東峰十字路事件
反対派の作戦
一方の反対派は、第一次行政代執行および7月に行われた農民放送塔仮処分阻止闘争の経験から、実力闘争に参加する全員が団結小屋や地下壕に立て篭もる第一次行政代執行までの戦術を転換し、「ゲリラ部隊」を結成して外周警備の警察による阻止線を突破し、機動隊の規制によって足止めされた野次馬と篭城部隊を合流させて機動隊と対峙するという計画を立てた。反対派ではボール紙で現地の立体模型を作ってルートが決められ、無線機を持った支援者の主要地点への配置や警察無線の傍受など、機動隊の動向を察知する体制も整えられた。
対峙
9月16日からの新東京国際空港建設に伴う第二次行政代執行警備のため、千葉県警察代執行警備本部は千葉県警察機動隊の他、警視庁機動隊、関東管区機動隊など、総勢5300人の警備部隊を動員した。
当日早朝6時45分に代執行が宣言される。一坪共有地では日本社会党議員など一坪地主が座り込みを続けており、「砦」と呼ばれた3カ所の団結小屋には反対派住民（三里塚芝山連合空港反対同盟）と支援グループが立て篭もっていたが、警備部隊は行政代執行法に基づいてこれらを排除すべく、行動を開始した。
一方、前日15日には中核派など新左翼の活動家約2000人が現地入りしており、翌日の代執行当日には5000人を越すとみられていた。中核派は代執行に先立つ9月10日に東京で開かれた総決起集会席上で、代表が「権力の手先である機動隊を殲滅、北総地帯を解放区とする」と宣言していた。また過激派グループの間では、「警察は権力の手先であり、すきあらば殺せ」が合言葉になっていた。
代執行が開始された直後から、「ゲリラ部隊」が計画に従って団結小屋周辺の後方警備を担当する部隊を次々と襲撃した。空港予定地北西側の大清水等で爆弾ゲリラやバリケード構築などの動きがあったため、対応にあたる警備当局の意識は東峰方面に向けられなかった。
事件までの反対派と堀田大隊の動き
神奈川連隊第2大隊は、大隊長が神奈川警察署次長の堀田安夫警視であることから堀田大隊と呼称された。
神奈川署員を中心に編成された堀田大隊261人は当日、午前4時前に集結地点であった川崎臨港警察署から幌付きトラック等14台の車両に分乗して出発し、代執行が宣言される直前の午前6時30分頃、駒井野団結小屋の東側、小見川県道の東峰十字路に到着した。
現地に到着した堀田大隊は、十字路付近の山林内に火炎瓶、ゲバ棒が隠匿されているという情報に基づき、それらの凶器を発見・押収するため、東峰十字路を中心に第1中隊が二手に分かれて南北に、第2中隊が西側にそれぞれ展開した。第3中隊は第1小隊が車両警備のため警備本部に残り、第2小隊が空港公団事務所に向かった。
一方、空港反対派による青年行動隊が案内役を務め、叛旗派・プロ学同・日中派・解放派・フロント・労学連・人民連帯・宇都宮大全共闘などの過激派学生集団により構成されたゲリラ部隊約700人は、午前3時頃に東峰十字路南方の芝山町横堀地区に集合、途中火炎瓶・竹竿などを補給しながら、東峰地区に向かっていた。十字路南方の県有林で休憩していたところ、東峰十字路に機動隊が入り始めているとの情報がゲリラ部隊にもたらされた。ゲリラ部隊は堀田大隊の挟撃を目論み、集団を青年行動隊を含む先発隊と支援グループ中心の後発隊の2つに分けることとした。先発隊は東峰十字路を一旦迂回して北方へ回りこみ、後発隊は少し遅れて東方から十字路に向けて西進するかたちで現地へ向かった。一方、午前5から6時にかけて、東峰十字路とは空港予定地を挟んで反対側に位置する大清水地区で学生による爆弾投擲や検問が実施されていたことから、警察本部は警視庁部隊を差し向け、結果としてこれが陽動の役割を果たす。
反対派と堀田大隊の衝突
