1937年8月30日にスコットランド、グリーノックのスコッツ造船・エンジニアリング社で起工する。1939年4月19日に進水し、1940年5月24日に4番主砲塔を搭載せずに就役した。1940年12月28日にテネリフェ島のサンタ・クルス・デ・テネリフェ沖でドイツの輸送船バーデン（8,204トン）と遭遇する。バーデンはテネリフェからフランスへ向かう途中であり、悪天候のため拿捕することはできなかったため、ボナヴェンチャーはこれを攻撃し撃沈した。1941年1月、ボナヴェンチャーは地中海でマルタ島への輸送船団の護衛任務に就いた。1月10日にイタリア海軍の魚雷艇キルケー、ベガによって攻撃を受けるが、反撃によりベガを撃沈した。3月22日、護衛任務中に輸送船と接触事故を起こし損傷した。その後、ラスター作戦に参加したが3月31日、ギリシャからアレキサンドリアへ向かうGA8船団を駆逐艦スチュアート、ヘレワード、グリフィンとともに護衛中、クレタ島とアレクサンドリアの中間地点で潜水艦の攻撃を受けて魚雷2本が命中し沈没した。ボナヴェンチャーを雷撃したのはイタリアの潜水艦アンブラであった。ヘレワードが310名を救助し、最終的にボナヴェンチャーの死者は138名であった。
プレーヤーはカーショップで自分の車を購入してゲームを進める。車種は幅広く、クーペ、ハッチバック、セダンはもとより、ステーションワゴン、軽自動車、1BOXミニバンまで自車として使用することができ、ライバルも同様にこれらの車種で登場する。ゲーム開始時に購入できる車種は非常に少なく、ライバルを倒すことでそのライバルが搭乗していた車種が入荷される。購入した車はガレージ内に計50台まで保管できる。なお、特定の車種に乗っていないとバトルに応じないWANDERERも存在する。他にもアザーカーとして一般車、トラック、タクシー、社用車、特殊車両などが登場する。また、バトルをしていないライバルはアザーカーとして走行している。登場車種はメーカーの公認を取っていないため、すべて形式番号やグレード名を組み合わせた独自の名前が付けられている。そのため、次作『首都高バトル01』にはないホンダ車が登場したり、車名のエンブレムが実車と異なっているなど、実車との差別化が図られている。ただし、車名は任意に変更できるので、実車相当の名前に書き換えることも可能である。
大学4年生の高橋（森岡龍）は、サークルの仲間とともに、自らの脚本・監督作『ここにいるだけ』の最終ショットを撮影していたが、ただ頷くだけのはずの最後の部分で、ヒロインを演じる莉沙（岡本奈月）が高橋の脚本にないセリフを口走る。それと同時に激しい雨が降り始め、撮影は中断してしまう。その夜、自室で撮影済みの映像を眺める高橋に、仲間から電話がかかってくる。莉沙が突然の交通事故で亡くなった。莉沙は共演者の光浦（渡辺大知）の彼女だった。1年が過ぎ、高橋たちはすでに大学を卒業し、それぞれの就職先でそれぞれの社会人生活を始めていた。ある日、高橋は、いつもの街で死んだはずの莉沙にそっくりな女性（岡本奈月）を発見する。憑かれたように後を追い、ぎこちなく会話を始めるうちに、彼女はロンドンに留学していた「莉沙の双子の妹」なのだと名乗る。高橋は、莉沙の死によって中断された映画の最終ショットを彼女の出演によってリテイクしようと思う。彼女は初めは自分は姉ではない、演じることなどできないと拒むが、やがて高橋を受け入れるに至る。土曜日に打ち合わせ、日曜日には撮影だ。土曜日。高橋は仲間をかつての部室に招集し、彼らに「莉沙の妹」を、その場で本人に名まえを聞いて「洋子さんです」と紹介する。高橋は名まえも聞かずにきたのだ。しかし仲間たちには、そこにはだれもいないようにしか見えない。仲間たちは動揺するものの、元部長の佐久間（橋本一郎）が機転を利かせ、カメラの調整があるからと言って、高橋を帰らせる。佐久間は高橋が自分たちを担ごうとしているのではないかと思う。後輩の森本（前野朋哉）は高橋の生真面目な性格を知っている。井上（佐藤貴広）は高橋が精神的におかしくなってしまったのだと思う。光浦は高橋の様子からなにかを感じ取っていたが、なにも言わなかった。とにかく、明日は撮影をしよう、病院に連れて行くとしたらそれからだ、という結論で仲間は別れた。その晩、高橋の部屋を光浦は訪れ、奇妙なことを言う。「彼女は妹じゃない。莉沙だよ」。高橋は光浦の言うことがわからない。光浦もとっさに、いやそれは撮影に臨むにあたっての心構えだとごまかす。「俺はお前がうらやましいんだよ」と光浦は言い、帰って行く。日曜日、高橋をはじめ仲間たちは、1年前と同じ場所で撮影の準備をする。「莉沙の妹」が現れたという高橋、彼女の提案でテストなしにカメラを回す。高橋以外の目には「莉沙の妹」は見えない。光浦のセリフが終わり、頷くだけの最終部分にさしかかった。「莉沙の妹」はまるで莉沙が言いかけた莉沙の考えたセリフをつづけるように、話し始めたのだった。高橋がカットをかけると、「莉沙の妹」は走り出した。追いかける高橋、追いつくと「莉沙の妹」は語り始める。彼女は、光浦の言うようにやはり莉沙の魂だったのだ。さらに3年が過ぎた。高橋は会社を辞めることにしたと、井上に話す。現実主義者の井上は高橋の前途の多難さを予想する。高橋はそれでも踏み出したいというのだ。そんなある日、高橋はふたたび莉沙によく似た女性（岡本奈月）を発見する。それが莉沙の妹・洋子だった。高橋はふたたび洋子にリテイクのオファーをする。たくさんの新たなセリフの書き込みがされた脚本を洋子に示しながら。