同年6月2日の本能寺の変後は、そのまま前田利家の家臣となった。同年の石動山の戦いに参加し、その戦功により能登国内で3万1000石を与えられた。天正11年（1583年）、賤ヶ岳の戦いに参加して前田軍の殿軍を務め、この際に連龍の家臣30名余が討死した。天正12年（1584年）の佐々成政による末森城攻めでは、利家の救援軍に属して華々しい活躍を挙げ、利家に「抜群の活躍比類なし、真実頼もしく候」と賞されている。ただし、末森城の合戦に連龍は実際には参加しておらず、合戦後に危険を顧みずに駆けつけた点を利家から賞されている。その後も小田原征伐、朝鮮出兵に参陣し、伏見城築城や宇治川の土木工事などにも参加し、いずれも功を挙げた。慶長4年（1599年）に利家が死去すると、後継者の利長に仕え、翌年の関ヶ原の戦いでは北陸で丹羽長重と戦い、浅井畷の戦いでは敗れながらも奮戦した。慶長11年（1606年）に家督を長子の好連に譲り隠居したが、慶長16年（1611年）に好連が早世すると再び当主の座に復帰し、大坂の役にも従軍した。これらの功績の数々から加増も受けて、長家は最終的に3万3000石の大身となる。元和5年（1619年）2月3日、能登田鶴浜（現七尾市）にて死去。享年74（満72歳没）。家督は次男の連頼が継いだ。以降、子孫は加賀前田家の家老として3万3000石を領した。
フリーメイソンが最初に日本に訪れたのは江戸幕府による鎖国政策の時代であり、1779年に長崎港出島のオランダ商館に商館長として駐在したオランダ東インド会社のイサーク・ティチングが初訪日のフリーメイソンであると考えられている。ティチングがフリーメイソンリーに入会したのは1772年、オランダ領東インドバタヴィア（インドネシアジャカルタ）でのことである。日本国内にメイソンリーのロッジ設立が始まったのはそれよりさらに後になってからである。江戸末期の1853年、開国（開港）を日本に迫ったマシュー・ペリーはメイソンであった。ペリーは1819年にニューヨークのホーランド・ロッジでメイソンリーに加入した。ペリーを日本に遣わせたミラード・フィルモア米大統領は、フリーメイソンの集まりに参加した記録はあるが、フリーメイソンではない。1860年2月26日（安政7年2月5日）、横浜で攘夷派によってオランダ人船長W・デ・フォスと、商人N・デッケルが暗殺された（オランダ人船長殺害事件）。外国人達は攘夷派への示威行動の意味もあり、できるだけ盛大に二人の葬儀を行おうとした。この時、殺された二人はフリーメイソンであると言われており、外国人のメイソン達は、儀式用の正装であるエプロン着用で葬儀に臨んだ。これが日本におけるフリーメイソンの最初の記録という（ただし、二人が会員であった証拠は見つかっていない）。二人は横浜の外国人墓地に埋葬され、その墓は現存している。1864年（元治元年）、イギリスは居留民保護のため英国第20（イースト・デヴォンシャー）歩兵連隊（後のランカシャー・フュージリアーズ）を香港から横浜に移動させた。同隊の軍隊ロッジ「スフィンクス」は、隊員のためのロッジであるが、在日イギリス人のためのロッジとしても機能し、また恒久的な民間ロッジ設立のための手助けをした。1865年1月、スフィンクス・ロッジは横浜在住のフリーメイソンから家を借り、これをロッジとして日本初の集会を行った（現・港の見える丘公園内）。スフィンクス・ロッジは1866年（慶応2年）3月に離日したが、歌手ジョン・レディ・ブラックら横浜在住の外国人によって、改めて民間人のための「横浜ロッジ No.1092」設立が申請され、慶応元年12月14日（1866年１月30日）にイングランド・グランド・ロッジの承認を受け、6月26日、「横浜ロッジ」が恒久的な民間ロッジとして設けられた。このロッジは度々移転しているものの現存しており、日本国内最古の現役ロッジといえる。1869年には横浜に2つめのロッジとして「オテントウサマロッジ No. 1263」が設立された。続いて登場したのが1870年（明治3年）発足のロッジ・兵庫・大阪（神戸）である。第二次大戦前までに国内には8つのロッジが設立され、そのうちの半分が、横浜におかれた。「東方の星(STAR IN THE EAST) No. 640」、「東洋の印章ロッジ(Orient Mark Lodge) No. 304」「横浜支部(Yokohama Chapter)」と「オテントウサマロッジ No. 1263」の4つは、共同所有の形で山下町の一等地に集会所「メソニックホール(Masonic Hall)」を建設した。幕末の長崎に滞在して薩摩藩などに武器を売っていたとされるスコットランド系英国人商人トーマス・ブレーク・グラバーがフリーメイソンだったとする主張もあるが、彼はフリーメイソンではない。彼の地元にあるスコットランド・アバディーン・ロッジとの関連も記録からは何も発見されていない。長崎にスコットランド系のロッジがあるが、その創設はグラバーが活躍していた時代から20年も後の話であり、グラバーは無関係である。グラバーがフリーメイソンだという誤解が広まったのは旧グラバー邸近くにメイソンの石柱があることを根拠にして空想を広げたことによると思われるが、このメイソンの石柱は戦後になって長崎市が観光目的で別の場所から移築してきたものにすぎない。したがって「グラバー＝メイスン」説には何ら根拠はない。またグラバーは薩摩藩など討幕派の藩だけではなく、幕府や佐幕派の藩にも武器・船舶を売っていたと見られる。