Létalité synthétique
Catégorie : Sciences

context: Les dépistage à haut débit de létalité synthétique sont aussi réalisés chez les métazoaires, mais le problème principal rencontré est l'efficacité de la perturbation génique. Chez le nématode C. elegans, l'interférence par ARN peut être combinée avec une mutation de perte de fonction chez une souche d'intérêt. Alors que l'interférence par ARN est plus contraignante expérimentalement chez Drosophila, les microréseaux de cellules vivantes permettent d'inactiver deux gènes simultanément. L'interférence par ARN est aussi applicable aux cellules de mammifères, et les tests génétiques dans des lignées de cellules de mammifères sont importants pour identifier des cibles pharmacologiques de médicaments.
qas: question: Avec quoi l'interférene par ARN  peut-elle être combinée chez C. elegans ?
answers: text: une mutation de perte de fonction

question: Quel est le problème principal lors des tests à haut débit de létalité synthétique chez les Metazoaires ?
answers: text: l'efficacité de la perturbation génique

question: Quel procédure permet la désactivation simultanée de deux gènes chez Drosophila ?
answers: text: les microréseaux de cellules vivantes

question: Pourquoi les tests génétiques dans des lignées de cellules mammifères sont-ils importants ?
answers: text: identifier des cibles pharmacologiques de médicaments

text: pour identifier des cibles pharmacologiques de médicaments

question: Quel est le nom de l'organisme modèle cité en premier dans ce texte ?
answers: text: C. elegans

context: La létalité synthétique peut être explorée dans une large gamme d'organismes modèles, dont Drosophila melanogaster et Saccharomyces cerevisiae. Comme les mutations létales synthétiques ne sont pas intrinsèquement viables, les approches communes consistent à utiliser des mutations thermosensibles ou insérer des mutations sous le contrôle d'un promoteur régulé afin de permettre l'exploration du phénotype résultant sans conduire à la mort de l'organisme. Certaines paires de gènes létaux synthétiques peuvent être détectées en essayant d'élucider des mécanismes moléculaires de processus biologiques fondamentaux sans utiliser de tests à haut débit. Par exemple, la létalité synthétique de la parkine et de la MTF1 chez Drosophila a été découverte en examinant le lien entre un stress oxydatif et l'homéostasie métallique dans la pathogénie de la maladie de Parkinson.
qas: question: En quoi consistent les approches communes d'exploration du phénotype ?
answers: text: utiliser des mutations thermosensibles ou insérer des mutations sous le contrôle d'un promoteur régulé

text: utiliser des mutations thermosensibles ou insérer des mutations sous le contrôle d'un promoteur régulé

question: Quels sont les 2 organismes modèles cités dans ce texte ?
answers: text: Drosophila melanogaster et Saccharomyces cerevisiae

question: Que peut-on détecter sans utiliser de tests à haut débit ?
answers: text: Certaines paires de gènes létaux synthétiques

question: Comment peut-on détecter certaines paires de gènes létaux synthétiques sans avoir recours à des tests à haut débit ?
answers: text: en examinant le lien entre un stress oxydatif et l'homéostasie métallique

text: en essayant d'élucider des mécanismes moléculaires de processus biologiques fondamentaux

question: Quel exemple de létalité synthétique impliquant une paire de gènes est cité dans ce texte ?
answers: text: la létalité synthétique de la parkine et de la MTF1

context: La létalité synthétique est la conséquence d'une tendance des organismes à maintenir des "schémas de mise en mémoire tampon" permettant une stabilité phénotypique malgré des variations génétiques, des changements environnementaux et des événements aléatoires tels que les mutations. Cette robustesse génétique est le résultat de voies redondantes parallèles et de "protéines condensatrices" qui camouflent les effets des mutations de telle façon que les processus cellulaires importants ne dépendent d'aucun composant individuel. La létalité synthétique peut aider à identifier ces liens de "mise en mémoire tampon", ainsi que le type de maladie ou dysfonctionnement quand ces liens se décomposent, grâce à l'identification d'interactions géniques qui fonctionnent soit dans le même processus biochimique soit dans des voies métaboliques qui se révèlent ne pas être liées.
qas: question: Que permettent les schémas de mise en mémoire tampon ?
answers: text: une stabilité phénotypique

