COMPTE-RENDU ANATOMO PATHOLOGIQUE

Patient : Jose Ligonie

Né le : 09/01/1962

Sexe : M

Prélevé le : 29/09/25

Reçu le : 29/09/25

Prescripteur : Dr Manuel Vaugrente

NATURE DU PRÉLÈVEMENT :

Deux biopsies pulmonaires :

-   Nodule du lobe inférieur droit.

-   Nodule du lobe moyen droit.

RENSEIGNEMENTS CLINIQUES :

Homme de 63 ans, suivi pour HTA, hospitalisé pour hémoptysie et altération de l'état général. L'imagerie thoracique montre deux nodules pulmonaires droits (lobe inférieur et lobe moyen) ainsi que des lésions secondaires cérébrales et surrénaliennes.

EXAMEN MACROSCOPIQUE :

-   Nodule du lobe inférieur droit : Plusieurs fragments biopsiques mesurant entre 0,5 et 1 cm. (blocs 1-2)

-   Nodule du lobe moyen droit : Plusieurs fragments biopsiques mesurant entre 0,5 et 1,5 cm. (blocs 3-4).

EXAMEN MICROSCOPIQUE :
- Nodule du lobe inférieur droit : on observe une proliferation tumorale constituée d'amas plus ou moins cribriforme et de nappes solides de cellules atypiques cuboïdes, à cytoplasme modérément abondant, avec anisocaryose nucléaire et des nucléoles visibles.

- Nodule du lobe moyen droit : on note une prolifération tumorale faite de structures acineuses bien individualisées, associées à des zones solides. Les cellules présentes des atypies marquées et les quelques figures mitotiques sont observées.

Immunohistochimie sur les nodules du lobe inférieur (bloc 2) et du lobe moyen droit (bloc 4) :

- CK7 (clone OV-TL 12/30, Dako, dilution 1/200) : positivité diffuse.

- TTF-1 (clone SPT24, Novocastra, dilution 1/100) : positivité nucléaire diffuse.

- Etude de l'expression de PDL1 nodule lobe inférieur et nodule du lobe moyen droit (anticorps DAKO, clone 22C3) :

Nombre de cellules évaluables : > 100.

Témoins positifs : externes.

Pourcentage de cellules tumorales avec un marquage membranaire : 0 %.

Score TPS : 0%

- Recherche de translocation ALK et ROS1 nodule lobe inférieur et nodule du lobe moyen droit :

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|   Anomalies chromosomiques                                      |   Résultat IHC                                  |   Résultat FISH                               |   Résultat des tests                                                                        |
|                                                                 |                                                 |                                               |                                                                                             |
|                                                                 |   (1 CT positive déclenche 1 contrôle par FISH) |   (positif à partir de 15% de CT réarrangées) |                                                                                             |
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|   Translocation d'ALK                                           |   -Nb de cellules analysées :50                 |   -non réalisée                               |   -Absence de translocation en ImmunoHistoChimie                                            |
|                                                                 |                                                 |                                               |                                                                                             |
|   prétraitement CC1 Roche 64 min                                |   -% de cellules positives :0                   |                                               |                                                                                             |
|                                                                 |                                                 |                                               |                                                                                             |
|   Clone 5A4 Abcam 1/50 incub 2H                                 |   - Score : negatif                             |                                               |                                                                                             |
|                                                                 |                                                 |                                               |                                                                                             |
|   Révélation OptiviewDAB sur Benchmark ULTRA                    |                                                 |                                               |                                                                                             |
|                                                                 |                                                 |                                               |                                                                                             |
|   Sonde Vysis LSI ALK bicolore Break Apart (Abbott)             |                                                 |                                               |                                                                                             |
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|   Translocation de ROS1                                         |   -Nb de cellules analysées :50                 |   -non réalisée                               |   -Absence de translocation en ImmunoHistoChimie sous réserve des conditions préanalytiques |
|                                                                 |                                                 |                                               |                                                                                             |
|   prétraitement CC1 Roche 64 min                                |   -% de cellules positives :0                   |                                               |                                                                                             |
|                                                                 |                                                 |                                               |                                                                                             |
|   Clone D4D6 Cell Signaling 1/25 incubation 2h sans chauffage   |   - Score : négatif                             |                                               |                                                                                             |
|                                                                 |                                                 |                                               |                                                                                             |
|   Révélation OptiviewDAB sur Benchmark ULTRA                    |                                                 |                                               |                                                                                             |
|                                                                 |                                                 |                                               |                                                                                             |
|   Sonde ZytoLight SPEC ROS1 dual color break Apart (Zytovision) |                                                 |                                               |                                                                                             |
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CONCLUSION :

