ビルの基本構想には総合プロデュースを担当していた浜野安宏とともに働いていた安藤忠雄が携わっており、横浜ベイクォーター側にある半円形のカーブは安藤の提案をもとに設計されたものである。この部分に非常階段が設置されている。またメインテナントのそごうの提案により、3階から上の部分の外壁には磁器タイルの凹凸でカモメが描かれ、光の加減によってカモメが浮かび上がって見えるようになっている。附置義務駐車場は、地下3階の「横浜駅東口地下駐車場」（認定は121台分）と、横浜ベイクォーター前の「そごうパーキング館」、横浜ベイクォーター駐車場。出島地区は貯炭場や横浜新興倶楽部（旧 横浜社会館）があった埋め立て地でありお汁粉状の軟弱な地盤であったため、地盤改良のためにビルの高さよりも長い杭が多数打ち込まれている。なおビルの設計当初は、ビルの海側の地下に国鉄横浜線の新駅を設置する計画があったため、地下1階のバス会社窓口・コンビニエンスストアがある場所に新駅への連絡通路（「みなとみらい21地区（はまみらいウォーク経由）」と表示）が、ポルタに直結する地下2階そごう正面入口前広場（新都市プラザ）の右側にエスカレーターと階段が用意されている。1998年9月19日から1999年1月17日まで、10月に38年ぶりにリーグ優勝を遂げることになる横浜ベイスターズの人気にあやかり、新都市プラザに佐々木主浩投手（当時）の右腕を型取りした像をご神体にした神社「ハマの大魔神社」を設置した。全国からも観光客が訪れるほどの大盛況で、2度にわたって展示期間の延長を行った。その結果、東口全体で10億円以上の増収となった。
そこで1971年（昭和41年）6月に横浜市全員協議会が「横浜駅東口総合計画」を策定し、横浜駅東口の開発が開始されることになった。10月には財団法人横浜駅東口開発公社が第三セクターで設立され、横浜駅東口開発公社が東口駅前広場・周辺道路・横浜ポルタ・横浜駅東口地下駐車場・出島地区（みなとみらい21 68街区）・横浜駅東口バスターミナルの建設・運営を行うことになった。しかし設立の1か月後に理事長の内山岩太郎（元 神奈川県知事）が死去したことによる内部体制の不備や、第三セクターという形態による出資者の当事者意識の不足。また財団法人という形態をとったため資本金1億円では資金が不足し、首都高速神奈川1号横羽線の建設決定による設計変更・第1次オイルショックの狂乱物価による建設費の高騰などの影響も加わり、出島地区の開発が困難になってしまった。なお公社の設立当初は出島地区との一体開発を前提にしていた。そのため1980年11月7日完成の地下街横浜ポルタ・横浜駅東口地下駐車場の運営だけでは事業の採算が取れず、公社の赤字が膨らみつづけたため、1988年3月31日に解散。元の計画に立ち返る形で、公社の事業は出島地区の開発・運営を行っている横浜新都市センターが継承した。
1960年代の横浜駅東口は、横浜駅開業当初からの表玄関であったことから権利関係が複雑な土地や公有地が多く、自然発生的な再開発が期待できなかった。その一方、西口は1950年代から相模鉄道によって開発が進められ、1960年代には一大繁華街として発展しており、東口は見劣りするようになっていた。そこで民間企業の横浜駅前振興株式会社（現 株式会社横浜スカイビル）によって、横浜駅東口の出島地区・東口地下街の開発が開始された。1968年3月には初代スカイビルの落成、1967年7月にはスカイプールの開業にこぎつけたものの業績が伸び悩み、また横浜市警察庁舎跡地（現 横浜スカイビル）・横浜市営バス西営業所跡地（のちのスカイプール用地、現 横浜新都市ビル）の払い下げ価格が予想以上に嵩んだり、横浜市長が革新派の飛鳥田一雄に交代したことよる横浜駅東口総合計画の見直しなどの影響もあり、出島地区の北側・東口地下街の開発が困難になってしまった。
1683年10月10日の夕刻、「ヴァーペン・フォン・ハンブルク」の艦首最下層部で原因不明の火災が発生した。それは急速に燃え広がり、最大限の努力をもってしても適切に鎮火できなくなった。乗組員は短艇で避難しようとしたが、カープファンガーの命令でさらに消火を試みるべく火災の現場に回された。同時に「ヴァーペン・フォン・ハンブルク」の大砲から周囲の艦船に対し、応援の消火の派遣を求めるための信号弾が発射される。しかし火の手が甲板から前檣に広がり、不利な風によって索具と帆に燃え移ると、急ぎ来援した者たちは爆発を恐れて安全な間隔を取った。カープファンガーは航海に同行していた、避難を呼びかける息子を艦から降ろす。しかしカープファンガーは、いまだに船を失われたものと見なさなかった。配下の士官は艦体に穴を開け、海水を満たして艦を海底に沈座させることを提案した。しかし、カープファンガーはこれを却下する。結局、彼は艦を座礁させるという案に賛成し、岸の近くへ乗り上げさせるべく、その艫綱を切断させた。艦を離れるなど、彼にとっては元より問題外であった。なぜなら「託された艦隊の防衛にあたって雄々しく踏み止まり、艦を離れるよりは生命と財産、身命を捧げる」という、1674年7月14日の、ハンブルク市参事会に対する誓いを守る義務があると考えていたからである。護衛艦が岸へ向かってゆっくりと漂流する間、甲板下の火の手は艦尾に迫り続けた。結局、真夜中頃には次々に各砲に到達する。その結果、自然発火した砲はひとりでに砲弾を発射した。同時に、艦内の砲弾もいくつか燃えだした。午前1時、すでに艦が5時間も燃え続け、カープファンガー提督が誓いを守って最後の者として艦内に残っていた時、甲板下の火災が火薬庫に及び、遂にそれを爆破した。中央で割れた艦体の後部は吹き飛び、前部は側面を底にして沈み始める。破片は高所から降り注いだ。この事故は65名の死亡者を出した。兵員22名、船員42名とカープファンガー提督が犠牲となったのである。彼の遺体は1683年10月11日、カディス港内であるイングランド船の錨索の付近に浮かんでいる所を発見された。カープファンガーは葬儀の際、港内に在泊していた各国の船から相応の哀悼を捧げられた。同時代の記録によれば、弔砲は300発を数えたという。