16-18世紀、ヨーロッパで巨人と思われていたパタゴンおそらくは実在のテウェルチェ族は文字を持たず定住もしない民族であったため、どの程度の勢力であったのかはよくはわかっていない。ただし、16世紀ネグロ川以南はほぼテウェルチェ族の支配地で1万人程度であったのではないかと推定されている。パタゴニア以外のインカ帝国など南米各地の人々は16世紀中にはヨーロッパ人の激しい簒奪に遭い殺され、その支配下におかれ衰弱していったが、辺境で農業に向かないパタゴニアにヨーロッパ人が進出してくるのは少し先であった。18世紀半ばスペインへの対抗勢力であるチリのマプチェ族（アラウカノ族）がパタゴニアに勢力を伸ばし、テウェルチェ族はその文化にも影響を受け（アラウカノ化）ていき（テウェルチェの名自体がマプチェ語に由来するものである）勢力も衰えていった。さらにヨーロッパ人が大陸から持ち込んだ天然痘やチフス、麻疹などの伝染病はインカをはじめ免疫を持たなかった南アメリカの諸民族を甚だしく減少させたが、ヨーロッパ人の持ち込んだ伝染病に免疫を持たなかった点はテウェルチェ族についても同様であり疾病で人数を減らしている。気候の厳しいパタゴニアへのヨーロッパ人の入植は遅かったが19世紀1865年に最初のパタゴニアへのヨーロッパ人入植が始まり、さらに1879年フリオ・ロカ将軍によるインディオ討伐戦が開始されて、伝染病から逃れて生き延びた少数のテウェルチェ族たちは次々殺され追い詰められていき、1885年最後のテウェルチェ族長が降伏しテウェルチェ族は自立した民族としては壊滅した。日本の2倍強にあたる広大な面積のパタゴニアに現在のテウェルチェ族は200人程度とされている。
パタゴニアへの渡航がごく限られた冒険者たちの時代16世紀から17世紀、パタゴニアは巨人の国だとの認識がもたれていたが、18世紀に入ると航海技術も向上しパタゴニアへの渡航は冒険者だけの物で無くなり、パタゴニアに関する報告は増えていった。1740年にパタゴニアに派遣されたイエズス会宣教師トマス・フォークナーはパタゴニアに長期滞在の上で1774年に自伝を発行し、そのなかでパタゴニアの人々は確かに大柄ではあり、フォークナーの知っているパタゴニアの族長の1人の身長は2.1メートルを超えていたとも残しているが、巨人というほどではなかったと証言している。1766-1769年に世界周航をしたフランス人ブーガンヴィルは航海に科学者を同行させ、その著書「世界周航記」のなかでパタゴニア先住民族との接触について詳しく書いていて、彼らパタゴン人はグアナコの毛皮を着、歌や踊りが好きで巨人というほどではないが彼らフランス人よりは大柄であったと報告している。ブーガンヴィルはより具体的な数字をあげており、パタゴン人の身長は5ピエ6プース（約1.8メートル）以下の者もいないし5ピエ10プース（約1.9メートル）以上の者もいないが、複数の船員が6ピエ（1.98メートル）以上のパタゴン人を何人も見たと証言したと書いている。先に記述した1773年のジョン・バイロンのパタゴニア人は背は高いが巨人と言うほどではないとの報告を加え、18世紀後半1770年代に続けて発行されたパタゴニアあるいはパタゴン人についての諸報告はいずれもパタゴンが当時のヨーロッパ人よりは背は高いものの巨人というほどではないことを証言し、これらの報告によってヨーロッパ人に伝わるパタゴニアの巨人伝説は終わりを告げるのであった。
本土寺は元々日朗・日像ら日蓮門人を輩出した平賀忠晴の屋敷跡と伝えられ、後に日蓮の支援者であった千葉氏家臣曽谷教信が法華堂を建立したとされている。後に日朗が本土寺として開堂供養した（実質的な開山は、日朗門人の日伝であったとする説もある）。『平賀本土寺史要』によると、文永6年（1269年）、日蓮に帰依した蔭山土佐守が「小金の狩野の松原」の地に法華堂を建てたのが本土寺の起源という。建治3年（1277年）曽谷教信（胤直）が平賀郷鼻輪に法華堂を移し、日蓮の弟子日朗が開堂供養した。日蓮の直弟子である日朗、その異母弟にあたる日像（四条門流の祖）、日輪（池上本門寺3世）は平賀氏の出身で、平賀郷はこれら日蓮宗の祖師ゆかりの地であった。延慶2年（1309年）、曽谷教信の娘・芝崎（千葉胤貞の妻）より、土地の寄進を受け、寺が整備された。芝崎夫人は夫の胤貞の死後、出家し、日貞尼とも称される。延文3年（1358年）、台風により、本堂が倒壊するが、その後再建された。貞治4年（1365年）、山号を北谷山から長谷山に改称したとされる。曽谷教信の曾孫にあたる8世日福は、嘉吉元年（1441年）に現在地に本堂を移し、鎌倉妙本寺の日寿を招いて開堂供養を行った。宝徳4年（1452年）、火災により、本堂が焼失。9世日意・10世日瑞は火災で焼失した本堂再建のための勧進事業をきっかけに布教を行い、地元の高城氏やその同族の原氏の支援を受けて寺を整備した。日瑞の時には本土寺に現存する建治4年（1278年）在銘の梵鐘を得た。この梵鐘は印東荘（現・佐倉市六崎）の大福寺（廃寺）にあったもので、鐘に刻まれた追銘によれば、檀那の設楽助太郎によって文明14年（1482年）に寄進されたものである。高城氏が小田原征伐で改易されると、徳川家康の5男で甲斐の穴山武田氏を継承した武田信吉が母の秋山夫人（家康の側室、於都摩）とともに小金城に封じられたが、間もなく天正19年（1591年）夫人が亡くなったために15世日悟がこれを厚く葬り、家康も朱印地10石を与えた。本土寺は元々不受不施派の影響が強く、寛永7年（1630年）の身池対論でも18世日弘が参加している。ところが、江戸幕府が不受不施派弾圧の方針を取ったために、日弘は伊豆に流され、続いて21世日述も伊予国に配流された。その結果、寛文5年（1665年）に受不施派の久遠寺の支配下に組み込まれることになった。その後派遣された22世日令の元で受不施派寺院としての改革が行われた。日令の貞享元年（1684年）に前述の秋山夫人の甥にあたる徳川光圀の申し出により秋山夫人の墓が本堂脇に移されて参道の整備と寺領20石6斗の寄進が行われている。その後、享保20年（1735年）から安政2年（1855年）にかけて江戸浅草にあった末寺の本法寺での5度にわたる出開帳によって、寺の名は江戸でも知られるようになった。安政3年（1856年）には末寺4院6坊75寺を数えた。