1866年のサロンでは、絵画・素描部門の審査委員は24人となり、選挙による委員が18人、美術行政による任命委員が6人であった。選挙による委員の上位3人はジェローム、カバネル、ピルスであったが、コローとドービニーも選挙で選ばれた。コローとドービニーが入ったこともあり、前衛的な画家に寛容な審査となった。ギュスターヴ・モローは『オルフェウスの首を運ぶトラキアの娘』が好評を博して国家買い上げとなったのに対し『自らの馬に食い殺されるディオメデス』は厳しく批判された。クロード・モネ、ピエール＝オーギュスト・ルノワール、フレデリック・バジールといったバティニョール派の画家たちは入選した。他方、マネ、ポール・セザンヌは落選した。セザンヌは、この年、美術総監ニューウェルケルクに対し、落選展の開催を求める手紙を送っている。モネは、マネの作品に着想を得た『草上の昼食』を出品しようとしたが、断念し、その代わりに『緑衣の女』ほか1点を出品して入選した。スペイン趣味が強かった当時の審査委員や批評家からは好評を得た。
1865年のサロンでは、絵画・素描部門の審査委員12人のうち、選挙による委員が9人、美術行政による任命委員が3人であった。カバネルがナポレオン3世の肖像画で大賞を受賞した1865年はマネが『オランピア』を出品し、1863年の『草上の昼食』を上回るスキャンダルを起こした。娼婦に顧客から花束が贈られている場面をあからさまに描き出したことが不道徳と非難された上、平面性の強い造形手法も批判された。クロード・モネは『オンフルールのセーヌ河口』ほか1点の海景画で、またエドガー・ドガも『中世の戦争の場面』でそれぞれ初入選を果たした。ギュスターヴ・モローは前年に続いて『イアソン』を出品してメダルを獲得した。またジェームズ・マクニール・ホイッスラーはジャポニズムの影響の強い『バラと銀：陶磁の国の姫君』を出品した。
サロンは、1864年から、再び毎年の開催となった。この年のサロンは、それ以前のサロン受賞者とレジオンドヌール勲章受章者が審査委員の4分の3を選挙し、美術行政が残りの4分の1を任命する方式に改められ、アカデミーの権限は後退を強いられた。それでも、審査委員の選出にアカデミー会員の影響が大きかったため、審査はそれほど緩和されず、再度の落選展の開催を求める声も上がった。また、この年のサロンから、審査部門が、絵画・素描、彫刻、建築、版画の4部門に分けられた。ミレーの『羊飼いの少女』が1等賞をとり、政府買上げの申出がされるなど、ミレーに対する評価が高まった。コローは晩期の代表作『モルトフォンテーヌの思い出』を出品し、政府買上げとなった。この年、ギュスターヴ・モローは『オイディプスとスフィンクス』で画壇復帰を果たした。作品は高い評価を受けナポレオン・ジョゼフ・シャルル・ポール・ボナパルトによって購入された。一方、ピエール＝オーギュスト・ルノワールが『踊るエスメラルダ』で入選を果たしている。ベルト・モリゾも、コローの影響を受けた『オーヴェルの古い道』で初入選した。
1863年のサロンの審査が余りに厳しかったことから、審査委員会に対して芸術家たちの非難の声が高まった。これを受けて、ナポレオン3世は、サロンとは別に、落選作のみを展示する落選展の開催を決定した。この年の落選展には、少なくとも687点が展示されたが、中でもエドゥアール・マネの『草上の昼食』が大スキャンダルを巻き起こした。ホイッスラーの『白のシンフォニー』も激しい批判を浴びた。
アメリカが第二次世界大戦へ参戦するとルメイは南大西洋からアフリカ、北大西洋からイギリスへの空路を開いた。1942年に第305爆撃隊を組織、訓練し、ヨーロッパで戦闘する部隊を指導した。ヨーロッパの作戦でB-17の爆撃隊によるフォーメーションや爆撃技術を改良する。これらの基本的な手順や技術は後に太平洋で活躍するB-29にも適用された。1942年9月から1943年5月までイギリスにおいて第8爆撃軍団傘下で航空軍大佐として同隊の指揮を執り、のちに第4爆撃航空団を率い、1943年9月に同航空団が第3航空師団に再編成されたときにはドイツのレーゲンスブルク爆撃の功績により准将に昇進、その最初の司令となり、1944年3月には少将に昇進した。ドイツ本土への爆撃に赴く搭乗員に対し「君が爆弾を投下し、そのことで何かの思いに責め苛まれたとしよう。そんなときはきっと、何トンもの瓦礫がベッドに眠る子供の上に崩れてきたとか、身体中を炎に包まれ『ママ、ママ』と泣き叫ぶ三歳の少女の悲しい視線を、一瞬思い浮かべてしまっているに違いない。正気を保ち、国家が君に希望する任務を全うしたいのなら、そんなものは忘れることだ」と言い聞かせたこともある。“鉄のロバ”（頑固者）と呼ばれ、訓練が実戦で生死を分けると信じており、作戦と作戦の間に部下を徹底的にしごき寡黙で鬼のように厳しかったが、部下からは絶大な信頼を寄せられていた。統計学などを駆使して効率的な爆撃作戦の研究をしたロバート・マクナマラ・ハーバード大学助教授は、第二次世界大戦時の爆撃任務における高い任務中止率に関する報告書に「指揮官の一人にカーティス・ルメイというB-24部隊を指揮する大佐がいた。彼は私が戦中に出会った者の中で最も優れた戦闘指揮官だった。 しかし彼は、異常に好戦的で、多くの人が残忍だとさえ思った。 ルメイは（爆撃機の空爆任務の中断率に関する調査で、高い中止率の原因は隊員が撃墜を恐れてこじつけの理由で任務放棄しているに過ぎないと結論づけたマクナマラの）報告書を受けた後、命令をだした。『これから全ての任務において自分が先陣の爆撃機に搭乗する。今後は出撃した全ての爆撃機が攻撃目標まで到達する。これを成し遂げないものは全員軍法会議にかけ処分する』。任務中止率は瞬く間に低下した。彼はそういう類の指揮官だった。」と記している。