独立国家共同体
前史
ソビエト連邦が1980年代後半から機能不全を起こし急速に弱体化が進む中、ソビエト連邦書記長のミハイル・ゴルバチョフは連邦を構成する各共和国に大幅に権限を委譲する新連邦条約を1991年8月20日に調印する予定であったが、その前日の8月19日、これに反対する国家非常事態委員会によるクーデターが勃発することでいったん調印は見送られた。このクーデターは数日で鎮圧され、復帰したゴルバチョフは再度新連邦条約の締結をめざしたものの、ソ連政府の威信低下はもはや明らかであり、各共和国でも完全独立論が台頭するようになった。それでも11月にはいくつかの共和国が条約に調印し、「主権国家連邦」の発足が決定したものの、有力共和国のひとつであるウクライナ・ソビエト社会主義共和国が12月に国民投票を行い、90％以上の賛成を得て完全独立を決定すると、ソ連の崩壊は決定的となった。
創設
上記のウクライナ国民投票の結果を受けて、1991年12月8日、ロシアのボリス・エリツィン大統領、ウクライナのレオニード・クラフチュク大統領、ベラルーシのスタニスラフ・シュシケビッチ最高会議議長はベラルーシのベロヴェーシの森で、ソビエト社会主義共和国連邦の消滅と独立国家共同体 (CIS) の創立を宣言した（ベロヴェーシ合意）。続いて12月21日、カザフスタンでの首脳会議にジョージア（グルジア）を除く8か国も参加してアルマトイ宣言に合意した。これにより、加盟国のほとんどを失ったソビエト連邦は崩壊し、ゴルバチョフ書記長は辞任を表明した。
初期の活動
ソ連崩壊によって誕生したCISであるが、各新独立国の体制は整っておらず、軍事面および経済面において問題が噴出し、この調整を行うことがCISの最初の課題となった。
軍事面においては、CIS統一軍の創設を行うかが焦点となった。ロシアは各国による独自軍とCIS統一軍を併存させる考えを有しており、この構想には国力・経済力的に独自軍の整備が困難である中央アジア諸国が賛同していた。一方で、ロシアとの間で黒海艦隊やクリミアの帰属問題を抱え、独立を強く志向するウクライナはこの構想に反対であり、これに同じく沿ドニエストル共和国の問題を抱えるモルドバや、アルメニアとのナゴルノ・カラバフ領土紛争を抱えるアゼルバイジャンが同調した。結局1992年5月にロシア連邦軍が創設され、同時に集団安全保障条約をロシア、アルメニア、中央アジア諸国が締結することで軍事的協力体制の構築が図られた。こうした動きによってCIS統一軍は形骸化していき、1993年には消滅した。
加盟各国および西側諸国にとって最大の懸案は、各地に置かれた膨大な軍事施設、戦略核、弾道ミサイルであった。特に核戦力がベラルーシ、ウクライナ、カザフスタンによって大量に保管されていたことは脅威であったが、CISによってロシアが一括管理することが取り決められた。カザフスタンのICBM用核弾頭650発は1995年4月に撤去。ベラルーシは核弾頭18発を1995年末、ICBM18基を1996年に撤去。ウクライナにはICBM176基、戦略爆撃機46、核弾頭は実に1592発が存在していたが、第一次戦略兵器削減条約のリスボン議定書に基づいて、全てロシアの管理下におかれた。またカザフスタンに建設したバイコヌール宇宙基地はロシアがカザフスタンに使用料を支払うこととした。
また経済面においては、ルーブル圏の維持が焦点となった。独立当初はソビエト連邦ルーブルが全ての国で流通していたものの、各国に創設された中央銀行がそれぞれ異なった経済政策を取りながらルーブルを発行したため経済的混乱が起こった。そこで1992年10月、ロシア・ベラルーシ・アルメニア・カザフスタン・ウズベキスタン・キルギスの各国があらためてルーブル圏を創設することを決定し協定を結んだ。しかし混乱は収まらず、1993年7月にはロシアが1992年以前に発行された旧ルーブル紙幣の流通を停止し、これを受けてウクライナとキルギスは独自通貨へと移行した。1993年9月には新ルーブル圏創設協定がロシア・ベラルーシ・アルメニア・カザフスタン・ウズベキスタン・タジキスタンによって調印されたものの、わずか2か月後の11月には破綻が明らかとなり、アルメニア・カザフスタン・ウズベキスタンが独自通貨へ移行して、ルーブル圏にはロシア・ベラルーシ・タジキスタンが残るのみとなった。
