長州藩郷士・丹藤左衛門正純の二男として生まれ、21歳で槇村満久の養子となる。藩右筆役を経て明治元年(1868年）、議政官史官試補となる。同年、京都府に出仕。権大参事、大参事、参事などを歴任。小野組転籍事件を起こし明治6年（1873年）10月に勾留され、同年12月31日に罰金30円の判決を受けた。明治8年（1875年）7月に京都府知事となり、東京奠都により人口が減少し、荒廃した京都の復興に尽力した。明治13年（1880年）5月、京都府会の同意を得ず地租追徴を決定する。山本覚馬が議長を務める府会は反発すると、槇村は追徴を撤回し府会に追徴議案を提出し、議案は可決する。明治14年（1881年）1月、元老院議官となる。明治20年（1887年）5月24日、男爵を授爵し華族となる。明治23年（1890年）2月から行政裁判所長官となり、また同年7月に貴族院議員（男爵議員）となり、ともに死去するまで務めた。明治28年（1896年）4月21日に死去。死後、爵位は長男・正介が継承したが、昭和8年（1933年）に嗣子なく没したため、家系は断絶している。墓は青山霊園にあったが無縁仏となり撤去された。
文部省が本訓令を発した目的は、学生野球の問題に対する取り組みとしてだけではなく、学生の思想対策としてスポーツを利用しようとしたものであるという見解もある。例えば、加賀秀雄は、訓令におけるスポーツの純粋性の強調は、スポーツを通じた国民の思想善導（共産主義思想対策）を意図したものであるとして、訓令を「学生スポーツに対して、国家の権力的な規制による政策的な対応」と評価している。訓令を思想善導の一環とする加賀のような見解がある一方で、加藤橘夫らのように、訓令を思想善導の一環ではない、と評価する見解もある。
戦時中の学生野球弾圧を可能としたのが本訓令であったため、1946年（昭和21年）2月から北沢清・文部省体育課長と東京六大学野球の部長・OBらを中心にして、訓令の廃止と学生野球統制団体の設立に向けた話し合いが行われることとなった。1946年8月、学生野球指導委員会が結成され、同年12月には日本学生野球協会が結成され、「学生野球基準要綱」が制定された。これに伴い本訓令は、翌1947年（昭和22年）5月21日発令の昭和22年文部省訓令第6号によって廃止された。
訓令によって、中学校の全国大会の開催や大学野球連盟の設置に文部省の承認が必要とされることとなった。すなわち、訓令によって文部省は学生野球の生殺与奪の権限を握ることとなったのである。1943年（昭和18年）3月、太平洋戦争の戦局の悪化に伴い「戦時下学徒体育訓練実施要綱」が文部省により制定され、中学校のスポーツの全国大会と大学のスポーツのリーグ戦の開催が禁止される。これを受けて同年4月6日、北沢清・文部省体育振興課長代理から内村祐之・東京大学野球連盟理事長代理に対して「連盟解散通知書」が手渡された。4月28日、文部省の通知書に従って、東京大学野球連盟は解散した。戦局の悪化に伴う文部省の学校体育・スポーツ政策の転換があったことは確かであるが、文部省の学生野球弾圧を法的に可能としたのが本訓令であった。
訓令により、学生野球の選手とプロ野球選手の試合が禁止されたため、1934年（昭和9年）、ベーブ・ルースやルー・ゲーリッグらが参加した米国メジャーリーグベースボールの選抜チームとの対戦に際して、大日本東京野球クラブ（後の読売ジャイアンツ）が創設された。訓令は、1936年（昭和11年）からの職業野球開始の法的要因となった。
1974年、ベルリンのジャズフェスティバルに参加した彼は、エルメート・パスコアールやパーカッション奏者とナナ・ヴァスコンセロス (en:Naná Vasconcelos) らと共演する。その後ECMのマンフレート・アイヒャーと出合う。1975年にレーベルへの参加を乞われ、1976年、ECMのメンバーに加わった。当初ECMに入る事を躊躇していたのは、ジスモンチ自身がECMのことを余り良く知らなかったためである。ジスモンチはECMでブラジルの著名なミュージシャンによるアルバムを構想していたが、ブラジル軍事政権が国外に出るブラジル人に対し高額の課金をしていたため、彼らをECMのスタジオがあるノルウェーに連れ出すことが困難であった。そこで彼はソロアルバム制作に方針を変更してノルウェーに向かった。当地でアマゾン近くで育ってきたという共通の経歴を持つナナ・ヴァスコンセロスと再会し、アルバムへの参加を要請。1976年こうして完成したアルバム『Dança das Cabeças』(ECM) は20万枚を売り上げるとともに、イギリスではポップの、アメリカではフォルクローレの、ドイツではクラシックと様々なジャンルの賞を受けることになる。このアルバムを機に、ヴァスコンセロスは世界的なミュージシャンとして各国を飛び回るようになるとともに、ジスモンチはアマゾンのフォクルローレの研究に没頭するようになる。そして、2年間、アマゾンで現地の人と生活を共にする。1978年にサックス奏者ヤン・ガルバレク、マルチ楽器奏者のコリン・ウォルコット (en:Collin Walcott)、ラルフ・タウナー (en:Ralph Towner) らと 『Sol Do Meio Dia』(ECM) を、1980年にヤン・ガルバレク、チャーリー・ヘイデンと『Magico』(ECM) をリリース。また、1979年にリリースしたソロアルバム『Solo』(ECM) はアメリカで10万枚以上を売り上げるヒットとなった。それ以降もコンスタントにアルバムを発表し続けている。