Ege bölgesi'ndeki atık sığır fetüslerinde neospora caninum'un moleküler yöntemlerle tespiti, moleküler karakterizasyonu ve bölge seroprevalansının belirlenmesi
Molecular detection of neospora caninum in aborted cattle fetuses in the aegean region, molecular characterization and determination of region seroprevalence
Yazar: ÖMER FARUK GÖKCECİK
Danışman: PROF. DR. HASAN EREN
Aydın Adnan Menderes Üniversitesi / Sağlık Bilimleri Enstitüsü / Parazitoloji (Veterinerlik) Ana Bilim Dalı
Derece: Doktora, 2023
Konu: Parazitoloji = Parasitology
Dizin: Ege bölgesi = Aegean region ; Enzime bağlı immünosorbent testi = Enzyme-linked immunosorbent assay ; Fetüs = Fetus ; Neospora caninum = Neospora caninum ; Polimeraz zincirleme reaksiyonu = Polymerase chain reaction ; Seroprevalans = Seroprevalence ; Sığırlar = Cattles

Özet:
Amaç: Bu çalışma ile son yıllarda dünyada ve Türkiye'de sığır abortlarının önemli 
nedenlerinden biri olan ve ciddi ekonomik kayıplara yol açan neosporosisin, büyükbaş 
hayvancılığın yoğun olduğu Ege Bölgesi'ndeki durumunun araştırılması amaçlanmıştır.
Gereç ve Yöntem: Araştırmada İzmir/Bornova Veteriner Kontrol Enstitüsü sorumluluk 
sahasına giren illerdeki sığır işletmelerinden örneklemeler yapılmıştır. Çalışmada Ege 
Bölgesi'nde bulunan işletmelerdeki abort vakalarına ait atık fetüslerin beyin ve iç organ
dokularından DNA izolasyonu yapıldıktan sonra, bu örnekler Real-Time PZR test metodu ile 
analiz edilmiştir. Pozitif olarak tespit edilen örneklerden Neospora caninum'un moleküler 
karakterizasyonu yapılmıştır. Ayrıca serolojik olarak, basit rastgele örnekleme yöntemi ile
%95 güven seviyesi, %10 beklenen prevalans (+/- 5) hata payı ile 973 sığırdan toplanan kan 
serumları ELISA yöntemi kullanılarak anti-N. caninum antikorları tespit edilmiştir.
Bulgular: Yapılan çalışmada RT-PZR yöntemiyle incelenen toplamda 88 sığır fetüsüne ait 
organ ve dokularının 8'inde (%9,09) N. caninum DNA'sı tespit edilmiş ve incelenen toplam 
973 sığırın 122'si (%12,66) serolojik olarak pozitif bulunmuştur. RT-PZR ile pozitif bulunan 
örnekler sekans işlemlerine tabii tutularak filogenetik ağaçları oluşturulmuştur.
Sonuç: Ege Bölgesi'ndeki sığırlarda N. caninum yaygınlığı hem serolojik hem de moleküler 
çalışmalarla kapsamlı bir şekilde belirlenerek bölgedeki büyükbaş hayvancılık 
yetiştiriciliğinde N. caninum ile ilgili problem yaşayan işletmelerin güncel durumu ve 
N. caninum kaynaklı abort problemlerinin saha yansıması ortaya konmuştur. Elde edilen 
bulgulara göre hastalıkla ilgili mücadele stratejilerinin belirlenmesi ve son konakları da içeren 
daha kapsamlı çalışmalar yapılmasının önemli olacağı kanaatine varılmıştır.

Abstract:
Objective: In this study, it is aimed to investigate the situation of neosporosis, which is one of 
the important causes of cattle abortions in the World and in Turkiye in recent years, and the 
disease causes serious economic losses, in the Aegean Region of Turkiye, where cattle 
breeding is common.
Material and Methods: In this study, the sampling was done from cattle commercial herds in 
the provinces which are under the responsibility of Izmir / Bornova Veterinary Control 
Institute. In this study, brain and internal organ tissues of aborted fetuses belonging to 
abortion cases in commercial herds in the Aegean Region were collected and DNA isolated. 
Then the DNA samples were analyzed by RT-PCR method. Molecular characterization of 
N. caninum was performed in the positive samples. In addition, serologically, anti-N. caninum
antibodies were detected using the ELISA test method in blood sera collected from 973 cattle, 
with a 95% confidence level and 10% expected prevalence (+/- 5) margin of error by simple 
random sampling method.
Results: In this study, N. caninum DNA was detected in 8 (9,09%) of the organs and tissues 
of 88 cattle fetuses examined by RT-PCR, and 122 (12,66%) of the 973 cattle examined and 
were found serologically positive. Phylogenetic trees were formed by sequencing the samples 
found positive by RT-PCR.
Conclusion: The presence of N. caninum in cattle in the Aegean Region has been 
comprehensively determined by both serological and molecular test methods, and the current 
situation of the commercial herds that have problems with N. caninum in cattle breeding in 
the region and the field reflection of N. caninum-induced abortion problems have been 
revealed. According to the findings, it was concluded that it would be important to determine
the control strategies for the disease and to carry out more comprehensive studies including 
the final hosts.