Farklı astım ağırlık derecelerinde sirküler RNA'lerin rollerinin incelenmesi
Investigation of the roles of circular RNAs in different severity levels of asthma
Yazar: ÖZLEM GÖKSEL
Danışman: PROF. DR. CUMHUR GÜNDÜZ
Ege Üniversitesi / Sağlık Bilimleri Enstitüsü / Tıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı / Tıbbi Biyoloji Bilim Dalı
Derece: Doktora, 2024
Konu: Genetik = Genetics ; Tıbbi Biyoloji = Medical Biology

Özet:
Giriş ve amaç: Sirküler RNA'lar (circRNA)astım patogenizinde ortaya konan önemli rolleri ile dikkat çeken, kodlanmayan RNA grubuna dahil astım patogenezindeki önemleri son yıllarda çok ilgi çekmeye başlamış güncel moleküllerdir. Bu çalışmanın primer amacı; güncel literatür taramaları sonucunda astımda anlamlı değişim gösterdiği en sık tespit edilen başlıca circRNA'lar (circ0000981, circ0002594, circ0005519, circERBB2, circHIPK3 ve circZNF652) ve astımın farklı ağırlık derecelerinde bu RNA'ların rollerinin analiz edilmesi ve astım, özellikle ağır astım
immunopatogenizine katkı sağlamaktır.
Yöntem: Gözlemsel, analitik, prospektif, olgu-kontrol araştırmasında; 1 yıl içerisinde
90 astımlı hasta, 30 sağlıklı olmak üzere toplam 120 gönüllü çalışmaya dahil edilmiştir.
Detaylı veri girişi tamamlandıktan sonra periferik kan örneklerinde circRNA'lar
çalışılmıştır.
Bulgular: Klinik bulgular ile karşılaştırmalı olarak analiz edilen toplam 6 circRNA arasından astım ve sağlıklı kontrolleri biribirinden anlamlı olarak ayırabilen başlıca 3 circRNA saptanmıştır (2 upregüle, 1 downregüle). Bu RNA'lar aynı zamanda hafif/orta ve ağır astımlı gruplarda farklı şekilde ifade edilmekte ve hastalık ağırlık derecelerini doğru olarak ayırabilmektedirler. Özellikle Circ_000081 çok yüksek düzeyde anlamlı farklı eksprese olarak hem ağır hem de hafif/orta astıma özel bir profil sergilemektedir (p<0,001). Onu takiben circ_0002594 ve ardından circHIPK3 ağır astım için daha spesifik olarak upregüle olmaktadır (sırası ile p<0,0094 ve p<0,0157).
Sonuç: Circ_000081, circ_0002594 ve circHIPK3 astım immunopatogenezinde rol oynayan özel biyomarkerlar olarak gözlenmiştir. Bu circRNA'ların özellikle Circ_000081'in ağır astım immunopatogenezinde spesifik bir biyomarker olarak daha ileri olarak çalışılması hastalık yönetiminde potansiyel katkıya sahip olabilecekleri görünmektedir.

Abstract:
Introduction and Aim: Circular RNAs (circRNAs) are non-coding RNA molecules that have recently garnered significant attention due to their critical roles in the pathogenesis of asthma. The primary aim of this study is to analyze the roles of the most frequently identified circRNAs that show significant changes in asthma, based on recent literature reviews (circ0000981, circ0002594, circ0005519, circERBB2, circHIPK3, and circZNF652), and to contribute to the understanding of asthma
immunopathogenesis by examining their roles in different severity levels of asthma.
Methods: In this observational, analytical, prospective, case-control study, a total of 120 volunteers were included over one year, consisting of 90 asthma patients and 30 healthy controls. After completing detailed data entry, circRNAs were analyzed in peripheral blood samples.
Results: Among the six circRNAs analyzed in comparison with clinical findings, three
circRNAs were identified as significantly distinguishing between asthma patients and
healthy controls (two upregulated, one downregulated). These circRNAs also displayed differential expression across mild, moderate, and severe asthma groups, accurately differentiating disease severity. Specifically, Circ_000081 exhibited highly significant differential expression, showing a specific profile for both severe and mild/moderate asthma (p<0.001). Following this, circ_0002594 and circHIPK3 were more specifically upregulated in severe asthma (p<0.0094 and p<0.0157,
respectively).
Conclusion: Circ_000081, circ_0002594, and circHIPK3 have been observed as specific biomarkers playing roles in the immunopathogenesis of asthma. Particularly, Circ_000081 appears to have potential as a specific biomarker for severe asthma immunopathogenesis, warranting further study to assess its contribution to disease management.