Floresan in situ hibridizasyon (FISH) yöntemi ile çocukluk dönemi akut lenfoblastik lösemide (ALL) 9;22 ve 12;21 translokasyonlarının tanımlanması
Detecting the 9;22 and 12;21 translocations in the childhood acute lymphoblastic leukemia by fluorescence in situ hybridization(FISH)
Yazar: ELİF ÖZDAMAR
Danışman: PROF. BEYHAN TUYSUZ
İstanbul Üniversitesi / Sağlık Bilimleri Enstitüsü / Genetik Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2007
Konu: Genetik = Genetics ; Hematoloji = Hematology
Dizin: FISH = FISH ; Genetik = Genetics ; Genler-ABL = Genes-ABL ; Prekürsör hücreli lenfoblastik lösemi-lenfoma = Precursor cell lymphoblastic leukemia-lymphoma ; Prognoz = Prognosis

Özet:
Çocukluk çağı Akut Lenfoblastik Lösemi (ALL) de sayısal ve yapısal kromozomal anomaliler%80 oranında görülmekte olup prognoz için önem taşımaktadır. Bu dönemdeki olgulardat(9;22)(q34;q11) (Philadelphia kromozomu (Ph)) %5 oranında görülmekte, kötü prognozlailişkilendirilmektedir. t(12;21)(p13;q22) sonucunda TEL/AML1 füzyon geni oluşmaktadır.İyi prognozla ilişkilendirilen TEL/AML1 geni çocukluk dönemi ALL'sinde %25 oranındagörülmektedir. Onbirinci kromozomun q23 bant bölgesinde MLL geninin dahil olduğutranslokasyonlar arasında ALL'de en sık görülenler t(4;11)(q21-q23) ilet(11;19)(q23;p13.3)'dur. Kötü prognoz gösteren MLL geninin sıklığı %3-4'dür . Buçalışmanın amacı; yeni tanı konmuş çocukluk çağı lösemisinde kemik iliği kromozomlarındasitogenetik ve FISH yöntemi ile (12;21) ve t(9;22) ve 11q23'deki MLL geni anomalilerininaraştırılması, iki yöntemin birbirleriyle uyumununun ve translokasyonlar ile lösemiprognozu arasındaki ilişkinin değerlendirilmesiydi. Çalışmamızda ALL'li 30 olgunun kemikiliği örneklerinden sitogenetik ve FISH yöntemiyle t(9;22), t(12;21) ile 11q23 gen anomalileriaraştırıldı. Philadelphia kromozomu (p-210 BCR/ABL) %3,3 (1/30), TEL/AML1 geni %16.7(5/30), MLL gen anomalisi %3.3 (1/30) olarak saptandı. BCR/ABL, TEL/AML1 füzyon genive MLL geni anomalilerinin görülme sıklığı literatür ile uyumlu bulundu. Sitogenetik olaraktatanımlanan Ph kromozomu pozitif olgu kaybedilmiş, t(12;21) pozitif olan 5 olguda 1'ikaybedilmiş, diğer hastalarda 1 yıllık izlem sonucunda remisyon devam etmektedir. MLL genanomalisi olan olguda idame tedavisi sürmektedir. Bu çalışmanın sonucunda; çocukluk çağılösemilerinde kemik iliği kültürlerinde t(12;21) ve t(9;22) ve 11q23'deki MLL genianomalilerinin FISH yöntemi ile kolayca tanımlanabileceğini, translokasyonların hastalığınprognozu için önemli olduğu, kromozomal değişikliklerin değerlendirilmesinde FISH ilesitogenetik yöntemlerin birbirini desteklediği ortaya konulmuştur.Anahtar Kelimeler: Çocukluk çağı ALL, FISH, Ph kromozomu, TEL/AML1 geni,MLL geni

Abstract:
In acute lymphoblastic leukemia (ALL) the numerical and structural anomalies?re seen about%80 and important for the prognosis. In childhood ALL, the prevalence of t(9;22)(q34;q11)?s(Ph chromosome) %5, confers poor prognosis. In childhood ALL the prevalence oft(12;21)(p13;q22)?s (TEL/AML1) %25 and confers a favorable diagnosis. 11q23 translocate(MLL) with other chromosomes in ALL. The most often translocations are t(4;11)(q21-q23)and t(11;19)(q23;p13.3). 11q23 anomalies?re seen %3-4 in childhood ALL and confers poorprognosis. We investigated the frequency of t(9;22), t(12;21), 11q23 rearrangements by FISHand cytogenetics methods, the accordance of 2 methods,the relationship of translocations andprognosis. In this study, we analyzed 30 new ALL diagnosed cases bone marrow samples?.We detected BCR/ABL (p-210) in %3.3 (1/30), TEL/AML1 gene in %16,7 (5/30), 11q23translocations in %3.3 (1/30). Our results show the frequency of BCR/ABL, TEL/AML1,MLL gene?re detected nearly as the percentage obtained in the literature. One BCR/ABLobtained patient by cytogenetics and FISH methods was exitus. In 5 TEL/AML1 geneobtained patient, only 1 patient was exitus. The other patients? are on remission in 1 yearview. The patient that was obtained MLL gene anomaly is in continuation therapy.In this study, we confirm that by FISH method the t(9;22), t(12;21), 11q23 rearrangementsthat are observed difficultly in bone marrow samples? can be easily detected, the importanceof translocations related to the prognosis and the countenance of cytogenetics and FISHmethods.Key Words: Childhood ALL, FISH, Ph chromosome, TEL/AML1 gene,MLL rearrangements