開基は弘法大師空海。遣唐使の留学僧として渡唐の途中、留学の目的達成を肥前国（現在の佐賀県武雄市山内町）黒髪山大権現に祈願、806年（大同元年）の帰国後に満願成就を報告した際に自ら爪で不動像を刻し、弟子快護に託して山内に庵を作らせたのが寺の起源と伝わる。1645年（正保2年）、当時の住職尊覚が京都大覚寺門主の尊性法親王に招かれ書講を行い、その功績により大覚寺内塔頭「大智院」を下賜された。以来、当寺住職は「院家」との敬称で呼ばれるようになる。「和漢三才絵図」等にもその名が記載されている。往時は約80もの末寺を抱える肥前の大勢力であった。1878年（明治11年）、大火により堂宇の大半を焼失した。再建するにあたり、当時佐世保鎮守府が開設され、人口が急増しつつあった佐世保への移転を計画。1908年（明治41年）になり、現在地へ移転した。戦時中から戦後にかけて一時衰退したが世状の安定とともに寺運も回復し、2006年（平成18年）には開創1200年を迎えて記念法要を行った。※「別格本山黒髪山大智院開創1195年記念」冊子において、三本尊・仏像類・掛け軸・古文書などが公開されている。中でも無銘の梵鐘(十六弁菊紋入り)・京都真言宗大覚寺宮下賜の「院家兼帯之令旨」など歴史的価値ある品も確認される。
佐世保市の中心街に近い戸尾町の高台にある。毎年1月最終日曜日には節分大祭があり、佐世保市で唯一恒例行事として「火わたり」が行われる。古くは武雄鍋島藩主の御祈願所として栄えた。また京都旧嵯峨御所大覚寺宮との関わり深く、歴史由緒に富んだ古寺であるが、肥前地方が佐賀県と長崎県に行政区分分断されたため、歴史研究者からは未研究の領域多しとの評がある。
生態学者であるStephen Hubbellによって、群集における種の個体数と多様性はおもにランダム分散、種形成、絶滅によって決定されると提唱されている。これは、生物多様性における統合中立説（UNTB：Unified Neutral Theory of Biodiversity）として知られている。
アセンブリー・ルールの検証は、しばしば種のランダムな集合体の特性と実験データを比較するためにコンピュータシミュレーションを用いた複雑なプロセスとなる。このルールは、一般的に個別の事例に基づいて検証する必要がある仮説であるとみなされており、受け入れられた結論ではない。
島嶼部で同所的に生息する種は特殊化しているため、ランダムな集団よりもニッチ重苦が少なくなるはずである、というルールがテストされた。このケースでは、場はカリフォルニアの近くの37の島において、トカゲのニッチ重複を測定し、それらのデータをコンピュータが生成したランダムな種の集団と比較した。このケースでは、37の島のうち30の島において、ランダム集団よりも低いニッチ重複であったこと、そして競争のいくつかが種間競争によるものであることが分かった。
第一の法則は「禁じられた種の組み合わせ（Forbidden species combinations）」である。ダイアモンドの仮説は、島嶼における種組成を構築する主な力は、ランダムな移入ではなく競争であるというものであった。例えば、コクタンミツスイ(Myzomela pammelaena) はクロタイヨウチョウ(Leptocoma sericea)を排除する。コクタンミツスイは調査が行なわれたビスマルク諸島の41の島のうち23の島に生息するが、クロタイヨウチョウの生息している14のどの島にも生息していなかった。この2種の鳥類は同じくらいの体サイズで、両種ともに曲がった嘴をもち、花蜜食性である。ダイアモンドは競争が彼らの分布に影響したのだと主張した。
ダメージ（Damage, Dmg, 基本ダメージ, Basic Damage）は、体力によって決まる。体力は素手や白兵武器で与えるダメージに影響する。体力から導出されるダメージには、「突きダメージ」（Thrusting Damage）と「振りダメージ」（Swinging Damage）の2種類が存在する（「突き」（Thrust）や「突」（Thr）、「振り」(Swing)や「振」（sw）と略されることがある）。「突き」はパンチ、キック、噛み付き、槍、レイピア、弓矢タイプの突く武器の基本ダメージ （Basic Damage）になる。「振り」は斧、棍棒、剣、ハルバードのように振る武器の基本ダメージになる。「突き」と「振り」の基本ダメージは各体力の値に応じて決まっている。例えば体力が10のキャラクターの「突き」は1D-2、「振り」は1Dになる。ここでDはDice（ダイス）の頭文字で、Dの左側にダイスの個数を記述し、その右側にプラスマイナス(±)の補正値を加えた値で基本ダメージを表現している。1D-2はダイス一個の出目から2を引いた値がダメージ数になることを意味する(基本ダメージ数の範囲は0 - 4)。ただしダメージ数は0より小さくなることはなく、ダイスを振った結果がマイナスのときはダメージゼロとして扱う。体力が20のときは「突き」が2D-1で「振り」が3D+2となり、「突き」はダイスを2個振った結果から1を引いた値が基本ダメージになることを意味し、「振り」はダイスを3個振った結果に2を加えた値が基本ダメージになることを意味する。体力が1から100までの間は、「突き」でダイスを1個から11個、「振り」でダイスを1個から13個まで使う。「突きダメージ」よりも「振り」のほうが基本ダメージが大きい。体力が100を超える場合は、体力が10増えるごとに「突き」と「振り」両方に1Dを加える。ここで1D を加えるとは、振るダイスを一つ増やすという意味である。例えば体力が110の場合、体力100の「突き」が11D、「振り」が 13Dなので、その基本ダメージに1Dを加えるから「突き」は12D、つまりダイス12個を振った値（基本ダメージ数の範囲12 - 72）「振り」は14D、つまりダイスを14個振った値（基本ダメージ数の範囲14 - 84）になる。