Mycobacterium tuberculosis suşlarının duyarlılık testinde kullanılan sensititre mycotb panel yönteminin performansının agar proporsiyon yöntemi ile karşılaştırılması
A comprasion of performance of the sensititre mycotb panel and the agar proportion method for the susceptibility testing of mycobacterium tuberculosis
Yazar: FATMA KAMER VARICI BALCI
Danışman: PROF. DR. CENGİZ ÇAVUŞOĞLU
Ege Üniversitesi / Tıp Fakültesi / Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
Derece: Tıpta Uzmanlık, 2015
Konu: Mikrobiyoloji = Microbiology
Dizin: Agar = Agar ; Mycobacterium tuberculosis = Mycobacterium tuberculosis ; İlaç alerjisi = Drug hypersensitivity ; İlaçlara direnç = Drug resistance ; İlaçlara direnç-mikrobiyal = Drug resistance-microbial

Özet:
GİRİŞ VE AMAÇ:Tüberküloz, enfeksiyöz bir etkene bağlı ölüm nedenleri arasında dünyada halen ilk sıralarda yer almaktadır. Çoklu ilaca dirençli tüberküloz (ÇİD-TB) ve yaygın ilaca dirençli tüberküloz (YİD-TB) olgularındaki artış Mycobacterium tuberculosis'de ilaç duyarlılığını belirlemek için hızlı, kolay uygulanabilen ve standardize yöntemlerin geliştirilmesine ihtiyaç oluşturmuştur. İlaç duyarlılığının hızlı ve doğru bir şekilde belirlenip, hastalara uygun tedavinin planlanması tüberküloz kontrol programlarının temel hedeflerinden biridir. Bu çalışmanın amacı Sensititre MycoTB plak yöntemini doğruluk, sonuçların alınması için gerekli olan inkübasyon süresi ve kullanım kolaylığı açısından altın standart agar proporsiyon yöntemi (APY) ile karşılaştırmak ve APY'nin yerine kullanılabilecek kadar etkin bir yöntem olup olmadığını belirlemektir.
GEREÇ VE YÖNTEM: Çalışmada, Ege Üniversitesi Tıp Fakültesi Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı Mikobakteriyoloji Laboratuvarı kültür koleksiyonunda bulunan 36'sı farklı direnç paternlerine sahip, 64'ü tüm birinci seçenek ilaçlara duyarlı toplam 100 M.tuberculosis suşu kullanıldı. Tüm M.tuberculosis suşlarında rifampisin (RİF), izoniyazid (INH), etanbutol, streptomisin, ofloksasin, moksifloksasin, amikasin, rifabutin, para-aminosalisilik asit, etiyonamid, sikloserin ve kanamisin ilaç duyarlılıkları APY ve Sensititre MycoTB plak yöntemiyle belirlendi. APY CLSI'da tanımlandığı şekilde, Sensititre MycoTB plak yöntemi üreticinin tanımladığı şekilde yapıldı. Veri analizinde SPSS 20.0 paket programı kullanıldı. Sonuçlar %95 güven aralığında değerlendirilip, duyarlılık, özgüllük hesaplandı. p <0,05 değeri istatistiksel olarak anlamlı kabul edildi.
BULGULAR: Çalışmada test edilen tüm antibiyotiklerin uyum yüzdeleri  % 95'le %100 arasında, özgüllükleri % 95'le %100 arasında ve duyarlılıkları %86'yla %100 arasında değişmektedir. Antibiyotiklerin uyum yüzdeleri, özgüllükleri, duyarlılıkları sırasıyla RIF için% 99; %99; %100 , INH 0.2µg/ml için%98; %97.2; %100, INH 1 µg/mliçin % 98; %97.4; % 100, STR için%99; %99; %100, ETB için %96;% 97; %89, OFL için %97;% 97; %100, MXF için %95; %95; %100, AMI için%100; %100; %100, RFB için % 97; %97; %100, PAS için %%96; %96; 100, ETH için %96; %98;% 86, CYC için %98; %98; %100, KAN için %97;% 97; %100 olarak bulunmuştur. Tüm antibiyotikler %95 güven aralığında olup, p değeri p<0.001 olarak istatiksel olarak anlamlı saptanmıştır. Çalışma sonucunda izolatların 14'ünde 
APY ile 16'sında ise Sensititre MycoTB plak yöntemiyle ÇİD (INH ve RİF direnci birlikte) saptanırken, izolatların hiçbirinde YİD[ÇİD ek olarak TB tedavisinde kullanılan herhangi bir florokinolona ve parenteral ikinci-basamak antitüberküloz ilaçlardan (amikasin, kanamisin ve kapreomisin) herhangi birisine direnç gelişmesi]saptanmamıştır.
