秋田県北部では鎌倉時代以降土着した小領主を常陸に転封し、代わりに佐竹氏（久保田藩）が入った。最上氏改易（1622年）後には酒井氏（庄内藩）・鳥居氏（山形藩）・戸沢氏（新庄藩）・能見松平家（上山藩）が入ったが、山形藩の入れ替わりは激しかった。山形藩の領地は天領に組み込まれ、尾花沢・長瀞・寒河江、柴橋などの代官陣屋が置かれた。戊辰戦争時には奥羽越列藩同盟に加わり旧幕府方についたが、佐竹氏が直後に離反すると庄内藩・南部藩が攻め込み秋田戦争を引き起こした。久保田城付近まで攻め込むが、会津藩・米沢藩・仙台藩が降伏する中撤退を決断し降伏した。
会津征伐のため北上した徳川家康は下野小山で石田三成挙兵の報に接し、反転西上を開始する。また、山形に集結していた東軍に属する東北地方の領主らも、自領へ引き上げてしまう。孤立を恐れた最上氏は上杉氏との和議を模索するが、上杉氏庄内領への侵攻計画が露呈し上杉氏は最上氏領への侵攻を開始する。直江兼続率いる上杉軍は最上氏の拠点を多数落とすが長谷堂城攻略中に西軍敗北の報に接し退却を開始、最上義光自らによる追撃戦が展開される。上杉氏を置賜地方へ駆逐した最上氏は、村山地方、最上地方の拠点を取戻し、翌年3月までに奥州仕置以降上杉領となっていた庄内地方の奪還にも成功する。この結果、最上氏は出羽国に57万石ともされる領地を得る一方、最上氏の讒訴を受けた秋田氏は転封、西軍に付いた小野寺氏は改易となった。なお、陸奥国の大名伊達氏が関ヶ原の戦いに際し、徳川家康と「百万石のお墨付き」とされる約定を交わし、旧領である長井（置賜地方）他7郡の回復を望んだが、南部領内での扇動（和賀合戦）と合戦の直前に伊達氏と上杉氏が和議を結んだことが家康の疑念を生み、約定は果たされなかった。
出羽国南部では、伊達稙宗が最上義定との戦いに勝利すると妹を嫁がせ優位に和議を結び、義定が継嗣を残さず死去すると妹を介して影響力を強めた。最上の諸将が反発すると最上領に侵攻し、最上氏の傀儡化に成功するなど村山地方全域にまで影響力を広げた。大宝寺氏は庄内地方で勢力を広げ全盛期を築き、安東氏は秋田県北部、小野寺氏は仙北から最上地方への進出を果たした。しかし、伊達氏において天文の乱が発生すると最上氏が介入して独立を果たし、最上氏で天正最上の乱が起こると逆に伊達氏が介入し激しく争った。両氏の間で和議が成立すると最上氏は村山地方・最上地方・庄内地方に順次勢力を拡大し在地勢力を駆逐・懐柔していった。最上氏と大宝寺氏が争うと大宝寺は越後の上杉氏を頼ったが、家臣の謀反により庄内地方は最上氏の支配下に入る。その後大宝寺義勝を奉じた本庄繁長により奪取されることになる(十五里ヶ原の戦い)。この戦いは、惣無事令違反であったが、上杉氏が豊臣政権内で有力な立場であったことから奥州仕置の結果上杉氏の領地となった。また、この奥州仕置によって伊達氏は置賜地方を失い、代わりに蒲生氏が入った。蒲生氏郷が早世した後、上杉氏家臣直江兼続が置賜地方を有し関ヶ原の戦いを迎えた。一方、出羽北部では秋田氏が下国家と湊家を統合して勢力を強めたが安東愛季が死去すると後継者争いが発生し、これが惣無事令違反と見做され大幅に領地を減らされた。小野寺氏、戸沢氏も所領を安堵されたが、仙北・由利地方で仙北一揆が発生し小野寺氏は減封された。
カトリーヌがローマを訪れた際にヴェネツィア大使は「小柄で痩せており、顔立ちに優美さはなく、またメディチ家特有の突き出た目をしている」と述べている。カトリーヌは従兄のイポリットと恋仲になっていたが、教皇クレメンス7世は野心家の彼を退けて別の婿を探した。ウルビーノ公デッラ・ローヴェレ、ミラノ公フランチェスコ2世・スフォルツァなど数多くの求婚者がいたが、1533年初めにフランソワ1世が次男オルレアン公アンリとの縁談を持ちかけると教皇クレメンス7世はこれに同意した。教会の出身者の姪であったが、メディチ家の出身のカトリーヌとフランス王族との結婚は不釣り合いと見られた。反対する意見もあったが、フランソワ1世はイタリア対策を重視してこれを押し切った。派手な装飾や贈答品によって誇示された盛大な結婚式は1533年10月28日にマルセイユで挙行された。アンリ王子はカトリーヌのためにダンスと馬上槍試合を披露している。その深夜、14歳の夫婦は婚姻を遂行するために結婚舞踏会を辞した。アンリは父フランソワ1世に伴われて寝室に現れ、フランソワ1世は婚姻が完了するまでそこで見届けたとされる。彼は「二人は馬上槍試合の如き勇気を示した」と述べている。教皇クレメンス7世は翌朝に新郎新婦の元を訪れ、婚姻が成し遂げられたことを祝福した。結婚した最初の年、カトリーヌは夫とほとんど会うことはなかったが、宮廷の女性たちは彼女を丁重に扱い、その知性と好意を得るための熱心さに感銘を受けている。ところが、1534年9月25日に教皇クレメンス7世が死去するとフランス宮廷におけるカトリーヌの立場は悪化した。新教皇パウルス3世はフランスとの盟約を破棄し、先代クレメンス7世が約束した巨額の持参金の支払を拒否した。フランソワ1世は「この少女は素っ裸で私のところへ来た」（J'ai reçu la fille toute nue. ）と嘆いている。アンリ王子は妻であるカトリーヌに関心を示さず、愛人を持つようになった。結婚から最初の10年間、カトリーヌは子を産むことができなかった。一方、1537年にアンリの愛妾の一人フィリッパ・ドゥーチが女子を出産し、アンリはこの子を認知している。これによってアンリが子を成すことが証明され、カトリーヌへの圧力がより一層強まることになった。