地震危険度の評価は、計器観測記録が残る19世紀終盤以降のデータだけでは足りず、長期間のデータが必要である。地震の見落としや過大評価があるとそれが誤差となって現れるため、データの不完全さという問題が付きまとう。また、確率が低いからと言って地震が起こらない訳ではない。確率や期待される最大震度が低いからと言っても、大地震が起きた時の被害が小さい訳ではなく、起きてしまえば甚大な被害が出ることに変わりはない。そして、確率的長期評価に対する否定的な見解もあり、「確率の大小が地震防災の優先度を左右してしまう」という批判や、「確率の高い地域では危機意識の高まりにつながる一方で、低い地域では安心につながる場合があり、想定されていない断層で大地震が発生する場合もあるのだから、確率が低いからといって安心できるわけではない」という指摘、確率を取り上げるのではなく「いつどこで大地震が起きてもおかしくない」というようにランダム性を強調すべきという指摘もある。2011年に発生した東北地方太平洋沖地震（東日本大震災）は評価において全く想定されておらず、地震危険度評価に対しても疑問を投げかけた。同じ領域で同じ規模の地震が繰り返し発生するという仮定に依存していた従来の評価を一部見直して連動型地震のような低頻度のものを評価できるようにし、津波堆積物調査や地殻変動観測の成果を積極的に取り入れることとされた。これにより、2011年以降は「全国を概観した地震動予測地図」の更新が休止されている。
地震調査研究本部は、内陸の活断層の地震（内陸地殻内地震）において、発生後に当時の確率値を逆算していくつか紹介している。これによると、地震発生直前での30年間発生確率は、1995年の兵庫県南部地震(M7.3) では0.02-8%、1958年の飛越地震(M7.0-7.1)ではほぼ0-13%、1847年の善光寺地震(M7.4) ではほぼ0-20%などとなっている。地震動予測地図工学利用検討委員会の2002年の報告によると、確率論的地震ハザード評価は耐震設計や耐震補強などの建築構造設計の分野、リスクマネジメントやライフサイクルコスト(LCC)評価などの経営分野、不動産の鑑定や地震保険などの保険の分野、各自治体の地域防災計画など防災政策の分野で主に用いられる。一方シナリオ型地震動評価は、先に挙げた建築構造設計や防災政策の分野の中でも特に、原子力施設や超高層建築物などの重要な構造物の設計、地震の被害想定などで主に用いられる。
新鹿では縄文時代以降の複合遺跡が里川・湊川の両岸から発見されており、長らく人々が居住してきたことが判明している。その後、阿須賀神社（和歌山県新宮市）の神領地となり、堀内氏の所領になったとされる。堀内氏の当主・堀内氏善は伊勢国司の北畠氏と対立し、永禄7年（1564年）から永禄9年（1566年）にかけて新鹿で戦を交えている。この戦闘は平和だった熊野地方にとって一大事件であり、堀内氏方が勢力を盛り返す天正年間（1573年 - 1592年）まで負け戦が続いたという。近世には紀伊国牟婁郡木本組に属し、新鹿村ないし新鹿浦として紀州藩の配下にあった。枝郷として沼田野（ぬたの）・端馬があり、現代ではそれぞれ甫本・橋間に改称している。村には地士や庄屋、遠見番所の監視役を務めた有力家系がいくつかあった。村高は『慶長高目録』では446石余、『天保郷帳』では524石余とあるように農村であったが、農閑期には林業や漁業ができたため、生活に困ることはなかったと『紀伊続風土記』に記されている。農業では、寛永から文化（1624年から1818年）にかけて新田開発が行われ、農地が拡大した。林業では、紀州藩が宝永2年（1705年）に御仕入方役所を設立して林産物に課税するとともに、資金の融資を行って奨励した。海に面した新鹿には、飛鳥・五郷などの内陸部から八丁坂（現・三重県道737号新鹿佐渡線）を越えて木材や薪炭を集め、海路で名古屋や大坂へ出荷する中継地としての役割があった。特に炭作りを奨励し、ここで生産された炭は「御仕入炭」ないしは「熊野炭」の名で流通した。漁業も林業同様、藩が御口前所を設置して課税と融資を行った。白浜の広がる新鹿は地引網に適した地で、村人の共同経営で3つの網が操業していた。また小網が3 - 4統、漁船が3隻、小舟が2隻あった。元禄2年（1689年）、俳諧師の向井去来が新鹿を訪れた。また宝暦9年（1759年）伊勢国山田（現・伊勢市）から木本を目指していた俳諧師の三浦樗良が河川の増水で新鹿に足止めされ、地元住民の好意でしばらく留まり、岐川庵（ふたまたあん）を構え、『白頭雅集』を発刊した。樗良は宝暦11年（1761年）にも新鹿の岐川庵に滞在し句集『ふたまた川』をまとめ、当地の俳人らと年越しした。樗良が新鹿で詠んだ「消えもせむ 有明月の 浜千鳥」の句碑が新鹿海岸沿いに建立され、新鹿では樗良祭が開催されている。嘉永2年（1849年）の記録によると海防のために浦組が結成されており、鉄砲や舟を備え、15歳から60歳までの男性347人（うち村人は173人）が防衛に当たった。嘉永7年11月4日（グレゴリオ暦：1854年12月23日）、安政東海地震が発生し、新鹿村に津波が押し寄せ、民家はすべて流失したという。幕末には桑名藩の医師が寺子屋を開設していた。