抵当権の順位が下がる順位変更の登記を申請する場合、抵当証券法施行細則21条ノ2に規定される、抵当権が債権全部の弁済を担保するに足りることを証する書面を添付しなければならない（平成元年10月16日民三4200号通達）。順位の譲渡（民法376条1項）を受ける登記を申請する場合、抵当証券法施行細則21条ノ2の書面の添付は不要である。また、この変更登記をした場合、抵当証券の記載の変更をしなければならない（平成7年11月7日民三4167号通知）。なお、登記上の利害関係人（利害関係を有する抵当証券の所持人又は裏書人を含む）が存在する場合、変更・更正登記を付記登記でするにはその承諾が必要であり（法66条）、承諾証明情報が添付情報となる（令別表25項添付情報ロ）。この承諾証明情報が書面（承諾書）である場合には、原則として作成者が記名押印し（令19条1項・7条1項6号）、当該押印に係る印鑑証明書を承諾書の一部として添付しなければならない（令19条2項、昭和31年11月2日民甲2530号通達参照）。この印鑑証明書は当該承諾書の一部であるので、添付情報欄に「印鑑証明書」と格別に記載する必要はなく、作成後3か月以内のものでなければならないという制限はない。
債務者の氏名・名称・住所に変更・更正があった場合、原則である共同申請（法60条）によらずに、債務者が単独で申請をすることができる（法64条2項）。不特定多数の抵当証券所持人が全員登記権利者として申請することは、現実には不可能に近く、登記事項の1つである債務者の変更に関しては単独申請を可能としている。登記原因証明情報は原則として公務員が職務上作成した情報であり、抵当証券の添付は不要である（令別表24項添付情報参照）。この場合、抵当証券が添付されないので登記官が記載の変更をすることはできず（抵当証券法19条参照）、別途記載の変更の申請（抵当証券法17条後段）を抵当証券を作成した登記所に対してすることになる（抵当証券法施行細則53条）。弁済場所である住所に所持人が提示することになるため所持人に知らせるという意味で変更登記がされることになる。
登記申請情報には抵当証券を添付しなければならない（令別表25項添付情報ニ）。登記官が抵当権の変更・更正登記を完了したときは、抵当証券の記載を変更して所持人に還付しなければならない（抵当証券法19条）。例えば、登記の申請人と抵当証券の所持者が別人である場合、抵当証券は所持人に還付するべきである（昭和6年7月17日民事764号回答）。なお、抵当権の被担保債権の弁済期の到来後でも、弁済期の変更の登記を申請することができる（昭和7年2月19日民事電報回答、登記研究571-151頁）。その他の登記の申請及び手続きは、原則として抵当証券を発行していない場合の抵当権変更登記及び更正登記と同様である。
抵当権の譲渡による移転は抵当証券への裏書によってする（抵当証券法15条・14条）。しかし、移転登記を禁止する条文は存在しないので、抵当権移転登記を申請することもできる。この場合、登記申請情報には登記原因証明情報として抵当証券を添付しなければならない（抵当証券法14条1項参照）。一方、抵当権者に相続が発生した場合、「譲渡」ではないので抵当権移転登記を申請することになる。また、抵当権の被担保債権の弁済期到来後の日付で裏書した抵当証券を添付して、当該日付の債権譲渡を原因とする抵当権移転登記の申請をすることはできない（平成11年4月28日民三911号通知）。なお、抵当権の被担保債権の弁済期の到来後に抵当権が移転した場合、抵当証券を交付した旨の付記登記を抹消して、通常の抵当権移転登記の手続きをすることができる（登記研究595-119頁）。
抵当証券発行の特約の登記がある場合、元本又は利息の弁済期・支払場所の定めがあれば登記することができる（法88条1項5号・6号）。登記官は、抵当証券を交付又は作成したときは、職権で抵当証券交付又は作成の登記をしなければならない（法94条1項ないし3項、規則171条・172条）。これらの登記は付記登記で実行される（規則3条8号）。以下、抵当証券が発行されている場合の抵当権に関する登記を中心に述べる。
参加クラブ数は16。2回総当たり全30試合の合計勝ち点によって順位を決定する。優勝チームはUEFAチャンピオンズリーグ予備予選2回戦、2位チームとカップ戦優勝チームはUEFAヨーロッパリーグ予備予選2回戦、3位クラブは予備予選1回戦の出場資格を得る。上位3クラブのいずれかがカップ戦優勝チームとなった場合はリーグ戦4位のチームが繰り上がる。15位および16位のチームはボスニア・ヘルツェゴビナ連邦1部リーグ、スルプスカ共和国1部リーグ（ともに2部リーグ相当）に降格する。ボスニア・ヘルツェゴビナがユーゴスラビア社会主義連邦共和国の一部だった時代は、ユーゴスラビア・プルヴァ・リーガが国内トップリーグだった。ボスニア・ヘルツェゴビナのユーゴスラビア離脱後、ボシュニャク系クラブ、クロアチア系クラブがそれぞれボスニア・ヘルツェゴビナサッカー協会を設立し国内リーグを、セルビア系クラブがスルプスカ共和国リーグを構成した。1998年からボシュニャク系協会主催でボシュニャク系クラブとクロアチア系クラブの統一王者決定プレーオフが行われ、2000年よりスルプスカ共和国協会を除く2協会を統合し、プレミイェル・リーガが開始された。統一初年度は、ボシュニャク系リーグから前シーズンの1部リーグ上位11クラブと2部優勝クラブ、クロアチア系リーグから1部上位9クラブと2部優勝クラブの計22クラブで開催され、下位8クラブが降格する変則システムがとられた。2002年からはセルビア系クラブもプレミイェル・リーガに参加し、スルプスカ共和国リーグは下部リーグに組み込まれた。このシーズンのプレミイェル・リーガは、前シーズンのプレミイェル・リーガ上位12クラブとボスニア・ヘルツェゴビナ連邦1部リーグ上位2クラブ、スルプスカ共和国1部リーグの上位6クラブの計20クラブで開催され、下位6クラブが降格した。