旅団は、バイエルン山岳部隊の前身である1805年に創設された山岳狙撃隊を伝統の源流としている。伝統に基づいて部隊は1915年にドイツ・アルペン軍団はエーデルワイスを部隊章とした。1957年に旅団の母体となるA8戦闘群が編成される。早くも1960年には輸送用に駄獣小隊（後の第230山岳駄獣中隊の前身）でラバを使用した。冷戦時点で山岳部隊は第1山岳師団の隷下に2個旅団を有し、第二単位として第23山岳猟兵旅団と第三単位として第24装甲旅団があり、第1山岳師団は第2軍団隷下にあった。1973年に旅団は再編成され第236山岳補給大隊が解隊され、新しく第230山岳衛生中隊、第230山岳補給中隊、第230山岳整備中隊および第230山岳駄獣中隊の4個部隊が編成される。1981年に旅団は再編成され第231山岳猟兵大隊、第232山岳猟兵大隊および第234山岳猟兵大隊がミッテンヴァルトに駐屯し、第230山岳補給中隊および第230山岳衛生中隊は解隊される。1992年に第234山岳猟兵大隊は解隊、フュッセンの第225山岳砲兵大隊の1年後に第235山岳砲兵大隊が解隊される。2001年に第1山岳師団が解隊される。この年までに第22装甲擲弾兵旅団と第24装甲旅団は解隊されており、残存部隊を継承していた。そして、同じ2001年に第23山岳猟兵旅団は第10装甲師団隷下に所属変更された。旅団はドイツ陸軍に残された唯一の山岳戦専門部隊となっている。2003年に第8山岳整備大隊、第8山岳後方支援大隊および第23山岳猟兵大隊が隷属する。2003年、インゴルシュタットの第60工兵教導旅団からブランネンブルクの第8山岳工兵大隊が編入される。2007年7月1日に第225山岳装甲砲兵大隊は第230山岳偵察大隊に改編される。第5装甲偵察大隊の一部はゾントラで再編成され、第230山岳偵察代替に編入され2008年6月30日に解隊される。2007年10月1日には第210通信大隊が第210山岳通信大隊に改称される。2008年6月16日、旅団創隊50周年を記念して称号「バイエルン」を与えられる。
2010年に第8山岳通信大隊はインゴルシュタットへの移駐が決まっている。第210山岳偵察大隊の一部（第1、第3および第4中隊）はウルムに駐屯し、2010年末までに第1中隊はバート・ライヘンハルに、第3および第4中隊はビショフスヴィーゼン＝シュターブに移駐する予定。第231山岳猟兵大隊はフクス装甲兵員輸送車の更新としてボクサー装輪装甲車の装備が始まる。第232および第233山岳猟兵大隊には同様の意図のため既にBv206装甲兵員輸送車を装備している。 第210山岳通信大隊は2010年にウルムからバート・ライヘンハルに移転したが、2014年に廃止され、通信任務は司令部中隊が引き継いだ。
1934年6月30日のエルンスト・レームら突撃隊幹部を対象とした粛清（長いナイフの夜）は、ゲーリング、ヒムラー、ハイドリヒの3名が主導してヒトラーに働きかけたものである。レーム初め突撃隊幹部は、突撃隊をドイツの正規軍とすることを望んでおり、国軍と軋轢を強めていた。ヒトラーは国軍を掌握するためには突撃隊を何とかしなければならないとは考えていたが、レームとは古参幹部で唯一「お前」と呼び合う対等の仲の同士であり、なかなか粛清に踏み切れなかった。そこでハイドリヒは突撃隊謀反の証拠を捏造・流布し、これをヒムラーからヒトラーへ伝えさせ、とうとう彼に粛清の決意を固めさせたのであった。レームはヒムラーとともにハイドリヒの長男クラウスの代父になっていた。ヒムラーが突撃隊の粛清には賛同しつつもレーム個人については躊躇していたのとは対照的に、ハイドリヒが彼に同情を抱く様子は全くなかった。ハイドリヒは、レームの粛清を親衛隊が突撃隊へ優位を確立するチャンスとしか捉えておらず、ヒムラーを説き伏せて抹殺の決意を固めさせたのであった。ハイドリヒは、粛清対象をリストアップする事実上の最高責任者であった。彼はこれに乗じて突撃隊だけではなく、党内外の反対分子をまとめて粛清することを企み、突撃隊以外の人々の名前も次々とリストに加えさせていった。なおハイドリヒは、粛清名簿の中にゲーリングの息のかかった前ゲシュタポ局長ルドルフ・ディールスの名前も加えていたが、それに気づいたゲーリングが猛抗議し、名簿から削除させている。6月28日夜にヒトラーはバイエルン州のバート・ヴィースゼーで療養中のレームに電話を入れ、突撃隊員が起こした暴力事件について、30日にそちらで会議をしたいので幹部を集めておくようにと指示を出した。ヒトラーは、30日にミュンヘンへ飛び、ヨーゼフ・ディートリヒのライプシュタンダーテ アドルフ・ヒトラーを指揮してレーム達突撃隊幹部の逮捕を自ら行った。突撃隊幹部らが次々と銃殺されていく中でも、ヒトラーはレームだけは助命するつもりでいたが、ヒムラーらが強硬に処刑を主張するのに折れ、最終的に認めさせた。一方ハイドリヒは、ヒムラーやゲーリングとともにベルリンにあり、同地で粛清の指揮にあたっていた。ゲシュタポやSDの将校を次々と呼びだしては独特な早口の甲高い声で次の命令を繰り返した。「総統命令。レームによる武装蜂起。国家非常事態。直ちに行動せよ」。ベルリンや北ドイツでの粛清は多くがハイドリヒの命令によって行われた。エーリヒ・クラウゼナー、エドガー・ユリウス・ユング、カール・エルンストの殺害などはハイドリヒの命令による。事件後、ハイドリヒは粛清の功績を認められ、親衛隊中将に昇進した。1934年7月20日には、ヒトラーは親衛隊の功績を賞して突撃隊からの独立を認めている。この事件でハイドリヒは冷酷無比の評判を得、党の古参党員達からも恐れられるようになった。内相ヴィルヘルム・フリックは、「今後、私はヒムラーの入閣を支持することはあり得る。だがどんな場合でも、あの“暗殺者”ハイドリヒだけは入閣させるわけにはいかない」と述べたという。