1700年にスペイン・ハプスブルク家が断絶すると、ブルボン家のフェリペ5世がスペイン王に即位するが（スペイン・ブルボン朝）。これをめぐり1702年にフランス（ブルボン家）とオーストリア（ハプスブルク家）との間でスペイン継承戦争が始まった。1713年に結ばれたユトレヒト条約により、サヴォイア公（サヴォイア家）のヴィットーリオ・アメデーオ2世がシチリアの王位を得ることとなった。
1282年、フランス人による苛政に対してシチリア住民の反乱が発生（シチリアの晩祷）。カルロ1世も鎮圧に乗り出したが、アラゴン王ペドロ3世（バルセロナ家出身）が介入してシチリア島を支配下におさめた（シチリア晩祷戦争）。シチリア島とイタリア半島南部にまたがっていたシチリア王国は、カルロ1世が保った大陸側の王国（ナポリ王国）と、「アラゴン連合王国」の一部に組み込まれたシチリア島側の王国（トリナクリア王国とも称される）に分裂する。ナポリ王国の王位継承問題はイタリア全土を巻き込むイタリア戦争を引き起こした。一方、シチリア島は、以後アラゴン王家であるバルセロナ家、トラスタマラ家によって支配された。スペイン王国の成立後にはスペイン・ハプスブルク家によって支配された。この間、1656年には疫病が爆発的に蔓延し、1693年には島の東側で起きた大地震により大損害を受けている。
827年にカイラワーンから侵入してきたアラブ人（アッバース朝支配下のアグラブ朝）によってシチリア島は征服され（ムスリムのシチリア征服、827年-902年）、シチリア首長国（831年 - 1072年）が成立。
シチリア島は、東ローマ帝国の領土となり、662年から668年に皇帝コンスタンス2世が暗殺されるまで、シラクサが帝国の首都であった時期もある。670年にウクバ・イブン・ナフィがイフリーキヤのカイラワーンへ進出し、675年に駐屯基地を完成させた。ユスティニアノス2世は、692年のセバストポリスの戦いでウマイア朝に惨敗すると、軍政改革を開始してテマ制を敷き、695年にテマ・シチリア（695年 - 902年）が置かれた。同年、テマ・ヘラスの長官レオンティオスがクーデターを起こすと、アフリカ総督府のカルタゴがウマイア朝に制圧された。697年にレオンティオスがカルタゴを奪回。698年のカルタゴの戦いで再度カルタゴをウマイア朝に奪われる。テマ・キビュライオタイの長官アプシマロス（ティベリオス3世）がクーデターを起こし、レオンティオスも失脚。705年にユスティニアノス2世が復位し、レオンティオスとティベリオス3世は処刑された。
その数十年後、東ゴート人が侵入してきたが、535年、東ローマ帝国の派遣したベリサリウス将軍によって征服された。しかし、東ゴート王国の新たな王トティラは、イタリア半島を席巻したのち、550年再びシチリア島を奪取した。552年、彼はまたもや東ローマ帝国の派遣した将軍ナルセスによって征服され、遂には殺された。
地形は山がちで平野は少なく、東部に位置する州第二の都市カターニアのあるカターニア平野と海岸沿いの低地を除けばほぼ丘と山で占められている。北海岸にはペロリターニ・ネブロディ・マドニーエなどの山があるなど、標高1300mから標高2000m級の山脈が連なり東海岸にはヨーロッパ最大の活火山であるエトナ火山がそびえている。島の8割近い面積は標高500mを超える高原地帯であり、海岸近くの狭い平野にある都市部よりも気温が低い。標高900mよりも高いところでは冬には雪も多く降り、スキー場もある。エトナ山も11月初めから5月初めにかけては雪で覆われる。
地中海の中央部にあることからもわかる通り、典型的な地中海性気候となっている。夏は乾燥して暑く、冬は穏やかで降水量が増える。夏にはアフリカからシロッコが吹き付ける。パレルモでは夏には平均最高気温が30℃に達するが、冬は10℃台前半で過ごしやすい。年間降水量は300ｍｍ程度だが、北海岸の山岳地帯では700ｍｍを超えるところもある。後述の通り島の大半の場所は高原地帯であり、海岸部よりも気温が低く雪も降る。カテナヌオーヴァの観測所では1999年の8月に（非公式記録であるが）最高気温48.5℃を記録した。
2000年、土星に向かう途上の土星探査機カッシーニは木星でフライバイを行い、それまでで最高の解像度の画像を撮影した。最接近は、2000年12月30日で、多くの科学的観測を行った。1ヶ月のフライバイの間に、約2万6000枚の画像が撮影され、観測可能な最も小さな構造物は直径60kmであった。2003年3月6日に、木星の大気が循環しているという、フライバイでの主な発見が公表された。木星の大気では、暗いベルトと明るいゾーンが交互に並び、淡い雲を持つゾーンは、かつては上昇気流が発生している場所であると考えられていた。しかし、カッシーニの画像の分析で、暗いベルトにも、地球からは見えない程度の大きさの明るい白い雲があることが明らかとなった。その他の大気の観測の成果として、大赤斑に匹敵する大きさの暗い楕円の渦が木星の北極付近にあることが明らかとなった。赤外線画像は、自転方向の帯と反対方向の隣接する帯からなる極付近での循環の存在を明らかとした。同じ公表の中で、木星の環の存在についても言及された。環中の粒子によって散乱された光は、粒子の形が球形ではなく不規則で、木星の衛星、恐らくはメティスとアドラステアに衝突した流星塵による噴出物に由来することを示した。2000年12月19日、カッシーニは、ヒマリアの非常に低い解像度の画像を捉えたが、遠すぎて詳細な構造は見られなかった。