会員数は2008年に約100名、2010年に約120名で微増傾向にあるという。現在、一般からの入会の申請は受け付けず、会員2名の推薦があった場合のみ入会が認められている。会の規約はこの入会の規定と会費を納めることだけであり、会員の思想や信条は問わない。そのため、会員は必ずしも超常現象否定派や疑似科学批判者だけというわけではなく、作家や落語家、大学の教員はもちろん、宗教家や占い師、ヒーラーや新しい歴史教科書をつくる会会員などもおり、幅広い。もっとも、疑似科学と見られがちな分野の者がと学会会員として活動するのはやはり精神的に辛く、それゆえと学会会員としての活動を控える事もある。男女比率は男性が圧倒的に多く、女性会員の割合は2004年時点で2割に満たない。2007年の時点で、と学会には若い会員があまり入会せず、年代は40歳代が中心になっている。若い会員があまり入会しない理由について、元会員で作家の岡田斗司夫は、「と学会での発表のために本を読んで面白いものを見つけることを継続して行なうのが若い年代には難しいからではないか」と解釈した。
当初はパソコン通信ニフティサーブの仲間内の掲示板であるパティオで情報交換していたが、インターネット上での情報交換に移行すると、年に4回程度の会員による例会（非公開）が開かれ、その成果を書籍あるいは同人誌、日本トンデモ本大賞の公開講義の形で発表している。商業出版された書籍の印税に関しては、執筆者の担当したページ数に比例して支払額が振り分けられている。1992年に日本SF大会の企画の一つとして行なわれた日本トンデモ本大賞を引き継ぐ形で発足。以後雑誌『宝島30』の「今月のトンデモ本大賞」を皮切りに様々な媒体を通じて活動を行なっている。雑誌『宝島30』では創刊号の1993年6月号から休刊号になる1996年6月号まで連載。途中で「今月のトンデモ本」にタイトルを変更。執筆は山本弘と藤倉珊が交代で担当した。『宝島30』の連載の好評を受けて、この連載を基に同人誌の一部の内容を加えて大幅加筆して、1995年に出版した初の単行本『トンデモ本の世界』は、その数か月前に起こったオウム真理教事件で疑似科学やカルト宗教の異様さに関心が集まった中での発売となり、10万部のベストセラーとなって「と学会」の名を一躍世間に知らしめた。2003年には、日本トンデモ本大賞の発表を初めてSF大会から独立したイベントとして開催した。2017年9月に目黒雅叙園にて25周年記念イベントを行った。
「と学会」が正式名称であり、「トンデモ本学会」の略ではない。「と学会」で取り上げられた者（近年では副島隆彦など）、「と学会」に否定的な立場で語るものだけではなく、一般のメディアや、かつては会員の一部でもこの点を間違えていた(いる)事がある。第1回トンデモ本大賞終了後に会の設立を決定後、打ち上げの席での山本弘と藤倉珊の会話から名称が決定した。自分たちはトンデモないものを「と」と総称していると藤倉から聞き、語感が間抜けでいいとして山本が「と学会」と名付けた。
1863年6月、ロバート・E・リーはその北バージニア軍を、シェナンドー渓谷を抜けて北に動かし、ペンシルベニア州に向かわせた。J・E・B・スチュアートの指揮する騎兵隊の一部は、北軍ポトマック軍の前を横切って東に動いた。メリーランド州東部における一連の襲撃で捕虜や物資を捕まえ、さらに北軍の通信線や電信線を妨害した。しかし、スチュアートはリー軍の前進を遮蔽し北軍の動きに関して情報を提供するために効果的な位置にはいなかった。スチュアートがリー軍本隊と合流しようと北に向かうと、北軍騎兵隊の指揮官アルフレッド・プレソントン少将がペンシルベニア州のスチュアートの西に向かった。その師団には幅広く散開して南軍に対する監視を怠らないよう命令していた。北軍ジャドソン・キルパトリック准将の師団は、北軍の右翼にいた。その部隊の大半が6月30日早朝にハノーバーを通過し、短時間は休息のために停止し、歓呼する町民の歓迎を受けていた。その町は3日前に南軍のエリジャ・V・ホワイト中佐の騎兵隊から襲撃を受けていた。この騎兵隊はヨーク郡を占領していたジュバル・アーリー少将の師団に付設されていた。ホワイトのバージニア兵とメリーランド兵は近くのゲティスバーグから鉄道伝いにハノーバーに行き、町民から馬、食料、物資、衣類、靴その他望みのものを奪い、南軍政府の発行する価値の無い紙幣や為替手形を支払うことが多かった。ホワイトの襲撃者は地域の電信線を遮断し、外界との通信を妨害し、その後に近くのハノーバージャンクションの鉄道駅を襲撃した。キルパトリックの部隊が思いがけなく到着したことで、ハノーバー住民にとっては嬉しい驚きとなり、北軍兵を食料や飲み物で温かく迎えた。キルパトリックの部隊の大半は再度馬に乗り、町を抜けて北の近くにあるピジョンヒルズを通り、アボッツタウンに向かった。ハノーバーの南と西の道路を警戒するために、小さな後衛部隊を残した。その間にスチュアートはメリーランド州シュライバーズコーナーの宿舎を離れ、メイソン・ディクソン線を越えて北のペンシルベニア州に入った。その目的地であるリトルズタウン近くで北軍騎兵隊が視認されたと聞き、方向を隣接するヨーク郡のハノーバーに向けた。その進行は、メリーランド州ロックビル近くで捕獲していた125両以上の物資荷車の厄介な列があったためにかなり緩りだった。さらに、6月29日にはメリーランド州ウェストミンスターでデラウェア騎兵隊と小競り合いを行って、さらに遅れていた。