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そんな折、佐藤は後の函館市長である函館教育会長・齋藤與一郎から、函館盲唖院の再建を依頼された。特殊教育がまだ義務化されていない当時、同院の運営は地元有志たちの寄付で賄われていたために経営難に陥り、大正時代後期には廃校寸前に陥っていたのである。加えて火災の多い函館の地で、校舎は2度の函館大火と暴風、および老朽化に晒され、生徒たちも後に佐藤が「三十人計りの盲唖児がションボリと寂しく集まって居る」と語っているような状況であった。初代院長の篠崎清次は36歳で死去、その跡を継いだ伊東松太郎も病気療養を強いられていた。そうした窮状の中、齋藤が院の再建を函館図書館長の岡田健蔵に相談し、岡田が適任者として、函館毎日新聞で教育論を論じていた佐藤を優れた教育者として推薦したのだった。生徒たちからは一切授業料をとらない方針のため無給という悪条件であったが、1922年（大正11年）、佐藤はこの院長に就任した。折しも1922年は、佐藤は妻と娘2人と死別し、17歳から1歳まで計7人の子供を抱えた身となり、院長就任後には恩師の新井奥邃も死去し、人生最大の試練といっていい時期であった。逆境の身にもかかわらず、この話を快諾したのは、教育に金銭的価値があってはいけない、無報酬の教育こそ自分の望んだ校風だとの考えであった。その意気込みを新たにするべく、立待岬の谷地頭共同墓地に「己を捨てて社会に尽くすことは人の行うべき道であり、私利私欲の感情を持ってはいけない」との意味で「大義滅私親（たいぎししんをめっす）」と刻んだ石碑を建立した。翌1923年（大正12年）には一家を離散し、年少の子供5人を親戚や知人に預け、年長の子供2人とともに盲唖院の寄宿舎に移り住んで仕事にあたった。函館盲唖院の院長に就任した佐藤は、老朽化の激しい築30年の校舎の改築にとりかかった。函館新聞の紙上でその現状を訴えて寄付金を募り、後援会員の数を4倍にまで拡大した。さらに北海道内の小・中学校へ80万の慈善袋を送り、生徒たちと共に市内の家々を戸別訪問したりと、募金活動に取り組んだ。愛国婦人会のバザーや慈善音楽会などの活動も行われた。雄弁家でもあった佐藤の訴えは、救済教育の必要性について多くの市民に感銘を与えた。この活動の最中、前述のとおり同院院長としては無給であり、生活費は商業学校の嘱託教員としての給料で賄われていた。1925年（大正14年）には虫垂炎の病苦もあった。この厳しい状況の中、佐藤の子供たち7人のうち5人が盲唖院の教員となり、父を公私共に支えた。やがて寄付金は平成期でいうところの7千万円にまで達し、同1925年、ついに新校舎が完成した。その後も佐藤の手腕により、安定した経営を保つことができた。3年後の1928年（昭和3年）には、日本聾唖教育総会が盲唖院で開催された。この会が私立盲唖院で開催されるのは初めてのことであり、市や地元の協力を仰ぎながら盲唖院の再建を成し遂げた佐藤の手腕は、社会事業家として日本全国的に見ても高く評価され、函館盲唖院は東京以北での有数の盲唖院となった。1924年（大正13年）には日本聾唖協会の評議員に任命され、1935年（昭和10年）まで勤め上げた。財政緊縮の影響により盲唖教育補助費が大幅な減額を強いられた際には、他の委員たちと協力し、補助費の回復という結果をもたらした。また、日本聾唖協会の北海道支部の結成にも力を尽くした。また勉強以外の教育理念として、校内には用務員を置かず、教師たちが率先して清掃活動にあたることで、子供たちも一緒に校内外の清掃活動に参加するようになった。老人ホームの訪問で奉仕の心を養ったり、地元の商店や工場に協力を求めることで、子供たちに和裁、洋裁、洗濯、靴製造などを教授するといった活動も展開した。
この当時、日本のろう教育は大きな転機を迎えていた。それまでの手話法に代る新たな教育法として口話法（言葉を声に出して発音する方法）が普及し始め、手話を一切認めないという運動にまで発展していた。1936年（昭和11年）発行の雑誌『聾唖教育』には、梓渓生なる人物の著で「手話は聾唖者同士の会話手段であり、健常者と会話することができない。かといって、健常者が手話を学習し、多数者が少数者の犠牲になる必要はない。手話は口話最大の敵である」「多数の教育のために少数の犠牲はやむを得ない」と論じられ、全国の聾唖学校が手話学級を廃止し、手話を使う子供は全体の1割以下にまで減っていた。しかし、それまで手話を使っていた子供たちにとって口話は大変な苦痛であり、補聴器も無い当時、聾唖者にとって正しい発音の困難さは想像を絶するものがあった。これに対して佐藤は、『聾唖教育』の翌々号で、『理想と実際』と題した9000字以上の長文に及ぶ教育論文を発表し、口話法に真っ向から対立した。論文内で佐藤は「口話教育で効果を上げる生徒は全体の2、3割に過ぎず、聾唖者にとって手話は必要不可欠なものである」「口話を中心とした聾唖教育では国語科が中心であり、単純会話にほとんどの労力が費やされるため、道徳、地理、歴史、理科、算術などを学ぶ暇がなくなるが、手話を用いれば簡単に良い教育が可能となる」という持論を展開した。そして以下のように結び、少数者を多数者の犠牲にすることへの疑問と、愛情を込めた教育でハンディをもつ児童へ勇気と自信を与えるべきとの主張を訴えた。（前略）少数者をして多数者の犠牲者たらしむることも亦人道の趣旨にかなはぬと思ふ。之れ功利的言説であり、覇者の道であり、動（やや）もすれば強者の横暴とならざるを得ないのである。（中略）教育は愛の精神を根基に置くべきであり、而して愛の精神は如何なる微細の者に対しても犠牲を強ふるものではない。（中略）然るにひとり聾唖者に対しては、正常者の立場に立ち、己と同様になれと強ふる口話主義教育は其の根元義に於て大々疑問をはさまざるを得ないのである。 — 佐藤 1936, pp. 15-16より引用この実践として、函館盲唖院では手話と口話を、それぞれ生徒の特性に合わせる教育が実施された。その結果、ほかの学校では3年生になってから1年生の学習内容が理解されるところを、盲唖院では普通校と同じ学年対応で授業を行うことができた。また勉強以外にも、盲唖院の学芸会では、能力に合せたプログラムを組んで手話と口話を使い分けることで、子供たちは人前で生き生きと音楽や劇を披露することができた。口話能力で生徒の能力を評価しない盲唖院の教育は、地域の人々にも好意的に受け止められて感銘を与え、『函館新聞』でも生徒たちが学芸会で喝采を浴びたことが報じられた。生徒1人1人が豊かな人生を歩むことのできる教育こそ、佐藤の目的であり、佐藤はろう学校のことを「単なる勉強の場ではなく、家庭であり、街」「親兄弟とも会話のできない子供たちにとって、人の輪ができ、会話が弾む、人生を表現する愛情のつまった家」と表現した。この主張には保護者、地域住民、教育界までもが感化を受け、盲唖院の教育に地域が一丸となって協力するまでになった。