Galektin-3 gen varyantlarının ve serum düzeylerinin meme kanseri hastalarda araştırılması
Investigation of galectin-3 gene variants and serum levels in breast cancer patients
Yazar: MELEK ARU
Danışman: PROF. DR. İLHAN YAYLIM
İstanbul Üniversitesi / Sağlık Bilimleri Enstitüsü / Moleküler Tıp Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2023
Konu: Moleküler Tıp = Molecular Medicine
Dizin: Galektin-3 = Galectin-3 ; Galektinler = Galectins ; Genetik varyasyon = Genetic variation ; Kanser hastaları = Cancer patients ; Meme hastalıkları = Breast diseases ; Meme neoplazmları = Breast neoplasms ; Neoplazmlar = Neoplasms

Özet:
Meme kanseri kadında en çok görülen kanser türü olup, kanserden ölümlerin başlıca
nedenidir. GLOBOCAN 2020 verilerine göre dünyada 2,3 milyon yeni vaka ile şu anda
en yaygın teşhis edilen kanserlerden biridir. Galektinler meme morfogenezinde rol oynar
ve tüm dokularda eksprese edilirler. Galektin-3'ün SNP'leri ile MK ne ait risk ve
progresyonu arasında bilgi eksikliği tespit edilmiştir. Bu sebeple çalışmamızda, meme
kanseri 76 hasta ve 50 sağlıklı kontrolde Gal-3 genindeki rs4644 ve rs4652 SNP lere
ait genotip frekansları ve çalışma gruplarındaki serum Gal-3 düzeyleri arasındaki olası
ilişkiyi saptamayı ve hastalığın riski, progrozyonu üzerine olası etkilerini, hastalık klinik
ve patolojik parametrelerle birlikte incelemeyi amaçladık. Çalışmamızda, hasta ve
kontrol gruplarının DNA örneklerinden RFLP yönetimi ile SNP (rs4644 ve rs4652)
genotiplemesi yapılmış ve ELISA ile serum örneklerindeki Galektin-3 seviyeleri tespit
edilmiştir. Çalışmamız sonucunda, Gal-3 rs4644 hasta grubunda CC genotipi frekansı
(%5,3) sağlıklı kontrol grubuna (%50) göre daha düşük olduğu gözlemlenmiştir ve
aradaki fark istatistiksel olarak çok ileri derecede anlamlıdır (p<0,001; OR=0.105; 95%
CI=0.039-0.284). Ayrıca meme kanseri hasta grubunda CA genotipi frekansı (%82,9) ise
kontrol grubuna (%34) göre istatistiksel çok ileri düzeyde anlamlı ve yüksek bulunmuştur
(p<0,001; OR=2,438; 95% CI=1,635-3,635). rs4644 için allel dağılımına bakıldığında
ise, C allelinin MK hasta grubunda sağlıklı kontrol grubuna göre değerlendirildiğinde
istatistiksel ileri düzeyde anlamlı olarak düşük frekansta olduğu saptanmıştır (p= 0,015).
Galektin-3 rs4652 genotipi açısından incelendiğinde MK hasta ve SK grubu arasındaki
allel ve genotip dağılımında istatistiksel bir fark saptanmamıştır (p>0,05). Göze çarpan
bir bulgu olarak, rs4652 e ait CC genotipinin hasta grubunda (%27,6) sağlıklı kontrol
grubuna (%14) göre istatistiksel anlamlılığa yakın olarak yüksek frekansta olduğu
gözlenmiştir (p=0,072). Hastaların sGal-3 düzeyleri SK ile karşılaştırıldığında MK
hastalarında sGal-3 düzeyleri SK e göre yüksek bulunmuş ve istatistiksel olarak anlamlı
bulunmamıştır (p>0,05). Bu sonuçlar, Gal-3 varyasyonlarının, meme kanseri gelişim ve
progresyon süreçlerinde rol oynayabileceğini göstermektedir.

Abstract:
Breast cancer is the most common type of cancer in women and is the main cause of death
from cancer. It is currently one of the most commonly diagnosed cancers, with 2.3 million
new cases worldwide, according to GLOBOCAN 2020 data. Galectins are involved in
mammary morphogenesis and are expressed in all tissues. There was a lack of information
between the SNPs of galectin-3 and the risk and progression of MC. Therefore, in our
study, we aimed to determine the possible relationship between the genotype frequencies
of rs4644 and rs4652 SNPs in the Gal-3 gene in 76 breast cancer patients and 50 healthy
controls and the serum Gal-3 levels in the study groups and their possible effects on the
risk and progression of the disease, and to analyze the clinical and pathological
parameters of the disease. We aimed to review together in our study, SNP (rs4644 and
rs4652) genotyping was performed with RFLP management from DNA samples of
patient and control groups, and Galectin-3 levels in serum samples were determined by
ELISA. As a result of our study, it was observed that the frequency of CC genotype
(5.3%) in Gal-3 rs4644 patient group was lower than that of the healthy control group
(50%), and the difference was statistically very significant (p<0.001; OR=0.105; 95%).
CI=0.039-0.284). In addition, the frequency of CA genotype in the breast cancer patient
group (82.9%) was statistically very significant and higher than the control group (34%)
(p<0.001; OR=2.438; 95% CI=1.635-3.635). When the allele distribution for rs4644 was
examined, it was found that the C allele was at a significantly lower frequency in the MC
patient group when compared to the healthy control group (p= 0.015). When galectin-3
was analyzed in terms of rs4652 genotype, no statistical difference was found in genotype
and allele distribution between breast cancer patient group and healthy control group
(p>0.05). As a striking finding, the CC genotype of rs4652 was observed to be at a higher
frequency in the patient group (27.6%), close to statistical significance, compared to the
healthy control group (14%) (p=0.072). When the sGal-3 serum levels of the patients
were compared with the healthy control group, sGal-3 levels were found to be higher in
MC patients than in the healthy control group, and it was not statistically significant
(p>0.05). These conclusions suggest that galectin-3 variations likely play a role in breast
cancer development and progression.