2007年3月20日、現在もマネージャーを務めているゲーリー・ハイドがキューバボクサーについて執筆しているライターになりすましてキューバに入国。リゴンドウとの接触に成功しマネージャー契約を交わす。ハイドは同時にマイク・ペレスとも契約を交わした。マイク･ペレスがハイドが手配した亡命業者を使ってキューバからの脱国に成功したが、脱国時にいくつかの問題が起こったことでリゴンドウはハイドに不信感を抱き、別ルートでの亡命を模索するようになった。2007年7月下旬、パンアメリカン大会出場のために訪れていたブラジルでエリスランディ・ララと共に深夜に選手村から抜け出し亡命を図ったが失敗し、同年8月2日に身柄を確保されキューバへ強制送還された。帰国後、亡命に失敗したリゴンドウに厳しい処分が下された。金メダル獲得時に贈られた車を政府に没収され、当局から監視されるようになった。友人や仲間の選手からも避けられるようになり、キューバ代表の座からも外されたリゴンドウは塞ぎ込み、自宅のバルコニーでタバコとビールを立て続けに呷りながら車や人々が行き交う通りを眺める日々を送るようになった。2009年2月23日、ユデル・ジョンソン、ヨルダニス・デスパイネ、ユニエル・ドルティコスと共にハイドが手配した亡命業者の高速ボートでカンクンにたどり着き、そこから国境を越えアメリカ合衆国フロリダ州マイアミに亡命し、アリーナ・ボックス・プロモーションと契約した。2009年5月22日、マイアミビーチでフアン・ノリエガと対戦し、3回1分9秒TKO勝ちを収めデビュー戦を白星で飾った。2009年9月18日、マイアミビーチでジョバンニ・アンドラーデとNABA北米スーパーバンタム級王座決定戦を行い、3回2分53秒TKO勝ちを収め王座獲得に成功した。2010年11月13日、アーリントンのカウボーイズ・スタジアムにてマニー・パッキャオ対アントニオ・マルガリートの前座で、元WBA世界スーパーバンタム級王者でWBA世界スーパーバンタム級3位のリカルド・コルドバとWBA世界スーパーバンタム級暫定王座決定戦を行い、12回2-1（117-109、114-112、112-114）の判定勝ちを収めプロ7戦目にして世界王座獲得に成功した。2011年3月19日、ダブリンのシティーウェスト・ホテルでWBA世界スーパーバンタム級11位のウィリー・ケーシーと対戦し、初回2分38秒TKO勝ちを収め初防衛に成功した。防衛後地元テレビ局RTEは、リゴンドウの強烈な連打を津波と表現した。2012年1月5日、自身の他、パイパロープ・ゴーキャットジム（ミニマム級）、ホセ・アルフレド・ロドリゲス（ライトフライ級）、ファン・カルロス・レベコ（フライ級）、リボリオ・ソリス（スーパーフライ級）、ウーゴ・ルイス（バンタム級）、ブライアン・バスケス（スーパーフェザー級)、リカルド・アブリル（ライト級）、ヨハン・ペレス（スーパーライト級）、イスマエル・エル・マスウーディ（ウェルター級）、アンソニー・ムンディン（スーパーウェルター級）、ハッサン・ヌダム・ヌジカム（ミドル級）、ブライアン・マギー（スーパーミドル級）、デニス・レベデフ（クルーザー級）の17階級中14階級の暫定王者が世界ランキング1位にランクインされた  。2012年1月20日、ラスベガスのパームスでWBA世界バンタム級正規王者リコ・ラモス（アメリカ）と王座統一戦を行い、6回1分29秒KO勝ちを収め王座を統一した（記録上は暫定王座2度目の防衛）。この試合でリゴンドウは56,000ドル（560万円）のファイトマネーを稼いだ。この試合後、リゴンドウはノニト・ドネアへの対戦要求を繰り返した。