開通後の数年間は、従来レールター駅、ゲルリッツァー駅、ポツダマー駅を終点としていた列車が、市街線を走行するようになった。こうして他の頭端駅は、軽減分の運行を拡大することを可能にした。しかし19世紀末までほとんどの列車は、運行本数が増大したため、また一部は、頭端駅へと至る区間で郊外列車線・長距離列車線を増線したため、再び元の頭端駅に発着するようになった。市街線に残った運行は、レールテ線経由のハノーファー、ケルン行き急行列車、大砲線のデッサウ行き、東線のダンツィヒ、ケーニヒスベルク行き、またフランクフルト (オーダー)、ポーゼン方面、ブレスラウ、カトヴィッツ方面であった。この他にもシュパンダウ方面とシュトラウスベルク方面への郊外列車も、1928年までに市街線の長距離線を走行するようになった。西方への列車の起点はシュレージッシャー駅で、東方へはシャルロッテンブルクであった。ルンメルスブルク（当時の呼称は「カールスホルスト機関区」、Lok-„Bw Karlshorst“）とグルーネヴァルトには大規模な車両基地があった。
アレクサンダー広場付近にあった中央市場への貨物輸送のために、7本の特別列車が設定されていた。4本は夜間、2本は日中、1本は夕方に運行されていた。市街線ではこの他には定期貨物列車の設定はなかった。通常の貨物輸送は、環状線を経由してモアビート駅、ヴェディング駅、ヴァイセンゼー駅、中央家畜市場駅、フランクフルター・アレー駅、リックスドルフ駅、テンペルホーフ駅、ヴィルマースドルフ＝フリーデナウ駅、ハーレンゼー駅、ベルリン＝シャルロッテンブルク貨物駅 (Güterbahnhof Berlin-Charlottenburg) で荷役されていた。
都市区間のみを走行する郊外列車と環状線の半分を走行する列車（北環状線、南環状線）では、当初の数十年間は蒸気機関車、例えばプロイセン国鉄T12型蒸気機関車で牽引された。燃料にはコークスを用いることで煤や匂いの軽減が図られていた。コンパートメント車（総扉式）の扉は、乗客が自分で開ける必要があった。また停車駅案内は行われなかった。既にこの時代に朝4時から深夜1時まで運行されていた。普通、列車は9両編成で、時間帯に応じ2分、3分、5分間隔で運行された。運賃は20世紀初頭に三等車で10ペニヒ、二等車で15ペニヒであった。
建築技術的には、市街線の区間は大部分が高架線で、8 kmがレンガ造りの高架橋（当初は731のレンガ造りのアーチ）、2 kmが鉄橋、残りが総計約12 kmの築堤の区間で、一部には土留め擁壁が設置されている。橋梁は全区間で64か所、特に有名なものとして全長240 mのフンボルト港橋がある。幅の広い橋梁のほとんどの橋脚は、ハルトゥング橋脚であり、1880年から1910年までのベルリンの鉄道建築を特徴づけるものである。こうして市街線の区間は、これ以前の1851年に開通したが、地平面上に建設されたため大きな問題を引き起こしていた「王立駅間接続鉄道」と全く異なるものとなった。軌道は当初、鉄製で長手方向の枕木（ハールマン式、System Haarmann）が使用されたが、20世初頭に横手方向の木製のものに取り換えられた。
生年不詳ながら、一説に享禄3年（1530年）頃、長女として生まれたといわれる。『細川家記』に妻木勘解由左衛門範煕の女とあるのは『明智軍記』などに拠るものであろうが、細川忠興の室の母であることから一応この所伝は信じても良いとされている。また、妻木広忠を父とする説もあるが、典拠となる史料は不明であり俗説の域を出ない。夫婦仲は非常に良かったとされ、「結婚直前に疱瘡にかかり、左頬にその後が残ってしまった煕子を光秀は気にせずに迎えた」､「弘治2年（1556年）、斎藤義龍によって明智城が落とされると、光秀は身重の煕子を背負って越前へ逃亡した」などの逸話がある。その後、光秀は長良川の戦いで斎藤道三に与したため、道三の跡を継ぎこれと対立した斎藤義龍に攻められ、本拠を失い浪人。美濃から越前に移り、朝倉義景に仕えることになるが生活は苦しく、そのような中、連歌会の催しを光秀が担当することになった。酒宴の用意に苦労する光秀をみかねた煕子は、自分の黒髪を売ることで費用を工面したと伝わる。元禄2年（1689年）に松尾芭蕉が門弟の山田又玄の邸宅でその妻に宛てて詠んだ句「月さびよ、明智が妻の、咄（はなし）せむ」はこの逸話にちなんだもので、芭蕉は丸岡を訪れた際に称念寺に伝わるこの逸話を聞いたと考えられる。天正4年10月14日､煕子は病気になり､光秀は平癒の祈祷を吉田兼見に依頼している（『兼見卿記』）。10月24日には平癒したので､非在軒という者が銀一枚を持参して礼に行っている。11月2日には､吉田兼見が煕子の病気見舞のために光秀の京都の宿所に行き光秀と面会をしている。天正4年11月7日（1576年11月27日）または6月7日（7月6日）に死去。享年は、46または36、42とも言う。戒名は福月真祐大姉。滋賀県大津市の明智氏、妻木氏の菩提寺である西教寺に墓がある。光秀が重病となった際の看病疲れが元で病死したという。しかし、『明智軍記』によると天正10年（1582年）の坂本城落城のときの言動を記し、年齢48歳で死去としているがこの説は信用できないとされている。