延長戦のイニング制限はセ・パともにレギュラーシーズンと同じ12回と定められており、12回を終えても同点の場合は引き分け試合となるが、引き分けが生じても再試合は行わない。引き分けを含め、ステージ勝者が確定した場合には残りの試合を開催しない。また、セ・リーグでは2013年より、パ・リーグでは2015年より、勝つか引き分けで上位チームのステージ勝利が確定する試合では、12回表終了または12回裏途中で同点となった時点で試合を打ち切り、コールドゲームとする事に改正された。該当事例は2014年のセ・リーグの1stステージで初めて発生した。なお、この改正前の2011年にパ・リーグで該当する事例があり、この時は通常通り12回裏を実施した（結果は1位チームのサヨナラ勝ち）。2011年・2012年のレギュラーシーズンで採用していた特別ルール（延長戦に関しては、試合開始から3時間30分経過後は新しいイニングに入らない）はクライマックスシリーズでは適用せず。時間制限なしで最大12回まで行った。
予告先発は2007年から2017年までは、パ・リーグでのみ実施され、セ・リーグは実施されていなかった。2018年より両リーグとも予告先発が実施された。ただし、パ・リーグでは第2戦以降の予告先発の発表は、レギュラーシーズンとは異なり、当日の試合終了後となる（翌日にも試合が行われる場合のみ）。このため、翌日の先発候補投手を複数名準備させておき、当日の勝敗に応じて翌日の先発を決めるといった戦略も可能となる。一方のセ・リーグでは第2戦以降の予告先発の発表は、レギュラーシーズンと同様に、当日の試合開始までに既に行っている。これは当日の試合結果次第で打ち切りとなり、行われない可能性のある試合であっても発表される（例として2018年のセ・リーグ1stステージでは、第2戦終了で打ち切りとなったものの、試合開始時点では既に第3戦の予告先発が発表された）。
出場できる選手は当該シーズンの8月31日時点で出場球団に支配下選手登録され、且つCS開催時点においても引き続き出場球団に支配下登録されていることが条件となる。レギュラーシーズン同様、29人以内の出場選手登録された選手の中から25人以内のベンチ入り選手が出場でき、登録抹消となった選手は10日間再登録できない。なお、この規定はレギュラーシーズンから継続して適用される。期間前に改めて白紙から登録されるわけではなく、レギュラーシーズン終了からCS開幕までの間に出場選手登録を抹消された場合、CSが開幕しても抹消日から10日経過しないと再登録できない。2017年より導入された引退試合特例制度を用いて出場選手登録し、抹消された選手は本シリーズに出場できない。
開催日程には予備日が設けられ、悪天候等で中止・ノーゲームとなった場合は原則として翌日以降に順延される。ただし、予備日を含めた日程で全試合を開催できなかった場合には、予備日以降の順延は行わずに開催打ち切りとなり、その時点の勝敗でステージ勝者を決定する。勝利数が同数の場合は、レギュラーシーズン上位チームがステージ勝者となる。中止の有無がステージの勝敗に関わるため、レギュラーシーズン終盤同様、試合開始前までは各リーグの責任者が中止決定権を持つ。試合開始後はどの試合とも同じく審判団が判断する。パ・リーグでは2試合以上の試合が中止・順延となり、予備日最終日の1日前までに決着がつかない場合はダブルヘッダーを行う場合がある（ただし勝敗によっては1試合目のみで終わる）。2013年のファイナルステージでは、中止試合が発生したことで初めて開催の可能性が生じたものの、中止はその1試合のみで、予備日前にステージ勝利チームが決定した。一方、セ・リーグではダブルヘッダーは実施していない。台風の接近が予測された2014年の1stステージにおいても、パ・リーグでは実施の可能性があったものの。セ・リーグでは実施予定がなかった。このため、仮に2位チームが第1戦に勝利しその後2日間中止になった場合には、予備日の試合を行うことなくステージ勝利が決定する可能性もあった。なお、結果的には台風接近前に開催した2試合でステージ勝利チームが決まったため、試合を消化せずに打ち切りとなる事態は回避された。2017年にも天候不良でセ・リーグ1stステージの開催が危ぶまれ、2位チームが第1戦に勝利した後の第2戦はグラウンドが水浸しの中で強行され物議を醸した。2017年の事例を受けて2018年の日程のあり方が検討されたが、上位の優位性を保つなどの理由で変更せずに実施することとなった。
1999年は近鉄の二軍打撃コーチを務めた。2000年から近鉄のスカウトに転身し、2003年に日本ハムに九州地区担当スカウトとして復帰。スカウト時代は技術面だけでなく性格や環境を重視するようになり、それぞれの選手に合った指導をする事の難しさに気がついたという。2008年に日本ハムの一軍打撃コーチに就任したがチーム打率・得点・安打・本塁打がリーグ最下位に低迷。2009年は二軍打撃コーチを務め同年退団。2011年には台湾の統一セブンイレブン・ライオンズのコーチを務め、2012年途中から八百長事件に関わり辞任した呂文生に代わり、監督に就任した。同年は鎌田祐哉を辛抱強く起用し、最多勝を獲得する活躍を支えた。2012年より統一セブンイレブン・ライオンズの監督を務めてきたが、2013年8月4日、成績不振により二軍監督へと降格になった。2014年に四国アイランドリーグplus・徳島インディゴソックスの野手総合兼打撃コーチに就任。同年オフ、横浜DeNAベイスターズコーチに転身した島田直也の後任として、2015年シーズンより同チームの監督に就任した。2015年前期は3位、後期は2位に終わり、チームとしての年間総合優勝3連覇の目標は達成できなかった。前期終了後に、リーグが編成した北米遠征選抜チーム「四国アイランドリーグplus ALLSTARS」（カナディアン・アメリカン・リーグと対戦）の監督も務めた。2016年前期は2位、後期は勝率5割ながら4位（最下位）だったが、年間勝率2位となったことで、前後期を連覇した愛媛マンダリンパイレーツとの年間チャンピオンシップに出場した。チャンピオンシップは0勝2敗で敗退。また、前年に続いて北米遠征選抜チームの監督を務めた。12月5日に徳島監督退任と韓国プロ野球・ハンファ・イーグルスの打撃コーチ就任が発表された。一軍を担当したが2017年10月に退任した。