もともとはイタリア遠征軍当時の司令官ナポレオンの護衛隊が前身であり、当初は騎兵部隊のみであったが、執政時代に執政親衛隊として歩兵部隊と騎兵部隊が組織されたのが原型で、帝政の始まりとともに次第に拡大されていった皇帝近衛隊（こうていこのえたい, La Garde impériale）のうちで、古参のベテラン兵を中心に構成された部隊または中堅および新規近衛隊のベテラン下士官を指している。特に近衛猟歩兵、近衛擲弾兵、近衛猟騎兵、近衛擲弾騎兵などが有名だが、これらは他の部隊とは一線を画する戦闘能力と士気の高さ、ナポレオンに対する絶対的な忠誠心で知られた。常に皇帝ナポレオン1世と共にあり、栄枯盛衰を共にした部隊として名高い。近衛隊は、ナポレオンを家長とした軍隊家族を形成していた。ナポレオンは彼らを敬愛し、また彼らの忠誠心も並々ならぬものがあった。ナポレオンの最後の切り札として戦場では決戦兵力として用いられ、「黒い熊毛帽の森」「無敵の古参近衛隊」「ビッグブーツ」などの威名は敵を震え上がらせ、味方にとっては勝利を約束する存在だった。ナポレオンとは堅い精神的な絆で結ばれており、1814年の1回目の退位の時にフォンテーヌブロー宮殿前の広場で別離を告げた時には、ナポレオンは師団長プティ将軍を抱擁した後、軍旗に口づけして泣き崩れたという、「フォンテーヌブローの訣別」は特に有名である。彼らは志願してエルバ島にも付き従い、百日天下でもナポレオンを支え続けた。ワーテルローの戦いでは、終盤にネイ元帥が繰り返し近衛隊の投入を要請したが、ナポレオンはこれを拒否。躊躇したことが勝利を逃す一因になったとも言われているが、実際にはすでに退路を遮断しようとしたプロイセン軍をプランスノアから撃退するのに出動中であり、ナポレオンのもとには予備兵力はほぼなかった。いわゆる伝説の一つである。後方の安全を確保した後に、最終局面で近衛軍団はようやく投入され、イギリス軍メイトランド旅団等の陣取るモン・サン・ジャン高地へと突撃するが、前進を阻止され、側面への逆襲を受けて撃退された。しかし敗北が決まった後も、古参近衛隊だけは戦場に踏みとどまって味方の退却を援護しつづけた。敵に完全に包囲されて降伏を勧告されるが、連隊長カンブロンヌ将軍は「近衛隊は死すとも降伏せず」（La Garde meurt mais ne se rend pas）と言ったという伝説がある。カンブロンヌは無口で片言が多い人物として知られており、実際には「糞ったれ!」（Merde!）と言い放ったと広く信じられている。ともかくこの近衛隊のモットーの通りに降伏を拒否して壊滅した。フランスで「カンブロンヌの一言」または「五文字」といえば、この「糞ったれ!」という意味である。1840年12月、ナポレオンの遺体がパリに帰還した際の式典には、綻びた軍服を身につけた生き残りの古参近衛隊がパレードに参加した。
この間にもTFGとエチオピア軍はイスラム勢力（ICUなど）と戦闘を続けており、TFG・エチオピア連合軍は概ね勝利を続け、2006年末までにバイドア、バンディラドリー (Bandiradley) 、ベレトウェイン、ジョハール、ジリブ、モガディシュを取り返した。2007年1月1日にはキスマヨも取り返した。エチオピア軍はバイドア政府の防衛にも協力した。エチオピアは介入させた人数は1000にも満たず、主にTFG軍の訓練教官やアドバイザーであると主張しているが、ICUは介入したエチオピア軍は数万であると主張した。TFGの中にもエチオピア軍の介入を快く思わない勢力もあった。2006年12月15日、議員オマール・ハシイ（Omar Hashii）ら60人のTFGメンバーが外国軍に抗議するため首都モガディシュに集まった。2007年1月1日、TFGのユスフ大統領は、ヒーラン地区 (Hiiraan) の責任者ユスフ・ダバギード (Yusuf Ahmed Hagar Dabageed) を解任し、フセイン・モアリム（Hussein Mohamud Moalim）を責任者に、サレイマン・ヒラウル（Saleyman Ahmed Hilawle）を副責任者に任命した。また同じ1月1日、ゲーディ首相は「首都モガディシュの軍閥支配時代はすでに終わった」と発表した。ゲーディ首相は非政府組織の武装解除を実行し、集めた武器を港に集め、モガディシュの大統領官邸 (Villa Somalia) で管理すると発表した。イスラム勢力への恩赦も実施された。2007年1月17日、大統領、首相と並んでTFGのトップであるアデン国会議長 (Sharif Hassan Sheikh Aden) が賛成183、反対8、棄権1で解任された。その理由はアデンがICUに便宜を図り、さらに長期間議会を休んだためとされた。2007年1月31日、新国会議長にアダン・モハメド・ヌール・マドベが選ばれた。275票の内、マドベが154票、イブラヒム・ハッサン（Ibrahim Adan Hassan）が54票だった。2007年2月7日、ゲーディ首相は閣僚3名の解任を発表した。厚生長官アブディアジズ・ユスフ (Abdiaziz Sheikh Yusuf) 、高等教育・文化長官のフセイン・モハマド（Hussein Mohamud Sheikh Hussein）の2名は横領と能力不足とされた。鉱物・水資源担当長官のモハマド・ヌール（Mohamud Salad Nuur）は長官指名後に宣誓に応じなかったためだった。内務長官のフセイン･アイディードは公共工事・建築長官という重要度が低いポストに変更された。合計10の閣僚が見直された。2007年9月、エチオピアを追われたイスラム武装勢力の一部がソマリア再解放連盟 (Alliance for the Re-liberation of Somalia) (ARS)を結成した。2007年11月24日、ハウィエ氏族のヌル・ハッサン・フセイン (Nur Hassan Hussein) が首相となった。2008年8月、ICUの跡を継いだソマリア再解放連盟のうちの穏健派とTFGが和解した。これはジブチ合意と呼ばれる。ユスフ大統領はフセイン首相と人事などを巡って対立し、ユスフ大統領は2008年12月14日にフセイン首相と閣僚全員を解任し、後任にムハンマド・マフムド・グルド (Mohamoud Mohamed Gacmodhere) を指名するが、議会の信任を得られなかった。12月29日、ユスフ大統領は辞任した。マドベ国会議長が暫定大統領となった。南部の大部分をイスラム武装勢力に占領された状態での辞任であった。辞任の理由は任期満了であり、4年間で国内勢力を纏められなかったため続投を断念するというものだった。