藤本の行く先には常に「ミスターばんえい」こと金山明彦が映っていた。厩務員として勤め始めた先の本沢厩舎では、当時すでに第一線級の騎手であった金山から馬の扱い方や騎乗方法などばんえい競馬に関する様々な手ほどきを受ける事になる。藤本はこの頃の事を「厩務（きゅうむ）員時代の一番の思い出は、スター騎手だった金山さんから馬のさわり方や騎乗方法など、いろいろ教えてもらったことかな」と振り返る。 そもそも「騎手になる気はなかった」藤本が騎手を目指し出したのは、金山に勧められたのも要因の一つである。騎手となってからは更に金山からの影響は強くなり、金山が騎乗していない馬へどんどん騎乗させてもらう形で新人にして500回もの騎乗機会をもらう形で経験を積んでいった。本人は金山への印象を「聞けば何でも教えてくれた。でもまねはできなかった」と語る。金山から見れば「やんちゃな若者」であった藤本であったが、勝利を重ねてゆく内に金山からも認められる程の騎手となる。3,300勝記録達成が見えてくる頃になると「匠なら、きっとおれの記録を塗り替えられる」と期待を寄せられ、3,300勝記録を達成した際には金山が「若い時から弟子みたいな存在だったので、『おめでとう』と言いたい。看板ジョッキーとして今後の記録更新に期待している」と、藤本がばんえいの「看板騎手」となった事を喜んだ。
「20代のころは、がむしゃらに勝ちをつかんでいった。」と語る藤本は「でも30代になったとき、長く騎手を続けていくためには目先の1勝だけでなく、たとえ負けても馬主と信頼関係をつくっていくことが大切だと気がついたんだ。」と勝利へのこだわりもさることながら、そもそも「騎乗機会」を大切にする事が騎手として何よりも肝要であると気付く。3,300勝達成の際には、通算騎乗回数がばんえい競馬で最多となる25,300回以上に達した事にも触れ「記録達成もうれしいですが、勝数よりも、自分を信頼してくれ、ばんえい競馬で一番多い25,300回以上騎乗させてくれたことを誇りに思います。」と藤本は締めくくった。
「ベッドの下にほこりがたまっていると、落ち着かなくて自分で掃除機をかけてしまう」と語る藤本は、休日でもそのまま休むよりは掃除をこまめに行うなど自分で環境を整えるタイプである。その性格の一端は競馬にも表れており、調教の段階から極力自らの手で馬に触れる事を信条としている。他の騎手から「自分でなんでもやろうとしたらだめだ」と言われた事もあるが、藤本は馬の管理を他人任せにして事故などにつながった場合に悔いが残ると考えており、自らの手を忙しく動かして競走生活を送っている。
騎手デビューして4年目には年間100勝ペースに達したが、その頃になると夜の街で飲み歩くなどして朝の調教へ出ない事が多くなる。その影響は年間勝利数が70勝ペースまで落ち込む形で現れ、騎乗依頼も減って馬主の関心が藤本から離れてゆく。藤本はこの頃の事を「慢心が招いた結果だが、自分がふがいなかった」と振り返る。こうした事があり、藤本は競馬への姿勢を改めるようになった。特に早朝の「攻め馬」への参加は欠かさないようになった。
引退後は一口1500万円、総額9億円のシンジケートが組まれ、1995年より社台スタリオンステーションにて種牡馬として供用されていた。なお、馬房は父のライバルであったミスターシービーがレックススタッドへ移動する前に使用していた馬房であった。有馬記念優勝のインパクトもあり、初年度より多数の良血牝馬を集め、例年100頭以上の繁殖牝馬と交配された。1998年に初年度産駒がデビュー。産駒の成績が関係者の期待に反して振るわず、一時は種付け頭数も70頭台に減少したが、2001年以降、トウカイポイントがマイルチャンピオンシップを、ヤマニンシュクルが阪神ジュベナイルフィリーズを、2005年にはダート交流GIへ昇格したばかりのかしわ記念をストロングブラッドが勝利し、種牡馬としても一定の実績を残している。ただし、トウカイポイントは騸馬、ストロングブラッドは引退後乗馬となって去勢されている。2013年現在、トウカイテイオーを父に持つ種牡馬は登録されておらず、後継種牡馬の目処は立っていないのが現状である。ジャパンカップ優勝から12年後の2004年、JRAゴールデンジュビリーキャンペーンの「名馬メモリアル競走」の一環として「トウカイテイオーメモリアル」が同年のジャパンカップ施行日に東京競馬場にて施行された。また、2010年には歴代のジャパンカップの勝ち馬から選ばれるJRAプレミアムレース「東京ウェルカムプレミアム」の投票で2位となり、11月28日の東京競馬第6競走に「トウカイテイオー賞」の名前が付けられた。2009年11月7日と11月8日、東京競馬場にて展示された。2011年7月24日には函館競馬場に来場した。社台スタリオンステーションでは種付けシーズン・夏季以外は一貫して一般客からもっとも見やすい場所で日中放牧により公開されていたが、2010年冬より高齢のため公開放牧を見合わせるようになった。2011年は上記の函館競馬場でのお披露目後、8月の展示でのみ姿を見せた。これがトウカイテイオーが公に見せた最後の姿となった。2013年8月30日、社台スタリオンステーションの馬房にて心不全を起こして息を引き取った。25歳没。産駒のうち牡馬の活躍馬は騙馬か乗馬になったため後継種牡馬がなく、サイアーラインは継続できなかった（なお、同様に父・シンボリルドルフのサイアーラインも断絶しており、日本におけるパーソロン系（ヘロド系）種牡馬はメジロマックイーンの直仔であるギンザグリングラスただ一頭のみという状況である）。