Edirne yöresine ait işletmelerde yetiştirilen sığırlarda Escherichia coli O157:H7 yaygınlığının real-time PCR ile araştırılması
Investigation of Escherichia coli O157:H7 prevalence in cattle raised in Edirne region by real-time PCR
Yazar: YUNUS EMRE KARATOPAK
Danışman: PROF. DR. FATİH BÜYÜK
Kafkas Üniversitesi / Sağlık Bilimleri Enstitüsü / Mikrobiyoloji (Veterinerlik) Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2024
Konu: Mikrobiyoloji = Microbiology

Özet:
İnsan ve hayvanların bağırsak floralarında yaşayan ve oportunistik özellikte
olan Escherichia coli bazı durumlarda enterik veya septisemik karakterde
enfeksiyonlara neden olarak buzağı ve sığır ölümlerine yol açan en yaygın
etkenlerden biridir. En yaygın bilinen ve patojenik olan serotipi E. coli O157:H7'dir.
Bu serotipin rezervuarı sığırlardır ve etken sığırların bağırsak florasında
yaşayabilmektedir. E. coli O157:H7'yi taşıyan hayvanlar dışkıları ile etkeni saçtıkları
için meyve, sebze, et, süt vb. gıdaları ve suları kontamine edebilmekte ve buna bağlı
olarak sonraki olası bulaşlara aracılık edebilmektedir. Ayrıca hayvanlarla direkt
teması sonucunda etken insanlara bulaşabilmektedir. Hayvanlara bulaşma sonucu E.
coli O157:H7, Hemorajik Kolitis (HC), Hemolitik Üremik Sendrom (HUS) ve
Trombotik Trombositopenik Purpura (TTP) gibi ciddi hastalıklara sebep
olabilmektedir. Bu nedenle, sığırların etken taşıyıcılıklarının araştırılması olası
bulaşların önlenmesi açısından önem arz etmektedir.

Bu çalışmanın amacı; Edirne yöresinde yetiştirilen sığırlarda E. coli
O157:H7'nin yaygınlığının Real-Time PCR ile araştırılmasıdır. Çalışmanın
materyalini, Edirne il merkezi, ilçe ve köylerine ait aile tipi veya özel işletmelerde
yetiştirilen buzağı, düve ve sığırlardan alınan taze dışkı örnekleri oluşturdu. Dışkı
örnekleri 79 farklı yerleşim yerinden 120 adeti buzağı, 80 adeti düve ve 200 adeti
ergin sığır olmak üzere 400 adet taze dışkı örneği alınmış ve alınan dışkı örnekleri ait
140 adet semptomik, 260 adeti asemptomatik hayvandan alındı. Alınan dışkı
örnekleri Tamponlanmış Pepton ile ön zenginleştirmesi (41,5 °C +16 saat)
yapıldıktan sonra E. coli O157:H7 yönünden Real-Time PCR ile analiz edildi.

Toplam 120 adet buzağıya ait taze dışı örneğinin; 70 adetinin semptomik
(ateş, iştahsızlık, ishal) belirti gösteren buzağıya ait olduğu ve 1 adet dışkı örneğinin
pozitif sonuç tespit edildiği, 50 adet asemptomatik buzağıdan alınan taze dışkı
örneğinden ise pozitif sonuç tespit edilmedi.

Toplam 80 adet düveye ait taze dışkı örneğinin; 20 adetinin semptomik, 60
adetinin asemptomatik hayvana ait olduğu ve pozitif sonuç tespit edilmeği görüldü.

Toplam 200 adet ergin sığıra ait taze dışkı örneğinin; 50 tanesinin semptomik
(ateş, iştahsızlık, ishal) belirti gösteren ergin sığıra ait olduğu ve pozitif sonuç tespit
edilmediği ve 150 adet asemptomatik ergin sığırdan alınan taze dışkı örneğinden 1
adet taze dışkı örneğinin pozitif sonuç verdiği görüldü.

Sonuç olarak Edirne yöresindeki işletmelerde yetiştirilen her yaş grubuna ait
sığırlardan alınan 400 adet taze dışkı örneğinden 2 tanesinde Escherichia coli
O157:H7 bulundu ve yaygınlığının %0,5 (2/400) olduğu tespit edildi.

Abstract:
Escherichia coli, which lives in the intestinal flora of humans and animals
and has an opportunistic character, is one of the most common factors that lead to
calves and cattle deaths by causing enteric or septicemic infections in some cases.
The most known serotype is E. coli O157:H7. The reservoir area of this serotype is
cattle and it can survive in the intestinal flora. Animals carrying E. coli O157:H7 can
cause the agent to spread to the environment by contaminating foods and water such
as fruits, vegetables, meat, milk, etc. with their feces. Direct contact with animals can
cause the agent to be transmitted to humans. As a result of contamination, E. coli
O157:H7 serotype can cause serious diseases such as Hemorrhagic Colitis (HC),
Hemolytic Uremic Syndrome (HUS) and Thrombotic Thrombocytopenic Purpura
(TTP).

The purpose of this study; To investigate the prevalence of E. coli O157:H7
using Real-Time PCR in cattle raised in the Edirne region. The material of the study
consisted of fresh fecal samples taken from cattle raised in family type or private
farms in Edirne city center, districts and villages. Fecal samples were taken from 79
different settlements, and fecal samples of a total of 400 clinically healthy and
diarrheal cattle were used for the detection of E coli O157H:7; Buffered Peptone
Water (BWP) pre-enrichment (41.5 °C +16 hours) was performed and the samples
were analyzed by Real-Time PCR. In the study, E. coli O157H:7 was detected in two
(0.5%) of 400 stool samples.

Out of a total of 120 fresh fecal samples of calves, 70 of them belonged to
calves with symptomatic (fever, anorexia, diarrhea) symptoms and 1 fecal sample
was positive and 50 fresh fecal samples from asymptomatic calves were not positive.

Out of a total of 80 fresh fecal samples of heifers, 20 were symptomatic and
60 asymptomatic animals and no positive results were detected.

Out of a total of 200 fresh faecal samples of adult cattle, 50 of them belonged
to adult cattle with symptomatic (fever, loss of appetite, diarrhoea) symptoms and no
positive result was detected and out of 150 fresh faecal samples taken from
asymptomatic adult cattle, 1 fresh faecal sample was positive.

As a result, Escherichia coli O157:H7 was found in 2 of 400 fresh faecal
samples taken from cattle of all age groups raised in Edirne region and its prevalence
was 2/400 (0.5%).