堀田大隊が各中隊・小隊単位で分散し各々の任務に就いて間もなく、同隊とゲリラ部隊は十字路付近で接触した。公団事務所へ向かおうとした第3中隊第2小隊の後方に停止していた小型輸送車が火炎瓶攻撃を受け炎上し、その直後に藪の中から現れた赤、白、黒のゲバヘル集団が部隊に襲いかかった。3時間程かけて現地に到着して展開を終えたばかりの堀田大隊からすれば、側面の孟宗竹等が茂る藪の中から総勢700名以上のゲリラ集団が部隊を分断するように突如現れたかたちとなった。
午前7時ごろ、東峰十字路の北側に展開していた福島誠一警部補が率いる第1中隊第1小隊(福島小隊)30人は検索を終了し整列していたが、十字路北東のガサ藪を順次抜けてきた200人以上のゲリラ部隊の先発隊集団に中隊本隊との間を分断され、孤立してしまう。
圧倒的に不利な状況下に陥った福島小隊からの救援要請の警察無線を傍受した大隊本部は、警備本部に対して警察無線で救援部隊を要請すると同時に、付近を検索中の第2・第3中隊を包囲された福島小隊の救援に向かわせようとした。しかし、直後に両中隊と大隊本部もゲリラ部隊の後発隊集団と南下してきた先発隊集団に襲撃されて指揮系統は混乱に陥り、大隊は総崩れとなった。さらに車両トラブルのため20分遅れて到着した第3中隊の輸送車も別の300名の集団に挟み撃ちされ、パトカー・指揮車・輸送車が炎上した。この襲撃により、堀田大隊長が腕を骨折したほか、大隊全体で80名以上が負傷した。この中には全身火傷や右眼失明などの重傷者も含まれる。
他の部隊からの救援が来ないまま、完全に孤立した福島小隊は大盾を並べて阻止線を張り、ゲリラ部隊の検挙を試みたが、包囲する集団から火炎瓶・角材・丸太・投石などで激しい攻撃を受け、小隊は総崩れとなり、本隊と反対の十字路北方への退却を余儀なくされた。
この衝突の中で、逃げ遅れた小隊長・福島誠一（神奈川警察署外勤第一課係長、警部補、当時47歳。殉職後二階級特進で警視。）、第1分隊長・柏村信治（巡査部長、神奈川警察署外勤第一課主任、当時35歳。殉職後二階級特進で警部。）、隊員・森井信行（巡査、神奈川警察署外勤第一課、当時23歳。殉職後二階級特進で警部補。）の3名が殺害され、隊員20名以上が重傷を負った。
福島小隊の惨劇
以下は、当時の報道など。階級は二階級特進後のもの。
火炎瓶を投げつけられた隊員たちは火だるまになってのた打ち回った。火傷を負って倒れ無抵抗となった隊員それぞれに「殺せ!ヤッちまえ!」「生きて帰すな!」などと叫ぶ複数人が寄ってたかり、隊員の衣服を引きちぎり防護装備を外し、（事件後、一部のマスコミは「襲撃を受けた福島小隊員は、装備を外し、一部には靴まで脱いで休憩状態のものもいた」とあたかも部隊が現地で油断をしていたかのように報じた）、さらに手錠をかけるなど抵抗できない状態にした上で釘を打ち込んだ角材や鉄パイプで滅多打ちにするなど、激しいリンチを加えた。またその場から撤退しようとした隊員らも、土地鑑がない上に付近にあるのは反対派の農家ばかりで助けを求められる民家もなく、ゲリラに取り囲まれると次々と脇の林や茂みに引きずり込まれてやはり滅多打ちにされ、土下座を強いられたり裸にされ手錠で木の幹に繋がれるなどした。
福島警視は火炎瓶を受けて火だるまになり、炎を消そうと苦悶しながら転げまわっていたところをゲリラ集団に襲われた。無抵抗の福島警視はヘルメットを剥ぎ取られ、手錠をかけられた上でゲバルト棒や鉄パイプで顔や胸を滅多打ちにされ危篤状態となり、病院に搬送中に死亡した。柏村警部と森井警部補も倒れたところを襲われ、防護装備を奪われ福島警視と同様の暴行を受け、それぞれ搬送先の病院、空港公団事務所の救護室で死亡が確認された。これらの暴行を行った者達の積年の恨みを晴らさんとするかのような容赦ない仕打ちは周囲にいた青年行動隊からも制止が入るほどの激しさであり、事件を目撃した反対派シンパであるとする地元住民も後日マスコミのインタビューでやりすぎだったと語り、東峰十字路周辺に住む反対派の農民ですら「警官を殺してくれとは言っていない。遺族が可哀想だ」と学生の暴走を非難した。