同様に口話法に強く反対した教育者に大阪市立聾唖学校（後の大阪府立中央聴覚支援学校）校長の高橋潔がおり、佐藤は高橋と深い交流を持った。前述の日本聾唖教育総会開催以来、函館盲唖院の沿革には大阪市立聾唖学校との交流を示す記事が登場しており、また大阪市立聾唖学校の学校史にも、函館大火に遭った盲唖院に見舞金を贈ったことなどが記されている。また高橋の長女は、父がいつも手話について佐藤と話し合っていたと語っており、佐藤と高橋は強い絆で結びついていたと見られている。前述の佐藤の論文も、大阪市立聾唖学校では会報に転載され、広く読まれることになった。ただし佐藤自身が聾唖児を教えたことや、手話擁護派にもかかわらず佐藤自身が手話を直接用いて聾唖児の教育にあたったことは確認されていない。佐藤の次女も、父が手話をあまり使わなかったと証言している。函館盲唖院は無給のために、生活費を得るための函館商業学校での仕事が週4日を占めており、ほかにも講演や新聞社での仕事の依頼もあったため、これが盲唖院での直接的指導を困難にさせた一因と見られている。戦後の1947年（昭和22年）より、敗戦による経済界の混乱、物資不足、物価高騰にともない佐藤は次第に健康を害した。同年、函館盲唖院も経営難から市立に移管されて函館市立盲唖学校となり、翌1948年（昭和23年）には道立に移管、さらに盲学校と聾学校に分かれ、北海道立函館盲学校、北海道立函館聾学校として発足した。佐藤は病気の身ながら、両校の校長として発令された。その後も頑として手話法を擁護し続け、純口話法を認めることはなかった。
ろう教育の一方で、佐藤は社会教育者として、いくつもの研修団体を主宰し、地域の青少年教育にも力を入れた。1925年末頃より、佐藤のもとに出入りしていた青年男女が集まり、盲唖院を会場として、毎週土曜に古典や聖書などを学習する「土曜会」が開催された。1927年（昭和2年）には毎月第2木曜に青年教師が集う「木曜会」、1928年には毎年夏に1週間行われる「夏季論語会」が発足し、1932年（昭和7年）にはこれらの参加者たちの要望に応えて「尚友会」が発足した。また、「希望社学徒連盟」や、その後身「緑生会」の学生たちも佐藤を慕い、佐藤は彼らの相談や指導にもあたった。佐藤のもとに集った者たちの中で、思想的な影響を受けた者は数百名に上った。佐藤のもとで働くことを望み、盲唖院の教員となった者も多い。ただし、佐藤に憧れて盲唖院に就職したものの、聾唖児との意思疎通の困難さや盲唖院の窮乏から、短期間で盲唖院を退職した者も少なくなかった。やがて日中戦争が勃発し、戦争が激化すると、佐藤は青年たちを集めて人生講座を開き、「戦争では何も解決しません。戦争のない社会にしなければなりません」と説き、皆からは慈父のように慕われた。講演においても北海道内の人々に親しまれ、晩年の病床にあっても、死の直前まで後進の指導を続けていた。
1949年（昭和24年）4月、訓盲院初代院長・篠崎清次の息子である篠崎平和が函館聾学校の校長に就き、盲・聾の両校の校長であった佐藤は、盲学校の専任となった。翌1950年（昭和25年）、盲学校校長を退職し、その後も教諭として後進の指導にあたった。同年に住みなれた校内の寄宿舎を出、函館市湯川町に移り住んだ。1951年（昭和26年）から翌1952年（昭和27年）にかけては、北海道新聞でコラムを連載した。実質より形式を重んじる当時の宗教、教育界を皮肉たっぷりに批判した文章や、古今東西の知識を織り交ぜた教育・人生論など、鋭い感覚とユーモアに満ちた多彩な内容であり、函館の郷土史家である神山茂との教育論争、実名入りの函館人物評、椴法華村の旅行記など、地元に関する興味深い記述も多かった。同1951年に函館市文化賞（人文科学部門）を受賞。1953年（昭和28年）に北海道文化賞（教育部門）、1955年（昭和30年）に北海道新聞文化賞（社会文化部門）を受賞した。1956年（昭和31年）、「ただ御心のまま」の一言だけを遺し、胆石症により死去。没年齢80歳。その遺骨は前述した立待岬の「大義私親を滅す」の石碑の下に埋葬された。晩年に親交のあった歌人の宮崎郁雨は「小説の『坊ちゃん』のモデル漱石にあらずば蓋し若き在寛」「百人の弟子に歎かれ千人の友に惜しまれ天に召されし」など40首の短歌を詠み、佐藤の死を惜しんだ。1960年（昭和35年）、門弟や関係者らの寄付により墓碑が建立され、墓碑名は齋藤與一郎が手掛けた。なお死去に前後して、市立函館図書館（現在の函館市中央図書館）は教育雑誌『実験教授指針』を含む著作と師・新井奥邃に関する旧蔵資料の寄贈を受け、これらを「在寛文庫」の名で郷土資料に加えている。
函館市文化賞の受賞について、齋藤與一郎は「今さらいうまでもないその人柄」と題し、佐藤を以下のように高く評価している。先生は非常な経営困難とたたかいながら三十年間函館の盲唖教育に従事し、学校を今日あらしめた功労者ですが、学校が私立から市営、道営となるまでその苦心はたいへんなものでした。しかも自分の教育信条をいささかも曲げず何ものにもこびることなくその所信を貫いたことは現在の函館盲・ろう学校の校風に一だんの光彩をそえたのです。 — 佐藤在寛先生顕彰会 1995, p. 23より引用北海道国際交流センターの代表理事である大総一郎は、佐藤を以下のように高く評価している。佐藤在寛（政次郎）先生は、函館の盲・聾両校にとっての大功労者であるばかりでなく、函館市における偉大な教育者、思想家であり、秀逸した指導者でもありました。（中略）市民意識の啓発、教育に多大の影響を与えていた。先生の薫陶を受けて、今もなお教育界、経済界で大きく活躍し、函館市のために貢献している人が多くおられるということは、在寛先生の偉大さを証するものといえよう。 — 佐藤在寛先生顕彰会 1995, p. 1より引用東京滞在時に出版した教育雑誌『実験教授指針』について、教育史家の石戸谷哲夫は自著で「教育界の開眼先駆者たち」と題し、「平民社に呼応して、教員の社会的開眼に働いたのは、官学の教育学者たちではなく、『実験教授指針』主筆任天佐藤政次郎と、『教育実験界』主筆隈川渡辺英一とであった」と述べている（『任天』は当時の佐藤の号）。上野女学校の退職にあたっては、卒業生たちが総会を開き、同窓会は母校との絶縁を宣言した。また、多くの教え子たちが佐藤の退職に抗議し、温旧会を発足させ、佐藤を師と仰ぎ、その後も長きにわたって佐藤の教えを受け続けていた。佐藤の晩年には彼女らの子供が函館盲唖院に寄宿し、佐藤と生活を共にしたケースもある。これらのことから佐藤の影響力、教え子たちに慕われる佐藤の人間性の魅力を評価する声もある。佐藤のもとで主宰された研修団体について、函館盲唖院の生徒であった日本点字図書館創立者の本間一夫は「町の真面目な青年たちが先生を慕って集まり（中略）私も函館の七年間特別に、薫陶を受け、大きな影響を受けた忘れられない大恩人です」と語っている。実際の参加者の内、茨城大学・明治大学の教授である桐田尚作は、木曜会のことを「行ってみたらとてもやさしいので安心した。