RFC1 geni tekrar artışlarının sporadik parkinson ile ilişkisinin incelenmesi
Examining the relationship of RFC1 gene repeat increases with sporadic parkinson's
Yazar: İLAYDA SÖNMEZ
Danışman: DR. ÖĞR. ÜYESİ EBRU ERZURUMLUOĞLU GÖKALP
Eskişehir Osmangazi Üniversitesi / Sağlık Bilimleri Enstitüsü / Tıbbi Genetik Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2024
Konu: Genetik = Genetics ; Moleküler Tıp = Molecular Medicine

Özet:
Amaç: Replikasyon faktörü C alt birimi 1 (RFC1) genindeki biallelik AAGGG
tekrar dizisi artışlarının (AAGGG)(eksp) , serebellar ataksi, nöropati ve vestibüler
arefleksi sendromu (CANVAS) ve geç başlangıçlı ataksinin sık görülen bir nedeni
olduğu yapılan çalışmalar ile gösterilmiştir. RFC1 (AAGGG)(eksp) neden olduğu ek
kinik etkiler tanımlanmaya devam etmektedir. Parkinson hastalığında (PH) RFC1
tekrar artışlarının yaygınlığını araştıran sınırlı sayıda çalışma bulunmaktadır.
Ülkemize ait herhangi bir veri bulunmamaktadır. Bu doğrultuda çalışmamızda PH'da
RFC1 AAGGG tekrar artışlarının profilinin çıkarılması amaçlanmıştır.
Yöntem: Çalışmada klinik olarak sporadik PH tanısı almış 200 hasta ve 100
kontrol bireyde RFC1 AAGGG tekrar dizisi artışı açısından araştırılmıştır. AAGGG
tekrar dizisi artışı uzun menzilli Polimeraz Zincir Reaksiyonu (Long-Range PCR) ve
Repeat-Primed PCR yöntemleri kullanılarak analiz edilmiştir.
Bulgular: Hasta grubunda bir vakada patojenik AAGGG motifinde homozigot
ekspansiyon saptanmıştır (%0,5). Hasta grubunda patojenik AAGGG motifinde
heterozigot ekspansiyon taşıyan olgu sıklığı %8,5 olarak belirlenmiştir. Kontrol
grubunda ise bu oran %4,08'dir. Hasta ve kontrol grubu arasında patojenik
AAGGG(eksp) motifi için istatistiksel olarak anlamlı bir fark gözlenmemiştir (p=0.193).
Sonuç: Çalışmamız sonucunda biallelik AAGGG tekrar dizisi artışı için elde
ettiğimiz frekans değerleri literatür ile uyumludur. Parkinson hastalarında heterozigot
taşıyıcıların (%8,5) daha yaygın bulunması bu taşıyıcılığın PH için bir risk faktörü
olabileceğini düşündürmektedir. Saptanan kompleks motiflerin belirlenmesi ve elde
edilen verilerin doğrulanması için daha geniş hasta serilerinde ileri sekanslama
yöntemleriyle yeni çalışmalara ihtiyaç duyulmaktadır. Aynı zamanda RFC1 geninde
saptanmış yeni motiflerinde PH ile ilişkisinin incelenmesi gerekmektedir.

Abstract:
Aim: The increase of biallelic AAGGG repeat expansions in the replication
factor C subunit 1 (RFC1) gene has been demonstrated through studies to be a common
cause of cerebellar ataxia, neuropathy, and vestibular areflexia syndrome (CANVAS),
as well as late-onset ataxia. The additional clinical effects caused by RFC1 AAGGG
expansions continue to be described. There are a limited number of studies
investigating the prevalence of RFC1 repeat expansions in Parkinson's disease (PD).
Furthermore, no data specific to our country is available. Therefore, our study aims to
profile the AAGGG repeat expansions in RFC1 in individuals with PD.
Method: In the study, 200 individuals diagnosed with sporadic PD and 100
control subjects were investigated for RFC1 AAGGG repeat expansions. The AAGGG
repeat expansions were screened using Long-Range Polymerase Chain Reaction
(PCR) and Repeat-Primed PCR techniques.
Results: In the patient group, a case of homozygous pathogenic AAGGG
expansion was identified (0.5%). The frequency of cases carrying heterozygous
pathogenic AAGGG expansions in the patient group was determined to be 8.5%, while
in the control group, this rate was 4.08%. No statistically significant difference was
observed between the patient and control groups for the pathogenic AAGGGexp motif
(p=0.193).
Conclusion: The frequency values obtained for biallelic AAGGG expansions in
our study are consistent with the literature. The higher prevalence of heterozygous
carriers (8.5%) among PD patients suggests that this carrier status may be a risk factor
for the disease. To confirm the identified complex motifs and validate the obtained
data, further studies should be conducted with larger patient cohorts, and other motifs
identified in the RFC1 gene should also be investigated.