コリントスを追われたメーデイアは、初めテーバイのヘーラクレースを頼った。そしてヘーラクレースが狂気に憑りつかれて我が子を殺戮しているのを目の当たりにした。ヘーラクレースはイアーソーンが本当に不誠実で、自分を襲った狂気を治してくれるのなら匿おうと言った。そこでメーデイアは英雄を苦しめる狂気を薬草で治癒したが、エウリュステウスがヘーラクレースに別の苦役を強いたため、英雄に保護してもらうことを諦めざるを得なかった。次にメーデイアはアテーナイを訪れた。アテーナイのアイゲウス王は喜んで迎え、メーデイアと結婚した。しかしメーデイアは王宮にやって来たテーセウスを危険視し、排除しようとした。そこで夫にテーセウスに用心するよう言い含めた。アイゲウスは彼が自分の息子だとは気づかずにメーデイアの言葉を信じ、テーセウスをマラトーンの牡牛退治に行かせた。そしてテーセウスが無事に戻って来るとメーデイアは今度は毒殺しようと試みた。しかしアイゲウスがメーデイアから渡された毒薬入りの飲物でテーセウスをもてなそうとしたとき、トロイゼーンに残した自分の剣をテーセウスが献上したので自分の息子だと気づいた。こうして毒殺に失敗したメーデイアは王の息子を殺そうとしたために息子メードスとともにアテーナイを追放された。その後メーデイアはイタリア半島に行き、マルビウム人たちに蛇遣いの術を教えた。テッサリアー地方にも一時滞在し、女神テティスと美しさを競ったが、イードメネウスの審判で敗れたという。さらに、小アジアに達して王と結婚した。この王はアイギオスでメーデイオスの父だともいう。
追放されたイアーソーンとメーデイアはコリントスで幸福に暮らしたが、コリントス王クレオーンに気に入られたイアーソーンは王から娘グラウケーを与えられた。そこでイアーソーンはメーデイアと離婚してグラウケーと結婚したが、激怒したメーデイアは結婚の誓約を立てた神々にイアーソーンの忘恩をなじり、グラウケーに毒を浸したペプロス（あるいは魔法の薬で作った黄金の冠）を贈り、それを着たグラウケーは炎に包まれ、助けようとしたクレオーン王とともに王宮もろとも焼け死んだ。さらにメーデイアは2人の息子であるメルメロスとペレースを殺し、ヘーリオスから授かった有翼の竜の戦車に乗ってアテーナイに逃れた。この復讐劇は後代のエウリーピデースによる脚色であるとも言われる。イアーソーンとメーデイアの間には、7人の息子と7人の娘がいたが、メーデイアが手にかけたのではなく、グラウケーとクレオーンの殺害に憤激したコリントス人たちが、彼らをことごとく捕らえ、石を投げつけて殺したというものである。また、長男のメーデイオスは、イアーソーン同様ペーリオン山のケイローンに養育されていて、難を逃れたともいう。また、復讐劇は起きなかったとする説もある。パウサニアスによるとコリントスはもともとメーデイアの父アイエーテースの出身地であり、アイエーテースが国政を執った時期があったので、コリントス人は王統が途絶えた後にメーデイアを迎え入れた。しかしメーデイアは子供を不死にしようと考えてヘーラー神殿に隠したが、そのことを知ったイアーソーンはコリントスを去ったため、メーデイアもコリントスをシーシュポスに譲って去ったという。
メーデイアはペリアースの娘たちに老いた雄羊を切り刻んで鍋に入れてぐつぐつ煮て、若返らせる所を見せた。姫たちは父親を同じように若返らせようと、ペリアースを切り刻み、鍋に入れてぐつぐつゆでたが、ペリアースは死んでしまった。メーデイアがペリアースを謀計によって殺した後、イオールコスの人々はメーデイアの残酷な仕打ちに怒って追放し、メーデイアはイアーソーンとともにコリントスに向かった。
オウィディウスの『変身物語』によると、イアーソーンは、メーデイアに対して自らの寿命を縮め、年老いた父アイソーンの延命を願い出たが、メーデイアは夫の望みに応じて死期の迫ったアイソーンを魔法の秘薬で若返らせるという不思議な術を行った。
第1楽章はフォーレの音楽でもっとも感覚的な美しさを持ち、その雰囲気は終わりまで持続する。とくに冒頭部分は、フォーレの室内楽作品の中でもとりわけ美しいものの一つに数えられ、丸山によれば、第1楽章の第1主題はフォーレの全室内楽作品中でももっとも官能的に響く。第2楽章は、第1楽章とは対照的に単一性が重んじられている。クライトンによれば、「人間の深い感情が確かな腕に支えられて、高揚された次元で歌われる」。また、拡大されたコーダの見事さも特筆される。丸山は、「（第2楽章に）あふれる悲愁は、フォーレの失われてゆく聴覚を惜しむ気持ちの表れか。この透明な音の果てにひそんだ情感こそ、音楽の至高な領域に根ざすものだ」と称賛している。第3楽章は「明るく、しかし節度を失うことのない、簡潔かつ自由な終曲」（平島）である。内面的な感情を表した二つの楽章のあとに、開放感に満たされた民衆的な楽想が繰り広げられる。この終曲についてクライトンは、速度がモデラートでスケールの大きい先行楽章に見合うようなスケルツォとフィナーレを考えることは明らかに困難であること、第1主題を除くとこの楽章の他の素材はあまり面白くなく、鋭い対照にも欠け、音楽全体をわずかにぼやけたものにしているとして、「すべての批評家の気に入るものではない」と述べる。しかしネクトゥーは、「この終曲における作曲者の見事な手腕は、そのバランス感覚と形式面における創造性の点で、師サン＝サーンスの影響を思わせるが、やがてそれはフォーレの弟子ラヴェルに受け継がれてゆくのである。すべては理にかなって書かれており、作曲者の確かな手応えが感じられる。マルセル・プルーストの言う、《火の神のなせるわざ》なのである。」と擁護している。なお、フォーレはこの楽章の第1主題について、ベートーヴェンの交響曲第9番のフィナーレに似ていることを気にしていたが、この二つの主題に共通性はほとんど見いだせない。クライトンは、現代の人間はむしろセザール・フランクのヴァイオリンソナタを思い出すとしている。