無格社は、法的に認められた神社の中で村社に至らない神社であり、正式な社格ではなく、社格を有する神社と区別するための呼称だったが、社格の一種ともされるようになった。無格社の神社であってもほとんどは氏子を有し、村社以上の神社とは、神饌幣帛料供進がなかった点や境内地が地租もしくは地方税免除の対象とされなかった点などが異なる以外に、目立った相違はない。規模の小さな無格社の多くは、明治末期の神社合祀で廃社とされた。全国約11万社のうち、無格社は1938年（昭和13年）の調査では60,496社あり、当時の神社数の半数であった。最終的には59,997社が存在したとされる。
諸社（民社）は、府社=県社=藩社＞郷社＞村社の順である。これらの社格の区別は実質的な待遇の差異を伴わず、特に官国幣社においては、官幣社と国幣社の区別の意義などがはっきりしなかった。より整備された社格制度を作ることも考えられたが、成立しなかった。だが、実質的な待遇を見れば、官国幣社、神饌幣帛料供進社（府県社と郷村社の一部）、それ以外の神社の3段階の社格になったといえる。なお、社格とは国家による待遇の差を表したもので、その神社への崇敬の厚さを表したものではない。
明治40年（1907年）からは、府県郷を始め、村社（指定神社以上）が例祭に地方公共団体の神饌幣帛料の供進を受けることが、大正3年（1914年）4月からは祈年祭・新嘗祭にも神饌幣帛料の供進を受けることが、それぞれ認められ、神饌幣帛料供進社と称された。神饌幣帛料供進指定神社、あるいは社格と併せ指定県社、指定村社等の表現も為される。
神奈川県により県内宗社として明治3年（1870年）に創建された伊勢山皇大神宮が、明治4年（1871年）に列されたもの。神祇省の令達書によれば「右神社ハ元伊勢神宮勧請ノ儀二付、官幣国幣社等外別格ニ處シ」とあるが、正式に制定された社格ではなかった。神奈川県もそれを不服とし、その後たびたび官幣中社あるいは国幣中社への昇格を求めている。
後に、国家に功績を挙げた忠臣や、国家のために亡くなった武将・志士・兵士などを祭神として祀る神社のために別格官幣社が創設され、明治5年（1872年）に楠木正成を主祭神とする湊川神社が初の別格官幣社に列格している。別格官幣社は官幣小社と待遇は同じであるが、国幣小社よりも上位とされた規定はない。なお、臣下であった菅原道真を主祭神とする天満宮は天神信仰によって祭神は雷神と同一視されたため、北野神社（現・北野天満宮）と太宰府神社（現・太宰府天満宮）の2社が例外的に別格官幣社ではなく待遇が上となる官幣中社に列した。
官国幣社（官社）については、官幣社は国幣社よりも格が上とされ、それぞれ大・中・小の順に格が下がる。『神道辞典』などによると、官幣大社＞国幣大社＞官幣中社＞国幣中社＞官幣小社＞国幣小社＞別格官幣社 となるが、官幣中社と国幣大社はどちらが上かなどの明確な規定はない。
近代社格制度では、社格を官社と諸社（民社）、無格社に分ける。伊勢の神宮は、「全ての神社の上にあり、社格のない特別な存在」とされた。
明治4年5月14日（1871年7月1日）に太政官布告「官社以下定額・神官職制等規則」により制定。これ以前の初期の社格として神祇官直支配社（大奉幣社・中奉幣社・小奉幣社）や勅祭社（大祭社・中祭社・小祭社）があった。昭和21年（1946年）2月2日、連合国軍最高司令官総司令部(GHQ)の神道指令により神社の国家管理が廃止されると同時に廃止。GHQの干渉を恐れ、石の社名標の社格が刻まれた部分をセメントで埋めた神社が多かった。その後セメントを除去した社名標もあるが、現在でもそのままのものも多い。神社本庁は昭和23年（1948年）に包括する旧官国幣社の全てを別表神社に指定、人事で特別に扱うとしたが、これは社格とは無関係である。
東京英和学校は、1878年にジュリアス・ソーパーが築地1丁目に設立した男子校「耕教学舎」が起源である。同校は、1881年に「東京英学校」に校名を変更。また、1879年にロバート・S・マクレイによって設立された男子校「美會神学校」が、1882年に「東京英学校」に合同する。その後、ジョン・F・ガウチャーの寄付により、伊予西条藩松平左京大夫上屋敷跡地（約3万坪）を購入し、1883年に「東京英学校」は現在の青山の地に移転し、「東京英和学校」と改称した。その後、欧米主義が衰えを見せ始めたことで、校名に「英」の文字が入っていることに反感が出たため、青山の地にあるということで、1894年、二代目院長の本多庸一の時に、「青山学院」と校名を変更する。1927年にはドーラ・E・スクーンメーカーの女子小学校を起源とする「青山女学院」と合同し、現在の青山学院の基礎となる。予備学部・高等普通学部・神学部があったが、神学部は後に、明治学院大学神学部と東北学院大学神学部と共に、東京神学大学に統合された。東京英和学校は戦前の財界、教育界、宗教界で有力な人物を輩出した。