question: Comment la létalité synthétique permet-elle d'identifier des schémas de mise en mémoire tampon ?
answers: text: identification d'interactions géniques qui fonctionnent soit dans le même processus biochimique soit dans des voies métaboliques qui se révèlent ne pas être liées

question: Pourquoi les schémas de mise en mémoire tampon confèrent-ils une robustesse génétique ?
answers: text: les processus cellulaires importants ne dépendent d'aucun composant individuel

question: Quels sont les sources de pertubations du phénotype d'un organisme ?
answers: text: des variations génétiques, des changements environnementaux et des événements aléatoires tels que les mutations

question: De quoi résulte la stabilité phénotypique que confère les schémas de mise en mémoire tampon ?
answers: text: de voies redondantes parallèles et de "protéines condensatrices" qui camouflent les effets des mutations

context: Le phénomène de létalité synthétique a été décrit pour la première fois par Calvin Bridges en 1992, qui a remarqué que certaines combinaisons de mutations chez l'organisme modèle Drosophila melanogaster conféraient une létalité. Theodosius Dobjansky a formulé le terme de synthetic lethality en 1946 afin de décrire le même type d'interaction génétique chez des souches sauvages de Drosophila. Si la combinaison d'événements génétiques résulte en une diminution non létale de la fitness, l'interaction est appelée "maladie synthétique". Bien qu'en génétique classique le terme de létalité fait référence à l'interaction entre deux perturbations génétiques, la létalité synthétique peut aussi s'appliquer aux cas où la combinaison d'une mutation et de l'action d'un composé chimique cause une létalité, alors que la mutation ou le composé pris séparément n'est pas létal(e).
qas: question: Qui a décrit pour la première fois le phénomène de létalité synthétique ?
answers: text: Calvin Bridges

question: Chez quel organisme Calvin Bridges a-t-il étudié le phénomène de létalité synthétique ?
answers: text: Drosophila melanogaster

text: Drosophila melanogaster

question: Qui a formulé le terme de synthetic lethality en 1946 ?
answers: text: Theodosius Dobjansky

text: Theodosius Dobjansky

text: Theodosius Dobjansky

question: Dans quel cas parle-t-on de 'maladie synthétique' ?
answers: text: une diminution non létale de la fitness

text: Si la combinaison d'événements génétiques résulte en une diminution non létale de la fitness

text: la combinaison d'événements génétiques résulte en une diminution non létale de la fitness

question: Hormis les cas de combinaisons de mutations, quand peut-on parler de létalité synthétique ?
answers: text: cas où la combinaison d'une mutation et de l'action d'un composé chimique cause une létalité

context: Lors d'un dépistage génétique de létalité synthétique, il est nécessaire de partir d'une mutation qui ne tue pas la cellule, qui peut éventuellement conférer un certain phénotype (par exemple une croissance ralentie), et ensuite tester de façon systématique d'autres mutations à d'autres loci afin de déterminer lequel confère cette létalité. La létalité synthétique est utile en thérapie cancéreuse ciblant les molécules, avec l'exemple de la thérapie ciblant les molécules exploitant un gène létal synthétique exposé par un gène suppresseur de tumeurs inactivé (BRCA1 et 2) qui a reçu l'aval de la FDA en 2016 (inhibiteur de PARP). La létalité collatérale constitue un sous-cas de létalité synthétique, où les vulnérabilités sont exposées par la délétion de gènes passagers plutôt que par un suppresseur de tumeurs.
qas: question: Qu'est-ce que la létalité collatérale ?
answers: text: utile en thérapie cancéreuse ciblant les molécules

text: un sous-cas de létalité synthétique, où les vulnérabilités sont exposées par la délétion de gènes passagers

question: En quoi la létalité synthétique peut être utile ?
answers: text: en thérapie cancéreuse

question: Quel exemple de phénotype résultant d'une mutation non létale est donné dans ce texte ?
answers: text: une croissance ralentie

question: Quels exemples de gène suppresseur de tumeur sont donnés dans ce texte ?
answers: text: BRCA1 et 2

question: Que cible la thérapie ayant reçu l'aval de la FDA en 2016 ?
answers: text: un gène suppresseur de tumeurs inactivé

text: inhibiteur de PARP