Osteogenezis imperfekta tanılı hastaların genotip ve fenotip korelasyonu
Genotype and phenotype correlation of patients diagnosed ofosteogenesis imperfecta
Yazar: LAMIYA ALIYEVA
Danışman: DOÇ. DR. ŞEBNEM ÖZEMRİ SAĞ ; DOÇ. DR. ŞEHİME GÜLSÜN TEMEL
Bursa Uludağ Üniversitesi / Tıp Fakültesi / Tıbbi Genetik Ana Bilim Dalı
Derece: Tıpta Uzmanlık, 2020
Konu: Endokrinoloji ve Metabolizma Hastalıkları = Endocrinology and Metabolic Diseases ; Genetik = Genetics ; Ortopedi ve Travmatoloji = Orthopedics and Traumatology
Dizin: Dizi analizi = Sequence analysis ; Fenotip = Phenotype ; Genetik varyasyon = Genetic variation ; Genotip = Genotype ; Osteogenez = Osteogenesis ; Osteogenez-imperfekta = Osteogenesis-imperfecta ; Varyantlar = Variants

Özet:
Osteogenezis imperfekta (Oİ), artmış kemik frajilitesi, düşük kemik
kitlesi, tekrarlayan kırık ve deformitelerle karakterize, kemik dokusunun sık
görülen kalıtsal bağ dokusu hastalığıdır.
Bu çalışmada, 2016-2020 yılları arasında Bursa Uludağ Üniversitesi Tıp
Fakültesi Tıbbi Genetik Anabilim Dalı polikliniğine başvuran, Oİ ön tanısı alan
54 olgu kullanıldı. Tanı amaçlı yapılan yeni nesil dizileme (YND) sonucunda
genlerde saptanan varyantlar veritabanları kullanılarak olguların klinik
özellikleri ile birlikte retrospektif olarak değerlendirildi.
Olguların 17'si erişkin, 34'ü çocuk ve 3'ü fetüstü. 54 olguya klinik
sınıflandırma yapıldığında 24 olgu Tip I, 3 olgu Tip II, 16 olgu Tip III, 9 olgu Tip
IV olarak değerlendirildi. Olguların 30'unda mavi sklera, 16'sında skolyoz,
32'sinde çoklu kırığa bağlı ekstremite deformiteleri, 27'sinde osteoporoz,
19'unda osteopeni, 38'inde boy kısalığı, 7'sinde Dİ, 1'inde işitme kaybı
görüldü. Olguların 19'unda COL1A1 geninde 17, 10'unda COL1A2 geninde
10, 4'ünde LEPRE1/P3H1 geninde 5, 3'ünde FKBP10 geninde 3, 2'sinde
SERPINH1 geninde 3, 1'inde IFITM5 geninde 1, 1'inde PLS3 geninde 1, 1'inde
NBAS geninde 2 varyant tespit edildi.
Veri analizi yapılan 54 olgunun 41'inde, 18 yeni varyant olmak üzere
toplam 39 varyant saptandı. Varyant saptanmayan 13 olguya tüm ekzom dizi
analizi yapılması planlandı. Çalışmamızda Oİ'nin moleküler tanısında panel
testinin YND tekniği ile çalışılmasının etkinliği, genotip-fenotip korelasyonu,
genetik danışma ve preimplantasyon/prenatal tanının önemi vurgulandı.

Abstract:
Osteogenesis imperfecta (OI) is the most common inherited connective tissue
disease of the bone, characterized by increased bone fragility, low bone mass,
recurrent fractures and deformities.
In this study, 54 patients who were admitted to the outpatient clinic of Bursa
Uludağ University, Department of Medical Genetics between 2016-2020 and
prediagnosed as OI were used. The variants detected in the genes as a result
of rouitine next generation sequencing (NSD) diagnostic tests were evaluated
retrospectively with the clinical data of the cases.
17 of the cases were adult, 34 were children and 3 were fetuses. 24 cases
were evaluated as Type I, 3 cases as Type II, 16 cases as Type III, and 9
cases as Type IV. Blue sclera in 30, scoliosis in 16, extremity deformities due
to multiple fractures in 32, osteoporosis in 27, osteopenia in 19, short stature
in 38, DI in 7, and hearing loss in 1 case were seen. 17 variants in COL1A1 In
nineteen caseses 10 variants in COL1A2 ; in ten cas, 5 variants in LEPRE1 /
P3H1 in four cases, 3 variants in FKBP10 in three cases, 3 variants in
SERPINH1 in two cases, 1 variant in IFITM5 , 1 variant in PLS3 and 2
variants in the NBAS gene in three cases were detected.
A total of 39 variants were detected on 41 cases. 22 of these variants were
novel. In our study, the effectiveness of the NGS panel test in the molecular
diagnosis of OI, genotype-phenotype correlation, genetic counseling and
preimplantation/prenatal diagnosis were emphasized.