1895年（明治28年）6月3日、日本軍が基隆を攻略した。同月、日本の技師が実地検査を行った際にはこの路線の線路はアップダウンが激しく、急曲線や急勾配が多いことに気づき改良事業に着手することになった。8月、台湾総督府は臨時台湾鉄道隊を設立し、基隆～台北間の改良工事を進行させた。まずこのトンネルを含む獅球嶺地区の区間を別経路で新設することになった。それがこのトンネルより東に約1 km離れた竹仔藔トンネル（その後の竹仔嶺トンネル）だった。1898年（明治31年）3月、竹仔藔トンネルが完工するとともに獅球嶺トンネルは放棄され、開業から僅か7年でその歴史を閉じてしまった。その後まもなく、1916年に『縦貫道』と命名される道路に組み込まれ基隆と八堵間を短絡する陸路交通としての役割を果たした。板車や牛車、商人などがここを経由し八堵にある基隆河の渡船場に至り、水路で台北まで往来していた。南側出口付近には土地公を祀る廟（石黎坑土地公）があったが、戦時中に軍によるオイルタンク建設に伴い移設されている。
後継の歩兵銃として採用されたM1ガーランドは1938年から配備が進められていたが、第二次世界大戦が勃発した1939年時点では依然としてM1903が多くの部隊に配備されていた。また、アメリカ軍の拡大に伴い、スプリングフィールド造兵廠がM1ガーランドの製造を最優先で進め、予備装備として残されていたM1917エンフィールドの再配備も行われたが、それでも歩兵銃が徐々に不足しつつあった。1940年、ダイナモ作戦（ダンケルク撤退）においてイギリス軍は大量の装備を喪失した。イギリス政府はアメリカへと武器の供給を打診し、その結果かつてロックアイランド造兵廠で使われていた設備を借りたレミントン・アームズ社がイギリス向けのM1903を製造することが決定した。イギリス側は.303ブリティッシュ弾仕様、リー・エンフィールドと同型の着剣装置、同型の銃床の取り付けなどの設計変更を求めていたが、レンドリース法が議会を通過したことで小銃および銃弾の直接供給が可能となり、.303弾仕様のモデルは製造されなかった。情勢が緊迫する中で、レミントン社は引き続きアメリカ軍向けのM1903の製造を担当した。当初はM1903A1を製造する予定だったが、レミントン社に与えられた銃床用ブランク材は在庫として残されていたS型銃床用のものだったので、こちらを製造することになった。1941年11月、最初の1,273丁がレミントン社から出荷された。同年12月の真珠湾攻撃によってアメリカは第二次世界大戦に参戦し、これに合わせてM1903の生産規模も拡大された。この時期には生産効率を高めるために工程の簡略化や設計の変更が加えられ、それらのモデルはM1903改（M1903 Modified）としてM1903と区別された。M1903改は1943年5月に製造が終了した。1942年初頭、レミントン社ではリアサイトを簡素化することで一層の生産効率の向上が望めると判断した。新たなモデルの外見上の相違点として、リアサイト（後部照準器）が単純かつ小型な環形構造にされ、ボルト・アッセンブリの近くに移された点がある。増産に対応するために、銃床の用心鉄や床尾板などの部品は、鍛造や切削からプレス加工に変更された。また、銃身や機関部の素材が戦時規格鋼に変えられたほか、金属部の表面処理も簡略化された。1942年5月21日、このモデルがU.S. Rifle, Cal. .30, Model of 1903A3（合衆国1903年式A3型30口径小銃）として制式採用された。10月には銃身のライフリングが2条に減らされた（射撃の精度に悪影響は出ないものとされた）。出荷は12月から始まった。タイプライター大手として知られるスミス・コロナ社もM1903の製造を担当したメーカーの1つである。さらなるM1903の供給を求めていた軍部はハイスタンダード社に契約を持ちかけたものの、その他の火器の製造のために同社の生産力は限界に達していた。ハイスタンダード側は自社が銃身のみ製造し、組立等をスミス・コロナ社に下請けさせることを提案した。最終的にはスミス・コロナ社が主契約業者、ハイスタンダード社が銃身製造下請けという形で契約がまとまった。1942年2月25日に正式に製造契約が結ばれ、5月には契約内容がM1903からM1903A3に切り替えられた。量産は11月から始まり、契約が終了する1944年2月19日までに234,580丁が出荷された。M1903A3はほとんどが国内での訓練等に用いられ、実戦用の歩兵銃としてはM1903やM1ガーランドほど広くは配備されなかったものの、憲兵を初めとする後方要員向けの小銃としてはヨーロッパや中国・ビルマ・インド戦線などで使用された。また、M1903用のM1ライフルグレネードランチャーから発射できるM9対戦車榴弾は、大戦初期のアメリカ軍における主力対戦車装備であり、各小銃班あたり1名が射手に任命されていた。1944年頃からはM1ガーランド用M7グレネードランチャーへの更新が進んだが、M7ランチャーはM1ガーランドのガスシステムと自動装填機能を一時停止した上で擲弾を取り付ける必要があり、その手間を嫌った多くの射手が1度の射撃きりで使い捨てていた。そのためM7ランチャーの普及は進まず、空砲弾を込めるだけでよいM1903とM1ランチャーの組み合わせが好まれ、終戦まで広く使われた。アメリカ軍は開戦後も制式狙撃銃を採用していなかった。しかしM1ガーランドの狙撃銃仕様は設計に時間が掛かると判断されたため、軍部はレミントン社に対しM1903A3をベースとした狙撃銃の開発を要請した。1943年には製造契約が結ばれ、新たな狙撃銃にU.S. Rifle, Cal. .30, M1903A4, Sniper’s（合衆国1903年式A4型30口径狙撃銃）の名称が与えられた。レミントン社は1944年2月にM1903A3の生産を、6月にM1903A4の製造を終了した。この時点までにM1903およびM1903改をあわせて348,085丁、M1903A3を707,629丁、M1903A4を28,365丁出荷していた。