hakansabunis/tr-academic-research-agent-index huggingface dataset:
Jasione supina alt türlerinin tozlaşma biyolojisi
Pollination biology of Jasione supina Subspecies
Yazar: VOLKAN EROĞLU
Danışman: DOÇ. DR. SERDAR GÖKHAN ŞENOL
Ege Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Biyoloji Ana Bilim Dalı
Derece: Doktora, 2016
Konu: Bilim ve Teknoloji = Science and Technology ; Biyoloji = Biology

Özet:
Bu tezde Jasione supina Sieber alt türlerinin tozlaşma biyolojisi çalışılmıştır. Çiçekleri hermafrodit, protandrik ve stilus üzerindeki polen toplayan tüyler ile ikincil polen sunumu yapmaktadır. İkincil polen sunum mekanizmasında alttürler arasında zamansal farklılıklar ortaya konmuştur. Alttürlerin ürettiği polen, ovül sayıları ile stigma aktivitesi ve polen canlılıkları karşılaştırılmıştır. Arazide gerçekleştirilen tozlaştırıcı gözlemlerinde, tozlaştırıcılar, davranışları, ziyaret saatleri, sıcaklık ve rüzgar hızı istekleri tespit edilmiştir. J. supina subsp supina üzerinde 6 farklı familyaya ait 10 tür, subsp. akmanii'de 7 farklı familyaya ait 9 tür, subsp. pontica'da 9 farklı familyaya ait 16 tür tozlayıcı böcek olarak belirlenmiştir. Üreme sistemi bakımından en avantajlı sistemin çoktan aza doğru subsp. supina, subsp. akmanii, subsp. pontica olduğu bulunmuştur.
Anahtar sözcükler: Jasione, tozlaşma, ikincil polen sunumu

Abstract:
In this thesis, pollination biology of Jasione supina Sieber subspecies have been studied. Its flowers are hermaphroditic, protandrous and exhibit secondary pollen presentation with pollen collecting hairs on the style. Temporally differences among the species was determined in the secondary pollen presentation mechanism. Stigma activities and pollen viabilities, pollen grains and ovules produced by subspecies, were compared. In the observations of pollinator realized in the field, pollinators, their behaviors, visiting hours, temperature and wind speed wishes are determined. 10 species belong to 6 family on subsp. supina, 9 species belong to 7 family on subsp. akmanii, 16 species belong to 6 family on subsp. pontica have been discovered as pollinator insect. The most advantageous reproductive system, gradualy, were found as subsp. supina subsp. akmanii and subsp. pontica.
Keywords: Jasione, pollination, secondary pollen presentation
Bilgisayar destekli geometrik tasarım ve uygulamaları
Computer aided geometric design and its applications
Yazar: VAHİDE BULUT
Danışman: PROF. DR. MUSTAFA SERDAR KORUKOĞLU
Ege Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Matematik Ana Bilim Dalı
Derece: Doktora, 2016
Konu: Matematik = Mathematics
Dizin: Bezier eğrileri = Bezier curves

Özet:
Bilgisayar Destekli Geometrik Tasarım (BDGT) ve Bilgisayar Destekli Üretimde (BDÜ) geometri çok büyük bir öneme sahip olduğundan bu tezde, yaygın bir şekilde kullanılan eğri ve yüzeylerle ilgili bazı uygulamalar verilmiştir. Tezde, kuaterniyonlar, eğri ve yüzeyler, Bezier eğri ve yüzeyleri, B-spline eğrileri, regle ve açılabilir regle yüzeyler ilgili temel kavramlar üzerinde durulmuştur. Ayrıca, özel eğrilerden olan Smarandache eğrileri hakkında çeşitli bilgiler verilmiş ve bu eğrilerden bazılarının küresel görüntüleri üzerinde çalışılmıştır. Benzer şekilde, CNC tezgahlarında büyük öneme sahip bulunan ofset eğri ve yüzeylerinin varyasyonları incelenmiştir. Ardından, dayanak eğrileri Bezier ve herhangi bir eğri olan iki açılabilir regle yüzeylerin varyasyonları verilmiş ve küresel görüntüleri Spherical Linear Interpolation (SLERP) kullanılarak ifade edilmiştir. Son olarak, iki uzay eğrisini interpole eden yarı-açılabilir Bezier yüzeyi A-Star algortiması kullanılarak elde edilmiştir. Bu tezin amacı, bazı eğri ve yüzeyleri inceleyerek geometrinin, teknolojik tasarım ve üretim sanayinde niçin çok büyük bir öneme sahip olduğunu, ayrıca geometrinin birçok mühendislik ve bilim dallarının niçin ayrılamaz bir parçası olduğunu ortaya koymaktır.

