副砲は破壊力を重視して1908年型 19 cm（45口径）速射砲を採用した。重量90.9kgの砲弾を使用した場合最大仰角25度では射程22,000 mであり、これを連装砲塔に収めた。俯仰能力は仰角25度・俯角5度である、旋回角度は160度。砲身の俯仰・砲塔の旋回・砲弾の揚弾・装填は主に電力で行われ、補助に人力を必要とした。発射速度は毎分2.6発である。その他に対水雷艇用にアームストロング 7.62 cm（40口径）速射砲を単装砲架で舷側ケースメイトに片舷8基ずつの計16基16門を配置。オチキス社製47 mm（43口径）機砲を単装砲架で2基2門を搭載した。水雷兵装として、45 cm水中魚雷発射管単装3基を装備した。1938年の近代化改装により、「サン・ジョルジョ」には対空火器としてOTO10cm（47口径）連装高角砲（トレント級重巡洋艦#高角砲・機銃・水雷兵装を参照）が搭載された。
独立戦争の間の1776年12月、大陸会議の議員がボルティモアに逃げたときもモリスはフィラデルフィアに留まった。ワシントンの軍隊に払うための1万ドルを何とか借金で工面できた。これがトレントンとプリンストン両戦闘の直前の大陸軍をつなぎ止めることになった。1778年3月、モリスはペンシルベニア邦の代表として連合規約に署名するよう選ばれた。モリスの大きな富は戦争中もイギリス船の貨物を捕獲する私掠船のお陰で増え続けた。多くの私掠船を所有しており、イギリス船が港に来たときは戦利品を売り払う役にも立った。大陸会議での活動を終えた直後にもペンシルベニア邦議会でさらに2期、1778年から1781年まで議員を務めた。この任期中に邦憲法の抑制と均衡を回復させるために働き、宗教試験法を廃案にさせた。この期間、トマス・ペインやヘンリー・ローレンスなどがモリスとその会社は戦争を利用して暴利をむさぼっていると批判した。大陸会議の委員会は1779年にモリスとその会社は不適切な金融取引を行っているという訴えに対し無罪を宣告したが、その評判はこの出来事で損なわれた。モリスはペンシルベニア邦が軍隊に軍需物資を供給することに失敗したときに、商人協会に加入した。ペンシルベニア邦は支配していた市場の失敗と自らに課した禁輸のために1780年に破産していた。究極的には邦がモリスを呼び出して経済を建て直すよう要求した。モリスは貿易のために港を開き、市場には商品価値と通貨を決めさせた。1781年のアメリカは危機的状況だった。イギリス軍は海上から海岸線、2つの主要都市および西部の前線を支配していた。政府の財政は2,500万ドルの負債超過となり、公的な信用貸しは破綻した。大陸会議は直面する問題を凝視してその政策の失敗を認識し、長い間使っていた委員会システムを変更してアメリカの歴史では初めて行政府を創出した。モリスは財政と海事の2つの役職を兼任した。モリスの批判者が心配する中で、今日では「行政権限」と呼ばれるものを認められ「独裁的な権限」を得ていた。大陸会議は1781年から1784年までモリスをアメリカ合衆国の財政最高責任者に指名した。批判者の中傷から自身を防衛するために、大陸会議がモリスに関連する公的役職に奉職しながら利益の出る私的事業を続けることを認めていると主張した。実際の所は、この期間の私的事業では活動的でなく、様々な会社ではものを言わない共同経営者であった。財政最高責任者になった3日後、モリスは国立銀行の設立を提案した。これは1782年に合衆国に設立許可された最初の金融機関、バンク・オブ・ノースアメリカの創設に繋がった。この銀行はモリスが1781年にフランスから獲得した大きな借金によって一部資金が手当てされていた。銀行の最初の役目はイギリスとの戦争の資金を賄うことであった。財政最高責任者のモリスは歳出を減らす幾つかの改革を行い、競争入札の利用、出金手続の締め付け、および連邦政府が各邦と金や物資の負担を分け合うよう要求することで政府の支出を大きく減らした。モリスは1779年、および1781年から1783年にナサニエル・グリーン軍に対する補給物資を調達した。ワシントン将軍がニューヨーク邦からバージニア邦のヨークタウンに移動するときも積極的な役割を果たした。この移動が始まった時にはワシントンの宿営地にいた。行軍の補給係将校として働き、軍隊移動のための資金140万ドル以上を自身の信用で調達した。海事関係の官吏でもあったので、フランス海軍と連絡を取り、ワシントン軍のヨークタウンの戦いに間に合うようにした。ヨークタウン以後、モリスはこの戦争が弾丸の戦いから財政の戦いに変質したと述べた。時には友人から金を借りることもあり、また軍需物資のようなものを買うために自署のある借用書を発行して個人的な信用のリスクを採ることもあった。例えば、1783年に兵士の給与のために80万ドルの借用書を発行した。これは同年にニューハンプシャー邦が戦争協力のために供出したものが3,000ドル相当の牛肉だけであり、全邦を併せても80万ドルに満たなかったときに行った。このように個人的な信用を拡張して使ったことで将来に禍根を残した。モリスは後に、戦争中に150隻以上の船を失ったが、「ほぼトントン」になったと言っていた。財政最高責任者の在任期間、友人で助手のガバヌーア・モリス（親戚ではない）の助力を得た。モリスは「公的信用について」という文書で国の経済の仕組みを提案した。これは後にハミルトンが同じ名前で提出した計画の基礎になった。1782年1月15日、モリスは後に大陸会議に提出する提案書の原稿を書いた。この中にはアメリカ合衆国造幣局の創設や十進法による硬貨の提案が含まれていた。しかし、アメリカ合衆国が造幣局を作ったのは1792年のことであり、ハミルトンが別の提案を行った後だった。