Akciğer kanserli hastalarda, matriks metalloproteinaz-2 geni c1306t ve matriks metalloproteinaz-9 geni c1562t polimorfizmi, matriks metalloproteinaz -2 ,-9 ve doku ınhibitör metalloproteinazların ekspresyonu, plazma matriks metalloproteinaz -2 ,-9 se
The associations of matrix metalloproteinase (mmp) -2 gene c1306t and mmp-9 gene c1562t polymorphisms, expression of mmp -2 and -9 and tissue inhibitor of mmps (timp), and plasma activitiy levels of mmp-2 and 9 in lung cancer patients
Yazar: AYŞEGÜL BAYRAMOĞLU
Danışman: PROF.DR. HASAN VEYSİ GÜNEŞ
Eskişehir Osmangazi Üniversitesi / Sağlık Bilimleri Enstitüsü / Tıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
Derece: Doktora, 2007
Konu: Tıbbi Biyoloji = Medical Biology

Özet:
Çalısma, Akciger kanserli hastalarda, MMP-2, MMP-9, TIMP 1, 2, 3, 4 genekspresyonu, MMP-2 C1306T , MMP-9 C1562T polimorfizm sıklıkları, MMP-2 veMMP-9 enzim aktivitesinin akciger kanseriyle iliskilerini açıklamak amacıylayapıldı.Çalısmada, 300 kisiden (200 akciger kanserli, 100 kanser olmayan ) eldeedilen DNA ve RNA'lar kullanıldı. DNA'lardan PCR, RFLP ve elektroforezyöntemleriyle MMP-2 C1306T ve MMP-9 C1562T polimorfizm genotipleri,RNA'lardan PCR ve elektroforez yöntemleriyle MMP-2, 9, TIMP-1, 2, 3, 4ekspresyonları belirlendi. Plazma MMP-2, 9 enzim aktivite düzeyleri ELSAyöntemiyle belirlendi. Sonuçlar istatistiksel olarak degerlendirildi.Akciger kanseri için erkek cinsiyet, asbest teması ve sigara içiminin riskfaktörleri olabilecegi, C1306T genotip sıklıgı kontrollerde CC % 65, CT % 32,TT % 3, hastalarda CC % 62, CT % 37, TT % 2, C1562T genotip sıklıgıkontrollerde CC % 67, CT % 30, TT % 3, hastalarda CC % 75, CT % 24, TT% 1 olarak belirlendi. Gruplar arasında 1306 C -T ve 1562 C-T alel sıklıklarıyönünden istatistiksel olarak önemli bir farklılıgının olmadıgı, hasta grubunda,her iki genotip kendi arasında karsılastırıldıgında, CC genotipinin önemli düzeydeyüksek oldugu görüldü. MMP-2 ve MMP-9 enzim aktivitesinin, CC ve CTgenotipli hastalarda daha fazla olmak üzere tüm hastalarda yükseldigi belirlendi.Akciger kanserli hastalarda MMP-2 ve TIMP-1 ekspresyonunun istatistikselolarak önemli düzeyde yüksek oldugu belirlendi.Sonuçta, MMP-2 ve MMP-9 enzim aktivitesi belirlenmesinin, akciger kansertanısına yardımda kullanılabilir belirteç olabilecegini, özellikle CTCT heterozigotbireylerde MMP-9 enzim aktivitesi yüksek oldugundan, bu genotipin bir riskfaktörü olabilecegini söyleyebiliriz.Anahtar kelimeler:Doku nhibitör Metalloproteinazlar, Matriks metalloproteinaz-2 , Matriks metalloproteinaz-9, MMP-2 C1306T polimorfizmi,MMP-9 C1562T polimorfizmi.

Abstract:
We planned to investigate the association of gene expression levels of MMP-2, -9 and TIMP 1, 2, 3, 4 and polymorphisms frequencies of MMP-2 C1306T andMMP-9 C1562T, and plasma enzyme activities of these MMP in lung cancerpatients.DNA and RNA samples were extracted from pheripheral blood samples of300 subjects (200 patients + 100 controls). In DNA and RNA samples, MMP-2C1306T and MMP-9 C1562T polymorphisms and expression levels of MMP- 2,9,TIMP-1,2,3,4 were determined by using PCR, RFLP and electrophoresis. PlasmaMMP-2 and 9 enzyme activity levels were measured by using ELISA. The resultswere evaluated by using different statistical analyses.Sex , asbestos expose and smoking might be risk factors for lung cancer.The frequencies of C1306T genotypes in controls CC 65 %, CT 32 %, TT 3 % andin patients CC 62 %, CT 3 %, TT % 2, were found. The frequencies of C1562Tgenotypes in controls CC 67 %, CT 30 %, TT 3 % and in patients CC 75 %,CT 24 %, TT 1 % were found. It was determined that CC genotype frequencyincrease significantly between 1306 C-T and 1562 C-T allele frequencies. There isno difference between 1306 C-T and 1562 C-T allele frequencies when the groupswere compared with each other. The enzyme activities of MMP-2 and MMP-9increased in patients, espicially in patients with CC and CT genotypes. Theexpression of MMP-2 and TIMP-1 were found high in lung cancer patients.Finally, we claimed that determining of MMP-2 and MMP-9 enzyme levelscan be used as a marker, and since the MMP-9 activity was high in CTCTheterozygote subject, this genotype is a risk factor for lung cancer .Key Words: Tissue inhibitor metalloproteinases, Matrix metalloproteinase-2 , Matrix metalloproteinase-9, MMP-2 C1306T polymorphism,MMP-9 C1562T polymorphism.