Abstract:
Due to the importance of geometry in Computer Aided Geometric Design (CAGD) and Computer Aided Manufacturing (CAM), in this thesis, some applications related to curves and surfaces that are used widely are given. In the thesis, we focused on quaternions, curves and surfaces, Bezier curves and surfaces, B-spline curves, ruled and developable ruled surfaces. Also, various informations about Smarandache curves, which are one of the special curves, are given and the spherical images of some of these curves are studied. Similarly, exchange variations of offset curves, which have big importance at the CNC workbenches, and surfaces are examined. Additionally, the exchange variations of any two developable ruled surfaces that have directrix curves as Bezier curves or any curve are given and the spherical images of these surfaces are expressed by using Spherical Linear Interpolation (SLERP). Finally, quasi-developable Bezier surface interpolation of two space curves is obtained via using A-Star algorithm. The purpose of this thesis is to put forth why geometry has very big importance in the technological design and manufacturing industry, and also why geometry is an inseparable part of many engineering and disciplines by examining some curves and surfaces.
Ege Üniversitesi Tıp Fakültesinde Ocak 2005 ile Mayıs 2014 yılları arasında tiroid operasyonu olan basedow-gravesli,hashimoto tiroiditli ve nodüler guatrlı hastalarda tiroid kanseri görülme sıklığının retrospektif olarak değerlendirilmesi
Evaluating of the frequency of thyroid cancer retrospectively in basedow-graves disease, hashmoto's thyroiditis and nodular goitre patients who had thyroid operation between january 2005 and may 2014 in Ege University Medical Faculty Hospital
Yazar: ŞAHİN BEDİR
Danışman: DOÇ. DR. MEHMET ERDOĞAN
Ege Üniversitesi / Tıp Fakültesi / İç Hastalıkları Ana Bilim Dalı
Derece: Tıpta Uzmanlık, 2016
Konu: Endokrinoloji ve Metabolizma Hastalıkları = Endocrinology and Metabolic Diseases
Dizin: Graves hastalığı = Graves disease ; Guatr = Goiter ; Guatr-nodüler = Goiter-nodular ; Hashimoto hastalığı = Hashimoto disease ; Retrospektif çalışmalar = Retrospective studies ; Tiroid bezi = Thyroid gland ; Tiroid hastalıkları = Thyroid diseases ; Tiroid neoplazmları = Thyroid neoplasms

Özet:
TİROİD KANSERİ ENDOKRİN SİSTEMDE EN FAZLA GÖRÜLEN KANSER TÜRÜDÜR. BASEDOW-GRAVES VE HASHİMOTO TİROİDİTİ EN SIK GÖRÜLEN OTOİMMUN TİROİD HASTALIKLARIDIR. BASEDOW-GRAVES VE HASHİMOTO TİROİDİTİ HASTALIKLARININ TİROİD KANSERİ İLE OLAN İLŞKİLERİ TARTIŞMALI BİR KONUDUR. ÇALIŞMANIN AMACI TİROİD OPERASYONU OLMUŞ,TİROİD BEZİNDE NODÜL BULUNAN BASEDOW-GRAVES VE HASHİMOTO TİROİDİTİ HASTALARININ PATOLOJİ SONUÇLARINI İNCELEYEREK,BU HASTALIKLARIN TİROİD KANSERİ GELİŞİMİ ÜZERİNE OLAN ETKİLERİNİ DEĞERLENDİRMEKTİR.

