九州産交バス
乗合バス営業所一覧
九州産交バスおよび産交バスの乗合バス営業所はバスの行き先案内などで○○産交と呼ばれることがある。たとえば、松橋営業所へ向かうバスは松橋産交行きと案内される。ただし、熊本営業所に向かうバスは西部車庫行き、天草営業所は産交車庫前と案内される。また一般の路線バス車両のリアガラスの左下には、「熊本」「八代」「木山」「松橋」といったステッカーが貼り付けてあり、所属営業所がひと目で分かるようになっているが、最近は各営業所も新規(中古車も含む)、転属ステッカーを貼り付けていない。
なお、本社・熊本営業部においては2007年10月1日開設時より熊本営業所とした1つの営業所としてすべての路線を運営していたが、2012年4月1日の組織改正において業務ごとに分割された。また、子会社の産交バスにおいても一部営業所においては地区ごとに営業部を設けている。
一般路線バス
同社直轄路線および子会社である産交バスの路線を合わせると、ほぼ県下全域にネットワークを持つ。路線バスを運営する分離子会社として、天草産交（天草・牛深）、熊北産交（荒尾・玉名、高森）、熊南産交（八代・水俣・人吉）、産交観光バス（菊池・阿蘇・小国・三角）の4社があったが、2005年4月1日付けで合併し、産交バスとして統合された。
路線バスの車両は、熊本都心部などでは大型車がほとんどで、それ以外の地域では中型車が比較的多い。また、乗客の極端に少ない路線や、山間部のローカル線では小型車を使用することがほとんどで、小型車は主にレインボー・リエッセ・ポンチョ・エルガミオの四種類が存在するが、最も保有台数の多いリエッセのBDG-RX6JFBA型を使うことが多い。最近では自家用マイクロタイプのローザ・リエッセⅡも導入している。また、近年一部地域において新規に開設した路線（これまで路線バス空白地域だった区間など）においては一般乗用車タイプのワンボックスカー（トヨタ・ハイエースコミューター〈12人乗り〉）が使用されている（何れも右の写真参照）。
路線の詳細については各営業所の記事を参照のこと。
都市間バス
熊本県内の主要都市間を結ぶ快速バスと、主に他県の主要都市へ向かう特急バスからなる。高速道路を経由する特急バスは、とくに高速特急と呼ばれる。また、本渡線においては2011年3月12日より超快速バスも運行開始した。
このほか過去においては急行バス（福岡、杖立、高森、三角、日奈久線等）、準急バス（杖立、高森、山鹿、本渡線等）も存在したが、現在は上記四種だけである。
下記の路線のほか、九州国際観光バスから引き継いだ九州横断バスも運行している。
特急バス・高速バス
高速バスにおいては、熊本桜町バスターミナルを発着する路線の他、同BTを経由しない八代（新八代駅）発着便と福岡発着便がある。
カッコ内は共同運行会社。
貸切バス
かつては子会社である九州産交観光によって運行されていたが、2015年10月1日の会社統合により現在は当社にて貸切バス事業も行っている。
過去に運行していた路線
この項では、運行撤退・廃止・休止・運行終了した路線について記す。高速・特急・快速・急行・準急バスほか空港線その他特殊路線のみ述べる（一般路線バスについては各営業所記事を参照）。
車両
日本国内の4メーカーの車種は全て導入しているが、いすゞ車と日野車の比率が高い。地域柄、西日本車体工業製の車体架装車も多い。このほか、観光・高速路線・空港リムジン用にヒュンダイ製バスといった輸入車も保有。かつては路線用にネオプラン製バスも保有していたが、2014年3月までに廃車となっている。
教習車
新人教育、または社員教育用車両である。
かつては営業車両の貸切及び快速車両の中扉増設車の経年車をワンマン機器の搭載は勿論、教育機材を追加設置した上で教育車両専用への塗装、白ナンバーへ変更となり、営業車両と区別を図っていた。
