1868年（明治元年）前後には、幾度かの太政官布告・太政官達によって、神道を国家の宗祀と位置付け国家によって中央集権化し、神職の世襲制を廃止することで、白川家吉田家による神職管轄が終焉していく。神社ノ儀ハ国家ノ宗祀ニテ一人一家ノ私有ニスヘキニ非サルハ勿論ノ事ニ候処中古以来大道ノ陵夷ニ随ヒ神官家ノ輩中ニハ神世相伝由緒ノ向モ有之候ヘ共多クハ一時補任ノ社職其儘沿襲致シ或ハ領家地頭世変ニ因リ終ニ一社ノ執務致シ居リ其余村邑小祠ノ社家等ニ至ル迄総テ世襲卜相成社入ヲ以テ家禄卜為シ一己ノ私有卜相心得候儀天下一般ノ積習ニテ神官ハ自然士民ノ別種卜相成祭政一致ノ御政体ニ相悖リ其弊害不尠候ニ付今般御改正被為在伊勢両宮世襲ノ神官ヲ始メ天下大小ノ神官社家ニ至ル迄精撰補任可致旨被仰出候事 — 明治四年太政官布告第二三四号1868年（明治元年）明治維新により神祇官が復活し、神道による国民教化が行われる。また太政官達である神仏判然令を始まりとする神仏分離も同時に進行する。1870年（明治3年）大教宣布の詔により、大教という概念が提起され、神道を宣教するために宣教使という制度が発足する。1872年（明治5年）、宣教使は廃止される。
マーティンの伯父第6代フェアファックス・オブ・カメロン卿トマス・フェアファックス（フェアファックス卿と呼ばれた）は、ノーザンネック領地払下げ地を所有しており、それは1719年にマーティンの曾祖父にあたる第2代コルペパー男爵トマス・コルペパーから承継したものだった。その領地はバージニアのノーザンネックの土地500万エーカー (20,000 km²) もあり、ポトマック川北支流の水源から西に広がる広大な土地だった。ノーザンネック領地は1649年に、イングランド王チャールズ2世から、その支持者7人に報償として与えられたものであり、1688年には再度公式の特許地となった。その7人の支持者の1人がコルペパー卿であり、1681年に全領地の所有権を取得し、その孫のフェアファックス卿がコルペパー卿の死のときに土地を承継した。フェアファックス卿は従兄のウィリアム・フェアファックス（1691年-1757年）を、ロバート・カーター1世に代わって、ノーザンネック領地の執事兼土地管理人として派遣した。ウィリアム・フェアファックスはこの役職をその死の1757年まで務めた。1750年、マーティンの叔父であるフェアファックス卿が、現在のクラーク郡ホワイトポスト近くに狩猟用プランテーションのグリーンウェイコートを設立し、自分でその領地を管理しようとした。フェアファックス卿は以前の1747年に、当時「ザ・クォーター」と呼ばれた私宅用地としてこの土地を取っておいた。従兄のウィリアム・フェアファックスが土地管理人として活動する間に、フェアファックス卿はその領地を管理する助けになる者をさらに求め、その任にあてられる者をイングランドの一族の中から探した。まず弟のロバート・フェアファックスを考え、続いて義兄弟であるデニー・マーティンを検討し、最後は1751年、21歳になる甥でデニー・マーティンの息子であるトマス・マーティンをその助手にすることに決めた。フェアファックス卿がマーティンを派遣するよう求め、マーティンはイングランドからウィリアム・フェアファックスに伴われ、1751年5月24日に「ハットリー号」に乗ってバージニアに到着した。ウィリアム・フェアファックスはイングランドでの役職指名を求めていた。マーティンとフェアファックスはウィリアムズバーグに到着し、そこでフェアファックスの仲間で植民地総督評議会委員であるジョン・ブレア・シニアと会食し、総督公邸と議会議事堂を訪れた後、5月31日にノーザンネックへの旅を始めた。マーティンはノーザンネック領地に到着すると、その秋に伯父のいるグリーンウェイコートに入った。マーティンは質素な育てられ方をしていたので、直ぐにグリーンウェイコートのフロンティアの生活に適応した。活力ある性格と忠誠心、さらに視力が良かった故に間もなくフェアファックス卿の気に入られ、近視だった伯父を大いに助けた。1752年5月21日、マーティンが21歳の誕生日を迎えて直ぐに、フェアファックス卿はその甥にグリーンウェイコートと、シェナンドー川西岸、リーズ・マナーの対岸の土地8,840エーカー (35.8 km²) を与えた。その土地は「グリーンウェイコートのマナーという名前で呼ばれることになり」、大天使セントミカエルの祝日に年間賃借料として「良き牡鹿と牝鹿」を献上することとされた。グリーンウェイコートは、ケントにあるカルペパー家の荘園からその名前を採っていた。マーティンは領地の管理についてより大きな役割を与えられることを望み、伯父に働きかけて、領地管理の再編成を行おうとした。フェアファックス卿はマーティンの提案に従い、1762年、領地運営の基地をそれまでのベルボアから北西に56マイル (90 km)、グリーンウェイコートであからさまに建設された土地事務所倉庫と古文書館に移した。この移転に先立ち、グリーンウェイコートでも小さな土地管理事務所が運営されていた。1757年にウィリアム・フェアファックスが死んだ後、その息子のジョージ・ウィリアム・フェアファックス（1729年-1787年）がその領地の執事と土地管理人を引き継いでいた。1762年、マーティンがフェアファックスの役目だった領地の執事と土地管理人を引き継いだ。マーティンがフェアファックスの仕事を継ぎ、土地管理事務所を移管したことと、マーティンがフェアファックス卿への影響力を増したことは、ジョージ・ウィリアム・フェアファックスの感情を害することになった。それはこの時代にフェアファックスが書いた手紙でも明らかである。フェアファックスとその妻、サリー・キャリー・フェアファックスは、アメリカ独立戦争に先立つ1773年にイングランドに戻り、その後は戻って来なかった。マーティンはグリーンウェイコートに住みながら、そこでの生活はより大きな邸宅を建設するまでの一時的なものと当初想定していたので、田舎の荘園よりも快適な宿舎を求めていた。1767年、マーティンはグリーンウェイコートでの更なる建設と改良の計画を策定した。「現状に留まり、彼らが留まりたいとする状態で...我々は城を建てる。大いに望んだ地の上ではなく、空中の城である」と記していた。マーティンの叔父であるロバート・フェアファックスがグリーンウェイコートの原始的生活について、「奇妙で野卑な人々の中で...あらゆる概念を超えている」と記していた。その後の30年間、フェアファックス卿が1781年に死ぬまで、マーティンはグリーンウェイコートに留まり、「自己追放」した伯父の寂しさと孤独を共有していた。マーティンはグリーンウェイコートで自立する一方で、農業の利益追求に関わった。1768年、マーティンはタバコのことを「我々の全てとなる」作物だと表現した。シェナンドー・バレーにいる他の多くの農園主や農夫と同様、マーティンは1792年までに小麦の栽培に移行しており、そのときイングランドの兄弟に宛てて「我々の小麦にそんな価格をつけるとは飢えているからなのか。農業は今や私の目的だ」と記した手紙を送っていた。