Psödoeksfoliyasyon sendromlu ve psödoeksfoliyasyon glokomlu olgular ile LOXL1 gen polimorfizminin ilişkisi
The Association of LOXL1 gene polymorphisms with cases having pseudoexfoliation syndrome and pseudoexfoliation glaucoma
Yazar: YETKİN YAZ
Danışman: PROF. DR. NİLGÜN YILDIRIM
Eskişehir Osmangazi Üniversitesi / Tıp Fakültesi / Göz Hastalıkları Ana Bilim Dalı
Derece: Tıpta Uzmanlık, 2012
Konu: Genetik = Genetics ; Göz Hastalıkları = Eye Diseases
Dizin: Genetik-medikal = Genetics-medical ; Genler = Genes ; Glokom-geniş açılı = Glaucoma-open angle ; Polimorfizm-genetik = Polymorphism-genetic ; Psödoeksfoliasyon sendromu = Pseudoexfoliation syndrome

Özet:
Psödoeksfoliasyon sendromu (PES) anormal extrasellüler matriks materyalinin göz dokularında üretilmesi ve birikmesi ile karakterize yaşa bağlı elastozis olarak tanımlanır. Psödoeksfoliyasyon glokomu (PEG) ise sekonder açık açılı glokomun en sık nedeni olup PES'da en sık görülen klinik tablodur. PES'nun patogenezi ve psödoeksfoliyatif materyalin (PEM) biyokimyasal yapısı henüz tam olarak bilinmemektedir. Son zamanlarda yapılan araştırmalarda, PES/PEG olgularında 15. kromozomunun q24.1. lokusunda bulunan liziloksidaz-benzeri protein 1 geninde (LOXL1) ki üç tek nükleotid polimorfizminin (SNP) varlığı saptanmıştır. Çalışmamızda Türk toplumunda PES/PEG olgularında LOXL1 genindeki üç SNP'ini (rs2165241, rs3825942 ve rs1048661) araştırarak PES ve PEG ile ilişkisini ortaya koymayı amaçladık. Bu nedenle çalışma kapsamına alınan PES, PEG ve kontrol olgularının tam göz muayeneleri yapıldıktan sonra kan örneklerinden DNA eldesi yapıldı. DNA örneklerinde prob temelli bir genotipleme yöntemi olan RT-PCR ile polimorfizm varlığı araştırıldı. Çalışma sonucunda PES/PEG olgularında, LOXL1 gen üç SNP'nin kontrol grubu olgularından daha fazla olduğu saptandı. Ancak PES ile PEG grubu arasında fark bulunamadı. Üç SNP'den PES/PEG ile en fazla ilişkili olanı rs3825942 olup bu sonuç Avrupa ve Amerika'da yapılan çalışmalar ile benzerlik göstermekteydi. Cinsiyete göre sonuçlar değerlendirildiğinde sadece rs2165341 SNP'i erkeklerde 3 kat daha fazla risk taşımaktaydı.

Abstract:
Pseudoexfolation syndrome (PES) is defined as the age-related elastosis characterized by production and accumulation of abnormal extracellular matrix materials in a variety of ocular tissues. On the other hand, pseudoexfoliative glaucoma (PEG) is the most common cause of secondary open-angle glaucoma and the most common clinical picture seen in PES. PES pathogenesis and biochemical structure of PEM is not known yet. In recent studies, in PES/PEG cases, the presence of three single-nucleotide polymorphism (SNPs) has been detected on lysyloxidase-like protein 1 (LOXL1) gene located on chromosome 15 area q24.1. In our study, we aimed to investigate the association of LOXL1 gene three SNPs (rs2165241, rs3825942 and rs1048661) with PES/PEG cases in Turkish population and assess the relationship with PES and PEG. For this purpose, after complete eye examination of the PES, PEG and control cases included, DNA is extracted from the blood samples and polymorphism is investigated by RT-PCR which is a probe-based genotyping method. Based on the study results, LOXL1 gene three SNPs is more frequently seen in PES/PEG cases than it is seen in control cases. However, no difference was found between PES and PEG groups. Out of three SNP, rs3825942 was found to be more strongly associated with PES/PEG than the other two and this was similar with the studies conducted in Europe and America. When the results were evaluated regarding the gender, the only significant finding was that, males carried three times greater risk of having rs2165341 SNP.