2013年4月から5月にかけて、査読付き医療雑誌"BMJ Case Reports"に、森口および「Joren Madson」なる人物が共同で3件の論文を投稿し、一時的に掲載された。その後、ネイチャーの指摘や外部からの問い合わせなどにより、これら3件の論文は調査のため一時的に撤回または二重投稿のため撤回とされている。ネイチャーの調査によると、共著者のJoren Madsonおよび所属先としているReprogramming, Inc.いずれもその存在を確認できなかった。また、森口の用いたe-mailアドレスは、大学病院医療情報ネットワーク研究センター（UMIN）から提供されたものであったが、UMINでは森口の在籍を確認できなかった。また、ネイチャーが森口に直接e-mailで本件内容について問い合わせたが、具体的な回答は得られなかった。2014年11月のアメリカ心臓協会(AHA)のシンポジウムに発表、2015年にはClinics and Research in Hepatology and Gastroenterology誌に発表と継続的に研究活動を行っており、所属は大阪市のオーククリニックとなっている。
2012年平成24年10月11日、読売新聞は、森口がiPS細胞を使った世界初の臨床応用として心筋移植手術を実施したことが10日分かった、と朝刊一面で大きく報じた。それによればハーバード大学客員講師の森口が同年2月に虚血性心筋症の男性患者（34歳）に対し、男性の肝臓から取り出した細胞から独自の手法でiPS細胞を作成、心筋細胞に変化、増殖させた。この心筋細胞を心臓バイパス手術を受けた患者の心臓に注入した。約10日後から心筋機能は平常になり、報道時点では平常の生活を送っているというもの。この手術を行う際にハーバード大学倫理委員会から「暫定承認」を受けたという。治癒対象の患者は6人で、前述の患者のほかに43歳の男性と35歳の女性にも手術を行ない、残りの3名についても年内中に移植手術を終える予定だとした。読売新聞は夕刊一面でも、森口のインタビュー記事など続報を掲載した。森口は、現地時間で10月10日、11日にニューヨークで開かれる国際会議や、科学誌で手法を公表するとしていた。
2010年5月1日、読売新聞朝刊（大阪版）が「iPS活用 初の創薬」と報じた。記事では、森口と東京医科歯科大学がC型肝炎の治療法を発見したとしていた。また、日経産業新聞も同年4月に独自に森口を直接取材し、6月2日にiPS細胞を活用したC型肝炎創薬について報じていた。しかし、2012年10月12日に、同大は記者会見の中で「このような実験及び研究が同大内で行われた事実はない」ということを明らかにした（東京医科歯科大学　2012年12月28日調査報告書も参照）。
2009年11月8日の読売新聞の記事で、「米ハーバード大研究員も務める東京大の森口尚史特任教授」の肩書で登場し、国による研究者への予算配分についての意見を述べた。しかし、前述にもある通り、森口は2009年にハーバード大学研究員だったという事実は未確認だった。一方、森口自身は電子書籍の自著「iPS細胞騒動」でハーバード大学との密接な関わりを公的な証拠を示して主張している。
2009年10月25日に、テレビ朝日系列の「大正製薬Human Scienceスペシャル人体再生 〜iPS細胞 山中博士の挑戦!〜」に「ハーバード大学研究員」の肩書で出演。iPS細胞から肝臓の細胞を作る際、細胞の中にはがん抑制遺伝子があり、その働きを抑えるとがんになることを発見したと紹介された。しかし森口は、1999年11月から2000年までハーバード大学傘下のマサチューセッツ総合病院の客員研究員だったことはあるが、2009年にハーバード大学研究員だったかは不明なため、この主張も疑問視されている。森口自身は電子書籍の自著「iPS細胞騒動」でハーバード大学との密接な関わりを主張している。
関東地方・中日本を管轄しており、その管轄地域は、以下の1都16県にわたる。東京都・神奈川県・千葉県・埼玉県・茨城県・栃木県・群馬県・山梨県・長野県・新潟県・静岡県・愛知県・岐阜県・三重県・石川県・富山県・福井県東京都内の気象観測（桜の開花等の生物季節観測を含む）を行っているが、他の管区気象台とは異なり、東京都（東京都島嶼部を含む）の気象予報の発表は気象庁予報部の直轄となっている。
山林や山間部において、樹木の刈り払いや樹皮もしくは果実の採取、または狩猟の際の止めさしや解体などの幅広い用途（場合によっては屋外での調理作業）に用いられる刃物を指す言葉で、形状や用途などに明確な定義があるものではないため、「山刀」といった場合にどのようなものを指すかは、この語が用いられる状況・文脈によって異なるが、三省堂の『大辞林』ではさん とう －たう【山刀】やまがたな。やま がたな【山刀】山仕事をする人の用いる鉈（なた）のような形の刃物。（『大辞林』第三版 より）と定義している。平凡社の『世界大百科事典』にはやまがたな【山刀】おもに焼畑などの山林伐採や狩猟の際の獲物の皮はぎなどに用いる刀。これを動物との格闘刺突に使用するのは危急の場合に限られる。一般に小型で片刃のものが多く、野鍛冶（のかじ）に打たせたもの、または昔の脇指を切り縮めたものなどがある。地方により名を異にし、九州山地ではヤマカラシ、四国西部でサッカン、中国山地でホウチョウ、青森県津軽地方でコバヤリ、秋田県阿仁でマキリ(これはアイヌ語と同じ)など各地ごとにちがっている。（『世界大百科事典』第2版 より）と記載されている。また、海外で同様の用途に用いられる刃物や、鉈様の刀剣類に対する和訳語として宛てられることもある。