『セールスマン』で外国語映画賞を獲得したイラン人監督のアスガル・ファルハーディーは当初はドナルド・トランプ大統領による入国禁止令により出席不可能であることが報じられていた。その後彼は「私は映画界の仲間と一緒にアカデミー賞授賞式に出席しないことに決めた」とボイコットを表明した。アカデミー会長のシェリル・ブーン・アイザックスは入国禁止令に対し、「アメリカは常にバリアではなくビーコンでなければならず、私たち一人ひとりが若干の空席がアカデミー・アーティストを活動家にしたこの部屋にあることを知っている」と述べた。欠席したファルハーディーに代わり、著名なイラン系アメリカ人であるアニューシャ・アンサリ（史上初の女性の民間宇宙旅行者）とフィルー・ナデリ（元NASA太陽系探査委員会長官）がオスカー像を受け取った。当初、アメリカ合衆国国務省公式のペルシャ語のツイッターアカウントには受賞を祝福する声明が投稿されていたが、ナデリがスピーチでトランプの入国禁止令を「非人道的」であると非難した直後に削除された。2017年5月、第70回カンヌ国際映画祭の会場で、メレディス・シア（映画芸術科学アカデミーのメンバーの一人）がファルハーディーにオスカー像を手渡した。
アカデミー賞は過去2年間で有色人種の俳優が候補に挙がっていないこと等、主要部門候補者の人種の多様性の欠如が指摘されていた。1月24日に第89回アカデミー賞の候補者が発表されると、多数のメディアが7人の有色人種俳優が候補に挙がり、内6人が黒人俳優で史上最多記録であることを報じた。アカデミー賞の歴史上初めて演技4部門全てで黒人俳優が候補に挙がっており、助演女優賞では3人の黒人女優、脚色賞では3人の黒人脚本家が候補となった。また黒人監督が監督賞の候補者となるのは史上4例目である。一方で非黒人のマイノリティたちの俳優やメディア団体によって批判は続いた。ナショナル・ヒスパニック・メディア連合は「（ラテン系の俳優は）カメラの前で働く機会を得られず、そしてカメラの裏側も例外ではない」と主張した。またアジア太平洋アメリカメディア連合会のダニエル・メイダ会長は候補者にアジア系俳優がほどんど挙がっていない（助演男優賞のデーヴ・パテールのみ）ことに触れ、「ハリウッドでのアジア人の本当の機会が失われ続けている」と述べた。ヴィオラ・デイヴィスは『ダウト〜あるカトリック学校で〜』（2008年）、『ヘルプ 〜心がつなぐストーリー〜』（2011年）に続いて3度目の候補であるが、これはアフリカ系アメリカ人女優としては最多記録である。ブラッドフォード・ヤングはアフリカ系アメリカ人としては初めての撮影賞候補者であり、またジョイ・マクミロンは『真夜中のカーボーイ』のヒュー・A・ロバートソン以来となるアフリカ系アメリカ人の編集賞候補者である。『ムーンライト』は史上初めて主要キャストが黒人のみで作品賞を受賞した映画となった。今回受賞に至った黒人の数は史上最多である。
前年の授賞式の低視聴率と低評価を受けてプロデューサーのデヴィッド・ヒルとレジナルド・ハドリンが降板し、代わってマイケル・デ・ルカとジェニファー・トッドが就任した。また俳優でコメディアンのクリス・ロックは『バラエティ』で司会を続投する意思があるかについて「誰かがやるだろうね」と語った。2016年12月、ジミー・キンメルが司会を務めることが発表され、彼はプロデューサーに「優れた計画とその熱意が伝染している」と説明し、「89回目にして最後のオスカーの司会に選ばれたことを光栄に思う」と述べた。キンメルが司会を務めることに伴い、ABCは過去数年にわたって授賞式の後に放送していた『ジミー・キンメル・ライブ!』の特別エピソードを中止した。代わりにABC『Live from Hollywood: The After Party』を放送し、『グッド・モーニング・アメリカ』のアンソニー・アンダーソンとララ・スペンサーが司会を務めた。ステージのセットはデレク・マクレーンがデザインした。
第89回アカデミー賞の候補者は2017年1月24日にアカデミーより全世界にストリーミング配信された。『ラ・ラ・ランド』は1950年の『イヴの総て』、1997年の『タイタニック』に並んで史上最多の14部門で候補に挙がった。次いで『メッセージ』と『ムーンライト』が8部門で候補に挙がった。また長編ドキュメンタリー賞候補作品である『O.J.: Made in America』の上映時間は467分であるが、これは第41回で外国語映画賞を獲得した『戦争と平和』の431分を上回って史上最長作である。
1993年前後から再び麻原はヴァジラヤーナ路線再開を指示した。村井は入信当時から目を付けていた化学に強い信者の土谷正実に『毒のはなし』『薬物乱用の本』を渡して、このようなもの（化学兵器、違法薬物）を作れないかと要求。「化学兵器にダーティーなイメージがあるのは一般兵器を売るための軍需産業とフリーメイソンの情報操作だ」「自衛のため」などど言って土谷を説得し、サリンの製造を決心させた。さらにサリン70トンの大量生産を目指し、滝澤和義らと共にサリンプラント計画やサリン噴霧車の製造に取り組んだ。そして1993年冬には2回の池田大作サリン襲撃未遂事件を指揮、ついにサリンを「実戦投入」した。村井にはいわゆるマッドサイエンティスト的な側面があり、想像力は留まるところを知らず、上記の兵器類のほかプラズマ兵器、レーザー兵器「輪宝」、AK-74自動小銃の密造、ついには核兵器の製造までも企画し挑戦。一説には他にもアンモニアプラント、硫酸プラント、硝酸プラント、ニトログリセリンプラント、ニトロセルロースプラント、ニトログリセリンとニトロセルロースからダブルベース火薬をつくるプラント、ダブルベース火薬加工プラント、ダブルベース火薬推進戦闘機、ジェット戦闘機、ヘリコプター、電磁波兵器、高度測定計、半導体工場、ミサイル（ICBM他）、ミサイルの誘導装置、フッ素ガスプラント、フッ化水素プラント、ウラン濃縮工場といったものを計画（夢想）していたという。土谷正実も村井から人工衛星を落とすための炭酸ガスレーザーやUFO、レールガンの製造といった無謀な指示を受けたと証言している。数十万ドルのソフトウェアを購入しつつ放置したりもしていた。教団内のリンチ事件にも関与しており、1993年発生の薬剤師リンチ殺人事件では殺害決定の会議や遺体隠蔽に参加。男性現役信者リンチ殺人事件ではスパイがいると言い出した張本人で、スパイ疑惑をかけられた被害者をマイクロウェーブ焼却炉で焼き殺すことを提案するが、新実智光が中止したため折角の機会を失ったと残念がったという。