hakansabunis/tr-academic-research-agent-index huggingface dataset:
In vitro ortamda üretilen HL-60 hücre soyu üzerine Sorafenib ve Lityum klorürün biyokimyasal etkilerinin incelenmesi
HL-60 cell line generated in vitro environment on analysis of the biochemical effects of Sorafenib and Lithium chloride
Yazar: AYSUN EKİNCİ
Danışman: PROF. DR. SAFİYE KAYA
İstanbul Üniversitesi / Cerrahpaşa Tıp Fakültesi / Biyokimya Ana Bilim Dalı
Derece: Tıpta Uzmanlık, 2011
Konu: Biyokimya = Biochemistry ; Onkoloji = Oncology
Dizin: Antineoplastik ajanlar = Antineoplastic agents ; Apoptozis = Apoptosis ; HL60 = HL60 ; Lityum klorür = Lithium chloride ; Lösemi = Leukemia ; Protein kinazlar = Protein kinases

Özet:
Akut lösemiler olgun hücrelerin azalması ve lökosit prekürsörlerinin (lösemik blastlar) birikimi ile karakterizedir. Bu çalışmada HL-60 insan Akut Promyelositik Lösemi (APL) hücre kültüründe Sorafenib ve Lityum Klorür (LiCl)'ün etkilerini araştırmak amaçlanmıştır. Deneylerde Sorafenib ve LiCl ilaçları tek tek ve birlikte, insan kökenli HL-60 APL hücrelerinden oluşan kültürde 72 saat boyunca denenmiştir. Tümör hücre sayıları sayım kamarasıyla, apoptoz oranları akım sitometri yöntemiyle değerlendirilmiştir. Hücre kültüründe hücrelerde meydana gelen değişiklikler geçirimli elektron mikroskobu ile araştırılmıştır. İlaçların etkileri hangi yoldan oluşturduklarını saptamak için ELISA yöntemi ile kaspaz-3 aktivitesi, fosforile GSK-3ß, fosforile AKT, total AKT, fosforile p38, total p38, fosforile ERK, total ERK, fosforile I?B?, total I?B? , fosforile c-jun, total c-jun, fosforile STAT3 ve total STAT3 seviyelerine bakıldı. Sorafenib ve LiCl'ün tek tek ve birlikte verilmesi durumunda HL-60 insan hücre kültüründe kontrol grubuna göre istatistiksel olarak anlamlı derecede hücre sayısını azalttığı ve apoptoz oranını artırdığı tespit edilmiştir.

Abstract:
Acute leukemia is characterisized with decreasing mature cells and aggregation of leucocyte precursors. In this study we aimed to investigate the effects of Sorafenib and Lithium Chloride (LiCl) on HL-60 human Acute Promyelocytic Leukemia (APL) cell line. The HL-60 APL cell cultures are subjected to Sorafenib and LiCl separately and in combination for 72 hours during experiments. Tumor cells are counted under Cell Count Hemocytometer and the apoptose ratios are investigated with flow cytometry method. The changes in the cells in cell cultures are evaulated by transmission electron microscopy. To determine the possible the mechanism of action of the drugs, the caspase 3 actvities, phosphorylated GSK-3ß, phosphorylated AKT, total AKT, phosphorylated p38, total p38, phosphorylated ERK, total ERK, phosphorylated I?B?, total I?B? , phosphorylated c-jun, total c-jun, phosphorylated STAT3 ve total STAT3 levels are investigated with ELISA method. Separately and in combination Sorafenib and LiCl decreased the number of cells and increased the apoptotic ratio in HL-60 APL cell line in a statistically significant manner when compared with the control group.
NVIDIA cuda ile yüksek performanslı görüntü işleme
High performance image processing with NVIDIA cuda
Yazar: ERTAN YILDIZ
Danışman: PROF. DR. SABRİ ARIK
İstanbul Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Bilgisayar Mühendisliği Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2011
Konu: Bilgisayar Mühendisliği Bilimleri-Bilgisayar ve Kontrol = Computer Engineering and Computer Science and Control

