Tiroid disgenezisine bağlı konjenital hipotiroidili çocuklarda PAX-8, TTF-1 VE TTF-2 gen polimorfizmlerinin rolü
The role of PAX-8, TTF-1 AND TTF-2 gene polymorphisms in children with congenital hypothyroidism due to thyroid dysgenesis
Yazar: ALİ SEÇKİN YALÇIN
Danışman: DOÇ. DR. MEHMET KESKİN
Gaziantep Üniversitesi / Tıp Fakültesi / Çocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı
Derece: Tıpta Uzmanlık, 2011
Konu: Endokrinoloji ve Metabolizma Hastalıkları = Endocrinology and Metabolic Diseases ; Çocuk Sağlığı ve Hastalıkları = Child Health and Diseases
Dizin: Genotip = Genotype ; Hipotiroidizm = Hypothyroidism ; Malformasyonlar = Abnormalities ; Polimorfizm-genetik = Polymorphism-genetic ; Tiroid hastalıkları = Thyroid diseases ; Çocuklar = Children

Özet:
Amaç: Tiroid disgenezisine bağlı konjenital hipotroidi tanısı almış çocuklarda PAX-8, TTF-1 ve TTF-2 gen polimorfizmlerinin rolünün olup olmadığının araştırılması hedeflenmektedir. Çalışılan polimorfizmlerin bir fonksiyonu olup olmadığının belirlenmesi hastalığın tanı, tedavi ve patogeneziyle ilgili araştırma ve uygulamalara yeni açılımlar sağlayabilecek ve konjenital hipotroidinin önlenmesi ve yeni tedavi hedeflerinin belirlenebilmesi ile ilgili önemli bilgiler verecektir.Materyal ve Metod: Bu çalışma 100 hasta, 100 kontrol grubu olmak üzere toplam 200 çocuk ile yapıldı. Tüm hastaların tanı yaşı, cinsiyet, TSH düzeyi, sT4 düzeyi, tiroglobülin düzeyi, ultrasonografi bulguları kaydedildi. Hasta ve kotrol grubundan alınan kanlardan öncelikle DNA eldesi yapıldı. TTF1 (rs3739914), TTF1 (2054238), TTF2 (rs998532) ve PAX8 (rs80049915) gen bölgelerinin PCR yöntemiyle çoğaltılması işlemi yapıldı. DNA dizileme işleminin ardından her gen bölgesi için SNP (single nucleotide polimorphism) değişimi olan diziler tespit edilmiştir.Sonuçlar: TTF1 (rs3739914) gen bölgesinde 100 hasta ve 100 kontrol grubunda polimorfizim saptanmadı. TTF1 (2054238 C/T) gen bölgesinde 76 hastada polimorfizm saptanmadı, 24 hastada CT heterozigot mutasyonu saptandı. Kontrol grubunun 80'inde polimorfizm saptanmadı, 20'sinde CT heterozigot mutasyonu saptandı. TTF1 (2054238 C/T) gen polimorfizminin hastalık için bir risk faktörü olmadığı görüldü (odds=0,766[0,387-1,518], p=0,445). TTF-2 (rs998532) gen bölgesinde 94 hastada polimorfizm saptanmadı, dört hastada GA heterozigot mutasyonu saptandı, iki hastada GG homozigot mutasyonu saptandı. Kontrol grubunda 96 hastada polimorfizm saptanmadı, dört hastada GA heterozigot mutasyon saptandı. TTF-2 (rs998532) gen polimorfizminin hastalık için bir risk faktörü olmadığı görüldü (odds=0,707[0,189-2,641], p=0,606). PAX8 (rs80049915) gen bölgesinde 100 hasta ve 100 kontrol grubunda polimorfizim saptanmadı.Yorum: Tiroid disgenezisine bağlı konjenital hipotiroidili çocuklarda PAX-8, TTF-1 ve TTF-2'nin sık görülen SNP gösteren bölgelerinde hastalıkla ilişkili polimorfizm saptanmadı.Anahtar Kelimeler: Çocuk, Disgenezis, Genotip, Konjenital hipotiroidi.

Abstract:
Objective: We aimed to investigate whether there is any relation between congenital hypothyroidism due to thyroid dysgenesis and PAX-8, TTF-1, TTF-2 gene polymorphisms in children. Investigations of functions of polymorphisms in these genes can provide valuable information for further studies about diagnosis, treatment, pathogenesis of congenital hypothyroidism, and may give new ideas about preventing this disease.Patients and Methods: 200 children were included to this study. A hundred of 200 children were suffering from congenital hypothyroidism and the remainder was healthy. Age of diagnosis, gender, TSH level, free T4 level, thyroglobulin level and ultrasonographic findings of all patients were recorded. Firstly DNA extraction was done from blood samples of all children. TTF1 (rs3739914), TTF1 (2054238), TTF2 (rs998532), and PAX8 (rs80049915) gene regions were proliferated by PCR method. Sequences which have single nucleotide polymorphism (SNP) have determined for each gene region after lining up procedure for DNA.Results: No polymorphism was found on TTF1 (rs3739914) gene region in neither congenital hypothyroidism group nor healthy group. Polymorphism was found on gene region of TTF1 (2054238 C/T) in 76 children with congenital hypothyroidism and also CT heterozygote mutation was in 24 patients of the same group. No polymorphism was found in 80 children of healthy group but CT heterozygote mutation was detected in 20 ones of the same group. It was found that gene polymorphism of TTF1 (2054238 C/T) is not a risk factor for this disease (odds=0,766[0,387-1,518], p=0,445). No polymorphism was detected on TTF-2 (rs998532) gene region in 94 children of congenital hypothyroidism group; GA heterozygote mutation in 4 children and GG homozygote mutation in 2 children was detected in the same group. No polymorphism were detected in 96 children of healthy group, GA heterozygote mutation was detected in 4 children of the same group. It was found that TTF2 (rs998532) gene polymorphisms are not a risk factors for this disease (odds=0,707[0,189-2,641], p=0,606). No polymorphism is detected in on PAX8 (rs80049915) gene region in neither congenital hypothyroidism group nor healthy group.Conclusion: No polymorphism on the mostly seen regions of PAX-8, TTF-1, and TTF-2 genes which shows SNP was found in children with congenital hypothyroidism due to thyroid dysgenesis.Keywords: Child, Dysgenesis, Genotype, Congenital hypothyroidism