エーゲ海では夏に季節風であるエテジアンが吹く。このエテジアンは北北西からエジプト、アフリカ大陸に向けて吹いているが、これは乾ききっており、さらにその強さは激しく現在でも島から島を繋ぐ小さな蒸気船は向かい風になると減速を余儀なくされる。6月から9月までエーゲ海、近東を襲うこのエテジアンは秋になると勢力を弱め、湿り気の多い西風がこれらの地域を包み込むことになる。リース・カーペンターによれば、前13世紀最後の数十年、このエテジアンが長期にわたったために地中海は干ばつ期のピークであったと仮説されている。これによれば、ヒッタイトやミケーネ、海の民らは人的な被害ではなく干ばつの影響を受けたとされており、特にミケーネは乾燥が著しくこの数十年に渡る干ばつは致命的な影響を受けた。そのため、農民らは暴動を起し宮殿を襲い、物資の略奪を行ったために物資が集積されていた宮殿が焼壊したが、物資が集積されていない都市部は略奪の対象にならなかった。そのため、ミケーネ文明の遺跡では宮殿は焼けた跡があるが、都市部は打ち捨てられたためにその跡が見られないとしている。ブローデルはこの仮説について見捨てられた地帯とミケーネ人らが避難先に選んだ地帯の地理的分布を見る限りでは説得力があるとしており、ミケーネ人らはエテジアンが猛威を振るったと思われるギリシャ北部、アッティカの地域から西風の恩恵を受けるロドス島やキプロス島へ移住しているとする。
エジプト第19王朝末期、エジプトにはマシュワシュ族 (en) 、リブ族と呼ばれる人々が定住しつつあった。彼らはリビュアのキュレネからの移民であったが、エジプトの支配の及ばない地域であった。当時の王、ラムセス2世はこれを警戒して砦を築くなどの対策を採っていたが、マシュワシュ族などは商業活動でエジプトと関係していたため、さほど問題は生じておらず、ラムセス2世がヒッタイトと激戦を交わしたカデシュの戦いの際には傭兵として後に『海の民』と呼ばれるシェルデン人 (en) も参加している。しかし、メルエンプタハ王が即位すると風向きが変わった。「イスラエル石碑」によるとエジプトで大規模な飢饉が発生したことで、メルエンプタハはリビュア人らを追い返し、1万人近くを切り殺した。さらに非リビュア系のシェルデン、シェケレシュ、トゥレシュ (en) 、ルッキ (en) らの部族も侵入を開始したが、これら移民らの侵入は第20王朝のラムセス3世によってからくも撃退された。しかし、ラムセス3世の治世、さらなる問題が生じた。この問題はリビュアなどの西側ではなくヒッタイト、シリアなど東側から生じた。これがいわゆる「海の民」による襲撃であった。ただし、この「海の民」は一部の部族のことではなく、少数民族が集まって部族連合を組織したものであったが、彼らはラムセス3世によって撃退された。これらについてロバート・モアコット (en) によれば全ての部族がリビュアと関係しており、さらに少人数であったとしており、これらはリビュアに雇われた傭兵隊であった可能性を指摘している。さらに「海の民」らの侵入はエジプトに留まらず、シリアの諸都市、ウガリット、エマルも破壊された。そしてこの中でもパレスチナには「海の民」の一派であるペリシテ人らが定住することになった。旧約聖書上では否定的に描かれた彼らは実際には優れた都市建築者で鉄器の製造者であり、移住先に先進的物質文化が持ち込まれた。
それまでもドラッグ使用の噂はあったが、確定したのは1987年のスプリングトレーニング中にコカインの陽性反応が出た時だった。彼は4月1日から6月5日まで出場停止を防ぐためにリハビリセンターに入り、復帰した時点でシーズンは3分の1が過ぎていたが、15勝7敗・防御率3.21を記録する。1988年は18勝9敗・防御率3.19の成績で、チームの2年ぶりの地区優勝に貢献。ドジャースとのリーグチャンピオンシップシリーズ第1戦で、同年59イニング連続無失点のメジャー記録を達成したオーレル・ハーシュハイザーと対決。7回を4安打10奪三振2失点に抑えたが、リードされたまま降板。勝てば王手をかける第4戦も8回まで2失点だったが、9回にマイク・ソーシアに痛恨の同点2ランを打たれ、延長12回の末敗れた。結局第7戦でハーシュハイザーに完封負けを喫し、3勝4敗で敗退。1989年は肩の故障に悩まされて17試合の登板に留まり、9勝4敗・防御率2.89と自身最低の成績に終わり、連続15勝以上も5年でストップした。1990年は19勝7敗・防御率3.83・223奪三振を記録して復活を果たし、奪三振はチームメイトのデビッド・コーンの233に次ぐリーグ2位だった。1991年は13勝7敗・防御率3.60をマークするが、8月22日の登板を最後に故障で戦線離脱。同年2人のチームメイトとレイプの疑いで起訴されるが、報道はされなかった。1992年は防御率3.67ながら、援護に恵まれず10勝13敗。自身初の負け越しで、敗戦数が二桁に達したのも初めてであった。1993年も防御率3.45ながら12勝15敗、9月は故障により登板なしに終わる。チームは103敗を喫し新球団フロリダ・マーリンズよりも下の地区最下位に沈んだ。同年シーズン中、スポーツ・イラストレイテッド誌はグッデンの特集記事を執筆し、題は「From Phenom to Phantom（怪物から幻へ）」であった。1994年は開幕投手を務め勝利投手となるが、シカゴ・カブスの1番打者タフィ・ローズに初回から3打席連続本塁打を浴びるなど7失点を喫した。その後不振でマイナーに降格する。3勝4敗・防御率6.31の段階で、コカインの陽性反応が出て60日間の出場停止処分を受ける。その期間中再び陽性反応が出たため、翌1995年も全試合出場停止となった。2度目の処分を受けた翌日、妻モニカはグッデンが寝室で弾のこもった銃を頭に向けている姿を発見している。10月24日にフリーエージェントとなった。