会が認定した者で、聖職者名簿に記載されたものを聖職者としている。実績・実務年数・論文審査などをふまえて、研修聖職者、補教師、正教師、牧師に認定され、任命を受ける。聖イエス会では洗礼と聖餐を聖礼典としているが、このうち聖餐は牧師の称号を持つもののみが執り行うことができる。聖イエス会は基本的には万人司祭説を重んじるプロテスタント教会の立場に立ちながら、かつ、聖職者が信徒と明確に区別している。聖イエス会では聖職者が率先してキリストのように生きることによって信徒の手本となり、信徒に聖書を教え導き、ある意味で神と人との仲介者であるべきであると強調されている。聖職者はその多くが教会敷地内の牧師館に居住している。
聖イエス会における「信徒」とは、使徒信条を告白しバプテスマ（洗礼）を受け、教会の定めた信徒の義務（献金・礼拝）を行うもので、信徒名簿に記載された者のことである。現在約5000人の信徒がいる。聖イエス会では、子どもに対する教会学校の活動も活発に行ってきた。原則として幼児洗礼を認めていないため、教会学校生徒は信徒とはみなされない。聖霊のバプテスマを体験した子どもは、中学校を卒業する年齢になり、自分の意志で信仰を告白できるとみなされた段階で洗礼を受け、信徒（正会員）となることができる。青年向けにも様々な活動があり、全国規模での大会なども開催されている。信徒には献金及び教会での様々な役目を果たす義務が課される。
大槻は教団の拡大に伴い、以前に属していたホーリネス教会の行政形態を参考として、教団の組織化を進めた。聖イエス会では、教団組織の執行責任者として「司牧」がおかれる。また教団の事務を総理するものとして「代表役員」がおかれる。代表役員を含む4人の聖職者によって構成される聖職者責任役員を「長老」と呼び、司牧を補佐する。責任役員会が決議した議案について審議する機関として、「代議員会」がおかれ、聖職者24名、信徒24名から構成される。また、必要に応じて会の運営に関して助言を行う「顧問」をおいている。
聖イエス会では、教会の理想の姿は使徒言行録にあるという信念から 使徒言行録の初代教会で行われていたような神癒が現代の教会にあっても同じように起こることが強調されている。キリストは今も生きていて聖霊のバプテスマを受けた人とともに働き 神癒を行い自分の栄光を表すと信じられ、集会の中で積極的に病人の癒しが祈られる。新約聖書の中で使徒ペトロのハンカチに触れた病人が癒された話や、ヤコブ書では神癒の祈祷にオリーブ油を用いることが勧められていることもあり、聖イエス会で行われる癒しの祈祷の際には「御名」が書かれたハンカチ（しばしば大槻の直筆）や、聖別されたオリーブ油等が用いられる。
聖イエス会は「キリスト者はキリストのごとく」「教会は使徒行伝のごとく」を標語とし、神の御名によるキリストの内住体験に起因する聖化・神化を強調している。大槻は自らの生涯を通じた愛読書として『霊の賛歌』（十字架の聖ヨハネ著）『キリストにならいて』（トマス・ア・ケンピス著）『聖フランシスコの小さき花』（フランシスコ会修道士著）などを挙げているが、カトリック教会の聖人たちの生涯や著作物は、キリストの謙遜と従順を学ぶための手本として、重要視されている。また東方教会や神秘主義の神学の中にみられる、人間が創造主の似姿を回復し、神の性質の一部に与るいわゆる神化の神学を尊び、これを人間救済の究極的な姿としている。
元は、甲武鉄道が1897年（明治30年）10月にアメリカ合衆国のブルックス・ロコモティブ・ワークスで3両（製造番号2836 - 2838）を製造・輸入した、車軸配置2-6-2(1C1)で2気筒単式の飽和式機関車である。輸入の扱いはアメリカン・トレイディングであった。甲武鉄道での形式はK3形、番号は10 - 12であった。1906年（明治39年）、甲武鉄道は国有化されたが、しばらくは甲武鉄道時代の形式番号で使用された。その後、1909年（明治42年）には鉄道院の車両称号規程が制定され、本形式は3020形 (3020 - 3022) に改められた。ボイラーはストレートトップ式で、第2缶胴上に蒸気ドームが、第1缶胴と火室上にそれぞれ1個ずつ砂箱が設置されている。安全弁は、蒸気ドームと後部砂箱の間の火室上に設置されている。前端梁から後端梁まで一直線に通された歩み板（ランボード）が特徴的で、その上部にシリンダ弁室とむき出しの第1動輪が顔をのぞかせており、溝型鋼を使用した端梁などにブルックス製機関車の特徴を保持するが、側水槽や運転室周りにはブルックス製の特徴である曲線的なデザインは用いられておらず、角ばった印象である。国有化後は足尾線で使用され、1923年（大正12年）末に全車が廃車となった。そのうち 3022 が西武鉄道（旧）に払い下げられ、同社の6として貨物列車牽引用に使用されたが、晩年は川越に長らく放置され、1938年（昭和13年）9月に廃車解体された。本形式は、手頃な大きさと性能で国産化の対象となり、汽車製造や日立製作所で同系機が製造された。国有鉄道籍を得たものでは、3070形や2930形があげられる。