福島小隊の重傷者の多くは事件後の犯人特定や証言を困難にするために顔を集中攻撃されており、若い隊員の中には顎の骨を砕かれ、全ての歯を失った者もいた。襲撃の場に居合わせ、負傷者の搬送に協力したトラックの運転手は竹槍で顎を刺し貫かれた隊員がいたと証言している。
さらには倒れた隊員に濃硫酸をかけ、火炎瓶で放火したとの警察側の主張もある。負傷者が搬送された成田赤十字病院の院長は、かなり固いもので殴られているため、制服の下に防護装備をつけていても胸を骨折した者がいた、と証言している。
その後、血の海に倒れうめく機動隊員らを残し、ゲリラ集団は入り組んだ地形を利用して逃げ去った。
午前7時15分頃に、大隊本部からの救援要請の無線を傍受した警備本部は、朝日台三叉路を担当していた関東管区機動隊関根大隊と警視庁第二機動隊を堀田大隊の救援に向かわせたが、救援部隊が東峰十字路の現場に到達した時には、ゲリラ部隊は逃げ去った後であった。堀田大隊の隊員36名が武装解除され、30名が一時的にゲリラ部隊によって連れ去られたが、正午過ぎまでに警視庁第二機動隊によって全員救出された。また、大盾や手錠、警棒などの装備品がゲリラ部隊によって略奪されている。
16日午後から成田警察署特別捜査本部が行った現場検証では、現場付近で叩き割られた隊員たちのヘルメットや、引きちぎられた血染めの上着やズボン、血まみれの竹槍などが多数発見され、砂利道の石ころや道の両脇にあるススキには血の跡がべっとりと付着していた。
また、交差点周辺には一升瓶の破裂跡が数百カ所も残されていた。これは、通常火炎瓶はコーラ瓶やビール瓶等で作るところ、この時の襲撃では一升瓶を使用したことによるもので、それが発火すると十数mもの高さに火柱が噴き上がるほどの威力があったという。また、火炎瓶は農薬を用いて触発式に改造されていた。盾で火炎瓶を防いでも引火したガソリンが制服に飛び散り、警官らは顔や手足にやけどを負っていた。
襲撃を受けた堀田大隊について
事件当時、神奈川県警察では常設の警備部第一・第二機動隊の他、関東管区機動隊が設置されていた。関東管区機動隊員は、平素は地域部集団警ら隊として、各警察署で活動に従事するが、定期的に集合して部隊訓練を行っており、第一・第二機動隊と同様に、錬度の高い部隊である。成田の行政代執行警備には基幹隊・関東管区機動隊神奈川部隊の計5個大隊約1000名が派遣されていた。
しかし、襲撃を受けた堀田大隊は代執行最前線への反対派支援勢力と武器供給の遮断等後方支援を目的として臨時編成された特別機動隊であった。同隊は主に刑事・防犯・交番・パトカー勤務等を普段している若手警察官によって構成されており、隊員らが機動隊の訓練を積んでいないばかりでなく、隊長にも機動隊勤務の経験が無く、武術の有段者もいるとはいえ部隊としての練度は低かった。さらには隊員の装備も警棒と作業着といった程度であり、非常に貧弱な状態で現地に投入されていた。大隊は150人前後のゲリラに対応できるように編成されており、「必要なら撤収しても良い」との指示も受けていたが、500人を超える大集団に襲われることは全くの想定外であった。
結果として、機動隊の精鋭が行政代執行の最前線で警備実施をしている間に、後方支援に当たっていた現地に慣れない臨時編成部隊が反対派の大集団に襲撃される構図となり、衆寡敵せず堀田大隊は潰走することとなった。
