島式ホーム2面4線で、待避設備（1・4番線）を有する高架駅。成田空港駅への乗り入れ開始に合わせて改良工事が行われ、現在の形態となった。ホームの有効長は8両分ある。改札階とホームを結ぶエレベーターが設置されている。以前は町屋管区の傘下（助役配置）であったが、管区再編により町屋から移管され、千住大橋管区（駅長配置）として町屋駅 - 堀切菖蒲園駅間の各駅を管轄している。かつては急行も停車し、一部の急行列車は緩急接続を行っていたが、2002年10月12日に行われたダイヤ改正より普通列車のみの停車となっていた。その後は朝夕時間帯において優等列車の通過待避が行われていたが、2010年7月17日のダイヤ改正からは快速が当駅に停車し、再び緩急接続が図られている（ただし昼間時は京成上野発着の快速は運行されないため、普通しか停車しない）。2003年までは行灯式の接近表示器が使われていたが、以降はLED式発車標が稼動している。上野方に下り→上りの渡り線があり、3・4番線からも上野方面へ発車できるように信号が設置されている。
ローマ帝国時代、マノスクは地域の市場町であった。マノスクについて記述された最古のものは、986年に発生したサラセン人の襲撃である。町は完全に破壊され、住民たちは周辺の5つの村へ避難していた。村の中で最も重要なのは、モンドール山地の城、丘の上のトゥト・オールであった。マノスクから遠く離れていたモンテギュ村は16世紀まで人が暮らしていた。マノスク旧市街にある大理石製の板には、オスコ・デ・マノスコ（Osco de Manosco）の名で町が再建されたことが刻まれている。荘園の権利は、マルセイユのサン・ヴィクトル修道院、フォルカルキエ伯爵、サン＝ジャン病院の三者が1790年まで共有していた。マノスクはプロヴァンス伯の代官区であった。中世のマノスクは4つの区に分かれていた。12世紀には聖ヨハネ騎士団が軍区を置いた。13世紀のマノスクは商業が盛んで、人口は1万人近くあった。14世紀の百年戦争の不安、戦場を離れた傭兵たちの群れが社会を脅かし、町は防衛設備を強化させた。1509年、地震がマノスクを襲った。宗教改革はマノスクである程度の成功をおさめ、一部がユグノーとなった。ユグノー戦争にもかかわらず、新教徒たちはナントの勅令によって17世紀には自分たちの教会の周りで暮らしていた。しかし1688年のナントの勅令廃止がこのコミュニティーに追い討ちをかけ、一部はカトリックに改宗させられ、一部は町を去っていった。18世紀、マノスクでは市が開催されていた。この時代のマノスク旧市街は現在と同じ規模となり、東へ拡大していった。マノスクは、プロヴァンス全体を大きく損なった伝染病流行に影響を受けた（1720年はペスト、1834年はコレラ）。フランス革命中の1791年後半、政治的クラブが結成された。マルセイユのクラブとの抗争にマノスクのクラブは破れ、反動化した。騎士団の城は国有化を宣言され、競売にかけられた後取り壊された。現在そこは広い広場となっている。1851年12月2日クーデター（fr）において、市長ジョゼフ・ビュイッソンはプロヴァンスにおける抵抗運動の柱となり、ディーニュに共和国臨時政府を設置した。20世紀初頭の大規模集落は、旧市街とその近郊に限定され、マノスクの人口は1950年代から1970年代までの間に4倍となった。
2018年1月以降はすべて養老線管理機構の所有で、養老鉄道に無償で貸与している。2014年4月から2017年12月までは養老鉄道の所有であった。2014年3月までは近鉄の所有で、養老鉄道はそれを借り受けて運行していた。日常の検修業務は近鉄時代と同じく西大垣にて行われ、大規模な検修も同じく近鉄の塩浜検修車庫にて行われる。検修業務は養老鉄道では行わず、近鉄により実施される。車両の塗色は、2008年7月6日の営業運転を最後に全車両が近鉄時代のマルーンの旧色1色塗装に戻されたが、2009年9月に600系1編成 (606F) がかつて走行していた近鉄南大阪線時代の「ラビットカー」と同じオレンジバーミリオン地に白帯を巻いた塗装に変更を受けている。電気検測は引き続き近鉄所有の「はかるくん」（モワ24系）で行われている。公有民営方式に移行した2018年以降も同車で検測が行われている。2018年度からは、東京急行電鉄（東急）池上線・東急多摩川線で使用されていた7700系電車15両を東急テクノシステムから購入し、2018年度に3両編成2本、2019年度に3両編成1本と2両編成3本の計6編成15両を導入して、老朽化した既存車両31両の約半数の15両を置き換える予定である。今回導入される15両は2018年の9月から12月にかけて陸送され、このうち2018年度導入の3両編成2本の計6両は近鉄の塩浜検修車庫に直接輸送され、2019年度導入の3両編成1本と2両編成3本の計9両は同年度に改造を行うため、西大垣駅に留置される予定である。塩浜検修車庫に陸送された3両編成2本の計6両は、ここで機器類の養老線仕様への変更、先頭車にワンマン運転時に使用される運賃箱とデジタル表示の運賃表示板の設置、編成内の1両に車椅子スペースの設置、一部の3両編成の中間車に転換式クロスシート8席の設置などの各種の改造を行う。車体の外観デザインは、養老鉄道オリジナルの「緑帯」と「緑歌舞伎」、東急電鉄オリジナルの「赤帯」と「赤歌舞伎」の計4種類とする予定である。2019年4月27日より営業運転を開始した。2019年6月、サンリオとコラボレーションして、在来車1編成をハローキティのラッピング列車として走らせると、大垣市のイベントで発表し、600系601Fを使用して同年7月13日から運行が始まった。11月30日まで運行される。