Nöral tüp kapanma hastalığı olan hastalarda karyotip analizi
Karyotype analysis in patients with neural tube closure disease
Yazar: AKİF YILDIRIM
Danışman: YRD. DOÇ. DR. FATİH BAYRAKLI
Cumhuriyet Üniversitesi / Tıp Fakültesi / Nöroşirürji Ana Bilim Dalı
Derece: Tıpta Uzmanlık, 2013
Konu: Genetik = Genetics
Dizin: Karyotipleme = Karyotyping ; Kromozomlar = Chromosomes ; Meningomiyelosel = Meningomyelocele ; Nöral tüp defektleri = Neural tube defects ; Pediatri = Pediatrics ; Sinir cerrahisi = Neurosurgery

Özet:
Nöral tüp kusuru (NTK) nöral tüpün kapanmasındaki yetersizliğe ikincil oluşan santral sinir sisteminin (SSS) konjenital malformasyonunu belirten genel bir terimdir. Tüm dünyadaki insidansı her 1000 doğumda 1 ila 10 arasında değişmektedir. Olguların büyük kısmı anensefali veya spina bifida (SB) olarak sınıflandırılabilir ve bu iki grup doğumda aynı sıklıkta görülür. Gelişen tıbbi tedavi yöntemleri sonucunda SB'lı hastaların daha uzun yaşamasına olanak vermiştir. SB grubunun altında meningomyelosel (MM), meningosel ve lipomeningosel gibi alt gruplar incelenir.Bazı gözlemler NTK oluşumunda genetik faktörlerin rol oynadığını düşündürmüştür. Öncelikli olarak bazı etnik/ırk (İrlanda'lı ve Meksika'lı) gruplarında daha yüksek görülmesi, ikinci olarak birinci derece akrabalarında NTK olan ailelerde bu hastalığın ortaya daha sık çıkması, üçüncü olarak 200'den fazla NTK fare modelinde bir kısmında kendiliğinden, bir kısmında ise genetik mühendislik sonucunda bu hastalığın ortaya çıkmasıdır. Bunların dışında NTK tek gen bozuklukları ve aynı zamanda kromozomal bozukluklarla beraber seyreden bazı sendromların fenotipik bir özelliği olarak karşımıza çıkması genetik tabanlı bir patogenezi düşündürmektedir. Fakat rutin olarak kullanılan pozisyonel klonlama ve bağlantı analizi gibi hastalığa yol açan geni ortaya çıkarma yöntemleri genellikle bir ailede bir etkilenmiş birey olduğundan dolayı uygulanabilir görülmemektedir.İnsan genomundaki yapısal değişkenler, genomun bir parçasını içeren mikroskobik veya submikroskopik olabilen genellikle 1 kilobazdan daha geniş değişimler olarak tariflenir. Bu yapısal değişkenler kopya sayısı değişkenliği, kopya sayısı polimorfizmi, segmental duplikasyon veya düşük kopya sayısı tekrarı, inversiyon, translokasyon ve segmental uniparental dizomi olarak alt gruplara ayrılabilir. Son yıllarda hem deneysel hem de hesaplama stratejilerindeki gelişmeler insanın yapısal genetik değişikliklerinin daha yüksek çözünürlükte analize edilmesine izin vermiş ve insan genomundaki yapısal değişkenliklerin hastalıklar ile ilişkili olduğunu gösterilmiştir.Bizim yaptığımız çalışmada, karyotipleme tekniği kullanılarak tüm genomda varolabilecek olası bir yapısal varyasyonun nöral tüp defekt ile ilişkisini ortaya koymaya çalıştık.

Abstract:
Neural tube closure defects secondary to insufficient closure of the central nervous system with congenital malformation is a general term indicating. The incidence of all over the world every 1000 births ranged from 1 to 10. The majority of cases can be categorized as anencephaly or spina bifida at birth, but are seen equal in these two groups. As a result of developments in medical treatment, the patients with spina bifida cases can live longer. Spina bifida subgroups are examined such as meningomyelocele, meningocele, and lipomeningosel.Some observations suggest a role of genetic factors in the development of neural tube defects. Firstly, some of the ethnic / race (Irish and Mexican) groups, second part a higher occurrence of neural tube defects as the first-degree relatives in families ,third part as a result of genetic engineering more than 200 spontaneous mouse model of neural tube defects are made. Addition of single gene disorders, neural tube defects, as well as a phenotypic characteristic of some syndromes associated with chromosomal abnormalities seen the emergence suggests a genetically based pathogenesis. However, as a routine use, such as positional cloning and linkage analysis methods to reveal the disease is not applicable, because causing gene in a family affected by an individual patient.Human genome structural variables, including a part of the genome can be microscopic or submicroscobic, often described as the changes are wider than 1 kilobase. These structural variables, the variability of the number of copies, copy number polymorphism, segmental duplications or low copy number repeat, inversion, translocation, and may be subdivided into segmental uniparental disomy. In recent years, developments in both experimental and computational strategies allow human structural genetic changes and gave a higher resolution analysis of the human genome is associated with the structural variations shown diseases.In our study we have tried to show the relationship between neural tube defect and possible structural variations exist in the genome by using the technique of karyotyping .