シャーマーはドキュメンタリーなどのいくつかのテレビ番組に出演したことがある。また、会議でのスピーチや講演も定期的に行っている。1994年、Donahue に出演し、ホロコースト否認論者と討論した。1995年には、オプラ・ウィンフリー・ショーで自称超能力者のローズマリー・アルテアと対峙した。2004年には Penn & Teller の Bullshit! に出演し、聖書は「架空の物語」であり、書かれている事象を文字通りに解釈することは「聖書の論点を外れることになる」と主張した。1994年から1995年にかけて、シャーマーはNBCの超常現象などを扱う番組 The Other Side にしばしば出演した。彼は、懐疑主義的指向も加えて両論を戦わせるような番組にすべきだと提案した。直接それが受け入れられることはなかったが、数年後その意見を採用した Exploring the Unknown という番組のプロデューサー兼司会となった。この番組は毎回20万ドルの予算をかけ、彼が Skeptics Society や Skeptic 誌で行ってきたことの延長上にあるような内容だった。いかがわしそうなタイトルにしたのは、ゲストや視聴者に番組の懐疑主義的性質を隠す意味があった。Exploring the Unknown の断片はシャーマーのYouTubeチャンネルで見ることができる。2006年から3年間、シャーマーは Beyond Belief で講演を行った。2006年のTEDカンファレンス では "Why people believe strange things" というテーマで講演した。
シャーマーは、不合理で実証不十分な信念が至る所にあることを説明する本をいくつか書いている。1997年の『なぜ人はニセ科学を信じるのか』では、様々な奇妙な考えや団体（カルトなど）を検討したもので、マーティン・ガードナーの懐疑主義を受け継いでいる。2002年には改訂増補版が出版された。How We Believe: The Search for God in an Age of Science では、信仰を心理学的に分析している。2002年初め、シャーマーのサイエンティフィック・アメリカン誌でのコラムで、クラークの三法則をひねった Shermer's Last Law を紹介している（十分に進化した地球外知性体は神と区別がつかない）。2002年、Alex Grobman との共著 Denying History: Who Says the Holocaust Never Happened and Why Do They Say It? を出版。同書では、ホロコースト否認運動を検証し反論している。様々な否認論者とも会った上で書かれており、偽史を扱う最良の手段は言論の自由であると結論付けている。2005年、Science Friction: Where the Known Meets the Unknown を刊行。2006年の Why Darwin Matters: The Case Against Intelligent Design はインテリジェント・デザインへの批判をこめて,進化をサポートする論点をひとつひとつ整理している。また同書は科学が信仰を無効化するわけではないことを示し、キリスト教徒や保守主義者も進化論を受け入れるべき（受け入れられる）としている。シャーマーは地球温暖化について科学的観点から懐疑主義的立場を表明していたが、2006年6月、これまでの証拠の蓄積を考慮すると地球温暖化を否定する立場をもはや防御できないと書いている。The Mind of The Market: Compassionate Apes, Competitive Humans, and Other Tales from Evolutionary Economics は2007年に出版された。この中でシャーマーは現代の動きを進化論から説明しようとするいくつかの研究を紹介している。
1992年、シャーマーは Skeptics Society を創設し、Skeptic 誌を刊行した。同協会は現在55,000人以上の会員を有する。さらに同協会は Caltech Lecture Series を主催しており、科学、心理学、社会問題、宗教、懐疑主義などをテーマとした講演を行っている。過去の講演者としては、スティーヴン・ジェイ・グールド、ジャレド・ダイアモンド、リチャード・ドーキンス、フィリップ・ジンバルドー、スティーブン・ピンカー、デビッド・ボルティモア、リサ・ランドール、ダニエル・デネット、ミチオ・カク、スーザン・ブラックモア、クリストフ・コッホ、ビョルン・ロンボルグなど、多数の人がいる。講演は土曜の午後に行われ、最低限の料金で一般にも公開されている。
第1期は2016年7月より12月まで放送された。7月4日から11月4日まで平日の早朝にテレビ東京系列及び近畿地方の独立テレビ3局（びわ湖放送・奈良テレビ放送・テレビ和歌山）で放送される『おはスタ』内の短編アニメとして最速放送し、まとめた5話分を30分枠でテレビ東京・テレビ愛知・テレビ大阪で翌週月曜1時35分（日曜深夜）に放送するという変則的な放送形態を採っていた。11月7日から2017年1月5日まで本放送を月曜1時35分（日曜深夜）に、『おはスタ』内では毎週水曜日にセレクション放送をしていた。原作を忠実に再現しているが、『おはスタ』内で放送していることもあり放送コードの関係上残酷とみられるセリフやシーンは省略されている。時折挿入されるナレーションは古川慎が担当。第2期は第1期最終回の放送で制作が発表され、2018年1月17日から6月27日まで第1期と同様にテレビ東京系列にて放送された。第1期とは異なり深夜枠のみの放送となり、放送局も上記の3局に加えて『おはスタ』版を放送していたテレビ北海道・テレビせとうち・TVQ九州放送が追加されている。また、本放送前週の1月10日に事前特番『「斉木楠雄のΨ難」第2期放送直前 アニメΨ始動!おかえりなΨスペシャル!』が放送された。また、『おはスタ』の全編収録回で傑作選も放送されている。また、第2期第1話で、『銀魂』とコラボした。完結編は、第2期最終話、および第2期公式サイトにて6月28日に新作アニメの制作が発表され、ティザービジュアルも公開された。9月3日には完結編の制作が発表され、12月1日に開催された本作のイベント内で放送日時が発表された。テレビ東京系列にて12月28日朝7時35分 - 8時30分に年末特番として放送。また、2期1話、最終話に登場した三上愛子（でんぱ組.incの相沢梨紗が声を担当）もオリジナル演出で登場する。Ψ始動編は、2019年3月24日に行われたAnimeJapanのNetflixの斉木楠雄のΨ難ステージにて、斉木楠雄役の神谷浩史と照橋心美役の茅野愛衣が登場し、新シリーズの製作発表し、Netflix独占で配信をする事を発表した。10月12日には、今季冬から配信する事を発表し、井口工役を鳥海浩輔、鈴宮陽衣役を東山奈央が演じる事が発表された。2019年10月23日には、2019年12月30日配信予定であることが発表された。