最初に仲間を選び、パーティを組んで冒険する。GB版では5人の仲間候補から2人を、PCE版・FC版では7人の仲間候補から3人を仲間に加えることができる。仲間たちは様々な能力を持ち、中にはあまり冒険の役に立たない能力を持つ仲間もいる。なお必ずしも最大人数の仲間を連れる必要は無く、一人で冒険することも可能。他のシリーズ作品と違い、通常の戦闘で敵を全滅させた際に敵が必ず捨て台詞をはく。この台詞の内容は物語の進行状況によって変化する。GB版とPCE版・FC版では、覚える術の種類やダンジョンの構成など、相違点が多い。
桃太郎たちが地獄王をこらしめてから1年。改心した鬼たちが穏やかに暮らしていた地獄に、マンダラ王率いるマンダラ地獄の鬼たちが侵略してきた。マンダラ地獄とは、全部で108ある地獄の101番目にあたる地獄王の地獄よりもはるかに格上の、8番目の地獄である。マンダラ鬼たちの侵攻に、かのえんま大王も傷つき倒れ、地獄王も絶望しかけていたその時、地獄王の娘・夜叉姫が立ち上がる。夜叉姫は、桃太郎より学んだ愛と勇気を胸に、マンダラ王をこらしめるべく旅立った。
戦闘シーンでは「相手のお金を盗むこと」が攻撃手段となる。「敵の体力（HP）＝敵の所持金」という扱いで、金を一定量盗むことで相手をこらしめる（倒す）ことができる。戦闘で盗んだお金はそのまま自分の所持金となる。戦闘により多額のお金を得られる一方で、お金を盗む敵が出現する地域があったり、所々で通行料を取られたり、歩くごとにお金が減ったりする場所があったりなど、所持金を消費する場面も多い。ぜに王を倒した後は福の神・ろっかく仙人・あまのじゃくのいずれかを主人公にした2周目をプレイすることができる。この主人公はルーレットで選ぶ形式になっているが、実際は、ある人物との会話の有無や天の仙人が出す質問への答え方により決定され、必ず同じキャラクターが選ばれる。3作中、唯一終始一人旅となる。
いつも人のお金を盗んでばかりの貧乏神のもとに桃太郎が訪れ、なぜ盗みを働くのかたずねた。「一人でさびしいから、お金を盗めば皆が騒いでさみしくなくなる」と答える貧乏神に、桃太郎は「盗むならば悪い人の心を盗まなくちゃ」と諭す。その時、どんべい村のどんべいが現れ、「ぜに王」が畑仕事の道具を不当に高く売りつけてきて困っていると助けを求めた。貧乏神はそれを聞き、「正義の盗み」でぜに王をこらしめることを決意するのであった。
『桃太郎伝説』シリーズの外伝作品として、シリーズのキャラクターである貧乏神、夜叉姫、浦島太郎をそれぞれ主人公とした3作の短編RPG「貧乏神伝説」「夜叉姫伝説」「浦島伝説」がオムニバス形式で収録されている。時系列は、『桃太郎伝説II』で桃太郎たちが地獄王をこらしめた後にあたる。収録作品の1つ「夜叉姫伝説」では1年後であることが作中で語られている。なお、PCエンジン版のみタイトルが『桃太郎伝説外伝 第1集』となっており、スタッフロールでは「第2集」の存在をほのめかす表記もあったが、その第2集が発売されることはなかった。
2003年の発足以来、時代に流されることなくアメカジスタイルを貫いている。SMAPの木村拓哉が着用したティアドロップ型サングラスは2009年時点でも販売され続けている定番商品。
舞台は森の中。日差しがYUKI(森の妖精という設定)を照らす。妖精はある人物に恋をしていた。その人物は森の奥に迷い込んだ男(演:西島秀俊)だった。妖精は腕に光るリングを着け、その光に気付く男は光に導かれるかの様に森の奥へと進んだ。だが光は途中で消えてしまい、男は光を探す。光を探す度、男は妖精に近付く。しかし、その森は罠が仕掛けられていた。男は落とし穴に3回も落ちた上、網にまで捕まってしまう。その様子を見た妖精は笑っていた。一方、男はなぜかその森に住むペンギンに助けられる。ペンギンは妖精とは親しい様子だった。そこへ、何度も罠にかかって体中泥だらけの男が姿を現す。妖精は男の頬を触れるが、男は頬を触れられた感覚はしたが、男には目の前にいる妖精の姿が見えていなかった。そんな男を見た妖精は悲しそうな表情を浮かべる。男の目に見えていたのは、一面に広がる森と、妖精の近くにいたペンギンだけだった。
ブラゴエヴグラト州はサッカーが盛んであり、FCヴィフレン・サンダンスキ（FC Vihren Sandanski、PFCベラシツァ・ペトリチ（PFC Belasitsa Petrich）PFCピリン・ブラゴエヴグラト（PFC Pirin Blagoevgrad）の3チームがブルガリアプロサッカーリーグの1部リーグ（A PFG）で戦っている。多くの山に覆われているプラゴエヴグラト州では、ウィンター・スポーツも盛んであり、バンスコはスキー・リゾートの地としてブルガリア国外でも知られている。
元久元年（1204年）、比叡山の僧徒は専修念仏の停止を迫って蜂起したので、法然は『七箇条制誡』を草して門弟190名の署名を添えて延暦寺に送った。しかし、元久2年（1205年）の興福寺奏状の提出が原因のひとつとなって承元元年（1207年）、後鳥羽上皇により念仏停止の断が下された。念仏停止の断のより直接のきっかけは、奏状の出された年に起こった後鳥羽上皇の熊野詣の留守中に院の女房たちが法然門下で唱導を能くする遵西・住蓮のひらいた東山鹿ヶ谷草庵（京都市左京区）での念仏法会に参加し、さらに出家して尼僧となったという事件であった。この事件に関連して、女房たちは遵西・住蓮と密通したという噂が流れ、それが上皇の大きな怒りを買ったのである。法然は還俗させられ、「藤井元彦」を名前として土佐国（実際には讃岐国）に流罪となった。なお、親鸞はこのとき越後国に配流とされた。