hakansabunis/tr-academic-research-agent-index huggingface dataset:
Bazı oksim bileşiklerinin bağlanma özelliklerinin moleküler kenetlenme yöntemiyle incelenmesi
Investigation of binding properties of some oxime compoundsby molecular docking method
Yazar: ÖMER AYSAN
Danışman: PROF. DR. BÜLENT DEDE
Süleyman Demirel Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Kimya Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2019
Konu: Kimya = Chemistry

Özet:
Bu tez çalışmasında, biyolojik aktivite gösterme potansiyeli yüksek olan bazı oksim bileşiklerinin seçilmiş bazı proteinlerin aktif bölgesine bağlanma özellikleri moleküler kenetlenme (Doking) yöntemiyle incelenmiştir. Bu amaçla çalışılan tüm oksim ligand molekülleri, Yoğunluk Fonksiyonel Teorisi (DFT) yöntemiyle B3LYP fonksiyoneli ve 6-311G(d,p) temel seti kullanılarak Gaussian 09 programında optimize edilmiştir. Optimize edilen tüm moleküllerin bazı kuantum kimyasal parametreleri, moleküler elektrostatik potansiyel (MEP) diyagramları ve HOMO-LUMO orbitalleri de hesaplanmıştır. 

Ligand moleküllerinin seçilen proteinlerle moleküler kenetlenme yöntemiyle bağlantı çalışmaları, ligandların optimize edilmiş geometrileri kullanılarak gerçekleştirilmiştir. Protein Data Bank'dan seçilen proteinlerin kristal yapıları *.pdb formatında temin edilmiş ve bu kristal yapıların optimize ligandlarla etkileşimi SwissDock web sunucusu kullanılarak incelenmiştir. Moleküler kenetlenme çalışmaları sonucu, ligand-protein bağlanma enerjileri,  ligand-protein arasında oluşan hidrojen bağ bölgeleri ve sayısı tespit edilerek değerlendirilmiştir.

Abstract:
In this thesis study, binding properties to the protein of some oxime compounds with high potential for biological activity were investigated by molecular docking. All oxime ligand molecules studied for this purpose were optimized by Gaussian 09 program using B3LYP function by Density Functional Theory (DFT) and 6-311G(d,p) basis set. Some quantum chemical parameters, molecular electrostatic potential (MEP) diagrams and HOMO-LUMO orbitals of all optimized molecules are also calculated. 

Binding studies of ligand molecules with molecular docking method by selected proteins were performed using optimized geometries of the ligands. 
The crystal structures of selected proteins were provided in * .pdb format from the Protein Data Bank and their interactions with optimized ligands were investigated using the SwissDock web server. As a result of the molecular docking studies, ligand-protein binding energies were determined by determining the number of hydrogen bond regions that could occur between the ligand-protein.
Bakteriyel selüloz esaslı tıbbi tekstil malzeme üretimi
Bacterial cellulose based medical textile material production
Yazar: NUR KILINÇ
Danışman: DR. ÖĞR. ÜYESİ DİCLE ÖZDEMİR KÜÇÜKÇAPRAZ
Süleyman Demirel Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Tekstil Mühendisliği Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2019
Konu: Biyomühendislik = Bioengineering ; Tekstil ve Tekstil Mühendisliği = Textile and Textile Engineering

