Pozitif kan kültürlerinden yapılacak hızlı antimikrobiyal duyarlılık testi (HADT) ile uygun antibiyotik tedaviye katkı sağlanması
Contributing to appropriate antibiotic treatment with rapid antimicrobial susceptibility testing (RAST) from positive blood cultures
Yazar: FURKAN ARABACI
Danışman: PROF. DR. HÜSEYİN GÜDÜCÜOĞLU
Trakya Üniversitesi / Tıp Fakültesi / Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
Derece: Tıpta Uzmanlık, 2024
Konu: Mikrobiyoloji = Microbiology

Özet:
Hızlı Antimikrobiyal Duyarlılık Testi, bazı bakteriler için Avrupa Antimikrobiyal Duyarlılık Testi Komitesi tarafından doğrulanmıştır. Çalışmada; antibiyotik disklerinin ve mikroorganizma tanımlama sürelerinin değerlendirilmesinin rutin olarak kullanılan otomatik sistemlerle zaman ve doğruluk açısından karşılaştırılması amaçlandı.
Pozitif sinyal veren şişelerden alınan numunelerde 4, 6, 8 veya 16-20. saatlerde antibiyotik disk zon çapı sonuçları belirlendi ve bu sırada ilk tanısını sağlayacak konvansiyonel yöntemler kullanıldı. Kolonilere tahmini tanı uygulanmış sonuçları kliniğe rapor edilmiştir. Kanlı agar besiyerindeki üremelerin tanımlanması ve antimikrobiyal duyarlılık testi otomatik sistem (Vitek-2, bioMérieux, Fransa) ile yapıldı. İstatistiksel yöntemler olarak; Z-Testi ve Fisher'in kesin testi kullanıldı.
Laboratuvarımıza 5.5 ayda 5.049 kan kültürü ulaştı. 2170 tanesi pozitif sinyal verdi. Kategorik uyum şu şekilde belirlendi: (4,6,8,16-20), E. coli (88,89,93,-), K. pneumoniae (88,95,89,-), A. baumannii (95,94,95,-), P. aeruginosa (-,86,86,-), TPZ (86,87,92,-), CAZ (95,95,92,-), MEM (95,96,89,-), CIP ( 90,95,93,-), SXT (92,95,89,-), AK (82,94,95,-), IPM (86,93,89,-), S. aureus (100,100,98,100), FOX (100,100,98,100), E. faecalis (-,100,68,72), E. faecium (-,-,84,-), AM (-,100,85,100), VA (-,-,36) ,0), LNZ (-,100,94,100), S. pneumoniae (-,-,-100), AM (-,-,-,100), E (-,-,-,100). En fazla numunenin okunma süresi Gram negatif bakterilerde 6-8 saat, S. pneumoniae'de 16-20 saat, diğer Gram pozitif bakterilerde ise 8 saattir. Bunların dışında Vitek-2 ile 136 bakteri isimlendirildi. Hızlı Antimikrobiyal Duyarlılık Testi ile otomatik tanımlama sistemi arasındaki saat farkı şu şekildedir; E. coli (20,9 saat), K. pneumoniae (20,8 saat), A. baumannii (29,7 saat), P. aeruginosa (19,2 saat), S. aureus (15,3 saat), E. faecalis (10,8 saat), E. faecium (14,5 saat), S. pneumoniae (37 saat).
Hızlı Antimikrobiyal Duyarlılık Testi ile kan kültürlerinde üreyen bakterilerin antimikrobiyal duyarlılık sonuçları saatler içerisinde yüksek doğrulukla verilebilmektedir.

Abstract:
Rapid Antimicrobial Susceptibility Testing technique validated by European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing for some Gram (+/-) bacteria. In this study; It was aimed to compare the evaluation of antibiotic discs and microorganism identification times with routinely used automatic systems in terms of time and accuracy.
Antibiotic disc zone diameter results were determined at the 4, 6, 8 or 16-20 hours for the samples taken from the bottles that gave a positive signal on the blood culture system, and at this time, conventional diagnostic methods that would provide the first estimated diagnosis to the colonies that had grown were applied and the antimicrobial susceptibility testing results were reported to the clinic. Identification and antimicrobial susceptibility testing results of growths on blood agar medium were made with automatic system (Vitek-2, bioMérieux, France). As statistical analysis methods; Z-Test and Fisher's exact test were used.
5049 blood culture bottles arrived in our laboratory (within 5.5 months). A total of 2172 blood culture bottles gave a positive signal in this period. Categorical agreement was determined as follows: (4,6,8,16-20), E. coli  (88,89,93,-), K. pneumoniae (88,95,89,-), A. baumannii (95,94,95,-), P. aeruginosa (-,86,86,-), TPZ (86,87,92,-), CAZ (95,95,92,-), MEM (95,96,89,-), CIP (90,95,93,-), SXT (92,95,89,-), AK (82,94,95,-), IPM (86,93,89,-), S. aureus (100,100,98,100), FOX (100,100,98,100), E. faecalis (-,100,68,72), E. faecium (-,-,84,-), AM (-,100,85,100), VA (-,-,36,0), LNZ (-,100,94,100), S. pneumoniae (-,-,-100), AM (-,-,-,100), E (-,-,-,100). The time when the most samples were read for the bacteria is 6-8 hours in Gram negative bacteria, 16-20 hours in S. pneumoniae  and it is 8 hours in other Gram positive bacteria. Apart from these bacteria, 136 bacteria have been identified with Vitek-2. The time difference between Rapid Antimicrobial Susceptibility Testing and automatic identification system is as follows; E. coli (20.9 h), K. pneumoniae (20.8 h), A. baumannii (29.7 h), P. aeruginosa (19.2 h), S. aureus (15.3 h), E. faecalis (10.8 h), E. faecium (14.5 h), S. pneumoniae (37 h).
With the Rapid Antimicrobial Susceptibility Testing method, antimicrobial susceptibility results of bacteria grown in positive blood cultures can be given within hours with high accuracy.