日本各地に残る縄文時代の貝塚から、多数のフグの骨が発掘されている。このことより、ふぐ食が古くから行われていたことが分かる。また、中国では秦時代の書物『山海経』に「フグを食べると命を落とす」という旨の記述がある。平安時代の本草書『本草和名』には「布久」という名称でフグが登場する。
ふぐを捌く場合、ふぐの持つ毒を含む部分と食用が許可された部分を分離する作業は、各都道府県の許可したふぐ調理師（または処理師、包丁師などとも呼ばれる）が行うことが決められている。この免許は、各都道府県のふぐ条例により定められているため、ある県で取得した免許を持っている場合でも、他県では無効となる場合が多い。また、ふぐ調理師により食用として処理された部位のみを再調理する場合に関しては、特に資格は必要としない。ただし地域によっては、飲食店等でふぐ料理を提供する・スーパー等で身欠きふぐ等を販売するといった目的で、あらかじめ処理済みの部位のみを取り扱う場合でも、別途、保健所への届出・講習会の受講等が義務付けられる。
魚肉は白身魚と赤身魚に大きく分けられ、ふぐは白身魚に属する。白身魚は高たんぱく・低脂肪であるが、フグ肉は白身魚のなかでも、さらに脂質が少ないという特徴を持つ。また繊維質であるため肉質は弾力が強く、普通の刺身の厚さに切ると、一般の人では噛み切ることに苦労する。このため、ふぐ刺しではフグ肉を薄く切って盛り付ける。一般の魚は、〆てから死後硬直により身が引き締まる4時間から5時間程度以内が食べるのに適していると言われている。しかしフグは元々肉に弾力があるため、死後硬直から旨味成分であるアミノ酸やイノシン酸が増加し、肉が軟らかくなる24時間から36時間程度経過後が適していると言われている。
愛媛県新居浜市発祥。フグの白身や皮などを細切れにし、ポン酢ともみじおろしで味付けする。ふぐざくの上にカワハギの肝が乗っているのが特徴である。
下関駅でかつて販売されていた駅弁。1960年に登場し、10月から翌4月までの期間限定であった。ふぐをかたどった丸い容器にフグのダシ汁で炊いたふぐ飯の上に、ふぐの天ぷら、ふぐの煮つけ、山菜などが載る。
石川県白山市（旧・石川県石川郡美川町地区）には、ふぐの卵巣を糠（ぬか）に漬けた「ふぐの子糠漬け」という郷土料理がある。フグの肝や卵巣はフグ毒を多量に含んでいるが、塩水に1年、糠の中に2年から3年漬けると分解され、ほとんど人体に影響を与えなくなるレベルにまで低下する。この経過を経て、ふぐの卵巣の糠漬けは珍味として重宝される。ふぐの子糠漬け、粕漬けは、猛毒のゴマフグの卵巣を上記のように加工したもので、製造・販売が許可されているのは石川県のみである。
本作は『クレージー・ママ』（Crazy Mama: 1976年）、『グローイング・アップ』（Eskimo Limon: 1978年）、『グローイング・アップ3/恋のチューインガム』（Shifshuf Naim: 1981年）、『スタンド・バイ・ミー』（Stand by Me: 1986年）、『チキン・リトル』(Chicken Little: 2005年）、『ローラーガールズ・ダイアリー』（Whip it: 2009年）といった映画の中で用いられた。またアメリカのTVドラマ『チアーズ』（Cheers）や『スクラブス（Scrubs）〜恋のお騒がせ病棟』のほか『CSI：科学捜査班』（CSI）でも使われた。テレビのシチュエーションコメディ『チアーズ』では、登場人物のノームとクリフがヘリウムを吸って声のトーンを高くしてから本作を唄った。『ザ・シンプソンズ（The Simpsons）』のエピソード「ザ・シンプソンズ番外編特集（The Simpsons Spin-Off Showcase）」では、「シンプソンファミリー・スマイルタイム・バラエティアワー」（Simpson Family Smile-Time Variety Hour）という短編のなかでジャスパーが本作を唄おうとするが、“ポン”という音を出そうとして歯が抜けてしまう。1977年、『ハッピーデイズ』（Happy days）のエピソード「タイム・カプセル」では、仲間達が偶然地下室に閉じ込められ、ポッティーが本作を唄ってみんなを元気付けようとする。2005年、『スタッブス・ザ・ゾンビ』（Stubbs the Zombie）というテレビゲームでは、ベン・クウェラーの唄うヴァージョンが用いられている。これはさらに人気ゲーム『デストロイオールヒューマンズ』（Destroy All Humans）でもジャンキーXLによってリミックスされた。2007年、ハリー・ポッターのパロディ『ポッター・パペット・パルズ』（Potter Puppet Pals）のエピソード「ザ・ミステリアス・ティッキング・ノイズ」（The Mysterious Ticking Noise）で、ヴォルデモードが最後に本作を“ヴォルデモード、ヴォルデモード、オゥーヴォルディ ヴォルディ ヴォルディ ヴォルデモード！ ”と唄っている。同じく2007年にはレディー・ガガが本作を未公開のレアソング「キャンディ・ライフ」（Kandy Life）に取り入れていたが、2009年に流出した。アメリカCBSの『コールドケース迷宮事件簿』（Cold Case）のエピソードは本作で始まった。オフブロードウェー演劇の『ザ・マーベラスワンダレッツ』（The Marvelous Wonderettes）でも用いられた。また本作は1989年より放映されルーン・ラーソンが司会を務めたノルウェー放送協会の番組『ロリポップ』（Lollipop）のテーマソングにもなった。2009年、デルコンピューターのCMで工場の労働者が本作を唄っている。2009年の映画『プラネット51』（Planet 51）でも本作をソフィ・グリーンが唄っている。2012年発売のPS3/Xbox 360用ゲーム『ロリポップチェーンソー』にて、コーデッツ版がサウンドトラックとして使用された。