Tip 1 dıabetes mellıtus prognoz ve patogenezinde dendritik hücrelerin önemi
Importance of dendritic cells in Type 1 diabetes mellitus prognosis and pathogenesis
Yazar: TAMAY SEDA TAŞÇI
Danışman: PROF. DR. NİLGÜN IŞIKSAÇAN
Sağlık Bilimleri Üniversitesi / Hamidiye Sağlık Bilimleri Enstitüsü / İmmünoloji Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2023
Konu: Allerji ve İmmünoloji = Allergy and Immunology ; Genetik = Genetics ; Tıbbi Biyoloji = Medical Biology
Dizin: Akım sitometrisi = Flow cytometry ; Antikorlar = Antibodies ; Dendritik hücreler = Dendritic cells ; Diabetes mellitus = Diabetes mellitus ; Genetik hastalıklar-doğuştan = Genetic diseases-inborn ; Genler = Genes ; Otoimmün hastalıklar = Autoimmune diseases ; Otoimmünite = Autoimmunity ; Polimeraz zincirleme reaksiyonu = Polymerase chain reaction

Özet:
Amaç: Tez çalışmasının amacı, Tip 1 Diabetes Mellitus hastalığının patogenezinin aydınlatılması için hücre tiplerine ve gen ekspresyonuna bakılmasıdır. Böylelikle T1DM hastalarının prognozları ve tedavileri için yol gösterici bir adım atılması hedeflenmektedir.
Gereç ve Yöntem: Tez çalışmasındaki gruplar; yeni tanılı olanların tanısı 5 yıldan az olan hastalar, eski tanılı olanlar, 5 yıl ve üzeri süredir hastalığı olanlar ve kontrol ise hiçbir hastalığı olmayan sağlıklılardan oluşmaktadır. Toplanılan 39 numune ile immünofenotipleme ve gen ekspresyonu çalışmaları yapılmıştır. İmmünfenotipleme çalışması akan hücre ölçer cihazı ile yapıldı. Dendritik hücre alt gruplarına bakıldı ve tiplendirilme analizleri ile hücrelerin bulunma yüzdeleri hesaplandı. Diğer bir çalışma olan gen ekspresyonunda kalitatif reverse transkriptaz PCR yöntemi çalışılıp, gönüllülerin immün sistem ile bağlantılı olduğu düşünülen PTPN22 genindeki ekspresyon düzeyleri bakıldı. Ct değerlerinin ortalaması ile relatif kantitatif analizi yapıldı.
Bulgular: Yeni tanılı ve eski tanılı gruplarının HbA1c düzeyi, kontrol grubuna göre anlamlı bir şekilde yüksek bulundu. Yeni tanılı ve eski tanılı gruplar arasında C-peptid düzeylerinde anlamlı bir farklılık bulunmadı. Eski tanı ve yeni tanı gruplarının mDH değeri kontrol grubundan anlamlı (p<0,05) olarak daha düşük bulundu. Eski tanı grubunda mDH2 değeri, kontrol ve yeni tanı grubundan anlamlı olarak daha yüksek bulundu. Gruplar arasındaki mDH1 ve pDH değeri anlamlı bir farklılık göstermemiştir. Gruplar arasında relatif hesaplama değerleri açısından istatistiksel olarak anlamlı bir farklılık bulunmamıştır.
Sonuç: T1DM'li olan hasta ve kontrol gruplarındaki çalışma sonuçlarına göre eski tanılı grubun dendritik hücrelerin alt grubundaki mDH ve mDH2 de anlamlı bulunmuştur. PTPN22 geninin C1858T polimorfizmi, Türk popülasyonundaki T1DM'in anlamlandırılabilmesi için başka moleküler çalışmalar yapılmalıdır.
Anahtar Kelimeler: Dendritik Hücreler, Otoimmün Hastalıklar, PTPN22 Geni, Tip 1 Diabetes Mellitus

Abstract:
Aim: The aim of the thesis study is to look at cell types and gene expression to elucidate the pathogenesis of Type 1 Diabetes Mellitus disease. Thus, it is aimed to take a guiding step for the prognosis and treatment of T1DM patients.
Materials and Methods: The groups in the thesis study; newly diagnosed patients with a diagnosis of less than 5 years, those with a previous diagnosis, those with a disease for 5 years or more, and control patients with no disease. Immunophenotyping and gene expression studies were performed with 39 samples collected. The immunophenotyping study was performed with a flowing cell meter. Dendritic cell subgroups were examined and the percentages of cells were calculated by typing analysis. In another study, the qualitative reverse transcriptase PCR method was studied in gene expression, and the expression levels of the PTPN22 gene, which is thought to be associated with the immune system of the volunteers, were examined. Relative quantitative analysis was performed with the average of the Ct values. 
Results: The HbA1c levels of the newly diagnosed and previously diagnosed groups were found to be significantly higher than the control group. There was no significant difference in C-peptide levels between newly diagnosed and old-diagnosed groups. The mDH values of the old diagnosis and new diagnosis groups were found to be significantly (p<0.05) lower than the control group. The mDH2 value in the old diagnosis group was found to be significantly higher than the control and newly diagnosed groups. The mDH1 and pDH values between the groups did not show a significant difference. There was no statistically significant difference between the groups in terms of relative calculation values. 
Conclusion: According to the results of the study, the patient and control groups with mDH and mDH2 in the subgroup of dendritic cells of the old diagnosis group were also found to be significant. Further molecular studies should be performed to make sense of the C1858T polymorphism of the PTPN22 gene and T1DM in the Turk population.
Key Words: Autoimmune Diseases, Dendritic Cells, PTPN22 Gene, Type 1 Diabetes