Yerli alabalıklar (Salmo trutta sp. L.) arasındaki genetiksel varyasyonun mikrosatelit markırlar kullanılarak belirlenmesi
Determination of genetical variations of indigenous trout species (Salmo trutta sp. L.) with microsatellite markers
Yazar: SALTUK BUĞRAHAN CEYHUN
Danışman: DOÇ. DR. ABDULKADİR ÇİLTAŞ
Atatürk Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Su Ürünleri Ana Bilim Dalı
Derece: Doktora, 2007
Konu: Biyoteknoloji = Biotechnology ; Su Ürünleri = Aquatic Products ; Ziraat = Agriculture
Dizin: Alabalıklar = Trouts ; Mikrosatelitler = Microsatellites ; Salmo trutta labrax = Salmo trutta labrax

Özet:
Bu çalısmada Türkiye'de bulunan 2'si göl 3'ü derede yasayan 5 dogal Salmo trutta L.populasyonu arasındaki fenotipik özellikler ve 10 mikrosatelit markır kullanılarak genotipikvaryasyon arastırılmıstır. Mikrosatelit bölgelere SSCP uygulamaları ile her lokustaki allelsayıları tespit edilmistir. Çalısılan 10 adet mikrosatelit lokusta toplam 62 adet allel gözlenmistir.Faktöriyel benzerlik analizi sonucu tüm populasyonların birbirlerinden ayrı gruplar olusturdugukaydedilmistir.Tüm lokuslar bazında beklenen heterozigotlugun (He) 0.602-0.668 arasında ve gözlenenheterozigotlugun (Ho) 0.570-0.670 degerleri arasında degistigi saptanmıstır. Agrı Balıklı gölpopulasyonunda Ho degeri He degerinden istatistiki olarak önemli derecede yüksek çıkmıstır(p<0.05). Populasyon için populasyon içi fiksasyon indeksi (FIS) degerlerinin ?0.0370 (AgrıBalıklı Göl) ile 0.1818 (Yesildere) arasında degistigi, tüm lokuslar için hesaplananpopulasyonlar arası genetik çesitlilik (FST) degerinin ise 0.0790 oldugu saptanmıstır.Populasyonlar arası hesaplanan FST degerlerine göre, populasyonlar arası genetik mesafelerden4'ü önemli bulunmustur. Bes populasyondan 4'ünün Hardy-Weinberg dengesinde (HWE)oldugu belirlenmistir. Populasyon içi genetik mesafenin dere formlarına göre göl formlarındadaha kısa oldugu görülmüstür.

Anahtar Kelimeler: Salmo trutta, mikrosatelit, SSCP, genetik varyasyon

Abstract:
In this study phenotypic properties and genotypic differences of 5 different trout populations, 2of them found in lakes and 3 of them in rivers, were compared by using microsatellite markers.Allele numbers in each locus were determined by application of SSCP to the microsatellitesections. A total of 62 alleles were observed from 10 microsatellite locus. According to theresults from factorial correspondence analysis, it was determined that all of the populations wereformed different groups from each other.Considering all locus, expected heterozygosity (He) and observed heterozygosity (Ho) valueswere changed from 0.602-0.668 and 0.570-0.670 respectively. Ho value was significantly(p<0.05) higher than He value of populations of Agrı Balıklı Lake. Fixation index forsubpopulations (FIS) values were ranged from -0.0370 (Agrı) ? 0.1818 (Yesildere) inpopulations and the overall average diversity between populations (FST) value of the all locuswas calculated as 0.0790. According to FST values calculated from between populations, 4 of thegenetic distances between populations were found significant (p<0.05). It was determined that 4of the 5 populations were at the Hardy-Weinberg equilibrium. Considering genetically distancein populations, it was observed that the distance was shorter in lake forms compared to Riverforms.Keywords: Salmo trutta, microsatellite, SSCP, genetic variation