大正後期から昭和初期の東京を舞台に「帝都一の名探偵」と言われた御神楽時人と、彼の助手である鹿瀬巴・久御山滋乃・桧垣千鶴の「御神楽少女探偵団」と呼ばれている3人の少女、及び時人の世話係である蘭丸の周りで次々と起こる難事件を解決していくゲーム。本編シナリオは、「事件編」、「捜査編」、「解決編」の3編によって構成されている。「事件編」は、御神楽探偵事務所に事件解決の依頼が持ち込まれてから、実際に捜査を行うところまでを描く導入部分。プレイヤーが操作して介入する部分はなく、従ってゲームオーバーも存在しない。「捜査編」は、実際の捜査を行い、推理の材料を全て集めるところまでを描くゲームのメイン部分。1つのシナリオは複数のセクションから構成されている。登場人物との会話や現場の調査中に、「プレイヤーが事件解決のヒントとなる情報があると推測した箇所」で“推理トリガー”と呼ばれるコマンドを入力する（回数制限あり）ことで、指摘箇所を言及、追求し新たな情報を得ることができる。この推理トリガーの入力が成功すると「推理ポイント」の値が増え、それが一定値に達することで該当セクションクリアとなる。推理トリガーの入力回数制限は各セクションごとに設定されており、残り回数が0になるとゲームオーバーとなる。「解決編」は、捜査編で集めた情報を基に、御神楽時人の推理によって事件の真相が解き明かされるシナリオの完結編部分。『御神楽』では事件編と同様にほぼオートデモであったが、『続・御神楽』ではプレイヤーも推理に参加することになり、途中でいくつか捜査編での情報を総合して考察をする必要がある選択肢が出現する。選択を誤ってもゲームオーバーにはならないが、シナリオ終了後の探偵度評価で減点を課されるペナルティがある。始めの二作にはストーリーの途中アニメシーンやミニゲームがある。初期2作はプレイステーション用ソフトとしては珍しい、512ドット×480ライン解像度出力を用いたソフトでもあり、その高解像度によってテキストを独自のフォントで表記しているほか、ルビが表示されている。
1作目『御神楽少女探偵団』と2作目『続・御神楽少女探偵団』はプレイステーション用のゲームソフトとして発売されたが、3作目の『新・御神楽少女探偵団』では、キャラクターデザインや声優陣が一新され、性的要素が含まれるアダルトゲームとなっている。また1作目と2作目はゲームアーカイブスにて配信が行われている（PS3・PSP対応。担当は株式会社ハムスター）。脚本・監督・ゲームデザインは、3作とも河野一二三。なお、本項では1作目の『御神楽少女探偵団』を『御神楽』、2作目の『続・御神楽少女探偵団 〜完結編〜』を『続・御神楽』、3作目の『新・御神楽少女探偵団』を『新・御神楽』と略記して扱う。ヒューマンの破産以降、著作権の所在に混乱があったが、2009年8月、（河野の）ヌードメーカーとハムスターが共同保有することで合意した。
毎週リスナーから「アニソン（アニメソング）」を送ってもらうコーナー。アニメであればジャンルは問わず（特撮モノもOK）、その曲を取り扱ったアニメについてアメザリの二人が熱く語る。曲は基本的には毎週2曲ずつだが1曲目のアニメについての話が盛り上がりすぎて2曲目をかけられないこともしばしば。逆にアメザリの二人がよく知らないアニメのことや、知っているアニメではあるが曖昧な記憶だけでしゃべったために、間違った知識を披露してしまい、その度にリスナーからの鋭い指摘がくる。
2007年5月、プロデューサーに前任のドン・ギルモアから新しくリック・ルービンを迎え、実に4年2か月ぶりとなる3枚目のオリジナル・アルバム『ミニッツ・トゥ・ミッドナイト（Minutes To Midnight）』をリリース。音楽性で大きな路線変更があり、賛否両論が起こったものの、アメリカや日本を初め世界31か国で1位を獲得。そのほとんどの国々でプラチナディスク、ゴールドディスクの認定を受けた。現在までに全世界で2,000万枚以上の売り上げを記録している。アルバムからの1st.シングル『ワット・アイヴ・ダン（what i've done）』はスティーヴン・スピルバーグ制作総指揮の映画『トランスフォーマー』の主題歌に使用された。2007年7月、世界7大都市で同時開催されたチャリティーコンサート『ライヴ・アース（LIVE EARTH）』の東京公演にヘッドライナーとして出演した。同年11月には、来日公演の『JAPAN TOUR 2007』が開催され、その際に来日記念盤として、『ミニッツ・トゥ・ミッドナイト―ツアー・エディション（Minutes To Midnight -Tour Edition）』がリリースされた。2008年4月、ラッパーのバスタ・ライムスとのコラボレーション曲『ウィ・メイド・イット（We Made It）』のシングルCDをリリース。この曲はバスタ・ライムスの新アルバムに収録される予定だったが最終的には収録に至っていない。2008年11月には、2nd.ライヴ・アルバム『ロード・トゥ・レヴォリューション（ROAD TO REVOLUTION: LIVE AT MILTON KEYNES）』 と、未発表音源を収録したミニ・アルバム『ソングス・フロム・ジ・アンダーグラウンド（Songs From The Underground）』をリリースした。同アルバムには、これまでにLPU会員限定で公開されてきたデビュー前の楽曲やアルバム未収録の『QWERTY』が収録されている。日本では来日記念盤が2009年5月14日にリリースされた。2009年5月18日、前述した『トランスフォーマー』の続編にあたる2009年6月公開の映画『トランスフォーマー: リベンジ』の主題歌として『ニュー・ディヴァイド（New Divide）』が書き下ろされ、全米で初登場6位を記録した。前回は主題歌に起用されただけだったが、本曲は映画のために書き下ろされたものである。8月に開催されたサマーソニック09ではヘッドライナーを務め、そのライヴ中には、同月に本格始動したチェスター・ベニントンによるソロプロジェクト『デッド・バイ・サンライズ（Dead By Sunrise）』がスペシャルゲストとしてパフォーマンスを行った。同プロジェクトの1st.アルバム『アウト・オブ・アッシュズ（Out Of Ashes）』は9月30日に日本先行で発売された。2009年12月には、未発表音源、デモ楽曲を収録した2枚目となるミニアルバム『デモ・トラックス（LP Underground 9: DEMOS）』をリリースした。同アルバムには、試作段階の曲や『QWERTY』と同じく3rd.アルバムの選曲から外された楽曲『アクロス・ザ・ライン（Across The Line）』が収録されている。また、一般販売はアメリカと日本のみである。