ベネディクト16世（在位: 2005年 - 2013年）は前任者と同様、文化や宗教間の対話に高い関心を払った。ある観点からは彼は「インカルチュレーション」という概念から「インターカルチュアラリティ」（文化の相互作用の意、en:Interculturality）に転向しようとするが、後に、信仰のインカルチュレーションは必要であり、「信仰の文化」の特異性および完全性は損なわれないと述べている。
教皇ピウス9世およびピウス10世は微妙にラテン回帰の傾向があったが、ベネディクト15世（在位1914年 - 1922年）は、特に第一次世界大戦により苦しんでいる宣教活動の拡大に関心を持っていた。インカルチュレーションとは、彼にとっては第一に、宣教地域内の聖職者の開発を意味した。1919年11月20日、彼は全世界のカトリック信徒に対し、宣教活動、なかでも脱ヨーロッパ化したカトリック宣教を志向した地域の聖職者開発を訴えた。教皇ピウス11世（在位1922年 - 1939年）は地域の聖職者の開発を促進する前例に倣い、地域の文化はよりよく理解されるようになった。彼はローマで1922年に宣教会議を招集し、毎年、アジア、アフリカ、ラテンアメリカの司教を叙階した。彼の死去時には240の教区と管理区が地域の司教に委ねられていた。
永正5年（1508年）4月、高国が京都に侵攻を開始する。この時、摂津の伊丹元扶や丹波の内藤貞正、河内の畠山尚順らも呼応したために澄元は敗北し、之長や将軍・足利義澄と共に4月9日に山中為俊を頼って近江に逃れた。5月には摂津で抵抗を続けていた池田貞正と芥川信方（薬師寺元一・長忠の弟）が高国軍に討たれてしまう。そして6月、足利義尹が大内義興に擁されて上洛すると、やがて将軍職に復帰した義尹によって澄元の家督は剥奪され、代わって高国の家督継承が承認されることとなった。8月に大和に残った赤沢長経も畠山尚順に討たれた。ところが大内義興と義尹が対立し始めたため、澄元と之長は永正6年（1509年）に京都に侵攻したが、逆に高国と義興の反撃を受けて敗北（如意ヶ嶽の戦い）し澄元と之長は阿波に逃走する。なお、この時の侵攻の失敗について、澄元は阿波からの援軍との挟撃を計画していたものの、澄之→高国を支持していた讃岐の諸氏が阿波への侵攻を図り、阿波勢が動けなかったことが背景にあったという。永正8年（1511年）には義澄、義兄弟の細川政賢（細川典厩家当主）や同族の細川元常（和泉守護）・細川尚春（淡路守護）、更に赤松義村（播磨守護）と連携して深井城を攻め（深井城の合戦）、一方では鷹尾城を攻め（芦屋河原の合戦）、その後京都に侵攻し船岡山合戦となる。しかし船岡山合戦以前に義澄が病死したこともあって、大内義興の反撃を受けて大敗を喫し、政賢は戦死し、澄元は摂津に逃走した。この出兵は祖父・成之や三好之長の反対を押し切って出兵したものらしく、之長が阿波守護家存続を意図して高国陣営に内通しようとした気配があるとする指摘も出されている。もっとも、この出兵の直後に成之と之持が相次いで死去したため、阿波国内で混乱が発生し、澄元と之長は和解して阿波の治安回復や讃岐における主導権回復に乗り出すことになる（なお、馬部隆弘は通説では之持の子とされる細川持隆を澄元の次男と比定し、澄元が之持の没後暫くの間、それまでは成之によって峻別されて澄元が直接関与出来なかった阿波の領国経営に関与せざるを得ず、高国との戦いの低調も澄元が阿波から離れられなかったからとしている）。永正15年（1518年）8月、大内義興が周防に帰国すると、永正16年（1519年）に澄元と之長は摂津に侵攻（田中城の戦い）する。永正17年（1520年）1月に入ると、澄元に呼応して山城で土一揆が発生する。そして、将軍・足利義稙（永正8年（1513年）、義尹より改名）も澄元に通じて裏切ったため、細川高国は単独で近江坂本に逃れた。これにより、澄元政権が成立する。既に高国側に離反していた細川尚春を滅ぼして淡路を手に入れ、阿波・讃岐でも巻き返した澄元は前の2度の出兵では得られなかった四国からの援軍を上陸させる構想を実現させたことが成功の背景にあったとみられる。ところが5月、高国は大軍を集めて京都に侵攻する。これに対して澄元・之長らは兵を集めることができず、之長は等持院の戦いで敗北し捕らえられて自害させられ、澄元も摂津伊丹城に敗走し、政権は短期間で崩壊した。そして失意のうちに病に倒れた澄元は、まもなく高国の攻撃を受けて播磨に逃走し、最終的には永正17年（1520年）6月10日に阿波勝瑞城にて死去した（『応仁後記』『細川系図』『細川両家記』『諸家系図纂』）。享年32。三度にわたる出兵はいずれも失敗に終わったものの、3度目の出兵をきっかけに生じた義尹と高国の不仲や丹波国人の離反が高国の立場を動揺させ、残された嫡男六郎（後の細川晴元）と三好元長（之長の孫）による細川高国政権の打倒につながることになった。