1993年の生理学・医学賞は、「分断された遺伝子の発見」によりリチャード・ロバーツとフィリップ・シャープに授与された。ノーマン・デイビッドソンやジェームズ・ワトソンなどの科学者は、ロバーツと協力した台湾の研究者周芷（ルイーズ・チョウ）も受賞対象に含めるべきだったと主張した。1976年に周はアデノウイルス転写物のゲノム起源と構造の研究を行い、これがコールド・スプリング・ハーバー研究所での1977年のRNAスプライシングと選択的RNAプロセシングの発見に直接つながった。ノーマン・デイヴィッドソンは、スプライシングが観察された電子顕微鏡を操作したのは周であり、彼女が開発した技術を使用した実験の唯一の設計者が彼女であったことを認めた。
1997年の生理学・医学賞は、プリオンの発見によりスタンリー・B・プルシナーに授与された。この受賞は、長い論争を巻き起こした。批評家は研究の妥当性を批判し、プリオンが本当に存在するのかについて疑問を呈した。これは他の研究者によって、まだ証明されていないと批判されていた。プリオンの存在は、この受賞から少なくとも10年間は、科学界に完全には受け入れられていなかった。
1998年の生理学・医学賞は、「循環器系における情報伝達物質としての一酸化窒素に関する発見」によりロバート・ファーチゴット、ルイ・イグナロ、フェリド・ムラドに授与された。ファーチゴットとともにこの分野の発見に大きく貢献したサルバドール・モンカダが除外されたことに対する科学界からの抗議があった。
2000年の生理学・医学賞は、「神経系における情報伝達に関する発見」によりアービド・カールソン、ポール・グリーンガード、エリック・カンデルに授与された。多くの神経科学者が、パーキンソン病に対するドパミン補充療法の先駆者であるオレー・ホルニキーヴィクツが除外されたことに抗議した。
2003年の生理学・医学賞は、「核磁気共鳴画像法(MRI)に関する発見」によりポール・ラウターバーとピーター・マンスフィールドに授与された。この受賞に対しては、2つの独立した主張が存在する。レイモンド・ダマディアンは、核磁気共鳴(NMR)によって癌性組織と非癌性組織をin vitroで見分けることができると初めて報告した。後に彼はこれを人間の全身に対して初めて応用した。ダマディアンの報告は、ラウターバーがNMRを本方法に展開することを促した。ダマディアンは、自身が賞から除外されたことに抗議する広告を国際的な新聞に出した。これとは別に、ハーマン・カーは1950年代にNMR勾配法を開発し、初歩的なMRIを実証した。ノーベル賞受賞者は、カーの研究をほぼ確実に見ていたが、それを引用しなかった。その結果、ノーベル委員会は、カーによる発見を知らない可能性が非常に高い。マンスフィールドは自叙伝で、本当に賞を逃したのは、スピンエコー法の原理の発見に貢献したアーウィン・ハーンだったと書いている。
2006年の生理学・医学賞は、「RNA干渉（二重鎖RNAによる遺伝子サイレンシング）の発見」によりアンドリュー・ファイアーとクレイグ・メローに授与された。委員会がファイアーとメロー（彼らは線虫の一種Caenorhabditis elegansでRNA干渉を研究した）による発見としたものの多くは、それ以前に植物学者によって研究されており、その中の少なくとも1人（デイビッド・バウルクームなど）は受賞対象に含めるべきだったと示唆された。
1977年8月27日の夕方5時ごろ、大阪府東大阪市内の市道は幹線道路の抜け道であったため帰宅ラッシュで混雑していた。この時、前が進んだにもかかわらず一台のライトバンが進もうとしなかった。そのため自宅まで100mであった帰宅途中の会社員の男性（当時37歳）は、前のライトバンに警笛を鳴らした。この行為は日常どこにでも見られるものであった（ただし厳密には法律上警笛の目的外使用にあたる）。実際に目撃者のなかには、拳銃の発射に気付かず、帰宅後に証言のために警察へ出頭した者もいたほどだった。しかし、ライトバンを運転していた元暴力団員（当時32歳）は警笛を鳴らされたことに腹を立て、会社員のライトバンに詰め寄り、所持していた拳銃で会社員の首に発砲し、助手席にいた愛人（当時33歳）と逃亡した。会社員は病院に搬送されたが午後6時に死亡した。この事件は「クラクション殺人」として大きく報道され、社会問題化した。警察は被疑者の愛人を割り出し、8月30日に同行を求めた。愛人は服毒自殺しようとしたが救命措置で助かり、元暴力団員の犯行を認めた。被疑者は傷害と覚せい剤取締法違反などで逮捕歴18回、前科5犯の常習犯であったが、殺人の前科はなかった。犯行に使用した拳銃は六連発で弾丸が残っており同様の事件を起こす恐れがあったが、9月2日に潜伏先の大阪市内のホテルで逮捕された。被疑者は刑事裁判では犯行時に覚醒剤を服用しており、その幻覚作用の影響下にあり心神耗弱であったことを主張したが、犯行後に大阪府内を逃亡したことから責任能力に問題はないとされた。検察側から無期懲役が求刑され、一審の大阪地方裁判所は無期の判決を下した。二審の大阪高等裁判所は1979年7月28日に、心神耗弱は認められず犯行動機も身勝手であると非難したものの、当時の有期刑では最長の懲役20年に減刑した。その理由は、無期でも量刑不当ではないが反省しているというものであった。なお、被害者遺族に対し労働省（現在の厚生労働省）は勤務先から帰宅途中の労働災害と認定し1977年12月に遺族年金支給を決定した。労働省の見解は「ピストルを持った無法者の横行は、キバをむいて街をうろつく野犬と同じ」というものであった。