Romatoid artritte KIR genleri polimorfizminin hastalıkla ve hastalığın klinik özellikleri ile ilişkisinin araştırılması
Investigation of the relationship between KIR genes polymorphism and disease and disease clinical characteristics in rheumatoid arthritis
Yazar: FIRAT KOCABAŞ
Danışman: PROF. DR. EREN ERKEN
Çukurova Üniversitesi / Tıp Fakültesi / İç Hastalıkları Ana Bilim Dalı
Derece: Tıpta Uzmanlık, 2018
Konu: Romatoloji = Rheumatology
Dizin: Artrit-romatoid = Arthritis-rheumatoid ; Eklem hastalıkları = Joint diseases ; Genler = Genes ; Polimorfizm-genetik = Polymorphism-genetic ; İnflamasyon = Inflammation

Özet:
Romatoid artritte KIR genleri polimorfizminin hastalıkla ve hastalıgın klinik özellikleri ile ilişkisinin araştırılması

Amaç:KIR genlerinin özellikle transplantasyon reddi ve hastalıklarla iliksisini gösteren çalışmaların sayısının artmasıyla birlikte tüm toplumlarda KIR genleri,genotipleri ve allellerinin belirlenmesine yönelik populasyon taramalarıyapılmaya başlanmıştır. KIR genlerini kodlayan genler çok yüksek bir polimorfizm sergilerler, bu da popülasyonlar arasında önemli ölçüde çeşitlilik olduğunu gösterir. Bu da akraba olmayan iki farklı kişide aynı KIR genotipini bulmanın çok zor olduğunugöstermektedir1. Bu karakteristik özelliklerden dolayı KIR genleri iyi bir popülasyon genetik belirleyicisi olarak değerlendirilebilinir.Ülkemizde de bazı otoimün hastalıklarla KIR genlerinin ilişkisini gösteren çalışmalar yapılmaktadır. Çalışmamız Türkiyede Romatoid artritli hastalarda KIR gen frekanslarının, haplotip ve genotip oranlarının değerlendirildiği ilk çalışmadır. Çalışmamızda buldugumuz oranların diğer populasyonlarla karşılaştırılarak bölgemizin genotip yapısının belirlenmesi, Romatoid artrit hastalarında hastalığın patogenezinde rol oynayabilecek immunogenetik belirteçlerden 16 farklı KIR geninin ortaya konması ve KIR genleri ile RA hastalarının klinik özellikleri arasındaki ilişkiyi değerlendirmeyi amaçladık.
Gereç ve Yöntem:Çalışmaya Romatoid Artrit hastalığı sınıflandırma kriterlerini karşılayan ve rastgele seçilen 120 Romatoid artrit hastası dahil edilmiştir. Yaş ve cinsiyet açısından hasta grubu ile uyumlu, herhangi bir sağlık problemi ve RA ile ilgili herhangi bir bulgu öyküsü olmayan 120 gönüllü kontrol grubunu oluşturmuştur. KIR tiplendirmesi SSOP yöntemi ile yapılmıstır (Luminex100, Tepnel Lifecodes). Bu yöntem; isaretli tek sarmallı PCR ürünlerinin SSO problarına hibridizasyonuna dayanmaktadır.Hasta ve kontrol gruplarında KIR genlerinin oranlarının karşılaştırılmasında Minitab 17 istatistik programı ile iki oran karşılaştırma testi ve Fisher'in kesin Ki-kare testleri kullanıldı
Bulgular:Sağlıklı ve hasta grubu karşılaştırıldığında, hasta grupta aktivatör genlerden KIR2DS5 geni sağlıklı gruba göre daha anlamlı olarak fazla bulunmuşken, sağlıklı grupta inhibitör genlerden 3DL1 geni anlamlı olarak daha fazla bulunmuştur. Tüm grubu genotipler açısından incelediğimizde AA genotipi taşıyan bireylerin sayısının 33 (% 27,4), BX genotipi taşıyan bireylerin sayısının 87 (%72.6)  olduğu gözlemlenmiştir. Çalışma sonucu 6 yeni genotip elde edilmiştir.  Hasta grup içinde DAS28, CRP ve RF degerleri açısından anlamlı farklılıklar bulunmamıştır. Anti-CCP negatifligi olanlarda Anti-CCP pozitif olan gruba göre KIR2DS4 geninde anlamlı bir fazlalık saptanmıştır. KIR2DS4 geninin Anti-CCP  negatif grupta fazla olması şiddetli hastalıktan koruyucu bir rolü olabileceğini düşündürmüştür.
Sonuç: Yapılan çalışmalar sonucunda genel olarak RA hastalarında sağlıklı gruba göre aktivatör genlerden bazılarının daha anlamı olarak fazla  bulunduğu gözlemlenmiştir. Farklı populasyonlarla karşılaştırmalarda farklı sonuçlar elde edilmiştir. Çalışamalar arası farklılıkların nedenı etnik farklılık ve yeterı kadar fazla olmayan hasta sayısı olabilir.

