この地域は、モスクワ時間帯の標準時を使用している。時差はUTC+3時間で、夏時間はない。（2011年3月までは標準時がUTC+3、夏時間がUTC+4、同年3月から2014年10月までは通年UTC+4であった）
当初は2両とも米子運転所（現在の後藤総合車両所運用検修センター）に配置された。主に境線の普通列車と伯備線・山陰本線生山駅 - 伯耆大山駅 - 米子駅間の普通列車の一部に運用されていたが、2003年10月のダイヤ改正以降は定期運用から外れ予備車となっていた。しかし2004年8月ごろに、2両とも鳥取鉄道部西鳥取車両支部に転配された。本形式にはトイレがないため単独では運用せず、トイレ付きのキハ47形0番台とペアで2両編成を組み山陰本線浜坂駅 - 鳥取駅間の普通列車（浜坂方先頭車）として運用されていた。当初はアイボリー地に青帯を配した車体塗色であったが、後に「鯛」「水鳥」といったイラスト塗装とされ、さらに「鬼太郎と妖怪」の塗装に変化した。そして鳥取転属後の2004年に1002が、2005年1月に1001がそれぞれ朱色5号一色（首都圏色）に変更された。2010年3月13日のダイヤ改正で定期運用から退き、同年3月30日付で廃車・廃形式となった。このうち1001については津山まなびの鉄道館（旧津山機関区・扇形機関車庫）で静態保存されているが、1002は後藤総合車両所にて解体された。上記のとおり配置から廃車まで米子支社を離れることはなかった。客車として運用されたのは10年ほどであるが、気動車としては22年間運用されていた。
50系ではデッキと客室が分かれていたが、本形式ではワンマン運転に対応した構造とするため、デッキと客室の仕切り壁は取り除かれている。座席は種車よりもロングシートが増えているが、クロスシートも残っている。運転室は半室式で、低い位置に設けられている。両運転台構造となっている（1002の片方側にはJRのロゴは入っていない）。種車のオハ50形と同様、トイレは設けられていない。
台車・機器などの走行部分については、国鉄分割民営化前に北海道・四国・九州に配置されたキハ31形・キハ32形・キハ54形、あるいはそれと類似する各地の第三セクター鉄道の新製気動車とほぼ同様のものを使用している。エンジンは新潟鐵工所製DMF13HS (250PS) を1基搭載している。客車の車体を利用しているため同形のエンジンを搭載する他社の車両に比べて車体重量が大きく、重量あたりの出力はやや劣っている。台車は廃車発生品のDT22（動力台車）、TR51（付随台車）が用いられている。変速機も発生品のTC2A・DF115Aである。在来他車との併結が可能な構造であり、ブレーキ装置の関係から最高速度は95km/hとなっている。
オウシュウヤドリギは幹に対を成す長円形で凹凸のないふちの葉、また2から6個が密集した白い滑らかな液果をつけることから容易に見分けられる。アメリカヤドリギも似ているが、その葉はより短く幅広く、10個以上の果実が長めの塊を成す。様々な種類の樹木に寄生し、特に繁茂が激しい場合には宿主を枯らしてしまうこともあるが、通常は生長を阻害する程度に留まる。大部分のヤドリギは半寄生である。すなわち、常緑の葉を持ち自身で光合成を行うが、地面からのミネラルの供給は宿主に依存する。Arceuthobium 属（dwarf mistletoe, ビャクダン科）はそれすらも行わず、光合成と栄養素を宿主に依存する全寄生である。ほとんどの種について、繁殖は主に果実を食べる鳥による。ヨーロッパではヤドリギツグミ、北アメリカ南西部ではレンジャクモドキが媒介する鳥として知られる。日本では冬季にヒレンジャクやキレンジャクがこれに集まる。果実を食べた鳥が落とす排泄物が小枝に付着したり、果実をくわえて種子を搾り出したあと手近な枝でくちばしをぬぐったりすることによって種子が頒布される。種子は粘着質のガムであるビシン (viscin) で覆われており、これが固化することによって宿主となる樹木の樹皮に付着しやすくなっている。樹皮表面の種子は根を伸ばして発芽し、これが樹木の幹に侵入することで寄生する。歴史的には樹木を枯らす疫病のようなものであり、生育環境の価値を減ずるものとみなされていたが、近年では、考えられていた以上に生育している環境に影響を与える生物であり、生態系の要を担っているということが認識されるようになってきた。多種の動物がヤドリギの葉や新芽を食餌とすると同時に受粉や粘着質の果実の拡散を助ける。また、密集した常緑の葉は休憩や巣作りの場を提供する。ヤドリギ類に営巣する鳥としてニシアメリカフクロウ、マダラウミスズメ、オオキンカチョウ、ミツスイなどが知られる。実際にヤドリギに巣作りを行う鳥類は現在確認されているよりもずっと多いとされ、オーストラリアでは樹上に巣を作る240種以上の鳥はヤドリギに営巣することが知られており、これはオーストラリアに住む鳥類相の75%以上を占める。ヤドリギの量が多い地域はより多様な動物を揺籃することから、このような相互作用は生物の多様性に劇的な影響をもたらしているとされる。すなわちヤドリギは、疫病であるというよりも、むしろ生物多様性に良い効果をもたらし、森林に住まう多くの動物に品質の良い食料と環境を提供している。