アフリカ地域では、1993年に、第二次国際連合ソマリア活動の一員としてソマリア内戦に介入した。これは、前任者のブッシュが第一次国際連合ソマリア活動で人道支援（人道的介入）を掲げたのに対して無政府状態を解消する国家建設（Nation-building、State-building）を目的とした平和強制の最初の例である。これにより、一時的に援助物資の輸送路が確保され、1日平均の餓死者を¹⁄₃以下に激減させる効果を上げた。だが、モガディシュの戦闘では多数の死傷者を出したため、世論の反発から、アメリカ軍はソマリアから撤退することとなった。そして結局、アメリカ軍主導であった国連ソマリア活動そのものも失敗に終わった。この事件は、アメリカが国連平和維持活動に消極的となった一因とされる。その結果、ルワンダ虐殺などの非人道的行為に関してクリントン政権は傍観したと批判されるようになった。また、1998年には、アルカーイダの関与したアメリカ大使館爆破事件への報復を名目として、アフガニスタンとともにスーダンをミサイル攻撃した。この際、スーダンの医薬品の5割以上を供給していた工場が、「化学兵器工場」であるとして破壊された。
ヨーロッパ地域では、ロシアとの融和や西欧諸国の協調などをベースに行動し、旧ユーゴスラヴィアで発生したボスニア・ヘルツェゴビナ紛争の和平調停に乗り出して、和平協定締結に成功した。だが、コソボ紛争に対するNATO軍単独での武力介入（1999年）は、ロシアや中国との協調関係に亀裂を生じさせた。特に中国は大使館が誤爆されたことに当時の胡錦濤中国国家副主席がテレビ演説で抗議する事態となり、ホワイトハウスなど米国政府のウェブサイトは中国からサイバー攻撃を受けた。また、このユーゴ空爆は、「人道のためには国連決議無しで武力行使しても良い」とする「前例」を産み出した。ただし、介入それ自体は未だに賛否両論である。
中東地域では、湾岸戦争後に中東和平に尽力したブッシュ前大統領の貢献もあり和平の機運が高まる中、ノルウェーの仲介により、いわゆるオスロ合意が締結され、クリントンはその立会人となった。また、1994年のイスラエル・ヨルダン平和条約を後押しした。しかしパレスチナ自治政府が成立すると、イスラエル・パレスチナ双方で強硬派がオスロ合意に反対し、イツハク・ラビン首相が暗殺されると、和平継続反対派のベンヤミン・ネタニヤフが首相に選出され和平は頓挫した。1999年にエフッド・バラクがイスラエルの首相になると、和平交渉は再開された。しかし2000年3月イスラエルとシリアの和平交渉を仲介するも失敗に終わる。そして7月、キャンプデービットにバラク首相とアラファト議長を招いて中東和平交渉を仲介するも、聖地・エルサレムの帰属権などをめぐり両者が対立。クリントンとしては、残り半年の任期中に交渉を結実させようと15日間に及び徹夜で両者を説得したが、バラク、アラファト双方の溝は最後まで埋まらず、中東和平交渉は決裂した。その後、9月にパレスチナ自治区にて第2次インティファーダ（民衆蜂起）が起こり情勢が悪化する。2001年2月に、対パレスチナ強硬派のアリエル・シャロンが首相になり、パレスチナ自治政府にたいして武力攻撃を行い、再びオスロ合意は頓挫した。また、クリントンはブッシュ親子同様にサダム・フセインを敵視しており、国連安保理の承認を得ないまま、1998年には米英軍により、イラクの首都バグダッドなどの軍事施設に対する巡航ミサイル「トマホーク」などを使った大規模な空爆を開始し、砂漠の狐作戦を行った。
北米地域では、アメリカ合衆国、メキシコ、カナダが自由貿易圏をつくり、関税障壁をなくすというNAFTA（北米自由貿易協定）に調印した（1994年1月1日発効）。
ブッシュ政権が国内問題・経済問題を軽視していると批判し、ホワイトハウスに上り詰めたクリントンだったが、その公約の通り外交は不得意分野だった。彼の政治キャリアはアーカンソーの地方政治に限定されており、また、彼が頼りにすべき民主党も外交に関する人材は不足していた。その外交姿勢は、場当たり的だという批判にさらされている。政権の後期には外交に力を入れ、中東和平や朝鮮半島問題などに尽力したが、さしたる成果のないまま時間切れに終った。
2000年のMLBドラフト1巡目追補（全体38位）でアトランタ・ブレーブスから指名され、プロ入り。2005年5月29日にメジャーデビュー。同年、打撃面では87試合の出場で.241・9本塁打・40打点、守備面では主に左翼を守り、無失策・6補殺を記録。2006年は右肘の故障でトミー・ジョン手術を受け、シーズンを全休した。2007年は前年オフに生え抜きのブレーブスの二塁手マーカス・ジャイルズがサンディエゴ・パドレスに移籍したため、ジョンソンとマーティン・プラドが後釜の候補となったが、ジョンソンが1番・二塁として開幕から出場。4月は打率.326・出塁率.473を記録したが、それ以降の48試合は打率.250・出塁率.325と低迷し、6月下旬以降、ウィリー・ハリスが1番打者を務め、ジョンソンは7番打者などで出場。2008年は、自己最多の150試合に出場。出場試合数も含め、打数・安打・二塁打・打点・盗塁・打率・塁打数・犠打・犠飛・ダブルプレーなど、数多くの部門で自身最高の数字（ダブルプレーは自身最小）を記録。9月1日から24日にかけて22試合連続安打を記録。リーグシーズン最長、球団史上（1966年以降）6位タイとなった。2009年は、打率が2割前半で低迷し、7月からはプラドが、正二塁手となり、ジョンソンは控え二塁手へ降格。その直後の7月3日から右手首の痛みにより故障者リスト入り。故障から復帰後も控え二塁手として出場。打率.224・8本塁打・29打点と自己ワーストの成績でシーズンを終えた。オフの12月12日にFAとなった。