大会終了後、日本協会は、目標としていたW杯2勝はできなかったものの、準備期間が短かったことや、けが人が続出した中で予選プール最下位を免れたことを評価し、引き続きカーワンにジャパンの指導を託した。2008年、まずは、同年より開始されたアジア5カ国対抗で優勝をもたらした。続くIRBパシフィック・ネイションズ・カップは前年同様1勝4敗に終わったが、トンガには前年に続き連勝。その後、11月のアメリカ来日シリーズでは、テストマッチ連勝を果たした。2009年、アジア5カ国対抗を連覇。続くIRBパシフィック・ネイションズ・カップはトンガに3年連続で勝利したものの1勝3敗に終わった。2009年7月28日に行われた国際ラグビー評議会 (IRB)の理事会で、2019年のラグビーワールドカップ開催国に日本が決定した。同年11月、カナダが来日。日本はテストマッチで連勝した。2010年、アジア5カ国対抗では順当に3連覇を達成し、7大会連続となるW杯出場を決めた。続くIRBパシフィック・ネイションズ・カップでは、サモアとトンガに勝利し、得失点差の末、3位に終わったとはいえ、サモア、フィジーと同じく2勝1敗の好成績を挙げた。その後、10月30日のサモア来日テストマッチでは10-13と惜敗したが、翌週11月6日のロシア来日テストマッチでは75-3と大勝。JKが本格的に指導を行なった成果が徐々に実績にも現れつつあり、翌年に控える2011年のワールドカップにも弾みがついたと思われた。
太田HC代行体制で挑んだ2006年11月のW杯アジア予選で、韓国、香港に快勝し、6大会連続の本戦出場を決めた。2007年1月9日 (就任は同年1月1日付)、日本協会はジョン・カーワンをヘッドコーチ (HC) とすることを発表した。カーワンは海外のラグビー事情を多少でも知る者ならば誰でも知っているスーパースターであり、1987年の第1回のワールドカップにおけるイタリア戦で、90メートル独走トライをしたことでも知られている。また、現役生活の晩年にはNECでもプレー経験があり、日本のラグビーファンにも知名度があった。また現役引退後、イタリア代表のヘッドコーチを務めた。既にW杯出場を決めていることもあり、カーワンに求められたのは本戦での実績。これについて、カーワンは、フィジーとカナダには少なくとも勝つことを主眼におき、決勝トーナメント (各プール2位まで)には残れなくとも、3位以内 (同位以内であれば、次回のW杯予選が免除される)には確実に入る算段を目論んでいた。しかし、IRBパシフィック・ネイションズ・カップでは1勝4敗で最下位。8月18日にイタリアのサン＝ヴァンサンで行われたイタリア戦も12-36で敗退した。ワールドカップ開幕直前になって、エースの大畑大介、山本貢、安藤栄次の3選手が怪我により帰国したため、急遽替わりのメンバーが招集されるといった事態にも見舞われた。カーワンは、確実に2勝するため、同じプールBに入った強豪のオーストラリア、ウェールズにはいわばリザーブ主体の選手で挑み、フィジー、カナダにはレギュラー級で戦うという、「二刀流」を試みた。したがって、初戦のオーストラリアには3-91で大敗したが、カーワンには「想定の範囲内」のようだった。しかし、続くフィジー戦では、フィジーのフィットネスが後半になって急激に低下する形になったにもかかわらず、31-35で惜敗。さらにウェールズにも18-72で大敗し、6大会連続の予選プール敗退決定。加えて、1995年W杯のウェールズ戦から数えて13連敗となってしまった。そして、最終戦のカナダに例え勝ったとしても、最低限の目標である3位以内もきわめて難しくなった。そんな状況で迎えたカナダ戦。日本はノーサイド直前まで5-12でリードされていたことから、4大会連続の全敗が確実視されていたが、ロスタイムに平浩二が右隅にトライを決めて2点差まで迫ると、その後、大西将太郎がゴールキックを決め同点となり、ここでノーサイドの笛。この結果日本は14試合ぶりに敗戦を免れ、また、4大会ぶりに予選プール最下位を免れた。
1924年（大正13年）5月15日、筑摩は第一潜水戦隊からのぞかれた。12月1日の改訂で水雷母艦の類別は潜水母艦と変更され迅鯨もそのまま移行、名実共に潜水母艦となった。当時の第一潜水戦隊は、旗艦〈北上〉、母艦〈迅鯨〉、第6潜水隊、第24潜水隊、第26潜水隊となった。末次少将（第一潜水戦隊司令官）は革新的訓練指導をおこない、訓練終了後の研究調査は迅鯨（旗艦兼母艦）で行われた。主に中国方面で活動した。昭和に入り伊号潜水艦（巡潜型）や海大潜が潜水戦隊の主力となると、呂号潜水艦の潜水戦隊旗艦・母艦を想定していた迅鯨型では能力不足となった。海大潜の水上速力は20ノットを越えていたのである。このため潜水戦隊旗艦には5,500トン型巡洋艦（軽巡由良、鬼怒、五十鈴など）や新型の潜水戦隊用巡洋艦（大淀型）が配備もしくは建造された。また迅鯨型の艦齢も15年を超え、旧式化が顕著になった。新鋭潜水母艦の大鯨、剣埼が相次いで竣工すると、潜水戦隊旗艦の座を譲る。1938年（昭和13年）9月4日、第一潜水戦隊旗艦は迅鯨から伊号第七潜水艦に変更された。翌5日、第一潜水戦隊に大鯨が編入され、同艦は9月8日より第一潜水戦隊旗艦となった。迅鯨は9月15日より第五艦隊付属第2根拠地隊に配備された。1939年（昭和14年）11月より練習艦となった。航海学校（運用術練習艦）、兵学校、機関学校生徒用の練習艦として重宝される。また日中戦争では工作艦としても利用されたという。しかし新鋭潜水母艦3隻（大鯨、剣埼、高崎〈未完成、のちの瑞鳳〉）は有事の際に空母へ改造する予定であり、この3隻は順次軽空母へ改造される。新鋭潜水母艦の空母改装計画により、迅鯨型2隻（迅鯨、長鯨）は翌年11月から再び潜水戦隊旗艦に戻ることとなる。さらに事前の予定どおり、大型貨客船を徴傭して特設潜水母艦とした。なお、迅鯨型2隻は1940年（昭和15年）10月11日に横浜港沖で行われた紀元二千六百年特別観艦式に参加した。同年11月15日、日本海軍は第四艦隊を増強する。第十八戦隊（鹿島、天龍、龍田）、第六水雷戦隊（夕張、第29駆逐隊、第30駆逐隊）等とともに第七潜水戦隊（潜水母艦〈迅鯨〉、第26潜水隊〈呂60、呂61、呂62〉、第27潜水隊〈呂65、呂66、呂67〉、第33潜水隊〈呂63、呂64、呂68〉）が編制され、迅鯨は同潜水戦隊旗艦となった（司令官佐藤勉少将）。1941年（昭和16年）1月29日に横須賀を出港し、南洋方面に進出する。以後、第七潜水戦隊は第四艦隊各隊・各艦と共に南洋諸島方面で行動した。