Bakteriyofajlara dirençli yanık örneklerinden izole edilen Pseudomonas aeruginosa'da Crisper Cas geninin araştırılması
Investigation of Crisper Cas gene in Pseudomonas aeruginosaisolated from burn samples resistant to bacteriophage
Yazar: IBRAHIM AHMED KADHIM ALSAMAWI
Danışman: DR. ÖĞR. ÜYESİ CİHAN ÇİTİL ; DR. ÖĞR. ÜYESİ ZAINAB RADHI ABDUL-HUSSEIN
Çankırı Karatekin Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Biyoloji Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2024
Konu: Biyoloji = Biology

Özet:
Yanıklar, termal, radyasyonel, kimyasal veya elektriksel temas sonucu deri veya diğer 
dokularda meydana gelen yaralanmalardır. Bu nedenle hasta, antibiyotiklere dirençli 
olduğu bilinen Pseudomonas aeruginosa bakterisi de dâhil olmak üzere birçok 
mikroorganizmaya maruz kalır. Bu çalışmanın amacı, yanık hastalarından Pseudomonas 
aeruginosa'nın izolasyonu, yanıklarından izole edilen bakterilerin bakteriyofaj direnci 
ile bu bakteriler için bazı Crispr-Cas geninin sıklığı arasındaki ilişkinin belirlenmesidir. 
Bu bağlamda, yanık hastalarından yaşları 5 ile 70 arasında değişen 25 erkek, 60 kadın 
ve 25 çocuk olmak üzere toplam 110 örnek alınmıştır. 60 (%54,55) hastada yanıkların 
birincil nedeni sıcak su iken, bunu 28 (%25,4) hastada ocak yanıkları, 15 (%13,64) 
hastada yağ yanıkları ve 5 (%4.55) hastada elektrik yanıkları izlemiştir. Mevcut çalışma 
örneklerinin tamamı MacConkey agar besiyerinde ve Cetrimide Agar'da kültüre 
edilmiştir. Üreyen izolatlar daha sonra çeşitli biyokimyasal testlere tabi tutulmuştur. 28 
izolat Vitek-2 kompakt sistemi ile, geri kalanı ise Crispr-Cas genleri kullanılarak teşhis 
edilmiştir. Pseudomonas aeruginosa enfeksiyonundan en çok kadın hastalar 
etkilenmiştir. Pseudomonas aeruginosa türleri, Kolistin (%75) hariç tüm antibiyotiklere 
%100 dirençli bulunmuştur. Genomik DNA ekstraksiyonu, incelenen tüm örneklerde 
Cas5 varlığını göstermiştir. Bu durum antibiyotik direnci ile ilişkili olabilir

Abstract:
Burns are injuries to the skin or other tissues caused by thermal, radiational, chemical or 
electrical contact. Therefore, the patient is exposed to many microorganisms, including 
the bacterium Pseudomonas aeruginosa, which is known to be resistant to antibiotics. 
The aim of this study was to isolate Pseudomonas aeruginosa from burn patients and to 
determine the relationship between bacteriophage resistance of bacteria isolated from 
burns and the frequency of some Crispr-Cas genes for these bacteria. In this context, a 
total of 110 samples were taken from burn patients, including 25 men, 60 women and 
25 children aged between 5 and 70 years. In 60 (54.55%) patients, the primary cause of 
burns was hot water, followed by hearth burns in 28 (25.4%) patients, oil burns in 15 
(13.64%) patients and electrical burns in 5 (4.55%) patients. All of the present study 
samples were cultured on MacConkey agar medium and Cetrimide Agar. The cultured 
isolates were then subjected to various biochemical tests. 28 isolates were identified 
using Vitek-2 compact system and the rest were identified using Crispr-Cas genes. 
Female patients were mostly affected by Pseudomonas aeruginosa infection. 
Pseudomonas aeruginosa strains were found to be 100% resistant to all antibiotics 
except Colistin (75%). Genomic DNA extraction showed the presence of Cas5 in all 
samples analysed. It is thought that this may be related to antibiotic resistance