甘粕事件
事件の発覚
関東大震災で東京や神奈川が混乱に陥るとして戒厳令が発せられていたさなか、1923年（大正12年）9月16日、大杉栄は、内縁の妻伊藤野枝（作家）を連れ、鶴見区三笠園に住居があった辻潤（伊藤の前夫）を見舞ったが、辻が留守であったので、近くの神奈川県橘樹郡鶴見町に住む実弟の大杉勇宅を訪問。偶然、大杉の末妹あやめとその息子の橘宗一（6歳）が滞在していて、宗一が「東京の焼跡を見に行きたい」というので、これを同行して東京に戻ることになった。
夕刻に自宅付近に帰ってくるが、伊藤が果物を買っていると、張り込み中の憲兵隊に強引に連行され、淀橋警察署から自動車で麹町憲兵司令部に連れて行かれて消息を絶った。行方不明になった大杉を、その友人で読売新聞記者であった安成二郎が探すが、見つからずに事件性を直観。家人が警察に捜索願を出した。
警視庁は捜索願を受けて驚き、調べてみたところ、淀橋警察署が憲兵隊による検束を報告した。そこで警視庁が憲兵隊に問い合わせると、憲兵はすでに帰したと返答した。警視庁は行方不明の大杉が何か良からぬ計画でも行っているのではないかと思い、血眼で行方を捜した。
大杉はアナキストの大立者であり、18日の報知新聞の夕刊で「大杉夫妻が子供と共に憲兵隊に連れて行かれた」という記事が出て、噂はすぐに広まった。以前より陸軍が何かやるらしいと聞いていたが沈黙していた警視庁官房主事の正力松太郎（後述）は、子供が関わっていたことを憂慮して、警視総監湯淺倉平に相談。湯淺総監は新任の後藤新平内相に報告するが、後藤に自分では対処できないとして総理に報告するように言われて、湯淺総監は直接、総理大臣山本権兵衛に会って報告した。山本首相が閣議で田中義一陸相に聞くと「知らん」と言い、戒厳司令官福田雅太郎を呼んで問いただしてみても関知していなかったので、憲兵隊の捜査が開始された。するとすぐに内部の犯行が明らかになった。田中陸相が改めて憲兵司令官小泉六一を呼んで問いただすと、小泉は甘粕の犯行を認めた上で賛美したため、田中は叱責して小泉に謹慎を命じた。憲兵隊司令部では9月19日中には甘粕と森が衛戍監獄に収監された｡また古井戸から遺体が引き上げられた。
9月20日、「甘粕憲兵大尉が大杉栄を殺害」の一報を大阪朝日新聞と時事新報が号外で発し、大阪朝日新聞は東京からの記者の電話でこの日は2度号外を出した。時事新報は記者を憲兵隊本部に張り込ませ、大杉だけではなく伊藤野枝と子供が殺されたこと、現場の井戸も確認した。
軍は突如として9月20日付で、東京憲兵隊渋谷分隊長兼麹町分隊長であった甘粕正彦憲兵大尉と東京憲兵隊本部付（特高課）森慶次郎憲兵曹長が「職務上不法行為」を行ったとして軍法会議に送致し、福田雅太郎戒厳司令官を更迭、憲兵司令官小泉六一少将と東京憲兵隊長小山介蔵憲兵大佐を停職処分とすると発表した。また同時に本件に関する新聞記事を差し止める情報統制の決定をした。以後、新聞各紙は核心部分をすべて○○の伏字として事件を報じた。報道は止められたが、情報は各社に電話で拡散したため、検閲を掻い潜った九州日報は21日にも号外を出している。
戒厳令下で不眠不休で治安維持に当たっていた軍隊に、世論は普段反軍的な者さえも含めて支持や敬意を表明していたが、突然の司令官更迭について新聞で詳細が報じられないことから、何事が起こったのかと騒然となった。流言飛語が盛んになっていたこともあり、人心不安が高まった。
批判が強まる中で、軍は前日の予審の結果を受けて9月25日に第一師団司令部発表として、甘粕大尉が16日の夜に大杉栄と他2名を某所に連行して殺害した、と公表したが、他2名が何者であるかは公表させなかった。10月8日に記事差し止め処分が解除されると、新聞は他2名が、伊藤野枝と橘宗一であることを報じ、日本を騒がせるアナキストであり恋愛スキャンダル（日蔭茶屋事件）でも世間に有名になった大杉・伊藤の2人に加え、6歳の小児までも殺されたとあって世間は騒然となった。
軍法会議
9月24日に軍法会議予審があり、事件の概要が明らかにされた。軍法会議の公判も極めて性急に行われた。それらによると、甘粕大尉らは、大震災の混乱に乗じてアナキストらが不穏な動きを起こし政府を転覆しようとすると憂慮し、アナキストの主要人物であった大杉と伊藤を殺害することを決めたという。
予審で明らかになったところでは、9月16日に大杉ら3人が鶴見から帰る途中、自宅付近で甘粕大尉と東京憲兵隊本部付の森慶次郎曹長（後に明らかになるところによれば、さらに鴨志田と本多の両名を加えた4名）が張り込みをしており、子供だけは帰宅させてくれという大杉の要望を拒否して、強引に3人を拉致し、麹町憲兵分隊に連行した。東京憲兵隊本部で夕食を出したが、大杉と伊藤は食べず、橘だけが食べた。大杉はナイフを借りて伊藤が持っていた梨を2人で食べた。午後8時、3人は別々の部屋に移された。