Abstract:
THYROİD CANCER İS A KİND OF CANCER THAT İS MOST SEEN İN ENDOCRİNE SYSTEM. BASEDOW-GRAVES DİSEASE AND HASHİMOTO'S THYROİDİTİS ARE FREQUENT DİSEASE AUTOİMMUNE THYROİDİTİS. İT İS ARGUED THAT THE RELATİONSHİP BETWEEN HASHİMOTO'S THYROİDİTİS DİSEASES AND THYROİD CANCER. THE AİM OF THİS WORK İS TO EVALUATE EFFECTS OF THESE DİSASES ON THE PROGRESS OF THE THYROİD CANCER BY İNVESTİGATİNG PATHOLOGİCAL RESULT OF THE BASEDOW-GRAVES AND HASHİMOTO'S THYROİDİTİS PATİENTS WHO HAD AN THYROİD OPERATİON AND HAD NODULE ON THYROİD GLAND
Güllük Körfezi Kaplankaya Mevkii deniz çayırlarının dağılım haritasının hazırlanması
Preparation of distribution map of sea meadows in Kaplankaya Region, Gulluk Bay
Yazar: HANİFİ MAT
Danışman: YRD. DOÇ. DR. İNCİ TÜNEY KIZILKAYA
Ege Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Çevre Bilimleri Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2016
Konu: Biyoloji = Biology

Özet:
Deniz çayırları, dünya genelinde çok geniş bir alana yayılım gösteren, deniz diplerinde rizom ve yaprak biçiminde şekillenmiş ve kökleriyle deniz dibine (sedimente) tutulu halde yaşayan, güneş ışınları yardımıyla kendi besinini fotosentez yaparak üretebilen su bitkileridir.
Bu yüksek lisans tez çalışması kapsamında; Güllük Körfezi Kaplankaya Mevkii'nde bulunan deniz çayırları türlerini ve kapladıkları alanları belirlemek, elde edilen verilerin CBS (Coğrafi Bilgi Sistemi)'den yararlanılarak deniz çayırlarının dağılım haritalarının ortaya çıkarılması amaçlanmıştır. Çalışma, Güllük Körfezi kıyı şeridinde Nisan 2015 – Kasım 2015 tarihleri arasında gerçekleştirilmiştir. Bölgenin belirlenmesinde Posidonia oceanica deniz çayırlarının bulunup bulunmaması esas alınmıştır. Buna göre dağılımın coğrafik sınırındaki P. oceanica yataklarını içeren 15 bölge seçilmiş ve haritalama çalışmaları bu bölgeler içinde gerçekleştirilmiştir. Ölçümler sonucunda elde edilen bulgular Coğrafi Bilgi Sistemi teknolojilerinden yararlanılarak bilgisayar ortamına aktarılmıştır. Sayısallaştırma ve veri dönüşümleri ile veriler üzerinde yapılan coğrafi analiz ve sorgulamalar sonucunda grafik ve öz nitelik verileri sunulmuştur.

Abstract:
Seagrass species are plants that diffirantiate as leaves and rhizomes. They attached to the sea bottom (sediment) with those rhisomes. They have a worldwide distribution.
The aim of this project is to map the seagrass population in Gulluk Bay, Kaplankaya region by GIS and to calculate the coverage percentage in the same area. The field trip studies were accried out between April and November 2015. The resion of the region designated as study are is the existence of Posidonia oceanica meadows. According to this attribute, there had been 15 station chosen and the P. oceanica meadows in those area were mapped. The data we obtained analysed by GIS. Digitisation and data convertion, graphical and attributal data and the GIS analysis of those data were presented.
Orta Asya ile bereketli hilal arasında bileşik yayın keşfi ve gelişim aşamaları (MÖ 3000 - MÖ 500)
Invention of composite bow and its development states between Central Asia and fertile crescent (BC 3000 - BC 500)
Yazar: RECEP EFE ÇOBAN
Danışman: DOÇ. DR. ABDULLAH TEMİZKAN
Ege Üniversitesi / Sosyal Bilimler Enstitüsü / Türk Tarihi Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2016
Konu: Tarih = History
Dizin: Kültür tarihi = Cultural history ; Oklar = Arrows ; Okçuluk = Archery ; Silahlar = Guns ; Yay teknikleri = Bow techniques ; Yaylar = Springs

Özet:
İnsan, var olduğu günden itibaren silah ile iç içe geçmiş bir varlıktır. Bu yüzden ilerleyişini çoğu zaman geliştirdiği silah teknolojileri ile ortaya koyar. Yay da kuşkusuz bu silahların başında gelir. Tartışma götürmeksizin binlerce yıldan beri insanlığa hizmet etmiş bu silahın en önemli gelişim aşamalarından biri bileşik yay mimarisidir. Bu mimari, ahşap, tendon, boynuz, tutkal gibi en az dört farklı materyalin bir araya gelmesi sonucu oluşmaktadır. Zira Türkler de bilinen tarihlerinin başından itibaren bileşik yay ile özdeşleştirilmiş bir kavim olarak zikredilmektedir. Fakat ne yazık ki ülkemizde bu konuyla ilgili müstakil bir çalışma bulunmamaktadır. Biz de çalışmamızda, bu eksikliği gidermek adına insanın savaş ve silah kavramları ile ilişkisi, okçuluğun ortaya çıkışı, bileşik yayın icadı ve gelişim aşamaları gibi konuları ortaya koymaya çalışacağız.

