Yoğun bakım ünitelerinden izole edilen pseudomonas aeruginosa suşlarında N-açil homoserin lakton üretiminin araştırılması
Investigation of N-acyl homoserine lacton production of pseudomonas aeruginosa isolated from intensive care units
Yazar: SEYHAN ULUSOY
Danışman: Y.DOÇ.DR. GÜLGÜN TINAZ
Süleyman Demirel Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Biyoloji Ana Bilim Dalı
Derece: Doktora, 2007
Konu: Mikrobiyoloji = Microbiology ; Moleküler Tıp = Molecular Medicine
Dizin: Pseudomonas aeruginosa = Pseudomonas aeruginosa

Özet:
Bu çalısmada, Süleyman Demirel Üniversitesi Arastırma ve Uygulama HastanesiYoğun Bakım Servisi hastalarından izole edilmis 100 adet P. aeruginosa klinikizolatı kullanılmıstır. Bu izolatlar, Chromobacterium violaceum CV026 veAgrobacterium tumefaciens NT1 indikatör susları kullanılarak, AHL sinyalmoleküllerinin üretimleri açısından test edilmistir. C. violaceum CV026 susukullanılarak yapılan testlerde yirmi adet izolatın BHL sinyal molekülünü üretemediğitespit edilmistir. ?nce Tabaka Kromatografisi kullanılarak BHL sinyal molekülününbu izolatlarda bulunmadığı doğrulanmıstır. Bu izolatlar proteaz, ramnolipid,piyosiyanin, elastaz, lasA gibi virülens faktörleri ayrıca; yüzme, titreme ve kaymahareketleri gibi kontrolü çevreyi algılama sistemi tarafından gerçeklestirilenözellikler bakımından analiz edilmistir. Bu izolatlar çevreyi algılama sistemi lasR,lasI, rhlR ve rhlI genlerinin varlığı açısından analiz edilmistir. Sonuçta dört adetklinik izolat rhlR ve rhlI genleri için dizi analizi yaptırılmıstır. Ve dört susun ikisinderhlR ve rhlI genlerinde, diğer iki susta ise sadece rhlI geninde mutasyon tespitedilmistir. Bu mutasyonlar daha önce rapor edilmemistir. Bu mutasyonlar izolatlarda,BHL sinyal molekülü üretimindeki bozukluğun yanı sıra virülens faktörlerininüretilmesindeki bozuklukları da açıklamaktadır. Bu klinik P. aeruginosa izolatlarıçevreyi algılama sistemlerinde bozukluk bulunmasına rağmen, farklı enfeksiyonlarıolusturabilmektedir.Anahtar kelimeler: P. aeruginosa, Çevreyi Algılama, N-Açil- Homoserin lakton.

Abstract:
Hundred P. aeruginosa strains isolated from Intensive Care Units at SüleymanDemirel University Hospital were used in this study. These isolates were tested forproduction of AHLs using indicator strains the Chromobacterium violaceum strainCV026 and the Agrobacterium tumefaciens strain NT1. Twenty isolates had no BHLactivity by using bioassay strain C. violaceum CV026. We confirmed BHLproduction deficiency in these isolates by using thin-layer chromatography (TLC).These isolates were analysed for the production of several virulence factors such asprotease, rhamnolipids, pyocyanine, elastase, LasA and swimming, twitching, andswarming, motility controlled via N-acylhomoserine lactone (AHL)-mediatedquorum sensing. These isolates were also analysed for presence of quorum sensinggenes lasR, lasI, rhlR and rhlI. Analysis of the sequences of the rhlR and rhlI genesof these four isolates showed that two of the four isolates had mutational defects inboth rhlR and rhlI genes and other two were only mutated in the rhlI gene. Thesemutations were not reported previously. Mutations in these isolates could explainvirulence factor negative phenotype, as well as their deficiency in BHL production.Although these isolates have deficient QS systems, they are capable of causinginfections.P. aeruginosa, Quorum sensing, N-Acyl-Homoserine lactone