ハマーの暴動以後、イスラム主義者の武力闘争は破綻した。ムスリム同胞団は亡命者グループとなり、他の派閥も服従するか、地下に潜った。暴動中シリア政府は国内に向けてきわめて強硬な姿勢をとっており、その後もアサドは政治家としての余生を政治的戦術によらず圧政に頼るようになる。一方で経済の自由化は1990年代に始まっている。またこの事件により以前から明らかになっていた反政府勢力の足並みの乱れに拍車がかかり、各派閥内で深刻な亀裂が生じた。とりわけ彼らの信念が揺らいだことにこの虐殺の意味がある。そして同時に彼らはハマーの暴徒の支援なしにシリア国内ではもうスンニ派の蜂起が起こりえないことを理解していた。反政府グループのメンバーの大半は国外へ脱出し（あるいは追放状態のままで）主にヨルダンとイラクに向かった。中にはアメリカ、イギリス、ドイツを目指した者もいる。最大の反対勢力であったムスリム同胞団は武力による抵抗を諦め、その後2派に分裂した。一方はより近代的で、国外のムスリム同胞団にも承認されており、最終的にイギリスに本拠地を置きこの地で活動を続けている。もう一方はイラク政府の支援を受けてイラク国内に何年にもわたって軍事組織を擁していたが、後にロンドンの主流派と合流した。ハマー虐殺はアサド政権が人権を軽視していた「前科」を告発する文脈においてしばしば取りあげられる。シリア国内でこの虐殺事件に触れることは厳しく制限されている。しかし事件全体のおおまかな輪郭―双方が様々なゲリラに置き換えられて―は国中でよく知られている。虐殺が公の場で言及されたとき、それはすでにハマーにおける一つの「出来事」「事件」でしかなかった。
1982年に初めて西側の各国政府の外交筋から伝えられた情報では戦闘で1000人が殺害されたということが信じられていた。その後犠牲者の推計は、政府軍の死者およそ1000人も含めて7,000人から40,000人までばらつきがある。虐殺直後のハマーに滞在したロバート・フィスクは、もともと死者数を10,000人としていたが後になって倍の20,000人と推計している。あるいは政府側の「推計」であれば、大統領の弟であるリフアトが誇らしげに自分は38,000人を殺したと語ったというエピソードも伝わっている。アムネスティ・インターナショナルははじめ犠牲者数を10,000から25,000人の間でありほとんどが民間人であるという数字を出していた。シリア人権委員会の報告では、「25,000人以上」あるいは30,000人から40,000人が殺されたと推計されている。シリア・ムスリム同胞団も40,000人前後の犠牲者が生まれたと主張している。24年後、シリア人ジャーナリストのスビ・ハディドは「アリー・ハイダル少将の指揮のもと街の包囲は27日間に及び、重砲と戦車の火力に晒された。そして街は侵略され、30,000人、40,000人という市民が殺された。15,000人がいまも行方不明であり、土地を追われた人間は100,000人に達する」。
ハマー虐殺の発端となる出来事が1982年2月3日の午前2時に起こった。旧市街を探索中の陸軍部隊が「〔アブー・バクルの名でも知られる〕地元ゲリラの指揮官ウマル・ジャワドの潜伏場所を偶然に発見し」待ち伏せを行っていた。それ以外の反政府勢力の部屋には無線で警戒態勢をとるよう連絡がはいり、「屋上の狙撃手がおそらく1人〔のシリア軍兵士〕を仕留めた」。増援部隊は当時ハマーに「一斉蜂起の号令をかけた」アブー・バクルの包囲に急いだ。モスクのスピーカーを使って信者にバース党へのジハードが呼びかけられ、何百という暴徒化したイスラム主義者が政府職員やバース党指導者の自宅に殺到し、警察署は占拠され、武器庫は荒らされた。2月3日の明け方までには70人近いバース党幹部が殺され、蜂起したイスラム主義者を始めとする反政府勢力はハマーを「解放区」であると宣言し、シリア人に「異教徒」に対して立ち上がることを訴えた。
外国軍の統合参謀総長あるいは国軍参謀総長に相当し、陸海空の自衛隊の運用に関し一元的に防衛大臣を補佐し、統合幕僚監部の所掌事務に係る大臣の指揮命令は、全て統合幕僚長を通じて行う（統合幕僚監部の所掌事務に係らないものは、従来通り、陸海空各幕僚長を通じて行う）。有事の際には、フォースプロバイダー（練度管理責任者）の陸上幕僚長、海上幕僚長、航空幕僚長から提供された各部隊を、自衛官最高位のフォースユーザー（事態対処責任者）として運用し、陸自の陸上総隊司令官や方面総監、海自の自衛艦隊司令官や地方総監、空自の航空総隊司令官に指揮を下すことになる。階級章は、陸海空各幕僚長たる将と同じ4つ星（大将）である。また、左胸（ポケット）には統合幕僚長の身分を示す統合幕僚長章を着用する。この統合幕僚長章はかつては統合幕僚会議議長章であり、1962年（昭和37年）12月1日に4つ星が制定された際、陸海空各幕僚長が左胸に着けていた幕僚長の身分を示す幕僚長章が廃止されたのに対し、本章は初代統幕議長以来、連綿と受け継がれている。統合幕僚監部の設立までは、統合幕僚会議の長として統合幕僚会議議長（とうごう-ばくりょう-かいぎ-ぎちょう）、略して統幕議長（とうばくぎちょう）が置かれていた。2006年（平成18年）3月27日、「統合幕僚会議」が「統合幕僚監部」に改編され、統合幕僚会議議長も統合幕僚長となり、権限も強化された。最後の統合幕僚会議議長は、2004年（平成16年）8月30日に就任した先崎一陸将である。なお、統合幕僚長・統合幕僚会議議長ともに自衛官の最上位であり、その先の昇進がないので、任期満了後はいずれも自衛官を退官する。退官に際しては、皇居への参内と園遊会への招待を受けることが慣例となっている。