台湾明郑时期

台湾明郑时期是指1661年至1683年间由明郑政权统治台湾的历史时期。其统治期间一直奉南明为正朔，前后历经郑成功、郑经及郑克塽三世统治共二十一年
明郑统治台湾的时间虽然不长，但却是台湾历史上首个汉族政权，同时亦为一以闽南民系为主体的事实上独立政权，对台湾政治认同发展有重要意涵，其影响极为深远持续至今。明郑以台湾为反清复明据点，号召大批仁人志士随其渡台并形成一大明朝遗民群体。他们于明郑与满清斗争中既坚持汉族「华夷之辨」的儒家正统观，同时又产生割据台湾对抗满清的本土意识。该现象的本质是明朝遗民对抗满族统治的民族精神，渡台后转化成热爱台湾这块不受满清统治土地的本土意识。此一民族精神与本土意识的并存与互动，构成了台湾汉族民众反抗满清统治的两个思想层面。
名称.
明郑时期又被称为郑氏治台时期、郑氏时代（时期）、南明郑氏治台时期、南明郑氏治理时期、明郑王朝、郑氏王朝、东宁王朝、国姓爷王朝（Koxinga dynasty）等。
明郑，清代官书称之为「伪郑」、「逆郑」、「海逆」，记载郑经将东都改为「东宁省」，升天兴、万年二县为州，又称「东宁国」 。朝鲜史料《李朝实录》，称呼郑经时期（1670年）的明郑为大樊国或大樊。当时也有西方人称之为福尔摩沙王国（Kingdom of Formosa）、台湾王国（Kingdom of Taiwan）。现今又被称为明郑政权、延平王国、郑氏王国、东宁王国（Kingdom of Tungning、Reino de Tungning）等。明郑下辖的台湾地区，也称为明郑台湾。
历史.
郑家崛起.
郑芝龙原为东海及南海一带海域势力最大的海盗，于明崇祯元年九月（1628年9月27日－10月26日）接受朝廷招安获赐任海防游击，号「五虎游击将军」。其于获朝廷认可后，经营海运贸易生意更如日中天，成为了东海至南海的海上霸主。其只手遮天之程度于史载叙述可见一斑：「凡海舶不得郑氏令旗者，不能来往。每舶例入三千金，岁入千万计，以此富敌国，自筑城安平镇」；「从此海氛颇息，通贩洋货，内客外商，皆用郑氏旗号，无儆无虞，商贾有二十倍之利，芝龙尽以海利交通朝贵，寖以大显」、「八闽以郑氏为长城」，至此，明郑势力的通商范围广及：大泥、浡尼、占城、吕宋、魍港、北港、大员、平户、长崎、孟买、万丹、旧港、巴达维亚、马六甲、柬埔寨、暹罗。 ，甚至连欧洲列强荷兰东印度公司的营运亦受到郑芝龙势力的影响，地方商贸周济不顺，意图数度联合其他势力攻击郑芝龙，但居然被郑氏海军击溃。
抗清.
明末烽烟四起，内有流寇作乱，外有满清觊觎中原。1644年4月25日（明崇祯十七年三月十九日）甲申之变，大顺李自成攻陷明朝首都北京，明思宗城破后自缢煤山，明朝灭亡；明朝遗臣吴三桂因此引清军入关击败大顺军。但满清入主北京后因兵力不足，暂放慢脚步改采「以汉制汉」战略，并未有立即进取华南，明朝遗臣得以南迁并在南京拥立明宗室福王朱由崧，建立偏安政权南明以联合各地汉族抗清，先后由安宗弘光帝（福王）、监国（鲁王）、绍宗隆武帝（唐王）、绍武帝（小唐王）、昭宗永历帝（桂王）等君主执掌。
1645年，满清豫王多铎举兵南下并擒获福王，弘光政权瓦解，郑芝龙旋即于其根据地福建拥立绍宗隆武帝（唐王）继续抗清，并于1644年－1645年间，先后被授予南安伯、南安侯、平虏侯和平国公等爵位，并身兼户部、兵部、工部三部尚书。然而1646年12月郑芝龙终为满人以高官厚禄诱降；其子郑成功则誓死不降，接起郑家大旗继续抗清。
1659年7月，郑成功北伐兵败金陵后退守东南沿海地区，其时明郑损兵折将难以与清军抗衡，不断遭围剿而势力范围日渐缩小，为寻找反清复明的长远基地而于1661年毅然决定东征荷属福尔摩沙。
征服台湾.
