先行車両の試験結果を反映し、量産車両では以下の点で仕様が変更された。外観では側面戸袋部のカラーバンドを青色の「ビビッドブルー」からグリーンラインの緑色のカラーバンドに変更した。先頭車両では乗務員室後部外板戸袋部に設けていた換気口を省略した。視認性向上のため、尾灯の取り付け位置を約20mm車体中央寄りの設置とした。車内は基本的な仕様は先行車両のものを踏襲している。変更点はドア横の車内情報表示装置のモニター画面のカバー形状を角ばった形状から丸みのあるものへと変更した。座席端部のガラス製袖仕切りは、破損した場合に備えて交換が容易な取付け構造へと改善した。制御装置、補助電源装置、台車、主電動機などの走行機器類は特に変更されていない。なお、側面戸袋部のカラーバンド色変更と車内情報表示装置のカバー形状変更は先行車両についても、仕様統一のために改修が実施された。この量産車両は2007年（平成19年）7月から製造が開始された。最初に4両編成1本（第03編成）が落成し、神戸から横浜へ甲種車両輸送された。同年8月に4両編成2本（第04・第05編成）8両、同年9月頃に4両編成5本（第06 - 第10編成）20両、そして翌2008年2月頃に4両編成5本（第11 - 第15編成）20両も落成し、開業時に必要な編成すべてが出揃った。第03編成以降の編成の甲種輸送は、兵庫駅→大船駅→横浜羽沢駅→川崎貨物駅→鶴見駅→東高島駅→桜木町駅→根岸駅→横浜本牧駅の経路で行われた。横浜本牧駅からはトレーラートラックで川和車両基地へと搬入された。
先行車両となる4両編成2本（第01・02編成）8両は、2006年（平成18年）5月に川崎重工業兵庫工場で落成し、神戸港から横浜港（大黒埠頭）まで貨物船により船舶輸送された。大黒埠頭からはトレーラートラックによる陸上輸送でセンター北駅へと運ばれた。そして、同年6月に同駅付近の高架線上へクレーンで吊り上げるという地下鉄車両としては極めて珍しい車両搬入が実施された（過去には大阪市営地下鉄6000形で実施されたことがある）。同年7月から先行工事により早期に完成していたセンター北 - センター南間で性能確認試験（性能確認試運転）を開始した。なお、工事の進捗に伴い試運転区間は順次延長されていった（2007年1月まで実施）。主な確認内容はATC装置・ATO装置や加速・減速性能、誘導障害試験、対列車画像伝送システム、列車無線などの機器や走行安全性、乗り心地、空調装置、ホームドア制御など多岐にわたるものとなった。この先行車両での性能確認試験はおおむね良好であり、この試験結果を元に細部の仕様見直しを行った量産車両（第03 - 15編成）が製造された。
リニア地下鉄初採用となる高周波連続誘導式による車上演算方式のデジタル方式ATC（HD-ATC yokoHama - Digital -ATC）が採用されている。車両基地内においてもATC運転が行われており、入換信号現示も車内信号で行われる。ワンマン運転に対応したATO装置が搭載されており、駅の出発から駅間の走行制御、駅停止時の定位置停止制御まで一連の運転操作を行う。ATO運転時における乗り心地の低下を防止する観点から、力行操作・ブレーキ操作とも31段階の多段制御を行っており、駅停車時の定位置停止精度は前後35cm以内と精度は高い。ATC装置とATO装置は一体形で、Mc1車に搭載されている。各主要機器はYTM装置 (Yokohama Train Manegement system) と称する列車制御管理装置により集中制御・監視されており、これにより乗務員支援、乗客へのサービス、メンテナンス作業の効率化などを図っている。
作新学院高校ではエース・八木沢荘六の控え投手として、主にリリーフを担当していた。1962年、作新学院は八木沢などの活躍もあって春の選抜に優勝、続く夏の甲子園予選北関東大会も勝ち上がり、春夏連覇に期待をかけられた。春の優勝後、加藤は野球部長の勧めで投法をオーバースローからアンダースローに転向している。大会直前、エースの八木沢が赤痢にかかり、チームは急遽加藤を主戦投手として戦うこととなった。甲子園では1回戦で気仙沼高に苦戦したものの勝ち上がり、準決勝では林俊彦、木俣達彦の強力バッテリーを擁する中京商を2-0で完封。決勝でも久留米商のエース伊藤久敏と投げ合い、1-0で完封勝利。作新学院は史上初の甲子園春夏連覇を果たした。高校同期に八木沢の他、高山忠克、中野孝征がいた。甲子園優勝投手となった加藤にはプロ野球からオファーが殺到、獲得競争が始まった。当初は読売ジャイアンツ入りが有力視されていたが、中日ドラゴンズは当時コーチだった土屋弘光と加藤の姉を見合いさせて加藤に接近しようという作戦を立てた。この結果、お見合いは見事に成功し、加藤も中日入りすることとなった（詳細は土屋の項も参照）。1年目の1963年から一軍で登板し、10月22日の最終戦では山中巽をリリーフ、5イニングを無失点で抑え阪神タイガースから初勝利を挙げた。2年目の1964年5月10日には大洋ホエールズを相手に初先発、佐々木吉郎と投げ合い4被安打で初完封を飾る。プロ2年目のシーズンを終えた1965年1月3日、帰郷していた加藤は宇都宮市内で開かれた作新学院のクラス会に出席、その2次会に参加するため友人を乗せて自家用車で日光市の旅館に向かっていた。加藤が運転するダットサン・フェアレディは今市市（現・日光市）内を走行中、凍結した路面でハンドル操作を誤り、民家のブロック塀の角にフロント部分が突き刺さる状態で衝突した。加藤は頭蓋骨陥没により意識不明の重体、同乗の友人も重傷を負った。病院に搬送された加藤は意識を取り戻すことなく翌1月4日に死亡した。享年20。