桐山零は、幼いころに交通事故で家族を失い、父の友人である棋士、幸田に内弟子として引き取られ、15歳でプロ棋士になった。幸田の実子の香子たちとの軋轢もあり、六月町にて1人暮らしを始めた零は1年遅れで高校に編入するが、周囲に溶け込めず校内で孤立し、将棋の対局においても不調が続いていた。自らの境遇を停滞していると感じていた零は、ある日先輩棋士に無理やり付き合わされたあげくに酔いつぶされ、倒れこんでいたところを川本あかりに介抱されたことがきっかけで、橋向かいの三月町に住む川本家と出会い、3姉妹と夕食を共にするなど交流を持つようになる。そんな折、獅子王戦トーナメントにて、義姉の香子を巡る因縁を持つ棋士・後藤との対決に零は気炎を上げるが、それを意識するあまりに己の分を見失い、格上であるA級棋士の島田を侮っていたことを島田本人に見透かされて、大いに恥じる。その後、島田と後藤の対局を見た零は、ひとつ自分の殻を破り、島田の研究会に参加する。学校生活でも、担任の教師・林田の提案で将棋部を設立することになり、紆余曲折を経て放課後理科クラブと合体した放課後将棋科学部（将科部）に所属し、部活動を体験する。こうした様々な人々に関わることで、少しずつ零の心境に変化が生じていった。
2009年9月PLOS ONE  は、学協会出版者協会(Association for Learned and Professional Society Publishers, ALPSP) から出版イノベーション賞を受賞した。受賞理由は、「あらゆる面に対して真にイノベーティブなアプローチを行い、コミュニティに利便性をもたらしかつ長期的な展望を持ちつつ、独創的・革新的な質の高い出版を行った」からであった。2010年1月には、Journal Citation Reportsにおいてインパクトファクターが算出されることとなった。 PLOS ONEの2013年のインパクトファクターは3.534であった。 Scopus Journal Analyzerの"Trend Line"（ある年において、いままでその雑誌に掲載されたすべての論文への総引用数を、その年に掲載された論文数で割った数値）では、PLOS ONEの2009年の値は3.74であった。
幅広い分野をカバーし、それほど選考が厳しくなく、著者支払いモデルで、通常はクリエイティブ・コモンズ・ライセンスで出版するという「PLOS ONE モデル」は、他の雑誌にインスピレーションを与えてきた。そのような雑誌には、たとえばScientific Reports やOpen Biologyがある。
Public Library of Scienceのすべての雑誌と同じように、PLOS ONE は、著者に出版手数料を課すことによって賄われている。「著者支払い」モデルによって、PLOSのジャーナルはすぐに出版後無料で誰にでもすべての論文を提供する（すなわち、オープンアクセスとする）ことができる。2015年3月の時点でPLOS ONE は、著者に1,350ドルの手数料を課している。十分な資金を持っていない著者に対しては、手数料を免除するか、減額することもある。しかしながら、このモデルは批判を集めている。2011年リチャード・ポインダーは、PLOS ONEのように読者ではなく著者に課金するモデルでは、ジャーナルが査読基準を低くしてより多くの論文をアクセプトしてより多くの収入を得ようとする利益相反が起こるとした。スティーブン・ハーナッドは、出版に対してではなく、採否にかかわらず査読の各段階に対して著者に課金する「無過失」査読モデルを提唱している。PLoSは2009年まで赤字経営であったが、2010年に初めて運用コストを賄えるようになった。それは主にPLOS ONEの成長によるものとされる。
創業時の編集長はクリス・サリッジであった。 2008年3月、ピーター・ビンフィールドに引き継がれ、2012年5月まで務めた。現在の編集長はダミアン・パティンソンである。
2006年に138本、 2007年には1,200本強の論文を掲載したにすぎなかったが、2008年には約2,800本の論文を掲載し、世界最大のオープンアクセスジャーナルとなった。2009年には4,406本の論文を掲載して論文数で世界第3位の科学誌に、そして2010年には6,794本を掲載してトップに立った。2011年には13,798本の論文を掲載したが、これはその年にPubMedに収録された全論文数の60分の1にあたるとされる。2012年には23,468本、 2013年には31,500本の論文を掲載した。
上記の経緯により、現在では、8個警察本部（警視庁、大阪府警察、北海道警察、千葉県警察、神奈川県警察、愛知県警察、福岡県警察、沖縄県警察）にSATが設置されている。基本的には機動隊に設置されているが、警視庁では警備部警備第一課、大阪府警では警備部警備課の附置機関とされており、機動隊から独立している。警視庁の特科中隊の創設時の体制は警視1名、警部2名、警部補6名、巡査部長12名、巡査30名の計51名体制であり、大阪府警察の零中隊は約半数の規模であったとされている。特科中隊では、当初は小隊編成であったが、後に専門任務別のチーム制（指揮班、技術支援班、狙撃支援班、制圧一班、制圧二班）に移行した。SATとして改編された後は、警視庁に3個班、大阪府警察に2個班、他の道県警察に各1個班の合計11個班が編成され、部隊の総員は300名とされている。警視（警視庁では警備第一課長、道府県警察本部では警備課長など）を指揮官として、指揮班、制圧班、狙撃支援班、技術支援班という班編成となっており、各班長は警部・警部補が務めているといわれている。また1個班にはおよそ20名の隊員がいるとされる。2016年に公開された訓練では、警視庁SATにおいてメディック担当の隊員が確認された。