir. 19.yüzyılın sonlarında Alfred Marshall'ın çalışmalarından bu güne kadar geçen sürede endüstriyel kümelenme literatürü farklı disiplinlerden yapılan katkılar ile hızlı bir biçimde büyümüş ve genişlemiştir. Şüphesiz bu alanda göreceli olarak daha az çalışılmış sektörler ve coğrafyaların konu edildiği araştırmalar, endüstriyel kümelenme konusu daha iyi anlamamıza yardımcı olacaktır. Bu noktadan hareketle, Türk gemi inşaat sanayisinin yer seçim eğilimlerinin ele alındığı bu tez çalışmasında Tuzla Özel Sektör Tersaneler Bölgesi (TÖSTB) örneğinden yola çıkarak sektördeki üretim ilişkileri, yığılmacı kuvvetler ve küme yapıları incelenmektedir. Araştırmanın özünü TÖSTB içerisinde (1) çelik gemi ve (2) ahşap tekne alanlarında faaliyet gösteren iki firmanın tedarikçileri ile kurduğu ilişkilerin karşılaştırmalı analizi oluşturmaktadır.

Abstract:
Industrial clusters has always been among the most popular and central themes in the literature of economic geography, management and planning. Since Alfred Marshall?s writings in the late 19 century, clustering literature has grown rapidly and become voluminous with the contributions from various disciplines. Undoubtedly, more empirical evidence from relatively less explored localities and sectors will improve the present understanding of clustering. This thesis, therefore, investigates the locational behaviour of the ship building industry in Turkey. It the analyses the structure of Tuzla Shipyards Cluster (TSC) by conducting a comparative study based on two case studies (1) a large scale ship manufacturer (2) a small scale producer specialised on wooden sailing boats. The main focus of the empirical research is to understand the organisational and locational structure of supplier customer relationship networks in Tuzla and analyse the agglomerative forces of TSC.