Hepatosellüler karsinoma ve kolon kanser hücrelerinde miR-105-5p'nın etkisinin incelenmesi
Investigation of the effect of miR-105-5p in hepatocellular carcinoma and colon cancer cells
Yazar: EYLEM NAS
Danışman: DOÇ. DR. YASEMİN SAYGIDEĞER
Çukurova Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı / Biyoteknoloji Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2022
Konu: Biyoteknoloji = Biotechnology
Dizin: Hepatoselüler karsinom = Hepatocellular carcinoma ; Hücre dizisi = Cell line ; Kolon neoplazmları = Colonic neoplasms ; Neoplazmlar = Neoplasms ; mRNA = mRNA

Özet:
Son yıllardaki gen ekspresyon çalışmaları kanser hücrelerinde çarpıcı bir
şekilde değişikliğe uğramış miRNA ekspresyonlarına dikkat çekmektedir.
miRNA'lar hedefledikleri genin karakterine göre tümör baskılayıcı veya onkogen
bir özellik gösterebilmektedirler. Bir miRNA olan miR-105'in de kanser tipine
göre tümör baskılayıcı yada onkogen olarak işlev gördüğü bilinmektedir.
Araştırmamızda miR-105-5p'nin kolon ve hepatosellüler karsinomadaki
(HCC) etkisini incelemek amacıyla; HCT116 ve Huh7 hücrelerine miR-105-5p-
mimic, inhibitör ve negatif kontrolün transfeksiyonu gerçekleştirildi. miR-105-
5p'nin transfeksiyonunun; HCT116 ve Huh7 hücre hatlarında; hücre
proliferasyonuna, koloni oluşumuna, invazyonuna, hTERT, p21 ve p53
ekspresyonuna nasıl bir etkisi olduğu araştırıldı. miR-105'in downregülasyonunun
HCC de kolonileşmeyi azalttığını upregülasyonunun ise HCT116 da
kolonileşmeyi ve hTERT, p53, p21 genlerinin ekspresyonlarını azalttığı
gözlemlendi. Ancak Huh7 hücrelerinde miR-105-5p'nin downgülasyonu hTERT
ve p53'ün ekspresyonlarını azalttı. Ayrıca miR-105-5p'nin downregülasyonu ise
her iki hücre hattının da proliferasyonunu arttırdı. Son olarak miR-105-5p'nin
ekspresyonunun artışı hem Huh7 hem de HCT116 hücrelerinde kolonileşmeyi
arttırmıştır. Ayrıca miR-105-5p'nin inhibisyonu her iki hücre hattında da
proliferasyonunun artmasına neden olmuştur. Ek olarak transfeksiyon işleminin
gerçekleşip gerçekleşmediğini kontrol etmek amacıyla transfekte Huh7 ve HCT116
hücrelerinde miR-105-5p ve let-7c gen ekspresyonları kontrol edildi ancak sonuç
alınamadı.

Abstract:
Gene expression studies in recent years have drawn attention to strikingly
altered miRNA expressions in cancer cells. miRNAs can show a tumor suppressor
or oncogene feature depending on the character of the gene they target. It is known
that mir-105, a miRNA, also functions as a tumor suppressor or oncogene,
depending on the cancer type.
In our study, in order to examine the effect of miR-105-5p in colon and
hepatocellular carcinoma (HCC); HCT116 and Huh7 cells were transfected with
miR-105-5p-mimic, inhibitor and negative control. Transfection of miR-105-5p; In
HCT116 and Huh7 cell lines; Its effects on cell proliferation, colony formation,
invasion, hTERT, p21 and p53 expression were investigated. It was observed that
downregulation of miR-105 reduces colonization in HCC, while upregulation
reduces colonization in HCT116 and expression of hTERT, p53, p21 genes.
However, downregulation of miR-105-5p in Huh7 cells decreased the expression
of hTERT and p53 In addition, downregulation of miR-105-5p increased the
proliferation of both cell lines. Finally, increased expression of miR-105-5p
increased colonization in both Huh7 and HCT116 cells. In addition, inhibition of
miR-105-5p resulted in increased proliferation in both cell lines. In October, the
expression of miR-105-5p and let-7c genes were checked in transfected Huh7 and
HCT116 cells to check whether the transfection process had occurred, but no
results were obtained.