WJBLでは所属選手が籍を残したまま他のリーグでプレーすること、すなわち「二重登録」を原則禁止している。この二重登録についてはWJBLとシーズンが異なる米国・WNBAも例外ではない。2006年に河恩珠がロサンゼルス・スパークスでのプレーを希望した際、シャンソン化粧品と10年契約中であり、二重登録の解消が争点となっていた。しかしながら双方の主張が食い違い河はWNBAでのプレーはかなわずシャンソンも退団し帰国を余儀なくされた。過去に萩原美樹子がWNBAでプレーした際は特例により認められた。大神雄子については国内プロ契約のため、WJBL・WNBAそれぞれのシーズンで契約を交互に行うことで二重登録にならないよう配慮されている。他の競技ではバレーボールやアイスホッケーで所属チームに籍を置いたまま日本国外でプレーできる（いわゆるレンタル移籍）ようになっており、女子バスケットボールでも認めるべきという声は存在する。
旧日本リーグ女子時代には米国代表のアン・ドノバンなど外国人選手がプレーしていたが、前述の通り1992年シーズンを最後に外国人選手登録（日本帰化選手は除く）を廃止。その後、センターなど長身を要するポジションを中心に日本代表強化面で効果は現れている。ところが、日本で教育を受けた河恩珠が2002年よりシャンソン化粧品でプレーするに当たり日本国籍取得を余儀なくされ、大韓協会とトラブルになるなど弊害も見られるようになった。これを受けて2003年に日本帰化選手に加え、国内で教育を受けた選手に限り日本国籍を取得せず出場登録が可能になった。さらに2009年からは日本国籍取得申請中の選手に限り採用が認められ、2010-11シーズンから出場が認められるようになった。しかし、外国人排除の上でのナショナルチーム強化では身体能力の非常に高い欧米などの選手とのマッチアップの機会が大幅に限られるなど限界が見えており、一部で外国人登録復活の声も多くなっている。
バスケットボールのプロ化は国際的な流れであり、女子もまた例外ではない。しかしながらプロ化へ向けて一歩ずつ歩みを進めている男子の日本バスケットボールリーグ（JBL）と比べ、WJBLはプロリーグ化への動きが鈍い。プロ契約は男子同様1997年に解禁されたが、第1号は2007年の大神雄子（当時JOMO）まで待たなければならなかった。五輪から30年以上遠ざかっている男子と違い、女子は1996年のアトランタと2004年のアテネの2度五輪を経験し、ワールドカップ（旧世界選手権）にも出場を重ねており、ナショナルチーム強化の上でプロ化の必要性が薄いと言う意見が多いのも理由として挙がっている。しかし、韓国では既に韓国女子バスケットボールリーグ（WKBL）をプロ化するなどアジアでもプロリーグが次々と発足され、国内リーグがアマチュアのままである日本は強化で出遅れ、2006年世界選手権及び北京五輪を立て続けに逃した（特に世界選手権不出場は1986年以来20年ぶりで、1964年の初出場以降は2度目であった。）。また、WKBLとの対抗戦である日韓Wリーグチャンピオンシップではこれまで1勝も上げておらず、プロアマの実力差が現れている。これらを受け、プロ化の必要性も迫られることが予想される。
2004年より「WJBLトライアウト」と題して、新人選手の発掘を行っている。国立代々木競技場第二体育館（2006年は東京体育館、2007年は日本航空体育館）にて9月（2005年は8月、2006年は12月）に開催され、高卒以上を対象としている。定員は30名でおおよそ10~20名が参加。2004・05年は各2名がWJBL入りを果たしたが、2006年以降はWJBL加入に至った選手はいない。それもあってか2008年の参加はわずか8名であり、2009年は参加者が集まらず中止になった。2010年は12月20日に味の素ナショナルトレーニングセンターで開催された。
WJBLでは「サマーキャンプ」と題したイベントを7月下旬頃に実施している。このサマーキャンプではWJBL所属チームに加え、実業団連盟の強豪チームなどを招待し、5日間に渡り強化試合を組むとともに、バスケットボールクリニックなども開催し、選手・審判員の育成に加え地域振興も目的としている。開催地は2年ごとに変わる。
WJBLではホームゲーム制度を導入し、レギュラーシーズンの一部の試合を一方のホームゲームとして開催している。各チーム3～10試合程度ホームゲームが組まれ、本拠地が置かれる市町村での試合をホームタウンゲームとして行う。
ヒ86船団に参加するためシンガポールに集まった輸送船は、タンカーの極運丸（極洋捕鯨：10045総トン）、同さんるいす丸（三菱汽船：7268総トン）、同大津山丸（三井船舶：6859総トン）、同昭永丸（大阪商船：2764総トン）、貨物船永万丸（日本郵船：6968総トン）、同余州丸（宇和島運輸：5711総トン）、同辰鳩丸（辰馬汽船：5396総トン）、同建部丸（大阪商船：4519総トン）、冷凍船の第63播州丸（西大洋漁業：533総トン）および屎尿運搬船の優清丸（東京都：600総トン）のタンカー4隻とその他6隻だった。各船は石油やボーキサイト、生ゴムなどの天然資源を満載していた。ヒ船団と称しても、従来であればミ船団に加入していたような小型船が含まれ、船団速力は8ノットと低速だった。各船には、機関砲や爆雷を装備したり、煙幕展開用の発煙筒を搭載したりといった自衛武装が施されていた。船団は1944年12月30日に輸送船のみでシンガポールを出港して北上、1月4日にフランス領インドシナ（仏印）のサンジャック（聖雀、現在のブンタウ）に到着した。サンジャックで、門司から同地までヒ85船団を護衛してきた第101戦隊（司令官：澁谷紫郎少将）と合流し、1月6日に船団編成を完了した。第101戦隊は、日本海軍初の船団護衛専用の戦隊で、練習巡洋艦香椎を旗艦とした。本来は隷下に海防艦6隻を有していたが、ヒ85船団の護衛中に海防艦対馬が空襲で損傷離脱していたため、軽巡1隻・海防艦5隻（鵜来、大東、27号、23号、51号）の陣容だった。