深夜叢書
設立までの経緯
第二次世界大戦中のヴィシー政権下ではナチス・ドイツによって反独的な書物やユダヤ人による出版は禁止され、厳しい検閲が行われていた。また、あらゆる物資が不足し、紙やインクなども配給制であった。ドイツ軍は配給を制限することで、さらに言論・思想の自由を抑圧したのである。さらに、1940年9月28日には出版社労働組合と占領当局との間で検閲協定が締結された。この結果、ナチスの呼びかけに応じて対独協力路線を歩む作家もあり、たとえば、1909年2月にアンドレ・ジッド、ジャン・シュランベルジェ、ジャック・コポーら6人の作家によって創刊された『新フランス評論』は、党派性を排除し、外国文学を積極的に紹介したことで戦間期には国際的な影響力をもつ文学雑誌として知られていたが、ナチスによる言論統制を受けながらも刊行を続けるために、1940年から43年までファシズム政党であるフランス人民党のピエール・ドリュ＝ラ＝ロシェルが編集長を務め、主に対独協力作家の作品が掲載された（このため、戦後1953年まで休刊）。だが、対独協力・反ユダヤ主義に転向した、最も責任の重い新聞は、『オ・ピロリ(さらし台)』紙、『ジュ・スイ・パルトゥー (監視)』紙、『ラ・ジェルブ(花束)』誌であった。当時挿絵画家であったヴェルコールは、占領下において作家やジャーナリストが直面したジレンマを、「表立って公然と物が言えなかったため、公的な表現の企てはナチスへの奉仕に直結した。すべて彼らの都合のよいように解釈され、それに異議を唱えることはできなかったのだ。したがって、私たちに残された唯一の義務、唯一の信条は、ただ沈黙を守ることであった」と表現する。すなわち、ナチスの検閲を経て出版された作品は、この事実によって必然的に対独協力の性格を帯びてしまう以上、良心的な作家は「沈黙」を余儀なくされたのである。
一方、この間、レジスタンス運動の機関紙をはじめとして、地下出版物も多数刊行された。特定のレジスタンス・グループに参加するのではなく、文筆活動によってナチスの弾圧に抵抗し、言論・表現の自由を擁護する活動であり、こうしたレジスタンス文学運動を牽引したのが、共産党が結成したレジスタンス・グループ「国民戦線」の地下出版物の一つである文学誌『レットル・フランセーズ (フランス文学)』と深夜叢書である。
戦後の経営難
戦後、深夜叢書が合法化されると、ヴェルコールは1945年に正式に株式会社を設立した。だが、商業的には『海の沈黙』が成功を収めただけで、深刻な経営難に陥った。そこで、文芸顧問のジョルジュ・ランブリクスは、編集方針を変えることなく、新しい傾向の作家を紹介することにし、1947年に哲学者ジョルジュ・バタイユの『鼠の話』、『ディアヌス』、後にルネ・クレマン監督の映画として知られることになるフランソワ・ボワイエの原作『禁じられた遊び』、新しい戦争小説で知られるアンリ・カレの『アメリカ』、『30から40』、ランボーの影響を強く受けた（後のフェミナ賞受賞作家）アンドレ・ドーテルの『マザグラン高原』、『ダヴィッド』のほか、米国の小説家アーサー・ミラーの『みんな我が子』の仏語訳、ウェールズの小説家ディラン・トマスの『仔犬のような芸術家の肖像』を刊行。さらに48年にはピエール・クロソウスキーの『ロベルトは今夜』、アンリ・トマらの評論『84』、ドイツの哲学者カール・ヤスパースの『責罪論』などを出版したが、いずれも発行部数が限られていたため、経営難を脱することができず、ヴェルコールは社長を辞任。ジェローム・ランドンが編集長に就任し、発行責任者を兼任した。
その後3年間は、引き続きバタイユの『呪われた部分』、『C神父』、『エポニーヌ』（『エロティシズム』は後の1957年に同じく深夜叢書から刊行）のほか、モーリス・ブランショの『ロートレアモンとサド』、『永遠の繰言』、ジャン・カスーの『近代芸術の状況』、ジャン・フーラスティエの『機械化と幸福』、ジャン・ポーランの『どのような批判にもささやかな序文を』などを刊行し、51年にサン＝ジェルマン＝デ＝プレに移転した後、ジャック・イレレの『パリ街路歴史事典』、ポーランの『レジスタンス指導者への手紙』、サミュエル・ベケットの『モロイ』といった分野の異なる重要な書物を刊行した。
