1590年に国王秘書長官を務めていたウォルシンガムが死去した。バーリー卿は次男ロバートを後任に据えようとしたが、エリザベスが若年すぎると難色を示したため、国王秘書長官職はしばらく空席のままでバーリー卿が国王秘書長官の職務を代行することになった。しかしバーリー卿とロバートは常に一緒に仕事をしていたので、1591年秋頃には「国務の全てはセシル親子が牛耳っている」とまで評されるようになったというこの頃から女王の寵臣であるエセックス伯ロバート・デヴァルーとセシル親子の対立が深まった。エセックス伯爵はエリザベスと血縁関係があり、また野心的な美男子だったため、女王や国民からの人気が高かった。特に都市とその選挙区における彼の人気は絶大であり、セシル親子の権勢さえも脅かすものがあった。1593年の法務総裁の人事問題や1594年の女王侍医ロドリゴ・ロペスの事件をめぐって両者は鋭く対立した。またスペインとの戦争をめぐってはエセックス伯が主戦派だったのに対して、セシル親子は和平派だった。1596年7月には息子ロバートが国王秘書長官に任命された1598年8月4日午前5時に78歳で死去した。エリザベス女王即位から40年にわたって女王を支え続けた人生だった。バーリー男爵の爵位は長男トマスが継承した。
1571年2月25日にバーリー男爵に叙され、貴族となった。これまでセシルは議会の庶民院においても庶民院運営を巧みにリードする存在であったが、貴族に叙せられたことで貴族院議員に転じることになった。以降の庶民院運営の主導権はウォルシンガムらに移ったが、彼らはセシルほど円滑にやれず、特許権などをめぐって政府と議会の対立が激化していった。スペインとの緊張が高まっていく中、宮廷内ではレスター伯やウォルシンガムが対スペイン主戦論を唱えたが、セシルは開戦に慎重でエリザベスもセシルの助言に従って1585年まではスペインとの戦争を避けた。ちなみにセシルとレスター伯は敵対関係だったが、セシルとウォルシンガムは戦争についての意見が食い違いながらも敵対的な関係ではなく、むしろウォルシンガムは最重臣セシルの補完者のような存在であり続けた。
1570年2月に教皇ピウス5世がエリザベスを破門したため、以降イエズス会士などカトリック宣教師がイングランドに潜入してきて反エリザベス謀議を行うようになった。セシルはすでにフランシス・ウォルシンガムのもとに秘密警察的な情報組織を完成させており、女王暗殺謀議は即時に取り締まった。1571年にはリドルフィ陰謀事件を摘発した。これは教皇に忠実なフィレンツェの銀行家ロベルト・ディ・リドルフィが中心になって立案した計画で、ネーデルラントのスペイン軍をイングランド南岸に上陸させ、それに乗じてノーフォーク公とメアリーが反乱を起こし、2人がイングランドとスコットランドの王位についてカトリック信仰を復活させるという計画だった。セシルとウォルシンガムは、陰謀の中心人物としてノーフォーク公を逮捕させ、裁判にかけて死刑に処し（リドルフィにはイングランド外に逃げられた）、駐英スペイン大使にもイングランド退去を命じた。
1568年12月、ネーデルラントで反乱鎮圧に当たるアルバ公への軍資金を乗せたスペイン船が悪天候とユグノー派海賊の追跡から逃れるためにイングランド南岸に寄港する事件があったが、これを知ったセシルは女王に進言してこの船に積んである軍資金を全て没収させた。これに対抗してアルバ公がネーデルラントにいるイングランド人を逮捕してその財産を没収すると、エリザベスもこれに対抗してスペイン人とフランドル人の財産を没収した。この一連の騒ぎでイングランドとスペインの関係は決定的に悪化したため、イングランド国内でもセシル批判が高まった。反セシルの機運が高まる中、1569年にはセシル排除の計画が、イングランド亡命中のスコットランド前女王メアリーとノーフォーク公トマス・ハワードの結婚計画と合わせて盛り上がりを見せていた。ノーサンバランド伯トマス・パーシーやウェストモーランド伯チャールズ・ネヴィルらカトリック北部諸侯と駐英スペイン大使がこの計画の中心であり、メアリーも前向きだった。宮廷内のセシルのライバルであるレスター伯も一時この計画に協力していた。しかし反セシルだけではなく、反エリザベス色も強い計画だったため、後にレスター伯は計画から手を引いた。ノーフォーク公も手を引こうとしたが、ノーフォーク公は1569年10月にロンドン塔に幽閉された。カトリック北部諸侯は11月に反乱を起こしたが、スペインが援軍を送らなかったため、失敗に終わった。この北部諸侯の乱によってセシルの権勢はむしろ強化された。
1982年、ブラジル政府は初の南極探検隊を送り込み、1年後に同国初の基地を建設する（南極大陸での活動において死んだ海軍士官にちなみ、コマンダンテ・フェラスと名付けられた）。建設以来、通年基地として機能している。南極におけるブラジルの立場は新参者だが、特に1964年から1985年にかけての軍事政権下において、ブラジルの地政学者は南極に対する国家の政策に大きな影響力を持っていた。ただし、ブラジルではアルゼンチンやチリとは異なり、南極における領有権に対する国民の意識は薄かった。1991年2月、フェルナンド・コロール・デ・メロ大統領はブラジルの南極基地を3日間訪れ、ブラジルはこの領域に関心があると再び主張した。メロは南極大陸に足を踏み入れた初のブラジル大統領となった。2008年1月、ブラジル議会のブラジル領南極委員会の議員13人が同国南極基地を訪れた。2009年1月には別の議員が訪れている。2008年2月16日、ルイス・イナシオ・ルーラ・ダ・シルヴァ大統領と、夫人のマリサ・レティシア・ルーラ・ダ・シルヴァを含む23人の代表団がブラジルの南極基地を訪れた。ブラジル政府はこの大統領の訪問を、同国の科学者や軍人の仕事を支持する「政治的な意思表明」と位置づけた。2009年、ブラジルは南極氷床に初の国家的な科学的探検を実施した。探検はパトリオットヒルズ、そしてエルズワース湖（氷底湖）の領域に沿って、大気圏、雪氷学、地質学、そして地球物理学の見地から総合的に行われた。2回目の調査は2011年11月上旬に予定されており、その際には調査員が南極点から約500キロ、コマンダンテ・フェラス基地 (EACF) から約2,500キロ離れた場所に監視局（さらに上級の基地）を設置する予定である。