2002年4月から9月まで、28:30–29:00 (JST) の時間帯は音楽とは関連の薄いネタコーナーなども行っていた。2003年4月から10月までの上記時間帯では「DASEINのオールナイトニッポンレコード」を放送、11月から2004年3月までの上記時間帯では、「オールナイトニッポンレコード2」と題して、レーベル内アーティストの一人が30分間トークをするコーナーが設けられた。全国ネット（27:00-28:30の時間帯)としては2004年3月で終了、公式サイトも閉鎖された。2004年4月から9月までは並行して「オールナイトニッポンレコード」のレーベル内アーティストを特集した、グローバーのオールナイトニッポンR内の1コーナー・「4時です 朝です 吉田です」が放送されていた。また、28:30-29:00の時間帯でもそれに多少連動した企画を行っていた。2004年10月からは、インディーズのアーティストに関する企画を全く行っておらず、事実上「オールナイトニッポンレコード」というレーベルは休止状態にある。2005年10月1日までは吉田尚記（2002年10月から2004年3月まではリスナーズBEST担当のため25:00から29:00までぶっ通しで担当し、同年9月までは「4時です 朝です 吉田です」を担当）、2006年4月1日までは冨田のりこがパーソナリティーであった。番組コンピレーションアルバム・「青田屋1号」「青田屋2号」「青田屋3号」が発売中。一部の新聞では、28:30-29:00の時間帯のオールナイトニッポンレコードというこの番組の存在を抹消していた。
主に、インディーズのアーティストを番組（ニッポン放送独自）のレーベル「オールナイトニッポンレコード（旧称LF+R RECORD）」に所属させ、番組出演やコンピレーションCDの制作、ライブを行うなどの企画をしていた。
中学生のころ阪神大震災を経験し、スーパーマンのような強くて希望を与えられる存在にあこがれていたため、スーパーマンを愛するトレーナーとして活動。また、健康に関しては独自の理論と考え方を持つ。人が二足歩行でもバランスが取れるのはバランスを感じるセンサーが至る所にあるからだという自論と頭・手のひら・足のうらの骨はそれぞれ約28個であるという点から、全身の連動性を考慮した7点治療法、渦巻きセラピー、5秒整体、5秒整体反射テクニックなどを考案している。
1980年に『日本文学史序説』上・下で大佛次郎賞、1993年に朝日賞、2000年にその長年の文化功労に対してフランス政府からレジオンドヌール勲章（オフィシエ賞）を授与される。
通勤電車での読書術について、「混雑する通勤電車の中では、ページをめくらなくてもいい本を選択」「電車に乗る時には手に1冊だけ」「受験生なら英単語集、社会人なら他の外国語テキスト」「フランス語ならば動詞の変化表を持って暗唱」と述べている。
2008年12月5日、多臓器不全のため東京都世田谷区の病院で死去した（89歳没）。同年夏、加藤は上野毛教会でカトリックの洗礼を受けた（洗礼名はルカ）。雙葉高等女学校出身である母や妹もカトリック教徒であり、1948年に書かれた「ボードレールに関する講義草稿」以来、加藤の「カトリシスムへの関心は並々ならぬものがあり、それは生涯続いていた」 とする海老坂武がこの受洗を岩下壮一や吉満義彦らが日本に紹介した新トマス主義への関心からではないかと推測している。また、40年来の親交があった鷲巣力も「超越的存在としての神」に「ずっと関心を抱いていた」加藤の受洗は意外ではないとしている 。
1960年の安保闘争においては、改定反対の立場から積極的に発言した。1960年秋、カナダのブリティッシュコロンビア大学に招聘され、日本の古典の講義をおこなった。これは1975年に『日本文学史序説』としてまとめられている。以後、国内外の大学で教鞭をとりながら執筆活動を続け、とりわけ『読書術』や『羊の歌』などが話題を呼んだ。また、1984年版『大百科事典』（平凡社）の編集長をつとめ、これをもとにした1988年版『世界大百科事典』の編集長をもつとめ、その「富岡鉄斎」「日本」「日本文学」「林達夫」「批評」の項目を執筆した。1979年より「朝日新聞」夕刊に「山中人閒話」を連載、1984年に「夕陽妄語」と改題して2008年7月まで連載していた。1988年から1996年の間、東京都立中央図書館長も務めた。
セント・アンドルーズ大学で、学友としてウィリアム王子と知り合う。大学内で開かれたファッションショーにモデルとして出演したキャサリンにウィリアムが一目惚れし、ルームメイトだったこともあり、親しく交際が始まった。在学中に他の友人も交えた共同生活で絆を深めた。長期間にわたり交際の噂はあったものの、2人の関係が公になったのは2004年頃で、ウィンザー家毎年恒例のスキー旅行にキャサリンが同行したことで、「未来のプリンセス」として取り上げられた。2007年1月ごろ、イギリスのメディアが、キャサリンの誕生日の9日にウィリアムがプロポーズし婚約する、という報道を行った。この頃から報道合戦が過熱し、パパラッチが問題視され、報道規制がかけられる事態となった。2007年4月14日、英大衆紙「サン」はウィリアムとキャサリンの関係が突如破局したと報じた。理由に関しては定かではないが、BBCの王室担当記者は「2人の仲は問題はないように思えたので驚きだ」と語り、「王子は結婚はまだ早すぎると話していたが、王子の決断というよりは2人で合意したことだろう」と指摘した。一部メディアは破局の一因としてパパラッチの問題や、中流階級であるキャサリンおよびキャサリンの母親の言動を挙げ、階級差を指摘し王室に相応しくないと報じるマスコミの存在を指摘している。英大衆紙『News of the World』は、エリザベス女王が「（結婚の意思がないのなら）急ぐべきでない。ダイアナ元王太子妃の二の舞になることを望んでいない。」とウィリアムに対し忠告したと報じている。2007年6月24日付けの英大衆紙「メール・オン・サンデー」がウィリアム王子との復縁を報じる。7月1日に行われたウィリアムとヘンリー王子主催のダイアナ妃の追悼コンサートに姿を見せた。既に同棲しており2009年には結婚、と伝えるメディアもあるが、公式には復縁の発表はなかった。2010年10月、2人は旅行先のケニアで婚約し、11月16日、王室より正式に公表された。婚約指輪はダイアナ元妃のものであった。