CTAは、シカゴ市の公営企業として、1947年10月1日に事業を開始した。事業開始にあたり、CTAはシカゴ市内とその近郊で高架鉄道を運営していたシカゴ・ラピッドトランジット・カンパニー社と路面電車を運営していたシカゴ・サーフェス・ライン社の2社の資産を買収し、路線網を整備した。この買収に関しては、1800年代後半から1900年代前半にかけて、アメリカでは民間資本によるバスや地下鉄、路面電車などの公共交通機関の整備が相次いで行われたが、第二次世界大戦後、これらの民間事業者の多くが、資金面での問題やモータリゼーション進展により、経営難に悩まされるようになったという経緯がある。この経営難に関しては、CRTなども例外ではなく、CSLに至っては破産に追い込まれてしまった。この状況を受けて、シカゴ市とイリノイ州の議会は、シカゴの公共交通を担う3つの異なるシステムを統合し、これを公営企業として運営することに同意し、その結果誕生したのがCTAである。1952年、CTAはシカゴ・モーターコーチ・カンパニーの資産を買収し、バス事業を傘下に収めたことで、今日の事業形態が築かれた。ちなみに、この時買収したシカゴ・モーターコーチカンパニーは、イエローキャブの創始者として知られているジョン・D・ハーツ（John D. Hertz）の支配下にあった企業である。1984年、シカゴ・オヘア国際空港への乗入開始。1993年、鉄道"L"の路線名が色別に変更される。シカゴ・ミッドウェー国際空港への乗入開始。1997年、乗車用磁気式カード(後述のトランジットカード)の導入開始。2006年、鉄道"L"のピンクライン(Pink Line)開通。2013年、それまでのシカゴカードおよびトランジットカードを置き換える形で非接触ICカード、「Ventra」が導入された。
経営に関しては、直接には市長から任命された公社総裁（President）があたっている他、シカゴ都市圏の交通政策を決定するシカゴ交通委員会（Chicago Transit Board）が政策面でのサポートを行っている。2009年7月現在、総裁はリチャード・ロドリゲス（Richard Rodriguez）、また交通委員会委員長(Chairman)はキャロル・ブラウン（Carole Brown）が務めている。CTAは資金面でも行政のサポートを受けている。CTAは、運賃収入や広告収入などの事業収入の他に、地域交通局(Regional Transportation Authority(RTA))から補助金を受けている。RTAは、RTA法という法律に基づいた公的機関であり、イリノイ州北東部の3つの公共交通機関(CTA、メトラ(Metra)、Paceバス)を財務面で支援すると共に運営を監視する任務を負っている。2006年の報告によれば、CTAは事業コストのうち53％を自身の事業収入で賄っており、RTAから受けている補助金の総額は5億2,400万ドルである。このうちの4億7,950万ドルには、シカゴ地区で徴収された売上税の一部が充てられている。
シカゴ交通局(Chicago Transit Authority, CTA)は、アメリカ合衆国イリノイ州シカゴ市内とその近郊において公共交通機関を運営する公営企業。"シカゴ・L"として知られる高架鉄道及び地下鉄とバスを運営している。
大きな夢を叶えた直後の元日、メンバーは国立競技場を訪れ、同所でライブを行うことを次の目標として宣言した。しかし、大きな試練にも直面する。国際的なロックフェス『Ozzfest Japan』に出演が決まった際、過去同様のラインナップを期待していた一部のヘヴィメタルファンの不満が爆発し、プロモーターへの批判が殺到し、当日はももクロファン必須アイテムであるペンライトの持ち込みが禁止された。だが、メンバーはあえてアイドル然とした衣装を身にまとってステージに登場。リーダーの百田夏菜子が「見てから決めろー! 今、目の前にいる私たちがアイドルだ! 今、目の前にいる私たちが週末ヒロイン ももいろクローバーZだ!」と叫びライブがスタートした。ロック雑誌『ロッキング・オン』は、当日の様子を「ライヴがはじまる前から歓迎ムードしか感じられない」とし、NARASAKI（COALTAR OF THE DEEPERS）と和嶋慎治（人間椅子）を従えていたため「ややオズフェスに寄り添っているように見えたかもしれない」としながら「彼女たちの全てを巻き込めるキャパシティを再確認させられたような気がしてならない」と取り上げるなど、心配されていた混乱も起こらなかった。挑戦的なライブも数多く行われた。2ndアルバム『5TH DIMENSION』を発売すると、メンバーが覆面の状態でトークもなしという趣旨のもと『「5TH DIMENSION」ツアー』を開催。仏教の“輪廻転生”の世界観を描いた『「GOUNN」ツアー』も行った。『ももクロ春の一大事2013 西武ドーム大会』からは、武部聡志の率いる「ダウンタウンももクロバンド」を導入し、これ以降の大規模公演では生演奏でライブが進行するようになった。夏に単独の女性アーティストとしては初となる横浜国際総合競技場（日産スタジアム）でのライブを開催し、6万人を動員（ももクロ夏のバカ騒ぎ WORLD SUMMER DIVE）。冠番組『ももクロChan』の地上波放送がスタートするなど人気が拡大した。だが時に、思わぬ形でバッシングを受けることもあった。社会学者・古市憲寿の著書『誰も戦争を教えてくれなかった』に収録された巻末対談にメンバーがゲストとして参加し、日韓関係・太平洋戦争などの話題に言及。「もっとちゃんと韓国の言い分も知りたい。歴史のこととか」などと発言をし、これがネット上に取り上げられ、いわゆる炎上状態となった。アイドルに政治的発言をさせ、政治利用したとしてマネージャーの川上アキラに批判が集まる一方、対談全体を読めば自然な発言であったと擁護する声もあった。川上は「ももクロは全く反日でも親韓でもありません」「面白おかしく書かれる隙を作ってしまったのは自分のミス」とマネジメントの反省点を挙げた。一方で明るい話題も多く、この年からグループと宮城県女川町の交流がスタート。東日本大震災後に設立された臨時災害放送局・女川さいがいFMで、同世代の女子高校生がパーソナリティとして活動していることを高城れにが知り、「行ってみたい」と提案したのがきっかけ。5月15日に初訪問し番組に出演後、女川小学校を訪問しサプライズライブも開催。その後も、継続的に同町を訪問することになる。迎えた年末、『ももいろクリスマス2013』にて、夢の“国立競技場ライブ”が翌春に実現することが発表され、メンバーはステージで泣き崩れた。