1963年のボルボ PV 544に始まるミッコラのラリーキャリアは31年に渡ったが、最も成功したのは1970年代と1980年代だった。1970年代、ミッコラはフォード・エスコートを駆る数多くの国際的イベントのフロントランナーだった。WRCドライバーズタイトルが創設された1979年には重要な局面をつくり、チャンピオンとなったビョルン・ワルデガルドに僅か1ポイント及ばず総合2位でシーズンを終えた。ミッコラは1977年にスウェーデン人のコ・ドライバー、アーネ・ヘルツと組んだ。この組は非常に速く力を発揮し、エスコートで1978年の英国ラリー選手権タイトルを獲得した。ミッコラ / ヘルツのパートナーシップは1990年シーズンの終わりまで13年間続き、1991年シーズンはヨニー・ヨハンセンと組んだ。ミッコラはフォードで1980年再びシーズン2位となったが、1981年シーズンには新しいアウディ・ファクトリー・チームに移り、革命的な四輪駆動アウディ・クアトロをドライヴした。この提携は当初から成功し、ミッコラはアウディのデビューイベント、1981年ラリー・モンテカルロをアクシデントでリタイアするまでリードした。次のWRCイベント、スウェーディッシュ・ラリーでは圧勝したが、クアトロは信頼性の問題を抱えており、RACラリーで更に勝利を重ねたにもかかわらずミッコラはドライバー選手権で3位となっただけだった。翌年は1000湖とRACに勝利したが、オペルのヴァルター・ロールとチームメイトのミシェル・ムートンに遅れ再度3位で選手権を終えた。1983年はミッコラの年となった。4勝し3回2位となり、ついに彼とコ・ドライバー、アーネ・ヘルツが世界選手権タイトルを獲得した。続く1984年はチームメイトのスティグ・ブロンクビストに次いで選手権2位となったが、1985年は新しいグループB競技でアウディ・チームはプジョーとランチアに圧倒され、4戦エントリーに留まり3回リタイア、4位1回で最終順位は22位に落ちた。ミッコラは1987年シーズンまでアウディに残り、この年グループA アウディ・200でサファリ・ラリーに勝利し、翌年マツダに移籍した。1993年に完全にモータースポーツを引退するまで国際的なラリーにスポット参戦していたが、1991年にセミ・リタイアに入るまではマツダに留まっていた。その後ミッコラは1970年ロンドン-メキシコ・ワールドカップ・ラリー25周年記念ランでのコ・ドライバー、グンナー・パルムとの再会（ミッコラは1970年のこのイベントと1995年の再走に優勝している）や、1968年の1000湖ラリー  で優勝したフォード・エスコートで長男のユハ・ミッコラ とロンドン-シドニー・マラソン 2000 ラリー出場などを行った。2008年9月、ミッコラはスコットランド・ラリー選手権のラウンド、コリン・マクレー・フォレスト・ステージ・ラリー（ Colin McRae Forest Stages Rally ）にフォード・エスコートで参加した。2007年に死去したマクレーの追悼イベントには何人かの元世界チャンピオンも参加しており、ミッコラもそのひとりだった。
1990年、埼玉大学工学部電子工学科卒業。1995年、埼玉大学大学院理工学研究科博士後期課程修了。博士（学術）（埼玉大学）。同年に山梨大学工学部助手、2002年より山梨大学工学部助教授、2007年より同准教授を経て、2014年4月より同教授。
1988年、調教師である藤岡健一の二男として生まれる。兄・佑介に影響され乗馬を始め、その後父の影響で競馬の騎手を志す。2004年に競馬学校第23期生として入学、同期生には浜中俊らがいた。2007年に平地・障害の免許を取得する。同年、宮徹厩舎の所属となり、3月3日に中京競馬場で行われた3歳未勝利戦にて初騎乗を果たす。このレースで、父・健一の管理馬で1番人気に推されたヤマニンプロローグに騎乗した藤岡は、2着に1/2馬身差をつけ勝利、JRA史上42人目となる初騎乗・初勝利を達成した。また、この日の騎乗回数8回は1996年の福永祐一、1997年の武幸四郎と並ぶデビュー日最多騎乗回数タイ記録であった。2009年にはジョーカプチーノとのコンビでファルコンステークス・NHKマイルカップ両競走を制覇し、重賞競走並びにGI競走初勝利（GI騎乗2回目での初制覇）を達成。20歳4か月22日でのGI勝利はグレード制導入後では10番目のスピード記録となり、兄・佑介よりも早いGI制覇となった。この他8月にはオーストラリアのフレミントン競馬場にて行われた「アジアヤングガンズチャレンジ」に日本代表として出場、35ポイントを獲得し優勝した。2010年、2月7日の中京第9競走でJRA通算100勝を達成。3月26日の早朝に胸の痛みを訴え、救急車で病院に搬送される。肺気腫（後の報道では自然気胸）と診断され、この週の騎乗予定をすべて取り止めて以後休養に入り、3月31日に手術。4月10日にいったん復帰したが、4月21日に再手術のため4月11日以降ふたたび休養に入り、再手術終了後の5月25日から調教に参加し、6月5日に復帰した。しかし2011年9月18日に持病の自然気胸が再発したため騎乗を取り止め、10月23日から11月29日まで治療のため静養していた。2014年10月18日、府中牝馬ステークスをディアデラマドレで優勝して、初のGII制覇。この年は自身最多の年間51勝を記録している。2015年3月22日、中京2Rをティーポイズンで制し、JRA通算300勝を達成。この年は59勝を記録し、前年の自己記録を上回っている。2016年12月10日、中京6Rをフィエルテで制し、JRA通算400勝を達成。また、初勝利、JRA通算100勝・300勝・400勝、JRA重賞初勝利を中京競馬場で達成している。2018年9月23日、神戸新聞杯をワグネリアンで制し、JRA通算500勝を重賞勝利で達成した。同馬の主戦騎手だった福永祐一騎手の落馬負傷に伴い、普段調教をつけている藤岡に代打騎乗が回ってきたことでの勝利だった。