モンゴルの高麗侵攻
侵攻までの経緯
高麗とモンゴルの関係の始まりは1218年である。当時、金朝に属していた契丹族の一部（黒契丹と呼ばれる）が満洲から高麗に乱入し、江東城（カンドンソン）に籠城したが、モンゴルと高麗が共同でこれを滅ぼしている。その後の1220年から1223年にかけて高麗王国は連年モンゴルへ朝貢していたが（以降とは異なり奴隷を要求されず）、1225年にモンゴル使節が殺害される事件が起きためモンゴルの侵攻を招いた。ただしこの時、モンゴルのチンギス・カンは西夏への遠征中であり、高麗侵攻はチンギスの死後、三男のオゴデイが大カーンに即位した後に行われた。
12世紀後半の1170年には高麗で文臣の支配に対して武臣(軍人)によるクーデターが起きて、以降1270年まで武臣政権と呼ばれる執政体制が敷かれた。1196年に崔忠献（チェ・チュンホン）が政権を握ってからは「崔氏」が権力を握った。モンゴルによる高麗侵攻当時、崔氏2代目の崔瑀（チェ・ウ）が政権を運営していた。
第一次侵攻
1231年、オゴデイは高麗に対して、先の使者殺害を詰問し降伏・臣従を促す国書を送る。これを機にモンゴルによる高麗侵攻が始まる。
首都開城陥落と降伏
サリクタイ・コルチに率いられたモンゴル軍は、鴨緑江を越え、瞬時に国境の義州を陥落させた。このとき高麗の将軍洪福源（ホン・ボグォン）は1,500戸を引き連れてモンゴルに降伏した。崔瑀は歩兵を率いて安州および亀城で迎撃した。モンゴル軍は安州を落とした後、亀城を包囲したが落とせなかったため、サリクタイはこれを無視して一挙に首都の開城の攻略に成功した。首都の陥落を受け、高麗朝廷はモンゴルの侵攻に抵抗できないことを悟り、講和を求めることとなる。これに対しモンゴルは、1万枚の毛皮、2万頭の馬、100万人分の軍服および大量の奴隷など大量の貢物を要求した。
サリクタイは1232年春、主力軍を北に撤退させたが、高麗が講和条件を守るかどうか監視させるためもあり、開城その他の都市に72人の「ダルガチ」（統治官）を配置した。
高麗による反撃と江華島への朝廷移転
しかし同1232年、崔瑀はモンゴルが残したダルガチ72人を全員殺害した。さらに国王と開城の民を引き連れて、京畿道沖にある江華島に朝廷を移し、モンゴルの脅威に備えて防備を固めた。モンゴル軍は陸戦には長けているが、海戦には不向きと判断したためである。崔瑀は国内の船を総動員して兵や軍事物資を江華島へ運搬した。また平民にも城や山砦、沖合の島などへの移動命令が出されたが、実現不可能な空文に過ぎなかった。江華島には強固な砦が築かれ、対岸の半島本土側にも小規模な城壁が施され、文殊山（ムンスサン、慶尚北道）には二重壁が建設された。この結果、農村の休耕や国土の荒廃を招くことになる。
第二次侵攻
モンゴル側はこれらの朝廷移転やダルガチの殺害という明確な敵対行為に対して、2度目の遠征を行った。モンゴル軍は、第1次侵攻で降伏した洪福源に兵を率いさせ、半島北部を制圧。続いて半島南部へ到達したが、陸地からわずかの距離しかない江華島を制圧することができず、光州で反撃された。この間、サリクタイは龍仁附近で行われた処仁城 （チョインソン）の戦いで流れ矢に当たり戦死し、モンゴルは撤退を余儀なくされた。
第三次侵攻
この状況を受け、1234年に金を滅亡させたオゴデイは、3度目の高麗制圧を企図し、1235年から慶尚道・全羅道全域で掠奪が開始された。モンゴル軍は江華島政権および半島本土の山城の攻略を避け、高麗軍の補給を絶つため農地を焼き払う挙に出た。江華島政権は防御をより固めていたが、度重なるモンゴル軍の侵略に対して、抗戦不能に陥りつつあった。
