1998年には長野オリンピック（長野五輪）の開会式上空における航過飛行（フライバイ）の要請を受けた。東京五輪とは異なり「五輪を描く」ことはなかったものの、開会式の会場が冬期の山岳地域であり、会場が冬期迷彩のように視認性に劣るため、会場の脇には移動式TACANが設置された。また、開会式当日は第11飛行隊の飛行隊長が会場から無線で編隊に直接指示を送る体制をとった。開会式当日、ベートーヴェンの交響曲第9番第4楽章の演奏・合唱が終了すると同時に、会場上空で5色のスモークを引きながらレベルオープナーを披露した。同年7月には松島基地にブルーインパルス専用の格納庫と「ブルーインパルス・ミュージアム」が完成。同年7月27日の松島基地航空祭において「お披露目式典」が行なわれた。1999年からはカラースモークは使用されなくなった。一方、1982年の事故以来、水平系の課目しか行われていなかった浜松基地の航空祭では、この年の11月14日に浜松基地で行われた「エアフェスタ浜松」にて、17年ぶりに垂直系の課目を含めた展示飛行が行われた。飛行隊として独立してから、部隊運用や管理はスムーズに行なわれており、全国の航空自衛隊隊員にとって、ブルーインパルスは魅力的な部隊となった。
F-86Fの後継機については、日本で製造した「国産機」によってパフォーマンスを行うことが、自国の防衛力や航空産業のレベルを誇示する上で大きな意義があると考えられた。このため、前述したように後継機としてT-2によるアクロバット飛行について研究の指示が出されていた。T-2は超音速機であることから、飛行速度の高速化に伴いターン（旋回）やループ（宙返り）の半径が大きくなり、会場上空へ戻るのに時間がかかるため、課目の間の時間が長くなる。このため、「T-2では単独機を1機増加させた6機体制での展示飛行が効果的である」という研究報告がまとめられた。これに伴い、1979年にはブルーインパルス用として6機のT-2が予算として計上された。つまり、編隊飛行による演技の間隙を単独機による演技で埋めるという工夫である。1980年10月には次期ブルーインパルスの塗装デザインの一般公募が行なわれ、2,055作品が集まった。1981年1月には、女子高校生4名による合作デザイン案が最優秀賞として採用された。1982年1月12日には松島基地の第4航空団第21飛行隊内に戦技研究班が設置され、同年3月10日までに新造された6機のT-2がすべて引き渡された。機種の変更と同時に、パイロットと地上要員の制服についても新しいデザインとなり、さらに地上でのパフォーマンスも変更された。
1969年12月、日本万国博覧会協会からブルーインパルスに対して、日本万国博覧会（大阪万博）の開会式上空における展示飛行の要請があった。当初、展示飛行の内容についてはブルーインパルス側に任されていた。この当時のブルーインパルスは飛行技術面や組織面でも安定した時期で、実力のあるパイロットも揃っており、自主的な研究によって "EXPO'70" という文字を描くことになった。早速訓練を行ない、万博協会の関係者が浜松基地を訪れた際に訓練中の文字を見せた結果、本格的にプロジェクトとして進められることになった。これは五輪を描くよりも困難だったが、1970年1月12日には浜松基地上空で "EXPO'70" の文字を描くことに成功した。一方、万博の会場からわずか8マイルの地点に大阪国際空港があるため、大阪航空局からは「飛行の承認は出来ない」と通告を受けた。これに対し、万博協会からも陳情を行なった結果、1970年2月中旬には飛行許可を得ることが出来た。開会式当日の1970年3月14日、浜松基地を出発したブルーインパルスは、万博の会場で4課目のアクロバット飛行を行なった後、2分30秒かけて会場上空に "EXPO'70" の文字を描いた。その後、同年6月29日にも同様に文字を描いている。
2013年8月17日、ロックフェスティバル「RISING SUN ROCK FESTIVAL 2013 in EZO」のEARTH TENTに出演。10月4日に東京都内のLIQUIDROOMで初の単独ライブを行う。2015年7月17日、約1年半ぶりにLIQUIDROOMで単独公演を開催、11月3日には横浜Bay hall、4日は京都磔磔で追加公演も行われた。
退院後、2008年4月18日にアメリカを去り日本へ。高田馬場のライヴ・ハウスPlaza Stageでウェイトレスとして働きつつトークとライヴで出演、オープン・ジャムに参加し多くのミュージシャンたちとセッションを重ねる。同所で杉笑太郎と出会い、デュオでの活動を開始(5月5日〜11月13日)。新聞社をプロモーションして回るうち、元MLBの通訳、エージェントでトランスジェンダーのギタリストとしてのコウタの存在が新聞で何度か取り上げられる。これが旧交を温め始めるきっかけとなり、東京スポーツでの連載「コータ姐のカミングアウト」や『WBCの内幕』執筆、スポーツ・ビジネス・コメンテーターとしてのテレビ、ラジオへの出演へと繋がっていく。2008年11月一杯でPlaza Stageが閉店となると、拠点を新宿LIVEたかのやに移し、Kota Project Bandを結成。同時進行で『WBCの内幕』(WAVE出版)を執筆し、2009年3月に出版。Kota Project Bandは当初ハード・ロックのカヴァーをメインに演奏していたが、オリジナル曲を書き始め、5月にはヒーリング・インストゥルメンタルに特化した全曲オリジナルの初ライヴを行う。ヨーロッパのフォークロアに日本の子守歌や童謡といった｢和｣のテイスト加味したシンプルなメロディが特徴。並行して『週刊ベースボール』で｢コータのトランス野球学｣の隔週連載が始まる。通訳、エージェント時代の経験、さらにはトランスジェンダーについて講演を行うようになる。2010年、映画監督の市川徹と会い、『Sakura Sakura』に譲吉の妻の母メアリー役に抜擢される。11月からは創造学園大学創造芸術学部音楽学科の教授に就任。『マイケル・ジャクソン IN ソウル・トレイン』の翻訳など、活動は多岐に渡る。