また、代執行時には、警視庁航空隊のヘリコプター2機が上空から反対派の襲撃を警戒していたが、1機は早朝から爆弾ゲリラに備えて移動する部隊の先導を続けていたために事件発生当時給油中であり、もう1機も無線機が飛行中に故障したため、反対派の襲撃隊の動静を警備本部が把握できなかったことも被害を大きくした要因であった。また東峰地区では無線の感度が低く、更にこれまでの警備実施で一ヵ所に連絡が集中して使い物にならなかった反省から用途と区域で無線周波数を分割していたことがかえって混乱に拍車をかけ、その上大清水で火炎瓶投擲でパトカーと一般車両が炎上する事件が重なったことも、本部による堀田大隊の位置確認を遅らせた。
司法解剖
下着だけを纏った状態で空港公団の工事事務局に運び込まれた福島警視ら3人の殉職者の遺体は、半身が焼けただれ顔が異常に膨れ上がるなど正視に忍びない惨状であり、立ち会った警察官や堀田大隊員は同僚の変わり果てた姿に嗚咽を抑えきれず、盾を投げ捨てて泣き崩れた。ベテランの検視官ですら、残虐行為により著しく損壊した遺体を前にして「これが人間のすることか!」と激昂したという。
事件後行われた司法解剖の結果、死亡した3名の機動隊員のうち小隊長の福島誠一警視は、頭蓋骨亀裂骨折、頭頂部から後頭部にかけ脳内出血、12対の肋骨のうち胸部1本、背中16本が折れ、折れた骨は肺に突き刺さっていた。このほか顔、頭、左右胸部などに28ヵ所の打撲傷があった。同小隊隊員の柏村信治警部は、顔から左肩にかけて2度（水ぶくれができる）から3度（皮膚がただれたり、黒く焦げる）の火傷、頭蓋骨亀裂骨折、胸肋骨2本折損、頭頂部5ヵ所に打撲傷、左右腕、背中に多数の打撲傷があった。また、同じく同小隊隊員の森井信行警部補は、頭蓋底骨折、頭部に多数の打撲傷。顔、アゴ、および胸から肩にかけて3度の火傷、左肩および左右の足に打撲傷があった。3名とも死因は脳挫傷と脳内出血であった。
捜査
支援学生らが撤収し、捜査陣が現場に入れたのは事件の一週間後であった。地元住民らは基本的に用地を売却せずにその地にとどまる「空港反対派」であるため、捜査陣は機動隊に守られなければ現場に入ることもできず、捜査協力は望むべくもなかった。したがって、機動隊員の死亡に空港反対派、または支援者の中の何者かが関わっていることは明白であったが、誰が致命傷を与えたかが問題となり、人物の特定は難航した。
500人以上の集団が最大3キロメートル以上の道のりを警備当局に察知されることなく集結して堀田大隊に襲い掛かったことから、警察は地元の地理に詳しい青年行動隊又は常駐学生がこの襲撃に参加しているものとにらんだ。過去の言行から中核派によるものとの見立てで捜査が当初進められたが、当日の中核派の活動家らは駒井野と天浪の団結小屋に立て篭るか大清水にいたことが明らかとなり、現行犯逮捕者がおらず有力な物的証拠も得られないまま、警察による捜査は行き詰まった。捜査本部は「コンピューター捜査」と称して、あらゆる証言や物証を複合的に検証して、犯人を特定しようとした。
捜査当局は、空港反対運動での逮捕歴がある空港反対同盟青年行動隊員らを中心に、同年12月8日から15次に亘って地元住民や常駐学生らのべ153人を逮捕連行し、55名を起訴した（凶器準備集合12名、凶器準備集合・公務執行妨害11名、凶準・公妨・傷害・傷害致死32名）。
それまでに行われた第一次代執行や農民放送塔の撤去の際には、警察側にもまだ同情的な雰囲気が残っており、反対同盟員を逮捕しても反対運動のいきさつや農作業への配慮等から起訴を見送り数日で釈放するなどしていたが、「警察官の死亡」という事件の結果に、警察の取り調べは厳しいものとなった。
反対同盟では家族会を結成し、逮捕者に対する支援を実施した。
マスコミ・世論
