都市というのは、都市としての発展の力学・ダイナミズムがあり、それは行政区分や行政機関とは合致しない形で起きることもある。東京都を語る上ではそこにある東京という巨大都市のことは無視できないので、ここで（地方自治体としての東京都ではなく）「都市や場所としての東京」にも一応触れる。都市としての東京は元々、江戸幕府が置かれた江戸であり、徳川家康の都市計画によって築かれ、大いに発展した。幕末の動乱を経て、明治元年の文書から「東京」と表記されるようになった。（江戸時代後期の佐藤信淵著『混同秘策』に既に書かれていた、江戸を「東京」と改称する案を、大久保利通は読んで知っており、明治の新政府発足の折にその案を採用し、提案したことでその名になった。）しかし、日本の行政区画上「東京」という自治体は現在は存在しない。東京には日本の首都機能が集中している。よって、多くの資料・統計などでは、日本の首都は「東京」とされているものが多い。この「東京」には、「東京都」の意味を含む場合もある。日本の民間研究所が2016年に発表した「世界の都市総合力ランキング」では、ロンドンとニューヨークに次ぐ世界3位と評価された。グローバル情報誌の「MONOCLE」による「世界で最も住みやすい25の都市ランキング」では、デンマークのコペンハーゲンに次いで2位に選ばれている。また、世界で最も大きな経済圏を持つ都市であり、しかも第2位のニューヨーク大都市圏の1.4倍の経済規模をもつ。エコノミスト・インテリジェンス・ユニットが発表している2017年度の「安全な都市指数」では、100点満点の89.80点となり、世界トップとなった。
「東京都庁の位置を定める条例」では都庁所在地を東京都新宿区西新宿二丁目と定めている。東京都の都庁所在地たる都市については特別区単体を市町村と同等とみなし「新宿区」とする見方と、特別区部全体を1つの都市とみなし「東京」とする見方がある。国土地理院によると、東京以外の道府県庁の所在地は市の名称を用いるのに対し、東京都の場合は、実際の所在地である新宿区を含めた23区をまとめて「東京」と表記する。教科書でも国土地理院と同じく「東京」としているものが多い。「新宿区」ではなく「東京」とする理由として、特別区が市町村でないことに加え、消防など、市町村が持つ業務の権限の一部を持たないこと、特別区部がかつて東京市という1つの市であったことなどがあるといわれる。
行政機関の集合体も「東京都」という。「東京都」は、旧東京府と旧東京市を廃止し、それらを統合する形で設置された行政機関である。第二次世界大戦中の1943年（昭和18年）7月1日、首都の行政機能を強化する目的から東京都制が施行された。終戦後の1947年（昭和22年）の地方自治法施行に伴い、1943年以来の東京都制は廃止されたが、「東京都」の名称と行政区域は変更していない。すなわち、東京都制によって、東京都の直轄とされた、旧東京市内に設置されていた区は、地方自治法施行によって特別地方公共団体たる特別区という名前を与えられて、市に準ずる権限を与えられたものの、一部の事務や徴税権は、東京都に引き続き留保された。このため東京都庁は、今なお「23区を包括する市役所としての機能」と「県庁としての機能」とを併せ持っている。東京都の議決機関は東京都議会である。東京都の首長は、東京都知事である。（略す場合は「都知事」という。）その権能や任期については地方自治法において定められており、任期は4年。東京都知事選挙が行われ、東京都民が候補者の中から投票で決めている。副知事（東京都副知事）も置かれ、その定員は4名と定められている。2017年4月時点、現在、東京都の職員数（いわゆる「都の職員」）は、知事部局等の一般行政職員が約2万5千人、公営企業部門（交通・上水道・下水道）が約1万3千人。これに東京消防庁および警視庁の職員、東京都内の公立学校の教職員を加えると総計約16万8千人もの職員を抱える巨大な組織である。東京都庁舎（本庁舎）は長年、千代田区有楽町にあった。1991年（平成3年）4月1日に新宿区の西新宿へ移転した。移転に伴い、地方自治法に従って都条例も改正され、同時期以降、都庁所在地は新宿区となった。都知事の執務室もそこにある。
2017年3月までの3年間は2020年の東京オリンピック・東京パラリンピックの開催が決定し、その東京オリンピックや将来の可能性を秘めたアスリートの卵（番組内ではミライモンスターと表現）たちにスポットライトを当て、MCの関根勤、高橋みなみ、ミライ☆モンスター紹介人の澤部佑（ハライチ）、又吉直樹（ピース）の4人がそのアスリートの原石となる彼らを応援するというものであった。関根・澤部・又吉は本番組の前番組である『笑っていいとも!増刊号』（1982年開始）終了時のレギュラーから引き続き当番組に出演する。2017年4月2日から番組が3年ぶりにリニューアルされ、提供がトヨタ自動車から旭化成に変更となった。これにより、『メトロポリタンジャーニー』（1997年終了）以来20年振りにフジテレビでの旭化成の一社提供番組が復活した。スポンサー交代に伴い、かねてからトヨタがサポートしており当番組で「ミラモン☆ナビゲーター」を務めてきたAKB48チーム8メンバーの番組出演が3年で終了し、その代わりに2017年以降旭化成グループキャンペーンモデルが次回予告紹介人として参加するほか、「ミライ☆モンスター紹介人」としてじゅんいちダビッドソンなど芸人数人が、さらに「ミライ☆モンスター世代代表」としてAKB48の高橋朱里が加入した。これまでは将来の可能性を秘めたアスリートの卵たちにスポットライトを当てていたが、リニューアルにより将来の可能性を秘めた様々な業界（旭化成協賛・読売新聞主催の日本科学大賞との連動企画も含まれる）の卵たちにスポットライトを当てる番組へと変更された。2018年3月25日の放送内で、第1回から出演していた高橋みなみが降板し、以前本人からAKB48グループ総監督を引き継いだ横山由依が当番組でも翌週4月1日放送分から後任のMCとして加入することが発表され、加えて週代わりだった紹介人のカミナリの石田たくみが昇格となった。高橋朱里は2019年3月で降板、同年4月7日からはAKB48の矢作萌夏が加入し、ミライ☆モンスター紹介人として初の俳優である磯村勇斗が加入した。