1945年から1946年までヴィリー・ヴォルファーマンが町長を務めた。ゲオルク・リヒベルク（在職: 1949年 - 1967年）および次代のヨーゼフ・ヴィットヴァーの在任中にフライツァイトパルクが実現した。ヴィットヴァーの後任ベールスの次代に、町役場を含む小官庁街、スーパーマーケット、パン工房、薬局、小さな商店街といった町の中心部の改造が行われた。この町最大の政治スキャンダルが、1991年の収賄容疑によるベルス町長の逮捕である。CDU の有利となるような政治献金とシュヴァルツバッハ連盟宛の架空請求書とを「交換」したとされた。ベルスは「大規模建築の建設許可に対する障害」を撤廃したとして訴えられた。また、豪華な旅行に招待され、ある建設会社が彼に格安で家を貸していた。町長は無実を訴え、多くの住民が太鼓を打ち鳴らし、松明を掲げて町長支援のデモを行った。最終的にベルスは有罪にならなかった。ベルスの町長職を引き継いだパウル・デュンテ（在職: 1994年 - 2006年）は、新しい住宅地区「アム・エルトベールアッカー」と「ツィーゲライパルク」の基本計画を立案した。パウル・デュンテの後をクリスティアン・ザイツ (CDU) が継いだ。彼は元々、ホーフハイムのヴァラウ市区で生まれ育った。ザイツは 2006年3月26日の最初の投票で、カール・ハインツ・グレプと戦い、60.4 % の票を獲得した。この選挙にデュンテは出馬しなかった。2012年3月4日の選挙では、レギーナ・ヴィッシャー（同盟90/緑の党）に対して、75.1 % の票を獲得して再選され、さらに6年の任期を得た。
1618年から1648年の三十年戦争はクリフテルにひどい影響を遺した。1609年頃に存在していた 13の農場、44家族、水車1基がこの戦争の犠牲となった。最初のボニファティウス礼拝堂も戦争で破壊された。この礼拝堂は、1755年に新たに再建された。特にひどい傷痕を残したのは1635年に襲来したスウェーデン軍で、73歳のクリフテルの司祭ヨハン・ヴァグナーも絞首刑にされた。クリフテルは、比較的素速く戦争から立ち直ったが、1671年3月6日に再び不幸に襲われた。この日の朝 10字に村長のヨハン・オーアウスの納屋から出火し、強い風に煽られて勢いを増し、残ったのは34軒の木組み建築のうち4軒と教会の一部だけであった。1792年にフランス革命軍がこの地域に侵攻し、マインツとフランクフルトとの間の地域を占領した。19世紀初めのクリフテルの人口は 628人であった。1803年に聖界諸侯が廃止された。マインツ大司教領もその大部分が失われた。クリフテルは他のライン川右岸地域とともにナッサウ公領となった。普墺戦争後、ナッサウ公領はプロイセン王国に併合された。クリフテルは、プロイセン領となることで利を得た。マイン＝ライン鉄道がクリフテル近傍を通ることになったのである。1877年10月15日、この村の駅に通常列車が初めて停車した。この鉄道への接続やマイン川河畔の化学産業の興隆、特にヘーヒスト染料工場（旧マイスター・ルーツィウス＆ブリューニング）は、20世紀初頭のこの町に人口増加をもたらした。
754年、フルダへ向かう聖ボニファティウスの葬列は、おそらくこの町の付近でシュヴァルツバッハ川を渡った。この宣教師を讃えて、数多くのボニファティウス礼拝堂が建立された（初出は1277年）。クリフテルは、790年にフルダ修道院に寄贈された際に初めて文献に記録された。当時は、Cruoftera（「峡谷の小川」を意味する）と呼ばれていた。現存する古文書でクリフテルは、しばしば Cruftera または Cruftero と記述されている（中高ドイツ語で "Cruft" は「刻み込まれた」「食い込んだ」の意）この村の表記は、13世紀までに Cruftela あるいは Cruftila、後には Crüfftel と変遷した。現在のクリフテル町内には、同じくらい古くからヘディングハイムという集落があった。ヘディングハイムは 16世紀に廃村となった。クリフテルは、近隣のホーフハイム・アム・タウヌスと同様に、13世紀にフランケンシュタイン家の支配下に置かれた。この村は、14世紀にマインツ選帝侯領となった。クリフテルの町の紋章に描かれた「マインツの輪」が、かつてマインツ選帝侯領であったことを現在でも示している。その後、クリフテルをも含むアムト・ホーフハイムは、エップシュタイン伯に借金の担保に出された。エップシュタイン家の断絶後はシュトルベルク伯がこれを相続し、1540年にクリフテルにも宗教改革をもたらした。1559年、マインツ選帝侯の借金が返済され、クリフテルはカトリック信仰に戻された。
紀元後72年から73年頃、ローマ人はその定住地を護るため、クリフテルを見下ろす高台（現在はホーフハイム市内で、マイン＝タウヌス郡の郡庁がある）に石造の城塞を築いた。このホーフハイム城は、ホーフハイムのカレンベルクに設けられた見張り塔をも視認できる位置にあった。現在の町境にあった宿営のための村は、1841年に発見されて以降、何度も考古学的発掘の対象となっている。
ある夏の日、タブスおばあさんがピンク・パンク・ポンクの3匹と森の中を散歩している時に猛烈な嵐が吹いて、農場にあるタブスおばあさんの家を無残に押し潰してしまった。ピンク・パンク・ポンクは3匹で手分けしてタブスおばあさんを安全な所へ誘導するが、食べ物が無くなってしまう。ピンクは潰れてしまった家の地下室にチーズがあったことを思い出すが、それを言い出すとポンクは「あんたはどうせ、いつものようにくだらないことを思い付いたんでしょう」と発言を遮ってしまう。しかし、パンクは「くだらないことでもやってみる価値があるかもしれないから言ってみろ」とピンクに発言を促し、ピンクが言った通りに地下室からチーズを掘り出したのでおばあさんと3匹は晩ごはんを食べることが出来た。しかし、家が潰れたままではどうにもならずポンクが困り果てていると、ツバメの女王・ティリーが飛んでいたのでポンクはティリーを呼び止め、ツバメたちを動員して木の葉の家を作ってもらう。ところが、木の葉の家は次の日の夕方に吹いた強風でまた綺麗さっぱり吹き飛ばされてしまった。ピンクは「地下室の瓦礫を取り除けばそこに住めるかも知れない」と提案し、ポンクは反対するがパンクは賛成してミズネズミの王様・トミーやその仲間たちに手伝ってもらい地下室から綺麗に瓦礫を取り除いてまだ使える家財道具を引っ張り出した。タブスおばあさんが地下室へ降りて行ったのを見届けたピンクは1匹で農場の外へ行き、幼い兄妹に芸を見せる。兄妹はこの豚がサーカス団から逃げて来たのだと思い、後へ付いて行くとそこはタブスおばあさんの家の跡だった。兄妹は面白がって瓦礫を片付け、地下室に天井を作ってくれた。こうして、タプスおばあさんの雨にも風にも雪にも強い新しい家が完成し、アヒルのポンクが子豚の思い付きを馬鹿にすることは二度と無くなったのであった。