Kliniğimizde üriner sistem enfeksiyonu tanısı alan 0-16 yaş arasındaki hastalardan idrar kültürlerinde E. coli ve NON-E. coli saptananların özelliklerinin retrospektif olarak incelenmesi
Retrospective investigation of patients from OUR clinic with urinary tract infection, between the ages 0-16, with urine cultures positive for E.coli and NON-E.coli
Yazar: SELİN AKGÜL
Danışman: DOÇ. DR. MELTEM EROL
Sağlık Bilimleri Üniversitesi / Bağcılar Eğitim ve Araştırma Hastanesi / Çocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı
Derece: Tıpta Uzmanlık, 2022
Konu: Çocuk Sağlığı ve Hastalıkları = Child Health and Diseases
Dizin: Ergenler = Adolescents ; Escherichia coli = Escherichia coli ; Ultrasonografi = Ultrasonography ; Çocuklar = Children ; Üriner sistem = Urinary tract ; Üriner sistem enfeksiyonları = Urinary tract infections ; İdrar tahlili = Urinalysis ; İlaçlara direnç = Drug resistance

Özet:
Amaç: Üriner sistem enfeksiyonları çocukluk çağının en sık rastlanılan bakteriyel enfeksiyonlarındandır. En sık tespit edilen etken E. Coli'dir. Klebsiella, Proteus, Pseudomonas, Enterokoklar, Stafilokoklar vb diğer bakteriyel etkenleri oluşturur. Çalışmamızda kliniğimizde ÜSE nedeni ile takip edilen olgularda idrar kültüründe E. Coli ve Non-E. Coli üremesinin yaş, cinsiyet gibi demografik verilere göre dağılım ve sıklığının belirlenmesi, altta yatan risk faktörlerinin saptanması, hastaların özelliklerinin ortaya konulması, idrar kültüründe E. Coli ve Non-E. Coli üremesi saptanan hastaların laboratuvar sonuçlarının ve ultrason bulgularının karşılaştırılması, patojenlerin antibiyotik duyarlılıklarının tanımlanması ve buna göre uygulanacak ampirik antibiyotik tedavilerinin seçiminde katkı sağlanılması amaçlanmıştır.
Materyal ve metod: 2018-2021 Yılları arasında Sağlık Bilimleri Üniversitesi Bağcılar Eğitim Araştırma Hastanesi Çocuk Sağlığı ve Hastalıkları Kliniği'nde, 0-16 yaş grubunda üriner sistem enfeksiyonu tanısı almış olan, idrar kültürü sonuçlarına göre E. Coli ve Non-E. Coli mikroorganizma üremesi gözlenen hastalar katılımcı olarak belirlenmiştir. Her iki gruptan 66 hasta çalışmamıza dahil edilmiştir. Hasta verileri bilgisayar kayıtlarından retrospektif olarak incelenerek elde edilmiştir.
Bulgular: Çalışmamız 2018-2021 tarihleri arasında muayene yaşları 1 ile 185 ay arasında değişmekte olan, 52'si (%39.4) erkek ve 80'i (%60.6) kız olmak üzere toplam 132 çocuk ile yapılmıştır. E. Coli enfeksiyonu tespit edilenlerde kız olma oranının Non-E. Coli tespit edilenlere göre daha yüksek olduğu saptanmıştır (p:0.001; p<0.05). Çalışmamıza katılan çocukların yaş ortalaması 38 ay, medianı ise 10 aydır. E. Coli grubu için median değer 20 ay iken, Non-E. Coli grubu için median değer 8 aydır ve E. Coli grubuna göre düşüktür. 
Çocukların %47'sinde altta yatan risk faktörleri görülürken, %53'ünde görülmemektedir. E. Coli grubunda altta yatan risk faktörü görülme oranı (%31.8), Non-E. Coli'den (%62.1) istatistiksel olarak anlamlı düzeyde düşük bulunmuştur (p:0.001; p<0.05). Çocukların %61.4'ünde USG'de anormallik görülürken, %38.6'sında görülmemektedir. E. Coli grubu için üriner USG'de anormallik görülme oranı (%50), Non-E. Coli grubundan (%72.7) istatistiksel olarak anlamlı düzeyde düşük bulunmuştur (p:0.012; p<0.05). 
Laboratuvar ve idrar tetkiklerine bakıldığında E. Coli grubu için idrarda eritrosit sayısı değerleri ve bakteri sayısı değerleri, Non- E. Coli grubundan istatistiksel olarak anlamlı düzeyde yüksek bulunmuştur (p:0.027, p:0.003; p<0.05). 
E. Coli grubunun idrarda nitrit pozitif olma oranı (%57.6), Non- E. Coli grubundan (%22.7) istatistiksel olarak anlamlı düzeyde yüksek bulunmuştur (p:0.000; p<0.05).
E. Coli grubunun CRP değerleri, Non- E. Coli grubundan istatistiksel olarak anlamlı düzeyde yüksek bulunmuştur (p:0.028; p<0.05). USG'de anormallik görülenler ve görülmeyenler karşılaştırıldığında NLR (p:0.004; p<0.05), CRP (p:0.038; p<0.05), üre (p:0.009; p<0.05), kreatinin (p:0.005; p<0.05), BUN değerleri (p:0.009; p<0.05) istatistiksel olarak anlamlı düzeyde yüksek bulunmuştur.
