預言者ジャンを新たな王として迎えるための戴冠式が執り行われようとしている。大規模なサクソフォーン群とトランペットの旋律を伴う行進曲にのって、正装した選帝侯たちに続いてジャンが登場する（この「戴冠式行進曲」はハイライトのひとつとなっている）。全員が戴冠された王である預言者を讃える。フィデスは群集に紛れ込んで教会に入り、あの偽預言者に神罰が下るようにと高揚して歌う。子供のコーラスが続き、全員が預言者にして王であるジャンを讃えよと歌う。ジャンは王冠を被って階段を降りてくると、フィデスはようやく預言者が自分の息子であることに気づき、立ち上がって群集の前で、我が子よとジャンに駆け寄る。人々は驚くが、これは預言者に従う者にとっては不敬である。ジャンは最初、母を抱擁するために走り寄ろうとするが、マティサンに止められる。もし彼女を母と認めれば、再洗礼派の3人はフィデスを殺すしかないと言う。ジャンは冷静を装いつつ、フィデスにこの女は誰だと質問する。フィデスは自分の母親を忘れた薄情者と主張し続ける。ジャンはフィデスに剣を向けるジョナを制して、この狂った老婆を正気に戻すには、奇蹟を起こす以外に方法はないと言い、もし自分がこの老婆の子供だとしたら、私を詐欺師としてみなの剣で殺せと言う。そして、フィデスの目をじっと見据えて私はそなたの息子かと問う。フィデスは真実を答えれば破滅をもたらすことを理解して、狂女が突然正気に戻ったような振りをして、預言者が息子であることを否定する。人々の奇蹟を讃える合唱で幕が下りる。
再洗礼派に占領されたミュンスターの市民は、再洗礼派への服従を余儀なくされている。裕福な市民は、彼らの宝物を手放して再洗礼派の機嫌を取ることを強いられ、金銀の袋を持って階段を上がっている。彼らは陰では低い声で預言者を罵倒するが、巡視が見回りに来ると声高に「預言者万歳」と斉唱する。そこへ今は乞食になったフィデスが市民に施しを求めている。フィデスはジャンが死んだと信じている。フィデスはそこへ巡礼に来たベルトに出会い、互いに抱擁する。ベルトは城壁から川に飛び込んだが、漁師に助けられたのだった。フィデスはジャンの死をベルトに告げ、それを預言者のせいにする。ベルトは復讐を誓い、フィデスは許しと慈悲のために祈る。
再洗礼派の兵士たちがミュンスターの攻略に失敗し、敗走して帰ってくる。ミュンスターの攻略の遅れのため、兵士たちはジャンが本当に預言者ではないのではないかと疑いを持ち始める。そこで、ジャンは兵士たちを招集し、勝利の賛美歌「天と天使の王」（Roi du ciel et des anges）を歌う。兵士たちはこれに導かれてミュンスターへの大行進を始める。霧が晴れ、氷湖の奥にミュンスターの街が見えてくる。
マティサンはオーベルタル伯爵のドルトレヒトの居城を焼き払うことに成功し、さらにオーベルタル伯爵の父親が支配するミュンスターの開城の交渉を行ったが、交渉は成立しない。そこで、マティサンとザカリーはミュンスターへの夜襲を計画する。居城が既に灰燼に帰してしまったオーベルタル伯爵が、ミュンスターの父のところ行こうとしていたが、再洗礼派の支配地域に迷い込んでしまい、ジョナに捕まってしまう。オーベルタル伯爵は苦し紛れに、再洗礼派に参加したがっているふりをする。再洗礼派たちは暗がりの中で彼の素姓に気付かず、オーベルタル父子、本人とその父を絞首刑にすることを誓わせる。しかし、ジョナがランプをつけた途端に正体がばれてします。ザカリーは即座の死刑を宣告する。オーベルタルは引き立てられる。ジャンが物思いにふけりながら入ってくる。ジャンは反乱のための旗頭としての偽預言者の生活に既に疲れていて、特に彼が殺人者の一団を導いていることを気に病んでいる。ジャンはフィデスに会いたがるが、再洗礼派たちは拒否し、ジャンが預言者の役割に留まらなければ彼を殺すと誓う。オーベルタルが連れて来られる。ジャンの胸は後悔の念で満ちている。ジャンはベルトが城壁から川に身を投げたが救われ、今はミュンスターにいることをジャンに話す。ジャンはオーベルタルを釈放する。マティサンが再洗礼派たちのなかにも造反する者が出ていると指摘するが、ジャンはミュンスターの攻略を命じる。
1942年2月27日、ジェイコブ・ジョーンズはニューヨークを出撃してニュージャージー州沿岸部に向かい、バーナガット灯台沖の5尋海域を哨戒した。次いで哨戒海域をデラウェア湾メイ岬に移して哨戒を継続した。15時30分、バーナガット灯台の東の沖に戻ってきたジェイコブ・ジョーンズは、前日に雷撃を受けて沈没したタンカーR.P. リゾールのくすぶっていた残骸を発見し、2時間にわたって弧を描くように生存者を探したあと、針路を南に向けた。速力を15ノットに固定し、20時からは無線封止を実施する。2月27日の夜は満月であり、視界は良かった。ジェイコブ・ジョーンズは誘導灯を点灯することもなく南下を続けた。日付変わって1942年2月28日の夜明け、U-578は無警戒であったジェイコブ・ジョーンズに対して魚雷を発射。2本から3本の魚雷はジェイコブ・ジョーンズの左舷側に命中した。生存者の証言では、最初の魚雷は艦橋の艦尾寄りに命中し、弾薬庫が大爆発を起こして艦橋、海図室、士官および乗組員居住区を破壊して命中部分より前は切断されて海没した。別の魚雷は艦尾から40フィート前方に命中し、艦尾とキール、シャフトもろとも吹き飛ばして乗組員の4分の1は戦死した。船体の中央部分は辛うじて浮いていた。艦長ブラック少佐以下25名あるいは30名の士官は爆発でことごとく戦死し、生存者の中で最先任だった信号長は負傷しながらも救命ボートを降ろす努力を行った。しかし、海上に散乱した残骸が救命ボートの行動を妨げた。ジェイコブ・ジョーンズは45分もの間浮いており、生存者は4つ5つの救命で艦を離れた。間もなくジェイコブ・ジョーンズは沈んでいき、その際に艦尾の爆雷が誘爆を起こして救命いかだの上にいた何名かの生存者のうち幾人かはそのあおりで亡くなった。同じことは、先代艦がやはりUボートの攻撃で沈没した際にも起こっていた。8時10分、陸軍航空軍の観測機は救命いかだを発見し、近在の哨戒艇PE-56に自機の位置を知らせた上で救命いかだの発見を通報した。PE-56は現場に急行して12名を救助したが、11時ごろには海が荒れてきたため捜索は打ち切られた。PE-56は生存者を乗せてメイ岬に向かったが、その途中で1名が亡くなった。続く2日間、航空機と艦船によってジェイコブ・ジョーンズの生存者の捜索が行われたが、何も発見できなかった。