Özet:
Bu tez çalışmasında, statik kültür ortamında Acetobacter xylinum bakterisi kullanılarak kombu çayı kültüründe bakteriyel selüloz (BS) yapılar üretilmiştir. Tıbbi amaçlı kullanılmak üzere üretilen bakteriyel selüloz yapılar ve çeşitli dokusuz yüzeyler kullanılarak kompozit yapılar elde edilmiştir. Ham BS yapıların özellikleri ile hidrojen peroksit ve sodyum hidroksit uygulanmış olan bakteriyel selüloz yapılarının özellikleri karşılaştırılmıştır. Ayrıca, kombu çayı kültürü ile BS oluşturulması amacı ile BS üretiminin optimum pH değerleri belirlenmiştir.
Elde edilen bakteriyel selüloz yapıların su tutma, boyut değişimi, porozite, toz tutma, eğilme açısı, sürtünme direnci, mukavemet, FT-IR, SEM, EDS ve DSC analizleri yapılmıştır. Bunun yanısıra, bakteriyel selüloz yapılarından içi boşluklu yapıda üretimin yapılabilirliği araştırılmıştır.
Yapılan analizler neticesinde özellikle hidrojen peroksit ve sodyum hidroksit uygulamasından geçmiş olan bakteriyel selüloz ve bakteriyel selüloz kompozit yapıların tıbbı amaçlı olarak kullanılabilecek özeliklere sahip olduğu belirlenmiştir. Bakteriyel selüloz yapılarından içi boşluklu yapıda üretim sağlanmıştır.

Abstract:
In this thesis, bacterial cellulose structures were produced in kombucha tea by using Acetobacter xylinum bacteria in static culture medium. Composite structures were obtained by using bacterial cellulose (BS) structures and various nonwovens made for medical purposes. The properties of the raw BS structures and the properties of the BS structures which were applied hydrogen peroxide and sodium hydroxide were compared. In addition, pH values of BS production were investigated for the purpose of determining the optimium pH values in kombucha tea culture.
Water retention, size change, porosity, dust retention, bending resistance, rubbing resistance, strength, FT-IR, SEM, EDS and DSC analysis of the bacterial cellulose structures were done. In addition, the feasibility of production in hollow structure from bacterial cellulose structures was investigated.
As a result of the analyzes, it has been determined that the bacterial cellulose and bacterial cellulose composite structures, which have undergone the application of hydrogen peroxide and sodium hydroxide, have properties which can be used for medical purposes. Hollow structure production has been provided from bacterial cellulose structures.
Yarışlı gölü havzası'nın fiziki coğrafyası ve havza yönetimi önerileri
Physical geography and basin management recommendations of Yarisli lake basin
Yazar: BÜŞRA DEMİR
Danışman: DR. ÖĞR. ÜYESİ AHMET TOKGÖZLÜ
Süleyman Demirel Üniversitesi / Sosyal Bilimler Enstitüsü / Coğrafya Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2019
Konu: Coğrafya = Geography
Dizin: Coğrafya = Geography ; Fiziki coğrafya = Physical geography ; Havza yönetimi = Basin management ; Yarışlı Gölü = Yarışlı Lake

Özet:
Bir yörenin havza yönetim planını açıklamaya yönelik yapılan çalışmalar, o alanın planlanması ve söz konusu bölgenin potansiyellerinin belirlemesi adına önemli fikirler sunmaktadır. Ülkemizde çeşitli şekillerde yararlanılan göl alanlarına ilişkin problemlerin her geçen gün artması ve Göller Bölgesi'nde yer alan araştırma sahasında oluşan yoğun baskı da araştırmanın yapılmasını zorunlu kılmaktadır. 
Yapılması planlanan çalışmada bir yandan geleneksel araştırma prensibi dikkate alınırken diğer yandan bilimsel manada her alanla ilgili modern yöntemlere yer verilecektir. Böylece araştırmanın bulguları kullanılarak, hem daha sağlıklı yorumlamalar yapılacak hem de belirli bir konuda ihtisaslaşmanın getirebileceği sorunlara bir çözüm yolu sunacaktır. 
Tüm bu veriler ve planlanan yöntemlerle birlikte, Yarışlı Gölü Alt Havzası ve yakın çevresinin, havza yönetim unsurlarını belirlemek ve elde edilecek verilerle havzanın daha sağlıklı planlanması ve yönetilmesi adına çeşitli önerilerin üretilmesi araştırmanın başlıca amaçlarıdır.

