かつては日野以外の3メーカーの車両が在籍していたが、置換や減便による配置両数減少により、三菱ふそう、いすゞ車のみ配置されている。一般路線カラーの三菱ふそう・ニューエアロバスが最も多く、その他、いすゞ・ガーラ、三菱ふそう・エアロエースも在籍する。近年導入の車両は京成グループカラーで導入されている。高速車はすべてトイレ付。2005年10月まではJRバス関東からのリースでネオプラン・メガライナーも在籍していたが、「つくば号」の減便に伴い返却されている。
つくバス用として、三菱ふそう・エアロミディME、日野・ポンチョと、比較的利用客の多い、南部シャトル用として、いすゞ・エルガミオワンステップが専用車として配置されている。牛久市コミュニティバス「かっぱ号」用としては、三菱ふそう・ローザ、日野・ポンチョがそれぞれ配置されている。
大型車、中型車、小型車ともに在籍し、国内4メーカーすべての車両が配置されている。大型車は、かつては1985年の国際科学技術博覧会開催時に自社発注で大量導入された車両のうち、川重車体製のいすゞ・キュービックLVが多く在籍していたが、現在は全て廃車された。移籍車は、かつては元京阪バスの日野RC、元川崎鶴見臨港バスのいすゞCJM、元横浜市営バスの三菱MP、元西武バスのUD･U33系が在籍していた。その後は京成バスおよび京成グループからの車両が中心で、IKボディのいすゞ・キュービックLVが最も多く、その他、富士重7EボディのいすゞLV、日野・ブルーリボンHTも在籍する。また移籍車にはワンステップバスも配置されている。京成グループ以外では、元東急バスのいすゞ・エルガノンステップも在籍している。そのうち元東急バスのエルガ（9375YT）は、東急バス時代のカラーリングのまま、つくばサイエンスツアーバスのラッピングが施されており、つくばサイエンスツアーバス運行時は、優先して運用されていたが、2019年（令和元年）夏に廃車された。一台だけの自社発注車（1923YT）は、深夜急行バス運行開始時につくば北営業所から転属してきた「筑波山シャトル」の元専用車で、メトロ窓・2人掛けシート主体のいすゞ・エルガ郊外路線仕様であったが、新車代替で2019年（平成31年）春に水戸営業所へ転出した。2017年3月には、つくば中央営業所では初となるいすゞ・エルガハイブリッドノンステップバスが2143YTとして新製配置された。大型路線車は、一般路線の他、スクールバスや企業輸送などの契約輸送にも使用され、上述の専用車も運用がない時は、他の大型車と共通に運用されている。中型車は自社発注車が中心で、他社からの移籍車は元西武バスの日産ディーゼル・RMが1台のみが在籍していたが、2015年秋にいすゞ・エルガミオノンステ配置の代替で水戸営業所へ移籍した。いすゞ・エルガミオ、日野・レインボーII、三菱ふそう・エアロミディの、ノンステップ、ワンステップ車が多くを占め、かつて当営業所に多数在籍していたいすゞLRは2014年現在、残り2台となっている。小型車は、松代循環専用車の日野・ポンチョが1台の他、コミュニティバス予備車兼用の三菱ふそう・エアロミディMEが配置されている。
所在する南アルプス市上八田は甲府盆地西部に位置し、釜無川・御勅使川扇状地上に立地する。一帯は古くから水害が及んだ地域で開発は遅れ、「八田」の地名は開墾地を意味する「墾田（はりた）」に由来すると考えられている。古代の律令制下では巨摩郡に比定され、近在には平安時代の集落遺跡である百々遺跡があり、ウマ・ウシの動物遺体が出土していることも注目される。甲斐国では、古代に『延喜式』に記される甲斐の三御牧（穂坂牧・真衣野牧・柏前牧）が設置され、朝廷に貢馬を行っていた。八田牧は史料上は「御牧」と記されているが、朝廷に貢馬を行う公的な御牧ではなかったと考えられている。平安時代後期から鎌倉時代には甲府盆地各地で荘園・牧が立荘されるが、八田牧に関する唯一の史料は南アルプス市高尾の穂見神社に伝来する天福元年（1233年）の御正体の銘文で、「甲斐国八田御牧北鷹尾」と記されている。「鷹尾」は穂見神社が所在する高尾の地を指すと考えられており、八田牧は櫛形山東北麓にあたる釜無川右岸地域に存在したと考えられている。『続日本後紀』承和2年（835年）4月2日条に拠れば、この年に桓武天皇の皇子葛原親王は「巨摩郡馬相野の空閑地500町」を甲斐巨摩郡の御勅使川扇状地に求め、八田牧はこの後身であると考えられている。「馬相野」の地について、江戸時代後期に成立した『甲斐国志』では、現在の南アルプス市の「駒場」「有野」の地名を牧の遺名としているが、「馬相野」の地を北巨摩郡に求める説もある。八田牧の在地領主については、『吾妻鏡』治承4年（1180年）8月25日条に、駿河へ向かう甲斐源氏の安田義定の軍勢のなかに見られる工藤景光・行光親子の存在が注目される。甲斐工藤氏が甲斐において領していた地は不詳であるが、『国志』では『曽我物語』を根拠に甲斐工藤氏が芦倉（南アルプス市芦安）・奈良田（早川町）を領していたとする伝承を紹介しており、甲斐工藤氏の支配が八田牧まで及んでいた可能性が考えられている。