2012年1月4日、PayPal社長のスコット・トンプソンがCEOに指名された。同年4月には、全従業員の14%にあたる約2000人のレイオフを発表するなど再建に乗り出した。2012年末の完了後、Yahoo!はレイオフで「年間3億7500万ドル」が節減されたと発表した。3月には、Yahoo!はFacebookに特許を侵害されたと提訴した。4月にはFacebook側から逆提訴をされている。2012年4月、スコット・トンプソンはYahoo!は顧客最優先であるべきだという彼の見解を何度も繰り返した電子メールを従業員のもとに送っていた。トンプソンにとって顧客とはユーザーと広告主の両方だと定義していた。トンプソンは、さらに完全にYahoo!の再編成を行った。再編成は2012年5月1日に効果が現れ、その要因は「消費者」・「地域」・「テクノロジー」と3つの大きなグループの経営戦略だった。しかし2012年5月、トンプソンがコンピュータ・サイエンスの学士号を有しているとした誤りから起こった「学歴詐称」問題が発覚。5月13日、就任からわずか4カ月でCEOを解任された。そして、役員のロス・レビンソンが暫定CEOに就任した。
2009年1月に、Yahoo! は、ジェリー・ヤンの後任のCEOに就任したキャロル・バーツの指揮のもとで経営立て直しを試みることになった。7月には、Yahoo! のウェブサイトにマイクロソフトの検索技術と検索広告プラットフォーム「adCenter(現Bing Ads)」を使うことでマイクロソフトとYahoo! は提携に合意した。2009年7月21日に、Yahoo! は新しいバージョンのトップページを公開した。トップページ左側のカスタマイズ可能なYahoo! JAPAN のお気に入りに該当する「MY FAVORITES（マイ・フェイバリッツ）」には Yahoo! のサイト上で提供されているサービスのみならず、Netflix、Facebook、Twitterなどの他社のウェブサイトのサービスを選んで配置できるように、その当時はなっていた。2011年9月6日、バーツは突如、取締役会長ロイ・J・ボストックの電話で解任された。一方、会社の全体または一部事業の売却を検討しているとされた。売却先としてAOL、マイクロソフト、アリババ等が候補に挙がっているとされた。しばらくの間はティム・モースCFO（最高財務責任者）が暫定的CEOを勤めていた。
2008年1月29日に、Yahoo!は同社の厳しく、苦しい経営状況では、検索エンジン業界のリーダーであるGoogle社と相乗的に市場競争ができないとして、全従業員14,300人のうち7％である1000人をレイオフ(人員削減)すると発表した。Yahoo!は急成長がみこまれ会社の拡大が期待できる分野に経営資源を集中することにしている。2008年2月12日に、マサチューセッツ州ケンブリッジのオンライン動画プラットフォームプロバイダーのMaven Networks（メイブン・ネットワークス）を1億6000万ドルで買収。2008年11月17日に、創業者のジェリー・ヤンはCEOを辞任し、以前の役職であるチーフに就任。2008年12月10日には業績悪化に伴い、世界で1520人の従業員のレイオフを始めた。
1990年（平成2年）7月場所限りで現役を引退し、以降は押尾川部屋の部屋付き親方として後進の指導にあたっていた年寄・15代錣山（元関脇・益荒雄）は、1992年（平成4年）9月に年寄名跡・阿武松を正式に取得して年寄・12代阿武松を襲名し、同時に押尾川部屋の師匠である17代押尾川（元大関・大麒麟）に分家独立を申し出たところ、師匠に相談せずに分家独立を計画していたこと、二所ノ関一門の外から名跡を取得したことの二点が押尾川の逆鱗に触れ破門されたために、大鵬部屋へ移籍した。その後、1994年（平成6年）10月に12代は大鵬部屋から分家独立して阿武松部屋を創設した。しばらくは一番弟子の大名（後の幕下・阿武若）しか弟子がおらず、2LDKのマンションで当時独身だった12代と弟子1人の2人暮らしと苦しい出発となったが、1995年4月に現在の千葉県習志野市鷺沼で部屋開きを行った。2001年1月場所において小緑が新十両へ昇進し、部屋史上初となる関取が誕生した。2005年5月場所には片山が新入幕を果たした。学生相撲出身者を積極的にスカウトして、片山以降は専修大学出身の力士が多くなっている。所属力士の四股名には、主に「阿武」「松」「荒」「緑」（「緑」は横綱・阿武松緑之助から）が付けられることが多い。2010年1月に行われた日本相撲協会理事選挙において、貴乃花親方（元横綱・貴乃花）が二所ノ関一門内の事前調整を拒否して独自に立候補を表明し、12代は貴乃花親方に対する支援を表明して貴乃花親方へ投票したために、部屋はそれまで所属していた二所ノ関一門から事実上の破門扱いを受けた。その後は貴乃花親方が率いる「貴乃花グループ」に参加して、グループでの合同稽古を行うなどの活動を行っていた。グループが一門となった後の2018年2月1日に12代は理事選に立候補し、当選。同年6月に貴乃花親方が一門を離脱し、同年7月の理事会で全ての親方が五つある一門のいずれかに所属することが決定されたため、同年9月21日に旧貴乃花一門の大嶽、千賀ノ浦、無所属の錣山、立田川、湊とともに二所ノ関一門に加入を申請して認められた。2019年9月、12代が高血圧など体調不良を理由に日本相撲協会を退職する意向を示した。9月場所終了後、同月26日の相撲協会理事会において、12代と21代音羽山（元前頭・大道）との名跡交換を行い、22代音羽山となった先代は同日付で退職。代わって13代の阿武松部屋継承が承認された。