（中略）その後むしゃくしゃしたときに、先生のお宅でお会いするとスーッと気持がさわやかになるので、知らず知らず足が向くようになりました」、函館文化会会長である棟方忠は土曜会を「先生は滅多に結論めいたことは言われなかったが、聖書や論語などを引用し、或いは巧みな比喩で、その行くべき道を示唆してくれた。しまいには先生の傍にいるだけで、胸のもやもやが拭い去られるような感じさえした」と語っている。重複障害者として知られるアメリカの教育家のヘレン・ケラーは、1937年（昭和12年）に来日して函館盲唖院を訪問した際、佐藤を「単なる教育家でなく、人生におけるノーマルな幸をつくる人格者」と称えた。なお戦後の1948年（昭和23年）、ケラーは2度目の来日において佐藤に面会を求めたが、佐藤は戦争の責任の痛感から会見せずに終わった。佐藤の手話擁護については、口話を推進していた戦前にあっては後進的なものとして捉えられていたらしく、評価は低かった。『聾唖教育』において佐藤が執筆した論文も、口話主義者たちからは黙殺に近い扱いを受けていた。函館聾学校も、佐藤が校長を退いた翌日からは口話教育が実施されている。しかし戦後、佐藤の教え子で盲唖院教員となった鈴木忠光の二男・鈴木重忠（金沢大学医学博士）は、「金沢方式」と呼ばれる聴覚障害児への言語指導を実践し、手話を効果的に用いている。このほかに東京、奈良、三重などのろう学校でも幼稚部から手話が導入され、効果を上げている。このことから、佐藤らの手話擁護の主張は平成期において確実に広がり始めていると見る向きもある。
1910年（明治43年）2月12日、東京府東京市浅草区仲町（現在の東京都台東区浅草）に初代空中軒マストンの長男として生まれる。「江川の玉乗り」は、1884年（明治17年）に区画整理により東京の「浅草公園六区」に見せ物小屋等が成立し始めたころから、関東大震災までの期間、常打ち小屋「大盛館」（現在の浅草新劇場の位置）で興行が行われた曲芸の一座で、幕末からのキャリアを持つ興行師・江川作蔵がこれを率いた。のちの二代目江川マストンは、初代マストンのもとで、1917年（大正6年）、江川 茶目（えがわ ちゃめ）の名で舞台に上がっている。同時期に軒を隔てた向こう側には第一共盛館（のちの大勝館）があり、青木一座が「青木の玉乗り」の興行を行い、競い合っていた。「江川の玉乗り」は小屋での見世物であり、大道芸ではなく、したがって江川は大道芸人ではない。1920年（大正9年）には、江川 小マストン（えがわ こマストン）に改称する。1923年（大正12年）9月1日、関東大震災が起き、浅草の興行街が壊滅し、江川一座は浅草の常打ち小屋を失う。1955年（昭和30年）5月31日、初代が死去、二代目 江川 マストン（にだいめ えがわ マストン）を襲名する。70代となった1980年代には、『日本の曲芸』の公演で、国立演芸場の舞台に3度立ったほか、テレビ番組『痛快なりゆき番組 風雲!たけし城』（TBSテレビ）にも出演していた。1998年（平成10年）9月6日、死去した。満88歳没。2日後の同年9月8日、水道橋博士がダンカンから訃報を知らされた旨をブログで記している。没後の2002年（平成14年）11月20日、DVDビデオグラム『昭和名人芸大全 -珍芸・奇芸・ビックリ芸- 四日目』（発売元NHKソフトウェア、販売元ポニーキャニオン）が発売され、江川の玉乗り芸が収録されている。2010年（平成22年）には、プラネット映画資料図書館が、大正時代に製作された短篇ドキュメンタリー映画『元祖 大曲藝連鎖 東京江川巡業部』を発掘、東京国立近代美術館フィルムセンターと共同で復元し、同年5月にフィルムセンター、翌2011年（平成23年）3月には第3回恵比寿映像祭（東京都写真美術館）、同年4月には神戸映画資料館でそれぞれ上映されている。
市民の人権擁護の会（しみんのじんけんようごのかい、英語: Citizens Commission on Human Rights、CCHR）とは、精神医学における人権侵害を調査・摘発し、精神治療の分野を正常化することを目的として、サイエントロジー教会によって1969年に設立された団体である。現在、世界31ヶ国に130以上の支部を持ち、活動を続けている。国際本部はアメリカ合衆国のロサンゼルス市にある。
国際本部の諮問委員会は、医師、弁護士、教育者、芸術家、実業家など民間からの代表者や人権問題専門家の代表者で構成されている。市民の人権擁護の会が医学的、法的助言を与えることはないが、医師と共に働き、医療行為を支援している。市民の人権擁護の会の第一の関心事は「科学や医学の基準に基づかない精神医学」による「診断」の「詐欺的濫用」とされている。市民の人権擁護の会の支援者の中には、トーマス・サズ博士のような精神医学の専門家もおり、設立以来、精神科医療の分野における不正や濫用、人権侵害を告発し、この分野の改革に貢献していると主張している。しかしながらこの団体の精神医学に対する考え方には批判が多い。市民の人権擁護の会は「精神疾患は医学によって治療できるものではない」と結論付けており、「精神疾患に対する処方薬の使用は有害で詐欺的な診療である」と主張している。これは作家でありサイエントロジー教会創始者のL・ロン・ハバードの精神医学に対するスタンスを反映したものである。また団体はアメリカ同時多発テロ事件は精神科医たちによって計画されたと主張し、そしてその精神科医たちが数十億年前の宇宙の大破壊を引き起こしたとも主張してきた。
2005年12月、CCHR は「精神医学:死の産業」博物館をカリフォルニア州ハリウッドのサンセット大通りに開館した。博物館はCCHRの主張する「精神医学の長きに渡る世界征服への基本計画」と、「アドルフ・ヒトラーがその計画で果たした中心的な役割」などについて展示しており、 さらにレポーターのアンドリュー・ガンベルによると、 「アーネスト・ヘミングウェイ、デル・シャノン、ビリー・ホリデイ、カート・コバーン、スポルディング・グレイらの死は精神医学に責任があるという趣旨の展示も含まれている」とのことである。会館記念式典は2005年12月17日に行われ、エルビス・プレスリーの元妻であるプリシラ・プレスリー、リサ・マリー・プレスリー、ジェナ・エルフマン、ダニー・マスターソン、ジョヴァンニ・リビシ、リー・レミニ、キャサリン・ベル、アン・アーチャーらをはじめとする著名なサイエントロジー信者らが出席した。
同様に精神医学に否定的・反対的な主張をしている組織として「反精神医学連合」という団体が存在している。ただし、「反精神医学連合」は「市民の人権擁護の会」や「サイエントロジー教会」とは無関係の組織である（反精神医学連合ホームページの「お知らせ」を参照のこと）。
