ウラル語学者の小泉保は著書『縄文語の発見』において、異なる発音をもつ「裏日本縄文語」と「九州縄文語」の母音体系が「弥生人」によって統合されて上代特殊仮名遣が誕生したという、従来とは全く異なる説を提唱した。
1981年には森博達が「唐代北方音と上代日本語の母音評価」を発表した。森は『日本書紀』のうちの一部（α群と称する）は日本の漢字音ではなく当時の中国語音を使って表記されていると考え、唐代北方音と切韻を利用した具体的音価の推定を試みた。森の推定では甲類は現在の母音と同様で、イ段乙類は母音 /ï/、オ段乙類は /ə/ を持ち、エ段乙類は二重母音 /əi/ であるとした。したがって二重母音を除くと7母音になる。森説に対しては、中国語音韻論の専門家である平山久雄との間に「森博達氏の日本書紀α群原音依拠説について」「平山久雄氏に答え再び日本書紀α群原音依拠説を論証す」「森博達氏の日本書紀α群原音依拠説について、再論」という論争が『国語学』誌上で行われている。
ローランド・A・ランゲは、『万葉集』の一部の万葉仮名に使われている漢字を中国中古音によって検討し、甲類・乙類の区別はわたり音の有無によるものと結論づけた。すなわちイ段甲 i：乙 wi、エ段甲 ye：乙 e、オ段甲 wo：乙 o とした。
服部四郎は、奄美大島の諸鈍方言の中にオ段甲類・乙類の区別に対応する区別が存在していると主張し、それを元にオ甲類を [ɔ]・オ乙類を [ɵ] (=ö) と推定した。音韻的にはキ甲 /kji/・キ乙 /ki/・ケ甲 /kje/・ケ乙 /ke/・コ甲 /ko/・コ乙 /kö/ と解釈した。服部はキの甲乙の区別についても琉球語に痕跡が残っているかもしれないという。上代特殊仮名遣と琉球語の関係には例外が多く、また甲類・乙類の区別とは無関係に二次的に発達したものという意見も強いが、服部四郎以降も多くの研究が続けられている。
金田一京助は、甲類を i, e, o と、乙類を ï, ë, ö と表記する音標記号上の書き分けを初めて行い、その後の各種の論考において、ウムラウト（トレマ）は乙種母音を示すラテン文字または音標記号として広く用いられることになる。
橋本・有坂らによるこれらの研究により上代特殊仮名遣は国語学における定説となった。当時の学界では『古事記』が後世に編纂された偽書であると言う説をとる者が少なからずいたが、『古事記』が他の古史古伝とは違って「上代特殊仮名遣」を有していること、しかも『日本書紀』編纂の時点では消滅していた古い使い分けであると思われる「モ」の使い分けを残していることが判明し、『古事記』が偽書ではなく実際に『日本書紀』より古い書物であることがほぼ確定した。また、いわゆる古史古伝の竹内文書などに使用されている神代文字も、「上代には8母音あったはずなのに、なぜか5母音のままで上代の仮名遣いに配慮していない」ということから、そうした仮名遣いの区別がなくなった後世の偽書として否定された。これに関連し橋本は1942年、第二次天津教弾圧事件裁判の際検察側の証人として出廷した。いわゆる古史古伝（の神代文字）信奉は現在も後を絶たないが、上代特殊仮名遣はそういったものを評価する際の主要な観点のひとつとなっている。
紀元前31年9月2日、アントニウス派およびプトレマイオス朝の連合軍と、オクタウィアヌスが率いるローマ軍が、ギリシャ西岸のアクティウムで激突する（アクティウムの海戦）。この海戦の最中にクレオパトラ7世は戦場を離脱し、アントニウスもクレオパトラ7世の船を追って逃亡、ともにアレクサンドリアへ戻った。結局、アントニウス派およびプトレマイオス朝の連合軍は、追跡してきたオクタウィアヌス軍に敗北を喫する。アントニウスは部下を置き去りにし、女を追って戦場を後にしたと嘲笑されることになった。帰国したクレオパトラ7世はオクタウィアヌスとの外交交渉を試みるものの、条件面などで折り合いがつかず失敗に終わった。この結果、カエサリオンを国外へ逃がすことを決意し、実行に移した。しかし、ローマ軍はアレクサンドリアにまで到達し、アントニウスは残存する全軍を率いて決戦を挑むが、海軍の寝返りなどで失敗した。そして、紀元前30年8月1日、アントニウスはクレオパトラ7世が自分を裏切ったと思い込んでいたところに届けられたクレオパトラ7世死去の報告（ただし、これは誤報）に接して自殺を図る。それを知ったクレオパトラ7世の指示により、アントニウスは瀕死の状態でクレオパトラ7世のところにつれてこられたが、息を引き取った。8月29日、オクタウィアヌスは捕虜となったクレオパトラ7世が自殺することを警戒し、厳重な監視下に置いていたが、クレオパトラ7世自身はオクタウィアヌスに屈することを拒んで自殺した。贈答品のイチジクに忍ばせていたコブラに身体（乳房か腕）を噛ませて自殺したとも伝えられている。オクタウィアヌスは彼女の「アントニウスと共に葬られたい」との遺言を聞き入れた。エジプトを征服したオクタウィアヌスは、紀元前30年、「カエサルの後継者」となる可能性があったカエサリオンを呼び戻して殺害し、プトレマイオス朝を滅ぼした。そして、エジプトをローマに編入して皇帝直轄地（アエギュプトゥス）とした。しかし、クレオパトラがアントニウスともうけていた3人の子供たちは、オクタウィアヌスの姉にしてアントニウスの前妻であるオクタウィアに預けられ、養育された。