原産地エクアドルの公用語であるスペイン語ではペピーノのことをペピーノ・ドゥルセ（pepino dulce）といい、「ペピーノ」は「キュウリ」、「ドゥルセ」は「甘い」という意味である。また、英語では、melon pear, pear melon, melonshrub, sweet cucumberとも呼ばれる。いずれも、ペピーノの味や香りがキュウリやメロン、ナシに似ていることから名づけられた。
もっとも代表的なピラミッドであるギザのピラミッドが明確に四角錐の形状をしているため、「ピラミッド」は四角錐または三角形のものの代名詞となっている。例えば上部がとがって下部に向かって広がっていく形状のものや四角錐のものは「ピラミッド型」と呼ばれる。ヒエラルキーは、上部に少数の支配層や強者が位置し、下部に行くにしたがって数を増していく被支配層や弱者が位置する階層構造が三角形をなしているため、「ピラミッド型構造」と呼ばれる。自然界の生物量も食物連鎖に従い同様の階層構造をしているため、生態ピラミッドという言葉で呼ばれる。
たびたび秘密結社として紹介されるフリーメイソンが作ったとする説がある（フリーメイソン#起源も参照）。これはフリーメイソンの起源の1つとして石工組合としての実務的メイソンリーが前身として中世に存在したとする説であり、フリーメイソンのシンボルの1つであるプロビデンスの目はピラミッドを想起させる三角形が使われており、事実、集会所でもあるロッジには「ピラミッド・ロッジ」や「スフィンクス・ロッジ」などエジプトやピラミッドにちなんだ名前がつけられている。古代エジプトにフリーメイソンが存在した証拠は発見されていなかったが、近年フリーメイソンのロッジを思わせる集落が発見されたらしい。また、参入儀式はエジプト神話のオシリスとイシスの伝説に基づいて行われる。
永久3年（1115年）、左大臣 源俊房の子で醍醐寺14代座主勝覚が灌頂院（かんじょういん）として開き、後に仏教の三宝にちなんで現在の名に改めた。康治2年（1143年）に鳥羽上皇の御願寺となっている。勝覚が村上源氏の出身であったことから、初期には代々源氏の寺院とみなされていた。　鎌倉から南北朝時代にかけて、成賢（7世）・憲深（11世）・定済（13世）・賢俊（21世）と高僧を輩出し、足利尊氏から厚く保護された。成賢は朝廷や鎌倉幕府の信任が厚く多くの弟子を育成したが、亡くなった後に弟子の道教が三宝院、同じく弟子の憲深が極楽房（後の報恩院）を継承した。ところが、道教が急死したことから、朝廷では三宝院の再建のために憲深を三宝院門跡に任じた。このため、憲深と亡くなった道教の弟子が対立した。だが、火災によって三宝院は焼失してしまい、三宝院を再建したのは憲深の弟子の定済であった。だが、憲深の他の弟子達もこれに反発したために、三宝院の後継を巡る争いが続いたが、定済の流れを汲む賢俊が足利尊氏の庇護を背景に三宝院のみならず報恩院・理性院・金剛王院も支配下に置いて他派を圧倒した。賢俊の没後、三宝院の急激な台頭に対する醍醐寺内部を含む内外の反発の動きを受けて光済（22世）が配流されるなどの苦難を受けるが、応安7年/文中3年（1374年）になって足利義満が光助（23世）を室町幕府の祈祷を行う武家護持僧の管領役に任じたことから幕府の中でも特別な扱いを受けた。反面、これが室町幕府による三宝院人事への介入の名目となり、定忠（24世）は足利義満の不興を買って醍醐寺を追放されて三宝院門跡が一時空席となっている。満済（25世）は「黒衣の宰相」とも呼ばれ、応永3年（1396年）に足利義満の猶子となって醍醐寺座主に任じられ、続いて准三后となり、後には足利義教の室町幕府将軍擁立にも活躍するなどした。以後、歴代院主が醍醐寺座主を兼ねる慣例が成立する。また、古くから醍醐寺は真言宗系の修験の中心であったが、この頃から三宝院が真言宗系の修験者・山伏の取締にあたるようになる。また、貴種出身の門跡で諸事情によって先に門跡の継承が決定した者であっても、伝法灌頂に必要な四度加行（十八道法・金剛界法・胎蔵界法・護摩法）を全て完成させなければ、伝法灌頂を受けて正式な門跡にはなれないという原則が厳守されていたことも三宝院が重んじられた一因になったと考えられている。応仁の乱で三宝院が焼失し廃寺同然となるが、安土桃山時代に醍醐寺金剛輪院の院主であった義演は豊臣秀吉の信頼が厚かったため、同院を中心に有名な「醍醐の花見」が開かれた。義演は准三后となり、秀吉の許可を得て三宝院32世を名乗り、金剛輪院を三宝院と改称した。桜で有名な醍醐寺三宝院庭園はその時期に整備された。義演は徳川家康からも信任を受け、江戸時代初期の天台宗系修験道である本山派本山の聖護院との相論では江戸幕府の支援を受けて、慶長18年（1613年）に修験道法度が制定された。明治4年（1871年）、廃仏毀釈の影響で門跡号を差し止められるが、14年後に復称する。現在では、真言宗醍醐派総本山として宗務庁、醍醐寺の寺務所が三宝院内に設置され、醍醐派管長・醍醐寺座主・三宝院門跡の三職兼務が定められており、仲田順和が在任している。