Tuttavia il Sant’Uffizio lo arrestò e lo processò accusandolo di essere un astrologo e un eretico appartenente a una setta calvinista .
Un tal Guillén Lombardo de Guzmán fue acusado de querer libertar México ; sin embargo , con el objeto de apresarlo y procesarlo , el Santo Oficio lo acusó de practicar la astrología y ser un hereje partidario de Calvino .