2005年12月22日、ボイドがレンジャーズとの契約にサインしたことが、1月の移籍期間に報じられた。彼が公式にレンジャーズの一員になったのは2006年1月1日である。このシーズン途中における珍しい移籍劇において、彼は本来キルマーノックFCがボイドに払わねばならない4万ポンドの半額を権利放棄し、かつて彼自身が恩恵をうけた同クラブの若手育成プログラムに寄付した。ボイドのレンジャーズでのデビュー戦は2006年1月7日に行われたスコティッシュ・カップの第3ラウンドで、対戦相手はピーターヘッドFCだった。彼はそこでハットトリックを決め、チームは5-0で勝利した。彼はこのシーズンを前半はキルマーノックFCで、後半をレンジャーズFCで過ごすことになったが、移籍前に20得点、移籍後にさらに17得点を挙げており、計37得点を計上したことになる。こうして彼は「1シーズン中に2つのクラブでそれぞれ最高得点を挙げた選手」という栄誉を手にした。2006-07シーズンの最初の試合で、彼は新監督のポール・ル・グエンによってレギュラーから外されてしまった。ボイドの不在はその後2試合続き、それぞれ2-2（vsダンディー・ユナイテッド）と1-1（vsダンファームリン）で引き分けに終わっている。彼は2006年8月19日のハーツ戦から戦線に復帰し、2得点を挙げ2-0でチームを勝利に導いた。ボイドは続く週でも古巣のキルマーノックFC相手に2得点を挙げたが、試合は2-2で引き分けに終わった。彼はまた、ダンファームリンを相手取ったCISカップの試合で、ゴールキーパーのアラン・マクレガーが約85ヤード（約77メートル）「ぶっ飛ばした」ボールを、30ヤード（約27メートル）のロングボレーシュートによって得点した。
ボイドは、スコットランドのキルマーノックFCでプロのサッカー選手としてデビューした。彼のデビュー戦は、2000-01シーズンの最後の試合で、対戦相手はセルティックだった。次のシーズンでは、アリー・マッコイストとクリストファー・コウカードがクラブから離脱したことによって、ボイドにレギュラー出場のチャンスが巡ってきた。彼はこのシーズンを通じて5得点を挙げた。2002-03シーズンで、ボイドは12得点を挙げ、キルマーノックで最も優れた若手選手として表彰された。彼はまた、スコットランド代表のU-21チームでレギュラーの位置を獲得した。続くシーズンでもボイドは15得点を挙げた。2004-05シーズンもボイドはキルマーノックに所属し、ゴールネットを揺らし続けた。2004年9月に行われたダンディー・ユナイテッドを相手とした試合では、全5得点が全てボイドによるものだった。もちろん試合は5-2でキルマーノックが勝利している。この記録は、レンジャーズのケニー・ミラーがセント・ミレンFCを相手に5得点を挙げたものに並ぶものであった。2005-06シーズンでも、ボイドは力強いプレーによってキルマーノックに貢献し続けた。その活躍振りは、イングランドのチャンピオンシップ・リーグのカーディフ・シティとシェフィールド・ウェンズデイの関心を喚び、両者から50万ポンド（約1億2000万円）におよぶ契約を持ちかけられたが、ボイドはそれらを断った。
2010年10月ニュージャージー州のラマポ州立大学の新入生歓迎パーティーなどで、未成年を含む数十人にも及ぶ集団急性アルコール中毒患者が発生。このことを契機に、成分中のカフェイン、タウリン、ガラナの存在が酔いを助長するとして問題視されるようになった。同年11月には、食品医薬品局がこれら成分に問題性があると通達を出したほか、ニューヨーク州など一部州ではカフェイン入りアルコール飲料の販売禁止が打ち出された。同年12月、フュージョン・プロジェクト社は、問題となる成分を抜いた製品を発売。製品は、単なる炭酸アルコール飲料に衣替えした。
夏は休養のため放牧に出され、9月に帰厩。緒戦には神戸新聞杯（菊花賞トライアル）に出走すると、追い込み一辺倒であった従来のレース運びとは異なり、中団から抜け出しての勝利を収めた。競走後、距離やコース適性などを考慮の結果、次走にはクラシック最後の一冠・菊花賞ではなく、古馬相手となる天皇賞（秋）への出走が選択された。戦後に天皇賞（秋）が3歳馬に開放されて以降、日本ダービー優勝馬が菊花賞を回避して天皇賞に向かうのは、史上初めての例であった。天皇賞（11月2日）では、牝馬の二強とされていたウオッカ、ダイワスカーレットと対戦。戦前は「三強対決」と注目を集め、当日は両馬に次ぐ3番人気に支持された。レースでは神戸新聞杯と同じく中団からレースを進め、最後の直線で差し脚を見せたが、ウオッカ、ダイワスカーレットから僅差の3着に終わった（競走詳細は第138回天皇賞を参照）。次走には、陣営が天皇賞前から「秋の最大目標」と明言していたジャパンカップに出走。天皇賞で敗れたウオッカらを抑えて1番人気に支持され、レースではスローペースで推移するなか、中団からやや後方の17頭中12-13番手を進み、最後の直線では出走馬中で最速となる上がり3ハロン33秒8の末脚を繰り出すも、早めに先頭に立ったスクリーンヒーローに及ばず2着に敗れた。年末のグランプリ競走・有馬記念は回避し、この競走を最後にシーズンを終える。当年のJPNサラブレッドランキングでは、3歳馬として歴代4位タイとなる121ポンド（芝Lコラム）の評価で首位に据えられ、ワールド・サラブレッド・レースホース・ランキングでも総合33位に付けた。翌1月にはJRA賞最優秀3歳牡馬に満票（300票）で選出され、授賞式の席上で、昆は来春のローテーションと、春のGI勝利を前提とした来秋のフランス・凱旋門賞への出走プランを明かした。