崇徳可汗の次は弟の曷薩特勤が立って昭礼可汗（在位：824年 - 832年）となったが、彼はその配下に殺されてしまう。続いて従子の胡特勤が立って彰信可汗（在位：832年 - 839年）となったが、彼もまた宰相の掘羅勿（キュレビル、Küräbir）という者に殺され、代わりに㕎馺特勤（在位：839年 - 840年）が立てられて可汗となった。当時のモンゴル高原では異常気象が相次ぎ多くの家畜が死に絶えた。　渠長（宰相）の句録莫賀（句録末賀、キュリュグ・バガ）は掘羅勿を恨み、黠戛斯（キルギス）10万騎を招き寄せて回鶻城（オルド・バリクか？）を攻め、㕎馺可汗と掘羅勿を殺し、その牙帳を焼き払った。これによって回鶻可汗国は崩壊し、諸部は分散した。宰相の一人である馺職（そうしょく）は厖特勤の15部とともに葛邏禄（カルルク）に奔走し、残りは吐蕃（河西）と安西（タリム盆地）に逃げ込んだ。
元和3年（808年）、長寿天親可汗以来、4代の可汗に嫁いできた咸安公主が亡くなったため、保義可汗（在位：808年 - 821年）は唐に新たな公主を求めた。しかし、唐がそれに応じなかったため、保義可汗は3千騎を率いて鸊鵜泉に至り、唐の辺境を脅かした。これによって唐の辺軍は戒厳令を敷き、両国に緊張が走った。憲宗（在位：806年 - 820年）は宗正少卿の李孝誠と太常博士の殷侑を回鶻に赴かせ、回鶻を説得させたが、保義可汗は求婚をあきらめず、翌年にまた合達干（アルプ・タルカン）らを送って求婚させた。長慶元年（821年）、穆宗（在位：821年 - 824年）の代になってようやく許しが出たが、保義可汗はこの世を去ってしまう。そこで穆宗は皇妹である太和公主を次の崇徳可汗（在位：821年 - 824年）に出嫁することにし、太和公主が新たな回鶻可敦（ウイグル・カトゥン：皇后）となった。
貞元11年（795年）2月、奉誠可汗が死去し、子がいなかったため、国人たちは宰相である阿跌（エディズ）氏の骨咄禄（クトゥルグ）を立てて可汗とした。彼は6月に唐から懐信可汗（在位：795年 - 805年）に冊立されるが、これによって回鶻の薬羅葛（ヤグラカル）政権が終わり、阿跌（エディズ）政権が始まったことになる。懐信可汗はマニ教を再び受容し、西方からの文化を受け入れていった。この後、マニ教は回鶻可汗国の国教になっていく。
1346年に義父アブー・バクルがチュニスで没した後、ハフス朝内では後継者争いが勃発したイフリーキーヤは分裂状態になり、王位を争う一派の中からマリーン朝の支援を求める者たちが現れた。1347年初頭、ハフス朝から亡命した侍従（ハージブ）イブン・ティーファラージーンの進言を容れたアルハサンは、息子のアブー・イナーン・ファーリスにトレムセンを中心とするマグリブ中部の支配を委ね、東進を開始した。マリーン朝軍はイフリーキーヤを早々に通り抜け、同年9月15日にチュニスに入城する。モロッコからチュニジアにわたる北アフリカ一帯がマリーン朝の支配下に置かれ、マリーン朝はかつてマグリブを支配していたムワッヒド朝に匹敵する大国となった。しかし、広大な領土を最後まで保つことはできなかった。マグリブ南部のカビーラの非友好的なアラブ遊牧民（ベドウィン）に対して、彼らの指導者が封地に有する権利を認め、役人に登用することで懐柔を図った。1348年4月、カイラワーン近郊の戦いでアルハサンはアラブ遊牧民および彼らの支援を受けたハフス朝のスルタン・アブー・アルアッバース・アフマドとの戦いに敗れ、その余波を受けてチュニス、トレムセンにおけるマリーン朝の権威は失墜した。タシュフィーン1世の末子アブー・サイード・ウスマーン2世がトレムセンを回復、ハフス朝の王子たちもコンスタンティーヌ、ボーナ、ヴィジャヤを拠点としてそれぞれ王位を主張した。マリーン「帝国」は早くも崩壊し、ムワッヒド朝の再建というアルハサンの夢は水泡に帰した。1349年12月13日にアルハサンはやむなくチュニスを後にするが、陸路は敵軍に阻まれており、海路によってヴィジャヤに帰還しようとした。しかし、船は嵐に見舞われて損傷を受け、ヴィジャヤへの入港を阻止され、艦船は沈没して将兵、艦船に同乗していた法学者たちの多くが溺死した。数人の部下と共にかろうじてアルジェリアに逃れ、奪回に十分な数の軍隊を集めてトレムセンに向かうが、シェリーフ川（en:Chelif River）付近の戦いでザイヤーン朝の王子に敗れて計画を挫かれる。なお、最大版図を実現したマリーン朝の急速な崩壊について、チェコスロバキアのアラブ史研究者であるI.フルベクは、人材と物資が二方向に分散していたこと、王朝内に存在していた部族主義と地域主義、財政にかかる負担、国内の統制の不足を原因として挙げた。