甘粕は予審調書で大杉と伊藤とを自分が絞め殺したと認め、その様子を細かく描写した。大杉は応接室で森曹長と雑談のような取り調べを受けていたが、入室した甘粕は背後から柔道の締め手で大杉の首を右手で絞め、森は苦しみもがく大杉の足を押さえた。15分ほどでぐったりして亡くなった。その後、念のためとしてさらに麻縄で絞めた。午後9時15分、次に甘粕は階下の隊長室に入れられた伊藤のもとを訪れ、しばらく会話して油断させると、同様に絞殺した。
甘粕は最初、「個人の考えで3人全てを殺害した」として、大杉と伊藤との間の子供と誤解された橘宗一の死に関しても認めたが、軍法会議では、橘の死の経緯を調書で省略したことに官選弁護人塚崎直義が疑念を持って追及した。特に甘粕の母親が「正彦は特に子供好きでした。罪とがもない子供を手にかけるなど、あり得ない」と涙ながらに主張したことにより、自白を一部撤回。自分は「子供は殺していない。菰包（こもづつ）みになったのを見て、初めてそれを知った」と証言を変えて、大杉と伊藤を殺したのは認めたが、子供殺しは自分ではないとした。橘は連行するために自動車に乗せた最初から甘粕に懐いていた。甘粕は便所に行ってくるといってその場を離れ、少年の死には立ち会っていないと主張した。
この供述の撤回により予審の内容が覆されたことで、塚崎弁護士は捜査のやり直しと公判の中止を申請した。
このため、陸軍省から橘宗一殺しの再調査が命令され、10月5日、鴨志田安五郎と本多重雄という2名の憲兵上等兵が橘殺しの共犯であるとして自首し、6日には平井利一憲兵伍長も見張り役として伊藤の死に関与していたことを告白して自首。被告人は5名となった。
鴨志田と本多は子供殺しを認めたが、甘粕と森が「上官の命令だからやりそこなうな」と話していたと証言して波紋を呼んだ。しかし憲兵隊の小泉少将と小山大佐がこの証言を否定した後、以後は軍上層部が関与した疑惑は追及すらされなかった。結局は森曹長が鴨志田に「おまえがやれ」と命令したとされ、鴨志田と本多が手を下すことになった。2人も子供殺しに躊躇したが、命令に逆らえずに、鴨志田が首を絞め、本多が押さえて殺した。森は「甘粕大尉が子供も殺せと命令した」と主張し、自分に命令したのは甘粕であるとした。甘粕は投げ槍な態度で「森が言うのですからその通りでしょう。私は軍人であります。命令しました」と自分が責任を被る旨の答弁をして、再度、供述を翻した。
甘粕と森は遺体の処分について話し合ったが、構外に運び出すと露見するとして森が難色を示し、本部裏の古井戸に投げ込むこととした。甘粕は3名の着物をハサミで切って裸として菰に包み、古井戸に落とした。衣類は翌17日に別の場所で焼却した。何も知らない人足に指示して、古井戸は馬糞や煉瓦を投げ込んで埋められた。
動機については、関東大震災の混乱に乗じて無政府主義者が朝鮮人を扇動して騒動を起こすという噂を信じていたとされた。甘粕は「大杉の次は堺利彦と福田狂二を殺す予定だった」と述べた。さらに、最も危険視された無政府主義者の大杉栄が検挙されていないから「やっつけろ」という意見が淀橋署にあったが、警察ではできないから憲兵の方でやってくれないかという話だったとも、甘粕と森は主張したが、淀橋署員らは「記憶にない」と殺害依頼を否定し、真相解明に至らなかった。 また新聞では橘宗一の殺害理由を伊藤野枝の殺害を目撃したがためであると報じられたが、公判ではこれは取り上げられず、前述のように甘粕が命令した事実のみが認定され、子供の死に関して理由や経緯などについても解明されなかった。
なお、法務官小川關次郎と被害者橘宗一は従甥の関係にあるとわかって、途中で交代した。
世論と判決
このスキャンダラスな事件については、軍法会議の内容が連日詳しく報道された。現代とは異なり、亀戸事件・朴烈事件など大震災直後に起こった社会主義者・労働活動家・朝鮮人に対する警察や軍隊による不法拘束や虐殺についてすら世論は2つに割れていたが、甘粕に対しては、弁護士の塚崎のもとには鴨志田や本多等の下士を罰するのみで「甘粕を減刑させたら承知せぬぞ」という社会主義者からの脅迫が届いていた一方で、「甘粕は国士である」との肯定的な評価から「国賊・大杉を処断した甘粕大尉に減刑を」との署名が数十万名分も集まるなど甘粕大尉を支持する声も強かった。また甘粕も命令を受けて行動したのみで真犯人を庇って責任を1人で被ったのであって、真相は闇の中であるという意見も根強くあった。
しかし軍法会議は事件の背後関係には立ち入らないまま、11月24日に検察求刑、最終弁論があって、12月8日、殺害を実行および命令したとして甘粕大尉を首謀者と断じて懲役10年、森曹長には同3年、命令により殺害して遺体を遺棄した本多・鴨志田の2名は命令に従ったのみとして無罪を、また見張りとして関与した平井伍長は証拠不十分により無罪と、判決を下して終了した。甘粕に懲役10年が告げられると、傍聴人の中からは有罪が不満であるとして草履を投げる者や怒号を上げる者があって一時騒然としたが、本人らは黙して退出。無罪となった3名は安堵の表情で退出した。
事件の余波
公判中の10月4日、甘粕大尉の弟で学生の甘粕五郎は、ギロチン社の田中勇之進に襲撃された。

