MEFV Geninin Exon 2 bölgesindeki Arg202Gln polimorfizminin bölgemizdeki sıklığı ve Exon 10'daki mutasyonlar ile ilişkisi
Frequencies of Arg202gln polymorphism at the region of Exon 2 in MEFV gene and its assocıation with Exon 10 mutations
Yazar: ATİLLA TOPÇU
Danışman: PROF. DR. İBRAHİM PİRİM
Atatürk Üniversitesi / Sağlık Bilimleri Enstitüsü / Tıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2011
Konu: Genetik = Genetics ; Tıbbi Biyoloji = Medical Biology
Dizin: Ailesel akdeniz ateşi = Familial mediterranean fever ; DNA = DNA ; Fenotip = Phenotype ; Genotip = Genotype ; Mutasyon = Mutation ; Mutasyon frekansı = Mutation frequence ; Polimorfizm-genetik = Polymorphism-genetic

Özet:
FMF (Familial Mediterranean Fever) veya Ailesel Akdeniz Ateşi (AAA), tekrarlayan ateş, serozal, sinovyal ya da kutanöz inflamasyon şikayetleri ile tesbit edilen otozomal resesif kalıtılan sistemik otoinflamatuar bir hastalıktır.FMF hastalığına neden olan gen 16. kromozomun kısa kolunda (16p13.3) haritalanmıştır. MEFV geni 15 kb uzunluğunda 3505 nükleotidden oluşmaktadır. FMF genin kodladığı proteine Pyrin/Marenostrin denilmektedir. Pyrin 781 aminoasitten oluşan bir proteindir ve bu proteinin inflamasyonda regülatör olarak görev yaptığı düşünülmektedir.Pyrin granulosit, monosit, dendritik hücre ve sinovyal fibroblastlarda eksprese olur. Ayrıca dalak, akciğer ve kasta da eksprese edilir.FMF'in nedeni pyrin proteinini kodlayan MEFV geninde resesif kalıtılan mutasyonlardır. FMF taşıyıcı frekansı Doğu Akdeniz populasyonunda çok yaygındır. Hastalık genel olarak Türk, Arap, Askenazi olmayan Yahudi ve Ermenilerde yaygındır ve taşıyıcı oranı yüksektir. Hastalığın en ciddi sorunu renal amiloidozdur.Olgu grubu belirlenirken MEFV geninin ekzon 2 bölgesinde R202Q değişiminin olduğu 186 hasta çalışmaya alındı. Ekzon 2 bölgesinde R202Q gen değişimi bulunan hastalarda bu değişimin Ekzon 10 bölgesindeki mutasyonlar ile ilişkisi araştırıldı. Tüm örneklere DNA Dizi Analizi yapıldı. Çalışma sonucunda R202Q değişimi olan 186 hastada Ekzon 10 bölgesinde yer alan M694V (%71) ile önemli bir ilişki gösterdiği, M680I (%8,6) , V726A (%8,1) , R761H (%4,3) , A744S (%0,5) mutasyonları ile ilişki göstermediği görüldü.

Abstract:
Familial Mediterranean Fever (FMF) is an autosomal recessive disease characterized by recurrent attacks of inflammation of serosal membranes.The gene, which is related to the FMF, is localised on short arm of chr16 (16p 13.3). It consists of 3505 nucleotid with 15 kb length. The product of FMF gene is called Pyrin/Marenostrin. Pyrin involves 781 aminoacid and plays a role for inflammation.Pyrin protein is expressed in granulocyte, monocytes, dendritic cells and fibroblasts. Moreover, spleen, lung and muscle cell are also expressed the protein.The frequency of FMF carriage is high at the population of Eastern Mediterranean region. The prevalence of the disease is frequently high among Turkish, Arabs, Jews and Armenians populations.The study plan was made according to presence of R202Q polymorphism in patients 186 subjects. In these subjects, exon 2, R202Q polymorphism was compared to existance of exon 10 mutation. All DNA samples were analyzed by DNA sequence. The results of the study represented that M694V (%71) mutation was significantly associated with R202Q polymorphism, less significant other mutations were found as follow; M680I (%8,6), V726A (%8,1), R761H (%4,3) and A744S (%0,5).