Kronik tinnitusta bdnf (beyin kaynaklı nörotrofik faktör) val66met polimorfizmi ile bağlantılı bdnf antisense rna polimorfizmlerinin araştırılması
Investigation of bdnf antisense rna polymophisms in connection with bdnf (brain generated neurotrophic factor) val66met polymophism in chronic tinitus
Yazar: BUSE YÜKSEL
Danışman: DOÇ. DR. SEDA ÖRENAY BOYACIOĞLU
Aydın Adnan Menderes Üniversitesi / Sağlık Bilimleri Enstitüsü / Moleküler Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı / Moleküler Biyoloji Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2022
Konu: Bilim ve Teknoloji = Science and Technology
Dizin: Antisens elementler (genetik) = Antisense elements (genetics) ; Polimorfizm = Polymorphism ; Sinir büyüme faktörleri = Nerve growth factors ; Tinnitus = Tinnitus

Özet:
Tinnitus, dışarıdan herhangi bir uyarı olmaksızın kişinin kulağında veya başının herhangi bir
bölgesinde ses algılamasıdır. Nöral plastitede önemli faktörlerden birisi olan beyin kaynaklı
nörotrofik faktör (BDNF) işitsel yolun gelişiminde anahtar rol oynayan nörotrofik
faktörlerden biridir. BDNF geni, genin downstream yönünde konumlanan uzun kodlama
yapmayan bir BDNF antisens RNA geni (BDNF-AS) ile düzenlenir. Bu nedenle,
hem BDNF ve BDNF-AS işitmede etkili olabilecek aday gen lokusları olabilir. Literatürde
tinnitus ile BDNF Val66Met polimorfizmi ile arasındaki ilişki gösterilirken, BDNF Val66Met
polimorfizmi ile bağlantılı BDNF-AS polimorfizmleri ile ilişkisini sorgulayan bir çalışma
mevcut değildir. Bu nedenle bu çalışmada BDNF Val66Met polimorfizmi ile linkage
disequilibrium gösteren BDNF-AS polimorfizmlerinin tinnitus patofizyolojisindeki yerini
incelemek amaçlanmıştır.
Bu çalışmaya, Aydın Adnan Menderes Üniversitesi Tıp Fakültesi KBB polikliniğine başvuran
en az 3 aydır tinnitus yakınması olan 85 olgu ve tinnitus semptomu ile bir sistemik hastalığı
bulunmayan 60 olgu dahil edilerek ve olgulardan 2cc periferik kan alındı. Alınan periferik
kanlardan toplam 6 BDNF-AS polimorfizmlerine (rs925946, rs10501087, rs1488830,
rs4074134, rs1519480, rs10767658) Fluidigm SNPType metodu ile bakıldı.
Tinnituslu hastalar ve kontrol grubu ile BDNF-AS rs925946, rs10767658, rs1519480
polimorfizmleri genotip dağılımı karşılaştırıldığında istatistiksel olarak anlamlı farklar
saptanmıştır (sırasıyla p=0,020, p=0,002, p=0,002). rs1519480 polimorfizmi için allel
frekansları karşılaştırıldığında istatistiksel olarak anlamlı bir fark saptanmıştır (p=0,009).
rs925946, rs10767658, rs1519480 ve rs1488830 polimorfizmleri tinnitus süresi ile

Abstract:
Tinnitus is the perception of sound in one's ear or in any part of the head without any external
warning. Brain-derived neurotrophic factor (BDNF), one of the important factors in neural
plasticity, is one of the neurotrophic factors that play a key role in the development of the
auditory pathway. The BDNF gene is regulated by a long non-coding BDNF antisense RNA
gene (BDNF-AS) located downstream of the gene. Therefore, both BDNF and BDNF-AS may
be candidate gene loci that may be effective in hearing. While the relationship between
tinnitus and BDNF Val66Met polymorphism has been shown in the literature, there is no
study questioning the relationship between BDNF Val66Met polymorphism and BDNF-AS
polymorphisms. Therefore, in this study, it was aimed to examine the role of BDNF Val66Met
polymorphism and BDNF-AS polymorphisms showing linkage disequilibrium in the
pathophysiology of tinnitus.
In this study, 85 patients with tinnitus complaints for at least 3 months and 60 patients with
tinnitus symptom and no systemic disease who applied to the ENT polyclinic of Aydın Adnan
Menderes University Faculty of Medicine were included, and 2cc of peripheral blood was
obtained from the patients. A total of 6 BDNF-AS polymorphisms (rs925946, rs10501087,
rs1488830, rs4074134, rs1519480, rs10767658) were analyzed from the peripheral blood
taken by the Fluidigm SNPType method.
When the genotype distribution of BDNF-AS rs925946, rs10767658, rs1519480
polymorphisms was compared with tinnitus patients and control group, statistically
significant differences were found (p=0.020, p=0.002, p=0.002, respectively). When the allele
frequencies for the rs1519480 polymorphism were compared, a statistically significant
xvi
difference was found (p=0.009). When rs925946, rs10767658, rs1519480 and rs1488830
polymorphisms were compared with tinnitus duration, a statistically significant difference
was found (p=0.029, p=0.029, p=0.041 and p=0.036).
In conclusion, BDNF-AS rs925946, rs10767658, rs1519480 and rs1488830 polymorphisms
may affect the auditory pathway and may be candidate gene loci for gene polymorphisms that
may have an impact on auditory performance in humans.
Keywords: BDNF gene, BDNF-AS gene polymorphisms, Chronic tinnitus, Val66Met
polymorphism.