既述のとおり、学校法人立の学校と比べ財政的に不利な点もあって、約4割の学校が赤字に陥っている。また、大半が通信制高校であることから多くの生徒は特区認定を受けた地域にある本校に通学する機会が少なく、地域おこしとしての効果も限定的であった。さらに、一部では設置母体となったサポート校等の活動と渾然一体となり、本来は禁止されているサポート校でのスクーリング実施等の教育上問題のある学校も見受けられた。このため、政府は本制度の全国での解禁をしない方針を固め、既設校は希望すれば学校法人に移行できるよう支援することとした。構造改革特区法に基づく株式会社立の通信制高校の7割が、同法が禁じている特区外での教育活動をしているとして、文部科学省は規制に乗り出す方針を固めた。また、教育内容に関しても「不適切な状態にある」として、質の改善を促すとした。文部科学省の担当者は「脱法行為であり、教育の質も低く、高卒資格取得を売りにしたビジネス」と指摘した。
日本では2004年から2009年春までに全国で高等学校21校、中学校1校及び小学校1校が設置された。既存の学校と違い、カリキュラムを自由に組んで特色を打ち出すことができたり、校舎や運動場等の施設についての条件が緩いのが利点であるが、逆に私学助成金が受けられず、また学校法人への寄付には認められている税制上の優遇措置がないという財政的に不利な点がある。この不利な点のためか、中には学校法人立に転換した学校も存在する。また、特区制度が地域おこしの手法として用いられることもあって、所在地も地方の辺地に偏っているのも特徴である。現在はLCA国際小学校およびフェリーチェ玉村国際小学校の2校を除き、株式会社立の学校は通信制高等学校のみである。なお、近江兄弟社が経営している近江兄弟社中学校・高等学校は、初めから学校法人として設立されているので株式会社立ではない。また、これらの他にも株式会社立大学が存在するが、それについてはこちらを参照のこと。
李登輝が進める「台湾化」政策に反発する国民党内の反李登輝グループで、外省人（大陸出身者）の元監察院院長の陳履安と元監察委員の王清峰は国民党を離党し、無所属で立候補することを表明した。また反李登輝グループの代表格で本省人（台湾出身者）、司法院院長の林洋港と軍人で元行政院院長だった郝柏村は李登輝・連戦に対立しつつ党内に残っての出馬を模索したものの、党執行部は野党・新党との関係を問題視し党除名の処分を出した。結果的に無所属で新党の支持を受けて出馬することを表明した。
与党の国民党は、1995年8月に開催された第14回党大会で総統候補の選出方法を議論し、林洋港や郝柏村など党内非主流派が主張する約200万人の党員投票ではなく、主流派が求める1973人の党員代表による投票で行うことを決定した。党員代表による投票の結果、現職の李登輝を総統候補に指名した。李は副総統候補に行政院長の連戦を指名した。連戦は立候補にあたって行政院長を辞職する意向であったが、後任の行政院長を立法院が承認する可能性が低かったため、李登輝は連戦の辞職を認めなかった。
仁寿3年（853年）蔵人、斉衡元年（854年）右衛門少尉を経て、斉衡2年（855年）従五位下・右衛門佐に叙任。天安元年（857年）周防権守に転任するが、翌天安2年（858年）文徳天皇の崩御後、同い年の従兄弟で太政大臣・藤原良房の養子となっていた基経と共に蔵人頭（兼右近衛権少将）に任ぜられ、これ以降常行は基経と昇進を競っていく事となる。同年11月の清和天皇即位に伴い従五位上、貞観2年（860年）には正五位下次いで従四位下と急速に昇進する。貞観4年（862年）右近衛権中将、貞観6年（864年）正月には基経と同時に参議に任ぜられ、20代（29歳）で公卿に列す。貞観8年（866年）常行は基経と同時に、正月に従四位上、3月には正四位下と昇進する。しかし、同年8月に発生した応天門の変の処理に当たった太政大臣・良房が摂政となる反面、常行の父である右大臣・良相は政治的影響力を失ってしまう。この状況の中で基経は12月8日に上位者7人を飛び越えて従三位・中納言に叙任、常行は昇進面で大きく水をあけられる。一方、良相が左近衛大将を辞任した事と引き替えに、12月16日に常行は右近衛大将に任ぜられた。貞観9年（867年）先任の参議4名（源生・南淵年名・春澄善縄・大江音人）を越えて従三位に昇進し位階で基経に追いつくものの、翌貞観10年（868年）基経は左近衛大将に任ぜられ、常行は近衛府の席次でも基経の後塵を許してしまう。基経が貞観12年（870年）大納言に昇進すると同時に、常行も中納言に昇進する。貞観14年（872年）8月に太政大臣・藤原良房が重態に陥る中で太政官の体制変更が行われ、常行は大納言に昇進するが、基経は右大臣として大臣の地位に就く。さらに9月に良房が薨去した際には、基経は猶子として父子の礼で喪に服す等、基経が良房の後継となることが明確になった。この状況の中で、常行は9月末と10月末の二度に亘って辞職の上表を行うが許されなかった。貞観17年（875年）正月に正三位に昇叙されるものの、結局、昇進面で基経に追いつくことができないまま、同年2月に薨去。享年40。最終官位は大納言正三位兼行右近衛大将陸奥出羽按察使。