ムスリムの市民の多くは、アル＝アクサー・モスク、岩のドーム、神殿の丘などに逃げた。『ゲスタ・フランコルム』は神殿の丘周辺についてしか述べていないが、次のように殺戮の様を描く。…（われらの兵は）ソロモンの神殿でも殺して斬っていった。神殿ではあまりにも殺した数が多かったので、われらの兵は足首まで血に浸かって歩いた…レーモン・ダジールも神殿の丘周辺についてしか言及していないが、こう書く。ソロモンの神殿でもソロモンの玄関でも、騎馬の兵は膝や手綱まで血に浸かって歩いた。これらは文字通りの描写ではなく、ヨハネの黙示録14章20節からの引用（血が馬のくつわにとどくほどになり…）が含まれている可能性がある。シャルトルのフーシェはボードゥワンとともにエデッサにおり、エルサレム攻囲戦を直接は目にしていないが、神殿の丘での出来事についてこう書く。神殿では1万人が殺された。たしかに、もしそなたがそこにおれば、そなたは我らの足はくるぶしまで殺した者らの血の色になっているのを見たであろう。しかしこれ以上何を語るべきであろう。彼らのだれも生き残らなかった。女も子供も容赦はされなかった。このような神殿の丘での殺戮は、時として市全体の人口の殺戮にまで膨らまされる場合もある。しかし神殿の丘以外での状況については大殺戮についての目撃証言は残っていない。『ゲスタ・フランコルム』によれば命を容赦された者もいたようである。異教徒たちが打ち負かされると、われらの兵は大勢を捕らえた。男も女もおり、彼らの望みに応じて殺したり捕らえたままにしたりした。後に書かれた別の文献では次のようにあり、神殿の丘以外でも殺戮のあったことが示唆されている。（我らの指導者は）すさまじい悪臭のため、サラセン人の死体をすべて外へ捨てるよう命じた。全市が死体で埋め尽くされていたためである。生き残ったサラセン人は死体を市門の出口の前まで引きずり、馬の死体かのように積み上げた。誰も異教徒に対するこのような殺戮を見たことも聞いたこともなかった。死体の山々はピラミッドのように見え、死者の数は神のみぞ知ることであろう。しかしレーモンはエミールと、共にいた者たちについては、アスカロンへ無傷で逃げることを許した。その場にいたレーモン・ダジールも、ダビデの塔に立て篭もっていた者らにレーモンが降伏を薦め、保護したことを書いている。これらの者たちは、司令官イフティハールらとともにアスカロンへ退去することができた。ムスリムの歴史家イブン・アル＝アシールも、エルサレムが陥落し略奪を受けている最中のこの出来事について書いている。ムスリムの一団はミフラブ・ダウード（ダビデの塔）に立て篭もって数日間戦った。彼らは降伏の代わりに命は許された。フランクたちは約束を守り、夜にアスカロンへ出発させた。カイロ・ゲニザの一つは、このときにユダヤ人の住民の一部がイフティハール・アッ＝ダウラらとともにアスカロンへ脱出したことを伝えている。タンクレードは神殿の丘地区を自らの管理下とし、その場のムスリムの命を救ったと主張している。彼はモスクの屋根に逃れたムスリムらの安全を保証するため、持っていた軍旗を彼らに渡したという。しかし、他の十字軍の兵士らが結局彼らを殺すことを止めることはできなかった。
サラザールは連邦上院議員就任から間もなく、ジョージ・W・ブッシュ政権の司法長官候補としてアルバート・ゴンザレスを推薦した。サラザールはゴンザレスの指名承認公聴会においてゴンザレスの支持に回り、議論を引き起こした。2005年5月23日、サラザールはブッシュ大統領が指名した連邦判事の承認手続きに対して議事妨害を行う民主党と、いわゆるニュークリア・オプションの強行採決で議事妨害に対抗しようとする共和党との間の調停を図った。サラザールは民主党中道派と共和党穏健派によって構成された14人の上院議員の中に名を連ね、両党間の妥協を探った。その結果、次のような合意が図られた。(1)民主党は判事指名の承認手続きに関して、「特別な事情」がある場合に限り、議事妨害を継続すること。(2)ブッシュ大統領が指名した連邦判事のうち最も保守的な控訴裁判事3名（ジャニス・ロジャーズ・ブラウン、プリシラ・オーウェン、ウィリアム・プライアー）について、満場の賛成票が投じられること。サラザールは判事指名承認に関する考え方の違いから、コロラド州を基盤とするキリスト教右派フォーカス・オン・ザ・ファミリーとしばしば小規模な論争を引き起こした。2005年、サラザールは自動車やトラックを対象とした企業平均燃料節約基準の厳格化に反対票を投じた。サラザールはその理由として、この立法に関与した環境保護団体の自然保護有権者同盟が作成したメモが、資源の無駄遣いであるためであると述べた。また同年、サラザールはエクソンモービルその他の主要石油企業に与えていた減税を撤廃する修正法案に、反対票を投じた。2006年8月、サラザールはコネチカット州における民主党上院議員予備選挙で、古参議員ジョー・リーバーマンを支持した。だが予備選挙では反イラク戦争を掲げたネッド・ラモントが勝利を収めた。サラザールはその後もリーバーマンの支持を継続し、リーバーマンは無所属候補として本選挙に立候補した。リーバーマンは民主党ラモントおよび共和党アラン・シュレジンガーに大差で勝利した。2006年、サラザールはフロリダ半島のメキシコ湾沖合における石油掘削の限界保護線制定に賛成票を投じた。2007年、地球温暖化対策としての治水プロジェクトをアメリカ陸軍工兵司令部に実施させる法案の審議が連邦上院で行われた。サラザールは民主党員の一部議員とともに、この法案に反対票を投じた。市民団体『賢明な投票プロジェクト』の調査によると、サラザールが2007年に上院で行った環境関連の議決投票において、野生動物を守る会が好ましいと認める側に投じた票は、全体の60パーセントであった。また2007年にサラザールが上院で行った投票のうちアメリカ動物愛護協会が支持する側の票は25パーセントであった。サラザールが2005年から2006年にかけて行った投票のうち、動物基金の支持と適合した票は全体の0パーセントであった。サラザールはブッシュ政権において、環境脆弱地域における耕地回復を目的とした農地保全回復プログラムを支持した。その理由として、当時のコロラド州ではユマ郡やフィリップス郡などにおいて土地の乾燥荒廃が深刻化していたことが挙げられる。自然保護有権者同盟によると、サラザールは第110議会において、自然保護に関する投票の85パーセントが自然保護有権者同盟にとって望ましい側の票であった。そして特に2008年の会期には、保持している票の100パーセントが自然保護有権者同盟にとって望ましい側の票であった。サラザールは内務長官就任のため、2009年1月20日に連邦上院議員を辞任した。