オリジナルアニメ(OVA)が1998年-2001年に発売され、2004年-2011年の夏に新作が全日空で機内上映され、後日発売された。
アニメシリーズの構成はこれまで1997年にスタートした無印編から2019年現在放送されている『ポケットモンスター サン&ムーン』までの6作となる。どのシリーズも、ゲーム版（本編）が新作に代わる度に既存のシリーズが終了し、新しいシリーズに突入するという形を取っている。BW編とSM編では無印編から登場しているキャラクターのデザインの変更がなされ、BGMについてもBW編ではDP編まで使用されていたものから新規のものに変わるなど、一部リニューアルが施されることもある。しかし、今までの冒険のことが語られることもあり、無印から繋がっていることには変わりはない。一番放送期間が長いのは第1シリーズ無印版の5年7ヶ月。その後『ポケットモンスター アドバンスジェネレーション』、『ポケットモンスター ダイヤモンド&パール』は約4年間放送され、2010年からスタートした『ポケットモンスター ベストウイッシュ』と2013年にスタートした『ポケットモンスター XY』は約3年間放送された。DP編までは初回から最終回までシリーズタイトルの途中変更などはなかったが、BW編以降はリーグ戦や悪の秘密結社との闘いといった各区切りの際には、放送中にシリーズが分離されるようになった。例として、BW編ではシーズン2・エピソードN・ デコロラアドベンチャーとタイトルが変わっており、XY編でも『XY&Z』として第2期を放送した。ただし無印編は「カントー編」「オレンジ諸島編」「ジョウト編」、AG編は「ホウエン編」「バトルフロンティア編」へと、同一のシリーズ内で物語の舞台によって区分されている。これに加えてサトシとムサシ・コジロウ・ニャースは一貫して全シリーズで登場しているのに対し、ヒロイン枠はシリーズごとに交代し、BW編以降はタケシなどのようにジムリーダー枠も交代する形となっている。シリーズ終盤や映画に次の地方のポケモンがゲスト出演として（ハヅキのバシャーモ、ルカリオなど）登場したり、XY編以降はゲームに先んじて新フォルムとして（サトシゲッコウガ、たそがれのルガルガンなど）登場することがある。AG編からDP編までは放送終了後の翌週には次作の放送直前番組が放送されていた。DP編からXY編は本編最終話の後に特別編が放送されており、BW編とXY編ではシリーズの垣根を超えてサトシの旅の仲間だった者同士が共演している。
2010年はチューリップ賞から始動。陣営は前走同様にチューリップ賞前に栗東入りした。レースでは前半折り合いに苦労する面を見せながら立て直したものの、最後の直線でショウリュウムーンにかわされて2着に敗れた。チューリップ賞後もそのまま栗東に残って調整した。そして本番の4月11日の桜花賞ではスタートから先行する形でレースを進め最後の直線でスパートをかけるとゴール前で逃げるオウケンサクラを差して優勝を飾り、鞍上の蛯名と調教師の国枝栄に初の桜花賞のタイトルをもたらした。勝ち時計1分33秒3は2005年のラインクラフトが持っていた1分33秒5を0秒2更新する桜花賞レコードとなった。また美浦所属の騎手が桜花賞を制したのは1985年のエルプスで制覇した木藤隆行以来25年ぶり。福島デビュー馬が、桜花賞を制したのは1974年のタカエノカオリ以来36年ぶり4頭目となった。桜花賞後は美浦に戻り優駿牝馬（オークス）へ向けての調整が行われた。そして迎えたオークスでは大外8枠17番、レース前に血統面での適性による距離不安などが囁かれながらも1番人気に支持されての出走となった。レースはニーマルオトメがレースを引っ張る形でアパパネは中団のサンテミリオンのすぐ後ろで折り合いをつける形で追走し、最後の直線で先に飛び出したサンテミリオンに後方から迫ると2頭が並走する形になり1番手で粘っていたアグネスワルツに2馬身差をつけそのまま並んでゴール板を駆け抜けた。約15分間にも及ぶ長い写真判定の末、JRA・GIおよび八大競走では史上初となる1着同着という結果となった。鞍上の蛯名とサンテミリオン騎乗の横山典弘は奇しくも1992年の帝王賞でのラシアンゴールド（蛯名騎乗）、ナリタハヤブサ（横山騎乗）でも1着同着となっていたことでも話題となった。なお、この勝利によってアパパネは2009年のブエナビスタに続く2年連続での牝馬クラシック2冠を、また馬主の金子真人は中央レースでの五大クラシック競走の完全制覇を達成した。また関東馬による牝馬クラシック2冠達成は1986年のメジロラモーヌ以来、24年ぶりであった。夏は美浦で調整し、秋緒戦は9月19日のローズステークスから始動。レース直前の馬体重は実にプラス24キロを計測、レース中は折り合いも欠くなど本来の状態ではなくそれでもゴール前では一旦先頭に立つがやはりあとひと伸びがなくアニメイトバイオの4着に敗れた。10月17日の秋華賞は前走より体重をマイナス4キロと絞った。レースでは最後の直線で伸びると追いかけるアニメイトバイオ、アプリコットフィズを抑えて1着となりスティルインラブ以来、7年ぶり史上3頭目の牝馬三冠馬となった。父内国産馬の牝馬三冠馬は初で、牡馬を含めてもミスターシービー（父・トウショウボーイ）以来史上2頭目である。2歳（旧3歳）時のGI（JpnI）も合わせて制覇している三冠馬は牡馬を含めても本馬の他には1994年のナリタブライアンのみである。続いて出走した11月14日のエリザベス女王杯では、好スタートから道中6番手前後を追走し4コーナーから直線で外に持ち出して追いあげるもスノーフェアリーの3着に敗れた。