日本大学理工学部の研究（1999年）でも（1997年の比嘉らの研究は前述）、EMXによる防錆効果を発見し、一般に水中では酸化が早い鉄に77日目まで赤さび発生がなく鉄表面の変色から抗酸化物質などに被膜されたと推測され、「微生物による環境にやさしい防錆液」としている。佐藤、比嘉、庄谷、杉田による2004年の研究による、コンクリートへのEMの減水剤的、AE剤的、初期強度の増進、中性化抑制を追試したとする実験（2004年）では、減水剤的、AE剤的効果を確認し、3日目までなどの初期強度の増強がみられ、それは水に対するEMの置換率5%や10%で確認された。さらに長期間の強度試験を行った別の研究は、EM-1を5%では初期により強い強度だったが91日目で2割となり、15%では91日目で3割増加、EMXは中性化を抑制していた。また別の研究（2010年）では、EM-1をコンクリートに混入しセメント重量に対して2%、5%混入した場合には強度は低下し、この研究の要件であったカビの抑制が見られEMの好気細菌分解効果は発揮されていたとした。自然農法国際研究開発センター（EM系の研究所）に所属する中国東北農業大学などの研究者による研究（2015年）では、EMによって発酵させた液体によるヒドロキシラジカルなどの除去能力は、2週間まででEMを入れていない比較対象に比べて高かった。さらに長期間で研究を実施し5か月目まである程度保たれており、タンパク質はアミノ酸へと転換され、1か月以内の方が菌が多いが、貯蔵半年後でも「けっこうな良品」だとした。イタリアでの研究（2014年）では、家具などによって持ち込まれる有害なホルムアルデヒドなどがあるが、EMは1週間でホルムアルデヒドと芳香族アルデヒドを70%から100%除去した。（1999年、金沢工業大学）EMは実験条件で生分解性プラスチック（L-ポリ乳酸）の分解促進を40%促していた。
水質汚染が深刻なインドのヤムナー川の水を、EMで処理した実験（2012年報告）では、ナノテクノロジー処理より、EMが化学物質汚染に有効であると発表した。測定尺度にはCOD、BODを用い劇的な減少を確認した。韓国（2009年）でEM泥団子による海洋堆積物の悪臭に効果がみられ、微生物の構成もいくらか変化させていた。マレーシア（2010年報告）では河川の水質汚染の改善のためにEMが活用されており有用性が示されている韓国の研究者による港底堆積物の浄化（2011年）では、団子を投げ込み悪臭処理がより速かった。エジプトでの研究（2015年）は過剰なリンを減少させた。中国（2010年報告）、CODの高いデンプン性の廃水をEMを使って処理しCODは99%減少し、濁度は2100から0となった。ポーランドの報告（2009年）、EMの技術を応用したSCDプロバイオティクスは、池の窒素、リン、クロロフィルなどを減少させた。カナダの報告（2007年）、酪農での排水処理にて、処理3か月でリン、浮遊固形物、BODの大幅な減少を確認し、非常に効率的とした。インドネシア（2017年）では、EMを使って高いアンモニアレベルを15日で100%下げた。韓国（2008年）での石油流出によって油汚染された水で、6日後の石油炭化水素の総量はEM処理で91.3mg/kg、そうでない場合127.7mg/kgとなり、原油流出の処理に有用だと判明した。EMに藍色細菌（シアノバクテリア）の増殖を抑制する効果はない。
1945年以前に移出した燐鉱石は 160万tにのぼり、島の表土はほとんどなくなったといわれる。採掘された燐鉱石は、貨物船で東京都、大阪市、岩手県宮古市の工場まで運搬された。南北大東島同様、沿岸部は断崖と浅瀬で囲まれているため、デリックやクレーンによって人及び物資の乗降が行われていた。燐鉱石の積み出し用にトロッコのレールが埠頭まで敷設されていた。八丈島（南北大東島の開拓民の中心でもあった）を中心とする伊豆諸島からの出稼ぎ者と沖縄県からの出稼ぎ者が燐鉱石採掘に従事した。支給される食料は米飯や味噌汁、たくあんといった物に限られ（このほかに労働者が持ち込んだラードや味噌を使ってアンダンスーが食べられていたという）、野菜類は極度に不足していた。水はもっぱら天水が頼りで（風呂には海水を用いた）、貯水タンクが粗末であった事から伝染病が幾度か発生していた。島には娯楽と呼べるものは無く、会社から酒や少量の菓子類が支給されたが、飲酒によるトラブルが頻発した。大正時代には、伊豆諸島出身者との間に賃金や待遇に格差が設けられていた事から、沖縄県出身労働者による待遇改善を要求する暴動が発生した事もあった。南北大東島と同様に町村制が布かれず、もっぱら企業による自治が続いていた。ただし、1929年までは島に住めるのは成人男性のみであり、南北大東島のそれに比べて極めて簡略化されていた。沖縄県警から請願巡査が派遣されており、時としては労働者の騒乱鎮圧などにもあたった。1930年代以降は夫婦の労働者が優先的に雇用されるようになり、最盛期の人口は2000人を超えた。そのため、島内に小規模な会社立の青年学校が開校されたりした。また、鉱山施設の他、体育館や公会堂、購買所、山神社も島内に建てられた。この頃には、鉱山労働者の大半は沖縄県出身者によって占められていた。この時期には前述のような待遇格差は無くなり、労働環境は依然過酷であるものの、賃金や待遇が大幅に改善された事から出稼ぎの応募者が増加したという。数少ない表土のある長屋には畑が作られ、会社所有のボートでごく小規模な漁も行われていた。この他、会社によって養豚も行なわれていたともいわれる（このほかに、家庭によっては鶏やウサギも飼育されていた）。食糧・日用品などはこうした小規模な自給の他、本土や沖縄本島において会社による買い付けも行われていた。こうした物品は、市価の半値で住民に供給されており、物資の面では沖縄本島よりも水準の高い生活が可能だった。子供のいる世帯では、人形や玩具類もカタログによって注文購入する事ができたという。1956年からは島全域がアメリカ海軍による空対地爆撃射撃場（沖大東島射爆撃場）として使用されており、現在でも島の表土はほとんどなく緑が全くない。ラサ工業に対してはその代償として毎年借地料が支払われているが、同社はその額については非公開としている。