Gökkuşağı alabalığında (Oncorhynchus mykiss, Walbaum 1792) mayaların izolasyonu ve probiyotik etkilerinin araştırılması
Isolation and investigation of probiotic effects of yeasts in rainbow trout (Oncorhynchus mykiss, Walbaum 1792)
Yazar: ÖZGE ÇAYLI BEKTAŞ
Danışman: PROF. DR. BEHİRE IŞIL DİDİNEN ; PROF. DR. ERTAN EMEK ONUK
Isparta Uygulamalı Bilimler Üniversitesi / Lisansüstü Eğitim Enstitüsü / Su Ürünleri Yetiştiriciliği Ana Bilim Dalı
Derece: Doktora, 2022
Konu: Su Ürünleri = Aquatic Products
Dizin: Maya = Maya ; Oncorhynchus mykiss = Oncorhynchus mykiss ; Probiyotikler = Probiotics

Özet:
Bu tez çalışmasında, gökkuşağı alabalıklarının bağırsaklarından probiyotik maya suşlarının izolasyonu, identifikasyonu, in vitro ve in vivo probiyotik özellikleri araştırılmıştır. Bunun için, öncelikle sağlıklı gökkuşağı alabalıklarının bağırsaklarından maya suşlarının izolasyonu yapılmıştır. Daha sonra, izole edilen maya suşlarının bakteriyel balık patojenlerine (Lactococcus garvieae, Vagococcus salmoninarum, Vibrio anguillarum, Yersinia ruckeri ve Aeromonas hydrophila)  antimikrobiyal etkileri (çukur difüzyon agar testi) ve adezyon kabiliyetleri, safra tuzlarına ve düşük pH şartlarına toleransları, hidrofobisiteleri ve gökkuşağı alabalıklarındaki patojeniteleri araştırılmıştır. Maya suşlarının tür teşhisleri ITS gen bölgesi sekans analizi ile gerçekleşmiştir. Seçilen aday probiyotik mayalar gökkuşağı alabalıkları yemlerine ileve edilerek 35 günlük besleme denemesi yapılmıştır. Besleme denemesi sonucunda maya suşlarının balıklarda serum immünolojik parametreleri, serum biyokimyası ve L. garvieae'ye karşı hastalık direnci üzerindeki etkileri araştırılmıştır. Araştırma sonucunda, izole edilen iki maya izolatının hidrofobik özellikte olduğu, safra tuzlarına ve asidik şartlara tölerenslı oldukları, patojenlere in vitro antagonizm göstermedikleri, tüm patojenlere adezyon özelliği gösterdikleri ve gökkuşağı alabalıkları için patojenik olmadıkları belirlenmiştir. Maya suşları Candida zeylanoides Y12-3 ve Hyphopichia pseudoburtonii Y12-1 olarak tanımlanmıştır. Maya suşları ile besleme denemesi sonucunda, serumdaki myeloperoksidaz ve lizozim aktiviterlerinin etkilenmediği (P>0.05), serum biyokimyasal parametrelerinden glikoz, total protein, globülin değerlerinin Hyphopichia pseudoburtonii ile beslenen balıklarda kontrol grubu balıklara göre daha yüksek olduğu (P<0.05), kolestrol değerinin Candida zeylanoides Y12-3 ile beslenen balıklarda kontrole göre daha düşük olduğu (P<0.05) tespit edilmiştir. L. garvieae ile deneysel enfeksiyon denemesi sonucunda mayalar ile beslenen balıklardaki ölüm oranlarının kontrol grubuna göre daha düşük olduğu belirlenmiştir (P<0.05). Sonuç olarak Hyphopichia pseudoburtonii Y12-1 ve Candida zeylanoides Y12-3 maya suşlarının, gökkuşağı alabalığı yetiştiriciliğinde probiyotik olarak kullanılabilme potansiyeli olmakla birlikte, gelecekte yapılacak çalışmalarda ilave in vivo testlerle probiyotik etkilerinin araştırılması faydalı olacaktır.

Abstract:
In this thesis, isolation, identification, in vitro and in vivo probiotic properties of yeast strains from the intestines of rainbow trout were investigated. For this, first of all, yeast strains were isolated from the intestines of healthy rainbow trout. Then, antimicrobial effects (well diffusion agar assay) and their ability to adhere to bacterial fish pathogens (Lactococcus garvieae, Vagococcus salmoninarum, Vibrio anguillarum, Yersinia ruckeri and Aeromonas hydrophila), their tolerance to bile salts and low pH conditions, hydrophobicity and their pathogenicity in rainbow trout was investigated. Identification of yeast strains was performed by ITS gene region sequence analysis. Feeding trial was carried out by adding selected candidate probiotic yeasts to rainbow trout feeds for 35 days. After the feeding experiment, effects of yeast strains on serum immunological parameters, serum biochemistry and disease resistance against L. garvieae in fish were investigated. As a result of the study, it was determined that the two yeast isolates were hydrophobic, tolerant to bile salts and acidic conditions, not show in vitro antagonism to pathogens, showed adhesion to all pathogens and not pathogenic for rainbow trout. Yeast strains were identified as Candida zeylanoides (Y12-3) and Hyphopichia pseudoburtonii (Y12-1). As a result of feeding experiment with these yeast strains, serum myeloperoxidase and lysozyme activities were not affected (P>0.05). Serum biochemical parameters, glucose, total protein, globulin values were higher in fish fed with Hyphopichia pseudoburtonii compared to control group fish (P<0.05). Cholesterol value in fish fed with Candida zeylanoides (Y12-3) was lower compared to the control (P<0.05). As a result of experimental infection with L. garvieae,  the mortality rates in fish fed with yeasts were lower than the control group (P<0.05). In conclusion, although Hyphopichia pseudoburtonii Y12-1 and Candida zeylanoides Y12-3 yeast strains have the potential to be used as probiotics in rainbow trout farming, it would be beneficial to investigate their probiotic effects with additional in vivo tests in future studies.