TJライナー
運行概要
ふじみ野以北各駅への速達性を高め、「座席指定制」として快適な車内環境を確保する目的で、下り列車は夕方以降に、上り列車は朝に運転を行っている。
2019年3月16日改正のダイヤでは、下り列車は平日ダイヤでは14本（1 - 23号は小川町行き、25・27号は森林公園駅行き）、土休日ダイヤでは11本（全列車小川町行き）が運転され、上り列車は平日ダイヤに2本運転される（森林公園駅始発）。
なお、大幅にダイヤが乱れた場合は運転を取り止めることもあり、他の種別に変更して運行される場合もある。
2008年（平成20年）6月の運行開始以降、順調に乗客を獲得していることから、2011年3月5日のダイヤ改正で平日ダイヤで3本を増発し、土曜日・休日ダイヤで森林公園行き2本を小川町行きに延長した。2013年3月のダイヤ改正からは、全列車が小川町行きとなり、平日ダイヤ1本、土曜日・休日ダイヤ2本の増発がなされた。さらに2011年から毎年12月 - 1月には夜間に臨時列車が1本運転され、2014年7月からは毎週金曜日、2015年6月からは毎週木・金曜日の運転に変更されている。
2016年（平成28年）3月のダイヤ改正で、平日ダイヤのみ上り列車が新設された。
2019年3月16日より、着席方式が座席定員制から座席指定制に変更された。
下り列車
池袋から乗車する場合は、乗車券のほかに座席指定券（大人370円・小児190円）が必要となる。ふじみ野以北は乗車券のみで乗車できるが、着席の保証はない。定期乗車券・回数乗車券等との併用も可能。
池袋駅は5番線ホームから発車する。座席指定券確認のため中央口2・北口改札内の5番線ホーム連絡階段と南口5番線ホーム入口で、座席指定券に表示されているQRコードをその読取機にタッチする必要がある（この部分はライナー改札口と呼ばれる）。ただし、中央口1改札内の5番線ホーム連絡階段からは入場できない。また、16時以降は5番線ホームに通じる全ての通路が一時閉鎖される。
改札外の自動券売機は当日初列車から発車2分前まで、改札内の券売機は発車30分前から発車1分前まで、チケットレスサービスによる購入は乗車日の1週間前の4:50から発車5分前まで発売している。各コンコースには販売状況を知らせる液晶ディスプレイが設置されており、座席が50席以上残っている場合は「○」、残り座席がわずかな場合（1 - 49座席）は「△」、座席が完売した場合は「×」、運休の場合は「休」を表示するようになっている。なお「△」ときは一度に複数枚購入ができない。
座席指定制移行前は、着席整理券の自動券売機は、「前5両」は中央口2切符うりば（改札外）と中央口2・北口改札内の5番線ホーム連絡階段付近（改札内）に、「後5両」は南口切符うりば（改札外）と南口改札付近（改札内）にそれぞれ設置されていた。なお、QRコード導入前は不正乗車防止のため着席整理券の地紋の色は毎回変えられていた。
券売機で購入した使用済みの指定券は、自動改札機には通せないので、持ち帰るか指定券回収箱（停車駅のみに設置）に投入する必要がある。
上り列車
上り列車は乗車駅によって座席指定券の料金が異なり、森林公園駅・東松山駅・坂戸駅・川越駅から乗車する場合は大人470円・小児240円、ふじみ野駅から乗車する場合のみ大人370円・小児190円となる。
座席指定券は、ふじみ野駅 - 玉淀駅間各駅と池袋駅・越生線全駅の自動券売機（東武本線の特急券が購入可能な機種）およびチケットレスサービスで発売される。自動券売機では乗車日の前日（ただし乗車前日がTJライナー運転日の場合は当該列車の発車後）から、チケットレスサービスでは乗車日の1週間前4:50から発売される。下り列車同様、定期乗車券・回数乗車券等との併用も可能。
下り列車と異なり、途中停車駅での降車はできない。また、乗車口は森林公園駅・東松山駅は1ヶ所、坂戸駅・川越駅・ふじみ野駅は2ヶ所のみである。
座席指定制移行前は、発売席数と指定車両は乗車駅ごとに決められており、森林公園駅・東松山駅・ふじみ野駅はこの3駅合計で92席（指定車両は3駅共通で5号車・6号車）、坂戸駅・川越駅はそれぞれ172席（指定車両は坂戸駅が1 - 4号車、川越駅が7 - 10号車）の発売となっていた。
チケットレスサービスとQRコードの使用開始
