hakansabunis/tr-academic-research-agent-index huggingface dataset:
MisL ototransporter proteininin salmonella enterica Serovar typhimurium'a karşı geliştirilen immün yanıttaki  rolünün belirlenmesi
Identification of the role of MisL ototransporter protein on the innate immune   response to salmonella enterica Serovar typhimurium
Yazar: NESLİHAN TAŞKALE KARATUĞ
Danışman: PROF. DR. MUSTAFA AKÇELİK
Ankara Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Biyoloji Ana Bilim Dalı
Derece: Doktora, 2016
Konu: Biyoloji = Biology ; Biyoteknoloji = Biotechnology ; Mikrobiyoloji = Microbiology

Özet:
Bu araştırmada S. Typhimurium'da tanımlanan bir ototransporter olan MisL proteininin, yolcu domaini klonlanarak E. coli BL21 suşuna aktarıldı. Klonlanan gen bölgesinin ifadesi Western Blot yöntemi ile tanımlandı. Heterolog konakçıda üretilerek saflaştırılan MisL peptidine karşı geliştirilen antikorlar ile yürütülen hücre kültürü denemelerinde, MisL'in immün yanıtları (IL-6 ve TNF-α) istatistiki açıdan anlamlı bir şekilde teşvik ettiği belirlendi. Nötralizasyon denemelerinde ise; anti-misL antikorunun TNF-α için kısmi nötralizan etki göstermesine rağmen aynı durumun IL-6 için söz konusu olmadığı belirlendi. Biyotin ile işaretli antikorun streptavidin muamele edilmiş hücrelerle ilişkisi ve enzim uygulaması denemeleri, MisL proteininin salgı sürecinde hücreden kesilerek ortama salındığını kanıtlamıştır. Bu durum yeterli nötralizan etkisinin görülememesini açıklamaktadır.

Abstract:
In this study, the passenger domain of the protein MisL which is described as auto-transporter on S. Typhimurium has been cloned and transferred into E. coli BL21 strain. 
Expression of the cloned gene region was characterized by Western Blot method. Cell culture experiments were carried out with antibodies were developed against the purified MisL peptide produced in a heterologous host and statistically, it was determined that MisL promoted immüne responses (IL-6 and TNF-α) as meaningful. Neutralization assays showed that although the anti-misL illustrated a partial neutral effect for TNF- α, the same situation was not valid for IL-6. The relationship between antibodies marked with biotin and cells treated with streptavidin besides enzyme application trials proved that MisL released into the environment by cutting from the cell in the secretory process of proteins. This situation explains the failure to observe the impact of adequate neutralizing.
Adnan Özyalçıner'in öyküleri üzerine bir inceleme
A review on Adnan Özyalçıner's stories
Yazar: TÜBA ÇETOK
Danışman: YRD. DOÇ. DR. ERDOĞAN KUL
Ankara Üniversitesi / Sosyal Bilimler Enstitüsü / Türk Dili ve Edebiyatı Ana Bilim Dalı / Yeni Türk Edebiyatı Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2016
Konu: Türk Dili ve Edebiyatı = Turkish Language and Literature
Dizin: Doğa = Nature ; Hikaye = Story ; Kapitalizm = Capitalism ; Kentleşme = Urbanization ; Varoluşçuluk = Existentialism ; Özyalçıner, Adnan = Özyalçıner, Adnan ; İdeoloji = Ideology

Özet:
Adnan Özyalçıner; 1950 Kuşağının bütün yazarları gibi Sait Faik Abasıyanık'tan etkilenmekle birlikte, kuşak olarak eleştirdikleri Orhan Kemal ve Haldun Taner'in işlediği konular ile dil ve anlatımlarının da etkisi altında kalmıştır. İlk öykülerinde 1950 Kuşağının eserlerinde görülen bireysel temalar, varoluşçuluk felsefesinin etkileri, soyut imgeler ve uzun cümleler ağır basar. Bir süre sonra toplumsal sorunları ön plana çıkaran yazar, ideolojik yönü ağır basan öyküler yazmış, okur kitlesini de genişletmiştir. Bu durum dil ve üslubunda da etkisini gösterir. İlk öyküleriyle kültürlü, felsefeden haberdar olan okurlara seslenen cümleleri; daha sonraki öyküleriyle toplumun birçok kesimine hitap eder.

