アレンは1789年2月12日にバーリントンにおいて脳卒中で死んだ。51歳。遺骸はバーリントンのグリーン・マウント墓地に埋葬された。アメリカ海軍にはアレンの栄誉を称えてイーサン・アレンと名付けられた艦船が2隻あった。バーモントのコルチェスター・アンド・エセックスには騎兵の基地、イーサン・アレン砦がある。シャンプレーン湖にはスピリット・オブ・イーサン・アレンという名の観光船がある。ニューヨーク市からバーモントのラトランドを結ぶアムトラックの急行列車はイーサン・アレン・エクスプレスと名付けられた。ワシントンD.C.アメリカ合衆国議会議事堂の国立彫像ホール・コレクションにおけるバーモント州を代表するのはアレンの大理石像である。
アレンはバーモントに戻ったが、そこは不満の温床になっており、イギリス軍側に付くか新生アメリカ側に付くかで揺れ動いていた。バーモントはイギリス軍からも大陸軍からもかなり多くの脱走兵の避難所になっていた。アレンは、今日ではバーリントン市となったウィヌースキ川の下流デルタにあった自家で落ち着いた。アレンはバーモントの議会では活発に活動を続け、バーモント軍の将軍にも指名された。1778年、アレンは大陸会議の場に登場しバーモントが独立した国となったことを認識するよう促した。ニューヨーク植民地とニューハンプシャー植民地の間のバーモントに関する紛争が残っていたため、大陸会議はバーモントの独立を認めることに逡巡した。アレンは続いて、1780年から1783年にかけてカナダ総督と交渉を続け、バーモントを軍事的に守るためにイギリスの植民地の一つとして生き残りを図った。このために大陸会議はアレンを反逆罪で告発した。しかし、カナダとの交渉が明らかにバーモントにおける軍事行動を起こされた場合を想定したものであったので、告発が起訴されることは無かった。
グリーン・マウンテン・ボーイズの指導者にはアレンの従兄弟、セス・ワーナーが選ばれた。アレンは1775年のカナダ侵攻作戦に参加し小さな民兵隊を率いた。この時連絡ミスと判断ミスの結果として、アレンは一握りの部隊でモントリオール攻撃中にイギリス軍に捕まってしまった（ロングポイントの戦い）。アレンはイギリス本国に送られ、コーンウォールのペンデニス城に収監されかなりの虐待も味わった。1778年5月3日、アレンはニューヨーク港のスループ型帆船に乗せられ、スタテンアイランドに送られた。そこでは、キャンベル将軍の宿舎に行き、イギリス軍の将軍や数名の士官と飲食を共にし、2日間丁重にもてなされた。3日目に、ジョージ・ワシントン将軍に指名された大陸軍の捕虜兵站総監であるエリアス・ブーディノット大佐が差配した捕虜交換によって、アレンはアーチボールド・キャンベル大佐と交換された。
アレンは身長が6フィート (約 1.80 m)を超えていた。率直で歯切れの良い物言いをした。24歳の時にフレンチ・インディアン戦争で植民地民兵隊に従軍した。1770年代の初期、アレンはニューハンプシャー特権地問題で反ニューヨークを旗印にする軍事的集団「グリーン・マウンテン・ボーイズ」の指導者として知られるようになった。アレンとグリーン・マウンテン・ボーイズはバーモント共和国 (1777-1791)の創立に貢献し、後にアメリカ合衆国の一つの州にすることになった。この時はニューヨーク植民地政府が反発し、アレンの逮捕状を発行し、協力者に賞金100ポンドを提供することになった。
イーサン・アレンは、コネチカット植民地のリッチフィールドで、ジョセフ・アレンとメアリー・ベイカー・アレン夫妻の最初の子として生まれた。アレンが生まれた直ぐ後に一家がコーンウォールに移動したため、リッチフィールドで生まれたのはアレン一人であり、弟妹7人はコーンウォールで生まれた。アレンの弟、アイラ・アレンはバーモントの歴史の初期で傑出した人物である。父親のジョセフ・アレンは、ニューハンプシャー特権地におけるニューハンプシャー植民地の裏書きによる土地利用権を所有する土地所有者や土地投機家の反抗的一団の中での指導者であった。ニューヨーク植民地もその地域における利用権を主張しており、ニューハンプシャーの裏書きによる土地利用権を否定し、多くはバーモントに住んでいない異なる人々にその所有権を販売していた。このためバーモントの住人の間に表立った反抗が生まれていた。1755年に父親のジョセフ・アレンが死ぬと、イーサン・アレンは一家の農園の経営と土地の所有権問題を引き継ぐことになり、大いにうろたえることになってしまった。
『新・人間革命』の単行本第26巻の発行を機に、2015年3月27日をもって当番組も終了、12年の歴史に幕を下ろした。その数週前から、番組では前述の第26巻について一部抜粋という形で朗読、最終週となった3月23日以降は、沢田による本編後のスタッフ紹介の際に「3月27日の放送をもって終了」という旨の告知が行われた（最終回を除く）。そして3月27日当日は、第26巻においての最後の章「奮迅」の末尾付近まで朗読、「聖教新聞ラジオライブラリー『新・人間革命』は、この放送をもって終了いたします」という沢田の告知で、最終回は締めくくられた。文化放送に於いての聖教新聞社提供のラジオ番組は、同年3月30日から『渡辺徹 家族の時間』（パーソナリティ：渡辺徹）に引き継がれていたが、同番組はあくまでも『新・人間革命』の休止に伴うつなぎ番組だった。2018年、原作が全30巻（30巻は上下巻のため全31冊）で完結。翌年度の2019年4月1日に、「今日からこの時間は、聖教新聞ラジオライブラリー『新・人間革命』の続編を、第27巻からお送りいたします」という沢田のアナウンスで番組が再開された。なお、ネット局は『家族の時間』から引き継がれるため、沖縄県では琉球放送への事実上のネット移行となるが、かつて『新・人間革命（第1期）』をネットしていた栃木放送・茨城放送は非ネットとなる。