Akut myeloblastik lösemi (AML) hastalığı hücrelerinin aptamer temelli akım sitometrik profillenmesi
Aptamer based flow cytometric profiling of acute myeloblastic leukemia (AML) cells
Yazar: OKAN AKCA
Danışman: DOÇ. DR. BASRİ GÜLBAKAN
Hacettepe Üniversitesi / Sağlık Bilimleri Enstitüsü / Kök Hücre Ana Bilim Dalı / Kök Hücre Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2023
Konu: Endokrinoloji ve Metabolizma Hastalıkları = Endocrinology and Metabolic Diseases ; Hematoloji = Hematology
Dizin: Akım sitometrisi = Flow cytometry ; Aptamerler = Aptamers ; Lösemi = Leukemia ; Lösemi-miyeloid-akut = Leukemia-myeloid-acute

Özet:
kısa, kendisine özel üç boyutlu konformasyonel yapıya sahip ve özel bağlanma
bölgeleri bulunan tek zincirli oligonükleotid dizileridir. Aptamerler, SELEX ismi
verilen yönemle üzerinde çalışılmak istenen hücreye spesifik olarak
üretilebilmektedirler. Aptamerler düşük immünojeniteye sahip olmaları, daha kararlı
yapıda olmaları ve üretim aşamasındaki kolaylığından ötürü diğer ilginlik ajanlarına
göre özellikle antikorlara muadil bir molekül olarak görülmektedir. AML tanısı, çeşitli
tanı yöntemlerine ek olarak hücrenin yüzeyindeki çeşitli yüzey proteinlerine
antikorlarla boyama yapılan akım sitometri yöntemi ile desteklenir. Akut miyeloid
lösemi hastalığında, sağlıklı insanlara göre yüzey proteinlerinde önemli farklılıklar
görülmektedir. Bazı proteinlerde fazla ekspresyon, bazılarında ise daha az ifade
edildiği literatürde gösterilmiştir. AML hastalığına ait hücrelerle AML olmadığı
bilinen hücreler aynı koşullar altında aptamer bağlanma çalışmaları yapılmış ve akım
sitometrik analizleri yapılmıştır. Yapılan deneylerde çıkan sonuçlar kıyaslandığında
aptamerlerin AML tanısında antikorlara muadil olduğu çalışmaları destekler şekilde
olmuştur. Ayrıca aptamerlerin lösemik kök hücrelerin tanınmasında kullanılabileceği
bulunmuştur.
Aptamerlerin bu yüzey proteinlerine tutunması ve akım sitometri deneylerinde elde
edilen bağlanma profilleri göz önünde bulundurulduğunda hastalığın tanısının
aptamlerler aracılığı ile yapılmasının ve aptamerlerin bağlandığı proteinlerin AML'ye
özgü olan proteinler olduğunu ve bu proteinlerin tanımlanmasının önü açılacaktır.
Anahtar kelimeler: Aptamer, akut miyeloid lösemi, akım sitometri

Abstract:
Aptamers are short,
oligonucleotide sequences with a special 3-dimensional conformational structure and
special binding sites. Aptamers can be produced specifically for the cell to be studied
by the method called SELEX. Aptamers are seen as a molecule especially equivalent
to antibodies compared to other affinity agents due to their low immunogenicity, more
stable structure and ease of production.. In addition to various diagnostic methods, the
diagnosis of AML is supported by the flow cytometry method, in which various
surface proteins on the surface of the cell are stained with antibodies. In acute myeloid
leukemia, there are differences in the surface proteins synthesized compared to healthy
people. It has been shown in the literature that some proteins are overexpressed and
some are less expressed. Aptamer binding studies were performed under the same
conditions with cells from AML disease and cells from non-AML disease and flow
stometric analyzes were performed. When compared with AML disease cells and nonAML cells, these different results still support studies that aptamers are equivalent to
antibodies in the diagnosis of AML. Considering the attachment of aptamers to these
surface proteins and the binding profiles they gave us in flow cytometry experiments,
it will be possible to diagnose the disease through aptamers, and that the proteins to
which aptamers bind are AML-specific proteins and that these proteins will be
identified.
Key words: Aptamer, acute myeloid leukemia, flow cytometry