hakansabunis/tr-academic-research-agent-index huggingface dataset:
Epistemolojik açıdan Kierkegaard'da hakikatin öznelliği sorunu
Epistemological point of view truth is subjectivity problem in Kierkegaard
Yazar: MUSTAFA TAŞDELEN
Danışman: DOÇ. DR. MUSTAFA YILDIZ
Erciyes Üniversitesi / Sosyal Bilimler Enstitüsü / Felsefe Ana Bilim Dalı / Felsefe Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2015
Konu: Felsefe = Philosophy
Dizin: Epistemoloji = Epistemology ; Felsefe = Philosophy ; Hakikat = Truth ; Kierkegaard, Soren = Kierkegaard, Soren ; Nesnellik = Objectivity

Özet:
Kerkegaard'ın felsefesinin temelinde epistemoloji bulunur. "Hakikat Öznelliktir" düşüncesinden hareket eden Kierkegaard, modern felsefenin, temel özelliği "düşünme" olan "soyut özne" anlayışını eleştirerek kendi epistemolojisini oluşturur. O'nun öznesi somut, yaşayan, duyguları olan ve varoluş içinde bulunan bir insandır. Varoluşu "ben olma", "birey haline gelme", "insan olma" ve "kendi bilincine varma" olarak gören Kierkegaard "asıl bilme"yi, ahlaksal-dinsel bilme olarak görür. 
"İnsan olmanın ne anlama geldiği" ve "nasıl iyi bir Hristiyan olunacağı" sorunlarını araştıran Kierkegaard, bireyin gerçek anlamını "dinsel varoluş" içinde bulacağını düşünür. İnsanın "ben haline gelmesi" sürecinde "umutsuzluk" ve "kaygı"nın da ona eşlik ettiğini düşünen Kierkegaard insanın kurtuluşunu "iman"da bulur. Kişi "tutkulu" bir bağlanma ve tam bir teslimiyetle, içselliğindeki özne olan "Tanrı"ya yönelerek ve O'nun karşısında bir "ben" olur ve mutluluğa kavuşur.
Bu tezde öznenin varoluşu ile ilgisi içinde epistemolojik açıdan Kierkegaard''ın hakikatin öznellik olduğuna yönelik görüşünü nasıl temellendirildiğini belirlemek amaçlanmıştır.  

Anahtar Kelimeler: 
Hakikat, öznellik, nesnellik, varoluş, iman, paradoks, umutsuzluk, kaygı.

Abstract:
The philosophy of Kierkegaard is based on epistemology. Kierkegaard, suggesting "Truth is Subjectivity", forms his own epistemology by criticizing the "abstract subject" that is the corner stone of the modern philosophy. His subject is a concrete human being who lives, feels and exists. Kierkegaard regards the real knowing as an ethical and spiritual knowing and he also regards the existence as "being I", "becoming an individual", "being a human", "self-recognition".
Kierkegaard, searching the answers for the questions: "the meaning of being a human" and "how to become a good Christian", thinks that an individual can find the real meaning in "religious existence". According to him "despair" and "anxiety" accompany the individual in the course of "becoming I" and salvation is hidden in "faith". The individual tends towards the God, the subject in his internality, with a passionate commitment and becomes "I" in the presence of the creator and reaches the happiness.
In this thesis, it is aimed to describe how Kierkegaard's opinion which truth is subjective was grounded related to existentialism of subject in terms of epistemological point of view.

Keywords: 
Truth, subjectivity, objectivity, existence, faith, paradox, despair, anxiety.
Yapay arı koloni algoritması ile bir saldırı tespit sistemi
An intrusion detection system with artificial bee colony algorithm
Yazar: MURAT ÇELİK
Danışman: YRD. DOÇ. DR. RİFAT KURBAN
Erciyes Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Bilgisayar Mühendisliği Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2015
Konu: Bilgisayar Mühendisliği Bilimleri-Bilgisayar ve Kontrol = Computer Engineering and Computer Science and Control

