この駅に関して特徴的なことは前述したように、拡張した城壁に設けられた、フランスの鉄道がスイスの駅に連絡するための「鉄道門」である。アルザス線は、1843年6月の建設認可に基づいて、堀を越える橋と門を建設する必要があった。バーゼルの建築家Melchior Berriは、1844年2月21日、半円形の通路を脇に備えた方形の堂々とした門と、町側から階段で登ることができる階段形破風に関する2つの試案の設計を行った。Berriは2番目のプランを採用し、建設工事が始まった。バーゼルの石工フリードリヒ（Friedrich）が石材の調達を行い、ニーダーシェーンタル（Niederschönthal）の鉄骨組立工シュテーリン（Stehelin）が落とし戸の製作を行った。1845年12月赤い砂岩で造られた門が完成し、列車が12月11日からバーゼルの町へ運行することができるようになった。建設認可に基づき、門衛が始発列車の到着前に落とし戸を開け、最終列車の出発後に閉めることになっており、鉄道会社は門衛が出す信号に従って列車を運行することになっていた。さらにバーゼル当局は、戦争、暴動、疫病の蔓延の際には鉄道の運行を遮断する権限を持っていた。
1844年の夏、駅舎の建設工事がシェーレメーテリで始まり、11月には完成していた。しかしながら城壁の建設工事が遅れていたため、列車を運行開始できたのは1845年12月11日の厳粛な開通式の後であった。J.B.Schacreによって設計されたこの駅は、ミュルーズの1841年の駅舎と一致している。駅舎は、2階建ての中央の建物の両脇に1階建てのウィングが伸びている。表側には車寄せが設けられ、線路側には木造のホールが設けられた。
駅舎の建築と町の新しい城壁の建設が遅れていたため、ストラスブール・バール鉄道の技術者は1844年3月12日に城壁前に仮駅を建設することを提案した。1840年にミュルーズ（独 Mülhausen ミュールハウゼン、仏 Mulhouse ミュルーズ）で仮駅を使った経験と関係している。1844年6月15日、城壁前のバーゼル仮駅に最初の列車が到着した。1845年4月1日、本駅舎が完成する8ヶ月前に仮駅は火災で焼失している。
1838年3月6日、ストラスブール（Strasbourg）からバーゼルへ向けて、ストラスブール・バール鉄道（Chemin de fer de Strasbourg à Bâle）（StB）が鉄道の建設を開始した。ただちにバーゼル州議会の鉄道委員会は町への鉄道の接続方法について検討を開始し、1840年5月に議会が建設の認可を与えた。1840年10月25日、ストラスブール - サン・ルイ（Saint-Louis）が開通し、アルザス線はスイスとの国境まで到達した。バーゼル州議会では、駅を城壁の外側に作るか内側に作るかで激しい議論が繰り広げられた。1841年1月22日、バーゼル州議会は駅を城壁の内側に建設することを決定した。その当時のバーゼルは国境の防備を固めている都市であり、ストラスブール・バール鉄道がフランス資本の会社であることとあいまって、政治的・宗教的な、あるいは都市計画の面からの賛否が分かれる決定であった。このため、鉄道を町の中に敷設せずに、シャンツェン通り（Schanzenstrasse）の位置で城壁を取り壊してシェーレメーテリ（Schällemätteli）刑務所の位置に駅を建設することが提案された。1843年6月12日、鉄道会社は全ての法的・財務的・建築規制上の点を考慮した鉄道施設の建設計画を決定し、最終的な認可を得た。鉄道会社は、町が新たに建設する堀を越える橋と城壁に設けた鉄製の落とし戸つきのゲートを通って町へ入るように、鉄道設備と関連の建物を建設することになった。町の当局はそのために必要な土地を無償で提供することになった。1年後、1844年にアルザス線は城壁の外側に到達し仮駅を設け、さらに1845年にバーゼルに到達し、バーゼルはスイスで最初に鉄道が敷かれた町となった。
江戸の北品川陣屋横町で開業していた医師の管沼隆慶はアメリカ合衆国長老教会の宣教師で、医師でもあったJ・C・ヘボンと出会い、キリスト教の文書を貰う。1874年（明治7年）にキリスト教信仰が認められると、荏川町の医師宅で集会を始め、戸田忠厚、安川亨たちが伝道を始める。 1875年（明治8年）、管沼らにより青物横町の民家を拠点に集会を行い、アメリカ長老教会の宣教師クリストファー・カロザースから8名が受洗した。最初の信徒を根幹として、1877年（明治10年）4月11日、教会が設立された。O・M・グリーン宣教師仮牧師に就任し、鈴木清作、野口孫次郎が長老に就任した。1877年（明治10年）より日本基督一致教会の中会に所属し東京品川長老教会と称した。同年10月3日に日本基督公会で第一回中会が開かれて戸田忠厚が奥野昌綱、小川義綏と一緒に按手礼を受け牧師になる。1878年（明治11年）3月に会堂を建設する。そして、6月に安川亨が初代牧師に就任する。1882年（明治15年）には第2代目牧師戸田忠厚の時に、高輪方面に伝道し、高輪教会を形成し、戸田が高輪教会の牧師を兼務する。1890年（明治23年）には日本基督教会に所属した。1885年（明治18年）2月には教会立小学校の知本小学校を開設する。1887年（明治20年）7月北品川長者町に新会堂を建築する。その後、大井町に移動。1941年（昭和16年）に日本基督教団大井町教会と改称する。1970年（昭和45年）に現在の会堂を建設する。