労働運動社（神田北甲賀町）で行われた大杉ら3名の葬儀・告別式では、国賊の葬儀などさせぬという右翼の一団が車2台で乗りつけ、そのうちの1人下鳥繁造が焼香の際に遺骨を奪い、制止する古田大次郎や和田久太郎に高笑いして、大杉栄の遺影に銃弾を放って逃走するという事件があった。遺骨は下鳥から寺田稲次郎に、寺田から大化会会長岩田富美夫が受け取って車で逃走。下鳥らはその場でアナキスト30名ほどに囲まれるが私服警官に投降し、寺田は逃走中の岐阜駅で捕まった。逃走に成功した岩田は、数ヶ月後に北一輝（猶存社）の仲介で3名を起訴猶予とすることを条件として、自ら警視庁に出頭して湯淺総監に遺骨を返還した。岩田は逮捕を免れ、釈放された。
アナキストらは大杉殺害の報復として、関東戒厳司令官の福田雅太郎を標的とした狙撃事件（犯人は古田大次郎、和田久太郎、村木源次郎）、福田に糞尿を投げつけた糞喰らえ事件（犯人は古河力作の弟古河三樹松と義弟池田寅三）などを相次いで起こしたが、次々と逮捕された。
アナキストのうち特に朝鮮出身者は中華民国の上海や満州地方に渡ってテロリズムに傾倒するが、日本出身者では転向したり活動を抑圧される者が多く、日本のアナキスト運動は急速に衰退に向かった。
甘粕大尉は3年弱、千葉刑務所において刑に服したが、摂政宮の御成婚による恩赦による減刑で、1926年（大正15年）の10月に仮出所で釈放された。その後、陸軍の官費で夫婦でフランスに留学し、満州に渡って満州事変に関わることになった。
正力松太郎の談話
事件発生当時の1924年（大正13年）9月は警視庁官房主事で、年末の虎ノ門事件で警務部長を罷免となって読売新聞社長に転じた正力松太郎は、1924年10月の社内の招待会で談話して甘粕事件の陸軍の組織的犯行を示唆し、「陸軍が14日に大杉を殺すと言って来た。大杉と吉野作造博士と外の2人」・・・中略・・・「4人を殺すと言って来た、そんなバカなことがあるかと言って置くと、16日になって淀橋署から大杉が憲兵隊に連れられて行ったという報告が来た。殺したナと思ったが、黙ってゐた。」と語り、「子供が一緒でなければ大杉事件はまるで知られずに済んだのだ」と発言した。また軍隊が面目をつぶされた後藤内相と湯浅総監とを恨んでいたと言い、殺さんとする動きがあったとも述べた。
吉薗周蔵の手記
月刊ニューリーダー誌2003年8月号と11月号の落合莞爾連載『陸軍特務 吉薗周蔵の手記』の中で、甘粕事件についての言及があった。吉薗周蔵手記の内容は検証困難なもので今なっては異説の1つに過ぎないが、落合の説明によれば、吉薗や甘粕、あるいは藤田嗣治も、上原勇作元帥（前陸相）の特命を受けて行動する立場であったという。一方で、大杉栄は後藤新平に買われていた「草」で度々多額の金を無心していたといい、伊藤野枝は大杉の指示で、ユダヤ系フランス人のポンピドゥー牧師の拠点である神田メソジスト教会を探っていたとされる。
教會ニ モグリ込ムダルハ 野枝

