彼のブルースバラード・ヒット「It's Too Late (She's Gone)」はオーティス・レディング、ロイ・オービソン、バディ・ホリーとクリケッツ、エリック・クラプトンのデレクとドミノスとジェリー・ガルシア・バンドがカバーした。2005年にはカニエ・ウェストがアルバム『レイトレジストレーション』から切った「ゴーン」で同曲を採取している。1972年にザ・バンドが代表作『ロック・オブ・エイジズ』で「ハングアップ・マイ・ロックン・ロール・シューズ」をカバーし、二枚組アルバムの最後に置いた。エルヴィス・プレスリーは『I Feel So Bad』『C. C. Rider』をカバーし、Ruth BrownとConway Twittyは『Oh What a Dream』をカバーして売れた。ウィリスのいとこです。チック・ウィリスは。
長年にわたって胃潰瘍をわずらい、腹膜炎の手術中に死亡した。30歳でキャリアのピーク時に。ちょうど彼の最後のシングル「私は何のために生きていますか」/「ハングアップ・マイ・ロックン・ロール・シューズ」のリリース直後だった。「私は何のために生きている？」は100万枚以上売れ、ゴールド・ディスクとなった。1958年のR＆B売り上げ一位だった。
1956年、アトランティック・レコードに移籍、シングル「手遅れに（彼女はゴーン）」、「ファニータ」と「ラブ・ミー・チェリー」が成功した。最も成功したレコーディングは、故郷アトランタでマ・レイニーが歌っていた12小節ブルース「CCライダー」（1957年）で、ポップ市場でも売れた。同曲のゆるいビート、まろやかなヴィブラフォンのバッキングやコーラスは人気ダンス・スタイル「ストロール」を生み出した。次のシングル「ベティとデュプリー」もストロールの曲で、売れた。ファッツ・ドミノの曲「ゴーイング・トゥー・ザ・リヴァー」のカバーはR＆Bチャートで4番に達した。
マフフーズは1988年にノーベル文学賞を受賞した。アラビア語圏の文筆家としては始めてのノーベル文学賞受賞者である。マフフーズのもとに届いたスウェーデンからの手紙には、「豊かで入り組んだ作品は、私たちを人生の本質への再考へといざなう。さまざまなシチュエーションで、時と愛や、社会と規範、知識と信義の本質といった主題が繰り返され、読み手の思考や感情を喚起するような、斬新なやり方で提示される。また、あなたの散文の詩的価値は言語的障壁を越えて感じ取ることができる。」と書かれていた。サルマン・ラシュディが1989年にルーホッラー・ホメイニーから非難を受けた際には、『悪魔の詩』がイスラームを「侮辱している」と指摘しながらも、ラシュディを擁護した。マフフーズは、ルーホッラー・ホメイニーが発したラシュディ死刑のファトワーよりも、表現の自由を重視した。ファトワー直後にマフフーズは、知識人80人が集まって宣言した、「文筆家を殺そうという呼びかけが文筆家への攻撃にならないの同様に、神への冒涜がイスラームやムスリムへの攻撃にはならない」という宣言に参加した。1989年の『悪魔の詩』の出現は、過去の『街角の子どもたち』に関する議論を再燃させた。エジプトを拠点とするイスラーム過激派組織ガマーア・イスラーミーヤの首領、盲目のシェイフことオマル・アブドゥッラフマーンは、ジャーナリストに対して「マフフーズが何かしらの罰を受けたらラシュディは自作を引っ込めるだろう」といった趣旨のことを話した。オマル自身がその言葉をマフフーズ攻撃を示唆するファトワーであると認めることはなかったが、マフフーズは1994年10月にカイロの自宅を出たところで暴漢2名に襲われ、刃物で首を切りつけられた。襲撃犯らはオマルの声明をマフフーズ殺害を呼びかけるファトワーとして解釈したと見られている。82歳の老小説家は7週間入院し、命に別状はなかったものの、右上腕部の神経をやられた。また、眼球を動かすのに苦労するようになり耳も遠くなった。暗殺未遂事件後のマフフーズは、一日に数分しか執筆に取り組めなくなった。カイロの弁護士ナビール・ムニール・ハビーブのオフィスに身を寄せ、ムニールの書庫を図書館代わりにした。ボディガードに常時守られながらの生活であったが、それでも執筆を続け、1996年12月11日、85歳の誕生日に自伝を出版した。2006年の年初には最後の作品となる『第七天国』を発表した。『第七天国』は死後の世界を描いた短編を含むオムニバスである。原題の Ali-Sama' al-Sabia は七階層ある天国の第七番目を意味し、殺人により第一天国に来た男が第七天国を目指す話（アクエンアテンやウッドロウ・ウィルソン、アブドゥンナーセルなど歴史上の有名人も登場する）や、人生の秘密や魅力におぼれたくなくば近くにある森に近寄ってはならないと忠告されるティーンエイジャーの話など、マフフーズが過去に書き綴ってきた歴史小説や自然主義文学とはまったく異なる、幻想文学が展開された。2006年7月16日、マフフーズは深夜の散歩中に倒れ、頭にけがをして入院した。カイロ市内アグーザ地区の警察病院の集中治療室で治療を受けていたものの、同年8月30日に腎不全と肺炎により死去、94歳だった。翌日、ムバーラク大統領が指揮する軍隊による国葬が行われた。作家が眠る棺を中心とした葬列は、故人の望みにより、ガマリーヤ地区のフセイン・モスクに少し立ち寄った。ここはイマーム・フセインの首が埋葬されているという信仰のあるファーティマ朝時代に建てられた古いモスクである。マフフーズの生家から目と鼻の先にあり、作家が幼い頃よく母に連れられて礼拝に来たモスクでもあった。その後、葬列はカイロ郊外のマディーナトナスルのラシュダン・モスクへ向かい、そこで葬儀と埋葬が行われた。マフフーズは生涯を通して、滅多にカイロの外へ出なかった。エジプト国外へ出たのは生涯で3度だけ、イエメンとユーゴスラビア、そしてイギリスに手術のため訪れたことがあるのみであった。ノーベル文学賞の授賞式すら高齢を理由にして出席を断り、娘たちを代理としてスウェーデンに送った。