2015年4月に導入された。事業者の責任において、「おなかの調子を整える」「脂肪の吸収を抑える」などの科学的根拠に基づいた機能性を表示した食品。販売の60日前までに安全性及び機能性の根拠に関する情報を消費者庁長官へ届け出ることにより表示できる。ただし、特定保健用食品とは異なり、消費者庁長官の個別の許可を受けたものではない。特定保健用食品の審査が厳しく、認可取得までの時間と費用がかかり過ぎるという問題を受けて導入された制度であるが、消費者庁の審査が不要になったことにより食品の機能性表示が容易に行えるようになった反面、「チェックの方法があいまいである」「国は健康被害のリスクを全面的に消費者に負わせている」など制度を問題視する意見もある。また、届け出のあった商品の一部には消費者団体などから効果や安全性を疑問視する意見が消費者庁へ提出されている。
2005年より制度化されたが、これまでに認可申請はほとんど無い。特定保健用食品のうち、特定保健用食品の許可のレベルには届かないが一定の有効性が確認される食品（作用機序は明確だが有効性は少し低い・作用機序は不明だが有効性は認められる）について、限定的な科学的根拠である旨の表示をすることを条件として許可対象とされるもの。表示内容の前に「根拠は必ずしも確立されていませんが」という但し書きが必須となる。トクホの場合に数千万円とも言われる認可取得に要する費用が大幅に軽減されるわけでもなく、食品企業にとって取得のメリットがないため認可をとろうとする企業が少なく、開発された条件付き特定保健用食品はほとんど無いのが現状である。
その成分を含んだ特定保健用食品許可実績が十分（おおよそ100件以上）であり、科学的根拠が蓄積されている一定の基準を満たしている食品（成分）に関しては、国が規格基準を定めたうえで、個別審査なしで許可をうけることができる。
実験データに基づいて審査を受け、健康づくりのための食習慣改善のきっかけとして「～が気になる方に」という効能効果を表示することを日本政府から認可された食品。通称「トクホ」「特保」と呼ばれる。健康増進法に基づく特別用途食品に含まれる。1991年に導入された制度だが、認知度が低かったため、日本国政府がヤクルト本社にトクホを取得するように提案し、1998年認可された。医薬品ほどの効能がない食品機能を保証する制度であるが、審査が厳しく認可取得に関する費用と時間がかかり過ぎることが問題視されてきた。当初の所管は厚生労働省であったが、2009年9月に製造所固有記号の届出などとともに、消費者庁の食品表示課に所管が変更されている。審査にあたっては消費者庁から専門家からなる内閣府消費者委員会へ諮問がなされ、消費者委員会の出した答申を参考にして消費者庁が許可・不許可を決める。通常は消費者委員会の答申通りの決定がなされるが、消費者委員会が「適切でない」としたノンアルコール飲料2種について、消費者庁が許可する事例が発生した。消費者委員会の答申が覆されたのはこれが初めて。臨床試験では、数十人の被験者数で行っていた企業が多かったが、6人といった企業もあり、2012年には基準策定が模索されてきた。
保健機能食品は、健康食品のうち安全性や有効性等が国の設定した一定の基準を満たした食品である。健康食品の品質を見極める時、評価基準の一つとすることが出来る。健康増進法及び食品衛生法により定義され、特定保健用食品と栄養機能食品、機能性表示食品の3つに分けられる。
上記のとおりラトビア大学時代の1926年から1928年にわたって「 Vorarbeiten zu einer Algenflora von Lettland I-IV （”ラトビアの藻類相に関する研究” 1-4）」と題する一連の優れた論文を書き、これによってラトビア産の藻類相が飛躍的に明らかにされた。更に1934年と1939年には「 Beitrag zur Algenflora Lettlands I, II （”ラトビア産藻類相の研究”1、2）」でラトビアの淡水藻類の全群についての研究結果を公表した。またラトビア産以外の藻類についても論文を書いており、1937年にはウィーン国立科学アカデミーによる中国南西部調査の研究報告書の藻類の部を担当し、1938年にはドイツによるスンダ列島の淡水域調査の調査報告書において同列島の淡水産紅藻類の研究を担当した。渡瑞後のウプサラ大学時代にも引き続き研究に打ち込み、1948年には「 Taxonomie des Phytoplankton einiger Seen in Uppland （”ウップランドの湖沼性植物プランクトンの分類学的研究”）」という399ページの論文を、1956年には「 Taxonomische und biologische Studien über das Phytoplankton schwedischer binnengewässer （”スウェーデンの淡水植物プランクトンの分類と生物学的研究”）」という404ページの大冊の論文を著わした。スウェーデン以外のものについても1949年に「 Zur Süßwasserralgenflora Burmas （”ビルマの淡水藻類相について”）」を書いている。これらの他にも協力者によって得られた資料をその都度発表するなどして長短の多数の論文を書いているが、かつて製図技師の経験もある彼の作図は、「各論文に見られる氏の図は精確で独特の迫力があり他の学者の追従を許さぬものである」とも評される。彼が常ながら深い興味を覚えていた淡水産紅藻類についての広範なモノグラフも計画していたとされるが、これは実現せずに終わった。