Ektoservikal mikrobiyotanın servikal preinvaziv lezyonlar ve HPV enfeksiyonu ile ilişkisinin incelemesi
Examination of the relationship between ectocervical microbiota and cervical preinvasive lesions and HPV infection
Yazar: ALPER DEMİR
Danışman: PROF. DR. TUFAN ÖGE
Eskişehir Osmangazi Üniversitesi / Tıp Fakültesi / Kadın Hastalıkları ve Doğum Ana Bilim Dalı
Derece: Tıpta Uzmanlık, 2024
Konu: Kadın Hastalıkları ve Doğum = Obstetrics and Gynecology

Özet:
Serviks kanseri tüm dünyada önemli bir sağlık sorunu olup başlıca nedeni human
papillomavirüs virüs(HPV) enfeksiyonudur. Servikovajinal mikrobiyota kompozisyonu ile
kalıcı HPV enfeksiyonu arasında ilişkiyi gösteren çalışmalar olmasına rağmen preinvaziv
servikal epitelyal lezyonu olan kadınlarda çalışmaların sayısı kısıtlıdır. Bu çalışmada HPV
pozitif olan ve güncel smear testlerinde negatif, düşük dereceli skuamöz intraepitelyal
lezyonları (LSIL) ve yüksek dereceli skuamöz intraepitelyal lezyonları (HSIL) olan hastalar
ile HPV negatif olup güncel smear testi negatif, atipik skuamöz hücreler (ASCUS), LSIL
olan hastaların servikal mikrobiyota kompozisyonun karşılaştırılması planlandı. Bu çalışma
servikal mikrobiyota için örnek alınan 42 kadın hastada yapıldı. Çalışmada HPV pozitif olan
21 olgu ve HPV negatif 21 olguda metagenomik analizlerle mikrobiyota kompozisyonu
değerlendirildi. Filum düzeyinde, HPV negatif ve HPV pozitif gruplarda Firmicutes filumu
en sık saptanmıştır. HPV pozitif grupta Firmicutes azaldığı, Actinobacteria artışı saptandı.
HPV negatif ve HPV pozitif gruplarda cins düzeyinde en sık Lactobacillus, tür düzeyinde ise
en sık Lactobacillus iners (CST III) saptanmıştır. HPV pozitif ve negatif olgularda cins ve
suş düzeyinde farklılıklar saptandı. HPV pozitif olgularda, HSIL grubunda Prevotella copri
ve Atopobium vaginae; LSIL grubunda Gemmiger formicilis, Veillonella dispar, Prevotella
copri ve Faecalibacterium prausnitzii; NSIL grubunda, Prevotella melaninogenica sık
olarak gözlendi. Çalışmamızda HPV negatif grupta da ASCUS, LSIL ve NSIL gruplarında
özellikle suş düzeylerinde farklılıklar mevcuttu. SIN durumuna göre gruplarda en sık
saptanan suş, Lactobacillus iners olup, LSIL olgularında mikrobiyota kompozisyonunda
%87.9 düzeyinde saptandı. HPV pozitif NSIL olgularında cins düzeyinde Parabacteroides,
tür düzeyinde ise Blautia obeum, Parabacteroides_s, ve Peptostreptococcus_s baskın olarak
saptandı. HPV negatif NSIL olgularında ise Paracoccus marcusii türü baskın olarak
saptandı. NSIL olgularında HPV pozitif olgularda Blautia obeum, HPV negatif olgularda
Paracoccus marcusii saptanması, HPV pozitifliğin mikrobiyota kompozisyonunda aynı
patolojik durumdaki farklılığını göstermektedir. Özellikle HPV pozitif olgularda Blautia
obeum baskınlığının daha büyük kohortlarda gösterilmesi faydalı olacaktır.
Anahtar Kelimeler: serviks kanseri, HPV, mikrobiyota, mikrobiyom, servikal mikrobiyota
Destekleyen Kurum: Bu çalışma Eskişehir Osmangazi Üniversitesi Bilimsel Araştırma
Projeleri Koordinasyon Birimi tarafından TTU-2023-2814 nolu proje kapsamında
desteklenmiştir.

Abstract:
Cervical cancer is a significant global health issue that is predominantly caused by infection
with the human papillomavirus (HPV). While there is evidence linking the cervico-vaginal
microbiota to persistent HPV infection, research on women with pre-invasive cervical
epithelial lesions is limited. The objective of this study was to analyze and compare the
composition of cervical microbiota in patients who tested positive for HPV and had low-
grade squamous intraepithelial lesions (LSIL) or high-grade squamous intraepithelial lesions
(HSIL), with patients who tested negative for HPV and had negative results for both current
smear tests with atypical squamous cells (ASCUS) and LSIL. The investigation was
conducted on a sample of 42 female patients, who were examined for cervical microbiota.
Metagenomic analysis was used to assess the composition of the microbiota in a group of 21
patients who tested positive for HPV and another group of 21 patients who tested negative
for HPV. The Firmicutes phylum was the most commonly observed at the phylum level in
both the HPV negative and HPV positive groups. The abundance of Firmicutes decreased
while the abundance of Actinobacteria increased in the group of individuals who tested
positive for HPV. Lactobacillus and Lactobacillus iners (CST III) was the predominant
genus and species in both the HPV negative and HPV positive groups. Distinct variations
were seen in at genus and species level between HPV positive and negative groıp. In HPV
positive cases, at species level Prevotella copri and Atopobium vaginae in the HSIL group,
Gemmiger formicilis, Veillonella dispar, Prevotella copri, and Faecalibacterium prausnitzii
in the LSIL group, and Prevotella melaninogenica in the NSIL group, have been observed.
We also observed differences at species level among the ASCUS, LSIL, and NSIL groups in
HPV negative group. Based on the SIN status, the predominant species was Lactobacillus
iners, 87.9% in the microbiota composition of LSIL patients. Parabacteroides at the genus
level and Blautia obeum, Parabacteroides_s, and Peptostreptococcus_s at the species level
were more abundant in HPV positive NSIL group. Paracoccus marcusii was more abundant
in HPV negative NSIL group. The presence of Blautia obeum in HPV positive NSIL cases
and Paracoccus marcusii in HPV negative cases in NSIL cases indicates that the microbiota
composition differs based on HPV status in the same pathological condition. Displaying the
prevalence of Blautia obeum, particularly in HPV positive patients, in larger groups would
be beneficial.