セガの初参入作品のニンテンドーDSiウェア。2009年3月25日配信開始（要200ポイント）。ゲームの目的は、グラーシア渓谷を再編成したステージを舞台に、レイバーン撃破までのスコアアタックとなっている。本編ではNPCだったカイ、オギ、サリサをプレイヤーキャラクターとして使用する。DSワイヤレスプレイに対応しているが、本DSiウェア同士のみの対応で、本編である『ファンタシースターZERO』との通信は出来ない。また、Wi-Fi通信プレイには対応していないが、DSワイヤレス通信時に最大4人まで遊ぶ事が出来る。
『PSU』と同様敵をオートロックする機能が無いが、Lボタンで敵をロックオンする事が出来る。いわゆるZ注目。後述するように短銃、機関銃はこのまま撃ち続ける事が出来るため、HPの高い中ボスクラスの敵には有効な手段である。また、盾を使っても防御し続けながら隙を見て攻撃する、といった戦法も可能である。ただし仕様上、現在ロックオンしている敵よりも近い敵が現れると自動的にターゲットが移行してしまうためセイバー系などの接近武器でロックオンを多用していると思わぬアクシデントに見舞われることも多い。
『PSU』同様、基本的に時間回復する。回復に関してはソルアトマイザーかアンティ系で完治可能（ソルアトマイザーによる死亡回復は不可能だが）。また、氷の状態異常がいわゆるレバガチャで治療不可能となったため、氷を回復するにはあらかじめメニューを開いておくか、NPCや他プレイヤーに解除してもらったり、凍る瞬間にアンティを掛けなければならない。キャストは再び毒状態にならなくなり、麻痺と感電が統一され、『PSO』の麻痺に近いものとなった。氷に関しては攻撃されれば解除されてしまうため、『PSO』のフリーズトラップや凍結武器のような凶悪さが無くなり、バランスが取られている。複数の状態異常になることが無いため、既存の状態異常が他のプレイヤーの攻撃により上書きされやすくなっており、トラップで状態異常にしても他者に上書きされてしまう事も少なくない（ただし、能力上昇および下降、状態異常は別枠である）。
派手で強力な必殺技を発動するフォトンアーツは、今作ではドロップした武器毎に設定されており、『PSU』のようにレベルは存在せず、任意で入れ替えることもできない。また『PSU』とは異なり近接系の武器以外の射撃武器、法撃武器にもフォトンアーツが用意されている。各武器のカテゴリごとに3種類ずつ割り振られており、レアアイテムでも固定のものから変動するものまであり、フォトンアーツが存在しない武器も存在する。ノーマルアタックもしくはヘビーアタックボタンを押し続けチャージすることによって発動される。チャージ時間は武器により異なるが、チャージ時間を短くするアイテムも存在する。また、一部武器には武器のエレメントとは別に固有の効果を持つものも存在する。
明治元年閏4月には大阪堀江の芝居で奈川七五三助作の忠臣蔵もの『武士鏡忠義の礎』が初演され、明治2年3月には大阪筑後の芝居で同じく奈川七五三助の『仮名手本四十七文字』が初演されている。同じ年の5月には河竹黙阿弥の『名大星国字書筆』が市村座初演された。これは脱盟者・小山田庄左衛門の遊蕩が実はお家の家宝の金の鶏を詮議するためのものであったという筋で、このとき大星由良助を演じたのは後の「劇聖」九代目市川団十郎であった。続けて明治4年には黙阿弥の『四十七石忠箭計』という、討ち入りの一日を十二時に分けて演じる趣向の演目が初演されており、「南部坂の別れ」など実録所や講談で有名な場面がふんだんに取り入れられた。明治6年には「義平拷問」、「山科閑居」、「島原遊興」に今日も演じられる「清水一角」を取り合わせた『忠臣いろは実記』が初演されている。江戸時代までは幕府の禁令により、歌舞伎狂言で実在の人物を扱うときは名前は仮名にする必要があったが、本作では忠臣蔵ものとしては初めて、実在の人物の名前を本名のまま用いている。明治7年には、桜田門外の変を忠臣蔵に仮託して描いた『讐怨（かたきうち）解雪赤穂記』が沢村座で初演されている。明治期の歌舞伎の潮流のひとつは、これまでの歌舞伎の荒唐無稽な所を排して史実をそのまま描く活歴物が台頭してくる事だが、忠臣蔵ものの歌舞伎にも活歴の影響が出ている。前述した明治4年の『四十七石忠箭計』ではすでに九代目市川団十郎が大星由良助を実録風に演じていたが、他の場面では従来の歌舞伎の味を残したものになっておりやや不調和であった。明治23年には『実録忠臣蔵』という、その名の通り実録風の忠臣蔵ものが作られたが、不評であった。ただしこの中の「土屋主税」の場面は後まで残り雁次郎の当たり役となった。明治35年にも活歴物の福地桜痴作『芳哉（かんばやし）義士誉』が初演されているが不評だった。講演には興行主が二の足を踏んでいたのに、活歴好みの団十郎があえて上演したという。大正10年には二代目市川左團次一座の『忠義』が上演され好評を取った。この作品は、イギリスの詩人ジョン・メイスフィールドが膠着した西部戦線における連合軍の指揮を鼓舞する為に忠臣蔵を翻案した『The Faithful』を日本に逆輸入して小山内薫が翻訳したものである。『The Faithful』も再三上演され、『忠義』も築地劇場で再演される等好評であった。昭和3年（1928年）8月には旧ソ連において二代目市川左團次等が史上初の歌舞伎の海外公演が行っており、その時の演目が『仮名手本忠臣蔵』であった。昭和9年には今日でも上演される真山青果の連作『元禄忠臣蔵』の最初の作品である「大石最後の一日」が歌舞伎座で二代目市川左團次により上演されている。