＜平安時代中期 - 鎌倉時代中期＞   ※ 太線は実子、細線は養子。  源満快　  ┃　 満国　  ┃　 為満　  ┃　 為公　  ┣━━━━━━━━━┓ 伊那為扶            依田為実　  ┃　            　　┣━━━┓ 依田為実              実信    豊平　  ┃　　　　　┏━━━┻━━━┓ 　実信   　　 信行    　　　　行俊（飯沼太郎）　              ┃　        　　┃ 　     　手塚氏/諏訪氏    資行（飯沼三郎）　                　    ┏━━━┫ 　                    常遠    唯心　                　            ┣━━━┓ 　                            行盛    朝行＜戦国時代 - 織豊時代＞  （依田氏/芦田氏）  系未詳　  ┃　 信常?　　┃　 信守　  ┣━━━┓　 信蕃    信幸　  ┣━━━┳━━━┓　 康国    康勝    康寛＜戦国時代 - 織豊時代＞  （依田氏/相木氏）  系未詳　  ┃ 相木昌朝（依田昌朝）　  ┃　 常林
東信で芦田を名乗った武将は、滋野氏系と依田氏系に分かれる。滋野氏系の芦田氏は鎌倉時代から佐久郡芦田に館を構えており、その系譜は、滋野滋氏王ー蔵人敦重ー又三郎為重ー法師僧光ー盛弘ー芦田七郎盛忠ー備前守朝ー下野守氏久となる。永享元年（1429年）、室町幕府六代将軍に足利義政が就任すると、鎌倉公方足利持氏はこれに反発し、関東管領の上杉憲具の諌めにも耳を貸さずに、幕府に対する決戦に備えるため、鎌倉に味方する東国武将に下知状をもって出兵を促した。滋野系芦田氏の下野守もこれに呼応し、関東出兵のため小県郡芝生田まで兵を進めた。これに対抗したのが、信濃守護小笠原政康の祖からの分流である、大井越前守持光だった。この噂を耳にした将軍足利義政は、御教書を発した。「大井越前守と芦田下野守不快の事、然るべからざる候。早々和睦すべきの旨仰せ出され候。よって東国の面々御教書なされ候おわんぬ。若し尚事行かずんば、美濃・越後の御勢差し遣わさるべきの由、沙汰申すべく候の段堅く仰せ含められるべく候以上　　　二月十七日　永享七年　　小笠原殿　　足利義政]　　花押」滋野系芦田氏は、将軍義政の調停案を一蹴し、芝生田氏の協力を得て、芝生田城、別府城の両城に立てこもり、幕府が後ろ盾となった、信濃守護小笠原政康、越後守護長尾邦景、大井持光の連合軍を迎え撃つ体制を取った。小笠原政康は、依田右衛門尉経光と、高井郡井上一族の米持次郎光遠をもって、滋野芦田氏を攻略し滅亡させた。依田右衛門尉経光の子、備前守光徳から芦田姓を称するようになり、信蕃の父下野守信守まで、嫡流だけが「芦田」、傍系は依田姓を名乗ったが、信蕃の代から依田姓を使用した。
佐久市八幡(旧南御牧浅科村）の依田氏は、長野県屈指の地主であり、農地解放が実施されるまで長野県の高額納税者1位の常連であった。八幡の依田氏は、仙右衛門を通称として、遠祖は小諸城主依田氏の庶子の一人であった。小諸城主依田氏が、上州藤岡城主となった際、これに随従せず土着帰農した。元禄15年（1702年）から維新まで小諸城主となった牧野氏から馬上を許され奏者格の格式が与えられた。また依田氏の邸宅にたびたび藩主・牧野氏が立ち寄った（小諸領内旧家録等）。依田仙右衛門家の江戸時代を通じての文書約1万点は、現在早稲田大学図書館に「依田家文書」として保管されている。依田専左衛門家は、専右衛門家の分家である。藩主の国替えに随従しない事を例としていた小諸藩の御城番組の番士（卒族）にも、依田姓が散見される。
大永（1521年～1527年）の頃、遠州進出を図った今川氏親の家臣長池親能が浜名湖西岸に築いたという。城主には長池親能、次に小原親高が入り享禄年間以降は朝比奈泰長が入った。弘治元年（1555年）に氏泰が病没すると、その嫡男泰長が城主となる。永禄3年（1560年）桶狭間の戦いで今川義元が討たれると、自立を志す徳川家康が三河国統一に向けて邁進。徳川方に誼を通じる土豪が多くなる中で、掛川朝比奈氏の分流であった泰長は、惣領家と同様に今川氏への忠誠を貫こうとしていた。永禄5年（1562年）、今川氏から徳川氏へ転属・離反した三河国八名郡五本松城を襲うと、城主西郷正勝を討ち取り、凶報により駆けつけた正勝の嫡男西郷元正をも討ち取っている。泰長は永禄5年11月晦日に死去しその跡を嫡子の孫太郎泰充が継いだ。しかし、泰充は永禄9年正月、城中における謡初め会にて、徳川に誼を通じていた弟の孫六郎真次に殺され、そのまま城主の座を奪われた。しかし、永禄10年正月、真次も今川氏真の命を受けた小原鎮実に討ち取られてしまう。そして、今川方は、境目城を築き、宇津山城とともに家康の来攻に備えた。永禄11年（1568年）12月、徳川方の酒井忠次は土豪の佐原重吉、内藤三左衛門、松野三右衛門らと境目城を落としたのち、同月12日に遠江国に侵攻。同月15日、宇津山城を守備していた小原鎮実の家老増田団右衛門は城より討って出るが討死し、城主小原鎮実らは城に爆薬を仕掛け浜名湖から逃亡した。しかし、爆薬の量が少なく、酒井勢は爆発音に驚いたが死傷者はでなかった。その後、家康は松平家忠を在番として城郭を拡張させている。元亀3年（1572年）には松平清善が1,000貫文を賜って城番に命じられた。廃城になった時期は不明。