オバノンはカリブ海で短期間の訓練の後、1942年4月29日にボストンを出港し、すでにガダルカナルの戦いが始まっていた太平洋南西部へ向かった。日米両軍による一進一退の激戦が続くソロモン諸島において、オバノンは第21駆逐戦隊（Destroyer Squadron 21, DesRon 21）に加わり活躍、同隊の他の艦と共に殊勲部隊章を受章した。1943年3月の編成当初の第21駆逐戦隊は、旗艦ニコラス以下、オバノン、フレッチャー（USS Fletcher, DD-445）、ラドフォード（USS Radford, DD-446）、ジェンキンス（USS Jenkins, DD-447）、シャヴァリア（USS Chevalier, DD-451）、ストロング (USS Strong, DD-467)、テイラー（USS Taylor, DD-468）から成っていた。1942年10月を通して、オバノンは上陸部隊の防衛、ヌーメアとエスピリトゥサント島からガダルカナル島およびツラギ島への護衛任務、ガダルカナル島、ムンダとコロンバンガラ島への艦砲射撃、「ザ・スロット」（ニュージョージア海峡）での夜間哨戒、日本軍の増援部隊輸送に対する警戒といった多様な任務を実施した。オバノンはニューカレドニアのヌーメアを拠点に、10月9日に護衛空母コパヒー（USS Copahee, ACV-12）を護衛して最初の護衛任務を実施した。コパヒーはヘンダーソン飛行場へ展開させる海兵隊所属の20機のF4Fワイルドキャットを輸送していた。オバノンは同月の間、ニューヘブリディーズとソロモン諸島南部で護衛任務を実施した。11月7日、ヌーメアにてオバノンはダニエル・J・キャラハン少将の支援艦隊に加わり、緊急の増援部隊、補充部隊、糧食、弾薬、そして航空機材を輸送する船団の護衛に備えた。ガダルカナル島への途上、オバノンは浮上中の敵潜水艦を発見、砲撃によって潜航させ船団を安全に通過させた。11月12日の午後、一部が空荷の輸送船団を護衛中に16機の敵雷撃機による襲撃を受けたが、11機を撃墜。オバノンはそのうち4機の撃墜を記録している。11月13日の第三次ソロモン海戦の第一次夜戦では、オバノンは戦艦比叡に果敢に攻撃をかけ、主砲で射撃できない至近距離まで接近した。オバノンの射撃は他の艦による攻撃と共に比叡に大きな損傷を負わせ、翌日処分へ追い込んだ。一説によると、オバノンはまた重巡洋艦サンフランシスコ (USS San Francisco, CA-38) と共同で駆逐艦暁を撃沈したともされる。1943年4月5日午前2時18分、第21駆逐戦隊の僚艦ストロングと共に夜間の沿岸砲撃任務から帰投中だったオバノンは、ラッセル諸島付近で日本の潜水艦呂号第三十四潜水艦が浮上しているのを9,350ヤード（約8,550m）の距離からレーダーで発見、急速に距離を詰めて午前2時30分に体当たりを試みた。しかし衝突する直前、艦長ドナルド・マクドナルド（Donald MacDonald）少佐らオバノンの士官たちは呂三十四を機雷敷設艦と誤認して衝突を避けるため急転舵を命じた。この行動の結果、オバノンは呂三十四の真横に並ぶことになった。この時、呂三十四の乗員が甲板上の8cm高角砲で攻撃を行おうとしているのを確認したが、阻止しようにも近すぎて主砲は使用できず、またオバノンの乗員たちは接近戦を想定しておらず小火器を持っていなかった。そのため、やむなくオバノンの乗員は何かしら彼らに抵抗する道具を探し、近くの保存容器に入っていたジャガイモを掴むと呂三十四に投げつけたとされる。そして、呂三十四の乗員は投げつけられたジャガイモを手榴弾と誤認し、慌てて投げ捨てながらオバノンから船体を離した。しかし艦長のマクドナルド少佐によるとこれは事実ではない。彼は、「潜水艦が非常に近接していたのでオバノンの司厨員がジャガイモを投げられると信じていた」とだけ語っている。マクドナルド少佐は実際にはジャガイモが投げられていないと繰り返し主張してきたが、「アメリカの駆逐艦が日本の潜水艦をジャガイモで沈めた」という話はメディアに取り上げられ、今日でもよく信じられている伝説が急速に広まったという。