再びキャスト・スタッフを一新。BGMは初代・堂本剛版を手がけた見岳章が担当し、初代で使用した音楽も使用するなど、原点回帰を果たした作品となっている。2013年に単発ドラマ「香港九龍財宝殺人事件」、2014年に「獄門塾殺人事件」の2作品が放送された後、『金田一少年の事件簿N（neo）』のタイトルで連続ドラマが同年7月から9月にかけて放送された。『N（neo）』では容疑者リストが復活されたが、第2シリーズとは演出が異なっている（第1話のオープニング+CM後に表示された容疑者リスト以外は、CM前に表示、死亡者が確定した場合は反転かつ写真が白黒になり「DEAD」の文字が表示されるなど）。本作での不動高校の制服は、初代・堂本剛版のものと同じデザインの制服が使用されている。
日本テレビ系で2005年9月24日、土曜日21:00 - 23:09に放送された。再びキャスト・スタッフを一新。主な登場人物の性格なども大幅に変更されている。「三代目金田一」として制作されたのは本作のみである。
日本テレビ系で2001年7月14日 - 9月15日、毎週土曜日21:00 - 21:54に放送された。松本潤の連続ドラマ初主演作。平均視聴率13.7%（クール5位）。ラストははじめと美雪が手をつないで帰り道を歩くシーンで、明確な完結の描写はない。毎回エンディングの最初に「to be continued」と表示されるのだが、最終回のみ「What is your justice?」という最終回の内容を反映した文に変更されている。
キャスト・スタッフともに一新し、「21世紀の金田一少年」として若返りを図った。なお、鈴木杏は連続ドラマ第2シリーズにて別役で出演している。また、主演の松本潤は先代の堂本が主演した同局のドラマ「向井荒太の動物日記 〜愛犬ロシナンテの災難〜」の最終回のおまけシーンに金田一役のバトンタッチとして登場している。ビデオ、DVD のジャケットには制服姿の一と美雪が写っているが、本編では不動高校のシーンがないため、制服姿の2人はほとんどない。連続ドラマ第3シリーズ「金田一少年の事件簿」、単発ドラマ「魔術列車殺人事件」が制作された。
映画化作品として1997年12月13日に公開された。堤幸彦監督作品。配給収入は14億円。第16回ゴールデングロス賞優秀銀賞を受賞。第1・2シリーズ（初代金田一シリーズ）の完結篇となっており、ラストではじめと美雪が想いを伝え合う。全シリーズ通して、唯一完結が描かれた作品である。実際に上海で撮影されているが、「中国の警察が日本の探偵に負けてしまう」という内容が問題となり、中国での上映が禁止された。香港や台湾では公開されている（『金田一少年の事件簿公式ガイドブックファイナル ラストエピソード』より）。
第1シリーズと同じキャスト、スタッフの続編。メインキャストは堂本剛（KinKi Kids）、ともさかりえ、古尾谷雅人。日本テレビ系で1996年7月13日 - 9月14日、毎週土曜日21:00 - 21:54に放送された。平均視聴率22.4%（クール1位）を記録し、第1シリーズに続き20%を超えた。第7話「異人館ホテル殺人事件」では、はじめが入院してしまい、代わりに美雪が推理を披露している。さらに、ゲストキャストに堂本光一（KinKi Kids）主演の連続ドラマ『銀狼怪奇ファイル』ゆかりの天神学園の生徒（三宅健、秋山純、松山幸次）が登場する。なお、秋山と松山は第1期で別役で登場している。また、実写作品の続編でキャスト変更を行っていないドラマとしては珍しく、原作同様に登場人物が加齢していない。今シリーズでは、CM明けに容疑者リストが表示されるようになっており、死亡者には「DEAD」の文字が表示される（CMが明ける度に「DEAD」と記された被害者以外の人物たちの表情が変化していく、「あそび」的要素も含まれている）。ただし、「DEAD」の文字表示には例外もある。
1970年代以降、ロバート・ルーカス（1995年ノーベル賞受賞）、トーマス・サージェント（2011年ノーベル賞受賞）、ロバート・バロー、ロバート・タウンゼントらを中心に、シカゴ学派は第二世代の実証主義から数学的に厳密な理論へと研究が一変した。ルーカスは1972年に発表した論文"Expectations and the Neutrality of Money"において、合理的期待の仮定の下ではケインズ的な財政・金融政策は短期的ですら効果をもたらさないことを厳密な数学的方法で証明した。バローが1974年に発表したリカード＝バローの定理もこの合理的期待形成仮説を発展させたものである。さらに、「政府の政策が裁量的に変われば，経済主体の期待が変わるので，計量経済モデルの方程式のパラメーターが変化してしまう。それゆえ，クラインたちが完成させたマクロ計量経済学モデルは，予想妥当性を持たない。」と要約される「ルーカス批判」によって、ミクロ経済学的基礎付けのない当時の新古典派やケインズ派のマクロ経済研究の意義が無くなり、リアルビジネスサイクル理論を通じて新しい古典派や新ケインズ派といった今日の主流派マクロ経済学が誕生する契機となった。彼らはケインズ経済学だけでなく1960年代のシカゴ学派（の一部の経済学者）が支持したマネタリズムをも徹底的に批判したため（実物的景気循環理論）、前時代のシカゴ学派と区別するために、彼らを「ミネソタ学派」と呼ぶ場合もある。「ルーカス批判」によって「マクロ経済学のミクロ的基礎付け」というアイディアはマクロ経済学全体に普及した。これに対してルーカスは1987年の講義録で、「近年の最も興味深いマクロ経済学の進展は、インフレや景気循環のようなマクロの問題が、ミクロ経済理論の一般的なフレームワークの中で扱われるようになったことであり、この進展が進めば、マクロという言葉自体も使われなくなるだろう」と述べ、ケインズ経済学について「理論にそぐわない、理解し難い現象が現れた時に、それは何か全く別の経済理論の証左だと言いたくなる誘惑に屈服したものである」と切り捨てている。