Diyete devam eden otizmli çocuklarda metilentetrahidrofolat redüktaz (MTHFR) geni C677T polimorfizminin belirlenmesi
Diyete devam eden otizmli çocuklarda metilentetrahidrofolat redüktaz (MTHFR) geni C677T polimorfizminin belirlenmesi
Yazar: ÖZNUR YILMAZ
Danışman: PROF. DR. MUHSİN KONUK
Üsküdar Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Moleküler Biyoloji Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2016
Konu: Biyoloji = Biology ; Genetik = Genetics

Özet:
Otizm, karşılıklı sosyal etkileşim, dil ve iletişim becerilerinde bozukluk ve sınırlı ilgi alanları, tekrarlayıcı hareketler gibi davranış problemlerinin gözlemlendiği nörogelişimsel bir bozukluktur. Son yıllarda yapılan genetik çalışmalarda gen kopya sayıları (CNVs), tek nükleotid polimorfizmleri (TNPs) ve mutasyonların Otizm etiyolojisinde önemli bir etkisi olduğu gösterilmiştir. Bu çalışmada folat metabolizmasında yer alan metilentetrahidrofolat redüktaz (MTHFR) geninin C677T polimorfizmi Otizmli çocuklarda incelendi ve MTHFR geninin C677T allelinden kaynaklanan enzim aktivitesi azalmasının Otizmle ilişkili olup olmadığının belirlenmesi amaçlandı.
Çalışmamızda periferik kan örnekleri 30 Otizmli ve 90 sağlıklı kişilerden toplanmıştır. Bu örneklerden DNA izolasyonu yapılmıştır. MTHFR 677. baz çifti bölgesini polimeraz zincir reaksiyonu (PZR) yöntemi ile çoğaltıp, MTHFR C677T varyantını restriksiyon fragment uzunluk polimorfizmi (RFLP) yöntemi ile belirledik. Sonuçlarımıza göre CC, CT, TT frekansları otizmli olgularda 24 (%80), 4 (%13,3), 2 (%6,6) TT ve kontrol grubunda 61 (%67,8), 23 (%25,6), 6 (%6,7) saptanmıştır. Yapılan bu çalışmada hasta - kontrol grupları arasında genotip dağılımları bakımından istatistiksel olarak anlamlı bir fark bulunmamıştır (p=0,384). Ayrıca diyete yanıt veren ve diyete yanıt vermeyen çocuklar arasında T allel frekans farkı ilişkisinin bulunmadığı gözlenmiştir. Ancak çalışmaya alınan hastaların sayısının yetersiz olması ve homojen olmaması nedeniyle beslenmenin genlere olan etkisinin belirlenebilmesi için daha kapsamlı çalışmalar yapılması gerektiği önerilmektedir.
Anahtar Kelimeler: Otizm, genetik, analiz, polimorfizm, diyet

Abstract:
Autism is a neurodevelopmental disorder and characteristic with behavioral problems such as reciprocal social interection, impairment in language and communication skills and restricted interest and repetitive movements. Recent studies showed that gene copy numbers (CNVs) have significant effect on single nucleotide polymorphism (SNPs) and mutations in the etiology of Autism. In this study, we examined the C677T polymorphism of methylenetetrahydrofolate reductase in children with Autism. The aim of the study was the determine any possible relation between C677T allele and autism due to the enzymic activity reducing affect of T allele on MTHFR.
In our study, peripheral blood samples were collected from the 30 children with Autism and 90 healthy children. DNA was extracted from these samples. We determine the MTHFR C677T variant by the rectriction fragment length polymorphism (RFLP) method, while MTHFR 677. base pair region by the polymerase chain reaction (PCR) method. According to our results the frequencies of MTHFR CC, CT, TT genotypes were 24 (%80), 23 (%25,6), 4 (%13,3) in the autistic children and 61 (%67), 23 (%25,6), 6 (%6,7) in the controls, respectively. The present study found no statistically significant relationship between autistic case and controls' genotypes (p=0,384). It was also observed that there was no relation between T allel frequency and diet responses. However, as we had inhomogeneus and insufficient number of patients, the further studies having a large number of the samples are suggested to determine the effect of nutrition on the genes.
Keywords: Autism, genetics, analysis, polymorphism, diet.