Karışık ligantlı CD(II) kompleksinin sentezi, yapısal, spektroskopik ve antikanser özelliklerinin incelenmesi
Synthesis of mixed ligand CD (II) complex,investigation of its structural, photo-physicaland molecular docking properties
Yazar: KAĞAN FEHMİ FEYZİOĞLU
Danışman: DOÇ. DR. ÖMER TAMER
Sakarya Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Fizik Ana Bilim Dalı / Fizik Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2019
Konu: Fizik ve Fizik Mühendisliği = Physics and Physics Engineering

Özet:
Anahtar kelimeler: 4-metoksi-piridin-2-karboksilik asit, Moleküler Spektroskopi, DFT, Doğrusal Olmayan Optik, Moleküler Kenetlenme

Bu çalışmada, 4-metoksipirdin-2-karboksilik asit ve 4,4'-dimetil-2,2'bipiridinin içeren yeni karışık ligandlı Cd(II) kompleksi sentezlenmiş ve kristal yapısı X-ışını kırınım yöntemi ile belirlenmiştir. Bunun sonucunda, Cd(II) kompleksinin bozulmuş oktahedral geometrili koordinasyon simetrisine sahip olduğu görülmüştür. Sentezlenen kompleksin titreşim ve elektronik soğurma özelliklerini incelemek için FT-IR ve UV-Vis spektrumları elde edildi. Elde edilen FT-IR sonuçlarına göre, 4-metoksipirdin-2-karboksilik asit ve 4,4'-dimetil-2,2'bipiridinin ligandları merkez Cd(II) iyonuna N ve O atomları üzerinden ikişer dişli koordine olmuşlardır. UV-Vis spektrumundan elde edilen değerlerde yüksek enerjili metal-ligand ve ligand-ligand yük geçişleri gözlemlenmiştir.

Sentezlenen Cd(II) kompleksi hakkında daha detaylı bilgi edinmek için, Doğal Bağ Orbital (NBO), Doğrusal Olmayan Optik (NBO), Moleküler Elektrostatik Potansiyel (MEP) özellikleri Yoğunluk Fonksiyonel Teori metoduyla araştırıldı. B3LYP/LanL2DZ yöntemi ile elde etmiş olduğumuz teorik IR titreşim dalga sayılarını deneysel karşılıklarına yakınsamak için 0.96 ile skala edilmiştir. çarpılmıştır. 

Son olarak Cd(II) kompleksinin DNA ile atomik seviyedeki etkileşimleri incelemek amaçlı moleküler kenetlenme çalışması yapılmıştır. Cd(II) kompleksi ile hedeflenen DNA arasında çok sayıda π-alkil, π-anyon ve C•••O etkileşimleri bulunmuştur.

Abstract:
Keywords: 4-methoxy-pyridine-2-carboxylic acid, Molecular Spectroscopy, DFT, Nonlinear Optics, Molecular Docking

In this study, the new mixed ligand Cd (II) complex containing 4-methoxypyridine-2-carboxylic acid and 4,4'-dimethyl-2,2'bipyridine was synthesized and its crystal structure was determined by X-ray diffraction method. As a result, it was observed that Cd (II) complex has coordination symmetry with distorted octahedral geometry. FT-IR and UV-Vis spectra were obtained to investigate the vibrational and electronic absorption properties of the synthesized complex. According to the FT-IR results, 4-methoxypyridine-2-carboxylic acid and 4,4 dimetil-dimethyl-2,2'bipyridine ligands were coordinated to the central Cd (II) ion as twodentate ligands via N and O atoms. High energy metal-ligand and ligand-ligand charge transitions were observed in the UV-Vis spectrum of Cd(II) complex.

In order to obtain detailed information about the synthesized Cd (II) complex, the Natural Bond Orbital (NBO), Nonlinear Optics (NBO), Molecular Electrostatic Potential (MEP) properties were investigated by Density Functional Theory method. The theoretical IR vibrational wavenumbers obtained by the B3LYP/LanL2DZ method were scaled down with 0.96 to converge with their experimental counterparts. 

Finally, a molecular docking study was conducted to investigate the effects of Cd (II) complex on atomic level with DNA. A large number of π-alkyl, π-anion and C •• O interactions were found between the Cd (II) complex and the targeted DNA.