パーニーパットの敗戦以降、マラーター諸侯は宰相府から独自した行動を行い勢力を広げていたが、シンディア家が最も強勢だった。シンディア家の当主マハーダージー・シンディアは自国の近代化を進め、1784年12月にはムガル帝国の摂政と軍総司令官となっていた。そして、1790年9月9日にムガル帝国の皇帝シャー・アーラム2世に自分を北インドにおける同盟の宰相の代理であることに認めさせ、宰相マーダヴ・ラーオ・ナーラーヤンを皇帝代理人に任じさせた。彼とナーナー・ファドナヴィースは同盟の権威を最高潮にまで高めた人物であった。だが、ナーナー・ファドナヴィースとマハーダージー・シンディアとの関係は相当悪かったことが知られている。マハーダージー・シンディアは宰相府における権力闘争では、ナーナー・ファドナヴィースに敵対する派閥に肩入れしていた。とはいえ、マラーター諸侯はマーダヴ・ラーオ・ナーラーヤンを擁するナーナー・ファドナヴィースを同盟の事実上の盟主と見なし、緩やかな連携を組んでいた。
一方、南インドにおいては、1772年6月以来、宰相マーダヴ・ラーオの時代に講和したマイソール王国が存在した。その支配者ハイダル・アリーはさらなる領土拡大をめざし、マーダヴ・ラーオの死後からデカン高原南部のマラーター同盟の領土に侵攻して、1776年3月15日にはマラーター諸侯ゴールパデー家の拠点グッディを占拠した。また、ゴールパデー家の領土ダッタワードやガジェーンドラガドなどには、マイソール側の知事としてファテー・アリー・ハーンが任命された。これにより、ナーナー・ファドナヴィースは兵を派遣し、マイソール側と全面的に争った。だが、1777年1月8日にマイソール側がダーラヴァーダ付近の会戦でマラーター軍に勝利するなど、マラーター側は分が悪かった。そのうえ、1778年3月に第一次マラーター戦争中にイギリスがラグナート・ラーオに援軍を送ると、ナーナー・ファドナヴィースは兵を引き返した。これにより、ハイダル・アリーはカルナータカ地方の制圧に乗り出し、1779年にチトラドゥルガ・ナーヤカ朝とカダパのナワーブを滅ぼした。
そうしたなか、1774年4月18日にナーラーヤン・ラーオの未亡人が息子マーダヴ・ラーオ・ナーラーヤンを生んだ。ナーナー・ファドナヴィースと主な重臣はラグナート・ラーオの廃位を決定し、この幼児を宰相位につけた。そして、ナーナー・ファドナヴィースはその後見人となった。だが、廃位されたラグナート・ラーオはプネーを逃げ、宰相マーダヴ・ラーオ・ナーラーヤンを擁するナーナー・ファドナヴィースを打倒するため、1775年3月6日にイギリスとスーラト条約を結んだ。ラグナート・ラーオは宰相府と戦争に突入し、ここに第一次マラーター戦争が始まった。この戦争は長期にわたり続いたが、1782年5月17日に講和条約サルバイ条約が結ばれ終結し、ラグナート・ラーオは復権することは阻止された。
1761年1月の第3次パーニーパットの戦いのち、バーラージー・バージー・ラーオが死ぬと、マラーター同盟の結束が崩壊していった。マラーター同盟は事実上、デカンの宰相府のほか、北インドのシンディア家、マールワーのホールカル家、中央東インドのボーンスレー家、グジャラートのガーイクワード家がそれぞれ分立していた。宰相位を継いだマーダヴ・ラーオはニザーム王国やマイソール王国にたびたび外征を行っていたが、ナーナー・ファドナヴィースがその間にマラーター同盟の内政を担当した。同年11月28日にマーダヴ・ラーオは結核より死亡し、弟のナーラーヤン・ラーオが即位した。その叔父ラグナート・ラーオがその摂政になったものの、彼は妻のアーナンディー・バーイーと共謀し、ナーラーヤン・ラーオの暗殺を考えるようになった。そして、1773年8月30日、プネーのガネーシャの祭りの最終日、ラグナート・ラーオは刺客シュメール・シング・ガルディーを放ち、ナーラーヤン・ラーオを自室で暗殺させた。遺体はその日の深夜にひそかに川で火葬したという。ラグナート・ラーオの犯行であることは明らかだったが、証拠がなかったため、10月10日に彼がナーラーヤン・ラーオの跡を継いで王国の宰相となった。だが、ナーナー・ファドナヴィースは事件の徹底究明に努め、ラグナート・ラーオとその妃アーナンディ・バーイーおよび実行犯と思われたシュメール・シング・ガールディーの調査を行った。
決勝の見所として、マレーシアGPと同じくシューマッハの「アシスト」に注目が集まった。スターティンググリッド通りシューマッハ優勝・ハッキネン2位という結果になるのであれば、アーバインは4位フィニッシュでチャンピオンを獲得することができる。そのような状況になった場合、ハッキネンの僚友クルサードがアーバインを5位以下に封じ込めるという作戦も考えられた。スタートではシューマッハのホイールスピンが大きく、イン側から好スタートを切ったハッキネンが先頭で1コーナーに飛び込んだ。アーバインはクルサードとフレンツェンを抜いたが、オリビエ・パニス（プロスト）に先行されて4位。軽めの燃料を積んだハッキネンは、2位シューマッハを徐々に引き離していく。ハッキネンはシューマッハに対して7秒近くマージンを稼ぎ、最初のピットストップを無難にこなした。20周目にパニスがリタイアしたため、アーバインが3位に浮上したが、ピットストップでクルサードに逆転され再び4位に落ちた。クルサード以下、アーバイン、フレンツェン、ラルフ・シューマッハ（ウィリアムズ）らは3位グループの接戦となっている。今回が引退レースとなる元チャンピオンのデイモン・ヒル（ジョーダン）は、スプーンカーブでコースオフ。ピットでノーズ交換してからレースに復帰したものの、再びピットに戻り自らマシンを降りた。3位のクルサードも単独コースオフし、ノーズ交換のためピットイン。周回遅れとなったクルサードはシューマッハの前を塞いだが、40周目にマシントラブルのためリタイアした。ハッキネンは終始安定した走りでシューマッハとの差をキープし、53周のレースを走破して優勝。4ポイント差を逆転して、2年連続ドライバーズチャンピオンを決めた。2位にシューマッハ、3位にアーバインが入賞したため、コンストラクターズチャンピオンはフェラーリが獲得した。フェラーリにとっては1983年のコンストラクターズ以来16年ぶりのタイトル獲得となった。