近年では一般低床車両が主で、現在は松橋営業所最終配属の三菱ふそう・エアロスターM(九州産交では一台のみの新規導入車(KC-MP617M)でLED改造取付車)と阪東自動車から教育車として導入した日野・ブルーリボンHU、そして、かつて新製導入時は天草営業所において快速「あまくさ号」で使われたのち熊本営業所において空港専用リムジンバスに転用された日野ブルーリボンシティ（初代セレガマスク）の3台が在籍している。日野ブルーリボンシティについては、前扉で観光仕様のままの転用は初である。過去には松橋営業所・砥用駐在所に最終配属していた旧空港専用リムジンバス(日野ブルーリボンHU)の中扉増設車もあったが、廃車となっている。
また、阪東自動車からの車両は水色と紺色の教習車専用色になったものの、残りの2台については一般路線用カラー・空港リムジン色のまま、白ナンバーに変更となった位で、方向幕に「教習車」と記載している以外は営業車との区別はあまりない。
3台とも熊本営業所(西部車庫)に配置している。
熊本地域振興ICカード
2015年4月1日より運用開始。イメージキャラクターにくまモンが採用され、通称・くまモンのIC CARDまたはくまモンカードとも呼ばれる。実質的に後述の回数券やTO熊カードの後継的なカードで、2016年3月31日まではTO熊カードと併用という形で両方のカードが使用できた。当カードは、従来TO熊カードを使用していた熊本都市圏を運行する当社グループ及び熊本県内他事業者（熊本電気鉄道・熊本バス・熊本都市バス）運行の一般路線バスをはじめ、熊本空港専用リムジンバスや、天草線「あまくさ号」・高森線「たかもり号」・福岡線「ひのくに号」・延岡線「たかちほ号」といった一部の都市間バスに加え、かつてはTO熊カードが使えなかった産交バス路線（熊本都市圏に乗り入れない地域を運行する路線）や、大分線「やまびこ号（産交便のみ）」・九州横断バスでも使用出来る。また、熊本市電においては諸般の事情により同年8月から使えるようになった。電子マネー機能も有しており、バス運賃のほか加盟店の店舗における支払いなどでも使える。チャージはバス車内の他、窓口や加盟店店舗・チャージ機により1,000円～30,000円までの間であればできるが、車内におけるチャージでは残高が20,000円を超えている場合では不可。
2016年3月23日からは熊本市電が導入している「でんでんnimoca」との相互利用が可能となり、さらにはJR九州と連携し同社が導入している「SUGOCA」ならびに「SUGOCA」と相互利用している全国10社交通系ICカード（「Suica」・「PASMO」など）との片利用が可能。各種カードの車内でのチャージも出来る。
定期券
定期券は、一般の通勤定期券・通学定期券のほか、熊本市内において昼間専用（9：30 - 17：00）のフリー定期券『ゆうing（自分専用）』・『Bフリーパス（無記名式の持参人式定期券）』や、熊本駅・新水前寺駅からの乗継ぎに便利な『駅からパス』も使用できる。また、熊本電鉄バス路線と乗継が可能な『他社間乗継ぎ定期券』も販売されている。これらは、2015年8月31日より前述の熊本地域振興ICカード（くまモンのIC CARD）に搭載されるようになり、『ICカード定期券』として販売されるようになった。このため、従来からの紙式定期券は販売が終了し、全てICカード定期券へと移行している。
これ以外にも、都市間バスの中では唯一福岡線に『ひのくに号定期券』がある（産交便・西鉄便共通）。
回数券
