ジョーンズに1813年3月に大佐に昇進し、フリゲートのマケドニア (USS Macedonian) 艦長となる。マケドニアは1814年の間ニューロンドンに封鎖されたディケーター艦隊の支隊の1隻であった。その後ジョーンズはオンタリオ湖に転任、モホーク (USS Mohawk) 艦長として終戦まで過ごした。1815年の第二次バーバリ戦争でジョーンズは再びマケドニアの艦長となり、その後1816年から18年までゲリエール (USS Guerriere) の艦長を務めた。
1810年4月20日にジョーンズは中佐に昇進し、6月4日にワスプ (USS Wasp) の艦長となる。1812年10月にワスプは大西洋に出航した。10月13日にイギリス軍のブリッグ、ドルフィン (HMS Dorphin) を捕獲した。ワスプは暴風による損害を受けたが、10月18日にはイギリス船団を攻撃し、激しい戦いの後スループのフロリック (HMS Frolic) を捕獲した。この戦いは後に有名になり、両艦の乗員は多数がひどく負傷したが、その後間もなくワスプはイギリス軍の戦列艦ポワティエ (HMS Poictiers) によって捕獲された。しかしながらジョーンズの功績は広くたたえられ、捕虜の交換で帰国した後彼は議会名誉黄金勲章を受章した。
フランスとの擬似戦争ではジョン・バリー代将の指揮するユナイテッド・ステーツ (USS United States) に乗り組み、1801年2月27日に大尉に任命された。1803年5月24日にフィラデルフィア (USS Philadelphia) に転任する。1803年10月31日にトリポリ湾で他の乗組員と共に捕らえられ、1805年6月まで拘束された。
ジョーンズは1799年、31歳のときに合衆国海軍に入隊した。非常に高齢の士官候補生であり、当時の候補生は通常彼よりも10歳程度は若かった。ジョーンズは妻の死の悲しみが理由で海軍に入隊し、22ヶ月を士官候補生として過ごした。
ジョーンズはデラウェア州ケント郡スマーナの市街地から北西約1マイルに位置する農場で生まれた。彼の父親は模範的、道徳的で信心深い農民で、母親は家族から大いに愛されていた。母親はジョーンズが幼いときに死去し、父親も彼女の後を追うように死去し、ジョーンズは4歳で孤児となった。彼がその後どのようにして医師になったかははっきりしていない。薬学を学び、医師として働いた後に彼はデラウェア州最高裁判所の書記官に任命された。彼は第15代デラウェア州知事のジェームズ・サイクスの娘、アンナ・マチルダ・サイクスと結婚したが、アンナはジョーンズが海軍に入隊する前に死去した。
2015年の戦後70周年に合わせて、戦後日本を切り開いた開拓者、いわゆる「プロデューサー」ともいえる人物に毎回スポットライトを当て、その人物像と、その文化を切り開くまでの様々な工夫・苦悩やエピソードを、再現ドラマや関係者の証言を交えて振り返るというものである。
低磁場中で核磁気共鳴信号を測定しようとすれば印加される静磁場の強度が低く信号強度が弱くなるので、プロトン磁力計のように地磁気に対して約1000倍の分極磁場をFID信号の検出前に数秒間印加してプロトンの核スピン軸を一方向に揃える。この時に印加される分極磁場は均一である必要はない。分極磁場の印加後、プロトンは外部磁場方向を回転軸とする歳差運動を始め、外部磁場の向きにスピンが揃うまでの間に外部磁場の強度に比例した周波数(ラーモア周波数)の電磁波を放射する(自由誘導減衰:FID)。この時の外部磁場は分極用の磁場と比較して低強度ではあるものの、1 ppm 以下の高い均一性を要求される。磁場の印加にはコイルに電流を流す方法とハルバッハ配列の永久磁石の配列を制御したり永久磁石を試料に一時的に近づける方法がある。事前分極済みの核スピンを検知する場合、FID信号の強度は分極磁場とは独立となり、地磁気程度の極めて弱い磁場下でのFID信号の検知が可能となる。FID信号の周波数は外部磁場強度に比例するため、数十μTの超低磁場NMR/MRIのFID信号はkHzオーダーの低周波数となり、誘導コイルでは十分な感度が得られないのでFID信号の検出に使用される素子はこの周波数帯に高い感度をもつ超伝導量子干渉素子 (SQUID) や光ポンピング磁力計が使用される。光ポンピング磁力計を使用する場合に同一磁場中に試料およびガラスセルを設置すると、アルカリ金属原子の電子スピン偏極の磁気回転比はMRIにおいて主に計測対象となるプロトンの約164倍であるため、共鳴周波数の不一致により計測感度が低下するのでフラックストランスフォーマ(flux transformer : FT)を用いた遠隔計測法が提案されている。ロスアラモス国立研究所では野戦病院や開発途上国での使用を想定して開発が進められる。核磁気共鳴信号の検出では2011年には 4.4 mT の分極磁場を印加後、0.047 mT の静磁場で4pTの核磁気共鳴信号の検出が報告された。核磁気共鳴画像の撮像では2006年に400 mT の分極磁場を印加後、52 mT の静磁場で核磁気共鳴画像の撮像が報告され、2013年には 80 mT の分極磁場を印加後、4 mT の静磁場で核磁気共鳴画像の撮像が報告された。核磁気共鳴画像法に適用した場合、磁石のコストが大幅に低減できるものの、コンピュータ断層撮影と同様の方法で再構成する事は可能だが撮像時点でのスライス選択が不可能等の本質的な欠陥を内包する。既に10年以上に渡り、開発が進められているものの、本格的な実用化には至っていない。