Telltale Gamesが開発を担当する、Minecraft本編とは別のアドベンチャーゲーム。ストーリーが基本であり、ブロックを自由に配置したりする要素はない。シーズン1、2があり、一部日本語に対応した物もある。Netflixでは映像として配信され、日本語吹き替え、多言語字幕がある。他と同様に選択肢が表示されるインタラクティブ作品であるため対応するデバイスが必要となる。開発元のスタジオが閉鎖したため、2019年6月25日に配信・サポートが終了する。終了前に購入済みのエピソードをダウンロードするようアナウンスされた。なおNetflixでは終了日以降も映像配信を継続している。
Minecraftは、しばしばプログラミングやアクティブ・ラーニングなど、教育に有用であるとされ、授業や学習に取り入れられている。例えば、コーデックの学習やコーディング、都市計画の練習などに用いられる。スウェーデンのヴィクトル・リュードベリ記念学校では授業の必修科目として取り入れられている。アメリカでは、基本的な計算の学習で使われているほか、ロサンゼルスにある中学校では人文学の授業で、宗教的に「神聖な場所」についての研究などに利用されている。日本では、プログラミングスクールにMOD開発の題材として使用されるなどの例がある他、教育関係者向けにMinecraftの研修会が実施されている。対してトルコは、2015年3月までの政府調査内で"暴力的なゲーム"として規制をするなどの声を挙げている。
2015年にMinecraftをより有効に教育現場で活用できるように「Minecraft in education」を発表。Microsoft in Education Teamが教育者や識者から集めたさまざまなアイデアを基に教育のためにデザインし直した作品となる。2016年1月、Mojangは『Minecraft: Education Edition』を発表し、2016年11月1日に提供を開始した。提供開始当初はWindowsおよびMacOSのみの対応であったが、2018年9月からiOSでも利用できるようになった。2018年2月のアップデートでは、化学の学習に使用できるモードが追加された。統合版では、チートの項目をオンにすることでEducation Editionの一部、化合物にアクセスできる。
プレイヤーはスキンを変更することで容姿を変えられる。デフォルトスキンのスティーブ、あるいはアレックスは初めから用意されている。アレックスのスキンは従来モデルより腕が細くなったスリムモデルとなっている。このほか有志が作成・公開しているスキンや自作のスキンを使用してこの容姿を変更することができる。ゲーム内ストアには有料のスキンもあり、中には他のゲームとコラボレーションしたスキンもある。またアドオンを利用することで見た目や生物などの動きを変えることが可能である。このアドオン導入は統合版の一部の機種に限られる。Java版ではリソースパック、データパック、そしてMODを利用したカスタマイズが可能である。リソースパックやデータパックはアイテムやブロックなどの外見を自由に変更できたり、新しいレシピや複数のコマンドを関数として追加できる。MODはゲーム性や難易度を変更したり、新しい地形を追加したり、更には根本的なシステムを変更するなど、さまざまな要素を追加する。大型の変更を加えるものから小規模の変更を加えるものまで、数多くのMODが配布されている。Java版のコードは難読化しているため、MOD制作を容易にするためにAPIやオートローダー（MODの自動読み込み）をサポートするMODがいくつか存在する。これらは「前提MOD」と呼ばれ、代表的な例として「Minecraft Forge」がある。また、プレイヤーが制作したマップのデータを他者に配布することも可能である。中にはイギリス地質調査所がイギリス本土を再現したマップも存在する。
Minecraft Realms（マインクラフト レルム）またはRealms（レルム）は、Mojang社が運用する有料のマルチプレイサーバーである。RealmsにはJava版とPlayStation 4を除いた統合版で分かれ、それぞれ料金プランがある。所有者は他のプレイヤーを2人、あるいは10人まで招待（ホワイトリスト）可能で、招待される側は無料で、所有者に承認されるとサーバーに参加できる。サーバー構築にあたっての必要な知識なく、簡単かつ手軽に運用ができる。Realmsでのマルチプレイには「Microsoftアカウント（Xbox Liveアカウント）」が必要である。
サーバーソフトウェアを用いて複数のプレイヤーで遊ぶマルチプレイ機能が実装されている。シングルプレイで使っていたワールドをLANに公開するか、公式ページで配布しているサーバーソフトウェアを用いることで複数のプレイヤーと遊ぶ事が出来る。また、有志によって改良されたソフトウェアも存在し、中にはプラグインを用いての高度な制御が可能である。プラグインを導入することにより、PvPなど独自の機能を持ったサーバーも存在する。
ポーションとは、プレイヤーに様々な効果を付与する薬のようなアイテムであり、「醸造台」と呼ばれるユーティリティを用いて作成できる。一部のポーションには効果がないものがある。作成にはモンスター等から取得できる材料が必要となる。ダンジョン等の構造物のチェストや、一部モンスターのドロップ品として入手することもできる。
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