Helicobacter pylori tanısında floresan in situ hibridizasyon ile diğer hızlı tanı yöntemlerinin karşılaştırılması ve eşlik eden klaritromisin direncinin araştırılması
Comparision of fluorescent in situ hybridization and rapid diagnostic methods on helicobacter pylori diagnosis, and detection of accompanying clarithromycin resistance
Yazar: BİROL ŞAFAK
Danışman: Y.DOÇ.DR. İHSAN HAKKI ÇİFTCİ
Afyon Kocatepe Üniversitesi / Tıp Fakültesi / Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
Derece: Tıpta Uzmanlık, 2007
Konu: Mikrobiyoloji = Microbiology
Dizin: Clarithromycin = Clarithromycin ; FISH = FISH ; Helicobacter pylori = Helicobacter pylori ; Kültür = Culture ; Polimeraz zincirleme reaksiyonu = Polymerase chain reaction

Özet:
Helicobacter pylori, insanların midesine yerlesen spiral seklinde, Gramnegatif, mikroaerofilik bir bakteridir. Gelismis ülke populasyonlarında eriskinlerin% 50'si, gelismekte olan ülkelerde ise toplumun % 90'ı H. pylori ile infekteolmaktadır. Gastrik ülser, duodenal ülser, gastrik MALT lenfoma, distal gastrikkanserde H. pylori'nin major etyolojik rolu açıkça gösterilmistir.Uygun tedavi protokollerinin belirlenmesi ve özellikle bakterinineradikasyonu için etkenin doğru saptanması önemlidir. H. pylori tanısında invaziv(histopatolojik tanı, kültür, üreaz testi, moleküler metodlar) ve non-invaziv (ürenefes testi, serolojik testler, H. pylori gaita antijen testi) testler vardır.Semptomatik hastaların primer tanısı için invaziv testler halen kabul görmesinerağmen noninvaziv metodlar daha çok kullanılmakta ve uygulanması da oldukçakolay olmaktadır.Çalısma 147 hastadan alınan ( % 61.9 kadın ve yas ortalması 45.2+14.9)antral biyopsi örnekleriyle gerçeklestirildi. FISH ve HpSA çalısmaları sırasıyla133 ve 122 örneğe uygulandı. Klaritromisin direnci varlığı FISH ve agar dilüsyonmetodlarıyla arastırıldı.Kültür ile 61 (% 41.5) hastada, HpSA ile 67 (% 54.9) hastada pozitifliksaptandı. FISH ve PCR ile sırasıyla 82 (% 61.7) ve 108 (% 73.5) hastada pozitiflikbulundu. Klaritromisin direnci incelemesinde ise agar dilüsyon yöntemiyle %11.6, FISH yöntemiyle % 24.4 pozitiflik gösterildi. Bu çalısmada FISH içinduyarlılık % 72.5, özgüllük % 74.1 olarak bulundu.Çalısmamıza göre FISH metodu H. pylori infeksiyonu tanısında veklaritromisin direncinin tespit edilmesinde, diğer tanı yöntemlerini destekleyenhızlı, duyarlı ve basit bir metod olarak kullanılabilir.

Abstract:
Helicobacter pylori, is a spiral shaped gram-negative, microaerophilicbacterium which coloni?s gastric mucosa. The infected population with H. pyloriprevalence rate is 50 % in developed countries and over 90 % in developingcountries. Persistent infection induces peptic ulcer and chronic gastritis and hasalso been associated with gastric cancer and mucosal associated lymphoid tissuelymphoma.The accurate detection of the organism is essential for proper patientmanagement and particularly for the eradication of the bacteria followingtreatment. There have been many invasive (histopathological diagnosis, culture,urease tests, molekular testler) and noninvasive methods (urea breath test,serological tests, HpSA) for the detection of H. pylori. Although some of theinvasive methods are still accepted for the primary diagnosis in symptomaticpatients, noninvasive methods are much more utilized in practice easier toperform.This study was carried out with 147 patients (%61.9 females; mean age45.2 ± 14.9) who has taken antral biopsy. FISH and HpSA examinations weremade on 133 and 122 samples respectively. The presence of clarithromycinresistance investigated with FISH and agar dilution methods.A total of 61 (41.5%) biopsy samples were positive for culture and 67(54.9%) stool samples were positive with HpSA. FISH and PCR positivity rateswere found 61.7% (82) and 73.5% (108) respectively. Clarithromycin resistancewas detected 11.6% with agar dilution and 24.4% with FISH. In our study on H.pylori, we have evaluated the sensitivity and spesivity of the FISH method as72.5% and 74.1% respectively.Our study suggests that the FISH method can be used in the diagnosis of H pyloriinfections and for detecting clarithromycin resistance as a rapid, sensitive andsimple method to support other diagnostic tools.