7月に、ルワンダ愛国戦線がツチ系の保護を名目に全土を完全制圧し、大量のフツ系難民が発生した（大湖地域の難民危機）。7月19日、フツのパストゥール・ビジムングを大統領、ツチのポール・カガメを副大統領（のち大統領）とする新政権が発足。1994年末、国連ルワンダ支援団のロメオ・ダレール司令官が辞任。1995年4月22日、キベホ虐殺。同時期に、国連のガーリ事務総長は、ソマリア内戦への介入失敗（モガディシュの戦闘、1993年10月3日 - 10月4日）によりアメリカと対立し、さらに1995年初頭より国際支援が落ち込んで、キヴ州のゴマ（北キヴ州）などの難民キャンプに住む大量のフツ系難民が困窮する等で実務面の弱さを露呈したことから、1996年の事務総長選挙ではアメリカの拒否権発動によって再選を拒否された。1996年3月8日、国際連合ルワンダ支援団が活動を打ち切り。
1994年4月6日に、フツのジュベナール・ハビャリマナ大統領とブルンジのシプリアン・ンタリャミラ大統領とを乗せた飛行機が、何者か（「フツの過激派による犯行」と「ツチの犯行」の二説有り）に撃墜されたことに端を発して、フツ（インテラハムウェ、インプザムガンビ）によるツチの大量虐殺（ジェノサイド）が始まった（ルワンダ虐殺、en:List of massacres in Rwanda）。4月7日、アガート・ウィリンジイマナ首相と国連ルワンダ支援団のベルギー人とガーナ人の兵士が大統領警護隊により暗殺される。4月9日、ギコンド虐殺。4月15日、ニャルブイェ大虐殺。
1993年10月21日、隣国ブルンジのフツ系のンダダイエ大統領が暗殺されると、フツによるブルンジ虐殺が発生し、ブルンジ内戦（1993年 - 2008年）と呼ばれる報復合戦に突入した。
セント・キルダ群島は第三紀の火成岩地層、花崗岩や斑レイ岩から構成され、ひどく風化が進んでいる。群島は、海面下の海底台地からおよそ40m上昇している、遥か昔に消滅した輪火山の跡である。670ヘクタールの範囲の中で、ヒルタ島が群島最大の島で、群島の陸地面積78%以上を占める。次いで99ヘクタールのソアイ（英語でヒツジの島を意味する）、86ヘクタールのボーレー（英語で要塞化された島を意味する）である。ソアイはヒルタの0.5km北西にあり、ボーレーはヒルタの6km北東にある。群島には小島と、スタック・アン・アーミン（en）、スタック・リー（en）、スタック・レヴェニッシュ（en）といった海食柱がある。南西の季節風から湾の村を守る役割を持つダン島は、昔は自然のアーチでヒルタ島とつながっていた。マクリーンは、スペインの無敵艦隊敗北から逃れてきたガレオン船に当たってアーチが壊れたと示唆している（1972年）。しかしミッチェルやフレミングのような他の説においては、より信頼できる（ロマン的要素は少ない）説明を掲示している。アーチは単に、毎年冬に島々を打ちのめす複数の嵐の一つにさらわれたのだとしている。群島の最高地点は、ヒルタ島にあるコナシェア（Conachair、信号を意味する）で、村のすぐ北にあり、標高は430mである。南東にあるOisevalは標高290m、そしてコナシェアの真西にあるMullach Mòrは361mである。西側の崖に面したRuivalは137m、Mullach Biは358mである。ボーレーは384mに達し、ソアイは378mである。他には見られないスタック・アン・アーミンの海食柱は、高さ196mであり、スタック・リーは高さ172mで、これらはブリテン諸島内最大級の海食柱となっている。現在のセント・キルダ群島唯一の定住地は、ヒルタ島にあるベイ村（スコットランド・ゲール語: Bàgh a' Bhaile/och Hiort）である。ヒルタ北岸のGleann Mòrとボーレー島の定住地は、ごく初期に定住した跡である。ヴィレッジ湾に入ってヒルタに海側から接近すると、標高の高い丘陵に挟まれた半円形の小さな定住地が指し示される。これはベイ村だと誤解を招く恐れがある 。コナシェアの北面全体は最大427mの高さの、海へ向かって切り立った崖で、ブリテン諸島内で最も高い海食崖である。群島は、ブリテン諸島内で最も壮観な海食崖の多くある場所である。バクスターとクラムリーは1988年に、セント・キルダは「神がかつて狂気の中で生み出した、華美で豪華な景観は不必要であるとすべてを怒った、神の不完全な貯蔵物である。島々は本土の腐敗した影響から100マイルの大西洋上に孤立して、最西端の島々からさらに40マイル西に、無作為に散らばった。神は自分にとって最良の部分を保存し、狂気の証しとして周囲に島々の一区画を織り上げた。」と示唆している。セント・キルダは最も近い陸地から64km離れている。およそ129km彼方にある、スカイ島のCuillinの山頂尾根からに限って見えるほどの遠さである。気候は、雨の多い海洋性気候である。雨は1400ミリに達し、湿度が高い。気温は総じて冷涼で1月の平均気温は5.6℃、7月の平均気温は11.8℃である。冬には特に季節風が強く、南からと南西から吹く。風速は平均時速13kmになり、時間の85%吹き荒れる。さらに時速24km以上の風が時間の30%を占めている。強風は1年で時間のうち2%未満発生するが、時速185kmの突風や、さらに速い風が定期的に発生する。時速209kmの風が時折海面近くで記録されている。干満の差は2.9mで、海のうねりが5mにまで頻発する。このために一年中どんなときも上陸が困難であったり不可能であったりするのである。しかし、海洋の存在が島々を雪から守っている。降雪は年間わずか10日間ほどしかない。セント・キルダが遠隔地であることと、海洋性気候は、イギリス国内にある数少ない離島、フラナン諸島、ノース・ロナ島、Sula Sgeir（en）、アウター・ヘブリディーズの南端にあるビショップ島と一致する。行政上、セント・キルダは歴史的なインヴァネス・シャイア、ハリス島のシビル・パリッシュに属する。現在はユニタリー・オーソリティー（en）であるComhairle nan Eilean Siarに属している。