1933年、陳は、僑務委員会を通じて親交を深めた蔡廷鍇の福建第19路軍（軍長・蔡）と福建人民革命政権（主席・李済深）のために福建省債の購入運動を推進し、国民政府に批判的な郷土の革新勢力を支援した。1940年2月には、NCRGAが援蒋ルートの物資輸送と公路補修のために派遣した奉仕団が国民政府官僚の酷使に耐えられず相次いで脱走していたことから、要員43名の派遣を中止した。1940年3月、NCRGAの祖国慰問団に参加。重慶で国民政府官僚の汚職・腐敗や献金が使途不明となっている実態を知って失望し、その後訪れた延安で、共産党の厳正な規律を賞賛し、同地で抗日宣伝工作をつづけていたアモイ大学の学生たちを激励した、とされる。
1929年、中国国民政府は、陳を中央僑務委員会の名誉顧問に任命し、1935年には学校教育振興の功労を表彰して勲二等に叙勲して、陳の支援を促していた。1936年に陳は、国民政府からの「南洋華僑による軍用機製造費の献納」要求に対して「蒋介石の生誕祝賀募金」の名目で募金総額を寄付。1937年には胡文虎とともに国民参政会の委員に任命された。1937年に日中戦争が始まると、シンガポールで祖国救援運動、特に籌賑会の活動を主導し、翌1938年8月15日にシンガポール華僑籌賑祖国難民大会（SCCRGA: Singapore Chinese China Relief General Association）を組織、国民政府からの勧告を受けてその年の10月10日に東南アジアの華僑代表が集まって結成された南洋華僑籌賑祖国難民総会（NCRGA: Nangyang Chinese Relief General Association: 南僑総会）の主席に選ばれた。籌賑会は救国公債の募集、難民救済のスローガンの下、中華総商会や各地の郷党会を通じて資金・物資を集め、援助資金・物資として中国の国民政府に送るとともに、英領マラヤで日貨排斥などの排日運動を展開し、抗日救援活動を続けた。陳は、英国政庁の僑務担当官ジョーダンの顧問となり、同担当官の補佐で福建人の孫崇瑜を通じて英植民地当局の「中国軍への軍事費援助にあたる募金運動は許可しない」「在留日本人との共存関係を損なう排日政治運動は許可しない」という行政方針に協力、募金の使途を難民救済のための社会福祉活動に限定し、シンガポールで活動する中国国民党支部やマラヤ共産党から距離を置き、1939年秋には欧州戦線の英軍傷病兵救済のためとして李光前の募金団体を通じて2万シンガポール・ドルを英国政庁に寄付するなどしてトーマス総督の信頼を保持し続け、英国政庁の弾圧を免れた。
1926年秋頃から華僑によるゴム業は次第に衰退し、欧州人のゴム園が増加、1929年からの世界恐慌によって需要が落ち込み、生産過剰によりゴムの価格は暴落、華僑ゴム業者の倒産が相次いだ。資本をゴム業に集中投下していた陳への打撃も大きく、またパイナップル工場の経営も行き詰まり、1933年2月に陳嘉庚公司は破産に至った。ゴム園経営が行き詰まると、陳はゴム園経営を陳六使と陳文確の兄弟に委ね、南洋華僑による祖国難民救済運動に注力するようになった。
昼航便運航にもかかわらず、旅客は依然夜航便に集中し、壱岐丸型では輸送力不足となったため、夜航便用客貨船として、旅客定員603名と大型化した高麗丸（こままる）（3028.51総トン）と新羅丸（3020.66総トン）を神戸の川崎造船所で建造し、1913年（大正2年）1月31日と4月5日に就航させた。この2隻の就航で、さくら丸と、再傭船していた薩摩丸の2隻の解傭はできたが、1912年（明治45年）6月から傭船中の日本赤十字社の病院船　弘済丸（2,589.86総トン）は引き続き傭船された。なお、うめが香丸は1912年（大正元年）9月23日、門司港停泊中暴風雨で浸水沈没していた。1913年（大正2年）10月1日には関釜連絡船、朝鮮鉄道、南満洲鉄道経由で日中連絡運輸が開始され、旅客は日々増加、1914年（大正3年）7月勃発の第一次世界大戦は、その後の大戦景気と、世界的な船腹不足による海運貨物の鉄道への転移を促し、鉄道連絡船航路であった関釜航路の貨物輸送量も急増した。このため、1916年（大正5年）以降は、傭船不足と傭船料高騰の中、常時3、4隻の傭船を運航し、主として貨物輸送に充てた。青函航路でもこの時期、同様に傭船不足の中、苦しい運航が続けられていたが、1916年（大正5年）4月に青函航路へ転出していた弘済丸が1917年（大正6年）10月3日から事故休航し、その代船として10月11日から10月27日まで対馬丸を急遽青函航路に助勤させていた。鉄道院経理局で石炭輸送をしていた多喜丸（載貨重量1,830トン　総トン数1,227.56トン）を1919年（大正8年）4月、貨物船転用のうえ関釜航路へ転属させてからは、 コレラ予防検疫停船による貨物輸送激減対策として、同年9月から山光丸（846総トン）を3か月間傭船した以外は、戦後恐慌の影響による貨物輸送量減少もあり、傭船は1918年（大正7年）4月から傭船中の日本赤十字社の病院船　博愛丸（2,614総トン）1隻のみとなった。