オウム真理教の教義は、元となっている宗教教義を誤って解釈したもの、意味を取り違えたもの、都合主義的な拡大解釈などが少なくない。しかし、密教を中心に原始仏教からキリスト教まで幅広い宗教から摂取して、オウム独自の体系化が図られたため、麻原の説教の録音テープや録画映像が、いまだに布教に用いられてアーレフの信者などに信奉されており、マスコミも折りにつけてそれを問題視した報道を行っている。
当初は、専らヨーガの手法を用いた修行が行われていた。その後、本来「秘技伝授」を意味する宗教用語であった「イニシエーション」という言葉を、オウム独自の「解脱者のエネルギーを伝授することで弟子を成就、解脱させる」という意味で使うことで信者を増やしていった。しかし一方で、麻原彰晃は終末思想を煽り、1994年前後には違法薬物や電気による様々な洗脳施策を取るようになった。
オウム真理教では、修行の内容を3種類または4種類に分けて説く。小乗（ヒナヤーナ）、大乗（マハーヤーナ）、真言秘密金剛乗/秘密真言金剛乗（タントラ・ヴァジラヤーナ）で、厳密に説かれるときはタントラヤーナとヴァジラヤーナを分ける。ここでは4つの修行体系に分けて述べる。ただし、顕教が大乗を説くのに対して密教は金剛乗（ヴァジラヤーナ）を説くことは多いが、通常の仏教語の定義とは異なる。
国土法違反事件の影響もあり、1991年（平成3年）〜1992年（平成4年）はホスゲンプラント計画や生物兵器開発などの教団武装化を中断、テレビや雑誌への出演や文化活動などに重点を置いた「マハーヤーナ」路線への転換を図った。だが1992年頃より、「宇宙衛星から電磁波攻撃を受けている」などといった麻原の妄想、幻聴が現れ始める。「シヴァ大神の示唆では仕方ないな」とつぶやき、「内なる声」が自らの進みたい道とは違うことに苦しみ始め「いっそ死んでしまいたい」と言ったのを3女麗華が聞いている。麗華は麻原を統合失調症などの精神疾患に罹患していたのではないかと推測している。
1988年（昭和63年）、在家信者死亡事件が発生。麻原は「いよいよこれはヴァジラヤーナに入れというシヴァ神の示唆だな」とつぶやいたという。隠蔽のため、1989年（平成元年）には男性信者殺害事件を起こし殺人に手を染める。
1989年の参院選でマドンナ旋風が沸き起こったことから、1990年2月に行われる衆院選に、当初麻原は石井久子をはじめとした女性信者を出馬させる構想を立てたが、その後麻原自身が徳によって政を行い、地上に真理を広めるために1990年（平成2年）には真理党を結成して第39回衆議院議員総選挙へ麻原と信者24人 が集団立候補。選挙に立候補するかどうかはオウムとしては珍しく幹部による多数決が採られた。結果は10:2で賛成派が勝利。反対した2人は上祐史浩と岐部哲也であった。しかし結果は惨敗し、当時立候補者1人あたり200万円だった供託金として計5,000万円が没収される。
宗教法人に適用される不課税、税額控除目的に1989年3月1日、東京都に認可申請を行った。しかし、未成年の信者を巡って家族及び被害者の会からの批判によって認証手続きが遅れる。4月24日には麻原が信者200人を引き連れ東京都庁に押しかけ、抗議するという騒動を引き起こした。この認証手続きには被害者の会の家族から依頼を受けた北川石松衆院議員の圧力に対し、教団側は『元弁護士で裁判官だった出家信者』及び『沖縄の参院議員』を利用し、認証手続きを推し進めようとしたことが麻原の第43回公判で明らかになっている。しかし結局、不認可する理由がないことから8月25日、宗教法人認可を受けた。
1988年10月頃、富士宮市人穴に総本部道場建設。この頃より麻原は体調を崩すことが多くなり、健康面に不安を感じ始め「自分が死んだら、教団をどうするのか」あるいは「私は長くてあと5年だ」「死にたい」などと洩らすようになる。肝硬変や肝臓がんだと大騒ぎになったりもする。高弟の前でも「もう死のうかな」と呟き、新実智光は「お供します」、早川紀代秀は「困ります」、上祐史浩は「残って救済活動をします」と答え、妻の松本知子は「勝手にすれば」と言ったという。3女松本麗華は、この頃から「麻原の死への願望は強まった」と考えている。解脱者が多くなりオウム真理教が世界宗教へと変貌し救済ができるとの真剣な思いがあったが、弟子の修業が思うように進まず、通常通りの方法では人間界が救われないという否定的な認識が麻原彰晃に芽生えたと見ている。
1990年代のパルマの正GKを長く務めていたが、その後若手のジャンルイジ・ブッフォン（現・ユヴェントス）にポジションを奪われると、ペルージャ、トリノ、エンポリなどへ移籍した。03-04シーズン終了後にエンポリから放出され無所属が続いていたが、04-05シーズン冬のマーケットで古巣パルマに復帰。同シーズンはほとんど出番がなかったが、05-06シーズンから07-08シーズンにかけては正GKとして活躍。06-07シーズンには地元銀行が選ぶクラブ年間最優秀選手にも選出されている。しかし、07-08シーズンはレッジーナから移籍してきたニコラ・パヴァリーニにレギュラーを奪われ出場機会が激減。シーズン終了後に放出された。その後暫く無所属だったが、08-09シーズン冬のマーケットでGKに負傷者が相次いだナポリに加入。しかし1試合の出場にとどまり、チームは09-10シーズンの夏のマーケットでトルコのガラタサライからモルガン・デ・サンクティスを獲得したこともあり1年で退団した。