藤嶺学園側がいつ頃から藤沢海軍航空隊跡地の利用に向けて動き出していたのかははっきりしていない。記録に残っているところでは、藤嶺学園の父兄向けの出版物に、1946年（昭和21年）1月25日、進駐軍から旧藤沢海軍航空隊のバラックの利用許可を得たとの紹介が載せられている。つまりそれ以前から藤沢海軍航空隊跡地の利用に向けて、運動、画策を進めていたことは確実である。ところが実際の使用には神奈川県の許可がいるとの横やりが入ったため、この時の進駐軍からのお墨付きは役立たなかった。そこで藤嶺学園側は県当局とともに藤沢海軍航空隊跡地を管理する大蔵省サイドへの働きかけを進めた。藤嶺学園が藤沢海軍航空隊跡地獲得へ本腰を入れだした頃、前述のようにカトリック系の社会事業家たち、そして農民たちがやはり獲得に向けて積極的に動いていた。藤嶺学園側は他の獲得運動を見て、1946年（昭和21年）1月25日に進駐軍から旧藤沢海軍航空隊のバラックの利用許可を得た後、職員、生徒からなる警備隊を組織して藤沢海軍航空隊跡地の旧兵舎周辺を自主警備するようになった。1946年（昭和21年）夏には、農民団体が跡地の一部を占拠して耕作を開始し、藤嶺学園側も中学5年生を派遣して、現在、聖園女学院中学校・高等学校となっている場所にあった兵舎を占拠し、自主警備を行うという実力行使に出た。藤嶺学園は当初、藤沢海軍航空隊跡地への移転対象として藤沢商業学校を考えており、進駐軍、神奈川県などへの申請を行っていた。しかし交渉の過程で藤嶺学園側の要求は拡大し、藤沢中学校、藤沢商業学校、そして藤沢工業学校の3校の移転に加えて、上級学校として藤沢専門学校を開校するという、相模商業女子学校以外の藤嶺学園の全機能を藤沢海軍航空隊跡地へ移転させた上に専門学校を創設するという大計画へと発展した。現在、聖園女学院中学校・高等学校となっている場所にあった兵舎を占拠して行っていた藤嶺学園の藤沢海軍航空隊跡地の自主警備は、やがてグリーンハウスとその周辺の兵舎警備へと重点が移っていった。1946年（昭和21年）10月末からは、教員に率いられた藤沢商業学校、藤沢工業学校の上級生10〜20名でチームを組み、昼夜交替で警備を行うようになった。警備チームは夜間はグリーンハウスに泊まり込んだ。当時、旧ゴルフクラブのクラブハウスであったグリーンハウスのような鍵がかけられる部屋は珍しく、警備に当たった生徒たちは半ばキャンプ気分であったという。実際、グリーンハウス内でレコードを聴いたり卓球を楽しんだりするなど、生徒たちにとって警備活動はむしろ楽しみであったと伝えられている。しかし戦後の混乱期、夜間の盗難事件がしばしば起こっており、キャンプ座間に進駐していたオーストラリア兵が昼間にトラックを仕立てて現れ、鉄板を持って行ってしまうなどの騒ぎも起きたため、結局、藤嶺学園側は教師1名をグリーンハウスに常駐させる措置を取ることになった。この警備活動のことを藤嶺学園では、ゴルフ場、藤沢海軍航空隊があった高台の別称から、八州台警備隊と呼ぶようになった。
1876年（明治9年）1月12日、山口県佐波郡中関村（現・防府市）に生まれる。高等小学校卒業後に上京し、医師･賀古鶴所宅で住み込み書生をしながら苦学して、医術開業前期試験に合格した。合格後は実技試験対策のために済生学舎に入学、1895年、開業後期試験に合格する。済生学舎の同期に野口英世がいる。東京帝国大学医学部選科に籍を置き、学士でないハンディを乗り越えて病理学を学び、ハンセン病の撲滅を志すようになる。当時ハンセン病の療養施設「養育院｣から献体があったが、学士の同僚達は罹患を恐れ、誰も解剖をしようとはしなかった。「ハンセン氏病の患者を救いたい」という一心から光田は危険を顧みず、解剖にあたったとされる。1898年、東京帝国大学医科大学専科（病理特科）を卒業し、同年7月に、東京市養育院に就職する。翌1899年にかけて、院内に「回春病室」を開設し、ハンセン病患者の医療に取り組み、患者隔離政策の推進派となる。1908年には同院副医長に就任。1909年、公立癩療養所全生病院医長に就任。1914年（大正3年）、全生病院長に就任するとともに、保健衛生調査会委員に就任し、ハンセン病予防事務視察のため、欧米各国などに渡る。1915年には、入所者に対してはじめて断種手術（ワゼクトミ－）を行う。これは男女別に収容されていた入所者間に子供が生まれたことを背景に、入所者間の所内結婚（通い婚）を認める条件として、男性入所者に対して行われたものであった。1919年に発表した論文「らい結節乳剤を以ってする皮膚反応の価値」は、ハンセン病の病型を診断する「光田反応」の開発へと繋がる研究成果であった。1923年にストラスブールで開催された第3回国際らい学会では名誉会頭・座長を務め、「光田反応」などについて発表したが、反応はなかった。なお、光田反応は弟子の林文雄によって完成された。1930年（昭和5年）頃より日本政府によるらい根絶運動が本格化し、光田はその中心人物の一人となる。同年、岡山県の長島に完成した国立療養所長島愛生園の初代園長に就任する。1931年4月には癩予防法が改正され、全ハンセン病患者を強制隔離する無癩県運動がはじまった。1943年にハンセン病特効薬プロミンが開発され、1947年には日本でもプロミンによる治療が開始され、薬物療法が確立されて強制隔離の医学的必要性が疑われるようになっても、光田は強制隔離政策の維持・強化を主張し続けた。1951年、ハンセン病治療研究および患者救済における功績により文化勲章を受章する。また、山口県防府市並びに岡山市名誉市民となる。大島青松園長野島泰治によれば、すでに1943年に文化勲章受章の動きがあったという。これによれば、同年秋の全国癩療養所所長会議が東京で開催された翌日、厚生省医務課秘書課長が野島に対し、光田反応の発見を理由とした光田への文化勲章奏請について意見を聞いたといい、野島は光田反応は光田の業績のごく一部にしか過ぎず、「先人未到のライ病理の解明をされたことこそ文化勲章に値する」という理由で、光田反応を理由としたもの文化勲章奏請に反対したという。また青柳緑は、1950年から翌年にかけて光田のハンセン病関連論文をまとめた『癩に関する論文』の第2〜4輯が刊行されたのは、光田を文化功労者にするための井上謙と厚生省の好意ある陰謀と評している。その後も、1953年制定のらい予防法に積極的に関わるとともに、法令の存続に力を入れた。1957年3月に退官し、長島愛生園名誉園長となる。1961年には、ハンセン病医療への貢献に対して贈られるダミアン・ダットン賞（Damien-Dutton Award）を受賞した。1964年5月14日死去。享年89。死後2時間後、岡山大学の浜崎名誉教授と小川教授の執刀により、遺体が病理解剖された後、遺骨は長島愛生園にある万霊山遺骨堂に納められた。叙・正三位、勲一等瑞宝章追贈。