伊賀守護に就任した後、元亀2年（1571年）、伊賀の国人たちによって江州から招かれ、織田信長の支援も得て、伊賀へ入国した。しばらく三田に滞在した後、上野の平楽寺へ城を構えた。伊賀国主として振る舞ったが、国人たちには侮蔑の対象とされており、次第に亀裂が生じていった。更には、百田藤兵衛と仏像をめぐり対立し、天正5年（1577年）に信楽の地へ追放された。（伊乱記）また、「参考伊賀乱記」には流浪して六角承禎に匿われていたが、六角を背き織田信長に近づき、享禄２年（1529年）伊賀に国主に任命されたとあるが、これは元亀2年の誤りか。天正伊賀の乱の後、織田家臣として平楽寺城主に返り咲いたが、本能寺の変の後起きた一揆に攻められ再び没落し、守護としての仁木氏は滅亡した。その後は興福寺に隠遁し、医者として暮らしたことが多聞院日記で分かる。日記によると美女とされた娘がおり、新たに伊賀守護に任命された筒井定次の側室となった。さらに二位殿と呼ばれた息子がおり大乗院に奉公している。
生活世界（せいかつせかい）とはフッサールによって提唱された哲学用語。実際に体験することから知覚することが可能な世界のことを生活世界という。生活世界というのはリアリティを持ってはいるが、個人だけで閉ざされているような世界ではない。個人というのは外部とのつながりを無くしては生活を成り立たせえることが不可能であるから、生活世界の考察からは個人だけでなく、その個人と繋がりを持った人物や社会までが見えてくるということである。
天文19年（1550年）、丹羽氏勝の長男として尾張国岩崎に生まれる。父の後を継いで織田信長に仕えた。天正8年（1580年）に父・氏勝が信長の勘気を被って追放されているが、氏次にはその影響は及ばなかったようで、以後、織田信忠の家臣として仕え、天正10年（1582年）の甲州征伐では木曾義昌・織田長益らと共に信忠軍団の一員として武田領内へ侵攻している。本能寺の変で信長が死去した後はその次男・信雄に仕えて各地で武功を挙げたが、信雄と対立してその勘気を被ったため、翌天正11年（1583年）に徳川家康の家臣となった。天正12年（1584年）の小牧・長久手の戦いでは岩崎城を弟・氏重に守らせ、自身は家康に従って小牧に赴いて武功を挙げた。しかしこのとき、池田恒興と森長可の猛攻を受けて氏重は討ち死にしている（岩崎城の戦い）。その後、家康の取り成しで再び信雄に仕え、伊勢国内に7千石を与えられた。しかし小田原征伐後に信雄が改易されると、再び家康の下で仕えようと豊臣秀吉に懇願したが、秀吉の命により豊臣秀次に仕えることとなる。このとき、長男・氏資を家康に仕えさせている。慶長5年（1600年）の関ヶ原の戦いでは氏次は東軍に属し、家康より尾張・三河を結ぶ重要拠点・岩崎城の守備固めを命じられる。また家康の命により西軍石田三成に味方する岩村城主田丸直昌（直昌本人は大坂城を守備）の攻撃に備えるため妻木頼忠の妻木城の防備を強化する工事のため数百人の人夫を送った。その後、関ヶ原本戦にも参加した功により、三河国伊保に1万石を与えられ、その初代藩主となった。翌慶長6年（1601年）3月19日に死去。享年52（53との異説もある）。跡を次男・氏信が継いだ。
787は、機体の70%近くを海外メーカーを含めた約70社に開発させる国際共同事業である。これによって開発費を分散して負担できるとともに、世界中の最高技術を結集した機体になるとしている。参加企業は下請けを含めると世界で900社におよぶ。イタリア、イギリス、フランス、カナダ、オーストラリア、韓国、中華人民共和国といった国々が分担生産に参加しており、日本からも三菱重工業を始めとして数十社が参加している。ボーイング社外で製造された大型機体部品やエンジン等を最終組立工場に搬送するため、貨物型の747を改造した専用の輸送機が用いられており、日本では部品の生産工場が「アジアNo.1航空宇宙産業クラスター形成特区」（国指定国際戦略総合特区）である愛知県・岐阜県を中心としたエリアに存在するため中部国際空港に定期的に飛来している。三菱重工業は747X計画時の2000年5月にボーイングとの包括提携を実現しており、機体製造における優位性を持っている。1994年に重要部分の日本担当が決定しており、三菱は海外企業として初めて主翼を担当（三菱が開発した炭素繊維複合材料は、F-2戦闘機の共同開発に際して航空機に初めて使用された。この時、アメリカ側も炭素系複合材の研究を行っていたものの、三菱側が開発した複合材の方が優秀であると評価を受けたため、三菱は主翼の製造の権利を勝ち取っている）、川崎重工業が主翼と中胴の結合部と中央翼、富士重工業（現・SUBARU）がセンターボックスと主翼フェアリングに内定していた。計画は747Xからソニック・クルーザーを経て787となり、三菱が主翼、川崎が前方胴体・主翼固定後縁・主脚格納庫、富士が中央翼・主脚格納庫の組立てと中央翼との結合を担当している。エンジンでも、トレント1000に川崎、GEnxにIHI、両エンジンに三菱（名誘）が参加している。機体重量比の半分以上に日本が得意分野とする炭素繊維複合材料（1機あたり炭素繊維複合材料で35t以上、炭素繊維で23t以上）が採用されており、世界最大のPAN系炭素繊維メーカーである東レは、ボーイングと一次構造材料向けに2006年から2021年までの16年間の長期供給契約に調印し、使用される炭素繊維材料の全量を供給する。ボーイング787の大型部品をアメリカ等の工場へ空輸する際は、ボーイング747ドリームリフターが使用される。