1980年代半ば以降、政策の矛盾、党内の腐敗の深刻化などによって、制度的革命党は左右両翼の反対勢力から挑戦を受け、その支配体制は徐々に揺らぎ始める。北部一帯では、右派野党の国民行動党 (PAN) の勢力が拡大し、一方で従来四分五裂していた左翼政党（一部は制度的革命党の支配体制に組み込まれていた）も、大同団結によって民主革命党（PRD）となり、支持率を拡大していった。1987年、前ミチョアカン州知事であったクアウテモク・カルデナスがカルロス・サリナスとの大統領候補指名争いに敗れて離党したことで、制度的革命党の支配体制の揺らぎは決定的なものとなる。カルデナスは、メキシコ史上もっとも尊敬される大統領の一人ラサロ・カルデナスの息子であり、党内左派の中心人物であった。彼と行動を共にして離党した党内左派グループと左翼政党を糾合して1988年の大統領選挙に臨み、実際の得票では制度的革命党のサリナス候補を上回ったのではないかと言われているが、大規模な選挙不正によってサリナス候補が当選、制度的革命党の支配体制はかろうじて維持された。その後、1994年の選挙でもサパティスタの武装蜂起とサリナス大統領をめぐる様々なスキャンダルにもかかわらず、かろうじて制度的革命党の政権は維持されたが、2000年の大統領選挙で右派のPAN出身のビセンテ・フォックスが当選し、同時に行われた国会議員選挙でも、上院で過半数を失い、下院では第1党の座もPANに明け渡し、71年間与党であった制度的革命党は野党に転落した。2006年の大統領選挙では選挙連合「中道連合」（緑の党<PVEM>が参加）を結成、前党首のロデルト・マドラッソを擁立したが、PANのフェリペ・カルデロンと左派連合（PRDを主体とする選挙連合）のロペス･オブラドール候補の狭間で伸び悩み、3位に留まった。同時に行われた下院選挙でもPANとPRDに次ぐ第3党に転落した。2009年7月の下院選挙ではカルデロン政権発足後における治安や経済の悪化によるPANへの批判票を集めて237議席（得票率39.55％）を獲得、第1党に返り咲いた。2012年7月の大統領選挙ではエンリケ・ペーニャ・ニエト候補を擁立、PRDのロペス･オブラドール候補に大差をつけて当選を確実にした。これにより12年ぶりの政権与党返り咲きを果たした。しかし2018年7月の総選挙では、新興左派政党の国民再生運動（国家再生運動、MORENA）のロペス・オブラドールが当選し、国民再生運動および連携する労働党（PT）・社会結集党（PES）の3党の合計得票率が上下両院とも40％を上回り最大勢力となった一方、制度的革命党は得票率が両院とも20％を下回り地方首長選挙でも左派候補が躍進するなど低迷し6年ぶりに野党へと転落した。
1781年にフェアファックス卿が死んだ後、マーティンは伯父の家の家政婦だったクロウフォード夫人を愛人とし、彼女との間に1人の娘をもうけた。クロウフォード夫人は暫く愛人のままだったが、数年後に死んだ。二人の間の娘はイギリスのフランシス・ゲルダート大尉と結婚した。しかし、その結婚から間もなく子供を残さずに死に、マーティンはゲルダートにグリーンウェイコートの土地1,000エーカー (4.0 km²) に多くの奴隷を付けて渡した。マーティンは娘の死後、グリーンウェイコートで家政婦としてベッツィ・パワーズを雇った。1798年、マーティンは未婚のまま死亡し、1794年7月24日付だった遺言は、1798年10月1日に証明された。その遺言書の中で、そのグリーンウェイコート荘園と隣接する土地1,000エーカー (4.0 km²) を家政婦のベッツィ・パワーズに遺贈した。パワーズは「その上の家屋、家財（食器と時計を除く）、家畜の馬、牛、羊、豚の半分、および選別した奴隷10人」も承継した。マーティンの姉妹の存命だったフランシス、シビラ、アンナ・スザンナが「金の全額、個人資産の残り」でパワーズに残されなかったものを受け取った。マーティンの遺言執行人それぞれが10ギニーを受け取った。マーティンはその資産の残りとグリーンウェイコートの土地1,000エーカー (4.0 km²) を、パワーズが彼より先に死んだ場合には、遺言執行人のガブリエル・ジョーンズ、ロバート・マッケイ、ジョン・シャーマン・ウッドコックに贈り、それを小分けして売却し、それから上がった利益をマーティンの姉妹たちに分けることとしていた。パワーズは、馬車、ハーネス、およびファルマスに近いスタフォード郡の土地160エーカー (0.65 km²) も受け取った。パワーズはマーティンの死後、W・カーナジーと結婚した。マーティンの兄デニー・フェアファックスは、高齢であることとアメリカへ移住できなかったために、アメリカの保有物を適切に保護し維持することができず、1797年8月30日付の譲渡証書でジェイムズ・マーカム・マーシャルに、「ダイバーの通った道の全て、土地の区画、バージニア州ノーザンネックの領地の一部や区画、前記のもの全てが持っている利益ある権利と権益の全てとともに」譲渡した。この譲渡によりフェアファックス家とマーティン家の領地における権益を停止させた。1799年、バージニア州議会はフェアファックスの残っていた土地についてマーシャルを法的受権者と認めた。ノーザンネックの領地は1806年に公式に解体され、バージニア州が再度その法的所有者となった。デニー・マーティン・フェアファックスが1800年に死んだ後も、ノーザンネックの領地をバージニア州が押収したことの合法性は、州と連邦の裁判所で争われ続けた。バージニア州最高裁判所は、領地の土地を州が押収し、権利を受けたことを支持した。その判決では、イギリスとのジェイ条約の条項は、この領地のことを問題にしていない、と論じた。1813年、アメリカ合衆国最高裁判所は、「フェアファックスの受遺者対ハンターの賃借人事件」に対するバージニア州最高裁判所の判決を審査し、条約は実際にこの論争に関わっており、審理を州最高裁判所に差し戻すと裁定した。バージニア州最高裁判所は、州の裁判所で発生した事件について連邦裁判所は権限を持っていないと裁定した。バージニア州最高裁判所がアメリカ合衆国最高裁判所の判断を拒否したことは、1816年に再度「マーティン対ハンターの賃借人事件」で審査された。アメリカ合衆国最高裁判所はバージニア州最高裁判所の判断を覆し、アメリカ合衆国憲法第3条で連邦法に関する事件では連邦裁判所が州の裁判所に対する司法権と権限を有することを認めていると裁定した。アメリカ合衆国最高裁判所長官のジョン・マーシャルは、彼自身と兄弟のジェイムズが以前にデニー・マーティン・フェアファックスと契約して論争のある領地の土地を購入していたので、「マーティン対ハンターの賃借人事件」の判断には加われないこととなった。