他方の江華島では1236年、高宗王が第2次侵攻の際に戦災で焼失した符仁寺（プインサ）大蔵経の版木の復元を指示。15年の歳月をかけて1251年に経典1,512部、6,805巻を集めた81,258枚の版木が製作された（高麗八萬大蔵経）。その後海印寺（ヘインサ）に移され、現在韓国の国宝となっている。
1238年、高麗は再び和議を望むようになり、高麗王室から人質を出すことを条件にモンゴル軍が撤退することとなった。しかし無関係の人間を王室の者と偽って人質に出したため、モンゴル側は激怒し、高麗王室の江華島からの退去、海上のすべての艦艇の一掃、反モンゴル的貴族の差し出しなどを強硬に求めた。しかし、高麗側は王族佺と10人の貴族子弟を人質に出した以外は要求を拒絶した。
第四次侵攻
1247年、モンゴルは4度目の高麗侵攻を実施、江華島から松都（開城）への還都、および高麗王室からの人質を再び要求した。アムカン率いるモンゴル軍は塩州に駐屯。高宗王が江華島から松都への帰還を拒むと、全土への掠奪を再開するが、1248年にグユク・カンが崩御したことで、モンゴル軍は一時撤退した。しかし、モンゴル軍の襲撃は1250年まで続く。
モンケによる江華島朝廷への出陸要求
1251年10月、モンケはモンゴル帝国第4代皇帝に即位すると、自らの即位を通告する使者として将困、洪高伊ら40人を送り、詔を発して国王高宗に「出陸」（江華島からの退去と半島本土への帰還）および「親朝」（自らの宮廷への出頭）を求めた。これを受けた高宗の宮廷は朝議で紛糾し、太子を代わりに遣わして親朝するか、あるいは高宗は老病のため親朝できないことを伝え、これを詰問された場合は太子を代わりに遣わして親朝させれば良いのではないか、という意見が出た。
翌1252年正月にモンゴル側に李峴を使者として送り出したが、7月にはモンゴル側から使者として多可・阿土ら37人が来て国王の出陸について審問してきた。一旦は使者をモンゴル側に送って近く出陸すると答えた。モンゴル側はこれを言質として再度使者をよこすと国王高宗の出陸を要求した。使者たちはモンケの命令で高麗からの使者李峴がモンゴル宮廷に留め置かれたことを告げ、「国王が陸でお前たち使者を迎えるならば、たとえ人々がまだ出て来なくともそれで良しとする。もしそうでなければ直ちに帰還せよ。お前たちが来るのを待って（高麗に）兵を発して討伐させる」というモンケから使者たちに課された指令を伝えた。モンゴル側は高麗宮廷が未だ江華島に立て籠って違約を続けている事に対して、旧都・開京への帰還を求めた。
高麗朝廷の動き
高宗が崔氏三代目の崔沆（チェ・ハン）に対策を問うたところ、「国王は軽々しく江華島より出るべきではありません」と答えた。廷臣たちはモンゴル側の出陸の要求に従うべきだと考えていたが、崔沆がこれを拒絶すべきとの意向を示したため、高宗共々これに従ったという。高宗は代わりに新安公佺に使者たちを迎えさせるよう遣わし国王の出陸は行われなかった。この高麗の違約は使者の多可らを怒らせ、モンゴルの使者は帰還した。
1252年12月、モンケの命を受けた諸王イェグ（諸王 也古、ジョチ・カサルの長男）が軍をともない併せて質子（トルガク）としてモンゴル宮廷に出仕していた永寧公綧を使者として寄越して来た。モンゴル軍はその間、東真国のあった地域に進駐した。
第五次侵攻と停戦
