Sepsiste  nükleer faktör kappa B ve TNF-alfa gen varyantlarının ve TNF-alfa serum düzeyinin incelenmesi
The investigation of tnf-alpha and nuclear factor-kappa B gene variants and of TNF-alpha serum levels in sepsis
Yazar: LEYLA ACAR
Danışman: PROF. DR. HAYRİYE ARZU ERGEN
İstanbul Üniversitesi / Sağlık Bilimleri Enstitüsü / Moleküler Tıp Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2015
Konu: Allerji ve İmmünoloji = Allergy and Immunology ; Biyokimya = Biochemistry ; Moleküler Tıp = Molecular Medicine
Dizin: Nükleer faktör-kappa B = Nuclear factor-kappa B ; Polimorfizm-genetik = Polymorphism-genetic ; Polimorfizm-genetik = Polymorphism-genetic ; Sepsis = Sepsis ; Tümör nekroz faktörleri = Tumor necrosis factors ; İnflamasyon = Inflammation

Özet:
Sepsis, bir çok sistemi tutan, özellikle hemodinamik değişikliklere yol açan, şok, organ fonksiyon bozukluğu ve organ yetmezliğine kadar giden öldürücü bir enfeksiyon hastalığıdır. Yapılan araştırmalarda dokularda oluşan enfeksiyon ve travmatik hasar sonucu vücutta hümoral sistemin aktive olduğu ve çeşitli sitokinlerin salındığı gösterilmiştir. Nükleer Faktör Kappa B (NFkB) genleri tarafından kodlanan NFkB dimerleri, inflamasyonda rol oynayan ve aralarında Tümör nekrosis faktör-alfa (TNF-α)'nın da yer aldıgı bir dizi proteinin transkripsiyonunu düzenleyen bir ailedir. Çalışmamızda NFkB1 -94 ins/del ATTG ve TNF-α (-308 G/A) gen polimorfizmlerinin ve TNF-α serum düzeyinin incelenerek, hem bu polimorfizmlerinin TNF-α düzeylerine olan etkisi hem de sepsiste klinik ve prognostik parametrelerle birlikte ele alınarak olası etkilerinin incelenmesi amaçlanmaktadır. Bu amaçla 72 sepsis hastası ve 104 sağlıklı kontrolde NFkB1 -94 ins/del ATTG ve TNF-α (-308 G/A) gen polimorfizmlerini saptamak için PCR-RFLP ve TNF-α serum düzeylerini incelemek için ELISA teknikleri kullanılmıştır. Deneysel çalışmalar sonucunda çalışma grupları arasında her iki polimorfizm açısından anlamlı bir farklılık gözlemlenmemiştir (p>0,05). Serum TNF- α düzeyleri çalışma grupları arasında karşılaştırıldığında istatistiksel olarak anlamlı bir farklılık görülmemiştir (p>0,05). Sonuç olarak, çalışmamız her iki polimorfizm açısından da sepsis vakalarında ülkemizde yapılan ilk çalışma özelliğini taşımaktadır. Yaptığımız deneysel çalışmalar sonucunda elde ettiğimiz bulgular her iki polimorfizm ile sepsis riski arasında bir ilişki olmadığını ancak TNFα (-308 G/A) polimorfizmi açısından ise AA genotip ve A allelinin hastalarda artmış TNF-α düzeyleri ile ilişkili olduğunu öngörmektedir. 
Anahtar Kelimeler: Sepsis, inflamasyon, gen polimorfizmi, NFkB1 -94 ins/del ATTG, TNFα (-308 G/A)

Abstract:
Sepsis is a multisystem disease, typically leading to hemodynamic changes, shock, organ dysfunction and organ failure and can be life threatening. Studies showed that humoral system is activated and various cytokines are released due to infections in tissues and traumatic damage.  Nuclear Factor-Kappa B (NFkB) dimers are encoded by NFkB genes and regulate transcription of several crucial proteins of inflammation such as Tumour necrosis factor-alpha (TNF-α). In this study it was aimed to investigate the possible effect of polymorphisms on TNF-α serum levels with clinic and prognostic parameters of sepsis by determining the NFkB1 -94 ins/del ATTG ve TNF-α (-308 G/A)  gene polymorphisms and TNF-α. serum levels. Thereby, 72 sepsis patients and 104 healthy controls were included to this study. In order to determine the polymorphisms of NFkB1 -94 ins/del ATTG ve TNF-α (-308 G/A), the PCR-RFLP method was performed and serum TNF-α levels were measured by Elisa technique. No statistically significant differences were found in these two polymorphisms between patient and control groups (p<0,05). We did not observe any significant differences of serum TNF-α levels  between study groups. Finally, this is the first study on these two polymorphisms conducted on sepsis patients in our country. Our results showed no association between sepsis risk and these polymorphisms. On the other hand, the AA and A alleles of the TNF-α (-308 G/A) polymorphism may be used as a predictor of elevated TNF-α levels in sepsis patients. 
Key words: Sepsis, inflammation, gene polymorphism, NFkB1 -94 ins/del ATTG, TNFα (-308 G/A)