Endometriyum kanserinde RASSF1A ve RASSF2a tümör baskılayıcı genlerinin promotör metilasyon analizi
Endometriyum kanserinde RASSF1A ve RASSF2A tümör baskilayici genlerinin promotör metilasyon analizi
Yazar: HABİBE NUR ATMACA
Danışman: DOÇ. DR. ŞENGÜL TURAL
Ondokuz Mayıs Üniversitesi / Sağlık Bilimleri Enstitüsü / Tıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2019
Konu: Tıbbi Biyoloji = Medical Biology
Dizin: Endometrial neoplazmlar = Endometrial neoplasms ; Endometriyum = Endometrium ; Genler = Genes ; Genler-tümör baskılayıcı = Genes-suppressor-tumor ; Metilasyon = Methylation ; Promotor bölgeler-genetik = Promoter regions-genetic

Özet:
Amaç: Çalışmamızda RASSF1A ve RASSF2A tümör baskılayıcı genlerinin
hipermetilasyon durumlarının endometriyal kansere etkisinin incelenmesi
amaçlanmıştır.
Materyal Metod: Ondokuz Mayıs Üniversitesi Kadın Hastalıkları ve Doğum Kliniği'
nde Endometriyal CA tanısı konan 15 hasta çalışmaya dâhil edildi. EDTA' lı tüplere
periferik kan örnekleri alındı. Ayrıca, Endometriyal CA tanısı konulmuş bu 15 hastanın
Ondokuz Mayıs Üniversitesi Patoloji bölümünden, formaline fikse edilmiş parafin
gömülü tümör doku örnekleri temin edildi. Kontrol grubu için, Ondokuz Mayıs
Üniversitesi Kadın Hastalıkları ve Doğum Kliniği'nden sezeryan doğum sırasında 10
sağlıklı kadından rahim doku örnekleri alındı. Periferik kan, rahim doku ve parafine
gömülü tümör doku örneklerinden DNA izolasyonu yapıldı. Daha sonra DNA
örneklerine bisülfit modifikasyon yöntemi uygulandı ve metilasyon spesifik PCR
yapıldı. PCR ürünleri agaroz jelde yürütülerek, RASSF1A ve RASSF2A genlerinin
promoter CpG metilasyon analizi yapıldı. Elde edilen sonuçlar SPSS ve Ki-kare analizi
ile değerlendirildi.
Bulgular: RASSF1A geni promotor bölgesi metilasyona spesifik PCR analizi sonuçları,
hasta kanı, tümör dokusu ve kontrol grubu örnekleri ile karşılaştırıldığında istatistiksel
olarak anlamlı bir fark saptanmazken (p=0,08), RASSF2A geni promotor bölgesi
metilasyona spesifik PCR analizi sonuçları, hasta kanı, tümör dokusu ve kontrol grubu
örnekleri ile karşılaştırıldığında istatistiksel olarak anlamlı derecede fark görüldü
(p<0,001).
Sonuç: Çalışmamızın sonucuna göre, Türk popülasyonunda RASSF1A geni promotor
bölgesi metilasyonu endometrium kanseri gelişiminde önemli bir rol oynamazken,
RASSF2A geni promotor bölgesi metilasyonunun önemli derecede rol oynadığı
saptanmıştır.
Anahtar Kelimeler: Endometriyal kanser; RASSF1A tümör baskılayıcı geni; RASSF2A
tümör baskılayıcı geni; metilasyon; promotor bölge

Abstract:
Aim: In this study, it is aimed to evaluate effects of RASSF1A and RASSF2A tumor
suppressor genes hypermethylation status in endometrial cancer.
Material and Method: We evaluated 15 endometrial CA diagnosed patients in
Ondokuz Mayıs University Obstetrics and Gynecology Clinic. Peripheral blood samples
were taken into EDTA tubes. Besides, formalin fixed paraffin embedded tumor tissue
samples of these 15 patients were collected from Ondokuz Mayıs University Pathology
Department. For control group, womb tissue samples of 10 healthy women were taken
in Cesarian section delivery operation from Ondokuz Mayıs University Obstetrics and
Gynecology Clinic. DNA isolations were performed from peripheral blood, womb
tissue and paraffin embedded tumor tissue samples. Then, bisulfite modification method
was applied to DNA samples and methylation specific PCR was performed. PCR
products were analyzed in agarose gel and RASSF1A and RASSF2A genes' promoter
CpG methylation status were registered. The results were evaluated with SPSS and Chi
square statistical analysis.
Results: As a result of the study, there is no statistical significant difference of
RASSF1A gene promoter region methylation status between patients' blood and tumor
tissue samples and healthy womb tissue samples (p=0.08). Also according to results of
RASSF2A gene promoter region methylation status, there is statistical significant
difference when comparing patients' blood and tissue samples and healthy womb tissue
samples (p<0.001).
Conclusion: According to results of our study, RASSF1A gene promoter region
methylation status doesn't have an important role in endometrium cancer cases in
Turkish population. However, RASSF2A gene promoter region methylation status has an
important role in endometrium cancer cases in Turkish population.
Keywords: Endometrial cancer; RASSF1A tumor suppressor gene; RASSF2A tumor
suppressor gene; methylation; promoter region