西部戦線では、1921年にケマルの腹心イスメトが西部方面総司令官に任命されてアンカラ政府が攻勢に転じ、2度にわたってギリシャ軍を撃退したが、コンスタンティノス1世国王が自ら指揮を執って体制を立て直したギリシャ軍の逆襲によりアンカラ西部の要衝エスキシェヒルを奪われた。この非常事態に対し1921年夏、ケマルは議会から全軍の指揮権を付与されると、サカリヤ川の戦いでギリシャ軍を敗走させた。翌1922年9月9日、アンカラの大国民議会政府軍は西南アナトリアの拠点都市イズミルを奪還し、ギリシャ軍をアナトリアから駆逐した。
南部ではキリキアに駐留してその領有をねらうフランス軍との戦闘になった。1920年5月から1921年10月まで続いた戦争はトルコも勝利を収めることができなかったが、21年10月にアンカラ条約を結び、翌1922年からフランス軍はトルコの南に確保していたフランス委任統治領シリアへ撤退を始めた。
アンカラの大国民議会政府はロシアのソビエト政権と連絡をとり、1920年中にキャーズム・カラベキル将軍率いる東部方面軍がダシナク党のアルメニア軍を撃退、東部アナトリアを確保した。
オスマン帝国がムドロス休戦協定を結んで連合国に降伏して第一次世界大戦に敗北したとき、広大な帝国のうちアラブ地域は連合国によってほとんど占領されていたが、アナトリアの全域と東トラキア（ルメリアの一部）、北シリアのアレッポ、ジャズィーラ（現イラク北部）のモースルは依然としてオスマン軍の勢力下に残っていた。しかし、休戦協定が発効すると連合国は休戦協定の条文を盾に、戦時中の列強国同士の協定に従ってオスマン帝国の残存領土に進駐し、アナトリアはイギリス、フランス、イタリア、ギリシャによって各方面ごとに分割占領された。また、これに呼応してアナトリア半島内のアルメニア人やギリシャ人の中から独立運動に乗り出すものが現われ、オスマン帝国は残された領土の中核をなすトルコ人の居住地帯でさえほとんど細切れに分断されようとしていた。この状況に対しアナトリア各地でも分割に反対する抵抗運動が起こりつつあったが、帝国政府は王朝の保身に走って占領政策に迎合し、ムスタファ・ケマル准将を軍監察官としてアナトリアに派遣した。ところがケマルには反意があり、1919年5月5日にアナトリア黒海沿岸のサムスンに上陸すると、アナトリアに駐留する帝国軍や活動家を結集して「アナトリア・ルメリア権利擁護委員会」を起こした。同年末に召集された帝都イスタンブールにおける帝国議会も権利擁護委員会の影響下に入り、翌1920年1月28日、帝国領のうちトルコ人が多数を占める地域が不可分であることをうたう「国民誓約」を採択した。イギリスを中心とする連合国は3月16日にイスタンブールを占領し、アナトリア西南部エーゲ海沿岸を占領するギリシャ軍を抵抗運動の強い内陸に向かって進軍させるとともに、8月10日に帝国政府とセーヴル条約を結んだ。この条約ではトルコ国家に残されるのはアナトリア北部の3分の2に過ぎず、アナトリア東部にはアルメニア人の国家を建設することを認めた。旧ロシア帝国領のアルメニア（現アルメニア共和国領）ではダシナク党によるアルメニア第一共和国が建設されており、東部アナトリアには既にアルメニア軍が侵攻していた。これに対し抵抗運動の権利擁護委員会はイスタンブールから逃れてきた帝国議会の議員に権利擁護委員会の支部で選出された議員をあわせ、4月23日にアンカラで「大国民議会」を開いた。大国民議会はムスタファ・ケマルを議長に選出し、議長を指導者として独自の内閣と政府を持つ抵抗運動政権に発展する。
1917年、エリソンはアナポリスを卒業した士官候補生たちとともに、戦艦「ワイオミング」 (USS Wyoming, BB-32) および「カンザス」 (USS Kansas, BB-21) で巡航を行った。アメリカの第一次世界大戦参戦後の1918年2月14日には、ニューロンドンの駆潜艇基地に派遣され、次いでイングランドのプリマスに設置されるアメリカ海軍第27基地に駆潜艇隊を迎え入れる準備のためロンドンに渡った。エリソンは航空とは正反対に位置する対潜水艦部門でも、駆潜艇隊のための戦術を考案し、その功績により海軍十字章を受章した。1918年11月11日の大戦の休戦協定締結後も、エリソンはヨーロッパに残り、1919年3月から5月にかけては「ツェッペリン」を管理していた14名のクルーのトップにあった。アメリカへの帰国に際しては、ウィリアム・クランプ・アンド・サンズで建造されて竣工したばかりの駆逐艦「J・フレッド・タルボット」 (USS J. Fred Talbott, DD-156) の初代艦長を1919年6月から1920年7月までの間務め、1920年の残りの期間は「リトル」 (USS Little, DD-79) と「ブルックス」 (USS Brooks, DD-232) からなる部隊の指揮官を務めた。1921年1月10日、エリソンはハンプトン・ローズに設置された海軍航空基地司令となり、9カ月間務める。9月1日付で海軍省にアメリカ海軍航空局（航空局）が設置され、中佐に昇進していたエリソンは初代局長ウィリアム・A・モフェット少将（アナポリス1890年組）の下で事務計画部門のトップに10月21日付で就任する。1年後の1922年12月には航空局を離れて海軍使節団の航空部門担当としてブラジルに赴任し、ブラジル海軍の再編成の指導にあたった。一連の指導を終えて帰国後の1925年5月からは、再び航空局に勤務した。2カ月後の7月20日には第1水雷艇隊の司令となり、1926年6月には水上機母艦「ライト」 (USS Wright, AV-1) 副長となる。また、1926年6月23日には巡洋戦艦から航空母艦へ改装中の「レキシントン」 (USS Lexington, CV-2) に艤装委員として赴任し、就役時まで在艦していた。