「SL人吉」の機関士と機関助士は国鉄時代のものを復刻させたものを、車掌はレトロ調の制服を、観光列車「ゆふいんの森」「あそぼーい!」号の車掌はホテルの支配人をイメージしたオリジナルの制服を着用する（博多車掌区、門司車掌区、大分車掌センター等の車掌が着用する）。通常の制服と異なり黒のダブルの制服で胸元にそれぞれ、ゆふいんの森・あそぼーい!号オリジナルのロゴが入ったピンバッジを付けている。制帽は省略されている。また、門司港駅では男性駅員・駅長の制服も他の駅とは異なっており、門司港レトロと調和されたデザインの制服となっている。同様のコンセプトで、由布院駅でも駅員・駅長の制服が独自デザインとなっている。客室乗務員、ななつ星in九州の全乗務員のデザインは車両などのデザインも手掛けているドーンデザイン研究所の水戸岡鋭治によるものであり、それぞれ冬服・夏服もある。
2017年度より制服のデザインが、ロウタスインターナショナルのクリエイティブディレクターである嶋﨑隆一郎デザインによるものに変更された。水戸岡はトータルアドバイザーを引き続き担当し、客室乗務員制服は従来のものに生地やポケットなど一部変更が加えられた。同一コンセプトのもと、職域ごとに異なった制服が男女ごとに設定されている。冬服・合服はジャケット・ズボンが紺色から黒となり、胸には「つばめ」のエンブレム、肩に英名の社名が入っている。帽子は従来を踏襲し、男性はドゴール帽、女性はハットタイプとなった。夏服は青のカッターシャツを着用するが、クールビズを踏襲し、ノーネクタイとなった。職域ごとの制服の違いとして、冬服・合服には「ダブルジャケット」と「シングルジャケット」が職域によって使い分けされている。「ダブルジャケット」は駅長、副駅長、新幹線車掌、特急列車車掌が着用する。ダブルジャケットは帽子に赤地のライン、ジャケットの裾・襟の縁取り、およびズボンのサイドラインに金色を配している。「シングルジャケット」は駅員、運転士、在来線普通・快速列車の車掌、ホーム輸送係等が着用する。シングルジャケットには前述の縁取りやラインは省略している。また、乗務員を除く駅員、旅行支店勤務の女性職員には「女性接客用制服」が着用できる。これは、シングルジャケットおよび夏服をベースにしているが、冬服・合服ではネクタイの代わりにスカーフを、夏服ではカッターシャツの上からベストを着用することができる。共通して、ズボンの代わりにスカートを着用する。初代同様に乗務員等ではマジックテープ止めのエンブレムを左肩に取り付ける。従来のデザインから大きく変わり、黒地に金文字の英社名・役職名（和英ともに）を並べたシンプルで小さいものになった。在来線乗務員・指令員では金文字単色のものを使用する。客室乗務員の制服は従来のものをマイナーチェンジし、専用制服を除きデザインが統一された。マイナーチェンジながら、生地の改良、機能性の向上により「これから先も通じる制服」としている。技術系制服も更新され、青ベースの制服から灰色ベースの制服に変更となった。
発足当初は団体用のジョイフルトレインも保有していたが、団体用については1994年までに全廃され、以後は保有していない。団体専用列車には一般の特急形車両や、D&S列車（観光列車）用車両を使用しており、結果的には、ジョイフルトレインと同じような対応が可能となっている。
ワールドトレードセンターの敷地には、1921年から1966年まで「ラジオ・ロウ」と呼ばれる電気部品街が存在していた。1921年にハリー・シュネック（Harry Schneck）がコートランド・ストリートに「シティ・ラジオ」という店をオープンしたのを皮切りに、最終的にこの地には数ブロックにわたって広がる電気部品店の街が形成された。とあるビジネス記者によると、ラジオ・ロウは電子部品流通事業の起源であった。1939年、ニューヨーク万国博覧会の中で、「World Peace through Trade（貿易を通じての世界平和）」をテーマに「ワールドトレードセンター」と名付けられたパビリオンが設置された。第二次世界大戦終結後の1946年、ローワー・マンハッタンに世界的な貿易センターを建設する提案がニューヨーク州議会によって承認され、当時のニューヨーク州知事トマス・E・デューイが建設計画の立案に乗り出したが、1949年になるとこのプロジェクトは頓挫した。1959年、ミッドタウンの繁栄の影で経済的に停滞していたロウアー・マンハッタン地区の再興を望んでいたデイヴィッド・ロックフェラーは、「ダウンタウン・ロウアー・マンハッタン協会 (Downtown Lower Manhattan Association)」を設立し、一旦は頓挫した世界的な貿易センターの建設プロジェクトを復活させた。この計画を実現するため、ロックフェラーはニューヨーク港湾公社に協力を要請した。ニューヨーク港湾公社のエグゼクティブ・ディレクターであるオースティン・トービンはロックフェラーの計画を支持し、貿易センターの建設プロジェクトを強力に推進した。トービンは、このプロジェクトで建設されるものは単なる「世界的な貿易センター（world trade center）」ではなく、「ワールドトレードセンター（the World Trade Center）」という唯一無二の存在であるべきだと述べた。1962年1月までに、トービンはニューヨーク州・ニュージャージー州の両州政府から計画への支持を取り付けることに成功し、一帯を再開発して巨大なオフィスビルを複数作り、貿易関係の企業や公的機関を集積させるという「ワールドトレードセンター・コンプレックス」の建設が正式に認可された。1961年に公開された当初の案では、ワールドトレードセンターはイースト川沿いの敷地に建設されることとなっていたが、最終的にハドソン&マンハッタン鉄道のターミナルがあり、ニュージャージー州との交通が便利なハドソン川沿いのラジオ・ロウ地区が建設用地として選ばれた。ラジオ・ロウに存在する事業者への移転費用の補償として、港湾公社は各事業の存続期間や売り上げの程度にかかわらず、全ての事業者に一律に3000ドルを支払った。1965年3月、敷地がWTCの建設用地として買収され、翌1966年3月からラジオ・ロウの解体工事が開始された。1966年8月、起工式が執り行われ、WTCの建設工事が始まった。