Türk Akça ağacı şurubu hastalarında dallı zincirli Alpha - keto asit dehidrogenaz enzim kompleksi mutasyonlarının araştırılması
Investigation of mutations in Branched chain Alpha - ketoacid dehydrogenase enzyme komplex in Turkish patients with MSUD
Yazar: ALİ DURSUN
Danışman: PROF. DR. ASIM CENANİ
İstanbul Üniversitesi / Sağlık Bilimleri Enstitüsü / Genetik Ana Bilim Dalı
Derece: Doktora, 1998
Konu: Tıbbi Biyoloji = Medical Biology
Dizin: Akçaağaç şurubu idrar hastalığı = Maple syrup urine disease

Özet:
MSUD, BCKAD enzim kompleksinin yapısına giren 6 genden herhangi birisindeki mutasyon sonucu oluşmaktadır. Türk MSUD hastalarında, BCKAD enzim kompleksindeki mutasyonları iki aşamalı bir çalışma ile araştırdık. Birinci çalışmamızda PCR-RE metodu kullanarak daha önce MSUD hastalarında tanımlanmış olan Eloc-148ins C, 887 del 8 ve G 245 R yanlış anlamlı mutasyon ve El(3- 80 del 11 mutasyonlarını 12 hastamızda araştırdık. Çalışma sonucunda 12 hastamızın daha önce tanımlanmış bu 4 mutasyonu taşımadığını tespit ettik. Birinci çalışmamızın sonucu, İtalyan araştırmacıların Eip / Ekson 1 deki delesyonun Akdeniz ülkelerinde sık görülebileceği hipotezini desteklememektedir. 2 ci çalışmamızda BCKAD enzim kompleksine giren Ela, El (3, E2 genleri PCR - SSCP - Dizi analizi metodu ile araştırıldı. SSCP çalışmasında 10 hastamızda baz değişikliklerinin yerleri tespit edildi. Dizi analizi çalışması sonunda, 3 hastamızın C213Y mutasyonunu homozigot, 1 hastamızın Q80E mutasyonunu homozigot, 1 hastamızın T107M mutasyonunu heterozigot aynı hastanın diğer mutasyonunun ise E2 - IVS2-1 g => a olduğu tespit edildi. Hastalarımızda bulduğumuz mutasyonlar daha önce MSUD hastalarında tanımlanmamıştı. Çalışmalarımız Ankara - Çamlıdere yöresinde C 213 Y mutasyonunun kurucu etkisinin olabileceğini göstermiştir. Çalışmalarımız sonucunda BCKAD enzim kompleksinde lokus heterojenitesi gösteren ilk vaka tanımlanmıştır. Çalışmalarımız MSUD hastalığında, Türk hastalarında genetik yapının diğer toplumlardan farklı olduğunu göstermiştir.

Abstract:
MSUD is one of the inborn errors of metabolism which results from deficiency of branched-chain - a ketoacid dehydrogenase enzyme complex. BCKAD shows an autosomal reccessive inheritance pattern. Therefore the disease is occur as a result of consanguinity marriages which are frequent in Turkey (21.1%). The frequency of the disease is not known in Turkey, however a high frequency of occurance for the disease can be expected as the second most prevalent metabolic disorder in Turkey after PKU. So far, no research has been carried out on Turkish patients in MSUD. In the framework of the thesis, we investigated the mutations in Ela, Eip and E2 genes in 12 Turkish patients with MSUD and we identified 4 novel mutations C213Y, T106M, Q80E and IVS -1 g=>a in Ela and E2 gene respectively. Our study indicated the homozy presence of a novel mutation C213 Y in 3 patients with MSUD. We also concluded C 213 Y mutation has a founder effect in Çamlıdere town near to Ankara. One patient was found to be homozygously Q 80 E, another patient whose mutations are T 106 M in El a and IVS 2-1 g=>a in E2 gene has locus heterogenity in MSUD. This study showed that molecular basis of MSUD in Turkey is very heterogenous and different from other populations.