2017年以降、放送内容に関して謝罪に追い込まれる事例が多発しており、朝日新聞は、視聴率低迷が背景にあると指摘している。以下、並びは発生順。所属・役職については特記の無い限り、発生当時のものである。また、スポーツ中継などのCM入りのタイミングや演出など番組の細部への批判や、一時的にSNSサイトなどで炎上した案件も含めた場合は極めて膨大な量となるため、ここでは公に問題となった事例のみ示す。
フジテレビは、放送事業者であると同時に日本最大級の映画製作集団であり、編成局映画事業センターが映画製作とテレビでの映画放送を行っている。2003年7月に編成部門から独立して映画事業局（2004年2月19日時点のアーカイブ）となったが、2017年7月の組織再編で再び編成局の傘下に入ることになった。映画事業センターは、劇場用映画を製作する「映画制作部」と、『土曜プレミアム』などテレビ等で放送する映画放映権の獲得交渉・宣伝を行う「映画調整部」の2セクションに分かれる。規模で言えば、既存の映画製作会社を凌ぎ日本でも最大級である。製作する映画のほとんどは映画制作部が主体となる。映画事業局時代は初代局長の亀山千広や石原隆らが中心となり、企画から制作・配給契約・宣伝・DVD化・テレビ放送・海外セールスまでを同局が一括して管理していた。配給は東宝系列で行われる例が多い。『踊る大捜査線』をはじめとして高い興行収入が見込める作品は、通常の番組への映画キャストの出演や関連特集番組の放送など、通常の番組を徹底して映画の宣伝に利用し、ドラマの視聴者を映画館に誘導して高い興行収入に結びつけるビジネスモデルを開拓。2000年代に多くのテレビ局映画を産む契機ともなった。現在、フジテレビは同局が中心となり、株式会社GDH（アニメーション制作会社であるGONZOの持株会社）の株を第三者割当により10%取得して資本関係を結び、アニメ映画の共同製作（第一作は宮部みゆき原作、2006年夏公開の『ブレイブ・ストーリー』）を行っている。その一方で、『攻殻機動隊』シリーズで名高いアニメーションおよびCG制作スタジオProduction I.Gと共同で、有限責任事業組合フジ・IG・ラボ・フォー・ムービーズ（FILM。現 FILM有限責任事業組合）を設立。同組合専用のデジタルスタジオ「FIX STUDIO」を立ち上げ、同スタジオと米国の音楽制作プロダクションスカイウォーカー・サウンドのスタジオ間に専用の大容量ネットワーク回線「スカイ・リンク」を敷設し、日米で同時並行作業が可能な体制を整えるなど、劇場用実写・アニメーション映画の製作力向上に対して積極的な姿勢を取っている。なお、2008年4月よりフジテレビ製作の映画はWOWOWが先行放映している。
2003年より、CSフジテレビでは代表格となるゲームバラエティ番組『ゲームセンターCX』が放送されている。日本国内のみならず海外でも人気や知名度を獲得したり、任天堂をはじめとした数多くのゲームメーカーからも好評や支持されている。現在も10年以上放送が続いている。また、麻雀バラエティ番組『THEわれめDEポン』も20年以上続いており、著名人を中心に高い評価を受けている。
2011年より放送開始した『東北魂TV』が、番組だけではなく被災地での復興ライブイベント・DVDなどの幅広い場で活動して好評であり、2007年より放送開始した『所さんの世田谷ベース』もBS番組では珍しい長寿番組であり、いずれの番組もBSフジでは代表格で現在も放送が続いている。
ミニマル・ミュージックの後継者あるいはポストミニマリズムの代表者として見られることが多いものの、彼の姿勢は政治的や地理的にもライヒやグラスとはやや異なっている。1960年代にAnti-Bass Musicでデビューした頃はベトナム戦争に関わるデータを音楽に用いるなどの反体制音楽家であった。彼の1972年に書かれた代表作「影のミサ」で、はっきりと調性音楽の全肯定を行う。Wolf is Dead (1984)やCALIFORNIA FAMILY: A PORTRAIT (1989)では確かに反復ジェスチャはグラスと共通していてもフレデリック・ジェフスキーのように転調やテクスチャ変更がとても多く、ライヒやグラスに見られる「静的な」雰囲気は完全に払拭されている。デビュー時にはUSA国歌を生のまま楽曲に応用したThe Crack in the Bellなど、ミニマリズムの本尊とは乖離が見られる。非常に動的なテクスチャを好む一方で、「影のミサ」のようなアンビエントに近い音楽性にも強く、MIDIにプリセットされた音源をそのまま使うなど1980年代のルイ・アンドリーセンや当時のオランダの作曲業界の態度と共通項が多い。レンツもライヒと同じように「ダニエル・レンツ・グループ」としてエレクトロニクスをふんだんに用いた活動を世界中で行った。調性に基づいた言語は一切手放しておらず、西洋音楽の過去に見られた作曲技法(カノン他)と近い姿勢を見せることからヨーロッパで好意的に受け止められており、アメリカ合衆国人二人目のガウデアムス音楽大賞を受賞した。彼はアメリカで徹頭徹尾アカデミックな教育をオハイオ大学、ブランデイス大学ほかでロジャー・セッションズ、アーサー・バーガーから正規に師事して受けており、完璧な基礎能力に裏打ちされた技術が評価の要になっている。他のミニマル作曲家と同じように彼も美術業界に進出。自筆譜をもとにした彫刻を展示(ILLUMINATED MANUSCRIPTS)するとともに彼自身の作曲した音楽をその場でテープで流すなど、視覚的な要素を重視する点も「演出家任せにしてきた」他のミニマリズムの作曲家とは際立って異なっている。ワンパターンなテクスチャを一貫して回避してきた点が、グレン・ブランカやラ・モンテ・ヤングのよう単一のフィギュアにこだわるミニマリストとは別個に分類される所以である。作品はNew Albion, Aoede, Materiali Sonori, Cold Blue Musicほかから発売されている。現在も南カリフォルニアに家族とともに住む。1940年代生まれであるにもかかわらず、東海岸アカデミズムと西海岸実験主義の様式を折衷させて世に送り出した貴重な存在でもある。