ピットにプルトニウム240が含まれると崩壊熱や放出中性子が増え、核分裂効率が下がり、過早爆発や不完全核爆発を起こす危険性が高まる。このため、兵器級プルトニウムではプルトニウム240濃度は7%以下に制限されている。 スーパーグレードでは4%以下とされ、アメリカ海軍の水上艦や潜水艦に搭載される核兵器など、乗員の被爆が懸念される用途で用いられた。プルトニウム241は兵器級プルトニウムに0.5%ほど含まれている。これは、アメリシウム241に壊変する際に強いガンマ線を放射する。年月とともにプルトニウム中のアメリシウムは増えていき、ガンマ線の線量が増えることで作業者に危険を及ぼす。このため、アメリシウムは新たに生産された、あるいは再処理で得られたプルトニウムから除去しなければならない。。しかし、1967年にロッキーフラッツ工場ではコスト削減と生産効率向上のためアメリシウム分離を行わなくなり、ラインにはアメリシウムを含んだ古いピットが最大で80%も流れていた。 このため、作業者のガンマ線被爆量は増えることになった。
ウランもプルトニウムも非常に腐食されやすい。 UGM-27 ポラリスに搭載された W47 核弾頭 は定期点検で核物質に腐食が見つかって交換が必要になることがあった。後の W58 核弾頭 でも同じような腐食の問題が起きた。 W45 核弾頭はその形状から腐食を起こしやすかった。また、グリーングラスのピットも腐食しやすかった。ピットの放射性によって周囲の物質が腐食することもあった。プルトニウムは湿度に敏感で、湿った空気中では腐食の進行は200倍も早まる。特に水素による腐食は破壊的で、水素の存在により腐食速度は13桁（10兆倍）も加速される。水素は空気中の湿度や周囲の有機物（プラスチックなど）の放射線分解によって生じるため、これらの要素はプルトニウムの保管において大きな問題となった。酸化によって体積が膨張することで格納容器が破裂したり、ピットが変形する恐れもあった。事故あるいは設計上の都合によってピットが重水素や三重水素に晒されると、水素化腐食が起こってピットの表面に自然発火性の水素化プルトニウムの層ができる。これは空気中の酸素によって加速される.。また、重水素と三重水素は多くの材料に水素脆化を引き起こす。保管条件が適切でないと腐食が起きやすい。パンテックス保管所で使われていた AL-R8 コンテナは腐食を防ぐどころか自己腐食性があった。ピット自身の崩壊熱（ピットが 150 ℃にも達することがあった）も懸念材料で、多数のピットを保管する施設では積極的に冷却する必要があった。湿度管理も問題となった。ベリリウム外殻は清掃に使う溶剤によって腐食することがある。研究の結果、 トリクロロエチレン (TCE) はベリリウムを腐食させ、トリクロロエタン (TCA) は腐食させないことが分かった。ベリリウム外殻を持つピットの腐食は、パンテックス保管施設での保管期間が延びるにつれ大きな懸案となっていった。
旧ブラジル領シスプラチナ州は1820年代のシスプラティーナ戦争以降、ウルグアイ東方共和国として独立した。しかし、ウルグアイはすぐにフアン・アントニオ・ラバリェハ率いるブランコ党とフルクトゥオソ・リベーラ率いるコロラド党の間の内戦に巻き込まれた。ラバリェハはすぐに近隣のブエノスアイレスを治めるロサスからの軍事援助と財政援助に期待できることを発見した。1832年より、ラバリェハはリオグランデ・ド・スル州出身の軍人ベント・ゴンサウヴェス・ダ・シウヴァからの援助を受けるようになった。ゴンサウヴェスは1835年にロサスに唆されてブラジル政府に対し反乱した。その最終目標はアルゼンチンにリオグランデ・ド・スル州の併合を許すことだった。ラバリェハとゴンサウヴェスはウルグアイで軍事行動を起こし、住民に暴力と略奪をはたらいた。しかし、ゴンサウヴェスはロサスとラバリェハを裏切り、リベーラに味方した。2人は続いてウルグアイを侵攻、首都モンテビデオを除くウルグアイの大半を占領した。当時のウルグアイ大統領でブランコ党に属したマヌエル・オリベは辞任してアルゼンチンに逃亡した。ロサスはウルグアイをアルゼンチンの属国に戻し、ゴンサウヴェスに復讐することを決めた。これにより、度重なる介入が行われた。1839年、ラバリェハ、オリベ、フスト・ホセ・デ・ウルキーサ（エントレ・リオス州知事）率いる軍勢がリベーラに撃退された。これ以降、ラバリェハは内戦から身を引いた。1845年、ロサスは再びオリベとウルキーサ率いるアルゼンチンとウルグアイの軍勢を派遣、今度はリベーラの軍勢を撃破して、残党を殺戮した。リベーラは逃亡に成功した数少ない人々の1人であり、リオデジャネイロに逃亡した。コロラド党の残党がモンテビデオに立てこもる中、オリベの軍勢はモンテビデオを包囲した。ウルグアイにおける暴力がエスカレートし、オリベの軍勢がウルグアイ人17,000人、アルゼンチン15,000人を殺害した。オリベがウルグアイの大半への支配を確保したことで、ブラジル南部への侵攻が可能になった。彼の軍勢は進軍しつつ牛を盗んだり、農場を略奪したり、政敵を粛清したりした。ブラジルの農場188か所以上が襲撃され、牛814,000頭と馬16,950頭が盗まれた。現地のブラジル人は独自に報復し、ウルグアイに襲撃した。これは「カリフォルニアス」（Califórnias）と呼ばれるになったが、カリフォルニア州がメキシコに反乱して短期間独立し、やがてアメリカ合衆国に併合されるときにおきた暴力に由来する呼称だった。ロサスがブランコ党支持の姿勢を崩さなかったため、ウルグアイの多くの地域が無政府状態に陥った。これにより貿易が脅かされるようになったため、イギリスとフランスがアルゼンチンに宣戦布告してラプラタ川を封鎖するに至った。ブエノスアイレスは英仏連合艦隊の度重なる攻撃を受けたが、アルゼンチンの抵抗が奏功したため1849年にアラナ・サザン条約で講和した。