#NEWLINE# def _get_cl( args ) : #NEWLINE# #INDENT# clargs = [ 'upgrade' ] #NEWLINE# if args . install_data : #NEWLINE# #INDENT# clargs . append ( '--data' ) #NEWLINE# for g in args . genomes : #NEWLINE# #INDENT# clargs . extend ( [ '--genomes' , g ] ) #NEWLINE# #UNINDENT# for a in args . aligners : #NEWLINE# #INDENT# clargs . extend ( [ '--aligners' , a ] ) #NEWLINE# #UNINDENT# for t in args . datatarget : #NEWLINE# #INDENT# clargs . extend ( [ '--datatarget' , t ] ) #NEWLINE# #UNINDENT# #UNINDENT# return clargs