一部の軍事評論家は、UFOの目撃談は軍事組織や情報機関によって捏造された物であると主張している。これらは、上記のような実験機目撃談や実験の失敗などにより重大な機密が世間やスパイに漏れるのを防ぐため、敢えて超常現象としてマスメディアを通じて喧伝したり噂話を増長させることで肝心な部分から目を眩ます欺瞞工作であるというのだ。捏造自体はそれと証明された物が多いが、これらに軍や情報機関が関与している証言や物証は乏しく陰謀論から抜け出すものではない。ただし、エリア51のように、秘密兵器の研究基地であることがわかっている場合もある。テレビ局が超常現象を扱う人気番組を作るために故意に物語を捏造したり、偶発的に起こった騒ぎを利用したり誇張したりする場合もある。（→#ヴァルジーニャ事件）
立花隆によれば、臨死体験を経験した後に、UFOと遭遇する者は少なくない。臨死体験の研究者であるケネス・リングが収集した事例では、その体験が臨死体験なのかUFO遭遇体験なのか区別できない事例が複数あったという。一例として、ニューヨークに住むある女性が腫瘍で倒れ、体外離脱を経験した後に、気が付けば宇宙の施設内の手術台の上にいたという事例がある。女性が窓から宇宙を眺めていると「7人位の背の高い痩せた何か」に囲まれ「それ（腫瘍）はもうなくなった」と告げられた。女性の意識が地球に落下していき、肉体の中に戻ると、腫瘍が消失していることに気付いた。
変性意識状態に入った人間がUFOとの遭遇を異次元にて起こした、と解釈する説。UFOとの遭遇時には体外離脱を経験する者も多く、そうした例では何らかの変性意識下の状態にあったと推測される。（→#アブダクション（第4種接近遭遇））臨死体験研究者であるケネス・リングやハーバード大学の宗教学教授であるキャロル・ザレスキーによれば、UFOとの遭遇はシャーマンが隠された次元に旅する時に遭遇する神話的な現実と似ているという。研究家のダニエル・ピッチベックは我々の世界に別次元から干渉している妖精や異星人などの存在が太古から存在し、シャーマンのような特殊な資質をもった人間だけが彼らを知っていたのではないか、と述べている。
UFOは隠れた現実である「異次元」から来ているとする説。「精神投影説」のように、UFOを「心理現象」であると解釈してしまうと、UFOの着陸跡（焦げ跡など）やレーダー上の航跡、アブダクションされた人々の手術跡などの物理的痕跡の説明がつかない。そこで人間の意識が投影された異次元が存在することを想定し、そこからUFOが現れると推測する説が成り立つ。「UFOが地球外の物であることを示す証拠は何もないが、時空を超越した異次元からきている証拠は山ほどある」と研究家であるジャック・バレーは指摘しており、アラン・ハイネックは、UFOが突然出現し、忽然と消え去る現象が多数目撃されているため、それらは他の惑星からやって来たものではなく、異次元からやってきたものではないか、とコメントしている。ノンフィクション作家のマイケル・タルボットは、現実とは決して客観的なものではなく人間の精神が生み出す間主観的なホログラムである、と述べたうえで、ホログラフィックな別次元からUFOが現れるのではないかと推測している。
未知の異次元存在が、UFO目撃者の深層心理から材料を抽出し、物理痕跡を含めた劇を目撃者と共同創作した、とする説。UFO現象においては、目撃者の心象がUFOや異星人の形となって現れるという奇妙な側面もあるが、一方で複数の目撃者がいたり物質的痕跡を残すケースもある。理解不能であり人間の集合無意識にも属さない「未知の知性体」が、複雑な構造の無意識を持つUFO目撃者の心とコンタクトを取ろうとしたとすると、その結びつきは歪曲作用を生み出すことが予想される。この歪みがUFO現象における気まぐれな側面となり認知されるという解釈である。
UFO現象には元型的な体験が含まれている。そのため「普遍的無意識のエネルギーの投影により起きている」と分析心理学的に解釈することが可能である。1959年、分析心理学者のカール・グスタフ・ユングは、UFOは人間の集合無意識の産物であり、形成過程にある現代の神話の一種ではないかという説を唱えた。研究家のジャック・ヴァレーは、UFOの搭乗者の奇妙な行動は、ヨーロッパにおける妖精や天使の伝説、アメリカ先住民族のトリックスターの伝説と共通点が多いため、UFO現象は近年になって発生したものではなく、太古から起きていた現象なのではないかと推測した。また、UFO目撃事件は各月の24日前後によく起きている事実がある。こうした傾向は、比較的に信頼性が高いとされる目撃事件にも、創作の疑いが強いとされるストーリーにも同様に見られた。一方で精神投影がUFOなどの物質化を起こすのであれば、何故それはUFOに限られるのか。なぜ車やテレビなど見知った概念は物質化されないのか、と言った疑問も出ている。
1925年（大正14年）。関東大震災によって倒壊したキリスト教青年会の復旧のため来日したポール・ラッシュは、主教たちの要請で立教大学の教授として教壇に立つことになった。学生たちと接する内に、ポールは日本への愛着を深めていったが、太平洋戦争の勃発により、日本を離れざるを得なくなってしまう。1945年（昭和20年）。ポールはGHQの将校として再び日本を訪れたが、そこで彼は、かつての生徒たちが戦死したことを知り悲しみにくれた。ポールは山梨県の清里を尋ね、かつて親交のあった茂・高志と再会した。ポールは二人から清里の窮状を聞き、清里のために残りの人生を掛けることを誓い、アメリカでの募金活動・公共施設の建設・日本初の高地酪農を行った。ポールの活動により、清里は日本の酪農をリードするようになり、清里の人々はポールに深い感謝と敬愛の念を抱くようになった。ポールは、そんな清里の人々を心から愛し、1979年（昭和54年）に生涯を終えた。