石原は、中央区築地にある築地市場を、施設の老朽化やアスベスト問題のため、2012年度を目処に江東区豊洲地区へ移転させる方針を明らかにしているが、予定地である東京ガスの工場跡地において、環境基準を超える毒物（鉛・ヒ素・六価クロム・シアン・水銀・ベンゼンの6種類が国の環境基準を超えており、発癌性物質であるベンゼンにいたっては国の基準の1500倍である）が検出されるなど土壌汚染が判明している。また、土壌を入れ替え、アスファルトで被覆する都の対策では不十分との指摘がある。一部の関係者は「生鮮食品を扱う市場の移転先としては論外」とし、築地市場移転反対派の団体「市場を考える会」が中心となって移転反対運動を行っている。石原は「築地は古くて清潔でない。都民や消費者の利益を考えれば、市場を維持するわけにはいかない。ほかに適地はない」と述べて、移転計画に変更は無いとし、移転後の跡地には「2016年東京オリンピック」のメディアセンターを建設する構想を明らかにしている。また、石原は2006年（平成18年）9月8日の定例記者会見において築地市場跡地に「NHKが移転する」と発言したが、NHKは「そんな計画はない」と否定している。2007年（平成19年）10月6日には、東京都は移転予定の豊洲において調査した56カ所のうち14カ所で有害物質のベンゼンが基準値の1000倍の値で検出されたと発表した。
石原は2000年（平成12年）に発生した三宅島火山の噴火による観光客減少への対策として、イギリスのマン島で行われているマン島TTレースを参考に、日本初となる一般道路を使用した本格的なオートバイレースを三宅島で開催することを提唱した。レースは東京都と三宅村が主催し、2007年（平成19年）11月9日から11日に開催が予定されていたが、「公道でスピードを競うのは危険すぎる」との意見が本田技研工業など二輪大手4社から続出し、中止が決定した。都は、専門家による検討経費などに4000万円、都道改修に3億円を2007年度予算に計上していた。結局、三宅村では代替イベントとしてチャレンジ三宅島モーターサイクルフェスティバルを開催することを発表している。東京都が2006年（平成18年）に三宅島で実施したテスト走行に参加したプロレーサー3人のうち2人が報告書で危険性を指摘し、公道レースの開催に反対を表明していることが2007年（平成19年）2月23日の都議会で明らかになっており、バイクレースの専門家からも「殺人レースだ。絶対にやめるべし」と批判されていることに対し、石原は「レースは危険があるからエキサイトする。ある程度ライダーの自己責任もある」として同レースを強行する姿勢を示していた。また、『朝日新聞』は「三宅島は現在も火山ガスが噴出しており航空路は再開していないため、観光客誘致の起爆剤となるのかは未知数」と報じた。石原は観光客や機材の輸送には海路を用いる考えを示していた。
全国市民オンブズマン連絡会議による2006年（平成18年）の第11回全国情報公開度ランキングでは、東京都は閲覧手数料を徴収するという理由により「失格」となり、ランキング外となった（他の失格自治体は香川県のみ）。情報公開度のポイント評価は全国47都道府県中ワースト3に相当する位置付けとなっている。東京都のこの調査における失格評価は石原都政以前も含み2007年まで10年連続である。石原は「公開請求の55%は都外の人で、東京での業務展開に必要とする人が多い。都民の税金を使うわけにいかず、『失格』というのはとんちんかん」と反論している。
都心部である千代田区紀尾井町に残るわずかな緑の空間を候補地にした、参議院による新清水谷議員宿舎建て替えに反対を表明した。2008年12月、石原と西岡武夫参院議院運営委員長、石川雅己・千代田区長の三者は計画を白紙に戻すことで合意した。
1941年5月、クルーガーは臨時に中将に昇進し、第3軍と南部防衛司令部の司令を兼ねる。クルーガーは、この2つのポストで第二次世界大戦参戦を迎えることとなった。1943年1月、クルーガーはオーストラリアに赴いて新編成の第6軍の司令官となる。第6軍の下には第1軍団、第10軍団、第14軍団および第24軍団がおり、クルーガーの第6軍はこれら4軍団を中心として日本軍と対峙することとなった。第6軍はカートホイール作戦の主軸として、ウッドラーク島およびキリウィナ確保のクロニクル作戦（1943年6月）を手始めに、ニューブリテン島（1943年12月 - 1944年2月）、アドミラルティ諸島の戦い（1944年2月 - 5月）、アイタペの戦い（1944年7月 - 8月）およびモロタイ島の戦い（1944年9月 - 10月）と飛び石作戦で攻め上り、1944年10月からのフィリピンの戦いでもレイテ、ミンドロを経てルソン島と日本軍を追い詰めていった。一連の戦いのさなかであった1943年11月、クルーガーは最高機密部隊としてアラモ・スカウトを編成し、戦線に投入した。部隊名はテキサス州サンアントニオのアラモ伝道所にちなみ、クルーガーは小規模な志願部隊のアラモ・スカウトに高度な訓練を施し、敵陣奥深く入り込ませて情報収集や戦術的な偵察を行わせて第6軍の上陸作戦などの助けにした。1945年3月、クルーガーは四つ星の大将に昇進。日本が降伏したあとの1945年9月には日本に進駐して占領行政の一翼を担った。1946年1月にいったん中将の地位に戻るが、1946年7月に大将の地位をもって退役した。