事件が発生してから7年後の1940年（昭和15年）2月、AはBの遺体を埋めた鶏小屋に隣接する野菜倉庫から野菜を取り出そうとしたところ、鶏小屋の一角が崩れ、白骨化したBの遺体が露出した。驚いたAは遺体を田の畔道に埋めて隠蔽するもこの頃から夢枕に現れるBにうなされるようになった。 やがてAのうなされる様が集落の噂となるのと前後して管轄の町田警察署に事件の再捜査を依頼する投書が寄せられた。町田警察署は再捜査を神奈川県警察部刑事課に依頼し、周辺捜査の結果、事件発生から7年4カ月後の8月10日にAを逮捕し、自供させた。
昭和8年4月8日、Aの家族がいない間にAの家を訪れたBはAに督促を行った。やがてAは大金が入っていると財布を差し出すが財布の中身は札束状に加工した紙切れであり、Aはその金を別の取引における保証としたいのでBに金を預かっているという書類を書いてほしいと頼んで受諾させた。やがてAは用便に立つと偽って屋外に出ると風呂用の薪を持ちだして油断しているBを背後から殴打して殺害してBの所持金を奪った後、一旦物置に隠してから家族が寝静まった深夜にBの遺体を敷地内に埋めた。更に1ヶ月後には万全を期して鶏小屋の改修と偽って小屋の下に遺体を埋め、続けてその上にコンクリートを流しかためる隠蔽工作を実施した。この間Bの家族からBの捜索願が出され南村を管轄する警視庁、Bが住む横浜市を管轄する神奈川県警察部も捜査のためAに事情聴取を実施したが「Bは八王子に行くと言って出たきり見ていない」という内容の供述をし、更にBが書いた保証書を提示して無関係と主張した。やがて警察側もBを家出人とみなして捜査に消極的となり事件は風化していった。
南村で床屋を営んでいたAはたまたま客として知り合った横浜市に住む金融業者Bの下で貸した金の集金をしながら自らもBから元手を出してもらい、住んでいる集落の住民相手に金融業を営んでいた。しかし折からの不況で自身も借金で苦しみ、Bから返済が出来ない場合は家と土地をよこせと催促を受けていた。金の当てがないAは遂に返済延長の交渉がまとまらない場合はBを殺害することを決意した。
大土御祖神社と同じ社地に鎮座するため、植物相も同じである。1977年（昭和52年）に行われた境内の立木調査によると、カヤノキ・マキ・スギ・ヒノキ・カシ・シイ・クスノキ・ヤブニッケイ・シロダモ・タブ・トベラ・モチノキ・ヤブツバキを主要樹種とし、計258本あった。
国津御祖神社で行われる祭祀は、大土御祖神社と同じである。すなわち、巡回祭典の形で祈年祭（2月）、月次祭（6月・12月）、神嘗祭（10月）、新嘗祭（11月）の際は社殿の前で祭祀が行われ、歳旦祭（1月）、元始祭（1月）、建国記念祭（2月11日）、風日祈祭（5月・8月）、天長祭（12月23日）は遥祀を催行する。
伊勢神宮の摂社の定義より『延喜式神名帳』成立、すなわち延長5年（927年）以前に創建された。『皇大神宮儀式帳』にも「国津御祖社」として記載があることから延暦23年（804年）以前から存在したことになる。中世以後、祭祀が断絶し、寛文3年12月22日（グレゴリオ暦：1664年1月20日）に遷御（せんぎょ）の儀を行い再興された。大土御祖神社の旧社地を特定が容易であったため、同じ社地の国津御祖神社も労せず旧地に復興された。明治4年（1871年）に葦立弖神社を国津御祖神社へ同座させる。社殿は1914年（大正3年）に造り替えられた。45年後の1959年（昭和34年）7月に建て替えられ、1982年（昭和57年）10月に大修繕が施された。
葦立弖神社は、内宮の末社16社のうち、第14位である。社殿は中絶し、国津御祖神社に同座する。祭神は玉移良比女命（たまやらひめのみこと）。宇治都比女命（うじつひめのみこと）の子であるとされ、産土神であるという。宇治都比女命は国津御祖神社の祭神・宇治比賣命と同じであると考えられている。
木次駅と宍道駅を結んだ簸上鉄道によって開業し、のちに鉄道省によって南方に延伸されて芸備線と接続し、芸備線とともに陰陽連絡路線の一つとして機能していた路線である。1950年代から1990年までは広島・松江へ直通する急行「ちどり」などの優等列車が運転されていたが、山陽新幹線の開業と伯備線の電化に伴う旅客の流れの変化に加え、道路整備の進展と自家用車・高速バスの隆盛にも押されて、1990年代以降は陰陽連絡線としての役割は失われた。JR西日本の他のローカル線と同様に、保守点検の合理化を目的とした25km/h - 30km/hの速度制限箇所が多数あり、軽便鉄道並みの運用となっている。2013年度（平成25年度）の輸送密度（平均通過人員）は245人/日である。本来ならば1980年代初頭の「第2次特定地方交通線」（輸送密度500人/日以上2000人/日未満）に指定され、廃止対象となる予定であったが、当時「沿線道路が未整備である」として対象から除外された。米子支社が管轄する宍道駅と、岡山支社が管轄する備後落合駅をのぞき、米子支社の木次鉄道部が管轄している。2016年2月4日、米子支社によってラインカラー、路線記号の導入が発表され、同月中より順次導入されている。ラインカラーは「沿線の紅葉の色」をイメージする山吹色（■）、記号は E である。