本籍は咸鏡北道会寧郡（現会寧市）鳳儀面南山洞で、裕福な家庭に育った。1921年日本に渡る。1923年関東大震災後千葉中学校3年に編入され、1927年春卒業。在学中親の事業が失敗して仕送りが途絶え、学校側の配慮で「理科の助手」として雇われ、苦学を経験した。日本大学専門部に入学するが、一時期の通学に終わる。在日本朝鮮労働総同盟（労総）に加入し、東京朝鮮労働組合北部支部員として活動を始めた。労総が全協に解消後は、金斗鎔が朝鮮語訳した「議会解散選挙闘争方針書」を1930（昭和5）年1月に金凡伊と協力印刷して、東京朝鮮労働組合東京支部、北部支部の各班に配布した。これが原因となり4月4日、治安維持法違反（目的遂行）容疑で在日本朝鮮労働総同盟（在日朝総）幹部らとともに検挙されたが、不起訴処分となった。11月1日現在で日本労働組合全国協議会（全協）系の関東木材労働組合（組合員20名）の中心的活動家となり、東京市深川区木場の製材所に働きつつ、東京東部を拠点に労働運動に携わっており、また、朝鮮共産党日本総局との関係の有無は不明ながら、遅くとも1930年中に再建途上の日本共産党に入党した、とみられる。党では東京市委員会江東地区厩橋細胞責任者となった。やがて全協傘下の日本土木建築労働組合結成にかかわり、江東地区委員として積極的な活動をするに至る。全協組合員の30％を超える朝鮮人労働者の中で最も信望の厚い日本共産党員であった。1932年8月、共産党によって、岩手県矢作村鉄道工事現場における虐殺事件に関連して、全協の活動家宮上則武（党名松原）につらなるスパイと決め付けられ、1932年8月15日、下谷区上野恩賜公園で同党の活動家により射殺された（尹基協射殺事件）。実行犯とされたのは同年8月17日逮捕された村上多喜雄（治安維持法違反容疑、殺人罪では立件されていない）で、当時共産党東京市委員長。共産党一斉検挙の際、短刀で特高課の警部を刺して逃走中の身だった。一審では無期懲役、二審で転向を表明して懲役15年となった。村上は獄中で「尹は絶対にスパイではない」「自分は取り返しのつかない誤りを冒した」「党中央にはスパイがいるに違いない」と確信して「死を賭した叫び」を党中央の紺野与次郎に伝えるが反応がなかったという。村上は1940年、江古田療養所で腸結核により死去。尹をスパイと断定して射殺させたのは、共産党史上最大のスパイといわれる飯塚盈延（「スパイM」、党名松村）であったという。
1949年、小岩井農場で開催された最後の競り市に上場された。馬主・北竹清剛から「どうしてもダービーを勝ちたい」と要望され馬を探していた調教師の鈴木勝太郎が競り落としたものであった。父は戦前から数々の活躍馬を輩出していたプリメロ、祖母に帝室御賞典優勝馬ロビンオー（繁殖名マンナ）を持つ良血馬であり、雄大な馬格も相俟って、この競りで2番目の高額馬となった。しかし脚が曲がっていた上、装蹄の失敗により蹄の形が左右不揃いという欠点も抱えており、デビュー前に鈴木が騎乗依頼をした中村広、二本柳俊夫といった面々にはいずれも断られた。田中朋次郎が騎乗した初戦（3着）を経て、2戦目から「近所にいた」橋本輝雄が騎手として定着。その朝日杯3歳ステークスは9頭立ての最下位に終わると、以後も連敗を続け、翌1950年4月9日に8戦目でようやく初勝利を挙げた。なお、これは日本ダービー歴代優勝馬の中で、初勝利までに要した最多出走記録である。その後、続く2戦を3、2着として5月5日にクラシック初戦・皐月賞に臨んだ。当日は10頭立て4番人気の評価だったが、降雨による不良馬場を利して、前走負かされていたハイレコードに4馬身差を付けて優勝した。橋本によれば、クモノハナは「水かきを付けているように重馬場が上手」な馬であり、「乗っている僕もアッとおどろくような勝ち方」だったと回想している。なお、クモノハナは9勝のうち6勝を稍重よりも悪い馬場状態で挙げており、しかも出走した28レース中17戦で馬場状態が稍重よりも悪かった。次走のハンデ戦は2着に敗れたものの、日本ダービーへの前哨戦を3馬身半差で快勝し、6月11日にダービーに臨んだ。当日は皐月賞に続く雨天の不良馬場、当時最多となる26頭の出走馬が揃い混戦模様を呈す中、オッズ4.8倍の1番人気に支持された。スタートが切られると、橋本クモノハナは先行勢7-8頭の中を進んだ。最終コーナーからは6番人気のキミガヨ、13番人気のアンダーフェアが抜け出しを図ったが、直線半ばで両馬を捉え、キミガヨに1馬身余の差を付けて優勝。1941年セントライト以来の皐月賞・日本ダービー連覇を達成した。また、橋本は1944年カイソウ以来のダービー優勝で、史上初の2勝ジョッキーとなった。橋本は前夜にNHKのラジオ番組『二十の扉』に出演、この時すでに雨天だったことから、翌日の重馬場を見越して「勝つ」と予告した上での勝利であった。後に競馬法で事実上厳禁となった騎手や調教師の予想行為は当時容認されていたことであったが、橋本本人は出演後に当時国民的メディアであったNHKラジオで勝利予告をしてしまったことの重大さに気付き、気が昂ぶって全く眠れなかったという。「馬が強かったから良かったものの、勝てなかったら赤っ恥をかくところだった」と後に語っている。夏を休養に充て、9月に復帰。3戦2勝という成績で進んだ後、10月29日、セントライト以来2頭目の三冠が懸かる菊花賞に臨んだ。当日は50%近い単勝支持を受けて1番人気に推された。レースはレコードオーがハイペースで逃げ、これにつられたハタカゼが2番手、同馬を相手と見た橋本クモノハナがマークする形で3番手を進んだ。第3コーナー付近でハタカゼが先頭に立ち、追うクモノハナは残り200m付近でこれを交わして先頭に立った。しかし、スタートでの出遅れから待機策を採っていた浅見国一騎乗のハイレコードが後方から追い込み、競り合いの末クモノハナはアタマ差交わされて2着、三冠を逃した。後に橋本は「先頭に立ったところで勝ったと思った。あれが油断だったんだな」と反省の弁を述べたが、浅見は「本当はクモノハナが勝っていたレースです」と相手を立てている。なお、橋本は調教師転向後の1958年に浅見を乗せたコマヒカリで菊花賞に優勝。その競走前、騎乗に関して浅見に付けた注文は「ハイレコードと同じ乗り方」であったという。菊花賞以後は一般のオープンやハンデキャップ競走を10戦3勝という成績で、翌1950年秋をもって引退。軽種馬農協に買い上げられ、東北支部（青森県）で種牡馬となった。産駒は中山大障害（春）に優勝したクロシオや23勝を挙げたアングロアラブのマルキシオー、キヨフジ記念に優勝しオペックホースの祖母となったステツプホースらを出すに留まり、 1959年に廃用となった。以後の消息は不明である。