Coronavirüs replikasyonunda TRPC gen ailesinin ifadesinin ve rolünün araştırılması
Expression of TRPC genes family on replication of coronavirus
Yazar: YOSIF A. ABDUL AL-RAHMAN
Danışman: YRD. DOÇ. DR. MUSTAFA ULAŞLI
Gaziantep Üniversitesi / Sağlık Bilimleri Enstitüsü / Tıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2013
Konu: Tıbbi Biyoloji = Medical Biology
Dizin: Gen ifadesi = Gene expression ; Korona virüs enfeksiyonları = Coronavirus enfections ; Korona virüsler = Coronaviridae ; Solunum sıkıntı sendromu = Respiratory distress syndrome

Özet:
Coronavirüsler (CoV) pozitif polariteli genomik RNA?ya sahiptirler ve belirli morfolojik özellik gösterirler. Coronavirüsler dünya çapında ölüme sebebiyet vermektedirler. 10 yıl önce SARS salgını olarak adlandırılan bir hastalık ortaya çıkmış ve hastalık etmeni SARS-CoV olarak tanımlanmıştır. SARS-CoVsekiz binden fazla vakaya sebep olmuş ve yüzlerce insanın ölümüne sebebiyet vermiştir. Çok daha yeni olarak şiddetli solunum yolu enfeksiyonlarına sebep olan ve ölüme sebebiyet veren orta doğu solunum yetmezliği sendromu coronavirüsü (MERS-CoV) tanımlanmıştır. MERS-CoV?ü için pandemi riski birçok bilim adamı tarafından bildirilmiştir.  Geçici reseptör potansiyel kanonikal kanalları TRP süper ailesi kanallarının bir alt ailesidir. TRPC kanalları insanlarda, hücre çoğalması, hücre göçü, anjiogenez ve inflamasyon gibi birçok hücresel ve fizyolojik olayın gerçekleşmesinde rol oynar. Bu çalışmada geçici reseptör potansiyel kanonikal kanallarının coronavirüs enfeksiyonundaki rolü ileri teknoloji mRNA analizi ile ortaya konmuştur. Bu çalışmada, HeLa-CEACAM hücre hatları MHV-A59 coronavirüsüyle 6 ve 8 saatlik sürelerle enfekte edilmiştir. Enfeksiyon sonrasında hücrelerden total RNA izolasyonu yapılmıştır.  mRNA analizleri için Fluidigm Real-Time-PCR sistemi kullanılmıştır. Bu çalışma sonucunda TRPC5 ve TRPC7genlerinin ifade seviyeleri anlamlı olarak artmış TRPC6?nın ifade seviyesi anlamlı olarak azalmıştır. Böylelikle bu genlerin coronavirüs enfeksiyonuyla ilişkisinin olabileceği ortaya konmuştur. Daha açıklayıcı olarak bu genlerin şiddetli coronavirüs enfeksiyonlarında rollerinin olabileceği düşünülmektedir.

Abstract:
Coronavirüsler (CoV) pozitif polariteli genomik RNA?ya sahiptirler ve belirli morfolojik özellik gösterirler. Coronavirüsler dünya çapında ölüme sebebiyet vermektedirler. 10 yıl önce SARS salgını olarak adlandırılan bir hastalık ortaya çıkmış ve hastalık etmeni SARS-CoV olarak tanımlanmıştır. SARS-CoVsekiz binden fazla vakaya sebep olmuş ve yüzlerce insanın ölümüne sebebiyet vermiştir. Çok daha yeni olarak şiddetli solunum yolu enfeksiyonlarına sebep olan ve ölüme sebebiyet veren orta doğu solunum yetmezliği sendromu coronavirüsü (MERS-CoV) tanımlanmıştır. MERS-CoV?ü için pandemi riski birçok bilim adamı tarafından bildirilmiştir.  Geçici reseptör potansiyel kanonikal kanalları TRP süper ailesi kanallarının bir alt ailesidir. TRPC kanalları insanlarda, hücre çoğalması, hücre göçü, anjiogenez ve inflamasyon gibi birçok hücresel ve fizyolojik olayın gerçekleşmesinde rol oynar. Bu çalışmada geçici reseptör potansiyel kanonikal kanallarının coronavirüs enfeksiyonundaki rolü ileri teknoloji mRNA analizi ile ortaya konmuştur. Bu çalışmada, HeLa-CEACAM hücre hatları MHV-A59 coronavirüsüyle 6 ve 8 saatlik sürelerle enfekte edilmiştir. Enfeksiyon sonrasında hücrelerden total RNA izolasyonu yapılmıştır.  mRNA analizleri için Fluidigm Real-Time-PCR sistemi kullanılmıştır. Bu çalışma sonucunda TRPC5 ve TRPC7genlerinin ifade seviyeleri anlamlı olarak artmış TRPC6?nın ifade seviyesi anlamlı olarak azalmıştır. Böylelikle bu genlerin coronavirüs enfeksiyonuyla ilişkisinin olabileceği ortaya konmuştur. Daha açıklayıcı olarak bu genlerin şiddetli coronavirüs enfeksiyonlarında rollerinin olabileceği düşünülmektedir.