Denizli yöresinde gözlenen hb d-los angeles mutasyonunun beta globin gen ailesi haplotip analizi
The beta globin gene cluster haplotypes associated with hb d-los angeles in denizli province
Yazar: ONUR ÖZTÜRK
Danışman: PROF.DR. EROL ÖMER ATALAY
Pamukkale Üniversitesi / Sağlık Bilimleri Enstitüsü / Biyofizik Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2007
Konu: Biyofizik = Biophysics
Dizin: Hemoglobinler = Hemoglobins

Özet:
Denizli yöresinde anormal hemoglobinler ve beta talasemiler, T.C. Sağlık BakanlığıDenizli Hemoglobinopati Merkezi verilerine göre % 3.5 oranındadır. Denizli ili, ülkemizdeHemoglobinopati Kontrol Programı uygulanan 33 il merkezinden bir tanesidir. Anormalhemoglobinler yöremizde toplum sağlığı açısından önemli kalıtsal hastalıklar arasında yeralmaktadır. Denizli yöresinde gözlenen anormal hemoglobinler içerisinde Hb D-Los Angeles[b121(GH4)Glu®Gln], % 57.8 oranı ile en sık gözlenen anormal hemoglobindir. Diğertaraftan yöremizde Hb S [b6(A3)Glu®Val], Hb G-Coushatta [b22(B4)Glu®Ala], Hb ESaskatoon[b22(B4)Glu®Lys], Hb C [b6(A3)Glu®Lys], Hb J-İran [ß77(EF1)His®Asp], HbBeograd [ß121(GH4)Glu®Val] gibi hemoglobin türlerine de rastlanmaktadır.Hb D-Los Angeles [b121(GH4)Glu®Gln]'a ilişkin çalışma sayısı, bu anormal hemoglobintürünün Hb S [b6(A3)Glu®Val]'e oranla daha az görülmesi ve belirgin bir sağlık sorunuoluşturmaması nedeni ile az sayıdadır. Özellikle beta globin gen ailesi haplotip çalışmalarıbelirtilen nedenlerle yaygın değildir. Yayınlanmış tek çalışma PAÜ Tıp Fakültesi BiyofizikAna Bilim Dalı tarafından yapılan ve dünyadaki dördüncü özgün odağı tanımlayançalışmadır. Ülkemizde Hb D-Los Angeles [b121(GH4)Glu®Gln] olgularındaki beta globingen ailesi haplotiplerine ilişkin, ayrıntılı veri bulunmamaktadır.Tez çalışmasında; yöremizde sıklıkla rastlanan Hb D-Los Angeles [b121(GH4)Glu®Gln]mutasyonu taşıyan bireylerde, e-globin, Gg/Ag-globin, yb-globin, d-globin ve b-globingenleri üzerinde bulunan toplam yedi odak için, beta globin gen ailesi haplotip analiziyapılmıştır. Elde edilen sonuçlara göre, yöremizde gözlenen olguların büyük oranda Akdenizkuşağı haplotip I [+ - - - - + +] ile ilişkili olduğu saptanmıştır. Bu haplotipin normalpopülasyonda da ilk sırada olması mutasyonun yerel haplotip üzerinde gelişmiş olduğunudüşündürmektedir.

Abstract:
In Denizli province of Turkey, carrier rate for abnormal hemoglobins and betathalassemiasis 3.5 % according to the data obtained from Turkish Ministry of Health, DenizliHemoglobinopathy Center. The city of Denizli is one of the 33 target cities of whichHemoglobinopathy Control Program is applied as premarital screnning in Turkey. In Denizliprovince, the most common abnormal hemoglobin variant is Hb D-Los Angeles[b121(GH4)Glu®Gln] with a frequency of 57% of the total abnormal hemoglobins observed.In addition, Hb S [b6(A3)Glu®Val], Hb G-Coushatta [b22(B4)Glu®Ala], Hb E-Saskatoon[b22(B4)Glu®Lys], Hb C [b6(A3)Glu®Lys], Hb J-İran [ß77(EF1)His®Asp], Hb Beograd[ß121(GH4)Glu®Val] are also observed.Since Hb D-Los Angeles is not an hemoglobin variant presenting a severe clinical picture,the research on this mutation is not commonly seen in the related literature. Regarding to thebeta globin gene cluster haplotypes, the data is not available in detailed manner for theTurkish cases observed. There is only one exception that the Pamukkale University MedicalFaculty Department of Biophysics has recently published a novel haplotype [- + - - + + +]which is known as the fourth haplotype in the published cases in the world population.Considering all these information, the beta globin gene cluster haplotypes in association withthe Hb D-Los Angeles cases for the Turkish population, especially in Denizli province is notknown.In this study, beta globin gene cluster haplotype analyses was done for the Hb D-LosAngeles cases observed in Denizli province. According to our results; Hb D-Los Angelesmutation observed in Denizli province is in association with Mediterranean haplotype I [+ - -- - + +]. In normal population the highest frequency haplotype is also Mediterraneanhaplotype I [+ - - - - + +]. Our results demonstrates that the Hb D-Los Angeles should havearosen mostly on local Mediterranean haplotype I.