- Adénocarcinome pulmonaire, retrouvé de manière concordante dans les biopsies du lobe inférieur droit (architecture majoritairement solide) et du lobe moyen droit (architecture majoritairement acineuse).

Score TPS (nodule lobe inférieur droit et lobe moyen droit) : 0%

- Dans la limite des techniques utilisées, aucune altération n'a été détectée dans les gènes ALK et ROS1 (nodule lobe inférieur droit et lobe moyen droit) en ImmunoHistoChimie. L'utilisation d'une thérapie par inhibiteur de tyrosine-kinase anti ALK et ROS1 n'est pas recommandée.

- Une analyse moléculaire est en cours sur les blocs 1 et 3 afin de déterminer s'il agit de deux tumeurs différentes ou s'il s'agit d'une seule et même tumeur. Les résultats d'analyses moléculaires feront l'objet d'un compte rendu complémentaire.

Fait le 01/10/25 par Dr Giorgio Troussu.

Codification ADICAP :

BHRPA7A0


COMPTE-RENDU ANATOMO PATHOLOGIQUE COMPLÉMENTAIRE

Patient : Jose Ligonie

Né le : 09/01/1962

Sexe : M

Recherche d'anomalies moléculaires par NGS

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|   RENSEIGNEMENTS ANATOMO-CYTO-PATHOLOGIQUES ET TECHNIQUES                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 |
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|   - Recherche effectuée à partir du bloc : BLOC 1                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         |
|                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           |
|   - Fixation : FORMOL                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     |
|                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           |
|   - Type de prélèvement et organe : BIOPSIE POUMON LOBE INFÉRIEUR DROIT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   |
|                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           |
|   - Type histologique et état tumoral: Adénocarcinome pulmonaire                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          |
|                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           |
|   - Pathologiste responsable du diagnostic : Dr Giorgio Troussu                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           |
|                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           |
|   - Analyse réalisée sur une zone sélectionnée par le Dr Giorgio Troussu                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  |
|   représentant une surface de 2 mm² et comportant 60 % de cellules tumorales.                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             |
|                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           |
|   - Extraction d'ADN réalisée avec l'extracteur Promega Maxwell IVD et le kit Maxwell® 16 FFPE Plus LEV DNA Purification Kit, Préparation des librairies réalisée avec le kit KAPA HyperPlus ROCHE, Captures réalisées avec le kit Solid Tumor Solution CSTS_B_v1 SOPHIA GENETICS, Séquençage Illumina réalisé sur un MiSeq en Paired End, Analyse informatique réalisée avec la plateforme SOPHIA DDM® version en vigueur Pipeline : ILL1XG1S4_FFPE_1, Génome de référence : GRCh37/hg19 |
|                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           |
|   - Seuil de positivité des variants : 5%                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 |
|                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           |
|   - Profondeur minimale de lecture : 300X                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 |
|                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           |
|   - Référence Analyse : STS_25--055                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       |
+-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------+

+-----------------------------------------------------------------------+
|   RÉSULTATS                                                           |
+=======================================================================+
|                                                                       |
+-----------------------------------------------------------------------+

