ゲーム開始からエンディングまでの経過時間に制限がなく、いつエンディングを迎えるかをプレイヤーの自由意志で決定できる点が、従来のアトリエシリーズとは大きく異なっている。イベントに関しても特定の条件を満たしさえすればいつでも発生する。また、一度エンディングを迎えると隠し要素の「マイバウムの塔」が出現するとともに、次のクリア時には「もうひとつの」エンディングが用意されるようになる（エンディングはプレイヤーが選択できる）。最大の特徴は「品質」、「劣化」の概念。素材アイテムの持つ品質や特性が調合アイテムに受け継がれるシステムとなっており、これを理解してアイテムを調合することが求められる。また、農作物などのなまものは時間の経過により腐り、シリーズではお馴染みの爆弾「フラム」も雨に濡れればしけって使い物にならなくなるなど一部を除くアイテムは劣化する。放っておくとゴミと化すアイテムがある一方で、時間を置くことでワインは熟成して価値を高め、魔法アイテムには魔力が充填されるなど悪いことばかりではない。食料品や薬など一般的に広く使われる調合アイテムについては各地の量販店での取引が可能となっており、質の高い物を登録しておけばその後、わざわざ調合せずとも購入して利用することが出来るようになっている。ただし、店ごとに品数の制限や店主の腕前による品質制限が設けられており必ずしも万能とは言い難い。調合のためには5つの都市のいずれかに拠点（工房）を構える必要がある。宿代を支払い、荷物を整理することでいつでも転居可能。各都市ごとに購入できるアイテムや品質、店舗の種類ばかりか、依頼内容の傾向や報酬についても明らかに異なる。他の都市との交通面についてもゲームには大きく影響する。街の特性を知った上で自分のプレイスタイルや当面の目標に即した拠点を選ぶ戦略性も重要な要素となっている。
初回限定盤にはリバーシブルピンナップ帯が付属されている。この楽曲には「Little Wish 〜first step〜」（以下「〜first step〜」）と「Little Wish 〜lyrical step〜」（以下「〜lyrical step〜」）の2つのバージョンがあり、2番の歌詞が少し違う。原曲である「〜first step〜」は2005年3月2日の4thアルバム『琥珀の詩、ひとひら』に収録。「〜lyrical step〜」はこのシングルのほかには、2007年3月28日のベストアルバム『Sincerely Dears...』に収録されている。田村は「〜first step〜」の方が気に入っている旨をベストアルバム『Sincerely Dears...』のライナーノーツに記しており、自身のライブではほとんどの場合「〜first step〜」を歌っているが、『魔法少女リリカルなのは』のイベントとして2005年から数度開かれている『リリカル☆パーティ』『リリカル☆パーティSP』『リリカル☆パーティIII』『リリカル☆パーティIV』『リリカル☆パーティV』では、「〜lyrical step〜」を歌った。また、2010年8月8日に放送されたNHK『MUSIC JAPAN』において水樹奈々とのデュエットによる「〜lyrical step〜」が披露された。
板前になるため北海道の高校を中退して上京する直前の石川凛は、行方をくらませていた「火の玉」欣二の消息を知り、再会を果たす。そこで同居人のレイラにボクシングの才能を見出される。上京した凛は、就職先の料亭「天海」の近所に「中尾ボクシングジム」を見つけ、中尾と出会う。いきなり現役プロボクサーの新藤を相手にスパーリングを挑むなど、トラブルを起こしながらも才能を見出され入門する。「天海」では、初出勤の日から無断で欠勤したことで一度不採用を言い渡されるも、その後のアピールによって何とか採用され、仕事の休憩時間に同僚に隠してジムに通う生活を続けながらトレーニングを重ね、プロボクサーの道を突き進んでいく。
『SUGAR』（シュガー）は、新井英樹による漫画。ボクシングを主題とし主人公・石川凛がボクシングと出会い、プロボクサーとしての道を歩み始めるまでを描く。タイトルは、プロボクサーシュガー・レイ・ロビンソンと、彼のボクシングスタイルを形容した“Sweet as SUGAR”から取ったもの。『ヤングマガジンアッパーズ』（講談社）にて、2001年15号から2004年21号（最終号）まで連載された。その後、同じ主人公による続編『RIN』が、『週刊ヤングマガジン』および『別冊ヤングマガジン』（ともに講談社）にて連載された。
室町時代末期に書かれた御伽草子『三人法師』にも正儀は脇役で登場、自分から離反した部下の子らにも情けのある人物として描かれる。この時期の書籍としては珍しく、正儀が北朝に投降した歴史的事実を拾っているのが特徴である。この物語は三話構成で、最後の話が玄梅という僧、俗名を篠崎六郎左衛門という人物によって語られる。六郎左衛門の父の篠崎掃部助は楠木正成の一族で、湊川の戦いでも正成に殉死するほどの重臣だった。六郎左衛門自身も正行のもと武将として四條畷の戦いに参戦し、生き延びた後は正儀に仕えていた。しかし、正儀が足利方に投降すると聞くと、抗議の意から出家して僧侶となり、「玄梅」と名乗った。玄梅が諸国放浪して故郷に帰ってくると、妻は病死し、子の姉弟は日の暮らしにも困窮する有様だった。当時、京都では、聖徳太子が開基して正儀が再興させたという「ほうにんじ」という寺で説法があり、姉弟が母の供養にと遺骨を持ち運んだ。姉弟が不遇を嘆いた和歌二首が詠まれると、僧侶も聴衆も泣き出し、出家するものが続出した。玄梅は子を愛しく思い名乗り出ようとしたが、一方で、愛着の煩悩に囚われるのではないかという恐怖を感じて、その場から急いで離れ、高野山で仏道に専念することにした。この事件を耳にした正儀は、玄梅の子らの境遇を不憫がり、玄梅の息子を家臣に取りたてて篠崎氏を再興させ、娘が比丘尼（正式な手続きで出家した尼僧）になれるように取り図らったという。江戸時代の伝説によれば、その後、玄梅は樟葉道心と名乗って大阪府枚方市久親恩寺を開基したという（→墓所・史跡など）。なお、この御伽草子には、谷崎潤一郎による翻案が存在する（→関連作品）。