Herediter otoinflamatuar hastalıklarda ASC gen mutasyonlarının ve mRNA ekspresyonunun saptanması
Determination of ASC gen mutations and mRNA expressions in hereditary autoinflammatory disorders
Yazar: SİNEM MELEK NALBANTOĞLU
Danışman: DOÇ. DR. BAHATTİN TANYOLAÇ ; PROF. DR. AFİG BERDELİ
Ege Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Biyomühendislik Ana Bilim Dalı
Derece: Doktora, 2010
Konu: Biyomühendislik = Bioengineering ; Çocuk Sağlığı ve Hastalıkları = Child Health and Diseases

Özet:
Bu çalışmada, herediter otoinflamatuar hastalıklarda bir prototip olan Ailesel Akdeniz Ateşi (FMF: Familial Mediterrenean Fever: OMIM249100) hastalığında ortaya çıkan farklı fenotiplerin oluşumunda intraselüler adaptör protein olarak bilinen ASC (apopthosis-associated speck like protein with a CARD) molekülünün rolü araştırılmıştır. 165 bireyden oluşan çalışma grubumuzda, MEFV ve PYCARD (ASC) geni mutasyon analizleri ve `'PYCARD'' mRNA gen ekspresyonu kantitasyonu gerçekleştirilmiştir. MEFV geni mutasyon analizinde; 2, 3, 5 ve 10. ekson mutasyonlarından homozigot, heterozigot, bileşik heterozigot ve MEFV geninde major mutasyon saptanmayan klinik olarak şüpheli FMF gruptan oluşan hasta alt grupları oluşturulmuştur. ASC geninin tüm kodlayan eksonlarını içeren mutasyon analizinde hiç bir hastada nukleotit değişimi saptanmamıştır. ASC geni mRNA ekspresyonu kantitasyonunda, sağlıklı kontrollere relatif olarak FMF hastalarında istatistikî anlamlı (p<0,004) ekspresyon artışı görülmüştür.Bu verilere göre, çalışma grubunu oluşturan Türk FMF hastalarında ASC geni mutasyona uğramayarak, evolüsyoner süreçte hücre içinde merkezi ve adaptör niteliğe sahip korunmuş bir protein olduğunu göstermiştir. ASC geni FMF hastaları otoinflamasyonunda önemli bir yere sahiptir ve sorumlu MEFV genine modifikatör olarak; hastalığın ortaya çıkışı, klinik seyir ve özellikle major mutasyonu bulunmayan hastalarda fenotipik özelliklerin oluşumunda rolü olduğu düşünülmektedir.

Abstract:
In this study, the role of ASC (apopthosis-associated speck like protein with a CARD) gene in processing the different phenotypes during the pathogenesis of Familial Mediterranean Fever which is a prototype in hereditary auto-inflammatory diseases was analyzed. In the study group consisting of 165 patients, mutation analysis of MEFV and PYCARD (ASC) genes and gene expression quantitaion of PYCARD (ASC) gene were performed. In the mutation analysis of MEFV gene, patient subgroups were constituted involving homozygous, heterozygous, compound heterozygous and suspicious cases with synonimous and non-synonimous sequence changes relative to mutations taken part in exons 2, 3, 5 and10. We didn?t found any sequence change in the whole coding exons of ASC gene in 165 individuals. In gene expression quantitation, sytatistically significant ASC gene expression fold increases (p<0,004) were seen relative to healthy controls.Our results pointed out the evolutionary role of ASC gene which seems to be conserved since neither mutation nor polymorphisms were foumd within exons of this gene. ASC gene has significant modificator role relative to MEFV gene in FMF patients, and suggesting a role in occurring of the disease, prognosis and phenotypic characterization in particularly for the no-major-mutation group.