ポール・ワトソン
生い立ち
1950年、12月2日、ポール・ワトソンはトロントで、アントニー・ジョセフ・ワトソンとアンナマリー・ラーソンとの間に生まれ、ニューブランズウィック州セント・アンドリューズで育った。1967年のモントリオール万国博覧会のツアーガイドとして働いた後、貨物列車で西のバンクーバーへと移住。
1968年、そして1970年代初頭には、彼はカナダ沿岸警備隊に入隊し、気候観測船や救援用ホバークラフト上、あるいはブイの監視役などとして働いた。1969年にはバンクーバーのノルウェー領事館における商業航海人となり、載貨容積3万5千トンのノルウェー船「ブリス（Bris）」の甲板員となった。
グリーンピース時代
1969年10月、ワトソンは自然保護団体シエラクラブの、アムチトカ島に於ける核実験への反対運動に参加した。この運動の結果、カナダのバンクーバーに誕生したのが、「波を立てるな委員会（Don't Make a Wave Committee）」である。この団体は後にグリーンピースへと発展していった。ワトソンは1971年「グリーンピース2号（Greenpeace Too!）」の船上員となった後 、1972年には同組織の「アストラル号（Astral）」の船長を務めた。その後、1970年代半ばまで、グリーンピースで働くこととなるが、1975年の6月、ソ連の捕鯨妨害活動の最中、彼の人生を変える出来事が起こったらしい 。なお、グリーンピースはワトソンを「初期の影響を持つメンバーではあったが、彼の主張とは異なり、グリーンピースの創立者ではなかった」としている。ポール・ワトソンは、しかし、依然として自分がグリーンピース及びグリーンピース・インターナショナル創立者であったと主張し続けている。
1977年、賛成11票、反対1票（この1票はワトソン自身によるものである） でワトソンはグリーンピースの理事会から降ろされた。それは、彼の目立ちたがりで傲慢な性格により組織内の調和が乱れるため、次期代表のパトリック・ムーアに反対したため、そしてニューファンドランド州での抗議活動中に取った彼の行動（アザラシ狩り漁師から棍棒を取り上げ、アザラシの生皮と共に海へ投げ捨てた）がグリーンピースの理念に反するのにもかかわらず、彼がそれを謝罪しようとしないため、という3つの理由によるものであった。非暴力的抗議活動に限界を感じたワトソンは、グリーンピースを離脱。この行動は、グリーンピースから「反逆」として受け止められた。
シーシェパード時代
1977年、グリーンピースを脱退したワトソンは、シーシェパードの前身となる「アースフォース（Earth Force Society）」を結成した。1978年12月、英国の作家で動物基金の代表者でもあるクリーブランド・アモリー（Cleveland Amory）から支援を得て、シーシェパード号を購入、本格的な活動を開始した。1979年3月、カナダセントローレンス湾においてアザラシ狩船に対して、シーシェパードとして初の抗議活動を行った。同年6月、海賊捕鯨船シエラ号（Sierra）に、船首に100トンのコンクリート塊を取り付けたシーシェパード号で体当たりし、航行不能に陥らせた。この事件の後、ワトソンは自らをキャプテン（船長）と呼ぶようになったが、船長の資格を得たことはない。ワトソンらの抗議行動は、捕鯨船の甲板へ物を投げる、異物をスクリューに絡ませようとする、捕鯨船への侵入、アイスランド近辺における自沈など、過激なものであり、シーシェパードはすぐに最も攻撃的な環境保護団体の一つとして知られるようになった。1993年に著した著書で、ワトソンは地球防衛戦士の教えとして、派手派手しいドラマを演出し相手を騙しなさい、信頼を得るために犠牲者のふりをしなさい、などと記した。シーシェパードの反捕鯨活動は現在アニマルプラネットで放送されているドキュメンタリー番組『クジラ戦争（Whale Wars）』として注目を集めている。
2012年3月、クロマグロ漁師から賄賂をもらっているとワトソンから非難されたマルタ首相ローレンス・ゴンジは、国会答弁でワトソンを名誉毀損で訴えると断言した。
同年5月、2002年に映画『シャークウォーター（Sharkwater）』を撮影した際にグアテマラ沖でコスタリカのサメ漁船の航行を妨害した容疑でフランクフルトにて逮捕された。身柄はコスタリカに引き渡される予定であったが、7月、保釈中にドイツから出国して所在不明となり、コスタリカの要請を受けた国際刑事警察機構（ICPO）は、ワトソンに対する国際指名手配を情報提供などを求める「青手配」から、身柄引き渡しのために逮捕を求める「赤手配」に格上げした。またICPOは、同年9月に、ポール・ワトソンの日本の調査捕鯨妨害の件についても日本の海上保安庁から要請を受けて「赤手配」をしている（後述）。
