正常なRasは受容体型チロシンキナーゼにより必要に応じて活性化されるが、上流からのシグナルがなくてもRasが常に活性化されるようなことがあるとがん化を引き起こしうる。Rasのアミノ酸配列のうちGTPが結合する窪みにあるGly13とGln61に別のアミノ酸と入れ替わるミスセンス変異があると、そのような変異型RasはGTPと結合できるものの、GTPを加水分解できなくなり、常に活性化することになる（一方で、Rasのナンセンス変異はがん化に寄与しない。というのもそのような変異型Rasは機能を失い下流のシグナル経路を活性化できないからである）。これに加えて、下流の分子に変異が起こるとがん化するリスクがさらに高くなる。
RalはRasと似た分子で、GTPと結合すると活性化され、GDPに変換されると不活性化する（RalもRho、Rasと同じRasスーパーファミリーに属する）。RalのGDPをGTPに交換するのがRal－GEFであるが、これはRasによって活性化される。Ral蛋白質は細胞の運動性の調節に関わっていると考えられている。
Rafの過程は蛋白質のリン酸化が中心の経路であったが、PI3Kの経路ではPIP₃（ホスファチジルイノシトール三リン酸）という蛋白質でないセカンドメッセンジャーを介して行うのが特徴である。この経路はアポトーシスの抑制や細胞の大きさの成長で重要である。まず、PI3キナーゼ（PI3K）がRasと会合すると細胞膜上のリン脂質の中のPIP₂（ホスファチジルイノシトール二リン酸）をリン酸化することでPIP₃を生じる。PIP₃はプレックストリン相同性ドメイン（PHドメイン）をもつAkt（プロテインキナーゼB）やRho-GEF（RhoのGDPをGTPに交換する分子）を活性化する。Aktはアポトーシスを促進するBadや、増殖を抑えるGSK-3β、細胞の成長を抑えるTsc2などを阻害することで細胞の増殖・成長を助ける。RhoはRasスーパーファミリーに属する分子でRasと同様GTPによって活性化された後、細胞骨格の立体配置の変換や細胞の周囲環境との物理的接着に関与する。RasはRho-GEFに働きかけRhoのGDPをGTPに交換し細胞の運動性を変化させる。PIP3の濃度は通常、その脱リン酸酵素であるPTENにより低く抑えられており、PI3Kの経路が過剰に活性化されないようになっている。
Rafを活性化する経路はRasの下流として最初に見つかったものである。この経路は転写など細胞の増殖上重要である。まず、Raf（MAPキナーゼキナーゼキナーゼ）が活性化したRas（RAS-GTP）と会合するとMekをリン酸化して活性化する。活性化したMek（MAPキナーゼキナーゼ）はさらにErk（MAPキナーゼ）をリン酸化して活性化する。そのErkが転写や蛋白質の合成に関わる分子群（MAP: mitogen-activated protein）を活性化する。このようなリン酸化が続く過程のゆえMAPK（MAPキナーゼ）経路とも呼ばれる。
不活性なRasはGDPと結合しているが、これがグアニンヌクレオチド交換因子（GEF）によりGTPと交換されると活性化する。PDGF（血小板由来成長因子）やNGF（神経成長因子）、EGF（上皮増殖因子）などを含む事実上すべての受容体型チロシンキナーゼ（チロシンキナーゼ受容体）（RTK）が何らかの分子を介してRasを活性化する事が知られている。例えばEGF（上皮増殖因子）の場合、受容体に基質が結合しEGF受容体の特定のチロシン残基がリン酸化されると、それを認識するSH2というドメインをもつGrb2という蛋白質が引き寄せられ活性化したEGF受容体に結合する。すると、Grb2のSH3というドメインを介してSosが結合し活性化する。SosはRas-GEFとしてRasのGDPをGTPに交換しRasを活性化する。ただし、EGF受容体とGrb2との間にShcがはさまることもある。このようにして活性化されたRasはGTPase活性化蛋白質（GAP）と結合するとGTPを加水分解してGDPに変えることで不活性型となる。
第1次調査は1962年（昭和37年）に立教大学、同志社大学の共同調査で始められ、1975年（昭和50年）にははす川拡幅・護岸工事に伴い県教育委員会の緊急調査が始まり、1980年（昭和55年）から1985年（昭和60年）まで連続調査があり、10次にわたる調査が実施された。第3次調査までは、地下約3メートルの深さまで掘り進んだ。第4次調査から地下鉄工事のように鋼矢板を用いた。1975年（昭和50年）から考古学と主に自然科学分野の学際的研究が行われた。1980年から1985年までの連続調査では「縄文人の生業を復元してみよう」という統一テーマが設定された。遺跡は、海抜0m〜-4.0mにある低湿地帯貝塚で、赤漆塗の櫛をはじめとする漆製品、石斧の柄、しゃもじ、スコップ状木製品、編物、縄などの有機物遺物やヒョウタン・ウリ・アサ・ゴボウ等の植物遺体、丸木舟、糞石など、通常は腐食して残りにくい貴重な遺物が、水漬けの状態で良好に保存されていたため、「縄文のタイムカプセル」と呼ばれることがある。また、網漁に用いられる縄文草創期の打欠石錘が出土しており、2002年時点で国内最古の石錘の出土事例とされている。何度かの発掘で、約5,500年前の遺物層が約60cmの厚さで検出され、その中には、ドングリ・クルミなど堅果（ナッツ）の種子層、魚骨やウロコなどの魚骨層、淡水産の貝殻の貝層が確認された。これらの堆積状況から、秋に採取した森の食べ物を秋から冬にかけて食べ、春には三方湖で魚や貝をとっていたことが分かった。また、土壌の水洗選別を行った結果、夏は若狭湾に回遊するマグロ・カツオ・ブリ・サワラなどの海水魚を捕って食べていたことがわかり、季節に応じた食生活の様相が明らかとなった。