hakansabunis/tr-academic-research-agent-index huggingface dataset:
Amiloid Aß yapılarının moleküler dinamik simülasyonları
Molecular dynamics simulations of amyloid Aß structures
Yazar: RECEP KESKİN
Danışman: DOÇ. DR. MEHMET DİLAVER
Hacettepe Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Fizik Mühendisliği Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2023
Konu: Fizik ve Fizik Mühendisliği = Physics and Physics Engineering

Özet:
Amiloid-β izoformlarından olan Aβ40 ve Aβ42 fibrillerinin varlığı ve birbirleri ile etkileşimleri Alzheimer hastalığının patolojik özelliklerin biridir. Birçok klinik vaka çalışmasında, SARS-COV-2 virüsü Alzheimer hastalığının seyrini kötüleştirdiği ve ölüm oranlarının artmasına neden olduğu rapor edilmiştir. Araştırmamızın odak noktası, SARS-COV-2 virüsünün amiloidojenik Ser55PheTyrValTyrSerArgValLys63 (SK9) peptiti varlığında Aβ40 ve Aβ42 proteinlerinin 1:1 oranda çapraz tohumlanmasıyla elde edilen heterojen (Aβ40/Aβ42) ve homojen (Aβ40) fibril modellerinin kararlıklarının nasıl etkilendiğini incelemek olmuştur. Gerçekleştirdiğimiz simülasyonlar neticesinde, SARS-COV-2 virüsü varlığı altında heterojen fibril modelinin ile homojen fibril modeline kararlılıkları arasında anlamlı sayılabilecek farklılıklar gözlemlenmemiştir. Ancak, heterojen fibril modelinin merkezi hidrofobik bölgesinin karboksil ucu hidrofobik bölgesinin rezidüleriyle homojen fibril modeline göre daha fazla etkileşim içinde olduğu görülmüştür (yayınlanmamış veri).

Abstract:
The existence of Aβ40 and Aβ42, their aggregates, and their interaction are some pathological characteristics of Alzheimer's disease. Numerous clinical case studies throughout the COVID-19 pandemic revealed that the SARS-COV-2 causes aggravate the course of Alzheimer's disease and upsurge mortality rates. The investigation element of our study is to probe how the stability of the homogeneous (Aβ40) fibril model and 1:1 cross-seeded Aβ40 and Aβ42 fibrils of the heterogeneous (Aβ40/Aβ42) fibril model are impressed by the presence of the amyloidogenic Ser55PheTyrValTyrSerArgValLys63 (SK9) peptide of the SARS-COV-2 E-protein (envelope protein). Our analysis demonstrated that there are no prominent dissimilarities between the stability of the heterogeneous and the homogeneous fibril model. However, we observed the central hydrophobic region of the heterogeneous fibril model interacts more with the residues of the carboxyl-terminal hydrophobic region (unpublished data).
Yeni kamu işletmeciliği bağlamında Türkiye'de iş sağlığı ve güvenliği denetiminin değerlendirilmesi: İş Teftiş Kurulu Başkanlığı model önerisi
Occupational health and safety inspection in turkey in the context of new public management: A model proposal for  Labor Inspection Board
Yazar: HACİ KUTLAY
Danışman: PROF. DR. UĞUR ÖMÜRGÖNÜLŞEN
Hacettepe Üniversitesi / Sosyal Bilimler Enstitüsü / Siyaset Bilimi ve Kamu Yönetimi Ana Bilim Dalı / Kamu Yönetimi Bilim Dalı
Derece: Doktora, 2023
Konu: Kamu Yönetimi = Public Administration

