文化放送ホームランナイター
NRNナイターとしての対応
文化放送は土・日曜のNRNナイターの統括局かつ関東地区担当局であるため、一部のNRN系列局でも同局の中継が放送されている（後述参照）。また、平日のライオンズナイターと異なり、在関東5球団（巨人、ヤクルト、DeNA、西武、ロッテ）のホームゲーム以外は、原則NRN系列局が制作したものをそのまま放送するスタイルとなっている（聴取率調査週間などの例外を除く）。また、土日NRN全国ネットカードが前述5球団のビジターゲームの場合、ビジターチームリポートは文化放送のアナウンサーが担当する。
他球場速報のチャイム音（メロディー）は、平日のNRN中継担当であるニッポン放送（原則NRN担当とならない土・日曜を含め全曜日使用）や他のNRNナイター制作局と同じで、速報を伝える際は本番組では「文化放送プロ野球速報」（自社ローカルの場合は「文化放送ホームランナイター プロ野球速報」）と称して伝えている。
NRNナイターとして全国ネットされる場合はネット局での放送開始時刻および中継音声への切り替え時刻が異なるため、18時30分までの複数回、切り替え時刻に解説者・アナウンサーがコメントをやめて場内音→飛び乗り配慮のコメント（それまでの試合概要など）をしている（これはJRN・NRNナイター全国ネット共通）。
基本的にはネット局数が1局でもある場合の2018年以前や、2019年以降の裏送りでも対戦相手地元局に加えて福井放送・山口放送が加わる場合は、実況アナウンサーは「文化放送をキーステーションに、全国の皆様にお送りします」とコメントし、個別のネット局名・番組名をアナウンスすることはない（文化放送ローカル、あるいは文化放送発裏送りで対戦相手地元局のローカルの場合は、番組名をコメントする）。
文化放送では、自社向けのレギュラー放送を終了する2019年以降も、NRNナイター扱いで裏送り方式による一部系列局（土・日曜とも地元球団が関与する試合のみネット受けする球団所在地の局と、土曜日のみネット受けする福井放送<FBC>・山口放送<KRY>）向けの中継の制作を続ける。特に関東圏の球団（巨人・ヤクルト・DeNA・西武・ロッテ）同士の対戦はNRNナイター本番カードの設定であっても、西武主催試合におけるインターネット配信用もしくは土曜日は福井放送・山口放送限定の裏送りに、日曜日は基本的に素材録音用になるが、まれに東海ラジオや朝日放送ラジオが予備カードとすることがある。また、文化放送制作による関東圏での試合中継が土曜日のNRN本番となってもビジター側のNRN系列局のアナウンサーが実況を担当する事例が発生している。
NRN公式サイトのNRNナイター放送予定は、2019年4月を最後に更新が止まっているため、同年5月以降の日曜NRNナイター本番カードは、公式文書上では東海ラジオが原則としてNRN本番カード時に限り放送可能としている巨人対中日戦が、日曜ナイター時に同局で放送される場合以外明確な確認ができない状態となっている。一方、土曜については福井放送が公式サイトのラジオ番組表に本番・予備・雨傘番組を実況・解説ともに記載しているため、確認が可能となっている。
2013 - 2018年の日曜日における対応
2013年度は土曜ナイターの定時放送を行われているが、日曜はナイターがある時の注目カードのみ放送となり、定時放送は行っていない。ただし、NRN日曜ナイター自体の機能は、その「注目カード」の自社での中継や、系列局の中継（各局自社制作分や文化放送からの裏送り分）を交えることで2017年まで維持されていた なお、実際に2013年の日曜日に公式戦を文化放送で放送したのは4月28日の「ヤクルト対巨人」の1回のみであり（このときのみ『文化放送ホームランナイタースペシャル ヤクルト対巨人 実況中継』として放送）、この試合を最後に日曜日の公式戦は一切中継していない（よって日曜ナイターは事実上日本シリーズのみ中継）。
また、2012年まで土曜のナイターオフ番組として放送されていた『ズミスポ』を日曜分の『ホームランナイター プロローグ』の代替番組として設定している。しかし、2014年以降、注目カードのみ日曜ナイターを放送する旨の文言は、公式サイトの番組表における番組紹介文から削除された。
文化放送では日曜ナイターの定時放送を廃止（特番扱い化）したため、NRN全国放送の指定試合であっても、日曜ナイターの放送自体をネットしている局は地元勢の試合を優先するため、結果的には全国放送指定試合が予備カード扱い、あるいは地元勢以外の試合を放送しない、ビジター側が乗り込み自社制作をするにもかかわらず、当該局がニッポン放送の協力となるため（特にヤクルト主催の対阪神戦におけるABC）文化放送が別に予備待機を配置した場合等、局の方針の都合で全く放送されず素材録音同然となる場合（特に在関東のチーム同士の対戦や前述のヤクルト対阪神戦等の場合に、全国放送の指定カードが1局も流れない試合も多数ある）、あるいは当該チーム本拠地の1-2局のみ（在関東チームとの対戦であれば、対戦相手の地域の局向けの自社製作か裏送り＜関東のチーム主管である場合＞のみ）となるケースもまれではない 。そういったことから、在関東チーム同士の試合については、土曜日に本番カードであった場合でも、日曜日には予備順を下げて他の関東圏外のカードに本番を変更する場合がある。
