Metabolik sendromlu hastalarda atp-binding kaset transporter a1 genindeki mutasyonların saptanması
Possible correlation of mutations in the atp-binding cassette transporter a1 gene with metabolic syndrome
Yazar: NESLİHAN ÇOBAN
Danışman: PROF.DR. NİHAN ERGİNEL ÜNALTUNA
İstanbul Üniversitesi / Sağlık Bilimleri Enstitüsü / Genetik Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2006
Konu: Kardiyoloji = Cardiology ; Moleküler Tıp = Molecular Medicine ; Tıbbi Biyoloji = Medical Biology

Özet:
ÖZETÇoban N. Metabolik Sendromlu Hastalarda ATP-Binding kaset taşıyıcı A1 (ABCA1)genindeki mutasyonların saptanmasıİstanbul Üniversitesi Sağlık Bilimleri Enstitüsü, Genetik ABD. Yüksek Lisans Tezi. İstanbul.2006Amaç: Metabolik Sendrom (MS), düşük HDL-K düzeyinin de yer aldığı beş kriterden üçününbir araya gelmesi sonucunda oluşmaktadır. ABCA1 genindeki polimorfizmlerin plazma HDL-K düzeyi ile ilişkili olduğu gösterilmiştir. Bu polimorfizmlerin trigliserid değerinin düşmesive HDL-K düzeyinin yükselmesi ile bağlantılı olduğu belirtilmiştir.Bu nedenle çalışmamızda ilk olarak genin önemli fonksiyonel bölgelerine karşılıkgelen ekzonların incelenmesi ile bu bölgelerdeki mutasyonların saptanması hedeflendi. İkinciolarak, ABCA1 geni R219K polimorfizminin lipid düzeyleri üzerine olan mevcut etkilerininve MS ile ilişkisinin araştırılması amaçlandı.Yöntem: Çalışmada ABCA1 geninin 14., 19. ve 49. ekzonları SSCP analizi ile incelenmiştir.ABCA1 geni R219K genotipleri RFLP yöntemi ile belirlenmiştir. İstatistiksel analizler ?MannWhitney U? testi ile yapılmıştır.Sonuç: SSCP analizinde her bir ekzon için 109 sağlıklı ve 109 MS'lu birey incelenmiştir.İncelediğimiz hasta ve sağlıklı gruptaki tarama sonucunda bu ekzonlarda herhangi bir farklılıksaptanmamıştır. R219K polimorfizmi 181 MS'lu ve 173 sağlıklı kontrolde çalışılmıştır.Genotip (RR: % 34.3, %37 RK: %51.9, %50.9 KK: %13.8, %12.1 sırasıyla hasta ve sağlıklıkontrollerde) ve allel frekansları ( 0.62, 0.65 ve 0.38, 0.39 sırasıyla sağlıklı kontrol vehastalarda) açısından iki grup arasında istatistiksel olarak anlamlı bir fark gözlenmemiştir.Tüm grupta, RR genotipi ile karşılaştırıldığında K allelini taşıyan bireylerde lipid değerleriilişkili bulunmuştur. Total Kolesterol (p=0.004), LDL-K (p=0.004) ve Lp(a) (p=0.007)değerleri K allelini taşıyanlarda anlamlı derecede yüksek çıkmıştır.Bu çalışma sonucunda, MS'lu bireyler ve sağlıklı kontrol grubu arasında ABCA1genindeki R219K polimorfizmi açısından istatistiksel bir fark gözlenmedi. ABCA1 genininSSCP analizi ile incelenen 14., 19. ve 49. ekzonlarında MS'lu bireylerde ve kontrollerdefarklılık belirlenmemiştir.Anahtar Kelimeler : ABCA1, Metabolik Sendrom, HDL-K, SSCP, RFLPBu çalışma İstanbul Üniversitesi Bilimsel Araştırma Projeleri Birimi tarafından T-608/17032005 no'lu proje olarak desteklenmiştir.

Abstract:
ABSTRACTCoban N. Possible Correlation of Mutations in the ATP-Binding Cassette Transporter A1Gene with Metabolic SyndromIstanbul University, Institute of Health Science, Genetics Common Programme, Istanbul,2006Aim: Presense of Low HDL-Cholesterol level is one of the factors that leads to MetabolicSyndrome. Polymorphisms in the gene are thought to have correlation with changes in bloodHDL and trigliceride levels.The aim of this study is to explore the relationship between Metabolic Syndrome and R219Kpolymorphism, furthermore, to investigate probable new mutations in the functional regionsof the ABCA1 gene (exons 14, 19 and 49).Method: 14th, 19th and 49th exons are analyzed using SSCP (single strand conformationalpolymorphism) method. R219K genotypes are determined using RFLP (restriction fragmentlength polymorphism) method. Statistical analysis are done using the ?Mann Whitney U? test.Results: First, 109 healthy individuals and 109 Metabolic Syndorme-patients were analyzedfor each exon. No differences between the exons of the healthy-group and the patient- groupwere found. Secondly, 181 MS patients and 173 healthy controls were analyzed for R219Kpolymorphism. Genotypes (RR: 34.3%, 37% RK: 51.9%, 50.9% KK: 13.8%, 12.1%respectively, MS patients and healthy controls) and allelle frequencies (0.62, 0.65 ve 0.38,0.39 respectively, MS patients and healthy controls) did not show statistically significantdifferences between the two groups. However, when the individuals carrying the K allellewere compared to the individuals carrying the RR genotype, a correlation to total cholesterol,LDL-K and Lipoprotein a (Lp(a) was identified. The total cholesterol (p=0.004), LDL-K(p=0.004) and Lp(a) (p=0.007) levels are meaninfully higher in the individuals carrying the Kallelle, than the ones with R.In conclusion, no relationship between the R219K polymorphism in the ABCA1 geneand Metabolic Syndrome was established in this particular study population. In 14th, 19th and49th exons of ABCA1 gene, we did not found any difference between the two groups bySSCP technique.Key Words: ABCA1, metabolic syndrome, HDL-C, SSCP, RFLP.This study was supported by The Research Support Unit of İstanbul University as theproject no T-608/17032005