子のう菌・担子菌など高等な菌類の生活の主体は陸上である。したがって不完全菌も、陸上の環境に多く見られる。おおよそ、菌類の生息する環境ならばどこにでも不完全菌は出現する。人間の生活空間であれば、食物、家具、家の壁等、有機物が存在し、ある程度の湿気があれば、カビは出てくるし、それはたいていは不完全菌である。自然な環境であれば、動植物遺体、糞、落ち葉などそれぞれに様々なカビが繁殖する。セルロース分解が得意なものもあるし、動物の毛などケラチン質を好むものもある。また、生き物を侵すものもたくさんある。植物の病気を引き起こすもの、動物に寄生するもの、線虫捕食菌など、様々な形で栄養を漁る。藻類と共生して地衣類となるものもあり、不完全地衣類と呼ばれる。水中には、落ち葉につく水生不完全菌がいる。海産種も数は多くないが知られている。ただし、その活動を本当に知ることはかなり難しい。カビがそこに“いる”ことを知るためには、培養によってその姿を見なければならない。正確な同定には純粋培養が必要になる。このことが、自然界でのカビの活動を知るためには、大きな困難となる。たとえば、森林土壌中のカビを探すために、土を取ってきて、水に入れてかき混ぜ、上澄みをシャーレの中の培地に流し込み、育てたとしたら、おそらく、アオカビやコウジカビがたくさん出てくるかもしれない。ところが、慎重に土の中から枯葉を取りだし、これを滅菌水中で完全に洗い、それを培養すれば、たぶん違ったカビが出現する。アオカビやコウジカビは、人家の中で、すぐに生えてくることでもわかるように、常にそこら中に胞子が飛んでいて、好適な場があればすぐに生えてくるので、このような結果になるわけである。いわば、彼らは菌類の中の雑草のような存在である。また、後者のようなやり方でも、キノコには、この枯葉は小さすぎて、たぶん出てはこないことも配慮せねばならない。
子のう菌・担子菌には、単細胞で生活する酵母の形を取るものと、菌糸体を発達させるものがある。不完全菌にも、それに対応して、不完全酵母類・不完全糸状菌類がある。不完全酵母は出芽や分裂によって増殖する。不完全糸状菌は、一定幅で隔壁を持つ菌糸からなる菌糸体を作る。所々から柄をのばし、胞子を形成する。不完全糸状菌の胞子の主要なものは分生子といい、分生子柄の先に分裂や出芽などによって作られる。袋に入った状態で作られることはない。分生子の形、作られ方などは不完全菌の分類で重視される特徴である。分生子柄はバラバラに作られるものが多いが、互いにより集まって分生子柄のマットを形成するもの、くっつき合って共通の柄を作り、その先に多数の分生子を作るもの、それらを覆う構造を持ち、簡単な子実体のようになるものも知られている。他に、菌糸の一部の壁が厚くなった厚壁胞子を形成するものもある。また、分生子を子実体様の構造を作って形成するものがある。子のう菌類の閉子のう殻に似たものなどが知られ、分生子果不完全菌という。分生子を形成しない不完全菌もある。この場合、菌糸の特徴や菌核などの形質で同定が行われる。
学者たちの中には、ハドソン・バレーにおける非公式スパイ監督者としてのハウの行動に関して疑問を投げかける者がおり、イギリス正規軍士官への任官と引き換えにハウが何らかの取引を行おうとしたことを示す証拠になっている。それはベネディクト・アーノルドが1780年に行ったことと類似していた。ハウが准将に指名された1776年には既に、ヘンリー・ケリーというロイヤリスト商人がイギリスの植民地担当大臣ジョージ・ジャーメインに、ハウは容易にイギリス側に与するよう誘惑できると助言しており、さらにイギリスの戦争遂行のために大きな取引を提供できるとも主張していた。1780年、ベネディクト・アーノルドが裏切りをしようとして露見した後、イギリスの離反者で元イギリス軍士官ビーズリー・エドガー・ジョエル大尉が、アーノルド以外にも寝返ろうとしていると主張しており、尋問後にジョエルはその士官としてハウを挙げていた。ジョエルはその情報源としてウィリアム・トライアンの秘書エドマンド・ファニングの名前を挙げていた。さらにハウのイギリス軍との対話手段として、たびたび捕虜となり、捕虜交換を繰り返した者が両者の間で伝言を運んだとも述べていた。ワシントンも大陸会議の戦争委員会も、ジョエルがイギリスのスパイだと疑っていたので、その話を信じなかったが、ジョエルは後にトーマス・ジェファーソンとバージニア政府から国内のロイヤリスト勢力に対して愛国者民兵隊を率いるよう任官されていた。さらにニューヨークのロイヤリストで、ハウの代理人かつアーノルドの共謀者であるジョシュア・ヘット・スミスの兄弟、ウィリアム・スミスがその日記の1780年4月29日に、兄弟のトマス・スミスがジョエルの語ったのと同じ方法で愛国者からの「情報」を持って代理人がイギリス側に来たということを知らされたと記していた。1780年9月28日、ウィリアム・スミスはヘンリー・クリントンに、「ボブ」・ハウが愛国者を売る用意があると考えると伝えていた。後の歴史家、例えばダグラス・サウスオール・フリーマンは、ハウが裏切ろうとしたという仮定を度々否定し、ジョエルが愛国者政府に自身を結び付けようとした創作だと考えている。ハウの生涯を扱った唯一の著作では、1ページでこの反逆の噂を議論しただけだった。一方で、フリーマンの判断は主にこの噂に対するワシントンの評価に基づいているが、ワシントンはウィリアム・スミスの日記にあるかなり念入りな証拠を見ていなかった。他の可能性として、ハウはその統制下にあった膨大なスパイ・ネットワーク管理を隠すために、裏切りの可能性をイギリス軍の間に広げようとしただけだとも考えられる。この戦術はフィリップ・スカイラーなど他の大陸軍スパイ操作者も使っていた。ハウの経歴と動機を調べた歴史家フィリップ・ランレットは、スカイラーの輝かしい経歴とハウの失敗の記録を比較して、ハウが寝返ろうとしていたという結論を引き出した。ハウが無罪であるか、あるいは裏切ろうとしたことで有罪であるか、今日まではっきりとした証拠はない。