Onkogenik wip1 fosfatazın metabolik stres indüklü otofaji aktivasyonunda rolünün araştırılması
Investigation of the role of oncogenic wip1 phosphatase in activation of metabolic stress-induced autophagy
Yazar: NAZLICAN KAYGUSUZ
Danışman: PROF. DR. MEHTAP KILIÇ EREN
Aydın Adnan Menderes Üniversitesi / Sağlık Bilimleri Enstitüsü / Tıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2022
Konu: Moleküler Tıp = Molecular Medicine ; Onkoloji = Oncology ; Tıbbi Biyoloji = Medical Biology
Dizin: Anneksin V = Annexin V ; Hipoksi = Hypoxia ; Hücre dizisi = Cell line ; Hücre ölümü = Cell death ; Meme neoplazmları = Breast neoplasms ; Nöroblastom = Neuroblastoma ; Onkogenler = Oncogenes ; Otofaji = Autophagy

Özet:
Amaç: Bu çalışmada Wip1'i aşırı ifade eden nöroblastom (SH-SY5Y) ve meme kanseri (MCF-
7) hücreleri kullanılarak hipoksi ve açlık ile metabolik stres aracılı otofajide Wip1 'in rolü
araştırılmıştır.
Gereç ve Yöntem: MCF-7 ve SH-SY5Y hücre hatlarına Western Blot, MTT analizi, Annexin
V/7AAD analizi, immün çöktürme ve immün floresan teknikleri uygulanmış olup elde edilen
verilerin istatistiki analizi 'one-way ANOVA' ile yapılmıştır.
Bulgular: Yapılan Western blot ve immün floresan yöntemi ile belirlenen konsantrasyonların
otofaji indüksiyonunu sağladığı saptandı. MCF-7 ve SH-SY5Y hücre hatlarında otofaji
indüksiyonu için belirlenen konsantrasyonların MTT ve Annexin V/7AAD analizi aracılığıyla
hücre ölümünü tetiklemediği gösterilmiştir. Wip1-ULK1 ilişkisi ise immünçöktürme ve
western blot teknikleri aracılığıyla gösterilmiştir.
Sonuç: Yapılan deneyler sonucunda Wip1 fosfatazın otofaji başlangıç kompleksinde görevli
temel bir protein olan ULK regülasyonunda etkili bir fosfataz olduğu açığa çıkarılmıştır.
Yapılan Western blot ve immün çöktürme yöntemleri ile elde edilen veriler, Wip1 fosfatazın
ULK defosforilasyonunda rol aldığına işaret etmektedir.
Anahtar Kelimeler: Hipoksi, MCF7, Metabolik Stres İndüklü Otofaji, SH-SY5Y, Wip1
fosfataz

Abstract:
Objective: In this study, hypoxia and starvation-related stress-mediated autophagy from Wip
was investigated for Wip1 overexpressing neuroblastoma (SH-SY5Y) and breast cancer (MCF-
7).Materials and Methods: Western blot, MTT analysis, Annexin V/7AAD analysis,
immunoprecipitation and immune fluorescence techniques were applied to MCF-7 and SH-
SY5Y cell lines, and the statistical analysis of the obtained data was made by 'one-way
ANOVA'.
Results: It was determined that the concentrations determined by Western blot and
immunofluorescence method provided autophagy induction. It was shown that the
concentrations determined for autophagy induction in MCF-7 and SH-SY5Y cell lines did not
trigger cell death by MTT and Annexin V/7AAD analysis. Wip1-ULK1 association was
demonstrated by immunoprecipitation and western blot techniques.
Conclusion: As a result of the experiments, it was revealed that Wip1 phosphatase is an
effective phosphatase in the regulation of ULK, an essential protein involved in the autophagy
initiation complex. The data obtained by Western blot and immunoprecipitation methods
indicate that Wip1 phosphatase plays a role in ULK dephosphorylation.
Key words: Hypoxia, MCF7, Metabolic-Stress Induced Autophagy, SH-SY5Y, Wip1
phosphatase