旧寮の老朽化に伴い2013年12月に完成し、2014年1月より利用が始まった。かつて複数の建物に分散していた寮の機能が全て一つの建物に集約され、利便性や安全性が大幅に向上した。食堂などの共用スペースが1階、生活スペースが2階から4階となっており、中学寮と高校寮は建物こそ同じものの、1階を除き内部で完全に区切られている。居室は旧寮と同じく中学が8人部屋、高校が個室となっており、中学高校共に各階自習室が設けられている。
遠方からの生徒は、寮・下宿で生活することになる。入寮生は毎年抽選で決まる（ほぼ全ての生徒が入寮できるが、人数の多い学年では定員の関係で抽選に溢れる生徒も増える）。校内に中学寮である松風寮と高校1,2年生向けの高校寮である東寮・西寮が設置されていたが、2013年12月、旧第2体育館跡地に新寮が完成した。全ての寮の機能は新寮舎に集約されることになる。
例年、東京大学をはじめとする首都圏の難関大学や、国公立大学医学部医学科（地元の九州大学や鹿児島大学が中心）に進学する学生が多い。特に、医学部医学科への進学数、進学率は全国でもトップクラスでもある。2018年度の合格者数は東京大学42名、京都大学10名、九州大学19名、慶應義塾大学30名、早稲田大学38名、国立医学部医学科85名である。
2018年に実施された第12回科学地理オリンピック日本選手権では本校の高校2年生が金メダルを受賞し、カナダのケベックで行われる国際地理オリンピック世界大会に日本代表4人の中の一員として派遣された。なお、この大会でメダルを受賞した64人のうち7人がラ・サール高校の生徒である。
全国高等学校クイズ選手権（通称、高校生クイズ）の常連校としても有名で、2013年8月現在全国大会出場回数は歴代2位の16回、全国大会決勝進出回数は5回と最多記録である。1993年の第13回大会で全国制覇を果たし、そして14年後の2007年の第27回大会で大会史上2校目となる2度目の全国制覇（14年ぶり2回目）を果たした（同大会では大会史上初の同一メンバーとして2年連続全国大会決勝進出）。このほか、第29回大会や第38回大会などで準優勝している。また、全国高校生金融経済クイズ選手権（エコノミクス甲子園）においても第1回（2006年度）および第4回（2009年度）で優勝している。
1888年（明治21年）2月、慶應義塾の英語教師経験をもち、英語雑誌を刊行していた米国人のフレデリック・イーストレイク（イーストレーキ）と慶應義塾出身の英学者磯辺弥一郎によって東京市神田区錦町3丁目（現在の千代田区神田錦町）に設立。当時、慶應義塾の人々が力を入れて推進していたのは、医学や英学であって実用英語ではなかった。これに不足を感じた磯辺が幹事に、イーストレーキが教頭となり、両人のほかに1名の教師を雇って開校した。初めは授業料も無く月謝も極めて安かった。苦学生のための夜間部も開校し、1906年（明治39年）には別科の中に数理化受験科を設立するまでに至った。開校2年のうちに会員総数は1700名を越え、日々出席する生徒は600人を数える盛況となったが、イーストレーキが収入面の不満から、退職して独立することを磯辺に通告、数百人の生徒を抱えるなか、退職わずか1週間ほど前の突然の通告であったため、急ぎ和田垣謙三、井上十吉に協力を仰ぎ、川田正澂、長沢市蔵、高橋五郎 (翻訳家)らを講師に招いて運営を続けた。イーストレーキの妻によると、退職はイーストレーキの意思ではなく、磯辺の策略により追い出されたとしている。第一高等学校をはじめとする高等学校、高等商業学校（東京高等商業学校→東京商科大学）、慶應義塾などの正規の学歴コースに乗れない者たちを対象とする学校であるにも拘らず、講師陣には高名な英語学者であるアーサー・ロイド（慶應義塾大学教授）、斎藤秀三郎（第一高等学校教授）、吉岡哲太郎（理学博士）、内藤明延、岡倉由三郎を迎えるなど講義の質が高く、人気を集めた。しかし、やがて磯辺と反目した斎藤は、1896年（明治29年）10月、国民英学会から分裂する形で、同じ神田錦町3丁目に正則英語学校を開校し、校長に就任。斎藤みずから教鞭を執った他、上田敏、戸川秋骨といった名講師を揃え、磯辺と別れて開校した英学校が不調に終わったイーストレイクもこれに加わった。1897年に国民英学会は神田錦町3丁目19番地に校舎を増築し、米国帰りの北島亘・リリアン夫妻らを講師に会話専修科を新設した。北島はハーバード大学神学校などで学び、米国でユニテリアンの牧師になった最初の日本人で、家庭教師をしていた岩崎小弥太の父・岩崎弥之助の縁故で日本銀行に入行したためほどなくして講師を辞したが、妻のリリアンは20年以上にわたって国民英学会で教えた。正則英語学校の出現で、国民英学会は勢いをそがれることとなったが、正則と並ぶ英学校としてその後の大正・昭和初期にかけても学問機関として存続し、1945年ごろまで活動していたことが確認できる。