改名当初はF1で使用されるピレリ製タイヤやそのサーキットの経験を積めないことや、タイトルを獲得してもスーパーライセンスを取得する条件を満たせないため、レベルは充分高いがやはりF1を目指す上では参戦する意義は薄いと見られていた。ところがストフェル・バンドーンが2016年に、ピエール・ガスリーが2017年にF1のシートを確保するまで参戦していたことで注目度が上がり、ヨーロッパのジュニアカテゴリーの参戦資金が高騰していることから、F2以外でF1マシンに準じた経験を積めるカデゴリーとして見直され、本カデゴリーの参戦を企図する海外勢のドライバーが増えつつある。一方で前述に関連することだが、F1参戦にはFIA F2あるいはF3の経験がないと不利な状況に変わりなく、前述の二人もF2(GP2)のタイトルを獲得し、スーパーライセンスの発給条件を満たした上での参戦であるため、本カテゴリーが再評価されつつあるものの課題も残っている。また、本カデゴリーも含め、審査委員会への報告内容に統一的な基準がないため、サーキット側の競技長の判断基準に委ねられているという、国内レース共通の課題を抱えている。他にもレース運営に課題を抱えており、スーパーフォーミュラのセッション中の判定だが、JRPがレースディレクターを派遣しているものの、主催者側（開催地のサーキット）が決める競技長に決定権があり、その決定を審査委員会が承認するという形を取っている。メディア対応は基本はJRPが担っているが、JRPがレースの判定／裁定についての決定権がないため、無許可で説明できないという状況である。この状況については、長年苦悩しているらしく、2016年にJRP社長へ就任した倉下明によれば、「三権分立のような形で判定と裁定がされているため、メディアへの対応や最高責任者が明確化されていない」という課題を抱えているとコメントしている。その一方で、SUPER GTが株式会社GTアソシエイションが必要に応じて対応するのに対し、スーパーフォーミュラ側は2019年シーズンの第3戦で予選が赤旗中断のまま終了になった一件でJRPが公式声明を出すという対応した例を除けば、運営側がノーコメントで終わるケースも多い。また、その問題について事実上手を付けられず、それらが明文化されないままレース運営が行われている状況であり、参加ドライバーから度々苦言を呈される点も課題となっている。
フォーミュラカー（オープンホイール）を使用した四輪レースで、日本レースプロモーション（JRP）を運営母体とし、日本自動車連盟（JAF）公認の下、フォーミュラ・ニッポンを引き継ぐ形で2013年にスタートした。全日本F3000からフォーミュラ・ニッポン時代には『日本一速い男 決定戦』とも呼ばれ日本最高峰のカテゴリーとして扱われており、時期によってはランキング3位以内を獲得すればスーパーライセンスを取得できたこともあり、ステップアップカデゴリーとしてF1ドライバーを輩出していた。だが年を追うごとに海外に拠点を移してF1を目指す日本人ドライバーが増えたこともあり、F1にステップアップするドライバーはほとんど見られなくなった。またリーマン・ショックによる経営への打撃でトヨタやホンダが相次いでF1から撤退したことから出場台数や観客数が減少傾向となった。そこで2013年から国内という枠からの脱却し、アジアのスタンダードフォーミュラを目指しアジアを中心にグローバル展開を進めるにあたり、現在の名称であるスーパーフォーミュラとして再スタートすることとなった。その関係で初年度の2013年に韓国のインジェ・スピーディウムでの開催が予定されたが、結局開催されることなく中止された。また、2015年の概要発表会の際、当時のJRP社長である白井裕の口から「名実ともに世界の三大フォーミュラカーレースのひとつとして、F1、インディカーと並び称されるカテゴリーにまで発展させることを目標」と述べ、独立したカテゴリーの性格を強めていく方針を取ったこともあり、現在に至るまで海外展開は見送られたままである。そのため、本カテゴリーと並び国内最高峰のレースであるSUPER GTとは異なり海外展開はされていない。
1980年（昭和55年）12月から登場した78系車体更新車の第2陣である。更新施工は全車アルナ工機（現・アルナ車両）で行われ、1984年（昭和59年）3月までに4両編成と2両編成各12本の計72両が製造された。本系列から78系更新車にも冷房装置が搭載されることとなり、また4両編成の編成形態も5000系ではMTMTと、電動車と付随車（制御車）が交互に連結されていたものを、本系列では8000系と同様TMMTと、電動車を編成中間に集約した。よって、4両編成はクハ5150形-モハ5250形-モハ5350形-クハ5450形と編成形態が変更されている。2両編成はモハ5550形-クハ5650形の順に編成され、こちらは5000系と同様である。冷房装置は8000系と同一のRPU-3002（冷凍能力10,500kcal/h）を1両当たり4基搭載し、それに伴いパンタグラフも下枠交差形のPT-4801に変更され、モハ5250形に2基集約して搭載し、モハ5550形は連結面寄りに1基搭載した。なお、モハ5350形は隣接するモハ5250形より架線電圧を給電される形が取られている。補器の配置は、MGについては5000系と同様クハ5450形およびクハ5650形に搭載するが、4両編成のCPについてはクハ5150形に2基集中搭載するよう変更された。また、同時期に落成した8000系81103編成の仕様を踏襲する形で、本系列から客用扉窓の固定支持方式がHゴムから金属枠固定に変更され、車内外の見付に変化が生じたほか、前述のように5157編成より行先・種別表示幕が自動化され、同時に側面行先・種別表示幕が新設されている。なお、本系列から空気制動がHSC化されたことにより、8000系との連結総括制御も可能とされたものの、両者の性能差が大きいことから、ダイヤの大幅な乱れからやむなく混結された事例がわずかにあるものの、通常運用で両者が混結されることはなかった。竣工当初は伊勢崎線と東上線に分散配置されたが、1983年（昭和58年）頃からは冷房化率向上目的で野田線にも配属された。