旧幕臣で当時山口県令を務めていた関口隆吉の次男として現在の山口市道場門前に生まれる。「出」という名は、父親が山口県と山形県の県令だったことから「山」という字を重ねて命名された。1889年（明治22年）4月に父・隆吉が機関車事故により不慮の死を遂げた後、徳川慶喜家の家扶で、慶喜の側室新村信の養父にあたり元小姓頭取の新村猛雄の養子となる。慶喜の多彩な趣味のひとつに写真撮影があったが、彼の遺した写真の中には若き日の出の姿を写したものもある。出は慶喜家で子弟の家庭教師も務めていた。静岡尋常中学、第一高等学校を経て、1899年（明治32年）、東京帝国大学文科大学博言学科卒業。在学中は上田萬年の指導を受けた。この頃からの友人として亀田次郎がおり、のちに『音韻分布図』を共同して出版した。国語研究室助手を経て、1902年（明治35年）に東京高等師範学校教授となり、1904年（明治37年）には東京帝国大学助教授を兼任した。1906年（明治38年）から1909年（同41年）までイギリス・ドイツ・フランスに留学し、言語学研究に従事する。その間、1907年（明治39年）に京都帝国大学助教授、帰朝後に同教授となった。言語学講座を担当し、1910年（明治43年）には文学博士、1928年（昭和3年）には帝国学士院会員となる。1936年（昭和10年）に定年退官した。終生京都に在住して辞書編纂に専念し、1955年（昭和30年）に初版が発刊された『広辞苑』の編纂・著者として知られる。息子の新村猛がこの共同作業に当たった。出は新仮名遣いに反対し、当初予定の『廣辭苑』が『広辞苑』に変更になったときは一晩泣き明かしたという。そのため『広辞苑』の前文は、新仮名遣いでも旧仮名遣いでも同じになるように書き、せめてものの抵抗した。出はまた形容動詞を認めなかったため『広辞苑』には形容動詞の概念がない。新村はまたエスペランティストでもあった。1908年にドレスデンで行われた第4回世界エスペラント大会に日本政府代表としてJEA代表の黒板勝美とともに参加している。1956年（昭和31年）文化勲章受章。1967年（昭和42年）の死去時に賜銀杯一組。没後にその業績は『全集』（筑摩書房）にまとめられた。南蛮交易研究や吉利支丹文学（キリシタン版関連）は平凡社東洋文庫などで再刊されている。出の業績を記念し1982年（昭和57年）から、優れた日本語学や言語学の研究者や団体に対し毎年「新村出賞」が授与されている。
1957年、ギリシャ人移民の子としてアイオワ州ダビュークに生まれる。14歳のときに写真への興味を持つようになり、ミズーリ大学において写真ジャーナリズムを学んだ。1980年、24歳の時にナショナルジオグラフィック協会に職を得て以後17年間に渡ってナショナルジオグラフィック誌に係わった。この期間に結婚し、二人の子供をもうけた。写真においては幾つかの受賞歴があるほか、「タイム」、「ニューズウィーク」、「ニューヨーク・タイムズマガジン」、「スポーツ・イラストレイテッド」などの雑誌に採用された実績がある。2005年、非営利団体・海洋保全協会（Oceanic Preservation Society, OPS）を共同で設立した。同協会の目的は、海洋の実際を知らしめ、将来に渡って今以上に豊かな環境を実現することであるとされる。2009年、長編ドキュメンタリー映画『ザ・コーヴ』を公開した。リック・オバリー、ジム・クラークらとともに、日本の和歌山県太地町におけるイルカ漁について世界中の耳目を集めることを意図して製作されている。また、日本政府からの撮影許可が得られなかったため、当映画の撮影隊が狙い通り撮影シーンを得るためには、通常のドキュメンタリー映画では決して使われたことのないような小道具や方策や駆使し、大変な長時間を要し盗撮を行った（この点に関して『ザ・コーヴ』の元カメラマンは、ドラマチックに盛り上げるための演出であると『ビハインド・ザ・コーヴ』で語っている）。さらにこの映画では、国際捕鯨委員会（IWC）を取り上げ、イルカのような小型クジラ目の保護提案が日本などの反対により否決されたことを紹介している。さらに、この映画では日本政府がイルカ肉を日本の学校児童に食べさせるプログラムを行っていることをとりあげつつ、“イルカ肉を食した人間が水銀中毒になる”ことを警告している（この点に関して、太地町小学校では「イルカ肉を児童に食べさせたことはない」と『ビハインド・ザ・コーヴ』で反論している）。同年、東京六本木で日本のネットメディアの取材に答え、菜食主義者になったきっかけが「1986年に屠殺場を見た経験から牛や豚を食べられなくなった」と答えている。また、映画の中で日本政府が魚に含まれている水銀情報を隠蔽していると何度も繰り返していることに対し、実際は厚生労働省が60の種別にわけてデータ公開していると問われると、「たしかに政府は公開しているがネットでは見ない人もいる」として、一部事実誤認を認める発言をしている。さらに、日本国内での上映が実現した背景として、「日本の政権交代が行なわれたから。自民党がすべてをコントロールしていた時代では無理だっただろう」と発言している。2010年3月、『ザ・コーヴ』は、アカデミー長編ドキュメンタリー映画賞を受賞した。関西地方の和歌山大学にて東京都の「非実在青少年・創作物規制」に絡めてイルカ漁禁止と非実在青少年創作物規制は精神面では全く同一の物で、賛成だとシホヨスは語った。2010年2月に、和歌山県太地町で日本語に吹き替えた『ザ・コーヴ』のコピーされたDVDが「海を考えるグループ」の名前で多数の住民の自宅や漁協に送りつけられた事件で3月にシホヨスが送ったことを明かし、送った理由は「映画は日本各地で上映中止になったので、住民に見る機会を与えたいと思った。特にイルカの肉には高い濃度の水銀が含まれることを知って欲しかった。太地町を攻撃したいのではなく思いやりの気持ちからやった。私からのラブレターだと思って欲しい」と語り、漁師を凶悪犯、暴漢と罵った。また、特別な日本語吹き替え版を作成し、制作費や送料はすべてシホヨスが負担した。そして、コピーや郵送の作業は日本の環境保護の団体「海を考えるグループ」が行ったと語った。