2018年4月現在、NRN公式サイトの基本番組表には日曜のNRNナイター枠が存在しているが、4月については日程上「（名目上の）日曜日のNRNナイター本番カード」は設定されていなかった。5月については6日の「ヤクルト vs 広島」、13日の「巨人 vs 中日」、27日の「ヤクルト vs DeNA」が名目上のNRNナイター本番カードとなるが、事実上6日はRCCへの、13日はSFへの裏送りとなり、27日は他カードがデーゲームのためネット局が発生しないが（解説者が空欄でアナウンサー（長谷川太）のみ記述）、2017年以降はこうしたケースでは番組として設定していなかったため珍しい措置である。
NRNナイターの放送が球団所在地の地元局かつ地元球団が関与した試合のみ放送となっている現状から、文化放送を幹事局とする非NRN番組ながら、ネット局の多い競艇中継が日曜に行われる場合は、競艇中継にNRN回線（モノラル）を充てて、NRNナイターを個別の素材回線（ステレオ）でのネットとすることがある。
埼玉西武ライオンズの試合への対応
平日の『文化放送ライオンズナイター』で中継している埼玉西武ライオンズのナイトゲームの優先度は低く、通常はセ・パ交流戦の対巨人戦で放送される（あくまで通常通りの優先度で、相手が西武だったという扱い）程度である。また、セ・リーグの試合が全試合デーゲームである場合など通常は西武戦を中継できる状況にあっても、シーズン終盤に西武が上位争いに絡めていない場合には、上位チームの試合の中継を優先する場合がある（2016年9月17日が該当。パ・リーグ3試合のみナイターであるが、本番組ではKBC制作のソフトバンク対オリックス戦のネット受けとし、西武戦は予備カード扱い）。西武戦が全国中継となった場合は、NRNの中継音源であることには変わりは無く「ライオンズナイター方式」は採らず、西武勝利時のBGMの挿入も行わない。但し、前座番組では「ライオンズ・ドニーチョ」という情報コーナーを設置して土曜日の試合をフォローしているほか、本番組で中継する場合は同時刻にライオンズナイターのコーナーは放送する。さらに結果的に自社単独放送となった場合は、中継自体もライオンズびいきの実況となる場合がある。また、2011年以降は関東地区で開催される西武戦ナイターが『ホームランナイター』の予備カードとされ、かつ対戦相手地元局での放送予定がない場合、インターネット配信を実施するが、あくまで『ホームランナイター』ではなく『ライオンズナイター』のインターネット中継として配信される。 
かつては、聴取率調査週間や夏休み期間等に、全国中継カードを別カード（系列局制作か、文化放送制作の裏送り）とした上で、「ライオンズナイター方式」で西武戦を自社ローカル放送した例もあった。2018年8月4日には久々に「西武対日本ハム」を文化放送の独自編成で放送したが、平日の「ライオンズナイター」に準じてビジター側のSTVにもネットされた（NRNナイター本番の「DeNA対広島」は文化放送からビジター側のRCCとNRNナイターネット局のKRY・FBCに裏送り）。
また、西武もしくは西武がパ・リーグの優勝争いしている相手球団の優勝決定が見込まれる試合は、本来放送すべき全国中継カードを裏送りとして文化放送独自で放送することがある。一例として1999年（平成11年）9月25日は、デーゲームで西武が敗れたことを受けてNRN本番カード予定だった「巨人対ヤクルト」のナイトゲームをNRN各局への裏送りとしマジック１となり勝つか引き分けでダイエーの福岡移転後初優勝が決まる「ダイエー対日本ハム」を文化放送ローカルで緊急中継した。
2010年（平成22年）9月26日は、STVラジオの『STVラジオ ファイターズスタジアム』第2部をネット受けし、「日本ハム対西武」のデーゲーム（この試合で西武が敗れるとソフトバンクの優勝が決定）を試合途中から放送。その間、本来の全国中継カード「ヤクルト対中日」はネット局への裏送りとなった。この試合は西武敗戦でソフトバンクの優勝が決まり、文化放送も全国中継に飛び乗ったが、もし西武が勝利もしくは引き分けて、優勝の行方が「楽天対ソフトバンク」のナイトゲームへ持ち越された場合は、東北放送の『TBCパワフルベースボール』のネット受けで同試合を放送することも想定されていた。
