家名はシュタイアーマルクのオプダッハ（Obdach）にあったエッペンシュタイン城から名付けられた。バイエルン発祥であり、ユーデンブルク付近を拠点とした。マルクヴァルト3世（970年以前 - 1000年頃）が最初にシュタイアーマルク辺境伯となった。アダルベロは広大な領土を確保し、1000年頃にケルンテン辺境伯に、そして1012年にはケルンテン公に任ぜられた。1035年に退位させられ、4年後に死去した。アダルベロの息子マルクヴァルト4世（1076年没）は、広大な領土を継承し、ケルンテンの事実上の支配者となった。その息子ルイトポルト（1090年没）は、1077年にハインリヒ4世により再びケルンテン公およびヴェローナ辺境伯に任ぜられた。ルイトポルトは弟ハインリヒとともに、バンベルク、ザルツブルクおよびアクイレイアまで勢力を拡大させようとした。父マルクヴァルトとハインリヒはシュタイアーマルクにザンクト・ランブレヒト修道院を創設し、修道院は文化の中心となった。1122年、ハインリヒの死去によりエッペンシュタイン家は断絶した。上シュタイアーマルクの領地は従兄弟オタカール2世（1122年没）およびその息子レオポルトに継承された。ケルンテン公領は親族のシュポンハイム家の手に渡った。
第12王朝のアメンエムハト3世（前1842-前1797）の死後、非王族である可能性が指摘されているアメンエムハト4世（前1798-前1786）が跡を継いだ。彼の治世についてはほとんど知られていない。その後女王セベクネフェルが即位した。女王即位という事態は後継者問題の存在、恐らくは男系王統の断絶を示すであろう。その後、第13王朝が成立した。第12王朝から第13王朝への交代は大きな問題もなく行われたように思われるが、第13王朝の王達については多くの場合詳細がわからない。その初代王はかつてトリノ王名表の記述からウガエフであると考えられていたが、現在ではセベクヘテプ1世が初代であると認識されている。現代の研究者はこの二人が名前（即位名）の類似（クタウィラーとセケムラー・クタウィ）のためにトリノ王名表の編者によって混同された結果、ウガエフが初代王であるという記載がされたのだと考えている。セベクヘテプ1世と、第2代のセネブエフは第12王朝のアメンエムハト4世の息子である可能性がある。だが、明らかに第13王朝の王達は単独の家系によって構成されておらず、数多くの明瞭でない出自の王達から成っていた。このような状況は王位継承についての異変があったことを示すが、それぞれの王達の関係については系図の再構成はもちろん、王位継承順についても復元に問題があり、学者達は統一した見解を見つけられないでいる。この原因の一つは第13王朝の王名、継承順についての主要史料であるトリノ王名表の保存状態が悪く、分析が困難であることである。また、この王朝には平民出身の王が数多くいた。セベクヘテプ2世の父はネンと言う名前の平民であったことがトリノ王名表の記録からわかる。即位前には高級官吏であったセベクヘテプ3世の父親は平民のメンチュヘテプ（メンチュヘテプA）であった。彼の跡を継いだネフェルヘテプ1世もまた、その両親が平民であったことは各種の資料から明白である。このような状況で、第13王朝の王権は極めて弱体化していたと見られる。マネトはこの王朝はディオスポリス（テーベ）の60人の王からなるとするが、個々の王については何も触れない。また、トリノ王名表には少なくとも36人の王が記録されている。明らかに第13王朝の王達の平均在位期間は数年程度であった。にもかかわらず、第13王朝の政府機構は王朝が存続したほとんどの期間において正常に機能していた。初代のセベクヘテプ1世や次のセネブエフは統治機関の短さとは裏腹に、記念碑の分布から全エジプトにその権威を及ぼしていたし、セベクヘテプ2世以降はやや王位が安定し、やはりエジプト全土を支配下に置いている。この理由として第12王朝時代に長期間かけて作り上げられ、センウセルト3世（前1878 - 前1841）によって完成されていた官僚機構が第13王朝時代にも正常に機能していたことがあげられる。中王国の官僚組織は極めて完成度が高かったらしく、王権が弱体化しても事実上の統括者であった宰相を中心として国家を運営することが可能であったと見られている。この見解は第13王朝についての伝統的な見解であるが、一方で資料の不足のためかつての（あるいはその後の）王朝と第13王朝の統治がどのように異なっているのか具体的には不明なため、こうした見解に異を唱える研究者も近年登場している。上記の通り、第13王朝の歴史を細かく明らかにするのは困難であるが、政治の実権を握る宰相職の世襲が進んでいたことがわかっている。セベクヘテプ2世時代の宰相アンクウは、次のケンジェル（前1747年頃）王の治世下でも権勢を振るい、その後彼の子供、孫へと宰相職が世襲された。このことが関係するのか必ずしも明らかではないが、アンクウの孫イイメルウが宰相となったセベクヘテプ4世の時代には下エジプト（ナイル川デルタ地帯）のクソイス出身とされる政権（一般に第14王朝と言われる）が狭い範囲を支配下において第13王朝の統制を離れ、エジプトの統一は再び失われた。1つ明らかであるのはこの時代には下エジプトで「アジア人」の勢力が増大していたことである。彼らアジア人は少なくても第1中間期以来、傭兵や奴隷、そして時には外敵としてエジプトに入っていた。彼らはエジプト人の歴史叙述においては「侵入者」と見なされるが、実際には中王国時代にアジア系の高官が輩出しており、その人的交流は相当に活発であった。アイ王（前1720頃）は、第13王朝の王の中で最も長く在位した王であり、その治世は約23年間続いた。同時に彼は上下エジプトにその名を記した記念建造物を残す最後の王でもある。彼の時代以降、下エジプトでは第13王朝の統制は完全に及ばなくなった。そのため中にはアイ王を中王国時代最後の王と見なす研究者もいる。その後下エジプトでは第14王朝に続きアジア系の王が築いたとされる第15王朝が権力を確立していく。彼らアジア系の支配者はヒクソスと言う名で知られている。マネトの記録によればヒクソス（第15王朝）はトゥティマイオスと言う名前の王の時にエジプトの支配権を握ったとされている。終盤の第13王朝の王達はヒクソスの宗主権のもとで上エジプト（ナイル川上流）を統治した可能性があるとされているが、その終焉についての情報はない。ヒクソス支配下のエジプト北部と、南部とが分裂した時代は第2中間期に分類される。