2005年3月4日、4時台の「電書鳩ポポー」終了後突然放送終了が決まったことが告知される。翌週（2005年3月11日）、わたなべヨシコは同じく2005年3月で放送終了となる「MEGA HITS RADIO」のエンディングに出演。さらにその日、当番組の3時台オープニングに「MEGA HITS RADIO」のパーソナリティ・岩本三千代が当番組宛にメッセージを贈った。また、以前はメールでのみの受付だったリスナーからのメッセージを、2005年3月に限りFAXでも受け付けた。2005年3月19日での放送では、わたなべヨシコへのドッキリとして、わたなべが尊敬するミュージシャンの山下達郎からのメッセージを放送。そして2005年3月25日、5年半の歴史に幕を閉じた（「MEGA HITS RADIO」も同日放送終了）。最終回の時は、BGMも曲も流さず（ただしこの番組にゆかりのある曲は流していた）、放送内容のほとんどをメッセージ紹介の時間にあてた。エンディングは、「パッヘルベルのカノン」をBGMにしながら、男性ナレーター（担当：ホズミックス）が過去在籍していたスタッフのあだ名や、この番組に関わった人たちの名前を読み上げ、そしてわたなべヨシコの涙まじりのコールが入り、最後はこの番組の挿入歌（詞はリスナーからアイデアを集めて作り、作曲はカンケという謎のミュージシャンが担当）だった「メイド・イン・キス」が流れるというものだった。なお、当番組と「MEGA HITS RADIO」の後番組は、深夜1時からの「ミッドナイトランブラー」（パーソナリティ:鈴木ダイ、オアシズ）。この番組も飛び乗り・飛び降りネットをする局が多いが、理由の1つに、「MEGA HITS RADIO」とこの番組を飛び乗り・飛び降りネットもしくはネットしていなかった局がその放送枠に放送している番組や、「放送室」の放送枠を確保するためであることが多い。
これは、JFNが行っているインターネットでのコミュニティーサイト。しんドルもサークルプレイヤーを運営していたが、この番組では35ものサークルを持ち、各地域別サークル（この番組の放送ネットから離脱した放送局のある地域にもあった）、「IR3交換日記」というスタッフの交換日記など多種多彩なサークルが存在していた。なお、現在もサークルプレイヤー自体の運営は続いている。（詳細はJFN Circle Playerまで）
IR3「Voices Of IR3 JAPAN」着声総数　148IR3→IR3se→IR3 JAPANオンエア通算　 284　　　　　　　IR3 JAPANオンエア通算　 191
「MEGA HITS RADIO」との枠入れ替えで当初の27:00から120分に戻る。10月ネット開始 HFM、Date fm（28:00から飛び乗り）、FM岡山（ネット再開）、Boy-FM（ネット再開）
MUSIC QUEST (TOKYO FM) が終了。25:00から120分の放送に戻る。4月ネット開始 FM中九州（現・エフエム熊本）、Kiss-FM KOBE、K-MIX、ふくしまFM、エフエム岩手　ネット飛び降り（〜26:00） ふくしまFM、エフエム青森　ネット飛び乗り（26:00〜） SMILE-FM、FM福井、FMとやま、FM-NIIGATA9月ネット終了 SMILE-FM、K-MIX、エフエム秋田
10月ネット開始　 なし　ネット飛び降り（〜26:00） μFM、エフエム青森　ネット飛び乗り（26:00〜） SMILE-FM、FM福井、FMとやま2003年3月ネット終了 FM岡山
「IR3se」→「IR3 JAPAN」にリニューアル。「Weiβ kreiz FM」終了。25:30開始に戻る。4月ネット開始 μFM、エフエム青森（ネット再開）　ネット飛び降り（〜26:00） μFM、エフエム青森　ネット飛び乗り（26:00〜） SMILE-FM、FM福井、FMとやま、FM-NIIGATA9月ネット終了　　なし
「Weiβ kreiz FM（ヴァイスクロイツエフエム）」（子安武人らが出演したJFN全国ネットで数少ないアニラジ）放送開始のため26:00スタート。10月ネット開始 FMとやま2002.3ネット終了 JOEU-FM
4月ネット開始 Radio80　ネット飛び降り（〜26:00） エフエム青森　ネット飛び乗り（26:00〜） SMILE-FM、FM福井、FM-NIIGATA9月ネット終了 エフエム青森（一時ネットから外れる）
富士見町・湘南深沢・西鎌倉・目白山下の各駅で列車交換（行き違い）ができる。単線ながら、早朝と夜間をのぞいて7.5分間隔の高頻度運転が行われており、すべての交換可能駅で列車交換が行われる「ネットダイヤ」を形成している。このため、これ以上運転間隔を短くすることはできない。大半の列車は大船 - 湘南江の島間の通しで運行されているが、途中駅の湘南深沢駅近くに深沢車庫があるため、朝晩の一部列車に同駅を起・終点とする列車の設定がある。また、ダイヤグラム上昼間の「大船発湘南江の島行き」列車でも途中の湘南深沢で車両交換が行われることがあるが、その場合は乗り換えを余儀なくされる。日本の多くの鉄道事業者が土曜・休日ダイヤを設定しているなかで、沿線に抱える大規模工場への通勤客輸送という側面を抱える当路線では土曜日の運転には平日ダイヤが適用されていたが、2016年6月1日のダイヤ改正で休日（土日・祝祭日）ダイヤに統合された。また、観光客対策として毎年8月の第1火曜日に開催される江の島花火大会当日は23時過ぎまで日中同様7分半間隔での臨時ダイヤで運転されている。なお、2007年3月18日は片瀬海岸を発着とする湘南国際マラソン大会への対策として休日ダイヤ適用日ながら平日ダイヤで運転されたほか、2010年まで、毎年元日は平日ダイヤで運転されていた。2018年12月31日から2019年1月1日にかけてには、全線45分間隔で終夜運転を行なった。2008年2月24日に発生した西鎌倉駅でのオーバーラン事故以来、12月22日まで臨時ダイヤで運転が行われていた。3月23日まで、平成初期まで存在していた大船 - 湘南深沢間を折り返し運行するシャトル便が朝晩を中心に一時的に復活したほか、開業以来設定されたことのなかった土曜日ダイヤの適用も行われていた。車両の夜間停泊は、車庫のある湘南深沢駅と湘南江の島駅で行われている。