1992年のバルセロナ夏季オリンピックとアルベールヴィル冬季オリンピックにおいては、統一した選手団を送ることとした。ジョージアが当時はまだ加盟していなかったため、地域名はCISもフランス語のCommunauté des États indépendants (CEI) も用いられず、英語のUnified Team にあたるフランス語のÉquipe Unifiée からEUNと表記された。日本のマスメディアでは、漢字名で「独立国家共同体」或いはCISと呼ばれたりしたが、事実上「旧ソ連統一チーム」として扱われた。その後、1994年に開催されたリレハンメルオリンピック以降は各国がそれぞれ代表団を送ることとなり、EUN選手団は消滅した。
1993年にはCIS憲章が制定され、この憲章を批准した国家がCISの加盟国として認められることとなった。この年にはそれまで反露・親欧米路線を主張してCISへの参加を拒否していたジョージアが、国内の南オセチア・アブハジア問題を契機として加盟した。一方で初期加盟国のうち、アゼルバイジャンの憲章批准はやや遅れ、またトルクメニスタンとウクライナは憲章批准を拒否し正式加盟を見送った。
ユーラシア経済共同体 (EurAsEC)と民主主義と経済発展の機構 (GUAM)
設立からしばらくは、ボリス・エリツィンのロシアが安定しなかったこともあり、共同体としての連携は目立たず、その間に、新設国は概ね強大な権力を持った大統領が治める独裁国家となった。
1994年になると、それまで分離傾向が目立っていた加盟各国に統合の動きが現れはじめた。1996年にはベラルーシ、カザフスタン、ロシア、キルギスの4か国が統合強化条約を結んだ。
ジョージア、ウズベキスタン、ウクライナ、アゼルバイジャン、モルドバはロシアから距離を置く政策を採り、ウズベキスタンを除く4か国は、ロシアに対抗して1997年にこれら諸国の頭文字を採ったGUAMを結成した。この組織には1999年にウズベキスタンも参加し、GUUAMと呼ばれるようになったが、2005年にウズベキスタンは脱退し、残った4か国は2006年にこの組織を「GUAM 民主主義と経済発展のための機構」へと改称した。これらの国は、2006年7月のCIS首脳会談に欠席している。これに対し、ベラルーシ、カザフスタン、タジキスタン、キルギス、アルメニアはロシアとの緊密な関係を保ち、アルメニアを除く5か国で2000年10月ユーラシア経済共同体 (EurAsEC) を結成した。こうしてCIS内に、ロシアを中心とする統合派と、ウクライナやジョージアなどからなる反統合派の2つのグループが成立することとなった。
バラ革命、オレンジ革命
2000年にウラジーミル・プーチンがロシア大統領となると、周辺国との連携を強化しようと試みるが、2001年のアメリカ同時多発テロが発生したため、国内のテロ対策も踏まえ、対テロ戦争に同意してアフガニスタン戦争のため、ウズベキスタン・タジキスタンへのアメリカ軍駐留を黙認したが、中央アジアでのアメリカの覇権が強まると考えられた。
プーチンは2003年のイラク戦争には反対して米国と対立する。イラクのサッダーム・フセイン政権打倒を果たし、西欧のNGOなどと共にCIS域内の民主化勢力の支援を行った。この結果、ジョージア（バラ革命）、ウクライナ（オレンジ革命）、キルギス（チューリップ革命）で独裁政権が倒れて民主化が達成された。しかし、米軍が駐留していたウズベキスタンでは、市民運動が革命に繋がらずに失敗、その結果アメリカはウズベキスタンのイスラム・カリモフ大統領の怒りを買い、（アフガン作戦が一段落したこともあるが）同国から米軍を撤収させることとなった。