SONUÇ:Sonuç olarak elde ettiğimiz verilere bakarak; inkübasyon süresinin 14 gün olması, uyum %95-100, özgüllük %95-100, duyarlılık %86-100, p <0.001 saptanmasıyla Sensititre MycoTB plak yönteminin altın standart kabul edilmiş APY yerine kullanılabilecek kadar etkin bir yöntem olduğu sonucuna varılmıştır.

Abstract:
INTRODUCTION AND AIM: Tuberculosis is still one of the most common mortal enfectious disesase around the World.Due to increase of multidrug-resistant (MDR)M.tuberculosis and extensively drug-resistant (XDR) tuberculosis cases, fast, easy and standardised methods need to be developed to determine drug resistance inM.tuberculosis. Determining drug resistance rapid and correctly, and starting appropriate medication is one of the main goals of tuberculois control programmes. Aim of this study is to compare the Sensititre MycoTB plate method to the gold standard agar proportion method (APM) fort the parameters: precision, incubation time for results and simplicity. We also aimed to determine if the Sensititre MycoTB plate method is effective enough to be used instead of the APM.
MATERIALS AND METHOD: 36 isolates with different resistance patterns and 64 isolates sensitive to all first line agents, a total of 100 M.tuberculosisisolatesstored in culture collection of  Microbiology Department Laboratory, Ege University School of Medicine, were used. Rifampin, isoniazid, ethambutol, streptomycin, ofloxacin, moxifloxacin, amikacin, rifabutin, para-aminosalicylic acid, ethionamide, cycloserineand kanamycin drug sensitivities of all isolates were determined by the APM and the Sensitirre MycoTB plate method. As defined in APM CLSI, Sensititre MycoTB plate method was used as instructed in producers manuel. SPSS 20.0 package programme is used for data analysis. Results are assessed in %95 confidence interval and sensitivity and specificity are defined. P<0,05 accepted statistically significant.
RESULTS: All antibiotics used had% agreement categorical between 95 to 100 %, specificity between 95 to 100%, sensitivity between 86 to 100 %. In order, % agreement categorical, specificity, sensitivities of drugs are; RIF %99;% 99;% 100, INH 0.2µg/ml%98; %97.2;% 100, INH 1 µg/ml%98;% 97.4;% 100, STR  %99;% 99;% 100, EMB%96;% 97;% 89, OFL %97; %97;%100, MXF %95;% 95;% 100, AMI %100;%100;%100, RFB %97;% 97; %100, PAS %96;% 96;% 100, ETH %96; %98;% 86, CYC %98;% 98;% 100, KAN %97; %97; %100. All antibiotics were in %95 agreement categorical and p value was <0,001, statistically significant. MDR was detected in 14 of isolates by the APM and 16 of isolates by the Sensititre MycoTB plate method. None of the isolates had XDR[In addition to MDR resistance aganist any fluoroquinolones and at least one of the second-line injectable drugs (amikacin, kanamycin or capreomycin)]
CONCLUSION: According to results, with an incubatioan period of 14 days, 95 to 100% agreement, 95 to 100 % specificity, 86 to 100 % sensitivity and p<0,001 we could state that the Sensititre Myco TB method is effective enough to be used instead of the gold standard APM.