スパーズに再び連覇のチャンスが訪れた2007-08シーズンは、ダンカンは平均19.3得点11.3リバウンド、スパーズは56勝26敗の成績を残した。プレーオフ1回戦では、元レイカーズで過去に何度もスパーズとダンカンを苦しめてきたシャキール・オニールが電撃移籍してきた、打倒スパーズを目指すフェニックス・サンズと対戦。ダブルオーバータイムにもつれる接戦となった第1戦は、1つ目のオーバータイム終盤で3点ビハインドを背負った状況からダンカンの珍しい3Pシュートが決まるという劇的な場面も見られ、ダンカンが40得点をあげたスパーズが勝利。勢いに乗ったスパーズは4勝1敗でこのシリーズを制した。カンファレンス準決勝ではライジングチームのニューオーリンズ・ホーネッツと対戦。若手No.1ポイントガードのクリス・ポールに手を焼いたもののこれも4勝3敗で辛うじて退け、夢の連覇にまた一歩近づいたが、ダンカンの前に立ちはだかったのがオニールの放出による一時の低迷から復活したロサンゼルス・レイカーズだった。コービー・ブライアントにパウ・ガソル擁するレイカーズに、ホーネッツとのシリーズで疲弊していたスパーズは1勝するのがやっとで、1勝4敗でまたもやスパーズの連覇はならなかった。
プロ10年目、30歳となる2006-07シーズンを迎えたダンカンは、成績を平均20.0得点10.6リバウンドに回復させ、オールNBA1stチームにも復帰。チームは58勝24敗を記録してプレーオフも順調に勝ち進んだ。このシーズンはレギュラーシーズンで断トツの勝率を残したダラス・マーベリックスが優勝候補だったが、マーベリックスが1回戦で敗退してしまったことで、カンファレンス準決勝でのフェニックス・サンズとスパーズのシリーズが事実上の優勝決定戦となった。サンズとのシリーズは乱闘騒ぎも発生するなど荒れた内容となったが、サンズを得意な相手としているスパーズは4勝2敗でサンズを降すと、カンファレンス決勝ではユタ・ジャズを破り、ファイナルに進出。クリーブランド・キャバリアーズとのシリーズでは、キャバリアーズの若きエース、レブロン・ジェームズにエースキラーのブルース・ボウエンがマッチアップするが、そのボウエンの後ろにダンカンが控えているとあっては、さしものレブロンも手も足も出なかった。チーム間の実力に明らかな差があるシリーズとなったファイナルは、スパーズが4戦全勝でキャバリアーズを一蹴。4度目の優勝を飾ったが、先の3回の優勝と違う点はファイナルMVPを受賞したのがダンカンではなく、トニー・パーカーであったことである。ダンカンもシリーズ平均18.3得点11.5リバウンドと活躍したが、それ以上に平均24.5得点をあげたパーカーの活躍が目覚しかった。しかし優勝のためにダンカンの貢献が不可欠であった点は変わることなく、ポポヴィッチはダンカンを「公分母」とたとえ、「99年、03年、05年と彼の周りには異なるメンバーがいた。ダンカンは彼らを皆受け入れた。ダンカンとのプレイはとても容易で、彼はとても基本的であるため、皆彼に適合し易かったんだ」と語った。またファイナルを観戦したデビッド・スターンNBAコミッショナーは「彼は同世代で最も優れた選手だ」と認めた。
奨励会入りは中学2年の頃であったにもかかわらず、史上最年少タイトルの記録を樹立する。1983年、小学6年生で第8回小学生将棋名人戦に出場し、3位。1985年、中学2年生のとき第10回中学生名人戦で優勝し、同年、奨励会に入会。1988年10月1日に四段昇段してプロ入り（第3回三段リーグを14勝4敗の2位で通過）。奨励会6級から四段昇段までが3年足らずで、入会時の年齢が違うとはいえ、羽生善治、谷川浩司、村山聖より速い（しかも、彼ら3名がプロ入りした頃は三段リーグ制度がなかった）。第3回三段リーグでは1位の小倉久史と屋敷が三段リーグ1期抜けを果たしたが、第1回を除くと三段リーグ初挑戦者によるワンツーフィニッシュは2018年11月に至るまでこの時が唯一であり、三段リーグ1期抜けも両者のほかには第12回（1992年度後期）で川上猛、第24回（1998年度後期）で松尾歩、第53回（2013年度前期）で三枚堂達也、第59回（2016年度前期）で藤井聡太が達成しただけである。第55期（1989年度後期）棋聖戦の予選・本戦トーナメント（1989年4月11日 - 11月27日）で高橋道雄や当時竜王の島朗を破るなどして一番下から連戦連勝し、中原誠棋聖への挑戦権を得る（タイトル挑戦の最年少記録）。中原との五番勝負（1989年12月12日 - 1990年2月2日）は、フルセットの2勝3敗で惜敗。しかし、第56期（1990年度前期）の棋聖戦でも、本戦トーナメント（1990年3月27日 - 5月28日）を勝ち上がり、中原に2期連続挑戦。五番勝負（1990年6月18日 - 8月1日）では2連敗の後に3連勝して奪取。18歳6か月で初タイトルを獲得（タイトル獲得の最年少記録）。前年に羽生善治が作ったばかりの史上最年少タイトル獲得（竜王、19歳）の記録を1年足らずで塗り替えた。また、プロデビューから1年10ヶ月での初タイトル獲得も、歴代最速である。第57期（1990年度後期）の棋聖戦五番勝負（1990年12月11日 - 1991年1月25日）は、森下卓の挑戦を3-1で退けて防衛（タイトル防衛の最年少記録）。しかし、続く第58期（1991年度前期）棋聖戦五番勝負（1991年6月18日 - 7月31日）で、南芳一に2-3で敗れる（タイトル失冠の最年少記録）。