グラントはジェイムズ・マクファーソン准将に、ビックスバーグ市の北西に、ミシシッピ川からレイク・プロピデンスまで数百ヤードの運河を建設するよう命じた。これができると、バクスターやメイヨーのバイユーおよびテンサスやブラックの川を通じてレッド川までの経路ができるはずだった。レッド川まで届けば、グラント軍はポートハドソンのバンクス軍と合流できた。マクファーソンは3月18日に航行できる水路ができたと報告したが、バイユーを航行するためにグラントに送られていた「通常のオハイオ川のボート」で8,500名の兵士を運ぶことができただけであり、あまりに少なくてポートハドソンの情勢を変えられなかった。歴史家のエド・ベアスは、グラントがそれが機能すると期待したことはなく、ヤズーパス遠征と最終的な作戦であるミリケンズ・ベンドから南に陸路を移動する事のために工事を放棄したことから、この出来事を「レイク・プロピデンスの無駄骨」と呼んだ。
デ・ソト半島を横切るウィリアムズ運河は、1862年7月にファラガット提督とウィリアムズ准将が中断したものだったが、ビックスバーグの砲台を迂回して川を下る経路を提供する可能性があった。1月遅く、シャーマン隊は、海軍からリンカーン大統領がこの考えを好んでいると忠告されたグラントの要請で掘削を開始した。シャーマンはこの運河を侮蔑的に「バトラーの溝」と呼んだ（以前ベンジャミン・バトラー少将がウィリアムズを上流に送ってこの仕事をさせていた）が、やっと幅6フィート (1.8 m)、深さ6フィートのものだった。グラントはリンカーンからうち続く運河の状態に関する問い合わせに疑いもなく影響されて、シャーマンに幅60フィート (18 m)、深さ7フィート (2.1 m)に拡げるよう命令を出した。これがグラントの運河と呼ばれるようになった。しかし、この運河はミシシッピ川の水門学（すいもんがく）に基づいて適切に設計されたわけではなく、水嵩が上がると運河川上のダムを決壊させ地域は水浸しになった。この運河は後背地の水と堆積物で埋まり始めた。この計画を救うために絶望的な努力が払われ、2隻の大きな蒸気駆動浚渫船ハーキュリーズとサンプソンが水路を開こうとしたが、浚渫船がビックスバーグの崖の上から南軍の砲火に曝され、撤退した。3月遅くまでに運河工事は放棄された（グラント運河約200ヤード (180 m)の名残はルイジアナ州のビックスバーグ国立軍事公園によって保護されている）。
その冬、グラントはビックスバーグに近付き攻略するために一連の独創性を発揮し、これが「グラントのバイユー作戦」と呼ばれている。その共通目的は、南軍の砲台下にあるミシシッピ川を直接接近する必要性無しに、ビックスバーグから射程内に軍隊を配置できる別の水路を使いあるいは建設することだった。
デイビッド・ディクソン・ポーター海軍少将が指揮する北軍戦隊が1月9日の夜にアーカンソー・ポストで軍隊の揚陸を始めた。この軍隊は川に沿ってハインドマン砦に向かい始めた。シャーマンの軍団が南軍の塹壕線を突破し、南軍は砦の防壁の中や近くの射撃壕に退いた。1月10日、ポーターはその戦隊を動かしてハインドマン砦に向かい、砲爆した後で薄暮に退いた。1月11日には北軍の大砲が川向こうの陣地から砦を砲撃し、歩兵隊は攻撃のための配置に付いた。北軍の鋼製被覆砲艦が砦に対する砲爆を始め、ポーターの戦隊は脱出を防ぐために砦の下を通過した。この包囲とモーガン隊による攻撃の結果、南軍は午後に降伏した。北軍の損失は大きく、この勝利がビックスバーグ占領に貢献するものではなかったが、ミシシッピ川を航行する北軍の艦船にとっての障害を取り除くことができた。グラントはマクラーナンドがグラントの承認無しに作戦を実行したことを喜ばず、その主目的であるビックスバーグから気を逸らすものと見なしたが、それが成功に終わり同調者であるシャーマンが提案したことなので、懲罰行動は採らなかった。しかし、マクラーナンドにはミシシッピ川に戻るように命じ、ビックスバーグの北西15マイル (24 km)ミリケンズ・ベンドで1月13日に自ら方面作戦の指揮を執った。
主人公、頸城（くびき）ヒデユキは高校1年生でラグビー部で活躍中。八木沢アイ子（やぎさわあいこ）という飛び切り可愛いガールフレンドも出来たばかり。幸福の絶頂にある時彼は突然倒れ入院する。そして、彼の体は女性に変化してしまう。彼は「女性仮性半陰陽」という体質で、本来女性であるはずが、ホルモンの関係で男性の外見で生まれてしまい、16歳で女性ホルモンが活発になり、本来の女性の肉体になってしまったということを聞かされる。自分は男だと主張しラグビーを続ける。ヒデユキの前に出雲崎（いずもざき）ひかるという女生徒が現れる。彼女はヒデユキの担当医師の娘なので事情をすべて知っている。彼女は、ヒデユキをデートに誘い、そこで「ジェンダー」の話をする。彼女によれば、ジェンダーとは「肉体の性」に対する「心の性」のことで、体は女でも心（脳）は男の場合がある、そして自分の心は男で、ヒデユキも同じだと告げる。女として生きるか、女の体を持った男として生きるか。大きな悩みを抱えながらも、目の前の問題として女性化した体を隠しながら学校生活を続けるヒデユキ。しかし、ラグビー部合宿のとき、深夜に海辺で上半身裸になって水浴びをしていたところを見られてしまい、ついにガールフレンドや皆にばれてしまう。学校中パニックになり、八木沢にはふられ、ラグビー部も退部することになり、「何もかも失ってしまった」と泣き崩れるヒデユキ。しかし、それでもヒデユキは女の体を持ちながら、自分の心に正直に生きる決心をしてラグビー部に復帰する。その姿を見て、他の生徒にもヒデユキを理解し、支援しようとする動きが現れてきた。2年後、ヒデユキはキャプテンとして花園ラグビー場に立つ。