大学入学後、夜学連に参加し、2年次に文学研究会が属していた研究部連合会の事務長を務めていた重信は学費値上げに絡んで明大闘争に参加した。この際、後に連合赤軍山岳ベース事件でリンチ殺人の犠牲となった遠山美枝子（二部法学部、麒麟麦酒勤務）と知り合う。明大闘争において全学連における立場を失墜させた共産主義者同盟(第二次ブント)の再建に協力してほしいとオルグされ、加入。系列の明大現代思想研究会、二部の社会主義学生同盟の責任者として活動。神田カルチェ・ラタン闘争にも関わった。その後分裂した共産主義者同盟赤軍派に創立メンバーとして加わる。塩見孝也ら幹部が逮捕され弱体化する中で主導権を握った森恒夫と対立した。
＊概ね LEOPORDINA 14 (1-2) : pp. 7-9 と波部, 1977による。プファイファーは、ヘッセン州高等裁判所の法務官である父・ブルクハルト・ヴィルヘルム・プファイファー（Burkhard Burchard Wilhelm Pfeiffer, 1777年 - 1852年）の息子としてヘッセン州・カッセルに生まれた。子供のころから頭脳明晰かつ勤勉な性格で、学校ではトップの成績であった。1820年にギムナジウムを卒業すると、1821年に16歳でゲッティンゲン大学に入学して医学を学び、1825年7月4日の20歳の誕生日にはマールブルク大学において「De phlegmasia alba dolente quaedam, adnexa hujus morbi historia」と題する有痛性白股腫に関する論文により医学博士の学位を授与された。このあともパリやベルリンで勉強を続けたが、1826年の秋には故郷のカッセルに戻って22歳で医者として開業した。1830年-1831年にかけて起こったポーランドの十一月蜂起 の際には、ドイツ医師団の要請によりポーランド側の軍医としてワルシャワに赴き、負傷者や当時世界的に流行していたコレラの患者の手当などに従事した。この当時の彼の日記は 『Als Kasseler Arzt im Polnischen Freiheitskampf 1831: ein Tagebuch. （”カッセル人医師のポーランド解放闘争1831：ある日記”）』として2000年にヘッセン歴史地理協会の ホフガイスマール 支部から出版されている。1833年に結婚したが、結婚のあとは医学関係の研究はやめ、個人的に興味のあった植物や貝類の研究に熱中するようになり、この年には リエージュ、ブリュッセル、ベルリン、ドレスデン、ライプツィヒ、ミュンヘン他の各地をまわる調査旅行をし、のちに発表されることになるヨーロッパの植物相に関する資料を得た。1837年にはドイツで栽培されているサボテン類の記載とそのシノニムに関する研究書を発表した。これは『Enumeratio Diagnostica Cactearum hucusque Cognitarum』と題するもので、一般には『Beschreibung und Synonymik der in deutschen Gärten lebend vorkommenden Cacteen』の方の名でよく知られる彼の最初の単行出版物であったが、評判が高かったことから彼は”サボテンのプファイファー”とも呼ばれるようになったという。このサボテンの研究は後に Christoph Friedrich Otto (1812-1885) も手伝うようになり、1843年-1850には二人の共著で 『Abbildung und Beschreibung blühender Cacteen』 という図版付きの2巻本として出版されている。1838年10月28日には Otto と John Gundlach (1810-1886) らと共に研究調査のためにキューバに向けてハンブルクを出港した。2か月以上の苦しい航海を経た翌1839年1月5日キューバについてみると、当初の目的であったサボテン採集についてはあまり良い成果が見込めなかったため、急遽貝類の調査採集に切り替えた。翌年にはキューバでの調査結果について報告し、帰国後も Juan Cristóbal Gundlach (1810 - 1896) や フェリペ・ポエ(Felipe Poey y Aloy:1799 - 1891) といったキューバ在住の研究者から貝類を送ってもらい、後々までに80編あまりの報告を書いている。1840年から1843年にかけてはパリ、ハンガリー、ケルンテン州の山岳地帯、リエカ、トリエステなどヨーロッパ各地を旅行し、1845年にはロンドンに滞在して大英博物館の文献や標本を調査した。これらの成果は 『Monographia Heliceorum viventium und Symbola ad historiam heliceorum』として （1841-1846）に出版された。ロンドン滞在中には有名な貝類収集家のである ヒュー・カミング(1791-1865) のコレクションも研究し、その中には日本産の貝類も含まれていた。それ以降も終生にわたり精力的に研究を続け、主に植物や陸産貝類に関する多くの報告やモノグラフを著わすとともに、Karl Theodor Menke (1791–1861) と共に貝類専門の学術雑誌 『Zeitschrift für Malakozoologie』（1846-1853）・『Malakozoologische Blätter』（1854 - 1877）を編集発行した。私生活では1833年に結婚した最初の妻との関係はあまりうまくいかず離婚、1842年に再婚し5男1女をもうけた。頑健なたちで、若い頃からヨーロッパ各地を幾度も旅行していた彼であったが、1870年に勃発した普仏戦争で、祖国のために1年間の志願兵となった末息子が18歳で異郷の地に倒れてしまうと、非常なショックを受け、それまでずっと健康そうに見えた彼もこれを境に急に衰えを見せるようになった。1875年の70歳の誕生日には、50年の長きにわたって医学・科学の進展に寄与した功績が讃えられて、20歳の誕生日に授与された医学博士号に加え、新たに哲学博士の称号が授与された。この祝賀の席にはカッセルの各界の権威、学会、協会などからの多くの祝辞が寄せられた。その後も明晰な頭脳と研究心は終生衰えを見せなかったが、肺を患って日に日に弱る様子をみせ、1877年10月2日、72年の生涯を閉じた。没後、書籍と標本は Heinrich Wolfgang Ludwig Dohrn （1838 - 1913）に売却されたが、後にシチュチンの博物館に寄贈され、手紙類はゼンケンベルク自然博物館に保管されている。