2008年（平成20年）、BNPパリバ銀行と行った豪ドルの通貨スワップ取引で140億円の評価損を抱えた。11月21日にこの事実を発表、この取引がオーストラリア産食材の輸入に関する為替リスクを回避する目的だったものと釈明した。2009年（平成21年）2月10日にはこれを理由として創業者の正垣泰彦が社長退任を発表した。結果、2009年（平成21年）8月期の通期連結決算は、売上高が前年同期比4.0％増、営業利益が同22.2％増にも関わらず、経常損益は69億円の赤字、最終損益は48億円の赤字を記録した。
2008年（平成20年）10月19日、サイゼリヤは自主検査により、中国のメーカーに生産委託していた冷凍ピザ生地の一部から微量（一日摂取許容量の60分の1、健康への影響なし）のメラミンを検出したため、厚生労働省に報告したと発表した。同年9月下旬に自主検査を始めたものの、他社でメラミン混入が相次いだこともあり、同年10月3日より使用するピザ生地を切り替え、同月16日に混入が発覚した。同月21日、「対象のピザを食べた可能性のある客すべてに代金を返還する」と発表（返還期限は同月28日まで）したほか、東日本の542店舗でピザの販売を中止した。返還はレシートを持参しない場合も申し出があれば原則として返金に応じるとしたが、最終的な返還総額は予想の8千万円を大きく下回る1千万円程度であった。また、代金返還の過程で一部の客が飲食したことを偽り金を騙し取るという事件も発生した。なお、返還期限を過ぎた後も、レシートを持参した場合は返金に応じるとしている。同年11月5日、中止していたピザの販売を一部店舗で再開したが、生地は国産のものに切り替えている。
2007年（平成19年）3月24日に放送された『惑星ジャパ〜ン!』（日本テレビ）の1コーナーで、「サイゼリヤはどこまで本場イタリアンか?」と題したコーナーが放送された。これは5人のイタリア人が実際に海浜幕張住友ビル店を訪れ、「果たしてどのメニューがもっとも本場の味に近いのか?」を検証したもの。結果、もっとも本場の味に近いとしてイタリア人達が答えたメニューは、1位：プロシュート・2位：リブステーキ・3位：フォッカチオだった。このほか、ミラノ風ドリア・粗挽きグリルソーセージ・モッツァレラトマトも評価が高かった。ちなみに、本場の味にもっとも近くないメニューとされたものは、ハヤシ&ターメリックライスであった。また、2008年（平成20年）7月18日に放送された『ランキンの楽園』（毎日放送）では、ほぼ全メニューを食べてランキングを行っている。これらの放送で採りあげられたランキングは、サイゼリヤ公式サイト内の「サイゼリヤのおいしい使い方」で同社からの御礼コメントとともに紹介されている。2008年9月14日放送の『がっちりマンデー!!』（TBS）には社長が出演した。
「日本を真に豊かな国にするお手伝いをする」を企業理念とし「スパゲッティをラーメンと同じ価格で提供」することを念頭に、ポピュラープライスと呼ばれる価格相応かつ期待外れに終わらない価格帯とメニュー構成で「安くて美味しいもの」を提供することをポリシーとしている。なお、このポリシーは進出した中国でも受け継がれた。進出の際には「中国の人たちにイタリアンを安くておいしく食べてもらいたい」という設立主旨を徹底して訴え、合弁ではなく独立資本（100%出資）として認可された、国外資本では数少ない受け入れ例となっている。ちなみに、スパゲッティが9元（約144円）で提供されている。生産・流通システムの構築を目指し、福島県白河市に100万坪のサイゼリヤ農場を持つ。またカミッサリー（食品加工・流通工場）を福島県・埼玉県・神奈川県（店舗も併設）・兵庫県に持つ。このほか日本国外の拠点として、オーストラリアのメルボルン郊外に40万坪の工場（サイゼリヤ オーストラリア Saizeriya Australia Pty. Ltd.）を設立し、2002年より生産を行っている。
1947年11月19日、時の国王ジョージ6世の長女エリザベス王女と元ギリシア王族のフィリップ・マウントバッテンの婚儀が行われると、同日フィリップには王室の一員として殿下 (HRH, His Royal Highness) の称号が与えられ、翌日「エディンバラ公爵」が授爵された。したがってこの日から1952年2月に女王として即位するまで、エリザベス王女の正式な呼称は「エディンバラ公爵夫人エリザベス王女殿下」 (HRH Princess Elizabeth, The Duchess of Edinburgh)」だった。従属称号としてメリオネス伯爵およびグリニッジ男爵が同時にフィリップに叙爵されている。英国の貴族称号において、これらの従属称号は一般にトップの爵位を継承すべき推定継承者の儀礼称号として使用される。これに従えばフィリップの長男であるチャールズは、本来はイギリス王室から見て女系の傍系王族であり、メリオネス伯爵チャールズとなる予定であった。しかしチャールズの祖父であるジョージ6世にはエリザベス王女ら女子しか子供がおらず、英国の王位継承は弟の男子より兄の女子が優先して王位を継承する「兄弟間のみ男子優先制」を採用していたため、チャールズが将来的に王位を獲得することが確実となっていた。このため、ジョージ6世はチャールズをあらかじめ「王子」とすることを決定した。王子の称号は従属称号を名乗るよりも格が上であるため、チャールズが儀礼称号メリオネス伯爵を名乗ることは一度として無かった。そのままフィリップの妻エリザベスが王位を継承し、チャールズはプリンス・オブ・ウェールズをはじめ王太子が帯びる多くの称号を叙爵し、それが以後のチャールズの称号となった。なおエリザベス女王とエディンバラ公の三男エドワード王子は、1999年の結婚時に王子としては異例の伯爵位（ウェセックス伯）を授けられているが、これはエドワード王子が近い将来エディンバラ公位を授けられることが予定されているためである。すなわち、フィリップの死後エディンバラ公位はその長子であるチャールズ王太子によって継承されるが、チャールズはプリンス・オブ・ウェールズつまりウェールズ公であり、いずれ国王となることからエディンバラ公位は王冠に統合される。そのあかつきに、王弟たるエドワード王子にあらためてエディンバラ公を授けるというもので、これも1999年の結婚時に発表されている。