Ailesel akdeniz ateşi hastalarında mikroRNA-204-3P, mikroRNA-223-3P, deltex1, sitotoksik T-lenfosit ile ilişkili antijen geni-4`ün önemi
The importance of microRNA-204-3p, microRNA-223-3P, deltex1, cytotoxic T-lymphocyte related antigen gene-4 in Familial Mediterranean Fever patients
Yazar: RAMILA HAJIYEVA
Danışman: PROF. DR. HAFİZE UZUN
İstanbul Üniversitesi-Cerrahpaşa / Lisansüstü Eğitim Enstitüsü / Biyokimya Ana Bilim Dalı
Derece: Doktora, 2022
Konu: Biyokimya = Biochemistry
Dizin: Ailesel akdeniz ateşi = Familial mediterranean fever ; Antijenler = Antigens ; Genler = Genes ; Hastalık şiddeti indeksi = Severity of illness index ; Mikro RNA = Micro RNA ; RNA = RNA ; T lenfositleri = T lymphocytes ; İnflamasyon = Inflammation

Özet:
Ailesel Akdeniz ateşi (AAA) dünyada en sık görülen kalıtsal otoinflamatuar bir
hastalıktır. Yeni nesil dizileme birçok yeni varyant tanımladı, ancak bunların klinik
ilişkileri büyük ölçüde bilinmiyor ve yorumlanmalarını engelliyor. Teşhis, hastalık
şiddetinin değerlendirilmesi ve tedaviye yardımcı olabilecek fonksiyonel testler ve
biyobelirteçler geliştirilme aşamasındadır. Bu tez projesindeki amacımız; AAA
hastalarında serum miR-204-3p, miR-223-3p, plazma pyrin, deltex (DTX1), CTLA4
düzeylerinin etkinliği değerlendirilerek hastalığın patogenezi ve progresyonu ile ilişkisini
araştırmaktır. 48 AAA'li çocuk ve 36 sağlıklı çocuk çalışmaya dahil edildi. Serum miR204-3p ve miR-223-3p düzeyleri PCR yöntemi ile plazma pyrin, DTX1, CTLA4
düzeyleri sandviç ELISA yöntemi ile ölçüldü. Plazma CTLA4 düzeylerinde gruplar
arasında istatistiksel anlamlılık bulunmadı. Serum miR-204-3p, miR-223-3p, plazma
DTX1 düzeyleri AAA hastalarında kontrol grubuna göre anlamlı düşük bulunurken,
plazma pyrin düzeyleri (p<0.05, tümünde) anlamlı yüksek bulundu. CTL-4 düzeyleri ile
pyrin ve DTX1 düzeyleri arasında pozitif korelasyon (r=0,602, p<0,001; r=0,740,
p<0,001, sırasıyla) bulundu. Çalışmamızın bu sonuçları doğrultusunda, miR-204-3p ve
miR-223-3p AAA patogenezinde etkili olabilir. MEFV genini kodlayan pyrin proteininin
plazma düzeylerinin artması apoptotik ve inflamatuar sinyal yolaklarında önemli bir rolü
olabilir. Pyrinin artması FMF mutasyonları varsayılan pyrin inflamazomlarının
sensitivelerini arttırabilir. DTX1 düzeylerinde azalma, DTX1 ve CTL-4 arasında pozitif
korelasyon AAA hastalarında ataksız dönemlerde de subklinik inflamasyonun devam
edebildiğini düşündürmektedir.

Abstract:
Familial Mediterranean fever (FMF) is the most common inherited
autoinflammatory disease in the world. Next-generation sequencing has identified many
novel variants, but their clinical relevance is largely unknown, precluding their
interpretation. Diagnosis, assessment of disease severity, and functional tests and
biomarkers that may aid treatment are under development. Our aim in this thesis project
is to evaluate the efficacy of serum miR-204-3p, miR-223-3p, plasma pyrin, deltex
(DTX1), CTLA4 levels in FMF patients and to investigate their relationship with the
pathogenesis and progression of the disease. 48 children with FMF and 36 healthy
children were included in the study. Serum miR-204-3p and miR-223-3p levels were
measured by PCR method and plasma pyrin, DTX1, CTLA4 levels were measured by
sandwich ELISA method. There was no statistical significance between the groups in
plasma CTLA4 levels. Serum miR-204-3p, miR-223-3p, plasma DTX1 levels were found
to be significantly lower in FMF patients compared to the control group, while plasma
pyrin levels (p<0.05, in all) were significantly higher. A positive correlation was found
between CTL-4 levels and pyrin and DTX1 levels (r=0.602; p<0.001; r=0.740; p<0.001,
respectively). In line with these results of our study, miR-204-3p and miR-223-3p may be
effective in the pathogenesis of FMF. Increased plasma levels of the pyrin protein
encoding the MEFV gene may have an important role in apoptotic and inflammatory
signaling pathways. Increasing pyrin may increase the sensitivity of putative pyrin
inflammasomes as FMF mutations. A decrease in DTX1 levels and a positive correlation
between DTX1 and CTL-4 suggest that subclinical inflammation may continue in attackfree periods in FMF patients.