以前は弾薬庫として使用されていたため、敷地内で一部弾薬庫や貯水槽、貯水池などが見ることができる。約半世紀の間一般の利用が制限されたため、照葉樹林の原始風景が広がる。この森を守り、育てるため、「三十世紀の森づくり」を基本テーマに、自然とふれあい観察できる「利用区域」と、環境保護を優先する「保全区域」「保護区域」にゾーン分けして公園整備した。「利用区域」は約48.5 ヘクタール。公園正門前から広がる区域で、森の家や芝生広場などの居心地のよい開放空間を整備。「保全区域」は30 ヘクタール。今ある植生を維持しながら、人が自然にふれあい、親しむ区域。入場できるが、時間と人数が制限される。「保護区域」は70 ヘクタール。基本的に人の立ち入りを禁止し、人間の管理を一切行わない。自然の植生である照葉樹林（常緑広葉樹林）への移り変わりを見守る区域。なお、公園付近には小熊野川があり、ホタルの名所になっている。
ミネルバの進水式のためにアーモリーワンに滞在していたが、地球連合軍の特殊部隊ファントムペインによる、セカンドステージシリーズのMS3機の強奪事件に遭遇する。オーブ連合首長国代表首長カガリとその護衛（アレックス・ディノ）がミネルバへ緊急退避して来た際には、自ら尋問を行う。その後、カガリとアレックスを士官室へ案内する際、冷静さを欠いたカガリが「アスラン」と本名で呼んでしまった事をきっかけに彼の正体に気付く。ザフト軍脱走兵によるユニウスセブン落下事件の際には、ミネルバが地球へ降下するまでの宇宙空域において、ステラのガイアと互角の交戦をする。ミネルバの地球降下後、FAITH待遇で復隊したアスランがミネルバ乗員に加わると、英雄視されている事に重ねて挑発的に接する事もあったこれまでの態度から一変、好意的に接するようになる。その真意はアークエンジェル一向の介入に疑念を抱き真意を問いただしに行きたいとタリア・グラディスに進言したアスランを尾行した頃に判明し、そのタリアから命じられていたアスランの監視任務によるものだった。とはいえ、「スパイ容疑ではない」とタリアは言うものの、録画（撮影）しながら聞いていたアスランとキラ・ヤマトの会話の中で、現在プラントにいるラクスは偽者で本物のラクスはコーディネイターにより暗殺されかけたという話に関しては告げられなかった。そんなアスランが気遣ってきたキラが駆るフリーダムとの交戦でセイバーを破壊され、トップエリートとしてもMSパイロットとしても権威を失い徐々にミネルバ艦内で孤立を深めると、自分も愛機を失い骨折ほか大怪我の身でありながら「優し過ぎるんです。そういうところも好きですけど…損ですよ」と励まし、むしろアスランの理念や行動に理解を示した。しかし、ジブラルタル基地でアスランがグフイグナイテッドを奪取して脱走、追撃したシンとレイの二人によって撃墜されるという事件が起こると、妹のメイリンも一緒だったと知らされ、彼女を懐柔させ機密情報を盗んでいたとする保安部の見解（デュランダルの謀略）を信じ、妹を失って辛い現実に号泣するルナマリアはアスランへの誤解を強めていくが、この時アスランを追い詰めるのにデュランダルが用意していた物は、非情にもルナマリアがタリアに提出した尾行時の写真だった。一方、命令ゆえにアスランとメイリンを手にかけたが、激しい自責の念に苛まれながらも自分を気遣ってくれるシンとの距離を急激に縮めていく。オペレーション・ラグナロクからはインパルスの専属パイロットに昇格。出撃前にはシンと想いを重ねて口付けを交わし結束を深め、レイも含めた3人で全てのデストロイを撃破。オペレーション・フューリーでは、あと一息というところで撃墜する事が出来ずジブリールの逃亡を許し悔いが残った。作戦終了後、カガリの演説中に突然始まった現ラクス＝偽物（ミーア）との真偽を問う一幕を見たが、それでも以前と同様に真相について言及する事はしなかった（できなかった）。レクイエム攻防戦では陽動の本隊と分かれた単機潜入を担当。コントロール室を砲撃し制圧に成功する戦果を上げた。デスティニープラン宣言後に司令部からシンとレイへの異動が命じられる頃になると、一人グラディス隊に残る形となったままオーブ・クライン派同盟勢力との戦闘が始まる。戦乱の中でエターナル艦内から死んだはずのメイリンの呼びかけが届き驚愕するが、妹からの説得をもってしても三度受け入れる事が出来ないまま戦闘を継続し、インフィニットジャスティスに搭乗するアスランに攻撃を仕掛けるが一蹴されてしまう。そこへ助けに入ったシンのデスティニーに一時は歓喜するも2人の争いを見る内に迷いが生まれ、最終的には身を挺して仲裁。アスラン側の不殺によるデスティニーの破壊で決着となり月面に落下した機体を追い、気絶していたシンを介抱しながら戦局の結末を見届けた。「FINAL PLUS 選ばれた未来」と「スペシャルエディション完結編 自由の代償」では停戦直後に2人を気遣い戻ってきたアスランとの対面が追加され、新規エピローグではメイリンも含めてキラやラクスとも遺恨なく接し関係の修復を見せた。なお、後者では更なる後日談が描かれ、オーブで暮らさずにシンと共に引き続きザフト（プラント）に所属する道を選んでいた（ちなみに、この時は愛用の改造軍服ではなく、本来の正装であるズボンと制帽によるザフトレッド服を着用していた）。「機動戦士ガンダムSEED DESTINY HDリマスター Blu-ray BOX3」初回限定版に、特典として封入された両澤千晶書き下ろしの新作ドラマCD「OMAKE quarters Vol.3」では、ユニウス戦役の停戦後にザフトも階級制を導入することになったため、ルナマリアは少尉となっているほか、シンと共にオーブ軍に交流出向しており、オーブ軍大佐であるムウが2人を預かっている。ほか、「機動戦士ガンダムSEED DESTINY HDリマスター Blu-ray BOX4」初回限定版に、特典として封入されたドラマCD「OMAKE quarters Vol.4」では、ルナマリアとシンが「現在進められてる新たな安全保障の枠組み」の交流出向プログラムに志願したことにより、オーブ軍に交流出向することになったことが明らかにされている。『スーパーロボット大戦』シリーズではシンとの親密関係がより濃くなっている。特に『UX』では担当声優の坂本真綾がシンの担当声優である鈴村健一と結婚した事もあり、彼女が結婚報告の際に使った台詞がゲーム中で使用されている。