2005年頃には萌えアニメの急激な増加やその経済効果が話題になった。同年、浜銀総合研究所は萌えアニメの市場規模を155億円、萌え系のゲームやコミックも併せた萌え関連産業の市場を888億円と算出して反響を呼んだ。この調査における萌え作品とは、研究員が主観に頼りつつも「愛らしくて可愛いキャラがいる」「子供向け作品ではない」といった基準で選びだしたもので、グッズや同人誌などは集計に入っていない。また、萌えアニメの舞台のモデルとなった実在の土地がファンによるロケ地巡り（いわゆる聖地巡礼）の対象となったり、地域おこしの題材の題材となったりするなど（萌えおこし）、地域振興と結びついた例もある。こうした萌えアニメを含む萌え産業の背景には、元は子供向けに作られていたアニメやゲーム、漫画の市場が少子化によって縮小する一方、未婚人口の増加によって趣味に私費を費やすことができる人が増加していることがあるとされる。その一方でアニメ映画監督の押井守は「僕の見る限り現在のアニメのほとんどはオタクの消費財と化し、コピーのコピーのコピーで『表現』の体をなしていない」と「『萌え』が流行すればそうした作品ばかりになり、制作者には新たな創造性や、作品を通じて訴える思想的なものが欠如し、アニメが空洞化している」と、批判している。
萌えを意識した『まんがタイムきらら』系のマンガがアニメ化され、2013年の『きんいろモザイク』、2014年の『ご注文はうさぎですか?』などに代表されるように萌えを意識したアニメが増加した。さらに、この頃からBS11やBSフジが深夜アニメ全般の放送や製作委員会への参加にも積極的となったことにより、地上波に代わってBSで萌えアニメの放送も増加するようになった（作品によっては、CSのAT-Xで先行して放送されることもある）。
『エヴァンゲリオン』以降の「萌え」を意識した作品は、当初はマニアックな視聴者層を意識したものが中心であったが、1999年頃になると粗製乱造の反動で敬遠されるようになる。その一方でこうした作品群がきっかけになり、今度はライトなアニメファンを対象にした「萌え」作品が人気を得ていったといわれる。2001年の深夜アニメ『シスター♥プリンセス』はギャルゲー専門誌『電撃G's magazine』の読者参加型ゲームを原案とする作品だが、その「男性の主人公が12人の妹たちに囲まれて過ごす」という内容はアニメ関係者にも動揺を与え、同作のような作品が主流になっていくのではないかと予感させるものであった。ただし2001年時点では「萌えもの」のアニメはジャンルとしてはまだ確立していなかったともいわれ、2002年の『ナースウィッチ小麦ちゃんマジカルて』などをその後に続く「萌えアニメ」のはしりとして挙げる意見もある。いずれにせよ、1999年から2002年にかけては萌え産業に関わる企業であるブロッコリーが業績を3倍に伸ばしており、この頃に萌え産業が新たな局面に入ったことを示している。ゆるい雰囲気の萌えアニメの広まりは深夜アニメの隆盛とも無関係ではなく、仕事で疲労して帰宅した大人が深夜にアニメを見るとき、堅苦しくない作品を求めるのではないかという意見もある。
ACミランのプリマヴェーラ出身。セリエBのFCトレヴィーゾへレンタル移籍していた際に半年で10得点を挙げ2002年にミランへ復帰。プレシーズンマッチで得点を挙げ注目されたが、当時のチームにはアンドリー・シェフチェンコ、フィリッポ・インザーギ、ヨン・ダール・トマソン、リバウドなどの名選手がおり数多く在籍しており、出場機会を求めてエンポリFCに再びレンタル移籍。その後もレンタルでの生活が続き結果を出せずにいた。2006年にカルチョ・スキャンダルに揺れて補強のままならない状態だったミランが控えとして買い戻したが11月11日に行われたASローマ戦後のドーピング検査で陽性反応が出て、半年の出場停止処分を受けシーズンを棒に振った。恋人の擁護（陽性は避妊薬の可能性を訴えた）などもあったが、裁定は覆らなかった。2007年に共同保有の形でジェノアCFCに移籍すると初めてセリエAでレギュラーを掴みゴールを量産した。2008年2月6日のポルトガル戦で代表初出場も果たすとEURO2008の代表メンバーにも選出された。2007-08シーズンのジェノアで19ゴールの結果を残し、2008-09シーズンからミランに復帰することが決まった。しかし怪我に苦しみ出場機会に得られずにいた。2009-10シーズンは一転してシーズン中盤から好調を維持し再びゴールを量産した。最終的には14ゴールを挙げてアレシャンドレ・パトやロナウジーニョらを抑えてチーム得点王となった。2010年8月31日、レンタル移籍でASローマに加入した。クラウディオ・ラニエリ監督の下でゴールを量産したが、2011年2月22日にラニエリ監督が解任されてヴィンツェンツォ・モンテッラ監督に交代すると徐々に出場機会が減少した。しかし、34試合に出場して11得点の成績を収めた。活躍が認められて6月22日にローマに完全移籍。ローマ側が初めにレンタル料200万ユーロを払い、シーズン終了後に1000万ユーロを支払うことで権利を完全に買いとった。しかし、モンテッラ監督が退任し新たに就任したルイス・エンリケ監督の構想からは外れた。2012年1月3日、ユヴェントスFCに半年間のレンタル移籍が決定。レンタル料は50万ユーロで800万ユーロの買取オプションつき。しかし、チャンスで決めきれずに13試合で2得点と振るわず無敗優勝のチームにおいて、それに貢献できない格好となった。シーズン終了後にローマに戻ったが、ズデネク・ゼーマン新監督の下でも構想外となり、8月31日に古巣ジェノアにレンタル移籍。5季ぶりの古巣復帰となった。2013-14シーズンでは新監督のリュディ・ガルシア監督の下で準レギュラーとして活躍し、開幕連勝記録を更新したキエーヴォ戦では決勝点を挙げた。しかしマッティア・デストロが復帰して以降出番が減り、2014年1月25日、出場機会を求め同胞のアントニオ・ノチェリーノと共にプレミアリーグのウェストハム・ユナイテッドFCにレンタル移籍した。2015年2月2日、ジェノアCFCに完全移籍した。2015年9月1日、クラブ史上初のセリエA昇格を果たしたカルピFCと1年契約を結んだ。2016年1月28日、アタランタBCへシーズン終了までの契約で移籍。2016年8月5日、カリアリ・カルチョへ自由移籍で加入。2016-17シーズンには16得点を記録し、シーズン終了後に2019年まで契約を延長したが、クラブとの対立し退団した。2017年8月19日、SPAL 2013へ2年契約で加入。