同年年末から昭和34年（1959年）1月までの間に、土谷豊は、山本清、斉藤和雄、宮倉徹らを集めて、門司市内に、土谷組（後の工藤會土谷組）を結成した。土谷豊は、大長組が守りをするパチンコ店の従業員に話をつけて、従業員に裏からパチンコ玉を出させ、パチプロを雇って、パチプロに土谷組の護衛を付けさせて、大勝させていった。パチンコ店から、土谷組の行動が、大長組金庫番兼代貸格・豊島一広に伝えられた。同年1月下旬、豊島一広は、防府市の兄弟分と若衆10人を連れて、土谷豊と山本清と河野信夫の3人を、三光寺境内に連行した。豊島一広と防府市の兄弟分が、土谷豊に鎧通しを突きつけ、若衆たちが山本清と河野信夫に日本刀を突きつけて、大長組が守りをするパチンコ店にが手を出さないように脅迫した。昭和34年（1959年）1月27日、門司市栄町の上海パチンコ店で、土谷組組員数人が遊んでいたところ、大長組組員が追い出した。山本清、斉藤和雄、宮倉徹、河野信夫、今井秀雄、三桑野三男ら土谷組組員7人はアジトである旅館に戻った。同日午後7時30分になっても、土谷豊からの連絡が、旅館に入ってこなかった。山本清や今井秀雄らは、土谷豊が大長組にさらわれたのではないかと疑った。土谷組組員7人は、大長健一が入院中だった門司労災病院に行き、大長健一の病室（個室だった）を覗いたが、大長君子にすぐドアを閉められた。土谷組組員7人は、門司労災病院を出るところで、大長健一の末弟と出会った。土谷組組員7人は、大長健一の末弟と、大長健一の自宅に行ったが、土谷豊はいなかった。土谷組組員7人は、大長健一と話し合うため、門司労災病院に戻った。この知らせを受けた大長定雄や豊島一広ら大長組組員14、15人が日本刀や短刀を持って、門司労災病院に急行した。同日午後9時ごろ、大長組組員たちは、土谷組組員を切りつけて、山本清と今井秀雄にそれぞれ4週間の重傷を負わせ、三桑野三男に1週間の傷を負わせて逃走した。門司警察署は、門司市内に非常線を張った。同日夜、大長健一は門司労災病院を抜け出し、大長定雄ら大長組組員5人らと、非常線を突破し、熊本県小国町の杖立温泉に潜伏した。同年1月30日午前、警察は、大長健一が門司労災病院から逃亡したことに気がついた。大長健一は、同行していた大長組組員のうち2人を、別々に別府市に送り、石井組を探らせた。2人からは、ずっと「石井一郎は関西に出向いていて、別府には不在」の報告がなされた。1週間後、大長健一は、別府市に送り込んだ2人を引き上げさせた。翌日、大長健一たちは、杖立温泉を去り、門司市に向かった。同年2月13日午後7時45分ごろ、大長健一と大長の隣家の沖仲仕は、門司市港町で、福岡県警北九連絡所のパトカーで警邏中の平山満巡査と竹原隆義巡査に職務質問された。大長健一は、逃走した。平山満が追跡した。大長健一は、平山満に下駄を投げつけて抵抗した。平山満は公務執行妨害の現行犯で、大長健一を逮捕した。大長健一と大長の隣家の沖仲仕は、門司警察署に連行された。大長の隣家の沖仲仕は、釈放された。大長健一は再び絶食を始めた。大長定雄ら大長組5人が、山本清と今井秀雄と三桑野三男に対する傷害で自首した。土谷豊も警察に出頭させられたが、拘留21日で釈放された。その後、山本清と三桑野三男は懲役3年の判決を受けた。今井秀雄は懲役5年の判決を受けた。大長定雄は過剰防衛で懲役7年の判決を受けた。河辺修一も松村武旺殺害容疑で逮捕され、懲役21年6ヶ月の実刑判決を受けた。同年2月末、大長健一は、絶食の衰弱により、病舎に移された。同年3月、大長健一は腐った牛乳を血管注射した。同年3月19日、大長健一は高熱を出し、多くの青黒い浮腫が浮き出し、吐血をし、下血していた。国立小倉病院の内科部長が呼ばれ、大長健一を診察した。国立小倉病院や市立記念病院などの各総合病院は、「逃亡のおそれのある前科者は入れない」として大長健一の引取りを拒否した。同年3月21日、小倉市古船場の警察医・個人病院「掛札医院」が、「逃亡しても責任は負わない」と云う条件で、大長健一の引き取りを了承した。同日、大長健一は、掛札医院に移送され、拘置執行が停止された。大長健一の3人の弁護士が、保釈金30万円を立て替えて支払った。元参議院議員で、緑屋デパート社長・島田千寿が、大長健一の身元引受人となった。同年4月末、大長健一は歩行に不自由しなくなってきた。同年8月20日前後から、大長健一は密かに体を動かす練習を始めた。同年9月1日、掛札病院は、大長健一の拘置執行停止期間の延長を求めた。同年9月15日までの拘置執行停止が認められた。同年9月6日午後、大長君子が掛札病院を訪れ、大長健一に面会した。同日午後3時ごろ、大長君子は大長健一の髪を洗ってあげた。同日午後9時ごろ、大長君子は掛札病院を出た。同年9月7日午前0時から午前5時までの間に、大長健一は、掛札病院から脱走した。同日午前8時、掛札病院の看護婦が、大長健一がいないことに気がつき、小倉警察署に届け出た。