翌1253年5月にはイェグ（也窟大王）は先年高麗に使者として来たった阿豆ら16人を改めて使者として送って来たが、進展は無かった。ついに、その国王が国外へ旅するなど先例がないとして拒絶。モンケは親族のイェグ（諸王 也古、ジョチ・カサルの長男）に、高麗の軍を統治するよう命じ、モンケ宮廷の高麗人の勧めにより1253年7月に侵攻を開始した。イェグはアムカン（阿母侃）を伴い、高麗に降伏を要求。高麗はこれを拒絶するが、モンゴルへの抵抗は諦め、山城や島嶼部に農民を集めはじめた。
またジャラルダイ（札剌児帯）はモンゴルに降伏した高麗の将とともに国土を蹂躙。イェグの使者が高宗の宮廷に遣わされると、高宗はついに半島本土への帰還と、第2王子の安慶公淐を人質に出すことを承諾。高麗の降伏を受け、モンゴルは1254年1月に停戦に応じた。しかし、高麗朝廷上層部は江華島に残留していた。
ジャラルダイ軍侵攻
モンゴル帝国は後に高麗朝廷上層部の江華島残留を知り処罰した。その後1253年から1258年にかけて、罷免されたイェグに代わって征東元帥に任じられたジャラルダイ配下のモンゴル軍は、貴人と官吏のみが要衝へ立て籠ったため多くが放置されていた高麗領へ、6年に渡り断続的な破壊・略奪を行う第6次侵攻が開始された。
この第6次侵攻は小休止を挟んで4度の波があったが、渡る第一波となった1254年には206,800余人の高麗人が捕虜となり、殺された者は数えきれず、「蒙古軍が経る所の州郡みな灰燼となる」「骸骨野を蔽う」といった惨状を呈したという。
高麗朝廷による全面降伏
この間、高麗朝廷内部はモンゴルへの対応について2派に分かれていた。モンゴルとの戦争に反対し降伏を進めようとする文臣グループ（文班）と、モンゴルとの戦争を継続しようとする崔氏が率いる武臣グループ（武班）である。しかし、文臣の筆頭だった柳璥（ユ・ギョン）が武臣の金俊（キム・ジュン）と結託して崔竩（チェ・ウィ）を暗殺して崔氏政権を倒すと、モンゴルとの講和が進展する。崔氏滅亡を告げるモンゴル宛て国書で高宗は「今まで我が国が貴国に事大の誠を尽くせなかったのは権臣が政治を奪い貴国へ属するのを嫌がったためであり、崔竩が死んだ今、ただちに都を戻し、貴国の命を聞きます」と全面的な従属を宣言した。
モンゴル帝国直轄領
以後、旧高麗領の多くはモンゴル領征東行省（高麗行省）となり、モンゴルの役人によって軍政両面に渡り統括された。モンゴルは和州（現金野郡）に「双城総管府」を設置し、その周辺を直轄領に編入。1259年4月に王子倎をモンゴルに入朝させることを決した。
クビライと元宗の王政復古
高宗の世子・倎は大カーンのモンケに拝謁するため、モンゴルへ向かっていたが、1259年南宋へ遠征中のモンケが急逝。上都開平府へ帰還中のクビライ（モンケの弟。後の元世祖）に拝謁した。さらに翌1260年春、今度は高宗が没したため倎は帰国を哀願、クビライは帰国を許可した（即位して元宗と称する）。4月12日、モンゴル皇帝に即位したクビライは倎以下上下朝臣の帰服を嘉した。倎が、モンゴル軍による掠奪の免除と捕虜・逃民を帰参させる許しを求めると、5月13日に詔諭を下しこれを許可した。6月、倎が子の僖を入朝させたことにより、国王の冊封を受け王印と虎符を賜った。
以後、元宗は度々モンゴル・元朝へ入貢を行いモンゴルを背景として権力の安定を図ったが、反モンゴル派はこれを不満として親モンゴル派との対立を深める。1268年、林衍（イム・ヨン）らが権臣・金俊を暗殺する。翌年には林衍らが親モンゴル派の崔坦（チェ・ダン）らとの確執により、元宗を廃して弟の安慶公淐を擁立する乱を起こした。クビライは、入朝していた世子諶の、兵3,000と5ヶ月分の糧秣を頂き私が同行すれば騒乱は収められる、との献策を受けて諶に3000・将軍モンゲトゥに2000の兵を授け高麗へ派遣、モンゴル軍は瞬く間に乱を鎮圧した。さらに急死した林衍の跡を継ぎ高麗令公（高麗武人のトップ）となった林惟茂（イム・ユム）を文班の洪文系（ホン・ムンギェ）、宋松礼（ソン・ソンネ）らが殺害、高麗の武臣政権は終わりを告げ、王政復古が成った。
