生徒により時間割が異なるため登校時間および下校時間もまちまちで、SHR（ショートホームルーム）はない。ただし、2012年度から１年次は朝のSHRが週に3回ある。1コマ90分の授業はごく一部を除きホームルームクラスごとではなく、選択した科目ごとのレッスンクラスで受けるのでホームルームクラスの友達と一緒ではない。授業は最多でも30人程度の少人数で実施されており、10人程度の授業も多くきめ細かな教科指導がなされる。自由な雰囲気の一方で、授業に遅刻すると出席と認められず、学習態度やテストでもそれなりの結果を出さないと単位も修得できないので、厳しい自己管理が求められる。時間割に授業のない空き時間ができた場合は、カフェテリア（学食）やバームクーヘンという自習室で次の授業まで各自思い思いに過ごす。文芸部や漫画部など音を出さない文化部は空き時間を使って部活動もできる。文化部の数は高校としては多く、声優部や箏曲（そうきょく）部などユニークなものもある。音を出す吹奏楽部や太鼓部などの文化部や野球部やサッカー部などの運動部は放課後のみの活動である。高校だが、大学生の学校生活と似ている部分がある。修学旅行（三浦臨海高校では「研修旅行」と称する）の行先は沖縄県（平和学習）、ブリティシュヒルズ（福島県で国内英語留学）、神戸・大阪（郷土学習）の3方面となっている。
県立初声高等学校と県立三崎高等学校の再編統合により開校した、単位制普通科高校。定員は1年次238名、34人×7クラス。ホームルームクラスは3年間同じでクラス替えはない。ほとんどの授業はその科目を選択した生徒によるレッスンクラスで実施。90分1日4コマ、2学期制を実施している。2018年（平成30年） 4月、神奈川県立平塚農業高等学校初声分校との再編統合により、神奈川県立三浦初声高等学校が開校。旧三浦臨海高校の校地校舎は三浦初声高校入江キャンパスとして使用されている。
日本で生まれ、アメリカ合衆国で育つ。芸術と科学に興味を持ち、大学では生化学を専攻していた（神戸大学）。科学的法則や自然現象をテーマにした作品やプロジェクトを国内および海外で発表している。ラボを立ち上げて運営するほか、ラジオ番組でのバイリンガルDJとしても活動。
前身の雑誌は、格闘美少女コミック誌『COMIC闘姫』（コミックとうひめ）。A5判・中綴じの雑誌で、『comicセラフィン』の増刊として創刊（雑誌コードは13858）。当初は『闘姫』という名称の格闘美少女アンソロジーとして発売されていたが、読者から「アンソロは高い」との意見が多く寄せられたため、「紙質と保全性の良さを捨てて値段を約半額」にして隔月刊雑誌として創刊した。VOL.4（1995年9月号）から独立・月刊化され（毎月28日発売）、タイトル表記も『comic闘姫』に変更された（雑誌コードは03843に変更）。しかし、東京都青少年の健全な育成に関する条例に基づく不健全図書（有害図書）に連続3回指定され、「出版倫理協議会の自主規制の申し合わせ」（帯紙措置）によりVOL.9（1996年2月号）、VOL.10（1996年3月号）、VOL.11（1996年4月号）に帯紙を貼る事態となったため、VOL.11（1996年4月号）を以って廃刊した。『comic闘姫』廃刊から2ヵ月後、1996年6月号（1996年4月発売）を後継誌『COMIC阿呍』として新たに創刊した（雑誌コードは13963）。判型はB5判・平綴じ（無線綴じ）に変更され、ページ数も『comic闘姫』の約200頁から約340頁へ大幅に増加したが、定価は500円に据え置かれた。雑誌名は『COMIC闘姫』と同時期に販売されていた、A5判サイズの美少女アンソロジー『コミックA-UN』から継承して漢字表記に変更された。なお、漢字表記について「『阿吽』とも書くんだけどロゴとしてバランスが悪そー」「“牛”が入っているのもカッコ悪そー」との理由で「阿呍」が採用されたが、「呍」がワープロ文字に入っておらず、関連業者や同人サークルに迷惑をかけたため、「これからワープロで打つ人は『AUN』でお願いします」「雑誌名を決める時はよく考えて♡」「『めんどくせーからアンソロのそのまま漢字にしちゃえ』とゆーよーな適当はやめる」とコメントされている。創刊当初のキャッチコピーは「新世代の月刊美少女コミック」で、2002年6月号のタイトルロゴ刷新以降は「超世代の月刊美少女コミック」に変更されている。2004年9月号で通巻100号、2013年3月号で通巻200号を達成した。過去に2回「謹賀新年合併特大号」が発売されており（2009年1・2月合併号、2012年1・2月合併号）、発売翌月は休刊している。Vol.153（2009年3月号）の誌面リニューアル以降、休刊した『COMIC ino.』の作家陣の一部が合流している。2011年6月号（15周年記念特大号）は「深崎暮人表紙イラスト小画集」、2013年6月号（17周年記念特大号）は「深崎暮人表紙イラスト小画集ver.2」、2014年6月号（18周年記念特大号）は「師走の翁イラストセレクション」、2015年6月号（19周年記念特大号）は「深崎暮人表紙イラスト小画集vol.3」、2017年7月号は「深崎暮人表紙イラスト小画集vol.4」、2018年3月号は「Hitenイラストセレクション」、2018年7月号は「深崎暮人表紙イラスト小画集vol.5」が豪華特別付録として付属した。2019年4月号から、諸般の事情により偶数月28日発売の隔月刊に移行した。なお、2019年5月から、奇数月28日発売のWEB版コミック阿吽『COMIC阿吽 改』が新創刊されている。