Kırım-kongo kanamalı ateşi hastalarında uzun kodlama yapmayan RNA NRAV ve uzun kodlama yapmayan RNA LETHE ifade düzeylerinin hastalığın prognozu ile ilişkisinin incelenmesi
Investigation of the relationship of Non-Long-Coding RNA NRAV and non-long-coding RNA LETHE expression levels with the prognosis of the disease in patients with breeding fever of the Crimean Congo
Yazar: AYŞENUR ÇÖMEZ BAYSAL
Danışman: DR. ÖĞR. ÜYESİ YASEMİN ÇAKIR KIYMAZ
Sivas Cumhuriyet Üniversitesi / Tıp Fakültesi / Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Bakteriyoloji Ana Bilim Dalı / Enfeksiyon Hastalıkları Bilim Dalı
Derece: Tıpta Uzmanlık, 2024
Konu: Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji = Infectious Diseases and Clinical Microbiology

Özet:
Kırım-Kongo kanamalı ateşi virüsü (KKKA), Bunyavirales ailesinin
Ortonairoviridae alt grubuna ait KKKA virüsün (KKKAV) neden olduğu zoonotik bir
enfeksiyon hastalığıdır. KKKA hastalığının patogenezi tam olarak bilinmemektedir. Bu
çalışmada KKKA hastalarında lncRNA-NRAV ve lncRNA-lethe ekspresyon
seviyelerinin değerlendirilmesi amaçlanmıştır. Çalışmaya Sivas Cumhuriyet
Üniversitesi Tıp Fakültesi Araştırma Hastanesi Enfeksiyon Hastalıkları Anabilim Dalı
tarafından Mayıs ve Ağustos 2012 tarihleri arasında KKKA tanısı ile takip edilen 80
hasta dahil edildi. KKKA tanısı Sağlık Bakanlığı Halk Sağlığı Genel Müdürlüğü
referans laboratuvarında KKKA'ya özgül RT-PCR test kitleri ve KKKA Ig M ELISA
yöntemi ile konuldu. Hastalar ciddiyet skorlamasına göre hafif, orta ve ağır ciddiyetteki
hastalar şeklinde üç gruba ayrıldı. Gruplar arasında lncRNA-NRAV ve lncRNA-lethe
ekspresyon düzeyleri karşılaştırıldı. Ayrıca hastalar mortal seyredenler ve yaşayanlar
olarak da iki gruba ayrılarak da lncRNA-NRAV ve lncRNA-lethe ekspresyon düzeyleri
karşılaştırıldı. qPCR sonucu elde edilen veriler "RT2 Profiler PCR Array Data Analysis
version 3.5 yazılımına yüklendi ve analiz, ΔΔCq metoduna göre yapıldı. 0.05'ten
küçük p değerleri anlamlı kabul edildi. Yapılan analiz sonucuna göre ağır hasta
grubunda orta şiddetli hasta grubuna göre lncRNA-NRAV ifadesinin 21.86 kat artığı,
hafif hasta grubuna göre ise 22.74 kat arttığı ve bu artışların istatistiksel olarak anlamlı
olduğu gösterildi. Mortal seyreden olgular ile yaşayanlar karşılaştırıldığında ise
lncRNA-NRAV ifade düzeyleri mortal seyreden olgularda 9.2 kat artmış bulundu.
Sonuç olarak çalışmamızın bulguları lncRNA-NRAV'ın KKKA hastalığının
patogenezinde rol alan bir lncRNA olabileceğini düşündürmüştür.
Anahtar Kelimeler: Kırım-Kongo hemorajik ateş virüsü, uzun kodlamayan
RNA, prognoz

Abstract:
Crimean-Congo hemorrhagic fever virus (CCHF), a member of the Nairoviridae
subfamily of the Bunyavirales order, is a zoonotic infectious disease caused by the
CCHF virus (CCHFV). The pathogenesis of CCHF disease is not fully understood. This
study aimed to evaluate lncRNA-NRAV and lncRNA-lethe expression levels in CCHF
patients. The study included 80 patients, followed by a CCHF diagnosis by the
Department of Infectious Diseases at the Faculty of Medicine, Sivas Cumhuriyet
University Research Hospital between May 2012 and August 2016. CCHF was
diagnosed with CCHF-specific RT-PCR test kits and CCHF Ig M ELISA method in the
reference laboratory of the Ministry of Health, General Directorate of Public Health.
Patients were divided into three groups based on severity scoring: mild, moderate, and
severe. Expression levels of lncRNA-NRAV and lncRNA-lethe were compared
between these groups. Patients were divided into two groups survivors and mortals.
LncRNA-NRAV and lncRNA-lethe expression levels were compared between these
groups. The qPCR results were uploaded to the "RT2 Profiler PCR Array Data Analysis
version 3.5" software and analyzed using the ΔΔCq method. P values less than 0.05
were considered significant. The analysis showed that the expression of lncRNA-NRAV
increased 21.86 times in the severe group compared to the moderate group, and 22.74
times compared to the mild group, and these increases were statistically significant.
When comparing non-survivors with survivors, the expression levels of lncRNA-NRAV
were found to be 9.2 times higher in non-survivors. In conclusion, the findings of our
study suggest that lncRNA-NRAV may be a lncRNA involved in the pathogenesis of
CCHF disease.
Keywords: Crimean-Congo hemorrhagic fever virus, long noncoding RNA,
prognosis