Çocuk yoğun bakım ünitesine yatan hastaların solunum yolu multiplex pcr sonuçlarının incelenmesi
Evaluation of respiratory tract multiplex pcr results in pediatric intensive care unit patients
Yazar: MEHMET FATİH AYBAR
Danışman: DOÇ. DR. GÜRKAN ATAY
Sağlık Bilimleri Üniversitesi / İstanbul Ümraniye Eğitim ve Araştırma Hastanesi / Çocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı
Derece: Tıpta Uzmanlık, 2024
Konu: Çocuk Sağlığı ve Hastalıkları = Child Health and Diseases

Özet:
Amaç: Akut solunum yolu enfeksiyonları günümüzde hala çocuk yaş grubu hastalarında önemli morbidite ve mortalite nedenleri arasında ilk sıralarda yer almaktadır. Çocuk yoğun bakım ünitesinde (ÇYBÜ) yatan kritik hastalarda solunum yetmezliği ve solunum sıkıntısı başlıca yatış endikasyonları arasındadır.Bu hastaların solunum yolu enfeksiyonlarınıerken dönemde tanımlamak ve patojeni saptamak tanı ve tedavide oldukça önemlidir.
Akut solunum yolu enfeksiyon tanısında etkenlerin tespitiiçin farklı tetkikler kullanılır, bunlardan biri de özellikle bir örnekte çok sayıda solunum patojenini aynı anda ve kısa sürede tespit edebilen multiplex polymerase chain reaction (PCR)testidir.
	Solunum yolu multiplex PCR kullanımı ile ilgili bir çok çalışma yapılmış, bu  araştırmalarda antibiyotik kullanımına etkisi,çocuk hastalarda saptanan etkenlerin hastaların  klinik bulgularına etkisine dikkat çekilmiştir .
Çalışmamızın amacı, yoğun bakım ünitesine yatırılan pediatrik hastaların solunum yolu multiplex PCR sonuçlarını değerlendirmek,solunum yolu patojenlerinin prevalansını ve klinik sonuçlarla olan ilişkisini belirlemektir.

Gereç ve Yöntemler:Çocuk yoğun bakım ünitesine Nisan 2021 – Nisan 2023 tarihleri arasında yatırılan1 ay-18 yaş arası tüm hastalar retrospektif olarak değerlendirildi, yaş, cinsiyet, yatış nedenleri, semptomları,vital bulguları,laboratuvar parametreleri, solunum yolu PCR ve kültür sonuçları klinik durum ve survi incelendi. Dosya verileri yetersiz olan ve PCR alınmayan hastalar çalışmaya dahil edilmedi.
VerilerIBM SPSS Statistics 25 © Copyright SPSS Inc. 1989, 2017 yazılımı kullanılarak analiz edildi. 

Bulgular: Çalışmaya toplamda 160 pediatrik hasta dahil edildi. 96 hastanın PCR sonucu pozitifti, bu hastaların  %49,4 ünde virüs,  %24,4 ünde bakteri tespit edildi.En sık tespit edilen patojenlerRhino(RV)/enterovirüs(EV), Respiratuvarsinsityal virüs(RSV) ve haemophilusinfluenzae (HİB) oldu. Pozitif üreme saptanan 96 hastanın  %31 inde koinfeksiyonlargözlendi. Solunum sıkıntısı nedeniyle yatan hastaların multiplex PCR pozitifliği anlamlı şekilde yüksekti(p<0.05). 0-5 yaş arası hasta grubu ile PCR pozitifliği arasında anlamlı bir ilişki saptandı (p=0,22). PCR pozitif olan ve koinfeksiyon saptanan hastalarla ile solunum takip şekli (spontan, non-invazif, entübe) arasında anlamlı bir ilişki saptanmadı (p=0,111).PCR pozitifliği saptanan hastalarda burun akıntısı ve öksürük varlığı, PCR negatif olan hastalara göre anlamlı olarak daha fazlaydı(p<0.001).Çalışmamızda, PCR pozitif hastalarda PCR negatif hastalara göre nötrofil sayısı daha düşük, ALT, AST,  kreatinin ve laktat daha yüksekti.

