専門職学位は、専門職大学院を修了した者に授与される学位である。法科大学院の修了者には「法務博士（専門職）」、それ以外の専門職大学院を修了した者には「○○修士（専門職）」の学位が授与される。専門職学位は、大学院の学位ではあるが博士・修士と異なる第3の学位であり、教育課程としては修士課程（博士前期課程）と同等とみなされるが、研究上の博士・修士の学位とは区別される。2007年（平成19年）4月1日には教職修士（専門職）の学位が新設された。
修士は、博士と学士の中間に位置する大学院レベルの学位である。大学院の修士課程（博士前期課程）を修了した者に授与される。また、防衛大学校研究科博士前期課程、国立看護大学校研究課程部、水産大学校研究科、職業能力開発総合大学校研究課程を修了した者に対しては、独立行政法人大学評価・学位授与機構への論文の提出、審査を経て、同機構から授与される。なお、海外においては準修士という学位があるが日本ではそのような学位はないものの、大学独自の称号として設定している場合がある。
4月7日、北軍は2軍が合流して総勢45,000名となった。南軍は1日目に大きな損失を受けて、その数は8,500名とされたが、落ちこぼれや脱走のために、その指揮官達の報告では残り実質20,000名に過ぎなかった。ビューエルは戦後その数字に反論し、28,000名はいたと主張した。南軍兵は南のプレンティスとシャーマンが宿営地に使っていた場所に引き返し、ポークの軍団はピッツバーグ・ランディングの南西4マイル (6.5 km)、4月5日に露営した所まで戻った。戦線は築かれておらず、いたとしても弾薬の補給はほとんど無かった。兵士達は食料、水および最も必要とする夜の休息のための待避所を探す必要性で消耗していた。ボーリガードはこのとき勢力で負けていることに気付いておらず、攻撃を続行してグラント軍を川に追い落とす作戦を立てた。彼が驚かされたことに、北軍は夜明けと共に行動を開始し大挙して反撃を始めた。グラントとビューエルはその攻撃を別々に始めた。協働行動は師団レベルでのみ起こった。ルー・ウォーレス師団が北軍前線の最右翼で午前7時頃にティルマン・ブランチを渉って最初に戦闘に突入し、プレストン・ポンド大佐の旅団を追い返した。ウォーレス師団の左翼はシャーマン師団の生き残りであり、マクラーナンドやW・H・L・ウォレス（この時はジェイムズ・タトル大佐が指揮を引き継いでいた）の残存兵も加わった。ビューエル軍のブル・ネルソン、クリッテンデンおよびマクックの各師団は左翼に就いた。南軍の防御陣はひどく混じり合っており、部隊の結束は旅団を越えてはほとんど無かった。ポーク少将の師団を露営地から南西に動かして配置に付けるまで2時間以上を要した。午前10時までに、ボーリガードはその前線を安定させ、左翼からブラッグ、ポーク、ブレッキンリッジおよびハーディの順で並んだ。北軍の左翼はネルソンの師団が前進を誘導し、密接してクリッテンデンおよびマクックの各師団が続き、コリンス道路とハンバーグ・サバンナ道路を下った。激しい戦闘の後でクリッテンデンの師団が朝遅くまでにホーネッツネスト地域を取り戻したが、クリッテンデンとネルソンはどちらもブレッキンリッジによる決死の反撃で撃退された。北軍の右翼は着実に前進し、ブラッグとポークを南に後退させた。クリッテンデンおよびマクックの各師団がその攻撃を再開し、ブレッキンリッジは後退を強いられ、昼までにボーリガード軍の前線はハンバーグ・パーディ道路に沿うようになった。午後早く、ボーリガードはシャイロー教会地域から一連の反撃を掛けさせ、コリンス道路の制圧を狙った。北軍の右翼はウォーターオークス・ポンドでのこれら攻撃によって一時的に後退させられた。クリッテンデンはタトルの支援を受けてハンバーグ・パーディ道路と東コリンス道路の交差点を占拠し、南軍をプレンティスが使っていた宿営地に追い込んだ。ネルソンはその攻撃を再開し、午後遅くまでにロカストグラブ・ブランチを見下ろす高台を占領した。ボーリガードの最後の反撃は側面攻撃を受け、グラントがジェイムズ・C・ビーチ大佐の旅団を前進させたときに撃退された。ボーリガードは主導権を失い、弾薬や食料も尽きかけ10,000名以上の兵士が戦死し、負傷し、不明になっていることを認識し、もはやこれ以上は進めないと分かった。ブレッキンリッジの5,000名を殿軍に使い、教会とシャイロー・ブランチの南の尾根にあった大砲を集中させて軍をシャイロー教会の後に退かせた。これらの部隊が午後5時まで北軍をコリンス道路の陣地に留めさせ、その後南軍はコリンスに向けて秩序ある撤退を開始した。疲れ切った北軍は、以前のシャーマンやプレンティスの宿営地まで追撃するのがやっとだった。ルー・ウォーレスの師団はシャイロー・ブランチを越えて前進したが、他の部隊の支援がなかったので、闇が訪れると共に停止し、シャーマンの宿営地に戻った。戦闘は終わった。その後長い間、グラントとビューエルは、まだ明るさが残っている時間を利用してでも即座の追撃を掛けないとグラントが決断した事について口喧嘩した。グラントは、兵士が疲れ切っていることを挙げていたが、南軍も同じように疲れ切っていたことも事実だった。グラントが躊躇したことの一端は、ビューエルと普通ではない指揮の関係を持ったことでもあった。グラントが上級士官であり、事実上両軍を指揮したが、ビューエルは2日間の戦いを通じて独立して行動することを明確にしていた。