同年2月4日にアラモドームでノニト・ドネアとウィルフレド・バスケス・ジュニアとの試合を会場で観戦したが、中継局のHBOとドネア、そのプロモーターであるボブ・アラムに完全に無視されたことで激昂し、勝利者インタビューで会場にいるリゴンドウに言及しなかったHBOのベテラン解説者ラリー・マーチャントにも侮蔑の念を表明した。マーチャントはこれについて意見を求められると、「誰だって?　勘弁してくれ」と言い放ち、リゴンドウが米国にファン層を持たないことなどを理由にその時点でのドネア対リゴンドウの需要のなさを強調、そのためリゴンドウは方向転換を余儀なくされた。2012年6月9日、MGMグランド・ガーデン・アリーナでマニー・パッキャオ対ティモシー・ブラッドリーの前座でWBA世界スーパーバンタム級14位のテオン・ケネディ（アメリカ）と対戦し、5回1分11秒TKO勝ちを収め3度目の防衛に成功した。2012年9月15日、トーマス&マック・センターで、フリオ・セサール・チャベス・ジュニア対セルヒオ・マルチネスの前座でWBA世界スーパーバンタム級15位のロバート・マロキン（アメリカ）と対戦し、12回3-0（118-108×2、118－109）の判定勝ちを収め、4度目の防衛に成功した。この試合でリゴンドウは15万ドル（1500万円）のファイトマネーを稼いだ。2012年12月15日、テキサス州ヒューストンのトヨタセンターで、ノニト・ドネア対ホルヘ・アルセの前座で元WBA世界スーパーバンタム級王者のプーンサワット・クラティンデーンジム（タイ）と対戦予定だったが、試合2日前の予備検診で行われた血液検査でプーンサワットにHIVの陽性反応があり、テキサス州コミッションがプーンサワットのライセンス発行を拒否した為、試合は中止になった。タイに帰国後、プーンサワットはHIVではなくサラセミアと判明するが、この試合が中止になったのを機に引退を表明した。2013年4月13日、ニューヨーク・マンハッタンのラジオシティ・ミュージックホールでWBO世界スーパーバンタム級王者のノニト・ドネアと王座統一戦を行い、10回にダウンを奪われるも12回3-0（116-111、115-112、114-113）の判定勝ちを収めWBA王座の5度目の防衛、WBO王座の獲得、リングマガジン王座の獲得に成功した。この試合でリゴンドウは75万ドル(7500万円)のファイトマネーを稼いだ。2013年7月上旬、プロモーターのボブ・アラムが、これまで何度もリゴンドウの試合を放送しておりドネアとの試合も放送したテレビ局のHBOが、リゴンドウのファイトスタイルはエキサイティングでないとして、今後リゴンドウの試合放送を見合わせる方針を打ち出したことを「私がリゴンドウの事を口にするたびにHBOの連中は嘔吐するんだ」との言葉を交えて報道陣に伝えた。この決定について関係者やファンの間で賛否両論が巻き起こったが、リゴンドウに敗れたドネアは「俺もテレビ放送してもらうためにファイトスタイルを変えなければならなかった。ノックアウトするようになってからようやくHBOで放送してもらえるようになったんだ、リゴンドウはこのスポーツがエンターテイメントだということを理解する必要があるね」と話し、HBOのベテラン解説者のラリー・マーチャントも「リゴンドウは美しいボクサーだよ、だけどこれはプロボクシングなんだ、そしてプロボクシングはエンターテイメントなんだよ。(観客と視聴者に)また試合を見たいと思わせなければだめなんだ」と両者ともにHBOの決定を支持した。2013年8月7日、HBOが『チャンピオンたちの夕食会』と題した食事会を主催、HBOが試合を放送している選手ファン・マヌエル・マルケス、ゲンナジー・ゴロフキン、ミゲル・アンヘル・ガルシア、ユリオルキス・ガンボア、マイク・アルバラード、アドニス・ステベンソン、ルスラン・プロボドニコフ、テレンス・クロフォード、ノニト・ドネアが招待されたが、リゴンドウはノニト・ドネアに勝利しWBA・WBO統一王者となったのにもかかわらず招待されなかった。