クロアチア鉄道は、緊急に近代化の必要がある。ユーゴスラビア連邦の解体後、鉄道設備には最小限の投資しかなされてこなかった。主要幹線の多くは単線・非電化である。さらに国土が平地が少なく山がちなこともあって、急勾配、急曲線が多いため、列車の速度は遅い。最近10年間では改良も行われており、自動車の利便性に対抗できる水準まで、鉄道を改善することが目指されている。現在、国内の営業最高速度は160km/hで、試験運転では185km/hである。線路改良により、ザグレブ - ヴィンコヴツィ間の路線では、最高速度が80km/hから120km/hさらに160km/hに引き上げられた。近年はボンバルディア社の製造による新型振り子式車両のレギオスウィンガーが導入され、2大都市であるザグレブとスプリトを結ぶ山間路線などで用いられている。列車名はICN（InterCity Nagibni、振り子式インターシティ特急）この区間の所要時間は、それまでの9時間から5時間半に短縮され、車内設備も改善されて快適になった。この車両は、他の諸都市に向けてさらに運用を拡充する計画がある。さらに、高速鉄道を拡大する計画もある。カルロヴァツ - リエカ間に新線を建設し、ハンガリー国境からカルロヴァツまでは在来線を改良する事業が2007年に着工されており、全線電化し、高速化とリエカの港湾から東ヨーロッパ内陸部への貨物輸送の改善を目指している。
2019年4月1日、スズキ浜松ACが藤原の長距離走・男子ヘッドコーチ就任を発表。藤原はクラブを通じて「これ迄培ってきたマラソンのノウハウを生かすと共に、学んでいく謙虚な姿勢を忘れず指導にあたりたい」とコメント。また、選手活動については自身のFacebookにて「当面の処『プレイングコーチ』として自らも競技者として続けていくつもりです」と記載するも、マスコミ陣営は「第一線から引退」と挙って報道された。
左膝の怪我などに苦しみ、満足に走れない日々が続く。再起を期して、2017年2月26日の東京マラソン2017（世界陸上ロンドン大会選考レース）へ自身同大会通算8回目の出走に。序盤から日本最高記録を上回るハイペースの先頭集団についていかず自重したが、15Km付近を過ぎた後で早々とペースダウン、結局20Km地点を超えた所で途中棄権に終わった。同年4月16日開催のかすみがうらマラソン（兼国際盲人マラソン）へゲストランナーとして招待され、当初フルの部に出場予定だったが、同マラソン前日の前夜祭で藤原曰く「明日は半分まで走り、中間地点で皆さんを応援します」との事で、結局ゴール完走はしなかった。2017年10月29日開催の第3回富山マラソン（男子の部）では降雨の悪条件ながらも、藤原自身の持つ大会記録を33秒更新する2大会ぶり2度目（自身のマラソンでは通算5回目）の優勝を果たした。それから4週間後、同年11月26日のつくばマラソン（男子の部）でも2時間18分台ながら当大会初優勝・自身マラソン通算6回目の優勝と成る。12月17日開催の防府読売マラソンへ2年振りにエントリーしていたが、故障再発により欠場を表明。2018年9月、アキレス（MEDIFOAM）と「開発アドバイザリー」として契約。
一般参加で出場した同年8月30日開催の北海道マラソンでは、ゴール手前までサイラス・ジュイ（ ケニア出身・埼玉陸協）と激しく競り合う中、ゴールタイムは2時間16分台ながら自身5年ぶり2回目のマラソン優勝を達成した。続く11月1日の第1回富山マラソンでも、2時間17分台で通算3回目の優勝を果たし、初代王者となった。さらに自身初出場の防府読売マラソンでは、34Km付近で自らロングスパートで2位の川内優輝らを引き離し、2時間11分台で通算4回目の優勝を達成、フルマラソン3連覇を成し遂げた。2016年2月7日、香川丸亀国際ハーフマラソン男子の部では総合36位に留まったが、1時間02分57秒のゴールタイムで藤原曰く「75点の出来」と評価。同年8月開催のリオデジャネイロオリンピックへ2大会連続五輪日本代表入りを目指し、2月28日の東京マラソン2016に出場。その東京マラソン本番は29Km地点で第二集団の先頭に立つ場面も有ったが、35km地点を過ぎた後で大失速し44位に終わってしまい、リオ五輪の男子マラソン代表は絶望となった。
WBCIは今大会の観客動員数が前回比23％増の108万6720人であり、WBC史上初の100万人突破を達成したことを発表した。東京ドームで開催された第2ラウンドE組では、組別では史上最多の20万9072人、ペトコ・パークで開催された第2ラウンドF組のアメリカ合衆国対ドミニカ共和国戦では、アメリカ国内の第2ラウンド試合としては史上最多の4万3002人、ドジャー・スタジアムで開催された決勝戦では、1試合では今大会最多でWBC史上では2009年決勝戦に次ぐ5万1565人を集めた。2009年大会では7試合で4万人以上を動員したが、今大会はそれを上回る9試合で動員しており、毎回盛り上がっている東京ラウンドだけではなく、MLBのスター選手が名を連ねたアメリカ合衆国やドミニカ共和国が登場したマイアミラウンドやサンディエゴラウンド、地元メキシコが奮闘したハリスコラウンドでも多くの観衆を集め、熱い応援が繰り広げられた。テレビ視聴率や関連商品の売り上げも過去最高となり、ファンからも好感触を得ている。MLB機構のロブ・マンフレッド・コミッショナーは「信じられない。毎回、このイベントは成長している。試合の内容、参加国、入場者数が上昇している。我々はこのイベントを前進させることに真剣に取り組んでいる。我々の国際的な戦略において重要なパートだ」と今大会の成功を歓迎するとともに、「選手が国を代表する貴重な大会。間違いなく次回大会も行う」と次回2021年大会の開催を明言した。