Sirkadien saat genlerinin iyi ve kötü huylu beyin tümörlerinin oluşumu üzerine etkileri
The effects of circadian clock genes on the formation of benign and malignant brain tumors
Yazar: BİLGE ONUR ŞİŞ
Danışman: DOÇ. DR. SEMRA TÜRKOĞLU
Fırat Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı / Biyoteknoloji Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2023
Konu: Biyoteknoloji = Biotechnology

Özet:
ÖZET
Dummy
Sirkadiyen Saat Genlerinin İyi ve Kötü Huylu Beyin Tümörlerinin Oluşumu Üzerindeki Etkileri

Bilge Onur ŞİŞ

Yüksek Lisans Tezi

FIRAT ÜNİVERSİTESİ
Fen Bilimleri Enstitüsü
BiyoteknolojiAnabilim Dalı
     
Temmuz 2023, Sayfa: x  +32

Sirkadiyen saat genleri, organizmanın biyolojik saatinin düzenlenmesinde önemli bir rol oynayan genlerdir. Sirkadiyen saat genleri, vücuttaki biyolojik süreçlerin uyumlu bir şekilde çalışmasını sağlar ve uyku-düzeni, metabolizma ve davranış dahil olmak üzere birçok süreci etkiler. Sirkadiyen saat, BMAL1, CLOCK, Cyrptochrome ve Period adlı dört gen/proteinden oluşan bir geri besleme döngüsüdür. Yapılan çalışmalar, gliomalar dahil olmak üzere malign tümörlerin gelişiminde sirkadiyen saatin bozulmasının önemli bir rol oynadığını göstermektedir. Ancak, iyi ve kötü huylu beyin tümörlerinin oluşumunda sirkadiyen ritmi kontrol eden genlerin moleküler mekanizmaları araştırılmamıştır. Bu nedenle, beyin tümörü oluşumu üzerinde etkili olduğu düşünülen BMAL1, CLOCK, Rev-Erbα ve Per2 biyolojik saat genlerinin moleküler mekanizmalarının araştırılması oldukça önemlidir. 
Elde edilen sonuçlar incelendiğinden ACTB ile Clock saat gen düzeylerin arasında negatif yönlü, ACTB ile Bmal1 ve Rev-Erbα gen düzeylerin arasında pozitif yönü güçlü bir ilişki belirlenmiştir (p<0,01). Ayrıca Bmal1 ile Clock geni ve Per2 geni arasında p<0,01 düzeyinde anlamlı bir pozitif korelasyon olduğu, Rev-Erbα ile p<0,001 düzeyinde anlamlı bir pozitif korelasyon olduğu tespit edilmiştir. Yine Clock geni ile Per2 geni arasında p<0,001 düzeyinde anlamlı güçlü bir pozitif korelasyon olduğu bulunmuştur. Kan biyokimyasal bulguları ve gen düzeyleri arasındaki korelasyon tablosu incelendiğinde WBC değerlerinin Bmal1 ve Rev-Erbα genleri ile p<0.05 düzeyinde, Clock geni ile p<0.01 düzeyinde anlamlı pozitif korelasyon gösterdiği tespit edilmiştir. CRP değerlerinin ise Clock ve Per2 genleri ile p<0.05 düzeyinde, Bmal1 geni ile p<0.01 düzeyinde anlamlı bir pozitif korelasyon gösterdiği tespit edilmiştir.
Sonuç olarak, bu genlerin beyin tümörü oluşumundaki rolünün anlaşılmasına katkıda bulunmak ve sirkadiyen ritmin tümör oluşumu üzerindeki etkisine ilişkin daha fazla bilgi edinmektir

Abstract:
ABSTRACT
dummy
The Effects of Circadian Clock Genes On The Formation of Benign and Malignant Brain Tumors

Bilge Onur ŞİŞ

Master's Thesis

FIRAT UNIVERSITY
Graduate School of Natural and Applied Sciences
Department of Biotechnology
   
July 2023, Pages:  x  + 32


Circadian clock genes are genes that play an important role in regulating the biological clock of the organism. Circadian clock genes ensure the harmonious functioning of biological processes in the body and influence many processes, including sleep-regulation, metabolism, and behavior. The circadian clock is a feedback loop consisting of four genes/proteins called BMAL1, CLOCK, Cyrptochrome and Period. Studies show that disruption of the circadian clock plays an important role in the development of malignant tumors, including gliomas. However, the molecular mechanisms of the genes controlling the circadian rhythm in the formation of benign and malignant brain tumors have not been investigated. Therefore, it is very important to investigate the molecular mechanisms of BMAL1, CLOCK, Rev-Erbα and Per2 biological clock genes, which are thought to be effective on brain tumor formation.
When the results were analyzed, a strong negative correlation was found between ACTB and Clock clock gene levels, and a strong positive relationship between ACTB and Bmal1 and Rev-Erbα gene levels (p<0.01). In addition, it was determined that there was a significant positive correlation at p<0.01 level between Bmal1 and Clock gene and Per2 gene, and a significant positive correlation at p<0.001 level with Rev-Erbα. Again, a strong positive correlation was found between the Clock gene and the Per2 gene at the p<0.001 level. When the correlation table between blood biochemical findings and gene levels was examined, it was determined that WBC values showed a significant positive correlation at the p<0.05 level with Bmal1 and Rev-Erbα genes, and at the p<0.01 level with the Clock gene. It was determined that CRP values showed a significant positive correlation with the Clock and Per2 genes at the p<0.05 level, and with the Bmal1 gene at the p<0.01 level.
In conclusion, it is to contribute to the understanding of the role of these genes in brain tumorigenesis and to gain more insight into the influence of circadian rhythm on tumorigenesis.