1973年8月『伝統医学の諸問題』（共著）『十二経絡図譜』（共著）1977年1月 『弁釈鍼道秘訣集』藤本蓮風著 （自然社・現在の緑書房）1978年4月『針灸舌診アトラス』（共著、自然社）1984年3月 『図解／簡明鍼灸脈診法』（自然社）1990年4月 『鍼灸医学における実践から理論へ パ－ト1』（たにぐち書店）1993年10月 『鍼灸医学における実践から理論へ パ－ト２』（たにぐち書店）『アレルギーは鍼で治せ』藤本蓮風著（双葉社）2002年9月 『改訂増補版　胃の気の脈診』（森ノ宮医療学園出版部）2003年6月 『臓腑経絡学』（藤本蓮風監修、藤本蓮風、奥村裕一、油谷真空主編、森ノ宮医療学園出版部）2004年1月 『鍼灸医学における実践から理論へ　パート3』（たにぐち書店）2007年12月 『藤本蓮風　経穴解説』（メディカルユーコン）『鍼灸医学における実践から理論へ パート４』（たにぐち書店）2008年8月31日 『アレルギーは鍼で治す！』（森ノ宮医療学園出版部）2009年6月1日 『鍼の力～知って得する東洋医学の知恵～』（緑書房）2009年11月 『鍼1本で病気がよくなる』（PHP研究所）2010年3月10日 『東洋医学の宇宙』（緑書房）2011年6月28日 『鍼狂人の独り言』（メディカルユーコン）2012年7月15日 『数倍生きる』（探究社）2012年8月1日 『鍼灸臨床能力 北辰会方式 【理論篇】』（藤本蓮風 監修 会内発）2012年8月20日 『体表観察学』（緑書房）2013年6月 『経穴解説』増補改訂新装版（メディカルユーコン）2014年8月 『臨床というもの』（たにぐち書店）2019年9月 『筆跡にみる壁』（たにぐち書店）　　　　　『舌鑑弁正 訳釈』（共著、たにぐち書店）
皇帝ハインリヒ4世時代、クレモナは皇帝と司教が要請した過酷な税の支払いを拒否した。言い伝えによれば、偉大なゴンファロニエーレ（gonfaloniere、市長）ジョヴァンニ・バルデシオは皇帝自身と決闘したという。ハインリヒ4世は馬から落ちて負け、市はその年の税である3kgもの金製のボールを免除された。金のボールは、ジョヴァンニの恋人ベルタに、彼女の持参金として与えられた。クレモナが自由になったという最初の歴史的な知らせは1093年以降であり、反皇帝派を率いるカノッサ女伯マティルデの元へ、ローディ、ミラノ、ピアチェンツァ同様に加わった。対立はハインリヒ4世の敗北と、1098年の有名な教皇ウルバヌス2世に対するカノッサの屈辱で終わった。クレモナは近郊の都市クレマ周囲の土地を自領インスラ・フルケリア（Insula Fulcheria）として獲得した。この時から、新たなコムーネが領土拡大のために近郊都市へ戦争を仕掛けるようになった。1107年、クレモナはトルトーナを征服したが、4年後に軍はブレッサノーロ近くで大敗北を喫した。多くの北イタリア諸都市のように、市民は2つの対立する派に二分された（教皇派と皇帝派）。ゲルフ（教皇派）は新たに獲得した都市で優勢であり、ギベリン（皇帝派）は従来の都市で優勢であった。2つの派は、ゲルフが二つ目のコムーネ宮殿を建てるほど和解ができなかった（現在もあるパラッツォ・チッタノーヴァがそれである。新しい都市宮殿の意味）。フリードリヒ1世が自身の宗主権を主張しようとイタリアへ押しかけた時、クレモナは、ミラノの支援を受けて反乱を起こしたクレマに対し、皇帝の支持を得る目的で皇帝側についた。その後の勝利と皇帝側についた姿勢が、1154年に市独自の硬貨を鋳造する権利を持つに至った。1162年、皇帝とクレモナ勢力はミラノへ猛攻撃を加え、破壊した。しかし1167年に市は態勢を変え、ロンバルディア同盟に加わった。クレモナ軍は皇帝軍の一翼を担っていたのであり、1176年5月29日、レニャーノの戦いでフリードリヒ1世を敗退させた。しかし、ロンバルディア同盟はこの勝利の後長く続かなかった。1213年、カステッレオーネで、クレモナ軍はミラノ・ローディ・クレマ・ノヴァーラ・コモ・ブレーシャの同盟に敗退した。1232年、クレモナは皇帝フリードリヒ2世と同盟を組んだ。皇帝は再び北イタリアの宗主国たらんと乗り出し始めようとしていた。コルテヌオーヴァの戦いでは、クレモナ軍は勝者側となった。そのためにフリードリヒ2世はクレモナでしばしば宮廷を開いたのである。しかしパルマの戦いで、ギベリン側は手痛い敗北を喫し、2000人を越えるクレモナ人が捕虜となった。数年後、クレモナはパルマ軍を敗退させたことによって仇討ちをした。軍はウンベルト・パッラヴィチーノが率いており、彼はパルマのカッロッチオ（戦闘馬車、チャリオット）を掴まえ、敵に恥をかかせる証としてその後数世紀に渡って敵のズボンを大聖堂から吊し続けた。1301年、トルバドゥールのルケット・ガッティルシオがクレモナのポデスタ（en、最高権力者）となった。この時代のクレモナは繁栄し、人口は80,000人を突破し、2001年時点の人口69,000人よりも多かった。