チームメイトのヒュルケンベルグはルノーへの移籍を発表、エステバン・オコンがマノーGPから移籍。バーレーンGPでは予選17番手スタートから7位に入賞を果たし、スペインGPではシーズン最高位となる4位入賞を飾るなど開幕戦から入賞を続け昨年以上に好調な出だしを見せた。カナダGP終了時点では37戦連続完走を果たしニック・ハイドフェルドの持つ連続完走記録まであと4とせまっていたが、優勝の可能性もあったアゼルバイジャンGPでは、オコンとの同士討ちが原因でリタイアを喫し連続完走記録が途切れた。さらにベルギーGPでも再び同士討ちでリタイア（17位完走扱い）となり、チームが「今後はチームオーダーでコントロールする」と発言する事態となった。最終的に表彰台はなかったが、この年もトップ3チームのドライバー6名に次ぐランキング7位で、この6人を除いたドライバーではただ1人、100ポイントを獲得。前年よりも1ポイント減っているがレース自体も1戦減っているため成績自体はわずかながらに向上したといえるシーズンとなった。
堅実で力強いアピールが功を奏し、モナコGPでは3位表彰台を獲得。さらにヨーロッパGPでも予選2位となりペナルティで7番手スタートなるが、決勝では順位を上げファイナルラップでフェラーリのライコネンをオーバーテイクして3位を獲得。前年よりもさらに進歩したドライビングを示している。ブラジルGPではマックス・フェルスタッペンに抜かれるまで3位を走行しており最終的に4位入賞。ドイツGP以降は全戦で入賞しており、この年のトップ3チーム（メルセデス・フェラーリ・レッドブル）を除いたチームのドライバーでは唯一、100ポイント以上を獲得しランキング7位となった。またこの年、自身2度目となる全戦完走を達成している（ただしオーストリアGPは完走扱い）。F1での複数回年間全レース完走を達成した最初のドライバーとなった。中盤には2017年にフェラーリへ移籍するという噂も囁かれたが、最終的にライコネンのフェラーリ残留が決定となり実現とはならなかった。その後もウィリアムズやルノーへの移籍も囁かれたが、マレーシアGP後に2017年もフォースインディアに残留することが発表された。
引き続きフォースインディアから参戦。新車開発が遅れ、昨年マシンとほとんど変わらない状態でシーズンに臨む苦しい幕開けとなった。序盤は棚ぼたで入賞出来るかどうかというような状況だったが、オーストリアGP(他メルセデスPU勢はカナダGPから導入)からの新PU導入や、イギリスGPでの大型アップデートの甲斐もあって上位を争うようになった。ロシアGPではセーフティカー導入のタイミングでピットインし、最終ラップで前にいたボッタスとキミ・ライコネンが接触し、3位表彰台を獲得した。その後も、アメリカGPで5位入賞。アブダビGPでは自己ベストタイの4番グリッド獲得から、5位入賞と後半戦は目覚ましい結果を残した。昨年のような荒いドライビングから一転して、リタイアはハンガリーGPの1回のみに留め安定した走りが目立った。ランキング9位で終え、ヒュルケンベルグを上回った。
2014年はフォースインディアより参戦。チームメイトはニコ・ヒュルケンベルグ。第3戦バーレーンGPでは、2年ぶりとなる3位表彰台を獲得した。第7戦カナダGPでも他車と異なる戦略で表彰台圏内を走行。しかし徐々にタイヤが厳しくなりオーバーテイクされていく形となる。そして最終周にペレスを抜いて行ったベッテルに続こうとしたマッサと1コーナーで接触し両車は大破しリタイアとなった。この事故でペレスは次戦5グリッド降格のペナルティを課せられた。しかし次戦のオーストリアGPはグリッド降格ペナルティがありながらも6位で入賞した。その後はマシンのパフォーマンスが下降していく中でも入賞を重ねたが、チームメイトのヒュルケンベルグに対してポイントで大きく遅れをとり、ランキング10位でシーズンを終えた。
適応説の一つが女性霊長類学者サラ・ブラファー・ハーディによって提唱された性選択説（性的対立説）である（Hrdy,1974）。ハヌマンラングールの場合で、前代の雄が負けて新しい雄がハーレムを所有することになった時点を考える。新しい雄にとっては、ハーレムの所有は永遠ではない。現実的には雄の群れ占有期間は平均で2年程度である。将来に他の雄に自分が負けるまでに、できるだけ早く、より多くの自分の子を雌に産ませなければならない。ところが、雌は乳児を持っている間は発情しないから、そのままでは群れを守りながら子供が独り立ちするまで待たなければ、自分の子を産ませることができない。しかも、その場合に自分が守ってやる子は自分の遺伝子を引き継いでいないから、雄にとっては全く（進化的、適応的な）利益がない。そこで、群れを手に入れてすぐに乳児を殺してしまえば、雌は発情が可能になるから、自分の子を持つまでの時間を大幅に短縮できる。つまり、新しい群れの雄にとっては、乳児を殺してしまうことは雄が支払った投資（先代雄と戦った苦労や、今後当分の群れを維持防衛するためのエネルギーなど）に対する利潤（自分の遺伝子を受け継ぐ子の獲得）を非常に大きくする、すぐれて適応的な行動と言える。もちろんオスが投資と利潤を理解している必要はない。様々な繁殖戦略の中で、もっとも利潤を最大化する戦略が進化的に発達すると言うことである。一方、雌にとっては仔を殺されるのは明らかに適応的ではない。そのため、ライオンなどでは群れの雌同士が協力して（ふつう群れの雌は近縁個体である）仔を隠したり守ったりすることがある。しかし多くの場合雄が思惑通り、子殺しを達成する。生き延びられるのは成熟目前の仔だけである。雄の思惑が達成されるのは、究極要因としては、子殺しによる雄の利益と（あるいは子殺しをしなかったときの雄の不利益と）仔を殺されることによる雌の不利益を比較した場合、前者の方が大きいからと推測されている。またこの行為から、雄と雌は必ずしも協力的であるのではなく、利害が対立することもあるのではないかと考えられるようになった。至近要因としては雌が雄に抵抗すると体格差からして雌が負傷、あるいは死亡する危険があることを指摘し、そのためにそのような行動が進化しなかったと考えられている（伊藤、2006）。なお、ハヌマンラングールはインドから東の地域にも分布するが、その地域では、雄は単独でハーレムを維持するのではなく、雌の群れに複数の雄がつく。その地域では上記のような子殺しの行動は見られないという。このような子殺しの行動は、単独の雄と複数の雌でハーレムを形成するタイプの動物特有のものと考えられている。またチンパンジーにも子殺しが見られるが、チンパンジーは乱婚性でオスにとってはどの子が自分の血を引いていないか明確ではない。チンパンジーの子殺しの意義は不明である。