フランシスコ・フランコ独裁政権はファランヘ党の管轄下に国民スポーツ局を置き、国内のスポーツを全体主義的に管理した。学校教育では男子に対して軍事訓練のような体育を行い、女子に対してスウェーデン体操や民族舞踊を教えた。フランコ体制下のジェンダー規範では、女性が行えるスポーツはバスケットボール・バレーボール・体操などに限られ、陸上競技を行うことはできなかった。テニスのマニュエル・サンタナ、自転車競技のフェデリコ・バーモンテスなど、国際的に活躍した個人競技選手は少数にとどまった。フランコ政権は特にサッカーを政治的に利用し、サッカースペイン代表のユニフォームを赤色から青色（ファランヘ党員のシャツの色）に変更したり、選手に対して試合前のファシスト式敬礼を義務付けた。お気に入りのクラブであるレアル・マドリードが国際大会で活躍することを歓迎し、自国開催の1964 欧州ネイションズカップでスペイン代表がサッカーソビエト連邦代表を破って優勝した際には、スペイン国家がソ連に勝利したかのように喧伝した。フランコ体制末期には、スポーツが反体制運動や様々な文化運動と結びついた。FCバルセロナのホームスタジアムであるカンプ・ノウではカタルーニャ語が使われ、カタルーニャ・ナショナリズムを呼びかける政治ビラが配られた。
1972年には、政治問題担当の国連事務局職員に任命された。ガインゴブは国連ナミビア研究所の所長に任命される1975年まで、同職を務めた。国連ナミビア研究所は、独立後にナミビアの行政を引き継ぐことができる幹部の養成をその役割としていた。また、独立ナミビア政府の政策枠組みをつくるための分野別研究も、研究所の主な業務であった。研究所のレベルは年を経るにつれて向上し、ウォーリック大学やイーストアングリア大学、サセックス大学など、ヨーロッパのさまざまな高等教育機関と提携するようになった。このほかにも研究所の学位記を認証し、その卒業生がさらなる研究を行うことを認めている研究機関がある。研究所の所長には、1989年まで在職した。この間、ガインゴブはSWAPOの中央委員会委員と政治局委員を兼務し続けた。1989年にはSWAPO政治局から、ナミビアにおける同党の選挙運動の本部長に起用された。この職務を果たすため、ガインゴブは1989年6月18日に多くの同僚とともにナミビアに帰国した。27年ぶりの帰国であった。SWAPOの選挙対策委員長として、彼は他の委員とともに全国にSWAPO選挙センターを立ち上げ、選挙戦を展開し、SWAPOが政権を獲得するのに貢献した。選挙後の1989年11月21日には、ナミビア憲法を編纂する制憲議会の議長に選出された。しかし、憲法案の起草前に、制憲議会は相互に憎悪する関係にある人々のあいだで信頼醸成プロセスを進めなければならなかった。したがって、制憲議会において国民和解の種はまかれた。国民和解はその後、政府の政策ともなった。ガインゴブが議長を務めた制憲議会は、1990年2月9日にナミビア憲法を全会一致で採択した。1990年3月21日、ガインゴブはナミビア共和国の初代首相に就任し、1995年3月21日には再任されて2期目をスタートさせた。彼は12年間、サム・ヌジョマ初代大統領のもとで首相を務めた。首相としてのガインゴブは、政権運営のため近代的な管理手法を導入した。2002年8月27日の内閣改造において、ガインゴブは首相職をテオ＝ベン・グリラブに明け渡し、代わりに地域・地方行政・住宅相に任命された。しかし、彼はこの地位の低い役職を引き受けることを拒否した。2002年8月のSWAPOの党大会では、368票の9位で党中央委員に選出された。しかし、9月15日に行われた政治局委員の選挙では、83人の中央委員から33票しか得られず、留任することができなかった。再選されるには、最低でも35票が必要であった。2003年には、ワシントンD.C.に本部を置く「アフリカのための地球連合」から事務局長として招聘された。同連合はアフリカの政策決定者や彼らの国際共同体における提携相手を集めて、アフリカの優先的な開発問題に関するコンセンサスを築くことを目的とする政府間フォーラムである。アフリカは自らの力だけで成長できるが、そのためには外部の支援を必要とするという前提に同連合は立脚している。ガインゴブは、アフリカの紛争解決やアフリカ諸国のグッド・ガバナンスの推進、アフリカ経済と世界経済の統合に向けて、アフリカの地域機関や開発のパートナーと協働することに活動の重点を置いた。2004年10月2日に行われた党代表団によるSWAPOの国会議員候補指名で、当時なおワシントンで「アフリカのための地球連合」に務めていたガインゴブは、60人中28位につけた。その後、彼は同年11月の国会議員選に立候補するため「アフリカのための地球連合」を退き、ナミビアに帰国した。この選挙で彼は当選した。2007年4月18日には、国民議会におけるSWAPOの院内幹事長となった。2007年なかばには、2つの欠員のひとつを補う形でSWAPOの政治局委員に復帰した。党大会を数週間後にひかえた2007年11月、政治局はガインゴブをSWAPO副代表の唯一の候補者に指名した。したがって、11月29日の党大会では満場一致で副代表に選任された。その後、2008年4月8日には通商産業相に任命された。2012年12月2日のSWAPO党大会で、ガインゴブは同党の副代表に再任された。この人事は、2015年に彼をヒフィケプニェ・ポハンバ大統領の後任とするための布石と考えられた。党代表団による投票で、ガインゴブは312票を、ジェリー・エカンジョ候補は220票を、ペンドゥケニ・リヴラ＝イサナ候補は64票をそれぞれ獲得した。党大会後の2012年12月4日、ポハンバ大統領はガインゴブを首相に任命した。2014年11月28日の大統領選で、ガインゴブはSWAPOの候補者として、87%という圧倒的な得票率で当選した。2015年3月21日に行われた大統領就任式には、周辺諸国から15人の首脳が出席した。同時にポハンバ前大統領の後を継いでSWAPO議長代行に就任し、2017年11月に正式にSWAPO議長に選出された。