ZIP書庫形式ファイルとしてまとめられた書籍のJPEGファイルがJコミにアップロードされると、自動的に解凍されスタッフの確認を経てから広告を挿入してPDF形式として無料公開される。PDFファイルは高解像度と低解像度の2種類が用意されている。2011年4月12日の正式公開以降はPDFの配信は一時中止されており、オンラインビューアーでのみの公開となっている。今後はオンラインビューアーで多く読まれた漫画上位3作品をPDF化する計画であると発表されている。読者によってクリックされた広告の収入は全額作者に還元され、会社の運営費用はウェブサイトのトップページの広告収入で賄うとしている。PDFファイルには著作権保護のプロテクトなどは組み込まれておらず自由にコピーできるが、広告を外すことは不可能となっており、「ユーザーの間で相互にコピーされることによって無限に広告が拡散する」というビジネスモデルの構築を目標としている。自前でサーバを持たずAmazon EC2を利用している。オンラインビューアーの愛称はVersion3が『サイボーグ009』の003フランソワーズ・アルヌールに因んだ「アルヌール」、Version4が『機動戦士Ζガンダム』のフォウ・ムラサメに因んだ「ムラサメ」とされている。
作者の了解を得て広告を挿入した形で絶版作品を公開し、広告収入を作者に還元することを目的としている。仮公開時には赤松健の漫画『ラブひな』全14巻が公開された。絶版作品とは謳われているものの、単行本未収録の読み切りやそれらを独自にまとめたオリジナルの短編集の他、既に連載終了された作品の続編も公開されている。また、他社から提供された漫画作品も公開されている。なお、紙メディアや他版元の電子書籍で復刻が決まった作品は公開停止になった他、著作者の裁量で掲載を取り下げた作品もある。これらの作品はブラウザやアプリを通じて誰でも無料で読む事が出来たり(但し、成人向け作品は有料会員のみ閲覧可能、それ以外は僅かのページしか読む事が出来ない)、無料会員になる事でオフィシャルとして登録された作品をPDFファイルとして購入、保有する事が出来る。正式公開に先立ち「Jコミを応援してくれるフェロー（仲間）」の第一期生20人の募集が行われ、最終的に20倍弱の応募倍率となったため急遽人数を増やして40人を当選とし、当選者には階級章バッジと赤松健のサイン入り仮契約カードが配られた。フェローは会費無料で、義務は特にないとされている。月一で対象となる作者の公開作品を一挙にまとめたものを加え、画集や作品のネームなどが加えられた限定商品や購入者による好きな作者のキャラクターを描いてもらえる権利や作者との飲み会等に参加出来る権利などの販売が行われている。この他に作者描き下ろしの年賀状を販売する作者応援キャンペーンも行われた。
西條の新たなショッピングモール展開として、新興住宅地のひじり野地区において同社による既存のスーパーセンター「ベストム東神楽店」（2003年開店）に隣接する形で建設した。アルティモールの建設に伴ってベストムをリニューアルしており、両施設は渡り廊下で接続している。名称は、究極を表す意味の英語「アルティメット」（Ultimate）から名づけている。
ヒロインたちが留守番電話に残したメッセージに対する主人公の反応を選び、その結果が翌週に放送されるという体裁のラジオドラマ『留守電メモリーズ』は、未放送分も収録したCDがヒロインごとに発売された。なお、『2nd』のアペンドストーリーには、水樹演じる白河ほたる（ほわちゃん）と中西演じる飛世巴（とと）が登場する「ほわととメモリーズ」という本番組のパロディ作品がある。さらに『Memories Off Duet』に収録されたストーリーでは、ほたるが混乱した状況をごまかすために寿々奈鷹乃（たけ）を引っ張り込んでほわたけメモリーズなる企画をでっち上げている。
アウターヘブン蜂起（『メタルギア』）時に登場。ソ連の科学者ドラゴ・ペトロヴィッチ・マッドナーによる開発で、正式名称は「TX-55 メタルギア」。全長:3.25m、全幅:2.75m、全高:6.05m、体重:25t。装甲はタングステン装甲と特殊耐熱セラミック。1.5cmバルカン砲と20cmレーザーバルカンを装備し、右肩に当たる部分に多弾頭中距離ミサイルを2門装備している。『二足歩行によってあらゆる地形を走破し、あらゆる地点からの核攻撃を実現する』兵器。核搭載二足歩行戦車というコンセプト自体は1964年にグラーニンによって考案されたが、当時GRUの大佐ヴォルギンはソコロフのシャゴホッドを優先した。その後のRAXAは、頭部にこそグラーニンの設計の痕跡が見られるものの、ソコロフの手による開発の結果、彼の得意とするロケット推進技術による移動方法が主軸となった。次いでヒューイによりグラーニンの発案をスピンオフしてZEKEとST-84という2機のメタルギアが制作されたが、どちらも国家ではない私的武装組織での運用であった。そのため、メタルギアという名が付く兵器が表の歴史上に登場するのは事実上アウターヘブン蜂起で登場した本機が初となる。厳重な警備システムに守られていたが、起動前に当時、まだ新米だったFOXHOUND隊員のソリッド・スネークによって破壊されたため、戦闘を経験することのなかったメタルギアでもある。なお、破壊された場合にはアウターヘブンの自爆装置が発動する仕掛けになっていた模様。過去に開発されたメタルギアやAI兵器では、歩行能力は発射点を相手に悟られないことを目的としており、核弾頭を目標まで運ぶ手段にはICBMを用いる（核自爆を除く）ため、動く核ミサイルサイロという性質上巨大にならざるを得なかった。TX-55から始まるコンセプトでは、メタルギア自身の歩行によって目標付近まで核を運び、SRBMのような小型の短距離ミサイルや汎用ミサイルを使って核を撃ち込むよう変更したことで、メタルギアシリーズとして最小のサイズとなった。スカルフェイスは、メタリックアーキアによって作成した安価な核爆弾を小型二足歩行マシンであるウォーカーギアとセットで販売、現地までの輸送と撃ち込みを行う事を計画をしており、この構想を拡大、重装甲・重武装化させたものと言える。しかし、NPTやSTART I・START IIなどの核兵器の軍縮条約により、コンセプトの変更を迫られた結果、REX以降のメタルギアは再び大型化している。ファミコン版では、このTX-55は直接登場せず話題のみの登場であり、代わりにTX-55とアウターヘブンを管理するスーパーコンピューターを破壊する事になる。