ローデンバッハにおける宗教改革のため、ニーダーローデンバッハの牧師ミヒャエル・ヴァインブレンナーが招聘され、1527年に着任し、1556年までこの地にあった。ヴァインブレンナーは、ハーナウ伯領の他の牧師達と同様に、速やかに宗教改革を遂行した。1549年にマインツ大司教の命令によって巡察が行われるまでカトリックに留まっていたのは、伯領内の22の教区の内、わずか5教区だけであった。しかし、1527年以前にはすでに教会側からの働きかけが必要な状態であった。1525年と最終的には1527年に、ローデンバッハの農民たちが1468年に創設されたヴォルフガング修道院を破壊した。この修道院は、現在はその跡だけが遺されている。修道士たちの理想的とは言い難い素行に対して非難がなされた。暴力や宴会が非難の的となった。農民のこうした行動に対して、ハーナウ伯は処罰を与えなかった。宗教改革は、宗教上のみならず、社会生活や文化活動、特に教育に影響を及ぼした。これはルターのパンフレットにある「ドイツのすべての街の市参事会にキリスト教の学校を設立し、運営すべきである」という文言に直結していた。ここで、16世紀後半までハーナウにも学校がなかったことに注意すべきである。1606年になってやっと、フランクフルトの最初の学校が記録されている状態であった。一方、ローデンバッハでは早くも1540年頃に学校教育が始まっていたという証拠が見られる。さらに、ニーダーオーデンバッハは、1539年の「聖マルティヌス」の日に、「ハーナウの学校教師に」それまで1年分の報酬 1 ギルダーを支払っている。しかしその後、ハーナウからの請求はなく、こうした支出は記録されていない。1544年に「シュトラスブルクの歌の本」を2冊購入したのも教育の萌芽と見なされている。このうち1冊はもちろん牧師のものだが、もう1冊は助手の手に渡り、合唱が奨励された。最初の本当の学校は、1600年頃の世紀の変わり目にあったことが証明されている。その教師について1599年にすでに最初の記録が遺されている。
1493年に大火がこの村を襲い、多くの人命が犠牲となった。多くの家屋の他に、教会もすべての備品と共に破壊された。犠牲者の中に3人のユダヤ人男性と7人のユダヤ人女性が含まれていた。これは、ハーナウ伯が埋葬に関して質問するためにフランクフルトのユダヤ人コミュニティーに質問した2通の書状から判明した。ユダヤ人家族に関する文献上の証拠はその後の世紀にも常に見られ、15世紀末から国家社会主義の時代に至るまで、ローデンバッハにもユダヤ人社会が存在していたことを示している。
こうした13世紀から14世紀の史料からは、ローデンバッハがすでに2つの集落からなっていたのか、どちらか一方だけであったのかという証拠は見つかっていない。しかし、14世紀から15世紀の文献には、オーバーローデンバッハにマインツのペテロ修道院の土地が記録されており、これに対してニーダーローデンバッハは明らかにハーナウ伯の勢力下にあることが示されている。ニーダーローデンバッハとオーバーローデンバッハとを区別した最初の文献記録は、1338年のランゲンディーバッハ教区教会（現在のエルレンゼー市内）の収益簿にある「Item in Rodenbach inferiori VI denar」という記述である（inferiori は低位を意味する語であり、Rodenbach inferiori でニーダーローデンバッハを明示している）。この文献には、何が 6 プフェニヒであったのかという記述も、「Rodenbach superiori」すなわちオーバーローデンバッハに関する記載もない。しかし、「ニーダーローデンバッハ」という名前が記載されていることから、1338年には「オーバーローデンバッハ」も存在すると考えるのが自然である。
浄土真宗の総本山である本願寺との交流も活発に行われた。当寺の第12世住職・慶順は第8代・蓮如と親交があり、第13世住職の善祐は蓮如から本尊を下付された。また、天文16年（1547年）8月から同17年（1548年）2月にかけて第10代・証如の下で三十日番を務めていることから、当寺が本願寺の末寺の中でも比較的高い立場にあったことが推測される。戦国期に入ると古河公方との関係を深め繁栄した。大永3年（1523年）に第3代公方の足利高基から磯辺郷之内大坊宛に禁制が下されているが、これは高基と小弓公方・足利義明との間で戦闘状態となっていたことから、当寺が軍勢の乱暴を禁ずるよう高基に願い出たものと推測される。また禁制を記した文書にある「大坊」とは当寺を指すものであり、繁栄を示すものとされる。永禄2年（1559年）には古河公方家臣で関宿城主の簗田晴助から当寺に対して、磯部郷の5貫文の寺領が寄進されている。永禄9年（1566年）には関東侵攻を繰り返す越後国の上杉謙信の動きを牽制するため、第5代公方の足利義氏から加賀国の本誓寺へ使者として派遣された。また、永禄11年（1568年）には義氏が辛嶋庄、古河、信濃太田庄の道筋で地域外への物資輸送を禁じる荷留を行ったが、当寺に対しては5疋・5所分の過所を発給し、下総と信濃の地域間を結ぶ物流を担った。こうした措置については、当寺の住職が古河公方の支配地域外へ使者として赴くこともあったことから、その便宜を図ったものと推測される。この時期、一向宗徒と関東地方を結ぶ役割も担っており、大永3年（1523年）の北陸一向一揆の際には当寺住職の普賢が浄土真宗第9代・実如から古河公方への使者を務め、永禄4年（1561年）の越後一向一揆の際には交渉役を務めた。元亀元年（1570年）から天正8年（1580年）にかけて本願寺勢力と織田信長との間で行われた戦い（石山合戦）において、当寺および磯部6か寺も石山本願寺に対して門徒や兵糧を送るなどの支援を行った。