主祭神の天児屋根命（アメノコヤネ）は、古代氏族の中臣氏（なかとみうじ、中臣連）および中臣氏から分かれた藤原氏の祖神として知られる。『古事記』・『日本書紀』ではこの神について中臣神・中臣連等祖・中臣上祖と見え、天照大神の岩戸隠れの際に太玉命（忌部氏祖神）とともに神事を行なったことや、瓊瓊杵命（邇邇芸命）の天孫降臨の際に五部神（五伴緒）の1神として従ったことが記されている。『新撰姓氏録』では河内国に多くの中臣系氏族が見えるが、そのうちの平岡氏（平岡連）が当社の奉斎氏族とされる。天児屋根命と並ぶ比売神は、天児屋根命の配偶神になる。祭神とする文献上初見は承和3年（836年）条。文献上で具体的な神名は知られないが、社伝では天美豆玉照比売命（あめのみづたまてるひめのみこと）とする。また文献上においては常に天児屋根命・比売神がペアとして記される点が注意される。『延喜式』「春日祭祝詞」では、藤原氏が氏神として春日大社（奈良県奈良市）を創建する際に枚岡坐天之子八根命（天児屋根命）と比売神の分霊を勧請したとし、現在も両神は春日大社の第三殿・第四殿に祀られている。他の祭神2柱である経津主命（フツヌシ）と武甕槌命（タケミカヅチ）は、それぞれ香取神宮（千葉県香取市）と鹿島神宮（茨城県鹿嶋市）の主祭神である。当社祭神とする文献上初見は前述の貞観7年（865年）条。両神は、天児屋根命・比売神と同様に春日大社創建に際して勧請されているが（春日大社 第二殿・第一殿）、枚岡神社においても春日大社と同様に両神を勧請して2祭神から4祭神に改めたとされ、その時期は春日大社の創建年といわれる神護景雲2年（768年）から貞観7年（865年）の間に推定される（社伝では宝亀9年（778年）の合祀とする）。なお『日本三代実録』に見える河内国の弥加布都命神・比古佐自布都命神を当社の武甕槌命・経津主命に比定する説もある。
日本統治の第2期は西来庵事件の1915年（大正4年）から1937年（昭和12年）の盧溝橋事件までである。国際情勢の変化、特に第一次世界大戦の結果、西洋諸国の植民地統治の権威が失墜し、民族主義が高揚した時期である。民主と自由の思想による民族自決が世界の潮流となり、1918年（大正7年）1月にアメリカ合衆国大統領ウィルソンが提唱する民族自決の原則と、レーニンの提唱した植民地革命論は世界の植民地に大きな影響を与えるようになった。このような国際情勢の変化の中、日本による台湾統治政策も変化した。1919年（大正8年）、台湾総督に就任した田健治郎は初の文官出身者だった。田は赴任する前に当時首相であった原と協議し、台湾での同化政策の推進が基本方針と確認され、就任した10月にその方針が発表された。田は同化政策とは内地延長主義であり、台湾民衆を完全な日本国民とし、国家国民としての観念を涵養するものと述べている。その後20年にわたり台湾総督府は同化政策を推進し、具体的な政策としては地方自治を拡大するための総督府評議会の設置、日台共学制度及び共婚法の公布、笞刑の撤廃、日本語学習の整備などその同化を促進し、台湾人への差別を減少させるための政策を実現した。また後藤の政策を改め、鉄道や水利事業などへの積極的な関与を行い、同化政策は具体的に推進されていった。1914年（大正3年）、台中霧峰の著名な土着地主資産家である林献堂が来台した板垣退助と協力し在台日本人と同等の権利を求める台湾同化会を設立する。しかし、板垣が台湾を離れるとまもなく台湾総督府により解散させられた。その後、台湾総督府の中央集権的な特権を認めた六三法の撤廃を求めて啓発会が結成され、その解散後は新民会が結成されたが、知識人階級から六三法撤廃運動は台湾の特殊性の否定であるとの批判が出ると、台湾に議会設置を求める台湾議会設置請願運動が開始される。1921年（大正10年）、第一回台湾議会設置請願書を大日本帝国議会に提出すると、以降13年15回にわたって継続的に行なわれた。1921年（大正10年）には台湾文化の涵養を目的として、林献堂を総理とした台湾文化協会が設立され、各地で講演会や映画上映などを行い大衆啓蒙運動を展開した。1927年（昭和2年）、左派が協会の主導権を握ると右派の離脱を惹起し、台湾における社会運動は分裂することになる。台湾文化協会は事実上台湾共産党の支配下に入り、台湾共産党が一斉検挙されると同時に台湾文化協会も崩壊した。離脱した右派は、その後台湾民衆党を結成。台湾民衆党が蒋渭水により左傾化すると、右派は、1930年（昭和5年）台湾の地方自治実現を単一目標に挙げる台湾地方自治連盟を結成した。1937年（昭和12年）、日本統治期最後の政治団体である台湾地方自治連盟が解散に追い込まれ、「台湾人」による政治運動は終わりを告げた。