Çoğul dirençli nozokomiyal pseudomonas aeruginosa suşlarında beta laktamazların fenotipik ve genotipik olarak incelenmesi
The phenotypic and genotypic study of beta lactamases in nosocomial pseudomonas aeruginosa strains with multiple resistance
Yazar: NİGAR ÇELİK
Danışman: PROF.DR. ÇİĞDEM BAL
İstanbul Üniversitesi / Sağlık Bilimleri Enstitüsü / Mikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
Derece: Doktora, 2007
Konu: Mikrobiyoloji = Microbiology

Özet:
xiÖZETÇelik N. (2007). Çoğul Dirençli Nozokomiyal Pseudomonas aeruginosa Suşlarında BetaLaktamazların Fenotipik ve Genotipik Olarak İncelenmesi. İstanbul Üniversitesi SağlıkBilimleri Enstitüsü, Mikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Anabilim Dalı. DoktoraTezi. İstanbul.Anahtar Kelimeler : Pseudomonas aeruginosa, çoğul direnç, beta laktamaz.Bu çalışma İstanbul Üniversitesi Bilimsel Araştırma Projeleri Birimi tarafındanT-639/17032005 no'lu proje olarak desteklemiştir.Bu çalışmada İstanbul Üniversitesi Cerrahpaşa Tıp Fakültesi hastanesinde yatan24'ü çocuk, 26'sı erişkin 50 hastadan izole edilmiş olan çoğul dirençli Pseudomonasaeruginosa suşlarında beta laktamaz enzimleri araştırılmıştır.Suşların duyarlılıkları disk difüzyon ve agarda dilüsyon yöntemleriylearaştırılmıştır. Çift disk sinerji yöntemiyle dokuz (%18) suşta genişlemiş spektrumlubeta laktamaz (GSBL) varlığı saptanırken, 16 (%32) suşta indüklenebilir beta laktamazvarlığı pozitif bulunmuştur. Beta laktamazların pI değerleri izoelektrik nokta tayiniyöntemiyle 4.5 ve 8.2 arasında bulunmuştur. Kloksasilinli besiyeri ile dört (%8) suştaGES türevi GSBL enzimleri saptanmıştır. Bioassay yöntemi ile yalnız 10 (%20) suştakarbapenem hidrolize eden enzim varlığı saptanırken, E-test ile 14 (%28) suşta metalobeta laktamaz (MBL) bulunmuştur. 0,5 M EDTA ile yapılan çift disk sinerji testinde 12(%24) ve kombine disk testinde 26 (%52); 0,1 M EDTA ile yapılan çift disk sinerjitestinde iki (%4) ve kombine disk testinde bir (%2) suş MBL pozitif olarakbulunmuştur. Polimeraz zincir reaksiyonu (PCR) ile 22 (%44) suşta PER-1 enzimi, 43(%86) suşta GES/IBC türevi, 23 (%46) suşta OXA-10 türevi ve 14 (%28) suşta OXA-2türevi enzimler pozitif olarak saptanırken; TEM, SHV, VEB, IMP, VIM, SPM türevienzimler negatif bulunmuştur.Sonuç olarak GSBL oranı %96 olarak bulunmuştur. Bunların %86'sı Türkiye'deilk kez bu çalışmada araştırılmış olan GES/IBC genlerini içermektedir. EDTA ilefenotipik olarak MBL pozitifliği saptanan suşlardan hiçbiri PCR ile doğrulanmamıştır.

Abstract:
xiiABSTRACTÇelik N. (2007) The Phenotypic and Genotypic Study of Beta Lactamases inNosocomial Pseudomonas aeruginosa Strains with Multiple Resistance. IstanbulUniversity. Institute of Health Sciences, Department of Microbiology and ClinicalMicrobiology. Doctoral Thesis. Istanbul.Key Words: Pseudomonas aeruginosa, multiple resistance, beta lactamases.This study was supported by The Research Support Unit of İstanbul University as theproject no T-639/17032005.Beta lactamase enzymes in 50 multiply resistant Pseudomonas aeruginosa isolates from24 pediatric and 26 adult patients hospitalized in Istanbul University Cerrahpaşa Facultyof Medicine were investigated.Susceptibilities of the strains were tested with disk diffusion and agar dilution methods.Nine (%18) strains were positive for extended spectrum beta lactamases (ESBL) withdouble disk synergy test, while 16 (%32) strains showed inducible beta lactamases withthe disk induction method. pI ranges of the beta lactamases were between 4.5 and 8.2 byisoelectric focussing. Using cloxacillin-containing media, GES-like ESBLs weredetermined phenotypically in four (%8) strains. Bioassay method conferred 10 (%20)strains to produce carbapenem hydrolising enzymes while E-test found 14 (%28) strainspositive only for metallo beta lactamases (MBL). Using 0,5 M EDTA and imipenem,double disk synergy test showed 12 (%24) and the combined disk test 26 (%52) strainsas MBL producers. Double disk synergy and combined disk tests with 0,1 M EDTAfound 2 (%4) and 1 (%2) MBL-positive isolates. TEM, SHV, VEB, IMP, VIM, andSPM enzymes were all found negative by polimerase chain reaction (PCR), althoughPER-1 enzyme was positive in 22 (%44), GES/IBC derivatives in 43 (%86), OXA-10derivatives in 23 (%46) and OXA-2 derivatives in 14 (%28) strains.As a whole, the ESBL rate was 96%. Of these, 86% harboured the GES/IBC genes,which were investigated for the first time in Turkey in this study. None of the positiveMBL findings in the EDTA-using phenotypical tests were verified by PCR.