集電装置（パンタグラフ）は、シングルアーム型のFPS130形を採用、各電動車の屋根上に1台ずつ搭載した。Mc250形では前位側に、M251形では後位側に搭載することで、集電装置の間隔を確保した。また、離線対策と冗長性の向上のため、同一ユニット内の集電装置は母線で引き通しており、電気的に接続されている。補助電源装置は、出力85kVAの静止形インバータ (SIV) をMc250形に2台搭載した。電動空気圧縮機については、毎分1,600mlの容量のスクロール式とし、Mc250形に1台搭載した。連結器は、先頭車前部が並形自動連結器、ユニット内の車両間は半永久連結器、編成内の異なるユニット同士の連結は密着連結器である。先頭車前部を並形自動連結器としたのは、機関車による救援を考慮したものである。
運転台は車体の節で記述した通り、前方視認性の向上を目的とした高床式構造である。JR貨物の車両では初めて主幹制御器にブレーキ設定器を一体化した左手操作式ワンハンドルマスコンが採用された。速度計など運転に必要な計器類を前面計器盤に、各種スイッチ類は運転席右側に配置した。また、M250系では車両の状況や機器の動作状態などをモニタリングするため、モニタ装置を搭載した。モニタ中央装置はMc250形に搭載され、M251形とT260形に搭載したモニタ端末装置を車両間伝送で結合し、各端末装置と機器との間を装置間伝送で結合することで情報を取得する仕様とした。取得された情報は、運転台に設置したモニタ表示器に表示される。また、故障が発生した際には故障の内容と応急処置のガイダンスをモニタ表示器に表示した上で、各機器の動作状態を記録する。記録した情報はICカードを経由して外部のパソコンに取り込み、解析が行われる。なお、T261形にはモニタ端末装置は設置せず、T260形に設置した端末装置がT261形の機器についてもモニタリングを行う。
東海道本線では東京と大阪を結ぶ貨物輸送が行われているが、2004年度の実績では約280万tとなっており、これはJR貨物の年間総輸送量の13%に相当するものであった。しかし、起終点の鉄道駅と発着地の間においてはトラック輸送となるため、速達性が要求される中距離の小口貨物輸送分野については鉄道を選択しづらい状況にあった。一方、JR貨物ではトラック輸送をトラック以外の輸送手段に転換する「モーダルシフト」の受け皿とするための取り組みを行っており、1999年からは小口貨物輸送に特化した輸送について検討を開始した。それ以前にも、機関車牽引の貨物列車が最速6時間40分で東京と大阪の間を結んでいたが、宅配貨物運送事業者の要望には応え切れていなかった。そこで、東京と大阪の間の所要時間を約6時間に短縮することを目標とした。この対応策を検討した結果、電車型貨物列車による高速鉄道輸送を行う方針が打ち出された。動力分散方式とすることにより加減速性能の向上と軸重の軽減を図り、積み替え時間の短縮のために貨物の積載はコンテナによるものとした上で、既に旅客用電車で採用実績のあるものを可能な限り採用することで安全性と信頼性を確保するという方針が打ち出された。この方針に従い、開発・設計されたのが本系列である。
305年、ディオクレティアヌスとマクシミアヌスは20年の統治を終え、ともに退位した。同時に副帝であったガレリウスとコンスタンティウスは正帝に昇格し、新たにマクシミヌス・ダイアがガレリウスの副帝（東方）に、フラウィウス・ウァレリウス・セウェルスがコンスタンティウスの副帝（西方）に選任された。ここに第2のテトラルキアが形成されたのである。しかしこの制度は間もなく瓦解した。306年、西方正帝コンスタンティウスが死ぬと、東方正帝ガレリウスは西方副帝セウェルスを正帝とした。一方、コンスタンティウスの息子コンスタンティヌス（後の1世、大帝）も、軍に推戴され父の後継者として西方正帝を宣言した。同時にマクセンティウス（マクシミアヌスの息子）は新秩序から疎外された身分を不満とし、セウェルスを退位させ、307年には殺害した。その後、マクシミアヌス・マクセンティウス父子も正帝を宣言した。すなわち、308年にはガレリウス、コンスタンティヌス（1世）、マクシミアヌス、マクセンティウスの4人が正帝を名乗り、副帝は東方のマクシミヌスのみという状況になった。308年、元々の東方正帝ガレリウスは先帝ディオクレティアヌスと（同じく先帝であるはずの）マクシミアヌスを伴い、ドナウ川河畔のカルヌントゥム (Carnuntum) でいわゆる「帝国会議」を開催し、リキニウスが西方正帝でコンスタンティヌス1世はその副帝であるという合意を得た。一方、東方ではガレリウスとマクシミヌスが引き続き正帝と副帝に就いた。一度は復位を宣言したマクシミアヌスは再び引退し、その子マクセンティウスは簒奪者とされた。だが、この合意がのちに事態を一層悪化させることとなった。308年の時点で皇帝の位から追われたマクセンティウスは、イタリアとアフリカを事実上支配していた。また、コンスタンティヌス1世とマクシミヌスの両者（ともに305年から副帝）は正帝としてのリキニウスの幕下に入る気は毛頭持ち合わせず、その地位を認めようともしなかった。コンスタンティヌス1世とマクシミヌスの両者に「正帝の息子（filius Augusti）」（副帝の別称であり同時に正帝位の継承権も意味した）という名目的な称号を与えることで懐柔しようという試みは失敗に終わり、309年には両者とも正帝と認めざるを得ない状況となった。こうして4人の正帝が互いに反目しあっている状態が生まれたが、これはテトラルキアにとって好ましい状況とはいえなかった。