ウィリアマイト戦争は、ウィリアム3世とメアリー2世の共同統治が決定してわずか2日後の1689年2月15日に起こった。ジェームズが王位を取り戻そうと、亡命先のフランスからルイ14世に借りた軍を起こしたのである。ジェームズはアイルランドに上陸し、当地のジャコバイト勢力と結びついて、またたくうちにアイルランド全土を席巻した。これを受けて5月5日、イングランドは対仏同盟に参加し、フランスに宣戦布告する。ウィリアム3世は自ら軍を率い、1690年7月1日、アイルランドのダブリン近郊ボイン川でジェームズ軍を破った（ボイン川の戦い）。ジェームズはまだ余力を残していたにもかかわらずフランスに逃げ帰り、アイルランド各地で起こっていた武力抵抗も1691年10月に鎮圧された。これ以降、カトリック教徒は公職・法律職を禁じられ、土地所有や借地も厳しく制限され、アイルランドは少数のプロテスタント勢力によって支配されることとなった。また、これまでイングランドはヨーロッパ大陸の争いごとにあまり参加してこなかったが、この戦争からイングランドも大同盟戦争に巻き込まれ、「第2次百年戦争」ともよばれる対仏戦争を繰り返し、ヨーロッパの覇権争いに加わることになった。
ジャコバイトはフランスなど海外勢力の後押しを受けて、イングランド内外で大小さまざまな政治的・軍事的行動を起こし、ステュアート朝の復活を企図した。特に1715年と1745年の反乱はそれぞれ「the 'Fifteen」「the 'Forty-Five」と呼ばれ、イングランドの人々の記憶に長く残る事件となった。後述するこうした反乱などに、17世紀末から18世紀前半の革命政府はすくなからず動揺した。しかし1745年の反乱以降、ジャコバイトが組織化されることはほぼなくなり、名誉革命転覆の危機はひとまず去った。
父親は航空技術者、母親は音楽教師である。イシアル・ボジャインは1967年にマドリードで生まれ、双子の姉妹としてマリーナ・ボジャインがいる。自由な気風の家庭で育ったため、イシアルとマリーナは幼少期から芸術に興味を示し、イシアルは映画製作の道に進み、マリーナはオペラ歌手になるために学んだ。14歳の時、イシアルはビクトル・エリセ監督の『エル・スール』（1983年）に出演し、謎めいた父親の秘密を探る少女エストレーリャの役を演じた。18歳以降、イシアルとマリーナはおじのフアン・セバスティアン・ボジャインが監督した2本の映画、『Las dos orillas』（1987年）と『Dime una mentira』（1992年）に出演した。イシアルはまた、フェリペ・ベガ監督、マヌエル・グティエレス・アラゴン監督、ホセ・ルイス・ボラウ監督などの作品にも出演した。イギリス人のケン・ローチ監督がイシアルの赤髪に興味を抱き、スペイン内戦を描いた『大地と自由』（1995年）に配役された。ローチ監督との仕事について、後にイシアルは『Ken Loach: un observador solitario』という書籍を執筆した。23歳の時に「La iguana」（イグアナ）という映画制作会社を設立し、『Baja Corazón』（1992年）、『Los Amigos del muerto』（1995年）という2本の短編映画を制作した。フェルナンド・コロモの支援を受け、1995年には初監督作品として『Hola ¿estas sola? 』（やあ、君はひとりなの?）を制作した。地上の楽園を見つけることを夢見て、海に向かって長い旅に出かける2人の少女についての物語である。2作目の長編『Flores de otro mundo』（別の世界からの花、1999年）では、フリオ・リャマサーレスと共同で脚本を執筆した。愛を求めて農村部に旅行する3人の女性の物語である。3作目の『Te Doy Mis Ojos』（私の目を取って、2003年）はゴヤ賞で作品賞、監督賞、主演女優賞（ライア・マルル）、主演男優賞（ルイス・トサール）、助演女優賞（カンデラ・ペーニャ）、脚本賞、音響賞の7部門を受賞し、その他にも新人女優賞（エリサベット・ヘラベルト）、編集賞にノミネートされていた。ボジャイン自身は作品賞・監督賞・脚本賞（脚本賞はアリシア・ルナと共同）を受賞した。ルイス・トサールとライア・マルルが出演したこの映画は、妻に対する夫の虐待と、生活パターンの変化に苦しむ彼らを描いた映画である。2007年の『Mataharis』はゴヤ賞で作曲賞を受賞した。2010年の『雨さえも』では、脚本家の夫ポール・ラヴァーティとタッグを組んだ。ゴヤ賞で作品賞、監督賞、主演男優賞（ルイス・トサール）、助演男優賞（カラ・エレハルデ）、新人男優賞（フアン・カルロス・アドゥビリ）、脚本賞、作曲賞、編集賞、プロダクション賞、衣装デザイン賞、メイクアップ&ヘアスタイル賞、音響賞、特殊効果賞の13部門にノミネートされ、助演男優賞と作曲賞とプロダクション賞の3部門で受賞した。第83回アカデミー外国語映画賞のスペイン代表作品に選ばれ、9本のノミネート作品に選ばれた。この映画には劇中劇が登場し、スペインの映画制作会社がクリストファー・コロンブスの新大陸への到着を主題とした作品を取る過程で、ロケ地の農民の搾取に関する問題に巻き込まれる。ガエル・ガルシア・ベルナルが監督役を務め、ルイス・トサールがプロデューサー役を務めた。この劇中劇の中ではフアン・カルロス・アドゥビリが先住民アイマラ族の指導者役を務め、水資源の民営化のための抵抗組織の指揮を執る。アドゥビリはゴヤ賞の新人男優賞にノミネートされた。2011年の『Katmandú, un espejo en el cielo』ではゴヤ賞の主演女優賞（ベロニカ・エチェギ）と脚色賞にノミネートされ、主演女優賞を受賞した。2016年の『オリーブの樹は呼んでいる』ではラヴァーティと3度目のタッグを組んだ。ゴヤ賞で3部門にノミネートされたが、いずれも受賞を逃した。第89回アカデミー賞外国語映画賞にスペイン代表作品として出品されたが、ノミネートはされなかった。この作品は2017年7月1日にシネスイッチ銀座や名古屋シネマテークなどで公開された。