逮捕から56日後、初公判が開かれ、Aは無実を主張した。初公判から約2ヶ月後に行われた第二回公判では、Bに対する尋問が行われた。Bの心情を考慮し、法廷には衝立が設置され、Aと傍聴席からはBの姿が見えないようになっていた。Bは検察側の尋問に対し、「被害当時、右後ろにA、左後ろに女性が立っていたため、Aが犯人だろうと思った。Aの手を掴んだが、振り払われた」と証言した。続いて、弁護側の尋問が行われ、Cが「手を掴んだ時何が見えたか」と質問すると、Bは「白いトレーナーと手が見えた。時計は確認しなかった」と証言した。外国人風男性に関する質問に対しては、「外国人風男性では手が届かないと思う」と証言し、その理由について「再現実験でも届かなかったと聞いた」と証言した。この再現実験のことは裁判が始まるまで弁護側に知らされていなかった。再現実験では、Bと外国人風男性の距離が何cmだったかなどの詳細が全く反映されておらず、また、A役の警察官と女性役の警察官の腰に拳銃と警棒が付けられたままになっており、外国人風男性役の警察官の手が入る隙間がなくなっていた。にもかかわらず、捜査主任の警部補がBに「これじゃ届かないよね」と言った。第二回公判終了直後、Aは200万円の保釈金を納め保釈された。Aの拘束は105日に及んだ。この間、Aの長男はAと離れていたためAに懐かなくなっていた。CはAの証言通りに再現ビデオを作成していると、肩が密着した状態のAと女性の腰辺りに隙間ができていたこと、その隙間を外国人風男性の手が通り、Bの下半身に十分届くこと、その際に男性の手がAの腰や太腿などに触れることが判明した。この再現ビデオの上映は、事件から約8ヶ月後の公判で行われた。この公判では警部補の証人尋問も行われ、Cはまず「Aが逮捕時に着用していた腕時計のことを覚えているか」と質問した。Aが着用していた腕時計は斬新なデザインでかなり大きいスポーツタイプのもので、一目見れば記憶に残りそうなものだったが、警部補は「覚えていない」の一点張りだった。更に、Cは警部補が取り調べ室に入っていきなりAに「お前、下着の中にまで手を入れたんだってな！」と怒鳴ったことに言及し、警部補にAの手の付着物を調べたか否かを問い詰めた（Aが痴漢行為をしていた場合、Aの手からBが着用していた衣服の繊維が検出される）。すると警部補は「忘れていました」と証言し、傍聴席から怒号が飛んだ。裁判は事件から1年が過ぎようとしていた頃、裁判が結審した。判決は約1ヶ月半後に言い渡されることとなった。判決公判の12日前、Dは神に「私の命と引き換えにAの無実を証明して」と願い、リストカットし自殺を試みたが、傷は浅く、命に別状はなかった。判決公判当日、Dは体調を考慮し、自宅でAの吉報を待った。が、Aは執行猶予付きの有罪判決を受けた。Aは「控訴したら職場復帰のめども立たず、裁判費用もかかる。これ以上家族に迷惑をかけるわけにはいかない」として判決を受け入れることを決め、Dに報告した。しかしDは「絶対に無罪を勝ち取らなきゃ私が許さない」と言い、Aは迷わずに東京高等裁判所に控訴した。
美輪明宏が自著でこれについて説明している。美輪明宏は、霊能者が「霊を見る」と表現することについて、以下のように説明した。「霊を見る」というのはどこで見るかというと、大脳のスクリーンで見ているとし、ちょうど、夢というのが肉眼を用いずともはっきりと映像として見えるのと同じことだという。霊能者によって見え方というのは様々であり、異なっているという。霊能者といわれる人たちの多くは、目を半眼にする（少しだけ開ける）かあるいは閉じると、大脳のスクリーンに映った映像を読むことができるという。そうしておいて、そのスクリーンに映った映像で判断をするという。これが顕著にわかる人を我々は霊能者と言っているのだという。夢を見ることができるということは、すでに霊的な能力を持っているということだ、と美輪明宏は説明した。ただし、それを信じることができるかできないかが問題なのだという。ほとんどの人は「夢だから信じない」と思ってしまったり、「変な夢を見たわ、正夢かしら」と思う程度でそれを忘れてしまう。そのようにして人々は自分たちの能力を見過ごしてしまっている、というのである。目の開きかたについて、美輪明宏は次のように説明した。仏像を例に挙げ、目を開いているのはお不動様か仁王様くらいのもので、「他の仏様というのはほとんど半眼で、目を半分だけ開いています」と示唆した。（ちなみに霊視しようという時には半眼にするのがコツだということについては、美輪明宏はテレビ番組『オーラの泉』に出演中にも述べたことがある。半眼にして25メートルほど先をぼーっと見ているとやがてそうした映像が見えてくる、といった主旨のことを視聴者に対して説明した。）霊視に様々な見え方があるということに関しては、まるで実際の肉眼で見えるような見え方をする霊能者もいれば、まぼろし（イリュージョン）として見える霊能者もいるという。美輪明宏自身の見え方に関して言えば、ちょど普通の人が《思い出す能力》を持っているように、思い出している時と同じような見え方がしているという。例えば読者がパソコンの画面を見ている時、肉眼は画面を見ているわけだが、それでも「小学校の時の音楽の授業風景を思い出しましょう」と言われれば、肉眼ではなく脳のスクリーンに音楽の授業を受けていた時の教室の風景がはっきりと映る。「霊を見る」とはそのようなものだという。また、霊の声が聞こえるという場合でも、その声というのは（肉の）耳で聴くのではないという。上の音楽の授業の例で言えば、授業を思い出せば、学校の好きだった先生、嫌いだった先生や、子供たちの声がしっかりと聞こえることに言及しつつ、「 それはどこで聴いているのでしょう 」、と美輪は読者に熟考を促している。さらに、こうした説明をしても理解できない読者の理解を促すため、美輪明宏は霊を見ることを《タイムスリップする》とも表現していると述べた。ちょうど《思い出す》行為が時間を超えて大脳のスクリーン上に現出させるように、霊の世界には時間と空間が無いから、霊を見ることはいわば時空を超えるということであり、霊を見ることというのは、肉体はここにあるけれども瞬時にして時間を超えて思い出すということ、と説明した。なお、実は人間にはそういう能力があるというのに、人間というのはそうした能力のことは何となくボンヤリと、ただいい加減に思っているだけだし、科学者もしっかりと研究しようとも思っていない、と美輪明宏は指摘した。