1960年代にはハーバード大学で大規模なシロシビン実験が行われる。1960年にメキシコでマジックマッシュルームを食べた心理学教授のティモシー・リアリーは、神秘体験をして衝撃を受け、オルダス・ハクスリーやリチャード・アルパートらと共に研究を開始。刑務所の囚人での研究や、400人ものハーバード学生らにシロシビンの錠剤を投与した結果、前向きな変化が現れることを確認。神学校の学生に投与した研究では、10人中9人が本物の宗教的な体験をしたと報告した。しかし、この時代にはLSDが豊富に出回り、キノコはまだ栽培法が出回っていなかった。乱用により1971年の向精神薬に関する条約にて、シロシビンは規制された。メキシコがキノコ自体を規制しないように呼び掛けた。1970年代に入ると、LSDの規制に伴いナチュラルな幻覚剤の人気が上昇する。世界中でシロシビンを含むキノコが発見されるのである。マジックマッシュルームが登場するカルロス・カスタネダの『呪術師と私―ドン・ファンの教え』や、テレンス・マッケナ、デニス・マッケナ兄弟による、『マジックマッシュルーム栽培ガイド』（未訳 Magic Mushroom Growers Guide）が出版され、『ハイ・タイムズ』などのカウンターカルチャー雑誌は、自宅でマジックマッシュルームを簡単に栽培するための胞子や栽培キットの販売を行うようになった。1977年9月3日、フロリダ州タンパ市郊外にてスティーブン・ポロックが採取したキノコは、シロシベ・タンパネンシス Psilocybe tampanensis と名付けられ人工栽培され広まることになるのだが、それ以来誰もこのキノコを発見していない。ポロックは1979年には国際向精神性植物学会を開催してこのキノコについて発表する。このキノコは菌核を作るという珍しい特徴を持ち、菌核には幻覚成分が含まれマサテカ族は小鳥（シロシベ・メキシカーナ）の近くに埋まっている菌核をコモロティスと呼びキノコよりも素晴らしい、神の一部として大切にしたものである。アメリカのテルユライド地域(Telluride)では、1980年からこうしたキノコの祭典であるテルユライド・マッシュルーム・フェスティバルが毎年開催されている。1987年にはガストン・グスマン（多くの菌種を発見）が、著書『シビレタケ属』（未訳 The Genus Psilocybe）にて、467種の約半分223は存在しなかったり類似の種とした。1994年に放送されたNHKスペシャル『驚異の小宇宙 人体II 脳と心』（第6集：果てしなき脳宇宙―無意識と創造性）は、メキシコの女性のシャーマンがキノコを食べて治療を行う姿が取材された。キューバでの発見にちなんだPsilocybe cubensisは、日本で1967年にシビレタケモドキと命名されたが、1997年に日本菌学会にて和名がミナミシビレタケに決定されたことが報告された。日本で「観賞用」として露店でも構わず販売されていたが、2001年4月に俳優の伊藤英明が摂取して警察が出動する騒ぎを起こすなど社会問題化した。2002年6月6日から規制された（#法規制に詳細）。第3次小泉内閣時の2005年10月に、首相官邸の植栽にヒカゲシビレタケが生えているのが発見された。日本に自生する種であるため不自然なことではない。オランダでは規制されたマジックマッシュルームに変わり、マジックトリュフが販売されている。他の俗名にはマジックストーンとか、賢者の石 (Philosopher's stone) があり、シロシビンが含まれている菌核はキノコを禁止する法律に含まれていない。うつ病や、薬物依存症、群発頭痛を治療するための臨床試験が進行しており、ロンドンの研究者はシロシビンが薬として利用可能になるのは不可避なことだと考えている（抗うつ薬の研究は行き詰っている）。先行するアメリカでの強迫性障害に対するシロシビンの有効性から、2010年までに高崎健康福祉大学にて日本原産のきのこヒカゲシビレタケの基礎研究が行われ、マウスに対するヒカゲシビレタケ抽出物のキログラム当たり0.1-1グラム投与では、抗強迫作用が見いだされた。
1921年満州鉄道から委嘱された記録映画と『夕陽の村』を撮って蒲田を去る。理由は諸説いわれる。ハリウッド式映画技術の伝授が終わり、カメラマンが育ってくるともはやヘンリーの役割もすんで居場所がなかった、あるいは新しく撮影所長になった野村芳亭が導入した、見えやすさを優先した新派スタイル映画の中に、撮影・照明技術が革新的過ぎる小谷の技術は必要とされなかった、また高額なギャラを松竹が払い続けられなかったため、などといわれる。毎日、自動車に女優を2、3人積んで、蒲田から銀座のレストランに昼食に通ったといわれる。1923年、自身のプロダクション「ヘンリー映画製作所」を設立し『舌切雀』（トーマス・栗原、関操出演）と『続アマチュア倶楽部』（トーマス・栗原監督主演、関操、葉山三千子出演）を製作。同年3月創刊された名古屋における最初の本格的な映画雑誌「中京キネマ」創刊号に寄稿。同年関東大震災に遭い、松竹が京都に設立した松竹下加茂撮影所と契約、時代劇など7本を監督・撮影した。1924年の『黒法師』（市川荒太郎主演、犬塚稔脚本）は、伏見桃山城址に厖大なオープンセットを組んで、400～500名のエキストラを動員。当時としては他に見ないスペクタクルなもので、新聞、雑誌記者も多数詰めかけ、大層な人数の群集が押し寄せたといわれる。同年、松竹下加茂を退社。この年電通映画社の母体で、日本電報通信社（現・電通）内に設置された「電通写真課活動写真係」の立ち上げに協力した。1930年日本発声映画社のチーフカメラマンとなり『中山七里』を撮影、1931年日中合作（日本発声映画＝大中国影片公司）『雨過天晴』を撮影した。本作は川谷拓三の父・川谷庄平が当初撮影予定であったという。1934年京都「エトナ映画社」設立に関与。戦後は駐留軍から招かれて、アメリカ陸軍通信隊映画班の教官となった。今東光の自伝小説といわれる『十二階崩壊』にヘンリーが登場する。この書によれば、ヘンリーは日本に招かれた時には千代子というアメリカ生まれの二世の夫人がいた。松竹時代のヘンリーは英百合子と噂があって家を空けることが多く、千代子夫人は寂しさからか、今東光や谷崎潤一郎、花柳章太郎らと交遊を持った。中でも今は千代子夫人に熱烈な恋愛感情を抱き『十二階崩壊』は、千代子夫人とのエピソードが大部分を占めている。晩年は日活の女優だった堀富貴子と結婚し「パラマウント・ニュース」極東代表、技師長となり、ニュース映画界の啓発にも一役かった。1960年、日本映画の先覚者として近代的撮影技術を確立させた功績により毎日映画コンクール特別賞。1964年、勲五等瑞宝章受章。松竹下加茂時代にハリウッドから帰米を要請されたが、ついに日本に踏みとどまった。再び人種偏見と闘うことに二の足を踏んだといわれる。ヘンリーの息子・映一は、同郷の大林宣彦の個人映画時代のスタッフで付き合いがあり、ヘンリーを二度役者として起用。亡くなる一年前に大林のCMに出演している。1972年、脳卒中により東京で死去。84歳。小谷の教えをうけた映画人は数多いが、特にカメラマンでは、小津安二郎を指導したことでも知られる碧川道夫、野村昊、水谷文二郎、吉田英男、川口和男、持田米彦らの名手が門から出ている。この他、菊地周の師匠・高場隆史はヘンリーの甥、大久保忠素はヘンリーの助監督を務めた。