1992年（平成4年）11月1日、ソニーが初のMDプレーヤー「MZ-1」と60分のブランクディスク「MDW-60」を、翌1993年（平成5年）4月10日に74分タイプの「MDW-74」を発売した。同年10月には富士フイルム（AXIA）やTDK、日立マクセル（現・マクセル）のそれぞれがブランクメディアを発売した。当初は録再機器もディスクも非常に高価格であったため、全くと言っていいほど市場が拡大しなかったが、90年代中頃以降、ソフトを持ち運ぶ必要があるカーオーディオや携帯音楽プレーヤーなど、若年層をターゲットとする業界では、その手軽さ（CDに比べて）と高音質（カセットに比べて）が受け、カーオーディオではCD＋MDの2DIN一体機が、携帯プレーヤーではMDウォークマンタイプが主流となった。その後、これら持ち運び文化のある若年層の更なる需要に応えるべく、1999年（平成11年）2月10日にはソニーから80分ディスク「MDW-80H」が発売され、また2000年代に入ると、今度はMDLP対応機種が発売されて、長時間の再生に対応したことや、カーオーディオやMDウォークマン等でMDに馴れた若年層の間で、今度は家庭用MDコンポやMDラジカセ等も普及したことで、全盛期を迎えた。但し、前述のようにセパレートタイプのステレオやデッキの製品数が少なかったことから、オーディオマニアの間ではほとんど普及せず、また従来型のラジカセを愛用する保守的な中高年齢層にも受け入れられなかったため、コンパクトカセットを完全に代替するには至らなかった。海外では全く普及せず、当初のコンセプトでもあったコンパクトカセット並みの普及には程遠い結果となり、音楽ソフトも前述のソニー・ミュージック系を中心としたものがわずかに存在した程度だった。MDに用いられているATRACも、ネットワークウォークマンの海外向けモデルでは2007年（平成19年）秋頃から対応が打ち切られるなど、こちらも海外では全く普及しなかった。MDおよびATRACは事実上、日本独自のメディアフォーマットになっている。当初はソニーが海外向けにウォークマンのみならず据置型デッキ・ミニコンポ・カーオーディオ機器を開発・発売し、オーバーシーズモデルのカタログにも掲載されていた。一部完全な海外専用モデルも存在したが、既に生産・販売終了となっている。その結果、現在販売されている海外向けオーディオフォーマットはCD（CD-R/CD-RWを含む）とコンパクトカセットが主流である。2019年（平成31年）現在、iPodやメモリータイプのウォークマンなどに代表されるデジタルオーディオプレーヤーやデジタルメディアプレーヤー、Google Play Musicのロッカー機能などのオンラインストレージサービス、音楽再生に対応したスマートフォンなどの普及により、MD市場はほぼ終焉している。またCDからの録音に関しては2000年代に入り、CD-R/CD-RWが普及し、更に会議・会話・野外録音などの分野では同じく2000年代にICレコーダー（前者・中者）、およびリニアPCMレコーダー（後者）が着実に普及したためMDを使用するメリットは相対的に低下した。特にポータブルMDプレーヤー/レコーダーに関しては2007年（平成19年）3月以降パナソニックを皮切りに各メーカーが次々と生産・販売から撤退し始め、これ以降約1年間でソニー以外のメーカーは全てポータブルMDプレーヤー/レコーダーの生産を終了した。2009年（平成21年）以降はソニー製の録音・再生対応Hi-MDウォークマン、MZ-RH1が唯一現行機種としてカタログに残っていたが、2009年（平成21年）10月頃には取り寄せ不可になる販売店が出始め、2011年（平成23年）7月7日にはソニーから「MZ-RH1の生産、出荷を2011年9月をもって完了する」と発表された。なお、ソニーの予想を上回る駆け込み需要が発生し、予定より早く2011年（平成23年）8月に生産を完了した。ポータブルMDに必須のガム型電池の生産の縮小も進み、新品で購入可能なポータブルMDは事実上、市場からほぼ完全に消滅した。据置型デッキ・ミニコンポ・MDシステムについては、ラジオ放送や地上・BSデジタル放送の録音用およびMDからハードディスク、内蔵メモリー（ビクターのMemory COMPOシリーズなど）などへのダビング用途や、パソコンやメモリーなど利用しないでCDなどからデジタルで高音質録音という点では一定の需要があるが、2011年（平成23年）2月頃より、各メーカーが相次いでMD搭載のミニコンポ、ラジカセ等の生産を終了した。パナソニックはSC-PM870SD、ビクターはUX-Z2、ケンウッドはMDX-L1、シャープはSD-FX200がMDを搭載した最終機種となり、いずれも2011年（平成23年）6月までにMD搭載機種を全て生産終了とした。なお、シャープはオーディオ事業そのものから事実上撤退している。撤退について、パナソニックは「需要の減少」、JVC、ケンウッドは「MD機構部品の調達が困難」を理由としている。開発元であるソニーの日本国内向け製品でMDが搭載されていたのは、オールインワンコンポ「CMT-M35WM」の1機種のみで、2013年（平成25年）3月で出荷終了。これをもってソニーはMDプレーヤーの販売をすべて終了し、レコーダー/プレーヤー事業からも撤退した。