Jリーグ所属の全18クラブ、ジャパンフットボールリーグ（旧JFL）所属クラブのうち予選が免除された11クラブに加え、関東（4校）・関西（2校）の大学チーム代表と、各都道府県から予選を勝ち上がった47チーム、あわせて前回大会より1チーム増の82チームが本大会に出場した。参加全82チームのうち、都道府県代表、大学代表、JFL代表の64チームが1回戦から出場、Jリーグクラブについては、同年の1stステージで15―18位だった4クラブ（京都パープルサンガ、コンサドーレ札幌、ヴィッセル神戸、アビスパ福岡）が2回戦、それ以外のJリーグ14クラブが3回戦からそれぞれシードされた。1998年シーズン限りで横浜マリノス（合併後に横浜F・マリノスに改称）に吸収合併された横浜フリューゲルス（横浜F）が決勝で清水エスパルスを下し、クラブ最後の大会で優勝した。
2012年3月、『Jason Becker: Not Dead Yet』と題されたドキュメンタリー映画が公開された。この映画はベッカー本人や家族、友人、関連するミュージシャンへのインタヴューを含む、彼の生い立ちから現在までを網羅したバイオグラフィーである。同映画はDVD化もされ地元の映画祭で賞を取るなど一定の評価を得た。2014年11月8日には、『ジェイソン・ベッカー NOT DEAD YET〜不死身の天才ギタリスト〜』というタイトルで日本公開された。
その後も病状は進行し続け、1997年に呼吸・嚥下・発声能力を喪失し、気管切開して体外人工呼吸器、気管カニューレ、胃瘻経管による生命維持治療を開始し、『パースペクティヴ〜永遠の情景〜』発表時には可能だった会話も、眼球の動きを用いたサインによる意思表示で意思疎通状態している。1999年と2003年には、未発表曲を集めたアルバムが発表された。また、シュラプネル・レコーズに在籍していた頃からの盟友や、彼を尊敬するミュージシャン達によるトリビュート・アルバムが製作された。2008年11月、シュラプネル・レコーズより、カコフォニー、ソロ、デイヴィッド・リー・ロス時代の曲を収録したベスト盤、『コレクション』を発表。同アルバムには新曲が3曲収録されており、ギターソロで、マーティ・フリードマン、スティーヴ・ヴァイ、ジョー・サトリアーニ、グレッグ・ハウらが参加している。2014年、セイモア・ダンカンからベイカーのシグネイチャー・ピックアップ「パーペチュアル・バーン」が発売された。2018年12月7日に『Triumphant Hearts』をリリース。ゲストとしてマイケル・ファーキンス、スティーヴ・ヴァイ、ジョー・ボナマッサ、ポール・ギルバート、ニール・ショーン、Mattias IA Eklundh、マーティ・フリードマン、グレッグ・ハウ、ジェフ・ルーミス、リッチー・コッツェン、ガス・G、スティーヴ・ハンター、ベン・ウッズ、ジョー・サトリアーニ、トレヴァー・ラビン、スティーヴ・モーズ、クリス・ブロデリック、ジェイク・シマブクロらが参加する。
1990年、アルバム『ア・リトル・エイント・イナフ』レコーディング中に左手足に脱力感を持ち、それが悪化していく。アルバムは完成したものの、ライブには参加できずにバンドを去る。その症状は筋萎縮性側索硬化症によるものと判明。この時、多くの有名なミュージシャンらが治療費などを集めるためにベネフィット・コンサートを開いたものの症状の悪化は避けられず、表舞台からは次第に遠のいていった。1995年に病に侵されながらも2ndアルバム『パースペクティヴ〜永遠の情景〜』を完成させる。あまりギターを弾けない状態であった為、同アルバムのハイライト曲の1つ"エンド・オヴ・ザ・ビギニング"において、マイケル・リー・ファーキンスが代わって演奏するという異例のパターンで製作された。また、ベッカーは1991年頃よりスティーヴ・ペリーと親交を深めており、『パースペクティヴ〜永遠の情景〜』にはペリーの参加した曲も収録された。
エフゲニー・イゴーレヴィチ・ニキーチンは1973年、ソビエト連邦のムルマンスクに生まれる。ロシア連邦軍からの徴兵を避けるため、歌手を志した。父親のつてを頼って1992年にサンクトペテルブルク音楽院に進むが、兵役の2年分が免除される音楽院時代のニキーチンはクラシック音楽以外のことに興味を持とうとしていた。しかし、ゲルギエフがニキーチンの才能を認めたこともあって、23歳で卒業後にマリインスキー劇場とソリストとして契約した。マリインスキー劇場に入りたてのころ、ニキーチンは相変わらず「古典的」なことにはあまりなじめなかったものの、当時ゲルギエフが繰り返し上演していたワーグナーの諸作品で端役を立て続けに演じているうちに、ワーグナーの虜になっていった。ニキーチンは、1996年にサンクトペテルブルクで行われたプスコフスキー国際オペラシンガーコンクールで優勝し、2年後の1998年にはリムスキー＝コルサコフ国際ヤングオペラシンガーコンクールとチャイコフスキー国際コンクール声楽部門（男声）で、ともに入賞を果たす。2002年にはプロコフィエフ『戦争と平和』のドーロホフでメトロポリタン歌劇場（メト）にデビュー。メトでは他にプッチーニ『ラ・ボエーム』のコリーネ、ワーグナー『ニュルンベルクのマイスタージンガー』のポーグナー、『ラインの黄金』のファーゾルトおよびリヒャルト・シュトラウス『エレクトラ』のオレストを歌っている。メト以外においても、ヨーロッパやメトを除くアメリカ、日本、韓国などで公演を行い、2005年にはパリ・シャトレ座にルビンシテイン『デーモン』の表題役で初出演。パリにおいては同じくシャトレ座でムソルグスキー『ボリス・ゴドゥノフ』の表題役、パリ国立オペラでリヒャルト・シュトラウス『サロメ』のヨカナーン、ワーグナー『パルジファル』のクリングゾルなどを演じた。また、バーデン＝バーデン、トロント、ライプツィヒなどの音楽都市やエクサン・プロヴァンス音楽祭、BBCプロムス、シュレースヴィヒ＝ホルシュタイン音楽祭といった音楽祭にも登場。ロリン・マゼールやクリストフ・エッシェンバッハ、サイモン・ラトルといった指揮者のもとでヨカナーンやワーグナー『さまよえるオランダ人』のオランダ人、『パルジファル』のアンフォルタス、クリングゾルなどを歌った。オペラ以外においてもマーラーの交響曲第8番やベートーヴェンの交響曲第9番のソリストを務めた。故郷ロシアのマリインスキー劇場への出演も欠かさず、ワーグナー作品やロシア・オペラのほか、モーツァルトの『フィガロの結婚』や『ドン・ジョヴァンニ』のそれぞれの表題役をも占めている。日本へは2011年のバイエルン国立歌劇場来日公演で『ローエングリン』のフリードリヒ・フォン・テルラムント伯爵を、2012年3月の新国立劇場における『さまよえるオランダ人』でオランダ人を歌うなど、複数回来日している。