陸軍飛行戦隊
沿革
日本軍航空部隊は、観測気球の装備・運用を目的とし1904年（明治37年）に編成され同年の日露戦争に従事した臨時気球隊を原点とする。これは翌1905年（明治38年）に気球班となり、さらに1907年（明治40年）には気球隊に改編され交通兵旅団隷下となった。
飛行機で編成された実戦部隊としては、第一次世界大戦（日独戦争）下1914年（大正3年）の青島の戦いに初めて実戦投入された臨時航空隊（青島派遣航空隊）が日本陸海軍初の実戦飛行部隊となる。1915年（大正4年）12月10日には臨時でない常設の飛行部隊として、日本の航空発祥の地である所沢陸軍飛行場にて航空大隊が編成され、1917年（大正6年）には計6個大隊を保有していた。1919年（大正8年）に官衙たる陸軍航空部が設立、1925年（大正14年）に陸軍航空本部に昇格し、同時に航空兵科が独立した。
1920年代から航空部隊の更なる拡張を始めていた帝国陸軍は、1922年（大正11年）に従来の航空大隊を飛行大隊と改称、さらに1925年には飛行連隊(FR)に昇格され1930年（昭和5年）には計8個連隊および気球隊を保有していた。実戦飛行部隊としては飛行連隊そのものが出征するのではなく、飛行連隊内で編成された飛行大隊ないし独立飛行中隊(Fcs)が動員される。
1930年代後半、ソビエト赤軍（赤色空軍）を仮想敵とした研究の中で、航空兵力差を補う効率的な航空部隊の運用法として空地分離方式が検討された。これは従来の飛行連隊から整備・補給などの支援部門（地）を切り離し、飛行部門（空）だけを高速で前線基地へ展開させるという構想である。この構想を実現するために1937年（昭和12年）から満州所在の飛行連隊の空地分離が進められ、飛行部門の飛行戦隊（FR / F）と、支援部門の飛行場大隊(ab)が編成された。日本本土の飛行連隊についても飛行戦隊と飛行場大隊への改編は行われたが、本土の部隊は固定的な防空任務を予定していたために、各飛行戦隊の隷下に飛行場大隊が置かれ、従来と実質は変化しなかった（内地型戦隊）。教育飛行部隊については飛行戦隊編制は基本用いられず、教育飛行連隊（1944年前後より教育飛行隊に改称）が基本単位だった。
1938年（昭和13年）には陸軍航空総監部が設置され（航空総監以下部員は陸軍航空本部兼）、同年に分離独立した陸軍航空士官学校を筆頭とする航空関連学校を管轄した。
太平洋戦争開戦時には計46個戦隊を有しており、大戦中の1943年（昭和18年）にも空地分離の改良が行われたが（#編制）、飛行戦隊は編制の変化はありつつも陸軍航空部隊の基本的な部隊単位として維持され、敗戦までには計92個戦隊に上った。
なお、帝国陸軍の空挺部隊（落下傘部隊）である挺進団（隷下に挺進連隊・滑空歩兵連隊など）では、挺進兵の輸送やグライダーの曳航を行う飛行部隊として、挺進飛行戦隊(RFR)・滑空飛行戦隊(KFR)が編成されともに挺進飛行団（RFB)に属し、1944年末には第1挺進集団に隷属した。
定数
飛行戦隊が保有する機体の定数は、時期や部隊や装備機種にもよるが、おおむね太平洋戦争当時は1個中隊が飛行分科「戦闘」では12機、「重爆」・「軽爆」・「司偵」・「偵察」では9機で、戦隊としては約24~36機+α（本部機・予備機など）が一般的であった。これは中隊編制から飛行隊編制に改編された、大戦後期の「戦闘」戦隊も基本同様となる。
また部隊によっては帳簿上の定数に含まれない員数外の機体として、廃棄機の修復機や鹵獲機を保有している。
戦隊長
飛行戦隊の長は戦隊長で、階級は大佐・中佐・少佐・大尉が補職する。戦隊でも飛行分科によって違いはあるが、太平洋戦争開戦前頃までは大佐・中佐・少佐が一般的で、太平洋戦争前中期には中佐・少佐が多くなり、後期には大尉が任命されることが珍しくなくなっている。