Özet:
Son yıllarda hızla gelişen GPU teknolojisi araştırmacıların ve yazılım geliştiricilerin dikkatini çekmiştir. Özellikle GPU'ları genel amaçlı hesaplamalar için kullanabilen programlama arayüzlerinin geliştirilmesi ile GPU dünyasında yeni bir çağ başlamıştır. Yaşanan bu gelişmeler, tıbbi görüntü işleme ve 3D modelleme gibi birçok alanda yeni fikirleri tetiklemiştir. Görüntü işleme gibi yüksek derecede veri paralelliği gerektiren bazı alanlarda köklü değişiklikler yaşanmıştır.Bu çalışmada, NVIDIA firmasının CUDA destekli platformlarında, paralel programlama ile yüksek performanslı uygulamalar geliştirmeyi sağlayan CUDA C dili incelenmiştir. Bu dil ile örnek bir tekil nesne takibi uygulaması geliştirilmiştir. Uygulama geliştirme aşamasında CUDA C dilinin bazı temel özellikleri test edilmiş ve sonuçlar ayrıntılı istatistikler ile birlikte sunulmuştur.

Abstract:
GPU technology, which is developing rapidly in recent years, has attracted the attention of researchers and software developers. Especially the development of programming interfaces that can use GPUs for general-purpose computations, started a new age ın GPU world. These developments triggered new ideas in so many fields such as medical image processing and 3D modeling. Fundamental changes have occurred in some fields such as image processing which require high level data parallelism.This study examines the CUDA C language which provides development of high-performance applications by parallel programming on NVIDIA CUDA-supported platforms. A sample single object tracking application is developed via using CUDA C. Some of the basic features of the CUDA C language has been tested during application development stage and the results have been presented along with detailed statistics.
Manyetik alana duyarlı jelatin - hidrojellerin hazırlanması ve ilaç salımı profilinin incelenmesi
The preparation of magnetic sensitive gelatin - hydrogels and investigation of drug release profile
Yazar: AYLİN YALÇIN
Danışman: PROF. DR. AYŞE ZEHRA AROĞUZ
İstanbul Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Fizikokimya Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2011
Konu: Kimya = Chemistry
Dizin: Jeller = Gels

Özet:
Günümüzde biyobozunur polimerlerden oluşturulan hidrojeller bilimsel çalışmalarda oldukça önem kazanmıştır. Hidrojeller özellikle tıbbi alanda hücre büyütme çalışmalarında, ilaç yükleme ve salım sistemlerinde yaygın olarak kullanılmaktadır. Son zamanlarda ilaç endüstrisinde araştırma ve geliştirme tekniklerinde yapılan çalışmalar kontrollü ilaç yükleme ve salım prosesleri üzerinde yoğunlaşmıştır.Bu çalışmada, jelatin ferrojel, jelatin/akrilik asit (jelatin/AA) ve gluteraldehit çapraz bağlı jelatin/akrilik asit ferrojel (jelatin/AA/GA) olmak üzere üç farklı ferrojel kullanılmıştır.Manyetik alana duyarlı ferrojel elde etmek amacıyla, demir II ve demir III tuzları kullanılmıştır. Bu hazırlanan jelatin ferrojeller 220C de manyetik alanlı ve manyetik alansız ortamda ilaç yükleme çalışmalarında kullanılmıştır. Ayrıca ferrojellerin ilaç yüklemesi için vücut sıcaklığı olan 370C'de çalışılmıştır.Benzer şekilde şişme deneyleri destile suda 220C de ve 370C de gerçekleşmiştir. Sonuçlar vücut sıcaklığı 370C'de jelatin/AA ferrojeli için yüksek şişme değerlerini göstermiştir. Bu çalışmada hazırlanan ferrojellerin morfolojik analizleri, taramalı elektron mikroskobu kullanılarak yapılmıştır.