Abstract:
Humans are always known as creatures which has connected with weapon from their first steps. Because of this, most of their time, they show us their developments with new weapon technologies. And bows are one of the most important technologies that has been invented by humanity. After this, composite bow structures are giant steps of the bow without doubt. This structure is made of more than three materials like wood, sinew, horn and glue. From beginning of their time, Turks are always known with their composite bows. Unfortunately, in Turkey, there is not any research about this matter. Because of this, we are going to try resolve it on this thesis with relations between human, war and weapon; beginning of archery; invention of composite bow and its development stages.
HN1 proteininin sentrozom yerleşimi ve düplikasyonundaki görevinin hücre biyolojisi açısından araştırılması
Investigating the role of HN1 in centrosome localization and duplication
Yazar: BİLGE ESİN ÖZTÜRK
Danışman: PROF. DR. KEMAL SAMİ KORKMAZ
Ege Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
Derece: Doktora, 2016
Konu: Biyoloji = Biology

Özet:
Hematolojik ve Nörolojik Ekspresyon 1 (HN1) geni omurgalılarda evrimsel
olarak korunmuş olan ve farklı hücrelerde ubikitöz ifadesi görülen bir gendir.
Sentrozomlar bölünen hücrelerde mikrotübülleri organize eden ana merkezlerdir.
HN1'in bazı kanserlerde seviyesinin arttığı ve onkogen olarak görev aldığı
bulunmuştur. HN1'in bu önemli görevlerini anlayabilmek için; tümör hücre
hatlarında, HN1 geninin hücre döngüsüne, siklin ve siklin bağımlı kinazlarla olan
ilişkilerine, mitozun düzenlenmesine, sentrozom oluşumuna ve β-catenin yolağına
olan etkilerinin araştırılması amaçlanmıştır.
Bu tez çalışmasında HN1 proteininin sentrozomlarda yerleşim gösterdiği,
özgül siRNA kullanılarak HN1 susturulduğunda, hücrelerde sentrozom sayısında
bozulmalar, poliploidi gibi anomaliler ve ayrıca S fazında sentrozom
matürasyonun baskılandığı gözlenmiştir. HN1 susturulduğunda sentrozom
formasyonunu bozması ve multipolariteye sebep olması, HN1'in insan kanser
hücrelerinde bölünme kontrolünde, sentrozom çekirdeklenmesinde ve iğ
iplikçiklerinin oluşumunda önemli bir rolü olduğunu göstermektedir.
Sonuçlarımız, HN1'in aynı zamanda prostat kanseri hücrelerinde migrasyonu
artırdığı ve de β-catenin yıkım kompleksi ile etkileşim içinde olarak hem mitozun
zamanında tamamlanmasını arttırdığını hem de mitotik doğruluğu sağladığını
göstermiştir.

Abstract:
Hematological and Neurological expression 1 (HN1) is a highly conserved
gene in vertebrates with its ubiquitous expression in various cells. Centrosomes
are the main microtubule-organizing centers (MTOCs) in dividing cells. It is
shown that the expression level of HN1 increases in various cancers and HN1 acts
as an oncogene. To be able to elucidate the function of HN1, we aimed to
investigate the effect of HN1 on cell cycle, cyclin and cyclin dependent kinase
interactions, regulation of mitosis, centrosome formation and β-catenin pathway
in tumor cell lines.
In this study, we showed that HN1 is localized in the centrosomes and
knockdown of HN1 using specific siRNA resulted in disruptions in centrosome
number and structure, and polyploidy, subsequent to inhibition of centrosome
maturation at S phase. These results indicate that HN1 has a crtitical role in
mitosis regulation, centrosome nucleation, spindle formation in human cancer
cells. Further, we found that, HN1 augments migration in prostate cancer cells,
interacts with β-catenin destruction complex and augments both the timely
completion of mitosis and contributes to mitotic fidelity.
Açık kanal akımlarında bitkilerin neden olduğu enerji kayıpları
Energy loses due to vegetation in open channel flow
Yazar: MESUT MERTSOY
Danışman: DOÇ. DR. CAHİT YERDELEN
Ege Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / İnşaat Mühendisliği Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2016
Konu: İnşaat Mühendisliği = Civil Engineering

