西暦2201年、遂行中の宇宙間戦争に必要なエネルギー源となるガミラシウムとイスカンダリウム獲得のため、ガミラスおよびイスカンダルへマゼラン方面軍を派遣。ガミラスでガミラシウムを採掘していたところ、故郷に一目別れを告げに来たガミラス総統デスラーが率いるガミラス残存艦隊と遭遇する。母星を侵されて憤激したデスラーの命により両艦隊は交戦状態に突入し、この戦闘で暗黒星団帝国側は作業船団と護衛艦隊が壊滅する大損害を受けた。この戦火の影響でガミラスが爆発して消滅してしまい、引力のバランスが崩れたイスカンダルは漂流を始めてしまう。イスカンダル女王スターシャ救出のためにイスカンダルを追うガミラス艦隊を、デーダー率いる帝国第一艦隊が捕捉。圧倒的な戦力で報復攻撃を加え、デスラーに「もはやこれまでか」と言わしめるほどに追い詰めたが、救援に駆けつけたヤマトによって艦隊は全滅する。唯一残ったデーダー座乗の艦隊旗艦プレアデスも、ヤマトの波動砲によって失われた。第一艦隊が敗北したことを知ったマゼラン方面軍総司令メルダーズは、自動惑星ゴルバによる報復攻撃でヤマトとガミラス艦隊を殲滅しようと目論む。デスラー砲すら通用しないゴルバの戦闘力は圧倒的で、ガミラス艦隊とヤマトに事実上の勝利を収めた。しかし、自艦をゴルバに特攻させて自らの命と引き換えにスターシャを救おうとするデスラーの行動を見かねた彼女が暗黒星団帝国にイスカンダリウム採掘を許可したため、両軍は戦闘を停止。ゴルバはイスカンダルへの降下を開始したが、スターシャがイスカンダルを自爆させたためにゴルバは星もろとも消滅し、当初の目的であるガミラシウムやイスカンダリウムの採掘は失敗に終わった。しかし、グレートエンペラーはメルダーズに地球侵略を示唆していた。
過去の地球の軍事組織（現実の世界の各国軍隊）で使用されていた尉官等から構成される、階級制度と同じものを採用している。暗黒星団帝国軍人の制服（サイボーグ化された身体）は、『新たなる旅立ち』では肌の色と同じで全裸のような外観であるが、『永遠に』では基本的に黒色に変更されている。また、両作とも階級に関係なく黒色のマントを羽織っている。『永遠に』では、ヤマトを味方のゴルバ型浮遊要塞ごと撃破しようと目論むなど、任務遂行のためにはいかなる犠牲もいとわない冷酷な面が見受けられる。艦艇や兵器の機体色は濃紺色とオレンジ。光線兵器の色は、『新たなる旅立ち』では緑がかった黄色。『永遠に』では、ピンク色だったゴルバ型浮遊要塞を除き、橙色に統一されている。暗黒星団帝国の艦隊は、地球側から「黒色艦隊」と呼ばれていた。
暗黒星団帝国人は頭部のみが生体で、首から下がサイボーグ化されている。これは、高度な機械文明により脳以外を機械で補うようになったためである。しかし、その弊害として肉体的に退化したことで種としての生命力が衰え、生命体としては末期的な状況に陥っている。なお、そのような事態になった詳しい経緯は語られていない。男性の肌は『新たなる旅立ち』では灰色であるが、『永遠に』ではガミラス人より幾分濃く暗青い灰色に変更されている。強膜（いわゆる白目と呼ばれている部分）は青色（スカルダートのみ赤色）で、眉毛は生えていない。また、頭髪を生やしている人物は少ない。唇の厚く顎が角ばった顔立ちが多数見られ、メルダーズやアルフォンのような細面は少数である。女性はサーダしか登場しない。サーダの容姿は地球人と同じだが、性差なのか異民族出身なのか、あるいはスカルダートがヤマト乗組員たちを騙すために行ったのと同じように変装していたのかは不明。
暗黒星団帝国の本星。地球から40万光年、大マゼラン星雲から約57万光年の距離にある二重銀河のうち、白色銀河の中にある惑星。200年後（2402年）の地球に偽装し、惑星の外観はもとより、スフィンクスや万里の長城などの古代遺跡からクラシック音楽などの古代芸術まで忠実に再現していた。しかし、新波動砲によるグロデーズ艦隊の爆発をきっかけとした誘爆で偽装が剥がれ、正体を現す。それは、中心核を球状の骨組が取り巻くといった、肋骨に囲われた心臓のような姿に赤い光が脈打つ、堅牢な装甲を持ったグロテスクな人工天体だった。真田志郎によれば、デザリアム星を構成する超金属は「新波動砲をもっても決定的なダメージを与えられない」とのことであり、惑星の中心核からパイプを介してエネルギーが供給され、中心核内部に水晶都市が骨組の南北の両極に出入り口がそれぞれ存在する。収納式の大型砲と、要塞化された浮遊隕石などの防衛兵器が無数に配備されているため、撃破はおろか接近すら容易ではない。水晶都市はガミラス帝国の天井都市のような大型ミサイルとなっており、極地の出入り口から敵が侵入した場合はこれで迎撃する。指令室にはスカルダートと側近のサーダ以外の幹部や兵士は見られず、サーシャが内部で起爆装置の破壊工作に動いた際にはスカルダートが指令室を離れ、自ら彼女を探し回っていた。
1996年にCAタジェレスの監督に就任して指導者としての道を歩み始めた。1997年にはタジェレス監督を退任してCAインデペンディエンテ監督に就任したが、結果はついてこず、同年末にはタジェレスの監督に復帰した。1997-98シーズンにはタジェレスをプリメーラB・ナシオナル（2部）優勝に導き、プリメーラ・ディビシオン（1部）昇格を果たした。1999年にはコパCONMEBOLで優勝し、クラブにはじめて主要タイトルをもたらした。ブエノスアイレスとサンタフェ以外に本拠地を置くアルゼンチンのクラブが国外大会で優勝するのは史上初めてのことであった。2000年にはCAコロンの監督に就任したが、すぐにタジェレス監督に復帰した。2002年にはプリメーラB・ナシオナルのキルメスAC監督に就任し、2003年にはAAアルヘンティノス・ジュニアーズ監督に就任した。プリメーラ・ディビシオン昇格プレーオフでキルメスACに敗れたが、アルヘンティノスを昇格間際まで押し上げた。2004年には選手時代にチームメイトであったガレカに誘われ、スペインのエルチェCFのアシスタントコーチに就任した。2005年には古巣アメリカ・デ・カリを率い、2006年にはインデペンディエンテ・サンタフェを指揮した。同年には4度目のタジェレス監督に就任したが、チームはプリメーラB・ナシオナルでもがき続けた。2007年10月にはペルーのウニベルシタリオ・デポルテス監督に就任し、2008年7月にはアペルトゥーラのタイトルを獲得した。2009年にアルゼンチンに復帰し、選手時代の古巣CAベレス・サルスフィエルド監督に就任した。就任直後の2009クラウスーラでは19戦で11勝7分1敗の好成績を収め、CAウラカンやCAラヌースを抑えてリーグ優勝を果たした。2009アペルトゥーラでは5位、2010クラウスーラでは9位と安定した成績を残し、2010アペルトゥーラでは13勝4分2敗で勝ち点43を稼いでエストゥディアンテス・デ・ラ・プラタに次ぐ2位に入った。2010アペルトゥーラでは12勝3分4敗で2度目のリーグ優勝を果たした。