241年春正月、呉の零陵太守である殷札は、魏帝曹芳が非常に幼く即位してからまだ間もないことから、今が魏を征伐する絶好の機会であると呉帝孫権に進言し、以下のような計画を立案した。まず、荊州・揚州の民を徴兵し、強者を前線に送り老弱の者に後勤を命じる。それから蜀と連携を図り長安方面へ出兵させる。呉軍は諸葛瑾、朱然を襄陽へ、陸遜、朱異を寿春へ進軍させ、孫権自らも軍の指揮を執り淮河を北に進み青州・徐州へ侵攻する。襄陽や寿春を包囲し、長安以西も蜀軍の攻撃を受ければ、許昌や洛陽に動揺がうまれるであろう。その後、魏軍を四路のうち一路でも打ち破ることが出来れば戦線は崩壊して他の三路もやがて瓦解し、そこで更に攻勢をかければ中原一帯を平定するのは容易であろうというものであった。孫権は失敗したときの危険性を考慮してこの作戦自体は容れなかったが、魏への大規模出兵を決意するに至った。
ヘニパウイルスはパラミクソウイルス科に含まれる属で、ヘンドラウイルスとニパウイルスのふたつが特に知られている。ヘンドラウイルスはオオコウモリが自然宿主と考えられ、またニパウイルスはコウモリからの感染が示唆される症例が報告されている。
フィロウイルス属は、ヒトやサルで出血熱を起こすことで知られ、マールブルグウイルスやエボラウイルスが含まれる。マールブルグ・エボラ両ウイルスともコウモリ由来と考えられ、SARSコロナウイルスと並んでヒト-ヒト感染を起こすことで知られる。
齧歯類、トガリネズミで検出されるハンタウイルスは、2種のコウモリからも検出されている。Mouyassué virus (en) (MOUV) は、西アフリカ・コートジボワールの Mouyassué 村近くで捕まえられた Banana pipistrelle (en) （Neoromicia nana、アブラコウモリの近縁種）から単離された。マグボイ・ウイルスは、2011年に、シエラレオネのマグボイ川近くで捕獲されたミゾコウモリ科の Nycteris hispida（英: Hairy slit-faced bat）から単離された。どちらも1本鎖のマイナス鎖RNAウイルスでブニヤウイルス科に属している。
狂犬病ウイルスとリッサウイルスは、同じくラブドウイルス科に属する。狂犬病を媒介する哺乳類はコウモリだけでないが、コウモリがこの病気を伝播することは広く知られている。例えばアメリカ合衆国では、コウモリが狂犬病の感染源として最多であり、1997年から2006年までの死亡例19件の内、17件でコウモリが関係していた。但し、狂犬病による死亡例の原因としては、病名にも含まれる犬が圧倒的多数である（世界保健機関の統計では、ヒトに対する狂犬病伝播の99%が犬によるものである）。Arctic rabies virus (en) は、ホッキョクギツネをホストとして北極圏に広がっている。リッサウイルスもコウモリからの分離が報告されており、臨床症状も狂犬病ウイルスに似る。
2002年に起きた重症急性呼吸器症候群（SARS、原因はSARSコロナウイルス）のアウトブレイク、また2012年の中東呼吸器症候群（MERS、原因はMERSコロナウイルス）アウトブレイクは、追跡の結果コウモリが元々の原因だったと考えられている（但しコウモリからは遺伝子を検出したに留まっている）。コロナウイルスはプラス鎖の1本鎖RNAウイルスで、コロナウイルス亜科がアルファコロナウイルス、ベータコロナウイルス、ガンマコロナウイルス、デルタコロナウイルス (Alphacoronaviruses, betacoronaviruses, gammacoronaviruses, and deltacoronaviruses) の4属に分けられるが、このうちアルファとベータがコウモリ由来とされる。
ヒトにおいては、直接コウモリから感染して新興感染症を起こすことはまれで、間に家畜などの媒介動物を挟んだ上で流行を起こすと考えられている。また、現在ヒトで感染を起こしたことが確認されているウイルスは、全てRNAウイルスであることも指摘されている。
齧歯類もハンタウイルスなどを媒介することが知られているが、コウモリは飛行能力や渡り、就塒の関係で、齧歯類より広範囲に病気をばらまく可能性が高い。加えて、ある種のコウモリは人家の屋根裏をねぐらにすることを好み、そこから建物内へと入り込むこともある。一方の齧歯類は、コウモリよりは居場所が地理的に限定されており、ある季節地下の穴で冬眠したり、避難所として人家やその他の建物を利用する。また進化系列的に、コウモリの方がヒトにより近縁であることも原因として指摘されている。
コウモリのねぐら、生殖サイクル、移動、冬眠などの生活様式は、ウイルスに対する自然な感受性を生む原因だと考えられている。加えて、コウモリは他の哺乳類に比べ、ウイルスの持続感染率が高いことが知られている。この原因は、コウモリの抗体の半減期が短いためとされている。ヒトを初めとした他の哺乳類は多様な免疫機構を持っている一方で、コウモリは同じウイルスに再感染しやすいことも示されている。
第15シードで出場した2010年全仏オープンでは4回戦で第4シードのアンディ・マリーを倒し、ロビン・セーデリングとの準決勝まで勝ち上がった。結果は6-3, 3-6, 5-7, 6-3, 6-3で敗退したが、自身初となるグランドスラム4強入りを果たした。勢いに乗ったベルディハはウィンブルドン選手権で旋風を起こし、準々決勝、同選手権で6度の優勝を誇るロジャー・フェデラーを6-4, 3-6, 6-1, 6-4で破った。同大会で2年連続7度目の優勝を狙っていたロジャー・フェデラーが決勝進出を逃したのは8年ぶりだったこともあり、快挙を成し遂げたベルディハは大きな注目を集めた。次の準決勝で世界3位のノバク・ジョコビッチを破り、初の4大大会決勝進出を果たす。決勝戦、ラファエル・ナダルに3-6, 5-7, 4-6で敗退するが、チェコ勢として、1987年のイワン・レンドル（当時チェコスロバキア）以来、実に23年ぶりの決勝進出を果たした。全米オープンでは1回戦で敗退するなどシーズン後半は調子を落とした。2010年ATPレース・ランキングでグランドスラム準優勝、マスターズ1000準優勝など合計3755ポイント獲得し、世界第6位の成績で、トップ8選手による最終戦ATPワールドツアー・ファイナルに初出場を果たし、世界ランキングを自己最高の6位に上げた。