2011年（平成23年）に生産・出荷を終了したHi-MDウォークマン「MZ-RH1」の場合と同様に、ソニーの予想を大幅に上回る駆け込み需要が発生したため、予定時期より早く2013年（平成25年）2月に出荷を終了した。なお、CMT-M35WMは、国外生産のまま2010年より生産拠点を変更して2013年（平成25年）1月まで継続生産された。ソニーは同社製（当時）PCのVAIOにもデスクトップPC、ノートPCに関わらずごく一部にMDデッキ搭載モデルを発売していたが、こちらは2003年夏モデルを以て展開を終了しており、最終モデルはPCV-W121である。2013年（平成25年）3月当時でソニー以外の日本国内向け製品の場合でMDが搭載されていたのはオンキヨーのCD/MDチューナーアンプ+スピーカーシステム一式セットモデルX-N7XX(D)、およびCD/MDチューナーアンプ単品モデルFR-N9NX(S)で、いずれも2013年（平成25年）7月に生産を終了した。この2機種が、カーオーディオ、および業務用機器を除けば日本国内で最後まで販売（ただし、製造は両者共に国外(マレーシア)で製造）されていた据え置きMDコンポであり、2012年（平成24年）6月に発売されたX-N7XXが日本国内で最後に発売されたMD搭載機種である。2013年（平成25年）8月より順次発売開始された事実上の後継モデルとなるX-NFR7、およびNFR-9（いずれも2016年12月現在販売終了済み）では両機種の製品コンセプトの変更によって遂にMDが割愛され、代わりにMP3のほかにfs44.1KHz/16ビットのリニアPCM（WAV）によるリッピング及びダイレクトエンコード（録音）機能に対応したUSB、及びSDメモリーカード（32GBまでのSDHCメモリーカードに対応）の各種スロットとBluetoothが搭載された。また、据置型デッキについては2019年（平成31年）1月現在、ティアックから業務用（TASCAMブランド）向けに販売されているCDプレーヤー/MDレコーダーのコンビネーションデッキであるMD-CD1MkⅢ（XLR端子なし）とMD-CD1BMkⅢ（XLR端子あり）の2機種、そしてTEACブランドでコンシューマー用CDプレーヤー/MDレコーダーのコンビネーションデッキのMD-70CDも現行モデルとして販売されているが、これら3機種が最終機種となる見込みである。カーオーディオについては1DIN規格のMDチューナー、各メーカー専用品（1DINカセット、CDチューナーなどと組み合わせて利用する方式）のMDプレーヤーは2010年代以降、2013年（平成25年）中頃に三菱電機が特定車種向け1DINCD/MDチューナーを、2014年（平成26年）内にパイオニアと三菱電機がそれぞれCD-RW対応1DINCD/MDメインユニットの生産・販売をそれぞれ終了したことで市場から姿を消した。一方2DIN規格のMP3対応CD/MDチューナーやUSBメモリーに対応した製品は2017年（平成29年）2月現在、パイオニアのFH-P530MD-B/-S(及び同機種の品番を変更した三菱自動車のディーラーオプション品)のみ生産・販売が継続されているが、それ以外のメーカーでは各自動車メーカーの標準装備品・メーカーオプションにディーラーオプション、社外品共に全て生産・販売が終了している。加え、AVカーナビゲーションの分野からも2005年（平成17年）以降MDは段階的に淘汰され、代わりにDVDビデオ、CD-Rや機種によってはDVD-R、SDカード、メモリースティック、USBメモリに記録されたMP3などの再生機能がより充実するようになる。これらの再生機能はUSBを除くとMD時代にも一部存在していた。このように、2019年（令和元年）9月現在は、据え置き型はTASCAMブランドを含む一部のティアック製CDプレーヤー/MDレコーダーのコンビネーションデッキを除き、MDに対応したミニコンポ並びにラジカセ型のパーソナルシステム、ポータブル機器、カーオーディオなどMD機器がほぼ全て生産終了となっており、ミニディスクという規格自体が事実上ほぼ終焉した状態である。ただし、現在流通している音声記録メディアではCDレコーダーやDATとともに、パソコンを使用せずにCDなどからの音源をデジタル録音できる数少ないメディアであるため、パソコンを持たない、十分に使用することが困難なユーザーなど、一部では未だに根強い需要がある。そのためミニディスクそのものは、スーパーマーケットなどでも大抵は5巻パックなどが揃っている場合が多い。ただし、ビクターアドバンストメディア（Victorブランド）製「MD-80RX5/MD-80RX10」とパナソニック（AY-MD74D、2001年1月発売）がそれぞれ生産・販売終了となった為、2018年（平成30年）10月現在の時点における国内メーカーでは唯一、ソニー（MDW80T、2015年11月発売）だけがディスクを生産・販売している状況である。その他の単品ディスクは大創産業からも発売しているが、徐々に取り扱う店舗が減ってきている。尚、普及当時は莫大なライセンス料の支払いという意味での敗者になることを避けるため、競合規格のDCC共々ソニー・フィリップス・松下電器産業（現：パナソニック）の3社で共同ライセンスしていた。