Hafif ve orta şiddetli COVİd-19 hastalarının varyantlara göre değerlendirilmesi /
Yazar: SELMA AKSOY
Danışman: DOÇ. DR. İSMAİL KASIM
Sağlık Bilimleri Üniversitesi / Ankara Bilkent Şehir Hastanesi / Aile Hekimliği Ana Bilim Dalı
Derece: Tıpta Uzmanlık, 2021
Konu: Aile Hekimliği = Family Medicine
Dizin: Aile hekimliği = Family practice ; COVID 19 = COVID 19 ; Korona virüs enfeksiyonları = Coronavirus enfections ; Korona virüsler = Coronaviridae ; Pandemiler = Pandemics ; Prognoz = Prognosis ; SARS virüsü = SARS virus ; Varyantlar = Variants

Özet:
Giriş ve Amaç: Covid-19 hastalığı 2019 yılının Aralık ayında Çin'de ortaya çıkıp tüm dünyaya yayılmıştır. Hastalığın etkeni olan SARS-CoV2 virüsü zaman içerisinde mutasyonlara uğrayıp yeni varyantlar ortaya çıkmıştır. DSÖ bu varyantlardan bazılarını endişe uyandıran varyantlar (VOC) grubuna almıştır. Alfa, beta ve gama varyantları ülkemizde de görülen bu gruptaki varyantlardır. Çalışmamızın amacı alfa, beta ve gama varyantlarında sosyodemografik verileri, komorbideteleri, görüntüleme bulgularını, klinik ve laboratuvar verilerini inceleyerek bu varyantları daha yakından tanımak ve Covid-19 pandemisinde hasta tanı ve takibine katkıda bulunmaktır.
Gereç ve Yöntem: Ankara Şehir Hastanesi Klinik Gözlemevinde 14 Nisan 2021-14 Temmuz 2021 tarihleri arasında yatan 18 yaşından büyük, gebeliği bulunmayan, PCR ve gen analizi sonuçları İngiltere varyantı veya Güney Afrika/Brezilya varyantı pozitif olan hastaların dahil edildiği kesitsel çalışmadır. Çalışmaya dahil edilen tüm hastaların sosyodemografik verileri, komorbiditeleri, Covid-19 hastasıyla temas durumları, sigara kullanımı, görüntüleme bulguları, hastaneye kabul sırasında semptomları, vital bulguları ve laboratuvar parametreleri, aldıkları tedaviler incelenmiştir. İstatistiksel analizler SPSS 23.0 paket programı kullanılarak yapılmıştır. P anlamlılık değeri <0,05 olarak kabul edilmiştir.
Bulgular: Çalışmamıza 114 (%41) erkek hasta, 164 (%59) kadın hasta olmak üzere 278 hasta dahil edildi. Hastaların yaş ortalaması 41±13.96 yıl bulundu. PCR sonucu 135 (%48,6) hastanın İngiltere varyantı, 143 (%51,4) hastanın Güney Afrika/Brezilya varyantı olarak saptandı. Bu varyantlarda yaş, kilo ve BMI artması kötü prognostik faktör olarak bulundu. Hem İngiltere hem de Güney Afrika/Brezilya varyantında en sık görülen kronik hastalık hipertansiyondu. Hipertansiyon İngiltere varyantında prognozu kötü etkilerken, Güney Afrika/Brezilya varyantında prognozu etkilemedi. Hem İngiltere varyantında hem de Güney Afrika/Brezilya varyantında en sık görülen semptom kas ve eklem ağrısıdır (%37). Öksürük, nefes darlığı ve satürasyon düşüklüğü Güney Afrika/Brezilya varyantında prognozu kötü etkiledi, İngiltere varyantında prognozu etkilemedi. Güney Afrika/Brezilya varyantında İngiltere varyantına göre ateş, nabız, solunum sayısı daha yüksek bulundu ve akciğer tutulumu daha fazla görüldü (p=0,002). Güney Afrika/Brezilya varyantında satürasyon düşüklüğü ve nabız yüksekliği prognozu kötü etkilerken, İngiltere varyantında sadece satürasyon düşüklüğü prognozu  kötü etkilemiştir. İngiltere varyantında Güney Afrika/Brezilya varyantına göre trombosit, INR, D-Dimer, sedimantasyon değeri düşük bulundu ve hemoglobin, albümin, total ve direkt bilirubin, sodyum, potasyum ve klor değerleri daha yüksek bulundu. Hastalığın prognozunu kötü etkileyen parametrelere baktığımızda hem İngiltere varyantında hem de Güney Afrika/Brezilya varyantında nötrofil yüzdesi, NLO değeri, fibrinojen, D-Dimer, CRP, prokalsitonin, sedimantasyon, ferritin, kreatinin, glukoz düzeylerinin yüksek olması, GFR, kalsiyum, lenfosit yüzdesinin düşük olması bulundu. Ayrıca İngiltere varyantında sodyum ve klor düzeyinde düşüklük, Güney Afrika/Brezilya varyantında ise trombosit sayısının düşüklüğü, üre, AST, LDH, GGT düzeylerinin yükseklik prognozu etkileyen kötü parametrelerdendir.
