村井秀夫刺殺事件
犯行
1995年4月23日午後8時35分、教団東京総本部ビル前において、山梨県西八代郡上九一色村（現・南都留郡富士河口湖町）のサティアン群から戻ってきた村井が、犯人によって刃物で左腕と右脇腹を続けざまに刺された。村井ら教団幹部は、東京総本部に出入りする際は地下通用口を使用していたが、事件当夜はなぜか施錠されており、村井が外階段を引き返し1階出入口に向かおうとした際に襲われた（後述の通り教団の事件関与を疑う見方もあったが裁判では認定されていない）。この様子は、TVニュースで繰り返し放映され、日本中に衝撃を与えた。刺された後、直ちに村井は東京都立広尾病院に救急車で搬送されたが、右脇腹に受けた深さ13cmの刺し傷が致命傷となり、出血性ショックによる急性循環不全の為、翌4月24日午前2時33分に亡くなった。実行犯は事件後直ちに逮捕された。
犯人と裁判
実行犯の徐裕行は、三重県伊勢市所在の右翼団体「神洲士衛館」の構成員を名乗ったが、「神洲士衛館」は政治活動をほとんど行っていない休眠団体であり、実際は三重県伊勢市所在の山口組系暴力団羽根組の構成員だった。徐は過去に催事企画会社を経営していたが、倒産により2300万円の借金を抱えていたことが捜査でわかった。その供述により、暴力団若頭K・Kも共犯として5月11日に逮捕された。羽根組はその後解散した。
徐は犯行動機について「義憤にかられて殺した」と供述したが、取り調べの後に「若頭の指示により犯行に及んだ」と証言を変え、「人を刺すという行為が怖かった」「しくじって残念という気持ちと、やらなくて良かったという安堵感で複雑だった。体は震えていた」、若頭から「ある人がお前に期待している」と言われた、と供述。
一方、若頭は「指示」そのものを否定した。警察の捜査でも、暴力団若頭とオウム真理教の接点が見当たらなかった。また、公判において若頭からの犯行指示日に関する実行犯の供述が不自然であると認定された。裁判の結果、東京地方裁判所は徐裕行に懲役12年、暴力団若頭K・Kに無罪判決が下り、確定した。この事件で安廣文夫裁判長は「犯行の背後関係はいまだ解明し尽くしておらず、不透明な点が残されていると言わざるを得ない」と発言した。
若頭はその後2000年11月14日に建設資材会社に対する恐喝容疑で宮崎県警に逮捕された。実行犯の徐は旭川刑務所に服役し、2007年に出所した。
徐裕行は「上祐史浩、青山吉伸、村井秀夫の教団幹部3人なら誰でもよかった」と供述したが、犯行当日のテレビ報道では実行犯が東京総本山ビル周辺でうろついている姿が度々映像に映っているものの、教団幹部である上祐や青山が出入りしても一切動いておらず、最初から村井をターゲットにしていたことが明白と指摘された。このことについて、徐は「週刊金曜日」2011年9月16日号で「3人がどこから来てどのスピードで入口に入るか分からず、実行の際にナイフを取り出すのが間に合うかを考えた。上祐、青山の時は距離等の関係で出来なかったが、村井の場合はかなり遠くから歩いてきたので体勢とかポジションの準備をする余裕はあった」旨の回答をしている。
また、週刊朝日2012年7月5日特別号のインタビューに応えた際には、「この事件はもう判決が出て終わっている。今もお話しできないこともある。だが、なぜ、僕が事件を起こしたか。それは、最終的には『個人の憤り』です。あの当時、社会全体がオウムに対し憤りがあったし、僕も『とんでもない連中だ』と強い義憤を感じていた」とし、裁判当時の供述とは正反対の主張を展開。また森達也から背後関係について質問された際、実行犯は「組織的なことはない」と主張した。週刊新潮の取材では若頭との関係については一切語らなかった。
