時効成立後、三億円事件犯人を自称する人物が何人か登場している。テレビ等で事件が取り上げられることが多いのが原因で時期は事件発生時と同じ12月に集中している。なお、当時の担当刑事によると事件の際に発炎筒が通常通り点火しなかったが、犯人は通常とは異なる手法で発炎筒を点火させていることが遺留品から判明している。またジュラルミンケースには現金・ボーナス袋のほかにある特殊な「モノ」が入っていたという。発炎筒の特殊な点火手法やジュラルミンケースに留置された「モノ」は一般発表されておらず、捜査関係者と真犯人しか知らないはずである。
以下P。三億円事件から13年前の1955年に銀行員1人を仲間にしたり仲間の1人が刑事を装うなどして、東京都千代田区にある銀行の現金輸送車を襲う計画を仲間3人と実行。この事件ではすぐに逮捕されたものの計画性や発想が三億円事件と類似するものであった。Pは出所後に刑務所の中で知り合った友人に「今度は1年がかりで大きなことをやる」と豪語。三億円事件発生後に土地や住宅や外車を購入して金回りが良くなったため、容疑者として浮上。しかし、金回りに関しては、不動産会社から合法的な資金提供を受けたことが判明した。ハワイへ移住しマンション暮らしをしていたことがわかった。後にハワイで病死した。
1976年に、創業者である細野 昭雄の自宅ガレージにて創業。最初の仕事は福井県の繊維業者から発注された「オンライン織布工場管理システム」であった。社名のアイ・オー・データの「I-O」とはそれぞれデータ入力 (input) の「I」、出力 (output) の「O」に由来し、入出力を「I/O」と記述する事から、社名の中黒、ハイフンはスラッシュや省略という形で誤記される事が多い。コーポレートメッセージは「進化する明日へ Continue thinking」が掲げられている。一般にはシャープやNECの8ビットパソコンに対応した外部記憶装置、周辺機器の開発などから注目を浴びるようになり、HDDやMO、CD-RW、DVD-RAMドライブなどのストレージ機器やIDE、SCSI、USBなどのインターフェース部品、メモリーに比較的強い。また、NECのPC-9800シリーズが市場から姿を消した後も、長期に亘り対応機器を発売し続けたことでも知られる。PCメーカー各社の純正パーツのOEM、設計も行っている。かつてのマスコットは、三角帽をかぶった「マルチ君」と「メディアちゃん」。店頭のデモンストレーションや、カタログ、ローカルCMで姿を見ることが出来た。マルチメディアという言葉が持て囃されていたMicrosoft Windows 3.1から95の頃に活躍していた。その後森井ケンシロウによって描かれる、女子大学生のアイちゃんと、猫のオデッタを中心としたキャラクター群が公式キャラクターとなり、製品の活用例や、紹介が4コマ漫画やアニメーションとして掲載されていた。IODATAチャンネルで公開されている動画にも動画などがあり、主に台詞は噴出しで表記されていたが、音声入り動画ではオデッタを原田ひとみ、アイちゃんを平田真菜が演じていた。1999年（平成11年）には釈由美子を起用したMP3プレーヤーとしてHyperHydeのCMも放映されていた。2002年（平成14年）以降、更なる成長を目指しRec-ON、Rec-POTなどのハードディスクレコーダーや液晶テレビ、地上デジタル放送対応チューナーなど家電分野への進出も積極的である。2010年（平成22年）2月1日には同業のバッファローの親会社であるメルコホールディングス、デジオンと一般社団法人デジタルライフ推進協会を設立しパソコン周辺機器メーカーの立場から家電分野への影響力強化を狙っている。2013年からは、スマートフォンを意識した製品が増え、PC向け以外の製品の開発や販売が増えている。2013年（平成25年）1月、経営環境悪化を理由に80名の希望退職を募集。同社としては、初めてのことであり、その規模は、全従業員数の約14％に相当する。最終的に121名の削減が発表されている。2013年（平成25年）6月、コーポレートロゴ (CI) のリニューアルを発表。創業以来長らく使われてきた、青の長方形に白抜きのI-O DATAと描かれたロゴに対し、新しいロゴでは、フォントは丸くなり、文字色が紺、ハイフンに該当する部分がひし形で紫になっているほか、コーポレートメッセージである「進化する明日へ Continue thinking」が掲げられた。実際のロゴでは、コーポレートメッセージの位置や有無はレイアウトによって異なる。従来ロゴに対し、外枠を取り払い、丸みを帯びた字体には、顧客を含むすべての利害関係者との間に垣根の無い身近な存在であり、既存の枠組みに囚われることなく柔軟に進化し続ける企業でありたいという表現、ひし形になったIとOの間のシンボルは「心」をモチーフに、顧客のお客様の声に耳を傾け、それに応える製品作り（O：アウトプット）を行うための技術とアイデアを磨き続ける創業精神を示している。2013年7月の会計年度より、順次切り替えは行われる。2015年（平成27年）4月、ウェスタン・デジタルとの日本国内におけるWD社製の外付けハードディスク製品に関する販売代理店契約を締結。アイ・オー・データ機器ブランドの外付けHDDでは、録画向けなど日本固有の需要に特化した市場へ訴求し、WDブランドの外付けHDDは、Macユーザーに対してMac専用モデルの訴求や、高機能な付属アプリケーションなどの付加価値を重視するユーザーに訴求していきたいとしている。2017年（平成29年）2月、Embest Technology Co. Ltdとの代理店契約を締結。第1弾として「Raspberry Pi」及びそのオプション品など6商品の販売を2月中旬より開始する。2017年（平成29年）9月26日、創業者で現代表取締役社長の細野昭雄が代表取締役会長に、常務取締役事業戦略本部本部長兼プロジェクト推進室室長の濵田尚則が代表取締役社長兼事業戦略本部長兼プロジェクト推進室室長に就任。