この論議は別の面から熱を帯びることになった。1998年アメリカ合衆国議会はビル・クリントンに弾劾を実施し、ピュリッツァー賞受賞歴史家のジョセフ・エリスは、以前にも『ニューヨーク・タイムズ』の全面広告にも他の歴史家たちと登場していたが、クリントン弾劾について反対意見を表明し、ジェファーソンと比べることでクリントンを擁護した。エリスは以前1996年に書いた『アメリカのスフィンクス：トマス・ジェファーソンの性格』で、ジェファーソンがヘミングスと性的関係を持ったのはその性格から有り得ないものだと書いていた。エリスは後に、自著が出版された後に出たDNA鑑定の結果で確信を抱いたときにこの声明を撤回し、この関係があったことが証明されたと考えた。エリスは次のように書いた。ウィリアム・ジェファーソン・クリントン大統領もこの件の暴露に関心をもった。ジェファーソンは常にクリントンのお気に入りの建国の父であった。現在、性欲の強い、あまりに人間的なジェファーソンが彼の四面楚歌状態の横に出てきている。それはあたかもクリントンがアメリカの全歴史の中でも最も尊敬されている人物の1人を証人に呼び出して、最初の衝動は紛れもない大統領の血統であることを証言させるかのようである。このニューズの大きな効果はクリントンの罪を異常なものではなく、心地よいものに見えさせるだろう。クリントンに反対する票がジェファーソンに反対する票であるならば、弾劾の見込みは薄くなっていく。エリスの主張は曲解という告発を受けた。ステーブン・グッドは『インサイト・マガジン』に、DNA鑑定で「合理的な疑いを越えて」ジェファーソンとヘミングスの関係を肯定したというエリスの声明は誇張であると書いた。『ネイチャー』誌の記事の主要な執筆者であるフォスターも、DNAの証拠は具体的な父親を特定したのではなく、他の候補を排除しただけだと主張した。報告書がジェファーソンとヘミングスの関係を示唆していることを認めた者の中でも、エリスの主張する「合理的な疑いを越えて」関係を示しているということには同意しない者がいる。モリー・セコールズは『ナッシュビル・シティ・ペーパー』にその関係について記事を書き、「我々がそのことを「強姦」以外の何かと言うことは陰険で危険である」と言った。デウェイン・ウィッカムは『USAトゥディ』で、「彼とその奴隷の間の性交を合意に基づくと仄めかすことは、たとえテレビの映画の中であったとしても、アメリカの奴隷制の最も汚れた秘密を残酷なくらい不正直に表すことである」と書いた。
さらに研究が進められた。『国立系図学協会クォータリー』2001年9月号ではサリー・ヘミングスの4人の子供の父親はトマス・ジェファーソンだったと結論付けた。この記事は明白に学会委員会の報告を批判している。
劇場は1705年に開場。当時は女王劇場(Queen's Theatre)という名前だった。ジョン・ヴァンブラとウィリアム・コングリーヴによる劇場のこけら落としはイタリア語の牧歌劇『エルガストの愛』だったが失敗に終わった。1711年にヘンデルがロンドン・デビュー作のオペラ『リナルド』をこの劇場で上演し、大成功をおさめた。1714年にアン女王が死去してジョージ1世が即位すると国王劇場(King's Thatre)に名前が変わった。1720年には隣にヘイマーケット小劇場（現在のシアター・ロイヤル・ヘイマーケット）がオープンした。「ヘイマーケット劇場」というとこちらを指す可能性もあるので注意が必要である。1720年には貴族たちによってオペラ興業のための会社「ロイヤル・アカデミー・オブ・ミュージック」が設立され、国王劇場でイタリア・オペラを毎年上演した。同年ヘンデルの『ラダミスト』が初演され、熱狂を呼び起こした。アカデミーはヘンデルのほかにボノンチーニやアッティーリオ・アリオスティのオペラを上演した。アカデミーの倒産後も貴族オペラによってポルポラが、ミドルセックス卿によってガルッピやグルックらがロンドンに呼ばれてこの劇場でオペラを上演した。1762年にはヨハン・クリスティアン・バッハがこの劇場でデビューし、翌年『オリオン（オリオーネ）』を初演して成功している。1791年にハイドンがロンドンに招かれ、ザーロモンの演奏会（ハノーヴァー・スクエア・ルームズで上演）のための交響曲（第1期ロンドン交響曲）と、ジョヴァンニ・ガッリーニ(en)一座が国王劇場で上演するためのオペラ『哲学者の魂』を作曲した。交響曲は実際に演奏されたが、オペラの方は当時の国王派と王子派の対立に巻き込まれて上演することができなかった。1789年6月17日に全焼したが、1792年に再建された。ナポレオン戦争で大陸のオペラ歌手を招くことができなくなったため、ザーロモンは1795年にイギリスにいた音楽家の大同団結をはかってオペラ・コンサートをはじめ、ふたたびロンドンを訪れていたハイドンやクレメンティも参加した。ここでハイドンは交響曲102・103・104番を初演している。1830年代にはメンデルスゾーンが指揮者・作曲家として活躍し、『フィンガルの洞窟』や交響曲第4番が初演された。1837年にヴィクトリア女王が即位すると、ハー・マジェスティーズ劇場と呼ばれるようになった。1837年から1847年にかけて「イタリアン・オペラ・ハウス」とも呼ばれたが、1847年以降この名称はコヴェント・ガーデン劇場に対して使われるようになった。1867年にまたしても火災で全焼し、再建された後もしばらくはかつての繁栄を取り戻すことはできなかった。1897年にチャールズ・J・フィップスが現在の建物を設計し、ここで1916年に初演されたミュージカル『Chu Chin Chow』は2238回上演される大ヒットとなった。ヴィクトリア女王没後の1901年には「His Majesty's Theatre」に変更されたが、1952年のエリザベス2世の即位後は再び元に戻された（"Her Majesty"は「女王陛下｣の意）。18世紀から19世紀にかけてはバレエやオペラなどが上演されていたが、20世紀に入るとミュージカルの上演が多くなった。現在上演されている『オペラ座の怪人』は1986年10月6日に世界初演され、その年のローレンス・オリヴィエ賞で新作ミュージカル作品賞を受賞した。