2016年8月1日にマット・ムーアとのトレードで、マイケル・サントス、ルシウス・フォックスとともにタンパベイ・レイズへ移籍した。レイズ移籍後はショートで起用され、21試合で打率.276・1本塁打・7打点と、やや復調した。ショートの守備は18試合で無失策・DRS0と無難にこなした。ジャイアンツとのトータルでは、91試合で打率.258・5本塁打・28打点・8盗塁という成績だった。2017年当初の予定では、アキレス腱が回復して開幕からショートとして起用される計画だった。しかし、リハビリの過程で合併症を発症したため、60日間の故障者リストに入った。2017年はある程度のリハビリで再びメジャーでプレーできる手はずだったが、合併症が生じたため、計画が破綻してしまった。ダフィーとタンパベイ・レイズ機構はリハビリの過程は挫折として表れたが、それでも楽観的に考えると2017年にメジャーの試合に出場することは不可能ではないと踏んでいた。合併症は続き、2017年は結局試合には出ることができなかった。2017年の終わりに指導を受けたり、レイズが提携する冬季リーグで2018年に機運を作ることもしていた。2017年オフに正三塁手のエバン・ロンゴリアがトレードされて以来、正三塁手の一番の候補となり、開幕戦のロースターにも入った。2018年4月17日に、右膝の腱の張りで10日間の故障者リストに入ったが、まもなく戻ってきた。6月13日のトロント・ブルージェイズ戦でサヨナラヒットとなる安打を放ち、チームを1-0の勝利に導いた。9月20日の時点で、2011年のレイズ以来となるレギュラーとしての初年度で打率.300でシーズンを終える機会が回ってきた。しかしその後は、13打数1安打に終わり、レギュラーシーズンでは、2015年以来となるシーズン通してレギュラーで、132試合に出場し、打率.294・出塁率.361・長打率.366・4本塁打を残したため、カムバック賞の候補にも挙がった。
2012年のMLBドラフト18巡目（全体568位）でサンフランシスコ・ジャイアンツから指名され、プロ入り。この年は傘下のA-級セイラムカイザー・ボルケーノズで47試合に出場し、打率.247・1本塁打・16打点・10盗塁だった。2013年はA級オーガスタ・グリーンジャケッツで78試合に出場し、打率.307・4本塁打・43打点・22盗塁だった。7月22日にA+級サンノゼ・ジャイアンツへ昇格。ここでは26試合に出場し、打率.292・5本塁打・14打点・3盗塁だった。2014年はAA級リッチモンド・フライングスクウォーレルズで97試合に出場し、打率.332・3本塁打・62打点・20盗塁と活躍。8月1日にジャイアンツとメジャー契約を結んだ。同日のニューヨーク・メッツ戦でメジャーデビュー。2番・二塁で先発起用され、4打数1安打1打点だった。9月からは主に代打として起用され、この年は34試合に出場し、8打点、打率.267だった。レギュラーシーズン終了後にプレーオフのロースター入りを果たし、チャンピオンリングを獲得。このシーズンは「リラックスするため」にバットのグリップエンドにザ・シンプソンズのダフマンを飾り付けていた。2015年は初めて開幕をメジャーで迎えた。当初は控えだったが、5月下旬より新加入のケイシー・マギーから三塁のレギュラーの座を奪取し、そのままレギュラーに定着した。主に3番打者を務め、149試合に出場して打率.295・12本塁打・77打点・169安打を記録した。勝利貢献度を示すfWARは新人ではクリス・ブライアントに次ぐ4.9を記録し、ナ・リーグの新人王投票でもブライアントに次ぐ2位に入った。2016年、ジャイアンツでは70試合に出場していたが、前年ほど打てず打率.253・4本塁打・21打点・8盗塁という成績に終わった。
顧問は下中弥三郎、島中雄三、大川周明、幹事長は林癸未夫、常任幹事は小池四郎、赤松克麿、平野力三、山名義鶴、津久井龍雄、狩野敏、事務局主事は石川準四郎。
フランス出身の貴族で、本名はピエール・ロジェ（Pierre Roger）。教会の組織機構を整備させた一方、ナポリ女王兼プロヴァンス女伯ジョヴァンナからアヴィニョン市を買い取り（1348年） 、前教皇ベネディクトゥス12世が始めた教皇庁宮殿の建設などを行った為財政状況は悪化したという（なお、アヴィニョンはフランス革命まで教皇領として続く）。教皇庁建設には各地から画家らが集まり、国際ゴシック様式の普及に一役買った。その豪奢な生活でも知られており、「どんな君主も、金遣いの派手さでかなう者はなく、気前のよさでも匹敵する者はいない」、白テンの毛皮を一千八十枚も所持し、「ギャンブルや競馬」に打ち興じ、「教皇の宮殿は……時間を問わず、つねに女性を歓迎」していたという。即位後の1343年、ローマ市民代表のニコラ・ディ・リエンツォ（通称コーラ）がアヴィニョンを訪れ、教皇のローマ帰還を熱心に訴える。教皇はコーラの訴えに感銘を受け、第2回聖年（1350年）を実施する旨を定め、コーラに祝福を与えた。コーラはローマに帰った後、1347年に護民官となってコロンナ家などの貴族層を抑え、市の実権を握る（コーラ革命ともいわれる）。アヴィニョンにいた人文主義者・ペトラルカも多大な期待をかけていたが、コーラは次第に尊大な振る舞いに出た為、教皇庁からも批判を受け、まもなく失脚。後に捕らえられてアヴィニョンに移される（コーラは次の教皇インノケンティウス6世のときに再びローマの実権を握るがまたも失脚、最後は処刑された）。1346年、ヨハネス22世の代から対立している神聖ローマ皇帝ルートヴィヒ4世を廃位、カール4世を皇帝に擁立した。1350年の聖年には多くの巡礼者がローマを訪れたが、教皇がローマに赴く事はなかった。アヴィニョン捕囚が終わる時期は1370年にクレメンス6世と同名の甥がグレゴリウス11世に選出、ローマへ帰還した1377年である。なお、1348年1月頃からアヴィニョンはペスト禍にさらされており、この間彼は、新しい墓地のための土地を買い入れ、瀕死の病人全てに赦免を与え、病気の原因を探る為に医師による死体解剖を許可し、ユダヤ人迫害を弾劾する勅書を出した。しかし為すすべなく、同年5月にはエトワール・シュル・ローヌ（現ローヌ＝アルプ地域圏、ドローム県。アヴィニョンより北北東）に避難した。