本エピソードはクリフハンガーで終了したため、モルダーは本当に死んでしまったのかという点に注目が集まることとなった。『ウォール・ストリート・ジャーナル』や『ザ・ニューヨーカー』でも特集が組まれるほどの注目が集まったのである。カーターは「「ゲッセマネ」全体のストーリーラインは政府によるでっち上げを中心に回っていますが、後々大胆な真実が明かされるわけです。信念を失ったモルダーが自殺を選んでしまったと視聴者の皆さんが信じ込んだのは、私たちスタッフにとって実に驚くべきことです。」と語っている。UGOネットワークスは本エピソードを「テレビドラマ史上のシーズンファイナル傑作選」で21位に選出し、「シリーズ全体のミソロジーの核心をはっきりと打ち出したエピソード」と評した。『デン・オブ・ギーク』のジョン・ムーアは本エピソードを「シーズンファイナルとして最も傑出したものの一つ」「ファンの予想を見事に裏切った。」と絶賛している。また、ムーアはマイケル・クリッチュガウのキャラクター造型にも惜しみない賛辞を送っている。ラース・パーソンとロバート・シャーマンは「モルダーが自殺するほど幻滅するというのは、彼のキャラクター設定からして考えられない」と述べている。
1997年5月18日、FOXは本エピソードを初めてアメリカで放映し、1985万人の視聴者を獲得した。本エピソードは賛否両論となったが、肯定派の方が優勢であった。『シカゴ・サンタイムズ』のロン・グランケは「鮮やかなシーズンファイナルだった」と高く評価している。『シネファンタスティック』のポーラ・ヴィタリスは本エピソードに4つ星評価で2つ星を与えて、「情報をあまりにも隠し過ぎているので、1本のエピソードとして成立しているとは言い難い。」「「ゲッセマネ」の脚本にはかなりの曖昧さがあり、そのために俳優陣の演技がどうとでも解釈できるようなものになっている。」「俳優陣はそんな脚本に果敢に立ち向かった。」と述べている。『A.V.クラブ』のザック・ハンドルンは本エピソードにB+評価を下し、「幾つかの仮説をどれももっともらしく提示し、それもがあり得そうだと思わせようとしているが、5年間にもわたって続いているシリーズでそれをやるのはあまりにも困難である。」「クリッチュガウの説明が崩した陰謀の前提はほんの一部である。姿形を変えるバウンティハンターや治癒能力を持ったエイリアンはどう説明するのか。これらはエイリアンの実在を信じさせるのに十分であろう。」と述べている。ロバート・シャーマンとラース・パーソンは本エピソードに対して5つ星評価で4つ星を与え、「多くのものをやろうとしすぎている」と苦言を呈しつつも、「視聴者の心をぐっとつかもうとする熱意がある。」と評している。1999年の感謝祭に、FXは本エピソードと続く「帰還 Part.1&2」を「ミソロジー系エピソードのベスト」として特別に放送した。
山頂の洞窟でのシーンを撮影するために、倉庫を借り切ってセットが組み上げられた。その倉庫はかつて冷凍庫として使用されていたものだった。セットの建設にはトラック数台分の資材と930平方メートルのスタイロフォームが使用された。このセットは『X-ファイル』で使用されたセットの中で最も高額なセットのひとつであった。セットの装飾には本物の雪と氷が使用されたため、倉庫内の温度を氷点下29度以下に保つ必要があった。その寒さの中では俳優の息も白くなるため、俳優たちはよりリアルな環境で演技をすることができた。また、山頂でのシーンはバンクーバー近郊のシーモア山で撮影されたのだが、山の天候が思わしくなかったため、予定を延長して撮影を行う必要があった。本エピソードの製作はドゥカヴニーの結婚式の1週間前に行われたので、彼の結婚相手であったティア・レオーニがセットを訪れるというサプライズがあった。厳しい撮影の末に出来上がったファースト・カットは長すぎるものであったため、12分ほど削る必要があった。カーター自ら山頂でのシーンの幾つかを削る決断を下したが、完成版が出来上がったのは放送の2日前であった。カーターは本エピソードを「大きなアイデアがあるエピソード」と評しており、「主な関心は神の存在について議論することであった」と語っている。また、マイケル・クリッチュガウの名前はアンダーソンが以前師事していた演劇のコーチの名前から取られたものである。
吉村 真事（よしむら まこと、1928年3月31日 - 2004年1月8日）は、自由民主党参議院議員（1期）。
立命館大学では近年、オリター・エンターによる不祥事が多発している。産業社会学部でのオリターに相当する「エンター」は、2017年、担当した基礎演習のクラス内で「学部として見過ごすことのできない」（教授会）ほどの内容を含むアンケートを1回生（1年生）に対して実施していたことが発覚した。例えば「性的な表現や人をさげすむような表現が用いられ、それに当てはまる人の名前を挙げさせるなどの問題」「合宿では任意の男女に「告白」を演じさせるシチュエーションゲーム」など、「ハラスメントを惹起する不適切な活動」であると同学部教授会から糾弾された。これについては、新入生本人に対するアンケート実施や問題のアンケートの画像流出によりかなり確証の高い事実が確認されたと見られる。これを受け、同学部教授会は、①エンター団の2017年度基礎演習およびサブゼミアワーへの参加を禁止、②前期の基礎演習のクラス合宿を一律中止、③2017年度前期のサブゼミアワーについては、基礎演習の延長、成果に関わる教員学生間の指導・相談のみ利用を許可、④基礎演習のクラスを単位として形成されているLINE等のSNS上のグループからエンターが脱退することを強く求める　という強い措置を行うと共に、1回生（1年生）を通して同じクラスで行っていた基礎演習クラスの後期からのクラス替えという異例の措置を行った。2017年度の立命館大学は、他の学部のオリター団からも未成年の飲酒運転、不適切な画像のTwitter投稿（性的なものを含む）、1回生女子に対するサブゼミ内でのセクハラ（スカートめくり）等の不祥事がTwitterを通して次々と明るみに出たこともあり（これらについては当事者または被害者によるTwitter投稿によるもののため詳細は未確認）、新入生・在校生・教員・保護者等の間で新入生支援のあり方が改めて議論されるきっかけにもなった。また、立命館大学ではこれらオリター制度を大学公認のものとしてかねてより支援しており、これらの不祥事を黙認してきた大学の責任も改めて問われている。