2006年12月21日発売のPlayStation 3用ソフト『Railfan』は、電車でGO!スタッフとTrain Simulatorスタッフ（音楽館）の共同制作タイトルである。
2017年稼働開始の「電車でGO!!」では、E231系500番台を模した外観の大型筐体となり、車窓表示用の3画面と、運転台表示用の1画面の計4画面で構成。運転台表示用画面は、運転中の指差呼称や前照灯操作に対応したタッチパネル式となっている。マスコンについては筐体外観のモチーフであるE231系500番台の実物に似たワンハンドルタイプが搭載された。これまで、シリーズにおけるワンハンドルマスコンの採用は家庭用でのみであり、アーケード版では初の搭載となる。
2019年6月26日のアップデートで、電車でGO!を再現したモード「電車でGO！ 復刻版」が収録された。また、2019年9月25日のアップデートで、復刻版に電車でGO!2高速編 3000番台を再現したモードが追加された。但し、収録されているのは秋田新幹線、奥羽本線、田沢湖線、山手線、京浜東北線、東海道本線の6路線となり、北越急行ほくほく線は収録されていない。
Wii：2007年3月1日発売Wii版ではPS2版をベースに、ダイヤや周辺の景観を2006年時点のものに変更している。これに伴い、700系B編成と0系・100系フレッシュグリーンおよびK編成が追加され、小郡駅が新山口駅に変更された（ただし、古いダイヤは放送のみ小郡と放送される）。一部ダイヤを除き、車内メロディが「いい日旅立ち・西へ」に変更されている（「AMBITIOUS JAPAN!」は収録されていない）。駅構内放送でも、「○番線」から「○番乗り場」になる。また、新しく採用した「キッズモード」にはWiiリモコンを振って加速・減速をする速度キープ機能、キャラクターをさがせ、などの機能がある。NINTENDO64以来の任天堂プラットフォームからのソフトである。
AC：1997年9月ごろ稼動 SS：1998年10月1日発売アーケード版の電車でGO! のバージョンアップ版。バグフィックスが行われたほかに「山手線EX」と「京浜東北線EX」が追加され、天候が雪の状況で運転が可能となっている。1998年10月1日には、セガサターン用ソフトとして移植された。当初は日本フレックスから発売される予定だったが、発売前に同社が倒産したため、タカラが販売を引き継ぐ形となり、セガサターン対応専用コントローラーも同時に発売された。
各作品の収録路線名の表記は、実際の路線の正式名称ではないものもある。またダイヤ、使用車両、駅名など、現在とは異なっている場合もある。CEROの審査を通した作品は全て全年齢対象となっている。なお、各項目の、「AC」は「arcade」の略で「アーケード（ゲームセンター用据え置き）版」を、「PS」は「Playstation」の略で株式会社ソニー・インタラクティブエンタテインメント製Playstationシリーズ向けソフトウェアを、「Win」はMicrosoft corporation製Windowsシリーズの各日本語版を表す。
名鉄編の美濃町線では、緊急車両がサイレンを鳴らしながら近づいて来る地点があるので通過するまでに停車し、通過し終わるまで待つとGoodとなり加点される。通過時に動いていると減点される。
踏切事故でトラックを無事に回避したときは、5 - 15秒のボーナスがもらえる（ただし、名鉄編は300秒）。逆に激突したときは大幅な減点となってしまう。また、名鉄編の美濃町線・犬山橋と旅情編の伊予鉄道・京福電気鉄道・函館市交通局では路面区間で車が通ることが日常茶飯事のため、ボーナスはもらえない。しかし、衝突すると減点される。
一定時間内に決められた順序・速度で連結を成功させればクリアとなり、ボーナスがもらえる。さまざまな列車が連結できる。プロフェッショナルでは盛岡駅でのやまびこ・こまち連結と天王寺駅での関空快速の大阪発列車とJR難波発列車との連結。プロフェッショナル2は宇多津駅での特急列車同士の併結との早岐駅での特急みどり・特急ハウステンボスとの併結。プロフェッショナル2の早岐駅の連結は特急ハウステンボスを運転した場合のみ行う。なお、プロフェッショナルでは連結が不十分だったり一定以上の衝撃を与えた場合、プロフェッショナル2は連結が不十分だったり一定以上の衝撃を与えた場合の他にも、時速5km/h以上を出した場合はそれぞれ失敗となる。
Macのキーボードには"コマンドキー"という修飾キーがある。2007年まで、コマンドキーは「command」のような文字表示ではなく、アップルマークと四葉のクローバーに似たコマンドマークが並んでいる珍しい表示になっていた（初代の"Apple Macintosh Keyboard"はアップルマークがなく、コマンドマークのみ）。なぜ、2つのマークを並べる表示になったのかというと、Mac用の二代目キーボードである"Apple Desktop Bus Keyboard"が、Apple IIシリーズの一機種であるApple II GS用のキーボード"Apple II GS Keyboard"と全く同一製品だったことに由来する。（アップルが1993年まで販売していたパーソナルコンピュータ"Apple II"のキーボードには、アップルマークが表示された"アップルキー"という修飾キーがあった）つまり「Apple II GS使用時にはアップルキー」、「Mac使用時にはコマンドキー」として使える(一目で判別できる)ための工夫であった。この2つのマークを並べる表示は、近年のMacシリーズのキーボードにも継続されていた。しかし2007年8月に販売開始された"Apple Keyboard"で、ついにアップルマークの表示が廃止され、コマンドマークと「command」の併記に変更された。よくMacユーザーでコマンドキーのことをアップルキーという者がいるが、アップルキーとは、あくまでApple IIの修飾キーの名称であり、Macの修飾キーを指す名称ではない。