志帥会
結成
1998年11月30日、政策科学研究所（中曽根派→渡辺派→旧渡辺派）の後継をめぐり、山崎拓グループが近未来政治研究会（山崎派）を結成して旧渡辺派から分離独立した。派閥のオーナーであった中曽根康弘らは、派内の路線対立により清和会（三塚派）から離脱していた亀井静香グループと合流し、1999年3月18日に志帥会を結成した。
旧渡辺派から山崎派が分離独立する際、旧渡辺派所属の参議院議員については、当時参院幹事長で「参議院の法王」とも呼ばれた村上正邦がまとめあげていたため、山崎派への賛同者は少なかったが、衆議院議員は中堅・若手の大半が山崎派に移行したため、旧渡辺派側は長老・ベテラン議員が多く残り、一方の亀井グループ側は、所属衆議院議員の半数以上を経験不足の当選3回以下の若手が占めていた。このため、共に影響力を削がれた少数派閥として両派は思惑が一致し、分離独立した派閥同士の「対等合併」により志帥会は一気に衆参あわせて60人規模の大派閥となった。
1999年3月18日、初代会長に村上が、会長代行に亀井がそれぞれ就任。
江藤会長時代
1999年7月、村上が自民党の参議院議員会長に選出されたことを受けて派閥を離れることになり、亀井が後任会長の候補に挙がるが、旧渡辺派から入ってきた山中貞則、中山正暉のような頑固者の重鎮が多く、とてもじゃないが手に負えないそんなベテラン達を束ねる力がないと思った亀井は人柄のよさで知られる江藤隆美に会長を打診し「俺は金がない、だから引き受けられない」と断られるが、亀井が金を全部出すことで江藤が引き受けることになり第二代会長に就任（亀井は会長代行のまま、実務担当）。2000年6月25日に行われた第42回衆議院議員総選挙では櫻内義雄、原健三郎が引退し、前通産相の与謝野馨、政調会長代理の桜井新ら中軸メンバー、大物議員（中尾栄一、木部佳昭、佐藤孝行、松永光、島村宜伸など）の落選が相次ぎ、11人の大幅減となり、政調会長の亀井は「人数より中身が痛い」と漏らした。選挙後の発足した第2次森内閣では亀井が政調会長留任し、谷洋一が農林水産大臣、平沼赳夫が通商産業大臣に就任した。2001年自由民主党総裁選挙には亀井が立候補したが小泉純一郎に敗れた。
派閥結成当初より、党内でも守旧派であったが、村上・小山孝雄がKSD事件で受託収賄容疑で逮捕され、参議院議員辞職したため、柳川覚治が繰り上げ当選2001年の小泉政権誕生以降は、江藤と亀井は、改革派の小泉の言ういわゆる「抵抗勢力」の代表格として、小泉改革を批判する急先鋒となった。
亀井会長時代
江藤の政界引退表明を受け、2003年10月10日に亀井が3代目会長に就任したが、亀井が会長に就任してから間もなく、同年の第43回衆議院議員総選挙における公認問題をめぐり、同派の最高顧問だった中曽根が小泉純一郎総裁により総選挙不出馬、引退に追い込まれた。
長年の持論であった郵政民営化を強力に推進する小泉に対し、亀井や参院亀井派会長の中曽根弘文らは強硬に反対。しかし、亀井の姿勢は小泉改革に賛同する水野賢一らの離反を引き起こした。亀井が「反小泉」の旗幟を鮮明にするにつれ、亀井派を離脱する議員もいたが、亀井は退会の意思を示した議員を引き止めず、「（亀井のトレードマークである）亀のバッジをつけていると、選挙に不利だから、亀のバッジをはずしてやってくれ」と逆に自派の議員たちを思いやったという。亀井のほか、元衆議院議長の綿貫民輔、前総務会長の堀内光雄、元郵政大臣の野田聖子ら、亀井派以外の派閥からも衆院での郵政民営化法案の採決では造反者が相次いだが、5票差で可決される。しかし、参議院では中曽根弘文らの造反により、法案は否決された。これを受け、小泉はただちに衆議院を解散する。解散後、亀井は志帥会会長を辞任し、自民党を離党。綿貫や元国土庁長官の亀井久興らと共に国民新党を結党した。
この後、一時的に元経済産業大臣の平沼赳夫が後任の会長に就任したが、衆議院での採決で反対票を投じた平沼も自民党から公認されず、無所属での出馬を余儀なくされたため、会長を辞任。これにより、伊吹文明が後任の会長に選出されるまで、志帥会会長のポストは空席となった。なお亀井派所属の農林水産大臣・島村宜伸が、閣議で衆議院解散に反対し辞表を提出したが、小泉に罷免された。
伊吹会長時代
2005年9月15日、郵政民営化法案に賛成した会長代行の伊吹が派閥の次期代表に内定したが、派内に反発の声があり、正式就任は見送られた。同年12月14日に反対していた島村を名誉会長に棚上げすることで、伊吹の正式な会長就任の運びとなった。亀井・平沼らが自民党を離党した後、伊吹らは「亀井派」のイメージを払拭するため、平沼が命名した「志帥会」の名称を変更する事も検討していたが、派内の反発もあり断念した。
