やがて、長老派の東京第一長老教会に転会し1874年(明治7年)4月に牧師に任命される。最初に芝露月町教会と品川教会（大井町教会）を兼牧した。東京で牧師をしながら、安川はさらに郷里の法典村で伝道を続ける。そして、1877年(明治10年)で安川と戸田忠厚の伝道に接した、法典村の渡辺伊十郎がキリスト教の求道を始める。その後、渡辺は安川から洗礼を受け、自宅で家庭集会を開く。それがきっかけで、1883年(明治16年)に九十九里教会が設立される。1883年4月9日、霜月町教会で韓国最初のクリスチャンの一人とされる当時留学生の李樹廷に洗礼を授ける。また同年1883年に安川は服役囚の好地由太郎の実姉で養母の好知つるに依頼されて刑務所に聖書を差し入れた。それがきっかけになり、つると夫の新聞記者の好地重兵衛は芝露月町教会の教会員となった。1884年(明治17年)、安川は板垣退助、植木枝盛、片岡健吉、小林樟雄、細川瀏ら立志社、自由党と関係があったので、彼らの支援で、日本基督一致教会が高知県の伝道を推進した。その結果、翌年1885年(明治18年)に高知教会が誕生する。
1990年代以降、土浦駅周辺を中心に減退傾向にあったが、商業統計調査結果によると、2004年から2007年にかけては卸売・小売ともに年間販売額が微増となり、市全体としては下げ止まりの状況となっている。卸売販売額は372,667百万円（2007年）、小売販売額は201,606百万円（2007年）であり、いずれも茨城県内では3位の規模となっている。また、2009年5月にはイオン土浦ショッピングセンター（現:イオンモール土浦）が開業。土浦駅周辺では、1997年に、土浦駅西口の再開発ビル「ウララ」（中心地の別の場所にあったイトーヨーカ堂が主なテナントとして移転）が完成したが、1996年以降西友や地場百貨店小網屋、京成百貨店、東武ホテルが閉店、2003年には丸井、2007年3月には京成ホテルが閉店となり、モータリゼーションの発達や規制緩和による郊外型店舗増加等の影響を受け、駅周辺の空洞化が進んでいる。現在、旧東武ホテルの建物は大幅改装されビジネスホテルに、丸井が撤退したビルはリニューアルされ、飲食店やパチンコ店などが入居している。西友跡地・小網屋跡地ではマンションが建設された。また、土浦駅ビル「WING（ウイング）」も売上げの低迷により2008年7月に営業を終了したが、2009年7月、「ペルチ土浦」としてリニューアルオープン、更に2018年3月に「プレイアトレ土浦」に改称している。そして、ウララ自体も駅周辺の空洞化の影響を受け、2013年2月17日に医療機関など一部を残し営業を終了した。その後、2015年9月、かねてより老朽化と利便性の悪さが問題となっていた土浦市役所本庁舎をウララに移転、その際、地下1階のフロア全体と地上フロアの一部を商業スペースとし、地下1階にはカスミ土浦駅前店(2代目)とダイソー土浦駅前店、その他地階と地上フロアに専門店がテナント入居している。西口の歓楽街である桜町は北関東最大の風俗街で、ソープランドの店舗数は川崎市堀之内に次いで関東で2番目に多い。ブックオフ土浦真鍋店は二階建ての大型ブックオフであり、関東最大級の古本店である駅前のつちうら古書倶楽部と並ぶ市民のオアシスであったが、惜しまれつつも閉店となってしまった。荒川沖駅周辺では、平屋建てのカスミ荒川沖店（旧）を中心とした西口商店街が優勢だったが、1981年の荒川沖ショッピングセンター「さんぱる」オープン（東口）をきっかけに、一転して西口商店街は衰退の一途をたどり、カスミ荒川沖店は立地条件の悪さもあり撤退を余儀なくされている。その後、西口の再開発事業によって再開発ビル「さらさ荒川沖」が完成したものの、筑波研究学園都市への玄関口としての役割が隣接のひたち野うしく駅に奪われたことから、周辺部のビルも含めてテナントの撤退が相次いでいる。一方「さんぱる」は3階建て、駅との直結性と駐車場の収容台数の多さを兼ね備えた当時は画期的な施設であった。しかし駅とほぼ直結という立地条件もあり一定の集客力を確保していたものの、キーテナントである長崎屋の業績悪化から2010年5月9日にドン・キホーテへ業態転換したが経営的に振るわず2015年1月4日にキーテナントのドン・キホーテが閉店、同月12日には専門店などその他のテナントも閉店し、現在はフットサル用コートの「DO Football Park 荒川沖」となっている。ブックオフスーパーバザー荒川沖店は、本のみならず古着なども扱っており、万が一閉店してしまえば、荒川沖の文化水準は地に堕ちると思われる。一方で、駅から離れた郊外の主要道路沿いに、広い駐車場を持つ各種大型店の進出が続いており、真鍋地区にカスミをキーテナントにする駐車場付き大型ショッピングセンター「ピアタウン土浦」があり、その至近にはカドヤ（現・セブン&アイグループ系列のヨークベニマル）及びカワチからなるショッピングセンターが開業した。さらにとりせんが木田余地区にショッピングセンターを、加えてイオン土浦ショッピングセンターが高津地区に開業している。荒川沖駅地区にも、大型ホームセンター「ジョイフル本田」の荒川沖店や、ゼビオドーム（「スーパースポーツゼビオ」がキーテナント）がある。