E.coli ve klebsiella spp. suşlarında genişlemiş spektrumlu beta laktamazların 3 farklı yöntem ile araştırılması
Investigation of extended spectrum beta lactamases in e.coli and klebsiella spp. strains by 3 different methods
Yazar: YASİR NECMEDDİN ÜYÜMEZ
Danışman: DR. ÖĞR. ÜYESİ MERİH ŞİMŞEK
Afyonkarahisar Sağlık Bilimleri Üniversitesi / Lisansüstü Eğitim Enstitüsü / Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2019
Konu: Mikrobiyoloji = Microbiology
Dizin: Beta laktamazlar = Beta lactamases ; Escherichia coli = Escherichia coli ; Klebsiella pneumoniae = Klebsiella pneumoniae

Özet:
E. coli   K. pneumoniae   suşlarında genişlemiş spektrumlu beta laktamazların farklı Yöntemlerle Araştırılması Amaç: Afyonkarahisar Sağlık Bilimleri Üniversitesi Tıp Fakültesi Araştırma ve Uygulama Hastanesinde hastalardan  izole idilen E. coli   K. pneumoniae   suşlarında genişlemiş spektrumlu beta laktamazların Kombine Disk Yöntemi, Çift Disk Sinerji Yöntemi ve  Üç Boyutlu Test Yöntemleri ile  tespiti amaçlanmıştır. Gereç ve Yöntem: Çalışmamızda hastalardan izole edilen 125 E. coli ve  25 K. pneumoniae  suşlarına  3 yöntem  uygulanmıştır. Suşlar  konvansiyonel yöntemlerle tür düzeyinde tanınmıştır. Çift disk sinerji yöntemi ile GSBL üretimini 125 E. coli izolatı için 85 (%68,00) ve 25 K. pneumoniae izolatı için 9 (%76,00), üç boyutlu test ile E. coli için 125 izolatta 105 (%84,00) K. pneumoniae için de 25 izolatta 17 (%68,00), kombine disk difüzyon yöntemi ile E. coli için 125 izolatta  77 (%61,60) K. pneumoniae için 25 izolatta 17 (%68,00) tespit edilmiştir. Enterobacteriaceae suşlarında farklı direnç genleri sebebiyle fenotipik yöntemlerle GSBL saptanması  genellikle  yanlış sonuçlara neden olmaktadır. Çalışmamızda E. coli izolatları  için fenotipik yöntemlerden, üç boyutlu test , K. pneumoniae izolatı için ise çift disk sinerji yöntemi  en yüksek GSBL saptama yöntemi olarak bulunmuştur. Çalışmamızın sonucuna göre moleküler testler ile fenotipik testlerin bir arada çalışılması önerilmektedir. şartlarına uygun olmayan merkezlerde GSBL araştırılmasında en etkili yöntem E. coli  için üç boyutlu test , K. pneumoniae için çift disk sinerji testi  uygulanmalıdır.

Abstract:
Investigation of expanded-spectrum beta-lactamases in E. coli K. pneumoniae strains by different methods Objective: Combined Disc Method, Double Disc Synergy Method and Three Disc Dimensional Testing Methods Materials and Methods: Three methods were applied to 125 E. coli and 25 K. pneumoniae strains isolated from patients. Strains were identified at the species level by conventional methods. ESBL production by double disc synergy method was 85 (68.00%) for 125 E. coli isolates and 9 (76.00%) for 25 K. pneumoniae isolates, 105 (84%, 125 isolates for E. coli with three-dimensional test). 00) 17 (68.00%) of 25 isolates for K. pneumoniae, 77 (61.60%) of 125 isolates for E. coli and 17 (68.00%) for K. pneumoniae were detected by combined disc diffusion method. . Detection of ESBL by phenotypic methods due to different resistance genes in Enterobacteriaceae strains often leads to wrong results. In our study, the three-dimensional test for E. coli isolates and the double disc synergy method for K. pneumoniae isolates were found to be the highest ESBL detection methods. According to the results of our study, it is suggested that molecular and phenotypic tests should be combined. The most effective method to investigate ESBL in centers that do not meet the requirements of E. coli for the three-dimensional test, K. pneumoniae double disc synergy test should be applied.