現在は、インクの補充を簡単に行うため、インクを詰めたカートリッジが広く使われている。カートリッジの形状はメーカーごとに異なっており、ペンの製造メーカーから供給されるカートリッジを使用するのが一般的であるが、ヨーロッパのメーカーの多くでは欧州共通規格のカートリッジが採用されており、この場合は欧州共通規格を採用する他のメーカーのインクを使用することが可能である。ただし欧州のメーカーであっても独自規格のカートリッジを採用するメーカーもあり、またペンの種類によって利用可能なカートリッジが異なっている場合もある。また、カートリッジ式の場合、ランニングコストが吸入式の5倍近くになると言われている。カートリッジ専用（コンバーター不可）の万年筆においてインクにかかる費用を抑えたり、好きなインクを使うために、使用後のカートリッジに注射器やスポイト等で瓶のインクを詰めれば瓶のインクを使えるが、カートリッジが劣化した時や、カートリッジの差し込み口が緩くなってしまうと、インクが漏れてしまい危険である。もちろん、メーカーの保証外行為のため自己責任となる。
カートリッジ、コンバーター両用式ともいわれる。カートリッジを挿す部位にコンバーターと呼ばれる吸入器を装着し、インク瓶からインクを吸入出来る様にするものである。カートリッジ装着部に取り付ける構造上の都合から、吸入出来る量はカートリッジ式とほぼ同じか若干劣るものの、基本的には吸入式と同じく使用出来るインクの種類が多く、インク装填時にペン内部を掃除する事が出来る等の利点がある。そのため、昨今の主流であるカートリッジ式と違い、コンバーター購入等の初期費用が掛かる事が多いが、インクに掛かるコストを考慮に入れると長時間筆記し続けることが多い人には適した方式とも言える。吸入式に比べ、吸入機構が劣化しても修理に出す必要が無く簡単に交換できる点や、ペン内部の洗浄がしやすいといった利点がある。しかし、吸入式に比べるとインク蓄量が少ないといった欠点がある。最近は、吸入式と違い後述のカートリッジ式と機構を共用できる事から、コスト面からこの方式を吸入式の代わりとして用いているメーカーが増加傾向にある。コンバーターは基本的に消耗品であり、抜き差しを繰り返すと差し込み口が弱くなると言う欠点がある。
ペン軸内にインクを吸入するための機構が内蔵されているものを吸入式と言い、吸引式と呼ばれることもある。ボトルインクに入ったインクを吸入して用いる方法で、後述するカートリッジ式や、コンバーター（吸入器）式のものよりも多くのインクを一度に充填する事が出来る。万年筆が考案された当初から使われている形式で、現在でも高価格帯の製品を中心に多くのモデルで製造されている。かつては吸入装置は様々な方式があったが、現在の吸入装置の殆どは回転吸入式と呼ばれるピストンを上下させることでインクを吸い上げる方式のものになっている。使用出来るインクの種類が多い上、インクを出し入れするときに細かいゴミなどを同時に掃除する事が可能であり、それがメンテナンスとしての役割も果たす（パーカー、モンブラン等の一部のメーカーは洗浄成分をインクに混入させている）。カートリッジ式を採用した製品では、コンバーターを装着しない限りこの掃除機能は望めない。しかし、後述のコンバーター（吸入器）式に比べると、構造の劣化が危惧されメンテナンス性の問題があるうえ、ペン内部の洗浄がしづらいといった欠点がある。
万年筆はインクを充填する方式により大きく2通りに分けられる。ひとつは、ボトルインクからペン先を浸してインクを吸入する方式、もうひとつはペン軸内にインクの入ったカートリッジを装着して使用する方式である。
私生活では麻薬や発砲事件などのトラブルが多い。1990年には当時交際していたケリー・プレストン（現・ジョン・トラボルタの妻）に誤って発砲して怪我をさせるという事件を起こしている。アルコール依存症で療養所に3か月間入院したこともある。また、5000人の女性とセックスしたというほどの好色漢である。2015年11月17日、米NBCテレビのインタビューで自らがHIV感染していることを公表した。代表作の一つである『メジャーリーグ』シリーズでは野球選手を演じたが、現実でも野球経験者であり、監督のデヴィッド・S・ウォードが一作目のDVD内のインタビューで述べた内容によると、高校時代はプロからもスカウトされたことがある程の腕とのこと。なお、シーンはステロイドを出演時に服用しており、それによって球速が10キロほど上がったが、元々127キロ出ていた事を後のインタビューで答えている。三度の結婚歴がある。1995年9月3日から1996年11月19日までドナ・ピールと結婚していた。ピールとの離婚後、女優デニス・リチャーズと2002年6月15日に結婚。彼女との間には2004年に生まれた娘のサムと2005年に生まれたローラ・ローズがいるが、2006年に離婚し、親権争いがタブロイド紙を賑わせる結果となった。2007年7月に不動産投資家のブルック・ミュラーと婚約、2008年5月に結婚。2009年3月14日に双子の男女が誕生。2009年12月25日、家でブルックと喧嘩をして突き飛ばし、ブルックが警察に通報。ドメスティックバイオレンスによる暴行容疑で逮捕された。その後、8500ドル（約77万円）の保釈金を支払って保釈されたが、2010年2月8日に脅迫や暴行などの容疑で起訴された。2010年11月、ブルックとの離婚を申請した。結婚はしていないが、高校時代の恋人であるポーラ・プロフィットとの間に娘のカサンドラ（1985年 - ）がおり、彼女の結婚式の際には花嫁の父としてヴァージンロードを歩いた。また、2013年にカサンドラが出産したことで、47歳にして孫を持つ身となった。Twitterのフォロワーは、200万人以上になってギネス記録になる。トラブルメーカーのイメージが強いが、いい話もあり、難病のチャリティ活動アイス・バケツ・チャレンジでは氷水を被る変わりに、自宅で鍋を頭の上に持ち上げ、ひっくり返したところ、中からはお札がこぼれ落ちてくる映像をインターネットに公開。本人は「おや、氷じゃないね。これは1万ドルだ。僕はこれを全額ALS基金に寄付する。氷は溶けるけど、このお金は役に立つからね」とコメントしている。2015年HIVに感染したことを公表した。しかし、発症はしていない。