グループステージから参加する16チームに、プレーオフ勝者の22チームとUEFAチャンピオンズリーグ 2016-17・プレーオフ敗者の10チームを加えた合計48チームで争われる。グループステージの組み合わせ抽選会は2016年8月26日に、モナコで行われた。参加する48チームは、2016年のUEFAクラブ係数 によって4ポットに振り分けられる。ただし、同じ協会から複数のチームが参加した場合は同じグループにはならない。また、ウクライナ情勢を受けてロシアとウクライナのクラブは同一グループにはならないように配慮されている。各グループの4チームはホーム・アンド・アウェーの2回戦総当たり戦（各チーム6試合）を実施する。試合は第1節が9月15日、第2節が9月29日、第3節が10月20日、第4節が11月3日、第5節が11月24日、第6節が12月8日に実施される。各グループ1位と2位の合計24チームと、UEFAチャンピオンズリーグ 2016-17・グループステージ3位の8チームを加えた32チームが決勝トーナメントに進出する。グループステージ初出場は、予選を突破したオスマンルスポル、オリンピアコス、サッスオーロにグループステージからの出場となるアスタナ、セルタ・ビーゴ、ダンドーク、ハポエル・ベエルシェバ、コンヤスポル、マインツ05、マンチェスター・ユナイテッド、ニース、サウサンプトン、ゾリャ・ルハーンシクを加えた13チーム。(セルタ・ビーゴとオリンピアコスはUEFAカップ時代にグループステージには出場しており、マンチェスター・ユナイテッドとオリンピアコスはUEFAチャンピオンズリーグのグループステージ3位のチームとして決勝トーナメントに出場している)。また、マッカビ・テルアビブは予選1回戦から勝ち上がりグループステージ出場を達成した。
各サッカー協会のUEFAヨーロッパリーグ 2016-17出場枠は、2010-11シーズンから2014-15シーズンまでの過去5シーズンに実施されたUEFAチャンピオンズリーグおよびUEFAヨーロッパリーグの獲得ポイントを対象としたUEFAランキング2015によって決定された。国内リーグを持たないリヒテンシュタインはカップ戦優勝の1枠のみとなる。また、ジブラルタルもカップ戦優勝の1枠のみとなる。また、2016年5月3日に開催されたUEFA総会において、コソボサッカー連盟の加盟が承認されたが、UEFAライセンスを満たすクラブが無かったため、出場枠は0となった。なお、今シーズンからUEFAリスペクト・フェアプレーランキング上位3協会に与えられるフェアプレー枠（予選1回戦から出場）は廃止されている。
『正倉院文書』、天平20年（748年）4月25日の写書所解（案）申願出家人事などに、右京六条三坊の人「呉金万呂」の名前がある。また『撰解文集』に「呉公員」という名が見える。呉浦（現在の広島県呉市）の開発領主は呉氏であった。
渡来系氏族と思われる呉氏である。この氏族の人物として、奈良時代の医術家・呉粛胡明（ごしゅく こめい）があげられる。呉粛胡明の名前は『続日本紀』養老5年（721年）正月紀に「従五位下呉粛胡明」、神亀元年（724年）5月紀に「従五位下呉粛胡明に姓を御立連と賜う」と記述されている。『姓氏家系大辞典』では、「呉粛」の「呉」は国名を指し、氏は「粛」ではないかと推測している。
呉（くれ、ご）は、日本の姓・氏族の一つ。「伎（くれ）」とも表記されることがあった。呉氏の由来について『姓氏家系大辞典』の説明によると、飛鳥時代から奈良時代後期の日本は、多くの場合中国の南朝と交流していた。その南朝の支配地域が三国呉の故地だったため、「くれ」の音に当てて「呉」の字を使用したとされる。そして、中国から日本に移住してきた氏族であること、その移住者が住んでいたことから生じた地名を氏としたこと、中国に使者として赴いたこと、などの理由から呉という氏がはじまったとされる。
呉（ご）は中華圏の代表的な姓の一つで、2007年の統計によると、中華人民共和国で9番目に多い姓であった。北方語では「ウー」、閩南語では「ゴ」または「ゴー」、広東語では「ン」のように仮名表記されることが多い。発音が近い「武」「伍」などと区別するために、「口に天の呉」と呼ぶことが多い。
1858年、スペイン宣教師2名の処刑を理由として、フランスとスペインはツーラン（ダナン）に軍を派遣した。その後フエの攻略も図るが行き詰まり、コーチシナのサイゴンを本格的に攻撃することになった。1861年にフランスが提示した講和条件を阮朝が拒んだため、さらにビエンホアを占領するなど軍事行動を継続し、軍艦をフエに向かわせた。この結果、ファン・タン・ジャンとラム・ズイ・ヒエップを中心とする使節団がサイゴンに派遣され、1862年6月5日にサイゴン条約が成立した。
国鉄最終年度の1986年（昭和61年）11月1日改正から運行されている種別である。種別カラーは紫。平日の東京発17時台 - 21時台の下りのみで特別快速に代わって運行されている。運行開始当時は東京始発6本・新宿始発3本が設定されていた。東京駅 → 三鷹駅間（通過運転区間）の途中停車駅は神田駅・御茶ノ水駅・四ツ谷駅・新宿駅・中野駅で、三鷹駅から終点・高尾駅までは各駅に停車した。新宿始発の電車は中野駅を通過していた。後に、三鷹駅 → 立川駅間は国分寺駅のみ停車となり、1988年（昭和63年）12月1日に荻窪駅・吉祥寺駅に停車するようになり、現在に至る。2019年3月16日時点では、東京発17時台から21時台までの速達種別として最大で1時間に4本が運行されている。特別快速との違いは、荻窪駅・吉祥寺駅にも停車することである。三鷹駅・国分寺駅・立川駅で快速（各駅停車区間）との接続を行う。一部の通勤快速は豊田駅・高尾駅・相模湖駅・四方津駅のいずれかで特急の通過待ちを行う（ほとんどが大月行または河口湖行、高尾行は東京20:35発〈新宿20:50発〉のみ新宿21:00発特急「あずさ35号」を豊田駅で通過待ちする）。現行ダイヤでは高尾行きが中心に運転されるが、そのほか1時間に1本から2本の割合で、大月行、青梅行、富士急行線河口湖行（後ろ6両大月止まり）、高麗川・武蔵五日市行（青梅線拝島駅で分割）がそれぞれ設定されている。