Enterobacteriaceae klinik izolatlarında karbapenemaz varlığının fenotipik yöntemlerle araştırılması
Exploration of carbapenemase presence via phenotypic methods in 
clinical enterobacteriaceae isolates
Yazar: EMRAH AYDIN
Danışman: DOÇ. DR. ABDURRAHMAN KİREMİTÇİ
Eskişehir Osmangazi Üniversitesi / Tıp Fakültesi / Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
Derece: Tıpta Uzmanlık, 2013
Konu: Mikrobiyoloji = Microbiology
Dizin: Enterobacteriaceae = Enterobacteriaceae ; Fenotip = Phenotype ; Karbamazepin = Carbamazepine ; İlaçlara direnç = Drug resistance ; İlaçlara direnç-mikrobiyal = Drug resistance-microbial

Özet:
Karbapenemler beta-laktam antibiyotikler arasında en geniş aktivite
spektrumuna sahip ilaçlardır. Ancak günümüzde karbapenem dirençli
Enterobacteriaeceae enfeksiyonları dünya çapında bildirilmektedir. Bu direncin esas
nedeni, genetik olarak aktarılabilir karbapenemaz üretimidir. Bu çalışmada, Eskişehir
Osmangazi Üniversitesi Tıp Fakültesi Mikrobiyoloji Anabilim Dalında klinik
örneklerden izole edilen ve Phoenix (BD Diagnostics, ABD) otomatize sistemi ile
karbapenem minimal inhibitör konsantrasyon (MİK) değerlerinde artış saptanan 190
Enterobacteriaceae suşundan 104'ünde Etest (bioMerieux, Fransa) yöntemi ile MiK
değerlerinde artış olduğu doğrulanmıştır. Bu suşlar üzerinde yapılan fenotipik testler
ile, karbapenem direnç mekanizması olarak; 33'ünde (%31,5) "genişlemiş
spektrumlu beta-laktamaz (GSBL) + OXA-48 ve benzeri profil", 26'sında (%25)
OXA-48 ve benzeri profil, 18'inde (%17,5) metalo-beta-laktamaz (MBL), 13'ünde
(%12,5) "KPC+MBL", 13'ünde (%12,5) "GSBL+Porin kaybı" ve 1'inde (%1) KPC
saptanmıştır. Ayrıca Eskişehir Osmangazi Üniversitesi Tıp Fakültesinde çeşitli
servislerde yatmakta olan 210 farklı hastadan alınan rektal sürüntü örnekleri 1 μg/ml
dozda imipenem içeren EMB agar besiyerlerine ekilmiş, izole edilen 16 suşta Etest
yöntemi ile karbapenem MiK artışı olduğu doğrulanmıştır. Bu suşlar üzerinde
yapılan fenotipik testler ile, karbapenem direnç mekanizması olarak; 11'inde (%5)
OXA-48 ve benzeri profil, 3'ünde (%1,5) "KPC+MBL", 2'sinde MBL (%1)
mekanizması saptanmıştır. Bu çalışmaya göre; otomatize sistem sonuçlarına göre
karbapenem MİK değerlerinde artış saptanan izolatlarda bu artışın doğrulanması ve
hastane içinde, karbapenem dirençli Enterobacteriaceae prevalansının arttığı
birimlerde karbapenem içeren besiyeri kullanılarak taşıyıcılık taraması yapılması
mantıklı görünmektedir.

Anahtar Kelimeler: Enterobacteriaeceae, karbapenem direnci, karbapenema

Abstract:
Carbapenems have the widest spectrum of activity among beta-lactam antibiotics. However, today,
carbapenem resistant Enterobacteriace infections have been reported worldwide. The
main cause of this resistance is the genetic transfer of carbapenemase genes. In this
study, 104 of 190 Enterobacteriaeceae strains which were isolated from clinical
specimens at Eskisehir Osmangazi University Medicine of Faculty, Department of
Microbiology and detected as having increased MIC values by Phoenix (BD
Diagnostics, USA) automated system were confirmed as having increased MIC
values by using Etest (bioMerieux, France) method. By using phenotypic methods on
these strains, the mechanisms of carbapenem resistance have been detected as
follows: At 33 strains (%31,5) as "extended spectrum beta-lactamase (ESBL) +
OXA-48-like profile", at 26 strains (%25) as OXA-48-like profile, at 18 strains
(%17,5) as metallo-beta-lactamase (MBL), at 13 strains (%12,5) as "KPC+MBL", at
13 strains (%12,5) as "ESBL+Porin loss" and at 1 strain (%1) as KPC. On the other
hand, 210 rectal swabs collected from hospitalised patients at various services of
Eskisehir Osmangazi University Faculty of Medicine were plated on EMB agar
media which contain imipenem at 1 μg/ml dose for each. Sixteen of isolated strains
were confirmed as having increased carbapenem MIC values by using Etest method.
By using phenotypic methods on these strains, the mechanisms of carbapenem
resistance have been detected as follows: At 11 strains (%5) as OXA-48-like profile,
at 3 strains (%1,5) as "KPC+MBL", at 2 strains (%1) as MBL (%1). According to
this study, confirmation of increased carbapenem MIC values detected by automated
system and screening of the carriers by using carbapenem containing media at the
units that have increased carbapenem resistant Enterobacteriaceae prevalance, seem
reasonable.

Key Words: Enterobacteriaceae, carbapenem resistance, carbapenemase