このゲームではプレイヤーが任意のタイミングで味方NPCへの指示や会話を行うことが出来る『リップルリンク』というシステムを搭載している。ボイスコマンドはその自由度を高めるためにマイクが接続されている状態で使用できる音声認識を利用した機能。マイクが接続されていない状態では簡易コマンド画面を開き選択したい定型文のボタンを押して指示・会話を行う。『隠れろ』など一部の指示はボイスコマンドでしか指示が出せない。非戦闘中ではこちらから会話を振る事も出来る。味方NPCがプレイヤーの指示を受け入れるかどうかも信頼度によって変わる。
味方NPCには、それぞれのキャラクターに主人公に対する『信頼度』が設定されている。信頼度は相手の作戦に同意したり、戦闘中に助けたり、会話で好感を得ると上昇し、逆に誤射をしたり、強引な作戦行動で仲間がダメージを受けたり、会話で不評を買った場合には下降する。信頼度が高いとNPCはプレイヤーが楽になる作戦を、逆に低いとプレイヤーの身を危険にさらす作戦を提案する。プレイヤーが提案した作戦を味方NPCが同意するかどうかも信頼度によって決まる。更に、信頼度によってストーリーの内容が変化し、エンディングにも影響を及ぼす。
ゲーム内容は一般的なサードパーソン・シューティングゲームであるが、ウォータースライダーステージや水上バイクの操作などアクションステージやQTEも存在する。プレイヤーだけでなく味方NPCが死んでもゲームオーバーになる。プレイヤーがダメージを受けると、受けたダメージが大きいほど画面の周囲が赤くぼやける。体力はある程度までなら一定時間ダメージを受けなければ自動回復する。武器の購入や強化はステージの所々に置かれているショップ端末で、敵を撃破すると入手できるクレジットを使用して行う。ショップ端末にはクジがついており、買い物をして端末を離れる際にハズレ・アタリ・大当たりをランダムで抽選し、アタリと大当たりでは景品としてアイテムが射出される。また、武器は倒した敵が落とした物を一時的に使用することもできる。キャラクターそのものの強化はショップ端末で販売していたり、ステージに落ちている『ナノマシン』というアイテムを、2×3のマス目パズルの要領で組み合わせを考えながら装備する事で行う。ステージによっては同行する味方を絞る必要がある。ステージを進んだ先で更に同行者を絞る必要がある事もある。
2080年。2012年頃から始まった海水面上昇により多くの大地が水没し、ほとんどの都市が富裕層や特権階級が住む高層建築街の上層都市と、そこに住めない者達が住む下層のスラムに分かれていた。そして、高層建築の建設など危険な仕事をさせるためのロボット技術が進歩した世界。ロボットのシェアを独占するベルゲン社に、男が「お前ら、俺に何をした」などと意味不明な事を叫びながら武器を手に立てこもる事件が発生した。男がおもむろに自らの頬の皮膚をはがすと、その下には金属の骨格があった。翌日、アメリカ上層部の会議で、その男は人近似ロボットの開発と研究を禁じるジュネーブ・コードに抵触する『自らを人間と思い込んでいるロボット』だという報告が出された。上層部はこのロボットに『ホロウチルドレン』という呼び名を付けた。ホロウチルドレンは男が持っていたグリーンカードによると、30年以上前から相当な数が人間社会に紛れ込んでいる可能性が高いと推測され、事実、その場にいた将軍の一人もホロウチルドレンであった。会議で、ホロウチルドレンの製作者として、かつてベルゲン社とロボットの基本OSの特許権を巡って法廷闘争をした人工知能の権威・天田洋二の名が挙がる。そして、ホロウチルドレンに関するデータの入手と天田の身辺調査・身柄拘束のため、日本にIRTA（国際ロボット技術機構）の特務部隊『ラストクルー』の派遣が決定する。ベルゲン社襲撃事件から10日後。排他主義が主流になった日本で、内務省治安維持部隊の銃口を掻い潜りながらAMADA社へ向かうラストクルーのメンバー達。そこには誰も想像だにしていなかった、人類全体の深刻な危機が待ち構えていた。
K点は、ジャンプ台の着地斜面の下部に位置し赤い線が引かれており、この位置を境にして着地滑走路の傾斜曲率が変わる。2005年現在の採点法ではK点を飛距離の基準とし、K点に着地した飛躍に対し60点が与えられる。着地地点がK点に達しなかった場合は減点され、超えた場合は加算される。減加算される点数は、ジャンプ台の規模により異なるが、一般的にノーマルヒルでは2.0点/m、ラージヒルでは1.8点/mである。着地区域の開始点はP点 (独: Punkt, 英: P-point) と呼び、青い線が引かれている。着地地点は前述の傾斜路の曲率が着地時に危険が伴うことから、これ以上飛ぶと危険であるという「極限点」を意味する Kritischer Punkt (英: critical point) の意味として、1972年札幌オリンピック当時は用いられていた。競技中においても最も飛距離の長い選手であっても着地地点がK点を超えないように、大会運営者はスタート地点の高さや助走路の長さを調節して設定していた。その後、滑空中の姿勢を含む滑空技術・着地技術・競技服等が大幅に進歩したことでジャンプ場の完成時に固定されていたK点を越える、いわゆる「K点越え」のジャンプが可能になり、極限点は事実上意味をなさなくなった。かつてのK点の役割に相当するものは2004 - 2005年シーズンから「ヒルサイズ」と呼ばれ、K点より遠くに設定されている。選手がこの距離を超える飛行をすると、危険のため競技の続行について審議される。また、K点距離が同じであってもジャンプ台によってヒルサイズは異なるが、おおむねバーンの斜度がノーマルヒルで31度、ラージヒルで32度となっている。すなわち、現在ではジャンプ台の大きさは「ヒルサイズ=Xm、K点=Ym」というかたちで示される。1995年頃からヒルサイズ導入までは斜度30度を目安にした「ジュリーディスタンス」が用いられていた。1998年長野オリンピックでジャンプ競技が執り行われた白馬ジャンプ競技場のK点は、ノーマルヒルで90m、ラージヒルで120mである。