1929年、タジク・ソビエト社会主義共和国 (タジクSSR) とウズベク・ソビエト社会主義共和国 (ウズベクSSR) が分裂した。ウズベキスタン共産党の指導者として、ホジャエフは1920年代後半から1930年代前半にかけて行われたソビエト連邦政府の集団農場政策を強制的に実行し、同時に政府や政党におけるウズベク人の参加を増やそうとした。ソビエト連邦の指導者であったヨシフ・スターリンはソビエト連邦内の非ロシア人共和国のすべての指導者の改革主義的な動機を疑った。1930年代後半までに、ホジャエフとウズベクSSRの要職にあった集団は皆逮捕され大粛清の被害者となった。愛国主義者の粛清後、ウズベキスタン国内の政府や政党の要職はモスクワ中央政府に対する忠誠を誓う人々で占められた。経済政策では農業の多様性は無視されソビエト連邦内の他の共和国に対する綿花供給が強調された。第二次世界大戦中、ヨーロッパロシアから多くの工場がウズベキスタンや中央アジアの他の国々に疎開してきた。これに伴い、ロシアや他のヨーロッパの工場労働者が国内に流れこむこととなった。土着のウズベク人は国内において農業の盛んな地方に居住していたため、移民が集中するタシュケントや他の大都市などの都市部は次第にロシア化されていった。戦争中にウズベキスタンへ移入してきたロシア人に加え、モスクワ中央政府がヨーロッパロシアにおける危険分子と認識していたクリミア・タタール人やチェチェン人、高麗人といった他の民族が共和国内に亡命してきた。
20世紀に入るまで、ロシア帝国は中央アジアにおいて完全な支配権を確立していた。ウズベキスタンの領地は3つの政権にわかれていた。ブハラ・ハン国とヒヴァ・ハン国、そしてトルキスタン総督府である。トルキスタン総督府はロシア帝国軍事省の直轄下にあった。20世紀の最初の10年間時点では独立した主権を持つウズベキスタンの共和国のもとに統合された3つの地方が存在した。その間の10年間は革命、弾圧、大規模な混乱、植民地支配の時代であった。1900年以後、二つのハン国のハンは内政上ある程度の自治権を与えられていた。しかし、彼らは究極的にはロシアの皇帝ニコライ2世の名のもとに統治を行なっていたタシュケントの総督府に対して卑屈であった。ロシア帝国は中央アジアにおいて広大な領地に対して直接的な制御を行なっており、ハンに対し彼らの祖先代々の土地の大部分を統治することを許していた。この時代に温暖な気候や利用可能な土地に惹かれた多くのロシア人が中央アジアへと移り住んだ。1900年以後、ロシア文明との接触の増加がロシア人が多く住むようになった大都市圏において中央アジア人の生活に影響を与え始めた。
中央アジアに対するモンゴル帝国の侵攻はこの地方の歴史のターニングポイントの一つである。モンゴル帝国はあらゆる中央アジアの正統な支配者にはチンギス・カンの血族のみがなる事ができるとする伝統を築いていたため、同地域に長く続く影響を与えた。モンゴル帝国の中央アジアへの侵入は1219年から1225年まで続き、マー・ワラー・アンナフルの人口に劇的な変化をもたらした。チンギス・カンの軍隊はモンゴル人の将校に率いられていたものの、配下の兵士の多くはモンゴル軍に取り込まれたテュルク系民族により構成されていたため、征服地のいくつかの部分に急速なテュルク化をもたらした。モンゴル軍がマー・ワラー・アンナフルの都市を占領した際、彼らは逃亡しなかった現地の住民を自分たちの軍に取り込んだ。モンゴル帝国の征服のもう一つの影響は、ブハラをはじめとする都市やホラズムのような地方に対し、モンゴル軍の破壊がもたらした深刻な被害であった。ホラズムは甚大な被害をこうむり、ホラズム内の灌漑網は何世代にも渡り修復できないほど破壊された。そして、多くのペルシア系の知識人は迫害を逃れて南の土地への逃亡を強いられた。
1938年、A. Okladnikovは7万年前の8～11歳と推定されるネアンデルタール人の子供の頭蓋骨をウズベキスタンのテシク・タシュにおいて発見した。
海と山の迫る東西に細長い市街地を持ち、十分な水深のある扇状の入り江部に発展した理想的な港湾・神戸港を有する日本を代表する港町である。「神戸」という地名は、現在の三宮・元町周辺が古くから生田神社の神封戸の集落（神戸「かんべ」）であったことに由来する。西国街道の宿場町であり北前船の出発地の一つでもあった兵庫津（ひょうごのつ）に近く、廻船問屋が軒を並べていた神戸村を指していた。神戸三社（神戸三大神社）をはじめとする市内・国内にある神社の神事に使うお神酒の生産にも係わり、前述の有馬温泉や神封戸の形成も市名の由来に関係している。海運においても古くから盛んで、近代には世界の市場にその名を知られるほどに隆盛していった。以降も貿易・鉄鋼・造船・機械・製造・ゴム・真珠加工・観光等の産業を中心に発展、ファッション・医療・食料品などの産業も近年は盛んである。1995年1月17日に発生した兵庫県南部地震による阪神・淡路大震災では市内のほぼ全域で震度7を観測した。市街地と港、道路、インフラは甚大な被害を受けたが急速に復興を遂げ、2005年には国内3番目の市営空港として神戸空港が開港した。2008年、アジアの都市で初めて「デザイン都市」としてユネスコに認定された。2012年、スイスのECAインターナショナルが世界400余りの都市の、気候、医療サービス、インフラ、安全性、大気品質などの生活水準を調査し発表した「世界で最も住みやすい都市」で、日本の都市で唯一トップ10に入り、世界全体で5位、アジア圏ではシンガポールに次ぐ2位に選ばれている。神戸市は大阪市中心部から西に30km圏内に位置している。