明永历十五年正月（1661年），郑成功在金门誓师；他亲率将士25,000名、战船数百艘，自金门料罗湾出发，次月抵达明郑的领地澎湖，四月初二日（4月30日）抵达鹿耳门。并利用涨潮出敌不意地在鹿耳门及禾寮港登陆。以优势兵力包围荷军防守薄弱的「普罗民遮城」，并切断荷军水陆交通，不久，普罗民遮城守将猫难实叮（Jacobus Valentijn）献城投降。
四月初七日，郑成功亲率大军攻坚固若金汤的荷军首府「热兰遮城」。经派杨朝栋谕揆一投降无效后，即调集火砲朝城堡砲轰，然而在从大员市镇朝城堡进攻时，却遭荷军居高临下击退。之后郑军即采取长期围困，同时将多数部队派往各地囤垦以解决粮食不足的问题。五月二十八日，「荷兰东印度公司」得知台湾战况后，决定派七百人、战舰十艘赴台，于七月初五日抵达。之后双方稍有接触，但均无较大战事。至八月二十三日（9月16日），双方再度海战，郑军经一小时激战，击毁荷舰二艘、俘小艇三艘、杀敌百余人，其余荷舰逃往远海。
闰十月，荷军发动作最后一次攻击，但仍寡不敌众，之后又有日尔曼籍佣兵逃脱，向郑成功说明堡内荷军士气低落，并指出欲取热兰遮城，必先取其卫星碉堡「乌特勒支碉堡」（位于今汤匙山上），夺取该碉堡则可居高临下，砲击热兰遮城最脆弱的「四角附城」。郑成功遂于当月，著手准备攻城计划。
十二月初六日（1662年1月25日）郑军于鲲鯓半岛炮轰乌特勒支碉堡2,500发，命中1,700发左右并几乎将之夷为平地，荷兰守军被迫自行炸毁碉堡残余部分后撤退。此役彻底瓦解了热兰遮城守军的士气，两天后大员评议会决定议和谈判。
大员长官揆一于同年十二月十三日（1662年2月1日）于缔和条约签署投降。至此，台湾台江领地尽落郑成功之手。
设府立家.
永历十五年五月十八日（1661年6月14日)，郑成功登陆台湾后仿效明朝中央官制设制六官，并依然对明朝宗室礼遇有加，为其建王府官邸并供岁禄，每次拜封官员亦请诸位大明皇族遗脉和其他宗室在旁观礼，以示尊重体制；又依郡县制将赤崁城改名「东都明京」，并设置承天府为地方府治的行政中心，府城分为东安、西安、宋南、镇北四坊，各设首领，管理事务。府下并设北天兴、南万年二县。
为确保军队补给充足，明郑于初步安顿后即开展查户口、报田产、征劳力、纳税银等各种民生工作，并实施「寓兵于农」政策令诸将士至全台各地屯垦，范围北达噶玛兰地区、南抵瑯峤一带，以点状分布，按镇分地、按地开垦。明郑政权于大规模开垦期间多有侵害到原住民诸部的活动空间，导致与原住民政权之间频繁爆发武装冲突，如明郑政权对大肚王国领土的侵犯曾造成数次战争。因于大肚王国与瑯峤等在地政权的抵御，郑成功实际的统治范围，仅约北至二林（今彰化县二林镇），南达茄藤（今屏东县佳冬乡）。
南明昭宗永历十六年五月初八（1662年6月23日），郑成功薨逝，时年38岁，自其征服台湾至逝世仅13个月。其于逝世后近二十年（永历三十五年四月，1681年）获孙郑克塽追谥「潮武王」。
郑经时期.
郑经克台.
史书记载，郑经自年少时即已颇为好色，并特别喜爱徐娘半老的中年熟女，几乎与胞弟的每一名乳母均有私通；郑成功征台前，留守思明州（厦门）的郑经纳其中一人陈昭娘为妾并倍加宠爱。郑成功得知后本令陈氏自行跳海了断，但郑经却以其驻地权势包庇陈氏并隐瞒父亲长达三年之久，驻厦军慑于世子权势无人敢通知人在台湾的郑成功。陈氏更恃宠生骄霸凌本已长期不受宠的郑经原配唐妃，满腹冤屈的唐妃唯有向于明郑朝廷位居要职的祖父唐显悦求助。
永历十六年（1662年）三月，陈氏生下郑克𡒉，郑经于是向父报称为侧室所出但隐瞒陈氏身份，一时郑成功大喜过望，满朝文武皆贺。不甘孙女受辱的唐显悦此时即发难上奏向郑成功举报揭破郑经谎言，事件于台湾酝酿成严重政治丑闻。
郑成功得知被世子欺骗后勃然大怒，下令主管厦门的堂兄郑泰全数处死董妃、郑经、陈昭娘与郑克𡒉等人。郑泰固不认同堂侄不伦之举，但亦无法接受堂弟对血脉族亲灭绝人性的手段、以及大规模肃清宗族必然引致军心动摇的后果，起初与奉命渡海来厦的都司黄毓谈判，打算仅将陈昭娘郑克𡒉母子首级送回台湾交差了事，再动员大量宗亲为董妃郑经母子求情。郑成功得知郑泰意见后更为愤怒，立即解下佩剑令黄毓回厦斩杀四人，郑泰无法下手唯有叫黄毓亲自找郑经行刑，但暗中提前通报郑经，黄毓刚见到郑经就被其随从包围拘捕。
此时在台湾犯罪的参军蔡鸣雷投奔厦门，并警告说郑成功已令周全斌率军至厦门执行命令，打死不愿杀害宗亲的郑泰唯有按洪旭建议毅然以堂兄身份抗命，并令水师于大胆岛海域严阵以待。周全斌刚接近厦门即被郑经按黄廷建议围困缴械并拘捕，并令黄昌收编其部队。郑成功听闻厦门抗命之事大为光火，再令洪有鼎渡海执行命令，唯洪航至东山岛时眼见水师守备森严，再听闻周全斌被捕的消息，即吓得不敢再前打道回台。被捕的驻台将领其后更几乎遭郑泰以谋害宗室罪名处斩，仅得董妃为顾全大局不计前嫌力保方得保命。此举被驻台郑军视为公然抗命，令其与驻厦军之间开始出现嫌隙，成为日后两岸争位的导火线。
郑成功死后，驻台的黄昭、萧拱宸等人以郑经乱伦罪及联合驻厦军抗王命为由，于安平拥立郑成功五弟郑袭为监国，将军马信、黄安不从，马信于不久后逝世。赏勋司蔡政奉郑成功之衮龙袍入厦门晋见世子郑经，洪旭等人遂拥郑经为「世藩」。同年11月，郑经命周全斌为五军戎政，亲率陈永华、冯锡范等人攻入鹿耳门。右虎卫黄安闻讯后，率师前来会合，与黄昭会战并杀之，胜利后领兵进王城诛杀萧拱宸、张骥与曹从龙等人，流放其族人。事后，郑袭的家臣蔡云自缢，郑袭本人则遭郑经押回厦门软禁，不久惧死而投清。
郑泰事件.
