八郎の出身地である清川に、正四位の追贈を機に昭和8年（1933年）に清河神社が創建された。また昭和37年（1962年）には神社境内の一角に清河八郎記念館が開館。八郎の書簡など遺品を展示している。
倒幕運動を続けるため、京に潜伏したり諸国を回り、田中河内介に続いて九州遊説に入った。筑後国の水田天満宮に蟄居中の真木保臣の下にも滞在し、福岡藩士の平野国臣、小郡、肥後の尊皇攘夷派とも接触。その戦略は薩摩藩の率兵上京に期待を寄せるものであり、薩摩は立つと諸国を遊説したが、小松清廉は一切の言質を与えていない。『近世日本国民史』では京都に参集した尊皇攘夷派は、清河の空想的政局論により集められた一面があるとしている。その後、山岡鉄舟らを通して松平春嶽（幕府政事総裁職）に急務三策（1. 攘夷の断行、2. 大赦の発令、3. 天下の英材の教育）を上書する。尊攘志士に手を焼いていた幕府はこれを採用し、松平忠敏のもとに浪士組結成が許可された（234名）。上手く幕府を出し抜いて、今度は佐幕派を京に集め出した。文久3年（1863年）2月23日、将軍・徳川家茂上洛の際、その前衛として浪士組を率い京へ出発。到着した夜に浪士を壬生の新徳寺に集め、本当の目的は将軍警護でなく尊王攘夷の先鋒にあると述べる。鵜殿鳩翁が浪士組隊士の殿内義雄・家里次郎の両名に、京に残留することを希望する者の取りまとめを依頼し、攘夷に反対した根岸友山・芹沢鴨・近藤勇・土方歳三らが残留、袂を分かった。翌日、200名の手勢を率い朝廷に建白書の上申を願い出で、幸運にも受理された。このような浪士組の動静に不安を抱いた幕府は、浪士組を江戸へ呼び戻す。江戸に戻ったあと浪士組を動かそうとするが、京都で完全に幕府と対立していたため狙われていた。同年4月13日、幕府の刺客、佐々木只三郎・窪田泉太郎など6名によって麻布赤羽橋（現麻布十番商店街そば）で首を討たれた。享年34。『女士道』（山岡英子　1903年）の記述によると首は石坂周造が取り戻し、山岡英子（山岡鉄舟の妻）が保管し伝通院に葬ったが後に遺族に渡したという。墓所は東京文京区の伝通院にある。死後、幕府は浪士組を新徴組と改名し、庄内藩預かりとした。明治41年（1908年）、特旨により正四位を贈位された。
代表者は、長谷川町子本人が務め、営業担当は町子の姉の長谷川毬子と町子の妹の長谷川洋子が務めた。父の死で一家で上京し、田河水泡に師事して漫画家デビューした町子は、1946年、疎開先の福岡市で「サザエさん」の連載を福岡の地方紙『夕刊フクニチ』で開始した。翌年の1947年、福岡から東京に戻ったばかりの町子の作品を大手出版社に頼らず、自費出版としての形で毬子らと共に『姉妹出版』として設立した。自費出版の資金は、父が建てた福岡の自宅の土地・建物を担保として捻出した。同年、『サザエさん』の単行本第1巻を出版した。当初のサイズはB5判の横綴じという形だったが、書店の店頭に並べにくいとの理由から返品され、姉妹出版は当時の日本出版配給から出入り禁止の処分を受けた。その後、長谷川の自宅は返品された第1巻に占拠される事態となった。長谷川姉妹の実母の薦めで第2巻からB6判にサイズを変更した際、読者に好評だったこともあり、B5判の第1巻は店頭に置かれることが許された。以降、「サザエさん」の第1巻はB6判に改訂されて再出版され、全68巻出版された。また、『いじわるばあさん』（全6巻）他の長谷川町子作品もB6判で出版された。但し、『よりぬきサザエさん』や『サザエさんうちあけ話』、『サザエさん旅あるき』はA5判サイズで出版された。『サザエさんうちあけ話』によれば、『サザエさん』の出版が軌道に乗ると、大手出版社から、宣伝や装丁などのノウハウのある自社に任せてもらえれば更に売り上げを伸ばせるという打診を受け、毬子は一時検討するが、どうしても出したいが他で扱ってくれない作品が将来できた時のために姉妹社での『サザエさん』の出版を続けたほうが良いのではとの考えに至った。一方、「将来どうしても出したい作品ができるかもしれない」当人の町子自身はそのあたり無頓着であり、姉の考えに任せていた。1992年5月27日に長谷川町子が逝去。翌年の1993年4月、町子の死と毬子の高齢などの理由により「姉妹社」は日本出版販売に廃業届を出して解散となり、著書は全て絶版となった。町子が残した作品の著作権管理は、長谷川町子美術館に移管された。これにより、1969年から現在まで続いているアニメ版『サザエさん』のコピーライトのクレジット表記も「©姉妹社」から「©(財)長谷川町子美術館」（現在は「(財)」の部分を割愛）に変更された。また、1994年から、「サザエさん」など姉妹社が取り扱った町子の作品が朝日新聞社から文庫本として再版されている。単行本の裏表紙に表示された姉妹社のシンボルマークは、道路標識をモチーフにした木板に「SSS」と記された「スリーエスマーク」であった。これは、毬子・町子・洋子の長谷川三姉妹を表すものであった。姉妹社の「社」の字も単行本の裏表紙では部首が「示」になっている。