1964年（昭和39年）3月26日設立。当初は株式会社別府ステーション・センターという社名で、大分県別府市駅前町12番13号に本社を置き、1966年（昭和41年）10月1日に開業した別府駅ビル内の商業施設別府ステーションセンター（現在の別府駅商業施設）及び別府駅ビル駐車場の運営を行っていた。かつては第三セクター企業であり、別府市が株式を保有していたが、別府市は2007年（平成19年）に株式を売却している。大分駅新駅ビルの開業が2015年春に予定されたことを踏まえ、2012年（平成24年）11月25日に大分ターミナルビル株式会社に社名を変更。さらに2014年（平成26年）4月1日には本社を大分市に移転した。このように、企業活動の中心が別府ステーションセンターの運営から大分駅新駅ビルの運営へとシフトする中で、別府ステーションセンターの運営は同じJR九州グループのJR九州ビルマネジメント株式会社に移管されている。2014年10月1日には、大分駅新駅ビルの名称をJRおおいたシティとすることを発表するとともに、社名を株式会社JR大分シティに変更している。なお、2019年4月1日のグループ内再編で株式移転を以て、同日に設立されるJR九州駅ビルホールディングス株式会社の子会社となる。
2015年8月10日、志賀高原で行われていた夏期合宿において、宿泊先である一つホテルで生徒から預かった貴重品が、盗難にあった事実が判明した。早稲田アカデミーによると、盗まれたのは生徒およそ340人の財布と、スマートフォンおよそ120台。合宿は8日～12日までの日程行われ、初日に生徒から貴重品を集めていた。塾では貴重品は例年はホテルに預けていたが、今年は部屋ごとに集めて布袋に入れ、それらを初日の夕方に複数の段ボール箱に入れ、ホワイトボードで仕切ったロビーの一角に置いた。9日午前2時にはあったのが塾側が確認しているが、午前7時に再度確認したところ、なくなっていたという。ホテルは塾の貸し切りで、玄関は無施錠だった。生徒1人辺りの所持金は3000～4000円であった。塾の担当者は「数人が相部屋のため、子ども同士の盗難やトラブルを防ぐ目的で貴重品を集めた」と説明し、謝罪。塾側は9日、長野県警中野署に被害届を出し、保護者全員に電話で事情を説明したという。2015年8月11日、早稲田アカデミー・山本 豊取締役が、管理に落ち度があったことを謝罪。被害について同塾が全額補償することを発表した。なお他のホテルで行っている合宿では、被害の報告はなかったという。2015年8月11日に、早稲田アカデミー公式HP上で、本件に関する謝罪と保護者への告知が行われている。また、2015年8月14日には、本件に関する見解を公開。2015年10月26日には、その後の状況も報告している。2016年5月11日、別の窃盗事件で既に逮捕されていたホテルの元従業員が本事件について窃盗と建造物侵入の疑いで再逮捕され、容疑を認めている。
「日本一の夏期合宿」と銘打ち、毎年8月に志賀高原（小4、小5、小6、中1、中3）と苗場（小６、中2、高2、高3）で夏期合宿を行っている。
カンバーランド郡は第二次世界大戦後に人口が急増し、1960年代は増加率が43％となって、ノースカロライナ州の100郡の中でも最大の数字になった。商業開発や郊外小区画の開発がファイエットビル市域の外、フォートブラッグ基地やポープ空軍基地の方にまで拡がり、家屋などの建設が急ピッチで進んだ。ファイエットビルとカンバーランド郡の教育学区は1960年代初期から次第に統合の方向に進み、1970年代にはバス通学によって大規模な学区統合が進んだ。ファイエットビル州立師範学校（現在のファイエットビル州立大学）の学生が先頭にたった公民権運動の行進やシットインによって、レストランでの白人へのみのサービスや劇場での差別シートの慣習が終わらせられた。政治が変化し、1960年代から1980年代初期に掛けて黒人や女性がかなりの数で公職を得るようになった。ベトナム戦争の時代はファイエットビル地域でも変化の時代だった。フォートブラッグから多くの部隊を送り出した訳ではなかったが、1966年から1970年に掛けて、20万人以上の兵士が出征する前の訓練を受けた。このような大人数が入れ替わり立ち替わり動いたことの効果は劇的であり、この時代の名残が今のファイエットビルでも見ることができる。ファイエットビルでの反戦運動は、概して戦争を支持していた市の近くにフォートブラッグがあったために全国的な注目を浴びた。ジェーン・フォンダは市内であった反戦行事に出席するため、3度ファイエットビルを訪れた。1960年代と1970年代のこのような変化のために、ファイエットビル市は「ファイエットナム」というような渾名がついて、今日でも使われている。またこの時代の1970年には、陸軍軍医ジェフリー・R・マクドナルドがフォートブラッグにあった自宅で妊娠中の妻と2人の娘を殺すという事件があり、全国紙の見出しを飾った。ファイエットビル市はその中心街の様々な再開発プロジェクトでそのイメージを変える試みを行ったが、諸々の結果を生んだ。空挺部隊特殊任務博物館、ファイエットビル地域交通博物館、ファイエットビル・リニアパークおよびファイエットビルお祭り公園のような新設物件が2006年後半にオープンし、中心街を変えることに幾らかの貢献を果たした。ファイエットビル市は今でも犯罪率が大変高い状況にある。ファイエットビルとそれを取り囲む田園部は過去10年間に急速な発展を経験した。この成長はホープミルズ、レイフォードおよびスプリングレイクのような郊外地にまで達した。カンバーランド郡の西部は近年ファイエットビル市に併合された。2008年、「ベストライフ・マガジン」がアメリカ合衆国国勢調査局、教育統計全国センター、FBI、アメリカ博物館協会、健康統計全国センターおよびアメリカ法律家協会のデータを使って、アメリカで子育てに適した都市ランキングの悪い方から3番目にファイエットビルを上げた。「ホエア・トゥ・リタイア」誌はファイエットビルを退職後に住むのに適した都市の一つに挙げた。2005年、連邦議会は基地再編閉鎖計画に従い、フォートブラッグは新しく幾つかの司令部を受け容れるものとした。アメリカ陸軍はアトランタの国軍司令部と予備役司令部を閉鎖し、これをフォートブラッグに移すことになった。この司令部の移転とこれを支える事業の移転により3万人以上が地域内に入ってくることが予測されている。国軍司令部は毎年3,000億ドルの発注を行っている。