経済企画庁政務次官（1997年8月～）を務めていた1996年1月9日、バブル崩壊後に多額の不良債権を抱え大きな社会問題となった住宅金融専門会社から600億円を超える多額の融資を受けて焦げつかせていた大阪市中央区南船場に本店を置く不動産会社「メイセー」（金田直己社長）の役員として、総額2000万円もの報酬を受け取っていたことが発覚した。同社は住宅分譲、ビルの建設・販売・賃貸などをしているとされ、第一勧業銀行などが母体の住宅ローンサービス、信託銀行7件を母体とする第一住宅金融と地銀生保住宅ローンの4社から600億円超の融資を受けていたが、バブル崩壊後の1994年4月末時点で、1千億円を超える負債と93億円余の欠損を抱えた。村田は1989年4月に大蔵省を退官後、同年夏に同社役員に就任、翌1990年2月に衆議院議員に初当選している。「関連会社等報告書」（1993年4月提出）によれば「同社非常勤取締役」、同報告書（1994年5月提出）では「同社顧問」となっており、同社の法人登記簿では1995年12月11日付で取締役を辞任したとされている。村田を顧問に起用した理由について、同社長は、村田が影響力を持つ金融当局や国税方面への便宜を期待したものではなく、在中国日本大使館二等書記官という国際的な経歴を重視したものだと新聞取材にコメントしている。
2009年1月13日、衆議院予算委員会において村田が無許可でデジタルカメラを持ち込み撮影したところ、その様子を菅直人らに発見され、委員長がカメラを没収する事態となった。衆議院規則においては、委員会を撮影する場合は委員長の許可を要すると定めている。しかし、村田は同規則に違反しカメラを無届で持ち込み、委員会の審議を勝手に撮影していた。ところが、撮影に気づいた野党議員らが激しく抗議するなど混乱したため、委員会審議が一時中断する騒ぎとなった。衆議院予算委員長の衛藤征士郎が「委員長の許可なくしてカメラの撮影は厳禁いたします。なお、撮影したフィルムは、委員長が直ちに没収します。カメラを委員長のもとに、ここにお持ちください」と宣言し、国会法の秩序保持権に基づきカメラをその場で没収処分とした。撮影した理由について、村田は「自分のホームページ用に撮影した」と釈明した。日本共産党の穀田恵二国会対策委員長は「委員会の開催中に与党の国対幹部が野党の行動を撮影するなど、前代未聞で論外だ」厳しく批判した。民主党は同日「盗撮的行為で容認できない」として、衆議院に対し村田の懲罰動議を提出した。
村田は、1981年に大阪国税局調査部長に着任してから部落解放同盟幹部で山口組系暴力団元幹部で財団法人飛鳥会理事長の小西邦彦と知り合い、共に北新地のクラブを親しく飲み歩く仲となり、小西から選挙で全面支援を受け、その見返りとして飛鳥会に関する脱税告発を握り潰すなどの便宜を図っていた。この蜜月関係は2006年に小西が飛鳥会事件で逮捕されるまで続いたが、マスコミの取材に対して村田は「暴力団とつながりのある人とは知らなかった。解放同盟の有力者だからお付き合いした」「選挙で応援してくれた」と答えた。この他、小西が理事長を務める社会福祉法人「ともしび福祉会」の役員に村田の秘書が就任していたため、大阪府知事太田房江が2006年5月24日の大阪府議会で「暴力団を取り締まる国の責任者の秘書が暴力団とつながりのある団体の役員等に就任していたことをどう思うか」と質問を受けたこともある。
2012年（平成24年）4月に、東京都が尖閣諸島を地権者より購入する計画について記者会見し、2012年4月27日より東京都によって東京都尖閣諸島寄附金が募られた。寄附金は2012年10月24日現在で14億7800万円。石原は寄附金を基金化し総選挙後の新政権に託す考えを示している。東京都による尖閣購入計画が持ち上がっていた当時、自民党は所属全議員に対し、賛成しないよう緘口令を敷いたという。
1892年（明治25年）2月5日、滋賀県彦根市近郊の士族野津家に生まれる。彦根第一中学校、1913年（大正2年）7月第三高等学校第二部乙類を卒業し、1916年（大正5年）京都帝国大学理科大学を卒業する。卒業後神戸の鈴木商店（現双日のルーツの一つ）に入社し化学研究所に勤務、1921年（大正10年）1月大日本木管（紡績用木管類を生産）に転職した後、同年12月京都帝国大学理学部小松茂教授の下で講師になる。大学では久原躬弦教授に指導を受け「アミノメチルフェニカルビノールのベンゾイルエスチルの合成」卒業研究を行った。1923年（大正12年）助教授に昇任、有機化学研究のため1925年（大正14年）アメリカ・イギリス・ドイツ・フランスへ留学し、翌年4月17日理学博士の学位を授けると共に教授に就任し、化学第三講座（有機化学）を担当した。英国ではオックスフォード大学のロビンソン教授（1947年ノーベル化学賞授賞）に、ドイツではフライブルク大学シュタウディンガー教授（1953年ノーベル化学賞授賞）に指導を受けた。1946年（昭和21年）京都大学化学研究所第5代所長に就任（1948年（昭和23年）退任）し、退官後1955年（昭和30年）3月9日京都大学名誉教授となった。その間、理学部長、日本学術会議会員、日本化学会長等の要職を歴任し、退官後も甲南大学教授に招かれて文理学部長（後に理学部長）となり、日本放射線高分子研究会大阪研究所長を兼務したが、1957年（昭和32年）10月27日65歳で胃癌により急逝した。