長野県松本市出身。旧制広島第一中学校（現・広島県立広島国泰寺高等学校）の上級生だった頃に、西洋絵画集を買いラファエロの大作『アテナイの学堂』プラトンとアリストテレスの部分を、切り取り部屋に飾った。北村透谷『ホメロス在りし時、プラトン在りし時、彼の北斗は今と同じき光芒を放てり』という美文とあいまって、第三高等学校 (旧制)の受験勉強の気休めにしていたのが、哲学への憧憬のはじまりだったと回想している。（著書『プラトンの哲学』あとがきより）1951年京都大学文学部哲学科卒業。在学中に知り合った梅原猛と橋本峰雄とは、同級生でこの頃より親交があった。1958年九州大学文学部助教授、1963年京都大学文学部助教授、1969年教授。1989年に定年退官後名誉教授、京都国立博物館館長を歴任した。また1986年から1998年まで松平千秋の後任で、日本西洋古典学会委員長（第5代）に就いていた。1993年紫綬褒章。1998年叙勲二等授瑞宝章。2004年没時に叙正四位。主要な著作は『藤澤令夫 著作集』（全7巻　岩波書店）に収めている。京都大学学術出版会「西洋古典叢書」の発足に寄与し、没時まで編集委員を務めた。没後の2005年に『イリソスのほとり　藤澤令夫先生献呈論文集』（内山勝利、中畑正志編　世界思想社）が刊行された。
六道絵の原形はインドにあり、アジャンター石窟群第17窟の「五趣生死輪」がその例とされる。この種の六道絵は西域を経て中国に達したと考えられている。西域ではトルファン近郊のベゼクリク千仏洞（中華人民共和国新疆ウイグル自治区）の壁画中に「六道輪廻図」がある。日本では浄土教が広まった平安時代以降、大衆教化の役割を兼ねて多数制作された。源信の『往生要集』（985年）は、仏教信仰の面のみならず、日本の文学や造形芸術にも多大な影響を与え、同書の「厭離穢土」（おんりえど）の記述に基づく六道絵が制作されるようになった。平安時代の作例は記録のうえでは多数みられるが、現存するものは少ない。鎌倉時代になると滋賀・聖衆来迎寺の『六道絵』（15幅）は『往生要集』「厭離穢土」に基づく絵画作品として著名である。承久本『北野天神縁起絵巻』（北野天満宮蔵）には僧・日蔵の六道巡りの説話が絵画化されている。鎌倉時代の六道絵には、六道の描写に加えて、目蓮救母説話のような地獄救済説話や、地蔵十王図を組み合わせたものがみられる。京都・禅林寺の『十界図』（2幅）、兵庫・極楽寺の『六道図』（3幅）などはその例である。室町時代には十界（六道に声聞界・縁覚界・菩薩界・仏界を加えたもの）と当麻曼荼羅信仰が融合した當麻寺奥院の『十界図』（六曲屏風一双）のような作品もつくられた。
5月7日、第四艦隊司令長官井上成美中将は、水上機部隊に「デボイネ南東165浬にある敵航母に蝕接を確保せよ」と命じ、MO機動部隊にはアメリカ軍機動部隊の撃滅を下令した。ラバウルの第四海軍航空隊第二十五航空戦隊からは一式陸上攻撃機3機、ツラギから横浜海軍航空隊の九七式飛行艇4機も加わり、珊瑚海の索敵を行った。MO機動部隊では、原少将が航空参謀の西方索敵案を却下し、南方重視の索敵を指示した。午前4時（06:00）、第五航空戦隊翔鶴と瑞鶴から偵察機12機（九七式艦上攻撃機各艦6機）が発進した。午前5時30分頃（07:30）、翔鶴偵察機2機（柴田飛曹長機、大竹 一飛曹機）がアメリカ軍空母、油槽艦、重巡洋艦発見を報告する。原少将は、自らの南方重視索敵が的中したことで勝利を確信したという。午前6時15分（08:08）、瑞鶴から嶋崎重和少佐率いる37機（零式艦上戦闘機9、九九式艦上爆撃機17、九七式艦上攻撃機11）が発進、翔鶴から高橋赫一少佐率いる41機（零戦9、九九艦爆19、九七艦攻13）、両艦合計78機が発進した。ところが翔鶴偵察機の報告はタンカーと空母の艦型を見間違えたことによる誤報であり、午前7時15分（09:15）前後にMO機動部隊第一次攻撃隊が到着した時、実際にいたのは空母ではなく駆逐艦シムスと給油艦ネオショーであった。日本軍攻撃隊はネオショーを放置し、幻のアメリカ軍機動部隊を求めて付近の捜索を行った。午前6時50分（08:50）、衣笠・古鷹偵察機より翔鶴偵察機の報告位置とは全く違う地点にサラトガ型航空母艦出現の情報が入った。MO機動部隊は、まず南方のアメリカ軍機動部隊を撃破し（ネオショーの誤認に気付いていない）、続いて西方のアメリカ軍機動部隊（第17任務部隊）を撃破するという方針をたてた。午前8時（10:00）、2機の翔鶴索敵機は自分達が発見した「航空母艦」の正体が「タンカー」であることに気付いた。翔鶴索敵機は午前8時35分（10:35）になって「わが蝕接せるは油槽船の誤り」と報告（第一報より3時間10分、艦爆隊到着より1時間33分後）した。MO機動部隊は恐慌に陥り、攻撃隊に帰投命令を出すと、西方のアメリカ軍機動部隊へ変針した。MO機動部隊第一次攻撃隊のうち雷撃隊は攻撃を行わず帰路につき、午前9時30分（11:30）九九式艦上爆撃機36機のみで急降下爆撃を行った。この攻撃でシムスが轟沈、ネオショーにはアメリカ軍記録直撃8発・至近弾8発があり、さらに被弾した瑞鶴隊1機が体当たりを行った。航行不能となったネオショーは漂流し、5月11日に駆逐艦ヘンレーによって処分された。翔鶴索敵機2機は母艦にたどりつけずインデスペンサブル礁に不時着、搭乗員6名は救助に向かった駆逐艦有明に収容された。MO機動部隊は九九艦爆2機、九七艦攻2機を失った。