『起工趣意書』には「其六井泉之事」として着工前から計画のあったことが窺われるが、実際に上水道に使うのは三大事業を待つことになった。『琵琶湖疏水（第2疏水）開削願書』 の「理由書」筆頭に挙げられ、「山紫水明」の地の井戸が実際には水質不良で水量も先の趣意書に見るように干天が続けば枯れるものであるので琵琶湖の水でこれを解決するほかないとした。蹴上浄水場は蹴上船溜と三条通をはさんで向いに建設された。現在は蹴上、新山科、松ヶ崎の浄水場が疏水から取水している（新山科は一部宇治川から）。
舟運については、開通から十数年は客貨とも大いに利用された。貨物では、大津からの下りは米・砂利・薪炭・木材・煉瓦など、伏見からの上りは薪炭などであった。しかし競合陸運（主として鉄道）の発展により衰退し、伏見行き下りは1935年にゼロとなり、大津行き上り貨物は1936年以降なくなった。伏見行き下りは第2次世界大戦中に運航が再開されたが、1948年（昭和23年）には蹴上インクラインも運転を停止した。最後となったのは、1951年（昭和26年）9月に大津から山科まで運ばれた4.5tの砂利であった。旅客は1891年（明治24年）に大津－蹴上の下りが1時間22分30秒で4銭、上りが2時間20分で5銭だった。並行する鉄道の京都－馬場が運賃上等50銭（往復75銭）、中等30銭（往復45銭）、下等15銭よりはるかに安く、馬車も8銭を6銭に値下げして競争したという。1911年（明治44年）には渡航およそ13万人を数えたが、翌年8月の京津電気軌道（現京阪京津線）の古川町－札ノ辻開業でおよそ4万7千人に減少した。1915年（大正4年）の京阪本線五条－三条の延長により電車で大津－京都市内－伏見が直結されると3万人台になり、唯一の渡航船会社、京近曳船は廃業した。戦後の1951年（昭和26年）に新会社が設立され屋形船が姿を現したが、同年冬の第1疏水取入口改造工事のため運航を停止した。昭和期最期の舟運は、大津から京都・山科への砂4.5トンの輸送であった。1959年（昭和34年）に伏見インクラインが、また翌年には蹴上インクラインから電気設備が撤去された。1963年（昭和38年）には四条－団栗の水面に駐車場が建設され、水運の機能は実質的に失われた。以後は生洲船や屋形船を使った料亭が見られたものの、2016年時点では観光目的の船が水面に浮かぶのみであった。一方で、2013年の京都・大津市長が船下りに試乗したことなどを機に本格的な観光船復活の機運が盛り上がり、2018年に観光船が大津-蹴上間で運航された。春季（3月29日-5月28日）と秋季（10月6日-11月28日）で、火曜・水曜を除く。運航までの経緯については#観光船運航構想参照。
公園がある滝野は、1879年（明治12年）に開拓使が札幌本府建設に伴う木材を求めるためにアシリベツ山器械場（厚別水車器械所）を設置したのが歴史の始まりである。器械場をとりまく人の出入りが多くて賑わっていたが、1890年（明治23年）頃に閉鎖となり部落は無人となる。1900年（明治33年）に豊平開拓功労者の阿部仁太郎が貸下げを受けると農地への開墾を目的とした開拓が始まる。しかし、冷害が多く交通の不便な地での開拓は困難を極め、移ってきた人々が再び離れてしまうことも多かった。戦後の1953年（昭和28年）になると、滝野周辺の土地がアメリカ軍演習場として接収された。1960年（昭和35年）、演習場跡地に農地を共同所有し収入を出資者の間で配当する「パイロットファーム」を開設、事務所や畜舎を置いて養豚や果樹を主体とする営農に努めたが、事業は不振を極め1960年代後半に解散となる。1971年（昭和46年）に札幌市は350ヘクタールの山野を取得、廃校となった滝野小学校校舎を活用した野外学習施設（札幌市滝野自然学園）を開設。1972年（昭和47年）には「札幌市青少年自然の村基本計画」を策定し、青少年の家、キャンプ場5カ所、ロッジ10棟などを計画、1976年（昭和51年）までにキャンプ場とロッジ5棟が完成して「ドンガバチョ村」と名づけられ、翌年以降「ドンガバ町」から「ドンガバ共和国」となるなど滝野は自然体験活動・レクリエーションエリアへと転換した。一方、同時期に北海道開発局は北海道における国営公園の適地選定を開始しており、1976年（昭和51年）に札幌市とともに「滝野大規模公園基本構想」を策定し、翌年に都市計画決定。これにより「札幌市青少年自然の村基本計画」は「滝野公園都市計画」へと発展した。1979年（昭和54年）から渓流ゾーンの整備に着手し、1983年（昭和58年）に渓流ゾーンの一部を供用して開園。以降、渓流ゾーンの残り部分及び歩くスキーコースを順次供用後、宿泊ゾーンの整備に着手して「札幌市青少年自然の村基本計画」にもあった札幌市青少年山の家やオートリゾート滝野を供用した。その後整備は中心ゾーンに移り、カントリーガーデン、こどもの谷、森のすみかを順次供用した。そして、滝野の森ゾーンの整備に着手して2010年（平成22年）に滝野の森ゾーン【西エリア】を供用し、国営滝野すずらん丘陵公園は全国のイ号国営公園の中で最初の全面開園となった。