Akut lenfoblastik lösemi (ALL) ve kronik myeloid lösemi (KML) ön tanılı olgularda füzyon gen ekspresyonlarının analizi
Analysis of the fusion gene expressions in the preliminary diagnosis cases of acute lymphoblastic leukaemia and chronic myeloid leukamia
Yazar: VOLKAN ÖZER
Danışman: YRD. DOÇ. DR. ÖZLEM İZCİ AY
Mersin Üniversitesi / Sağlık Bilimleri Enstitüsü / Tıbbi Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
Derece: Yüksek Lisans, 2011
Konu: Genetik = Genetics ; Hematoloji = Hematology
Dizin: Genler = Genes ; Kromozom düzensizlikleri = Chromosome aberrations ; Lösemi-miyeloid-kronik-BCR-ABL pozitif = Leukemia-myelogenous-chronic-BCR-ABL positive ; Neoplazmlar = Neoplasms ; Polimeraz zincirleme reaksiyonu = Polymerase chain reaction ; Prekürsör hücreli lenfoblastik lösemi-lenfoma = Precursor cell lymphoblastic leukemia-lymphoma ; Translokasyon-genetik = Translocation-genetics ; Çocuklar = Children

Özet:
Kronik Myeloid Lösemi, pluripotent hematopoetik kök hücrelerinin neoplastik dönüşümüne neden olan klonal bir hastalıktır. KML'nin ayırıcı özelliği t(9;22)(q34;q11) translokasyonu sonucu oluşan ?Philedelphia kromozomu?nun varlığıdır. Bu translokasyona KML hastalarında %90-95 oranında rastlanılmaktadır.Çocukluk çağı Akut Lenfoblastik Lösemi (ALL) de sayısal ve yapısal kromozomal anomaliler %80 oranında görülmekte olup tanı için önem taşımaktadır. Bu dönemdeki olgularda t(9;22)(q34;q31) ile BCR-ABL füzyon geni %5 oranında görülmekte olup, kötü prognozla ilişkilendirilmektedir. t(12;21)(p13;q22) sonucunda TEL/AML1 füzyon geni oluşmaktadır ve iyi prognozla ilişkilendirilir. TEL/AML1 geni çocukluk dönemi ALL'sinde %17-25 oranında görülmektedir. t(4;11)(q21-q23) sonucunda MLL-AF4 füzyon geni oluşur. Kötü prognozla ilişkilendirilen bu füzyon genin sıklığı %3-4'dur.Tez kapsamında, Mersin Üniversitesi Tıp Fakültesi Dahili Bilimler Anabilim dalı- Hematoloji Bilim Dalı'na gelen yetişkin KML ön tanılı hastaların kemik iliği örneklerinde p210BCR-ABL füzyon genlerin varlığı ve Çocuk Hematoloji Bilim Dalı'na gelen çocukluk çağı ALL ön tanılı hastaların kemik iliği örneklerinde p190BCR-ABL, TEL-AML ve MLL-AF4 füzyon genlerinin varlığı araştırıldı. Hastaların kemik iliği örneklerinden RNA izole edildikten sonra RNA'lar komplementer DNA'ya (cDNA) çevrildi. Hastaların cDNA örnekleri spesifik primer ve problar kullanılarak, Gerçek Zamanlı Polimeraz Zincir Reaksiyonu (Real Time-PCR) yöntemiyle füzyon gen ekspresyonları araştırıldı. 20 KML ön tanılı hastanın 4 tanesinde p210BCR-ABL füzyon geni tespit edildi. Bu hastalar sitogenetik yöntemle Ph kromozomu açısından da değerlendirildi ve 20 hastanın 10 tanesinde Ph kromozomu tespit edildi. 15 çocukluk çağı ALL ön tanılı hastalarda p190BCR-ABL, TEL-AML1 ve MLL-AF4 füzyon genlerine rastlanmadı.

Abstract:
Chronic Myeloid Leukemia is a clonally disease, leading to the neoplastic transformation of pluripotent hematopoietic stem cells. The presence of ?Philadelphia Chromosome? as a resulting of t(9 ;22)(q34 ;q11) translocation is a distinctive characteristic of CML. This translocation is found in 90-95% of CML patients.Occurring in 80% of childhood ALL, the numeric and structural abnormalities are required for the diagnosis. BCR-ABL fusion gene that arise from t(9 ;22)(q34 ;q31) translocation is associated with poor prognosis, detected in 5% in the case of diagnosis. TEL-AML1 fusion gene occurs as a result of t(12 ;21)(q13 ;q22) and is associated with favorable prognosis. The TEL-AML1 gene is observed in 25% of childhood ALL. MLL-AF4 fusion gene is formed by the outcome of t(4 ;11)(q21-q23). The frequency of this fusion gene associated with poor prognosis is 3-4 %.In the context of this thesis, bone marrow samples, obtained from adult patients with CML preliminary diagnosis diagnosed at Medicine Faculty of Mersin University, Department of Integrated Sciences - Department of Hematology are examinated for the presence of p210BCR-ABL fusion gene. In addition, the presence of p210BCR-ABL, TEL-AML1 and MLL-AF4 fusion genes is searched in the bone marrow samples obtained patients with childhood ALL at preliminary diagnosis diagnosed at Department of child?s Hematology. RNAs are isolated from patients? bone marrow samples then transformed to the complement DNA (cDNA). Using specific primer and probe, the fusion gene expressions are examinated by Real Time Polymerase Reaction (Real Time-PCR). p210 BCR-ABL fusion gene was determinate at the 4 of the 20 CML preliminary patients. These patients evaluated with the cytogenetic procedure also aspect of chromosome Ph and it was confirmed the 10 of the 20 patients. P190BCR-ABL, TEL-AML1 and MLL-AF4 fusion genes are not found in 15 patients with childhood ALL at preliminary diagnosis.