前身の内閣官房情報セキュリティセンターは2005年4月25日、さらにその前身である情報セキュリティ対策推進室の機能を強化して設置され、IT戦略本部の「情報セキュリティ政策会議」とともに日本の情報セキュリティ対策として中心的な役割を果たした。情報セキュリティ政策会議は、2005年5月30日にIT戦略本部令により日本政府が設置を決定した会議（それに伴い、「情報セキュリティ対策推進会議」を廃止）であり、第1回の会合は2005年7月14日に開催された。情報セキュリティセンターには5つのチームが設けられ（2010年現在）、クラッカー (コンピュータセキュリティ)対策の立案、国際会合のFIRSTへの参加、政府機関情報セキュリティ対策統一基準群の作成、サイバー攻撃の未然防止、ライフラインである重要インフラの防護など、官民一体となって取り組むものとされた。2015年1月9日、サイバーセキュリティ基本法の施行に伴い内閣に「サイバーセキュリティ戦略本部」が設置され、同時に、内閣官房に従来の内閣官房情報セキュリティセンターを改組して「内閣サイバーセキュリティセンター」が設置された。JPCERT/CCと共に、日本における実質的なナショナルCSIRTの役割を果たしている。
内閣サイバーセキュリティセンター（ないかくサイバーセキュリティセンター、英: National center of Incident readiness and Strategy for Cybersecurity、略称：NISC）は、2015年1月9日に日本政府が内閣官房に設置した組織。前身は、2000年に設置の内閣官房情報セキュリティ対策推進室（ないかくかんぼうじょうほうセキュリティたいさくすいしんしつ）、およびそれを改組して2005年に設置された内閣官房情報セキュリティセンターである。
10月20日耳川以北に布陣していた大友軍が南下を再開、島津方の要衝高城を包囲した。佐土原城主の島津家久は高城に急行し、高城城主山田有信とともに守りを固めた。大友軍は数千丁の鉄砲と国崩しと呼ばれる大筒を使用して3度にわたって攻撃を行ったが、島津家久と山田有信は城を守りぬいた。10月24日島津義久は薩摩・大隅の軍勢を動員、3万の兵を率いて鹿児島を出陣した。島津軍は紙屋城を経由して佐土原城に入ると日向各地の守兵をあわせ4万の軍になった。11月9日島津義弘、島津征久、伊集院忠棟、上井覚兼らの諸将が財部城に入り軍議を開いた。松原に布陣する大友軍を撃破するため陽動部隊と3つの伏兵部隊が小丸川を渡河して出立し、島津義弘は小丸川の南岸に布陣し戦況を見守った。300の陽動部隊がまず松原の大友軍を襲撃、荷駄を破壊し75人を討ち取った。事態に気付いた大友軍が松原の陣に急行すると、陽動部隊は伏兵の埋伏地点に退却した。また伏兵を支援するため高城の島津家久が出撃、大友軍本隊を牽制した。3つの伏兵部隊は埋伏地点におびきだされた大友軍を殲滅、敗残兵を追って松原の陣に突入し火を放った。島津義弘、島津征久、島津忠長、伊集院忠棟らの主力部隊も混乱に乗じて渡河し、高城川の南岸に布陣した。島津軍は大友軍の陣に火矢を放ち、伏兵によって各陣地を寸断した。前哨戦の敗北により大友方は田原親賢ら16人の使者を島津の陣へと派遣、講和を申し出た。一方で大友軍は主戦派と講和派に割れ方針が不明確だった。軍議では主戦派の田北鎮周は交戦を主張していたが、大将の田原親賢は島津軍との和睦交渉を進めていたためこれに応じなかった。田北鎮周と佐伯宗天がこれを不服として島津軍に攻撃を仕掛けたため大友軍はこれを放置するわけにもいかず、やむなく島津軍と戦うことになった。また、大友軍の軍師角隈石宗は「血塊の雲が頭上を覆っている時は戦うべきでない」と主張するも結局交戦に至った。佐伯宗天は当初慎重論を唱えていたが、軍議の席で田北に侮辱され、それが原因で田北とともに攻撃を仕掛けた。一方大友方の軍議を知った島津義久は決戦に備えて諸将を埋伏させ、自らは1万の兵を率いて根白坂に布陣した。島津征久の馬標が攻撃の合図となり、馬標がたてられるまで攻撃は禁じられた。11月12日の朝、田北・佐伯の軍勢が小丸川北岸に布陣する島津軍前衛への攻撃を開始した。大友軍の本隊も二人に続き、島津軍前衛部隊は壊滅、北郷時久、北郷久盛らが戦死した。勢いにのった大友軍は小丸川を渡ると島津義久本隊へと殺到した。島津義弘、島津歳久、伊集院忠棟らが大友軍をむかえうち、伏兵部隊を指揮する島津征久が大友軍の陣形が伸びきった段階で馬標を立てた。前後左右から伏兵が大友軍に襲いかかり、高城の島津家久、根白坂の島津義久も攻撃に参加した。包囲された大友軍は崩れて敗走、一部の部隊は竹鳩ヶ淵へと逃走、多くの兵が溺死した。ここで佐伯宗天も戦死している。川原、野久尾の陣が陥落、本陣も制圧されると大友軍は耳川方面へと逃走。島津軍は敗走する大友軍を追撃し多くの首を挙げた。大友軍は3000人近い人数が戦死したが、これの大半は敗走後に急流の耳川を渡りきれず溺死した者や、そこを突かれて島津軍の兵士に殺されたものだという。敗報を知った宗麟は単身豊後へと逃走。耳川の合戦は島津家の勝利に終わった。