PARP1 Ve XRCC1 polimorfizmlerinin astım'da DNA onarım mekanizması ile olan ilişkisinin araştırılması
The association of PARP1 and XRCC1 polymorphisms with DNA repair mechanism in asthma
Yazar: GÜLÇİN TEZCAN
Danışman: PROF. DR. GÖNÜL KANIGÜR
İstanbul Üniversitesi / Sağlık Bilimleri Enstitüsü / Tıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2008
Konu: Tıbbi Biyoloji = Medical Biology

Özet:
Tezcan G. PARP1 ve XRCC1 Polimorfizmlerinin Astım'da DNA Onarım Mekanizması ileolan İlişkisinin Araştırılması. İstanbul Üniversitesi Sağlık Bilimleri Enstitüsü, Cerrahpaşa Tıpfakültesi Tıbbi Biyoloji ABD. Yüksek Lisans Tezi. İstanbul. 2008Astımda enflamasyon sonucu ortaya çıkan doku hasarı ve oksidatif streste Poli(ADPriboz)polimeraz önemli rol oynamaktadır. Yapılan son çalışmalar PARP-1 inaktivasyonununenflamasyona karşı koruyucu etki gösterdiğini ortaya koymuştur. ADPRT geni tarafındankodlanan PARP-1 enzimi X-ray repair cross complementing-1 (XRCC1) proteini ileetkileşerek BER mekanizmasında önemli rol oynamaktadır. Bundan dolayı ADPRTVal762Ala ve XRCC1 Arg399Gln polimorfizmleri bu proteinlerin fonksiyonlarında ve BERaktivitesinde değişime yol açmaktadır. Bu bilgilerin ışığında çalışmamız Türkpopulasyonunda ADPRT Val762Ala ve XRCC1 Arg399Gln polimorfizmleri ile astıma eğilimarasındaki ilişkiyi araştırmaktadır. Çalışmamızda 112 astım hastası ve 180 sağlıklı kontroldentemin edilen DNA örneklerinde söz konusu polimorfizmler PCR-RFLP metodu ileincelenmiştir. ADPRT 762Val/Val genotipinin Val/Ala (OR=16,10, P<0,001) ve Ala/Ala(OR=3,365, P<0,01) genotiplerine göre astım hastalığı için risk faktörü olduğu gösterilmiştir.Aynı çalışma grubunda XRCC1 polimorfizmi incelendiğinde XRCC1 399Gln/Gln genotipininArg/Arg (OR=0,3851, P=0,01)) ve Arg/Gln(OR=0,5155, P=0,01)) genotipine göre astım içinrisk faktörü olduğu saptanmıştır. Benzer şekilde, allel sıklıklarına bakıldığında, ADPRT762Val allelinin (OR=5,0046, P<0,001) ve XRCC1 399Gln allelinin (OR=0,5848, P=0,003)astım için risk faktörü olarak görülmüştür. Gen gen etkileşimine bakıldığında, ADPRT762Val/Ala- XRCC1 399Arg/Gln ve ADPRT 762Val/Ala- XRCC1 399Arg/Arg genotiplerinibirlikte taşıyan kişilerin astıma karşı koruyucu özellik taşıdıkları saptanmıştır (P<0,001)Sonuçlarımız, Türk populasyonunda astım ile ADPRT,ve XRCC1 polimorfizmleriarasındaki ilişkiyi vurgulamaktadır.

Abstract:
Tezcan G. The Association of PARP1 and XRCC1 polymorphisms with DNA RepairMechanism in Asthma. İstanbul University, Institute of Health Science, Cerrahpaşa MedicalFaculty, Medical Biology.Master Thesis. İstanbul. 2008Poly (ADP-ribose)polymerase plays an important role in tissue injury in conditionassociated with oxidative stress and inflammation, in asthma. The inactivation of poly(ADPribose)polymerase1 (PARP-1) provides significant protection in tissue or systemicinflammation. ADPRT gene which codes PARP1 enzyme, functionally interacts with X-rayrepair cross complementing 1 (XRCC1) proteins. Polymorphisms of ADPRT Val762Ala andXRCC1 Arg399Gln have been associated with altered protein function and BER activity.Therefore, we conducted two studies to test whether an amino acid substitution variant ofthese polymorphisms individually and in combination are associated with asthma risk. Weanalyzed DNA samples from 112 cases and 180 control subjects for XRCC1 Arg399Gln andADPRT Val762Ala polymorphisms using PCR-RFLP. We observed that subjects carriers ofADPRT 762Val/Val genotypes have a higher risk than carriers of Ala/Ala genotype (OR=3,365, P< 0,01) or carriers of Val/Ala genotype (OR=16,10, P<0,001). In addition, Val allelein ADPRT gene is a risk factor for asthma (OR=5,0046, P< 0,001). Furthermore, we foundthat carriers of XRCC1 399 Gln/Gln genotypes and Gln allele have an increasedsusceptibility of asthma. (Respectively, OR= 0,3851, P=0,0195; OR:0,5848, P= 0,003) It hasalso been shown that, cases with the gene-gene interaction of ADPRT 762Val/Ala andXRCC1 Arg/Gln or ADPRT Val/Ala and XRCC1 Arg/Arg polymorphisms (P<0.0001) havelower risk of developing asthma. In conclusion, The ADPRT Val762Ala and XRCC1Arg399Gln polymorphisms may play important role in developing asthma in Turkishpopulation.