Özet:
Bu çalışmada, mal veya hizmet üretim süreçlerinde kullanılan çalışma alanlarını iş sağlığı ve güvenliği kapsamında denetleyerek düzenleyici rol oynayan İş Teftiş Kurulu Başkanlığı'nın mevcut denetim sistemini, kamu yönetimi alanında yaşanan değişim ve dönüşüm neticesinde ortaya çıkan "Yeni Kamu İşletmeciliği" yaklaşımının ilkeleri çerçevesinde değerlendirmek ve bu yönde önerilerde bulunmak amaçlanmaktadır. Bu kapsamda, İş Teftiş Kurulu Başkanlığı'nın iş sağlığı ve güvenliği denetimlerinin 2007-2017 yılları arasındaki etkinlik düzeyleri "Veri Zarflama Analizi", "Analitik Hiyerarşi Süreci" ve "TOPSIS" yöntemleriyle ölçülerek değerlendirmeler yapılmış; ardından etkin olmayan yılların, etkin olmama nedenleri ve etkin olabilmeleri için girdi veya çıktılar üzerinden hangi değişikliklerin yapılması gerektiği analiz edilmiştir. Böylece kısıtlı kaynaklara sahip olan devletin, iş sağlığı ve güvenliği denetimi işlevini yerine getirirken bu kaynakların dağılımını etkinliği arttıracak şekilde yapması hedeflenmiştir. Yapılan araştırma neticesinde elde edilen bulgular ve sonuçlar değerlendirilerek, İş Teftiş Kurulu Başkanlığı'nın mevcut denetim sisteminin etkinliğini arttıracak şekilde iyileştirilmesi için yeni model önerisinde bulunulmuştur.

Abstract:
In this study, it is aimed to evaluate the current audit system of the Labor Inspection Board, which plays a regulatory role by inspecting the work areas used in the production of goods or services within the scope of occupational health and safety, within the framework of the principles of the "New Public Management" approach, which emerged as a result of the change and transformation in the field of public administration and It is aimed to make recommendations in this direction. In this context, the efficiency levels of the occupational health and safety audits of the Labor Inspection Board between the years 2007-2017 were measured by using the "Data Envelopment Analysis", "Analytic Hierarchy Process" and "TOPSIS" methods, and evaluations were made. It has been analyzed what changes need to be made on the inputs or outputs in order for them to be efficient. Thus, it is aimed that the state, which has limited resources, will distribute these resources in a way that will increase efficiency while fulfilling the function of occupational health and safety control. By evaluating the findings and results obtained as a findings of the research, a new model has been proposed to improve the efficiency of the existing inspection system of the Labor Inspection Board.
Öğrencilerin geometri ve cebir sorularına verdikleri cevapların birliktelik kuralı ile incelenmesi
Reviewing students' answers to geometry and algebra questions using association rule
Yazar: ÖZGE ÖRDEK
Danışman: PROF. DR. NECLA TURANLI
Hacettepe Üniversitesi / Eğitim Bilimleri Enstitüsü / Matematik ve Fen Bilimleri Eğitimi Ana Bilim Dalı / Matematik Eğitimi Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2023
Konu: Eğitim ve Öğretim = Education and Training ; Matematik = Mathematics

Özet:
Bu çalışmada, veri madenciliğinden yararlanarak geometri ve cebir arasındaki birliktelik kurallarının çıkarılması amaçlanmıştır. Bu amaç doğrultusunda 2016 yılında gerçekleştirilen Akademik Becerilerin İzlenmesi ve Değerlendirilmesi (ABİDE) sınavına ait matematik alt testinde yer alan geometri ve cebir öğrenme alanları kapsamında sorulmuş soruların öğrenci cevapları, araştırmada veri olarak kullanılmıştır. Veriler 2016 yılında ABİDE sınavına katılarak matematik alt testini cevaplayan 3892 öğrenci verisinden oluşmaktadır. Çalışma, öğrencilerin cevaplarını içeren veri setinin veri madenciliği yöntemlerinden birliktelik kurallarına göre analizi ile sürdürülmüştür. Analizler WEKA programı kullanılarak ve program içerisinde yer alan ve yaygın olarak kullanılan Apriori algoritması ile gerçekleştirilmiştir. Araştırma sonucunda, geometri öğrenme alanına ait soruların cevap örüntüleri arasında, cebir öğrenme alanına ait soruların cevap örüntüleri arasında ve geometri ve cebir öğrenme alanlarına ait soruların cevap örüntüleri arasında çeşitli birliktelik kuralları elde edilmiştir.

