2020-2021 kış sezonunda SARS COV-2 ve diğer solunumsal virüslerin sürveyansı
Surveillance of SARS COV-2 and other respiratory viruses in 2020-2021 winter season
Yazar: AYŞE BETÜL ŞAHİN
Danışman: PROF. DR. MUSTAFA ALTINDİŞ
Sakarya Üniversitesi / Sağlık Bilimleri Enstitüsü / Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2022
Konu: Mikrobiyoloji = Microbiology
Dizin: COVID 19 = COVID 19 ; Polimeraz zincirleme reaksiyonu = Polymerase chain reaction ; SARS virüsü = SARS virus ; Solunum sistemi = Respiratory system ; Virüs hastalıkları = Virus diseases ; Virüsler = Viruses ; İnfluenza = Influenza

Özet:
GİRİŞ VE AMAÇ: Bu çalışmada; küresel COVID-19 salgını yeni mutasyonları ile toplumu ciddi anlamda tehdit etmeye devam ederken Sakarya ili 2020-2021 kış sezonunda solunum yolu örneklerinde SARS CoV-2 ve diğer solunumsal virüslerin sürveyansının araştırılması amaçlanmıştır.
GEREÇ VE YÖNTEM: Bu çalışma 2020-2021 kış sezonunda Sakarya Eğitim ve Araştırma Hastanesine ÜSYE veya ASYE semptomları nedeniyle başvuran hastaların saklanmış solunum yolu örneklerinden gerçekleştirilmiştir. Hastaların demografik bilgileri kayıtlardan ve bu çalışma için planlanmış veri toplama formundan elde edilmiştir. Çalışmaya alınan örnekler Influenza A/B, SARS CoV-2, RSV multiplex Real Time PCR kiti (Diagnovital, TR) ile BIO-RAD CFX-96 C1000 Touch Real-time system (Bio-Rad Laboratories) cihazında çalışılmıştır. 
BULGULAR: ÜSYE/ASYE tanıları konulan 200 hastanın 109'si (%54,5) erkek, 91'i (%45,5) kadındır. Örneklerin 57'sinde (%28,5) SARS CoV-2, 3'ünde (%1,5) RSV PCR pozitif bulunmuştur. Çalışmada Influenza A/B PCR pozitifliği tanımlanmamıştır. Hastalarda yapılan istatiksel analiz sonucuna göre anlamlı bulunan COVID-19 klinik bulguları sırasıyla en sık nefes darlığı 63 (%31,8), ateş 62 (%31,0) ve hapşırık 56 (35,9) olarak bulundu. 

SONUÇ: Çalışmada koşullar gereği sadece 3 ana viral etken araştırılabilmiştir. RSV sıklıkla çocuk hastaların önemli etkeni olarak belirlenmiş, influenza ise -alınan toplumsal ve bireysel önlemlerle (maske, mesafe, hijyen) ilintili olabilir- hiçbir örnekte saptanamamıştır. Verilerin ileri çalışmalar ile desteklenmesi anlamlı olacaktır.
Anahtar Kelimeler: Solumumsal virüsler, SARS CoV-2, İnfluenza, RSV, PCR.

Abstract:
Surveillance of SARS CoV-2 and Other Respiratory Viruses in 2020-2021 Winter Season
INTRODUCTION AND AIM: In this study; While the global COVID-19 epidemic continues to seriously threaten the society with its new mutations, it is aimed to investigate the surveillance of SARS CoV-2 and other respiratory viruses in respiratory tract samples in Sakarya province in the winter season of 2020-2021.
MATERIALS AND METHODS: This study was studied from the concealed respiratory tract samples of patients who applied to Sakarya Training and Research Hospital with URTI or LRTI symptoms in the winter season of 2020-2021. Demographic information of the patients was obtained from the records and the data collection form planned for this study. The samples included in the study were studied in Influenza A/B, SARS CoV-2, RSV multiplex Real Time PCR kit (Diagnovital, TR) and BIO-RAD CFX-96 C1000 Touch Real-time system (Bio-Rad Laboratories).
RESULTS: Of the 200 patients diagnosed with URTI/LRTI, 109 (54.5%) were male and 91 (45.5%) were female. SARS CoV-2 was found in 57 of the samples (28.5%), and RSV PCR was positive in 3 (1.5%) of the samples. Influenza A/B PCR positivity was not defined in the study. According to the statistical analysis results of the patients, the most common clinical findings of COVID-19 were found to be dyspnea 63 (31.8%), fever 62 (31.0%) and sneezing 56 (35.9), respectively.
CONCLUSION: Due to the conditions, only 3 main viral agents could be investigated in the study. RSV was frequently identified as an important factor in pediatric patients, whereas influenza -which may be related to social and individual measures (mask, distance, hygiene)- was not detected in any sample. It will be meaningful to support the data with further studies.
Keywords: Respiratory viruses, SARS CoV-2, Influenza, RSV, PCR