駅舎から少しはなれて相対式ホーム2面2線のある地上駅で列車同士の行き違いが可能。立山線の寺田駅から岩峅寺駅までの間では、この駅のみ列車同士の行き違いができることになる。各ホームと駅舎とが、構内踏み切りで結ばれているほか、駅舎西側には地下道で連絡している。現駅舎は、立山町の図書館、交流施設等、各種社会機能を統合した立山町「元気交流ステーション」愛称「みらいぶ」内にあり、2012年（平成24年）6月1日より供用が開始された。本来は2012年3月20日に供用開始予定であったが、東日本大震災の影響により工事が遅れ延期された。建設費は約16億円。旧駅舎は、1913年（大正2年）築の一階建て木造駅舎で、左右対称のデザインを持っていた。洋風だが瓦葺の屋根を持つ駅舎であった。駅舎の内部には広い待合所と出札口や改札のほか、自動券売機が設置されていた。台風時の強風で外の大木が折れ、そのまま駅舎に倒れこみ、駅舎が半壊したことがある。この駅は立山町の中心部にあるため乗降客が多く、業務委託駅となっている。2012年3月17日現在、7時00分から20時00分まで駅員が配置されているほか、ICカード専用改札機も設置されている。
館内の一部で銀座線開通時の上野駅ホームを再現している。地下鉄で実際に使用された車両の展示（銀座線旧車両、およびリニューアル後は丸ノ内線の一号車（300形）、さらに地下トンネル点検車等も追加された）のほか、地下鉄運転シミュレーター、鉄道模型レイアウトや模型の展示もあり、地下鉄クイズ、映画の上映（後述）なども行われている。図書室もあり、専門図書館としての専門書や専門誌の他、鉄道関係の一般書や絵本なども少々置いているが、特に『東京地下鉄道史』や各路線の建設史等、貴重書や非売品のため、他にはまずない資料もある。土・日・祝日のみ開放、資料帯出・コピーはできない。入口は営団地下鉄および東京メトロで実際に使われていた自動改札機と同様のものを使用しており、自動券売機で入館券を購入し、改札機を通過して入館するシステムになっている。なお、入館券の回収はなく、記念に持ち帰ることができる。2011年の東日本大震災以降、節電対策として土・日・祝日に限り自動改札の使用を中止し、改札鋏を使用した有人改札を実施している。また、併設されたホールでは「メトロコンサート」と題して、クラシック音楽を中心としたコンサートを多く開催するほか、鉄道映画や地下鉄建設に関する記録映画などの上映会を定期的に行っている。地下鉄運転シミュレーターは、運転士候補生（動力車操縦者養成）研修に使用されているものと同一の機器を使用している。入館客に人気があるのは千代田線用で、6000系（実車は2018年11月11日に千代田線での営業運転を終了）の実物大カットモデルを使用し、床下に揺動装置を組み込んで車両の揺れも再現されている（小学生以上限定）。他にカットボディではない銀座線01系（実車は2017年3月10日に銀座線での営業運転を終了、2010年にリニューアルされる前は丸ノ内線で、車両は02系の扱いであった）や半蔵門線8000系（映像は有楽町線、実際に新木場CRでのB修工事入出場で市ヶ谷 - 新木場間を走行している）、東西線5000系（実車は2007年3月17日に東西線での営業運転を終了）のシミュレーターもあり、こちらは小学生未満も体験できる。いずれも製作は三菱プレシジョンが担当している。博物館内には地下鉄の父、早川徳次の胸像も展示されている。
イダルゴ・イ・ロドリゲス・カンデラは1976年の著書"Inventario Vitícola Nacional"（全国ブドウ栽培目録）で、「アイレン」がシウダ・レアル県、クエンカ県、マドリード県、マラガ県、トレド県で、「ライレン」がコルドバ県、ハエン県、セビリア県で、「バルデペニェーラ」または「アイレン」がアルバセーテ県で栽培されていると書いた。マスター・オブ・ワイン(MW)の称号を持つイギリス人ワイン評論家のジャンシス・ロビンソンは、1996年の著書"Guía de Uvas para Vinificación"（ワイン醸造のためのブドウ案内）で、アイレンは世界全体の423,100ヘクタールで栽培されており、世界でもっとも栽培面積の大きな品種であるとしている。アイレンに続くのは、317,500ヘクタールのガルナッチャ種、244,330ヘクタールのマスエロ種、203,400ヘクタールのユニ・ブラン種、162,200ヘクタールのメルロー種、146,200ヘクタールのカベルネ・ソーヴィニヨン種であるとしている。さらにロビンソンは、アイレンはスペイン全体のブドウ畑の約30%を占め、スペインでもっともありふれた種であるとしている。バルデペーニャスやラ・マンチャの圧倒的な優先種がアイレンであり、スペイン南部ではライレンと呼ばれていることも付け加えている。ワイン・ガイド「ギア・ペニン」で世界的に知られるホセ・ペニンは、1997年の著書"Cepas del Mundo"（地球の幹）でアイレンの起源をラ・マンチャ地方であるとしており、スペインで栽培されているブドウの2/3はラ・マンチャが起源であるとしている。特にシウダ・レアル県とトレド県では圧倒的に支配的な品種であるとし、アルバセーテ県とクエンカ県ではやや劣るとしている。さらに南のモンティーリャ＝モリレスでも見ることができるとしている。ペニンはアイレンを「過去には生産性が低いという問題があった。ほとんどはブレンド用に他地域に送られた。一般的にアイレンのワインは黄みがかった光沢を持つ淡い色合いであり、果実が成熟しても酸度に欠けているが、バナナ、パイナップル、グレープフルーツに似た香りを持つ。アイレンのワインは『エレガント』ではないが、とても風味があり、好ましく、飲みやすい」としている。ペニンはアイレンの農学的特性にも触れており、「発芽は遅く、成熟時期は様々。アルコール度数は13-14度。ラ・マンチャ地方の極端な乾燥気候、石灰質土壌、最大700mの標高に完全に適応する。干ばつや疫病に非常に耐性があり、19世紀末のフィロキセラ後に大規模に植えられたことがそれを示している」とした。これらの文献からは、ワイン用となるアイレンと、生食用または干しブドウ用となるアイレンの2種類の存在を読み取ることができる。