水野の死と平行し、発症切れを迎えていた瀬里と真希は女医を急襲するが、瀬里と真希を失敗作と断じた女医はクルーズ船の証拠隠滅を兼ねた爆破を前倒しし、仁奈・神崎・楊は一般客たちに混じって脱出する。女医の命令で瀬里と真希を追い詰めた千歌たちは女医の非道な言動に憤慨して彼女を拘束し、脱出中に瀬里と真希の脱獄を成功させようと反逆する。そのことを知った五菱日本重工は、発症切れを迎えつつある千歌たちに特別機動警備隊を差し向ける。やがて大阪港に到着し、瀬里と真希を見送ろうとする千歌たちの前に、特別機動警備隊が立ち塞がる。それに先駆けて発症切れを迎えていた千歌たちは抵抗の果てに拘束されるが、瀬里と真希を脱獄させることには成功する。瀬里と真希は新大阪駅から一旦新神戸駅へ向かうことによって特別機動警備隊の追跡を振り切り、改めて名古屋へ向かう。
千歌は小夜子との奇策も用いて神崎を感電による気絶に追い込み、海へ転落させる。美依那と霧子のもとへあや・瀬里・真希・カレン・カチュアも加わっての猛攻は、きわめて頑強な肉体を誇る水野と人間離れした身体能力を持つ烏丸にすべてしのがれて圧倒されたうえ、そこに現れた生き残りの幹部たちとも戦闘となる。しかし、もはや一般客たちによる目撃も気にしない激戦の果てに千歌と小夜子も駆けつけたことから、幹部たちは谷に恋慕する楊紅花を除いて全滅する。船内の各所では、幹部たちの無残な死体を発見した一般客たちがパニックを起こし始める。そんな中、水野との最終決戦に臨んだ千歌は、それまで美依那たちが彼に積み重ねていたダメージがようやく目に見える形で響いたことも重なり、小夜子たちに見守られながら辛勝を収める。
2010年1月、プリンスの出身地であるミネソタ州が本拠地のミネソタ・バイキングスのトリビュートソングのレコーディングを行った。6月7日、新曲Hot Summerを公開（この日は自身の誕生日でもある）。7月10日、イギリスとベルギーの新聞に新作である『20ten』を付録として配布。7月22日、ドイツの雑誌「Rolling Stone magazine」に『20ten』を付録として配布。2012年11月、NPGのギタリストであるアンディ・アローのアルバムをプロデュース。2013年1月、twitterに於いて「3RDEYEGIRL」なるアカウントがプリンスの新曲・スタジオライブ映像をYoutubeにアップロードし始める。その後、Youtubeに投稿された動画は削除されたため同アカウントとプリンスの関係が取沙汰されたが、「3RDEYEGIRL」で正式にサイトを開設し、プリンスの新曲や動画のダウンロード販売、コンサートのチケット販売が開始された他、「3RDEYEGIRL」がプリンスがプロデュースする女性グループである事が発表された。2014年2月2日、アメリカ・FOXチャンネルの番組『New Girl～ダサかわ女子と三銃士　シーズン3』の2月2日放送回にプリンスがカメオ出演し、主演のズーイー・デシャネルをフィーチャーした新曲「FALLINLOVE2NITE」を公開した。3月18日、新曲「FALLINLOVE2NITE」の配信リリースを午前0時より日本のiTunes Storeでスタート。4月18日、古巣ワーナー・ブラザースと新たに契約を結んだことが突然公式発表される。加えて新曲「ザ・ブレイクダウン」のデジタル配信もスタートされる。以下はプリンスの弁『実は新しいスタジオ・アルバムも予定しているんだ。僕とワーナー・ブラザースはお互いの交渉にすごく満足しているし、このパートナー関係が実り多いものになるのを楽しみにしている。』7月4日、「Essence Festival」のヘッドライナーを務めたプリンスが、同フェスに出演していたナイル・ロジャースのセットに飛び入りし、デヴィッド・ボウイの「レッツ・ダンス」をカバー。9月30日、プリンス名義で『Art Official Age』を、3RDEYEGIRL名義で『PLECTRUMELECTRUM』を、前述のとおりNPGレコードからワーナー・ブラザースに独占的ライセンスされて同時リリースされた。これは、プリンスにとって4年ぶりのスタジオアルバムのリリースとなった。発売時には、自らそのセレブレーションとして、自身の所有するスタジオであるペイズリーパークからネットを介した世界同時中継を敢行した。この両作は、日本のオリコン週間チャートでも10位以内に入った。2015年2月8日に行われた第57回グラミー賞にAlbum of The Year部門のプレゼンターとしてサプライズ登場。この時の、"Albums — remember those?（アルバムって覚えてる？）"と"Like books and black lives, albums still matter（本や黒人の命と同じように、アルバムもいつだって大事なんだ）"はアルバムの存在と、トレイボン・マーティン射殺事件などに対するスピーチとして話題となった。9月7日にアルバム『HITnRUN Phase One』を、12月11日にその続編『HITnRUN Phase Two』を音楽ストリーミングサービスTidalから先行リリース。2016年4月15日、プリンスは移動中の自家用ジェット機内にてインフルエンザによる体調不良が悪化し、病院に緊急搬送された。だが、翌日16日には地元ミネアポリスのプリンスの所有する「ペイズリー・パーク・スタジオ」にて催行されているダンス・パーティでファンの前に姿を現した。ところが4月21日の早朝、「ペイズリー・パーク・スタジオで誰かが亡くなったようだ」と米ゴシップ・サイトのTMZが第一報で報じ、その後、「発見された遺体がプリンスのものである」とAP通信など複数のメディアが報じた。CNNはその時「ペイズリー・パーク・スタジオ内で何が起こったか警察が現在調べている」と報じており、発見時の状況について「スタジオ内のエレベーターの中で意識不明の状態」とされていたが、6月2日にミネソタ州の検視当局により死因は鎮痛剤のフェンタニルの過剰投与による中毒死である報告書が公表された。2016年6月、ミネソタ州知事のマーク・デイトンにより、6月7日を「プリンス・デー」とすることが発表される。