ヒトラーは1936年の秋頃から、湿疹や絶え間ない放屁、胃痙攣、便秘、心臓の圧迫感に悩まされていた。当時のドイツ医学界のトップにあるドイツ赤十字病院院長のエルンスト＝ロベルト・グラヴィッツなどの治療を受けていたが、疲労と心労によるものであり、根治はできなかった。エーファ・ブラウンによると、ヒトラーはこの変調を癌だと思い込んでおり、「私はもうすぐ死ぬ」などと口走るようになったという。病状を見かねたエーファは、1936年12月24日にベルヒテスガーデンのベルクホーフでモレルをヒトラーに紹介した。診察し、丸薬を処方したところ、放屁や胃痛がなくなったため、ヒトラーは直ちにモレルを主治医として迎え入れた。しかし彼の薬にはストリキニーネ等の劇物が含まれており、依存性・習慣性の強いものであった。処方を受けてから2時間ほどするとヒトラーは再び体調の悪化を訴え、モレルはその度に薬を処方した。このためヒトラーの健康は徐々に蝕まれていった。モレルはヒトラーが不調を訴えるたびに投薬や注射を安易に行った。このため、ヘルマン・ゲーリング帝国元帥はモレルのことを「Der Reichsspritzenmeister（国家注射マイスター）」といったあだ名で呼んだ。モレルをヒトラーに紹介したエーファや秘書官のクリスタ・シュレーダーといった側近たちは、彼に対して不信感を募らせるようになった。また、モレルは医師であるに関わらず、不衛生で体臭もひどく、テーブルマナーも悪かったため、大変嫌われており、エーファは彼の部屋を「豚小屋」と呼び、会うのを拒絶した。周囲の人物がこうした事に苦言を呈しても、ヒトラーは「私は彼を芳香剤として雇ったのではない、健康のために雇ったのだ」と言い耳を貸さなかった。モレルはアルベルト・シュペーア軍需相やハインリヒ・ヒムラーSS長官といった高官の治療も行ったが、すぐに彼らは治療を中断した。シュペーアは彼から薬を処方されたが、内容を怪しんで念のためにベルリン大学福祉病院のベルクマン教授に成分を調べてもらった結果、「非科学的、冒険的で習慣性の危険がある」と勧告された。彼はモレルの薬を飲まず、ベルクマンの指示に従ったことで短期間に回復した。シュペーアはモレルのことを藪医者とは思っていなかったが、総統の主治医という地位を得たことで、いい加減な治療をするようになり、医療行為より金に執着する人物だと後に回顧録で述べている。主治医の地位を得たモレルは、1933年以来ヒトラーの主治医を務めていたカール・ブラントと、主治医のトップの座をめぐって競争を行った。しかしブラントとモレルが争うと、ヒトラーはたいていモレルに同調したという。1939年、ヒトラーはチェコスロバキアの大統領、エミール・ハーハを総統官邸に呼びつけ、チェコスロバキア併合に同意するように恫喝した。ハーハは心臓発作を起こして倒れたが、モレルの注射によって蘇生した。蘇生したハーハはチェコスロバキアのナチス・ドイツへの併合に同意せざるを得ず、チェコスロバキアは消滅することになった。
戦後の真葛研究を切り開いたのは柴桂子であった。柴は、1969年（昭和44年）、江戸時代の女性の著作を広く渉猟して『江戸時代の女たち』を刊行した。そのなかで柴は、真葛を「哲学者であり、思想家であり、社会改良家」であるとしている。なお、柴は『朝日日本歴史人物事典』（朝日新聞社、1994年11月）の「只野真葛」を執筆しており、「真葛は体系的な学問をしたわけではないが、国学、儒学、蘭学などのうえに独自の思想を築いていった」と記し、『独考』については、「偏りもあるが、江戸期の女性の手になる社会批判書であり、女性解放を叫ぶ書として評価できよう」としている。1975年（昭和50年）、宮沢（関）民子は、『歴史学研究』に論文「幕藩制解体期における一女性の社会批判」、1987年（昭和63年）、鈴木よね子は、『日本文学』に論文「反真葛論」を寄稿しており、真葛への関心がいっそう広がり、研究の深まりをみた。1977年（昭和52年）に刊行された『人物日本の女性史10 江戸期女性の生きかた』には杉本苑子が「滝沢みちと只野真葛」を一般向けに執筆しており、そのなかでは、真葛を「文明批評家」として紹介している。こんにち、多様な視点からの真葛像の構築が試みられている。鈴木よね子は「肉体の思想」という概念を用いて『独考』を評価し、本田和子は『むかしばなし』について「父に憧れつつも一体化し得なかった娘の、二重三重の鬱屈に支えられた愛の物語」という解釈を示している。本田はまた、『むかしばなし』にみえる「臆面もなく繰り返される父親賛歌」について「これは、紛れもなく、類い希なファーザー・コンプレックスの文章ではないか」と述べる。また、大口勇次郎は、真葛は「両性の肉体の差異性を確認することを通じて」「才知の面における両性の対等な関係を主張」したと指摘している。近年の真葛研究の広がりは、1994年（平成6年）の鈴木よね子校訂『只野真葛集』の刊行によるところが大きい。真葛の著作のほとんどが収集、翻刻されており、校訂者による「解題」には、只野真葛の生涯が簡潔にまとめられ、また、個々の作品について底本の出所をふくめた紹介がなされている。門玲子は、毎日出版文化賞を受賞した1998年（平成10年）の『江戸女流文学の発見 - 光ある身こそくるしき思ひなれ』のなかで井上通女、正親町町子、荒木田麗女とともに「孤独な挑戦者、只野真葛」に1章を設け、文学者としての只野真葛について論じている。また、上述の"Kirishitan Kô By Tadano Makuzu : A Late Tokugawa Woman's Warnings"において、筆者のBettina Gramlich-Okaは、真葛を"Poet and Philosopher"として冒頭で紹介している。