Kolanjiokarsinoma hücre hattında (TFK-1) suberoylanilid hidroksamik asit'in growth arrest spesifik protein (GAS6) ve AXL üzerine etkisi
Effect of suberoylanilide hydroxamic acid on growth arrest specific protein (GAS6 ) and AXL in cholangiocarcinoma cell line (TFK-1)
Yazar: NESLİHAN HAKLIGÜR
Danışman: PROF. DR. GÜLDEN BAŞKOL
Erciyes Üniversitesi / Sağlık Bilimleri Enstitüsü / Kök Hücre Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2018
Konu: Biyokimya = Biochemistry ; Tıbbi Biyoloji = Medical Biology
Dizin: Epigenez-genetik = Epigenesis-genetic ; Gas6 = Gas6 ; Hücre dizisi = Cell line ; Kolanjiokarsinoma = Cholangiocarcinoma ; Suberoylanilid hidroksamik asit = Suberoylanilide hydroxamic acid

Özet:
KOLANJİOKARSİNOMA HÜCRE HATTINDA (TFK-1) SUBEROYLANİLİD HİDROKSAMİK ASİT'İN GROWTH ARREST SPESİFİK PROTEİN (GAS6) VE AXL ÜZERİNE ETKİSİ

Neslihan HAKLIGÜR

Erciyes Üniversitesi Sağlık Bilimleri Enstitüsü
Kök Hücre Bilimleri Anabilim Dalı
Yüksek Lisans Tezi, Haziran 2018
Danışman: Prof. Dr. Gülden BAŞKOL

ÖZET

Kolanjiokarsinoma (KK), safra yollarının epitellerinden kaynaklanan malign bir tümördür. KK'nın insidansı ve  mortalitesi dünya genelinde giderek artmaktadır. Asetilasyon ve deasetilasyon gen ekspresyonunun düzenlenmesinde önemli epigenetik mekanizmalardır. Birçok insan kanserinde,  asetilasyon seviyesinde değişiklikler olduğu ve çeşitli HDAC'ların overekspresyona uğradığı bildirilmiştir. Kanserde meydana gelen epigenetik değişikliklerin potansiyel geri dönüşümlü olması, epigenetik tedavi seçeneğini ortaya çıkarmıştır. SAHA, bir HDAC inhibitörüdür ve çeşitli tümör hücrelerinde antikanser aktivite gösterdiği bildirilmiştir. RTK'lar, hücre büyümesi, farklılaşması, migrasyon, apopitozis gibi çeşitli biyolojik faaliyetleri kontrol ederler. Reseptör tirozin kinaz yolağının, çoğu kanser türünde anormal aktivite gösterdiği bildirilmiştir. TAM reseptör kinaz ailesinden Axl ve ligandı Gas6'nın, çeşitli insan kanserlerinde aşırı ekspresyona uğradığı, invazyon ve metastazla ilişkili olduğu belirlenmiştir.
Biz bu çalışmada, kolanjiokarsinoma hücre hattında (TFK-1), SAHA' nın, Axl ve Gas6 üzerine etkisini araştırdık. Bu amaçla, TFK-1 hücrelerine, kültür ortamında 48 saat süre ile 2 μM SAHA uygulandı ve süre sonunda hücre kültür medium süpernatantlarında Gas6 ve Axl seviyesi ELİSA yöntemi ile değerlendirildi. Deney sonucunda SAHA uygulamasının, kontrol grubuna göre, Axl seviyesinde istatiksel olarak anlamlı biçimde azalmaya neden olurken, Gas6 seviyesinde, istatiksel olarak anlamlı biçimde artışa neden olduğu tespit edildi (p<0,05).
Sonuç olarak, kolanjiokarsinoma hücrelerinde, SAHA'nın Axl seviyesinde azalmaya neden olması olumlu bir etki olarak görülürken, Gas6 seviyesinde artışa yol açması, SAHA'nın Gas6/Axl mekanizması üzerinde farklı etkileri olabileceğini düşündürmektedir. Bu konunun aydınlatılması için ayrıntılı çalışmalar yapılması gerekmektedir.
Anahtar Kelimeler: Kolanjiokarsinoma, SAHA, Gas6, Axl

Abstract:
EFFECT OF SUBEROYLANILIDE HYDROXAMIC ACID ON GROWTH ARREST SPECIFIC PROTEIN (GAS6 ) AND AXL IN CHOLANGIOCARCINOMA CELL LINE (TFK-1)

Neslihan HAKLIGÜR

Erciyes University, Graduate School of Health Sciences
Department of Stem Cell Sciences
M. Sc. Thesis, June 2018
Supervisor: Prof. Dr. Gülden BAŞKOL

ABSTRACT

Cholangiocarcinoma (CC) is a malignant tumor originating from the epithelium of the bile ducts. The incidence and mortality of CC has been increasing worldwide. Acetylation and deacetylation are important epigenetic mechanisms in the regulation of gene expression. Alterations in the level of acetylation in many cancers have been identified and various HDACs have been found to undergo overexpression. The potential reversibility of epigenetic changes in cancer has led to the choice of epigenetic therapy. SAHA is an HDAC inhibitor and it has been reported to exhibit anticancer activity in various tumor cells. RTKs control a variety of biological activities such as cell growth, differentiation, migration, apoptosis. Receptor tyrosine kinase pathway has been reported to exhibit anormal activity in most cancer types. Axl, a member of the TAM receptor kinase family, and its ligand Gas6 have been found to be overexpressed in various human cancers and associated with invasion and metastasis.
In this study, we investigated the effect of SAHA on Axl and Gas6 in the cholangiocarcinoma cell line (TFK-1). For this purpose, TFK-1 cells were treated with 2 μM SAHA for 48 hours in culture medium and  than  the level of Gas6 and Axl in cell culture medium supernatants were evaluated by ELISA method. As a result, it was determined that the SAHA application resulted in a statistically significant increase in the level of Gas6  while causing a statistically significant decrease in the Axl level when compared with the control group. (p<0,05).
In conclusion, the fact that SAHA causing a decrease in Axl level in cholangiocarcinoma cells is considered to be a positive effect but the increase in Gas6 level suggests that SAHA may have different effects on the Gas6 / Axl mechanism. Furher studies are  needed  to clarify this issue.
Key Words:  Cholangiocarcinoma, SAHA, Gas6, Axl