表土は粒径が小さくなるとともに空隙率が増大する。きめ細かい表土ほど土壌生物の活動の影響を受けて団粒構造を形成するが、団粒構造は土壌粒子の接着によって生じるため、圧密の効果を受けづらくなるのである。砂質土のかさ密度の典型値は1.5-1.7 g/cm³であり、これは0.43 - 0.36の空隙率に相当する。粘土土壌ではかさ密度1.1-1.3 g/cm³、空隙率0.58 - 0.51が典型値となる。粘土分に富む土壌が「重埴土」と呼ばれることを考えると、重いはずの粘土が高い空隙率を持つのは直感に反するかもしれない。しかし粘土が「重い」のは空隙率が低いためではなく含水率が高いためである。また、「重」は重量を指すというより、耕作用具で粘土質土壌を掘り起こすのに必要な力が砂質土壌よりも大きいことを含意する表現である。下層土では重力による圧密のため空隙率は表土より低くなる。生物擾乱の発達した表土（biomantle）より下層に位置する、分級の悪い礫では空隙率が0.20となるのも珍しくない。土壌生成過程で団粒形成作用を受けない深度における、粒径の細かい物質はおおむねこれに近い空隙率を持つ。土壌の空隙率は複雑である。旧来のモデルでは空隙率を空間的に均一とみなすが、土中の変則的な構造を考慮していないため近似的な結果しか得られない。またこのモデルには空隙構造に対する環境的な要因を取り込むことが難しい。このほかフラクタル、気泡理論、裂け目理論、Boolean（en）粒化過程、球充填など、より複雑なモデルも数多く提案されている。関連する概念として空隙構造の分析（en:Pore space in soil）がある。
固結岩（砂岩、頁岩、花崗岩、石灰岩など）は沖積堆積物よりも複雑な2重多孔性（dual porosity）を持つ可能性がある。これらの物質における孔隙率は連結孔隙率（connected porosity）と孤立孔隙率（unconnected porosity）に分けられる。連結空隙率は岩石に液体や気体が侵入する量から容易に測定することができる一方、孤立空隙はそのような方法では測定できない。孔隙率は全体積に対する孔隙体積の比率である。孔隙率を左右する要因は、岩石の種類、孔隙の分布、膠結（en）、続成作用、圧密である。粒子間空間の体積比は粒子の充填方法だけで決まるため、孔隙率は粒子の平均径に依存しない。岩の年齢あるいは埋積深度が増えるとともに孔隙率は低下する。第三紀の砂岩は一般にカンブリア紀の砂岩よりも孔隙率が高い。埋積深度や熱史などの影響でこの規則の例外が生まれることがある。
京都時代に京都の名園に惹かれ庭園学の研究を思い立ち、1911年（明治44年）9月に『日本園芸雑誌』に掲載された『庭園及観賞植物に就て」という論説と、1912年（明治45年）の1月から5月にわたって『園芸之友』に掲載された「将来に於ける本邦の庭園」という文章を発表する。「庭園及観賞植物に就て」は欧米を視察した経験に基づいて書いている。庭園を整形式庭園（RegularGarden）と不整形式庭園（IlegularGarden）とに分類し、整形式は古式庭園（CrasicGardem）、近世式庭園（RomanticGarden）とも呼び、フランス、イタリア、オランダなどで発達した整形を旨とし、左右対象で地上に模様を描き、建築物等の上から僻撤するのに適しており、フランスのVerseille、SaintCloud、SaintGer－main等が有名であるとしている。不整形には庭園の風光が自然其健を示し実景を現わす実景的庭園と写景的庭園とがあり、実景的は4種類示している。芝生式切景的庭園は芝生地を本位としたもので、普通、英国式庭園と称しているもの、樹林地切景的庭園は樹林地を本位としたもので大陸式庭園とも称し、フランスやベルギーのBoisと称する遊園もこれに属するとし、森林式は樹林が森林的形態を有するものであって、あたかも森林内に庭園美を具えたようなものとし、木立芝生式（Hain式）は林ではあるが其樹林内の樹は下枝を生せしめず樹林地は芝生地となしたもので、ドイツにこの型のものが多い、と分類した。写景的庭園は日本固有の庭園とし、英国式庭園やフランスのBoisなどと等しく風光の美を発揮するものであるが、実景の美を其優に示すのではなく、栽樹立石仮山等に依って自然の風光を縮写するのを旨としていること、そして、庭園が分化するのは気候によるところが大きく、整形式から不整形式に移行しつつある理由は、絵画が絵模様から発達して線香となり今日の輪廓の余り明らかでない表現になったように、芸術美に対する考が進んだ結果ではないか、としている。「将来に於ける本邦の庭園」では、欧米では庭園の研究が進んでおり、教育機関も備わっているのに、わが国では美術や音楽には高等の学校を設けておきながら、庭園に関しては研究機閲すら存在せず、進歩するどころか、江戸時代の形骸にしがみつき古人の定めた方式の意義すら知らぬ植木屋のために、古庭園の園趣が破壊される事態に至っていると述べている。そして、庭園史の調査を基礎とする庭園学の必要性を述べ、個人的見解としてわが国の庭園の将来について、生活の近代化、特に建築物の規模拡大に伴い、縮写的庭園は減少し、樹林式や芝生式の広い庭園（公園）が多くなるであろうこと、日本の建築物の洋風化と、茶道や禅道の勢力の衰えから、清楚なる趣致は薄れてゆき、華靂なる装飾花壇を有する遊園が増加するであろうこと、夢想化よりも、植物学的に樹や潅木の自然の性状を調査する必要が増加するであろうが、古来の方式を学ぶことも大切であること、禁忌方位剋生の説は、否定はしないが重く見られることはないであろうこと、を論じている。