Abstract:
The purpose of the present study was to reveal the rules of association between geometry and algebra by means of data mining. For this purpose, students' answers to the questions asked in the geometry and algebra learning sections of the mathematics sub-test of the Academic Skills Monitoring and Assessment (ABİDE) test taken in 2016 were used as data. The data of 3892 students who took the ABİDE test and answered the math sub-test in 2016 were used in the study. The study was conducted by analyzing the data set containing the answers of the students using the rules of association, which is one of the data mining methods. The WEKA software and its widely-used algorithm "Apriori" were used to carry out the analyses. The study revealed various rules of association among the answer patterns of the geometry learning questions, the answer patterns of the algebra learning questions and the answer patterns of the geometry and algebra learning questions.
Çocuk ve ergenlerde süt ve daimi azı dişlerinde hipomineralizasyon ve taurodontizm prevalansının belirlenmesi
Çocuk ve ergenlerde süt ve daimi azi dişlerinde hipomineralizasyon ve taurodontizm prevalansinin belirlenmesi
Yazar: UGHUR HASANLI
Danışman: PROF. DR. ZAFER CAVİT ÇEHRELİ
Hacettepe Üniversitesi / Diş Hekimliği Fakültesi / Pedodonti Ana Bilim Dalı / Pedodonti Bilim Dalı
Derece: Diş Hekimliği Uzmanlık, 2023
Konu: Diş Hekimliği = Dentistry

Özet:
Bu çalışma, Büyük Azı-Keser Hipomineralizasyonuna (BAKH) sahip bireylerdeki taurodontizm varlığını değerlendirmek amacıyla yürütülmüştür. Dahil edilme kriterlerini karşılayan 6-14 yaş aralığındaki BAKH'li 182 birey çalışma grubuna dahil edilirken, sağlıklı mine yapısına sahip 289 birey ise kontrol grubuna dahil edilmiştir. İstatistiksel analizler için Ki-kare Testi ve Mann-Whitney U Testi kullanılmıştır. Bireylerin yaş ortalaması çalışma grubu için 10,5 yaş, kontrol grubu için ise 10,8 yaş olarak belirlenmiştir. Hasta düzeyinde değerlendirildiğinde, çalışma grubunda (%35,2) kontrol grubuna(%22,1)  kıyasla anlamlı derecede daha yüksek taurodontizm görülmüştür (p=0,015). Çalışma grubunda yer alan BAKH'li ve matür daimi birinci büyük azı dişlerindeki taurodontizm yüzdesi (%22,5), kontrol grubundaki sağlıklı mine yapısına sahip dişlere (%11,5) göre daha yüksek bulunmuştur (p<0,001). İmmatür daimi birinci ve ikinci büyük azı dişleri arasında taurodontizm yüzdeleri benzerlik göstermiştir.

Abstract:
This study was conducted to evaluate the presence of taurodontism in individuals with Molar-Incisor Hypomineralisation (MIH). 182 individuals with MIH, aged 6-14 years, who met the inclusion criteria, were included in the study group. On the other hand, 289 individuals with healthy enamel structure were included in the control group. Chi-square Test and Mann-Whitney U Test were used for statistical analysis. The mean age of the individuals was determined as 10.5 years for the study group and 10.8 years for the control group. Statistical analyzes concluded that taurodontism was significantly higher in the study group (35.2%) compared to the control group (22.1%) when evaluated at the patient level (p=0,015). The percentage of taurodontism in the mature permanent first molars (22.5%) affected by MIH in the study group was higher than the teeth with healthy enamel structure (11.5%) in the control group (p<0,001). However, taurodontism percentages were similar between groups for immature permanent first and second molars.
Riesz uzaylarında netlerin yakınsaklıkları üzerine
On convergence of nets in Riesz space
Yazar: EZGİ HAN ERYÜKSEL
Danışman: DOÇ. DR. NAZİFE ERKURŞUN ÖZCAN
Hacettepe Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Matematik Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2023
Konu: Matematik = Mathematics

