マギル大学の主な学部として、農環境学部（Faculty of Agricultural and Environmental Sciences）、教養学部（Faculty of Arts）、歯学部（Faculty of Dentistry）、教育学部（Faculty of Education）、工学部（Faculty of Engineering）、法学部（Faculty of Law）、経営学部（Desautels Faculty of Management）、医学部（Faculty of Medicine）、宗教学部（Faculty of Religious Studies）、理学部（Faculty of Science）、音楽院（Schulich School of Music）、生涯学習スクール（School of Continuing Studies）、建築学部（School of Architecture）、コンピュータサイエンス学部（School of Computer Science）、情報学部（School of Information Studies）、栄養学部（School of Dietetics and Human Nutrition）、理学・作業療法学部（School of Physical & Occupational Therapy）、看護学部（Ingram School of Nursing）、社会福祉学部（School of Social Work）、都市計画学部（School of Urban Planning）、環境学部（McGill School of Environmen）がある。また、イスラム学研究所（Institute of Islamic Studies：1952年設置）もあり、そこでは修士号（M.A.）と博士号（Ph.D.）につながる大学院課程を設置しており、イスラムの歴史、文化、社会を網羅している。研究所は、北米最大のイスラム学図書館の一つでもある。その他、大学院課程もあり、GPS（Graduate and Postdoctoral Studies）と呼ばれる組織が大学院教育（修士と博士課程両方を含む）の入学審査や登録などの業務を行っている。GPSは大学院生の奨学金、ポスドク業務、論文審査を含む修了手続を行っている。GPSは他のユニットと連携して、定期的にすべての学術分野のプログラムのレビューをしている。1959年に設立されたマギル管理職研究所（McGill Executive Institute）は、企業、政府、非営利団体に対してビジネスセミナーや個別教育を提供している。主にマギル大学の教員により行われる上級管理コースやマネジメント訓練プログラムは、役員クラスから上・中級管理者まで、すべての管理職レベルに向けて設計されている。
2007年、マギル大学は環境保護維持事務局（Office of Sustainability）を設置し、環境保護維持オフィサー（Sustainability Officer）に加え、それに次ぐ常勤の環境保護維持ディレクター（Director of Sustainability）をおいた。環境保護維持が持続可能な開発計画を実施するための最近の取り組みには、LEED-Silver認証を受け、緑の屋根が使用された建設された新しいライフサイエンスセンターや、他の環境保護維持活動プロジェクトの資金にするための2008年1月の駐車料金の引き上げが含まれている。
2006年、ケベック州政府はマギル大学ヘルスセンター（McGill University Health Centre : MUHC）のため1600万ドルのLEED再開発プロジェクトを開始した。このプロジェクトは、二つに分離したキャンパスの設備を拡張させ、ヴァンドーム駅（Vendôme）に隣接するかつてCPレイルヤード（CP rail yard）の敷地にあるMUHCの種々の病院を統合させることである。グレンヤードとして知られるこの一帯は、17万m²あり、モントリオールのノートルダムドゥグラース地区（en）近辺の一部と、ウェストモント市街地（en）にまたがる。グレンヤードプロジェクトは、プロジェクトに対する地元民の反対、環境問題、プロジェクトそれ自体のコストのために、論争の的となっている。2003年に州政府から承認を得たこのプロジェクトは、2010年に完了する予定であった。新たなキャンパスは完成し、古い病院（例えば、ロイヤル・ヴィクトリア病院（Royal Victoria）、モントリオール小児病院（Montreal Children's）、モントリオール総合病院（Montreal General））から診療所をMUHCに移動する大規模作業が行われている。
サンタンドゥベルヴュー地区（en）にある2番目のキャンパスは、マクドナルドキャンパス（en）である。そこには農学部、栄養学部、環境学部、寄生学研究所（Institute of Parasitology）がある。モーガン植物園（en）とJ・S・マーシャル・ラダー天文観測所（en）が近くにある。モーガン植物園は1945年に設立された。植物園は面積2.5平方km²におよび、「授業、研究、公教育」を目的とした森林保護区である。その委任された研究目的は、植物園の農園と森林地の健全性の維持に関わる研究を続けること、発展する環境条件に適合する種の選定にかかわる新たなプログラムを開発すること、天然及び人工ともに生物学上の多様性を保護・促進をさせる林業実務の発展に寄与することである。
1934年、菊池寛は『文藝春秋』4月号（直木三十五追悼号）に掲載された連載コラム「話の屑籠」にてこの年の2月に死去した直木三十五、1927年に死去した芥川龍之介の名を冠した新人賞の構想を「まだ定まってはいない」としつつ明らかにした。1924年に菊池が『文藝春秋』を創刊して以来、芥川は毎号巻頭に「侏儒の言葉」を掲載し直木もまた文壇ゴシップを寄せるなどして『文藝春秋』の発展に大きく寄与しており両賞の設立は菊池のこれらの友人に対する思いに端を発している。また『文学界』の編集者であった川崎竹一の回想によれば、1934年に文藝春秋社が発行していた『文藝通信』において川崎がゴンクール賞やノーベル賞など海外の文学賞を紹介したついでに日本でも権威のある文学賞を設立するべきだと書いた文章を菊池が読んだことも動機となっている。このとき菊池は川崎に文藝春秋社内ですぐに準備委員会および選考委員会を作るよう要請し、川崎や永井龍男らによって準備が進められた。同年中、『文藝春秋』1935年1月号において「芥川・直木賞宣言」が発表され正式に両賞が設立された。設立当時から賞牌として懐中時計が贈られるとされており、当時の副賞は500円であった。芥川賞選考委員は芥川と親交があり、また文藝春秋とも関わりの深い作家として川端康成、佐藤春夫、山本有三、瀧井孝作ら11名があたることになった。芥川賞・直木賞は今でこそジャーナリズムに大きく取り上げられる賞となっているが設立当初は菊池が考えたほどには耳目を集めず、1935年の「話の屑籠」で菊池は「新聞などは、もっと大きく扱ってくれてもいいと思う」と不平をこぼしている。1954年に受賞した吉行淳之介は、自身の受賞当時の芥川賞について「社会的話題にはならず、受賞者がにわかに忙しくなることはなかった」と述べており、1955年に受賞した遠藤周作も、当時は「ショウではなくてほんとに賞だった」と話題性の低さを言い表している。遠藤によれば、授賞式も新聞関係と文藝春秋社内の人間が10人ほど集まるだけのごく小規模なものだったという。転機となったのは1956年の石原慎太郎「太陽の季節」の受賞である。作品のセンセーショナルな内容や学生作家であったことなどから大きな話題を呼び、受賞作がベストセラーとなっただけでなく「太陽族」という新語が生まれ石原の髪型を真似た「慎太郎カット」が流行するなど「慎太郎ブーム」と呼ばれる社会現象を巻き起こした。これ以降芥川賞・直木賞はジャーナリズムに大きく取り上げられる賞となり1957年下半期に開高健、1958年上半期に大江健三郎が受賞した頃には新聞社だけでなくテレビ、ラジオ局からも取材が押し寄せ、また新作の掲載権をめぐって雑誌社が争うほどになっていた。今日においても話題性の高さは変わらず特に受賞者が学生作家であるような場合にはジャーナリズムに大きく取り上げられ、受賞作はしばしばベストセラーとなっている。