1991年から再開発計画はあったものの、長らく着工には至れず南口駅前はバスロータリーに小規模商店、空地などが点在する状態が続いた。2008年「八王子駅南口地区市街地再開発事業」が着工、同年1月から41階建ての再開発ビル「サザンスカイタワー八王子」の建設および駅前広場の整備を行い、2010年11月に竣工、同年12月1日に開業した。再開発ビルには、市民会館「オリンパスホール八王子」（4 - 10階・上野町のものを移転）や八王子駅南口総合事務所（4階）などの公共施設や、商業施設（1 - 3階）、業務施設（5 - 7階）、住宅（9 - 41階・390戸）、地下駐車場が入居する。2階に地元スーパーのスーパーアルプスが入居した他、カフェやドラッグストアが。3階には飲食店等のテナントが入居している。再開発ビルの下に整備された駅前広場には、「とちの木デッキ」という名称のペデストリアンデッキやバスロータリーが新設され、バスロータリーには八王子みなみ野駅から発着している近隣大学の通学バス専用発着場も整備された。2010年11月20日より「とちの木デッキ」およびバスロータリーの完全供用開始に伴い、北口発着分を含めたバス路線の整理が行われた。また、駅自由通路東側にはJR東日本がビックカメラ、保育所、飲食店等が入居する地上6階・地下2階建ての駅ビル（商業施設）「セレオ八王子南館」を建設し、2010年11月11日に開業した。さらに、駅自由通路西側ではJR貨物による地上5階建て6層の立体駐車場「駐太郎」が開業した。2016年、駅自由通路西側にJR貨物と住友不動産の共同開発で地上26階建て、地下1階建て住宅商業の複合ビルが着工した。地上6階建ての商業施設部分にはオーパ(OPA)が出店を決定。2018年11月29日に八王子オーパ(OPA)が開業した。
八王子市の中心市街地である（「駅周辺の歴史」も参照）。北口、南口にそれぞれある駅前広場は歩行者および路線バス、タクシーの発着用である。自家用自動車等は北口では駅からやや離れた場所か、地下駐車場を利用する。南口では2018年11月22日、新たに開業した「八王子オーパ」1階東側に一般車両の乗降場が設けられた。ただし、認められているのは一時的な停車だけで、出迎えのためなどの駐車やマイクロバスなど大型車両の進入は禁止されている。
以前は八王子駅（高尾駅）に玉川亭という業者が駅弁を販売していたが、既に撤退している。現在は、日本レストランエンタプライズ (NRE) の駅弁（新宿駅・大宮駅・水戸駅・いわき駅と全く同じ）が「駅弁屋」で販売されている。その後、2階コンコースのギフトプラザ売店にて崎陽軒の弁当の取り扱いが開始されている。
八王子オフレールステーション（略称：八王子ORS）は、JR貨物の施設の通称。旅客駅の中央本線に沿った東側、八王子市北野町600にある。2012年時点ではコンテナ集配基地として機能しており、貨物列車の発着はない。列車代替のトラック便が、1日3往復、梶ヶ谷貨物ターミナル駅との間で運行されている。かつては貨物列車の発着があり、コンテナは列車で輸送されていたが、1998年10月よりトラック代行になり、自動車代行駅となった。また、2006年3月の貨物駅の名称整理の際に、「オフレールステーション」の通称の使用を開始している。2012年時点ではコンテナヤードが置かれているのみだが、列車の発着があった時期は1面2線のコンテナホームを有していた。すでに荷役線は撤去され、山田川を渡る橋のみ残っている。
駅構内東側で、八高線から分岐し中央本線に沿って東進、途中で保線基地線を分岐させ、浅川西岸にある日本オイルターミナル八王子営業所（油槽所）へ至る側線がある。この線路は油槽所への石油搬入に使用されており、末端に石油荷役線2線と留置線1線がある。この油槽所へ石油を輸送するため、根岸駅や千葉貨物駅から石油輸送用貨物列車が運行されている。
JR貨物の駅は、コンテナ貨物（12ftコンテナのみ）と車扱貨物の取扱駅となっている。車扱貨物を輸送するための貨物列車は設定されているが、コンテナ輸送はすでにトラック代行化されている。駅の業務は神奈川臨海鉄道が受託している。
2005年12月25日から全ホームの発車メロディが八王子市内出身の中村雨紅作詞の『夕焼小焼』となった。メロディの制作はサウンドフォーラムで、編曲は牧野奈津子が手掛けた。ホームごとにアレンジが異なる。コンコースにはこの歌をイメージした壁画と歌碑が屋根の段差部分に取り付けられている。
ジャン・ド・リュクサンブール（仏:Jean de Luxembourg(-Ligny), 1342年頃 - 1373年4月4日）は、フランス出身のローマ・カトリック教会高位聖職者。ストラスブール司教（1365年 - 1371年）、マインツ大司教（1371年 - 1373年）、神聖ローマ帝国領ヴェッテラウの代官。ドイツ語名はヨハン・フォン・リニー（Johann von Ligny）。リニー領主ジャン1世とその最初の妻アリックス・ド・ダンピエールの間の息子として生まれた。幼い頃から聖職者の道に入り、1355年にトリーア大聖堂参事会助祭に任命された。マインツの年代記において、ジャンは取るに足りない人物で、大司教としての統治手腕も粗末なものだったと評価されている。ジャンの登用はむしろ、実家リニー家の本家筋にあたるリンブルク＝ルクセンブルク家の神聖ローマ皇帝カール4世による家権拡大政策の一環であった。カール4世は1365年にジャンをストラスブール司教に叙階させた。さらにカール4世は、対立関係にあったトリーア大司教クーノ・フォン・ファルケンシュタインから大司教の地位を奪い、ジャンに与えようとまでした。皇帝はジャンをケルン大司教にしようとも狙ったが、不首尾に終わった。カール4世は1371年、ジャンをマインツ大司教に就けることに成功した。同時に、皇帝はジャンにヴェッテラウの代官職をも与えた。ジャンは自身の統治する大司教管区や代官領、およびテューリンゲン地方の諸勢力と皇帝との間の調停者の役割を務めた。しかしジャンは大司教就任から2年も経たないうちに没した。まだ30歳前後だったジャンの突然死は、マインツ大司教の座を狙うシュパイヤー司教アドルフ・フォン・ナッサウ＝イトシュタインが仕組んだ毒殺ではないかという風聞が立った。ジャンの棺はエーバーバッハ修道院の付属教会内陣の側廊に埋葬された。ジャンの板碑には祭服と司教冠を身に着けたジャンの姿が描かれていた。この板碑は1830年代に取り壊された。