5月12日、挙兵した元就は、毛利・吉川・小早川の軍勢に熊谷信直ら安芸国人衆を糾合した兵3,000で出陣。最初に栗田肥後入道が城番を務める佐東銀山城を攻める。しかし、毛利家臣の児玉就方による説得で戦わずして城は開城。栗田肥後入道は周防へ送還された。多数の城兵が石見遠征軍に送られているなどして、守兵が殆どいなかったと考えられている。さらに毛利軍は、己斐城（広島市西区）を攻めるも、城主己斐直之に戦う意志はなく降伏した。その後、毛利軍は江良賢宣が守る桜尾城（廿日市市）へ進軍。支城の草津城（広島市西区）を落とし、その勢いで桜尾城も落とした。元春と信直の事前の調略により瞬く間に桜尾城を占拠したと伝えられる。厳島の対岸にある桜尾城が陥落したことにより、厳島も毛利が奪取（広島湾周辺で活動する交易商から毛利家臣となっていた堀立直正が廿日市や厳島の町方衆と交渉し、毛利軍の接収が順調に進んだと伝わる）。わずか1日で、佐東銀山城・己斐城・草津城・桜尾城の4城、厳島を押さえた。さらに元就らは、同月中旬までには仁保島城（広島市南区）も手に入れる。そして、草津城に児玉就方、仁保島城に香川光景と東林坊、桜尾城に桂元澄、厳島に己斐直之を置いて守らせた。就方は水軍（川ノ内警固衆）を率いており、安芸武田旧臣であった光景は旧武田方の水軍大将であり、一向宗門徒の東林坊も川ノ内警固衆と縁が深いなど、海の守りが重視されている。また、大内軍の反撃拠点になりそうな門山城（廿日市市）を破却して、強固な防衛体制を整えた。
吉見正頼と大内義長・陶晴賢の双方から来援を求められた元就だが、当初は自主独立は時期尚早として晴賢側への参陣を考えていた。しかし、隆元は「陶へ加勢はやむを得ないとしても、（吉見討伐の次には）父（元就）が拘束される恐れがある。毛利家存続のため、名代として自分（隆元）や元春が出陣すれば義理立てはできる」と主張し、謀反人としていつか天罰を受けるであろう晴賢のもとに元就自身が出陣することに強く反対（また、元就が吉田郡山城を空けると、背後の尼子氏が動き出す懸念もあった）。年明け後の書状には「毛利と陶はいずれ決裂するので、こちらが有利な時に断交するべき」とまで書き残している（毛利家文書）。天文23年（1554年）3月1日、大内義長を総大将とする大内軍は、三本松城を目指して出陣（三本松城の戦い）。しかし、元就は参陣する気配を見せなかった。既に晴賢は、安芸国人衆の盟主である元就を通さずに安芸の国人たちに出陣を催促する書状を2月下旬より送っていた。国人らに直接指示を出して、毛利と他の国人たちを分断しようと画策したのである。しかし3月に、密使が平賀弘保と広相に捕らえられてしまう。元就の働きで平賀氏再興を成し遂げることができた恩があり、毛利への忠誠を示す弘保らは、これまでの書状と共に密使の僧を元就に突き出したのである。これは、安芸・備後の国人領主たちを取りまとめる権限を元就に与えるとした約束に反することであり、元就も隆房との対決を最終的に決意する。5月11日、ついに元就は天野氏・平賀氏・阿曽沼氏などに対して、大内・陶と断交する旨を伝えた。なお、元就と正頼は密約を結んでから反乱したと言う説もあるが、当初元就は陶方に参加を決めていたとされており後世の脚色と思われる。また元就は当初から晴賢との決別を視野に入れていたが、隆元らの意見によって毛利家全体の意見が陶との断交で固まるのを待っていたと言う意見もあるが元就が早くから独立の機を伺っていたことを裏付けるような史料はなく、これも後世の脚色の可能性がある。
1900年、フェルディナント・レーヴェによりウィーン演奏協会管弦楽団（Wiener Concertverein Orchester）として設立された。1903年2月11日、ムジークフェラインザールにおいて、レーヴェ指揮によりブルックナーの交響曲第9番の初演を行った。1913年、本拠地をウィーン・コンツェルトハウスとし、1919年、ウィーン・トーンキュンストラー管弦楽団と合併、1933年、現在の名称となった。1920年代、ラジオ放送開始によりコンサートの聴衆数を減らしたが、1938年のオーストリア併合においても存続し、ナチス政権の「文化管弦楽団」政策（Kulturorchester (独語版)）に組み入れられ、1944年9月1日にオーケストラが消滅するまで、ナチス政権の宣伝目的のため、軍需工場の中での演奏という任務に従事させられた。1945年9月16日、第二次世界大戦後最初の演奏会が開かれ、マーラーの交響曲第3番が演奏された。 そして、ヨーゼフ・クリップスの指導により、10年間の空白を埋め、現代のレパートリーを回復させ、1946年夏、初めてブレゲンツ音楽祭に参加した。1946年から、当時の首席指揮者ではなかったがヘルベルト・フォン・カラヤン指揮による「カラヤン・チクルス」が始まり、ヨーロッパや北アメリカのツアーを行った。 カラヤンは1960年代初頭にかけて合計150回以上の演奏会を指揮し、同団の戦後の飛躍をもたらした。ただし、カラヤンとはベルリン・フィル、ウィーン・フィル、フィルハーモニア管と比べて極めて少ない録音しか残されなかった。それでも、ソヴィエトからセンセーショナルに西側に登場したばかりのスヴャトスラフ・リヒテルとカラヤンの世紀の共演として話題を呼んだドイツグラモフォンのレコーディング（チャイコフスキーのピアノ協奏曲第1番）では、リヒテルが西ベルリンに入れなかった（ウィーンフィルは当時デッカ専属で他社録音が難しく、同じ月に同社にカラヤンとの「トスカ」セッションがあった）ため珍しくバックに起用され、これは今なお名盤としてロングセラーを続けている。1959年、バチカンで教皇ヨハネ23世の前で、ヴォルフガング・サヴァリッシュ指揮による演奏会を行った。サヴァリッシュの下では、1962年のアン・デア・ウィーン劇場の復興演奏会、1964年のアメリカ・ツアー、1967年のアメリカ・日本ツアーが行われた。サヴァリッシュの後、クリップス、カルロ・マリア・ジュリーニが首席指揮者となった。1980年代、ジョルジュ・プレートルが首席指揮者となり、フランス音楽のレパートリーとともに、コンサートの数も増やした。1990年代初期、ラファエル・フリューベック・デ・ブルゴスが首席指揮者となり、スペイン音楽も多くレパートリーに取り入れた。1997年、ウラジーミル・フェドセーエフが首席指揮者に就任した。2005年からはファビオ・ルイージが首席指揮者を務めている。クリップスまではドイツ系の音楽監督が続いたが、その後はイタリア人、フランス人、ドイツ系スペイン人、ロシア人、イタリア人と、非常に国際的な人選でレパートリーの幅も広がっている。