ある日死因不明の遺体と遭遇した田口は、事件性無しと判断する警察にオートプシーイメージング（Autopsy imaging、Ai）を提言し、犯罪が見逃されるのを未然に防ぐ。一方白鳥は解剖率3％で残りの97％は死因が分からないまま闇に葬られている「死因不明社会」を打破するため、東城医大病院でAiセンター設立を進めていた。しかしAiを快く思わない警察庁と、法医学者である笹井の反対に遭い、更にAiの万能性を豪語して譲らない放射線科医・島津が両者と対立。センター運営会議は紛糾する。そんな中、Aiセンターに導入された新型の縦型MRIで連続殺人事件が発生する。警察の情報を管理しAiセンター潰しを目論むなど事件の裏で暗躍する斑鳩、業者との癒着を疑われる島津、20年前のDNA鑑定の不備が生んだ「松崎事件」と呼ばれる冤罪事件で心に暗い影を落とす笹井と北山、北山に忠義を尽くす宇佐見。事件の背景にそれぞれの思惑が交差する中、田口と白鳥は事件の調査に奔走し真相を紐解いていく。しかし、20年の時を超え「松崎事件」の因縁を呼び起こす女子高生殺人事件が発生。田口と白鳥は死因不明社会の闇の中へ逃れ続けていた真犯人を追及する。
コンビナート爆発炎上事故が発生し、救命救急センターのメンバー達が次々と運び込まれた患者の処置に当たってから数日後、患者が急変して死ぬという匿名の脅迫文が速水宛に送り込まれてくる。田口と白鳥も調査を開始するが、一人の患者が予告通りに急変し、以降も速水宛に送られた予告状通りに患者の容態は急変していく。犯人像として浮かび上がったのは速水に恨みを持つ者、あるいは救命救急センターから去ろうとする速水を留めさせたい者、そして速水と関わった過去の患者達。それぞれの可能性を追求しながら田口と白鳥は事件の謎に挑んでいく。
2011年1月2日の22時 - 23時30分に『ジェネラル・ルージュの凱旋』のスペシャルドラマとして放送された。内容は総集編ダイジェストを中心としたオリジナルストーリーとなっている。
東城医大病院の救命救急センターは「ジェネラル・ルージュ」と呼ばれる救命医・速水晃一によって束ねられていた。速水は天才で確かな腕を持つカリスマ的存在であったが、一方で患者の治療を優先するがために無理な要求でも押し通し、また手段を選ばない性格から、彼に不満や危機感を抱く者も少なくなかった。田口はある搬送患者に愚痴外来通院歴があったという偶然から救命救急センターに関わった結果、救急精神医療責任者に任命されてしまう。以後次々と運ばれてくる患者の病気の謎を救命医たちと共に究明しながら、患者や救命医たちの精神的なケアを行っていくことに。同じ頃、白鳥もまた抜き打ち監査のため救命救急センターにやってきていた。だが速水と医療代理店「メディカル・アソート」の社員・佐々木のただならぬ関係に気づいた白鳥は、監査後も患者と向き合う田口をフォローしつつも、速水の収賄疑惑を独自に調査する。
バチスタ・スキャンダルから9か月後、脳腫瘍患者の少年・岡部巧が、成功したはずの手術後に植物状態に陥った。巧の親族が訴訟を起こそうとする動きを懸念した院長の高階の依頼で、田口は再び白鳥とコンビを組んで内部調査をすることに。白鳥は早々に巧の執刀医の西園寺らと触発しながら調査を進めていくが、巧と同じ部屋に入院する少年・瑞人の父親が殺害される事件が発生する。
バチスタ・スキャンダルから3か月後、田口は不思議な病状を訴える一人の少女を診察していた。しかしその後病院を訪れた厚労省の人間に、半ば拉致同然で厚労省へと連れていかれてしまう。このことを知った白鳥は田口のもとへ急ごうとするが、ある人物によって彼もまた軟禁状態にされる。この一連の動きの裏には、白鳥の失脚を狙う厚労省内部の思惑が隠されていた。
2004年5月に、FEG主催で行われた「K-1 ROMANEX」を発展的終了させ、HERO'Sとしてリニューアルしたもの。大会名は、新たなヒーローを発掘する願いをこめたことから付けられた。前田日明がスーパーバイザーとして、マッチメイクやルール制定に関わっている。初期は、同じく前田がスーパーバイザーを務めていたビッグマウスが主催し、当時友好関係にあった谷川貞治率いるFEGが協力する形となっており、ビッグマウス社長の上井文彦が総合プロデューサーであった。FEGは当初、K-1に専念するとしていたが、前田がビッグマウスと袂を分かち、同社のスーパーバイザーを退任したことから、ビッグマウスはHERO'Sから撤退。FEGはその後、HERO'S実行委員会の中心として、運営役割を果たした。ジャッジとレフェリーは、和術慧舟會が中心となって運営しているJapan Totalfight Championship (JTC) から派遣された。ルールディレクターは和術慧舟會の磯野元、審判長は平直行が務めた。HERO'Sは登録商標となっており、商標権はK-1創始者の石井和義が保有している。2005年3月26日に旗揚げ戦を開催。当初は日本人を中心とした中量級路線と、K-1選手の総合格闘技進出を二本柱としてスタートした。同年、中量級世界最強決定トーナメントを開催。2006年8月5日の大会から、新たにライトヘビー級世界最強王者決定トーナメントがスタートした。「Road to Dynamite!!」をキャッチフレーズに、HERO'Sで活躍した選手を、FEGが主催しTBSが放送する大晦日開催の「K-1 PREMIUM Dynamite!!」に出場させている（トーナメントの決勝をK-1 PREMIUM Dynamite!!で行うなど）。HERO'Sとしては2007年まで開催された。ライバルの「PRIDE」が活動停止し、同年大晦日にPRIDEを運営していたドリームステージエンターテインメントの元スタッフとの共同開催興行「やれんのか! 大晦日! 2007」を開催したことから、この関係を発展させ、新たにFEG主催による後継イベント「DREAM」を2008年3月から開始した為、HERO'Sは終了した。冠スポンサーは、2005年と2006年はパチンコ・パチスロメーカーのサミー。2007年はパチスロメーカーのオリンピア。オリンピアは引き続き2009年まで、DREAMの冠スポンサーを継続した。HERO'S終了後、前田はDREAMには関わらず、自身がCEOを務めるリングスの興行「THE OUTSIDER」を旗揚げした。THE OUTSIDERの試合はHERO'Sに準ずるルールで行われている。