バイオジェネシス・クリニック経営者のトニー・ボッシュは医師免許を持たない偽医者で借金が嵩み、2012年9月に顧客だったボディービルダーのポーター・フィッシャーをクリニックの共同経営者にすると持ち掛けて彼から4000ドルを借りた。翌月に利息を付けて返済する約束だったが、反故にされたためにフィッシャーが激怒。フィッシャーからメジャーリーグベースボール（MLB）選手への禁止薬物密売についての詳細ノートの情報提供を受けた地元新聞社のマイアミ・ニュータイムズ紙によって2013年1月29日に報道され、スキャンダルが発覚した。資料によると、アレックス・ロドリゲス、ネルソン・クルーズ、メルキー・カブレラ、ジオ・ゴンザレス、バートロ・コローンらの名前が禁止薬物を入手していたとして記されていたが、ロドリゲスは代理人を通じて報道を否定した。4月12日にニューヨーク・タイムズ紙が「ロドリゲスが証拠隠滅を目的として既にバイオジェネシスから証拠を買い取っていた」と報じた。生活面と司法面で多額の援助を約束されたボッシュは6月4日にMLBの調査チームと調査の協力で合意し、クリニックが禁止薬物を提供した選手名を報告すると伝えた。その後にMLBの調査チームは疑惑選手を次々と事情聴取した。彼らは揃って証言を拒否したが、ボッシュから入手した決定的な証拠を突きつけられ、追い込まれた。
バイオジェネシス・スキャンダル（Biogenesis scandal）は、主にメジャーリーグベースボール（MLB）の薬物スキャンダルであり、プロボクサーのユリオルキス・ガンボアも疑惑が浮上した。2013年1月にヒト成長ホルモン（HGH）などの禁止薬物を購入していた事が判明した。同年7月22日にミルウォーキー・ブルワーズのライアン・ブラウンに65試合、8月5日にニューヨーク・ヤンキースのアレックス・ロドリゲスに211試合とその他12人の選手に50試合の出場停止処分が科された。
北条氏の滅亡後、文庫は衰退し、蔵書も多くが後北条氏、徳川家康、前田綱紀らによって持ち出された。明治時代に入ると、明治30年（1897年）に伊藤博文らの尽力によって金沢文庫は復興し、称名寺大宝院跡に再建されて旧蔵書の回収も進められたが、1923年（大正12年）に発生した関東大震災によって損壊するも、昭和5年（1930年）8月9日に図書館令に基づき、神奈川県の運営する最初の県立図書館である「神奈川県立金沢文庫」として復興した。昭和8年（1933年）に図書館令が改正され、公立図書館のうち1館を中央図書館に指定することになると、唯一の神奈川県立の図書館であった金沢文庫が中央図書館の役割を果たすことになった。中央図書館時代の金沢文庫は、郷土資料として金沢八景や神奈川県下の名所絵、県下でおこった歴史絵、横浜絵などの浮世絵を収集し、現在も200点余り所蔵している。昭和26年（1951年）に博物館法が公布・施行され、昭和29年（1954年）に神奈川県立図書館が設けられると、金沢文庫は図書館から博物館に変わることになり、昭和30年（1955年）に登録博物館となった。平成2年（1990年）に新築され、現在は称名寺が所有する国宝や重要文化財を含む鎌倉時代のものを中心とした所蔵品を保管し、展示公開する歴史博物館となっている。主な収蔵資料（称名寺からの寄託品）としては、金沢北条氏歴代の肖像画（実時・顕時・貞顕・貞将像、国宝）、忍性や審海の肖像画、木造釈迦如来立像、木造十大弟子立像、金銅製愛染明王坐像などの仏像、工芸品、審海所用の密教法具、古文書などがある。
「金沢」は歴史的・慣例的には「かねさわ」と読まれるのが本来であり、設立当初は「かねさわぶんこ」或いは「かねさわのふみくら」と呼称されていた。江戸時代に加賀藩の金沢が著名になり「かなざわ」という読みが広まり、現在では公共機関の読みも金沢区や京急電鉄「金沢文庫駅」は「かなざわ（ぶんこ）」となり、神奈川県立金沢文庫も同様に「かなざわぶんこ」の読みとなっている。
何事にも縛られず自由で怠惰な生き方を信条とする流れ者、ファングは、大企業ドルファ・ホールディングスが統治する大都市ゼルウィンズに立ち寄った際、台座から引き抜くことができれば何でも願いが叶うとされる剣の伝説を耳にし、空腹を満たすという刹那的な願いを叶えるためにその剣を引き抜く。しかし剣に宿っていた妖聖の少女、アリンから、実際に願いを叶えるには同様に妖聖を宿したフューリーを100本集め、封印されている女神を復活させなければならないと告げられる。願いを叶えることができなかったファングは無銭飲食の罪で逮捕されるが、脱獄を手引きしたアリンから、彼女が記憶喪失であることを打ち明けられ、記憶を取り戻すために女神復活を手伝って欲しいと懇願される。ファングは彼女のことを無下にできず、契約を交してフェンサーとなる。物語は、大都市ゼルウィンズを拠点に、情報屋の少女、ロロからフューリーの目撃情報を購入しつつ、モンスターが出没する各地の野山や洞窟へと向かうという形で進行する。ファングは最初の情報を元に向かった先で、同様にフューリーを集めているフェンサーの少女、ティアラと競合し、毒入り紅茶を飲まされて出し抜かれそうになるが、結果として彼女を助けることになり、以降は仲間として行動を共にすることになる。順当にフューリーを集め、その過程で妖聖研究家のハーラー、ドルファの下っ端戦闘員ガルド、謎の生き物ピピンといった仲間を増やしていったファングは、表向き地域密着型の優良企業として振る舞っているドルファが、邪神を復活させて世界征服を企む悪の組織であることを知る。ドルファもまた邪神復活のためにフューリーを集めており、ファングはドルファと戦うため、邪神の末裔に滅ぼされた一族の復讐のため戦う正義のフェンサー、シャルマンと共闘することになる。一方、次第に失っていた記憶の一部を取り戻していくアリンは、女神の記憶の一部を不完全ながらも受け継いだ、女神の化身として覚醒する。次々と現れるドルファの刺客や幹部を返り討ちにし、とどめを刺して殺害していくファングだが、やがてそういった相手にも家族がいるという現実に直面し、戦いに対する後味の悪さや迷いを抱えるようになる。また、邪神の末裔という忌まわしい出自を仲間に隠し続けているティアラも、自分の命を犠牲にすることで邪神復活を阻止するという決意を固めていく。女神復活に必用な準備を整え、儀式を執り行うための聖域へと向かうファングたちだが、ドルファの妨害により乱戦となる。その最中にティアラはシャルマンに殺害されて本懐を遂げるが、その結末に納得できないファングは無意識にティアラの復活を願い、その願いは復活した女神によって聞き届けられる。