一時、歳入に占める借金の割合である実質公債比率が18%を超えたため、借金に当たる地方債発行に県の許可が必要な地方債許可団体に移行。埼玉県内ワースト3位の財政状況となったことがある。財政健全化計画の策定及び実施により、平成19年度に実質公債比率が18%を下回り地方債許可団体を外れ、現在の財政状況は好転している。
平成の大合併に際して幸手市では当初、県は異なるが経済圏や生活圏が同一であるため隣接する茨城県猿島郡五霞町との合併を目指して法定協議会を設置し、準備を進めていた。しかし、合併後の帰属県など越境合併特有の難点もあり越県合併反対運動が発生、最終的に増田実市長のリコール運動へと発展した。発議事態は無効となったものの増田市長は責任を取って辞職し、2003年（平成15年）11月22日に出直し市長選が行われ隣接する久喜市の水道部長であった町田英夫が新市長に当選。この結果を受けて同じ埼玉県内での合併に方針転換し、12月に久喜市と鷲宮町が設置していた合併協議会へ加わった。2004年（平成16年）、3市町の合併後の新市名を「桜宮市」とすることが決定するがこの名称に対し久喜市で反発が強まり、桜宮市を新設して合併を行う是非を問う住民投票が実施され、その結果幸手市や鷲宮町では賛成票が上回ったのに対し久喜市で反対票が上回り合併構想は白紙撤回されることになった。2007年（平成19年）12月、町田市長は久喜市と鷲宮町・栗橋町・南埼玉郡菖蒲町の4市町が新たに設置した協議会で進められている合併協議に加わる意向を表明したが、協議会側は幸手市議会の承認を参加条件としたことから幸手市側は合併特例法の期限である2010年（平成22年）3月までに手続きが間に合わないとしてこれを拒否し、単独で存続することとなった。
注意：ここに記した旧幸手町は1954年（昭和29年）〜1955年（昭和30年）合併以前の町域を対象としており、他の行幸地区・上高野地区・吉田地区・権現堂川地区・桜田地区・八代地区・豊岡地区に関しては、行幸村・上高野村・吉田村・権現堂川村・桜田村・八代村・豊岡村の項を参照されたい。
関東平野のほぼ中央にあり、埼玉県内では東部地域の北寄りに位置する。東京都心からの距離は約50kmである。利根川に近く、ほぼ全域が海抜10m前後の沖積低地である。しかし東部には、自然堤防の微高地や下総台地の末端部（江戸川開削によって切り離された）など、海抜20m前後の台地状地形も存在する。市の西寄りを南北に東武日光線と国道4号が縦断しており、東武日光線幸手駅とその東側の旧道（旧・日光街道）、国道4号を中心に宅地を中心とする市街地が広がる。市街地の外側では水田地帯中に集落が散在している。近年は市南西部の国道4号沿いに多くの郊外型店舗が出店しており、2006年（平成18年）には大規模なショッピングセンターも開店した。一方で市中心部にある商店街の買い物客が減少しているとされる。
明応7年8月25日辰刻（ユリウス暦1498年9月11日8時頃）（以下西暦換算はユリウス暦）、東海道沖で大地震が発生した。『御湯殿の上の日記』、『後法興院記』、『実隆公記』、『言国卿記』および『大乗院寺社雑事記』等に京都や奈良など畿内付近の記録が見られる。『言国卿記』や『御湯殿の上の日記』には閏10月まで、『実隆公記』には11月7日まで余震と思われる地震の記録がある。畿内の被害と思われるものは『大乗院寺社雑事記』にある興福寺と見られる地蔵堂の庇が崩壊した記録である。『後法興院記』の東海道沿岸における記録は伝聞によるもので「大地震之日、伊勢、参河、駿河、伊豆大浪打寄、海辺二三十町之民屋悉溺水、人歿命、其外牛馬類不知其数云々、前代未聞事也」とある。しかし、明応の頃になると畿内付近のみならず、遠江や駿河で記された記録も確認されるようになる。紀伊から房総にかけて太平洋側で震動が強い。山梨県山梨市の窪八幡神社別当・普賢寺の『王代記』明応7年（1498年）条には「天地振動シテ国所々損、金山クツレ（崩れ）」と記されており、甲斐国でも強い揺れであったと考えられている。なお、『王代記』に記される「金山」は地理的関係から甲州市塩山の黒川金山と考えられている。各地の揺れは江戸時代の安政東海地震や宝永地震に共通するが震害の記録は少ない。熊野本宮の社殿が倒壊、那智の坊舎の崩壊、遠江では山崩れに地割れがあった。『熊野年代記』の記録によれば紀伊湯の峯温泉の湧出が10月8日まで42日間停止した。河角廣により規模MK = 7.5 が与えられ、マグニチュードはM 8.6 に換算されている。またM 8.3前後、あるいは東海沖から伊豆半島南方沖と推定される断層モデルから地震モーメントはM₀ = 7 × 10²¹N・m (Mw 8.5)と推定され、震度分布を推定する記録もこれ以前の地震よりはるかに充実しているが、江戸時代の地震より記録が少ない歴史地震であり、断層モデルによる近似の程度も悪く数値の精度は低い。震源域の東端が駿河湾に入っているのではなく、銭洲海嶺系の活断層が本地震に関連しているとの考えもある。