Yağ dokusunda katalaz aktivitesi ölçümü için farklı izolasyon yöntemlerinin karşılaştırılması
Comparison of different isolation methods for catalase activity measurement in adipose tissue
Yazar: SİNEM USTA
Danışman: PROF. DR. AHMET ALVER
Recep Tayyip Erdoğan Üniversitesi / Sağlık Bilimleri Enstitüsü / Tıbbi Biyokimya Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2019
Konu: Biyokimya = Biochemistry
Dizin: Adipoz doku = Adipose tissue ; Antioksidanlar = Antioxidants ; Enzimler = Enzymes ; Katalaz = Catalase ; Oksidatif stres = Oxidative stress

Özet:
Son zamanlarda yapılan çalışmalar yağ dokusunun yalnızca enerji deposu olmadığını, bunun yanında endokrin bir organ olduğunu gösterdi. Beyaz yağ dokusu, vücutta bol oranda bulunmasının yanında ihtiyaç fazlası enerjiyi trigliserit halinde depolayarak sakladığı ve enerji homeostazına katkıda bulunduğu bilinmektedir. Vücutta artan yağ kitlesi sonucu oluşan obezite artmış oksidatif stres ve düşük dereceli kronik inflamasyonla birlikte gözlenir. Antioksidan enzimler, daha az aktif radikal oluşmasına yol açarak veya serbest radikal zincir reaksiyonunun proteinler, lipidler, karbonhidratlar ve DNA üzerine hasarını azaltarak oksidatif stresin şiddetini bastırmaya yardımcı olan proteinlerdir. Katalaz enzimi önemli bir oksidan kaynağı olan H2O2' yi su ve oksijene parçalayarak oksidatif stresin oluşmasını engeller. Yağ dokusunun yüksek lipit ve düşük protein içeriğine sahip olması, lipit interferansının yüksek olması gibi durumlar bu dokuda protein izolasyonunu ve ölçümünü zorlaştırmaktaydı. Çalışmamızda, yağ dokusunda farklı protein izolasyon yöntemlerinin kullanılmasının CAT aktivitesi üzerine etkisinin incelenmesi ve ölçüm için gerekli şartların ortaya konulması amaçlandı. Katalaz aktivitesi ölçümleri Aebi yöntemi ile yapıldı. Sıçanlardan retroperitoneal yağ dokusu çıkarılıp üç farklı homojenizasyon yöntemi için anıldı. Homojenizasyon 1 (H1)' de organik çözücü olarak kloroform/metanol, homojenizasyon 2 (H2)' de ve homojenizasyon 3 (H3)' de sadece  kloroform kullanıldı. Yapılan değerlendirmeler sonucunda H1 yönteminin ortalama spesifik aktivite değerleri diğer iki yönteme göre daha yüksek bulundu. Sonuç olarak, retroperitoneal yağ dokusunda H1 yönteminin CAT enzim aktivitesi ölçümünde daha uygun olabileceği kanaatine varıldı.

Abstract:
Recent studies have shown that adipose tissue is not only an energy store, but also an endocrine organ. White adipose tissue, which is abundant in the body, stores excess energy in triglyceride form and contributes to energy homeostasis. Obesity caused by the increased adipose tissue mass related with oxidant antioxidant in balance and low grade chronic inflammation. Antioxidant enzymes are proteins that help suppress the oxidative stress by causing less active radical formation or by reducing the damage of the free radical chain reaction on proteins, lipids, carbohydrates and DNA. The catalase enzyme breaks down H2O2, an important source of oxidant, into water and oxygen, thus preventing the formation of oxidative stress. As fat tissue has high lipid and low protein content which leads to high lipid interference. Hence, protein isolation and measurement are difficult in fat tissue. In this study, we aimed to investigate the effect of using different protein isolation methods from adipose tissue on eventual CAT activity and to determine the necessary conditions for measurement. . Catalase activity was measured by Aebi method. Retroperitoneal fat tissue was obtained from the rats and used for three different homogenization methods. In homogenization 1 (H1) chloroform / methanol was used as the organic solvent, in homogenization 2 (H2) and in homogenization 3 (H3) only chloroform was used. The result of the evaluations revealed that  the average specific activity values of H1 method were elevated than the other two methods. It was concluded that H1 method in retroperitoneal adipose tissue may be more suitable for CAT enzyme activity measurement.