Özet:
Banach latisleri sıra, relatif düzgün, sınırsız sıra, sınırsız norm ve sınırsız mutlak
yakınsaklık gibi birçok farklı yakınsaklık yapılarıyla donatılabilir. Bu yakınsaklıkların
bir kısmı topolojik iken bir kısmı topolojik olmasa da sadece sıra yapısını koruyan
yakınsaklıklardır. Sınırsız sıra yakınsaklık ilk olarak "bireysel yakınsama" adı altında
De Marr tarafından tanımlandıktan sonra Nakano tarafından "uo-yakınsama" adı altında
incelenmiştir. Son zamanlarda birçok araştırmacı farklı tipteki sınırsız yakınsamaların
özellikleri ile ilgilenmiştir. Sınırsız norm yakınsaklık ise ilk olarak Troitsky tarafından
tanıtılmış ve incelenmiştir. Son olarak Zabeti uaw-yakınsaklığı tanımlamış ve üzerinde
çalışmıştır. Bu tezde tüm bu yakınsaklık çeşitleri ile ilgilenilmiştir, aralarındaki ilişkiler
araştırılmıştır.

Abstract:
Banach lattices can be equipped with many convergence structures such as order,
relative regular, unbounded order, unbounded norm convergence, and absolutely unbounded weak convergence. While some of these convergences are topological, some
of them are not. However they are convergences that only preserve the order structure. Unbounded order convergence was firstly defined by De Marr under the name of
"individual convergence" and then examined under the name of "uo-convergence" by
Nakano. Recently, many researchers have focused on the properties of different types
of unbounded convergence. Unbounded norm convergence was firstly introduced and
studied by Troitsky. Finally, Zabeti uaw-convergence defined and worked on. In this
thesis, all these types of convergence is studied and the relationships between them are
investigated.
Doğrudan yabancı yatırımların vergilendirilmesi: Türkiye örneği
Taxation of foreign direct investments: The case of Turkey
Yazar: EZGİ SEVİNÇHAN KURUN
Danışman: DOÇ. DR. OYTUN CANYAŞ
Hacettepe Üniversitesi / Sosyal Bilimler Enstitüsü / Kamu Hukuku Ana Bilim Dalı / Mali Hukuk Bilim Dalı
Derece: Doktora, 2023
Konu: Hukuk = Law ; Maliye = Finance
Dizin: Doğrudan yabancı sermaye yatırımları = Foreign direct investments ; Gelir vergisi = Income tax ; Kurumlar vergisi = Corporate tax ; Türk vergi sistemi = Turkish tax system ; Uluslararası işletmeler = International enterprises ; Vergi sistemi = Tax system ; Vergilendirme = Taxation ; Vergiler = Taxes ; Çok uluslu sermaye şirketleri = Multinational equity companies

Özet:
Çalışmanın konusunu doğrudan yabancı yatırımların vergilendirilmesinde Türkiye uygulamaları oluşturmaktadır. Söz konusu yatırımların büyük ölçüde çok uluslu şirketler tarafından gerçekleştiriliyor olması ise konuyu daha geniş bir perspektiften ele almayı gerektirmektedir. Zira çok uluslu şirketler, devletlerin vergi uygulamalarını dolanabilme yeteneklerine sahip olup ekonomik büyüklükleri sebebiyle vergi egemenliğini de etkileme potansiyeline sahiptir. Türkiye açısından ise doğrudan yabancı yatırımlara ilişkin hukuki sınır 4875 sayılı Kanun ile çizilmiş olup söz konusu Kanun vergi uygulamaları bakımından da temel oluşturmaktadır. Bu doğrultuda çalışmada hukuken doğrudan yabancı yatırım statüsünde olan yatırımların elde ettikleri kazançların Türk vergi sistemi içerisindeki konumu ele alınmaktadır.

