ショートの殺害は有名になり、それが原因で数年にわたって数多くの人々が出頭していった。その多くは嘘であると考えられた。初期捜査では合計して60回の出頭があった。そのほとんどが男性によるものだった。それ以来、500名以上の人々が犯行を自白してきた。その中にはショート殺害の時点では生まれていない人さえもいた。引退するまでこの事件に取り組んだジョン・P・セント・ジョン (英: John P. St. John) 巡査部長は、これほどまで多くの人が自分は殺人者であると名乗り出るのは驚くべきことだと述べた。2003年、事件を担当した刑事の一人であるラルフ・アスデル (英: Ralph Asdel) はロサンゼルス・タイムズに、ショートを殺したと思しき人物を尋問したことがあると語った。その男性は、1947年1月15日の早朝に、遺体が発見された空地の近くでセダンを駐車しているのを目撃された。その日、近隣住民が刈り取った芝を空地に捨てに車で立ち寄ったときに、駐車されたセダンを見かけた。セダンは右後方のドアが開いており、セダンの運転手が空地の中に立っていたという。運転手は近隣住民が現れたことに驚いていたようで、近隣住民の車に近付き、窓の中を凝視すると、セダンの方へ戻って去っていった。セダンの持ち主は地元の料理店で働いていることまで追跡されたが、最終的には容疑から外れた。様々な著述家や専門家の間で依然として議論の対象となっている被疑者の中には、ウォルター・ベイリー (英: Walter Bayley) という医師もいる。ベイリーが犯人であるという説は、かつてロサンゼルス・タイムズの原稿整理編集者だったラリー・ハーニッシュ (英: Larry Harnisch) により提案された。伝記作家のドナルド・ウォルフ (英: Donald Wolfe) は、ロサンゼルス・タイムズの経営者であるノーマン・チャンドラー (英: Norman Chandler) がショートを妊娠させ、後に殺害したと主張している。他にも被疑者として、レスリー・ディロン (英: Leslie Dillon)、ジョセフ・A・デュメー (英: Joseph A. Dumais)、アーティ・レーン (英: Artie Lane、またの名をジェフ・コナーズ <英: Jeff Connors>)、マーク・ハンセン、フランシス・E・スウィーニー (英: Francis E. Sweeney) 医師、ジョージ・ヒル・ホーデル・ジュニア (英: George Hill Hodel Jr)、ホーデルの友人フレッド・セクストン (英: Fred Sexton)、ジョージ・ノールトン (英: George Knowlton)、ロバート・M・"レッド"・マンリー、パトリック・S・オライリー (英: Patrick S. O'Reilly)、ジャック・アンダーソン・ウィルソン (英: Jack Anderson Wilson、またの名をアーノルド・スミス <英: Arnold Smith>)が挙げられている。警察はジョージ・ヒル・ホーデル・ジュニアを被疑者と考えたことがあったが、正式に告発することはなかった。ホーデルの死後、その息子がホーデルを告発したことで注目を集めた。ホーデルの息子のスティーヴ・ホーデル (英: Steve Hodel) はロサンゼルスで殺人事件を担当する刑事であり、父はショートの他にも数名を殺害したと主張した。ブラック・ダリア事件の前にも、ホーデルは自身の秘書のルース・スポールディング (英: Ruth Spaulding) を殺害した容疑で疑われていたが、告発されなかった。しかし、自身の娘のテーマー (英: Tamar) を強姦した容疑で告発されたことはあり、その犯行は認めていた。ホーデルは数回アメリカから逃亡していたことがあり、1950年から1990年はフィリピンに住んでいた。
ショート殺害事件は1947年の春までには新しい手掛かりが乏しくて迷宮入りとなっていた。事件の主任捜査官の一人だったフィニス・ブラウン (英: Finis Brown) 巡査部長は、記者が事件の詳細を調査したり、確証のない報道をしたりして、捜査を妨害したということで報道関係者を批判した。1949年9月、大陪審が開かれ、ロサンゼルス市警察の殺人事件捜査班が、過去数年間で数多くの殺人事件、特に女性や子供が殺害された事件を解決できなかったことについて審議された。審議の対象にはショートの事件も含まれていた。大陪審の影響で、ショートの過去についての更なる調査が実施され、刑事たちはマサチューセッツ、カリフォルニア、フロリダ間のショートの行動を追跡し、テキサスやニューオーリンズでショートと知り合っていた人々の尋問も実施した。しかし、この尋問でも捜査に使えそうな情報は得られなかった。
徳島県三野町（現・三好市三野町）生まれ。三野町立芝生小学校（現・三好市立芝生小学校）、三野町立三野中学校（現・三好市立三野中学校）、徳島県立脇町高等学校、早稲田大学第一文学部英文科卒業。1994年、ダイエーに入社し、社長室秘書部に配属された。1998年からアメリカ合衆国ワシントン大学に1年間留学し、1999年よりダイエー業務室配属。同年9月、ダイエーを退社。2000年、民主党の候補者公募に合格する。同年の第42回衆議院議員総選挙に民主党公認で徳島2区から出馬したが、自由民主党の山口俊一に敗れ、落選した。2003年、第43回衆議院議員総選挙に徳島2区から出馬し、再び山口に敗れるが、重複立候補していた比例四国ブロックで復活し、初当選した。2005年、第2子出産のため通常国会に欠席届を提出し、国会議員では珍しい産休を取得した。同年7月の郵政国会での郵政民営化法の採決にも欠席。第44回衆議院議員総選挙では、徳島2区選出の自民党議員だった山口俊一が郵政民営化に反対し、採決で造反したため、自民党の公認を得られないまま、無所属で出馬。自民党は七条明を徳島2区で公認し、日本共産党の新人を含めた4人で議席を争ったが、無所属で出馬した山口が当選し、高井は次点で落選した（次々点の七条は比例復活）。同年12月13日、比例四国ブロック選出の民主党衆議院議員五島正規の政策担当秘書の公職選挙法違反に伴い、五島が衆院議員を辞職。五島の辞職により、比例四国ブロックで次点だった高井が繰り上げ当選した。2009年の第45回衆議院議員総選挙では、2006年に自民党に復党し同党公認で出馬した山口俊一を徳島2区で下し、初めて選挙区で当選した（山口も比例復活）。選挙後に発足した鳩山由紀夫内閣で文部科学大臣政務官に任命される。2010年1月、山形県で行われた日本教職員組合の教育研究全国集会に出席。文部科学省の政務三役が日教組の集会に来賓で出席するのは2001年の同省発足以来初めてで、文部省時代を含めても1951年に当時の文部政務次官が出席して以来、59年ぶりである。2012年4月6日、野田第1次改造内閣で文部科学副大臣に任命され、野田第2次改造内閣まで務める。同年の第46回衆議院議員総選挙では、徳島2区で自民党の山口に敗れ、比例復活もできず、落選した。第47回衆議院議員総選挙においても徳島2区で公認を受けていたが、2014年9月14日、徳島県議会議員選挙への出馬を表明し、徳島2区での公認を辞退した（民主党は同年の衆院選で徳島2区に候補を擁立せず）。2015年4月、徳島県議会議員選挙に三好第1選挙区（定数2）から無所属・民主党推薦で出馬。高井、自民現職の来代正文、自民新人の井下泰憲はいずれも5千票台の接戦となるも、高井はトップ当選を果たした。2019年4月の県議選で再選を果たした。