1945年5月、アメリカ軍によって逮捕される。ニュルンベルク裁判には被告人ではなく証人として呼び出されたが、証言の中でエルツベルガー暗殺への関与が明らかになった。1946年11月、バーデン州司法長官は占領当局に対してシュルツの身柄をバーデンの司法当局に引き渡すようにと要請を行った。しかし非ナチ化プロセスにおける手続きが優先され、この中でシュルツはまず労働収容所での懲役8年を言い渡された。1949年12月、シュルツの身柄がドイツ側へと引き渡される。彼はオッフェンブルクの拘置所に送られた。1950年7月17日から19日まで、オッフェンブルク地方裁判所にてエルツベルガー暗殺事件に関する裁判が行われた。この裁判にはティレッセンが証人として呼び出されており、彼は自らが主犯だと主張してシュルツを擁護した。しかし、最終的にはエルツベルガーを死に至らしめた至近距離からの頭部への銃撃のうち少なくとも1発はシュルツが発砲したものと判断された。シュルツには殺人ではなく故殺（Totschlag）について有罪とされ、懲役12年が言い渡された。1952年12月22日、特赦により釈放。以後はフランクフルト・アム・マインにて暮らした。1979年、エルトフィレ・アム・ラインにて死去。
パウル・フォン・ヒンデンブルク大統領が署名した1933年3月21日の特赦令に基づき、シュルツは帰国後もエルツベルガー暗殺事件に関する刑事処分を免れた。1933年5月または6月、シュルツは親衛隊（SS）に入隊し、その後しばらくはバイエルンの政治警察部ミュンヘン支局に勤務した。シュルツが主張するところによれば、この時期には彼がSS保安部（SD）への異動を拒否したことによるラインハルト・ハイドリヒとの対立があったという。1933年末から1934年にかけて、シュルツは親衛隊少尉としてカッセルの第30親衛隊地区（SS-Abschnitt XXX）に幕僚長（Stabsführer）として勤務した。上官との衝突からこの職を追われた後、コブレンツの上級親衛隊地区「ライン」本部の管理部門で勤務する。1936年1月、アーロルゼンにあった新設の親衛隊上級地区「フルダ＝ヴェラ」本部に移る。当初は管理部門に勤務していたが、1938年までに厚生部門へと移っている。国家社会主義ドイツ労働者党（NSDAP, ナチ党）への入党は1937年6月だった。彼は一般親衛隊での勤務を続け、親衛隊中佐まで昇進した。1940年4月15日、武装親衛隊に所属を移す。同年からカッセルの第2軍管区（Wehrkreis II）における武装SSおよび警察の厚生将校（Fürsorgeoffizier）として勤務。その後、敗戦までいくつかの福利厚生の関連部局で勤務し、戦傷を負った武装SS隊員への支援や、戦死者の親族への報告などを行っていた。また、銃後の武装SS隊員の家族に対する支援も彼の任務であった。武装SS隊員としての最終階級は武装SS中佐で、敗戦時の上官はヨシアス・ツー・ヴァルデック＝ピルモントSS大将だった。
エルツベルガー暗殺後、シュルツはティレッセンと共にハンガリーへと逃れ、さらにヘルマン・ベルヒトルド（Hermann Berchtoldt）の暗殺を計画した。1924年に逮捕される。ハンガリー政府はドイツ側からの身柄引き渡し要請を拒否したものの、シュルツの釈放後に追放処分を下している。その後、彼はイタリア王国、南西アフリカ、スペイン領ギニアを移り住み、1926年から1932年までは農場主として働いた。1932年または1933年、マラリアに罹患して療養するべくバルセロナに移る。1933年3月または4月、マラリア完治後にドイツへと帰国した。
松本零士の作品群のクロスオーバー作品であるPlayStation用ゲーム『松本零士999 〜Story of Galaxy Express 999〜』では、第七章「銀河の交差点」や再演「わが青春の銀河鉄道」を中心に、ヤマトシリーズとのクロスオーバーが行われており、波動エネルギーが重要なガジェットとして扱われている。波動エネルギー理論は作中において遥かな過去にイスカンダルから地球に伝わることで全宇宙に広まり、999の時代においては旧式科学として一般民衆に知られている。しかし、実際にイスカンダルによって地球へ伝えられた理論は、意図的に核心部分が伏せられた本来の波動エネルギーの数パーセントに満たないエネルギーしか活かせない理論であり、波動エネルギーを100パーセント活かせる「究極の波動エネルギー理論」は最重要機密として、イスカンダル最後の女王スターシアの人格を模したマザーコンピュータに秘匿・封印されていた。その後、イスカンダルの遺跡を大山トチローが調査・研究したことにより、彼自身が本来の「究極の波動エネルギー理論」正確に理解してしまったことで、その成果を狙う機械帝国および「ネオガミラス」と名乗る一派に、理論を知る者やイスカンダルが狙われることになる。最終章である再演「わが青春の銀河鉄道」では、トチローが製作した戦士の銃は、原作設定通りの次元反動銃ではなく「究極の波動エネルギー理論」を用いた小型の波動エネルギー兵器であるという設定が語られる。また、将来訪れるであろう機械帝国の脅威に対抗するために、戦士の銃の発展形である「コスモ波動システム」に基づいた「コスモ波動砲」という砲熕兵器も開発されており、劇中ではそれを装備した「コスモ波動艦」が登場する。また、劇中ではそれ以外にも、「究極の波動エネルギー理論」を実現するための「究極の波動ユニット」を譲り受けた星野鉄郎を「ネオガミラス」から救うために、ワープしてきた「伝説の宇宙戦艦ヤマト」より波動砲が発射され、ネオガミラス艦隊を壊滅させている。