1994年、日本が出場を逃したワールドカップ・アメリカ大会でアジア勢は奮闘した。サウジアラビアはエースオワイランを中心に躍進。アジア勢として7大会振りのベスト16入りを果たす。土壇場で出場を決めた韓国も勝利を収めることはできなかったが、スペイン戦では試合終了5分前から2点差を追いつき、ドイツ戦でも3点ビハインドから1点差に追い上げ、前回大会全敗に終わったアジア勢の復活を印象付けた。1996年、U-23日本代表がアトランタ五輪アジア最終予選でサウジアラビアと対戦した際には、ハーフタイム中に選手の興奮を鎮めたり、リードした後半に効果的に時間を稼ぐなどドーハの悲劇の教訓が活かされ、28年ぶりの五輪出場が成し遂げられた。1998年のワールドカップ・フランス大会以降、アジア最終予選はホーム・アンド・アウェー方式で行われるようになった。日本は1997年のアジア最終予選でイランとの3位決定プレーオフに勝利してワールドカップ初出場を決めている（ジョホールバルの歓喜）。1994年大会出場を逃したいわゆる「ドーハ組」の中で、1998年大会の本戦メンバーに選ばれたのは中山雅史と井原正巳の2名のみだった。以後、日本は自国開催枠出場の2002年日韓大会を含め、2018年ロシア大会まで6大会連続でワールドカップ出場を果たしている。2011年、アジアカップ・カタール大会で日本代表は6試合中5試合をドーハで戦い、史上初となる4度目のアジア制覇を成し遂げ、「もうドーハは『悲劇の地』では無くなった」などと言われた。特に初戦のヨルダン戦では、敗色濃厚の後半ロスタイムにショートコーナーからヘディングで同点に追いつくという、まさに18年前の立場を逆にしたかのような試合展開であった。2013年、2014年ワールドカップ・ブラジル大会アジア最終予選においては、『日本がドーハの地でイラクとの最終戦に臨む』ことが話題となった（試合は1-0で日本が勝利）。2015年、アジアカップ・オーストラリア大会のグループD第2戦では、ドーハの悲劇にDFとして出場したラディ・シュナイシェルが指揮を執るイラクとブリズベンで対戦し、1-0で日本が勝利した。2016年、リオデジャネイロ五輪アジア最終予選を兼ね、ドーハでアジアU-23選手権が行われた。準決勝ではU-23日本代表がU-23イラク代表と対戦し、後半48分に決勝点を奪ってリオデジャネイロ五輪本大会出場を決めた。この世代の選手は「ドーハの悲劇」が起きた1993年かそれ以降に生まれた選手たちだった。手倉森誠監督は勝利後のインタビューで「日本サッカー界のことを思えば、ロスタイムで取るあたり歴史を逆転させた。いい勝ち方だなと思います」と述べた。
1998年に創設され、ノースイースト・リーグに加盟。モントリオール・エクスポズ傘下のマイナーチームでコーチを務めていたキャッシュ・ボーシャンが監督に就任。前期を1位、後期を2位で終え、プレーオフに進出。プレーオフではオールバニ・コロニー・ダイヤモンドドッグスに勝利し、創設1年目にして初の優勝を飾った。1999年、ノースイースト・リーグがノーザンリーグと合併したため、ノーザンリーグに加盟。前期1位、後期2位タイでプレーオフに進出。第1ステージのアレンタウン・アンバサダーズ戦で完勝し初の地区優勝を果たした。2年連続となるダイヤモンドドックスとのチャンピオンシップ・シリーズは1-3で敗れリーグ優勝を逃した。2000年は前期・後期4位と低迷し、プレーオフ進出を逃した。シーズン終了後にボーシャン監督が退任。ウォーターバリー・スピリットからジョージ・トサミス監督を招聘した。2001年は前期3位、後期2位という成績だったが勝率5割でシーズンを終えた。第1ステージのダイヤモンドドッグス戦は3タテし、チャンピオンシップ・シリーズではエルマイラ・パイオニアーズに3-2で勝利。ノーザンリーグ・チャンピオンシップ・シリーズでウィニペグ・ゴールドアイズに勝利し、ノーザンリーグでは初優勝を果たす。2002年はシーズン過去最多の62勝を挙げ、前期・後期ともに1位で終了し西地区優勝を果たす。プレーオフでは第1ステージでパイオニアーズに3-2で勝利。チャンピオン・シリーズでアディロンダック・ランバージャックスに3-2で勝利。ノーザンリーグ・チャンピオンシップ・シリーズでは3-1でゴールドアイズに勝利し2年連続で優勝を果たした。オフにトサミス監督がセントポール・セインツに移籍。その後ゲーリー・サウスショア・レイルキャッツのジョー・カルファピエトラ監督が就任。2003年には、ノースイースト・リーグが再び独立したため、そちらに加盟。前期・後期で1位通過し、地区優勝を果たすも、プレーオフ第1ステージでブロックトン・ロックスに3-2で敗れリーグ優勝を逃した。2004年は前年同様前期・後期1位で地区優勝を果たす。第1ステージでバンゴー・ランバージャックスに3-1で勝利。チャンピオン・シリーズではノースショア・スピリットに勝利し、3度目のリーグ優勝を果たした。2005年からカナディアン・アメリカン・リーグに加盟。前期2位・後期3位で5年ぶりにプレーオフ進出を逃した。2006年は前期を2位タイで終えたが、後期は失速し7位に転落。2年連続でプレーオフ進出を逃した。2007年は前期1位・後期10位の成績でリーグ加盟後初となるプレーオフ進出を果たすが、第1ステージのナシュア・プライドに2-3で敗退。2008年は前期4位・後期8位で再びプレーオフ進出を逃した。2009年は前期1位・後期3位でプレーオフ進出。しかし第1ステージのウースター・トルネードズに3タテされ敗退。2010年は前期5位・後期4位でプレーオフに進出するも、第1ステージでケベック・キャピタルズに3タテされ敗退。2011年は前期2位・後期1位でプレーオフ進出。第1ステージのピッツフィールド・コロニアルズ戦では3-0と完勝し、チャンピオン・シリーズに進出するもキャピタルズに1-3で敗北。2012年は前期・後期が撤廃され、59勝41敗でシーズン2位に。チャンピオン・シリーズでキャピタルズと対戦し、1-4で敗れた。