ノースカロライナ、サウスカロライナおよびジョージアの各邦がグリーンに土地と金、さらにバムバーグ郡のエディストの南に“ブーンズバロニー”(Boone's Barony) という農園を提供することを可決した。彼はこれを売って南部軍の兵士の給費に当てた。陸軍長官の職を2度断り、1785年、グリーンはサバンナの14マイル (22 km) 北、“マルベリーグローブ”という農園に落ち着いた。彼は1786年6月19日この農園で熱中症のために44歳で死去した。グリーンは著しく有能であり、他の大陸軍で功績をあげた将軍達と同様、自制の効く軍人だった。彼は大陸軍の将校の中で軍事的能力ではワシントンに次ぎ、ワシントンとヘンリー・ノックス以外では独立戦争の8年間を戦い抜いた唯一の将軍である。ワシントン同様、彼は小さなことでも大きな利点に変える能力があった。彼のイギリス軍に対する姿勢は人間性が溢れ親切でさえあった。彼は、繰り返し彼のことを誹謗していたゲイツが南部戦線での失態を批判された時は、ゲイツを弁護する寛大さがあった。
南部の軍隊は弱く装備も悪く、コーンウォリスの優秀な部隊の脅威に曝されていた。グリーンは部隊を分割してイギリス軍も分割されるように仕向け、部隊間の戦略的な相互作用を生み出すように画策した。この戦略で1781年1月17日、ダニエル・モーガンが指揮したカウペンスの戦いでは、イギリス軍のほぼ90%を倒すか捕虜にすることができた。800人以上の捕虜とともに、モーガンは北のサリスベリーに向けて戦略的撤退を開始し、カトーバ川のコーワンズフォードにいたグリーンと合流した。そこでは愛国者民兵の部隊がコーンウォリスの軍隊と小さな戦闘を行っていた。グリーンはフーガーにギルフォード郡庁舎に部隊を動かすよう命じた。2月9日、ギルフォードに到着すると、グリーンは主だった士官による作戦会議にその下の士官も招集し、今後の戦いをどのように続けるべきかを問うた。評決によって、当面撤退を続けさらに兵力を高めるべきであるとし、コーンウォリスとの対決は引き伸ばすことになった。翌10日、彼はパトリック・ヘンリーに軍隊を要求する文書を送った。もし貴殿が1,500人の志願兵を集められるなら、即座に私の援軍として送って欲しい。イギリス軍を大変難しく危険な立場にしてみせる」「最も可能性が高いのは、ダン川の北に駐屯していることだろう。繰り返すが、現在の状況は最も重要な地点に差し掛かっており、最大の誠心誠意の実行が求められている。
大陸会議は南部戦線の指揮官選出においては不運続きだった。まずロバート・ハウを選び、サバンナを失った。ベンジャミン・リンカーンが続いて、チャールストンを落とされた。1780年8月16日、キャムデンの近くでホレイショ・ゲイツの軍隊がイギリス軍の攻撃にあって崩壊し大混乱に陥った。このことで、イギリス軍のチャールズ・コーンウォリス将軍が南部のロイヤリストを集めバージニアでの戦いを有利にする道を作ってしまった。コーンウォリスは南部に確保した港から兵士や物資をノースカロライナやサウスカロライナの内陸部に送る計画を立てた。ゲイツの後任を選ぶ必要に迫られて、大陸会議はワシントンにその選択を委ねた。10月5日の決議は「最高司令官として、ゲイツ少将に代わる南部軍の指揮官を指名されたし」とされていた。ワシントンは選択に迷うことはなかった。彼が大陸会議の決議文を受け取った翌日にはウエストポイントのナサニエル・グリーンに「貴殿を指名するのが私の願いです」という手紙を送った。大陸会議はこの指名を承認し、グリーンにデラウェアからジョージアまでの全軍を指揮する異例の全権を与える「総指揮官の統括に委ねる」任命書を送った。グリーンは12月2日、ノースカロライナのシャーロットで任務に就いた。サウスカロライナのアイザック・フーガー准将が彼の副官に就いた。フーガーはサウスカロライナでは信頼できる指揮官の一人だった。
1774年8月、グリーンは地元の民兵隊立ち上げに貢献し、この部隊が10月にはケント防衛隊として認可された。グリーンは片足を軽く引きずっていたので、その入隊には異議が出た。グリーンが軍隊の戦術に関する多くの高価な本を手に入れ始め、兵法について独学で学び始めたのがこの時期だった。12月には民兵法を改訂するために議会から指名された委員会に参加した。グリーンが軍務に就きたがったために1773年にはクエーカー教から除名されたと推測されてきた。しかしクエーカー教からの離脱はもっと時間を掛けてのものであり、実際にはキャティとの結婚から始まった。当時、非クエーカー教徒との結婚は除名の対象だった。
2005年に起きたJR福知山線脱線事故の運転再開に際しATS-Pの整備が求められ、ATS-P地上設備への改修とともに運用する車両もATS-P装備車が必要になった。そのため一旦は同線での運用から撤退していた113系のうちATS-P装備車が同線運用に復帰。福知山線入線のための改造・再改造、複雑な転配をすることになった。当時福知山線に配属されていた117系はATS-P未装備であったため対応が注目されたが、117系にATS-Pを取り付けるのではなく、岡山に転出した元日根野区113系と交換のうえ、ATS-P装備車の確保を行った。113系は貸出→転用の形で宮原総合運転所に復帰。塗色変更は後回しにされ、阪和色や瀬戸内色のまま運用を開始されたほか、一部は検査入場時に湘南色に戻され、所属も宮原所属に変更された車両も存在した。このほか京都総合運転所所属の113系ATS-P装備車も宮原所に貸し出された。この関連で阪和色や瀬戸内色車が嵯峨野線や湖西線の運用に入ることもあった。また上記小浜線運用車の1本も貸出されていた。ところが冬季を迎えるにあたり、元日根野区転用車は半自動設備が無いため改善が必要になった。今度は日根野電車区の体質改善車と交換されることになる。日根野区の体質改善車は紀勢スイッチ取り付けに伴い半自動設備が撤去されていたが、転用に際して同スイッチの撤去および半自動設備の再取付が実施された。このため元日根野車は再度日根野区に復帰することになった。また2パンタ車は京都所の嵯峨野線運用車のモハ112-5700番台や7000番台が転用された。福知山線で同系の運用が終了する2012年3月まで宮原所と京都所では車両の貸借を行いながら運用されていた。