小田ら運動の中核となった少数の幹部は、違法な手段を使いアメリカ軍の「良心的脱走兵」の逃走支援も行い、これらの活動はベ平連とは別に「JATEC（Japan Technical Committee to Aid Anti War GIs―反戦脱走米兵援助日本技術委員会）」として運営された。1967年に、アメリカ海軍の航空母艦「イントレピッド」からの4人の脱走兵を、横浜港でソ連極東部のウラジオストックへ向かうソ連の定期船に違法に乗船させ、モスクワ経由でスウェーデンに入国させたことから、「イントレピッド4人の会」が結成され、さらに脱走を援助する組織として「JATEC」が武藤一羊により命名された。栗原幸夫が指令役になり、吉岡忍、山口文憲、阿奈井文彦などの若手メンバーが実動役を請け負った。だが、1968年にアメリカの情報機関の工作員であるラッシュ・ジョンソンが脱走兵のふりをして侵入したことにより（“ジョンソン”が本名だったのか、また所属機関は今も不明）、同行して釧路に飛んだ脱走兵のジェラルド・メイヤーズが、11月5日に日本の警察に逮捕され、アメリカ海軍に引き渡された。メイヤーズの乗ったレンタカーを運転していた山口文憲は、モデルガンを所持していてメイヤーズにそれを見せていたため、翌1969年2月15日、銃刀法違反で逮捕された。また、メイヤーズが隠れていた高橋武智宅も家宅捜索をうけた。JATECが正規の出国手続きを踏まない形での国外逃亡の幇助などの、非合法活動も含むあらゆる手段を用いて日本から脱走兵を秘密裏に出国させたものの、その数は数人に留まり、多くの脱走兵はアメリカ軍へ帰還した。1968年2月15日の「山口逮捕、高橋宅捜査」以降、JATECは方針を変更し、高橋武智をリーダーとして「脱走兵の国内潜行援助」、パンフレット『脱走兵通信』『ジャテック通信』による宣伝活動、そして在日アメリカ軍基地周辺での「反戦GI運動支援」活動を行った。
発足直後の1965年4月に東京の駐日アメリカ合衆国大使館へのデモ行進を行ったのを始まりに、アメリカ政府やアメリカ軍、日本政府を断罪する多くのデモを行ったほか、同年11月には作家の開高健の発案でアメリカの有力紙の1つである『ニューヨーク・タイムズ』への全面での「反戦広告」を掲載、1967年4月には画家の岡本太郎・筆の「殺すな」と大書された文字の下に英文のメッセージをデザインした反戦広告を『ワシントン・ポスト』に掲載するなど、その活動規模も運営資金も既成の「市民運動」の枠を大きく超えたものであった。そのため既存の左翼・市民運動勢力から「文化人のベトナム遊び」と批判を受けるが、一方で少年雑誌の『ボーイズライフ』に大きく取り上げられたり、「穏健な反戦運動だから」と既存の左翼・市民運動とは敵対する立場の警察官や自衛官からの寄付もあり、反戦運動に関心を持つ人々の裾野を広げることとなった。また、アメリカ国内の反戦運動団体とも連帯を形作った。
山梨県は公共文化施設が未整備で「文化不毛の地」と評されていたが、戦後には郷土研究が活発化し、1961年（昭和36年）には山梨郷土研究会が発足した。山梨郷土研究会や諸研究会の活動により、山梨県の郷土研究や史跡や文化財の保存活動、自治体史の編纂事業などが行われ、県立博物館創設の気運が生まれた。県立博物館創設の運動が具体化したのは1962年（昭和37年）で、老朽化していた旧睦沢小学校校舎の移転問題において起こった。旧睦沢小学校は現在の甲斐市亀沢に所在し、公民館として利用されていた。山梨郷土研究会や『山梨日日新聞社』関係者の間ではこの睦沢小学校を適切な地に移築して県立博物館として活用する案を提示し、解体された睦沢小学校の資料は甲府市善光寺の甲斐善光寺境内に保管された。翌1963年（昭和38年）には山梨県教育委員会において県立博物館条例が整備されるが、この案は実現せずに睦沢小学校は甲府市武田の武田神社境内に移築され、藤村記念館として甲府市の郷土資料館となった。なお、現在は藤村記念館は甲府市北口へ移築されている。1968年（昭和43年）・1970年（昭和45年）には、山梨郷土研究会から山梨県に対して、新築移転した山梨県立図書館の休館を活用して県立博物館とする構想が陳情されたが、これも実現せずに終わった。山梨県立図書館では功刀亀内が蒐集した「甲州文庫」をはじめとする郷土資料が保管されており、1978年に山梨県立美術館が開館し近代以前の美術資料を収集し、1982年（昭和57年）には山梨県立考古博物館が開館し考古資料収集の中心施設となり、これらが郷土研究の中心施設となっていた。1990年（平成2年）には『山梨県史』編さん事業が開始され、再び県立博物館の構想が生まれた。同博物館の基本構想は、東八代郡御坂町（現・笛吹市御坂町）出身の歴史学者で館長に就任が予定されていた網野善彦が中心となって作られている。網野は開館前年に死去したが同博物館のコンセプトは“網野史観”を反映したものとなっており、山梨に暮らした民衆が、どのように自然と付き合ってきたかという部分に主眼が置かれている。収蔵品は山梨県に関する山梨県立博物館では山梨県に関する資料を購入、寄贈、寄託の手段で幅広く収蔵しており、収蔵されている資料の点数は19万点に及ぶ。資料は歴史、民俗、考古、美術工芸、自然、画像映像、その他の分類で整理されており、特に山梨県立図書館から移管された「甲州文庫」「頼生文庫」「若尾資料」は全体で3万点を数えている。歴史・美術工芸・民俗など分野別や低湿度収蔵庫など大小8つの収蔵庫がある。また、地域博物館として、収蔵品や企画展に関するツアーや年中行事に関するイベント、民俗芸能の実演などを実施している。開館初年度の企画展「やまなしの道祖神祭り」は山梨県内各地域の協力を得て多様な道祖神祭りの飾り物を展示し、道祖神祭りや芸能保存会への参加者が増加し、演目の復活など祭りの活性化にも繋がり、博物館活動が地域の民俗へも関わる試みとなった。2012年（平成24年）には文化庁から公開承認施設に認定される。