開発者達が「日本で作成されたソフトウェアである」と言う意味を込めて和名にしたかったため、当時開発者の1人が暮らしていた東京都の地名「深大寺」（じんだいじ）から付けられた。
ネクスコ管轄の高速道路と直結している為、ネクスコ通行料金と第二みちのく通行料金を合併収受している。例えば仙台宮城IC流入でそのまま第二みちのく有料道路を利用する場合は、ネクスコ管轄の仙台宮城IC - 下田百石ICまでの通行料金と第二みちのく有料道路の通行料金を合わせて精算することになる。ネクスコの通行料金はETC・クレジットカード・現金の支払いになるが、下田本線料金所にはETCレーンがない為、ETC流入の場合は徴収員にETCカードを手渡しする必要がある。さらに第二みちのく有料道路通行料金が現金か回数券のみの支払いとなるので、合わせて出さなければならない。（ETCカード+現金など）この際ETC各種割引（深夜割引・休日割引など）はETC車載器の有無を確認後に徴収員が割引処理をする。通行券の場合は合算した金額で請求される。ネクスコ分と第二みちのく分の２枚の領収書（ETCの場合は利用証明書）が発行される。第二みちのく有料道路通行料金は上り線と同じ車種別の均一料金である。ETCレーンがない為にETC利用者は、ETCカードを抜き合わせて現金を用意して手渡しする必要がある為に非常に不便な料金所となっている。度々ETCバイクの利用者が料金所脇の駐車スペースで荷物を降ろしシートを外してカードを抜き、精算後また荷物を載せている姿を見ることがある。ETCカードを抜き取る手間を省く為には、１つ手前隣の下田百石ICのETCレーンで一旦流出し、再度下田百石ICの一般レーンから通行券を取り第二みちのくへ行く方法がある。下田百石ICのETCレーンでネクスコ利用分の通行料金が一旦精算となる。下田百石IC以北が第二みちのく有料道路になるので、下田本線料金所へは通行券を持って行き、第二みちのく有料道路通行料金を現金もしくは回数券で支払いをする形となりETCカードは必要がない（管轄の境界かつ通しで通行した場合の割引は設定されていないため、一時流出による割り増し料金は発生しない）。
第二みちのく有料道路通行料金のみの支払い。普通車210円、軽自動車150円、大型車320円、特大車730円、中型車210円の車種別均一料金となっている。支払いは現金か回数券のみ。ネクスコ管轄の有料道路・高速道路へ直接接続されているので、ネクスコ区間のICで流出する場合はその出口で当該区間の通行料金の支払いが必要になる。このため、入口で一般レーンを通行した場合は通行券が手渡される。接続先のネクスコ区間の支払いをETCで行う場合は、当料金所のETCレーンで一旦停止して徴収員に当有料道路区間の通行料金を現金もしくは回数券で支払えば、ETC設置のインターチェンジではETCレーンを使用できる。ETCの各種割引（深夜割引・休日割引など）については、ETC車載器の有無を確認後に徴収員がその処理をする。八戸西SIC供用開始以前は上り線のETCレーンが未整備であったため、八戸北IC以南の出口においてETCで支払いをする場合は、通行券とともにETCカードを徴収員に手渡しする必要があった。また、通勤割引などのETCの各種割引を適用するためには、下田本線料金所隣の下田百石ICの一般レーンで一旦流出し再度下田百石ICのETCレーンから再流入する方法があった。この乗り直しによる料金の割り増しは生じなかったが、係員に問い合わせるドライバーもおり、標識などでもこの点について注意を促していた。
1921年2月7日、エドゥアルト・メーリケ指揮 シャルロッテンブルク・ドイツ・オペラハウス管弦楽団によって、第4楽章の前半（低弦が歓喜の主題を奏で始める直前まで）と中間部をカットした演奏がパーロフォン・レーベルにレコード録音された。これが第4楽章の世界初録音となったが、すぐには発売されなかった。1923年、独ポリドール社がブルーノ・ザイドラー＝ヴィンクラー指揮 新交響楽団（実態はベルリン国立歌劇場管弦楽団の団員を中心に組織された臨時の演奏団体）ほかによる全楽章のレコードを録音（世界初の全楽章録音だが、第2楽章にカットがある。また、録音の制約上シンバルが抜けている）し、同年12月に発売された。このレコードは日本にも紹介され、好評を博した。1923年10-11月に収録されたアルバート・コーツ指揮、交響楽団ほかによる英語歌唱のレコードが1924年5月、この曲の「初演100周年」として英HMV社より発売。（ただし、アルト歌手が再テイクの際に交代しているため、二人のアルト歌手の名がクレジットされている）。1924年1-2月、フリーダー・ワイスマンがベルリン・ブリュトナー管弦楽団を指揮して第1-3楽章を録音。これにエドゥアルト・メーリケが1921年に収録した第4楽章の抜粋・短縮版を組み合わせたアルバムが同年7月に英パーロフォン社から発売された。しかし、全てのラベルにワイスマンとブリュトナー管弦楽団の名がクレジットされていたため、誰も第4楽章が全くの別テイクであることを疑わなかった。（1997年にカナダのレコード研究家が真相を発表）。1925年1月、エドゥアルト・メーリケがベルリン国立歌劇場管弦楽団を指揮して第4楽章の抜粋・短縮版を収録。これにワイスマンが1924年に録音した第1-3楽章を組み合わせたアルバムが独パーロフォン社から発売された。なお、これらの録音は全て『合唱が原語（ドイツ語）ではない』あるいは『曲の一部がカットされている』のどちらかに該当し、この曲本来の姿での録音ではなかった。完全な録音は、この後1928年のオスカー・フリートとベルリン国立歌劇場管弦楽団によるものが世界で初めてである。