トミー（現タカラトミー）の玩具シリーズ「ゾイド」のアニメ第4作。海外で先行放送された第3作『ゾイドフューザーズ』とは異なり、完全に日本向けに制作された。キット付属のバトルストーリー等を基本設定にしていた過去の作品とは異なり、本作はアニメスタッフが世界観を創作した（バトルストーリー世界の遠い未来ではないかと思わせる設定が存在するが劇中で明言されることはなかった）。メインとなるアニメ制作会社は無く、メインスタッフが随時、様々な制作会社（主に国外の会社）の下請けで製作するという方法が採られた。第29話以降では作中ヒロインのレ・ミィ（声：こやまきみこ）とコトナ・エレガンス（声：伊藤静）の二人のユニット「レ・ミィ×コトナ」をED主題歌のボーカルに起用し、以降ヒロインを主とした商品展開がされ、本作終了後もゾイド関連の家庭用携帯ゲームのイメージソングを歌うなどの活動をしていた。キットでも特別仕様パッケージの物が販売された。2009年に発売された、ロボットアニメのクロスオーバー作品「スーパーロボット大戦シリーズ」の1つ『スーパーロボット大戦K』に「機獣創世記ゾイドジェネシス」名義で参戦。ゾイドシリーズにおける、スーパーロボット大戦シリーズ初参戦作品となった。2016年1月6日にBlu-ray BOXが発売。
天文年間初め（1530年代前半）頃、筑前国志摩郡柑子岳城を大内氏が乗っ取り、城普請を行う。致定は父の梅月頼致に従い、石見国高城（三隅城）から柑子岳城に移り、天文4年（1535年）、父が隠居すると城代となる。同7年（1538年）在番中に豊後国より大友氏が攻め入った際、致定は早良郡安楽平城に退き、同城代の大村興景とともに城を守った。しかしその後、志摩郡は大友氏の勢力下となり、臼杵鎮続が志摩郡代を兼ねて柑子岳城に入った。
欧州宇宙標準協会（European Cooperation for Space Standardization, ECSS）とはヨーロッパの宇宙技術における標準化向上に従事する組織。1993年秋に複数の企業、機関が署名し、正式に発足した。ECSSは頻繁に標準規格を公開し、欧州宇宙機関と契約する企業はそれに従わなくてはならない。
NIPRNet (Unclassified but Sensitive Internet Protocol Router Network) は、「取扱注意だが機密扱いではない」情報を内部の利用者間で交換したり、利用者にインターネットへの接続を提供するアメリカ軍のコンピュータネットワーク。"Non-classified IP Router Network" とも呼ばれている。NIPRNet はアメリカ国防総省 (DOD) の所有する Internet Protocol ルーター群で構成されている。1980年代にMILNETを置き換える形で作られ、アメリカ国防情報システム局 (DISA) が管理している。国防総省が把握しないうちにどんどん拡張されてしまったため、全ルーターの所在をマッピングし、どう拡大していったのかを分析し、無許可の利用者を特定し、誰が密かにこのネットワークに参加したのかを調査するため、国防総省が1000万ドルを費やしている。この調査でセキュリティ上の弱点を探すことも視野に入れている。特にここ数年（2011年現在）、国防総省はネットワークセキュリティの強化に力を入れている。ペンタゴンは、2012年度予算で国防部門内のネットワークセキュリティの強化とアメリカ合衆国国土安全保障省のセキュリティ部門との連携強化のために23億ドルを要求した。SIPRNetとNIPRNetは、口語では「シッパーネット」と「ニッパーネット」のように発音されている。
新月の夜、風太郎は闇に紛れて高台寺に忍び込み、ねねにひょうたんの事をある一言を添えて頼む。ねねはその事について詰問するが、最終的に本阿弥光悦への紹介状を書く。しかし翌日光悦の元に行くと、いくさが終わってからまた来るよう断られる。十一月に入ったある日、瓢六宛てに届いた風太郎の手紙を芥下が持ってくる。その時に、芥下から自身の生い立ちを聞いて衝撃を受ける。手紙の主は黒弓で、堺に来て商売の手伝いをしてほしいという頼みだった。しかし堺の待ち合わせ場所にいたのは采女の命を受けた柘植屋敷の仲間・蝉たちで、否応なく忍びに加えられる。宿の主で伊賀の忍びである孫兵衛たち十二人は二人一組になり、采女の命によりいくさで見通しをよくするために天王寺の家々を焼き払う。風太郎は蝉と組んで焼き討ちを行うが、その最中に一軒の家の親子に見つかってしまい咄嗟に殺してしまう。その三日後堺を発ち、大坂に向かう最中で藤堂軍に加わる。大坂到着後は後方に回される。その内に十二月を迎え、いくさが始まる。夜明けとともに藤堂軍以外の徳川方が一斉に攻撃を仕掛けるが、真田丸の攻撃に手も足も出ず大勢の犠牲を出す。藤堂軍は味方の他軍を一切助けないまま翌日になり、日が暮れてから夜討ちをする事になる。夜討ちのメンバーには堺の宿にいた忍び達が揃っているが、なぜか孫兵衛だけが見当たらない。城壁を乗り越えると戦いが始まっていた。敵か味方か分からない雑兵達に襲われるが、まともに刀も扱えないような兵ばかりで全員一撃で殺してしまう。帰還する時、蝉が持っている首について尋ねると、采女の命により城に忍び込んでいた味方を始末したと言う。また、陣地に戻ってから、先日の天王寺焼き討ちに関して家康が高虎に対し「余計な事をした」と叱ったため、孫兵衛が采女にその責任を取らされて切腹した事を知る。その後も足軽や穴掘りに従事していると、唐突に和議が結ばれいくさが終了する。和議の条件である堀の埋め立てを終え近くの石段を上ると、小さな祠が立つ槐の下で黒弓と再会する。黒弓は一時的に堺を離れ大坂にいた時にいくさが始まり、城下から出る事ができなかったと話す。いくさの前と何ら変わらない無邪気な黒弓と比べ、いくさの間に何人もの命を奪った自分がすっかり変わってしまった事を実感する。