Crohn hastalığında vitamin D reseptörü ve interlökin gen ailesi tek nükleotit polimorfizmlerinin belirlenmesi /
Yazar: SENA AKSU
Danışman: PROF. DR. ELİF DAMLA ARISAN
İstanbul Kültür Üniversitesi / Lisansüstü Eğitim Enstitüsü / Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı / Moleküler Biyoloji ve Genetik  Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2019
Konu: Genetik = Genetics
Dizin: Crohn hastalığı = Crohn disease ; Genler = Genes ; Hastalık = Disease ; Nükleotid = Nucleotide ; Polimorfizm-genetik = Polymorphism-genetic ; Vitamin D = Vitamin D ; İnterlökinler = Interleukins

Özet:
Crohn hastalığı, öncelikle sindirim sistemini etkileyen, karmaşık, uzun süreli,
kronik bir bağırsak hastalığıdır. Aşırı iltihaplanmaya neden olan anormal bağışıklık
yanıtları içerir. İnflamasyon sindirim sisteminin herhangi bir yerinde, ağızdan anüse
kadar meydana gelebilir. En çok bağırsak duvarlarını, özellikle ince bağırsağın alt
kısımlarını ve kalın bağırsağı etkiler. İnflamasyon olduğu zaman iltihaplı dokular
kalınlaşır şişer, sindirim sisteminin iç yüzeyinde açık yara gibi ülserler oluşur.
Crohn hastalığının nedeni tam olarak bilinmemektedir. Çevresel faktörler, genetik
yatkınlık, immünolojik yetersizlik gibi sebepleri olabilir. Crohn hastalığına bağlı
genlerin çoğu bağışıklık sistemi fonksiyonunda rol oynar. Crohn hastalarında
görülen düşük Vitamin D düzeyleri dikkati çekmektedir. Bu amaçla VDR geninde
görülen polimorfizmlerinflamatuar bağırsak hastalığı olan kişilerde araştırılmış ve
VDR polimorfizmleri ile tez kapsamında Crohn ve ülseratif kolit hastalarındaki
ilişki değerlendirilmiştir. Ayrıca interlökinlerde görülen düzensizliğin
tanımlanabilmesine yönelik olarak polimorfizmler sağlıklı kontroller, Crohn
hastalığı ve ülseratif kolit hastalarından elde edilen periferik kan örneklerinden elde
edilen DNA örneklerinde incelenmiştir.
Kontrol ve Crohn hastalarında ILRN'deki polimorfizmleri ve allelleri açısından
istatiksel olarak farklılık bulunmamıştır. Sağlıklı kontrol, ülseratif kolit ve Crohn
hastalarında allel sıklıkları hesaplanmıştır.
VDR genindeki polimorfizmlerin belirlenmesinde FokI ile kesim yapılan ürünler
için Crohn hastalığına duyarlılığı, TaqI ile kesim yapıldığında ise ülserleşmiş kolite
karşı duyarlı olduğu yapılan analizler sonucu görülmektedir.
IL-8 (845) rs2227532 ve IL-8 (-251) rs4073 polimorfizmi kontrol ve hasta grupları
arasında anlamlı bir fark bulunamamıştır.
Tez kapsamında İBH'lerde VDR ve interlökinpolimorfizmlerinin çalışılmasına
dikkat çekilmiş olup, gerekli teknik süreç tanımlanabilmiştir. Ancak gelecek
çalışmalarda daha fazla hasta grubunun çalışmaya alınması istatistiksel olarak
yeterli sayıda verinin eldesine olanak sağlayacaktır.

Abstract:
Crohn's disease is a complex, long-term, chronic bowel disease that primarily
affects the digestive system. It contains abnormal immune responses that cause
excessive inflammation. Inflammation can occur anywhere in the digestive tract,
from the mouth to the anus. It affects mostly the intestinal walls, especially the
lower parts of the small intestine and the large intestine. When inflammation
occurs, the inflamed tissues become thick, swollen, ulcers such as open wounds
occur on the inner surface of the digestive tract. The etiology of Crohn's disease is
unknown. Environmental factors, genetic predisposition, immunological deficiency
are the most probably underlying reasons. The genes that are linked to Crohn's
disease play a role in immune system function. Low vitamin D levels seen in
Crohn's patients are noteworthy. For this purpose, polymorphisms in vitamin D
receptor (VDR) gene were investigated in patients with inflammatory bowel disease
and the relationship between VDR polymorphisms and Crohn's and ulcerative
colitis patients were evaluated. In addition, polymorphisms were examined in DNA
samples obtained from peripheral blood samples obtained from healthy controls,
Crohn's disease and ulcerative colitis patients in order to identify the disorder seen
in interleukins. There was no statistically significant difference in ILRN and alleles
in control and Crohn's patients. Allele frequency was calculated in healthy control,
ulcerative colitis and Crohn's patients. In the determination of polymorphisms in
the VDR gene, sensitivity to Crohn's disease for FokI-cut products and sensitivity
to ulcerated colitis when cut with TaqI is observed.
The IL-8 (845) rs2227532 and IL-8 (-251) rs4073 polymorphism did not show a
significant difference between the control and patient groups.
Within the scope of the thesis, attention was drawn to the study of VDR and
interleukinpolymorphisms in IBDs and necessary technical process could be
defined. However, recruitment of more patient groups in the future studies will
allow obtaining sufficient statistical data.