嗣位之争结束后，郑经继位。1663年初，郑经以洪旭守厦门、郑泰守金门。郑经听说郑泰与之前拥立郑袭为王的黄昭有书信往来，便怀疑他亦参与逆谋，因此欲召见他，郑泰却称病不见。参军陈永华以郑经将回东都为由，委任郑泰为「居守户官」，铸印送至金门并邀郑泰入厦门饯行。7月10日，郑泰率兵船赴宴，被郑经扣留软禁，船舰皆为周全斌所并，只有蔡璋逃回金门。郑泰之弟郑鸣骏与子郑缵绪率部属及家眷入泉州投降清朝。郑泰闻讯后自缢，郑经王权得以巩固。
清荷联盟.
1663年11月18日（永历十七年/康熙二年十月十九日，清军于荷兰东印度公司舰队的协助下进攻明郑统治之厦门、金门，明郑尽管拼死奋战击毙清提督马得功，但仍寡不敌众，清军20日（二十一日）终于厦门登陆并乘胜攻占金门、浯屿，明郑军退往铜山。战后军心动摇，大将周全斌降清，郑经眼看无法固守，只好于翌年3月弃守闽南沿海诸岛并全面撤至台、澎，除军队外眷口及文臣、宗室、遗老共约七千人一同撤出，于初十日抵台；此次退守台湾是郑氏所代表的南明抗清势力的总撤退，此后郑经将「东都」改为东宁。1664年4月10日（永历十八年/康熙三年三月十五日），清军进攻铜山，明郑完全失去大陆领土。荷军更乘势于8月27日重占鸡笼。
1665年，清荷联军继续进攻澎湖，却遭遇台风而无功而返，清廷因此放弃了攻台，转而于1667年7月与郑经展开首次谈判。面对清军和荷兰军队咄咄逼人的态势，郑经声称台湾「非属版图之中」、「东连日本，南蹴吕宋，人民辐辏，商贾流通。王侯之贵，固吾所自有，万世之基已立于不拔」；于1669年的和谈中，派遣柯平、叶亨赴泉州与清廷议和。郑经再度强调郑氏占领台湾是「建国东宁」、「于版图疆域之外，别立乾坤」，然而两次的谈判郑经皆以不接受薙发拒绝清朝，并用箕子朝鲜作比喻，谈判最终破局。最终清廷亦无重拾攻台计划，改以迁界令封锁东南沿海，明郑暂得以偏安台湾。
清朝的立即威胁解除后，郑经旋即于1666年率兵进攻鸡笼的荷兰守军，虽然战败，但荷方亦受海禁打击无法贸易，缺乏资源补给导致难以防守，终于1668年再度撤出并自此放弃台湾。
偏安东宁.
1664年8月，郑经认为永历帝驾崩后台湾已无称行都的必要，乃「谨守藩封」而改「东都明京」为「东宁」，建都安平镇于热兰遮城，经过加以翻修称之后，台人称之为「王城」。对内奉南明永历帝正朔，对外与占据中原的大清互不统属，所谓“东宁建国，别立乾坤”，始有开国长治之想，经营成效斐然。明郑政权的有效统治地区仅限于台湾西南部地区，其他地方则有大肚王国、大龟文、瑯峤等原住民政权管辖。
郑经即位后任用陈永华为谘议参军，拓展实业，整饬吏治，强固治安，以官田、私田、屯田三田并用，使得饱经战乱的台湾得到休养生息的机会，也得到了发展的机会，一时间称为乐土。1668年，郑经还派军收复了荷兰人在台湾北部最后的据点—基隆，在台湾南北路和澎湖设置三个安抚司，在福建泉州一带建筑了19个具有军事性质的寨子，巩固了台湾内外围的防御。期间清军虽然两次进攻澎湖，都因郑军防守的当使得清军无功而返。此后十年间，台海维持了相对的稳定局面。
郑经试图以贸易来提升其实力。除了与清朝进行走私贸易外，日本的德川幕府也是其重要贸易伙伴，大量进口日本的银、铜等金属与盔甲以武装郑军，双方贸易于1665至1672年达到高峰，郑经更允许日本商人居于鸡笼以促进贸易交流。日人以「东宁国王」称呼。郑经亦于1672年邀请英国东印度公司来到台湾，并与之签订通商条约，出口糖与鹿皮并进口西洋枪砲以增强郑军的战斗力，另外更请求英国人训练砲兵，战争时更借用英国炮手作战。
西征大清.
