「トルキスタン」とは、「テュルク人の」 (Turki) という単語に「〜が存在する（ところ）」 「国」(-stān) を意味する接尾辞が付属したペルシア語での他称に由来するものである。前近代においてはその地域的な範囲は明確ではなく、イスラーム時代以降はマー・ワラー・アンナフルと呼ばれた中央アジア南部のオアシス都市の地域の北方に広がるテュルク系遊牧勢力がいた領域を指す漠然としたものであった。一方、スィル川の中流にはヤサヴィー教団の始祖アフマド・ヤサヴィーの廟墓があることで有名なトルキスタン市（古名ヤス）がある。西トルキスタンは変わらずマー・ワラー・アンナフルと呼ばれていた。これはティムール朝末期のバーブルの時代でも同じであった。13世紀以降はモンゴル帝国、次いで後継の汗国に支配される。19世紀後半、ロシア帝国がタシュケントにトルキスタン総督府を置き、その域は東部で天山山脈西部とパミール高原、西部でカスピ海東岸、南部でイラン・アフガニスタン国境にまで拡大した。ロシア領トルキスタン (西トルキスタン)という名称と実態が成立すると、その東方は東トルキスタン、アフガニスタン北部はアフガン・トルキスタンとも呼称されるようになった。ソ連邦ではトルキスタン自治ソビエト社会主義共和国消滅後、パン・テュルク主義を想起させるトルキスタンのかわりに、中央アジア (Средняя Азия)と呼称されるようになり、ロシア領トルキスタンや西トルキスタンという名称は用いられなくなったが、東トルキスタンという名称は使用されている
トルキスタンは、西はカスピ海、東は中国、北はアラル海、イルティシュ分水界、南はアフガニスタン北部、イラン国境に及ぶ地域 (ロシア・トゥルケスターンあるいは西トルキスタン、今日のトルクメニスタン・ウズベキスタン・キルギス・カザフスタン・タジキスタン)、中華人民共和国の西北部の新疆ウイグル自治区 (シナ・トゥルケスターンあるいは東トゥルケスターン)、およびアフガニスタン北部の三地域に大別される。西トルケスタン、東トルケスタン、南トルケスタンとすることもある。面積は約150,000平方キロメートル。
HMSチャレンジャー探検航海の概要レポートでは、チャレンジャー海淵が初めて発見された時に採取されたサンプルからの放散虫が掲載されている 。これら（ナッセラリア目とスプメラリア目）はエルンスト・ヘッケルによって書かれた「放散虫レポート」（1887年） にて報告されている。1960年の潜航でトリエステの乗組員は、海底は珪藻土から成り、海底に横たわっている「ある種のヒラメ」を観察したことを記述した。最後の水深測量を終える際、私は素晴らしいものを見た。靴底に似た、長さ約1フィート（30cm)、幅が約6インチ（15cm)のある種のヒラメが海底に横たわっているではないか。私が彼を見ると、頭の上にある彼の2つの丸い目が私たちを盗み見た 。 鉄の怪物 （トリエステ号）は、 彼の静かな領域に侵入していった。目？彼に目が要るのか？単に燐光を見るため？彼に浴びせた投光照明は、水深6000ｍを超えるこの超深海（hadal）領域に入る最初の光だった。この瞬間が、生物学者が何十年も求めてきた答えとなった。海の最深部に生命は存在しうるのか？出来た！それだけでなく、ここは紛れもなく真実なのだが、骨のない真骨類の魚であり、原始的なエイ上目や板鰓亜綱ではなかった。ええ、高度に進化した脊椎動物で、（進化の）時間軸でいえばヒトに非常に近いです。ゆっくり、とてもゆっくりと、このヒラメは泳ぎ去った。片方を泥にもう片方を水中に、海底伝いに動き、彼は暗闇へと消えた。とてもゆっくりと 、 恐らく海底では全てが遅く 、 ウォルシュと私は手を振った。多くの海洋生物学者は現在、この真偽不明の目撃について懐疑的であり、その生物はナマコかもしれないと指摘されている。探査機かいこうに搭載のビデオカメラは、海底でナマコ、ウロコムシ、ヨコエビを捉えており、日本のNHKが2017年8月27日、「DEEP OCEAN超深海／地球最深（フルデプス）への挑戦」でその映像を放映した。探査機ネーレウスは、長さ約3cmのゴカイ類（多足動物）を捉えた。かいこうが採取した堆積物サンプルを分析したところ、10900 mので多数の単純生物が見つかった。同様の生命体が浅い海溝（7000m以上）と水深4000～6000ｍの深海層で存在することが知られているが、チャレンジャー海淵で発見された生命体には、より浅い生態系のそれとは異なる分類区別を示す可能性がありうる。採集された生物の大半は、単純で柔らかい有孔虫（ナショナル・ジオグラフィックによると432種）であり、他の4種は複雑な種、多室のレプトハリシス属とレオファクス属である（どちらも有孔虫の一種）。標本の85％が有機の柔らかい殻を持つアログロミイダであり、これは有機壁の有孔虫の割合が5％から20％の範囲にある他の深海環境からの堆積で暮らす生物のサンプルと比べても稀である。圧力がかかった水中における炭酸カルシウムの高い溶解度のため、硬い石灰質の殻を持つ小さい生物は極端な深度で成長するのが困難であり、チャレンジャー海淵における柔らかい殻を持つ生物の偏重は、今よりもチャレンジャー海淵が浅かった頃の一般的な生物圏から生じたのかもしれない、と科学者たちは理論づけをしている。600万から900万年超の間、チャレンジャー海淵が現在の深さへと成長するにつれ、堆積物に存在する多くの種が死滅したか、水圧上昇と環境の変化に適応できなくなった。深さの変化でも生き残った種が、チャレンジャー海淵の現在の生息生物の祖先と言えるのかもしれない。2013年3月17日、研究者らは、微生物の生命形態がチャレンジャー海淵で繁栄することを示唆するデータを報告した。他の研究者らは、米国北西部海岸の海底8500フィート（約2591m）から1900フィート（579m）までの岩石内部で微生物が増殖するという関連研究を報告している。ある研究者によれば、「どこでも微生物は発見できる。彼らは状況への適応が極端で、どんな場所でも生き延びる。」