2017年、長崎電気軌道、松浦鉄道、長崎県交通局、長崎県央バス、させぼバス、西肥自動車は、西日本鉄道グループが主導する全国相互利用ICカード「nimoca」へ切り替える方針を明らかにした。その後、2019年度末頃にnimocaが導入される見込みとなった。これらの事業者では、nimoca導入を待って長崎スマートカードの新規発行と積み増しを終了し2020年夏頃までに利用を終了する予定。なお、佐世保市交通局もnimoca導入を表明していたがそれを待つことなく2018年度いっぱいをもって事業譲渡している。
長崎スマートカードは導入から15年が経過し機器の老朽化が進行していることから、2020年までに新しいICカードサービスを開始することになったが、導入するサービスを巡って、長崎スマートカードの取扱高の過半数を占める長崎自動車グループとそれ以外の事業者に二分されることになった。なお、新サービス移行に伴う長崎スマートカードの払い戻しは発行社局群毎の取り扱いとなるほか、新カードへの残高移行等の取り扱いもない。
2009年7月15日、7社局及び県バス協会は車載器の不具合により、特定の利用者から運賃を過徴収していたことを発表した。過徴収額は19,890円。2008年3月20日から2009年1月10日までの期間中、前日までに乗り継ぎ割引を利用し、当日最初に路面電車でカードを利用した場合、乗り継ぎ割引の利用回数が0に戻らず、乗り継ぎ割引が受けられないケースが982件生じた。影響を受けたカードは410枚で、1枚当たり10円から720円を過徴収していた。過徴収されたカード利用者には、翌日以降の利用時に過徴収額をカードに積み戻しすることで対処した。対象かどうかはホームページに判別プログラムがあり、カード番号を入力することで対象カードかどうかが判別できる。
長崎自動車が2008年に開業したみらい長崎ココウォークのクレジットカード。オリエントコーポレーションと提携し発行。長崎スマートカードの機能にクレジットカードの機能が付いている。JCBやNTTドコモのiDの加盟店で使用可能である。後述するように長崎スマートカードの廃止にともない長崎スマートカード機能は使えなくなるが、クレジットカード機能については引き続き利用可能。なお、長崎自動車グループでは今後クレジットカード機能付のエヌタスTカードを発行する。
2005年12月12日からおサイフケータイに対応した、モバイル長崎スマートカードのサービスを開始した。NTTドコモのiモードFeliCa対応機種のみ利用可能で、auとソフトバンクモバイル、スマートフォンのおサイフケータイは対応していない。また、島鉄バスと松浦鉄道ではモバイル長崎スマートカードは利用できない。モバイル長崎スマートカードは、島鉄バスと松浦鉄道を除く各社局の定期券にも対応し、携帯電話の画面で区間表示・利用表示が停留所名で表記されるほか、停留所の追加・廃止にも対応できる。
12月1日、伊25は横須賀を出港し、トラックに移動。9日、トラックを出港し、12日にショートランドに到着。13日、輸送物資を搭載してショートランドを出港し、ガダルカナル島に向かったが、任務は中止された。14日、ラバウルに到着。17日、輸送物資を搭載してラバウルを出港し、20日にブナに到着して輸送物資8トンを降ろしたが、途中で米魚雷艇2隻を発見したためそれ以上の揚陸を中止して出港。23日にラバウルに到着。25日、輸送物資を搭載してラバウルを出港し、27日にブナに到着したものの、米魚雷艇を発見した上守備隊との連絡が取れなかったため一旦退避。28日に再度連絡を試みたものの応答がなかったため、諦めて出港。31日、ラバウルに到着。1943年（昭和18年）1月5日、輸送物資25トンを積んでラバウルを出港。7日にブナに到着して輸送物資を揚陸し、傷病兵70名を収容した後出港。8日、ラエ近海で、前日に第51師団のラエ輸送作戦である第十八号作戦に参加中にPBY カタリナの攻撃で撃沈された貨物船日龍丸（日産汽船、5,447総トン）の生存者救助に向かい、乗船していた岡部支隊第3大隊117名を救助した。9日1406、ニューブリテン島アドラー湾近海で浮上航走中、米潜グランパス(USS Grampus, SS-207)に発見される。潜航中のグランパスは2800mの距離から魚雷3本を発射。ちょうど司令塔で喫煙中の田上艦長は600mの距離で接近する魚雷を発見し、面舵一杯を下命。魚雷2本は回避し、1本は伊25の右舷中央部艦底下を通過していった。同日、ラバウルに到着。11日、輸送物資を乗せてラバウルを出港し、13日にブナに到着して輸送物資を降ろし、傷病兵37名を収容した後出港。17日にトラックに戻った。23日、伊25はトラックを出港し、ガダルカナル島南東沖に進出。29日、レンネル島沖海戦を目撃。伊25は空襲の支援に向かったが、スコールにより失敗。30日、曳航中の米重巡洋艦シカゴ(USS Chicago, CA-29)の迎撃のため、浮上して18ノットで先回りをして待ち伏せたが、シカゴは空襲で撃沈された。午後、伊25は米駆逐艦に発見され、合計40個の爆雷を投下されたが被害はなかった。2月17日0015、エスピリトゥサント島を飛行偵察。24日、トラックに到着。3月29日、伊25はトラックを出港し、フィジー諸島方面へ向かう。5月18日、南緯17度30分 東経173度02分のフィジー島西方420浬地点付近で、ヌーメアからサンペドロへ向かっていた米タンカーH・M・ストレー（H. M. Storey、10,763トン）を発見し、砲雷撃により撃沈。6月2日、トラックに到着。7月15日、艦長が小比賀勝中佐に交代。