Ailesel Akdeniz ateşi (FMF) ile MİR-4520A arasındaki ilişkinin araştırılması
Investigation of the relationship between familial mediterranean fever (FMF) and MIR-4520A
Yazar: BİRNUR ÖZKORUCU
Danışman: PROF. DR. FETHİ SIRRI ÇAM
Manisa Celal Bayar Üniversitesi / Sağlık Bilimleri Enstitüsü / Tıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2022
Konu: Tıbbi Biyoloji = Medical Biology
Dizin: Ailesel akdeniz ateşi = Familial mediterranean fever ; Gen ifadesi = Gene expression ; Mikro RNA = Micro RNA ; Polimeraz zincirleme reaksiyonu = Polymerase chain reaction ; RNA = RNA

Özet:
Amaç; Ailesel Akdeniz Ateşi (FMF); Ortadoğuda çok yaygın görülen, monogenik otozomal resesif otoinflamatuar bir hastalıktır. İnflamatuar yolaklarla ilişkili mi-RNA'lar, hastalığın ekspresyonundan sorumlu tutulmaktadır. miR‐ 4520a'nın ifadesi, FMF mutasyon taşıyıcıları ve kontrolleri arasında farklı olduğu saptanmıştır. Bu çalışmada, FMF mutasyonu taşıyan ve taşımayan hastalarda miR- 4520a ekspresyon seviyesi incelenmesi amaçlanmıştır.
Gereç ve Yöntem; FMF hastaları için rutin moleküler ve klinik olarak tanı alan 30 olgu ile klinik bulgu ve FMF mutasyon değişimi göstermeyen 30 kontrol çalışmaya dahil edilmiştir. MEFV geninde yaygın olarak incelenen 12 mutasyon strip assay kiti ile miRNA ekspresyon seviyeleri ise Real-Time qPCR (RT-qPCR) ile belirlendi.
Bulgular; Çalışmaya alınan kontrol grubunun 20'si kadın, 10'u erkek; hasta grubunun ise 18'i kadın, 12'si erkektir. 13 hastada M694V, 8 hastada R202Q, 7 hastada E148Q, 6 hastada V726A, 5 hastada M680I, 1 hastada I692del, 1 hastada A744S, 1 hastada M694I ve 1 hastada R761H mutasyonları tespit edildi. Her bir kontrol ve hastaya ait miR-4520a ekspresyon düzeyi hesaplanmış olup kontrol ve FMF hasta grupları arasında anlamlı fark bulunmuştur (p=0,002). Kontrol örneklerinde miR-4520a ekspresyon düzeyi ortalama 1,55 olarak bulunmuşken, FMF hasta örneklerinde miR-4520a ekspresyon düzeyi ortalama 2,37 olarak bulunmuştur. E148Q mutasyonlu hastalarda miR-4520a'nın ekspresyon düzeyinde ciddi artış tespit edildi. M694V ve M694V/V726A mutasyonları da istatistiksel olarak anlamlı olduğu görüldü.
Sonuçlar; Yapılan çalışma sonucunda, FMF hasta örneklerinde miR-4520a'nın ekspresyonunun istatiksel olarak anlamlı bir şekilde (1,55 kat) arttığı görülmüş olup hastalığın ekspresyonundan sorumlu olabileceği değerlendirilmektedir.

Abstract:
Aim: Familial Mediterranean Fever (FMF); It is a monogenic autosomal recessive autoinflammatory disease that is very common in the Middle East. Mi-RNAs associated with inflammatory pathways are held responsible for the expression of the disease. The expression of miR‐4520a was found to differ between FMF mutation carriers and controls. In this study, it was aimed to examine the expression level of miR-4520a in patients with and without FMF mutation.
Materials and Methods: For FMF patients, 30 patients with routine molecular and clinical diagnoses and 30 controls without clinical signs and FMF mutation changes were included in the study. MiRNA expression levels were determined by Real-Time qPCR (RT-qPCR) with 12 mutation strip assay kits that are widely examined in MEFV gene.
Results: Of the control group included in the study, 20 were female and 10 were male; The patient group consisted of 18 females and 12 males. Mutations M694V in 13 patients, R202Q in 8 patients, E148Q in 7 patients, V726A in 6 patients, M680I in 5 patients, I692del in 1 patient, A744S in 1 patient, M694I in 1 patient and R761H in 1 patient were detected. MiR-4520a expression levels of each control and patient were calculated, and a significant difference was found between the control and FMF patient groups (p=0.002). The mean expression level of miR-4520a was found to be 1.55 in control samples, while the mean expression level of miR-4520a was found to be 2.37 in FMF patient samples. A significant increase in the expression level of miR-4520a was detected in patients with E148Q mutation. M694V and M694V/V726A mutations were also found to be statistically significant.
Conclusions: As a result of the study, it was observed that the expression of miR-4520a increased in a statistically significant way (1.55 fold) in FMF patient samples, and it is considered that it may be responsible for the expression of the disease.
Key words: