Simulium (Simuliidae, Diptera) Cinsi angustipes tür gurubu Türkiye populasyonlarının genetik çeşitliliğinin araştırılması
Investigation of genetic diversity of Simulium (Simuliidae, Diptera) genus "angustipes species group" populations in Türkiye
Yazar: OKAN AKÇINAR
Danışman: DOÇ. DR. DAVUT ÜMİT ŞİRİN ; DR. EBRU CEREN FİDAN
Eskişehir Osmangazi Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Biyoloji Ana Bilim Dalı / Zooloji Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2024
Konu: Biyoloji = Biology

Özet:
Bu çalışmada Anadolu'da yayılışı gösteren Simulium angustipes tür grubu
popülasyonlarının filogenileri ve taksonomik durumları COI gen bölgesi kullanılarak
araştırılmıştır.

Anadolu'nun 35 farklı lokalitesinden 2016-2022 yılları arasında toplanan 8 farklı
populasyona ayrılarak değerlendirilmiştir. Toplamda 103 bireyden DNA eldesi
gerçekleştirilmiştir. COI gen bölgesinin çoğaltılması ve Sanger sekanslama yapıldıktan
sonra veri bilgileri oluşturulmuş ve Maksimum olasılık, SVD Quarted, Bayesian filogeni,
haplotip ağı analizleri ile tür sınırları belirleme testleri uygulanmıştır.

Çalışma sonucunda elde edilen tüm veriler değerlendirildiğinde; S. angustipes
gruba ait morfotaksonomik teşhisi yapılan 3 tür genetik olarakta tespit edilmiştir. S.
petricolum türünün Anadolu'da yayılış alanın geniş olduğu ve gurubun baskın türü olduğu
görülmektedir. S. flexibranchium türüne ait haplotipler beklenildiği gibi yüksek dal destek
değeri ile ayrı bir haplogrup oluşturmuştur. Bununla birlikte, Artvin ilinden tespit edilen S.
angustipes gruba ait yeni tür olabileceği öngörülen bir 3. Tür tespit edilmiştir. Haplotip ağı
analizleri de bu bulguları desteklemiştir.

Çalışmada tek bir gen bölgesi kullanılarak elde edilen verilerin türlerin taksonomik
statüsünün belirlenmesine katkı sağlamak ile birlikte yeterli olmadığı sonucuna varılmıştır.
Tür gurubu ile ilgili hem ülkemiz hem de tür gurubunun yayılış gösterdiği Palearktik bölge
genelinde morfotaksonomik, sitotaksonomik ve DNA temelli verilerin birlikte kullanıldığı
geniş bir taksonomik revizyon çalışması yapılması gerektiği düşünülmektedir.

Anahtar Kelimeler: Simulium,angustipes, DNA barkodlama,COI, Filogeni

Abstract:
In this study, the phylogenies and taxonomic statuses of the Simulium angustipes
species group populations distributed in Anatolia were investigated using the COI gene
region.

Individuals collected from 35 different localities in Anatolia between 2016 and
2022 were evaluated by dividing them into 8 different populations. Total DNA was
extracted from a total of 103 individuals. After the amplification of gene regions and
Sanger sequencing, data sets were generated, and Maximum Likelihood, SVD Quartets,
Bayesian phylogeny, haplotype network analyses, and species delimitation tests were
applied.

Upon evaluating all the data obtained from the study, it was determined that the
three morpho-taxonomically identified species within the S. angustipes group were also
genetically confirmed. It was observed that the S. petricolum species has a wide
distribution area in Anatolia and is the dominant species of the group. Haplotypes
belonging to the S. flexibranchium species formed a separate haplogroup with high branch
support values, as expected. Additionally, a third species within the S. angustipes group,
potentially a new species, was identified in the Artvin province. Haplotype network
analyses also supported these findings.

The study concluded that, while the data obtained using a single gene region
contribute to determining the taxonomic status of the species, it is not sufficient on its own.
It is suggested that a comprehensive taxonomic revision study should be conducted,
combining morpho-taxonomic, cytotaxonomic, and DNA-based data, both in our country
and across the Palearctic region where the species group is distributed.

Keywords: Simulium,angustipes, COI, DNA barcoding , Phylogeny