勝久マイケルHCが退任し、青木勇人ACが新HCに就任。齊藤洋介、久山智志、ナイルズ、ホール、ラーカイ、マーシャルが退団し、エマニュエル・ウィリス、コーリー・ジョンソン、ジョーダン・ヘンリケス・ロバーツ、兵頭健斗、稲垣敦、喜久山貴一が加入した。シーズン開幕後の10月にウィリスの契約を解除して再契約したホールと久山が復帰。前シーズン終了後に選手契約が更新されず練習生となっていた西谷亮一とは2月に再び選手契約を締結した。bjリーグにおける最終シーズンになったが、シーズン前半はプレイオフ圏内を争った。しかし中盤以降は大失速、4連敗、7連敗、8連敗を続けざまに喫して下位に沈んだ。
勝久マイケルHCが続投、堀田剛司が現役を引退。兵頭健斗、オマー・リード、マークィース・グレイ、マーカス・シモンズが退団し、齊藤洋介(前信州、秦野市出身)、ウォーレン・ナイルズ、ジャーフロー・ラーカイが新加入した。シーズン前半はウェイン・マーシャルの故障離脱の影響などもあり、7連敗、12連敗を喫するなどプレイオフ圏外の順位に低迷。シーズン途中にカイル・マーシャル、西谷亮一が加入、兵頭健斗が復帰したが、何れも退団。カイルの退団後にカール・ホール(前信州)が加入した。チーム状態は持ち直したが、最終的にプレイオフ圏内の8位とは1.0ゲーム差のイースタン10位に止まり、プレイオフ進出を逃した。
レジー・ゲーリーHCが退任し、勝久マイケルが新HCに、青木勇人が現役を引退しACに就任。前シーズン在籍していた外国人選手全員と木村実が退団し、代わってマークゥィース・グレイ(前千葉)、ウェイン・マーシャル（前信州）、オマー・リード、堀川竜一（前富山）と契約して開幕を迎えた。外国人が開幕当初は3人しかいなかったため、12月にマーカス・シモンズが復帰した。シーズンは序盤から一進一退が続いた後、シモンズが復帰した2013年末に4連勝を記録して白星を先行させ、波に乗るかとも思われたが、直後の2014年1月の試合で4連敗を喫すると再び白星が先行することはなかった。シーズン後半は新加入の青森ワッツ、仙台89ERSなどとプレイオフ圏内の6位を争ったが、最終的にイースタン7位に止まり、創設3シーズン目で初めてプレイオフ進出を逃した。前シーズン優勝チームがプレイオフを逃したのは9シーズン目で初となる。
日本人全員とドゥレイロン・バーンズ、ファイ・パプ・ムールが残留し、岩手ビッグブルズからトーマス・ケネディ、高松からポール・ビュートラックが加入、昨シーズン練習生であった河野誠司も選手登録された。その後シーズン途中でビュートラックを豊田通商(JBL2)に放出し、岩手のショーン・マロイを補強。11月には横浜DeNAベイスターズの親会社であるディー・エヌ・エーとオフィシャルタイアップパートナー契約を結んだ。レギュラーシーズンは最終節まで新潟アルビレックスBB、富山グラウジーズ、岩手ビッグブルズとイースタンカンファレンス首位争いを演じた末、2位でのプレーオフに進出が決定。プレーオフ・カンファレンスセミファイナルでは3位の富山を破ると、カンファレンスファイナルの新潟戦では第4Q残り5秒52-52の状況からバーンズがブザービーターを決めてファイナルに進出。ファイナルでもライジング福岡を101-90で破り、参入2シーズン目、関東のチーム初のリーグ優勝を達成。MVPはファイナルで35得点をマークした蒲谷正之が受賞。チームが好成績を収める一方で経営状態は思わしくなく、シーズン後半にはおよそ3億円もの未払い金や借入金を抱えていた。報道でもチーム運営は危機的な状況でチームを優勝に導いたゲイリーヘッドコーチとの契約も更新できない状況が報じられた。チーム消滅を回避するため、2012-13シーズン終了後の2013年6月に廣田が保有している株式の全てを一旦YSEに無償譲渡した上で、51％をバディ企画研究所に、残り49％を公募にてそれぞれ売却し、また大手広告通信社に業務委託することを発表。以後のチーム運営は大手広告通信社が担い、YSEはバディ企画研究所と共にバスケットボールスクール運営などに取り組むこととなった。財政危機の詳細は｢廣田和生｣の記事を参照の事。
2011年10月、音楽活動の再開が告知されると、同年11月30日には3年7か月ぶり通算3作目となるオリジナルアルバムの発売が決まり、発売日は自身のデビューと同じ2月1日と発表された。アルバムの本格的な制作は2011年秋に進められ、1か月半に渡って全13曲のレコーディングが行われた。なお、作品に関するインタビューの中で、2年という活動休止期間について、締め切りもなく、いつ届けられるかもわからない「水面下の制作期間」という。そのうえで、「2年間」という時間を凝縮し、「深化」し「進化」した作品に仕上がったとのこと。本作は自身初のセルフ・プロデュースとなったが、本人曰く「初めからそう決まっていたわけではないが、ひとつひとつこだわっているうちに、いつの間にか、そうなっていたという感じ」。アルバムのタイトルは、「始まり」と「原点に戻る」という意味を持たせるうえで、『The beginning』以上にしっくりくる言葉がなかったことから、ここからまた始まるんだという思いで名付けられた。2012年2月1日、自主レーベルのA stAtionから発売。CDのみとDVD付属の通常盤の2種、初回生産限定盤の計3種リリース。ジャケットデザインは、2年間撮り溜めた写真をプリントして細かく切ったものを傘に貼り付けたモザイク・アートとなっており、これは「ジャケットでも2年間を表現できないか」という発想からなる。キャッチフレーズは『“過去”も“今”も“未来”も…。「はじまりのとき」は必ず訪れる。』、『ここから「絢香」の第二章が始まる。』。2012年2月7日、オリコン週間アルバムランキング（2012年2月13日付）で首位となったことが発表された。首位獲得はベストアルバム『ayaka's History 2006-2009』以来2年4か月ぶり2作連続、オリジナルアルバムでは『First Message』以来5年3か月ぶり、アルバムでは自身通算3度目の記録となった。