Kanserde HINT1  gen ekspresyon analizi /
Yazar: ÇAĞLA GÜRSOY
Danışman: PROF. DR. SEVGİ AKAYDIN
Gazi Üniversitesi / Sağlık Bilimleri Enstitüsü / Biyokimya Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2012
Konu: Biyokimya = Biochemistry

Özet:
Evrimsel açıdan yüksek oranda korunmuş olan HIT protein 
süper ailesinin üyesi Histidin Triad Nükleotid bağlayıcı protein1 (HINT1), 
memeli dokuları dahil çeşitli türlerde yaygın olarak eksprese edilen bir 
gendir. HINT1'in önemli bir tümör supresör gen olduğuyla ilgili giderek 
artan sayıda çalışma olmasına rağmen, onun tümör baskılama 
konusundaki etkinliği ve mekanizması halen tam olarak bilinmemektedir. 
Çalışmamızın başlıca amacı HINT1'in değişik kanserlerdeki gen 
ekspresyon oranlarındaki değişiklikleri incelemekti. Biz ayrıca onun 
antioksidan özelliği olup olmadığını da incelemeyi amaçladık. 
Çalışmamızda, RT-PCR yöntemiyle kolorektal, mide ve meme 
kanserlerinde HINT1'in ve SOD1' in normal ve tümör dokularında gen 
ekspresyon düzeyleri ölçülmüştür. HINT1'in ekspresyon değerleri, toplam 
26 hastanın 14'ünde (%53.85), kolorektal kanseri olan 13 hastanın 8'inde 
(%61.54), meme kanseri olan 7 hastanın 3'ünde (%42.86) ve mide kanseri 
olan 6 hastanın 3'ünde (%50) tümör dokusunda normal dokuya oranla 
daha düşük olduğu gözlenmiştir. Bununla birlikte, HINT1'in tümörlü doku 
ortalama ekspresyon düzeyleri normal dokulardakinden istatistiksel olarak 
anlamlı olmasa da yüksek bulunmuştur (p>0.05). Tümör dokularındaki 
SOD1 ekspresyon değerlerinin, ilginç olarak, toplam 26 hastanın 10'unda 
(10/26, %38.46), kolorektal kanseri olan 13 hastanın 6'sında (%46.15), 
meme kanseri olan 7 hastanın 2'sinde (%28.57) ve mide kanseri olan 6 
hastanın 2'sinde (%33.33) normal dokuya göre daha az olduğu tespit 
edilmiştir. Total kanser hastalarının normal dokularında (R=0.768, 
p<0.0001), kolorektal kanser hastalarının hem normal (R=0.753, p< 0.005) 
hem de tümör dokularında (R=0.768, p<0.0001), ve mide kanseri 
hastalarının normal dokularında (R=0.945, p<0.0001) HINT1 ve SOD1 gen 
ekspresyonları arasında yüksek korelasyon olduğunu gözledik. Meme 
kanserli hastaların, sadece tümör dokusunda (R=0.758, p<0.05) HINT1 ve 
SOD1 gen ekspresyonları arasında zayıf pozitif bir korelasyon vardı.Çalışmamızda elde edilen sonuçlara göre, diğer kanserlerde olmasa da, 
kolorektal kanserli hastaların çoğunda tümör dokusunda azalan HINT1 
gen ekspresyonları, bu kanser türünde HINT1'in tümör supressör özelliğini 
destekler niteliktedir. Ayrıca iyi bilinen bir antioksidan olan SOD1 ile HINT1 
arasındaki yüksek korelasyon, HINT1'in bir tümör supressör gen olmasının 
yanı sıra, p53 gibi bir antioksidan olarak değerlendirilebileceğini 
göstermektedir. 
 
Anahtar kelimeler: HINT1, SOD1, kanser, gen ekspresyonu

Abstract:
Histidine triad nucleotide-binding protein (HINT1), a member of the 
evolutionary highly conserved HIT protein superfamily, is ubiquitously 
expressed in diverse species including mammalian tissues. Although an 
increasing number of studies show that HINT1 is an important tumor 
suppressor gene, its effectiveness and mechanism of tumor suppression 
is still unclear. The main purpose of this study was to investigate the 
changes of HINT1 gene expression rates in various cancers types. We 
also aimed to study its antioxidant properties by comparing with SOD1, is 
a well-known antioxidant. The gene expression levels of HINT1 and SOD1 
were measured by RT-PCR method in normal and tumor tissues in colon, 
gastric, and breast cancers. HINT1 expression values were observed to 
be lower in tumor tissues of 14 of the total 26 patients (%53.85), 8 of 13 
patients with colorectal cancer (%61.54), 3 of the 7 patients with breast 
cancer (%42.86), and 3 of 6 patients with gastric cancer (%50) than in 
normal tissues . However, the mean levels of HINT1 expression in tumor 
tissue were higher, but not statistically significant, than those in normal 
tissues. However, the mean levels of HINT1 expression in tumor tissue 
were higher, but not statistically significant, than those in normal tissues. 
Interestingly, SOD1 expression values were found to be lower in tumor tissues of 10 of the total 26 patients (%38.46), 6 of 13 patients with 
colorectal cancer (%46.15), 2 of the 7 patients with breast cancer 
(%28.57), and 3 of 6 patients with gastric cancer (%33.33) than in normal 
tissues. We observed high positive correlations between HINT1 and SOD1 
gene expressions in normal tissues (R=0.768, p<0.0001) of total cancer 
patients, in both normal (R=0.753, p< 0.005) and tumour tissues (R=0.919, 
p<0.0001) of colorectal cancer patients, and in normal tissues (R=0.945, 
p<0.005) of gastric cancer patients. There was a weak positive correlation 
between HINT1 and SOD1 gene expressions in tumour tissue (R=0.758, 
p<0.05) of patients with breast cancer. According to the results obtained in this study, the decreasing HINT1 gene expressions in tumor tissue in the 
majority of patients with colorectal cancer support tumor suppressor effect 
of HINT1 in this type of cancer, but not in other cancers. In addition, high 
correlation between SOD1, well-known antioxidat enzyme, and HINT1 
show to be able to evaluate as an antioxidant rather than a tumour 
supressor gene. 
Keywords: HINT1, SOD1, cancer, gene expression