Non-alkolik yağlı karaciğer hastalığı patogenezinde bağırsak mikrobiyotasının etkin rolü
The effective role of intestinal microbiota in nonalcolic fatty liver disease pathogenesis
Yazar: ANIL DELİK
Danışman: PROF. DR. SADIK DİNÇER ; PROF. DR. HİKMET AKKIZ
Çukurova Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Biyoloji Ana Bilim Dalı
Derece: Doktora, 2023
Konu: Biyoloji = Biology ; İç Hastalıkları = Internal diseases

Özet:
Non-alkolik yağlı karaciğer hastalığı (NAYKH), dünyadaki en yaygın karaciğer hastalığı olarak bilinmekle birlikte, bu durumu önlemek veya tedavi etmek için halen onaylanmış farmakolojik tedaviler bulunmamaktadır. NAYKH, hepatosellüler karsinom ve siroz riskinde artış ile bağlantılı olmasının yanı sıra şu anda karaciğer yetmezliği ile ilişkili transplantasyonun önde gelen nedeni haline gelmiştir. Gelişen teknolojik gelişmelerle birlikte artan mikrobiyota çalışmaları sonucu NAYKH patogenezinde intestinal mikrobiyotanın rolü önemli bir şekilde açığa çıkarılmaktadır. Bu çalışmada NAYKH patogenezinde intestinal mikrobiyotanın klinik prognostik önemini saptamak ve NAYKH hastalarında intestinal mikrobiyomu tespit etmek amaçlanmıştır. Bu çalışmaya çeşitli tetkikler sonucu NAYKH teşhisi konmuş 20 hasta ve 20 normal kontrol grubu dahil edilmiştir. Bu çalışma için etik kurul onayı alınmış ve çalışmanın başında hastalar bilgilendirilmiş ve yazılı onamı alınmıştır. Hastaların yaş cinsiyet, vucut kitle indeksi (VKI), insülin direnci (ID), AST, ALT seviyeleri kaydedildi. Hastalarla aynı yaş ve cinsiyette sağlıklı kontrol grubu belirlendi. Çalışmaya dahil edilen bireylerden steril koşullarda biyopsi örnekleri alınmıştır. 16S rRNA gen metagenomik prosesler sonuçunda mikrobiyal sonuçlar elde edilmiştir.  Kaydedilen parametrelerin analizi SPSS.19 istatistik programı ile yapılmıştır. Tasarlanan çalışmada toplam 40 bireyde 16 filum, 28 sınıf, 56 ordo, 128 familya, 415 cins, 1041 tür mikroorganizma taksonomik olarak analiz edilmiştir. Çalışmamızda NAYKH hastalarında bağırsak mikrobiyal çeşitliliği kontrol grubu bireylere göre daha düşüktür. Ayrıca NAYKH hastalarında gram negatif bakterilerin daha baskın olduğu bulundu. Filum olarak NAYKH grubunda Proteobacteria, kontrol grubunda Bacteroidetes ve Actinobacteria artarken Firmicutes her iki grupta eşit dağılıma sahiptir. Laboratuvar verilerinde VKI, OR=6.37, %95CI (0.39-0.40) p değeri 0.001 iken, mikrobiyal profilde Proteobacteria OR=1.754, %95 CI (0.901-3.416), p değeri 0.05 olarak tespit edildi. NAYKH hastalığında kolon mukozal biyopsi örnekleri kullanılarak bağırsak mikrobiyotasının 16S rRNA metagenomik çalışması Türk popülasyonunda yapılan ilk çalışma olup, diğer çalışmalar için önemli veriler elde edilmiştir. Elde edilen verilerde NAYKH hastalarında kolonik mukozal epitelde artış gösteren Ruminococcaceae, Escherichia coli ve Bacilli türleri ile azalan Bacteroidetes, Actinobacteria ve Enterococaceae türlerinin hem tanı hem de tedavi seçeneklerinde önemli aktif rol oynayacağını düşünmekteyiz.

Abstract:
Non-alcoholic fatty liver disease (NAFLD) is known to be the most common liver disease in the world, and there are currently no approved pharmacological treatments to prevent or treat this condition. In addition to being associated with an increased risk of hepatocellular carcinoma and cirrhosis, NAFLD has now become the leading cause of liver failure-associated transplantation. As a result of increasing microbiota studies with developing technological developments, the role of intestinal microbiota in the pathogenesis of NAFLD is revealed in an important way. In this study, it was aimed to determine the clinical prognostic importance of gut microbiota in the pathogenesis of NAFLD and to determine the microbial composition in NAFLD patients. We included 20 patients diagnosed with NAFLD as a result of various tests and 20 normal control groups, as well as laboratory data parameters of all individuals to use in this study. Written informed consent obtained from the individuals, after the ethics board approval had documented for this study. The healthy control group of the same age and gender as the patients were determined to be equal, and the age, gender, BMI, insulin resistance, AST, ALT levels of the individuals were recorded for analysis. Colonic mucosal biopsy samples were taken from the individuals included in the study under sterile conditions. Microbial results were obtained as a result of 16S rRNA gene metagenomic processes. The analysis of the recorded parameters was done with the SPSS.19 statistical program. In the designed study, 16 phylum, 28 class, 56 ordo, 128 family, 415 genus, 1041 species microorganisms were analyzed taxonomically in a total of 40 individuals. In our study, Intestinal microbial diversity is lower in NAFLD patients compared to control group individuals. In addition, gram-negative bacteria were found to be more dominant in NAFLD patients. As a phylum, Proteobacteria increased in NAFLD group, Bacteroidetes and Actinobacteria in control group, while Firmicutes had equal distribution in both groups. BMI OR=6.37, 95%CI (0.39-0.40) p value was 0.001 in laboratory data, whereas Proteobacteria OR=1.754, 95% CI (0.901-3.416), p value 0.05 in microbial profile. The 16S rRNA metagenomic study of intestinal microbiota using colonic mucosal biopsy samples in NAFLD disease was the first study in the Turkish population, and important data were obtained for other studies. In the data obtained, we think that Ruminococcaceae, Escherichia coli and Bacilli species, which increase in colonic mucosal epithelium in NAFLD patients, and Bacteroidetes, Actinobacteria and Enterococaceae species that decrease, will play an important active role in both diagnostic and treatment options.