コーンフォース試薬はピリジンに、三酸化クロムの濃縮水溶液をゆっくり添加することにより合成する。この反応は爆発を引き起こす可能性があるため、三酸化クロムは完全に水に溶かし、氷で溶液を冷却する。生成物をろ過し、アセトンで洗浄し、乾燥させると橙色の粉末が得られる。この粉末は空気に対して安定で、吸湿性も無く、pHもほとんど中性であり、取り扱いが容易である（ピリジニウムカチオンの存在により若干酸性である）。コーンフォース試薬は水、ジメチルホルムアミド、ジメチルスルホキシド (DMSO) に容易に溶けるが、アセトン、塩素化有機溶媒（ジクロロメタンなど）には溶けず、懸濁液となる。
シアノコバラミンは化合物を単離する際に得られる人工産物で、喫煙者などの特殊な場合を除き、人間の体内ではシアノコバラミンは合成できない。草食動物は腸内細菌としてプロピオン酸生産菌（プロピオニバクテリウム属）等を保有し、これがビタミンB₁₂を生産するので、これらの菌からビタミンB₁₂を摂取している。アミノ酸や脂肪酸の代謝および葉酸の生合成に用いられる。これ自体に補酵素活性はなく、生体内で補酵素型であるメチルコバラミンおよびアデノシルコバラミンに変換される。
ポルフィリン類似のコリン環（図の赤色部位）とヌクレオチド（図の緑色部位）の構造をもつ、コバルトの錯体である。シアノコバラミンは合成が極めて困難であるため、現在は放線菌（プロピオニバクテリウム属）などの細菌の培養液から生産されている。
ビタミンB₁₂は代謝に関与しており、特にDNA合成と調整に加え脂肪酸の合成とエネルギー産生に関与している。しかしながら、体内でビタミンB₁₂が葉酸（ビタミンB₉）の再生産に利用されているため、全てではないが多くのビタミンB₁₂の機能は十分な量の葉酸によって代替される。チミンやプリン体の合成のための十分な量の葉酸が体内に存在しない場合にはDNA合成障害を引き起こし、その葉酸欠乏症状は悪性貧血症状や巨赤芽球性貧血を引き起こすため、ほとんどのビタミンB₁₂欠乏症状は実際には葉酸欠乏症状である。十分な量の葉酸が利用できる場合には、メチルマロン酸(MMA)を代謝するビタミンB₁₂依存酵素であるメチルマロニルCoAムターゼ(MUT)やホモシステインを基質としてメチオニンを合成する酵素として知られている5-メチルテトラヒドロ葉酸-ホモシステインメチルトランスフェラーゼ(MTR)を助けることになり、ビタミンB₁₂欠乏症として知られるほとんどの症状は正常化される。ビタミンB₁₂補酵素の反応性の高いC-Co結合が3つの主な酵素反応に関連している。1番目は異性化酵素反応である。1番目の置換基である水素原子と酸素原子、アルコール基、アミノ基などと、1番目の置換基と隣り合った2番目の置換基である炭素原子（X基）を直接移動させる再配置である。例として、メチルマロニルCoAをスクシニルCoAに変換する反応である。2番目はメチル基転移反応である。メチル基が2つの分子間を移動する。例として5-メチルテトラヒドロ葉酸を脱メチル化してテトラヒドロ葉酸に変化させると同時に、ホモシステインをメチル化してメチオニンへ変換させる。3番目は脱ハロゲン反応である。有機化合物からハロゲン原子が離脱される反応である。この種の酵素はヒトからは発見されていない。ヒトにおいては、上記最初の2つの反応に対応した2つの主要なビタミンB₁₂依存酵素が知られている。それらは次に示す2種類の酵素である。
MUT（メチルマロニルCoAムターゼ）は、アデノシルコバラミン型と炭素骨格の再配置（X基は-COSCoA）を触媒する反応型1の異性化酵素である。MUTの反応は、メチルマロニルCoAをスクシニルCoAに変換し、タンパク質や脂肪からエネルギーを抽出する重要なステップを担っている。この機能はビタミンB₁₂欠乏症により失われてしまい、その機能はメチルマロン酸血中濃度で医学的に測定することができる。メチルマロン酸の濃度上昇はビタミンB₁₂欠乏症に鋭敏に反応するが、不運にもその濃度上昇が必ずしもビタミンB₁₂欠乏症のみによるものではないことである。ビタミンB₁₂欠乏症患者の90-98%は、メチルマロン酸の濃度が増加する。この試験は大変微妙なものがあり、70歳を超える被験者の20-25%はメチルマロン酸の濃度が増加するが、それらの25-33%はビタミンB₁₂欠乏症ではない。この理由により高齢者にはメチルマロン酸濃度での判定は勧められない。ビタミンB₁₂の欠乏が起こると体内組織は備蓄したビタミンB₁₂を取り崩して血中濃度を維持するため、ビタミンB₁₂欠乏症の黄金律試験は存在しないのである。それゆえ欠乏症を示し始めるビタミンB₁₂血中濃度が、必要最低限のビタミンB₁₂の状態を示しているわけではない。ミエリン形成や中枢神経の働きに必要なビタミンB₁₂依存酵素MUTの機能は葉酸摂取に影響を受けることはない。MTR（5-メチルテトラヒドロ葉酸-ホモシステインメチルトランスフェラーゼ）機能障害に関連したDNA合成に関わるビタミンB₁₂のその他の機能は葉酸摂取によって正常化することができるが、MTRによるメチオニンへ通常変換されるホモシステインの濃度上昇を正常化することはできない。 --->
MTR（5-メチルテトラヒドロ葉酸-ホモシステインメチルトランスフェラーゼ）は、メチオニン合成酵素として知られており、ビタミンB₁₂の一種であるメチルコバラミンを利用してホモシステインをメチオニンに変換する第2の種類の反応を触媒するメチル基転移酵素である。この転移機能はビタミンB₁₂欠乏症で失われ、医学的にホモシステインの濃度の上昇で判定することができる。ビタミンB₁₂は、葉酸の活性型であるテトラヒドロ葉酸（THF）の再生産を手助けしているため、葉酸欠乏症でもホモシステイン濃度の上昇が起こり得る。ビタミンB₁₂なしではテトラヒドロ葉酸は5-メチルテトラヒドロ葉酸に変化してテトラヒドロ葉酸に戻ることができない。MTRはホモシステインの存在下で5-メチルテトラヒドロ葉酸と反応してメチオニンとTHFを生成し、それゆえ食事からの新たな葉酸の摂取の必要性が少なくなる。THFはホモシステインからメチオニンへの変換に伴って生成されるか、食事から得られることとなる。それはビタミンB₁₂非依存のチミン合成に関わる5,10-メチレンテトラヒドロ葉酸（5,10-メチレン-THF）のプロセスによって変換される。5,10-メチレン-THFの利用の減少はDNA合成に障害をもたらし、血球や吸収を司る腸壁細胞のように回転率の高い細胞分裂で障害が生じる。血球細胞の合成障害は、かつて致死性の病として恐れられていた悪性貧血を引き起こす。悪性貧血の巨赤芽球性貧血を含めたすべてのDNA合成の影響は、十分な葉酸の存在により解決される。これは十分な葉酸があれば必要な5,10-メチレン-THFが残るからである。DNA合成、細胞分裂や悪性貧血に関連するビタミンB₁₂の最もよく知られている機能は、効率的なDNA生成に必要な活性型の葉酸のビタミンB₁₂による維持機能である。その他のコバラミンを必要とするメチル基転移酵素は、バクテリア中のMメチル転移酵素（Me-H₄-MPT）が知られている。
