1stシーズンでは主題歌にアニメオリジナルの楽曲を使っていたが、2ndシーズンでは主題歌をアニメオリジナルの曲ではなくタイアップ曲を中心に起用するようになった。劇場版・3rdシーズンは作詞や作曲に有名なミュージシャンとライターを起用し、同時期から4thシーズンまではアーティストには主にお笑い芸人を起用していた。なお、アニメの本編で主題歌のアーティストにちなんだパロディをすることもある。5thシーズンの初めは1stシーズン以来となるアニメオリジナルの楽曲が使われた。タイアップしていたソニー・ミュージックとそのグループ会社のキューンレコードとエピックレコードジャパンは2007年3月31日をもって契約解消した。4thシーズンに関してはOPテーマ、EDテーマ共に1stシーズン以来2年ぶりにビクターエンタテインメント（第181話以降はJVCエンタテインメントが担当）の楽曲に回帰した（アニメ編集のソニーPCLとの契約は継続）。また、4thシーズン終了をもってYOSHIMOTO R and C Co.,Ltdとも契約解消した模様。5thシーズン以降は代わりにランティスが担当している。
3rdシーズン前期には、番組終了を連想させるような動きが見られた。3rdシーズン最初の回である第104話（テレビ東京では2006年4月7日放送）Bパートで、ケロロ小隊が許可無く東北地方へ慰安旅行に行ったのがケロン軍本部に発覚し、「あと175日以内に（テレビ東京では2006年9月29日（第129話）までに）地球を侵略せよ」というノルマを突きつけられた。その後カウントダウンは毎週着々と進み、エンディングテーマの直前に残り日数が表示されていた（途中から、ナレーターの「ペコポン侵略期限まで、あと○○日」という読み上げが入るようになった）。さらに、カウントダウンが0に近づくにつれて、カウンターに「マッシュ」と名づけられるなど、カウンターの存在が大きくなっていった。カウントダウンは終了し第130話（2006年10月6日）以降も、上記の通り2011年3月末に終了するまで番組は継続した。（カウントダウン終了の経緯はキルル.を参照）。
原作にあるパンチラなどのお色気や過剰な暴力場面などが大幅に削減され、程度の軽いものになったり映像が差し替えられたりしている。現段階ではアニメオリジナルとなる失禁・嘔吐物の映像も同じ扱いである。これらの要素は総監督（現・監修）である佐藤順一の判断で排された」と『テレビブロス』2005年5月14日号に記述がある。このことにより原作から変更された設定もある。また、放送コードによる制限を受けており、原作における宇宙人が地球のことを指す「ポコペン」という言葉が「ペコポン」になっており、同様に劇中劇の『ゲロロ酋長』も『ゲロロ艦長』に変えられている（「ポコペン」と「酋長」は侮蔑語に値し、放送禁止用語となっているためである）。ドラマCDや小説版でも同様である。
テレビアニメ化にあたって、いくつかの点が漫画設定から変更されている。シリーズ構成上の問題や、ファミリー向け・子供向けアニメとしてふさわしくないと判断された設定または、それに該当してひっかかるような設定などが変更の対象となっている（なお、漫画とアニメのオチが違うなどの作中の細かい部分は除く）。また、アニメ版で原作に沿ったストーリーを放送する際に原作で連載された時期（季節）とアニメでの放送時期（季節）が異なる場合はアニメで原作の設定を一部変更する場合がある。
うみまるとは、海上保安庁のマスコットキャラクター。1998年（平成10年）に制定された。妹分のマスコットとして、2002年に制定された「うーみん」もいる。
1270年以降、ボレスワフ2世の戦力の衰えが顕在化し、彼は自分の幼い息子により大きな権力を残そうと動き出した。1273年、ボレスワフ2世は長男のヘンリク5世にヤヴォル（ヤウアー）を公国として与え、自身は政治の舞台から引退するかに見えた。しかし、1277年にボレスワフ2世は皆を驚かせる行動に出た。ボレスワフ2世はローマ王ルドルフ1世（ライバルのボヘミア王オタカル2世と他のポーランド諸公との同盟関係を壊そうと狙っていた）との同盟に調印し、ルドルフ1世の要請に基づいて、オタカル2世の同盟者であり自分自身の甥でもあるヘンリク4世（ヘンリク3世の息子）を誘拐した。この誘拐の口実は、1270年にボレスワフ2世の末弟であるザルツブルク大司教ヴワディスワフが1270年に死んだ時、ヘンリク4世がヴロツワフの3分の1を要求したことに対する罰だとされた。ヘンリク4世は高貴な囚人としてレグニツァの城に幽閉された。ヘンリク4世を解放するべく、ボヘミア王オタカル2世、グウォグフ公ヘンリク3世及びヴィエルコポルスカ公プシェミスウ2世の3者が連合、両軍は4月24日にストレツの戦いで激突した。ボレスワフ2世の軍隊は連合軍に比べかなり小規模であり、戦いが始まった時には敗北するかに見えた。しかしボレスワフ2世の息子ヘンリク5世が予想外の奮戦を見せ、諸公の連合軍を打ち破った。結局、この争いは賠償金で解決し、ヘンリク4世は自らの公国の領域の3分の1にあたるシロダ・シロンスカ（ノイマルクト）をボレスワフ2世に譲渡することで解放された。この戦勝はボレスワフ2世にとって最後の成功であり、1278年12月26日（31日とも）に58歳（53歳とも）で死去、レグニツァのドミニコ会修道院に埋葬された。遺領は3人の息子ヘンリク5世、ボルコ1世、ベルナルトが分け合った。ボレスワフ2世は中央集権の失敗と弟達の反乱に敗北したことにより、シロンスク公国の分裂を招いてしまった。シロンスク諸公は以後も分裂と内乱を繰り返し、ドイツやボヘミアとの結びつきを強めた。この結果、後にポーランド王国が再興された時、シロンスク諸公はボヘミアに臣従、ポーランド王国から外れてボヘミア、ひいてはドイツの領邦化を招いた。