サミュエル・ベケット
1950年11月にサミュエル・ベケットの妻シュザンヌ（シュザンヌ・ドゥシュヴォー＝デュメニル）が、ベケットの『モロイ』、『マロウン死す』、『名づけえぬもの』の原稿を深夜叢書に持ち込んだ。アイルランド出身のベケットは1938年からフランスの定住し、フランス語で執筆していたが、これら3作はいずれも多くの出版社に断られていた。1951年に『モロイ』と『マロウン死す』が刊行されると、ジャン・ブランザは『フィガロ・リテレール』紙上で、ついに「戦後の主要作品が現れた」と称え、モーリス・ナドーは『コンバ (闘争)』紙上で「捉えがたい現実を見事に征服した」作品と評した。これら三部作のほか、1952年の不条理演劇の代表作『ゴドーを待ちながら』およびこれ以後のベケットの作品はすべて深夜叢書から刊行された。ベケットは1969年にノーベル文学賞を受けた。
時事問題
深夜叢書は主に文学、哲学、芸術に関する書物を刊行しているが、政治・社会問題については特にアルジェリア独立戦争におけるフランス軍の拷問に抗議する運動に参加し、1957年に民族解放戦線 (FLN) 地下組織の指導者ヤセフ・サーディの協力者として爆弾を運んだ容疑で逮捕されて拷問を受け、テロ行為で死刑判決を受けたジャミラ・ブーヒレッドを擁護する弁護士ジャック・ヴェルジェスと作家・調査報道記者ジョルジュ・アルノーの著書『ジャミラ・ブーヒレッドのために』、1958年に自ら体験した拷問の実態を綴ったアンリ・アレッグの『尋問』、および、25歳のアルジェリア共産党員・独立運動家で数学者のモーリス・オーダンがフランス軍に拷問され、失踪した事件について真相究明を求める「オーダン委員会」を結成した歴史学者ピエール・ヴィダル＝ナケの『オーダン事件』を刊行した。『尋問』は6万部以上の売上となり、政府に没収されたが、にもかかわらず、次いで、拷問を受けたアルジェリアの学生ら5人の証言をまとめた『壊疽』を刊行し、発禁処分を受けた。深夜叢書は以後約4年にわたって10冊以上の「ドキュメント」シリーズを刊行し、1960年には脱走兵ジャン＝ルイ・ユルストがモーリエンヌの筆名で書いた反植民地主義宣言『脱走兵』を刊行したために、ランドン編集長が有罪判決を受けた。ヴィダル＝ナケはこうした経緯をまとめた研究書『共和国における拷問 1954-1962』を執筆。1972年に深夜叢書から刊行された。
この他、パレスチナ問題に関するヴェルジェスの著書や、エリアス・サンバーらが創刊した中東問題に関する季刊『パレスチナ研究誌』(1982年から2008年まで計108号) を刊行した。
新傾向の文学・哲学
近年までの文学作品では、特に新しい傾向の作家を発掘し、モニック・ウィティッグの代表作『子供の領分』（メディシス賞受賞）、『女ゲリラたち』、『レスビアンの躰』、トニー・デュヴェールの『幻想の風景』（メディシス賞受賞）ほか全作品、ジャン・エシュノーズの『チェロキー』（メディシス賞受賞）、『ぼくは行くよ』（ゴンクール賞受賞）ほか全作品、ジャン＝フィリップ・トゥーサンの『逃げる』（メディシス賞受賞）ほか全作品、エルヴェ・ギベールの1989年までの作品、マリー・ンディアイの『ロジー・カルプ』（フェミナ賞受賞）ほか2004年までの作品、エルヴェ・ギベールの1989年までの作品などを刊行している。
深夜叢書のシリーズには言語研究に関する「プロポジシオン (提案)」、ディディエ・フランクが創刊した「フィロゾフィー (哲学)」があり、また、ジル・ドゥルーズのほとんどの作品が「クリティック」、「アルギュマン (議論)」、「パラドックス (逆説)」のシリーズとして刊行された。また、ピエール・ブルデューは「サンス・コマン (常識)」シリーズを創刊・主宰し、代表作をこのシリーズから発表している。これらのシリーズはダヴィッド・ラプジャードら若手研究者を紹介する場ともなっている。