『魂斗羅』（1987年）の続編。前作では序盤は謎の軍隊との戦いで、終盤にてその正体がエイリアンということが判明したが、本作では序盤からエイリアンが正体を隠さずに登場する。前作はサイドビューの横スクロール、奥方向への疑似3Dステージ、サイドビューの縦スクロールと3種類のステージがあったが、本作ではサイドビューの横スクロールステージ（坂道があり上下にも若干スクロールする）とトップビューの縦スクロールステージの2種類に大別される。トップビューのステージではジャンプや伏せができず、ジャンプボタンでシェルを使用する（使用回数に制限あり）。ステージ中、特定の場所でカプセルが飛来し、これを打ち落とすとパワーアップアイテムが落ちてくる。同じ武器を2度取るとさらにパワーアップするようになったり、ジャンプ中にレバー上下で高さを調節できたりといった変更がなされている。これに伴いラピッドビレッツは廃止された。
舞台やキャラクターを前シリーズから一新し、2009年夏には待ち受け画像やヒロイン紹介などが公式サイトに掲載されたが、その後フルボイスアプリゲーム化の企画も進められ、ユーザーアンケートに基づく各ヒロインを担当する声優を2009年10月に発表、2009年12月24日に本編同様のフルボイスによる関連作品『魔王様は女子高生!?』を無料にて先行配信、2010年3月5日に本編第1作目、同年4月27日に第2作目を配信開始した。
県立伊豆島高校2年C組の女子学生、恋、理奈、千鶴、美唯、小鳩、夕菜、そして担任教師ほのかは、いずれも個性的ながら普通の学校生活を送っているが、実は誰にも言えない秘密を持っている。プレイヤーは男子同級生または校医として彼女らと秘密を共有し信頼を築きながら、短くも忘れられない秋を過ごしていく。
「中村書店」の源流となる「日吉堂」を菅谷與吉が東京府東京市（現在の東京都）に創業したのは、1880年代（明治10年代後半）とされる。国立国会図書館蔵書によれば、1884年（明治17年）3月に発行された『撰名本朝二十四功』、あるいは同年5月の『絵本太閤記』等がもっとも古い「日吉堂」による出版物であり、いずれも菅谷が編集・発行している。菅谷の「日吉堂」から分離、中村惣次郎が「中村日吉堂」を名乗るのは「明治末年」とされるが、国立国会図書館蔵書によれば、1899年（明治32年）6月、揚名舎桃李口演・加藤由太郎速記による、実在するとされる江戸時代の侠客・腕の喜三郎を描いた講談本『侠客腕の喜三郎』等がもっとも古い「中村日吉堂」による出版物である。当時の「中村日吉堂」は東京府東京市浅草区馬道町1-5-14に所在していた。1912年（大正元年）11月3日に発行された三原天風の『探偵奇談 白髪夜叉』の奥付には、発行者に菅谷と中村が連名で、発売元に東京市下谷区和泉橋通り徒町の「日吉堂書店」と、東京市浅草区旅籠町（現在の柳橋）の「中村書店」が連名で記されており、この時期は、すでに「中村書店」の名で共同出版・共同発売を行っていたようである。同年7月に「中村書店」が発行した三原天風の『探偵奇談ジゴマ』は、前年11月に浅草公園六区・金龍館で公開されて一世を風靡した同名の映画のノベライズである。一方、国立国会図書館蔵書によれば、その後関東大震災を経て、1924年（大正13年）2月1日、「トモエ文庫」第1巻として発行した『天下三馬術』が最後の「中村日吉堂」名義の出版物である。当時の「中村日吉堂」は東京府東京市浅草区瓦町24番地に所在していたが、これは戦後の所在地である東京都台東区浅草橋2丁目8番地と同一である。1933年（昭和8年）、大城のぼる、謝花凡太郎、新関青花（新関健之助）、芳賀たかしらを起用し、漫画作品の刊行を始める。大城の『冒険ターちゃん』、謝花の『びっくり突進隊』は同年の発表で、後者は謝花のデビュー作である。これら「ナカムラ・マンガ・ライブラリー」は全70冊、「ナカムラ繪叢書」は全30冊に上るとされる。このころ小熊秀雄が編集顧問として入社、「旭太郎」の筆名で原作物語を書き、これを大城が漫画化したものが「ナカムラ繪叢書」の『火星探検』（1940年）であり、これは当時読者であった手塚治虫らに影響を与え、「SF漫画・科学漫画の先駆」とされる。「ナカムラ繪叢書」にはほかにも、大城の『愉快な鉄工所』（1941年）、筑波三郎の『戦ふ勇太』（1942年）、新関の『空の中隊』（1943年）等があった。同社の漫画本は、書店での販売ではなく、駄菓子屋、夜店、縁日の露店等のルートをもって販売したのが、強みであったとされる。1944年（昭和19年）2月ころまでは、芳賀まさをの『りんごの便り』等の出版を行っている形跡があるが、第二次世界大戦の戦局が深まるにつれて、活動を停止している。戦後、1947年（昭和22年）8月25日に発行された石田英助、ワタナベカゾウ（渡辺加三）、新関青花の『弓の矢太郎』には、「有限会社中村書店」と記されており、これは5年前の『戦ふ勇太』には記されていなかったもので、このころ有限会社化したとみられる。同じころ、「ナカムラマンガシリーズ」を開始、1959年（昭和34年）ころまでに400冊を超える漫画作品を発行した。謝花凡太郎（1933年）、新関健之助（1934年）、オオトモヨシヤス（1951年、のちの大友康匠）、わたなべまさこ（1952年）、井上智（1957年）らが同社でデビューしている。1980年代、大城のぼるの『火星探検』と『愉快な鉄工場』が、晶文社、名著刊行会によってそれぞれ復刻され、2005年（平成17年）には、小学館クリエイティブがこれらを再び復刻した。