社会復帰後は「徐裕行のブログ」を開設し、ヨットレースや海外旅行など私生活の様子を公開。閲覧者からヨット購入について「刺殺で報酬を得た」と指摘されたが、「あなたも、やりたいことがあったら、そんな妄想言ってないで、人の何倍も働きなさい（笑）」と回答している。
事件から20年後の2015年4月以降はブログの更新が途絶えている。
教団の供養
司法解剖後、村井の遺体は紺と白の格子しまのある浴衣が着せられ、渋谷区の代々幡斎場へ移送された。遺体はオウム信者が製作した棺に納められた。棺は木くずだらけでラッカーが塗られておらず、窓のレリーフが粗末で、釘を打つ場所がずれている状態だった。火葬後、遺骨は両親とともに、東海道新幹線で大阪府吹田市の実家へ帰郷した。
教団では、村井が死亡した4月24日以降の10日間、事件現場となった東京総本部前で弔いの踊り「鎮魂の舞い」を披露し、村井を追悼した。1踊りの期間を10日間とした理由は、「死者は遅くとも死後49日以内に輪廻転生するが、これが早ければ早いほど高い世界に転生し、遅いほど低い世界（人間界は45日目、地獄界は49日目）に転生する。」という教団の教義に基づくもので、村井は幹部としての「功績」が高いので、10日以内に転生するとされたためである。
事件から一週間が経った4月30日には、熊本県の市民団体「人権尊重を求める市民の会」の会員10人が、村井の追悼集会と称して事件現場に集まり「あの時、マスコミ、警察はなぜ村井氏を助けなかったか」と拡声器で訴えながら、鐘と太鼓を打ち鳴らした。
また、『巨聖逝く 悲劇の天才科学者 村井秀夫』『巨聖逝く マンジュシュリー・ミトラ正大師物語（漫画版）』を発刊し、村井の「功績」を称えた。その中で、オウム真理教教祖の麻原彰晃が、瞑想中に村井の魂と会話を交えた、と声明文を出している。
村井の刺殺場所となった教団東京総本部ビルは、当事件発生から20年後の2015年4月に解体された。
陰謀説
事件直後、警視庁はオウム真理教の捜査に重大な支障となりかねないことから、村井の死を首相官邸に報告している。オウム真理教の事件は1994年6月の松本サリン事件、坂本弁護士一家殺害事件、そして地下鉄サリン事件と世間を震撼させており、首相官邸への報告は当然の義務であった。当時国家公安委員長だった野中広務は「捜査中である、オウム真理教内での科学部門担当トップといわれる村井氏が刺殺されたことは残念だ。どんな理由があれ、殺すことは許されない。（徐裕行は）右翼と名乗っているが、背景などを徹底的に捜査したい」と延べ、背後関係などの解明に全力を挙げる考えを示していた。結果、組織的犯行は認められなかったが、裁判長やメディア、捜査関係者等現在も背後関係を指摘する説が残っている。
事件発生当時
事件発生当時は3月20日に地下鉄サリン事件の発生をきっかけに2日後の3月22日に教団施設への強制捜査によってオウム真理教への疑惑が深まった。そして、岐部哲也（4月6日逮捕）、越川真一（4月6日逮捕）、 林郁夫（4月8日逮捕）、石川公一（4月8日逮捕）、新実智光（4月12日逮捕）、早川紀代秀（4月20日逮捕）などの教団大物幹部が次々と逮捕され、村井自身にも疑惑の目が向けられる中で、連日大勢の報道関係者や警察から24時間体制で監視されていた。しかし現場は建物の周囲にロープを張る対策はされておらず、連日見物人が詰めかけている状況だった。4月19日には二人組の男が怒鳴り込む騒ぎがあり、4月20日には泥酔したサラリーマンが教団東京総本部前で腹いせに立ち小便をし、警察に連行される騒ぎが発生していた。
事件当日も教団東京総本部前で村井を報道陣が取り囲んでいた最中にTVカメラの前で刺殺された（村井が襲撃を受けた東京総本部ビル前では当時、赤坂署員6人が警護にあたっていた）。
現場の状況
