第一次イタリア戦争後、フランスの援助によって教皇アレクサンデル6世はロマーニャ地方を獲得しており、イタリア中部では教皇国の影響力が強まりつつあった。アレクサンデル6世の下で教皇軍最高司令官であったチェーザレ・ボルジアは、当時ボローニャを支配していたベンティヴォーリョ家をボローニャから追放し、この地方に強固な「ボルジア王国」を作り上げようとしていた。1503年8月18日にアレクサンデル6世が死ぬと、ピウス3世の短い統治の後、ユリウス2世が新教皇に選出され、チェーザレの力は弱まった。これを好機と見たロマーニャ地方の没落貴族達は、町の支配権と引き換えに経済的援助を求めてヴェネツィア共和国に接近した。ヴェネツィア議会はこの申し出を受諾し、1503年の終わりにはリミニやファエンツァなど多くの都市がヴェネツィアの支配下に置かれる事となった。チェーザレを失脚させて教皇軍の指揮権を取り戻したユリウス2世は、直ちにヴェネツィア領となっていたロマーニャ地方の返還を要求した。ヴェネツィア共和国自身はロマーニャ地方の諸都市に対する教皇の支配権と徴税権を認めていたものの、都市の多くが教皇の下へ戻る事を拒否したため、ヴェネツィアは教皇の要求を拒絶した。これに対し、ユリウス2世はヴェネツィアに対抗すべくフランスと神聖ローマ帝国との間に同盟を締結した。この同盟はカスティーリャ女王イサベル1世の死に伴う国際情勢の混乱によってすぐに崩壊してしまったが、ヴェネツィアに幾つかの都市を放棄させる事に成功した。ユリウス2世はこの成果に満足していなかったものの、ヴェネツィアと単独で争える程の軍事力を持っていなかった事から共和国との全面衝突は避け、代わりに両国の間で半独立状態にあったボローニャとペルージャを2年間かけて再征服した。1507年、ユリウス2世は再びヴェネツィアに対しロマーニャ地方の返還を求めた。ヴェネツィア議会が再度この要求を退けると、彼は新たに選出されたばかりの神聖ローマ皇帝マクシミリアン1世にヴェネツィアを攻撃するよう働きかけた。マクシミリアン1世は教皇の意向に応じ、戴冠式をローマで行うための進軍と称して1508年に大軍を引き連れてヴェネツィア領に侵攻、ヴィチェンツァまで軍を進めたものの、バルトロメオ・ダルヴィアーノ率いるヴェネツィア軍に敗北を喫した。数週間後に二度目の攻撃が行われたものの、皇帝軍は大敗して逆にトリエステやフィウメにまでヴェネツィア軍に攻め込まれたため、マクシミリアン1世はヴェネツィアとの和議に応じざるを得なくなった。
1508年、ローマ教皇ユリウス2世はイタリア北部におけるヴェネツィアの影響力を払拭するため、フランス王ルイ12世、神聖ローマ皇帝マクシミリアン1世、そしてアラゴン王フェルナンド2世との間に反ヴェネツィア同盟たるカンブレー同盟を結成した。この同盟はある程度の成功を収めたものの、ユリウス2世とルイ12世の対立が原因で1510年に崩壊し、教皇はその後フランスに対抗するためにヴェネツィアと手を組んだ。ヴェネツィアと教皇間の同盟は後に神聖同盟へと発展し、1512年にはイタリア半島からフランスを追い出す事に成功した。しかし領土分割に関する意見対立からヴィネツィアが同盟を離反してフランス側に寝返ると、ルイ12世の後を継いだフランソワ1世の指揮の下、フランス-ヴェネツィア同盟は1515年のマリニャーノの戦いに大勝し、両国は失った領土を取り戻す事に成功する。翌年にノワイヨンとブリュッセルで結ばれた終戦条約によって、最終的にイタリア半島は1508年の開戦前の状態に復帰する事が決定された。
『聖プラクセディス』には、聖人が海綿から絞った殉教者の血を華美な器に注いでいる情景が描かれている。フェリーチェ・フィチェレッリが1640年から1645年に描いた、現在フェラーラのフェルマーニ・コレクションが所蔵する作品と酷似しており、『聖プラクセディス』はこのフィチェレッリの作品からの模写だとされているが、後述のように別の見解も存在する。『聖プラクセディス』とフィチェレッリの作品とのもっとも大きな違いは、胸元の十字架の有無である。もし『聖プラクセディス』がフェルメールの真作で、制作年度も1655年ごろであるならば、『マリアとマルタの家のキリスト』や『ディアナとニンフたち』とともに、フェルメールの最初期の作品の一つであり、知られている作品中で唯一、他の画家による作品からの模写ということになる。ただ、なぜフェルメールが数ある作品の中からイタリアでもあまり名の知られていないこの画家の作品を選んだかは不明である。20世紀半ば以前の『聖プラクセディス』の来歴はわかっていない。コレクターのヤーコブ・レダーが1943年にニューヨークの小さなオークションハウスで購入したのが最初の記録である。1969年、ニューヨークのメトロポリタン美術館でのフィレンツェ・バロックを主題にした特別展でフェリーチェ・フィチェレッリの作品として展示されていたが、この際にイギリス人美術史家マイケル・キットソン (en:Michael Kitson) がフェルメールの作品の可能性があると指摘した。所有者のレダーは同年に死去し、『聖プラクセディス』がフェルメールの真作であると信じていた画商スペンサー A.サミュエルズが購入した。その後、バーバラ・ピエセッカ・ジョンソン・コレクション財団が、1987年にスペンサーからこの作品を購入した。著名なフェルメール研究者である美術史家アーサー・ウィーロックが、『聖プラクセディス』はフェルメールの真作であると主張し始めたのは1986年からである。ウィーロックらがキュレーションした2012年のローマでのフェルメール展ではこの作品も展示されたが、2010年にハーグ他を巡回した『若きフェルメール』展では展示作品に含まれなかった。バーバラ・ピエセッカ・ジョンソン・コレクション財団は『聖プラクセディス』をモナコの訪問会礼拝堂美術館に展示していた。財団オーナーのバーバラ・ピエセッカ・ジョンソンは2013年に死去し、コレクションは競売にかけられるため礼拝堂から2014年に撤去されたが、そのうち『聖プラクセディス』は2014年7月8日に、ロンドンで大手オークションのクリスティーズで競売にかけられた。落札価格予想は600万ポンドから800万ポンドだったが、結局624万2500ポンド（10億8600万円）で落札され、売上の一部がバーバラの出身地ポーランドの自閉症研究施設の支援にあてられた。新たな所有者からこの作品の寄託を受けた日本の国立西洋美術館は、2015年3月17日よりこの作品を常設展示する。