2016年9月4日、シカゴでのレッドスターズとの試合において、試合前の国歌斉唱の際にラピノーは跪く姿勢をとった。これは、人種の不平等や少数派への抑圧に抗議して試合前の国歌斉唱を拒否し議論を呼んだフットボール選手のコリン・キャパニックの行動に共鳴したものであった。一方、3日後の9月7日、ラピノー所属のレインFCと対戦したNWSLのワシントン・スピリットは、通常の国歌演奏は行わず、選手がフィールドに入場する前に国歌を流すという措置をとった。これについてスピリットは「アメリカ人や我々のファンの大多数にとって大きな意味を持つ伝統をハイジャックする者（ラピノーのこと）を喜んで認めることはできない」とする旨の声明を発表した。これに対しラピノーは「アメリカ最大の悲劇の一つ（アメリカ同時多発テロ事件）の4日前に、『ハイジャック』という言い方をされたのはとても不愉快だ」と不快感を表明した。その後、9月15日に行われた代表のタイ戦でもラピノーは跪く行為を続けた。これについて、アメリカ合衆国サッカー連盟は「国を代表することは代表選手やコーチにとっての特権・名誉であり、したがって国歌はアメリカサッカーにとって重要である。国内外の観衆の前で国歌を演奏することは、アメリカ国民が享受してきた自由について思いを馳せる機会となる。我々は国を代表するという特権を与えられた者として、選手やコーチは国歌演奏中に起立し、国旗に敬意を払うことを期待する」と声明を発表した。ラピノーはこの声明に対し、「抗議から身を守るために愛国心を利用するのはとても臆病だ」と述べ、おそらく今後一切国歌を歌わないだろうと語った。2019年のワールドカップにおいても、国歌演奏の際に起立はしたものの、国歌は歌わず、胸の前に手を当てるポーズはとらなかった。
2015 FIFA女子ワールドカップの優勝後、ラピノーたちアメリカ代表の優勝を記念して、ニューヨーク市でティッカー・テープ・パレード（紙吹雪を使って演出するパレード）が開かれた。女子のスポーツチームを記念してニューヨークでティッカー・テープ・パレードが行われるのは初めてであった。この時、ビル・デブラシオニューヨーク市長から「市の鍵」を授与された。10月にはホワイトハウスでバラク・オバマ大統領を訪問した。
ラピノーはナイキ、サムスン電子とスポンサー契約を結んでいる。ナイキの複数のCMに出演したことがある。2013年、衣料品メーカーの Wildfang の広告に登場し、また医療機器メーカーの DJO Global ともパートナーシップを結んだ。2016年には、エナジー・ブランズ（グラソー）のビタミンウォーターの広告に出演した。同年には、ナイキのCMでクリスティアーノ・ロナウドと共演している。
ラピノーは大学一年生の時に同性愛者であることを自覚した。2012年7月、彼女はLGBTファッション雑誌のOutで同性愛者であることをカミングアウトした。同誌によれば、彼女は2009年からオーストラリアのサッカー選手 Sarah Welsh と交際していた。2013年にWelshとの関係を解消した。その後、シアトルのレコードレーベル、サブ・ポップに所属するアーティスト Sera Cahoone と交際し、2015年8月に婚約を発表した。2017年1月、結婚を保留することを発表した。2017年7月には、2016年後半からシアトル・ストーム所属のバスケットボール選手、スー・バードと交際していることを認めた。2018年、バードとラピノーはThe Body Issue（ESPNが発行するESPNマガジンの、スポーツ選手のヌード写真を掲載する企画）の表紙を、同性カップルのスポーツ選手として初めて飾った。
2011年のワールドカップでの活躍を受けて、出身地のレディングでは彼女を表彰するパレードが開催され、9月10日が「ミーガン・ラピノーの日」として制定された。2012年10月25日、FIFA女子最優秀選手賞の候補10人の一人に選ばれた。同年、スポーツ・イラストレイテッドによる Most Inspiring Performers の最終候補にも名前が挙がった。2012年11月10日には、LGBTのスポーツ選手への認識を広めたことを称され、ロサンゼルスLGBTセンターから表彰を受けた。2014年12月、ラピノーはフットボール選手のライアン・オキャラハン、リッキー・レイと共に、出身地であるカリフォルニア州シャスタ郡のスポーツの殿堂に選出された。2015年、ラピノーは National Gay and Lesbian Sports Hall of Fame に選出された。ワールドカップでMVP・得点王に輝いた2019年には、FIFA女子最優秀選手に選出された。イタリアのミラノで行われた授賞式に参加し、「本当に信じられない1年だった」と活躍を振り返った。
1976年に Seymour Schlanger、Hugh Jenkyns らにより初めて報告されたこの事変は、有機物が分解されないまま地圧等で変成されて生成された黒色頁岩のような地層が、浅海・深海を問わず、海洋規模ないし全地球規模で同時に堆積していることから見いだされた。この地層の調査から、過去に少なくとも 3回の大規模な海洋無酸素事変 (OAE) が起きたことが認識されている。（なお、この他にも幾度か絶滅事変が起きているが、その原因についても研究が進められている。）この事象が起きると海底付近は無酸素（または極度の低酸素）状態となり、有機物を分解する好気性細菌や動物が生息できない状態となる。海底へ沈んだ生物の死骸等（デトリタス）を分解する生物が海底にいなくなるため、沈んだデトリタスはそのまま堆積する。つまり、この事象が起きた年代の地層には大量の植物プランクトンや陸生植物その他の生物の死骸が分解されないまま堆積していることが特徴で、そうした地層が特定の年代かつ広範囲にわたって見られることや、その葉理の様子から、海洋無酸素事変の発生が見いだされる。最近ではジュラ紀前期および白亜紀中 3期間で認識されている。（en:Hangenberg event、en:Aptian extinction、en:Cenomanian-Turonian boundary event）局所的な富栄養化や生物相の貧困化による酸素欠乏状態は現代でも見られるものの（たとえば赤潮など）、それが全球規模に拡大すると、逃げ場を失った生物の大量絶滅が起こり、生物多様性が著しく減退する。事実、その時代の地層から発見される化石の種類などからその傾向が見出されている。また、表層と深層の間で水循環が起こらない、当時と似た環境を研究することで、当時の環境を推定する研究もされている。たとえば日本の上甑島・貝池や、アメリカ合衆国ニューヨーク州のグリーンレイク、黒海などの部分循環湖が該当し、こうした環境では表層部に炭素固定を行う植物プランクトンや窒素固定も行うシアノバクテリアが生息するものの、ある水深（貝池では 5m、グリーンレイクでは 20m 付近）を超える深層は水の循環がない酸素欠乏状態となり、その境界部には紅色硫黄細菌や緑色硫黄細菌などの嫌気性光合成細菌が高密度で生息し（これらは酸素は無いが太陽光が届く範囲に集まる）、それより下は硫酸還元細菌などの限られた生物のみが棲む層になる。このような環境から類推すると、当時の海は広範にわたって硫化水素のような有毒物質も多く存在する環境であり、多くの生物が死滅する一因になったとも考えられている。