ニューヨーク市とロングアイランドの鉄道貨物輸送は衰退しているが、アメリカ各地からの旅客列車（通勤電車および州間連絡列車）が頻繁に運行されている。ニューヨーク市からの都市間連絡鉄道はアムトラックが担っている。ニューヨークからフィラデルフィアへの路線には毎日54本の列車が走っている。アムトラックはニューヨークから北東回廊経由で500マイル（800キロメートル）未満の各都市へ向かう場合には航空機よりも安く速く移動することができる。アムトラックはニューヨーク - ワシントンD.C.間を自動車を使わずに移動する人のうち47％が利用しており、自動車利用者も含めると約14％が利用している。アムトラックの高速列車アセラ・エクスプレスはボストンから北東回廊経由でニューヨークを通りワシントンD.C.までを約7時間で結んでいる。車両には車体傾斜装置がついておりカーブを高速で通過することが可能である。アムトラックの駅で最も乗客数が多い駅がニューヨークに位置するペンシルベニア駅で、2004年には4400万人の乗客が利用しており2番目に乗客数の多い駅であるワシントンD.C.のユニオン駅の2倍以上となっている。夜行列車も運行されておりニューヨーク市からシカゴ（西海岸の路線に接続） 、アトランタ、ニューオーリンズ、マイアミに向かっている。マイアミへは1日2本、シャローットやサバンナへは1日1本が運行されている。シカゴへはアップステート・ニューヨーク - クリーブランド経由が1日1本、シンシナティ経由が週3本運行されている。そのほか、運行頻度の多い行き先としてはオールバニ、ボルチモア、ボストン、ハリスバーグ、フィラデルフィア、プロビデンス、ワシントンD.C.などがある。また、カナダのトロントやモントリオールへ向かう国際列車も運行されている。
ニューヨーク市の通勤鉄道網はアメリカ国内で最も広範囲に渡っており、ニューヨーク都市圏ではおよそ250の鉄道駅と20の路線が年間1億5,000万人の通勤者を輸送している。郊外から市内へ向かう鉄道は大きく2つの会社が運営している。ロングアイランドからのロングアイランド鉄道とコネチカットとハドソン・バレーからのメトロノース鉄道をMTAが、ハドソン川西に広がる路線網をニュージャージー・トランジットが運営している。これらの鉄道はマンハッタンにあるアメリカ国内で最も混雑する駅であるペンシルベニア駅と2番目に混雑する駅であるグランド・セントラル駅をニューヨーク市側のターミナルとしている。更に、これらの路線から南東ペンシルベニア交通局（SEPTA）などに乗り換えることにより、更に遠方へ向かうことができる。
ジョン・F・ケネディ国際空港とニューアーク・リバティー国際空港へは空港連絡鉄道が運行されている。ジョン・F・ケネディ国際空港の空港連絡鉄道はエアトレインJFKと呼ばれている。これは同空港とニューヨーク市地下鉄およびクイーンズの通勤電車網を結ぶ総延長8.1マイル（13キロメートル）の新交通システム路線で、空港ターミナル間の無料輸送機関も兼ねている。このため空港内から乗り空港内で降りる場合は運賃はいらず、空港外から乗る（へ行く）場合は5ドルの運賃が必要となる。2006年には約400万人がこの鉄道を利用しており、2005年に比べて約15％乗客数が増えている。ニューアーク・リバティー国際空港への連絡鉄道はエアトレイン・ニューアークと呼ばれている。こちらは同空港とアムトラックおよびニュージャージー・トランジットの北東回廊線を結ぶ総延長1.9マイル（3キロメートル）の跨座式モノレール路線である。
港湾公団ハドソン川横断公社、略称PATH、通称パストレインはマンハッタンとニュージャージー州のジャージーシティ、ホーボーケン、ハリソン、ニューアークを結ぶ4路線を運行している高速輸送鉄道である。マンハッタン - ニュージャージー間の主要な交通機関となっているPATHは平日に4路線合計で24万人の乗客を輸送している。一部の駅はニューヨーク市地下鉄やハドソン・ベルゲン・ライトレールの駅と隣接しているが、双方を行き来する無料の連絡通路は無く乗り換える場合は必ず改札を出て再度入り直す必要がある。また、ニューヨーク市地下鉄と同様に24時間運転となっている。PATHは元々1908年に私有企業であるハドソン・アンド・マンハッタン鉄道として開業し、1962年以降はニューヨーク・ニュージャージー港湾公社によって運営されている。
ニューヨーク市の地下鉄は総駅数424駅という世界最大の地下鉄網で、年間旅客数（2015年17億6000万人）では7番目となる。この地下鉄はアメリカ国内ではボストンの地下鉄の次に作られた2番目に古い地下鉄である。 2002年には毎日480万人の乗客が地下鉄を利用している。2013年には、地下鉄が17億両以上の車両を納入し、平日は約550万両、土曜日は約320万両、日曜日には約260万両が平均で運行されている。特にガソリン価格の上昇と地下鉄のエネルギー効率の良さのため、ここ数年乗客数は一貫して増加している。ニューヨーク市内の鉄道は市民の大きな足となっており、ニューヨーク市地下鉄とパストレインは24時間運転している。市内を走るニューヨーク市地下鉄の25個の系統はスタテンアイランド鉄道線を除く全ての地下鉄路線を24時間運行している。地下鉄の乗客は運賃をメトロカードで支払っている。メトロカードは地下鉄のほか、その他の市内の高速輸送システムやバス、ルーズベルト・アイランド・トラムウェイでも使用することができる。メトロカードは過去に使用されていたトークンの代わりとして開発され、トークンはメトロカードの導入と共に廃止された。
当地区では、明治時代の初期（1869〜1872年頃）には、邸地、寺社境内などに新しい町名を付す、あるいは小規模な町を隣町に合併するなどの変更が多数実施された。その結果、明治11年（1878年）の浅草区成立時には区内に110か町が存在していた（一丁目、二丁目等はそれぞれを1町と数える）。明治22年（1889年）の東京市成立時には北豊島郡の一部が浅草区に編入された。当該編入区域には、2年後の明治24年（1891年）までに新たに6か町が設置され（これらの詳細は後述）、区内の町丁数は116となった。浅草区は関東大震災で大きな被害を受けた。震災復興・区画整理に伴い、区内では昭和7年（1932年）から同16年にかけて大規模な町名整理が実施された。これにより従前の町名の多くが廃止されている。昭和22年（1947年）の台東区成立後、昭和39年（1964年）から41年にかけて浅草地区の住居表示が実施され、町名・町界が再度変更された。このように再度にわたる大規模な町名整理を経ているため、当地区では同一の地名であっても、時期によって指し示す範囲が異なっている場合があるので注意を要する。一例として、昭和9年（1934年）に成立した「雷門一・二丁目」と、昭和40年（1965年）の住居表示実施によって成立した現行町名の「雷門一・二丁目」は（一部重なる部分もあるが）別個の町域で、旧・雷門二丁目は現・浅草一丁目にあたる。