Göz kapağı, konjunktiva ve orbita tümörlü hastalarda bap1 ve bap1 ile etkileşimde bulunan bazı genlerin ekspresyon profillerinin belirlenmesi
Determination of the expression profiles of BAP1 and BAP1 associated several genes in patients with eyelid,conjunctiva and orbita tumours
Yazar: AYÇA TAŞ
Danışman: PROF. DR. YAVUZ SİLİĞ
Cumhuriyet Üniversitesi / Sağlık Bilimleri Enstitüsü / Tıbbi Biyokimya Ana Bilim Dalı / Biyokimya Bilim Dalı
Derece: Doktora, 2017
Konu: Biyokimya = Biochemistry
Dizin: Gen ifadesi = Gene expression ; Göz hastalıkları = Eye diseases ; Göz kapağı neoplazmları = Eyelid neoplasms ; Karsinoma-bazal hücreli = Carcinoma-basal cell ; Konjonktival neoplazmlar = Conjunctival neoplasms ; Neoplazmlar = Neoplasms ; Orbita neoplazmları = Orbital neoplasms ; Polimeraz zincirleme reaksiyonu = Polymerase chain reaction

Özet:
Göz kapağı, konjunktival ve orbital tümörler dünya genelinde tüm kanser türleri arasında nadir görülen fakat optomolojide en yaygın tümör tiplerindendir. Göz kapağı birçok doku tipi içerdiğinden dolayı, benign ve malign tümörlerin çeşitli tipleri içerebilmektedir. Göz kapağı tümörlerinin % 90'dan fazlasını bazal hücre karsinomu oluşturmaktadır. Çalışma grubumuzun büyük bir kısmı da bazal hücre karsinomu hastalarından oluşuyordu. 
BRCA1 ile ilişkili protein-1 (BAP1) bir tümör baskılayıcı gendir ve BRCA1 proteinin RING finger domaini etkileşime giren bir proteindir. O-bağlı N-asetil transferaz (OGT), N-asetilglikozaminin treonin ya da serin rezidülerine O-glikozidik bağla eklenmesini katalizler. Ying Yang1 (YY1),  BAP1 ve OGT ile etkileşime giren bir transkripsiyon faktörüdür. Biz bu çalışmada göz kapağı, konjunktival ve orbital tümörlü 20 hastada BAP1, OGT ve YY1 ekspresyon düzeylerini Real Time PCR (RT-PCR), Enzim bağlı immünosorbent Analiz (ELİSA) ve immünohistokimya (IHK) gibi yöntemleri ile belirledik. RT-PCR yöntemiyle yapılan analizlerde BAP1, OGT ve YY1 ekspresyon düzeylerin artış gözlenmesine rağmen istatistiksel olarak anlamlı bir ilişki saptamadı (p>0,05). Ancak ELİSA ve IHK gibi yöntemleriyle yapılan analizde BAP1ve YY1 ekspresyon düzeylerinde kontrol gruplarına göre anlamlı bir artış kaydedildi (p<0,05). Dolasıyla buna benzer daha geniş kapsamlı araştırmalarda birey sayısının artırılması; göz kapağı, konjunktival ve orbital tümörlü oluşumunda risk faktörlerinin belirlenmesi açısından anlamlı sonuçlar elde etmemize katkı sağlayabilir. Daha anlamlı değerler elde edilmesiyle çeşitli tümörlerde büyük öneme sahip olan BAP1, OGT ve YY1 proteinlerin bu tür hastalıkların teşhisinde bir biyobelirteç olarak kullanılabileceği kanısındayız.

Abstract:
Eyelid, conjunctival and orbital tumors are rare in all types of cancer worldwide but they are the most common tumor types in optomology. Because the eyelid contains many types of tissue, benign and malignant tumors may contain various types. More than 90% of eyelid tumors constitute basal cell carcinoma. Most of our study group consisted of patients with basal cell carcinoma. More than 90% of eyelid tumors constitute basal cell carcinoma. The majority of our study group consisted of patients with basal cell carcinoma. 
BRCA1-associated protein-1 (BAP1) is a tumor suppressor gene that interacts with the RING finger domain of the BRCA1 protein. O-linked N-acetyl transferase (OGT) catalyzes the attachment of O-glycosidic linkages to N-acetylglucosamine threonine or serine residues. Ying Yang1 (YY1) is a transcription factor that interacts with BAP1 and OGT. In this study, we determined BAP1, OGT and YY1 expression levels in 20 patients with eyelid, conjunctival and orbital tumors by using Real Time PCR (RT-PCR), Enzyme Linked Immunosorbent Assay (ELISA) and immunohistochemistry (IHC). Although the expression levels of BAP1, OGT and YY1 were increased in RT-PCR analysis, no statistically significant correlation was observed (p> 0.05). However, a statistically significant correlation was found between BAP1 and YY1 expression levels in ELISA and IHK (p <0,05). Increasing the number of individuals in a wider range of similar studies; Eyelid, conjunctival, and orbital tumor formation. By obtaining more meaningful values, we believe that BAP1, OGT and YY1 proteins, which have large prevalence in various tumors, can be used as a biomarker in the diagnosis of such diseases.