ミッションモードは「演出」であり、大当たり確率等の変更はない。ただし、大当たり時の演出として「ミッションモード突入演出」が抽選される場合があり、初回転でいきなり「完遂」することがある。時短中に発生した場合は大当たり確定であり、初回転で「完遂」となる。ミッション内容は基本的に「○の図柄でリーチをかけろ」という内容の物となるが、ごく稀に「右（左）図柄に○をとめろ」という内容のミッションが出される場合がある。この場合は大当たり確定であり、突入時にいきなり「完遂」する。また、途中で「ミッション追加」と表示され、新しいミッションが追加される事もある。この場合も大当たり確定であり、その回転で「完遂」する。尚、「完遂」せずに（関係の無い図柄で）大当たりする事もある。ミッションモード中は「チャンスボタン予告」以外の予告演出が発生しなくなる。
デジタル変動直後、画面上下に「緊急事態」・中央に「EMERGENCY」と表示され、各々の台詞の後「ミッションモード突入」と表示された後、「ミッション内容」が表示される。これらの表示はすぐに消え、変動していたデジタルが停止。その後、盤面右上のタイマーが5分にセットされ、作動する。尚、ここでリーチが掛かった場合は大当たり確定となる。
ミッションモードはデジタル変動中に突然発生し、エヴァンゲリオンの内部電源で動作可能な時間である「5分」の間に指示された「ミッション」（〇の図柄でリーチをかけろ!）を達成出来れば大当たり確定となる。また、確変図柄が指定されたミッションを達成できれば確変大当たり確定となる。この状態になると予告演出が「チャンスボタン予告」と「左右同時停止」を除き発生しなくなる。なお、突入1回転目にリーチが確定すれば大当たり確定となり、これはミサトの部屋も共通である。あくまで演出であるため、当選確率は通常時と変わらない。そのため、ミッションモードの指定図柄以外でも内部的に当選していれば大当たりする事もある。「Mission追加」が発生したり、「〇の図柄でリーチをかけろ!」以外のミッションが指示された場合も大当たり確定。
暴走モード中は通常の高確率状態と同様、デジタル変動の強力な短縮と電チューによるスタート入賞のサポートを受けることができ、次の大当たりまで継続する。暴走モードの正体は2ラウンド・ショート開放の確変大当たりであり、突入演出中にアタッカーが一瞬開くのは2Rの大当たりを消化している為である。『SF』の場合は確変割合が67%であるが、47/67を通常の確変大当たり (15R) に割り振られ、残りの20/67は暴走モード (2R) に割り振られる。
突然確変の「暴走モード」は『SF』及び『SN』に搭載されており、突入すると高確率状態となる。なお、突然確変を搭載していない『ZF』・『ZX』では、高確率状態が常に暴走モードの演出となる。そのため、初号機格納庫（確変確定のプレミアム演出）を見る事が出来ず、『SF』や『SN』の高確率状態の変動BGMも聞くことができない。
2005年9月にはパチスロ版が登場した。ちなみにパチスロ版は、内規の新基準に適合した「5号機」の第1号機（業界初、パロットを除く）である。同年10月には、フィールズの連結子会社であるディースリー・パブリッシャーから、PS2版のシミュレーター（パチンコゲーム）が発売された。移植としての完成度は決して高くなく、音声と映像のズレ、音とび等の問題点があったが、セカンドインパクト版では実機をかなり忠実に再現した移植がされている。
同名のテレビアニメ『新世紀エヴァンゲリオン』をベースにしたタイアップ機であり、同時にフィールズにとって「2004年の新基準機第一号」となる。原作アニメを忠実に再現した高品質な演出により、パチンコ業界に新たな客層を呼び込むことに成功し、10万台以上を出荷する大ヒット作となり、発売から1年以上が経過してもパチンコ攻略雑誌に攻略法が掲載され続けていた作品である。また、突然確変となる「暴走モード」や、原作での演出（エヴァンゲリオンの内部電源での活動時間5分間）を使った「ミッションモード」などの演出があり、その後のほとんどの新機種にミッションモードや突然確変が搭載されることとなった。本作はタイアップ機ではあるが、原作を知らないパチンコファンにも受け入れられ、また新たな原作のファン層を生み出した。突然確変（暴走モード）が評判になったことやリーチ演出・予告演出のわかりやすさなどがヒットの要因となった。
シチリア島の帰属を争った第一次ポエニ戦争の結果、カルタゴを下した共和政ローマが、同国の最初の属州として紀元前241年に併合した。属州化時に、当時有力な都市国家であったシラクサは同盟都市として属州からは除かれていたが、第二次ポエニ戦争においてカルタゴ側に付いたシラクサは執政官マルケッルスによる包囲戦により陥落し、属州に組み込まれた。マグナ・グラエキアと呼ばれギリシア文化が栄えていたシチリア島は、属州化以降に徐々にラテン化が進められたが、ギリシア的要素が完全に消えることは無かった。当初、ローマの小麦の供給地として非常に重要な地位を占めたが、プトレマイオス朝を下して小麦の大生産地であるエジプトを手中にして以降、シチリアの穀倉地としての地位は低下した。しかし、ローマ帝国後期になりアフリカ支配（アフリカ属州およびアエギュプトゥス）が揺らいだため、シチリア島は再びローマの穀倉地として重視されるようになった。属州化後、奴隷を大量に使役する大土地経営による小麦栽培が盛んとなっていった。それに伴い、境遇に不満を募らせた奴隷が大規模な反乱を起こすこととなる。共和政ローマ期に起こった3度の大規模な奴隷戦争のうち、2回がこのシキリア属州内で発生した。紀元前135年にはシリア人奴隷エウヌスが首謀した第一次奴隷戦争。紀元前104年に起こった第二次奴隷戦争がそれである。