この作品に登場するキャラクターの中には、日本の時代劇から着想を得たものやオマージュを捧げているものが少なくない。ウサギのかつての主君はミフネと名づけられたが、何作もの傑作時代劇映画に主演した三船敏郎への敬意が込められている。犀の賞金稼ぎムラカミ・ゲンノスケは三船が『用心棒』・『椿三十郎』で演じた役から着想を得たキャラクターである。盲目の豚侠客ザトウイノは『座頭市』から名を借りている。『子連れヤギ (Lone Goat and Kid)』編には乳母車に息子を乗せて放浪する刺客が登場するが、映画・劇画作品『子連れ狼』から設定を引いている。もちろん、主人公ミヤモト・ウサギの名も五輪書の著者として知られる宮本武蔵の語呂合わせである。
ダークホース版の13号から22号にかけて展開された『グラスカッター (Grasscutter)』編は、1999年にコミックス・バイヤーズ・ガイド誌のファン投票において良いストーリー部門のトップ票を集めた。さらに2000年には同作のトレードペーパーバックがグラフィックアルバム部門のトップに選ばれた。
物語の舞台となるのは江戸時代初期（17世紀初頭）の日本だが、そこでは人間の代わりに擬人化された動物が住んでいる。主人公ミヤモト・ウサギ（宮本兎）は兎の浪人で、用心棒として路銀を稼ぎながら武者修行 (musha shugyo) の旅を続けている。ウサギは実在の人物である宮本武蔵をモデルにしているが、作風や物語に直接影響を与えているのはセルジオ・アラゴネス (en:Sergio Aragonés) によるコミックブック作品『グルー・ザ・ワンダラー (en:Groo the Wanderer)』、英訳された劇画作品『子連れ狼 (en:Lone Wolf and Cub)』、黒澤明監督の映画作品である。シリーズの主体は一話完結の短編であるが、数章にわたる長編も時おり刊行されている。個々の作品はより大きなプロットの中に位置づけられ、多くの支流を持つ長大な物語を成している。作品の多くは日本史や日本民話に題材を取っているが、妖怪変化の類が登場することもある。建築・衣服・武器その他の文物は忠実に当時の様式を模して描かれており、日本の美術・工芸（凧・刀剣・陶芸など）を紹介することが主眼の話も多い。また、キャラクターの名前は日本式に名字-名前の順になっている。これらの試みが功を奏して、1990年には"巧みに織り込まれた史実と伝説"の教育的価値に対してParents' Choice Awardが贈られた。
オペレーション・メテオが発動されると、「相棒」と呼ぶ機体ガンダムデスサイズで地球へ降下する。地球降下後は太平洋上のサルベージ船の船長で、かつてはトールギスの開発にも関わった技術者でもあるハワードの協力を受け、任務を遂行していく。同じガンダムパイロットの中ではヒイロ・ユイと最初に出会い、その最初の対面ではリリーナ・ドーリアンを殺そうとするヒイロの行動を阻止したが、必要以上にヒイロをいたぶってしまったことから、リリーナからは逆に非難されてしまう。地球圏統一連合の医療施設からヒイロを脱出させた後は、彼の無茶な行動に驚き呆れながらも行動をともにするが、ウイングガンダムの修理にデスサイズのパーツを勝手に抜き取られるという貧乏クジを引かされる。OZのトーラス輸送襲撃作戦が失敗した後はカトルと共に行動し、コロニーを懐柔して取り込もうとするOZの企みを知らせようと、シンガポールの基地から宇宙に上がる。しかしヒイロと違ってモビルスーツを捨てずにHLVに載せていたため、宇宙で漂流中にOZに発見されてモビルドールのトーラス部隊の前にあえなく捕虜になってしまう。この際自爆スイッチを押すが、回路の故障で自爆できずに終わった。囚われていた基地からはヒイロによって救出されるが、自分の「相棒」が見せしめのために破壊されるのを目の当たりにし、アストロビジョンの前で絶叫する。月面基地に潜入するためOZ宇宙軍の新兵募集に紛れ込み、そこで志願兵の少女ヒルデ・シュバイカーと出会う。ヒルデにあっさり潜入を見破られ拘束されるが、彼女に一体誰が敵で、なぜコロニーが戦うのかなどを語りかける。そのヒルデに助けられ辛くも月面基地に辿り着き、そこで自分のデスサイズがシェンロンガンダムと共に、ガンダムを製造した5人の科学者によって改良されているのを発見する。科学者達に提案され、再びデスサイズに乗るためにその完成まで基地に囚われることにする。その際科学者達がデュオを捕え、OZに協力的なところを印象付けるため、拳法の達人である老師Oに叩きのめされてしまうなど、ここでも貧乏クジを引く。張五飛と共に拘束中に独房の空気を遮断されるという危機をしのぎ、この時点で完成度7割だったが、新型のガンダムデスサイズヘルで月面基地を脱出する。月面基地脱出後は、コロニーでヒルデと共にジャンク屋をやりながら、部品調達と調整を兼ねてデスサイズヘルでOZにゲリラ的な攻撃を繰り返していたが、OZの技術将校トラント特尉に発見され、ウイングガンダムゼロのゼロシステムの実験に協力させられる。システムに圧倒されたデュオはまともな人間の扱える代物ではないと、ウイングゼロに戦慄を覚え、その性能に憑りつかれて暴走するトラントを撃退する。その後コロニー市民の武装組織ホワイトファングに危険を感じて協力を拒んでからは、ジャンク屋をたたんで旅立ち、他のガンダムパイロットと合流して、かつての協力者ハワード率いるピースミリオンに乗り込む。OZトレーズ派の残党が血迷って占拠したコロニーへと忍び込んで司令部を制圧、解放させたり、ホワイトファングの宇宙戦艦リーブラに潜入したヒルデのピンチを間一髪で救い、ガンダムパイロットのデータが組み込まれたヴァイエイトとメリクリウスを単独で撃破する、などの活躍を見せる。最終決戦ではリーブラに囚らわれていた5人の科学者を解放し、彼らをデスサイズヘルに取り付かせたまま砲弾の飛び交う戦場を強行突破する。その甲斐あって科学者達の手により、地球に落下するリーブラの軌道を変えさせることに成功した。