この戦いにおいて、里見義豊は戦いそのものの打撃以上に、鶴岡八幡宮の炎上という失態による打撃を受けた。鶴岡八幡宮は源氏及び鎌倉の守護神であり、里見義成の末裔である里見氏歴代当主にとっても崇敬の対象であった。また、同氏が盟主に擁立していた小弓公方は鎌倉を拠点とする関東公方の継承者としての立場を打ち出しており、何よりも公方である足利義明自身が鶴岡八幡宮を統括する「雪下殿」であった。このため、合戦後北条氏綱が推進した鶴岡八幡宮の再建に対する協力を義明も義豊も拒絶することは出来なかった。また、敗戦によってこの戦いを主導した義豊の権威は傷つき、相対的に上総進出の責任者として勢力圏の拡大に努めてきた叔父の実堯の発言力が高まった。この状況は後の義豊による実堯暗殺、そして義豊自身滅亡を招く事になる天文の内訌の遠因となった。この内乱に勝利した里見義堯は北条氏綱の後押しで立てられた当主であり、当初は氏綱が積極的に推進した鶴岡八幡宮の再建にも参加していた。だが、真里谷恕鑑没後の真里谷武田氏の家督争いに対する見解の対立から、天文6年（1537年）5月になって義堯は北条氏綱との断交と鶴岡八幡宮再建のために送る予定だった房総の材木の輸送を差し止める通告を行った。鶴岡八幡宮の再建は「雪下殿」であった小弓公方足利義明の希望でもあり、重臣逸見祥仙を派遣して義堯を説得したが遂に翻意することは無かった。一方、義明も北条氏綱と兄・高基の後を継いだ足利晴氏の連携を断つべく努力していたが成果を得ることは出来ず、下総最西部の葛西城が北条氏の支配下に入ったことで関係の悪化は決定的となった。やがて、この対立は第一次国府台合戦へと発展することになった。
だが、連年の北条氏攻撃の成果の効果が見られないことに対し、里見義豊は8月に叔父実堯と協議した上で重臣の中里実次（民部少輔）に対して水軍を安房岡本に集めるように指示している。また、上総の酒井定治にも協力を要請している。同年11月、里見義豊・実堯は正木氏・安西氏・酒井氏などの兵とともに船数百隻を連ねて、三浦半島から鎌倉に向かって進撃した。この日付については、『里見軍記』『北条記』は12月、『鶴岡八幡宮創建并造営記』には11月のこととされている。この11月には鎌倉のすぐ北にある玉縄城が上杉朝興の攻撃を受けており、両者の挟みうちによる玉縄城攻略を意図していたと考えられている。鎌倉の海岸部にて里見軍は船縁に焼人形を並べて北条軍に遠矢を打たせて、北条方の船が接近すると、大石や材木を投げ込んだと言われている（『里見軍記』）。その後、戦いは鎌倉市中に移り、里見軍は鶴岡八幡宮の社家に乱入したり、宝物を奪ったり、仏閣を破却したとされている（『北条記』）。ところが、合戦中に鶴岡八幡宮から出火して炎上し始めたことから、里見軍は鎌倉から離れて玉縄城に向かった。だが、玉縄城を守る北条氏時は城と鎌倉の間の戸部川にて北上する里見軍を迎え撃ち、これを撃退した。一方、扇谷上杉氏も玉縄城を攻略できずに撤退し、北条氏が玉縄・鎌倉から三浦半島一帯を防衛した。
1923年（大正12年）9月1日の関東大震災によって、東京帝国大学図書館は甚大な被害を被った。図書館棟が全焼となり、旧幕時代から築き上げられた所蔵図書76万冊のうち70万冊の蔵書を焼失した。『マックス・ミューラー文庫』や『古今図書集成』などが失われ、「焼け残り本」として『法華経集験記』、『天目中峯和尚広録』、『欽定熱河志』などがある。東京帝国大学は、震災後直ちに、図書復興委員会を組織し、図書の復興運動を開始した。幸いにも、国内から「南葵文庫」や「青州文庫」（一部）をはじめ多数の貴重な図書の寄贈の申し出があり、さらに、震災直後より各国大使館から援助の申し出が多く寄せられた。国際連盟においても図書復興援助の決議が採択され、海外30数カ国から数多くの図書の寄贈を受けた。また、東京帝国大学自身も多額の予算を費やし、内外の貴重な資料を購入した。その甲斐あって、所蔵図書冊数は1927年（昭和2年）に55万冊にまで回復している。図書復興と並行して、1924年（大正13年）、図書館再建と図書の復興のためにとロックフェラー財団より400万円の寄付の申し出が寄せられた。これを財源に新図書館の建設を決定し、直ちに図書館建築委員会を組織、欧米に設計・設備について調査を行った。また、キャンパス構想全体も手がけていた内田祥三（当時営繕課長兼図書館建築部長で後に工学部教授、さらに東大総長となる）の下、建設計画が進められた。1925年（大正14年）末には、早くも設計が決定している。1928年（昭和3年）に完成。同年12月1日に竣工式を迎えている（以後同日を開館記念日としている）。1944年（昭和19年）、今度は太平洋戦争による空襲が避けられない情勢となり、貴重な資料を守るため、山梨県市川大門の青洲文庫があった空き家へ、職員総出で貴重書疎開を行った。このときの疎開図書は、インキュナビュラをはじめ、木内文庫のカント著作および関係古版本、キリシタン関係貴重書、16〜18世紀の貴重書など約2千冊であった。これをタバコの空き箱3百個に詰めて、秋葉原駅から現地に送ったとのことである。日ごとに物不足、交通事情の悪化が深刻となっていた頃で、たいへんな作業であったと伝えられている。空襲の被害で本郷界隈をはじめ東京一帯が焼け野原となる中で、図書館棟は幸運にも延焼することはなかった。一説には、東京大学周辺に植えられた樹木が防火林の働きを果たしたといわれている。