伝承によれば文覚上人（1139年～1203年）が独鈷池付近に開創。康元元年（1256年）蘭渓道隆（大覚禅師）が立ち寄り、鉾持山乾福興国禅寺（ほこじさんけんぷくこうこくぜんじ）を興した。のち、武田信玄の帰依により、静岡市の臨済寺から東谷宗杲禅師を招いて中興開山とし、妙心寺派となった。貞享2年（1685年）、喝道和尚中興、明和3年（1765年）3月24日類焼、安永4年（1775年）少山和尚がさらに中興するも、嘉永4年（1851年）正月19日焼失、安政3年（1856年）に再建した。武田勝頼が高遠城主の時、武田家菩提所とし、母諏訪御料人を埋葬して乾福院殿という。さらに次の藩主、保科氏も菩提寺とし、大寶山建福寺と改名。寛永13年（1636年）保科正之が会津若松藩主となり、移封する際に、鉄舟和尚が供奉して会津にも建福寺を創建した。
仕事一徹で、昼夜を問わず駆けずり回っていた石井は、多数の委員会の委員や委員長を歴任すると共に、大正製薬以外の事業を数多く手がけた。1940年には皇紀2600年を記念して、国際政治学者で東京帝国大学法学部教授の神川彦松らと皇道文化研究所を設立した。1943年4月に東京商工会議所満鮮北支経済使節団長として渡支し、帰国後チフスを発病、同年5月9日永眠。享年55。5月13日に警報下、音羽の神齢山悉地院護国寺において告別式が営まれ、同墓地に埋葬された。葬儀委員長はのちに外務大臣となる藤山愛一郎が務めた。戒名：鳳心院剛毅慈恵居士。
1912年に「大正製薬所」を設立し「ヘモグロビンエキス」「ヘモグロビン菓子」の製造販売を始め、事業が軌道に乗る。当時、日本薬剤師会を中心に薬界をあげて取り組んでいた売薬法改正をめぐる運動に参加し、島田三郎や三木武吉ら政界有力者への積極的なロビー活動を行った。結果的に、『売薬調整権を薬剤師に限る』という売薬法改正案は成立し、薬剤師の地位が飛躍的に向上した。因みに、三木とは同県人のよしみから、その後も急速に接近した。事業拡大に伴う従業員増強の必要性から、それまでの縁故者に限っていた採用方針を転換し、1916年に当時19歳だった上原正吉を住み込みで採用した。関東大震災で日本薬剤師会が焼失した際に、大正製薬所の応接間を仮事務所に提供する一方、出入りの大工を焼跡に派遣し、バラック建の事務所を急造させたほか、1918年に開設していた大阪支店に命じて、大阪から大量の医薬品や衛生材料などを至急輸送させ、罹災した会員に無料配布するなど、迅速果敢な処置を行った。結果的に、東京の同業者の多くが罹災したが、運よく罹災を逃れた大正製薬所に注文が殺到し、損失の数倍に匹敵する利益を上げた。1928年に大正製薬所を株式会社大正製薬へ改組。翌年、営業不振により撤退していた大阪に再進出し、当時まだ32歳だった上原正吉を大阪支店長に大抜擢する。1932年には大連に支店を開設した。
高瀬弥一は豪壮な鵠沼御殿を嫌い、中藤ヶ谷の屋敷を銀座の豪商・徳力に売却し、江之島電氣鐵道高砂（たかすな）停車場（現在の石上駅）西方一帯を買い占め、南向き斜面3千坪を敷地とする数寄屋造りの瀟洒な屋敷を構え、その下の低湿地に2千坪の池を掘って舟を浮かべた。関東大震災で屋敷は倒壊し、次女を失ったが、火事は起こさなかったため廃材を利用して復興できた。四軒別荘（現在の鵠沼松が岡）で被災した林達夫・芳（弥一の末妹）夫妻が離れにしばらく居住した。藤沢駅から門前を結ぶ道路を建設し、橘通りと名付け、江の島道から門前を通る道路を建設し、高瀬通りと呼ばれた。時は人力車時代から自動車時代へと向かっていた大正末期、藤沢駅と鵠沼海岸を結ぶ自動車道路建設を計画し、地主に呼びかけて鵠沼新道（地主の名を採り高瀬通り - 上郎通り - 宮崎町 - 髙松通り - 小川町 - 熊倉通りと命名）を敷設した。開通間もないこの道路のことは、当時短期間鵠沼海岸に住んだ芥川龍之介の小説「歯車」 の冒頭に描かれている。この道は完成後藤沢町に寄附する予定だったが、町はこれを受け入れず、多額の固定資産税が弥一の財力を急速に奪った。弥一はまた、自宅の井戸水を江の島に送る「江之島水道」を建設した。これは1928年（昭和3年）に東京府の玉川水道株式会社と業務提携を結んだ際に「湘南水道株式会社」と商号を変更、1933年（昭和8年）には神奈川県に買収されて県営水道となり、継続的な収入には結びつかなかった。屋敷と池の5千坪以外の土地は「高瀬住宅地」として分譲され、主に横須賀鎮守府の軍人らが購入した。江口朴郎が少年時代を過ごしたのもここである。また、第一高等学校の校長になった杉敏介も高瀬家の筋向かいに住み、一高時代の恩師との交流も芽生えた。しかし、折からの世界恐慌で、不動産業も行き詰まった。高瀬弥一の晩年は、アルコール使用障害に罹り、悲惨なものだったという。