1986年（昭和61年）の5000系導入と同時期より塗装変更が開始され、塗装作業の効率化のためクリーム色の塗装となり、赤と黒のラインを配すものとなった。
1988年に3000形3034-3035、1989年には3036-3037の計4両の主電動機・駆動装置を2000系の廃車発生品へ換装、3206-3207と3208-3209に改番された。1998年には3000形3010・3011の主電動機と駆動装置が2300系の電装解除に伴う発生品に換装され、3210・3211となった。なお、改造で捻出したMB-3020S主電動機と駆動装置は、5000系の増備に流用されたほか、予備品確保に使用された。3210編成は2017年に主電動機と駆動装置を再交換し、再び3010編成となった。これにより、3200形更新車及びこのグループの3200形は消滅、他のグループの編成が全車廃車されたこともあり3200形から3000系に編入された唯一の事例となる。また、3206 - 3209の4両は3200形で最後まで残っていた車両である。
パンタグラフは中間電動車（M車）に2基を搭載する。3000形・3200形では菱形パンタグラフのPK-55であるが、3050系では集約分散式冷房装置の搭載に伴い、投影面積の小さなPK-57下枠交差式パンタグラフが搭載されている。PK-57は後にPK-60へ換装、続いてPK-80に変更された。
台車は3000系アルミ車では軸梁式金属ばね台車を搭載したが、鋼製車からはウイングバネ金属ばね台車が採用された。3050系の1973年以降の増備車より空気ばね台車が採用されている。
特急での4両編成運転を見据えて、2M2Tでも2000系3両編成と同等以上の性能を確保するため、主電動機は出力125kWの三菱電機MB-3020Sを採用した。駆動装置は2000系と同様のWNドライブで、歯車比は82:15 (5.47) である。従来、山陽電鉄線では軌道法に基づく併用軌道区間が存在したことから、編成長に制約が存在していた。神戸高速鉄道乗り入れにより併用軌道が廃止され、制約が解消されることから4両編成での運行が計画された。このため当面はMT比1:1で山陽電鉄線内での特急運用における想定最高速度（110キロ）をカバーでき変電所の負担増を最小限に抑制できるもので、後年乗り入れ先での性能要求（阪急線内での高速走行及び阪神線内での高加減速性能）にはMT比の変更で応える、という所要条件においてメーカーである三菱電機からの推奨に従い、近畿日本鉄道（近鉄）で使用実績を重ねていたMB-3020系電動機が採用された。山陽向けはサフィックスとして末尾にSが付与され、ねじのISOねじ化などの改良・仕様変更ごとにS1・S2・S3・S4とその後ろに数字が付加して区分される。なお、現行モデルはMB-3020S4であり、高速運転への対応として最弱界磁率が35%まで拡大された。
1基で2両分8基の主電動機を制御する1C8M方式を採用、電動車 (M) に2基のパンタグラフと主制御器を、制御電動車 (M'c) に各種補機を、それぞれ集約分散搭載する。主制御器は川崎電機製造/富士電機KMC-201（直列11段、並列9段、弱め界磁4段）をM車に搭載する。
1948年7月14日、マニンガム＝ブラー準男爵家の嫡男で保守党の政治家であるレジナルド・マニンガム＝ブラー（後の初代ディルホーン子爵）とその妻メアリー・リリアン（第27代クロウフォード伯爵デイヴィッド・リンジーの娘）の間の次女として生まれる。父レジナルドは1956年に祖父マーヴィンから第4代準男爵位を継承し、政界では保守党の庶民院議員として活躍し、1962年に大法官に就任した際に初代ディルホーン男爵に叙せられて連合王国貴族となり、さらに1964年には初代ディルホーン子爵に叙せられた人物である。ベネンデン・スクールを経て、オックスフォード大学レディ・マーガレット・ホールで学ぶ。1974年にMI5に入省する前、3年間、ロンドンのクイーンズ・ゲイト・スクール（Queen's Gate school）で教師として働いていた。当初、対ソ防諜を専門とし、ゴルジエフスキー事件にも関係した。後に対テロ部門に異動。ロッカビー事件時、対テロ局長であり、後に連絡幹部としてワシントンに駐在した。1992年、アイルランド人テロ対策の機能がMI5主管となった。1997年、MI5副長官（外部監視・盗聴担当）に任命された。2002年10月から2007年4月までMI5の長官（Director General）を務めた。2005年の女王誕生日の記念にバス勲章デイム・コマンダー(DCB)に叙せられた。MI5長官退任後の2008年6月に一代貴族「ノーサンプトンシャー・カウンティにおけるノーサンプトンのマニンガム・ブラー女男爵」（Baroness Manningham-Buller, of Northampton in the County of Northamptonshire）に叙され、貴族院議員に列した。貴族院内では中立派の議員である。2014年4月23日、女王エリザベス2世よりガーター勲章勲爵士（LG）に叙せられた。