新20系についても初期車の竣工から既に約25年が経過したため、更新工事が実施されることになった。第一陣として千日前線用25系25607Fの更新工事が完了し、2011年1月14日に営業運転を開始した。2019年9月現在、49編成312両に施工されており、既に24系・25系からは未更新車は消滅している。更新工事の主な内容は次の通りである。
新20系ではGTOサイリスタの容量増大を受けて1台の制御器で4基の主電動機を制御する1C4M制御が実現しており、それぞれ東芝SVF-001-A0・-A1、日立VF-HR-129、三菱MAP-144-75V26に変更された。ただし、制御器が各メーカーでの競作となった20系とは異なり、新20系では細部は違うものの、日立製作所が設計主導の下、3社で制御器の設計を共通化した関係で、メーカーの違いで励磁音が違うことはなくなった。主電動機は20系と互換性を持つが、東芝SEA-309B、日立HS-34529-04RB・-05RB、三菱MB-5012-A3・-A4に形式が変更された。台車・集電装置は20系のものを踏襲した。ただし、新たに設定された4両編成では電動車が2両ともMb車であるため制御車2両が共に全台車集電装置付きとされ、6両編成時には4両と2両で電気的に分割されることからペアとなるべきMa車のない2両側のMb1車（2100形）のために隣接する制御車（2600形）の全台車に、そして9両編成・10両編成時にはペアとなるべきMb車を持たないMa車（2400形）のために隣接する付随車（2700形）のMa車寄り台車に、それぞれ集電装置が設置されている。
三重県立四日市中央工業高等学校1年生時に兄である樋口士郎（現同校監督）を擁する同チームで全国高校選手権準優勝を果たす。卒業後、1980年（昭和55年）に日産自動車サッカー部（現在の横浜F・マリノス）に入団した。選手としての活動は短く、1985年（昭和60年）に日産サッカースクールのコーチに就任する。その後、Jリーグ元年の1993年（平成5年）からマリノスのユースコーチ・監督を務め、1999年（平成11年）からはトップチームのコーチに昇格した。2003年（平成15年）にはS級ライセンスを取得する。選手･指導者時代を通して日産/マリノス一筋だったが、モンテディオ山形の監督だった鈴木淳が2005年（平成17年）限りで退任したことに伴い、2006年（平成18年）から山形の監督を務めることになった。2005年（平成17年）に時点で44歳と、初監督当時の年齢としては決して高齢というわけではないが、指導者歴22年目にして初めてトップチームの監督を務めるというのは日本ではあまり例がない。資金的に苦しい山形のチーム事情の中、安定した成績を残した鈴木の後任として手腕が注目され攻撃的サッカーをテーマに挙げたが、守備に安定感を欠き1年目は8位。翌2年目も序盤こそ好調を維持するも、中盤以降は失速し9位で終えることとなり、シーズン終了を以って退任することが決定。2007年（平成19年）オフに大宮アルディージャが佐久間悟の後任として樋口を招聘。大宮は樋口の積極的な守備からの攻撃志向が、チームの目指すスタイルに合うと判断。手腕を高く評価していたが、リーグ戦で12位と低迷。2008年（平成20年）12月7日、今季限りで退任すると発表した。2009年からは横浜FCの監督に就任。16位に終わり、大宮に続き1シーズン限りで退任することになった。2010年（平成22年）から古巣の横浜F・マリノスにコーチとして復帰し、木村和司監督の下でトップチームを指導した。2011年（平成23年）12月30日、前日の天皇杯全日本サッカー選手権大会準決勝の敗戦による木村の解任を受けて、2012年（平成24年）シーズンより横浜F・マリノス監督に就任することが発表された。2013年（平成25年）はシーズン当初より中村俊輔、中澤佑二等のベテランを中心とし序盤戦から快進撃を続け優勝争いを演じる。第33節時点では勝ち点62で2位以下との勝ち点差を「4」をつけ9年ぶりの優勝に王手をかけるも、硬直した起用法が祟って終盤戦を前に控え選手の意欲は削がれ、第33節アルビレックス新潟戦、第34節川崎フロンターレ戦と立て続けに連敗。最終節にして優勝を取りこぼした。それでも、天皇杯では決勝でリーグ優勝した広島を破り、21年ぶりの優勝を達成した。2014年をもってマリノスを退団し、2015年からはヴァンフォーレ甲府の監督に就任。しかし第3節から6連敗を喫するなど最下位に低迷。地元紙からは練習量が少ないと指摘されるなど 内容も思わしくなく、第8節の浦和戦終了後に進退伺を提出し、翌節の鹿島戦に勝利し連敗を止めたもののその後連敗。順位だけでなく得点3、失点20と攻守ともにリーグ最下位の状況となり、クラブとの双方合意のもと契約解除（辞任）となった。2016年、横浜スポーツ&カルチャークラブの監督に就任。就任当初はチームがまだアマチュアに近い状況で結果を出せないままでいたが、2017年シーズンはクラブ史上初のJ3リーグ最下位を脱出。就任3年目となる2018年も神奈川県予選を勝ち上がり天皇杯本戦に進出するなどの結果を残し、このシーズン限りでの退任を発表した。2018年12月14日、FC琉球の監督に就任。