1673年，清朝平西王吴三桂起兵反清，史称三藩之乱。1674年4月21日，清朝靖南王耿精忠起兵响应，隔海邀请郑经加入。郑经允之西征，但是只是联合发出讨伐满清檄文，并未联合出兵北伐，双方都是借此机会扩大地盘。郑经渡海后，要求耿精忠将漳州与泉州交给自己，占领整个福建的耿精忠拒绝，郑经遂出兵占领海澄与同安，双方开始交恶。然而，泉州、漳州以及潮州陆续投靠郑经，耿精忠见情势不对便出兵进攻泉州，为明郑将领刘国轩所击退，双方接著又持续相互进攻、战斗。1675年，耿精忠与郑经谈判，双方以枫亭为界，北属耿氏、南属郑氏，平息战斗。1676年，郑经击败平南王尚之信，迫使尚之信加入反清行列，郑经随后占领惠州。由于郑经于拥有漳州、泉州、潮州、惠州等四座首府后，又攻下汀州，因此与耿精忠的联盟再度破裂，腹背受敌的耿精忠只好降清。耿精忠降清后，独自面对清军的郑经节节败退，明郑所得闽粤各地全部得而复失，前功尽弃，最后只好退回厦门，自此一蹶不振。
1677年退回厦门后，清朝再度与郑经展开和谈，清朝康亲王杰书向郑经许诺郑经若从中国大陆沿海的岛屿撤退，就答应比照朝鲜，成为清朝藩属并通商、永无猜嫌。1678年的和谈中，清朝将领赖塔给郑经的书信中声称，如果郑军肯退守台湾，则「本朝何惜海外一弹丸之地」，郑氏可永据台湾，清廷把台湾当成朝鲜、日本一样的外国，不必剃发易服、称臣纳贡也可以不必。郑经一开始予以拒绝，但最终于1680年，全面撤离厦门据守台湾，至此明郑在大陆沿海的主要岛屿丧失殆尽。
郑经回台后曾一度尝试专心治台，但是面对抗清局面不断恶化，意志开始消沉，移居北园别馆，终日饮酒赋诗、棋艺书画、出外狩猎，将政事全权交予监国世子郑克𡒉与咨议参军陈永华。
郑经去世.
1681年3月17日，郑经因狩猎摔伤不治，薨于北园别馆，得年40，统治东宁国近20年。1681年（永历三十五年）四月刚登基的元子郑克塽追谥其父王为「潮文王」。
东宁之变.
1679年，郑经西征之际，因其并无嫡子，听陈永华之请将庶长子郑克𡒉立为世子，并授职为监国，号监国世子。由于其办事英明果断，颇有其祖郑成功之风范，因此人称东宁贤主，但也因此得罪了王叔郑聪等人。1680年，郑经西征无功而返，监国世子继续执政，并深得父亲郑经之信任，但后来其岳父总制陈永华去世，因此监国渐渐在政治上孤立无援。
1681年3月17日（永历三十五年正月二十八日），郑经薨逝，逝世前于北园别馆将监国郑克𡒉托付给刘国轩，然而明郑王室随即爆发权斗。郑氏宗亲郑聪等人眼见郑经已薨，便与冯锡范、刘国轩等人联手向董太妃进谗言，诬蔑郑克𡒉乃李氏之螟蛉子，董太妃一时不察便下令收回郑克𡒉之监国印玺。得到董太妃允许后，刘国轩与冯锡范便领兵进入延平王府捉拿监国、囚禁于北园别馆，并于当夜遭郑聪等人谋杀。监国遭谋杀后，原意仅是罢免郑克𡒉的董太妃亦无力挽回，遂命监国夫人陈氏将郑克𡒉之遗体送返延平王府、收敛守丧。丧毕，陈氏自缢。世子郑克𡒉遭弑杀后，自责的董太妃也于同年6月去世。20日（二月初一），冯锡范拥立年仅12岁的女婿郑克塽（元子）为王；自此朝政大权旁落入外戚冯锡范与刘国轩手中，民心渐趋涣散，明郑亦从此一蹶不振。
降清灭亡.
1682年9月，明郑降将施琅上书康熙帝请求征台，康熙允之。翌年6月，施琅奉康熙诏，并效法当年郑成功征台先进攻澎湖。7月10日于澎湖附近海域遭遇并击溃刘国轩率领的明郑水师，继而于16日占领澎湖，史称澎湖海战。
1683年（永历三十七年）9月，郑克塽与众臣商议后呈降表，鲁王世子朱桓、泸溪王朱慈旷、巴东王朱江、乐安王朱俊、舒城王朱著、奉南王朱熺等其他明朝宗室随其降清，而宁靖王朱术桂身着大明衣冠而自杀。10月8日，施琅入台受郑克塽投降，明郑正式灭亡，台湾亦自此正式进入清治时期；从1661年（永历十五年）4月郑成功入台到郑克塽1683年（永历三十七年）9月降清为止，计于台湾经营共23年。
为防止明郑遗民反叛，清廷灭明郑后将明朝宗室、郑氏王室、明郑朝臣们及其亲属大举迁往中国大陆。其中，郑成功家族纳入上三旗管束；文武官员与士兵则分别迁至在山东、山西及河南诸省垦荒，使台湾失去可能领导反清的人物；甚至不惜郑成功、郑经等郑氏在台王陵悉数迁葬中国内陆。
至于明郑的大量遗民，清廷则采取以汉治汉的策略，长期以攻台将领担任台湾军事首长。如福建水师一职从1684年至1721年计37年间共历施琅、张旺、吴英、施世骠四任提督，除张旺之外，其他皆是攻台将领，尤其是施琅、施世骠父子共任职达25年之久。在陆路提督方面由万正色、吴英、蓝理皆为攻台将领。
行政区划.