2013年8月16日、リゴンドウは「ボブ・アラムとトップランクは『リゴンドウをスーパースターにするにはカストロにプロモートさせる必要がある』や『リゴンドウの名前を聞くとHBOの連中は嘔吐する』とかの悪趣味なジョークを言っており、俺への尊敬が足りない。イライラする。HBOは最近（食事会を開いて）全てのチャンピオンたちに敬意を表したけど俺は招待すらされなかった。彼らは試合を組む組むと言っておきながらその約束を忘れる。すべての面で尊敬が足りない。俺をきちんとプロモートするか契約を破棄するかどちらか決めて欲しい、とにかくこれ以上の軽蔑は受け入れがたいんだ。アラムが選手を平等に扱っていないことは疑いようがないのだから。」と胸の内を明かした。2013年12月7日、ニュージャージー州アトランティックシティのボードウォーク・ホール・ダンスホールで、1階級下のIBO世界バンタム級王者で、元IBF世界バンタム級王者でWBA世界スーパーバンタム級12位で世界スーパーバンタム級12位のジョゼフ・アグベコ（ガーナ）と対戦し、12回3-0（3者とも120-108）の判定勝ちを収め、WBA王座の6度目、WBO王座の初防衛に成功した。ドネアとの再戦いついて聞かれ「ドネアは貧弱な男だよ。俺にやられてトラウマになってしまっているようだ。またやられたいなら、やられに来いと伝えておいてくれ。俺がナンバーワンなんだ。」とドネアを挑発した。HBOがボクシングアフターダークの枠で中継したこの試合は55万人が視聴したが、メインイベントとしては1996年の番組開始以来最低の視聴者数となった。2014年7月19日、マカオにあるザ・ベネチアン・マカオ内コタイ・アリーナで鄒市明VSルイス・デ・ラ・ロサの前座でWBA世界スーパーバンタム級8位でWBO世界スーパーバンタム級5位のソッド・ゴーキャットジム（タイ）と対戦し、初回1分44秒KO勝ちを収めWBA王座の7度目、WBO王座の2度目の防衛に成功した。当初はジョナサン・グスマンと対戦する予定だったがファイトマネーで折り合いがつかずに交渉は決裂しソッドとの対戦に変わった。リゴンドウはこの試合を持ってプロモーターのトップランクと契約が満了。無敗でありリングマガジン選定のパウンド・フォー・パウンドランキングでも7位にランクインしていたが、トップランクが契約延長を拒んだことで、リゴンドウは新たなプロモーターを探すことになった。2014年8月4日、WBOからクリス・アバロスと指名試合を行うよう命令が出され、リゴンドウ陣営が入札により興行権を獲得するが後にアバロス側が対戦を辞退した。2014年12月31日、大阪府大阪市浪速区の大阪府立体育会館でWBA世界スーパーバンタム級10位でWBO世界スーパーバンタム級6位の天笠尚（山上）と対戦。序盤から試合を支配し5回に攻勢をかけるが凌がれると、7回に2度のダウンを奪われKO負け寸前まで追い詰められ一気に劣勢を強いられる。しかし、直ぐに立て直して攻勢に転じ天笠にダメージを蓄積させ、10回にダウンを奪い返し、11回終了後のインターバルで天笠の左頬の腫れが酷く天笠陣営が棄権を申し出た為、WBA王座の8度目、WBO王座の3度目の防衛に成功した。なお、リゴンドウは減量の必要が無かったため、試合直前にも関らず、ホテルで肉やサラダ、デザート、アイス、コーラなど好きなだけ飲み食いする余裕を見せていた。また、身長は168cmとされていたが、実際には161.5cmだった事が判明した。2015年4月14日、WBA世界スーパーバンタム級王者スコット・クィッグとの対戦の話が持ち上がるが、クィッグのプロモーターのエディ・ハーンがリゴンドーはボクシングファン以外には人気が無いから金にならないとして消滅した。