Özet:
Ağ bağlantısı günümüz bilişim sistemlerin vazgeçilmez bir öğesi haline gelmiştir. Bilgi
sistemlerine ait uygulama servislerinde haberleşme amacıyla kullanılan ağ bağlantılarını
güvenli bir şekilde kullanabilmek önemlidir. Araştırmacılar bilgisayar ağlarının
güvenliğini sağlamak amacıyla birçok farklı metot kullanarak anormallik tabanlı saldırı
tespit sistemi modelleri geliştirmişlerdir. Anormallik tabanlı saldırı tespit modellerinde
ağ saldırılarının tespiti için veri sınıflandırma işlemi bu modellerin başlıca
problemlerinden bir tanesidir.
Yapay Arı Koloni algoritması tabiattaki arıların yiyecek kaynağı bulma çalışmalarını
modelleyen başarılı optimizasyon algoritmalarından biridir. Bu tez çalışmasında, saldırı
tespit sistemi için veri sınıflandırma işleminde kullanılabilecek yarı-öğrenimli bir saldırı
tespit algoritması test edilmiştir. Yapay Arı Koloni algoritması veri kümelemede küme
merkezlerini optimize etmek ve en iyi kümeleme çözümlerini tespit etmek için
kullanılmıştır.
Deneylerde literatürdeki KDD Cup 99 veritabanına ait alt veri setleri hazırlanmış ve bu
veri setleri ile algoritmanın başarımı test edilmiştir. Sonuçlar, test edilen algoritmanın
anormallik tabanlı saldırı tespit sistemi için bir model olarak kullanılabileceğini
göstermiştir.

Abstract:
Network connection is an essential in today's information systems. Network
connections used for communication, applications in the services of information
systems are important to be able to use it safely. Researchers used a variety of methods
to ensure the security of computer networks with anomaly-based intrusion detection
systems. Data classification process for anomaly-based detection is one of the main
problem of these models.
Artificial bee colony algorithm is one of the successful optimization algorithms that
models the work of bees to finding food sources in nature. In this thesis, a semisupervised intrusion detection algorithm was proposed and tested. Artificial bee colony
algorithm is used to optimize cluster centers and select best candidate clustering
solutions.
In experiments sub-sets of KDD Cup 99 database prepared and tested performance of
the algorithm with this sub-sets. Results shows the tested algorithm can be used as a
model for anomaly based intrusion detection system.
Türkiye'de yayılış gösteren üç kanid türünün (Canis aureus,  
C. lupus, Culpes vulpes) DNA barkodlaması
DNA barcoding of three canid species (Canis aureus, C. lupus,  
Vulpes vulpes) in Turkey
Yazar: EREN AKSÖYEK
Danışman: PROF. DR. COŞKUN TEZ
Erciyes Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Biyoloji Ana Bilim Dalı / Zooloji Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2015
Konu: Biyoloji = Biology ; Zooloji = Zoology

Özet:
Mitokondriyal DNA'nın sitokrom c oksidaz alt ünite I (COI) gen dizilerine dayanan DNA barkodlaması, filogeni çalışmalarında ve türlerin tanımlanmasında kullanılan etkili araçlardan biridir. Bu çalışmada, türleri ayırt etmede DNA barkodlarının geçerliliğini test etmek ve COI gen dizilerine dayanarak genetik çeşitliliği belirlenmek amaçlandı. Türkiye'den üç kanid türüne ait 54 örnek, COI geni (Canis aureus ve C. lupus için 1506 bç., Vulpes vulpes için 696 bç. ve 740 bç.) kullanılarak analiz edildi.
Bu çalışmanın sonuçları, üç türün DNA barkodlarının kendilerine özgü olduğunu ve barkod dizilerinin hiçbirinin üç tür arasında paylaşılmadığını göstermiştir. K2P modeline dayanarak Türkiye'den örneklenen üç tür içindeki ortalama tür içi ve türler arası ayrılma, sırasıyla 0.0055 (% 0.55) ve 0.1204 (% 12.04) iken Türkiye ve Gen Bankası/BOLD'dan elde edilen diziler analiz edilince üç tür içindeki tür içi ve türler arası ortalama ayrılma, sırasıyla 0.0054 (% 0.54) ve  0.1229 (% 12.29)'dur. K2P modeline dayanan Neighbour-Joining metodu kullanılarak elde edilen filogenetik ağaç, Canis ve Vulpes cinsleri arasında ve ayrıca Canis cinsinin iki türü ile Vulpes vulpes arasında derin bir ayrılmanın olduğunu gösterdi. Bu veri setleri içerisinde, Canis aureus ile C. lupus arasındaki genetik ayrılma nispeten derin değildir.

