1972年2月、国は「公害に係る健康被害の救済に関する特別措置法」に基づき富士市を当制度の適応とすることとした。これは大気汚染による患者を対象にした制度である。また1974年に国により「公害健康被害補償法」が施行され、同年時点で富士市の認定者数は508人となっている。このとき富士市の公害病の認定は国の「公害健康被害補償法」と市の「富士市大気汚染に係る健康被害の救済に関する条例」による二本立てとなっていた。前者（国認定）は前述の通り1974年時点で508人であり、後者（市認定）は同年で150人であった。しかし市の公害病認定者は国認定者と比べ不公平な救済措置を受けていたため、市の認定患者も国認定患者同様に補償を受けられるよう「富士市大気汚染に係る健康被害の救済に関する条例」を1974年に改正し「富士市公害健康被害補償条例」を交付した。1978年には市認定者と国認定者の合計で1,000人を超えるまでに至った。その後は次第に認定者数は減少し、治癒患者の増加が認められるようになった。
大気汚染で最も問題となったのは気管支喘息の多発であり、富士喘息や不治喘息といった呼称があった。特に1967年・1968年頃から多くなったとされ、富士市は1968年より千葉大学に委嘱して学童の発病調査を実施した。これらの結果から、工場に隣接する小学校の児童に有意差をもって患者児童の比率が高いことが分かった。また富士市医師会は工場が多い今井地区の幼児の健康診断を実施した。その結果診断を受けた幼児のうち32％が風邪を引きやすい体質であり、また47％に喉の炎症が確認された。このことから対象児童に千葉大学による精密検査をすることとなった。また医師会は藤間地区でも検診を行ったが、このうち51％が最終的に精密検査を受ける事態となった。この気管支喘息患者の増加をうけ、市は1971年1月に「富士市大気汚染に係る健康被害の救済に関する条例」を制定した。このように当公害の特徴として、児童に影響が大きかった点が挙げられる。富士市では1968年から亜硫酸ガス濃度の測定を行っているが、南部に点在する製紙工場地帯から離れるにつれ濃度が減少しており、製紙工場が原因であることは明らかであった。加えて富士市は自動記録計を導入し硫黄酸化物を測定するなどしているが、汚染の範囲が南部から北部へと広がっており、これは高煙突化によるものとされている。硫黄酸化物が高濃度を示すのは富士保健所および富士市立元吉原中学校・富士市立吉原第三中学校であり、これは一貫している。1971年時点では未だ1日平均で環境基準を大幅に上回っており、1972年では濃度低下が見られるが季節や時間帯によっては未だ環境基準を大幅に上回るという状況であった。1973年には「富士503計画」が発表された。これは「昭和50年までに0.03PPM以下にする」という環境目標から由来し、50が昭和50年を意味し、3が0.03PPMを意味する。しかしこの時点で国は1977年以降は0.02PPM以下という目標を検討し、県では1977年まで0.015～0.018PPMとすることを目標としていたので、高い目標とは言い難かった。
水質汚濁の問題と並行して生じた問題に「大気汚染」がある。1969年3月には「大気汚染防止法」により富士市は「ばい煙規制地域」のB地域に指定された。
9月26日、グレイバックは8回目の哨戒でシャード (USS Shad, SS-235) とウルフパックを構成し東シナ海に向かった。途中、ミッドウェー島でセロ (USS Cero, SS-225) がウルフパックに合流。このウルフパックは、アメリカ潜水艦部隊で最初の編成されたもので、セロに座乗したチャールズ・モンセン司令の指揮を受けた。10月10日午後、グレイバックは北緯28度34分 東経138度33分の地点で輸送船団を発見して魚雷を4本発射し、1つの命中音を聴取する。10月14日16時45分、グレイバックは北緯27度35分 東経127度30分の地点でシンガポールから高雄を経て六連に向かっていた特務艦高崎、タンカー日南丸（飯野海運、5,175トン）、特設運送船（応急タンカー）高瑞丸（高千穂商船、7,072トン）のサ13船団を発見。魚雷を2度にわたって5本発射し、高瑞丸に2本命中させて撃沈した。高瑞丸の船名は、翌15日夜に救助した高瑞丸乗組員への尋問で判明した。10月22日3時45分には北緯26度49分 東経125度03分の地点で上海からラバウルに向かう丁四号輸送部隊第三輸送隊を発見し、特設運送船粟田丸（日本郵船、7,397トン）に魚雷4本を命中させて撃沈した。10月27日未明、グレイバックとシャードは北緯28度25分 東経130度02分の奄美大島曽津高崎灯台西方海域でマ08船団を発見。船団には駆逐艦汐風が護衛についていた。0時27分、船団中の貨客船賀茂丸（日本郵船、8,524トン）にシャードからの魚雷1本が命中し、賀茂丸は沈没を防ぐべく応急修理の上、22時30分ごろに修理のため奄美大島久慈湾に座礁した。次いで6時20分、賀茂丸から脱出した乗船者の収容作業を行うため停止していた貨客船富士丸（日本郵船、9,138トン）の後部にグレイバックからの魚雷2本が命中し、富士丸は6時45分に沈没した。残る貨客船鴨緑丸（大阪商船、7,362トン）は富士丸遭難者の救助を行ったのち一旦避退したものの、進路を戻して航行中の12時25分にグレイバックの射程内に入り、魚雷1本が命中したが不発に終わった。グレイバックは一連の攻撃により魚雷を使い果たした。10月29日夕刻、北緯29度00分 東経124度30分の地点で2隻の漁船を発見して5インチ砲の砲撃を行うが、戦果は得られなかった。11月10日、グレイバックは45日間の行動を終えてミッドウェー島に帰投した。