Metisiline dirençli staphylococcus aureus izolatlarında vankomisine düşük düzeyde direnç varlığının araştırılması
The investigation of low-level resistance to vancomycin in methicillin-resistant staphylococcus aureus isolates
Yazar: ŞERİFE UÇAR
Danışman: DOÇ. DR. YÜCEL DUMAN
İnönü Üniversitesi / Tıp Fakültesi / Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
Derece: Tıpta Uzmanlık, 2021
Konu: Mikrobiyoloji = Microbiology

Özet:
ÖZET
Amaç: S. aureus toplum ve hastane kaynaklı enfeksiyonlara yol açan patojenlerin başında gelmektedir. MRSA enfeksiyonlarının tedavisinde ilk seçilecek antibiyotik vankomisindir. 
Vankomisin tedavisi alan hastalarda tedavide başarısızlıklara neden olan VISA ve hVISA suşları rutin laboratuvar yöntemleriyle tespit edilememektedir. Bu suşların tespitinde altın standart yöntem ise PAP-AUC yöntemidir. Çalışmamızda PAP-AUC yöntemiyle VISA ve hVISA varlığını araştırmayı hedefledik.
Gereç ve Yöntem: Çalışmamıza 2015-2020 yılları arasında hastanemiz mikrobiyoloji laboratuvarına gönderilen çeşitli örnekleden izole edilip -80oC'de stoklanan 68 MRSA suşu dahil edilmiştir. Öncelikle sefoksitin disk difüzyon yöntemi ile metisilin direnci belirlenen tüm suşlarda PZR yöntemi ile mecA ve mecC gen varlığı araştırıldı. Bu suşlarda makro E-test, agar tarama, broth mikrodilüsyon ve PAP-AUC yöntemleriyle VISA ve hVISA varlığı araştırıldı. Suşlar arasındaki klonal ilişki PFGE yöntemi ile araştırıldı.
Bulgular: Tüm suşlar mecA geni içermesine rağmen hiçbir suşta mecC genine rastlanmadı.
Broth mikrodilüsyon yöntemi ile MİK değeri 4 μg/ml bulunan bir suş hariç tüm suşlar duyarlı kategorisinde yer almaktaydı. 
 Makro E-test yöntemiyle yapılan tarama sonucunda şüpheli hiçbir izolata rastlanmadı. 2 μg/ml vankomisin içeren beyin kalp infüzyon agarla yapılan tarama sonucunda 6 VISA, 4  hVISA şüpheli suş tespit edildi. Altın standart yöntem olan PAP-AUC yöntemi ile bu şüpheli suşlardan bir tanesi, MİK değeri 4 μg/ml olan suş, VISA olarak, 1 tanesi de hVISA olarak değerlendirildi.
PFGE ile baskın bir salgın suşu tespit edilmemiştir.
Tartışma: MRSA enfeksiyonlarında kullanılan vankomisin tedavisi sırasında başarısızlık yaşanan hastalarda VISA ve hVISA olabilme ihtimali göz önünde bulundurulmalı ve tadavide başarısızlık yaşamamak adına vankomisin daha akılcı kullanılmalıdır.
Anahtar Kelimeler: hVISA, mecA, mecC, MRSA, PAP-AUC, S. aureus, VISA

Abstract:
ABSTRACT
Aim: S. aureus is one of the leading pathogens causing community and hospital-acquired infections. Vancomycin is the first antibiotic of choice in the treatment of MRSA infections.
VISA and hVISA strains that cause treatment failure in patients receiving vancomycin therapy can't be detected by routine laboratory methods. The gold standart method for the detection of these strains is the PAP-AUC method. In our study, we aim to investigate the presence of VISA and hVISA with the PAP-AUC method.
Materials and Methods: 68 MRSA strains isolated from various samples sent to our hospital's microbiology laboratory between 2015-2020 and stocked at -80 degrees were included in our study. First of all, the presence of mecA and mecC genes was investigated by PCR method in all showers with methicillin resistance determined by cefoxitin disk diffusion method. The presence of VISA and hVISA was investigated in these strains by macro E-test, agar screening, broth microdilution and PAP-AUC methods. The clonal relationship between strains was investigated by PFGE method.
Results: Although all strains contain the mecA gene, no mecC gene was found in any strain.
All strains were in the susceptible category, except for one strain of which MIC value was 4 μg/ml by broth microdilution method. 
No suspicious isolate was found as a result of the scanning performed with the macro E-test method. As a result of the screening performed with brain heart infusion agar containing 2 μg/ml vancomycin, 6 VISA and 4 hVISA suspect strains were detected. With the PAP-AUC method, which is the gold standart method, one of these suspicious strains, the strain with a MIC value of 4 μg/ml, were evaluated as VISA and one as hVISA.
No dominant outbreak strain detected with PFGE.
Conclusion: The possibility of VISA and hVISA in patients who fail during vancomycin treatment used in MRSA infections should be considered and vancomycin should be used more rationally in order to avoid treatment failure.
Keywords: hVISA, mecA, mecC, MRSA, PAP-AUC, S. aureus, VISA