ゼントラーディ軍内部にも、スパイによって持ち込まれた情報や鹵獲品によって地球文化に対するカルチャーショックによる混乱が広がり、とうとうブリタイ艦隊の一部の兵士らがマクロスへ亡命、または出撃命令拒否という、暴動寸前までの騒動となる。これ以上の戦闘継続が困難と判断した艦隊司令官ブリタイ・クリダニクは、マクロスと単独で停戦交渉を打診する事態となる。一方、マクロスも囮として発進した以上、統合軍からの援軍も期待できる状況ではなく、自衛のため、マクロス艦内の民間人の安全を確保するために独断で停戦交渉の申し入れを受託、了承する。ゼントラーディからの交渉の使者として、ゼム一級記録参謀エキセドル・フォルモがマイクローン化してマクロスに来艦。双方の状況説明と情報交換を行い、停戦交渉を開始する。　その頃ブリタイは、自分と同様に地球圏に派遣されていたラプラミズに停戦交渉状況を説明するも、その話の際にボドル基幹艦隊総攻撃移動を知り文化に触れた自分達も地球人と共に消されると判断しゼントラーディ軍からの離反を決意。停戦交渉の最中にボドル基幹艦隊総旗艦総攻撃移動を知らされたエキセドルはボドル基幹艦隊への共同攻撃をマクロスに提案する。 マクロス側と同様にブリタイ側でもラプラミズとカムジン・クラヴシェラに対して自らが置かれている状況を説明し、同盟参加への説得を試みる。これに対してラプラミズは了承するものの、カムジンは反対し、艦隊ごと地球圏から離脱する。エキセドルからの情報によりゼントラーディ軍の命令系統や軍規の概要を把握したマクロス・ブリタイ同盟艦隊は、圧倒的な劣勢を挽回する作戦を話し合い、共に基幹艦隊への抵抗手段を立案する。それは「基幹艦隊の旗艦が撃沈された際には、残存艦隊は速やかに戦闘を中断し、近くの他の基幹艦隊へと撤退する」という軍規を逆手にとり、命令系統上位の艦隊旗艦、そしてボドル基幹艦隊総旗艦であるフルブス・バレンスへの集中攻撃という作戦であった。
西暦1999年7月に地球に落下してきたASS-1からゼントラーディ軍や監察軍の存在を察知した人類は、統合戦争の末、地球統合政府と地球統合軍を樹立。ASS-1からもたらされたオーバーテクノロジーを解析、会得しながら、その技術をもってASS-1を宇宙軍所属SDF-1マクロスとして改修。同時に既存兵器の発展と新兵器の開発を推進させ、バトロイド・バルキリーやデストロイドシリーズの開発、宇宙軍の創設等を行い、宇宙規模の戦闘勢力に対抗する準備を行っていた。一方、ゼントラーディ軍と監察軍は50万周期前から戦争状態を継続していたが、太陽系近辺における戦闘の際、一隻の砲撃戦艦 (ASS-1) が監察軍から放棄された。放棄艦は自動操縦にて単独でフォールド航行に突入し、戦線を離脱。月の軌道上に出現し、地球へと落下する。この戦艦の航跡を追って、ゼントラーディ軍第118基幹艦隊・第67グリマル級分岐艦隊（ブリタイ艦隊）がゼントラーディとしては初めて太陽系へ侵入する。
西暦1999年のASS-1落下に伴い樹立された地球統合政府と、ゼントラーディ基幹艦隊の一つである第118基幹艦隊（ボドル基幹艦隊）の間の戦争。SDF-1マクロスの主砲による砲撃でゼントラーディ軍の艦艇が撃沈されたことが直接の開戦の引き金となる。戦争の結果、第118基幹艦隊は旗艦を失い壊滅（航行可能な残存艦は全て撤退）、同艦隊のボドルザー司令長官は戦死。人類も基幹艦隊約480万隻による地球全土にわたる軌道爆撃によって、地球の生態系もろとも壊滅的なダメージを被り、地上での生存者数はわずか約100万人足らず（後継作品では異説あり）となる。
1948年（昭和23年）18歳の頃、母を連れ湯治に行った先で出会った女性のひとことがきっかけで運転免許を取得。1951年（昭和26年）,21歳で木炭車の貨物自動車を25万円で購入し運送業を始める。1956年（昭和31年）に結婚。副業で畳床製造も行い成功。1962年（昭和37年）11月に運送業免許を取得し新宮運送店としてトラック3台で開業。地元名産のそうめん「揖保乃糸」の北陸東海方面への運送で事業は順調に推移。地元の帝国電機製作所、ブンセン、日東木材なども顧客とする。1966年（昭和41年）頃からは、日本通運の傭車で日本触媒姫路工場の運搬を始めたことをきっかけにタンクローリーの長期契約など同社の仕事が多くなる。1974年（昭和49年）から翌年にかけ、自社の自動車修理工場を建設、車検も行えるようにし、新和自動車として社長に収まる。運送業は高度成長期の波に乗り順調に成長したが、1976年（昭和51年）に経理ほか多くの業務をこなしていた片腕でもある妻が乳がんを発症。神戸大学医学部附属病院で手術を受ける。手術は成功し再発はなかったが、このことをきっかけに、木南の人生観は大きく転換。金儲けだけではなく世の中のためになることがしたいという思いが強まり、社会活動に熱中するようになる。1981年（昭和56年）、物流団地を開拓し、姫路西配送センター事業協同組合を設立。日本スチレンペーパーとの取引も強化。1983年（昭和58年）には株式会社化。社長に就任。1988年（平成63年）、兵庫物流会長就任。2000年代からは、ライオンズクラブの地区ガバナーとしての活動が多忙となり、社長の座を長男木南一志に譲り会長に就任。他社とともに自主的に立ち上げた「物流ネットワーク播磨協同組合」では、全国の求貨・求車情報をオンライン化することで全国各地の車両の手配ができる「ローカルネットワークシステム」を構築、大手運送業者では困難なサービスを実現したほか、「世直しクラブ」を設立、オフィスで大量に発生する不要紙をトイレットペーパーに再生する企業参加型のリサイクルシステムを確立した。