地下に過度の圧力がたまり何らかの振動がきっかけとなり噴出が始まったとされているが、きっかけとなった振動については科学者の中でも意見が分かれており、泥火山噴出の2日前に約260キロメートル離れたジョグジャカルタで発生したマグニチュード6.3の地震が原因だとする説、噴出口から150メートルの位置にあるバンジャル・パンジ (Banjar Panji) 天然ガス田が原因だとする説の2つがある。2008年にケープタウンで米国石油地質家協会の会議が開催され、双方の仮説の支持者がディベートを行った。ダラム大学のリチャード・デイヴィスは新たに公開された試掘井のデータからは噴出の原因となった圧力の上昇が読み取れると主張したが、ラピンド・ブランタス社の掘削アドバイザーであるロッキー・サウォロ (Rocky Sawolo) はそのデータの圧力は許容範囲内に収まっていると反論した。彼の同僚でオスロ大学のアドリアーノ・マッツィーニ (Adriano Mazzini) は地震が原因だと主張したが、カーティン大学のマーク・ティンゲイ (Mark Tingay) は地震のマグニチュードは6.3と小さすぎると反論した。投票の結果、議論を聞いた地質学者ら74人の内42人が掘削が原因だとする説を支持し、13人が地震と掘削の両方が原因だとし、16人は証拠不十分と判断、地震のみが原因だとしたのは3人だけだった。この投票結果に対し、議長を務めたエジンバラ大学のジョン・アンダーヒル (John Underhill) は「圧倒的大差」で掘削が最有力の原因として支持されたと述べた。2007年の『GSAトゥデイ』では、ガスの試削井が地下2800キロメートルの高圧の岩石を刺激したのが原因だという説が掲載された。2008年の『ナショナルジオグラフィック』の特集記事では、同じく掘削が原因だとするダラム大学のリチャード・デイヴィスの見解が報じられたが、彼は地震はあまり大規模ではなく震源も遠いと指摘し、自身の調査で掘削が原因だという有力な調査が得られたと述べた。2013年に『ネイチャー ジオサイエンス』に掲載された論文では、ボン大学のスティーブン・ミラー (Stephen Miller) らのコンピュータモデルを使用した研究によりジャワ島中部の地震が原因だと主張している。だが、リチャード・デイヴィスはこの論文に懐疑的であり、井戸の圧力は地震以前から高かったと指摘、圧力が高い状態で適切な措置をとらずに採掘用のドリルを引き抜いたことが原因だと主張した。また、2015年に『ネイチャー ジオサイエンス』に掲載された論文もミラーらの論文に異論を唱えており、掘削作業中に測定されていた天然ガスの濃度と組成を分析して、原因は地震ではなく天然ガスの掘削調査だと主張している。この論文の共同執筆者であるアデレード大学のマーク・ティンゲイによると、地震により地下深部の粘土が液状化して噴出した泥土の発生源となったのであれば大規模な天然ガスの噴出により泥流が上昇し地上に噴出するはずだが、分析結果はそのような天然ガスの噴出が発生していないと示していたという。2017年夏に『マリン・アンド・ペトロリアム・ジオロジー』に掲載された論文では、ジョグジャカルタの地震が原因だと提唱している。
1999年5月、シュルディナーは首の上部に痛みを感じるようになった。最初シュルディナーは神経が刺激されて痛みを感じているのだと考えていた。セラピスト/鍼師に続いてカイロプラクターに相談し、MRI検査を勧められた。そのアドヴァイスを受けて受検したMRI検査によって、その痛みが腫瘍によって引き起こされていたことが発覚した。1999年5月13日、シュルディナー32回目の誕生日に神経膠腫、脳幹に侵入する悪性の脳腫瘍と診断され、すぐに放射線療法が行われた。1999年10月、シュルディナーの家族が、シュルディナーの腫瘍は治療によって縮小し、シュルディナー自身は快方に向かっていると公表した。2000年1月、シュルディナーは残りの腫瘍の摘出手術を受けた。同手術は成功した。しかしこの時、シュルディナー一家はこれらの治療費によって経済的に逼迫した状態に陥っていた。これらの治療にかかった費用は、およそ$70,000（約700万円強）であり、シュルディナーの家族にこの費用を捻出する余裕はなかった。そのため多くの募金、オークション、コンサートがその費用を助けるために開催された。シュルディナーの生命の危機が知れ渡ると、費用はメタル・コミュニティーから捻出されるようになったのである。しかし、治療費用が不足したためにシュルディナーの生命が一時危機に陥ったことから、メタル・コミュニティーとシュルディナーの家族は、ミュージシャンの社会保障について強い懸念を示した。シュルディナーは音楽活動を再開し、彼のバンド・コントロール・ディナイドも併せて活動を再開した。しかし、最初の癌診断から約2年後の2001年5月、脳腫瘍が再発しシュルディナーは再び入院することになった。早急に処置を行う必要があったにも関わらず、シュルディナーは費用不足を理由に最初手術を拒否した。仲間のアーティストを含めた様々な人からの支援を求めプレスリリースが行われた。チャックの母であるジェーン・シュルディナーは、そのプレスリリースにおいて、アメリカの医療保険制度についての憤りを述べ、シュルディナー自身が保険金を得る事の難しさについて書かれていた。シュルディナーが最初の手術の後に加入した保険は、腫瘍が保険に入る前から存在していたと主張して、保険金の支払いを拒否していたのである。キッド・ロックやコーン、レッド・ホット・チリ・ペッパーズを含む多くのアーティストが、シュルディナーの医療費を捻出するために私物を出品したチャリティーオークション実施した。このオークションは、2001年夏にMTVで集まって行われた。トリヴィアムのボーカリスト兼ギタリストのマシュー・キイチ・ヒーフィーは、シュルディナーが入院している間ローカルバンドで活動し、チャリティーライヴを行ったと述べている。シュルディナーは、治療のためにビンクリスチンを用いた化学療法を受けるようになった。他の抗癌剤と同様にシュルディナーは大幅に弱体化した。同年10月末から11月にかけては、肺炎にも罹患している。2001年12月13日、午後4時（東部標準時）、シュルディナーは脳腫瘍によって死去した。34歳没。彼は火葬され埋葬された。MTVは、デスの現・元メンバーと共に、マイク・パットン、グレン・ベントン、キング・ダイアモンド、ヴィレ・ヴァロ、トレイ・アザトース、マックス・カヴァレラといいた多くのアーティストが、彼の追悼式に出席する模様をレポートした。