真澄は、以前は角館で亡くなったと言われていたが、神代村梅沢（現在の仙北市田沢湖梅沢）で病の床につき、そこで亡くなり、遺骸を角館の神明社に移して其処で死を公表して、その後秋田に運んだと考えられている。秋田市寺内にある菅江真澄翁墓は1962年（昭和37年）に秋田市史跡第一号に指定されている。墓碑正面中央には「菅江真澄翁」と陰刻され、その周囲に真澄と親交が深かった国学者の鳥屋長秋(とやのながき)による万葉調の長歌が彫られている。右側面には「文政十二己丑七月七月十九日卒年七十六七」と没年月日や年齢が刻まれている。墓石は、最初は南向きであったが、隣接する墓所を通って参拝することになるので、1909年（明治42年）に西向きに変えられた。2014年3月25日には、秋田県指定史跡に指定されている。
1811年、久保田藩金足の豪農奈良家 を訪れた真澄は、久保田藩の藩校であった明徳館の学者、那珂通博（なかみちひろ）に出会う。那珂は領内の様子を書いた文章に自信がなく、真澄に密かに添削を頼んだ。これが縁となって真澄は藩主の佐竹義和から出羽六郡の地誌を作ってほしいと頼まれる。以降真澄は久保田城下に住み、藩主とも親交を持ち、久保田藩の地誌の作成に携わり、その後は久保田藩領から外に出ることはなかった。小説家の司馬遼太郎は、このことが真澄の書いた文章が散逸することを防いだと指摘している。秋田に住み始めた頃から、道士のような被り物を頭に被るようになった。これはそもそも吉田を出奔するに至った刀傷を隠すためではとも推測されたが、実際にはそのような傷はなかったといわれる。また、これは津軽藩を追い出された後の事であり、津軽藩で嫌疑をかけられたことを繰り返さないとそのような姿になったとも言われている。
1797年9月5日、弘前藩主津軽寧親によって開設されたばかりの藩校稽古館によばれ、薬事係に任命される。これは、弘前藩の山崎永貞（浪岡北畠氏の後裔の山崎氏出身。滝口館に住していた）によって推薦されたこともあるが、真澄の本草学の知識を利用し、弘前藩の薬草の自給自足をはかるためでもあった。真澄は藩医たちと薬草採取を行い、藩の期待に応えたが、1799年4月突如その任を解かれ、過去2年の報酬である金5百疋と盛岡藩を通っての帰国費用である5両が与えられた。しかし、真澄はその後2年間弘前藩領にいて、薬草収集の際やその後地元住民から見聞きした事柄をまとめた『岩木山物語』『善知鳥物語』『浪岡物語』を著した。村人に必要以上に接近し、見たことを丹念に記録したことによって、真澄は盛岡藩の間者ではないかと疑われた。少数の知人は弁護したが、結局身柄追放は動かず、真澄は1801年に3冊の本や弘前藩にいた時期の差し障りのある部分を没収され、弘前藩を追放されることになる。現在、没収されたこの部分の日記や記述した3冊の本は発見されていない。その後、1810年までは久保田藩（秋田藩）の北部や南部藩の鹿角地方を漫遊している。
菅江真澄は三河を出奔して1783年5月から1784年6月まで信濃国本洗馬村に逗留。その後、越後国を経て同年9月には出羽国庄内に至る。1785年さらに北上し、蝦夷地を目指したが天明の飢饉のため断念し奥州平泉をめざし南下した。平泉周辺にしばらく滞在した後、1788年再度蝦夷地への渡航を決意し北上した。念願の蝦夷地では、松前藩の庇護のもと各地を数年間漫遊し、数多くの記録を残した。1792年に蝦夷地を出て南部藩田名部に迎えられ、ここで数年を過ごす。1795年南部藩を去り、津軽藩に入る。
河角廣(1951)は規模MK = 7.0 を与え、マグニチュードは M = 8.4に換算されている。また、M 8.0-8.5、あるいはM 8.3などと推定されているが、断片的な記録しか有しない歴史地震であるため数値の精度は高くない。畿内、琵琶湖、および揖斐川付近（木曽川河口付近）の強震動および津や駿河の甚大な津波被害から震源域は熊野灘沖および遠州灘沖（C, D領域）を含むことは確実とされ、さらに駿河湾（E領域）まで及んでいた可能性もあると推定される。2年後に発生した康和地震を永長東海地震と対をなす南海道沖の地震と考えるには、日付の誤記、また阿波の『太龍寺縁起』が康和地震に触れていないなどいくつかの疑問点が残り、また震源時間の長い多重地震を思わす長時間の地震動から永長地震が南海道沖の地震を含んだ宝永型であった可能性を検討する必要もあるとされる。浜名湖沿岸で津浪の痕跡が発見され、この時期に東海・南海地震が発生したことが示された。887年の仁和地震から209年の間隔が開いているが、この間にもう1回の南海トラフ沿いの地震の存在が示唆され、1994年の奈良県香芝町の箸尾遺跡の発掘調査により、10世紀後半から11世紀初頭の間に生成したと推定される液状化現象による砂脈が発見された。しかし、この地震痕跡は西日本の内陸地殻内地震の可能性も排除できず、この箸尾遺跡の地震痕のみを以て南海トラフ巨大地震と断定することはできないとされる。