Anahtar kelimeler: Adnan Özyalçıner, 1950 Kuşağı, Sınıf Ayrımı, Kapitalizm, Şehirleşme, Doğa, Varoluşçuluk

Abstract:
Adnan Özyalçıner who was effected from Sait Faik Abasıyanık as the whole writers of language and 1950s, was effected from the subjects of Orhan Kemal and Haldun Taner whom they criticized from the point of generation. The personal subjects that seen in the generation of 1950s, the effects of Existentialism philosophy, abstract objects and long sentences have stronger influence. Then, the writer who highlighted the social problems wrote the ideologic stories and had a wide literal society. This also effects his language and pronounciation. At first, his sentences were important for the people who are cultural and understand from the philosophy, then also had on importance for the other people of the society.

Key words: Adnan Özyalçıner, 1950s, class difference, capitalism, urbanızatıon, nature, existentialism.
Agrobacterium tumefaciens aracılığıyla herbisitlere toleranslı keten (Linum usitatissimum L.)genotiplerinin geliştirilmesi üzerine araştırmalar
Studies on improving flax (Linum usitatissimum L.) genotypes resistant to herbicides via agrobacterium tumefaciens
Yazar: OUSMANE SADOU
Danışman: PROF. DR. MUSTAFA YILDIZ
Ankara Üniversitesi / Biyoteknoloji Enstitüsü / Temel Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
Derece: Doktora, 2016
Konu: Biyoteknoloji = Biotechnology

Özet:
Tez çalışmasında, üç keten (Linum usitatissimum L.) ketenin Clarck", "Madaras" ve "1886 Sel." çeşidine Agrobacterium tumefaciens'nin 'GV2260 pTF101.1' hattı aracılığıyla glifosinat amonyum herbisite toleransı belirleyen bar geni aktarılmıştır. Çalışmada 0 (kontrol), 0.25, 0.50, 0.75 ve 1 mg/L Bialofos herbisiti kullanılarak keten çeşitleri hipokotil eksplant üzerindeki en etkılı dozu belirlemeye çalışılmıştır. Elde edilen sounçlara incelediğinde kontrol dozunda Clark, Madaras ve 1886 Sel keten çeşitlerinde glifosinat amonyum herbisite karşı en düşük toleransı izlenmiştir. Tüm çeşitlerde seleksiyon için 0.75 mg/L Bialofos dozu optimum olarak kabul edilmiştir. Yapılan gen aktarımı çalışmaları inokulasyon, ko-kultivasyon, seleksiyon ve bitkilerin toprakta şaşıtması ile oluşmuşlardır. Çalışma sonucu her 3 çeşidinden yabancı ot mücadelesinde yaygın olarak kullanılan "glifosinat amonyum" herbisitine karşı 48 adet toleranslı transgenik adayı bitki elde edilmiştir.

Abstract:
This thesis study included three linseed/flax (Linum usitatissimum L.) cultivars Clarck", "Madaras" and "1886 Sel" for genetic transformation through Agrobacterium tumefaciens GV2260 pTF101.1' strain against glifosinat amonyum herbiside tolerance with bar gene. The study used 0 (control), 0.25, 0.50, 0.75 and 1 mg/L Bialofos herbiside on flax cultivars hypocotyl explant to find the most effective dose. Available data analysis found kontrol dose as most ineffective doze glifosat ammonium against Clark, Madaras and 1886 Sel. 0.75 mg/L Bialofos was selected as the most optimum selection dose. The genetic transformation studies consisted of inoculation, co-cultivation, selection and transfer of plants to soil.  The results confirmed putative genetic transformation of 48 plants from three flax cultivars for tolerance against "glifosinat amonyum" herbicide.
Alkenil pirimido[1,2-a]pirimidinlerin sentezi ve furopirimido[1,2-a]pirimidinlere dönüştürülmesinin araştırılması
Synthesis of alkenyl pyrimido[1,2-a]pyrimidines and investigation of their conversion to furopyrimido[1,2-a]pyrimidines
Yazar: SİBEL ARIBALI
Danışman: PROF. DR. MUSTAFA GÜLLÜ
Ankara Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Kimya Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2016
Konu: Kimya = Chemistry