Abstract:
DNA barcoding based on the cytochrome c oxidase subunit I (COI) gene sequences of mitochondrial DNA has been considered one of effective tools used in species identification and phylogeny studies. In this study, it was aimed to test the validity of DNA barcodes in species discrimination and to determine genetic diversity relying on the COI gene sequences. The 54 Turkish samples of three canid species were analyzed using COI gene (1506 bp for Canis aureus and C. lupus; 696 bp and 740 bp for Vulpes vulpes).The results of this study indicated that the DNA barcodes of three species were unique, and no barcoding sequences were shared among three species. Based on K2P model, the mean intraspecific and interspecific divergences within three species by analyzing sequences obtained from Turkey and the GenBank/BOLD database were 0.0054 (0.54%) and 0.1229 (12.29%), respectively, whereas the mean intraspecific and interspecific divergences within three species sampled from Turkey were 0.0055 (0.55%) and 0.1204 (12.04%), respectively. Phylogenetic tree generated by using Neighbour-Joining method relying on K2P model showed that there was a deeply divergence between two genera, Canis and Vulpes, also two Canis species and Vulpes vulpes. Within these data sets, the genetic divergence between Canis aureus and C. lupus was not relatively deep.
Ayrık kosinüs dönüşümü DC bileşenleri ile dayanıklı görüntü damgalama
Robust image watermarking via DC components of discrete cosine transform
Yazar: HAKKI BOZPOLAT
Danışman: YRD. DOÇ. DR. RİFAT KURBAN
Erciyes Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Bilgisayar Mühendisliği Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2015
Konu: Bilgisayar Mühendisliği Bilimleri-Bilgisayar ve Kontrol = Computer Engineering and Computer Science and Control

Özet:
Son yıllarda internet kullanımında hem kullanıcı sayısının hem de bağlantı hızlarının artması nedeniyle sayısal bilgilerin çoğaltılması ve işlenmesi yaygın hale gelmiştir. Bu nedenle dijital resimlerin kopyalanma riskine karşı korunması ihtiyacı doğmuştur. Telif hakkının korunması için önerilen yöntemlerden birisi de sayısal görüntünün damgalanmasıdır.Bu tez çalışmasının amacı, ayrık kosinüs dönüşümü uzayında katsayıların değiştirilmesiyle dayanıklı bir sayısal damgalama yöntemi gerçekleştirmek ve mevcut yöntemlerin başarımını arttırmaktır. Ayrık kosinüs dönüşümü DC bileşenlerinin değiştirilmesine dayalı mevcut yöntemlerde sabit ve ikili-adaptif ölçekleme faktörleri kullanılmıştır. Bu tez çalışmasında çoklu-adaptif ölçekleme faktörleri kullanan bir damgalama yöntemi önerilmiştir. Damgalanacak görüntünün tüm blokları uzaysal resim frekansı metriği ile değerlendirilmiş ve her bloğa doku miktarıyla orantılı olarak bir ölçekleme faktörü atanmıştır. Böylece damgalanan görüntünün en az bozulmayla ataklara karşı en fazla dayanımı göstermesi amaçlanmıştır.Gerçekleştirilen deneylerde, önerilen çoklu-adaptif ölçekleme faktörü kullanan damgalama yönteminin sabit ve ikili-adaptif ölçekleme faktörü kullanan yöntemlere göre aynı saydamlık düzeyinde ataklara karşı daha başarılı olduğu görülmüştür.

