ベルモント・レポートは、ヒトを対象とする研究についての倫理規範を規定するため、政府委員会「生物医学および行動研究のヒト対象の保護のための委員会」によって作成されたものである。この報告書は、現在の米国のシステムで、研究試験でヒトを保護するために最も頻繁に使用されている。 主にヒトを対象とした生物医学的および行動学的研究に目を向けることによって、報告書は、倫理的基準がヒト被験者の研究において基準として従われる事を保証するために作成された。レポートが基準とする方法、および人間の被験者をどのように調査するかについては、3つの基準となる原則がある。それは、「人への敬意（respect for persons）」、「与益（beneficence）」 、そして「正義」。「与益（beneficence）」は、倫理的で対象を危害から守ることによって、（１）人々の幸福を守り、（２）彼らの決断を尊重する、と述べられている。この2つの与益は研究からの益を最大にすることと、あらゆる可能な危険性を最小限に留めるためにある。人体研究の利点とリスクを人に知らせることは研究者の務めである。正義の原則は、研究者が自分たちの研究結果について公正であり、情報が良いか悪いかにかかわらず、発見したものを共有するために必要となるので重要である。また、被験対象の選択プロセスは公平であるべきで、人種、性的指向または民族グループで区別してはならないともされている。  最後に、人を尊重することは、研究に関わっている人がいつでも参加したいのか、参加しないのか、あるいは研究から完全に撤退するのかを決定できる事を指す。この二つは、人の自主権を尊重するためのもので、自主権が何らかの理由で損なわれている（囚人など）人もが保護を受ける権利が与えられるべき、ということを指す。これらの原則の唯一の目的は被験者の自主性を確保し、環境が自分の管理下にないものがあるために自主性を維持することが難しい人々を保護することである
ヘルシンキ宣言は、ヒトを対象とした国際的な研究を規制するために採択された（初めに1964年に採択、その後なんども改訂されている）。世界医学会によって採択されたこの宣言は、ヒトを対象とする生物医学的研究を行う医師のためのガイドラインを提唱したものである。これらのガイドラインのいくつかは、「研究プロトコルは開始前に独立した委員会によってレビューされるべきである」また、「ヒトを用いた研究は実験動物および実験からの結果に基づくべきである」といった原則を含んでいる。 このヘルシンキ宣言は、人間の研究倫理に関する基本文書と広く見なされている   。
1947年に、強制収容所の囚人に対して致命的または加害的な実験を行ったドイツ人医師達は、 ニュルンベルク裁判で戦争犯罪者として訴追された（医者裁判）。 同年、連合軍はニュルンベルク綱領を公開。これは「被験者の自発的な同意が絶対に不可欠である」という概念を支持する最初の国際文書である。戦争捕虜、患者、捕虜、兵士が対象になることを強要されるのを防ぐために、ニュルンベルク綱領では個人の同意が強調された。さらに、実験のリスク - ベネフィットを参加者に知らせることも強調されている。
1991年に最初に発表された「コモン・ルール」（連邦規則 「人間の被験者保護のための連邦政策」） は、 アメリカ合衆国保健社会福祉省の人間保護保護局によって規定されている。 「機関審査委員会（仮訳）」 （IRB）のガイドライン、インフォームド・コンセントの取得、および研究対象のヒト被験者に対する遵守保証（Assurances of Compliance）」 。 2017年1月19日、2018年7月19日の公式発効日を伴う最終規則が連邦登録 に追加された。
「マクロスシリーズ」生誕20周年記念として制作されたのが本作である。地球が異星人ゼントラーディとの戦争（第一次星間大戦）に巻き込まれる7か月前、2008年の南海の孤島マヤンを舞台に、現代文明と伝統文明の相克、人類創生の秘密が描かれる。『超時空要塞マクロス』の舞台となる近未来（2009年）を現実に迎えつつあることから、本作はそれまでの続編作品とは逆にシリーズの過去にさかのぼり、現実世界と架空のマクロスワールドが交錯する過渡期の状況に焦点を当てた。F-14やMiG-29という実在する兵器と、可変戦闘機 (VF) やデストロイドという空想未来兵器が同世界のなかに登場する。監督の河森正治は当初、南の島を舞台にした戦記ものに可変戦闘機の開発エピソードを絡めた短編2本立ての物語を構想していた。しかしロケーション・ハンティング（ロケハン）中にアメリカ同時多発テロ事件が発生し、ミリタリー的な作風を自粛するムードがあったため、民俗学を下敷きにした神話的作風へ方向転換することになった。また、近作の例にもれず本作でも自然との協調が唄われているが、これらの描写には以前の作品である『地球少女アルジュナ』で開発された生物を3DCGで描画するテクニックが随所に使用されている。本作の設定について河森は「発表されているマクロスの基本年表には載っていない話」であるとしていた。アメリカでは機密事項の公文書が50年経たないと公開されない場合があるという例を挙げ、本作は歴史から抹消されている前提のエピソードであり、物語の構成ものちのちに伝説として語られるというまとめ方に近いと述べている。2008年には『マクロスF』（設定年代は2059年）が制作され、これにあわせて改訂された基本年表では、本作の事件が2008年7月に起きたとする記述が加えられ、この時代（2059年）には機密情報が公開されてマヤン島事変やVF-0の存在も公になっていることが示唆された。また、作中では本作の物語がシン・工藤の伝記とされ、『マクロスF』第10話「レジェンド・オブ・ゼロ」ではこれを原作とした映画「鳥の人」として、本作を題材にした劇中劇が登場し、一般市民にも広く知られた「物語」となっている様子が描かれている。また本作の登場人物、マオ・ノームのその後の消息も描かれている。この『マクロスF』内のエピソードが語るように、すべての「マクロスシリーズ」に共通する「架空の世界（マクロスワールド）の歴史的出来事をモチーフにして、あとから作られた創作作品（フィクション）である」という設定（参照）は本作品においても例外ではなく、史実をモチーフに制作されたが、必ずしも作品内の事象がすべてにおいて史実どおりとは限らないということである。本作ではあえて随所にそれを強調する演出が意図的に盛り込まれている。