Kronik periodontitisli bireylerde osteopontin gen polimorfizminin incelenmesi
Investigation of osteopontin gene polymorphism in chronic periodontitis patients
Yazar: BURÇ TAYLAN
Danışman: PROF.DR. TUNÇ İLGENLİ
Ege Üniversitesi / Sağlık Bilimleri Enstitüsü / Periodontoloji Ana Bilim Dalı
Derece: Doktora, 2007
Konu: Diş Hekimliği = Dentistry
Dizin: Kronik hastalık = Chronic disease ; Periodontitis = Periodontitis ; Polimorfizm-genetik = Polymorphism-genetic

Özet:
Amaç: Kronik periodontitisli ve periodontal açıdan sağlıklı bireylerde osteopontin(OPN) geninin genotip dağılımı, allel sıklığı ve genotip?fenotip ilişkisinin araştırılması vekarşılaştırılması amaçlanmıştır.Gereç ve Yöntem: Periodontal açıdan sağlıklı 50 birey ve 50 kronik periodontitislihastada, periodontal klinik (Sondalanan cep derinliği, klinik ataşman seviyesi, sondalamadakanama ve plak indeksi değerleri) ve radyografik incelemeler yapılarak, periodontal yıkımşiddeti belirlendi. Hastalardan alınan periferik kan örneklerinden elde edilen genomikDNA'da OPN geninin 6. ekzonunda 8090 C/T polimorfizmi, PCR-RFLP yöntemiyle çalışıldı.Kronik periodontitisli bireyler başlangıç periodontal tedavilerinin ardından, 6 ay boyuncabelirli aralıklarla klinik takip ve klinik periodontal ölçüm programına yerleştirildiler. Eldeedilen veriler Pearson Ki-Kare testi, Fisher's Exact Test, bağımsız iki grup t testi, lojistikregresyon ve tekrarlayan ölçümler için varyans analizleri kullanılarak değerlendirildi.Bulgular: Kronik periodontitis (KP) ve sağlıklı kontrol (K) gruplarında OPN (+8090)C/T genotip dağılımlarının sırasıyla CC %28, CT %48, TT %24 ve CC %32, CT %64, TT %4olduğu saptandı. OPN +8090 geni CT genotip dağılımı (K %64; KP %48) CC dağılımına göredeğerlendirildiğinde (K %32; KP %28), istatistiksel olarak anlamlı bir fark bulunamazken(p=0.7), TT genotip dağılımının (K %4; KP %24) istatistiksel olarak anlamlı olduğu saptandı(p=0.02, OR 6.85, %95 CI 1.3?36.06). Ancak +8090 T allel sıklığının kronik periodontitis(%48) ve sağlıklı (%36) gruplar arasında farklılık göstermediği belirlendi (2=2.95, p=0.86,OR: 1.64, %95 CI: 0.932?2.891). Benzer şekilde, T allellini taşıyan kronik periodontitis(%72) ve sağlıklı kontrol (%68) gruplarına ait bireyler arasındaki farkın da istatistiksel olarakanlamlı olmadığı görüldü (2=0.19, p=0.663). Ayrıca, OPN (+8090) C/T polimorfizmininkronik periodontitisli bireylerde, başlangıç periodontal tedavisini takiben periodontal dokuiyileşmesinde fonksiyonel bir rol üstlenmediği de saptanmıştır.Sonuç: Türk toplumunda OPN geni +8090 C/T polimorfizmi kronik periodontitiseyatkınlık oluşturabilecek genetik faktörlerden biri olabilir. Sonuçlarımızın daha fazla hastaüzerinde gerçekleştirilecek ileri çalışmalarla da desteklenmesi gereklidir.

Abstract:
Aim: To study and evaluate osteopontin (OPN) gene dispersion, allele frequency andgenotype-phenotype relations in chronic periodontitis and periodontally healthy subjects.Material and methods: 50 subjects with chronic periodontitis and 50 periodontallyhealthy subjects were examined radiographically and clinically (Probed pocket depth, probedattachment level, bleeding on probing and plaque indexes) to determine the periodontaldestruction levels. 8090 C/T which is in the 6th exon of the osteopontin gene was studied withPCR-RFLP method in the genomic DNA gained from the sampled blood of the subjects. Thesubjects with chronic periodontitis have been placed into a clinical re-examination andmaintenance program for 6 months at intervals after receiving initial periodontal therapy. Thestatistical evaluation of the data was performed with Pearson Chi-Square test, Fisher?s ExactTest, independent sample test, logistic regression and anaslyses of varience.Results: The +8090 C/T genotype frequencies determined for chronic periodontitis(CP) and healthy control (C) groups were CC %28, CT %48, TT %24 and CC %32, CT %64,TT %4 respectively. Altough the difference between OPN (+8090) CT genotype dispersion(C %64; CP %48) according to the CC frequency (K %32; KP %28) at +8090 of OPN genewas not statistically significant (p=0.7), a statistically significant difference was observed atTT genotype frequency (p=0.02, OR 6.85, %95 CI 1.3?36.06). However when chronicperiodontitis (%48) and healthy control groups (%33.3) were compared for the difference in+8090 T allele genotype frequency, no statistically significant difference was observed(2=2.95, p=0.86, OR: 1.64, %95 CI: 0.932?2.891). Similiarly, when T allel positive subjectsamong chronic periodontitis (%72) and healthy control (%68) groups were compared, nosignificant difference was observed (2=0.19, p=0.663). It was also determined that, the OPN(+8090) C/T polymorphism does not hold a functional role in periodontal tissue recover andhealing following initial periodontal therapy in chronic periodontitis subjects.Conclusions: It may be concluded that, the OPN gene 8090 C/T polymorphism may beone of the genetic factors which increases the risk of development of chronic periodontitis inTurkish population. Our results have to be confirmed by further studies where more subjectswill be included.