1900年（明治33年）、27代守時は男爵の爵位を授けられた。守時は一族分家から夫人を迎えており、そのため子の時望・時哲は種子島氏女系の血をひいている。また、太平洋戦争時、国産ジェットエンジン開発の第一人者で橘花開発に携わっていた種子島時休海軍大佐は種子島氏の一族である。16代久時の娘は島津家家老・伊勢貞昌の子、伊勢貞豊に嫁いで娘（島津光久正室・曹源院殿）を生んで、その嫡男島津綱久以降、代々の島津家当主は種子島氏の血を引いており、香淳皇后の母久邇宮邦彦王妃俔子は最後の薩摩藩主島津忠義の八女に当たるため、上皇明仁は種子島氏の血を引く。司馬遼太郎による紀行文『街道をゆく 種子島みち』には時哲（前代当主の弟「アッキー様」）と時邦（若い当主）が登場している。
23代久道は島津斉興の息子・忠教を押しつけ養子とされ、後に突如撤回されるなど島津家の内紛に翻弄され、早世する。久道死去時には正室御隣の方（島津斉宣の娘・松寿院）との間に儲けた女子2人と側室との間に生まれた女子1人しか子供がなく、男子後継者を欠いた種子島氏は取りつぶしの危機となった。これを救ったのは御隣の方であり、養嗣子の要請を行うと共に実質的な種子島氏当主となり政務を執り行った。種子島の殖産産業の多くは彼女によって興されたものが多いと言われる。後、久道死後15年目にしてようやく島津斉宣の12男が養子となり24代久珍を名乗るが、これにより鎌倉時代から続いた種子島氏嫡流の男系血統は断絶している。
13代恵時は島津家の勝久・貴久の抗争で貴久側につく。1543年（天文12年）、14代時堯の代に鉄砲が伝来。島の古来からの豊富な砂鉄をもとに国産化に成功したことはよく知られる。このために、鉄砲のことを「たねがしま」と呼ぶ俗称が生まれた。また、この頃、大隅国の禰寝氏（根占氏）と屋久島をめぐり激しく抗争している。禰寝氏は肝付氏と結び、種子島氏は島津氏と結んだ。これは｢禰寝（根占）合戦」として知られる。16代久時は島津氏に臣従し、それまで独自に行っていた琉球貿易権や屋久杉の伐採販売権も島津氏の手に渡った。文禄4年（1595年）、太閤検地に伴う所替えで薩摩国知覧に移封された。慶長3年（1598年）には薩摩藩の家老に任命され、江戸時代を通して家老の家柄として1万石の家格を保持した。翌年には知覧から旧領の種子島に移封されたが、屋久島は島津氏の直轄地のままで、鹿児島への在府を義務づけられた。
ただし、実際は承久の乱後に大隅国の守護職、島津荘大隅方惣地頭に補任された北条朝時の被官である肥後氏（藤原北家勧修寺流と称す）が守護代・惣地頭代に任じられ、名越氏（北条氏支流）が守護職を解任された後も島津荘大隅方惣地頭は名越氏がそのまま継承し、惣地頭代である肥後氏の嫡流が南北朝時代に多禰嶋を名字としたと考えられる。もっとも、5代時基より前代は史料がはっきりしない。鎌倉幕府滅亡後も在地領主（国人）として島を支配。6代時充の頃から「多禰嶋（種子島）」を称する。1408年（応永15年）、8代清時は守護島津元久より屋久島を与えられる。
ロストックおよびキールでの初期の職務の後、1922年にシュリックは、ルートヴィヒ・ボルツマンやエルンスト・マッハがかつて行っていたウィーン大学の自然哲学の講義を受け持つことになった。シュリックは哲学や科学の分野で才能のある人を系統だてるうえで特別な成功を並べた。シュリックは、ウィーンにやってきた際、毎週木曜日に化学部の学部舎で定期的な会合を開いて科学における哲学的な話題について議論している科学者と哲学者の集団のリーダーになるよう請われた。その集団の初期の成員には数学者のハンス・ハーンがいて、1・2年のうちにルドルフ・カルナップ、ハーバート・ファイグル、クルト・ゲーデル、オットー・ノイラート、フリードリヒ・ヴァイスマンなどが参加した。彼らは初めエルンスト・マッハ協会と自称していたが、その後ずっとウィーン学団として知られている。1925年から1926年には、彼らはその頃のゴットロープ・フレーゲ、バートランド・ラッセル、ルートヴィヒ・ヴィトゲンシュタインらによる数学基礎論の研究について議論した。ヴィトゲンシュタインの著書『論理哲学論考』は簡潔で、宝石のように輝いている著書で、他の同種の著書の中でも特に象徴主義の理論と「絵画」つまり言語学の「モデル」理論を発展させた。シュリックとウィーン学団はこの本の研究に少なからぬ時間を費やしており、この本がもはや彼らの議論の主要な関心事でなくなってもこの本は議論で言及され続けた。やがてヴィトゲンシュタインもシュリックやウィーン学団の成員と会って『論考』や他の考えについて議論することを承知したが、彼は後に訪問者を共感している対談者にとどめておくことが必要だと気付いた。シュリックの影響を通じてヴィトゲンシュタインは鼓舞され、哲学の分野から離れて10年ほどたって哲学の分野に戻ってくることになった。それにもかかわらず、シュリックとヴァイスマンのヴィトゲンシュタインを交えた議論は、ヴィトゲンシュタインが未発表のアイディア (a charge of dubious merit) がカルナップの評論で許可なく使われていると感じるまでしか続かなかった。しかし彼はウィーン学団の他の成員とは会わなくなったのちもシュリックとは書簡によって議論を続けた。