Abstract:
Nowadays hydrogels from biodegradable polymers are considerably interest in the scientific research. Hydrogels are commonly used in the medical areas such as in the cell growth experiments, drug delivery and release systems. Recently, many studies on the research and development techniques in farmaceutical industries are concentrated on the controlled drug loading and drug release processes.In this study, three different ferrogels as gelatin ferrogel, gelatin/acrylic acid (gelatin/AA) ferrogel and gelatin/acrylic acid ferrogel crosslinked with gluteraldehide (gelatin/AA/GA) were prepared. For this purpose iron II and iron III salts were used to obtain magnetic field sensitive ferrogels. These prepared gelatin ferrogels were used for the drug loading studies with and without magnetic field at 220C. The drug loading of ferrogels was also studied at the body temperature, 370C. The swelling experiments were done in distilled water at 220C and 370C. The results showed that high percantage of swelling were obtained in the gelatin/AA ferrogel in the body temperature. The morphological analysis of the ferrogels prepared in this study were obtained by using scanning electron microscope.
Batı Karadeniz yöresi sarıçam meşcerelerinde artım ve büyüme
Increment and growth of Pinus silvestris forests in West Blacksea region
Yazar: MUAMMER ŞENYURT
Danışman: PROF. DR. ÖMER SARAÇOĞLU
İstanbul Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Orman Mühendisliği Ana Bilim Dalı / Orman Hasılatı ve Biyometri Bilim Dalı
Derece: Doktora, 2011
Konu: Ormancılık ve Orman Mühendisliği = Forestry and Forest Engineering
Dizin: Batı Karadeniz bölgesi = West Black Sea region ; Büyüme = Growth ; Hacim = Volume ; Pinus sylvestris = Pinus sylvestris ; Sarıçam = Scoth pine ; Sıklık = Density

Özet:
Bu çalışmada, Batı Karadeniz Yöresi Sarıçam (Pinus sylvestris) meşcerelerinde artım ve büyüme ilişkileri incelenmiştir. Bu incelemeler tek ağaç ve meşcere bazında yaş, bonitet ve sıklık derecelerine göre yapılmıştır.Bu amaçla, 2006-2008 yılları arasında Kastamonu, Sinop, Bolu, Zonguldak, Ankara ve İstanbul Orman Bölge Müdürlükleri bünyesinde toplam 101 geçici örnek alan alınmıştır. Bu örnek alanlardan elde edilen veriler yardımıyla bonitet, hacım ve hasılat tabloları düzenlenmiştir. Hasılat tablosunu istenilen yaş, sıklık ve bonitete göre veren bir program yazılmıştır. Hasılat tablosu 5 farklı sıklık derecesi ve 5 farklı bonitet sınıfına göre 20 yaşından başlamakta ve 10 yıllık periyotlara göre sonuç vermektedir.Batı Karadeniz yöresi sarıçam hasılat tablosu değerleri hem Alemdağ (1967), Batu (1971) ve Erdemir (1974) sarıçam hasılat tablolarıyla hem de diğer bazı asli ağaç türleri (Karaçam, Kızılçam ve Doğu ladini) ile karşılaştırılmıştır. Doğal kanuniyetler hakkında yorumlamalar yapılmıştır.

Abstract:
In this study, the increment and growth relationships of West Black sea Scots pine (Pinus sylvestris) stands in Western Black Sea region were examined. These relationships are based on individual tree and stand level according to age, site quality and stand density.For this purpose, 101 temporary sample plots were taken in Kastamonu, Bolu, Zonguldak, Ankara and Istanbul forest regional offices between 2006 and 2008 years. Site quality, volume and yield tables were made with the help of the data which obtained from these sample plots. A computer program designed to make revenue table according to desired age, density and site quality. Yield table prepared according to 5 different density and 5 different site quality classes. Yield tables are 10 years period and begin from 20 ages.The values of western Black sea Scotchs pine yield tables compared with both Alemdağ (1967), Batu (1971) and Erdemir (1974) Scotchs pine yield tables and with some of the common species (Pinus nigra, Pimus brutia and Picea orientalis) yield tables. Comments made about nature rules.
İMKB'de kurumsal yönetim ve firma değeri ilişkisinin modellenmesine ilişkin bir uygulama
An application on modelling for the relationship between corporate governance and firm value in IMKB
Yazar: HALİL CENK SÜER
Danışman: PROF. DR. AHMET KÖSE
İstanbul Üniversitesi / Sosyal Bilimler Enstitüsü / İşletme Ana Bilim Dalı
Derece: Doktora, 2011
Konu: İşletme = Business Administration
Dizin: Firma değeri = Firm value ; Kurumsal yönetim = Corporate governance ; Kurumsal yönetim endeksi = Corporate governance index ; İMKB = İstanbul Stock Exchange

