TIM-3 polimorfizmlerinin astim hastaligi ile iliskisi
The relationship with TIM-3 polymorphisms and asthma.
Yazar: NİLÜFER ÇİÇEK EKİNCİ
Danışman: PROF.DR. OLCAY YEGIN
Akdeniz Üniversitesi / Sağlık Bilimleri Enstitüsü / Çocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2007
Konu: Allerji ve İmmünoloji = Allergy and Immunology

Özet:
Yakın bir zamanda, Th1 hücre yüzeyinde TIM gen ailesine ait olanTim-3 adında yeni bir reseptör tanımlanmış ve bu molekülün etkisinin Th1yönetimli immün yanıtlar üzerine olduğu bildirilmiştir. Bu reseptörün, Tlenfositlerde eksprese edilen Galectin-9 adlı ligandı ile etkileşimi sonucundaefektör Th1 hücrelerinin eliminasyonuna neden olduğu ve fonksiyonununbozulması halinde Th1/Th2 yanıtı dengesinin etkilenebileceği gösterilmiştir.Nitekim, bazı toplumlarda TIM-3 geninin değişik polimorfizmlerinin, astım veallerjik rinit insidansıyla ilişkili olduğu gösterilmiştir.Bu çalışmada, Türk toplumunda henüz bu konuya yönelik yapılmış birçalışma olmaması nedeniyle, TIM-3 geninin ifadesine etkili olabileceğimuhtemel olan promotor bölgesindeki -574 T>G ve 3. exondaki +4259 G>Tpolimorfizmlerinin Türk toplumundaki dağılımını ortaya koymayı ve bupolimorfizimlerin astım hastalığının oluşumu ile bir ilişkisinin olup olmadığınıaraştırmayı amaçladık.Bu amaçla, 76 hasta ve 91 sağlıklı bireyden oluşan kontrol grubundakikişilerin periferik kanından izole edilen genomik DNA dan ARMS-PCRyöntemi kullanılarak genotiplendirme yapılmıştır. TIM-3 geni -574 T>Gpolimorfizimi için GG, GT ve TT genotip frekansları kontrol grubundasırasıyla 0.81, 0.17 ve 0.01; hasta grubunda ise 0.75, 0.22 ve 0.03 (p=0,34;Odds oranı=1,43) olarak saptanırken, +4259 G>T polimorfizimi için TT, GTve GG genotip frekansları kontrol grubunda sırasıyla 0.79, 0.21 ve 0.0; hastagrubunda ise 0.89, 0.11 ve 0.0 (p=0,13; Odds oranı=0,540) olarakbulunmuştur. Her iki polimorfizmde de genotip ve allel frekansları açısındanastım ve kontrol grubu arasında istatistiksel olarak anlamlı bir farklılıksaptanmamıştır.Türk toplumunda ilk kez yapılmış olan bu çalışmada her ne kadarincelediğimiz polimorfizmler ve astım hastalığı arasında bir ilişkisaptanamamışsa da, Türk toplumunun TIM-3 geni -574 T>G polimorfizimidağılımı açısından Kore toplumu ile benzerlik gösterdiği ancak, +4259 G>Tpolimorfizmi dağılımının Çin ve Kore toplumundan farklı olduğu gösterilmiştir.Anahtar kelimeler: Astım, Tim-3, Tim-3 4259 G>T, Tim-3 -574 T>G, ARMSPCR

Abstract:
Recently, a new receptor named Tim-3 has been identified on Th1cells. TIM-3 is a member of TIM gene family and affects immune responsemediated by Th1. The ligand for Tim-3, galectin ?9, is expressed on T cellsand interaction of Tim-3 with its ligand causes apoptosis in the Th1 cells. Ithas been shown that dysregulation of Tim-3 functions affects balance ofTh1/Th2 immune responses. To support this view, correlations have beenfound between atopic diseases and polymorphisms of TIM-3 gene in variouspopulations.In this study, we aimed to investigate whether any correlation existsbetween the occurrence of asthma and two of the TIM-3 genepolymorphisms, namely -574 T > G and +4259 G>T, in the Turkishpopulation. For this purpose, we have isolated genomic DNA from peripheralblood of 76 asthmatic patients and 91 healthy individuals, and analysed forthe presence of the above-mentioned polymorphisms using ARMS-PCRtechnique.For the -574 T > G polymorphism, we found that GG, GT and TTfrequencies were 0.81, 0.17 and 0.01 in the control group and 0.75, 0.22 and0.03 in the patient group, respectively (p=0.34, Odds ratio = 1,43). Whereas,for the +4259 G>T polymorphism, the genotype frequencies for TT, GT andGG were 0.79, 0.21, 0.0 for control group and 0.89, 0.11, 0.0 for the testgroup, respectively (p=0,13, Odds ratio = 0,540). We failed to detect astatistically significant difference with respect to the genotype frequencies ofthe patients and controls.Although, there was not a correlation between the presence of any ofthese polymorphisms and the occurrence of asthma, we have found that thegenotype distribution of the Turkish population for the -574 T>Gpolymorphism exhibited a similar pattern to that of seen in Korean population.However, the distribution of the other polymorphism was found to be differentfrom either Chinese or Korean populations.Key words: Asthma, Tim-3, Tim-3 4259 G>T, Tim-3 -574 T>G, ARMS-PCR