保守派、とりわけ共和党テッド・クルーズ候補の支持者からハニティーは批判を浴びた。それは、2016年の予備選挙期間中、ドナルド・トランプ候補に過度に肩入れし、他の候補者よりトランプ候補を番組で取り上げているという指摘だった。CNNの報道によると、ハニティーはインタビューを通じ、トランプと同意見、またはトランプは正しいと頻繁に述べ、より詳細を聞き出そうとした他、批判の声を無視したりトランプを擁護したとされている。2016年のラジオ・インタビューでは、クルーズとハニティーの緊張対立が極度に高まった。同インタビューでクルーズはハニティーを「トランプの強硬な支持者」と呼び、一方のハニティーはクルーズを「こちらの真っ当な質問に対し、レッテル貼りばかりしている」と応酬した。2016年8月、政治記者ジム・ルーテンバーグは「メディア界でトランプの強力な支持者はハニティー以外にも存在する」「ハニティーはトランプのアドバイザー役としても機能している」と評し、数ヶ月に渡ってハニティーがトランプに選挙戦略やメディア対策の助言を行ったとの関係者証言を報じた。ルーテンバーグの主張に対しハニティーは「ドナルド・トランプ次期大統領を熱望する事実を隠したりはしない。また私は自分をジャーナリストだと称したことも一度もない」と反論した。ハニティーと対立したトランプ不支持の保守派には、時事雑誌ナショナル・レビューのジョナ・ゴールドバーグ、ウォール・ストリート・ジャーナル国際問題担当のブレット・ステファンズ、ナショナル・レビューのリッチ・ローリーなどが挙げられる。
バラク・オバマ大統領はアメリカ生まれだと信じつつも、国籍陰謀論をたびたび取り上げ、出生記録の公表を求めた。またドナルド・トランプを始めとした国籍陰謀論者を擁護する立場を採った。ハワイ州による公式出生記録をオバマが2008年に提示した後も、ハニティーは出生記録を公表すべきだと主張し、「本当に出生記録が存在するのであれば、ホワイトハウスは公表すればよいだけで、世論も納得するだろう」と発言した。2016年10月、ハニティーは再び国籍陰謀論を蒸し返し、ケニアへの片道航空券をオバマ大統領のために購入する用意があると述べた。
保守派のカル・トーマスとリベラル派のボブ・ベッケルは著書Common Groundの中でハニティーを「ジェームズ・Q・ウィルソンを継承し、政治を二極化させる放送業界の主導的存在だ」と述べた。トーマスとベッケルは、ハニティーが思想の異なるグループ間の対立と差別化を扇動するような人物や文化、イデオロギーを強力に擁護していると評した。
2003年以来、ハニティーはチャリティー募金を目的としたカントリーミュージックの「フリーダム・コンサート」を開催している。2006年のコンサートでは500万ドル以上を集めた。
ショーン・ハニティー・ショーのオープニング主題歌には、カントリーミュージック歌手マルティナ・マクブライドの楽曲「インディペンデンス・デイ」、およびロックバンドのサバイバーの楽曲「アイ・オブ・ザ・タイガー」 (映画ロッキー3の主題歌) が使用された。なお、インディペンデンス・デイの作詞家グレッチェン・ピーターズは、政治観ではなく家庭内暴力を扱った歌詞であるとインタビューで語っている。歌手マクブライドは、ハニティーの番組内で自身の楽曲が使用されていることに否定的でありながらも使用停止できないため、番組から支払われる楽曲使用料を寄付に充てている。2014年5月現在、番組オープニング主題歌はカントリーミュージックのフロリダ・ジョージア・ラインの「''This is how we roll''」に変更されている。
経緯にもある通り、地元自治体が働きかけて「宇都宮線」の呼び名が決まったため、関東地方（黒磯駅以南の直流区間）では「宇都宮線」の呼称が使用され、「東北線」（「東北本線」）の呼び名は東北本線のうち黒磯駅以北の区間を指すことが多い。JR東日本の運行情報案内では、この区間については「宇都宮線」（路線愛称名）を用いており、黒磯駅以北については「東北本線」（正式路線名）または「東北線」の名を用いている。ただし、公式のスマートフォンアプリ『列車運行情報』でのみ「東北本線（宇都宮線）」表記を用いている。また、JR東日本公式サイト掲載の時刻表の路線名表記は、すべての駅で「東北本線」となっている。名称制定について住民感情に基づく紆余曲折を経ているため、駅構内時刻表やのりば案内、列車内停車駅案内で「宇都宮線（東北線）」と併記されることがある。当初は長距離旅客主体の新幹線の車内放送などでは「東北線」と案内することがあったが、現在は「宇都宮線」での案内が定着している。また、JR東日本公式サイト掲載の構内図のうち、上野駅・大宮駅などや市販されている雑誌型の時刻表では「東北本線（宇都宮線）」などと表記されている。なお、宇都宮線の呼称制定前の国鉄時代に登場した211系電車の正面方向幕は、通常は列車種別である「普通」と表示するが、まれに「東北線」と表示させることがあった（写真参照）。一方、JR発足後に登場したE231系、E233系電車の行先表示器は「宇都宮線」・「湘南新宿ライン宇都宮線直通」・「上野東京ライン宇都宮線直通」である。211系の場合でも、JR発足後に新規設定された湘南新宿ライン運用時の表示には「宇都宮線直通」で設定されていた。関東地方の日常的なJR東日本利用者の間では、各鉄道事業者（東海道新幹線を除く）などが車内放送や駅構内案内などで「宇都宮線（あるいはJR宇都宮線）」を日常的かつ恒常的に用いるため、「宇都宮線」の呼称が定着している。また、東京駅 - 大宮駅間において高崎線列車が乗り入れていることから、同区間内においては、運行系統上一体化され「宇都宮・高崎線」と案内されることがある。上野東京ライン開通により、東京駅・新橋駅・品川駅では「宇都宮・高崎・常磐線」と案内されることがある。しかし、あくまでも「宇都宮線」は愛称であるため、出発信号機や場内信号機などの鉄道信号の表記は「東北」もしくは略した「東」が、踏切などの表記は「東北本線」「東北線」が用いられているほか、東海旅客鉄道（JR東海）が運営する東海道新幹線でも「東北線」（もしくは「東北・高崎・常磐線」）と案内している。JR東日本公式運行情報などで、大まかな方面別（東京から見て大宮方面）でくくる場合は「東北・高崎方面」と表記されている。また、Yahoo!地図などの地図類では「東北本線」と表記されるが、iOS純正マップ・Googleマップ（2019年3月以降）では「宇都宮線」のみの表記となっている。