一時期、ハンデ制が導入され（この時期は得点制であったため）、過去の成績などを元にハンデを設定していた。そのため渡嘉敷は常に500点からのスタートであったが、優勝できなかった。この頃は、本編とは別にエンディングで早抜け方式の問題が1問出題されて、時間内に抜けられなかった生徒は放課後残されるという演出があった。まれに北野も解答に参加することがあり、「瞬間判断力テスト」で優勝したために、最終的に優勝してしまったことも一度あった。
北野復帰後も1994年秋以降の構成が継続された。1995年秋頃から1997年1月までは独創力テスト、ひらめきパズル等、クイズ形式のコーナーがメインになっていた。同時に「たけしおとし」は消滅した。主なコーナーは、早抜け形式の頭の体操「IQ早押し（後に回転力テストに変更）」、従来通り授業形式で行われる「北野ゼミ」、答えが複数ある問題が出題されて他の人（北野も含む）と被らない答えを書いていく「独創力テスト」、提示されたテーマに当てはまらない言葉が読み上げられたら目の前のえんぴつのオブジェを素早く奪取する「瞬間判断力テスト」（このコーナーは後に『ロンQ!ハイランド』でリメイクされた）、チームメイトがカズーで吹いた曲を当てる「音楽リレーテスト」、二つの値を3秒以内に比較する「等号・不等号テスト」、漢字のブロックを並べ替えて二文字熟語のしりとりを完成させる「漢字しりとり」、早書きクイズの「ひらめきパズル」などがある。また最大10点から200点（1996年4月の放送時間拡大時には400点）までに変更された（また逆に200点減点の大目玉を食らう生徒もいた。この体制はレギュラー終了まで続いた）。ラサール石井はオープニングに登場せず、10点の問題に正解したものの200点減点の大目玉を食らった。本人によると、本番前に「トイレの大きい方」に行っていて、ラサール不在のままオープニングが始まったという。
1995年3月4日の放送から北野が復帰し、タイトルが正式に『平成教育委員会』となった。この回の視聴率は35.6%（ビデオリサーチ 関東地区調べ）で、ビデオリサーチ「クイズ・ゲーム」部門の史上高視聴率番組・第6位に記録し、1990年代以降のクイズ番組では最高視聴率である。北野が復帰したこの回は番組開始からすぐにの登場ではなく、所ジョージが進行の下で進められ、番組後半部分に差し掛かった頃に北野が笑いをとるために扮装した姿で登場するという形であった、その翌週も所ジョージが進行を務め北野は解答者として参加する形式で、同年3月18日に晴れて先生へ復帰を果たした（同時に班別コース以外での成績優秀者などに与えられるものとして、たけしおとしが復活）。その翌週放送の春のスペシャルからは、のちの特番でも恒例の「給食」の時間が始まった。
ニューヨークのブロンクス区で生まれ、ミシガン大学でクラシック音楽を学んだ後、ニューヨークに戻ってアレンジャーやプロデューサーとして仕事を行うようになった。グリニッジ・ヴィレッジのフォーク・ミュージシャン達と旧交を温め1960年代前半はトム・パクストンやヴィンス・マーティン&フレッド・ニールなどの作品でベースを弾き、ストリングス編曲を引き受け実績を重ねた。1967年よりクリームのアルバムをプロデュースするようになり、また、アルバム『カラフル・クリーム』（1967年）収録曲「ストレンジ・ブルー」をエリック・クラプトン、それに妻のゲイル・コリンズと共作した。続く『クリームの素晴らしき世界』（1968年）、『グッバイ・クリーム』（1969年）ではプロデュースだけでなく様々な楽器の演奏でも貢献しており、『グッバイ・クリーム』の最後に収録された「ホワット・ア・ブリングダウン」ではジャック・ブルースの代わりにベースを弾いた。クリームとの仕事と並行して、パパラルディはヴァグランツというバンドの作品もプロデュースするがヒットには結びつかず、ヴァグランツのギタリストだったレスリー・ウェストのソロ・デビュー作『マウンテン』にプロデュース、ソングライティング、演奏で参加した。また、クリーム解散後にはジャック・ブルースのソロ・アルバム『ソングス・フォー・ア・テイラー』もプロデュースしている。そして、1969年にはウェストと共にマウンテンを結成し、7月にフィルモア・ウェストでライヴ・デビューした後、ウッドストック・フェスティバルにも出演した。マウンテンではベースの演奏、プロデュース、ソングライティングに加えて、一部の曲ではリード・ボーカルも担当した。マウンテンは1972年に一度解散し、その後パパラルディはベドラム（コージー・パウエルが在籍していたバンド）のアルバム『狂人どもの舞踏会』（原題：Bedlam）をプロデュースした。また、1973年にはマウンテンの再結成に参加するが、ライヴ・アルバムとスタジオ・アルバムを1作ずつリリースした後に再解散した。1975年8月、日本の5都市で開催された「第1回ワールド・ロック・フェスティヴァル」でジョー山中（元フラワー・トラベリン・バンド）と共演。その後、同フェスティヴァルに対バンとして出演したクリエイションをアメリカに招き、コラボレーション・アルバムの制作に入る。1976年4月5日にアルバム『クリエイション・ウィズ・フェリックス・パパラルディ』が発売され、同月には日本武道館と天王寺野外音楽堂でクリエイションとの共演ライヴも行って、武道館公演のライヴ録音は2007年にCD化された。また、『クリエイション・ウィズ・フェリックス・パパラルディ』のアメリカ盤は『Felix Pappalardi & Creation』というタイトルでA&Mレコードから発売され、6月にはクリエイションと共にアメリカ・ツアーを開始した。なお、クリエイションの次作『ピュア・エレクトリック・ソウル』（1977年）に収録された「See You in the Night and Leave You at Dawn」は、パパラルディに捧げられた曲である。1978年、パパラルディはコーキー・レイング（元マウンテン）、イアン・ハンター、ミック・ロンソンと共に新バンドを結成するが、正式なデビューには至らず、このバンドにより残された録音は、1999年にペット・ロック・レコードから発売された発掘音源集『The Secret Sessions』に収録された。1979年にはエリック・ゲイル、リチャード・ティー、チャック・レイニー、バーナード・パーディ等のセッション・ミュージシャンと共に制作したソロ・アルバム『ドント・ウォリー・マ』を発表し、このアルバムにはクリームの曲「サンシャイン・ラヴ」をファンクにアレンジしたカヴァーも収録された。