Hastanemizde izole edilen acinetobacter baumannii suşlarının moleküler epidemiyolojik değerlendirmesi
Molecular epidemiological evaluation of acinetobacter baumannii strains isolated in our hospital.
Yazar: NAGİHAN ÖZLÜ
Danışman: Y.DOÇ.DR. CANAN KÜLAH
Zonguldak Karaelmas Üniversitesi / Tıp Fakültesi / Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
Derece: Tıpta Uzmanlık, 2007
Konu: Mikrobiyoloji = Microbiology

Özet:
Bu çalısma hastanemizdeki yedi aylık dönemde gözlenenAcinetobacter baumannii infeksiyon veya kolonizasyonlarının klinik, demografik veepidemiyolojik özelliklerini degerlendirmek ve izolatlar arasındaki klonal iliskiyiortaya çıkarmak amacıyla yapıldı. Bu dönemde yatan hastalardan izole edilen 51A. baumannii izolatının epidemiyolojik verilerine ulasılabilen 42'si incelemeyealındı. zolatların çogunlugu yogun bakım ünitesinden (YBÜ) izole edilmisti (%74).Birisi hariç hastaların tümü A. baumannii izolasyonundan önce bir veya birden fazlainvaziv islem geçirmis ve antibiyotik almıstı. Bu çalısmadaki A. baumannii ileinfekte veya kolonize olan hastaların genel özellikleri Acinetobacter ve digerhastane infeksiyonları ile ilgili bildirilerle uyumluydu. Tüm A. baumannii izolatlarıseftriakson ve sefotaksime dirençli bulundu. En etkili in vitro ilaç tobramisin (%96duyarlı), onu takiben imipenem ve meropenem (%93), gentamisin (79), trimetoprimsulfometoksazol(%29) ve ampisilin-sulbaktam (%26) olarak tespit edildi. 40hastadan alınan 42 sus ve çevre örneklerinden izole edilen iki sus tiplendirmeçalısmalarına dahil edildi. Susların 24'ünde benzer antibiyotip görüldü (A ve B).Pulsed-field jel elektroforez (PFGE) sonuçlarında dokuz genotip ve 11 alttipgörüldü. PFGE ile susların 27'si salgın ile iliskili bulundu (genotip 1, 1a, 1b, 1c).Yaygın bir çevresel kaynak bulunamamasına ragmen çevresel bir izolatta salgınsusu tespit edildi. Bu çalısmada antibiyotiplemenin bir A. baumannii salgınınınarastırılması ve tahmini için yararlı ve hızlı bir yöntem oldugu kanısına varılmıstır.PFGE genotipleme için uygun bir yöntem olmakla birlikte yogun emekgerektirmesi, optimizasyon güçlügü ve maliyetinin yüksek olması önemlidezavantajları olarak degerlendirilmistir Sonuç olarak hastane ortamındaA. baumannii izolatları arasındaki klonal iliskinin tanımlanması için antibiyotiplemeve standart PFGE'nin basarıyla kullanılabildigi kararına varılmıstır.

Abstract:
This study was performed to assess the clinical, demographic and epidemiologiccharacteristics of A. baumannii infections or colonizations observed in our hospitalin a seven month period and to show the clonal relationship between the isolates. Ofthe 51 A. baumannii strains isolated from the hospitalized patients in this period, 42isolates with available epidemiological data were investigated. Majority of isolateswere collected from intensive care units (%74). All patients except one had one ormore invasive procedures and had received antibiotics before the isolation ofA. baumannii. The general characteristics of the patients with A. baumanniiinfections/colonizations in this study were in accordance with those in the publishedAcinetobacter and other nosocomial infections. All A. baumannii isolates werefound to be resistant to ceftriaxon and cefotaxime. Tobramycin was the most activein vitro agent (%96 susceptible), followed by imipenem and meropenem (%93),gentamycin (%79), trimethoprim-sulfamethoxazole (%29) and ampicillin-sulbactam(%26). Typing studies were performed on 42 strains isolated from 40 patients andtwo strains isolated from environmental sites. Twenty-four of the strains weresimilar, showing two antibiyotypes (A and B). PFGE results showed nine genotypesand 11 subtypes. Twenty-seven of the strains were found outbreak-related by PFGE(Genotype 1, 1a, 1b, 1c). Although a common environmental source was not found,the outbreak strain was present on an environmental site. In this study, antibiotypingwas proved to be a useful and rapid method for screning and predicting anA. baumannii outbreak. PFGE is considered to be an appropriate method forgenotyping, nevertheless; labor-intensiveness, problems in optimisation and highercosts are evaluated as the major disadvantages.As a result we concluded thatantibiotyping and standardized PFGE can be succesfully used to determine theclonal relationship between the A.baumannii strains isolated in hospital settings .