Down sendromunun hızlı prenatal tanısında kantitatif floresan polimeraz zincir reaksiyonu (QF-PCR) tekniğinin kullanılması
Application of quantitative fluorescent-polymerase chain reaction (QF-PCR) technique in the rapid prenatal diagnosis of down syndrome
Yazar: HATİCE KOÇAK
Danışman: Y.DOÇ. NURAY ALTINTAŞ
Celal Bayar Üniversitesi / Tıp Fakültesi / Tıbbi Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
Derece: Tıpta Uzmanlık, 2007
Konu: Tıbbi Biyoloji = Medical Biology

Özet:
Prenatal tanı için en sık endikasyon, fetusda artmış trizomi 21 riskidir.Bu çalışmada, trizomi 21'in hızlı prenatal tanısında QF-PCR tekniğinin klinikuygulanabilirliğinin gösterilmesi amaçlandı. Ayrıca, bu teknikle trizomi tanısıkoyabilmek için gerekli en az hücre sayısı ve bu değerin gebelik haftalarıylailişkisi değerlendirildi. 224 gebeye ait amniyon sıvısında hücre sayımı yapıldıve gebelik haftalarına göre sınıflandırıldı. Amniyon sıvısında bulunan total vecanlı hücre sayısı ile canlı hücre oranının gebelik haftasıyla istatistikselolarak anlamlı bir ilişkisi olduğu (p<0.001) gösterildi. 135 olgudan DNAizolasyonu yapıldı. DNA örnekleri D21S1411 belirleyici ile QF-PCRkullanılarak amplifiye edildi. Normal örneklerin pik oranı ortalama 1,1 vetrizomik diallelik örneklerin pik oranları 2,0 olarak hesaplandı.14?22. gebelik haftaları arasında 0,1?1,9 ml amniyon sıvısından eldeedilen amniyosit sayısının QF-PCR ile tanı koymak için yeterli olduğugösterilmiştir. QF-PCR testinin trizomi 21'i teşhis etmede duyarlılığının %90,seçiciliğinin %93,6, pozitif ve negatif öngörü değerlerinin ise %100 olduğuhesaplanmıştır. D21S1411 belirleyicinin heterozigozite oranının ise 0,8320olduğu gösterilmiştir. Bu verileri esas alarak, D21S1411 belirleyicinin Türktoplumunda trizomi 21 tanısı için güvenle kullanılabileceği sonucunavarılmıştır.Anahtar Kelimeler: Trizomi 21, QF-PCR, prenatal tanı, amniyosit.

Abstract:
The most frequent indication for prenatal diagnosis is the risk ofincreased trisomy 21 in fetus. In this study, it is targeted to show that theclinical practicability of QF-PCR technique in the rapid diagnosis of trisomy21. Also, with this technique, the minumum required number of cells in orderto diagnose trisomy and the number of amniocytes in relation to thegestational week were interpreted. In 224 pregnant women's amniotic fluidcell counts were carried out and the findings were classified according togestational week. It was proved that there is a statiscally significant (p<0.001)relation between the total and viable cell number and viable cell ratio inamniotic fluid with the gestational week. The DNA isolation was made from135 case. The DNA samples were amplified by using the D21S1411 locus onchromosome 21. It was calculated that the average peak ratio of normalsamples is 1,1 and the peak ratio of trisomic diallelic samples is 2,0.It is demonstrated that the amniocyte number which is obtained from0,1?1,9 ml amniotic fluid between the range of 14?22 gestation weeks issufficient to diagnose by QF-PCR within an acceptable certainty range. It iscalculated that the sensitivity of QF-PCR test is %90, specificity is %93,6,positive and negative predictive values are %100 in diagnosing trisomy 21. Itis indicated that the heterozygosity ratio of D21S1411 marker is 0,8320.Based on these data, it is concluded that D21S1411 marker can safely beapplied in Turkish population for diagnosis of trisomy 21.Key Words: Trisomy 21, QF-PCR, prenatal diagnosis, amniocyte.