1985年10月10日前後、クランクイン。スタジオ撮影は東映東京撮影所ではなく、にっかつ撮影所。アクション・シーンを担当した高瀬道場は府中刑務所の壁の外側にあり、仲村らは役が決まってクランクインまで毎日、高瀬道場にトレーニングに通った。仲村は当時千葉に住んでいたため片道2時間半以上かかったという。この間、どうやったらカッコよく殴ったり蹴ったりしているように見えるかとか、腹に膝を入れるときは、どこに当てればあまり痛くないか、のような練習を繰り返した。
土砂降りの中、ヒロシ&トオルとへび次の戦いは、ワンシーン・ワンカットの撮影で84手あり、何回ももやって日が暮れた。「画が繋がらないじゃないかな」と小沢仁志は思ったが、やっているうちに仲村が転がって、へび次の足に乗っかり小沢の骨が折れた。小沢は病院に行ってギプスを付け、東映でラッシュを見てたら那須が「暗いから繋がらないな、明日リテイク！」と言った。小沢は「やる前から分かっとるだろ、それ」と思ったが、那須から「明日リテイク大丈夫か？」と聞かれ、ダメと言えず。暗がりを繋げるため朝一から撮るのかなと思っていたら、翌日は小沢ら戸塚が愛徳を追いかけるシーンからの撮影。小沢はギプスを取って、足の裏にかまぼこ板を付けガムテープをぐるぐる巻きにして撮影した。痛くて靴も履けず、無理して全力疾走すること20回。踏ん張りも効かず止まることもできない。それなのに那須はテストからいちいち「小沢、足が遅い！」と怒鳴る。足がギンギンに痛くて病院に行き注射で痛みを麻痺させて対決シーンのリテイク。また20回も雨を降らせてリハーサル。「本番、よーいスタート！」が聞こえた瞬間、小沢は意識を失った。高瀬にビンタされ、意識は戻ったが以降もほとんど意識がない状態で撮影を続け、バックドロップはやる場所にマットが埋まっていたが、仲村が場所を間違えマットの無いところでバックドロップをやり、小沢は完全に気絶した。監督のOKが出ても小沢が微動だにしないため、高瀬が頬を叩いて蘇生させた。小沢は「今映画を観てもあのときのことはいっさい記憶にない」と話している。
『ビー・バップ・ハイスクール』を伝説にした鉄橋ダイブは、脚本の那須は「誰のアイデアだったか覚えてない、決定稿には『電車から落ちる』と書いてあった」と話しているが、「最終的に高瀬さんが出来るというからやることになった」と話している。両岸に1本づつ、真ん中に1本、計3本鉄柱があり、スタントマンがぶつかって電車に巻き込まれたら最期なので、列車の速度を落としてもらい、二本目と三本目の間に、飴ガラスを破って、高瀬道場の瀬木一将と高山瑛光が仲村に蹴られて仰向けで電車から落ちる段取りだった。海に近い場所で本来は満潮に合わせて飛び込む予定だったが、時間が押して干潮に近い時間帯になり、スタント時は腰の高さ程の浅瀬となった。予定では一本目と二本目の間にひとり、二本目と三本目の間でひとり落とす予定だったが、水が引いたら一本目と二本目の間に何本も土留の杭が立っていた。そのため二本目の前後で間髪入れず、時間差でふたりを落とすという凄まじく微妙な作業の敢行を強いられた。高瀬が死角に入って必死のタイミング出しでこれを成功させた。小沢は「こっちは興奮しちゃっているから、とにかくガラスを割りまくるわけよ。それで手が切れてさ、床に垂れた血が滑って困ったんだよ」と話している。
足利義晴を擁立した高国は、管領・従四位下武蔵守に任官された。大永5年4月21日（1525年5月13日）、剃髪して道永（どうえい）と号し、家督と管領職を嫡子の稙国に譲って隠居した。ただし、これは高国が厄年であったためにこれを機に息子に家督を譲ろうとしたもので、本人は隠退の気持ちを持っている訳ではなかった。ところが12月に稙国が没したため、やむなく管領・細川家（細川京兆家）当主として復帰する。大永6年7月13日（1526年8月20日）、従弟に当たる細川尹賢の讒言を信じて、重臣の香西元盛を謀殺した。しかし、これを知った元盛の実兄（波多野稙通と柳本賢治）に背かれ、丹波で挙兵される。仕方なくこの鎮圧に尹賢を向かわせたものの敗退。そこへ、かつての敵対者であった澄元の遺児・細川六郎（晴元）や三好元長（之長の嫡孫）にまで阿波で挙兵されてしまう。再び畿内に進出した阿波勢に、丹波勢も加わって膨れ上がった敵対連合軍には、いくら権力者の道永であっても効果的な対抗策を施せなかった。嫡男であった稙国を失った道永には実父・政春が晩年に儲けた32歳も年下の弟の晴国がいたが、既に野州家を継ぐことが決まっていた。このため、道永は野州家よりも格上である典厩家から尹賢の子である細川氏綱を養子に迎えることにし、大永6年12月27日（1527年1月29日）に晴国と氏綱の元服を同時に行った（『後法成寺関白記』）。翌大永7年（1527年）2月には、とうとう敵対連合軍の尖兵・柳本賢治や三好元長らに京に侵攻され、桂川で迎撃したが敗れ、足利義晴を擁したまま近江坂本に逃れた（桂川原の戦い）。こうして高国政権は崩壊した。10月には越前の朝倉孝景に軍事支援を要請し、地位回復を目論む。これに応えた孝景の大叔父である朝倉宗滴を総大将とする加勢を得て、高国は上洛を果たした。だが翌大永8年（1528年）3月には越前軍の帰国により、5月に再び近江へ逃れた。