ボスニア・ヘルツェゴビナ紛争終結後、多くのセルビア系やクロアチア系の市民はブゴイノを去り、現在ではそのほとんどがボシュニャク人が占めるようになった。厳しい経済状況やこの地域での貧しい教育機会など多くが難民となりボスニア・ヘルツェゴビナを逃れている。クロアチア系の市民は1992年春からブゴイノから逃れ、クロアチアやオーストリア、ドイツなどで暮らしている。紛争の痕跡は今でも見ることが出来、市街を見下ろす小さな丘の上には病院の骨組みが残されている。1995年のデイトン合意後、平和安定化部隊のヘリコプターの基地としてブゴイノの工場用地が使われていた。後に基地はスルプスカ共和国のバニャ・ルカに移転している。
1991年に起こったクロアチアとスロベニアでの紛争によって、ボスニア・ヘルツェゴビナの状況は危機的なものとなった。1992年5月、ユーゴスラビア人民軍(JNA)は砲撃を町に行うようになりボシュニャク勢力とクロアチア系勢力の連合勢力は町の防衛を行っている。JNAの攻撃直後、ボスニア・ヘルツェゴビナ紛争が勃発する。初期の段階では連合を組んでいたボシュニャク人とクロアチア人であったが、ブゴイノの町は1992年5月から1993年7月までクロアチア系勢力の攻撃下にあった。クロアチア系武装勢力のクロアチア防衛評議会の兵士や部隊等はボシュニャク人に対しヴルバニャ地区での大量虐殺(ジェノサイド)を犯している。毎年7月17日はこの大量虐殺を追悼するメモリアルデーとなっている。後の解放の為の攻撃時、ボスニア・ヘルツェゴビナ政府勢力はクロアチア系兵士や武装したクロアチア系市民を逮捕している。逮捕者は9つの強制収容所に送られ、ほとんどは町のスタジアムで残酷な処刑が行われた。また多くのクロアチア系市民もボスニア・ヘルツェゴビナ共和国軍の支援者などに殺されている。
オーストリア＝ハンガリー帝国によってボスニア・ヘルツェゴビナは1878年から支配下に入り1908年までその領域であった。新たな行政機構が作られている。その後、第一次世界大戦後には後のユーゴスラビア王国となるスロベニア人・クロアチア人・セルビア人国が成立する。第二次世界大戦後、ユーゴスラビア社会主義連邦共和国が成立すると経済が回復しその後、経済成長が進んで行く。1960年代、ブゴイノ、ドニ・ヴァクフ、ゴルニ・ヴァクフなど周辺の自治体を合わせた人口は約10万人おり、経済の好況によって新たな産業や観光が発展した。
スコパリスカ峡谷(Skopaljska)がハンガリー王ベーラ4世により言及されている。1244年にはこの地域一帯は中世ボスニア王国の支配下に入っていた。1463年にボスニアはオスマン帝国の支配下に入り、ブゴイノ周辺はクリスサンジャクに含まれていた。1693年に今日のブゴイノ市街中心にあるスルタン・アフメドモスクが建てられ、このモスクはボスニア・ヘルツェゴビナにおいては最も古いモスクの一つに含まれている。
すでに、ローマ時代には今日のブゴイノにあたる場所は属州ダルマチアとヘルツェゴビナを結ぶ街道網の重要な要衝であった。考古学的な発見から青銅器時代や鉄器時代から人間の生活の跡も示されている。イリュリア人の一部族であるサーデアタン族(Sardeaten)がこの地域に移動していた。また、6世紀になるとアヴァールがケルト人を侵略している。
ブゴイノの平均海抜は570mで自治体全域のほとんどが森林を占めている。山がちな地形もこの地域を特徴付けるもので、ストゼル(Stozer,1,662m)、カリン山(Kalin,1,530m)、ルディナ山(Rudina,1,385m)などはブゴイノでは最も高い山々である。
新JBLではファン投票などにより選出された10人からなる2チームによる東西対抗形式となる。ファン投票は各5ポジション1位と外国籍選手2名を選出。残り3名はメディア・チーム推薦により選出される。投票は会場投票・インターネット投票・ハガキ投票の3通りで行われる。締め切りは11月中旬頃まで（ハガキ投票は消印有効）。
1940年2月11日、太田村が屋島町、古高松村、木太村、鷺田村とともに高松市に編入された（高松市第4次合併）。かつて香川郡太田村、伏石村、松縄村、今里村と万蔵村の一部（現・三条町）であった地域で、1890年2月15日の町村制施行に伴い太田村、伏石村、松縄村、今里村の現在の太田地区4村と福岡上村（現・上福岡町、観光町）の5村が合併して太田村が発足した。なおこの時、現・三条町の部分は万蔵（ばんぞう）村の一部として坂田村、勅使村、馬場村、沖村とともに鷺田村（現・鶴尾地区）となった。その16年後の1956年に行われた昭和の大合併（高松市第5次合併）では市域が一気に拡大したため、市民サービスの窓口として第4次合併で編入されていた市域も含めそれぞれに高松市の出先機関である「出張所」が設置された。このとき、旧太田村には太田出張所が設置されたが、旧村内のうち上福岡町と観光町は市役所本庁の管轄として出張所の管内とはならず、さらに本来ならば鶴尾出張所管内になる旧鷺田村の一部の三条町が太田出張所の管内に組み入れられた。高松市に合併された時点のこの地区はまだ純粋な農村地帯であり、一面に田が広がっていた。戦後になり高松市中心部のベッドタウンとしての傾向が強くなる。その傾向に拍車をかけたのは戦後まもなく始まった太田第1土地区画整理事業で、上福岡町と今里町のほとんどが区画整理され、その後の太田第2土地区画整理事業では松縄町、伏石町のほとんどが区画整理された。これらは地区内の面積の約半分にあたる。それによって出現したレインボーロードやサン・フラワー通り周辺は20世紀末から21世紀にかけて郊外型の近隣商業が集積し急速に発展した。