Enfekte kök kanallarında treponema denticola, porphyromonas gingivalis ve bu bakterilere ait virulans faktörlerinin moleküler mikrobiyolojik teknikler ile incelenmesi
Identification of treponema denticola, porphyromonas gingivalis and their virulence factors in infected root canals by molecular microbiologic techniques
Yazar: ÖZGÜR İLKE ATASOY ULUSOY
Danışman: PROF.DR. GÜLİZ GÖRGÜL
Gazi Üniversitesi / Sağlık Bilimleri Enstitüsü / Diş Hastalıkları ve Tedavisi Ana Bilim Dalı
Derece: Doktora, 2007
Konu: Diş Hekimliği = Dentistry

Özet:
Bu çalışmanın amacı, enfekte kök kanallarında Treponema denticola,Porphyromonas gingivalis ve bu patojenlerin msp ve prtC genlerinin varlığı veprevalanslarının Real-time PCR ile belirlenmesidir. Bu iki endodontopatojen vevirulans genleri ile klinik semptomlar arasındaki ilişki de çalışmamızdadeğerlendirilmiştir.60 hastadan elde edilen enfekte pulpalar, akut apikal periodontitis, kronikapikal periodontitis ve akut apikal abse olmak üzere üç gruba ayrıldı. DNAekstraksiyonunun ardından örnekler, T.denticola ve P.gingivalis için özgülprimer ve problar kullanılarak Real-time PCR ile incelendi. P.gingivalisDNA'sının pozitif saptandığı örneklerde, kollajenaz geninin belirlenmesiamacıyla prtC'ye özgül bakteriyel primerler ve TaqMan problar kullanılarakReal-time PCR gerçekleştirildi. T.denticola'nın pozitif saptandığı örneklerde,msp geninin belirlenmesi amacıyla konvansiyonel PCR uygulandı.T.denticola, incelenen tüm örneklerin % 44.1'inde, akut apikalperiodontitis grubundaki 26 vakanın 12'inde, akut apikal abse grubundaki 7vakanın birinde, kronik apikal periodontitis grubundaki 27 vakanın 12'indesaptandı. P.gingivalis, incelenen tüm örneklerin %16.7'inde, akut apikalperiodontitis grubundaki 26 vakanın 3'ünde, akut apikal abse grubundaki 7vakanın ikisinde, kronik apikal periodontitis grubundaki 27 vakanın 5'indesaptandı. msp DNA'sı T.denticola'nın pozitif saptandığı 26 adet örneğin 7'inde,prtC DNA'sı P.gingivalis'in pozitif saptandığı 10 örneğin 9'unda saptandı.Bakteriler ve virülans genleri ile üç klinik patolojik durum arasındaki ilişkiistatistiksel olarak anlamlı bulunmadı. (p>0.05)Anahtar sözcükler: Kollajenaz, ana yüzey proteini, Porphyromonas gingivalis,Real-time PCR, Treponema denticola

Abstract:
The aim of this study was to assess the presence and prevalence of T.denticola, P. gingivalis and their msp and prtC genes in the infected rootcanals by Real-time PCR. The relationship between the presence of these twoendodontopathogens, their virulence genes and the clinical symptomatologywas also evaluated.The infected pulps of 60 patients were divided into three clinical groups:acute apical periodontitis, chronic apical periodontitis, acute apical abscess.DNA was extracted from samples which were further analysed using theprimers and probes that are specific for T. denticola and P.gingivalis. In thesamples that yielded positive P.gingivalis DNA amplicon, in order to detect thecollagenase gene Real-time PCR were performed using prtC specific bacterialprimers and Taq Man probes. Conventional PCR method was employed toidentify msp in the samples that were positive for T.denticola.T.denticola was found in 44.1% of the total samples, in 12 of 26 caseswith acute apical periodontitis, one of seven cases with acute apical abscess,and 12 of 27 cases with chronic apical periodontitis. P.gingivalis was observedin 16.7% of the total, three of 26 cases with acute apical periodontitis, two ofseven cases with acute apical abscess, and five of 27 cases with chronic apicalperiodontitis. msp DNA was detected in seven of 26 T.denticola positivesamples, and prtC DNA was detected in nine of ten P.gingivalis positivesamples. The association between the presence of the bacteria, the virulencegenes and three clinical pathologies was not statistically significant (p>0.05).Key words: Collagenase, major surface protein, Porphyromonas gingivalis,Real-time PCR, Treponema denticola