作中ではブラック・ジャックが趣味に興ずる場面はいっさい描かれていない。「わたしゃ商売（医療）以外には関心がないんだ」という発言と合わせると、趣味はないようである。特技（医療以外）としては、メス投げがある。元はダーツ投げで、少年時代、ダーツを復讐の道具に選び、授業をサボってまで練習に明け暮れていた。その他、描写からすると喧嘩は強いようである。食事に関しては庶民的でありグルメではない。海外出張も多く外食が多いので、お茶漬けが食べたいと言ったり、大金を持っているのにレストランでカレーライスを注文したりする場面がある。「ボンカレーはどう作ってもうまいのだ」とおふざけ調子で言ったことがあるが、その一方でピノコが作るカレーがいつまで経っても不味い事に嘆いていた。もっとも、美味しいという評判の寿司屋にわざわざ遠方から通い詰めた事もある（この時は寿司を食わせる事を条件に、高額の手術の報酬の代わりとしている）。また居酒屋での一ヶ月飲食無料を手術代の代わりとした事もある。喫煙者。パイプを愛用しているが、通常の巻き煙草を吸っている場面もある。上記のとおり、酒を飲んでいる場面は多いが、酔っぱらった場面はない。酒の場面は、前述の桑田このみとの出会いの場や、殺人事件への関与を疑われた際の無実を証明するアリバイ、コレラ感染の疑いを持つきっかけになるなど、作中の転機に絡んでいることも多い。
ライバルは特に出てこない。ドクター・キリコは出てくるたびに、なんらかのかたちでブラック・ジャックと衝突しているが、技術を競う間柄ではなく、医療に対する考え方の相違によっている。ブラック・ジャックに比肩する優れた医療技術を持つ医師は何人か登場したことがあるが、ブラック・ジャックは大体において超然としており、彼らを敵対視したり腕を競おうとしたことはほとんどない。ただ、『過ぎ去りし一瞬』に登場した外国の神父で医師でもあったファスナーという人物は、同じくらいのレベルの医療技術を持つ「仲間」を欲しているブラック・ジャックが唯一「ライバル」と呼んだことがある。ただファスナー神父は神の力で奇跡的な手術を行っただけだと主張しており、また利き手の指をなくしてしまったので、ファスナーへのブラック・ジャックのアプローチは独り相撲に終わっている。逆に、自分の地位や名声を鼻にかけるばかりで実力が伴わない医師に対しては容赦ない。海外から訪れた有名な難病患者の手術を前にして「自分以外でこの手術をする者は身の程知らずだ」とテレビの取材で大言壮語し、その一方で同じ病気の別の患者の治療を（無名の一般庶民だからという理由で）冷淡に拒否したA大病院の板台教授に対しては激しく敵愾心を燃やし、「男としての意地（本人談）」から板台教授が治療拒否した同じ病気の患者の手術を、自分が執刀したことを伏せるのを条件に引き受けたことがある。その際には手術の開始時刻まで板台教授に合わせて術式を開始し、「こうなれば教授と勝負だ」などと発言するなど、徹底的な対抗心を露わにしていた。結果は、板台教授の手術は失敗して患者は死亡し、逆にブラック・ジャックの手術は見事に成功して、板台教授の面目は完全に潰されることとなった（『はるかなる国から』）。
爆弾事故については劇中で幾度か「○○年前」と言及されており、第202話『20年目の暗示』では、爆弾事故は「20年前」と語られている
よって、この時点ではブラック・ジャックの年齢は28歳と設定されていたと考えられる（手塚がブラック・ジャックの年齢を28歳と決めたのは、当時担当だった2代目の担当編集者の年齢にちなんだと言われる）
また、第233話『骨肉』では爆弾事故が「25年前」と語られており、この時点では年齢は33歳ということになる

ミシシッピ州立大時代の1985年に全米大学選抜チーム入り。その年のドラフトでサンフランシスコ・ジャイアンツから1巡目（全体2番目）の指名を受け入団した。マイナーリーグでのデビュー戦の初打席では、調整登板していたロサンゼルス・ドジャースの名投手フェルナンド・バレンズエラから本塁打を打つ。翌1986年4月8日に早くもメジャーデビューを果たすと、デビュー戦で通算最多奪三振のノーラン・ライアン（当時ヒューストン・アストロズ）からメジャー初打席初本塁打を打つ。ルーキーイヤーの1986年は111試合で打率.287、11本塁打、41打点。新人王は当時の新人記録となる36セーブをマークしたトッド・ウォーレルに譲ったが、投票でも上位に入る活躍。翌1987年は打率.308、35本塁打、91打点の活躍でチーム16年ぶりの地区優勝に貢献。1988年には初のオールスター出場を果たし、全162試合に出場して109打点をあげ、打点王のタイトルを獲得。1989年には打率.333、23本塁打、111打点をあげてチームの地区優勝に貢献。シカゴ・カブスとのチャンピオンシップシリーズ第1戦（リグレー・フィールド）では、カブス先発のグレッグ・マダックスから、3回表にソロ本塁打を、4回表に満塁本塁打を打った（後述）。ジャイアンツが3勝1敗と王手をかけて迎えた第5戦（キャンドルスティック・パーク）では1-1と同点の8回裏に、クローザーのミッチ・ウィリアムズから、2点タイムリーヒットを打つ。この活躍でクラークはこのシリーズのMVPに選ばれ、チームは27年ぶりのワールドシリーズ出場を果たした。オークランド・アスレチックスとのワールドシリーズでは良いところなく4連敗で敗れたが、これが唯一のワールドシリーズ出場となった。東西地区制最後の年となった1993年に、チームは103勝をあげるが、わずか1ゲーム差でアトランタ・ブレーブスの後塵を拝し、その年限りでフリーエージェント（FA）でチームを離れる。移籍先にはルイジアナの自宅に近いテキサス・レンジャーズを選ぶ。チームは1996年と1998年に地区優勝し、プレイオフ進出を果たすが、いずれもディビジョンシリーズでニューヨーク・ヤンキースに敗れる。1999年にはボルチモア・オリオールズに移籍し、6月15日のカンザスシティ・ロイヤルズ戦で通算2,000本安打を達成。ただしこの年は故障のため77試合の出場に終わる。2000年途中に、マーク・マグワイアの故障で一塁手を探していたセントルイス・カージナルスに移籍。移籍後、51試合に出場して打率.345、12本塁打、42打点の活躍でチームをナ・リーグ中地区優勝に導く。特に、移籍最初の試合からは4試合連続本塁打の活躍で、復調を印象付けた。ディビジョンシリーズではブレーブスを寄せ付けず、ニューヨーク・メッツとのリーグチャンピオンシップシリーズに進出。クラークはそのシーズン限りの引退を発表するが、チームはメッツに1勝4敗で敗れ、10月16日に行われた第5戦で、3打数1安打を最後に現役を引退した。2006年には大学野球殿堂入りを果たす。