宮崎の部屋から押収された大量のビデオテープの中に『ギニーピッグ2 血肉の華』が含まれていたと報道されると、この作品に影響されて犯行に至ったという解釈が世間に広まり『ギニーピッグ』シリーズは全作品が廃盤となる。しかし実際に部屋から押収されたのは、全編コメディ調の『ギニーピッグ4 ピーターの悪魔の女医さん』であり、宮崎は『ギニーピッグ2』を見ていないと供述している。この影響で宮崎の逮捕後しばらく、ホラー映画のテレビ放送が自粛された。
宮崎がいわゆるおたく・ロリコン・ホラーマニアとして報道されたことから、同様の趣味を持つ者に対して強い偏見が生じた。宮崎が殺害後の幼女をビデオカメラで撮影し、膨大なコレクションのビデオテープの中に隠し持っていたことから、現実と空想・妄想と犯罪行為の境界が曖昧で、明確な規範意識の欠落が犯罪に及んだとされ、これがおたくだと誤解された。
宮崎が暴力的、性的、猟奇的な内容の漫画やビデオを多数所持していたことから、一部マスコミではそれらの悪影響を主張する意見もみられた。実際はそれら内容の漫画やビデオは、宮崎の膨大なコレクションのごく一部であった。宮崎の趣味の特異性は、むしろジャンルに関係なく無作為に多数の漫画やビデオを収集していたこととされる。この事件により「有害コミック騒動」が活発化してアニメ・漫画・ゲームなどが青少年に悪影響を及ぼすとする風潮が高まり、マスコミやPTAなどでの議論となった。のちの「有害コミック騒動」で、事件の代表格である「幼女連続誘拐事件」が取り上げられている。
事件の奇異さから憶測が飛び交い、宮崎自身が要領を得ない供述を繰り返していることから、裁判でも動機の完全な特定には至っていない。鑑定に当たった医師たちによると、彼は本来的な小児性愛者ではなくあくまで代替的に幼女を狙ったと証言されている。第1次精神鑑定鑑定医の保崎秀夫は法廷で「成人をあきらめて幼女を代替物としたようで、小児性愛や死体性愛などの傾向は見られません」と証言し、簡易精神鑑定書は「幼児を対象としているが、本質的な性倒錯は認められず……幼児を対象としたことは代替である」としている。一方で彼の性愛の対象は、成人の女性より幼女とする幼女性愛、幼女よりその死体とする死体愛、死体よりそれを解体したものとする死体加虐愛、さらにそれをビデオに撮ったものとする拝物愛へ移っていった、とする意見もある。1989年8月24日に東京地方検察庁の総務部診断室で簡易精神鑑定を受ける。その結果「精神分裂病（当時の呼称で、現在では統合失調症に改称）の可能性は否定できないが、現時点では人格障害の範囲に留まる」と診断されたことから、これを受けて検察は起訴に踏み切っている。公判開始後の1992年12月18日より、弁護側の依頼により3人の鑑定医により3度目（公判開始後は2回目）の再鑑定が始まる。1994年12月に鑑定書が提出される。その際の鑑定では1人は統合失調症を、2人が解離性同一性障害と異なる鑑定結果を出している。
雑誌『創』の篠田博之編集長に宛てた手紙には日本の現行の死刑方法における批判がしばしば書かれており、2006年には「踏み板がはずれて下に落下している最中は、恐怖のどんぞこにおとしいれられるのである」と絞首刑を批判、薬物注射による死刑導入を訴えていた。2007年の書簡には「この国の現行の死刑執行方法だと、死刑確定囚の人は、『私は刑執行時は死の恐怖とたたかわねばならなくなるから、反省や謝罪のことなど全く考えられなくなる』」とも記していた。編集部に宛てた手紙はおよそ300通、内容は拘置所内で読んだ漫画本のタイトルを並べただけのものがほとんどであった。知人にも合計で2,000通近くの手紙を拘置所内から送っていた。また、死刑判決が決定してからは独房でアニメビデオを鑑賞することが許可されていた。
法務大臣鳩山邦夫が執行命令書に署名し、2008年6月17日に東京拘置所で死刑が執行された。宮﨑は冷静に執行を受け入れ、また宮﨑の母親は遺体との対面後、拘置所に処置を任せたという。
2000年現在の国勢調査で、この郡は人口15,636人、5,958世帯、及び4,438家族が暮らしている。人口密度は18/km² (46/mi²) である。8/km² (20/mi²) の平均的な密度に6,719軒の住宅が建っている。この郡の人種的な構成は白人86.90%、アフリカン・アメリカン10.91%、先住民0.26%、アジア0.18%、太平洋諸島系0.05%、その他の人種0.97%、及び混血0.73%である。ここの人口の2.28%はヒスパニックまたはラテン系である。この郡内の住民は26.70%が18歳未満の未成年、18歳以上24歳以下が8.50%、25歳以上44歳以下が28.10%、45歳以上64歳以下が24.50%、及び65歳以上が12.20%にわたっている。中央値年齢は36歳である。女性100人ごとに対して男性は96.90人である。18歳以上の女性100人ごとに対して男性は92.40人である。この郡内の世帯ごとの平均的な収入は29,895米ドルであり、家族ごとの平均的な収入は35,903米ドルである。男性は28,331米ドルに対して女性は19,771米ドルの平均的な収入がある。この郡の一人当たりの収入 (per capita income) は14,230米ドルである。人口の18.40%及び家族の14.40%は貧困線以下である。全人口のうち18歳未満の25.50%及び65歳以上の22.40%は貧困線以下の生活を送っている。