法人は、病院組織の外部から公正、中立、客観的検討を行い、結果を報告し、広く日本の病院における「医療の安全体制」、「医療の質の向上」に資することを目的として、外部評価を依頼した。外部評価委員会は、2002年7月31日、「医療の民主化と安全文化を育む組織の仕組みと運営」と題して、外部評価委員会報告書を公表した。報告書は、事件を一つの事例として取り上げた。本事例を起こすにいたった要因の多くは日本の病院では少なからず経験する、日常的に遭遇している問題であるが、問題解決に向けて明確にされてこなかった、将来においてもすっきりと解決し難い問題を含むとして、個人の責任追及より組織医療の問題点を解明する立場で、問題点を浮き彫りにし、解決策を検討した。 報告書は、川崎協同病院は、組織の理念として、民医連綱領と医療生協の「患者の権利章典」をもっているが、この理念と本事例は大きく乖離しており、理念が日常の医療現場で生かされていないと断じた。 病院の理念と目的を浸透させ実現するための計画や運営方法、仕組みが十分でなく、病院組織の実際の運営と組織図は整合性を欠き、旧態依然とした医師のパターナリズムが前面に押し出された指導がみられ、組織医療をまとめるリーダーとしての医師の役割とあるべき姿に欠けている。本事例では、インフォームド・コンセントのあり方に重大な問題があり、チーム医療がうかがわれず、コミュニケーションの要としてのカンファランスの記録も残されていない。医療行為の中心は患者自身にあり、インフォームド・コンセントは医療の民主主義といっても過言ではない。患者からインフォームド・コンセントをえるプロセスを大切にし、医療現場における日常的なコミュニケーションシステムを構築し、チーム医療を実践し、毎日の医療現場における倫理的課題に取り組むことの大切さを指摘した。 報告書は、本事例は終末期医療のあり方、尊厳死、安楽死とも関連しているが、「許される安楽死」に当たるとは考え難いと述べた。そのうえで、しかし現状においてはこのような問題に対応するためのガイドラインは多くの病院でも用意されておらず、用意されても安易な判断は許されないと述べ、最後にこの事例は川崎協同病院に特異的なものではなく、その多くの要因は日本の病院に潜在的に存在していると繰り返した。
法人は内部調査委員会を発足させ、事実関係の調査を行い、問題の原因と背景を分析し、病院の責任を明らかにし、再発防止の具体化をすすめた。内部調査委員会は、2002年7月30日、調査報告書を公表した。 診療録に基づき入院後の経過を検討し、患者の死亡当日の病態と聞き取りに基づいた死亡当日の経過を調べ、事件発生後発表までの経過と病院の対応の問題点も検討した。報告書は、医師の患者家族への説明について、診療録には家族の希望に基づいて抜管したと記載してあるが、家族のだれと、いつ話したか、病状をどのように説明したかが明確でなく、かえって誤った説明をしており、使用した薬剤についても説明しておらず、抜管が患者を死にいたらしめる行為であることを説明していなかった可能性があるとした。 報告書は、事件が生じた原因と背景を分析した。「患者の人権を尊重する医療」という理念を、実際の医療現場で実践することが徹底されていなかった、チーム医療についての認識とその実践が極めて不十分であった、管理システムと運用上の問題が改善されなかった、「危機管理」意識の不徹底が必要な対応をおくらせた、と痛切な反省を連ねた。更に、倫理委員会の設立と終末期医療についての取り組みが遅れ、インフォームド・コンセントを定着させるための努力が不十分であったと指摘した。報告書は、再発防止の取り組みと病院の抜本的な改革にむけての提言をした。公表以来、内科におけるチーム医療体制の強化、危機管理システムの見直し、医療倫理委員会の設立、業務基準の見直しが進められているが、今後、更にチーム医療の徹底を図る、医療安全管理意識の教育を進め、病院の抜本的改革のために、地域における病院の存在意義を再確認し、診療体制を再構築し、病院の管理運営システム、職員教育システムの改善を図ると宣言した。
事件後3年たった2001年10月30日、麻酔科医師が内部告発という形で、次期院長に訴えた。院長は患者の診療録を検討し、医師に面談した。医師は家族の要請で抜管を行ったが、苦悶様呼吸がみられたので鎮静剤投与と筋弛緩剤を投与したことを認めた。病院管理部は、医師が不適切な処置により患者を死に至らしめたことを確認し、医師として許されない行為を行ったとして、11月末に医師に退職を勧告し、2002年2月、医師は退職した。法人は、事件の公表をどういう形で行うか検討をすすめた。社会的に影響が大きいこと、患者家族への影響があり、組合員や職員に与えるショックも大きくなることが予想されたが、2002年4月、患者家族に謝罪し、記者会見で事件を公表し、事件を起こしたことをお詫びした。事件はマスコミにより、センセーショナルに繰り返して報道された。
5月4日、サンガモンは補給のため慶良間諸島に到着。補給は神風などの接近でしばしば中断されたものの、18時30分には終了して再び外洋に向かって動き出した。しかし、間もなくサンガモンは47キロ先から神風が接近しつつある事を知った。陸上戦闘機が迎撃して9機を撃墜。残る1機は19時ごろにサンガモンの左舷艦尾部めがけて突入してきた。サンガモンは取舵で急旋回しつつ対空砲火を撃ち、護衛艦艇の助けも得て神風を撃墜。サンガモンの右舷からわずか7.6メートル離れた海面に墜落した。別の特攻機（日本陸軍飛行第105戦隊の三式戦「飛燕」もしくは日本海軍第17大義隊の零戦）は19時25分、迎撃戦闘機の哨戒網を突破して対空砲火を避けるため一旦雲中に入り、19時33分に雲から出てきたかと思えばサンガモンに真一文字に突っ込んで、操舵室中央部に命中。爆弾は艦内部で爆発し、サンガモンに多大な損害を与えた。わずか15分の間に、格納庫や操舵室を初めとして艦のあちこちから制御不能なほどの火災が発生し、艦橋との音信が途絶えることとなった。悪い事に、火災は風に煽られてますます大きくなりつつあった。それでも、20時15分までには消火手順が整理され、乗員は大火災に立ち向かう事となった。爆弾の炸裂で消防装置にダメージがあって水圧が低かったものの、消火ガスボンベによって消火が始まった。また、近在の艦船もサンガモンの消火作業を手伝うため集合してきた。その甲斐あって、22時30分までには鎮火する事ができた。通信も、近接した駆逐艦フラム (USS Fullam, DD-474) を介した通信および、艦内で唯一使用可能だった航空機用超短波無線を利用して、23時20分頃までには回復した。サンガモンは11名の戦死者、25名の行方不明者および21名の重傷者を出した。生き残った乗員は、修羅場を潜り抜けて生き残れた事を祝ってアイスクリームを食べた。また、乗員の一人は「わが艦の飛行甲板を突き抜けたあの男は、私より立派だ。私には、あんなことはやれなかっただろう」と、サンガモンに命中した神風のパイロットを称えた。サンガモンは仮修理のため慶良間諸島に引き返した。