Abstract:
Studies to explain the basin management plan of a region; it provides important ideas for planning the area and identifying the potentials of the area in question. The increasing number of problems related to the lake areas used in various ways in our country and the intense pressure that occurs in the research area in the Lakes Region also necessitates the research.
While the study is planned to take into consideration the traditional research principle on the one hand, modern methods related to each field in scientific sense will be included. Thus, by using the findings of the research, both healthier interpretations will be made and a solution will be provided for the problems that can be brought about by specialization in a particular subject.
With all these data and planned methods, the main objectives of the research are to determine the basin management elements of the Yarisli Lake Basin and its immediate surroundings and to produce various recommendations for the healthier planning and management of the basin with the data to be obtained.
Kırâat-anlam ilişkisi açısından İbn Kesîr kırâatinde Ferşü'l-Hurûf
Farshü'l-Hurūf which is in the recitation of ibn Kathīr in terms of recitation-meaning relationship
Yazar: YAVUZ MUTLU
Danışman: DR. ÖĞR. ÜYESİ ALİ BULUT
Süleyman Demirel Üniversitesi / Sosyal Bilimler Enstitüsü / Temel İslam Bilimleri Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2019
Konu: Din = Religion
Dizin: Anlam = Meaning ; Anlam bilim = Semantics ; Arapça = Arabic ; Dil bilgisi = Grammar ; Dil bilim = Linguistics ; Ferşü'l-Huruf = Ferşü'l-Huruf ; Kıraat = Reading ; İbn Kesir = İbn Kesir

Özet:
Bu çalışma, on sahih kırâatten biri olan İbn Kesîr kırâatini konu edinmektedir.
Önce İbn Kesîr ve râvileri hakkında bilgi verilmiş, akabinde kırâatinin özellikleri, usûl
ve ferş yönünden incelenmiştir. İnfirâd ettiği kelimelerin, Kur'ân tefsirine nasıl bir
etkisi olduğu îzah edilmiştir.
Bu tezde sırasıyla, dünyada en çok okunan 'Âsım kırâati ile İbn Kesîr kırâati
arasındaki kırâat ve farklı okunan kelimelerin "Fâtihâ sûresinden Nâs sûresine kadar"
hangi sûrede ve hangi âyette geçtikleri tespit edilmiş ve bu kelimeler çalışmanın
sonunda tablo şeklinde gösterilmiştir. Âyetlerin Arapça metin ve mealleri verilmiş,
âyetin icmâlî tefsiri ve kırâatler arası tefsir ilişkisi açısından ele alınarak, netîce kısmıyla
sonlandırılmıştır.
Bu çalışmada, İbn Kesîr kırâatindeki okuyuş farklılıklarının, genel îtibâriyle
mânâyı değiştirmemekle birlikte, bazı âyetlerin farklı yorumlanmasına sebep olduğu
görülmüştür.

Abstract:
The focus of this study is giving information about Ibn Kathīr and his narrators,
examining the features of his recitations in terms of method (usūl) and (farsh) and to
reveal the effects of only the words are recited by Ibn Kathīr (infirād) to the Qurānic
exegesis.
In this study, it is determined the words have been read differently by reciters
Āsım and Ibn Kathīr, from the first chapter of the Qurān, Sūrah al-Fātihah to the last
chapter of that, Sūrah al-Nās. It has shown those words in a table. In addition, the texts
and meanings of the verses have been given the meanings of the words which recited
differently also mentioned. The general explanation of the verses and their relations
with the recitation have been illuminated.
The result obtained in this study is that the reading differences in the recitation
of Ibn Kathīr do not change the meaning in general, but it has been observed that it adds
a different perspective.
Talebin kısmi ertelenmesi durumunda bir ekonomik sipariş miktarı modeli
An economic order quantity model under partial backordering of the demand,
Yazar: AHMED ADNAN HAFEDH ALGBURI
Danışman: PROF. DR. ABDULLAH EROĞLU
Süleyman Demirel Üniversitesi / Sosyal Bilimler Enstitüsü / İşletme Ana Bilim Dalı
Derece: Doktora, 2019
Konu: İşletme = Business Administration
Dizin: Deterministik modeller = Deterministic models ; Deterministik stok kontrol modelleri = Deterministic inventory control models ; Ekonomik sipariş miktarı = Economic order quantity ; Kusurlu ürün = Faulty product ; Sipariş = Order ; Stok yönetimi = Stock management ; Talep = Demand ; Talep etme geri çekilme = Demand- withdraw

