Wnt antagonisti gen polimorfizmleri ve meme kanseri arasındaki ilişkinin araştırılması
Investigation of relationship between wnt antagonist gene polymorphisms and breast cancer
Yazar: GONCA DÖNMEZ
Danışman: PROF. DR. ALİ FAZIL YENİDÜNYA
Cumhuriyet Üniversitesi / Sağlık Bilimleri Enstitüsü / Tıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
Derece: Doktora, 2014
Konu: Tıbbi Biyoloji = Medical Biology
Dizin: Antagonistler = Antagonists ; Meme neoplazmları = Breast neoplasms ; Neoplazmlar = Neoplasms ; Polimorfizm-genetik = Polymorphism-genetic

Özet:
Çalışmamızda DKK3 nonsinonim ekzon 7 Arg335Gly, DKK3 intron 4 G/C, DKK4 sinonim ekzon 4 V169V ve sFRP4 nonsinonim ekzon 6 R340K polimorfizmlerinin meme kanseri gelişiminde risk oluşturup oluşturmadığının araştırılması amaçlanmıştır. Çalışmada meme kanseri tanısı konmuş 100 kadın hasta ve 100 sağlıklı kadın kontrol araştırılmıştır.
DKK3 nonsinonim ekzon 7 Arg335Gly, DKK3 intron 4 G/C, DKK4 sinonim ekzon 4 V169V ve sFRP4 nonsinonim ekzon 6 R340K polimorfizmlerinin genotiplendirilmesi, izole edilen DNA'lar kullanılarak PCR-RFLP (Polymerase Chain Reaction ve Restriction Fragment Length Polymorphism) yöntemleri ile gerçekleştirilmiştir.
χ2 testi kullanılarak yapılan istatistiksel analizde, DKK3 nonsinonim ekzon 7 Arg335Gly, DKK3 intron 4 G/C ve sFRP4 nonsinonim ekzon 6 R340K polimorfizimlerinin dağılımı açısından hasta ve kontrol grubu arasından anlamlı bir fark bulunamamıştır (p>0.05). 
Bununla beraber, DKK4 sinonim ekzon 4 V169V polimorfizmi dağılımının hasta ve kontrol grubu arasında anlamlı olarak farklı olduğu gözlemlenmiştir (p<0.05). Ayrıca Forward Stepwise lojistik regresyon analizi kullanılarak yapılan istatistiksel analizde CC genotipine sahip bireylerin, CT ve TT genotipine sahip bireylere göre meme kanseri geliştirme riskinin 16 kez daha fazla olduğu bulunmuştur (p<0.05) (OR, 16,38; %95 CI, (6,37-42,12)). Buna ek olarak vücut kitle indeksi ve sFRP4 nonsinonim ekzon 6 R340K genotip farklılıklarının meme kanseri gelişiminde risk faktörü olduklarını Forward Stepwise lojistik regresyon analizi ile belirledik.
Çalışmamızda bu polimorfizmler ve klinikopatalojik veriler arasında ilişki olup olmadığı değerlendirilmiştir. İstatistiksel analiz sonucunda, DKK3 nonsinonim ekzon 7 Arg335Gly polimorfizminin uzak metastaz oluşumuna etkisi olduğunu belirledik.

Anahtar kelimeler: Meme kanseri, Wnt antagonistleri, DKK3, DKK4, sFRP4,polimorfizm

Abstract:
In our study, we aimed to investigate whether DKK3 nonsynonymous exon 7 Arg335Gly, DKK3 intron 4 G/C, DKK4 synonymous exon 4 V169V and sFRP4 nonsynonymous exon 6 R340K polymorphisms are risk factors of breast cancer development. In this study, 100 female patients with breast cancer and 100 healthy females as a control group were examined. 
Genotyping of DKK3 nonsynonymous exon 7 Arg335Gly, DKK3 intron 4 G/C, DKK4 synonymous exon 4 V169V and sFRP4 nonsynonymous exon 6 R340K polymorphisms had been performed by PCR-RFLP (Polymerase Chain Reaction ve Restriction Fragment Length Polymorphism) methods using isolated DNA.
In statistical analysis using χ2 test, we observed that there was no significant difference between case and control groups for distribution of DKK3 nonsynonymous exon 7 Arg335Gly and DKK3 intron 4 G/C polymorphisms (p>0.05).
On the other hand, distribution of DKK4 synonymous exon 4 V169V polymorphism between case and control groups was significantly different (p<0.05). Using Forward Stepwise logistic regression analysis, we also found that individuals with CC genotype have 16 times more risk for breast cancer development than individuals with CT and TT genotypes (p<0.05) (OR, 16,38; 95% CI, (6,37-42,12)). In addition using Forward Stepwise logistic regression analysis we determined that body mass index and sFRP4 nonsynonymous exon 6 R340K genotype differences have been identified as a risk factors in the development of breast cancer.
In our study, the relation between these polymorphisms and clinicopathologic data was evaluated. As a result of statistical analysis, we determined that there was a significant effect of DKK3 nonsynonymous exon 7 Arg335Gly polymorphism on distant metastasis.

Key words: Breast cancer, Wnt antagonists, DKK3, DKK4, sFRP4, polymorphism