Streptococcus pyogenes' in tanısında kullanılan testlerin karşılaştırılması, bakteriyofaj izolasyonu ve karakterizasyonu
Comparison of tests used' in diagnosis of s pyogenes, isolationand characterization of bacteriophage
Yazar: YAĞMUR CAHAN
Danışman: PROF. DR. ŞENGÜL ALPAY KARAOĞLU ; DR. ÖĞR. ÜYESİ İLKAY BAHÇECİ
Recep Tayyip Erdoğan Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Biyoloji Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2019
Konu: Biyoloji = Biology ; Mikrobiyoloji = Microbiology ; Tıbbi Biyoloji = Medical Biology

Özet:
Streptococcus türü bakteriler doğada oldukça yaygın olarak bulunan, gram pozitif, zincir
oluşurabilen kok morfolojisinde bakterilerdir. İnsanda normal flora elemanları olarak
bulunabildikleri gibi, streptokoksal farenjit, bakteriyel endokardit, impetigo, idrar yolu
enfeksiyonları, romatizmal kalp hastalığı, akut romatizmal ateş, ve akut glomerulonefritis gibi ciddi postinfeksiyöz sendromlara yol açan patojen türleri da bulunmaktadır. Çalışmamızda üst solunum yolu enfeksiyonun başında gelen S. pyogenes'in tanısında, öncelikle kültür yöntemi
ve hızlı tanı testinin (TOYO-TSA01) birlikte karşılaştırılması hedeflendi. İzole ve identifiye
edilen S. pyogenes suşlarının bakteriyofaj/bakteriyosin içeriğinin belirlenmesi, bakteriyofaj
izolasyonu ve konak genişliğinin belirlenmesi ikincil hedef olarak belirlenmiştir. Bu çalışma,
Recep Tayyip Erdoğan Üniversitesi (RTEÜ) Eğitim ve Araştırma Hastanesi Mikrobiyoloji
Laboratuvarına gelen tüm boğaz sürüntüsü örnekleri olmakla birlikte, yara, abse, doku, idrar,
kulak akıntısı, eklem ve plevral sıvı (sadece S. pyogenes üremiş olan) örnekleri inceleme
materyali olarak alınmıştır. Çeşitli şikayetlerle poliklinik ve servis hastalarından gelen 174
erkek ve 94 kadın/çocuk olmak üzere toplam 252 hastadan boğaz kültür örnekleri, 9 yara
sürüntü, 4 abse, 3 doku, 1 idrar, 1 kulak akıntısı sürüntüsü, 1 eklem sıvısı ve 1 plevral sıvı
örnekleri hastalardan alındı ve çalışmada kullanıldı. Toplam 272 örnek incelenmiş, kültür ve
kit (Strep A testi) yöntemiyle pozitif olarak bulunan 71 örnek belirlenmiştir. Kültür ve kit
yöntemlerinin doğruluk oranı incelenmiş 7 örnekte kit negatif olmasına rağmen kültür
pozitifliği gözlenmiş olup kültür yönteminin altın standart olduğu teyit edilmiştir. İzole ve
identifiye edilen ve konak olarak kullanılan 68 S. pyogenes suşlarının 49'unda faj içeriğinin
varlığı, geniş konak aralığı, bakteriyosin veya antimikrobiyal aktivite içerdiği belirlendi.

Abstract:
Streptococcus bacteria are commonly found in nature, gram positive, chain forming bacteria in
the coke morphology. Human can be found as normal flora elements, as well as streptococcal
pharyngitis, bacterial endocarditis, impetigo, urinary tract infections, rheumatic heart disease,
acute rheumatic fever, and acute glomerulonephritis, such as pathogen species causing severe
postinfectious syndromes. The aim of this study was to compare the culture method and the
rapid diagnostic test (TOYO-TSA01) together in the diagnosis of S. pyogenes, the leading
respiratory tract infection. Determination of bacteriophage / bacteriocin content, isolation of
bacteriophage and determination of host width of S. pyogenes strains isolated and identified
were determined as secondary targets. In this study, all throat swab specimens from Recep
Tayyip Erdogan University (RTEU) Training and Research Hospital Microbiology Laboratory
were examined. Samples of wound, abscess, tissue, urine, ear discharge, joint and pleural fluid
(only S. pyogenes) were examined taken as. Throat culture specimens, 9 wound culture, 4
abscesses, 3 tissues, 1 urine, 1 ear discharge swabs, 1 joint fluid and 1 pleural fluid samples
were collected from 252 patients, 174 male and 94 female children from polyclinic and ward
patients with various complaints and used in the study. A total of 272 samples were examined
and 71 samples were found positive by culture and kit ( Strep A test ) method. Accuracy of
culture and kit methods was examined. Culture kit was negative in 7 samples although the kit
was negative. The presence of phage content, wide host range, bacteriocin or antimicrobial
activity were determined in 49 S. Pyogenes strains isolated and identified and used as hosts.