しかし窒素固定法の実験で体調を崩したため官を辞し、1923年8月31日（関東大震災の前日）、夜汽車に乗って東京を離れる。そして臼杵へ帰省する途次、兵庫県立姫路高等女学校に転勤していた音と再会。1925年に信夫が婿養子になる形で結婚。信夫の静養を兼ねて明石市に住むこととなる。この明石滞在中の1931年4月18日、西八木海岸で旧石器時代のものと思われる化石人骨を発見した（後に長谷部言人が調査の結果原人と判断し明石原人と名付けた。なお化石現物は東京大空襲により消失）。同年『人類学雑誌』に「播磨国西八木海岸洪積層中発見の人類遺品（一）・（二）」と題する論文とともに旧石器と旧象の写真、石器の出土した地点の層序ともに、伴出した植物化石についても報告している。これに対して正面から否定し、石器は洪積世以前の自然石であると反論したのは鳥居龍蔵である。しかし鳥居は石器の実物を見たわけではなく、学生だった樋口清之から聞いた印象のみで反論しており、後に芹沢長介が石器であると指摘している。この鳥居の否定により直良は世間から嘲笑され、旧石器の研究から遠のいていったとされるが、実際にはその後1950年にも直良は栃木県安蘇郡葛生町にて発見した一群の化石骨を葛生原人として報告している。なお、この報告については後の調査によりクマ、トラ、サルの骨の誤認があった事、人骨と判定されたものも15世紀頃の骨であった事が判明しており、事実上完全な誤りであった事が明らかとなっている。
1902年1月10日、大分県北海部郡臼杵町（現・臼杵市）に、8人姉弟の次男として生まれる。村本家は祖父の代まで臼杵藩の武士であったが、明治以降は没落し、父が沖仲仕をしながら母や姉弟が農作業で収入を助ける貧しい家であった。そんな中、信夫は野外にいることが多かったこともあり、生物に興味を持つ一方、祖父から源平合戦などの武者話を聞き続けることで、歴史にも興味を持ったという。臼杵男子尋常高等小学校高等科中退後、様々な仕事をしながら早稲田中学（現・早稲田高等学校）講義録（通信講座）の購読などを通じ独学を続ける。この時期に、臼杵町立実科高等女学校（現・大分県立臼杵高等学校）に勤務していた直良音（なおら おと）と出会うことになる。1917年、恩師を頼って上京し、鉄道院上野保線事務所の職員食堂で働きながら岩倉鉄道学校（現・岩倉高等学校）工業化学科夜間部に通学。1920年に卒業し、農商務省臨時窒素研究所に勤務。黒田修三の元でブッチャー氏式窒素固定法の研究に関わる。在勤中、喜田貞吉の影響で考古学に興味を持つようになり、いくつかの発掘調査に参加している。
入学後、全員が相談室ガイダンスで実際にカウンセラーやドクターと顔を会わせ相談室の利用方法などを学ぶ。4人のカウンセラーを生徒の様子や課題に合わせて割り振り担当制で実施。不登校対応、親子関係、子どもの進学について、保護者も多く利用している。
現在の横浜線を建設した私鉄であった横浜鉄道は、1908年（明治41年）9月23日に東神奈川 - 八王子間を開通させた。横浜鉄道の創業者らは、これと並行して横浜倉庫を通じて東神奈川沖の埋立免許を取得し、ここに岸壁と倉庫を造る計画を進めていた。これに合わせて東神奈川駅から貨物線を延長して海陸連絡を図る計画を持ち、この路線の免許を取得した。この当時すでに東神奈川駅のすぐ海側には京浜電気鉄道（後の京急本線）の線路があったために、京浜電気鉄道の線路を高架化することになり、その仲木戸駅の下をくぐって1910年（明治43年）10月に線路が延長された。実キロは63チェーン（約1.3 km）であったとされる。海神奈川駅の正式な開業は1911年（明治44年）12月10日となっている。この際に設定された距離程は1.2マイル（約1.92 km）であった。この際の駅の位置は現在の千若町二丁目であった。ただし、1910年（明治43年）4月1日より横浜鉄道の全線を鉄道院（国有鉄道）が借り受けて営業しており、実際には海神奈川駅とそこへ至る支線は当初から国鉄による営業であった。1917年（大正6年）10月1日付で正式に国有化され、国鉄横浜線の駅となった。しかし、横浜倉庫はより沖合の埋立免許を取得することができず、岸壁の築造を行うことができなかったため倉庫を建設するにとどまり、この貨物線も倉庫との連絡を果たすにとどまった。正式な国有化よりも前の1917年6月17日、東海道本線貨物支線の鶴見 - 高島間通称高島線が開通し、この線路が海神奈川に至る貨物支線と平面交差することになった。この平面交差の地点には海神奈川信号扱所が開設されたが、正式には海神奈川駅の構内扱いとされた。この信号扱所は1924年（大正13年）10月1日に千若信号場として独立した信号場となった。1930年（昭和5年）4月1日に距離にメートル法を採用し、東神奈川 - 海神奈川のキロ程は2.0 kmとされた。この際にこの貨物支線はそれまで横浜線所属であったのが東海道本線所属に変更されている。1934年（昭和9年）頃、海神奈川駅が高島線よりも北側の千若町一丁目付近に移転し、高島線との平面交差が解消された。ただし平面交差の線路自体はずっと後まで残されていたという証言がある。東神奈川から南下してきた貨物線は、そのまま運河に突き当たるまで南下して止まる線と、東へ曲がる線に分岐する構造になっていた。後にこの付近は横浜市環境創造局神奈川水再生センター（下水処理場）となっている。1959年（昭和34年）4月1日に、東神奈川 - 海神奈川間の貨物支線とともに廃止となった。