Antibiyograma bakıldığında her iki grupta da yüksek antibiyotik dirençleri dikkati çekmektedir. Farklılık olarak E. Coli grubu için nitrofurantoin dirençli olma oranı (%5.6), Non-E. Coli grubundan (%40.5) istatistiksel olarak anlamlı düzeyde düşük bulunmuştur (p:0.000; p<0.05). Yine E. Coli grubunun ertapenem dirençli olma oranı (%5), Non-E. Coli grubundan (%25) istatistiksel olarak anlamlı düzeyde düşük bulunmuştur (p:0.005; p<0.05).
Sonuç: Çalışmamızda hastanemizde üriner sistem enfeksiyonu nedeni ile takip edilen hastaların özellikleri ve E. Coli, Non-E. Coli üriner sistem enfeksiyonları arasındaki farklar ortaya konmuştur. Non-E. Coli saptanan hastalarda altta yatan risk faktörleri daha sık görülmüştür, ultrasonlara bakıldığında ise etkilenmenin daha fazla olduğu belirlenmiştir. Hastalar değerlendirilirken bu durum gözden kaçırılmamalı, gerekli yönlendirmeler yapılmalıdır. Ayrıca çalışmamızda yüksek antibiyotik dirençleri dikkati çekmektedir. Hastalar tedavi edilirken antibiyotik seçiminde çok dikkatli davranılmalı, halk ve sağlık personeli bu konuda bilinçlendirilmelidir.
Anahtar Kelimeler: Antibiyotik direnci, çocuklar, E. Coli, Non-E. Coli, USG, üriner sistem enfeksiyonu

Abstract:
Aim: Urinary tract infections are one of the most common bacterial infections of childhood. The most common factor detected is E. Coli. Klebsiella, Proteus, Pseudomonas, enterococci, staphylococci, etc. constitute other bacterial factors. In our study, it was aimed to determine the distribution and frequency of E. Coli and Non-E. Coli growth in urine culture according to demographic data such as age and gender in patients followed up for UTI in our clinic. In addition, it is aimed to identify the underlying risk factors and to reveal the characteristics of the patients, to compare the laboratory results and ultrasound findings of patients with E. Coli and Non-E. Coli growth in urine culture, to define the antibiotic susceptibility of pathogens and to contribute to the selection of empirical antibiotic treatments to be administered accordingly.
Material and methods: Patients who were diagnosed with urinary tract infection in the 0-16 age group in the Pediatric Health and Diseases Clinic of Bağcılar Training and Research Hospital of the University of Health Sciences between 2018-2021 and who had E. Coli and Non-E. Coli microorganism growth according to urine culture results were determined as participants. 66 patients from both groups were included in our study. Patient data were obtained retrospectively from computer records.
Results: Our study was conducted between 2018-2021 with a total of 132 children, 52 (39.4%) boys and 80 (60.6%) girls, whose examination ages ranged from 1 to 185 months. The rate of being a girl was found to be higher in those with E. Coli infection compared to those with Non-E. Coli infection (p:0.001; p<0.05). The average age of the children participating in our study is 38 months and the median is 10 months. While the median value for the E. Coli group was 20 months, the median value for the Non-E. Coli group was 8 months and  was lower than the E. Coli group. 
While the underlying risk factors are seen in 47% of the children, they are not seen in 53% of the children. The rate of the underlying risk factor in the E. Coli group (31.8%) was found to be statistically significantly lower than Non-E. Coli (62.1%) (p:0.001; p<0.05). While an abnormality in USG was seen in 61.4% of the children, it was not seen in 38.6% of the children. The incidence of abnormalities in urinary USG (50%) was found to be statistically significantly lower in the E. Coli group than in the Non-E. Coli group (72.7%) (p:0.012; p<0.05). 
When laboratory and urine tests were examined, erythrocyte count values and bacteria count values in urine were found to be statistically significantly higher for the E. Coli group than the Non-E. Coli group (p:0.027, p:0.003; p<0.05). 
The rate of nitrite positivity in urine of the E. Coli group (57.6%) was found to be statistically significantly higher than the Non-E. Coli group (22.7%) (p:0.000; p<0.05).
The CRP values of the E. Coli group were found to be statistically significantly higher than the Non-E. Coli group (p:0.028; p<0.05). When those with and without abnormal USG were compared, NLR (p:0.004; p<0.05), CRP (p:0.038; p<0.05), urea (p:0.009; p<0.05), creatinine (p:0.005; p<0.05), BUN values (p:0.009; p<0.05) were found to be statistically significantly higher.
When the antibiogram is examined, high antibiotic resistance is noted in both groups. As a difference, the rate of nitrofurantoin resistance (5.6%) for the E. Coli group was found to be statistically significantly lower than the Non-E. Coli group (40.5%) (p:0.000; p<0.05). Again, the rate of ertapenem resistance (5%) of the E. Coli group was found to be statistically significantly lower than the Non-E. Coli group (25%) (p:0.005; p<0.05).
Conclusion: In our study, the characteristics of the patients followed up due to urinary tract infection in our hospital and the differences between E. Coli, Non-E. Coli urinary tract infections were revealed. It was observed that the underlying risk factors were more frequent in patients with Non-E and Coli, and the ultrasound findings were more frequent. This situation should not be overlooked while evaluating patients and necessary guidance should be made. In addition, high antibiotic resistance is noteworthy in our study. While treating patients, antibiotic selection should be treated very carefully and public and health personnel should be made aware of this issue.
Keywords: Antibiotic resistance, children, E. Coli, Non-E. Coli, USG, urinary tract infection