Klinik materyallerden izole edilen candida albicans suşlarında SAP genlerinin araştırılması
Investigation of SAP genes in candida albicans strains isolated from clinical materials
Yazar: MURADİYE YARAR
Danışman: DOÇ. DR. NURAL CEVAHİR
Pamukkale Üniversitesi / Tıp Fakültesi / Temel Tıp Bilimleri Bölümü / Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
Derece: Tıpta Uzmanlık, 2014
Konu: Mikrobiyoloji = Microbiology
Dizin: Biyofilmler = Biofilms ; Candida albicans = Candida albicans ; Fenotip = Phenotype ; Genler = Genes ; Peptid hidrolazlar = Peptide hydrolases

Özet:
IX
ÖZET
Klinik Materyallerden İzole Edilen Candida albicans Suşlarında SAP
Genlerinin Araştırılması
Dr. Muradiye YARAR
Candida türleri; normal flora üyesi olmakla birlikte, fırsatçı patojenler olarak
çevresel ve bireysel koĢulların konak aleyhine geliĢtiği durumlarda, hafif yüzeyel
enfeksiyonlardan ağır sistemik enfeksiyonlara kadar çeĢitli klinik tablolara yol
açabilmektedirler. Candida enfeksiyonlarının patogenezinde konak savunma
sisteminin yanı sıra, patojene ait çeĢitli virülans faktörleri de rol almaktadır. Candida
türlerine ait virülans faktörleri arasında; hif oluĢumu, toksinlerin salınımı, fenotipik
ve genotipik değiĢim gösterebilmeleri, dimorfizm, adezinler, asit proteinaz gibi
enzimlerin üretimi ve biyofilm oluĢturması sayılabilir. Candida türleri içersinde en
sık izole edilen tür C. albicans türüdür. Bu çalıĢmada laboratuvarımızdaki çeĢitli
klinik örneklerden izole edilen C. albicans suĢlarında, biyofilm oluĢumu ve
proteinaz aktivitesinin fenotipik yöntemlerle araĢtırılması, aynı zamanda genotipik
yöntemle SAP genlerinin varlığının ortaya konması ve bu virülans faktörleriyle SAP
genleri arasındaki bağlantının incelenmesi amaçlanmıĢtır. Ocak 2012-Ocak 2013
tarihleri arasında Pamukkale Üniversitesi Tıp Fakültesi Sağlık AraĢtırma ve
Uygulama Merkezi Mikrobiyoloji Laboratuvarı'nda çeĢitli klinik örneklerden izole
edilmiĢ ve C. albicans olarak tanımlanmıĢ 140 C. albicans suĢu çalıĢmaya dahil
edilmiĢtir. SuĢlardaki biyofilm oluĢumunun araĢtırılmasında modifiye tüp aderans,
Kongo kırmızılı beyin kalp infüzyon agar (KKBKI) ve modifiye mikroplate yöntemi
kullanılmıĢtır. Candida suĢlarının salgısal asit proteinaz aktivitelerini saptamak için
%1'lik sığır serum albumin agar (SSAA) kullanılmıĢtır. SAP1-10 genlerinin varlığı
PCR yöntemi kullanılarak araĢtırılmıĢtır. ÇalıĢmaya alınan 140 C. albicans suĢunda,
KKBKI agar yöntemiyle %51.4 oranında, modifiye tüp aderans yöntemiyle %63.6
oranında ve modifiye mikroplate yöntemiyle %87.9 oranında biyofilm varlığı
saptanmıĢtır. SSAA ile suĢların %92.9'unda asit proteinaz aktivitesi varlığı
saptanmıĢtır. C. albicans suĢlarında PCR yöntemiyle ise %65 oranında SAP1, %82.9
oranında SAP2, %77.9 oranında SAP3, %79.3 oranında SAP4, %13.6 oranında SAP5,
%81.4 oranında SAP6, %82.9 oranında SAP7, %40 oranında SAP8, %38.6 oranında
SAP9 ve %36.4 oranında SAP10 varlığı saptanmıĢtır. Toplam 4 suĢta (%2.8) tüm
X
SAP genlerinin varlığı aynı anda izlenmiĢtir. 10 suĢta ise (%7.1) hiçbir SAP genine
rastlanmamıĢtır. Bu çalıĢmada en sık SAP1,2,3,4,6 ve SAP7 genlerine rastlanmıĢtır.
Candida suĢlarının virülans faktörlerinin ve ilgili virülans genlerinin belirlenmesinin,
Candida türleri ile oluĢan enfeksiyonların patogenezini açıklamada önemli katkılar
sağlayacağı kanısındayız.
Anahtar Kelimeler: C. albicans, SAP, biyofilm, asit proteinaz

Abstract:
XI
SUMMARY
Investigation of SAP genes in Candida albicans strains isolated from clinical
materials
Dr. Muradiye Yarar
Although Candida species are a member of the normal flora, they may lead to
various clinical conditions as mild superficial infections, and severe systemic
infections as opportunistic pathogens when environmental and individual conditions
hinder the host. Various virulence factors of the pathogen also play a role in the
pathogenesis of Candida infections beside the defense system of the host. The
virulence factors of Candida species include hypha formation, toxin release, display
of phenotypical and genotypical changes, dimorphism, adesines, production of
enzymes like acid proteinase and biofilm formation. C. albicans is the most
frequently isolated Candida species. In this study, it was aimed to investigate biofilm
formation and proteinase activity using phenotypical methods in C. albicans strains
isolated from various clinical samples in our laboratory, in addition to demonstrating
the presence of SAP genes using genotypical methods, and to investigate the
correlation between these virulence factors and SAP genes. A total of 140 C. albicans
strains, which were isolated from various clinical samples in the Microbiology
Laboratory of Pamukkale University Medical School Research and Training Center
between January 2012 and January 2013, were included in the study. The modified
tube adherence, the Congo red brain heart infusion agar (CRBHI) and the modified
microplate method were used for the investigation of biofilm formation. 1% bovine
serum albumin agar (BSAA) was used to investigate the secretory acid proteinase
activities of Candida strains. The presence of SAP1-10 genes was investigated using
the PCR method. In 140 C. albicans strains included in the study, the presence of
biofilm was detected at a rate of 51.4% with the CRBHI agar method, at a rate of
63.6% with the modified tube adherence method and 87.9% with the modified
microplate method. Acid proteinase was detected in 92.9% of the strains with BSAA.
SAP1 was detected at a rate of 65%, SAP 2 at a rate of %82.9, SAP3 at a rate of
%77.9, SAP4 at a rate of %79.3, SAP5 at a rate of %13.6, SAP6 at a rate of %81.4,
SAP7 at a rate of %82.9, SAP8 at a rate of %40, SAP9 at a rate of %38.6, and SAP10
at a rate of %36.4 in C. albicans strains using the PCR method. The presence of all
XII
SAP genes was observed concurrently in a total of 4 strains (2.8%). In this study,
SAP1, 2, 3, 4, 6 and 7 genes were detected most frequently. We consider that
determination of the virulence factors and related virulence genes in Candida species
will significantly contribute to explaining the pathogenesis of the infections
developing with Candida species.
Key words: C.albicans, SAP, biofilm, acid proteinase