都市に大きな影響を与えていた名望家層が鉄道建設などを通じてイスタンブールの宮廷と直接結びついていたこともあって、ダマスカスはベイルートと比べると民族主義の勃興が遅れたが、20世紀初頭にはダマスカスでも民族主義的感情が興るようになった。始めは文化的ナショナリズムだったが、次第に政治的色彩を帯び始めるようになる。また、ダマスカスで起こったアラブ・ナショナリズムの諸運動は、ベイルートで起こったアラブ・ナショナリズムの諸運動が早くから帝国からの独立を要求したのと対照的に、比較的遅い時期まで帝国の枠組みの中での自治を要求する傾向があった。1908年の青年トルコ人革命後、統一と進歩委員会が中央政府を掌握すると、ダマスカスでもアラビア語の公用語化や連邦制の導入といった、アラブ人の権利や帝国の分権化を要求する運動が起こるようになる。これらの動きに対し、中央集権化を進めたい統一と進歩委員会は時には懐柔しつつも、もっぱら強硬策をもって臨んだ。このような統一と進歩委員会の方針は中央集権化という名の「トルコ化」政策であると受け取られ、ダマスカスのアラブ・ナショナリストの中にも自治から独立へとその主張をより強める動きが現れるようになった。第一次世界大戦が始まると、統一と進歩委員会の中心人物であるジェマル・パシャが方面軍の司令官としてダマスカスに赴任してくる。1915年から1916年にベイルートとダマスカスで、ジェマルにより愛国的な知識人が数多く絞首刑にされたことは、さらにナショナリストの感情を逆撫ですることになった。また、この処刑はダマスカスの住民にマッカの太守フサイン・イブン・アリーによる「アラブの反乱」への支持を広げる結果にもなり、1918年にアラブ軍とイギリス軍が迫るに連れて、住民は撤退してゆくトルコ軍に対して発砲した。
1400年にモンゴル人の征服者ティムールがダマスカスを攻撃した。マムルークのスルタンはカイロから、イブン＝ハルドゥーンら代表団を送り交渉に当たらせるが、彼らが去った後街は略奪される。ウマイヤド・モスクは燃やされ、男女は奴隷にされた。膨大な数の職人がティムールの首都サマルカンドに連れ去られた。それでも、彼らは幸運な部類だった。数多くが虐殺され、その首は城壁の北東隅の外に積み上げられた。今日なお都市の一角にburj al-ruus（原義は「首の塔」）という名が付いている。ダマスカスは再建され、1516年までマムルーク朝の地方首都として機能した。
アイユーブ朝の支配（および自治）は、1260年モンゴル帝国がシリアに侵入したときに終わる。モンゴルの撤退後はマムルーク朝の地方首都となり、エジプトから支配される。
三島食品は1949年（昭和24年）にトウガラシ粉や桜でんぶを製造する三島哲男の個人商店「三島商店」として創業し、魚類の粉末を使った業務用ふりかけ「弁当の友」の製造で成長を遂げた企業であった。1960年代後半のある日、三島食品の名古屋エリアを担当していた営業マンが、現地で見つけた赤ジソを刻んだ漬物の商品化を提案したのが、ゆかり誕生のきっかけとなった。営業マンは上司に掛け合ったものの相手にされず、三島哲男社長の自宅に夜間に電話をかけると「大石内蔵助みたいなことをするな。寝ていたのに、明日にしろ」と言われた。そこで翌日再び三島社長に電話すると、三島は「漬物屋ではない」としてこの提案を却下したが、営業マンは粘り強く営業日報で商品化を訴え続けた。三島は「漬物ではなく乾燥できれば」という条件を付けて開発許可を出した。開発段階では、香りと赤紫色を両立できる、赤ジソを乾燥させる適温を見つけ出すのに数か月を要した。提案から2年を経て1970年（昭和45年）に販売開始したものの、当時としては斬新なふりかけであり、会社には返品の山ができてしまった。1973年（昭和48年）には一般小売向け販売も開始したが、特に店頭では長時間陳列しておくとふりかけが白っぽくなってしまい、余計に売れなくなってしまった。しかし、学校給食で採用されていた東海地方で子供を経由して親に美味が伝わり、口コミで広められ、1978年（昭和53年）頃から売上が軌道に乗った。この頃、ゆかりの食塩量を50%削減する大幅な変更を行った。販売開始当初は簡易包装であったが、1975年（昭和50年）にデザイナーに依頼して今につながるストライプ柄のパッケージデザインが登場した。ただし当時は淡い紫色のパッケージあった。その後1985年（昭和60年）に現行デザインに近い深い紫色に変更、1996年（平成8年）にストライプ柄のパターンを変更し、上部にチャックを付けた現行のものになった。パッケージを大きく変更しないのは、このパッケージが消費者に浸透し、安心感につながっていると三島食品が考えているためである。姉妹商品として1984年（昭和59年）には青ジソふりかけ「かおり」を、2010年（平成22年）には「あかり」を販売開始した。1988年（昭和63年）には需要増に対応するため、ゆかり専用工場を稼働させた。2002年（平成14年）、パッケージ上部に「ゆかり」の点字を付けるようになり、開封時に切り取って点字部分が失われることから2005年（平成17年）より側面にも点字を入れるようになった。2002年（平成14年）には製造工程で工業油が混入し、約50 tを回収、生産ラインも停止するという事態に直面している。2008年（平成20年）には広島県山県郡北広島町に自社農園を設け、ゆかりの原料となる赤ジソの自社栽培に進出した。2018年（平成30年）現在、ゆかりは約480種ものふりかけを製造する三島食品の売上の3割を占める主力商品に成長している。