Köpeklerin ürogenital sisteminden izole edilen escherichia coli suşlarında genişlemiş spektrumlu beta laktamaz ve plazmidik AmpC direncinin karakterizasyonu
Characterization of expanded spectrum beta lactamase and plasmidic AmpC resistance in escherichia coli strains isolated from the urogenital system of dogs
Yazar: BERİVAN KAPLAN
Danışman: DR. ÖĞR. ÜYESİ ÖZGÜL GÜLAYDIN
Van Yüzüncü Yıl Üniversitesi / Sağlık Bilimleri Enstitüsü / Mikrobiyoloji (Veterinerlik) Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2021
Konu: Veteriner Hekimliği = Veterinary Medicine
Dizin: Beta laktamazlar = Beta lactamases ; Escherichia coli = Escherichia coli ; Köpekler = Dogs ; Polimeraz zincirleme reaksiyonu = Polymerase chain reaction ; Veteriner hekimlik = Veterinary medicine ; Ürogenital hastalıklar = Urogenital diseases ; Ürogenital sistem = Urogenital system ; İdrar = Urine

Özet:
Bu çalışmada, farklı ırk, cins ve yaştaki köpeklerin ürogenital sisteminde izole edilen
50 adet Escherichia coli suşunda, Genişlemiş spektrumlu beta laktamazlar (GSBL) ve plazmidik AmpC
direncinin fenotipik ve genotipik karakterizasyonu amaçlandı. Bu amaçla izolatlarda GSBL ve AmpC
varlığının fenotipik olarak belirlenmesinde disk difüzyon ve kombine disk yöntemi kullanılırken, direnç
ile ilişkili genlerin varlığı PCR ile belirlendi. Araştırmada incelenen 50 adet E. coli suşunun 22
(%75.86)'si GSBL pozitif bulunurken, tüm izolatlarda plazmidik AmpC direnci tespit edilemedi. GSBL
pozitif 22 izolatın blaTEM, blaSHV ve blaCTX-M grup 1 genleri sırasıyla 11 (%50), 1 (%4.54) ve 6
(%27.27)'sında tespit edildi. İncelenen izolatların çoğunun çalışmada kullanılan antimikrobiyal
maddelere karşı duyarlı olduğu belirlenirken, en yüksek direncin tetracycline (%28) karşı geliştiği ve
bunu sırasıyla streptomycin (%24), trimethoprim+sulfamethoxazole (%24) ve chloramphenicol (%22)
direncinin izlediği görüldü. ERIC-PCR ile incelenen izolatlarda 4 farklı genotipik profil belirlendi.
GSBL pozitif izolatlarda genotipler arasındaki dağılımın farklı oranlarda olduğu ve GSBL pozitiflik ile
genotipler arasında istatistiksel bir ilişkinin de bulunmadığı tespit edildi. Sonuç olarak, bu çalışma ile
köpeklerin ürogenital sisteminde enfeksiyonlara neden olabilecek E. coli izolatlarında beta laktam grubu
antibiyotiklere direnç oranının yüksek olduğu ve bu doğrultuda enfeksiyonların tedavisinde etkili
antimikrobiyal madde seçiminde genişlemiş spekturumlu beta laktam grubu antibiyotiklerin kullanımına
dikkat edilmesi gerektiği kanaatine varıldı.

Abstract:
In this study, it was aimed to characterize ESBL and plasmidic
AmpC resistance in 50 Escherichia coli strains isolated from the urogenital system tract of dogs with
different breeds, sexes and ages, phenotypically and genotypically. For this purpose, disk diffusion and
combined disk methods were used to determine the presence of Extended spectrum beta lactamases
(ESBL) and AmpC in isolates phenotypically, while the presence of resistance-related genes were
determined by PCR. 22 (75.86%) of 50 E. coli strains examined in the study were found to be ESBL
positive. However, plasmidic AmpC resistance was not detected in E. coli isolates. BlaTEM, blaSHV and
blaCTX-M group 1 genes were detected in 11 (50%), 1 (4.54%) and 6 (27.27%) of 22 ESBL positive
isolates, respectively. In the study, it was determined that the isolates were susceptible to the used
antimicrobial agents, generally while the highest resistance developed against tetracycline (28%),
followed by streptomycin (24%), trimethoprim+sulfamethoxazole (24%) and chloramphenicol (22%),
respectively. Four different genotype profiles were determined in isolates by ERIC-PCR. It was
determined that ESBL positive isolates were distributed at different rates among genotypes, and there was
no statistical relationship between ESBL positivity and genotypes. As a result, in this research, it was
observed that the resistance rate of beta-lactam group antibiotics in E. coli isolates, which can cause
infections in the urogenital system of dogs, is high. Thus, it was concluded that the use of extendedspectrum beta-lactam group antibiotics should be considered for the selection of effective antimicrobial
agents in the treatment of infections.