Metisilin dirençli Staphylococcus aureus suşlarının moleküler tiplendirmesi
Molcular typing of methicillin-resistant staphylococcus aureus strains
Yazar: ZEYNEP ERDEM
Danışman: DOÇ. DR. SÜHEYLA TÜRKYILMAZ
Adnan Menderes Üniversitesi / Sağlık Bilimleri Enstitüsü / Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2011
Konu: Mikrobiyoloji = Microbiology
Dizin: Elektroforez = Electrophoresis ; Metisilin = Methicillin ; Stafilokok protein A = Stafilokok protein A ; Staphylococcus aureus = Staphylococcus aureus ; İlaçlara direnç = Drug resistance ; İlaçlara direnç-mikrobiyal = Drug resistance-microbial

Özet:
Metisilin dirençli S. aureus (MRSA) nozokomiyal ve toplum kökenli enfeksiyonlara yol açan önemli bir patojendir. MRSA suşları dünya çapında ortaya çıkmış ve çeşitli antibiyotiklere dirençli hale gelmiştir. Bu bakterinin en önemli özellikleri kolonize olma ve klonal yayılabilmesidir.Bu çalışmada, Ocak-Mayıs 2010 tarihleri arasında Adnan Menderes Üniversitesi Veteriner Fakültesi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı'nda subklinik mastitisli inek sütlerinden (n=90) ve nazal svaplardan [insan (n=35) ve sığır (n=56)] izole edilen 12 MRSA suşunun pulsed field jel elektroforezis (PFGE), stafilokokal protein A (spa), çok lokuslu dizi tiplendirme (MLST) ve stafilokokal kromozom kaset mec (SCCmec) tiplendirmesi yapılarak moleküler özelliklerinin ortaya konulması amaçlandı. İzolatların SCCmec tipleri multipleks polimeraz zincir reaksiyonu (PCR) ile belirlendi. Stafilokokal protein A'yı kodlayan spa geni ve S. aureus suşlarında bulunan 7 farklı yapısal metabolik gen (arcC, aroE, glp, gmk, pta, tpi ve yqiL) PCR ile amplifiye edildi ve sekanslandı. PFGE analizi sonucunda 12 MRSA izolatında pulsotip A-D olamak üzere dört pulsotip belirlendi. Pulsotip A olan suşların (n=7) sekans tipi (ST) tipi ST 239, spa tipi t030 olarak bulunurken biri hariç hepsinin SCCmec III taşıdığı tespit edildi. Pulsotip B (n=3) ST1294, t459 ve SCCmec Tip III; pulsotip C (n=1) ST1940, t660, SCCmec Tip III ve pulsotip D (n=1) ST737, t542, SCCmec tip II olarak belirlendi. spa tip t030 Türkiye'deki hastanelerde ve doğu ülkelerinde en sık görülen tiptir. Bu klon Amerika ve Avrupa'da nadir olarak görülmekle birlikte ?Türk Klonu? olarak isimlendirilmektedir. Hastane kökenli MRSA suşlarının fazlalığı MRSA suşlarının humanoz olabileceğini düşündürmektedir. Aynı klonla enfekte olan 2 inek sütü, 2 inek burun svabı ve bu hayvanlara bakan veteriner hekimlere ait burun svaplarından oluşan toplam 7 suş, MRSA'un klonal yayılma özelliğinin olduğunu gösterdi. Çalışma sonucunda Aydın yöresinde inek sütü, insan ve inek burun svaplarından izole edilmiş olan en yaygın spa tipi t030, MLST tipinin ise ST 239 olduğu belirlendi.

Abstract:
Methicillin resistant S. aureus (MRSA) is a major pathogen causing both nosocomial and community-acquired infections. MRSA strains have emerged worldwide and became resistant to a variety of antibiotics. The most important features of this bacterium are becoming colonization and able to expend clonally.The aim of this study was to determine the molecular characteristics of 12 MRSA strains isolated from milk samples (n=90) and nasal samples of cows (n=56) with subclinical mastitis obtained from Adnan Menderes University, Faculty of Veterinary Medicine, Department of Microbiology between January-May 2010, and from nasal samples (n=35) of veterinarians and farm workers using pulsed field gel electrophoresis (PFGE), staphylococcal protein A (spa), multi locus sequence typing (MLST) and staphylococcal chromosome cassette mec (SCCmec) typing. SCCmec types of these strains were investigated by multiplex polymerase chain reaction (PCR). The spa genes encoding for protein A and 7 housekeeping genes (arcC, aroE, glp, gmk, pta, tpi ve yqiL) for MLST were amplified by PCR and sequenced. PFGE analysis of all 12 MRSA isolates produced four distinct pulsotypes designated as pulsotypes A-D. The pulsotype A (n=7) strains detected the most prevalent sequence type (ST) were ST 239, spa type t030 and SCCmec III except one. The pulsotype B strains (n=3) were ST1294, t459 and SCCmec III, the pulsotype C (n=1) strains were ST1940, t660, SCCmec III detected. The remaining pulsotype D (n=1) strains were ST737, t542, SCCmec II. spa type t030 which were the most common spa type in Turkish hospitals and east country. This clone, which is rare in USA and Europe, called as ?Turkish Clone?. It was thought that the high amount of MRSA strains originated from hospitals would be humanosis. Two bovine milk and nasal swabs obtained from veterinarians who looked after the animal, infected with the same clone, a total of 7 strains of MRSA clonal propagation has shown that property. Consequently, it can be said that t030 and ST239 was the most common spa and MLST types which isolated from cow milk and nasal swabs and nasal swabs from workers of these farms in Aydın.