1932年（昭和7年）5月5日、当時、学校教練のために上智大学予科に配属されていた陸軍将校が、学生60名を引率し靖国神社を参拝した際、カトリック信者の学生2名が参拝を見送った。これを問題視した陸軍は配属将校引き揚げの意向を示す。当時、学校教練を履修すると兵役が10か月短縮されていたため、学校教練の実施は学生獲得の点から重要であり、将校引き揚げにより教練が中止されることは学校経営面からの死活問題であった。また、軍との決裂は、学校の取りつぶしやカトリック教会の弾圧にまで発展しかねないおそれもあった。これに対して、日本カトリック教会の東京教区長であったジャン・アレキシス・シャンボンは9月22日付書簡をもって文部大臣鳩山一郎に靖国参拝の意義について照会し、9月30日付の文部次官粟屋謙からの返信で、参拝は愛国・忠君のためのものであるとの回答を得る（なお、この返信は、参拝が宗教行為か否かについては触れていない）。カトリック教会は、この返信をもって靖国参拝は宗教行為ではないと解し、神社参拝を許容することで事態の収拾を図ろうとした。しかし、10月1日に事件を『報知新聞』が報じ、メディアで大きく取り上げられるようになると、カトリック教会への非難が一気に強まった。カトリック教会はカトリック教会の国家や忠君愛国についての見解を示し誤解を解消する『カトリック的国家観』を出版することを、11月20日に予告した。同書は12月1日にカトリック中央出版部から出版され、カトリック信者にも愛国・忠君のための神社参拝が許容されることが公に示された。カトリック教会の対応により、陸軍将校は上智大学に復帰したが、軍部の圧力の前に存亡の危機に瀕した日本のカトリック教会は、完全に屈服する道を選ぶことでこの危機を逃れた。そして、学長以下、神父、学生に至るまで靖国神社へ参拝し、聖省訓令「祖国に対する信者のつとめ」を出した。西山俊彦神父は、これを「従来は他宗教への儀式を禁じていた教会が、物理的安全のために信仰者の魂を売り渡し、神社参拝を含む天皇制支配に屈服し」たのだと説明している。また、この「結果として教会は侵略戦争の推進に協力したことになる」と主張し、聖省訓令の取り消しを訴えている。
上智大生靖国神社参拝拒否事件（じょうちだいせいやすくにじんじゃさんぱいきょひじけん）は、1932年（昭和7年）に上智大学の学生が靖国神社参拝を拒否したことに端を発する事件。
2007年のPRIDEの活動休止とともにUFCと再び契約し、それに前後してシュートボクセ・アカデミーから脱退。アメリカに移住し、ランディ・クートゥアのジムであるエクストリーム・クートゥアでトレーナーに就任した。2007年12月29日、UFC 25以来7年半振りのUFC復帰戦となるUFC 79ではチャック・リデルと対戦し、0-3の判定負けを喫するもファイト・オブ・ザ・ナイトを受賞した。2008年5月24日、UFC 84でキース・ジャーディンと対戦。試合開始直後に右フックでダウンを奪いパウンドによる追撃でわずか36秒で秒殺KO勝ち、ノックアウト・オブ・ザ・ナイトを受賞した。12月27日のUFC 92ではPRIDEで2連勝したクイントン・"ランペイジ"・ジャクソンと3度目の対戦を行い、カウンターの左フックで失神KO負けを喫した。2009年3月、ネバダ州ラスベガスに自身のジム「ヴァンジ・ファイトチーム」を設立。2009年6月13日、UFC 99でリッチ・フランクリンと契約体重195ポンド（約88kg）で対戦し、判定負けを喫するもファイト・オブ・ザ・ナイトを受賞した。10月にはミドル級で秋山成勲との対戦が発表されたものの、その後マイケル・ビスピンに変更となった。試合は2010年2月20日のUFC 110で行なわれ、シウバが判定で勝利。2010年7月3日のUFC 116で秋山成勲と改めて対戦予定であったが自身の怪我により欠場することが試合1週間前に発表された。2011年7月2日のUFC 132でクリス・リーベンと対戦するも試合開始早々にアッパー連打でダウンしたところにパウンドを浴びせられKO負け。2011年11月19日、UFC 139でカン・リーと対戦し、パウンドでTKO勝ち。ファイト・オブ・ザ・ナイトを受賞した。2012年、ビクトー・ベウフォートと共にThe Ultimate Fighter: Brazilでコーチを務めた。2012年6月23日、UFC 147でリッチ・フランクリンと対戦し、0-3の判定負け。ファイト・オブ・ザ・ナイトを受賞した。当初はビクトーとTUFのコーチ対決を行う予定であったが怪我で変更になった。2013年3月3日、6年半ぶりの日本での試合となったUFC on Fuel TV 8でブライアン・スタンと対戦。1R序盤からお互いにダウンを奪い合う壮絶な激戦となり、2Rに左フックでスタンからダウンを奪いパウンドでKO勝ち。ファイト・オブ・ザ・ナイトを受賞した。この試合の前に、「渋谷LIVE! ザ・プライムショー」において、一部で囁かれたスタン戦がラストマッチであるという説を否定した。2014年7月5日のUFC 175で長年に渡って挑発し合ってきたチェール・ソネンと対戦する事が決定するも、シウバが薬物検査を拒否したために欠場した事が発表される。これに対しシウバは薬物検査官が持参した文書が英語であまり詳細がわからず、加えて試合を控えたヘナン・バラオンのサポートで忙しくその場にあまりいられなかった、これまでのキャリアで一度も薬物検査を失格したことも拒否したことも無いと主張した。しかし6月17日、シウバはネバダ州アスレチック・コミッションの公聴会において、骨折した手首の保水性を最小限に抑える事を名目に、禁止薬物である利尿剤を服用していた事を明かした。2014年9月19日、総合格闘家として引退する事を表明。最後にUFCを批判するようなコメントを残した。2015年7月24日、「UFCが八百長試合を行っている証拠がある」と発言するが、7月29日にズッファから名誉棄損で訴えられ、2016年1月14日にシウバは「そのような（八百長試合の）証拠は無く、私が間違っていた発言を撤回したい」と謝罪を表明した。同日、UFCから正式に契約解除されたことをシウバの弁護士が公表した。2016年2月17日、ネバダ州アスレチック・コミッションが薬物検査を拒否したシウバに永久追放と罰金7万ドルの処分を下し、シウバはそれに対し異議申し立てをしていた件で、コミッションが再審議をした結果、3年間の出場停止と罰金無しに処分を軽減することが確定した。ネバダ州地方裁判所裁判も2015年5月に「ネバダ州アスレチック・コミッションがシウバに下した処分は権限を超えたものである」とシウバ勝訴の判決を下していた。