数値分類体系、数値表形分類学において分類体系は、排他的にクラスタ分析と生体数の測定可能な特徴を特徴づけるベストフィットの数値方程式に近隣結合する。それは種の間の進化の「距離」の基準をもたらす。今日、この手法は主としてクレード分析によって代替された。それは原始形質あるいは祖先形質の特徴によって誤解されがちである。
今日、伝統的な階級ベースの生物学的分類は、タクソンが何を区別するかに焦点を当てるのではなく、系統樹へと遡及する系統的体系に代替されている。この良く知られたシステムを分岐学という。伝統的な分類学（また古い系統学）における分析結果はしばしば分岐図として描かれる。分岐学者の考えでは、認識されたタクサは常に分岐論分析によって定義される分岐学用語（特徴）を備え、まとまったクレードに対応するものとしている。昆虫学を専門とした分岐学者ヴィリー・ヘニッヒに先立ち、鳥類学のピーター・チャルマーズ・ミッチェルやロバート・ティラード（英語）、植物学のウォルター・ツィマーマン（英語）などの20世紀初頭から中盤の数人の学者によって、生物種のクレードが不完全な、すなわち分岐論的な系統のみを重視する生物命名法が提案されている。これは旧来の命名法に近い。そして階級ベースの学名においてはクレードの公式な命名規準にICZN、ICBN等のモデルに基づく系統学的命名法ファイロコードを支持している。
分類学の父とも呼ばれるカール・フォン・リンネ (大リンネ) が動植物の情報を分類表にまとめ、二名法を提唱し体系化した生物学的分類は、今日でも一般に知られる分類体系の形式である。前述の分類体系は特定の対象の進化過程の最終段階のみに注目し、最終結果をコミュニケートする手段、いわば経験的科学であるのとは対照的である。二名法に発する生物学的分類の対象にはタクソンから発生するタクサの予測や発見、記述及び（再）定義を含む。基本単位として界、門、綱、目、科、属及び種を含み、さまざまな略名表現にリンネの分類体系の序列の考え方とは別に発展している。動物学における学名命名法はより上位の名称がより広範囲を表す一方で、重要度順（上科から亜種への）の分類階級に付番を許すことを含め、国際動物命名規約で厳しく規制される。分類体系自体は決して規制されないが、常に特定のコミュニティでの研究成果を反映している。研究者は入手可能なデータに依存してタクサの変化に到達する上で、DNA配列データ解析が大幅に詳細化するにつれ、資源と手法にはコンピュータ分析印象的特徴の単純な量的かつ質的につれて変動がもたらされる。
何人かの人々は、大人の人間の心は世界に関する彼の知識を、そのようなシステムへ自然に組織化すると論じた。この見方はしばしばイマヌエル・カントの認識論に基づく。人類学者 は、分類体系が一般に地域的な文化と社会システムに組み込まれることを観察した。おそらく民族の分類体系の最もよく知られかつ影響力を持つ研究はエミール・デュルケームの『宗教生活の原初形態』である。より最近の（数十年の経験的研究の結果を含む）民族的分類体系の取扱と科学的分類体系へのそれらの関係の議論がスコット・アトランの『博物学の認知的基礎』に見ることが出来る。
家業を手伝うも、読書に熱中し商売に適していないと、母に相談して医業を学んだ。地元・松坂では医師として40年以上にわたって活動しており、かつ、寛政4年（1792年）紀州藩に仕官し御針医格十人扶持となっていた。宣長は昼間は医師としての仕事に専念し、自身の研究や門人への教授は主に夜に行った。宣長は『済世録』と呼ばれる日誌を付けて、毎日の患者や処方した薬の数、薬礼の金額などを記しており、当時の医師の経営の実態を知ることが出来る。亡くなる10日前まで患者の治療にあたってきたことが記録されている。内科全般を手がけていたが、小児科医としても著名であった。当時の医師は薬（家伝薬）の調剤・販売を手掛けている例も少なくなかったが、宣長も小児用の薬製造を手掛けて成功し、家計の足しとした。また、乳児の病気の原因は母親にあるとして、付き添いの母親を必要以上に診察した逸話がある。しかしながら、あくまでその意識は「医師は、男子本懐の仕事ではない」と子孫に残した言葉に表れている。山室町高峰の妙楽寺に葬られた。鈴コレクターで、駅鈴のレプリカなど珍しいものを多く所有していた。この駅鈴は、寛政7年（1795年）8月13日に浜田藩主・松平康定が宣長の源氏物語講釈を聴講するのに先立って、自筆色紙と共に贈ったものである。また、自宅に「鈴屋」という屋号もつけている。19歳の頃には架空都市「端原氏城下絵図」を描いた。平安朝の王朝文化に深い憧れを持ち、中でも『源氏物語』を好んだ。これは、万葉の「ますらをぶり」を尊び、平安文芸を「たをやめぶり」と貶めた賀茂真淵の態度とは対照的である。読書家であると同時に、書物の貸し借りや読み方にこだわりがあり、「借りた本を傷めるな」、「借りたらすぐ読んで早く返せ、けれど良い本は多くの人に読んで貰いたい」、などの考えを記している。大和国吉野の水分神が子守明神として、子を与え、守る神と世間で信じられていたため、宣長の父は男子が得られるよう祈り、宣長が生まれたため、宣長自身は「水分神の申し子」として生まれたと堅く信じていた。儒仏に対する排除を主張していた宣長だが、10代頃は浄土教思想の強い影響下にあり、『直毘霊』成立前後から排除思想が強くなった。宣長の生涯にわたる恋愛生活は、大野晋により明らかになった面が大きい。