Organik tavuk parça etlerinde salmonella serotipleri ile izolatlarda antibiyotik direnç profilinin belirlenmesi
Determination of salmonella serotypes in organicchicken meat and antibiotic resistance profile ofserotypes
Yazar: CANAN ASAL ULUS
Danışman: DOÇ. DR. ALİ GÜCÜKOĞLU
Ondokuz Mayıs Üniversitesi / Sağlık Bilimleri Enstitüsü / Veteriner Besin Hijyeni ve Teknolojisi Ana Bilim dalı
Derece: Doktora, 2019
Konu: Besin Hijyeni ve Teknolojisi = Food Hygiene and Technology
Dizin: Antibiyotikler = Antibiotics ; Organik gıda = Organic food ; Polimeraz zincirleme reaksiyonu = Polymerase chain reaction ; Salmonella = Salmonella ; Stereotip = Stereotyping ; Tavuk eti = Chicken meat ; Tavuklar = Chickens ; İlaçlara direnç = Drug resistance

Özet:
Amaç: Bu çalışmada, Samsun ilinden temin edilen organik tavuk parça etlerinde
Salmonella spp. varlığının, klasik kültür ve IMS teknikleri kullanılarak araştırılması,
elde edilen izolatların oriC gen sekansı esas alınarak PCR ile doğrulanması ve
izolatların serotiplerinin belirlenmesi ile antibiyotiklere karşı dirençlilik durumlarının
saptanması amaçlanmıştır.
Materyal ve Metot: Mayıs-Ağustos 2015 tarihleri arasında 4 ay süre ile paketlenmiş
formdaki toplam 150 organik tavuk parça etinde (50 but, 50 kanat, 50 derisiz- göğüs eti)
analiz edildi. Örneklerdeki Salmonella klasik kültür ve IMS tekniği ile izole edildi.
Şüpheli izolatlar MALDI-TOF yöntemi ile Salmonella spp. olarak belirlendi. PCR
yöntemiyle izolatların konfirmasyonu tamamlandı. İzolatların antibiyotiklere karşı
dirençliliği VITEK 2 Compact Technology yöntemi ile saptandı. Serolojik olarak
Salmonella serotipleri belirlendi.
Bulgular: İncelenen 150 örnekten 42'sinin (%28) Salmonella spp. ile kontamine olduğu
saptandı. Yapılan serotiplendirmede 93 izolatın 53'ü (%56.9) Salmonella enterica
serotip Infantis, 40'ının (%43.1) ise Salmonella enterica serotip Anatum olduğu
belirlendi. Antibiyotik direnç profili analizi sonucu S. Infantis izolatlarının tamamı,
sefuroksim aksetile, amikasine, gentamisine ve siprofloksasine karşı dirençli
bulunurken, izolatlardan 1'i ampisiline, 16'sı trimetoprim\sülfametaksazole, 1'i ise
seforoksime karşı dirençli bulunmuştur. Benzer şekilde S. Anatum izolatlarının tamamı
amikasine, gentamisine ve siprofloksasine karşı dirençli bulunurken, izolatlardan 2'si
trimetoprim\sülfametaksazole karşı dirençli bulunmuştur.
Sonuç: Organik tavuk etinde Salmonella spp. elde edilmesi ve izolatların antibiyotiklere
direnç göstermesi halk sağlığı açısından oldukça önemlidir.
Anahtar Kelimeler: Organik tavuk; Salmonella; Antibiyotik dirençlilik; MALDI-TOF

Abstract:
Aim: The aim of this study is to examine the presence of Salmonella spp. in organic
chicken parts supplied from Samsun province by using classical culture and IMS
techniques; to verify the obtained isolates with PCR based on oriC gene sequence and
to determine the serotypes of isolates and to find out their resistance against antibiotics.
Material and Method: 150 pieces of organic chicken parts (50 drumstick, 50 wings, 50
chicken breast without skin) in packaged form were analyzed for four months between
May and August 2015. Salmonella in the samples was isolated with classical culture
and IMS technique. Suspicious isolates were determined as Salmonella with MALDITOF method. Isolates were confirmed with PCR method. The resistance of the isolates
against antibiotics were found with VITEK 2 Compact Technology method. Serotypes
of Salmonella were determined serologically.
Results: Of the 150 samples analyzed, 42 (28%) were found to be contaminated with
Salmonella spp. In the serotyping performed, 53 (56.9%) out of 93 isolates were found
to be Salmonella enterica serotip Infantis, while 40 (43.1%) were found to be
Salmonella enterica serotip Anatum. According to antibiotic resistance profile analysis
results, while all of the S. Infantis isolates were found to be resistant to cefuroxime
axetil, amikacin, gentamicin and ciprofloxacine; 1 was found to be resistant to
ampiciline, 16 were found to be resistant to trimethoprim\sulfamethoxazole and 1 was
found to be resistant to cefuroxime. Similarly, while all of the S. Anatum isolates were
found to be resistant to amikacin, gentamicin and ciprofloxacine, 2 of the isolates were
found to be resistant to trimethoprim\sulfamethoxazole.
Conclusion: Salmonella spp. in organic chicken meat and the resistance of the isolates
to antibiotics is very important for public health.
Keywords: Organic chicken; Salmonella; Antibiotic resistance; MALDI-TOF