2012年6月から数種類のテレビCMが放映されている。日常の街中に登場した「バハムート」などのモンスターたちを、プレイヤーたちが携帯電話を片手に協力しあって倒すという内容。しかし、このストーリーは未完になっている。以降はモンスターはCG合成だが、「ダークエンジェル・オリヴィエ」はダコタ・ローズが演じている。
『神撃のバハムート』をやり込む少年・久遠円は、事前に何の告知も無く現れたイベントクエスト『朽ちた黒龍の鱗』を怪訝に思いつつもプレイしようとするミスタルシアの世界に迷い込んでしまう。
2014年8月30日発売に発売されたノベライズ。作者はゆうきりん。イラストはえなれいん(Cygames)。KADOKAWAのファミ通文庫より刊行。全1巻。
ゲーム内にて2013年7月1日よりオリジナル・ストーリーの漫画を配信開始。ウェブコミック配信サイトのサイコミに移籍し2019年4月1日まで連載。作者は近藤るるる。単行本は、アース・スター エンターテイメントのアース・スターコミックスより1～3巻まで発売された後、新装版が講談社のサイコミから発売されてこちらから4巻以降も刊行された。全6巻。
他のカードを消費することでカードのLv.をアップさせる。スキル持ちのカードに対してスキル持ちのカードを消費するとスキルLv.を上げることができる。ただし、同じ名前のカードは強化に使用することができない。
引き換え条件（アイテム、ルピ、他のカード）を設定して手持ちのカードを出品すること、および出品されたカードを購入することができる。出品、購入いずれも1回につき1枚のバザーチケットが必要。
無料ガチャ（友情ガチャ）と有料ガチャが用意されている。有料ガチャの内容や仕様は時期によって変わる。なお、有料ガチャを回すとバザーで使える「バザーチケット」が獲得できる。
※現在は廃止されているシステム。手持ちのカードで最大5枚のデッキを攻守それぞれで作成し、他のプレイヤーと対戦する。勝利した場合は相手プレイヤーから聖宝とルピを奪い取ることが出来る。
プレイヤーは王からの君命の下、大陸を冒険し使命を果たす騎士となり、ルピ（ゲーム内通貨）やカードを集めながらストーリーを進め、経験値を獲得してプレイヤーをレベルアップさせていく（旧クエスト）。2016年年末から開始した「クエスト新章」ではストーリーを進めながら敵を倒して「ぷちキャラ」をレベルアップさせていく。「ぷちキャラ」は、新章のクエストで入手するトレジャーと交換、イベント配布、イベント限定ガチャの対象カード入手、「神撃のバハムート VIRGIN SOUL」特設ページからの入手がある。また、ぷちキャラたちにはそれぞれ対応するカードの種類と魔晶石がありそれらを強化していく必要もある。
あらゆる種族の入り混じる神秘の世界ミスタルシア。世界を征服せんと魔族侵略派が侵攻し戦闘が勃発、人類と天界、魔族穏健派も侵略派の世界征服を防ぐべく共闘し、世界各地で交戦している。かくして世界は天界と人間界と魔界、そして陰で暗躍する「混沌の闇」により混沌の一途を辿ることとなる。大陸には大昔、魔法技術が発達し、その技術を以て島を大空に浮かばせ一大王国を築いた「天人」が存在していたと言われ、現在もその名残である浮遊城が点在し、ゴーレム技術をはじめとする魔法技術の遺産が大陸各地に眠っていると言われている。
しかし、10月6日に蘆名盛隆が家臣に殺害されたことで、重家を取り巻く状況が暗転し始める。天正13年（1585年）5月、伊達輝宗に家督を譲られた伊達政宗が蘆名と開戦し（関柴合戦）、秋には上杉に新発田への道を貸すなど、輝宗による越後介入路線を完全に放棄した。さらには10月8日には輝宗が死んだことで、伊達・蘆名両家による重家の支援体制は崩れ、重家は後ろ盾を失った。加えて11月20日に新潟城と沼垂城が藤田信吉の調略によって上杉方の手に落ちると、新発田方は新潟港から塩の津潟を経由して新発田に至る水利権を失い、これにより物資の大量輸送が困難になり、蘆名家との津川経由のルートによって当面の物資を補給せざるをえない状況に追い込まれた。天正14年（1586年）、景勝は上洛して正式に羽柴秀吉に臣従した。これによって強力な後ろ盾を得た景勝は、新発田攻めに全力を傾けたものの、決着をつけることは出来なかった。しかし、この頃になると新発田方では兵糧が欠乏し、配下の討死や寝返りなどもあって戦力が目に見える形で衰えていった。天正15年（1587年）夏、秀吉の支援を受けた景勝は1万余の大軍をもって新発田城を遠巻きに取り囲んだ。また、景勝と親交があった青蓮院門跡・尊朝法親王が重家に和睦を勧告したが、重家はこれを断固としてはねつけた。周囲の諸城は上杉勢に次々攻略され、金上盛備が赤谷城の救援に向かうも藤田信吉に阻まれて撤退。9月19日、赤谷城が攻略された事により補給路は陸路・水路共に完全に寸断され、新発田城は義弟の五十公野信宗らが籠る五十公野城共々、孤立した。9月24日、秀吉からの使者が先ず景勝に対し派遣された。「因幡守（重家）城を出て降参すれば赦すべし」との降伏勧告・ただし助命条件であり、景勝は使者を新発田城に送った。使者は重家に対面して勧告内容を伝えたが重家は拒否、景勝は秀吉に早飛脚を送り勧告の結果を報告した。折り返し、秀吉から景勝に対し「来春までには落着すべし」と厳命が下ったことにより、景勝は先ずは五十公野城を総攻撃することになった。