Yoğun bakım hastalarının idrar kültürlerinden izole edilen candida türlerinin dağılımı ve antifungal duyarlılıklarının belirlenmesi
Distribution of candida species isolated from urine cultures of icu patients and determination of antifungal susceptibility
Yazar: BAN ALI HASSAN HASSAN
Danışman: PROF. DR. FAHRİYE EKŞİ
Gaziantep Üniversitesi / Sağlık Bilimleri Enstitüsü / Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2018
Konu: Mikrobiyoloji = Microbiology
Dizin: Antifungal ajanlar = Antifungal agents ; Antifungal duyarlılık testleri = Antifungal sensitivity tests ; Kandida = Candida ; Kandida = Candida ; Yoğun bakım = Intensive care ; Yoğun bakım üniteleri = Intensive care units ; Üriner sistem = Urinary tract ; Üriner sistem enfeksiyonları = Urinary tract infections ; İdrar = Urine

Özet:
Candida`lar insanların normal florasının bir üyesi olup, doğada yaygın olarak bulunurlar. İdrarda Candida türlerinin varlığı kandidüri olarak adlandırılır. Bu durum klinik örneklerin kontaminasyonu, alt üriner sistem kolonizasyonu veya alt ya da üst üriner sistemin invaziv enfeksiyonunun göstergesi olabilir. Çalışmamızda yoğun bakım ünitesinde yatan hastaların idrar kültürlerinden izole edilen Candida'ların identifikasyonu ve antifungallere duyarlılık durumlarının belirlenmesi amaçlandı. Bu çalışma Kasım 2016-Haziran 2017 tarihleri arasında Gaziantep Üniversitesi Şahinbey Araştırma ve Uygulama Hastanesi, Anasteziyoloji ve Reanimasyon ve İç Hastalıkları Yoğun Bakım ünite'lerinde yatan hastaların idrar kültürlerinden  izole edilen 100 Candida suşu (≥ 104 CFU/mL) değerlendirmeye alındı. Candida suşlarının identifikasyonu klasik yöntemler yanında, otomatize identifikasyon yöntemi kullanılarak yapıldı. Tanımlanan Candida suşlarının antifungal duyarlılıkları, Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI) M27-S3 ve M27-S4 dökümanlarındaki referans broth mikrodilüsyon yöntemi kullanılarak araştırılmıştır. Çalışmada C.parapsilosis ATCC 22019 ve C.kruseiATCC 6258 kontrol suşları kullanılmıştır. İdrar kültürlerinde Candida izole edilen hastaların %60'ı kadın %40'ı erkek, yaş ortalaması 68.02±17.48'idi. Hastaların idrar örneklerinden izole edilen 100 Candida suşunun %54'ü Candida albicans, %34'ü C.glabrata, %7'si C.tropicalis, %2'si C.kefyr, %2'si C.lusitaniae, %1'i C.parapsilosis olarak identifiye edildi. Çalışmamızda, antifungal ilaçların MİK aralıkları kaspofungin için 0.015-0.5 µg/mL, flukonazol için 0.125-64 µg/mL, itrakonazol için 0.03-16 µg/mL, vorikonazol için 0.03-16  µg/mL arasında saptandı. Candida suşlarının, %1'i kaspofungine dirençli, %40'ı flukonazole dirençli; %69'u itrakonazole dirençli, C.glabrata dışındaki Candida'ların %54.5'i vorikonazole dirençli olarak tespit edildi. Amfoterisin B ve flusitozine dirençli Candida türü tespit edilmedi. Sonuç olarak idrar kültürlerinden izole edilen Candida türlerinde profilaksi ve tedavide en sık kullanılan azol grubundaki antifungallere yüksek oranda direnç saptanmıştır.

Abstract:
Candida spp. are the member of the human normal flora and they are commonly found  in the nature. The presence of Candida species in the urine is considered as candiduria, this case  may represent contamination of clinical sample, actual colonization of the lower urinary tract or may be a true indicator of invasive infection of lower and/or upper urinary tract. We aimed to determine the distribution of Candida spp isolated from the urine cultures of intensive care unit (ICU) patients and to investigate their antifungal susceptibility. From November 2016 to July 2017, We evaluated 100 Candida spp. from urine cultures of hospitalized patients in Anesthesiology and Reanimation and Internal Diseases intensive care unites (ICU) of University of Gaziantep Şahinbey Research Hospital. Candida species isolated from culture plates with colony count ≥ 104 CFU/ml were considered as significant. The isolated species were identified by using classical methods and automatic identification methods. The investigation of the antifungal susciptibilty tests was performed with the utility of the reference broth microdilution method in the documents of Clinical and Laboratory Standards Institute CLSI M27-S3 and M27-S4. Quality control isolates C.parapsilosis ATCC 22019 and C.krusei ATCC 6258 were included in the study. The 60% of the patients were female while 40% were male, the average age was 68.02±17.48. The isolated Candida spp. from patients' urine samples were identified as 54% Candida albicans, 34% C.glabrata, 7 % C.tropicalis, 2% C.kefyr, 2% C.lusitaniae and 1% C.parapsilosip. The MIC range for antifungal agents was found as following; caspofungine 0.015-0.5 µg/ml, fluconazole 0.125-64 µg/ml, itraconazole 0.03-16µg/ml, and for voriconazole 0.03-16 µg/ml. Only %1 of Candida strains were resistant to caspofungine and 40% were resistant to fluconazole; while 69% were resistant to itraconazole, 54.5% of them were found to be resistant strains to voriconazole, in which C.glabrata strains were excluded. Whereas no resistant strain was found to both of amphotericine B and flucytosine. As a result a high rate of resistant Candida spp. isolates to the azole group of the antifungal agents was detected, which are used as prophylaxis and  also in the medication.