1997年シーズン途中の7月31日にセントルイス・カージナルスへ移籍する。この年のア・リーグ、ナ・リーグのHR王はそれぞれ54本のケン・グリフィー・ジュニア、49本のラリー・ウォーカーであるが、移籍前に34本、移籍後に24本の計58本を打ったマグワイアはリーグをまたいで移籍したため規定によりHR王とは認定されなかった。1998年にはサミー・ソーサとのシーズン最多本塁打記録争いを演じ、最終的に1シーズン70本の当時の新記録を達成し、ソーサと共にスポーツ・イラストレイテッド誌の「スポーツマン・オブ・ザ・イヤー」に選出される。同年にロジャー・マリスのシーズン61本塁打の記録を破る試合にマリスの一族を招待した。この年の70号本塁打ボールは翌年1月のオークションにて3,054,000ドルで販売され、オークションにおける史上最も高額な野球に関する取引としてギネス世界記録に認定された当時のマグワイアはランディー・バーンズが金メダルを剥奪されたアンドロステンジオンを使用していたが、MLBでは禁止されていなかったことと野球メディアもマグワイアを擁護する論調を展開したことから、記録に疑問を持つ人は少なかった。しかし道義的に良くないと追及されたため、翌年から薬物をやめた。チームメートだったホセ・カンセコはその著書『禁断の肉体改造』の中でマグワイアは本当は、既に当時から道義的に使用を問題視されていたアナボリックステロイドを使用しており、その隠蔽としてのリークであったと指摘している。 前後を主にレイ・ランクフォードとブライアン・ジョーダンが固めた。1999年も65本塁打を放ち、本塁打王となったが、2000年・2001年はいずれも故障のため、出場試合は100を切り、2001年限りで引退した。ただし最後の2年も100に満たない出場試合数ながらも、30本前後の本塁打を放った。
1984年のMLBドラフト1巡目（全体10位）でオークランド・アスレチックスから指名され、プロ入り。1986年8月22日にメジャーデビューし、1987年には当時のMLBの新人の本塁打記録（38本）を上回る49本塁打を放ち、本塁打王を獲得すると共に、満票でア・リーグ新人王に選出された。1996年から1999年まで4シーズン連続で50本塁打以上を放つ。その打球速度の凄まじさは、木田優夫曰く「マグワイアが打席に入るたびに、危険なので三塁コーチがフェンス際まで避難するほどだった」という。アスレチックス時代はチームメートのホセ・カンセコと共に本塁打を量産し、バッシュ・ブラザーズと呼ばれた。
ダミエン高等学校時代は投手としても登板していた。1981年のMLBドラフト8巡目（全体199位）でモントリオール・エクスポズから指名されたが、契約せずに南カリフォルニア大学へ進学した。大学進学後に本格的に野手転向し、1983年には第12回日米大学野球選手権大会のメンバーとして来日、1984年にはロサンゼルスオリンピックで公開競技として行われた野球競技にアメリカ代表として出場し、銀メダルを獲得している。大学時代はランディ・ジョンソンとチームメイトだった。
専門は、文化人類学、文化政策論、パブリック・ディプロマシー論、アメリカ研究。2004年、ハーバード大学へ提出した博士論文をもとにした処女作『アフター・アメリカ　ボストニアンの軌跡と＜文化の政治学＞』でサントリー学芸賞、アメリカ学会清水博賞、義塾賞など受賞。日本学術振興会賞、日本学士院学術奨励賞受賞。現代アメリカやパブリック・ディプロマシーに関する第一人者でメディアに頻出する。書評に定評があり、読売新聞と朝日新聞で書評委員を歴任。近年、カルチュラル・セキュリティ（Cultural Security）という概念を提唱しており国際的に注目されている。2015年の慶應義塾大学の入学式で教職員代表として祝辞を述べた。
1964年（昭和39年）に75歳で鶴見教会牧師を辞職。新築した希望ヶ丘の自宅に移り、長年の願望出会った文書伝道に力を注いだ。1980年（昭和55年）2月13日午前10時45分自宅にて死去（90歳）。
ヘイブリルは長年フロンティアの町であり、時としてはインディアンの襲撃に遭い、ヌーベルフランスからのフランス植民地軍が伴われる場合もあった。ウィリアム王戦争の時、ハンナ・ダスティンが1697年のヘイブリル襲撃で捕まえられた後に、カトリック教徒に改宗していたインディアン捕獲者を殺し、頭皮を剥いだことで有名になった。ヘイブリルはアメリカ合衆国で最初に1人の女性を称える像を建てたことで有名になった。19世紀後半、グランドアーミー・レパブリック公園にダスティンを記念する像を発注したのは、毛織物工場の大物であるエゼキエル・J・M・ヘイルだった。ダスティンの像は斧を振りかざし、アベナキ族の頭皮数枚を見せている。ダスティンが捕虜になっていたときの話やその後の脱出、さらに捕まえた者への報復は、著作家コットン・バザーの注意を惹き、彼女に関する作品を書き、彼女は植民地の指導者からインディアンの頭皮に対して報償を要求した。ハンナ・ダスティンはその生涯を通じて論議が多く、彼女が逃げるために殺して頭皮を剥いだというインディアンは彼女を捕まえた者ではなく、また殺した者の中には幼い子供もいたとされたことから、さらに議論を呼んだ（ハンナは問題のある家族でハンナ・エマーソンとして生まれていた。1676年にはその父のマイケル・エマーソンが12歳の娘エリザベスに対する過剰な暴力で罰金を科され、1693年には非嫡出の双子姉妹の死を隠したことで絞首刑にされていた。1683年ハンナの姉妹メアリーは姦淫で鞭打ち刑になっていた）。1708年、アン女王戦争のとき、当時30家族がいた町は、フランス人、アルゴンキン族、アベナキ族インディアンに襲撃された。他の多くの町と同様に、ヘイブリルは何度か疫病にも災いされた。1735年11月17日アkら1737年12月31日の間で、ヘイブリルでは256人の子供がジフテリアで死んだ。ジョージ・ワシントンが1789年11月4日にヘイブリルを訪問した。ワシントンはニューイングランドを巡行する「勝利の巡回」の途上にあった。