2011年3月11日の東北地方太平洋沖地震ならびに福島第一原子力発電所事故の松本の対応について週刊現代は、「官邸に引きこもって閣議後の定例会見すら開かない。取材対応も記者との立ち話程度で、原発のことを聞くと『私は担当じゃないから』と逃げる。何をやってるのかさっぱり分からない」（匿名の全国紙政治部記者）、「官邸の危機管理センターに詰めていた松本氏がまったくの役立たずで、自衛隊の初動が遅れた」（匿名の全国紙政治部デスク）、「防災担当相として松本がやるべき仕事はほとんど仙谷由人が行っており、松本は単なるお飾りと化している」（匿名の官邸スタッフ）などの声が上がっているとしている。この点に関連して、松本自身は7月3日の岩手県知事との会談で「私はボーッとしていたけど、みんなでやってくれた」と述べている。2011年7月4日、共産党の小池晃はツイッターで、松本が部落解放同盟の副委員長を務めていることを引き合いに出して「大臣はもちろん国会議員の資格なし」「『書いたら終わりだぞ』というマスコミ恫喝は、部落解放同盟の地金が出たものでしょう」と批判した。なお解放同盟と共産党は1960年代後半から対立関係にあるという。また、『週刊文春』2011年7月14日号は、松本氏の義理の兄弟（妻の姉の夫）が北九州市に本拠を置く指定暴力団の最高幹部であることを伝えた上で、「今後の復興に向けて、がれき処理や住宅建設の問題を巡って、暴力団とのしがらみやゼネコンに絡む様々な利権の話が必ず出てきます。そういったときに特定の暴力団と関係のある松本氏が大臣という立場に適切なのかどうか」との民主党関係者の懸念を報じている。福岡空港は、空港用地の地権者である松本組を含める地主への地代総額が年間80億円にも達し、相場を度外視した地代のために毎年地代分の赤字を計上しているという。しかも「同和問題の解消に資するため」に固定資産税の課税は免除されてきた。
民主党宮城県連の幹事長だった宮城1区の郡和子議員は辞任はさせるべきではなかったとして「大臣は当たり前のことを指摘したまで」、「この問題を大きく取り上げるべきでない」と擁護した。
2011年6月28日、復興相就任会見の席上で「3月11日以来、私は民主も自民も公明も嫌いだ」と発言。このことが自民党や公明党から「復旧・復興の中心に立つべき人が与野党の協力が必要ないと考えているならば任に当たる資格無しだ」（逢沢一郎）、「信じられない言葉だ。松本氏はどうかしてしまったのか」（漆原良夫）といった反発を呼び、7月1日、発言を謝罪した。
2011年6月3日、内閣総理大臣菅直人が退陣する意向を表明するとともに、衆議院本会議で内閣不信任決議案が否決された。その翌日、焦点に浮上した菅の退陣時期について、松本は「復旧復興を急がないといけないということから言えば、（菅内閣は）一日も早く退陣した方がよいとの文脈になると思う」と発言した。さらに「6月いっぱいというのが私の中にはある。復興基本法案や二次補正予算案の編成あたりがめどだ」と述べ、現職閣僚でありながら菅に早期退陣を迫る異例の発言となった。
2012年1月、野田政権において衆議院政治倫理審査会長に就任。2012年第46回衆議院議員総選挙では、俳優の菅原文太も応援に駆けつけるなどしたが、福岡1区では1位の井上貴博（自民）に6万票以上の大差で敗れ、2位となったみんなの党の新人・竹内今日生にも8400票近い差を開けられる3位の得票数だったため、比例九州ブロックでの復活当選もならず、落選。日本社会党所属時の1990年、第39回衆議院議員総選挙において中選挙区時代の旧福岡1区から初当選して以来、小選挙区制となった第41回総選挙以降も継続し7期連続で守り続けてきた自らの議席を失うこととなった。2014年10月21日、次期総選挙に立候補しないことを表明した。2018年7月21日0時55分、肺がんのため、福岡市内の病院で死去。67歳没。叙従三位、旭日大綬章追贈。
1950年（昭和25年）、国鉄は連合軍総司令部民間運輸局 (Civil Transportation Section/CTS) の指令により、リクライニングシートを装備した優等車両「スロ60形」を製作した。アメリカでいう「コーチ」車に相当するものである。日本の鉄道における在来客車の車内設備は居住性に難があると判断したCTS側の意向で特に製作されたもので、緊急製作の都合上、木造客車の鋼体化改造に伴う資材を流用して製造された。国鉄側は、「在来車に比し設備水準が高すぎる」という理由により一等車扱いを希望したが、CTSは二等車扱いとする様に強く命令した。このため、在来二等車と区別する目的で、一般の二等乗車券以外に追加料金を徴収する「特別二等車」としたものである。従って当初計画されていた一等車相当の形式名「スイ60形」を二等車扱いの「スロ60形」に変更した。この特別二等車は、特別急行列車ないしは急行列車に連結され、特別急行列車の二等車は特別二等車のみ、急行列車は1958年まで特別二等車の車両数が不足していたため、座席指定席となる特別二等車と自由席である従来型の二等車（並ロ）がともに連結されるのが原則であった。なお、特別二等車料金制度下における乗車時には、特別急行列車の場合は二等乗車券・二等特急券（三等の倍額）のみで利用できたが、急行列車の場合は二等乗車券・二等急行券に加えて特別二等車料金を必要とした。特別二等車の増備によって、1958年（昭和33年）10月1日以降、急行以上の二等車はすべて特別二等車を連結することになった。その中で指定席・自由席が設けられ、急行列車の二等車に座席指定制度が適用されることとなり、旅客輸送規則上、特別二等車料金が消滅し、これ以降は特別二等車の呼称は営業上は使用されなくなった。旧並二の従来型の二等車同様、1960年（昭和35年）7月1日の二等級制移行で「一等車」となった。その後、旧並二の一等車は順次二等車に格下げされていったが、旧特二の一等車は格下げされず（一部を除く）、1969年（昭和44年）5月10日のモノクラス制移行により特別車両「グリーン車」となった。