Doğu Anadolu bölgesi FMF ( Ailesel Akdeniz Ateşi ) hastalığı MEFV gen mutasyonları dağılımlarının incelenmesi
Determinations of MEFV gene mutations prevalence in the Familial Meditarian Fever (FMF) at the region of East Anatolia
Yazar: NUMAN TAŞPINAR
Danışman: YRD. DOÇ. DR. HASAN DOĞAN
Atatürk Üniversitesi / Sağlık Bilimleri Enstitüsü / Tıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2011
Konu: Tıbbi Biyoloji = Medical Biology
Dizin: Ailesel akdeniz ateşi = Familial mediterranean fever ; DNA hasarı = DNA damage ; Doğu Anadolu bölgesi = Eastern Anatolia region ; Genler = Genes ; Mutasyon = Mutation

Özet:
Ailesel Akdeniz ateşi(AAA, FMF (Familial Meditarian Fever)) aralıklı olarak tekrar eden ateş, peritonit, plevrit ve artrit ile karakterize otozomal resesif geçişli bir hastalıktır. FMF geni MEFV; 16. Kromozomda 16p13.3 bölgelenmiştir. Gen 10 ekzondan oluşmuş olup pozisyonel klonlama yoluyla tanımlanmıştır. Şuana kadar dünya genelinde 200 mutasyon ve polimorfizim tespit edilmiştir. Mutasyonların çoğu ekzon 10 ve ekzon 2 bölgesindedir. Doğu Akdeniz populasyonunda en yaygın 4 mutasyon; M694V, V726A, M680I ve R761H dır.Bu çalışma 2530 FMF ön tanılı vakayı içermektedir ve DNA Dizi Analizi tekniğiyle MEFV geninin ekzon10 ve ekzon2 bölgeleri çalışılmıştır. DNA periferik kandan izole edildi. PCR ekzon10 ve ekzon2 primerleriyle yapıldı ve ekzon analizleri Dizi Analizi yöntemiyle yapıldı.Yapılan analizler sonucunda biz normal genotipi %58.58 ve mutasyonlu genotipi ise %41.42 olarak tespit ettik. Doğu Anadolu bölgesinde FMF ön tanılı 1048 hastada MEFV gen mutasyonlarının frekansları sırasıyla ekzon10 da M694V %57,16 (n=599), V726A %27.19 (n=285), M680I %20.80 (n=218), R761H %8,87 (n=93) ve ekzon2 de ise E148Q %6,68 tespit edildi. Tespit edilen nadir mutasyonlar ise A744S (n=15) ve M694I (n=3), E148V (n=3), T267I (n=3), E167D (n=2) ve L110P (n=1) olarak belirlendi.Sonuç olarak çalışmamızda FMF hastalarında yaygın olarak tespit edilen M694V mutasyonu diğer mutasyonlardan daha yüksek olarak bulundu.Anahtar Kelimeler: Ailesel Akdeniz Ateşi, MEFV, Dizi Analizi

Abstract:
Familial Mediterranean fever (FMF) is an autosomal inflammatory recessive disease characterized by recurrent episodes of fever accompanied by peritonitis, pleuritis, or arthritis. The FMF gene, MEFV, is located on chromosome 16p13.3. It has been identified by positional cloning and comprises 10 exons. Until now with 200 mutations and polimorfisms having been identified in the world. Exon 2 and 10 carry most mutations. The 4 mutations; M694V, V726A, M680I and R761H are the most common mutations in East Mediterrian populations.The study involved in 2530 cases who were clinically pre-diagnosed as FMF and studied exon 2 and exon 10 of MEFV gene by DNA sequencing techniques. Peripheral blood taken and DNA was isolated. The PCR was performed with exon 2 and exon 10 primers and exons analysis were made by the gene alignment sequence.As the result of the analysis, we established %58.58 wild genotype and %41.42 mutant genotype. In FMF pre-diagnosed 1048 patient with muations MEFV gene mutations frequency were M694V %57,16 (n=599), V726A %27.19 (n=285), M680I %20.80 (n=218), R761H %8,87 (n=93) on exon 10 and 2 E148Q %6,68 (n=70) on exon 2 respectively. The rare mutations were detected as A744S (n=15), M694I (n=3), E148V (n=3), T267I (n=3), E167D (n=2) and L110P (n=1) in the East Anatolian region.In conclusion, in our patients M694V mutation was found higher than the other mutations that has been detected commonly in patients with FMF.Key Words: Familial Mediterranean fever, MEFV, sequencing