Uyuşturucu tipi kenevir genotiplerinin rapd-pcr metodu ile karakterizasyonu ve kullanılan istatistiki yöntemlerin değerlendirilmesi
Characterization of drug-type cannabis genotypes via rapd-pcr and evaluation of statistical methods in use
Yazar: EMİNE PINARKARA
Danışman: YRD. DOÇ. DR. SEYİT ALİ KAYIŞ
Selçuk Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Zootekni Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2007
Konu: Adli Tıp = Forensic Medicine ; Biyoteknoloji = Biotechnology ; İstatistik = Statistics
Dizin: Kenevir = Hemp ; Polimeraz zincirleme reaksiyonu = Polymerase chain reaction

Özet:
Bu çalışmada, Türkiye'nin farklı coğrafik bölgelerinden kaçak ekimler sonucu elegeçirilerek, İstanbul Adli Tıp Kurumu tarafından fakültemize teslim edilen kenevirtohumları arasında akrabalık bulunup bulunmadığı RAPD dominant markörlerikullanılarak araştırılmıştır. Dominant markörlerin istatistiki analizlerinde kullanılantemel koordinatlar analizi, kümeleme analizi, kümelerin güven sınırları, Mantel testi veNei ve Li genetik mesafesi tanıtılmış ve elde edilen veriler üzerinde bu metotlaruygulanmıştır.Bu çalışmada 29 kenevir aksesyonu sera saksı ortamında DNA izolasyonu içinyaprak örnekleri alınıncaya kadar yetiştirilmiştir. Moleküler genetik çalışmalarda tekbirey DNA (SET1) ve bulk DNA (SET2) setleri kullanılmıştır. PCR amplifikasyonlarısonucunda SET1'de 264, SET2'de 241 DNA bantı skorlanmıştır. Elde edilen verilerinistatistiki analizleri sonucunda SET1'de kullanılan aksesyonlar arasında belirgin birgruplaşma gözlenmemiştir. SET2'de ise ülkemizin batısındaki illerden elde edilenkenevir aksesyonları ile, doğusundaki illerden elde edilen kenevir aksesyonlarının ikifarklı grup oluşturduğu gözlenmiştir.ANAHTAR KELİMELER: Kenevir, RAPD-PCR, Temel Koordinatlar Analizi,Kümeleme Analizi, Mantel test, Nei ve Li Genetik Mesafesi

Abstract:
In this study, Cannabis Sativa L. accessions which were seized from differentparts of Turkey were used. The Istanbul forensic institute provided the Cannabisaccessions, which used in this study. Aim of the study was to determine geneticrelatedness between the accessions. For this purpose dominant markers (RAPD) wereemployed. In addition, statistical methods (such as principal coordinate analysis, clusteranalysis, bootstraps Mantel test, and Nei and Li genetic distance), which are used in theanalysis of dominant markers, were evaluated and employed in the analysis of Cannabisdata.In this study 29 Cannabis accessions were grown in the green house conditionsuntill DNA extraction material obtained. In the molecular study, single Cannabisaccession (SET1) and bulk of accessions of the same genotype (SET2) were used. PCRamplifications produced 264 markers in SET1 and 241 markers in SET2. Analysis ofSET1 data did not show a separation between the accessions. On the other hand, whenthe SET2 data were analysed, Cannabis accessions were clearly separated into two maingroups, one of which made up of Cannabis accessions which were seized from easternpart of Turkey while the other group was made up of Cannabis accessions which wereseized from western part of Turkey.KEY WORDS: Cannabis Sativa L., RAPD-PCR, Principal Coordinate Analysis,Cluster Analysis, Mantel test, Nei and Li Genetic Distance