地方行政方面，可分为两个阶段：郑成功时期与郑经时期。1661年，郑成功击败荷兰东印度公司，五月占普罗民遮城，改赤崁地方为东都明京，台湾总地号为「东都」。还实施郡县制度，设置了「一府二县」，承天府、天兴县以及万年县，并以承天府安平镇为京畿。其中，天兴县县治设于佳里兴（今台南市佳里区），而万年县县治则设于二赞行（今台南市仁德区二行里）。此外，明郑还先后设置了思明州、思明县，管辖厦门、金门等岛屿，郑氏时期就存在的地名有左营、新营、小新营、旧营、柳营、林凤营、中营、下营、大营、后营、前镇、后镇、二镇、左镇、后劲、官田、北港、大甲、淡水等地名。
1662年，郑成功逝世，世子郑经经历政争后掌权，对行政区划进行变革。全面实施并沿用郑成功设置的郡县制度，但稍稍做出变革。保留承天府，京畿承天府主事官为承天府府尹，改二县为二州，即地方的天兴与万年两州主事官则为知州（郑成功在位时期则为两县知县），于天兴州以及万年州之下，设有「二十四里」。为了安抚原住民族，于原住民居住地区，设置澎湖、北路以及南路等三个安抚司，其主事官为安抚使，形成「一府二州三司」平行的体系。承天府京畿地区又设有东安坊、西定坊、镇北坊以及宁南坊四坊，坊设签首。承天府以及两州的里级行政区则设有总理。签首及总理两职负责的职务如：户籍、迁徙、婚嫁、出生、死亡等基层民事，并规定按时汇呈州府。
政治.
在行政上，延平王拥有至高的权力。延平王之下，设有咨议参军又称为幕府，总理国政。参军府辖下又设立六官（吏、户、礼、刑、兵、工），六官皆设有主事，其下又设都事，品秩分别比照侍郎与郎中。另外，又设立察言司、承宣司、审理司、赏勋司、中书科、储贤馆、育胄馆等官僚机构。1674年，郑经西征清朝，命陈永华为东宁总制，于六官之上；然而，郑经诸弟骄横难制，郑经因此于1679年立长子郑克𡒉为世子，并授职监国，于总制与六官之上，总理国政。东宁之变后，冯锡范掌权，并以侍卫镇掌政，并身兼咨议参军之职，而六官则继续实行。明郑官员在郑成功时自称为「卑职」，在郑经时则改为「臣」，制度已趋成熟。
军事.
郑成功与陈永华、郑经、刘国轩经营的屯兵态势或军事规模是台湾首见。永历十五年（1661年），郑成功除固守金门数万水师之外，亲自率领约25,000名士兵攻打台湾大员，打败荷兰东印度公司的部队，展开对于台湾的统治。明郑时期的军事制度与组织渊源复杂，且经多次变革。如简化之，其官职大约可分为五军戎政（五军戎务）、总督军务、管军提督、将军、亲军卫镇、陆师镇、水师镇及监军数部份。永历三十七年（1683年）明郑覆灭后，郑军将领与军队悉数被强迫内渡中国，而据《钦命太保建平侯郑造报官员兵民船只总册》，据守台湾的官兵共有37500名。
亲军镇.
提督之下设「卫」与「镇」。卫为亲军，镇则非亲军。郑成功尚未占领台湾之前，亲军为镇，称为「亲丁镇」。1650年增设「戎旗镇」。1652年亲丁镇全镇覆没，而未再设置之。1656年扩编戎旗镇为左右二镇，1658年则改名为左右武卫。同年，又增设仿日本武士的亲军部队－左右虎卫。1662年，郑经承嗣延平王，升左虎卫黄安为勇卫，其位于武卫与虎卫之上；黄安殁，咨议参军陈永华继之。又设置侍卫，由冯锡范统领，位于勇卫与武卫之后。郑经死后，外戚冯锡范发动政变，杀监国克𡒉，改立元子郑克塽为王，并开始以侍卫掌政、统领六官，直至明郑灭亡。
特种镇营.
特种镇营中，马兵有北镇以及铁骑镇；火器有神器镇。郑成功攻台成功后，建立护卫镇，由荷兰时期的黑人佣兵「乌鬼」（"Oo-kuí"）组成，手持步枪，专门守卫延平王府。
经济.
农业经济.
在经济方面，明郑于台湾经济史仍占有一定比例。其中，以经贸与农业为主。于农业经济方面，为了解决军队兵粮问题，不论郑成功或郑经基本上都贯彻「寓兵于农」的策略，也是诸将士平日分散各耕地，按镇分地、按地开垦。这种具有营盘田、文武官田的土地私有制，于定则征赋的经济模式下，大量提供经济产能。根据统计，包含承袭荷据已开垦的「王田」、后续开发的营盘田、官田、私田等，明郑时期拓垦的田地超过一万八千四百五十四甲以上。此等经济开发，虽造就农耕文化盛行的汉人，但郑氏王朝扩张领土的行动，却也同时让台湾原住民面临比荷西时期更严重的生存危机，导致与大肚王国发生冲突，并对平埔族展开屠杀。为了军需民食，台湾农产重心由糖转米，这个农业经济的性格转变直至今日仍影响台湾。西元1665年，陈永华的农业水利更促使汉人移民至今高雄的方向发展。除此，陈永华引进同安制盐法至台湾来发展盐业经济，除此尚有鹿皮、鹿角、鹿脯等土产的外销，因此多鹿的台湾，来自原住民团体的捕鹿业，也是早期台湾的重要经济产业活动。明郑时期对16岁以上男子课「人丁银」；有别于荷兰统治台湾时期对七岁以上的汉人移民课以「人头税」（能以鹿皮缴交）。
货币制度.
