Sendromik olmayan izole veya tam dudak-damak yarıklı bireylerin genetik analizler ile değerlendirilmesi
Genetic evaluation of non-syndromic isolated or complete cleft lip and palate individuals
Yazar: ASLI ŞENOL
Danışman: PROF. DR. FERABİ ERHAN ÖZDİLER
Ankara Üniversitesi / Sağlık Bilimleri Enstitüsü / Ortodonti Ana Bilim Dalı
Derece: Doktora, 2017
Konu: Diş Hekimliği = Dentistry ; Genetik = Genetics
Dizin: Genetik = Genetics ; Genetik hastalıklar-doğuştan = Genetic diseases-inborn ; Genler = Genes ; Ortodonti = Orthodontics ; Yarık damak = Cleft palate ; Yarık dudak = Cleft lip

Özet:
Bu araştırma kapsamında, sendromik olmayan izole veya tam dudak-damak yarıklı bireyler genetik analizler ile değerlendirilmiş ve bu durumun genetik kökeninde rolü olabileceği düşünülen faktörler arasından MSX1 geni incelenmiştir.
Ankara Üniversitesi Diş Hekimliği Fakültesi Ortodonti Anabilim Dalı'na başvurmuş herhangi bir sendrom bulgusu bulunmayan 50 dudak damak yarıklı birey çalışmaya dahil edilmiştir. Bireylerin herhangi bir sendrom taşıyıp taşımadıkları bilgisine İntergen Genetik Tanı Araştırma ve Uygulama Merkezinde ile yapılan konsültasyonlar ve genetik değerlendirmeler neticesinde ulaşılmıştır. 
Çalışmamızda dudak damak yarıklarının oluşumunda literatürde hipodonti ve yarık dudak damakla ilişkilendirilmiş ve her iki anomali için ortak etiyolojik faktörü olmasından şüphe ettiğimiz MSX1 geni etkisi değerlendirilmiş ve bu gende saptanan değişiklikler incelenmiştir. Tespit edilen MSX1 değişkenleri bakımından dudak damak yarıklı hastaların Türkiye kontrol ve genom popülasyonları ile karşılaştırılmasında Ki-Kare / Fisher's Exact Test kullanılmıştır. Dudak damak yarıklı hastalarda MSX1 değişkenlerinin görülme riskinin kaç kat fazla olduğu Odds Oranı ve %95 güven aralığı ile belirlenmiştir.
Araştırma bulgularımıza göre 50 hastanın 23'ünde, MSX1 geninin 4 ayrı bölgesinde değişiklikler (A40G, c.119C>G; G116G, c.348C>T; R167R, c.501C>G; c.*6C>T, c.1152 C>T) belirlenmiştir.
MSX1 geninde tespit ettiğimiz 4 varyanta ait bulguların Türkiye kontrol grubu ve 1000 genom çalışma verileri ile karşılaştırıldığında MSX1 geninin gerek doğrudan gerekse transkripsiyonu etkileyen faktörleri dolaylı bir şekilde etkileyerek dudak damak yarıkları ile ilişkili olduğunu düşündürmüştür.
Bu sonuçlar dudak damak yarıklarının oluşmasına engel olabilecek yeni araştırmalara ve toplumdaki sıklıklarını azaltacak muhtemel gen tedavileri için yol gösterici niteliktedir.
Anahtar Kelimeler: Dudak Damak Yarıkları, Genetik, MSX1

Abstract:
Genetic Evaluation of Non-Syndromic Isolated or Complete Cleft Lip and Palate Individuals
Within this study, the individuals with non-syndromic cleft lip and palate were assesed with genetic analysis. MSX1 gene was thought to be the leading candidate in the genetic reasons and was analysed. 
50 patients with non-syndromic cleft lip palate, were selected in this study among patients who came to Ankara University Faculty of Dentistry, Department of Orthodontics. After genetical evaluations and consulting with Intergen Genetic Diagnosis Research and Applicantion Center, it was concluded whether the patients are syndromic or not. 
In this study, the affect of MSX1 gene which is associated with the cleft lip palate and hypodontia in the literature and which we suspected that was the common etiologic factor for both anomalies were evaluated in the occurence of cleft lip and palate. Chi Square/Fisher's Exact test was used to compare the detected MSX1 variants with the Turkish control group and 1000 genome population. The incidence of MSX1 variants in cleft lip and palate patients was evaluated by referring to Odds Ratio and 95% confidence interval.
According to our findings, in 23 patients among 50, changes in four different regions of the MSX1 gene (A40G, c.119C>G; G116G, c.348C>T; R167R, c.501C>G; c.*6C>T, c.1152 C>T) were found.
The findings of four detected variants were compared with the Turkish control group and 1000 genom studies and it made us thought that the MSX1 gene can directly or indirectly be in relation with the formation of cleft lip and palates by affecting the transcription factors.
These results can open a path to the further researches for avoiding the occurence of cleft lip and palates as well as developing potential gene therapies for reducing the frequency of the celft lip and palates among the population.
Key words: Cleft lip and palate, Genetic, MSX1