柴谷篤弘による構造主義生物学は『構造主義生物学』（東京大学出版会、1999年）においてまとめて解説されている。それによると、『進化における上位分類群間の差異の起源については、これを単に新しいゲノムの創立としてあつかうのでなく、「構造」の創立として解かねばならない。「構造」とは、自然言語の例に見るように、人間の脳内に仮構される定式である。』と説明し、『「構造」はそれにあらたな成分が生成または付加されることがあっても、対応する外界の実態のように随時変動はしない。この仮構が外界の理解に役立てば、あたかも外界にその「構造」が実在するかのように、科学人も普通人も同様に考えてしまうことが一般である。』とする。『「構造」は遺伝子DNAの上位にあり、それを組織化し、概念上ある種の「論理回路」ともいうべき形式に構築される。しかし、それは物理法則のように生物の外部にあるのではなく、むしろ個々の生物や細胞に封じ込められている。このようにして生物現象は恣意的な「構造」に還元される』と述べる。そして、『「構造」は物理法則と両立するが、「構造」の成立は物理的必然によっては規定されない』とする。
『成田系図』によれば慶長5年（1600年）の関ヶ原の戦いでは幕下に従ったと記されている。また、『行田史譚』によれば泰親は4から5年で家督を重長に譲り隠居したと記されているが、重長が家督を継いだ確証はない。慶長8年5月7日（1603年6月16日）に死去。法名は黙室宗伝居士。『断家譜』によれば重長には房長（新五郎）という嫡子がいたが父・泰親が亡くなった当時は幼年であったといい、実弟の成田泰之が房長が成人するまでとの条件で家督を継いだと記されている。
牧野筑意は牛久保城主牧野右馬允の分かれといい、照山城を居城としたというが、当初の照山城は城ではなくその隠棲の屋敷であったらしい（城趾・居館跡の項参照）。嫡子伝太夫もこれを継ぎ牛久保牧野家に付属したが、その子・弥次兵衛尉成政は松平元康（徳川家康）の永禄4年4月の牛久保城攻めの際、徳川方に帰属して八名郡の国人領主西郷正勝に与力して、牛久保牧野家の当主・牧野成定には敵対した。正勝戦死のあとも家康の命により西郷氏後嗣に合力・補佐したが元亀2年（1571年）武田軍が東三河を攻めた際、豊川東岸の八名郡崇山八丁木縄手（豊橋市）で武田方の紫母衣武者と槍合わせの末に成政は戦死した。成政の嫡子成勝（弥次兵衛）は、その後も西郷家に客分として残留した。しかし西郷家が所替え（下総国生実5千石）になった際、家臣化されるのを嫌い、牛久保牧野家の牧野成定から家督を相続した牧野右馬允（康成）が上州大胡城主（2万石）になったのを機に同族の誼みでこれに付属、のち家臣となった（後の長岡藩士牧野弥次兵衛家）。
柴田晴廣 『穂国幻史考』第三話の「牛窪考」で、牧野氏は、愛知県豊川市砥鹿神社神主・草鹿砥氏と同族ではないかとしている。ただし草鹿砥氏自身が穂国造同族と見られるため、この場合上記穂国造末裔説と同趣である。このほか、郷土史家などから、牧野氏は、神官・神職が土豪化・地侍化したものではないかと指摘する声がある。三河山本氏、堀田氏、諏訪氏などは、神官・神職の出身者が土豪化した例である。
太田亮が戦前に唱えた説である。太田亮は著書『神社を中心としたる寶飯郡史』で阿波国田口氏末裔説を否定した上で、牧野氏と贄氏は、穂国造の末裔ではないかとするが、穂国造が実在したとする学会での定説がない。また穂国造との関連性が一部で指摘されている愛知県の麻生田大橋遺跡発掘調査の最終結果及び、同遺跡の学会での定説の確立をみない状況である。
三河の牧野氏を穂国造の末裔、あるいは三河一宮の砥鹿神社や尾張成海神社等の神官の末裔ではないかとして、四国の田口氏末裔説に否定的な諸説が存在する。
天宝8載（749年）、隴右節度使として、王忠嗣が左遷される原因となった吐蕃の石堡城の攻略を命じられる。隴右・河西・朔方・河東及び突厥の兵合わせて10万を率いて攻め込んだ。石堡城は難攻不落であったが、数万の兵を失いつつも落城させた。同じ節度使の安禄山とその従兄弟の安思順と仲が悪かった。来朝した時に安禄山から「私の父は（西域の）胡人。母は突厥。あなたの父は突厥。母は（西域の）胡人。族類が同じようなのに、なぜ、仲が悪いのかね？」と尋ねられ、「ことわざに『狐が穴に向かって吠えるのは不祥である』というものがある。根本を忘れているからだ。心を尽くすつもりはあるのだが」と答えた。安禄山は侮辱されたと思って怒り「突厥とはこのようなものか」といったため、反論しようとする。しかし、高力士の仲介で酔ったことにして席を外したことがあった。河西節度使を兼ね、涼国公となる。吐蕃を破って九曲の地を奪い、西平郡王に封じられた。安禄山と対立する宰相の楊国忠と組み、太子少保に任じられた。この頃から哥舒翰は酒や色を好んだため病体となり、長安に入り、屋敷から外出することはなかったと伝えられる。