1898年、独立とエノシス（ギリシア語: Ένωσις、ギリシャ人が暮らす地域の統合）に向けての最後の行動の間、列強はハニアを半自治国家『クレタ州』（ギリシア語: Κρητική Πολιτεία）の州都とし、ギリシャ王子ゲオルギオス（ゲオルギオス1世の次男）がクレタ総督となってハニアに暮らした。この時代のクレタ島は、独自の切手と通貨を発行していた。これは非常に重要な過渡期で、もはやオスマン帝国の隔絶したウィラーヤー（県）ではなく、ハニアはさらに国際都市となり繁栄し、ヨーロッパからも東方からも影響を受けた文明の交差路としての役割を再獲得した。多くの重要な建物は、この時代に建てられ、知識階級や芸術を愛好する階級が生まれ、地元有力者の新たな階層は町の日々の生活に違った雰囲気をもたらした。ヘレパ地区は、この時代に作られた多くの優れた新古典主義建築の大使館、領事館がある。しかし、クレタ島の真のゴールはギリシャとの再統合であり、エレフテリオス・ヴェニゼロスがゲオルギオス王子支配への定期的な反対を繰り返した後にもたらされた。1905年のテリッソス革命を含む対立の連続は、ゲオルギオス王子を退任させ、高等弁務官アレクサンドロス・ザイミス（のちギリシャ首相となる）のクレタ島統治が始まった。ついに1908年、ヴェニゼロスは、列強の承認のもとで革命政府の設立を成し遂げた。1910年に行われたギリシャ首相選挙は、クレタが1913年12月1日にギリシャと統合する前の最後のステップとなった。ギリシャの国旗が、エレフテリオス・ヴェニゼロスと国王コンスタンティノス1世が出席した旧港のフィルカ砦での式典において、初めて掲げられた。ハニア近郊のモウルニエス出身であるヴェニゼロスは、1896年-1897年に起きた対トルコ支配暴動の指導者だった。彼はのちにギリシャ首相となった偉大な政治家である。彼の墓は、ハニアを見下ろす丘の上にある(Profitis Ilias, 北緯35度31分29.5秒 東経24度03分22.2秒)。
1645年、わずか2ヶ月の包囲戦に耐えられなかったハニアの城壁はオスマン帝国に陥落させられた。トルコ人らはキッサモスにあるゴニア修道院近くに上陸し、略奪を働き火を放った。多くの死者、特にトルコ人の死者が包囲戦で生じた。トルコ人司令官は、40,000人以上という兵士を失ったことから本国へ召還され処刑された。のち、ほとんどの教会はモスクに転用され、市の富は持ち去られた。トルコ人は主に東のカステリ地区、スプランツィア地区に居住した。スプランツィア地区のドミニコ会派の聖ニコラオス教会は中央モスク（Houghiar Tzamissi）に変えられていたからである。トルコ人らはKioutsouk Hassan Tzamissiのような港にある新しいモスクも作った。公衆浴場（ハンマーム）、泉はトルコの都市のような特徴であった。クレタ島のパシャはハニアに居住した。1821年、ギリシャはオスマン帝国に対し反旗を翻し、ハニアにおいてもギリシャ人とトルコ人の間に対立が起きた。どちらの側からも犠牲者が出て、その多くはキリスト教徒であった。キッサモス主教メルヒセデク・デスポタキスは革命的な事件に参加したために、スプランツィアで絞首刑に処され木に吊された。1878年、ハレパ協定が締結され、キリスト教徒は権利を与えられた。このためにクレタ島在住のイスラーム教徒らがトルコへ移っていった。島に残ったトルコ人らは、1922年のギリシャ＝トルコの住民交換によって島を去った。
メアリー1世死去の証拠として彼女の婚約指輪を携えたロンドンからの使者がハットフィールドに到着した。そして、自らが国王に即位したと聞くと、エリザベスは旧約聖書詩編118編第23節を引用してラテン語でこう語った。 "A Domino factum est istud, et est mirabile in oculis nostris"（「これは神の御業です、私たちの眼には奇跡と写ります。」）。1559年1月15日、エリザベスは25歳で女王となった。ハットフィールドで、エリザベスはウィリアム・セシルを国務卿、ニコラス・ベーコンを国璽尚書になど主要人事を発表した。そして、この際に、後にエリザベスとの浮名を流すことになる幼馴染のロバート・ダドリーが主馬頭に抜擢されている。1558年11月20日、忠誠を誓うべくハットフィールドへやって来た枢密院やその他の貴族たちに対して所信を宣言した。この演説は彼女がしばしば用いることになる「二つの肉体」（生まれながらの肉体と政治的統一体）のメタファーの最初の記録である。我が諸侯よ、姉の死を悼み、我が身に課せられた責務に驚愕させられるのが自然の理です。しかしながら、私は神の被造物であることを思い致し、神の定められた任命に従いましょう。また、私は心の底から神の恩恵の助けを得ていることを望みつつ、私に委ねられたの神の素晴らしい御意志の代理人たる地位をお受けします。自然に考えれば私の肉体は一つですが、神の赦しにより、統治のための政治的肉体を持ちます、それ故に私は貴方たち全てに私を助けるよう望みます。そして、私の統治と貴方がたの奉仕が全能の神によき報告をなし、私たちの子孫に幾らかの慰めを残すことになるでしょう。私はよき助言と忠告によって全ての私の行動を律するつもりです。戴冠式の前日に市内を練り歩く勝利の行進 (en) で、彼女は市民たちから心を込めて歓迎され、（そのほとんどが強いプロテスタントの風味を持つ）式辞や野外劇で迎えられた。エリザベスの開放的で思いやりのある応対は「驚くほど心を奪われた」観衆たちから慕われた。翌1559年1月15日、エリザベスはウェストミンスター寺院で戴冠し、カトリックのカーライル司教によって聖別された。それから彼女は耳を聾するようなオルガンやトランペット、太鼓そして鐘の騒音の中で群衆の前にその姿を現した。