前項で細川稙国は大永5年4月21日に細川京兆家の家督を父・高国から譲られ管領職を継いだと記載したが、実際には家督継承時にも同年6月14日には細川京兆家の当主として幕府に初出仕している時にも、管領就任に関する命令が将軍足利義晴から出された記録は無い。そもそも、管領職自体が、大永元年（1521年）12月に義晴の元服関係の儀式終了後に高国が辞任した後はずっと空席のままであったと考えられている。
前項で生年を永正5年（1508年）としたが、その10年前の明応7年（1498年）とする説もあり、以下のことを踏まえればこちらの可能性が高い。一つ目に、現実的に考えて、18年の生涯の中で息子（頼国）が生まれているというようには考え難く、生きた年数を28年とすればまだあり得るという考えである。二つ目に、足利義稙から偏諱を授与された稙国に対して、叔父、すなわち父・高国の弟にあたる晴国、通政（のち輝政）が義稙の後に将軍となった義晴、義輝から偏諱の授与を受けていることである。将軍から偏諱を賜うのは、元服時に行って諱を確定する際が一般的であるため、この順序から言えば稙国の方が年長者と考えられる（甥が叔父より年上であることは珍しくはない）。晴国の生年は長年不詳とされてきたが、近年馬部隆弘が『後法成寺関白記』永正13年8月29日条にある「房州家督誕生」記述を晴国の誕生記事であると結論づけた。従って、稙国が死去した当時の晴国はわずか10歳でまだ元服を行っていなかったことになる。また、馬部は通政（輝政）を長府細川家が創作した架空の人物とも結論づけている。前述の通り、永正5年（1508年）は義稙が復権した年であり、義稙が高国との確執により出奔した大永元年（1521年）までの間に偏諱の授与が行われたかどうかということになる。14歳という年齢は逆に元服には十分な年齢であり、これだけで考えれば永正5年（1508年）生誕説でも差し支えない。また、前述の通り生年を1498年とするならば、父の高国は当時14～15歳という事になる（高国は1484年生まれ）が、この歳で子供がいたとは考えにくい。いずれにせよ、明確にする史料はないため、謎のままである。
永正5年（1508年）、細川高国の子として生まれる。のち元服時には、父により擁立され、同じく1508年に将軍に復職していた足利義稙より偏諱を賜い稙国と名乗る。大永5年（1525年）に厄年を迎えた父が4月21日に出家して法体の身となったため、家督と管領職を父から譲られて後を継いだ。しかし10月23日（12月説もある）、病のため早世した。管領職を譲られてわずか半年のことであった。これに父である高国はひどく落胆したという。享年18。子の頼国は後に東国に流浪したとされる。
諏訪氏の文明の内訌の際に惣領家と対立した高遠継宗の子とも孫（父は高遠満継）ともいわれる。諏訪頼満が諏訪氏を統一すると抵抗するもその傘下となった。のちに頼満の娘を妻に迎えている。戦国期に甲斐国守護武田氏と信濃諏訪郡の諏訪氏は同盟関係を結んでいたが、天文10年（1542年）6月に武田氏では武田晴信（信玄）が当主になると、晴信は信濃侵攻を本格化させ、諏訪氏との同盟を破棄して諏訪郡へ侵攻する。翌天文11年7月2日、頼継は武田氏の諏訪侵攻に与し、諏訪頼重の本拠上原城（長野県諏訪市）へ侵攻する。頼重は武田方に降伏すると同年7月に甲府へ護送され自刃する（『高白斎記』『守矢頼真書留』）。諏訪領は宮川を境に武田氏と分割され頼継は西半分を支配していたが、諏訪氏惣領を志向する頼継は伊那郡福与城の藤沢頼親らと武田領へ侵攻する。しかし同年9月25日には宮川の戦いにおいて武田方に敗退し、諏訪から退去した（『高白斎記』）。武田方はさらに伊那の藤沢頼親や小県郡長窪城の大井貞隆らを攻め、天文14年（1545年）4月17日には高遠城も落城し（高遠合戦）、頼継も武田方に降伏し、甲府へ出仕する（『高白斎記』）。高遠城はその後武田氏により改修され、信濃支配における拠点となる。天文17年（1548年）2月14日、武田方は小県郡の村上義清との上田原の戦いにおいて敗退すると同年7月に諏訪西方衆が謀反を起こすなど武田の支配領域では動揺が起こるが（『高白斎記』『勝山記』）、頼継は同年4月3日に甲府から高遠城へ帰城している（『高白斎記』）。その後、再び武田氏に出仕しているが、天文21年（1552年）の下伊那攻めの際に自害させられた。法名は大用普徹大禅定院。それに代わって高遠氏重臣の保科正俊が武田氏に重用されるようになった。高遠氏は従来、頼継の死去をもって滅亡したと考えられていたが、近年は高野山成慶院に伝来する『甲斐国過去帳』の記載から、永禄5年（1562年）に諏訪惣領家を継いだと見られていた信玄四男の勝頼が高遠諏訪家を継いでいたことが指摘されている。