予防接種プログラムが病気の脅威を低下させることに成功すると、その病気の影響についての文化的な記憶が薄らぐにつれ、病気の危険性の認識も低下する可能性がある。この点に関し、親は子供に予防接種を行わないことによって失われるものなどないと感じるようになるかもしれない。もし人々が、予防接種を行わないで集団免疫の恩恵にあずかろうという「ただ乗り」を望むようになれば、予防接種の水準は集団免疫が機能しなくなる水準まで低下する可能性がある。
一般的に用いられているワクチンは、急性または慢性疾患の治療と比較して、健康増進のための費用対効果に優れた予防医療である。2001年のアメリカでは、7つの疾患に対する定期的な小児期の予防接種により、出生コホートあたり、直接医療費100億ドルを含む、社会費用全体で400億ドル以上の節約になると推計されており、これらの予防接種の費用便益比は 16.5 と推計されている。
予防接種が不完全であると、予防接種を受けた人を含めて、集団全体のリスクが増大する。それは集団免疫が減少するためである。例えば、麻疹ワクチンは9ヶ月から12ヶ月の間に投与されるが、母親由来の抗体の消失 (それ以前は抗体陽転に失敗することが多い) と自然感染の間の短期間は、予防接種を受けた子供はしばしば脆弱である。もしすべての子供が予防接種を受けていれば、集団免疫によってこの脆弱性を低下させることができる。アウトブレイク時またはアウトブレイクの危険性がある時に集団免疫を強化することは、集団予防接種の正当化の理由としておそらく最も広く受け入れられている。新しいワクチンが導入されたとき、集団予防接種はその適用範囲を迅速に広げるために役立つ。集団の十分な割合が予防接種を受けていれば、集団免疫は効果を発揮し、幼すぎる、高齢すぎる、免疫抑制状態にある、またはワクチンの成分に対して重度のアレルギーがある、などの理由でワクチンを接種できない人々のリスクを低下させることができる。免疫抑制状態の人々が感染したときの予後は、一般的な集団よりもしばしば悪い。
大規模な予防接種運動の効果に関する科学的なエビデンスは良く確立されている。予防接種運動は、かつてはヨーロッパで7人に1人の子供が死亡していた天然痘の根絶を助け、ポリオをほとんど根絶した。もっと控えめな例でも、細菌性髄膜炎や他の子供の重症感染症の主要因であるインフルエンザ菌 (Hib) による感染症は、1988年にアメリカでワクチンが導入されて以降99%以上減少した。出生から思春期までの予防接種が完全に実施されれば、ある年にアメリカで誕生した子供のうち、3万3000人の命が救われ、1400万件の感染症が予防されると推計されている。これらの感染症の減少は、予防接種よりもむしろ衛生環境の改善の結果である、もしくは特定のワクチンが導入される以前にすでに減少していた、という議論がある。これらの主張は科学的データに基づいていない。ワクチンによって予防できる疾病の発生数は、特定のワクチンが導入されるまでは時とともに変動する傾向があるが、導入によってほぼゼロにまで減少する。アメリカ疾病予防管理センターのウェブサイトではワクチンに関する一般的な誤解についての議論がなされている。他の批判では、ワクチンによって付与される免疫は一時的でありブースターを必要とするが、疾病を生き延びた人は終生免疫を獲得する、という議論がなされる。後述するように、いくつかの代替医療実践者の教義はワクチンが効果的であることを受け入れない。
1904年11月、長年の不適切な衛生状態と疾病、そしてそれに続く公衆衛生担当オスワルド・クルスによる説明不十分な公衆衛生運動に対し、リオデジャネイロの市民と士官候補生はワクチン反乱 (Revolta da Vacina) と呼ばれる蜂起を行った。暴動は予防接種法が施行される日に起こった。多くの人々が長年にわたって都市の再開発などの公衆衛生計画に反対してきたが、予防接種はその計画の最も恐ろしい面、最も目に見えてわかりやすい面の象徴であった。
2000年、前半戦は不振に悩む高橋由伸に代わり3番打者として活躍、リーグ最多の勝利打点を挙げ（最多勝利打点のタイトル表彰はこの年限りであったため、江藤が最後の受賞者となった）、セ・リーグ優勝と日本一に貢献。特にリーグ優勝を決めた9月24日の中日戦（東京ドーム）では、4点ビハインドで迎えた9回裏に当時の守護神エディ・ギャラードから同点満塁本塁打を放つなど、勝負強さを発揮した。これは2000年巨人の通算200本塁打であった。福岡ダイエーホークスとの日本シリーズでもホームランを放っている。同年はシーズンの打率は.256と低調だったが32本塁打、91打点をマークした。2001年、移籍後2年連続のベストナイン・30本塁打を記録。スラッガーとして結果を残した。2002年、2割台前半・本塁打18本とレギュラー定着以降最低の成績に終わり、この年から徐々に成績が低迷。2003年、前年からの不振が続き、二軍落ちも経験するなど11年ぶりに規定打席に到達しなかった。代打での起用も多くなり、2004年には三塁手である小久保裕紀がダイエーから移籍してきたこともあり、スタメン出場は15試合にとどまった。2005年には、打率も2割を切り、スタメン出場は8試合で完全に代打要員となった。通算350本塁打にあと1本に迫っていたが、7月30日の対中日12回戦で本塁打性の当たりを放ったものの、天井に当たり左翼フライとなり、通算350号本塁打は幻となったため、結局本塁打を1本も打てなかった。同年オフの契約更改では野球協約の限度である40%を超える減俸となった。その直後、FAで巨人へ移ってきた豊田清の人的補償として西武ライオンズへの移籍が決定。「FA移籍」と「別の選手のFA移籍に伴う人的補償選手として移籍」の両方を経験したプロ野球史上初の選手となった。