キョンフォンの生母が亡くなったあと、アジャゲは後妻としてナムォン夫人を迎えた。ナムォン夫人はキョンフォンを嫌い、この状況に耐えられなかったキョンフォンは故郷を飛び出し、新羅で軍人の道を歩んだ。アジャゲはキョンフォンに自分の後を継いで尚州にいてほしかったのだが、キョンフォンはこれを断って西南海へ向かった。親子の確執が、キョンフォンにとって足枷となってしまい、勢力の拡大に支障をきたすことになった。
初期段階では織田軍の勇戦が目立つ戦いであった。しかし、まだ研究段階ではあるが、朝倉義景が近江六角氏からの養子であったとする説があり（朝倉義景の項を参照）、そのために朝倉家内部が必ずしも一枚岩ではなかった結果、もたらされた戦果である可能性も否定できない。また信長が無事逃げ延びたのは池田勝正の統率力と明智光秀や木下秀吉らの命がけの戦いのおかげであったが、朝倉本隊・朝倉義景軍の追撃が鈍かったことも大きな要因になったと言われている。これに対し、朝倉軍の追撃はごく一般的な速さであったが、それ以上に信長軍の撤退が迅速であったために充分な追撃が行えなかったとの説や、織田軍の統率が取れていてつけいる隙がなかったという説、上記のような朝倉家内部の問題があったとする説などある。また金ヶ崎の戦いの本質は、将軍足利義昭が企画したもので、朝倉氏が拉致軟禁していた武田元明の救出が目的であったとの説もある。
信長は近江豪族の朽木元綱の協力もあり、越前敦賀から朽木を越えて（朽木越え）、京へ逃げ延びた。京への到着は4月30日（6月3日）。信長の供はわずか十人程度であったという（『継芥記』）。池田勝正が指揮を執る織田本隊も撤退に成功し、京へとたどり着いた。信長は論功行賞で秀吉の貢献を称えて黄金数十枚を与えた（他の武将の恩賞については伝わっていない）。なお、朽木元綱は当初信長を殺すつもりでいたが、松永久秀が元綱を必死の決意で説得して翻意させたため京に帰還できたとされる（『朝倉記』）。またこの朽木越えの際、信長軍の殿（しんがり）を務めた秀吉は、3000人の盗賊団に襲われかけたという。この盗賊の頭領を猿飛仁助といい、説得で秀吉配下に入り、天下取りに功労したという（『清正実記』）。信長京到着の翌5月1日、信長は改修中の御所を視察するなど窮地を脱してきた素振りも見せず平然と振舞って見せ、5月9日、岐阜へと戻り軍勢を立て直し長政討伐の準備にとりかかった。
織田信長が越前（福井県）の朝倉義景を攻撃したところ、同盟関係にあった妹婿の小谷城（琵琶湖東岸）の浅井家の裏切りにあい、挟撃の危機に瀕した。そのため木下藤吉郎（豊臣秀吉）と、信長の同盟軍の徳川家康が後衛となって、信長本隊が信長勢力地まで帰還するのを援護したのがこの戦いである。敦賀口における金ヶ崎城（敦賀市）攻略自体はすでに成功していたが、浅井家離反の情報を受けて、おおよそこの地で信長軍の撤退が始まり、木下藤吉郎の殿軍は最初にこの地を拠点にして撤退戦を行った。
中世、この島は「大崎荘」という荘園であった。記録によると、建長5年（1253年）近衛家領に大崎荘の名が出てくる。時代が下ると、康正元年（1455年）で大崎両荘（東・西荘）、文明12年（1480年）でこれに加え大崎中庄の名が記録に残る。年貢は、瀬戸内海の他の島々と同様に「塩」であった。畿内に向け塩が運ばれたことにより交易網ができていき、その海路を水先人として取り締まる海賊衆が生まれるのである。この島にも海賊衆がおり、最終的には「大崎衆」と呼ばれた集合体となった。文禄4年（1595年）小早川古文書には大崎衆として、沖浦葛城主・土倉源右衛門、大崎東庄代官・有田善右衛門、大崎中庄代官・金山清兵衛、大崎西庄代官・田坂庄兵衛、の名が書かれている。島全体に中世の城址が12ヶ所存在するが、これらは大崎衆のもの、あるいは安芸小早川氏と村上水軍などの伊予河野氏系海賊衆との縄張り争いの中で造られたものと推定されている。大崎衆は戦国時代になると忠海を拠点とした小早川庶家の浦宗勝の傘下に入ることとなり、小早川水軍そして毛利水軍に組み込まれることになる。記録によると、厳島の戦いの前には毛利方に組み込まれており、第一次木津川口の戦いなどに従軍している。天正16年（1588年）海賊停止令により海賊勢力は解体されることになる。木江は文禄・慶長の役において造船港となった。中世から江戸時代初期まで大崎上島は「大崎島」の名で通っていた。例えば元和5年（1600年）の知行帳や、江戸時代初期の地誌である『藝備國郡志』にその名で記載されている。一方で現在の大崎下島は、中世までは「下島（あるいは御手洗島）」とよばれ伊予国三島領（大山祇神社領）であった。江戸時代に大崎上島・下島ともに広島藩蔵入地となった。大崎上島・下島の名が出てくる時期は不明だが少なくとも江戸時代のことで、例えば伊能忠敬『日本實測録』には「大崎上島、周廻一十二里一十一町七間」「大崎下島、周廻五里二十七町四十九間」で記載されている。