長谷川泰等は「医師は医師会に加入するに非ざれば、患者を診察することを得ず、診察する者あるときは、其の業務を停止す」という内容を含む「医師会法案」を1898年に国会へ提出した。東京帝国大学医科大学の教授入沢達吉、青山胤通、森鴎外等は、エリート意識より生じた医師差別論からその案を貴族院で廃案にせしめ、更に「明治医会」を組織して「日本の医学を良くするためには医術開業試験を廃し、粗末な私立医学校を廃校にして官立の医学校を充実させるべきである」と決議(「医学教育統一論」)し、文部省と秘密裡に協議の上1903年3月26日、今後私立医学校が存続する為には文部大臣の「認可」が必要であること、官立並みの実験設備及び建物の完備を求め、「期限は翌年の3月31日までに手続きを取らなければ廃校と看做す。調査により一点でも欠点があり、不認可の命令を受けたるものは、その命令を受けた日に於いて廃校と看做す」という済生学舎を標的とした「専門学校令」(勅令第61号)を発布せしめる。その背景には、天皇の侍医であり、長州閥の山県有朋の主治医であった初代東京帝国大学綜理池田謙斎がおり、山県との50通にわたる書簡から特別な関係であった事と池田は入沢達吉の叔父にあたり、東京帝国大学赤門派閥教授入沢達吉等による藩閥政治的権力による政治活動を可能にした実力者山県有朋との橋渡し的役割を果していたことがあげられている。
1901年「薬律改正問題(医薬分業論)」が起り、長谷川泰は医師数が約3万2千人、薬剤師数が2千5百人と絶対数が足りないので医薬分業は時期尚早である事を理由に反対すると、日本薬局方調査会の丹波敬三、青山胤通、入沢達吉等の委員が総辞職し、長谷川泰は時の総務長官山県有朋に責任を取らされ衛生局長職の辞表を提出させられ、衛生局長就任時の貴族院議員勅選の誓約も入沢達吉の叔父池田謙斎に奪われて精神的失望感を味わう。しかも誓約の立会人芳川顕正逓信相は山県の側近であった。山県は、北越戊辰戦争時新政府が組織する征東軍の北陸道鎮撫総督府(会津征討越後口総督府軍)参謀で、会津への途中長岡藩に2ヵ月半に及ぶ想わぬ抵抗に遭う。その時の長岡藩家老上席軍事総督が河井継之助で、長谷川泰は河井に3人扶持で雇われた軍医であり、特に山県は松下村塾での親友時山直八をこの戦いで失っており、泰に嫌悪感を久しく持っていた。
1903年の長谷川泰による突然の済生学舎廃校宣言の理由は、従来文部省が済生学舎を私立大学として許可しない、今後官立府県立医学校が新設されるので医学専門学校として継続して行く必要はもはやないという長谷川泰の判断と、済生学舎の建物・環境が粗末であったので医学専門学校として認められないからであると一般的には考えられている。しかし、実際は以下に述べるように山県有朋の私怨により泰が廃校宣言を決意せざるを得なかった経緯が存在している。
建中寺（けんちゅうじ）は、中国の洛陽城内にかつてあった仏教寺院。531年（普泰元年）、北魏の尚書令・楽平王の爾朱世隆が爾朱栄の追福のために宦官の劉騰の邸宅跡に寺を建立した。朱門黄閣のいわゆる仙居のつくりであった。前庁を仏殿とし、後堂を講室とした。涼風堂が1カ所設けられており、もともと劉騰の避暑地として作られたため、常に冷涼が保たれていた。境内には「万年千歳の樹」と呼ばれる老木が立っていた。
第38任務部隊から離れたモントゴメリーは、1945年1月にサンディエゴの西海岸艦隊航空団指揮官に就任し、要員、部隊、機材その他を前線へ送り出す後方支援の立場から太平洋の戦いを支えることとなった。この任務が評価され、二度目のレジオン・オブ・メリットがモントゴメリーに授与された。7月20日、モントゴメリーは中将に昇進するとともに、ハワイの太平洋航空部隊司令官となった。第二次世界大戦終結後の1946年9月、モントゴメリーはテッド・シャーマンの後任として第5艦隊司令長官に就任し、揚陸指揮艦アパラチアン（USS Appalachian, AGC-1）を旗艦として将旗を掲げた。1947年1月1日付で第5艦隊が廃止になったあと、7月に新たに編成された第1艦隊の司令長官に横滑りし、8月1日まで戦艦「アイオワ」（USS Iowa, BB-61）を旗艦とした。第1艦隊の職を離れたあとは少将のランクに戻り、北太平洋海域兼アラスカ海域兼第17海軍区司令官となってコディアックに司令部を置いた。1949年から1950年にかけては英領バミューダ諸島に置かれたバミューダ海軍基地司令官を務め、1950年2月からはフロリダ州ジャクソンビルの海軍航空基地司令官となって、1951年7月に中将に名誉昇進の上退役するまでその職を全うした。モントゴメリーはカリフォルニア州オークランドでアリス・クレア・スミスと結婚し、アリスは一人息子となるブルック・モントゴメリーを産んだ。ブルックは海軍中尉になったが、1956年2月1日に航空機事故で殉職した。それから5年後の1961年12月13日、アルフレッド・ユージン・モントゴメリーはワシントン州ブレマートンの海軍病院において、70歳で亡くなった。