フランスをもとに軍の近代化、行政機構の中央集権化および行政区画の再編を進め、土地制度や司法制度、幣制の改革を行い、新たに併合した領土の統治に力を入れ、マイソール王国の国力の向上を目指した。ティプー・スルターンは父ハイダル・アリーが行った産業振興をさらに活性化させようとし、養蚕や絹織産業を育成した。首都シュリーランガパッタナやバンガロールなどの拠点には官営の作業場を増設し、外国人の職人を専門家として招き、国家が中心となってインドに近代的な産業を起こそうとした。ティプー・スルターンはジャーギールを与える慣行を廃止し、国家による直接徴税を徹底化し、徴税における中間介在者を排除しようとした。彼は一部地域において存在した世襲の在地役人を原則として廃止することを決定し、それらの領地を没収して、従わない場合は殺害することもあった。これらの土地には代わりに定額給与を受け取る国家の役人らが任命された。しかし、耕作民に課した地租は同時代のムガル帝国、マラーター同盟などと変わらず、その額は生産物の3分の1に及んだ。とはいえ、直接徴税化により、在地領主の不法な付加税の徴収には歯止めがかかり、免税にも積極的であった。インド総督であったジョン・ショアは「彼（ティプー・スルターン）の支配地の農民はよく庇護され、彼らの労働は奨励され、かつ正当な見返りが保証されている」とし、また別の人物は「（農地は）よく耕作されており、勤勉な住民にあふれ、町は新しく作られ、商業が発展しつつある」と記している。ティプー・スルターンは父同様に広い国際視野を持ち、イギリスと対立していたフランスはもとより、トルコのオスマン帝国やアフガニスタンのドゥッラーニー朝、アラビア半島のオマーンに使者を送り、イギリスに対しての同盟を持ちかけていた。フランスに送った使節は宮廷に赴き、ルイ16世と謁見している。また、各地とも交易を行い、イラン、アラビア半島のオマーン、トルコ、ビルマのペグーなど、さらには遠く中国とまで交易をおこなった。
1779年、イギリスがフランスからケーララ地方の都市マーヒを奪うと、軍事的にも重要だったこの地が奪われたことで、南インドにおけるイギリスの脅威が増し、マイソール王国との対立が再燃した。一方、第一次マラーター戦争は依然といて続いており、ラグナート・ラーオとの戦いで不利になったナーナー・ファドナヴィースは、1780年2月7日にマイソールのハイダル・アリーと反英で同盟するところとなった。かくして、ハイダル・アリーはイギリスの脅威に対して、マラーター王国、ニザーム王国と同盟し、1780年5月28日にイギリスの領土に攻め入った（第二次マイソール戦争）。マイソール軍は8月にマドラスを包囲し、11月3日にはアルコットを占領した。だが、1781年7月1日、ハイダル・アリー率いるマイソール軍はポルト・ノヴォで、アイル・クートが率いるイギリス軍に敗北したが（ポルト・ノヴォの戦い）彼はその軍事的才能によって戦況を覆すことに成功したものの、1782年5月にナーナー・ファドナヴィースはイギリスとの講和条約サールバイ条約の締結を承認し、第一次マラーター戦争を終わらせた。これはマイソール王国との盟約を破ることであったが、ハイダル・アリーは第二次マイソール戦争を続行した。第二次マイソール戦争中の1782年12月7日 、ハイダル・アリーは第二次マイソール戦争中にアーンドラ地方、チットゥール付近ナラシンガラーヤンペートの陣営で死亡した。ハイダル・アリーの死後、その息子ティプー・スルターンが父の地位を継承し、新たな支配者となった。それはマイソール王にも認められたものであった。ティプー・スルターンもまた父同様に有能な戦士であり、その武勇から「マイソールの虎」とも呼ばれた。彼は第二次マイソール戦争をイギリス相手に有利に戦い、1784年3月11日にマンガロール条約を結んで戦争を終わらせた。
戦後、リーはその将軍達に仕事に戻って南部経済を立て直すよう勧めた。マホーンもそうした。ノーフォーク・ピーターズバーグ鉄道、サウスサイド鉄道およびバージニア・テネシー鉄道を結ぶための旗振り役になった。1867年までこれら3社の社長を務めた。戦後のレコンストラクション時代、バージニア議会に熱心に働きかけて、1870年にはノーフォークからブリストルまで408マイル (653 km) におよぶ従来の3社線を合わせた新線、アトランティック・ミシシッピ・オハイオ鉄道 (AM & O) の形成に必要な法律を制定させた。マホーンは非常に個性的な人物であり、AM&Oの文字は「全て私とオテリアのもの」（All Mine and Otelia's）を意味していたと言われた。この頃家族はリンチバーグに住んだが、1872年にはピーターズバーグに戻った。1873年の恐慌によっAM & O鉄道はイングランドやスコットランドの社債保有者との紛争に突入した。数年間は破産管財人の管理下に置かれた後、債権者との関係が崩れ、代わりの破産管財人ヘンリー・フィンクがAM & O鉄道の財政を監督する者として指名された。マホーンは再度支配権を取り戻そうと働いたが、1881年にフィラデルフィアに拠点を置く同業者がオークションでマホーンを上回って買収し、ノーフォーク・アンド・ウェスタン鉄道と改名した時、マホーンの鉄道建設者としての役割は終わった。南北戦争の前に、バージニア公共事業局がAM & O鉄道の前身の鉄道会社のかなりの株式に州債で投資していた。鉄道会社の支配権は失ったが、マホーンはバージニア州の政界を指導する重要人物として、会社の売却で得た利益のうち州の取り分を、以前に市長も務めたことのあるピーターズバーグ近くで黒人の子供達や元奴隷を教える教師を育てる学校を造る予算に振り向けることに成功した。他にもピーターズバーグに近いディンウィッディ郡に今日の州立中央病院の前身を設立するために予算の一部を充てることができた。マホーンは個人的に投資した土地の所有者であり、それらはバージニア州西部やウエストバージニア州南部の豊富な炭田に絡んでノーフォーク・アンド・ウェスタン鉄道の開発と結びつき、マホーンの伝記作者ネルソン・ブレイクによれば、マホーンの死の時にバージニア州でも最も裕福な者の一人に数えられることになった。