当初は土曜22:00 - 22:54の放送であったが、1987年10月3日より21:00 - 21:54に枠移動した。枠移動後の初回は編成の都合上、基本放送時間より30分遅れでの放送となった。また、スポーツ中継の影響により30分以上遅れる回もあった。CS放送のTBSチャンネルでは、2004年に、同年のアテネオリンピック開催に合わせ、アテネやオリンピック関連のテーマを取り扱った回の再放送が行われた。系列外のABS・JRT・FBCは1995年に開始（いずれもNNS非マストバイ局。ABS・JRTは4月に、FBCは10月に開始）。系列外ネット開始当初は木曜19:00-19:54（当時ローカル枠だった『嗚呼!バラ色の珍生!!』を差し替え）での放送であったが、日本テレビ系列では1999年3月をもって、ゴールデンタイムのローカル枠が廃止となったため、現在の放送時間となる。なお、番組名に特定の企業名が入っていることから、ABS・FBC・JRTによる放送でもスポンサーの変更はない（いわゆる、時差スポンサードネット）。
2012年6月30日放送分までエンディングテーマに様々な版権曲が使用されており、2 - 3か月おきに変更されていた。2012年7月7日放送分以降はエンディング曲が廃止された。
最初にこの人形の企画およびデザインを行ったのはモンチッチの作者でもあるワシの良春。非常に精巧な制服と小道具、頭が揺れるデザイン、ボッシュートの際にある程度の高さから落ちても大丈夫な耐久性、といった条件を満たすために非常に高価であり、製作はひとつひとつが手作りだった。2008年には放送1000回を記念して、各ヒトシ君人形の貯金箱や首振りフィギュア、首振りマスコット、マスコットストラップなどが商品化された。
不正解になるとヒトシ君人形が没収される。この没収のことを司会の草野仁はボッシュートと呼んでおり、草野のニックネームである「HBK（Hitoshi Bosshoot Kusano）」の由来にもなっている（本来はプロレス団体WWEのプロレスラー、ショーン・マイケルズのニックネーム「ハートブレイク・キッド（Heart Break Kid）」）。ヒトシ君人形が落とされる様子がダストシュートに似ているということで、「没収」と「ダスト・シュート」を掛け合わせた造語である。視聴者からの問い合わせがあった際に『「没収」と「シュート」を合わせた言葉』であると説明した。
2012年1月28日放送分のスペシャル回から、2005年度より一旦廃止した「スーパーヒトシ君人形」が復活、更に得点表示もヒトシ君人形による表示が復活し、概ね2000年度中盤までのルールに戻った。ノーマルの場合は1ポイント、スーパーヒトシ君の場合は3ポイント。つまり、3問全問正解・5ポイント(2012年のスペシャル版は、4問全問正解・6ポイント)獲得するとパーフェクト賞と視聴者に海外旅行がプレゼントされる。2012年のスペシャル版は、問題が1問増えるため、使用可能なノーマルヒトシ君人形の数が1つ増える。概ね2000年度中盤までのルールに戻っているがトップ賞獲得の条件は復活しておらず、スーパーヒトシ君の1問のみ（=ヒトシ君3個）の正解のみならず、ノーマルヒトシ君1問の正解だけでトップ賞を獲得することもある。未使用のヒトシ君人形は解答者席横のボックスに収納されている。正解すると獲得できるヒトシ君人形は解答者席前面のスペースにあらかじめセットされており、獲得ポイント分のヒトシ君人形が出てくる仕組みになっている。パーフェクト賞の解答者にはトップ賞の賞品に加え、クリスタルスーパーヒトシ君が贈呈される。
2010年10月には番組開始25周年を記念して3週にわたる特別企画を放送。10月9日、10月16日は問題が全問三択となり、その全てが電話投票形式での視聴者プレゼントクイズとなった。同年10月23日には2時間スペシャル（19:56 - 21:54）を放送。当時の番組出演者一同がハワイへ上陸し、解答者2チームと司会者に分かれて取材を行いながら、視聴者向けに電話投票クイズを出題した。その後、取材の成果をもとに日立の樹の前に特設セットを設け、解答者チームが対抗で電話投票形式のクイズ対決を行った。また、ミステリーハンターの日記も現地の小学校を取材。小学生と共に特設セットに飾るための絵を描き、電話投票クイズの出題を行った。
1922年創設。1935-36シーズンに初めてプリメーラ・ディビシオン（1部）に参戦したが、その後の約40年間は主にセグンダ・ディビシオン（2部）でプレーし、時にはテルセーラ・ディビシオン（当時3部）にも在籍した。1961年から1969年までは同じアリカンテに本拠地を置くアリカンテCFがエルクレスCFの若手有望株を育成するクラブとして機能した。1970年代半ばから1980年代後半にかけてプリメーラ・ディビシオンに計10シーズン在籍した後はセグンダ・ディビシオンやセグンダ・ディビシオンB（3部）でプレーし、1995-96シーズン終了後に9年ぶりのプリメーラ・ディビシオン昇格を決めたが、この時は1シーズンでセグンダ・ディビシオン降格となり、再びセグンダ・ディビシオンBまで落ちた。2004-05シーズンはセグンダ・ディビシオンBを2位で終え、昇格プレーオフを勝ち抜いて5シーズンぶりにセグンダ・ディビシオンに昇格した。2005-06シーズンから3シーズンはセグンダ・ディビシオンで確固たる地位を築き、2008-09シーズンは昇格したCDテネリフェと勝ち点3差の4位で昇格を逃した。2009-10シーズンは常に昇格争いに絡むシーズンを送った。41節のラーヨ・バジェカーノ戦は前半終了時点で0-1と劣勢だったが、後半に2-1と逆転して勝利し、レアル・ベティスを上回って昇格圏内の3位に浮上した。最終節（42節）はセグンダ・ディビシオンB降格の危機にあったレアル・ウニオンに2-0で勝利し、13シーズンぶりのプリメーラ・ディビシオン昇格を果たした。レバンテUD、エルクレスCF、レアル・ベティスの3クラブは同勝ち点であり、得失点差で昇格クラブが決まる接戦であった。2010-11シーズン、2010年9月11日にカンプ・ノウで行われたFCバルセロナ戦はネルソン・バルデスの2得点で2-0と勝利した。FCバルセロナはホームで13連勝中であり、3ヶ月以上に渡って1得点以上を挙げていたが、どちらの記録もストップさせ、1年3か月ぶりにホームでの敗北を与えた。両者の対戦は1996-97シーズン以来であったが、この勝利でFCバルセロナに対して3連勝となった。シーズン前半戦は順位表の中位に位置したが、後半戦に失速し、19位でセグンダ・ディビシオン降格となった。