Kronik lenfositik lösemide (KLL) metilentetrahidrofolat redüktaz (MTHFR) enziminin gen polimorfizmlerinin araştırılması
Gene polymorphisms investigation of methylenetetrahydrofolate reductase (MTHFR) enzyme at chronic lymphocytic leukemia (CLL)
Yazar: AHMET UMAY
Danışman: PROF. DR. RAMAZAN BİLGİN
Çukurova Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Kimya Ana Bilim Dalı
Derece: Doktora, 2016
Konu: Kimya = Chemistry

Özet:
Metilentetrahidrofolat redüktaz (MTHFR), hücre içi folat metabolizmasını düzenleyen, DNA metilasyonu ile karsinogenezde önemli bir rol oynayan anahtar bir enzimdir. Bu çalışmada gerçek zamanlı polimeraz zincir reaksiyonu kullanımı ile 91 KLL'li ve 101 sağlıklı kontrol bireyde MTHFR geni A1298C (rs1801131) ve C677T (rs1801133) polimorfizmleri araştırılmıştır.
MTHFR A1298C polimorfizmi allel ve genotip frekansları kontrol ve hasta grubu arasında karşılaştırılmıştır. İstatistiksel analizlerde, A alleli ve AA genotipi anlamlı şekilde koruyucu olarak bulunmuştur. A1298 C polimorfizminde kontrol ve hasta grupları arasında C alleli ve CC genotipi için anlamlı (p=0.04 ve p=0.03)  bir ilişki vardır. 1298CC genotipi KLL için 2,58 kat riski artırmaktadır.
	MTHFR C677T polimorfizmi allel ve genotip frekansları kontrol ve hasta grubu arasında karşılaştırılmıştır. Hasta ve kontrol grubu arasında C677T polimorfizminin alel sıklığı yönünden anlamlı bir fark belirlenememiştir. Bununla birlikte, C677T polimorfizminin CT ve CC genotipleri KLL riskini anlamlı bir şekilde arttırmıştır (P=0.04, OR=4,21 (1,10-16,09) and P=0.05, OR=3,77 (1,00-14,17), sırasıyla).
	Haplotip analizi yapıldığında haplotipler açısından hasta ve kontrol grupları arasında anlamlı fark bulunmuştur. AC haplotip bloğu (A1298 ve C677) KLL hastalık riskine karşı koruyucu etki göstermiştir. 
	Sonuçlarımız MTHFR geni 1298C ve C677 allellerinin KLL hastalık riski üzerine önemli etkiye sahip olduğunu göstermektedir.

Abstract:
Methylenetetrahydrofolate reductase (MTHFR) is a key enzyme regulating the intracellular folate metabolism which plays an important role in carcinogenesis through DNA methylation. In the current study, MTHFR gene A1298C (rs1801131) and C677T (rs1801133) polymorphisms were investigated in a case–control study of 91 patients with chronic lymphocytic leukemia (CLL) and 101 healthy control subjects by using a real-time polymerase chain reaction (RT-PCR).
The allele and genotype frequencies of MTHFR gene A1298C polymorphism were compared between control and case groups. In the statistical analysis, the A allele and AA genotype were significantly found to be protective variant. There were significant associations between the control and the case groups for the C allele and CC genotype of A1298C polymorphism (p=0.04 and p=0.03). The 1298CC genotype increased 2.58-fold the risk of CLL. 
	The allele and genotype frequencies of MTHFR gene C677T polymorphism were compared between control and case groups. There was no association between the control and the case groups for the allele frequencies of C677T polymorphism. However, in the statistical analysis, 677CT and 677CC genotypes significantly increased the risk of CLL (P=0.04, OR=4,21 (1,10-16,09) and P=0.05, OR=3,77 (1,00-14,17), respectively).
When the haplotype analysis was performed, there were significant differences between the case and control groups in terms of haplotype blocks. The AC haplotype block (A1298 ve C677) showed a protective effect against the risk of CLL (p=0.034). Our results demonstrate that MTHFR gene 1298C and C677 alleles have a major effect on the risk of CLL.