2003年から古巣の阪神に復帰し、中日時代の3×2=6の語呂合わせから背番号32を付けた。2003年は、持ち前の抜群の守備力で同年のリーグ優勝に貢献した。阪神復帰時は試合終盤の21時頃に守備固めで出場する機会が多かったことから、ファンや実況中継では「9時に久慈」と呼ばれていた。久慈が中日に在籍していた時期と、阪神に復帰した2003年の監督であった星野仙一は、久慈の守備能力とともに指導者としての資質を高く評価。2005年にも阪神から、次期指導者育成の一環として、二軍コーチへの就任を打診された。しかし、現役続行を希望する久慈がこの打診を拒否したため、球団は久慈の意思を尊重したうえで自由契約にした。その後は合同トライアウトに参加したが獲得球団がなく、2006年に入って引退を決意した。最後に出場した試合は2005年の日本シリーズ（対千葉ロッテマリーンズ）の第4戦、9回に一塁の代走として出場したが、矢野輝弘の送りバントが三塁手への小飛球となり、飛び出した本人も一塁へ戻れず併殺となった。
1997年オフ、脱税事件で出場停止となった鳥越裕介の穴埋めとして1998年に関川浩一とともに、大豊泰昭・矢野輝弘との交換トレードで中日へ移籍。背番号は6。6は高校時代と社会人時代に慣れ親しんでいた背番号でもあった。遊撃手として新外国人の李鍾範が入団したため二塁手に転向。しかし李が死球により戦列を離れたため、シーズン後半からは遊撃手を務めた。1999年には福留孝介にレギュラーの座こそ譲ったものの、当時守備に不安があった福留に代わり試合の後半に出場することも多かった。その後は、井端弘和・荒木雅博ら若手の台頭により出場機会が減少。2002年のシーズン終了後には、守備コーチ就任の打診を受けたが、現役続行を求めて自由契約で退団。
堅実な守備と勝負強い打撃で1年目から活躍し開幕戦にも先発出場しオールスターゲームのセリーグ遊撃手部門ファン投票選出、1992年に打率.245で新人王に選出。本塁打0本で新人王に選ばれた野手は史上初であった(後に同じ山梨県出身の松本哲也が2009年新人王に選ばれる)。1993年は年初に前年の新人王を争った相手でもある同僚の新庄剛志が遊撃へ再コンバートされるも、春季キャンプにおいての守備力評価で優位となりポジションを守った。1996年5月18日の甲子園の広島戦では9回二死から二塁打を放ち、ロビンソン・チェコのノーヒットノーランを阻止した。この他にも同年6月23日の富山での広島戦で山崎健から二塁打、1993年4月27日にナゴヤ球場での中日戦で郭源治から単打をそれぞれ打ち、ノーヒッターを阻止している（いずれも1安打完封、且つ相手投手が安打）。ルーキーイヤーから不動の遊撃手として出場していたが、1997年、規定打席到達はしていたものの、同年に監督就任した吉田義男からは久慈の肩の弱さから併殺を取れないことを指摘され、同年に入団し、主に二塁・三塁を守っていた今岡誠を来年からは遊撃手として育てる方針が固まっていた。
旗本槍組同心・椿嘉左衛門定重が54歳のとき、二男二女の末子として江戸に生まれる。椿山7歳の時、父と死別。長じて世襲制であった槍組同心となり、兵学（師は平山行蔵）・槍術・居合（片山流抜刀法）・馬術などの武術を習得した。同心勤務をしながら、微禄を補うために画を志した。はじめ金子金陵に就いて沈南蘋風の花鳥画を学んだが、金陵が死没してしまい、その師・谷文晁に一時入門する。17歳の頃、同門の渡辺崋山を慕い崋山塾に入門。崋山を終生の師とする。はじめ椿山は同門の者から不器用といわれたが、画の修業を怠らずたいへんな努力をした。これを知った崋山は「後に必ず名をなすだろう」といったという。早い時期に槍組同心を辞職し、画業と学問に専念する。師・崋山の作風をよく受け継ぎながらもその作風は柔軟な筆遣いと温和な彩色に特質がみられる。花鳥画・虫獣画・人物画に名品が多い。また俳諧・煎茶にも通じ、笙の名手としても知られる。椿山は穏やかで誠実な人柄であり寡黙であった。友人からは「飯少なく、遊少なく、眠少なく、言葉少なく、磨墨少なく、着筆少なく、彩色少なく、酒を飲まず、女に近付かず、煙草を喫せず、故に十少と称す」と評されていた。親孝行で知られ年老いた母を孝養で報いた。子弟の情宜にも篤く崋山が蛮社の獄で捕らわれた際には、救済運動の中心となり奔走した。崋山自刃後は弟弟子の福田半香・平井顕斎らとともに献身的に遺族の後見をし、崋山の二男・小華を弟子に迎え養育して後に養女の須磨を娶らせた。また密かに田原まで亡き崋山の墓参をしている。享年54。東京都新宿区の円福寺、港区青山霊園に墓と碑がある。椿山の息子・華谷（恒吉）は崋山に入門して豊かな才能を示していたが椿山に先立つこと4年の嘉永3年（1850年）、わずか26歳で夭折し跡を継ぐことができなかった。