脳への障害からツール・ド・フランスでの区間優勝や事故の記憶などは失っており、片側の肺の損傷などもあったが懸命なリハビリを続け、2004年にはアテネパラリンピックへと出場することになる。そのアテネではロードレース / タイムトライアルlCP3では金メダルを獲得、追い抜きにおいても予選で世界記録を樹立したものの、決勝でイギリスのダレン・ケニーがその記録を塗り替え、銀メダルに終わった。2008年の北京パラリンピックではタイムトライアルCP3で金メダル、ロードレースLCでは再びダレン・ケニーに次ぐ銀メダルを獲得した。個人の追い抜きでは彼を追い越したダレン・ケニーのすぐ後ろに近付き過ぎたとして失格扱いになった。これに対してダレン・ケニーは決勝でオチョアと競い合いたかったのに残念だと述べている 。2018年8月24日に死去した。43歳。
2001年2月、双子の弟のリカルド・オチョアとともにマラガでブエルタ・ア・アンダルシアに向けて練習していたところ、後ろから来た車に二人ともはねられ、弟のリカルドは即死した。ハビエル自身も脳に強くダメージを負ったほか、全身を複雑骨折し、手術を行ったものの、昏睡状態へと陥った。一時は医師より生命維持装置を外すことも提案されたが家族は回復を信じて治療を続け、60日以上の昏睡状態を経てついには意識が戻った。
1997年から2001年までの間、ケルメ・コスタ・ブランカに所属していた。2000年にはツール・ド・フランス2000に出場。第10ステージのオカタムの山岳ステージで区間優勝を果たし、総合成績では13位、山岳賞ではコロンビアのサンティアゴ・ボテーロに次ぐ2位となった。
ロシア生活党（Российская партия жизни、Rossiyskaya Partiya Zhizni、Russian Party of Life）はロシアの政党。党首は、ロシア連邦議会上院（連邦会議）議長のセルゲイ・ミロノフ（ミローノフ）。本部はモスクワにある。ロシア生活党の政治的立場は、公式サイトによれば、経済問題については自由主義、それ以外の政治路線については国家主義的な立場を取ると主張している。2003年12月7日に行われたロシア連邦議会下院（国家会議）代議員選挙では、ロシア再生党と同盟を組み、比例代表で統一名簿を作成した。しかし、統一名簿に2002年にロシア人初のミス・ユニバースに選ばれ、4ヵ月後ミスのタイトルを剥奪されたことで（本人はタイトルは剥奪されたのではなく自分から返還したと主張）話題となったオクサナ・フェドローワOxana Fedorovaを筆頭とする何人かの著名人を載せたがわずか1.9%しか獲得できなかった。2006年10月統一地方選挙で予想外に躍進し、10月28日祖国、ロシア年金党とともに新党「公正ロシア」を結成した。
マドンナ、ティナ・ターナー、シェーア、マイケル・ジャクソン、ビング・クロスビー、エルヴィス・プレスリー、ボブ・ディラン、ダイアナ・ロス、ブリトニー・スピアーズ、クリスティーナ・アギレラ、フランク・シナトラ、レディー・ガガ、ビヨンセ等に代表されるアメリカのアーティストはイギリスでも高い人気を誇る。一方で、ビートルズ、ローリング・ストーンズ、スティング、ザ・フー、シャーリー・バッシー、トム・ジョーンズ、デヴィッド・ボウイ、スパイス・ガールズ, ビージーズ、エイミー・ワインハウス、KTタンストール、レオナ・ルイス、エルトン・ジョン、コールドプレイ等のイギリスのアーティストもアメリカの音楽市場において大きな成功を収めている。疑いの余地なく、両国のポピュラー音楽は互いに強い影響を与えている。アメリカでは、多くのハリウッド映画やブロードウェイ・ミュージカルが音楽作品やサウンドトラックと密接に結びついて制作された。これらの分野（映画音楽、ミュージカル音楽）で著名なアメリカ人作曲家にはジョージ・ガーシュウィン、ロジャース&ハマースタイン、ヘンリー・マンシーニ、ジョン・ウィリアムズ、アラン・シルヴェストリ、ジェリー・ゴールドスミス、ジェームズ・ホーナーがいる。ケルト音楽はアメリカの音楽に大きな影響を与えた。とりわけ、合衆国南部の伝統音楽はイギリス植民地時代に受けたケルト音楽やイングランドのフォーク音楽の影響から派生した。これは後にカントリー・ミュージックと呼ばれるようになり、アメリカのフォーク音楽を築き上げた。ジャズ、スウィング、ビッグバンド、そして特にロックンロールの音楽ジャンルはすべてアメリカ合衆国に端を発しており、後にイギリスで発展したロック音楽にも大きな影響を与えた。アメリカのブルースが基となって、特にビートルズやローリング・ストーンズなどイギリスのエレクトリック・ロックに影響を与えた。
1995年3月の地下鉄サリン事件ではサリン散布実行犯となった。サリンについてはサリンプラントの電気工事をしたり説法で何度も聞かされたこともあるので有毒性は知っており、嫌だと思ったが「断ったら制裁がある。恋人との仲がばれて私は殺され、家族にも累が及ぶ」と思い承諾した。この林の公判中における証言は、他の実行犯らが「救済のためには殺人も許される」とする教団教義や麻原の絶対性を主張する中で、異色なものとなった。村井秀夫は一応「嫌なら断ってもいい」と言ったが、「断ることは当時の自分たちには無理であることを村井さんは分かっているのに、そう言うのは残酷だと思った」と証言している。教団が犯行のために用意したサリンが入った11袋のうち3袋を引き受け、散布した車両では最も多い9人の死者を出した。これについては林が傘で袋を4回以上突き刺してサリンを流出させていたことに加えて、小伝馬町駅構内でサリンに身体を侵された乗客が異臭を放つ物体（犯行に使われた袋）を車外へ蹴り出したことで、さらにサリンが拡散されたからとも考えられる（警察無線記録にも残されている）。林は自ら志願して他の実行犯よりも多い3袋を受け持ち（残りの実行犯4人は2袋ずつ）、実行したと報道され、オウムへの忠誠心が厚くダーティーワークを厭わずに実行する「殺人マシーン」との認識が一般に広まった。だが、実際は事件の前日中川智正・遠藤誠一がサリンのパックを11個用意して端数が生じたが、林が犯行当時、指示を断れない状況下にあるのを知っていた村井が5人の中で最初に林に1つ多く持ってくれるかと頼み、引き受けたものだった。井上嘉浩は「実行メンバーの中でもっとも人間的で優しい人なのでいやがることを引き受けた」と語り、他の実行犯も「みんながいやがる仕事を引き受けるのが彼だった」と口を揃えた。更に林が持参したサリンのパックが1つ、配布時から破損し、二重の袋内に漏れていたという。1994年6月の松本サリン事件にもサリン噴霧車の製造という形で関与している。