Gemsitabin'e maruz bırakılan pankreatik kanser hücre hatlarında seçilmiş genlerin anlatım değişimlerinin incelenmesi
Investigation of gemcitabin effect on gene expression changes inpancreatic cancer cell lines
Yazar: NESLİŞAH YEGEN
Danışman: DR. ÖĞR. ÜYESİ MEHVEŞ PODA
İstanbul Üniversitesi / Sağlık Bilimleri Enstitüsü / Genetik Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2023
Konu: Genetik = Genetics
Dizin: Pankreas kanseri hücre hattı =

Özet:
Pankreas kanseri, agresif ve yüksek bir yayılma hızına sahip bir kanser türüdür. Hem
çevresel hem de genetik faktörler hastalığın seyrinde etkilidir. Hastalığın erken teşhisi ve
tedavi takibi pankreas kanseri hastalarının sağ kalımları açısından önemlidir. Kanser tanı
ve tedavi etkinliğinin arttırılabilmesi amacıyla, tüm bu süreçlere yeni biyo-belirteçler
eklenmesiyle araştırmalar çok yönlü olarak sürdürülmektedir. Güncel tedavide genellikle
Gemsitabin kullanılmakta ve etkinliğin arttırılması için florourasil, sisplatin içeren
kemoterapiler kombinasyon halinde uygulanmaktadır. Gemsitabin'in gen ifadesi
düzeylerinde oluşturacağı değişimler, ilaç dozaj ve tedavi takibi açısından önemlidir.
Çalışmada, pankreas kanser hücre hatları üzerinde farklı dozajlarda ve sürelerde
Gemsitabin'in etkileri qPCR analizleriyle incelenmiştir. İlaç maruziyeti sonrasında gen
ekspresyon düzeylerindeki değişimler araştırılmış; dört hedef gen (POU5F1, SLCO4C1,
CD24,SCG2) üzerinde odaklanılmıştır.
SLCO4C1 gen anlatım düzeyinde en büyük ve anlamlı değişiklik (150,38 kat, p=0,004)
gözlenmiştir. Bu genin tümörojenezde rol oynayabileceği başka araştırmalarda
bildirilmiştir. Gemsitabin'in hücre içine alınma mekanizmasında sodyum iyonu rol
oynamasına rağmen; SLCO4C1 proteini; sodyum iyonundan bağımsız olarak hareket
etmektedir. İlaç maruziyetine bağlı olarak gen ifadesindeki yüksek artış, ilacın sodyum
iyonundan bağımsız olarak da PANC-1 hücreleri içine alınmasında SLCO4C1 proteinin
rol oynadığına işaret edebilir.
POU5F1 geni, embriyonik gelişimde, kök hücre pluripotensinde önemli rol oynayan ve
yetişkin dokularında anormal gen anlatım düzeyinin tümörijenez ile ilişkili olduğu
bilinmektedir. Bu genin pankreas kanseri hücrelerindeki gen ekspresyon düzeyi, ilaç
maruziyeti sonrasında artış (4,14 kat, p=0,043) göstermiştir. Bu durum, hücrelerin
gemsitabin duyarlılığının azalmasıyla açıklanabilir.
Bu çalışmada CD24 ve SCG2 geninde anlamlı bir ifade değişikliği gözlenmemiştir.
Sonuç olarak, POU5F1 ve SLCO4C1 genlerinin, ilaç-direnç ve ilaç-takip çalışmalarında
kullanılabilecek yeni biyo-belirteç panellerinin oluşturulmasına katkı sağlayabilecekleri
düşünülmektedir.

Abstract:
Pancreatic cancer is an aggressive and highly metastatic type of cancer. Both
environmental and genetic factors play a role in the progression of the disease. Early
diagnosis and treatment monitoring are crucial for the survival of pancreatic cancer
patients. To increase the effectiveness of cancer diagnosis and treatment, research is being
conducted to add new biomarkers to these processes. Currently, Gemcitabine is
commonly used in treatment, and to enhance its effectiveness, chemotherapy
combinations containing fluorouracil and cisplatin are applied. Understanding the
changes in gene expression caused by Gemcitabine is important for drug dosage and
treatment monitoring. This study investigated the effects of Gemcitabine on pancreatic
cancer cell lines at different dosages and durations using qPCR analysis. The focus was
on four target genes (POU5F1, SLCO4C1, CD24, SCG2).
The most significant and substantial change (150.38-fold, p=0,004) was observed in the
expression level of the SLCO4C1 gene. Previous research has suggested that this gene
may play a role in tumorigenesis. Despite the role of sodium ions in the cellular uptake
mechanism of Gemcitabine, the SLCO4C1 protein acts independently of sodium ions.
The substantial increase in gene expression may indicate that the SLCO4C1 protein plays
a role in the uptake of Gemcitabine into PANC-1 cells, independent of sodium ions.
The POU5F1 gene is known to play a significant role in embryonic development and stem
cell pluripotency and is associated with abnormal gene expression in adult tissues related
to tumorigenesis. In pancreatic cancer cells, the gene expression level of POU5F1 showed
an increase (4.14-fold, p=0,043) after drug exposure. This could explain a decrease in
Gemcitabine sensitivity in the cells.
In this study, no significant expression changes were observed in the CD24 and SCG2
genes.
In conclusion, the POU5F1 and SLCO4C1 genes are believed to contribute to the
development of new biomarker panels that can be used in drug resistance and drug
monitoring studies.