デ・フカの初期の航海は極東で、1587年にバハカリフォルニア半島のサンルーカス岬沖でイギリス人のトーマス・キャヴェンディッシュの私掠船が彼のガレオン船「サンタ・アナ」を拿捕し、ヌエバ・エスパーニャに上陸させられたと彼は主張している。デ・フカは熟練の船員で、スペイン艦隊の水先案内人としての技能を完成させた。スペイン王はデ・フカの優秀さを認めてスペイン艦隊の西インド諸島への水先案内人に指名したとデ・フカは主張していたが、スペインの公文書には、彼の名前や地位、あるいは王宮への訪問の記録は存在しない。有名な北米大陸北西海岸への航海をする前に、彼は中国、フィリピン、メキシコへ向かった。
彼は、イオアンネス・フォカスをスペイン語に訳したファン・デ・フカ（実際の発音はフアン・デ・フーカに近い）の名前で知られている。一説には、本名はアポストロス・ヴァレリアノス(Ἀπόστολος Βαλεριάνος, Apóstolos Valeriános)であるという。これは、出生時の名前がアポストロスで、洗礼時にイオアンネスとつけられた可能性がある。
イオアンネスの祖父、エマヌエル・フォカス(Ἐμμανουὴλ Φωκᾶς, Emmanouíl Phokás)は、1453年、コンスタンティノープルの陥落時に兄弟のアンドロニコス(Ἀνδρόνικος)とともに逃げ落ちた。2人は当初ペロポネソス半島に住んでいたが、1470年にエマヌエルのみケファロニア島に移り住んだ。イオアンネスの父、イアコヴォス(Ἰάκωβος)は、島内のヴァレリアノス村で独立した家を立て、兄弟と区別するためにヴァレリアノスのフォカス(Φωκᾶς ὁ Βαλεριάνος)と呼ばれるようになった。イオアンネスはヴァレリアノス村で1536年に生まれた。1555年頃にスペイン王に仕えるようになる前の彼の人生についてはほとんど何も知られていない。
太陽系第10惑星「スターボー」から脱出し、地球に「A・I（愛）」を伝えるためにやってきた性別不明の3人組アイドルという設定の下で売り出された。この楽曲の衣装に関しては若き三銃士をイメージした宇宙的なコスチュームが採用され、髪型もこの当時の若年の男性の時流を意識した刈上げのテクノカット、更に態度も無表情・無口と、徹底して性別不明で非人間的なイメージを演出して活動していた。当初メンバーはそれぞれナカト、イマト、ヤエトと称していたが、全員の名前の語尾に「ト」が入るのは「男らしくするため」という理由があった。当楽曲では作曲者の細野晴臣が所属していたYMO色の濃いテクノポップやニュー・ウェイヴ的なサウンドと、男目線で書かれた命令口調の歌詞のラブソングが用いられた。またメンバーの歌唱法も意図的にドスの利いた裏声で歌われ、男性的なキャラクターを一層際立たせていた。なお、当楽曲の作詞を担当した松本隆はスターボーの商業的失敗に関し2000年のインタビューで「全然記憶がない（笑）。多分ね、思い出したくない、早く忘れようっていう自己防衛本能が働いているんだよ。なにがどうなってああなっちゃったんだろう…（中略）…アルバムまで作ったのに売れないっていうのは相当なブラックホールに迷いこんだような、ま、悪夢です（笑）」と自嘲気味に述べていた。
伊予松山藩の御用絵師遠藤廣實の三男として生まれる。遠藤家は元々江戸に住み、狩野興以の子・興甫に連なる一族だったとも推測されるが、少なくとも祖父・遠藤廣古の代には住吉派に転向し、江戸で松山藩に仕えるようになった。父・広實も父の跡を継いで松山藩に仕え、江戸幕府御用絵師・住吉廣行の弟子だった。廣賢も廣行の次男で住吉家を継いでいた住吉弘貫（廣定）に絵を学ぶ。実兄である遠藤廣宗・貫周は既に弘貫に学んでいる兄弟子で、弟弟子に山名貫義がいる。時期は不明だが弘貫の養子となり、1863年（文久3年に弘貫が亡くなると、翌年30歳で跡を継ぎ、幕府の御用を務めた。しかし、1868年5月11日（慶応4年4月19日）に若年寄の服部常純から御用絵師の職を解かれた旨を通達される。徳川家の静岡下向に付き従おうとしたが、病身のため同行できなかった。ところがこれが幸いし、同年9月17日新政府への出仕を命じられ東京府を貫属とし家禄として現米13石を支給された。11月13日に18日に行われる明治天皇による新嘗祭で用いる砂子泥引の四季花鳥図屏風一双の制作を急遽命じられ、18日当日に奉納した。その後も新政府への画事は続き、翌1869年（明治2年）会計官租税司の図籍方へ移動、1871年（明治4年）9月大蔵省、後に内務省出仕となり、大小広範囲に渡る画事を依頼される。1875年（明治8年）内務省地理寮11等出仕を免職となるが、東京国立博物館やに現存する古画模本の多くがこれ以降に制作されたと見なせる事から、その後も官公庁や半官的な職務を請け負っていたようだ。1878年（明治11年）にアーネスト・フェノロサが来日すると、狩野友信、狩野永悳らと共に彼の日本美術研究に協力した。享年49歳。 戒名は常輕院深達廣賢居士。墓所は、『東洋美術大観』や『東京美術家墓所誌』によると護國院だが、現在は多磨霊園にある。跡は息子の住吉廣一が継いだが大成せず、39歳の若さでなくなったため住吉家も途絶えた。弟子に高取稚成など。