このテロが航空機を用いたものであったことや、シティグループやオムニコム・グループをはじめとするアメリカを中心とした大企業が緊急なものを除く外国出張の禁止を命じたことなどから、事件後は航空需要が一時的に激減し、世界中の航空会社が大きな打撃を受けることとなった。テロの標的となったユナイテッド航空だけでなく、標的にならなかったノースウエスト航空、デルタ航空も、連邦倒産法第11章の適用を申請し経営破綻した。また、サベナ航空やスイス航空など、アメリカ以外の航空会社も多くが赤字に転落したうえ経営破綻し、そのうちのいくつかは姿を消した。また、以前より空港や機内での保安体制が強化され、搭乗客への身体検査や手荷物の検査が厳重化されたほか、操縦室のドアなども強化された。
アメリカ同時多発テロ事件が起きた時刻はアメリカ合衆国での取引が始まる前で、多くの金融機関が入居するワールドトレードセンターで起きた事件ということもあり、その日のアメリカ合衆国国内の取引は中止。翌週の17日（月曜日）に再開するまで、取引所や金融機関は修復作業に追われた。9月10日の終値が9,605.51ドルだったNYダウは、取引が再開された17日には取引時間中に8,883.4ドルまで下落することになり、9月10日に121円を付けていた円ドルのレートも、翌日には118.5円まで値を落とした。なお、1機目の衝突直後から南側ビルの崩壊までの間だけでNYダウは100ドル以上下落していた。一方、取引中だったヨーロッパではCNNやCNBCを通じて事態が明らかになるとすべての取引所で株価の全面安が起きる。明くる12日の東京市場の日経平均株価は680円以上の下落となった。これは一部で「9・11ショック」とも報道されていた。その後多くの国においては株価の低迷がしばらくの間続くこととなる。又、9月18日のタイムズ紙によると、事件の数日～数週間前にかけてアメリカ、イギリス、ドイツ、イタリア、日本の株式市場で航空会社や保険会社、軍事関連企業などの株式が大量に信用売りされ、テロ攻撃の結果、株価が暴落した直後に安値で大量に買い戻された不審な売買形跡が認められたという。
なお、事件後にアメリカ合衆国を中心に行われたイラクへの侵攻に同調し派兵を行ったイギリスやスペインでは、この派兵に反対するイスラム過激派と見られる集団による一般市民を狙ったテロ事件が発生し、多くの人命が失われた。また、アメリカ合衆国主導で行われたイラク侵攻に同調し派兵することに対して、上記のようにこれらの国の内部で国民の意見が二分した。その結果スペインでは、2004年3月のマドリードにおける列車爆破テロ事件後に行われた選挙で、アメリカ合衆国への支持と派兵を決定したホセ・マリア・アスナール首相率いる国民党が敗退し、ホセ・ルイス・ロドリゲス・サパテロ率いるスペイン社会労働党に政権が交代した。同じくアメリカ合衆国への支持と派兵を打ち出して以降人気が急落していたイギリスのトニー・ブレア首相が任期途中で退陣することを発表するなど、アメリカ合衆国への支持と派兵はこれらの国における政権交代のきっかけを作ることとなった。
事件後のアフガニスタン攻撃に伴う対アフガニスタン人道援助・資金援助は、アフガニスタンとの国交を唯一保ったパキスタンが窓口となった。アフガニスタン向け援助は、その10-80%がアフガニスタンに届く前にパキスタンにおいて横流しされ、イスラム原理主義者を勢いづかせたのではないか、という意見もある。
1581年11月末、ホーセイはイヴァン4世からエリザベス1世に宛てた瓶詰めの親書を届けるよう命じられたが、北東航路が凍っていたため陸路での移動だった。旅は非常に困難で、さらにデンマーク領のエーゼル島で逮捕された。ところが島の総督夫人は偶然にもかつて自分が助けたマデリン・フォン・ユクセルであり、彼女の計らいですぐに釈放された。イングランドに到着するとジェロームはエリザベス1世に何度か謁見を許され、イヴァン4世の親書を英語に翻訳して読み上げた。この時の親書では、イングランドの王女をイヴァン4世の妻に迎えたい意向が伝えられた（これは実現されなかった）。ホーセイはモスクワ会社以外の冒険商人が集めてきた物産品を含む、土産の積み荷を搭載した9艘の船でロシアに向かった（2度目の訪露）。1586年にホーセイは再びイングランドに新ツァーリのフョードル1世の親書を携えてロンドン宮廷に戻ってきた。この親書には「妃が妊娠しにくく、子供が出来ないので力を貸してほしい」と書かれていた。イングランド宮廷はホーセイに助産婦を伴わせてモスクワへ向かわせた（3度目の訪露）が、この助産婦はヴォログダでモスクワ入りを拒まれた。これはフョードル1世の妻の兄で宮廷の実力者であるボリス・ゴドゥノフと、その敵対勢力との政争の道具になったのである。ボリスの対抗派閥は「ボリスは異教徒の手を借りて皇子を産ませようとしている」とボリスを糾弾したのである。ホーセイ自身は西欧文化に憧れを持つボリスとは友人関係にあった。ホーセイはロシア政府の依頼により、王家の一員であるマリヤ・ウラジーミロヴナを救出した。マリヤはリヴォニア戦争での戦略の一環としてイヴァン4世が傀儡に立てたリヴォニア王マグヌスと結婚したが、夫の死後は囚われの身となっていた（ホーセイは1581年末にイングランドへ向かう途中、ピルテンでリヴォニア王夫妻に謁見している）。ホーセイはマリヤとの結婚を望んだが、ボリスは彼が平民であることを理由にこれを許さなかった。こうしたなか、1587年にホーセイはイングランドで詐欺罪に問われたために帰国せざるを得なくなったが、宮廷内の友人たちの弁護もあって事なきを得た。1591年にホーセイはロシアに戻った（4度目の訪露）が、フョードル1世は彼に謁見を許そうとせず、エリザベス1世に2度とホーセイにはロシアの国土を踏ませないよう要求した。さらにイングランドでは彼に「公然たるスパイ行為を働いている」という疑いがかかり、結局は故国に戻ることとなった。友人であるボリスはホーセイの帰国の旅のお膳立てをしたうえ、彼に沢山の高価な贈り物を持たせている。