本系列は長らく東武東上線には配置されていなかったが、2011年1月26日に31601F・31401Fが森林公園検修区へ回送され、6月13日より東上線での営業運転を開始した。同年10月には31611F・31411Fが同様に森林公園検修区に転属し、同線で運用に就いている。前述したが、これは東上線車両の改修工事の効率化を目的としたものである。その後、2015年1月15日に31602F・31402Fが東上線に転属したことにより、半蔵門線・田園都市線との直通運転対応機器が搭載された31606F・31406F・31609F・31409Fを除く全編成（130両）が東上線に転属し、東武本線の地上線運用から撤退した。東上線転属後はクハ36600形とクハ31400形は付随車（サハ）に改造されており、10両固定編成化されている。ただし、乗務員室の撤去は実施されていない。また、先頭車の電気連結器の撤去、床下車両情報制御装置本体の更新や運転台計器類の液晶モニター化 (グラスコックピット) 、マスコンハンドルの交換、行先表示器や自動放送装置のプログラム変更なども実施されている。2018年10月から、31604F+31404Fの車体に高坂駅を最寄りとする埼玉県こども動物自然公園のラッピング広告が貼付されている。
車内の客用ドア上部には千鳥配置（交互配置）で20070系で使用されているものと同種の旅客案内表示器が設けられており、左側には種別と行先を常時表示し、右側では次駅案内・乗り換え案内等をスクロール表示する。ドアの開閉に合わせてドアチャイムを鳴動する。現在の自動放送装置は直通先を含めて英語放送にも対応している。このほか側面に車外スピーカーが設けられており、車掌の操作で乗降促進放送を流す機能がある。
乗務員室はそれまでのグリーンの配色をやめ、ダークグレーの色調としている。運転台コンソールは淡いグレーの色調で落ち着いた色調としている。主幹制御器は前述の通りワンハンドルマスコンを採用している。計器盤中央に車内信号に対応した速度計があり、両側に表示灯を、右側には車両情報制御装置のモニター表示器が収納されている。乗務員室仕切は客室から向かって左から（運転台背面は壁）仕切扉窓・固定窓がある。遮光幕は両方の窓に設置している。
20 m両開き4ドア、車体は軽量ステンレス製鋼体であり、従来の東武ステンレス車と同じく「ロイヤルマルーン」色の帯を巻く。前頭部はFRPの成形品を使用し、併結運転を考慮して正面貫通式である。客室との仕切壁付近には地下線内における非常用の梯子が設置してある。前照灯は東武では初めてHID式を採用した。下部にはスカートを設置したが連結器の関係で高さを限界まで下げている。連結器は密着連結器であり、下部に併結運転用に二段の電気連結器がある。上部の122接点が本系列と10000系列の共用、下部の37接点は本系列同士の連結用である。側面見付は10030系に準じているが、扉間の側窓が2連のユニット窓となった。客用ドアは高さを10000系列より50 mm高い1,850 mmとしており、ドアガラスには複層ガラスが使用されている。連結部には新たに転落防止幌が設置された。前面・側面の行先表示器はLED式であり、前面には種別・行先表示・運行番号の表示器が、側面には従来車よりも横幅が約2倍ある大型の種別・行先表示器がある。東武線内における半蔵門線直通列車では行先の右側に「半蔵門線直通」と表示される。当初は乗り入れ先の東急田園都市線での使用に備えて、前面に急行灯（通過標識灯）が設置されていたが、その後直通先の東急田園都市線内での前面の急行灯の使用停止に伴い、2002年（平成14年）度の増備車である31611F・31411F以降より急行灯が省略されている。
化学において、ヘテロリシス (英: heterolysis) または不均一結合開裂とは化学結合の開裂のことであり、特に電荷を持たない分子からカチオンとアニオンを形成するものをいう。この過程で、結合に使われていた2つの電子は2つとも同じ原子団に渡される。より電気的に陰性な残基が電子を受け取る。このイオン対の開裂過程に必要なエネルギーのことをヘテロリシス結合解離エネルギーと呼ぶ。電解質溶液ではこの追加のエネルギーは少なくて済む。ほかのタイプの結合開裂にホモリシスと呼ばれるものがある。
1940年代には酵母から抽出した混合物の免疫特性が研究されており、1941年、ルイス・ピレマー（Louis Pillemer）は酵母細胞壁抽出物にザイモサン(Zymosan)と名付けた。ザイモサンは1943年に事典にも登録されている。1958年にDi CarloとFioreによってザイモサンの50～60％がグルカンである事が確認された。1961年にはRiggiとDi Luzioによってザイモサンの活性成分がβ-1,3-グルカンである事が確認された。穀物および菌類製品は、何世紀にもわたって医薬品や化粧品用途として使用されてきた。しかしながらβ-グルカンの特異的な機能性について20世紀になるまで調査されていなかった。β-グルカンは、最初地衣類から発見され、その後すぐに大麦からも発見された。1981年にコレステロール低下作用が報告されたオート麦β-グルカンは特に注目された。1997年、FDAは1日当たり3.0gのオート麦β-グルカン摂取はコレステロールと冠状動脈性心疾患のリスクを低下させるというクレームを承認した。承認されたヘルスクレームは後に修正され、次の由来に含まれるβ-グルカンが追加されている。ロールドオーツ（オートミール）、オート麦ふすま、オート麦全粒粉、Oatrim（非デンプン多糖から作った脂肪代替物の商品名）、大麦全粒粉、大麦ベータ繊維。許容される表示の例：「飽和脂肪酸とコレステロールが少ない食事の一種であるオートミール由来の可溶性食物繊維は、心疾患のリスクを減少させます。この効果を得るのに必要な一日あたりの量である3.0gのうち、0.75gのβ-グルカン水溶性繊維を一杯のオートミールは供給します。」この健康強調表示の表現は、連邦官報21号連邦規則集101.81「特定の食品に由来する可溶性繊維および冠状動脈心疾患(CHD)のリスク」に記載されている。