IGY終了後も、より高い宇宙を目指し改良の続けられたカッパロケットは、1960年（昭和35年）にはK-8型が高度200kmまで達するようになり、このまま飛行高度が上がると、飛翔後の機体が日本海を越えて大陸に落下する恐れが出てきた。たとえ陸上に落下せずとも、李承晩ラインの存在していた当時、これを超えて大韓民国側海上に落下することがあっても問題となりかねなかった。道川からの打ち上げは高度300〜350kmが限界とされた。この頃には在日米軍による海岸の利用制限も緩和されていたため、飛行高度の制約を解消するべく、太平洋側に新しい実験場を建設することとなり、1年近くかけて糸川英夫自ら足を運び候補地を検討した結果、鹿児島県肝属郡内之浦町（現肝付町）に白羽の矢が立ち、1962年（昭和37年）2月、「鹿児島宇宙空間観測所（現内之浦宇宙空間観測所）」の建設工事が着工された（1963年（昭和38年）12月9日開所）。
1957年（昭和32年）から1958年（昭和33年）にかけての国際地球観測年(IGY)に日本が参加を表明したことを受け、文部省（現文部科学省）は、大気圏上層観測のために高度100kmまで到達可能なロケットの開発を糸川に打診、1956年（昭和31年）1月、東大生研へ正式に協力要請が下された。ペンシルおよびベビーで経験を積んだAVSA研究班は、本格的な観測用ロケット『カッパ（K）ロケット』の開発に着手した。ベビーよりも大型となるカッパを打ち上げるにあたって、発射場は勝手川河口北側500mの海岸へと移された。1956年（昭和31年）9月24日、K-1型が初飛翔。到達高度は10kmであった。カッパの開発は必ずしも順風満帆ではなかったが、1958年（昭和33年）9月、K-6型が高度60kmに到達した。当初目標の高度100kmには及ばなかったものの、この観測データをもって日本はIGY参加の責務を果たした。
ペンシルの飛翔実験は1955年（昭和30年）8月8日で終了し、8月23日からは、全長1.2m、直径80mm、2段式の『ベビーロケット』の発射実験を開始した。標準型であるベビーS型は、ペンシル300と同様の発煙剤による光学追跡であったが、ベビーT型でテレメータを搭載し電磁気的な追跡が可能となった。またベビーR型では、パラシュートによる機器回収の実験を行った。ベビーロケットは、1955年（昭和30年）12月までに計13機が打ち上げられた。到達高度は6kmであった。
清による統治が開始されると、埔社、眉社と邵族系統の頭社、水社、貓蘭社、沈鹿社を併せて「水沙連六社」と称されるようになった。雍正年間以前これらの地域は化外の生蕃地とされ，清朝は石限界を設け、原住民がこれを超えて進出すること、同時に平埔族及び漢人越がこれを超えて狩猟或いは開墾することを厳しく禁じた。僅かに通事築寮、撥社丁によりタバコ、糖、塩、鉄製品などを原住民と交易し、狩猟による鹿皮などを清廷への課餉としていたに過ぎない。台湾は1661年に鄭成功がオランダ人を駆逐した後、大量の漢人が大陸東南部より移住してきた。その主要な出自は福建及び広東であり、彼らは出自、言語と経済利益の衝突により抗争が発生した。しかし西部平原の平埔族群の土地を収奪するに至ると、漢人としてのまとまりを見るようになり、高度な水稲栽培技術を基礎に、水利灌漑を整備し、集落を形成していった。台湾西部平原と宜蘭平原が元来平埔族の勢力範囲であり、人類学上では凱達加蘭族（Ketagalan）、雷朗族（Luilang）、道卡斯族（Taokas）、巴宰海族（Pazeh）、拍瀑拉族（Papora）、洪安雅族（Hoanya）、巴布薩族（Babuza）、卡瓦蘭族（Kavalan）、西拉雅族（Siraya）、馬卡道族（Makatao）、猴猴族（Kau–Kaut）諸族に分類されている。彼らは狩獵、漁業と遊耕を中心としていた。大陸沿岸部から大量の漢人が流入すると、経済力と農業技術の差異により、平埔族の土地は通事土目により管理されることとなった。また平埔族の経済観念の差異に加え、漢人との間に交わされた契約書の文字が読めなかったことから、不当な負債を負い土地を失う者が続出し生活に困窮を極める事態となった。その為多くの平埔族が新天地を求めて移動することとなった。1712年、水沙連各社は朱一貴の抗清起義に呼応し、通事を殺害反乱を起こした。翌年清廷によるタバコ、布、銀を与えて招撫するまでこの反乱が続いた。雍正年間になと、清朝は原住民の居住地である内山への統制を強め「水沙連堡」を設置し、諸羅（現在の嘉義市）の守備軍を彰化に移した。これにより既存の生存空間を失った原住民が大量に出現し、その不満が高まった結果漢人を襲撃する事件が多発、それに対し1726年に原住民弾圧としての骨宗事件が発生するに至った。清朝は武力で水社頭目の「骨宗」父子を捕らえ、台南府に移送して斬首したものであり、これによる邵族の部落連盟体制が崩壊し、邵族は二度とこの地区の中心的な立場に立てなくなるほどの打撃を受けた。1787年、林爽文が彰化大里杙（現在の台中市大里区）で反乱を起こすと、その一派が水沙連内山に入った。この反乱も清朝により鎮圧されると、平埔各族と水沙連邵族などの原住民が反乱鎮圧に協力したとのことで論功行賞を受けることとなった。その方法として四川屯練制度を模倣したものであり屯番制を実施した。表面上は原住民に土地を与えたのであるが、実際には原住民を屯田兵として清朝の招撫を受けていない内山の「生蕃」からの攻撃を防ぐ役目を与えたものであった。