ゴジラアイランドの怪獣として登場する。島の怪獣たちのリーダーのような役目を持っている。普段は「ゴジラのどうくつ」に棲息しており、島に敵の怪獣が現れると一目散に出撃し、島の平和を守っている。基本的には温厚な性格だが、ジュニアが敵に襲われた際には、単身敵の懐に入り込むといった勝気な面もある。他の怪獣に比べて圧倒的な戦闘力を持っており、X星人もゴジラだけは恐れる。武器は口から吐く6万度の放射熱線。ガイガンとの戦いでは「曲がる熱線」を使用する。「スペースゴジラの悪霊編」ではかつて撃退したスペースゴジラに取り憑かれ、島の怪獣たちのオーラを吸い取り、赤い熱線を吐き大暴れする。また、「さよならトレマ編」ではデストロイアとメガロにだまされ、マタンゴ島の洞窟に閉じ込められる。造形物はバンダイのソフビ人形。
通称ファイナルゴジラ、ファイナルゴジデザインは全体的にシャープで逆ゴジに近い精悍（せいかん）なイメージとなっている。背びれはアクションに備えてやや小型化された。眼球は意志があるように見えるのを避けるため白目があえて排除されており、充血しているかのように赤い。着ぐるみの造型にあたっては軽量化とスーツアクターの動きがストレートに反映される構造が追求された。84ゴジ以降の着ぐるみは肩部分の可動域が非常に小さかったが、本作においては監督の北村龍平からの希望（劇中のアクションへの対応）から、肩から動かすことができ大きく腕を上げられる構造となっている。九州朝日放送特別番組『ゴジラ×村仲智美 ファイナルウォーズ』での若狭の解説によれば、着ぐるみはシーンに応じて使い分けるため「メインスーツ」「弾着アクションスーツ」「超アクションスーツ」の三種類が製造させている。
通称GMKゴジラ、GMKゴジプロポーションは前作とは打って変わって太めかつ頭部が大きく、キンゴジやビオゴジに近い（顔のラインには初ゴジやモスゴジのイメージも残る）。感情移入を拒絶する「悪の権化」を強調するため、眼は白目のみで黒目が存在しない。着ぐるみはバラゴンとの体格差を表現するため、シリーズ最大となる頭頂高220センチのものが作られた。監督の金子修介らのアイディアをもとに造形されており、具体的なデザイン画は存在しない。造形は金子の指名で品田冬樹が担当。民宿と魚市場を踏み潰すシーンは昭和シリーズで使われていた巨大な足だけの造形物を改修して使用している。
通称ギラゴジスーツは前作の型を流用して製作したものと前作の着ぐるみを改修したものが使われた。形状そのものは変わらないが体色が明緑色になり、歯にすびが入っているなどの点が異なる。新規スーツは素材の変更により50キログラム以下に軽量化された。実物大の背中の一部の造形物が製作された。海上を泳ぐシーンで使われたゴジラのモデルはスタッフから「カチコチ君」と呼ばれていた。
基本デザインは西川伸司によるもの。通称ミレニアムゴジラ、ミレゴジ。体の色は黒に近い濃緑色で、本作以前の直立姿勢から若干前傾姿勢になり、口も大きめに造形されているなど、より爬虫類に近い印象をもつ。背びれは炎をイメージした巨大かつ鋭利なものとなり、配色も従来とは異なり紫がかっている。また、足の指の付き方は初代ゴジラのものと同様になり、歯並びもビオゴジの二列から一列に戻され、以降継承される。本作の特殊技術を担当した鈴木健二によると、「まだ成長しきっていないやんちゃな個体」としてこのゴジラをイメージしたという。ミレニアムシリーズでは、『vsデストロイア』まで東宝内部で行われていたゴジラの着ぐるみ製作が外部発注されており、『大怪獣総攻撃』以外の作品では若狭新一が代表を務める有限会社モンスターズが造形を担当した。着ぐるみは海用とアップ用と爆破用が製作された。海中を泳ぐシーンではゴジラを初めてフルCGで描いている。
前作で山根博士が出現を懸念していた2体目のゴジラ。岩戸島にてアンギラスと戦っているところを発見される。形状の違いやストーリー上の矛盾が存在するものの、『ゴジラの逆襲』から『メカゴジラの逆襲』までに登場するゴジラは同一個体とされており、二代目ゴジラと呼ばれることが多い。また、作品によっては眼を潰されても短時間で回復するなど、自己治癒能力も非常に高く描写されている。『怪獣島の決戦 ゴジラの息子』『怪獣総進撃』『ゴジラ・ミニラ・ガバラ オール怪獣大進撃』の3作では息子とされるミニラが登場する。
ウッドランドの商工会議所は市の事業が発展することに貢献することを目指して1900年に設立された。この頃、公的な活動で図書館、市民公園および墓地の改良が進められた。1910年の人口は3,187人と郡内最多になり、その後の40年間で緩りではあるが着実に人口、事業および工場が増え続けた。その経済は主に農業関連の分野に基づいていた。すなわち3つの製粉所、砂糖大根の精製所およびトマトの缶詰工場がこの期間に設立された。第二次世界大戦後の時代はウッドランドの成長を加速させた。1950年から1980年の間にウッドランドの人口は3倍になった。1950年代のウッドランドはカリフォルニア州のどの市よりも人口当たりの百万長者の数が多いという噂があった。製造業の工場と配送センターが北東部で増え、町の周辺には新しい小区画やショッピングセンターが出現した。1960年代後半から町の歴史的な建物を保存することへの関心が増し、数多くの建物が改装されて家屋、事務所、店舗および博物館になった。ウッドランドの「歴史巡り」は1989年に始まり、年間行事の中で町中のビクトリア様式の家屋など歴史史跡の多くが公開された。1970年代、州間高速道路5号線の建設が完成し、ウッドランドの周辺にも高規格道路が通った。時とともに州間高速道路5号線とカリフォルニア州道113号線が主要交通機関として鉄道と置き換わった。