イブン・ルシュド以前の何世紀にも渡り、ムスリム思想家の間に宇宙は特定の瞬間に創造されたのか、それとも常に存在していたのかについて論争があった。アル・ファーラービーやイブン・スィーナーなどの哲学者は、世界は常に存在したと主張した。この主張はアシュアリー派の神学者によって批判された。特にアル・ガザーリーはこの宇宙の永遠説について広範な反論を書き、彼ら哲学者の不信（Kufr）を非難した。これに対してイブン・ルシュドは「『自滅』の自滅」においてアル・ガザーリーに答えた。第一にこの二つの立場の違いは不信（Kufr）の罪に当たるほど広大なものではないと主張した。また、この宇宙永遠説はクルアーンに矛盾しないとも述べ、クルアーンにおける創造に関連した箇所、「王座」「水」について言及する句を引用した。クルアーンを注意深く読めば、宇宙の形態だけが時間内に創造されたことを暗示するが、その存在そのものについては永遠と主張した。
イブン・ルシュドの時代、哲学はスンナ派は、特にハンバル学派やアシュアリー神学派から攻撃を受けた。アシュアリー神学派のアル・ガザーリーは「哲学者の自滅」を書き、ネオ・プラトニズム的な哲学、特にイブン・スィーナーを批判した。アル・ガザーリーは哲学者のイスラームへの不信仰を訴え、論理的な議論を用いて哲学者に反証しようとした。彼に対し「論説の決定」において、哲学は啓示に反することはなく、それらは真理に達する二つの方法であり「真理は真理に反することはできない」と書いた。哲学によって成された結論が啓示のテキストと矛盾すると思われた時には、矛盾を除くために啓示は解釈され、または寓意的に理解によらなければならない。この解釈はクルアーン3:7のいうところの「知識の根差した」人々によらなけばならず、イブン・ルシュドによれば、それは「知識の最も高い方法」に達した哲学者を指す。また、クルアーンはムスリムが哲学を学ぶことを要求していると主張する。なぜなら、自然の研究と考察は造物主である神についての知識を高めるからである。彼はクルアーンの一節を引用し、ムスリムに自然を考察し、哲学はムスリムに許され、それに対する才能を持つ人々にとっては義務であるという法的見解を表明した。また議論の三つの様式があることを説く。説得力に基づく修辞的なもの。論争に基づく弁証的なものでありこれは神学者やウラマーによって使用される。そして推論に基づく論証的なものである。イブン・ルシュドはクルアーンは修辞的な方法に用いて人々を真理へと導く。一方、哲学は可能な限り最高の理解と知識とを与える論証的な方法を用いて哲学を学ぶ者を導く。イブン・ルシュドはアル・ガザーリーの哲学批判の多くはイブン・スィーナーの哲学にのみ当てはまり、アリストテレスの哲学には当てはまらないと主張する。
彼はアリストテレス哲学に回帰しようとしたが、それはアル・ファーラービーやイブン・スィーナーのようなネオ・プラトニズム的なムスリム哲学者によって歪められていたからであった。アリストテレスがプラトンのイデア説を拒絶したように、彼はプラトンとアリストテレスの思想を融合させようとする試みを拒絶した。彼はまたアリストテレスを誤って解釈したアル・ファーラービーの論理についての作品を批判した。また中世イスラーム哲学の標準的な担い手であったイブン・スィーナーについて広範的な批判をした。イブン・スィーナーの流出論はアリストテレスには見られないものと主張し、存在は本質に対して偶有にすぎないとするイブン・スィーナーの説に反対した。有るものはそれ自体で存在し、本質は抽象化によってしか見出すことができない。また、神を必然的存在として証明するイブン・スィーナーの説を否定した。
EF-Tu はタンパク質合成のポリペプチドの伸長過程に関与する。細菌では、EF-Tu の主要な機能は正しい aa-tRNA をリボソームのA部位に運搬することである。EF-Tu はGタンパク質であり、その機能には GTP が利用される。リボソーム外で、GTP を結合した EF-Tu (EF-Tu•GTP) が aa-tRNA と安定な EF-Tu•GTP•aa-tRNA 三者複合体を形成する。EF-Tu•GTP は、開始tRNAとセレノシステイン-tRNA を除く、全ての正しくアミノ酸が付加された aa-tRNA とほぼ同じ親和性で結合する。アミノ酸残基の性質はそれぞれ異なるが、側鎖の結合親和性の差を補償するさまざまな構造を tRNA は持っている。三者複合体はリボソームのA部位に移動し、tRNA のアンチコドンが mRNA のコドンと対合する。正しいアンチコドンが mRNA のコドンに対合している場合には、リボソームはその構成を変化させて EF-Tu の GTPアーゼドメインの形状を変化させる。その結果、EF-Tu に結合した GTP は GDP とリン酸に加水分解される。このように、リボソームは EF-Tu に対して GTPアーゼ活性化タンパク質 (GAP) のような機能を果たす。GTP の加水分解に伴って EF-Tu のコンフォメーションは劇的に変化し、aa-tRNA を解離してリボソームから出てゆく。その後 aa-tRNA はA部位に深く入り込み、そのアミノ酸部分はP部位のポリペプチドに近接する。そしてリボソームはP部位のポリペプチドからA部位のアミノ酸への共有結合の転移を触媒する。細胞質では、細菌の翻訳伸長因子 EF-Ts によって、不活性化された EF-Tu•GDP から GDP が取り除かれる。EF-Ts が EF-Tu から解離すると、EF-Tu は GTP と複合体を形成する。これは細胞質の GTP の濃度が GDP の濃度よりも5-10倍高いためである。このようにして再活性化された EF-Tu•GTP は、再び別の aa-tRNA と三者複合体を形成する。