この件に対するノバルティスの対応は一貫しない。日本法人であるノバルティスファーマ（以下「日本法人」とも）はこの件に関して何回かの発表を2013年にホームページで行なったが、7月29日に、それ以前の発表は全て削除した。本社のノバルティス（以下「本社」とも）でも2013年7月29日の発表を、遅くとも10月3日には消去している。元社員の関与によるデータの不正操作や改竄に関してノバルティスファーマは、7月17日には、それらがあったかのように報道されていることは見解とは異なる、とした。不正を否定する証拠は挙げていないものの、不正を示す証拠はないことを理由とした。しかし、7月29日にノバルティスファーマは新たな発表を行った際、それまでの発表を削除した。その結果、データの不正操作・改竄に関しては、ノバルティスファーマは何も語っていない格好に、それ以降はなっている。本社は2013年4月に、法律事務所にこの件の調査報告書の作成を依頼した。提出された報告書は英語で作成されたとされ、日本法人は一部分の日本語訳を発表した。それによると、依頼を受けたモリソン・フォースターは、論文の科学的な整合性については調査をしていない。しかし、本社は7月29日に「調査では意図的なデータの操作・捏造は発見されなかった」と発表した。その一方で本社は後にこの発表を削除しているが、削除の理由も、そもそも削除した事も発表されていない。その後は捏造を否定も肯定もしていない。報告書の提出に関する日本法人の発表では、捏造の有無に関しては特に見解を示していない。ノバルティスは社員が研究に関与した事による利益相反の問題については認めており、事件の発覚後、「再発防止策」を発表したが、実際にはその後もそれは守られていなかった。次の「白血病薬研究(SIGN研究)への関与」の項を参照。なお、ノバルティスの発表ではこの臨床研究を一貫して「医師主導臨床研究」（英語発表では「investigator initiated trials」）と呼んでいる。この語は、製薬会社がスポンサーで行う研究ではなく、医療機関が自ら届け出ての治験を表す。2017年3月16日、ノバルティスファーマは、無罪判決ではあるものの、この問題の本質は医師主導臨床研究において弊社が適切な対応を取らなかったことにあるとの声明を発表。社会的、道義的責任を感じているとした。再発防止策として医師主導臨床研究の支援方法を全面的に改め、新しい研究助成方針を導入するなど多くの社内改革に取り組んでおり、企業風土・文化の改善を継続していくとしている。
『愛撫』を書き終わった後、1930年（昭和5年）5月に弟の勇が結婚し、基次郎は母・ヒサと共に大阪市住吉区王子町2丁目44番地（現・阿倍野区王子町2丁目14番地12号）の実家から、兵庫県川辺郡伊丹町堀越町26（現・伊丹市清水町2丁目）の兄・謙一（エンジニア）の家に移住した。そこはまだ田舎の自然風景が残る地域であった。基次郎は縁側に寝椅子を出して横になり、雲の移り変わりを眺める時間を持った。その雲の風景は3年前の湯ヶ島を思わせるものでもあった。雑誌『青空』の創刊同人だった稲森宗太郎が同年の5月に亡くなったことを知った基次郎は、〈稲森が死んだ知らせにはおどろいた。どんな病気で死んだのか知らないが、僕は僕の死後のことなど考へて淋しい気もする〉と記しているが、この頃、兄の同級だった大道俊英（大阪朝日新聞記者）が無線の話を聞きに訪れ、2階にいた基次郎の顔に死相が表われているため驚き、おもわず「どうしたんだ」と声をかけた。発熱の症状が続き、兄の狭い家から7月に大阪の実家に一旦帰った基次郎は、湯ヶ島時代から温めていた〈闇〉の街道の主題の本稿執筆に集中した。夏の暑さで赤ん坊か老人のように汗疹にも時々悩まされた。原稿依頼されていた『詩・現実』第2冊の締め切りまでに間に合いそうもなく一度はあきらめかけたが、8月13日に出来上がった原稿は新婚の弟・勇がオートバイで大阪中央郵便局まで届け、ぎりぎりで間に合った。長い結核との闘病の果て、以前は死を意味する〈闇〉をおもに絶望や恐怖として捉えていたが、やがて自身の死が刻々と面前に迫るに従い、その湯ヶ島の〈闇〉は変化し、〈安息〉という一種の諦念のような気持、あるいは悟りの境地に似た思いを交えて回想され、『闇の絵巻』の作品が仕上がった。兄・謙一の家に再び戻った基次郎は、甥っ子たちが取って来た蜘蛛を軒端に放ち、縁側で蜘蛛の巣の張り方や喧嘩をする生態を眺めて観察し、シューベルトの楽譜を一心に読み耽ける日々を送った。見舞いに来た友人・辻野久憲は、基次郎の冷静な科学者的な目と詩人的な感受性の融合の秘密に触れた気がした。この頃の基次郎は栄養を摂っても痩せていた。僕は随分やせてしまつた。肉も野菜も充分とつてゐるのに身体に脂が出ない。肺病といふものはどんなに頑丈な男でも　徐々に痩せさせて骨と皮とにしてしまひ　本人の納得がゆくやうにしてから殺すものらしい。これは「俺はこんなに頑丈だからまさか死ぬことはあるまい」と自分の頑丈を永遠的に考へてゐる人間に思ひ知らすためだ。肺病は決して頑丈な男をそのまゝの姿では倒さない。納得がゆくやうにしてから倒す。なかなか残酷な奴だ。この病気は初期の間は苦痛がないが　僕位になると苦痛が出て来るので　これには困る。楽なまゝで痩せて死んでゆくのなら　さう困らない。 — 梶井基次郎「北川冬彦宛ての書簡」（昭和5年9月27日付）