Ankilozan spondilit hastalarında tedavide kullanılan ilaçlara göre MDR1 gen polimorfizm ve  ekspresyonunun araştırılması
The investigation of MDR1 gene polymorphism  and  its expression after drug suse for  treatment of patients with ankylosing spondylitis
Yazar: FATMA ÇOLAK
Danışman: DOÇ. DR. ÇETİN SAATÇİ
Erciyes Üniversitesi / Tıp Fakültesi / Tıbbi Genetik Ana Bilim Dalı
Derece: Tıpta Uzmanlık, 2014
Konu: Genetik = Genetics
Dizin: Gen ifadesi = Gene expression ; Genler-MDR 1 = Genes-MDR 1 ; Polimorfizm-genetik = Polymorphism-genetic ; Spondilit = Spondylitis ; Spondilit-ankilozan = Spondylitis-ankylosing ; Tedavi = Treatment ; Tümör nekroz faktörleri = Tumor necrosis factors ; İlaç kullanımı = Drug utilization ; İlaçlar = Drugs

Özet:
Ankilozan spondilit sakroiliit ve spondilitten dolayı inflamatuar sırt ağrısı ile karakterize kronik, inflamatuar romatizmal hastalıktır. AS sıklıkla hayatın 3. dekadında başlayan ve erkeklerde kadınlardan biraz daha sık  (2.4 kat) görülen bir hastalıktır. Hastaların %80'inde 30 yaşından önce ilk semptomlar gelişir ve %5'den daha az hastada semptomlar 45 yaşın üzerinde ortaya çıkar .Ankilozan spondilitin cinsiyete bağlı eğiliminden dolayı şüphelenilen bir gen olan X kromozomuyla herhangi bir bağlantısı olmadığı bildirilmiştir. Ankilozan spondilit ve diğer SpA'lerin kesin sebebi henüz bilinmemektedir. Fakat patogenezde genetik ve çevresel faktörlerin önemli rol oynadığı bilinmektedir.
P glikoproteini 7.kromozomdaki 28 ekzon içeren MDR1 geni kodlamaktadır. Bu bölgede en yaygın çalışılan alleller c.1236C>T, c.2677G>T7A ve c.3435C>T allelleridir. Bu üç allel genomda lokus olarak birbirine yakın olarak yerleştiğinden alleller aynı anda kodlanmaktadır. Bu nedenle tüm geni incelemek yerine 3 allelinde olduğu haplotipler analiz edilerek AS hastalarında  c.1236C>T, c.2677G>T/A ve c.3435C>T allellerindeki polimorfizm sıklığını ve bu polimorfizmlerle MDR1 gen ekspresyonu arasında bağlantıyı araştırdık.
34 biyolojik tedavi , 32 diğer tedavileri alan toplam 66 AS hastası ve 32 sağlıklı herhangi bir ilaç kullanmayan bireyden oluşan grup karşılaştırıldı. DNA izolasyonu High Pure PCR Template Preparation Kiti kullanılarak gerçekleştirildi. RNA izolasyonu trizolle yapıldı. Kantitatif gerçek zamanlı PCR, Roche LightCycler FastStart DNA Master HybProbe cihazında gerçekleştirildi. 
Çalışmamızın sonucunda AS hastalarında c.1236C>T, c.2677G>T/A ve c.3435C>T polimorfizmleri ile MDR1 geni ekspresyonları  karşılaştırıldığında istatistiksel olarak anlamlı bir fark bulunamadı.  Biyolojik tedavileri kullanan AS grubunun  MDR1 gen ekspresyonu anlamlı bir farklılık bulundu  (p<0.001).

Abstract:
Ankylosing Spondylitis (AS) is a chronic inflammatory, rheumatical disease of the axial skeleton, with variable involvement of peripheral joints and nonarticular structures. AS is a disease which oftenly start in the 3 rd decade of life and its indidence a little more in men than women (2.4 times). 80% of patients develop symptoms before age 30and less than about 5% of patients symptoms revealing occur over 45 years. Suspected gene related with AS has no  link to the X chromosome. The exact cause of ankylosing spondylitis and other spais not yet known. But in the pathogenesis of AS, genetic and environmental factors are known to play an important role.
P glycoprotein encoding MDR1 gene located on 7. Chromomosome and contains exon28. In this gene, the most widely studied alleles are c.1236C>T, c.2677G>T/A and c.3435C>T. These three alleles are positioned in close proxmity in the genome and are coded at the same time. Therefore, instead of analyzing complete gene, only three alleles of the gene were analyzed in patients with AS to see allele frequency and connection between these polymorphism and MDR1 gene expression.
Study group was formed from 34 patients with biological therapy, 32patients with other treatments  (in total 66 AS patients) and 32 healthy individuals without any medication were compared.
DNA isolation done with using High Pure PCR Template Preparation Kit.RNA isolation was performed with trizoll manual isolation. For Quantitative real-time PCR, Roche LightCyclerFastStartDNA Master device hybprob was used.
As a result of our study, there was no statistically significant difference between in AS patients with c.1236C>T, c.2677G>T/A and c.3435C>T polymorphisms and MDR1 gene expression. On the other hand, in group of biological therapies, significant differences were found in the MDR1 gene expression (p <0.001) and c.1236C>T, c.2677G>T/A and c.3435C>T polymorphisms.