その後、時代はレコードからCDに移り変わる。まず『YAMATO2520』が展開されていた1995年頃、西崎監修の下で再カタログ化が試みられた。レコードで発売されていた音楽集がCD化され、それ以外の楽曲も「オリジナルBGMコレクション」（2005年頃にシリーズ30周年を記念して復刻）として発売された。その後、PlayStationでゲーム版ヤマトが展開されていた2000年頃、劇中使用曲を使用順に収録し、よりアニメ本編に沿ったサウンドトラック（つまり手軽に作品を振り返れるベスト盤）とすることをコンセプトにした「ETERNAL EDITION」シリーズが発売した。オリジナルBGMコレクションは言わばヤマト音楽の復活を目論んだものだったが、未収録曲の曲もいくつか残っていた。ETERNAL EDITIONはその補完もコンセプトの1つとしていたが、マスターテープが行方不明のままの曲もあったことから、またしても未収録曲が残ってしまった。ヤマト楽曲のコンプリートを目指す場合、それぞれのシリーズはコンセプトの違いから異なる長所と短所を備えることになり、どれか1つに絞って揃えればいいという状態にはならず、逆に全部揃える場合は曲の重複も多くあった。「YAMATO SOUND ALMANAC」は、上記2つのシリーズの特徴を融合させたシリーズであり、バラバラ状態のヤマト楽曲を1つの統一したシリーズとして商品化した。2009年の『宇宙戦艦ヤマト 復活篇』の折に行われた大規模発掘作業によってほぼ全てのマスターテープを発掘することに成功しており、本シリーズでは「未CD化アルバムのCD化」「廃盤となっていた音楽集CDの復刻」「本編で使用されたBGMの完全収録」を3大テーマとして掲げ、これまでの未収録曲まで網羅し、さらには他社発売のアルバムの復刻まで実現させた。このシリーズ1種で、ボーカル曲を除けばほぼ一通りの楽曲が揃えられる形となった。
『宇宙戦艦ヤマト』（1974年）から『宇宙戦艦ヤマト 完結編』（1983年）にかけて、「宇宙戦艦ヤマトシリーズ」各作品の放送・上映当時（初期作品は放送の数年後）に発売された音楽集などを「Blu-spec」仕様の高品質CDとして年代順に復刻するという「音楽年鑑」プロジェクトで、初CD化音源や初商品化音源も含まれる。元々は2014年10月にヤマトシリーズ40周年記念として発売することを意図していたものだったが、2012年からリメイク版アニメ作品『宇宙戦艦ヤマト2199』が始まったことに合わせ、前倒しでリリースされた。2012年7月より順次発売が開始され、ヤマトシリーズ放送開始40周年となる2014年までに全30タイトルが発売された。2015年10月28日、補完盤として『YAMATO SOUND ALMANAC 1974-1983 YAMATO MUSIC ADDENDUM』（CD3枚組）が発売。
『YAMATO SOUND ALMANAC』（ヤマト サウンド アルマナック）は、「宇宙戦艦ヤマトシリーズ」のテレビ版第1作（1974年）から劇場版『宇宙戦艦ヤマト 完結編』（1983年）までのために製作された劇伴音楽などを年代順に復刻するCDシリーズ。日本コロムビアより、2012年7月から2014年3月にかけて隔月発売された。2015年10月には、「YAMATO SOUND ALMANAC」シリーズに収録しきれなかった音源を収録した補完盤が発売されている。
クラビシュラーによる投稿でこの動画を知ったソーシャルメディアユーザーは、先を争うように動画全体に隠された暗号の解読を試みた。 DVDのメニュー画面に表示された題字は"11B-X-1371"と読むことができ、これが動画の名称として扱われるようになった。動画の音声について『International Business Times』のジェームズ・ビリングトンは、「何人かは『 "I would love to kill you"（お前を殺したい）』という言葉がずっと繰り返されているように聞こえると報告した」と書いた。一部のユーザーは動画の音声からスペクトログラムを作成し、そこに文字列と画像の両方が隠されていることを発見した。スペクトログラムには "You Are Already Dead"（もうお前は死んでいる）という平文が含まれていたが、これ以外の文字列は暗号化されていた。一方、スペクトログラムに表示された画像は切り裂かれ、拷問される複数の女性の写真だった。これによって動画の作者がシリアルキラーなのではないかという不安が引き起こされたが、後の検証によって写真の1枚がホラー映画『バニーゲーム』に由来するもので、同様に別の1枚がドイツ映画『スラッシャー』、さらに別の1枚はボストン絞殺魔事件の被害者写真であることが発覚したことでその懸念は払拭された。隠されたメッセージは概して脅迫的なトーンを帯びていた。DVDメニュー画面の音声スペクトログラムは、頭蓋骨の画像とさらなる暗号化されたメッセージを明らかにした。 "AETBX" が投稿した動画の2進数で書かれたタイトルは、スペイン語で「死」を意味する "Muerte" という言葉を示しており、同様に説明文は「あなたの時間は1年減った」を意味する "Te queda 1 año menos" というスペイン語の文章になった。動画の終盤に現れる三角形と四角形によるメッセージは、ピッグペン暗号でラテン語の文章 "Ad oppugnare homines" を示すものとして解読され、これは「人を攻撃または標的とすること」を意味していた。ペスト医師のコスチュームが登場することにより、一部の読者はこの動画に含まれる脅迫がバイオテロに関係していると解釈した。動画の暗号文のひとつは解読されることにより「鷲=感染者が病を広める。我々はアンチウイルス、国連を守る。」となり、別のひとつは「鷲の心臓を矢でつらぬけ」と解読されていた。さらに、1371という数字は黒死病がヨーロッパで猛威をふるった1371年を暗示しているとも指摘された。動画に挿入される映像は、モールス信号とほかの一般的な暗号文を含んでいることが明らかになっていた。動画で示されるモールス信号の平文は、"RED LIPS LIKE TENTH" というフレーズだった。さらに一連の、20組の2桁の文字列はワシントンD.C.のホワイトハウスの緯度・経度を示していることが判明した。その後、"RED LIPS" のフレーズは "KILL THE PRESIDENT"（大統領を殺せ）のアナグラムである可能性が指摘された。これらのメッセージはアメリカ合衆国全体に対する脅迫、ひいてはバラク・オバマ大統領に対する脅迫であると捉えられた。クラビシュラーは、動画に含まれる暗号のひとつが "STANDANDFIGHTWITHUSTAKEDOWNTHEBLACKBEASTKILLHISDISEASEORFALLWITHTHEREST" というメッセージに解読できることを報告し、ここで倒されるべき対象とされている "BLACKBEAST"（黒い獣）は、アフリカ系アメリカ人のオバマへの言及である可能性があると述べた。クラビシュラーは動画には政治的メッセージが含まれているものの、テロ攻撃の脅しなどではないとの見解を示した。2015年11月末、パーカー・ワーナー・ライトと称する人物が Twitter 上で「11B-X-1371」の作者として名乗り出た。その直後、ライトは動画の解読作業を続けている人々に対し「君たちはメッセージの理解には程遠い状態だ」と述べた。一方でライトは、暗号の解読のために人々が協力して作業することが自分の目的であったことを認め、「1人の個人にはすべてを解読することはできない」と述べた。