1867年11月までに、路線はサンミシェル駅とスーザ駅、そして路線の覆いの一部を除いて完成していた。バーンズは25人を雇っていた。イギリス人の4人の優れた機関士、6人の機関車整備士、分岐器などを担当する3人の鍛冶職、客貨車を担当する整備士、鍛冶職、その見習いが1人ずつであった。2月21日にはタイムズ紙は5月1日に開通すると報じたが、しかしこれもまた実現しなかった。
11月に開かれた総会では、仕様で第1級の鉄または鍛造の鋼鉄を使うべきとしていた揺動軸についてグインが質の低い鉄を使っており、そのために試運転において軸が壊れたということが株主に報告された。また従輪もきつい曲線に対応することができず、撤去する必要があった。これにより、後ろ側の動輪は追加の軸受けとばねが必要となった。1868年4月17日、タイムズ紙は7両の機関車が車軸を交換したか、またはまもなく交換される見込みであると報じた。
会社は、できるだけすぐに貨物輸送を開始し、さらに10月には旅客輸送も開始したいと見込んで、フランス・イタリア両政府の監督官に9月20日に検査に来るように招請した。これは楽観的に過ぎた。しかし、9月には第3号機関車、グインから納入された最初の機関車を使って非公式試運転が行われ成功した。10月には、ブラッシーは自分が請け負っている現場を巡回していた。彼は12日にモン・スニの現場に試験の成功を期待して到着した。その日は寒く湿った日であった。試験は災難であった。第3号機関車だけでなく他の2両の機関車も、試験の過程で壊れてしまった。ブラッシーは寒く湿った環境で、交換の機関車を待って立ち続けなければならなかった。彼の伝記を書いたヘルプスによれば、ブラッシーはこれで体を冷やしてしまい、結果的に亡くなってしまうことになったという。
この現地検査において、ブログデンとタイラーはフレジュス鉄道トンネルについても検査をしている。前述したブログデンの報告によれば、トンネル工事の進捗は良いとされた。事前に想定されていたよりかなり早く、トンネルは3年で貫通し、4年で開通にこぎつけるだろうとされた。タイラーのトンネルに関する公式報告によれば、7,366メートルが掘削済みで、4,884メートルが残されており、フランス側では硬い石英の層を突破して、より柔らかい片岩の層に戻っていた。トンネルとフランス側の鉄道網をつなぐ連絡はまた別の問題であった。建設は年内にははじまらず、さらに4年の日数が完成までにかかると見込まれた。
1867年2月19日、半年ごとの総会の第2回において、5月までには路線のほとんどの準備ができると株主に説明された。3月4日には、フェルは取締役会に対して、9月に開通すると見込んでいると報告を送った。4月4日には、取締役会に対し機関車の製作が予定よりかなり遅れていると報告された。最初の機関車は5月1日までに使用可能となり、2両目は6月に、さらに残りの機関車はその後1週間に1両のペースで納入されるとされた。また最初の客車は車輪以外は完成しているとされた。
この夏は冷夏であり、例年通りには氷が融けなかった。数日にわたって温かい雨が降り続いた後の9月25日に、アルク川の支流が本流へと岩を押し流し、そこに天然ダムを形成して水がたまった。最終的にこの天然ダムが決壊し、洪水がテルミニヨンからサンミシェルまでの間の50か所に被害をもたらした。ランスブールからスーザまではすべて問題なかった。雪が降りだして工事が中断した12月初頭までには、路盤工事はほぼ完成していた。
1866年9月初め、アビンガー男爵、ブログデン、ヴァランブロサ公爵は工事現場を訪れた。彼らは、工事現場には2,200人が雇われており、路線両端部と高原になっている区間ではレールが敷かれ始めており、第三次イタリア独立戦争の影響で馬が不足しているということを確認した。フランス側では、道路の基礎になっている石がとても大きく、柵を立てるための穴を開けるために発破が必要となっていた。機関車は問題になる可能性があったが、それ以外に開業を遅らせそうに思われるものはなかった。
1863年から1864年にかけて、クロムフォード・アンド・ハイ・ピーク鉄道のホエーリー・ブリッジ近郊の勾配区間において、この鉄道を借り受けていたロンドン・アンド・ノース・ウェスタン鉄道の許可を得て、新しい機関車の試験が行われた。初期の試験は非公開であったが、1月には公開の実験が行われた。12分の1勾配（83.3パーミル）の勾配において、中央の駆動用レールなしでは軽量の機関車は走ることができなかったが、中央レールを用いることで、7トンの貨車4両を牽くことができることが示された。
原は独学で英語、ドイツ語、フランス語、イタリア語、ラテン語を習得していた。南方熊楠はそのような原の才能を認め、研究を支援しようと助力していた。しかし原は南方に「小生よりもまだ世の中のことに疎い人」と評されるほどの世間知らずであったために、十分な資金援助を受けることができなかったとされている。
サメの頭部には小さな穴が点々と開いており、その奥にはゼリー状の物質が詰まった筒状の構造が存在する。これがロレンチーニ器官である。ゼリー状の物質はケラタン硫酸と考えられており、プロトン伝達体である。これにより、100万分の1ボルトという極小の電位差を感知できる。例えば、これで筋肉が発する微弱な電流を感知するなど、食物を探す方法の1つとして利用する。このように敏感な感覚器なので、例えば乾電池などを海中に投入した場合には速やかに放電が起こるが、あまりにも近くで放電されるとサメは驚いて逃げてしまう場合がある。この器官は1700年代後期にイタリアのステファノ・ロレンチーニによって発見され、発見者の名前を取ってロレンチーニ器官と命名された。当時から何らかの感覚器官であろうと言われていたが、その機能が具体的に判明したのは1960年代になってからだった。