三里塚闘争開始以来マスコミは全般的に反対派に同情的な論調であり、移転に応じた地権者を「裏切り」「寝返り」扱いするようなありさまだった。また、マスコミは反対派への情報提供などの便宜を図ったり代執行の際には反対派が立てこもる砦に中継車を横付けして機動隊が手を出せないようにするなどの実質的な支援もしていた。新聞・テレビ・週刊誌だけでなく、少年漫画雑誌までもが巻頭特集で反対派の子弟が参加する少年行動隊を取り上げるほど、当時は新左翼・反政府活動に寛容な時世でもあった。
直接の反対運動や支援に関わらないが反対派農民に共感を持つ者も市井には少なくなく、警察の指導に反して火炎瓶の材料となる空瓶を反対派に渡す酒屋や空港建設に携わる労働者の中には工事車両を使って投石用の石を秘密裏に提供する者があったほどであった。
しかし、初めての闘争での死者を出した今回の事件ではマスコミは掌を返し、警官の死を喜んだ農民を「人殺しを賛美する外道」と痛罵するなど反対派を非難し始め、「三警官殺し」の犯人探しをするようになった。
市井では反対運動に対し一気に態度を硬化した。同日夜の都内の主要ターミナル駅では、学生らが三里塚闘争支援のカンパに立ったり「学生側も危篤者二人。当局は巧みに報道管制をしいている」などと書かれたビラを張るなどしていたが、これに勤め帰りのサラリーマンらが「罪のない警官をなぜ殺したんだ」と詰め寄り、殺人もやむを得ないと悪びれないジーンズ姿の学生らと各所で論戦となった。また事件は大学紛争が収束し全共闘運動が急速に支持・勢力を失いつつある時期と重なり、さらに翌年にはあさま山荘事件の発生と山岳ベース事件の発覚によって新左翼全般に対する嫌悪が全国に伝播し、過激派と同列にみなされるようになった反対派から世論は急速に離れていった。
また、国鉄千葉動力車労働組合以外の労働者はこの事件で一斉に手を引いた。
反対派・地元住民
警察官死亡の報を聞いた地元の農民の中には「天罰だ」と歓声を上げる者もいたが、事態の重大さに気づき、すぐに重苦しい雰囲気に包まれた。なお、反対同盟事務局長の北原鉱治は、新聞記者の取材に対し「機動隊が前面に出てこのような代執行をしたことが、一切の事態の原因です。力と暴力によって生きる権利を奪おうとしているのはだれなのか。だいたい県の責任たる代執行を、なぜ機動隊がやるのか。問答無用で死人が出るような状況を作っているのは権力側ではないか。警官三人が死んだ責任はあげて国側にある」と述べ、死亡した警官と遺族には謝罪をしなかった。また、反対同盟の戸村一作代表も「きょうの学生たちの行動は決してわれわれ反対同盟の方針からはね上がったものではなく、われわれと一体となって戦ったものだ」と学生の蛮行を正当化した。
第一次代執行の頃までは警察も農民には同情的であり、デモの前に機動隊員と反対派の農民が雑談を交わすなど僅かながらに交流もあったが、この事件をきっかけに警察内部の同情の声は消えた。
反対派では、身内を殺害された警察の強硬な捜査や法廷闘争による疲弊に加えて、事件後の10月1日に、青年行動隊の三ノ宮文男が、精神的苦痛により自殺したことにショックを受けたことや、被告の保釈金や裁判費用捻出のために出稼ぎに出なければならなくなったことなどで、反対同盟員である地元住民の実力闘争離れが進んだ。なお、警察では三ノ宮が東峰十字路事件に深く関与していたと目していたが、反対派の証言によれば三ノ宮は事件時にリンチを受ける機動隊員に覆いかぶさって「もうやめろ」と暴行を加えるグループを制止していたとされる。
この後、三里塚闘争に係る実力闘争の実行は反対同盟員に代わって新左翼活動家が行い、青年行動隊ほか反対同盟は指示役や調整役を担うこととなる。指示役となった反対同盟は時にセクト同士を競わせるようにして実力闘争をけしかけた。新左翼活動家の側も実力闘争の主体としての自負を持つようになり、各セクトは援農をだしにしたり活動家の女性を嫁がせるなどして、反対同盟の実力者や集会への参加が多く弁舌が達者な反対派農家を自派へ囲い込むようになった。
