まず感染防止のため、患者を直ちに個別室に隔離する。2009年の英国国立医療技術評価機構(NICE)ならびに、2012年の日本感染症学会の診療ガイドラインでは、発症してから48時間以内といった条件を満たした場合、ノイラミニダーゼ阻害薬の投与を行う。抗生物質は効かないばかりか、薬剤耐性を生み出すので使わない。2009年のNICEのガイドラインでは、オセルタミビル（タミフル）かザナミビル（リレンザ）が治療に選択されるとしている。一方でNICEは、アマンタジンはインフルエンザの治療に推奨していない。さらにアメリカ疾病予防管理センター (CDC) も2005年 - 2006年のインフルエンザについて、アメリカではアマンタジンとリマンタジン（日本未発売）を使用しないように勧告を行った。このシーズンに流行のインフルエンザウイルスの90%以上が、これらの薬剤に耐性を得ていることが判明したためである。2014年、コクラン共同計画と英国医師会雑誌は共同で、出版バイアスを除外して24,000人以上からのデータを分析し、オセルタミビルとザナミビルは、当初の使用の理由である入院や合併症を減少させるという十分な証拠はなく、成人では発症時間を7日から6.3日に減少させ、小児では効果は不明であり、世界的な備蓄が必要なほどの恩恵があるかどうかの見直しの必要性を報告した。2017年には世界保健機関の必須医薬品専門委員会は、そうした新たな証拠があるためオセルタミビルを必須医薬品から補助的な薬に格下げし、重篤な入院患者でインフルエンザウイルスの感染が疑われる場合のみの使用に制限することを推奨した。
2017年4月5日、東京医科歯科大学生体材料工学研究所バイオエレクトロニクス分野の合田達郎・宮原裕二、医歯学総合研究科ウイルス制御学の山岡昇司らの研究グループはヒトインフルエンザウイルスを選択的に捕捉する新たな導電性高分子を開発し、国際科学雑誌 （ACS Applied Materials Interfaces）オンライン版で発表された。開発された導電性プラスチックは、その場での診断を可能にする小型化・微細化・低コスト化・省エネ化に適した電気的なセンサーの開発に繋がる。2019年1月31日、東京大学などのチームがインフルエンザウイルスを高感度で検出できる診断法を開発したと、英科学誌電子版に発表した。従来の1万倍の感度で感染初期からウイルスの検出が可能で、早期の治療開始で重症化の防止が期待される。
真珠湾攻撃後の1942年5月、デュボースは大佐に昇進して重巡洋艦「ポートランド」艦長となる。当時「ポートランド」はトーマス・C・キンケイド少将（アナポリス1908年組）率いる攻撃部隊に属し、日本軍が5月4日から8日にかけて行ったポートモレスビー攻略に伴う珊瑚海海戦に参加した。この戦いで空母「レキシントン」 (USS Lexington, CV-2) が失われ、「ポートランド」は「レキシントン」の生存者722名を救出した。続くミッドウェー海戦ではフランク・J・フレッチャー少将（アナポリス1906年組）率いる第17任務部隊に所属し、空母の護衛任務を担当した。「ポートランド」艦長時代初期のデュボースは、乗組員から「甘いP」 (Sweet ‘P.') というニックネームを授けられていた。しかし、デュボースに率いられた「ポートランド」は、やがて「甘い」どころか激烈な戦場に飛び込んでいくこととなる。「ポートランド」は8月7日から9日にはソロモン諸島のガダルカナル島、ツラギ島に上陸する海兵隊の支援を行い、以降もその後同海域に留まり連合軍の補給線の防衛任務に従事。8月23日から25日にかけて行われた第二次ソロモン海戦参加ののち一旦後退し、部隊に再合流するためギルバート諸島近海を通過中の10月15日にタラワを艦砲射撃し、測量艦「筑紫」や特設巡洋艦「浮島丸」（大阪商船、4,730トン）などを大いに狼狽させた。10月26日、27日の南太平洋海戦において「ポートランド」は空母「エンタープライズ」 (USS Enterprise, CV-6) の護衛を担当。海戦でデュボースは「ポートランド」を巧みに操って「エンタープライズ」を守りきり、その戦功が評価されてデュボースに1回目の海軍十字章が授けられた。間を置かず、「ポートランド」はダニエル・J・キャラハン少将の第67.4任務群に加わって、ガダルカナル島行の輸送船団の護衛を行う。南太平洋軍司令官ウィリアム・ハルゼー中将（アナポリス1904年組）は、輸送任務が終われば任務群は即座に退避するよう命じていたが、ニュージョージア海峡を南下する阿部弘毅少将率いる日本艦隊の接近が報じられたため、キャラハンは決然として日本艦隊に立ち向かうこととなった。11月12日深夜からの第三次ソロモン海戦では、「ポートランド」はキャラハンの旗艦である「サンフランシスコ」 (USS San Francisco, CA-38) の後ろにあり、日本艦隊の戦艦「比叡」と「霧島」に応戦したが、間を置かず駆逐艦「夕立」からの魚雷が「ポートランド」の右舷後部に直撃。「ポートランド」はスクリューを損傷して操舵が困難となり、3番砲塔も損傷し砲塔は旋回不能となった。艦は旋回を余儀なくされたが、生き残っていた砲塔で「比叡」に対して砲撃を行った。朝になり、いまだ旋回を続けていた「ポートランド」は、すでに他の艦艇の攻撃で廃墟となっていた「夕立」に対して砲撃を行い、これを撃ち沈めて復讐を果たした。「ポートランド」は大きな損傷を蒙ったものの生き残り、修理のため後送された。デュボースの「不屈の闘志」と「勇敢で献身的」な行為は高く評価され、2度目の海軍十字章に代わる金星章が授与された。「ポートランド」はメア・アイランド海軍造船所で修理とオーバーホールに入り、その間にデュボースは少将に昇進して「ポートランド」に別れを告げた。