İdrar yolu infeksiyonlu çocuklardan izole edilen E. coli'lerin özelliklerinin araştırılması
İnvestigating the properties of E. coli isolated from children with urinary tract infection
Yazar: HATİCE ELİF KOCA
Danışman: PROF. DR. UFUK ABBASOĞLU
Gazi Üniversitesi / Sağlık Bilimleri Enstitüsü / Farmasötik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2009
Konu: Mikrobiyoloji = Microbiology

Özet:
E. coli, idrar yolu infeksiyonlarından en sık izole edilen mikroorganizmadır ve üriner epitelde kolonizasyonlarını ve persistansını kolaylaştıracak virulans faktörlerine sahiptir. Bu çalışmada, Gazi Üniversitesi Hastanesi Mikrobiyoloji Laboratuvarından sağlanan 50 adet E. coli suşlarında, hemaglütinasyon, hemolizin oluşumu ve biyofilm oluşturmanın rolü ve önemi araştırılmış ve duyarlılık sonuçları ile virulans faktörlerinin arasındaki ilişkiyi vurgulamak için antibiyotiklere duyarlılık ve GSBL varlığı araştırılmıştır. Levofloksasin, meropenem, siprofloksasin ve gentamisinin minimum inhibitor konsantrasyonları (MİK) CLSI önerileri doğrultusunda saptanmıştır. GSBL fenotipik doğrulama testi CLSI önerileri doğrultusunda yapılmış ve sefotaksim, sefotaksim/klavulanik asit, seftazidim ve seftazidim/klavulanik asit kullanılmıştır. Biyofilm oluşumu, modifiye mikrotitre plak yöntemi kullanılarak saptanmış ve ELISA optik okuyucu ile ölçülmüştür. Ayrıca mannoza dirençli hemaglütinasyon ve hemolizin oluşumu da saptanmıştır. Duyarlılık sonuçları ile virulans faktörleri arasındaki ilişki incelenmiştir. Sonuç olarak, 7 suş siprofloksasine dirençli ve 5 suş da gentamisine dirençli bulunmuştur. Onbeş suşun GSBL ürettiği saptanmış ve bu suşlardan 10 tanesinin biyofilm oluşumu, 2 tanesinin de mannoza dirençli hemaglütinasyon açısından pozitif olduğu saptanmıştır.Beta hemoliz üretimi, GSBL üretmeyen ama mannoza dirençli hemaglütinasyon yapan, sadece 1 suşda saptanmıştır. Sonuç olarak, biyofilm oluşumu ile GSBL üretimi arasında istatistiksel olarak anlamlı bir fark bulunmuştur.

Abstract:
E. coli is the most common microorganism isolated from urinary tract infections and has virulence factors that facilitate their colonization and persistence in the urinary epithelium. In this study, Gazi Üniversity Hospital Microbiology Laboratory proveded 50 pieces E.coli strains, haemagglutination,haemolysin and biofilm formation has been investigated and the importance of creating a role and sensitivity result and to highlight the relationship between virulance factors and antibiotic suscebtibilty were investigated evtended spectrum beta lactamase(ESBL) presence. The Minimum Inhibitory Concentrations (MIC) of Levofloxacin, Meropenem, Ciprofloxacin and Gentamycin were determined according to the guidelines of Clinical Laboratory Standards Institute (CLSI). ESBL phenotyping confirmation test was applicated according to the guidelines of CLSI and Cephotaxim, Cephotaxim/Clavulanic acid, Ceftazidime and Ceftazidime/Clavulanic acid were used. Biofilm formation was determined by a modified microtitre plate test and measured using an ELISA optical reader. Mannose resistant hemagglutination and hemolysine production were also determined. The correlation of susceptibility values and the virulence factors was investigated. As a result, 7 strains were resistant to Ciprofloxacin and 5 strains were resistant to Gentamycin. Fifteen strains were determined as ESBL producing and among these strains 10 strains were biofilm forming and 2 were mannose resistance hemagglutination positive. Beta hemolysin production was observed in only 1 strain that was not ESBL producing and mannose resistant hemagglutination of this strain was positive. As a result, statistically significant difference was determined between biofilm formation and GSBL production.