カスタムの初代モデルは外観のフロントグリルがスケルトン構造となり、ヘッドランプも形状を変更され、LEDポジションランプを内蔵。バンパーの形状もスペーシアから変更され、専用デザインアルミホイールを装備した。内装はブラック基調となり、エアコンルーバーリングやインサイドドアハンドルにシルバー加飾が施された。後期型ではフロントグリルにメッキを追加。内装には赤のアクセントが新たに施された。カスタムZはボンネットフードの位置をカスタムよりも高くし、フロントグリルをブラック基調のメッキに変更の上、大型メッキフロントミドルグリルが追加され、フロントバンパーをエアロ形状に変更してLEDイルミネーションを組み込んだフロントフェイスを採用され、LEDフォグランプが装備された。ちなみに、カスタムZのディスチャージヘッドランプは、2代目ワゴンRスティングレーと同じデザインとなっているが、干渉を防ぐ為内部構造が変更されている。内装はカスタム同様ブラック基調だが、アクセントにチタンシルバー加飾が採用されている。カスタムの2代目はフロントメッキグリルが大型化され、ヘッドランプをLED化。内装はブラックを基調に、ピアノブラック・メッキ加飾・シルバー加飾が施された。
初代は外観にボディ同色のフロントグリルが採用され、全てのピラーをブラックアウトしている。2013年8月に追加設定された「レーダーブレーキサポート装着車」ではフロントグリル下部にメッキアクセントが配された。内装はインパネにおいて上面を低くした上下2段構造とし、上部はブラウン、下部を明るめのベージュの2トーンカラーとした。後期型では外観のフロントグリル下部のメッキアクセントが新形状に変更して標準化。内装色はベージュ内装とグレー内装の2種類となり、ボディカラーに応じた設定となった。「T」はフロントグリルが上部に白色LEDのイルミネーションを内蔵したフルメッキタイプとなった。2016年12月の一部仕様変更で、内装色がグレーに替わってカスタム/カスタムZと同じブラック内装が標準設定となり、「X」でホワイト2トーンルーフまたはボディカラーで「クリスタルホワイトパール」を設定した場合でベージュ内装の選択を可能とした。2代目はフロントグリルが新デザインとなり、グレードによりカラード又はメッキとなった。内装色は初代モデルの2016年12月の仕様変更時同様にブラック内装が基本となっているが、新たに赤のアクセントカラーが取り入れられた。また、「HYBRID X」に設定のベージュ内装はホワイト2トーンルーフに加え、モノトーンカラーでも全色選択が可能となった。
2013年8月に衝突被害軽減ブレーキ、誤発進抑制機能、エマージェンシーストップシグナル、ESPの4点が採用され、「レーダーブレーキサポート装着車」として設定された。2015年5月のマイナーチェンジで車線逸脱警報機能、先行車発進お知らせ機能及び軽自動車初採用となるふらつき警報の3点が加わり、セットオプションとして設定された。2017年12月のフルモデルチェンジでハイビームアシストとリアパーキングセンサーを追加、衝突被害軽減ブレーキと誤発進抑制機能が前方に加えて後方にも追加され、これらの装備全てが標準装備化された（オプションで非装着設定が可能だが、この場合「全方位モニター用カメラパッケージ」の装着が不可となる）。この衝突被害軽減ブレーキは導入当初、レーザーレーダー方式の「レーダーブレーキサポート」が用いられていたが、2015年5月のマイナーチェンジで軽自動車で初採用となるステレオカメラ方式の「デュアルカメラブレーキサポート」に変更。2代目は軽自動車では6代目ワゴンR/4代目ワゴンRスティングレーに次いでの採用となる、単眼カメラ+レーザーレーダー方式の「デュアルセンサーブレーキサポート」に再変更。後方では超音波センサー方式の「後退時ブレーキサポート」が用いられている。なお、先代車種のパレットでは廉価グレードを除く全車にサイドエアバッグが標準装備されていたが、初代モデルでは前述の軽量化の都合に伴い非装備となっていた。2代目モデルではフロントシートSRSサイドエアバッグが新たに標準装備され、カスタム「HYBRID XSターボ」はSRSカーテンエアバッグも併せて標準装備された。
シリアスサム2のゲームプレイはプレイヤーが一度に数十の敵を倒すことで殆どが成り立っているため比較的単純なものである。ゲームのストーリーはプレイヤーがチャプターからチャプターへとどのように移動するかの方法と理由を確立している。これはできるだけ多くの敵を殺すためにプレイヤーをある場所から別の場所へと運ぶものとしてストーリーが単に存在し、プロットはプレイヤーが結果に関係なく無視できる単なるメッセージで構成されていたシリーズの過去作からの重要な変更である。シリアスサム２はストーリーをより目立たせてはいるが、未だにできるだけ敵を殺すことに重点を置いている 。ストーリーはゲーム中に散在し特に各惑星の開始と終了時に使われるカットシーンを通じて展開されるプレイヤーは一定数のライフ数と共に始まり、ライフ数はプレイヤーが全体力を失うことができる回数を現している(その後はプレイヤーが最後にセーブしたチェックポイントからすぐに復活する)。他のゲームでしばしば見られるようなより複雑なゲームプレイの仕組みは滅多に無く、遭遇した時でも通常はドアのロック解除または次のステージに進むために鍵・オブジェクトを探すことが求められるなどそれらはかなりシンプルである。プレイヤーが操作する乗り物 (ホバーバイクや円盤など)がシリアスサム2でシリーズに導入された。乗り物にはロケットランチャー、マシンガン、レーザータレットなどの砲塔が搭載されているシリアスサム2の単純化したゲームプレイはシリーズの過去作と同様であるが、シリアスサム2のライフシステムはシリーズの(チェックポイントまたはセーブゲームから何回でも再開することができる)オリジナルゲームからの根本的な変更である 。シリアスサムのXbox版が「ライフシステム」を採用したシリーズ最初のゲームであるが、PC版でこのシステムを実装したのはシリアスサム2が初めてである血とゴア表現は過去作に比べて改善し、ボス以外の全ての敵はバラバラにすることができた 。生きている敵は血と血まみれの肉片に分解することができ、クレアスケルトン(Kleer Skeletons)を除くアンデッドの敵は腐敗した部分と膿まで減らせる一方で、魔法生物の破壊は閃光と紫色のガスで示される。 パワーアップアイテムはゲーム全体に散在しており、特定のオブジェクトを破壊することで入手できる。ハーフライフ2のグラビティガンの効果と同様の方法でプレイヤーは特定のオブジェクトを持ち上げ操作できるが、外部デバイスは必要ない。ゲームではチェーンガンやブラスター、ロケットランチャーを持つ兵士などファーストパーソン・シューティングで見られる様々な敵が登場する一方で、魔女、ぜんまい仕掛けのサイのおもちゃ、ショットガンを持った株式ブローカーのゾンビや自爆するピエロなど奇妙な敵も多く出現する。それぞれのチャプターでは「チャプター特有」の土着の敵も登場する。例えば惑星「Kleer」では飛行するKleerが登場し、東洋設定の惑星「Chi Fang」ではマーシャルアーツゾンビが登場する。 プレイヤーはまた訪れる惑星の各々の原住民である5つのノンプレイヤーキャラクター(NPC)のグループ(The Sirians、the Simbas、Zixies、Chi Che及びElvians)と出会い、彼らはゲームの様々な設定を通してプレーヤーを助ける。