ドハーティには姉と妹がおり、それぞれエイミー・ジョーとエミリーという名前である。母ジャクリーン・ドハーティは看護婦で、ドハーティとの家族生活や彼のドラッグ問題について書いた本 "Pete Doherty: My Prodigal Son"(ISBN 978-0755316083) を出版している。ドハーティの父ピーター・ドハーティ・シニアは陸軍士官である。ドハーティの父は、息子に対して真剣にリハビリに取り組むよう何度も説得を試みた後、2005年の初めには何度となく約束を破られるのに疲れ果て、ドハーティが完全にドラッグと手を切るまで息子には会わないと誓った。この問題をめぐってドハーティが神経過敏になっていることは、2006年11月12日に放映されたBBC Twoによるドキュメンタリー "Arena" のドハーティを描いた回において明らかとなった。この番組ではドハーティが自分の個人的生活のうちこの問題に関わる側面について語った場面などが含まれている。彼は目に見えて動揺し、ある所ではインタビュアーに対して礼儀正しくも撮影を中止するよう要請せざるを得なかった。2007年の10月には、 BBC Radio 4 の番組 "Front Row" において、音信不通だった父がリハビリ中の彼を訪ねてきて、3年ぶりに和解したとドハーティは語っている。ドハーティはケイト・モスと交際し、しばしばプレスの報道の種となって世間を騒がせた。2人は2005年1月、モスの31回目の誕生日に出会い、それ以来くっついたり離れたりを繰り返す関係をもってきた。モスはドハーティのショーでときおり歌ったりもしている。2007年4月11日、モスも出演したロンドンのハックニー・エンパイア劇場におけるドハーティ初の単独ギグの公演中、彼はモスを自分のフィアンセとして発表した 。ドハーティは2007年の夏のあいだにモスとの結婚を予定していた。しかし、2007年7月以降2人は関係を解消している。2007年の10月に、ドハーティはファッション・モデルのイリナ・ラザレアヌとごく短期間ながら婚約していた 。ドハーティには、歌手のリサ・ムーリッシュ (Lisa Moorish) との間にアスタイルという名の息子がいる。
ドハーティは麻薬の不法所持やその不正使用から引き起こされる、酩酊状態での運転や免停中の運転などといった揉め事のために、たびたび逮捕されている。この麻薬中毒のため、挙句の果てには投獄され、さまざまなリハビリ施設に通うこととなり、ステージでの演奏に悪影響を与えることさえあった。彼の人生におけるドラッグの影響は、彼が自伝で認めているように、若い頃すでにドラッグ購入のための金を得るため、同性愛者相手の男娼や麻薬ディーラーとして働かざるを得なくなる事さえあるほど強いものであった。
2012年、俳優としてロマン派の作家、アルフレッド・ド・ミュッセの自伝的小説を映画化した「『詩人、愛の告白』（原題 Confession of a Child of the Century）」にオクターヴ役で主演した。ブリジット役はシャルロット・ゲンズブール。
モデルであると同時に元フィアンセであったケイト・モスに倣い、ドハーティはロベルト・カバリの2007/08年秋冬シーズンのファッション広告キャンペーンのモデルを務めた。このときの写真はドハーティを普段以上に小奇麗かつハンサムに写したものとして評判を呼んだ。この1950年代風の写真は故マーロン・ブランドのイメージとも比較された。
「萌えキュンソングを世界にお届け」をキャッチフレーズに、電子音を多用し速いBPMで情報量の多い歌詞が詰め込まれる「電波ソング」を歌うアイドルとして活動を開始する。この方針はプロデューサーのもふくちゃんのアイデアであり、「電波ソングを中心にしたアイドルは今までにないのでは」と思った事から電波ソング界で実績のある音楽家に楽曲提供依頼をするようになる。ランティス時代に発表したシングル「Kiss＋kissでおわらない」、「ピコッピクッピカッて恋してよ」は、電波ソングの代表的な楽曲の1つ「もってけ!セーラーふく」を手がけた畑亜貴が作詞を手がけ、UNDER17やULTRA-PRISMで萌えソングを手がけてきた小池雅也が作曲・編曲を担当。トイズファクトリーからの第1弾シングル「Future Diver」では、畑、小池に加え「みっつ数えて大集合!」などの電波ソング系アニメソングを手掛けてきた前山田健一が編曲として参加。夢眠は、畑、小池の事を「でんぱ組.incにとって親のようなコンビ」と話している。電波ソング系の楽曲を続けて発表する一方で、小沢健二の「強い気持ち・強い愛」のカバーや、かせきさいだぁ・木暮晋也が楽曲提供した「くちづけキボンヌ」「冬へと走りだすお!」、2016年発売の「GOGO DEMPA」では車谷浩司による「アンサンブルは手のひらに」や、「きっと、きっとね。」で渋谷系にも接近する。他にも2014年に、かせきさいだぁ・カジヒデキが「ファンシーほっぺ♡ウ・フ・フ」を、2015年にはBOSE・渡辺俊美が「ギダギダdaズバズバda!!」を楽曲提供している。2013年1月にでんぱ組.incにとって転機となる問題作「W.W.D」を発表する。同作品は前山田健一がプロデュース、作詞、作曲を手がけ、「マイナスからのスタート」をキーワードに、ひきこもりやいじめといったメンバー6人の暗い過去からでんぱ組.incのメンバーとして活動するに至るまでの姿を描いたドキュメンタリーソングを発表し話題を呼んだ。同年10月には続編「W.W.D II」を発表し、「現在抱えている問題」をテーマに「自信がない」「私なんかいなくなれば…」「がんばりたいけど がんばれない」といったダメな自分と正面から向き合い、「W.W.D」と併せて至極パーソナルな心情を吐露することでより注目を集めた。2015年2月に発売されたアルバム『WWDD』では、「W.W.D」、「W.W.D II」のような要素が薄くなり、相沢は「暗いところがあまりない」、藤咲は「大人しい曲から、でんぱ組.incっぽい曲まですごい振り幅があるアルバムになった」、夢眠は、「W.W.Dシリーズ、武道館を経て、エンターテインメントに特化するということを意識し始めてる気がする」と話している。収録曲「サクラあっぱれーしょん」ついて藤咲は「マイナス要素や暗い部分が一切ない」と述べた。「檸檬色」「ブランニューワールド」「イロドリセカイ」といった普遍的なポップソングも収録されており、これについて古川は「いつものでんぱ組からは想像できない曲」、相沢は「でんぱ組.incらしさをなんとなくわかってくれる人も増えてきたことから、BPMが遅い曲を導入する事で改めて驚いてもらいたい」とした上で、「普遍的なポップソングばかりの方向に行くかと言うと、それはありえないと思う」、「いろんな曲に挑戦した事で、でんぱ組.incの色が薄れてしまったら意味がない」、「何をやってもでんぱ組.incだという存在にならないといけないと思った」、「『WWDD』以降のでんぱ組.incはみんなと一緒に作っていく」と話した。また、最上は予てより「でんぱ組.inc」というジャンルを確立させたいという気持ちが強いと話している。