2012年、学校法人森友学園の要望を受け、大阪府が私立小学校設置認可基準を緩和。2013年9月に、学校法人森友学園は大阪府豊中市の国有地の取得を財務省近畿財務局に要望。2014年10月、学校法人森友学園は大阪府庁に小学校設置認可を申請。2015年5月29日、「10年以内の売買契約を前提」に「定期借地権契約を締結」された。2015年9月4日、学校法人森友学園による私立小学校の校舎及び体育館の建設計画が、国土交通省「平成27年度サステナブル建築物等先導事業（木造先導型）」の採択プロジェクト（費用補助事業）に決定した。2015年12月に本体工事の着工。2016年3月、学校法人森友学園が地中の大量のごみの存在と、土地を買い取る意向を財務省近畿財務局に報告した。同年6月、土地評価額からごみ撤去費用などを差し引いた金額での売買契約が結ばれ、土地の評価額を9億5600万円、ごみ撤去費用を約8億2000万円とし、評価額からごみ撤去費用などを差し引いた1億3400万円で森友学園側に売却する契約が結ばれた。2018年3月2日、財務省が国有地売却に関する決裁文書を書き換えた疑いがあると朝日新聞が報道した。麻生太郎財務相は、地検の捜査に影響を与える可能性があることを理由に「答えは差し控える」と述べた。その後、理財局長在職時に関係者であった佐川宣寿国税庁長官が3月9日に辞任を表明、辞任取材では書き換え疑惑について「捜査を受けている立場なので差し控えたい」と述べた。3月10日、財務省は決裁文書の書き換えを認める方針を固め、3月12日に国会へ報告すると報じられた。
2016年6月に大阪府豊中市の国有地を小学校建設を目的に森友学園が購入した際に、価格が評価額の14%で払い下げられたこと、「安倍晋三記念小学校」名目で寄付金を集めていたこと、学校の教育方針などについて、2017年2月に報じられた。2017年2月9日付朝日新聞では、売却額が同規模の国有地に比べて1割程度であるとし、売却額が公表されていないのは例外的であるなどと報じた。2017年2月27日に衆議院予算委員会で、森友学園による国有地取得や、運営する幼稚園の運動会における園児の宣誓が取り上げられ、安倍晋三首相は不適切との認識を示した。安倍首相は、この学園の活動や用地取得に関する関与を全面否定している。小学校の建設を巡っては、「認可の見通しが薄く、（運営している）幼稚園への影響も考慮し、早期に解決を図るため」を理由に2017年3月10日に認可申請の一時取り下げを表明している。認可申請取り下げにより、3月12日に財務省は更地の土地返還を求める方針を発表した。
日本の伝統や文化に重点を置いたカリキュラムのなかで、愛国心等を育むことを目的とし、教育勅語を導入している。園長は、阪神・淡路大震災が発生した際、人々の行動には矜持があったとし、その矜持を育むことこそ教育であると考え、教育の根幹を十二の徳目におき、教育勅語の導入を始めたという。園の方針により、日の丸を掲げ君が代を斉唱している。2014年4月に、安倍昭恵首相夫人が、同園の視察と教職員研修で訪問した際、園長の籠池泰典が首相の安倍晋三はどのような人物かと園児に問い、「日本を守ってくれる人」と答え、昭恵夫人は「ありがとう。（安倍首相に）ちゃんと伝えます」と涙を浮かべながら述べたとし、同幼稚園を“愛国”幼稚園であると、産経新聞は2015年1月8日付で報じた。2016年12月9日に、前園長の籠池泰典による「伝統的な日本人としての美徳を子どもたちに学ばせる」という方針にもとづき、園児たちに「教育勅語」や「五箇条の御誓文」を唱えさせている教育について、ロイター通信社は"戦前教育"と報じた。
近親相姦と近親交配の用語は似ているようで異なる。近親交配は遺伝的な問題を重視するためそれは自然科学的用語である。一方、近親相姦の用語は文化的なタブーから発生した用語で、人文科学的、あるいは社会科学的な用語である。歴史的に近親婚は、地位や財産の一族外への散逸を防ぐため、西洋とも王族・貴族間では慣例的に広まっていた。有名な例では、スペイン・ハプスブルク朝では、血族同士の結婚を繰り返し、17世紀末には虚弱な人物ばかりが誕生するようになり断絶するに至った。その典型例である最後の王カルロス2世は、伯父と姪の婚姻の結果であるとみられている。ベラスケスの肖像画で知られる同母姉マルガリータ王女は、父方の従兄・母方の叔父にあたるレオポルト1世と結婚し、夫妻の間に生まれた4人中3人の子が1歳未満で夭折(死去)した。日本でも近親婚の風習は戦前までよく見られた。戦後に制定された民法により、三親等内の婚姻は禁止されている（民法734条）が、近親婚の風習が残る地域もある。古代においては、皇族は、豪族・貴族に対して、神聖さを強調するために、近親婚が当たり前のように行われた。例えば、天武天皇は、兄の天智天皇の皇女で、天武からみればめいである持統天皇を皇后とし、その間に生まれた草壁皇子を皇太子として、その男系子孫に皇位を継がせようとした。しかし、天武天皇と持統天皇の男系子孫にあたる、草壁皇子と文武天皇、基王は、近親婚の結果としての虚弱体質が祟り、早死にしてしまう。聖武天皇は50代まで長生きするが、生涯病弱であった。また世界的にみて、いとこ婚のような比較的血縁の近い者どうしの婚姻の頻度が高い地域特に中近東、ロシア系ユダヤ教徒内にあるが、遺伝的背景による精神的または体格的障害児が頻繁に生まれやすくなることが報告されている。現在のロシア、ユダヤ教ではこの風習を完全に控える事が一般的である。逆に創世神話・伝説等には英雄や神が近親婚や近親相姦によって生まれたとの伝承がある例が広く見られる。これはむしろ、その生まれの特殊性を示すためと考えられている。