このことは、地元住民と新左翼活動家の間の歪な力関係や反対派内部の党派争いを生む遠因ともなる。条件派に移行した農家には「脱落」の烙印が押され、学生らに自己反省を書かされたり、言葉だけでなく暴力も振るわれたりもした。
新左翼・過激派
事件後の反対派支援の新左翼学生らは、「警察権力が加えてきた弾圧に対する労働者、農民側からの階級的復讐である。責任は佐藤首相と警察機動隊にある」「アメリカはベトナム人民を殺し続けているが、佐藤（首相）はこれに協力している。だから、われわれ人民にも佐藤を殺す権利がある」「権力のイヌは殺されても当然だ」などと主張した。
この事件の直後から、成田に駐在する支援学生は警備の機動隊や地元警察から憎悪の対象となり、町を歩いているところを取り囲まれ殴る蹴るの激しい暴行を加えられ、瀕死の状態で反対派の畑に放り捨てられるなどのリンチを受けるようになる。寝泊まりしていた小屋が襲撃され、中にいた学生が半殺しにされたこともあったという。
警察官殺害のニュースは、大衆運動を離れ少数精鋭・過激化していく連合赤軍をはじめとした各地の極左暴力集団に強いインパクトを与えることとなる。連合赤軍の元活動家である植垣康博は「先を越された」という気持ちだったと当時を回想している。
同じ年には朝霞自衛官殺害事件・沖縄ゼネスト警察官殺害事件・渋谷暴動事件といった警察官や自衛官を標的とした事件が相次いでいる。
裁判
なお、刑事裁判中の1983年（昭和58年）3月8日に、三里塚芝山連合空港反対同盟は「熱田派」と「北原派」に分裂し、被告の大多数が「熱田派」に属すこととなったが、3名が「北原派」となった。これに伴い、最終弁論を巡って被告団および弁護団が「熱田派系」と「北原派系」に分裂した。
空港の2期工事の着工が迫る1986年（昭和61年）10月4日、千葉地方裁判所201号法廷（石田恒良裁判長）で判決が下された。判決文には「新空港の建設それ自体までが違法不当なものであるとまでは認められず、ましてや、その反対のためであれば、いかなる行動をもその手段、方法を問わずに合法化するほどに違法、不当なものとは到底みとめられない」としつつも、「政府、空港公団などの関係諸機関においては、新空港建設の必要性、緊急性を重視するあまり、その心情を十分理解せず、地元農民の理解と協力を求めるための努力にかけた点も窺われ」、「地元農民らが、新空港の建設に反対するに至った心情には、当裁判所としても理解しえないわけではない」と同情的な文言が盛り込まれていた。
量刑では、「暴虐の限りを尽くし、三名の警察官を死亡させるとともに、多数の警察官に重軽傷を負わせるという非人間的、冷酷、残虐な集団暴力犯罪といわざるえを得ない」としつつも、「被告らが福島小隊員に対する暴行行為に直接加わったと認めるに足る証拠はない」「本件被害者に対しどのような暴行を加えたのか明らかでない以上、（中略）殊更に重刑をもって臨むのは相当でない」として傷害致死罪を適用せず、また共謀共同正犯を問うにしても科刑上公務執行妨害のみで起訴された他の被告らと大きな差異をつけることも相当ではないとしたことから、公務執行妨害罪と凶器準備集合罪などのみを有罪とし、さらに「本件審理が長期に亘り、（中略）それぞれ生活に大きな変化を来しているうえ、それぞれ有形、無形の社会生活上の不利益を受けて来ていると認められること」などが加味された。この結果、事件当日のアリバイを主張していた3名に無罪、有罪とされた他の52名についても3年から5年の執行猶予が付いた懲役刑（10ヶ月から3年）となり、実刑判決を受けた被告はいなかった。
