Marullarda Clostridium difficile varlığı, yıkama solüsyonları ve modifiye atmosfer paketlemenin etkisinin belirlenmesi
Detection of Clostridium difficile in lettuce and determination of the effect of washing solutions and modified atmosphere packaging
Yazar: MELİKE NUR TOSUN
Danışman: DOÇ. DR. NÜKHET NİLÜFER ZORBA
Çanakkale Onsekiz Mart Üniversitesi / Lisansüstü Eğitim Enstitüsü / Gıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı
Derece: Doktora, 2022
Konu: Gıda Mühendisliği = Food Engineering ; Mikrobiyoloji = Microbiology
Dizin: Biyosidal etkiler = Biocidal effects ; Clostridium difficile = Clostridium difficile ; Modifiye atmosfer ambalajlama = Modified atmosphere packaging ; Tarçın = Cinnamon ; Uçucu yağlar = Essential oils

Özet:
Çalışmamızda 107 marul örneğinde C. difficile varlığı tespit edilememiştir. Doğal 
maddelerin C. difficile ATCC 700057, 43593, 1870, 9689, C. perfringens ATCC 12915 ve 
C. sporogenes ATCC 11437'ye karşı antibakteriyel aktiviteleri agar kuyucuk ve disk 
difüzyon yöntemleri ile belirlenmiş ve en yüksek zon tarçın esansiyel yağı (TEY) ve çay 
ağacı esansiyel yağlarında (ÇEY) gözlenmiştir. Etkili bulunan yağların MİK değerleri 0,39-
12,5 (%, v/v) arasında değişkenlik göstermiştir. Tarçın ve çay ağacı yağlarının uçucu yağ 
profilleri GC-FID-MS ile belirlenmiş ve temel bileşenler tarçın yağında sinnamaldehit 
(%85,64), çay ağacı yağında 4-terpineol (%83,60) olarak belirlenmiştir. TEY-vankomisin 
arasındaki sinerjistik aktivite dama tahtası ile belirlenmiş ve FİK değeri 0,51 olarak tespit 
edilmiştir. TEY ve ÇEY'in tüm konsantrasyonlarının C. difficile'ye karşı antibiyofilm 
aktivite sergilediği saptanmıştır. TEY'in C.difficile'ye karşı sporisidal aktivitesinin 
matematiksel modellemesi yapılmış ve veriler en iyi Modifiye Gompertz eşitliği ile 
tanımlanmıştır. TEY ile asetik asit kombinasyonu (TEY-AA) arasında sinerjistik aktivite 
belirlenmiştir. 2xMİK (%0,76 TEY+%0,5 AA) konsantrasyondaki TEY-AA'nın 5 dk 
uygulaması ile 50 ppm NaOCl'nin 15 dk uygulanması marullara inoküle edilen C. 
difficile'nin uzaklaştırılmasında ve marulların fiziksel, kimyasal özelliklerinin 
korunmasında en etkin parametreler olmuştur. Modifiye atmosfer paketlenen marullarda 
inoküle edilen C. difficile sporları 1,3,5,7 ve 10. günlerde canlılığını korumuş fakat azalan 
O2 konsantrasyonuna rağmen çimlenme gözlenmemiştir. Tarçın esansiyel yağının C. difficile enfeksiyonlarında önleyici veya tedaviye destek  ajan olarak kullanılma potansiyeli değerlendirilebilir. Aynı zamanda sporisidal aktivitesinden dolayı sağlık hizmetleri gibi C. difficile açısından riskli olan ortamlarda ve sebzelerin dekontaminasyonunda klora alternatif dezenfektan olarak kullanılabilir.

Abstract:
In our study, the presence of C. difficile could not be detected in 107 lettuce samples. 
Antibacterial activities of natural substances against C. difficile ATCC 700057, 43593, 1870, 
9689, C. perfringens ATCC 12915 and C. sporogenes ATCC 11437 were determined by 
agar well and disc diffusion methods, and the highest zone was observed in cinnamon 
essential oil (TEY) and tea tree essential oils (TEA). The MIC values of the oils found to be 
effective varied between 0,39-12,5 (%, v/v). Essential oil profiles of cinnamon and tea tree 
oils were determined by GC-FID-MS and the main components were determined as 
cinnamaldehyde (85,64%) in cinnamon oil and 4-terpineol (83,60%) in tea tree oil. The 
synergistic activity between TEY and vancomycin was determined by checkerboard and the 
FIC value was determined as 0,51. All concentrations of TEY and TEY were found to exhibit 
antibiofilm activity against C. difficile. Mathematical modeling of the sporicidal activity of 
TEY against C. difficile was performed and the data were best described by the Modified 
Gompertz equation. Synergistic activity was determined between TEY and acetic acid 
combination (TEY-AA). The most effective parameters for the removal of C. difficile
inoculated into lettuce and the preservation of the physical and chemical properties of lettuce. 
has been. C. difficile spores inoculated in modified atmosphere packed lettuce preserved their 
viability on days 1,3,5,7 and 10, but no germination was observed despite the decreasing O2
concentration. The potential of using cinnamon essential oil as a preventive or adjunctive agent in C. difficile infections can be evaluated. At the same time, due to its sporicidal activity, it can be used as an alternative disinfectant to chlorine in environments where there is a risk for C. 
difficile, such as health care services, and in the decontamination of vegetables.