Sonuç: Solunum yolu multiplex PCR yoğun bakım ortamında, birden fazla solunum yolu patojeninin hızlı bir şekilde tespit edilmesini sağlayan değerli bir tanı aracıdır. Spesifik patojenlerin hızlı bir şekilde tespiti klinik takip ve tedavide oldukça önemlidir, solunum yolu enfeksiyonlarında etkenler çoğunlukla virüslerdir ve mevsimsel geçiş ve yaş ile sıklığı değişebilmektedir. Erken tespit ile gereksiz antibiyotik kullanımı engellenebilir, antiviral ve semptomatik tedavide yol gösterici olabilir. Prospektif ve çok merkezli çalışmaların yapılmasına ihtiyaç vardır.

Anahtar Kelimeler: akut solunum yolu enfeksiyonu, multiplex PCR, çocuk yoğun bakım

Abstract:
Objective: Acute respiratory infections remain one of the leading causes of morbidity and mortality among pediatric patients. Respiratory failure and respiratory distress are among the primary indications for admission to the Pediatric Intensive Care Unit (PICU). Early identification of respiratory infections and detection of pathogens in these patients are crucial for accurate diagnosis and effective treatment. Various diagnostic tests are used to identify the causative agents of acute respiratory infections, one of which is the multiplex polymerase chain reaction (PCR) test, capable of detecting multiple respiratory pathogens simultaneously and rapidly. Several studies have been conducted on the use of respiratory multiplex PCR, focusing on its impact on antibiotic usage and the clinical implications of pathogens detected in pediatric patients. The aim of our study is to evaluate the respiratory multiplex PCR results of pediatric patients admitted to the intensive care unit, and to determine the prevalence of respiratory pathogens and their association with clinical outcomes.

Materials and Methods: All patients aged 1 month to 18 years admitted to the Pediatric Intensive Care Unit between April 2021 and April 2023 were retrospectively evaluated. Age, gender, reasons for admission, symptoms, vital signs, laboratory parameters, respiratory PCR and culture results, clinical status, and survival were analyzed. Patients with insufficient file data and those who did not undergo PCR testing were excluded from the study. The data were analyzed using IBM SPSS Statistics 25 © Copyright SPSS Inc. 1989, 2017 software.

Results: A total of 160 pediatric patients were included in the study. PCR results were positive in 96 patients, with viruses detected in 49.4% and bacteria in 24.4% of these cases. The most frequently identified pathogens were Rhinovirus (RV)/Enterovirus (EV), Respiratory Syncytial Virus (RSV), and Haemophilus influenzae (HIB). Coinfections were observed in 31% of the 96 patients with positive cultures. Multiplex PCR positivity was significantly higher in patients admitted due to respiratory distress (p<0.05). A significant relationship was found between the 0-5 year age group and PCR positivity (p=0.22). No significant relationship was observed between the respiratory support mode (spontaneous, non-invasive, intubated) and patients with PCR positivity and coinfections (p=0.111). The presence of rhinorrhea and cough was significantly higher in PCR-positive patients compared to PCR-negative patients (p<0.001). In our study, neutrophil counts were lower, while ALT, AST, creatinine, and lactate levels were higher in PCR-positive patients compared to PCR-negative patients.

Conclusion: Respiratory multiplex PCR is a valuable diagnostic tool in the intensive care setting, enabling the rapid detection of multiple respiratory pathogens. The rapid identification of specific pathogens is crucial for clinical management and treatment, as viruses are the predominant causes of respiratory infections, with frequency varying by season and age. Early detection can prevent unnecessary antibiotic use and guide antiviral and symptomatic treatment. Prospective and multicenter studies are needed.

Keywords: acute respiratory infection, multiplex PCR, pediatric intensive care