同日午前9時ごろ、外部から掛札病院の大長健一へ電話がかかってきた（小倉警察署は脱走の成否を確認するための電話だと考えた）。同日午前10時すぎ、大長君子が、掛札病院を訪れ、掛札病院と小倉警察署署員に泣いて詫びた。門司警察署は、大長健一の自宅や身内の者の家、門司駅、門司港駅などに張り込み、非常警戒をした。小倉警察署も非常線を張った。同日、大長健一の拘置執行停止が取り消された。大長健一は、宮崎斉蔵と合流し、関西に脱出した。同年9月9日、福岡地裁小倉支部は、大長健一の保釈金30万円（実際は大長健一の3人の弁護士が立て替えていたため、3人の弁護士の負担となった）を没収した。大長健一と宮崎斉蔵は、山陽本線で京都に着き、数日間滞在した後、大和郡山市の隠れ家に入った。同年9月下旬から10月初旬、大長健一は宮崎斉蔵とともに、関西汽船で別府市に入った。大長健一と宮崎斉蔵は、1週間野宿をしながら石井一郎の動向を探った。石井一郎は別府市にはいなかった。大長健一と宮崎斉蔵は、小倉市に移動した。その後、宮崎斉蔵は警察に逮捕された。同年年末ごろ、大長健一と妻・君子は、長男とともに、奈良市内のアパートに潜伏し、ここで逃亡生活を始めた。大長健一は「中町」という偽名を使った。昭和35年（1960年）8月5日、大長健一と妻・君子の間に、長女が誕生した。昭和36年（1961年）3月、大長健一たちは、奈良駅の近くの奈良市中清水町の「沢ノ井アパート」に転居した。同年4月、大長健一の長男が、市立大宮小学校に入学した。同年4月27日、門司警察署の武田部長刑事、塚田刑事ら3人が、奈良市に入った。同年5月5日午後7時20分ごろ、奈良警察署は、門司警察署と協力して、沢ノ井アパートで、大長健一を逮捕した。同年5月6日午後7時、大長健一は門司警察署に向かって護送された。それから、大長健一は小倉拘置所に送られた。大長健一は、小倉拘置所で、土谷組・土谷豊会長、土谷組若頭・前田健治、土谷組舎弟頭・山本清らと面会し、「門司の港の方を大長組が守り、門司の街の方を土谷組が取る」ことを取り決めた。同年、大長君子は、門司市本川町に一軒家を借り、畑田町の戦災住宅を出た。畑田町の戦災住宅には、母・静江が住んだ。同年、大長健一は懲役7年の実刑判決を受けた。同年夏、大長健一は岡山刑務所に収監された。その後、大長健一は京都刑務所に押送された。さらに、大長健一は府中刑務所に押送された。昭和39年（1964年）末、大長定雄が出所した。昭和43年（1965年）の梅雨明け、大長健一は、八王子医療刑務所を出所した。大長定雄、宮崎斉蔵、豊島一広らが出迎えた。大長健一は、門司市本川町の借家に帰った。前田健治や山本清が、ビールケースを持参して、放免祝いに駆けつけた（土谷豊は服役中だった）。大長健一は、前田健治を通じて、石井一郎に面会を求めた。石井一郎は、大長健一との面会を拒否した。同年、大長定雄は、元大長組の岩崎の知り合い・溝下秀男（後の三代目工藤會會長、四代目工藤會総裁、名誉顧問）の保釈金を出した。同年夏、溝下秀男は、40日間の絶食で、拘留執行停止を受けた。同年夏、溝下秀男は、岩崎とともに、大長健一宅を訪問した。昭和44年（1969年）夏、溝下秀男は、大長定雄のもとで部屋住みを始めた。昭和45年（1970年）、大塚兼雄は引退し堅気となった。同年9月19日、大長健一は、宮崎斉蔵とともに北九州市門司区栄町の小料理屋「花のつゆ」でふぐとエビフライを食べ、酒を飲んだ。大長健一はスナック「百合」に入り、流しを呼んだ。宮崎斉蔵はドアの外で待機していた。大長健一は、宮崎斉蔵をスナック「百合」の店内に入れた。宮崎斉蔵が1曲歌った後、大長健一は童謡を歌った。同日午後9時ごろ、スナック「百合」での飲み会はお開きとなり、大長健一は、一緒だった前田健治と山本清を返した。大長健一と宮崎斉蔵は、キャバレー「月世界」に入った。大長健一と宮崎斉蔵は、キャバレー「月世界」からの帰り際、土谷組幹部・土谷誠と競輪のコーチ屋・猿渡と出会った。大長健一は、競輪のコーチ屋・猿渡に罵声を浴びせ、頭を叩いた。同日午後10時ごろ、土谷誠は、近くの食堂「満作」から刃渡り30センチくらいの刺身包丁を持ち出した。その直後、キャバレー「月世界」のカウンター付近で、大長健一は、土谷誠に刺身包丁で、左腹部を刺された。宮崎斉蔵は、土谷誠に刺身包丁で、みぞおちを刺された。大長健一は、宮崎斉蔵を、北九州市門司区老松1丁目の国道3号の桜町交差点近くまで運んで、力尽きた。同日午後10時10分ごろ、通行人が血まみれの大長健一を発見し、119番通報した。その直後、宮崎斉蔵は、自力で、同区の浅生外科までたどり着いた。それから、宮崎斉蔵は意識不明の重体に陥った。大長健一は長崎外科に搬送された。同日午後11時ごろ、大長君子は刑事の訪問を受け、大長健一が長崎外科に搬送されていることを知った。大長君子は長崎外科に急行した。宮崎斉蔵は、浅生外科で、一命を取り留めた。門司警察署は特別捜査本部を設け、捜査を開始した。同年9月20日午前0時過ぎ、大長健一は、長崎外科で出血多量により死亡した。