ストーリーは原作の初期に相当する。プレイヤーは葉瀬中の生徒で、何故か佐為が見えたため、ヒカルと共に囲碁部に入部して塔矢アキラとの対局を目指す。チュートリアルを内包したストーリーモードとフリー対局（9路、13路、19路盤が選択可能）、通信対局（要 通信ケーブル）、詰碁（初級・中級・上級各100問+α）で構成されている。ハードのスペック上、上級者との対局はCPUの思考時間がかなり長い。
興宗が皇太子の位にあったとき、喜孫はその側近として補佐と教導にあたった。太平11年（1031年）、聖宗が死去すると、喜孫は馮家奴とともに仁徳蕭皇后と蕭浞卜らが反乱を計画していると誣告した。欽哀蕭皇后が皇太后となって称制すると、喜孫は最も重用された。重熙年間、喜孫の子の耶律涅哥は興宗に近侍していたが、事件に連座して処刑された。興宗は喜孫に推戴の功績があり、その子が罪に落ちて死んだことを悼んで、喜孫に品部を統率させることとした。7年（1038年）12月、喜孫は南府宰相に任じられた。15年（1046年）に東北路詳穏として出向し、ほどなくして死去した。
耶律喜孫（やりつ きそん、生没年不詳）は、遼（契丹）の政治家。字は盈隠。永興宮（国阿輦オルダ）の出身。
多元世界に現れ、仮面をつけて暗躍する謎の男。各勢力に様々な情報を提供しつつ、UNに怪情報を流して不安定な多元世界の人々を煽る謎の人物。カイメラ隊に協力している。「黒のカリスマ」という名前はギルバート・デュランダルに呼び名を尋ねられたときに答えたもので、UN上のハンドルネームでもある。愉快犯的に動き回っており、ZEUTHをも翻弄していく。カイメラ隊の真意が明らかになった当初、その正体はエーデル准将と思われていたが、実際の正体はジ・エーデル・ベルナル。本人によるとUN上の黒のカリスマは一般人の愉快犯（もしくは模倣犯）であるということである。なお、バッドエンドルートに進んだ場合は正体が明かされる事はない。スペシャルディスクではレムレース試作型を駆って013特命部隊の前に現れている。その際の戦闘では、『Z』ラスボス時の滅茶苦茶な言動を聞く事ができる。黒い仮面という容姿の影響で続編の『第2次Z』では、同じく黒い仮面を被り容姿が類似しているゼロが当初、ZEUTHのメンバーに異常なまでに疑われる事になった。また、その直後の会話から、ジ・エーデルの存在がZEUTHのメンバーにとって半ばトラウマになっている事が判明している。
エーデル准将に仕える科学者で機械工学と時空制御を専門としている。常に異様なハイテンションを保つ。一人称は「ワシ」。自他共に認める変人であり怪人物。脳みそのような頭の形や黄色い白目、虫の触覚のような髪の毛と髭という人間離れした風貌を持つ。異性の射程範囲は±50歳と語り、大好きなエーデル准将にお仕置きされることを至上の喜びとする。ランドとは妙に気が合うらしく、男主人公ルートでは博士の紹介をした際「少々問題の有る人」と言ったレーベンに対し、ランドと共に「これで少々だぁ!?」「ワシを舐めとんのか!?」と叫び、慌てて「大いに問題の有る人物」と訂正したレーベンに満面の笑みで「オッケー！」「異議無し！」などと言ったりする愉快な場面も。この時、ジエーの満面笑顔にランドの暑苦しいヒートスマイルまでもが加わり、レーベンに本心から「この組み合わせ…耐えられない」と思わせている。技術力は非常に高く、カイメラ隊の機体をはじめレムレース、カオス・レムレースを開発するほど。またバルゴラ・グローリーも彼の手が入っている。カイメラ隊が全滅するとあっさり降伏してZEUTHに協力したが、それもエーデルにお仕置きをしてもらうためである。実際、ミサイルという強烈すぎるほどのお仕置きを貰い吹き飛んだ。その正体はジ・エーデル・ベルナルであり、醜悪な姿でおかしな振る舞いをするのも自分の快楽を得るためであった。エーデル准将の前では口癖のように「アイラビュー」と連呼しているが、後にその真の理由が明らかになる。
ガヴドス島には新石器時代から人が定住していた。『オデュッセイア』において、英雄オデュッセウスが流れ着き海の女神カリュプソーに引きとめられたオギュギアの島（オギュギエーとも）は、ガヴドス島に比定されることがある。考古遺跡からは、ローマ帝国がこの島で活動していたことがわかっている。また、使徒パウロが、ローマへ向かう旅の途上に立ち寄ったとされている。この時代に島の植物は乱伐に晒され、今日に至る衰退の過程が始まった。西暦900年頃の東ローマ帝国統治時代に、島の人口は約8,000人を数え、3人の主教と1人の大主教が駐在していた。1665年から始まったオスマン帝国による統治は1895年まで続き、島は「ゴンゾ島」の名で呼ばれたが、その末期、1882年の人口は500人であった。オスマン帝国の統治は、「サラセン人のもの」を意味するサラキニコ海岸 Sarakinikoにその名をとどめている。1930年代には、ギリシャ国内の共産主義者の流刑地として利用された。流刑に付されたのは250人以上に上り、その中にはマルコス・ヴァフィアディスのような指導者たちもいる。第二次世界大戦中、クレタ島の戦い（1941年）に敗れた連合軍は、部隊をこの島に撤退させた。ギリシャの他の地域で1960年代に始まった人口の都市への集中の影響（過疎化）は、この島では1950年代に始まっている。この時期、島民たちはクレタ島のかつてのトルコ人の土地と島の土地とを国の仲介で交換した。クレタ島に移り住んだガヴドス島出身者は、パレオホラの一角に ガヴディオティカ Gavdiotika と呼ばれる地区を構成した。