北部鉄道元社長および証券取引合唱団名誉会員で新しいマネージャーのリチャードがパリ国立オペラに到着し、物語は始まる("Introduction")。彼はアーティストやスタッフらから挨拶を受ける("Welcome Sir, I'm So Delighted")。以前のマネージャーはオペラ・ゴーストの月2万フランとボックス席の要求を守らなかったため短期間で退職したのである。頑固で愚かなリチャードもゴーストの要求を拒否すれば悲劇が起きると小耳に挟むがこの要求を拒否する。ボックス席案内係のマダム・ジリーはリチャードに、ゴーストは落胆するだろうと警告する。ゴーストがいつも使用する5番ボックス席をリチャードが要求しマダム・ジリーは恐怖を抱く。マダム・ジリーはリチャードの態度にゴーストが何もしない訳がないと知っているのである。マダム・ジリーはリチャードに悲劇が起きると警告するが、リチャードは相手にしない。夜公演が開幕する("Accursed All Base Pursuit of Earthly Pleasure")。ゴーストはメフィストフェレスの姿で最初の警告をする。終演後、リチャードの、ハンサムだが鈍くコーラスのクリスティーヌ・ダーエに恋い焦がれる息子ラウルが彼女の楽屋に向かうと、他の男性と話しているのが聞こえる。嫉妬したラウルが部屋に押し入ると誰もいない。ゴーストはとてもリアルで、クリスティーヌを愛しており、邪魔が入り悲嘆する("How Dare She")。厩務員がリチャードの事務所にやってきて、シーザーという馬が行方不明だと語る("Late Last Night I'm In The Cellars")。リチャードは厩務員の不始末として即解雇する。愛する人に裏切られた若きラウルとクリスティーヌは地元の墓地を訪れる("All Of My Dreams Faded Suddenly")。ラウルは天使の声を持つ「音楽の天使」を紹介される("While Floating High Above")。クリスティーヌが先に帰り、怪人はラウルの首を締めようとするが、墓荒らしがやってきたため逃げる。オペラ座ではリチャードが息子がコーラス・ガールを追いかけまわしていることを嘆く。その夜出演する予定だった歌姫カルロッタはとても具合が悪い("She Says She's Got The Nodules")。カルロッタが演じる裏でクリスティーヌが歌うこととなる。怪人にとってはそんなことは関係ない。怪人は事故を起こすのをやめる気はないし、カルロッタを降板させるなど全力で上演中止に追い込むつもりである。夜公演でカルロッタは動きを間違え、クリスティーヌの歌と全く合わない("What Do I See")。終演に近付いた頃、クリスティーヌは気を失い、カルロッタはカエルの鳴き声のような声を出し、公演は中断する。観客たちが爆笑する中、怪人はカルロッタがシャンデリアを落とすと宣言する。しかし彼はシャンデリア(chandelier)ではなく燭台(candelabra)のスイッチを入れ、カルロッタに落とす。終演後、クリスティーヌとラウルはオペラ座の屋根の上で会い、オペラ座と怪人から逃げる方法を話し合う。しかしこの時怪人は近くにいたのである。怪人は2人の上にあったアポロ像の裏から姿を現す("To Pain My Heart Selfishly Dooms Me")。クリスティーヌとラウルは屋根から下り、怪人は1人になる。1人の老人が入ってきて、オペラ座の屋根に鳩の餌を撒く。怪人は怒りを増幅させ、無関係の老人を屋根から投げ落とす。怪人はクリスティーヌを手に入れると叫ぶ。
ジャック・スパロウ船長が指揮する帆船である（ただし長らくバルボッサに乗っ取られていた）。船の規模はフリゲート程度で、三本のマストを持ち横帆7枚、縦帆5枚を備える。船体と帆は黒く塗られており、(ベケットに火を放たれ焼け焦げてしまったため黒くなっているとする説もある)本船の外観上の特徴となっている。そのため、真夜中の海上で明かりを全て消すと遠目では全く目視できなくなる。砲甲板は一層で18～20門程度の大砲を搭載し、また上甲板にも8～10門程度を搭載しているので装備している大砲は25～30門程度である。本船の最大の特徴はカリブ海で一番といわれる高速で、インターセプター号にも軽く追いつく。カリブ1の快速とされていながら、最後の海賊ではイギリス海軍艦隊エセックス号に軽々と追い付かれているシーンも存在する。パイレーツオブカリビアン自由の代償にてデイヴィ･ジョーンズとの血の契約によって引き上げてもらう際の契約の一つで快速の帆船となった。ジャックがデイヴィ・ジョーンズと血の契約で13年間船長を務めることになっていたが、2年目に反乱が発生、それ以後バルボッサが船長となる。『呪われた海賊たち』でジャックが船を取り戻し再び船長となるが、『デッドマンズ・チェスト』のラストでクラーケンにジャック共々海底に引きずり込まれてしまった。『ワールド・エンド』では、デイヴィ・ジョーンズの墓場で孤独さのあまり錯乱状態になっていたジャックと共に、引きずり込まれた直後と同じ姿で登場。その後助けにきたウィルやバルボッサ達と共に現世に戻り、彼らを乗せて難破船島へと向かう。その後行われた海戦でフライング・ダッチマン号と戦い、一時的に渦の中に沈めた。その後にウィルが船長となり復活したダッチマン号と共にベケット卿のエンデヴァー号を彼もろとも葬り去った。戦いの後、船は三度ジャックの物となるが、今度はトルトゥーガ島でギブスと共に置き去りにされ、再びブラックパール号はギブス以外の乗組員と共にバルボッサに奪われてしまう。その後、バルボッサは黒ひげとの戦闘でブラックパール号を奪われてしまい、『生命の泉』ではボトルシップにされてしまった。しかし最終的にはジャックの手に奪還された。『最後の海賊』では、バルボッサが黒髭から手に入れた剣によってブラックパールを元に戻すことに成功した。また作中では語られていないが、公式設定によると、実はブラックパール号は元々東インド貿易会社の船でありベケット卿が所有しており名前も「ウィキッド・ウィンチ号」といった。ジャックは若い頃、海賊の掟を破ってしまい逃亡。ベケットの元で働いており、この船をベケットより常に任されていた。ある日、ジャックは奴隷をウィンチ号に乗せて輸送する仕事を言い付けられたのだが、自由主義であるジャックはこれを嫌い奴隷を全て解放。再び海賊稼業に復業した。そんな中、突如としてサラザールの襲撃を受け、ウィンチ号の船長が戦死してしまう。一等航海士だったジャックは後を引き継ぎ、見事サラザールたちを誘導し、「魔の三角海域」へと幽閉。この功績が仲間たちに認められ、ジャックは名実ともに若くしてウィンチ号の船長となった。しかしジャック裏切りの事実を知ったベケットは当然のことながら怒り、海軍を動かしてウィンチ号を沈めた。海軍より貿易会社に引き渡されたジャックは、ベケットにより裏切りの烙印を腕に押されてクビとなる。その後、ジャックは長い間乗船していたウィンチ号を捨てきれずに、海の悪霊デイヴィ・ジョーンズに頼み、血の契約を交わす。その際、ウィンチ号を海底より引き上げてもらったがウィンチ号は海軍に沈められた際の炎の影響で船体が真っ黒に変色していた。ジャックは、この船の名前を見かけにちなんで「ブラックパール」と改名。これが現在の名前の由縁である。