İnsan, hayvan ve içme sularından izole edilen hareketli aeromonas suşlarının dna profillerinin karşılaştırılması
Comparison of dna profiles of motile aeromonas strains isolated 
from human, animal and drinking water
Yazar: HANİFİ KÖRKOCA
Danışman: PROF. DR. MUSTAFA BERKTAŞ
Yüzüncü Yıl Üniversitesi / Sağlık Bilimleri Enstitüsü / Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
Derece: Doktora, 2006
Konu: Mikrobiyoloji = Microbiology

Özet:
Hareketli Aeromonas' lar başlıca su ortamlarında olmak üzere doğada yaygın olarak bulunmakta,
insan ve hayvanlarda enfeksiyonlara neden olmaktadırlar.
Bu çalışmayla hareketli Aeromonas'ların bölgemiz içme sularından
izolasyonunu gerçekleştirmek, insan, hayvan ve içme sularından izole edilen
Aeromonas'ların PFGE profillerini ortaya koymak ve izolatlar arasında baskın bir klon
olup olmadığını tespit etmek, ayrıca bölgemizden izole edilen bakteriler için fenotipik
ve moleküler tipleme sonuçlarını karşılaştırmak amaçlanmıştır.
Çalışmada 52 Aeromonas suşu çalışmanın materyalini oluşturmuştur. Çalışmada
daha önce izole edilen 14 suşun dışında, 38 suş yeni bir çalışmasıyla izole edilmiştir.
İdentifikasyon işlemleri BD phoenixTM (Becton, Dickinson and Company, Sparks,
Maryland 21152 USA) cihazında gerçekleştirilmiştir.
Toplam 52 adet suşun DNA paternleri Pulsed-field gel electrophoresis'le ortaya
konulmuştur. Yedi suşa ait DNA profili elde edilememiştir. İnsanlardan izole edilen bir
suşla sığırlardan izole edilen bir suş, iki balık suşu; martı suşu ile içme suyu suşu ve
martı izolatı ile sığır izolatının klonal ilişkili olduğu tespit edilmiştir.
Sonuç olarak; bu çalışmada insanlarda ve çevresel kaynaklarda baskın bir klon
tespit edilememiştir. Ayrıca bu çalışmada bölgemizde içme suyu ile insan gastroenteriti
arasında klonal ilişki tespit edilememiş, bununla birlikte daha önce hayvanlarda
Aeromonas'ların varlığı insanlar için potansiyel bir risk olarak düşünülmesine rağmen
çalışmamızda bu yönde genotiplendirme seviyesinde pozitif bir bulgu elde edilmiştir.
Ayrıca bir martı izolatı ile içme suyu izolatı arasında klonal ilişkinin tespit edilmesiyle,
kuş gribinin de görüldüğü bölgemizde, içme suyu kaynaklarının güvenliği açısından
gerekli tedbirlerin alınması gereği, bununla birlikte Aeromonas'ların epidemiyolojisinin
aydınlatılmasına ve özellikle çevresel izolatların biyokimyasal identifikasyonuna
yönelik daha kapsamlı çalışmaların yapılması gereği ortaya konulmuştur.
Anahtar Sözcükler: Aeromonas spp., insan, içme suyu, hayvan, PFGE.

Abstract:
The aim of this study was to perform isolation of motile Aeromonas from
drinking water in our area, and state PFGE profiles of isolated Aeromonas; and whether
the presence a dominant clone, in addition was to compare results of phenotyping and
genotyping.
In the study, 52 Aeromonas strains were used as matarials, and together with 14
strains previously isolated, 38 strains isolated were identified in BD phoenixTM (Becton,
Dickinson and Company, Sparks, Maryland 21152 USA).
DNA patterns of 52 Aeromonas strains totally were established with pulsed-field
gel electrophoresis. It was not detected DNA patterns of seven strains. It was stated
clonal relation with human strain and cattle strain, with a fish strain and a fish strain,
drinking water strain and a gull strain, and cattle strain and gull strain.
In conclusion, it was not detected clonal relation with drinking water and human
gastroenteritis. Althought the presence of Aeromonas in animals previously was thought
as potential risk for human theoretically, it was established a positive finding at the level
of genotyping in this study. In addition, it was emphasized that detection a relationship
between a gull isolate and drinking water isolate even presence avian influenza in our
region, in terms of safe of drinking water source take necessity measures. With this
study constate that evidence epidemiology of Aeromonas and paricularly perform
necessery future study isolate of environmental.
Key Words: Aeromonas spp., human, drinking water, animal, PFGE.