巨大な塔の中の一室に結はいた。椅子に腰かける彼女の傍らには、額にセーフガードのシンボルマークを掲げた男が一人。「気分はどうだね裾野結」。ここはどこか、と問いかける結に男は答える。ここは、ネットスフィアの空間でセーフガードの管理する領域である。基底現実では医療スタッフが結を蘇生させており、意識のみが今ここにある。結の体は新規構築され最高の技術が投入された珪素基系のものにされる。完成したならば、セーフガードの一員として我々に助力せよ、と。要は、命を助けてやる代わりに協力しろ、と、強要しているのである。男の独善的な態度に、強い拒否の意思を示す結。だが、男は無視して続け、「君には洗脳を施す」、「ネット端末移植のない人間は積極的に排除しろ」、「教団が誘拐した子供達に生存者がいたら殺せ」などと暴言を吐く。怒りに震える裾野結。次の瞬間、結の意識は基底現実の自分の体の中に突如帰ってくる。ネットを介して侵入したクローサーが彼女の意識を強制的に覚醒させたのだ。セーフガードの力を使い、統治局の研究施設から逃亡を図る結。そこに再び教団の刺客が現れる。だが、最高峰の技術で作り上げられた体に珪素生物の攻撃は全く効かず、結は難無く2体の珪素生物を返り討ちにし、研究施設からも脱出した。
単身、独自に調査を続ける結。だが、ある日突然、都市の公共サービスを利用できなくなってしまう。統治局の質問センターに問い合わせたが、「裾野結様というお名前での市民登録は存在しておりません」と、にべも無い。どうやら、何者かに市民権を抹消されたようだ。すると、そこへ公衆電話のけたたましいベル音が鳴り響く。訝しみながらも、受話器に手を伸ばす結。電話の相手は教団に殺害されたはずのクローサーだった。彼は、かの一件で肉体を失いながらも、意識をネットスフィアに残存させ生き続けていたのだ。クローサーは結に、セーフガードという組織が彼女を捜していること、教団も彼女のことを追っていることを、助言する。しかし、クローサーのアクセスが教団に関知されてしまった。瞬時に、教団からの刺客、重武装した珪素生物2体が現れる。珪素生物の登場に反応した「剣」を振るい戦おうとする結。だが、抵抗むなしく、結は腕と頭部を切断され惨殺されてしまう。
結は教団の情報を得る為、最下層にある旧市街へと赴く。そこで誘拐現場を目撃したという子供の情報を得る。子供に会いに行くため、最下層を歩く結。そこで会った子供はネット端末移植を受けていた。この地区の子供のほとんどは高価なネット端末移植を受けておらず、そして教団が誘拐したのはいずれも移植を受けていない子供だけだったのだ。
先の建造物の破壊の一件によって、結の警察官としての特権は全て剥奪された。その勧告を受け家路に着くが、家は警告として教団に荒らされていた。また剣の手がかりを知る武器商も殺されていた。その後電車に乗る結。そこにはフードを被った男と大きな箱がいた。箱を弄った後、フードの男は駅に降りる。電車に乗っている結はすれ違いざまにフードの男があの山羊の司祭であると気づく。そして箱の中身は変わり果てた二人の赤子と機器の群れだった。時限式のスイッチが入り、赤子たちはクローサーの時と同じく双頭の異形に変化する。剣の力を振るうべく、電車を飛び降りて広い場所を探す結だったが、異形が行った車両とホームの破壊を結の行為と勘違いした警備部隊により取り押さえられる。その直後、双頭の異形が結を追って現れる。驚いた警備部隊は重火器で破壊を試みるが、双頭の異形の持つ武器の前に壊滅状態となる。手錠で拘束されていた結だったが、剣で手錠を切ることに成功し、刀身の出力が調節できることを知る。そして双頭の異形が警備部隊を一掃しようとする隙をつき、一刀両断に破壊した。涙を流しながらも、結は教団の壊滅に人生を懸けることを再び強く誓う。
アメリカ軍は当初、空爆は地上にいたアメリカ軍部隊を防御するために行われたもので、「近隣の医療施設への付帯的損害があったかもしれない」としていた。アメリカ軍およびNATO軍の司令官であるジョン・F・キャンベル大将は、ターリバーンの銃火にさらされた現地のアフガニスタン軍からの要請により攻撃が行われたと述べていたのに反して、アメリカ軍のAC-130ガンシップが病院を攻撃する決断をしていたことを後に認めた、この航空火力を使用する決断が「アメリカの指揮系統においてなされた」と明言した。キャンベルは、攻撃は「誤り」であり、「保護された医療施設を意図的に狙うことは決してしない」と述べた。ホワイトハウスのジョシュ・アーネスト報道官はアメリカ軍を擁護し、アメリカ国防総省は世界中のどこの軍隊よりも「民間人死傷者を出すことを回避することに、長きに渡って重要な位置を与えてきた」と主張し、犠牲者とその家族への補償示唆した。オバマ大統領は、攻撃は誤りでありターリバーン戦闘員を狙うことを意図したものであったと述べて、国境なき医師団のジョアンヌ・リュー（Joanne Liu）総裁に事件について謝罪した。アメリカは犠牲者の家族に弔慰金の支払いを申し出たほか、病院の再建にも協力するとした。アフガニスタン政府内務省報道官のセディク・セディキ（Sediq Sediqi）は、10月3日に空爆があったことを確認し、「10から15人のテロリストが病院に隠れていた」と述べ、病院の勤務者が殺害されたことを認めた。アフガニスタン国防省とクンドゥーズ警察署長の代理人は、攻撃当時、ターリバーンの戦闘員が病院に紛れ込んでいたと語り、病院を人間の盾としていたと主張した。国境なき医師団によれば、ターリバーンの戦闘員はいなかった。国境なき医師団ゼネラル・ディレクターのクリストファー・ストークスは、2015年10月4日の声明で次のように述べている。「クンドゥーズの病院に対する攻撃を正当化しようとするアフガニスタン政府当局者の最近の声明は不快である。これらの声明は、アフガニスタン軍とアメリカ軍が協力して、180人以上の職員と患者が中にいる完全に機能していた病院を、ターリバーンのメンバーがいたからといって、破壊しようとしたということを意味している。これは戦争犯罪の自白をなしている」。ストークスは言う。「大規模な軍事作戦が進行中であるとしたら、われわれのスタッフは注意を向けるだろう。そして、攻撃が行われたとき、そのようなことはなかった」。10月5日に公開された声明では次のように述べられている。「（アメリカ政府の）攻撃に関する説明は変化しつづけている。付帯的損害から悲劇的な事故、いまはアフガニスタン政府への説明責任を看過させようとする企てに。このおぞましい攻撃を正当化することなどできない」。