十分な葉酸が存在している場合には、ヒトにおいてビタミンB₁₂依存酵素であるMUT関連反応は神経系に最も特徴的な副次影響を示す。これは、葉酸の再生産に関連したメチル基転移型のMTR反応が、葉酸が十分存在している場合にはその欠乏の影響が明らかでなくなるためである。1990年代後半から多くの国々で強化小麦粉として葉酸が添加され始めてから葉酸欠乏症は稀となった。同時に貧血と赤血球のサイズに関連したDNA合成感受性試験が小規模の医学試験所でも日常的に行われているため、ビタミンB₁₂欠乏症に影響を受けるMTRはDNA合成障害による貧血のような古典的症状のように明らかでなく、血中や尿中のホモシステイン濃度の上昇のようにあまり明らかでない症状で判別されることになる。この症状は、動脈と（脳卒中や心臓発作に影響する）凝固系へ長期間にわたりダメージを与えるが、この影響はアテローム性動脈硬化症や老化と関連したその他の要因と分離するのが難しい。ビタミンB₁₂欠乏症の結果によるミエリンの損傷は、適切な量の葉酸やメチオニンの存在があっても、より特徴的で明確なビタミン欠乏の問題となる。これは、メチルマロニルCoAからスクシニルCoAへ代謝されるに際して絶対必要なMUTと関連した反応により最も直接的に結び付いている。この2番目の反応の障害はメチルマロン酸の濃度の上昇をもたらし、ミエリンの不安定さをもたらす。過剰なメチルマロン酸は、通常の脂肪酸合成に障害をもたらし、通常のマロン酸よりもより通常の脂肪酸合成に悪影響を与えている。異常な脂肪酸がミエリンに影響を与えているのなら、結果としてミエリンは脆くなり、ミエリンの崩壊が発生する。しかしながら正確なメカニズムは解明されていない。結果として亜急性の中枢神経と脊髄の複合した崩壊が引き起こされる。たとえ葉酸が十分に存在して貧血が発生していなくとも、原因が何であれ、ビタミンB₁₂欠乏症はニューロパチーを引き起こす。ビタミンB₁₂依存のMTR反応は、間接的なメカニズムではあるが神経に障害を与える影響を起こす。ミエリン鞘のリン脂質のメチル化に必要なS-アデノシルメチオニンを合成するには（もしビタミンB₁₂によりホモシステインから再生産されない場合には、葉酸のように食事中から摂取しなければならないように）適切なメチオニンが必要である。S-アデノシルメチオニンの合成はビタミンB₁₂に依存しないが、ビタミンB₁₂は基質の原料となる必須アミノ酸のメチオニンの再利用を手助けしている。加えて、S-アデノシルメチオニンは神経伝達物質、カテコールアミンの合成や脳内の代謝に関わっている。これらの神経伝達物質は、気分を保つために重要で、ビタミンB₁₂欠乏症が抑うつとなぜ関連しているかを説明しうるものである。葉酸を大量に摂取しない限り、ミエリン鞘のリン脂質のメチル化は、MTRの再利用に関係して適切な量の葉酸に依存するかもしれない。
コバルト上のシアノ基をメチル基に置き換えたメチルコバラミン (methylcobalamin) や、5-デオキシアデノシル基に置き換えたアデノシルコバラミン (adenosylcobalamin) などが存在する。ヒドロキシ基に置き換えるとヒドロキソコバラミンになる。CN基がヌクレオチドに置換されることによって、補酵素型であるコバミドとなる。1964年、ドロシー・ホジキンらは、X線構造解析によってシアノコバラミンの構造決定を果たしノーベル化学賞を受賞した。
シアノコバラミンは眼精疲労の治療薬として市販される点眼薬に配合されているほか、医療用として参天製薬より「サンコバ点眼液0.02%」として販売されている。他にも補酵素型ビタミンB₁₂のメチルコバラミンも医療用医薬品として販売されており、末梢神経障害や悪性貧血の治療に用いられる。
ビタミンB₁₂は、穀類、芋類、砂糖類、豆類、野菜類、果実にはほとんど含有されない。例外的に、野菜ではビタミンB₁₂の水溶液をかいわれに吸収させた「マルチビタミンB₁₂かいわれ」が開発され、6.8µg含んでいる。また、ビタミンB₁₂が不足しやすい菜食主義者に対して、海苔が摂取源として有効かどうかには議論がある。文部科学省の発行する五訂増補日本食品標準成分表では海苔類はビタミンB₁₂を含有するとされている。五訂増補日本食品標準成分表に掲載されている海苔のビタミンB₁₂含有量は、近年の主流となってきた化学発光免疫測定法に基づく自動分析法ではなく、測定精度が低く、なおかつ熟練を要する微生物法により測定された値である。市販の複数の藻類のビタミンB₁₂含有量を微生物法と化学発光法で測定した結果、スジアオノリとスサビノリが多量に含有するビタミンB₁₂のほとんどが生理的に有効なOH-B12であり、人間が対象ではなく参考ではあるが、ビタミンB₁₂欠乏ラットを用いた実験ではこれらの海苔がビタミンB₁₂供給源として有効であると報告されている。乾燥状態のスジアオノリ、スサビノリ、クロレラに含まれるビタミンB₁₂は生理的に有効なビタミンB₁₂であり、スサビノリから単離したビタミンB₁₂を、人間ではないので参考ではあるが、ビタミンB₁₂欠乏ラットを投与したところ供給源として有効と報告されている。一方で、2002年に複数の文献を検査した海外のベジタリアンのサイトの報告によれば、生海苔を乾燥させた乾燥海苔はビタミンB₁₂の供給源になるという結論を持った論文に対して、そのデータに対してそうではないとの見解を示し、テンペ、生海苔、円石藻類のみがビタミンB₁₂源として確実な摂取源であるかさらに研究されるべきであるとする報告もある。日本の研究者は、海外では藻類を食する文化がないため、適切でない乾燥方法を用いた藻類のビタミンB₁₂が生理的に不活性になることがあるという報告があると指摘している。1995年に、鈴木英鷹が行った調査では、厳格な玄米菜食の菜食歴4～10年の7～14歳の子供6名を対象とした研究において、1日あたり2～4gの海苔を摂取した場合、コントロール群とビタミンB₁₂値などに有意差がないために、厳格な玄米菜食を行う子供でも海苔を食べることによってビタミンB₁₂の欠乏を防ぐことができると報告している。この研究は血清ビタミンB₁₂値とMCV（平均赤血球容積）だけの計測結果である。海外のベジタリアンのサイトの報告では、血清ビタミンB₁₂値は、ビタミンB₁₂欠乏症を悪化させる可能性のある有害なビタミンB₁₂類似体もビタミンB₁₂として計測されてしまうために、尿中メチルマロン酸を調査すべきで、海苔を食べることはビタミンB₁₂の供給源であるという論文の結論に同意しないと主張し、その理由として統計上の有意差はないが改善もしていないためである。同じ鈴木英鷹が2003年に生後より厳格な玄米菜食をしている小中高生の菜食者6名（男4名、女2名）を対象にした研究において、1日あたり海苔を0～2グラム摂取していた2名は、体内ビタミンB₁₂の減少を示す尿中メチルマロン酸の上昇を示したものの、1日あたり海苔を4グラム以上摂取していた4名は尿中メチルマロン酸の上昇を示さなかったことから、海苔を毎日4グラム以上摂取することで、ビタミンB₁₂の供給源になることが示唆された。
