1979年（昭和54年）には日本の中堅自動車メーカーであるマツダと資本提携し、マツダの株式の24.5 %を取得した。マツダにはアジアやオセアニア、またアメリカ向け小型車の開発と生産を委託したほか、「オートラマ」の名で全国にディーラーネットワークを展開し、「レーザー」や「テルスター」、「フェスティバ」など、マツダの工場で生産されたフォードの各モデルや、「マスタング」などのアメリカからの輸入モデルを販売するなど、日本でのフォードビジネスを共同で展開していた。しかし1990年代に入り、バブル崩壊や販売多チャンネル化の失敗などによりマツダの経営状態が悪化したため、1996年（平成8年）にフォードはマツダへの出資比率を33.4 %に引き上げて自社の傘下におき、最高執行責任者のマーク・フィールズ、最高財務責任者のボブ・シャンクス、欧州担当のスティーブン・オデール氏、エンジン開発担当のジョセフ・バカーイなど役員を多数マツダに出向させた（マツダ・マフィア）。その後マツダの経営再建は進んだものの、2000年代後半に経営危機に陥ったフォードは、資金調達のためにマツダへの出資比率を2008年（平成20年）より段階的に引き下げ、2015年（平成27年）までに所有する全てのマツダ株式を売却した。これにより、30年以上続いたマツダとの資本提携は解消された。
太平洋戦争中の1941年（昭和16年）12月から1945年（昭和20年）8月の期間、工場設備は日本政府に接収されたが、戦後の連合国軍の管理を経て1958年（昭和33年）までにフォードに返還された。現在、この一帯（子安地区）はマツダのR&D（研究開発）センターとなっている。また、現在の新横浜地区では、東海道新幹線の計画が発表される以前、「フォードが工場を作るらしい」という触れ込みで土地の売買が盛んに行われていた。
日本への輸出は、日露戦争が終結した1905年（明治38年）に開始された。その後第一次世界大戦の戦勝国かつ世界五大国のひとつとなり、当時のアジア最大の経済大国となり、さらに関東大震災後にバスやタクシーの需要が急増した日本を重視したフォードは、1925年（大正14年）に「日本フォード」を設立した。その後横浜市の子安にアジア初のフォードの製造工場を開設し、フォード・モデルTのノックダウン生産を開始した。1927年（昭和2年）には二代目A型フォード（英語版）の生産を開始し、またローン販売も開始した。フォードは乗用車やトラックを年間1万台生産し、トヨタ自動車、日産自動車、いすゞ自動車を始め、大阪に工場を置いた日本ゼネラル・モータースをしのぐ国内最大の自動車メーカーとなった。また子安工場製のフォード車は日本の友好国である満州国などにも輸出された。しかし、日米間の関係が悪化しつつあった1936年（昭和11年）に、日本政府は自国の自動車産業の保護育成を目的とする「自動車製造事業法」を制定した。この法律により、国内資本が50 %以上の企業のみ自動車製造が許可されることになり、100 %アメリカ資本だったフォードは1940年（昭和15年）に操業停止を余儀なくされる。
フォードはフォード研究・改革センター（Ford Research and Innovation Center）を4カ所、米国ディアボーン、シリコンバレー（パロアルト）、ドイツ・アーヘン、中国上海に開設している。また、開発センターは米国内だけでなく海外で、英国エセックス州（Dunton Technical Centre）、ドイツ・ケルン（Merkenich-Cologne Technical/Design Centre）、オーストラリア・メルボルン（Asia Pacific Product Development Centre）、中国南京および重慶などに持っている。
前身は、株式会社いよてつそごうである。伊予鉄道がターミナル型百貨店計画の受け皿会社として1969年に「伊予鉄百貨店」を設立。提携する百貨店を検討中、当時地方展開を積極的に図ろうとしていた大手百貨店・そごうが適当という判断のもと、「株式会社いよてつそごう」（店名もいよてつそごう）として、そごうグループ5番店、地方進出第二陣として、松山市駅ターミナルビルに、1971年（昭和46年）7月5日に開店した。旧そごうグループで唯一破綻を免れた企業であり、地域との連帯も良かった。以後、地域の中核企業である伊予鉄グループをバックに業績を伸ばし、増床も重ねた。いよてつ高島屋となった今も四国を代表する百貨店である。そごうグループの破綻により2000年（平成12年）12月、そごうとの提携解消。高島屋へ変わる際にそごう時代に計画途中であった拡張工事と観覧車の設置が危ぶまれた。そごうから高島屋に変わる一時期、「ローズナード伊予鉄百貨店」の看板を掲げていた。いよてつそごう時代は毎時59分と正午、午後3時にはいずみたく作曲のテーマソング（当時のCMにも採用）を流していた。2001年（平成13年）6月1日には社名を「株式会社伊予鉄百貨店」（店名はいよてつ百貨店）とした（この時点で伊予鉄道と三菱電機の合弁となる）。新たに高島屋と業務提携し高島屋ハイランドグループに加盟する。同年10月10日には増床オープンした。2002年（平成14年）3月1日に高島屋との資本提携を行い、社名も「株式会社伊予鉄髙島屋」とした。店名は「いよてつ髙島屋」。百貨店店舗は本店のみ。ただし、愛媛県内の各地にサテライト店を有する（いよてつそごう当時から）。サテライト店所在地は四国中央市、新居浜市、西条市、今治市、大洲市、八幡浜市、宇和島市、愛南町である。高知市にもサテライト店が存在していたが2002年（平成14年）8月末で撤退した。本店店舗は伊予鉄道の松山市駅と一体となっており、駅前広場には市内電車駅やバス発着所、タクシー乗り場等がある。店舗面積は43000平米で、売上高と共に四国最大の規模を誇る百貨店である。