日米双方の艦隊が接近すると、海戦が発生する。双方、射程の長い艦から順に攻撃を行っていく（攻撃は同社の激闘!ソロモン海戦史シリーズと異なり、同じ射程を持つ艦全てが同時に処理される）が、海戦が何ターン行われるかは、双方の作戦と艦隊速度に依存する（端的に言えば、速度の勝る艦隊の方に、決戦か離脱かの選択権がある）。戦略級シミュレーションゲームのため、海戦は簡易化されており、大雑把な作戦と攻撃目標を指示するだけで、後は自動的に進行する。なお、砲撃の命中率などは、開戦当初は日本軍が有利に設定されているが、年々米軍が有利になっていく。
陸上兵力は特定根拠地において、各月第1ターンに鉄を消費して動員することが可能である。 陸上兵力には、攻撃部隊、守備部隊のほか、治安維持のための治安部隊(太平洋戦記2のみ)、連合軍専用の民兵部隊、根拠地の各種パラメータを強化する工兵部隊、使用済み航空機を未使用状態に整備するための整備部隊がある。太平洋戦記2にはこれらと独立した戦車も登場する。
戦闘機、爆撃機、艦上戦闘機、艦上爆撃機、艦上攻撃機、水上機等が有る。運用には燃料と弾薬が必要（ただし空母での運用時は、弾薬は消費されない）。主なパラメータとしては、武装、防御力、機動力、航続距離、燃料消費、整備ポイントなど。急降下爆撃性能を持つ機体は爆撃の命中率が非常に高く設定されている。一度使用した航空機は、陸上部隊である「整備部隊」が「整備力」を発揮する事により、未使用状態に回復する。その際のコストが整備ポイントである。新型機や大型機は整備の手間がかかるため、比較的大きな値が設定されている。新型機の開発時に、特定の機種を優先的に開発することや、試作段階で開発を中止することなどが可能であり、史実では敗戦に間に合わなかった新型機を配備する事も可能となっている。
航空母艦、戦艦、駆逐艦、商船などがある。運用には燃料と弾薬が必要となる。各艦船のパラメータとしては、耐久力（ゲーム上ではステップと表記）、備砲、速力、航空機搭載機数などが有る。これら艦船の内から、大型艦20隻（内、空母は6隻）、小型艦20隻以内、商船20隻以内、合計60隻以内で艦隊を組む事ができる。艦船はドックの有る根拠地で、鉄を消費して建造が可能。大型艦の建造には数十ヶ月の期間と大量の鉄が要求される。また、ドックでは艦船を任意に解体して鉄に戻す事が可能。
各工場は各月第1、第6ターンのみ、根拠地の鉄を消費して、増築する事が可能である。鉄鉱石から鉄を生産する製鉄所、ボーキサイトからアルミニウムを生産する精錬所、原油から燃料を生産する精油所、鉄から弾薬を生産する弾薬工場のほか、鉄から艦船を建造するドック、鉄とアルミニウムから航空機を生産する航空機工場がある。各種の工場の規模は、その拠点によってまちまちである。また、期間はかかるものの、鉄を消費して増設することも可能となっている（増設のみであり、新規に建造することはできない）。
続いて『インデペンデンス・デイ』を製作していたローランド・エメリッヒに新たに監督としてオファーがかかる。エメリッヒは何度か断ったが、全く新しいゴジラのデザインを見せられたことでこれを受諾した。エメリッヒは「第1作の製作者たちが現代のSFX技術を持っていたらどのような映画になったか」を考えて作ったという。第1作でのゴジラが電車をくわえるシーンや調査隊が足跡を調査するシーン、1984年版でのビルにあいた穴からスーパーXがゴジラに攻撃するシーンなどをオマージュとして映画に挿入している。またエメリッヒは、日本のゴジラをアメリカ流に作り替えることも考えており、リサーチの結果、初代ゴジラが爬虫類をベースにしていたことを知り、あらゆる爬虫類を研究し、最終的にトカゲ（イグアナ）をモチーフにしたゴジラを考えたという。また、1954年のゴジラも本作のゴジラも、製作当時の獣脚類型肉食恐竜の最新の知見に適った形態をしている。エメリッヒ版ゴジラのデザインはパトリック・タトプロスによるものであり、「中途半端にアレンジを加えるとオリジナルに失礼だと考え、全く新しいものにした」という。このゴジラを見た東宝のゴジラ製作者たちは、あまりにも違いすぎるデザインにショックを受けたが、それでもハリウッドの作るゴジラ映画を見てみたいと考えて許可した。その際、東宝側の注文によって、2列だったエメリッヒ版ゴジラの背びれは日本のものと同じ3列に修正された（この他にも、劇中で人を食す描写を避ける等の諸注文がトライスター側に出された）。ちなみに米版ゴジラの顎はディズニー映画『ジャングル・ブック』に登場するトラのキャラクター、シア・カーンをベースにしたという。なお、デザイン担当の「タトプロス」は主人公の名前に引用された。コンセプトアートの段階ではトライスター版もレジェンダリー版も互いに良く似たものが存在した。本作のゴジラは主に3DCGやアニマトロニクスで撮影されているが、一部では日本のゴジラと同様、着ぐるみも使用されている。ただ、エメリッヒ自身は着ぐるみによる撮影手法には否定的であった。2004年にNHK BS2で放送された特番のインタビューでも、「時代遅れの技術を使うことに抵抗を感じる」と発言している。2014年のレジェンダリー・ピクチャーズによる新作製作時に『エンパイア』誌が行ったインタビュー企画で、エメリッヒは「当初、隕石が地球を襲う映画の企画をしていたが、東宝から突然本作のオファーが来た」「着ぐるみの怪獣映画には全く興味などなかったが、強い押しがあったので仕方なく受けた」「だが今度は『ゴジラが人を食べない』といった細かいルールを提示されたので嫌気がさした」「なので、いい加減な脚本とデザインを提出し『これなら、あちらから断るだろう』と思っていたらゴーサインが出てしまい、仕方なく撮影に入った」「もし、当初の予定通りに隕石の映画を撮っていれば『アルマゲドン』や『ディープインパクト』を上回る作品が撮れたはずだ」等といった旨の相当な本作に対する不満を述べている。