-   Variant dont l'impact clinique est connu :

+--------+------------------------------+---------------------------------------+-----------------------+
|   Gène |   Description de la mutation |   Altération protéique correspondante |   Fréquence allélique |
+========+==============================+=======================================+=======================+
|   EGFR |   c.2573T>G                  |   p.(Leu858Arg)                       |   30%                 |
+--------+------------------------------+---------------------------------------+-----------------------+

+-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------+
|   RENSEIGNEMENTS ANATOMO-CYTO-PATHOLOGIQUES ET TECHNIQUES                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 |
+===========================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================+
|   - Recherche effectuée à partir du bloc : BLOC 3                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         |
|                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           |
|   - Fixation : FORMOL                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     |
|                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           |
|   - Type de prélèvement et organe : BIOPSIE POUMON LOBE MOYEN DROIT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       |
|                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           |
|   - Type histologique et état tumoral: Adénocarcinome pulmonaire                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          |
|                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           |
|   - Pathologiste responsable du diagnostic : Dr Giorgio Troussu                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           |
|                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           |
|   - Analyse réalisée sur une zone sélectionnée par le Dr Giorgio Troussu                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  |
|   représentant une surface de 2 mm² et comportant 50 % de cellules tumorales.                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             |
|                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           |
|   - Extraction d'ADN réalisée avec l'extracteur Promega Maxwell IVD et le kit Maxwell® 16 FFPE Plus LEV DNA Purification Kit, Préparation des librairies réalisée avec le kit KAPA HyperPlus ROCHE, Captures réalisées avec le kit Solid Tumor Solution CSTS_B_v1 SOPHIA GENETICS, Séquençage Illumina réalisé sur un MiSeq en Paired End, Analyse informatique réalisée avec la plateforme SOPHIA DDM® version en vigueur Pipeline : ILL1XG1S4_FFPE_1, Génome de référence : GRCh37/hg19 |
|                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           |
|   - Seuil de positivité des variants : 5%                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 |
|                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           |
|   - Profondeur minimale de lecture : 300X                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 |
|                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           |
|   - Référence Analyse : STS_25--055                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       |
+-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------+

+-----------------------------------------------------------------------+
|   RÉSULTATS                                                           |
+=======================================================================+
|                                                                       |
+-----------------------------------------------------------------------+

-   Variant dont l'impact clinique est connu :

+--------+------------------------------+---------------------------------------+-----------------------+
|   Gène |   Description de la mutation |   Altération protéique correspondante |   Fréquence allélique |
+========+==============================+=======================================+=======================+
|   EGFR | c.2236_2250del               | p.(Glu746_Ala750del)                  |   40%                 |
+--------+------------------------------+---------------------------------------+-----------------------+

CONCLUSION :

Nodule lobe pulmonaire inférieur droit (bloc 1) :

- Présence de la mutation c.2573T>G ; p.(Leu858Arg) de l'exon 21 du gène EGFR, conférant une sensibilité aux inhibiteurs de tyrosines kinases de l'EGFR.

- Dans la limite des techniques utilisées, aucune mutation n'a été détectée dans les exons des autres gènes ciblés par le panel.

Nodule lobe pulmonaire inférieur droit (bloc 3) :

- Présence de la délétion c.2236_2250del ; p.(Glu746_Ala750del)de l'exon 19 du gène EGFR, conférant une sensibilité aux anti-tyrosines kinases ciblant l'EGFR. Cette délétion de 15 nucléotides entraîne la perte de 5 acides aminés dans le domaine fonctionnel tyrosine kinase de la protéine (www.uniprot.org).

- Dans la limite des techniques utilisées, aucune mutation n'a été détectée dans les exons des autres gènes ciblés par le panel.

Les mutations différentes au sein des deux nodules pulmonaires, suggèrent deux processus tumoraux d'origine différente.

Fait le 13/10/25 par Dr Giorgio Troussu.