ただ、最古の記録が1551年というアラキ等の前提は覆されており、1514年の『雲玉和歌抄』に詳しい言及があることが今では判明しているため、ポルトガル人伝来説は困難となっている。しかし坪内逍遥や新村出の「南蛮人」伝来説をより広義的にとり、例えばアジアに到達したイスラーム教徒を媒介したものだとすれば、可能性は十分にあり、このことは既に南方熊楠に指摘されている。そして井上章一も、逍遥の、南蛮時代に伝来したという説は成り立たないが、ユーラシア大陸全体に、前史時代に広まった説話の一つと見るのが妥当だろうとしている。中央ユーラシアの叙事詩『アルパムス』と類似しており、これがユリシーズ伝説との中間的な媒体だった可能性も指摘されている。甲賀三郎伝説も、これと同じようなアジア経由をたどったのでは大林太良などは推察する。また源義経には義経=ジンギスカン説が知られ、モンゴルとの関連ということで百合若と共通するが、松村一男などは、義経を主人公とする『御曹司島渡』と『百合若大臣』の類似を指摘する。
坪内との同調派には、新村出にくわえて、アメリカ出身のE・L・ヒッバード（同志社女子大学教授）があり、また日系人のジェームス・T・アラキがいる。アラキは、たとえ初演が1551年にあったとしても、1550年頃にザビエル神父の通訳ファン・フェルナンデズによって伝承されたことは可能であると力説した。これに賛意を唱えた論文も、井本英一（2004年）や松村一男（2016年）が新たに出ている。賛同派は、『ユリシーズ』と『百合若』のみが、いくつものモチーフが段ごとに連綿として一致する酷似性があると強調する。
この説は、いちどかつて津田左右吉、柳田國男、高野辰之、和辻哲郎などによって鋭く排撃されている。反対派の主旨としては、まず、この型の説話の分布は広く、偶然の一致として懐疑的に見る意見がある。また、百合若の初演が1551年であるが、ポルトガル人による種子島銃の伝来からわずか7年あまりでそれほど完成度の高い翻案を不可能と目す論旨がある（金関丈夫など）。
坪内逍遙は、古代ギリシアの詩人・ホメロスが謡った叙事詩「オデュッセイア」がなんらかの形で（あるいは室町時代にポルトガル人の手により）日本に伝えられ、それが翻案されたものこそが「百合若大臣」であるとの説を、1906年（明治39年）に『早稲田文学』誌上「百合若伝説の本源」で発表した。オデュッセイアのラテン語での発音「ユリシス」と「百合」が似ていることや、主人公・オデュッセウスの留守を守る妻・ペネローペーが織物をして時間を稼ぎ、求婚者をかわす逸話が、百合若の妻の行いを思わせるからである。坪内は、伝来の道筋として「いずれの国人」にもたらされたか不明であると断りながら、あるいは「堺や山口を経」たものとの思いつきに達したとする。これは室町時代にやってきた「南蛮人」・「ポルトガル人宣教師」による伝播説だと捉えられている。南蛮伝播により強く執着したのは、この坪内よりも新村出（『南蛮記』、1915年）であった。
大分市上野丘には、大臣塚古墳という前方後円墳が築造されている。副葬品に甲冑が含まれていたため、百合若大臣説話にちなみ名づけられた。また別府市上人には、討たれた別府兄弟が、葬られる予定だったと伝承される鬼の窟屋古墳も存在する。
鷹の名は多く緑丸となっており、鷹王山・鷹明神などとして祀っている所も東北地方から沖縄県まで十数カ所あるという。そのうち福岡県玄界島の小鷹神社に祀られる伝説の物と称される硯も伝わっている。宮城県名取郡の旧千貫村（現・岩沼市）にも、百合若大臣のゆかりの竜谷山鷹硯寺、緑丸石がある。仙台藩の地誌にそれらの記述が見える。鷹硯寺は、百合若の夫人に硯を託され落ちて死んだ鷹を供養した寺だと、現地に伝わる。この寺には鷹硯も保存されているという。緑丸石は、鷹の緑丸が文を届けて命尽き、石と化したと伝わる。新潟県にも聖籠村の鷹尾観音寺の近隣の林に翠丸（みどりまる）が住みついていたという記述が『越後野志』に見え、「聖籠山観音堂二王堂建立之由緒」(1608年の写本)にも、この寺は鷹の菩提を弔うために建立されたしている。
星野が「おげんさん」（お母さん役）に扮し、東京・渋谷にあるおげんさんの家にて、おげんさんとその家族に扮した出演者による生演奏やセッションをしたり、音楽について語る番組。進行は「おげんさんちのねずみ」（声：宮野真守）。ゆるい雰囲気のなか、緻密に練られた演奏や星野の音楽偏愛トークが聞けることで好評を博し、ギャラクシー賞5月度月間賞と第55回ギャラクシー賞奨励賞を受賞した。また、ネット上でも大きな反響を呼んだ。特にTwitter上では放送時間中に大いに盛り上がり、通常人気番組でもツイート数は1万程度である深夜の時間帯にも関わらず、「#おげんさん」のタグ付きのツイートが30万を超えた。1時間の放送時間にもかかわらず、NHK紅白歌合戦に匹敵する反響があったことから、第2弾の放送実現に繋がったというエピソードが第2弾放送の冒頭に星野により語られた。第2弾も大きな反響を呼び、生放送開始後、Twitterトレンドの世界1位を獲得した。第3弾は当初、2019年10月14日の22時から23時30分までの放送予定であったが、放送直前に日本に上陸した台風による特別編成の影響で、放送時間を30分後ろ倒しすることが放送前日に発表された。