帝国陸軍（陸軍航空部隊）においては「指揮官率先」の伝統から、戦隊長は階級や分科を問わず原則的に「空中指揮官」であり、自ら戦隊が装備する第一線機に搭乗し隷下の本部僚機や中隊・飛行隊を率い、積極的に空中指揮と戦闘を行うものとされた。そのため飛行第64戦隊の加藤建夫中佐や宮辺英夫少佐、飛行第244戦隊の小林照彦少佐、飛行第22戦隊の岩橋譲三少佐などを筆頭に少なくないエース・パイロットたる戦隊長を輩出していると同時に、多数の戦死者や負傷者も出しており、大戦末期には貴重な中堅空中指揮官を温存するために戦隊長の出撃を控えるよう、その旨の令を上級部隊から出されていた戦隊も多々あった。一方で、「重爆」・「軽爆」の場合は戦隊長は必ずしも操縦者としての教育を受けた者がなるものではなく、その場合は隷下中隊長機など指揮官機に同乗しての空中指揮を行う。例として1941年7月に九七式重爆を運用する飛行第98戦隊長となった臼井茂樹大佐（過去に駐在武官・参謀本部勤務）は、同年12月のビルマ攻略戦ラングーン爆撃任務において機上戦死している。
さらに「指揮官率先」は飛行戦隊に止まらず、上級部隊である飛行団（団長・飛行団長）でも珍しいものではなかった。飛行団は戦術単位の部隊であるため、戦隊長ほどの頻度ではなくとも飛行団長も空中指揮官として、飛行団司令部に配備されている第一線機ないし隷下部隊機に搭乗ないし同乗し、隷下飛行部隊を率い空中指揮を執るものとされていた。特に戦闘戦隊をメインとする「戦闘飛行団」ではそれが常識であり、操縦者出身かつ大佐・中佐級の古参高級将校たる団長の多くが操縦桿を握り実戦に出撃している。例として独立第15飛行団長・今川一策少将、第12飛行団長・川原八郎大佐、第14飛行団長・寺西多美弥中佐、第16飛行団長・新藤常右衛門中佐などが居り、中でも16FB長・新藤中佐は本土防空戦においてB-29を1機確実撃墜している。
なお、これらの「指揮官率先」の伝統はアメリカ陸軍航空軍やイギリス空軍でも同様であり、飛行戦隊に相当する飛行隊（米英）、飛行団に相当する航空群（米）の指揮官は自らが出撃し日本軍航空部隊と干戈を交えている。一例として、帝国陸軍航空部隊の一式戦が挙げた裏付の取れている多数の確実戦果中の高級指揮官機としては、第5爆撃航空団司令官ウォーカー准将機（隷下第43爆撃航空群リンドバーグ少佐機に同乗し爆撃任務空中指揮中に飛行第11戦隊機の攻撃を受け被撃墜、B-17）、第468超重爆撃航空群司令フォールカー大佐機（第1野戦補充飛行隊および第17錬成飛行隊機の攻撃を受け被撃墜、B-29） 、第348戦闘航空群司令カービィ大佐機（アメリカ軍主要エース、飛行第77戦隊機の攻撃を受け被撃墜、P-47）、第530爆撃航空群司令ミルトン中佐機（飛行第64戦隊機の攻撃を受け被撃墜、P-51）、第1特任航空群司令ゲイティ大佐機（飛行第64戦隊機の攻撃を受け被撃墜、P-47）、第1特任航空群司令コクラン大佐機（飛行第50戦隊機の攻撃を受け墜落寸前の状態まで被弾、帰還後に上級部隊より以後の空戦参加禁止命令を受領、P-51）などがあり、さらにこのほか米英飛行隊長機の多くを撃墜している。
上級部隊
飛行戦隊を筆頭に各飛行部隊の上級部隊として、主に以下の部隊が存在し「陸軍航空部隊」を組織していた。
独立飛行中隊・独立飛行隊
陸軍航空部隊の中核である飛行戦隊のほか、主に以下の実戦飛行部隊が多数編成されており帝国陸軍の屋台骨を支えていた。これらは基本的に飛行戦隊や飛行団に隷属せず、更なる上級部隊高級指揮官の直属となる「独立(s)」の称呼を冠する部隊である。
独立飛行中隊
独立飛行中隊（Fcs、独飛中隊・独飛中）は、約1個飛行中隊（定数はおおよそ10機前後）で編成され飛行師団（飛行集団）や航空軍に直属する。長は中隊長で少佐・大尉が補職。独立飛行中隊は編制が小規模ゆえに特に機動的に運用され、その任務性から飛行分科「司偵」・「偵察（軍偵・直協）」・「対潜」が多かった。
飛行戦隊の支援部隊としては飛行場大隊が充てられるのに対し、規模の小さい独立飛行中隊には飛行場中隊(ac)が主に充てられていた。
独立飛行隊
1941年7月には、上記の独立飛行中隊を2個以上束ね、航空軍や飛行師団（飛行集団）に直属する実戦部隊である独立飛行隊（Fs、独飛隊）が編成されている。長は隊長（飛行隊長）で大佐・中佐が補職し、本部を置いた。
