高杉艦隊の攻撃目標がパナマと気づいたアメリカ軍上層部は直ちに集められるだけの空軍部隊とカリブ海艦隊をパナマへと急派した。しかし、前述の通信機、暗号ブックによる欺瞞情報と高杉艦隊に所属する対潜水雷艇母艦『洋鯨』から放たれた魚雷艇を使った陽動作戦に嵌りパナマに展開していた航空戦力半分が留守の間に転戦してきた紺碧艦隊航空部隊がチャフを散布してレーダーを無効化し、高杉艦隊航空戦力の侵入を支援した。太平洋側のミラ・フロレス、ペドロ・ミゲル閘門には艦上爆撃機『銀星』による急降下水中弾爆撃、大西洋側ガトゥーン閘門には艦上攻撃機『蒼山』による雷撃、飛行場には艦上戦闘機『電征』による機銃掃射および滑走路破壊爆弾による攻撃を行い、徹底的に破壊した。一方、大西洋側に駆け付けていたカリブ海艦隊は『蒼山』への対空戦闘に気をとられている隙に紺碧艦隊の艦隊殲滅雷撃を受け、全滅した。
結局、アメリカ政府は原爆開発の発表、中止をしなかったため日本艦隊は行動を開始した。アメリカ側も日本艦隊が行動を起こしていることは掴んでいたが高杉艦隊はサンディエゴまたはロサンゼルスを目標としていると判断、両都市500kmの洋上に防衛線を展開したが高杉艦隊はその隙にパナマへと向かった。そしてココ島東500km洋上にて哨戒中のB-17に発見されこれを不時着水させて乗員および通信機、暗号ブックを鹵獲した。
本攻撃はアメリカ本土ロスアラモスにある原爆研究所破壊作戦『弦月作戦』を行うための支作戦であり、前もって10月に行われた紺碧艦隊による作戦『和』が成功しアメリカ政府が原爆開発の発表、中止を言明した場合は本攻撃も中止される予定であった。なお、本作戦は紺碧艦隊だけではなくハワイに本拠を置く高杉英作司令長官率いる東部太平洋艦隊（以後、高杉艦隊と記す）が主力を勤めた。
前述の『ガトゥーン閘門』および関連施設の攻撃により、ガトゥーン湖の水が全て大西洋へ排水されたことによりパナマ運河は1年近く使用不可能となり、アメリカ合衆国の太平洋側への軍事物資輸送は遅延することになり、反撃準備までに多くの時間が費やされた。また、ハワイから送還された米軍将兵やパナマから流れてくる日本海軍の秘匿潜水艦隊の断片情報に尾鰭が付きデマとなってアメリカ国民に大きな恐怖を与えた（アメリカ政府は正確な紺碧艦隊の情報を掴んでいなかったためこれを隠匿、公式には否定した）。なお、日本側では攻撃成功の情報は国民の慢心を防ぐためあえて報道発表はされなかった。
『乙姫号』を除く紺碧艦隊の4艦は攻撃機収容のためパナマ側に接近していた。しかし、そこへ母艦捜索のために米駆逐艦5隻が出現、攻撃機に収容地点を伝える標色素を発見、爆雷攻撃を開始した。しかし紺碧艦隊は魚雷戦術『G7』を初めて実戦使用し逆に米駆逐艦隊を返り討ちにして浮上、攻撃隊の収容作業を行った。作業終了前には米攻撃機が来襲、負傷者を出したものの全機を収容、離脱に成功した。この後、紺碧艦隊は通商破壊戦を行いながら紺碧島基地へ帰還した。
13日午前3時3分、『富嶽号』をはじめとする攻撃部隊は浮上、訓練の成果もあり10分も掛からずに全攻撃機を発艦させ、 3時25分には編隊を組んで攻撃地点へ向かった。攻撃隊はコロンビア寄りのルートをとり、夜明け直後には大西洋側に到達し、『雷洋』は閘門本体、『春嵐』はガトゥーンダムを初めとする運河施設を狙い攻撃は成功、遅れてきた米迎撃機隊と交戦し数機を撃墜して退けた後、後続部隊を高度1万mまで上昇することによって引き離すことに成功した。
大沢池は中国の洞庭湖を模して嵯峨天皇が築造したものといわれ、平安時代前期の名残をとどめ、日本最古の庭池とされている。当時の唐風文化の面影を今に残す園地は池の北方約100メートルにある「名古曽滝跡」とともに1923（大正12年）に国の文化財として名勝に指定されている。毎年、中秋の名月の頃に、大沢池に舟を浮かべて「観月の夕べ」が催される。大沢池は、嵯峨院の園池を引き継ぐものと推定されているが、これは南東にゆるく傾斜する地形を利用して南から東にかけて長い堤を築することで北西側からの流れをせき止めて築造された 。この池はまた周辺水田の灌漑用水として重要な役割を果たしてきたことが知られている。池の北岸沿いに、西から、天神島、庭湖石、菊の島と並んでいて、この二島一石の配置が華道嵯峨御流の基盤とされている。天神島は嵯峨天皇による造園当時は陸続きで、出島状に北から大沢池へと突出した形状をなし，東西両側が入り江状に入りくんでいたと想定されている。庭湖石は、巨勢金岡が立てたと伝えられる（西行『山家集』）。菊の島は、嵯峨天皇が菊を栽培した場所とされるが、最近の発掘調査で、島が現在の形になったのは室町時代だったことがわかっている。昭和56年から始まった発掘調査によって、名古曽滝跡の現存する滝石組のうち、2石は当初の位置にあるものの、その他の石は後代の手が加わっていること、滝から流れる豊富な水流が、その南方に開削された幅5-10mの蛇行溝（大部分が素堀）を通って大沢池へ注いでいたことが明らかになった。蛇行溝は自然の流れを模して造られた庭園の遣水施設であったと考えられる。嵯峨天皇が譲位を契機として冷然院からこの新院へと遷御した時期に最大幅約12メートル、深さ約1メートル規模拡張され、拡張と同時に流末に水位調節のために石組み溝が新たに設けられ、これによって流路全体がせき止められて池状のたまりとなっていたこと、このことから改修時期には供給される水量が減少し、池の注ぎ口に設けられた溝もやがて埋没し、流水方向に直交して低い土手が築かれてここに帯状に玉石敷が造られると同時に施設の西側に景石が添えられ、この施設によって流路は大きくせき止められて広大なたまりを形成しオーバーフローして大沢池に注ぎ込むこととなっていたものと考えられている。その後、藤原公任が「滝の音はたえて久しくなりぬれど名こそ流れて尚聞こえけれ」と詠ったように平安時代末期には滝の水が既に枯れ、西行の和歌には、滝石が閑院宮に運び去られた、と記されている。