2003年（平成15年）8月27日には六本木に株式会社マハラジャエンターテイメントが運営する「MAHARAJA TOKYO」が復活オープンするも、2005年（平成17年）1月31日に閉店。同年5月6日からは経営者が変わり「King&Queen ROPPONGI」として再オープンするも2010年（平成22年）7月27日に閉店となった。一方福岡では、2007年（平成19年）12月21日、中洲に株式会社マハラジャエンターテイメント福岡が運営する「MAHARAJA FUKUOKA」が復活オープンするも、2009年（平成21年）8月15日に閉店した。その後マハラジャの商標をNOVA21グループから大原俊弘が取得し、2010年（平成22年）11月2日にはオーナー大原俊弘のもと、日本都市プロダクション株式会社の運営で「King&Queen ROPPONGI」跡地に「MAHARAJA ROPPONGI」として再オープンした。2014年（平成26年）4月23日に株式会社創遊が運営する「MAHARAJA OSAKA」が、2016年（平成28年）11月10日には株式会社邦栄が運営する「MAHARAJA NAGOYA」がオープンした。2017年（平成29年）に入ると、3月3日に株式会社O'sが運営する「MAHARAJA MINAMI」が、9月13日に株式会社ドリームワークスが運営する「MAHARAJA 祇園」がオープンし、10月6日には株式会社サウンドプロモートが運営する「MAHARAJA SENDAI」がオープンなど、運営会社こそ異なれども多くの店舗が復活を遂げている。
1988年（昭和63年）1月5日に発生した照明落下事故以降、六本木界隈の第二次ディスコブームは衰退し、マハラジャの人気も下火になり始めるものの、地方出店は1991年（平成3年）まで続いた。しかし同年オープンしたジュリアナ東京のブームに便乗、再度人気が出ることとなる。1994年（平成6年）8月31日にジュリアナ東京が閉店、ディスコブームが去った後も数店が営業を続けていたが、1997年（平成9年）9月3日に旗艦店「MAHARAJA TOKYO」（麻布十番マハラジャ）が、1998年（平成10年）4月4日には国内最後の直営店である「MAHARAJA 横濱」（横濱マハラジャ）が閉店、同年10月にはMAHARAJAを冠する最後のフランチャイズ店舗である「MAHARAJA HAKUBA」（白馬マハラジャ）が閉店した。1999年（平成11年）10月、最後まで残った系列店である「King&Queen MAHARAJA SALOON MAEBASHI」（前橋キング&クイーン）が閉店、これを以ってマハラジャは約15年の歴史に一旦幕を閉じた。皮肉にも第三次パラパラブームを目前としての閉店であった。
「MAHARAJA TOKYO」等、東京地区マハラジャを運営する有限会社エヌ・エンタープライズ社長の成田勝が、全国のマハラジャ・チェーンのイメージリーダーとなり、1986年には歌手としてメジャーデビューも果たした。イタリアのユーロビートの雄、マイケル・フォーチュナティの大ヒット曲「INTO THE NIGHT」「GIVE ME UP」やデッド・オア・アライヴの大ヒット曲「TURN AROUND AND COUNT 2 TEN」などをカバーし、オリコンでも30位台に入るなどヒットした他、マハラジャ系列のディスコでプレイされ盛り上がった。また、その後も、「MAHARAJA TOKYO」よりもカジュアル路線を狙った「MAHARAJA WEST TOKYO」、「MAHARAJA EAST TOKYO」、「King&Queen TOKYO "AOYAMA"（青山キング&クイーン）」、「King&Queen KAWASAKI（川崎キング＆クイーン）」、「EDEN ROC TOKYO BAY」、「ROYALTON TOKYO BAY」（最後の2つは東京ディズニーリゾート内に存在した）などの人気系列ディスコを次々に手掛け、1980年代を象徴する青年実業家といわれた。なお、現在は元「MAHARAJA EAST」の場所にあるレストランバー「Prego」を経営しているほか、各種アドバイザーとして活躍している。
ヴェルナー・フォン・ブラウンをはじめ、多くの人々が有人月探査の次のステップは、有人火星探査であると考えてきた。有人探査の賛同者は、人間は無人探査機よりも幾分優れており、有人探査を進めるべきだと主張している。アメリカ合衆国のブッシュ大統領（父）は1989年に月および火星の有人探査構想を明らかにしたが、多額の予算を必要とするために断念された。また、ブッシュ大統領（息子）も2004年1月14日に「宇宙探査の将来」と題した新たな計画を発表した。これによると、アメリカは2015年までにもう一度月に有人探査機を送り、その後有人での火星探査の可能性を探ることとなっていた（コンステレーション計画）。また、ロシアも将来的に有人火星探査を行うことを予定しており、技術的・経済的に判断して2025年までには実現可能であるとしている。さらにESAも、2030年までに人間を火星に送る「オーロラ・プログラム」と呼ばれる長期計画を持っている。特にネックとなるのは、火星への往復と滞在期間の合計で1年強から3年弱という、月探査とは比較にならない長期間のミッションであることと、運ばなければならない物資の量である。このため、火星の大気から帰還用燃料を製造する無人工場を先行して送り込み、有人宇宙船は往路分のみの燃料で火星に到達し、探査後に無人工場で製造されていた燃料で帰還するというプラン「マーズ・ダイレクト」なども提案されている。2010年、オバマ大統領はコンステレーション計画の中止を表明したが、同時に予算を新型のロケットエンジン開発などの将来性の高い新技術開発に振り向けるとしており、より短期間で火星に到達できる航行手段が実用化されることが期待される。また、同計画の代わりにオバマ大統領は、2030年代半ばを目標にした新たな有人火星探査計画も発表している。