平成の不況と共に犯罪も増加した。刑法犯の認知件数は1996年（平成8年）から毎年戦後最多を更新し2002年（平成14年）には285万件に達した。しかしその後は減少し、2016年（平成28年）には100万件を下回って戦後最小を更新した。防犯カメラの普及を背景に、街頭犯罪に多かった少年犯罪の減少が全体の引き下げにつながった。感應寺38世・日裕（新井貫厚）は更生保護の活動に携わり、2008年（平成20年）から4年間、江戸川区保護司会の11代会長を務めた。また同活動の功績が認められ平成22年（2010年）法務大臣表彰、2015年（平成27年）秋に叙勲を受章し国から勲章「瑞宝双光章」を授かった。
1990年（平成2年）末、東京株式市場が大暴落した。バブル崩壊に始まった平成の不況は、金融危機に陥った1998年（平成10年）頃から慢性的なデフレとなり、失われた20年と称されるほど長期化した。景気停滞は所得格差を生み、高齢者の貧富の差も広がった。また非正規雇用やワーキングプアと共に増えた晩婚化は、非婚化現象に発展し少子化を進めた。さらに親子の別居や核家族化、離婚の増加が単身の高齢者を増やし、日本の特色ともいえた「共同体」意識の希薄化が、家族の絆を弱めた。こうした中、仏教界では墓を子に継承しない人や継承できない人が現れ、金をかけない埋葬や1世代だけを埋葬する新たな墓の形が生まれた。永代供養墓（合祀墓）・納骨堂・散骨・樹木葬などである。感應寺においても2013年（平成25年）に永代供養墓として納骨堂を建立した。
1935年（昭和10年）感應寺36世・日隆が新たに本堂を建立、広さは正面6間、奥行5間半、檜造りの本堂を完成させた。その後、日隆は千葉県茂原の本山・藻原寺79世となった。1965年 - 1975年（昭和40年代）までは、本堂の東に三十番神堂があり、講中の参拝で賑ったが、老朽化で取り壊され、御神体は本堂内陣に収められた。1971年（昭和46年）37世・日進が檀信徒の助力を得て、翌年迎える日蓮生誕750年の慶讃記念事業として庫裡書院を建立した。日進は完成の翌年、逝去した。
1945年（昭和20年）第2次世界大戦に敗れGHQの占領下に置かれた日本は、GHQ指導のもと民主化政策を進め、1947年（昭和22年）から農地改革を行った。当時の寺院は広大な農地を所有し、多数の小作人に耕作権を与え小作料を得ることで寺院経営を行っていたが、改革により農地は小作人に払い下げられ多くの寺院が窮乏した。しかし、その後の高度経済成長、バブル景気の波に乗り、都市部やその近郊など多くの寺院は檀家数を増やして経営を立て直した。感應寺もまた農地改革により広大な寺領を失ったが、その後、檀家数は増加した。感應寺が所在する江戸川区の人口は1950年（昭和25年）の約21万人から2010年（平成22年）には約68万人と大幅に増えている。
日中戦争中、軍需物資の生産資源に乏しく廃品回収運動でも補えなくなった大日本帝国は、1941年（昭和16年）金属類回収令を実施。工場・会社はもとより一般家庭や寺院などからも強制的に金属類を回収した。同年12月になると太平洋戦争が勃発、兵器の生産資源の需要が増す中、寺院では多くの梵鐘や仏具が戦時供出された。感應寺の梵鐘は37世・日進の尽力で1943年（昭和18年）金属類特別回収物件譲渡免除となり、江戸川区内で戦時供出を免れた唯一の梵鐘として現存している。金属類回収令には、国宝や重要な美術品、寺宝など申請により例外的に供出免除となるケースがあった。
1937年（昭和12年）日中戦争が勃発。翌年、国家総動員法を制定した大日本帝国は、宗教団体についても国の統制下に置く事を決めた。そして1939年（昭和14年）宗教団体を国が保護・監督する宗教団体法を公布し翌年施行した（戦後廃止）。同法により1941年（昭和16年）宗教法人となった日蓮宗は、本山と末寺の関係を解消して総本山・大本山以外の寺格を同等にした。各本山の力を失くし、総本山・身延山久遠寺を中心に全寺院を統制しつつ、大日本帝国に協力しやすい体制を整えた。本末解消により多くの本山が経済的に苦しむ一方で、末寺は上納金が無くなり所有地を増やした。特に檀家を多く抱えた末寺は経済的に豊かになった。のちに各寺院では旧本山・旧末寺と呼びならわし、感應寺も旧本山・中山法華経寺の旧末寺とした。
島を取り囲む美しいサンゴ礁を最も楽しめるスキューバダイビングは、現在でも依然として島の観光の目玉の一つである。これらのサンゴ礁は、主に島の大陸に向いた側に発達し、島の自然地理によって外洋（カリブ海）から保護されている。1996年に、メキシコの政府はコスメルリーフ国立海洋公園を設立し、公園の境界内の海洋生物に触れたり、採取したりするのを禁止した。コスメルの観光業に占めるサンゴ礁の重要性にもかかわらず、1990年代に水深の深い桟橋が建設され、珊瑚礁に被害を与えた。現在では、この桟橋にはカリブ海のクルーズ船が定期的に就航している。島ではさまざまなマリンスポーツが楽しめ、カイトサーフィンやパラセーリングも楽しめる。島には300を超えるホテルがあり、観光客向けの土産物屋やレストランも数多い。工業製品や食品はすべて本土から船で運ばれ、水は島にある3つの淡水化施設から供給される。2005年にはハリケーン・エミリーとハリケーン・ウィルマの二つのハリケーンがコスメルを直撃し、島に甚大な被害をもたらした。ハリケーン・エミリーは7月に上陸したが、最も被害が大きかったのは10月に直撃したハリケーン・ウィルマであった。これにより、特に浅い海の珊瑚礁や水中生物に被害がもたらされた。