2013年7月28日、サッカー東アジアカップの日韓戦で、韓国側応援団が観客席に政治的メッセージ（「歴史を忘れた民族に未来はない」とハングルで書かれた横断幕や伊藤博文を暗殺した安重根や文禄・慶長の役における韓国の英雄李舜臣の巨大な肖像画など）を掲げたことに関して、菅義偉官房長官が記者会見で「国際サッカー連盟は応援時に政治的主張を行うことを禁じており、横断幕が掲げられたことは極めて遺憾だ」と遺憾の意を表明した。これに対して、韓国側応援団は「競技場では戦犯旗が振られ、私たちより扇情的な横断幕があった」と旭日旗を用いた応援がより問題があったとと反駁し、韓国与党のセヌリ党のミン・ヒョンジュ報道官が「軍国主義時代、日本が起こした戦争で軍旗として使用され残忍な侵略を象徴した旗が旭日旗。正当化できない戦犯の旗を日本政府が公式化することは歴史に対して無礼」と非難を行った。なお、この試合に関しては日本人が個人で旭日旗を掲揚したことが確認されている。旭日旗を持ち込んだ男性は、フリーライターの清義明（著書『サッカーと愛国』で2016年度ミズノスポーツライター賞優秀賞）に誘われて在日特権を許さない市民の会の「嫌韓・反韓デモ」への反対活動に参加したこともあり、嫌韓感情は持っていないと述べ、サッカーを愛する気持ちだけで起こした行動であると主張している。
2012年FIFA U-20女子ワールドカップでは、韓国の朝鮮日報が「軍国主義の亡霊『旭日旗』」の見出しで「日本の軍国主義の象徴、旭日昇天旗が観客席のあちこちで、恨みを晴らすかのように恐ろしげにはためいていた。彼らにとって日韓戦は、サッカーではなく『戦争』だった」と扇動的に報道するなど、旭日旗を問題視する世論が韓国社会では急速に広まっていき、2013年のサッカー東アジアカップのサッカー日韓戦の騒動を経て「戦犯旗」の呼称が韓国社会に定着していった。
2011年AFCアジアカップの日韓戦で韓国代表のキ・ソンヨンが行った日本人に対する人種差別パフォーマンスが国際サッカー連盟に懲罰対象として提訴が検討されると、キ・ソンヨンは日本サッカー協会に対して「あのパフォーマンスは日本人に対してではない。（所属クラブの）セルティックでプレーしていて、相手のサポーターからサル呼ばわりされている。そういう差別発言をする人たちに向けてやった」と釈明と謝罪し、日本サッカー協会も謝罪を受け入れて提訴を取り下げた。しかし、キ・ソンヨンは韓国で「観覧席の旭日旗を見て私の心から涙が出た」（旭日旗が実際に掲げられていたかは不明）「私は選手である前に大韓民国の国民」と釈明したことから、国際社会から旭日旗の掲揚を抹消するべきという機運が高まった。この騒動は日本でもインターネット上で話題となった。テレビ朝日の報道番組がキ・ソンヨンの言い訳に沿った報道内容（「スタンドに旭日旗があった」と別の試合会場で旭日旗を掲げられた写真を引用したこと）ことが虚偽報道として非難され、テレビ朝日は報道内容の誤りを認めて謝罪を行った。また、日本側の応援団が「旭日旗」と「キム・ヨナ悪魔仮面」で韓国を挑発したという中央日報の報道は「キム・ヨナ悪魔仮面」という日本に馴染のない応援方法がパロディの対象となって、国旗の掲揚に関心のないネットユーザーにも知れ渡るようになった。
2012年7月に開催されたロンドンオリンピックでは、IJFの審判委員会によって選ばれた25名のインターナショナル審判員と3名のジュリーによって試合が運営されることになった。なお、審判員はコンピューター抽選によって担当試合が振り分けられた。但し今大会では、畳の上の審判員による技の判定が試合を監督するジュリーによって覆されるケースが何度となく起こり、物議を醸す事態にまで発展した。とりわけ、男子66kg級準々決勝の海老沼匡対韓国の曺準好戦では大きな騒ぎとなった。この試合での海老沼は、曺による反則負けの対象となりえる立ち姿勢から倒れ込む腕挫腋固にも疑われる技でで負傷しながらも、ゴールデンスコアに入ってから小内巻込を決めて、主審であるブラジルのエディソン・ミナカワもそれを有効と示したことにより、一旦は試合が終了したものと思われた。しかし、ジュリーの判断によって有効が取り消されて試合が続行されることになった。その後両者ポイントなく試合が終了した。旗判定では曺を支持する青旗3本が上がったものの、観客による大ブーイングが起こるなど場内が騒然となった。ジュリーからもこの判定に対する異議が唱えられて旗判定のやり直しが指示されると、今度は海老沼を支持する白旗3本が上がり海老沼の勝利となった。この事態に対して、今大会審判委員長も務めていたバルコスは、「あの海老沼の技は有効に近かった。そのため、3人のジュリーが3人とも海老沼の勝ちだと判断し、判定をくつがえすよう審判に伝えた。審判はミスをするものだ」「我々の責任は柔道精神を維持すること。真の勝者が勝者として畳を降りる状況を作った」と語った。IJFもこの件に関して声明を出して、旗判定をやり直させるような事態は今回が初めてのケースではあったものの、「最終的に正しい判定だった」とした。また、「審判は大変な重圧を受けている。ビデオ判定システムはその大きな助けだ」とも付け加えた。一部のマスコミは、南米で柔道を指導するある日本人コーチの話として、「あの人（ミナカワ）は、旗判定になると日本人に上げないことで有名」との談話を伝えた。なお、この試合で審判を務めた主審のミナカワと副審2名の計3名は翌日の試合の審判から外されたが、その後また復帰した。