駒場駅と東大前駅の統合という由来を持つ。この2駅間には現在の駒場東大前駅のホームの長さ分程度しか駅間距離がなかった。統合前の痕跡は、（西）駒場駅の跡としては池ノ上駅側（吉祥寺側）の踏切との間にプラットホームの残骸が、東大前駅（一高前駅・東駒場駅）の跡としては神泉駅側（渋谷側）に、駅の現在位置から少し不自然に離れて駅広告看板が現行で残っている。
島式ホーム1面2線構造である。傾斜地にあるため、吉祥寺寄りは高架ホーム、渋谷寄りは通常の地平ホームとなっている。改札口は、吉祥寺寄りホーム階下の西口と渋谷寄りの路盤上にある東口・東大口の2か所がある。東口は橋上駅舎となっており、2つの出口の内、南側は渋谷方面の道に、北側は東京大学駒場キャンパス方面に出る。ホームと西口改札との間にエレベーターが設けられている。トイレは構内には設置されておらず、駅利用者は西口駅前の目黒区公衆便所を利用することになる。京王電鉄全駅の中で自社管理の旅客トイレがない唯一の駅である。
一方で天逆鉾が、大国主神を通してニニギに譲り渡されて国家平定に役立てられ、その後、国家の安定を願い矛が二度と振るわれることのないようにとの願いをこめて高千穂峰に突き立てたという伝承がある。この天逆鉾は霧島六社権現の一社・霧島東神社（宮崎県西諸県郡高原町鎮座）の社宝である。この矛の由来は不明であるが、一説によると奈良時代には既に存在していたといわれる。古来、天逆鉾を詳しく調べようとした者はいなかったが、坂本龍馬が妻のお龍と高千穂峰を訪れた際、何を思ったか引き抜いて見せたというエピソードがある。このエピソードは龍馬自身が手紙で姉に伝えており、手紙も桂浜の龍馬記念館に現存している。なお、この天逆鉾はのちに火山の噴火で折れてしまい、現在残っているものはレプリカである。オリジナルは柄の部分は地中に残っており、刃の部分は回収され、島津家に献上され、近くの荒武神社（都城市吉之元町）に奉納されたが、その後も様々な人手を転々と渡って現在は行方不明となっている。喜田貞吉は『神皇正統記』などに触発され霧島山降臨の話を作り出した修験者が高千穂峰の山頂に逆鉾を置いたと推察している。兵庫県高砂市の生石神社では境内の石の宝殿を、天逆鉾、鹽竈神社の塩竈とともに「日本三奇」と称している。
寛永19年（1642年）、山村小兵衛（初代山村長太夫）という者が木挽町四丁目（こびきちょう、現在の中央区銀座4丁目の昭和通りの東側）に櫓をあげ、これを山村座（やまむらざ）といった。続いて慶安元年（1648年）には筑前の狂言作者・初代河原崎権之助が木挽町五丁目（現在の銀座5丁目の昭和通りの東側）に櫓をあげ、これを河原崎座（かわらさきざ）といった。さらに万治3年（1660年）には摂津の人で「うなぎ太郎兵衛」と呼ばれた森田太郎兵衛がやはり木挽町五丁目に櫓をあげ、これを森田座（もりたざ）といった。こうして木挽町四五丁目界隈にも芝居茶屋や芝居関係者の住居が軒を連ね、一時は堺町・葺屋町に匹敵する芝居町を形成、「木挽町へ行く」と言えば「芝居見物に出かける」ことを意味するほどの盛況となった。この山村座・河原崎座・森田座の三座を、木挽町三座（こびきちょう さんざ）という。しかし間もなく河原崎座が座元の後継者を欠いて休座になったので、寛文3年（1663年）に森田座がこれを吸収するかたちで合併した。さらに正徳4年（1714年）には江島生島事件に連座して山村座座元の五代目山村長太夫が伊豆大島に遠島となり、山村座は官許取り消し、廃座となってしまった。こうして木挽町にはひとつ森田座が残るのみとなり、あたりには次第に閑古鳥が鳴きはじめる。そこに享保の改革によってもたらされた不況の波が押し寄せ、森田座の経営は年を追うごとに悪化の一途をたどってゆく。ついに享保19年（1734年）には地代の滞納がかさんで地主から訴えられてしまう。南町奉行大岡越前の裁きは地主側の訴えを全面的に認めたものとなり、森田座は返済で首が回らなくなって破綻、とうとうこれも休座に追い込まれてしまった。慌てたのは芝居関係者だった。芝居小屋は役者や狂言作者を雇っているだけではなく、周囲に数々の芝居茶屋や浮世絵の版元などを従えた歓楽街の中核である。それがなくなってしまうということは、木挽町全体の死活問題でもあった。そこで森田座に代わる新しい櫓をあげることが模索されたが、すでにこの頃までに官許三座制が確立しており、新規の櫓が認められることはまず望めない。それならばと、かつて官許を得ながら廃座になった河原崎座・都座・桐座の座元の子孫が名乗り出て、それぞれの座の由緒書とともに旧座の再興を願い出たのである。街の灯が消えてしまうことは治安の面からも望ましいことではなかったので、町奉行所としては何らかのかたちで座の再興は容認することにしていた。しかし三座制の手前もあり、彼らすべてにこれを許すわけにはいかない。そこで再興するのはあくまでも森田座であるとし、三者のうちの一人が森田座の興行権を当面の間代行するというかたちでこれを許すことにした。そして森田座の勝手向きが改善したあかつきには、代興行主はすみやかに興行権を元へ戻すという条件をこれにつけ加えた。こうして三者による恨みっこなしのくじ引きの結果、二代目河原崎権之助が森田座代興行権を引き当て、翌享保20年（1735年）に河原崎座を復興したのである。