外来語、特に英語の語末が‐er,‐or,‐arなどに当たるものについて、長音符を付ける流儀と付けない流儀がある。工学分野では、外来語の最後の長音符を記載しない慣習もあり、分野・時期・企業などにより対応が分かれており、表記ゆれがある（例：カテゴリとカテゴリー、ユーザとユーザー、プリンタとプリンター、コンピュータとコンピューター、サーバとサーバー、など）。JISの従来の表記規格では、後述のように一定の基準で長音符を省略していた。省略した理由は、当時の活字などの印刷コスト、紙面や画面上の表示スペース、記憶装置などの節約と言われている。1991年の内閣告示「外来語の表記」（文化庁所管）では、原則として長音符を用いて書き表すが、慣用に応じて長音符を省くことができるとしている。またJISにおいても2005年のZ8301以降では、長音符は省略しても記載しても誤りではないとした。現状では、政府、官庁、関連企業、マスコミ、教科用図書（教科書など）などの対応は分かれている。法令、官公庁の公文書、国会の議事録などでは長音符を省略する場合が多く、一般向けのマスコミや教科書などでは長音符を記載する場合が多いが、それぞれ反対の場合も混在の場合もある。例として、航空自衛隊が「ヘリコプター」と表記した同一機種を、メーカーの三菱重工が「ヘリコプタ」と表記している。またコンピュータ業界では対応がほぼ二分されており、伝統的な国産メーカーは長音符の省略が多いが、IBMやインテルなどは従来より長音符を表記しており、HPやマイクロソフトは2008年7月25日に、「長音符を省略する記法」から「長音符を表記する記法」に変更した（サーバ#表記も参照）。ただし、「アクセサリ」「カテゴリ」のように「イ」列で終わる語には長音符は付けないこととしている。（財）テクニカルコミュニケーター協会のガイドラインでは、長音符を付けることとしている。
長音符は外国語を表すのに使われたのが始まりといわれ、江戸の儒学者なども使っていたが、明治時代に一般的となった。引く音の「引」の右側の旁（つくり）から取られたという説がある。1900年（明治33年）、小学校令施行規則によって小学校の教科書に棒引き仮名遣いを使うことが定められた。これは漢字音や感動詞の長音を「ー」を使って表すというもので、「校長」を「こーちょー」、「ああ」を「あー」、「いいえ」を「いーえ」とするような仮名遣いであった。しかし、1908年（明治41年）に文部省令で廃止された。
漢字音を示すふりがなの場合、現代的な中国語などの発音にはカタカナ表記で長音符を使うが、それとは別の日本漢字音にはカタカナ表記、ひらがな表記のいずれの場合も原則として長音符は使わず、上記の現代かな遣いにもとづいた方法で長音を表す。
ひらがなでは通常、長音符は使われず、現代仮名遣いに基づいた別の方法で長音を表す（例：かあさん、にいさん、すうじ、ねえさん、けいさん、とうさん、そのとおり）。ただし俗な用法として感動詞（例：「ああ」の代わりに「あー」、ありゃー）、擬音・擬態語（例：どすーん、そーっ、あーん）や方言・俗語（例：てめー、あぶねーっ!、あちー）、語調の強調による長呼（例：ながーい、よーく、たかーい）の表記などにひらがなでも長音符が使われることがあり、特に漫画の書き文字に多用される。
12月11日、天狗党一行は越前国新保宿（福井県敦賀市）に至る。天狗党は慶喜が自分たちの声を聞き届けてくれるものと期待していたが、その慶喜が京都から来た幕府軍を率いていることを知り、また他の追討軍も徐々に包囲網を狭めつつある状況下でこれ以上の進軍は無理と判断した。前方を封鎖していた加賀藩の監軍・永原甚七郎に嘆願書・始末書を提出して慶喜への取次ぎを乞うたものの、幕府軍はこれを斥け、17日までに降伏しなければ総攻撃を開始すると通告した。山国兵部らは「降伏」では体面を損なうとして反対したが、総攻撃当日の12月17日（1865年1月14日）、払暁とともに動き出した鯖江・府中の兵が後方から殺到すると、ついに加賀藩に投降して武装解除し、一連の争乱は鎮圧された。永原は投降した天狗党員を諸寺院に収容し、かなりの厚遇をもって処した。しかし、田沼意尊率いる幕府軍が敦賀に到着すると状況は一変する。関東において天狗党がもたらした惨禍を目の当たりにしていた意尊らはこの光景に激怒し、加賀藩から引渡しを受けるとただちに天狗党員を鰊倉（鰊粕の貯蔵施設）の中に放り込んで厳重に監禁し、小四郎ら一部の幹部達を除く者共には手枷足枷をはめ、衣服は下帯一本に限り、一日あたり握飯一つと湯水一杯のみを与えることとした。腐敗した魚と用便用の桶が発する異臭が籠る狭い鰊倉の中に大人数が押し込められたために衛生状態は最悪であり、また折からの厳寒も相まって病に倒れる者が続出し20名以上が死亡した。この時捕らえられた天狗党員828名のうち、352名が処刑された。1865年3月1日（元治2年2月4日）、武田耕雲斎ら幹部24名が来迎寺境内において斬首されたのを最初に、12日に135名、13日に102名、16日に75名、20日に16名と、3月20日（旧暦2月23日）までに斬首を終え、他は遠島・追放などの処分を科された。