1945年1月15日、サンフィッシュは10回目の哨戒で東シナ海、黄海方面に向かった。しかし、2月20日に北緯38度16分 東経124度29分の地点で1,000トン級輸送船を発見して潜望鏡を操作していたところ、浮氷に接触して2本とも損傷したため哨戒を打ち切った。2月27日、サンフィッシュは37日間の行動を終えてグアムアプラ港に帰投。艦長がジョン・W・リード少佐（アナポリス1938年組）に代わった。3月31日、サンフィッシュは11回目の哨戒で日本近海に向かった。大湊に出入りする艦船の動向を監視していたが、4月9日に艦体にダメージを受ける。この日、サンフィッシュは北緯39度27分 東経142度05分の地点で近在の僚艦パーチー (USS Parche, SS-384) とともに艦船に接敵していたが、パーチーが第3号掃海艇を撃沈したのに続いてサンフィッシュは6,000トンから8,000トン級輸送船に対して魚雷を4本発射し、1本を目標に命中させたが、反撃を受けて備砲を損傷した。ダメージは大したことはなく、応急修理でしのいだ。4月14日には北緯41度48分 東経141度13分の地点で2,000トン級輸送船を発見し、魚雷3本を発射したが命中しなかった。4月16日、サンフィッシュは北緯39度36分 東経142度05分の岩手県とどヶ崎沖で小輸送船団を発見し、魚雷を6本発射。この攻撃で第73号海防艦と輸送船萬龍丸（拿捕船、元オランダ船バルウック、1,623トン）を撃沈した。3日後の4月19日未明には、北緯42度09分 東経142度20分の厚賀沖で、千島列島から北海道に移動する陸軍部隊を輸送中の特設砲艦快鳳丸（農林省、1,093トン。元特務艦剣崎）と輸送船大誠丸（大阪商船、1,948トン）の2隻を発見し、魚雷を6本と4本の計10本発射して両船に命中させた。三度目の攻撃で、止めに魚雷を1本だけ発射したものの、目標が停止していたにもかかわらず命中しなかった。しかし、目標は2隻とも沈没した。4月28日、サンフィッシュは29日間の行動を終えて真珠湾に帰投。2日後にメア・アイランド海軍造船所に向けて回航された。その後、同造船所で5月7日から7月31日までの間オーバーホールを受け、8月9日に真珠湾へ再び戻る。8月15日の終戦時、サンフィッシュは新たな哨戒の準備中であった。
天正5年（1577年）に元服。加冠の役を務めたのが織田信長で、信長から一字を賜り信基と名乗る。天正8年（1580年）に内大臣、天正13年（1585年）に左大臣となる。関白の位をめぐり二条昭実と口論（関白相論）となり、菊亭晴季の蠢動で、豊臣秀吉に関白就任の口実を与えた。秀吉が秀次に関白位を譲ったことに内心穏やかではなく、更に相論の原因を作り、一夜にして700年続いた摂関家の伝統を潰した人物として公家社会から孤立を深めた事に苦悩した信輔は、次第に「心の病」に悩まされるようになり、文禄元年（1592年）正月に左大臣を辞した。幼い頃から父と共に地方で過ごし、帰京後も公家よりも信長の小姓らと仲良くする機会が多かったために武士に憧れていたという。秀吉が朝鮮出兵の兵を起こすと、文禄元年（1592年）12月に自身も朝鮮半島に渡海するため肥前国名護屋城に赴いた。後陽成天皇はこれを危惧し、勅書を秀吉に賜って信尹の渡海をくい止めようと図った。廷臣としては余りに奔放な行動であり、更に菊亭晴季らが讒言したために天皇や秀吉の怒りを買い、文禄3年（1594年）4月に後陽成天皇の勅勘を蒙った。信尹は薩摩国の坊津に3年間配流となり、その間の事情を日記『三藐院記』に詳述した。京より45人の供を連れ、坊の御仮屋（現在の龍巌寺一帯）に滞在、諸所を散策、坊津八景（和歌に詠まれた双剣石一帯は国の名勝に指定）、枕崎・鹿籠八景等の和歌を詠んだ。地元に親しみ、書画を教え、豊祭殿（ほぜどん・毎年10月第3日曜日・小京都風十二冠女）の秋祭や御所言葉、都の文化を伝播。鹿児島の代表的民謡『繁栄節（はんやぶし）』の作者とも伝えられる。またこの時期書道に開眼したとされる。配流中の世話役であった御仮屋守噯（あつかい）・宮田但馬守宗義の子孫は「信」を代々の通字としている。現在、近衛屋敷跡は近衛公園となり、近衛文麿に依る碑も建立、手植えの藤は季節に花を咲かせる。遠い薩摩の暮らしは心細くもあった一方、島津義久から厚遇を受け、京に戻る頃には、もう1、2年いたい旨書状に残すほどであった。慶長元年（1596年）9月勅許が下り京都に戻る。慶長5年（1600年）9月、島津義弘の美濃・関ヶ原出陣に伴い、枕崎・鹿籠7代領主・喜入忠政（忠続・一所持格）も家臣を伴って従軍したが、9月15日に敗北し撤退を余儀なくされる。そこで京の信尹は密かに忠政・家臣らを庇護したため、一行は無事枕崎に戻ることができた。また島津義弘譜代の家臣・押川公近も義弘に従って撤退中にはぐれてしまったが、信尹邸に逃げ込んでその庇護を得、無事薩摩に帰国した。信尹の父・前久も薩摩下向を経験しており、関ヶ原で敗れた島津家と徳川家との交渉を仲介し、家康から所領安堵確約を取り付けた。慶長6年（1601年）、左大臣に復職。慶長10年（1605年）7月23日には念願の関白となる。翌11年11月11日に関白を鷹司信房に譲り辞するが、この頻繁な関白交代は秀吉以降滞った朝廷人事を回復させるためであった。慶長19年より大酒を原因とする病に罹っていたが、11月25日（1614年12月25日）に薨去、享年50。山城国（京都）東福寺に葬られる。信尹には庶子しかいなかったので、後陽成天皇第4皇子で信尹の異腹の妹・中和門院前子の産んだ二宮を後継に選び、近衛信尋を名乗り継がせ、自身の娘（母は家女房）を娶らせた。信尹は、先祖である藤原道長が記した『御堂関白記』寛弘5年12月20日（1009年1月18日）条の裏に、『後深心院関白記』（『愚管記』とも）を抜書し、自筆本のうちの5巻分を折状の状態にしている。この抜書を発見し、表紙の外題に、「裏信尹公手跡／自延文元至三年抜書」と書き付けたのは、嗣子の近衛信尋であったという。