Kolorektal kanserde tanı belirteci olarak mikrorna'ların rolü
The role of microrna's as diagnostic markers in colorectal cancer
Yazar: SELÇUK GÜLMEZ
Danışman: PROF. DR. SEVGİ KALKANLI TAŞ
Sağlık Bilimleri Üniversitesi / Hamidiye Sağlık Bilimleri Enstitüsü / Moleküler Onkoloji Ana Bilim Dalı
Derece: Doktora, 2023
Konu: Genel Cerrahi = General Surgery ; Moleküler Tıp = Molecular Medicine ; Onkoloji = Oncology
Dizin: Biyobelirteçler = Biomarkers ; Gen ifadesi = Gene expression ; Gerçek zamanlı polimeraz zincir reaksiyonu (RT-PCR) = Reverse transcription polimerase chain reaction ; Kolorektal cerrahi = Colorectal surgery

Özet:
Amaç: Bu çalışma, üç mikroRNA (miRNA)'nın (miRNA-92a-3p, miRNA-29a-3p ve miRNA-21-5p) kolorektal kanser (KRK)'deki tanısal ve prognostik öngörülebilirliğini değerlendirmek için, tümörlü hastalardan elde edilen doku ve serum numunelerinin kontrolleriyle karşılaştırmalı analizini amaçlamaktadır.
Gereç ve Yöntem: Önceki çalışmalara dayanarak, KRK tanısı için en umut verici 3 miRNA (miR-92a-3p, miR-29a-3p ve miR-21-5p) seçildi. Çalışmaya yeni tanı almış kolorektal tümörlü toplam 15 hasta prospektif olarak dahil edildi. Kolonoskopi sırasında tümörden (15 tümör örneği) ve 5 cm komşu normal mukozadan (15 kontrol doku örneği) doku örnekleri toplandı. Aynı hastalardan ameliyat öncesi dönemde de kan örnekleri alındı (15 tümör serumu örneği). Kontrol serumları ise, yaş ve cinsiyet eşleştirilerek sağlıklı bireylerden elde edildi (15 kontrol serum örneği).
Bulgular: Her üç tümör doku ve serum miRNA'ları da upregüle olmuşlardır. Tümör serum miRNA 92a-3p'nin fold regülasyonu 10,79 (p=0,001), miRNA 29a-3p'nın 0,62 (p=0,003) ve miRNA 21-5p'nın ise 10,01 (p=0,001) idi. ROC (alıcı işletim karakteristiği) eğrisi ile hesaplanan tümör serum miRNA 92a-3p'nin cutoff değeri 8,10 [Area under curve (AUC)=0,885, duyarlılık %80,0 özgüllük %78,3 (p=0,002], miRNA 21-5p için cutoff değeri 6,08 (AUC=0,849, duyarlılık %76,7, özgüllük %72,4 (p=0,004), ve miRNA 21-5p için cutoff değeri 5,93 (AUC=0,822, duyarlılık %73,3, özgüllük %70,1, (p=0,001) idi. Tüm tümör serum miRNA'ları için lenfovasküler invazyon (LVI), tümör derecesi ve tümör evresi anlamlıydı (p<0.05). Kontrolleriyle karşılaştırıldığında tümör serum miR-92a-3p ve miR-29a-3p perinöral invazyon (PNI) için anlamlıydı (her ikisi için de p=0,044), ancak miRNA-21-5p anlamlı bir farklılık göstermedi (p =0,282).
Sonuç: Dolaşımdaki miRNA-92a-3p, miRNA-29a-3p ve miRNA-21-5p, KRK'nin tanısı ve prognozu için umut verici görünmektedir.

Abstract:
Aim: This study aims to evaluate the suitability of miR-92a-3p, miR-29a-3p, and miR-21-5p for diagnostic and prognostic predictability of colorectal cancer (CRC) by comparative analysis of tissue and serum samples with controls.
           Materials and Methods: Based on previous studies, the three most promising miRNAs (miR-92a-3p, miR-29a-3p, and miR-21-5p) for CRC diagnosis were selected. A total of 15 patients with newly diagnosed colorectal tumors were included prospectively. Tissue samples were collected during colonoscopy from the tumor (15 tumor samples) and 5 cm adjacent normal mucosa (15 control tissue samples). Blood samples were taken from the same patients in the preoperative period (15 tumor serum samples). Control serums were achieved from healthy individuals by matching age and gender (15 control serum samples).           Results: All of these miRNAs were up-regulated. The fold regulation of tumor serum miRNA 92a-3p was 10.79 (p=0.001), for miRNA 29a-3p 7.62 (p=0.003), and for miRNA 21-5p 10.01 (p=0.001). The cutoff value of tumor serum miRNA 92a-3p calculated with ROC curve was 8.10 (AUC=0.885, sensitivity 80.0%, specificity 78.3%, (p=0.002), for miRNA 21-5p 6.08 (AUC=0.849, sensitivity 76.7%, specificity 72.4%, (p=0.004)), and for miRNA 21-5p 5.93 (AUC=0.822, sensitivity 73.3%, specificity 70.1%, (p=0.001). LVI, tumor grade, and tumor stage were significant for all tumor serum miRNAs (p<0.05). The tumor serum miR-92a-3p and miR-29a-3p were significant for PNI compared to their controls (p=0.044 for both), but miRNA-21-5p was not significantly different (p=0.282).
           Conclusion: Circulating miRNA-92a-3p, miRNA-29a-3p, and miRNA-21-5p appear promising for the diagnosis and prognosis of CRC.