İstanbul bölgesinde mycobacterium tuberculosis pekin genotipinin diğer tüberküloz genotipleri ile klinik ve bakteriyolojik olarak karşılaştırılması
İstanbul bölgesinde mycobacterium tuberculosis pekin genotipinin diğer tüberküloz genotipleri ile klinik ve bakteriyolojik olarak karşilaştirilmasi
Yazar: AHMET SERHAN DAĞISTANLI
Danışman: PROF. DR. ZEKİ KILIÇASLAN
İstanbul Üniversitesi / Tıp Fakültesi / Göğüs Hastalıkları Ana Bilim Dalı / İç Hastalıkları Bilim Dalı
Derece: Tıpta Uzmanlık, 2021
Konu: Göğüs Hastalıkları = Chest Diseases
Dizin: Bakteriler = Bacteria ; Genotip = Genotype ; Isparta = Isparta ; Mycobacterium tuberculosis = Mycobacterium tuberculosis ; Tüberküloz = Tuberculosis ; İlaçlara direnç = Drug resistance

Özet:
Amaç: İstanbul'daki tüberküloz hastalarının Pekin genotipi taşıyanlarının sosyo-demografik özellikleri, radyolojik özellikleri, tedavi yanıtları, ilaç dirençleri gibi özelliklerini Pekin genotipi olmayan tüberküloz hastalarıyla kıyaslamaktır. Gereç ve Yöntem: İstanbul' da 2013-2019 yılları arasında Verem Savaşı Dispanserleri'ne kayıtlı, ilaç direnç testleri yapılmış, İstanbul Üniversitesi Deneysel Tıp Araştırmaları Enstitüsü'nde (DETAE) Tüberküloz ve Moleküler Epidemiyoloji biriminde spoligotyping tiplendirme yöntemiyle genotip tayini bulunan olguların kayıtları retrospektif olarak taranarak veriler toplandı. Saptanan 86 Pekin suşu hastasının ve randomize olarak seçilen 146 Pekin suşu olmayan toplamda 232 olgunun dosyası tarandı ve karşılaştırıldı.
Hastaların yaşı, cinsiyeti, uyruğu, memleketi, medeni durumu, BCG skarı, tüberkülozlu hasta ile temas öyküsü, kronik ek hastalık varlığı, madde kötüye kullanımı öyküsü olup olmadığı, HIV enfeksiyonu varlığı, sigara öyküsü, alkol öyküsü, olgu tanımı, radyolojik yaygınlık durumu, kavite varlığı, yurtdışı seyahat öyküsü, Çin/Avrasya bölgesinden kişi ile temas öyküsü, H/R/E/SM/H+R direnç varlığı/herhangi bir ilaca direnç olup olmadığı, tanı şekli, tutulan organ, verilen tedavi, tedavi sonuçları vaka bilgi formuna kaydedildi.
Bulgular: Pekin grubunda 86 (%37.1), kontrol grubunda 146 (%62.9) hasta olmak üzere toplamda 232 hasta çalışmaya dahil edildi. Pekin grubunda kontrol grubuna kıyasla hastaların yaşı anlamlı olarak daha düşük (p<0.001); yabancı uyruklu olma (p<0.001), yurtdışı seyahat öyküsü (p<0.001), Çin/Avrasya bölgesinden kişi ile temas öyküsü (p<0.001), bekar olma oranı(p=0.004), akciğer dışı tutulum (p=0.017), önceden tedavi görmüş olma (p=0.003), tedavi başarısızlığı (p=0.001), H/R/E/SM/H+R direnci/herhangi bir ilaca direnç oranı (p<0.001) anlamlı olarak daha yüksek saptandı. Pekin grubu ve kontrol grubu içerisindeki yeni olguların R, H+R ve herhangi bir ilaca karşı direnç paternlerine bakıldığında Pekin grubu yeni olguların direnç paterni kontrol grubunun yeni olgularına göre anlamlı olarak (p<0.001) daha yüksekti.
Pekin grubu içerisinde T.C. uyruklu kişiler ile yabancı uyruklu kişiler arasında direnç paternleri açısından anlamlı farklılık saptanmadı.
Sonuç: Türkiye'de görülme sıklığı artan Pekin suşunun ilaç direnci ve tedavi başarısızlığı ile ilişkisi mevcuttur. Etkin tüberküloz kontrolü sağlamak açısından rutin olarak genotipleme yapmanın kontrol programına katkı yapıp yapmayacağı konusunda ileri çalışmalar yapılmasının yararlı olabileceği düşünülmektedir.

Abstract:
Aim: The aim of this study is to compare socio-demographic characteristics, radiological features, treatment responses and drug resistance patterns of Beijing genotype TB patients with non-Beijing genotype patients in Istanbul
Materials and Methods: Data were collected by retrospectively scanning the records of the cases registered to Tuberculosis Dispensaries in Istanbul between 2013-2019, whose drug resistance tests were performed, and whose genotype was determined by spoligotyping typing method in the Tuberculosis and Molecular Epidemiology unit of the Experimental Medicine Research Institute (DETAE) of İstanbul University. The files of a total of 232 patients with 86 Beijing strains and randomly selected 146 patients without Beijing strains were scanned and compared.
Patients' age, gender, nationality, hometown, marital status, BCG scar, history of contact with a tuberculosis patient, presence of chronic disease, history of substance abuse, presence of HIV infection, smoking history, alcohol history, case definition, radiological patterns, presence of cavity, history of travel abroad, history of contact with a person from China/Eurasia region, presence of H/R/E/SM/H+R resistance, resistance to any drug, type of diagnosis, organ involved, treatment given, treatment results recorded in the patient registration form..
Findings: A total of 232 patients, 86 (37.1%) in the Beijing group and 146 (62.9%) in the control group, were included in the study. The age of the patients was significantly lower in the Beijing group compared to the control group (p<0.001); foreign nationality (p<0.001), travel abroad history (p<0.001), history of contact with a person from China/Eurasia region (p<0.001), rate of being single (p=0.004), extrapulmonary involvement (p=0.017), previous treatment history (p=0.003), treatment failure (p=0.001), H/R/E/SM/H+R resistance/resistance to any drug (p<0.001) were found to be significantly higher. When the R, H+R and resistance patterns of the new cases in the Beijing group and the control group were examined; the resistance pattern of the new cases in the Beijing group was significantly higher (p<0.001) than the new cases in the control group.
When the group with R resistance and the group without R resistance are compared among the total cases; there was no significant difference in resistance patterns between Turkish nationals and foreign nationals in the Beijing group.
Result: The Beijing strain, which has an increasing incidence in Turkey, is associated with drug resistance and treatment failure. It is thought that it may be useful to carry out further studies on whether routine genotyping will contribute to the control program in terms of providing effective tuberculosis control.