細菌に典型的ではないが、ある種の微生物は、細胞膜の他に細胞内に膜を持つものもある。初期には、細菌はメソソームと呼ばれる折り畳まれた膜構造を持つと考えられたが、後にこれは、細胞を電子顕微鏡の試験体にする際に用いられる化合物によるアーティファクトであることが示された。細胞内膜を持つ細菌の例には、光栄養生物、亜硝酸菌、メタン酸化菌等がある。あまり研究されていないプランクトミケス門の細菌にも細胞内膜が見られるが、これらは真核生物の持つ細胞小器官の膜に近く、機能は分かっていない。色素胞は、光栄養生物で見られる細胞内膜である。バクテリオクロロフィル色素とカロテノイドを含み、主に光合成に用いられる。
リボソームは生体内でタンパク質合成を行い、大部分の細菌では最も数の多い細胞内構造である。真核生物では細胞質内に、より大きい80Sリボソームを持つのに対して、全ての原核生物は70Sリボソームを持つ。70Sリボソームは、50Sと30Sのサブユニットから構成される。50Sサブユニットは、23Sと5SのrRNAを含み、30Sサブユニットは16SrRNAを含む。これらのrRNA分子は、真核生物とは大きさが異なり、多数のリボソームタンパク質と複合体を形成する。その数や種類は、生物によってかなり異なる。リボソームは最も一般的に見られる細菌内の多タンパク質複合体であるが、顕微鏡下では他の大型のタンパク質複合体も見ることができる。
真核生物と異なり、細菌のDNAは膜に囲まれた細胞核の中にはなく、細胞質内に存在する。これは、転写、翻訳、DNA複製による細胞情報の移動が全て同じ場所で起こり、リボソーム等の他の細胞質構造と相互作用していることを意味している。細菌のDNAは、真核生物のようにヒストンによって折り畳まれてクロマチンを形成することはなく、その正確な性質が不明な、非常にコンパクトなDNA超らせん構造をとる。線状DNAを持つBorrelia burgdorferi 等の一部の例外を除き、ほとんどの細菌は環状のDNAを持つ。また大部分の細菌は、染色体DNAに加えてプラスミドと呼ばれる小さな独立したDNA片を持ち、これらはしばしば細菌にとって有利だが必須ではない形質をコードする。プラスミドの獲得と喪失は容易に起こり、遺伝子の水平伝播により細菌間に伝達される。
真核生物と比べて、細菌細胞の細胞内構造は非常に単純である。細菌は真核生物と同じ意味での細胞小器官を持たず、簡単に観察できる構造は染色体とリボソームのみである。しかし特殊な細菌では、後述するようなより複雑な細胞内構造を持つものもある。
多くの細菌は、細胞壁の外側にグリコカリックスと呼ばれる細胞外ポリマーを分泌する。これらのポリマーは多糖で構成され、タンパク質が含まれることもある。莢膜は比較的浸透性の低い構造で、墨汁等の染料で染まらない。細菌を食作用や乾燥から守っている。粘液層は、細菌が他の細胞や非生物の表面に付着してバイオフィルムを形成するのを手助けする。細胞が食物を保存するのにも用いられる。
1521年3月21日、ザクセン公ハインリヒ4世の息子として生まれる。1541年、父が死亡したためザクセン公位を継承した。モーリッツは神聖ローマ皇帝カール5世に従い、1542年にはオスマン帝国のスレイマン1世と戦い、1543年にはユーリヒ＝クレーフェ＝ベルク公ヴィルヘルム5世と戦い、1544年にはフランス王フランソワ1世と戦った。1543年、カール5世はモーリッツにザクセン選帝侯位を与えることを条件に、シュマルカルデン同盟と戦うことを要請した。ヴェッティン家は1464年以降、エルンスト系とアルブレヒト系に分かれており、当時はエルンスト系がザクセン選帝侯位を有しており、モーリッツの又従兄でシュマルカルデン同盟の指導者ヨハン･フリードリヒ（エルンスト系）が当時のザクセン選帝侯であった。また、もう一人の同盟の指導者ヘッセン方伯フィリップはモーリッツの妻アグネスの父であった。つまり、モーリッツを引き入れることによって、同盟の中核を揺るがすことが出来たのである。モーリッツは条件を受け入れ、カール5世に味方することを宣言した。1546年から開始されたシュマルカルデン戦争において、モーリッツはカール5世の腹心として働き、1547年4月24日のミュールベルクの戦いで同盟を敗北させた。戦後、約束通りモーリッツはザクセン選帝侯位と広大な領地を授かった。しかし、この裏切りのためモーリッツは「マイセンのユダ」と呼ばれるようになった。戦争に勝利したカール5世はアウクスブルクに帝国諸侯、都市代表者を集め、ルター派を異端とする暫定規定の受諾を迫った。この時、マクデブルクだけが規定の受諾を拒否したため、カール5世はモーリッツを派遣して同市を包囲させた。しかし、自身プロテスタントだったモーリッツは、カール5世のやり方が許容できなかった。そこで、マクデブルクが降伏したかのように見せかけて包囲を解き、フランス王アンリ2世とシャンボール条約を結んで1552年3月、逆にアウクスブルクのカール5世を攻撃した。カール5世はインスブルックに逃亡し、弟のフェルディナント1世にモーリッツとの和平交渉を委ねた。1552年8月、パッサウでルター派を容認する旨の和平交渉が結ばれた（パッサウ条約）。これは1555年のアウクスブルクの和議の原型となった。モーリッツは再びカール5世と協力し、混乱に乗じて侵攻してきたオスマン帝国を退けた。1553年、ブランデンブルク＝クルムバッハ辺境伯アルブレヒト・アルキビアデス（好戦公）がパッサウの和約の受諾を拒否したため、モーリッツはヴォルフェンビュッテル侯ハインリヒ2世と共にこれを攻撃した。1553年7月9日、ジーフェルスハウゼンの戦いでアルブレヒト・アルキビアデスを破ったものの、彼自身は戦死した。妻アグネスとの間に一人娘のアンナしかいなかったため、弟のアウグストが選帝侯を継いだ。