小説『三国志演義』では、その容姿が「面如冠玉，眼若流星，虎体猿臂，彪腹狼腰」に描かれている、「錦馬超」（きんばちょう）として称えられている。初登場するのは、長安を占拠した李傕一派と馬騰・韓遂が戦ったときである。わずか17歳で敵将の李蒙、王方を討ち取る鮮烈な活躍を見せるが、父の馬騰が敗れたため敗退している。『演義』においては馬騰は曹操と対立する涼州の一勢力として描かれているため、袁紹残党の高幹と馬一族の戦いは『演義』においては採用されていない。馬騰が曹操暗殺計画に加担していた為、後に謀略によって一族のほとんどを曹操に謀殺されてしまう。涼州に留まっていたため難を逃れた馬超は、唯一生き残った従弟の馬岱と共に、復讐の為に兵を起こしたとなっている。挙兵と一族の殺害の前後が演義においては正史と逆転している。潼関の復讐戦において諸々のエピソードは史実をなぞっているが、所々で馬超の勇猛ぶりが史実に増して際立つように筆が進められ、特に曹操が渡河する際、馬超はその超人的な武で曹操軍を蹴散らしながら曹操を苛烈に追う。戦役半ばでは許褚との一騎討ちが挿入されており、馬超は上半身裸になった許褚と演武を繰り広げる。賈詡の離間の計により、韓遂と決裂して敗北するのは同じだが、韓遂はこのときに曹操軍に寝返っており、梁興らを斬ったことになっている。その後も挙兵するが敗れ、史実通り妻など残った一族をほぼ皆殺しにされている。その後、史実と同じく漢中の張魯の元に身を寄せるが、劉璋軍の援軍として派遣され劉備軍の張飛と一騎討ちした事象は、『演義』の創作である。この時に馬超は諸葛亮の策により楊松の讒言に惑わされた張魯に疑われ、引き返せなくなる。そして李恢の説得によって劉備軍に降り、劉璋を脅すことになったため、劉璋は援軍が来ない事を悟り、降伏するというものである。馬超は蜀に身を寄せ、五虎大将軍に任じられて、曹操と劉備との漢中攻防戦で活躍する。だが、その後の馬超は史実同様精彩を欠き、西涼の錦と言われた力は発揮出来なくなる。他に、劉禅即位後に曹丕が司馬懿の進言で、五つの道を使い蜀を攻めようとした時、その一つの、北から攻めるはずだった羌族は守備する馬超を恐れ、攻め込まなかったという話があり、史実より延命したことになっている。死去の場面は描かれないが、北伐の際、諸葛亮が馬超の墓を訪れる場面がある。
『山陽公載記』では、馬超は劉備からの待遇が厚いのをいいことに常々劉備の字を呼び捨てにしたため（目上には官職名で呼ぶのが礼儀であり、字で呼ぶのは完全に無礼）、関羽と張飛が怒り馬超を殺そうとしたという一文がある。しかし裴松之は、関羽は当時荊州の守りについており、益州に行った事は無い。よって馬超と関羽が共に劉備の傍にいた事実は考えられないとして、この記述の信憑性を強く否定しており「単純に考えても、いくら馬超でもそれはない」と擁護している。
成都市新都区に墓所が残る。道光17年に「漢故征西将軍馬公諱超字孟起之墓」との墓碑が立てられ、宣統元年には立派な社殿が建てられている。県級文物保護単位。
楊阜からは「馬超は父に背を向け君主に叛き、涼州の将を虐殺した」と批判された。姜叙の母からも同様の批判をされたため、立腹した馬超は姜叙の母を殺害した。張魯が娘を馬超と結婚させようとした時、張魯の臣下は「このように身内を愛せない者が、どうして他人を愛することなどできましょうか」と諫めている。孫盛は、馬超が父に背いたことを、家族よりも利益を優先した極端な残酷さであり、人質を取ることの無意味さを表す例として挙げている。『季漢輔臣賛』では、離反と連合を繰り返し、一族を滅ぼし軍勢を失い、道に背き徳に反したが、劉備に身を託したと評されている。陳寿は、馬超が武勇を恃んで一族を破滅させたことは残念であるが、窮地から抜け出て安泰に至ることができたのだから、まだましではないだろうかと評している。
残留の発端は、中国共産党軍（中原野戦軍）と対決していた閻錫山が内戦の本格化を見越し、日本人らの大規模残留を望んだことにある。閻は復員列車を止めるなどの妨害を行い、1万人規模の軍主力の残留を要求した。そして、復員輸送を円滑に進めるための捨て石的存在として、軍の一部が残留せねばならないとされた。これに日本軍の一部（当時山西省を担当していた澄田𧶛­四郎中将麾下の支那派遣軍第一軍将兵59000人）が応じた。また、城野宏や河本大作ら現地の関係者が同調し、結果、当時3万人いた民間人のうち約1万もの人数が残留に応じた。紆余曲折の末、在留日本人および日本兵を合計した約2600人（うち軍出身の現役組は約半数を占める）が戦闘員（特務団）として現地に残され閻錫山の軍隊に編入、終戦後も4年間の内戦を戦うこととなった。4年間のうちに約1600名は日本へ内地帰還できたが、残り約1000人のうち約550名が戦死、残りは人民解放軍により長きにわたる俘虜生活を強いられた。この残留では、A級戦犯としての追訴を免れると同時に日本軍兵力の温存を望む澄田と、共産軍と戦うために国民党軍の戦力の増強を目論んだ閻との間で不明朗な合意が結ばれ、現役日本兵のうち残留を希望しない者も正規の軍命により残留を余儀なくされたと主張して、一部の元残留日本兵が軍人恩給の支給を求めるという形で訴訟を起こしている。しかし、日本政府は残留兵を「志願兵」とみなして「現地除隊扱い」とし、原則として恩給などを補償しないという姿勢である。2005年には本件で最高裁判所に上告したが敗訴している。2006年公開のドキュメンタリー映画『蟻の兵隊』において、元残留兵の奥村和一が、山西省档案館（公文書館）において残留軍の総隊長訓と総隊部服務規定を提示している。総隊長訓は「総隊は皇国を復興し天業を恢弘するを本義とす」から始まり、残留軍が終戦後も旧日本軍の規律を維持していたことが窺える。この文書は裁判に提出済だったが、山西省人民検察院では、1949年に澄田が帰国する際に閻が書いた手紙を発見している。このことから当時、現地処理の際に中華民国側の閻の要請を受けた澄田が、部下を中国大陸に残す際に残留部隊に対し、事実と異なる嘘の駐留目的（中国共産軍との戦いのために一部の日本軍部隊を現地に残し中華民国軍の戦力に編入することを在地司令官の間で秘密裏に決められた）を伝えていた可能性がある。