1967年、ジューンおよびのちの夫ジョニーはデュエット『Jackson 』でカントリー・チャートで第2位を獲得した。第10回グラミー賞でカントリー・デュオ/グループ賞を受賞した。1970年の『If I Were a Carpenter 』で、まだ結婚する前の2人は第13回グラミー賞でカントリーデュオ/グループ賞を受賞した。1999年のアルバム『Press On 』がアメリカーナ・チャートで第15位を獲得し、第42回グラミー賞でトラディショナル・フォーク・アルバム賞を受賞した。2003年、亡くなった後に最後のアルバム『Wildwood Flower 』がリリースされた。第46回グラミー賞でトラディショナル・フォーク・アルバム賞を受賞した他、シングル『Keep on the Sunny Side 』で女性カントリー・ボーカル・パフォーマンス賞を受賞した。
2003年5月15日、心臓弁置換手術後の合併症によりテネシー州ナッシュビルで、35年連れ添った夫ジョニー・キャッシュを含む家族に見守られながら73歳で亡くなった。ジューンの葬式で継子のロザンヌ・キャッシュは「企業に妻があるならば、ジューンは最高経営責任者であるだろう。彼女にとって重要な役割だった」と語った。ジューンが亡くなった4ヶ月後、ジョニーが亡くなり、さらにその1ヶ月後に娘ロジー・ニックス・アダムスが亡くなった。ジョニー、ジューン、ロジーはテネシー州ヘンダーソンヴィルの邸宅近くのヘンダーソンビル・メモリー・ガーデンズに埋葬された。
3回結婚し、それぞれに1人ずつ子供がいる。子供3人共カントリー界で活躍。1952年7月9日、ホンキートンク歌手カール・スミスと結婚し、1956年に離婚した。2人は共に『Time's A-Wastin 』を作曲した。娘レベッカ・カーリン・スミスをもうけ、カーリン・カーターの名でカントリー・ミュージシャンとして活動している。1957年11月11日、元フットボール選手、警察官、レーサーのエドウィン・ニックスと結婚した。1958年7月13日、娘ロザンナ・リーをもうけ、ロジー・ニックス・アダムスの名でカントリー/ロック歌手として活動していた。2003年10月24日、ロジー45歳の時、一酸化炭素中毒により亡くなった。ロジーとミュージシャンのD・キャンベルがツアー・バスに作り替えられたスクール・バスでコンサート・ツアーに出ていた。暖房としていくつかのプロパン・ヒーターが使用されており、検死によると血中一酸化炭素濃度が79%にまで達していた。何年間もジューンおよびカーター・ファミリーはジョニー・キャッシュと共に演奏していた。1968年、カナダのオンタリオ州ロンドンにあるロンドン・アイス・ハウスでライヴ中、ジョニーはジューンにプロポーズした。3月1日、ケンタッキー州フランクリンで結婚し、2003年5月にジューンが亡くなるまで婚姻は続き、その4ヶ月後にジョニーも亡くなった。2人の息子ジョン・カーター・キャッシュはミュージシャン、ソングライター、プロデューサーとして活動している。1970年、ジューンの縁戚でのちのアメリカ合衆国大統領となるジミー・カーターはジューンおよびジョニーと改めて親しくなり、生涯を通して友情が続いた。1977年6月のスピーチでジミーはジューンが父方の縁戚であると語った。長年ジューンはSOS子供の村の支援者であった。1974年、ジューンおよびジョニーはジャマイカのバレット・タウンの別荘近くにこの村の設立資金を寄付し、夫妻はたびたび訪問して村の子供たちのためにギター演奏や歌唱を行なった。
川端文学の一つの主題である「生命（いのち）への讃仰」、「処女」について三島由紀夫は、川端にとり「生命」＝「官能」であるとし、以下のように論考している。氏のエロティシズムは、氏自身の官能の発露といふよりは、官能の本体つまり生命に対する、永遠に論理的帰結を辿らぬ、不断の接触、あるひは接触の試みと云つたはうが近い。それが真の意味のエロティシズムなのは、対象すなはち生命が、永遠に触れられないといふメカニズムにあり、氏が好んで処女を描くのは、処女にとどまる限り永遠に不可触であるが、犯されたときはすでに処女ではない、といふ処女独特のメカニズムに対する興味だと思はれる。 — 三島由紀夫「永遠の旅人――川端康成氏の人と作品」川嶋至は、川端の作品の主人公の眼を通して描かれる女性について、「彼に女を感じさせる瞬間にだけ光彩を放つ存在」であり、「人間としての実体を持たない」とし、作中に出てくる「愛」という言葉が、読者に戸惑いを感じさせるのは、名陶がどんなに美しくても、「厳然として対話のないもの」として人間に対するのと同様に、女も、「精神的な交流のない」あるいは、「交流を拒絶された存在」として描かれているからだと考察し、「川端氏ほど作品の上で、女性を冷徹なものとしてつき放して描く作家はいないと言っても、過言ではないであろう。まさしく作家としての氏は、女性讃美者ではなく、女体嗜好者なのである」と評している。川端にとっては、犬も女も同列の生態であることを指摘している三島は、川端のその非情の「地獄」を『禽獣』で見せたことについて以下のように解説している。女はイヌのやうな顔をし、イヌは女のやうな顔をしてゐる。作家が自分のうちに発見した地獄が語られたのだ。かういふ発見は、作家の一生のうちにも、二度とこんなみづみづしさと新鮮さで、語られる機会はないはずである。以後、川端氏は、禽獣の生態のやうな無道徳のうちに、たえず盲目の生命力を探究する作家になる。いひかへれば、極度の道徳的無力感のうちにしか、生命力の源泉を見出すことのできぬ悲劇的作家になる。これは深く日本的な主題であつて、氏のあらゆる作品の思想は、この主題のヴァリエーションだと極言してもいい。 — 三島由紀夫「川端康成ベスト・スリー――『山の音』『反橋連作』『禽獣』」羽鳥徹哉は、『夏の靴』の少女、『日本人アンナ』のアンナ、『浅草紅団』の弓子、『雪国』の駒子、『古都』の千重子など、川端文学の中で見られる「不孝で孤独な少女」、「常識的には無意味な反社会的な行動」により、崩れ落ちそうな自分を支えているような少女たちは、川端文学の具象化であり、「苛酷で、無情な運命に決して負けず、それと対決し、それに挑戦して生きようとする、川端の精神を託された美しい女の姿」であるとしている。