日曜日のデーゲームに関しては交流戦期間のビジターゲームを除いて、文化放送およびNRN系列局の実況録音ではなく、文化放送と業務提携を結んでいるNACK5制作の『NACK5 SUNDAY LIONS』で中継した実況を文化放送の番組などで流す。これは、NRN系列局向けに文化放送制作で裏送りを行った場合でも同様である。2010年度まで土曜日ならびに交流戦期間の「ヤクルト対西武」（NRN独占カード）以外のビジターゲームも同様の対応であったが、2011年度からはNACK5がデーゲームの中継を日曜日のみに縮小し、さらには交流戦期間はホームゲームのみの中継としたため、土曜デーゲームならびに交流戦期間のビジターゲームについては文化放送（関東地区で開催される西武戦のインターネット配信を含む）およびNRN系列局の実況録音で対応している。また、2016年のみは西武のホームゲームを女性による実況としたことを受け、NACK5の実況音源の使用はビジターゲームのみとなり、西武のホームゲームでは土曜日同様に自社（インターネット配信または系列局向けの裏送り）の音源を使用していた。
パ・リーグのクライマックスシリーズ（クライマックス・パ）は2015年まではNRNネットワークの担当として全試合を中継していたが、2016年以降はナイターオフ編成下の公式戦同様に、西武のホームゲームのインターネット配信のみとなり、地上波での放送からは撤退した。また、NACK5も制度制定当初からクライマックスシリーズの中継を行っていない。
西武が日本シリーズに進出した場合は、NRN全国放送非担当日はもちろん、担当日であっても「ライオンズナイター方式」でローカル放送する。そのため、担当日と西武のホームゲーム（もしくは対戦相手が巨人・ヤクルト・DeNAの場合のビジターゲーム）が重なった場合はNRN用に「ホームランナイター方式」で二重制作を行い、地方局へ裏送りする（ただしブースや人員の関係で二重制作できず、文化放送もそのまま「ホームランナイター方式」で放送する場合もある）。関東地方以外のセ・リーグ球場の場合はNRN担当局の中継を受けず、文化放送のアナウンサーと解説者が現地に乗り込んで制作し文化放送向けに放送する。
このとき、NACK5は文化放送の対応に関係なく西武のホームゲームのみ自社制作する。西武が日本シリーズに進めなければ、NACK5での放送は行わない。
クライマックスシリーズの対応
クライマックスシリーズは、平日にライオンズナイターを放送していることもあり、2015年までは西武の進出にかかわらず文化放送がNRN系列局向けの担当（厳密には個別ネット扱い）としてクライマックス・パの全試合を中継していた。
西武が進出せず、関東地区以外で開催される場合は、NRN担当局の中継をそのまま放送するか、文化放送が自主制作するかのどちらかになるが、西武に進出の可能性がある場合や、関東地区の聴取率調査週間と重なる場合は自主制作することが多かった。本来のNRN担当局が中継を行わない場合、該当試合を文化放送が自主制作してNRN系列局にネットする場合があった。
2016年からは前述のように、クライマックス・パの地上波での放送からは撤退した（西武が出場した場合でも西武ドーム開催分のインターネット配信のみ実施し、同じ関東圏の球団であるロッテが出場しても中継しない）。このため、現地NRN担当局の中継が文化放送へネットされない場合、当該中継はニッポン放送のセ・リーグ（クライマックス・セ）中継の予備カードとして組み込まれる場合がある（2016年は第2戦で『広島 vs DeNA』の終了後にSTVラジオの『日本ハム vs ソフトバンク』にリレー）。
ニッポン放送がNRN系列局向けの担当となる（厳密には個別ネット扱い）セ・リーグ（クライマックス・セ）の方の中継は、制度導入当初から文化放送では行われていない。前述のように2016年からは事実上、ニッポン放送が両リーグとも関東のNRNにおけるクライマックスシリーズの地上波ラジオ中継を独占することになった。
日本シリーズの対応
日本シリーズは、レギュラーシーズンの定時放送が廃止された土・日曜日の開催分も含め、全試合中継する。ここではパ・リーグの出場チームが西武以外の場合を説明する。西武となった場合は前項の「埼玉西武ライオンズの試合への対応」参照。
文化放送は2017年までは西暦奇数年の第1・3・5・7戦、偶数年の第2・4・6戦に於けるNRN全国中継の担当局となっていた。ネットワークが再編した2018年は全試合文化放送がNRN全国放送の担当となったが、2019年以降は開催年を問わずパ本拠地で開催する試合がNRN全国放送の担当局となる。このため、該当試合が関東地区の球団のホームゲームとなる場合は文化放送制作でNRN系列局へ同時ネットされ、関東以外の地域での試合はNRN担当局の中継をそのまま放送するが、関東以外のNRN担当試合でも関東地区の聴取率調査週間と重なった場合、およびNRNの全国担当をニッポン放送が担当する試合は、開催球場を問わず文化放送のスタッフが乗り込んで自社制作のローカル放送を行う。
ちなみに大阪地区では全国中継担当局の放送は1,2,6,7戦はMBS、3,4,5戦はABCがNRN向けを担当しており、TBSラジオがプロ野球中継から撤退した2018年もそれを踏襲した。
2019年については、ラグビーワールドカップ2019の決勝トーナメントの放送権を獲得したことから、ラグビー日本代表が関与する試合と日時が重複する場合は、ラグビー中継を優先することになった。