安政4年（1857年）10月9日の上有川地区の大火によって社記、縁起の類が焼失してしまったため創建年代は不詳である。『有川村郷土史』によると、「その昔、白木の弓と白羽の矢が天降った地に宮柱を営み、その弓矢を御神体として奉祀し「弓矢八幡宮」と号した」とされ、その後、「神託によって御神像を奉り前宮地に奉遷した」との記述があり、弓矢の天降った地を「矢はずの産土神」と称し、前宮地を「八幡の弓矢田」と称したとされる。また、『神社関係文書写』では、当時の有川村領主の老職に就いていた者が、「北北東の方角に幸森があり、八幡宮を鎮座建立して、自身の息子を神職とした」ともあり、天満神社の項目で記述した「争論になった神職とその父親」とはこの親子のことである。明治7年（1874年）5月5日に村社に列せられ、同41年（1908年）、神社合祀令に基づき、浜地区の弁財天宮（田霧姫神）と江孕水神社（水波能売命）が合祀された。 昭和9年（1934年）10月30日、神饌幣帛共進神社に指定された。
誉田別神を主祭神に田霧姫神と水波能売命の2柱を配祀していた。江戸初期より捕鯨が盛んだった有川地区であるが、当社は「有川鯨組」の守護神であり「八幡」の「八」の字が旗印に組み込まれるなど、篤く崇敬されていた。
安政4年（1857年）10月9日の上有川地区の大火によって社記、縁起の類が焼失してしまったため創建年代は不詳である。大正9年（1920年）に編纂された『有川村郷土史』によると、「10世紀中期に上有川地区広後古川（現有川神社付近）に有川村の守護神として奉祀していたものを、慶長3年（1596年）、当時の五島藩藩主五島玄雅より社領を寄進され、現有川神社宮地に社殿を建立し奉遷した」と記述されるが確証に乏しい。また、現有川神社宮司家所蔵の『神社関係文書写』では、「年代は不詳だがかつては浜・八幡神社に相殿として祀られていたが、天満神社のみ上有川地区広後古川に別殿し、帽子山の麓（現有川神社宮地）に安置された」とある。また別の記述として、「天満神社と八幡神社は同社であったが、当時の神職とその父親との間で両社についての争論があり、福江表の御裁許の上、天満神社を建立した」ともある。明治7年（1874年）5月、郷社に列せられ、翌8年3月17日、神道事務分局からの支局設立の御布達に基づき、天御中主神、高皇産霊神、神皇産霊神、天照大神の4柱を合祀し、その後上有川地区の山神社（大山祇神）も合祀した。同13年（1880年）10月25日、神饌幣帛共進神社に指定された。
主祭神は菅原道真公、天穂日命の2柱で、大山祇神、天御中主神、高皇産霊神、神皇産霊神、天照大神の5柱を配祀していたが、配神の中、天御中主神以下の4柱は3社合併の際の合祀はされていない。
明治以降、1945年までの銃規制は、規制をかけつつ原則として容認する点で、幕末と変わらなかった。明治政府は1872年（明治5年）に銃の所持を許可制とする銃砲取締規則を制定した。別に1884年（明治17年）制定の火薬取締規則があり、これと銃砲取締規則を統合して、1899年（明治32年）に銃砲火薬類取締法を制定した。銃砲火薬類取締法には1910年に大きな改正（明治43年法律第53号）があった。。郵便逓送人が持つ拳銃は1873年に所持が許され、1887年現金書留配達需要が増したため「郵便物保護銃規則」に定められた。銃砲火薬類取締法は、銃砲を軍用と非軍用に分けた。軍用の銃砲とは、日本軍で現に用いているか、それに匹敵する性能を持つものである。たとえば距離1000メートルで命中したときに殺傷能力を持つ銃は、軍隊になくとも軍用銃の扱いとなった。また、性能が劣っていても軍が用いているなら軍用銃砲となった。非軍用銃砲は、軍で用いるには性能が劣る銃砲で、陸軍から払い下げられて猟銃とされた旧式の銃がその典型である。軍用銃砲についてはその譲り渡しと譲り受けの両方について警察官署の許可が必要だが、非軍用銃砲は許可なしに取得・譲渡できた。所持には規制がない。別に、1910年制定の銃砲火薬類取締法施行規則（明治44年勅令第16号）の第39条と第40条によって、軍用・非軍用にかかわらず容易に隠し持てる形と大きさの武器を「拳銃、短銃、仕込銃、仕込刀剣その他の変装武器」としてまとめ、さらに厳しい規制をかけた。「仕込刀剣」が含まれるように、隠し持てる武器が規制対象である。これらは所持・授受・運搬・携帯が許可制であった。警察官署は安寧秩序の維持に問題があると考えれば随意に不許可にすることができたが、基本は許可するものなので、護身用の拳銃所持・携帯は普通に認められた。例外として、陸軍軍人が正装用に持つ拳銃と、郵便逓送人が僻地で郵便物保護のために持つ拳銃は、職務のためとして許可が不要とされた。