自著や下記のウェブサイトなどによると、高校卒業後に印刷会社に就職するも、上司の叱責に嫌気がさし2週間ほどで退社し、以降は車で寝泊りをしながら建設現場で日雇い労働に従事、そのうちホームレス状態に陥る。ゴミ漁りをしていたある日、他のホームレス男性から咎められたことをきっかけに発奮し運送会社に就職、そこで働くうちに請負業のヒントを得、1997年3月にエム・クルー社の前身となる『有限会社トラスティー』を創業。その後、2003年にフリーターやホームレス・刑務所等からの出所者の自立支援を目的として、東京・渋谷区に簡易宿所「レストボックス」を開設した2005年　「アントレプレナー・オブ・ザ・イヤーJAPAN」のスタートアップ部門に選出されたことが評価され、マスコミでも気鋭の社会企業家と持て囃された。2007年9月　自転車にて日本縦断をする。2007年10月　参議院臨時国会にて共産党小池議員より「ピンハネ暴利！竹中元総務相と親密」と指摘され、多くのマスコミより追及され、その後2009年4月(株)エム・クルー代表取締役を辞任。2009年12月　日本自動車連盟国内B級ライセンス取得。国内A級ライセンス取得。2010年9月　日本自動車連盟公認レース1000ccCUPに参戦し、国際C級ライセンスに昇格。2011年8月　国際ラリー「RALLY MONGOLIA」に参戦。半数近くがリタイヤする中3122.36kmをフル完走。2012年9月　自転車にてアメリカ大陸を横断する。2013年8月　国際自動車連盟公認「FIA ASIA CROSS COUNTRY RALLY 2013 タイ～ラオス区間」に参戦し完走、と国際ラリードライバーとして活躍。2014年10月　ミクロネシア連邦チューク州トラック諸島で、ウェイクボードにて世界最大級のトラック環礁150kmを滑り抜き、ギネス世界記録に承認される。2015年2月　マリンスポーツ専門誌「HOTWATER」にて特集される。2015年9月　外務省副大臣中山泰秀を表敬訪問する。2015年12月　ミクロネシア連邦政府から感謝の意をうけ表彰される。2016年10月　ミクロネシア連邦政府より観光親善大使に任命される。2017年3月　バイオエタノール燃料を使った車両にてオーストラリア縦断。その取り組みはNHKでも紹介される。2018年4月 日本セーリング連盟特別加盟団体日本カイトボード連盟理事に就任する。2019年4月 ノルウェーで行われたスノーカイト１５０キロレースRedBull Ragnarokスノーボードの部に日本人として初参戦。
東京府東京市浅草区（現在の東京都台東区浅草）に生まれ、のちに旧満州のハルピンへ一家で移住。第二次世界大戦敗戦後、日本へ引き揚げ、台東区立小学校内の引揚者住宅で育った。1954年、19歳で東京都立江北高等学校を卒業し、1956年に21歳で早稲田大学法学部に入学する。1960年、早稲田大学法学部を卒業。1963年、台東区議会議員選挙に出馬し、初当選を果たした。1965年、1期目の途中で台東区議を辞職。1969年、東京都議会議員選挙に台東区選挙区から出馬し、当選。自由民主党に所属した。1972年、都議会議員を辞職し、第33回衆議院議員総選挙に保守系無所属で旧東京8区（定数3）から出馬し、当選（当選同期に小泉純一郎・加藤紘一・山崎拓・石原慎太郎・村岡兼造・保岡興治・瓦力・三塚博・越智通雄・野田毅など）。のちに自民党に復党し、1976年の第34回衆議院議員総選挙では自民党公認で再選をめざしたが、ロッキード事件のあおりを受け次点で落選した。1979年の第35回衆議院議員総選挙では旧東京8区トップで返り咲きを果たす。1980年に労働政務次官、1982年に総理府総務副長官に就任。1990年、第2次海部内閣で郵政大臣に任命され、初入閣した。1993年、細川内閣の成立により、自民党は1955年の結党以来、初めて野党に転落した。深谷は予算委員会筆頭理事に就任し、同じく予算委員会の理事に就任した野中広務と共に予算委員会で細川内閣を追及し、1994年5月23日の質疑では、創価学会名誉会長の池田大作がローマ法王に宛てた親書が、連立与党である公明党を通じ、首相の羽田孜がイタリアを訪問した際に羽田によりバチカンに渡された疑惑を追及した。1995年、村山改造内閣で自治大臣兼国家公安委員会委員長に就任し、2度目の入閣。小選挙区比例代表並立制導入後初めて実施された1996年の第41回衆議院議員総選挙では、東京2区で旧民主党の鳩山邦夫に敗れたが、重複立候補していた比例東京ブロックで復活した。1998年、自由民主党総務会長に就任し、初めて党三役入りした。翌1999年、東京2区選出の鳩山邦夫が東京都知事選挙への出馬を表明し、衆議院議員を辞職。深谷は補欠選挙への出馬を模索するも、断念した（鳩山は石原慎太郎に敗れ、次点で落選した）。同年10月、小渕再改造内閣で通商産業大臣に就任。2000年の第42回衆議院議員総選挙では、東京2区で民主党の中山義活に敗れ、比例復活もならず、現職閣僚でありながら落選した。そのため投票日の翌日からパリで開かれるOECDの閣僚理事会への出席を急遽取り止め、経済企画庁長官の堺屋太一のみが出席した。2003年の第43回衆議院議員総選挙でも落選。落選後、東洋大学大学院経済学研究科客員教授に就任。2005年の第44回衆議院議員総選挙の大きな争点の1つであった郵政民営化に関しては、自民党の郵政相経験者である野田聖子、自見庄三郎、八代英太らが反対を唱えて離党する中、早々に賛意を表明し東京2区から自民党公認で出馬。民主党の中山義活に比例復活すら許さない大差をつけて圧勝し、5年ぶりに国政へ復帰した。なお、自民党の内規では小選挙区で2回連続で敗退し比例復活も出来なかった候補者は公認を受けられないが、特例で立候補が認められた。2007年の第21回参議院議員通常選挙では、東京都選挙区から出馬した保坂三蔵の選挙対策本部長を務めるが、保坂は次点で落選した。2008年自由民主党総裁選挙では、石原伸晃の推薦人代表を務める（石原は5人中4位で落選）。2009年の第45回衆議院議員総選挙では東京2区で中山義活に敗れ、落選。なお自民党は73歳以上の候補者の比例区への重複立候補を認めていなかったため、比例復活も実現しなかった。2012年6月22日、党公認の条件である支部長選任の年齢制限に抵触することから、次期総選挙には出馬せず、引退を表明した。深谷は「潮時だ。なすべきことをなした後は自ら身を引き、次の世代に渡すことが天の道だ」と述べた。