かつて先住民のアラワク族が島にある洞窟で暮らしていたが、後にカリブ族により追いやられてしまった。1493年クリストファー・コロンブスに発見された。好戦的だったカリブ族が島にいたため、コロンブスは島へ上陸しなかったが、スペイン語でウナギを意味する現名のアンギラと名付ける。なおカリブ族は島の事をマリオハナ（Malliouhana）と呼んでいた。1632年イギリスにより、アンギラはアンティグア島の管理下に置かれる。1650年カリブ族の激しい抵抗があったものの、イギリス人植民者がアンギラ島へ入植する。カリブ族は入植者により、追いやられる。1796年フランス艦隊の侵攻攻撃を受ける。1825年アンギラの植民地政府は反対したものの、イギリスはセントクリストファー島（セントキッツ島）の植民地政府と話し合いの結果、アンギラをセントクリストファー島の管理下に置いた。1967年2月にセントクリストファー島とネイビス島と共にセントクリストファー＝ネイビス＝アンギラとしてイギリスの自治領になった。しかしセントクリストファー島中心の政策に不満を抱き1967年7月12日に独立宣言し、1969年2月7日にアンギラ共和国（en:Republic of Anguilla）の成立を宣言した。同年、セントクリストファー＝ネイビス＝アンギラ自治領政府の要請によって派遣されたイギリスの武装警官隊に対して無血投降し、イギリス植民地統治下に戻った。1976年には改めて自治権が付与され、1980年にセントクリストファー・ネイビスから正式に分離された。
関東地方の縄文時代研究史に名を残す著名な遺跡であるが、国や自治体が指定する文化財保護制度上の文化財（史跡）には指定されておらず、いわゆる「周知の埋蔵文化財包蔵地」である（横浜市発行の『横浜市文化財地図』で遺跡の範囲は周知されている）。そのため、現状は宅地化が進行し、解説板や碑なども設置されていないため、遺跡の全容が把握しづらくなりつつあるが、現在でも部分的な調査が継続されている。2016年（平成28年）には、横浜市歴史博物館が称名寺貝塚を扱った展覧会を開催している。
称名寺山門西側の径150メートルの範囲を中心に、複数の貝層（地点貝塚）が分布する。貝層と重複して竪穴住居や墓壙などの集落跡も確認されている。出土遺物は、縄文土器や石器・骨角器のほか、マテガイやハイガイなどの貝類や、タイ、サメなどの魚類の骨、哺乳類ではイノシシやシカなどの陸上獣類だけでなく、イルカの骨が多量に含まれることが特徴的で、海に面した砂丘を拠点に漁労を中心とした集落が存在したと推察される。
1925年（大正14年）、神奈川県東部を調査フィールドとする考古学者、赤星直忠により称名寺山門付近で貝塚の存在が報告されて以降、石野瑛・吉田格（いたる）・和島誠一・岡本勇らによる調査が断続的に行われた。出土した縄文土器は、吉田格の研究により加曾利E式土器と堀之内式土器の中間に入る縄文後期初頭の土器型式として位置付けられ「称名寺式土器」が設定された。
東京湾に面した入り江「平潟湾」北東の、標高10メートル程の微高地上に立地する。この微高地は、現在金沢区役所などが所在する平野部が、近世、永島祐伯（すけのり、号：泥亀）らの新田開発事業により埋め立てられて成立（泥亀新田）する以前には、称名寺付近を基部に平潟湾へ突き出していた海岸砂丘であり、この上に縄文人が生活していたと考えられる。なおこの砂丘は、かつては沖合いの陸繋島である野島へと続いており（現在は水路建設により分断）、野島の山頂には縄文時代早期の野島貝塚（横浜市指定史跡）が所在する。
国の史跡・称名寺境内の山門付近からその西側を中心に、縄文時代後期の地点貝塚が複数展開しており、調査等により判明している限りでA～J貝塚が分布している。
称名寺貝塚（しょうみょうじかいづか）または称名寺貝塚群（しょうみょうじかいづかぐん）は、神奈川県横浜市金沢区金沢町から寺前1丁目付近に所在する縄文時代後期を中心とする貝塚である。この遺跡を標式遺跡として、縄文時代後期初頭に位置づけられる縄文土器型式である「称名寺式土器」が設定されたことで知られる。
年度内で取材されたラオス・イラク・タンザニア・エルサルバドル・モンゴル・パキスタン・トルコの全ての回を再構成して放送。ただし、トルコの最後の回（2007年3月30日放送分）は放送前だったため、総集編には含まれなかった。
「シリギの乱」が起こる前、コンギラト部はデイ・セチェンの息子アルチ・ノヤンの息子ナチン・キュレゲンの息子オロチンが当主の座にあった。「張氏先塋碑」によると、ジルワダイはオロチンの弟であったという。至元13年(1276年)冬、以前よりクビライ政権に不満を抱いていたシリギ、トク・テムルといったトゥルイ系諸王はアルマリクにて叛乱を起こし、シリギをカーンに推戴してクビライに叛旗を翻した(シリギの乱)。叛乱軍はアルマリクから東に進み、モンゴル高原を制圧しようとしたが、これに呼応して兵を挙げたのがジルワダイであった。ジルワダイは兄のオロチンを捕虜としてコンギラト部の根拠地応昌を包囲し、更に北上してシリギ軍と合流しようと企んだ。これに対し、クビライはコンギラトともに「左手の五投下」を構成するウルウト部当主トゴンとマングト部当主ボロカン、新興のキプチャク・アスト兵を率いるセチェン・バートル、カングス、ウワズ、シクドゥル、バイダル(オイラト人のベクレミシュの指揮下にあった)らがシリギ及びジルワダイの討伐に派遣され、そして耶律元臣や洪茶丘といった人物もこれに従軍した。ジルワダイと合流しようとしていたトク・テムルは先行してモンゴル高原に到着していたキプチャク軍を率いるトトガクに進路を阻まれ、ジルワダイの下に到着することができなかった。シリギ軍と合流できなかったジルワダイは単独でカラ・カドゥ(懐剌合都/懐魯哈都)の地において大元ウルスの軍勢と戦い、敗北した。この時の戦いでは、ジャライル部出身のトゴンが流れ矢を日本受けながら戦い抜くという功績を挙げ、後にクビライより労われている。敗れたジルワダイは逃れたが耶律元臣がこれを追跡し、魚児濼において捕虜とされた。耶律元臣はこの功績を賞され、この後も応昌に駐屯することになった。ジルワダイの乱鎮圧に参戦した将軍の多くはここから更に北上し、シリギ、トク・テムル軍の討伐に参加していった。