2003年（平成15年）、中原誠が会長になったのを受けて、日本将棋連盟の専務理事に就任。そして、2005年（平成17年） 中原誠の後を受け、日本将棋連盟会長に就任。名人戦の朝日新聞と毎日新聞による共催実現、瀬川晶司のプロ入り試験実現、日本女子プロ将棋協会（LPSA）の独立問題への対応など、個々の事例については批判もあるが、一定の実績を残している。また、将棋連盟の赤字体質改善のため、多くのリストラを行ったが、関西本部にあった「将棋博物館」を2006年（平成18年）に閉鎖し、収蔵品を大阪商業大学アミューズメント産業研究所に譲渡したことについては木村義雄十四世名人の娘などから批判を受けた。将棋連盟会長となって以降も、自身のサイトからの情報発信に加え、前述の『正論』や中日スポーツ・東京中日スポーツの連載コラム「セブンデイズ」など個人の立場での寄稿を継続している。日本将棋連盟のホームページでは笑顔でWピースの写真を役員紹介の写真に採用している。
升田幸三とはウマが合い、「麦長君」とよばれて親しまれた。また、芹沢博文、内藤國雄とも親しい関係で、中原誠とも自称親友の間柄という。趣味の一つに囲碁があり、『碁敵が泣いて口惜しがる本』という著書もある。囲碁界の無頼派の棋士・藤沢秀行を尊敬して、兄事している。大の将棋ファンであった山口瞳は米長のことを親しみを込めオランウータンというあだ名をつけた。1993年（平成5年）の名人位獲得には、若手とともに研究を行ったことが大きな要因であったとされる。米長は徹底的に自分の序盤戦術を洗い直す作業に取り掛かる。名人戦では対局の合間に、当時島朗が主宰して、羽生善治、佐藤康光、森内俊之で構成された伝説の研究会「島研」に顔を出した。また、1980年（昭和55年）から1990年代にかけて数十人の若手棋士が参加した「中原研究会」に対抗して、数年前から自宅を改造して若手棋士を集めて開いていた研究会「米長道場」で、徹底的に対中原名人戦の研究を重ねた。特に道場の師範代格で、当時序盤研究の第一人者だった森下卓から、大きな示唆をもらったという。なお、米長道場は「若手に教えを請う」という姿勢で運営しており、米長は森下卓のことを「先生」と呼んでいた。また佐藤康光に対する評価も高く、あるアンケートでの「無人島に1年間住むとしたら、何を持って行くか（2つ）」という質問に対し「美人とグロンサン」と回答している（「グロンサン」は当時の佐藤のあだ名）。武者野勝巳とゲームの著作権に関して裁判で争った。裁判は米長が武者野に対し和解金を支払うことで解決。ただし、米長は自身のサイトで「和解金」ではなく「解決金」と書いた。
棋士になった弟子は先崎学、中川大輔、伊藤能、長岡裕也、高崎一生、中村太地、杉本和陽の7名。他に、元・女流棋士の林葉直子。先崎と林葉は内弟子であった。
単式ホーム1面1線と島式ホーム1面2線、計2面3線のホームを有する地上駅。互いのホームは跨線橋で連絡している。駅舎は国道345号上の道の駅「道の駅笹川流れ・夕日会館（ゆうひかいかん）」に併設されている。駅入口は北側にある。当駅の設備としては待合室の機能のみとなっている。夕刻には日本海に沈む夕陽を見ることができる。景勝地「笹川流れ」に近く、臨時快速「きらきらうえつ」も停車する。村上駅管理の無人駅で、簡易自動券売機が設置されている。1990年（平成2年）ころまでは夏季のみ駅員が配置されていた。1985年（昭和60年）までは出札窓口を開けて、近距離の乗車券及び入場券（いずれも硬券）を発売していた。2012年5月から駅および駅周辺の美化活動を行うボランティアとしてJR東日本OBに名誉駅長を委嘱している。
島式ホーム2面4線の地上駅で、橋上駅舎を有している。ホームが2番線から始まるのは、1番線が橋上駅舎竣工と同時に廃止された為だが、線路は一部残されて上り線につながっており、保守機械（モーターカー等）の留置に使われている。上り2番線ホーム上の杉戸高野台駅寄りに、日光線の0キロポストが存在する。当駅北側で伊勢崎線上りと日光線下りが平面交差して分岐する。都心から当駅で折り返す列車が多数設定されているため、伊勢崎線の和戸駅方に引き上げ線が2本ある。当駅止まりの列車は、引き上げ線に入って折り返す。自動券売機前と上下ホームにはフルカラー液晶ディスプレイによる発車標、改札口にはフルカラーLED式発車標が設置されている。また券売機前と改札口の発車標には、東武スカイツリーライン北千住方面と伊勢崎線久喜方面、日光線南栗橋方面の3方向に分かれて表示されている。ホームの柱は伊勢崎線系統ラインカラーの赤色（■）中心の配色であるが、駅名標は姫宮方は東武スカイツリーラインのラインカラーのオレンジ色（■）と青、杉戸高野台方を日光線系統のラインカラーのオレンジ色と臙脂色、和戸方を伊勢崎線系統ラインカラーの赤と灰色で塗り分けた形になっている。2006年（平成18年）のダイヤ改正前は5番線のみ赤色中心の線が引かれている駅名標であったが、改正後は全線でオレンジ色中心の線に統一され、赤色中心の線は和戸駅以北の駅となっていた。さらに2012年（平成24年）の「東武スカイツリーライン」の愛称制定後は2番線のみ日光線系統のラインカラーのオレンジ色（■）中心の配色、3 - 5番線が赤色とオレンジ色を併用した配色となっている。下りホーム駅名標の隣接駅名表記は4番線が日光線（杉戸高野台駅）、5番線が伊勢崎線（和戸駅）と分かれていたが、後述する緩行線の使用により現在は両方面併記されたものが使われている。