Özet:
Bu tez çalışmasında, alkenil pirimido[1,2-a]pirimidinlerin sentezi ve furopirimido[1,2-a]pirimidinlere dönüştürülmesi reaksiyonları araştırılmıştır. 
Araştırmaların ilk aşamasını, farklı fonksiyonlu gruplar içeren 2-aminopirimidin bileşiklerinin sentezi oluşturmaktadır. Halojenleme ve nükleofilik yerdeğiştirme reaksiyonlarından yararlanılarak değişik sübstitüentler içeren 2-aminopirimidin bileşikleri yüksek verimlerle sentezlenmiştir.  İkinci aşamada, allil ve siklohekzenil gibi alkenil grupları içeren aktif malonat esterlerinin sentezi birkaç farklı basamak üzerinden gerçekleştirilmiştir. Takip eden aşamada farklı 2-aminopirimidinler ile aktif malonat esterlerinin kondenzasyon reaksiyonları üzerinden 2-hidroksi-3-alkenil-4H-pirimido[1,2-a]pirimidin-4-on bileşikleri sentezlenmiştir. Son aşamada ise, elde edilen 2-hidroksi-3-alkenil-4H-pirimido[1,2-a]pirimidin-4-on türevlerinin yan zincir üzerinden furo halkalaşma reaksiyonları çalışılmıştır. İyot ve güçlü bir asit olan CF3COOH varlığında furopirimidopirimidin bileşikleri ilk kez tarafımızdan sentezlenmiştir.
Sonuç olarak, tez kapsamında hedeflenen furopirimido[1,2-a]pirimidin türevleri sentezi başarılı bir şekilde gerçekleştirilmiştir. Elde edilen bileşiklerin yapıları, uygun spektral analiz yöntemleri (IR, GC-MS ve H-1NMR) kullanılarak aydınlatılmıştır.

Abstract:
In this thesis, synthesis of alkenyl pyrimido[1,2-a]pyrimidines and their conversion reactions to furopyrimido[1,2-a]pyrimidines have been investigated.
In the first stage of studies, the synthesis of 2-aminopyrimidine compounds containing different functional groups were investigated. These compounds containing various substituents was synthesized with high yields utilising halogenation and nucleophilic substitution reactions. In second stage, synthesis of active malonate esters containing different alkenyl groups such as allyl and cyclohexenyl was carried out via several consecutive reaction steps. The following stage includes the condensation reactions between of 2-aminopyrimidines and active malonate esters to synthesize 2-hydroxy-3-alkenyl-4H-pyrimido[1,2-a]pyrimidin-4-one compounds. Finally, the alkenyl and hydroxyl groups located on the main molecule attracted with each other to form intramolecular furo ring in presence of appropriate reagents. In the presence of iodine and strong acid CF3COOH, furopyrimidopyrimidine compounds were synthesized for the first time.
Consequently, within the thesis, convenient synthesis of target furopyrimido[1,2-a]pyrimidine derivatives was obtained successfully. Structures of the resulting compounds were elucidated using spectroscopic methods (IR, GC-MS, 1H-NMR).
Alibeyhüyüğü sulama kooperatifi alanında sulama uygulamalarının değerlendirilmesi
Evaluation of irrigation applications in Alibeyhüyüğü irrigation cooperative area
Yazar: İLHAN ÇAKMAK
Danışman: PROF. DR. YUSUF ERSOY YILDIRIM
Ankara Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Tarımsal Yapılar ve Sulama Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2016
Konu: Ziraat = Agriculture

Özet:
Konya ili Çumra ilçesindeki Alibeyhüyüğü sulama kooperatifi alanında yeraltı suyu kullanan çiftçilerin sulama uygulamalarının değerlendirilmesi bu çalışmanın amacını oluşturmaktadır. Kooperatif kayıtları incelenerek tezin amacına uygun farklı ürün ve farklı yıllara ait sulama uygulamalarının olmasına dikkat edilerek parseller seçilmiştir. Seçilen parsellerde uygulanan sulama suyu miktarları ve sulama tarihleri kooperatif kayıtlarından alınmıştır. IRSIS yazılımında mevcut sulama uygulamaları değerlendirilmiş ve optimum sulama zamanı planları hazırlanarak karşılaştırılmıştır. Çiftçilerin ödedikleri su ücretlerinin büyük bir kısmını enerji bedelleri oluşturmasına rağmen suyu etkin bir şekilde kullanmadıkları ve plansız yapılan sulamalardan da beklenen faydayı elde edemedikleri belirlenmiştir. Fazla miktarda yapılan sulamalara rağmen verimde düşüşler olduğu görülmüştür.

