2004年12月26日、スマトラ島沖地震で発生した津波によってインドの南東部の海岸で数千名が死亡したが、かつてフランスの植民地だったポンディシェリは難を逃れた。300年弱の植民地時代の間にフランス人技師らが巨大な石積みの防潮堤を作って維持したため、通常の満潮時の水位より24フィート（7.3メートル）の高さの津波からも旧市街地が守られた。この防潮堤が完成したのは1735年のことである。その後もフランス人らは防潮堤を強化し続け、港に打ち寄せる波による侵食を防ぐために1.25マイル (2km) 沖合いの海岸線に沿ったところに巨礫を積み上げた。最も高いところでは、海抜約27フィート（8.2メートル）ある。積み上げた巨礫は1トンの重さのものもある。防潮堤は毎年検査されていた。すき間が生じたり、石が砂に沈んだりすると、政府はさらに巨礫を追加して強度を維持していた。インドネシア沖合いで（マグニチュード9.0以上の）巨大海底地震が起き、それによって生じた津波がインドの海岸を襲ったとき、ポンディシェリでは600人が死亡したが、そのほとんどは防潮堤の外側に住む漁師だった。
防潮堤の種類は波のエネルギーとの関係で分類でき、海岸地形（断崖や砂浜など）のように様々なものがある。垂直壁型防潮堤は特に無防備な状況で建設される。これは、嵐のような定常波（重複波）が強い状況の波のエネルギーにも対応できる。場合によっては波のエネルギーを若干なりとも低減させるためにパイルを壁の前に置くことがある。湾曲型または階段型の防潮堤は、波を砕いてそのエネルギーを発散させるもので、波を海に対してはねつけるよう設計されている。壁の前面を湾曲させることで波が壁を越えて内陸に入ることを防ぐので、壁の上部を湾曲させてオーバーハング状態にすることでさらに防護を追加することもできる。緩傾斜式の構造は、それほど波のエネルギーが強くない場合に用いられる。特に地盤用シートや砂袋を積んで作る防潮堤は最もコストがかからない。そのような防潮堤は海岸の浸食を防ぐことを目的としている。傾斜を完全にコンクリートや防水シートで覆って防水性を持たせる場合もあるが、波エネルギーは発散させて水だけを浸透させるよう多孔性にする場合もある。
ジャック・シェパード（マシュー・フォックス）、ケイト・オースティン（エヴァンジェリン・リリー）、ヒューゴ・"ハーリー"・レイエス（ホルヘ・ガルシア）は島の心臓へと出発し、一方でジェームズ・"ソーヤー"・フォード（ジョシュ・ホロウェイ）は井戸へ投げ込まれたデズモンド・ヒューム（ヘンリー・イアン・キュージック）のもとへ向かった。ソーヤーが井戸に到着すると、島を破壊しようと企むベン・ライナス（マイケル・エマーソン）と黒服の男（テリー・オクィン）に出会った。それからソーヤーはベンのライフルを奪い、ジャックのグループと合流する。そしてジャックは黒服の男といずれ対峙することをソーヤーに話す。同じ頃、デズモンドはローズ・ヘンダーソン（L・スコット・コードウェル）とバーナード・ナドラー（サム・アンダーソン）に救出されていたが、黒服の男に遭遇する。黒服の男は協力しなければローズとバーナードを殺すと脅したため、デズモンドは従った。一方、マイルズ・ストローメ（ケン・レオン）はジャングルの中でリチャード・アルパート（ネスター・カーボネル）を発見し、2人は黒服の男が脱出に使う飛行機を爆破するためにボートで出発する。道中、彼らは潜水艦の爆発から生き延びでいたフランク・ラピーダス（ジェフ・フェイヒー）を救出し、そして飛行機を使って島を去ることにする。島の心臓に向かう途中、ジャックのグループは黒服の男のグループに遭遇する。ジャックは黒服の男を殺そうと思っていることを彼自身に明かし、グループは合流して島の心臓へと進む。ジャックはジェイコブが餌ではなく武器としてデズモンドを島に送り込んだと思われるため、デズモンドは黒服の男を殺せると考えていた。デズモンドは島の心臓に入ると別の場所へたどり着くため、島を壊しても黒服の男を殺しても意味がないとジャックに話す。ジャックと黒服の男はデズモンドを島の心臓の下層部に降ろし、デズモンドは中央に石の栓がある光るプールを目撃する。プールのエネルギーに耐性があるデズモンドは中央の石の栓を取り外す。すると光が消え、プールは干上がり、そして黒服の男の予想通り島の崩壊が始まる。またこの結果、黒服の男の不死の能力も失われた。ジャックとの激しい格闘の末、黒服の男はケイトに背後から撃たれてジャックから崖下へと突き落とされる。島の崩壊は進み、ジャックは止めるために心臓を元に戻すと言う。彼はケイトにクレア・リトルトン（エミリー・デ・レイヴィン）を飛行機に乗せて脱出するように言った。2人が愛の告白し合った後、ケイトはソーヤーやマイルズ達と脱出するため海へと飛び込み、ジャックはハーリーとベンと共にし島の心臓へと戻った。ケイトとソーヤーはデズモンドのエリザベス号でハイドラ島に到着する一方、ラピーダス、リチャード、マイルズはアジラ航空機を動かす準備をする。ケイトはクレアと遭遇すると、帰郷を拒否する彼女に対してアーロンを育てるのを手伝うと言って説得する。ケイト、ソーヤー、クレアが飛行機に乗り込んだ後、ラピーダスは離陸させる。ジャックはハーリーとベンと共に島の心臓にたどり着き、そこでジャックはハーリーに島を護る役割を引き継ぐように説得、そしてハーリーが常にリーダーであるはずだったと述べる。ハーリーとベンはジャックを下層部に降ろし、かろうじて意識のあるデズモンドが発見され、救い出される。ジャックは石の栓をすると再び光が輝き始め、ジャックは光に包まれる。新たな島の守護者となったハーリーは自分が何をすべきか分からないでいた。ベンはデズモンドを故郷に戻そうと言い、ジェイコブのやり方よりも良い方法で島を守れるかも知れないと語る。ハーリーがベンに協力するように言うと、彼はそれを光栄に思った。負傷したジャックは川沿いに森を進む。