郑成功奉明朝为宗主，以永历政权为正朔，因此发行永历通宝铜钱作为流通主要货币。郑经主政后，陈永华的中央政府体制，除了可以行使及于台湾南部的主权力量，也著实成为一个个别经济体。由于贸易对象众多，因此流通东宁的货币可以分为银币与铜钱二类，银币又有银元与银锭二者。
银元主要是西班牙银元，于荷兰与西班牙时期大量进入台湾流通。东宁建国后，银元持续流通，依外型与重量主要分为剑钱、圆钱、方钱以及茇等类型：
银锭多由郑氏携入台湾，加以戳记。东宁户官杨英，曾遣人前往麻豆社、新港社、目加溜湾社以及萧垅社，以银锭交易买籴禾粟。
铜钱，郑成功在台湾发行永历通宝，同时明朝其他时代铜钱、宋元等前朝铜钱和日本铜钱同时流通与市。
山海五商.
郑成功在和清军的多次较量中，，清军为了对付郑成功的海军，采取海禁政策，1661年下令山东、江苏、浙江、福建、广东等地迁界禁海，企图通过坚壁清野和经济封锁来扼杀郑氏。为了突破封锁和敛聚财富，郑成功创立山海五商。山海五商分为山五商与海五商。山五商分别以五行「金、木、水、火、土」为商团名，分布于北京、苏州、杭州、山东，采购丝绸等中国货物商品并运销外洋。海五商则掌管贩运东西两洋之船舶，分别以五常「仁、义、礼、智、信」为其商团名，皆设立于厦门。山海五商下又设有分支行号，遍布中国东南各大城港。
「山海商批货，海五商销货」为山海五商之分工模式。山五商向利民库领取公款，于苏、杭等地收购丝绸、瓷器等货品，并交予海五商后，再至利民库结帐并提领下一批公款。海五商交接获物后，交予船队。船队交易结束后，再至利民库结帐。山海五商各司其职。船队方面则以航线作为区分。东洋船队以日本、台湾、吕宋为主要航线；西洋船队则是航行于南洋、波斯，战争时转调战船使用。山海五商与东西两洋船队皆隶属于中央的户官管辖之下，财务各自独立，无从属关系。另外，「领本独立贩运个商」则是向郑成功借贷资本、缴交利息并受监督的商团。将苏杭货品运至海外销售，回航时采购海外货物并售予厦门之海五商。无论山五商、海五商或者是个体户商团，除了商业活动外，亦从事情报工作。
郑经主政后，承继之。1664年（永历十八年）退守台湾后，清朝实施迁界令，山五商受尽挫折。后采取陈永华之议，以贿赂、秘密交易之手段突破封锁。郑经西征时，厦门岛之商业再度兴盛，而舟山群岛则利用行贿，伪装渔船、猎船出海贸易，并派出海军巡逻保护海上贸易之安全与顺畅。
郑英通商条约.
郑经继位延平王后，积极拓展对外贸易，因此派出使节团至万丹（Bantam，今日的西北爪哇）邀请英国东印度公司来台湾进行贸易通商并给予英方优惠礼遇。1670年（永历二十四年）6月3日，英方船舰万丹号（The Bantam Pink）与珍珠号（The Pearl）航抵台湾。同年9月10日，英方指挥官克利斯布（Ellis Crisp）与郑经签署非正式通商协议。郑方同意英方20项条款，主要内容大致为：允许英船自由贸易；英人在台可以自由买卖，并将糖与鹿皮等货品运销日本与吕宋等地。郑方则向英方提出17项要求，主要内容大致为：英方船舰入港时须将火砲火枪移交郑方暂管，离去时归还；进口货物售后须缴交关税3%；派驻2名砲手与铁匠1名为国王（郑经）服役并为郑方制造枪砲；要求英方供应火药200桶、火绳枪200挺以及英国铁100担。
1672年10月13日，郑英正式缔结条约，双方将先前协议精简成13条，英方虽对于「入港缴交武器」与「进口税3%」等要求颇有微词，但仍然概括接受之。正式条约明文规定郑方须将砂糖、皮革等货品之年产量的三分之一售予英籍商人。郑方要求之军需品虽不见于此条约，但正式条约第4条仍载：「公司所属英国人或其他国人，在英国首长之允许以及本人同意之情况下，得被郑方留用或征用为其国王或臣民服务。此条约对英方来说是为了拓展国际贸易版图，而郑方则是为了取得军火以增强军事力量。
签订条约后，英国东印度公司于1672年在安平设立商馆，而英方则是积极争取与清朝、日本进行直接贸易，但与日方交涉重新设立商馆，仍遭日方拒绝。1675年，郑经为获得英制武器，因此与英国东印度公司追增补充条款：英方运销之货品应有枪200挺、铁100担，而郑方则是同意英方于厦门设立商馆。
虽然双方签订通商条约，但英国东印度公司却因郑方对货品的种种限制而经营不善。1680年，郑经西征失利，英国东印度公司因此关闭厦门商馆。台湾商馆则因为英国货品不易销出；丝绸缎无法取得；与日本之贸易不通；郑方对商品的严格管控，仲介贸易利润无法获得；郑方积欠大量货款债务，所以无法继续维系双方关系。1681年，英国人关闭台湾商馆，仅留一人代理清理债务。双方关系遂告一段落。
人口.
