5チャンネル体制崩壊後も存続していたが、1998年、全国オートザム店の店舗規模・売り上げ等に一定の基準が設けられ、基準をクリアした店舗の看板は「マツダオートザム」と掲げられることとなった。「マツダオートザム店」に変更した店舗はファミリア・ボンゴ・プレマシーの販売権を与えられ、取り扱い車種はマツダ店と同一化が図られる。また、チャンネル発足時の主力販売車両であった軽自動車は、独自開発車両の開発は止めてスズキからのOEM車となる。チャンネル再編期では、マツダオートザム店に移行できなかったオートザム店は、看板はそのままで取り扱い車種も軽自動車とデミオだけだったが、新機種としてAZ-オフロードとラピュタがマツダオートザム店と併売されていた。この2車以降「オートザム店」への新機種投入は無くなり、以降の新機種を取り扱うためにはマツダオートザム店に移行しなければならなくなった。基準未達成の店舗は新機種の販売権を与えられないままディーラー権を返上していき、結果2000年代前半までに、約900店舗あったオートザム店は350店のマツダオートザム店へと変わった。また、ランチアの正規輸入権も1998年までに返上した。2001年には株式会社オートザムと地区卸会社が合併して「株式会社マツダオートザム」となり、全国1社で販売網を統括する体制になった。その後は、2003年にアクセラ、2004年3月にMPV・トリビュート・ボンゴフレンディの取り扱いを開始。マツダの他のチャンネル（マツダ店・マツダアンフィニ店）でも、オートザムの専売車種だったキャロル・スピアーノ・AZ-ワゴン・スクラムを取り扱う様になり、他の販売チャンネルとの差別化は無くなっていった。2016年4月より、これまで販売されなかったマツダ車の最上位車種であるアテンザ、ロードスター、ファミリアバン、タイタンの取り扱いを開始。これにより、マツダオートザム店の名称は残るものの国内販売チャネルの事実上の1本化となった。それに伴い「株式会社マツダオートザム」は業務を停止し、全国販売網の統括・管理をマツダ本体および各地域のマツダアンフィニ店・マツダ店が行うこととなった。
「あなたの街の身近なカーショップ」をディーラーコンセプトに掲げ、中小規模の整備工場や中古車販売店を中心に販売網を整備したことが特徴の一つである。ブランド戦略ではユーノスやアンフィニと同様にマツダの名を伏せて展開した。設立時のラインナップは軽自動車が中心で、フラグシップはクロノスの系譜のセダンであるクレフ。また、高級車ラインナップを補う目的でランチアの正規輸入権を取得し、ランチア・テーマ、ランチア・デルタ、アウトビアンキ・Y10といったイタリア・フィアットオートが製造するランチア、アウトビアンキブランドの乗用車も販売されていた。全国販売網は「株式会社オートザム」および地区卸会社(株式会社オートザム○○)が統括していた。2代目キャロルの好調な売れ行きで一時は非常に賑わったものの、若年の女性ユーザーにターゲットを極端に絞り過ぎたキャロルの人気が出過ぎたため、量販セダンラインのレビューやクレフは、2代目キャロルが持つキャラクターを踏襲した意匠にせざるを得ず、ごく一部の若年の女性ユーザー以外には全くと言っていいほど不評を買ったため、惨憺たる販売不振となった。軽スポーツのAZ-1や小型スペシャルティカーのAZ-3もそれぞれマニアック過ぎて共に販売不振となった。利益率の高い高級車ラインのランチア・アウトビアンキもイタリア車好きのマニアックな層にしか興味を惹かれず、そういったマニアすら「キャロルのオートザム」と軽薄なイメージを敬遠され、ディーラーに足を運ばなかった。結果、2代目キャロル以外まったく採算の取れる車種は無かった。そのキャロルすらも、3代目にフルモデルチェンジした際、ややファンシー風味を後退させた中途半端なレトロフィーチャー的なコンセプトとなったため2代目ほどの人気は獲得できなかった。マツダ5チャンネルディーラーの中では、ユーノス・ロードスターのみが気を吐いていたユーノスよりも壊滅的に不採算なチャンネルであり、マツダ本社の経営を著しく苦しめていた。
殆どが全国高等学校体育連盟（高体連）の下で全国高等学校総合体育大会の一環として行われているが、野球（日本高校野球連盟）とアメリカンフットボール（日本高等学校アメリカンフットボール連盟）などは別な運営が行われている。（※詳細は当該記事を参照の事。）
国公立校の場合は全ての高専が全国高等専門学校連合会に所属し、運動部は全て高等専門学校体育大会（高専大会）の元に開かれる大会に参加する。私立校の場合と、国公立校の場合でも学校によっては、運動部単位の任意で高専大会に出場するか、地域の高校や大学の競技連盟に参加するかを選択して活動している。
短大生・大学院生も含めた形になっているものもあるが、参加対象も運営団体も競技によって事情が大きく異なっている。詳細は日本の大学スポーツ競技・団体一覧に記述されている。
2001年1月13日、プロデビュー。2005年8月20日、WBC世界フェザー級暫定王座決定戦でウンベルト・ソト（ メキシコ）と対戦し、0-3（112-114、113-114、113-114）の僅差判定負けで王座獲得ならず。キャリア初黒星を喫し、デビュー以来の連勝記録は23でストップした。2006年5月20日、WBC世界スーパーフェザー級王者マルコ・アントニオ・バレラ（ メキシコ）に挑戦し、1-2の判定負けで王座獲得ならず。2006年9月16日、WBC世界スーパーフェザー級王者マルコ・アントニオ・バレラにダイレクトリマッチで再挑戦し、0-3の判定負けで王座獲得ならず。2007年11月3日、WBC世界スーパーフェザー級王者ファン・マヌエル・マルケス（ メキシコ）に挑戦し、0-3の大差判定負けで王座獲得ならず。2009年2月28日、WBA世界フェザー級王者クリス・ジョン（ インドネシア）に挑戦し、0-0の判定ドローで王座獲得ならず。2009年9月19日、WBA世界フェザー級スーパー王者クリス・ジョンに再挑戦し、0-3の判定負けで王座獲得ならず。2010年4月3日、NABF北米スーパーフェザー級王者ジェイソン・リーツォー（ アメリカ合衆国)と対戦し、ファレスの7回終了時棄権により王座獲得に失敗した。2010年7月31日、元WBC世界フェザー級王者で元WBA世界スーパーフェザー級王者のホルヘ・リナレス（ ベネズエラ）とWBAフェデラテンライト級暫定王座決定戦で対戦し、0-3の判定負けを喫し、王座獲得に失敗した。2011年2月9日、アレハンドロ・サナブリア（ メキシコ）とWBCアメリカ大陸スーパーフェザー級王座決定戦で対戦し、0-3の判定負けを喫し、王座獲得に失敗した。その後、2012年6月2日の試合までに6連敗を喫する。2014年5月26日、レネ・アルバラードと対戦し、番狂わせとなる12回3-0の判定勝ちを収め、WBCフェザー級シルバー王座を獲得した。2015年1月26日、ロビンソン・カステラノスと対戦するが、5回に1度、12回に3度ダウンを奪われ大差判定負けを喫し、試合後にリング上で引退を発表した。