2007年3月15日、名誉会長だった島村が派閥を退会。これは、亀井の離脱以来、派内における主導権争いにおいて島村が伊吹と対立していたことや、島村が郵政解散に反対していた経緯から、「刺客」として選挙を戦った同派の西川京子や鍵田忠兵衛との間に確執が生じていたことなどが原因と見られている。
同年9月の自民党総裁選において、伊吹派は古賀派や町村派と連携して麻生派を除く八派閥で福田康夫支持を固め、「麻生包囲網」を敷いた。しかし、伊吹派からは麻生太郎の総裁候補推薦人を5人も出したため、伊吹派は福田支持で固まっていない派閥と見られた。なお伊吹派の所属議員で麻生支持を明確にした議員は28人中20人であった。9月24日、伊吹が新総裁・福田の下で幹事長に就任。志帥会からの幹事長輩出は派閥創設以来初で、中曽根派・渡辺派・旧渡辺派時代を含めても3人目である。幹事長就任に伴い、伊吹が形式的に派閥を離脱したため、中川昭一が会長代行に就任した。
伊吹は福田康夫改造内閣では財務大臣に就任したが、わずか1ヶ月余で福田は首相を辞任。5人が立候補した2008年の自民党総裁選では、伊吹派は幹事長・麻生太郎の支持を派閥単位で決定。麻生の盟友であった中川昭一がいち早く麻生支持を表明し、同年9月4日の伊吹派役員会でその旨が確認された。麻生内閣の発足に伴い、伊吹に代わり中川昭一が財務大臣に就任した（後に辞任）。
2009年の第45回衆議院議員総選挙では次期会長候補の筆頭だった中川昭一ら派閥メンバーの落選が相次ぎ、派閥領袖が苦戦する中、会長である伊吹も京都1区で敗れ、比例近畿ブロックで復活当選することとなった。選挙後、北海道7区で初当選した伊東良孝が加入した。
総選挙での惨敗を受け、派閥の勢力は大幅に縮小され、さらに中川が同年10月に急逝。こうした状勢の変化を受け、2009年の総選挙での当選者が会長の二階俊博1人だった保守新党の流れを組む二階派との合併が模索された結果、11月5日を以て二階派の二階俊博、泉信也、鶴保庸介の3人が伊吹派へ合流した。
2010年の第22回参議院議員通常選挙に泉信也が出馬せず、政界を引退。新たに2009年の総選挙で落選し、参議院に鞍替えして出馬した片山さつきが当選後、加入した。
2010年1月、古屋圭司が議員グループのぞみへの参加を表明して休会し、事実上伊吹派を離脱した。同年8月には中曽根弘文が自民党参議院議員会長選挙への出馬を表明。「脱派閥」を掲げての出馬であるため、中曽根は伊吹派を離脱した。
2011年5月12日、無所属の中村喜四郎が入会。自民党には入党せず、「客員会員」の形式で伊吹派にのみ入会した。
二階会長時代
2012年12月26日に会長の伊吹文明が衆議院議長に選出され、慣例により同派を離脱したことに伴い、翌12月27日に二階俊博が後任会長となり、二階派に移行。事務総長の河村建夫も党四役ポストに格上げされた選挙対策委員長就任に伴い、同派を離脱。後任の事務総長は西川公也となった。
衆議院議員の山口壮が2013年12月に民主党を離党し無所属のまま「客員会員」として入会した。二階の引き抜き工作があったとされている。
2014年9月の党役員人事で会長の二階が総務会長（2016年8月からは幹事長）に就任したため、慣例として派閥を退会。会長職は空席とし、選対委員長を退任した河村が会長代行に就任した。なお、対外的な呼称（通称）は引き続き二階派のままである。同年12月に伊吹が衆議院議長を退任し復帰。2015年1月、二階の強い意向により山口壮の自民党入党が認められた。同年4月に石原派との合流論が浮上する。二階が自民党総裁任期を「連続2期6年」から「連続3期9年」に延長する党則改正を主導した。2017年4月、二階の強い意向により小泉龍司と長崎幸太郎の自民党復党が認められた。第3次安倍第2次改造内閣で復興大臣の今村雅弘は2017年4月25日、所属する二階派のパーティーで講演した際、東日本大震災の被害に関し「まだ東北で、あっちの方だったから良かった。」と発言したことが引き金となり、翌26日付で大臣を辞任した。
2018年10月では第4次安倍改造内閣では吉川貴盛、片山さつき、桜田義孝が入閣したが桜田は2019年4月10日、都内で行われた高橋比奈子のパーティーの席上で「復興以上に大事なのが議員」と発言した問題の責任をとり国務大臣を辞任。
2019年1月、元環境大臣の細野豪志が無所属のまま「客員会員」として入会した。