領内の大生院村には市之川鉱山があり、輝安鉱（「白目」「白味」などと呼ばれた）が特産品であった。また、第2代藩主直治の時代に大洲藩領から小西伝兵衛を招き、製紙業を興した。小松藩の和紙生産は文政年間（1818年 - 1830年）頃に最盛期を迎え、藩の専売品として大坂に出荷された。これらの産品があったものの、参勤交代や江戸屋敷の維持などのため、多くの藩と同様に財政は逼迫し、借金も増大した。領内商人など領民からの上納金、藩士の減俸をしばしば行っている。寛政5年（1793年）には竹鼻正脩の進言により、「銭預かり札」という名目で、幕府の公許を得ないまま実質的な藩札を発行している。明治維新後、明治政府は諸藩の藩札を無効として新貨幣（円）と交換する措置を取ったが（新貨条例）、小松藩の「銭預かり札」は幕府の公認を受けない私札とされて政府による交換が拒否された。
家老や月番の奉行によって書き継がれた記録「会所日記」が、享保元年（1716年）から慶応2年（1866年）まで150年にわたって残されている。内容は藩の政務、藩士や商人・領民の生活動向、事件や噂など多岐にわたる。全262冊にのぼる記録は、1971年に小松町の文化財に指定されている。会所日記の内容は『小松町誌』（1992年）の編纂に当たって調査され、兵庫歴史研究会の北村六合光（くにてる）が原典の解読に当たった。2001年には増川宏一の執筆により（北村も「原典解読」として著者に挙げられている）集英社新書より『伊予小松藩会所日記』が刊行され、一般向けにその内容を紹介している。
家老は1人で、喜多川家が代々継いだ。家禄は藩内で最大の400石であった。家老に次いで奉行職が置かれ、藩政は家老と数人の奉行の合議制によって運営されていた。家老の執務の場は、陣屋の向かいに位置する「会所」と呼ばれる建物に入っていた。家臣の数も少なく、江戸時代中期に武士は約70人、足軽・小者などが約100人であった。幕末期の天保9年の調査では武士60人、足軽40人と記録されている。
第8代藩主頼紹の時代に幕末の動乱期を迎える。慶応4年/明治元年（1868年）の戊辰戦争において、小松藩は新政府軍に加わり、総勢51人（足軽・小者も含む）が出兵した。小松藩兵は京都で明石藩・小野藩・三日月藩・足守藩などの諸藩兵と合流してともに越後国に出陣し、新潟・長岡・村上などを転戦した（北越戦争）。この中で、戦死者1名・重傷者1名・軽傷者1名を出している。明治2年（1869年）6月、版籍奉還にともない頼紹は藩知事に任命されたが、間もなく病没している。頼明が藩知事を継いだが、明治4年（1871年）7月、廃藩置県によって小松藩は廃止され、小松県となった。小松県は同年のうちに廃され、松山県・石鉄県を経て愛媛県に編入された。明治17年（1884年）、一柳紹念（最後の藩主・頼明の弟）が華族令に伴い子爵に叙せられた。明治期に活躍した小松藩出身者には、黒川通軌（陸軍中将、東宮武官長、男爵）がいる。
2代藩主直治の治世、寛文年間から元禄年間（1661年 - 1704年）にかけて300町歩の新田開発を行った。3代藩主頼徳（直卿）は書の達人で、当時の大名の中でも随一と絶賛されている。享保17年（1732年）の享保の大飢饉では、小松藩でも救済を必要とする「飢人」が住民の4割を超える事態となったが、隣藩の松山藩が多くの餓死者を出したのに対して餓死者は皆無であった。小藩であるがゆえに領内の不作の兆候の把握が早く、対策が立てられたこと、また日頃からの備蓄米が功を奏したことによるものである。その後も天災や飢饉に際し、領民の状況の把握と救済米の支給など、きめ細やかな対応を行っている。18世紀後半には、大規模な逃散や、首謀者の領外追放で幕を閉じた騒動などはあるものの、流血を伴う事件は記録されていない。第7代藩主頼親のもと、享和2年（1802年）には奉行・竹鼻正脩によって藩の学問所「培達校」が設置された。翌享和3年（1803年）には朱子学者・近藤篤山を招聘し、「養正館」と改名している。
庭木としてよく植栽され、庭園などにも植栽される。庭木としては北アメリカ南部でも利用され、クサマキや "buddhist pine"、"fern pine" などと呼ばれる。防火・防風・防音の機能を有する樹種（防火樹・防風樹・防音樹）としても知られる。そのため屋敷林や畑の防風林に用いられる。遠州地方（静岡県浜松市）ではホソバ（細葉）と呼ばれ、防風林・防砂林目的に生垣として利用されてきた。古民家では必ずといっていいほどこの生垣を持っており、子供たちはおやつ感覚でその実を食べ、葉っぱで手裏剣などを作っていた。中国原産で、イヌマキより小型で葉の数が多いラカンマキ var. maki は庭木や生垣として栽培される。果実は、子供が人形、独楽、やじろべえ、おはじき、にした。単にマキともいう。本来は、別にあるマキなる木に対して、それよりも劣るものとして、この種のことをいやしんでつけられた名である。古くはスギ（杉）のことをマキとよんでいたことから、これに対するものとの説、あるいは、紀伊半島や四国地方ではコウヤマキを本槇と呼ぶことから、これに対しての命名とする説もある。ただし、材の使用に関しては、それほど劣るものではない。特に水に強いことから、風呂桶などにも用いられる。沖縄県では、古くから木造住宅の高級建築材として利用されることがあり、国の重要文化財である中村家住宅等にも用いられている。これはイヌマキが強い抗蟻性をもち、住宅の天敵であるシロアリに強いからである。千葉県の県の木に指定されている。