放射能汚染により放棄された無人の首都・東京に、わずかながら生存者がいた。自衛隊特別工科学校の教頭である三島鬼兵の指令を受けた保健係の3人のコッペリオン、成瀬荊、野村タエ子、深作葵は、生存者たちを救うべく東京に潜入し、捜索活動を行うこととなる。なぜ原発が東京に建設されたのか？ それはこれまで原発は地方に押しつけてきたが、エネルギーは自らの手でという世論から推進派と反対派が衝突する中、ついに推進派が勝利した結果であった。その頃、東京では生存者たちに物資を送る謎の組織があり、そのおかげで生存者は生き続けられていた。その送り主は、三ツ星重工の職員かつ原発の主任設計士の司馬博士であった。博士と出会った荊たちは、突如東京上空に現れたB－2ステルス爆撃機を追って空自の府中基地へ向かう。爆撃機に荊は９１式個人携帯型対空誘導弾を命中させて多摩川競艇場に墜落させるが、そこは爆撃機によって密かに使用済みの高レベル放射性廃棄物が遺棄されていた高濃度危険区域であった。高レベル放射性廃棄物の遺棄を行っていたのは、「イエローケーキ」という使用済み核燃料を扱う民間のバックエンド企業だった。放射能で汚染された東京ならばいくら汚染されても問題ないだろうと、海外から使用済み核燃料をかき集めて競艇場に遺棄したのである。ステルス機の乗員たちは超高濃度の放射線で死亡し、一人死のうとしていた司馬博士は荊に助けられ、自衛隊のヘリに救助されて東京を去って行った。
西暦2036年、「コッペリオン」と呼ばれる遺伝子操作により生まれた3人の女子高生が無人の東京を歩いていた。3人は、お台場の原子力発電所で発生したメルトダウンにより死の街と化した東京から生存者を救出するために陸上自衛隊が派遣した、特殊部隊の一員だった。
「コッペリオン」と呼ばれる特殊能力者たちの活躍を描いた、アクション漫画。残留放射能に満ちた無人の廃墟となり、緑に満ちた野生の王国もしくは異界と化した東京都内が主な舞台となっている。また、政治や外交に対する風刺描写が盛り込まれている。2010年9月頃にアニメ化が決定したが、テレビ放送へ至るまでの経緯は複雑なものとなっている。詳細は#テレビアニメを参照。
1976年相転移と素粒子物理での研究に対しヴァルター・ショットキー賞を受賞している。他にもハイデルベルク科学アカデミー会員への選出、1986年マックス・プランク・メダル、2015年ラルス・オンサーガー賞などの受賞、顕彰がある。
トップバッターでは、当番組では宝塚歌劇団 宙組が初めて担当してクリスマスソングメドレーの1曲目として「諸人こぞりて」を披露した。大トリでは、特別企画「後世に歌い継ぎたい日本の名曲」として総勢16名の出演アーティスト（下記参照）が担当して「糸」を披露した。第1夜のステージの最多出演者は嵐と宝塚歌劇団 宙組の真風涼帆であり、それぞれ5曲に参加していた。番組序盤では、番組恒例であるクリスマスソングメドレーが出演アーティストのカバー・コラボレーションで披露された。番組のオープニング前に行われた。番組前半では、作詞家・阿久悠のデビュー50周年の記念と没後10周年という2つの節目の特別企画として阿久が作詞を手掛けた楽曲のうち厳選された6曲を出演アーティストのカバー・コラボレーションで披露された。また、NEWSが番組初の試みで課題を出されて「NEWS×ミュージカル＝NEWSICAL」として自身の楽曲を披露する前に4人で考案されたミュージカルショーを披露した。番組中盤では、嵐がユニバーサル・スタジオ・ジャパンの人気キャラクター・ミニオンとコラボレーションしてクリスマスソングと「愛を叫べ」「Happiness」のクリスマスアレンジバージョンによる4曲のFNS限定のクリスマススペシャルメドレーを披露した。番組後半では、『めちゃ²イケてるッ!』『コード・ブルー』『ブザー・ビート』『明日の約束』『FNS27時間テレビ』『貴族探偵』といったフジテレビに縁のある各番組の楽曲のスペシャルメドレーが披露された。番組終盤では、近藤真彦（ボーカル）がTHE ALFEEの高見沢俊彦（ギター）、TOKIOの城島茂（ギター）、関ジャニ∞の丸山隆平（ベース）、関ジャニ∞の大倉忠義（ドラムス）、NMB48の山本彩（ギター）、番組の音楽監督の武部聡志（キーボード）と番組限定の一夜限りのスペシャルバンドを結成して「ミッドナイト・シャッフル」「ハイティーン・ブギ」の2曲のメドレーを披露された。また、番組の随所で、関ジャニ∞の全メンバー7人がソロで、それぞれ他のアーティストと共演した。横山裕（トランペット）は山崎育三郎と西川貴教との共演で「また逢う日まで」、渋谷すばる（ボーカル）は15名の出演アーティスト（下記参照）との共演で「糸」、村上信五（ピアノ）はNOBUとの共演で「いま、太陽に向かって咲く花」、丸山隆平（ベース）はJUJUとの共演で「いいわけ」、錦戸亮（ギター&ボーカル）と安田章大（ギター）は谷村新司と堀内孝雄との共演で「冬の稲妻」「今はもうだれも」、大倉忠義（ドラムス）は複数の出演アーティスト（下記参照）との共演で結成された近藤真彦 with FNSマッチバンドで「ミッドナイト・シャッフル」「ハイティーン・ブギ」を披露した。さらに、第1夜では関ジャニ∞も含めて、HKT48の指原莉乃、AKB48の渡辺麻友、宝塚歌劇団 宙組の真風涼帆、TOKIOの長瀬智也、乃木坂46の生田絵梨花・白石麻衣、V6の坂本昌行・井ノ原快彦といった各グループだけではなくソロでのパフォーマンスも多い番組構成だった。第1夜では、ジャニーズ事務所からは近藤真彦、TOKIO、KinKi Kids、V6、嵐、NEWS、関ジャニ∞、亀と山Pの8組が出演した。出演アーティストは全54組で、全70曲中36曲がコラボレーション（共演）で披露された。