太平洋戦争後は読売新聞（戦時中の新聞統制で読売と報知が合併しており、戦後に再分離されるがこの時旧・報知新聞から籍が移されていた）の運動部に記者として勤務し野球評を書いていた が、1947年シーズン途中の6月3日には、球団が成績不振に悩まされていたため、監督に就任することを球団側と合意、同6月6日、大学の後輩である監督の中島治康に配慮し、助監督・技術顧問へ就任した。9月には総監督へ就任し、実質的に指揮権を握った。この年巨人は5位。翌1948年は全試合で三原が指揮をとり2位。1949年に試合中に相手南海ホークスの選手を殴打する事件（三原ポカリ事件）を起こし無期限の出場停止処分に処される。後に救済運動があり出場停止100日に減じられ、同年7月23日より復帰（三原が出場停止の間、チームの指揮は監督の中島がとった）。三原の離脱があったもののチームは優勝を果たした（巨人の太平洋戦争後初優勝であり、日本野球連盟リーグ最後の優勝）。1949年には水原がシベリア抑留から復帰し、ファンや選手から水原のプレーを期待する声が高まった。しかし、総監督の三原は水原を起用することはなかった。だが水原は巨人の功労者であると、チーム内から批判が起きた。シーズン終了後に、巨人選手たちが三原を排斥して水原を擁立しようとするいわゆる「三原監督排斥騒動」が起きる。球団はこれをみて「総監督・三原、監督・水原」の人事を発表し、セントラル・リーグへ加盟した1950年より指揮権は水原が握ることになった。監督に就任した水原は、このとき、三原の監督交代には否定的だったが、一方で「三原君は副代表にどうですか。とにかく僕に監督ということなら、一本でやらせてください。」とも球団に提案している。総監督になった三原には球団から仕事が与えられることはなく、退屈しのぎに日がな碁を打つ日々をすごしていた。
1934年6月6日に契約選手第1号として、同年12月26日に正式発足する大日本東京野球倶楽部へ入団しプロ入り。1935年1月に入営のため退団した が、日本初のプロリーグである日本職業野球連盟（1939年より日本野球連盟）が発足した1936年の9月に後身である東京巨人軍へ選手兼助監督として復帰。俊足・堅守の選手だったが、応召で脚を負傷したこともあって1938年にわずか実働3年で現役引退。この間、1937年の連盟選手権試合（当時は前後期制で、前期と後期の優勝チームが年度王者をかけて対戦）対大阪タイガース戦の終了後に、判定に不満をもった監督の藤本定義と共に審判室へ抗議に入り、三原がバットを持っていたために連盟から出場停止処分と罰金が課された。引退後は報知新聞で記者として活動したが、応召しビルマ戦線で従軍した。
大地主の末っ子として何不自由なく育った。香川県立丸亀中学校で野球にのめり込み、官吏になることを望んだ父親の意向で香川県立高松中学校に転校させられたが、高松中の校長は文武両道を推進しており、野球部入部を条件に転入を認めた。高松中では遊撃手として投手の梶原英夫（のち東京帝大）らと共に第14回全国中等学校優勝野球大会（夏の甲子園）へ出場し、準決勝まで進出したが雨天コールドで敗退した。野球部のマネージャーを務めたのが後に日本社会党委員長となった成田知巳だった。卒業後、第四高等学校を受験するが、中学の先輩（水原義明）がいた早稲田大学にスカウトされ入学。野球部では1年生時から二塁手として活躍する。特に1931年春季の早慶戦2回戦で、投手・水原茂を相手に敢行した勝ち越しホームスチールは、早慶戦史に名を残している。リーグ通算67試合出場、231打数68安打、打率.294。しかし1933年、結婚を機に野球部を退部（当時早大野球部では、学生結婚は好ましく思われていなかった）、大学を中退し帰郷してしまう。故郷ではぶらぶらしていたが、大学時代の仲間に誘われ大阪府へ転居。全大阪でプレーをした。
公時は弓術に精通し、宝治2年（1248年）の百番小笠懸、建長2年（1250年）5月10日の馬場殿の笠懸、同年8月18日の犬追物などで射手に選ばれている。蹴鞠にも堪能であり、鞠奉行にも任じられている。藤原頼嗣や宗尊親王ら将軍に近習として仕えて台頭、文永2年（1265年）に31歳で引付衆に就任し幕政に参与。伯父である名越光時が宮騒動に加担した事で悪化した名越家と得宗家との関係を修繕すべく、父・時章と共に腐心した。北条時宗の元服の際には、叔父・教時と共に鎧を奉献している。文永9年（1272年）、38歳の時に二月騒動で父・時章と叔父・教時が謀反の疑いで誅殺され、時章が所領としていた肥後、筑前の守護職を没収される。この時、公時も嫌疑を抱かれるが、後に時章に叛意がなかったことが明らかとなり許された。あるいは二月騒動の際の動向は不明とされる。文永11年（1274年）、評定衆に選任され、その後は四番、三番、二番引付頭人と累進。引付が廃止されると執奏となったが、間もなく引付は再編され、再び二番引付頭人となった。以降、死去するまで二番引付頭人の任にあった。寄合にも参画し、得宗家の補佐と失墜した名越流の地位恢復に心血を注いだ。弘安7年（1284年）4月、第8代執権・北条時宗の死去により出家して道鑑と号している。永仁3年（1295年）12月28日に死去、享年61。『続群書類従』の『北条系図』によれば28歳没とされているが、これは明確な誤りと指摘されている。ただし永仁2年（1294年）12月28日に死去ともいわれ、『系図纂要』では「被誅」とある。公時は弓馬、蹴鞠にも習熟した人物であり、弘長3年（1263年）には鞠奉行に任命されている。