Ependimomlarda FISH yöntemi ile RELA füzyon gen varlığının ve immünhistokimyasal olarak P53 boyanmasının değerlendirilmesi
Detection of RELA fusion gene by FISH and immunohistochemical stain with P53 in epedymomas
Yazar: SELMA PAMUKÇUOĞLU
Danışman: PROF. DR. AYLAR POYRAZ
Gazi Üniversitesi / Tıp Fakültesi / Tıbbi Patoloji Ana Bilim Dalı
Derece: Tıpta Uzmanlık, 2018
Konu: Patoloji = Pathology
Dizin: Ependimom = Ependymoma ; FISH = FISH ; Genler = Genes ; Neoplazmlar = Neoplasms ; İmmünohistokimya = Immunohistochemistry

Özet:
Ependimomlar, nadir görülen heterojen nöroepitelyal malign tümörlerdir.
Çocuklarda daha sık görülür ve prognozları oldukça kötüdür.
Ependimomlarda, derecelendirmenin prognostik öngörü ve tedavi
yaklaşımını yönlendirmedeki kısıtlılığı nedeniyle ve farklı lokalizasyonlarda
tümör gelişimine neden olan farklı kök hücrelerin saptanmasıyla birlikte
moleküler çalışmalar başlamıştır. DNA metilasyon profili çalışmaları ile
ependimomlar lokalizasyona spesifik 9 moleküler subgruba ayrılmıştır. Bu
gruplardan biri olan "RELA füzyon pozitif ependimom" 2016 yılı DSÖ
sınıflamasına giren tek moleküler gruptur. ST lokalizasyonda görülmektedir.
Çoğunlukla çocuklarda saptanmakla birlikte erişkinlerde de gösterilmiştir. Kötü
prognozla ilişkilidir. NF-Kb sinyal yolağıyla ilişkili olan bu füzyon geni, çeşitli
teröpatik çalışmalar için hedeftir.
Çalışmamızda Gazi Üniversitesi Tıp Fakültesi Patoloji Anabilim Dalı'nda
2006-2017 yılları arasında tanı almış 110 ependimom olgusu yaş, histolojik tümör
tipi, grade, lokalizasyon, rezeksiyon durumu, nüks gelişimi ve genel sağ kalım
açısından incelendi. Tümör dokularında immünhistokimyasal olarak ki-67, p53 ve
EMA ekspresyonuna bakıldı. Ayrıca hazırlanan tümör doku mikrodizinine RELA
FISH boyaması yapılarak RELA füzyon gen varlığı araştırıldı. Tüm parametreler
birbiriyle karşılaştırıldı ve prognostik anlamları değerlendirildi.
İmmünhistokimyasal olarak ki-67 proliferasyon indeksi ile nüks ve genel
sağ kalım arasında anlamlı ilişki saptanırken, p53 ile her ikisiyle de anlamlı ilişki
bulunamadı.
ST yerleşimli, grade 2 ependimomu olan çocuk hastada ve grade 3
anaplastik ependimomu olan erişkin hastada olmak üzere 2 olguda break apart
FISH probu ile RELA füzyon gen varlığı saptandı. Her iki olguda da ki-67 ve p53
ile yüksek oranda boyanma görüldü. PF ve SP yerleşimli hiçbir olguda RELA gen
füzyon varlığı görülmedi.
RELA gen füzyon varlığı; lokalizasyon bağımlı, tümör derecesinden
bağımsız ve kötü prognozla ilişkili moleküler bir belirteçtir. Ancak az sayıda
vakada görüldüğü için, bu değerlendirme referans merkezler tarafından
yapılmalıdır. Kolay uygulanabilir immünhistokimyasal markerların belirlenmesi
için seri çalışmalar gereklidir.
Anahtar kelimeler: Ependimom, RELA füzyon geni, FISH, immünhistokimya.

Abstract:
Ependymomas are rare heterogenic neuroepithelial malignancies.
Incidence among children is more frequent and the prognosis of the disease is
worse than adults.
Molecular studies regarding ependymoma have started mainly due to the
following reasons: (i) assessment is limited for prognostic prediction and
treatment approach, and (ii) different root cells that cause tumor development at
different locations were discovered. Based on the methylation profiling studies on
ependymoma, the tumors are sub-grouped under 9 categories according to their
locations. RELA fusion-positive ependymoma is the only genetically defined
subtype accepted by World Health Organization Classification of Tumors of the
Central Nervous System in 2016. It occurs at supratentorial region. Although it
occurs mostly among children, some studies also reported among adults. RELA
fusion positivety is associated with worse prognosis. The fusion gene related to
NF-Kb signal pathway which is targeted for therapeutic practice.
In this study, we examined 110 ependymomas diagnosed between 2006
and 2017 in the Pathology Department of Gazi University Medical School. We
compared with many factors such as age, histological tumor type, grade, location,
resection, recurrence, and survival. We studied the expression of ki-67, p53, and
EMA immunohistochemistry in tumor tissues. Additionally, we investigated the
RELA fusion gene presence in microarrays of tumor tissues by RELA FISH
staining. We compared all the relevant parameters and looked at the prognostic
values.
Although there is a significant correlation between ki-67 proliferation
index and both recurrence and survival, there is no significant correlation between
p53 and either factor.
We found RELA fusion gene by break apart FISH probe at 2 cases: A
child with a grade 2 ependymoma at supratentorial region and an adult with grade
3 anaplastic ependymoma at the same region. In both cases, high degree of
staining with ki-67 and p53 was also observed.
The presence of RELA gene fusion is dependent on location whereas it is
independent of tumor grade. It is also a molecular marker associated with worse
prognosis. However, since this occurred in a small number of cases, further
evaluation should be made by reference centers. Further series of experiments are
needed to discover other immunohistochemical markers that are easier to handle.
Key words: Ependymoma, RELA fusion gene, FISH, İmmünohistochemistry.