外国人差別が想像を絶するほど酷かった19世紀、フランツ・リストは入学を許されることはなかった。スペインのピアニスト兼作曲家のイサーク・アルベニスは「ガラスを割って入学を延期」したかのように伝わっているが、実際には入学試験に落ち、ブリュッセル音楽院へ移った後はスコラ・カントルムで教え、生涯この学校への憎悪を露にしていた。フェルッチョ・ブゾーニがアントン・ルビンシテインにこの学校への留学を相談したところ、「あんなところには行くのを止めておけ」と返した。一部学生、作曲家らの反発はスコラ・カントルム、エコールノルマル音楽院の設立を促し、既に作曲家として市民権を得ていたモーリス・ラヴェルのローマ賞落選は、学長デュボアの退任という事態につながった。また後に国際的に活躍することとなった尹伊桑、黛敏郎は、教育内容への反発から、共に一年で自主退学をしている。幾度かの制度改革と共にその教育体制は変遷を辿ってきた一方、教育カリキュラムの内容とその質、量、各種コンクールの決定権に関しては、文化保全機関としてのコンセルヴァトワールとしての存在意義と関わりつつ、このような反発と反動の歴史を、現在に至るまで複雑に織りなしてきている。
1794年のエコール・ポリテクニーク、フランス国立工芸院の設立に続き、1795年8月3日の国民公会によって音楽院 (le Conservatoire de musique) の設立が議決され、国立音楽学院の全機能が移管された。これをもって、現在のパリ国立高等音楽・舞踊学校の創立とされる。国立音楽学院時代から所長であったゴセック、それにエティエンヌ＝ニコラ・メユール、ルイジ・ケルビーニ、ベルナール＝サレットを加えた4人の作曲家がその運営委員に指名され、器楽教育の体系化が進められた。とりわけ弦楽器の教育が強化された。
フランス革命真っ只中の1792年、革命政府の手によって、このルイ王家の王立声楽・朗読学校に、市民のための音楽学校が合併され、国立音楽学院 (l'Institut national de musique) へと改編された。国民公会の指名によってフランソワ＝ジョセフ・ゴセックを院長とし、運営に国家予算を割り当てられた。この統合は成功し、音楽家の養成に弾みがついた。
4月、司馬衷が即位すると、衛瓘は新たに千兵を与えられた。291年3月、楊駿が誅殺されると、衛瓘は復職して録尚書事に任じられ、緑綟綬を与えられ、剣履上殿・入朝不趨の特権を加えられ、騎司馬を下賜された。こうして、汝南王司馬亮と共に朝政を補佐する事となった。北軍中候である楚王司馬瑋は横暴で殺人を好んだので、衛瓘はこれを忌み嫌い、司馬亮と謀議して司馬瑋から兵権を奪うために臨海侯裴楷を司馬瑋に代わって北軍中候に任じた。だが、司馬瑋がこれに激怒すると、裴楷は恐れて中候の職を辞した。衛瓘は司馬亮と再び謀議し、司馬瑋を始めとした諸王を封国に帰還するよう命じたが、さらに司馬瑋の怒りを買った。賈南風は皇太子廃立の一件から衛瓘を憎んでおり、また司馬亮と衛瓘が政権を掌握していたので賈氏の権限が抑え込まれている事に不満を抱いていた。司馬瑋配下の岐盛は元々楊駿の側近であったが、司馬瑋と結託して楊駿誅殺に加担したので、衛瓘はその節操のなさを嫌い、機会を見つけて逮捕しようと考えていた。岐盛はこれを大いに恐れ、同じく司馬瑋配下の公孫宏と謀り、司馬瑋からの伝言と偽って、賈南風配下の積弩将軍李肇へ「司馬亮と衛瓘は皇帝廃立を企んでいる」と告げた。李肇はこれを賈南風に密告したので、賈南風は遂に司馬亮と衛瓘を除く事を決めた。6月、賈南風は恵帝に詔を作らせ、司馬瑋へ「太宰（司馬亮）と太保（衛瓘）は伊尹・霍光を模倣して皇帝廃立を企んでいる。王（司馬瑋）は淮南王（司馬允）・長沙王（司馬乂）・成都王（司馬穎）に命じて諸々の宮門を制圧させ、司馬亮と衛瓘の官を免じるように。」と告げた。司馬瑋は自ら統括している北軍を動かし、司馬亮と衛瓘の討伐を掲げて決起すると、公孫宏と李肇に司馬亮府を包囲させ、侍中・清河王司馬遐には衛瓘の逮捕を命じた。衛瓘邸が司馬遐に包囲されると、衛瓘の側近は司馬遐が詔を偽造したのではないかと疑い、上書して詔の真偽を確認するべきだと進言したが、衛瓘は従わずに逮捕を受け入れた。かつて衛瓘が司空となった時、帳下督栄晦は罪を侵して罰せられ、司空府から追放された事があった。その栄晦はこの時司馬遐軍に従っており、私怨を晴らすために司馬遐の制止を無視して衛瓘と子の衛恒・衛嶽・衛裔と孫ら9人を殺害した。司馬亮もまた捕らえられて誅殺された。ただ衛恒の二子である衛璪・衛玠は、当時医者の家にいたので災禍を免れた。太保主簿劉繇らは危険を承知で衛瓘の死体を収容し、これを手厚く葬ったという。賈南風は司馬瑋に威権が集まる事を恐れ、独断で詔書を偽造して司馬亮と衛瓘を殺害したと宣言して誅殺した。その後、衛瓘の娘は朝廷に上書して衛瓘の名誉回復を訴えると、劉繇らもまたこれに同調して衛瓘の冤罪と栄晦の処罰を上言した。これらの要求は認められ、衛瓘は蘭陵郡公に追封され、食邑を三千戸加増され、成と諡され、仮黄鉞を贈られた。また、栄晦は一族もろとも誅殺された。