SARS-CoV-2 RT-PCR eşik döngüsü değerinin hastalığın prognozu ve komplikasyonlarıyla ilişkisinin değerlendirilmesi
Evaluating the relation of SARS-CoV-2 RT-PCR cycle treshold value with disease prognosis and complications
Yazar: DENİZ GAZİOĞLU KOYUNOĞLU
Danışman: DOÇ. DR. HASAN SELÇUK ÖZGER
Gazi Üniversitesi / Tıp Fakültesi / Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı / İnfeksiyon Hast. Bilim Dalı
Derece: Tıpta Uzmanlık, 2022
Konu: Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji = Infectious Diseases and Clinical Microbiology
Dizin: COVID 19 = COVID 19 ; Komplikasyonlar = Complications ; Mortalite = Mortality ; Polimeraz zincirleme reaksiyonu = Polymerase chain reaction ; Prognoz = Prognosis ; SARS virüsü = SARS virus ; Virüsler = Viruses

Özet:
Çalışmamızda SARS-CoV-2 RT-PZR eşik döngüsü değeri (viral yükü) ile
Covid-19 ilişkili komplikasyon gelişimi ve mortalite arasındaki ilişki
değerlendirilmiştir.
Çalışmamız tek merkezli ve retrospektif yürütülmüştür.25 Eylül 2020-1
Ocak 2021 tarihlerinde yatarak izlenen SARS-CoV-2 PZR pozitif hastalar
çalışmaya dahil edilmiştir. SARS-Co-2 PCR eşik döngüsü değeri viral yükün
indirek göstergesi olarak kullanılmış ve ED < 25 olanlar yüksek, ≥ 25 olanlar
düşük viral yük olarak gruplandırılmıştır. Her iki grup demografik özellikler,
komorbiditeler, klinik bulgular ve klinik sonlanımlar açısından karşılaştırılmıştır.
Hastalar komplikasyon ve mortalite gelişen ve gelişmeyen hastalar olarak
gruplandırılmıştır. Tek ve çok değişkenli analizler ile etki eden risk faktörlerinin
saptanması amacıyla karşılaştırılmıştır. Çok değişkenli analizler için lojistik
regresyon analizi kullanılmıştır. p<0.05 değeri istatistiksel olarak anlamlı kabul
edilmiştir.
Yüksek viral yük grubunda,diğer grupla karşılaştırıldığında yaşın ileri,
yatış FıO2 değerin düşük, takipnenin daha fazla olduğu saptandı. (p<0.05).
Yüksek viral yükün ağır pnömoni [107(75,2%) & 85(60,7%) ,p=0,009] ve uzun
hastane yatış süresi [14(9-23) &11.5(8-19), p=0.08] ile ilişkili olduğu tespit
edildi. Çok değişkenli analiz sonucunda komplikasyon gelişimine etki eden
faktörler sırasıyla yaş (OR:1,05 (1,03-1,08), malignite varlığı (OR: 5,21 (2,14-
12,6),KAH (OR:3,23(1,40-7,43)ve KBY(OR:4.55(1.50-13.7) olarak saptandı.
67
Mortalite gelişimine etki eden bağımsız risk faktörleri ise yaş (OR:1.07 (1.03-
1.10) KAH (OR:2.66 (1.12-6.32), malignite [OR:8.10 (3.34-19.6) olarak
saptandı. Çok değişkenli analiz sonucunda viral yük ile komplikasyon ve
mortalite gelişimi arasında ilişki saptanmadı.
Çalışmamızda SARS-CoV-2 viral yükü ile Covid-19 ilişkili komplikasyon
ve mortalite arasında ilişkisi saptanmamıştır. Komplikasyon ve mortalite
gelişiminin viral yükten ziyade Covid-19 prognozu için daha önceden
tanımlanmış ileri yaş ve komorbiditelerle ilişkili olduğu gösterilmiştir

Abstract:
In our study, the relationship between SARS-CoV-2 RT-PCR cycle
threshold value (viral load) and Covid-19 related complications and mortality
was evaluated.
Our study was single-centered and retrospective. SARS-CoV-2 PCR
positive patients hospitalized between September 25, 2020 and January 1, 2021
were included in the study. The SARS-Co-2 PCR cycle treshold value was used
as an indirect indicator of viral load, and those with ED < 25 were grouped as
high and ≥ 25 as low viral load. Both groups were compared in terms of
demographic characteristics, comorbidities, clinical findings and outcomes.
Patients were grouped as those with or without complications and mortality. They
were compared with univariate and multivariate analyzes to determine the risk
factors. Logistic regression analysis was used for multivariate analyses. A value
of p<0.05 was considered statistically significant.
When compared to the other in the high viral load group, age was
determined to be advanced, hospitalization FiO2 value was lower, and tachypnea
was more common. (p<0.05). High viral load was found to be associated with
severe pneumonia [107(75.2%) & 85(60.7%) ,p=0.009] and long hospital stay
[14(9-23) &11.5(8-19), p=0.08 ] .
As a result of multivariate analysis, factors affecting the development of
complications were found to be age (OR: 1.05 (1.03-1.08),malignancy(OR: 5.21
(2.14-12.6)),CAD(OR:3 .23(1.40-7.43) and CRF(OR:4.55(1.50-13.7)) while
69
factors for mortality were age (OR:1.07 (1.03-1.10), CAD (OR:2.66 (1.12-6.32))
and malignancy [OR:8.10 (3.34-19.6)].As a result of multivariate analysis, no
correlation was found between viral load and the development of complications
and mortality.
In our study, no relationship was found between SARS-CoV-2 viral load
and Covid-19 related complications and mortality. It has been shown that the
development of complications and mortality is associated with previously defined
advanced age and comorbidities for Covid-19 prognosis rather than viral load.