主人公、元ヤンキー乙宮灰音は資産家のみが入学できる学園『帝国学園』に通う高校1年生である。この学園では生徒たちが金・銀・銅とランク付けされており、灰音はこの中で一番格下の銅に位置している。そんな灰音が恋心を抱いているのは帝国学園高等部生徒会長の東宮閑雅（通称皇帝）。ある出来事をきっかけに灰音は生徒会に入り、庶務兼皇帝の用心棒となった。さらに今は皇帝の女よけとしての偽恋人となり、学園内ただ1人の特別なランクであるプラチナとなる。閑雅に段々近づいていく灰音だが、ある事件から、現在帝国学園に通っている閑雅は、本当の閑雅ではないと気付いてしまう。実は、閑雅には双子の兄がいて、高等部からはその兄・東宮高成が病気を患っている閑雅の代わりに影武者として学園に通っていたのだ（このことは東宮家の人物と灰音以外は知らない）。また、灰音が大好きな絵本を描いたのは高成で、灰音がヤンキーをやめるきっかけをくれたのは閑雅だった。その後、灰音は、自分が閑雅だけではなく、高成も好きだと気付く。
地元、所沢市とさいたま市を本拠地とするプロバスケットボールチーム埼玉ブロンコスのオフィシャルパートナー（パンツスポンサー）である。2006年（平成18年）に日本プロサッカーリーグ（Jリーグ）川崎フロンターレのオフィシャルスポンサーとなり、3月の開幕戦からピッチサイドにアドボードを掲示。同年4月からは、本拠地・等々力陸上競技場のメインスタンドに出店した。2010年3月、埼玉スタジアム2002のコンコース内に出店した。
FM NACK5・文化放送で頻繁にスポットCMが流れる（文化放送CMのナレーションは野村邦丸が担当）。その末の言葉は「いらっしゃいませ。山田うどん」である。2008年（平成20年）4月からはTBSラジオでも放送されるようになった。2007年（平成19年）4月5日 - 4月15日に行われた「春のお客様感謝キャンペーン」のために、かかしが「山田うどんの歌」（アルバム「バーンパーク」にボーナストラックとして収録）を制作発表し、それをCMや各店舗のBGMとして使用。同曲はキャンペーン終了後も引き続き使用されており、2019年の日本映画『翔んで埼玉』の劇中曲としても登場している。
埼玉県庁が推進する「みんなでマイボトル運動」の飲食店冷水無料協力店となっている。これは、該当する山田うどんの店内で食事をした客がマイボトルへの給水を希望した場合、店側が無料で冷水を提供する活動である。
全店舗が関東地方のみの出店で、全店舗のおよそ半数が埼玉県で出店（2012年時点で92店舗）されている。かつては山口県萩市やニューヨーク（ラーメン店）にもあった。客席50席前後の店舗が多く、街道沿いのロードサイド出店が主力で、トラック専用スペースを用意した駐車場が多い、などの特徴がある。フランチャイズ店は「山田うどん」の店名で営業すること、セントラルキッチン「入間工場」から食材の提供を受けること以外の点については、必ずしも一律ではなく、営業時間もまちまちである。中には直営店にはないオリジナルメニューが存在したり、逆にどの直営店にもある定番メニューがなかったり（メニューや公式サイトに「一部の店舗を除く」と記載）するほか、店舗内外装が奇抜なデザインの店、夜には居酒屋を併営、名物店主やイベント開催など、個性的な店舗が存在する。かつては、小規模な店舗（兼住宅）で営業していたそば・うどん店主のフランチャイズ加盟も少なくなく、駐車場もないようなミニ店舗が「山田うどん」の看板を掲げていた例もあった。「山田うどん」の他に別業態の店として「らーめん食堂かかし（かかしのラーメン）」（ラーメン店。2店舗）・「山田うどん食堂」（うどん・ラーメン店。4店舗）・「うどん亭ヤマダテラス」（フードコート内店舗。1店舗）・「県民酒場ダウドン」（うどん店・居酒屋。1店舗）がある。また2017年には、とんかつ店「かかし乃」を出店した（とんかつ店。1店舗）。
前述のとおり、戦術パートは戦術シミュレーションの形式をとる。戦術パートに参加できるのはアイドル班と実動班のメンバーのみで、出撃できるメカは作戦ごとに決められている。作戦に入る前に、その概要説明と、装備や搭乗員の選択が行われる。また、「LOGOS Safeモード」が起動し、ミッション開始から再開できるデータをセーブすることができる。搭乗するメカや車両を操作するにはそれぞれの機体に応じた免許が必要とされ、それが無い者はその車両に乗ることができない。車両の装備の選択を行った後は作戦会議が開かれる。このときに攻略のヒントが与えられたり、選択で微妙に難易度が上下したり、後述する成功率に影響を与えることがある。そして、選択したユニットを率い、救助活動やテロの鎮圧などの作戦を実行する。戦術パートでは、ストーリーの性質上、災害救助系のミッションが多い。そのため、敵を撃破する「戦闘」よりも効率のよい移動や他のユニットの誘導が必要とされ、パズル的な思考が求められることが多い。装備にも避難を呼びかけるための拡声器や牽引用のワイヤーガン、誘導や足止めに使えるスモーク弾などがあり、それらを使うことがしばしばである。また、ミッションに関係の無い車両やオブジェクトはロボで踏み潰して破壊することが可能だが、その場合、損害賠償請求をされて、利潤からその分を引かれてしまう。戦闘で自ユニットが破壊されたときも修理費が利益から引かれるが、その額は一般車両とは比べ物にならない。ミッションが成功すると、成功報酬が入り、参加した人員には「実務経験」が加算される。さらに参加したアイドル班のメンバーの人気も上昇する。なお、ミッションには「成功率」があり、それが100%未満だと成功報酬が減額され、その後のイベントにも影響を与えることがある。成功率はクリアまでのターン数や達成目標などによって上下する。