生涯を通じて独身であり、もちろん妻子はいなかった。博多芸者を落籍して妾宅を構え、腹心の者にも絶対の秘密にしていたが、やがて水平社同人に妾の存在が露見して話題にされ「この問題の段になると主義主張の手前、何となく恥しそうな顔をするとの話があった」と伝えられる。甥の松本英一を養子として迎え、自身が創業した土建業松本組を継がせている。英一は治一郎の没後に参議院議員となった。英一の子・松本龍は元衆議院議員。その弟・松本優三は松本組社長。また、衆議院議員の楢崎弥之助は被差別部落出身ではなかったが治一郎の姪の長女と結婚。その息子が衆議院議員の楢崎欣弥である。治一郎の妹は井元麟之と結婚。野本武一の長女は井元の甥と結婚している。なお、治一郎の姪は松本組支配人の山田本蔵の妻。本蔵の妹が北原泰作の妻である。さらに、松本吉之助（全九州水平社の指導者、福岡県議会議員）の妻の叔父は柴田啓蔵（全九州水平社創立者のひとり）の父である。また松本吉之助の姉婿は花山清（全九州水平社創立者のひとりで福岡県議会議員）である。花山清の親類に全九州水平社の高丘松蔵がおり、松蔵の妻は松本治一郎の実妹である。
松本は生前、第10回部落解放委員会全国委員会会議（1955年8月27-28日）で大阪府連代表の錦織喜一から「松本天皇制を打倒しない限り、部落解放運動の民主化はありえない」と批判されたことがある。岡映もまた「正直言って私は戦後の松本委員長を見てきて、錦織と同じ気持ちにさせられていた。それは、たとえば関東地方を支配していた『エタ頭』弾左衛門をほうふつとさせ、今日の民主的な運動の指導者の人物像からはほど遠いものがあった。また、松本委員長自身も強調していた『人間による人間支配を打破する』ことが、組織内でも委員長自身によって踏み破られていることへの嫌悪感は、錦織喜一ならずとも、大会などでの横暴な場面を見るにつけたれもが抱いたのである」、「松本治一郎委員長は神格化され、水平運動における特等席、すなわち、彼が口汚く悪罵してきた天皇と同じ高御座（たかみくら）に座してきた」と述べている。
板付飛行場（今の福岡空港）の拡張を予想して周辺の土地を買占め、それを空港用地として国に貸し付けた。地権者の筆頭である松本一族らへの地代総額は年間80億円にも達するという。福岡空港の土地建物借料は日本全国の空港の中でも突出して高額であり、この結果、福岡空港は毎年67億円の赤字を出している。松本が空港建設に先立って周辺用地を買い占めたのは、彼が衆議院議員としての立場を利用し、空港建設計画に関する情報を事前に入手していたためとも指摘されている。
大連滞在当時、松本が「大日本国一等軍医監」を名乗って偽医者を続けていたことにつき、部落解放同盟は『松本治一郎伝』の中で「行く先々で近代的医療から見放された人々から歓迎され」たと記しているが、金静美は「もし、松本治一郎が、日本帝国主義者の中国侵略に批判的であったなら、『大日本国一等軍医監』と自称することはできなかっただろう」「松本は、日本侵略軍に所属する医者であるかのようにふるまい、中国民衆を『治療』し、金銭を得ていた。あやまった『医療』は、しばしば人命にかかわることがある。松本はなぜ、中国では、このような詐欺をおこない、日本ではおこなわなかったのだろうか」と松本の中に中国人に対する差別意識があると批判している。もっとも、松本自身は「私は打診、聴診はできないけれども、視診なら今でも自信がある」と後年自称していたという。なお日本の刑法上は、松本の行為は医師法違反ならびに詐欺罪（人体に有害な偽薬を投与したり外科手術を施したりしていれば傷害罪）にあたる。
試合は基本的にリアルタイムで進行。試合での操作はタッチペンで行い、適度なアクション操作が要求される。選手はある程度自動的に移動するが、必要な場合はタッチペンで任意に動かすことができ、一時的に時間を止めてから動作を予約することも可能。敵とボールの奪い合いになると時間が一時停止し、コマンドバトルに突入する。コマンドは、成功率が高いがボールをキープしにくいもの（ファウル率が高い）と、成功率は低いがボールをキープしやすいもの（ファウル率が低い）の二者択一を基本とし（例:ボールをキープしやすいキャッチと成功率が高いパンチング）または必殺技を選択し、これに加え能力が絡む。能力は必殺技を使うためのTP、体力を表すGP、シュートの威力やパス（スローイン）の距離が長くなるキック、相手からボールを奪って回したり、相手のシュートを止めるガード、相手のブロックを突破するためのボディ、パスやシュートの誤差が減るコントロール、選手の移動速度が上がるスピード、選手のGPの低下を抑えるスタミナ、相手のドリブルを防いだり、コマンドバトル以外でのボールの競り合いに必要なガッツに別れ、選択したコマンドと能力、属性相性（下記）を合計し、トータルテクニックが計算され、トータルテクニックが高い方がコマンドバトルに勝利する。また、ある程度のレベルの差があるとトータルテクニックが相手よりも高くてもコマンドバトルに敗北することもある。ミニゲームでは特定の条件を満たせばその場で勝利、正式な試合では試合終了時に自チームの得点が相手チームを上回っていれば勝利となる。同点の場合は敗北となる。選手や必殺技にはそれぞれ属性（風・林・火・山）が決まっており、敵選手の競り合い（コマンドバトル）や必殺技同士の激突の勝率が高くなる。属性の相性は風は山に強く、林は風に強く、火は林に強く、山は火に強い。コマンドバトル時に近くに同じ属性の選手が一人いればダブル、2人いればトリプルとなり、競り合いにより有利になる（最高3人）。そのほか選手と必殺技の属性が一致すれば威力が上昇する。一般的なサッカーゲームにあるイエロー・レッドカードの概念はなく、何度ファールをしても退場になることはない。そのため、ファールになりやすいが競り合いに強く威力の高い必殺技を連発して、相手選手のGPを削ぎ取る戦術も見られる。また、交代回数の制限もない。ただし、ペナルティエリア内で守備側のチームがファールをすると、通常のサッカーと同じようにペナルティキックが攻撃側に与えられる。