Üveiti olan Behçet hastalarında oksidatif stresle ilişkisi bilinen OXR1, OSGIN2 ve SOD2 genlerinin ekspresyon düzeylerinin araştırılması
Investigation of the expression levels of OXR1, OSGIN2 and SOD2 genes known to be associated with oxidative stress in Behçet's disease patients with uveitis
Yazar: MEHMET ERCAN
Danışman: PROF. DR. MUNİS DÜNDAR
Erciyes Üniversitesi / Sağlık Bilimleri Enstitüsü / Tıbbi Genetik Ana Bilim Dalı / Tıbbi Genetik Bilim Dalı
Derece: Doktora, 2024
Konu: Genetik = Genetics

Özet:
ÜVEİTİ OLAN BEHÇET HASTALARINDA OKSİDATİF STRESLE İLİŞKİSİ BİLİNEN OXR1, OSGIN2 VE SOD2 GENLERİNİN EKSPRESYON DÜZEYLERİNİN ARAŞTIRILMASI. 
Mehmet ERCAN 
Erciyes Üniversitesi, Sağlık Bilimleri Enstitüsü
Tıbbi Genetik Anabilim Dalı
Doktora Tezi, 2024
Danışman: Prof. Dr. Munis DÜNDAR

ÖZET
Behçet Hastalığı'nın genetik temelinin özellikle oksidatif stresle ilgili genler olan oksidasyon direnci 1 (OXR1), süperoksit dismutaz 2 (SOD2) ve OSGIN2'nin miRNA'lar (HSA-LET-7B-3p, HSA-MIR-4482-3p ve HSA-MIR-4666-3p) tarafından ifade ve korelasyonunu uveit hastalarında araştırmaktır.
Materyal ve Metot: Bu prospektif çalışma üveiti olan 40 Behçet hastası; yaş ve cinsiyete göre eşleştirilmiş 40 sağlıklı kontrol grubunu içerdi. RNA ekstraksiyonu ve cDNA sentezi sonrası, kan örnekleri RT-PCR analizine tabi tutuldu. İstatistiksel analiz, p<0.05 anlamlılık düzeyi belirlenerek, veri dağılımı, uç noktaların tespiti ve korelasyonlar için testler içerecek şekilde GraphPad Prism 9 kullanılarak gerçekleştirildi. Çalışmada miRDB ve TargetScan veri tabanlarını kullanarak miRNA hedef tahminlerine bakılarak miRNA'lar seçildi.
HSA-LET-7B-3p ve HSA-MIR-4666-3p ifadelerinde azalmalar, OXR1, SOD2 ve OSGIN2 ifadelerinde ise artışlar saptandı. 
Öte yandan, HSA-MIR-4482-3p ifadesinde önemli bir artış saptanmıştır; diğer genlerin ve miRNA'ların ifade seviyeleri ile korelasyon göstermediği belirlendi.
Bu genler ve miRNA'ların ifadesindeki önemli değişiklikler, Behçet Hastalığı 'nın patofizyolojisinde oksidatif stresin kritik bir rol oynadığını göstermektedir. Çalışma ayrıca HSA-MIR-4666-3p ve HSA-LET-7B-3p'nin terapötik hedefler ve biyobelirteçler olarak potansiyelini ortaya koymakta, Behçet Hastalığı'nın yönetimi ve tedavisi için yeni yaklaşımlar sunmaktadır. miRNA ve mRNA ifadeleri arasındaki korelasyon çalışmaları, düzenleyici ve etkileşim bağlantılarını ortaya koymakta, bu benzersiz bozukluğun patogenezinde karmaşık genetik yolları önermektedir. HSA-MIR-4482-3p'nin yüksek ifadesi ve korelasyon eksikliği, onu Behçet Hastalığı'nda bir faktör olarak dışlamaktadır.

Anahtar Sözcükler: Behcet hastalığı; Oksidatif stres; OXR1; OSGIN2; SOD2.

Abstract:
INVESTIGATION OF THE EXPRESSION LEVELS OF OXR1, OSGIN2, AND SOD2 GENES KNOWN TO BE ASSOCIATED WITH OXIDATIVE STRESS IN BEHÇET'S PATIENTS WITH UVEITIS 

Mehmet ERCAN
Erciyes University, Institute of Health Sciences
Department of Medical Genetics
PhD Thesis, 2024
Advisor: Prof. Dr. Munis DÜNDAR
ABSTRACT
To investigate the genetic basis of Behçet Disease with particular attention to the expression and correlation of the oxidative stress-related genes oxidation resistance 1 (OXR1), superoxide dismutase 2 (SOD2), and OSGIN2 by miRNAs (HSA-LET-7B-3p, HSA-MIR-4482-3p, and HSA-MIR-4666-3p) in uveitis patients.
Materials and Methods: This prospective study included 40 patients with Behçet Disease who had uveitis and 40 healthy age- and sex-matched control subjects. After RNA extraction and cDNA synthesis, blood samples were subjected to Real-Time PCR analysis. Statistical analysis was carried out using GraphPad Prism 9 with a significance level set at p<0.05, and included tests for data distribution, outlier detection, and correlations. Using the miRDB and TargetScan databases, the study also looked into miRNA target predictions.
There were correlated decreases in the expression of HSA-LET-7B-3p and HSA-MIR-4666-3p, and correlated increases in the expression of OXR1, SOD2, and OSGIN2. HSA-MIR-4482-3p expression, on the other hand, detected a significant increase and showed no correlation with other expression levels.
Significant changes in the expression of these genes and miRNAs are found in the inquiry, indicating that oxidative stress plays a crucial role in the pathophysiology of Behçet Disease. The work also reveals the potential of HSA-MIR-4666-3p and HSA-LET-7B-3p as therapeutic targets and biomarkers, providing fresh approaches to managing and treating Behçet Disease. Correlation studies between the expressions of miRNA and mRNA revealed their regulatory and interaction linkages, suggesting intricate genetic pathways in the pathogenesis of this unique disorder. High expression of HSA-MIR-4482-3p's and lack of correlation rule it out as a factor in Behçet Disease.

Key Words: Behcet 's disease; Oxidative stress; OXR1; OSGIN2; SOD2.