上演禁止から20年目となる1956年にショスタコーヴィチはこのオペラの改訂に着手し、『カテリーナ・イズマイァ』（Катерина Измайлова）作品114とする改訂稿を作りあげた。この作品の上演許可は1963年に出され、その年の1月8日にモスクワのネミローヴィチ＝ダンチェンコ劇場によって初演された。この改訂版では打楽器などの刺激的なオーケストレーションは避けられているが、新たに書かれた最初の部分の間奏曲などでは『ムツェンスク郡のマクベス夫人』よりも優れた音楽的効果を発揮しており、歌詞も旧版の卑俗な言葉遣いが上品で刺激の少ない表現に書き換えられている。なお、演奏時間はほぼ旧版と同じである。題名や作品番号の違いなども含め、作曲家の諸井誠は「『ムツェンスク郡のマクベス夫人』は『カテリーナ・イズマイロヴァ』と同一作品ではない、とする説が、昨今では大勢を占めているようだ」としている。1966年にはこのオペラの映画版も制作された。内容は約2時間にカットされ、主役のカテリーナに扮するソプラノ歌手のガリーナ・ヴィシネフスカヤの演唱と、コンスタンティン・シモノフの指揮・キエフ歌劇場管弦楽団による音源を元にプレスコで撮影された。演技は主役を除いて、すべて俳優によるものである。
1936年1月初旬、レニングラードのマールイ劇場が客演先のモスクワにて本作を上演中、作曲者も滞在していた。時を同じくして、ミネローヴィチ＝ダンチェンコ音楽劇場でも本作を『カテリーナ・イズマイロヴァ』と名前を変えて上演しており、ボリショイ劇場も前年の12月から本作を舞台にかけていた。したがって、同年1月のモスクワでは都合3つの舞台で本作が上演されており、同地はショスタコーヴィチの作品一色に染まっていた。そんな折り、1月26日にヨシフ・スターリンが側近と共にボリショイ劇場を訪れ、注目作である『マクベス夫人』を観劇した。劇場の関係者は称賛を受けることを期待して作曲者を舞台裏に待機させていたが、スターリンは第3幕の途中で席を立った。作曲者は不安に駆られつつ、別の演奏会のためアルハンゲリスクへ向かった。2日後の1月28日、共産党中央委員会機関紙『プラウダ』に「音楽のかわりに荒唐無稽」と題する批判的な内容の無署名記事（プラウダ批判）が掲載された。アルハンゲリスクで事態を知った作曲者は至って冷静であったが、スターリンの逆鱗に触れたことで、作曲者の身に危険が及びかねない状況となったため、本作はレパートリーから外され、以後20年以上にわたり事実上の上演禁止となった。
第4幕の完成後、1933年に初演のための準備が1年をかけて行われ、1934年1月22日、レニングラードのマールイ劇場（現ミハイロフスキー劇場）にて、サムイル・サモスードの指揮で行われた。初演は成功を収め、レニングラードとモスクワの劇場では2年間で83回の上演を記録し、アメリカやアルゼンチン、西欧諸国（イギリス、スイス、チェコスロヴァキア、スウェーデン）の各都市でも上演されている。その性暴力の描写を含む内容に、アメリカの一部批評家たちは本作を「ポルノフォニー」「寝室オペラ」などと酷評し、時にスキャンダルにまで発展している。またクリーヴランドでこのオペラを観劇していたストラヴィンスキーも「リブレットは嫌悪感をもよおさせる」と評した。本国でも、従来のオペラとは異なる内容に戸惑い、賛否両論が起こったという。初演当時は大好評を博し、ショスタコーヴィチの作曲家としての地位を揺るぎないものにした。前述のような批判もあったが、「作曲者が表現せんとした全ては、古くとも新しくとも、新鮮で原始的な何かを体験するものとして見ることができ、折衷的な一貫性をもつ生命力は、作品のすべてに説得力を持ち、ストレートに魅せられる。」（1935年のチューリッヒ公演の批評）と幅広く人気を集めた。
山梨県北巨摩郡清哲村字青木（現･韮崎市）に農業水上勘三郎・千鶴夫妻の五男として生まれる。水上家は江戸時代､庄屋を務めた家系という。旧制甲府中学校（現山梨県立甲府第一高等学校）を経て、1928年東京商科大学（現一橋大学）卒。大学の同期には三井物産副社長や東レ副社長等を務めた町田栄次郎、三菱地所社長を務めた伊藤達二、松下電器理事を務めた乗松健二、第一電工社長等を務めた松原美義がいる。1928年三井物産入社。高崎派出所駐在員を命ぜられ、以後6年間を同地で過ごす。その後は肥料部、天津支店などを経て北京支店支店長代理となり、太平洋戦争終戦を同地で迎える。北京での残務整理を終え翌1946年に帰国。三井物産に復帰した直後、財閥解体により、三井物産は多数の会社に分割され、そのひとつである第一物産代表取締役常務、同社副社長を歴任。1954年の三井物産大合同後は副社長等を経て、1961年から1970年まで三井物産社長、1969年から1971年まで三井物産会長、後に同社相談役就任。その間の1961年から1963年までは社団法人経済同友会代表幹事を務めた。1972年から1985年まで社団法人日本貿易会会長。貿易会会長としてはジェトロと、貿易研究所（現 財団法人国際貿易投資研究所）の設立に尽力。1977年から1989年まで財団法人中東調査会会長。  晩年には教育関係においても活躍し、1976年に就任した母校・一橋大学創立百年記念事業募金会副会長をはじめ、同年に財団法人国際大学設立準備財団設立発起人代表にも就任し、国際大学の設立・運営に尽力した。1976年一橋大学創立百年記念事業募金会副会長。1976年財団法人国際大学設立準備財団設立発起人代表。国際大の設立・運営に尽力。  葬儀は理事長を務めた聖路加国際病院の礼拝堂（チャペル）で行われた。