競走馬引退後の2002年からアロースタッドで繋養され種牡馬生活を送り、2007年12月9日にアロースタッドから西山牧場へ移動した。現役時代の休養からの復帰が結果的にうまくいかず、引退時期が遅れた格好になったうえ、血統的な評価が低いこともあり同世代（キングヘイロー、スペシャルウィーク、グラスワンダーなど）と比べて人気が上がらず種付頭数が圧倒的に少ない状況にあった。一時は障害用種牡馬としてアイルランドに輸出するという話も挙がっていたが、2006年9月9日に札幌競馬場で行われた2歳未勝利戦で、父と同じ芦毛のニシノプライドが中央競馬での初勝利を挙げ、その後オープンまで順調に勝ちあがったこともあり、しばらくは日本で種牡馬生活を続ける見通しだった。2011年8月16日、西山牧場の馬房にて立ち上がる際に頭部を強打して即死した。死因は心臓発作と発表された。墓は西山牧場に設置され、墓石には西山茂行の『青雲の空を 駆け抜けた稲妻よ 永遠なれ』という言葉が刻まれている。
天皇賞（秋）後、セイウンスカイは屈腱炎を発症し、長期休養を余儀なくされた。セイウンスカイが復帰したのは、約1年半後の2001年の天皇賞（春）だった。レース当日のセイウンスカイはイレ込みが激しく、スタート直後からタガジョーノーブルと並走する形になり、生涯最速となる1000メートル通過58秒3のハイペースで逃げた。しかし、タガジョーノーブルに先頭を譲ると、2周目第3コーナーで早々に失速し、勝ったテイエムオペラオーから16秒近く離された最下位に敗れた。宝塚記念の出走を回避したあと、橈骨を痛めたことから7月に引退が決まり、8月19日に札幌競馬場で引退式が行われた。
1999年の緒戦には日経賞が選択され、同じシェリフズスターを父に持つセイウンエリアに5馬身の差をつけて勝利する。しかし、2番人気で迎えた天皇賞（春）では、スペシャルウィーク、メジロブライトに差し切られ3着に敗れた。休養後、札幌記念では鞍上の横山が「馬の行くまま」にまかせた結果、戦法を一転させ後方に待機すると、3コーナー手前からまくり気味に進出して後続を突き放し、同期の2冠牝馬ファレノプシスを半馬身抑えて勝利する。しかし1番人気で臨んだ天皇賞（秋）では、本馬場入場時にダイワテキサスと接触し、ゲート入りを嫌がるアクシデントなどもあり5着に敗退。さらにはレース後に屈腱炎を発症し、長期の休養に入った。
本項を含め放送日などはあくまで暦日で表記しているため、注意のこと。キングコング等が出演していたラジオ番組『ゴチャ・まぜっ!』の火曜日が、2006年秋の番組改編でリニューアルされることになり、10月11日放送回より『オレたちやってま〜す』に出演していた藤井隆を中心とする番組構成となった。グラビアアイドル（2007年9月まで）やお笑い芸人が週代わりで出演。グラビアアイドルは「ゴチャ・まぜっ!ガールズ」として番組オープニングから、芸人は「ゴチャ・まぜっ!一週間のコーナー」からそれぞれ登場する。2009年春の番組改編で『ゴチャ・まぜっ!』が帯番組から土曜深夜の時間帯に集中して放送されるスタイルに変更されるに伴い、3月31日をもって終了。他の曜日と異なり、本番組の出演者や内容を引き継ぐ番組は開始されなかった。
ゴチャ・まぜっ!火曜日（ごちゃまぜかようび）は、MBSラジオで放送されていたラジオ番組。本項では2006年から2009年にかけて毎週火曜に放送された『ゴチャ・まぜっ!火曜日』ついて記載する。他の時期に放送された内容についてはゴチャ・まぜっ!火曜日 (2005年から2006年まで)もしくはゴチャ・まぜっ!火曜日 (2011年から2014年まで)を、2006年10月から2009年1月まで放送されていたミニコーナーの出演者及び内容ついては、ゴチャ・まぜっ!のミニコーナーをそれぞれ参照のこと。
後白河法皇は末娘の宣陽門院を溺愛して、院領の中でも最大規模の長講堂領を伝領させたが、宣陽門院の生母・丹後局と宣陽門院執事別当の土御門通親は所領拡大のために、播磨国・備前国において荘園の新規立券を行った。兼実は摂関家嫡流に生まれた自負から院近臣に反感を抱いていたが、法皇崩御を機にその抑圧に乗り出し、手始めにこの宣陽門院領の立荘を取り消した（『愚管抄』）。さらに建久4年（1193年）12月9日の除目において、参議の山科実教・藤原成経の中将兼任を停めて両名を辞職に追い込んだ。実教と成経は院近臣の代表的な家柄である善勝寺流の出身であり、実教は丹後局の子・教成を猶子としていた。翌年正月には、教成も左少将を辞任している。これらの措置は丹後局の憤激を招き、廟堂から排除された院近臣は宣陽門院を牙城として兼実を追い落とす機会を伺うことになる。兼実の認識では摂関家・公卿・諸大夫の区別が厳然として存在し、院政期に台頭した善勝寺流や勧修寺流は元々は摂関家の家司であるとして一段低く見る傾向があった。兼実の執政下では、大納言は摂関家・花山院流・閑院流などの上流貴族に限定され（例外は兼実の義兄で道綱流の藤原定能のみ）、実務官僚として地道に実績を積み上げてきた勧修寺流の吉田経房、葉室光雅、葉室宗頼などは昇進を見送られた。また兼実の故実先例へのこだわりは、誰にも掣肘されることのない最高権力者の立場になってから更に厳格さを増していった。公事・作法の過失・懈怠に対しては、過状の提出を求めたり勘責を加えるようになり、朝廷内では中・下級貴族を中心に兼実への反発が広がっていった。