第二次世界大戦でドイツ軍の本土空襲（バトル・オブ・ブリテン）にさらされたイギリスでも、戦時猛獣処分が行われた。ロンドン動物園では、開戦からまもなく、毒ヘビとサソリなどの無脊椎動物を逃亡予防のために殺処分した。25年間も爬虫類を担当してきた飼育員は、人目をはばからず泣いていた。しかし、そのほかの動物で事前に殺処分された例は無く、多くは被弾を避けるために片隅に集められ、ゾウなど一部の希少性の高い動物はホィップスネイド野生動物園に疎開させた。また、飼料不足から、アシカ2頭はアメリカへと疎開している。ロンドン動物園の受けた空襲被害は限定的で、直撃弾を受けたシマウマの飼育舎から1頭が逃亡したほか、猿山の柵が破壊されてアカゲザルが逃亡した程度だった。脱走した動物は、数日以内に再捕獲された。北アイルランドのベルファスト動物園（en）では、1941年にベルファストがドイツ軍の爆撃圏内に入ったため、公安局（Ministry of Public Security）の命令で33頭の飼育動物が殺処分された。処分の対象にはライオンやオオカミ、ハイエナ、ホッキョクグマなどが含まれた。処分対象となった種は、戦後の1947年頃に再取得されるまでベルファスト動物園では見られなかった。一方、ゾウは処分を免れて戦争を生き延びたものがあった。中でも、シェイラ（Sheila）と名付けられた子供のゾウは、殺処分を避けるため、ある飼育員の家の裏庭に一時期の夜間は匿われていた。ベルファスト動物園によるとシェイラを保護していた人物は長らく詳細不明で、「ゾウの守護天使」と称されて同園史上の謎とされてきたが、2009年に、女性飼育員の一人が母親と一緒にシェイラを匿ったことが判明したという。この女性飼育員は、男性飼育員たちが出征したために代用職員となっていた人物で、他の職員の帰宅後に密かにシェイラを檻から出して近所の自宅に連れ帰り、また朝には動物園に戻していた。住民の通報で事件は発覚し、女性飼育員は解雇されたが、以後も空襲の夜には動物園を訪れてシェイラが怯えないようなだめていたという。
第二次世界大戦後の1949年（昭和24年）、上野動物園がある台東区の子供たち（台東区子供議会）からの「生きたゾウが見たい」という要望に対してインドの首相ジャワハルラール・ネルーが応え、同年9月にインド政府から上野動物園にメスのアジアゾウ1頭が贈られた。このゾウは「インディラ」と命名されたが、ネルー首相の娘であり後に首相となるインディラ・ガンディーが名祖であるとされる。また、同じ9月にタイからもメスのアジアゾウ1頭が贈られており、このゾウは、同国から戦前に贈られ戦中に殺処分されてしまった「花子」（ワンリー）に代わる二代目として「はな子」と命名された。なお、はな子は1954年（昭和29年）、誘致運動によって上野動物園から井の頭自然文化園に移された。2016年5月26日 永眠。（別項「実在した象の一覧」も参照のこと）。また、1952年、上野動物園飼育企画長の林寿郎により、カバ、キリン、チーター、ブチハイエナなど48頭の動物がケニアの動物商から購入され（その中のカラカル2頭は喧嘩で死亡したが、その後寄港したマニラにてヒムネバト2羽が加わリ、動物は再び48頭になった）、名古屋港、神戸港、横浜港に陸揚げされた。カバの「重吉」(東山動物園。2001年没）、キリンの「タカオ」（上野動物園。1980年没）などが有名（日本のカバの約半数は「重吉」の子孫である）。第二次世界大戦後も、1950年に朝鮮戦争が勃発した際には日本への戦闘拡大が危惧され、動物園での対策が検討されている。上野動物園では、1950年末から1951年1月にかけて『上野動物園非常事態計画』『非常事態打開計画資料』というマニュアルをまとめた。同園では、戦時猛獣処分の再現や空襲被害による動物の死亡を避けるため、伊豆大島への疎開を行う方針であった。なお、1951年5月から6月にかけてゾウの「はな子」とライオン1頭が伊豆大島へと派遣されているが、これは戦争とは無関係で、平時の移動動物園の巡業の一環である。
戦後、本件を題材にした創作作品がいくつか作られた。最もよく知られているのは、上野動物園のゾウの悲劇を基にした土家由岐雄の童話『かわいそうなぞう』（1951年）で、同書を通して戦時猛獣処分が広く知られることとなった。他にも、飯森広一が漫画『トンキー物語』（1971年）や、藤子・F・不二雄が漫画『ドラえもん』作中の「ぞうとおじさん」（1973年、てんとう虫コミックス5巻/藤子・F・不二雄大全集4巻収録）で、動物園で行われた戦時猛獣処分について描いている。
2000年代後半からは"九州ブルトレ"だけでなく関西 - 九州間や東京 - 中国地方間のブルトレについても急速に縮減が進められた。2005年3月1日のダイヤ改正で「さくら」「あさかぜ」が、同年10月1日には「彗星」が廃止され、翌2006年3月18日のダイヤ改正では「出雲」が廃止された。2008年3月15日のダイヤ改正では「なは」「あかつき」が廃止され、関西 - 九州間のブルトレが消滅した。また、最後まで寝台急行として残っていた「銀河」も同時に廃止された。2009年3月14日のダイヤ改正では、「はやぶさ」と「富士」が廃止されたことにより、東京駅発着の元祖「ブルートレイン」は全廃となり、東海道本線、山陽本線および九州島内からブルートレインが消滅した。牽引機であるEF65形やEF66形などといった電気機関車も、旅客列車の定期運用がすべて消滅している。JR東日本の調査によると、2005年における東京から西へ向かうブルートレイン運行路線全体の利用状況は、JR発足年である1987年の利用者数と比較すると、21%にまで落ち込んでいた。東北方面でも、山形・秋田新幹線開業を機に廃止や統合が相次いだ。2002年12月1日の東北新幹線延長により「はくつる」が廃止となる。2008年3月15日のダイヤ改正では「北斗星」、「日本海」が減便されたが、これは「青函トンネルを北海道新幹線に供用する工事のための間合い時間の確保」とされた。2010年3月13日のダイヤ改正では、「北陸」が廃止となった。2012年3月17日のダイヤ改正では「日本海」が定期運行を終了し、臨時列車に格下げとなったが、2013年冬季以降は運行されなくなった。2014年3月15日のダイヤ改正では「あけぼの」が定期運行を終了し、臨時列車に格下げとなったが、2015年冬季以降は運行されなくなった。一方で2009年より、「北斗星」「カシオペア」等の牽引用として、EF510形電気機関車（500番台）が新造されている（詳細は該当記事を参照）。しかし、このころの列車廃止の説明として、JR分社ごろの主力車両であった14系・24系客車の老朽化があると説明されるケースが出てくるようになる。