Pamoik  asit içeren tek kristallerin sentezi ve molekül yapılarının X –ışını kırınımı  ile aydınlatılması
Synthesis of single crystal containing pamoic acid and structural characterisation by X-ray diffraction
Yazar: TUĞBA ŞİMŞİR
Danışman: PROF. DR. MUSA GÖGEBAKAN
Kahramanmaraş Sütçü İmam Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Fizik Ana Bilim Dalı / Fizik Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2018
Konu: Fizik ve Fizik Mühendisliği = Physics and Physics Engineering
Dizin: X ışını kırınımı yöntemi = X ray diffraction method

Özet:
Bu tez çalışmasında, pamoik asit-fenantrolin proton transfer kompleksi [(HPhen)(HPam)] ve Cu(II) kompleksi {[Cu(Phen)2(H2O)2] Pam ∙ 2.5H2O hazırlanmış ve yapıları spektroskopik ve analitik yöntemler ile karakterize edilmiştir. Bileşiklerin yapıları, tek kristal X-ışını kırınım çalışmaları ile belirlenmiştir. Proton transfer kompleksinin [(HPhen)(HPam)] yapısında, bir pamoik asit molekülünün karboksil gruplarından biri, fenantrolin azot atomuna protein transferi olmuştur. Yapıda, protonlanmış fenantrolin (HPhen)+ ve mono-deprotonlanmış pamoik asit (HPam)- arasında hidrojen bağ etkileşimleri gözlenmemiştir. DMF çözücüsü ve fenantrolin (HPhen)+ katyonları arasında bir hidrojen bağı (N1-H•••O7) gözlenmiştir. Mono deprotonlu pamoik asit [HPam]-  arasındaki hidrojen bağları ve π-π  etkileşimleri kristalin istiflenmesinde çok önemli bir rol oynamıştır. X-ışını kristalografik verileri, Cu(II) kompleksinin [Cu(Phen)2(H2O)2]+2 katyonik birimi,  bir pamoat anyonu ve örgü su moleküllerinden (karmaşık katyonu başına 2.5H2O)  oluştuğunu göstermiştir. Yapıda, her bir Cu(II) iyonu altı koordineli olup iki fenontrolin liganalının dört azot atomuna ve iki su ligandına bağlanıp oktahedral geometri oluşturmuştur. Pamoat anyonu ise Cu(II) iyonu ile koordinasyon bağı oluşturmamıştır. Kompleks katyonları hidrojen bağları ile iki boyutlu hidrojen bağ örgüsü oluşturmuştur. İki boyutta oluşan hidrojen bağ örgüsü π-π etkileşimleri ile genişleyerek üç boyutlu supramoleküler örgü oluşturmuştur. Sentezlenen ve molekül yapıları aydınlatılan bileşiklerin UV–Vis. ve emisyon özellikleri katı ve çözelti ortamında incelenmiştir.

Abstract:
In this thesis study, pamoic acid-phenantroline is prepared from proton transfer complex [(HPhen)(HPam)] and Cu(II) complex [Cu(Phen)2(H2O)2] Pam•2.5H2O and its structures are characterized by spectroscopic and analytical methods. It was. The structures of the compounds were determined by single crystal X-ray diffraction studies. One of the carboxyl groups of the pamoic acid molecule in the [(HPhen)(HPam)] structure of the proton transfer complex was protein transfer to the phenanthroline nitrogen atom. No hydrogen bond was observed between protonated phenantroline (HPhen)+ and mono-deprotonated pamoic acid (HPam)-. Between the DMF solution and the phenantroline (HPhen)+ cations, a hydrogen bond (N1-H•••O7) was observed. Mono deprotonated pamoic acid The hydrogen bonds between the [HPam]- and π-π interactions play an important role in the packaging of the structure. X-ray crystallographic data showed that the Cu(II) complex consists of [Cu(Phen2(H2O)2]+2 cationic units, a pamoate anion and lattice water molecules (2.5H2O per complex cation). In the structure, each Cu(II) ion is six- coordinated   and coordinated to  four nitrogen atoms of two  phenontrolin ligands and two water ligands with a distorted octahedral geometry. The pamoate anion  does not involve in coordination with Cu(II) ion. The cationic unitsare linked by intermolecular hydrogen bonds forming a 2D hydrogen bond network. 2D hydrogen bond network further extended to 3D network by π-π stacking  interactions. Absorption and emission spectral features of the compounds were investigated both in the solid state and solution.