Meme kanser hücre hatlarında NEAT1 ve MİR-410-3P'nin ekspresyonlarının araştırılması ve metastaza etkilerinin belirlenmesi
Investigation of the expressions of NEAT1 and MIR-410-3P in breast cancer cell lines and determination of their effects on metastasis
Yazar: CİHANGİR DOĞAN
Danışman: PROF. DR. İBRAHİM AÇIKBAŞ
Pamukkale Üniversitesi / Sağlık Bilimleri Enstitüsü / Tıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2022
Konu: Tıbbi Biyoloji = Medical Biology
Dizin: Gen ifadesi = Gene expression ; Meme hastalıkları = Breast diseases ; Meme neoplazmları = Breast neoplasms ; Neoplazm metastazları = Neoplasm metastasis ; Neoplazmlar = Neoplasms

Özet:
Meme kanseri ülkemiz ve dünya genelinde kadınlar için görülme sıklığı en yüksek
kanser türüdür ve kansere bağlı ölüm sebeplerinin en başında yer alır. Meme kanserinin 
uzak organlara metastazı bu ölümlerin önde gelen nedenlerindendir. Meme kanserinin 
erken tanısı hastalığın progresyonu ve sağkalımı açısından önemlidir. Meme kanseri 
meme dokusunda bölgesel olarak başlar, ancak lenf düğümlerine ve diğer organlara 
lenfatik veya kan damarları yoluyla metastaz yapabilir. Meme tümörünün metastazı için 
lokal invazyonu, kan veya lenfatik damarlara istilası olan intravazasyonu, dolaşımda 
hayatta kalması, dolaşım sisteminden geçerek ekstravazasyonu ve hedef bölgeye 
yerleşmesi gibi bir dizi adımları izler ve bu adımlardan herhangi birinin tamamlanmaması 
durumunda metastaz süreci durur. Bu adımları çok sayıda proteinler ve sinyal molekülleri 
aracılık eder. 
Uzun kodlamayan RNA NEAT1 meme kanseri hücre hatlarının çoğalması ve 
hayatta kalması için gerekli olduğu bildirilmiştir. Ayrıca miR-410-3p'nin farklı kanser 
türlerinde anormal ekspresyonları gözlemlenmiştir. Yaptığımız bu çalışmada MCF-7 
meme kanser hücre hattında ve MCF-10A normal meme hücre hattında NEAT1 ve miR410-3p'nin ekspresyonları incelendi. Kodlamayan RNA'ların ekspresyonları qRT-PCR 
ile analiz edildi. NEAT1'in kanser hücre hatlarında normal hücre hatlarına göre 2.30 kat 
artış olduğu tespit edildi. miR-410-3p'nin ekspresyonları normal hücre hatlarına kıyasla 
kanser hücre hatlarında -2.85 kat azalma olduğu gözlemlendi. Daha sonra 
gerçekleştirdiğimiz Transwell invazyon deneyinde MCF-7 hücre hatların invaziv özelikte 
olduğunu MCF-10A'nın invazyon yeteneği kazanmadığı gözlendi. 
Yaptığımız bu çalışma, literatür ile uyumlu olarak NEAT1'in artan 
ekspresyonunun invaziv özellik ile ilişkili olduğunu ve aynı zamanda ekspresyon 
artışının, hedefi olan miR-410-3p'nin ekspresyonunun azalması ile paralel olduğunu 
göstermiştir.

Abstract:
Breast cancer is the most common type of cancer for women in our country and 
around the world, and is one of the leading causes of cancer-related death. Metastasis 
of breast cancer to distant organs is one of the leading causes of these deaths. Early 
diagnosis of breast cancer is important for disease progression and survival. Breast 
cancer starts locally in the breast tissue, but can metastasize to lymph nodes and other 
organs through the lymphatic or blood vessels. For the metastasis of the breast tumor, it 
follows a series of steps such as local invasion, intravasation with invasion into blood or 
lymphatic vessels, survival in the circulation, extravasation through the circulatory 
system and localization to the target site, and if any of these steps is not completed, the 
metastasis process stops. These steps are mediated by numerous proteins and signaling 
molecules.
The long non-coding RNA NEAT1 has been reported to be essential for 
proliferation and survival of breast cancer cell lines. In addition, abnormal expressions of 
the miR-410-3p have been observed in different cancer types. In this study, the 
expressions of NEAT1 and miR-410-3p in MCF-7 breast cancer cell line and MCF-10A 
normal breast cell line were investigated. Expressions of non-coding RNAs were 
analyzed by qRT-PCR. It was determined that NEAT1 increased 2.30 times in cancer 
cell lines compared to normal cell lines. Expressions of miR-410-3p were observed to be 
reduced by -2.85 fold in cancer cell lines compared to normal cell lines. In the transwell
invasion experiment we performed, it was observed that MCF-7 cell lines were invasive 
and MCF-10A could not gain invasion ability.
Our study showed that the increased expression of NEAT1 was associated with 
the invasiveness, in accordance with the literature, and at the same time, the increase in 
expression was in parallel with the decrease in the expression of its target, miR-410-3p.