コンピュータに関する知識が乏しい者は生物学的なウイルスとの違いが分からず、コンピュータから人間に対して病原体が感染すると勘違いすることがある。その大規模な例としては、2007年4月にパキスタンならびにアフガニスタンで流布した「携帯電話から致死性ウイルスが感染する」という噂が挙げられる。このケースでは、沈静化のための声明を政府が発表する事態にまで発展した。この他にも人間に影響をおよぼすコンピュータウイルスの噂はコンピュータネットワーク上で多数流布している。が、その大部分は小説やマンガ、アニメ等の創作物から派生したものである。また長時間見つめると精神に異常をきたすというflashやgif、長時間聴くと自殺したくなるという音楽ファイル等、生理的作用を標榜する各種ファイルも数多く存在する。
本来、特定の働きを持つマルウェアの一種を指す「ウイルス」という語であるが、任意のマルウェアや、さらにはプログラムではない誤動作を起こさせるデータをも指して使われる誤用が大変多い。以下、その他の誤解。
コンピュータウイルスの感染を防ぐには、ウイルス対策ソフト（アンチウイルスソフトウェア）の導入がもっとも効果的かつ手軽である。ウイルス検出の方法にもよるが、ウイルス対策ソフトはウイルス検知用のデータがないと十分に機能しないので、頻繁に定義ファイルをアップデートしなければ役に立たない。自動アップデート機能がついていれば、自動的にウイルス対策ソフトの開発元のサーバからウイルス定義ファイルをダウンロードし更新してくれるので、オンにしておくほうが良い。できるならウイルス検出が出来るウェブサイトで検査し、定期的にハードディスク全体をスキャンすると良い。インターネットサービスプロバイダ（ISP）によっては、個人・小規模ユーザ向けに、メールゲートウェイ型のウイルスチェックサービスを提供している。（メールの送受信時に、ISPのサーバで添付ファイル等のウイルスチェックを行う。）また、ルーター・ファイアウォール機といった通信のゲートウェイとなる機器に、ウイルスや不正アクセスの検出・遮断機能を持たせる場合もある。（主に企業での接続の場合）
ネットワーク普及以前は、フロッピーディスクなどで感染が広がった。書籍や雑誌の付録として付いていたフロッピーディスクにウイルスが含まれていた事例もある。現在ではネットワークソフトウェアのセキュリティホールを使って感染するもの、電子メールの添付ファイルを使って感染するものなどがある。簡単に自身の複製をばら撒けるため、現在では電子メールによる感染がほとんどである。LANケーブルを抜くなど、ネットワークから物理的に隔離してしまえば感染が広がるのを確実に防ぐことができる。
定義上は、宿主となる他のプログラムを探し、感染することがウイルスプログラムの目的であるが、他種の多くのマルウェアと同様、プログラム自身にもその作者にも、その他にいくつかの目的があることも多い。くだらないメッセージを表示して世間を騒がせて目立つという、愉快犯的な目的で作られたと思われるものは多い。ハードディスクをフォーマットしたり、BIOSを書き換えたりされてコンピュータが起動しなくなることもあるが、データのバックアップを取っていれば修復は可能である。しかし、中にはコンピュータに侵入してパスワードやデータを盗み出したり、バックドアを作成してコンピュータの制御を奪ったりしてしまうような悪質な目的のものも存在する。派手に騒ぎ立てるようなウイルスは発見が早いが、こっそりと活動し微妙な改変を加えるようなものは発見が難しく対処が遅れることもある。ウイルスの作成自体は高度な技術がなくても可能である（感染が拡大するか否かは別であるが）。スクリプトで作成したウイルスは改変が容易で、またオープンソースのもの（SourceForge.net内でも平然と開発されている。しかし、それを禁止するような規約等が存在しないのが現状である）や多くのプラットフォームで動作可能のため、多くの亜種が登場する。特定のメーカーのソフトウェアを標的にして、そのソフトウェアの信用を失墜させようとしていると思われるウイルスもある。また、別の目的のための手段としての利用がみられる。一種のP2P用ネットワーク（ボットネット）を形成する事で、感染したコンピュータの情報を盗んだり、DoS攻撃やスパムの発信プラットフォームとする物を製作・流布させたりするグループも幾つか確認されている。金銭目的の犯罪の道具として使われる点で、同じ目的のスパイウェアやマルウェアとの垣根も低くなってきている。例では有益なツールとされるもの（主にP2Pネットワークを媒介とし、感染者のパソコンをサーバ化しHDD内のデータやスクリーンショットしてアップロードするウイルスの感染者を探し出すためのツール）にウイルスが含まれていたことがある。ウイルスの亜種がインターネット掲示板にホスト名を公開しながら犯罪予告をする等の動作を行うため、一部で話題になった（山田オルタナティブ）。
11月16日の衆議院解散後、離党の意向を示し、11月19日には民主党に離党届を提出し（11月21日付で除籍処分）、山田と同じくTPPに反対している無所属の亀井静香前国民新党代表ともに「反TPP・脱原発・消費増税凍結を実現する党（反TPP）」を結党し、党代表に就任した。11月22日、同党と減税日本が合流し減税日本・反TPP・脱原発を実現する党の結成を導いた。尚、新党では河村たかしとともに共同代表に就任した。しかし、11月27日に嘉田由紀子滋賀県知事が「卒原発」を旗印に結成した「日本未来の党」へ参加を表明、翌28日の総務省へ政党届出に際し、所属議員として名を連ねた。12月1日、党副代表に就任。同年12月3日には『米韓FTAを見ると明らかにアメリカ有利の不平等条約だ。これでは韓国人が怒るのも無理ない。日本政府は米韓FTAをもう一度よく勉強し、協定内容をしっかり検討すべきだ。』と主張した。しかし、米韓FTAは韓国経済外交の金字塔として韓国側に莫大な貿易黒字を生み、2017年にドナルド・トランプ大統領に破棄を通告されて10月に改定合意をさせられたように韓国にメリットが多い協定だった。12月4日公示の第46回衆議院議員総選挙に日本未来の党から出馬。12月16日に投開票され、長崎3区で谷川に敗れ、比例での復活もできず議席を失った。敗北理由について「立ち上がりが遅く公示直前になった」「党の政策が浸透できなかった」と述べた。落選後は嘉田由紀子らと行動を共にし、日本未来の党 (政治団体)の会合などに参加している。2013年4月、第23回参議院議員通常選挙にみどりの風公認で比例区から立候補することが決まる。同年7月、参院選の比例区でみどりの風は1議席も獲得出来ず落選した選挙に落ちてからは弁護士として、TPP交渉差し止めなどで活動している。