戦国時代には地域一帯に一向宗が広まっており、その中心人物で、『信長公記』に二の江の坊主と記される服部左京進（左京助・左京亮とも）が、市江島の鯏浦（うぐいうら）を拠点に海西郡一帯を支配する豪族として勢力を誇っていた。服部左京進は尾張の一角にありながら織田信長の支配に与せず、1560年（永禄3年）の桶狭間の戦いの際にも今川義元の援軍として出兵している。左京進は一向宗の中心である長島城の城代を務め、蟹江に進出してきた信長勢と戦った。1565年（永禄8年）には鯏浦の東・難畑にて織田信興の侵攻を受け、1567年（永禄10年）、信興は大楠あたりに鯏浦城を築いた。1568年（永禄11年）に左京進は伊勢でだまし討ちに遭い、自刃に追い込まれたが、服部党の抵抗は続き、1570年（元亀元年）には蜂起した長島一向一揆門徒の一角として他の門徒衆と共に小木江城（現在の愛西市）を攻めて織田信興を討っている。その後、1571年（元亀2年）、1573年（天正元年）と織田方の侵攻をしのいだが、1574年（天正2年）に信長10万の兵で攻撃が開始され、「市江島から南に人影なし」と呼ばれるほど激しく焼き尽くし、信長は五明に陣を敷き、門徒宗は長島一向一揆壊滅と運命を共にした。一揆殲滅後、この地は無人となっていたが、1575年（天正3年）、服部正友らが入植し、百姓を集めて土地を再建した。市内の重要文化財「服部家住宅」は服部正友が天正年間に建てたものとされている。
原始から古代までは市のほとんどが伊勢湾の海中であり、遺跡などは存在していない。平安末期になると現在の弥富市にあたる場所には、木曽川の土砂が堆積し、小島がいくつか形成されていた。弥富町誌によれば、1106年（長治3年）、東寺文書「平盛正」にてその地を「市江」（現在の愛西市西保・東保・西條・東條および弥富市五之三・荷之上・鯏浦にかけて跨る地区）として藤原家が開墾し、荘園としたという史料として残っており、弥富の有史はこの記録からとされている。また当時、平治の乱に破れた源義朝を乗せた船が当地を通ったとの伝承がある。市江は藤原信長から藤原頼長に伝領しのち皇室領の樑江庄となった。「市江八郷」と呼ばれた市江地区は「市江島」として室町時代に開発したが、当初は尾張と伊勢の国境が曖昧であり、伊勢国に属していた。のち、市江島と五明をはじめとする輪中が形成されていったと見られている。その後、荘園制が崩壊し村々の力が強くなると村周辺を次々と開墾し、「杁」と呼ばれる技術が進むと低い土地でも堤防で囲み田畑を広げ、新田開発が発展した。水から生活を守るため、自然堤防・州上に集落は立地し、葦洲がいたるところにみられた。
大規模な戦力が遠征の準備した。これにはツァーリであるイヴァン4世自身が参加する必要があった。 カザンにおけるクリムの同盟者はロシア国境を攻撃したものの遠征が維持できたのは4日間だけであった。7月3日にロシア軍は遠征に着手した。重兵器並びに兵糧が船でスヴィヤジスクに送り届けられ、主力軍もまた2つの部隊で陸地を進んだ。イヴァン4世が指揮する北部軍には哨戒部隊、ツァーリ直属部隊並びに左翼連隊が入った。南部軍には大部隊、先発部隊並びに右翼連隊が入った。北部軍はヴラジーミルからムーロムを経てアラーティリに進んだ。南部軍はリャザンからミェーシェルを経て進んだ。両軍は大都市ボロンチェーフのスーラ川にて邂逅した。8月13日に合流したロシア軍はスヴィヤジスクに到達した。8月23日にカザン包囲の最終段階が開始された。カザン軍は襲撃に対して万全の準備を整え、要塞は十分強化された。カザンから15 ベルスターの地点に要塞都市が建てられ、そこではロシア軍を後方から攻撃するための大規模な騎兵部隊がいた。要塞都市への進入路には沼地とバリケードで覆われていた。包囲直後の8月24日に強力な嵐が生じて多くの兵糧と兵器に被害が出た。このことは上記の遠征軍に作戦上の失敗をもたらすかもしれなかった。けれども今回、ロシア軍は新たな装備が送り届けられたスヴィヤジスクに拠点を置いていた。カザン軍は例によって果敢に防衛した。ロシア軍がカザンに接近するや即座に打撃を与えたが、ストレリツィの砲火によって撃退された。程なくしてカザンは塹壕、堡籃並びに防御柵によって囲まれた。攻城塔が建設された。要塞都市にいたエパンチの部隊はロシア軍を激しく震え上がらせた。襲撃の中の一つの際に軍司令官トレチャク・イヴァノヴィチ・ロシャコフが戦死した。この後にロシア軍の司令部は敵軍の殲滅に合せる形で作戦を入念に作り上げた。ガルバーティー公とセレビャヌイー公の部隊は退却を装って敵軍を誘い出して壊滅させた。要塞都市は一掃された。この後、ロシア軍は目立った妨害を得ずにカザンを砲撃して攻城用の作業に取りかかった。カザン強襲のための準備が完全に整った10月1日に軍使が降伏案を携えてカザンに派遣された。カザン民衆は拒絶した。10月2日の朝に2つの強力な爆発が壁を破壊した。攻撃の列はカザンに突入した。タタール人は必死になって防戦した。カザンに進んだ一部のロシア軍は略奪を開始した。これに気付いたタタール人は攻勢に出た。襲撃の最中、幾つかの場所ではパニックが起こり始めた。これを見たロシア軍の司令部は泥棒兵士と騒動屋をその場で殺すことを命じて戦闘に新たな軍勢を投入した。綱紀粛正されて襲撃が継続された。モスクでは苛烈な戦闘が行われ、そこではサイイドであるクール・シャリフを長とする守備兵が全員討ち死にした。最後の戦闘はハンの宮殿で行われ、そこではエディゲル・ハンとその親族が捕虜となった。都市全土が死体で溢れていた。僅かな一部の守備兵はロシア軍の列を突破してカザンカ川を渡って追撃から逃れることが出来た。全てが終わった。1552年10月12日にロシア軍はモスクワへの帰還を開始した。アレクサンドル・ボリスヴィチ・ガルバーティン＝シュイスキー公が総督として残った。カザンの国境では数年間未だに抵抗が続いたが、これは既に何の変革をもたらすことはなかった。