991年(正暦2年)に鎮守府将軍藤原秀郷の流れを汲む藤原通直後裔の川野辺通直により築城され、以来、野口城は通直の後裔川野辺氏が世襲にて領有した。別称を川野辺城ともいう。なお、通直の兄は太田城を築城して太田通延と名乗り、子孫は小野崎氏となっている。平安時代以降、常陸国北部は那珂で武門として名高い清和源氏の一家系河内源氏の流れを汲む佐竹氏と藤原秀郷の流れを汲む藤姓の両武士団が勢力を誇り、野口城は藤姓川野辺氏の拠点の役割を果たした。南北朝時代に入り、川野辺資鎮は川野辺氏の庶家ながら有力な武士として台頭した瓜連城主の那珂通辰に従い、南朝方として活躍し佐竹氏に対抗したが、那珂通辰が敗死すると、川野辺氏も衰退し、穴技の地に退き、野口城は佐竹氏に明け渡された。以後、野口城は佐竹氏の庶家野口氏により領有された。しかし、1540年（天文9年）、野口幹成が常陸守護佐竹義篤に背き敗北すると、幹成旧臣たる野口四天王らは佐竹氏に帰順、野口城は廃城となった。現在は城址のみ残る。
デンマーク中部オーフス県のシルケボア（Silkeborg）に生まれる。コペンハーゲン大学医学部を1890年に卒業後、ベルリンに留学し、ロベルト・コッホやベーリングについて細菌学を学ぶ。1900年、デンマークに戻りコペンハーゲン大学病理解剖学教授に就任、1926年には総長となった。ノーベル生理学医学賞を受賞したのも同年である。1928年コペンハーゲンで死去。
かつては信越本線の線路が延びていた軽井沢駅までの間には、1997年（平成9年）10月1日からJRバス関東による碓氷線が運行されている。バス乗り場は駅改札口を抜けて左手、徒歩1分程度車止の先の所にある。春・夏・秋の観光シーズン限定で、横川駅 - めがね橋 - 熊ノ平 - 軽井沢駅（通称：めがねバス）および横川駅 - めがね橋 - 熊ノ平駐車場（通称：碓氷旧道シャトルバス）も運行されている。
横川 - 軽井沢間の廃止からしばらく経ったのち、廃車されたEF63形電気機関車2両と189系電車長野色の7両編成が旧丸山信号所付近に留置された。これらは廃車以降全く手入れされておらず、錆や塗装の剥がれ・色褪せが目立ち、EF63形の前面貫通扉が盗難に遭うなど荒廃してしまったため、防犯のため当駅の4番線に移動されたが、展示しているのか放置しているのかわからない状況であった。なお、この際に車両の回送経路の関係で現役当時とは編成が逆になっており、EF63形が長野方に置かれていた。2005年末になり、EF63形の2両と189系のうち2両（先頭車1両・中間車1両）が鉄道文化むら内に収容されたが、残った189系電車の5両は2006年1月に解体された。なお、EF63形の2両はその後、整備を受け鉄道文化むらのEF63形体験運転車両として動態保存された。
北陸新幹線の高崎駅 - 長野駅間が部分開業した1997年10月1日以降、信越本線の終着駅となっている。1 - 3番線の線路は構内のはずれにコンクリート製の車止めが設置され途切れているが、かつては碓氷峠を越えて軽井沢駅へ複線電化の線路がつながっており、碓氷峠越えの拠点となった駅であった。碓氷峠には66.7‰という国鉄・JRで最も急な勾配があり、列車が上り・下りするためには補機であるEF63を連結・解放する必要があった。そのため、基本的には全ての列車が客扱いし長時間停車したが、臨時列車である『ファンタジー舞浜』など通過時間帯が深夜である列車のごく一部で、客扱いをせずに運転停車のみだったものも存在する。その時間を利用して乗客が購入していたのが「峠の釜めし」で、製造販売している「おぎのや」は駅前にある。
ナチスは、ハンブルク郊外のノイエンガンメ収容所の支収容所として、オルダニー島に4つの強制収容所を建設した。4つはフリースラント諸島にちなんでノルダニー収容所、ボルクム収容所、シルト収容所、ヘルゴラント収容所と名付けられた。ナチスのトート機関が各支収容所を運営し、強制労働でトーチカや銃座、防空壕、コンクリート製の要塞を建設した。収容所は1942年11月に運営を開始し、総収容者数は約6000人であった。シルト収容所やノルダニー収容所の囚人は、オルダニー島全域に作られた要塞や軍事施設の建設に従事した。シルト収容所ではユダヤ人が強制労働に駆り出されていた。ノルダニー収容所ではヨーロッパ人と（通常は東欧だがスペイン人を含む）ロシア人が強制労働に駆り出された。ボルクム収容所とヘルゴラント収容所は、「有志の」（Hilfswillige）労働収容所であり、ここの労働者も酷く扱われたが、シルト収容所やノルダニー収容所よりは幾分ましな扱いであった。ボルクム収容所はドイツ人技術者とヨーロッパの異なる国の「有志」に用いられ、ヘルゴラント収容所の収容者は、主にトート機関のロシア人労働者であった。1942年、ユダヤ人を収容するシルト収容所と、ロシア人捕虜とポーランド人捕虜を収容するノルダニー収容所は、マクシミリアン・リスト（de:Maximilian List）親衛隊大尉の指揮下に置かれた。収容所閉鎖までに700人を越える囚人の命が失われ、残りは1944年にドイツに移送された。