BRCA1 ve BRCA2 genleri metilasyonu ile infertil erkeklerdeki sperm DNA fragmentasyonu arasındaki ilişkinin araştırılması
Investigation of relationship between BRCA1, BRCA2 genes methylation and sperm DNA fragmentation on infertile men
Yazar: EMEL SEVGİLİ
Danışman: DOÇ. DR. SEZGİN GÜNEŞ ; YRD. DOÇ. DR. MEHMET ALPER ARSLAN
Ondokuz Mayıs Üniversitesi / Sağlık Bilimleri Enstitüsü / Tıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
Derece: Doktora, 2017
Konu: Genetik = Genetics ; Tıbbi Biyoloji = Medical Biology ; Üroloji = Urology
Dizin: DNA = DNA ; DNA hasarı = DNA damage ; Epigenez-genetik = Epigenesis-genetic ; Genler = Genes ; Kısırlık = Infertility ; Kısırlık-erkek = Infertility-male ; Metilasyon = Methylation ; Sperm = Spermatozoa

Özet:
Amaç: Çeşitli nedenlerle ortaya çıkabilen ve erkek infertilitesinderolü olan sperm DNA fragmentasyonunun (SDF) BRCA1 ve BRCA2 genlerinin metilasyonu ile ilişkili olup olmadığının belirlenmesi amaçlanmaktadır.
Materyal ve Metot: Çalışmaya, Ondokuz Mayıs Üniversitesi Tıp Fakültesi Üroloji Polikliniğinde sperm analizi yapılan 73 oligoasthenoteratozoospermik (OAT) infertil erkek ve altı normozoospermik gönüllü dahil edildi. Semen örneklerinde TUNEL yöntemi ile SDF ve DNA izolasyonu sonrası metilasyona spesifik PCR (MSP) ile BRCA1 ve BRCA2 genlerinin metilasyon paterni incelendi. Sonuçlar SPSS Paket programında analiz edildi.  
Bulgular: Sperm DNA fragmentasyonu ortalaması %21,79 olarak belirlendi. SDF oranının "hasarlı" olarak değerlendirilebilmesi için eşik değer %12,95 olarak hesaplandı.  Normozoospermik ve anormal semen parametreleri sergileyen  gruplar arasında SDF anlamlı farklılık gösterterdi (T testi, t=-3,70, df=77, p<0,001). SDF'nin semen parametreleri üzerinde önemli etkisi olduğu görüldü. Oligoasthenoteratozoospermik grupta BRCA1 geni metilasyonu ile SDF arasında negatif yönde bir ilişki saptandı. 
Sonuç: İlk defa bu tez çalışmasıyla, infertil erkeklerdeki sperm DNA fragmentasyonunun BRCA1 ve BRCA2 genlerinin epigenetik düzenlenmesi arasındaki ilişki incelenmiştir. Bulgular, SDF sonuçları infertilite kapsamındaki önceki çalışmaları ile büyük ölçüde destekler niteliktedir. Yardımcı üreme teknikleri öncesinde sperm DNA bütünlüğü incelenmesi yararlı olacaktır. BRCA1 ve BRCA2 genlerinin, SDF ile ilişkisini tam olarak ortaya koymak daha kapsamlı araştırmalar gerektirmektedir. 
Anahtar Kelimeler: BRCA1; BRCA2; epigenetik; infertilite; sperm; TUNEL testi

Abstract:
Aim: The purpose of the study was to investigate whether the methylation status of BRCA1 and BRCA2 genes is associated with sperm DNA fragmentation (SDF) which emerges due to various reasons and is effective in male infertility.
Material and Method: Seventy three oligoasthenoteratozoospermic infertile men and six normozoospermic volunteers who were diagnosed in Department of Urology at Ondokuz Mayis University, Faculty of Medicine were studied. To investigate SDF TUNEL assay was employed and methylation pattern of BRCA1 and BRCA2 genes were investigated by methylation-specific PCR (MSP) method after DNA isolation. The results of the study were analyzed by using. 
Results: The average SDF was calculated 21.79%. The calculated threshold value for damaged SDF was 12.95%. Regarding SDF, there were statistically significant differences between normozoospermic and abnormal semen parameter groups (T test, t = -3,70, df = 77, p <0.001). SDF had a significant effect on the semen parameters. Methylation of BRCA1 gene in the idiopathic oligoasthenoteratozoospermic group had negative correlation with SDF.
Conclusion: This is the first report analysing the relationship between epigenetic regulation of BRCA1 and BRCA2 genes and sperm DNA fragmentation in infertile men. Our findings support those of the previous studies. To better understanding the relationship between different genes or diseases and infertility additional studies are warranted. In routine clinical practice, sperm DNA integrity must be investigated before applying assisted reproductive techniques.
Keywords: Infertility; sperm; TUNEL assay; BRCA1; BRCA2; epigenetics