Abstract:
The present research was conducted to assess the irrigation application in groundwater irrigation district of Alibeyhüyüğü Irrigation Cooperative in Çumra town of Konya province. Investigated plots were so selected as to include different cropping patterns and different years. Amount of applied irrigation water and irrigation dates were taken from cooperative records. Current irrigation applications were assessed through IRSIS irrigation scheduling software. Optimum irrigation scheduling plans were prepared with this software and compared with the current applications. Although energy costs constituted the greatest portion of water fees paid by farmers, it was observed that they were not using water efficiently and thus they were not able to get desired benefits from irrigations. Excessive water uses resulted in significant yield losses.
Kiril harfli Tatar alfabesinin imla sorunları
Ortography problems in Cyrillic alphabet for Tatar Turks
Yazar: GAMZE ÇİMEN
Danışman: PROF. DR. UFUK TAVKUL
Ankara Üniversitesi / Sosyal Bilimler Enstitüsü / Çağdaş Türk Lehçeleri ve Edebiyatları Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2016
Konu: Türk Dili ve Edebiyatı = Turkish Language and Literature
Dizin: Alfabe = Alphabet ; Kiril = Cyrillic ; Tatarca = Tatar language ; İmla = Spelling

Özet:
Tatar Türkleri denilince ilk akla gelen Türk topluluklarından olan Kazan Türkleri İdil-Ural bölgesinde yaşamaktadırlar.  İdil-Ural  bölgesinde eskiden yaşayan bir çok kabilenin Kazan Türklerinin etnik bir unsur olarak oluşumunda payları vardır. Bu etnik oluşumda tarihten izleyebildiğimiz en büyük pay Bulgar Türkleri ve sonradan bölgeye gelen Kıpçaklarındır. Bu iki unsurun birbiriyle karışmasından meydana gelen Kazan Türkleri, isimlerini yaşadıkları bölgede Altın Orda hakimiyeti zamanında kurulan Kazan şehrinden almışlardır. 
Bulgar ve Kıpçak Türklerinin karışımı neticesinde bu halkların dilleri de birbirini etkilemiş ve ortaya Kazan Türkçesi çıkmıştır. Bu lehçe İslamiyet'in de etkisiyle Arap harfleriyle yazılmış, Arap alfabesinin yetersiz kaldığı anlaşılınca alfabede ıslah çalışmaları başlatılmıştır. Sonrasında Sovyetlerin de desteğiyle bu lehçenin yazımı için Latin alfabesi oluşturulmuş ve kabul edilmiş, ancak Latin alfabesi ancak 12 yıl kullanılmıştır. Daha sonra Sovyetlerin siyasi çıkarları sebebiyle ve onların baskısıyla Kiril harfleri kullanılmaya başlanmıştır. Günümüzde de Kiril alfabesiyle yazılan Tatar Türkçesi'nin ses bakımından Kiril alfabesiyle uyuşmaması sonucunda imla sorunları yaşanmaktadır. Çalışmamızda bu konular incelenmiştir.