Anahtar sözcükler: Romatoid artrit, KIR, klinik, polimorfizm

Abstract:
Investigation of the relationship between KIR genes polymorphism and disease and disease clinical characteristics in rheumatoid arthritis
	
Background and aims: Relation of KIR genes to transplantation rejection and diseases in particular with the increasing number of studies showing, KIR genes in all societies,Population screening for identification of genotypes and alleles started to be done. The genes encoding the KIR genes exhibit a very high polymorphism, indicating that there is a significant diversity among populations. This suggests that it is very difficult to find the same KIR genotype in two unrelated individuals1. Because of these characteristics, KIR genes can be evaluated as a good population genetic determinant. In our country, studies showing the relation between some autoimmune diseases and KIR genes are being made. Our study is the first study to evaluate the KIR gene frequencies, haplotype and genotype ratios in patients with rheumatoid arthritis in Turkey. We aimed to determine the genotype structure of our region by comparing the ratios we found in our study with the other populations, to identify 16 different KIR genes from immunogenetic markers that could play a role in the pathogenesis of the disease in rheumatoid arthritis patients and to evaluate the relationship between KIR genes and clinical characteristics of RA patients
Material and methods:120 randomized patients with rheumatoid arthritis who met the criteria for studying rheumatoid arthritis disease classification were included. We formed 120 volunteer control groups in terms of age and gender that were compatible with the patient group and had no health problems or any findings related to RA. KIR typing of these subjects were evaluated by SSOP (Luminex100, Tepnel Lifecodes). This method is based on hybridization of tagged and single stranded PCR to SSO probes. The ratio of KIR genes in the patient and control groups were compared using the Minitab 17 statistical program and the two ratio comparison test and Fisher's exact Chi-square tests
Results: When the healthy and the patient group were compared, it was found that the KIR2DS5 gene was significantly more frequent in the patient group than the activator gene in the healthy group, while the 3DL1 gene was found to be significantly larger in the healthy group than the inhibitor genes. When we examined the genotypes of the whole group, it was observed that the number of individuals bearing the AA genotype was 33 (% 27,4) and the number of individuals carrying the BX genotype was 87 (% 72,6). The study resulted in 6 new genotypes. There were no significant differences in DAS28, CRP and RF values in the patient group. A significant excess in the KIR2DS4 gene was detected in the anti-CCP negative group compared to the anti-CCP positive group. The excess of the KIR2DS4 gene in the Anti-CCP negative group suggests that it may have a protective role in severe disease. 
Conclusion: As a result of the studies performed, it has been observed that some of the activator genes are more meaningful in the RA patients than in the healthy group. Different results were obtained in comparison with different populations. The differences between the workshops may be due to ethnic disparities and the number of patients not being high enough.

Keywords: aRA, aKIR, aclinical, apolymorphism