Sendromik olmayan mandibular retrognati olgularında   ıgf-1 gen mutasyonu ve polimorfizmlerinin kodlandığı bölgelerin ve intron-ekzon birleşim bölgelerinin dizi analizi ile araştırılması
Investigation of igf-1 gene mutations and polymorphisms of the coding region and intron-exon junction by sequence analysis        in nonsyndromic subjects with retrognathic mandible
Yazar: DUYGU ÖZTÜRK
Danışman: PROF. DR. SELİN KALE VARLIK ; DOÇ. DR. SERDAR CEYLANER
Gazi Üniversitesi / Sağlık Bilimleri Enstitüsü / Ortodonti Ana Bilim Dalı
Derece: Doktora, 2017
Konu: Diş Hekimliği = Dentistry
Dizin: Dizi analizi = Sequence analysis ; Diş hekimleri = Dentists ; Genler = Genes ; Mandibula = Mandible ; Mutasyon = Mutation ; Polimorfizm-genetik = Polymorphism-genetic ; Retrognatizm = Retrognathism ; İnsülin benzeri büyüme faktörü I = Insulin like growth factor I

Özet:
Çalışmamızın amacı, mandibular retrognatizme sahip bireylerde, IGF-1 geninin mutasyon ve polimorfizmlerini belirlemek ve değerlendirmektir. Çalışmamıza, küçük mandibular boyutlar nedeniyle mandibular retrognatizme sahip iskeletsel sınıf 2 maloklüzyonlu, sistemik açıdan sağlıklı 100 birey dahil edilmiştir. Küçük boyutlu mandibuladan kaynaklanan mandibular retrognatizmi belirlemek için ANB açısı ile birlikte maksiller uzunluk (Co-A), mandibular uzunluk (Co-Gn), maksillomandibular fark, ramus yüksekliği (Co-Go), mandibular korpus uzunluğu (GoGn) ölçümleri yapılmış ve bu ölçümler uygun yaş normlarıyla karşılaştırılmıştır. IGF-1 geninin tüm mutasyon ve polimorfizmlerinin tespit edilebilmesi için, çalışmaya dahil edilen 100 bireyden %5 EDTA'lı tüplere 2 cc kan alınarak, genin tüm kodlayan bölgeleri ve intron-ekzon bağlantı bölgeleri yeni nesil dizi analizi yöntemi ile dizilenmiştir. Çalışmada kontrol verisi olarak daha önce yapılmış olan 200 ekzom dizileme çalışmasından elde edilen veriler ve 1000 genom projesi verileri kullanılmıştır. Her bir genotipe ilişkin odds oranları ve %95 güven aralıkları hesaplanmıştır. Çalışmamızda, hiçbir bireyde IGF-1 gen polimorfizmi tespit edilmemiş, çalışma grubunda 1 bireyde, Türk popülasyonu grubunda 2 bireyde heterozigot IGF-1 gen mutasyonu gözlenmiştir. Gözlenen mutasyon 3. Ekzon, 95. kodonda yer almakta ve rs3730193 olarak kodlanmaktadır. Çalışmamızda gözlenen bu mutasyonun Doğu Asya, Avrupa ve Güney Asya ırkında daha önce gözlenmediği, ExAC verilerinde ise 4/8596 oranında gözlendiği tespit edilmiştir. % 95 güven aralığıyla Odds oranı değerlerine göre iskeletsel sınıf 2 oluşumu ile riskli allel taşıma arasında ilişki kurulamamış ve çalışmamızın "IGF-1 geninde gözlenen mutasyon ve/veya polimorfizm sendromik olmayan mandibular retrognati oluşumuna neden olan faktörler arasında yer almaktadır" şeklinde belirlenen hipotezi kısmen reddedilmiştir.

Abstract:
The aim of this study is to determine and evaluate IGF-1 gene mutations and polymorphisms in subjects with mandibular retrognathism. The sample consisted of 100 systemically healthy subjects who had Class 2 skeletal pattern resulting from mandibular retrognathism. The age-appropriate norms for maxillary length (Co-A), mandibular length (Co-Gn), maxillo-mandibular difference, ramus length (CoGo), mandibular corpus length (GoGn) measurements were used together with ANB angle to determine mandibular retrognathism caused by small-sized mandible. 2 cc of peripheral blood stored in %5EDTA tubes. All coding regions and exon intron splice sites of the gene were sequenced with new generation sequence analysis method to detect all mutations and polymorphisms. Data obtained from previous 200 exon sequencing studies and 1000 genome project were used as control data. Odds ratios and 95%confidence intervals were calculated for each genotype. IGF-1 gene polymorphism wasn't detected in any of the individuals, heterozygous IGF-1 gene mutation was observed in one individual of the study group and in two individuals of Turkish population group. The observed mutation is located in the third exon, 95th codon and encoded as rs3730193. It was determined that this mutation wasn't observed before in Eastern Asia, Europe, South Asia, and was observed 4/8596 in ExAC data. According to odds ratio values with 95% confidence interval, there was no relation between skeletal class 2 and having risk allele. The hypothesis of our study that "The mutation and/or polymorphism observed in the IGF-1 gene is one of the factors that causes to non-syndromic mandibular retrognathia" was rejected.