Besi hayvanlarından izole edilen enterobacterales ailesindeki bakterilerden geniş spektrumlu beta laktamaz enzimi ve kolistin direncinin araştırılması
Investigation of extended spectrum beta lactamase enzyme and colistine resistance from enterobacterales family bacteria isolated from cattle
Yazar: METİN YALÇIN
Danışman: PROF. DR. ÖMER KÜÇÜKBASMACI
İstanbul Üniversitesi-Cerrahpaşa / Lisansüstü Eğitim Enstitüsü / Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2021
Konu: Mikrobiyoloji = Microbiology
Dizin: Antibiyotikler = Antibiotics ; Beta laktamazlar = Beta lactamases ; Enterobacter = Enterobacter ; Hayvancılık = Animal husbandry ; Kolistin = Colistin ; İlaçlara direnç = Drug resistance

Özet:
İstanbul ve İzmir-Ödemiş'te yetiştirilen büyükbaş besi hayvanlarının dışkılarında kolistin veya GSBL dirençli Enterobacterales ailesine ait bakteriler araştırılmıştır.
GSBL direnci için, 1µg/ml seftriakson, kolistin direnci için 2µg/ml kolistin içeren Mac Conkey agar tarama besiyeri olarak kullanılmıştır. Besiyerlerinde üreyen bakterilerin tamamı 89 suş konvansiyonel yöntemler (Triple sugar iron agar, Voges-Proskauer testi, MİO medium, glikoz agar, PAD agar) ve kromojenik Orientation besiyeri ile E.coli olarak tanımlanmıştır.
Genotipik (PCR) yöntemle GSBL pozitif olan 89 E.coli suşunun 3'ünde  blaTEM ve blaSHV birlikte saptanırken, 45 suşta blaCTX-M ve blaTEM birlikteliği, 7 suş  blaCTX-M, blaTEM ve blaSHV birlikteliği vardı. Bununla birlikte 1 suşta salt blaCTXM ve 33 suşta salt blaTEM pozitifliği saptandı.
Kolistin tarama besiyerinde üreyen 18 E.coli suşunun tamamı broth dilüsyon yöntemi  ile kolistine duyarlı bulundu (MİK <2 mg/L).
Önceki yıllarla kıyaslandığında E.coli suşlarında GSBL direncinin giderek arttığı görüldü. Bu bakteride GSBL direnç oranları ve GSBL direncinden sorumlu mekanizmalar literatür çalışmaları ile uyumlu iken, çalışılan populasyonda kolistin dirençli Enterobacterales bulunmamıştır. Tedavide önemli sorunlar yaratan GSBL ve kolistin direncinin izlenmesi direnç gelişimi ve hızı konusunda da önemli bilgi verecektir.

Abstract:
Bacteria belonging to the colistin or ESBL resistant Enterobacterales family were investigated in the feces of cattle raised in İstanbul and İzmir- Ödemiş.
Mac Conkey medium containing 1 µg/ml ceftriaxone for ESBL resistance and 2 µg/ml colistin for colistin resistance was used as screening medium. All of the bacteria grown in the media were identified as E.coli by conventional methods (Triple sugar iron medium, Voges-Proskauer test, MIO medium, Glucose medium, PAD medium) and Chromogenic Orientation medium.
While blaTEM and blaSHV were detected together in 3 of 89 E.coli strains positive for ESBL by the genotypic (PCR) method, blaCTX-M and blaTEM were found together in 45 strains, and blaCTX-M, blaTEM and blaSHV were found in 7 samples. However, blaCTXM alone was found in 1 strain and blaTEM-only positivity was found in 33 strains.
All 18 E.coli strains grown in colistin screening medium were found to be sensitive to colistin by broth dilution method (MIC <2 mg/L).
Compared to previous years, it was observed that ESBL resistance increased gradually in E.coli strains. While the rates of ESBL resistance and the mechanisms responsible for ESBL resistance in this bacterium were consistent with literature studies, no colistin-resistant Enterobacterales was found in the population studied. Monitoring ESBL and colistin resistance, which creates important problems in treatment, will also provide important information about the development and rate of resistance.