Ailevi akdeniz ateşinde kaspaz1 izoformlarının ekspresyon analizi
Expression analysis of caspase1 isoforms in familial mediterranean fever
Yazar: YUSUF ŞEFLEKÇİ
Danışman: PROF. DR. SEMA SIRMA EKMEKÇİ ; PROF. DR. AHMET GÜL
İstanbul Üniversitesi / Sağlık Bilimleri Enstitüsü / Genetik Ana Bilim Dalı / Genetik Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2022
Konu: Genetik = Genetics
Dizin: Ailesel akdeniz ateşi = Familial mediterranean fever ; Gen ifadesi = Gene expression ; Kaspazlar = Caspases ; Pirin = Pyrin ; İnflamazom = Inflammasome ; İnterlökin 1 = Interleukin 1

Özet:
Ailevi Akdeniz ateşi (AAA) otozomal resesif geçiş gösteren kalıtsal bir hastalıktır.
Hastalık pirin proteininin kodlanmasından sorumlu MEFV geninde meydana gelen
mutasyondan kaynaklanmaktadır. Mutant pirin tarafından oluşturulan inflamazom
kaspaz1'i aktive ederek kontrolsüz İnterlökin 1-beta (IL-1b) salınımını tetikleyip
inflamasyona neden olur. Bu çalışmada ataklı ve ataksız dönemdeki hastalarda kaspaz1
izoformlarının ekspresyonları kantitatif PZR ve western blot yöntemleriyle incelendi.
Nötrofillerde Kaspaz1 alfa izoformu mRNA ekspresyonu ataklı hastalarda ataksızlara
göre daha yüksek olsa da istatistiksel olarak anlamlı farklılık bulunmadı (p=0,835).
Nötrofillerde delta-gama ve epsilon izoformları ataklı hastalarda ataksızlara göre
istatistiksel olarak anlamlı düzeyde azalmış bulundu (sırasıyla, p=0.0047 ve p=0,004).
Western blot sonuçlarına göre yalnızca kaspaz1 alfa izoformunun eksprese olduğu
gösterilirken ataklı ve ataksız hastalar arasında ekspresyon açısından belirgin bir fark
görülmedi. Periferik kan mononükleer hücrelerinde kaspaz1 izoformlarının (alfa, deltagama ve epsilon) mRNA ekspresyonu ataklı hastalarda ataksız hastalara göre daha
yüksek bulunsa da istatistiksel olarak anlamlı fark bulunamadı (sırasıyla p=0,0583
p=0,0712 ve p=0,0549). Western blot sonuçlarına göre ataklı hastalarda daha çok alfa
izoformunun, ataksız hastalarda ise beta, delta ve gama izoformunun eksprese olduğu
gösterildi. Ayrıca THP-1 hücrelerinde LPS uygulamasının kaspaz1 izoformlarının
ekspresyonunda farklılığa neden olmadığı gösterildi. Çalışmamız kaspaz1
izoformlarının ekspresyonunu ataklı ve ataksız hastalarda değerlendiren ilk çalışma
niteliğindedir. Kaspaz1 izoformlarının ekspresyonunun daha geniş hasta
popülasyonunda değerlendirilmesi gerekmektedir.

Abstract:
Familial Mediterranean fever (FMF) is an autosomal recessive inherited disease. The
disease is caused by mutation in the MEFV gene, which encodes pyrin. The
inflammasome formed by mutant pyrin activates caspase-1 and cause inflammation by
triggering the uncontrolled release of Interleukin 1-beta (IL-1b). In this study, the
expressions of caspase-1 isoforms in patients during attack and attack-free period were
analyzed by quantitative PCR and western blot. Although mRNA expression of alpha
isoform in neutrophils was higher in patients with attacks than in attack-free patients, no
statistically significant difference was found (p=0.835). However, delta-gamma and
epsilon isoforms were found to be statistically significantly decreased in patients with
attacks compared attack-free patients (p=0.0047 and p=0.004, respectively). Western
blot results showed that only alpha isoform was expressed, but there was no significant
difference in expression between patient with attack and attack-free. Although mRNA
expression of caspase-1 isoforms (alpha, delta-gamma and epsilon) in peripheral blood
mononuclear cells was higher in patients during attack than in attack-free patients, no
statistically significant difference was found (p=0.0583, p=0.0712 and p=0.0549,
respectively). According to the western blot results, alpha isoform was expressed more
in patients with attacks, and beta, delta and gamma isoforms were expressed in attackfree patients. In addition, LPS treatment to THP-1 cells did not cause a difference in the
expression of caspase-1 isoforms. Our study is the first to evaluate the expression of
caspase-1 isoforms in patients during attack and attack-free periods. Expression of
caspase-1 isoforms needs to be evaluated in the larger patient population.