Viral hepatit C'li hastalarda genotip tayini ve mutasyon analizi
Genotype determination and mutation analysis in patients with chronic hepatitis C virus infection
Yazar: EDA SAVAŞ
Danışman: DOÇ.DR. TEKİN KARSLIGİL
Gaziantep Üniversitesi / Sağlık Bilimleri Enstitüsü / Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
Derece: Doktora, 2007
Konu: Gastroenteroloji = Gastroenterology ; Mikrobiyoloji = Microbiology ; Moleküler Tıp = Molecular Medicine
Dizin: Genotip = Genotype ; Hepatit C virüsü = Hepatitis C virus ; Mutasyon = Mutation

Özet:
Hepatit C virüsü (HCV) kronik karaciğer hastalığı, karaciğer sirozu vehepatoselüler karsinomun önemli bir nedenidir. Farklı genotipteki virüslerin biyolojikdavranışları, tedaviye cevapları ve coğrafik dağılımları farklılık gösterir. Bu çalışmadaHCV pozitif hastalarda genotip dağılımının araştırılması, HCV genomunda mutasyonanalizi ve hastalarda klinik gidişin ve tedaviye yanıtın genotiple ve mutasyonlarlailişkisinin belirlenmesi amaclandı.Gaziantep Üniversitesi Tıp Fakültesi Gastroenteroloji Bilim Dalı'nda kronik HCVinfeksiyonu tanısı almış 51 hasta çalışmaya dahil edildi. Hastaların 26 'sı erkek, 25 'sıkadındı. Yaş ortalaması 50,0±8,6 idi. Toplam 45 hastada (%88.2) genotip 1, baskın olantip olarak saptandı. Bunların 40 `ında (%78.4) genotip 1b olarak saptandı. Hastaların5'i (%9.8) genotip 1a, 4'ü (%7.8) genotip 2a, 1'i (%2) genotip 3a, 1'i (%2) genotip 4colarak bulundu. Hastalarda virüsün 5'UTR bölgesinin nükleotid ve aminoasit sekansdizileri belirlenerek araştırılan mutasyonlarda 20 insersiyon, 16 delesyon, 14transversiyon, 17 transisyon mutasyon bulundu.Hastaların 33 `ünde (%64.7) kalıcı viral cevap elde edilirken 18 hastada (%35.3)tedaviye cevap alınamadı. Genotip 1 ve Genotip non-1 hastalar olarak tedaviye cevababakıldığında Genotip 1 hastalarda tedavi başarısı %64.4 iken non-1 hastalardaki tedavibaşarısı %66.6 idi. Gruplar arasında istatiksel olarak anlamlı fark yoktu. Mutasyonlaragöre tedavi cevapları ve laboratuar bulgularına etkisi karşılaştırıldığında gruplararasında istatiksel olarak anlamlı fark saptanmadı.Sonuç olarak bölgemizde HCV genotiplerinden en sık genotip 1b görülmektedir.Tedaviye cevap açısından genotip ve mutasyonların etkisi bizim hasta grubumuzdaanlamlı olarak saptanmamıştır.

Abstract:
Hepatitis C Virus (HCV) is an important cause of chronic liver disease, livercirrhosis and hepatocellular carcinoma. Different viral genotypes may differ in terms ofbiologic behaviour, treatment response and geographic distribution. In this study, weaimed to detect genotype distribution in our region, analysis of mutations in viralgenome, effect of genotype and mutations on clinical course of the disease and treatmentresponse.Fiftyone(51) patients who were diagnosed as having chronic HCV infection atGaziantep University, Faculty of Medicine, Department of Gastroenterology wereincluded into the study. Patients composed of 26 males and 25 females with a mean ageof 50,0±8,6. years .Genotype 1 is determined as predominant genotype in 45 (88.2%) out of 51patients. Of these, 40 (78.4%) patients were diagnosed as genotype 1b, 5 (9.8%) asgenotype 1a, 4 (7.8%) as genotyp 2a, 1 (2%) as genotyp 3a, 1 (2%) as genotyp 4c.According to mutations analysis on nucleotide and aminoacid sequences, 20 insertion, 16deletion, 14 transvertion, 17 transition mutations were detected.Sustained virologic response was detected in 33 (64.7%) patients. 18 patients(35.3%) were non-responders to treatment. Treatment response in genotype 1 patientswas 64.4% and %66.6 in genotype non-1 patients. No statistically significant differencein treatment response and laboratory data according to the mutations was detected.In conclusion, the most frequent genotype in our region is genoype 1b. Effect ofviral genotype and mutations on treatment response was not detected in our patientpopulation.