香港特別行政区政府
行政長官
香港政府の首長は行政長官である。香港の新聞などでは特別行政区の首長を略して「特首」と呼ぶことが多い。行政長官は選挙委員会による間接選挙によって選出されるが、任命するのは国務院（中央政府の行政府）である。そのため、香港政府について理解するには、国務院など中央政府との関係を理解する必要もある。（詳細は「#中央政府との関係」の節で後述）
行政会議
香港政府の運営は行政会議において重要事項が決定される。行政会議の議長は行政長官である。そのメンバーには、官職メンバー(官方成員)と非官職メンバー(非官方成員)がいる。行政会議は諮問機関に過ぎず、議決は多数決ではなく、行政長官の判断に委ねられている。香港返還前や返還後しばらくは、司長と一部の局長、財界出身の非官職メンバーによる利害調整を行う色彩が強かった。
しかし、2002年7月の「高官問責制」の導入に伴い、3名の司長（政務司司長、財政司司長、律政司司長）と11名の局長の全員が官職メンバーとされ、行政会議はより内閣に近い組織となった。しかし、曽蔭権行政長官は非官職メンバーを増員して、官職メンバーの方が少数派となった。そのため、現在では政府と各政治勢力の間における、利害や意見調整の場としての性格がやや強くなった。
なお、プレスリリースされた結論を除き、行政会議における議論は非公開とされている。メンバーには守秘義務が課せられており、特に政府側の説明や他のメンバーの発言を公にすることはできない。
官職メンバー(3司長13局長)
3司長11局長は香港政府において閣僚に相当する役割を担っている。その人事は行政長官が指名し、国務院が任命する。ただし、立法会の承認は必要ない。そのため、民主主義国家の閣僚と違い、司長や局長は一体誰に責任を負っているのか不明確である。2002年まで、これら政府高官は公務員であった。2002年7月の問責制導入によって、政治任命ポストとなった。そのため、より閣僚に近い位置づけが与えられたと言われる。公務員から就任する場合は、一旦退職することが求められる。原則として再び公務員の身分に戻ることはできない(公務員事務局長を除く)。これにより財界や学者からの登用が可能となった。
司長は行政長官を直接補佐し、香港政府高官の中でも最上位にある。そのうち、政務司司長(政務長官)が筆頭とされ、全ての局および局長を指導する。財政司司長(財政長官)は序列二位とされ、財政や経済関係の局および局長のみを指導する。No.3の律政司司長(司法長官)は、行政長官の法律顧問としての役割と、律政司(香港政府の法律関係の事務などを管掌)という部門を統括しているが、局長を指導する立場にはない。なお、副司長は香港基本法に言及があるものの、返還後未だ設置されていない。
局長は決策局のトップである。司長の指導の下、職責分野の政策決定を担う。英語名称では司長と同じくSecretaryとされているが、実際には司長より格付けが低い。
非官職メンバー
行政会議の非官職メンバーは、公務員や政府高官以外から任命された非常勤の役職である。会議への出席を除いて、特定の職務を追っている訳ではない。そのため、司長や局長と異なり、閣僚のような職務とは言えない。
香港政府の組織
香港政府本体の組織は、政策決定を担う政府総部と、政策実行を担う執行部門に分けられる。そして、政府本体の他に、日本の独立行政法人に相当する公営機構がある。
政府総部
政府総部は組織であると同時に、香港島セントラル(中環)地区の下亞厘畢道にある中区政府合署（セントラル合同庁舎）をさす。組織としての政府総部は、政務司司長を頂点とし、政務司司長弁公室および財政司司長弁公室と11局（決策局）から構成されている。また、一部を除く局の所在地は、中区政府合署に集中している。

現在の政府総部は、しばしば「3司11局」(2007年7月以降は、「3司12局」)とも呼称されるが、司は1つしか設置されていない。しかし、唯一の司である律政司は金鐘道政府合署に入居し、また、執行部門に分類されている。つまり、政府総部の一部ではない。また、行政長官官邸である礼賓府は、この近く(上亞厘畢道)同じ場所にある。ただし、董建華行政長官は返還前の総督府であった礼賓府を用いず、中区政府合署にオフィスを構えていた。
11の決策局は、行政長官に対して責任を負っている。ただし、政務司司長の指導および、一部の局のみ財政司司長の指導も受ける。局のトップは局長である。複数の事務を管轄する局では、内部に「科」が設置され、局長の補佐役である常任秘書長が「科」の責任者を務める。ただし、一部の局では「科」が設置されていなかったり、執行部門が決策局の内部組織として組み込まれ、そのトップが常任秘書長を兼任する場合もある。
また、香港政府は、近い将来、副局長を設置することを検討している。
執行部門
執行部門はその名前のとおり、決策局が決定した政策を実行する部門である。執行部門は特定の局に管轄され、その局に対して責任をおっている。ただし、一部の執行部門は直接、司長や行政長官に責任を負っている。また、政府の会計監査を担う審計署は直接、立法会に報告を行っている。
