月刊少年誌『冒険王』『まんが王』を手がけていた秋田書店が週刊少年誌の時代に対応すべく、1969年7月に「フレッシュな少年週刊誌」の謳い文句で『少年チャンピオン』の誌名で隔週刊（月二刊）誌として創刊。創刊号の表紙にはキックボクサーの沢村忠が起用された。前年に創刊され、新人中心のラインアップで勝負を余儀なくされた集英社の『少年ジャンプ』と異なり、手塚治虫やさいとう・たかをなど有力作家を連載陣に揃えた。1970年6月24日発売号からの週刊化に伴い誌名は『週刊少年チャンピオン』に改められた。創刊の経済的基盤を支えたのは、大手出版社が本腰を入れていなかった新書判のマンガ単行本「サンデーコミックス」のヒットによるものと言われる。この時期の人気連載として、『夕やけ番長』（梶原一騎・荘司としお）、『あばしり一家』（永井豪）、『狂人軍』（藤子不二雄Ⓐ）、『ガッツジュン』（神保史郎・小畑しゅんじ）、『宇宙猿人ゴリ』（うしおそうじ・一峰大二）、『太陽の恋人』（梶原一騎・かざま鋭二）、『原始少年リュウ』（石ノ森章太郎）、『バビル2世』（横山光輝）などがある。
発行日および発売日は毎週木曜日（北海道、九州など、一部地域は金曜日。2010年1月以降、発行日と発売日が基本的に一致するようになった（「○月○日号」の部分は旧来の発行日表記のまま））。定価は270円。マスコットキャラクターは、ツートンカラーの大きなシルクハットを被った、ヒゲが特徴的なアイドルマークであり、正式名称は「少チャン」である（『月刊少年チャンピオン』も共通して使用している）。誌名ロゴはかつては毎年変更されていたが、1991年度以降現行のものになっている（1995年度と2015年度に「チ」の部分に若干のマイナーチェンジが加えられている）。過去の掲載作品の変遷の影響により、他の週刊少年漫画誌と比較して自由な作風でかつアクの強い漫画が多く掲載されていると形容される。チャンピオン読者そのものの絶対数が他の週刊少年漫画誌に劣ることから、雑誌内での相対的な話題作がそのまま絶対的な売上に反映されづらいのが現状である。書店での単行本の入荷量も他の週刊少年誌の作品に比べて少なくなっている。新人作家のための増刊号が発行されていないが、その代わり読切や短期集中連載が多く、ほぼ毎週そのための枠が確保されている。それらの作品は、読者から好評と判断されれば比較的早い段階で毎号連載が始まる。不人気による打ち切りも他誌同様に存在する。打ち切られた作品でも極端に人気が少ないと判断された場合少年チャンピオン・コミックスが発刊されなかったり、単行本の売上が極端に悪いと判断された場合は最終巻まで発刊されない時もある。実績の無い作家の単行本の第1巻の発行部数は、多くの場合同上他誌と比較しても非常に少なく抑えられているのも特徴であり、その売れ行き如何により連載時の待遇が上下する事が多い。そのような作家で連載当初から人気のある作品は、初版が発売直後に品薄となり、しばらくの間入手が困難となることもある。また、重版する場合も始めは増刷1回あたりの部数は少なく抑えられている場合が多いので、発売より数ヶ月経過してようやく出回る場合がある。
寛永11年（1634年）7月、将軍・徳川家光が諸大名に改めて領知朱印状を与えるために上京。これを好機と見た毛利秀元は、家光に直接自らの所領を安堵してもらうことで萩藩からの独立を図り、これに就隆も同調した。秀元は縁戚の永井尚政の協力を受け、老中の土井利勝と酒井忠勝に度々密かに面会し、水面下で独立運動を展開した。同年閏7月11日、領知朱印状の交付に先立ち、萩藩の公儀人である福間就辰は、老中の土井利勝と酒井忠勝から従来の領知朱印状の写しを朱印改奉行に提出することを求められた。福間就辰は朱印改奉行の永井尚政、安藤重政、内藤忠重に朱印状の写しを提出したところ、永井尚政は朱印状の原本を拝見したいと福間就辰に依頼した。この不審な対応に対し福間就辰は、今回の朱印改に乗じて毛利秀元の知行が萩藩の内分知であるとする文言を書き変えるつもりではないかと推測している。秀元と就隆の動きを察知した秀就は、朱印改奉行の永井尚政、安藤重政、内藤忠重の3名に使者を派遣すると共に自ら土井利勝を訪ね、従来通り周防・長門2ヶ国の領知朱印状を頂きたいと依頼。更に懇意にしていた大目付の柳生宗矩にも協力を依頼した。閏7月16日、二条城に登城した秀就は、従来通り周防・長門2ヶ国の領知朱印状を受け取った。これにより秀元と就隆が企てた萩藩からの独立は阻止され、以後、江戸時代を通して本藩と支藩の関係は変わらなかった。寛永12年（1635年）、幕府から半蔵門の手伝普請を命じられた秀就は、秀元と就隆に負担役の分担を指示したが、秀元と就隆は在江戸の頃には負担役の分担を免除されていたことを理由に普請役の分担を拒否。これに対して秀就は、普請役の免除は毛利輝元と幕府の間で特別に取り決められたものであるため、現状では通用するものではないと反論したものの、問題を大きくすることを嫌って独力で普請を終えた。普請を終えた秀就は老中の土井利勝と松平信綱に対して、今後秀元と就隆が普請役の分担を拒否した場合は幕府からも強く分担を指示するように依頼し、土井利勝と松平信綱は秀就の依頼に理解を示した。また、事態を見かねた柳生宗矩と永井尚政が秀就と秀元の仲介となり、久留米藩主の有馬豊氏と旗本の安藤定智が秀就と就隆の仲介となることで三者の和解が成立した。