2019年4月現在までに11両の除籍車両が発生しており、4両編成は2007年3月までに全廃されている。なお、前述した通り落成時から1000系として製造された車両はモ1000形の5両のみが現存しており、モ1050形とク1100形は全て1810系からの編入車となっている。2004年3月1日付で1002Fが、2007年2月13日付で1001Fのモ1051・モ1001が、同年2月19日付でク1101・サ1151が除籍・廃車解体された。これによって、1000系から金属バネ台車を装備する車両は消滅した。なお、1001Fと組成変更していた2430系2446Fは元の3両編成に戻されている。2008年には1003Fが塩浜に回送され、8月8日付で除籍・廃車解体された。2019年4月現在は3両編成5本15両 (1004F - 1008F) が在籍し、明星検車区に所属している。
名古屋線の準急・普通を中心に、一部は山田線・鳥羽線でも運用されている。ワンマン運転には対応しておらず、通常は湯の山線・鈴鹿線のワンマン列車に使用されない。
廃車発生品の菱枠パンタグラフが再利用され、1000系は各電動車の連結面よりにパンタグラフを1基搭載するが、冷房装備の1200系については集電容量確保のため各電動車にパンタグラフを2基搭載としている。
電動車については、将来のWNドライブ車への改造を考慮して吊り掛け駆動とWNドライブの双方に対応可能なトランサム部を持つ、近畿車輛KD-75（1200系）・KD-75Aダイレクトマウント空気バネ付円筒案内式（シュリーレン式）台車を装着するが、制御車と付随車については、名古屋線から養老線や伊賀線への在来車転出の際に余剰となった近畿車輛KD-32系金属バネ台車を改造した、KD-32G（ク1300・サ1351はKD-32F）を装着する。なお、このKD-32系は名古屋線改軌の際に新造されたもので、短リンク式揺れ枕とコイルバネによる枕バネを備える円筒案内式台車である。
名古屋線向けであるため、1810系と同様に発電ブレーキは省略されたが、WNドライブ車との混結を想定して、製造当初からHSC電磁直通ブレーキを新製装備している。
制御器は様々な形式からの発生品が流用されたため、1972年度製作車については、モ1001・モ1002・モ1051の3両が単位スイッチ式の三菱電機ABFMを、モ1201・モ1251は2回転電動カム軸式の日立製作所NMCを、1973年度製作車については、電動カム軸式の日立製作所MMC-HT10Dをそれぞれ搭載する。これらはいずれも主電動機を2基単位で直並列制御する。
主電動機は2200系用三菱電機MB-211BF（150kW）を整備・改修したMB-211BFR2を電動車の各台車に2基ずつ吊り掛け式で装架する。歯数比は種車と同じ56:27(2.07)である。この電動機の大出力から、本系列は吊り掛け時代でも全界磁定格速度55.2km/h、定格引張力4000kgによって最高速度は110km/hに達する。
前述のとおり、一部機器を廃車となった車両などから流用して製造されたため、旧式な吊り掛け駆動方式を採用して新造された。ただし、WNドライブ車との共用、および将来の主電動機換装によるWNドライブ車への改造を前提に新造機器が設計されており、WNドライブ車と共通運用が可能な性能が与えられている。
1907年（明治40年）に創業した富山県の大国屋が1918年（大正7年）に小樽市の稲穂第一大通り（現在の小樽都通り商店街）に呉服店を開いたのが始まりである。1934年（昭和9年）に小樽で最初の百貨店となり、札幌市から進出してきた丸井今井や1955年（昭和30年）に河野呉服店が百貨店となったニューギンザ百貨店と共に、同じ稲穂第一大通りに位置する小樽を代表する3大百貨店として激しい競争を繰り広げた。1974年（昭和49年）西武百貨店が主催する日本百貨店経営協議会に加盟。前年比18%の増加で30億円以上を売上げたが、1975年（昭和50年）4月に小樽駅前に長崎屋を核店舗とするショッピングセンター・サンポートが2倍くらいの店舗面積でオープンし、開店1か月で市内の人口の1.5倍となる30万人を集めて既存の商店街の顧客を奪ったため、1975年（昭和50年）からは売上が減少に転じた。1988年（昭和63年）に閉鎖したニューギンザ百貨店や北海ホテルの跡地を再開発して丸井今井が拡張移転して核店舗となる商業施設の計画が動き出したため、1989年（昭和64年）には西武百貨店の資本傘下に入って生き残りを図ったが、その計画が実現して1990年（平成2年）9月に丸井今井が拡張移転してさらに競争が激化した後の1993年（平成5年）4月に採算の悪化を理由に86年の歴史に終止符を打ち閉店した。閉店後は建物が解体されて駐車場になった後、ホテル（オーセントホテル小樽）が建設された。