FOCUS編集部専属カメラマンだった鷲尾倫夫は、取材のため現場で待機していたところ、村井を待ち伏せしていた徐の姿に気付き、マークしていたという。この時徐は目が定まっていない様子だった。村井が現れると鷲尾はビルの前にあった花壇に上り撮影を始めた。その直後に徐が村井を狙いはじめたため、ファインダーをのぞくのを止めて二人の位置を直接目で確認しながら、徐と刺される直前の村井の姿を写真に収めた。写真は第2回編集者が選ぶ雑誌ジャーナリズム賞に選ばれたが、鷲尾は人が死ぬ瞬間を撮影したことに嫌悪感を抱き、授賞式を欠席したという。また、宮嶋茂樹は現場を取材していたが帰宅したため撮影できず、鷲尾を羨ましく感じたという。しかし、同業者からの反響はあったものの渾身のスクープは売れずFOCUS編集部の山本伊吾は違和感を抱いたという。
ジャーナリストの山路徹は、オウムの諜報省を名乗る人物から取材に誘われた。刺殺事件当日に取材していた上九一色村で4時間、その後青山総本部の地下休憩所で1時間待機させられた。待機中、背後の扉を開けるような音が聞こえ（扉の向こうには村井がいたという）、その直後に事件が発生した。村井は総本部へは通常地下から出入りしており、事件当時も地下から総本部へ入ろうとしていたが、この時は扉が施錠されていたため地上へ戻り、その後刺されたという。事件発生後、山路はオウム側の要請で村井が搬送された病院へ入り、取材をおこなった。
この時待合室にいた信者が山路を案内していた信者に「尊師の予言通りになったな」と発言し、案内人が口止めするのを見たという。
東京スポーツ新聞社のカメラマン紙谷光人は村井のそばでカメラ撮影をしていたため返り血を浴び、村井の血痕が靴に残った。
この他にも、日刊スポーツの大西健一、松田秀彦、テレビ朝日の長谷川まさ子、贄田英雄が刺殺を目撃している。
刺殺映像
1995年4月23日に放送された「ザ・スーパーサンデー“久米宏が迫るオウム真理教の虚と実！”」では放送中に村井刺殺事件が発生し、事件から約10分後にVTRで現場の様子を放送。視聴率は38.9%を記録した。テレビのニュース番組やワイドショー等が生々しい刺殺シーンを無修正で繰り返し放送したため、事件報道のあり方に議論を巻き起こし、4月27日以降、この映像を放映しなくなった。
海外の報道
米紙ニューヨーク・タイムズ（早版）は殺害された村井の写真を大きく取り上げ「地下鉄サリン事件以来、広まっている一般の不安をさらに増幅した」と報道。英紙デイリーテレグラフは「ガス攻撃の復讐のためにオウムのリーダーが殺された」と報道。一方徐については「なぜ在日韓国人が右翼なのか」と疑問を投げかけた。
類似事件
事件後も教団施設へ襲撃犯が現れ警察に逮捕、連行される事件が起きている。
事件が起きた南青山総本部では警備が強化され、通行人の男女が取り押さえられた他4月27日にはナイフを所持していた男が銃刀法違反で逮捕される事件が起きている。
同日オウム京都支部では日本刀を持った男が現れ住居侵入と銃刀法違反で逮捕されたが、右翼関係者ではなかった。
不祥事
1995年7月16日に放送された報道特捜プロジェクトは羽根組の元幹部を自称する暴力団関係者を出演させ、事件の真相に迫る特番を流したが、生放送中に羽根組長から「あれはうちの組員ではない」と抗議が入るハプニングがあった。番組では「私は事件の全てを知っている。身の危険を感じているが、組を解散に追い込んだK・K（羽根組若頭）が憎い」と証言していたが、クレーム直後に司会者から「あなたは羽根組の組員ではないんですか」と問われ、「表面的にはです」と実質的には組幹部だったことを強調した。
日本テレビはこの暴力団員に出演料として50万円を支払った上、家族旅行の費用40万円を負担したため問題となった。
どこからか村井の遺体の写真が週刊誌に流出し、物議を醸した。