フランス革命が起こると、その影響はスイスへも波及した。フランスの革命軍はオーストリア帝国との戦いを通じてスイスを脅かした。1798年3月にベルンが落とされ、やがて総裁政府がヘルヴェティア共和国を設立した。啓蒙思想の革命家が従来の地方自治制を廃して中央集権政府の確立を目指し、言葉の壁と人材の不足から不徹底におわった。1800年1月から分権派によるクーデターが続き、財政を困窮させながら共和国は崩れた。1803年、第1統領のナポレオン・ボナパルトが調停者となり、スイス各州の指導者がパリに集まって協定を結び、スイスは地方自治の体制に戻った（ナポレオン調停法）。このとき、それまで共同支配地とされて格下の扱いだったアールガウ州、トゥールガウ州、グラウビュンデン州、ザンクト・ガレン州、ヴォー州、ティチーノ州が同格のカントンとして同盟の一員に加えられた（新カントン）。1815年、ナポレオン戦争後のヨーロッパについて協議したウィーン会議で、スイスの独立が改めて確認されると共に、永世中立国として国際的に認められた。このとき、ヴァレー州・ヌーシャテル州・ジュネーヴ州がフランスからスイス連邦に返還された。フランスの逆襲に備え、スイスはサルデーニャ王国の上サヴォイア地方の中立を保護する役を与えられた。失地として、ミュルーズがアルザスに編入された。グラウビュンデンのアルプス南側にある3つの代官区も、285年におよぶ自治権を奪われイタリア王国に組み込まれた。この年に画定された国境線は今でも維持されている。同年、新旧カントンの妥協により同盟規約が成った。カントン間の軋轢は狭い国土に非関税障壁を蔓延らせた。このころにスルザーなどが創業した。フランスの7月革命をきっかけに、およそ半数のカントンでブルジョワの改憲運動が起こった。ここから同盟規約が綻びだした。1841年、アールガウの急進派政府が一度に8つの修道院を廃止した。これは同盟規約の第12条に真っ向から違反した。盟約者団会議は4つの女子修道院を救済したが、しかしカトリックが劣勢であることに変わりなかった。1844年にイエズス会を招いたルツェルンには周囲のカントンから義勇軍が殺到した。義勇軍はルツェルン市民の決意を挫くことができなかった。するとスイス全土が無政府状態に陥った。カトリック派のカントンは1845年12月に保護同盟を結成した。
宗教改革者フルドリッヒ・ツヴィングリはもともと1518年にチューリッヒの大聖堂の説教師として招聘された。1523年に始まるツヴィングリの宗教改革運動はチューリッヒ市の政治体制と不可分の政教一致運動でもあった。ツヴィングリの始めた改革運動は他の州にも拡大したが、森林五州とよばれる5つの州は従来のカトリック信仰の保持を表明した。プロテスタント諸州とカトリック諸州は争いを避けようと交渉を繰り返したが、自らの力を頼みとするチューリッヒがプロテスタント陣営の中でも独走気味となった。1529年の第一次カッペル戦争はぎりぎりのところで交戦が回避されたが、ついに1531年の第二次カッペル戦争でチューリッヒ軍がカトリック連合軍と激突し、ツヴィングリ自身も戦死した。1531年に和平協定であるカッペル協定が結ばれ、スイスにおいてカトリックとプロテスタントは互いを攻撃することなく共存していく体制を作ることで合意した。ここでは各邦が宗教問題に対応すると決められ、アウクスブルクの和議の先取りとなった。また、この決定により、西南ドイツ都市と締結していた同盟は破棄され、ツヴィングリの死（西南ドイツ都市はルター派の影響下となる）とともにスイスが神聖ローマ帝国から分離していく原因の一つとなった。このころ、ジャン・カルヴァンが指導していたジュネーヴが盟約者団の一員として加わった。