チケットレスサービスを利用すると、携帯電話からインターネットを通じ、クレジット決済で購入した着席整理券（QRコード）を携帯電話の画面に表示することにより、池袋駅で券売機による着席整理券を購入することなく、そのまま乗車することができる。利用の際は、「東武携帯ネット会員」に会員登録する必要がある。
チケットレスサービスの利用開始と同時に、券売機で発売する着席整理券においてもQRコードが表示されるようになった。それまでは、駅員・ステーションアテンダント・警備員が整理券の確認を行っていた。
これらのサービスは2009年9月15日より開始した。
運休等による払戻しの取扱い
「TJライナー」が「全区間運休」はもちろんのこと、「池袋駅 → ふじみ野駅間で運休」した場合、「90分以上遅れてふじみ野駅（下り）・池袋駅（上り）に到着」した場合は手数料なしで払い戻しができる。
その他の場合は、発車前に申し出た場合のみ手数料100円を差し引いて払い戻しができる。
使用車両
車両は、「TJライナー」の運行開始に合わせて製造された50090系を使用する。客用扉間の座席は近鉄の「L/Cカー」のようなクロスシートとロングシートの両方に切り換え可能なマルチシートを装備し、TJライナー（および送り込み運用の列車）ではクロスシートで運用される。ただし車端部の座席は背もたれ高さをマルチシートと合わせたロングシートである。座席指定制移行前は、このロングシートの部分は乗車整理券の発売時の座席数に計上されていなかった。
名称の由来
2007年12月22日 - 2008年1月17日の間、この新ライナーの愛称が「TJライナー」「おかえりライナー」「アシストライナー」の3つより投票形式で募集され、一番投票の多い愛称が座席定員制ライナーの愛称に採用される方式をとった。その結果、「TJライナー」が4,313票と最も多く新ライナーの愛称に決定した。TJは「東上」のローマ字表記「TOJO」の「T」と「J」に由来し、のちに東上線の駅ナンバリングの記号にもなっている。
新ライナー愛称決定記念号
2008年3月23日、森林公園検修区において「新ライナー愛称決定記念イベント」が実施されたことに伴い、池袋 → 森林公園間直通で臨時運転された。50090系での運行。
この列車には、往復はがきによる事前応募制で抽選に通った人のみが乗車できた。もともと1列車の運行で予定されていたが、応募者多数により2列車で運転された。乗車した人には乗車記念の乗車証明書（硬券）などが配布された。
1号は池袋9:33発・森林公園10:28着、2号は池袋9:46発・森林公園10:49着であった。
七峰号
2008年4月20日、「第23回 外秩父七峰縦走ハイキング大会」が開催されたことに伴い、臨時運転された。
池袋駅（6:19発）から、同大会集合駅である小川町駅（7:36着）まで1列車の運行。50090系での運行で、停車駅は急行列車と同じであったがクロスシートで運用された。
大会参加者の乗車を目的としているが、ハイカー以外の一般乗客も乗車可能で事前応募等は不要であった。
PRE TJライナー
2008年6月7日運転。同年6月14日の「TJライナー」運転開始に先駆け、臨時運転された。50090系での運行で、車内自動放送・車体の行先表示などが初めて使用された。
池袋駅（17:02発）から、森林公園駅（18:03着）まで1列車の運行で、停車駅は「TJライナー」と同じであった。
この列車で池袋から乗車する場合は、東武百貨店池袋店で5月下旬より3,000円以上の買い物をした先着200名の希望者に、一人に付き2枚の着席整理券（硬券）と記念品が配布された。「TJライナー」と同じく、ライナー改札口で整理券を呈示し5番線から発車した。
なお、ふじみ野以北から乗車の場合は整理券を所持していない者も乗車できた。
TJライナーの歌
曲名：TJライナー
作詞／作曲／ボーカル：TJボーイズ
この楽曲は、2008年夏にヤマハ音楽教室に通う小学生3人により作詞・作曲が行われ、同年11月にヤマハ音楽教室主催の「ジュニア・オリジナル・コンサート」にて発表された。
「TJライナー」運転開始から1年目となる2009年6月14日、池袋駅において「TJライナー」の歌の発表が一般向けに行われ、「TJライナーの歌」が収録されたCDが無料配布された。