Myeloid neoplazilerin morfolojik, fenotipik ve moleküler özellikleriyle 2022 who ve ICC sınıflamalarına göre geriye dönük yeniden değerlendirilmesi, klinik prognostik verilerle karşılaştırılması
Retrospective reassessment of myeloid neoplasms according to the 2022 who and ICC classifications, comparing with clinical prognostic data, based on morphological, phenotypic, and molecular characteristics
Yazar: ELİF KARDELEN ÇAĞDAŞ
Danışman: PROF. DR. IŞINSU KUZU
Ankara Üniversitesi / Tıp Fakültesi / Tıbbi Patoloji Ana Bilim Dalı
Derece: Tıpta Uzmanlık, 2024
Konu: Patoloji = Pathology
Dizin: Histopatoloji = Histopathology ; Moleküler genetik = Molecular genetic

Özet:
Amaç: Bu çalışma kapsamında klinik, laboratuvar, histopatolojik, sitolojik ve genetik veriler kullanılarak anabilim dalımızda tanı konmuş kronik myelomonositik lösemi (KMML), myelodisplastik sendrom/myeloproliferatif neoplazi (MDS/MPN) ve myelodisplastik sendrom (MDS) tanılı olgular tekrar incelenerek; Dünya Sağlık Örgütü (WHO) 2022 ve International Consensus Classification (ICC) 2022 sınıflamalarına göre yeniden sınıflandırılıp tanılama sürecinin tekrar değerlendirilmesi amaçlanmıştır. Bununla sınıflamalar arasındaki farkların ortaya konması ve tanı grupları için tanımlayıcı özelliklerin değişiklikleri ile hastaların prognoz ve tedavi süreçlerindeki farklılıkların vurgulanması amaçlanmıştır.
Gereç ve Yöntem: AÜTF Tıbbi Patoloji AD. arşivinden Kasım 2018- Kasım 2022 tarihleri arasında yeni nesil dizileme (NGS) yapılarak tanısı kesinleştirilmiş MDS, KMML dışı MDS/MPN ve KMML tanılı, çalışmaya dahil edilme kriterlerini karşılayan 71 olgu seçilmiştir. Olguların kemik iliği biyopsileri ve kemik iliği aspirasyon yayma preparatları ışık mikroskopunda tekrar değerlendirilmiştir. Olguların laboratuvar ve klinik bilgilerine hastane bilgi yönetim sistemi (HBYS) üzerinden ulaşılmış, klinik takip ve tedavi bilgileri için hematoloji BD.'dan bilgi alınmıştır.  Olguların kemik iliği biyopsileri selülerite; hücre serilerinin dağılımı, displazisi; retikülin lif varlığı, eşlik eden lenfoid hücreler açılarından; kemik iliği aspirasyon yayma preparatları selülerite, ring sideroblast oranı, her hücre serisinin yüzdesi,  displazi blast ve monosit artışı açısından değerlendirilmiştir. Olguların tam kan sayımı ve nutrisyonel parametreleri, kemik iliği akım sitometri sonuçları, sitogenetik analiz sonuçları kaydedilmiştir. Anabilim dalımız tarafından yapılmış NGS sonuçları tüm diğer verilerle birlikte değerlendirilmiştir. Verilerin analizi, SPSS 22.0 (IBM, Armank, NY, ABD) programı ile yapılmış ve p<0.05 istatistiksel olarak anlamlı kabul edilmiştir.
Bulgular: Güncel sınıflamalara göre 29 KMML, 30 MDS, 12 KMML dışı MDS/MPN tanılı olgu çalışmaya dahil edilmiştir. İncelenen 71 olgunun 41'i erkek 30'u kadındır ve yaş ortalamaları 62,71±14,00 bulunmuştur. NGS ile mutasyon saptanan genlerin işlevlerine göre gruplandırılmasında KMML olgularında en sık epigenetik modifikatör genlerde, MDS olgularında epigenetik modifikatör ve splicing kompleks genlerinde, KMML dışı MDS/MPN olgularında RAS yolağında görevli genler ve splicing kompleks genlerinde mutasyon izlenmiştir. Yeni sınıflamalarda önemi olan TP53 mutasyonu 1 KMML, 9 MDS olgusunda  bulunmuştur. Ring sideroblast ile ilişkili SF3B1 mutasyonu 13 MDS ve 4 MDS/MPN vakasında saptanmıştır. %10 üzerinde varyant allel frekansı (VAF) bulunan mutasyon gösteren genler KMML tanı grubunda SRSF2, ASXL1, DNMT3A, EZH2, PRAMEF2; MDS tanı grubunda SF3B1, TET2, DNMT3A, TP53; KMML dışı MDS/MPN tanı grubunda KRAS ve ASXL1'dir.  Retikülin lif artışı en sık KMML dışı MDS/MPN olgularında izlenmiştir. Blast artışı ve TP53 mutasyonu bulundurmayan MDS olgularında retikülin fibrozis artışının kötü prognostik olarak değerlendirilen bir morfolojik değişiklik olduğu saptanmıştır. ICC sınıflamasında tanımlanan ve ancak NGS analizi ile tanı verebileceğimiz oligomonositik KMML (KMML-O) tanısı verdiğimiz 2 olgu saptanmıştır. Anabilim dalımızda kullanılan panel ile tanısal mutasyonları saptanan 4 olgunun, kurum içi başka bir merkezde daha az sayıda gen hedefleyen panel kullanılarak elde edilen NGS sonuçları ile doğru tanıya ulaşamadığı görülmüştür. 
