2002年1月9日から2002年12月25日、全51話。話の内容は「ヘラクレス・ファクトリー編」から「超人ワールドグランプリ編（原作の超人オリンピック編に相当）」（第1話 - 第44話）の途中とバロン・マクシミリアン率いる残虐超人たちとの死闘を描いたオリジナルエピソード（第45話 - 第51話）まで。「超人ワールドグランプリ編」の続きは2004年放送の第2期に持ち越しになる。第二期・王位争奪編まで連続出演していたキン肉マンとミートの声優も一新されたが、テリーマン、ロビンマスク、サンシャインは第一期、二階堂マリは第二期と同じ声優が起用され、それ以外の旧作から続投キャラの声優が全て一新された。サンシャインは本作での続投により、シリーズを跨いで登場したキャラで唯一変更がなされていないキャストともなった。時間帯から子供向きに制作されており、流血、人体切断などの残虐シーンや下ネタなどがソフトなものに修正されている（サンシャインやイリューヒンのように体が無機物・機械でできている超人は除く）。代わりにギャグ描写が多く、キッド、セイウチン、ガゼルマン、ジェイド、凛子などの出番も増えた。
『キン肉マンII世』はアニメを始めとしたメディアミックスがなされており、アニメ化は2002年1月にテレビ東京にて放送されたのが最初である。後に2004年と2006年にも続編があり、計3度もアニメ化された。ストーリーは第1部の「ヘラクレス・ファクトリー編」から「超人オリンピック（アニメでは超人ワールドグランプリ）編」まで放送された。このほか、小説やゲームソフトなども発売されている（アニメや小説、ゲームについては後述の節参照）。
2011年4月11日発売の『週刊プレイボーイ』17号において、『キン肉マンII世』も含めた『週刊プレイボーイ』誌連載の漫画作品（『たいようのマキバオー』など）を、5月9日を以って集英社のウェブサイトに移籍し、そこで連載を続行させる旨が発表され、同年5月9日付け（第590回）で『週プレNEWS』に移籍した。毎週更新で、閲覧は無料（要プラグイン）。2011年10月3日配信の610話を以って『キン肉マンII世 究極の超人タッグ編』は完結。同時に『II世』シリーズは完結となった。その後、10月10日と10月17日の2回にわたって『キン肉マン』アメリカ遠征編でのキン肉スグルとテリーマンのザ・マシンガンズ結成秘話を描いた新作「空白の三日間」を配信。11月28日より『キン肉マン』の新シリーズがスタートした。また『キン肉マン』新シリーズ連載決定前は『ネオ王位争奪編』が候補に上がっていた。
『キン肉マンII世』は第1部と第2部に分かれており、1998年19・20合併号から2004年29号まで連載された第1部は『キン肉マンII世 second generations』（キンにくマンにせい セカンドジェネレーションズ）、2004年48号よりWeb掲載への移行を挟み2011年10月3日掲載分まで連載された第2部は『キン肉マンII世 究極の超人タッグ編』（キンにくマンにせい きゅうきょくのちょうじんタッグへん）と、それぞれサブタイトルが付けられている。第1部は2004年29号で一旦終了するが、その後「特別編 〜倫敦の若大将!〜」（同年30号より47号まで掲載、第1部最終巻に収録）をはさみ、同年48号より第2部『キン肉マンII世 究極の超人タッグ編』が開始され、2011年19・20合併号まで『週刊プレイボーイ』誌上で連載された。なお第2部連載中途より作者のゆでたまごは「この作品は前作を超えるものにはならない」との思いを抱くようになり、II世シリーズを終了させ、『キン肉マン』を再開する動機になったとしている。また、2001年7月号から2007年5月号まで、集英社の月刊雑誌『Vジャンプ』で別ストーリー『キン肉マンII世〜オール超人大進撃〜』が連載されたほか、『漫'sプレイボーイ』などの集英社の雑誌において、読切として「テリー・ザ・キッドの夜明け」などの『II世』の番外編がいくつか描かれている。
レーニは1575年、イタリア北部のボローニャに生まれた。修業期にはフランドル出身の画家デニス・カルファート（1540年頃－1619年）に師事した。カルファートは16世紀のヨーロッパ画壇を席巻したマニエリスム系の画家であった。この師のもとで数年間修業した後、1594年、地元ボローニャの画家一族であるカラッチ家が主宰する画学校（アカデミア・デリ・インカミナーティ）に入門し、ルドヴィコ・カラッチに師事した。レーニは20歳代半ばの1601－1602年頃、ローマへ出て本格的な画業を始める。1604年頃まではアンニーバレ・カラッチの工房の一員として、カラッチの代表作であるファルネーゼ宮殿天井画制作に参加した。ローマには十数年間滞在し、教皇パウルス5世（在位1605－1621年）やその甥にあたる枢機卿シピオーネ・ボルゲーゼの注文を受け活動した。パウルス5世の注文による作品としては、1608年から翌年にかけて制作したバチカン宮殿「アルドブランディーニの間」（現在はバチカン図書館の一部）の装飾（画題はサムソンの物語）がある。ローマのクイリナーレの丘に建つパラヴィチーニ＝ロスピリオージ宮殿の天井画『アウローラ』（1612－1614年）はレーニの代表作である。この宮殿はもともと教皇の甥シピオーネ・ボルゲーゼの別邸として建てられた建物であり、『アウローラ』は宮殿の庭に建つカジーノ（離れ）の天井に描かれている。この作品は「アウローラ」（曙）と通称されているが、画面の中心的位置を占めるのは黄金の馬車に乗ったアポロンであり、主題は「アウローラ（曙）に導かれるアポロンの馬車」と解すべきであろう。アポロンの周囲をめぐって輪舞する女性たちはホラ（「時」の擬人像、英語の"hour"の語源）である。レーニは『アウローラ』を完成した1614年、生地ボローニャへ戻った。教皇や貴族らの注文を受ける華やかな生活よりも、故郷での自由な生活を望んだためと言われる。以後、没年までは短期間の旅行を除いてボローニャを離れず、制作と後進の指導に努めた。優美な女性像を多く描いたレーニは、実生活では女嫌いだったと言われ、生涯独身を通した。