ブラック・ホーク酋長がいたのは白人が「ブリティッシュ・バンド」と呼んでいた集団で、彼らは4月5日にミシシッピ川を渡った時点で、約500名の戦士と1,000名の老人、女性、子供であった。これにはソーク族、フォックス族およびキカプー族が加わっていた。彼らはアイオワ川との合流点近くでミシシッピ川を越え、続いて北東のロック川に沿って行った。ソークヌクの廃墟を過ぎ、ソーク族&ホーチャンク族（ウィンネバーゴ族）の呪い師ワボキエシエク（ホワイト・クラウド）のいる集落へ向かった。
1832年4月16日、イリノイ州知事は志願兵5個連隊をベアズタウンに終結させ、「命令」に従わないブラック・ホークたちソーク族の一派をイリノイから追い出すために北へ向かうよう宣言を発した。結果的にはアメリカ陸軍の3分の1が関わる事になったが、イリノイ州民兵9,000名がアメリカ軍の主要な構成員であった。5月9日、イリノイ州民兵の小さな大隊がディクソンのロック川にある軍隊の集合地点からブラック・ホークの追跡を開始したのが「ブラック・ホーク戦争」の最初の戦闘となった。最初の戦闘のあとは、幾つかの小さな小競り合いや「虐殺」が続いた。これらの小競り合いの後で、知事はさらに4,000名の民兵隊の徴兵を行った。5月27日と28日、最初に集めた民兵の1ヶ月の徴兵期間が終り、除隊となった。連邦政府はウィンフィールド・スコット将軍の1,000名の正規兵と300名の騎馬志願兵を作戦に加わらせた。この作戦の指揮官アトキンソンの役割は間もなく終わるものと見えたとき、コレラがアメリカ軍を襲った。ウィンフィールド・スコットの軍隊が東部からイリノイに持ち込んだものだった。スコット将軍はアメリカ軍正規兵約1,000名を集めた。ニューヨーク州バッファローから船に乗ってシカゴへ向かった。コレラの元はその軍隊の中にあったという記録がある。遠征隊は悪い運命にあった。病気が発生し多くの者が死んだ。兵士が上陸した場所では病原菌が残され、兵士は逃亡した。遠征隊が通り過ぎる町の人々に感染が広まることを防ぐ処置が採られ、最初の患者が出た所で3名の市民が死んだだけで留められた。しかし、1833年にも大規模のコレラ感染が合衆国中に起こった。その根源はスコット遠征隊に遡ると考えられた。遠征隊がシカゴに上陸した時、戦闘可能な兵士は200名に満たなかった。スコットは戦場へ向かう作戦を中止する必要性を感じた。その代わりに援軍と物資を待ち、病気に罹った兵士の面倒を見ることにした。スコットは戦場への到着が遅れたが、平和交渉の草案作りでは重要な役割を果たした。
マンスフェルトで生まれた。父親は床屋医者であった。ハレ大学、ベルリン大学で医学を在学中に学び、在学中にキノコに関する論文を書いた。在学中にうつ病にかかり、自殺を試み、名誉のために決闘を行い、相手はその傷がもとで死亡した。ユングフーンは姿をくらまして陸軍の軍医になったが、発見され、10年間の禁固刑を言い渡された。1833年の8月に脱走し、北アフリカのフランスの外人部隊に所属するが、健康の問題で解雇された。パリでオランダの植物学者、クリスティアーン・ヘンドリク・ペルズーンと知り合い、オランダ植民地軍の軍医としてオランダ領東インドに行く事を勧められ、ユングフーンはその助言に従った。1835年の夏にヨーロッパを発ち、ジャカルタに10月に到着した。ジャワ島に住み、地形や民族学を研究し、1837年にバンドゥンの南の直径500mの火山クレーター湖、カワプティ・クレーター（Kawah Putih crater）を発見した。多くの科学探検の成果や、その分析を発表した。ジャワ島の火山に関する研究を行い、"Bijdragen tot de geschiedenis der vulkanen in den Indischen Archipel" (「インド諸島の火山の歴史試論」1843)を出版した。1845年の著書、"Die Topographischen und Naturwissenschaftlichen Reisen durch Java"（「ジャワの地形学と科学的調査旅行」）やスマトラ島の最初の民俗学、地形学の研究書である、"Die Bättalander auf Sumatra"を執筆した。1849年に健康上の理由でオランダに戻り、1850年に結婚し、息子が生まれた。オランダ滞在中に1850年から4巻の"Java, deszelfs gedaante, bekleeding en inwendige struktuur"（「ジャワ、その地形、植生、地質構造」）を執筆し、これはドイツ語に翻訳された。熱心な博愛主義、社会主義者であった。1853年から1855年の間に、オランダで自由主義的な文書"Lichten Schaduwbeelden uit de Binnenlanden van Java"（「ジャワ内部の光と影」）を発表した。植民地での社会主義を擁護し、ジャワの人々をキリスト教やイスラム教に改宗させることを厳しく批判した。汎神論を擁護するこの書籍はオーストリアなどで出版禁止となった。健康が回復すると1855年にジャワに戻り、植物学とその実用面への興味をもった。マラリアの治療におけるキナノキの効果に関してボイテンゾルグの植物園の園芸家、ヨハネス・エリアス・テイスマン（Johannes Elias Teijsmann）やユストゥス・カール・ハッスカール（J.C. Hasskarl）と厳しい論争と論争を行った。この論争は公開や"Het Natuurkundig Genootschap"紙上の公開書簡で行われ、ユングフーンの監督で、ジャワで大規模なキナノキの栽培が行われた。へゴ科 の種、Cyathea junghuhniana や ウツボカズラ科の種、Nepenthes junghuhniiなどに献名されている。