ナント市内の交通機関はナント都市地域交通会社(SEMITAN)によって運営されている。ナントのバスは1826年にスタニスラス・ボードリーによって創業された乗合馬車を起源とする。現代では市内路線、郊外路線、ナント・アトランティック空港間の高速バスも運営する。1875年には馬車軌道（トラム）が開通し、1911年には電化されて路面電車となった。1958年に一度全廃されたが、1985年に復活した。これは20世紀末から21世紀にかけてのフランスでのトラム復権の第一号である。2009年1月現在で3路線40.1kmが運行されている。なお2006年に開業した4号線は当初トラムとして計画されていたがバス専用レーン方式のバス・ラピッド・トランジットに変更された。
中心となる駅はナント駅である。これはロワール川沿いにトゥールとサン＝ナゼールを結ぶ路線上にあり、またラ・ロッシュ＝シュル＝ヨンなどへの支線が分岐する。1938年のフランス国鉄発足まで、ナントに乗り入れる鉄道はパリ・オルレアン鉄道と国有鉄道に分かれており、駅もパリ・オルレアン鉄道がナント・オルレアン駅（現ナント駅）、国有鉄道がロワール川中州のナント国鉄駅となっていた。統合後は旧国鉄駅は貨物駅となっている。1989年のLGV大西洋線開通によりTGVが乗り入れるようになり、パリとはおよそ2時間でつながっている。コライユを利用すれば、カンペール、ラ・ロシェル、ボルドー、リヨン、トゥールーズまでつながっている。TERペイ・ド・ラ・ロワール線の鉄道とバスでは、サン＝ナザール、アンジェ、ル・マン、ラ・ロッシュ＝シュル＝ヨンとつながる。
ナントの南西約8kmのブグネにナント・アトランティック空港がある。エール・フランスのみならず、ライアンエアー、チュニスエア、ロイヤル・エア・モロッコなどが乗り入れており、国内線・国際線ともに充実している。また2015年開港予定のグラン・ウエスト空港建設計画が進んでおり、ナント北西30kmのノートルダーム＝デ＝ナントに建設する予定となっている。
上海に一時寄港した後、ブラウンとシモンズは先に神奈川に渡り、上海に妻マリアを残して11月7日に、日本語習得のために長崎に一人で上陸した。フルベッキは長崎の第一印象を「ヨーロッパでもアメリカでも、このような美しい光景を見たことはない」と記している。長崎では聖公会のジョン・リギンズとチャニング・ウィリアムズに迎えられ、崇徳寺広徳庵に同居した。その後、12月19日に妻マリアを上海より呼び寄せた。1860年1月26日には長女を授かり、エンマ・ジャポニカと命名するが、生後2週間で死去する。長崎では、開国後も依然としてキリシタン禁制の高札が掲げられており、宣教師として活動することができなかった。しばらくは私塾で英語などを教え生計を立てていた。1862年には、自宅でバイブルクラスを開いた。また1861年から1862年にかけては佐賀藩の大隈重信と副島種臣がフルベッキの元を訪れ、英語の講義を受けている。1863年（文久3年）の生麦事件をきっかけとした薩英戦争の時は上海に避難して、1864年に長崎に戻った。また大隈重信と副島種臣はこの頃から、フルベッキから英語の個人授業を受けている。大隈はフルベッキの授業によってキリスト教に興味を抱いたと述懐している。1864年（元治元年）には、長崎奉行より幕府が長崎につくった長崎英語伝習所（フルベッキが在籍した当時は洋学所→済美館→広運館などと呼ばれた）の英語講師への招聘があり、フルベッキは教師として幕府に雇用された。また、この幕府の英学所「済美館」とともに、佐賀藩が設置した致遠館でも教鞭を取っており、彼に師事して集まった学生達の姿はフルベッキ群像写真（上野彦馬撮影）として継承され、現在も長崎歴史文化博物館で展示公開されている。済美館の教え子には何礼之、平井希昌がおり、また大山巌も学生の一人であったといわれている。何礼之はその後私塾を開き、前島密、陸奥宗光、高峰譲吉、安保清康、山口尚芳らを輩出した。何礼之私塾の塾生はフルベッキのアドバイスや援助も受けていた。慶応3年（1867年）11月、佐賀藩前藩主の鍋島直正等と親交があった関係で、佐賀藩がフルベッキを雇用することになった。しかし佐賀藩が外国人の立ち入りを認めなかったため、フルベッキのために長崎に藩校「蕃学稽古所（慶応4年8月25日以降は致遠館）」が設立された。英語、政治、経済などについて講義をしている。また、オランダで工科学校を卒業した経歴から工学関係にも詳しく、本木昌造の活字印刷術にも貢献している。同年には佐賀藩家老の村田若狭と弟綾部恭に洗礼を授け、1868年には仏僧清水宮内に洗礼を授けた。伊藤博文はフルベッキの門弟だったといわれることもあるが、伊藤は長崎に長期滞在したこともなく、直接の関わり合いを示す文書は残っていない。しかし伊藤はフルベッキが滞在していた大徳寺に宿泊したことがあり、フルベッキの弟子である何礼之の弟子、芳川顕正を大徳寺に呼び寄せて英語を学んでいたことから、両者の間に何らかの接触があったと見られている。またほかに相良知安、山口尚芳、本野盛亨らを輩出している。慶応3年（1867年）から4年（1868年）にかけては薩摩藩や土佐藩によるフルベッキの引き抜きが行われようとしたが、大隈らが1000両の給金を支払うよう藩にかけあったことで決着している。明治元年（1868年）には岩倉具視の子、岩倉具定と岩倉具経が門弟となり、致遠館で学んだ。