東京出身。内田正八の長男として生まれる。岡山中学、第一高等学校を経て、1891年（明治24年）7月、帝国大学法科大学法律学科（英法）を卒業。同年7月、司法官試補、翌月、逓信省試補となり逓信省に入る。逓信事務官、逓信書記官（兼務）、船舶司検所司検官兼逓信省参事官、逓信大臣秘書官、官房秘書課長、人事課長（兼務）、高等海員審判所所長などを歴任。1901年（明治34年）7月、管船局長に就任。1910年（明治43年）8月、台湾総督府民政長官となり台湾に赴任、1915年（大正4年）10月までこれをつとめた。1917年（大正6年）3月、逓信次官に就任。1918年（大正7年）9月にこれを辞したのち、貴族院勅選議員に勅任され、同和会に属して死去するまでこれをつとめた。その間、1923年（大正12年）9月には第9代台湾総督に就任、翌年9月までこれをつとめた他、鉄道会議議員、日本無線電信株式会社社長、財団法人滝乃川学園理事などもつとめた。
試合前には他のスポーツ・ニュージーランド代表と同じ様に、ハカ（マオリのダンス）を踊る。競技人口はわずか2000人程度である。野球認知が課題である。ニュージーランドのジョン・キー首相の息子も野球をやっており、第3回WBC予選敗退後には、「このままでは終われない」とコメントを残した。ニュージーランド国内にはつい最近までプロ野球チームはなかったため、代表チームはアマチュアとマイナーリーガーが混合で構成される。
アジアの原人：1992年より大学院生として、アフリカの猿人化石研究で世界的に知られる諏訪元に師事。1994年に馬場悠男による日本・インドネシア合同のジャワ原人調査隊に参加し、馬場の引退後はその調査隊を引き継ぎ、さらに視野を広げるかたちで、アジアの原人化石について発掘調査と形態学的研究を続けている。ジャワ原人に関しては、1980年代までに発見されていた相当数の化石資料について、はじめて網羅的な形態解析を行い、その独特な進化の大筋を明らかにした。身長１メートルに矮小化していたことが発覚して専門家を驚かせたフローレス原人（ホモ・フロレシエンシス）については、これを発見したインドネシア・オーストラリアのチームに招待され、2007年以降にその化石研究に携わっている。頭骨と歯について詳細な形態分析を実施したほか、2014年に発見されたその祖先らしき化石の形態解析を担当してネイチャー誌に報告し、フローレス原人は大型のジャワ原人の仲間が矮小進化したとの説の論陣を張っている。台湾海峡の海底から発見された澎湖人（台湾の原人）についても日台合同調査を主導し、その独自性を明らかにした。こうして、かつてアジアに多様な原人のグループが存在していたことなどを解明した功績が評価され、2012年に日本学術振興会賞を受賞している。野外と室内におけるその研究の様子は、川端裕人の著書やWebナショジオでも紹介されている。アジア人類史：大学院時代に、恩師の１人である赤澤威が主導した大型研究プロジェクトに触発され、化石形態学・遺伝学・考古学などを統合した、総合的なアジア人類史の構築に興味を持つようになった。2005年に、当時の日本国内ではまだ主流でなかった「ホモ・サピエンスのアフリカ起源説」に注目し、その文脈の中で世界と日本の人類史を結びつける新しい切り口の著書を出版した。2011年には、出穂雅実・小野昭・佐藤宏之・Ted Goebelとともに国際シンポジウム「The Emergence and Diversity of Modern Human Behavior in Paleolithic Asia」（主催：国立科学博物館・日本旧石器学会）を開催し、それまで注目度の低かったアジアにおけるホモ・サピエンス史の研究推進に大きく貢献した。日本人の起源と変遷：縄文時代～近現代に至る顎骨と歯列形態の変遷について研究し、過去5000年間に生じた顎骨の縮小・歯列不正の増加・かみ合わせ形式の劇的な変化が、従来の想定に反して退化現象とは呼べないことを示すとともに、それを進化医学の観点と結びつける先駆的検討を行なった。その成果は、歯科学においても注目されている。旧石器時代の最初の日本列島人の渡来についての研究や論考も多く、例えば沖縄で発見された約２万年前の港川人の再研究や、従来の定説に反して彼らは陸路ではなく海を越えて列島に渡ってきたことを示した論文などがある。3万年前の航海 徹底再現プロジェクト：最初の日本列島人が成し遂げた航海を学術的に推定し、その一部を実験航海によって再現することにより、彼らがどのような困難に直面し、それをどうやって乗り越えたかを体験的に探ろうとする、日台共同プロジェクト（主催：国立科学博物館・共催：国立台湾史前文化博物館）。代表として、事務局マネージャーの三浦くみのとともに、企画と運営に当たっている。当時の舟は遺跡から未発見で不明であるため、候補と考えられる草・竹・木の舟をそれぞれ試作して海上実験を行ない、当時の航海技術を検討しようとしている。プロジェクトは2016年に正式に始まり、試行錯誤の結果得られたもっともらしいモデル（仮説）に基づいて、2019年に「本番の実験航海」（台湾→与那国島）を行なう計画。研究者と探検家が共同し、クラウドファンディング等により民間から直接・間接の協力を得つつ、経過と成果を広く公開するオープンサイエンスの試行としても注目されている。クラウドファンディング：2016年2～4月に国立科学博物館が実施した「3万年前の航海 徹底再現プロジェクト」のクラウドファンディングを、プロジェクト代表としてリードした。これは日本の国立の博物館としてはじめての試みで、その成功は、クラウドファンディングが公的機関の新たな研究資金獲得法として注目される契機ともなった。2018年には２回目のクラウドファンディングを成功させ、獲得資金は合計で59,782,000円にのぼった。