Abstract:
In recent years, processing and deployment of digital information have become widespread due to the increase in number of both users and bandwidth capacities of internet. Therefore, copyright protection of digital images has grown a necessity against the risk of unauthorized use. Digital watermarking is among the methods proposed for the protection of copyrights.The aim of this thesis is to implement a robust digital watermarking method via modifying the coefficients in the space of discrete cosine transform and to improve the performance of existing methods. In existing methods, based on modifying the discrete cosine transform DC components, fixed and dual-adaptive scaling factors have been used. In this study, a watermarking method using multiple adaptive scaling factors has been proposed. All blocks of the image to be watermarked have been assessed by spatial frequency metric and a scaling factor has been assigned to each block as proportionate to its amount of texture. Therefore, it is aimed that watermarked images exhibit maximum resistance against attacks with minimum deformation.In the experiments conducted, it is observed that the proposed multiple adaptive scaling factor method is more efficient against the attacks, at the same transparency level, than the methods using fixed and dual-adaptive scaling factors.
Kolorektal kanser metastazında "BRMS1 gen ekspresyonu" ve "SPOP gen mutasyonu"nun prognostik öneminin araştırılması
The research of prognostic significance of "BRMS1 gene expression and spop gene mutation in metastasis of colorectal cancer
Yazar: ŞERİFE SAR
Danışman: DOÇ. DR. ÇETİN SAATÇİ
Erciyes Üniversitesi / Sağlık Bilimleri Enstitüsü / Tıbbi Genetik Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2015
Konu: Genetik = Genetics
Dizin: Gen ifadesi = Gene expression ; Genler = Genes ; Kolorektal neoplazmlar = Colorectal neoplasms ; Mikro RNA = Micro RNA ; Mutasyon = Mutation ; Neoplazm metastazları = Neoplasm metastasis ; Neoplazmlar = Neoplasms ; Prognoz = Prognosis

Özet:
BRMS1 geni birincil tümör oluşumunu etkilemez fakat metastazı baskılar. BRMS1 in yeni bağlayıcı partneri olan Cul3, E3 ubikitin ligazın bir bileşenidir ve BRMS1 ile Cul3 arasındaki etkileşime SPOP adaptör proteini aracılık eder. BRMS1, Cul3-SPOP kompleksi tarafından ubikitinlenmiş olan güçlü bir alt tabaka olarak karşımıza çıkmaktadır. SPOP ekspresyonu azaldığında veya mutasyonlarında BRMS1 protein seviyesi artar ve BRMS1'in baskıladığı hedef genlerin ekspresyonu baskılanır. Yeni bir yayın dışında, şimdiye kadar BRMS1 geninin ekspresyonunun ve SPOP geninin mutasyonunun kolorektal kanser metastazında rolü araştırılmamıştı. Bu çalışmamızda BRMS1'in mRNA ekspresyonunun ve SPOP mutasyonlarının kolorektal kanser metastazındaki rolü ile ilişkisi değerlendirildi. BRMS1 mRNA ekspresyon düzeyi ve SPOP gen mutasyonları 60 hastanın parafine gömülü kolorektal dokusunda incelendi.
Sonuç olarak, SPOP geninin incelediğimiz bölgesinde mutasyon tespit edilmemiştir. BRMS1'in yüksek düzeyde ekspresyonunun kolorektal kanserde metastazı baskıladığını göstermekle birlikte, bu sonucun daha geniş hasta serisinde çalışılarak desteklenmesi gerekmektedir.

Anahtar kelimeler:Kolorektal Kanser, BRMS1, SPOP, Ekspresyon, Mutasyon

Abstract:
Breast cancer metastasis suppressor 1 (BRMS1) suppresses metastasis without affecting primary tumorigenesis. Cul3, a component of E3 ubiquitin ligase, is a new binding partner of BRMS1 and the interaction between BRMS1 and Cul3 is mediated by the SPOP adaptor protein. BRMS1 turns out to be a potent substrate that is ubiquitinated by the Cul3–SPOP complex. Knockdown or mutations of SPOP increases the level of BRMS1 protein and represses the expression of BRMS1 repressive target genes in breast cancer cells. However, BRMS1 mRNA expression and SPOP mutations role in colorectal cancer has never been investigated. In this present study, we evaluated the association of BRMS1 expression and SPOP mutations role in metastasis of colorectal cancer. BRMS1 expression and SPOP mutations examined in formalin fixed paraffin-embedded colorectal cancer tissues of 60 patients. In conclusion there was no metation detected where the location analysed of the SPOP. In conclusion not only show that highly expression of BRMS1 repress the metastasis on colorectal cancer but also should be fortify by examining at a large sequence of patients. 

