Thin Layer 7H11 agarın mikobakterilerin izolasyon ve identifikasyonundaki değerinin araştırılması.
Evaluation of Thin Layer 7H11 agar in the isolation and identification of mycobacteria.
Yazar: FERİHA BAŞOĞLU
Danışman: PROF. DR. MELTEM UZUN
İstanbul Üniversitesi / Sağlık Bilimleri Enstitüsü / Mikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2008
Konu: Mikrobiyoloji = Microbiology

Özet:
Çalışmamızda, TLA besiyerinin mikobakterilerin izolasyonu ve ön identifikasyonundaki performansı, LJ ve BACTEC MGIT 960 sisteminden alınan sonuçlarla karşılaştırılarak belirlenmiş ve bu besiyerinin rutin kullanımdaki yeri araştırılmıştır.İstanbul Tıp Fakültesi, Mikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Anabilim Dalı Mikobakteriyoloji Laboratuvarı'na tüberküloz tanısı amacıyla gönderilen toplam 700 klinik örnek çalışmaya dahil edilmiş ve örneklerin BACTEC MGIT 960, TLA ve LJ besiyerlerinde kültürü yapılmıştır. Kırk altı klinik örnekte Mycobacterium cinsi bakteriler üremiş ve bu bakterilerin %97,8'i BACTEC MGIT 960 (Becton Dickinson, Sparks, MD) sistemiyle, %82,6'sı TLA besiyeriyle ve %56,5'i LJ besiyeriyle izole edilmiştir. Preparat inceleme sonucu pozitif örneklerde BACTEC MGIT 960, TLA ve LJ besiyerleriyle izolasyon süresinin sırasıyla 8,94, 7,70, 22,25 gün; preparat inceleme sonucu negatif örneklerde ise sırasıyla 15,85, 14,28 ve 27,85 gün olduğu saptanmıştır. TLA besiyeri ve BACTEC MGIT 960 sistemi izolasyon süresi açısından karşılaştırıldığında aralarında istatistiksel olarak anlamlı bir fark görülmezken (p>0,05); LJ besiyerindeki izolasyon süresinin bu iki besiyerinden anlamlı derecede uzun olduğu saptanmıştır (p<0,05). Çalışmamızda TLA besiyerinin izolasyon oranı ve süresi açısından BACTEC MGIT 960 sistemi ile benzer, konvansiyonel LJ besiyerinden ise üstün olduğu sonucuna varılmıştır. TLA besiyerinde üreyen 38 mikobakteri suşunun kenarları düzensiz koloni oluşturduğu ve yüzeylerinin kord formunda olduğu belirlenmiş ve bu suşlar M. tuberculosis kompleksi olarak tanımlanmıştır. Ancak GenoType MTBC ile yapılan identifikasyonda bir suş nontüberküloz mikobakteri olarak tanımlanmıştır. Çalışmada tek bir TLA besiyerinden nontüberküloz mikobakteri izole edildiği için MTBC ve nontüberküloz mikobakteri kolonileri arasındaki fark gözlenememiş; ancak tüm MTBC suşlarının kenarları düzensiz koloni oluşturduğu ve üzerlerinin kord şeklinde görüldüğü belirlenmiştir. Çalışma sonunda GenoType MTBC (Hain Lifescience GmbH, Almanya) ile 27 suş M. tuberculosis, 2 suş nontüberküloz mikobakteri, 2 suş M. bovis ve 1 suş M. bovis BCG olarak identifiye edilmiştir.Anahtar Kelimeler : Thin Layer 7H11 agar, Mikobakteri, Mikrokoloni, Kord faktörüBu çalışma, İstanbul Üniversitesi Bilimsel Araştırma Projeleri Birimi tarafından desteklenmiştir. Proje No:1458.

Abstract:
In our study, the performance of TLA medium for isolation and presumptive identification of Mycobacteria was determined by comparing the results obtained from LJ and BACTEC MGIT 960 system and the routine utilisation of this medium was investigated. Seven hundred clinical samples sent to İstanbul Medical Faculty Department of Microbiology and Clinical Microbiology, Mycobacteriology Laboratory for the diagnosis of tuberculosis were included in the study and the samples were cultured on BACTEC MGIT 960 (Becton Dickinson, Sparks, MD), TLA and LJ media. Mycobacterium spp. was cultivated in fourty six clinical samples and 97.8 % of these bacteria were isolated by BACTEC MGIT 960 system, 82.6 % by TLA medium and 56.5 % by LJ medium. The isolation time with BACTEC MGIT 960, TLA and LJ medium was found to be 8.94, 7.70, 22.25 days respectively for smear positive samples and 15.85, 14.28 and 27.85 days for smear negative samples. While no statistically significant difference was found between the isolation time of TLA medium and that of BACTEC MGIT 960 system (p>0.05), the isolation time of LJ medium was detected to be longer than that of those two media (p<0.05). In our study the isolation rate and the isolation time of TLA medium was found similar to those of BACTEC MGIT 960 and superior to those of conventional LJ medium. The colony morphologies of 38 Mycobacterium isolates in TLA medium was detected to be irregular-edged colonies and cord formation and these isolates were identified as M.tuberculosis complex. However, one isolate was identified as non-tuberculosis Mycobacterium by Genotype MTBC (Hain Lifescience GmbH, Almanya) identification. The difference between the colony morphology of MTBC and non-tuberculosis mycobacteria couldn?t be observed because only one non-tuberculosis mycobacterium was isolated in TLA medium. However, it was found that all MTBC isolates formed irrugular-edged colonies and cord formation. As a result of the study, 27 isolates were identified as M. tuberculosis, 2 isolates were as non-tuberculosis mycobacteria, 2 isolates were as M. bovis and 1 isolate was as M. bovis BCG with Genotype MTBC kit.Key Words: Thin Layer 7H11 agar, Mycobacteria, Microcolony, Cord factorThe present work was supported by the Research Fund of Istanbul University.Project No.1458