Nedeni bilinmeyen ateş ve merkezi sinir sistemi enfeksiyonu olgularında flavi ve flebovirusların araştırılması
Investigation of flavi and phleboviruses in febrile diseases and central nervous system infections of unknown etiology
Yazar: MURAT ÖCAL
Danışman: DOÇ. DR. KORAY ERGÜNAY
Hacettepe Üniversitesi / Tıp Fakültesi / Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
Derece: Tıpta Uzmanlık, 2015
Konu: Mikrobiyoloji = Microbiology
Dizin: Ateş = Fever ; Batı nil virüsü = West nile virus ; Ensefalitler = Encephalitis ; Menenjit-viral = Meningitis-viral ; Menenjitler = Meningitis ; Merkez sinir sistemi = Central nervous system ; Merkez sinir sistemi enfeksiyonları = Central nervous system infections ; Toskana virus = Toscana virus ; Virüs hastalıkları = Virus diseases ; Virüsler = Viruses

Özet:
Batı Nil virusu (BNV), kene-kaynaklı ensefalit virusu
(KKEV) ve Toskana virus (TOSV), önemli vektör kaynaklı ateşli hastalık ve 
menenjit/ensefalit etkenleridir. Bu araştırmada, önceki raporlara göre virus 
aktivitesinin gösterildiği bir bölgedeki üçüncü basamak sağlık kuruluşu ve 
referans merkezinde, ilgili virusların etken olarak varlığı ve önemi araştırılmıştır. 
Toplam 94 hastadan alınan serum ve beyin omurilik sıvısı (BOS) örnekleri 
incelenmiş, örneklerde viral nükleik asit özgül ve jenerik PCR ile, antikor yanıtı 
ise ticari indirekt immünofloresan testleri (IIFT) ile araştırılmıştır. Toplam 8 
olguda (8.5%) BNV veya TOSV enfeksiyonları saptanmış, 7 olguda (%7.4) ise, 
daha önce gerçekleşmiş BNV veya TOSV maruziyeti gösterilmiştir. İki olguda 
viral RNA tayini ile nöroinvazif BNV enfeksiyonu tespit edilmiş, PCR ürünlerinin 
dizi analizi sonucunda, enfeksiyon oluşturan viruslar BNV "köken 1 grup 1a" 
olarak tanımlanmıştır. Toplam 12 olguda (%12.7) KKEV IgG ve/veya IgM 
antikorları saptanmış ancak ek olarak uygulanan plak redüksiyon nötralizasyon 
testi'de (PRNT) özgüllük doğrulanamamıştır. Toplam 2 olguda doğrulanmış, 4 
olguda ise muhtemel TOSV enfeksiyonları saptanmıştır (6.4%). TOSV RNA'sı 
saptanan olguda dizi analizi sonucunda enfeksiyon oluşturan virus "TOSV 
genotip A" olarak tanımlanmıştır. Viral RNA saptanan olguda klinik izlem 
sırasında geçici pansitopeni ortaya çıkmış; bu durum TOSV enfeksiyonlarında 
ilk kez rapor edilmiştir. Sonuç olarak bölgemizde süregelen BNV ve TOSV 
aktivitesi doğrulanmış, ilgili etkenlerle enfeksiyonların diğer bölgelerimizde de 
izlendiğine dair kanıtlar elde edilmiştir. TOSV ve BNV, nedeni bilinmeyen ateşli 
astalık, menenjit ve ensefalit durumlarında etken olarak değerlendirilmelidir.

Abstract:
West
Nile virus (WNV), tick-borne encephalitis virus (TBEV) and Toscana virus 
(TOSV) are among frequently-observed vector-borne viruses causing febrile 
disease and/or meningitis/encephalitis. The impact of these viruses were 
investigated at a referral center in Ankara province, Central Anatolia in 2012, 
where previous reports suggested virus circulation. Serum and/or 
cerebrospinal fluid samples from 94 individuals were evaluated. Viral nucleic 
acids in clinical samples were sought via specific and generic PCRs and 
antibody responses in clinical samples were investigated via commercial 
indirect immunofluorescence tests (IIFTs). In 8 (8.5%) patients, infections of 
WNV or TOSV were identified, where previous exposure to these viruses have 
been revealed in 7 (%7.4) individuals. In 2 patients, neuroinvasive WNV 
infections were dignosed via viral nucleic acid detection, where the virus 
strains were characterized as lineage 1 clade 1a via sequencing of the 
amplicons. TBEV IgG and/or IgM antibodies were detected in 12 cases (12.7%) 
but antibody specificity could not be confirmed via plaque reduction 
neutralization test (PRNT). Confirmed and probable TOSV infections were 
identified in 2 and 4 cases (6.4%), respectively. In one case with detectable 
TOSV RNA, the infecting isolate was characterized as TOSV genotype A via 
sequencing of amplicons. A transient pancytopenia was noted in this patient, 
which is reported for the first time in TOSV infections. In conclusion, circulation 
of BNV and TOSV was confirmed in our region, with further data indicating 
virus activity in other regions as well. These viruses must be considered in 
cases of fever, meningitis and encephalitis of unknown etiology.