2014年8月18日にウェイバーでトロント・ブルージェイズへ移籍。傘下のAAA級バッファロー・バイソンズへ所属すると、公式戦13試合の出場で打率.377、1本塁打、10打点を記録した。ただし、移籍後はメジャー公式戦への出場機会がなかった。2015年には、開幕からAAA級バッファローでプレー。公式戦136試合の出場で、リーグ最多の177安打、打率.338、11本塁打、92打点、5盗塁という成績を残したことから、インターナショナルリーグのMVPに輝いた。また、8月と9月にはメジャーへ昇格。通算10試合の出場で、打率.250を記録した。11月24日に自由契約。
2008年のMLBドラフト9巡目（全体264位）でピッツバーグ・パイレーツから指名され、プロ入り。契約後に傘下のA-級ステート・カレッジ・スパイクスとA級ヒッコリー・クロウダッズへ所属すると、2球団通算で公式戦64試合に出場。打率.322、6本塁打、32打点、1盗塁という成績を残した。2009年には、A+級リンチバーグ・ヒルキャッツで公式戦122試合に出場。打率.293、8本塁打、50打点、3盗塁を記録した。2010年には、AA級アルトゥーナ・カーブで公式戦135試合に出場。打率.295、15本塁打、86打点、3盗塁という成績を残した。2011年には、AAA級インディアナポリス・インディアンスで公式戦141試合に出場。リーグ最多の165安打を放つとともに、打率.309、12本塁打、75打点、4盗塁という成績を残した。シーズン終了後の11月19日に、40人枠へ初登録。2012年には、スプリングトレーニング中のオープン戦で、両リーグ最多の7本塁打を記録した。開幕をメジャーリーグで迎えると、4月7日の対フィラデルフィア・フィリーズ戦でメジャーデビュー。翌8日の同カードでメジャー初安打を記録した。しかし、メジャー公式戦全体では、30試合の出場で打率.229、0本塁打、7打点、1盗塁という成績にとどまった。その一方で、AAA級インディアナポリスでは、公式戦91試合に出場。打率.283、4本塁打、54打点、3盗塁という成績を残した。2013年には、AAA級インディアナポリスで公式戦142試合に出場。リーグ最多の153安打、打率.285、8本塁打、69打点、4盗塁を記録したが、メジャー昇格の機会はなかった。2014年には、AAA級インディアナポリスで公式戦93試合に出場。打率.267、14本塁打、66打点、1盗塁の成績を記録。2年振りにメジャー昇格を果たしたが、3試合の出場で2打数無安打に終わったため、8月14日にDFAを受けた。
アメリカ法人は両米大陸の事業を統括している。2005年10月、NXGamesを設立。2006年11月2日、NEXON Americaに社名変更。2006年11月9日、MTV Networksと提携。
村田は女性起業家として、シリアルアントレプレナー（連続起業家）として注目を集め、AERA2015年6月1日号の「日本を変える最強の人脈」の約80人の1人に含まれた。DeNA創業者南場智子は、村田は「日本の女性シリアルアントレプレナーとしては、私が知る限り唯一の方」「業界の先導者」と評している。やろうと思えば株式公開できたiemoを売却するという決断を「ものすごく尊敬している」と述べており、「私はマリさんの大ファン」なのだという。投資家の渡辺洋行は、村田は「実績があり、業界ネットワークがあり、ビジネス戦略、能力などいろいろ合わさっている人」「本当に凄い起業家」であると述べている。村田はDeNAでキュレーション事業を統括した。2016年12月にキュレーションサイト問題の謝罪会見が行われ、村田の責任について問われた社長の守安功は「責任の所在については、第三者委員会による調査の中で決めていく」と述べた。村田は健康上の問題などを理由に謝罪会見に出席していない。会見では現場の人間がいないため、問題の詳しい経緯の説明はなかったが、詳細を知る人物は責任者の村田であると指摘されていた。2017年3月、第三者委員会の調査のあとのディー・エヌ・エーの会見で、村田がディー・エヌ・エー執行役員、iemo株式会社代表取締役CEO、株式会社Find Travel代表取締役社長を辞任する意向であると伝えられた。ペロリ社長の中川綾太郎と共に解任ではなくあくまで辞任であり、東洋経済の渡辺拓未は「報告書の指摘は多岐に渡るものの、個人に対する責任は明確にされていない」と述べている。調査では、守安社長が現場に相談なく掲げた数値目標を、村田は相当高い水準にあると思いつつも達成するために邁進したことが明らかになっており、会長の南場は村田と中川綾太郎は誠心誠意事業に打ち込んでおり悪徳なことを考えていたわけではないとし、「この2人の有能な若者を正しく導けなかったDeNAの責任は極めて重い」と述べた。一橋大学教授の楠木建は、村田は「起業（のち、よきところで売却）専門家」であり、メディアというサービスを「消費者（というか正確には広告主）」に売っていたのではなく、「自分が起業した事業」という商品を会社という顧客に売る人であった。つまり、「彼女が向き合っていたのは競争市場ではなく、資本市場。この2つでは仕事の中身がまったく違う」と述べている。メディア業界の現状と将来を分析する大熊将八は、村田は「根っからの起業家・事業売却家」であると評している。シンガポールで面会した村田の印象は「まさにパワフルな起業家」で「成功すること」への飽くなき欲求を感じたが、村田が頻繁に口にしていたのは自社のメディア事業の数字がいかに伸びているかということであり、「ジャーナリズムについての考え方や、健全なメディアのあり方という点は彼女の興味の範疇になかったのだと思う」と述べている。