「卑弥呼の庄」を巡る土地売買トラブルは、当時の桜井市議会の懸案事項となった。「大和さくらい」へ土地を売却する際には議員から反対の声があったにも関わらず、市長がオープン直前の2009年12月に市長権限で株式会社ファームを連帯保証人から外したという経緯があり、市みずからがファームに支払いを求める道を閉ざしていた。そのファームも、事実上連帯保証人としての効力は疑問視されていた。市への支払いも2億円を5回に分割して納付するという異常な契約で、議会や新聞では谷奥市長の責任を問う声が上がった。「大和さくらい」は、この土地売買代金の2億円とは別に桜井市に対して1億8000万円の寄附を分割で行うという申し出をしていたが、こちらも実際には市に寄付されることはなかった。この寄付金の1億8000万円は、土地の購入価格の補填金とされ、合計の3億8000万円が市の希望売却価格であった。しかしその価格では本社のファームの決済が下りないため2億円の購入代金と1億8000万円の寄付という形に分割された。寄付とは本来任意のものであり、なぜそのような不明瞭な形で契約したのか、議会では契約に携わった関係者の責任が問う声もあった。奈良日日新聞は、市が業者側の常軌を逸脱した要求を鵜呑みにしたことが問題であるとして、谷奥桜井市政を批判した。市は周辺地の地権者の説得にも関与しており、「大和さくらい」との土地売買契約に応じるように促してきた経緯もあった。結果的に市は周辺地権者を無用のトラブルに巻き込むこととなった。塩付けの土地に民間を巻き込んだ新たな負債を加えてしまった谷奥市長は、2011年11月の市長選挙で元奈良県議の松井正剛に2倍以上得票数差で惨敗し、1期のみで市政から去った。
「卑弥呼の庄」は、「くらはし農村公園　卑弥呼の庄」に改名して2010年10月16日に再オープンした。「大和さくらい」の実質的な債権者でもある西上建設と御所興産（御所市）は、同年10月に新しい運営会社として「株式会社倉橋」設立し、残された施設で営業を行った。駐車場を無料化に戻すとともに、レストランは価格帯を下げて「農村バイキング料理」を中心に取り扱うようにした。敷地内の棚田での古代米の刈り取り体験などは、そのまま継続されたが、経営の主体は広い駐車場とレストランを生かした団体向けの休憩所的な運営であった。また、地権者である市の了解を得た営業ではなく、債権者としての独断の営業であったため、市は施設の明け渡しを求め、「大和さくらい」とともに「株式会社倉橋」を訴えて、土地の返還を求める裁判を起こした（既述）。「くらはし農村公園　卑弥呼の庄」は、桜井市の土地明け渡し訴訟での判決もあり、2012年5月30日に閉鎖に至った。建設して4年にも満たない敷地内の建物も、取り壊されることが決定した。
2011年（平成23年）4月8日、桜井市は敷地の明け渡しと土地の使用料を求めて訴訟を奈良地方裁判所へ起こした。この訴訟では、2011年以降に同施設を運営していた「株式会社倉橋」（後述）も被告となった。5月16日に第1回口頭弁論が開かれ、両被告側は訴えの棄却を求める答弁書を提出し、争う姿勢を示した。2012年12月10日に市側が勝訴し、「大和さくらい」に土地の原状復帰と引き渡し、および土地使用代金の支払いが命じられた。「大和さくらい」側は控訴しなかったものの、判決命令に応じようとしなかったため、桜井市は「債権者による破産申し立て」を裁判所に行い、強制的な資産整理に着手した。2015年（平成27年）9月7日、奈良地裁は「大和さくらい」の破産手続開始を決定し、同社は2016年（平成28年）4月に破産した（奈良地裁 平成27年（フ）第226号）。負債総額は数億円とされた。
「卑弥呼の庄」を開設するにあたり、「大和さくらい」は市の所有地だけでなく周辺の地権者からも土地を購入したが、その地代も適切に支払われることは無かった。また建物などの施工業者への造成・建設費用も同様であり、施工した西上建設を筆頭に、総額4億2000万円が不払いとなり、この騒動の最大の被害者となった。西上建設は施工費の未払いを理由に、レストランなどの建物の所有権を占有した。
デカルトは1596年に、中部フランスの西側にあるアンドル＝エ＝ロワール県のラ・エーに生まれた。父はブルターニュの高等法院評定官であった。母からは、空咳と青白い顔色を受け継ぎ、診察した医者たちからは、夭折を宣告された。母は病弱で、デカルトを生んだ後13ヶ月で亡くなる。母を失ったデカルトは、祖母と乳母に育てられる。1606年、デカルト10歳のとき、イエズス会のラ・フレーシュ（La Flèche）学院に入学する。1585年の時点で、イエズス会の学校はフランスに15校できており、多くの生徒が在籍していた。その中でもフランス王アンリ4世自身が邸宅を提供したことで有名であるラ・フレーシュ学院は、1604年に創立され、優秀な教師、生徒が集められていた。イエズス会は反宗教改革・反人文主義（反ヒューマニズム）の気風から、生徒をカトリック信仰へと導こうとした。そして信仰と理性は調和する、という考え（プロテスタントでは「信仰と理性は調和しない」とされる）からスコラ哲学をカリキュラムに取り入れ、また自然研究などの新発見の導入にも積極的であった。1610年に、ガリレオ・ガリレイが初めて望遠鏡を作り、木星の衛星を発見したとの知らせに、学院で祝祭が催されたほどである。ただし、哲学は神学の予備学としてのみ存在し、不確実な哲学は神学によって完成されると考えられていた。デカルトは学院において従順で優秀な生徒であり、教えられる学問（論理学・形而上学・自然学）だけでなく占星術や魔術など秘術の類（たぐい）のものも含めて多くの書物を読んだ。そして、学問の中ではとりわけ数学を好んだ。カリキュラムの1つである哲学的討論においては数学的な手法を用いて相手を困らせた。のちにミニモ会士になり、終生の友人となるマラン・メルセンヌは、学院の先輩にあたる。好んだ数学に対して、神学・スコラ学の非厳密性、蓋然性は際立ち、それを基礎にした学院の知識に対して、懐疑が生まれることになる。しかし、この学院での教育や教師たちに、デカルトは終生感謝の念を持ち続けた。1614年、デカルトは18歳で学院を卒業する。その後ポワティエ大学に進み、法学・医学を修めた。1616年、デカルト20歳のとき、法学士の学位を受けて卒業する。この後2年間は、自由気ままに生活したと考えられる。パリで学院時代の友人であるメルセンヌに再会し、偉大な数学者フランシス＝ヴィエタ（ヴィエタについては#数学への功績も参照）の後を継ぐものと騒がれた数学者クロード・ミドルジと知り合うなど、交際を広げた。