Hepatı̇t C vı̇rüsü ı̇le enfekte hastalarda ı̇nterferon gen polı̇morfı̇zmlerı̇nı̇n araştırılması
Investigation study of interferon gene polymorphisms in patients infected with Hepatitis C virus
Yazar: FIRAS YOUSIF NAJI NAJI
Danışman: PROF. DR. SEÇİL AKILLI ŞİMŞEK
Çankırı Karatekin Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Biyoloji Ana Bilim Dalı / Biyoloji Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2023
Konu: Biyoloji = Biology

Özet:
Bazı sitokin genlerindeki genetik varyantlar, bir kişinin hepatit C virüsü (HCV) ile enfekte olduğu süreyi, klinik sonucu, HCV replikasyon oranını ve karaciğer hasarının şiddetini etkileme potansiyeline sahiptir. Vaka-kontrol çalışmasına Al-Muthanna Valiliği'ndeki Al-Hussein Eğitim Hastanesi'nden hepatit C virüsü ile enfekte olan 50 hasta dahil edilmiştir. Çalışmada hastalık grubu ile aynı yaş ve cinsiyette 50 gönüllüden oluşan bir kontrol grubu da bulunmsktsdır. IFN- γ gen polimorfizminin (+874) genotipini belirlemek için özel bir dizi primer polimeraz zincir reaksiyonu (SSP-PCR) kullanılmıştır. Her katılımcının plazmasındaki IFN-γ seviyesini belirlemek ve katılımcıların karaciğer fonksiyonlarını değerlendirmek için üreticinin talimatlarına uygun olarak ELISA ve tam otomatik biyokimyasal ekipman kullanılmıştır.  Hepatit C virüsü taşıyan hastaların serum karaciğer enzimleri ve bilirubin düzeylerinin yanı sıra IFN- γ düzeylerinde sağlıklı kontrollere kıyasla istatistiksel olarak anlamlı bir fark bulunurken, yaş ve cinsiyet dağılımı açısından iki grup arasında anlamlı bir fark bulunmamıştır. Bu çalışmada ayrıca, IFN- γ+874 polimorfizmlerinin A aleline ek olarak TA/AT genotipinin hastalardaki diğer genotiplere kıyasla sağlıklı kişilerde olduğundan daha yüksek prevalansa sahip olduğu bulunmuştur. Öte yandan, en yüksek interferon-gamma konsantrasyonu TT genotipi ve T aleli taşıyan hastalarda görülmüştür. Sonuçlarımız, IFN- γ+874 polimorfizmlerinin TA/AT genotipi ve T alelinin hepatit C enfeksiyonu ve patogenezi ile açık bir ilişkisi olduğunu düşündürmektedir. Ayrıca, TT genotipi ve T aleline sahip hastaların IFN- serum seviyelerinin diğer genotipe sahip olanlardan daha yüksek olduğu tespit edilmiştir.

Abstract:
Genetic variants in certain cytokines genes have the potential to affect the length of time an individual is infected with the hepatitis C virus (HCV), the clinical result, the rate of HCV replication, and the severity of liver damage. The case-control study involved 50 patients with hepatitis C virus infection from Al-Hussein Teaching Hospital in the Al-Muthanna Governorate and a control group consisting of 50 volunteers of the same age and gender. In order to determine the genotype of the IFN- γ gene polymorphism (+874), a particular sequence primer polymerase chain reaction was used (SSP-PCR). Following the manufacturer's instructions, ELISA and fully automated biochemical equipment were used to figure out how much IFN- γ was in each participant's plasma and to test their liver function. There was a statistically significant difference in the serum level of liver enzymes and bilirubin, in addition to the level of INF- γ in patients with hepatitis C virus compared to healthy controls, while there was no significant difference between the two groups in terms of age and gender distribution. This study also found a higher prevalence of the TA/AT genotype in addition to the A allele of IFN- γ+874 polymorphisms in patients than it is in healthy people compared to other genotypes. On the other hand, the highest concentration of interferon-gamma was in patients who carried the TT genotype and the T allele. Our results showed that the TA/AT genotype and allele T of IFN- γ+874 polymorphisms have a clear relationship with infection and pathogenesis of hepatitis C. It was also discovered that patients with the TT genotype and allele T had higher IFN- serum levels than those with another genotype.