5月27日、トラウトは9回目の哨戒でフィリピン方面に向かった。この哨戒では、ミンダナオ島に物資と陸軍要員を輸送する任務も与えられていた。6月9日、トラウトは輸送船に対して魚雷を3本発射したが命中しなかった。6月12日、トラウトはミンダナオ島サンボアンガ・デル・スル州パガディアン湾に入り、J・A・ハマー大尉以下5名の陸軍要員と8,000発に及ぶ弾薬を陸揚げした。作業終了後スールー海方面に向かったトラウトは、6月15日に北緯04度58分 東経118度37分の地点で特設運送船（給油）三楽丸（拿捕船、大阪商船委託、3,000トン）に向けて魚雷を3本発射。うち2本が前部と後部に命中し、船体は分断された。三楽丸は曳航されたものの、翌16日に沈没した。6月26日には3隻の沿岸汽船を発見し、そのうちの2隻を砲撃で撃沈した。7月1日、トラウトは北緯13度40分 東経121度50分の地点で陸軍船五十鈴丸（日之出汽船、2,866トン）に対し魚雷を4本発射し、命中させて撃沈した。7月9日には再びパラディアン湾に入り、チャールズ・「チック」パーソンズ中尉とウィリアム・E・ダイス大佐を引き取った。7月20日、トラウトは59日間の行動を終えてフリーマントルに帰投した。
10月26日、トラウトは6回目の哨戒でニュージョージア諸島方面に向かった。11月13日朝、トラウトは司令部からの「日本艦隊が付近にいる」という情報に基づいて哨戒をしていたところ、南緯07度09分 東経160度17分のインディスペンサブル海峡近海でまず高速で航行する駆逐艦を発見し、次いで第三次ソロモン海戦から一旦引き揚げてくる戦艦霧島を発見。霧島は単艦で航行しており、絶好の獲物だった。射点に就こうとしたが、霧島がジグザグ航行をし始めたため魚雷発射の機会を逸してしまった。その後、霧島は駆逐艦を伴って反転して再度南下して来た道を戻ってきた。霧島を再度発見したトラウトは魚雷深度を7.6メートルに設定し、距離1,700メートルで魚雷を5本発射。魚雷は霧島に命中したものの、不発だった。11月23日、トラウトは28日間の行動を終えてブリスベンに帰投。その後、トラウトはフリーマントルに移動することとなり、12月2日に到着した。
5月21日、トラウトは4回目の哨戒でミッドウェー島近海に向かった。トラウトは第7.1任務群の一艦として、日本の攻撃に備えるべくミッドウェー島のはるか西南方に配備された。6月4日8時12分、トラウトは後方に日本の戦闘機が飛んでいるの発見し、潜航。その後、一連の爆発を聞いた。6月9日、トラウトは大きい油膜といくらかの残骸の間を抜けたのち、木製のカバーにつかまっている、ミッドウェー海戦で撃沈された重巡洋艦三隈の生存者2名を救助した。この哨戒では、魚雷は一度も発射しなかった。6月14日、トラウトは26日間の行動を終えて真珠湾に帰投。艦長がローソン・P・ラメージ少佐（アナポリス1931年組）に代わった。
11月29日、トラウトは戦時哨戒の訓練のためミッドウェー島近海に向かった。担当海域では航空機に発見されないよう、日中は潜航して哨戒していた。12月7日朝、トラウトは真珠湾攻撃を伝える伝言を受け取った。その夜、トラウトは2隻の駆逐艦がミッドウェー島に砲弾を浴びせるのを観測した。この駆逐艦は潮と漣であり、 潮、漣とトラウトの間は約10マイルも離れていた。トラウトは全速力で潮と漣を追ったが、その前に2隻は去っていった。トラウトは戦闘機会がないまま哨戒を続けた。12月20日、トラウトは22日間の行動を終えて真珠湾に帰投した。
トラウトは1939年8月28日にメイン州キタリーのポーツマス海軍造船所で起工した。1940年5月21日にウォルター・B・ウッドソン夫人によって命名、進水し、11月15日に艦長フランク・W・フェノー・ジュニア少佐（アナポリス1925年組）の指揮下就役する。1941年7月2日、トラウトは僚艦トライトン (USS Triton, SS-201) とともにニューヨークに向けて試運転を行ったあと、パナマ運河とサンディエゴを経て太平洋に向かい、8月4日に真珠湾に到着。その後、トラウトは第62潜水群に編入された。
古典論ではランダウ反磁性が生じないことは以下のように説明できる。自由電子気体に磁場Bがかかると、それぞれの電子にはローレンツ力\boldsymbol{F} = -\frac{e}{c}\boldsymbol{v}\times\boldsymbol{B}がかかるが、磁場のローレンツ力による仕事はdW_{\rm m} = -\frac{e}{c}(\boldsymbol{v} \times \boldsymbol{B})\cdot d\boldsymbol{r} = q \boldsymbol{v} \cdot (\boldsymbol{v} \times \boldsymbol{B})dt = 0であり、磁場は仕事をしない。ここで\boldsymbol{v} = d\boldsymbol{r}/dtを用いた。 よって電子のエネルギーは磁場によって変化せず、E, N, Tにのみ依存する分布関数も変化しない。 よって古典論では誘導電流も反磁性も生じない。また、円運動する粒子のイメージから考えると以下のようになる。磁場に垂直な面を考えると、面内での複数の電子の円運動はストークスの定理のように磁場に垂直な面内で互いに打ち消しあい、最も外側の円運動だけが残る。更にその外側においても、金属の表面に衝突してしまう電子は円運動をすることができず、逆回転の運動が残り、円運動が打ち消される。よって円運動による磁場は残らず、反磁性も生じない。