多くの真正細菌のゲノムDNAは環状であり、負の超らせん構造をとるが、その約半分はフリーの plectonemic 型として存在する。これは DNA gyrase と呼ばれる II 型トポイソメラーゼが積極的に負の超らせんを導入しているためである。ゲノムDNAの超らせん密度は、負の超らせんを導入する DNA gyrase とそれを解消する topoisomerase I とのバランスによって制御されている。これらの細胞では、ゲノム全体に負の超らせんを蓄えることによって、核様体構造をコンパクトにするとともに、速やかな２重鎖DNAの開裂を可能にして複製や転写などの機能を支えている。
21世紀の中ごろ、上述した粘菌の発見によりナノマシンが実現化され、科学技術は飛躍的に発達する。しかしその一方で国家間の水資源紛争が活発化、さらにはエネルギー枯渇問題も重くのしかかり、明るい未来というような風潮は感じられていなかった。22世紀に入っても紛争はやむことを知らず、2118年に南米で生まれた独裁政権の暴走で限定核戦争が勃発。それは人類崩壊につながるような終末的なものではなかったものの、国家間のパワーバランスは極限まで緊張に達しており、何かの弾みで最終戦争が起こる危険性が常にあることを人類につきつけ、人類全体にいいようのない不安が広がるようになる。そして2130年頃、世界各地にアンデッドの軍団が現れるという大事件が起こった。このアンデッドたちの正体はいまだ謎であるが、ネクロマンシーなどという技術がまだ知られていない頃のことだったので、人類全体にパニックが発生する。人々はゾンビによる世界の終末の始まりを口々に叫び、前述した「いいようのない不安」は容易に終末思想へ結びついた。その流れにのって生み出されたあるカルトが、実際に終末戦争を起こすことを画策。2135年に世界の各地で同時に核テロリズムを起こす。これを敵国からの攻撃と勘違いした一部の国の指導者は報復に核を撃ちかえし、二回目の限定核戦争が起こる。それは前回のものとは比べ物にならない大規模な被害を世界にもたらし、地球環境は大きな打撃を受ける。しかしそれでも、人類がまだ滅ぶほどのことではなかった。2140年、人類はここに及んでようやく核使用禁止条約を締結。しかし、当時の地球は二回の限定核戦争による汚染が進んでおり、残された清浄な資源をめぐる紛争は激化の一途を辿っていた。核に代わる新たな軍事力をどこの国も求めていた。そして2141年、北米大国と東アジアの大国がほぼ同時に、あの世界各地に現れたアンデッドたちのメカニズムを解き明かした。これが死体操作技術ネクロマンシーが生み出された瞬間である。当時の社会にとってネクロマンシーが魅力的だったのはコストがとても安価であるということであった。アンデッドを構成する粘菌はわずかな栄養で活動することができるため、生きている人間のような水や食料の補給がほぼ必要ない。もちろん、戦車や戦闘機のように燃料を使うこともない。アンデッドは体が傷つき磨耗しても新しい死体のパーツを用意すればすぐに復活する。そして、二回の核戦争とそれに続く紛争の激化は死者の数を生まれる数より多くしていた。つまり、材料となる「死体」には事欠かなかった。エネルギーや資源で争っている戦争の中で、そのエネルギーや資源を使わずに動く兵器というのは重要だったのである。倫理的な反対も大きかったが「死体を兵士に使うということは、今生きている者を犠牲にしない、人道的なこと」というプロパガンダを押し通し、二大国はアンデッド兵士を戦場に送り込んだ。そしてその他の国々も追随してネクロマンシー技術を研磨させ、多種多様な軍事用アンデッドが生み出された。また、ネクロマンシーの発達は、対アンデッド兵器としての生物兵器の研究も促進させた。アンデッド兵器が実戦投入されたことで起こった最大の悲劇は、人類から軍事モラルを崩壊させたことである。死体を動かすことさえ人道的と言う詭弁が通用するならば、他のもっと凶悪な兵器さえ使うことに躊躇しなくなるのも時間の問題であった。これには前述した自我次元論を応用して「人格をコンピュータにダウンロードする」という技術が実用化したことも背景にある。肉体が滅んでも人格が再現できるという考え方が、魂は不滅であり生前の肉体や生命の価値は低いという過激な認識を広めるに至ったのである。そして、「核ではない兵器」なら何でも許されるという風潮のもとにありとあらゆる非人道的な兵器が生み出され、実戦に投入されていった。2154年には核以上に広域破壊をもたらす兵器が次々に使われた。東アジアでは地震兵器が、欧州では気象兵器と変異昆虫兵器の大群が実戦投入され地球人口はさらに激減した。ここに至って核使用禁止条約は破棄された。もはや核兵器などなくても人類は滅ぶ選択ができることを皆知ってしまったのである。2155年、南北アメリカ大陸間で130発の核弾頭が炸裂した。どこの国の誰がはじめにボタンを押してしまったのかは定かではないが、前年に欧州が大打撃を受けて世界のパワーバランスが崩れたことが遠因であるともされている。とにかくこれで世界最終戦争が起こることになる。世界は無政府状態になり核の冬が訪れたが、アンデッド兵士たちはそれでもまだ戦争を続けていた。アンデッド兵士たちは生き残っている敵側の人間たちを無差別攻撃し、人類は98％が死滅、人類文明は終了した。2182年には核の冬が終了し、核シェルターで生き残っていたわずかな人類が地上に帰ってきた。しかしそこは彼らが予想していた「静かな滅んだ世界」とは全く異なる光景が広がっていた。何らかの手段でこの世界を生き延びた「ネクロマンサー」たちが群雄割拠し、地上の支配権をかけて闘争する世界。ネクロマンサーの手駒であるアンデッドが跋扈し、野生化した生物兵器がそのアンデッドさえ食らう死の大地。ネクロマンシー技術を持たない人間たちはこの世界に耐えることができず、死ぬかアンデッドにされていった。「ネクロマンサーであるかどうか」で万物の霊長としての地位が決まる時代が到来したのである。ネクロマンサーでさえあれば人類でも人工知性でもアンデッドでも等しく歴史の主役になれるが、人類という種の単位での歴史が語られることはなくなった。さらにそれから時が経った2200年代。そのネクロマンサーたちさえも大きな行動をしなくなった。彼らは覇権を争う戦争にさえ飽き、ただ自分の領地にひきこもるだけとなった。もはや誰もが何もしようとしない、ただ終わってしまっただけの世界。新しい歴史が紡がれず、過去の思い出のみが慰めとなる世界。その思い出を求めることこそが「後日談」として語られる世界。それが『ネクロニカ』の舞台である。