引退後はブラッドリーのアイドルアワーストックファームで種牡馬となった。1946年にブラッドリーが死去すると、グリーンツリースタッド、キングランチ、オグデン・フィップスによって組まれたシンジケートによって購入され、グリーンツリースタッドに移された。生涯に30頭のステークス競走勝ち馬を出した。代表的な産駒に5歳時まで活躍し、バイムレックの産駒の中でも最も多くの賞金を稼いだ馬となったベターセルフ（1945年生・牡馬）がいる。同馬は種牡馬としても結果を出し、特にドクターフェイガー・タウィーらの母となったアスピディストラなど出して母の父として影響を残した。このほかではフューチュリティステークス優勝馬のギロチン（1947年生・牡馬）、ホーソーンゴールドカップなどに勝ったビーフェイスフル（1942年生・牝馬）、サンタアニタダービー優勝馬のバイミーボンド（1942年生・牡馬）などがいる。後継の種牡馬も多く、いずれの系統も孫の代くらいまでは成功した。しかしその後は他のピーターパン系と同じく先細りし、現在ではその父系は残っていない。バイムレックは自身の種牡馬成績よりも、母父としての影響が大きく、産駒の牝馬が産んだステークス競走勝ち馬は50頭にも上った。代表的なところでは、1955年のケンタッキーオークス優勝馬でネヴァーベンドの母となったレイラン（1952年生・父ジェッダ）、フューチュリティステークス優勝馬のポーターハウス（1951年生・父エンデバー）などがいる。バイムレックは1966年7月21日、29歳という高齢からくる老衰により死亡した。その遺骸はグリーンツリースタッドの墓地に埋葬されている。後の1990年、バイムレックはアメリカ競馬名誉の殿堂博物館によって殿堂馬の1頭として選出された。
タイコンデロガ砦からの撤退後に政界と大衆の非難が凄まじかった。大陸会議は衝撃を受けて、スカイラーとセントクレアの責任を問うて批判した。ジョン・アダムズは「我々は1人の将軍を射撃するまで基地を守ることはできないと思う」と記し、ジョージ・ワシントンはそれが「悔しさと驚きの出来事であり、私の理性の範囲内では理解できない」と語った。セントクレアとスカイラーは退却と引き換えに賄賂を受け取った裏切り者という噂まで広まった。スカイラーは最終的に北方方面軍の指揮官を外され、ゲイツ将軍に挿げ替えられた。タイコンデロガ砦の陥落がその理由に挙げられた。セントクレアは指揮官を外され、審問のために作戦本部に送られた。セントクレアはその行動が名誉あるものであると主張し、軍法会議での査問を要求した。その軍法会議はワシントンに対する政治的陰謀が露見したために1778年9月まで開かれなかった。セントクレアは完全に無罪が証明されたが、その後は野戦指揮官の任務を与えられなかった。スカイラーも軍法会議で如何なる悪事も証明されなかった。このタイコンデロガ陥落の報せはヨーロッパの新聞のヘッドラインを飾った。イギリス国王ジョージ3世は薄着の女王の部屋に飛び込み、「私はやつらを叩いた！私は全てのアメリカ人を叩いたのだ」と叫んだと伝えられている。フランスとスペインの宮廷は、アメリカ人を支持し、彼らにその港を使うことを認め、貿易も行っていたので、その報せに不満だった。この結果はイギリスを大胆にさせ、フランスとスペインにアメリカに対する港を閉じるよう要求させた。この要求は拒否され、ヨーロッパ列強の間の緊張を高まらせた。
大陸軍が撤退する前の小競り合いで少なくとも大陸軍兵7名が戦死し、11名が負傷した。イギリス軍の損失は集計されていないが、小競り合いで少なくとも5名が戦死していた。大陸軍はハバードトン道路をうまく進んだ。部隊の大半は7月6日の夜に30マイル (50 km) の行程にあるキャッスルトンに到着した。7月7日にイギリス軍追跡部隊が大陸軍後衛に追いついてハバードトンの戦いがおこったが、このことで大陸軍主力の逃亡を可能にし、最後はエドワード砦でスカイラーの部隊と合流できた。船でスキーンスボロに逃げた大陸軍の小部隊はバーゴイン軍前衛とアン砦の戦いを行ったが、スキーンスボロの小競り合いで装備や多くの病人および負傷兵を放棄するしかなかった。タイコンデロガ砦の対戦はバーゴイン軍の進行速度を実質的に遅らせることができなかったが、バーゴインはタイコンデロガ地域の守りのために900名以上を残し、スキーンスボロでは散らばっていた部隊が再集合するのを待つために7月11日まで留まった。その後、スキーンスボロとエドワード砦の間では材木で埋まった道路を進むために遅らせられた。これはスカイラー軍が樹木を切り倒して道に転がし、湿地では橋を破壊していったためだった。バーゴインのこの作戦は最終的に失敗し、サラトガの戦い後に降伏を強いられた。ゲイツ将軍は11月20日にジョージ・クリントン知事に当てた報告書で、タイコンデロガとインデペンデンスの砦は退却するイギリス兵によって放棄され焼かれたと告げていた。
1961年11月25日、ヒル夫妻はNICAPのメンバー、C・D・ジャクソンとロバート・E・ホーマンにより2度目のインタビューを受けた。ウェッブによる最初の報告を読み、ジャクソンとホーマンはヒル夫妻の証言に多くの疑問点を抱いていた。その中でも大きな疑問は彼らがドライブしていた時間の長さであった。ヒル夫妻もウェッブもその点についてまったく注意を払っていなかったが、ドライブは4時間ほどあれば充分であるのに対し、彼らが出発してから帰宅するまでには7時間が費やされていたのである。ホーマンとジャクソンがこの矛盾を指摘したときには夫妻も愕然とし、原因を説明することができなかった（こうした「失われた時間」は、UFO遭遇事件においてしばしば報告される）。しかしベティは月が地上で輝いていた光景を後に思い出した。「あらゆる努力を払ってみたものの、ヒル夫妻はインディアン・ヘッドからアッシュランドに至るまでの35マイルの道中について、ほとんど何も思い出すことができなかった。催眠療法の話がもちあがった。催眠療法ならば失われた記憶を開放することができると期待してのことである。バーニーは気が進まなかったが、彼に言わせれば「馬鹿げた」ベティの夢が繰り返されるのを止めることができるかもしれないと考えた」とクラークは書いている (Clark, 282) 。1962年2月までに、ヒル夫妻は何度も週末にドライブに出て彼らがUFOと遭遇した場所を確認しようとした。その場所を見つければより多くの記憶が掘り起こされるかもしれないと期待したためである。しかし、その後数年間にわたって努力したものの、問題の場所を見つけることはできなかった。クラークが書いているように、「（1962年の）2月または3月、バーニーの鼠径部の周囲にほぼ真円を描いていぼが現れた。それらは外科手術によって除去された」 (Clark, 282) 。