日本では、移入種を除く約100種の哺乳類のうち、約3分の1に当たる35種（種数は分類説により若干変動する）をコウモリ類が占めており、約4分の1に当たるネズミ目（齧歯類）24種を抑えて、最多の種数を擁している。また、近年は琉球列島の島々に固有種が発見されている。このうち、オオコウモリ類は熱帯性で、日本では小笠原諸島と南西諸島にのみ分布する。ただし、個々の種についてみれば、個体数が少ないと判定されているものもあり、多くの種がレッドデータブック（環境省版）入りとなっている。これには、日本ではコウモリの研究者が少なく、生息調査も散発的であるという事情もあるが、実際に絶滅の危険がある状態にあると考えられているものも多い。特に、森林性のコウモリについては、その生活の場である自然の広葉樹林と、それ以上に、住みかとなる樹洞ができるような巨木が極めて減少しており、棲息環境そのものが破壊されていることが、大きな問題となっている。コウモリ用の巣箱などが工夫されているが、普及していない。洞穴に生活するものは、集団越冬の場所などが天然記念物となっている場所もある。いずれにせよ、彼らの生活そのものも、未だに謎が多い。ユビナガコウモリなど、集団繁殖する種もある。これらのものでは、季節的に大きな移動を行っている可能性が高いが、具体的な習性については、現在研究が進められつつある段階である。
コウモリ目は南極以外の全大陸に分布し、さらに海洋島にも広く分布する。このような例は人為分布を除いては哺乳類の中では他にない。これは、哺乳類が（クジラ類などの例外を除けば）陸上動物であり、しかも大きく進化したのが大陸移動による各大陸の分裂後であったため、陸橋等の存在如何でその分布が大きく制限されているのに対し、コウモリ目は鳥類同様に翼による飛翔能力を持ち、海などによって遮られた場所でも自由に移動できたためであると考えられている。たとえば、ハワイ諸島において、在来の陸上哺乳類はアカコウモリ属の1種のみだった。
恐竜の栄えた中生代において、飛行する脊椎動物の主流は恐竜に系統的に近い翼竜と恐竜の直系子孫である鳥類が占めていた。中生代の終結において、恐竜とともに翼竜は絶滅し、鳥類も現生の鳥類に繋がる新鳥類以外の系統が絶えた。これにより、飛行する脊椎動物という生態系ニッチには幾分か「空き」ができた。ここに進出する形で哺乳類から進化したのがコウモリ類である。コウモリが飛行動物となった時点では、鳥類は既に確固とした生態系での地位を得ていたため、コウモリはその隙間を埋めるような形での生活圏を得た。コウモリの直系の祖先にあたる動物や、コウモリが飛行能力を獲得する進化の途上過程を示す化石は未だに発見されていない。恐らく彼等は樹上生活をする小さな哺乳類であり、前肢に飛膜を発達させることで、樹上間を飛び移るなど、活動範囲を広げていき、最終的に飛行能力を得たと思われる。確認される最古かつ原始的なコウモリはアメリカ合衆国ワイオミング州産のオニコニクテリスで、始新世初期（約5200万年前）の地層から化石が発見されている。この時期には既に前肢は（現生群に比べ短いなどの原始的特徴が目立つものの）翼となっており、飛行が可能になっていたことは明白である。化石から耳の構造を詳細に研究した結果、反響定位を持っていなかったことが判明し、コウモリはまず飛行能力を得たのちに、反響定位を行う能力を得たことが分かっている。
「コウモリ」の名は古語に「かはほり」、「かはぼり」と呼ばれたものが転訛したものである。平安時代の『本草和名』では、コウモリを「加波保利」（かはほり）として紹介しており、現在の「こうもり」という名は、この「かはほり」（かわほり）に由来する。
兵庫県出身。1972年東北大学法学部卒業、住友金属工業入社。住友金属工業新材料事業部企画グループ長を経て、2001年関東特殊製鋼取締役。2006年SUMCO企画部担当部長。2007年ミライアル経営企画室長。2008年ミライアル取締役経営企画室長に昇格。2010年山城精機製作所代表取締役社長。2012年宮本樹脂工業取締役。2013年からミライアル代表取締役社長を務め、熊本地震を受け、リスク分散等のため、福島市に東北工場の新設を行うなどした。
山脇 秀夫（やまわき ひでお、1949年9月24日 - ）は、日本の実業家。ミライアル代表取締役社長や、関東特殊製鋼取締役等を歴任した。
近代以降、有島武郎や川端康成ら多くの文人が訪れ、川端は『花のワルツ』（1936年刊行）を別所温泉の旅館、臨泉楼柏屋別荘（1910年創業、2017年閉館）で執筆している。柏屋別荘には1923年、北原白秋も逗留して百首以上の歌を詠み、後年北向観音に歌碑が建てられている。また旅行記や随筆の題材に取り上げたり、断片的に残る別所温泉にかかわる史実や伝承を作品に取り入れた文人も少なくない。吉川英治は『新平家物語』において義仲が愛妾の葵御前を連れて「大湯」に入湯する場面を描いている。史料上の根拠はないが、「大湯」は「葵の湯」と宣伝されるようになっており、「大湯」の傍らには吉川の文学碑も建てられている。また戦国武将真田昌幸・真田信之・真田幸村関連の作品を数多く執筆した池波正太郎は取材のため上田市街や別所温泉を度々訪れ、代表作の一つとなった長編小説『真田太平記』においては「真田幸村が「石湯」に頻繁に入湯していた」という設定を導入し、若き日の幸村が入浴に訪れるなど、重要な場面にしばしば登場している。ただ幸村と別所温泉のゆかりについての史料上の根拠は確認されていない。こちらも『新平家物語』同様小説の中のフィクションに留まっているものの、宣伝効果を生んでおり、「石湯」は「真田幸村公隠しの湯」と形容されるに至っている。現在「石湯」前に立つ石碑の文字も池波の筆によるものである。