Çeşitli klinik örneklerden izole edilen enterobacteriaceae türlerinde karbapenemaz varlığının fenotipik olarak araştırılması
Phenotypic investigation of carbapenemase in enterobacteriaceae species isolated from various clinical specimens
Yazar: KÜBRA ALAY KARA
Danışman: PROF. DR. MUHAMMET HAMİDULLAH UYANIK
Atatürk Üniversitesi / Tıp Fakültesi / Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
Derece: Tıpta Uzmanlık, 2018
Konu: Mikrobiyoloji = Microbiology
Dizin: Antikorlar = Antibodies ; Beta laktamazlar = Beta lactamases ; Enterobacteriaceae = Enterobacteriaceae ; Enterobacteriaceae enfeksiyonları = Enterobacteriaceae infections ; Karbapenemler = Carbapenems ; İlaçlara direnç = Drug resistance ; İlaçlara direnç-mikrobiyal = Drug resistance-microbial

Özet:
Karbapenemler, geniş spektrumlu aktiviteye sahip ve özellikle çoklu ilaç
direncine sahip bakterilerin sebep olduğu enfeksiyonların tedavisinde kullanılan bir
beta-laktam antibiyotik grubudur. Günümüzde karbapenem dirençli
Enterobacteriaceae türü bakterilerin neden olduğu enfeksiyonlar ülkemizde ve
dünyada giderek artan sayıda bildirilmektedir. Bu direncin esas nedeni,
karbapenemaz üretiminden sorumlu genlerin bakteriler arasındaki aktarımıdır.
Direnç mekanizmalarının açıklığa kavuşturulması etkin tedavi ve dünya genelinde
endişe verici yayılımın kontrol edilebilmesi için çok önemlidir.
Bu çalışma Atatürk Üniversitesi Tıp Fakültesi Araştırma Hastanesi
Mikrobiyoloji Laboratuvarında 2016 Aralık-2017 Aralık tarihleri arasında yapıldı.
Çeşitli klinik örneklerden izole edilen ve VITEK-2 Compact otomatize sistemi ile
karbapenem minimal inhibitör konsantrasyon (MIK) değerlerinde artış ve disk
difüzyon yöntemi ile meropenem zon çapında azalma olduğu saptanan
Enterobacteriaceae suşlarından 112'si çalışma kapsamına alındı. Bu suşlar
karbapenemaz varlığı açısından Modifiye Hodge Testi (MHT) ve Carbapenem
İnaktivasyon Metodu (CIM) ile tarandı. Ayrıca karbapenemaz türünün fenotipik
olarak belirlenmesi amacıyla kombine disk difüzyon yöntemi kullanıldı.
Karbapenemaz taraması için kullanılan testlerde, 112 suşun 102'sinde
(%91,07) MHT ile 100'ünde (%89,29) ise CIM ile pozitiflik saptandı. Kombine disk
difüzyon yöntemi ile suşların 96'sında (%85,71) "OXA-48 ve benzeri profil", 4'ünde
(%3,57) MBL, 10'unda (%8,93) "GSBL+Porin kaybı", 1'inde (%0,89) KPC ve 1'inde
(%0,89) "AmpC+Porin kaybı" fenotipik olarak karbapenem direnç türleri saptanmıştır.
Karbapenem dirençli tüm suşlar antimikrobiyal duyarlılık sonuçları in-vitro olarak
kolistine duyarlı olarak bulunmuştur. Karbapenemaz üreten suşların rutin
laboratuvarlarda taranması etkin bir tedavinin düzenlenmesi açısından önemlidir.
EUCAST önerileri doğrultusunda meropenem MIK ve inhibisyon sınır değerleri esas
alınarak tedaviye yön verilmelidir. Tarama için önerilen değerlerin saptanması
durumunda basit ve kolay uygulanabilirliği açısından tarama yöntemlerinden MHT ve
CIM, karbapenemaz türünün belirlenmesi amacıyla fenotipik yöntemlerden kombine
disk yöntemleri kullanılabilir. Kombine disk yöntemiyle her ne kadar çeşitli
karbapenemaz türleri fenotipik olarak saptanabilse de elde edilen sonuçların referans
yöntemlerle doğrulanması gerekmektedir.
Anahtar Kelimeler: Enterobacteriaeceae, karbapenemaz, karbapenem direnci

Abstract:
Carbapenems are a group of beta-lactam antibiotics with the broadest
spectrum of activity used especially in the treatment of infections caused by
multidrug resistance bacteria. Recently, infections caused by carbapenem resistant
Enterobacteriaceae members have been reported in increasing numbers in our
country and in the world. The main cause of this resistance is the transfer of
carbapenemase producing genes between bacteria. The clarification of resistance
mechanisms is very important to effective treatment and to control worrying spread
across the world.
This study was carried out at Ataturk University, Medical Faculty, Research
Hospital, Microbiology Laboratory between December 2016 and December 2017.
112 of Enterobacteriaceae strains isolated from various clinical specimens and
determined increased carbapenem minimal inhibitor concentration (MIC) values
with VITEK-2 Compact automatization system and decrease diameter of meropenem
inhibition zone by disc diffusion method were included in the study. These strains
were screened for the presence of carbapenemase by Modified Hodge Test (MHT)
and Carbapenem Inactivation Method (CIM). Also, the combined disc diffusion
method was used for the definition of carbapenemase type phenotypically.
In the tests used for carbapenemase screening, 102 of 112 strains (91.07%)
were positive by MHT and 100 (89.29%) were positive by CIM. Carbapenem
resistance strains in our study defined phenotypically by the combined disc diffusion
method as; 96 (85.71%) in "OXA-48 and similar profile", 4 (3.57%) in MBL, 10 (8,93%)
in "ESBL + Porin loss", 1 (0.89%) in KPC and 1 (0.89%) in "AmpC + Porin loss". All
carbapenem resistant strains were sensitive to colistin in antimicrobial sensitivity
testing.
The detection of carbapenemase producing strains in routine laboratories is
important for the regulation of effective treatment. According to the EUCAST
recommendation related with the meropenem MIC and zone diameter breakpoints,
treatment should be regulated. In the case of determining the recommended values
for screening, MHT and CIM can be used as screening methods and combined disc
methods can be used for phenotypic determination of carbapenemase type.
Although various carbapenemase types can be detected phenotypically by the
combined disc method, the obtained results need to be confirmed by reference
methods.
Key words: Enterobacteriaceae, carbapenemase, carbapenem resistance