2006年3月31日に財団法人久留米市鳥類センターが解散し、同年4月1日に財団法人久留米市都市公園管理センターと統合を行って、経営が移管された。この際に園の名称は「財団法人久留米市都市公園管理センター 久留米市鳥類センター」となった。2008年4月1日に、財団法人城島地区筑後川水辺環境整備センターと統合し、のち2011年9月1日に、財団法人久留米市都市公園管理センターは、公益財団法人となった。
1997年にモモイロペリカン、アカガオヤブトリ、ニシムラサキエボシドリ、ムジエボシドリ、1998年にセキショクヤケイ、アメリカオシ、コクチョウ、ミニブタ、キジ類、ショウコク、トウテンコウ、ベニコンゴウインコ、カラカラ、シチメンチョウ、1999年にニホンキジ、ケープペンギン、ボリビアリスザル、コサンケイ、カピバラ、ジトッコ、2000年にコブハクチョウ、ムラサキテリムクドリ、2001年、ロップイヤード、アオバネワライカワセミ、2002年にマクジャクなどの動物種が増えている。
1985年頃から、施設や動物舎の改築・増築・新築を行っている。また1986年にアライグマの公開が行われる。1989年にはアジア太平洋博覧会協会のバードカントリーにウミウを出展している。この時期、入場者は増え続け、1991年にピークの154,068人を迎えている。1990-1991年に園内工事が行われた。園内広場が舗装され、古い放鳥舎は撤去されて、新しい放鳥舎が新設された。1992-1994年には、3年に渡って園内の環境整備を行い、「見やすく、学びやすく、遊びやすく」をテーマにした鳥類センターにリニューアルされた。この時期、ヒクイドリ、エミュー舎やリスザル舎、17連舎ができている。1995年3月、ドーム型バードケージ（中央ドーム）が完成し、園のシンボルとなっている。1997年11月には入園者通算350万人の記念式典が開かれる。1998年2月に園内にヒラドツツジが100本、ヒイラギが55本、それぞれ植樹された。1999年9月にケープペンギン舎が完成し、ベニコンゴウインコ舎も改修されている。
1964年4月1日に久留米市の外郭団体である財団法人久留米市鳥類センターに経営が移管され、「久留米市鳥類センター」となる。その後の1967年2月に、東櫛原町中央公園に移転が決定し、1969年1月から着工する（1974年7月に工事完成）。1969年10月には「三本松動物園」は閉鎖されて、動物園は1970年1月に中央公園に移転する。1974年5月28日、園は福岡県甘木農林事務所より「久留米傷病野生鳥獣医療所」を受託し、傷ついた動物の受け入れを開始する。また、1976年に園内にスライダーを備えた流水プールが開業し、翌1977年には遊園地も開業する。
1952年に戦後の荒廃した世の中で子供たちのために動物園計画が持ち上がり、子どもたちの心を癒す動物園づくりと市民の奉仕活動とが行われた。市内外からの動物の募集（寄付）が始まり、1954年1月1日に久留米市役所近くの三本松公園に、市民手作りの、市営で無料の久留米市動物園が、25種77点、約1,000m²の規模で開園する。開園当初の正月三が日（さんがにち）で、7万5000人を超える入園者があった。1954年2月には園の「動物友の会」が結成されている。三本松動物園（久留米市動物園）は当初はクマも展示する動物園である。1954年12月に上野動物園と、ひとつがいのインドクジャクをムササビ4頭と交換したのをはじまりに、インドクジャクの繁殖作戦を展開し、1962年8月までにクジャクが200羽となり、また同年10月、野中町の正源寺に孵化場を新設（～1969年7月）し、1963年8月20日に600羽のクジャクを繁殖させることに成功した。8年目に一千羽に到達し、｢千羽孔雀｣となったことで、「日本一の孔雀園」と日本全国的に有名となっている。
ガンダムシリーズに登場するMS（モビルスーツ）やMA（モビルアーマー）などの兵器を立体化したプラモデル、通称「ガンプラ」を題材とした作品。自分で組み立てたガンプラを仮想世界で操縦して戦うゲームが流行しているという設定の2009年の日本を舞台に、謎のガンダムを購入したガンプラ初心者の主人公が、ガンプラの楽しさや工作技術を学んでいくという内容になっている。実在のガンプラやイベントが登場し、劇中で「ガンダムのアニメ」として2009年の短編アニメ「GUNDAM PERFECT MISSION」の映像が劇中アニメとして使用される一方、物語の中心には架空のゲームが据えられており、虚実を混ぜ合わせた物語世界が構築されている。全3話のエピソードは、いずれも10分から15分弱程度の短編となっており、それぞれ第1部「パーツA」、第2部「パーツB」、第3部「パーツC」と呼称される。各エピソードは2010年8月から12月にかけて、BS放送の特別番組やインターネット番組として公開された（詳細は「#放送情報」を参照）。2010年12月22日には全3部作を収録したBlu-rayとDVDが発売された。また、アニメ版の内容を元にストーリーを膨らませたコミカライズ版が『ケロケロエース』で連載されたほか、複数の模型誌上で外伝作品が連載された。本作が制作されてから3年後の2013年には、本作と同様にガンプラを戦わせる設定のテレビアニメ『ガンダムビルドファイターズ』が放送されており、設定やストーリー上の繋がりはないものの、脚本には本作と同様に黒田洋介が参加しており、本作に登場した「ベアッガイ」や「ビギニングガンダム」などのガンプラも登場している。