Özet:
Açık kanallarda, batık olmayan rijit bitkilerin akış direnci üzerinde önemli etkileri bulunmaktadır. Bu deneysel çalışmada, farklı çap ve bitkisel topluluk kompozisyonlarının akış alanları üzerindeki  hız ve akış derinliğine olan etkilerin araştırılması için ölçümler yapılmıştır. Bütün deneyler 18 metre uzunluğunda, 0.7 metre genişliğinde ve 0.5 metre derinliğinde dikdörtgen kesitli bir açık kanalda gerçekleştirilmiştir. Yürütülen çalışmalarda iki farklı çaptaki boru bitkileri temsil etmek için kullanılmıştır. Pürüzlülük katsayılarını (Manning n, Darcy-Weisbach f and Chezy C) hesaplamak için debi ve su seviyeleri ölçülmüştür. Manning (n), Darcy-Weisbach (f) and Chezy (C) pürüzlülük katsayıları, Froude sayısı ve Reynolds sayısı hesaplanmıştır. Sonuçlar, akış direncinin bitkisel yoğunluk, bitkisel dizilim, bitki çapı, kanal eğimi, Reynolds sayısı, ortalama hız ve dikey enkesitsel blokaj alanı etkisinde değiştiğini göstermiştir. Ayrıca, çalışmalar sonucunda önerilen denklemlerin deneysel verileri tahmin etme başarısı % 90'ın üzerinde çıkmıştır.

Anahtar sözcükler: Açık kanal akımları, akış direnci, hidrolik direnç, pürüzlülük

Abstract:
Unsubmerged rigid vegetation has a significant impact on flow resistance in open channel. In this experimental study, measurements were conducted to explore the impacts of different diameter and vegetation community composition within the flow domain on velocity and flow depth. All the experiments were performed in  a rectangular open channel measuring 18m in length, 0.70 m in width and 0.5 m in depth. In experiments, carried out two pipes having different diameters  were used to represent the vegetation. The discharge and water level were measured and used to calculate the roughness coefficients (Manning n, Darcy-Weisbach f and Chezy C). Manning (n), Darcy-Weisbach (f) and Chezy (C)  coefficients of roughness, Froude number (Fr) and Reynolds numbers (Re) were calculated. The results indicate that the flow resistance varies with vegetation concentration, vegetation configuration, vegetation diameter, channel slope, Reynolds Number, average velocity and vertical  cross sectional blockage area. Additionally, success of predicting the experimental data which suggested equations was determined over ninety percent.

Keywords: Open channel flows, flow resistance, hydraulic resistance, roughness
Es-Seb'ü's-Seyyâr Fi Ahbâr-ı Mülûki't-Tatar (Tenkitli metin neşri, inceleme)
Es-Seb'ü's-Seyyâr Fi Ahbâr-ı Mülûki't-Tatar (Criticial edition, analysing)
Yazar: YAVUZ SÖYLEMEZ
Danışman: PROF. DR. TURAN GÖKÇE
Ege Üniversitesi / Sosyal Bilimler Enstitüsü / Türk Tarihi Ana Bilim Dalı
Derece: Doktora, 2016
Konu: Tarih = History
Dizin: Kırım Hanlığı = Crimean Khanate ; Osmanlı Devleti = Ottoman State ; Seyyid Mehmed Rıza = Seyyid Mehmed Rıza ; Yazma eserler = Manuscripts

Özet:
Seyyid Mehmed Rıza tarafından kaleme alınan "Es-Seb'ü's-Seyyar Fi Ahbar-ı Müluki't-Tatar" isimli elyazma eser, Kırım Hanlığı tarihine hasredilmiş en önemli kaynaklardan biridir. Eserde, genel bir dünya tarihi anlatımının ardından I. Mengli Giray'ın Kırım Hanlığı tahtına oturduğu dönemden başlayarak II. Mengli Giray'ın 1737 yılında ikinci kez cülus ettiği döneme kadar Kırım Hanlığı'nın tarihi anlatılmaktadır. Ayrıca söz konusu yazma, Kırım'ın coğrafyası, sosyo-ekonomik tarihi, kültürü, edebiyatı için de oldukça önemli bir kaynak niteliği taşımaktadır. Bundan başka, Osmanlı Devleti, Kırım Hanlığı, Rusya ve Lehistan arasındaki ilişkilerin anlaşılması açısından eserde verilen malumatın değeri de oldukça yüksektir.

