2013年10月27日に執行された大統領選挙では、ダヴィト・バクラゼ前国会議長を擁立したが親露派のギオルギ・マルグベラシビリ前第1副首相に敗れた。11月17日をもって大統領を退任。2013年12月には、ウクライナで発生した大規模反政府デモに連帯表明するために姿を見せた。グルジア政府から一連の汚職や拷問、弾圧等による国際指名手配が出ているため、母国へ帰らずそのままウクライナに留まっている。ポロシェンコ政権の諮問機関最高顧問に就任し、エカ・ズグラゼやアデイシヴィリ等自身の盟友を引き連れて反露親米姿勢を強めるウクライナに事実上亡命した形となる。2015年5月30日、ポロシェンコ大統領の協力を得てウクライナ国籍まで取得し、さらにオデッサ州知事にも就任した。オデッサ州は親露派が多く、2015年5月2日にはオデッサにおいて親欧米派と親露派の衝突に端を発した火災により多数の死者が発生する事件が起きている。反露主義の亡命政治家であるサアカシュヴィリの知事就任により、同地域の親露派制圧の意図を示したと見られている。2016年11月7日にオデッサ州知事を辞任する意を示し、ポロシェンコ大統領は同9日に辞任を受理したが、顧問辞任は却下した。ポロシェンコ大統領との路線対立が激化し、2017年7月26日にポロシェンコの大統領令によりウクライナ国籍を剥奪された。その後、2017年9月には無国籍という状態ながらもウクライナの国境検問所を強行突破して不法入国し、ユーリア・ティモシェンコ元首相と共にポロシェンコ大統領の辞任を旗印に反政府運動を行っている。12月5日にはポロシェンコ政権打倒のため蜂起を呼びかけたことが国家転覆容疑にあたるとして逮捕されたが、支持者の手により釈放されている。翌6日に犯罪組織参加罪などの罪で起訴され、8日に再び逮捕された。2018年1月5日、ジョージア（旧グルジア）の首都トビリシの裁判所から、大統領在任中の2009年に殺人罪で服役していた元警官4人に対し違法に恩赦を与えたとして職権乱用罪で懲役4年の実刑判決を言い渡された。2月12日には不法滞在を理由にウクライナの首都キエフにおいて拘束され、その後ポーランドに強制追放された。
2012年10月1日、総選挙で統一国民運動は野党連合「グルジアの夢」に過半数を奪われ、親サアカシュヴィリ派政権は内閣総辞職に追い込まれた。大統領として「グルジアの夢」派のビジナ・イヴァニシヴィリ議員による内閣を承認する結果となり、表面的にはNATO交渉の継続決定など両者の友好と自身の中立性をアピールしたが、サアカシュヴィリの政治的影響力は明確に低下した。イヴァニシヴィリ首相は就任するにあたって、サアカシュヴィリが私物化していた大統領官邸からの立ち退きを要請した。これに対してサアカシュヴィリは報道官を通じて「大統領官邸は大統領の私物だ」と反論した。これに対してイヴァニシヴィリ首相は自ら得た私財でなく、国民の税金で賄った「私邸」に住む事は「厳しい経済情勢下で行われる非倫理的行為である」として官舎への移住を提案した。2012年10月23日、イヴァニシヴィリ政権が本格的に始動すると統一国民運動体制下での様々な不法行為についての政府調査委員会が設立され、ダヴィッド・ウスパシュヴィリ国会議長が委員長に着任した。イヴァニシヴィリ首相は統一国民運動が関与した様々な非合法行為（汚職、言論弾圧、拷問等）について真相を明らかにすると宣言した。11月22日に政府調査委員会は「場合によっては（統一国民運動の実質的指導者である）サアカシュヴィリ大統領の逮捕も有りえる」とコメントした。サアカシュヴィリの側近は大統領が逮捕に怯え、少なくとも大統領任期中は逮捕は出来ないにも関わらず周囲に「逮捕される」と繰り返すなど、再びノイローゼ状態に陥っていると証言した。2013年4月12日、イヴァニシヴィリ首相は棚上げされていた南オセチア紛争の開戦経緯についても正式な調査を行う事を決定し、既に国防相による軍内調査が開始され、イヴァニシヴィリ政権は必要に応じてサアカシュヴィリ大統領を重要参考人として尋問すると表明した。
尾道学という文言自体は、2003年に出版された『尾道学と映画フィールドワーク』（荒木正見・鈴木右文共著・中川書店刊）で初めて打ち出された。同書は、大林宣彦監督による尾道作品のロケ地をフィールドワークし考察したもので、著書の荒木正見は、「尾道とその周辺を総合的学問の視点から見詰め直して、その本質的意味を確認するという尾道学の提唱を掲げ、その探求には町を徹底的に歩くフィールドワークを推奨するためのもの」であると語っている。荒木は1995年に『尾道を映画で歩く－映像と風景の場所論－』（中川書店刊）を出すなど、尾道学を冠した本を出す以前から、尾道学的な取組みを既に実践している。その後2005年5月、浄土寺研修道場にて尾道学構築に向けての市民との懇談会（意見交換会）が開かれる。この懇談会は、地域交流・貢献を目的として2004年に尾道大学内に設置された地域総合センターによって主催されたものであった。センター関係者（大学教員）と地域の歴史文化、まちづくりに関心ある市民有志が同会に集い、活発な意見のやりとりがみられた。その後、参会した一部の市民有志によって、個人的活動として市内を歩き地域を再発見するフィールドワークが進められた。2005年11月、前述の懇談会に集った一部の市民有志が個人の立場で集い、民間グループとしての尾道学研究会が立ち上がり、第一回例会（『失われた尾道囃子発掘報告会』）を尾道市立中央図書館で開催される。以後、尾道の雑煮、尾道の通信史、尾道古絵葉書の発掘、尾道鉄道、尾道に由来する人物伝、郊外地域へのフィールドワーク（現地学習）の例会（定期的）や、「まちかど尾道学ミュージアム」と題した企画展示会（不定期）などを重ね、様々な分野で地域学習・地域再発見に取り組まれている。発端となった尾道大学における尾道学では、2006年度より、尾道に関する図書・文献の尾道学データベースを尾道大学ホームページ内に開設・公開しているほか、同年10 - 11月、しまなみ交流館において地域総合センター主催の「尾道学講座」（全7回）が開かれ、「井伏鱒二と尾道」など、大学教員が講師となって尾道をテーマに市民向けの講義を行った。講座には尾道大学主催で短大時代から開かれている公開講座を上回る多くの受講者があった。この荒木による尾道学と2005年より大学・民間双方で始動した尾道学に関係や繋がりはないが、共に地域について総合的に学ぶ地域学である事に変わりない。