引き続き中口雅史が監督を務めた。前年のメンバーからMF岡村の引退に加え、MF高橋はじめ3名が海外クラブへ移籍した。新人3人に加えて、FC岐阜からMF嶋田正吾が5年ぶりにチームに再加入し、三たび連覇を狙うシーズンとなった。開幕2戦は昇格チームに対してともに先行を許しながらも逆転で連勝したが、3月24日の第3節YSCC戦で1-4と大差で敗れると、以降6試合勝利から遠ざかった。5月6日には当時首位のカマタマーレ讃岐に勝利するが、その後も連敗するなど調子が安定せず、長崎、長野パルセイロなどの上位陣にも白星をあげられずに11位でシーズン前半を折り返した。しかし7月に入ると、好調の清原を中心に攻撃陣が調子を取り戻して5連勝とし、順位を3位に上げた。8月に入るとドローで連勝が途切れるが、天皇杯滋賀県予選では前年に続いて決勝でMIOびわこ滋賀との対戦を制し、6年連続の天皇杯出場を決めた。天皇杯本大会では1回戦で関西学院大学に6-0と勝利 すると、9月8日に姫路市立陸上競技場で行われたJ1のヴィッセル神戸との2回戦では、前半の嶋田、後半の清原のゴールとGK森田の好セーブなどでと2-1と逃げ切り、滋賀県勢として初、チームとしては前身の一つである佐川東京以来7年ぶりのJリーグクラブに対する勝利をあげた。その後のリーグ戦でも好調を維持して、10月10日にホームズスタジアム神戸で行われたJ2のジェフユナイテッド千葉・市原との天皇杯3回戦では、後半開始早々に先制されるも御給のゴールで追いつき、同点での延長戦、さらにはPK戦に持ち込んだ。PK戦も当初リードを許すものの後に追いつく粘りを見せたが、最終的にはここで敗退となった。その後、中3日で行われた長野とのリーグ戦を引き分けた後、10月20日にはすでにチームの活動停止（次項参照）の報道が流れていたなか、首位に立つ長崎を2-0と下した。さらに活動停止が正式発表された後の秋田との対戦も制し、7月以降のリーグ戦を13戦無敗として優勝への望みを残したが、11月3日の横河武蔵野FC戦に逆転で敗れて優勝の可能性が消えた。そして、チーム最終戦となった11月18日の藤枝MYFC戦を1-1の引き分けとし、最後のシーズンを3位で終えた。リーグトップの得点数を挙げ、この年Jリーグ参入を争った長崎に1勝1分、讃岐には2勝と互角以上の戦いをみせたが、前年に1つのみだった引き分けが9つに増え、下位チームに対する取りこぼしもあるなど、やや安定感に欠けたシーズンとなった。DF旗手、奈良輪、MF清原がベストイレブンに選ばれるとともに、前年に続きフェアプレー賞を受賞して、チームの歴史に幕を下ろした。
パーカーは、おそらくはウィルトシャー州スタントン・セント・バーナード (Stanton St Bernard) に、父ロバート・パーカー牧師 (the Reverend Robert Parker, M.A.)と母ドロシー・スティーヴンス (Dorothy Stephens) の間のただひとりの子どもとして生まれた。パーカーは、オックスフォード大学のモードリン・カレッジに入学したが、父がその信仰上の信条からダブリンへの移住を余儀なくされた際に、大学を離れ父とともにダブリンへ移った。ダブリンでは、大司教ジェームズ・アッシャー (James Ussher) の下で学んだ。その後、オランダのライデンで亡命生活を送っていた父の許へ赴き、当地でウィリアム・エイムス (William Ames) と知り合い、1617年にはライデン大学から修士 (M.A.) を取得した。その後、イングランドに戻ったパーカーは、バークシャー州ニューベリー (Newbury) に居を構えて、セント・バーソロミューズ・スクール (St. Bartholomew's School) で教鞭を執り、ウィリアム・トゥイス (William Twisse) の説教助手を務めた。パーカーはそのピューリタン的主張が原因となって、他の数多くのウィルトシャーの人々とともに、1634年3月26日に Mary and John of London 号に乗船してニューイングランドへ向かうことになり、5月にアメリカに上陸した。当時アガワム (Agawam) と呼ばれていた、後のイプスウィッチ (Ipswich) に定着した百人ほどとともに、パーカーは1年間とどまって、ナサニエル・ウォード (Nathaniel Ward) の助手を務めた。パーカーは、従兄弟であるジェイムズ・ノイズ (James Noyes) や甥のジョン・ウッドブリッジ (John Woodbridge) ほか数人とともに、メリマック川 (Merrimack River) 河口部のカスカクンケン (Quascacunquen) と呼ばれていた場所へ移る許可をマサチューセッツ地方集会 (Massachusetts General Court) から得、この入植地はニューベリー（綴り字は Newbury とも Newberry とも記した）という名で、1635年に郡区/タウンシップとして法人化された。ノイズは教師に選ばれ、パーカーは植民地で10番目に建てられた教会の最初の牧師となった。パーカーは、その後、終生ニューベリーにとどまり、 コットン・マザー (Cotton Mather) によれば「彼の生涯を通しての美しく、神聖で、慈愛に満ち、謙虚な姿は」「まわりの人々にとって、彼が説く教理についての常に最も生き生きとしたお手本であり続けた」という。この頃、パーカーは、母親が出産直後に死去し、父親であったリチャード・ダマー (Richard Dummer) がイングランドへ戻ってしまい、置き去りにされたシュベル・ダマー (Shubael Dummer) の保護者、教師となった。ノイズとともに、パーカーはハーバード大学を目指す者の入学準備も手助けしたが、報酬は一切受け取らなかった。1643年以来、視力の衰えを訴えていたパーカーは、1663年にジョン・ウッドブリッジがイングランドから戻るとこれを自らの助手にしたが、視力の衰えは続き、晩年にはまったく視力を失っていた。しかし、視力を失いつつある中でもパーカーは、ノイズと同居していたジェイムズ・ノイズ・ハウス (James Noyes House) に12人から14人ほどの生徒たちを集め、教えることを続けていた。パーカーは様々な言語を、記憶だけによって教授することが容易にできた。シュベル・ダマーの従兄弟のひとり、サミュエル・シーウォール (Samuel Sewall) は、その生徒のひとりで、日記にパーカーのことを書き残した。パーカーが牧師を務めていた時期には、教会の運営形態をめぐって、教会区（パリッシュ）内を二分する、深刻な論争が行なわれた。パーカーは、1677年4月24日に、独身のまま82歳で死去した。カスカクンケン川は、1697年に、パーカー川 (the Parker River) と改名された。