ダイアナ・Bの時代より100年ほど昔に生きていた関口朋美（トモミ・S・ナイン）。朋美は地球から移住してきた直系の子孫で、純血。超特権階級の出身だった。朋美には、左半身に麻痺があったが超特権階級であるが故に、画家として生活していた。ルナは朋美に、人類が絶滅した今、芸術に意味はあったのか? 絵を描くことに意味はあったのか? と問いかける。特権階級出身としてプライドも高かった朋美はルナを無視していたが、ノブレス・オブリージュからルナの殺害を考えるようになった。しかし、ルナが階段から落ちそうになった時、朋美はルナを助けようと動き、自分が落ちてしまう。息を引き取る前、朋美はルナに「自分が最後の子供として生まれてきたことを怒るのではなく、自分を独り残して他の皆が死んでしまったことを怒るのではなく、自分が好きなこと、自分がやりたいことがついに無かったという境遇に対して怒るべきなのだ」と告げるのだった。
マリア・Dの時代より100年ほど昔に宇宙管理局の職員を勤めていた真面目な女性ダイアナ・B・ナインはコールドスリープから目覚めて、マリア・Dが遺した手記を読んで愕然とする。ダイアナ・Bの生きていた時代は急激な人口爆発と食糧危機が発生しており、ダイアナ・Bは人口減少策を推し進めていたのだ。ダイアナ・Bは免疫不全の病にかかり、コールドスリープに入る。ダイアナ・Bはルナと共に宙港へと向かい、地球から来ていた宇宙船の中身を確認した。そこで、ルナにせがまれて、蝶や、蛍といった昆虫類をナインへと放し、ルナはそれ昆虫にパンゲア、コウガ、アマゾン、ナイル、ユーラシア、チグリス、ユーフラテス、……といった名前を付けて行く。やがて、ダイアナは風邪を引き、免疫不全から死亡した。
マリア・Dがコールドスリープから目覚めたとき、目の前にいたのはフリルのついた幼児用デザインの衣装を着た白髪の老婆・ルナだった。ルナの実母イブ・Eはマリア・Dにとって妹のような存在だった。マリア・Dの時代、人口減少は一途化が進んでおり、子供を産める可能性があるというだけで特権階級であった。マリア・Dもそういった特権階級であったが、なかなか子供に恵まれなかった。妹のようにかわいがっていたイブ・Eの妊娠にマリア・Dは嫉妬する。マリア・Dは致死性の病にかかってしまう。助かるには子宮を摘出するしかない。子宮摘出を断り、マリア・Dはコールドスリープする道を選んだ。
1986年に新井は、舗装から雑草が伸びている荒れた無人の宇宙港に舞う2匹のホタルと「ホタルの名はチグリスとユーフラテス」とナレーションが聞こえてくる夢を見た。印象の強い夢に、新井は小説になると確信したが、人のいない宇宙港のイメージからスタートしたため、いっこうに登場人物が動き出さず、小説の執筆はまったく進まなかった。ところが、『小説すばる』から連作短編の依頼があったとたんに構想が具体化し、登場人物が頭に浮かんだ。登場人物が定まったことで、それぞれの人物が自立的に動き始めた。『小説すばる』1996年4月号に「マリア・D」が掲載された。以後、4作が掲載され、1999年2月に集英社より全1冊でハードカバー単行本が発売される。装丁画は花井正子。この年の日本SF大賞を受賞した他、第12回山本周五郎賞の候補作にも推されている。2000年4月に徳間書店から発売されたSF雑誌『SF Japan [MILLENNIUM:00]』には「チグリスとユーフラテス外伝/馬場さゆり」が掲載され、2000年12月に早川書房から発売された『2001』には外伝「あした」が掲載された。2002年には集英社文庫より上下巻に分冊した文庫版が発売されている。
ウォッカをテキーラに替えるとメキシカン・ミュールに、またラムに替えるとジャマイカン・ミュール（スージー・テーラー）に、スコッチ・ウイスキーに替えるとマミー・テーラーに、ジンに替えるとマミーズ・シスターに、アブサンに替えるとワイルド・ミュールとなる。
トンプソンの世界を舞台にした快進撃は2015年から始まった。3月のインターカレッジで再び優勝し、4月11日のUTechクラシックで自身初の10秒台となる10秒92を記録し、当季世界最高記録を樹立した。キングストンで開かれたジャマイカ国際招待でブレッシング・オカグバレやアリソン・フェリックスを抑えて10秒97をマークし、世界を代表するスプリンターとして証明された。アメリカ・ユージーンで開かれた7月27日のプリフォンテーンクラシックではイングリッシュ・ガードナーと同タイムの10秒84をマークし、当時の歴代30位に入った。世界選手権代表選考を兼ねたジャマイカ選手権では100mへの出場が期待されたが、コーチのスティーブン・フランシスがストップをかけ、200mに専念することになり、5月に自己ベストとなる22秒37を樹立した。この活躍により100mと200mの2種目出場が期待されることとなったが、コーチのフランシスは2種目出場の準備は行っておらず、目下200mの出場に向け弱点のスタート練習をさせていると語った。トンプソンはジャマイカ選手権で22秒51で優勝、世界選手権の出場資格を得た。7月25日のロンドングランプリでは200mで自己新記録となる22秒10をマークし、トリ・ボウイやキャンディス・マクグローンに勝利しただけでなく、マリーン・オッティが1991年に樹立した大会記録を塗り替えた。世界選手権本番では21秒66と前回大会の優勝記録を上回ったが0秒03差でダフネ・シパーズに競り負け、銀メダルであった。2016年リオデジャネイロオリンピックでは100mに出場、トリ・ボウイやシェリー＝アン・フレーザー＝プライスを抑え、金メダルを獲得した。続いて200mでも優勝候補と言われていたダフネ・シパーズを振り切って金メダルを獲得、1988年のソウルオリンピックでのフローレンス・グリフィス＝ジョイナー以来となる100m・200mの2冠という快挙を成し遂げた。4×100mリレーではジャマイカチームの一員として出場、銀メダルを獲得した。