Gaita kalprotektin düzeyinin gastroenteritlerin tanısında kullanımı
The use of gaita calprotectin level in the diagnosis of gastroenterites
Yazar: İBRAHİM HAYRİ ÖZKAYA
Danışman: PROF. DR. YASEMİN ZER
Gaziantep Üniversitesi / Sağlık Bilimleri Enstitüsü / Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2021
Konu: Mikrobiyoloji = Microbiology
Dizin: Dışkı = Feces ; Gastroenterit = Gastroenteritis ; Gastrointestinal hastalıklar = Gastrointestinal diseases ; Kalprotektin = Calprotectin ; Teşhis = Diagnosis

Özet:
Kalprotektin bir kalsiyum bağlayıcı sitoplazmik nötrofil proteinidir ve nötrofilin immünomodülasyonunu ve antibakteriyel etkilerini uyarır. Dışkıda kalprotektin düzeylerinin varlığı inflamasyonun iyi bir göstergesidir. Bakteriyel enterit ve inflamatuar barsak hastalığı gibi bir dizi enflamatuar durumda yükselir.  Viral gastroenteritlerde inflamasyon olmadığı klasik anlamda kabul edilmekle birlikte, bu çalışma hassas bir parametreyle viral gastroenteritlerde inflamasyon bulgusunun araştırılması amacıyla yapılmıştır. Gaziantep Üniversitesi Tıp Fakültesi Hastanesi Mikrobiyoloji Laboratuvarına Haziran-Kasım 2020 Tarihleri arasında Adenovirus, Rotavirus ve Norovirus tanısı amacıyla gönderilen gaita örnekleri çalışmaya dahil edilmiştir. Dışkı örneklerinde viral etkenleri saptanmasında immünokromatografik yöntem prensibi ile çalışan kaset testler üretici firma önerileri doğrultusunda çalışılmıştır. Rotavirus, Adenovirus testleri (Biomedica Diagnostic, Spain) ve Norovirus testi (Biopharm, Germany) immünokromatografik olarak çalışılmıştır. Güç analizi yapılarak çalışmaya dahil edilmesi gereken minumum örneklem sayısı 73 olarak bulunmuştur. Çalışmaya 73 örnek viral parametrelerinde pozitiflik saptanan (test grubu), 73 örnek de viral parametreleri negatif saptanan örnekler (kontrol grubu) dahil edilmiştir. Örneklerin tümünde kalprotektin düzeyi, test kasetlerindeki reaksiyonun bir okuyucuda okutulması ile kantitatif sonuç alınan immünokromotagrafik Call Fast (Eurospital, Italy) kiti ile çalışılmıştır. Test sonucu <70 µg/gr negatif olarak değerlendirilmiştir. Grup I ve Grup II arasında cinsiyet ve yaş dağılımı istatistik olarak benzer bulunmuştur. Test grubunda  33 örnekte (%45.2) ve kontrol grubunda 12 örnekte (%17.8)  kalprotektin pozitif bulunmuştur. Test grubu ve kontrol grubu arasında kalprotektin düzeyinin pozitif ve negatif saptanması arasında istatistiksel anlamlı fark bulunmuştur. Kalprotektin düzeyi, bu çalışmada viral gastroenterit etkeni saptanan hastalarda yüksek bulunmuş olup, viral gastroenteritlerde inflamatuar cevabın irdelenmesine yönelik daha fazla sayıda çalışmanın yapılmasının faydalı olacağı düşünülmektedir.

Abstract:
Calprotectin is a calcium binding cytoplasmic neutrophil protein and stimulates the immunomodulation and antibacterial effects of the neutrophil. The presence of calprotectin levels in stool is a good indicator of inflammation. It is elevated in a number of inflammatory conditions such as bacterial enteritis and inflammatory bowel disease. Although it is accepted in the classical sense that there is no inflammation in viral gastroenteritis, this study was conducted with the aim of questioning the evidence of inflammation in viral gastroenteritis with a sensitive parameter. Samples sent to Gaziantep University Şahinbey Research and Application Hospital Microbiology Laboratory between June-November 2020 for the purpose of diagnosing Adenovirus, Rotavirus and Norovirus were included in the study. Cassette tests, which work with the principle of immunochromocographic method in detecting viral agents in stool samples, were studied in accordance with the manufacturer's recommendations. Rotavirus and Adenovirus tests (Biomedica Diagnostic, Spain) were studied on a single cassette and the RIDA QUICK Norovirus test (Biopharm, Germany) on a separate cassette. With a prevalence of 5%, the minimum number of samples that should be included in the study was 73. 73 samples with positive viral parameters (test group) and 73 samples with negative viral parameters were included in the study. The calprotectin level in all samples was studied with the immunochromotagraphic Call Fast (Eurospital, Italy) kit, where quantitative results were obtained by reading the reaction in the test cassettes on a reader. Test result <70 µg / gr was considered negative. Of the patients included in the study and positive in any of the viral parameters, 34 were female (46.6%), 39 (53.4%) were male, and 68 (93.2%) were <18 years old. In the negative group of virological parameters taken as the control group, the gender and age distribution was found to be 32 (43.8%) female, 41 (56.2%) male and 63 (87.7%) <18 years, respectively. There was no statistical difference between them. Calprotectin was found to be positive in 33 samples (45.2%) in the test group and 12 samples (17.8%) in the control group. A statistically significant difference was found between positive and negative calprotectin levels between the test group and the control group (p <0.05). Calprotectin level was found to be high in patients with viral gastroenteritis in this study, and it is thought that more studies should be conducted to examine the inflammatory response in viral gastroenteritis.Keywords: Package chicken, Campylobacter, Salmonella, Public Health,  Food Safety.