Pulmoner enfeksiyondan izole edilen pseudomonas aerugınosa'nın çoklu ilaç direncinde virülans genlerinin varyasyonu
Virulence genes variation in multidrug resistant pseudomonas aeruginosa isolated from pulmonary infection
Yazar: FOUAD MAHMOOD ABBOOD AL ALWANI
Danışman: PROF. DR. SEÇİL AKILLI ŞİMŞEK
Çankırı Karatekin Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Biyoloji Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2024
Konu: Biyoloji = Biology

Özet:
Pseudomonas aeruginosa, antibiyotiklere karşı çok dirençli olması nedeniyle 
tedavisinde genellikle birden fazla antibiyotik kullanılmaktadır. Doğada çok yaygın 
olan bu tür, nemli ortamlarda bol miktarda bulunur. Hasarlı deride enfeksiyon 
(yanıklar), idrar yolu enfeksiyonları (kateterler), damar içi enfeksiyonlar 
(enjeksiyonlar), menenjit (lomber ponksiyon), solunum yolu enfeksiyonları (kistik 
fibrozis patojenleri), ektima gangrenozum (deri nekrozu), yüzücülerde otitis eksterna 
gibi çeşitli durumlarda patojen olabilirler. Bu çalışma kapsamında, solunum yolu 
enfeksiyonu olan 150 (%40 erkek ve %60 kadın) hastadan örnek alınmıştır. Bu örnekler 
MacConkey agar ve Cetrimide agar gibi farklı kültür ortamlarında geliştirilerek 
biyokimyasal testlere tabi tutulmuşturr. Tanımlamadan sonra, P. aeruginosa izolatları 
daha sonra kullanılmak üzere -20°C'de %20 gliserol ile desteklenmiş LB broth içinde 
saklanmıştır. Elde edilen sonuçlar, hastalardan izole edilen tüm örneklerin agar besiyeri 
ve manitol tuzlu agar gibi optimal kültür ortamlarında bakteri üremesi açısından pozitif 
olduğunu göstermiştir. Ayrıca, örneklerin 35'inde (%23,3) pozitif bakteri üremesi tespit 
edilmiştir. Ayrıca, PCR ürünleri jel elektroforezinde beklenen boyuttaki bakteriyel 
CTXM (676bp), GES (692bp), OXA (928bp), TEM (766bp) ve SHV (827bp) geninin 
spesifik amplifikasyonuyla doğrulanmıştır. Bunlara ek olarak, Pseudomonas 
aeruginosa'nın farklı antibiyotiklere karşı direnç gösterdiği belirlenmiştir. En yüksek 
direnci Seftazidim'e, en düşük direnci ise Siprofloksasin'e karşı tespit edilmiştir. Elde 
edilen sonuçlar, Pseudomonas aeruginosa ‗ nin birçok antibiyotiğe dirençli olduğu 
sonucunu ortaya koymuştur.

Abstract:
Since Pseudomonas aeruginosa is very resistant to antibiotics, more than one antibiotic 
is usually used in its treatment. This species, which is very common in nature, is 
abundant in humid environments. They can cause various pathogens such as infection of 
damaged skin (burns), urinary tract infections (catheters), intravenous infections 
(injections), meningitis (lumbar puncture), respiratory tract infections (cystic fibrosis 
pathogens), ecthyma gangrenosum (skin necrosis), otitis externa in swimmers. In this 
study, samples were collected from 150 patients (40% males and 60% females) with 
respiratory tract infections. These samples were cultured on different culture media such 
as MacConkey agar and Cetrimide agar and identified by biochemical tests. After 
identification, P. aeruginosa isolates were stored in LB broth supplemented with 20% 
glycerol at -20°C for later use. The results obtained showed that all samples isolated 
from patients were positive for bacterial growth on optimal culture media such as agar 
medium and mannitol saline agar. Moreover, positive bacterial growth was detected in 
35 (23.3%) of the samples. Furthermore, PCR products were resolved by gel 
electrophoresis and specific amplification of bacterial CTXM (676bp), GES (692bp), 
OXA (928bp), TEM (766bp) and SHV (827bp) genes of the expected size was 
confirmed. In addition, Pseudomonas aeruginosa showed resistance to different 
antibiotics. While the highest resistance was determined against Ceftazidime, the lowest 
resistance was determined against Ciprofloxacin. It was concluded that Pseudomonas 
aeruginosa bacteria obtained from different clinical sources were resistant to many 
antibiotics. The highest resistance was found against Ceftazidime and the lowest 
resistance was found against Ciprofloxacin. The results revealed that Pseudomonas 
aeruginosa was resistant to many antibiotics.