2016年1月29日、45型駆逐艦は2基の発電機の容量不足から頻繁に艦全体の停電が発生しており、6隻すべてが機関に何らかの問題を抱えているということが報じられた。これに対し改善案として新規に3基目のエンジンを追加する予定であるが大規模かつ高額な工事となることから改修工事は2019年からとなる見込みである。2016年6月7日に開催された英議会国防委員会において、ロールス・ロイスやBAEシステムズの幹部は「当初要求された条件よりはるかに過酷な状況での運用を強いられた」と主張。温度の高い環境をシステムが認識できず、タービンの発電能力が追い付かなくなってすべての電力が失われたと述べた。一方英国防相の広報は、「45型駆逐艦は亜北極帯から熱帯環境まで、世界中で運航できる設計になっている。ペルシャ湾でも南大西洋でも1年を通して安定的に運航し続けている」と強調した。2017年3月、電力問題を解決するための電力改善プロジェクトの契約が2018年に授与される予定であることを国防省の議会下院秘書が述べた。また、船の船体を切断し、追加のディーゼル発電容量を合わせるこの計画はプロジェクトネイピアとされていることも明らかとなった。改修には280万ポンドの費用が掛かるという。問題の原因はノースロップ・グラマン製のインタークーラーの信頼性問題にあり、これにより一時的に推進力だけでなく、兵器、航行システムなどの発電を一時的に無効にし時折ほぼ完全な艦の停電を引き起こしていたとされた。2015年の時点で国防省は船舶がこの問題を経験していたことを認識していたという。2017年2月、デイリー・テレグラフは45型駆逐艦の水中放射雑音が激しく、100マイル先のロシア海軍の潜水艦にも聞こえるほどだと報道した。これは冷戦終結以来、騒音防止について無視してきた結果だという。
「聞くだけで今日がビビビとわかる情報バラエティ」と銘打って、2015年3月30日から、全曜日の放送開始時間を15:30に変更。月曜日には18:00（2015年10月26日以降は17:54）、火曜日から金曜日までは基本として17:43まで本編を放送するようになった。この時の番組改編では、前年度に毎週金曜日の16:00 - 17:46で通年放送を実施していた『松井愛のすこ〜し愛して♥』（第1期の水曜レギュラーで毎日放送アナウンサーの松井愛がパーソナリティを務める生ワイド番組）を、平日の帯番組にリニューアル。当番組と放送枠を交換する格好で、放送時間を毎週月 -  金曜日の10:30 - 12:30に変更している。当番組では、同年3月9日からFacebook上に公式アカウントを開設するとともに、第1期で使用してきた番組のロゴをマイナーチェンジ（書体はそのままで背景や配色を変更）。また、放送当日（金曜日は放送週全般）のニュースを振り返る情報コーナー「知ってええなぁ! ちなみNEWS」を15時台、日替わりの特集コーナーを16時台と17時台に組み込んだ。その一方で、第1期に使用していた留守番電話を廃止したほか、特集の内容を第1期から一新している（詳細後述）。また、金村義明と坪田信貴（坪田塾塾長・「ビリギャル」の著者）を新たな曜日パートナーに起用。第1期の曜日パートナーについても、出演曜日を変更したり、第1期に続いて週替わりパートナー制を採用する金曜日へ交互に出演させたりしている。なお、2015年11月3日に長居公園で開かれた「MBSラジオ秋まつり2015」では、番組グッズの製作費増額を賭けた（『子守康範　朝からてんコモリ!』『ありがとう浜村淳です』を含む）平日生ワイド5番組の対抗企画に優勝。この結果を基に、「数量限定の番組グッズ」として、新たにネックウォーマーを製作している。2017年1月16日（月曜日）に、第1期本放送開始からの通算放送回数が2,000回に到達。同月10日（火曜日）の本番前に大阪市内で開かれた今宮戎神社（同市浪速区）の宝恵駕籠（ほえかご）行列では、MBSラジオの番組出演者を代表して、「MBSラジオ　ええなぁ!祝2000回」と記された提灯付きの宝恵駕籠に上泉が搭乗した。放送開始10年目を迎える2018年には、上泉と坪田による対談企画やリスナーからのメッセージなどを盛り込んだ初めての番組本「上泉雄一のええなあBOOK〜人生100年時代の受験と勉強〜」を、6月18日に西日本出版社から刊行。7月14日（土曜日）には、同書の刊行を兼ねた本編初の公開収録と、上泉・坪田によるサイン会を毎日放送の本社で実施した（同年8月13日の『MBSマンデースペシャル』で公開収録のダイジェストを『ええなぁBOOK発売記念～ビリギャル坪田と東大佐藤ママ平成最後の夏期講座～』として放送）。ただし、坪田は自身の意向で、同年9月25日（火曜日）放送分を最後に当番組へのレギュラー出演を終えた（後任は学研グループ地理科講師の村瀬哲史）。また、2018年6月中旬からは、毎日放送とNTTレゾナントによる共同プロジェクト（ナビダイヤルを利用したラジオ広告実証実験）に参加。「みんなのCMゴーゴゴー」と称して、リスナーから専用の電話番号を通じて20秒の広告（音声メッセージ）を7月23日（月曜日）まで受け付けたうえで、局内での審査に通過したメッセージを7月9日（月曜日）から8月3日（金曜日）まで毎日17時の時報明けに1件ずつ放送していた。その一方で、「上泉雄一のええなあBOOK」の発売初日（2018年6月18日）には、7:58に大阪府北部地震が発生。毎日放送の本社がある大阪市北区で最大震度6弱（発生時点の地震観測体制下での府内最大震度）を観測するほどの地震であったことを受けて、MBSラジオでは地震発生の直後から、『ありがとう浜村淳です』から当番組までの生ワイド番組を報道特別番組に切り替える措置を講じた。当番組では、藤林温子（2017年10月から月曜日のコーナーにレギュラーで出演する毎日放送アナウンサー）と松井愛による進行の下で、地震関連情報の伝達に特化する内容で放送した。2019年4月改編からは、第1期で全曜日に実施していた留守番電話との連動企画を、「ニッポン全国留守電大賞」というタイトルで月曜日に復活させている。また、平成時代最後の日（同月30日＝火曜日）には、『上泉雄一のええなぁ! 10thアニバーサリー! 感謝を歌おう公開なま〜!』（放送開始10周年を記念した「ちゃぷらステージ」からの公開生放送）を15:00 - 16:50に編成。観覧を希望するリスナーから、抽選で150名を同ステージへ招待した。さらに、リスナーから「ラジオあるある」（ラジオ番組でありがちなこと）に関するメッセージを募ったうえで、金曜日の週替わりパートナーの1人である嘉門タツオが「10周年記念ソング」を制作。当日の放送中に、嘉門によるギターの弾き語りで『明るい未来〜ええなぁ!10周年バージョン〜』として発表された。その一方で、第1期の開始当初から続いていた金曜日のレギュラー放送を、2019年9月27日で終了した。