その後、約1年3ヶ月にわたり南太平洋上を航行していたとされる。2013年10月28日、日本鯨類研究所がシーシェパードに対して調査捕鯨妨害の差し止めを求めて起こした民事訴訟に出廷するため、アメリカ合衆国に入国。11月6日、シアトルの連邦高等裁判所で証言台に立った。
日本との関係
1982年、イルカ漁に抗議するために訪日し、朝日新聞から「イルカの使者」と呼ばれた。イルカ漁を止めれば1頭につき100ドルを支払うが、止めないならばシー・シェパード2世号を自沈させて港を封鎖すると脅したが、長崎県壱岐で県水産部次長と話し合いをもった結果、漁民はイルカを積極的に捕獲しているのではないという説明に納得して何もせずに帰った。
2010年6月に、海上保安庁は調査捕鯨を妨害した容疑でポール・ワトソンの逮捕状をとり、国際刑事警察機構（ICPO）に青手配（犯罪に関連していないか追加情報の提供を求める）を請求し、ICPOが各国にこれを実施したが、ポール・ワトソンは共同通信の電話取材に対して「日本政府はわれわれが（次の捕鯨シーズンに）南極海に行くのを阻止しようと、あらゆる手段を取ろうとしている」と政治的な意図があると批判した。逮捕状に関しては「全く心配していない」と強調した。
2010年、シーシェパードの抗議船アディ・ギル号は日本の捕鯨監視船第2昭南丸と衝突し沈没したが、アディ･ギル号元船長のピーター・ベスーンに「ワトソンがPR目的のために、沈めるよう指示を出した」と自作自演行為であったことを暴露され、「不正直だ」「道徳的に破綻している」と批判された。
2010年、CNNテレビのトーク番組に出演し「経済的に日本の彼らを痛めつけるのが、捕鯨中止への最善の方法」とし、「彼らはわれわれを殺そうとしているが、われわれは彼らを負傷させていない」と語った。
2011年3月11日の東北地方太平洋沖地震の直後、ポール・ワトソンは「捕鯨を行う日本への海神ネプチューンの怒りが津波となって日本を襲った」とする内容を含む詩 Tsunami をオンラインで投稿した。これらは震災の被害者を侮辱し、また、死者を冒涜する内容であることから、人種差別であると批判されている。
ただ、ワトソン個人はこの世の森羅万象に神々が宿る宗教観を持ち自然を崇拝する日本の文明や宮本武蔵を尊敬し、特に宮本の著書『五輪書』を元にシーシェパードの作戦を立案している。このことからシーシェパードの活動は日本人への人種差別に基づくものではなく、人類文明への嫌悪が行動原理であると指摘されている。
2012年、海上保安庁は、ICPOが2010年6月にポール・ワトソンを青手配していた件を赤手配に格上げするようを請求し、2012年9月にICPOは赤手配を各国に実施した。
2015年、慰安婦問題や南京事件問題を例に「日本の教科書はまるでそうした出来事がなかったかのように残虐行為の言い逃れを行っている」などと批判。
今後の展開として、(1)イルカの死が増加する (2)太平洋地域の魚の放射能レベルが増える (3)日本でのガン患者が増加する (4)政府は今後、ますます情報を押さえつける (5)2020年に日本でオリンピックは開かれない、と予測している。 
事実として、シー・シェパードはすでに、2020年の東京五輪のボイコット運動も始めている。
私生活・性格
ワトソンは2度の離婚を経験しており（現在は3度目の婚姻）、最初の妻との間に娘をもうけている。1人目の妻スターレット・ラムは、グリーンピース・ケベック支部、シーシェパード等の創立者。2人目の妻は元モデル、リサ・ディ・ステファーノで、彼女はサンファン島のフライデー・ハーバーに於けるマカ族に対しての反捕鯨キャンペーンの指揮官であった。3人目の妻、アリソン・ランスは、動物保護運動家でシーシェパードのクルーである。2015年2月14日、ロシア人ヤニナ・ルシノヴッチ動物保護運動家34歳とパリで4度目の結婚をする。2016年9月29日、ヤニナとの息子タイガーをアメリカニューハンプシャー州レバノンで生まれた。朝日新聞の電話取材に対して、動物から取られた食材は牛乳やチーズを含めて取らない徹底した菜食主義であると答え、その理由は家畜の飼育には大量の植物が必要であり環境に負荷がかかるからとした。鯨肉を食べたことがあるかとの問いには「ない。強制されたとしても絶対に食べない」と語った。
2011年、2005年以来52万ドル（約4千万円）の報酬を受け取ったと報道された。