2015年のシーズン中に愛媛球団主催の小中学生向け「投力向上プロジェクト」でメイン講師を務めた縁で、愛媛球団の薬師神績から「愛媛県内の野球の底辺拡大に手を貸して欲しい」と打診された。2016年1月に、星企画株式会社（薬師神が経営する地元の広告会社）へ入社。「More Baseball Project プロジェクトリーダー」という肩書で、県内の小中学生が怪我をせずに野球を続けられるような取り組みや、協賛企業の募集を始めたと報じられた。同年5月には、愛媛と巨人3軍の定期交流戦をNHK松山放送局でテレビ中継した際に解説者として出演した。2016年に再婚した。2017年1月4日、オリックス・バファローズのコーチ就任に伴い退団した弓岡敬二郎の後任として愛媛の監督に就任することが発表された。監督初年度の前期は最下位であった。2018年と2019年の2年連続して後期優勝を達成したが、年間総合優勝を決めるリーグチャンピオンシップには2年続けて敗退した。
2012年2月22日、愛媛マンダリンパイレーツとの入団に合意。3月13日に入団会見が行われた。背番号は70。2013年、2014年とも10試合程度の登板であった。2014年はシーズン中に数度、契約解除（練習生への降格）と再契約を受けている。2015年は肩痛のため、シーズン開始直後の4月9日付で練習生に降格。公式戦への登板がないまま、10月27日に球団を通じて引退を発表した。
2009年5月15日に2年ぶりに昇格。5月24日の対北海道日本ハムファイターズ戦に2番手として登板し1回を0点に抑え、初ホールドを記録。以降は中継ぎとしてチームを支え、7月10日の対広島東洋カープ戦（ナゴヤドーム）で、2005年6月11日以来となる勝利を挙げた。この年は44試合の登板で15ホールド・防御率1点台と「復活」と呼ぶに相応しい結果を残した。2010年は調整の遅れなどから7月に一軍入りを果たしたが怪我で再降格。終盤に再昇格するがレギュラーシーズンは4試合の登板にとどまった。ポストシーズン（巨人とのクライマックスシリーズ、ロッテとの日本シリーズ）ではレギュラーシーズンを上回る計5試合に登板した。日本シリーズ第7戦では打ちこまれるなど期待に応えられず、チームも延長戦で勝ち越され日本一を逃した。2011年は30試合に登板し、1勝4敗・防御率2.65の成績だったが、10月19日に球団から戦力外通告を受けていたことが明らかになり、10月29日に球団から正式に発表された。その後も日本シリーズ終了までチームに帯同し、ヤクルトとのクライマックスシリーズとソフトバンクとの日本シリーズ、計3試合でリリーフ登板した。その後12球団合同トライアウトに参加。プロ野球珍プレー・好プレー大賞にて、9回裏･三塁線のバント処理で三塁へ送球するも無人だったため、三塁悪送球となり走者が生還しサヨナラ負けになったプレー（2011年4月20日、対東京ヤクルトスワローズ戦）で2011年度大賞を受賞した。
その後、同年11月17日に12球団合同トライアウトへ参加するも獲得球団は現れず、12月に浪人を決意。駒澤大学で翌年のトライアウトに向けてトレーニングを行ない、この間に膝の故障を完治させている。2008年10月1日、大学の先輩でもある森繁和一軍バッテリーチーフコーチ(当時)と連絡をとって中日ドラゴンズの入団テストを受験し合格。1年ぶりの現役復帰を果たした。
2005年4月9日の福岡ソフトバンクホークス戦（福岡ドーム）で移籍後初先発初勝利を挙げると、6月11日の対読売ジャイアンツ戦（東京ドーム）で勝利投手となったが、その後は自身も調子を崩して一軍での先発登板は自己最高の19試合だったが、2勝11敗と大きく負け越した。シーズン終了直前の対福岡ソフトバンクホークス戦で右膝靭帯を損傷し、オフに手術を受ける。2006年は手術の影響により一軍登板はなかった。2007年は2度先発登板したものの0勝2敗、防御率12.19と不振で、オフに球団から戦力外通告を受けた。
安徳即位直後の3月に1つの事件が発生している。それは、園城寺の大衆が延暦寺・興福寺の大衆に呼びかけて後白河・高倉両院を誘拐して寺院内に囲い込み、朝廷に対して後白河法皇や前関白基房の解放、そして平家討伐命令を要求しようとした。摂関政治の解体以後、太政官は最高意思決定機関としての機能を喪失し、安徳天皇も3歳であったことから後白河法皇・高倉上皇のどちらかが治天の君として院政を執る必要があった。その両院がいなくなれば朝廷は機能停止に陥るが、当時は「仏罰」の存在を武士達からも信じられていた時代であり、寺院の攻撃は一種の禁忌となっていた（鹿ケ谷の陰謀自体が、清盛への延暦寺攻撃命令に対する平氏側の報復とする説もある）。このため、公卿たちには要求を認めるしか選択肢は無くなるだろうという計画であった。実際に興福寺は同意、親平氏派が多い延暦寺でも反平氏派の恵光房珍慶の集団が参加の意思を示した。決行日を高倉上皇が厳島行幸に向かう3月17日と決定したが、前代未聞の計画であったため、興福寺の使者が鳥羽殿幽閉中の後白河法皇に打ち明けたところ、驚いた後白河法皇が平宗盛に事の次第を告げたために、高倉上皇の出発日が19日に変更されて失敗に終わった。だが、これを機に高倉上皇と清盛の間で後白河法皇の安全を理由に幽閉場所を鳥羽殿から京都市中へ移動させることについて協議された。5月14日の深夜、後白河法皇は鳥羽殿から八条坊門烏丸邸に遷った（『百錬抄』は藤原俊盛邸、『玉葉』は藤原季能邸とする）。引き続き高倉上皇が院政を執ることになったものの、幽閉生活から解放されることになった。以仁王が園城寺や興福寺を頼りにした背景にはこの出来事の存在が背景にあったと思われる。