同年のドーフィネ・リベレ開幕を目前にして、自転車競技界を震撼させたオペラシオン・プエルトにボテロも関与しているという疑いが持たれ(渦中の医師が元ケルメのチームドクターだったため)、6月2日、フォナックはボテロに出場禁止処分を言い渡した。しかし同年10月2日、コロンビア自転車競技連盟は、ボテロの関与は認められなかったことを表明した(出場停止の最終判断はUCIではなく各国の自転車競技連盟が下すため、この判断により競技復帰)。ところで、フォナックチームはその後、同年のツール・ド・フランスにおいて総合1位となりながらも、後に失格処分が下ることになるランディスの影響を強く蒙り、同年に解散に追い込まれることになる。翌2007年、地元コロンビアのウネ・オルビテルに移籍。コロンビア国内選手権の個人タイムトライアルや、ブエルタ・ア・コロンビアで総合優勝を飾るなど、圧倒的な強さをみせつけた。また2008年、アメリカ合衆国に所在するロックレーシングに移籍した。2009年、国内選手権・個人タイムトライアル優勝。
2003年、T-モバイル（2003年はドイツテレコム）に移籍。2004年まで在籍したが、アシスト役に徹する機会が多く、これといった戦績を残すことはできなかった。だが、フォナックに移籍した2005年、ケルメ時代を彷彿とさせるかのような活躍を見せる。同チームのリーダー格的存在となったことが功を奏し、ツール・ド・ロマンディでは総合優勝（区間1勝）、ドーフィネ・リベレでは区間2勝を挙げ総合2位。そしてツール・ド・フランスでは堂々リーダーとして出場した。しかし第11ステージで2位に入った程度の成績に終わり、途中からフロイド・ランディスのアシスト役に回らざるを得なくなった。結局この年の総合順位は51位に終わった。それでも2006年シーズンについては、この年のツール・ド・フランスを制することになるオスカル・ペレイロがケス・デパーニュへ移籍したことから、ランディスとともにダブルリーダーの称号を事実上チーム内から与えられた。同年のカタルーニャ一周で総合2位に入り、昨年の捲土重来に期するものがあった。だがその後、思わぬ形でその年のツールに出場できなくなったばかりか、ロードレースの第一線からも退かざるを得ない羽目に陥ることになる。
1996年から2002年まで、スペインの名門チーム、ケルメに在籍。1999年のパリ〜ニースで区間1勝。そして翌2000年のツール・ド・フランスでは大活躍を見せる。第14ステージにおいて、ツールでは定番の難所と言われるイゾアール峠をトップで通過。最後はパオロ・サヴォルデッリ、マルコ・パンターニらを抑えて区間優勝を果たした。そして、総合7位に食い込んだ他、山岳賞（マイヨ・グランペール）部門においても、当時同賞を5回獲得していたリシャール・ヴィランクを抑えて受賞。2001年、ツール・ド・フランスで総合8位。世界自転車選手権・個人タイムトライアルでは3位に入り、山岳レースのみならず、タイムトライアルにおいても非凡な走りを見せつけた。そして2002年、ツール・ド・フランスでは第9ステージの個人タイムトライアルで、王者、ランス・アームストロングを11秒差退け勝利。また5つの峠を通過する第15ステージでは、エディ・メルクスの息子である、アクセル・メルクスと序盤から競り合った末、最後はメルクスらを退けて勝利。総合では自身最高位となる4位に食い込んだ。そして同年10月10日、ゾルダーで行われた世界選手権の個人タイムトライアルで優勝し、悲願のアルカンシエルを手中にする。
益田氏の5代・益田兼季の子で益田惣領家の6代・益田兼時の弟・兼定は、周布郷の地頭となって周布氏を称した。その弟3人もそれぞれ分立して、兼直は末元氏、兼忠は丸茂氏、兼政は多根氏を称した。周布氏の歴代については異説があるが、貞応2年（1223年）3月の「石見国田数注文」に、すでに「すふ知行」として那賀郡来原を領していることがみえ、それは兼定のことであろうと考えられている。来原の地は来原別府と呼ばれ、兼定の弟・多根兼政の子弥四郎盛家が地頭職を得て、その子孫は南北朝時代から来原氏を称するようになった。兼定の周布郷・鳥居郷などの地頭職は、異母弟・兼政の子・時兼に譲られ、鳶巣城を本拠として以降、周布氏歴代に受け継がれた。鎌倉時代の半ば頃から周布氏・三隅氏・福屋氏ら、比較的早く独立した庶流各家は、惣領家の本拠益田から離れた地を領有していたこともあり、次第に惣領家とは別の独立した領主的活動を行うようになり、益田氏を中心にした惣領制は綻びを見せはじめた。南北朝時代には周布氏・三隅氏・福屋氏は南朝方に付いて、北朝方に付いた益田氏と争った。戦国時代に入ると、周布氏は地政学的に、周防山口の大大名大内氏に従うようになり、尼子氏に付いた益田氏と争った。周布氏は大内氏を通じて朝鮮と貿易を行った。大内氏滅亡後は毛利氏に居城の鳶巣城を攻められて、その傘下に入った。周布元兼は天正5年（1577年）の播磨上月城攻めの際、吉川元春の軍に属して討ち死にしている。その子長次の時に関ヶ原の戦いが起こり、西軍の総大将となった毛利輝元は減封処分を受け、安芸広島から長門萩に移封され、長次もそれに従って萩に移った。その子の元真のとき杉岡氏を称したが、孫・兼宣のときに再び周布氏に復した。以後、明治維新にいたるまで萩藩毛利氏家臣として存続した。幕末に分家の一族から周布政之助が出た。政之助は藩主毛利慶親に仕え、萩藩の財政再建などの藩政改革に取り組んだ村田清風のあとを引き継いで、萩藩革新政権を主導した。しかし、禁門の変、四ヶ国連合艦隊の下関来襲、第一次長州征伐など、防長を存亡の危機に追い込んだ責任を痛憤して、元治元年（1864年）9月、自刃している。江戸期に周布氏の一族は、萩藩大組筆頭の本家（1,530石）をはじめとして大組士に三家、他に萩藩陪臣として阿川毛利氏と周布氏本家の家臣に庶子家がある。