根据《台湾通史》的推断，明郑晚期的台湾人口，已经近趋二十万人。
文化.
教育.
1661年，郑成功抵台湾，开中华制度之始，未致力于推行汉文化教育。郑经继承王位后，初期亦因忙于对抗清荷联军而无暇文教；直至1664年败退东宁才开始建设并推行台湾文教。郑经鲜少亲理政事，多委由宰辅陈永华掌理。1665年9月，陈永华认为开辟屯垦略显成果，启奏郑经请求兴建圣庙、普设学校；起初，郑经以「荒服新创，不但地方局促，而且人民稀少，姑暂待之将来」等语推辞，但在听完陈永华以下言论之后，郑经立刻下令择地兴建圣庙。
陈永华选定于承天府宁南坊鬼仔埔兴建圣庙，命名为「先师圣庙」，并采行「庙学制」于旁设立明伦堂作为国子监。明伦堂为平时之教学场域，此外亦作为饮射、读法、宾贤学习礼仪之处。圣庙落成之日，郑经率领文武百官，亲诣圣庙举行祭祀至圣先师释菜礼，圣庙四周围绕上千东宁士庶，已深具儒家风气。圣庙落成后，郑经又再度下令设立社学，由中土儒士前往民间教导东宁子弟。当时东宁之社学可分为「汉-{庄}-社学」以及「土著社学」，学童年满八岁即进入社学学习经史和写作，定期实施考课。1666年（永历二十年）2月，陈永华订定「两州三年两试，照科、岁例开试儒童。州试有名送府，府试有名送院，院试取中，准充入太学」的取材模式。太学教育上，则「仍按月月课，三年取中式者，补六官内都事，擢用升转」。
由陈永华所建的台南孔庙，被视为引进汉文化教育典章之初始；日后清朝历代知府修建文庙时，缮造东大成坊的「全台首学」门额更闻名全国。
衣冠制度.
1650年代后，清朝多次尝试与明郑和谈，但从郑成功以至郑经，服制问题始终是双方谈判时所重视的条件之一。
清康熙二十二年（西元1683年）明郑降清，台湾汉人的衣冠服仪制度也有所转变，根据文献的记载：「十九日（1683年7月），施琅遣侍卫吴启爵至台晓喻薙发…。二十日，克塽令兵民悉遵制削发。是日，福建总督姚启圣亦遣…至台招抚，见兵民已薙发，知功归于琅，…。十八日，克塽率文武官佐悉薙发易服」。
宫殿.
荷兰人退出台湾后，郑成功以热兰遮城（Zeelandia）为居城，人称王城（nan|Ông-siânn）。王府分为内、外两城。1664年，郑经主政东宁，因为王府设于与本岛有台江之隔的安平，所以联络、取水不便，因此另在赤崁兴建王府，作宴居之用。
1664年，郑经从福建迎宁靖王朱术桂至台湾，并于承天府（今赤崁楼）旁的西定坊建立宁靖王府邸，且供岁禄于朱术桂。1681年，郑经去世，郑克塽继位。1683年清将施琅赢得澎湖海战之胜利后，郑克塽投降清朝，而宁靖王朱术桂则连同五位后妃一起自杀。宁靖王故宫改建为天后宫，供俸妈祖，即为今日台南的大天后宫。
北园别馆是郑经为其母亲董太妃所兴建的别馆，即今日之台南开元寺。由于建于王城之北，故称之北园。园面西、向台江，环境清幽、俭朴雅致。1680年（永历三十四年）郑经西征清朝无功而返，遭董太妃责备，因此渐渐无心于国事，又加上元老重臣陈永华、杨英、柯平等人相继去世而更受打击。因此，移居北园别馆。1681年，郑经薨逝于此馆。同年又发生东宁之变，监国郑克𡒉于此遇害。数月后，董太妃逝世于此。董太妃逝世后，北园渐渐荒废。
宗教.
道教、佛教与民间信仰.
祭祀官方性质的有「明朝护国之神」称号的真武玄天上帝的真武庙、郑氏另外又祭祀教人忠义，保佑商业的关帝；关帝庙数量更是当时之冠。设民庙者寥寥无几，有守护水师之妈祖庙，有慈悲送子、广渡众生的观音亭；保身康健的医神大道公庙；以及主祀地府主宰，五岳山神之首东岳大帝的东岳庙。
儒教.
至圣先师的孔子庙，素为文人所重。明郑东宁总制陈永华建了台南孔庙，附设学堂，人称「全台首学」。
真武与妈祖.