Abstract:
Kazakh Turks one of the societies first comig into our mind when we say Tatar Turks live in the Idyll-Ural region. A lot of tribes lived there in the past contributed to the ethnic formation of Kazan Turks. In this ethnic formation the most important part belongs to the Bulgarian Turks and then Kipcaks. Kazan Turks who originated from this mixture, took their name from Kazan city which was established in sovereignty of Golden Horde. 
With the mixture of Bulgarian and Kipchak Turks, the languages were also affected each other and Kazan Turkish aroused. This dialect once was written with Arabic alphabet with the effect of Islam, but as that alphabet was insufficient, they started to make some reforms. After that, with the support of Soviets, Kazan Turks accepted Latin alphabet and used it nearly for ten years. After a while, for the political purposes and because of the coercion of Soviets, they started to use Cyrillic alphabet. Since then,  Kazan Turks have been using this alphabet but as their phonetic does not suit with the Cyrillic one, they encounter some problems. We are going to discuss these problems in our study.
3-boyutlu Öklid uzayında küresel eğrilerin geometrisi
The geometry of spherical curves in Euclidean 3-space
Yazar: HAZAL CEYHAN
Danışman: PROF. DR. FAİK NEJAT EKMEKCİ
Ankara Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Matematik Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2016
Konu: Matematik = Mathematics

Özet:
Bu tez beş bölümden oluşmaktadır.
İlk bölüm giriş kısmına ayrılmıştır. 

İkinci bölümde tezin diğer bölümlerinde kullanılacak temel kavramlar ve teoremlere yer verilmiştir. 

Üçüncü bölümde Öklidyen düzlemde ve Öklidyen kürede front eğriler tanıtılmış ve bu eğrilerin evolütlerinin özellikleri verilmiştir. 

Dördüncü bölümde , küresel eğrilere göre front eğri  tanımlanmış ve küresel eğrilere ait front eğrinin eğrilikleri gösterilmiştir.

Beşinci bölümde ise küresel eğrilere ait front eğriler araştırılmış ve bunlarla ilgili sonuçlar elde edilmiştir.

Abstract:
This thesis consists of five chapters.

The first chapter is introduction of thesis.

In the second chapter, some basic fundamental definition and theorem has been presented.

The third chapter has been devoted to presentation of front curves in the Euclidean plane and on the Euclidean 2- sphere, properties of evolutes of front curves 

.
In the fourth chapter, according to spherical indicatrixs front curves and the curvatures belong to front curves of spherical indicatrixs have been presented.

In the fifth chapter, front curves of spherical curvves have been explored and the results have been obtained about them.
"Geçmiş Yılların Hikayesi" (Povest Vremennıh Let) adlı kroniğin tahlili ve tenkitli tercümesi
The analysis and criticism translation of the named "The Tale of Bygone Years" (Povest' Vremennykh Let)
Yazar: AHMET ULUSAN
Danışman: DOÇ. DR. HATİCE ORUÇ
Ankara Üniversitesi / Sosyal Bilimler Enstitüsü / Ortaçağ Tarihi Ana Bilim Dalı
Derece: Doktora, 2016
Konu: Tarih = History
Dizin: Doğu Avrupa = Eastern Eurepean ; Kronikler = Chronicles ; Orta Çağ = Middle Ages ; Ruslar = Russians

Özet:
Geşmiş Yılların Hikayesi (GYH) Ortaçağ Rusları, Bizans ve Doğu Avrupa'da yaşayan çeşitli Türk kavimleriyle ilgili en önemli metinlerden biridir ve X. yüzyılın ortalarından XII. yüzyılın başına kadar cereyan etmiş hadiselerden bizi haberdar eder. GYH beş ana Rus yıllığının muhtevasında bulunur ve bulundukları yıllıkların başlangıç kısmını oluşturur. Nüshalar (Nestor, Slvester ve 1118 tarihli nüsha) girift ve her biri diğerinden iktibas edilen konulardan meydana gelir. Birçok tarihçi ve âlim söz konusu metinle ilgili kafa karıştırıcı bir pek çok problemi çözmeye çalışmış ve birçoğu açıklığa kavuşturma konusunda başarılı da olmuştur. Birçok yanılgı ve hata barındıran GYH şüphesiz kusursuz bir metin değildir. Eseri tercüme ederken açıklamalarında bu hususlara değindik. Dolayısıyla GYH'yi bir kez daha analiz edip incelemek ve önceki tarihçi ve âlimler gibi biraz olsun mütevazı bir katkıda bulunmak bu çalışmanın amacıdır.

