2013年度に文部科学省が創設した研究大学強化促進事業の支援対象機関（22機関）に採択された。「知のボーダレス化」、「連携と協働」、「開放性と透明性」の3つの経営戦略を基盤として、大学院の強化、人材登用の強化や国際化の強化を図ることで研究推進体制を整備し、「小さくても光る大学」を目指している。
新たなイノベーションを創出する博士を育成するため、2010年（平成22年）11月18日に『スーパー連携大学院コンソーシアム』を結成、翌年度から学生の受け入れを開始した。これは、所属する大学院と並行して、所定の産学官共同研究、他大学受講を行う大学院教育プログラムであり、文部科学省の2008年（平成20年）度「戦略的大学連携支援事業」教育研究高度型に採択された。修了時の博士号は「イノベーション博士サーティフィケート」である。2018年6月現在、9大学、15の株式会社、研究機関、財団法人、社団法人、個人などから構成され、本学はその正会員となっている。
2010年、12月16日に入団会見を行い、背番号はダイエー時代の20、登録名も「寺原 隼人」へ戻す事が発表された。2011年、4月13日に一軍登録され、同日の開幕2戦目である本拠地（京セラドーム大阪）で対ソフトバンク戦で移籍初登板・初先発し、昨年までわずか出場3試合の4年目・伊藤光とのバッテリーで移籍後初完封勝利を挙げた。4月27日の対千葉ロッテ戦では自己ワーストの1試合8失点（自責点8）を喫したが、5月4日の対日本ハム戦で2度目の完封勝利、その後前田大輔と組み2連敗したが、5月23日にはプロ入りして12連敗（先発では11連敗）していた巨人から敵地・東京ドームで9回1失点の完投勝利を挙げた。5月31日の対横浜戦では口唇ヘルペスを発症しながらも6回を無失点に抑えて古巣から移籍後初勝利を挙げた。6月6日にはプロ入り8連敗（先発では7連敗）の対阪神戦で9回1失点完投勝利を挙げた。6月14日の対横浜戦（横浜スタジアム）ではトレード相手の山本省吾と投げ合い、8回無失点で勝利した。7月4日には監督推薦により2度目のオールスターゲーム出場が決まった。7月8日の対西武戦でも勝利し、自己最多の7連勝を記録した。この7戦7勝期間の先発マスクは全て伊藤光だった。しかし伊藤光が打撃不振と脳震盪により7月12日に抹消され、1月に横浜から移籍した齋藤俊雄とオリックスで初バッテリーを組むことになった。7月15日の対楽天戦では近鉄を含む13球団からの勝利を賭けて臨んだが味方打線が完封を喫して敗戦した。球宴前で登板機会が無いため7月16日に登録を抹消。7月22日のオールスターゲーム第1戦で先発してプロ野球史上74人目両リーグ出場を果たし、3イニング打者10人に対して1安打無失点の投球で敢闘選手賞を受賞した。7月29日に一軍登録されて同日の試合で4年ぶりとなる二桁勝利を記録したが、試合中に右肘に痛みを感じて8月4日に右肘の張りにより出場選手登録を抹消された。8月14日に最短で再昇格し、再び伊藤光とのコンビで5試合全てQS達成で無四球完投勝利を含む2完投を挙げたものの1勝3敗と負け越し、以降は他の捕手と組んだ。9月28日の対千葉ロッテ戦では2回に角中勝也の打球を左太腿に受けながらも9回を2安打1四球と完封し、自己最多タイの12勝目を挙げた。以後2試合は10月10日に中4日の登板も1回2/3で5失点し移籍最短KOされるなど試合を作れず、最後の登板も背筋痛で登板を回避し、チームは1毛差でクライマックスシリーズ出場を逃した。最終的には170回1/3を投げ12勝7完投3完封（いずれもチームトップ）、QS率72.0パーセントで終えた。伊藤光と組んだ16試合は10勝5敗だった。オフの12月12日の契約更改交渉で2,500万円増の年俸8,500万円で更改した（金額は推定）。2012年、春季キャンプ2月13日に右肩に張りを訴えて宮古島市内の病院で検査を受け、さらに右太腿裏痛で調整は遅れたが、開幕一軍に間に合い、開幕第3戦の対ソフトバンク戦に先発して7回2失点と好投も援護が無く敗れた。4月5日の飛行機移動の際に腰痛を発症して4月7日に登録を抹消された。5月4日に再昇格したが開幕3連敗を喫し、登板機会が無いため二軍で再調整となった。5月26日に一軍復帰してからは連勝、6月30日の対千葉ロッテ戦では完封勝利を挙げた。球宴時期の7月15日に抹消され7月27日に再昇格して連勝したが、調子を崩して8月23日に2回7失点KOされ、右肘の炎症で翌日8月25日に抹消され、そのままシーズンを終えた。最終的には16試合に登板してQS率は62.5パーセント、6勝止まりだったが最下位のためチーム3位の勝ち数だった。同年も主に伊藤光・齋藤俊雄とバッテリーを組み、前年と同じく他の捕手では1度も勝てなかった。11月14日に故障者選手特例措置制度によって得たフリーエージェント権（FA権）を行使し、11月24日に7年ぶりのソフトバンク復帰を表明し、かつてのトレーナー山尾伸一との再契約も結んだ。