本系列は前述した入線時のATS搭載によって運転台仕切直後の座席が撤去されているが、後年同位置は車椅子スペースとされた。その他、全編成ともMGの再換装が行われたほか、クハ2100形に搭載するCPをMH16B-AK3からHB-2000へ換装した。第1編成（1009編成）はワンマン運転に対応させるため2008年（平成20年）にワンマン・ツーマン切替スイッチ、戸閉放送スイッチ、ワンマン表示板が設置された。ただし、他系列（3000系および7000系）と異なり、ドアチャイムは設置されていない。また、各車両の客用扉に車両・扉位置案内プレートが、各車両の車端部（外側も含む）には号車番号表記がそれぞれ貼付された。号車表記は修善寺側から1号車（クハ2100形）・2号車（モハ1200形）・3号車（クモハ1100形）となっている。しかし、同時期には全編成とも車齢40年を超えて老朽化が著しくなったことから、2009年（平成21年）以降、同じく西武鉄道からの譲受車である1300系導入によって代替が進められることとなり、同年1月16日付で第2編成（1011編成）が、同年6月10日付で第3編成（1013編成）が相次いで廃車となった。最後に残った第1編成（1009編成）についても、営業運転の終了予定が決まった後の2011年（平成23年）7月16日より引退を記念するヘッドマークを掲出して運行され、2012年（平成24年）6月13日をもって営業運転を終了した。一方、2011年9月3日には、伊豆の国市韮山の地ビール「反射炉ビヤ」が飲み放題の『反射炉ビヤガー電車』が計画されていたが、都合により1300系の運行に変更された。
入線時に3両編成化改造が施工されたことに伴い、前述のように編成単位における機器構成には変化が生じたものの、搭載する機器そのものは基本的に西武在籍当時と変化はない。ただし、前述のように制御車クハ2100形の台車が住友金属工業製ペデスタル式空気バネ台車FS072から電動車と同一の住友金属工業製ウィングばね式コイルバネ台車FS342Tに交換された。主電動機は日立製作所製HS-836-Frbで、駆動方式は中空軸平行カルダン、歯車比は15:84 (5.6) である。主制御器は日立製作所製電動カム軸式MMC-HT-20Aを搭載する。同制御器は型番「HT」が示す通り、発電制動機能は装備していない。制動装置は電磁直通空気制動 (HSC) である。電動空気圧縮機 (CP) はMH16B-AK3（容量990l/min）をクハ2100形へ2基搭載する。第3編成（1013編成）は西武在籍当時HB-2000（容量2000l/min）を1基搭載していたが、譲渡に際してMH16B-AK3への換装が実施され仕様の統一が図られた。
入線時に3000系に準じた「ライオンズブルー」と称する青と白のツートンカラーへの塗色変更が行われ、西武在籍当時はステンレス無塗装とされていた客用扉部分も車体同色に塗り分けられた。その他車体周りには目立った改造は施工されていないため、塗装を除く外観については比較的原形を保っている。なお、第3編成（1013編成 ）は701系初期車を種車としており、乗務員扉手すりが露出型であることが他編成と異なる。内装についてはほぼ西武在籍当時のままとされ、車内はオールロングシート仕様である。
本系列は車体塗装を含め西武在籍当時より一切手を加えられていない状態で譲渡を受けたが、導入に際しては各種改造を自社大場工場において施工した。前述3両編成化は、運転台部分の移設ではなく、旧モハ701形奇数車の台車、主電動機等の床下機器一式を旧クハ1701形奇数車へ移設し、同車を電動車化する形で実施された。また、旧クハ1701形偶数車の台車をFS342Tに交換し、編成内における台車を統一した。その他、短編成化に伴う電動発電機 (MG) の換装（出力適正化）、制輪子をレジン製から鋳鉄製のものへ交換、電気連結器の撤去、ATSの交換とそれに伴う一部座席の撤去ならびに列車無線の変更、自動放送装置の新設が実施された。
アリー・シール・ナヴァーイーはチャガタイ語の詩を詠む時に「ナヴァーイー（「美しい旋律」の意）」の筆名を、ペルシア語の詩を詠む時には「ファーニー」という筆名を使い分けていた。ナヴァーイーはチャガタイ語をペルシア語と比較し、チャガタイ語は簡潔かつ創造性に富み、ペルシア語は洗練された思索に適した言語であるとそれぞれの長所を解説し、文章語としてのチャガタイ語の優位性を主張した。ティムール朝や自分自身の出自に関わるテュルク、モンゴルの歴史や伝承はナヴァーイーのチャガタイ文学作品の題材にはならず、自らが見聞きした出来事や 伝統的なペルシャ・イスラーム文学を題材とした。人生の四つの時期に応じて編集した詩集『意味の宝庫』はインドのペルシア詩人アミール・ホスローの発想に倣い、五部で構成される長編叙事詩『五部作』の形式はアミール・ホスローやニザーミーがとった伝統に則ったものである。『鳥の言葉 (Lison ut-Tayr)』は12世紀末から13世紀初頭のペルシア詩人ファリードゥッディーン・アッタールの『鳥の言葉 (Mantiq-ut Tayr)』と同じテーマ・韻律を用いたチャガタイ語詩であるが、ナヴァーイーの『五部作』『鳥の言葉』は元となったペルシア語詩の単なる翻訳・翻案を脱した独自の世界を形作っている。ナヴァーイーは学者・文人の保護者でもあり、ティムール朝統治下のヘラートの文化の隆盛に大きな役割を果たした。ヘラートの宮廷や庭園では、ナヴァーイーが主宰する学者・文人・芸術家の集まりが催され、集まった人間たちは互いに才能を披露しあった。ナヴァーイーから援助を受けた人物として、画家のビフザード、シャー・ムザッファルらが挙げられる。1491年/92年に書き上げた『麗しきものの集まり』には、ナヴァーイーによる当時の文人評が記されている。ナヴァーイーはナクシュバンディー教団のスーフィー（聖者）・詩人のジャーミーとも交流があり、自身の哲学・政治・社会的思想を述べた『敬虔な信者の困惑』をジャーミーに献呈し、1496年にジャーミーが著した『スーフィー聖者列伝』をチャガタイ語に訳した。また、ナヴァーイーは詩作以外に作曲、絵画も好んでいた。