アリオとしては13店舗目、長野県内では2店舗目となる店舗だった。1978年4月20日にイトーヨーカドー松本店として開業したのが始まりである。イトーヨーカドー南松本店が開店するのに合わせ、1996年に「エスパ」業態へと転換した。2011年12月16日にアリオ松本としてリニューアル。リニューアル当時はイトーヨーカドーと専門店27店の構成であり、西武百貨店やロフト、アカチャンホンポ、Comme ca ism等が入居した。しかし、業績不振の為、2017年秋をめどにアリオ松本を閉店する方針が同年2月28日に報じられ、同年7月下旬に2017年9月10日をもって閉店することが正式発表された。「アリオ」業態が閉店するのは初の事例となる。2017年1月には西武百貨店が全面撤退、同時期にComme ca ism、スタジオマリオ、八天堂、こすげ亭なども相次いで閉店し、イトーヨーカドーの直営売場の拡大をしたものの、空き店舗が目立つ状態になっていた。また、同年9月21日に開業するイオンモール松本の影響も報じられている。予定通り2017年9月10日をもって通算39年間の歴史に幕を下ろしたが、7階レストラン街は営業を継続する他、入居テナントのうちロフトやアカチャンホンポは同年10月6日に市内のイトーヨーカドー南松本店に移転する。閉店後は、同ビルを所有するアルピコ交通が観光商業施設アルピコプラザとして改装し再オープンする予定で、テナント誘致と開業後の運営は、商業施設コンサルティングのやまきに委託した。
職員数は約1000人。その事業の性質および設立の経緯から、NEDOには多数の出向者が在籍する。機構固有の職員は全体の3分の1程度であり、およそ半数は企業からの、残りは官庁（主に経済産業省）からの出向者である。現状では研究開発マネジメントの多くを、実際に開発現場にいた企業からの出向者に頼っている。しかし出向者は定期的に入れ替わるため、ノウハウが機構に蓄積されにくいという欠点も指摘される。
京都議定書に基づく第一約束期間における日本の削減目標を達成するため、政府からの委託を受け、クリーン開発メカニズム（CDM）、共同実施（JI)、排出量取引（ET）等京都メカニズムを活用したクレジット取得事業を平成18年度より実施している。
産業競争力の強化を通じた経済活性化に貢献するための基盤となる「ナショナルプロジェクト」、市場創出・経済活性化を促進する「実用化開発」、将来の新たな産業の核となる「技術シーズの発展」の各段階の技術開発を推進する。特に重点的に推進されている分野は医療技術（生命科学）、情報技術、ナノテクノロジー。つまり前項のエネルギー・環境技術と合わせて、政府の科学技術政策における『重点4分野』を強く推進しており、同政策の執行機関のひとつとして機能していることがうかがえる。本事業に関しても実際の研究開発は産学の研究機関に委託していることから、NEDOは公的研究資金（競争的資金など）の配分機関としての側面を持っていると言える。同様の研究資金配分機関としては科学技術振興機構（JST）や宇宙航空研究開発機構（JAXA）などが知られるが、推進する研究開発ステージ（基礎研究→応用研究→技術開発）や研究分野を分けることで基本的には事業の重複を避けている（連携して推進する場合もある）。
エネルギー・環境技術の開発を推進することで、普及を支援している。具体的には太陽光発電や風力発電、バイオマス利用技術、省エネルギー技術、燃料電池、各種リサイクル技術、地球温暖化対策技術などの開発・普及が挙げられる。なおNEDO自体は研究開発施設を保有しておらず、実際の技術開発は産学の研究機関に委託して行われている。
新津市（現：新潟市秋葉区）の新津車両所（新津車両製作所→現：総合車両製作所新津事業所）の敷地脇に所在した、新潟鉄道病院・新津分室が1982年（昭和57年）3月を以って廃止されたのに際して、「新津市の鉄道文化を後世に伝承したい」として日本国有鉄道の職員OBや鉄道ファンなどが中心となって、鉄道を題材とした資料館の設置を求める動きが起こり、当時の新津市が旧分室の施設を活用して1983年（昭和58年）10月14日（鉄道記念日）、「新津市鉄道資料館」として開館した。開館に際し、国鉄OBを中心とした市民から数多くの資料提供を受け、当時の資料数は静態保存車両を含め約2,000点を有した。その後国鉄が1966年（昭和41年）7月、新潟市下所島（現：中央区幸西）から新津市 西金沢（新津市 東町を経て、現：新潟市秋葉区新津東町）へ移転した国鉄職員の訓練施設「新潟鉄道学園」が、1987年（昭和62年）の国鉄分割民営化に際して廃止・閉鎖された後、1997年（平成9年）4月に新津市が施設を買収し公民館施設へ転用されることになり、施設名称を「新津地域学園」とした。加えて鉄道資料館も旧施設の老朽化などから地域学園の別棟へ移転するに至り、1998年（平成10年）4月1日に開館した。この際に静態保存車両は東日本旅客鉄道（JR東日本）へ返却されたが、この移転時にも市民から数多くの資料提供を受けた。また、2005年（平成17年）3月21日に新津市が新潟市へ編入合併されたことに伴い、地域学園は「新潟市新津地域学園」に改称し、鉄道資料館も現名称に改称した。後述するリニューアル事業着手前の2012年（平成24年）時点において約8,600点の資料を所蔵していた。