Klinik örneklerden izole edilen Klebsiella pneumoniae  
suşlarında plazmid aracılı kinolon direnç geni QNR'nin araştırılması
Detection of the plazmid-mediated quinolone resistance determinant gene QNR among clinical isolates of Klebsiella pneumoniae
Yazar: YAĞMUR EKENOĞLU
Danışman: PROF. DR. AKGÜN YAMAN
Çukurova Üniversitesi / Sağlık Bilimleri Enstitüsü / Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2013
Konu: Mikrobiyoloji = Microbiology
Dizin: Genler = Genes ; Kinolonlar = Quinolones ; Klebsiella pneumoniae = Klebsiella pneumoniae ; Levofloksasin = Levofloxacin ; İlaçlara direnç = Drug resistance ; İlaçlara direnç-mikrobiyal = Drug resistance-microbial

Özet:
K. pneumoniae bakterilere toplum ve hastane kökenli birçok enfeksiyonun etkeni olarak bilinmektedir. Özellikle son yıllarda ESBL üreten suşların artmasıyla K. pneumoniae?ya bağlı enfeksiyonların tedavisini güçleştirmiştir.
	1962 yılından beri kullanımda olan kinolonlar hem Gram pozitif hem de Gram negatif bakterilere etkili ajanlardır. Kinolonlar, DNA giraz ve topoizomeraz IV enziminin inhibisyonu sonucu bakterisidal etki gösterir. Bakterilerdeki kinolon direnci, genellikle kromozomal genlerde meydana gelen mutasyonlar sonucunda ortaya çıkmaktadır. Ancak son yıllarda bu direnç mekanizmalarına ek olarak ortaya çıkan bir mekanizma da plazmid aracılı kinolon direncidir. Bu direnç genleri qnr olarak adlandırılmıştır. Son yıllarda artan plazmid aracılı kinolon direnç genleri enfeksiyonların tedavisinde güçlükler oluşturmaktadır. Qnr genleri tek başlarına kinolon direncine neden olmasa da kinolon duyarlılığında azalmaya ve minimum inhibitör konsantrasyonu değerlerinde artmaya neden olmaktadır.
	Çalışmamızda çeşitli klinik örneklerden izole edilen 90 ESBL pozitif ve levofloksasin dirençli K. pneumoniae suşunda qnrA, qnrB ve qnrS genlerinin varlığının araştırılması amaçlanmıştır. Çalışmaya dahil edilen suşlarda qnr genleri Real-time PCR yöntemiyle araştırılmıştır. Çalışma sonunda 30 (%33,3) izolatta qnrB geni, 5 (%5,6) izolatta ise qnrS geni pozitif olarak bulunmuştur. Hiçbir suşta qnrA genine saptanmamıştır. 
Plazmid aracılığıyla aktarılabilen qnr genlerinin prevalansının yıllar geçtikçe artması klinik açısından önemli sonuçlar doğurabilecektir. Bu nedenle aktarılabilen kinolon direncinin izlenmesi ve yayılım oranlarının saptanması, alınacak önlemlerin belirlenmesi için önemlidir.

Abstract:
A bacterium is known as a cause of lot of inflection in the community and is a mistake originated.  Especially, in recent years with increasing ESBL producing strains, the treatment of the infections are made in difficult which are depending on K. pneumoniae.
Quinolones have been in use since 1962, these are effective agents in both Gram-positive and Gram-negative bacteria.  The result of DNA gyrase and topoisomerase IV enzyme inhibition, quinolones show bactericidal effect.  Resistance quinolones in bacteria is usually the result of chromosomal genes mutations. However, in recent years, in addition to these mechanisms of resistance, there is another mechanism which is emerging, is called plasmid-mediated quinolone.   These resistance genes are referred to as qnr.  In recent years, increasing of plasmid-mediated quinolone resistance genes is constituted difficulties in the treatment of infections.  The genes of qnr does though not cause alone to quinolone resistance, it causes to decrease in sensitivity of the quinolone and to increase in the minimum inhibitory concentration values.
In our study, 90 ESBL positive and levofloxacin resistant were isolated from various clinical specimen, in the strain of K. pneumonia, aim to investigate the presence of genes which are qnrA, qnrB ve qnrS.  The genes of qnr was investigated by real-time PCR method in strains which are included in the study. In the end of the study, 30 (33.3%) isolates qnrB gene, 5 (5.6%) isolates were positive for the gene qnrS. There was not qnrA gene in any strains.  
Plasmid can be transferred through qnr genes? increase in prevalence could prove importance in the terms of clinically.   Therefore, the transmittable quinolone resistance should be monitor and determine the rates of disturubition, are important to identify the measures which should be taken.