2003年には、高額の課金に利用者が驚く事が続出した、またクローン携帯問題も話題となった。またそれと前後して多発した振り込め詐欺や架空請求では、通話手段の1つとして携帯電話・特にプリペイド式携帯電話が悪用される例が多かったため、2005年5月には携帯電話不正利用防止法が施行され、携帯電話・PHSについて契約者の本人性確認の義務付けや、不正な譲渡の禁止等がなされた。
携帯電話の普及に伴い、自動車・オートバイ運転中の携帯電話の使用による事故の増加が社会問題となった。1999年11月改正の道路交通法で自動車・オートバイを運転中に携帯電話を使用して事故等を起こした場合の罰則事項が追加されたが、それでも改善の目処が立たなかったため、2004年6月成立・同11月施行の改正法により、ハンズフリー装置を利用した通話等を除き、反則告知対象となった。自転車を運転中の使用についても2011年以降、各都道府県公安委員会規則で罰則を設けるケースが増えている。東京都では5万円以下の罰金となる。
携帯電話は、着信やメールを受信するときに設定によっては音が鳴ることから公共の場ではマナーとして電源を切る、マナーモードにするなどを求められることがある。列車内では、マナーモードに設定して優先席では電源を切り、全車での通話を禁止している鉄道事業者も多い。
毎年、1月1日（元日）0時からの2時間前後は、「おめでとう電話」「おめでとうメール」等と呼ばれる新年のあいさつの通話やメール通信が一斉に集中するため、通話が繋がりにくくなる傾向がある。携帯電話キャリア各社は、緊急ではない利用は極力控えるように広報をしており、同時に通信規制を行うことで対応している。
携帯電話・PHSの普及拡大などによって、一般的に加入回線（固定電話）の利用は減少の傾向にある。特に入学・就職などで新生活を始める若者は、固定電話を新規に敷設する際に必要となる電話加入権の負担を嫌い、また携帯電話・PHSだけでも日常生活にはさほど困らないことから、固定電話を設置せず携帯電話・PHSだけを持つ者もみられる。これらの要素も加わって、携帯電話・PHSの普及率の上昇と入れ替わるように公衆電話の利用が激減した。日本における公衆電話の設置台数は、1989年の約83万台から2003年には約50万台に減少している。携帯電話とPHSを合わせた普及率が固定電話の普及率を追い越したのは、2000年である。
日本の携帯電話端末（スマートフォンを除く）は、普及が始まってからはどの時代においても他国の端末よりも機能面では充実している。日本の携帯電話は、販売時にインセンティブ方式を用いている故に、端末の開発費や制作費の割に割安で販売される。この制度が日本の端末の多機能化をもたらした最大の理由であるが、新たな技術の開発が盛んに日本で行われ、端末供給会社同士で多機能化を競争しているという側面もある。このようにして機能の豊富な携帯電話端末が広く普及することにより、世界標準の通信規格（W-CDMA）に則った携帯電話であっても、日本で販売される端末の大半は日本のキャリアでのみ利用できる機能を搭載した日本専用機種となっているほか、日本のインターネットではキャリア公式ではない勝手サイトも含めて、日本の携帯電話でのみ利用できるサービスが数多く展開している。このため、韓国と並んで世界的に見ても特異な携帯電話文化が生まれている。
携帯電話の普及により、携帯電話の独自の機能から特有の文化が多く生まれている。まず、絵文字があげられる。絵文字は携帯電話のサービス会社（キャリア）ごとに異なり、パソコンなどの他のプラットフォームとの互換はない（携帯電話間の互換性は確保されるようになった）。また2000年代前半ではギャル文字と呼ばれる崩し文字が流行したり、ポケベル打ちと呼ばれる入力方式も存在した。社会問題としてパケ死やケータイ不況、携帯電話ウイルス、クローン携帯なども問題となっている。
小谷 太郎（こたに たろう、1967年（昭和42年） - ）は、日本のサイエンスライター、大学教員。東京都生まれ。東京大学理学部物理学科卒。博士（理学）。理化学研究所、NASAゴダード宇宙飛行センター、東工大などの研究員を経て著述活動を開始。平塚市在住。
1999年、大阪府出身の大西政之が平尾旧坑で発見し、岡山大学大学院教育学研究科理科教育専攻 (地学教室) 在学中の2007年2月に「大阪石（オオサカアイト）」として国際鉱物学連合の新鉱物および鉱物名委員会から新鉱物として新種認定された(IMA No. 2006-049)。この認定で、当時、日本から発見された100番目の新鉱物となった。得られた試料が微量で、不安定な鉱物であることも相まって分析が困難であったことから、最初の発見から認定までに7年の歳月を要した。近年発見される新鉱物は微細なものが多く、その化学分析にはほとんどが電子線マイクロアナライザー (EPMA) が用いられる。しかし、大阪石は真空中や電子線照射に対して安定ではないため、誘導結合プラズマ発光分光分析 (ICP-AES) および熱重量分析 (TGA) によって化学組成が決定された。非常に希な鉱物で、日本ではいまだに平尾旧坑以外からは発見されていない。大阪府は全国の都道府県の中でも産出する鉱物の種数が少ない地域であり、当初は府下から新種が見つかる見込みはないと思われていた。そのため、最初に見つかった新鉱物に “大阪” の名を冠したといわれている。その後、同じ平尾旧坑から発見された2種目の新鉱物には、市名をとって箕面石と命名されている。2003年9月には、東京都奥多摩町白丸の白丸鉱山で発見された東京石が新鉱物として認定されている。そのほか、都道府県名のついた鉱物には、滋賀石、岡山石、新潟石、千葉石、愛媛閃石、岩手石、イットリウム三重石がある。