ビタミンB₁₂は、特定の真正細菌及び古細菌による原核生物によってのみ天然に産生され、多細胞または単細胞の真核生物によって産生されたものではないと主張されている。プロピオニバクテリウム属の菌種は、ビタミンB₁₂の産生や同ビタミンによる代謝の関わりが深いプロピオン酸などの産生ができる。ヒトや他の動物のいくつかの腸内細菌によって合成されるが、内因子と結びついたビタミンB₁₂が吸収される回腸の部位からさらに遠位の大腸でビタミンB₁₂が産生されているので、ヒトは大腸で作られたビタミンB₁₂を十分に吸収することができない。しかし、牛や羊のような反芻動物は細菌を第一胃と第二胃で培養し産生されたビタミンB₁₂を小腸内で吸収することができる。反芻動物の腸内細菌がビタミンB₁₂を産生するには、動物は十分な量のコバルトを細菌に提供しなければならない。反芻動物以外の反芻胃を有さない草食の放牧動物はビタミンB₁₂とそれを産生する細菌をそれらの動物が食べる植物の根に付着した土壌から摂取することになる。
ビタミンB₁₂は水溶性なので、過多症の心配はないと考えられている。しかし、血漿中のビタミンB₁₂濃度が高かった人ほど、血液学的な癌、喫煙関連癌、飲酒関連癌などの特定の癌を1年以内に発症するリスクが高かった旨のコホート研究による調査結果が報告されている。
ビタミンB12欠乏症は、ビタミンの供給、吸収にかかわるタンパク質、このビタミンを利用する酵素の異常、など非常に複雑な要因が絡んで起こる。ビタミンB₁₂の一日の必要量は極めて少なく（2.6µg）程度とされる。ビタミンB₁₂の正常な成人の必要量は1.0µg/日で、吸収率を50%として必要な摂取量は2.0µg/日である。摂取推奨量は、1.2を乗じて2.4µg/日である。肝臓や筋肉に大量に貯蔵されているため、胃全摘術などによって吸収障害が起きても体内貯蔵分のシアノコバラミンによって充当されるので、欠乏症が出現するまでは3-5年を要する。　胃全切除後では、ビタミンB₁₂の吸収に必須の蛋白質である内因子の分泌能が恒久的に失われるのでビタミンB₁₂欠乏症を発症しやすい。また、野菜・果物類にはほとんど含まれないので、極度の菜食主義でも欠乏症になることがある。
ビタミンB₁₂あるいは葉酸が不足して、葉酸が触媒的に再生産されないとDNA合成に異常が起こり細胞の成熟が正常に行われなくなるのは巨赤芽球を呈する赤芽球だけではなく、顆粒球系や巨核球系、さらに他の細胞とくに増殖の盛んな上皮や精子など細胞にも同様の影響をあたえる。ビタミンB₁₂の吸収不足の原因となる萎縮性胃炎では大球性高色素性貧血 （平均赤血球容積(MCH)の高値）が認められることがある。胃全摘や高度な萎縮性胃炎では、内因子が不足するためビタミンB₁₂の吸収障害が起こる。赤血球のDNAの合成が阻害され大球性貧血（巨赤芽球性貧血）が起こることがあり、悪性貧血と呼ばれている。
ビタミンB₁₂欠乏症は、潜在的に深刻で不可逆的な障害を脳と神経にもたらしうる。ビタミンB₁₂欠乏症は、躁病や精神病、疲労、記憶障害、神経過敏、抑うつ、運動失調及び人格変化の症状を引き起こす可能性もある。オックスフォード大学が61歳から87歳の107人に対して行った研究によると、ビタミンB₁₂濃度が最も低い群は脳収縮を引き起こす可能性が6倍高いと報告されている。
葉酸、ベタインなどとともに自閉症児へのサプリメンテーションが有効という報告があるが、シアノコバラミンは適切なビタミンB₁₂ではない。補酵素型であるメチルコバラミンを使うのがよい。注射やパッチは、消化器からの吸収が不十分な場合に用いられるが、0.5から1mg以上の高容量の経口摂取であれば注射やパッチは必要ではないとの証拠もある。悪性貧血であっても経口投与で治療が十分に可能であるとも言われている。このような主張があるものの、ビタミンB₁₂は内因子と結び付かないと腸から効果的に吸収されないため、内因子の分泌量が制約要因となり食事当たり2μg 程度でビタミンB₁₂の吸収が飽和する。このため、ビタミンB₁₂は胃から分泌される内因子を介した吸収機構が飽和すれば食事中から過剰に摂取しても吸収されない。また大量（500 μg 以上）のシアノコバラミンを経口投与した場合でも内因子は非依存的に投与量の1%程度が吸収されるのみである。ピロリ菌感染等による萎縮性胃炎による内因子の分泌障害とそれに伴うビタミンB₁₂の吸収不全が疑われる場合には、ビタミンB₁₂の錠剤の舌下での服用と吸収も考えられる。
哺乳動物では、奇数鎖脂肪酸の代謝や一部のアミノ酸の代謝でプロピオン酸が生成される。このプロピオン酸とCoAが結び付いたプロピオニルCoAは、ビオチン依存性酵素であるプロピオニルCoAカルボキシラーゼによって(S)-メチルマロニルCoAに変換され、さらに(R)-メチルマロニルCoAに変換される。(R)-メチルマロニルCoAは、メチルマロニルCoAムターゼによってクエン酸回路で代謝されるスクシニルCoAに変換されるが、この酵素は炭素-炭素結合の移動を触媒するためのコバラミン（ビタミンB₁₂）を要する。メチルマロニルCoAムターゼの欠如は、メチルマロン酸の蓄積をもたらし血液のpHが低下するメチルマロン酸血症を引き起こす。新生児マススクリーニングの1つとなっている。
必須アミノ酸の一つであるメチオニンの代謝経路において、中間生成物ホモシスチンの代謝酵素であるシスタチオニン-β合成酵素（シスタチオニン-β-シンターゼ）の先天的欠損によりホモシスチンがシスチンに変換されず、体内に多量に蓄積され尿中へ排出される先天性アミノ酸代謝異常症のひとつである。メチオニン代謝経路において、代謝不良によるメチオニン蓄積にあわせて、中間生成物ホモシスチンの一部がメチオニン合成酵素（メチオニンシンターゼ）によってメチオニンへと還元されることから血中メチオニン濃度が上昇するという特徴も併せ持つ。新生児マススクリーニングの1つとなっている。
最高点の一等三角点は基準点名が「大台ヶ原山」であるが、国土地理院による地図には日出ヶ岳（ひでがだけ）と表記され、三重県の最高峰である。三津河落山（さんずこうちさん）や経ヶ峰（きょうがみね）など、標高1400mから1600mの複数の山と、これらの山に囲まれた東西5 kmほどの台地状の地帯は大台ヶ原（おおだいがはら）と呼ばれ、奈良県吉野郡上北山村と同郡川上村および三重県多気郡大台町旧宮川村にまたがっている。大台ヶ原は吉野熊野国立公園の一部として指定され、特に景観を保護するために特別保護地区に指定されている。大台ヶ原は中央構造線の南に位置し、海洋プレートがユーラシアプレートの下へ潜り込む際に、海洋プレートに堆積した砂岩やチャートがユーラシアプレートの縁へと押し上げられて隆起した地形であると考えられている。大台ヶ原は日本では希な非火山性の隆起準平原であるとされているが、一方で、今から1500万年前に巨大噴火が起こり、大台カルデラが形成されていたとする説もある。西部と南部は山地隆起と削剥によって標高差1,000mの深い谷筋が形成され、硬い岩石で構成された地質が鋭く切り立った地形を作り上げている。南東方面は熊野灘に面するリアス式海岸で、大台ヶ原は海岸線からの急峻な斜面の頭頂部にある。南東の急峻な斜面を海上から湿った風が吹き上げるため大台ヶ原では年間を通じて降水量が多く、屋久島に並ぶと言われるほどの多雨地帯である。特に日本列島の太平洋側を台風が通過する際には南東からの風が強くなるため、10月ごろを中心に降水量が多い。1920年（大正9年）には年間8,214ミリの雨量を記録し、1923年（大正12年）9月の台風時には一日に1,011ミリの降水記録がある。