Abstract:
The subject of this study is Turkish practices in the taxation of foreign direct investment. The fact that these investments are largely made by multinational companies necessitates a broader consideration of the issue. This is because multinationals are able to circumvent the tax practices of states and, due to their economic size, have the potential to affect tax sovereignty. For Turkey, the legal boundary for foreign direct investment was drawn by Act No. 4875, and this act also forms the basis for tax practice. Against this background, this study analyses the position of investment income, which is legally FDI, within the Turkish tax system.
Yaylı çalgıların evrimsel gelişimi ve günümüz çalgılarıyla Barok dönem müziklerinin yorumlanması
Evolutionary development of string instruments and performing Baroque music on contemporary instruments
Yazar: DORUK SELEN GÜLEÇ
Danışman: PROF. BİGE BEDİZ KINIKLI
Hacettepe Üniversitesi / Güzel Sanatlar Enstitüsü / Yaylı Çalgılar Ana Sanat Dalı / Viola Sanat Dalı
Derece: Sanatta Yeterlik, 2023
Konu: Müzik = Music
Dizin: Barok Çağ = Baroque Age ; Keman = Violin ; Viyola = Viola ; Yaylı çalgılar = String instruments ; Çalgılama teknikleri = Instrumentation techniques ; Çalgılar = Musical instruments

Özet:
Yaylı Çalgılar üyesi viyolanın ataları orta çağa dayanır. Zaman içinde enstrümanın geçirdiği fiziksel değişimler, çalım tekniği ve müzikal anlayışı da geliştirmiştir. Barok dönem müziklerini modern enstrüman ile yorumlarken dikkat edilmesi gereken teknik ve müzikal temeller her ne kadar kesin bir gerçeklik kazanmamışsa da birçok müzisyen, besteci ve teori uzmanı tarafından onay ve kabul görmüş bir çerçeve oturtulmuştur. Yapılan araştırmada dilimizde bu teknikleri bütün halinde birleştiren yeterli kaynağın bulunmadığı tespit edilmiştir. Bu çalışma, ülkemizdeki dönemine uygun Barok müziği icrası yapmak isteyen müzisyenler için temel tekniklere değinen bir kılavuz olma amacı taşımaktadır.

Abstract:
Viola, the member of string instruments, originated in the middle ages. The playing technique and the musical understanding has developped because of the physical changes that the instrument has faced over time. Although there is no absolute truth to be considered  in the technical and musical basics while performing the Baroque period music by the modern instrument, accepted and approved boundaries by many musicians, composers and theory experts is reframed. With brief research, it has been established that there is not sufficient resource which combines all techniques in a body in our language. This study aims to be a guide that mentions and discusses all the technical details for the musicians who wants to expert in period performance of the Baroque music.
Soda pişiriminde renkli astar araştırmaları ve özgün uygulamalar
Colored lining research and original applications in soda firing
Yazar: ZÜLEYHA YILMAZ SİR
Danışman: DOÇ. HÜSEYİN ÖZÇELİK
Hacettepe Üniversitesi / Güzel Sanatlar Enstitüsü / Seramik Ana Bilim Dalı
Derece: Sanatta Yeterlik, 2023
Konu: Güzel Sanatlar = Fine Arts

Özet:
"Soda Pişiriminde Renkli Astar Araştırmaları ve Özgün Uygulamalar" başlıklı bu çalışma raporu 3 ana bölümden oluşmaktadır.

"Soda Pişirimi ve Astar" başlıklı bölümde; Soda pişirimi tanımlanarak, soda pişirim tekniğinin tarihsel gelişimden ve fırınlarından bahsedilmiştir. Astarlar ve soda pişiriminde astar kullanımı hakkında bilgiler verilerek, soda pişirimi ile çalışan sanatçılardan örnekler aktartmıştır.

"Deneysel Uygulamalar" başlıklı bölümde; astarların renklendirilmesi için; soda pişiriminde kullanılan bünyeler ve astarlar üzerine araştırmalar yapılmıştır. Araştırmalar sonucunda, literatürden elde edilen astar reçetelerine ve bu reçetelere renklendiriciler katılarak yapılan denemelerle yeni renk sonuçlarına ulaşılmıştır. Elde edilen sonuçlar ve reçeteler hakkında detaylı bilgi verilmiştir.
"Özgün Uygulamalar" başlıklı bölümde; çalışmanın önceki bölümlerinde yapılan araştırmalar doğrultusunda, soda pişirimine uygun özgün seramik formlar oluşturulmuştur. Deneysel çalışmalar neticesinde başarılı bulunan astar reçeteleri, özgün seramik formların belirli yüzeylerine uygulanarak soda pişirimi gerçekleştirilmiştir. 

