2015年現在、スカイマークではマイレージサービスを実施していない。UFJカードと提携したクレジットカードの「スカイマークカード」を発行していた時期には、ポイントを貯めて航空券と交換できるようになっていたが、ポイントの有効期限は1年と短かった。一方で、2011年6月からデルタ航空のマイレージプログラム「スカイマイル」の上級会員（メダリオン）および提携クレジットカード所有者を対象にスカイマーク便の座席を提供するサービスを開始している。また2014年1月からの国際線進出と国内幹線への大型機（エアバスA330-300型機）の導入に伴うマイレージサービスの導入の意向を表明していたが、その後の導入取りやめと経営破綻により、実質的に白紙となっている。
搭乗順序として、身体障害者（車いす利用者など）やお子様、お年寄りなど、「フォワードシート」（旧「足のばシート」）利用者の優先搭乗が行われる。また、機内混雑緩和と搭乗時間短縮のため、分割搭乗（セパレートボーディング）を実施し、客室窓側/後方からの搭乗案内を行っている。搭乗券には二次元コードが印字されており、改札機にかざして搭乗する。
搭乗手続きは空港の自動チェックイン機、カウンターのいずれかで行い、預託手荷物がある場合、手荷物タグの取り付けは利用者自身で行う。航空券の座席予約システム（CRS）は自社のものを使用している。ANAの出資を受けている新規航空会社（AIRDO、ソラシドエア、スターフライヤー）はすべてANAのシステム「able」（エイブル）を利用しているが、スカイマークはANAの出資を受けた後も自社のシステムを使い続けて独立性を担保する予定である。
1993年9月13日、ニューヨークのロックフェラー・センターにあるGEビルディングのスタジオ6Aから『レイト・ナイト・ウィズ・コナン・オブライアン』の放送が始まったが、批評家からはあまり良い評判ではなかった。これは特に驚くべきことではなく、オブライアン自身が『ニューヨーク・タイムズ』紙に『O'Brien Flops! 』(オブライアン大失敗)のタイトルで自虐記事を寄稿した。批評家達はオブライアンを責め、『ワシントン・ポスト』紙のトム・シェイルズは「忘却」の意の「oblivion」にかけて「本名はコナン・オブリヴィオンではないか」と語った。主な批評家はオブライアンはカメラに慣れておらず緊張しており、「賢さを鼻にかけ、都会ぶり、上品ぶり、若すぎ、成功するには色々と過ぎるところがある」とする向きもあった。この番組は常に打ち切りの恐れがあり、1994年にはNBCはオブライアンと週ごとの契約をしていた。NBCの重役達は『レイト・ナイト』の後番組である深夜1:30からの『レイター』の司会者であるグレッグ・キニアをオブライアンの後任にすべきかどうか考えていた。支局から司会者交代について聞かれるようになり、観客席の空席をNBCのインターンが埋めなくてはならなかった。再放送後のある放送で共演者のアンディ・リクターがオブライアンの休暇中「もし自分が失業したらどうしようか」と語ったことから、NBCが打ち切りを検討しているのではないかと噂になった。状況は徐々に好転していった。オブライアンとリクターの掛け合いが評判となり、また『If They Mated 』『Desk Drive 』、『In the Year 2000 』などのコーナーも人気が出てきた。オブライアンの机の後ろにテレビ・スクリーンがあり、時事ネタの画像を映していた。ここに登場する田舎風の喋りをするビル・クリントンなどのキャラクターの声を共同脚本家のスミゲルが担当した。ターニングポイントは1994年2月のレターマンのゲスト出演であった。「やる気が高まった」とオブライアンは語った。「私はこう思う。もし自分が賢く面白いという、12時半からの番組を製作したことのある誰かが参加するならやりましょう」。1995年1月、スミゲルが過労により第一脚本家を降板し、番組は一時的に揺らいだ。番組、特にオブライアンのコメディの質は徐々に上がった。1年以内に下劣と奇抜に上品さを兼ね備えたコントを始めた。Masturbating Bearなどがレギュラーで登場しており、オブライアンがヴィンテージベースボールに訪れるコントが有名になった。このコントはオブライアンにとってもお気に入りの1つで、後に「私が地球を離れる時、つまり葬式ではこれを流してくれ。なぜなら私の全てがここに詰まっているから」と語った。観客の多くは購買層である若い男性で、番組の人気は堅実になり、高視聴率を獲得して番組は15シーズン続いた。インターネット創世記、ファン達が各エピソードの詳細なデータを蓄積した非公式サイトを開設した。テレビ評論家のトム・シェイルズでさえも「テレビ史上最も目覚しい変化を遂げた番組の1つ」と語った。1996年よりオブライアンと『レイト・ナイト』の脚本家チームはプライムタイム・エミー賞脚本家賞コメディまたはバラエティ部門にノミネートされるようになり、唯一2007年のみ受賞した。1997年、2000年、2002年、2003年、2004年、全米脚本家組合賞脚本家賞コメディまたはバラエティ部門を受賞した。2001年、オブライアンは自身のテレビ・プロダクション会社Conaco を組織し、『レイト・ナイト』のプロダクション・クレジットをシェアするようになった。2005年10月、11年間常に平均視聴者数が250万人となった。2006年、フィンランドの女性大統領タルヤ・ハロネンに似ていることをネタにしたところ、番組の人気は頂点に達した。オブライアンは「ヘルシンキで5日間撮影し、2人が面会した時、国宝級の大事なもののようにお互い抱擁しあった」と語った。2009年2月20日、最終回を迎えた。過去の放送を振り返り、元共演者のアンディ・リクターがサプライズで登場した他、ウィル・フェレル、ジョン・メイヤー、ザ・ホワイト・ストライプスも出演した。最後にオブライアンは斧でセットを壊し、破片を観客に持ち帰らせ、ローン・マイケルズ、デイヴィッド・レターマン、ジェイ・レノ、妻と子など関係者へのお礼を語った。