PCETは水素化や脱水素化などの酸化還元反応で多くみられる反応機構であると考えられている。たとえば光合成における水の酸化や酸素の還元における窒素固定など細胞呼吸における多くの経路でこの機構で反応が起こっていると考えられている。無機化学ではこの機構を確かめるために単純な反応で研究が行われており、その一つに以下のようなRu(II)のアクア錯体とRu(IV)のオキソ錯体の均等化反応がある。cis-[(bipy)₂(py)Ruᴵⱽ(O)]²⁺ + cis-[(bipy)₂(py)Ruᴵᴵ(OH₂)]²⁺ → 2cis-[(bipy)₂(py)Ruᴵᴵᴵ(OH)]²⁺PCETは電気化学反応によって引き起こされることも多い。この場合、酸化は脱プロトン化、還元はプロトン化に相当する電子とプロトンの移動する軌道が異なることを示すことは比較的容易だが、それらが同時に起こっていることを示すのは難しい。一般的な多段階反応経路は協奏的経路よりもエネルギーが高い。PCETが起こっていることを示す主な根拠は、多くの反応が反応速度が多段階反応経路で予想されるよりも速いことである。電子移動反応では、最初の酸化還元反応で熱力学的な障壁がほとんど存在しない。同様にプロトン移動機構でも最初に起こる反応ではプロトンの脱離能を示すpKₐの障壁が小さい（酸性度が高い）。しかし、これらが別々に起こっているとすると最初の段階でこれらのエネルギー差を大きく超えるエネルギーが必要な反応が多く発見された。このため、エネルギーの低い第三の反応経路が存在すると推測され、考えられる経路として協奏的PCETが提唱された。この意見の正しさは速度論的同位体効果が通常の反応より大きいことによって証明された。一般的にPCETが想定されるのは、ETおよびPTそれぞれから考えられる活性化エネルギーが協奏反応のそれよりも高い場合である。いくつかの文献においてはPCETの定義が拡張され、多段階反応にも適用されている。このような定義のぶれを避けるため、PCETにかわる用語として電子移動-プロトン移動(electron transfer-proton transfer,ETPT)、電子プロトン移動(electron-proton transfer,EPT)、そして協奏的プロトン電子移動(CPET)などが提案されている。プロトンと電子の移動が同じ経路をたどる水素移動反応(HAT)とも異なっている。PCETとHATは量論的には類似しているが、HATはラジカル経路をたどることが異なっている。
オリマーたちが冒険する地域には、ピクミン以外にも数多くの種類の原生生物が生息している。いずれもが奇妙な形態と生活様式を有し、しかもその多くはオリマーたちやピクミンに対して攻撃的であり、彼らを捕食あるいは排除しようと攻撃を仕掛けてくる危険な存在である。また、これらの生物には捕食を行わない種が多く見られる。それらは分解者に属するとも考えにくい物が多く、現状では説明のつかない部分も多い。本作で登場する生物は、前作が20数種類だったが、今回はその倍以上に種類が増えており、単に種類が増えただけでなく、前作に登場した生物の亜種に相当する種類が多数登場したりしているなど生物によっては、大幅にバリエーションが増えた種類もある。更には本作で初登場する生物も多数存在する。また、『1』にて登場した生物によっては、戦闘能力が『1』よりも弱体化された種類もいるが、逆に強化された種類も存在する。
『日本書紀』には、天智天皇は実弟・大海人皇子を東宮（皇太子）に任じていたが、天智天皇は我が子可愛さの余り、弟との約束を破って大友皇子を皇太子に定めたと記されている。しかし漢詩集『懐風藻』や『万葉集』には「父・天智が大友皇子を立太子（正式な皇太子と定めること）していた」とあり、これを支持する学説もある。また、皇位には天智天皇の皇后・倭姫王を立て、自らは皇太子として称制していたとする説もある。父・天智天皇（天智7年・668年即位）のもとで天智10年（671年）に太政大臣となり、その政務を補佐した。『日本書紀』天智10年（671年）11月の条に、「大友皇子は左大臣蘇我赤兄臣・右大臣中臣金連・蘇我果安臣・巨勢人臣・紀大人臣ら五人の高官と共に宮殿の西殿の織物仏の前で「天皇の詔」を守ることを誓った。大友皇子が香炉を手にして立ち、「六人心を同じくして、天皇の詔を奉じる。もし違うことがあれば必ず天罰を被る」と誓った。続いて5人が順に香炉を取って立ち、「臣ら五人、殿下に従って天皇の詔を奉じる。もし違うことがあれば四天王が打つ。天神地祇もまた罰する。三十三天、このことを証し知れ。子孫が絶え、家門必ず滅びることを、などと泣きながら誓った」とある。丙辰 大友皇子在內裏西殿織佛像前 左大臣 蘇我赤兄臣 右大臣 中臣金連 蘇我果安臣 巨勢人臣 紀大人臣侍焉大友皇子手執香鑪 先起誓盟曰 六人同心 奉天皇詔 若有違者 必被天罰 云云 於是 左大臣 蘇我赤兄臣等手執香鑪 隨次而起 泣血誓盟曰 臣等五人隨於殿下 奉天皇詔 若有違者 四天王打天神地祇亦復誅罰 三十三天 証知此事 子孫當絶 家門必亡 云云ここでいう「天皇の詔」（詔勅）の内容は判然としないが、天智天皇の死後に大友皇子に皇位を継承させることを指示していたものと考えられている。天智天皇10年12月3日（672年1月7日）の先帝・天智天皇崩御から壬申の乱による敗死までその治世は約半年と短く、即位に関連する儀式を行うことは出来なかった。そのため歴代天皇とみなされてはいなかったが、明治3年（1870年）になって弘文天皇と追号された。