単式ホーム1面1線と島式ホーム1面2線を持つ地上駅。1・2番線が本線、3番線が副本線となっている。3番線から保線車両留置用の側線が分岐している。2つのホームは跨線橋で連絡している。折り返し列車が多数あり、運行上の拠点になっている。3番線が折り返し専用であり、ふじかわの通過待ち以外はすべて折り返し列車となっている。ただし、ダイヤ改正により通過待ちに使われなかった時期もあった。3番線に入線する列車は3 - 6両編成までである（ただし、6両が停車してもホームにはまだ2両ほど余裕がある）。そのため3番線に入線する上り列車は編成が6両より長いとき、静岡駅で運行する編成を短くしている。東海交通事業の職員が業務を担当する業務委託駅で、清水駅が当駅を管理している。構内南側の単式ホーム（1番線）に接してコンクリート造りの駅舎がある。内部には待合所やJR全線きっぷうりば・自動券売機・簡易型自動改札機などが設置されている。早朝・夜間は無人となる。かつては売店が営業していたが、今は営業が中止され店舗自体も撤去されている。
東西両京を結ぶ鉄道計画で東京～名古屋・岐阜間のルートが中山道経由から東海道経由に変更された際、東海道五十三次17番目の宿場町であった興津宿では、小躍りして喜んだという。そして鉄道のことをよく知ろうと、ジャーナリストや経済・法律の専門家を呼び寄せ、興津の宿の一つで宴会を催したともいわれる。ぜひ興津に駅を設けて欲しいと、隣の清見寺をもつ清見寺町の住民も巻き込んで熱心な誘致運動を展開し、それが功を奏して路線の開業とともに「興津駅」は誕生した。その際、清見寺では境内の一部が鉄道敷地として召し上げられ、それによって風致が損なわれた事に対する補償金が支払われたが、寺の住職はそれを献納したといわれる。現在でもその名残で、東京側から見ると興津駅を過ぎた先で、清見寺の総門と本堂の間を東海道本線が横切っているのを見る事ができる。大正から昭和戦前にかけての元老、西園寺公望が晩年を過ごした別荘「坐漁荘」の最寄り駅としても知られ、当時は政府閣僚らが事あるごとに興津駅を利用したという。また西園寺の上京に備え当駅に西園寺専用の優等車両が配置されていたといわれる。
当初はレシプロ機であるホーカー シーフューリー、フェアリー ファイアフライを搭載していたが、改修後はグラマン アベンジャーとジェット機であるホーカー シーホークを搭載するようになった。1960年以降はアベンジャーはグラマン トラッカーに変更された。また、ヘリコプターも搭載している。
2008年9月29日、第16期倉敷藤花戦の挑戦者決定戦で甲斐智美女流二段を破り、初のタイトル挑戦を決め、「タイトル挑戦」の規定を満たし、2008年9月29日付で女流二段に昇段した。清水倉敷藤花との三番勝負では、第1局（11月6日）第2局（11月23日）で連勝し、林葉直子、中井広恵に続く史上3番目の若さの16歳8か月で初タイトルの倉敷藤花に輝き、「タイトル1期」の規定を満たして、翌2009年4月1日付で女流三段に昇段した。連盟関西本部に所属する女流棋士のタイトル獲得は史上初であった。2009年1月9日、第40期新人王戦で稲葉陽四段を破り、「女流棋士が公式戦で男性棋士を破る史上最年少記録」を大幅に更新（16歳10か月）。また、男性棋士との公式戦2戦目での勝利は、当時の最速記録である。里見は、同年、『将棋世界』2009年10月号掲載の若手実力派の村山慈明五段との平手対局で勝利を収めている。同年11月22日、第17期倉敷藤花戦で中村真梨花女流二段の挑戦を退けてタイトル初防衛。同年、第36期女流名人位戦A級リーグ戦にて7勝2敗の成績で千葉涼子女流三段、岩根忍女流二段と1位で並び、3人によるプレーオフの末、挑戦権を得る（12月10日）。清水女流名人との五番勝負では清水に第1局(1月24日）、第2局（1月31日）、第3局（2月10日）までで3連勝し、史上3番目の若さ（17歳11か月）で女流名人を奪取し、十代では史上2人目、林葉直子（15歳0か月）に次ぐ若さで女流二冠となり、「タイトル3期」（女流名人1期、倉敷藤花2期）の規定を満たし、2010年2月12日付で女流四段に昇段。同年、第60回NHK杯将棋トーナメントに初出場。初戦で小林裕士六段に敗れる。一方、『将棋世界』2010年10月号掲載の「里見香奈 試練の三番勝負!」で橋本崇載七段に勝利した。同年9月30日、第32期霧島酒造杯女流王将戦の挑戦者決定戦で上田初美女流二段を下して挑戦権を得る。清水女流王将との三番勝負では、10月28日に行われた第2局、第3局を連勝したことで2勝1敗と勝ち越し、女流王将を奪取し、18歳7ヶ月で、史上3人目・史上最年少の女流三冠となる。それまでの女流三冠最年少記録は、1994年に清水が達成した26歳0か月であった。同年11月3日、第18期倉敷藤花戦で岩根女流二段の挑戦を退け3連覇。