島式ホーム1面2線を有する地上駅。折り返し用の線路（引き上げ線）が新杉田方と根岸方にそれぞれ設けられており、そのうち後者は主に留置線の出入り用に使われる。北東側には、11本の留置線を持つ鎌倉車両センター磯子派出所が広がっている。かつては駅の海側に1面1線の貨物ホームが存在していた。1986年11月に使用停止となった後に大半が撤去され、現在は駐車場や住宅などになっている。残されたその線路の一部が着発線・保線用に各1本、工事臨時列車の発着と荷役・保線作業車の留置などに使用されている。そのうち着発線用は、2011年時点で駅構内の信号機が使用停止となっているため、側線として機能している。京浜東北線系統（根岸線）の列車の約半数が当駅始発・終点となっている。1987年4月1日時点では、横浜線系統で当駅・大船駅まで乗り入れる列車が朝晩を除く時間帯に設定されており、2018年現在では朝晩に数本設定されている。
伝統的にバキオの経済は農業と畜産業であり、バシェリ（カセリオ）と呼ばれる農場家屋が旧来の経済モデルの核だった。まぐさ式構造の玄関を持つもの、アーチ型の玄関を持つもの、立方構造のものなど、様々な時代や様式のバシェリがある。バキオでは今日でも農業が重要な役割を担っており、白ワインのチャコリが知られている。農村部で水力発電が利用されていた証拠として製粉所と鋳造所がある。バキオには18世紀からエステポナ川周辺に建物が増え、8つの製粉所と3つの鋳造所が設立された。この鋳造所では近隣地域から船で運ばれてきた鉄鉱石を製錬した。製粉所は数十年前までは現役で稼働しており、いくつかはまだ設備や特性を保持しているものの、いくつかは観光客向けのレストランなどに変容した。
16世紀にはバシゴ地区にゴシック様式のアンドラ・マリ教区教会が建設され、その他にはサンタ・マリーア・デ・ラ・アスンシオン教区教会がある。農村部には聖マルティン礼拝堂、聖ウルスラ礼拝堂、聖エステバン礼拝堂、聖クリストーバル礼拝堂、聖カタリーナ礼拝堂などがある。20世紀初頭には、普段はビルバオに住む富裕層が休日に過ごすための別荘が、教区教会と海岸を結ぶ道路沿いに建設されるようになった。これらの建築物には所有者の経済的・社会的地位を強調するために様々な様式が用いられている。バキオには3つの博物館、エネペリ民族学博物館、ゴロンドナ・チャコリ博物館、シンツィリ・エロタ博物館がある。
内蔵寮の起源は律令制以前の三蔵、大蔵（おおくら）・内蔵（うちくら）・斎蔵（いみくら）の一つである内蔵にさかのぼる。内蔵は履中天皇の時代に遡るとも言われ、皇室の財宝を管理する倉庫で律令施行後も中務省の一機関として存続した。内蔵寮の職掌は大蔵省より毎年宮廷運営のために送付された金・銀・絹などをはじめとする皇室の財産管理・宝物の保管・官人への下賜・調達など皇室関係の出納事務である。また、諸蕃貢献物すなわち対外貿易による調達品も管理しており、勅旨による交易（勅旨交易）およびそれで獲得した物品（交易雑物）も管理していたとみられている。更に自らも官営工房として装飾品などを製造していた。国家の出納事務を行う大蔵省や官営工房の中核である内匠寮と重複する部分も多く官制は度々変化した。また、官司の倉庫にある公の金品の支出は原則として太政官符の発給などの手続を必要としたが、その歴史的経緯から天皇が必要と認めた場合には 内侍や蔵人を介して直接寮に対して金品の調達あるいは支出を命じる勅旨を出すことができた。また、鍵の管理も他の官司とは異なっており、監物を介さず、主鑰（廃止後は属）が直接内裏に申請して開閉を行うことが出来た（ただし、蔵人所の管理下に入ってからは、それまで内蔵寮官人のみで行っていた蔵の鍵の開閉に蔵人の立ち合いを必要とすることになった）。そのため､非常に重用され、律令制が機能しなくなって以後も蔵人所の管轄下で一定の存在意義をもって活動していた。特に節会などの饗宴において天皇から諸王や殿上人に下賜する御物は内蔵寮から出された物が用いられた。こうした事から、従来、内膳職や大膳職が担当していた饗宴における食事（饗饌）も代わって内蔵寮が調達する事例もみられるようになる。また、神祇官や諸陵寮が扱っていた諸社・山陵への奉幣とは別に天皇が独自に行う奉幣にも内蔵寮の物資が用いられた。こうした措置は律令制の変化とともに国家とは別に、天皇個人が皇親・貴族や自身につながる祖先や神々との関係を再構築するために行ったと考えられている。だが、内蔵寮の役割拡大とともに、大蔵省からの送付や臨時的に行われる内外との交易での調達品だけでは支出を賄うことができなくなった。特に大蔵省からの送付には米などの食料品が含まれていないことも支出に支障を来した。そのため、『延喜式』においては大蔵省以外の官司（織部司・図書寮・内匠寮・兵庫寮など）から送付される「諸司年料供進」、諸国に品目と分量を指定して送付させる「諸国年料供進」などが制度化されて、収入部分の拡張が図られた。律令制の衰退によって朝廷自体が皇室の家政機関としての色彩を強めてくると、内蔵頭には蔵人頭や弁官・近衛中将・少将を歴任した四位の殿上人が就任するのが慣例となり、内蔵頭・蔵人頭を兼帯した頭頭（とうのとう）も存在した。更に院政期には財力を有する有力な受領に移り、室町時代初期には山科家の当主が御厨子所別当を兼務して就任するようになると、以後同家の事実上の世襲となった。なお、赤穂事件で有名な大石良雄の通称（百官名）である内蔵助はこの内蔵寮の次官ということである。前記のように内蔵寮と浅野長矩が長官に任じられた内匠寮とは職務上関連が深かった。