大杉榮 伊藤野枝ハ 共産党デハアルガ 後藤新平ノ草デアッタ由。

同席ノ藤根サンモ認ムル｡

　タコロガ 大杉ハ サノ根ガサモシク サモシヒ故ニ 後藤ニ直接 會ヒニ行ッタラシヒ。何度カ ニ行ッタ模様。

サレハ 自分ニハ納得デキル。自分ノ見タル大杉モ マカトニ サモシヒ表情ヲ シテヲッタ。

デアルニ當然ノカトナガラ 大杉ハ 閣下ノ事モ 甘粕ノ事モ ユスッタデアラフ。

トナレバ 大杉ヲ アアマデ始末シタルハ閣下ノ命モアラフガ ナルホド 甘粕サンノ意向モアラフ。
 — 周蔵手記、ニューリーダー誌2003年8月号
落合は、吉薗の別の記述から、上原と後藤のアヘン栽培（当時合法）やモルヒネ国産化で利権争いをしていたと指摘。上原はポンピドゥー牧師の妹とかつて愛人関係にあり、一女をもうけた。その上原の隠し子である混血女性と甘粕は愛人（もしくは妻）関係にあったとされ、それらの事実を伝えたのが王希天であり、彼も関東大震災のどさくさに軍隊によって殺されたが、政治スキャンダルを起こす目的で密事を探られた私怨、もしくはそのことでゆすられたことが、大杉夫妻殺害の動機ではないかと、吉薗は考えていたとする。
その他
無罪判決を受けた本多重雄憲兵上等兵は、「昭和天皇桐生行幸誤導事件」の本多重平警部の実弟である。