Gastrointestinal sistem adenokarsinom örneklerinde p53 kodon 72 polimorfizmi ve insan papilloma virüs (HPV) arasındaki ilişkinin araştırılması
Investigation of the relationship between p53 codon 72 polymorphism and human papillomavirus (HPV) in gastrointestinal system adenocarcinoma samples
Yazar: DENİZ EROL
Danışman: YRD. DOÇ. DR. HÜSEYİN YÜCE
Fırat Üniversitesi / Sağlık Bilimleri Enstitüsü / Tıbbi Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
Derece: Doktora, 2007
Konu: Tıbbi Biyoloji = Medical Biology
Dizin: Neoplazmlar = Neoplasms

Özet:
Bazı p53 polimorfizmleri artmıs kanser gelistirme riskiyle iliskilidir. p53'ün yaygınbir polimorfizmi, kodon 72'de gerçeklesmektedir. Bu polimorfizm ya bir prolin (CCC) ya dabir arginin residüsü (CGC) içeren varyant bir proteinle sonuçlanmaktadır. p53 TS genininkodon 72 polimorfizminin ayrıca HPV-iliskili kanserlerin gelisiminde bir risk faktörüolabilecegi ileri sürülmektedir.Bu çalısmada gastrointestinal sistem kanserlerinde HPV'nin farklı tipleri ile p53kodon 72 polimorfizmi arasındaki iliski arastırıldı. Genomik DNA hasta grubunda parafinegömülü doku kesitlerinden ve kontrol grubunda periferal kandan izole edildi. Çalısmaya 106gastrointestinal sistem kanser hastası ve 107 saglıklı birey dahil edildi.p53 kodon 72 polimorfizmi genotip frekansları, hasta grubunda %88.7 (94/106)Arg/Pro, %11.3 (12/106) Arg/Arg, kontrol grubunda ise %46.7 (50/107) Arg/Pro, %45.8(49/107) Arg/Arg ve %7.5 (8/107) Pro/Pro'dir. Hasta ve kontrol grubu arasında kodon 72genotipi açısından istatistiki olarak önemli bir fark tespit edildi (p<0.01). Tümör dokusuörneklerinde 41 HPV (+) örnegin 36'sında Arg/Pro ve 5'inde Arg/Arg tespit edildi. AncakArg/Pro ve Arg/Arg genotiplerinin HPV (+) ve (-) örneklerdeki dagılımında önemli bir farksaptanmadı (p>0.05).Bu çalısmanın sonuçlarına göre p53 kodon 72 polimorfizminin gastrointestinal sistemkanserlerine yatkınlık olusturabilecegini, ayrıca HPV'nin gastrointestinal sistem kanserpatogenezinde bir rol oynayabilecegini fakat p53 polimorfizminin herhangi bir HPV tipi ileiliskisi olmadıgını düsünmekteyiz.Anahtar Kelimeler: Kanser, p53 kodon 72, HPV

Abstract:
Some of p53 polymorphisms have been associated with increased risk of cancerdevelopment. A common polymorphism of p53 at codon 72 results in either a variant proteinwith a proline (Pro) residue (CCC) or an arginine (Arg) (CGC) residue. Furthermore, recentreports suggest that polymorphism at codon 72 of the p53 tumor suppressor gene might be arisk factor in the development of HPV associated cancers.In this study we investigated the relationship between different type HPV and p53codon 72 polymorphism in gastrointestinal system cancers. Genomic DNA was isolatedparafin embedded tissues in patient group and peripheral whole blood in control group. Thestudy composed of 106 gastrointestinal system cancer patients and 107 healthy controlindividual.In patient group, p53 codon 72 genotype frequency, 88.7% (94/106) Arg/Pro, 11.3%(12/106) Arg/Arg, in control group 46.7% (50/107) Arg/Pro, 45.8% (49/107) Arg/Arg and7.5% (8/107) Pro/Pro. There was statistically significant differences between patient andcontrol groups with regard to codon 72 genotypes (p<0.01). It was detected 36 Arg/Proand 5 Arg/Arg of 41 HPV (+) samples in tumor tissue samples. However, there was nosignificant differences the distribution of Arg/Pro and Arg/Arg genotypes in HPV (+) andHPV (-) samples (p>0.05).Based on the results of this study, we suggest that p53 codon 72 polymorphism mayconstitute susceptibility to gastrointestinal system cancers, and also HPV may have a role ongastrointestinal system cancer patogenesis, but p53 polymorphism has no relationship withany type of HPV.Key Words: Cancer, p53 codon 72, HPV