天正11年（1583年）の賤ヶ岳の戦いでは、その前哨である伊勢亀山城（三重県亀山市）攻めで一番乗りの手柄をあげている。また、翌12年（1584年）の小牧・長久手の戦いでは、秀吉の命で、家康を包囲するための付城構築の作業に当たっている。四国平定後、羽柴秀次（豊臣秀次）が大幅に加増されると、田中吉政・堀尾吉晴・中村一氏・一柳直末と共にその宿老の1人として付けられて、天正13年（1585年）には若狭国高浜城主、まもなく秀次が近江八幡に転封すると、一豊も近江へ移り、長浜城主として2万石を領した。天正18年（1590年）の小田原征伐にも参戦し、秀次に従い山中城攻めにも参加した。織田信雄の改易に伴って再び秀次が尾張・伊勢で加増されると、一豊ら宿老衆も転封して、遠江国掛川に5万1000石の所領を与えられた。この頃から大名としての行動が見られ、掛川では城の修築と城下町づくりを行い、更に洪水の多かった大井川の堤防の建設や流路の変更を川向いを領する駿府城主中村一氏とともに行っている。朝鮮の役では、他の秀次配下の諸大名と同じく出兵を免れたが、軍船の建造や伏見城の普請などを担当して人夫を供出した。文禄4年（1595年）に秀次が謀反の疑いで処刑され、この頃に秀次の宿老であった前野長康と渡瀬繁詮はこの事件の責任を負わされて、秀次を弁護した繁詮は切腹を命じられ、長康は中村一氏に預かりとされて蟄居後、賜死とされた。しかし一豊や田中・中村・堀尾ら配下の大名衆は、秀吉の命令を遂行して秀次らを取り調べる立場となり、秀次の処断の後で逆に遺領から8000石を加増されている。秀吉の死後の慶長5年（1600年）には五大老の徳川家康に従って会津の上杉景勝の討伐に参加した。家康の留守中に五奉行の石田三成らが挙兵すると、一豊は下野国小山における軍議（小山評定）で諸将が東軍西軍への去就に迷う中、真っ先に自分の居城である掛川城を家康に提供する旨を発言し、その歓心を買って東軍に組した。この居城を提供する案は堀尾忠氏と事前に協議した際に堀尾が発案したが、油断してうっかり洩らしたものを聞き、自分の案として家康に申し出、感謝を受けたと言われる。また大坂の妻からの密書で石田三成の挙兵の知らせを受けたという話も有名である。これらは話の信憑性には疑問があるものの、東海道筋の他の大名である中村一氏が死の床にあり、同じく忠氏の父である堀尾吉晴も刺客に襲われて重傷を負うなど老練な世代が行動力を失っている中で、周辺の勢力が東軍に就くよう一豊がとりまとめていた。三河国吉田城主の池田輝政など、この時期に一豊と接触しており、豊臣恩顧の家臣衆の取り纏め役を果たしていたと考えられる。関ヶ原の戦いの前哨戦である河田島村と米野村での戦いで、西軍に味方した岐阜城主の織田秀信の軍勢を、池田輝政や浅野幸長らと共に破った。本戦でこれらの武将は南宮山に陣取った毛利・長宗我部軍などの押さえを担当したが、東軍に内応していた毛利軍先鋒の吉川広家隊が南宮山にいたためにさしたる戦闘もなく、輝政を残して主戦場へ移動した。戦後は小山会議で去就を決めかねていた諸侯を徳川加担に向かわせた発言が功績として評価され、土佐国一国・9万8,000石を与えられた。後に、高直しにより20万2,600石を幕府から認められている。
1989年10月6日、露橋スポーツセンターで旗揚げ戦を開催。7月2日、「格闘技の祭典」で遺恨が勃発した大仁田と空手家の青柳政司との抗争を軸に元全日本プロレス所属選手のターザン後藤や元新日本プロレスの栗栖正伸も参加。初期におけるFMWは、その団体名が示す通り柔道、キックボクシング、テコンドーなどプロレス以外の格闘家が参加しており異種格闘技戦的な要素が強かった。しかし、その意味付けは当時隆盛だったUWFへの対抗心（あるいは皮肉）によるところが大きく「総合格闘技オープントーナメント」と銘打たれた大会で栗栖がイス攻撃を駆使して優勝したりボクシングの元世界チャンピオン、柔道メダリスト、空手家、プロレスラーなどのタッグチームが競う「世界最強総合格闘技タッグリーグ戦」を開催。FMWの看板と位置付けて行ったのがデスマッチとストリートファイトマッチなどである。資金難を始め様々な面で既存メジャー団体に劣っていたFMWが選んだのは「何でもあり」をキーワードにしてのアイデアで勝負する道だった。有刺鉄線デスマッチを皮切りに数々の「日本初」を敢行。1990年8月4日、レールシティ汐留大会で開催した大仁田と後藤の「究極のデスマッチ」、ノーロープ有刺鉄線電流爆破デスマッチでFMWの浮沈をも賭けた。その思惑は当たりFMWは一躍注目を浴びるようになった。1992年には兵庫県三田市でファイヤーデスマッチを日本で初めて開催して大きな話題となる。多様な格闘家、奇抜な試合形式、男女混合、怪奇派レスラーなどが行われて大仁田が「おもちゃ箱をひっくり返したような」と表現した団体色は一大センセーションを呼びUWFを除けば当時のメジャー団体だった新日本と全日本に匹敵する第3勢力になった。大仁田はFMWの宣伝目的もありテレビ等に極力出演してタレント並みの知名度を得た。このことによりFMWの知名度も全国区になりニュース番組やTBSの番組「ギミア・ぶれいく」などでドキュメンタリーが放送された。後にライバルのミスター・ポーゴの退団などもあったものの、ザ・シーク、タイガー・ジェット・シンといった新たなヒールレスラーも獲得して1991年には川崎球場で興行を開催。因みに、その同じ日に10kmくらいの距離の先の横浜市では新日本プロレス横浜アリーナ大会が開催されて1万8千人もの観客を動員したこともあり「時期尚早では?」と言われていた、しかし蓋を開けてみれば約3万3千人の動員に成功。1992年には横浜スタジアム、1993年には2度目の川崎球場と阪急西宮球場で興行を開催して経営規模は順調に拡大していった。その一方で全国各地の駐車場や空き地での小さな興行も欠かさず行い、津々浦々にファンを増やしていった。デスマッチ中心のプロレス団体として1991年に分裂した社長の茨城清志（元渉外担当）、ポーゴらが率いるW★INGプロモーションとは激しい興行戦争となったが資金面に劣るW★INGから看板選手であったポーゴらを引き抜きW★INGを壊滅させてインディー団体の最高峰に立つまでに成長。 1994年5月5日、FMW川崎球場大会で自らの土俵である電流爆破マッチに持ち込みながらも天龍源一郎に敗れた大仁田は引退を決意。1年間の引退シリーズを経て1995年5月5日、FMW川崎球場大会で引退試合を行う。最後の対戦相手は当初は後藤が予定されていたが突如、ミスター雁之助、市原昭仁らと共に退団。対戦相手の再考を余儀なくされた大仁田は名乗りを上げていた東京プロレスの石川敬士を指名。さらに試合の調印直前で名乗りを上げた弟子であり次代のエースのハヤブサに石川の了解を得て変更して引退試合を行った。