Abstract:
The manuscript written by Seyyid Mehmed Riza titled "Es-Sebü's-Seyyar Fi Ahbar-ı Müluki't-Tatar" is one of the most important works attributed to the Crimean Khanate. The manuscript comprises of the history of the Crimean Khanate beginning from ascension of Mengli Giray I to the throne of the Crimean Khanate until the second enthronement of Mengli Giray II in 1737. Furthermore this manuscript in question is a very significant source for the geography, socio-economic history, culture and literature of Crimea. And also, the value of the information it contains is considerably high with regards to understanding the relations of the Ottoman Empire, the Crimean Khanate, Russia and Poland.
Sıvı kristallerde yüzey etkilerinin moleküler dinamik simülasyon ile incelenmesi
The investigation of surface effects in liquid crystals by molecular dynamics simulation
Yazar: HATİCE ESİN DÜVEN
Danışman: DOÇ. DR. EMİNE MİNE ÇAPAR
Ege Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Fizik Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2016
Konu: Fizik ve Fizik Mühendisliği = Physics and Physics Engineering

Özet:
Bu tezde, alkan ve alkol molekülleri ile kaplanmış grafen yüzeyler üzerinde nematik tek tabaka pentil siyanobifenil (5CB) ve pentiloksi siyanobifenil (5OCB) sıvı kristal (SK) bileşikler, moleküler dinamik (MD) simülasyon yöntemi ile incelenmiştir. Pentan (C5), dodekan (C12), hekzadekan (C16), pentanol (C5OH) ve dodekanol (C12OH) yönlendirici yüzey molekülü olarak seçilmiştir. Yüzey molekülleri ile kaplı grafen üzerindeki tek tabaka SK moleküllerinin yayınım ve yapısal özelliklerini, yönelimlerini incelemek için SK moleküllerinin öteleme difüzyon katsayıları, radyal dağılım fonksiyonları ve eğim açıları hesaplandı. Yüzey molekülleri ve SK molekülleri arasındaki arayüz bölgesini karakterize etmek için bu moleküllerin sayıca yoğunluk profil hesapları yapıldı. Farklı C atom sayılı yüzey molekülleri kullanılarak zincir uzunluk etkisi, yüzey molekül sayısı değiştirilerek kaplama yoğunluk etkisi ve simülasyon hücresi genişletilerek sistem büyüklük etkisi incelendi. 5CB ve 5OCB molekülleri üzerine polar hidroksil fonksiyonel grubunun etkisini anlamak için, yüzey molekülü olarak alkoller kullanıldı. C5/C16 ve C5OH/C12OH karışım yüzey kaplamalı sistemlerin simülasyonları yapıldı ve sonuçlar tartışıldı. Elde edilen sonuçlar önceki çalışmaların sonuçları ile kıyaslandı.

Abstract:
In this thesis, the nematic monolayer pentyl cyanobiphenyl (5CB) and pentyloxy cyanobiphenyl (5OCB) liquid crystal (LC) compounds on graphene surfaces covered by alkane and alcohol molecules have been investigated by molecular dynamics simulations. Pentane (C5), dodecane (C12), hexadecane (C16), pentanol (C5OH) and dodecanol (C12OH) molecules were chosen as orienting surface molecules. To investigate the transport and structural properties and the alignment of the monolayer LCs at the graphene covered by the surface molecules, the translational diffusion coefficients, the radial distribution functions and the tilt angle of LC molecules were calculated. To characterise the interface region between the surface and LC molecules, the calculation of the number density profiles of these molecules were found. The effect of chain length by using the surface molecules with different C atom numbers, the effect of coverage density by changing the surface molecule numbers and the effect of system size by enlarging the simulation cell were investigated. In order to understand the effect of the polar hydroxyl functional group on the 5CB and 5OCB molecules, the alcohols were chosen as surface molecules. The simulations of the systems with the C5/C16 ve C5OH/C12OH mixed surface coverage were performed and the results were discussed. The obtained results were compared with the results of the previous studies.