2006年9月2日、アフガニスタンで作戦飛行中のMR.2 XV230が、空中給油を受けた直後に火災が発生して墜落する事故が発生、乗員14人全員が死亡した（→w:2006 Royal Air Force Nimrod crashを参照）。2007年12月4日、イギリス国防省は調査報告を発表し、墜落した機体は、給油後タンクから燃料漏れが生じており、高温空気パイプの熱によって発火、拡大して墜落に至った、と分析した。機体の旧式化・老朽化が著しいにもかかわらず、海軍の新型原子力潜水艦（アスチュート級）や航空母艦（クイーン・エリザベス級）の整備・建造計画によって補修に関する経費は切り詰められ延期されていた、と報道されている。イギリス空軍の警告にもかかわらず、十分な補修予算を計上するに至らなかったことが事件を引き起こしたとして政府は非難されており、国防大臣は遺族に対して公式に謝罪した。このように2006年の墜落事故は、軍事の範疇を超えて政治問題化している。
1992年からイギリス空軍は後継海洋哨戒機計画(Replacement Maritime Patrol Aircraft ,RMPA)を開始し、ニムロッド MR.2の後継機の検討を開始した。これにロッキード P-3C、ダッソー アトランティック、BAe ニムロッド 2000らが候補にあがったが、1996年12月にBAeのニムロッド 2000が選定され、ニムロッド MRA.4としてMR.2からの改装による生産が決定された。MRA.4は新世代のターボファンエンジンロールス・ロイス BR700を搭載し、これを適合させるため胴体の設計を一新。主翼を拡大し、エアバスA340のグラスコックピットを導入した。1999年にBAeから改組されたBAEシステムズによりデータ処理システム、サーチウォーター・レーダーシステムが開発された。当初の採用予定はMR.2の稼働全機に相当する21機であったが、コストの問題などから19機→12機と段階的に採用数が削減され、最終的には9機まで削減された。最初の生産機は2009年9月10日に初飛行し、2010年3月にイギリス空軍へ引き渡され、2012年の配備に向けて試験が行われていたが、ベースとなった機体の機齢がすでに40年前後に達していたこともあり、当初の想定外に多額な改装費がかかっていたことから、大幅な国防費削減を目指したデーヴィッド・キャメロン政権により計画は2010年10月にキャンセルされ、改装済み・改装中の全機体も2011年1月にスクラップにされた。計画中止の時点で40億ポンドの予算が消費されていた。その後哨戒機の独自開発は断念し、2015年12月にアメリカ海軍がすでに運用しているP-8を後継機として導入する予定。
1980年代に、ニムロッドを早期警戒機 (AEW&C)として用いるためのプロジェクトがあった。機首と尾部に大型レーダーを搭載し、前後のレーダーが連動して周囲の警戒を行う仕組みであった。しかし、開発に失敗したためアメリカ製ボーイングE-3早期警戒管制機の導入が決定され、採用にはいたらなかった。11機が改造される予定だった。1982年に初飛行しているが、1986年の計画中止後は、改造のために保管されていた機体は既存の機体の部品取りに使われ、再度通常任務に戻されることは無かった。
1975年より、MR.1から32機が電子装備を更新した改良型MR.2へ改装が開始された。フォークランド紛争時に、空中給油装置とサイドワインダー空対空ミサイルが装備できるように改修された。
馬籠は遠山荘に属していたとされ、鎌倉時代に成立した『吾妻鏡』では、木曾義仲の妹の宮菊姫は北条政子の養女となり「美濃国遠山荘の一村」を与えられたと記され、これが馬籠とされて宮菊姫にまつわる伝承や墓が馬籠に伝わっている。室町時代には、馬籠遠山氏の所領となっていたようであり、永享3年（1431年）の『永享以来御番帳』に遠山馬籠左馬介、文安元年（1448年）の『内裏』に遠山馬籠、長享元年（1487年）の『常徳院殿』に遠山馬籠右馬介の名が見える。なお、応仁の乱時の文明5年（1473年）には、東軍の小笠原家長と木曾家豊が伊那谷と木曽谷から遠山荘に侵攻している。天文年間に入って甲斐国の武田信玄が信濃国に勢力を伸ばすと、天文24年（1555年）に木曾氏も武田氏に降り、続いて遠山氏も武田氏の傘下に入った。その後、元亀2年（1572年）頃から、武田信玄と織田信長の間で抗争が始まり、『甲陽軍鑑』によると天正2年（1574年）武田勝頼が落とした遠山十八支城の中に、まごめの名が見える。天正9年（1581年）、木曾義昌が武田家を見限ると馬籠城は木曾氏の支城となった。天正12年（1584年）小牧・長久手の戦いの際には豊臣秀吉側に付き、馬籠城に島崎重通（島崎藤村の祖先にあたる）を入城させたが、徳川家康方の菅沼定利・保科正直・諏訪頼忠の連合軍が現在の馬籠宿の北に陣を張り馬籠城を攻める事を知った島崎重通は、山村良勝の守る妻籠城に逃げ、そこで徳川勢を撃退した。馬籠城はそのまま放置されたが馬籠は戦火から逃れた。慶長5年（1600年）関ヶ原の戦い以後、徳川氏の領土となり、元和元年（1615年）以降は尾張国徳川氏の領地になったが、特に手は加えられず廃城になった。