3DSと同様に本体のシステムソフトウェアや内蔵ソフト・機能は、インターネットや一部のゲームソフトを利用して更新（アップデート）する事が出来る。更新が完了すると本体のバージョン番号が変わる場合がある。バージョン番号は「本体設定」内の上画面に表示される。ただし一度更新が完了すると過去のバージョンへ戻す事は出来ない。以下では日本国内仕様の3DS向けに配布されている更新プログラムについてのみ記載している。New3DSシリーズ発売時の日本国内仕様の本体の初期バージョン番号は「Ver.8.1.0-0J」である。
3DS間での引っ越しについて、従来型のニンテンドー3DS・3DS LL及び同等の能力のニンテンドー2DSから、New3DS・New3DS LLへの引っ越しについては対応しているが、New3DS・New3DS LLから従来型のニンテンドー3DS・3DS LL、ニンテンドー2DSへの引っ越しについては対応していない。また、ニンテンドーDSiからの引っ越しについても対応している。
Newニンテンドー3DSのみに対応。Newニンテンドー3DS LLには取り付ける事が出来ない。きせかえプレートには上と下があり下のプレートを交換するには別途プラスドライバー（サイズ:1番）が必要。プレートの柄はマリオやルイージなど、本体と同時に38種類を発売。任天堂からは2016年3月までに76種類を販売している。
Newニンテンドー3DSシリーズのインターネットブラウザーは動画再生にも対応しておりHTML5に対応している動画サイトなら再生可能だがFlashを利用しているサイト、動画サイトはこれまで通り見る事が出来ない。また新しいインターネットブラウザーはYouTubeの3D動画にも対応しており3D動画が再生可能になっている。尚3DSにはYouTube再生用の専用アプリが提供されているが、アプリでは3D表示は非対応となっている。またNew3DSシリーズからは、インターネットブラウザーのフィルタリング機能が標準で有効となっている。任天堂側は、「子供が有害なサイトにアクセスしないようにする為の処置」として説明。そのため、アダルトサイトや出会い系サイト、交流系SNSサイトなどは閲覧不可能となっている。フィルタリングは解除する事が可能だが、クレジットカード認証と手数料が必要になる。これまでのブラウザーと違い、ユーザーエージェントをiPhone系と通知するようになっており、そのためスマートフォンに対応したサイトではスマートフォン用の表示を選択できる。また、インターネットブラウザーには隠しゲームが搭載されており、新規にタブを開いた直後の「新規ページ」で、ハイパーリンクになっていない場所を『スーパーマリオブラザーズ』の地上BGMのリズム（「タ タン タン タ タン タン」）でタッチした後に、表示されているハイパーリンクを選択すると、そのURLがブロック化し、ブロックくずしが始まる。
New3DS販売から間もない2014年（平成26年）12月に、画面上にバッジを飾る機能が追加された。バッジの入手方法は、同時期に開始したバッジとれ〜るセンターでクレーンゲームの要領でバッジを入手する。
Newニンテンドー3DSシリーズでは標準でテーマ機能が追加（ニンテンドー3DS/LLは本体更新で対応）されておりHOMEメニューを着せ替えてカスタマイズする事が出来る。テーマはテーマショップで販売されており、背景、BGMや効果音、フォルダやアイコンなどが専用のものに変えられる。また一部無料で配信されるテーマもある。この他にもゲームソフトや限定版New3DS本体の特典などとしてテーマがついてくるものもある。
Newニンテンドー3DSシリーズはCPU性能が旧型より向上している為、New3DSシリーズで遊ぶ際には処理速度が向上して動作が快適になったり、画面効果が向上するソフトが発売されている。本体発売から5ヶ月間は性能を生かしてNew3DSシリーズのみで遊べる専用ソフトは発売されていなかったが、2015年4月2日に初のNew3DSシリーズのみで遊べる専用ソフト『ゼノブレイド』が発売された。また、2016年3月4日より配信開始されたスーパーファミコン用ソフトのバーチャルコンソールもNew3DSシリーズのみで遊べる。なお発売済みであるニンテンドー3DSシリーズおよびニンテンドーDSシリーズのソフトも引き続き使用出来るが、発売済みのソフトについては起動や終了の際の動作が軽快になる以外の機能向上はない。ただし、本体の形状やゲームソフトのスロットの位置が異なるという理由で『ポケモントレッタラボ for ニンテンドー3DS』など一部のソフトはNew3DSには対応しない。
NFC（近距離無線通信）に対応しており、下画面にamiiboなどとの読み書きが行うエリアが搭載されている。2014年（平成26年）12月9日からは電子マネーの決済、amiiboに対応した。対応電子マネーはWii Uですでに対応してる交通系電子マネーのSuica、PASMO、Kitaca、TOICA、manaca、ICOCA、SUGOCA、nimoca、はやかけんの9種類。PiTaPaは電子マネーの決済はできないが、『めがみめぐり』で連動した遊びに使用することが可能だった。
本体の内側カメラで顔を認識するセンサーがあり、操作中に本体や顔が大きく動いても（ジャイロセンサーとの組み合わせで）顔の位置を認識して自動調整する。本体設定で更に微調整が可能。
1925に白鳥庫吉が定年退官を迎え、彼の弟子池内宏・加藤繁・和田清らが、新しい東洋史学科の中心的な地位に立つことになるとともに、学派の指導地位に立つことになる。この時期の特徴は、日本の中国経済史・社会史研究が本格化する時期である。その研究は、資料や統計に基づいた「考證」を重視して緻密かつ着実な論証を重視した。また第1世代に位置する（より正確には第1世代と第2世代の双方にまたがって活躍した）池内宏・加藤繁・和田清が、朝鮮古代史の乏しい資料の中で花郎の研究、また慶長の役などの全体像を描き出すことに尽力したこと、明清における中国の周辺地域、特に元滅亡後のモンゴルについての研究および加藤をきっかけとして日本の中国経済史・社会史研究が本格化することでも知られている。この時期の主なメンバーとしては、池内宏、加藤繁、和田清と彼らの弟子黄現璠、松田壽男、前嶋信次、江上波夫、増井経夫、三上次男、周藤吉之、日野開三郎、山本達郎、田坂興道、岸辺成雄、榎一雄、矢沢利彦、前田直典らが挙げられる。そして、東洋史学分野における東京文献学派はその黄金期を迎えることになる。