2010年11月18日の参議院予算委員会において、仙谷由人内閣官房長官が「暴力装置でもある自衛隊」と述べたことから審議が紛糾して発言の撤回・謝罪に追い込まれた件に関連し、2009年3月30日、現職の農林水産大臣であった石破も民間のシンポジウムにて「国家の定義というのは、警察と軍隊という暴力装置を合法的に所有するというのが国家の1つの定義」と述べていたことが指摘された。この点について石破は、2010年11月19日に自身のブログにて、北朝鮮がなぜあのようなテロ行為を引き起こすのかを説明する上で、政治学上の定義を引用したに過ぎず、自衛隊を名指ししたものではないと釈明した。ただし石破は、清谷信一との共著である『軍事を知らずして平和を語るな』（2006年）にて、暴力装置に自衛隊も含まれるとの旨を以下のように明確に述べたことがある。なお、「暴力装置」は社会学者のマックス・ヴェーバーの著書で見られる表現で、「暴力」は軍隊や警察の実行力を、「装置」はそうした組織を指す言葉である。
民主党選挙対策委員長（当時）の石井一の「鳥取・島根は日本のチベット」発言に対し「日本海側の人間はかつて裏日本と言われ悔しい思いをしてきた訳で、地域の人を見下す対応をする人が選挙を仕切っているのが民主党のやり方だ」と批判した。
防衛庁長官在任中の2004年3月16日に、自衛隊についての発言で「今まで半分やゆ的に自閉隊と言われていたところがある。自閉症の子供の自閉と書いて自閉隊だ」と述べた。石破は、発言について「世間でそのように自衛隊を非難する人がいると言っただけ。自衛隊が内にこもっては駄目だという意図だ」と説明したが、自閉症に対する認識不足であるとの批判を浴び、3月19日に発言を陳謝した。
「勇気と真心をもって真実を語る」、「政策には大衆受けしないものもあるが、これを言えば選挙に不利だから言わないでおこうなどとはしてはいけない」といった趣旨の発言をしばしばするが、これらの発言は石破が議員になる前に聞いた、渡辺美智雄の講演から影響を受けたもので、石破は渡辺の言葉について、「政治・政治家の目的は次の時代を考えることであって、選挙に当選することや支持率を上げることは手段にすぎない。だが、選挙に落ちては次の時代を考えることはできない。だからこそ、大衆受けの悪い真実を語っても落選することのない、自身の真意が伝わるような日常活動が必要。」、「『どうせ難しいことは国民はわからない』、『これを言ったら選挙に落ちる』といって、聞こえの良いことばかり言う政治家がいるとすれば、それは内心、国民を軽蔑して信用していないのではないか。国民を信じない政治家が、国民から信用される道理はない。」と述べている。
自由民主党総裁に選出された安倍の下、無派閥ながら自由民主党幹事長に起用され、2012年の第46回衆議院議員総選挙、2013年の第23回参議院議員通常選挙の陣頭指揮を執った。
2008年、麻生内閣で農林水産大臣に任命される。農林水産大臣は松岡利勝（自殺）、赤城徳彦（辞任）、遠藤武彦（辞任）、太田誠一（辞任）ら前任者の多くが不祥事に見舞われていたが、石破は特に目立った不祥事を起こさず、約1年間、農林水産大臣を務めた。しかし総選挙が近づくと、閣内にありながら与謝野馨財務大臣らとともに麻生おろしに加担し、退陣要求を行った。2009年の第45回衆議院議員総選挙では鳥取1区で民主党の新人に比例復活を許さず8回目の当選を果たした。鳩山由紀夫内閣の発足に伴い、農林水産大臣を退任。
安倍晋三の退陣に伴う2007年自由民主党総裁選挙では福田康夫を支持し、福田が総裁に選出される。福田康夫内閣では防衛大臣に任命され、約3年ぶりに防衛省へ赴任する。翌2008年、福田首相の退陣に伴う自由民主党総裁選挙に出馬し、25票で立候補者5人中最下位に終わった（当選者は麻生太郎）。
WWE解雇後、2013年6月30日、オハイオ州を拠点とするAIW（Absolute Intense Wrestling）のAbsolution VIIIに本名名義で参戦。サブミッション・スクアッド（エヴァン・ジェリスティコ & ゲーリー・ジェイ）と組んでオールドスクール・エクスプレス（マリオン・フォンテイン & ジョック・サンプソン） & トレイシー・スマザーズ with イザベラ・スマザーズとバンクハウス・ブロウルマッチで対戦。最後にジェイがトレイシーを丸め込むと3カウントを奪い勝利。8月30日、AIW Gleaming The Cubeにてリングネームをブライリー（Briley）として、ゲーリー・ジェイと組んでトレイシー・スマザーズ & イザベラ・スマザーズと対戦。最後にジェイがトレイシーよりクルシフィックスで3カウントを取られ敗戦。2015年3月、WWEで同門であったジューダス・デブリンがカリフォルニア州を拠点とするVPW（Vendetta Pro Wrestling）のポッドキャストであるVendetta Pro Radio 2K15 showに出演した際、NXTのヘッドトレーナーを務めるビル・デモットが行ってきた卑劣な行為を告発。このデブリンの主張に同調し、自身は脚を故障していた期間にデモットより体罰を受けた事を告白。レスラー達の訴えによりデモットは同月6日に辞任という形でWWEを退職することになった。2016年6月23日、猫であるバニー・ザ・キャットからDDTのアイアンマンヘビーメタル級王座を奪取。7月16日、カリフォルニア州を拠点とするMPW（Millenium Pro Wrestling）のAll-Star Eventにホット・ヤング・ブライリー（Hot Young Briley）のリングネームで参戦。ブロンソン & ジューダス・ドレイブンと組んでダミアン・サンドウ & ジョニー・ムンド & セス・スカイファイアと対戦。終盤にレフェリーに妨害して無法地帯と化す中で女性レスラーのタヤ・ヴァルキリーの介入を受けて攻勢を逆転され、最後は3人まとめてフォールされると3カウントを取られ敗戦した。10月15日、MPW All Star Spectacular IIにてダニー・デバイン & セス・スカイファイアと組んでジャスト・ジューダス & ブロンソン & ブラッド・マドックスとスティールケージマッチで対戦。終盤にデバインがリング内で孤立するとマドックスとジューダスに痛めつけられ、ジューダスから背後より羽交い絞めにされ、マドックスがスーパーキックを放つも避けてジューダスに誤爆。最後にデバインがマドックスにデバイン・インターベンションを決めて勝利した。