駅跡地には遠軽地区広域組合消防署湧別出張所及び湧別町文化センターさざ波が建設されており、消防署前の歩道には「湧別駅の跡」の記念碑が建立されている。
当駅の所在する地名より。地名は、アイヌ語の「ユペ・オッ」（カレイサメが多い）に由来する。別説として「イペ・オッ・イ」（魚の豊富である所）に由来するという説もある。
廃止時点で、単式ホーム1面1線を有する地上駅であった。ホームは線路の北西側（湧別方面に向かって左手側）に存在した。転轍機を持たない棒線駅となっていた。かつては貨物用の側線を2線有しており、駅舎側から1、2、3番線となっていた（1975年（昭和50年）3月時点ではこの配線）。そのほか1番線の延長上から遠軽方に戻る形で駅舎側に分岐し駅舎北側の貨物ホームに至る側線を1線有していた（以上の側線は1981年（昭和56年）3月時点では撤去済みであった）。無人駅（簡易委託駅）となっていたが、有人駅時代の駅舎が残っていた。駅舎は構内の北西側に位置し、ホームとは通路で連絡した。開業当初からの、民家の様な木造平屋建ての建物であった。ホームの有効長は旅客ホームが50 m、貨物ホームが30 mであった。
中湧別駅から分岐する支線の終着駅となっていた。この区間は平行するバス路線は10本程度あったものの、末期の列車本数が朝夕の2往復しかなく、国鉄時代には清水港線（1往復/日）に次いで旅客列車の少ない区間として鉄道ファンに知られていた。しかしその様な駅でありながら、1986年11月1日国鉄ダイヤ改正まで駅員が配置されており、その後廃止時までは簡易委託駅となっていた。
湊素堂は1961年 (昭和36年) 11月に建長僧堂師家代参となった後、1964年 (昭和39年) 6月からは建長寺派管長兼僧堂師家に就任して1980年 (昭和55年) 5月8日に建長寺退山するまでの16年間もの間、臨済宗建長寺派の隆盛に力を注いだのであります。しかし、師匠である竹田益州からの「戻ってきて欲しい」という願いを叶えるために、湊素堂は「師命尊し」と修行の故地、建仁僧堂に移ることを決意した。これについて、湊素堂自身も以下の様に書いている。『京都の建仁寺僧堂の老師から老齢の故を以て帰って呉れとの依頼状を受けたのであるが、其の後の宗議会の席上の挨拶で其の由を報告し、「十八年間緑有って皆様の御援助で今日まで建長寺に居らしていただいたが、此の度師匠より帰って呉れないかと請われました。師の命は、万事に優先しますから誠に申し訳ありませんが京都に帰ります」と思いを決して断言しました。私としては断腸の思いでありました。』
1974年3月31日、JMPの役員の一人が、北海道室蘭市のバス会社の代表取締役社長に就任したが、翌1975年（昭和50年）4月10日に退任、5月には同社から特別背任容疑で札幌地検室蘭支部に告訴され、9月に逮捕、10月に起訴された。容疑の中核は、十六億七千万円にのぼる同社の手形を不正に乱発し、同社に実質五億円の損害を与えたことによる。この大型背任事件については、北海道新聞、朝日新聞、読売新聞、毎日新聞、サンケイ新聞等で報じられ、参議院の運輸委員会でも質疑応答がなされている。同役員に対しては札幌地裁が懲役3年6月の実刑判決を1981年（昭和56年）7月6日に言い渡し、控訴棄却、上告棄却を経て1984年（昭和59年）4月までに確定した。それらの記事によると、同役員は再建屋を自称しているが実態は整理屋であり、1973年夏頃にバス会社の経営難を聞きつけるや早速接近、衆議院の運輸委員長であった三池の信用を餌にバス会社に社長として乗り込んだが、まともな再建策は講じず、手形乱発により損害を与えて倒産に追い込んでいる（その後、バス会社は再建）。1974年5月には、JMPに対する三池からの融資の返済に、JMPの業務とは無縁のバス会社の七千五百万円の手形を充てようとしたが、この手形は三池から返却されている。バス会社への接近工作が1973年夏から1974年3月にかけて、手形乱発は1974年4月から9月にかけてのことで、同役員はこの大事な時期に、JMPの業務よりもバス会社の乗っ取りに熱中していた。三池、望月、守田ら他の役員は映画製作を志してJMPを興したが、同役員だけは詐欺の舞台装置としてJMPを利用したというのが、この事件についての各紙社会部・経済部の記事の論調であった。ところが、これらの記事は、映画『氷雪の門』を巡るその後の報道に生かされなかった。映画記者と社会部・経済部記者との情報のギャップによるものと思われるが、そのため村山三男、国弘威雄をはじめ『氷雪の門』一作かぎりの契約スタッフや出演者の大多数は、同役員の一連の怠業と不正を知らないまま過ごした。事情を知っている他の役員は騙されていたことを羞じてか、あるいは同役員の法廷闘争を見守ることを優先してか、スタッフや出演者の大多数に積極的な釈明を行わなかった。