2010年6月、日本共産党機関紙の『しんぶん赤旗』6月号外に支持者の一人として名前を連ねている。2008年2月1日の「赤旗」創刊80周年によせての寄稿では、新聞をとるなら「赤旗」も併読紙として重要だと購読をすすめている。2010年9月12日付の『しんぶん赤旗』「読者の広場（投書欄）」に一読者として「選挙制度改正大運動に賛成」と題して小選挙区制を批判する投書を行っている。
新渡戸稲造の『野球と其害毒』（『東京朝日新聞』連載）の後を承け、『貧困なる精神』のすずさわ書店版第21集は『新版「野球とその害毒」』のサブタイトルで、野球害毒論を説いた。広島ファンの筑紫哲也が巨人の金満補強を嘆いて『週刊金曜日』に「野球自体への興味が薄れつつある」と書くと、本多は「結構なことだなあ。巨人がもっともっと大選手をかき集めて、毎年ひとり勝ちになって、巨人ファン以外はだれも職業野球になど関心を失って、球場が赤字つづきになる。すばらしいことではなかろうか。不正が敗北するわけだから。どうか巨人「軍」よ、来年も再来年も勝ちつづけてくれ」と感想を返した。
日本において標準語が偏重され方言が軽んじられていることを批判している。一方で、普通語（標準語）以外の地方語が徹底的に弾圧されていた文化大革命期の中国を「共通語と方言（または少数民族言語）との間に階級差別のない関係」を実現したとして賞賛する発言も残している。
本多の生年は、著書によって1931年（昭和6年）、1932年（昭和7年）、1933年（昭和8年）の3通りを記しており、どれが正しいのかは不明である。たとえば『中国の旅』ハードカバー版（1972年、朝日新聞社）によると1931年であり、同書文庫版（1981年、朝日新聞社）によると1933年であり、『殺される側の論理』（1982年、朝日新聞社）によると1932年であるという。2011年のインタビューでは本多は1931年生まれと語っている。生年月日を記した資料『現代日本人名録98』および『20世紀日本人名事典』によると、1932年1月28日生まれだが戸籍上は1931年11月22日生まれであるという。殿岡昭郎の『体験的本多勝一論』（2003年、日新報道）によると、1987年3月3日、京都地裁で開かれたベトナム僧尼団焼身自殺をめぐる民事裁判の原告本人質問にて、本多は「1933年4月28日生まれである可能性がある」と発言している。本多は「私はですね、いわゆる旧制中学に入って間もなく戦争が終わった世代なものですから」、「私が(旧制)中学二年になった一九四五年四月」と述べている。
長野県下伊那郡大島村（現在の松川町）に生まれる。旧制長野県飯田中学校（のち長野県立飯田高松高等学校。現・長野県飯田高等学校）の同級に富永明夫がいた。千葉大学薬学部卒、京都大学中退。ただし梅棹忠夫は「本多勝一君は、京都大学農学部農林生物学科を卒業」と書いており、浅井清も「千葉大薬学部卒業後、京都大学農学部農林生物学科へ移り、三十四年卒業」と記している。1959年、朝日新聞社に入社。同年の朝日新聞社の入社試験は英語と論文と面接だけで一般常識などの筆記試験がなく「常識」なしの昭和34年組と社内で皮肉られたという。1968年から同社編集委員。1991年に同社を定年退職。1994年5月、「週刊金曜日」編集長となる。
「そうりゅう」は、中期防衛力整備計画に基づく平成16年度計画2900トン型潜水艦8116号艦として、三菱重工業神戸造船所で2005年3月31日に起工され、2007年12月5日の命名・進水式において、「そうりゅう」と命名され進水、2008年10月4日に公試開始、2009年3月30日に就役し、第1潜水隊群第5潜水隊に編入され呉に配備された。2008年7月9日、三菱造船所の作業員5名が感電し火傷をする事故が発生した。2012年10月8日午前7時前に定期検査後の確認運転のため、由良港を出港後、午前8時47分に潜航を開始。午後2時18分頃、潜航中の「そうりゅう」で3曹が当直に表れず行方不明になり、浮上して捜索したところ、艦橋セイル内浸水部で溺死しているのが発見された。事故調査委員会は3曹が自殺したものと結論づけた。2013年9月2日、呉基地で停泊中の「そうりゅう」艦内の寝室で、2等海尉が艦内の格納庫から持ち出した拳銃で自殺を図った。2等海尉に命に別状はなかったが、重い障害が残っている。海自は2015年に自殺の原因を上官の暴行と断定し、上官と暴行を黙認していた関係者を停職数日程度の懲戒処分を実施した。しかし、海自は2等海尉との協議が続いているという理由で処分を公表していなかったことが2016年1月12日に各メディアで報道された。2等海尉の両親は2016年1月中に国を相手に3000万円の損害賠償を求める裁判を山口地方裁判所に起こすことを明らかにしている。2018年6月8日から16日までの間、グアム島及び同島周辺海空域において実施される日米印共同訓練（マラバール2018）に参加する。参加部隊は「そうりゅう」の他、護衛艦「いせ」、「すずなみ」、「ふゆづき」、搭載航空機5機、P-1哨戒機2機。現在も第1潜水隊群第5潜水隊に所属し、定係港は呉である。