遺伝子の配列データを蓄積している大規模な配列データベースが直面している大きな問題は、個人研究者から大規模ゲノムシーケンシングセンターまで、さまざまな登録者から配列データが登録されていることである。このことはデータベースに高い網羅性をもたらしたが、一方で、配列のデータおよび配列に付された生物学的なアノテーション（注釈）のデータの品質のばらつきが非常に大きい（品質の高いデータと品質の低いデータが混在する）という問題が出てきている。さらに冗長性の問題がある。複数の研究機関が、既に配列データベースに登録されている配列と完全に同一な配列や、ほとんど同一な配列を、重複して登録してしまうということが、しばしば起きている。このことに気がつかずに複数の情報源からの情報を不用意にまとめてしまうと、結果として整合性に欠ける解析をしてしまうことになり、非常に問題である。
配列データベースに対しては、さまざまな手法で検索を行うことができる。最も一般的な手法は、おそらく手元にある既知のDNAの塩基配列やタンパク質のアミノ酸配列と、類似する配列を検索することであろう。BLASTプログラムはこの種の手法を実現するプログラムとして最もよく利用されているものの一つである。また、ある特定の遺伝子について、多数の生物種における相同な遺伝子の配列を抽出し比較するというのもよくある状況である。多くのデータベースではホームページにおいて簡易にこうした作業が実現できるように工夫されている。しかし大量の情報を相手にする場合、ホームページ経由の作業は一般に著しく非効率的である。そこで、このような作業を自動的に行うためのプログラムやそれらのプログラムを構築するためのプログラミングライブラリが多数開発され公開されている。
塩基配列情報を扱う前述の３データベースは密接な連携をとりながら運営されており、どのデータベースに登録された情報も自動的に他のデータベースに共有され参照できる仕組みになっている。現在では、塩基配列データを伴う学術論文を雑誌に掲載する際には、その情報をこれらのデータベースのいずれかに提供して登録を依頼し、それぞれのレコードに対応するID（アクセッション番号）を取得して論文中に明示することが求められるのが普通である。そのため、これらのデータベースは世界中で実験的に求められた塩基配列情報を高い網羅性をもって収納しており、生物科学系の幅広い分野の研究者にとってなくてはならないツールの一つとなっている。
配列データベースは、一つの種の生物から採られた配列だけを格納する方針で構築されることもあるし、配列決定されたすべての種の生物から採られた配列をすべて格納する方針が採られている場合もある。前者の例としては、出芽酵母のすべてのタンパク質を含む配列データベースなどが挙げられる。後者の例としては、公共の塩基配列データベースとして、日本DNAデータバンク (DDBJ) 、EMBL、NCBI GenBank が構築され、公に提供されている。配列情報そのものだけではなく、その配列を解析した機関や研究者、遺伝子の機能、染色体上の位置など様々な情報が付随しているのが普通である。これらは分子遺伝学や生物情報学はもちろん、幅広い生物科学系の研究の基盤として重要な情報となる。
開業時の地名（三養基郡基山村）が由来。古くは「基山（きざん）」、「城山（きやま）」とも読まれ、「城のある山」と言う意味である。664年に天智天皇によって駅の北西にある「基山（きざん）」に立てられた基肄城が由来で、大野城 (筑前国)と共に作られた日本最初の国防城郭である。
単式ホーム1面1線を持つ地上駅。国鉄時代の4番線を使用しJRホームの東側に位置している。JRとは線路が繋がっていない（車止めから先の線路は撤去されていないが砂利が盛られて行き止まりになっている）。自由通路から階段を降りるとホームになっている。改札も自動券売機もないが待合室や自販機、トイレがある。エレベーターなどはない。
単式ホーム1面1線・島式ホーム1面2線と橋上駅舎の設備を有する地上駅。全体は鉄路と共に並行する国道3号を跨ぐ形の自由通路となっている。国鉄時代の橋上駅舎への改築以前は全体で3面5線のホームを有していた。4番5番を使用していた国鉄甘木線の甘木鉄道移管や駅舎の改築の過程で5番線は撤去された。改札が橋上にあるため、駅構内だけでなく外部から改札に上がるためのエレベーターが設置されている。かつては橋上の待合室にキヨスクが、直下の1階部分ではトランドールが営業していたがともに撤退した。その後待合室には町内の職人や作家などでつくる「基山職人の会」のギャラリーが設置されている。JR九州鉄道営業が駅業務を行う業務委託駅で、みどりの窓口および自動改札機が設置されている。
1720年頃にモノモタパは独立を回復するが、この時点でモノモタパ王国はジンバブエ高原に所有していた領土のほぼ全てをチャンガミレ王国に奪われていた。交易の中心がザンベジ川流域に移るに伴い、1723年にモノモタパ王ニャマンドゥは首都をマゾウェ川流域の高原地帯からザンベジ川の低地に移転する。モノモタパ王国の勢力圏は東はテテ近郊のポルトガル人の領地、西はザンベジ川流域のズンボに限定され、かつて宮廷が置かれていた地域には東のショナ系グループが流入した。1735年に終わるニャマンドゥの治世の後、ニャマンドゥ家とボロマ家が王位を巡って対立し、1767年までに9人の王が現れた。1767年から1804年まで3人の王が即位するが、二つの家門の対立は解消されなかった。ポルトガル人との戦闘、内部抗争においてはニャイと呼ばれる戦士の集団が活躍したが、彼らの一部は主君への奉仕を放棄して賊徒となり、ズンボとテテの間を往来する商人たちを襲って税を取り立てた。1804年から1884年まで、少なくとも6,7人の人間がモノモタパ王位に就いた。モノモタパ王国の威信と政治的影響力の低下は続き、王国の実態は領地を所有する有力家門の連合体に変化していた。1851年にモノモタパ王と面会した探険家デイヴィッド・リヴィングストンはポルトガルが宣伝する強力な国王像と落魄した実際の王の姿の差に驚き、かつての栄光の名残は100人ほどの妻妾だけだと日記に書き残している。彼らは「マンボ」の称号を用い、1917年にMambo Chiokoがポルトガルとの戦闘で殺害されるまで独立を保った。