Mesane kanseri olgularında fibroblast büyüme faktörü reseptör 3 (fgfr3) a248c, s249c, g372c, t375c mutasyonlarının varlığı
Fibroblast growth factor receptor 3 (fgfr3) a248c, s249c, g372c, t375c mutations incidence in bladder cancer
Yazar: YAVUZ DODURGA
Danışman: DOÇ.DR. N. LALE ŞATIROĞLU-TUFAN
Pamukkale Üniversitesi / Sağlık Bilimleri Enstitüsü / Tıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2006
Konu: Tıbbi Biyoloji = Medical Biology
Dizin: Mutasyon = Mutation ; Polimeraz zincirleme reaksiyonu = Polymerase chain reaction ; Restriksiyon fragman uzunluğu polimorfizmi = Restriction fragment length polymorphisms

Özet:
transisyonel hücre karsinomdur. Fibroblast büyüme faktörü reseptörleri (FGFR) yapısalolarak reseptör tirozin kinaz ailesindendir ve hücre farklılaşmasında, proliferasyonunda,sinyal yollarının düzenlenmesinde ve embriyonik gelişmede önemli roller oynamaktadır.FGFR3 geni kromozom 4p16.3 bölgesine lokalizedir ve çeşitli yanlış anlamlı mutasyonlarsonucunda otozomal kalıtımlı çeşitli iskelet sistemi hastalıkları ortaya çıkmaktadır ve ayrıcaonkogenik etkisi olduğu da düşünülmektedir. Bu yüksek lisans tezinde, FGFR3 tanatoforikdisplazi mutasyonları olarak gruplandırılan ekzon 7 A248C, S249C ve ekzon 10 G372C,T375C kodonlardaki olası yanlış anlamlı mutasyonların mesane kanseri hastapopülasyonundaki varlığı ve klinikopatolojik parametreler üzerindeki etkisi araştırılmıştır.Denizli Devlet Hastanesi Patoloji bölümüne tanı alma amacıyla başvuran 56 olguya aitmesane transizyonel hücre karsinomu doku örneği çalışma kapsamına alınmıştır. Parafinkesitlerden DNA izolasyonunun sonrasında, FGFR3 geni ekzon 7 A248C, S249C ve ekzon 10G372C ve T375C kodonlarını içeren DNA parçaları polimeraz zincir reaksiyonu ile çoğaltılıp,A248C ve S249C kodonlarındaki mutasyonlar Restriksiyon Parça Uzunluk Polimorfizmiyöntemi ile ve ekzon 10 G372C ve T375C kodonlarındaki mutasyonlar DNA dizi analizi ilearaştırılmıştır.Bu çalışma kapsamına alınan 56 adet mesane transizyonel hücre karsinomunun 14tanesi (%25) pTa, 23 tanesi (%41,1) pT1, 19 tanesi (%33,9) pT2 olarak evrelendirilmiştir.Ayrıca 56 olgunun 5 tanesi (% 8.9) G1, 25 tanesi (% 44.6) G2, 26 tanesi (% 46.4) G3 olarakderecelendirilmiştir.FGFR3 genindeki tanatoforik displazi mutasyonları olarak gruplandırılan ekzon 7A248C, S249C ve ekzon 10 G372C, T375C kodonlardaki tespit edilen toplam mutasyonvarlığı 56 olgunun 23 tanesi (%41.1) normal, 33 tanesi (%58.9) heterozigot mutant olarakdeğerlendirilmiştir. 56 olgunun 7'sinde (%12.5) A248C ve 28'inde (%50) S249C, 3'ünde(%5.4) T375C kodonlarında yanlış anlamlı mutasyon saptanmış olup bu oran literatürdekidiğer çalışmaları desteklemektedir.FGFR3 genindeki ekzon 7 A248C, S249C ve ekzon 10 G372C ve T375C mutasyonsonuçları tek tek ve toplu olarak değerlendirildiğinde, daha önce yapılmış çalışmalardan farklıolarak tümör evresine ve derecesine göre homojen dağılımlı olduğu saptanmıştır. Ancak dahafazla sayıda erken evre ve düşük derece tümör örneğinin araştırma kapsamındadeğerlendirilmesi gerektiği düşünülmektedir.

Abstract:
Bladder cancer is the most frequent cancer derived from urinary system and %90 ofthem is transitional cell carcinomas. Fibroblast growth factor receptors (FGFR) belong to thetyrosine kinase family and have important roles in cellular differentiation, proliferation, cellsignaling and embryonic development. FGFR3 is localized chromosome 4p16.3. Missensemutations of fibroblast growth factor receptor 3 (FGFR3) are associated with autosomaldominant human skeletal disorders and some oncogenic effects. In this thesis study, weinvestigated the incidence of FGFR3 thanatophoric dysplasia mutations located at exon 7A248C, S249C and exon 10 G372C, T375C in a bladder carcinoma patient population and itscorrelation to clinicopathological parameters.Fifty six paraffin embedded specimens of transitional cell carcinoma of the urinarybladder were obtained from Denizli State Hospital Pathology department and included in thisstudy. After the DNA isolation from the paraffin sections, PCR amplification of DNAsegments incuding exon 7 A248C, S249C and exon 10 G372C, T375C was performed forRestriction Fragment Length Polymorphism (RFLP) and DNA sequencing analysis.Among the 56 transitional cell carcinomas, 14 of them (%25) were classified as pTa,23 of them (%41,1) were classified as pT1 and 19 of them (%33,9) were classified as pT2. Inaddition, 5 of them (% 8.9) were graded as G1, 25 of them (% 44.6) were graded as G2, 26 ofthem (% 46.4) were graded as G3.FGFR3 thanatophoric dysplasia mutations located at exon 7 A248C, S249C and exon10 G372C, T375C were detected in 33 of the patients (%58.9) (heterozygous mutant) and 23of the patients (%41.1) were found to be normal. Among the 56 transitional cell carcinomas,missense point mutations were detected in 7 of them (%12.5) at codon A248C, 28 of them(%50) at codon S249C, and 2 of them (%5.4) at codon T375C and these results are inagreement with the previous research reports in the literature.When the results of the FGFR3 thanatophoric dysplasia mutations located at exon 7A248C, S249C and exon 10 G372C, T375C were analyzed one by one or as a group, despitethe findings of previous research reports, it has been suggested that these mutations aredetected homogenously regardless of the tumor classification and tumor grade in our study.Hence, it is our intention to include more early stage and low grade tumor samples in thisresearch project.