Özet:
?Kurumsal Yönetim? kavramının ortaya çıkışı, modern halka açık şirketlerin sahipleri (hissedarlar) ile kontrolü elinde bulunduranları (yöneticiler) arasında ayrışma olarak ifade edilebilecek temel vekâlet problemi ile ilişkilidir. Teoride, kurumsal yönetimin firma değeri ile ilişkisi olduğu ifade edilerek, iyi kurumsal yönetim uygulamaları olan firmaların finansal krizlerden daha az etkilenmeleri beklenir. Literatürde finansal krizlerle, kurumsal yönetim arasında çeşitli ilişkiler gözlenmiştir. Türkiye dışında gelişmekte olan piyasalarda yaşanan finansal krizlerde, bağımsız yabancı yatırımcılar tarafından yüksek mülkiyet yoğunlaşması olan firmaların hisse değerlerinde krizden sonra küçük bir düşüş tecrübe edilmiştir. Yüksek kamuya açıklama kalitesi ve alternatif dış finansman kaynakları olan firmalar da krizlerde daha az zorlanmışlardır. Buna rağmen kontrol eden aile sahipliğinin yüksek pay sahibi olduğu firmaların özsermayelerinin değerinde kriz sürecinde daha büyük düşüş deneyimlenmiştir. Bu çalışmada kurumsal yönetim kalitesi bir endeks oluşturularak ölçülmüş, firma değeri ile ilişkisi kullanılan ekonometrik yöntemlerle incelenmiştir.

Abstract:
The concept of ?Corporate Governance? is related to the basic agency problem that could be identified as the segregation of the owners (stockholders) and controllers (managers) of the limited public companies of modern times. In theory, by stating that corporate governance could be associated with the firm value, throughout financial crises companies with good corporate governance should be expected to be affected less. In the literature, various relationship is observed between financial crises and corporate governance. During the financial crises experienced in the emerging markets other than Turkey, independent foreign investors have observed insignificant decrease in stock prices of the companies that have high ownership concentration. Companies with greater quality of public disclosure and alternative exterior financing sources have also lived less difficulty in the financal crises. In spite of this, however, there have been higher value loss of the shareholders? funds in the companies where the controlling shares of family ownership are comparatively high. In this study, quality of corporate governance has been measured through constituting of an index and relation with corporate value examined via econometric models.
Pers hakimiyeti altında Batı Anadolu
Western anatolia under the Qersian rule
Yazar: SERAP ÖZKAN KILIÇ
Danışman: PROF. DR. MUSTAFA H. SAYAR
İstanbul Üniversitesi / Sosyal Bilimler Enstitüsü / Tarih Ana Bilim Dalı / Eskiçağ Tarihi Bilim Dalı
Derece: Doktora, 2011
Konu: Tarih = History
Dizin: Anadolu = Anatolia ; Batı Anadolu = West Anatolia ; Batı Anadolu = West Anatolia ; Eski Çağ = Old Age ; Eski Çağ tarihi = Old Age history ; Persler = Persians ; Savaş = War

Özet:
?Pers hâkimiyeti altında Batı Anadolu? başlığı altında ele aldığımız konumuzun kapsamında kuzeyde Troas Bölgesi'nden başlamak üzere güneye doğru Bithynia, Mysia, Aiolis, Ionia, Lydia, Karia ve Lykia bölgeleri yer almaktadır. İ. Ö. 547/46 yılında Perslerin Lydia Krallığı'nın başkenti Sardeis'i ele geçirmesiyle başlayan ve İ. Ö. 334 yılında yapılan Granikos Savaşı sonucunda Büyük İskender'in Anadolu'daki Pers hâkimiyetine son vermesiyle noktalanan yaklaşık iki yüz yıllık süreçte Batı Anadolu kentlerinin durumu politik, ekonomik ve kültürel açılardan değerlendirilmiştir. Pers hâkimiyeti öncesinde ekonomik açıdan önemli bir refah düzeyine ulaşmış olan Batı Anadolu kentleri bu duruma paralel olarak bilim ve sanat dallarında da önemli merkezler haline gelmişlerdi. Pers işgalinden sonra, Pers-Yunan Savaşları ve Atina ile Sparta arasındaki çekişmenin doğurduğu Peloponnesos Savaşları nedeniyle sürekli savaş durumunda kalmaktan ve sözünü ettiğimiz egemen güçlere ödedikleri vergiler yüzünden ekonomik açıdan oldukça hırpalanmışlardır. Bu olumsuzluklar kentlerin mimari ve sanatsal faaliyetlerine de yansımış ve bu faaliyetleri neredeyse durma noktasına getirmiştir. Sanatsal açıdan her iki kültürün de birbirlerinden etkilenmiş olmaları beklenen bir durumdur. Ancak bölgede Pers etkisi taşıdığı düşünülen eser sayısı oldukça sınırlıdır.

