山陽新幹線との直通運転を行うN700系7000番台・8000番台が東海道新幹線仕様のデジタルATCを搭載するため地上設備の仕様変更を行い、また、車上設備の変更も行われた。変更の対象になったのは既存の6編成と2009年夏に投入された1編成。地上設備（新八代 - 鹿児島中央）と車上設備に計10億円をかけて改修を行った。仕様変更に伴い、2009年6月13日から同年12月末にかけて土日を中心に、営業時間外に800系を使用しての試験が行われた。同年9月までは 120km/h 以下、同年10月からは260 km/h での試験が行われた。
JR西日本の管轄である山陽新幹線との直通列車には、800系の後継車種であるN700系7000番台・8000番台が運用されており、800系は使用されていない。当初は新下関駅発着の「さくら」に使用する計画があったが見送られた。構造上は山陽新幹線への乗り入れも可能であり、2011年1月には乗り入れ対応のため山陽新幹線で試運転を行っている。
九州新幹線全線開業後、800系は九州新幹線内折り返し列車に限定して運用されている。2011年1月以降、列車電話の事業者をソフトバンクテレコムから山陽新幹線と同じNTTコミュニケーションズに順次変更している。
2004年3月13日の九州新幹線の新八代駅 - 鹿児島中央駅間開業と同時に「つばめ」の愛称で運用を開始した。当時、新八代駅発着の全列車は鹿児島本線の特急「リレーつばめ」と接続を行っており、同列車とは相互で同一ホーム上で接続を行っていた。2009年8月22日の「つばめ42号」より、新800系（1000番台・U007編成）の運用が開始された。
全車両普通車のモノクラス編成であり、座席は横に4席並び、2列+2列配置となっている。日本の「和」を基本コンセプトとする独自の意匠が施されている。木材にはすべて不燃処置が施されている。奇数号車の博多寄りには便所・洗面所が設置されているが、便所はサクラ材の手すりで温かさを、洗面所には八代のイグサの縄のれんで伝統の技を演出した。1, 5号車には、車椅子スペースとバリアフリー対応トイレが設けられている。2号車には公衆電話が、4号車には自動販売機が設置されている。
騒音・軽量化対策としては、700系のような大型の碍子カバーやパンタグラフカバーは装備せずに、東日本旅客鉄道（JR東日本）が開発しE2系1000番台で採用された低騒音碍子付きのシングルアーム式パンタグラフ（PS207K形）を装備している。この結果、700系に採用されているシングルアームパンタグラフ（TPS301形・パンタカバーなどを含む）と比較して約650kgの軽量化に成功している。
台車は直進安定性に優れた走行特性を示す軸梁式の軸箱支持機構を備えたアンチヨーダンパ付きのボルスタレス台車のWDT205Kを装着する。駆動方式はWNドライブである。乗り心地向上のため、全車両にセミアクティブサスペンションが搭載されている。ブレーキ装置については、700系と同様に回生ブレーキを装備するほか、緊急制動時の滑走対策のために先頭車の台車にセラジェットも装備されている。また、急勾配対策として抑速ブレーキの機能が追加されている。定速装置が装備されているが、営業運行中は使用しない。
架線からの単相交流25kVを主変圧器で降圧した上で、主変換装置で単相交流から直流に変換後、さらに三相交流へと変換して主電動機を駆動する。Mc+Mp+M2ユニットを採用し、Mc車（821形・822形）には主変換装置1基・空気圧縮機が、Mp車（826形）には主変圧器(WTM206K)・集電装置が、M2車（827形）には主変換装置2基が搭載される。主変換装置(WPC200K)は、IGBT素子を利用した3レベルPWMコンバータ+3レベルPWMインバータで構成されている。主電動機4基を並列接続して回路を構成し、1C4M制御を採用する。主電動機(MT500K)は、連続定格出力275kWを有するかご形三相誘導電動機であり、1両あたり4基搭載する。
700系と同じく、中空押出型材を用いたアルミダブルスキン構造となっている。700系と平行して800系を製造することによって製造コストの抑制が図られている。ただし、重量が大きい主変圧器搭載のMp車にパンタグラフが搭載されていることから、各車の輪重バランスを均一化するためにMp車の屋根は軽量なシングルスキン構造となっている。
承和8年（841年）従四位下に初叙され、翌承和9年（842年）に大学頭に任ぜられる。嘉祥3年（850年）仁明天皇が崩御した際には作路司を務める。仁寿2年（852年）讃岐権守次いで丹波守と地方官に転じる。天安2年（858年）の8月の文徳天皇崩御に際しては山作司を務めた。同年11月に清和天皇が即位すると弾正大弼として京官に復す。貞観元年（859年）従四位上に叙されたのち、貞観3年（861年）阿波守、貞観8年（866年）には大宰大弐と清和朝前半は再び地方官を歴任する。貞観11年（869年）宮内卿に遷ると、のち刑部卿と清和朝後半は京官を務めている。のち時期は不明ながら正四位下に至る。