Plazmid aracılı kinolon direnci(QNRS1 ve ACC (6')-IB-CR) ve enrofloksasin ile eliminasyonu
Plazmid-mediated quinolone resistance(qnrs1 and AAC (6')-IB-CR)and its elimination with enrofloxacin
Yazar: ERDEM ARSLAN
Danışman: DOÇ. DR. MURAT CENGİZ
Uludağ Üniversitesi / Sağlık Bilimleri Enstitüsü / Farmakoloji ve Toksikoloji (Veterinerlik) Ana Bilim Dalı
Derece: Doktora, 2017
Konu: Eczacılık ve Farmakoloji = Pharmacy and Pharmacology ; Veteriner Hekimliği = Veterinary Medicine
Dizin: Antibiyotikler = Antibiotics ; Antienfektif ajanlar-kinolon = Anti infective agents-quinolone ; Enrofloxacin = Enrofloxacin ; Escherichia coli = Escherichia coli ; Mutasyon = Mutation ; Plazmitler = Plasmids ; İlaçlara direnç = Drug resistance ; İlaçlara direnç-mikrobiyal = Drug resistance-microbial ; İn vitro = In vitro

Özet:
PLAZMİD ARACILI KİNOLON DİRENCİNİN (qnrS1 ve aac (6')-Ib-cr) ve ENROFLOKSASİN İLE ELİMİNASYONU
Bu çalışma, florokinolon direncini tanımlamak, florokinolon direnç etmenlerinin
enrofloksasinin mutant oluşumunu önleme potansiyeli ve bakteriyel inhibisyon
özellikleri üzerindeki etkilerini belirlemek ve enrofloksasinin hayvansal kaynaklı E. coli
izolatları üzerindeki etkinliğini değerlendirmek amacıyla gerçekleştirilmiştir.
Tez projesinde TUBİTAK (COST) 110O478 numaralı proje kapsamında Bursa
ili ve çevresinden toplanan 311 adet hayvansal kaynaklı E. coli izolatı ve 2 kontrol suşu
(E. coli ATCC 25922 ve E. coli AG100) ve moleküler olarak oluşturulmuş 3 klon suş
kullanıldı. Enrofloksasinin duyarlılığı mikrodilüsyon yöntemi ile belirlendi. Plazmidal
genlerin tespiti ve klonlama işlemleri moleküler teknikler ile gerçekleştirildi.
kromozomal mutasyonların ve plazmidal genlerinin direnç üzerindeki etkilerini
belirlemek amacıyla izolatlar arasından en geniş genetik skalaya sahip 5 izolat, 2
kontrol suşu ve 3 klon suş için Mutant önleyici konsantrasyon (MÖK),Mutant frekansı
(MF) ve mutant seçim penceresi (MSP) değerleri belirlendi. Statik in vitro
farmakodinamik model kullanılarak zamana bağlı doz-yanıt deneyleri yapıldı.
Doksan dokuz E. coli izolatı duyarlı, 50 orta derecede duyarlı, 162 tanesi ise
dirençli olarak sınıflandırıldı. On qnrS1 ve 32 adet aac (6')-Ib-cr geni tespit edildi.
Gen prevelanları sırasıyla % 3,3 ve % 10,3 olarak belirlendi. İki genin birlikte bulunma
oranı ise % 0,62 olarak hesaplandı. MÖK, MF ve MSP çalışmaları sonunda QRDR
mutasyonları ve qnrS1ve aac (6')-Ib-cr genlerinin enrofloksasinin MÖK, MF ve MSA
değerlerini arttırarak bakterileri enrofloksasinin antimikrobiyal etkilerinden koruduğu
belirlendi. Ayrıca zamana bağlı doz-yanıt deneyleri ile enrofloksasinin karakteristik
konsantrasyona bağlı bakterisidal etkisi klon suşlar, PMQR genlerine ve/veya QRDR
mutasyonlarına sahip E. coli izolatlarında zamana-bağlı veya ko-etkiye dönüştüğü
saptandı.
Anahtar kelimeler: E. coli, qnrS, aac (6')-Ib-cr, enrofloksasin, Mutant Önleyici
Konsantrasyon, statik in vitro farmakodinami

Abstract:
PLAZMID-MEDIATED QUINOLONE RESISTANCE (qnrS1 and aac (6')- Ib-cr) AND ITS ELIMINATION WITH ENROFLOXACIN
Aims of this study were to identify floroquinolone resistance, characterization of
QRDR mutations and PMQR genes and their influence on enrofloxacin resistance as
well as assessment and characterization of enrofloxacin activity against fluoroquinolone
resistant E. coli isolated from animals.
Three hundered and eleven E. coli strains from the sample collection of COST
Project 110O478, 2 control strains (E. coli ATCC 25922 and E. coli AG100) and 3
molecularly constructed clones were used in this study. Broth microdilution tests were
performed for determination of enrofloxacin susceptibility. Molecular methods were
used for detection and cloning of PMQR genes. Mutant prevention concentration
(MPC), mutant frequency (MF) and mutant selection window (MSW) values were
determined for 5 E. coli isolates 3 clone and 2 control strains. Static in vitro
pharmacodynamic model was used for assessment and characterization of enrofloxacin
pharmacodynamics.
Ninety nine E. coli isolates were classified as susceptible, 50 as intermediate and
162 as resistant. Sequencing results verified 10 S1 and 32 cr variants. Prevelance of
PMQR genes were 3,3 % and 10,3 % respectively. Prevelance of coexistance was 0,62
%. MPC, MF, MSW experiments indicated that QRDR mutations and PMQR genes
enhance MPC, MF, MSW values and provide protection against enrofloxacin activity
thus aiding survival and provoking emergence of enrofloxacin resistant sup-poulations
in E. coli. Static in vitro pharmacodynamic modelling revealed characteristic dosedepended
bactericidal effect of enrofloxacin is altered and displayed as time-depended
or co-effect in the prescence of QRDR mutations and/or PMQR genes in E. coli.
Keywords: E. coli, qnrS, aac (6')-Ib-cr, enrofloxacin, Mutant Prevention
Concentration, statik in vitro pharmacodynamics