次回予告は15秒で、すべて主人公バサラとヒロイン、ミレーヌの掛け合いによって構成される。多くの場合バサラの「過激にファイアー」「俺の歌を聞け」などといった台詞で締められるが、第32話 - 第34話、第36話、第37話における次回予告ラストでは『アニメージュ』1995年2月号で公募され、同年6月号で採用が発表された台詞が使用されている。
CM前後に挿入されるアイキャッチはOVA版の未放送3話も含めて39種類のバリエーションがある。使用回数が多いものもあれば、1回しか使われなかったものもある。詳細は後述の「各話リスト」を参照。
メカニックデザインは河森と、スタジオぬえの先輩である宮武が分担して行い、統合軍側の可変戦闘機を河森が、艦船、敵可変戦闘機のバトロイド形態、敵生命体プロトデビルンなどを宮武が担当した。宮武は他に、自身のデザインした艦船などが出る場面のレイアウト設定も担当している。また、一部の敵兵器は、河森が企画していた『空中騎行戦記』（『天空のエスカフローネ』の原案）からデザインが転用されている。本作では河森・宮武の共通認識として前作のように細部に凝った複雑なデザインとせず、ステルス性のある構成を取り入れている。初期のカラーリング設定画では継ぎ目の線がすべて消されたものが描かれたが、実際にアニメーションで動かす際にチープな印象になることや、継ぎ目がないと形がつかみづらいという問題から、継ぎ目が足されることになった。
キャラクターデザインは、主要キャラクターの場合は美樹本の原案をもとに桂憲一郎がアニメーション用のキャラクター設定を起こすという方式をとっている。美穂とサリー以外のオペレーター、ドッカー、ジャミングバーズなど、主要ではないキャラクターは桂のオリジナルデザインである。
作品の年代は2045年とテレビ版『超時空要塞マクロス』から35年後にあたり、劇場版『愛・おぼえていますか』は作品世界内で2031年に公開された映画という設定になっているが、「メルトランディ」という呼称やエキセドル・フォルモの容姿をはじめ、設定、メカニック・キャラクターデザインなど劇場版『愛・おぼえていますか』の要素も採り入れられている。これは、テレビ版『マクロス』や本作もまた作品世界内で歴史的事実を元に作られた作品（再現ドラマ）という設定であり、「史実」がテレビ版と劇場版のどちらか一方にのみあるからではないと説明されている。詳しくは項目「マクロスシリーズ」の「作品の解釈」、「超時空要塞マクロス 愛・おぼえていますか」の「補足」を参照。『マクロスプラス』（2040年）から5年後が舞台になるため、メカも試作機が制式採用される（YF-19からVF-19、YF-21からVF-22Sへ）、主力機がアップデートされる（VF-11BからVF-11Cへ）などの移行が設定されている。
作品の重要な要素のひとつである「歌」に関して、『超時空要塞マクロス』では女性アイドル、『超時空要塞マクロスII -LOVERS AGAIN-』では歌巫女をフィーチャーしていたが、本作では男女ツインボーカルのロックバンドを中心に据えている。さらに新機軸として、キャラクターの通常の声を声優が演じ、歌の部分はプロのミュージシャンが担当するという方法が採られている。配役は先にミュージシャンを決めてから、歌の声と違和感のない声優を選ぶというかたちがとられた。ただし、その分業方式は放送開始後まで伏せられており、1995年5月21日に日本青年館で行われたライブ「Let's Fire!!」において初めて明かされた。音楽プロデューサーの佐々木史朗によれば、通常の新番組では2 - 3曲ほどで済む歌を開始までに10曲以上制作せねばならず、さらに制作予算を最初の十数曲で使いきるという事態におちいったが、本作の大ヒットにより追加予算が下りたため、無事に番組後半用の音楽を制作できたという。また本編内ではバックグラウンドミュージック (BGM) がいっさい使用されておらず、使用される音楽はすべて作品世界内における歌や演奏、スピーカーから流れる音声といった「劇中曲」である（例外的に、楽器のない状況で登場人物が歌を歌った際、その場に存在しないはずの伴奏が流れることがある）。本作オリジナルの音楽に限らず、『II』や『プラス』の挿入歌やBGMも使用されている。アミノはことさらに盛り上げるのを避けたいと思い、ドキュメンタリー的な雰囲気づくりを要求してこの方法をとったと語っている。
備前国出身。当初文章生として朝廷に仕える。延暦4年（785年）に事件（藤原種継暗殺事件と想定される）に連座して禁錮に処せられるが、特別の恩赦により少判事に任ぜられる。その後従五位下・式部少輔に任ぜられ、大学別当を兼ねた。大学別当在任時に、墾田20町を大学寮に寄付して勧学料とし、これまで明経道試の結果が上位二階級（上上・上中）のみ叙位の対象としていたものを、上位四階級まで（上下・中上まで）叙位する案を提出した。また、大学寮の学者らを呼び、陰陽書や『新撰薬経』『大素』を講論させた。さらに、大学寮の南にあった和気氏の私邸に内外の経書数千巻を収めて、父・清麻呂の遺志を継いで、和気氏出身の子弟のための学館である『弘文院』として創建した。また、墾田40町を学問料として充当したという。桓武朝後半は式部少輔と大学頭を務める一方で、延暦18年（796年）阿波守、延暦24年（805年）美作守と地方官を兼ねる。また、延暦18年（796年）には私墾田100町を美作・備前両国の8郡30余郷の困窮者に対する財源とするために賑給田として寄進することを上奏し、許されている。桓武朝末の延暦25年（806年）式部大輔に昇格する。大同元年（806年）平城天皇の即位後まもなく、正五位下・左中弁に叙任された。