昭和十年代までは諏訪湖がほぼ氷結しても東側7ヵ所の湖底源泉の湖上は氷結せず、湖上に7ヵ所の穴が開いて見えたことから湖底の源泉は七ツ釜と称されていた。源泉のひとつとして七ツ釜は現在利用されており、諏訪湖東岸に所在する諏訪湖間欠泉センター、湖畔公園足湯、また上諏訪温泉などに引かれている。
かつては毎年のように厚い氷が湖面をおおい、戦前には氷上での戦車の走行や航空機の離着陸の訓練まで行われていた。また、ワカサギの穴釣りをはじめ、アイススケートなども行われていたが、近年は全面氷結の頻度が減少している。また、氷も薄くなっており、スケートなどを行うのは危険を伴う。ワカサギの穴釣り以外に陸釣りをする釣り客、船釣り客が訪れる。
平均滞留時間は3日から120日（平均40日程度）と変動が大きく湖水の水質は流入河川からの流入量（流域の降水量）と水質変動の影響を強く受ける。従って、歴史的に流域の暮らしの変化により水質も大きく変化してきた。諏訪湖はかつて非常に水質のよい湖であり、江戸期には琵琶湖や河口湖からの蜆が放流され漁業も行われていた。しかし、戦後の高度経済成長期にかけて農地からの化学肥料由来の栄養塩類や生活排水などにより湖の富栄養化が進み、過栄養湖へと変化した。特に1970年代から80年代にかけては、ユスリカやアオコのミクロキスティス(Microcystis )が大発生し湖面が緑色になり、悪臭が漂い発泡するなどといった環境悪化が見られた。水質悪化の要因は沢山あるが、流入河川が30を超え多いにも関わらず、流出河川が一つであり、かつ集水域が広く各流入河川の汚染物質が溜まり易い構造になっているからである。しかし、1979年（昭和54年）から一部供用開始し1993年（平成5年）全市町村共用となった流域下水道の整備事業などや市民による水質改善活動の結果、大幅に水質が改善されているが、昭和初期の姿を取り戻すまでには至っていない。浄化施設の顕著な効果はすぐには現れなかったが水質浄化の効果は徐々に現れ、1997年頃からは夏にアオコの発生が見られない年があったり、それまで大発生をしていたユスリカの発生が大きく減少したりするなど、水質浄化の影響を感じられる様になってきた。しかし、水質浄化に伴い生息生物相も変化し生態ピラミッドの底辺を構成する植物性プランクトン減少の影響は食物連鎖上位へも変化が及び、水草の増加、大型ミジンコの増加が報告されている。なお、ワカサギの減少と水質浄化の因果関係を示唆する報告もある。たとえば、水質浄化により透明度が上昇した沿岸では水草のヒシが繁茂し、ヒシの下部では水流が阻害され貧酸素水帯を形成する為、ヒシの除去も行われている。
新生代第三紀の終わり頃からの中央高地の隆起活動と糸魚川静岡構造線の断層運動によって、地殻が引き裂かれて生じた構造湖（断層湖）である。また糸魚川静岡構造線と中央構造線が交差する地で、諏訪湖を取り囲むように諏訪湖南西側を諏訪湖南岸断層群、諏訪湖北東側には諏訪断層群がある。「かつて、諏訪湖からの水は東の釜無川方面に流れていたが、八ヶ岳からの噴出物によって堰き止められ、南下するようになった」との説がある。また、時代と共に流入河川からの土砂の堆積や、護岸工事などにより面積は徐々に縮小している。
1976年7月に大洋図書の関連会社として設立。当初は1979年に創刊された『S&Mスナイパー』を始めとするマニア系SM誌を中心に活動していた。その後、1986年にグラビア系アダルト誌『URECCO』を創刊。1992年にお菓子系雑誌の元祖と言われる『クリーム』を創刊するなど、アダルト系雑誌を軸とした出版社として歩んでいくが、その一方で、1986年にはツーリング雑誌の草分けとも言われる『アウトライダー』を創刊する。その後、1989年にはレディース暴走族雑誌『ティーンズロード』、1994年にB級ニュースマガジン『GON!』を、1995年には元祖ギャル雑誌『egg』を創刊し、一時期40万部を発行するなど、他の出版社が手がけないような異色のジャンルを開拓し続ける。1998年に大洋図書の関連会社として、ワイレア出版が設立され、『S＆Mスナイパー』や『クリーム』は発行を移管。2000年の『egg』の一時休刊を機に、姉妹誌『men's egg』と共に発行を大洋図書に移管。2007年には社内に非アダルト向けブランド「グライドメディア」を設立。※グライドメディア名義の刊行物は表記上は「発行：グライドメディア」となっているが、実質、発行ミリオン出版。2001年に創刊された『実話ナックルズ』（創刊時は『実話GON!ナックルズ』）を中心に、実話誌を数多く刊行していた。2012年8月、『ティーンズロード』や『GON!』、『実話ナックルズ』などを手がけ、社の象徴的存在だった比嘉信顕が、社長職を解任された。2013年、グライドメディアを三和出版傘下の出版社メディアボーイに譲渡。これに伴い、『CAST-PRIX ZERO』や『声優PARADAISE』も同社に移管。2014年5月、ミリオン出版・ヒーローシリーズを継承した書籍・コミック・電子書籍ブランド「ヒーローX」を設立。2018年9月、同年12月1日付で大洋図書に吸収合併されることが明らかになった。出版中の雑誌は合併後も発行を継続するという。「実話ナックルズ」元編集長・久田将義は「やんちゃな会社だったが、なくなるのは寂しい」とコメントを出した。