Abstract:
?Western Anatolia under the Persian rule?, which is the main subject our the thesis, covers Bithynia, Mysia, Aiolis, Ionia, Lydia, Caria and Lycia to the south starting from the Troad. The 200 years that began with the capture of the Lydian capital Sardeis by the Persians in 547/6 BC closed in 334 BC by Alexander the Great Battle of Granicus, which brought an end to the Persian rule, was evaluated from political, economical and cultural perspectives. Anatolian cities, which had flourished before the pre-Persian period, had also become centres of culture and science. After the Persian invasion, the Persian Wars, the Peloponnesian Wars broke out due to the struggle between Athens and Sparta, and heavy taxes imposed by the dominant powers, the cities were economically declined. This negative developments were reflected in the cities? architectural and artistic activities, which came to a halt. Mutual influences in art is expected, but the number of Persian-influenced works in the region are small.
Erkek infertilitesinde sperm apopitozunun intrauterin inseminasyon ve intrasitoplazmik sperm injeksiyonu sonuçlarına etkisi
Effects of sperm apoptosis on the intaruterine insemination and intracytoplasmic sperm injection outcomes in male factor infertility
Yazar: H. HANDE KALEM
Danışman: PROF. DR. ŞENOL ERTÜRKOĞLU
İstanbul Üniversitesi / Cerrahpaşa Tıp Fakültesi / Histoloji ve Embriyoloji Ana Bilim Dalı
Derece: Tıpta Uzmanlık, 2011
Konu: Histoloji ve Embriyoloji = Histology and Embryology
Dizin: Akım sitometrisi = Flow cytometry ; Anneksin V = Annexin V ; Apoptozis = Apoptosis ; Dölleme = Insemination ; Kısırlık-erkek = Infertility-male ; Oligospermi = Oligospermia ; Sperm = Spermatozoa ; Üreme teknikleri = Reproduction techniques

Özet:
Sperm DNA kalitesi ile ilgili testler, infertilite kliniğine yardımcı olma özelliğini taşımaktadır. Son yıllarda yapılan moleküler, biyolojik, ultrastrüktürel ve histokimyasal çalışmalar sperm DNA ve kromatin yapısını incelemede hızlı ilerleme sağlamıştır .Sperm apopitozu fertilite incelemelerinde bir kriter olarak ele alınmaktadır.Bu çalışmanın amacı IUI ve ICSI olgularında sperm apopitozunun klinik sonuçlara etkisinin incelenmesi ve sperm hazırlamada kullanılan yöntemlerin Annexin V ve Tunel testleri ile sperm DNA bütünlüğünü ne derece koruduğunu araştırmaktır.Toplam 83 olgu çalışmaya dahil edildi. 45 IUI ve 38 ICSI olgusu çalışmada değerlendirilmiştir.Bu olgulardan 11 kontrol ve 12 oligospermi olgusu sperm hazırlama yöntemlerinin test edilmesinde ve elektronmikroskopi değerlendirilmesinde kullanılmıştır.Sperm hazırlamada iki ayrı ortam sıcaklığı ve 0. Saat ile 3.saat inkübasyonları değerlendirilmiştir. Sperm apopitozu tüm olgularda değerlendirilmiş ve klinik gebelik sonuçları ile ilişkisi incelenmiştir. Bu amaçla Annexin V ve Tunel testleri kullanılmıştır.Sperm apopitozunun IUI olgularında gebelik ile negatif korelasyonu görülmüştür. ICSI olgularında ise bir ilişki bulunamamıştır. Kullanılan farklı sıcaklık ortamlarından 37ºC nin sperm apopitozunu artırdığı gözlenmiştir.

