ティーンエイジ・ミュータント・ニンジャ・タートルズ (2003年のアニメ)
全体
漫画『ティーンエイジ・ミュータント・ニンジャ・タートルズ』の二度目のアニメ化作品となる本作の制作には、漫画の原作者であるミラージュ・スタジオが関わっているため、デザインや設定は比較的原作に忠実であり、1987年版シリーズよりも暗めの作風となっている。その一方で、武器や鉢巻を装備しなくても見分けがつくよう、タートルズの各メンバーのデザインや体色には差異を持たせている。
実質的な制作は韓国の同友アニメーションが担当している。オープニングテーマは、シーズン1 - 3、シーズン4前半、シーズン4後半 - 5とで若干歌詞が変わっている。
日本では、2007年4月2日から2008年3月31日までテレビ東京およびその系列局で放送。『アニメ530』枠の後半にあたる月曜 18:00 - 18:30 （日本標準時）に放送されていた。
日本語版では、前作同様独自演出によるギャグやアドリブが多い。またネット局によっては、作品本編の終了後にレオナルドが「ガレッジセールのお2人、この後はよろしく！」と言った後、直後の時間帯に放送されていた『ガレッジ×ビレッジ』の司会・ゴリ（ガレッジセール）が「はいはーい、任せとけ！」と受け答えるクロストーク風の演出（クロスプログラム）があった。テレビ東京版ではポケモンショックの問題で、残像処理などのさまざまな修正が施された。
日本語版を収録したDVDは2010年に発売される予定であったが急遽中止となり、その後も発売が実現していない。
シーズン4
シーズン4では、フット団の首領の座に就いたカライとタートルズとの戦いを描いている。
第97話（通算）"Insane in the Membrane" は、ストックマンが自身の頭脳を新たな身体へ移したことによって錯乱する様子を描いており、アメリカ合衆国では内容が問題視されたことによって放送が見送られ、2015年8月2日にニックトゥーンズで行われたタートルズ一挙放送の中で初めて放送された。
なおこの回は、イギリスにおいては2006年10月14日に放送された。
シーズン5 (Ninja Tribunal)
"Ninja Tribunal"という副題がつけられたこのシーズンは、オロク・サキこと天狗シュレッダーとタートルズの対決を描いたものであり、当初シーズン5として放送される予定であった。だが、視聴率を回復させたい製作会社の意向により、"FAST FORWARD" が代わりに放送され、"Ninja Tribunal" はDVDのみの発売となった。
2006年8月、製作会社の一つである4キッズエンタテインメントは、"Ninja Tribunal" をコムキャストの Comcast-On-Demand で配信する契約を結んだ。配信時、"FAST FORWARD" が第6シーズンとして扱われたことにより、多くの視聴者が混乱する事態を招いた。その後、"Ninja Tribunal" の5話分が配信された後、Comcast-On-Demand での配信は取りやめられた。
"Ninja Tribunal" は、2007年初頭にDVD化される予定であったが中止となった。その後、4キッズは2008年2月16日に "Ninja Tribunal" を未公開エピソードとして宣伝し、最終的にDVDを2008年5月20日に発売した。
シーズン6 (FAST FORWARD)
"FAST FORWARD"と名付けられたこのシーズンは2006年から放送された。99年後の世界にタイムスリップしたタートルズとスプリンターが、エイプリルとケイシー・ジョーンズの曾孫とともに戦うという内容である。
ミラージュ・スタジオと4キッズの方針変更により、シーズン1から5よりもカートゥーン調の強い絵柄になり、色彩も明るく華やかになっている。また、これまでのシリーズでは無かったタートルズ4人の体格差が表現されている。
シーズン7 (BACK TO THE SEWER)
2008年秋からアメリカ本国で放送されたシーズン7は、電脳空間で生み出されたサイバーシュレッダーとタートルズの戦いを描いている。
内容はそれまでのシーズンからの続きとはなっているものの、タイトルロゴはそれまでのものとは別にデザインされている。また、キャラクターデザインははFFよりもさらにカートゥーン色を強め、タートルズは全員鉢巻をした状態でも黒目が見えるようになっており、瞳の色はそれぞれの体色に準拠しているほか、FFで表現されていた体格差がより顕著になっている。
ミニシリーズ "Mayhem from Mutant Island"
"Mayhem from Mutant Island" は、2009年3月7日から The CW4Kidsにて放送された全13話のミニシリーズであり、1話につき1話につき90秒から2分である。
シーズン7の再放送では、このミニシリーズをひとまとめにした内容が "Mayhem from Mutant Island" という題名で、最終回として放送された。
未放送エピソード
2007年秋の放送に向けて制作されていた10話分は、製作途中で中止命令が出されたため、放送されることはなかった。このうち、"Master Fighter 2105" は、2009年5月11日に4キッズのウェブサイトにてアニマティックやストーリーボードなどが公開された。
またこれとは別に、第110話（通算）に相当する "Nightmares Recycled" はハンとゴミクズマンが非合法手術によって分離された結合双生児であることが明かされる内容であることから、4キッズエンタテインメントが「子供向けアニメにしては暴力的であるうえに、物議をかもしかねない」と判断し、初期段階で製作中止命令を出した。
評価
本作は好意的に受け入れられており、インターネット・ムービー・データベース (IMDb) では10点満点中7.7点、TV.com では10点満点中8.8点である。主な評価点としては、ストーリーの展開やアニメーション、そしてすべての世代に対するアピールなどがある。
本作はミラージュ版を思わせるような暗く気骨のある作風で人気を博した。
アメリカ合衆国での放送を担当した4キッズエンタテインメントは、日本のアニメの修正で賛否両論を巻き起こしていることで知られており、本作についてもレイティングがPGを超えないようにしていたため、"Fast Forward" と "Back to the Sewer" で明るい作風にしたことについては批判が巻き起こった。
本作に登場したキャラクターのうち、幾人かはミラージュ版にも逆輸入されている。例えば、シュレッダーの側近であるハンは、ミラージュ版 Tales of the Teenage Mutant Ninja Turtles Vol.2 #56に登場したほか、IDW版や2012年版シリーズにも登場しており、エージェント・ビショップも同様である。さらに、エンジェルや Ch'rell、Fast Forward に登場したダライアスおよびストリート・ファントムはIDW版に登場しており、トリケラトン共和国の司令官である Mozar は2012年版シリーズ第4シーズンの主要な敵役として登場した。
テレビ映画『Turtles Forever』
本作のキャラクターが1987年版とのキャラクター演するスピンオフテレビ映画。キャラクターデザイン・世界観はそれぞれの作品のものを準拠としている。メインとなるのは先述の2作品だが、ワンシーンのみさまざまな世界のタートルズ（作品）が映り、日本のOVAのタートルズもその中に混じっている。また、終盤では原作の世界のタートルズも登場する。
ストーリーは、本作のユートロム・シュレッダーがクランゲたちによって復活してしまい、テクノドロームを乗っ取りタートルズ抹殺に乗り出すというものである。
アニメ映画『TMNT』
2007年3月25日に公開された3DCGアニメーション映画。日本では劇場公開されず、2008年2月8日にDVD、Blu-ray Disc、HD DVDが発売された。
この作品は、本作でシュレッダーが倒された後の話となっている。日本語吹き替えはテレビ東京版での声優陣が担当しているが、独自演出によるアドリブやギャグが抑えられている。
2007年3月13日、ユービーアイソフトからこのアニメ映画を基にしたコンピュータゲーム『TMNT: Teenage Mutant Ninja Turtles』が発売された。