2001年（平成13年）4月21日の朝日新聞に掲載された安川寿之輔名古屋大学名誉教授の論説「福沢諭吉 アジア蔑視広めた思想家」に、平山が反論「福沢諭吉 アジアを蔑視していたか」（5月12日付同紙）を掲載したことで、いわゆる「安川・平山論争」が始まった。5月21日に安川は慶應義塾大学で講演をおこない、講演資料で「福沢論争 批判は事実に基づいて」という再反論を掲載した。この資料に対して、5月30日に平山は再々反論をおこなった。さらに、5月30日から6月26日の間に、安川と平山との間で往復で3回の意見交換が書簡でおこなわれた。その後2003年（平成15年）4月までに『福沢諭吉の真実』の原型を完成させた。この原型は、元慶應義塾福沢研究センター所長の西川俊作名誉教授の推薦により、出版の日の目を見ることになった。この原型は新書で出版するためにページ数を3分の2にまで減らしたため、無署名論説（社説）の起筆者の推定に関する部分は割愛されることになり、2004年（平成16年）8月20日に出版されることになった。
長野県塩尻市出身。長野県松本深志高等学校を経て、1958年、広島大学水畜産学部を卒業し、近畿大学白浜臨海研究所（現・水産研究所）副手となる。以来、約半世紀にわたり、一貫して魚類の養殖にたずさわる。数々の海産魚の完全養殖に成功したほか、交雑魚の研究でも成果をあげた。1983年同農学部教授。1991年から2008年まで同水産研究所所長。2002年には、研究チームのリーダーとして、難しいと思われていたクロマグロの完全養殖を成功に導いた。世界初の成果である。この研究は、1970年にスタートしたが、様々な困難が伴っていた。1991年には、研究チームのリーダーであった原田輝雄前所長が急逝するという危機をむかえるが、その後は熊井英水がチームのリーダーとなり研究が継続された。成功にいたる経緯は、NHKのプロジェクトX〜挑戦者たち〜に取り上げられている。2003年には、近畿大学水産研究所が申請した「クロマグロ等の魚類養殖産業支援型研究拠点」がCOE拠点として採択され、その拠点リーダをつとめる。また、2003年、養殖魚の販売を行う「アーマリン近大」を設立。2006年まで代表取締役をつとめた。日本水産増殖学会の会長もつとめた。
アニメ2003年版では母親を亡くした年齢が10歳であり、家を焼いたのは国家錬金術師資格取得前である1910年10月3日。原作では身長に明確な数値設定はないが、アニメ2003年版では身長は154 - 156cmほどである。最終的に長身へと成長した原作とは異なり、こちらでは多少は伸びたもののやはり低身長と言われる程度に収まった。また、原作以上にバリエーションに富んだ錬金術の使用が可能で、「FULLMETAL ALCHEMIST」に登場したアイザックのような氷系の錬金術を使用したり、機械鎧を別の種類の金属に錬成可能（本作ではその能力を用いて、スカーの分解錬金術を防いだり、機械鎧をサブマシンガンや傘に錬成したりした）。アニメ2003年版のエドは11歳から12歳にかけて、戦いの中で殺人を犯してしまう、ウィンリィと共にバリー・ザ・チョッパーに襲われる、ニーナとアレキサンダーで錬成されたキメラの惨殺死体を目の当たりにするなど、いくつものトラウマを抱え、情緒不安定な精神になっていた。それ故に原作のエドからはとても想像できない言動が多い。カッとなって八つ当たりでアルに食器や動物の飼料などを投げつけたり蹴りを入れたり、身長のことをからかった一般人を殴りつけたり、ウィンリィと同じく賛否両論が分かれる改変をされていた。原作のエドは幼少期以外では涙を見せたのは一度だけだが、アニメ2003年版のエドは辛い経験をするたびによく号泣している。また、原作ほどマスタングたち軍人らと交流はないものの、子供として守らなければならない存在と認識されている。そのため、軍部の人間たちが原作と比べるとエドたちを保護しようとしている側面が強く、しばしば反発はするものの、恩人である軍部の人間に対して敬礼をする、頭を下げるなど礼儀正しさを覗かせる。軍自体に不信感を抱かせる出来事に出くわすことが多かったため、連続殺人鬼であるスカーを捕まえる機会がありながらも敢えて逃がしたりと、軍自体へ反抗的な態度を取ったこともある。但し、終盤では自らを心配し、保護しに来たマスタングたちに大総統がホムンクルスであると告げ、信頼関係が芽生えていることが分かる。原作のエドに比べると精神的な弱さが目立つが、その分弟への愛情は深く、何を差し置いても弟を優先するように動く優しい兄という描写がされている。監督らが当初から掲げていた少年たちの心の成長という面で自分たち以外にも沢山の人間が居て、最終的には弟を元の体に戻すことを最優先にするものの、自分たち以外の人間を信用する、自分たちの都合で傷つけてはならないと考えるなど心の成長が見られる。物語終盤、苦心の末に賢者の石を手に入れるが、それはアルの鎧、つまりアルそのものであった。その後、賢者の石を狙うホムンクルスから逃げ延びたが、アルはエンヴィーによってダンテの地下都市にさらわれてしまう。エドはアルを救出するため地下都市に向かいエンヴィーと交戦。ホーエンハイムとそっくりな本来の姿を見せられたエドはエンヴィーを攻撃できず、隙をつかれて心臓を刺され死亡する。しかしアルが賢者の石である自身を代価にエドを生き返らせる。結果アルは消滅するが、エドは自身と自分達の旅してきた4年間の記憶を代価にアルを錬成し、アルは10歳の肉体で人体錬成を行った以後の記憶を全て失くした状態で蘇る。エドは代価としてパラレルワールドのドイツに飛んでいったが、元の世界に戻る方法としてロケット工学を学ぶ。   OVA「鋼の錬金術師 PREMIUM COLLECTION」内「SHORT COLLECTION　子供篇」では劇場版後の話が描かれており、2005年には100歳を迎えた。長髪に髭の生えた、原作に登場する「お父様」に似た姿で描かれている（「お父様」がホーエンハイムの血で誕生したホムンクルスであるため）。日本に移住し、曾孫達に誕生日を祝ってもらっている様子が描かれている。曾孫達の中にウィンリィ似の少女がおり、エドのことを「曾じいちゃん」と呼んでいる。