1980年代に入ると、市の再開発が始まった。1983年に開店した3階建てのチャールストン・タウン・センター・モールはその1つで、ミシシッピ川以東では最大の市街地型ショッピングセンターである。1990年代には新しい連邦ビルやリバーフロント・パーク、キャピトル・マーケットなどが建設され、ダウンタウンの再成長を促した。また、チャールストンは州でも一級の医療施設を揃える都市としても知られている。
第二次世界大戦中、全米最大の合成ゴム会社がチャールストン近郊で操業を開始し、軍需産業においてもチャールストンは重要な市になった。1947年にはカナワ空港（現イェーガー空港）が開港。この360エーカーの空港を建設するにあたって山を3座切り開き、900万立方ヤードの土を動かすなど、当時としては技術の粋を集めた建設であった。1960年代に入ると州間高速道路が建設され、チャールストンは3本の州間高速道路が交わる要所となった（後述）。
チャールストンはウェストバージニア州の州都となった。天然ガスや石炭といった豊富な天然資源と鉄道の延伸により、市は化学工業・ガラス・木材・鉄鋼業などの工業都市として発展を遂げた。ダウンタウンは建設ラッシュになった。現在においても、当時立てられた教会やオフィスビルのいくつかはダウンタウンの中心に建っている。
州はできたものの、州都はなかなか決まらなかった。しばらくの間は、州都はチャールストンとホイーリングとの間を絶えず行き来した。州都を決めるため、1877年に州民による最終投票が行われた。1885年についにチャールストンが州都に選ばれ、州会議事堂が建立された。1921年の火事の後突貫工事で建て直された庁舎は1927年に再び焼失した。しかし、1921年の州法で設置された州庁舎建設委員会により、現在の庁舎を建てることが認められた。建築家カス・ギルバートがデザイン、1000万米ドルの巨費を投じた新しい庁舎は、1932年6月20日についに開かれた。
1861年の南北戦争開戦まで町は成長を続けた。バージニア州が連邦から脱退し、チャールストンは連邦側と南部連合側に分かれた。1862年9月13日にチャールストンの戦いが勃発。南軍が勝利を収めたが、その占領は長くは続かず、わずか6週間で北軍が戻り、終戦までチャールストンを占領した。終戦までには、カナワ川の製塩業は事実上無くなってしまっていた。バージニア州は連邦から脱退して南部連合側であったにもかかわらず、連邦側がチャールストン、および州西部を占領していたため、州分割の機運が高まった。1863年6月20日に大統領エイブラハム・リンカーンはバージニア州北西部を連邦に戻すと宣言、連邦35番目の州としてウェストバージニア州が誕生した。
1800年代初頭、カナワ川の河岸で岩塩が発見され、1806年に採掘が開始された。製塩業は周辺一帯に経済成長をもたらした。1808年までには1日1,250トンの塩が生産されるようになった。チャールストンに隣接するカナワ・サリーンズ（現マルデン）は世界一の製塩地帯となった。1818年には、カナワ製塩会社が営業を開始した。1815年、現在ウェストバージニア州会議事堂がある位置の近くでジェームス・ウィルソン大尉が岩塩の掘削中に天然ガスを発掘した。1817年には石炭が見つかり、製塩業を支える燃料として使われるようになっていった。
チャールストンの歴史は古く、200年前にさかのぼることができる。1774年にカナワ川とエルク川の合流点付近の土地1,250エーカーがブリット家に譲渡され、1786年にジョージ・クレンドニン大佐に転売。1788年にクレンドニン大佐がバージニア・レンジャーズ開拓者集団を率いてこの地にリー砦を建設し、この地を大佐の父の名である「チャールズ」にちなんで「チャールズ・タウン」と名付けた。チャールズ・タウンは2つあったため、混同しないよう、こちらは後に「チャールストン」と短縮された（もう1つのチャールズ・タウンは現在もその名のままで州内に残っている）。1794年にチャールストンは正式に町となった。40エーカーの土地に7軒の家が立ち、人口は35人であった。
1916年（大正5年）に、現在の桜木町に創業した料亭「満月」を前身とし、1930年（昭和5年）に、磯子区（1948年より金沢区）柴町に、料亭と旅館の機能を併せ持つ旗亭「金沢園」が開業した。昭和初期の当地は「金沢八景」の名が示す通り景勝地で、京浜地区の市民や文化人などが避暑に訪れていた。1930年9月7日の横浜貿易新報に掲載された与謝野晶子の随筆「金沢の一日」には、鉄幹・晶子夫妻が金沢園を訪れた際に、ここから眺めた海岸線の美しさを讃えた一文が記されている。1939年（昭和14年）5月には俳人の高浜虚子が、日本各地の景勝地の風景を楽しむ会である「第四回日本探勝会」を金沢園で開催した。創業100周年を控え、建物の維持と活用が模索されるなか、横浜市港北区出身で留学のあっせんやシェアハウス事業を営む実業家が名乗りを上げた。主に訪日外国人旅行者の利用を想定したゲストハウスおよびカフェレストランとして活用するもので、改修費用の一部はクラウドファンディングでも調達された。2016年2月、金沢園は一旦営業を終了して改修工事を開始し、同年7月にレストラン「Cafe&Dining ぼたん」がオープン。同年12月には旅館業の許可を取得した。旅館の名称については当初「HOSTEL金沢園」を予定していたが、以前のオーナーから商標使用の許可が下りず、新オーナーの姓から「旅館 喜多屋」と名付けられた。