1987年、テキサス投資家グループは会社を日本の企業家、渋谷尚武に売却。渋谷はハリウッドにミュージシャンズ・インスティテュート（音楽学校）を所有し、ESPのオーナーでもある（が、シェクターとESPは現在も別会社である）。渋谷の所有下でシェクターはカリフォルニアに戻り、徐々に名声を取り戻し始める。渋谷は会社を原点のカスタムショップへと戻し、全ての努力をハイエンドなカスタム楽器の製造に注ぎ込んだ。シェクターのギターは再び僅かな小売店のみで入手可能になった。その1つにハリウッドに店を構える、渋谷所有のサンセット・カスタム・ギターがある。この店は後にシェクターの社長になるマイケル・シラヴォロが働いていた場所である。1995年、シェクターはSシリーズのギターとベースを発表。平均価格1,295ドルのフェンダータイプのギターである。1996年に渋谷はシラヴォロに対し社長として会社を経営するよう要請した。シラヴォロは自身も経験豊富なミュージシャンであり、ストーン・テンプル・パイロッツのロバート・ディレオやホワイト・ゾンビのジェイ・イェンガーとショーン・イスルート等、何人もの有名ミュージシャンとのエンドーサー契約を会社にもたらしていた。シラヴォロはフェンダーのデザインを全く好まず、過去のフェンダースタイルのデザインから距離を置きたかった。このため、彼はアヴェンジャー、ヘルキャット、テンペストといった製品をシェクターのカタログに加えた。また、彼は大手メーカーに無視された若手ミュージシャンへ手を差し伸べたかった。しかし当時は高価なカスタムギターしか生産しておらず、会社の生産能力は月40本であった。彼は理想を実現するため、高品質を保ったままで大量生産が可能な工場を探し始めた。1997年、シラヴォロは東京ミュージックフェスティバルで何人ものアジアのギター製造者と会い、最終的に韓国の仁川にある工場に決定した。ギターは韓国で製造し、アメリカに送られた後にシェクターショップでセットアップという工程を経る。そして1998年のNAMMショーで、シェクターは手頃な価格で非カスタムラインのダイヤモンドシリーズを発表した。1999年には7弦ギター「A-7 アヴェンジャー」がダイヤモンドシリーズに追加された。また、パパ・ローチのミュージック・ビデオ、「ラスト・リゾート」でジェリー・ホートンが手にしお目見えしたC-1も発表された。今日、シェクターは手頃な価格の非カスタムラインのギターをダイヤモンドシリーズとして量産しており、元来のシェクターのスタイルであるハンドメイド・カスタムギターの製造はカリフォルニア州のカスタムショップに於いて続けている。
2013年は左肩のリハビリを行った。8月15日に一軍登録され、同日の対福岡ソフトバンクホークス戦の6回にプロ初登板し、2/3回を投げ1失点だった。31日の対オリックス・バファローズ戦では同点の5回途中に救援登板し、1/3回を投げ無失点で初ホールドを挙げた。シーズン最終戦となった10月8日の対千葉ロッテマリーンズ戦では6回途中で救援登板し、1回2/3を投げ無失点で初勝利を挙げ、同時に13試合連続無失点を記録した。2014年は開幕一軍入りを果たした。シーズン途中で抑え投手に指名され、4月19日の対オリックス戦でプロ初セーブを挙げた。25日のソフトバンク戦から無失点で5試合連続セーブを記録した。この年、チーム最多の29セーブとチーム3位の13ホールドを挙げた。同リーグの新人王争いではプロ1年目の石川歩（ロッテ）の後塵を拝したものの、記者投票での得票数は1位の石川に次いで多かった。シーズンオフの10月9日には日米野球2014の日本代表に選出された。同大会では第2戦と第5戦でそれぞれ1回ずつを投げ無失点だった。2015年は開幕前から新加入のミゲル・メヒアとクローザーの座を競っていたが、オープン戦の結果によりミゲルが二軍へ降格した為、開幕からクローザーに抜擢された。3月27日からのオリックスとの開幕3連戦で、プロ野球史上初となる開幕3戦での3試合連続セーブを挙げると、31日の対東北楽天ゴールデンイーグルス戦でもセーブを挙げ、開幕からの連続試合セーブの日本記録を4に伸ばした。なお、登板5試合目となった4月5日の対ソフトバンク戦ではセーブはつかず、記録は途切れた。7月16日に、第1回WBSCプレミア12の日本代表第1次候補選手に選出された事が発表された。監督選抜によりオールスターゲームのメンバーに選ばれ、7月18日に行われた第2戦において8回裏に6番手で登板し、1回を投げ1失点だった。7月は8試合に登板したが、その内6試合で失点し、3失点で2敗目を喫した25日の対北海道日本ハムファイターズ戦の試合後には「投げることが怖い」と話した。同月下旬に中継ぎに配置転換され、8月6日の対楽天戦では先発から抑えに配置転換された牧田和久がセーブを挙げた。牧田が27日の対日本ハム戦で先発に戻った事で再び抑えを任され、28日の対楽天戦で7月7日以来のセーブを挙げた。9月23日の対オリックス戦では8回に登板、打球を処理しようとした際に右足を捻って倒れ負傷負傷交代し、25日に出場選手登録を抹消されたが、同日に行われた検査で右足の腓骨を骨折していたことが分かり、全治2,3カ月と発表された。9月10日には第1回WBSCプレミア12の日本代表候補選手に選出された事が発表されていたが、この骨折により同大会への出場も事実上不可能になった。2016年は開幕を一軍で迎えたが、左肘の張りにより4月22日に出場選手登録を抹消された。その後、左肘内側側副靭帯の再建手術（トミー・ジョン手術）を受け、成功したことが7月26日に発表された。2017年6月3日、二軍での対横浜DeNAベイスターズ戦の9回に救援登板し、1回を投げ無失点の成績で前年の手術からの実戦復帰を果たした。シーズン終盤の9月30日は一軍登録され、一軍では3試合に登板した。2018年のオープン戦では、6試合で4回と2/3を投げ無失点と左肘の手術から復活をアピールし、2年ぶりに開幕を一軍で迎えた。しかしシーズン初登板の3月31日の対北海道日本ハムファイターズ戦で左肩に違和感を訴えて一死もとれずに降板し、翌日に出場選手登録を抹消された。左肩関節痛の影響でその後は一軍、二軍とも登板することなくシーズンを終えた。10月29日、球団より来季の契約を結ばない旨が通告されたが、その際に併せて報道されていた通り、11月14日に育成選手として再契約した。