ブラウンのインディアンとレンジャーの部隊はベイカー隊の進行路で待ち伏せを行い、一方プレボストの正規兵部隊が3列縦隊でベイカー隊の背後に進んだ。5月17日午前9時頃、ベイカー隊が待ち伏せされている場所まで来ると、いきなり正面と側面から50ヤード (45 m) の距離でブラウン隊からの一斉射撃を受けた。ベイカー隊は後ろを向いて逃亡を始めたが、そのままプレボストの正規兵隊に飛び込むことになった。ベイカー隊の兵士は既に縮み上がっており、藪から現れた多数のレンジャーとインディアンにすぐに圧倒された。敵の姿を最初に見たときにベイカー隊の半数は逃亡した。ベイカーはその馬を仲間の一人に取られ、湿地の中に逃げ込んだ。この戦闘で生じた被害状況は史料によって異なる。デイビッド・ラッセルは、ベイカー隊の3名が戦死し、9名が負傷し、31名が捕虜となったとしている。捕虜の多くはその後復讐心の強かったクリーク族インディアンに殺された。チャールズ・ジョーンズは、戦死者と負傷者は同じだが、34名が捕虜になったとしており、ウィリアム・ネスターの史料でも同じである。エドワード・ケイシンは、40名が捕虜になり、そのうち16名だけがクリーク族の報復から逃れたとしている。アメリカ合衆国国立公園局の史料では、8名が戦死し、9名が負傷、31名が捕虜になり、そのうち15名が後に殺されたとしている。イギリス側の被害について、トーニン総督もブラウン中佐も報告していない。
東フロリダ総督パトリック・トーニンは4月にジョージア植民地が立てている作戦について警告され、5月10日にはベイカーの中隊がセントメアリーズ川を越えたと報告を受けた。ロイヤリスト・レンジャーと主にクリーク族インディアンの混成部隊をブラウン中佐が率い、2月の襲撃以後は2つの植民地境界で活動を続けていた。彼らがベイカー隊の宿営地を発見した。ブラウンはジョージア民兵の1人を捕まえて尋問したいと考えたが、ベイカーの偵察が用心深く、そのために派遣された部隊が銃撃を受けた。5月14日から15日の夜、ブラウンはベイカー隊の馬を盗むために15人のインディアンを派遣した。彼らはうまく馬を盗んだが（資料によりその数が異なり、40頭ないし100頭としている）、ベイカー隊の兵士に追跡された。続いて起こった小競り合いで馬は取り返された。しかし少なくとも1人のインディアンが殺され、その遺体はジョージア民兵によって切断されたことが、イギリス側から報告されている。トーニン総督の6月18日に書かれた報告では、この「非常に憤慨させる野蛮さ」がアメリカ兵にとって悲惨な結果をもたらすことになったとしている。ベイカーは、エルバート隊の遅延について心配し、地元住民から東フロリダの当局がこの遠征について警告を受けていることを知ったので、西に動いて待機するための戦略的に優れた場所を探し、ナッソー川支流のトマス・クリーク岸で宿営した。一方ブラウンのインディアンとレンジャーの部隊はマーク・プレボスト少佐の指揮するイギリス軍正規兵で補強され、総勢は約200名に上っていた。その放った斥候が5月16日から17日の夜にベイカー隊の宿営地を突き止めた。
1945年8月末までに東南アジア各方面での占領任務に割り当てられたイギリス軍部隊は準備を終え、一部は既に出発していた。しかし連合国軍最高司令官ダグラス・マッカーサーがSEACに対し、東京にて正式な日本の降伏手続きが行われるまで再進駐を控えるように要請したため、正式な占領任務の開始は8月28日と改められた。また、その後台風の影響で9月2日まで延期されている。要請の背景には、各地に展開する日本軍野戦指揮官らと日本本国の意思疎通が既に途絶していたため、日本政府の降伏手続きを待たない行動が野戦指揮官らの反発を招き、軍部隊の降伏拒否につながる可能性が危惧されていたことがある。マッカーサーの要請により連合国軍のベトナム到着が遅延したため、日本軍の捕虜となっていたフランス軍部隊の解放も遅れ、8月15日以降は様々な現地勢力による政治的空白地帯の支配が進められた。こうした情勢下で最も利益を受けたのが共産主義勢力であった。ホー・チ・ミン指揮下のベトミンは独自の政府を成立させるべく、他勢力を駆逐してハノイやサイゴンの確保を目指した。8月17日にはベトミンの総蜂起によるベトナム八月革命が発生し、9月2日にはベトナム帝国が廃されベトナム民主共和国（北ベトナム）の独立が宣言された。革命最中の8月22日には、フランス共和国臨時政府を代表したジャン・セディール少佐が、南ベトナムにおける統一準備政府である南部暫定行政委員会との交渉のためにコーチシナへと落下傘で降下したものの、現地の日本軍守備隊によって護衛と共に逮捕され、サイゴンへと連行されている。セディールは解放後に改めて委員会との交渉に着手し、後にインドシナ高等弁務官に任命されている。9月10日、南部暫定行政委員会は南部人民委員会に改組された。委員会は委員長ファム・バン・バック、副委員長兼軍事委員チャン・ヴァン・ザウなど13人から成っており、グエン・バン・フオン博士率いる50人の諮問委員会が付属した。連合各国はフランスのインドシナ領有を認めていたが、再進駐についてはアメリカ合衆国からの反対があった。この時点でアメリカ政府は公的な立場において共産主義勢力であるベトミンへの敵意を明らかにしてはいなかった。マッカーサーによる降伏文書調印式は9月2日に戦艦ミズーリ艦上で行われ、3日後には各地の捕虜収容所に対して支援物資のパラシュート投下が行われた。更に翌日、ALFFIC先遣隊がサイゴン入りし、11日には旅団主力がビルマのモビ飛行場（Hmawbi Field）からバンコク経由でサイゴンまで輸送された。サイゴンでは未だ武装を保った日本軍とベトミン軍の将兵によって連合国軍部隊の歓迎式典が行われた。