日本の平成デフレは、中国を初めとした新興国からの安価な輸入品によって引き起こされたとする説である。あるいは貿易自由化に関する議論などにおいても、輸入が増加するとデフレが進行するという意見が唱えられることがある。一方、理論的には輸入品価格の下落は相対価格の変化に過ぎず一般物価の下落であるデフレとは、短期的な調整期間を除き直接結びつかないことや、非輸入競合財価格の下落あるいは国内生産物付加価値の価格を表すGDPデフレータの下落を説明できないこと、また、日本以外の先進国も新興国からの輸入を行っていたにも関わらずデフレ傾向が表れたわけではないことなどから、デフレが安価な輸入品によって引き起こされたとする説には否定的な見方も多い。また、輸入品による価格の低下は、安価な商品が購入可能になることから消費者の購買力を増加させ、また、原材料費が低下することから企業の利潤も増加させるため、賃金・購買力や利潤を逼迫して不況を生み出すような一般物価の下落であるデフレとは異なることに注意が必要である。特に、交易条件の改善を伴う形での安価な輸入の拡大は経済に好影響を与える。これは、逆の場合を考えるとわかりやすい。たとえば原油価格が上昇した場合、一時的には物価全体が上昇してインフレ傾向となりえるが、原油価格上昇により交易条件が悪化していると景気は下押しされる。
松山商業、早稲田大学では投手として活躍、1925年秋の復活早慶戦で勝利投手となる。鋭いカーブを操り「カーブの藤本」と言われた。卒業後、東京鉄道局野球部（現：JR東日本）の監督。1935年、第1回アメリカ遠征から帰国した東京巨人軍との巡業試合で2勝をあげる。この時の巡業で巨人は36勝3敗であり、その3敗のうち2敗を喫させた手腕を見込まれ巨人監督に招聘される。1936年6月16日に第2回アメリカ遠征から帰国したチームに監督として合流、この年から始まった公式戦に臨んだが直後の夏季大会で2勝5敗と惨敗（こうした経緯から巨人の球団史は藤本を初代監督と位置づけている）。アメリカ遠征のおごりがあったチームを鍛え直すために兵役の終わった三原脩を助監督兼任選手として復帰させ群馬県館林市の分福球場で猛練習を行った。秋季大会は順当に勝利を重ね、巨人を公式戦第1回優勝球団に導いた。在任7年間の9シーズンで7度の優勝という第一次黄金期を築き、1943年シーズン終了後の1月14日をもって辞任。なお、当時藤本は巨人の運営会社株式会社大日本東京野球倶楽部の取締役も兼任しており、取締役についても辞意を表明していたが、球団は監督辞表のみ受理した。その後藤本は朝日軍オーナーの田村駒治郎から、田村が経営する田村駒の秘書という役職に迎えられ、空襲で家を失った戦争末期には東京の田村駒別邸に身を寄せていた。田村が藤本を呼んだのは、将来朝日軍の監督にする意向があったためであった。田村の意向を受ける形で1946年にパシフィックの監督として球界復帰。また、選手の待遇改善のために日本野球選手会を発足させ、初代会長に就任した。太陽ロビンスに球団名変更した1947年12月4日監督辞任・退団。1948年から1956年まで金星スターズの監督。1957年から1959年の阪急ブレーブス監督。1959年12月14日に阪神のヘッド兼投手コーチに就任。1961年シーズン途中の6月6日から阪神の監督代行に就任し、7月19日監督に昇格した。1962年には「打倒巨人」を掲げて 巨人OBの青田昇をヘッドコーチに招聘し、1962年と1964年にリーグ優勝。1965年10月28日に自身は総監督へ就任し、杉下茂投手コーチに監督を譲った。しかし、シーズン途中に杉下監督が辞任したことに伴い、1966年8月13日に監督へ復帰。1968年10月21日勇退を申し入れ11月19日球団の技術顧問へ就任した。監督としての実働期間29年は歴代最長。及び（正式登録上の）監督としての在籍球団数5球団は三原脩・石本秀一と並ぶ最多タイ記録。1968年における一軍監督在任は、プロ選手としての経験が無い一軍監督が在任した最後の例となっている。戦前は「茂林寺の猛練習」からスパルタ監督のイメージが強かったが、戦後は「伊予の古狸」の異名をとる程知略を前面に出していた。また選手の人心掌握に優れた監督だった。1937年のリーグ戦では「同一球団の2連戦には初戦に沢村栄治、2戦目にヴィクトル・スタルヒンか前川八郎をたてる」「先発投手には事前に登板日を予告する」 など現在の先発ローテーションに繋がる考えを持ち、1957年から1959年の阪急監督時代に日本プロ野球で初めて「先発ローテーション」を本格的に導入。当時同球団のエースであった米田哲也と梶本隆夫を一定の登板間隔で起用し、当時一般的であったエースの連続起用を指して「30勝投手を出すのは監督の恥」と批判した。阪神でもローテーションを守った投手起用をこころがけ、1962年は小山正明、村山実両投手、1964年はジーン・バッキーの活躍で優勝した。小山、村山を軸に、ペナントレースの焦点となる巨人戦から逆算するなど先々の試合まで先発投手を決めておいたため「巻紙ローテーション」と呼ばれた。ただし先発・中継ぎ・抑えといった投手分業制は嫌っており、先発完投型の投手像を追求。1962年には小山が26完投、村山が23完投、1964年にはバッキーが24完投している。藤本は東京鉄道局勤務時代、統計係として国鉄各駅の乗降人員を集計整理する業務を担当したことがあり、この経験がローテーション制の確立に役立ったとも言われている。自身が投手だったこともあり、若手投手をかわいがった。肩を痛め、巨人から冷遇されていた沢村を親身に世話し、ロシア系ということもあり、チームメートからいじめられることもあったスタルヒンを常にかばった。阪神時代は江夏豊。宿舎の部屋に江夏を呼んで、お茶を飲みながら、よくスタルヒンと沢村の話をしたという。のちに1979年に、広島で江夏が初めて優勝を経験した際にも杖をついて現れ「良かったなあ」とボロボロ泣きながら祝福した。1970年から報知新聞評論家。1974年に野球殿堂入り。同年から1979年までサンテレビの野球解説者を務めた（主に阪急戦の解説を担当）。1981年2月18日死去、76歳没。最初の妻は戦争中の1945年に失い、その後まもなく田村駒治郎の世話で田村の遠縁の女性と再婚している。