これは、本事件の遺留品や目撃証言が殆どなく、捜査段階での被告の自白には「信用性に疑問がある」こと等が最大の理由とされる。被告らはそもそも警察官への襲撃に全く関わっていなかったか、襲撃に関与していたとしても、数百人の多人数による騒乱状態の中で発生したため、誰が誰に対してどのような行為をしたかを具体的に示す証拠を千葉県警察や千葉地方検察庁は提示できず、自供調書と大きな齟齬があった。弁護団は、286通に上る被告の調書の矛盾点を追及し、供述の信用性が欠けていることを強調していた。
これに対して千葉地検は、判決に承服しがたい点もあるとしながらも、認定を覆すに足る証拠が不十分であることや諸般の事情を考慮して控訴しなかった。
この結果を実質上の勝利と位置づけ控訴をしなかった「熱田派」の被告らにはこれが確定判決となったが、「北原派」に属する3名の被告（うち2名は後に小川派として北原派を離脱）は、無罪を求めて控訴した。二審東京高等裁判所は、一審判決を支持し（1990年（平成2年）12月17日判決）た。3名のうち1名だけがさらに上告したが、1995年（平成7年）2月28日に、最高裁判所においても一審判決が支持されたことにより、執行猶予付きの有罪判決が確定した。
事件のその後
1990年代頃から被告の多くが合流した「（旧）熱田派」が政府との間で対話が行われるようになった。1992年（平成4年）12月15日の第11回成田空港問題シンポジウムでは、三里塚工房制作のドキュメンタリー映画『追跡・自白調書　東峰十字路裁判』が上映され、元被告が、
　法律知識に疎い、私たち農村青年が、戦前の特高のような取り調べに、耐えられるはずもありません。様々な手を用い、私たちの間を、裂き、嘘の供述を強いた取調官を私たちは今も、許しておりません。同時に、一時的ではあれ、権力に屈服し、迎合してしまった自分たちを思い出すと、権力に腹が立つというより、叩きのめされ、卑屈になってしまったおのれに、怒りが沸くのです。（中略）
　死亡した警察官に対し、私たちも哀悼の念を奉げます。でも当時、代執行を強行する先兵としてやって来た彼らを、私たちが歓迎するはずもなく、戦わざるを得なかったのです、ましてやその『犯人』としてデッチ上げられ、十五年もの長い間、裁判を強いられた恨みを決して忘れてはいませんし、許してもおりません。
と述べている。
これらの対話の結果、旧熱田派は、事件の引き金となった新東京国際空港建設時の強硬姿勢について日本国政府から謝罪を引き出し、1994年（平成6年）10月11日に開催された第12回成田空港問題円卓会議においては、警察官僚時代に事件の捜査の指揮を執っていた亀井静香運輸相と青年行動隊に所属していた元被告が握手を交わした。その後、多数の地権者が移転に応じたことで、B滑走路の建設を含む空港の二期工事が進展した。
なお、円卓会議による決着前の1993年には、日本社会党の伊藤茂運輸大臣が新東京国際空港視察の際に殉職警察官の顕彰碑に献花している。これに対し反対派農民からは、「社会党が反対運動に火を付けたから警察官が死ぬ事件が起きた。どういう気持ちで献花したのだろうか」との冷ややかな声も上がった。
事件から36年後となる2007年、殉職した3警官の顕彰碑に元被告らが献花した。献花した元青年行動隊員は「婚約者がいた警察官や子持ちの人もいた。当時は相手の立場まで想像できなかったが、今なら残された家族の気持ちにまで思いが及ぶ」と語った。
反対派の主張
青年行動隊としてゲリラ部隊に加わっていた元反対同盟員は、青年行動隊と現地に常駐していた学生の間では致命傷になるようなことはやらないと意思統一していたとした上で、大学闘争で機動隊に敗れ、恨みを抱きつつ全国の大学から急遽集まった学生による犯行であったことを仄めかしている。