Özet:
Stok yönetimiyle ilgili olarak ekonomik literatür incelendiğinde stokastik ve deterministik stok modellerinin geliştirildiği görülmektedir. Bunlar arasında, deterministik modeller matematiksel karmaşıklık düzeyi en düşük olan modellerdir. Klasik ekonomik sipariş miktarı modeli ve klasik ekonomik üretim miktarı modelleri deterministik modellerin yaygın olarak görülen örnekleridir. Her ne kadar bu modeller basit ve kullanışlı olsa da zaman zaman gerçek hayatta ortaya çıkan problemlere cevap vermekte yetersiz kalmaktadır. Bu nedenle, modelde yer alan varsayımlara ilave varsayımlar eklenmesi yahut mevcut varsayımların gevşetilmesi yoluyla yeni modeller geliştirilmektedir.
Bu çalışmada talebin bir kısmının sonradan karşılanmak üzere ertelenmesi, ödemelerde gecikmeye izin verilmesi ve defolu ürün durumunu ele alan bir model önerilmektedir. Modelde özellikle kısmî erteleme oranının etkileri incelenmektedir. Önerilen model için sayısal örnekler verilmekte ve parametrelerdeki değişimlerin optimal değerler üzerindeki etkileri duyarlılık analizi yardımıyla araştırılmaktadır.






Anahtar Kelimeler

Kısmi Erteleme, Defolu Ürün, Ödemelerde Gecikme, Ekonomik Sipariş Miktarı

Abstract:
ABSTRACT
The economic literature regarding inventory management modeling focuses on the development of stochastic and deterministic inventory control models. Among these models, deterministic static models are the ones that have lowest level of mathematical complexity. Classical economic order quantity and economic production quantity models are the most common examples of deterministic static modeling. Although these models are simple and practical, sometimes they are regarded insufficient to respond problems faced in real life.  For this reason, to be able to answer real life problems, new models are produced by adding new assumptions to the model or relaxing existing assumptions of the model. 
In this study, a model is proposed to allow partial backordering of the demand, delay in payments and defective items situations at the same time. In this model, the effects of partial backordering are investigated. Numerical examples are given for the proposed model and the effects of the changes in the parameters on the optimal values are investigated with the sensitivity analysis.





Key Words

Partial Backordering, Defective Items, Permissible Delay in Payment, Economic Order Quantity
Thiacloprid ve Cyprodinil pestisitlerinin Danio rerio (Hamilton, 1822) (Zebra Balığı) DNA'sı üzerindeki toksik etkileri
Toxic effects of Thiacloprid and Cyprodinil on Danio Rerio (Hamilton, 1822) (Zebrafish) DNA
Yazar: VEHBİ ATAHAN TOĞAY
Danışman: PROF. DR. YUSUF AYVAZ
Süleyman Demirel Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Biyoloji Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2019
Konu: Biyoloji = Biology
Dizin: DNA hasarı = DNA damage ; Ekotoksikoloji = Ecotoxicology

