横須賀海軍司令部に徴用された藤沢カントリー倶楽部は横須賀海軍航空隊の基地として使用される方針であると報道された。ゴルフ場の閉鎖後、まず境界線の範囲確認がなされた後、1944年（昭和19年）4月に航空隊の設立委員会が設立され、旧藤沢カントリー倶楽部に先遣隊が派遣された。そして6月1日には藤沢海軍航空隊が正式に発足した。藤沢海軍航空隊は戦闘機電話、電波探信儀などの無線兵器の整備員の養成を目的とする教育隊であった。藤沢海軍航空隊の司令部はグリーンハウス（旧藤沢カントリー倶楽部クラブハウス）内に設置された。開設当時、藤沢海軍航空隊内の兵舎等の建物はまだ建設中で、グリーンハウスしか建物が無かった。また兵員も20〜30名と少なく、兵士たちはグリーンハウス内に設置されたベットで寝起きし、調理場もクリーンハウス内にあった。滑走路、防空壕、そして兵士が起居する兵舎などの設備は徐々にではあるが整備されてきた。そして藤沢海軍航空隊の体制も、当初、第13連合航空隊に所属していた藤沢海軍航空隊は、1944年（昭和19年）10月1日に第20連合航空隊に編成替えとなった。第20連合航空隊の司令官には海軍少将久邇宮朝融王が任命され、グリーンハウス内に執務室が設けられた。皮肉なことに前述のように久邇宮朝融王は1932年（昭和7年）に行われた藤沢カントリー倶楽部の開場式に出席しており、藤沢カントリー倶楽部会員としてゴルフを楽しんでいた。なお、第20連合航空隊の本部機能がグリーンハウスに設けられることに伴い、藤沢海軍航空隊の本部指令室はグリーンハウス北側に建設された建物内に移動した。発足当初は20〜30名であった兵士も、その後続々と入隊して、やがて約1万名の兵士が練習生として無線兵器の整備員養成教育を受けるようになった。養成教育はまず銃を担いで航空隊内を走り回る訓練から開始された。もともとがゴルフ場であったためこのような訓練の場としてはうってつけであり、かなり厳しいメニューが課されたため、ついて行けずに除隊となる者もいた。しかし2か月間の訓練の後に無線教育が開始されるのだが、1万名分の教科書が用意できなかった。しかも滑走路は完成したものの、航空隊でありながら肝心の使用可能な飛行機が白菊1機のみであり、しかもその1機も燃料不足のためにほとんど使用されることはなかった。無線兵器の着脱訓練は、掩体壕内にあった廃機で行われたという。そして6か月間の養成教育を終えた練習生は全国各地の基地に配置されていった。藤沢海軍航空隊は1945年（昭和20年）8月15日後の16、17日にも演習を行ったと伝えられているが、8月20日には解散式が行われた。結局海軍航空隊時代はわずか2年足らずで終了を迎えた。
1950年7月9日、ソビエト連邦の一部だったウクライナ共和国ドネツィク州イエナーキエヴェ市に生まれた。父はポーランド人かタタール人。母はロシア人。2歳の時に母を亡くし、経済的にも非常に貧しい環境で暮らした。義母との関係はうまくいかなかったため、家を出た。ビリニュス出身の祖母によって育てられた。1967年12月15日、17歳の時、「ピフノフカ」暴力団の一員として強盗事件に関わった。懲役3年の実刑判決を受けた。7月間をクレメンチュク刑務所で過ごしたが、模範的な行動で（同時期施設にいたムィコーラ・モスコヴチェンコによると警察との協力により）早く解放された。1970年7月8日、新たな強盗事件（一説には強姦事件）を起こしたために懲役2年の実刑判決を受けた。1978年12月27日、ドネツク州裁判所は、犯罪の証拠がないという理由で以上の2つの判決を無効とした。裁判所の判断にヤヌコーヴィチの父の親友、ソビエト連邦議会議員ゲオルギ・ベレゴヴォイが関わったという。1969年に中等教育（高等学校相当）を終えると生計を立てるべく働き始める。1972年に地域の輸送部門において電気技師として働きながら、ドネツィク工業大学で学ぶなど苦学を続けた。労働者としては1974年に輸送部門の主任に昇進し、機械工学の学位を授与された1980年には輸送部門全体の総責任者に昇進する。同年にウクライナ共産党に入党。以降、20年間に亘って同地域の輸送部門責任者として地域の経済・政治活動に関わり続ける。教育面では後に博士号を授与されている。1996年8月、政府からドネツィク州国家行政府副長官に任命された事から政治活動を本格化させ、1996年9月から1997年5月まで同州第一副長官、1997年5月から2002年11月まで長官を歴任する。1998年9月から内政問題調整会議のメンバー。2002年11月21日、レオニード・クチマ大統領に首相に任命され、2004年12月までとどまる。2003年から地域党の党首。2004年、クチマ大統領の任期切れに伴うウクライナ大統領選挙に親クチマ勢力の統一候補として立候補する。ヤヌコーヴィチは、ドンバスを地盤とし、クチマ政権の内外政策の継続を主張した。これに対して野党候補のヴィクトル・ユシチェンコ元首相は民族主義勢力を糾合し、前政権下の汚職と非民主化的な政治手法を攻撃した。11月21日の決選投票でウクライナ中央選挙管理委員会は、24日ヤヌコーヴィチが49.64%、ユシチェンコが46.61%を獲得し、ヤヌコーヴィチの勝利を発表したが、その後、与党側の大がかりな選挙不正が明るみに出て、首都キエフでの大規模な抗議運動を引き起こし、決選投票をやり直すこととなった。12月26日選挙が行われ、開票の結果、ユシチェンコが52.12%、ヤヌコーヴィチが44.09%の得票でユシチェンコ側の勝利を発表した。大統領選挙敗退後、彼は中央政界では公的役職についていなかったが、地域党党首として最高会議内で隠然たる勢力を維持していた。ユーリヤ・ティモシェンコ内閣総辞職後、政権側と与野党間の妥協とも言うべき協力宣言に署名し、ユーリー・エハヌロフ首相の2度目の承認決議では彼の会派は全面賛成に回った。しかし、2006年初頭に天然ガス問題がロシアとの間で生じると、政権批判に回り、エハヌロフ内閣不信任決議の立役者となった。このように、ヤヌコーヴィチはユシチェンコ政権の数々の失政により、漁夫の利的に人気を回復し、2006年3月に行われた最高会議選挙で、彼の地域党は比例区32.12%（450議席中186議席）を獲得し、第一党に躍り出た。議会では、地域党は社会党、共産党と連合を組むことで多数派を構成し、2006年8月4日に賛成271票を得て議会承認され首相職に返り咲いた。2007年9月に行われた選挙では、ヤヌコーヴィチを名簿順位第一位に据えた地域党が再び第一党の地位を確保したものの、連合工作で過半数に届かず、野党にまわった。