上記のメカキングギドラの最高級品。初登場は第1シーズンのメカキングギドラ編だが、ここでは名前のみの登場で、実物が登場したのは第2シーズン完結編から。本作最後の敵怪獣でもある。怪獣自動販売機で販売されており、価格は1千万宇宙ゼニーで、ランクはスペシャルグレードA。地球に戻る途中で、ザグレスが購入する。尾以外はすべてメカで、両翼の形状が生身のキングギドラに近い。翼が大きく足が太い。また、カラーリングもメカキングギドラと比べると全体的に黒ずんだ色合いをしており、ところどころに赤い三角形のマーキングがある。武器は赤色のレーザー光線に加え、中央の首から吐く氷付け光線に命中したものはたちまち氷漬けになり、ゴジラも一時冷凍される。全体的な戦闘力も通常のメカキングギドラより高く、最高級品にふさわしい性能を有する。このほか、身体の一部が破損しても内部から修復プログラムを起動することで、自己修復が可能。地球攻撃隊隊長に再任命されたザグレスが、ワープゲート奪還のために乗ってゴジラアイランドを攻撃する。氷付け光線でGガード基地を氷付けにして一時的に基地の機能を麻痺させ、ゴジラすら凍結させるが、ザグレスを追って戻ってきたトレマの呼びかけで復活したゴジラに反撃されて一時退散し、終盤でふたたび登場する。このとき、ザグレスがいつの間にか購入していたトラクタービームを付け加えており、ワープゲートを奪おうとするが、そこに駆けつけたトレマのパンナトルテとミサトのタルトクープ、そして司令官の乗るメカゴジラとゴジラと戦闘になる。これにレーザー光線で応戦するもミサトたちの攻撃で左の首を破壊されたうえ、ゴジラを再度氷漬けにしようと放った氷付け光線もゴジラの熱線で押し返され、中央の首も破壊されてダウンする。次にザグレスは前記の修復プログラムを起動し、破壊された首が再生して復活するが、この直後にミサトがワープゲートの設定を逆転させたため、ザグレスごとワープゲートの向こうに吸い込まれる。通常のメカキングギドラ同様、「ハイパーメカギドラ」と呼ばれることが多い。『宇宙船 YEAR BOOK 1999』ではハイパーギドラと記載している。
X星人の操る宇宙怪獣として、第1シーズンの「キングギドラ編」に初登場。凶暴電波が消えて正気を取り戻したゴジラのもとへザグレスによって送り込まれ、ゴジラ、ラドン、子モスラと交戦して海に転落するが、ザグレスのヴァバルーダが放った「滋養強壮赤マンダドリンク光線」を浴び、3倍にパワーアップして復活する。しかし、ゴジラを圧倒するもトレマのミラクル念力を受けた影響で押されていき、宇宙へ退散する。その後、第2シーズンの「ミサト登場編」で怒ったランデスにより、宇宙から召還されて再登場する。Gガード基地を攻撃してモゲラを撃退し、駆けつけて来たゴジラを苦しめるが、ミサトにダンスグロビンを吸わされてダンスを踊らされ、撤退する。
3DCGモデルは監督の瀬下寛之のラフスケッチを元に川田英治が担当。瀬下によるテーマは稲妻。「まったく違う進化をしたゴジラ」というイメージを再現するため、モデリングは劇中に登場するゴジラの派生怪獣セルヴァムからの進化という方向性を軸に、セルヴァムのモデルをベースに発展させる形で行われた。3つの頭部はそれぞれ形状が異なり、複数の目玉を備え、上顎よりも下顎が大きい。首が非常に長く、鱗に相当する部分は植物の薔薇や柊の棘がモチーフとなっており、攻撃性が表現されている。
富士の樹海の氷穴で眠っていた。1万年の眠りから覚めると完全体となり、地・海・空すべてを支配する最強の聖獣となるという。 しかし不完全体で目覚めたため、翼も折り畳まれた状態であり、飛行も光線攻撃も不可能である。唯一の武器はかみつき攻撃と同時にスタンガンの要領で電気ショックを与えるかたちでの攻撃となる（技名：サンダースパーク）。ゴジラとモスラの闘いに割って入り、かみつき攻撃を仕掛けるが、ゴジラに投げられてあえなく気絶し、結果としてふたたびモスラに孤軍奮闘を強いることになる。
着ぐるみはキングギドラの上にFRPの別パーツをかぶせるかたちで製作されたが、そのために着ぐるみの重量は200キログラムにもなり、吊っていたワイヤーが重みで切れて撮影前に都庁舎のセットを壊すというハプニングも起きた。着ぐるみの構造上「中に人を入れるのは危険」と判断され、スーツアクターを入れないかたちで撮影が行われた。操演用のピアノ線は18本に増えている。飛行用の3分の1スケールのミニチュアもキングギドラを改修して使用され、都庁上空の飛行シーンではクレーンで吊るされてオープンセットで撮影された。操縦席のセットには排水口の網や鍋の蓋などキッチン用品を塗装・改造したものが使われている。スイッチ類はゴジラ捕獲装置のもの以外決まっておらず、エミー役の中川安奈がビームのボタンなどを自身で決めて演じていた。
董源は、10世紀頃の鍾陵（江西南昌）の人で、字を叔達といった。五代の南唐に仕え、後宛副使という職位にあったという。董源は後述の巨然とともに「董巨」と併称され、江南山水画の祖とされている。現存する董源の伝承作品としては、画巻では『夏景山口待渡図巻』（遼寧省博物館）、『瀟湘図巻』（北京故宮博物院）、『夏山図巻』（上海博物館）、掛幅では『寒林重汀図』（日本・黒川古文化研究所）、『龍宿郊民図』（台北故宮博物院）がある。うち、『夏景山口待渡図巻』と『瀟湘図巻』は、もとは同じ画巻の一部であったものが分かれたものとみられる。以上の伝承作品は、いずれも真蹟ではなく後人の模本とみなされている。董源と並び称される巨然（10世紀頃）の出身は、鍾陵（江西南昌）とも江寧（南京）ともいう。彼は開封の開元寺の画僧で、伝承作品は『秋山問道図』（台北故宮博物院）のほかいくつかあるが、真蹟とみなされるものはない。董源は生前にはさほど高名ではなかったが、北宋末（12世紀）頃から急に著名になり、文人山水画の祖として扱われるようになった。北宋末の文人画家・米芾（べいふつ）は、著書『画史』において、董源の画風を「平淡天真」であるとして高く評価した。明末の文人画家・理論家として影響力の大きかった董其昌も南宗画（文人系の山水画）の祖として董源を高く評価している。伝承作品にみる董源と巨然の画風は、江南の霞のかかったような湿潤な風景を描いたもので、披麻皴（ひましゅん）という、麻の繊維をほぐしたような筆致で山の稜線などを描くのが特色である。沈括（北宋）は著書『夢渓筆談』で「董源・巨然の絵は、近くで見ると何が描いてあるのかわからないが、遠くから見ると物の形がわかる」と評している。