1932年の無血革命により、絶対王政から民主政府に制度が変わると、学校と高等教育機関のさらなる拡大が奨励された。初の国家教育計画では、能力、性別、社会的背景によらない教育へのアクセスが公式に許可された。1960年には、義務教区が7年間に拡大し、障害者児童 - それまで障害者児童は義務教育から除外されていた - への特別規定が初めて作られた。1961年には政府は5か年計画を始め、多くの専用学校が建設された。町村部の木造学校や初期のコンクリート造中学校はこのとき作られたものである。1977年には、初等教育と中等教育の区切りが、4-3-3-2制から、現在でも用いられる6-3-3制に変更された。
体操伝習所における教材としてサッカーが取り入れられた1878年が現在の筑波大学とサッカーとの始まりとなる。1886年に高等師範学校に体操伝習所が統合されて、高等師範学校の「体操専修科」となった。1896年3月、高等師範学校の「フートボール部」として創設され、同校教授の坪井玄道が部長に就任した。なお、当時はラグビーと未分化であったと伝えられている。1902年に高等師範学校から「東京高等師範学校」（東京高師）に改名した。1902年4月、フートボール部の理事であった中村覚之助らが日本で最初のサッカー指導書の「アッソシェーション・フットボール」を翻訳。また、同年中に中村によってア式蹴球部が創設された。1903年秋に「東京高等師範学校蹴球部」の名前で日本で最初のフットボールの書物となる「アッソシェーション.フットボール」が出版された。1904年にイングランド人のウォルター・オーガスタス・デ・ハヴィランドが東京高師に教員として赴任。この時にデ・ハヴィランドがアソシエーション・フットボール（ア式フットボール。現在のサッカー）を指導したことでサッカーが行われるようになったと伝わっている（なお、デ・ハヴィランドは1906年に東京高師の教員を退任）。1904年2月、横浜カントリー・アンド・アスレティック・クラブ（YC&AC）と対戦して0-9で敗北。なお、この試合が日本で初めて開催された外国のチームとの対戦とされている。1907年11月、日本のクラブ同士で行われた初めての対抗試合とされる東京府青山師範学校との試合が開催された。1917年5月、東京高師が日本代表チームとして第3回極東選手権競技大会に出場。5月9日に初めての日本代表としての国際試合で中華民国代表と対戦した(0-5で敗北）。また、5月10日には元FCバルセロナのパウリノ・アルカンタラを擁するフィリピン代表と対戦し、2-15で敗れたが、この試合で東京高師在学中だった藤井春吉が日本代表初得点を記録した。なお、この試合は現在でも日本代表の最大差敗戦試合となっている。1921年、東京高師の関係者が中心となり「大日本蹴球協会」（現在の日本サッカー協会）が創設された。1922年、日本最初のリーグ戦である「専門学校蹴球リーグ戦」に東京帝国大学、早稲田大学、東京商科大学と共に参加。なお、同年で「専門学校蹴球リーグ戦」は休止されたが、1924年にア式蹴球東京コレッヂリーグ（現：関東大学サッカーリーグ戦 ）が創設され、「専門学校蹴球リーグ戦」に参加していた東京帝大、早稲田大に加えて、法政大、慶應義塾大、東京農大の5校と共に1部に入った（同年は4位の成績）。1925年、ア式蹴球東京コレッヂリーグで初優勝を果たした。1929年、東京高等師範学校から東京文理科大学へ改組し、同大学の蹴球部となった。1935年に開催された全日本蹴球選手権大會（第15回天皇杯全日本サッカー選手権大会）に初出場して関大クラブなどを破って決勝に進出。決勝は全京城蹴球団に敗れたが、準優勝の成績を残した。1936年ベルリンオリンピックのサッカー競技の日本代表に在学中の松永行が選出され、スウェーデン代表で決勝点となるゴールを決めた（ベルリンの奇跡も参照）。1949年、東京文理科大学が東京教育大学へ改組し、同大学の蹴球部となった。1954年、全日本大学サッカー選手権大会で初優勝を果たした。1959年、中央大学学友会サッカー部との中教サッカー定期戦（現在は「中筑サッカー定期戦」）が開始された。また、1957年から1959年まで3年連続で現役・OBによる茗友クラブとして天皇杯に出場している。1978年、東京教育大学が閉鎖され、筑波大学が発足すると共に同大学の蹴球部となった。1981年、総理大臣杯全日本大学サッカートーナメントで初優勝した。また、同年の第61回天皇杯全日本サッカー選手権大会の2回戦で古河電工、準々決勝で日立製作所とJSL勢を連破してベスト4に入った。2012年、26回目の出場となった第92回天皇杯全日本サッカー選手権大会の1回戦でJFL所属（当時）のFC琉球に勝利した。2014年11月、中央大学に敗れて創部以来初となる関東大学リーグ2部へ降格した。2015年11月、関東大学リーグ2部で2位に入って1年での1部復帰を決めた。2016年12月に開催された第65回全日本大学サッカー選手権大会で優勝した（13年ぶり9回目）。2017年、30回目の出場となった第97回天皇杯全日本サッカー選手権大会の1回戦でJ3・Y.S.C.C.横浜に勝利、2回戦のベガルタ仙台戦で創部以来初となるJ1クラブから勝利を挙げた。3回戦ではJ2・アビスパ福岡に勝利した。2017年11月、関東大学リーグ1部で13年ぶりに優勝した。勝利数（17）、勝点（54）は共に22試合制になった2005年以降で最多となる。