ニュルンベルク裁判は戦犯個人、および組織の罪を裁いたものであったが、ドイツという国家自体については裁かれなかった。カール・ヤスパースはナチス・ドイツをナチ党による不法な簒奪によって生成された「不法国家」であるとみなし、ニュルンベルク裁判の被告となったナチス指導者達は政治犯ではなく、刑事犯罪者であると規定した。この考え方はドイツにおけるニュルンベルク裁判観の主流となり、裁判によって個人やナチス組織の罪が追及されたものの、ドイツ国民やドイツ国の「集団的罪」についてはこれを否定する傾向がある。裁判中にドイツ国民に対して行われた調査によると、裁判で裁かれる各種犯罪について裁判で初めて知ったものの割合は当初三分の二であったが、終盤には80％を超えた。裁判開始の時点では70％の回答者が被告全員が有罪であると考えていたが、判決後には56％に減少している。また50％が判決は正当であると回答している。また西側占領地域で判決後に行われた国際軍事裁判の形式についての調査では、70％が正しいと回答していたが、4年後には70％が正しくないと回答している。これは少数のナチ党指導者を裁いたニュルンベルク裁判に対し、軍や企業と言った身近な組織が裁かれる印象をあたえたニュルンベルク継続裁判への反発があるとみられている。またドイツの政界では戦犯裁判は「戦勝国による不当な裁き」との認識で語られておりこのため戦後のナチス犯罪の追及において「戦争犯罪」と「ナチス犯罪」を同一視することが障害となったため1960年代には両者は明確に区別されるようになった。
この裁判によって採用された原則は、1947年の国際連合総会で「ニュルンベルク諸原則」として採択された（決議95-1）。この原則で平和に対する罪、人道に対する罪、戦争犯罪が国際的な罪であると初めて明文化されたほか、国際犯罪においては国内法の範囲は無関係であるとし、単に命令を実行した者であったとしても、責任は免れ得ないことなどが定められた。また検察官は最終論告においてユダヤ人の虐殺を「ジェノサイド」と形容し、「ジェノサイド罪」を国際法上の犯罪として位置づけようとする動きの中で、この言葉は法的実効性を持つものと考えられるようになった。
ダッハウ裁判やマルメディ裁判では，自白を引き出すための拷問は一般的であったという。弁護団から、ドイツ被告が公正な裁判を受けておらず、取調べで拷問が行なわれているという告発を受け取った、ダッハウ戦争犯罪裁判調査委員会委員アメリカ・ペンシルベニア州判事ヴァン・ローデンは，その調査報告書の冒頭で「ドイツのダッハウでの合衆国法廷のアメリカ人尋問官は，自白を手に入れるために次のような方法を使った。すなわち、殴打と野蛮な足蹴。歯を折ること、顎を砕くこと。偽裁判。独房への拘禁。僧侶の振りをすること。食糧配給の減額制。無罪の約束」と記している。
ニュルンベルク裁判での証拠採用基準は近代の裁判基準から大きく逸脱しており、通常の裁判でならば、信頼できないものとして却下されるような伝聞証言が、犯罪を立証する証拠として採用され、弁護団には裁判資料を閲覧する機会、検事側の証人に対する反対尋問の機会がほとんど与えられず、その一方で弁護側の証人は様々な脅迫を受けて、出廷を妨げられたり、退廷させられたりしたからだという。もっと問題であるのは、被告が逮捕・尋問の過程で脅迫ひいては拷問を受け、自白を迫られていることである。アウシュヴィッツ収容所の所長であったヘスも、尋問の際にリンチを受けている。ドイツ近代史の専門家であり、ミュンヘン大学教授でもあったヴェルナー・マーザー博士 (Werner Maser) はこの問題点について、こう述べている。弁護団の証人や援助者は、ときどき頃合いをみて、また執拗に脅迫を受けたりして、強引に出廷させてもらえなかったり、あるいは退廷させられたりすることも珍しくなく、さらには自分たちの声明を検閲されたり、押収されたりしたうえで、検察側の証人にされたりした。1946年5月になってやっと刑務所入りをしたオズワルド・ポール (Oswald Pohl) は、アメリカおよびイギリス役人から尋問を受ける際、椅子に縛りつけられ、意識を失うほど殴りつけられ、足を踏まれ、ついにワルター・フンク (Walther Funk) の有罪を証明するものを文書で出すと約束するまで虐待された。これに反して検察側によって証人やその文書の申し立てを適切とみなされた時はいつも、それらは法廷では自由に使用することができた。しかし検察側の一定の証人たちが、ややもすると、弁護団側の反対尋問にもちこたえられそうもないと判断されると、検察側や法廷は単なる宣誓供述書で満足するのだった。この種の宣誓供述書は、裁判の経過中に、数千通も書かれたのであった。」 — ヴェルナー・マーザー著、西義之 訳『ニュルンベルク裁判』
9月4日、サンティーは朝鮮半島に進駐する連合軍部隊の護衛で出港したが、途中で台湾に収容されている連合軍捕虜を収容する命令を受けた。サンティーは護衛駆逐艦クレッチマー (USS Kretchmer, DE-329) とともに台湾に向かい、155名のイギリス軍および英印軍士官を収容した。これらの捕虜は1942年のマレー作戦の際に捕虜となった者で、サンティーでは彼らに医療品を施し、格納庫を居住区として提供した。翌日には、護衛駆逐艦フィンチ (USS Finch, DE-328) とブリスター (USS Brister, DE-327) に救助された322名の軍人を収容した。この日に収容されたのは、バターン半島とコレヒドール島で降伏したアメリカ陸軍および海軍の士官30名および、ジャワ島で捕らえられたオランダ陸軍士官とオランダ商船の船員10名であった。9月9日、サンティーはマニラ湾に到着して477名の救助された捕虜を降ろした。5日後、サンティーはマニラ湾を出発して中城湾に向かい、9月19日に到着したが、翌日には和歌浦湾に向けて出港した。9月22日に到着したサンティーは、和歌山に進駐するアメリカ軍の空中援護を行った。10月3日に和歌浦湾を出港したサンティーは沖縄への道中、10月6日に、護衛空母に転換後のサンティーの初代艦長だったサンプル少将を乗せて行方不明になったPBM マリナーの捜索を行った。10月20日、サンティーは中城湾に到着した。10月23日、サンティーはマジック・カーペット作戦で375名の復員兵を乗せて真珠湾に向かい、11月4日に到着して復員兵を降ろした。翌日、サンティーは18名の海兵隊員を乗せて西海岸に向かった。11月11日にサンディエゴに到着したサンティーは、マジック・カーペット作戦の任務を続行して11月26日に出港してグアムとの間を往復した。1946年2月27日、サンティーはサンディエゴを出港し、パナマ運河経由で3月25日にボストンに到着した。10月21日に予備役となり、1955年6月12日に CVHE-29 （護衛ヘリ空母）へ艦種変更され、1959年3月1日に除籍された。その後、サンティーは1959年12月5日にマスター・メタルズ社にスクラップとして売却された。サンティーは第二次世界大戦の戦功で9個の従軍星章を受章した。