作品の舞台は千葉県の長浦で、作中でN浦駅となっているのは国鉄（現JR東日本）長浦駅である。重要な場所となった大衆食堂「やなぎ屋」のモデルとなった店は、長浦駅の山側で徒歩1分の距離に「よろずや」の名で実在する。ただし屋号は出しておらず「御食事処」とだけ書かれている。現在でも『やなぎ屋主人』当時の雰囲気を残しているという。本作品の主人公の青年がここでカツ丼を食べるので、「よろずや」でカツ丼を注文するつげファンが多いという。店内に飾られた神棚と岡持ちは正確に作中に描かれており、現存する。「よろずや」のおかみさん（作中では母親）の証言によれば、つげが来店したのは作品発表の4年前に当たる1966年（昭和41年）であったという。ただし、つげ自身の話では1967年4月に、つげは友人である立石慎太郎と旅行をし、「よろずや」に宿泊した。やなぎ屋の母と娘との会話に出るハマグリの雄雌をどうやって見分けるか、あるいは潮時についての「ヨタハジメ」という言葉は、実際に「よろずや」で耳にしたものであった。作品同様に「よろずや」はきれいな娘とその母の2人で経営しており、同じく父親は呉から出征して戦死していた。しかし、そこから先の作品での話はつげの妄想と言うべき創作であり、つげの内面が「よろずや」というロケーションを借りて、あますことなく展開されたものである。また、2007年時の「よろずや」は娘が若くして未亡人となり、老いた母親も健在であった。。なお、2012年4月7日の情報では、その1，2年前から営業を停止しているらしい 。
原子炉を動力源とする船は軍艦を除くと数少なく、ソ連の原子力砕氷船「レーニン」、アメリカの貨客船「サバンナ」、西ドイツの鉱石運搬船「オットー・ハーン」に続く世界でも4番目の船である。名称は一般公募から選ばれたもので、進水時の母港・大湊港のある青森県むつ市にちなむ。1963年（昭和38年）に観測船として建造計画が決まり、同年8月に「日本原子力船開発事業団」が設立された。1968年（昭和43年）に着工して翌1969年（昭和44年）6月12日に進水した。進水式には皇太子夫妻が出席し、美智子妃が支綱を切り、佐藤栄作首相らが拍手で送った。「原子力船進水記念」の記念切手が発行されるなど、当初の期待・歓迎は大きかった。1972年（昭和47年）の9月6日にかけて、原子炉へ核燃料が装荷された。1974年（昭和49年）に出力上昇試験が太平洋上で開始され、8月28日に初めて臨界に達した。しかし、直後の9月1日の試験航行中に放射線漏れが発生した。原子炉内の高速中性子が遮蔽物の隙間からわずかに漏れた程度であったが、メディアによってセンセーショナルに報道された。この放射線漏れで帰港を余儀なくされるが、風評被害を恐れる地元むつ市の漁業関係者を中心とする市民が放射線漏れを起こした本船の帰港を拒否したため、洋上に漂泊せざるを得なかった。1978年（昭和53年）に長崎県佐世保市への回航・修理が決まり、10月16日に到着。1980年（昭和55年）8月から1982年（昭和57年）6月末にかけて放射線の遮蔽性の改修工事が行われた。1975年6月、当時の佐世保市長だった辻一三が「むつ」受け入れを表明し、地元経済界や佐世保市議会、長崎県議会もこれを支持したのは、経営不振に陥っていた佐世保重工業に工事を請け負わせることで救済する意図があったためとされる。佐世保重工は存続できたが、長崎県漁連や労働団体は反対し、入港する「むつ」を抗議船団が取り囲んだ。その後、長い話し合いの末、むつ市の陸奥湾側にある大湊でなく、下北半島の津軽海峡側に新母港として関根浜港を整備することが決定。「むつ」は1982年（昭和57年）8月にいったん大湊へ戻った後、1988年（昭和63年）1月27日に、港開きされたばかりの関根浜港に入港した。この間、原子力船研究開発事業団は日本原子力研究所（現・日本原子力研究開発機構）に統合され、政府は「日本原子力研究所の原子力船の開発のために必要な研究に関する基本計画｣を策定した。1990年（平成2年）に、むつ市の関根浜港岸壁での低出力運転の試験と4度の試験航海、出力上昇試験と海上公試を実施。その結果、1991年（平成3年）2月に船舶と原子炉について合格証を得た。その後、1992年（平成4年）2月にかけて全ての航海を終了。解役に移り、1993年（平成5年）5～7月に使用済み核燃料が取り出され、1995年（平成7年）6月に原子炉室を撤去して、海洋科学技術センターに船体が引き渡された。1年間の試験航海中、「むつ」は原子力で地球2周以上の距離を航行した。機関士として乗り組み、後に原子力機構青森研究開発センター所長に就いた藪内典明は、アリューシャン列島沖合の最大波高11メートルに及ぶ荒海でも操舵性は良く、急な加速・減速、前進・後退の切り替えにも問題なく反応したと回想している。船体はその後、機関をディーゼルエンジンに換装して、海洋科学技術センターの後身である国立研究開発法人海洋研究開発機構（JAMSTEC）の「みらい」として運航されている。なお、原子力船「むつ」の操舵室・制御室、撤去された原子炉室がむつ科学技術館（むつ市）で展示されている。稼働実績がある原子炉を一般公開しているのは世界唯一で、見学は鉛ガラス越しとなっている。