1309年、ハルジー朝のアラー・ウッディーン・ハルジーによって名将マリク・カーフールがデカン地方に遣わされ、1310年（同1309年とも）に首都ワランガルが陥落させられた。だが、プラターパルドラ2世は貢納を差し出してカーフールと和議を結び、毎年の貢納を約束した。その後、プラターパルドラ2世は南方に転戦し、ホイサラ朝とパーンディヤ朝の軍勢を破り、北はゴーダヴァリー川から南はカーヴェーリ川下流のティルチラーパッリまで勢力下に収める勢いであった。しかし、これはハルジー朝がたまたま南インドを直轄支配しないという条件下のかりそめの繁栄にすぎなかった。1320年、デリー・スルターン朝では、ハルジー朝に代わってギヤースッディーン・トゥグルクがスルターンとなりトゥグルク朝が興ると、1321年にプラターパルドラ2世は貢納を停止した。そのため、1322年に南インドの直轄領化を目指して息子ウルグ・ハーンが遣わして攻撃したが、プラターパルドラ2世はこれを撃退した。その後、翌1323年にウルグ・ハーンの軍勢が再び派遣され、デリーの軍勢にワランガルは陥落させられ、カーカティーヤ朝の版図は併合された。プラターパルドラ2世は捕えられ、デリーに送還されたが、その途上で死亡し、カーカティーヤ朝は滅んだ。のち、1336年に成立したヴィジャヤナガル王国の創始者、ハリハラとブッカはこの王朝に仕えていたとされる。
プローラ2世の2人の息子プラターパルドラ1世とその弟マハーデーヴァは、ヤーダヴァ朝との戦争で戦死し、マハーデーヴァの息子ガナパティ・デーヴァが捕虜になるという屈辱を味わった。のちガナパティ・デーヴァは許されて帰国して、即位し王となると、東方カリンガと南方の地方勢力を服従させて勢力を回復した。チョーラ朝の版図を草刈り場として蚕食し、カーンチープラムまで席巻した。これにより、カーカティーヤ朝はホイサラ朝、ヤーダヴァ朝、パーンディヤ朝と争うこととなったが、ガナパティ・デーヴァはその治世において、シヴァ派を保護してその布教を援助した。一方、新首都ワランガルを築き、海港モートゥパッリでの海外貿易の振興に努めることによって国力の増強を図った。続く娘のルドラマ・デーヴィー（ルドラーンバー）の治世はヤーダヴァ朝の侵入があり、封臣の反乱も相まって、南方における領土を失った。だが、貿易振興策で経済的に繁栄し、カーカティーヤ朝の海港モートゥパッリを訪れたマルコ・ポーロは女王を名君とたたえ、善政とその繁栄ぶりをほめたたえる記録を残している。ルドラマ・デーヴィーの孫プラターパルドラ2世のとき、王国の領土の4分の一を77地区に分けてナーヤカと呼ばれる領主に統治させ、行政と防衛を委ねた。これはのちにヴィジャヤナガル王国のナーヤカ制に大きく影響したという。
11世紀、ベータ1世の名が初期の王として歴史に現れた。ベータ1世の息子プローラ1世のとき、その勢力を拡大した。後期チャールキヤ朝に仕える諸侯（封臣）となり、主君タイラ3世からハナムコンダの地を与えられた。だが、プローラ1世の孫プローラ2世は主君ヴィクラマーディティヤ6世の没後に反乱を起こし、ハナムコンダに攻めてきたタイラ3世を捕虜にするなどし、独立を果たした。
慶長5年（1600年）の関ヶ原の戦いに従軍した。岐阜城を攻略し、石田三成の追撃戦では河渡で交戦し、石田軍の殿・杉江勘兵衛を討った。主君・吉政が関ヶ原の戦功で筑後国柳川城32万石の大名になると、猫尾城代を務めた。
第5王朝時代に入ると上位官職の王族独占は終焉を迎え、最上位たる宰相を含めた地位に非王族の有力者が進出した。この人事的な変化とクフ王以後のピラミッドの縮小傾向を重ねて、王権が弱体化していったという説があるが、そもそも行政組織の体系的な整備と拡大が進行したことで、もはや王族から必要な人員を確保するのは非現実的であり、王族外の有能な人材の抜擢は必然的な流れであった。司法、農政、書記、財政といった主要な行政部門が整備されるのもこの時期である。一方で宰相が複数置かれるようになり、1人の役人に権力が集中することを防止しようとした形跡も見られる。地方行政においては「上エジプト監督官（imy-r Šm3w）」などの官職が登場するようになり、また第5王朝時代頃から、州侯が管轄するノモスに居住し、地位を世襲する動きが見られるようになった。こうした州侯は次第に王墓の周辺ではなく自らの任地に墓を造営するようになった。しかしこうして複雑化、細分化する行政組織に比して税収の増加は次第に頭打ちとなっていた。行政組織の複雑化はとりもなおさず役人の増加に直結する。役人に対しては王領地の租借や葬祭用の供物の提供などいくつかの方法で給与が与えられたが、人数の増加に伴い、土地であれ葬祭用の供物であれ、一人当たりに支払われる報酬は減少し、役人の生活状態は悪化した。第5王朝の末期から第6王朝にかけて、おそらく税収の増加を目指した行政改革が繰り返し行われているが十分な効果はあがらなかったようである。このため、ピラミッド都市管理者などへ各地の役人を任じたり、ピラミッド都市等の付属領地を褒賞として与える方策が採られるようになった。これによってピラミッド複合体を通じて供給される供物などが中央政府の役人や州侯等に開放される道が開けた。しかし、有力な州侯や役人はこうした官職をいくつも兼任し、次第に王を上回る勢力を持つものも形成されていった。そして第6王朝の王ペピ2世の極めて長期にわたる在位の間に、王の指導力や地方に対する統制力は著しく弱体化することになる。