Doğumsal üriner sistem anomalisi olan çocuklarda mikroRNA oluşum yolağında görevli gen polimorfizmleri
MicroRNA gene polymorphisms in congenital anomalies of kidney  
and urinary tract
Yazar: ÖZLEM TEZOL
Danışman: PROF. DR. ALİ DELİBAŞ
Mersin Üniversitesi / Tıp Fakültesi / Çocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı
Derece: Tıpta Uzmanlık, 2013
Konu: Çocuk Sağlığı ve Hastalıkları = Child Health and Diseases
Dizin: Malformasyonlar = Abnormalities ; Mikro RNA = Micro RNA ; Polimorfizm-genetik = Polymorphism-genetic ; Çocuklar = Children ; Üriner sistem = Urinary tract

Özet:
Doğumsal böbrek ve idrar yolu anomalileri çocuklarda kronik böbrek hastalıklarının en sık nedenidir. Doğumsal üriner sistem anomalilerinin (DÜSA) patogenezi net olarak bilinmemekle beraber etyolojide güçlü bir genetik yatkınlık vurgulanmaktadır. Çalışmamızda mikroRNA sentez yolağında görevli gen polimorfizmlerinin doğumsal üriner sistem anomalilerine yatkınlık oluşturup oluşturmadığı araştırılmıştır.
Mersin Üniversitesi Tıp Fakültesi Çocuk Nefroloji Polikliniği?nde Haziran 2007- Ekim 2012 tarihleri arasında izlenen toplam 147 DÜSA tanılı hasta (85 erkek, 62 kız) çalışmaya dahil edilmiştir. Kontrol grubunu 51 sağlıklı çocuk (17 erkek, 34 kız) oluşturmuştur. Hastalar üreteropelvik darlık (n:39, %26.5), vezikoüreteral reflü (n:37, %25.1), renal parankimal malformasyonlar (n:43,  %29.2) ve böbrek yerleşim,  rotasyon, füzyon anomalileri (n:28, %19) olarak 4 ana gruba ayrıldı. Hasta ve kontrol grubundan alınan periferik kan örneğinden DNA izolasyonu gerçekleştirilip RNASEN, DGCR8, XPO5, RAN, DICER1, GEMIN3 gen polimorfizmleri için genotipleme çalışması yapıldı.
Hasta ve kontrol grubunda RNASEN, DGCR8, XPO5, RAN, DICER1, GEMIN3 gen polimorfizmleri karşılaştırıldığında gruplar arasında istatistiksel olarak anlamlı bir fark bulunmadı (p>0,05). Üreteropelvik darlık, vezikoüreteral reflü, renal parankimal malformasyon ve böbrek yerleşim, rotasyon, füzyon anomalisi tanılı hasta grupları ile kontrol grubu tek tek karşılaştırıldığında genotip ve allel dağılımında istatistiksel olarak anlamlı bir fark saptanmadı (p>0,05). Vezikoüreteral reflü (VUR) grubunda GEMIN3 geni mutant allellerinin, renal parankimal malformasyon grubuna oranla istatistiksel olarak anlamlı yüksek bulunduğu saptandı (p=0,05). Hasta ve kontrol grubu arasında cinsiyet ve yaş bakımından anlamlı fark gözlendi (p=0,003, p<0,001).
Sonuç olarak mikroRNA sentez yolağında görevli genlerden GEMIN3 geni mutant allelleri DÜSA spektrumu içinde VUR ile ilişkili olabilir. Hasta sayımızın az olması nedeniyle DÜSA?da mikroRNA gen polimorfizmlerinin patogenezi açıklayabilmesi için daha fazla sayıda hasta içeren çalışmalara ihtiyaç vardır. 

Anahtar kelimeler: Anomali, mikroRNA, Polimorfizm, Üriner sistem

Abstract:
Congenital Anomalies of the Kidney and Urinary Tract (CAKUT) are commonest cause of chronic kidney disease in children. Pathogenesis of CAKUT is unknown, a strong genetic contribution is emphasizing. In this study we investigated the role of microRNA gene polymorphism in congenital anomalies of kidney and urinary tract (CAKUT ).
 147 patients with CAKUT (85 male, 62 female) have been followed in Mersin University Department of Pediatric Nephrology in the period of June 2007? October 2012. Control group consist of 51 healthy children (17 male, 34 female). Patients are divided into 4 groups: Ureteropelvic  junction obstruction (n:39 %26.5), vesicoureteral reflux (VUR) (n:37, %25.1), renal parenchymal malformations (RPM) (n:43, %29.2) and anomalies of renal embryonic migration (renal ectopi, fusion anomalies) (n:28, %19). RNASEN, DGCR8, XPO5, RAN, DICER1, GEMIN3 gene polymorphisms studied by peripheral blood samples of the patients after DNA isolation.
When the patient and control group compaired by polymorphism of the gene RNASEN, DGCR8, XPO5, RAN, DICER1, GEMIN3 a statistically significant difference was not found (p>0,05) and there is no statistically difference between the control group and the Ureteropelvic  junction obstruction, VUR, renal parenchymal malformation and anomalies of renal embryonic migration group. GEMIN3 mutant allel frequency is statistically higher at VUR group then renal parenchymal malformation group (p=0,05). The patient and control group showed a statistically significant difference with sex and age (p=0,003, p<0,001). 
Consequently, one might argue that among the genes that are part of the microRNA synthetic pathway, the mutant alleles of the GEMIN3 gene might be related to VUR within the context of the CAKUT spectrum. Due to the insufficiency of the number of our patients, studies including a higher number of patients are required so that pathogenesis in CAKUT can be attributed to microRNA gene polymorphisms.

Key words: Anomaly, MicroRNA, Polymorphism, Urinary tract