相模国足柄下郡小田原で没落士族の家に生まれた。本名は北村門太郎。弟に日本画家の丸山古香（本名は垣穂）がいる。親とともに上京し、東京の数寄屋橋近くの泰明小学校に通った（のちの筆名・透谷は「すきや」をもじったもの）。1883年、東京専門学校（現在の早稲田大学）政治科に入学（東京専門学校には、1886年（明治19年）頃まで籍を置いていたとされるが、卒業はしていない）。自由民権運動に参加したが、運動は次第に閉塞してゆく時期であり、大阪事件の際同志から活動資金を得るため強盗をするという計画を打ち明けられ勧誘され絶望し、運動を離れた。1888年、数寄屋橋教会(現・日本基督教団巣鴨教会)で洗礼を受けた。同年、石坂昌孝の娘、石坂ミナと結婚。その後、アメリカ・クリスチャン教会からD・F・ジョーンズ宣教師の通訳として麻布教会(現・日本基督教団聖ヶ丘教会)へ通う。1893年夏には、伝道師として基督教会の磐中教会から福井捨助の開拓した花巻教会を支援する。1889年『楚囚之詩』を自費出版したが、出版直後に後悔し自ら回収した。1891年『蓬莱曲』を自費出版。1892年に評論「厭世詩家と女性」を『女学雑誌』に発表し、近代的な恋愛観（一種の恋愛至上主義）を表明した。「恋愛は人世の秘鑰（ひやく）なり」（鑰は鍵の意味）という冒頭の一文は島崎藤村や木下尚江に衝撃を与えたという。1893年に創刊された『文学界』誌上に「人生に相渉るとは何の謂ぞ」、「内部生命論」など多くの文芸評論を執筆（当時は尾崎紅葉ら硯友社の最盛期であった）。また、イギリスから来日したクエーカー教徒のジョージ・ブレイスウェイトと親交をふかめ、その影響もあって絶対平和主義の思想に共鳴し、日本平和会の結成（1889年）にも参画、機関誌『平和』にも寄稿した。しかし、日清戦争前夜の国粋主義に流れる時勢も反映したのか、次第に精神に変調をきたし、評論『エマーソン』を最後に1894年、芝公園で首吊り自殺。25歳だった。透谷の作品群は、上記の近代的な恋愛観からも窺えるように、ジョージ・ゴードン・バイロンやラルフ・ワルド・エマーソンの影響下にロマン主義的な「人間性の自由」という地平を開き、以降の文学に対し、人間の心理、内面性を開拓する方向を示唆している。藤村は『桜の実の熟する時』『春』において透谷の姿を描いている。
京都府内の市町村と滋賀県・大阪府・奈良県・兵庫県・愛知県・東京都に支店と出張所を持つ。戦前まで、京都市内における銀行は東京市内（現：東京23区）と同じくほとんどが都市銀行の支店であり、地元の地銀は小規模のものが数行存在していたに過ぎなかった。しかも、そのいずれもが結局大手銀行への併合の道をたどり、京都大内銀行が安田銀行と当時福知山に本店を置いていた丹和銀行に分割譲渡されたのを最後に、戦時中において、京都市内では地元地銀が消滅してしまった。戦後、地域産業発展のため地元資本による地銀の設立を求める声が起こり、また蜷川虎三京都府知事も中小企業金融の充実に積極的であったこと、加えて日銀京都支店を歴任した一万田尚登総裁も「大都会に本店銀行がないのは日本七不思議の一つである」と地元本店銀行の必要性を説いたことから、丹波・丹後地区における戦時中の統合銀行であった丹和銀行が京都市内に進出した。すでに同行時代において、日本勧業銀行京都支店から京都府の本金庫（指定金融機関）業務を移管されていたこともあり、それに相応しい商号に変更する必要があるとして1951年に京都銀行に行名を改めた。さらに1953年には本店を京都市の現在地（旧：高島屋跡）に移転している。その後、京都市内における店舗拡大策として、都銀をはじめとした他銀行の支店の譲受や自主出店によって店舗を増やした、その一方で1980年代に府外支店の大部分を整理している。1998年6月、柏原康夫が頭取に就任する。当時京銀も少なからず不良債権を抱えており、担当部署から先述の株式含み益によって不良債権を処理する案が具申された。しかし、含み益を使用した場合には保有株式の簿価が上昇し、経営基盤が弱体化するため、それは使用せず、就任1年目はあえて赤字決算を計上した。その時分、京銀の資金量は地銀界において15～16位程度につける横ばいの状態が続き、周囲の金融機関を見渡してもリストラが横行していた。そうした中、柏原は銀行の規模を拡大することによって収益力を高めていく成長戦略に舵を切った。だが、京都はメガバンクのほか有力信金も存在する全国有数の金融激戦地であるため、府内で資金量を増やすことは至難の業であった。そこで、隣接県に出店して規模を拡大していく方針を定めた。それに沿って、2000年12月に滋賀県草津市に新規出店したことを皮切りに、「広域型地銀」を標榜し店舗の連続性を考えながら水が染み透るように出店を重ね、滋賀、大阪、奈良へと店舗網を拡張。さらに兵庫にも尼崎支店（2004年12月）、神戸支店（2005年9月）、川西支店（2007年10月）、六甲道支店（同11月）を開設するに至っている。また、2011年4月にはかつて撤退した名古屋支店を再出店。それに先立って、2011年1月より中京広域圏（テレビ愛知含む）でのテレビCM放送を開始している。このほか、2015年12月には、東京支店を営業部に昇格し人員を10名増員したほか、2016年7月19日には愛知県下2店目となる刈谷支店および刈谷住宅ローンプラザを刈谷市に開設した。これによって2000年以降の出店は50店舗超を数えた。京銀は後発であるため、京都市の指定金融機関には指定されず、また市内シェア（預金1兆円以上の金融機関のみで）も三菱UFJ銀行や京都中央信用金庫、京都信用金庫、三井住友銀行などと分け合っている。旧三和銀行の流れを汲み、京都でのシェアが高いMUFGは、府内預金シェア約15%、貸出シェア10%で、預金・貸出とも当行に次ぐ2位。京都中央・京都信用金庫を抜いた模様。京都府の出納機関業務を京都中央信金が固辞したため、京銀が烏丸高辻に本店を建設したとの話がある。また上記の経緯から京都市との結びつきは少ないが、府下の他市町村とは紐帯も強く、京都市以北では京都北都信用金庫と並び重要な地位をしめている。京阪電気鉄道と提携して駅構内ATM「ステーションATMエキバンク」を主要駅に展開している。