雨上がり決死隊デビュー後、単独では初めての冠番組。なお、複数の芸人がメインとして出演した冠番組としては過去に同じテレビ朝日で放送された『アメジャリチハラ』（1996年10月〜1997年3月、雨上がり決死隊・ジャリズム・千原兄弟3組合同の冠番組）という番組があった。まず2002年10月3日に単発スペシャル番組『苦節14年 初冠特別番組 雨上がり決死隊!!』が放送。この時既にゲストを迎えてのトークというスタイルが出来上がっていた。その後、同様に単発で2度（同年12月7日、2003年3月24日）放送され、その時のゲストは陣内孝則ほか。2003年4月8日から晴れて『雨上がり決死隊のトーク番組 アメトーク!』としてレギュラー番組化された。2006年9月26日までは放送時間がネオネオバラエティ（ネオバラエティ第2部）にて、毎週火曜日未明（月曜日深夜） 0:16 ‐ 0:46（後に0:15 - 0:45に1分前倒し）だった。2006年9月に『クイズプレゼンバラエティー Qさま!!』のゴールデン枠進出により、同年10月12日から現在の放送時間のネオバラエティ（ネオバラエティ第1部）となった。宮迫によると「放送時間が2倍になったから」という理由でタイトルに長音符が1本追加された（厳密には25分拡大、その後さらに5分拡大したため名実共に2倍になった）。これは木曜昇格1回目の放送時にて言われたもので、宮迫曰く「ゴールデンで2時間スペシャルをやったらタイトルは伸ばしが4本（アメトーーーーク）になる」とのこと。ネオバラエティに昇格して初のゴールデンタイムでの放送（2007年9月20日）は3時間番組で、その言葉通りタイトルが「アメトーーーーーーク」と長音符6本になった。また、以降もゴールデンでのスペシャルでは、放送時間30分ごとに長音符1本付いたタイトル表記になっている。ゴールデンタイムで特番が放送された日に、通常枠でも「延長戦」として通常放送を行う場合もある。毎年12月30日の5時間SPは『輝く!日本レコード大賞』と時間帯が被るため『輝く!〇〇名』が付くようになった。その後、木曜日以外にも特番を放送する(主に改編期の金曜日だが、後述の通り、土曜日と日曜日に特番が組まれたこともある)ケースが増えており、その場合は翌週にレギュラー枠で「延長戦」を行っている。特番の放送の翌週(または数週後)には諸事情でゴールデンタイムでは放送出来なかった部分を「ゴールデン未公開スペシャル」として1回、もしくは2週に分けて放送する。このバリエーションとして、スペシャル放送での企画の一つを一時間全て使い、ゴールデン未放送場面も含め放送する「完全版」がある。また、特番の直前の回ならびに番組DVDの発売前後には、コーナーの切り替わり時とCM開けのタイミングで、これらのスポットPRが流れる。毎年7月にテレビ朝日が独占中継をしている『全英オープンゴルフ』中継時と、年末年始には放送休止となる（その他不定期にスポーツ中継による休止もある）。8月は高校野球関連番組『熱闘甲子園』で30分、改編期に21時枠のドラマ枠拡大（主に初回）で15分それぞれ繰り下がる。高橋茂雄（サバンナ）が企画した「中学の時イケてないグループに属していた芸人」で、2009年1月の月間ギャラクシー賞を受賞した。また、この番組で取り上げられ話題を呼んだ「雛壇芸人」「家電芸人」が2009年のユーキャン新語・流行語大賞にノミネートされた。深夜番組にも関わらず、視聴率は平均で10%ほど（ビデオリサーチ調べ、関東地区・世帯・リアルタイム）あり、時には15%前後（ビデオリサーチ調べ、関東地区・世帯・リアルタイム）を取ることもある。2012年6月21日の「広島カープ芸人」では、広島ホームテレビにて歴代最高となる21.1%（ビデオリサーチ調べ、広島地区・世帯・リアルタイム。