『続風土記』の引く社伝によれば、和銅6年（713年）10月初亥日に大和国吉野郡西川峰（場所不明）から中雄山の山頂に勧請されたのが創祀という。また同記では、当初は海に面して西向きであったが、往来する船が恭意を表さないと転覆させるなどの神異を示したため、元明天皇（在位：707年-715年）の勅命により海が見えないよう中腹の現在地に移し南向きに改められたという。当社が勧請されたという和銅6年10月初亥日は、伊太祁曽神社が現在地（和歌山市伊太祈曽）へ遷座したと伝える年月日と一致する。『続風土記』では、このことから両社の縁故を指摘している。『古事記』の根の堅州国説話に見えるように、紀伊地方には古くからの信仰があったとされる。その時代、およそ古墳時代中後期（5・6世紀）の対朝鮮外交では紀伊の豪族・紀氏（紀伊国造家）が重要な役割を担ったとされることから、当時紀氏に率いられた海人によってすでに当社は祀られていたとする見方もある。また須佐神社の鎮座地は、古代の紀伊国在田郡（有田郡）須佐郷に属する。この「須佐」の地名については『万葉集』の歌「あぢの住む　渚沙（すさ）の入江の　荒礒松（ありそまつ）　我（あ）を待つ子らは　ただ独りのみ」に見える「渚沙」と同一視する説がある。また当地の中雄山の北端には6・7世紀の岡崎古墳群があり、考古学的に当社との関連が指摘される。
社名に見えるように、当社はスサノオ（素戔嗚尊/須佐之男命）を祀る神社であるとされる。古くは大同元年（806年）に「須佐命神」、貞観元年（859年）に「須佐神」の神名として見えるが、「スサノオ」とは地名「須佐」を冠して「須佐の男」を意味すると考えられている。『古事記』の「根の堅洲国」訪問の段では、大穴牟遅神（大国主）が「須佐能男命の坐します根の堅洲国」に参向するに際して、まず「木国」（紀伊国の古名）を目指したと記載されている。すなわち、紀伊は根の堅洲国（根の国）への入り口として想定されており、根の国に坐す「須佐能男命」と入り口の紀伊の「須佐神」（当社祭神）との関係性が見られる。松前健は、これと当社の海神的性格とを併せ見て、全国に展開するスサノオ信仰の原郷が当社であり、海の彼方の常世国としての根の国から豊穣をもたらすため、時期を定めて来訪するのが本来の神格であろうと推測している（後節「付説」参照）。そのほか『日本書紀』神代紀の宝剣出現段（神代上第8段）第5の一書では、スサノオの御子神として、五十猛命（イソタケル/イタケル）・大屋都比売命（オオヤツヒメ）・抓津姫命（ツマツヒメ）の記載がある。これら3神は紀伊国に木種をもたらした神であるといい、紀伊では「伊太祁曽三神」と総称され、それぞれ伊太祁曽神社（和歌山市伊太祈曽）、大屋都姫神社（和歌山市宇田森）、都麻都比売神社（論社3社）に祀られている。特に伊太祁曽神社と当社との関係は深く、当社の神戸は伊太祁曽神社に隣接してあったとされるほか（後節「歴史」参照）、祭事では伊太祁曽神社の社人の参拝があったといい、室町時代の史料では「伊曽太神ママの末社なり」の記載も見える。当社は古くから漁業の神や船材としての樹木を供給する樹木神として漁猟や航海に携わる紀伊の海人から崇敬を受けたという。また『紀伊続風土記』によれば、近世には剣難除けの神として信仰され、剣難除の神符を授与する古例があったという。
1937年（昭和12年）1月8日に千鳥興業の宗田専務が製作費をもって現れたが、製作過剰による千鳥からの資金ショートはなかなか緩和されなかった。同月、350名のアナキストの大量検挙が行われ、笹井は逮捕されなかったが行方不明となった。同年2月、松竹・日活・新興キネマ・大都映画・マキノトーキーの五社協定を組んで、前年6月設立の「東宝映画配給」をボイコットしようという申し入れをマキノは黙殺した。千鳥興業からの製作資金は6本分でショートした。千鳥興業の財産として、オール・トーキー58本、パート・トーキー2本、サウンド版6本の製作物、撮影所と機材が残った。製作中のマキノ正博（「牧陶六」名義）監督作『遊侠太平記』はマキノ個人資金で製作、中川信夫監督作『旗本五人男 大江戸の鳶』は松山企画部長が東京で配給権を売却し、これを退職金とした。また『瀧の白糸』の譲渡金も従業員の退職金に引き当てた。そのころ京都駅に戻ってきた笹井とマキノとの密談で、同年4月の同社解散を決めた。監督部の久保為義はJ.O.スタヂオへ、松田定次、広瀬五郎、姓丸浩、宮城文夫は永田雅一所長率いる新興キネマ京都撮影所へ、技術部も新興キネマへ移籍したが、大森伊八カメラマンはもともといた映音へ戻った。技芸部（俳優）は、トーキーに通用する役者たちなので引く手はあまたであり、葉山純之輔、大内弘ら大半は新興キネマへ、澤村國太郎、光岡龍三郎、そして第二次入社組の水原洋一、田村邦男、團徳麿、志村喬、大倉千代子、大久保清子らは日活へ行くことになる。同年4月の初めの夕刻、撮影所内の通称「マキノトーキー広場」で解散式を行った。解散式には月形龍之介も現れた。同社の看板を火に投じ、樽酒を飲み干し、『マキノトーキー社歌』を歌った。この時点で『遊侠太平記』は未完成であり、完成後の同年8月5日、日活京都撮影所作品として公開された。マキノは、比佐芳武の書いた吉川英治原作の『恋山彦』の脚本を手に、再び横田更迭後の日活に入社した。松竹から阪東妻三郎を譲り受け、入社第1作として阪東主演で『恋山彦 風雲の巻』を監督、また千恵プロを解散した片岡千恵蔵や元マキノトーキーの志村喬らとミュージカル映画『鴛鴦歌合戦』（1939年）を監督するのはこの後の話である。トーキー設備をもつマキノトーキー撮影所は、「甲陽映画」から独立した今井理輔の「今井映画製作所」となり22本を製作したが、同社も翌1938年（昭和13年）春には解散した。同撮影所はのちに松竹京都撮影所となった。新興キネマに行ったはずの広瀬五郎は今井映画で4本撮っており、東宝京都撮影所に行った中川信夫も1本シナリオを書いている。