執行部門の長官のうち、海関関長(税関長)、廉政専員(廉政公署長官)、警務処処長(警察長官)、入境事務処処長(入境管理局長官)、審計署署長(会計検査院長官)は香港基本法において香港政府の高官に準じる位置づけとされ、行政長官が指名し、中央政府(国務院)が任命することになっている。
公営機構
公営機構は、半官半民の組織である。政府本体には含まれない。ただし、多くの場合、名士や学識経験者などによる委員会が運営を決定しており、比較的強い独自性を持っている。その一部は日本の特殊法人や独立行政法人同様、政府の出資と指示を受けて行政サービスを提供する組織であるが、他にも由来や性格が様々に異なる組織がある。
また、政府から運営費を交付される機構だけではなく、事業収入で運営される公営企業あるいは公有企業も含まれている。九広鉄路やMTR、香港機場(空港)管理局がこれにあたる。
一部の組織には設立法があり、そのような場合は法定組織とも呼ばれる。多くの大学や慈善団体の他、香港証券取引所、香港貿易発展局、2007年に新設された香港映画発展局などがこれに含まれる。この中にも、香港証取など政府財政に依存しない組織がある。また、郷議局のような地方議会に相当する組織も含まれている。
中央政府との関係
香港の自治権は、外交と防衛を含まない。そのため、香港の外交事務については外交部駐香港特派員公署が、防衛については人民解放軍駐香港部隊が香港に設置および派遣されている。また、香港における中央政府の代表部として中央政府駐香港連絡弁公室が設置されている。
香港基本法の規定により、中央政府は香港政府高官の任命権を持っている。その対象は、行政長官、司長、副司長(未設置)、局長のほか、廉政専員(廉政公署=汚職取締独立委員会の長官)、審計署署長(会計検査院に相当)，警務処長(警察長官)、入境事務処長，海関長(税関長官)を含んでいる。ただし、行政長官は選挙で選出されることになっており、他の高官は行政長官が指名するため、事実上の任命拒否権に近い。
公務員制度
香港政府本体の職員つまり公務員には、政務職系、行政主任職系、法定言語主任・同時通訳主任・校正員職系、訓練主任職系、文書・秘書職系のカテゴリーがある。いずれも、中国語(普通話と広東語)、英語の能力が必須とされる。
給与水準は職系によって大きく異なる。一般職では日本よりやや低く、行政職系でほぼ同じである。一方、政務職系ではほぼ日本の倍程度の水準となり、さらに首長級に昇進するとさらなる高給が支給される。公務員最高位の決策局秘書長(D8、首長級甲一級政務官)では月給が21万香港ドル、日本円で300万以上と規定されている。また、部門である香港金融管理局の局長は、運用ファンドの成績次第とされつつも、実際には日本円で1億円を軽く超える報酬を得ている。ただし、2001年以降、不景気や財政赤字の拡大を理由に、公務員の給与は多少低減されつつある。
政務職系(政務官)
政務職系(AO、Administrative Officer)は、公務員の中で最高ランクのカテゴリーであり、公務員の最高位である決策局秘書長への門戸が開かれている。問責制以後は公務員を退職する必要があるが、局長や司長に任命される機会もある(中国国籍の者に限る)。香港政府全体で583名(2006年末現在)いる。
大学卒業とともに、1級もしくは2級栄誉学士(学士のうち特に成績優秀なものに与えら得る称号)を取得していることが就職条件である。就職後2年間の訓練の後、海外の大学院へ留学する機会が与えられる。また、北京の清華大学で中国国内の事情や中央政府との関係に関する研修も行われている。最初の職務は、民政事務処で末端の行政を学ぶことであり、その後は原則3年に1度ポストを替わりつつ、香港政府のさまざまな部署での経験をつむ。配属先は、決策局、部門、海外の出先機関など様々である。
返還前は、政務職系の多くがイギリス人であった。しかし、返還決定後、特にパッテン総督が就任してから、香港華人の登用が進んだ。現在でも、香港永住権があれば、外国籍でも政務職系を含む公務員になることができる。ただし、首長級と呼ばれる幹部クラスへの登用は中国籍の者に限定されており、イギリス人や英国籍の華人の昇進には限界がある。また、優秀な香港の学生が海外に留学していることも多いため、海外からの受験もスムーズに行えるよう採用試験の実施が工夫されている。
行政主任職系
行政主任職系(EO、Executive Officer)は、2番目のカテゴリーであり、主に執行部門での行政事務を担う。2122人いる。大学卒業が就職条件であるが、海外研修の機会が与えられていない。
その他
その下に位置するのが、文書・秘書職系であり、いわば一般職である。約2万人強いる。法定言語主任・同時通訳主任・校正員職系は、その名のとおり、政府文書を英語と中国語で作成したり、翻訳する専門職である。合計で600名強いる。訓練主任職系は公務員への訓練プログラム担っており、71名強(いずれも、2006年末現在)いる。