Özet:
Pestisitler geçtiğimiz 30 - 40 yıllık sürede gıdalarımızın sürekliliği korumaya yardımcı olarak insan yaşamına önemli katkılar sağlamıştır. Bununla birlikte, yaygın kullanımlarından dolayı içme ve yüzey sularında birçok pestisit tespit edilmiştir. Bu durum suların kirlenmesine ve sudaki hedef dışı organizmalara olumsuz etkilere neden olmaktadır. Sonuçta ekolojik olarak zincirleme etkiler ve insan sağlığına kalıcı zararlar ortaya çıkmaktadır. Bu nedenle, çevrenin ve insan sağlığının korunması için pestisitlerle ilgili kapsamlı değerlendirmeler gereklidir. Bu doğrultuda özellikle ülkemizde oldukça sık kullanılan thiacloprid ve cyprodinil pestisitlerine 21 gün boyunca maruz bırakılan zebra balığında (Danio rerio) meydana gelen genotoksik etkiler comet metodu ile ortaya konmuştur. Hem cyprodinil hem de thiacloprid DNA hasarına sebep olan genotoksik ajanlar olarak tespit edilmiştir. Sonuçlar hem ekolojik açıdan hem de insan sağlığı açısından tartışılmıştır.

Anahtar Kelimeler: Comet Metodu, Cyprodinil, DNA hasarı, Fungusit, İnsektisit, Pestisit, Thiacloprid, Zebra Balığı

Abstract:
Pesticides have significantly contributed to human life in the past few decades by helping to preserve the continuity of our foods. However, due to their widespread use, many pesticides have been found in drinking and surface waters. This causes water pollution and negative effects on non-target organisms in water. As a result, ecological knock-on effects and permanent damage to human health are emerging. Therefore, comprehensive assessments of pesticides are necessary to protect the environment and human health. In this respect, genotoxic effects of thiacloprid and cyprodinil pesticides, which are frequently used in our country, on zebrafish (Danio rerio) DNA have been demonstrated by comet assay. Both cyprodinil and thiacloprid have been identified as genotoxic agents that cause DNA damage. The results were discussed both in terms of ecological and human health.

Keywords: Comet Assay, Cyprodinil, DNA Damage, Fungicide, Insecticide, Pesticides, Thiacloprid, Zebrafish
Destinasyon imajı geliştirilmesinde yerel halk ve yöneticilerin algısının ölçülmesi: Burdur ilinde bir araştırma
Measurement the perception in the development of a destination image by local people and local authorities: A research in Burdur
Yazar: ŞEFİKA TAŞTEKİN
Danışman: DOÇ. DR. DİDAR BÜYÜKER İŞLER
Süleyman Demirel Üniversitesi / Sosyal Bilimler Enstitüsü / İşletme Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2019
Konu: Turizm = Tourism ; İşletme = Business Administration
Dizin: Burdur = Burdur ; Destinasyon = Destination ; Yerel halk = Local people ; Yerel yönetimler = Local administrations ; Yöneticiler = Managers ; İmaj = Image ; İmaj yaratma = Image making

Özet:
Küreselleşen dünyada turizm pazarında rekabet koşulları artmakta ve destinasyonların ikamesi kolaylaşmaktadır. Gittikçe zorlaşan bu rekabet koşullarında destinasyonların diğerlerinden farklılaşmak için imajını geliştirmesi gerekmektedir. Bu doğrultuda bölge halkına ve yöneticilerine de görevler düşmektedir. Bu çalışmada destinasyon imajının geliştirilmesinde Burdur ilinde yaşayan yerel halkın ve yöneticilerin algılarına ulaşmak amaçlanmıştır. Bu amaç doğrultusunda yerel halka anket uygulaması yapılmış ve yerel üst düzey yöneticilerin görüşme formu ile görüşleri toplanmıştır. İstatiksel analizlerden elde edilen anket sonuçları ile görüşme formundan elde edilen cevaplar yorumlanarak karşılaştırılmıştır. Elde edilen bulgulara göre Burdur'un sakin bir destinasyon olduğu ve imaj geliştirilmesi kapsamında turizm konusunda yerel halkın bilinçlendirilmesinin gerekliliği sonucuna ulaşılmıştır. Çıkan sonuçlardan Burdur'un insanlarda en çok anımsattığı turizm unsuru ise Burdur şiş olmuştur.

