Tükürükteki belirli biyomarkerların tek kullanımlık biyosensör sistemleri ile tayini ve kanser erken teşhisinde kullanımlarının araştırılması
Determination of specific biomarkers with disposable biosensor systems and investigation of useage in cancer early diagnosis
Yazar: ELİF BURCU AYDIN
Danışman: PROF. DR. MUSTAFA KEMAL SEZGİNTÜRK
Tekirdağ Namık Kemal Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Kimya Ana Bilim Dalı
Derece: Doktora, 2018
Konu: Biyokimya = Biochemistry

Özet:
Kanser çağın hastalığı olarak bilinir ve insan sağlığını önemli ölçüde tehdit eder. Biyomarkerların tanımlanması ve tayin edilmesi kanserin erken evresinde önemli bir role sahiptir. Biyomarkerler tükrük, serum, plazma ve dokuda bulunurlar. Bu nedenle, kanser biyomarkerlarının biyolojik sıvılarda ölçülerek kanserin erken saptanması mümkündür. Biyomarker ölçümü genellikle serum örneklerinde yapılır. Bununla birlikte, son araştırmalar, tükürükte kandaki çeşitli protein bileşenlerinin de bulunduğunu göstermiştir. Tükürük, kolay erişilebilir biyolojik sıvı olması nedeniyle dikkat çekmiştir. Tükürük örneklerinin toplanması, depolanması ve transferi kolaydır. Tükürük analizi, farklı kanser türlerinin teşhisi için istenen ve umut verici bir platform sağlar. Sonuç olarak, kanser biyobelirteçlerinin doğru ve hassas tespiti, kanserin tedavisini kolaylaştırır.
Bu tez çalışmasında kanser biyomarkerlarının vücut sıvılarında tespitini sağlamak amacıyla 6 farklı biyosensör üretilmiştir. Her bir biyosensörde farklı elektrot dizaynları kullanılmıştır. İnterleukin 1α, interleukin 1β ve interleukin 8 analizlenmesi hedeflenen kanser biyomarkerlarıdır. 6-fosfonohegzanoik asit (PHA), 3-fosfonopropiyonik asit (PHP), 3-(trietoksisilil)propil isosiyanat) (IPTES), lineer polimer poly(glisilmetakrilat), Super P- poly(glisilmetakrilat) polimer kompozit ara yüzey materyalleri olarak kullanılmıştır. Anti-interleukin 1α, anti-interleukin 1β ve anti-interleukin 8 biyotanıma elementi olarak kullanılmıştır. Elektrot yüzeyinde yapılan modifikasyonlar elektrokimyasal teknikler (elektrokimyasal impedans spektroskopi, dönüşümlü voltammetri) ve morfolojik teknikler (taramalı elektron mikroskobu, atomik kuvvet mikroskobu) ile karakterize edilmiştir. Ayrıca antikorlar ile antijenler arasındaki etkileşimi izlemek için sabit frekans impedans ölçümleri de yapılmıştır. Biyosensörlerin tekrarlanabilirliği, tekrar üretilebilirliği, raf ömrü, tekrar kullanılabilme yeteneği de izlenmiştir. Ek olarak, biyosensörlerin klinik başarısını izlemek için serum ve tükürük örneklerinde biyomarker tayini gerçekleştirilmiştir. Gerek ELISA testi gerekse standart katma metodu biyosensörün başarısını kanıtlamaktadır.

Abstract:
Cancer is known as a disease of epoch and it threats human health significantly. The identification and determination of biomarkers has a significant role in the early stage of cancer. Biomarkers are present in saliva, serum, plasma and tissue. Therefore, the early detection of cancer is possible by measuring cancer biomarkers in biological fluids. The biomarker measurement is usually performed in serum samples. However, recent research has displayed that a variety of protein ingredients in blood are also present in saliva. Saliva, has attracted attention due to being easily accessible biological fluid. The collection, storage and transfer of saliva samples is easy. The analysis of saliva provides a desirable and promising platform for the diagnosis of different types of cancers. Consequently, the accurate and sensitive detection of cancer biomarkers facilitates the treatment of cancer.
In this thesis, six different biosensors have been produced to detect cancer biomarkers in body fluids. Each biosensor is fabricated with different electrode designs. Interleukin-1a, interleukin-1 and interleukin-8 are the cancer biomarkers targeted for analysis. 6-phosphonohexanoic acid (PHA), 3-phosphonopropionic acid (PHP), 3- (triethoxysilyl) propyl isocyanate (IPTES), linear polymer poly (glycylmethacrylate) and Super P-poly (glycylmethacrylate) polymer composite interface materials. Anti-interleukin 1α, anti-interleukin 1β and anti-interleukin 8 were used as biorecognition elements. The modifications performed on the electrode surface are characterized by electrochemical techniques (electrochemical impedance spectroscopy, alternating voltammetry) and morphological techniques (scanning electron microscopy, atomic force microscopy). Single frequency impedance measurements were also performed to monitor the interaction between the antibodies and the antigens. Repeatability, reproducibility, shelf life, reusability of biosensors has also been monitored. In addition, biomarker deteminations were performed in serum and saliva samples to monitor the clinical success of biosensors. Whether the ELISA test is required or the standard addition method proves the success of the biosensor.