大手口と東口の双方にバスターミナルがあり、新潟県中越地方の主要都市や新潟市、県外行きの高速バスが発着している。都市間ツアーバスから転換した高速路線バスは、いずれも大手口側の大手通り等から発車する。なお、長岡市を経由する高速バス（東京・大宮 - 長岡・新潟線等）の一部は長岡駅など市街地には乗り入れない。
川東に所在する大手口側は長岡市の中心市街地であり商業地となっている。宿泊施設や地方銀行の本店、総合スーパーが軒を連ねており、学習塾などが多く立ち並んでいる。2000年代に入り市街地活性化を目的とした再開発が進められており、長岡市厚生会館の跡地には市役所本庁舎のアオーレ長岡が、ザ・プライス丸大跡地にはながおか市民センター（市役所支所）、ダックシティ（イチムラ）跡地にはフェニックス大手、大和跡地にはNaDeC BASEなどが新たに開設されている。いずれも放課後の学生利用客を見込んで自習スペースを設けている。なお、この再開発の一環で90年代後半には大型アーケードの整備や全長700mに渡る地下駐車場などが新設されている（詳細は新潟県道36号長岡停車場線#アーケード・地下駐車場・シンボルロードを参照）。
かつては前述の池田屋のほかに野本弁当店、長岡浩養軒の3社が調製・販売を行っていた。特に上越新幹線の開通以降、北陸方面への乗換駅（経由地）として当駅が機能し始めたこともあいまって、3社が趣向を凝らした商品を競って企画・販売したことから「駅弁激戦区」としてテレビ・雑誌でも取り上げられ、「花火寿し」「はしご弁当」などユニークな駅弁も数多く生まれた。しかし1997年に状況が変わり、当駅を起終点としていた特急かがやき号の廃止や、越後湯沢駅を起終点とする北越急行ほくほく線経由の特急はくたか号の運転が始まると、北陸方面への結節機能の中心が越後湯沢駅へ移ったことから乗換客が減少するなど各社の経営環境は一変した。また2004年に発生した新潟県中越地震では上越新幹線が2か月間にわたって区間運休したほか、野本弁当店が店舗施設に甚大な被害を受けて長期休業の末に廃業、さらに2009年7月には長岡浩養軒が事業を停止して自主廃業し、以後は池田屋のみが弁当の製造販売業務を続けている。
駅弁はすべて池田屋が調製・販売している。駅コンコース内のエスカレーター付近（不定期）・在来線改札内の蕎麦店・新幹線ホーム上の駅弁屋で販売を行っている。
先に竣工したのは駅東西を地下で横断する「長岡駅地下通路」で、延長は114m。歩行者に加え、手押し状態であれば自転車・バイクの通行も可能である。1955年（昭和30年）8月1日に開通し、かつては大手口側の国鉄駅舎と東口側の越後交通駅舎との間の連絡通路となっており、通路内の東口側には商店街も設けられていたものの、駅舎改築および自由通路の竣工により通行者が減少し、加えて通路自体の老朽化などもあって出店していた店舗も年々撤退し、東口駅前広場の整備の必要もあったことから商店街は1989年（平成元年）10月に閉鎖された。自由通路を通行できるのは歩行者のみに限られていることから、地下通路はその後も主に自転車が駅舎東西間を横断する手段として存続しており、2011年に新設された大手口地下自転車駐車場と、1994年から設置されている東口地下自転車駐車場に接続している。長岡市では「長岡駅周辺整備事業」の一環として2009年度（平成21年度）から2箇年にわたって大規模改修を実施し、東西双方の地下駐輪場との直結化やコンベア付き階段の新設、バリアフリー化などを行い、利用環境が改善した。
JR東日本ホテルズの「ホテルメッツ長岡」（トッキーが運営）が東口駅前広場に面して所在し、自由通路と直結している。かつて、この東口側は越後交通栃尾線（悠久山 - 長岡 - 栃尾間）の中心駅となっていた。現在、栃尾線の長岡駅跡地は東口・ロータリーの他、越後交通ビル、E・PLAZAの敷地となっている。
葉からコカイン（局所麻酔薬、興奮剤、麻薬）を抽出できる。一部の国（主に南米）では主に高山病対策として葉を茶として飲用するなど、一種の嗜好品や薬用として伝統的に利用されている。コカの葉自体はコカイン濃度が薄いため、依存性や精神作用は、抽出されたコカインに比較して弱い。古代文明では、宗教や儀式といった理由からコカの葉が使用されており、ペルーのミイラにも葉が残っているものがあるが、怪我のために唾液と混ぜて局所麻酔薬として用いたのか、儀式的な目的があったのかは定かではない。1492年にスペイン人が南米を征服した際に、コカの葉の使用を廃止しようとしたが、原住民が主張する「葉が与える力」を見出したため合法化され、税金を課して販売される制度となった。また、疲れにくく食欲を減らすため、鉱山での労働に使われたこともあり、広く使用されていた。摂取によって「恐怖感を喪失させる」「疲労感を薄れさせる」「空腹感を薄れさせる」「眠気を忘れさせる」などという効果が得られるため、ボリビアでは鉱山労働者などの重労働者がコカの葉を噛みながら仕事をする習慣がある。朝、入坑するときに頬いっぱいにコカの葉を詰め込み、そのエキスを飲むことで、鉱山崩落事故のなどの危険の恐怖を忘れ、疲労や空腹を癒しながら夕方まで（昼食もとらずに）働き続けると言われている。しかし、コカの葉の服用を継続的に行うことで、覚醒状態での注意力の欠如などにより、事故を誘発する原因となるとも考えられている。