ゲームシステムや世界設定など基本部分は従来と同じだが、音声・音楽の品質向上やゲームバランスの修正とWindows 7対応といった改修が施された。加えて、2007年に発表されたボイスドラマ「盲目の結界神・想武」に登場するカルナなど第2世代月人と、世界観を共有する続編である次作『キルツヴァルド 〜最後の人間〜』に登場する12名の第3世代月人が部将同様のキャラクターとして追加され、他にも部将や才能が複数追加された。さらには月人・月亜（げつあ）として原田ひとみを起用したボイスドラマ「〜京核の秋〜」を同梱する。この他、初回特典として、キャラクターグラフィックを担当する住屋昭博デザインのポストカード3枚と、次作の主要キャラクターである月人・アリエス（声・日笠陽子）が歌う「aries-Full Version-」を含む『KILLZVALD -SOUND TRACK-CD Ver』が付いた。
この作品に於けるバグ修正や機能改善・追加は、公式サイトからダウンロードできるパッチを通じて行われるが、バージョン1.05より「裏技ツール」に統合され、ゲームの正常動作のための補完要素だけでなく、隠しコマンドなどのいわゆる裏技要素を含む内容となっている。「裏技ツール」そのものは無料だが、解凍（EXEフォーマットの実行）には製品版に封入された「バージョンアップ用パスワード」が必要である。また、制作支援として「裏技ツール」購入費1000円（税込）を支払うことにより、神王や月人を描いた大判画像31点の解凍パスワードが送られる。
以上の手順を繰り返し、ゲーム世界39カ国全てをプレイヤーのみ、もしくはプレイヤー国と従属国ばかりで占めるとゲームクリアとなり、担当した国の「制覇回数」が1加算される。また、プレイヤー国が他国の従属国である状態で、支配国が全国制覇した場合もゲームクリアとなる（従属クリア）。いずれの場合も神王を除く配下部将や子孫の遺伝子情報（才能）が保存され次に遊ぶ際に引き継ぐことができ、またクリアした難易度モードの「裏技」が使用可能となる。加えて、制覇に至るまでの年表と得点がHTMLファイルとして出力される。なお、特殊な条件を満たすと迎えられる「レアエンディング」もある。他方、プレイヤー神王の篭城する城が敵の攻撃により陥落するとゲームオーバーとなる。
サンフランシスコ市警のハリー・キャラハン刑事は、違法賭博の元締めであるジェネロを逮捕・有罪に追い込み、一躍時の人となる。そんな中、ハリーは夜のサンフランシスコを巡回中にジェネロの部下に襲撃されるが、獲物の.44マグナム・S&W M29で返り討ちにする。しかし、派手な捕り物で覆面パトカーを破壊してしまい上司のドネリーに内勤を命じられ、広報のアッカーマンからは市警のイメージアップのためにマスコミとの協力を依頼される。マスコミ嫌いのハリーは依頼を拒否して捜査に戻ろうとするが、ドネリーから捜査に戻る条件として、中国系アメリカ人のクワンとコンビを組まされる。ハリーとクワンは、人気ロックスターのジョニー・スクエアーズ死亡の連絡を受け、彼が主演するホラー映画の撮影現場に向かう。ジョニーは薬物を大量摂取して死亡しており、ハリーは発見者のスワン監督に事情を聞くが、彼は非協力的な態度に終始する。事件を聞いて駆け付けたレポーターのサマンサはハリーを取材するが相手にされず、直後にジョニーの恋人スザンヌが泣き崩れる姿を撮影して取材しようとするが、配慮に欠ける態度に激怒したハリーはカメラを取り上げて破壊する。ハリーとクワンは捜査のためにチャイナタウンを訪れるが、そこで強盗現場に遭遇する。ハリーは強盗犯三人を次々に射殺し、クワンは逃げ出した一人を素手で取り押さえる。事件が解決した後、クワンは強盗に射殺された被害者の衣類から有名人の名前が書かれたメモを発見する。そのメモには「死亡」と書かれたジョニーの名前と、ハリーの名前が書かれていた。市警本部に戻ったハリーはドネリーに呼び出され、マスコミから壊したカメラの損害賠償を求められていることを聞かされ叱責を受ける。そこにサマンサが現れ、損害賠償を取り下げる条件としてハリーとのディナーを要求する。ハリーは要求に応じるが、ディナーの席でサマンサから独占取材を申し込まれる。しかし、ハリーは視聴率欲しさに血生臭い事件を求めるマスコミを批判し、反論する彼女を尻目に席を立ってしまう。その後、ハリーとクワンはテレビでサマンサのニュースを見て、ジョニーの死の背後にはスワンたちが行っていた「デッド・プール」と呼ばれる賭博が存在していることを知る。サマンサは、有名人の死を予想する「デッド・プール」に参加したスワンの会計士がチャイナタウンで強盗に射殺されたことを報じ、ハリーとクワンはスワンに事情を聞きに向かうが、スワンは事件への関与を否定した。ハリーは放送局に向かい、サマンサを食事に誘い、彼女と打ち解ける。しかし、食事の帰りに再びジェネロの部下に命を狙われる。彼らを射殺したハリーは刑務所に向かい、ジェネロに脅しをかけて襲撃を止めさせる。同じ頃、事件への関与を疑われたスワンはマスコミに対して「デッド・プール」を行ったことを反省する一方、事件への関与を否定するが、その夜に彼の映画を酷評した映画評論家モリーが殺害される。ドネリーはスワンを疑うが、彼にはアリバイがあり、ハリーは誰かがスワンを犯人に仕立て上げようとしていると考える。その後、テレビ番組司会者ロッカーが爆殺される。ハリーは容疑者がスワンの熱狂的なファンだったルックだと確信して捜査を進めるが、市警本部の彼の机には「ハリー・キャラハン死亡」と書かれたデッド・プールが置かれていた。ハリーはクワンと共にルックが通院していた病院に向かうが、途中でプラスチック爆弾を搭載したルックのリモコン・カーに追われ車を爆破されクワンが負傷する。病院の医師からルックの住所を聞き出したハリーとドネリーは彼の家に向かい、次の標的がサマンサであることを知る。彼女はルックによって連れ去られてしまい、ハリーは彼女を救うため映画が撮影されている港に向かう。ハリーはルックを追い詰めるが、サマンサを人質にされマグナムを奪われてしまう。ハリーは隙を突いてサマンサと共に脱出し、彼女を安全な場所に隠してルックと対決する。弾丸を討ち尽くしたルックに対し、ハリーは映画の撮影に使用されていた捕鯨砲を持ち出し、ルックを射殺する。警察やマスコミが駆け付ける中、ハリーはサマンサを連れて港を後にする。