三菱地所が解体工事を強行した後も、日本建築学会は1968年3月25日に工事中止の上、保存について協議するよう三菱地所に申し入れ、文化財保護委員会には保護措置をとるよう要請。同学会は同年3月26日付にて解体工事を即時中止するよう三菱地所へ申し入れ書「三菱旧一号館解体作業の即時中止と保存法に関する申し入れ」を提出し学会の意向を伝え、同日付で灘尾弘吉文部大臣・稲田清助文化財保護委員会委員長あてに強制的に文化財指定を適用するよう要望書「三菱旧一号館解体作業の即時中止と保存に関する要望書」を提出。1968年4月2日には日本建築学会において三菱地所の文化財建造物課長も出席し協議が行われたものの、三菱地所が意向を変えることは無く、文化財保護委員会も所有者の承諾を得ない文化財指定の適応に難色を示したため、結果として一部の解体材を移築保存のため開東閣へ送り保管の上解体された。三菱地所がこの移築保存を実現させることは無く、1974年（昭和49年）にその殆どの保管部材が廃棄された。跡地には地下4階・地上15階建の「三菱商事ビルヂング」が1971年に竣工した。
「第1号館」の竣工を契機として、丸の内には軒高と意匠の整えられた煉瓦造の建物が続々と立ち並び、1900年代末期には一丁倫敦と称される街並みを形成するまでに至った。しかし、耐震性に難のある煉瓦建築は関東大震災で甚大な被害を被り、耐震性や土地の利用効率に優れる明治生命館などの合理的なアメリカ式オフィスビルへの建て替えも進み、第二次世界大戦の戦災でも煉瓦建築の多くが破壊された上、高度経済成長の1959年（昭和34年）にスタートした三菱地所による再開発事業「丸ノ内総合改造計画」により、赤煉瓦街は急速に姿を消していった。第二次世界大戦で日本が敗戦したのちの1946年（昭和21年）4月には東寄別館を占領軍が接収し、1956年（昭和31年）2月解かれるまで隣接するもと丸ノ内八重洲ビルヂングにして八重洲ホテルの従業員宿舎として供された。1960年代後半になると、「東9号館」（当時の通称は三菱旧1号館）は一丁倫敦の面影を残す数少ない建物となっていた。特に同館は東京の近代的都市計画の出発点、初期の近代的事務所建築として歴史的価値があり、当初の形をよく保存した明治時代の洋風建築として文化的価値も高く、研究者の間では日本銀行本店、旧赤坂離宮（迎賓館）と並ぶ「明治の三大建築物」に挙げられていた。明治時代の優れた建築物などを文化財に指定することを要望する旨、日本建築学会が1960年（昭和35年）10月24日付で文部大臣及び文化財保護委員会委員長代理宛てに提出した「明治建築の保存に関する建議書」においても、本建物は文中に例としてあげられていた。一方、同館を所有する三菱地所では、オフィス需要の急伸に伴い同館を含む区画の立て替えが検討されていた。そのため同社は上述の東西別館を1967年（昭和42年）4月それぞれ取り壊して用地にあてることとした。
丸の内の土地が三菱に払い下げられた後、三菱の建築部門として「丸ノ内建築所」が設けられ（設けられた年月について『丸の内百年のあゆみ：三菱地所社史』によれば、明治23年9月ごろではないかとしながらも正確な年月は不明だとしている）、後の丸ノ内八重洲ビルヂングが建つ敷地に事務所を構えた。そうして1892年（明治25年）1月に着工、約2年半後の1894年（明治27年）6月30日に竣工し、同日付で三菱が麹町区区長宛に「家屋新築落成届」を提出した。なお、竣工年月日については、1894年（明治27年）12月31日とする文献（1968年5月の建築雑誌など）もある。1906年（明治39年）3月には隣接の敷地に煉瓦造の人力車置場が建てられ、後に「東9号館西寄別館」となった。さらに1910年（明治43年）8月には鉄骨煉瓦造の三菱本社食堂が建てられ、これは後に「東9号館東寄別館」となった。
1888年（明治21年）5月14日、大隊区司令部条例（明治21年勅令第29号）によって秋田大隊区が設けられ、陸軍管区表（明治21年勅令第32号）により秋田県全域が管轄区域に定められた。第2師管第4旅管に属した。1896年（明治29年）4月1日、秋田大隊区は連隊区司令部条例（明治29年勅令第56号）によって連隊区に改組され、旅管が廃止となり第8師管に属した。1903年（明治36年）2月14日、改正された「陸軍管区表」（明治36年勅令第13号）が公布となり、再び旅管が採用され連隊区は第8師管第16旅管に属した。日本陸軍の内地19個師団体制に対応するため陸軍管区表が改正（明治40年9月17日軍令陸第3号）となり、1907年（明治40年）10月1日、管轄区域の大幅な変更が実施された。1925年（大正14年）4月6日、日本陸軍の第三次軍備整理に伴い陸軍管区表が改正（大正14年軍令陸第2号）され、同年5月1日、旅管は廃され管轄区域は再び秋田県全域となった。この区域が終戦まで続くが、1940年（昭和15年）8月1日、秋田連隊区は北部軍管区弘前師管に属することとなった。ただし、北部軍管区を管轄とする北部軍司令部が設置される同年12月2日まで、弘前師管は東部軍管区に属した。1944年（昭和19年）3月25日、弘前師管は東部軍管区に所属を変更した。1945年2月11日、弘前師管は新設の東北軍管区に所属が変更された。同年には作戦と軍政の分離が進められ、軍管区・師管区に司令部が設けられたのに伴い、同年3月24日、連隊区の同域に地区司令部が設けられた。地区司令部の司令官以下要員は連隊区司令部人員の兼任である。同年4月1日、弘前師管は弘前師管区と改称された。