Fındık (Corylus avellana L.) diyet liflerinin kalın bağırsak mikrobiyotası üzerine etkilerinin araştırılması
Investigation of the impacts of hazelnut (Corylus avellana L.)  dietary fibers on the colonic microbiota
Yazar: ELANUR DAŞTAN
Danışman: DOÇ. DR. YUNUS EMRE TUNÇİL ; DOÇ. DR. MÜNİR ANIL
Ordu Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Gıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2022
Konu: Gıda Mühendisliği = Food Engineering
Dizin: Bağırsak-kalın = Intestine-large ; Diyet lifleri = Dietary fibers ; Fındık = Hazelnut ; Prebiyotikler = Prebiotics ; Yağ asitleri = Fatty acids

Özet:
Bu çalışmanın amacı, naturel fındık, kavrulmuş fındık ve fındık zarı diyet liflerinin (DL) bileşimini ve yapısal özelliklerini karakterize etmek ve in vivo koşullarda kolonik mikrobiyota bileşimi ve mikrobiyal metabolitler üzerindeki etkilerini incelemektir. Naturel fındık, kavrulmuş fındık ve fındık zarı suda çözünen ve çözünmeyen DL'leri enzimatik olarak ekstrakte edilmiş ve bileşimsel ve yapısal özellikleri, gaz kromatografisi/kütle spektrometrisi (GC/MS) kullanılarak belirlenmiştir. GC/MS analizi, naturel ve kavrulmuş fındığın çözünmeyen DL'nin selüloz (%40-47), ksiloglukan (%19-23), pektik polisakkaritler (%17-26) ve heteromannanlardan (%8-9) oluştuğunu; fındık zarı DL'nin ise yaklaşık yarısının lignin, geri kalan kısmının ise selüloz (%50), ksiloglukan (%17), pektik polisakkaritler (%23) ve heteromannandan (%3) oluştuğunu göstermektedir. Öte yandan örneklerin suda çözünen DL'nin ise pektik polisakkaritler (%58-68), ksiloglukan (%13-18) ve mannandan (%4.1-8.2) meydana geldiği belirlenmiştir. Daha sonra, C57BL/6J ırkı fareler, 6 hafta boyunca fındık örneklerinden ekstrakte edilmiş DL ile zenginleştirilmiş yemlerle beslenmiş ve kolonik mikrobiyota bileşimlerinde meydana gelen değişimler, besleme sürecinin 0., 3. ve 6. haftasında toplanan dışkı örneklerinin 16S rRNA sekanslama teknolojisi kullanılarak analiz edilmesiyle belirlenmiştir. Ayrıca, GC yardımıyla, kalın bağırsakta oluşan mikrobiyal kısa- zincirli yağ asitleri (KZYA) haftalık olarak dışkı örnekleri üzerinde ölçülmüştür. KZYA sonuçları, fındık DL'nin dişi farelerde bütirojenik, erkek muadillerinde ise asetojenik etki gösterdiğini ortaya koymaktadır. Kolonik mikrobiyotanın taksonomik karşılaştırmaları, fındık (özellikle naturel fındık) DL'nin probiyotik olarak bilinen ve probiyotik potansiyeli olan Lactobacillus ile ilişkili OTU'ların nispi bolluklarını, diğer gruplara kıyasla, daha fazla arttırdığını göstermiştir. LEfSe analizi, dişi fareler ele alındığında, Lachnospiraceae, Prevotella, Ruminococcaceae ve Lactobacillus'un; erkek fareler ele alındığında ise Bacteroides, Lactobacillus, Prevotella ve Lactococcus'un sırasıyla naturel fındık, kavrulmuş fındık, fındık zarı ve kontrol (selüloz) grubu için biyobelirteç olduklarını ortaya koymuştur. Bu sonuçlar, naturel ve kavrulmuş fındık ile fındık zarı DL'nin kolonik mikrobiyota bileşimi ve mikrobiyal metabolitler üzerine etkilerinin cinsiyete özgü olduğunu ortaya koymaktadır. İlaveten, bu sonuçlar kavurma işleminin fındık DL'nin fonksiyonel özelliklerinde kısmi değişime sebep olduğunu, ancak genel olarak, fındık DL'nin faydalı mikroorganizmaların ve mikrobiyal metabolitlerin bolluğunun artmasını sağlayarak, kolonik mikrobiyomu düzenlediğini açıkça göstermektedir. Son olarak, bu sonuçlar, fındık zarı DL'nin, kolonda faydalı bakterileri teşvik etme kabiliyetinde olduğunu ve dolayısıyla, fındık endüstrisi yan ürünü olan fındık zarının, prebiyotik (veya benzeri) özellikte sindirilemeyen karbonhidratların üretimi için hammadde olarak kullanılma potansiyeli olduğunu göstermektedir.

Abstract:
In this study, we aimed to characterize the compositional and structural features of dietary fibers (DF) of natural hazelnut, roasted hazelnut, and hazelnut skin and further aimed to investigate their impacts on colonic microbiota composition and function in vivo. Insoluble and soluble DF of natural hazelnut, roasted hazelnut, and hazelnut skin were extracted using an enzymatic extraction technique and their compositional and structural features were identified using gas chromatography coupled with mass spectrometry (GC/MS). GC/MS analysis revealed that natural and roasted hazelnut insoluble DF compose of cellulose (%40-47), xyloglucan (%19-23), pectic polysaccharides (%17-26) and heteromannans (%8-9), whereas that of hazelnut skin compose of lignin, cellulose, xyloglucan, pectic polysaccharides and heteromannans. On the other hand, soluble DF of the samples were made up of pectic polysaccharides (%58-68), xyloglucan (%13-18), and mannan (%4.1-8.2). Next, C57BL/6J mice were fed with chow diet containing the extracted DF for 6 weeks, and changes that occurred in their colonic microbiota composition were investigated using 16S rRNA sequencing technique on feces collected after 0, 3 and 6 weeks of feeding period. Further, microbial metabolites as means of short-chain fatty acids (SCFA) were measured on feces weekly using GC. SCFA analysis demonstrated that hazelnut DF show a butyrogenic effect in female mice models, whereas acetogenic effect was observed in male counterparts. Taxonomic comparisons of colonic microbiota revealed that hazelnut (especially natural hazelnut) DF supplementation increase the relative abundances of Lactobacillus related OTUs that are known to be probiotics or have probiotic potentials. LEfSe (linear discriminant analysis effect size) analysis revealed that, for female mice, Lachnospiraceae, Prevotella, Ruminococcaceae and Lactobacillus are discriminators for natural hazelnut, roasted hazelnut, hazelnut skin and control groups, respectively; whereas for male mice, Bacteroides, Lactobacillus, Prevotella and Lactococcus are discriminators for natural hazelnut, roasted hazelnut, hazelnut skin and control groups, respectively. Our results revealed that DF of natural hazelnut, roasted hazelnut, and hazelnut skin differentially impact the colonic microbiota composition and microbial metabolites in a gender-specific way. Additionally, these results clearly indicate that, although roasting process slightly impacts the functionalities (in terms of colonic microbiome) of hazelnut DFs, hazelnut DFs generally modulate colonic microbiota by favoring beneficial microbes and stimulating beneficial microbial metabolites. Further, this data suggest that, due to its ability to promote beneficial microbes in the colon, hazelnut skin, a byproduct of the hazelnut industry, has the potential to be used for the production of indigestible carbohydrates possessing prebiotic function.