IE8 で搭載された SmartScreen Filter のマルウェアの検出とダウンロード防止を強化した。米国連邦取引委員会が提言しているウェブ サイトや広告主によるブラウジング データの収集を防止する追跡防止機能が標準で対応した。
Windows カラー システムによる ICC カラー プロファイル (ICC v2 と ICC v4) に対応したカラー マネージメントが行われる。画像フォーマットは カラー マネージメント機能も利用する Windows Imaging Component によって、既存のメジャーなフォーマット TIFF と新しい国際標準フォーマット JPEG XR に対応する。Direct2D と DirectWrite、XPS API を使用することによる、CPU ではなく GPU を用いた高品質かつ高速なレンダリングを実現した。HTML5 Media は Media Foundation によってメディア再生の GPU アクセラレーションに対応する。
IE7 や IE8 に含まれた検索ボックスとアドレス バーの統合や以前から存在したステータス バーの標準非表示など、Internet Explorer のユーザー インターフェイスの整理が行われた。その結果、以前よりもウェブ サイトを広く表示することが可能となった。新しいタブを開くと、頻繁に利用するサイトの候補が利用頻度とともにページ中に表示されるようになった。Internet Explorer 9 からはダウンロードの履歴・ダウンロードの進捗状況を表すダウンロード マネージャーやタブ独立機能（ティアオフ タブ）が提供される。Windows 7 にはタスク バーへのピン留め機能が提供される。通知バーの仕組みが見直され、ブラウザ フレーム上部に（ページをずらしながら）表示された通知バーがブラウザ フレーム下部にまとめて表示されるようになった。この通知バーは以前と同じようにポップアップ防止の通知・ActiveX の動作等のメッセージに加えて、ファイルのダウンロードの情報も扱うようになった。Internet Explorer の起動や動作に影響を与えるアドオンの問題を解決するアドオン パフォーマンス アドバイザーが実装された。インストールもより簡単になり、ダウンロード後にすぐインストールが開始される。インストール画面もシンプルになり、クラシカルになった。正式版より、インストールが開始される際、開いているプログラムを閉じるのか無視するのかというダイアログが出てくるが、プログラムを閉じるに設定した場合、エクスプローラーなど、すべてのプログラムが閉じ、インストール後に再び起動する。そのため、インストール後の手動での再起動が不要になった。IE8 までナビゲーション音を出すことが出来ていたが、IE9 ではデフォルトで音が出ないように設定されている。
実業家の有田一壽が、難病により若くして亡くなった娘の日記を元にして綴った回想記『愛すれど愛は悲し』を原作としてテレビドラマ化。本作終了後に、本作の補稿として『愛の哀しみ』のタイトルで出版された（有田倶子・著、有田一壽・編集、日本テレビ放送網株式会社・刊）。実業家の蟻川和也は、46歳にして複数の会社を経営し、精力的に活躍している。和也の一家は妻・優子と4人の娘という女系家族で、明るさが取り柄の家族であった。しかし長女の敏恵は高校3年の時に、胸部に疾患が認められたことで大学進学を断念。そんな秋のある日に、西山洋一という青年が蟻川家を訪れる。就職を頼みに来たのではあるが、姉妹たちは洋一を心から歓迎し、中でも敏恵は洋一に心惹かれるまま。医者から胸部疾患がまずは大丈夫と通知を受けた敏恵は洋一との結婚を決意。両親の反対を押し切って結婚、後に子供も儲けた。しかし、敏恵は病が再発する…。
一般には、弥生人は中国から朝鮮半島、山東半島を経て水稲栽培を日本にもたらした集団と考えられてきた。崎谷満によれば、日本に水稲栽培をもたらしたのはY染色体ハプログループO1b2に属す集団である。O1b2系統は、オーストロアジア語族の民族に高頻度にみられるO1b1系統の姉妹系統であり、満州や朝鮮半島などの東アジア北東部に多く分布する。崎谷はO1b系統（O1b1/O1b2）はかつては長江文明の担い手であったが、長江文明の衰退に伴い、O1b1および一部のO1b2は南下し百越と呼ばれ、残りのO1b2は西方及び北方へと渡り、山東省、朝鮮半島、日本列島へ渡ったとしている。『翰苑』の『魏略』逸文などは、倭人は江南地方の呉の太伯（文王の伯父、紀元前12世紀頃の人とされる）の末裔を称したとしている。しかしながら、長江流域や江南地方などの華南地域においてはO1b2系統はほとんど分布が確認されないため、弥生人の祖先が長江文明の担い手であったという説を疑問視する見方や、上記の説より遥か早期に北上したという見方もある。土井ヶ浜遺跡の弥生人が北部モンゴロイドの特徴を持つことや、日本人にみられるミトコンドリアDNAハプログループやGm遺伝子が北方型であることなどから、弥生人の起源地を沿海州南部に求める見方もある。岡正雄の日本人起源説の「父系的、「ハラ」氏族的、畑作＝狩猟民文化（北東アジア・ツングース方面）」、鳥居龍蔵説の「固有日本人（朝鮮半島を経由して、あるいは沿海州から来た北方系民族）」がこれに対応すると思われる。東アジア北東部にはハプログループO1b2が比較的高頻度に確認され、弥生時代に広くみられる刻目突帯文土器と似たタイプの土器が沿海州南西部のシニ・ガイ文化にもみられることから、近年ではこちらの説を推す声も多くなっている。また、日本人の約20％に見られるO2系統も弥生人に含まれていたと想定されるが、O1b2とO2はルーツが異なると思われ、その渡来時期、ルートなどの詳細はまだまだ不明な点も多い。O2はその後のヤマト王権の成立に前後する渡来人によるものだとする見方も強い。なお、渡来した弥生人は単一民族ではなく複数の系統が存在するという説も主流である。