第1船。鋼材節約のための過剰な軽量化で船体が計画より浮き上がってしまい、車両積み込み時に船体の横傾斜が過大となり、車両が積み込めないことが竣工間際に判明、第3船艙を深水タンクに改造して海水を入れ、車軸室に川砂利を積載して計画喫水を確保した。また主機には陸軍特務船用の3,000軸馬力の日立製作所製衝動タービンを流用したが、このタービンは22kg/cm²、330℃という高圧高温の蒸気用で、これを16kg/cm²、280℃の蒸気で、2,250軸馬力に落として使用したため、効率の悪い運転となった。海軍監督官の意向で、船員の居住区画も徹底的に簡易化された。第四青函丸までは機関部員居室は車両甲板下第1船艙第二甲板に、甲板部員居室は部分甲板に、それぞれ各職種別に1名～10数名の2段寝台室を設けていた。しかし、第1船艙第二甲板の鋼甲板が大部分撤去され、これら船首部の普通船員居室は、船橋楼甲板の甲板室内の畳敷き大広間に集約され、雑魚寝となった。これにより、ここにあった1人個室の機関部・事務部高級船員居室は廃止され、1層上の遊歩甲板へ上がったが、遊歩甲板でも従来からの1人個室の甲板部高級船員居室は廃止され、畳6畳敷きの高級船員広間が造られた。当初、海軍監督官は船長も含めた全高級船員のここでの雑魚寝を要求してきたが、青函航路の実情を余りにも無視していたため、これでは暗号通信用の暗号書保管に責任が持てない、と反論した。結局、暗号書保管のための“機密室”を設置し、ここにソファーを入れ、その管理責任者として船長と機関長がここを共用することとした。なお、機械室後ろ隣の車軸室第二甲板は“馬匹付添人”などが利用する“その他の者室”として使用されていたが、この第二甲板は残存したものの居住設備はなくなり、“その他の者室”も廃止された。
「船体3年、エンジン1年」の考えで建造された船質不良のW型戦時標準船であったが、戦後種々の船質改善工事を重ねつつ十数年間使用されてきた。しかし老朽化とともに維持費は増大し、1959年（昭和34年）9月に出された国鉄内の「連絡船船質調査委員会」の2年間にわたる調査報告でも、“これ以上の長期使用は得策ではない”、とされた。事実上の引退勧告であった。折しも高度成長時代で、青函航路の客貨輸送量の増加は著しく、引き続きこの増加に対応できる運航効率のよい新型車載客船に置き換えるべき、と判断した国鉄は1962年（昭和37年）11月8日、その第1船建造を浦賀重工へ発注した。1964年（昭和39年）5月10日の新型車載客船の第1船津軽丸（2代）就航直前の5月3日、第六青函丸が終航となり、以後1965年（昭和40年）8月5日の第6船羊蹄丸（2代）就航1ヵ月前の7月2日終航の第十二青函丸まで、W型4隻は、津軽丸型当初計画6隻の就航とともに順次引退していった。
後部デッキハウス頂部と船橋楼甲板に水密辷戸動力室が設置され、動力室内の直流電動機の回転を、自在継手や傘歯車で接続されたロッドで延々と船底の水密辷戸まで伝達し辷戸を開閉する構造で、十和田丸（初代）と同等品であった
また、石炭焚き蒸気船のボイラー室での過酷な労働環境改善のため、1959年（昭和34年）8月には第十二青函丸、1960年（昭和35年）9月には第七青函丸にストーカーが装備されたほか、この時期までに第六青函丸、第八青函丸を除く全ての石炭焚き車両渡船にストーカーが装備されたが、これら2隻は終航まで手焚きで運航された

学問の道を勧める父に従い、上智大学文科予科でドイツ語を学んだが、中学時代の家庭教師であった芥川龍之介の影響などで文学に関心を寄せており、小説家を志して中退した。1921年（大正10年）、大佛次郎らと同人誌『潜在』を発行。後に父の紹介で菊池寛や久米正雄を知り、2人の斡旋により1924年（大正13年）、文藝春秋社の客員として編集に携わった。同1924年に川端康成らと文芸雑誌『文藝時代』を創刊。後に雑誌『文藝春秋』の編集長も務めた。小説家としても、いくつかの短編小説を発表し、1930年（昭和5年）には『新進傑作小説全集』第13巻として『関口次郎集・菅忠雄集』が出版されるなど、名の通る存在となっていた。翌1931年（昭和6年）に結婚し、神奈川県鎌倉町（後の鎌倉市）で結婚生活を営んだ。出版や創作に深く傾斜した菅にとって、結婚もまた仕事と切り離すことのできないものであり、京都で編集の仕事があるとの理由で新婚旅行の行き先を関西に決め、旅行では奈良で一泊後、京都で仕事をこなして自宅へ引き返すのみであった。同1931年、文藝春秋社の雑誌『オール讀物』の編集長に就任した。1933年（昭和8年）、父の親友である夏目漱石との幼少時の思い出を綴った『ナツメノオジサン わたしの偏奇館』を『時事新報』紙上に発表し、作家としての地位も安定したものとなった。私生活では一男一女に恵まれた。しかし幼少時から喘息を患っていた身でありながら、出勤すれば終電まで仕事か酒で、深夜の帰宅も珍しくない生活を送った末に、1938年（昭和13年）に肺結核で倒れ、慶應義塾大学病院に入院した。その後も見舞い客と共に飲みに行くなど無茶を繰り返したため、病状は好転しなかった。3年後に東北帝国大学医学部附属病院（後の東北大学病院）に転院し、闘病の末、1942年に肺結核により同病院で死去した。満43歳没。葬儀は文藝春秋社で社葬として執り行われた。没後、菅の幼友達であった俳人の高浜年尾は、自著の中で菅との思い出を著し、『文藝春秋』編集長であった鷲尾洋三も自著の中で、自身の入社当時の編集長であった菅を偲んだ。