いくつかの個人や企業がSETI@homeを非公式に改造して高速化を行い、そのために処理結果が一致しなくなる場合があった。これを防ぐためそのような変更を検出しやすくする修正が施された。ただしこれはBOINCが非公式なクライアントを許容しないという意味ではない。単に間違った結果を返してくるクライアントを許容しないという意味であって、それによってデータベースに不正データが混入するのを防いでいる。BOINCではデータをクロスチェックしているが、2つのクライアントが同じ間違ったデータを返す可能性もあるため、一度不正なデータを返したクライアントは信頼できないクライアントとして登録される。よく見られる非公式クライアントとして、SSE (SSE2, SSSE3, SSE4.1) を使って処理を高速化するものがある。プロセッサがサポートしていない機能を使うよう選択すると、結果が不正になる可能性が高くなる。自分の使用しているプロセッサがどういう機能をサポートしているかを教えてくれるツールは容易に入手可能である。
アメリカのSETIには現在政府の資金が投入されておらず、常に資金が不足している。バークレーの Space Science Lab は少ない予算で予定より長期間プロジェクトを続行する方法を見つけたが、SETIには他にも予算が必要なプロジェクトがいくつもあり、他の宇宙科学関連プロジェクトとも予算を奪い合っている。SETI@homeでは2007年12月16日、2008年もプロジェクトを継続するために47万6千ドルの寄付が必要だとして、寄付を呼びかけた。
オハイオ州政府のコンピュータにSETI@homeをインストールして使用したために解雇された例がある。また、SETI@homeが学校内のコンピュータにインストールされ、その除去に100万ドルかかったということで、その学校のIT責任者は責任をとって辞任している。この件は警察が捜査中である。2005年10月16日時点で、BOINCベースでない古いバージョンのSETI@homeの約3分の1が会社や学校のコンピュータにインストールされ稼動していた。その多くは一般ユーザーが勝手にソフトウェアをインストールできるとは考えられず、それぞれのネットワーク管理者がインストールしたという疑いが強い。
SETI@homeプロジェクト開始時から処理を行っているデータはアレシボ天文台が観測した結果であり、同天文台は米国天文学電離層センターが運営し、コーネル大学の管理下にある。予算削減で同天文台は赤字に陥っている。アメリカ国立科学財団はアレシボへの資金援助がなければ2011年に同天文台を閉鎖することになるとしている。そうなれば、SETI@homeへのデータ供給も止まる。2012年、新たな運営体制で閉鎖の危機は免れたが、2017年には大幅な予算削減により再び閉鎖の可能性がでてきている。詳しくはアレシボ天文台を参照のこと。2019年現在では、アレシボ天文台以外の望遠鏡からもデータを取得しているため、アレシボ天文台の閉鎖が SETI@home プロジェクトの終了を意味するわけではなくなっている。
2015年、ユーリ・ミルナーの資金提供により王立協会から発表された、ブレイクスルー・イニチアチブプロジェクトのひとつであるブレイクスルー・リッスンにより、グリーンバンク望遠鏡で得られたデータが2016年4月12日から SETI@home 向け work unit として配布されている。 ブレイクスルー・リッスンはグリーンバンク望遠鏡以外にも、リック天文台の自動惑星検出望遠鏡や、以前から観測データを使う予定であるとアナウンスされていたオーストラリアのパークス天文台も対象である。ただ、パークス天文台については2018年の時点で未だ SETI@home にて使用できる目処は立っていない。なお、2019年2月23日現在、アレシボ天文台からの観測データも従来どおり平行して SETI@home 向け work unit として配布されている。
Astropulse（コヒーレント分散除去法を使ってパルス信号を探索するアプリケーション）を使うという計画。Astropulseと本来のSETI@homeを組み合わせれば、高速回転するパルサー、爆発する原始ブラックホール、その他未知の天体物理学的現象を検出できる可能性がある。Astropulseの最終一般リリース版のベータテストは2008年7月に完了し、その直後から高性能なマシンへのAstropulse向け work unit の配布が開始されている。
全世界で520万人以上が参加しており、これまでで最大の参加者数の分散コンピューティング・プロジェクトである。元々の予測参加者数は5万から10万だった。1999年5月17日に開始して以来、プロジェクトは総計200万年ぶんのCPU時間を使用してきた。2001年9月26日、それまでの浮動小数点演算回数の総計が10²¹回を越えた。これは、史上最大の計算としてギネス記録に認定された。2009年11月14日の時点で、234カ国で278,832台のコンピュータが実際に稼動しており（登録は240万台）、その計算能力を合計すると769テラFLOPSになっていた。ちなみに2009年9月26日時点の Cray Jaguar の性能は2,331テラFLOPSだった。
ニューオーリンズ造幣局は、ミシシッピ川に近いフレンチ・クオーターの北東の端に位置しており、エスプラネード・アベニューに面している。この建物は建築家のウィリアム・ストリックランドの設計で、当時流行していたギリシャ復古調の建築物となっている。アンドリュー・ジャクソンが大統領だった1835年に建設され、3年後の1938年に造幣局としての業務を開始した。1861年にルイジアナ州が連邦から離脱し南北戦争が勃発した。ニューオーリンズ造幣局は州に接収され、翌年ニューオーリンズが北軍に接収されるまでの間は、南部連合の造幣局として機能した。アメリカの歴史の中で、合衆国と南部連合双方の通貨を鋳造したのは、ニューオーリンズ造幣局だけである。ニューオーリンズが北軍に接収されたあとは、造幣局は閉鎖されていたが、南北戦争後のレコンストラクション (再建) の時期を経て1879年に再び合衆国の造幣局としての業務を再開した。以後、1909年に閉鎖されるまで業務が続いた。閉鎖後は、その建物は評価機関、米国海岸警備隊の貯蔵庫、核シェルターなど様々な目的に使用されてきた。1981年以降は、ルイジアナ州立博物館の支局となっている。2005年のハリケーン・カトリーナで建物が被害を受け博物館は閉鎖されていたが、修理を経て2007年10月20日に再開した。ニューオーリンズ造幣局は、アメリカ国定歴史建造物に指定されており、現存する米国造幣局の建物としては最古のものとなっている。アート・ギャラリーを擁する元造幣局の建物としては、他にノースカロライナ州のシャーロット造幣局がある。