カガミが逮捕された後も、二十面相の模倣犯は後を絶たなかった。アケチは模倣犯を一人ずつしらみつぶしに逮捕していくが、日頃はやる気を見せないアケチが二十面相が絡む事件だけやる気を見せることをコバヤシは疑問に思っていた。ある日、新宿警視庁に二十面相を名乗る人物から「不可能犯罪を解明してみろ」という挑戦状が届き、その直後、三重県の通称・パノラマ島でコモダコーポレーション会長のコモダゲンザブロウとアートプロデューサーのヒトミヒロスケの遺体が発見される。2人は大量のマネキン人形に押し潰されており、遺体発見者で現場監督のツノダ（声 - 松田健一郎）、作業員のキタミ（声 - 竹内良太）、事務員のヒガシコウジの3人は「遺体のあった部屋は密室だった」と証言した。アケチは本来頑丈な鋼材が使われなくてはならない部品が脆いものとなっていること、ある程度の知識があればマネキン人形の倒壊時間を予測できることから部品の発注責任者であるヒガシコウジが犯人であると推理する。ヒガシコウジは「過酷な労働で死に追いやられた友人の家族に謝罪と賠償をするようコモダとヒトミに直談判したところ、代わりにパノラマ島に展示する女体のマネキン人形のモデルとなるよう強要され、さらにその後もコモダらの従業員に対する姿勢が改まらなかったため、殺害した」と自供した。東京に帰還後、アケチはコバヤシとハシバに昔話をする。中学時代、優秀すぎるゆえに孤立していたアケチは自分と同等の頭脳を持つナミコシと友人になった。ナミコシは社会を変革する法則「暗黒星」の算出に熱中しており、アケチもそれを手伝う。「暗黒星」が完成したあかつきにはそこから生み出される二十面相が社会の邪悪なものを排除する予定であった。やがて、アケチは法則に重大な欠陥があることに気が付き、ナミコシに警告するも、ナミコシは自らの法則の正しさを立証するため、自ら二十面相となり、焼身自殺を遂げた。そして、その後、二十面相の模倣犯が次々と出現するようになる。そのとき、アケチは全ての二十面相を逮捕することを決意した。
ある日、コバヤシがアケチの事務所を訪ねると、猫（声 - 日笠陽子）が捨てられていた。コバヤシはアケチ事務所で飼おうと提案するが、アケチは猫が苦手であった。やむなく、コバヤシが他の飼い主を探しに行こうとした矢先、事務所の前で時限爆弾をくくりつけられた影男を発見する。影男は「レンタルビデオ店で会計を済ませた直後に記憶を失い、気がついたらアケチ事務所の前にいた」と話す。影男の時限爆弾はエメラルドと共にベルトで影男にしっかりくくりつけられており、ベルトを無理にはがすと爆発する仕掛けとなっていた。さらに「この子は探偵さんの子です」というメモと共に赤ん坊まで事務所の前に捨てられる。その上、トウキョウ・レボリューションと名乗る集団が階下の消費者金融に立てこもり、事務所から脱出することも不可能になってしまう。アケチたちが思案にくれる中、エメラルドからコバヤシはベルトを解除するキーワードを割り出し、影男からベルトを無事に外すことに成功し、アケチが爆弾を空中に放り投げ、間一髪で事なきを得る。時限爆弾とエメラルドは黒蜥蜴が自分の誕生日を記念してアケチに送ったサプライズだった。さらに赤ん坊の母親も名乗りでて、アケチ事務所に平穏が訪れる。ただし、コバヤシの希望でアケチは苦手な猫と同居することになってしまう。その頃、ナカムラはカガミに接見し「警察とお前のどちらが正しいかわからなくなった」と弱音を吐く。カガミは「オレみたいにならないでください。憧れの先輩のままでいてください」と頭を下げる。
寛文6年（1666年）、旗本・小笠原直経の四男として誕生。延宝6年（1678年）2月18日、4代将軍・徳川家綱に拝謁し、同年12月6日に家督を相続し寄合に列する。天和3年（1683年）閏5月21日小姓組に列し、元禄2年（1689年）2月13日桐間番に移り、同年4月21日小姓に復する。元禄3年（1690年）5月10日大番に列し、元禄9年（1696年）7月4日御小納戸に移り、元禄10年（1697年）閏2月7日大番に復する。同年7月26日、廩米500俵を改め、下野国梁田郡、安蘇郡、都賀郡のうちに采地を賜る。元禄11年（1698年）、5代将軍・徳川綱吉の養女八重姫の水戸徳川家への輿入れの式を承り、時服2領黄金2枚を賜ったのを初め、この後も度々将軍家の姫の輿入式の任にあたる。宝永5年（1708年）12月3日小姓組番士となり、正徳3年（1713年）3月18日次期将軍徳川家継の元服の式を書し、正徳5年（1715年）1月11日徒士頭となり、享保2年（1717年）1月11日目付に転ずる。享保9年（1724年）10月25日、幕臣に流鏑馬、笠懸を師範する任を承り、将軍の台覧の際に時服3領を賜る。また享保11年（1726年）2月2日番士の輩に騎射を師範する任を承り、将軍の台覧の際に時服3領を賜る。これより赤沢小笠原家は代々幕府の騎射師範役となる。享保13年（1728年）、天然痘を罹患した徳川家重の快癒祈願のため、流鏑馬を興行する。享保14年（1729年）9月28日新番の頭に転じ、元文2年（1737年）6月2日徳川家治誕生の際にその礼式を承り、時服2領黄金2枚を賜る。元文3年（1738年）2月21日幕命により流鏑馬を興行し時服2領黄金3枚を賜る。元文4年（1739年）1月11日御槍奉行に転じ、元文5年（1740年）5月23日吹上御所にて、幕臣による騎射を将軍の台覧に供じる。延享2年（1745年）8月7日老齢を理由に職を辞し、寄合に列し、時服3領を賜る。延享3年（1746年）4月5日致仕し、養老の廩米300俵を賜る。延享4年（1747年）死去。享年82。浅草の長徳院に葬られた。