Ailevi akdeniz ateşi hastalarında interlökin-16(IL-16) ve otoimmun regülatör genlerinin (AIRE) promotör metilasyon durumunun araştırılması
Investigation of promoter methylation status of interleukin-16 (il-16) and aire gene mutation in familial mediterranean fever
Yazar: EBRU HATİPOĞLU
Danışman: DOÇ. DR. MUHAMMED OKUYUCU
Ondokuz Mayıs Üniversitesi / Tıp Fakültesi / İç Hastalıkları Ana Bilim Dalı
Derece: Tıpta Uzmanlık, 2024
Konu: İç Hastalıkları = Internal diseases

Özet:
Giriş: Ailevi Akdeniz Ateşi(AAA) ülkemizde sık görülen, özellikle erişkinlerde ciddi
morbidite ile seyreden, sebebi ve etiyopatogenezi hakkında henüz net bir fikir birliği
sağlanamayan bir hastalıktır. Bu çalışmadaki amaç, AAA hastalarında otoimmün
regülatör (AIRE) ve interlökin-16 (IL-16) gen polimorfizm sıklığını araştırmak ve
sağlıklı popülasyon ile karşılaştırmaktır.
Yöntem: Çalışmamıza Ondokuz Mayıs Üniversitesi Tıp Fakültesi İç Hastalıkları
Anabilim Dalı, Romatoloji Bilim Dalı Polikliniklerine başvuran 18 yaş üstü hastalar
dahil edildi. Çalışmaya AAA tanısı olan 40 hasta ve sağlıklı 40 gönüllü dahil edildi.
Alınan kan örneklerinden DNA izolasyon kiti kullanılarak elde edilen genomik
DNA'ların DNA konsantrasyonları ve saflıkları nanodrop ile ölçüldü. Sonrasında,
DNA örnekleri, bisülfit modifikasyon kiti kullanılarak modifiye edildi. Daha sonra
metilasyona spesifik PCR yöntemiyle, metilasyona özgül dizayn edilen primerler
kullanılarak AIRE ve IL-16 genlerinin promotör metilasyon profilleri belirlendi.
Çalışmanın sonuçları istatistiksel analiz programı ile değerlendirildi.
Sonuçlar: Hem AAA grubunda hem de sağlıklı kontrol grubunda çalışmaya katılan
tüm bireylerde AIRE ve IL-16 genlerinin promotör bölgesi metile saptanmış olup, bu
genlerin ifadesinin her iki grupta da farklılık göstermediği görülmüştür.
Tartışma: AIRE ve IL-16 gen mutasyonlarının her ne kadar pek çok otoimmün
hastalılığın patogenezinde rol oynadığı gösterilmişse de AAA hastalarında anlamlı
fark gözlenmemiştir. Bulgular ışığında bakıldığında, AAA'nın patogenezinde
otoimmunite rolünün zayıf olduğu sonucuna ulaşılmıştır.
Anahtar kelimeler: Ailevi Akdeniz Ateşi (AAA), interlökin-16 (IL-16), otoimmün
regülatör gen (AİRE)

Abstract:
İntroduction: Familial Mediterranean Fever is a common disease in our country that
can cause morbidities, especially in adults, and a clear consensus has not yet been
reached about its cause and etiopathogenesis. This study aimed to determine the
frequency of interleukin-16 (IL-16) and autoimmune regulator (AIRE) gene
polimorphisms and to compare with healthy population.
Method: Patients over the age of 18 who applied to Ondokuz Mayıs University
Faculty of Medicine, Rheumatology Department polyclinics were included in our
study. The study included 40 patients diagnosed with FMF and 40 healthy volunteers.
DNA concentrations and purity of genomic DNAs obtained from blood samples using
a DNA isolation kit were measured with a nanodrop. Afterwards, the DNA samples
were modified using a bisulfite modification kit. Then, the promoter methylation
profiles of AIRE and IL-16 genes were determined by using methylation-specific PCR
method and primers designed specifically for methylation. The results of the study
were evaluated with a statistical analysis program.
Results: In both groups the IL-16 and AIRE genes identified as methylated, expression
of this genes show no difference between this two group.
Discussion: Although AIRE and IL-16 gene mutation have been shown to play a role
in the pathogenesis of many autoimmune diseases, no significant difference was
observed in FMF patients. Consequently, it was postulated the autoimmunity does not
play a major role in FMF pathogenesis.
Key words: Mediterranean familial fever (FMF),IL-16, autoimmune regulatory gene
(AIRE)