1743年から1745年の間、ノウルズは多くの敵艦を拿捕したが、この行為に対して、ジャマイカの名士63人の署名がある手紙を受け取った。それにはこう記してあった。ノウルズ閣下　貴殿の過去、現在、そして未来における任務について我々はよく存じております。国王陛下の命によるこの任務は、常にそうであるように、大衆的人気をなんら得られないものです。今までのところ、これらの任務は完全に理にかなっておりますが、まさに、じかに任務に関わる方々のおひとりとして、貴殿のなさることは、少なくとも、許されざる任務怠慢と我々は見るべきでしょう。もしそのような行為がよからぬことをお考えでないのであれば、貴殿方の任務に対して、我々は統一見解を持つことを放棄するべきでしょう。—1745年、ノウルズは新しい軍艦であるデヴォンシャーの艦長となった。その年の遅く彼はイギリスに戻り、1746年の1月にカンタベリーに乗艦してザ・ダウンズの兵たちの指揮を、中将ウィリアム・マーティンのもとで執った。短期間、フランスの侵略の準備に備えて分遣され、2月には戻って2隻のフランス船を拿捕した。3月21日にはエディンバラに乗り、セントヘレンズからイギリス海峡に向かう船団を護衛し、その後は50門艦のノーウィッチに移った。1746年、ノウルズはピーター・ウォーレンの後継者としてルイブールの総督に就任した。1746年3月31日に、カンタベリーとルビーと共にルイブールに着いた。彼は2年近く総督として過ごし、始めのうちはニューカッスル公トマス・ペラム＝ホールズに「混乱して、汚くて、けだものじみた状況の」砦に関して不満をぶつけた。その当時、砦は修復と防御強化の工事がなされていた。1747年7月15日に白色少将に昇進して、ジャマイカの駐屯地の司令長官となった。この昇進に当たって、カンタベリーの甲板上に自らの旗をなびかせたが、すぐにコーンウォールに代わった。最初は自分の戦隊を使ってサンティアーゴ・デ・クーバを攻撃しようとしたが、逆風のため、サン＝ルイ・ド・スド砦を攻撃した。1748年の3月8日にサンルイ・ド・スドに到着し、砦を重爆撃で降伏させたのち、自らの支配下に置いた。1748年5月12日には、赤色少将に昇進し、4月5日にサンティアーゴ・デ・クーバに戻って新たに攻撃を仕掛けたが、砦の攻略はかなわず、一旦ジャマイカに戻った。
1742年、ノウルズは70門艦サフォークの指揮官となり、1743年にはオグルの命令により、スペインの植民地であるラ・ゴーリアとプエルトカベーロを攻撃した。スペイン軍はこの攻撃の情報をよくつかんでいて、予備の兵士を徴募しており、オランダから火薬を買い入れていた。その結果、1743年のラ・ゴーリア攻撃はイギリスの敗戦に終わった。ノウルズは兵士を撤退させ、キュラソー島で艦を修理して、攻撃のため4月15日にプエルトカベーロに赴いたが、4月24日にまたも敗れ、両戦闘はいずれも敗北に終わった。
『細川家記』の永禄11年（1568年）7月10日条に、明智光秀が足利義昭と織田信長を仲介する際の光秀の家人「溝尾庄兵衛」として史料に初めて登場する。天正元年（1573年）、朝倉氏滅亡後の8月から9月まで明智光秀と羽柴秀吉と滝川一益が越前国の占領行政を担当していたが、9月末から「三沢小兵衛秀次」、羽柴家臣・木下祐久、滝川家臣・津田元嘉の3人がそれぞれ代官として引き継ぎ、越前国北ノ庄の朝倉土佐守の旧館で業務をして「北庄ノ奉行信長殿御内三人衆」（『朝倉始末記』）と呼ばれ、10月1日には称名寺に領地の安堵状を出している（称名寺文書）。当時、越前の守護代には桂田長俊が任じられていたが、越前の政務の実態は信長の朱印状に基づいて北ノ庄の3人の代官が政務を執行しており、寺領の安堵や年貢・諸公事を収納する事の認可を3代官の連署で許可していたりと、越前支配の実権は3代官が掌握していた。天正2年（1574年）1月19日に富田長繁率いる越前一向一揆が起こり守護代・桂田長俊を殺し、次に一揆勢は21日に3人衆を攻めたが、安居景健と朝倉景胤の仲裁で、逃れて京都へ戻る。天正3年（1575年）からの光秀の丹波攻めに従軍する。天正4年（1576年）2月に丹波攻めの途中で国人の中台、曽根の2名に重臣「三沢惣兵衛尉秀儀」として「万雑公事」を免除している。天正7年（1579年）4月の光秀書状には「小兵衛」を「明智」としており明智の名字を使用していた（和田弥十郎宛光秀書状「下条文書」）。天正10年（1582年）5月には、接待役となった光秀に従って徳川家康の接待の指揮に参加したと言われる。以上のように朝倉氏滅亡後に越前の代官となった「三沢秀次」や、丹波統治時代に光秀書状に添え状を出している「三沢秀儀」は溝尾と同一人物と推測され、明智家中の政務に大きく関与していたと思われる。天正10年（1582年）、池田家本『信長公記』において本能寺の変前の重臣合議の場に明智秀満、明智光忠、斎藤利三、藤田行政と共に参加しており信長を討つことを賛成した。なお、他の自筆『信長公記』では他4重臣のみで池田家本では太田牛一の自筆で「三沢昌兵衛」が加筆挿入されている。本能寺の変後の山崎の戦いに参加したが、敗れて光秀と坂本城へ落ち延びようする。しかし、光秀が落ち武者狩りの百姓によって致命傷を負わされると、光秀の命令で介錯を務めた。そして光秀の首を持ち帰ろうとしたが、再び落ち武者狩りに見つかり首を竹藪の溝に隠すと坂本城へ落ち城で自害した。またその場で自害して果てたとも言われる。享年45。光秀の首は百姓に見つかり翌日、織田信孝に差し出された（兼見卿記）。