住島重工に勤める秋沢里志は友人の紹介で出会った梨田紘未と出逢い結婚するが、紘未は交通事故で亡くなってしまう。傷心の秋沢は上司からP・フレックに長期出張で欠員が出ているからと異動を提案され、流されるまま受ける事に。P・フレックでは開発四課に配属され、クロノス・ジョウンター、そして開発四課で独自に開発している時間螺旋理論を採用した『クロノス・スパイラル』の存在を知る。クロノス・ジョウンターは時間と場所を指定出来るが留まる事が出来ず、未来にはじき飛ばされる。その代わりクロノス・スパイラルはその時代に留まる事が出来るが、螺旋の周期は39年。クロノス・スパイラルでは39年毎にしか行く事が出来ないのだ。それを知った秋沢はクロノス・ジョウンターに乗って紘未を助けに行こうと決心し、積極的に開発の手助けをする。しかし、思わぬトラブルによってクロノス・ジョウンターの開発が中止、解体・撤去されてしまった。
1980年、夏。11歳の鈴谷樹里は入院していた病院で不治の病に冒された青年、青木比呂志と出会う。樹里は比呂志をヒー兄ちゃんと呼び、彼が読んだ小説や彼の創った物語を聴くのが好きだった。樹里と同じ名の少女が登場するロバート・F・ヤングの小説『たんぽぽ娘』の話を聴いている最中にヒー兄ちゃんは倒れてしまい、まもなくして亡くなってしまう。樹里はそれをきっかけに、医師になることを志すようになる。それから19年後の1999年、夏。医師になった樹里の元に、取引をしている製薬会社の古谷からヒー兄ちゃんのかかっていた不治の病を治す特効薬が開発された事を聞かされ、サンプルを貰う。同じ病気の入院患者に投与した所、みるみる内に回復したのだ。もしあの時、この薬があれば…。そう思っていた矢先、強制的に見合いをさせられる。相手は野方耕市。彼の実家は開業医なのだが、野方は工業系の会社に就職したために医師の嫁を探しているのだと言う。その野方から開発中止が決まったのにも関わらずこっそり開発を続けているクロノス・ジョウンターの話を聞いた樹里は野方を説得し、パーソナル・ボグの改良版『パーソナル・ボグII』を使って19年前に飛んでヒー兄ちゃんを助けに行く事に。
1991年12月23日。イラストレーターの枢月圭は、マンション近くのゴミ捨て場で倒れている布川輝良と出会う。圭は介抱している内に布川に惹かれ、また布川も圭に惹かれ相思相愛になる。しかし、布川には時間が残されていなかった。布川輝良はP・フレックの開発一課に所属していた。ある日開発三課と四課を束ねる野方に、人体実験として新たに開発した小さいクロノス・ジョウンターである『パーソナル・ボグ』を装着して過去に飛ぶよう依頼される。パーソナル・ボグを使うと本来よりも長く滞在できるが、二度とクロノス・ジョウンターに乗れなくなる装置だという。天涯孤独の布川はその依頼を受ける代わりに1991年12月25日に解体されてしまう朝日楼旅館の全景を見てみたいと頼み、過去にやってきたのだ。しかし、パーソナル・ボグのエネルギーが野方の計算よりも大幅に早く切れそうにな上に、朝日楼旅館は既に工事の準備で高い塀で覆われてまったく建物が見られない状況になっていた。
1995年、秋。住島重工の開発部門だけを担当する会社、P・フレックにて時間軸圧縮理論を採用した巨大な「物質過去放出機」、またの名を『クロノス・ジョウンター』の開発に成功する。だが、実験を重ねて行く内にクロノス・ジョウンターには重大な欠点がある事が発覚する。それは物質を過去に飛ばす事が出来ても長時間留まらせる事が出来ず、しかも戻ってくるのが現在ではなく未来にはじき飛ばされてしまうのだ。P・フレック開発三課に所属する吹原和彦は、通勤時に通りがかる花屋で働く蕗来美子に片思いをしていた。ようやく彼女との食事の約束を取り付けたのもつかの間、彼女の働く花屋に化学薬品を積んだタンクローリーが追突、彼女は亡くなってしまう。吹原は来美子を助けるべくクロノス・ジョウンターに乗り込むが、時の神クロノスの洗礼を受けてしまう。
こうした中で、日本語に人称を表す語彙が多いことは注意を引く。たとえば、『類語大辞典』の「わたし」の項には「わたし・わたくし・あたし・あたくし・あたい・わし・わい・わて・我が輩・僕・おれ・おれ様・おいら・われ・わー・わん・朕・わっし・こちとら・自分・てまえ・小生・それがし・拙者・おら」などが並び、「あなた」の項には「あなた・あんた・きみ・おまえ・おめえ・おまえさん・てめえ・貴様・おのれ・われ・お宅・なんじ・おぬし・その方・貴君・貴兄・貴下・足下・貴公・貴女・貴殿・貴方（きほう）」などが並ぶ。上の事実は、現代英語の一人称・二人称代名詞がほぼ "I" と "you" のみであり、フランス語の一人称代名詞が "je"、二人称代名詞が "tu" "vous" のみ、またドイツ語の一人称代名詞が"ich"、二人称代名詞が"du" "Sie" "ihr"のみであることと比較すれば、特徴的ということができる。もっとも、日本語においても、本来の人称代名詞は、一人称に「ワ（レ）」「ア（レ）」、二人称に「ナ（レ）」があるのみである（但し『ナ』はもと一人称とも見られ、後述のこととも関係があるか）。今日、一・二人称同様に用いられる語は、その大部分が一般名詞からの転用である。一人称を示す「ぼく」「手前」や三人称を示す「彼女」などを、「ぼく、何歳？」「てめえ、何しやがる」「彼女、どこ行くの？」のように二人称に転用することが可能であるのも、日本語の人称語彙が一般名詞的であることの現れである。なお、敬意表現の観点から、目上に対しては二人称代名詞の使用が避けられる傾向がある。たとえば、「あなたは何時に出かけますか」とは言わず、「何時にいらっしゃいますか」のように言うことが普通である。「親族語彙の体系」の節も参照。