2015年7月13日、WBO世界フェザー級王者のワシル・ロマチェンコとの対戦の話が持ち上がるが、リゴンドウが124ポンドのキャッチウェイトでの対戦を要求したことや、リゴンドウ側のマネージメント問題が浮上し消滅した。2015年10月7日、WBOはリゴンドウに対し防衛戦を行わない理由を説明するよう文書で求めた。2015年10月28日、WBOはリゴンドウが2014年12月31日の天笠戦来一度も防衛戦を行っておらず不活動状態が続いている為、WBO世界スーパーバンタム級王座を剥奪した。2015年10月30日、リゴンドウは同年12月4日にセサール・セダとの対戦を決めるがWBAはセダを防衛戦の相手として認めず、WBAはWBOから王座を剥奪され統一王者ではなくなったリゴンドウに対し、2016年5月1日までにWBA世界スーパーバンタム級正規王者と対戦することを条件に休養王座に認定した。2015年11月4日、WBCがWBC世界スーパーバンタム級2位のレイ・バルガスとWBC世界スーパーバンタム級挑戦者決定戦を行うよう指令を出した。2015年11月14日、ジェイ・Z率いる新興プロモーターのロック・ネイション・スポーツと契約した事を発表し、同月21日にドリアン・フランシスコと対戦することが急遽決まった。2015年11月21日、マンダレイ・ベイ・イベント・センターで、ミゲール・コットvsサウル・アルバレスの前座で元WBA世界スーパーフライ級暫定王者のドリアン・フランシスコ（フィリピン）とスーパーバンタム級契約10回戦で対戦し、10回3-0の判定で勝ちを収めた。しかし試合内容が酷かったためアメリカメディアの中では「もうリゴンドウはアメリカで試合をすることはないはずだ」と酷評された。2016年1月3日、WBAはWBA世界スーパーバンタム級休養王者ギレルモ・リゴンドウに対し同年2月27日のスコット・クィッグ対カール・フランプトンの勝者と同年7月27日までに王座統一戦を行うよう指令を出した。2016年3月12日、イギリスのリバプールのエコー・アリーナ・リヴァプールでジェームス・ディケンズとスーパーバンタム級10回戦を行う予定だったが 、プロモーターのミスで入国ビザの取得が出来ず中止となった。2016年4月7日、クィッグに勝利したフランプトンがリゴンドウとの王座統一戦に応じようとしなかった為、WBAはフランプトンからWBA世界スーパーバンタム級スーパー王座を剥奪し、リゴンドウと暫定王者のモイセス・フローレスとの間で王座統一戦を同年8月1日までに行うよう指令を出した。2016年7月16日、カーディフのアイス・アリーナ・ウェールズでWBA世界スーパーバンタム級10位のジェームス・ディケンズと対戦し、2回終了時にディケンズが顎を骨折した為棄権し、9度目の防衛に成功した。2016年7月19日、WBAはWBA世界スーパーバンタム級スーパー王者のギレルモ・リゴンドウとWBA世界スーパーバンタム級暫定王者のモイセス・フローレスに対し、王座統一戦に関する対戦交渉を同月18日から開始し、同年8月17日までの30日以内に対戦交渉を締結させるよう再度指令を出した。2016年7月30日、リゴンドウとのスーパーバンタム級王座統一戦を避け、代わりにレオ・サンタ・クルスとの試合を制しWBA世界フェザー級スーパー王者となったカール・フランプトンは「私は誰とでも戦うが、エキサイティングな試合に関与したい。クィッグとの試合は少し失敗したが、リゴンドウと試合をしてまた失敗したくないんだ。私には家族がいる。今29歳だが、あと数年で現役を終えた後も快適な暮らしを送りたいから金銭的な見返りが欲しいんだ。リゴンドウは1ポンドの利益さえもたらさない。彼は信じられないほど素晴らしい選手だが、正直、彼はお金をもたらさないんだ。」とリゴンドウについて語った。