群山記には以下に述べるとおり、3点の写本が知られている。このうち、伴存自筆と推定されるのは、伴存門弟の堀田龍之介の所蔵していた『和州吉野郡群山記』1本のみで、他の写本は自筆稿からの異本である。しかし、それら異本は、著者自身が一度も用いなかった「名山図志」なる語を書名としたり、正しくは「志」とすべきところを「誌」と書き誤るといった書誌学的な過誤だけでなく、学術的な博物誌であるにもかかわらず名所案内として解題するなど問題の多いものである。
巻七から巻八までは特に「和州吉野郡物産志」と題されている。題の物産とは、天然に産するものの意で、人工の生産物を指すものではない。記載対象は、薬草、菌類、草木、昆虫、魚、鳥獣など動植物のほかに鉱物も一部含んでいる。伴存は物産志において、個々の動植物の特徴を記述するだけでなく、前述のように挿絵をも描いている。さらに、その産地についても詳細に記述しており、巻一から六までの地誌と併せて生態学的・生態地理学的な地方動植物誌となっている。江戸時代の本草学者による自然誌が、個々の動植物を記載し、本草綱目に従って排列する記載分類学の域を出なかったことと比べると、こうした群山記の特色から伴存の稀有さが判明する。
群山記の巻一から巻六までは、伴存自身が書簡の中で風土志と呼んでいるように、吉野群山の地誌である。記述内容は地理・地質といった山岳地誌のみにとどまらず、当地の習俗にまで及び文化人類学的な側面も備えている。
全巻の目録によれば7巻となっているが、7巻目の和州吉野郡物産志が上下2巻からなるため、実質的には8巻構成である。草木志を著した江戸時代の本草学者はひとり伴存のみではない。しかしながら、一つの地域を特定し、その地域内の植物だけでなく動物、さらには鉱物まで含めて、地域の自然の全体的な特色の把握を試みた例は、伴存の他に見られず、加えて調査対象地の詳細な地誌まで著しているのは伴存の特色である。前述のように、本書の数々の挿絵は、本書を特徴付けるものである。動植物図は、動植物の特徴をよくつかんだ科学的にも優れたもので、絵画としての趣もそなえており、本書の価値を高めている。山岳図は、限られた紙の上に雄大な山容を再現するために、様々な画法を用いて工夫がなされているだけでなく、科学性をも兼ね備えている点で、他に類例のないものとして特筆すべきものである。その技法の中には、鳥瞰図や、山並みを圧縮する、重要部分を強調する、縦横に赤線で方眼を記入し方位距離を示すといったものがあり、高い効果を挙げている。さらに、伴存はただ自らの調査結果に頼るのではなく、多くの文献を参照して客観性を与えている。最初の6巻で引用された文献のみでも80種をかぞえ、主なものには『日本輿地通志』、『和州巡覧記』、『和州旧蹟記』がある。群山記の執筆年代と推定される時期には、伴存は50歳代に達そうとしており、しかも群山記のみに専念していたわけでもなかった。しかし、『白山記』と群山記を比較してみるとき、伴存の学問が円熟期を迎えていたことをうかがい知ることができる。
越前国福井藩陪臣・長谷川純一の長男として福井城下の佐佳枝上町（現在の福井市）に生まれる。明治4年（1871年）、21歳で上京し、横浜の高島学校で英学を学ぶが、校舎の火災により、翌年、慶應義塾に転学し卒業する。明治7年（1874年）、福井藩出身の司法省権大書記官・青山貞（小三郎）の周旋で司法省に通訳として出仕し大阪裁判所に勤務。土師経典の信任を得て判事となり、明治13年（1880年）神戸裁判所に転任、翌14年（1881年）には横浜始審裁判所に移り、翌15年（1882年）川崎剛八の病没により後任所長に昇進。井上馨外務卿からの信任も厚く、「お前が所長をしている以上は条約改正をしても安心だ」と語ったとされる。明治18年（1885年）7月、ベルギー・アントウェルペンにて開催された万国商法編輯会議に出席する内閣顧問・ヘルマン・ロェスラー（Hermann Roesler）の副委員となり、併せてベルギー・イギリス・フランス・ドイツ・オランダならびにエジプトの商業裁判所実況の視察を命ぜられ、さらにドイツ・フランスの裁判所構成法やエジプト混合裁判所の調査を行う。在欧中は、西源四郎、原敬、穂積八束、宮崎道三郎、樋山資之、森林太郎（鴎外）らや、明治19年（1886年）の留学組である、横田国臣、高木豊三、田部芳、河村譲三郎、小宮三保松、富谷銑太郎らと面識を持った。明治20年（1887年）に帰朝後、法律取調報告委員に就任し、本尾敬三郎・岸本辰雄・岡村為蔵・加藤高明らと共に商法組合に属し、明治21年（1888年）旧商法の元老院付議の内閣委員を命ぜられる。旧商法の注釈本『商法正義』を著した。明治23年（1890年）10月東京控訴院部長、明治24年（1891年）10月民法商法施行取調委員、同年12月大審院判事となり、同年4月には法典調査会主査委員。明治31年（1898年）大審院部長、明治36年（1903年）には老朽司法官淘汰事件で休職となった春木義彰の後を襲って東京控訴院長となり、明治39年（1906年）大審院長・南部甕男退職の際には寺島直（大審院部長）と並び後任を有力視されたが、ダークホースの横田国臣に敗れる形となった。