龍造寺隆信の重臣で、肥前国佐嘉郡飯盛城主・石井兵部少輔常延の次男。母は蓮華院（黒尾氏）。妹に佐賀藩祖・鍋島直茂の正室で、初代藩主・勝茂の生母になった陽泰院がいる。父や兄と共に、龍造寺隆信に仕えたが、隆信の世子である鎮賢（しげとも、のちの政家）の家老になり、のちに鎮賢から偏諱を授けられて、「忠張」から「賢次」（ともつぐ）に改名した。天正10年（1582年）、龍造寺氏が筑後国鷹尾城主・田尻鑑種を攻めたとき、支城・江ノ浦城攻略のため、一隊を率いて出陣したが、苦戦を強いられて、賢次も戦死した。享年51。石井氏の系図によれば、陽泰院（鍋島直茂正室）の弟とされているが、享年からすると兄にあたる。家督は嫡男・左衛門尉信貞（忠明）が継いだ。次男の進士之允茂兼は、龍造寺四天王の一人百武賢兼の養子となり、百武氏を継いだ。四男の修理亮茂成は、後に佐賀藩家老となり、鍋島直茂・勝茂父子に重用されている。
兄に「ミスター警視庁」と呼ばれた土田國保元警視総監（1971年12月の土田邸事件で夫人を亡くした）、弟に東京証券取引所社長の土田正顕がいる。
1980年4月進学生歓迎会の三次会において、「これから遺言を話す。俺が死んだら紙に書いて国史の研究室に貼っておけ」と語ったという。一、現代人の心で古代のことを考えてはならない。二、古代のことは、古代の人の心にかえって考えなくてはならない。三、俺は長い間、そうしようと思ってやってきたが、結局駄目だった。お前らにできるわけがない。ざまぁみろ。古代のことを古代人の心で考えるというのは研究者として当たり前の態度であるが、土田ほどの碩学が駄目だったと正直にこぼした意味は深い。また、常々「俺は道長なんかと酒は飲みたくない」と語っていたという。学徒出陣の際は、埼玉県にあった熊谷陸軍飛行学校に見習士官として入校し、教官から「お前たちは消耗品である」という訓示を受け、面会や外出、休暇もなく、家族写真の持ち込みや隊での写真撮影まで禁止される、特攻のための厳しい訓練を受けた。
東京大学卒業後は、史料編纂所に勤務し、「大日本史料　第二篇」の編纂に従事した。専門は日本古代史で、平安時代の貴族社会に関する論考が多い。特に摂関政治期の政治について、当時の通説であった摂関家の政所が政治の中心であったとする「政所政治」論を否定して、依然として太政官を中心とした政務が行われていたことを立証したことで知られている。土田の研究方針は、史料を精密に理解するの一言に尽き、後世に名を残すといった功名に基づく研究を嫌っていた。1993年1月24日、国立歴史民俗博物館長在職中のまま、肺炎のため死去。
土田 直鎮（つちだ なおしげ、1924年1月16日 - 1993年1月24日）は、日本の歴史学者。東京大学名誉教授。元国立歴史民俗博物館長。
『恋愛小説』（れんあいしょうせつ）は、2006年7月17日にTBSで放送されたスペシャルドラマ。短篇の恋愛小説である江國香織の『デューク』、光原百合の『十八の夏』、浅田次郎の『月のしずく』をオムニバス形式でドラマ化した作品。
1896年（明治29年）11月12日、神奈川県足柄下郡小田原町緑町（現在の小田原駅東口周辺）で、旧小田原藩士である牧野家の父・久雄と、母・ヱイの長男として誕生。父と母はそりが合わなかった。旧家の牧野家は家屋も古風で、入口を入ると直ぐに広い庭に面する座敷が3室あり、庭も古風で、夜になると石灯籠に小さな明かりが、池に落ちる筧の水を照らす風情があったという。1897年（明治30年）、信一が1歳に満たぬ時、父・久雄が単身渡米。以後10年近くをその地で暮らすという、通常の父子関係ではなかった。明治30年ごろの小田原にはアメリカへの移民熱が盛んだったという事情はあったが、因循姑息な土地柄や家風から脱出する気持や、妻と離れたい気持も久雄にはあった。母・ヱイは小学校の準訓導であったので、信一は祖父母の溺愛の元で育つ。1903年（明治36年）、小田原尋常小学校へ入学。この前後から外人宣教師に付いて英会話とオルガンを習う。アメリカの父親から通信などで「見知らぬ父」と、その父が住むアメリカへの思いを掻き立てられる。このことは牧野の文学の一つの母胎となる。信一自身もいずれは海を渡り、アメリカで父親と合流するとの予想もあり、幼年から英語を学ぶことに勤しむ。父親の放浪的な気質は信一にも多分に流れており、異国好みの作風の根底にあるものとされる。1905年（明治38年）、祖父・英福が急死し、父・久雄は帰国したが、家庭に馴染めずに足柄下郡国府津村（現:国府津町）に別居。箱根の富士屋ホテルの通訳、ガイドなどをする。父親の別宅を訪ねてくる息子・信一とは、時に英語で話す。信一はアメリカ帰りの父と日本語では恥ずかしくて喋れなかったが、言いにくい感情でも思いのたけでも英語では話せた。性格の弱い放蕩的な父と、そのような父を背負わされた自分の「エディプス的自我」の定まらなさは、信一の感受性の形成に影を与えた。また信一は、ほとんど終生母親を憎み、父親を愛していたともされ、母は、うとましくもしたたかな世俗や凡俗の「抜きがたい象徴」となる。1909年（明治42年）、神奈川県立第二中学校（現:神奈川県立小田原高等学校）に入学。同級に終生の友となる鈴木十郎（のち読売新聞記者、後年は小田原市長）がいた。弟・英二が誕生。歳は13歳離れている。中学校の頃の信一は、授業では英語が得意で、校内ではラッパの名手として知られていて、なかなかの洒落者であったという。祖父母に溺愛されて育ったお坊ちゃん気質は、楽天的な闊達な気性を見せる一方で、人見知り風の引っ込み思案げな表情も生活の中に見られたという。初恋は中学4、5年頃で、相手は2、3歳年上で当時20歳の青果問屋の娘だった。娘は爛熟した美人だったという