現在は本線の一部のようになっており、供用開始後も仮称のままである。本来はジャンクションのランプとしての構造であるため、亀山JCT-草津JCTで特に走行に注意を要するR=400mの急カーブ区間であり、下り線の場合は金勝山トンネルから縦断勾配4%の下り坂であるため、トンネル通過後すぐにこのカーブがあることから減速をしないと危険である。そのため導流レーンマークも亀山JCTや草津JCTの2箇所の他、当JCTにも路面表示されている。当JCT以西の新名神高速道路が開通するとジャンクション構造は亀山JCTのようなY型のジャンクションになる予定である。
2003年は1年目から先発ローテーションの一角を担い、チームの優勝に貢献。14勝（5敗）を挙げ、新人王を満票で獲得。阪神タイガースとの日本シリーズでは3勝3敗で迎えた第7戦に先発し、史上初めて新人で完投し、日本一の胴上げ投手となった。年末のアジア野球選手権には出場。2004年はアテネオリンピックに選出され銅メダル獲得に貢献。シーズンでは「2年目のジンクス」がないと言われ、相次ぐケガに悩まされものの二年連続で二桁勝利となる10勝（6敗）を挙げたが、防御率は4.35に終わった。2005年から出雲市内の少年野球チームを対象とした「和田毅杯少年野球大会」を私費で開催し、優勝チームは副賞として福岡ドーム開幕戦に招待している。トレーナーと正式に専属契約を結び、福岡ソフトバンクホークス初の開幕投手として勝利。その後12勝（8敗）をあげ、ホークスでは1960年の杉浦忠以来となる新人から3年連続の2桁勝利を達成。12月20日には入団4年目の選手の年俸としては松坂大輔の1億4000万円を抜いて史上最高額となる1億4,500万円（推定）で契約更改。12月10日にタレント・女優の仲根かすみと入籍したことを発表。14日には出雲大社で挙式・出雲市内の某所で披露宴を行い、翌年9月13日には長女が誕生した。2006年はルーキーイヤー以来の14勝を挙げた他、6完投を記録し、完封も3つマークした。また防御率ではプロ入り初の2点台をマークした。2007年は完封がなく完投も2つに減り10敗を喫したが、12勝を挙げ石川雅規（ヤクルト）に並び現役選手では2人目となる入団から5年連続の二桁勝利を達成。球団としては杉浦忠以来45年ぶりの記録となった。オフにはアメリカのロサンゼルス市内の病院で内視鏡による左ひじ遊離軟骨の除去手術を受けた。2008年はオールスター前までに8勝を挙げ、北京オリンピック日本代表に選出された。6年連続2桁勝利も期待され、チーム復帰後は埼玉西武相手に10回を1失点以下に抑える試合を2つ数えるなど、復帰後の防御率は3.18と安定した投球を続けたが、初めて二桁勝利に届かなかった。オフには和田との自主トレを志願した藤岡好明、岩嵜翔、千葉ロッテマリーンズの大嶺祐太と一緒に合同自主トレを行った。2009年4月3日のオリックス・バファローズとの開幕戦で2度目の開幕投手を務めた。完封勝利を挙げ、プロ野球最多タイ（1979年の平松政次に並ぶ）でパ・リーグ新である開幕戦14奪三振を記録。5月28日登板を最後に肘の炎症で長期離脱を余儀なくされた。9月に復帰して最終戦の10月11日に先発登板。5月22日以来の勝ち投手となった。しかし、最終成績は4勝5敗とプロ入りワーストの成績で終わった。2010年4月8日の千葉ロッテマリーンズ戦で自己最多である15奪三振（9回1失点完投勝利）を記録。6月12日の読売ジャイアンツ戦で交流戦最多の通算18勝目を挙げる。6月26日の東北楽天ゴールデンイーグルス戦で3年ぶりの10勝を挙げ、オールスターには監督推薦で選出されて6年ぶり3度目の出場となった。9月8日の楽天戦で自己最多更新の15勝目を挙げた。ロッテ戦では24イニング無失点を記録。9月23日のロッテ戦で17勝目を挙げ、新人王以来となるタイトル、自身初の最多勝を獲得しチームの7年ぶりの優勝に大きく貢献。初のMVP・ベストナインにも選出された。この年はチームメイトの杉内俊哉も16勝を挙げ、1993年の中日の今中慎二、山本昌（共に17勝）以来17年ぶり、パ・リーグでは1959年の大毎オリオンズの小野正一(22勝）、荒巻淳（17勝）以来51年ぶり、球団としては南海時代の1948年の中谷信夫（21勝）、柚木進（19勝）して以来62年ぶりとなる同一チームの左腕2投手での15勝以上を記録。リーグ優勝を決めた最終戦では監督の秋山幸二、主将の小久保裕紀、選手会長の川﨑宗則、そして杉内に続いて胴上げをされた。ロッテとのCSファイナルステージでは第2戦に先発し、初回に清田育宏に先制ソロ本塁打を打たれるも、その後は無失点に抑え、完投勝利した。第6戦では4点ビハインドの6回から登板し、2回を無失点に抑えたが打線が成瀬善久の前に得点を奪えずチームはCS敗退となった。2011年は2年ぶりの開幕投手に指名され、5月3日の楽天戦から7月6日の西武戦までプロ入り初の7連勝、8月3日のオリックス戦で通算100勝目を達成。シーズン中も杉内俊哉、D.J.ホールトン、攝津正らと並ぶ先発の柱としてフル稼働し16勝をあげ、11月3日のCS第1戦目に登板し勝ち投手となり、チームのリーグ連覇と8年ぶりの日本一に貢献した。11月30日にはこの年取得した海外FA権行使の申請を行った。会見ではメジャーリーグ全球団から先発として投げられることを優先して移籍先を探したいと述べ、アラン・ニーロを代理人とした。