持統天皇の治世は、天武天皇の政策を引き継ぎ、完成させるもので、飛鳥浄御原令の制定と藤原京の造営が大きな二本柱である。第一回神宮式年遷宮と新しい京の建設は天武天皇の念願であり、既に着手されていたとも、持統天皇が開始したとも言われる。未着手とする説では、その理由が民の労役負担を避けるためだったと説かれるので、後述の伊勢行幸ともども、天武の治世と微妙に異なる志向がある。また、官人層に武備・武芸を奨励して、天武天皇の政策を忠実に引き継いだ。墓記を提出させたのは、天武天皇の歴史編纂事業を引き継ぐものであった。民政においては、戸籍を作成した。庚寅の造籍という。687年7月には、685年より前の負債の利息を免除した。奴婢（ぬひ）身分の整頓を試み、百姓・奴婢に指定の色の衣服を着るよう命じた。こうした律令国家建設・整備政策と同時に持統天皇が腐心したのは、天武の権威を自らに移し借りることであったようである。天武天皇がカリスマ的権威を一身に体現し、個々の皇族・臣下の懐柔や支持を必要としなかったのとは異なっている。持統天皇は、柿本人麻呂に天皇を賛仰する歌を作らせた。人麻呂は官位こそ低かったものの、持統天皇から個人的庇護を受けたらしく、彼女が死ぬまで「宮廷詩人」として天皇とその力を讃える歌を作り続け、その後は地方官僚に転じた。天武との違いで特徴的なのは、頻繁な吉野行幸である。夫との思い出の地を訪れるというだけでなく、天武天皇の権威を意識させ、その権威を借りる意図があったのではないかと言われる。他に伊勢国に一度、紀伊国に一度の行幸を記録する。『万葉集』の記述から近江に一度の行幸も推定できる。692年3月3日の伊勢行幸では、農事の妨げになるという中納言・三輪高市麻呂のかん言を押し切った。この行幸には続く藤原京の造営に地方豪族層を協力させる意図が指摘される。持統天皇は、天武天皇が生前に皇后（持統）の病気平癒を祈願して造営を始めた大和国の薬師寺を完成させ、勅願寺とした。
天武天皇は、2年3ヶ月にわたり、皇族・臣下をたびたび列席させる一連の葬礼を経て葬られた。このとき皇太子が官人を率いるという形が見られ、草壁皇子を皇位継承者として印象付ける意図があったともされる。ところが、689年4月に草壁皇子が病気により他界したため、皇位継承の計画を変更しなければならなくなった。鸕野讃良は草壁皇子の子（つまり鸕野讃良の孫にあたる）軽皇子（後の文武天皇）に皇位継承を望むが、軽皇子は幼く（当時7歳）当面は皇太子に立てることもはばかられた。こうした理由から鸕野讃良は自ら天皇に即位することにした。その即位の前年に、前代から編纂事業が続いていた飛鳥浄御原令を制定、施行した。同年の12月8日には、双六を禁止している。持統天皇の即位の儀式の概略は、天武天皇の葬礼とともに、『日本書紀』にかなり具体的に記されている。ただし以前の儀式が詳しく記されていないので正確なところは不明だが、盾、矛を立てた例は前にもあり、天つ神の寿詞を読み上げることと、公卿が連なり遍く拝みたてまつり、手拍つというのは初見である。また前代にみられた群臣の協議・推戴はなかった。全体に古式を踏襲したものとみなす見解もあるが、新しい形式の登場に天皇の権威の上昇を見る学者が多い。即位の後、大赦を行い、天皇は大規模な人事交代を行い、高市皇子を太政大臣に、多治比島を右大臣に任命した。ついに一人の大臣も任命しなかった天武朝の皇親政治は、ここで修正されることになった。
2018年12月8日、NGT48のメンバーの山口真帆が、自宅玄関先で男2人に顔をつかまれるなどの暴行を受けた。2019年1月9日、NHKが新潟県警察などへの取材を基に報じた。また、犯人の男2人は暴行容疑で逮捕され、後日、不起訴になり釈放されたことも明らかになった。NHKの報道前日の8日に、山口が動画配信サービス「SHOWROOM」で泣きながら被害を告白していて、他のメンバーが犯人に対して、山口の自宅住所など個人情報を伝えていたことや、運営サイドが事件後1か月間にわたり対処や関与メンバーの処分をしてくれなかったと主張していた。その後もTwitterで「恋愛しないで真面目にアイドルやってたことが悪いの?ファンと繋がらなかったことが悪いの?」「多くのファンを裏切って繋がってる人が正しいの?なんでそれを許すか分からない」などとコメントを残していた。1月10日にNGT48劇場で行われた『「NGT48劇場三周年記念スペシャル」公演 〜石の上にも三年!私達はここからなのだ!〜』に山口も出演し、「この度はお騒がせして誠に申し訳ありません」などと謝罪、これに対しては、元NGT48キャプテンの北原里英がTwitterで謝罪の必要性に違和感を示した。同日にNGT48が属するAKB48グループのプロデューサー・秋元康もビジネス関連の授賞式で公の場に姿を現したが、本事件に関して言及しなかった。12日、「新潟開港150周年×NGT48劇場3周年記念イベント 〜いいよ今日は!思いっきり遊んじゃえ祭り〜」を予定通り開催。NGT48メンバーのうち、柏木由紀を除く全員が参加予定となっていたが、山口、10日の公演を体調不良のため途中退席した太野彩香、菅原りこの3名は、体調不良を理由に休演した。また同イベントにはNGT48劇場支配人の今村悦朗も姿を現さず、ファンのみならず世間からも事件の全容説明を求める声が上がっていた。5月5日にパシフィコ横浜で開かれたAKB48グループの握手会に事件発覚以降では初めて山口が参加した。本来はファンとの直接交流の場ではあるが、厳重な警備態勢のもと、山口については会話のみで「握手なし」という異例の握手会となった。4月21日のチームG「逆上がり」公演の千秋楽公演において、長谷川玲奈、菅原りこの2人がNGT48から卒業することを発表した。NGT48劇場で101日ぶりに出演した山口は、アンコールの後「（事務所社長に）会社を攻撃する加害者」と言われていたことを明かし、「今の私にNGT48のためにできることは、卒業しかありません」と卒業を発表した。5月18日には、NGT48劇場で『「太陽は何度でも」公演〜菅原りこ・長谷川玲奈・山口真帆 卒業公演〜』が開催された。卒業公演に出演したメンバーは、日下部愛菜・小熊倫実・角ゆりあ・高沢朋花・高橋七実・村雲颯香・渡邉歩咲の7人のみだった。