1560年、森林五州はサヴォイア公国と同盟した（ボロメオ同盟）。1602年、サヴォイアがジュネーヴを奇襲したが失敗。1604年、森林五州はヴァリスをカトリック側へ連れ戻した。三十年戦争（1618年-1648年）の前菜に、ユグノーと和解したリシュリューがサヴォイアを攻撃した。また、多くのスイス傭兵の血が流れた。三十年戦争で勇名を馳せたスウェーデン王グスタフ2世アドルフの軍には、多くのスイス人傭兵が参加していた。プロテスタント陣営に優勢をもたらしたグスタフ・アドルフは、スイス人の多勢を占めるゲルマン人とスウェーデン人の祖先を同一視させる政策（古ゴート主義）をとった。この王の死後、フランスでもスイス人の傭兵を得るために同様の政策をとり、スイスの独立を後押しした。三十年戦争の最中、スイスは「武装中立」という立場を初めて公式に宣言した。そして、中立を維持するための国境防衛軍として連邦軍が創設された。
ブラウントはノースカロライナのバーティ郡ウィンザー近くで、パムリコ川の堤沿いに広大な領地を所有する著名な商人かつ農園主の家に生まれた。アメリカ独立戦争のとき、第3ノースカロライナ連隊の主計官としての任務を受けた。連隊の主計官は戦場で指揮を執る責任のある将校ではなかったが、連隊参謀の証明書の下で働き、大尉と同じ給与と手当てを引き出した。1777年晩春にジョージ・ワシントンの主力軍がウィリアム・ハウ卿のイギリス軍からフィラデルフィアを防衛しようとする時に、所属する連隊も参加したのでその北への行軍に加わった。ブラウントとその仲間達はこの戦争の重要な戦闘の一つに参戦した。この戦闘では、ワシントンの戦いへの前向きな姿勢と大陸軍の回復力を示すことによって、アメリカ人が戦争を最後まで戦う気でいることをフランスに確信させ、フランスが公然と独立を支持しようという決断に直接影響を与えた。戦闘後、ブラウントは故郷に戻り、ノースカロライナ邦軍の主計長となり、後に邦の副主計総監となった。その後の3年間、北にあるワシントンの主力軍や南部の諸邦の防衛のための別の軍事行動の双方を支援するために、徴兵や軍隊の再装備という厳しい仕事に親密に関わり続けた。1780年5月、ヘンリー・クリントン卿が指揮するイギリス軍のためにチャールストンが陥落し、ノースカロライナが侵略されるがままにされた。この時はチャールズ・コーンウォリス将軍の指揮下にあるイギリス軍、ドイツ人傭兵部隊およびロイヤリスト軍に反撃するために、邦は再び新しい部隊を立ち上げる困難さに直面した。ブラウントはこれら市民兵の組織化に関わっただけでなく、彼らと共に戦場に向かいもした。そのノースカロライナ部隊はホレイショ・ゲイツ将軍の下に付いたが、ゲイツは性急にキャムデンでコーンウォリスとの血塗られた戦いを演じた（キャムデンの戦い）。1780年8月16日、ゲイツは右翼に大陸軍正規兵を、左翼にノースカロライナとバージニアの民兵を配置して、前進を命じた。アメリカ軍の兵士達は何週間もの行軍と不十分な食糧のために消耗していた。さらに、民兵の部隊は極最近正規兵に合流したばかりであり、2つの部隊間の規律ある協力体制がまだ整っていなかった。そのような協力体制は、18世紀の戦列を組む戦闘での複雑な歩兵操軍を急拵えの民兵隊が行えると期待される以前の特に必要なことであった。正規軍は容易に敵に向かって前進できたが、民兵は硝煙と混乱の中でその結束を直ぐに失い、イギリス軍に反撃する前にその戦列が崩れてしまった。コーンウォリスは続いて全軍を大陸軍正規兵部隊に仕向けた。1時間も持たないうちにゲイツの軍隊は崩壊した。不適切な戦闘準備の結果として南部ではこれで2度目の敗北であり、若いブラウントは後年に大いに役立つことになる教訓を得た。この戦いはブラウントにとって実戦の終わりともなった。