2009年（平成21年）2月18日、西尾市長の中村晃毅が受託収賄容疑で逮捕され、5月20日、西尾市議会による不信任決議を受けて失職。自民党と民主党が一本化による候補者擁立に合意すると、意欲を見せていた榊原が名乗りを上げ、すんなり一本化が決まった。6月28日に告示された西尾市長選挙に無所属で出馬し、無投票で初当選した。同年12月25日に「西尾市・幡豆郡三町合併協議会」を設置するも、合併手続きが住民不在で進んでいるとして市議と市民がこれに反発。合併の賛否を問う住民投票条例制定の直接請求署名運動が開始された。有効署名総数は1万8,947人にのぼり、2010年（平成22年）7月15日の臨時会で住民投票条例制定の議案が提出されたが、賛成10、反対13の小差で否決された。条例制定を求めた市民団体はさらに榊原に対するリコール運動を8月6日から開始。こちらは必要署名数が集まらず不成立に終わった。2011年（平成23年）4月1日、西尾市は一色町・吉良町・幡豆町を編入。合併によって保有する公共施設の数が2倍近くに増えたことから、榊原はこの年から、ファシリティマネジメントを踏まえた公共施設の再配置事業に取り組み始めた。2012年（平成24年）3月26日、PFIを活用する西尾市公共施設再配置基本計画を策定。2013年（平成25年）5月26日に行われた市長選挙で、元一色町長の都築譲、元市議の黒柳和義ら3人の候補者を破り再選を果たす。2016年（平成28年）1月22日、PFI事業の優先交渉権者を、株式会社豊和（本社・西尾市）を代表企業とする豊和グループに決定。豊和グループは同年5月、特別目的会社「エリアプラン西尾」を設立。6月3日、榊原は議会に「エリアプラン西尾」とPFI事業契約を結ぶ承認議案を提出した。6月27日、議案は賛成15、反対11、棄権1で可決。自民党系会派「至誠クラブ」に所属する中村健はPFIの凍結を訴え、翌2017年（平成29年）4月19日、市長選挙に出馬する意向を表明した。2017年（平成29年）6月25日に行われた西尾市長選挙は榊原と中村の一騎打ちとなった。榊原を支援したのは民進党衆議院議員の重徳和彦（愛知12区）、同党衆議院議員の中根康浩（比例区）、大村秀章知事、連合愛知、元幡豆町長の渡辺靖県議など。対する中村には、自民党衆議院議員の青山周平（愛知12区）、山田高生県議らがつき、市長選は代理戦争の様相を呈した。自民系の市議は両陣営に分裂した。投票は6月25日に行われ、榊原は中村に約2万7,000票差で敗れた。
前作から3年後。交通係に左遷させられたカーターはヘッドフォンで音楽を聴きながら交通整理をした結果、大渋滞しかも交通事故まで起こしていた。同じ頃、リーはハン大使の警護のため、国際刑事法廷のシンポジウム会場にいた。そこでハン大使が、今まで明かされなかった中国人マフィア組織「三合会(Triads)」のボス・シャイシェンの存在を明らかにしようとした瞬間、何者かに狙撃される。リーは向かい窓から逃げていく犯人を目撃し、追跡を開始する。無線でその話を聞きつけたカーターも現場へと向かった。なんとか追いついたリーは犯人の顔を見て驚く。それは子供の頃、孤児院で兄弟同然に育った男ケンジだった。リーは自分だけが養子として孤児院から去ったことを追い目に感じており、ケンジを取り逃がしてしまう。ハンは一命を取り留めるが、今度は娘のスーヤンの命が狙われることを知る。急いで病院へ駆けつけた二人は何者かに襲撃されるが、銃撃戦の末に犯人の一人を捕まえ尋問する。犯人は中国人なのにフランス語しか話さず、ある場所と「ジャンビエーブ」という名前を口にする。二人はジャンビエーブを探すためフランス・パリへと向かうが、リーは交際直前まで進展したイザベラをカーターが誤射したことを根に持っており、二人の関係はギクシャクしていた。パリに到着後、二人はタクシー運転手ジョージのタクシーに乗り込み、犯人が口にした地下カジノに向かいジャンビエーブを捜索する。リーは組織の一員ジャスミンに襲われ、カーターと共にジョージのタクシーで逃走する。怯えるジョージを「お前はスーパー・スパイだ」とその気にさせてマフィアを巻こうとするが、その気になったジョージの荒っぽい運転で道路に振り落とされて捕まってしまう。捕まった二人はケンジの前に突き出されるが、ケンジは自分を見逃したリーに借りを返すため、フランスから出て行くように警告して二人を解放する。ホテルに戻った二人はケンジのことで口論になり、別行動をとった。カーターは地下カジノで見かけたジャンビエーブを追って劇場に向かい、リーは国際刑事法廷のレイナード委員長からジャンビエーブの居場所を教えられ、劇場に向かう。彼女はシャイシェンの存在を知っており、それをハンに引き渡そうとしたため組織に命を狙われていた。二人は彼女を連れて組織の追手から逃れ、現場に駆け付けたジョージの家に匿ってもらう。二人はジャンビエーブから、シャイシェンの正体は自分の頭に彫られた組織指導者の名簿だと告げる。翌朝、レイナードと面会した三人はシャイシェンを引き渡そうとするが、組織の一員だったレイナードに殺されそうになったため反撃して取り押さえる。その直後、ケンジから電話がかかり、「スーヤンの命と引き換えにシャイシェンを引き渡せ」と告げられる。二人は引き渡し場所のエッフェル塔に向かい、ケンジはリーに一騎討ちを挑む。その末、リーは窓から落ちそうになったケンジを助けようとするが、ケンジは逆にリーを突き落とし、止めを刺そうと襲いかかった。二人は塔から落下防止用ネットまで落ち、さらにネットが武器の刀で破けてしまい、地上に落下しそうになる。リーは再びケンジを助けようとするが、ケンジはリーを助けるため手を離して転落死する。上階に戻ったリーは、カーターに助け出されたスーヤンと再会し、彼女を地上に逃がす。その直後、組織の追手が集団で現れ、二人はフランス国旗をパラシュート代わりにして塔から脱出する。無事に地上に降りた二人の元にレイナードが現れて二人を殺そうとするが、彼は二人の後を追ってきたジョージに射殺される。事件の解決後、休暇をもらったリーはカーターを旅行に誘い、イザベラとジャンビエーブが乗ったチャーター機でフィジーに旅立つ。