ビジターセンターから東の区域は東大台と呼ばれ、一般登山者向けのコース「東大台ヶ原自然観察路」が整備されている。日出ヶ岳山頂は東大台の北東端にあり、登山道は尾根沿いに南西へ牛石ヶ原（うしいしがはら）や正木ヶ原（まさきがはら）を通りながら大蛇嵓（だいじゃぐら、ぐらの字はやまかんむりに「品」）まで続いている。
ビジターセンターから西の区域は西大台と呼ばれ、自然環境を保持して自然体験の場を提供するため、環境省により立ち入り人数が制限されている（曜日や時期に応じて1日につき30人から100人）。また、立ち入りに当たっては事前申請を行って手数料を納付した上、当日までにレクチャーを受けなければならない。西大台へはビジターセンターから入るゲートと、南西の逆峠から入るゲートがある。
ハーブ園、（はーぶえん）ハーブガーデンとは、ハーブで構成された花壇や庭のことで、香草、薬草であるハーブを植えることで、その収穫と利用、あるいは草姿、花、香りを楽しむ庭園。
『メタルギアソリッド3』に登場するソ連の秘密設計局OKB-812（グラーニン設計局）の局長であるアレクサンドル・レオノヴィッチ・グラーニンによって「メタルギア」の原案が作成された。彼は「兵器は時代を動かす歯車である」と捉え、自らが開発中の新兵器に「金属の歯車」の意味を持つメタルギアと名付けたが、この原案自体は開発競争で競合していたドリル回転型推進機構を持つ核搭載型戦車「シャゴホッド」に敗れ、不採用となっている。不採用の理由としては、IRBMやロケットブースターなど、実績と信頼性を持った既存のテクノロジーの組み合わせだけで完成できるシャゴホッドに対して、メタルギアの二足歩行機構が研究途上で実績も無かった点などが挙げられており、登場人物の一人で「武器兵器の特別にスゴい専門家」を自称するシギントは、戦車に足をつけてもメリットは無いと切り捨てている。これに対してピースウォーカーの設計担当者であったヒューイは、山岳や沼地等のキャタピラでも移動不可能な険しい地形を大型兵器が踏破するためには、二足歩行による移動が最適と評している。結果として競合相手のシャゴホッドが採用されたため、これを不服としたグラーニンは、企画設計書をアメリカの友人であるヒューイ（Dr.エメリッヒ）に送り、自分のメタルギア計画の有用性を認めなかった軍部中枢に抵抗したが、これが原因でヴォルギン大佐にスパイの嫌疑をかけられ、拷問の末に落命している。またその設計書は漏洩とほぼ同時期に、当時三重スパイをしていたオセロットによって盗み出され、賢者達の手に渡っている。作中でシギントが語るように、アメリカにおいても当時既にヒューイによって二足歩行兵器の草案が発表されていたが、ヒューイ自身はこの内容のほとんどがグラーニンから託された設計書を元にした「東側のものの盗用」であったと告白している。
『ピースウォーカー』に登場。「メタルギア・ジーク」と読む。別名「AI搭載汎用換装二足歩行戦機 MSF仕様」。後述の有人改造型との戦闘後に、模擬戦が可能となるため区別のために「MSF仕様」と呼ばれる。最古のメタルギア。ビッグ・ボスの指示によってヒューイにより開発された機体であり、AIの開発にはピースウォーカー計画と同様にストレンジラブも参加している。レールガンとレドームを装備した外観は、後にヒューイの息子であるハルが設計することとなるREXによく似ている。AIによって制御され、指揮官の命令に従い高度に戦術的な行動が可能であるとされている。また、搭載AIには歩兵との連動を考慮し、AI兵器同様に音声合成システムが搭載されている。本来は海外派遣等での実地運用を想定しており、ゲーム中では完成後にOUTER OPS（紛争地帯への部隊の派遣）に出撃させる事が可能となる。また、後にピースウォーカーから回収した1発の核弾頭も搭載されたが、抑止力としての核弾頭の保有であるため、実際に使用されることは想定していない。MSFの拠点であるマザーベースではパーツの生産能力に限りがあるため、本体および搭載AIには、敵のAI兵器のパーツやAI記憶板を流用している。ヘッド、パワー、ウォーク、フットの4ユニットからなる基本フレームと、ヘッドユニット上に搭載されるAIから構成される。固定武装はヘッドユニットに2門、ウォークユニットに1門搭載された機関銃とパワーユニットに内蔵された誘導ロケットランチャーがあり、後のメタルギア同様、踏付けや体当たりでの攻撃も可能である（無人機であるためマン・マキシマムの枷がないこともあり、後に登場するメタルギア群と比較しても遜色のない高機動性を持つ）。また、AIポッドもZEKE用に新規に作成されており、形状は今までの円柱状のものから球状に変化、記憶版の搭載枚数も従来の40枚から最大400枚に増加している。さらに、回収したAI兵器群のパーツをオプション化しており、ピューパのジェットパック、クリサリスのレールガンとレドーム、コクーンの増加装甲を搭載可能。この他、ヘッド・フットユニットの接続部はAI兵器の同ユニットとの互換性があり、使用するユニットにより外観と機能が変化する。ヘッドユニットではZEKE専用ヘッド（機関銃）を、ピューパ（電撃）、クリサリス（ヘッドミサイル）、コクーン（主砲）、ピースウォーカー（電磁パルスと毒ビーム）と換装。フットユニットは同じ二足歩行機であるピースウォーカー（Sマイン、1対しかないため四足形態は足自体が足りず不可）との換装が可能である。コードネームの「ZEKE」の由来は、第二次世界大戦中に連合国側が日本の戦闘機「零戦21型」に対して与えたコードネーム「Zeke」から。『グラウンド・ゼロズ』では、IAEAの査察に伴い、ヒューイの手により核弾頭と共に海に沈められる。深海100m前後の海域に海上機動用のフロート付で係留されているが、その後のマザーベースの崩壊もあり、回収可能な状態かは不明である。ブリーフィングでのパスの会話から、MSFスタッフからは「守護神」のように扱われていることが分かる。
