発掘調査はムレイベットの居住史をI期からIV期の4期に分けており、放射性炭素年代測定によれば、ナトゥーフ期から先土器新石器時代B期の半ばまで、紀元前10200年から紀元前8000年に渡っている。IA期は紀元前10200年から紀元前9700年に渡り、ナトゥーフ人が居住していた。この時期の特徴は暖炉と調理用の穴だが、居住用の構造物は確認されていない。採集、あるいは一部栽培されていたと考えられる作物は大麦とライ麦であり、ごくわずかな数の鎌と臼が見つかっている。住人たちはガゼルとウマ科の動物を狩り、漁業も重要な位置を占めていた。彼らは犬を飼っており、ムレイベットにおいてはその証拠は間接的でしかないものの、村落の近くおよび同時代のテル・アブ・フレイラでは犬の骨が発見されている。I-B期およびII-A期、II-B期（紀元前9700年から紀元前9300年）はキアミア期（英語: Khiamian）であるとされるが、この時期についてはよくわかっておらず、ナトゥーフ期から先土器新石器時代A期への単なる移行期であるとの議論もある。ムレイベットはキアミア期の堆積物が考古学上の遺物と関連づけられる唯一の遺跡である。この時期の最も古い遺物はI-B期のもので、直径6メートルの円形の半地下の構造物が発見されている。これに続く時期には、これよりいくらか小さい円形の、地面に建てられた住居がいくつか発見されており、少なくともそれらのうちのいくつかは同時に利用されていた。壁は固められた土でできており、ときおり石を用いて強化されていた。暖炉と料理用の穴は建物の外にあり、採集された作物には大麦やライ麦、タデ属の植物が含まれる。採集用の鎌と作物をすりつぶす臼は過去に比べてより広く利用され、使用による摩耗を示しており、このことは穀物が居住者の食事として過去より重要な位置を占めていたことを示している。ムレイベットの動物相はII-B期の間に大きく変化し、発見された動物に関する廃棄物の70%をガゼルが占め、より小さい動物の重要性は低下したが、依然として漁業は重要であった。キアミア期の終わりに近づくにつれ、ガゼルの代わりにウマ科の動物の重要性が増していった。III-A期およびIII-B期（紀元前9300年から紀元前8600年）はムレイベット期であり、ムレイベット期は先土器新石器時代A期の一部とされている。建築物はより多様になり、長方形の、複数の貯蔵庫を持つ建築物が以前の時期において見られた円形の建築物の隣に存在した。壁は土を利用して作られ、葉巻状に加工された石が芯として用いられていた。一方で半地下構造も依然として利用されており、同時代のジェルフ・エル・アハマル（英語: Jerf el Ahmar）で発見された構造物との類似がみられる。ジェルフ・エル・アハマルでは同様の構造物は共同体のための何らかの機能を果たしていたと考えられている。長方形の構造物には多くの部屋があったが、それらは居住のためには小さすぎるため、貯蔵のためだけに利用されたと考えられている。暖炉と調理用の穴には石が利用されている一方、依然として建物の外にあった。III期では、大麦やライ麦、ヒトツブコムギが食用に利用されていた。いくつかの証拠が、これらの穀物が収集というよりも栽培されていたことを示している。以前よりウマ科の動物とオーロックスの狩猟の重要性が増し、ガゼルの重要性は低下した。この時期は魚に関する廃棄物も稀にしか見られない。分析によれば、骨器および石器を用いて獣皮が利用されていたことがわかっている。最後の居住期IV期は、IV-A期（紀元前8600年から紀元前8200年）とIV-B期（紀元前8200年から紀元前8000年）に分けられる。IV-A期においては建築物は発見されていない。穀物の栽培も確認されていないが、これはおそらくこの時期の考古学的資料がごくわずかしか採取されていないことによるものであると考えられている。狩猟の対象はもっぱらウマ科の動物であり、続いてオーロックスであった。家畜化された動物の利用の有無については明らかになっていない。IV-B期においては泥で作られた長方形の壁が発見されており、家畜化された羊とヤギが利用され、家畜化されたウシもおそらく存在した。
イニューディ（単数形は「イニュード」）は、中央の天井画（創世記の場面）9面のうち、5つの小画面の四隅を支える者としてミケランジェロが描いた、20名の筋肉質の男性裸体像である。これらの像は、ピンク色のリボン、緑色のクッション、大きな樫の実の花冠など、さまざまな物を持ち、あるいは身につけ、もたれかかっている。樫の実はミケランジェロのパトロンであるユリウス2世の家系（デッラ・ローヴェレ家）のシンボルであり、ラファエロ作のユリウス2世像の椅子の柱頭飾りにも用いられている。イニューディはすべて座るポーズであるが、前述のキリストの先祖たちの像とは異なり、のびのびとした姿勢で描かれている。各スパンドレルの上部に単色で表された一対の男性像および女性像が左右対称の同一ポーズを取るのに対し、イニューディたちのポーズは1体1体すべて異なっている。最初の頃に描かれた（入口に近い側の）イニューディは2体ずつがペアになり、バリエーションをつけつつも似たようなポーズをしている。バリエーションは後の方で描かれたものほど大きくなり、最後に描かれた4体（「光と闇の分離」の周囲に描かれる）では、各像のポーズには他の像との関連性が全くない。これらイニューディにおいては、ミケランジェロの解剖学と短縮法に対する習熟と、驚くべき創造力が天井画の他の像にもまして発揮されている。これらの裸体像が何を表しているかは、いまだによくわかっていないが、「人間は万物の基準である」という古代ギリシアの思想を受け入れた人文主義的発想に合致したものであることは確かである。これらの像の存在と、その裸体であることは多くの批評家の怒りを招いた。中でも教皇ハドリアヌス6世は、天井画を「裸体のごった煮だ」と評し、天井からはがしたいと考えていた。しかし、ミケランジェロは聖書に精通していた。彼は、熾天使（セラフィム）や智天使（ケルビム）は翼のある者として聖書に言及されているが、天使（エンジェル）はそうではなく、人間に似た者とされているという事実に気付いていたかもしれない。ミケランジェロが後に祭壇壁の『最後の審判』を描いた時、多くの（翼のない）天使を描いている。特にルネッタの、キリストの受難の象徴である十字架を運ぶ天使たちの場面がそうであり、死者を呼び起こすためにラッパを吹いたり、救われる者と呪われた者たちの名前が書かれた書物を示したり、罪ある者たちを地獄へ墜とそうとしている天使たちもいる。『最後の審判』には40体以上の天使が含まれるが、これらは皆、天井画のイニューディとよく似ている。イニューディについては「人間の完全性」よりは「天使」を表現したものと結論づけることが妥当である。それは、天井画の表す最大のメッセージは、人類の苦難と堕落ということだからである。つまり、神と人との約束の必要性を述べているのである。モーセを通じてのイスラエルの子らに対する古い約束（旧約）と、救世主イエスを通じての新しい約束（新約）については、すでに礼拝堂の側壁に描かれている。イニューディが実際に天使だとするならば、彼らは神のもとに常に仕える侍者であり使者であって、人類の運命を冷厳に見守り待ち受ける者たちなのである。