1650年代、モントリオールにはまだ数十人の開拓者がいるだけであり、人口が著しく少ないヌーベルフランスはイロコイ族の武力の前にほとんど完全に陥落しそうになっていた。1660年、開拓者のアダム・ドラール・デ・オルモーがカナダとヒューロンの民兵隊を率い、勢力の大きなイロコイ族部隊に立ち向かった。カナダ人は誰も生き残れなかったが、イロコイ族の侵略を食い止めることには成功した。1663年、フランス国王ルイ14世がここを王室領としたことで、ヌーベルフランスはより確かなものに変わった。1665年、ルイ14世はフランス軍の守備隊カリニャン・サリエール連隊をケベックに派遣した。植民地政府はフランス本国の政府の線にそって改革され、軍政府長官と監督官はフランス海軍省の部下とされた。1665年、海軍大臣ジャン＝バティスト・コルベールが初代監督官としてジャン・タロンをヌーベルフランスに派遣した。これらの改革で、シャンプランの死後巨大な権力を握ってきたケベック主教の権限を制限した。1665年から1666年にかけての冬に、監督官ジャン・タロンの指揮下でヌーヴェル・フランスの国勢調査が行われた。調査によれば人口は3,215人と、わずか数十年前にくらべて大きく増大したが、男女比は男性2,034人に対し女性1,181人と大きな開きがあった。これはヌーヴェル・フランスにやってきた探検家、兵士、毛皮商、開拓者の多くが男性であったためである。ルイ14世は、ヌーヴェル・フランスを強化することでフランス植民地帝国の中心とするため、15歳から30歳までの独身女性700人以上を送り込むことを決定し（この女性たちは王の娘 les filles du roi と呼ばれる）、また同時に、先住民との結婚が奨励されるとともに、年季奉公者（engages アンガジェ）がヌーヴェル・フランスに送られた。そのような「アンガジェ」の一人に、後のカナダ首相ピエール・エリオット・トルドーの先祖であるエティエンヌ・トルドーがいる。タロンはまた封建制度の改革を試み、「領主」には実際にその土地に住むことを強制し、「領地」の大きさを制限し、新しい開拓者が使える土地を多く確保しようとした。この計画は結局うまくいかなかった。開拓者はあまり増えず、タロンが創設した様々な産業も毛皮交易の重要性を超えることはなかった。
検死審問は9月10日にホワイトチャペルのワーキング・ラッズ・インスティテュートで地元の検視官のウィン・エドウィン・バクスター (英: Wynne Edwin Baxter) により開かれた。証拠によりチャップマンが午前5時30分に殺害されたと推定されるが、遺体が発見された裏庭のある家にいた16名の住人は、殺人のあった時刻に何も見聞きしなかった。住人たちはどの時刻でも頻繁に裏庭に行くため、家を経由して裏庭へ通じる通路は施錠されていなかった。遺体が発見されたとき、玄関のドアは大きく開いていた。リチャードソンによれば、家の通路には男女問わず部外者をよく見かけたという。警察医のジョージ・バクスター・フィリップス (英: George Bagster Phillips) 医師は、午前6時30分に見た遺体の状況を次のように説明した。左腕は左の乳房を横切るように置かれていた。両脚は縮こまっており、両足は地面に着き、両膝は外側に向いていた。顔は腫れ上がっており、右側を向いていた。舌は前歯の間から突き出ていたが、唇からは出ていなかった。舌は明らかにひどく腫れていた。前歯は上下とも第1大臼歯まで完全な状態で、非常に良好な歯だった。遺体はひどく切り刻まれていた。……四肢の硬直は見られなかったが、明らかに始まりかけていた。喉は深く切り裂かれていた。皮膚を貫く裂傷はぎざぎざで、首をちょうど一回りしていた。……件の庭と隣家の庭を隔てる木製の柵の杭に血痕が付着していた。これは遺体の頭があった場所に一致する。血痕は地面から約36センチメートルの場所にあり、首から流れた血があった場所のすぐ上にあった。喉と腹部に使用された凶器は同一のものだった。凶器は薄く細い刃のある非常に鋭いナイフに違いない。長さは少なくとも15センチメートルから20センチメートルは確実だが、恐らくもっと長い。銃剣ではそのような傷は付くはずがない。医師が検死用に使うような刃物を使った可能性があるが、通常の外科手術にはそのような刃物は使用しないかもしれない。食肉処理業者が使うよく削られて滑らかになった刃物ならばこのような傷がつくかもしれない。革の販売に使用するナイフは刃の長さが十分でないと思う。解剖学の知識の存在を示唆するものがあった。……最初に被害者を見たとき、被害者は少なくとも2時間前には殺害されており、恐らくもっと前に殺されたように思った。しかし、そのときは非常に寒い朝であり、大量出血により遺体は急速に冷えやすくなっていたことを言及すべきだろう。……被害者が抵抗したことを示す証拠は無かった。被害者は生きていたときに庭に入ったと確信している。早朝に見たときは、ハンカチが遺体の喉に巻かれていた。喉を切られた後に巻かれたものではなかった。チャップマンの喉は左から右に切られ、内臓を取り出されていた。腸が腹部から取り出され、両肩に投げ掛けられていた。死体安置所での調査で、子宮の一部が無くなっていることが判明した。舌が突き出て、顔が腫れ上がっていたことから、フィリップス医師は、チャップマンは喉を切られる前に首に巻いていたハンカチで窒息させられた可能性があると推測した。遺体を運搬するときに付くであろう裏庭へ続く血の跡が無いことから、フィリップスはチャップマンが遺体の発見された場所で殺害されたことを確信していた。チャップマンが肺の病気を長年患っていたこと、死亡時にはしらふだったこと、少なくとも死の数時間前はアルコール飲料を飲んでいなかったことをフィリップスは証言した。また、フィリップスは、15センチメートルから20センチメートルの長さの刃物を使って1回の動作で生殖器を切り取っていることから、殺人者には解剖学の知識があるに違いないと考えていた。しかし、殺人者が外科の技術を有しているというこの意見は他の専門家により退けられた。遺体は犯行現場では十分に調査されていなかったため、実際には死体安置所の職員が臓器を取り出した可能性があったためである。既に切り開かれた遺体から臓器を抜き取れば外科標本として売ることができた。バクスター検視官の約定では、あるアメリカ人がロンドンの医学校で子宮の試料の売買を持ちかけたことを根拠に、チャップマンは子宮を入手する目的で殺害された可能性を持ち出した。医学誌『ランセット』はバクスターの説を痛烈に否定し、全くあり得そうに無く不条理なことであると指摘し、非常に大きな判断の誤りであると述べた。医学誌『ブリティッシュ・メディカル・ジャーナル』も同様に否定的で、名前は明かさなかったが、子宮の試料を求めていた医師は非常に評判の良い人物で、殺人の18ヶ月前にこの国を去っていたと報じた。バクスターは自説を取り下げ、二度と言及しなかった。シカゴ・トリビューンではそのアメリカ人の医師はフィラデルフィアから来ていたと主張されており、後に著述家のフィリップ・サグデン (英: Philip Sugden) は、件の医師は悪名高いフランシス・タンブルティ (英: Francis Tumblety) ではないかと推測した。フィリップス医師は死亡時刻を午前4時30分かそれ以前と推定したが、殺人はもっと後に起きたという目撃者のリチャードソンやロング、カドシュによる証言と矛盾していた。ヴィクトリア朝での死亡時刻の推定方法は遺体の体温を測定するなどといった未熟な代物で、フィリップス医師は審問の際に、遺体は通常予測されていた以上に急速に冷却された可能性があることを強調した。