一方で、大戦後期に編成された独立飛行隊は規模が小さく特殊なものになっており、1944年末にサイパン島およびテニアン島のアメリカ陸軍航空軍飛行場を長距離夜間奇襲爆撃するため、浜松教導飛行師団にて編成された第2独立飛行隊は新海希典少佐を飛行隊長とし9機の九七重爆を、義号作戦にて義烈空挺隊を輸送し敵飛行場に強行着陸を敢行した第3独立飛行隊は、諏訪部忠一大尉を飛行隊長とし12機の九七重爆を装備・運用していた。
部隊マーク
陸軍航空部隊の飛行戦隊・挺進飛行戦隊・独立飛行中隊・独立飛行隊・飛行団（司令部機）・練習飛行隊・教育飛行隊・錬成飛行隊・直協飛行隊・野戦補充飛行隊・司令部飛行班・飛行学校・航空学校・航空士官学校・特別攻撃隊など、航空機を有する大半の軍隊および官衙や学校は職種を問わず部隊マーク（戦隊マーク・戦隊標識・部隊標識・部隊章）を有し、これを機体に描いていた（描画場所は視認性の良さから垂直尾翼が多く、大掛かりなものは機体側面や機首、水平尾翼にも描かれていた）。
部隊マークは隊員や関係者が自前で考案することが大半であり、これらはフランス空軍に範を取った帝国陸軍公認のもので各々の所属を識別する重要な標識であると同時に、隊員の士気や団結心を高める存在として重要視されていた。中には派手で個性的な意匠も多かったことから、いわゆるノーズアートに相当する側面もあった。
一例として、部隊マークに「矢印（斜矢印）」を用い一式戦「隼」の垂直尾翼に描いていた「加藤隼戦闘隊」こと飛行第64戦隊にて、当時整備班長として在隊していた新美市郎元少佐はマーク考案当時を回顧し以下の証言を残している。
隼に機種改変して、どうやら戦も近いらしい、戦隊マークを作らにゃいかんなあってことになって、安間さん（第3中隊長・安間克己大尉）と僕、空中勤務者と、整備の下士官が集まってわさわさやってたんだけど、この矢印なら描きやすいし、格好もいいから、これにしようってことになってね
 — 新美市郎中尉（第64戦隊第3中隊整備班長）
海軍航空部隊では極めて簡素かつ地味な識別記号（片仮名・漢字・英字・数字等の組合せ）をもって所属を表しており、ごくわずかな例外を除き陸軍航空部隊における部隊マークに相当する瀟洒な文化は存在しない。陸軍航空部隊でも、台湾沖航空戦から沖縄戦まで第七六二海軍航空隊指揮下で戦った飛行第7戦隊は、従来のアラビア数字の7を図案化したマーキングを廃して、7-77のように、海軍式の所属戦隊と機番号だけの識別符号を採用していた。
なお、現在の航空自衛隊偵察航空隊がテールマーク（部隊マーク）として使用している「光とレンズ」の意匠は、偵察航空隊初代司令（偵察航空隊長）である生井清2等空佐の発案によって、生井2佐がかつて属した帝国陸軍航空部隊の飛行第33戦隊の部隊マークがモチーフとなっている（生井は最終階級陸軍少佐、飛行第33戦隊第1中隊長を経て戦隊長、エース・パイロット）。
中隊色
これら部隊マークの中でも、飛行戦隊では中隊・飛行隊ごとにマークを色分けすることが多かった（中隊色）。飛行第104戦隊のようにマークではなく、垂直尾翼上端・主翼端・スピナーを塗り分けた部隊、飛行第244戦隊のように戦隊本部のみ垂直尾翼全面を赤で塗り、中隊色の塗り分けは主脚カバーの機体番号にとどめ、マークは共通で白とした部隊など例外も存在する。
例として第64戦隊では「斜矢印」を戦隊本部は「コバルトブルー」、第1中隊は「白」、第2中隊は「赤」、第3中隊は「黄」で、飛行第50戦隊では「電光」を戦隊本部は「青」、第1中隊は「赤」、第2中隊は「黄」、第3中隊は「白」で塗り分け区別していた。なお、第50戦隊のエース・パイロットである穴吹智軍曹が自称していた異名「白色電光戦闘穴吹」は、穴吹の原隊である第1中隊の中隊色「白色」・部隊マーク「電光」・飛行分科「戦闘」に由来する。
また、第50戦隊（太平洋戦争中期以降）や飛行第72戦隊のように、部隊マークにのみならずプロペラのスピナーや、エンジンのカウリング先端をも中隊色で塗り分ける戦隊も存在した。
中隊が廃止され飛行隊編制となった大戦中後期の「戦闘」戦隊においても（#編制）、機材の統一運用はするが中隊呼称を使用ないし事実上の中隊編制を復活する場合が多かったため、中隊色自体は継続して使用する部隊もある。