1月11日、大田へ再び藩政府軍が大挙して襲来するも、諸隊はこれを防いだ。同日、馬関にいた高杉と遊撃隊のもとに1月6日の勝利の詳報がもたらされる。高杉や伊藤らは、諸隊が立ち上がり、なおかつ勝利したことを非常に喜び、馬関に展開していた遊撃隊・力士隊を伊佐へ進め諸隊と合流する事を決意する。高杉は山縣への返信書簡の端に以下の狂歌を書き添えた。　　　わしとおまへは　焼山かつら　うらはきれても　根はきれぬ1月12日、征長軍副総督松平茂昭が小倉を離れ帰国の途につく。1月14日、本道の呑水峠（のみずたお）で午前10時より午後2時に渡る大規模な戦闘となるも、諸隊は藩政府軍の撃退に成功する。同日、高杉らが合流し諸隊の士気は大いに上がった。山縣は兵力が寡少である為これ以上の追撃に反対したが、高杉は決戦を主張した。最終的に高杉の案が受け入れられ、赤村にある粟屋率いる前軍本営を夜襲する事に決まる。
1月2日、高杉は『討奸檄』という文章を起草し、兵を進め伊崎の会所を襲撃し金穀を奪った。この行動は先日の正義派高官処刑を聞いた高杉が怒った為とも、三日に予定されていた伊佐諸隊の決起の先駆けとも言われている。また高杉はこの時の『討奸檄』を山県有朋へ渡すよう、白石正一郎へ依頼している。同日、遊撃隊の参謀前原一誠が諸隊を訪問する。また同日、吉川の使者が大阪薩摩藩邸を訪れ、薩摩藩の協力に謝意を示し、さらなる赦免斡旋を要請する。さらに同日、小倉総督府は長府藩家老へ解兵の旨を授ける。1月3日、建白書回答の約束の期限になっても藩からの使者は来なかった。伊佐の山縣は、藩政府内の混乱を考慮してさらに一日の猶予を諸隊幹部へ懇請し承認されたという。1月4日、征長軍総督徳川慶勝が広島を離れ帰国の途につく。江戸の幕閣は総督府の長州処分が寛大すぎるとして使者を送り、『毛利藩主父子の江戸護送、五卿の江戸護送、江戸より指示あるまで軍兵を引揚げない事』を求めたが、既に解兵令が出た後だった。慶勝は、毛利処分については江戸幕府より従軍した幕閣らとも相談したものであり、また今回の出征については総督である自分に全権が委任されていると言って取り合わなかった。しかし江戸幕府はこの後も執拗に使者を送り、慶勝自ら江戸に上り状況を報告するよう求めた。慶勝は困惑し江戸へ向かおうとするが、京都に入ったところで朝廷が滞京を命じた。さらに朝廷は征夷大将軍徳川家茂の上洛の内命を下し、江戸幕府がその対応に追われるうちに慶勝の江戸行きは有耶無耶になった。
元治2年1月1日、公爵山縣有朋伝によると赤禰武人は馬関にて伊藤を訪ね、両派混同論を説き、さらに高杉を罵倒する。伊藤は赤禰と別れた後、事の顛末を共に馬関にいた遊撃隊に話した。遊撃隊は大いに怒り赤禰を探そうとするが、危険を察した赤禰は即座に逃げ出し、翌日には九州へ渡ったという。上述の様に、後に出世した功山寺挙兵参加者の多くが赤禰武人は俗論派に与した裏切り者であると証言している。しかし赤禰武人はこれらの証言と当時の史料の間に矛盾がある人物でもある。一時的にであれ諸隊が俗論派へ恭順した事実を糊塗するため、赤禰武人のみが俗論派に与し、赤禰のみが諸隊の足を引っ張ったとし、正義派は徹頭徹尾正義であったとするために、故意に赤禰をスケープゴートとして史料の改竄が行われたとする研究者もいる。同日、藩政府軍より伊佐の諸隊へ使者が来て、期日までの武装解除を重ねて命令した。
ラ・クレロン（La Clairon, 1723年1月25日 - 1803年1月29日）はフランスの女優。本名はClair Josèphe Hippolyte Leris。現ベルギーのエノー州コンデ・シュル・レスコーで、陸軍曹長の娘として生まれた。1736年、コメディ・イタリエンヌにてピーエル・ド・マリヴォーの『奴隷の島』の端役で、初舞台を踏んだ。地方で数年を過ごした後、パリに戻る。『フレティヨンことルーエンのコメディの女優、クロネル嬢の物語、自ら記す』（Histoire de la vie et mœurs de Mlle Cronel, dite Frétillon, écrite par elle-même, actrice de la Comédie de Rouen、ハーグ、1746年）と題す中傷パンフレットが書き立てたり、自筆の『ヒッポリト・クレロン回想録』（Mémoires d'Hippolyte Clairon、1798年）に記されたほどではなかったにせよ、彼女の生活は荒んでおり、コメディ・フランセーズでのデビューの機会を得るのに苦労することとなった。しかし、ついにラシーヌの悲劇フェードルの主役の座をつかみ、大きな成功を収めた。その後22年間にわたり、コメディ・フランセーズで好敵手マリー・フランソワーズ・デュメスニルと人気を二分しつつ、古典悲劇の役を務め、ヴォルテール、ジャン・フランソワ・マルモンテル、ベルナール・フランソワ・ソーランやピエール・ド・ブロワなどの新作にも出演した。1766年に引退し、後進の指導にあたる。その中には、ロクール嬢もいた。イギリスの詩人オリヴァー・ゴールドスミスは、クレロン嬢について「私が舞台をみたなかでもっとも完璧な女性」と評し（The Bee, 2nd No.）、また同じくイギリスの俳優デビッド・ギャリックは、当意即妙の即興的演技の弱さを指摘しつつも、芸術と神から恵まれたあらゆる天分があると評した。