1988年8月、奈良交通では高速バス事業に参入した。まず関東バスとの共同運行による夜行高速バス「やまと号」を運行開始した。その後も1990年までに首都圏へ4路線を新設したほか、福岡線も1990年に開設した。また、1994年には関西国際空港へのリムジンバスの運行にも参入し、1998年には伊丹空港への路線も開設している。しかし、路線を取りまく環境の変化により、福岡・埼玉への路線は2000年までに休止となったほか、利用客の多い新宿線にはダブルデッカーの投入も行なわれた。1990年代後半以降はコストダウンを目的とした路線再編成が行なわれ、路線廃止やエヌシーバスへの移管や管理委託が進められたほか、奈良交通が運行を受託する自治体バスへの転換も行なわれた。また、営業所の統廃合も行なわれ、2営業所隣接体制は1998年に解消された。その一方で、都市部の路線バスについては改善が進められ、1994年に車椅子リフト付車両を導入したのをはじめとして、1997年にはワンステップバス、1999年にはノンステップバスの導入も行なわれた。また、2000年には鉄道との連絡定期券が新設されたほか、2001年には高齢者用定期券も新設した。同年には奈良市がオムニバスタウンに指定された。2006年には近鉄けいはんな線の開業により、大幅な路線再編を行なっている。また、観光客輸送についても、パークアンドライドへの取り組みを進めているほか、2007年3月1日からは奈良市内循環線に、レトロ調をイメージし車体に奈良を代表する鹿をデザインした「バンビーナ（愛称）」を運行開始した。2007年10月1日からは近鉄バス、奈良観光バスと共に、近畿日本鉄道が設立した中間持株会社（連結子会社）のけいはんなバスホールディングス（現：近鉄バスホールディングス）の傘下に移った。
定期観光バスにおいては、1970年以降は観光客のニーズにも変化が生じたため、時流などを見定めたコース新設が目立つようになった。1972年に高松塚古墳の壁画が発見され注目を集めたことに対応し、1975年に「飛鳥路史跡めぐり」コースが新設されたのをはじめとして、1982年からは季節コースの設定も行なわれた。さらに、観光キャンペーンにあわせた特別コースも設定されるようになった。また、1979年には定期観光バス運行50周年を記念してボンネットバスを投入したほか、1985年には天井をガラス張りにした車両が「奈良公園名所めぐり」に投入された。1987年には、定期観光バスのバスガイド制服を天平風スタイルに変更した。貸切バスについては、1970年の大阪万国博覧会以降、大型需要は減少したものの、修学旅行などの固定的な需要があったことや、大阪都市圏という需要発生源を控えていることから、大きく発展することになり、営業基盤も強化されていった。
一方、過疎化とモータリゼーションにより乗客が減少していた山間部においては、1975年に東吉野村でのスクールバスの運行受託を開始したほか、1980年には十津川村において村内ローカル路線の存続とスクールバスの効率化を同時に解決するため、支線を全て十津川村営バスとした上で、全ての運行業務について奈良交通が受託するという方法を採用した。この方式は「十津川方式」とも呼ばれ、日本のバス業界において注目を集めた。これ以後、自治体の自家用バスの運行などを積極的に受託している。また、1984年には都祁村などで村内路線をマイクロバスにした上で幹線路線との乗り継ぎを行なう方法を導入した。なお、1988年4月には和歌山県太地町の南紀開発がバス事業を廃止したことから、奈良交通が路線バスと貸切バス事業を継承しており、奈良交通にとっては新たな事業展開となった。
親兄弟、その他の生い立ちは不明。推定される生年は1945年（昭和20年）生まれ。昭和33年、13歳の時にチキンラン勝負を行い生き残り、嵐を避けるために場末の雀荘に立ち寄る。そこで命懸けの麻雀勝負をしていた南郷はアカギに異様な才気を感じ、自分の代打ちを頼む。このときは麻雀のルールすら全く知らず、南郷から簡単に教わっただけであったが、瞬く間にその天賦の才能を開花させ熟練者竜崎を圧倒。敵方もプロの代打ち矢木圭次を投入するが、覚醒したアカギを止められず、二連勝でアカギの勝利となる。また、この時にチキンラン勝負の生き残り(＝アカギ)を捜索していた不良刑事安岡と知り合う。矢木戦の延長戦として五日後に、勝ち金800万を賭けて裏世界で五指に入る実力者市川と対戦、ギリギリの激闘の末に勝利。一躍その名を裏世界に轟かせる。しかし、その後アカギは雲隠れしてしまう。6年後、アカギは玩具工場で働きながら、チンピラの間で喧嘩狂として名を馳せていた（その6年間も命懸けの勝負をし続けていた旨の発言をしている）。安岡が赤木しげるの名を騙らせたニセアカギ（平山幸雄）を倒したプロの代打ち浦部と対戦、圧倒的不利を覆し勝利。その後、町中の雀荘で勝負を挑んできた仲井純平と対局し勝利した後、再び行方をくらませてしまう。1年後、ヤクザの賭場での丁半博打に勝ち続けたため言いがかりをつけられて殺されかける。安岡と抑木が駆けつけ事なきを得るが肩を負傷。その治療先の病院で戦後の日本を裏から支配してきた闇の王、鷲巣巌との対局を依頼され、鷲巣を自らと同類の異端者と感じ取り、これを了承する。そんなアカギを待ち受けていたものは、鷲巣が対戦相手の死に怯える姿を見るために考案した、血液と億単位の大金を賭ける特殊な麻雀「鷲巣麻雀」であった。長きに渡る鷲巣麻雀においては終始優勢に対局を進めるものの、1800ccの血液を失って昏倒するなど、生死の境を彷徨う極限の死闘を演じた。最終的には鷲巣が大量の出血で卒倒したことにより、ルール上の勝利を収めることとなったが、戦いの内容から、アカギは実際に勝利したのは鷲巣であり、敗北したのは自分だと語って、対決で得られるはずの金も受け取ることなく立ち去っていった。鷲巣麻雀から更に3年後、玩具工場時代の同僚だった野崎治とともに、地方の賭場を巡って放浪する姿が描かれ、『アカギ』の幕が降りている。なおアニメでは原作が終了していなかったため、鷲巣編の途中である半荘4回終了時で終了し、「鷲巣との戦いは伝説として語り継がれ、後に神域の男として裏社会に君臨する」とされている。