2012年12月27日にニューヨーク市内のホテルで緊急記者会見を開き、2012年シーズン限りで現役を引退することを明らかにした。引退を決断した理由として、「命がけでプレーし、メジャーで力を発揮するという気持ちで10年間やってきたが結果が出なくなった」と述べ、NPB復帰を選択しなかったことについては「10年前の日本での自分の活躍を想像するファンの期待に応える自信を持てなかった」と説明した。一番思い出に残っていることは「たくさんある」としながらも、「長嶋監督と二人で素振りした時間」を挙げた。自身の引退後については「ゆっくりしながら今後のことを考えたい」という姿勢を示した。同日、巨人オーナーの白石興二郎は松井を将来的に巨人の監督として迎え入れたい意向を示し、既にヤンキースへのコーチ留学を打診したことを明らかにした。松井の引退を受け、数多くの球界関係者が談話を発表した。松井の恩師である長嶋茂雄は「現代で最高のホームランバッター」と賛辞を送った。内閣官房長官の菅義偉や外務大臣の岸田文雄といった政府要人からも引退を惜しむコメントが寄せられた。松井の引退は日本国内での速報から間もなくして各国でも報じられ、メディアやファンから引退を惜しむ声が相次いだ。ヤンキースでチームメイトだったデレク・ジーターは球団の公式サイト上で「ヒデキは特別な存在」と惜別の言葉を贈り、ヤンキースオーナーのハル・スタインブレナーも「ヤンキースの成功に大きく貢献し、常にヤンキースファミリーの一員として愛されるだろう」と称えた。ヤンキース時代の監督のジョー・トーリは「松井の監督だったことを誇りに思う」と称えた。また、CBSスポーツの記者のジョン・ヘイマンは「松井はヤンキースで最も人間的に優れた人物の1人で、誰からも愛された」と賞賛し、YESネットワークの記者のジャック・カリーは「松井は私が取材した選手の中でも最高級の振る舞いをする選手だった」と絶賛した。ニューヨーク・タイムズ紙は2ページに渡って松井の引退に関する記事を掲載した。
中学校への進学にあたって、柔道を続けるか悩むこともあったが、能美市立根上中学校に進学して野球に専念するようになった。根上中学校には野球部があるものの、柔道部がなかった（当初は、野球での部活動の後に柔道場へ通う案も提示されたが、取り組む種目を一本にして集中したいという本人の希望もあったため）ということが野球への道を選択した大きな決め手となった。中学入学時で身長は170cm、体重は95kgに達していた。中学時代は捕手をつとめ、2年夏から投手に転向した。通算打率は6割を超え、3試合連続本塁打も放ったことがある。3年生になると飛距離は130mにも達し、軟球を割ることもしばしばあった。代わりのボール代だけでも半年間で10万円を超えることになったという。その一方で、中学1年の時には能美郡相撲大会に出場し、個人戦で優勝。根上中野球部でも「関取」「相撲取り」などのあだ名で呼ばれていた。当時の根上中学校教諭で野球部のコーチでもあった高桑充裕は多くの松井の野球の師の中でも特に厳しかったことで知られており、アッパースイングだった松井に王貞治を手本にしたダウンスイングを指導したり、試合で敬遠されたために怒りの感情を露わにした当時の松井を、試合中でも激しく殴打し諌めたというエピソードがある。その高桑は星稜高校野球部卒であり、松井の先輩であり、同校の監督であった山下智茂の教え子の1人でもあり、箕島対星稜延長18回では1年生ながらもその試合で二塁手として途中出場を果たしている。中学時代から衛星放送でメジャーリーグの試合を熱心に見るようになった。その当時に憧れていた球団は、当時ホセ・カンセコ、マーク・マグワイアらを擁して黄金期を迎え、後に松井自身が入団することになるオークランド・アスレチックスだった。自由民主党所属の衆議院議員である佐々木紀とは2年1組で同級生 。
パーソナリティーは堀北真希。番組開始時（初登場は2005年10月17日）から2008年3月までは毎月3週目に、2008年4月から2009年5月14日までは毎月2週目に放送されていた。堀北は図書部部長を務めていた。他のガールズと比べて真面目な性格・雰囲気なので、校長と教頭から学級委員長的な扱いをされていた。また、校長は堀北のことを“まきんぽ”と呼んでおり、校長がそう呼ぶとほぼ毎回教頭が「堀北真希さんね」と訂正を入れていた。校長はウィキペディアの堀北真希の項目に「別名 まきんぽ」と書かれていたことを度々ネタにしており、2008年8月の放送で「ウィキペディアに書いてあるらしいから見てみよう」と言っていたが、該当部分が放送後に削除されたことを知っての発言なのかは不明。番組内で堀北を“まきんぽ”と呼んだことがあるのは新垣結衣やPerfume、ゲスト出演したドラえもんなど。2008年4月には、いつも訂正を入れている教頭が初めて“まきんぽ”と呼んだ。堀北がドラマ『野ブタ。をプロデュース』に出演していた縁もあって、修二と彰がコメント出演したことがある。逆電の成功率が低かった（生徒がケータイの電源を落としている、またはエリア外）ものの、終盤は逆電の引きが強くなった。本人が絵を描くのが苦手ということで、画力上達のため生徒から届いた絵描き歌に挑戦する「お絵かきLOCKS! えかきうたMIX!」というコーナーがあった。コーナー終了後に絵を見た校長と教頭から「ひどい」といわれることもしばしば。2009年3月のコーナー内で「（判断力などは身に付いたが）絵の腕が上達している気がしない」と言った。他のメンバーが「ガールズ・ロック」とコールするのに対し、堀北だけ「ガールズ・ロックス」とコールしていた。2009年5月8日の学校運営戦略会議において、堀北のガールズ卒業が発表され、同月14日をもって終了。後任は桜庭ななみ。