即位後、ユーヌスは1460年代に成立したカザフ・ハン国とティムール朝との友好関係を保ち、カザフと同盟してウズベクと敵対した。1468年にシャイフ・ハイダルに率いられたウズベクがモグーリスタンに侵入するが、モグーリスタン軍はシャイフ・ハイダルを戦死させ、ムハンマド・シャイバーニー・ハーンの即位に至るまでの間ウズベクの勢力は弱体化することになる。同1468年にティムール朝のアブー・サイードが白羊朝との戦いで敗死した後、アブー・サイードの息子たちが王位を請求して各地で割拠したため、モグーリスタンとティムール朝の間で結ばれた協定は複雑なものになる。ユーヌスは伝統的な遊牧生活を捨てて定住生活を採る政策を進めるが、アミールたちは彼の方針に反対し、反対勢力の一人であるシャイフ・ジャマールはユーヌスを拘束して数年の間モグーリスタンの実権を握った。ユーヌスの最初の妻であるイサン・ダウラト・ベギムはジャマールの部下ホージャ・カランに与えられたが、ホージャ・カランはイサン・ダウラト・ベギムの邸宅を訪れた際にイサン・ダウラト・ベギムの策略によって暗殺される。この事件の直後にジャマールはモグーリスタンのアミールによって暗殺され、1472年にユーヌスは遊牧生活を営むことを条件に反対派から解放された。同年にウイグルスタンのケベク・スルタンが部下の手によって殺害されると、ユーヌスは彼の部下がウイグルスタンを統治することを認める。シャイフ・ジャマールの死後、モグーリスタン・ハン国とティムール朝との婚姻外交が積極的に行われた。ユーヌスはティムール朝のサマルカンド政権の君主スルタン・アフマドとフェルガナを支配するアフマドの弟ウマル・シャイフがタシュケントとサイラムを巡る争いに介入し、1484年に両者の仲介者として振る舞い、モグーリスタンのタシュケントとサイラムの領有を認めさせた。タシュケントで定住生活を営もうと考えるユーヌスにモグーリスタンのアミールの多くは反対し、彼らの多くはユーヌスの次子アフマド・アラクの元に移動した。治世の後半にはヤルカンドを支配するドグラト部の領主アブー・バクルが半ば独立勢力と化し、アブー・バクルの叔父であるムハンマド・ハイダルはユーヌスに援助を求めたが、1479年/80年にユーヌスとムハンマドはヤルカンド近郊でアブー・バクルに敗れた。1487年にユーヌスはタシュケントで没した。死後、モグーリスタンの東部はアフマドが支配し、タシュケントはユーヌスの長子マフムードが支配した。
3月20日、グレナディアーは6回目の哨戒でマラッカ海峡方面に向かった。マレー半島西岸及びタイの沿岸を偵察し、グレナディアーは4月6日、プーケット島沖で貨物船を発見し攻撃し、うち1隻に命中弾を与えて海岸に座礁させたと判断した。4月20日の夜にも2隻の艦影を発見、攻撃のため接近するが途中で見失い、翌21日朝再び発見した。グレナディアーは攻撃準備にとりかかったが、この時、付近を船団護衛中の特設砲艦江祥丸（名村汽船、1,365トン）がグレナディアーを発見した。また、第九三六航空隊の艦上攻撃機もグレナディアーを発見し急接近してきた。江祥丸はグレナディアーを追跡したが見失ない、艦上攻撃機はグレナディアーに250キロ対潜爆弾を投下した。グレナディアーも急速潜航を行い、グレナディアーのフィッツジェラルド艦長は「ここは120から130フィートの距離があるので安全だ」と説明したが、ちょうどそのとき爆弾が炸裂。グレナディアーは振動して15度から20度傾いた。動力と照明は完全に停止し、82メートルの海底に沈座した。操舵室では火災が発生した一方、乗員は必死に修理を試みた。海底で13時間が過ぎ、何名かの乗組員が倒れるに及んで浮上を決意。21日の夕刻にグレナディアーは浮上、どうにか修理は一応成功したが推進システムの損害は完全には回復不能であった。艦の放棄とジャングルへの脱出ができるようにするため、グレナディアーのフィッツジェラルド艦長は艦に帆を付けて海岸に近づこうとした。しかしながら夜通し行われた作業は、結果論としては無意味であった。翌4月22日夜明け、グレナディアーの疲れ果てた乗組員は2隻の日本軍艦艇が接近するのを発見した。9時5分、第九三六航空隊の1機がグレナディアーを発見した。フィッツジェラルド艦長は「動力無しで280フィートの水中に潜行停止するのは望ましくない」として、乗組員は艦を放棄するため機密文書を焼却し始めた。日本軍機はグレナディアーへの攻撃を続けたが、グレナディアーも機銃で応戦し日本軍機が二度目の通過をした際に命中弾を与えた。被弾した日本軍機は離脱したが、入れ替わるように特設捕獲網艇長江丸（三光汽船。889トン）が接近、瀕死のグレナディアーに対して砲撃を開始した。ここに至ってグレナディアーのフィッツジェラルド艦長は観念して白旗を掲揚して降伏し、乗組員は艦を放棄するため全ての排水孔を開放した。艦は沈み、8名の士官と68名の乗組員は全て日本軍の捕虜となった。なお、4月6日に攻撃した貨物船と、最後の戦いで交戦した日本軍機はそれぞれ「撃沈」および「撃墜」と認定された。彼らは4月23日にペナンへ連行され、詰問、殴打された。彼らは別々の収容所に収監され、マレー半島に沿って移動された後、海軍徴傭船浅間丸（日本郵船、16,975トン）などで最終的に日本本土へ連行され、大船収容所や福岡、善通寺などの収容所に放り込まれた他、一部は足尾銅山での使役にこき使われた。グレナディアーの最後に関する情報は、1943年11月27日にオーストラリアに到達した。非人道的な扱いにもかかわらず、グレナディアーの乗組員は福岡の収容所で獄死した4名を除いた、フィッツジェラルド艦長を含む残り全員が2年間の収容所生活を生き残り、終戦後の1945年9月4日に解放されて9月12日にグアムに到着した。グレナディアーは第二次世界大戦の戦功で4個の従軍星章を受章した。また、グレナディアーを降伏させた長江丸は1944年2月13日、ペナン島ムカ岬沖合42km地点でイギリス海軍の潜水艦ストーンヘンジの雷撃で撃沈された。グレナディアーの記念碑がニューヨーク州バッファローのバッファロー・エリー郡ネーバル・アンド・ミリタリーパークの一角に展示されている。