Konotrunkal kalp anomalisi ve dismorfik bulguları olan çocuklarda fish yöntemi kullanılarak 22q11.2 delesyon sıklığının araştırılması
Chromosome 22q11.2 deletion in children with conotruncal heart defects and dismorphic features by FISH.
Yazar: ÖZLEM KAYA
Danışman: PROF. DR. BEYHAN TÜYSÜZ
İstanbul Üniversitesi / Sağlık Bilimleri Enstitüsü / Genetik Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2006
Konu: Biyoloji = Biology ; Moleküler Tıp = Molecular Medicine ; Tıbbi Biyoloji = Medical Biology

Özet:
ÖZETKaya Ö. (2006) Konotrunkal kalp anomalili ve Dismorfik bulguları olan çocuklarda FISHyöntemiyle 22q11.2 delesyon sıklığının araştırılması.stanbul Üniversitesi Sağlık Bilimleri Enstitüsü, Genetik ABD. Yüksek Lisans Tezi. stanbul.Doğumsal kalp anomalilerinin %10-15'ini oluşturan konotrunkal kalp defektleri (KTKD)kalbin çıkış yolu anomalileri olup, bu grup hastalarda 22q11.2 delesyonu prevalansı %12.8-30arasındadır. Bu oran izole KTKD defekti olan grupta %12-17 arasında iken, KTKD yanı sıra dismorfikbulgusu olanlarda ise %30'a kadar çıkmaktadır.Bu çalışmanın amacı KTKD ve dismorfik bulguları olan çocuklarda FISH yöntemi ile 22q11.2delesyon sıklığının saptanması, bu grup hastalarla, konotrunkal dışı kalp anomalisi/ dismorfikbulguları olan (kontrol-1) ve konotrunkal kalp anomalisi olup dismorfik bulgusu olmayanlar arasında(kontrol-2) 22q11.2 delesyon sıklığı bakımından anlamlı bir fark olup olmadığının araştırılmasıdır. Buamaçla 23 hasta grubu ile 10 kontrol-1 ve 13 kontrol-2 grubu olarak seçilen çocukta lokusa özgü probolan DiGeorge/VCFS TUPLE 1 probu kullanılarak yapılan FISH analizlerinde 22q11.2 bölgeleridelesyon açısından incelendi.KTKD ve dismorfik bulguları olan hasta grubunda 22q11.2 delesyon oranı %26 (6/23) vekontrol-1 grubu olarak seçtiğimiz KTKD dışı kalp anomalisi ve dismorfik bulgusu olan hastalardaki22q11.2 delesyon oranı %30 (3/10) olarak bulundu. Hasta ve kontrol-1 grubu arasında 22q11.2delesyon sıklığı açısından fark olmadığı görüldü. Kontrol-2 grubu olarak seçtiğimiz sadece KTKDolup dismorfik bulgusu olmayan hastalarda ise delesyon saptanmadı (0/13). Gerek hasta gereksekontrol-1 grubunda 22q11.2 delesyon sıklığı kontrol 2 grubundan anlamlı derecede fazla idi. Delesyonsaptanan olguların 5 tanesinin anne ve babası 22q11.2 delesyonu için tarandı ancak delesyonbulunamadı (0/10). Bu çalışma sonucunda KTKD kalp anomalisi ve dismorfik bulgusu olan hastagrubu ile KTKD dışı kalp anomalisi ve dismorfik bulgusu olan kontrol-1 grubunda 22q11.2 delesyonsıklığının yüksek oranda ve birbirine benzer bir değerde bulunması ile, 22q11.2 delesyonsendromlarının tanısında, KTKD varlığı kadar bu sendroma özgü dismorfik bulguların doğrutanımlanmasının önemli olduğu gösterilmiştir.Anahtar Kelimeler : DiGeorge Sendromu, Velocardiofacial Sendrom, FISH ve Caylerkardiofacial Sendrom,Bu çalışma stanbul Üniversitesi Bilimsel Araştırma Projeleri Birimi tarafından T-546/ 21102004no'lu proje olarak desteklemiştir.

Abstract:
ABSTRACTKaya O. Chromosome 22q11.2 deletion in children with conotruncal heart defects anddismorphic features by FISH.Istanbul University, Institute of Health Science, Genetics Common Programme, Istanbul,2006Conotruncal heart defects (CTHD) that represent 10-15% of congenital heart defects are thecardiac outflow tract defects. The prevalence of 22q11.2 deletion in patients with conotruncal heartdefect is 12.8-30%. This rate is 12-17% in patients with only CTHD while it increased to 30% inpatients with dysmorphic findings.The aim of this study is to determine the incidence of 22q11.2 deletion in patients with CTHDand dysmorphic findings, to research if there is a significant difference between this group, thepatients with not have CTHD but have dysmorphic findings (control group-1) and patients with CTHDbut not have dysmorphic findings (control group-2).In the present study for defining 22q11.2 deletions; FISH analyses were performed by usingone of the locus specific probe (DiGeorge/VCFS TUPLE 1 probe) to the group of patients(23 patientsgroup,10 patients in control group-1 and 13 patients in control group-2) that can not be defined22q11.2 deletion with Giemsa-trypsin banding method and karyotyping. The prevelance of 22q11.2deletion in patients with CTHD and dysmorphic findings is 26%(6/23), and the group of patients withnot have CTHD but have dysmorphic findings (control group-1) is 30%(3/10). In our results, nosignificant difference between the patients group and control group-1 was seen. No deletion wasdetermined in the control group-2 (0/13). The prevalance of 22q11.2 deletion in the patients? andcontrol-1 group is higher than the control-2 group. There was no deletion in the parents (0/10) of 5patients with 22q11.2 deletion. In this study, with the similar and high prevalance of 22q11.2 deletionin the patient and control-1 group, ?dysmorphic clinical features are also important as CTHD in thediagnosis of 22q11.2 deletion syndromes? is emphasized.Key Words: Conotruncal Hearth Defects, DiGeorge Syndrome, Velocardiofacial Syndromeand FISH.This study was supported by The Research Support Unit of stanbul University as the project noT-546/21102004