Pseudomonas aeruginosa'nın virülans faktörlerinin ve kolistin direncinin araştırılması
Investigation of virulence factors and colistin resistance of Pseudomonas aeruginosa
Yazar: BERAT ÖZKAN
Danışman: PROF. DR. FATMA BUDAK
Kocaeli Üniversitesi / Sağlık Bilimleri Enstitüsü / Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı / Mikrobiyoloji Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2023
Konu: Mikrobiyoloji = Microbiology

Özet:
Amaç: Pseudomonas aeruginosa, çoklu ilaç direncine sahip fırsatçı bir patojendir ve önde
gelen nozokomiyal enfeksiyon etkenlerinden biridir. Yoğun bakım üniteleri antibiyotik
direnci gelişimine ortam hazırlamakla birlikte en çok etkilenen hasta grubuna sahiptir. Bu
çalışma, servis ve yoğun bakım hastalarından izole edilen Pseudomonas aeruginosa'nın
virülans faktör prevalansını ve antibiyotik direnç profilini ortaya koymayı amaçlamaktadır.
Metod: Hastanede yatarak tedavi gören (yoğun bakım ve servis) toplam 208 hasta örneği
çalışmaya dahil edilmiştir. Elastaz aktivitesi için nutrient agar-elastin yöntemi kullanılırken
piyoverdin ve piyosiyanin için özel üretim besiyeri kullanılmıştır. Virulans faktörü olan
biyofilm için kristal viyole yöntemi tercih edilirken polimeraz zincir reaksiyonu ile las B
ve mcr-1 genleri incelenmiştir. Antibiyotik duyarlılık testi için Sıvı Mikrodilüsyon yöntemi
kullanılmıştır. Kolistin duyarlılığı için ayrıca Rezasurine Dayalı Hızlı Polimiksin yöntemi
ve disk elüsyon yöntemi değerlendirilmiştir.
Bulgular: Toplam 208 hastanın dahil edildiği çalışmamızda yoğun bakım ve servis
izolatlarının antibiyotik direnci ve virülans faktör sonuçları; piyosiyanin %90,1, %89,6,
piyoverdin %86,2, %86,7, elastaz %68,6, %67,9, las B %93,1, %89,6, biyofilm %51,9,
%48,1, meropenem %41,1, %28,9, kolistin %11,7, %13,2, seftazidim %43,1, %41,1,
sefepim %52,9, %48,5 olarak bulunmuştur. Disk elüsyon duyarlılık ve özgüllük
sonuçlarımız sırasıyla %84 ve %88, Hızlı Polimiksin duyarlılık ve özgüllük sonuçlarımız
sırasıyla %87 ve %92 bulunmuştur. Kolistin direnci bulunan suşların hiçbirisinde mcr-1
geni tespit edilememiştir.
Sonuç: Çalışma grubumuzda en sık las B faktörü tespit edilmiştir. Gruplarda sefepim hariç
antibiyotik dirençleri %50'nin altında kalmıştır. Kolistin direncinde mcr-1'in etken
olmadığı görülmüştür. Ek olarak kolistin direncini düşük oranlarda bulmamız bölgemizde
kolistine karşı direncin henüz yaygın olmadığını göstermektedir. Ayrıca kolistin için son
dönemlerde geliştirilen Rezasurine Dayalı Hızlı Polimiksin ve Disk Elüsyon yöntemlerinin
referans yöntem yerine geçebilecek iyi birer alternatif yöntem olduğu görülmektedir.

Anahtar kelimeler: Pseudomonas aeruginosa, virülans faktörü, antibiyotik direnci.

Abstract:
Objective: Pseudomonas aeruginosa has multidrug resistance and it is an opportunistic
pathogen, and is one of the leading nosocomial infections agents. Intensive care units have
the most affected patient group as well as preparing the environment for the development
of antibiotic resistance. This study aims to reveal the prevalence of virulence factor and
antibiotic resistance profile of Pseudomonas aeruginosa isolated from hospitalized
patients.
Methods: A total of 208 patient samples hospitalized (intensive care unit and service)
were included in the study. For the biochemical activity of elastase, a nutrient agar-elastin
method was used. Special production medium for pyoverdine and, pyocyanin and
polymerase chain reaction method for las B were used. The crystal violet method was
preferred using microtiter plates for biofilm. Broth microdilution was used for antibiotic
sensitivity.
Results: The results of antibiotic resistance percentages and virulence factor frequency in
intensive care and service isolates in our study: pyocyanin 90.1%, 89.6%, pyoverdine
86.2%, 86.7%, elastase 68.6%, 67.9%, las B 93.1%, 89.6%, biofilm 51.9%, 48.1%,
meropenem 41.1%, 28.9%, colistin 11.7%, 13.2%, ceftazidime 43.1%, 41.1%, cefepime
52.9%, 48.5%. For colistin, disc elution sensitivity and specificity results were 84% and
88%, and our Resazurin-Based Rapid Polymyxin sensitivity and specificity results were
87% and 92%, respectively.
Conclusion: The most common factor B was found in our study groups. The resistance of
the studied antibiotics was found below 50% in the groups. In addition, low rates of
colistin resistance indicate that colistin resistance is not yet widespread in our region. The
recently developed Resazurin-Based Rapid Polymyxin and Disc Elution methods for
colistin seem to be good alternative methods that can replace the reference method.

Keywords: Pseudomonas aeruginosa, virulence factors, antibiotic resistance