妻は元マンボロスのルシア・トポランスキー上院議員で、読書家で愛読書はミゲル・デ・セルバンテスの『ドン・キホーテ』。趣味は花の栽培である。ムヒカの個人資産は、フォルクスワーゲン・タイプ1（ビートル）とトラクター、農地、自宅のみで、大統領公邸には住まずに、首都郊外の質素な住居に暮している。園芸が趣味という。2015年の10月11日放送のフジテレビ『Mr.サンデー』拡大スペシャルでのインタビューでは、少年時代に近くに住む日本人（日系ウルグアイ人）の造園業の手伝いをし、造園のノウハウを学んだことを紹介し、「実は家の近所に10軒か15軒ぐらいの日本人家族がいてね。みんな花を栽培していたんだ。幼い私も育て方を教わり、家計を助けたよ。彼らはすごい働き者でね。昔ながらの日本人だった。農民の思考で狭い土地に多くのものを耕していたんだ」「ここには日本の造船会社が来ていてね。日本人技術者が大勢働いていたんだ。その子どもたちはここで成長し、自転車で学校へ通い、ここでサッカーを覚えたんだ。ある日、日本人の子どもが試合に出ていてね。激しいプレーで頭をけがして血を流してた。ついにはコートから出された。その子は泣いていたよ。でも傷が痛いからじゃない。最後までプレーできないことが悔しくて、名誉心で泣いていたんだ」と日本について述べた。ムヒカの愛車である1987年製フォルクスワーゲン・タイプ1（2014年現在の価値は2800ドル（約32万円））をアラブの富豪から100万ドル（約1億1600万円）で買い取る事を打診された際、地元のラジオ番組で「友人たちから貰った物だから、売れば友人たちを傷つけることになるでしょう」と、これを拒否する発言をした。大統領や国会議員としての報酬や寄付をもとに農業学校を設立し、子どもたちに農業を教える取り組みをしている。大統領や国会議員の公務ではネクタイを締めなかった。大統領在任中、ある政府の会議で他の出席者はスーツにネクタイをしているのに対し、ムヒカはノーネクタイで出席していた。ムヒカはネクタイを締めることは政治家の口を締めることであり、ネクタイは現代文明の奴隷の道具と考えていた。ブラジルで開催されたリオ会議（Rio+20）では、経済の拡大を目指すことの問題点を指摘した。そのスピーチが話題となり、ノーベル平和賞の候補にもなった。また、スピーチを子供向けに紹介した絵本「世界でいちばん貧しい大統領のスピーチ」（汐文社）が、日本でも出版された。2013年4月4日、ムヒカはアルゼンチンのクリスティーナ・フェルナンデス・デ・キルチネル大統領に対して「片方の目が見えない男より、あのばあさんの方がひどい」「ばあさんは頑固だ」と発言し、問題になった。2019年のベネズエラでの騒乱の際、5月1日に、政府側による鎮圧のために装甲車がデモ隊に突っ込み、轢かれた人々の映像が配信されている。この映像についてムヒカは「戦車の前に立ってはいけない」とコメントしている。
2008年12月、東京・品川で発生した無差別殺人事件に遭遇した弁護士・長部瞭司は、居合わせた青木敦と2人で犯人を取り押さえようと立ち向かうが、犯人ともみ合う中で犯人から取り上げたナイフで敦の首を切りつけ死なせてしまう。事件から6年後、敦の妻・文は、亡き夫とともに始めた海辺のドライブイン「コントレール」を細々と営みつつ、夫の死後に誕生した1人息子・友樹と暮らしている。事件を担当した刑事・佐々岡滋が、文に思いを寄せつつ、文と友樹を気づかって「コントレール」をたびたび訪れる。義母・英恵も佐々岡との縁談を勧めるものの、文は魅力を感じない。犯人の死刑が執行された翌日、ひこうき雲（コントレール）に導かれるように、事件のショックにより失声症で声を失いトラックドライバーとなった瞭司が「コントレール」へやってくる。2人は互いに吸い寄せられるように惹かれ合い、やがて結ばれる。2人は逢瀬を重ね、瞭司は文との関係を深めることで事件のトラウマにより長い間失っていた声を徐々に取り戻してゆく。そんなある日、敦の浮気相手で6年前の事件で瞭司が敦を切りつけた瞬間を目撃していた篠崎圭子が、犯人の死刑執行を知ってインドから帰国、敦の知人を名乗って焼香に現れる。偶然瞭司と文との交際を知ることとなった圭子は、2人への憎しみを募らせてゆく。圭子は警察に瞭司の罪を訴えるものの、とりあってはもらえない。瞭司に自らの過去を打ち明けたいと思い始めていた文は、品川の無差別殺人事件で夫を失ったことを瞭司に告げると、真相を悟った瞭司は文の前から姿を消す。店も友樹も放置して必死で瞭司を探しまわる文を見かねた佐々岡は瞭司の元を訪れ、文のために真相を告げてほしいと頭を下げ、ついに瞭司は文に6年前の事件の真相を語りそして別れを告げる。瞭司と別れた文は友樹の母として生きることを決意、佐々岡からプロポーズも断り、仕事と子育てに励もうとする。一方瞭司は、取引先とのトラブルを起こした勤務先の多田羅運送を法律の知識を駆使して窮地から救う。「コントレール」の客足が落ちカレー弁当の販売を始めた文は、配達からの帰路にスーツ姿の瞭司と偶然再会。瞭司の変化を感じとった文は、店を畳み佐々岡と結婚することを決意する。文は佐々岡のもとで友樹と3人で結婚生活を始め、瞭司は小さな法律事務所を開設して法律相談に乗り始める。そんな矢先、圭子の画策により6年前の事件での瞭司の罪を告発する記事が雑誌に掲載され、さらに圭子は文と瞭司を品川の事件現場へ呼び出す。自分を庇って殺された敦の死は自分のせいだと自らを責める圭子をなだめた文は、止めたままの時計を進めるようにと諭す。その直後、交通事故で圭子を庇った瞭司は、意識不明の重体となって病院に搬送される。入院中の瞭司のことが気掛かりでならない文に、佐々岡は文の瞭司への思いを改めて思い知らされる。やがて瞭司が意識を取り戻し退院、それを知った文は、最後の思い出とするために、人手に渡る直前の「コントレール」へ瞭司を呼び出す。