追加シナリオに関連するボスキャラクター2種類と、上述の「魂の暗域」に登場する専用のモンスターが追加された。本編の敵に関しては一部のモンスターの名称変更（変更要素を参照）のほか、特定のボスの護衛キャラクター2種類が追加されている。
今回は会話を記録するメモが「プレイヤーノート」と呼ばれるコマンドの1つになっており、メモ以外にもストーリーを進めるだけで状況を記録するようになっている。ゲームボーイ版オリジナルのストーリー（メインイベント）とリメイクの追加ストーリー（サブイベント）で、別々に記載される。
能力値を高めたり属性を強化させる「マギ」は1種類あたりの数が減少した。その分新たな秘宝が登場し、一部の秘宝は入手場所が変更されている。今回は秘宝を手に入れると、秘宝に対応した「マップアビリティ」が使える。これは移動中に起こせるアクションで、画面右上に「(Y) Ability」と表示されている時にYボタンを押すことで、フィールドやダンジョンに埋まったアイテムを発掘したり、敵とのバトルを回避しやすくしたりと、様々な補助効果を持つ。使用回数に制限があり、回復には宿屋などで宿泊が必要。これに伴いゲームボーイ版で無制限に使えた秘宝によるテレポートも、マップアビリティの使用回数が残っていないと使えなくなった。また、下画面に表示されているミニマップの機能を拡張するための秘宝も存在する。
基本的なゲームシステムやストーリー、マップデータはゲームボーイ版に準じているが、マップの3D化を始めグラフィックは全面的に描き直され、キャラクターデザインも小林元がほぼ新規にデザインを描き起こしている。戦闘シーンも3D化されたため、『ロマンシング サガ -ミンストレルソング-』のように味方も戦闘画面に表示されるようになった。なお、ゲームボーイ版のタイトルは『Sa・Ga2 秘宝伝説』のように「SaGa」の部分に中黒が入り、副題が「秘宝伝説」。それに対し、本作では『ロマンシング サ・ガ』のリメイク版『ロマンシング サガ -ミンストレルソング-』と同様「サガ」に中黒は入らない。また「秘宝伝説」は表題の一部となり、新たに副題として「GODDESS OF DESTINY」が追加される形となった。
福島県道293号江持谷田川停車場線（ふくしまけんどう293ごう えもちやたがわていしゃじょうせん）は、福島県須賀川市から郡山市のJR水郡線谷田川駅に至る一般県道である。
京都府京都市出身。特技は水泳、短距離走。スイミングスクールでは、バタフライの動きがどうしてもやりたくないと小2ながらに思い、進級テストの際あえてへたくそに泳ぎ、進級を拒み続けた為、バタフライは現在も泳げない。平泳ぎは早い。趣味は神社・仏閣めぐり、星型のグッズ集め、都市伝説。放課後プリンセス4期生として加入。はんなり委員長として活躍。放課後プリンセス卒業後、他アイドルグループを経て、2015年6月14日にベルサール秋葉原で開かれたWCS主催の「AKIBA POP JAM」より「超アニメ系微少女ユニット kiraLyraHeart」の「りんりん」としてデビュー。
新潟県出身。1902年（明治35年）陸軍士官学校第14期卒業。1928年（昭和3年）3月に陸軍砲兵大佐・独立山砲兵第1連隊長、1929年（昭和4年）12月に野戦重砲兵第4連隊長を経て、1932年（昭和7年）8月8日に陸軍少将に進級と同時に待命、同月30日に予備役に編入した。
群馬県出身。群馬県立渋川高等学校を経て、1975年東北大学法学部卒業、行政管理庁入庁。1979年コーネル大学大学院政治学研究科修士課程修了。行政管理庁行政監察局企画担当課長補佐、総務庁行政管理局行政手続法制定準備室長等を歴任し、行政手続法策定などにあたった。1999年総務庁長官官房会計課長。2001年総務省中国四国管区行政評価局長。2002年総務省郵政企画管理局次長。2003年消防庁審議官。2004年総務省大臣官房審議官。2005年総務省関東管区行政評価局長。2007年総務省行政評価局長。2009年財団法人簡易保険加入者協会監事。2015年中央大学総合政策学部教授。
関 有一（せき ゆういち、1951年 - ）は、日本の総務官僚。消防庁審議官や、総務省大臣官房審議官、総務省行政評価局長等を経て、中央大学総合政策学部教授。
桃太郎公園は、桜も多く近隣では有名な観光地ともなっていて、みやげ物屋も数件ある。この地方でよく食される「木の芽田楽」（豆腐の味噌田楽）や、菜飯を味わうこともできる。また、かつては公園の一角に、ヤクニホンザルを放し飼いにした野猿公苑（日本モンキーセンター栗栖研究所の関連施設）があり、午後3時になるとサルが園の外に出てきて、車の上に乗る姿が見られた（野猿公苑はすでに閉園）。神社背後には緑深い山が間近に迫り、すぐ前を木曽川が洗う。このあたりの木曽川は風光明媚であり、志賀重昂によって「日本ライン」と名付けられた。また、川縁には有名なチャートの露頭がある。道路からチャートの露頭までの広い河原は芝生の広場（栗栖園地）となっており、デーキャンプが行われるなど、市民や近隣住民の憩いの場として親しまれている。桃太郎神社に参拝したことがない近隣住民でも、この栗栖園地で遊んだことがある、という人は多い。神社の裏手は、栗栖遊歩道のセセラギ遊歩道入口になっている。この遊歩道は、岐阜県可児市の鳩吹山遊歩道に合流している。