特別な治療法はなく、対症療法のみである。アセトアミノフェンは症状の緩和に有効である。治療は、痛み、発熱、かゆみに対する対症療法を行い、患者を支援するものとなる。一部の専門家はアスピリンや非ステロイド性抗炎症薬の使用は、他のフラビウイルス科によるものと同様の出血症候群の危険性が高くなるため、回避を推奨している。さらに、ライ症候群の危険性から、子供に対してはアスピリンの使用は回避されている。2015年の流行以前にはジカウイルスに対する知見は乏しく、特別の治療法は存在しなかった。妊婦に対する助言も、一般的な感染症に対するものと同様に感染を避けることと、感染した場合の治療支援を越えるものではなかった。試験管レベルでは一般的なウイルス感染症と同様にインターフェロンの有効性は知られていたが、人間や動物での試験は行われていなかった。動物実験の結果によれば、リバビリンやファビピラビルなどのヌクレオシド類似体の抗ウイルス薬はジカウイルスに対しても有効であることが予期されているものの、その催奇形性により妊婦への使用が制限される。また、薬剤耐性化の問題を考慮する必要もある。
一部の専門家は、ジカウイルスの拡散に対抗するため、病原体の伝染を阻む遺伝子操作を行ったり、ウイルスの拡散を阻害すると考えられているボルバキアに感染させた蚊を育てて放つことを提案している。
ジカ熱と小頭症の関連する証拠が増加したため、危険情報が出されるケースが発生した。2016年1月15日には、アメリカ疾病予防管理センターから妊婦に対する渡航延期勧告が行われた。対象となったのは、カーボベルデ、カリブ海地域（バルバドス、キュラソー島、ドミニカ共和国、ハイチ、グアドループ、ジャマイカ、プエルトリコ、マルティニーク、セント・マーチン島、アメリカ領ヴァージン諸島）、中央アメリカ（コスタリカ、エルサルバドル、グアテマラ、ホンジュラス、ニカラグア、パナマ）、メキシコ、太平洋諸島（サモア、トンガ、アメリカ領サモア）、南アメリカ（ボリビア、ブラジル、コロンビア、エクアドル、フランス領ギニア、ガイアナ、パラグアイ、スリナム、ベネズエラ）。また、妊娠を予定している女性にも、渡航前に医師との相談を考慮するように示唆している。日本の国立感染症研究所は、「可能な限り妊婦の流行地への渡航は控えた方が良いと考える」とする見解を発表した。
蚊がジカ熱を伝播するため、感染地域の蚊の駆除によって予防効果が発生する。防虫剤、蚊帳、素肌をさらさない衣服、蚊の発生源となる水溜りの除去が対策に含まれる。アメリカ疾病予防管理センターでは、長袖・長ズボンにより露出部を減らす、ディート・ピカリジン・レモンユーカリオイル・エチルブチルアセチルアミノプロピオン酸を含む防虫剤の使用、各種製品の用法を守った使用、日焼け止めは防虫剤の下に塗布する、網戸があるかエアコンの効いた部屋に滞在・就寝する、屋外に面した場所で眠る場合には蚊帳を使用する等の対策を推奨している。さらに蚊の発生を抑える戦略として、水たまりの除去、浄化槽の修理、網戸をドアや窓に付けるなどの対策も勧めている。
他のフラビウイルス科のウイルスと同様に血液感染の可能性があり、感染が発生したいくつかの国では献血者を診断しふるいにかける戦略を構じている。血液感染のケースは、血精液症による1例が報告されている。輸血による感染は、2例報告されている。
ジカウイルスRNAが羊水から検出されたことから、母子感染を引き起こす可能性があるとされていて、小頭症を引き起こすと考えられている。ただし、文献に残る事例は僅かである。2015年11月、ブラジル保健省は北東地域で羊水検査により羊水中にジカウイルスが存在した2件の事例を基に、ジカウイルスと小頭症の関連性について警告を発した。2016年1月5日に発表されたこの2例の胎児に対する超音波所見は、2つのケースがいずれも脳の異なる部分を破壊されることにより小頭症を発症したことを示した。一方の胎児は目に石灰化が生じ、小眼球症を併発していた。ブラジル保健省は、11月に警告したジカウイルスに感染した妊婦と小頭症の関連性について、疑わしいケースが2015年12月12日の段階で少なくとも2400例に達し、乳児29人が死亡していることを明らかにした。2016年4月13日、アメリカ疾病予防管理センターはジカウイルスを小頭症など先天異常の原因だと結論付けた。
しかし、1945年4月26日から27日にかけての深夜、フランスSS突撃大隊第1中隊長ジャン・クレマン＝ラブルデットSS義勇少尉は、自分は戦線の新たな綻びを繕うよう地区防衛司令官から命じられたと大隊長アンリ・フネSS義勇大尉に伝えた。ラブルデットの第1中隊を頼りにしているフネは地区防衛司令官に対し、フランス師団（「シャルルマーニュ」）の生存者たちを分離させず最後まで一緒に戦わせて欲しいと頼み込んだ。しかし、それでもなお地区防衛司令官は第1中隊を要求した。さらに戦況も逼迫していたため、最終的にフネは突撃大隊が数時間の休息を取っている間のみの限定的な作戦を条件に第1中隊の貸与に同意した。ラブルデットは出発の直前に、フネから「血気にはやらず、そしていかなる犠牲を払ってでも約束の時間に帰ってこい」と伝えられた。ラブルデットは「任せてください、大尉」と答えたが、その返事に不吉な予感を覚えたフネはラブルデットの肩を抱いて言った。「部下と一緒に必ず帰ってくるんだ、必ずだぞ、わかったか？」しばしの沈黙の後、ラブルデットは若干ためらいつつ「ご心配なく。私は戻ってきます」と答えた。「よし、また会おう！」と言ったフネに対し、「また会いましょう、大尉！」と答え、握手を交わした後、ラブルデットは第1中隊を連れて夜の闇に消えて行った。