Hemodiyaliz hastalarında hepatit G virusu (HGV-GBV/C) infeksiyonunun cDNA polimeraz zincir tepkimesi ile gösterilmesi ve HGV genotiplerinin belirlenmesi
Determining the HGV infection in hemodialysis patients with cDNA polymerase chain reaction and evaluating the HGV genotype
Yazar: TUNCER TOKLU
Danışman: DOÇ. DR. Y. HAKAN ABACIOĞLU
Dokuz Eylül Üniversitesi / Tıp Fakültesi / Mikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
Derece: Tıpta Uzmanlık, 2000
Konu: Mikrobiyoloji = Microbiology
Dizin: Genotip = Genotype ; Hepatit G virüsü = Hepatitis G virus ; RNA = RNA ; Renal diyaliz = Renal dialysis

Özet:
HGV, 1995 yılında moleküler klonlama ile tanımlanmış, Flaviviridae ailesi içerisinde yer alan bir RNA virüsüdür. Tüm dünyada yaygın olarak bulunan HGV, temel olarak parenteral yolla bulaşır. Virus nedeni bilinmeyen hepatit olguları, kan aktaranı yapılan hastalar, damar içi uyuşturucu kullananlar ve hemodiyaliz sağaltımı alan hastalarda yüksek sıklıkla saptanmaktadır. Bu çalışmada, Dokuz Eylül Üniversitesi Tıp Fakültesi Hastanesi Hemodiyaliz Ünitesi'nde sağaltım alan 42 hasta, hemodiyaliz ünitesinde görevli 17 sağlık çalışanı ve dermatoloji polikliniğine başvurmuş 158 kontrol olgusunda, HGV-RNA varlığı ters transkriptaz-cDNA polimeraz zincir tepkimesi yöntemi ile araştırıldı. HGV izolatlannın 5'-kodlamayan bölgelerinin DNA dizileri Sanger* in "dideoksinükleotid terminasyon yöntemi" ile belirlendi. Bunların, bilinen diziler ile karşılaştırmalı filogenetik analizleri yapılarak, genotipleri ve aralarındaki filogenetik ilişkiler tanımlandı. Hemodiyaliz sağaltımı alan 42 hastanın beşinde (%12), 17 sağlık çalışanının birinde (% 5,8) ve 158 kontrol olgusunun ikisinde (%1,2) HGV-RNA saptandı. Kontrol grubuna göre hemodiyaliz hastalarında HGV infeksiyonu anlamlı olarak yüksek olmasına karşın (p<0,05), HGV-RNA olumluluğu ile tanımlanan risk faktörleri arasında istatistiksel bir ilişki belirlenemedi. Hemodiyaliz hastalarından ve hemodiyaliz hemşiresinden izole edilen genomik dizilerin genotip 2, kontrol grubundan izole edilen bir HGV izolatının ise genotip 4 HGV türlerine ait olduğu saptandı. Hemodiyaliz biriminden üç izolatın ayrı bir küme oluşturduğu belirlendi. Bu izolatlarda, daha önceden belirlenenlerden farklı olarak, -180 ve -177 nükleotid pozisyonları arasında dört nükleotidlik benzer bir insersiyon varlığı saptandı. Bütün bu veriler, söz konusu üç hastada HGV nin ortak bir kaynaktan köken almış olabileceğini ve HGV ye bağlı nozokomiyal infeksiyonlann olası olduğunu düşündürmektedir.Anahtar Sözcükler: GBV/C-HGV, HGV-RNA, Filogenetik analiz, Genotip, Hemodiyaliz.

Abstract:
HGV is an RNA virus within the Flavtviridae family whose presence was determined by molecular cloning techniques in 1995. The virus is common throughout the world and its mainly transmitted by parenteral routes. HGV infections are more frequent in unknown hepatitis cases, blood transfusion recipients, IV drug abusers and in hemodialysis patients. In this study, the presence of HGV-RNA was sought out in 42 hemodialysis patients, 17 dialysis unit personnel and in 158 dermatological patients as a control group by reverse transcriptase-cDNA PCR. The 5-NCR sequences of the HGV isolates were determined by Sanger's dideoxynucleotide chain termination method. Phylogenetic analysis of these sequences along with the known HGV 5'-NCR sequences has been utilized to determine the genotypes and phylogenetic relationships. Five of the 42 dialysis patients (%12), one of the 17 personnel (% 5,8) and two of the 158 dermatological patients (%1,2) have been shown to harbor HGV sequences. Eventhought the rate of HGV infection in hemodialysis patients is significantly higher than the control group (p<0,05), no known risk factors could be ascribed to HGV-RNA positivity in these patients. All isolates from the hemodialysis unit were related to HGV sequences, whereas a HGV group 4 sequence was determined in one the positive patients in the latter group. Three of the five HGV sequences isolated from hemodialysis patients clustered closely together, with bootstrap support for all three sequences, indicating a common source of infection. Besides, these sequences contained a similar insertion of 4 nucleotides between position -180 and -177. These data suggest that the viral sequences in these patients may have a common origin and nosocomial transmission of HGV infection in a hemodialysis setting is possible.Key words: GBV-C/HGV, HGV-RNA, Phylogenetic analysis, Genotype, Hemodialysis.