Hipertermik intraperitoneal kemoterapi uygulanmış peritona metastazlı kolorektal kanserlerde uzun kodlanmayan RNA'ların tanı ve prognoz açısından rolünün araştırılması
Investigation of the role of NON-encoded RNAS in hyperthermic intraperitoneal chemotherapy applied colorectal cancers metastasized to peritoneum in terms of diagnosis and prognosis
Yazar: ALPASLAN TANOĞLU
Danışman: PROF. DR. ERDAL POLAT
Sağlık Bilimleri Üniversitesi / Hamidiye Sağlık Bilimleri Enstitüsü / Moleküler Onkoloji Ana Bilim Dalı
Derece: Doktora, 2022
Konu: Moleküler Tıp = Molecular Medicine ; Onkoloji = Oncology
Dizin: Kolorektal neoplazmlar = Colorectal neoplasms ; Neoplazm metastazları = Neoplasm metastasis ; Neoplazmlar = Neoplasms ; Periton = Peritoneum ; Prognoz = Prognosis ; RNA = RNA ; Teşhis = Diagnosis ; İlaç tedavisi = Drug therapy ; İlaç tedavisi-kombine = Drug therapy-combination

Özet:
Amaç: Bu çalışmada sitoredüktif cerrahi ve hipertermik intraperitoneal kemoterapi uygulanmış peritona metastazlı kolorektal kanserli olgularda uzun kodlamayan RNA'ların tanı ve prognoz açısından değerlendirilmesi amaçlanmıştır.
Gereç ve Yöntem: Çalışmaya sitoredüktif cerrahi ve hipertermik intraperitoneal kemoterapi uygulanmış 32 hastanın parafinize kolon kanser dokusu ve komşu normal kolon dokusu ile 10 hastanın parafinize metastatik periton tümör dokusu ve komşu normal periton dokusu dahil edildi. Bu temin edilen dokularda uzun kodlanmayan RNA'lardan GAS5, MALAT1, CCAT2, HOTAIR ve H19'un ifade düzeylerine qRT-PZR yöntemi ile bakıldı ve retrospektif olarak hastaların klinikopatolojik ve demografik özellikleri kaydedildi.
Bulgular: Çalışmaya dahil edilen hastaların 11'i kadın (%34), 21'i erkekti (%66). Ortalama yaş 54,59±11,97 (24-73 yıl) idi. Hastaların 20'sinde (%62) daha önce hastalığına yönelik geçirilmiş operasyon hikayesi mevcuttu. Vakaların 10 tanesi normal kilolu (%31), 13 tanesi fazla kilolu (%41), 9 tanesi ise obezdi (%28). GAS5 ifade düzeylerinin kolon tümör dokusunda, tümöre komşu normal kolon dokusuna göre anlamlı düzeyde azaldığı (p<0,001), HOTAIR, CCAT2, MALAT1 ve H19 ifade düzeyleri ise kolon tümörlü dokularda, tümöre komşu normal kolon dokularına göre anlamlı düzeyde arttığı (her bir parametre için p<0,001) tespit edildi. Tümörün peritona metastaz yaptığı dokularda, komşu normal periton dokusuna göre GAS5 ifade düzeylerinin anlamlı düzeyde azaldığı (p=0,028), HOTAIR, CCAT2, MALAT1 ve H19 ifade düzeylerinin ise anlamlı düzeyde arttığı (sırasıyla p=0,007, p=0,005, p=0,009, p=0,028) saptandı. Uzun kodlamayan RNA ifade düzeyleriyle sağkalım arasında ilişki bulunamadı.
Sonuç: Peritona metastazlı kolorektal kanserli olgularda uzun kodlamayan RNA'lardan GAS5, HOTAIR, CCAT2, MALAT1 ve H19'un tanısal belirteç olarak kullanılabileceği değerlendirildi.

Abstract:
Aim: It was aimed to evaluate long non-coding RNAs in terms of diagnosis and prognosis in colorectal cancer patients with peritoneal metastasis who underwent cytoreductive surgery and hyperthermic intraperitoneal chemotherapy.
Materials and Methods: Paraffinized colon cancer tissue and adjacent normal colon tissue of 32 patients who underwent cytoreductive surgery and hyperthermic intraperitoneal chemotherapy, and paraffinized metastatic peritoneal tumor tissue and adjacent normal peritoneal tissue of 10 patients were included in the study. Expression levels of long non- coding RNAs GAS5, MALAT1, CCAT2, HOTAIR and H19 were measured in these tissues provided by qRT-PCR method, and clinicopathological and demographic characteristics of the patients were recorded retrospectively.
Results: Of the patients, 11 (34%) were female and 21 (66%) were male. The mean age was 54.59±11.97 (24-73 years). Twenty patients (62%) had a history of previous surgery. Ten of the cases were of normal weight (31%), 13 of them were overweight (41%), and 9 of them were obese (28%). Expression levels of GAS5 decreased significantly in colon tumor tissue compared to normal colon tissue adjacent to the tumor (p<0.001), while expression levels of HOTAIR, CCAT2, MALAT1 and H19 increased significantly in colon tumor tissues compared to normal colon tissues adjacent to the tumor (for each parameter). P<0.001) was detected. In tissues where the tumor has metastasized to the peritoneum, the expression levels of GAS5 decreased significantly compared to the adjacent normal peritoneal tissue (p=0.028), while the expression levels of HOTAIR, CCAT2, MALAT1 and H19 increased significantly (p=0.007, p=0.005, p=0.009, p=0.028, respectively) was detected. No association was found between long noncoding RNA expression levels and survival.
Conclusion: It was evaluated that long non-coding RNAs GAS5, HOTAIR, CCAT2, MALAT1 and H19 can be used as diagnostic markers in colorectal cancer cases with peritoneal metastasis.