恵帝が長安に連れ去られた後、司馬顒は敵でありながらも嵆紹の忠節を評価し、上表して嵆紹に司空を追贈して公に進爵させようとした。だが、実行される前に司馬顒は敗れて恵帝が奪還されたので、結局この措置は有耶無耶となった。308年、司馬越は許昌へ赴任する途上で滎陽に差し掛かり、嵆紹の墓を通りがかった。この時、司馬越は嵆紹の事を思って慟哭し、彼の為に石碑を立てると、改めて官爵を追贈するように上表した。恵帝は勅使を派遣して侍中・光禄大夫を追贈し、金章紫綬を加え、さらに侯に進爵した。また、墓田一頃、客十戸を下賜し、少牢を祠とした。313年、江東の政務・軍事を取り仕切る琅邪王司馬睿（後の元帝）は嵆紹の忠節を大いに称え、彼に贈られた礼がその勲徳に対して不十分であるとし、さらに太尉を追贈し、太牢を祠とするよう上表した。318年、司馬睿が帝位に即いて東晋を興すと、嵆紹は忠穆と諡され、正式に太牢の祠を加えられた。
303年、御史中丞として招聘を受けたがこれを受けず、再び侍中に復職した。同年7月、河間王司馬顒・成都王司馬穎が司馬乂討伐を掲げて挙兵し、洛陽へと進撃した。司馬顒らの大軍が城東まで至ると、司馬乂は「今日の西討において、誰を都督とすべきか」と諸将に問うた。軍中の将士はみな「願わくば嵆侍中（嵆紹）を軍の前鋒として力を尽くしていただければ、我らは死してもなお生となりましょう」と答えた。司馬乂はこれに同意し、嵆紹は使持節・平西将軍に任じられた。304年1月、司馬乂軍は敵軍に対して連戦連勝であったが、東海王司馬越の裏切りにより洛陽は陥落してしまった。司馬乂が司馬顒配下の将軍張方により処刑されると、嵆紹もまた司馬乂に従っていた事から捕縛されたが、処罰については一旦保留とされ侍中に復帰した。その後は司馬穎が朝廷の第一人者となり、嵆紹を含めた公王以下の百官はみな鄴に赴き、今回の一件について司馬穎に謝罪する事を強いられた（司馬穎は鄴に留まったまま洛陽を間接統治していた）。司馬穎は司馬乂に与した罪で嵆紹らをみな解任し、庶人に落とした。
300年4月、趙王司馬倫が政変を起こし、賈謐を始めとした賈氏一派を誅殺して政権を掌握した。当時、嵆紹は賈氏政権の下で職務に就いていたが、彼自身は賈氏に擦り寄っていなかった事から誅殺を免れた。司馬倫政権においては弋陽子爵に封じられ、散騎常侍に転任となり、さらに国子博士を兼務した。301年1月、司馬倫が恵帝を廃して帝位を簒奪すると、嵆紹は侍中に任じられた。4月、司馬倫が左衛将軍王輿らに誅殺されて恵帝が復位を果たしたが、嵆紹は引き続き侍中を任された。
291年、復職して給事黄門侍郎に任じられた。当時、恵帝の外戚である賈謐は皇帝を凌ぐ程の権勢を握っており、潘岳・杜斌を始めとした士大夫24名を集めて『金谷二十四友』と呼ばれる文学集団を形成していた。朝臣達はみな賈謐に媚び諂っており、嵆紹もまた彼より誘いを受けたが、嵆紹はこれを拒んで返答しなかった。
壬申の乱を起こした大海人皇子は、挙兵の決断と同時に吉野宮から東に逃れ、美濃国と伊勢国を固めてから、東山（東山道）と東海（東海道）に兵力動員を命じる使者を派遣した。徴兵範囲は記されないが、後の律令制では甲斐国は東海道に属し、『続日本紀』で引用されている安斗智徳の日記によれば信濃で徴兵が行われている。美濃の不破に集結した軍勢は、二手に分かれて7月2日に西に向かって進軍を開始した。そのうちの一つは、伊勢から倭（大和）に送り込まれ、その地で連戦していた大伴吹負の軍への援兵になった。7月、大友皇子（弘文天皇）側の将、犬養五十君は、廬井鯨（いおいのくじら）に200の精兵を与え、大和の古道中つ道に置かれた吹負の本営を急襲させた。吹負は一時危うくなったが、徳麻呂らの防戦と、三輪高市麻呂・置始菟の部隊の来援で鯨を退けることができた。白馬に乗って逃げる鯨が泥田にはまって動けなくなったのを見た吹負は、甲斐の勇者に「その白馬に乗っている者は、廬井鯨だ。急ぎ追って射よ」と命じた。甲斐の勇者は馳せて追い、鯨に迫った。鯨は急いで馬に鞭をやり、やっと泥を抜けて逃走した。『日本書紀』は乱の経過を詳しく伝えるが、動員された兵力の性格について語る箇所は少なく、長く歴史学者の間で学説上の争点になっている。甲斐の勇者については、関晃が1957年の論文「甲斐の勇者」において、東海の使者の命をうけて甲斐から派遣された軍に属した兵士と推測した。また、騎馬で射ることをよくしたらしいことから、民衆層というより、郡司級の一族に属したのではないかと推測した。この説は一定の支持を得たが、直木孝次郎は6月26日の使者発遣から7月の合戦までの期間から疑問視し、乱以前からの私的従者としている。また、甲斐には大伴山前連が存在することから、大伴氏に私的に仕えていた人で、それがたまたま甲斐の出身者だったということではないかという説もあり、実情は不明である。