Sağlıklı bireylerde Pneumocystis jirovecii kolonizasyonun araştırılması
Investigation of Pneumocystis jirovecii colonization in healthy idividuals
Yazar: IMAN QORAAN
Danışman: DOÇ. DR. YASEMİN ÖZ
Eskişehir Osmangazi Üniversitesi / Sağlık Bilimleri Enstitüsü / Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
Derece: Doktora, 2015
Konu: Mikrobiyoloji = Microbiology
Dizin: Pnömosistis jirovecii = Pneumocystis jirovecii ; Polimeraz zincirleme reaksiyonu = Polymerase chain reaction ; Sağlık personeli = Health personnel ; Sağlıklı insanlar = Healthy people ; İmmünite = Immunity ; İnsan = Human

Özet:
Pneumocystis jirovecii immundüşkün hastalarda interstisyel pneumoni (PCP) etkeni olan atipik bir mantardır. Bununla birlikte, hastalarda ve sağlıklı bireylerde asemptomatik alt solunum yolu kolonizasyonu da yapabilmektedir. Kolonize bireyler P.jirovecii için hem rezervuar hem de duyarlı hastalara bulaşta enfeksiyon kaynağı rolü oynayabilmektedir. Pneumocystis enfeksiyonlarının tanısında altın standart yöntem, geleneksel boyalarla veya işaretli özgül antikorların yer aldığı direkt floresan antikor (DFA) testleri ile Pneumocystis kist ve/veya trofozoitlerinin hasta örneklerinde gösterilmesidir. Ancak, özellikle düşük parazit yükünün söz konusu olduğu kolonize bireylerde moleküler yöntemlerin daha uygun olduğu bildirilmektedir. 
Çalışmamızda, PCP açısından sağlık çalışan ve sağlık çalışan olmayan bireylerde P.jirovecii kolonizasyonu sıklığının belirlenmesi hedeflenmiştir. Bu amaçla, Sağlk çalışanları, sağlık çalışan olmayan gönüller ve immünüşkün gönüllülerden oluşan 250 gönüllüden ağız çalkantı suyu ve nazal sürüntü örnekleri toplanmış ve real-time PCR yöntemi ile P.jirovecii MSG geni araştırılmıştır. Ayrıca, PCR ile P.jirovecii pozitif saptanan örnekler DFA testi ile değerlendirilmiştir.
P.jirovecii kolonizasyon oranı tüm çalışma grubunda %22.8 bulunmuş olup, sağlık çalışanları, sağlık çalışan olmayan erişkinleri ve immündüşkün hastalarda ayrı olarak değerlendirildiğinde sırasıyla %22, %21 ve %28 oranları elde edilmiştir. P. jirovecii kolonizasyonu üzerine etkili olabilecek faktörlerin analizinde; cinsiyet, geçirilmiş solunum yolu enfeksiyonu, kronik hastalık varlığı, sigara ve alkol kullanımı, antibiyotik ve kemoterapi ilac kullanımı, sağlık çalışanın çalışma süresi ile P. jirovecii kolonizasyonu arasında istatistiksel olarak anlamlı bir ilişki saptanmadı. Hematoloji hastalarında hastalık süresi ile kolonizasyon arasında istatistiksel olarak anlamlı bir ilişki bulunmuştur (P<0.05). Öte yandan, P.jirovecii kolonizasyonu pozitif örneklerin DFA testi ile de değerlendirilmesi sonucunda, P.jirovecii kolonizasyonunun saptanmasında real-time PCR testinin daha duyarlı olabileceği sonucuna varılmıştır.
Bu çalışma, sınırlı bir bölgeyi kapsamakla birlikte, ülkemizde P. jirovecii kolonizasyonunun varlığını ve yaygınlığını ortaya çıkarmıştır. Bilgilerimize göre çalışmamız, Pneumocystis jirovecii enfeksiyonu olmayan bireylerde kolonizasyon prevalansını belirlemeye yönelik ülkemizde yapılan ilk calışmadır. Ancak, ülkemizdeki genel durumun yansıtılabilmesi için, farklı bölgelerden, daha fazla sayıda katılımcının dahil edileceği, kapsamlı çalışmalara ihtiyaç bulunmaktadır.

Abstract:
Pneumocystis jirovecii, is an atypical fungus that can cause interstitial pneumonia in most immunosuppressed patients. However, it could colonize the lower respiratory sistem of patients as well as healthy population. P.jirovecii colonized individuals could act as a major reservoir and would serve as a source of infection for susceptible subjects.
The gold standard method for detection of P.jirovecii is staining trophozoites and cysts by conventional and immunoflorescence stains, though it can be diagnosed by different PCR methods. In colonized subjects, the load of organisms is usually low making it may be more appropriate for detection of Pnuemocystis colonization using PCR methods.
The object of our study is to determine the of prevalence Pneumocystis jirovecii colonization in three different Pneumocytis jirovecii not infected population groups: Health care workers, general population and immunosuppressed volunteers using oropharyngeal and nasal swabs. All specimens were analysed by real time-PCR targetting P.jirovecii MSG gen. Positive samples were re-assessed using direct immunoflourescence method as the standard diagnostic method of P.jirovecii.
Our results showed that a total of % 22 of the hospital workers, % 21 of general population and %28 of immunosuppressed volunteers are colonized with P.jirovecii. Analysis of colonization risk factors; gender, upper respiratory infection, chronic lung infection, smoking, alcohol, working duration in hospital, using antibiotics or chemotherapeutic drugs revealed that there is no statistical difference between these factors and P.jirovecii colonization; however, there is  statistical difference between colonized and non colonized groups in terms of  disease duration (p<0.05).  Moreover, comparing positive results given by real time-PCR with direct immunoflourescence test we found that real time-PCR method is more sensitive in detecting P.jirovecii low levels present ın colonized patients. 
In conclusion; our results of P.jirovecii colonization among health workers and general population in our country  are comparable to other published data in other  populations. This is also the first time to assess P.jirovecii colonization prevalence among PCP not infected immunosuppressed volunteers, health care workers and general population; however, there is a need to study broader groups in Turkey in order to generalize these results.