2017年2月2日、同月25日にテキサス州フリスコのフォード・センターでWBA世界スーパーバンタム級暫定王者でIBO世界スーパーバンタム級王者のモイセス・フローレスと王座統一戦を行い、WBA王座の10度目の防衛、IBO王座の獲得を目指す予定だったが、ミゲール・コット対ジェームス・カークランド戦がカークランドの鼻の負傷で中止になったことに伴いギレルモ・リゴンドウ対モイセス・フローレス戦も中止となった。2017年6月17日、マンダレイ・ベイ・イベント・センターにてアンドレ・ウォード対セルゲイ・コバレフ第2戦の前座でWBA世界スーパーバンタム級暫定王者でIBO世界スーパーバンタム級王者のモイセス・フローレスと王座統一戦を行い、初回終了のゴングが鳴った間際に放ったリゴンドウの左フックでフローレスが大の字になってダウン。しかしこの左フックはゴングが鳴った後の反則打ではないかとレフェリーのビック・ドラクリッチとネバダ州アスレチック・コミッションのエグゼクティブ・ディレクター、ボブ・ベネットがリングサイドで音声の無い映像を見て協議をした結果、HBOの制作スタッフから『リゴンドウのパンチはゴングが鳴る前に決まった』と聞いた事が決め手になり、ドラクリッチがパンチはゴング前に決まったものと裁定を下し、リゴンドウはKO勝ちを収め王座統一に成功、WBA王座の10度目の防衛、IBO王座の獲得に成功した。この試合でリゴンドウは12万ドル（約1300万円）、フローレスは2万5千ドル（約260万円）のファイトマネーを稼いだ。2017年6月26日、上述のリゴンドウ対フローレス戦を管轄したNSACは会合を開き、満場一致で試合結果をリゴンドウの初回終了時KO勝ちから無効試合に変更すると決定した。試合の映像と音声を検証したNSACはリゴンドウを勝利に導いた左パンチは初回終了を告げるゴングの後に放たれたものであるとの結論に達したが、「パンチは意識的に放ったものではなく、攻防の流れの中で繰り出したもの」というビック・ドラクリッチの証言を重視し、リゴンドウの反則負けにはならなかった。2017年12月9日、マディソン・スクエア・ガーデン・シアターで2階級上のWBO世界スーパーフェザー級王者のワシル・ロマチェンコに挑戦者として対戦したが、6回終了時に棄権した為プロ初黒星を喫して2階級制覇は出来なかった。WBA世界スーパーバンタム級スーパー王座を返上しないままの挑戦となり、WBAはこの試合を特別承認したもののリゴンドウが敗れた場合は同王座を剥奪するとの警告を出していたが 、12月31日にWBAは警告通りにリゴンドウからWBA世界スーパーバンタム級スーパー王座を剥奪すると共にリゴンドウをランキングから除外した。2018年8月1日、ロック・ネイション・スポーツと契約が1年残っていたが、話し合いの結果、両者納得の上でリゴンドウは同プロモーションを離脱した。2018年10月24日、アル・ヘイモンと契約しTGBプロモーションズに移籍した。2019年1月13日、ロサンゼルスのマイクロソフト・シアターにてジョバンニ・デルガドと対戦し、初回2分59秒KO勝ちを収めた。当初は元スーパーフライ級世界ランカーのダニエル・ロサスが予定されていたが、ビザの取得が出来ず入国が出来なかった為、デルガドに変更となっていた。この試合でリゴンドウは25,000ドル（約270万円）、デルガドは14,500ドル（約160万円）のファイトマネーを得た。2019年6月23日、マンダレイ・ベイ・イベント・センターにてジャーメル・チャーロVSホルヘ・コタの前座で元WBC世界スーパーバンタム級王者でWBC世界スーパーバンタム級1位のフリオ・セハとWBC世界スーパーバンタム級挑戦者決定戦を行い、8回TKO勝ちを収めた。7回までのジャッジ3者の判定は65-68、65-68、66-67で負けていた。