なお、同日のテレビ朝日は13.0%〈ビデオリサーチ調べ、関東地区・世帯・リアルタイム〉）を記録した。マイナビニュースが2012年4月に同会員を対象に行なったアンケートでは「毎回欠かさずに見ているテレビ番組」で1位となっている。また、業界視聴率が高いということもあって、この番組をきっかけに知名度を上げブレイクした芸人や再ブレイクした芸人も多い。サバンナ、有吉弘行、ケンドーコバヤシ、野性爆弾、ピース、レイザーラモンRG、椿鬼奴、博多大吉などがその例である。毎週火曜日23時15分（朝日放送テレビは遅れネット）から放送されている『ロンドンハーツ』とは姉妹番組にあたり、番組の終盤ではロンドンハーツの番組予告が流れる。2012年5月1日には当番組とのコラボ番組が放送された。放送内容は、『アメトーーク!』に『ロンドンハーツ』の司会のロンドンブーツ1号2号や同番組に出演頻度が多いゲストが出演して、逆に『ロンドンハーツ』に『アメトーーク!』の司会の雨上がり決死隊や同番組に出演頻度が多いゲストが出演するという、お互いの番組に出演し合う内容だった。2016年4月より、『ロンドンハーツ』は火曜日21時から金曜日21時に枠移動となり『金曜★ロンドンハーツ』として放送されることになり、それを受け2016年4月8日には、19:00 - 23:09に『金曜★ロンドンハーツ&アメトーーーーク!姉妹番組4時間SP!!』として本番組の特番後に『金曜★ロンドンハーツ』としての初回が放送された。当週は『報道ステーション』がメインキャスター交代とスタジオセット改修工事に伴う全曜日休止のため、初めて年末以外で『報道ステーション』を休止する形で22時にまたがる。2016年7月1日にも、19:00 - 21:48に『アメトーーク&金曜★ロンドンハーツ姉妹番組3時間SP!!』として、両番組合体形式での3時間スペシャルが放送された。2018年10月4日放送分より23:20 - 翌0:20枠に変更された（5分繰り下げ）。同時に正式開始時刻も23:20:00に変更。2019年4月18日の放送終わりに2月14日に放送した「高校中退芸人」の内容に事実と異なる内容や差別的表現があったとして謝罪した。また、同番組公式サイトにも同様の謝罪文を掲載した。2019年6月に、宮迫による反社会的勢力とのいわゆる闇営業問題が発覚。この影響で、問題発覚後の6月13日の放送では、ナショナルスポンサー4社のうち、2社がACジャパン（30秒×2）のCMに差し替え、翌週の6月20日の放送では、ナショナルスポンサーの提供クレジットが自粛となり、残っていたスポンサーのうち、1社がACジャパンのCMに差し替え、さらに、翌6月27日の放送では、ナショナルスポンサー全社がACジャパンに差し替えとなったほか、吉本興業が2019年6月24日に宮迫を含む11人の芸人の謹慎処分を発表したことに伴い宮迫の出演部分がカットされた。テレビ朝日は「当面の間、宮迫の出演を見合せる」としている。なお、宮迫は同年7月19日に吉本から契約解消（その後処分撤回）されている。これらの影響で、2019年は人気企画である「高校野球大好き芸人」の放送が見送られるなど、番組の内容にも影響が広がっている。問題発覚後、宮迫不在で初の収録・放送となった2019年8月1日放送「スポーツ推薦芸人」では宮迫の代役として有吉弘行・陣内智則が出演し、蛍原と共に出演メンバーとトークを展開した。番組では当分の間蛍原と代役の組み合わせで収録を続ける。9月26日放送の「ツッコミ芸人が選ぶ　このツッコミがスゴイ！」では、平均視聴率は9・0％（ビデオリサーチ調べ、関東地区）に達し、今年最高の数字を記録し、10月10日に放送した『～クセがすごい女性グループ～BiSHドハマり芸人』も8・5％と高視聴率を記録した。