9月17日中田の死が間近に迫っているので、中田の自宅に森五郎、大江捨一、谷中廣美、保坂一ら7人が集まり話し合った。中田の死後に、教団は監督の外に会長を立てることにする。また、会長は名誉制にして、監督に実権を握らせることと、補佐委員を立てることを決めた。また、これらの決議事項を弁護士の朝保浅次郎が法的に有効にしようとした。話し合いの結果、森五郎が会長になりきよめ寮に住み、聖書学院と柏木教会の責任も森が取ることが、中田の指示によって決められた。中田家のことは、保坂一と谷中廣美夫妻が任された。
9月14日午前0時14分、中田あやめが息を引き取った。息を引き取る前に、おいの中田愛成の仲介で中田羽後と和解することができた。9月16日に聖書学院大講堂で、あやめの葬式が行われた。斎藤源八の司式で、葬儀委員長は森五郎だった。
7月末に、あやめ夫人の容態が急変し病床に就くことになり、子宮癌の兆候が現れた。そして、8月に入ると、中田自身も下痢が続き、身体の衰えを自覚した。9月に入りあやめが危篤になり、中田も重態だったので、谷中さかえが側近にあって世話をした。中田は口述筆記により、機関紙の論説を書き続けた。加藤三郎医師が診断したが、中田夫妻が神癒を信じる故に特別な手当てはしなかった。
1939年(昭和14年)に入り、きよめの友には「新東亜建設の新春を賀す」との文章が載せられた。元旦から三日間、日本民族に与えられた神の義を力説した。1月26日の機関紙の文章では、宗教団体法は統制上必要とあればやむをえないとして、賛成した。2月9日には、ジャバ島で伝道していたきよめ教会の宮平秀昌が十数年前に、オランダ政府より退去命令を受けた事件を記して、八紘一宇の理想を実行するために、キリスト教が必要であると述べた。1939年2月11日の紀元節の連合礼拝では、君が代斉唱、宮城遥拝、愛国行進曲等を歌い、紀元節を祝い、中田は日本は皇道の上に立つ特殊の国であると述べた。4月のきよめ大会では、監督の下に総務を置き、一切の教務を取り扱うようになった。また、地方分権を廃止して、監督の直轄権を強化した。
4月の全国きよめ大会と題二会年会が行われた時から、中田は神経痛に悩まされた。6月には中田の健康悪化のために代行委員が設置され、中田あやめ、斎藤源八、斎藤保太郎、田中敬止、森五郎が選ばれた。10月30日、九段の軍人会館で皇威宣揚全国必勝祈祷会を開催した。その時、『聖書より見た日本民族の使命』と題する日ユ同祖論の講演を開催する。日匹信亮、ライオンはみがき小林喜一社長、青山学院教授比屋根安定らを初め約1800人が入場した。中田は疲労して加藤三郎医師らに付き添われて帰宅した。
1937年7月7日北支事変(日中戦争)が勃発した。文部省よりの通達に即して、中田は全国の福音使宛てに通達を発して、慰問袋を送るように命じた。慰問袋は7月中に4000個を突破した。7月上旬より、中田は体調を崩し藤沢鵠治の中岡に移り静養した。9月5日に、中田は東京に戻り、学院教会で「殉国と殉教」と題して説教し、愛国心を強調した。この頃から、中田は、国家主義的、愛国主義的な論説を書くようになった。10月13日の国民精神総動員強調週間には、毎日祈祷会を開けと命じた。さらに、11月3日には、宮城遥拝と祈祷会を開けと命じた。10月27日の中田の誕生日に日本軍の上海郊外の大場鎮(上海市宝山区大場)を陥落させたことを喜んだ。1938年(昭和13年)2月11日の紀元節祝典には慰問袋献納式を聖書学院で行った。
中山 照守（なかやま てるもり、元亀元年（1570年） - 寛永11年1月23日（1634年2月20日）） は、安土桃山時代から江戸時代初期にかけての武将、江戸幕府旗本寄合。中山家範の嫡男。諱は家守とも。通称は助六郎、勘解由。弟に水戸藩附家老の中山信吉。子に中山直定、中山直範、中山重良。初め父家範とともに北条氏照に仕えた。天正18年（1590年）小田原征伐における八王子城の戦いで父は討ち死にしたため、照守は武蔵加治に潜伏していたが、同年8月、父の最期に感銘した徳川家康に弟・信吉とともに召抱えられ、300石を与えられて徳川秀忠の使番に任じられる。慶長5年（1600年）、秀忠の軍に従い、上田合戦にて上田七本槍に数えられる働きをするが、軍律違反であり叱責を受け、真田信之お預けとなって上野吾妻郡に閑居するが、翌年に許され本領を安堵される。照守は高麗八条流馬術の使い手であったため、秀忠に馬術を教授し、のちに3代将軍徳川家光にも手ほどきしている。慶長14年（1614年）、大坂の陣では子の直定とともに参戦し、得意の馬術で戦功を挙げて500石を加増された。後に1000石加増され、目付に転じられて寛永3年4月に肥後国熊本に巡察として赴く。寛永9年（1632年）に鑓奉行となり、最終的に3500石の大身旗本となる。寛永11年（1634年）に死去。享年65。家督は、嫡男の直定が継ぐ。墓所は、菩提寺の能仁寺。法名は無相院殿可山宗印大居士。