Konjenital nazolakrimal kanal tıkanıklığında nazal ve oküler flora mikrobiyomunun polimeraz zincir reaksiyonu temelli karakterizasyonu ve  mikrobiyom ilişkili metabolik yolakların fonksiyonel analizi
Polymerase chain reaction based characterization of nasal and ocular flora microbiome in congenital nasolacrimal duct occlusion and functional analysis of microbiome related metabolic pathways
Yazar: HAZAL BİRCAN
Danışman: DOÇ. DR. NİLAY YÜKSEL ; PROF. DR. FATMA YÜLEK
Ankara Yıldırım Beyazıt Üniversitesi / Tıp Fakültesi / Göz Hastalıkları Ana Bilim Dalı
Derece: Tıpta Uzmanlık, 2023
Konu: Göz Hastalıkları = Eye Diseases
Dizin: Gram negatif bakteriler = Gram negative bacteria ; Gram pozitif bakteriler = Gram positive bacteria ; Nazolakrimal kanal = Nasolacrimal ductus ; PCR =

Özet:
Amaç: Polimeraz zincir reaksiyonu (PCR) bazlı yöntemler kullanarak tek taraflı konjenital nazolakrimal kanal tıkanıklığı (KNLKT) olan çocukların nazal ve oküler yüzey florasında Streptecoccus pnemonia, Staphylococcus aureus, Hemophilus influenzae, Serratia marcescens, Moraxella catarrhalis karakterizasyonu ile bu bakterilerin biyoaktivite ve enzimlerinin tanımlanmasını yapmak, yaş ve cinsiyet olarak eşleştirilmiş sağlıklı çocuklar karşılaştırmak.
Gereç ve yöntem: Sondalama yapılmadan önce, tek taraflı KNLKT olan 26 hastanın her iki taraf inferior meatus ve oküler yüzeylerinden sürüntü örnekleri alındı. Ayrıca tek taraflı şaşılık veya pitozis cerrahisi uygulanan çocukların kontralateral oküler yüzey ve inferior meatuslarından alınan örnekler kontrol grubunu oluşturdu. Örneklerde bakteri varlığı ve miktarı, bakteriye özgü primerler kullanılarak analiz edildi. Bakteri miktarını belirlemek için döngü eşiği (Ct) değeri kullanıldı. Düşük Ct değeri, numunede daha fazla bakteri DNA/RNA olduğu anlamına gelmekteydi.
Bulgular: Nazal florada Streptococcus pneumonia, oküler yüzey florasında Staphylococcus aureus ve hem nazal hem de oküler yüzey florasında Hemophilus influenza, Serratia marcescens, KNLKT tarafında kontrol grubuna göre daha fazlaydı (p<0.05). Tüm bakteriler için ct değeri KNLKT tarafında hem nazal hem de oküler florada kontrollere göre daha düşüktü (p<0.05). Fark en çok Serratia marcescens için dikkat çekiciydi. KNLKT'li çocukların tıkalı ve açık tarafları karşılaştırıldığında oküler yüzeyde Moraxella catarrhalis, nazal florada Streptococcus pneumoniae, Staphylococcus aureus, Serratia marcescens, Moraxella catarrhalis daha yüksek bulundu (p< 0.05). Bu bakterilerin metabolit analizi yapıldığında betaine, L-carnitine, L-leucine ve L-alanine'nin bu bakterilerin varlığında negatif olarak regüle edildiği yani KNLKT'li hastalarda daha az bulunduğu görüldü.
Sonuç: KNLKT, bazı bakterilerle veya bu bakterilerin oküler yüzey ve nazal floradaki miktarlarındaki değişikliklerle ilişkili görünmektedir. Bu mikrobiyolojik farklılıklar, KNLKT için bir risk faktörü veya KNLKT'nin bir sonucu olabilir.

Abstract:
Objective: To characterize Streptococcus pneumonia, Staphylococcus aureus, Hemophilus influenza, Serratia marcescens, and Moraxella catarrhalis in the nasal and ocular surface flora of children with unilateral congenital nasolacrimal duct obstruction (CNLDO) using polymerase chain reaction (PCR)-based methods, and to identify the bioactivity and enzymes of these bacteria, and to compare age- and sex-matched healthy children.
Materials and methods: Before probing, the swab samples were taken from the bilateral inferior meatus and ocular surfaces of 26 patients with unilateral CNLDO. Also, samples taken from the contralateral ocular surface and inferior meatus of the children who underwent unilateral strabismus or ptosis surgery constituted the control group. The presence and quantity of bacteria in the samples were analyzed by using primers specific to the bacteria. The cycle threshold (Ct) value was used to determine the amount of bacteria. The lower Ct value means there was more bacteria DNA/RNA in the sample. 
Results: Streptococcus pneumonia in nasal flora, Staphylococcus aureus in the ocular surface flora, and Hemophilus influenza, Serratia marcescens in both the nasal and ocular surface flora were more abundant on the CNLDO side than the control group (p<0.05). The ct value for all bacteria was lower on the CNLDO side in both nasal and ocular flora compared to controls (p<0.05). The difference was the most remarkable for Serratia marcescens. When the obstructed and patent sides of the children with CNLDO were compared, Moraxella catarrhalis was found to be higher in the ocular surface, and Streptococcus pneumoniae, Staphylococcus aureus, Serratia marcescens, Moraxella catarrhalis were found to be higher in the nasal flora (p<0.05). The metabolite analysis of these bacteria revealed that betaine, L-carnitine, L-leucine, and L-alanine were negatively regulated in the presence of these bacteria.
Conclusion: CNLDO seems to be associated with some bacteria or alterations in their amounts in the ocular surface and nasal flora. These microbiological differences may be a risk factor for or a result of CNLDO.