Korpus kallozum disgenezili hastalarda subtelomerik değişikliklerin MLPA yöntemi ile incelenmesi
Analysis of subtelomeric rearrangements in patients with corpus callosum dysgenesis
Yazar: ENDER KARACA
Danışman: DOÇ. DR. MUSTAFA ÖZEN
İstanbul Üniversitesi / Cerrahpaşa Tıp Fakültesi / Tıbbi Genetik Ana Bilim Dalı
Derece: Tıpta Uzmanlık, 2011
Konu: Genetik = Genetics
Dizin: Corpus callosum = Corpus callosum ; Fenotip = Phenotype ; Genotip = Genotype ; Malformasyonlar = Abnormalities ; Protein S = Protein S

Özet:
Genel Bilgi: Korpus kallozum agenezisi ve hipoplazisi (KKA/KKH) değişik etyolojilere bağlı oluşan bir çok sendromda ve farklı klinik ekspresyonda görülen bir beyin anomalisidir. Çoğunlukla genetik nedene bağlı bir tablo olmasına rağmen bugüne kadar sadece bir kaç gen ilişkilendirilebilmiştir. Keza korpus kallozum agenezisine yol açtığı ispatlanmış tek gen, 1q43-44'te yerleşmiş AKT3 olup, KKA/KKH' yol açtığı düşünülen diğer aday genlerin ve genomik lokusların önemli bir kısmın kromozomların subtelomerik bölgelerinde bulunmaktadırMetod: Çalışmada KKA/KKH bulunan 50 hasta bulunmaktadır. Subtelomerik kromozomal değişikliklerin saptanmasında multiplex ligation-dependent probe amplification (MLPA) yöntemi kullanılacaktır. Ayrıca hastaların klinik özellikleri (fasial dismorfizm, bilişsel fonksiyonlar, epilepsy..vb) ve beyin MR bulguları da sınıflandırılarak fenotip-genotip ilişkilendirilmesi yapılacaktır.Sonuç: Çalışmanın amacı KKA/KKH hastalarında olası subtelomerik yeniden düzenlenmelerin klinik özellikleri ile ilişkilendirilmesi ve bu şekilde genotip-fenotip korelasyonu yapılmasıdır. Diğer yandan KKA/KKH hastalarında gen içeriği bakımından zengin olan subtelomerik değişikliklerin haritalanmasının sorumlu kritik bölgelerin ortaya konması ve yeni aday genlerin belirlenmesine ileri dercede katkıda bulunacağına inanıyoruz.

Abstract:
Backround: Agenesis-Hypoplasia of the corpus callosum (ACC/HCC) is a common brain malformation of variable clinical expression that is seen in many syndromes of various etiologies. Although ACC/HCC is predominantly genetic, few genes have as yet been identified. The only ACC/HCC causative gene identified from one of these regions thus far is AKT3 from 1q43-q44, although recent data suggest that FOXG1 in 14q12 may be another. On the other hand studies for identification of genomic loci contributing to agenesis/hypoplasia of the corpus callosum revealed several candidate loci that dominantly includes subtelomeric regions which are also widely accepted as related to developmental delay/mental retardation (DD/MR). These regions of chromosomes are rich in gene and their rearrangements cannot be identified by conventional chromosome analysis.Method: This study included fifty patients with ACC/HCC. We are currently conducting subtelomeric-MLPA method to determine the subtelomeric copy number variations. Clinical picture (facial dysmorphism, cognitive functions, seizures.etc ), cerebral magnetic resonance imaging findings will be also categorized.Conclusion: The main purpose of this study is to classify patients according to their clinical picture (facial dysmorphism, cognitive functions, seizures.etc ), cerebral magnetic resonance imaging findings and subtelomeric rearrangements. We believe that fine mapping of aberrations in gene-enriched subtelomeric regions in these patients provides both essential clues for localizing critical regions, and a strategy for identifying new candidate genes.