ソ連崩壊後のロシアでもクーデターに賛同した防空軍は冷遇された。ロシアでは、1998年に防空軍はついにロシア空軍に吸収合併され、ソ連時代からのその歴史に幕を下ろした。なお、ロシア語では元々単に「防空軍」であるので国号が変わっても組織の正式名称に変更はなかった。ウクライナでは2004年まで軍の組織内で独立を保ったが、この年に空軍へ統合された。ベラルーシでは、航空部隊はすべて空軍及び防空軍に統合されており、現在でも防空軍の名称は残されている。カザフスタンでは、防空軍は空軍と別組織となっていた。なお、同国防空軍はソ連、ロシア以外で長距離迎撃戦闘機MiG-31を運用する唯一の軍隊であった。
1981年には組織改編が行われ、多くの機関は空軍へ移管された。名称も国土防空軍から防空軍に変更された。1991年8月19日に発生したソ連8月クーデターにおいて、ソ連空軍はボリス・エリツィン ロシア共和国大統領ら改革推進派側についたのに対し、防空軍は保守派側に味方し敗北を喫した。
防空軍の主な任務は領土上空に侵入してくる不審機の迎撃で、場合によっては機体の撃墜に到ったこともあった。ソ連上空に侵入してきた主な機種はU-2のような偵察機と軍用偵察気球であったが、そのほかに民間機が迷い込んでくることも少なくなかった。防空軍戦闘機は多くの気球といくつかの軍用機を実際に撃墜していたが、大韓航空機撃墜事件に代表されるような民間機の撃墜や強制着陸も何度か発生した。そのほか、重要な任務として敵戦略爆撃機やミサイルの迎撃訓練も行っていたが、こうした機体が国土に飛来するというような事態は発生しなかった。
第二次世界大戦（大祖国戦争）時には赤軍防空軍がソ連国土の防空任務に当たっていたが、1948年に再編されて新たな防空専門組織が編成された。国土防空軍と命名されたこの組織は、西側諸国の防空組織と異なり、空軍の中の一組織ではなくこれのみで独立した軍組織であった。従って、ソ連の空軍と防空軍は別個の組織であった。防空軍は独自の指揮組織、訓練組織、レーダー及び通信サイトを保有していた。防空軍は、防空兵器として地対空ミサイル（ロシア語では「ミサイル」ではなく「ロケット」と呼ぶ）と戦闘機を保有、そのほかにも支援機材としてヘリコプターや輸送機、練習機などを保有した。防空軍の戦闘機は「迎撃戦闘機」と呼ばれ、空軍の同世代の戦闘機（「前線戦闘機」）よりも高度な電子機材を搭載していた。迎撃戦闘機の航空隊組織は、防空軍戦闘航空隊（IA PVO；ИА ПВО）と呼ばれた。一方、広大なソ連領土の防空任務に必要不可欠となるはずの早期警戒機の整備は遅れ、基本的に迎撃戦闘機は地上からの管制下防空任務に当たることとなっていた。また、ソ連の迎撃戦闘機自体に関しても、可能な限り長距離を飛行でき、長距離の目標を探知できるレーダー・ステーションを搭載するような機体となるよう開発努力が続けられた。特に、飛行場のまばらな東シベリアや極東地方の防空は困難な課題であった。
この頃から次第に漫画に変化が生じ始める。特にロリコン漫画の台頭は、漫画全体の雰囲気を変えるものであった。これはエロ劇画においても、七十年代後半より、中島史男や村祖俊一のように次第に少女を中心に描く作家が出始めている。あるいは谷口敬や澤木あかねなどのように絵柄にもかわいさを前面に押し出す作家も出現し、内山亜紀（旧名 野口正之）や千之ナイフに至っては少年誌にまで進出を果たした。この流れを決定づけたのは、吾妻ひでおであった。彼は少年漫画の舞台でマニアックな人気を得、エロ劇画誌にギャクマンガを連載した後に自動販売機専門誌である「少女アリス」に現在の流れに通じるようなかわいらしい絵柄で本格的なエロ漫画作品を発表した（1980年（昭和55年））。自動販売機専門誌では部数が限られていたものの、この連載は後に「日射し」という単行本にまとめられ（1981年（昭和56年））一部の話題をさらうことになる。80年代前半は、ロリコン漫画雑誌としては、レモンピープル（1982年（昭和57年））と漫画ブリッコ(およびその後継誌の漫画ホットミルク)が二大ロリコン誌と呼ばれ、それ以外に若干数の類似誌が出版されるも短命に終わる状況が続いたが、80年代半ばを過ぎるとCOMICアットーテキやペンギンクラブらの創刊以降、次第に定着する雑誌が増え始め、それ以降はあっと言う間に類似誌が数を増やした。それらに描かれた世界はエロ劇画誌とそれほど差のあるものではなかったが、その絵柄は大きく異なっていた。それらはどちらかと言えば若い世代に受け入れられたが、それはエロ劇画を購入していた世代とも大いに重なるものとなりつつあった。ロリコン誌は数を増やすにつれて性質を変え始め、次第に描く対象を女子高生程度、つまりエロ劇画の範囲と被るようになり、一般的なエロ漫画との境目は不明瞭になり、その分エロ劇画の市場を奪って行った。他方、より社会的な要因を指摘する向きもある。この頃より雑誌の購入場所としてコンビニエンスストアが重要になったが、そこでエロ劇画誌が受け入れられなかったからである。印象が暗く不潔感があったためであろう。それが販売先を大きく狭めた点が響いたという指摘である。もう一つのアダルト系漫画雑誌の系列として、同じ頃から増加が始まったレディースコミックがある。当初はややソフトなムード的なセックス描写に止まっていたものは次第に過激になったが、これは読者層がエロ劇画誌とは異なっていたから、市場の取り合いという意味ではそれほど影響はなかったようである。むしろ新しい市場として、エロ劇画の書き手がレディースコミックへ流入する現象が見られた。したがって、その作風的にはエロ劇画誌の匂いが強い例もある。