別名「汎用換装二足歩行戦機・有人改造型」。工作員であるパス・オルテガ・アンドラーデ （パシフィカ・オーシャン）により有人機へと改造されたメタルギアZEKE。本来のZEKEは搭乗員が乗ることを想定しておらず、メンテナンス及び緊急時用の簡易コックピットがある程度（使用時には悪用を防ぐため核関係の機能は操作不能になる）で、本格的な操縦機器も存在しないが、パシフィカによりかなりの改修が行われ、核発射を含む完全な操作機能を持ったコックピットを有している。後に発覚したことだが、劇中で頻発したザドルノフの脱走劇は、この改造を完了するまでの時間稼ぎであった。しかし、マシンマキシマムで設計されたZEKEを有人機へ改造するのには無理があったらしく、巨大な二足歩行機の戦闘行動によって生じるG緩和のため、コックピット内に注水を行う機構を採用している。そのため操縦には潜水用の装備を必要とし、潜水可能時間がそのまま操縦可能時間となる（ただし、酸素自体は外部から空気を供給する方式のため、かなり長時間の潜水が可能となっている）。この機構を採用しているのは本機のみである。本性を現したパシフィカがMSFから強奪、カリブ海のマザーベースから合衆国東海岸への核攻撃を敢行しようとする。これを阻止しようとするビッグ・ボスと死闘を繰り広げるが、最後は暴走によって機体が制御不能となりコックピットが爆発、同時にパシフィカは機体外に投げ出され海へと転落した。事件後、再びZEKEが盗み出された時の事を考えたヒューイが、対ZEKE戦の模擬戦を提案し即決定となる。その後、本機が実戦配備されたかは判っていない。パシフィカ曰く、メタルギアは「元来人の操るべきもの」であり、初めからその設計で開発されたメタルギアの登場は、TX-55を待つことになる。
『メタルギアソリッドV ファントムペイン』に登場。別名「直立二足歩行兵器」。スカルフェイス（愛国者達を外れたサイファー）の指示により、ZEKEに引き続きヒューイによって開発された純ソビエト連邦製メタルギアである。STは『サヘラントロプス』の略で、劇中ではそのまま「サヘラントロプス」や「巨人」と呼ばれることが多い。本機はアフガニスタンの起伏の多い地形に対応するため、直立二足歩行の実現は開発に必須とされていた。メタルギアのフォーマットを発案したグラーニンの所属していたソ連製であり、開発にヒューイが参加していることで、細かい差異はあるがREX形態の外観は、オプション装備のZEKEや、後にオタコンの設計するREXと酷似した外観をしている。スカルフェイスの切り札の一つということもあり、作中における本機の頭部には髑髏のペイントが施されている。この髑髏のペイントは発掘された「サヘラントロプス」の頭蓋骨をモチーフとしているが、開発を担当したヒューイの弁によれば、MSFのトレードマークであったパンゲア大陸を模した骸骨の意味も込めており、それが自分がMSFを裏切っていない証拠であるとしていた。基本搭載武装は頭部の機関銃、股間部の火炎放射器、両脚部のミサイル、自律式偵察兼自爆ポッド（一定時間ロケットで浮遊して偵察を行い、稼働限界が迫ると敵に突撃または自爆する）、金属腐食型メタリックアーキアをばら撒くアーキアル・グレネード。巨体も生かした踏みつけも可能で旧作のメタルギアを踏襲している。過去のAI兵器やZEKE、未来に登場する他のメタルギアと決定的に異なるのは、収納式の明確な腕と手を持ち、足を逆関節から正関節として、立ち上がった人型（直立二足歩行）形態への変形が可能なことである。装備された腕は対象を持ち上げたり、握ったりする精密さとパワーを備えており、これにより専用の武装を持つことが可能で、右腕にはパイルバンカー、左腕には盾を装備、右脇部に内蔵されている刀身が赤熱化するアーキアル・ブレードと呼ばれる蛇腹剣を握って使用する。この剣は実体刃としての機能のほかに、爆発物生成型メタリックアーキアを撃ち込む機能があり、地面に突き立てることで爆発する金属片を発生させることができる。後に背部ユニットにレールガンとレドームが追加された完成形となった。人型形態の方が本来の姿で、移動・戦闘は人型形態で行われることが多く、腕を収納した逆関節のREX形態は格納時やレールガン使用時に使われる。技術不足もあって操縦方法の選定は迷走しており、人が乗って操縦する前提で頭部にコックピットを設け（ダンパーを設置し、緩衝材として有人型ZEKE同様注水する）、同時にAI兵器の弱点であった外付けの姿勢制御AIボッドを小型化して装甲内に収める設計を予定していた。しかし、演算能力そのままにレプタイルポッドの10分の1程度に小型化したものの、完成したコックピットには大人が乗って操縦できるスペースを確保できなかった（少年兵なら何とか収まるサイズ、ヒューイは実の息子である4歳前後のハル（後のオタコン）を乗せて実験していた）。次に有人操縦を諦め遠隔操縦を試すが、レスポンス・精度が悪く、ジャミングされる可能性も考慮して不採用。その次はAI兵器同様にAIに完全自律行動させることにして、ニカラグア湖に沈んだピースウォーカーのハイブリッドAIを回収、それをベースにストレンジラブの協力の下で新たな無人核兵器用AIを作成するはずだったが、ヒューイがストレンジラブを殺害（ハルを実験に使うことに反対して引き離したストレンジラブをヒューイが閉じ込めて窒息死させた）したため頓挫。機体の各部を折り畳んで頭高を落としたREX形態を設定することで、未完成のAIでも何とか歩けるようになるが、安定してバランスをとるにはさらなる検証が必要な状態だった（劇中に登場する変形は、この機能を何らかの理由で撤去せず残したものである）。結局、現状の技術では外付けのAIが早く確実という結論に至るが、あまりにも開発に時間がかかったことでスカルフェイスに未完成のまま引き取られてしまう。まともに動く事すらできない筈だったが、スカルフェイスは自分の報復心に感応して配下となった、ソ連の実験で超能力を見出された「第三の子供」と呼ばれる少年（後のサイコ・マンティス）を用いることでブレイクスルーする。過去のRAXA同様、強力なサイキック能力で操作された本機は、ヒューイの想定以上の性能を発揮した（曰く、ライト兄弟が月に行くようなもの）。また、空中に浮遊するなど超常的な能力も発揮している。劇中では核弾頭は装填されていないため（ただし、要求仕様ではピースウォーカー級ICBMの搭載能力が求められている）、一見メタルギアの定義から外れるが、装甲が劣化ウランで構成されており、これを内蔵したウラン代謝型メタリックアーキアによりに融解、90%以上の兵器級高濃縮ウランを生成する。つまり、本機自体がガンバレル型核爆弾となるのである。装甲材としてセラミックスに劣る劣化ウランを敢えて採用しているのはこのためであり、表向きはセラミックス技術者に接触できなかったことと、直立二足歩行をする上で軽量化が必要だったためと説明していた。自爆した場合の想定核出力は約15キロトン（広島に投下されたリトルボーイと同程度の威力で、これに必要となる高濃縮ウラン50キログラムを劣化ウラン23トンから瞬時に生成する）。メタリックアーキアが放出される瞬間までは、核兵器化できない劣化ウランの塊でしかなく（理論上は劣化ウランからも抽出可能だが、既知の抽出法ではコストと時間がかかり過ぎる）、必要量もMBTの主装甲材程度に収まるので、ほとんどの条約や規制を回避して輸出入が可能であり、監査や敵対組織からの警戒を受けることもない、一種のステルス核としてのデモンストレータの役割を持っている。