台車は阪神初のモノリンク式ボルスタレス台車である住友金属工業（現・日本製鉄）製SS-144を採用、くら型軸受の採用により整備が容易になった。また、車輪径は従来のジェットカー標準の762mmから急行系車両と同様の860mmとなった。主電動機は東洋電機製造製のTDK-6145-A（出力110kW）を搭載し、駆動方式はTDカルダン方式である。制御装置は阪神初のVVVFインバータ制御を採用、三菱電機製MAP-118-15V55を5601形に搭載した。加減速度は従来のジェットカーの起動加速度4.5km/h/s、減速度5.0km/h/sから0.5km/h/sずつ下げられ、起動加速度4.0km/h/s、減速度4.5km/h/sとなった。VVVFインバータ制御の採用で乗り心地も滑らかになったほか、中高速域の加速性能の向上で従来通りの運行ダイヤが維持可能な性能となっている。サービス電源を供給する静止形インバータ (SIV) は東芝製のINV094-HOを、電動空気圧縮機 (CP) はC-2000-MLを5501形に搭載している。連結器は5501形の運転台側がバンドン式密着連結器、5601形同士のユニット端部が廻り子式密着連結器、ユニット中間部が棒連結器である。併せて5601形奇数車神戸方および偶数車大阪方には簡易運転台を設置して工場入場時の構内入換に配慮している。
外部塗色は36年ぶりに変更が行われた。従来は旧来の上部クリーム、下部マリンブルーであったが、「震災を乗り越えて新たに出発する」との願いを込めて、上部をアレグロブルー（空色）、下部をシルキーグレイ（淡灰）のパステル調の新塗装が採用された。この塗装は8000系8233で実施された3種類の試験塗装のうちの1案が基となっている。2001年に登場した急行系車両の9300系にも、5500系に対を成す新塗装として上部「プレストオレンジ」下部「シルキーベージュ」が採用された。
車体外観は基本的に8000系のタイプIV後期製造車を踏襲しており、普通鋼製で19m級の3扉車である。側面窓は客用扉間の4か所（3連窓の両端側）が開閉可能となっているほかは全て固定窓となっている。前面は8000系の額縁スタイルから変更されており、窓にはHゴムが復活し、貫通扉と前照灯の周りがブラックフェイス化されている。前面下部の尾灯は埋め込み式のLED式となった。床面高さは従来車より40mm下げられ、車体断面の変更により屋根の丸みがきつくなった。屋根材はステンレスとなり、長手方向にビードが入っている。冷房装置はセミ集中式のCU703（21.000kcal）を1両に2台搭載する。5601形の大阪方には下枠交差式のパンタグラフを搭載している。座席はバケットタイプのロングシートで、電光式路線図と電光掲示板を一体化した車内案内表示装置、フットライン入りの床、車椅子スペースを設置するが、ドアには開閉予告ブザーが新たに設置された。運転台は阪神初となるデスク型を採用、2ハンドル式で前後動作式（水平回転軸）の主幹制御器と左右回転動作式（鉛直回転軸）のブレーキ設定器から構成される。
ユリアが、アメリカ海洋大気庁によって録音されたのは、1999年3月1日のことである。アメリカ海洋大気庁の発表によれば、この音の発生原因は不明とのこと。しかしながら、SOSUS（水中マイク）で、完全に感知できるほどの十分な強さを持った音（つまり、間違い無く存在した音）であるとも発表している。この音は、約15秒間に渡って継続した。
2013年1月、Google マップが更新され、北朝鮮の様々な施設が見られるようになった。2013年2月4日、韓国国防省は一部の坑道構造図と思われる写真を公開した。この写真によれば、坑道の長さは1キロメートルに上り、放射線の漏出を防ぐための遮蔽壁が9箇所にあるという。2013年4月8日、韓国軍は豊渓里周辺での活動を監視し、4度目の実験準備が進行しているのではないかという推測を立てた。後に、この活動は長期活動によるものではないかと考えられるようになり、すぐさまの実験はないだろうと結論付けられた。2016年1月6日、平壌放送は、2013年から準備していた場所で水爆実験を行ったと公表した。当初は、観測された爆発の規模から水爆ではないという疑いを日米は持っていたが、その後の解析から、実験場所が当初想定の2倍深いところにあることが判明し、水爆の部品が一部だけ作動した失敗の疑いが持たれている。2017年1月と4月には、38ノース提供の衛星写真から活動が示唆され、同年9月3日に実験があった。中国地震局は、この核実験の10分後に、豊渓里核実験場付近でマグニチュード4.6・震源の深さ0キロメートルの地震を観測しており、周辺の地盤が陥没した可能性を指摘している。また、『サウスチャイナ・モーニング・ポスト』は同年9月4日付の紙面にて、これ以上の核実験は山体自体の崩壊を招き、放射性物質の拡散が懸念されるとした、中国の専門家の意見を掲載した。このような懸念は同年9月20日に北京で開催された中朝の地質学者の会合にて中国側から北朝鮮側に伝えられたと報じられている。2017年10月31日、テレビ朝日が、北朝鮮消息筋の情報として同年9月、核実験後の地下坑道で大規模な崩落事故が起き、200人余りが死亡した可能性があると報道した。これに対して同年11月2日、朝鮮中央通信は、実験場の崩落報道が虚偽であると反論。日本当局がテレビ朝日に、虚偽報道・謀略報道をさせたとして批判した。この北朝鮮の核実験 (2017年9月)により、万塔山で地表部のずれや沈下が発生したとの分析が、米科学誌『サイエンス』2018年5月10日付に掲載された。2018年1月に『毎日新聞』が、豊渓里周辺で放射線被曝によるとみられる健康被害が発生しており、当該地域からの脱北者に染色体異常が確認されたと報道した。2018年4月20日に開催された朝鮮労働党中央委員会第7期第3回総会で豊渓里核実験場の廃棄が決定された。2018年5月に北朝鮮はアメリカのメディアに核実験場での取材には1人当たり1万ドル(110万円)を支払うことを要求した。5月24日には、残りの坑道、施設を爆破した