一般路線バスにおいては、回数券を古くから導入していた。かつては当社専用とされていたが、1990年頃からは共通回数券とし、熊本県内の他社（熊本市交通局・熊本電気鉄道・熊本バス）と共通使用できるようになった。熊本都市圏を運行する当社ならびに前出3社のバス事業者においては、1997年から1999年にかけて、共通回数券に代わるものとして熊本県内4事業者共通のTO熊カードが導入されて以降（後述）は九州産交バス各営業所での販売を徐々に中止し、完全導入後において廃止された。共通回数券廃止後においては、TO熊カードが使えない地域（熊本都市圏に乗り入れない路線）を運行する産交バス車内ならびに県内各営業所（熊本営業所を除く）において当社専用回数券として販売されていた。券種としては、1000円券（100円×11枚、120円×8枚＋40円…　他）・2000円券（200円×11枚）・3000円券（300円×11枚）・10円単位を集めたミックス券、このほか学生を対象とした通学回数券などがあった。
だが、これらの回数券は前述の熊本地域振興ICカード（くまモンのIC CARD）の導入ならびに全国交通系ICカードとの片利用開始に伴い、2015年8月31日に販売を終了し、2016年3月31日をもって廃止となった。（ただし、各コミュニティバス専用の回数券は除く）。
なお、都市間バスにおいては各路線ごとにスーパー回数券（4枚綴り）として現在も販売されている。
TO熊カード
前述のとおり、熊本都市圏を運行する路線においては1997年から1999年にかけて上記の共通回数券に代わるものとして、磁気式のバスカード（TO熊カード）が導入され、九州産交バスの全営業所ならびに産交バスの一部営業所のカードリーダーが設置された車両において使用できた。一般路線バス以外にも熊本空港専用リムジンバスや天草線「あまくさ号」・高森線「たかもり号」でも使用できたほか、福岡線「ひのくに号」・延岡線「たかちほ号」といった一部都市間バスでも使用可能だった（いずれも産交便のみ。また、予約制の都市間バスや定期観光バスなどでは使用できなかった）。
前述の熊本地域振興ICカード導入により、回数券と同様に、2015年8月31日に販売が終了し、2016年3月31日をもって廃止された。
運賃表示器
運賃表示器は1989年頃において熊本都市圏を運行する路線車ならびに高速車などはそれまでの幕式からデジタル方式に変更され、1995年までには残る子会社の車両など全車においてデジタル方式に切り替えられた。メーカーは小田原機器製である。なお、デジタル運賃表示器の導入当初は次の運賃区界停留所名（次に運賃が切り替わる停留所名）を表示していたが、1992年からは次停留所名（車内案内と同時に次の停車停留所名に自動で切り替わる）が表示される方式に変更されている。また、2009年以降に導入（移籍車を含む）された高速車や空港リムジンバスなどにおいては液晶2画面式の運賃表示機が導入されている（こちらは指月電機製が使用されている）。
バス以外の事業
以前は本体1社直営体制であったためロープウェイ事業もおこなっていたが、2006年4月1日の持株会社に移行ならびに分社化により、九州産業交通ホールディングス傘下の「九州産交ツーリズム株式会社」によって阿蘇山上の阿蘇山西駅－火口西駅間で、阿蘇山ロープウェーを運営していた。しかし、2016年に発生した熊本地震の影響や、その後の相次ぐ中岳第1火口の大規模噴火により駅舎やゴンドラなどに損傷を及ぼし、当面の運行再開が困難な状況にある事から、2018年秋以降に駅舎・索道共に解体された。その後、2020年度の営業再開を目指して2019年6月以降より支柱・索道の架け替え工事に着手する予定。現在は九州産交ツーリズムによってロープウェイ代行バス「阿蘇山ループシャトル」が運行されている（バスの運行は産交バス阿蘇営業所に委託）。
過去には、阿蘇山東駅－火口東駅間の仙酔峡ロープウェイ及び本渡市（現：天草市）において天草海上ロープウェイも運営していた。天草海上ロープウェイは系列の天草海洋レジャーランド（現在は系列を離れ天草アレグリアガーデンズ）内のホテル・水族館側と対岸の展望台・自然動物公園側との間を結ぶ本渡海水浴場上空を跨ぐ形で設置されていた。