Abstract:
It has been indicated by many studies that maturated spermatozoa could be exposed to apoptosis. Sperm apoptosis assessment has been suggested as a fertility predictor.The aim of this study was to examine the relationship between the results of Annexin V and Tunnel assay apoptosis marker and the outcome of IUI and ICSI.A total of 83 consecutive couples undergoing assisted reproduction were included. IUI was performed in 45 and ICSI in 38. Annexin V results were expressed as sperm viability, early apoptosis and late apoptosis cell fractions. Reproductive outcome parameter was clinical pregnancy with sac. 11 control and 12 oligospermic samples were tested also on two different incubation temperature for apoptosis.A negative correlation have been found between spermatozoa apoptosis and IUI outcome but no relationship with ICSI. Incubation period with 37ºC and 3 hours has detrimental effect on sperm DNA integrity.
İkinci dünya savaşı sonlarında ABD belgelerine göre Türkiye-ABD ilişkileri (1943-1945)
Turkey-usa relations at the end of second world war in the U.S. documents (1943-1945)
Yazar: MURAT ÖZATA
Danışman: YRD. DOÇ. DR. FATİH MEHMET SANCAKTAR
İstanbul Üniversitesi / Sosyal Bilimler Enstitüsü / Tarih Ana Bilim Dalı / Türkiye Cumhuriyeti Tarihi Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2011
Konu: Tarih = History ; Uluslararası İlişkiler = International Relations
Dizin: Amerika Birleşik Devletleri = United States of America ; Belgeler = Documents ; Dünya Savaşı II = World War II ; Tarihsel gelişim = Historical development ; Türk-Amerikan ilişkileri = Turkish-American relations ; Türkiye = Turkey ; Uluslararası ilişkiler = International relations ; Uluslararası politika = International policy

Özet:
II. Dünya Savaşının ardından ortaya çıkan iki kutuplu dünyada, Türkiye ABD'den yana olmuştur. Bu çalışmada savaş sonrası dönemde hızla gelişen Türkiye-ABD ilişkilerinin tarihi temelleri ABD belgeleri esas alınarak ortaya konmuştur. 1943-1945 yılları arasındaki siyasi, askeri, ekonomik ilişkilerin Türkiye-ABD yakınlaşmasındaki rolü, uluslararası gelişmelerin Türk ve Amerikan dış politikalarına yansımaları incelenmiştir. ABD'nin Türkiye ile ilişkileri ABD dış politikasının genel hatları içinde değerlendirilerek, Türkiye'nin bu çerçeveye dahil edilme süreci ele alınmıştır. Bu aynı zamanda daha geniş bir perspektiften Türkiye'nin uluslararası sistemde konumlandırılmasını sağlamıştır. Savaş sonunda ileri sürülen Sovyetler Birliği taleplerine karşı ABD kesin bir şekilde Türkiye'nin yanında yer almıştır. ABD dış politikasında bir kırılma noktası olarak görülen bu gelişme gerçekte savaş süresinde planlan-uygulanan Ortadoğu politikasının bir yansımasıdır. Türkiye ile savaş sonrası dönemde gelişen ilişkiler ABD'nin 1943 yılından itibaren sistemli bir şekilde sürdürdüğü askeri-ekonomik politikaların sonucu olmuştur.

Abstract:
In the bi-polar World which emerged after the Second World War, Turkey took the USA side. In this study the historical bases of the USA - Turkey relations which developed rapidly after the Second World War is presented based upon the USA sources. The role of political, military, economic relations between the years 1943-1945 in the USA-Turkey rapprochement and the reflections of the international developments to Turkish and American foreign policies are investigated. The USA relations with Turkey are discussed in the general framework of the USA foreign policy and the process of including Turkey to this framework is handled. This also helped to locate Turkey in the international arena by providing broader perspective. At the end of the Second World War, the USA conclusively supported Turkey against the demands of the USSR. This development is seen as a breakpoint in the USA foreign policy. Indeed, this change was a reflection of the USA?s Middle East policy which was planned and applied during the Second World War. The relations that flourished between Turkey and the USA after the Second World War is the result of the military and economic policies that the USA systematically followed after 1943.