Sonuç: Güncel sınıflamalarda MDS, MDS/MPN, KMML birbiriyle karışan ve ayırıcı tanı, risk sınıflaması ve tedavi planı için mutlaka NGS yöntemlerinin rutinde kullanılması gereken hematolojik neoplastik hastalıklar olarak tanımlanmaktadır. Ayrıntılı tam kan analizi, kemik iliği biyopsisi, kemik iliği aspirasyon preparatlarının incelenmesi ve uygun kapsamlı bir panel ile NGS uygulanması, sitogenetik değişiklikler bu hastalıkların tanı sürecinde yapılması gereken işlem basamakları arasında bulunmalıdır. 
Anahtar Kelimeler: Myelodisplastik Sendrom, Myelodisplastik Sendrom/Myeloproliferatif Neoplazi, Kronik Myelomonositik Lösemi, WHO 2022 Sınıflaması, ICC 2022 Sınıflaması

Abstract:
Aim: Within the scope of this study, cases diagnosed with chronic myelomonocytic leukemia (CMML), myelodysplastic syndrome/myeloproliferative neoplasia (MDS/MPN) and myelodysplastic syndrome (MDS) diagnosed in our department were re-examined using clinical, laboratory, histopathological, cytological and genetic data; It is aimed to reclassify and re-evaluate the diagnostic process according to the World Health Organization (WHO) 2022 and International Consensus Classification (ICC) 2022 classifications. With this, it is aimed to reveal the differences between the classifications and to emphasize the changes in the defining characteristics of the diagnostic groups and the differences in the prognosis and treatment processes of the patients.
Materials and Methods: 71 cases diagnosed with MDS, non-CMML MDS/MPN and CMML, whose diagnosis was confirmed by next-generation sequencing (NGS) between November 2018 and November 2022, and who met the inclusion criteria for the study were selected from the AUTF Department of Medical Pathology archives. Bone marrow biopsies and bone marrow aspiration smears of the cases were re-evaluated under a light microscope. Laboratory and clinical information of the cases was accessed through the hospital information management system (HBYS). Bone marrow biopsies of the cases revealed cellularity; distribution and dysplasia of cell lineages; In terms of the presence of reticulin fibers and accompanying lymphoid cells; Bone marrow aspiration smear preparations were evaluated for cellularity, ring sideroblast ratio, percentage of each cell lineage, and dysplasia status. Complete blood count and nutritional parameters, bone marrow flow cytometry results, and cytogenetic analysis results of the cases were recorded. NGS results performed by our department were evaluated together with all other data. Data analysis was done with SPSS 22.0 (IBM, Armank, NY, USA) program and p<0.05 was considered statistically significant.
Results: According to current classifications, 29 CMML, 30 MDS, 12 non-CMML MDS/MPN diagnosed cases were included in the study. Of the 71 cases examined, 41 were men and 30 were women, and their average age was 62.71±14.00. In grouping the genes with mutations detected by NGS according to their functions, mutations were most frequently observed in epigenetic modifier genes in CMML cases, in epigenetic modifier and splicing complex genes in MDS cases, and in genes involved in the RAS pathway and splicing complex genes in non-CMML MDS/MPN cases. TP53 mutation was found in 1 CMML and 9 MDS cases. SF3B1 mutation was detected in 13 MDS and 4 MDS/MPN cases. Genes showing mutations with a variant allele frequency (VAF) above 10% are SRSF2, ASXL1, DNMT3A, EZH2, PRAMEF2 in the CMML diagnosis group; SF3B1,TET2,DNMT3A,TP53 in the MDS diagnosis group; In the non-CMML MDS/MPN diagnostic group, these are KRAS and ASXL1. Reticulin fiber increase is a morphological change that is most frequently observed in non-CMML MDS/MPN cases, and when observed in MDS cases, is considered to be a poor prognostic after blast increase and TP53 mutation. We identified 2 cases that we diagnosed as oligomonocytic CMML, which is defined in the ICC classification and can only be diagnosed by NGS analysis. It was noted that the diagnostic mutations detected in our department could not be detected in 4 cases in the narrow panel NGS results studied in a second center.
Conclusion: In current classifications, MDS, MDS/MPN, CMML are defined as hematological neoplastic diseases that are confused with each other and for which NGS methods must be used routinely for differential diagnosis, risk classification and treatment plan. Detailed complete blood analysis, bone marrow biopsy, examination of bone marrow aspiration preparations and NGS application with a suitable comprehensive panel, cytogenetic changes should be among the steps that should be performed in the diagnosis process of these diseases.
Key Words: Myelodysplastic syndrome, Myelodysplastic syndrome /Myeloproliferative neoplasia, Chronic myelomonocytic leukemia, World Health Organization 2022 classification, ICC 2022 classification