Kolorektal kanserli dokularda mirna ekspresyon seviyelerinin belirlenmesi
Determination of mirna expression levels in tissues with colorectal cancer
Yazar: RUŞEN AVŞAR
Danışman: DR. ÖĞR. ÜYESİ TÜRKAN GÜRER ; DR. ÖĞR. ÜYESİ ALPER AYTEKİN
Gaziantep Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Biyoloji Ana Bilim Dalı / Moleküler Biyoloji Bilim Dalı
Derece: Doktora, 2023
Konu: Biyoloji = Biology ; Genetik = Genetics ; Moleküler Tıp = Molecular Medicine

Özet:
Kolorektal kanser dünyada en sık rastlanan kanser türleri arasında yer almakta olup farklı fenotiplere yol açan farklı moleküler yolaklara sahip heterojen bir hastalıktır. Bu nedenle hastalığın erken tanısına yönelik çok sayıda araştırma yapılmaktadır. MikroRNA'lar (miRNA), hedef mRNA'nın moleküler yolağındaki özelliğine göre, tümör baskılayıcı ve onkogenik özellik göstermektedir. Son yıllarda miRNA'ların işlevlerinin ve kanser gelişimindeki rollerinin belirlenmesiyle, hem kanserlerin moleküler patolojisinin anlaşılmasında hem de moleküler hedeflere yönelik yeni tedavi yaklaşımlarının geliştirilmesinde destek olmuştur. Bu tezin amacı kolorektal kanserli hastalarda miR-639, miR-641, miR-1915-3p ve miR-3613-3p ekspresyon düzeylerinin ve bu miRNA'ların hastalığın tanısındaki potansiyellerinin belirlenmesidir. Bu amaç doğrultusunda kolorektal kanserli 59 hastadan tümörlü ve sağlıklı komşu doku örnekleri toplanmıştır. Kantitatif Real Time-PCR yöntemiyle miR-639, miR-641, miR-1915-3p ve miR-3613-3p ekspresyon seviyeleri belirlenmiştir. Çalışma sonucunda miR-639 (p = 0.000), miR-641 (p = 0.000) ve miR-3613-3p (p = 0.000)'nin ekspresyonunun tümörlü dokularda normal dokulara kıyasla istatistiksel olarak anlamlı düzeyde azaldığı, miR-1915-3p (p = 0.032)'nin ekspresyonun ise anlamlı düzeyde arttığı tespit edilmiştir. Bununla beraber miR-639'un düşük ekspresyonu ile hastalığın ileri evresi arasında anlamlı bir ilişki bulunmuştur (p<0.05). Sonuç olarak miR-639, miR-641 ve miR-3613-3p'nin kolorektal kanser patogenezinde tümör baskılayıcı, miR-1915-3p'nin ise onkojenik rol oynadığını ve tanıda kullanılabilecek yeni biyomarkırlar olabileceği düşünülmektedir.

Abstract:
Colorectal cancer is among the most common cancer types in the world and is a heterogeneous disease with different molecular pathways that lead to different phenotypes. For this reason, many studies are carried out for the early diagnosis of the disease. MicroRNAs (miRNA) show tumor suppressor and oncogenic properties according to the molecular pathway of the target mRNA. In recent years, by determining the functions of miRNAs and their role in cancer development, it has supported both the understanding of the molecular pathology of cancers and the development of new treatment approaches for molecular targets. The aim of this thesis is to determine the expression levels of miR-639, miR-641, miR-1915-3p and miR-3613-3p in patients with colorectal cancer and the potential of these miRNAs in the diagnosis of the disease. For this purpose, tumor and healthy adjacent tissue samples were collected from 59 patients with colorectal cancer. Expression levels of miR-639, miR-641, miR-1915-3p and miR-3613-3p were determined by quantitative Real Time-PCR method. As a result of the study, the expression of miR-639 (p = 0.000), miR-641 (p = 0.000) and miR-3613-3p (p = 0.000) was statistically significantly decreased in tumor tissues compared to normal tissues, it was determined that miR-1915-3p (p = 0.032) increased significantly. However, a significant correlation was found between low expression of miR-639 and advanced stage of the disease (p<0.05). In conclusion, it is thought that miR-639, miR-641 and miR-3613-3p play a tumor suppressor role in the pathogenesis of colorectal cancer, while miR-1915-3p plays an oncogenic role and may be new biomarkers that can be used in the diagnosis.