Amsonia orientalis Decne.' nin farklı populasyonları arasındaki genetik çeşitliliğin RAPD ve SDS PAGE yöntemleri ile belirlenmesi
Determination of genetic diversity between different populations of Amsonia orientalis Decne. with RAPD and SDS PAGE methods
Yazar: TUBA ERBULUCU
Danışman: YRD. DOÇ. DR. ÖZLEM AKSOY
Kocaeli Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Biyoloji Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2012
Konu: Biyoloji = Biology
Dizin: Elektroforez-poliakrilamid jel = Electrophoresis-polyacrylamide gel ; Genetik varyasyon = Genetic variation ; Koruma = Conservation ; Polimorfizm-genetik = Polymorphism-genetic ; RAPD-PCR = RAPD-PCR

Özet:
Anahtar Kelimeler: RAPD, Amsonia orientalis, Genetik Çeşitlilik, SDS-PAGE, Koruma, PolimorfizmAmsonia orientalis Decne. (Apocynaceae) dünya üzerinde sadece Yunanistan'ın doğusu ve Türkiye'nin batısında bulunmakta ve Türkiye Bitkileri Kırmızı Kitabına göre ?çok tehlikede? (CR; critically endangered) tehlike kategorisinde gösterilmekte ve Bern Sözleşmesi gereği Avrupa Konseyi tarafından Avrupa ölçeğinde mutlak korunması gereken bitki türleri listesinde yer almaktadır. Çeşitli alkaloitler içermesinden dolayı antikanserojen ve antitümör etkileri vardır. Yaşam alanları insan etkisiyle zarar gördüğü için, tür tehdit altında bulunmaktadır. A.orientalis, İstanbul'da (Ömerli) ve Balıkesir'de (Gaziosmanpaşa, Adnan Menderes ve Paşa Alanı) dar bir yayılışa sahiptir. Koruma stratejilerinin geliştirilebilmesi için öncelikle bitkinin genetik çeşitliliğinin saptanması gereklidir. Bu bitkide populasyonlar arası genetik çeşitliliğin ilk değerlendirilmesi RAPD belirteçleri kullanılarak yapılmıştır. İkinci aşamada SDS PAGE ile protein profili saptanmıştır. Çalışmada kullanılan 40 primerden 37 primer 118 polimorfik bant oluşturmuştur. A.orientalis populasyonları arasındaki genetik mesafe 0.2881-1.2443 değerleri arasında değişmektedir. En yüksek genetik uzaklık değeri 1.2443 Gaziosmanpaşa ve Ömerli populasyonlarında bulunurken, en düşük genetik uzaklık değeri 0.2881 Ömerli ve Gaziosmanpaşa populasyonları arasında bulunmuştur. SDS-PAGE tekniği ile elde edilen toplam protein profilleri ile dendrogram ve populasyonlar arası uzaklık bulunmuştur. SDS-PAGE analizine göre, Ömerli populasyonu Gaziosmanpaşa populasyonuna yakın iken, Adnan Menderes populasyonu da Paşa Alanı populasyonu ile yakın görülmektedir.

Abstract:
Keywords: RAPD, Amsonia orientalis, Genetic Diversity, SDS PAGE, Conservation, PolymorphismAmsonia orientalis Decne. (Apocynaceae) which is only situated in the east of Greece and in the west of Turkey is shown in the category of danger ?Most endangered (CR, critically endangered)? according to the Red data book of Turkish plants and is listed in European scale shall be strictly protected plant species list by the European Council according to the Bern Convention. It has an anticarcinogenic and antitumor effect due to the integration of various alkaloids. Species is threatened due to the living areas which is damaged by human impact. A.orientalis has a narrow spread in Istanbul (Omerli) and Balıkesir (Gaziosmanpaşa, Adnan Menderes and Paşa Alanı). In order to develop conservation strategies firstly the detection of plant genetic diversity is required. The first evaluation of genetic diversity between populations in this plant was carried out using RAPD markers. Protein profile detected by SDS PAGE in the second stage. 37 of 40 RAPD primers that were used in this study formed 118 polymorphic bands. The genetic distance among the A. orientalis populations varies between 0.2881-1.2443 values. When the lowest genetic distance value 0.2881 was found between populations Ömerli and Gaziosmanpaşa, the highest genetic distance value 1.2443 was found between populations Gaziosmanpaşa and Ömerli. Dendogram and the distance between populations were found with the total protein profiles obtained by SDS-PAGE technique. According to SDS-PAGE analysis, when Ömerli population is close to Gaziosmanpaşa population, Adnan Menderes populations is seen close to Paşa Alanı population.