COVID-19 tanılı hastalarda akut faz reaktanı olarak serum pentraksin-3 ve supar düzeylerinin değerlendirilmesi
Evaluation of serum pentraxin-3 and supar levels as acute phase reactants in patients with COVID-19
Yazar: UFUK AKBAYIRLI
Danışman: PROF. DR. SELÇUK KAYA
İzmir Katip Çelebi Üniversitesi / İzmir Atatürk Eğitim ve Araştırma Hastanesi / Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
Derece: Tıpta Uzmanlık, 2022
Konu: Mikrobiyoloji = Microbiology
Dizin: COVID 19 = COVID 19 ; Pentraksin 3 = Pentraxin 3 ; Plazminojen aktivatörleri = Plasminogen activators ; Ürokinaz = Urokinases

Özet:
Giriş ve amaç: Koronavirüs Hastalığı-2019 (COVID-19) yüzyılımızın en zorlu sağlık problemidir, ancak hastalık hakkındaki bilgilerimiz kısıtlıdır. COVID-19'a neden olan Şiddetli Akut Solunum Sendromu Koronavirüs-2 (SARS-CoV-2) ile enfekte olan çoğu bireyde baş ağrısı, boğaz ağrısı, eklem ağrısı, tat ve koku duyusunda kayıp gibi hafif semptomlar izlenmektedir. Ancak enfeksiyon aynı zamanda özellikle komorbiditesi olan 65 yaş üzerindeki bireylerde önemli oranda morbidite ve mortaliteye neden olmaktadır. Ancak hangi hastalarda prognozun kötü olacağı tam olarak bilinmemektedir. Bu çalışmanın amacı COVID-19 hastalarında serum Pentraksin-3 (PTX3) ve Solubl ürokinaz plazminojen aktivatör reseptörü (suPAR) seviyelerinin incelenmesi, PTX3 ve suPAR seviyelerinin hastalığın prognozuyla olan ilişkisinin değerlendirilmesidir. 
Gereç ve Yöntem: Bu çalışma 1 Nisan-31 Aralık 2020 tarihleri arasında mikrobiyolojik veya klinik/radyolojik yöntemlerle COVID-19 olduğu doğrulanmış 150 hasta ile gerçekleştirildi. Bilinen COVID-19 öyküsü veya semptomları olmayan, RT-PCR sonucu negatif olan 30 kişi de kontrol grubunu oluşturmaktaydı. COVID-19 nedeniyle yatan hasta servislerine kabul edilen hastalar servis grubu (n=75) ve yoğun bakım ünitesine (YBÜ) kabul edilen hastalar YBÜ grubunu (n=75) oluşturmaktaydı. Serum PTX3 ve suPAR seviyeleri ELISA yöntemiyle analiz edildi ve üç grup arasında karşılaştırıldı. Hastaların lökosit, nötrofil, nötrofil/lenfosit oranı (NLO), troponin, prokalsitonin (PCT), D-dimer, CRP, lenfosit ve ferritin sonuçları analizlere dahil edildi. 
Bulgular: Hastaların yaş ortalaması 67,2 ± 11,8, kontrol grubunun ise 62,0 ± 8,4 idi. Gruplar arasında kadın/erkek oranı açısından anlamlı farklılık izlenmedi (p=0.582). Hastaların PTX3 ve suPAR seviyeleri kontrollerden daha yüksekti (sırasıyla p=0.001, p=0.023). PTX3 ve suPAR seviyeleri servis grubunda YBÜ grubundan (sırasıyla p<0,001, p=0,004) ve kontrol grubundan (sırasıyla p<0,001 p=0,001) daha yüksekti. Ancak PTX3 (p=0,291) ve suPAR (p=0,411) konsantrasyonları YBÜ ve kontrol grubu arasında farklılık göstermiyordu.  ROC eğrisi analizlerinde, 1,67 ng/mL üzerindeki PTX3 değerlerinin %72,6 sensitivite ve %60 spesifite ile COVID-19 tanısında belirleyici olduğu, 2,16 ng/mL altındaki değerlerin ise mortalitede %63,3 sensitivite ve %70 spesifite ile belirleyici olduğu izlendi. Benzer şekilde 127,7 pg/mL üzerindeki suPAR seviyelerinin %48 sensitivite ve %76,7 spesifite ile COVID-19 tanısında belirleyici olduğu, 112,9 pg/mL altındaki suPAR seviyelerinin ise %55 sensitivite ve  %67,8 spesifite ile mortalitede belirleyici olduğu izlendi. Mortalite için izlenen en yüksek eğri altında kalan alanlar (AUC) sırasıyla PCT (AUC=0,712), NLO (AUC=0,708) ve D-dimer (AUC=0,695) için izlenirken, YBÜ kabulü için en yüksek AUC değerleri sırasıyla lökosit (AUC=0,840), nötrofil (AUC=0,840) ve NLO (AUC=0,835) için izlenmişti. 
