中央競馬で競走生活を送る。1995年11月中京競馬場でデビュー。初勝利後、2000メートル前後のレースを数回試されるが最後の直線ですでに脚色なく敗退。これを受け以後マイル路線に専念しての出走となる。1996年3月さわらび賞8着後、脚元に不安をきたしNHKマイルカップを目標とした春ローテは白紙に戻され休養に出される。復帰後は条件戦を勝ち進み翌1997年重賞初挑戦となるマイラーズカップではクビ差2着と好走、続くダービー卿チャレンジトロフィーにて重賞初制覇、秋のマイルチャンピオンシップでは3着に入るなどマイル路線の中堅馬の1頭に名を連ねる。1998年前半こそ調整の遅れにより出遅れるも休養明け2戦目の安田記念では12番人気という低評価に反発し、有力馬が不良馬場に沈む中4着と健闘、スワンステークスでは久しぶりとなる上村洋行とのコンビでそれまでの主戦であった南井騎乗のエイシンバーリンを首差で競り落とし2つ目の重賞戴冠。さらに12月には香港国際ボウルへの出走を実現させタイム差無しの4着と、この年も好成績を残した。しかし1999年は前半を全休、さらに目標としていた香港マイルは体調不良により回避となり僅か2度の出走にとどまる。これ以降も精彩を欠く内容が続き、二桁着順を繰り返す。晩年はダート路線に転向し再起を図るも結果を出すには至らず、2001年7月現役引退となった。
妻ナグラーとの間に5人の子（息子4人、娘1人）がおり、長男・アフマドは、サウジアラビアで医師をしている。また、孫が3人いる。4人の息子のうち、2人はアメリカ生まれで、エジプトとアメリカの二重国籍を保有している。
エジプト革命後に行われる大統領選挙には当初、自由と公正党は同胞団副団長だったハイラト・シャーテルを擁立した が、シャーテルは2011年3月に服役を終えたばかりであった。大統領選挙出馬のためには刑期終了から6年以上経過している必要があるとして失格とされ、異議申し立ても却下された。その結果、シャーティルが失格となる可能性があったことから、念のため立候補の届け出をしていたムルシーが、自由公正党の候補となった。5月22日及び23日に行われた第一回目の投票で1位（得票数5,764,952票、得票率24.78％）となり、上位二人による決選投票へ駒を進めた。第1回の得票率は25パーセントに満たなかったが、決選投票では、世俗、リベラル、左翼の諸勢力も、反アフマド・シャフィークのために結束。決選投票翌日の6月18日には独自集計により勝利宣言を行った（対立候補のアフマド・シャフィーク元首相はこれを認めず）。6月24日、選挙管理委員会により大統領選挙の勝者と正式に認定された。得票数は13,230,131票（得票率51.73%）。この当選に伴い、ムスリム同胞団及び自由と公正党から脱退した。
シャルキーヤ県アル＝アドワ村の農家に生まれる。1975年にカイロ大学工学部を卒業後、1978年に同大学で工学修士、1982年に南カリフォルニア大学において工学博士を取得。1982年から1985年までカリフォルニア州立大学ノースリッジ校の助教授となり、その間、エンジニアとしてアメリカ航空宇宙局（NASA）に勤務しスペースシャトルの開発業務に助手として参加していたこともある。1985年にエジプトに帰国しザガジグ大学の教授となり、2010年までつとめた。2000年の人民議会選挙において無所属で当選し、2005年までムスリム同胞団議員団長を務めた。2011年の革命後にムスリム同胞団が母体となって設立された自由と公正党の党首に選ばれる。
アラブの春における民主化後では最初となるエジプト大統領に選出されるが、政教分離などの世俗的な価値観が浸透していないエジプト でイスラム主義に基づいた統治を進め、モハメド・エルバラダイら国内の世俗派から強い反発を受けた。政権後半にはイスラム主義に基づいた新憲法制定を目指した事で大規模な反政府運動が発生し、最終的に政権担当能力を疑問視したアブドルファッターフ・アッ＝シーシー国防大臣らによるクーデターにより解任され、身柄を拘束された（2013年エジプトクーデター）。その後死刑判決を受けるも、2016年11月に事実上の死刑判決が覆る最高裁判決後、2017年終身刑にあたる禁錮20年の判決が下り、2019年6月17日、法廷の審問後に倒れ、死去した。67歳没。
下野国（現栃木県）出身。1887年（明治20年）7月、陸軍士官学校（旧9期）を卒業し歩兵少尉に任官。1892年（明治25年）12月、陸軍大学校に入学するが、日清戦争開戦のため1894年（明治27年）7月に中退。戦後、1896年（明治29年）2月、陸大に復校し、1897年（明治30年）12月、陸大（11期）を優等で卒業した。参謀本部に配属。ドイツ駐在を経験した。1904年（明治37年）2月、オーストリア公使館付武官となる。1905年（明治38年）12月、参謀本部付に転じ、陸大教官に異動。1907年（明治40年）11月、歩兵大佐に昇進し第17師団参謀長に着任。1910年（明治43年）7月、第1師団参謀長に移る。1912年（明治45年）4月、陸軍少将に進級し歩兵第29旅団長となる。青島の戦いに参戦。1914年（大正3年）11月、青島守備軍参謀長。1915年（大正4年）7月、歩兵第10旅団長に移り、1916年（大正5年）3月、近衛歩兵第2旅団長に就任。1917年（大正6年）8月、陸軍中将に進み陸大校長に着任。1919年（大正8年）4月、第20師団長に親補された。1922年（大正11年）2月に待命、同年5月、予備役に編入された。