マイヤーによって1942年に提案された、生物学では最も一般に用いられている種の概念。この定義では、同地域に分布する生物集団が自然条件下で交配し、子孫を残すならば、それは同一の種とみなす。しかし、同地域に分布しても、遺伝子の交流がなされず、子孫を残さない（＝生殖的隔離が完了している）ならば、異なる種とされる。たとえば、ヒョウとライオンを強制的に交雑することによってレオポンと呼ばれる雑種が生まれるが、レオポンはほとんど繁殖力を持たない。よって、ヒョウとライオンは同一の種ではない。ラバ（ロバとウマ）についても同様である。それぞれの生物集団が異なる地域に属していたり、違う時代に属している場合、生殖的隔離の検証が出来ないため、その生物の形態の比較、集団レベルでの交配および受精の可能性の検証、雑種の妊性（稔性）の確認を通じて、同一の種であるかが検討される。ただし雑種が全て生殖能力に劣るわけではない。特に、植物では従来の見解では異種であった個体群を交配させて園芸品種を作ることは頻繁に行われている。このようなときは、この定義を厳密に当てはめた場合種ではなく亜種として分類しなおすことになる。野生下での交配可能性のみを問題にする立場からしても、イヌ属やカモ属、キジ属などの場合は亜種として扱うことになる。生物学的種を普遍的なものとして扱いたい場合に最も根本的な問題となるのは交配せず無性生殖のみを行う生物である。この定義を適用すれば全ての個体の系統が異なる種に分類されることになり、現実的ではない。はるか昔に絶滅した種を扱う古生物学にも適用できない。また実際的な問題として、無数の生物の組み合わせ全てで実際に交配が行われるかどうかを確認するのは不可能である。さらに輪状種の存在は生物学的種に困難をもたらす。輪状種とは近接して生息する個体群AとB、BとCが交配可能であるが、離れて生息する個体群AとCの間に生殖的隔離が存在する亜種の混合個体群のことである。この場合AとCは生物学的に別種であるが、AとB、BとCは定義上、同種である。全ての種は時間的には連続した存在だが、輪状種はそれを空間的に見ていると言うことができる。
様々な生物を分類するにあたって、外観や解剖学的特徴によって区別することは最も古くから行われてきた。生物の形態によって種を区別することを形態的種の概念と言う。形態的な差を種の同定の基準に用いることは分類が主観的になりすぎる問題がある。特に視覚的な基準を用いるのは人間の視覚が発達しているためでしかない。生物個体のどのような特徴を判断の基準とするかがあいまいである。また性的二型のような多型を別種と誤解する可能性がある。しかし、現在記載されている種のほとんどは形態的種で、特に化石生物は全て形態的種である。なお、このような分類では生殖器の構造、特に交接器の構造が重視される。これは生殖器の物理的な差異が配偶を困難にし、生殖的隔離をもたらす可能性が高いと推定できるためで、生物学的種の同定の基準となりうるからである。北アメリカでは複数種の同属のホタルがおり、それらは外見上は区別が困難であるが、それぞれの発光パターンが異なる。このパターンによる雌雄のやりとりで交尾が行われるので、種間の生殖隔離は成立している。このような生物は隠蔽種（英：cryptic species）と呼ばれ、形態によって区別することはできないから、他の概念を適用することでその存在が知られる。その場合でも、そこに種の違いが存在することを知った上で研究が行われれば、わずかの形態の違いで区別が可能となる場合もある。
以下にはよりなじみの深い真核生物の分類、より厳密に言えば動物を中心に成り立つ種分類上の留意点について記述する。ここには真核生物でも植物 (Plant)、菌類 (Fungi)、原生生物 (Protista) などでは成立しない定義も多く含まれている。上述した「有性生殖の役割」も植物、菌類、原生生物では成立しないケースがある。これらでは有性生殖がほとんど認められなかったり、交配できない不和合接合型（クローンや親子兄弟など同じもしくは近い型の間では有性生殖が成立しない）が認められたりする例が多数ある。このため「交配可能かどうか」は種の分類に使いにくい場面が多い。専門家の間で完全に同意を得られるような種の定義はない。つまり、生物の集団をどうとらえるかは、研究者・分類群・研究の目的によって異なり、全ての生物の分類に適用可能な種の概念は存在しないということである。
1929年、ギリシャ共和国アルタ県に生まれる。1951年にアテネ大学で神学を修めた後、2年半の軍務の傍ら、講師を務め、中高生向けに教理を教えた。1956年6月26日にレスボス島のレモノス修道院に修道請願し、その3日後に輔祭に叙聖された。1960年6月12日に司祭に叙聖され、次いで掌院に昇叙された。1965年には従軍司祭に従事した。1968年には、アテネ大主教座聖堂の主任司祭として従事する傍ら、アッティカのPapagou(Παπάγου)にある生神女庇護聖堂の主任司祭も兼任した。1975年11月に、志願して、当時ニュージーランド府主教区管轄下の韓国に赴き、積極的な牧会活動を行った。ソウルにしか拠点のなかった韓国正教会が全土に広まったのはこのときである。1982年には神学校を創設し、1996年には宣教のための財団を設け、教会の充実を図った。1993年にディオニシオス府主教の補佐としてゼラの主教に、次いで1995年に、韓国における総主教代理に叙聖された。また、韓国にとどまらず、アジア全域にわたる宣教活動を行い、1995年10月24日にはフィリピンの生神女福音大聖堂の基礎成聖式を行った。韓国でも、その宣教活動は認められ、2000年には、名誉市民の称号を受けた。2004年4月20日に、韓国府主教区がニュージーランド府主教区から分離独立し、初代の府主教に叙聖され、同年6月20日に着座した。また、2005年には、ニュージーランド府主教区2代目のイオシフ府主教の離任から3代目のアンフィロシオス府主教着座までの2ヶ月間、ニュージーランド府主教代行を務めた。2006年10月には、8月に成聖された平壌の至聖三者聖堂を訪問し、講演を行った。老衰のため、2008年に韓国府主教を離任。ピシディアの府主教という名義を与えられ（ピシディアに赴任している訳ではない）、加平郡にある加平救世主顕栄修道院で余生を送っている。