2013年3月16日のダイヤ改正で東海道本線での運用を終了した。同月18日にはC1編成がサハ205を抜いた6両に減車のうえ、約2年ぶりに阪和線の運用に復帰している。その後、他の3編成についても同様の形で阪和線に再び転属し、同線に所属する103系の6両編成との共通運用に就いている。4編成とも当初は引き続き東海道本線時代のままの帯色で運用されていたが、2014年1月より順次、スカイブルーの帯に戻され、その際新たに前面の帯下部と乗務員室扉には細いオレンジのラインが2本追加された、同年2月17日に全4編成の変更を終えている。オレンジのラインは、最高速度の異なる0番台と1000番台を区別するための視認用のもので、6連の0番台は103系と共通運用であるが、4連の1000番台は共通運用を組んでいない。また運転台には「この編成は205系0代」と書かれたシールが貼付されている。なお、編成から外れたサハ205形4両は2015年9月9日付で廃車された。2018年3月17日のダイヤ改正で、阪和線の全快速・普通列車が223・225系で統一されるため、205系電車は運用を終了した。
2010年12月1日までに225系5000番台が日根野電車区に配属されたこと、また翌年のダイヤ改正から直通快速が207系・321系に置き換えられることによる車両補充を見越して0番台の全車が11月から12月にかけて宮原総合運転所（現・網干総合車両所宮原支所）に転出し、207系・321系に準じた帯色に変更された。転属に際し、全4編成がサハ205形1両を増結した7両編成となった。その後2011年3月12日のダイヤ改正より朝ラッシュ時限定で東海道本線（JR京都線・JR神戸線）の京都駅・高槻駅 - 大阪駅・尼崎駅間で運用を再開した。
0番台、1000番台ともに転属歴がある。0番台は京阪神緩行線と阪和線の運用を行き来している。1000番台は新製以来約30年に渡って阪和線で運用していたが、2018年3月のダイヤ改正を以って阪和線から転属し奈良線の運用に就くこととなった。
現在のJR東日本所属車両の座席表地（一般席）は京葉線向け車両はマリンブルー色、600番台は赤色、それ以外の車両ではグリーン色で区分柄入りのものを使用している。また、横浜線向け車両、南武線向け車両と武蔵野線向け車両では、座席横袖仕切板上部にアクリル製の風除け板が取り付けられている。各車両間には転落防止幌が設置されている。JR東日本に所属する車両は、2008年春までに優先席付近のエリアを明確にするためにつり革がE233系で使用されているオレンジ色の細長い三角形のものへ交換された。
ウィリアムズ・ルノーのナイジェル・マンセルがシーズン16戦中9勝という圧倒的な強さを見せ、シーズン中盤の第11戦ハンガリーグランプリで早々とタイトルを決めた。これまで何度もタイトルに絡みながらチャンスを逃し、無冠の帝王と呼ばれていたマンセルにとっては悲願のタイトル獲得となった。前年はタイトル争いであと一歩及ばなかったウィリアムズ・ルノーは、アクティブサスペンションやトラクションコントロールなどハイテク装備を搭載したニューマシン・FW14Bを満を持して投入、16戦中10勝、1-2フィニッシュも6回、コンストラクターズ・ポイントは165ポイントと、2位マクラーレン・ホンダに対して65ポイントの大差をつけた。この強さに目を付けた、当時休養中だったアラン・プロストやアイルトン・セナによるシート争奪戦が勃発する。その結果、チャンピオンを獲得したマンセルはF1からの引退を表明（アメリカのインディカー(CART)に転向、のちにスポット参戦で復帰）、リカルド・パトレーゼもベネトンへ移籍を表明する。翌年はプロストと当時テストドライバーであったデイモン・ヒルの体制になる事が発表された。マクラーレン・ホンダは、前年チャンピオンとは程遠い勢いで苦戦を強いられ、最終的にはシーズン16戦中5勝を挙げたものの、ベネトンと2位争いをする状態であった。そんな中、第10戦ドイツグランプリの直前にホンダが今期限りでF1から撤退することを発表した。ベネトン・フォードは「バナナノーズ」と呼ばれるB192をヨーロッパラウンドから投入。ハイテクデバイスこそ全く搭載されなかったものの、抜群の空力性能にコーナリング性能で度々マクラーレン勢を脅かし、ベルギーGPでミハエル・シューマッハがF1初優勝を飾るとともにマーティン・ブランドルとのコンビで全戦で入賞を記録した。フェラーリはこの年も不振を極め、序盤からリタイアが相次いで3位がわずかに2回とふるわず、コンストラクターズ・ポイント3位のベネトン・フォードに大きく引き離された。中段チームでは、ロータスがトップ4チームに次ぐランキング5位を記録。ミカ・ハッキネンとジョニー・ハーバートがしばしばトップチームを脅かす健闘を見せた。他にはフットワークのミケーレ・アルボレート、ティレルのアンドレア・デ・チェザリスと言ったベテランの好走も光った。ドライバーズポイントでは、1991年途中からデビューしたミハエル・シューマッハがフルシーズン参戦最初の年となったこの年に53ポイントで3位に入り、マクラーレンのセナやゲルハルト・ベルガーを上回った。デイモン・ヒル、クリスチャン・フィッティパルディ、片山右京といったドライバーがデビュー。またF1で5人目の女性ドライバー、ジョバンナ・アマティもデビューしたが、予選を通過することなく序盤で姿を消した。一方でマンセルの他にステファノ・モデナ、マウリシオ・グージェルミン、ヤン・ラマースといったベテランドライバーが引退。コンストラクターではブラバム、マーチ、フォンドメタル、アンドレア・モーダ、スクーデリア・イタリアに供給していたダラーラ（翌年からローラに変更）が撤退した。また、ベンチュリー名義で参戦したラルースも93年シーズンから本来の名称で参戦した。タイヤはグッドイヤーのみのワンメイクとなった。一世を風靡したQタイヤ (予選専用スペシャルタイヤ) がこの年から禁止となった。また、シーズン途中の第11戦ハンガリーグランプリからはスペシャルガソリンの使用も禁止された。当時はレース中の給油は禁止されており (1994年-2009年は再給油が認められていた) で、エンジンの燃費や燃料の良し悪しが重要な要素となっていた。この年からセーフティカーがレギュレーションに加わる（翌年のブラジルグランプリで制定後初めて実戦で運用された）。日本ではバブル崩壊による景気後退もあり、一頃、F1に大量に流入していたジャパン・マネーの撤退も進んでいた。