Anahtar Kelimeler: Destinasyon İmajı, Yerel Halk, Yerel Yöneticiler

Abstract:
In the globalizing world, competitive conditions are increasing in the tourism markets and the substitution of destinations becomes easier. In these increasingly difficult conditions of competition, destinations are developing their image to be different from others. In this direction, the residents and local administrators have duties. In this study, it is aimed to reach the perceptions of local people and administrators who live in Burdur province in developing destination image. For this purpose, a questionnaire was applied to local people and their opinions were collected through interview form. The results of the questionnaires obtained from the statistical analyzes and the answers obtained from the interview form were compared by making comments. According to the findings, it is concluded that Burdur is a tranquil destination and it is necessary to raise awareness of local people about tourism within the scope of image development. According to residents Burdur şiş is one of the most reminiscent of Burdur.

Key Words: Destination Image, Local People, Local Administrators
Otomatik meteorolojik veri toplama ve iletim sisteminin tasarımı ve üretimi
Design and fabrication of the automatic meteorological data acquisition and transmission system
Yazar: HÜSEYİN ALTUĞ
Danışman: PROF. DR. MURAT ÖZTÜRK
Süleyman Demirel Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Fizik Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2019
Konu: Enerji = Energy ; Fizik ve Fizik Mühendisliği = Physics and Physics Engineering ; Mekatronik Mühendisliği = Mechatronics Engineering

Özet:
Bu tez çalışmasında meteorolojik verilerden, rüzgâr hızı, rüzgâr yönü, hava sıcaklığı, hava nemi, açık hava basıncı, yerel güneşlenme şiddeti ve süresi vb. ölçümlerin elde edilebilmesi için algılayıcı elemanlar kullanılarak; rüzgâr hızı ölçümü için 4 kepçeli mekanik Anemometre, rüzgâr yönü ölçümü için içinde doğrusal manyetik alan algılayıcılar barındıran mekanik rüzgâr yön algılayıcısı, hava sıcaklığını ve bağıl nemi aynı anda tek bir noktada ölçebilmek için polimer teknolojili yarı-iletken tümleşik sıcaklık ve nem algılayıcısı, güneş ışığı ölçümü için yarı-iletken ışık algılayıcı kullanılarak meteorolojik veri üreten ölçüm cihazları tasarlanmıştır. 

Meteorolojik verilerin toplanması, işlenerek anlamlı hale getirilmesi ve iletilmesi için Android işletim sistemli mobil bir telefon cihazı üzerinde çalışabilen OMOVTİS isimli yazılım geliştirilmiştir. Cihaz üzerindeki Bluetooth modül ile ham veriler toplamaktadır. Veriler bir saatlik dosyalar halinde SQLite veri tabanı dosyalarında saklanmaktadır. Ham veriler anlık olarak hesaplanmakta, cihaz ekranında görüntülenmekte ve uzak kullanıcılara html formatlı WEB sayfası şeklinde ulaştırılmaktadır. Ayrıca veriler *.db, *.xls dosya formatlarına dönüştürülerek medya ortamlarında saklanabilmekte ve uzak kullanıcılara transfer edilebilmektedir.

Abstract:
In this thesis, to provide measurements such as wind speed, wind direction, air temperature, atmospheric pressure, local insolation intensity and time etc. From meteorological data by means of detecting elements; for wind speed calculation four cup mechanic anemometer, for wind direction calculation mechanical wind direction sensor including linear magnetic field sensor, to measure air temperature and relative humidity for at a single point at the same time polymer technology semi-conductor integrated temperature and moisture sensor, for sun shine measure semiconductor light sensor have been designed.

A software called OMOVTIS has been developed to collect metrological data, to process to make meaningful information and to transfer, which can work on a mobile phone device that works with android operating system. With the bluetooth module on the device, the raw data is collected. Data is stored in SQLite database files hourly. Raw data is calculated instantly and displayed on the device screen and delivered to remote users in the form of a WEB page in html format.   In addition, the data can be kept in media in *.db, * .xls file formats and transferred to remote users.