シカゴのフィールド自然史博物館が所有するFMNH PR 2081は1990年にサウスダコタ州のシャイエン川インディアン居留地で発掘された。ニックネームのスー（Sue）は発見者である古生物学者のスーザン・ヘンドリクソンに由来する。スーは現在知られているTレックスの標本中、90パーセント以上残存と最も保存状態が良く、なおかつ最大の個体である。全長は12.3m、腰までの高さは3.66m、体重は8.4～14トンと見積もられた。1990年8月にヘンドリクソンらブラックヒルズ地質学研究所の研究者たちによって発掘されたが、後にこの化石の重要性に気づいた地主との間で所有権を巡り紛争が発生、FBIも介入し裁判が行われた。そして1997年10月にオークションにかけられフィールド自然史博物館が760万ドルで落札した。これは化石標本に支払われた金額としては史上最高額である。門外不出とされているが、2005年の「恐竜博2005」において、スー公開5周年と日本でのスーの全身骨格展示を記念して実物1点（肋骨の一部）が特別に貸し出された。2013年から「恐竜博2005」の開催地の一つであった福岡県の北九州市立いのちのたび博物館で復元骨格のレプリカが展示されている。
BHI 3033は1987年にサウスダコタ州ハーディング郡バッファローにて、ブラックヒルズ地質学研究所のチームが発掘した。ニックネームのスタン（Stan）は、発見者のスタン・サクリソンに由来する。現在までに発見されたTレックスの標本中、スーに次ぎ最も保存状態が優れている。全長は11.8m、体重は5.9トンから10.8トンと見積もられた。他のTレックスと同様に、スタンの頭骨や肋骨など至る所に受傷痕が確認できる。最も大きな傷は後頭部から頸にかけて存在し、おそらく他のTレックスの攻撃により付けられたと考えられている。これらの傷はいずれも治癒痕が認められるため、スタンは受傷後も生存していたことが分かる。またトリコモナスに感染した痕跡も確認された。スタンはブラックヒルズ地質学研究所によって全身骨格のレプリカが約30点製作され、世界中の博物館などに約10万ドルで販売された。主な展示施設はインディアナポリス子供博物館、ニューメキシコ自然史科学博物館、国立自然史博物館、オックスフォード大学附属自然史博物館、オスロ大学附属自然史博物館、 Googleplexがあり、日本でも国立科学博物館や北九州市立いのちのたび博物館で展示されている。
カナダのロイヤル・ティレル古生物学博物館が所蔵するRTMP 81.6.1は1980年にアルバータ州で発掘された。ニックネームのブラック・ビューティー（Black Beauty）は、化石化の過程でマンガンがしみこみ美しい黒色を呈していたことに由来する。1980年、当時友人たちと釣りに来ていた高校生ジェフ・ベイカーは河岸に大きな骨が露出しているのを発見し、高校の教師に知らせた。それからすぐに博物館に化石発見の連絡が入り、1982年から発掘作業が開始された。後の研究でブラック・ビューティーは他のTレックスの成体と比較してかなり華奢であることが指摘されており、このため亜成体だったと考えられている。ブラック・ビューティーは多数のレプリカが制作されており、スウェーデン・ストックホルムの自然歴史博物館をはじめ世界中でその全身骨格を見ることが出来る。日本では茨城県のミュージアムパーク茨城県自然博物館と福井県の福井県立恐竜博物館で展示されている。
AMNH 5027は1908年にブラウンがモンタナ州で発掘、オズボーンが1912年と1916年に報告した。初期に発見されたTレックスとしては最も保存状態が良く、それまで知られていなかった完全な頸椎と頭骨が含まれていた。この標本を元に復元の見直しが行われ、カルノサウルス類との相違点がよりはっきりと分かるようになった。オズボーンによって前述のAMNH 973と合わせ初めて全身骨格の復元が行われた。以前はカンガルー様の尾を地面に付けた姿勢で骨格が組み立てられていたが、その後の研究成果を踏まえて地面に対し尾を水平にした姿勢で再現された。
初めて最初からTレックスとして記載された標本は1902年にブラウンが発掘したAMNH 973である。ブラウンはオズボーンにこの化石の情報を送り、3年後の1905年にオズボーンがTレックスとして論文に発表した。最近この標本の再検討が行われ、全長11.9m・体重7.4–14.6トンと見積もられた。1905の論文では小さな前腕部が共通するという点でジュラ紀に生息していたカルノサウルス類と比較された。太平洋戦争勃発後の1941年、AMNH 973は日本軍の爆撃の脅威から守るためにアメリカ自然史博物館からピッツバーグのカーネギー自然史博物館に売却された。これに伴って登録番号はCM 9380に変更され、現在も同博物館で展示されている。
国内で被支配層（庶民・一般市民）の継続した生活がある居住地（住宅地）が世界遺産になるのは白川郷・五箇山の合掌造り集落以来となるが、合掌造り集落は家屋そのものが登録されているのに対し、潜伏キリシタン集落は建築物ではなく開拓造成された宅地や田畑の立地環境（文化的環境）といった村落景観が主体となる初の事例で（但しそこに建つ家は新しいもののため伝統的集落の世界遺産とはみなしにくい）、春日集落の棚田や石積みの畦など農地が含まれることも初となる（農業景観の世界遺産参照）。これらは寺社・城郭や産業遺産といった従来の日本の世界遺産にはない新たな類型で、日本の宗教としては仏教・神道・修験道・自然崇拝に加え、初めてキリスト教（カトリック）からの登録になった。なお、世界遺産としては禁教期の潜伏キリシタンの信仰を具現化したものが対象であるため、禁教明け後もカトリックに復帰せず昔ながらの信仰を保持した「カクレキリシタン」に関しては必ずしも重視されておらず、カクレキリシタン関連を追加登録するならば価値を組み替えなければならない。また、世界遺産は不動産有形財構築物でなければならないため、動産としての潜伏キリシタンの聖具や、無形文化財の口伝承歌「オラショ」などは補完資料扱いとなる。大浦天主堂は敷地背後で明治日本の産業革命遺産の構成資産になっている旧グラバー住宅を含むグラバー園と背中合わせになっており、異なる世界遺産がこれだけ近接していることは日本の世界遺産では珍しい。