6月、28日に全米選手権の男子100m2次予選で9秒89（+1.6）をマークし、30歳を越えてから初めて10秒の壁を突破した。29日の決勝では追い風参考記録ながら9秒84（+4.1）をマークして3位に入り、北京オリンピックのアメリカ代表の座を掴んだ。8月、北京オリンピックの男子100mと4×100mリレーに出場。初出場となった100mは2次予選で10秒04（+0.1）、準決勝で10秒03（+0.3）と9秒台に迫るタイムで決勝に進出し、10秒03（0.0）で8位に入った。4×100mリレーでは予選で3走（ロドニー・マーティン、トラビス・パジェット、パットン、タイソン・ゲイ）を務めたが、ゲイとのバトン交換の際にバトンを落としてしまい途中棄権となった。
8-9月、大阪世界選手権の男子4×100mリレーに出場すると、決勝で1走（パットン、ウォーレス・スピアモン、タイソン・ゲイ、リロイ・ディクソン）を務め、37秒78をマークしての金メダル獲得に貢献した。
8月27日、アテネオリンピックの4×100mリレーに出場すると、予選で2走（ショーン・クロフォード、パットン、コビー・ミラー、モーリス・グリーン）を務め、38秒02をマークしての決勝進出に貢献した。アメリカチームは決勝で銀メダルを獲得し、パットンは決勝に出場しなかったが予選を走ったのでメダルを獲得した。
8-9月、パリ世界選手権の男子200mと4×100mリレーに出場。200mは準決勝を20秒03（+0.6）の自己ベストで突破したが、決勝では20秒31（+0.1）とタイムを落とし、優勝したジョン・カペルと0秒01差の2位で銀メダルに終わった。しかし、4×100mリレーでは3走（ジョン・カペル、バーナード・ウィリアムズ、パットン、ジョシュア・ジョンソン）を務め、38秒06をマークしての金メダル獲得に貢献した。
ロシアのロックバンドAquariumは「アファナーシー・ニキーティン・ブギ」という曲を作曲した。また同じくロシアのパワーメタルバンドエピデミアは、ニキーティンの『三海渡航記』 を歌った"Хождение за три моря"を作曲した。トヴェリには、「アファナーシー」という銘柄のビールが存在する。
1955年、トヴェリ市政府がヴォルガ河畔にセルゲイ・オルロフの手によるニキーティンのブロンズ像を建てた。俗説によれば、当時のソビエト連邦の最高指導者ニキータ・フルシチョフがインドを訪問した際、インド首相ジャワハルラール・ネルーから「ロシアは最初にインドを訪れたロシア人を顕彰しているのか」と問われ、ロシアにはアファナーシー・ニキーティンの像が立っていると答えた。しかし実際にはそのようなものは無かったため、フルシチョフはネルーがロシアを訪問して嘘を暴かれないうちにと、ロシアに電話して直ちにニキーティンの像を建てるよう命じたのだという。この像は、2005年にトヴェリ州創設75周年記念切手の図版として使われた。また1997年には、ニキーティンの旅525周年記念硬貨が発行されている。1958年、モスフィルムで『三海渡航記』 と題した映画が製作された。オレグ・ストリジェノフがアファナーシー・ニキーティンを演じた。2000年、ムンバイの南120キロメートルに位置するレブダンダ村にニキーティンの記念碑が建てられた。この地はニキーティンがインドに最初に足を踏み入れた地とされている。2006年、インドの「アドベンチャラーズ・アンド・エクスプローラーズ」という団体が、インド駐モスクワ大使館やトヴェリ市政府の後援の元「ニキーティンの遠征」を再現した。これは14人のメンバーでトヴェリを出発し、ロシアから中東、中央アジア、インドとニキーティンの足跡をたどっていく旅であった。この「遠征」は2006年11月12日から2007年1月16日までかかり、インドのザ・ヒンドゥー紙が数度にわたり遠征の進行状況を報じた。インド到着後、さらにメンバーのうち2人が2007年3月にムンバイを出発し、SUVでニキーティンのインドにおける旅路をたどった。インド洋には、アファナーシー・ニキーティンの名を冠した海山がある。
明治維新で武家社会が終焉を迎えると活動を一時中絶するが、竹原家や旧藩士の尽力により保存された。1895年（明治28年）に竹原惟路が没した時に男子がなかったため、細川興増男爵（細川氏一門の子飼細川家〈長岡刑部家〉当主）に幽斎の印・伝統系図・伝書類などが預けられ、松井氏（旧家老家、八代城主）ら門人により伝統が守られたが、1930年（昭和5年）に竹原家の後継者正文に返還された。1961年（昭和36年）に武田流（細川流）騎射流鏑馬が熊本県重要無形文化財に指定され、竹原正文がその保持者に認定された。1971年（昭和46年）に武田流騎射流鏑馬保存会が熊本で発足し、1975年（昭和50年）3月24日には同保存会が熊本県重要無形文化財「武田流騎射流鏑馬」の保持団体に認定された。現在は竹原陽次郎が「宗家師範（47代）」である。これとは別に、明治～昭和期の高弟、井上平太の系統の団体が存在する。竹原惟路の没後、旧熊本藩主の細川護久侯爵は井上平太に伝書一切を印可相伝させ、「第三十三代武田流司家」を襲名させたという。井上は昭和8年に没し、翌9年に井上の弟子金子有鄰が細川護立侯爵（当時の細川家当主）の許しを得て、細川侯・熊本県知事立会のもと、「三十四代武田流弓馬軍礼故実司家」を相伝した。1939年（昭和14年）には金子堅太郎を会長に社団法人大日本弓馬会が設立された。以来、武田流弓馬道を名乗り鎌倉市に所在し活動している。現会長は金子家教で、「武田流司家、弓馬軍礼故実司家芸州武田氏正統師範」を名乗っている。また別に、金子有鄰の六郎家堅氏を師範として日本古式弓馬術協会（武田流鎌倉派）が結成され、弓馬軍礼武田家の道統を受継ぎ活動している。 。