志功が当地栄町に1946年（昭和21年）暮れに居を構えた住居を、愛染苑向いに移築保存展示し2001年（平成13年）より公開しているもので、当時、妻、子供3人の6人で暮らしていた。屋内のアトリエとして使用していた8畳間の板戸には「滝登りの鯉」、「雨に打たれた鯉」を書きなぐったように描いたことから、アトリエは「鯉雨画斎」と名付けられた。また板戸には鯰が、厠（便所）の壁や天井には天女や菩薩などが描かれている。またこの住居には多くの芸術関係者・文化人、地元の住民らが出入りし、志功らと親交を深めたといわれる。なお、この施設には解説員が常駐しており、解説を聞くことができる。
福光町の図書館司書・館長であった石崎俊彦が自分の土地・建物と数多くの棟方志功の作品を福光町に寄贈したことから、1982年（昭和57年）5月1日に開館した記念館で、主に志功が当地に在住中だった期間の作品を展示している。また前庭には、1951年（昭和26年）11月17日に建立された、谷崎潤一郎の文学碑が建つ。愛染苑は、居を構えた家屋に谷崎潤一郎が命名した名前で、良き理解者であり、家族同様の付き合いだった石崎俊彦が土地を貸与したものである。
分館3施設（愛染苑・鯉雨画斎・青花堂）は、2004年（平成16年）に当美術館の分館となった。また、本館と分館・棟方志功資料館は場所が離れている（アクセスの項参照）。
福光町（現 南砺市）出身の日本画家・石崎光瑤の遺族から450点余りの作品が同町に寄贈されたことにより、緑豊かな福光町郊外に「福光町立福光美術館」として建設された美術館である。その後2004年（平成16年）11月1日に、福光町が周辺7町村と合併し南砺市となったため同名称に改称した。石崎のほか、第二次世界大戦末期に福光町へ疎開し、6年半あまりの疎開期間中に多くの作品を残した、版画家の棟方志功の作品を多数収蔵・展示するほか、彫刻・陶芸家の松村秀太郎といった、福光町ゆかりの芸術家による作品を主に収蔵・展示している。2014年（平成26年）6月には展示室や収蔵庫が手狭になったため増築に着手し、2015年（平成27年）6月に増築工事が竣工、同年9月5日に新常設展示室としてオープンした。新常設展示室は355m²でこれまでの展示室の約1.81倍あり、棟方志功と石崎光瑤の専用展示室として使用する。これにより複数の大作をそれぞれ同時に展示できるようになった。またこれまでの展示室はコレクション室として、松村秀太郎を中心に、南砺市ゆかりの作家などの展示室として使用されている。また分館として福光町市街地の一画に「棟方志功記念館 愛染苑（あいぜんえん）」と、棟方志功が居住した家屋「旧棟方志功住居 鯉雨画斎（りうがさい）」、民藝館「青花堂（しょうげどう）」、また愛染苑に隣接して「棟方志功資料館」がある。
竹刀稽古の導入によって直心影流剣術は盛んとなり、藤川近義に始まる藤川派、団野義高（真帆斎）に始まる団野派、男谷信友の男谷派などの多くの分派が生まれた（これらの分派と区別するため、直心影流剣術の正統である長沼家の系統を長沼派と呼ぶ場合もある）。これらの分派の中でも男谷派は、上段の構えを使うことが多い直心影流を、正眼の構えを中心に改めるなど、より竹刀での試合に適した内容に改め、また男谷信友が講武所の頭取であったこともあって、幕末に大いに栄えた。同時期の藤川派も藤川整斎が名人として名高かった。また、長沼派も幕末には門弟2千人と号し、大いに栄えたが、長沼家の最後の伝承者である第15代の長沼称郷（可笑人）が明治初期の廃刀令で伝承を断念した。直心影流は全国に広まり、示現流系の流派が大勢を占める薩摩藩にも伝わった。薩摩藩は示現流系一辺倒だと思われがちが、直心影流が藩校の造士館も含め藩内で大いに稽古されていた。薩摩藩伝の直心影流は長沼国郷の弟子である鈴木藤賢（弥藤次）によって伝えられた。鈴木は元々は幕臣であったが、竹姫が島津氏に輿入れする際に従い、薩摩藩士となった。代々鈴木氏が継承して藩内にも大いに広まり、鈴木家の道場は「鈴木殿の稽古」（すずっどんのけこ）と呼ばれ畏敬されていた。江戸時代後期の坂口兼儔（作市）は名人といわれた。薩摩藩出身の直心影流（真影流）門人には、有馬新七、川路利良、牧野伸顕等がいる。また、薩摩藩での分派に深見有安（休八）の深見流がある。深見有安の養子の深見有正は、二の丸稽古所の師範17人の一人となった。鹿児島には、直心影流の法定を伝える『薩摩影之流』があり、示現流と折衷の形が伝わっている。示現流が、茨城県笠間の発祥であることから、示現流は、直心影流から分派したと見る研究家もいる。