Yerel Bacillus thuringiensis suşlarında sip gen ve proteinlerinin araştırılması
Investigation of sip genes and proteins in local Basillus thuringiensis strains
Yazar: ENİSE YAZICI
Danışman: PROF. DR. SEMİH YILMAZ
Erciyes Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Tarımsal Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2023
Konu: Ziraat = Agriculture
Dizin: Bacillus thuringiensis = Bacillus thuringiensis ; SIP = SIP

Özet:
B. thuringiensis (Bt), Bacillus cereus (Bc) grubunun bir üyesi olup Gram (+), insektisidal
protein üretebilen sporlu bir toprak bakterisidir. Zararlı böceklere karşı mücadele amacı
ile ürettikleri insektisidal kristal proteinler (Cry), vejetatif insektisidal proteinler (Vip),
salgılanmış insektisidal proteinler (Sip), ve sitolitik proteinler (Cyt) ile birlikte sporları
özellikle de tarımda kullanılan başarılı biyoinsektisitlerin ana maddesini oluşturmaktadır.
Bunlardan elde edilen farklı formülasyonlar böceklere çeşitli şekillerde uygulanmakta ve
etkili sonuçlar alınmaktadır. Bu özelliği nedeniyle günümüzde en etkili ve başarılı şekilde
kullanım alanı olan biyo-insektisit kaynağıdır. Bugüne kadar 78 Cry proteini, 3 Cyt
proteini, 4 Vip proteini ve 2 Sip proteini kullanılarak Lepidopter, Coleopter, Dipter,
Nematod, Himenopter gibi takımlardaki çok sayıda böcek türü üzerinde spesifik aktivite
gösteren ürün elde edilmiştir. Bu çalışma daha önceki çalışmalarımızda izole edilerek
tanımlanmış olan 116 yerel Bt suşunun sip genleri taşıyıp taşımadığının ve ilgili proteini
üretip üretmediğinin belirlenmesi amacı ile yürütülmüştür. 116 adet bakteri suşunda sipa ve sip-s primeri ile yapılan PCR çalışmasında 33 bakteri suşunda sip geni tespit
edilmiştir. Diğer primerler kullanılarak yapılan PCR çalışmalarından sip geni ile ilgili
bant görüntüsü alınamamıştır. Sip geni bulunduran suşlardan protein izolasyonu yapılarak
SDS-PAGE analizi sonucunda kaydedilen görüntülerde 40-41 kDA büyüklüğünde sip
geni içeren bakteri suşları belirlenmiştir. Böylece özellikle Coleopter zararlılarına yönelik
biyoaktivite çalışmaları, muhtemel toksisitesi ve kullanılabilirliği konusunda önemli
bilgiler elde edilmiştir. Anahtar Kelimeler: Bacillus thuringiensis, sip geni, Sip proteini

Abstract:
B. thuringiensis (Bt) is a member of the Bacillus cereus (Bc) group and is a Gram (+)
spore soil bacterium capable of producing insecticidal proteins. Insecticidal crystalline
proteins (Cry), vegetative insecticidal proteins (Vip), secreted insecticidal proteins (Sip),
and cytolytic proteins (Cyt) and their spores are the main ingredients of successful
bioinsecticides used especially in agriculture. They are applied in various ways through
different formulations obtained from them and effective results are obtained. Due to this
feature, it is the most effective and successfully used bioinsecticide source today. To date,
78 Cry proteins, 3 Cyt proteins, 4 Vip proteins and 2 Sip proteins have been used to obtain
products with specific activity on many insect species in orders such as Lepidoptera,
Coleoptera, Diptera, Nematodes and Hymenoptera. This study was carried out to
determine whether 116 local Bt strains, which were isolated and identified in our previous
studies, carry sip genes and produce corresponding proteins. In 116 bacterial strains, sip
gene was detected in 33 of them in PCR studies with sip-a and sip-s primers. No band
image related to the sip gene was obtained from PCR studies with other primers. Protein
isolation was performed from the strains containing sip gene and the images recorded as
a result of SDS-PAGE analysis revealed bacterial strains containing 40-41 kDa Sip
proteins. Thus, valuable information was obtained on bioactivity studies, possible toxicity
and their usability especially against Coleopteran species. Keywords: Bacillus thuringiensis, sip gene, Sip protein