車両航送する船やハシケが車両を積卸しするときは、陸上の軌道と船内軌道が接続している必要がある。しかし船やハシケは潮の干満、風波、船の喫水の変化等で常に動いており、両者の軌道接続部は、この動きに追従できなければ車両の積卸しはできない。このため、青森と函館には、陸上軌道からつながる軌道を敷設した長さ13.5mの鋼製桁の一端を陸上に固定し、他端を海中に建てた頑丈な木製の門構えから吊し、カウンターウェイト付き手動ウインチでこの鋼製桁の他端（海側端）を上下に動かせる構造の可動橋を設置し、これを車運丸船尾受台に載せ、連結ピンで固定して車両積卸しを行った。青森では、駅西側の貨物ハシケ用の第1船入澗奥に可動橋を設置し、車運丸を左舷係留して車両積卸しを行った。函館では木造桟橋の北方で、当時は直線の海岸であったが、太い丸太をまとめて杭打ちした木造ドルフィンを車運丸が海岸と直角に係留されるように立て、海岸から直角に伸びる可動橋を設置して、その先端を船尾に載せ、車両積卸しを行った。函館の可動橋付近は1921年（大正10年）、周囲が埋め立てられ、第3船入澗となり、1927年（昭和2年）の車運丸終航後は、後述の函館港内貨車ハシケ「カーフロート」用可動橋として使用され、門構えも鉄骨トラスに更新されていた。車両の積卸しは人力で行われ、ハシケが低くなって可動橋がハシケに向って下り勾配になる干潮時に積み込みを行い、逆に満潮時に陸揚げを行ったが、機関車は重いためレール上に古いロープを蛇行させて載せ、速度を抑制した。なお、車運丸の手本となった関森航路の貨車ハシケでは、陸上軌道と船内軌道接続には、満潮、中間、干潮用の高さの違う3本の航送線を設置したうえ、それぞれの先端を枕木ごと持ち上げ可能な「可動レール」とし、これをジャッキで持ち上げ、船内軌道とは継目板とボルトでその都度締結していたため、可動橋はなく、この車運丸用可動橋は車両航送用としては日本初の可動橋であった。
端島に残る集合住宅の中には、保存運動で話題になった同潤会アパートより古いものがいくつか含まれている。7階建の30号棟は1916年（大正5年）の建設で、日本初の鉄筋コンクリート造の高層アパートである（ただし1916年の竣工時は4階建て）。30号棟を皮切りに、長屋を高層化したような日給社宅（16号棟から20号棟、1918年）など、次々に高層アパートが建設された。第二次世界大戦前頃、国内では物資が不足し統制が行われ、鉄筋コンクリート造の建物は建設されなくなったが、この島では例外的に建設が続けられ、1945年竣工の65号棟は端島で最大の集合住宅である。なお、端島で鉄筋コンクリート造の住宅が建設されたのは、狭い島内に多くの住人を住まわせるため建物を高層化する必要に迫られていたためであり、鉱長や幹部職員などのための高級住宅は木造であった。高層アパートの中には売店や保育園、警察派出所、郵便局、パチンコ屋などが地下や屋上に設けられたものがいくつかあった。また、各棟をつなぐ複雑な廊下は通路としても使われ「雨でも傘を差さずに島内を歩ける」と言われたという。どの建物にも人員用エレベーターは設置されておらず（1945年建設の65号棟に計画されたが、資金不足で結局設置されなかった。なお小中学校には、閉山までのごく短い期間、給食用エレベーターが設置された）、また個別の浴室設備（内風呂）を備えるのは鉱長社宅の5号棟（1950年）および幹部職員用アパートの3号棟（1959年）、職員用集会宿泊施設の7号棟（1953年）、そして島内唯一の旅館「清風荘」だけであった。トイレも多くが落下式であったが、閉山時には半数ほどの住宅で水洗式が導入されていた。炊事場は閉山まで共同のところが多かった。岩山の南端、貯水槽の隣に灯台があるが、これは閉山によって夜間の島の明かりが無くなったため、その翌年（1975年）建てられ、同年12月29日に初点灯したもので、正式名称は『肥前端島灯台』。灯台は、1998年12月17日に強化プラスチック製の「2代目」に建て替えられた。木造や鉄骨造で建設された建物は、元から荒波に晒され続けた（酷い時には島全体を波が覆う事すらあった）上に、風雨のほか、防水技術の問題や無人化によって維持管理がなされなくなったことから急速に劣化しており、1号棟（端島神社）の拝殿をはじめ完全に崩壊したものが多い。なお、潮害対策として、建物外部に鉄製の部品が用いられることはほとんどなかった。鉄筋コンクリート造の場合も、その技術が未熟な時期のものも多く、配筋計画の問題のほか、建材の入手難から海砂を混ぜていたこともあり劣化が進んでいる。56・57号棟に設けられたキャンチレバー（張り出しベランダ）は、その設計に不備があったため亀裂が入り、鉄パイプの支柱で補強されていたが、閉山後その支柱も消失し、キャンチレバーが崩落するのは『時間の問題』とみられる。70号棟（小中学校校舎）は波で土台の土が浚われ基礎杭が剥き出しになっている。30号棟を筆頭に古い鉄筋コンクリート建造物が取り壊される事無く手付かずのまま放棄されているため、建築工学の観点からも経年劣化などの貴重な資料として注目されている。