ウクライナやジョージアは北大西洋条約機構 (NATO) 加盟の意思を表明しているが、実現していない。以前よりCISへの嫌悪を隠さなかったジョージアは、2008年8月の南オセチア問題をきっかけとしてCISからの脱退を表明した。このときロシアは南オセチアに爆撃を開始したジョージアに対して住んでいるロシア人を守るためと称して爆撃・侵攻したが、CISはこれに対して声明を発せず、また各国も沈黙（賛成も反対もしない）を通している。
2014年にはクリミア危機によってウクライナとロシアの間の関係が極度に悪化し、ウクライナはCISからの脱退を表明した（後述）。
経済
上記のとおりルーブル圏の維持が1993年に破綻したのち、1994年にはトルクメニスタンを除く11カ国によって自由貿易圏創設協定が締結されたものの、実際には発効しなかった。
その後、FTAとは別に加盟国間でロシアを中心とした経済統合の動きが起こり、ベラルーシ、カザフスタン、タジキスタン、キルギス、ロシアの5か国は2000年10月にユーラシア経済共同体 (EurAsEC) を結成した。2010年1月にはロシア・ベラルーシ・カザフスタンの3か国がユーラシア関税同盟を結成し、さらに統合の度合いを深めた。2015年1月にはユーラシア経済共同体が発展的解消してベラルーシ・カザフスタン・ロシアによってユーラシア経済連合が結成され、アルメニアおよびキルギスも同年中に加盟した。
その後、2011年10月18日、CIS加盟国のうちロシア、ウクライナ、ベラルーシ、カザフスタン、キルギス、タジキスタン、モルドバ、アルメニアの8か国によって自由貿易協定（FTA）が締結され、独立国家共同体自由貿易地域が成立した。2012年9月にはロシア、ベラルーシ、ウクライナの3ヵ国が批准を行ったために条約が発効し、2012年末までにはカザフスタン、アルメニア、モルドバも批准を完了した。2013年12月にはウズベキスタンが条約に署名し、その後批准した。署名したうちで残る2つの未批准国であるキルギスとタジキスタンも、2014年1月と2015年12月にそれぞれ批准を済ませた。こうして、CIS自由貿易協定の加盟国は9カ国となり、CIS内で自由貿易協定に参加していないのはアゼルバイジャンのみとなった。
一方、2016年1月1日よりウクライナとEUとの自由貿易協定である深化した包括的自由貿易協定（DCFTA）が発効したが、これに先立ってロシアは同日よりウクライナとのFTA関係を停止する大統領令を発布した。
軍事
上記のように初期のCIS統合軍構想が1993年に破綻したのち、CIS内ではいくつかの軍事協力の試みが行われてきた。1995年にはCIS統合防空システムの設立が合意され、アゼルバイジャンを除く当時の加盟国10か国による防空システムの構築が目指されたものの、各国の思惑やロシアとの政治的対立によって、実質上はロシア・ベラルーシ・カザフスタン・アルメニアの4か国間での協力にとどまっている。
CIS諸国の交通
これらの鉄道は1520mm広軌であるために今でも頻繁に国際列車が運行され、ソ連時代からのエレクトリーチカや客車が各国で使用され、各国で様々な内装や塗装に変更され、個性が出来ている。CISは広大であるが電化率は高く、中央アジアでも電気機関車やエレクトリーチカが走っている。しかしEUに加盟したバルト三国やNATOに加盟をしようとしているウクライナではヨーロッパの標準軌ではないためにボトルネックとなり、フリーゲージトレインが使用されている区間がある。
現在ロシアではモスクワとサンクトペテルブルクを結ぶドイツのICEをモチーフにした高速列車・サプサン号が、ウズベキスタンではタシュケントとサマルカンドを結ぶスペインのタルゴを元にした高速列車のアフラシャブ号が、カザフスタンでは同じくスペイン製のタルゴが高速列車として走っている。