PSは強奪した秘密結社によって特定の戦線に導入された。一番有名なのはクメン内乱末期におけるATH-14-WPC“スナッピングタートル”がヒロラム・カンジェルマンが率いるクメン反乱軍に加わり、クメン軍に多大な損害をもたらしたことに尽きる。この時、反乱軍に参加していたスナッピングタートルを操縦していたのは、秘密結社に奪取されたプロト・ワンを元につくり出された「プロト・ツー」イプシロンであり、その搭乗機は「ブルーAT」と呼ばれクメン正規軍から恐れられた。そして不可侵宙域のサンサ星での戦闘において、バララント艦隊と交戦した際にもイプシロンの操縦するX・ATH-02“ストライクドッグ”がバララント側に少なからず損害を与えた。また7215年開戦前の6月、ギルガメス主星メルキアの中立都市アコバにおいてバララント側のPS専用AT・BATH-XX“エクルビス”が確認され、メルキア軍がクエント事変において異能者キリコが搭乗した機体であるX・ATH-02-DT“ラビドリードッグ”を解析して生産した量産機が交戦したが、操縦者の能力がキリコに及ばなかったため撃破された。
キリコ・キュービィーは、ウドで初対決したATM-09-GCブルーティッシュドッグの前に完敗を喫するが、この時彼が対戦したのは小惑星リドの研究施設で発見した裸身の眠れる女性であり、秘密結社に強奪されたPS第1号、通称「プロト・ワン」であった。ウドにて再会した時にキリコは彼女が液体金属ヂヂリウムのシャワーを浴びる姿を目撃するが、このヂヂリウムはアストラギウス銀河において、コンピュータ回路の半導体として普及しているものである。これを搭載したコンピュータはパフォーマンスが大きく向上し、ATの場合ではMD（ミッションディスク）による演算処理能力が飛躍的に高まる。しかし非常に高価なため入手が困難となっている。このヂヂリウムはPSにとっては生命線であり、ヂヂリウムを浴びることでPSは本来の高い能力を発揮するが、これがなければPSの動作は鈍くなり、やがて体が硬直して最終的には死に至ってしまう。そのためPSは定期的にヂヂリウムを浴びる必要がある。
TVシリーズ内のクメン編で、当時はギルガメス軍に在籍していたジャン・ポール・ロッチナ大尉によって、誕生の様子が語られる。高度に訓練された兵士でも人体が発達したメカニズムのスピードに追いつけなくなったことから、マイクロコンピューターと一体化する思考力と判断力を加え、これによって機械的により計算された動きをこなすように人体が改造され、筋力強化もされた。なお、このプログラムのみが盛り込まれている状態を「素体」と呼ぶ。更に、日常的な知識や常識が戦闘においては障害となりうることから、脳そのものにまで手が加えられ、より機械の動きに対応できるようになった。その後は普通の人間と同じ知識や常識を持たされるが、脳を再処理する課程である対象を目にした場合、その対象への認識と依存性が高まり埋め込まれたプログラムよりも強固なものとなってしまう欠点がある。
テレビ局がアニメの制作に関与した場合には局側の権利として2年間で2回の放映権があり、本放送に加えて再放送が1回できる。その後は権利が製作会社側に移動し、テレビ局は製作会社と改めて放送契約を結んで再放送する。期間は2年間で回数の制限は無い。そのため、旧作のアニメが本放送とは異なる放送局で放送されることがある。たとえばフジテレビ系(FNS)で放送された『うる星やつら』のTOKYO MX・チバテレなどの独立放送局やNHK BS-2での放送、フジテレビで放送された『タッチ』やNHKで放送された『未来少年コナン』の日本テレビでの放送などである。この際に、自社系列外のテレビ局のクレジットを消去することがある。また、日本テレビで放送された『キン肉マン』が系列CSチャンネル日テレプラスで放送された後、フジテレビTWOで、さらにその後はテレ朝チャンネル2など、他系列のCSチャンネルで放送されたこともある。逆に民放で放送されたアニメが、NHK-BSで放送されることもある。また『金田一少年の事件簿』・『銀魂』（『よりぬき銀魂さん』）など1年以上の長期作品の場合には途中までの放送となったり、「傑作選」・「ベストセレクション」などと題して特に選んだ話を数話放送するだけということもある。本放送では低視聴率などで打ち切りとなった作品が再放送によって人気が再燃し、続編が作られたりリメイクが行われることもしばしばある。例としては『ルパン三世』や『宇宙戦艦ヤマト』、『機動戦士ガンダム』などである。中にはテレビ東京が日本テレビ系列で放送された『元祖天才バカボン』を再放送して高視聴率を挙げ、フジテレビで『平成天才バカボン』が制作されたという事例もある。再放送にあたっては制作会社から日本脚本家連盟に所属する脚本家と日本俳優連合所属の声優に使用料が支払われる。2000年代以降に深夜などによく放送されている新作のUHFアニメ（深夜アニメ）の場合、再放送はCS放送を中心に行われるという都合もあって地上波では1回限りの放送となることが多いが、TOKYO MXで2000年代以降に放送された深夜アニメやWOWOWアニメなどの再放送が行われているケースもある。また、2008年からは一部の新作アニメで本放送とリピート放送で2回ずつ放送する番組もある。2000年代後半以降になってからは、映像ソフトのブルーレイ版の発売に合わせ、その宣伝も兼ねて再放送が行われるケースも見られる。また、2012年度放送の『AKB0048』は地上波ネット局では分割2クールでの放送の際、第2期放送期に第1期の再放送枠を設けている。テレビ東京系列では全国同時ネットでのアニメ再放送が行われることも多い。例としては「アニメ530」では『カードファイト!! ヴァンガード』や土曜朝の『遊☆戯☆王シリーズ』などが挙げられる。作品によっては本放送時とは異なるOP・EDが制作されるケースも散見される。海外アニメの放送では、INCOLOR(カラー)の映像はカットされる。ワーナーブラザーズのイントロでは、地上波では番組タイトルロゴに差し替え（例:『トムとジェリーテイルズ』）。海外で使われたエンディングなどが日本ではカットされる事例もある（スタッフロールすら無い場合もあり声優・スタッフ表記も無い。）。