Besiyeri başlangıç glikoz ve glutamin derişimlerinin süspanse O tipi şap virüsü kültürlerine olan etkilerinin incelenmesi
Investigation of the effects of initial medium concentrations of glucose and glutamine on O serotype foot-and-mouth disease virus cultures
Yazar: NİLÜFER ÖZTÜRK
Danışman: YRD. DOÇ. DR. TEMİR ALİ DEMİR
Eskişehir Osmangazi Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Kimya Ana Bilim Dalı / Biyokimya Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2013
Konu: Biyokimya = Biochemistry
Dizin: Glutamin = Glutamine

Özet:
Sunulan tez çalışmasında, başlangıç besiyeri glikoz ve glutamin derişimlerinin şap virüsü kültürleri üzerine olan etkileri araştırılmıştır. Çalışmada, BHK 21 hücreleri ve O tipi Şap virüsü kullanılmıştır.Çalışmanın ilk aşamasında başlangıç glikoz ve glutamin derişimleri sırasıyla 5,00-40,00 mM ve 1,00-12,00 mM aralıklarında ve eşzamanlı olarak değişecek şekilde Design Expert®7.0.0 yazılımı kullanılarak deney tasarımı gerçekleştirilmiştir. Tasarım sonucuna göre farklı başlangıç glikoz ve glutamin derişimlerinde gerçekleştirilen virüs kültürü deneylerinde 146S ve Enfektif titre miktar tayinleri yapılmıştır. Besiyerinde başlangıç yüksek glikoz (30,00-40,00 mM) ve düşük glutamin derişimlerinin (1,00 mM) 146S ve enfektif titre değerlerini arttırdığı görülmüştür. Seçilen iki bağımsız değişken için Design Expert® 7.0.0 programı kullanılarak 146S ve enfektif titre cevap parametreleri olarak seçilmiş ve modellenmiştir. Önerilen modele ait sonuçlar ANOVA testi yapılarak istatistiksel açıdan değerlendirilmiştir. Yazılım tarafından bağımlı değişkenler için önerilen kuadratik model düşük P değerine (<0,0001) sahip olup istatistiksel olarak önemli bulunmuştur. Kurulan modelde bağımsız değişkenlerin bağımlı değişkenler üzerine etkileri incelenmiş ve optimum koşulların belirlenmesi için model optimizasyonu yapılmıştır. Optimizasyonda 146S ve Enfektif titre virüs kültürü verimliliği için maksimize edilmiştir. Yapılan doğrulama deneyleri sonucunda modelin 146S ve ET optimizasyonu için dizayn alanında güvenle kullanılabilir özellikte olduğu görülmüştür.İkinci aşamada tasarım ile sağlanan farklı başlangıç glikoz ve glutamin derişimlerinde gerçekleştirilen virüs kültürü deneylerinde hücre azalması, glikoz ve glutamin tüketim hızları ve laktat oluşum hızları incelenmiştir. Özgül glikoz tüketim ve görünür laktat oluşum hızları sırasıyla 0,346 µmol/106 hücre.sa ve 0,529 µmol/106 hücre.sa olarak bulunmuştur. Tüketilen glikozun ortalama %82,50'sinin laktata dönüştürüldüğü görülmüştür. Görünür glutamin tüketim hızı ise 0,163 µmol/106 hücre.sa olarak belirlenmiştir.Anahtar Kelimeler: Şap virüsü, modelleme, BHK 21, glikoz, glutamin.

Abstract:
In this study, the effects on foot and mouth virus cultures of initial medium concentrations of glucose and glutamine were investigated. It used that O type foot and mouth virus and BHK 21 cell in ial the study.At first step of study, simultaneously change intervals in initial concentrations of glucose and glutamine are selected as 5,00-40,00 mM and 1,00-12,00 mM respectively. The design of experiment sets was carried out using Design-Expert ® 7.0.0 and these runs were accomplished in accord with the design. Acording to results of design. İn experiments of virus culture which performed different concentrations of initial glucose and glutamine were determinated 146S and infectious titer. It seemed that incresaed in 146S and infectious titer values at initial high glucose and low glutamine concentrations in medium. For two independet variables, 146S and infectious titer response parameters were selected and modelled by used Design-Expert ® 7.0.0 software program. ANOVA test of the proposed models were described by thestatistical results. Proposed quadratic models for dependent variables with a low p value (<0.0001) were found statistically significant. The effects of indepented variables on depented variables were investigated and model optimization was done for determinate of optimum concentrations in the created model. 146S and infectious titer were maximized in the optimization for the process efficiency. In the results of verification experiments, it seemed that the model can be used for 146S and infectious titer optimization dizayn area safely.At the second step of study, cell decrase, glucose and glutamine consumption and lactate prodiction rate were investigated in the virus culture experiment that carried out different initial glucose and glutamine concentrations by prowded with design.Spesific glucose consumption and visible lactate rate were founded as 0,346 ?mol/106 cells.h and 0,529 ?mol/106 cells.h respectively production. %82,50 of consumption glucose converted to lactate. Visiable glutamine consumption rate was determinated as 0,163 ?mol/106 cells.hKeywords: FMDV, modeling, BHK 21, glucose, glutamine.