レーザー誘導型肩乗せ式SAMは、目標へのミサイル誘導のためにレーザーを使用する。ミサイルはレーザービームに沿って飛行し、ミサイル操作手もしくは砲手のレーザー照準する航空機へ直撃する。スウェーデン製のRBS 70やイギリス製のスターストリークのようなミサイルは全方位から航空機と交戦可能であり、操作手に要求されることは、標的上のレーザー照準点を維持するため、ジョイスティックを用いて継続的に標的を追尾することだけである。これら地上とミサイルの間にはデータリンクが存在せず、ミサイルは発射後に実質的に妨害を受けない。この技術はビームライディングとして知られる。将来のレーザー誘導式SAMは、操作手が一度のみ目標を指示し、手動で継続的に航空機上のレーザー照準点を維持する必要をなくす可能性がある。レーザー誘導ミサイルは比較的多岐にわたる訓練を必要とし、操作に技量が必要であるものの、多くの専門家は、今日用いられる伝統的な対抗手段の大半がミサイル防御であることから、こうしたミサイルは特に脅威的なものであると考えている。
指令照準線一致（CLOS）誘導方式のミサイルは、熱源、無線、レーダー伝送など特定の様態で目標の航空機へ誘導されるものではない。代わりにミサイルの操縦手もしくは砲手が拡大可能な光学照準器を使用し、目視で標的を捕捉する。兵員は、ミサイルを航空機へ飛翔させるために無線操縦を用いる。こうしたミサイルの利点の1つは、主にIRミサイルを無力化するフレアと、他の基本的な対抗システムに実質上の免疫を持つことである。CLOSミサイルの大きな欠点は、高度に訓練されて熟練した操作手を必要とすることだった。1980年代、アフガニスタン紛争における数多くの報告書では、アフガンのムジャーヒディーンが、イギリスの供給するブロウパイプCLOSミサイルに失望したことを言及している。その理由はこの兵器の習熟が非常に困難であったこと、また、高速飛行するジェット航空機に対して用いた時、精度が特に落ちたことだった。こうした点を考慮する多くの専門家は、IRミサイルはしばしばファイア・アンド・フォーゲット（撃ちっ放し）方式と呼ばれるが、習熟度の低い兵員がこうしたミサイルを撃つようにCLOSミサイルを用いることは想定上不適切であると考えている。後期のCLOSミサイル、例えばイギリスのジャベリンのような製品は砲手の任務をより簡易化するため、光学的追尾装置の代わりに固体素子テレビカメラを用いる。ジャベリンの製造元であるタレス・エア・ディフェンス社は、このミサイルは対抗手段から実質的に影響を受けないと主張している。より先進のCLOSバージョン、例えばイギリスのスターバーストでは、ミサイルを目標へと飛ばすために初期の無線誘導リンクの代わりとしてレーザー・データリンクを用いる。
第四世代のミサイルは、赤外線画像誘導（IIR）方式のような先進的なセンサー・システムを導入したものである。日本の個人携帯地対空誘導弾(改)（SAM-2B）はIIR方式を採用したが、これはMANPADSとしては初の試みであった。アメリカも同様の誘導システムを採用したRMP型スティンガー ブロックIIの開発を進めていたが、これは2002年に断念された。また、さらにロシアやフランス、イスラエルでも開発中と考えられている。
第三世代の赤外線を使用する肩乗せ式SAMには、アメリカのPOST型スティンガー、フランスのミストラル、ロシアの9K38 イグラ、また、日本の91式携帯地対空誘導弾（SAM-2）がある。これらは、フレアなどの赤外線妨害技術に対抗するため、二波長光波ホーミングなどの新たな手法を導入している。
第二世代の赤外線誘導ミサイルは、第2世代の赤外線ホーミング誘導方式を採用しており、アメリカのFIM-92 スティンガー、ソ連の9K34、中国のFN-6などが挙げられる。これは背景中のIR源からの干渉をシーカーから大部分除外でき、さらにヘッドオンや側方といった状態でも照準が可能となった。これらのミサイルはまた、フレアに対抗するための技術（IRCCM）が用いられたとされる。標的となる航空機はこうしたフレアを積んでいる可能性があった。また、他にスティンガーでは紫外線モードのような予備の目標探知モードが支給された。
ムルデルの分析によって示唆されていた分子量の下限は約 9 kであり、当時研究されていた分子の数百倍は大きい値であった。それゆえ、タンパク質の化学構造 (一次構造) は、1949年にフレデリック・サンガーがインスリンのアミノ酸配列を明らかにするまで活発な研究領域とはならなかった。タンパク質がアミノ酸がペプチド結合で連結された多量体であるという (正しい) 理論は、フランツ・ホフマイスターとエミール・フィッシャーによって1902年の同じ会議において独立して同時に提唱された。しかし一部の科学者は、そのような長い高分子が溶液中で安定していることに懐疑的であった。その結果、タンパク質の一次構造について、タンパク質は低分子の集合体であるとするコロイド仮説、ドロシー・リンチのシクロール仮説、エミール・アブデルハルデンのジケトピペラジン仮説、N. Troensegaardのピロール/ピペリジン仮説など、代替的な理論が多数提唱された。これらの理論の大部分は、タンパク質の分解によってペプチドやアミノ酸が生じるという事実を説明することが困難であった。最終的に、タンパク質は明確な組成を持つ (コロイド状の混合物ではない) 高分子であることがテオドール・スヴェドベリによって分析超遠心を用いて示され、その分子量が測定された。タンパク質の一部はこのような高分子が非共有結合的に結合したものである可能性がギルバート・スミスソン・アデアによるヘモグロビンの浸透圧の測定によって示され、後にフレデリック・M・リチャーズのリボヌクレアーゼSの研究においても示された。タンパク質の質量分析は、長く翻訳後修飾を同定する有用な技術であったが、近年ではタンパク質の構造を探索する目的でも利用されている。ほとんどのタンパク質は、現代の技術を用いてもミリグラム以上の量の精製には困難が伴う。そのため初期の研究は、血液や卵白のタンパク質、さまざまな毒素、屠畜場で得られる消化・代謝酵素など、大量に精製を行えるものに焦点を当てていた。第二次世界大戦中、兵士の生存を助けるための血液タンパク質の精製を目的としたエドウィン・ジョゼフ・コーンに率いられたプロジェクトによって、多くのタンパク質精製技術が開発された。1950年代後半にはアーマー・アンド・カンパニーが 1 kgの純粋なウシ膵臓リボヌクレアーゼAを精製し、世界中の科学者が低価格で利用できるようにした。この気前の良い行動によってリボヌクレアーゼAはその後の数十年間基礎研究で用いられる主要なタンパク質となり、いくつかのノーベル賞がもたらされた。