モートンは生前に何十曲も作曲した。例えば、「Wolverine Blues」、「The Pearls」、「Mama Nita」、「Froggie More」、「Black Bottom Stomp」、「London Blues」、「Sweet Substitute」、「Creepy Feeling」、「Good Old New York」、「Sidewalk Blues」、「Tank Town Bump」、「Kansas City Stop」、「Freakish」、「Shake It」、「Burnin' The Iceberg」、「Ganjam」、「Pacific Rag」、「My Home Is In A Southern Town」、「Turtle Twist」、「Why?」、「New Orleans Bump」、「Fickle Fay Creep」、「Stratford Hunch」、「Shreveport Stomp」、「Milneberg Joys」、「Red Hot Pepper」、「Jungle Blues」、「Mint Julep」、「Pontchartrain」、「Pep」、「Someday Sweetheart」、「The Finger Buster」、「The Crave」、「Grandpa's Spells」など。彼の作曲のいくつかは、自分自身へ贈ったものだった。たとえば、「Winin' Boy」、「The Original Jelly-Roll Blues」、「Mister Jelly Lord」などである。ビッグ・バンド時代には、「King Porter Stomp」はモートンが数十年も前に書いた初期の曲であるが、フレッチャー・ヘンダーソンとベニー・グッドマンとで大ヒットした。この曲はそのとき、非常に多くのスウィング・バンドがカバーするスタンダードになった。モートンはいくつかの曲について、他の人々が版権を取得するように要求した。たとえば、「Alabama Bound」や「Tiger Rag」がそうである。2つのブロードウェイ・ショー、「Jelly Roll」と「Jelly's Last Jam」が彼の曲をフィーチャーした。最初のショーは米国議会図書館の取材から、モートン自身の言葉と物語とに基づいて濃密に描かれた。次のショーは、モートンの役が非常に脚色され冷淡な人物として描かれたことで相当な物議をかもし、モートンの家族から訴訟を起こされた。バークリー音楽大学の教授 Jerry Gates は「コードネームはファーディ・グローフェ（1892 – 1972）とジェリー・ロール・モートンにより発案されたと聞いている」と述べている。
モートンは、取材の録音していた時期に、彼が演奏をしているワシントンD.C.のバーで喧嘩が起こり、そのときにナイフによる深刻な傷を負った。彼の怪我は完全には回復せず、それにより、彼はしばしば病気にかかったりすぐに息切れしたりするようになった。モートンはニューヨークで新しいシリーズを商業的に録音した。そのシリーズとは米国議会図書館の取材で話していた彼の初期のいくつかの曲のことである。彼は、新しいバンドを結成し、彼の仕事をやり直す計画をして、新曲と新しい編曲とを手書きした一式を持って、カリフォルニア州ロサンゼルスに引っ越した。しかしながら、彼は到着して間もなく深刻な病気にかかり、1941年7月10日に死去した。なお、映画『海の上のピアニスト』では、モートンをモデルにした同名の人物が登場する。
1938年5月、アラン・ローマックスは米国議会図書館用にモートンとのインタビューを録音することを始めた。その活動は、もともとは音楽研究家たちが米国議会図書館で用いるための、短い音楽の標本を採集することを意図されていたのだが、すぐに8時間以上にわたるモートンの談話とピアノ演奏とを録音し、おまけに、ローマックスはメモは取ったが録音はしないというより長い取材も行われた。これらの非商用の録音は音質が悪かったにもかかわらず、その音楽的、歴史的重要性はジャズ・ファンを魅了した。またその録音の一部は、商業的にも繰り返し出版され続けている。これらの取材は、ジャズの歴史におけるモートンの地位を確実にする手助けとなった。ローマックスは、モートンのストーリーヴィルでの日々と、ストーリーヴィルで演奏されている低俗な歌のいくつかについて、非常に興味を持っていた。モートンはそれらのことについて語ったり録音したりすることを渋々引き受けたのだが、結局はローマックスに感謝することになった。モートンの「ジェリー・ロール」という愛称には性的な意味があり、彼のストーリーヴィルでの日々から作った彼の詩は低俗だった。米国議会図書館の録音の一部は、その低俗さのせいで、20世紀の終わり近くになるまでリリースされなかった。モートンは自分が1890年生まれであることを知っていたが、ジャズの実際の創始者として彼自身に有利な主張をするためには少しばかり若すぎた。そこで彼は、実際よりも5歳年上だと見せていた。研究により、モートンは彼の人生の初期の出来事のいくつか（おそらく彼が初期の曲を最初に作曲した日付も）を、数年早く言っていたことがわかった。そしてモートンは、バディ・ボールデンはジャズではなくラグタイムを演奏していたのだと説明していたが、これはニューオーリンズの他の同年代の人々から反論された。しかしながら、モートンが過去を振り返って語ったそれ以外のことは、信頼できるものだと判明した。
2006年1月17日に、鹿児島市で一方通行の道を原動機付自転車で逆走するなどした際に、鹿児島県警察の出頭命令に従わなかったため、2007年6月に逮捕され、逮捕後も黙秘等を続けたため、道路交通法違反の罪で起訴された。検察から、罰金1万5000円を求刑されたが、同年10月、鹿児島地方裁判所は、前科2犯あることや交通違反を繰り返し、遵法精神に欠けることを重視し、求刑の8倍に当たる罰金12万円の判決を言い渡した。外山は控訴し、2008年3月、福岡高等裁判所宮崎支部は罰金12万円とした1審・鹿児島地裁判決を「重すぎて不当」として破棄し、罰金3万円とした。福岡市の飲食店「BARラジカル」の設立に関わり、1年ほど店長を務める。外山が退職した後、将棋BARとして営業する。2012年12月、自民党が圧勝した衆院選のときに九州各地の原発推進候補をショパンの「葬送行進曲」を大音量で流しながら追い回し、「原発を選挙戦の争点にしましょう」、「前を走っている人は原発推進派です」と告知していくという「原発推進派懲罰遠征」を決行。その後、右翼青年から『右翼の世界には“ほめ殺し”という手法もあって、それも違法じゃないんですよ』と聞き付け、ほめ殺しへ戦略を転換。翌年の第23回参議院議員通常選挙で、外山は「選挙戦の期間限定で原発推進派に転向する」と宣言し、「自民党ほめご…いや大絶賛キャンペーン」と称して、原発推進候補への「ほめごろし」を新潟、仙台、札幌などで行った。2014年（平成26年）に、2014年東京都知事選挙が始まると、毎日一般参加者を募り、舛添要一や田母神俊雄に対して、ほめ殺しの体験学習会を開いた。