2010年9月24日から2011年5月6日まで、『とある“ラジオ”の超電磁砲』と同じHiBiKi Radio Stationで配信された。全32回。パーソナリティは、第1期に引き続きインデックス役の井口裕香、御坂美琴役の佐藤利奈。略称は1期と同様に「とあラジ」または「とあラジII」。主な内容は、第1期と同様。第30回（2011年4月22日配信分）にて、5月6日の第32回で番組を終了することが発表され、第32回（5月6日）の配信で最終回を迎えた。
2008年9月19日から2009年5月1日まで、ジェネオンエンタテインメント→ジェネオン・ユニバーサル・エンターテイメント RONDO ROBE サイト内のアニメ『とある魔術の禁書目録』公式サイトで、毎週金曜日に更新された。全32回。ラジオ中のBGMはアニメラジオでは珍しく作中BGMではなく、ACIDのフリー素材（サンプリングループ）を編集したものが使われている。パーソナリティは、インデックス役の井口裕香、御坂美琴役の佐藤利奈。略称は「とあラジ」。主な内容は、コーナーを中心としたトーク、メールの紹介などの他、原作小説、コミックス、テレビアニメなど作品展開のプロモーションおよび最新情報の提供など。また番組中、主題歌やキャラクターソングといった楽曲が1曲流される。番組の提供読みは、オープニングで井口、エンディングで佐藤がそれぞれ担当し、使用されるジングルは1つで固定されている。第29回（2009年4月10日配信）にて、第32回の配信を以って番組が終了することが発表された。これにより、第32回（2009年5月1日）の配信で最終回を迎えた。2009年1月から、配信ファイルフォーマットがwmaからwmvに変更になり、要求されるマシンスペックが上がった。
CFNJ聖書学院（クライスト・フォー・ザ・ネイションズ・ジャパン・せいしょがくいん）は、1985年に、チャールズ・グリコとダイアン・グリコによって、「アジアのためのキリスト聖書学校（Christ For Asia Bible School）」として創立された、北海道石狩市花川北6条5丁目157にある聖書学校である。クライスト・フォー・ザ・ネイションズから公式参入を認められ、1994年に現在の名前を受けた。
マウルス・セルウィウス・ホノラトゥスは、モラ・サルサのことを「ピウス」（おそらくこの場合は「敬意をもって支度された」）や「カクタス」（「純粋な儀式」）と表現した。モラ・サルサは供犠には必須のものであり、「モラ (mola) に乗せる」（ラテン語で immolare）が転じて、「いけにえにする」という意味を持った。英語での「immolation」である。モラ・サルサの使用は、サビニ人であり、ローマ2代目の王であるヌマ・ポンピリウスの時代に始まった宗教的伝統の中でも、最も有名なものの一つである。ウェスタの聖職者たちは、「ウェスタリア」中にモラ・サルサを作る。「ウェスタリア」は火床の女神ウェスタを祭る重要な催しで、6月7日から15日まで彼女を祝って行われた。
古代ローマの宗教におけるモラ・サルサ (Mola salsa) は、粗く挽いたエンマー小麦(en)と塩を混ぜ合わせたもの。ウェスタの処女たちによって調製され、あらゆる公的な儀式で生贄に用いられた。生贄にされる動物の額や角の間に振り掛けられたり、供物台の聖なる炎に投じられたりした。家内安全を願うためであり、たいへんよく用いられた。
遺伝子間に相互作用がある場合、自然選択は常に遺伝子座の連鎖を強めるか、または同じ連鎖関係を維持する傾向のあることを最初に数学的に証明した。そして、ゲノムあたりの平均組換え率は、ふつう下等な生物よりも高等生物で低いことを発見し、これは自然選択が相互作用のある遺伝子間の連鎖を強くすることによるという提案を行った。Hox遺伝子、免疫グロブリン遺伝子、ヒストン遺伝子など相互作用をもつ多くの遺伝子は長期間にわたって遺伝子クラスターとして存在することが最近の分子データから分かっている。これも相互作用をもつ遺伝子間の連鎖の維持の法則によって説明することができる。有害な突然変異は、R. A. フィッシャーの理論とは異なって、集団の大きさが有限である場合、Y染色体や重複遺伝子に多く蓄積することを証明した。1969年には、アミノ酸置換、遺伝子重複、遺伝子機能の消失の速度を考慮して、高等生物は多くの重複遺伝子と機能を持たない遺伝子（現在では偽遺伝子と呼ばれる）をもつことを予測した。この予測は長い間忘れられていたが、1980-2000年になって多くの多重遺伝子族や偽遺伝子が発見され、その正しさが証明された。1970年代初めには、新たな遺伝距離の尺度（根井の距離）を考案し、集団や近縁種の進化的関係の研究の用いることを提唱した。この距離尺度は、分子集団遺伝学と分子生態学の分野では今でも広く用いられている。後に、系統樹のトポロジーを得るのに適した、DA距離という遺伝距離尺度も考案した。また、GST尺度を用いてどのような交配様式でも集団分化の程度を計ることのできる統計量を考案した。1975年、共同研究者とともに、集団のびん首効果による遺伝的変異の数式化を行い、びん首効果の生物学的意味を明らかにした。また、1979年、制限酵素を用いた遺伝的変異の研究に用いられる数学的理論を考案した。丸山毅夫とChung-I Wuとの共同研究で、2つの隔離集団の遺伝子間の不適合性のさまざまなモデルを用いて種分化の進化理論を考案した。このモデルにはまだ異論があるが、cis-調節エレメントと転写因子の共進化に当てはまると考えられる。