動的計画法は、理論的にはいくつのシーケンスに対しても適用可能である。しかし、n次の時間とメモリ空間を要するため、3配列以上の場合にはそのまま適用されることはほとんどない。標準の動的計画法ではまずすべてのクエリのペアが使用され、アライメントスペース（英: alignment space）を中間的な位置の可能なマッチやギャップを考慮して満たす。やがて2つのシーケンスアライメントの間の基本的なアライメントが構成される。この方式は計算コストが高いが、その全体的な最適解の保証は少数のシーケンスを正確に配置する必要があるときに有用である。動的計画法の計算コストを減らすためのひとつの方式はそれは「ペアの総計」の最適化関数を信頼するものだが、ソフトウェアパッケージのMSAで実装されている。
ワード法は、k-tuple法としても知られるヒューリスティックな方法で、最適アラインメントが見つかることを保証しないが、ダイナミックプログラミングよりも遙かに効率が良い。このため、大規模なデータベース検索に多く用いられる。この方法はFASTAやBLASTといったアラインメントツールが用いていることで知られている。ワード法では、まずクエリ配列を短い部分配列（ワード）に分け、その中からデータベースの配列に合うものを見つける。見つかったワードについて、比較対象の2配列中の相対位置を抽出し、オフセットを得る。もし複数のワードを用いて同じオフセットが得られれば、アラインメントすべき領域が示されたことになる。そのような領域が見つかった場合にのみ、より感度の高いアラインメントが適応される。これによって、明らかに似ていない配列間の不要な比較を減らすことができる。
動的計画法（英語: dynamic programming）の代表的な手法として、グローバルアラインメントについては Needleman-Wunsch法(ニードルマン＝ウンシュ法)、ローカルアライメントについてはSmith-Waterman法(スミス＝ウォーターマン法)がある。例えばタンパク質のアライメントでは、アミノ酸の一致・不一致に対しして置換マトリックスを参照してスコアを付与し、ギャップにはペナルティを付与するような計算である。
グローバルアラインメントとは配列中の全残基がアラインメントされるようにしたもので、ほぼ同じ長さの配列間での比較に有効である。ローカルアラインメントは、配列が全体としては似ておらず、部分的類似を見つけたい場合に有効である。
バイオインフォマティクスにおいて、シーケンスアラインメントとは、DNAやRNA、タンパク質の配列（一次構造）の類似した領域を特定できるように並べたもので、機能的、構造的、あるいは進化的な配列の関係性を知る手がかりを与える。アラインメントされたヌクレオチド残基やアミノ酸残基の配列は、典型的には行列の行として表現され、同一あるいは類似性質の配列が同じ列に並ぶようギャップが挿入される。アラインメントの二配列が祖先を共有する場合、分岐後の一方または両方の系統において、不一致部分は点変異が、ギャップ部分はインデル（indel=挿入欠失; 挿入変異または欠失変異）が生じたものと解釈される。タンパク質の配列アラインメントでは、特定位置におけるアミノ酸の類似度は特定領域、あるいは配列モチーフが系統間でどのくらい保存されているかを示す大まかな目安と解釈できる。置換がないか、保守的置換（類似の生化学的特性を持った側鎖との置換）しかないとき、その領域は構造的、あるいは機能的に重要であると示唆される。DNAとRNAの塩基は、アミノ酸の場合よりも互いに類似しているものの、塩基対の保存は、構造的、機能的重要性を示唆している。シーケンスアラインメントは、自然言語や金融データなどの非生物配列にも用いられる。
諸藩でも普請奉行職が置かれたが、筑後柳河藩のように普請役と呼称される場合や越後長岡藩のように普請奉行を統括する非常置の普請大奉行職を置く場合もあった。戸田氏時代の美濃大垣藩では人員3、4人。
江戸幕府においては、芙蓉の間席で従五位下に叙せられる諸太夫役。別名は、御普請奉行。ここでいう普請は、仏教用語で「ひろく大衆に労役に従事してもらう」という意味である。お城の石垣普請や縄張り、地取などの土木関係の諸業務や上水の管理を司る役割。定員は概ね2名程度。老中支配で、役高は2000石。寛文6年（1666年）に役料500俵となったが、天和2年（1682年）にこれは廃止になった。下に普請下奉行、改役、普請方などの役があった。作事奉行、小普請奉行とあわせ下三奉行（しもさんぶぎょう）といった。
東京都板橋区生まれ。豊島区出身。一つ下の弟がいる。スペイン人のハーフの従兄妹がいる。身長180cm、B93cm、W79cm、H92cm。子どもの頃から負けず嫌いで努力家だが、カッとなりがちで少し短気な面も持つ。本人も気にしているようで普段は温厚な性格を心がけている。好奇心旺盛で知らない街などを散歩したり、散策するのが好き。好きな飲み物はコーヒー。坂本コウルドという芸名は特にこれといった意味があるわけではなく、言葉の響きと覚えられやすい、見つけやすいという理由でつけた。学生時代に野球やキックボクシングをやっていたこともあって、特技にしている。しかし、肩と膝を怪我したことで現在は嗜む程度にしかやっていない。学生時代などに自主制作で友人たちと映画を撮影したり、編集したり、DVD製作をしていた。坂本コウルドは出演だけでなく、監督や脚本、編集も担当していた。今でもたまに撮影したり企画したりしている。子どもの頃から目が悪く、眼鏡やコンタクトレンズが嫌で若い頃にレーシックを受けて視力を回復させている。GLAYとB'zの大ファンであり、ライブにもこまめに観賞しに行ったり、ツアーがあると時間をみては地方開催にも参加している。本人曰く「ライブ観賞のために日々お金を稼いでいる」。元々、人と違う特技を持ちたいという理由から手相占いを学生時代に独学で身につける。その後、友人に促されたことをきっかけに占い師になる。占い業も基本フリーで行っている。趣味はサイクリング、コスプレ、喫茶店巡りなど。