1836年1月、ボウイは30名の分遣隊と共にベハルに到着した。彼の任務は、そこでの要塞を解体することだったが、ボウイは知事へ、アラモ砦を戦略的に重要な場所として保持する要請を書いた。ボウイと彼の兵士はすでにアラモ砦にいた79名の兵士に加わり、その後の数週間の間に、ウィリアム・トラヴィスと30名の兵士、デイヴィッド・クロケットと12名の兵士が加わった。アラモ砦の司令官、ジェームス・ニール (en:James C. Neill) 大佐は伝道所を去り、兵士たちはボウイを司令官に選出した。彼はお祝いに酒を飲み、その後、ボウイはトラヴィスと責務を共有することに同意した。1,500名の騎馬隊から成るメキシコ軍は、2月後半にベハルに到着し、テキサス軍に降伏を要求した。ボウイは拒否したが、2月24日には、おそらく進行していた結核のために倒れ、小さな部屋に幽閉された。メキシコ軍が攻撃した3月6日に、彼はアラモの防備兵の残りとともに死んだ。ベハルの知事、フランシスコ・ルイスは彼の遺体を確認し、サンタ・アナはボウイの死体を詳しく観察して死亡を確認した。
結婚後すぐに、ボウイは「失われた」ロス・アルマグレス鉱山の物語に魅了された。彼はメキシコ政府に、伝説の銀の鉱山の探しにインディアンの領地への遠征の許可を得た。1月2日、彼の兄レズィンと他9名の仲間とトモニ、ボウイはサンサバへ向かった。途中インディアンの襲撃に出くわし、交渉を試みるが失敗し、やむなく13時間も戦うこととなった。インディアンが最終的に撤退した時、ボウイの仲間は1名が死亡し、インディアンは40名が死亡、30名以上が負傷した。一行はサンアントニオへ一度戻り、1832年1月に再びより大きな軍で出発した。2ヶ月半の探索ののち、一行はなんの効果も見せずに戻ってきた。
1830年1月1日、ボウイと彼の友人のアイザック・ドノホはティバドーを発ちテキサスへと向かった。記録されているのは、彼らはナカドーチェスのブラゾス川の近くにあるJared E. Groceの農場に寄り、サンフェリペではスティーブン・オースティンへの紹介の手紙を、オールド・スリー・ハンドレッド（テキサスに最初に入植した300名）のトーマス・F・マッキニーに渡した。2月20日に、ボウイと彼の友人はメキシコへの忠誠を誓い、そしてサンアントニオへと進んだ。そこでもボウイは、収入をギャンブルで補いながら、時には借金もして、土地への投機を続けた。1830年の終わりまでには、ボウイはカトリック教会の洗礼を受け、メキシコ市民となった。彼が市民である期間に彼はコアウイラで織物工場を設立したかったので、現存する工場の購入の準備をした。その翌年、財産を大幅に誇張し年齢もごまかして、ボウイはテハス州（メキシコ領）知事の娘の、ウルスラ・マリア・デ・ベラメンディと結婚した。
ボウイは1820年代後半にはニューオーリンズに住み、ルイジアナ南部の土地の投機に集中した。1829年、ボウイはセシリア・ウェルズと婚約するが、婚礼の2週間前の9月29日に彼女はアレクサンドリアで死亡した。その後、彼の兄弟、レズィンとスティーブンと共に、1,800エーカー（730ヘクタール）の広さのサトウキビ大農場をティバドー近くに設立した。この農場は、州で最初の蒸気動力の圧搾機を備えていた。
ボウイは激しい気性でも知られていた。1826年、保安官であり、また銀行家でもあったノリス・ライト（Norris Wright）に借金を申し込んだが断られた。保安官選挙において、ボウイが対抗馬を応援していたことの仕返しだった。これが元で喧嘩となり、ライトがボウイを撃った。弾丸が逸れて、今度はボウイが素手でライトを殺そうとしたが、ライトの友人に止められて果たせなかった。その後は狩猟用ナイフをいつも持ち歩くようになった。現在では伝説的なこのボウイナイフは 9.25インチ（≒23.5cm）の刃渡りと、1.5インチ（≒3.81cm）の幅がある大振りなものだった。その翌年、ボウイはミシシッピ州ナチェズ近くのサンドバー（砂州）で起こった決闘 （サンドバーの決闘）に立会人として参加したが、決闘相手の立会人としてライトがいた。決闘は最終的には立会人を巻き込む乱闘となり、ボウイは撃たれながらもナイフでライトを刺し殺した。この戦いでボウイの名声は、すご腕のナイフ使いとして南部中に広まり、すぐにテキサス中の男がボウイの持っているのと同じナイフを鍛冶屋に注文した。
ワイオミング郡はニューヨーク州西部にあり、バッファロー市の東、ロチェスター市の南やや西寄りに位置している。ホランド買収地域内にある。郡域の大半は田園部であり、小さな町が点在している。郡庁所在地のウォーソーでも小さな町である。地表は幾重にも分かれた丘陵であり、土壌は肥沃である。森が多く、木材に使われた。カエデの多い森では毎年春にメイプルシロップが作られている。農業は大半が小さな家族酪農であり、あるいはバッファローやバテイビアで働く人の家庭菜園である。かつてはりんご園がおおかったが、今はほとんど残っていない。アウトドアスポーツでは釣り、猟、スノーモービルで知られる。デール・バレーを通る活断層が、リンデンを通り、バテイビアの東を抜けてオンタリオ湖に至っている。この断層で小さな地震を起こすこともあるが、煙突を倒す程度のものである。デール・バレー塩井戸によって化学産業用塩の産出地として開発されてきた。ナイアガラフォールズ市までパイプラインが引かれている。アメリカ合衆国国勢調査局に拠れば、郡域全面積は596平方マイル (1,540 km²)であり、このうち陸地593平方マイル (1,530 km²)、水域は4平方マイル (10 km²)で水域率は0.59%である。ワイオミング郡の南東はジェネシー川であり、その支流やトナワンダ・クリーク、バッファロー川などで排水されている。ジェネシー川の重要な支流であるオートカ・クリークはゲインズビル町に水源がある。