FMF öntanılı hastalarda cıas1, tnfrsf1a ve vegf mutasyonları ile insan köpüksü virüs varlığının araştırılması
Investigation of human foamy virus and cias1, tnfrsf1a and VEGF mutations in patients with fmf prediagnosis
Yazar: MELEK YÜCE
Danışman: PROF. DR. HASAN BAĞCI
Ondokuz Mayıs Üniversitesi / Sağlık Bilimleri Enstitüsü / Tıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
Derece: Doktora, 2015
Konu: Tıbbi Biyoloji = Medical Biology

Özet:
Amaç: Otoinflamatuar kalıtsal bir hastalık olan Ailevi Akdeniz Ateşi (AAA, FMF), MEFV geninde meydana gelen mutasyonlar sonucu ortaya çıkmaktadır. Çalışmamızda, Tel-Hashomer kriterlerine göre "kesin tanı" almasına rağmen, bu hastalığa neden olan ve yaygın olarak gözlenen 12 MEFV gen mutasyonundan hiçbirini taşımayan hastalarda, FMF hastalığının yaygın fenotipik özelliklerinin ortaya çıkmasında CIAS1 ve TNFRSF1A genleri mutasyonları ve VEGF genindeki polimorfizmin etkisi ile İnsan köpüksü virüsünün (HFV) varlığını araştırmayı amaçladık. 
Materyal ve Metod: Çalışmada FMF ön tanılı hastalar Tel-Hashomer kriterlerine göre değerlendirdi. Bu kriterlere göre kesin tanı alan hastaların periferik kanlarından elde edilen DNA'ları TNFSRF1A, CIAS1 ve VEGF geninin sık görülen mutasyon bölgeleri PCR-RFLP yöntemi ile Human foamy virüsü ise PCR ile çoğaltılarak çalışıldı.
Bulgular: TNFRSF1A geni açısından karşılaştırıldığında iki grup arasındaki fark istatistiksel olarak anlamlı bulunmazken (p=0,481), VEGF gen polimorfizmi açısından fark istatistiksel olarak anlamlı bulundu (p=0,03). Çalışmaya dahil edilen bireylerin hiçbirinde CIAS1 L307P mutasyonuna rastlanmadığı için istatistiksel olarak değerlendirmeye alınmadı. İnsan köpüksü virüs varlığı ise istatistiksel olarak anlamlı derecede farklı bulundu (p=0,002).
Sonuçlar: Elde ettiğimiz sonuçlar, VEGF geni 936 C/T polimorfizminin FMF'in fenotipik özelliklerinin ortaya çıkmasında etkili olabileceğini göstermektedir. Aynı şekilde insan köpüksü virüsünün görülme sıklığının farklı olması da FMF klinik tablosunda yalnızca MEFV gen mutasyonlarının değil, başka etmenlerin de rol oynayabileceği görüşünü desteklemektedir. Bununla beraber, TNFRSF1A ve CIAS1 gen polimorfizminin,  FMF'in klinik özelliklerinin ortaya çıkmasında etkili olmadığını göstermektedir. 

Anahtar Kelimeler: CIAS1; İnsan Köpüksü Virüsü; MEFV; TNFRSF1A gen mutasyonları; VEGF polimorfizmi

Abstract:
Aim: Familial Mediterranean Fever (FMF) is an autoinflammatory inherited disease caused by mutations in the MEFV gene. In our study, we aimed to determine whether there is any relationship between the emergence of common phenotypic symptoms of FMF disease and CIAS1 and TNFRSF1A gene mutations and VEGF gene polymorphism, as well as presence of  human foamy virus in FMF patients, with definite diagnosis according to Tel-Hashomer criteria, who do not carry any of the 12 most common mutations tested in their MEFV genes.
Material and Method: In this study, DNA was obtained from peripheral blood of FMF patients who were definitely diagnosed according to Tel-Hashomer criteria. While hot spot mutation regions of TNFSRF1, CIAS1 and VEGF genes were analyzed by PCR-RFLP, the presence of Human foamy Virus was studied by PCR. 
Results: While the difference between groups was not found to be statistically significant (p=0.481) for TNFRSF1A gene mutation, the difference was found to be statistically significant for VEGF gene polymorphism (p=0.03). As none of the individuals who participated in this study carried CIAS1 L307P mutation, no statistical evaluation was carried out regarding this mutation. The presence of human foamy virus was found to be significantly different between the groups (p=0.002).
Conclusion: Our results suggest that 936 C/T polymorphism in VEGF gene can be effective in the emergence of phenotypic symptoms of FMF. Similarly, significantly different presence of human foamy virus support the suggestion that clinical picture of FMF does not only depend on the mutations in the MEFV gene, but other factors may also play a role. On the other hand,  the results also suggest that TNFRSF1A and CIAS1 gene mutations do not seem to effect the emergence of clinical symptoms of FMF.

Keywords: CIAS1; Human Foamy Virus; MEFV, TNFRSF1A, VEGF gene mutations,