MMP-1 geni promoter bölgesindeki polimorfizmin ovaryum kanseri riski üzerine etkisi
The effects of MMP-1 gene polymorphism on promoter region on ovarian cancer susceptibility
Yazar: ÖMER FARUK BAYRAK
Danışman: DOÇ.DR. İBRAHİM PİRİM
Atatürk Üniversitesi / Sağlık Bilimleri Enstitüsü / Tıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2006
Konu: Moleküler Tıp = Molecular Medicine
Dizin: Neoplazmlar = Neoplasms

Özet:
Ovaryum kanseri önemli sağlık problemlerinden birisidir ve kadın kanserleriarasında %4 oranında görülür.1 Cerrahi, radyoterapi ve kemoterapi gibi tedavimetotları uygulanmasına rağmen hastalıkların survisi uzun değildir. Bu sebeple tedavive hastalıktan korunma yöntemlerine paralel olarak hastalığın moleküler temelinianlamak oldukça önemlidir.Matriks metalloproteinaz enzim ailesi ailesinin üyelerinden biri olan matriksmetalloproteinaz (MMP-1) intersitiyal kollojenlerin yıkımından sorumludur. MMP-1gen ekspresyonu, promoterindeki bağlanma bölgelerine bağlanan aktivatör protein-1(AP-1) ve polima güçlendirici aktivite-3 (PEA-3/ETS) vasıtasıyla mitojen aktive edicikinaz tarafından kontrol edilir. MMP-1 geni promoter bölgesinin -1607 bç'sindemeydana gelen guanin insersiyonu ile yeni bir ETS bağlanma bölgesi oluşur. Bunabağlı olarakta MMP-1 geninin transkripsiyonel aktivitesi artar.2Bu çalışmada, RFLP tekniği kullanılarak ovaryum kanserli olgularda, MMP-1geni promoter bölgesindeki guanin insersiyonu tespitini hedefledik. 66 hasta ve 66kontrol arasında yapılan genotiplemeye bağlı olarak 2G/2G ve 1G/2G genotipine sahipbireyler arasındaki allelik frekansta önemli fark bulunmuştur. Heterozigotların (1G/2G)ve homozigotların (2G/2G) frekansı ovaryum kanserli kadınlarda (% 82) kontrolgrubuna nazaran (% 73) önemli ölçüde yüksektir (c2 = 4.827; P = 0.028). Elde edilen budeğerlere bağlı olarak 2G alleli taşıyan kadınların 1G alleli taşıyan kadınlara nazaranovaryum kanserine yakalanma riski daha yüksek olduğu görülmektedir.

Abstract:
Ovarian cancer is a very important health proplem which appears withinwomen at the rate of 4% 1.Mortality rate is high even if radiotherapy, chemothraphyand surgery are routinely performed. It has, therefore, been important to investigatemolecular basis of the disease.Matrix metalloproteinase family degrades extracellular matrix. MatrixMetalloproteinase-1 (MMP-1) is a member of this family, which initiates breakdownof interstitial collagens. The expression of MMP-1 is controlled by mitogen activatedprotein kinase (MAPK) pathway. This pathway is activated by activity of activatorprotein-1 and polyma enhancer activity-3(PEA-3)/erythroblast transformation specificdomain (ETS). These factors bound to site of promoter region. But some casesguanine base insertion occurs on -1607 bp. This insertion creates a new binding sitefor ETS. So the transcriptional activity of MMP-1 is increased. The presence of thisinsertion deals with incidence of some cancer types.We aimed to investigate insertion of guanin within the promoter region ofMMP-1 gene in patients with overian cancers by using RLFP technique. We found asignificantly higher difference in allelic frequencies at this polymorphic site betweenpatients and controls. The frequency of heterozygotes and homozygotes for the 2Gallele (2G/2G and 1G/2G) was significantly higher among women with ovarian cancers(82%) than that in individuals without cancer (73%; c2= 4.827; P=0.028), indicatingthat individuals who carry even one 2G allele are more susceptible to ovarian cancerthan women with constitutional 1G/1G genotype.