Farklı kaynaklardan izole edilen Listeria monocytogenes izolatlarının bazı virulens genlerinin araştırılması
Investigation of some virulence genes of listeria monocytogenes strains isolated from different sources
Yazar: ADEM ADIGÜZEL
Danışman: PROF. DR. OKTAY KESKİN
Harran Üniversitesi / Sağlık Bilimleri Enstitüsü / Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2022
Konu: Mikrobiyoloji = Microbiology
Dizin: Genler = Genes ; Hayvan hastalıkları = Animal diseases ; Hayvan yemleri = Animal feeds ; Listeria = Listeria ; Listeria monocytogenes = Listeria monocytogenes ; Polimeraz zincirleme reaksiyonu = Polymerase chain reaction ; Virülans = Virulence ; Virülans faktörleri = Virulence factors

Özet:
Bu çalışmada klinik ve gıda kaynaklı L. monocytogenes izolatlarında türe özgü 
listeriolizin O ve internalin A moleküllerini kodlayan hylA ve inlA genleri ile virulensi 
belirleyen internalin C ve internalin J moleküllerini kodlayan inlC ve inlJ genlerinin
varlığının araştırılması ve izolatlarda bu 4 genin varlığının analizi için bir multipleks PCR 
protololünün oluşturulması amaçlandı. Bu amaçla 7 klinik ve 21 gıda orijinli olmak üzere 
toplam 28 L. monocytogenes izolatı kullanıldı. Çalışma sonucunda 6'sı klinik ve 12'si 
gıda orjinli olmak üzere toplam 18 izolat araştırılan 4 genin varlığı yönünden de pozitif 
olarak belirlenirken koyun beyninden elde edilen 1 izolat ve gıda orjinli 2 izolatın inlJ ve 
hylA gen varlığı yönünden pozitif olduğu saptandı. Ayrıca gıda orijinli 2 izolat inlA ve 
hylA genleri yönünden pozitif olarak belirlendi. Analiz edilen 4 izolatda ise araştırılan 
genlerin hiç birisi tespit edilemedi. Klinik orijinli izolatlar inlA ve inlC genleri yönünden 
%85,7 oranında ve inlJ ve hylA genleri yönünden ise %100 oranında pozitif bulundu. 
Gıda kaynaklı izolatlar inlA, inlC, inlJ ve hylA genlerinin varlığı yönünden sırasıyla 
%66,7; %76,2; %71,4 ve %80,1 oranında pozitif olarak belirlendi. Bu verilere göre ikisi 
tür spesifik, ikisi de virulens belirteci olmak üzere 4 gen bölgesinin tespit edilmesi için 
tasarlanan multipleks PCR tekniğinin hızlı ve kullanılabilir bir teknik olduğu kanısına 
varıldı

Abstract:
In this study, was aimed that to detect hylA, inlA, inlC ve inlJ genes, which encode
listeriolysin O, internalin A, internalin C and internalin J in, L. monocytogenes isolates 
from clinical and food originated samples. The first two genes encode respective proteins 
based on species specific, while the latters encodes molecules responsible for virulence. 
We also planned to establish a multiplex PCR protocol that enables to detect of all four 
genes together. A total of 28 L. monocytogenes isolates obtained from 7 clinical and 21 
food originated sample were used in the study. As a result of the study, a total of 18 
isolates including 6 of clinical origin and 12 of food origin, were found to be positive in 
terms of the presence of the four genes investigated, while 1 isolate, obtained from sheep 
brain, and 2 isolates, recovered from food origin, were found to be positive for the 
presence of inlJ and hylA genes.
In addition, 2 isolates of food origin were positive for inlA and hylA genes. None 
of the investigated genes could be detected in the 4 isolates analyzed. The clinical origin 
isolates were found to be positive in 85.7% for inlA and inlC genes, and 100% positive 
for inlJ and hylA genes. The isolates of food origin were detected to be positive for the 
presence of inlA, inlC, inlJ and hylA genes at the rate of 66.7% , 76.2%, 71.4%, and 
80.1% respectively. Based on these data, it was concluded that the multiplex PCR 
technique, designed to detect 4 gene regions, two of which is species specific and two of 
which are virulence markers, is a fast and usable technique. Based on these results, it is 
thought that multiplex PCR designed were found as a fast and useful technique to detect 
four genes, which are species-specific and virulence indicators