パーカーは世俗政治とのかかわりを避け、エリザベス1世の私的諮問機関にも加わることを認めなかったが、教会政治は彼を大いに悩ませることになった。福音主義派の一部は礼典の変更、そして最低でもいくつかの祭服については着用を完全に廃止するか、そうでないにしても着用は自由にすることを求めた。初期の長老派は主教制の廃止を求め、さらに保守派はそれらすべての変化に対して反対し、しばしば改革とは逆の方向にイングランド国教会を向けようとした。女王自身は、彼女が監督権を国王至上権に対する重要な防波堤の1つとみなすまでは、渋々ながらこれを与えていた。1559年からおきた祭服論争(en)においては、女王はパーカーの目指す目標が成し遂げられることを求めていたにもかかわらず、それまで許可していたパーカーが試みた強固な統一の実現を拒否し、これはパーカーを愕然とさせた。このようにしてパーカーは議会や主教会議、女王らのわずかな助け受けているピューリタンの流れに対抗するのをやめた。1560年には、前年のものよりも祭服のハードルを下げたほか、主教の考察などを統一した『Interpretations and Further Considerations』が発行された。しかしこれは、カヴァーデール（パーカーを聖別した主教の一人）のような反祭服派の満足するところではなく、カヴァーデールはロンドンにおいてこれに従わないことを公示した。パーカーが1566年に刊行した『好例の書』(en) は、反祭服派を非難するために王許を受けずに出版しなければならなかった。またパーカーの支持を受けてジョン・フォックスが刊行した『Reformatio legum ecclesiasticarum』も同じく王、議会の許可ともに取っていなかった。信仰問題を終わらせるために、議会は主教たちの主張に異議を唱えさえした。祭服問題についての論争は国教会の統治制度と権威についての反論や異論を生み出すまでに至り、1575年5月17日にパーカーが亡くなる際には、ピューリタンによる「統治」手法によって女王の意思と女王に依存するあらゆる事柄が原状に戻されてしまうのではないか、という懸念を抱いたまま死の床に就くことになった。彼は自身の振る舞いをもって国教会の聖職者たちに対し模範を示したのであって、王権側が宗教改革の個人主義的傾向を押さえつけることに失敗したことに関してパーカーに過失があったわけではなかった。
1545年に議会で法案が可決され、王権によって寄進礼拝堂 (en) や大学を解散させることが可能になった。この頃、パーカーはケンブリッジ大学の理事の一人であったが、理事会に出した報告書は大学を解体から救ったと考えられる。しかし、ストーク校は王権で解散させられ、パーカーには多くの恩給が入った。彼は新たな王エドワード6世の影響力を、1547年6月のノーフォークの大地主ロバート・ハーレストンの娘であるマーガレットとの結婚に利用した（1547年時においては聖職者の結婚は議会でも主教会議でもまだ認められていなかった）。ケットの乱 (en) に際しては、マウスホールド・ヒルに陣取る反乱軍の野営地で説得を行った。大きな成果は上がらなかったが、後にパーカーの御付司祭であったアレキサンダー・ネヴィルに反乱におけるパーカーの経歴を記すように促した。パーカーは年を追うごとにプロテスタントへの傾斜が強くなっていき、またサマセット公エドワード・シーモアの元の元よりもノーザンサバランド公ジョン・ダドリーの元で高い地位に就いた。また、ケンブリッジ大学において彼はマルティン・ブツァーと親しくしており、1551年にブツァーが死ぬとその弔辞説法を行った。1552年には豊かな財源を持つリンカン大聖堂の首席司祭（主教の下に当たる地位）に任ぜられた。翌1553年、パーカーはケンブリッジにおいて、メアリー1世の即位に反対し北に進軍するダドリー（すでにこの行動の成功は絶望的ではあった）と会食を行った。ダドリーの支援者、そして妻帯者として、メアリー1世の治世中、彼は首席司祭の任やコーパス・クリスティー・カレッジの長、その他の地位を剥奪された。ただし彼は、ほかのプロテスタント主義者のように国外逃亡はしなかったが、これは実際のところ、国外に逃れた熱心なプロテスタント主義者やメアリー1世によって殉教させられた仲間たち（彼らは理想像とされていた）をいらだたせていたと考えられる。パーカーは権威を敬い、さらに自身の番になったときにその矛先を他人に押し付けていた可能性がある。彼は職務に就けられることに乗り気ではなく、エリザベス1世が即位してすぐに彼に用意したカンタベリー大主教の椅子を避けるために大きな労力を払っていたとされる。
ローマ時代、現在のシュペヒバッハの地域は Vicus Nediensisという名で伝えられる入植地であった。この入植地は、ケルト時代にまで遡る可能性がある。ローマ時代にはリーメスの背後地の経済地であった。この時代から250年間、定住者の痕跡は遺されていない。このため中世盛期にあたるカロリング朝に新たな入植地として再興されたと考えられる。近世、シュペヒバッハの入植地はシュペヒバッハ渓谷右岸斜面の麓に発展した。この村は、1246年にハイデルベルクの住人「コンラドゥス・デ・シュペーバッハ」の名前として、その名が記録されている。村の名前（1246年 Spehbach、1337年 Spechbach、1349年 Spehsbach）は、おそらくSpecht（キツツキ）に由来する。村はまずシュタウフェン家のヴィンプフェン付属の帝国領に属し、その後ライン宮中伯の高権下にあるメッケスハイマー・ツェントに属した。1325年の遺産分与の際に、領主としてヴァインスベルク家が登場する。1401年にはフェンニンゲン家の分家にあたるナイデンシュタイン家が、その後ヘルムシュタット家、シュタイナハ家、ツァント男爵、ユクスキュル家、その他の領主が現れたが、フェンニンゲン家は帝国騎士の陪臣化（帝国代表者会議主要決議）まで常にこの村に対する影響力を保持し続けた。15-16世紀にはグロースシュペヒバッハとクラインシュペヒバッハに分かれた。後者は、ロプバッハ川沿いの水車小屋から発展したのだが、三十年戦争により荒廃した。シュペヒバッハは最初、メインストリート沿いに農場が点在する街道町であり、高台には塀で囲まれた墓地をもつ教会が設けられた。村はまず、領主の地所内に形成された。1838年からフェンニンゲンの家領は農地に解放されていった。19世紀の町の発達は、中心部の過密化をもたらした。このため、ローベンフェルト（ロプバッハの集落）へ向かう街道沿いに新しい住宅地が設けられた。これ以外の新興住宅地は1951年以降に造成されたものである。シュペヒバッハは、1803年までプファルツ選帝侯領のディルスベルク管区に属し、その後バーデンのネッカーゲミュント管区の所属となった。領主はこの他に、1807年から1813年までアイヒタースハイムの管轄にも地所があった。1857年にシュペヒバッハはバーデンのエーバーバッハ管区に移された。1863年にはハイデルベルク管区となり、ここから1938年にはハイデルベルク郡が創設され、1973年にはライン＝ネッカー郡に改組された。