2001年にスピンオフ作品として、モルダー捜査官を助ける3人組が主人公のテレビドラマ『ローン・ガンメン(The Lone Gunmen)』が1シーズン13話のみ製作され、X-ファイルのシーズン8と並行する形で放送された。その最終回はX-ファイルシーズン9のエピソードにつながる。日本ではセルビデオが3話だけ発売されたのみ。CS放送のFOXチャンネルにて全13話がビデオシリーズの吹き替えキャストで数回放送された。
2018年1月1日、ジリアン・アンダーソンがシーズン11を最後にスカリー役を引退する意向であると報じられた。クリス・カーターは「アンダーソン抜きで『X-ファイル』を続行することは考えられません」と述べているが、シリーズを続行するためのアイデアがあることは認めている。また、デヴィッド・ドゥカヴニーも同様の反応を示している。
2017年8月19日、スキナー副長官役のミッチ・ピレッジが撮影現場で撮影したドゥカヴニーの愛犬、ブリック君の写真を自身のTwitterに投稿したところ、想定外の注目を集めた。その人気のためにブリック君のTwitterアカウントが作成され、出演者やスタッフ及びファンとやり取りしている。本シーズンの芸術スタッフとして、ジリアンの娘であるパイパー・マルが参加している。また、第2話「This」には、アンダーソンの息子2人（オスカーとフィリックス）がエキストラとして出演した。
2017年9月6日、FOXはマーク・スノウ作曲のOPテーマを使用したシーズン11のプロモーションビデオの公募を開始した。応募作の中でも特に出来が良かったものはテレビCMとして使用される可能性があるという。なお、応募資格はアメリカ在住者に限定されている。10月8日、ニューヨークで開催されるコミコンで、シーズン11の予告編が初めて公開された。
2017年8月、バンクーバーでの撮影が始まった。シーズン11の撮影にあたり、FOXは関係者が撮影に関することをツイートすることを禁じ、シーズン11の詳細がネット上に流失することを回避しようとした。しかし、SNS上には、ファンが撮影中のスタッフ・俳優を撮影した写真が次々投稿されている。22日、アンダーソンがセットでセルフィーを撮影し、それを自身のTwitterで公開した。9月15日、撮影中にクマが出現し現場が騒然となったが、怪我人は出なかった。
シガレット・スモーキング・マンとスキナー副長官の過去を掘り下げるエピソードが存在すること、第3話がドッペルゲンガーを扱ったエピソードであることが明かされている。また、最終話がクリフハンガーで終了することも判明している。
2015年11月2日、『TVline』はFOXがローレン・アンブローズ演じるアインシュタイン捜査官とロビー・アメル演じるミラー捜査官を主人公としたスピンオフドラマを製作することを検討していると報じた。ただし、FOXはこの報道が事実であるかどうかコメントしていない。
第2話は批評家から好意的に評価されている。ロジャー・イーバート・ドットコムのブライアン・タレリコは「第2話は（モルダーとスカリーの子供ウィリアムを含めた）『X-ファイル』のミソロジー要素と現代的な要素が完璧に融合している。」と評している。『エンターテインメント・ウィークリー』は第2話にB評価を下し、「『X-ファイル』のファンにとっては楽しめるエピソードだ。」「第1話よりも出来がいい。」と述べている。『A.V.クラブ』のアレックス・マッコーンは「第2話によって『X-ファイル』の新シリーズは正しい軌道に乗った。」「見る者をハラハラさせる優れたエピソードだ。」「第2話で繰り広げられる登場人物たちの会話を見れば、なぜ私たちがモルダーとスカリーを気に入ったのかが分かり、なぜこの2人が絶妙なコンビネーションを発揮できるのかを思い出すことができる。」と評している。
アーリーレビューでは酷評されている。『バラエティ』のブライアン・ローリーは「かつての人気シリーズ『X-ファイル』の知名度を時代の風潮に合わせた形で利用しただけではないかという不安が頭から離れない。」「クリス・カーターをはじめとする製作スタッフは視聴者が『X-ファイル』のどこに魅力を感じていたのかを忘れてしまったようだ。」と評している。『ハリウッド・リポーター』のティム・グッドマンは「熱狂的な『X-ファイル』ファンですら「この番組を見る価値があるのか」と思ってしまう。実に残念な出来だ。」と述べている。『ディジタル・スパイ』のエマ・ディブディンは「十分に血が通った14年ぶりの復活作品というより、ノスタルジアに浸ったドラマに思える。」「エイリアンの入植と情報化社会に対する懸念を結び付けようとしているがこじつけに見える。」と批判している。
映画版第2作の後のモルダーとスカリーを描いたコミック『The X-Files Season 10』が2013年6月から月間の漫画雑誌に掲載され始めた。映画第2作の後のモルダーとスカリーを描いた作品で、ストーリーはクリス・カーター(第5話まで)とジョー・ハリスが担当した。シーズン10はドラマで展開されたミソロジーを受け継ぐストーリーとして、「より狂気に満ちたアメリカ同時多発テロやウィキリークスによる一連の告発以降の現代社会におけるエイリアンの陰謀を描き出す」ことを目指したものとなっている。
愛知県名古屋市の映画館シネマスコーレが、地元である中川運河の魅力をアピールするために企画したオムニバス『Filmusic in 中川運河・夏』のうちの1作である。フラワーカンパニーズでドラムを担当するミスター小西が初主演となる。監督の田中に依れば、小西が名古屋出身であることからキャスティングを行っている。小西が演じる尾西を「いい歳しているのに、バイトからも恋人からもバイトからも見離されそうな情けないドラマー」と関係者に説明したところ、「当て書のようだ（演じる俳優をあらかじめ決めてから脚本を書くやりかた）」と受諾している。2015年12月12日から2016年1月1日まで、バラエティ番組『水曜どうでしょう』のディレクター藤村忠寿とフラワーカンパニーズメンバーによる座談会を加えたシネマスコーレ限定の特別バージョン“名古屋版”が公開された。第10回したまちコメディ映画祭in台東、第10回札幌国際短編映画祭、なら国際映画祭2016などに出品。