寺伝によれば天平年間（729年 - 749年）に聖武天皇の勅命を受け行基が七難即滅・七福即生を祈念して開創したのが起源であるという。それは現在地より北西約2kmの仁井田川のほとりで、仁井田明神のあったことから当時は「仁井田七福」、別名「七福寺」とよばれた。その後、弘仁年間（810年 - 824年）に空海（弘法大師）が五社・五寺からなる福円満寺を増築し、東から、東大宮が不動明王、今大神には清浄観音菩薩、中宮が阿弥陀如来、西大宮が薬師如来、聖宮が将軍地蔵菩薩とそれぞれ本尊を安置し、星供の秘法を修したという。こうして「仁井田五社十二福寺」と称し嵯峨天皇の勅願所となり栄え、別当寺の福円満寺が札所であった。天正年間（1573年 - 1592年）に兵火によって焼失するが、時の足摺山主・尊快親王が弟子の尊信に命じて再興した。一方、岩本寺は、町中にあり福円満寺から足摺へ向かう途中の宿坊であった。中世末に一宿した尊海親王がこの宿坊に岩本坊の名を与え繁盛した。1652年から1688年の間に衰退した福円満寺から別当が移り、岩本寺と改称し、納経は「五社大明神　別當岩本寺」と記帳された。明治初期には神仏分離により仁井田五社の5つの仏像は岩本寺に移されたが、しばらくして、仏像と札所権は八幡浜の吉蔵寺に移る。しかし、明治22年（1889年）岩本寺は復興して仏像と札所権を取り戻し、現在に至る。
前後の札所、36番青龍寺および38番金剛福寺との距離が遠く、四国八十八箇所巡礼の遍路は当寺で一泊することが多かった。空海（弘法大師）の七不思議伝説が伝わる。それは仁井田五社にあったもので、子安桜（この桜に祈れば安産する）、三度栗（三度目は空海が焼き栗を加持したところ一年に三度も実るようになった）、口なし蛭（加持をしたところヒルが血を吸わなくなった）、桜貝（桜の花が散ったのを加持したところみんな貝になった）、筆草（ねじ花）、尻なし貝（巻貝に棘のあるもの）、戸たてず庄屋（空海が泊めてもらったお礼に加持をしたら泥棒が入らなくなった）である。
インターネット上で話題性のあるコンテンツを定期的に制作・配信。様々なSNSを利用する事で人との繋がりを大切にしていきたいという思いのもと、動画を発信し若い世代を中心とした視聴者のハートにメッセージを届けている。マクドナルドのドライブスルーで弾き語りをしながら注文をする動画や自身のあごを人に見立てて歌うというユーモア溢れる「あご人間」の動画も話題に。更には邦・洋楽問わずカバーをする事を始め、メドレーや邦楽と洋楽のマッシュアップ等も人気の動画となる。そして「田舎の唄」では、Facebook再生回数200万回を越えTwitterでもリツイートが8万回を超えとメディアでも大きく取り上げられ話題となった。他にも流行語をつなぎ合わせて曲を作ったり、結婚式で子供達と作詞作曲した歌をサプライズで披露することなどにも挑戦。常に自身のやりたいことを有言実行し、発信し続けている。また、祖父母の代から続くクリスチャンホームで生まれ、本人も【鳥取福音ルーテル教会】に所属する信徒である。
大永6年（1526年）、平安時代に医心方を著した名医・丹波康頼の二十世の末裔として生まれる。祖父・宗清、父・宗忠ともに権大僧都法印となっている。幼少時に父を失って僧籍に入り、比叡山菜樹院の住持であったが、元亀2年（1571年）に織田信長が行わせた比叡山焼き討ちに遭い、還俗して医師を目指し、曲直瀬道三に入門して漢方医学を極めた。その後、羽柴秀吉の知遇を得て、侍医となりながら叡山の弁護にあたった。天正10年（1582年）、信長が本能寺の変で斃れると、秀吉の許可を得て荒廃した比叡山の再興に尽力した。この頃、徳運軒全宗を名乗る。秀吉が天下人になった後の天正13年（1585年）に大飢饉と疫病の流行にみまわれると、廃絶していた祖先よりの「施薬院」の復興を願い出た。天正年間に勅命を受けて施薬院使に任命されて、従五位下に叙され昇殿を許される。7月下旬から9月までの間に号を「施薬院」とした。この施薬院は奈良時代・光明皇后による創建以来、800年の時を経て完全に形骸化していたが、全宗はこれを復興して、身分の上下を問わない施療を再開した。天正13年（1585年）10月6日、秀吉より山城御室戸・大鳳寺・上条等で200石を与えられる。さらに同年11月27日には山城・丹波内で450石を加増。「（全宗の）言ふところ必ず聞かれ、望むところ必ず達す」（『寛政重修諸家譜』）というほど秀吉の信頼は厚く、秀吉の諱を与えられた息子の秀隆とともに秀吉側近としても活躍。天正15年（1587年）発布の定・バテレン追放令は全宗の筆によるもので、切支丹追放にも活躍。豊臣氏番医の筆頭として、番医制の運営につとめる。同年10月2日、丹波桑田郡内で305石を加増。天正18年（1590年）、小田原の役の際に伊達政宗に上京を促す勧告使、佐竹義重との交渉役を務めている。また、同年に嫡男の秀隆が病没（外来の伝染病という）したため、近江の三雲資隆の子を養子とし、宗伯として継がせ、曲直瀬氏嫡流を守り道三流医術の衰退を防止した。この子孫は代々施薬院使を務めることになった。天正19年（1591年）9月18日、加増を含めて1,265石の知行。文禄年間、豊臣秀次の失脚事件で（道三養子の）曲直瀬玄朔が流罪となったのを契機に、曲直瀬一門の結束が全宗を頂点に強化されたことが知られる。後に正四位に陞爵。慶長元年12月10日（1597年1月27日）に没したとされてきたが、宮本義己により慶長4年12月10日（1600年1月25日）没であることが判明した。享年74（一説に69ともいう）。京都十念寺に葬られる。