高麗の分裂
1269年10月、林衍の乱の原因となった親モンゴル派で都統領の崔坦らが、西京（平壌）を中心とする西北面50城を領して、高麗から分離し元に帰属した。クビライは西京を「東寧府」へ改称し東寧路を置いた。またその北の遼寧平原の瀋州（瀋陽）一帯は先に降伏していた洪福源らの1族が統治していた。
一方、林衍1派の残党である裴仲孫（ペ・チュンソン）は残存勢力を集め、高麗王室の傍流にあたる王温を擁立して江華島を脱出、半島西南部の珍島を根拠として「高麗国」を自称した。
これら高麗人が別々に構成した4つの勢力（北から順に洪福源・崔坦・元宗・珍島）をまとめて統治するため、クビライは行中書省を置き、クルムシ（ムカリ国王家）を長官に据えた。クルムシの勧告を受けて元宗は江華島を退去し、開城に還都し、ここに約40年にわたった江華島政権は終了した。
三別抄の乱と高麗征服の完了
しかし江華島からの退去に従わない武人は、高麗の首都警備軍である「三別抄（サムピョルチョ）」を主力として反乱を起こし、珍島臨時政府に合流してモンゴルに抵抗した。クビライはヒンドゥ（忻都）に5,000の騎兵を授けて金州に駐屯させ、元宗に三別抄討伐のための軍船を造らせる一方、後に2度の元寇に従軍することになる洪福源の子・洪茶丘（ホン・タグ）にも兵を率いさせて屯田させた。
1271年（この年からクビライは国号を「大元」と改める）アカイ率いる第1次珍島討伐は失敗に終わる。同年3月、三別抄は日本の朝廷に対して援軍と兵糧を求めたが、日本側では事態がよく理解できておらず、この要求は無駄に終わった。同5月ヒンドゥ率いる元・高麗連合軍が珍島を攻略し、モンゴルとして初めて海戦に勝利して、王温を捕らえ斬刑に処した。
なおも三別抄の指導者金通精らは、属国の耽羅国（済州島）へ逃れて耽羅国王を追い出し籠城したが、ヒンドゥ軍12,000の兵は1273年軍船108艘に分乗して耽羅を攻略。三別抄勢力を壊滅させた元朝は耽羅総管府を設置、高麗征服事業は完了した。
征東行省による統治
征東行省が臨時機関から常設組織へと変質した1287年以降は、政治・軍事に加え行政も征東行省によって処理されるようになり、高官以下行政官の人事権も征東行省が握り、賦税も元の朝廷へ収めるよう変更されるなど、旧高麗は直接統治下（羈縻支配体制であり、他の行省ほど集権的ではなく、一定の自治権を残していたと考えられている）に組み込まれていった。イルハン朝で編纂された『集史』には「（高麗王）はクビライに寵愛され王と称してはいたが、実際には王では無かった」とある。高麗王が官制をモンゴル式から高麗風に改めようとした事もあるが、元の役人から反感を買って廃され、達成されることは無かった。
その後の高麗王室
その後、高麗王室と元皇室や元の貴人は互いに姻戚を結び、4代の高麗王は元朝宮廷において最高ランクの金印獣紐を授けられる諸王・駙馬のひとつ「駙馬高麗王」の地位を得る。元宗の子・忠烈王（在位1274年 - 1298年、復位1298年 - 1308年）にクビライの皇女クトゥルク＝ケルミシュ公主（斉国大長公主 忽都魯堅迷失）が下嫁した。
