シナリオ中でランダムに出現する他、地形を調べることでも出現する。スキル「よく調べる」でアルバムに登録される他、モンスターのステータスを確認することができる。シナリオによっては特定のモンスターを倒すことが目標となっている。またシナリオ「最後の戦い」で出現するボスモンスターはカード3枚分の大きさを持ち、それぞれの部位から攻撃してくる。本体を倒せばシナリオクリアとなり、倒した時点でアルバムに登録される。なお、モンスターの攻撃手段は「つめ」「炎」等のモンスター攻撃専用のカードの他、武器系アイテムカードをそのまま攻撃に用いる場合と、魔法あるいは技カードを使ってくる場合がある。モンスターごとに使用できるカードと使用頻度が設定されており、またモンスターのカードが尽きることは無い。
主人公となるキャラクターの他に、街の住人やイベントキャラもカードで表現されている。仲間にするか、スキル「よく調べる」で調べることでアルバムに登録される（イベントのみ登場のキャラクターは出会うだけで登録される）。仲間になるキャラクターの一部は他のカードに絵のモデルとして登場している。全ての主人公はある日「流星」を観測、そこに何かを感じ取って旅に出るという点で共通している。
上述のように、あらゆる要素がカードとして表現されている。なお、「カードを入手する」「カードを選択する」「スキル「よく調べる」でカードを調べる」等の行動で、タイトル画面から入れる「Album」に登録される。全930種類だが、コンプリートしても特典は無い。また、通信機能を利用して、アルバムに登録されているカードをやり取りすることもできる。
本作はシナリオ、フィールド、武器、バトル、魔法、スキル、行動といったRPGを構成する様々な要素が全てカードで表現されているのが特徴。9人の主人公から1人を選ぶことになるが、単に主人公を選ぶわけではなく、ゲーム開始時に様々な質問に答え、それに適したキャラクターが主人公に選ばれる。決まったシナリオをなぞる形ではなく、基本的には街でシナリオを選択していき、その選択したイベントをクリアしてゲームを進行させていくことになる。成長システムやシナリオの自由度の高さからサガシリーズの関連作と見られており、本作を手がけた河津は「マップがなくてもRPGは成立する」と考え、のちに『アンリミテッド:サガ』を開発した。また、作曲に携わった伊藤賢治は、このゲームに携わった後退社し、フリーとなった。
舞台は1190年の中東。後に「伝説のアサシン」と呼ばれることになる男、アルタイル・イブン・ラ・アハドが、任務を終えアサシン本部へと帰還しようとしていた。しかし、彼が目にしたものはテンプル騎士団によって攻撃され、炎上する本部の姿であった。なんとか彼らを撃退したアルタイルは、暗殺教団の長アル・ムアリムに聖杯“カリス”の発見を命じられる。聖杯には聖地を巡る争いの結果を左右するほどの力が秘められているのだという…。
アサシン クリードシリーズ初の携帯ゲーム機タイトル。前作にあたる『アサシン クリード』の前日譚となる物語が語られ、前作では名前だけが登場したアウダもキーパーソンとして登場する。
同性愛者のサラリーマンである川島洋二は、上司の口利きで妻の早苗と結婚したが、性交渉を持とうとせず夫婦仲は冷えきっていた。早苗と都合よく別れたい洋二は隣人の佐伯輝之と結託し、早苗の浮気現場を押さえることに成功する。作戦終了後、洋二は輝之とのホモセックスに臨むが、輝之の男性器に塗られていた毒にあたり倒れる。そこに現れた早苗の不敵な笑み。すべては浮気を悲観した焼身自殺に見せかけて洋二を殺すための二重の裏切りだった。
本作品はフランツ・カフカの愛読書のひとつであった。高等学校時代からクライストを愛読していたカフカは、不可解な訴訟の手続きに振り回された挙句処刑されてしまう男を描いた小説『審判』の執筆（1914-1915年）までに少なくとも三度『ミヒャエル・コールハース』を読んでいる。E・L・ドクトロウの映画化もされた小説『ラグタイム』（1975年）では、メインプロットのひとつで「コールハウス・ウォーカー」（Coalhouse Walker）という人物が登場する、本作と流れのよく似た物語が扱われており、ドクトロウ自身この作品はクライストの作品に対する明確なオマージュとして書かれたと述べている。このほか現代ドイツの作家クリストフ・ハインに、「現代の（より幸福な）コールハース」という、1970年代の東ドイツを風刺した短編がある。『ミヒャエル・コールハース』は、フォルカー・シュレンドルフ（1969年）、ジョン・バダム（1999年）、アルノー・ドゥ・パリエール（2013年）などの映画監督によってこれまでに5度映画化されている（テレビ映画などを含む）。
oDASS(光遺伝学的ドーパミン自己刺激）とは、マウスがレバーを引くと、そのマウスのドーパミン神経が光遺伝学的に刺激されるシステムである。要するにレバーを引くと快感が得られるということである。本説明のoDASSには電気ショックが伴っている。oDASSを行っているマウスの眼窩前頭皮質から、背側線条体に投射する神経細胞の活動をPhiberPhotometoryで記録したところ、図のようになった。oDASSの途中で電気ショックが与えられることがあるような設定にする。電気ショックに屈することなくレバーを引き続けたほうのマウスの神経活動が紫で、罰に屈してレバーを引かなくなったマウスの神経活動が緑である。赤いブロックは電気刺激の時間のを示している。レバー押し後の、眼窩前頭皮質から背側線条体に行く神経細胞の活動は、くじけないマウスの方が高く、くじけてしまうマウスの方では低い。さらに、oDASSを行っているマウスの眼窩前頭皮質から背側線条体に投射する神経の活動を光遺伝学的に抑制すると、くじけないマウスの割合が低下するということも分かった。　さらに、高カロリー液を摂取した際に活動した眼窩前頭皮質の細胞だけを、二光子励起顕微鏡を使って活性化したところ、高カロリー液を摂取するために過ごす時間が増えた。これは、摂食によって活性化された細胞は、因果的に摂食を促すということである。また、子供のマウスとの関わったときに活動した眼窩前頭皮質の細胞だけを、二光子励起顕微鏡を使って活性化したところ、高カロリー液を摂取するために過ごす時間が減った。これは、社会的交流によって活性化された細胞は、因果的に摂食を妨げるということである。