Key Words: Colorectal Cancer, BRMS1, SPOP, Expression, Mutation
Adsorpsiyona dayalı yeni bir eser-metal zenginleştirme yöntemi
A new trace metal preconcentration method based on adsorption
Yazar: DEMET ACAR
Danışman: PROF. DR. MUSTAFA SOYLAK
Erciyes Üniversitesi / Sağlık Bilimleri Enstitüsü / Analitik Kimya Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2015
Konu: Kimya = Chemistry
Dizin: Adsorpsiyon = Adsorption ; Analitik kimya = Analytical chemistry ; Eser elementler = Trace elements ; Katı faz özütlemesi = Solid phase extraction ; Kütle spektrometri = Mass spectrometry

Özet:
Bu tez çalışmasında, Pb(II), Cu(II) ve Cd(II) iyonlarının katı faz ekstraksiyon yöntemiyle manyetik grafen oksit üzerinde zenginleştirilmesi ve alevli atomik absorpsiyon spektrometresi ile tayini gerçekleştirilmiştir. Metal iyonlarının pH 6' da manyetik grafen oksit üzerinde adsorbe olması ve % 10' luk asetonda 3M HNO3 ile elüe edilmesiyle kantitatif geri kazanmalar elde edilmiştir.
Yöntemin optimizasyonu için analit iyonlarını içeren model çözeltiler hazırlanarak pH, elüent türü, konsantrasyonu ve hacmi, vorteks süresi, örnek hacmi ve yabancı iyon etkisi gibi analitik parametrelerin etkileri incelenmiştir. Analit iyonları için elde edilen ortalama geri kazanma değerleri  % 95-105 aralığındadır. Yöntemin doğruluğu sertifikalı referans madde analizleri ve su ve gıda örneklerine yapılan ekleme-geri kazanma çalışmaları ile kontrol edilmiştir. Yöntem çeşitli gıda örneklerinin analit içeriklerinin tayinine başarı ile uygulanmıştır.

Abstract:
In this thesis study, the preconcentration of Pb(II), Cu(II) and Cd(II) ions on magnetic graphene oxide by solid phase extraction and determination of these ions by flame atomic absorption spectrometry was carried out. The quantitative recovery was obtained by the adsorption of metal ions on magnetic graphene oxide at pH 6 and elution with 3M HNO3 in % 10 acetone solution. 
For optimization of the method, the effects of analytical parameters such as pH, eluent type, concentration and volume, vortex time, sample volume, matrix ion effect was examined by preparing model solutions containing analyte ions. The mean recovery values for analyte ions were in between 95-105 %. The validation of the method was checked by applying the proposed method to standard reference materials and addition-recovery studies for water and food samples. The method was succesully applied to the analyte contents of some water and food samples.
Farklı konaklardan elde edilen Echinococcus granulosus izolatlarının moleküler karakterizasyonu
Molecular characterization of Echinococcus granulosus isolates obtained from different sources
Yazar: EMRAH ERDOĞAN
Danışman: PROF. DR. SÜLEYMAN YAZAR
Erciyes Üniversitesi / Sağlık Bilimleri Enstitüsü / Parazitoloji Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2015
Konu: Parazitoloji = Parasitology
Dizin: Echinococcosis = Echinococcosis ; Echinococcus = Echinococcus ; Echinococcus granulosus = Echinococcus granulosus ; Kistler = Cysts ; Moleküler yapı = Molecular structure

