1910年京阪本線の開通と同時に開業し、駅から京都側約100mは併用軌道で併用軌道は1931年7月に分離され専用軌道となった。1917年9月29日からの「大正大洪水(淀川河川事務所・洪水の記録)」では、10月1日・堤防決壊駅周辺が約2km水没し昼夜兼行で復旧に努めたが10日に再度出水してやり直し14日京阪線が開通した。1939年3月1日午後2時45分に発生した大阪陸軍兵器支廠禁野倉庫の爆発事故により香里園駅 - 樟葉駅間が不通になり、4日の午後8時より運行を再開したが駅の使用再開は6日午前11時までかかった。1969年2月、牧野駅の大阪側(約700m)の高架化が着工され同年11月に完成している、これは3ヶ所の踏切の除去だけでなくショートカットによる曲線の緩和（400R→1000R）、旧線跡に電車用変電所の建設などもおこなわれた。1980年2月20日夜、隣の御殿山駅と枚方市駅の間で発生した京阪電車置石脱線事故では21日の始発までに復旧できず、御殿山駅にも当駅にも渡り線などの折り返し設備もないことから事故現場が仮復旧した21日午後まで運休した。運休中は樟葉駅と枚方市駅の間で府道京都守口線を使いバスによる振り替え輸送が行なわれた。
1880年12月8日、李朝の文臣申叔舟の末裔申光植の次男として、忠清道大徳郡山内面於南里桃林村(現大田広域市中区於南洞)で生まれる。1886年、父光植死去。寺子屋を運営する祖父申星雨から漢学教育を受ける。1898年、申箕善の推薦で上京し成均館に入学。11月頃、独立運動に加担した罪で逮捕、即釈放。1899年、兄ジェホが28歳で死去。1901年、申奎植、申伯雨と忠清北道清原に寺子屋設立。愛国啓蒙運動を展開。1904年、申奎植、申伯雨と清原郡で山東学院設立。1905年、成均館博士任命、翌日辞職。張志淵の招聘で皇城新聞論説委員。11月、皇城新聞停刊。1906年、梁起鐸の推薦で大韓毎日申報主筆。抗日言論運動を展開。1907年、安昌浩らと新民会創立。趣旨書作成。国債報償運動に参加。祖父死去。1908年、畿湖興学会月報に愛国啓蒙論説寄稿。大韓協会会報に寄稿。「乙支文徳伝」刊。周時経と「家庭雑誌」創刊。8月から12月まで大韓毎日申報に「読史新論」を連載。1909年、尹致昊、安昌浩、崔南善らと青年学友会創立。趣意書作成。1910年、李昇薫が設立した五山学校教師。青島に亡命。大韓光復会副会長。1911年、ウラジオストクへ渡る。5月、大洋報主筆。12月、勧業会結成、機関紙勧業新聞主筆。1913年11月、申奎植の斡旋で上海に渡る。独立運動団体を支援する貿易会社同済社に参加。朴殷植らと博達学院創立。1914年、勸業新聞廃刊。満州で高句麗、渤海など遺跡調査活動。尹世茸、尹世復兄弟に招聘され懷仁県で東昌学校教師。1915年、李石曽の斡旋で北京に渡り、普陀庵で生活する。「朝鮮古史」執筆。申奎植と上海で新韓青年会結成。1916年、中編小説「夢天」を執筆。1917年、大同団結宣言に参加。1918年、中華報、北京日報に論説寄稿。大韓独立青年団団長。新大韓青年同盟副団長。1919年1月、戊午独立宣言書に署名。4月、上海臨時政府発起会議に参加。忠清道議政院議員、全院委員会委員長就任。9月、上海臨時政府が高麗臨時政府、漢城臨時政府と統合した際に、李承晩らと対立し辞任。10月、上海で反臨時政府紙新大韓を発行。義英学校校長就任。武装独立運動路線を展開する。1920年4月、新大韓発行停止後、北京に戻る。看護婦の朴慈恵と結婚。満州地域の武装独立団体統一に向けた軍事統一準備会組織。大韓独立青年党（大同青年党）団長。朴容萬らと第二回普合団を組織。9月、朴容萬、申肅らと軍事統一促成会創立し、統一戦線運動を展開。1921年1月、金昌淑らの支援で漢文雑誌「天皷」「大同」を創刊。2月、国民代表会議を提案。4月、同志54名による「声討文」を公表。1922年、義烈団金元鳳の招請で上海に渡る。朝鮮革命宣言を執筆。1923年1月、上海で国民代表会議開催。その後、北京に渡りイ・ギュジュンが創立した武装独立運動団体多勿團顧問。創立宣言文作成。1924〜5年、「東亜日報」「朝鮮日報」に論説や歴史論文寄稿。この頃から無政府主義に傾倒する。1926年、在中国朝鮮無政府主義者連盟に登録。1927年2月、抗日団体新幹会に参加。統一戦線運動が失敗に終わり、さらにアナキズムに傾倒。9月、東方無政府主義者連盟に加盟。大会宣言文作成。1928年、小説「龍と龍の大激戦」執筆。4月、東方連盟北京会議を開催。機関紙「東方」「奪還」発行などの活動費捻出のため紙幣偽造。5月8日、台湾基隆市で逮捕。1930年、大連地方裁判所10年の刑を宣告。1931年、朝鮮日報が「朝鮮史」連載開始。1936年2月21日、旅順刑務所で獄死。死因は脳溢血。1948年、古史部分で終わった「朝鮮史」を、鍾路書院が単行本「朝鮮上古史」として出版。1962年3月1日、大韓民国功労勲章大統領章授与。