この事件を記念して贈られた飾り板は1970年代までメイン海事博物館で展示されていたが、その後所在不明になっている。ジャガイモを投げたのかその真偽はともかく、オバノンは射撃可能な距離に離れた呂三十四を約1,000ヤード（約914m）から5インチ砲で射撃して少なくとも1発を命中させ司令塔に損傷を与えた。呂三十四はなおも潜航したため、オバノンは爆雷8発を投下した。この攻撃の後に呂三十四が艦尾から沈んでいくのが見え、翌朝には厚い油膜が広がっていた。これが呂三十四の最期であったとみられている。またこの期間、オバノンは少なくとも2機の敵機を撃破している。この頃の戦況は、オバノンと乗員たちに緊張を強いた。入港している時間はわずかであり、短時間の補給を行うとすぐに再度出撃していった。オバノンは多くの水上戦闘に加わっている。7月6日にクラ湾夜戦に参加、一週間後にはコロンバンガラ島沖海戦を戦っている。続く2か月間、オバノンは大部分をベラ湾で過ごし、上陸援護、日本の増援輸送とその護衛の阻止、敵機への防空任務に従事した。第一次ベララベラ海戦をはじめとする数々の哨戒任務を通じ、オバノンは姉妹艦たちの助力を受けて数隻の舟艇、2隻の駆潜特務艇、1隻の武装艇、そして砲艇1隻を沈めた。この海域における戦いのクライマックスであった10月6日の第二次ベララベラ海戦では、オバノンとセルフリッジ（USS Selfridge, DD-357）、シャヴァリアの3隻が魚雷と砲撃で駆逐艦6隻からなる日本の夜襲部隊に攻撃をかけ駆逐艦夕雲を撃沈した。しかしシャヴァリアとセルフリッジが被雷し、オバノンもシャヴァリアの後方に接近しすぎていたため避けきれずシャヴァリアの艦尾に衝突してしまう。オバノンは艦首を破損したが、損傷した2隻の僚艦を護衛しシャヴァリアの乗員を救助した。その後日本側は退避していった。オバノンはツラギにおいて損傷の修理を行った後、オーバーホールのために西海岸へ向かった。1944年3月18日にソロモンに戻ってきたオバノンは、ニューギニアでの勝利以降西方へと続く各地への上陸戦に参加することになった。オバノンがレイテ島の戦いに参加する部隊を乗せた船団を護衛してホーランジアを出港した10月18日までの間、オバノンは各地で護衛や上陸支援に従事している。船団はレイテ沖海戦の直前の10月24日に無事に到着した。オバノンは空襲の中、北部上陸地域の防衛や海戦中のレイテ湾口警戒を行っている。1945年6月までの間、オバノンは主にフィリピン各地での護衛、戦闘任務をおこなった。一連の活動には、オルモック湾、ミンドロ島、リンガエン湾、バターン、コレヒドール、パラワン島、サンボアンガ、セブ島そしてカラボアでの戦闘が含まれる。初期には頻繁に空襲が行われたが、オバノンは数機の敵機を撃退した。リンガエン湾で活動中だった1945年1月31日、オバノンは3隻の駆逐艦と共同で敵潜水艦を撃沈した。この潜水艦は戦後調査された日本側の記録から、呂号第百十五潜水艦であったと考えられている。4月の終わりから5月初めにかけて、オバノンはフィリピンでの活動を中断してタラカン島とボルネオ島で火力支援を行ったほか、現地での掃海作業の援護を実施した。オバノンは6月17日に沖縄近海で護衛空母群と会合し、先島諸島を空襲する彼らを護衛した。7月には本州北部と北海道を空襲する大型空母の護衛を行った。終戦に伴いオバノンは8月27日まで本州近海の哨戒を実施。戦艦ミズーリ（USS Missouri, BB-63）が東京湾に入った時、オバノンはニコラスとテイラーと共にミズーリを護衛した。これは「南太平洋から最後の最後までの長い道程での彼女らの勇敢な戦いのために」（because of their valorous fight up the long road from the South Pacific to the very end.）というウィリアム・ハルゼー大将の言葉によるものだった。それから降伏文書調印式の前日である9月1日まで哨戒を実施した後にサンフランシスコへ向けて出港し、日本近海から初めて本国に凱旋した艦艇となった。オバノンはオーバーホールの上で1946年5月21日に退役した。