Mycobacterium fortuitum izolatlarında biyofilmoluşumu ve klaritromisin duyarlılığınınaraştırılması
Investigation of biofilm formation and clarithromycin susceptibility in mycobacterium fortuitum isolates
Yazar: BERKE KURUMANASTIRLI
Danışman: PROF. DR. ZEYNEP SARIBAŞ
Hacettepe Üniversitesi / Tıp Fakültesi / Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
Derece: Tıpta Uzmanlık, 2024
Konu: Mikrobiyoloji = Microbiology

Özet:
Kurumanastırlı Berke, Mycobacterium fortuitum İzolatlarında Biyofilm Oluşumu
ve Klaritromisin Duyarlılığının Araştırılması, Hacettepe Üniversitesi Tıp
Fakültesi, Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, Uzmanlık Tezi, Ankara, 2024.
Mycobacterium fortuitum, hızlı üreyen tüberküloz dışı mikobakteri (TDM) türlerinden
biridir. Dış ortamda çok yaygın bulunan bu bakteri özellikle immünsupresif hastalarda
nazokomiyal enfeksiyonlar ile ilişkilendirilmiştir. M. fortuitum'un çeşitli yüzeylerde
(cerrahi alet, implant, vb.) biyofilm oluşturabildiği gösterilmiştir. Biyofilm
mukopolisakkarid tabaka ve mikroorganizma topluluğundan meydana gelen yüzey
oluşumudur. Biyofilm tabaka içerisindeki özelleşmiş hücrelerin yükselmiş
antimikrobiyal minimum inhibitör konsanstrasyon (MİK) değerlerine bağlı olarak
tedavi başarısızlığına neden olabileceği gösterilmiştir. M. fortuitum enfeksiyonlarının
tedavisinde kullanılan antimikobakteriyel ajanlardan biri olan makrolid grubu üyesi
klaritromisine karşı erm (39) genindeki mutasyonlar indüklenebilir makrolid direnci
ile ilişkilendirilmiştir. Çalışmamızda, 40 adet M. fortuitum suşunda, standart sıvı
mikrodilüsyon testi ile klaritromisin duyarlılığının belirlenmesi, biyofilm oluşturma
özelliklerinin araştırılması ve erm (39) geninde mutasyon varlığının araştırılması
amaçlanmıştır. Yetmiş ikinci saatte yapılan değerlendirmede tüm izolatlar duyarlı, 14.
günde izolatların %65'i indüklenebilir makrolid dirençli olarak raporlanmıştır.
Biyofilm oluşumunun araştırılması için kristal viyole yöntemi kullanılmıştır ve iki
izolat (%5) "orta biyofilm pozitif", 38 izolat (%95) "zayıf biyofilm pozitif" olarak
rapor edilmiştir. Sanger dizileme yöntemi kullanılarak erm (39) geninde mutasyon
varlığı araştırılmıştır. İzolatların tamamında PZR'de, erm (39) geni pozitif
bulunmuştur. Dünyada ve ülkemizde M. fortuitum'u ele alan duyarlılık ve biyofilm
çalışmaları oldukça sınırlı sayıdadır. Elde edilen sonuçlar ile M. fortuitum
enfeksiyonlarında daha bilinçli ve etkili bir tedavi prensibine katkıda bulunmayı
hedeflemekteyiz.

Abstract:
Kurumanastırlı Berke, Investigation of Biofilm Formation and Clarithromycin
Susceptibility in Mycobacterium fortuitum Isolates, Hacettepe University Faculty
of Medicine, Department of Medical Microbiology, Thesis in Medical
Microbiology, Ankara, 2024. Mycobacterium fortuitum is a rapid growing nontuberculous mycobacteria (NTM) species. This species which is very common in the
environment, has been associated with nosocomial infections, especially in
immunosuppressed patients. M. fortuitum can form biofilm on various surfaces
(surgical instruments, implants, etc.). Biofilm is a surface formation consisting of a
mucopolysaccharide layer and a population of microorganisms. Specialized cells
within the biofilm which have high antimicrobial minimum inhibitory concentration
(MIC) values may cause treatment failures. Mutations in the erm (39) gene have been
associated with inducible macrolide resistance against clarithromycin, which is a
member of the macrolide antibiotic group used in the treatment of M. fortuitum
infections. In our study, we aimed to investigate clarithromycin susceptibility by
standard broth microdilution method, biofilm formation and erm (39) gene mutations
in 40 M. fortuitum isolates. While all isolates were found to be susceptible at the 72
nd
hour, 65% of the isolates were reported as inducible macrolide resistance on day 14.
The crystal violet method was used to investigate biofilm formation and two isolates
(5%) were reported as "moderate biofilm positive" and 38 isolates (95%) as "weak
biofilm positive". Mutations in the erm (39) gene were investigated using the Sanger
sequencing method. The erm (39) gene was found positive in PCR in all isolates. There
are a limited number of studies on susceptibility and biofilm testings of M. fortuitum
in the world and in our country as well. Thanks to our findings, we aim to contribute
to a more conscious and effective treatment principle in M. fortuitum infections.