亀井は北大を退職した2000年の6月、小樽市教育委員会の要請により、市立小樽文学館館長（嘱託）となった。文学館においては、〈市民に必要とされる文学館〉を目指し、また、〈文学〉の立場から市民に何を還元することが出来るかを考え、多くの展覧会の企画・解説・図録等を担当した。主な例として、「生誕100年小林多喜二展」（2003年2月1日〜3月30日）、「伊藤整展」（2005年6月18日〜8月28日）および「よみがえる伊藤整　生誕100年記念講演会・シンポジウム」（2005年6月18・19日）、「榎本武揚と歴史小説」（2008年6月14日〜7月6日）、「小樽俳句協会40周年展」（2008年7月12日〜8月24日）など。また、毎年複数回文学講座を担当し、道内・道外への文学散歩にも積極的に参加した。その時に受講者・参加者の前で語った文学論の主立ったものは、HP『亀井秀雄の発言』の中の「小樽文学館での発言」の項に挙げられている。代表例としては「中野重治と北海道」（2000年7月22日）、「小林多喜二の『テガミ』」（2003年2月23日）、「幽鬼の街の巡り合わせ」（2004年5月5日）、「貸本屋さんの文学史」（2004年11月3日）等。2009年（平成21年）9月に肺ガンの手術をし、同年12月から翌年2月まで抗ガン剤治療を行ったため、その後は文学散歩等のアクティブなイベントへの参加は減ったが、展覧会には力を注ぎ、「小樽高商・商大ゆかりの文人経済学者たち　大熊信行・早川三代治・大西猪之介」（2011年7月2日〜8月28日）、「吉本隆明追悼展」（2012年7月14日〜9月2日）、「詩人と美術　瀧口修造のシュルレアリスム展」（2013年5月18日〜6月30日）等で企画構成・図録作成を担当し、文学講座を行った。2014年（平成26年）1月18日〜3月30日の「小樽文学史展」の主担当を最後として、同年3月31日に市立小樽文学館を退任した。この展覧会の際の全キャプションを編集した図録「小樽はじめての文学史　——明治・大正編——」（2014年3月31日刊）は、小樽の成り立ちと、そこでの庶民生活の発展・変遷から〈文学〉と〈文学者〉の在り方を照らし返した、新構想による地方文学史である。
ホリデイズコーブと呼ばれる小さな村が1793年に設立され、それが現在のウィアトン中心街の大部分となっている。1909年、アーネスト・T・ウィアが近隣のピッツバーグから移って来て、ホリデイズコーブのすぐ北に鉄鋼工場を建設し、後にウィアトン製鋼会社と呼ばれるようになった。ウィアトンと呼ばれた非法人化地域がこの工場の周りで成長し。1940年には国内最大の非法人化都市と言われていた。その時までにホリデイズコーブとウィアトンハイツとマーランドハイツと呼ばれる他の2つの外郭地域も法人化されていた。その名前が示すようにそれらの町は「ウィア・コーブ」地域を囲む丘や尾根の上にあった。ホリデイズコーブ砦はアメリカ独立戦争前の1774年にピット砦の兵士が建設した砦だった。現在のウィアトン中心街、ハーモンズ・クリーク（ハーモン・グレートハウスから名付けられた）沿いにあり、オハイオ川に注ぐ口からは約3マイル (5 km) だった。アンドリュー・ヴァン・スウェアリンゲン大佐（1741年-1793年）が指揮し、後にはその義理の息子で、ブラディのレンジャーズの有名な指揮者であるサミュエル・ブラディ大尉（1756年-1795年）が指揮した。1779年、28人以上の民兵がホリデイズコーブに駐屯していた。その2年前の1777年、ヴァン・スウェアリンゲン大佐が10名余の兵士を率い、ロングボートでオハイオ川を下り、ホイーリングでイギリス軍とインディアンに包囲されていたヘンリー砦の住人を救いに向かった。その任務の様子が、チャールズ・S・チャップマン（1879年-1962年）によってコーブ郵便局の壁に描かれた公共事業促進局時代の壁画で記念されている。この壁画にはジョン・ビルダーバック大佐も描かれている。ビルダーバックは後の1782年、グナーデンヒュッテンでモラビアン・インディアンを虐殺した時の指導者であり、悪名を残した。1947年7月1日、ホリデイズコーブ、マーランドハイツ、ウィアトンハイツ、さらに未編入のウィアトンを含む地域の全体が合併してウィアトン市となり、現在に繋がっている。ウィアトン製鋼の事業部で、アーネスト・T・ウィアの別会社であるナショナル製鋼会社のトップであるトマス・E・ミルソップが初代市長に選ばれた。市憲章は1950年の住民投票で承認された。ウィアトンにはウィアトン製鋼会社があり、かつては12,000人以上を雇用する総合製鋼会社だった。ウェストバージニア州では最大の民間雇用主であり、最大の納税者だった。これはもはや当てはまらない。アメリカ合衆国のみならず世界中の製鋼業界の再編故に、現在は国際的巨大企業アルセロール・ミッタルの一部となり、僅か1,200人の労働者でブリキ板製造工程のみを動かしている（ブリキ板製造では国内最大である）。1980年代初期、ウィアトン製鋼会社の従業員が工場をナショナル製鋼会社から買収し、国内最大の従業員持ち株制度として、会社を破産から救った。市民指導者数人が近隣のピッツバーグ都市圏から企業を誘致し、住宅所有者を呼んで来ようとしている。ウィアトンをベッドタウンとして宣伝し、ピッツバーグ国際空港や州間高速道路に近いことを宣伝文句にしている。ウィアトンには多くのアメリカ合衆国国家歴史登録財がある。ジョンストン・トルアックス邸、マーランドハイツ公園とマーガレット・マンソン・ウィア記念プール、人民銀行、ジョージ・リガス博士邸、ピーター・ター溶解炉跡である。