城門を破壊して突破するのが、モティア占領の第一歩であった。ギリシア兵が前進すると、モティア軍は建物上から投擲兵器（弓矢、投石）で激しく抵抗し、攻撃側に大きな損害を与えた。このため、ギリシア軍は攻城塔を城内に入れ、城壁の近くの建物に接近させ、屋根に兵を上らせた。その後激しい白兵戦が行われ、絶望的なモティア軍（傭兵は雇用していなかったと思われる）の反撃により、攻撃側も大損害を受けた。数日間にわたり、夜明けから日没まで激しい戦闘が行われたが、ギリシア軍は何も得ることができなかった。ディオニュシオスは戦法を変更することを決断した。それまでは戦闘は夜明けに開始され、日没と共にギリシア軍は休息のために引き揚げていた。ある日、ディオニュシオスは傭兵からなる選抜部隊を、有利な拠点を確保するために、梯子を持たせて夜間に出撃させた。夜の闇にまぎれ、この特殊部隊はモティア軍に発見される前に、拠点を確保することに成功した。有利となったギリシア軍は、数でモティアを圧倒し、抵抗を排除した。ディオニュシオスは奴隷市場で売るために、できるだけ多くの捕虜を得るつもりであったが、ギリシア兵は鬱憤晴らしのために多くのモティア市民を殺害した。ディオニュシオスが救えたのは、寺院に避難していた市民のみであった。
カルタゴ艦隊の妨害が無くなったため、モティアに向かう突堤の建設は順調に進んだ。モティア自身は海軍をもっておらず、弓の射程まで突堤が延びてくるまで、ほとんど何もできなかった。突堤が完成すると、ディオニュシオスは攻城塔を前進させた。攻城塔はモティアの城壁より高く、最も高い建物と同程度の高さがあった。城壁上の守備兵を、攻城塔からの弓矢、投擲兵器、さらには大型弩弓による攻撃で制圧した。さらに城門を破壊するために破城槌を進めた。モティアでは城壁内部に船のマストを建て、それに兵を上らせた。これらの「カラスの巣」から、可燃性のピッチをしみこませた亜麻を攻城兵器に投下して焼却を試みた。しかし、ギリシア軍は消火部隊を準備しており、モティア軍の努力にもかかわらず、攻城兵器は城門に達した。
紀元前405年、アイゴスポタモイの海戦でリュサンドロス率いるスパルタ海軍は、停泊中のアテナイ海軍の大部分を鹵獲することに成功している。ヒミルコが北方に停泊しているディオニュシオスの艦隊を最初に攻撃せずに、南方に停泊していた輸送船を攻撃した理由は不明である。もし、ディオニュシオスが艦隊を失っていたら、包囲を中止して撤退せざるを得ず、ヒミルコはシュラクサイを攻撃する機会を得た可能性がある。攻撃開始は遅れたものの、ヒミルコはシュラクサイ艦隊をペルシア戦争のサラミスの海戦におけるペルシア艦隊と同様な状況に追い込んだ。すなわち、カルタゴ艦隊は十分に機動できる余裕がある水域にあり、ギリシア海軍にはそれがなかった。このため、質（ギリシア海軍は大型の五段櫂船を有していた）・量ともに上回るギリシア海軍は、当初その優位を活かせなかった。ディオニュシオスは艦隊を出撃させたが、水深が十分でないため、南のカルタゴ艦隊に向かえたのは一部でしかなかった。このため、ヒミルコは数でもまた機動性においてもギリシア艦隊に対して優位を得た。しかしながら、ディオニュシオスは出撃する船に多数の弓兵と投擲兵を乗せており、また陸上からは大型弩弓で支援した。乗船した弓兵や投擲兵がカルタゴ軍の三段櫂船と戦ったが、これによってカルタゴ艦隊が停泊中のギリシア艦隊に接近することを阻止できた。シケリア本島とルンガ島（現在のグランデ島）北部の間は軍船が通過できない浅瀬であったが、ディオニュシオスはそこに急遽木製の人力牽引用の足場を作らせ、80隻の三段櫂船を外洋に脱出させた。これら艦隊はルンガ島を回って南下を開始した。このためカルタゴ艦隊には南北から挟撃される危険が生じた。ヒミルコは数に勝る敵との二正面戦闘を避け、モティアを撤退してカルタゴに向かった。
一般に水域では植物プランクトンが基礎生産を担っており、植物プランクトンの増殖は栄養塩の多寡に左右される。植物プランクトンに必要な栄養は、窒素・リン・珪素（珪藻および珪質鞭毛虫が要求）および微量金属類である。この場合、窒素はアンモニア態窒素、硝酸態窒素あるいは亜硝酸態窒素として、リンはリン酸態リンとして、珪素はオルトケイ酸としての形態のものが中心であり、通常これらの塩を総称して栄養塩、または微量金属類と特に区別して多量栄養塩（Macronutrients）と呼ぶ。栄養塩は、水産業において、植物プランクトンだけでなく海苔やワカメといった海藻の生育や、赤潮の発生要因の一つであることなど、水域の一次生産に深く関係しており、水域の生態系や生物多様性・生産性に影響する非常に重要な条件の一つとなっている。なお、農業で重要な栄養塩とは異なり、カリウムは含まれない。これは海水中にはイオンとして多量に存在しており、不足する心配がないからである。指標として表示する場合、窒素分をDIN（Dissolved Inorganic Nitrogen; 溶存無機窒素）、リン分をDIP（Dissolved Inorganic phosphorous; 溶存無機燐、あるいはDissolved Inorganic phosphate; 溶存無機燐酸）、また、珪素分をDSi （Dissolved Si; 珪酸態珪素）とされる。海洋や湖沼における水域の環境基準の指標として、全窒素（Total Nitrogen; TN）と全リン（Total PhosphateまたはTotal Phosphorous; TP）が用いられ、水域の利用目的に応じて望ましい濃度が位置づけられている。なお、全窒素と全リンには無機態と有機態が含まれている。栄養塩類を数値で表す際に、水産ではmg/lやμM等の単位が用いられている。窒素とリンについて、mg/lとμMの換算は下の通り。 Ｎ原子量 14.01 Ｎ1mg/l＝71.37μM Ｐ原子量 30.97 Ｐ1mg/l＝32.28μM