Sonuç: Çalışmamızda hem İngiltere varyantında hem de Güney Afrika/Brezilya varyantında yaş, kilo ve BMI'nın artması ve ayrıca akciğer tutulumunun olması prognozun kötü olduğunu gösterdi. Nötrofil yüzdesi, NLO değeri, fibrinojen, D-Dimer, kreatinin, glukoz, CRP, prokalsitonin, sedimantasyon, ferritin düzeylerinin yükselmesi, lenfosit yüzdesi, GFR ve kalsiyum değerlerinin düşük olması prognozu kötü etkiledi. Güney Afrika/Brezilya varyantında İngiltere varyantına göre akciğer tutulumu daha fazla bulundu. Bu parametreler hastalığın ciddiyetini öngörmede önemli belirteçlerdir ve hastaların takiplerinde dikkat edilmesi gerekmektedir.
Anahtar Kelimeler: Covid-19, prognoz, Endişe verici varyant, Covid-19 varyantları, Aile Hekimliği

Abstract:
Background: Covid-19 disease emerged in China in December 2019 and spread all over the world. The SARS-CoV2 virus, which is the causative agent of the disease, has undergone mutations over time and new variants have emerged. WHO has grouped some of these variants into variants of concern (VOC). Alpha, beta and gamma variants are the variants in this group that are also seen in our country. The aim of our study is to examine the sociodemographic data, comorbidities, imaging findings, clinical and laboratory data for alpha, beta and gamma variants, to get to know these variants more closely and to contribute to the diagnosis and follow-up of patients in the Covid-19 pandemic.
Materials and Methods: It is a cross-sectional study that includes patients over 18 years of age, non-pregnant, with positive PCR and gene analysis results for the UK variant or South Africa/Brazil variants, hospitalized in Ankara City Hospital Clinical Observatory Unit between April 14, 2021 and July 14, 2021. Sociodemographic data, comorbidities, contact status with the Covid-19 patient, smoking, imaging findings, symptoms, vital signs and laboratory parameters during admission to the hospital, and treatments of all patients included in the study were examined. Statistical analyzes were performed using the SPSS 23.0 package program. P significance value was accepted as <0.05.
Results: Our study included 278 patients, with 114 (41%) male and 164 (59%) female patients. The mean age of the patients was 41±13.96 years. The PCR result was found to be the UK variant in 135 (48.6%) patients, and the South African/Brazil variant in 143 (51.4%) patients. Age, weight and BMI were found to be poor prognostic factors in these variants. Hypertension was the most common chronic disease in both the UK and South Africa/Brazil variants. Hypertension worsened the prognosis in the UK variant, but did not affected the prognosis in the South African/Brazilian variant. The most common symptom in both the UK variant and the South African/Brazilian variant was muscle and joint pain (37%). Cough, shortness of breath and low saturation worsened the prognosis in the South African/Brazilian variant, but did not affect the prognosis in the UK variant. Fever, pulse and respiratory rate were found to be higher in the South African/Brazil variant compared to the UK variant, and pulmonary involvement was more common (p=0.002). In the South African/Brazil variant, low saturation and high heart rate poorly affected the prognosis, where as in the UK variant only low saturation poorly affected the prognosis.  Platelet, INR, D-Dimer, sedimentation values were lower and hemoglobin, albumin, total and direct bilirubin, sodium, potassium and chlorine values were higher in the UK variant of blood parameters compared to the South African/Brazil variant. When we look at the parameters that poorly affect prognosis of the disease, high neutrophil percentage, NLR value, fibrinogen, D-Dimer, CRP, procalcitonin, sedimentation, ferritin, creatinine, glucose levels, low GFR, calcium, lymphocyte percentage in both the UK variant and the South African/Brazilian variants are found be. In addition, low sodium and chlorine levels in the UK variant, low platelet and high urea, AST, LDH, GGT levels in the South Africa/Brazil variants are among the poor parameters affecting the prognosis. 
Conclusion: In our study, increased age, weight and BMI, as well as pulmonary involvement in both the UK variant and the South African/Brazilian variant, affected the prognosis poorly. Increased neutrophil percentage, NLR value, fibrinogen, D-Dimer, creatinine, glucose, CRP, procalcitonin, sedimentation, ferritin levels and decreased lymphocyte percentage, GFR and calcium values affected the prognosis poorly. Pulmonary involvement was higher in the South African/Brazil variant compared to the UK variant. These parameters are important markers in predicting the severity of the disease and should be considered in the follow-up of patients.
Keywords: Covid-19, prognosis, Variants of Concern, Covid-19 variants, Family Physicians