12月17日、トートグは13回目の哨戒で東シナ海に向かった。ミッドウェー島とサイパン島を経由し、シルバーサイズ (USS Silversides, SS-236) の指揮下で哨戒を行った。1945年1月17日、トートグは北緯31度09分 東経130度29分の地点で第15号輸送艦を発見。トートグは3本の魚雷を発射し、うち1本が命中。トートグは640メートルまで接近してさらに魚雷を発射し、これが止めとなった。1月20日夜、トートグは北緯33度45分 東経128度43分の対馬海峡で9,100メートルの彼方に敵船を発見。相手は月によってシルエットが浮かび上がっており、トートグは敵船に接近して魚雷を2本発射。魚雷は命中し、沈んでいった。日付が1月21日になってすぐにトートグは残骸に接近し、生存者1名を救助。生存者の陳述によれば、この船は特設水雷母艦首里丸（大阪商船、1,857トン）であり、青島から佐世保に向かうところであった。その日の午後、トートグは北緯33度33分 東経129度33分の的山大島近海でタンカーを攻撃すべく護衛艦を避けて接近して四度の攻撃を行い、呉へ回航途中のタンカー瑞雲丸（岡田商船、10,045トン）を撃破した。1月26日には、北緯29度25分 東経136度25分の地点で木造トロール船を浮上砲戦で撃沈した。2月1日、トートグは42日間の行動を終えてミッドウェー島に帰投した。これがトートグの最後の哨戒となった。
6月23日、トートグは12回目の哨戒で本州東岸方面に向かった。7月8日、トートグは北緯41度17分 東経141度30分の地点で商船に魚雷を1本命中させて撃沈。浮上して生存者1名を救助し、生存者の陳述によれば、船名は貨物船松丸（日本海汽船、888トン）と言い、松丸は東京から室蘭に向けて木材を運搬しているところだった。翌9日、トートグは占守島方面に向かいつつあった。釧路南方海上を航行中、水平線上に船を発見。トートグは潜航して様子をうかがったところ、それはサンパンであった。トートグは浮上して5インチ砲を21発発射し、相手の船尾を破壊して炎上させた。トートグは予定を変えて南下し、7月19日に須美寿島近海で東京に向けてヤシ油を輸送中だった小型船を砲撃で撃沈。6名を救助して捕虜とし尋問すると、船名はHokuriu Maruと言った。トートグは翌20日に、鳥島から2マイル離れた海上で捕虜をゴムボートに乗せて解放後西に向かい、8月2日に北緯34度00分 東経136度17分三木崎沖で輸送船団を発見。トートグは730メートルのところにあった貨物船杭寧丸（帝国船舶所有/山下汽船運航、1,922トン/旧伊船フリエリ・コンソリー二）に向けて魚雷を3本発射。まず1本が命中し、目標が見えなくなるぐらいの爆発を起こした。続いて2本目が命中すると、後には一条の黒煙が残るのみであった。トートグは護衛艦からの反撃をかわし、ミッドウェー島へ向かった。この哨戒での戦果は2隻4,300トン（戦後に2,787トン）と前2回と比べると期待はずれなものであった。8月10日、トートグは48日間の行動を終えてミッドウェー島に帰投。アメリカ本土に回航され、ベスレヘム・スチールで2度目のオーバーホールに入った。作業終了後、12月上旬に真珠湾に戻った。
1877年（明治10年）、薩摩藩士族の明治政府に対する不満から西南戦争が勃発した。鹿児島県飯野（1883年以降に宮崎県へ編入）の大河平地区は戦国時代後期より薩摩藩島津氏の領内にあり、大河平地区の壮年の士族らも薩軍に加わっていたのであるが、官軍との戦闘による負傷に伴い帰郷する者が少なくなかった。大河平地区の領主である大河平氏14代隆芳の嫡子鷹丸も戦傷に伴い、鹿児島の本邸ではなく大河平の別邸へ戻って、妻である歌、5歳と3歳の二人の男子、長女（名称・年齢、共に不詳）と次女の英（8歳）、三女の時（7歳）、および生後数ヶ月の乳児と共に在った。その最中、官軍が人吉盆地に及び、薩軍は小林に本営を置きつつ、川内川を挟み対峙する形となる。薩軍は官軍が大河平に入ることを危惧し、鷹丸へ大河平の全村を焼亡するよう命じた。5月4日の戌亥の刻（20時から22時頃）、各村ではちょうど、端午の節句に向けてのちまき造りの最中にあり、また鷹丸と同じく薩軍に参加し戦傷により戻った者も少なくなかったが、鷹丸は従者数人を伴いまずは自らの別邸を焼くと、元屋敷・平木場までの60余村を次々と全焼させた（鍋倉の村のみ、明け方となったために実行されず）。6月13日、飯野越えを守備していた薩軍が敗戦し、参加していた大河平家の臣下の川野通貫・清藤泰助らは大河平へ帰り着くが、彼らは村々の焼亡に関して全く聞かされておらず、灰燼に帰した郷村に驚愕する。特に大河平家の山林・原野・田畑の管理の一切を任されていた川野の憤激甚だしく（以前に材木の盗難のことで鷹丸に叱責されており、宿怨を持っていたともされる）、鷹丸一行を追いかけて、翌日に才谷の陣の岡にて追いついた。すると、清藤が鷹丸の従者一人を斬殺、川野も鷹丸へ斬りかかる。鷹丸はどうにか逃げ遂すと、残る従者一人を連れて鍋倉の親戚の家へと逃げ込んだ。