腸捻転時代にキー局だったNET（現：テレビ朝日）とは、しばしば番組編成や内容を巡る衝突が起きていたという。その典型的な例が『23時ショー打ち切り事件』で、他にも『ヤングおー!おー!打ち切り』『大正テレビ寄席・サモン日曜お笑い劇場相互打ち切り』など実際の番組運行にまで響いたケースがある。ただ、NETが主導した教育・教養番組専門のネットワーク民間放送教育協会（民教協）を通じた両局の関係は、ネットチェンジ後も続いた。1992年（平成4年）3月末にJNN系列の団結をはかるために民教協を脱退したが、それまでは『親の目・子の目』などの民教協制作番組について引き続きテレ朝からの送り出しを受け、『親の目』では持ち回りの発局となることもあった。開局当初は、大阪テレビとの関係上TBSとのネットが難しくなったため、次善の策として高橋信三と鹿内信隆との親交関係や、ラジオでのニッポン放送・文化放送との結びつきからフジテレビとネットワークを組むことを考慮していたという。実際、本放送開始当初はフジからの番組がMBSへも流れ（「チエミのかわら版太平記」などのフィルム番組が12本）、また逆にMBS制作の番組をフジにネットすることもあった（鉄腕アトム (実写版)など）。2010年（平成22年）1月期に、フジが制作参加の深夜アニメ『刀語』がMBS制作協力で放送されていた。現在でもフジテレビ制作番組を『ちちんぷいぷい』等でプッシュするケースがある。テレビ東京は同社設立（1968年7月1日に「東京十二チャンネルプロダクション」として設立）以来MBSが大株主の一角に加わっており、1969年10月1日より1975年3月30日までは相互ネットを行っていた。以降も番組販売の関係は1982年3月1日テレビ大阪開局まで続いた（なお、MBSはテレビ大阪開局も支援した）。日本テレビとの関係は、1959年のプロ野球日本シリーズ中継を共同制作・放送した実績があるが、一部には親密といわれており、1996年（平成8年）に発覚したTBSビデオ問題を巡る報道で日テレとTBSの関係が険悪になった時も、MBSと日テレの関係は維持された。
2007年2月3日、UFCデビュー戦となったUFC 67で改めてイーストマンと対戦。2ラウンド、クリンチアッパーの連打でイーストマンをKOし、7年越しのリベンジを成功させた。2007年5月26日、UFC 71のUFC世界ライトヘビー級タイトルマッチで王者チャック・リデルと再戦。右フックからのパウンドで1ラウンドTKO勝ちを収め王座獲得に成功した。ノックアウト・オブ・ザ・ナイトも受賞した。2007年9月8日、UFC 75のUFC世界ライトヘビー級王座防衛戦でPRIDE二冠王者ダン・ヘンダーソンと対戦。全体として試合を優勢に進め、3-0の判定勝ちを収め初防衛に成功した。2008年1月3日、UFC公式サイトにおいてThe 2007 Fighters of The Year第1位に選ばれた。2008年4月から放送されたリアリティ番組「The Ultimate Fighter」のシーズン7でチーム・ランペイジのヘッドコーチを務めたが、シーズン中はチーム・ランペイジの選手は準決勝までで全員敗退。相手チームに失格者が出たことによりCB・ダラウェイが敗者復活を果たすも、ダラウェイは決勝でアミール・サダローに敗れた。シーズン後の同年7月5日に行われたUFC 86では同じくコーチを務めたフォレスト・グリフィンとライトヘビー級タイトルマッチで対戦。0-3の判定負けにより2度目の防衛に失敗し王座から陥落した。敗れたもののファイト・オブ・ザ・ナイトを受賞した。2008年7月15日、アメリカ・カリフォルニア州で当て逃げと無謀運転の疑いで逮捕され、ダナ・ホワイトが25,000ドルの保釈金を払い釈放された。最終的にジャクソンが罪を認め反省をみせ200時間の社会奉仕活動などを完了させると訴えが2010年1月8日に判事によって棄却された。2008年12月27日、UFC 92でPRIDEで2連敗したヴァンダレイ・シウバと3度目の対戦。左フックで失神KO勝ちを収めリベンジに成功。ノックアウト・オブ・ザ・ナイトを受賞した。2009年3月7日、UFC 96でキース・ジャーディンと対戦し、3-0の判定勝ち。ファイト・オブ・ザ・ナイトを受賞した。2009年9月から12月にかけて放送された「The Ultimate Fighter」シーズン10でヘッド・コーチを務めた。同じくヘッド・コーチを務めたラシャド・エヴァンスとはシーズン中から舌戦を繰り広げるなど因縁を深めたが、シーズン終了後映画出演（「特攻野郎Aチーム THE MOVIE」）を優先しエヴァンスとのコーチ対決を拒否した。2010年5月29日、UFC 114でエヴァンスと対戦し、0-3の判定負けを喫した。2010年6月にアメリカで公開された「特攻野郎Aチーム THE MOVIE」でバラカス軍曹役で出演。同年8月の日本公開に合わせ来日も果たした。2010年11月20日、UFC 123でリョート・マチダと対戦し、2-1の判定勝ちを収めたが、判定は物議を醸し、ランペイジがマチダに自ら再戦を申し出るという後味の悪い結末になった。2011年5月28日、UFC 130でマット・ハミルと対戦し、3-0の判定勝ちを収めた。2011年9月24日、UFC 135のUFC世界ライトヘビー級タイトルマッチで王者ジョン・ジョーンズに挑戦し、チョークスリーパーで一本負けを喫し王座獲得に失敗した。2012年2月26日、日本で開催されたUFC 144でライアン・ベイダーと対戦し、0-3の判定負けを喫した。なお、前日計量でジャクソンは5ポンド（約2.3キロ）のウェイトオーバーでファイトマネーの20パーセントを没収されている。2013年1月26日、UFC on FOX 6でグローバー・テイシェイラと対戦し、0-3の判定負けを喫した。