2019年（平成31年）4月1日現在、福知山電車区・吹田総合車両所（京都・日根野支所）・岡山電車区に配置されている。2005年4月25日の福知山線脱線事故の影響で、ATS-P形対応・非対応車の転配属が頻繁に行われていた時期があった。なお、京阪神地区（アーバンネットワーク）では221系・223系・225系・323系などの投入で運用が兵庫県の姫路駅以西となっている。JR西日本では殆どの車両に最高速度を110km/hにする高速化工事を行い、一時は車番が5000 - 7000台になった車両が大半を占めていた。福知山線（JR宝塚線）での運用ではブレーキてこ比改造の関連で高速仕様を外された車両が発生している。また、編成の組み換えが頻繁に行われるため、様々な塗装や仕様の車両同士を連結した編成が見られるというのもJR西日本ならではの特徴であったが、2009年から始まった塗装の単色化や113系自体の減少により、現在ではこのような編成は見られなくなっている。
国鉄分割民営化後は多くの車両が承継された。また、一部オリジナルカラーに塗り替えられた車両もある。2019年現在、定期運用と在籍があるのはJR西日本のみとなっている。
1985年に登場したサロ165-130の改造車である。定員48名。トイレ・洗面所付き。塗分位置（改造当初は塗分がサロ165形時代のままであった。ちなみに、サロ112形も当初は同様であった）の変更と行先表示器の追加、自車用の冷房電源用MGと回送運転台の撤去を除けば外観は種車とほとんど変わらない。形態的には回送運転台用ライトの有無と2段式のユニット窓（165系時代に下降窓から改造）以外は前述のサロ112形と変わらないが、すでに廃形式であったため、サロ110形に編入された。1992年に廃車となった。改造時から廃車まで国府津電車区所属。
1983年にサハ165-7を改造したもので、塗分位置の変更（165系より橙色部分が天地に広い）と行先表示器の追加を除けば後述の401と同様外観は種車とほとんど変わらない。1200番台と同等の簡易リクライニングシートを装備している。座席と窓の間隔は合っていない。サロ110形であるにもかかわらず車掌室はないが、定員をオリジナルのサロ110形と合せたため、その分シートピッチは1,010mmに拡大されている。定員60名。トイレ・洗面所付き。落成当初は静岡運転所配置だったが、国鉄時代の最後のダイヤ改正（昭和61年11月）で国府津電車区に転属した。1990年に廃車された。
1987年に登場したサロ183形の改造車である。0番台からの改造車が304 - 、1000番台からの改造車が1301 - をそれぞれ名乗る。定員48名。種車のトイレおよび洗面所部分に客用扉を増設したため、トイレおよび行先表示器は設置されていない。またサロ183形時代の車内販売準備室および車販コーナーが撤去されずに残っていたのがこのグループの最大の特徴である。1300番台のうち1305のみは、1988年の落成当初は湘南色に塗装して、田町電車区→国府津電車区に配属されて東海道本線で使用されたが、1991年に大船電車区に転属して横須賀線系統に使用された。304-307.1301-1304は国鉄時代に308-311.1305は分割民営化後に改造された。このグループの1302が1998年12月に廃車され、ユニークな特急形改造グリーン車は消滅した。305・306・307は、サロ125形と連結されるために方向転換され引通し線の改造も実施。（方向転換された車両は4号車から5号車に移動しそのままの状態で連結すると車掌室が6号車寄りになるため）
スタンドに据え付けられたゴーグル型のディスプレイを覗き込むようにしてプレイする。視差の概念を採り入れ、左右の画面に異なる映像を表示させることで立体画面を実現した。テレビに接続せず電池で駆動するが、視界を覆う専用ディスプレイが必要となるため、室内のデスクトップでのプレイが主となる、特異なゲーム機である。CPUはPC-FXと同じNECのV810を採用している。カスタムチップのV810は20MHzで動作し、浮動小数点演算処理ユニットも搭載している。サウンドはゲームボーイのサウンドとほぼ同じ。波形メモリ音源で、波形を32バイトPCMで変更できる。これを利用して短い声をPCMで発音できた。画面の解像度は384×224。色数は単色・赤色LEDによる赤～黒の4階調と少ないが、画面の明るさを32段階で調整できる。十字キーを2つ搭載。アナログスティックなどを除けば方向キーを2つ搭載した家庭用ゲーム機は他に無い。バーチャルボーイの名称はコピーライターの糸井重里が名付けたという噂が広まっていたが、『ほぼ日刊イトイ新聞』のコラム「今日のダーリン」2007年7月10日付にて糸井自身が「『ゲームボーイ』と『バーチャルボーイ』のネーミングは、ぼくじゃありません」と否定している。1992年に、任天堂にリフレクションテクノロジー社からLEDディスプレイ「プライベート・アイ」の売り込みがあり、当時、山内溥からバーチャル・リアリティをテーマにした商品開発を提案されていた横井軍平の元で、リフレクションテクノロジー社との共同開発が始まった。