Özet:
E. granulosus dünya genelinde görülebilmektedir. Parazitin neden olduğu "kistik ekinokokkozis" (KE) yurdumuzun da içinde bulunduğu hayvancılığın yaygın olduğu birçok ülkede önemli sağlık sorunları oluşturmakta ve ekonomik kayıplara neden olmaktadır. Parazitin sık görüldüğü bölgeler; Kuzey ve Doğu Afrika, Avustralya, Güney Amerika ve Avrasya'dır. 
Yapılan moleküler çalışmalarda taksonomik olarak doğrulanan dört türün yanında;      E. granulosus türünün varyasyonları veya suşları denilen 10 farklı suş tanımlanmıştır. Ancak ülkemizde suş tayinine yönelik çalışmalar sınırlı sayıdadır. Suşlar arasındaki ara konak farklılıkları ve gelişimsel farklılıklar parazitle mücadeleyi ve kontrol çalışmalarını olumsuz yönde etkileyebilmektedir.
Çalışmada amacımız; Türkiye'de farklı bölgelerden ve farklı ara konaklardan elde edilen hidatik kist materyalini moleküler yöntemlerle inceleyerek E.granulosus suş tayini yapmaktır.  Çalışmamızın; Türkiye'de ve bölgemizde KE'ye karşı yapılacak olan etkin eradikasyon, kontrol ve aşı çalışmalarında içeriğinden faydalanılacak  bir çalışma olması  düşünülmektedir.

Abstract:
E. granulosus can be seen throughout the world. Interference caused by the "cystic echinococcosis" (KE) is common in our country are also found in the animal constitutes a major health problem in many countries and cause economic losses. Parasite prevalent regions; North and East Africa, Australia, South America and Eurasia.
In addition to the four species by molecular studies confirmed the taxonomic; 10 different strains or strains of E. granulosus species known variations have been identified. However, in our country are limited studies on strain characterization. Search mansion differences between strains and developmental differences and the fight against parasite control studies can be adversely affected.
Our aim in this study; From different regions of Turkey and obtained from different intermediate hosts by examining the cyst material is to make the determination of molecular methods E.granulosus strains. Our study; Effective eradication keen to be held against Turkey and our region is considered to be a work that will benefit from the content in the control and vaccine development.
Habbazi'nin El-Mugni Fi Usuli'l-Fıkh adlı eserine Harizmi tarafından yapılan şerhin tahkik ve tahlili
The verification and analyse of Serhu'l-Mughni fi Usuli'l-Fikh by Khwarizmi
Yazar: MUHAMMED FERRUH ORUÇ
Danışman: DOÇ. DR. ŞÜKRÜ SELİM HAS
Erciyes Üniversitesi / Sosyal Bilimler Enstitüsü / Temel İslam Bilimleri Ana Bilim Dalı / İslam Hukuku Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2015
Konu: Din = Religion ; Hukuk = Law
Dizin: El-Muğni = El-Muğni ; Habbazi = Habbazi ; Harizm = Harizm ; Kur'an-ı Kerim = Koran ; İslam Hukuku = Islamic Law ; İslam Hukuku = Islamic Law ; İslamiyet = Islam ; Şerh = Commentary

Özet:
Türkiye'de bulunan yazma eserler esas alınarak incelenen Şerhu'l-Muğnî, Kâânî (ö. 775/1374) tarafından kaleme alınan bir Hanefî usûl eseridir. İlgili çalışma bir giriş, iki ana ve bir de sonuç bölümüne ayrılmıştır.
Giriş bölümünde tahkik ve tahlil aşamasında takip edilen metotlardan bahsedilmiştir.
Birinci ana bölüm, hem Muğnî'nin hem de şerhinin yazarlarıyla ilgili bilgilere ayrılmıştir. İkinci ana bölüm ise Kâânî'nin yazmış olduğu şerhin tahlili ile ilgili olan kısımdır.
Çalışma, genel hatlar çerçevesinde değerlendirmelerin yapıldığı sonuç bölümüyle tamamlanmıştır.
Arapça metin ise tezin sonunda ek olarak sunulmuştur.

Abstract:
In this study, Sharhu'l-Mughnî, a Hanafite methodology work written by Kââni (775/1374) is examined using the manuscripts in Turkey. This study consists of an introduction, two main chapters and a conclusion. At the introduction the method of criticism and analysis is explanied. The first main chapter is dedicated to the information regarding the writers of both Mughnî and the commentary of the Mughnî while the second main chapter is about the analysis of the exegesis written by Kââni. Finally without going into the details, study concludes with criticism and of the text with an evaluation. Arabic text is provided at the end of the thesis as an attachment.