Sonuç: Serum PTX3 ve suPAR konsantrasyonlarının COVID-19 için tanısal önemi vardır. YBÜ'ye kabul edilen hastalarda yüksek olan PTX3 ve suPAR seviyeleri azalmaktadır. PTX3 ve suPAR seviyelerinin azalmasının prognostik bir önemi olabilir.

Abstract:
Introduction and aim: Coronavirus Disease-2019 (COVID‐19) is one of the most pressing health problems of this century, but our knowledge of the disease is still limited. Most people infected with Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus-2 (SARS‐CoV‐2), the pathogen that causes COVID‐19, experience mild symptoms, such as headache, sore throat, joint pain, and loss of taste and smell. However, the infection can also cause severe morbidity and mortality, especially in individuals over 65 and those with comorbidity.  However, it is not known exactly which patients will have a poor prognosis. The purpose of this study is to evaluate serum Pentraxin-3 (PTX3) and Soluble urokinase plasminogen activator receptor (suPAR) levels in patients with COVID-19 and to investigate whether PTX3 and suPAR predicts the disease prognosis
Material and Methods: This study was conducted on 150 COVID-19 patients confirm by microbiological or clinical/radiological methods between April 01 and December 31, 2020. The control group (n=30) consisted of individuals with no known history of COVID-19 infection and negative RT-PCR. The patients consisted of 75 patients admitted to the inpatient wards (inpatient group) and 75 patients admitted to the intensive care unit (ICU group) due to COVID-19. Serum PTX3 and suPAR levels were analyzed at the time of admission to the inpatient ward or ICU. Serum PTX3 and suPAR levels were detected by enzyme-linked immunosorbent assays and compared between those three groups. The patients' leukocyte, neutrophil, neutrophil/lymphocyte ratio (NLO), troponin, procalcitonin (PCT), D-dimer, CRP, lymphocyte and ferritin results were included in the analysis.
Results: The mean age of the patients was 67.2 ± 11.8, while the control group was 62.0 ± 8.4. Female/male ratio of groups were similar (p=0.582). PTX3 and suPAR level were higher in patients than controls (p=0.001, p=0.023, respectively). PTX3 and suPAR level were higher in inpatient group than ICU (p<0.001, p=0.004 respectively) and control group (p<0.001, p=0.001, respectively). However, PTX3 and suPAR concentrations were similar between ICU and controls (p=0.291, p=0.411, respectively). ROC curve analysis revealed that serum PTX above 1.67 ng/mL was associated with diagnosis of COVID-19 with a diagnostic sensitivity of 72.6% and specificity of 60%, while concentrations under 2.16 ng/mL were associated with mortality with a diagnostic sensitivity of 63.3% and specificity of 70%. Similarly, suPAR concentrations above 127.7 pg/mL was associated with diagnosis of COVID-19 with a diagnostic sensitivity of 48% and specificity of 76.7%, while concentrations under 112.9 pg/mL were associated with mortality with a diagnostic sensitivity of 55% and specificity of 67.8%. The highest AUC values for mortality were observed in troponin PCT (AUC=0.712), NLO (AUC=0.708) and D-dimer (AUC=0.695) and the highest AUC values for ICU admission were observed in leukocytes (AUC=0.840), neutrophils (AUC=0.840) and NLO (AUC=0.835), respectively.  
Conclusion: Serum PTX3 and suPAR concentrations have diagnostic significance for COVID-19. High PTX3 and suPAR levels decrease in patients admitted to the ICU. Decreased PTX3 and suPAR levels in ICU patients might have prognostic significance.