大作たちはシズマ博士を国際警察機構北京支部に連れ帰るが、シズマ博士とサンプルの奪還を狙うBF団十傑集・衝撃のアルベルトの襲撃を受ける。九大天王の戴宗、エキスパートの楊志及び一清道人がアルベルトを足止めしている隙に、大作たちはシズマ博士を連れて支部を脱出する。一方、パリではBF団の怪ロボット・大怪球フォーグラーが地下から姿を現す。操縦者の謎の青年・幻夜が、自身の所有する二本のサンプルを同時に作動させると、再び大規模なエネルギー停止現象が発生し、街の明かりは消え、自動車は止まり、飛行機は落ち、列車は転覆する。北京でも戦闘の最中にサンプルが作動し、BF団の怪ロボット・ウラエヌスが沈黙する。サンプルの正体は、周囲のシズマドライブを暴走させ無力化する性質をもつアンチ・シズマドライブだった。アンチ・シズマは世界に三本あり、幻夜が二本、国際警察機構が一本を所有している。そして幻夜は、アンチ・シズマを内蔵する大怪球で、シズマドライブに依存しきっている現代文明を麻痺させようとしているのだ。幻夜はその行動を「バシュタールの復讐」と称した。
来るべき近未来。完全無公害・完全リサイクル可能な夢のエネルギー源、シズマドライブの恩恵で、人類は未曾有の繁栄のときを迎えていた。しかしその裏側では、世界征服を企む秘密結社BF団と、BF団を阻むために組織された国際警察機構がしのぎを削っていた。草間大作少年もまた、国際警察機構のエキスパートであり、史上最強のロボット・ジャイアントロボを操り、BF団と闘ってきた。ある日、南京にて、大作と銀鈴、鉄牛は、BF団のエージェントに追われているシズマドライブの発明者・シズマ博士を救出する。シズマ博士は黒いアタッシュケースを抱えており、その中には一本のシズマドライブのサンプルが収められていた。同じ日、パリでは、市街地が円形に隆起し、エネルギー停止現象が観測される。それはシズマドライブの開発過程で起きた大事故「バシュタールの惨劇」に酷似していた。現場に駆け付けた国際警察機構パリ支部のエキスパート・村雨健二は、シズマドライブの共同発明者の死体と、バシュタールの惨劇の元凶とされる科学者・フォーグラー博士を目撃する。
横山光輝原作の特撮テレビ番組『ジャイアントロボ』を原案とし、主人公、主役機体もそちらから選ばれている。本作はロボットアニメに分類されるものの、超人格闘シーンも大きな魅力である。また、父と子の絆という点にドラマ性を持たせている。スター・システムにより横山光輝作品の様々なキャラクターが登場し、ドラマを繰り広げるが原案からの敵味方関係の逆転が多く、元々善の主人公のバビル2世が敵首領「ビッグ・ファイア」になる一方、逆に敵役ヨミが主人公側トップ「黄帝・ライセ」になったり、十傑集の中では敵味方が協力する間柄になっていたりする。音楽は天野正道が作曲し、常任指揮者を務めたワルシャワ・フィルハーモニー管弦楽団によりフルオーケストラで演奏され、のちに交響組曲「GR」として管弦楽・吹奏楽編成による編曲もされた。特に吹奏楽版『交響組曲第2番「GR」より』、『「GR」より シンフォニック・セレクション』などは、現在でも吹奏楽コンクールなどでしばしば演奏されている。全7作それぞれにすべて異なる楽曲が作られた一方、本編では一曲も主題歌・ポピュラー系挿入歌がない（クラシック系歌曲は数曲ある）。反面、作画及び音楽へのこだわりが資金面・製作時間的に完結まで長期間を要する原因となった。2007年に製作された『GR-GIANT ROBO-』とは原作が同じであるが直接的なつながりはない。余談だが、原作者である横山はこれまで、自分の作品を基にアレンジした（『太陽の使者 鉄人28号』を除く）アニメを（「すべてお任せしますから、自由に書いてください」と製作者側に言っておきながら）散々に酷評してきていたが、本作については「面白い」と素直に評していたという。
襲撃者らとコチャリャンを結び付ける確かな証拠は発見されなかったにもかかわらず、アルメニア国内の多くの政治家・研究者は、事件にコチャリャンと国家保安相であり次代大統領のセルジ・サルキシャン（ワスゲンの血縁ではない）が関与していたと信じている。しかし、コチャリャンは襲撃者らとの繋がりを指摘されながらも、政治家としての力を強め、やがて最も強力な国家指導者となっていった。初代大統領であったレヴォン・テル＝ペトロシャンは、事件の真犯人はコチャリャンとセルジ・サルキシャン、そして彼らにより築かれてきた「犯罪者の寡頭政治」のシステムである、と繰り返し主張している。2008年の大統領選挙に際しても、テル＝ペトロシャンは「セルジ・サルキシャンに投票するのはフナニアンに投票するのと同じことだ。セルジ・サルキシャンを選ぶ人間はデミルチャンとワスゲン・サルキシャンの神聖なる墓を冒瀆する人間だ」と明言した。事件から10周年の節目となる翌2009年には、テル＝ペトロシャン率いる議会での反対派が、「アルメニア人の大部分によって事件の首謀者と考えられている」として、コチャリャンとセルジ・サルキシャンを殺人者と非難する声明を発している。その声明では、「テロリズムはこのように、体制側が権力にしがみ付き、自身を再生するための主要な方法となった」と結ばれている。2013年3月にはアラム・サルキシャンが、コチャリャン、セルジ・サルキシャン両政権に対する多くの疑問を表明した。アラム・サルキシャンは、多くの疑問が未解決のまま残されたために、事件の法的処理が体制に対する公衆の不信を強めたとする。そして、全容の解明は国家にとって重要事項であり、「私が彼らの政権を非難するのは、彼らが事件に責任を負っているためではなく、事件の全容を解明していないためである」と主張している。また、2009年10月に事件記念碑が議会広場に設置された際、除幕式に出席したステパン・デミルチャン（カレンの息子）も、「現政権において事件の全容解明は不可能であるが、遅かれ早かれ、国家としての尊厳をかけて、全容は暴かれる。その時になって初めて我々は、この事件を克服することができるのである」と語っている。元エレバン市長のアルベルト・バゼヤンは、事件はコチャリャンの権力を無制限で抑制不能なものにすることを狙って引き起こされたとの結論に至った、と2002年に語っている。そして、首謀者たちはワスゲン・サルキシャンとデミルチャンを物理的に排除することで、コチャリャンが大統領選に勝利する下地を作ったとも指摘した。