Anahtar Kelimeler: Ortaçağ, Doğu Avrupa, Ruslar, Yıllıklar

Abstract:
Tale of Bygone Years one of the most important text regarding medieval Russians, Byzantium and various Turkic people lived in East European steppes, and inform us developments that had occured from middle of the 10th to beginning of the 12th centuries. Three redactions of chronicle exist in content of the five main Russsian chronicles and they composed beginning parts of them. Redactions (Nestor, Slyvester and 1118 version) constitute from intricate contexts and all of them excerpts form each other. Many of historians and scholars tried to clarify lots of problems of that confusing texts and most of them succeeded to elucidating. İndubitably chronicle isn't precise text; it has many delusions and mistakes. We dealt with these questions in annotations while translating text. As a matter of fact, aim of this work is to analyse and scrutinise of chronicle ones again and to submit somewhat contribution like previous historians and scholars.

Keywords: Medieval, East Europa, Russians, Chronicles
İdil-Ural muhacir siyasî edebiyatında Yaŋa Millî Yul ve Ayaz İshakî'nin siyasî söylemi
Yaŋa Millî Yul in  İdil-Ural immigrant political literature and Ayaz İshakî's political discourse
Yazar: DERYA HAMİYE ERBİRSİN
Danışman: YRD. DOÇ. DR. SAİME SELENGA GÖKGÖZ
Ankara Üniversitesi / Sosyal Bilimler Enstitüsü / Çağdaş Türk Lehçeleri Ana Bilim Dalı / Çağdaş Türk Lehçeleri Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2016
Konu: Türk Dili ve Edebiyatı = Turkish Language and Literature
Dizin: Cedit hareketi = Movement of Jadidism ; Dergiler = Magazines ; Eleştirel söylem çözümlemesi = Critical discourse analysis ; Kazan Türkleri = Kazan Turks ; Milli kimlik = National identity ; Siyasal söylev = Political discussion ; İshaki, Ayaz = İshaki, Ayaz

Özet:
Rusya Türkleri arasında modernleşme, modern siyasî ve kültürel gelişme düşüncesini ifade eden Cedit Hareketi'nin en mühim siyasî aydın temsilcilerinden biri de Ayaz İshakî'dir. İshakî, muhacerette bulunduğu 1928-1939 yılları arasında Millî Yul ve Yaŋa Millî Yul dergilerini çıkararak özellikle memleketinden ayrı yaşayan veya yaşamak zorunda bırakılan Tatar halkına birlik ve beraberlik içinde olacakları bir gelecek ve millî kimlik inşa etmeye çalışmıştır. 
Bu çalışmanın ilk bölümünde Kazan Türklüğünün Durumu, Ayaz İshakî'nin hayatı ve entelektüel faaliyetleri Rusya'nın genel siyasî durumu içerisinde ele alınmaya çalışılmıştır. İkinci bölümde, dergi yıllara ayrılmış ve içeriği hakkında genel bir bilgi verilmiştir Üçüncü bölümde ise İshakî'nin bu dergilerdeki siyasî yazıları Eleştirel Söylem İncelemesi yöntemi ile incelenerek millî kimlik inşasında kullanılan söylemler ve stratejiler ortaya koyulmaya çalışılmıştır.



Anahtar Kelimeler: Ayaz Ġshakî, Millî Yul, Yaŋa Millî Yul, millî kimlik, EleĢtirel Söylem Analizi, Söylem-Tarihsel YaklaĢım.

Abstract:
One of the most important political intellectual representatives of Jadid Movement which states the thought of modernization, modern political and cultural development among Russian Turks is Ayaz Ishaki. Ishaki, especially, tried to form a future in which Tatars who lived or were made to live far from their homeland will be in unity and brotherhood, and a national identity by publishing the magazines Millî Yul and Yaŋa Millî Yul between the years 1928-1939 in which time he was in immigration. 
In the first chaper of this study, we tried to examine Kazan Turks' situation in Russia, Ayaz Ishak's life and intellectual activities in regard to Russia's general political condition. In second chapter, the magazine was seperated into years and their contents was analyzed. In the third chapter, it will be tried to reveal discourse and strategies used in identity formation by examining Ishaki's political writings in these magazines in terms of Critical Discourse Analysis.



Key Words: Ayaz Ishakî, Millî Yul, Yaŋa Millî Yul, National Identity, Critical Discourse Analysis, Discourse-Historical Approach.