複々線の緩行線部分に島式ホーム1面2線を有する高架駅。外側に2線の通過線（急行線）を持つ。かつては、池袋寄りには急行線と緩行線を連絡する渡り線が設けられており、上り線は緩行線から急行線へ、下り線は急行線から緩行線へ渡れるようになっていたが、定期列車では回送にしか使われていなかった。渡り線は2012年6月30日のダイヤ改正で使用が終了、同時に駅事務室にあった信号所も廃止となり、2013年1月に渡り線が撤去された。2001年に所沢寄りの上下線間に有効長10両編成分の留置線が1本設置され、平日朝ラッシュ時には一部の地下鉄直通電車が当駅で折り返していたほか、事故などでダイヤが乱れた場合、朝ラッシュ時以外の時間帯でも当駅で折り返しをすることもあった。また、東日本大震災に伴い2011年3月14日には全ての列車が当駅と池袋駅間の折り返し運転とされた。しかし、石神井公園までの複々線化で留置線を上り緩行線とすることから2012年6月23日に廃止され、当駅を終着・始発とする列車も同年6月30日のダイヤ改正で廃止された。開業時からエスカレーターとエレベーター、車椅子対応トイレを設置しており、バリアフリーに配慮した駅となっている。また、2005年7月には、ホーム中央部に空調装置付き待合室が設けられた。
各種レコード店系を除いたテレビショッピングではなかなか取り上げられない、大手レコード会社各社と共同企画したCD・DVDの商品を得意とし、同社の売上主力品目となっている。2008年からは「マニフィカ・ツアーズ」と題して、タレントの清水國明らが様々な場所に出向いて、その地域の特産品を紹介するという企画も行っている。出演者が各地で特産品を紹介する例は他でもよく見られるが、同社では内容を紀行番組風にしているのが特徴である。「住商ホームショッピング」時代では、エアーベッド、宝石類、外国製のダイエット器具なども販売していた。痛快!買い物ランドSHOPJIMAのVTRを流用してショップ島で販売している商品を、オープニングとエンディングと電話番号表示部分だけをショップ・マニフィカ用に編集しているものも放送している。（購入用電話番号は痛快！買い物ランドSHOPJIMAと同じ）これが放送されている放送局では痛快!買い物ランドSHOPJIMAは放送されていない。※は放映される商品
常磐線は、複々線化される前は各駅に停まる「電車」（国電）と、一部の駅にしか停まらない「普通列車」（中距離列車）が設定されていた。列車番号の末尾は「M」。かつてはアズキ色の塗装が施されていたため、快速電車の「青電」（初代）との対比において「赤電」や、中距離電車の略で「中電」とも呼ばれることもあった。その後、国際科学技術博覧会の開催決定（1985年に茨城県で開催）を機に白地に青帯の塗装に変更されたため、「白電」と呼ばれるようになった。現在はラインカラーが青であるため「青電」（2代）と呼ばれる。1971年（昭和46年）に綾瀬駅 - 我孫子駅間が複々線化され、上野駅発着の常磐快速線と、営団地下鉄千代田線（現在の東京メトロ千代田線）に乗り入れる常磐緩行線が分離された。このとき、従来の「電車」（各駅停車）は、複々線区間においては緩行線を走行し、綾瀬駅から千代田線へ直通させることとなった。この「常磐緩行線上を走行する電車」は各駅停車と呼ばれるようになり、取手駅を越えて土浦駅・水戸駅方面へ行く中距離普通列車と区別する際に使われる言葉となった。そして中距離列車は、複々線区間においては快速線上を走行することになった。現在、中距離列車は“普通”のほか、2005年7月9日より設定された“特別快速”の2種別が運行されている。前者は前述の快速電車と停車駅を統一したことから、常磐快速線内の案内名称が「快速」に変更されている。日中時間帯（11 - 14時台）の上野発は毎時09分（特別快速、品川発/上野駅10時 - 15時）・12分・32分（品川発）・52分に、取手発は毎時16分・24分（特別快速品川行き/10時 - 15時台）・42分（14時は43分）・55分（品川行き）に統一されている。上野東京ライン直通はほぼ終日に渡り設定されている（上野東京ライン開業時から2017年10月ダイヤ改正までは日中から夕方にかけてのみ設定されていた）。また、朝の下りと終電の各1本ずつ我孫子駅発着列車があり、上りの終電は直後の快速電車上野行きに接続している。さらにこの快速電車から松戸駅で北千住行き最終各駅停車にも接続している。特別快速は、2005年7月9日の設定当初は5.5往復で、2006年3月18日以降は6往復が運転されている。上野駅 - 取手駅間では日暮里駅・松戸駅・柏駅のみに停車し、取手駅以北は各駅に停車するダイヤとなった。最高速度は首都圏の普通列車で初の130km/hとされ、標準の所要時間は上野駅 - 土浦駅間55分、当線内の停車駅と上野駅間の所要時間は松戸駅15分、柏駅23分、取手駅31分であった。2015年3月14日のダイヤ改正より北千住駅に停車するようになり、所要時間はやや延びている（上野駅発着の所要時間は、北千住駅9分、松戸駅17分、柏駅25分、取手駅33分）。特別快速の運行開始の背景には並行路線となった首都圏新都市鉄道つくばエクスプレスの開業が挙げられる。つくばエクスプレスが高速運転を行ったのに対抗して設定され、当時新型のE531系が充当された。1991年3月16日の改正より、平日の朝の上りと毎日夕方の下りに通勤快速が運行されていた。本数は朝上り最大3本・夕方下り1本であったが、2005年7月9日より朝上り2本のみに削減され、2006年3月18日改正をもって普通列車に置き換えられ、すべて廃止された。上野駅 - 土浦駅間の停車駅は日暮里駅・松戸駅・柏駅・取手駅・牛久駅であった。このほか、毎年8月にはひたちなか市の国営ひたち海浜公園で開催されるROCK IN JAPAN FESTIVALの帰宅の足として臨時快速列車が運転されていた。2011年までの当線内の停車駅は、上りは取手駅・我孫子駅・柏駅・松戸駅・北千住駅・日暮里駅・上野駅である。2012年は、天王台駅・南千住駅・三河島駅にも停車した（2013年からは取手止まり）。2008年と2009年に運転された下り列車は、快速と同じ停車駅であった。