Helicobacter pylori CagA EPIYA motifleri ile klaritromisin direnci, gastropatolojik ve klinik ilişkinin araştırılması
Determination of Helicobacter pylori CagA EPIYA motifs and their association with clarithromycin resistance, gastropathology and clinical outcome
Yazar: MERYEM GÜVENİR
Danışman: PROF. DR. ÖZLEM YILMAZ
Dokuz Eylül Üniversitesi / Sağlık Bilimleri Enstitüsü / Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2010
Konu: Mikrobiyoloji = Microbiology
Dizin: Helicobacter pylori = Helicobacter pylori

Özet:
Helicobacter pylori (H. pylori)'de CagA'nın tirozin fosforilasyonu CagA proteininin C-terminal bölgesinde çeşitli sayılarda bulunan beş aminoasit sekansından (Glu-Pro-Ile-Tyr-Ala) oluşan EPIYA tekrar sekansları ile gerçekleşir. H. pylori suşlarımızdaki CagA EPIYA motiflerinin sayısı ve tiplerinin saptanması, histopatolojik korelasyonun ve ayrıca bu motiflerin klaritromisin direnci ile ilişkisinin belirlenmesi amaçlanmıştır. Endoskopi endikasyonu konulan dispeptik yakınmalı 124 hasta çalışmaya alındı. H. pylori suşlarının cagA pozitifliği PCR ile ürün uzunluğu 370-570 bp olarak saptandı. Amplifiye edilen PCR ürünleri QIAquick PCR kiti ile purifiye edildi ve sekans analizi için Macrogen'e gönderildi. Anti-H. pylori IgG ve CagA IgG antikorları ELISA yöntemi ile çalışıldı. Yüz yirmi dört hastanın 89 (%71.8)'u HUT, histopatoloji ve kültürün en az ikisinin olumluluğunda H. pylori enfeksiyonu olumlu saptandı. Altmış iki (%50) H. pylori kültür pozitif hasta suşlarından; 30 (%48.4)'u cagA pozitif, 32 (%51.6)'si cagA negatif saptandı. cagA pozitif hastalarımızda; 21 (%70)'i EPIYA-ABC, yedi (%23.3)'si EPIYA-ABCC ve iki (%6.7)'si ise hem EPIYA-ABC hem de -ABCC olmak üzere miks enfeksiyon saptandı. Ayrıca, 89 H. pylori pozitif hastanın 77 (%86.5)'si anti-H. pylori IgG antikoru; 14 (%46.6)'ü anti-CagA IgG antikoru olumlu bulundu. Sonuç olarak, cagA pozitif H. pylori suşlarının antrum ve korpus pitlerde enflamasyon (aktif enflamasyon) ve korpus atrofi ile ilişkisi olduğu saptandı. EPIYA motifleri ile histopatoloji ve klaritromisin direnci arasında bir korelasyon gözlenmedi.

Abstract:
Tyrosine phosphorylation of CagA in Helicobacter pylori (H. pylori) occurs at the EPIYA motif region, a five aminoacid sequence (Glu-Pro-Ile-Tyr-Ala) that is present in variable numbers in the C-terminal EPIYA repeat region of the CagA protein. The aim of the study was to identify the 3? variable regions of the cagA gene of the H.pylori CagA EPIYA motifs in H.pylori strains and correlate with histopathological findings in patients? biopsies and also identify the relationship between EPIYA motifs and clarithromycin resistance. A total of 124 patients with dispepsia referred to upper endoscopy were included. H.pylori strains? cagA status was established. H.pylori cagA positive PCR products ranging 370-570 bp were amplified. PCR products purified by QIAquick PCR kit and sent to Macrogen for sequencing. Anti-H.pylori IgG and CagA IgG antibodies were determined by ELISA tests. Eighty-nine of 124 patients (71.8%) were H.pylori infection positive by at least two positivity of RUT, histopathology and culture. Sixty-two patients (50%) were positive by culture. Among H.pylori-culture positive patients; 30 (48.4%) were cagA positive, 32 (51.6%) were cagA negative. Among the 30 cagA positive strains; 21 (70%) had EPIYA-ABC, seven (23.3%) had EPIYA-ABCC and strains from two patients (6.7%) had both EPIYA-ABC and -ABCC. In 89 H.pylori positive patients; 77 (86.5%) were anti-H.pylori IgG, 14 (46.6%) were anti-CagAIgG positive. As a conclusion, cagA positive H.pylori strains were related to inflammation of pits (active inflammation) in antrum and corpus and atrophy in corpus. The correlation could not be found between EPIYA motifs and histopathology and clarithromycin resistance.