NPBチームが存在する地域に生まれた最初の独立リーグチームであった。観客動員は2008年が1万9931人（1試合平均498人）、2009年は1万9546人（1試合平均489人）で、いずれもリーグでは下から2番目である。これに加え、不況に伴う経営環境悪化で翌シーズンの運営が困難になったという理由から、10月30日のリーグ理事会で、2010年のリーグ戦には参加しないことが決定した。同日のリーグ首脳の会見によると、2009年の売上高4000万円に対して赤字額は4000万円となる見込みとされた。監督・コーチや選手との契約が切れるため、チームとしてはいったん解散する。選手のうち希望者は10月30日に非公開で行われた救済ドラフトでリーグ内他球団の指名対象となり、12名がリーグ内の高知を除く他の4球団から指名を受け、うち香川が指名した2名を除く10名が指名球団への入団が内定した。残る2名のうち1名は個別にリーグ内他球団に移籍した。希望者で指名されなかった4名についてはリーグの新人ドラフト対象者扱いとなったが、1名がトライアウトでリーグ内他球団に移籍した。この結果、最終的に12名がリーグ内他球団に移籍することとなった。このほか、ベースボール・チャレンジ・リーグの球団に1名が移籍している。球団の事務所は引き続き残り、リーグと協力の上で新たなスポンサーを探して2011年からの復帰を目指すとしていた。このため、事務所はあるがリーグ戦には参加しない「準加盟球団」として存続することになった。シーズン終了後の12月に経費節減のため、球団事務所を従来の福岡市から大川市に移転した。新聞報道によると、復帰時には過去の開催地の中から集客の多かった球場を本拠地として集中的に開催することを検討していた。2010年10月、来季の復帰を見送る方針を固めたと報じられた。リーグは11月4日の定例理事会で、2011年度は四国4球団と新加入の三重スリーアローズの5球団でリーグ戦をおこない、リーグ名称も変更を検討すると発表し、事実上2011年度の復帰見送りが決まった。2012年度以降も、不参加状態が継続している。
鉱石は当初露天掘りで得られたが、それは直ぐに無くなり、鉱脈に辿り着くには地下にトンネルを掘る必要があった。銀鉱石鉱脈の大半は長く薄い鉱脈が続くが、コムストック・ロードの鉱脈は個別のものが厚さ数百フィートに及ぶものが多かった。鉱石は柔らかくシャベルで掘ることができた。このことで鉱石は容易に掘り出せたが、周りの物質が弱いためにしばしば恐ろしい落盤が起こった。掘削は3,200フィート (1,000 m) 以上の深さまで掘り進まれた。落盤の問題はドイツ人でオファー鉱山の監督に指名されていたフィリプ・ダイデシャイマーが発明したスクエアセット坑くいの方法で解決された。それ以前のやり方では坑道の両側に垂直の杭を立て、天井を支える水平材をその上に置いていた。しかし、コムストック・ロードの鉱脈はこれを適用するには大きすぎた。ここでは鉱石を除去するとその跡に一辺が6フィート (1.8 m) の立方体に組まれた木材で置き換えられた。こうすれば、坑道が順々に木材の格子で置き換えられて掘り進むことができた。坑道の鉱石を完全に掘り出した後で、その跡を他の坑道から持ってきた岩石で埋め直すこともしばしば行われた。杭の枠を組立ながら掘り進むこの方法によって、いかなる幅、高さ、あるいは深さの坑道でも安全に作業することができた。コムストック・ロードの初期には大量の湧水と戦う必要があった。このために水を汲み出す機械や装置が必要となり、掘り進むに連れて大型のポンプが要求された。太平洋岸の発明の天才が全て動員されて対策に取り組み、世界のどこにも見られないような強力で効率的な蒸気動力や水力のポンプ設備が作られた。当初の水は冷たかったが、支脈まで掘り進むに連れて熱い湯が大量に出るようになった。この湯は卵を茹でられるほど熱く、人を火傷でほとんど即死させるほどのものだった。鉱脈から熱湯の水だめに落ちて死ぬ者もいた。この熱水のために、暑くなった坑道で働くには冷たい空気を送り込む必要があり、ファン、ブロワーなど様々な種類の換気装置が必要になった。ドリルの動力、ファンの動力および小型揚重装置のために圧縮空気が採用された。堅い岩盤を長く掘り抜くためにダイアモンドドリルも一般に使われたが、探査のためには使われず、信頼できないことがわかった。岩盤を吹き飛ばすために新しい形態の爆破物も開発された。鉱石を運び出し、坑夫を送り込むために使われるエレベーターにも大きな改良が加えられた。坑道が深くなると地表まで鉱石を運び出すための麻縄では利用できなくなった。その自重ですら耐荷重の中のおおきな部分を占めるようになった。この問題を解決したのが1864年にA・S・ハリディが開発した平織りワイヤロープだった。このワイヤロープはサンフランシスコの有名なケーブルカーにも利用された。1859年のアメリカ人は銀鉱山について何も知らなかった。カリフォルニア州の砂鉱鉱山ではメキシコの銀鉱山で働いたことのあるメキシコ人が大勢いた。当初のコムストック・ロードの坑夫はメキシコ人と組みになるか、少なくとも作業の指揮をするメキシコ人監督を雇うことが奨励された。銀鉱石の精製のためにアラストラス、パティオおよびアドベの溶鉱炉を採用したのもメキシコ人だった。これらの方法はアメリカ人にとってはあまりに鈍いことがわかり、掘り出される大量の銀鉱石を処理できなかった。アメリカ人は鉱石を潰すためにスタンプミルを導入し、精製工程を短くするためにパン精製法を採用した。フライベルクの工業学校で教育を受けてきたドイツ人坑夫の中には、銀を含む鉱石を処理するために当時の最良のものと見なされたものがいた。かれらは精製のバレルプロセスと鉱石を焙る方法を導入した。バレルプロセスはパティオの改良にはなったが、コムストック・ロードの鉱石をパン精製処理する急速な方法にはうまく適合できないことが分かった。コムストック・ロードでは蒸気で過熱された鉄製のパンを使うワショー・プロセスを開発し、パティオ法で要した数日という単位を数時間のレベルに減らした。鉱石のパン・プロセスを使っていた初期に、貴金属とクィックシルバー（水銀）を多量に消耗していた。精錬所ではたらくほとんど全ての者が鉱石を溶融するための秘密の方法を実験していた。彼等は杉皮とヤマヨモギ茶の調合物など鉱物から植物までを使ったあらゆる方法を試した。当時、金、銀および水銀が選鉱くずと共に多量に川に流されていた。溶融パンの多くのパターンと形態が発明され特許も取られたが、まだまだ改良の余地があった。改良が次々と加えられ、金属の損失を減らすことになったが、コムストック・ロードで使われている装置のどれにも完成ということはなかった。