Yapılan denemeler ve özgün uygulamalar, çalışma raporunun sonuç kısmında değerlendirilmiştir.

Anahtar Sözcükler: Seramik, Soda Sırları, Soda Astarları, Soda Pişirimi, Soda Pişirimi Tekniği.

Abstract:
This study report titled "Coloured Lining Research and Original Applications in Soda Firing" consists of 3 main sections.

In the first chapter titled; "Soda Firing and Lining" By making the definition of soda firing, its historical development and furnaces are mentioned. Information was given about linings and the use of lining in soda firing, and examples from artists working with soda firing were given.

In the second part, titled; "Experimental Applications" for colouring linings; Researches has been done on the bodies and linings used in soda firing. As a result of the research, new colour results were obtained by adding colorants to the primer recipes obtained from the literature and these recipes. Detailed information was given about the results and prescriptions.

In the third and last section titled; "Original Applications" In line with the research, examinations and observations made in the previous sections, original ceramic forms suitable for soda firing were produced. Soda firing was carried out by applying the lining recipes, which were successful as a result of the trials, on the ceramic forms made.

In the conclusion part of the thesis, the data obtained as a result of the trials and applications were evaluated, and the results were examined.

Keywords: Ceramics, Soda Glazes, Soda Liners, Soda Firing, Soda Firing Technique.
Penrose aydınlanmayan oda geometrisinde tek foton ve birden fazla foton için kuantum yürüyüşü problemi
Single-photon and multi-photon quantum walk problem in penrose unilluminable room geometry
Yazar: ENES PUŞULU
Danışman: DR. ÖĞR. ÜYESİ EGE ÖZGÜN
Hacettepe Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Fizik Mühendisliği Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2023
Konu: Fizik ve Fizik Mühendisliği = Physics and Physics Engineering

Özet:
İlk olarak Ernst Straus tarafından, bir nokta ışık kaynağının kapalı bir geometrideki tüm alanları aydınlatıp aydınlatamayacağı soruldu ve daha sonra bu soru Roger Penrose ve babası tarafından Penrose aydınlanmayan oda olarak adlandırılan bir geometri önerilerek olumlu yönde yanıtlandı. Bu tez kapsamında öncellikle bu geometri klasik elektrodinamik kapsamında yeniden incelenmiştir. Daha sonra geometri kavite kuantum elektrodinamiği metotları kullanılarak modellenerek ışık kuantalarının, yani fotonların, geometrideki davranışı kuantum yürüyüşü olarak verilmiştir. Sırasıyla, ışığın klasik ve kuantum davranışı için simülasyonlar ve nümerik hesaplar yapılmıştır, ayrıca geometri modellenirken ortaya koyulan modeldeki kübit ve foton modları arasındaki evrensel dolanıklık da hesaplanmıştır. Sonuç olarak model göstermiştir ki sistemteki foton sayısı arttıkça sistemin davranışı klasik durumdakine yakınsamaktadır.

Abstract:
A question has been asked originally by Ernst Straus: does there exist a closed geometry such that a point-like light source is unable to illuminate all areas in the geometry? That question was later answered in the positive by Roger Penrose and his father by proposing a geometry, later named the Penrose unilluminable room. First, the geometry is re-examined in the context of classical electrodynamics. Then, the geometry is modeled in the context of cavity quantum electrodynamics methods to formulate the behavior of light quanta, photons, in the geometry, resulting quantum walk phenomenon. Computer simulations and numerical calculations are given in that respective order for classical and quantum behavior of light in the geometry, and a calculation of the global entanglement between qubits and fotonic modes, which were introduced in the process of modeling the system, is also given. The model shows that as the photon number increases in the geometry, the behavior of the system converges to the classical case.