第1・2次の征東行省において高麗国王は次官（長官は右丞相の阿剌罕、阿塔海ら）となった、第3次では無官となるが忠烈王の復位した際に再び左丞相に任じられた。恭愍王（在位1351年 - 1374年）に至るまで約80年間、歴代国王は世子の時期にモンゴル宮廷に人質（トルカク）として赴き、ケシクなどのモンゴル宮廷での歴代モンゴル皇帝近辺での職務に従事し、これによってモンゴル名を与えられ、またモンゴル貴人の娘を娶り、前王が逝去した後に帰国し、高麗王に就くのが慣例となる。
クビライ時代は「帰順が遅かった叛逆諸侯のひとつ」としてクビライからカルルク王家と比べられてなじられる場面もあったが、クビライ晩年のナヤン・カダアンの乱の鎮圧にも従事し、その鎮圧にあたった皇孫テムルがクビライを継いでモンゴル皇帝に即位すると、高麗王家の地位は上がった。しかし、クビライ王家との姻戚を深めることは同時にテムル没後のクビライ王家内における皇位継承紛争の影響を直接受けることに繋がり、モンゴル宮廷の高麗王族・官僚と高麗王室で確執が生じ、大都宮廷での内紛に伴うモンゴル皇帝の交替に伴い高麗王の改廃も生じる事態となった。また、高麗から宮廷などへ高麗王族と貴族が出仕する例が増え、高麗国内よりも高位の職を得る人物も出現した。元朝最後の皇帝（大カーン）となったトゴン・テムルの皇后となりアユルシリダラ（北元2代カーン）を生んだ完者忽都皇后（奇皇后）は、高麗からモンゴル宮廷に宮仕えのために出された宮女であった。
忠烈王の親モンゴル政策と日本侵攻（元寇）
特に忠烈王は父の元宗の路線を継承し、親モンゴル政策に傾倒した。忠烈王は元宗廃位事件によって父元宗救出のためモンゴル軍の出動を要請したおりに、高麗は以後モンゴル側への出征には率先して労力を惜しまない、という言質を与えたため、クビライの日本侵攻の意志が固まる頃には、その応対に「率先して当たる」態度を幾度も示さねばならなかった。出征に供出する兵員や人員、装備は高麗の国情にとっては重い負担だったようで、クビライの要求を受け入れつつ負担の軽減をその都度嘆願し、場合によっては自弁し切れなかった武器などを元軍から支給してもらうなどしていた。日本侵攻の為の第二、三次征東行省が置かれたが、高麗国王がその次官である左丞相となった。
文永・弘安の役に関わる一連の出来事は高麗王にとって、一面では高麗王家の地位安定に向けた絶え間ない危機と模索の時期であったともいわれる。日本への最初の侵攻となった文永の役（1274年）は、三別抄鎮圧の翌年、遠征軍出発に先立つ高麗世子諶と皇女クトゥルク＝ケルミシュと婚姻、直後に元宗が死没しており、その喪が明けると同時に世子諶は忠烈王として即位した年でもあるという、高麗にとっても目まぐるしい年であった。征東行省を運営したダルガチ以下のモンゴル人の役人は、高麗では貴族として扱われた。
耽羅島（済州島)
耽羅島（済州島）は元々高麗に属さず、また牧草に富み馬群の放牧に最適な地でもあり、対日本・南宋への絶好の軍事的位置でもあることから直轄地とされた（現在でも馬の毛色の名前にモンゴル語の影響が残っている）。
モンゴル支配からの脱却と高麗滅亡
1350年代、元朝の衰えが顕著となると、恭愍王は親元勢力を排除し、元の外戚として権勢を振るっていた奇氏を討伐。崔瑩（チェ・ヨン）や李成桂（イ・ソンゲ）らの武人を登用して1356年に元から高麗旧領土を奪い返し、ようやくモンゴル支配から脱して独立した。しかし、大陸で紅巾の乱が発生し、紅巾軍が朝鮮半島にも到来するが高麗軍は撃退に成功する。また同時期に倭寇の襲来にも高麗は悩まされており、1389年には朴葳（パク・ウィ）が対馬征伐を行なっている（高麗・李氏朝鮮の対馬侵攻)。
この過程で力を得た李成桂によって1392年に李氏朝鮮が成立し、高麗王朝は滅亡した。