由于明朝极重视代表众星拱辰的真武玄天大帝，奉玄天上帝（上帝公）为护国之神。故明郑亦将明朝「护国家神」真武大帝奉为守护神；香火传入大员后大力兴建真武庙，促成来台汉人热切信仰真武大帝；其中位阶最高的台南北极殿享有「大上帝庙」美誉，为官阶最高之大庙，敬以春秋两大祭。当时渡来汉民、兵士、商船航行海上需依靠北极星以进行船舶导航，因此来台汉人亦多数信奉上帝公。但女神妈祖早已名震闽南，水师官兵有相对少数的妈祖信徒，故明郑官方亦偶祭祀之。
清朝攻台是利用当时相对少数的妈祖信仰，对明郑官兵发动心理攻势，明郑灭亡后，清廷便大肆在台宣扬妈祖神迹，贬低原有的真武信仰与庙宇位阶。故明郑盛行的玄天上帝延至清治时代中叶后逐渐不及于妈祖。日后清朝遂利用妈祖信仰之宣传战对付各种抗清运动，历经日治时期民间对传统信仰的凝聚力，最终使妈祖成为信仰主流。
基督教.
台湾北部本为西班牙殖民，有许多天主教信徒，在西班牙败于荷兰后多已离去。至于基督新教方面，在荷兰统治时期与基督教密不可分，研判当时已有不少汉人新教徒及新港社原住民新教徒。代表人物为郑成功在台通事何斌。随著荷兰东印度公司败退离台后，基督新教也与荷兰人一起退出台湾，在台湾传播首度中断。
外交.
东亚.
清朝.
郑经曾派柯平、叶亨与清廷议和，并要求礼遇同等于李氏朝鲜的国与国地位，但不被慕天颜接受。
日本.
由于清军对明郑势力的封锁，郑经便开启对外贸易，其中包含与日本的往来。当时对日本主要输出品为稻米、鹿皮、蔗糖及来自中国的丝织品，输入银、铜、铅、盔甲、棉布、瓷器等，双方的贸易量在1665年到1672年达到高峰，为了加强双边的贸易关系，郑经允许日本商人住在基隆。也因为通商频繁，明郑亦流通当时日本的货币－宽永通宝。
朝鲜.
1667年农历五月初十日，林寅观、曾胜与陈得等人率领4艘货船从台湾起程，前往日本贸易，以及请求日本出兵帮助反清复明。途中遇风，1艘货船于五月二十三日漂到朝鲜，二十五日在朝鲜王朝济州岛大静县猊来里浦浦口东边歧头处，被当地政府发现，自称「大明福建省官商人」。船上95人，被称为「漂海人」，引起朝鲜兴趣，随即他们被带往汉城。朝鲜自身以「小中华」自居，崇明反清，同情汉族被大清统治不得已剃发易服，所有如何处置该船及人员就在朝廷上引发争执，很多朝鲜士大夫听说「明朝」还存在，异常激动。但由于怕得罪清朝，朝鲜显宗最终还是力排众议，决定把他们送交清朝。结果清廷将95人全部杀害。此后朝鲜对台湾漂来船舶改变办法，不准其登陆，就地遣返，以避免再次发生此类悲剧。
大肚王国.
大肚王国为台湾原住民族所建立的部落联盟，国王自称为白昼之王，统治著中台湾。1661年，明郑政权开启了对台湾的统治后，大肚与郑氏的关系就处于敌对的对立关系之中。
欧洲.
荷兰.
早在郑芝龙时期，明郑势力就开始和荷兰人接触，并且通商。料罗湾战役，荷兰人被郑芝龙打败，此后荷兰人据守台湾，直到郑成功攻下热兰遮城，荷兰人才开始逐渐退出台湾。
英国.
1670年7月，与英国东印度公司签立十三条通商约款，并且在安平设立台湾商馆，主要内容为英人可在台湾自由贸易、关税为百分之三，公司可得视需要随时提出条款，台湾国王（郑经）应尽量承认。为台湾史上第一份国际通商条约。1675年两方再增补充条款十条。
西班牙.
嘉靖四十四年（1565年），西班牙帝国开始殖民统治菲律宾群岛；万历三十一年（1603年）和崇祯十二年（1639年），西葡联邦殖民当局两次屠杀在最大岛吕宋的华侨华商，死亡人数高达五万余人。
郑成功于攻下台湾不久后，听闻在被西班牙人在菲律宾有杀戮与掠夺华侨的罪行，勃然大怒。永历十一年（1657年），郑成功曾经致函给爪哇岛巴达维亚的一位华侨甲必丹，要求他停止与菲律宾的西班牙殖民者进行贸易往来。郑成功曾多次对菲律宾华侨表示关切，并提出要率兵攻取菲律宾，以惩罚西班牙人。
永历十六年（1662年）四月，通过意大利籍神父李科罗向菲律宾的西班牙总督递交国书，谴责其杀戮掠夺华侨的罪行，令其「改邪归正，俯首纳贡」，但西班牙人反因此在马尼拉进行了第三次对华侨的屠杀。郑成功闻讯大怒，决定挥师征讨，为华侨报仇。他一面抚恤安置从菲律宾逃到台湾的华侨，一方面组织筹备军队，派人暗中与在菲律宾的华侨联络，以便到时可里应外合，但尚未出兵即已病逝。
郑经时期一度曾调集部队准备南下，但因接到耿精忠发动三藩之乱的消息，临时将部队派往厦门西征讨清，攻取吕宋之事半途而废。郑克臧末期，清军进攻台湾，明郑诸臣建议攻取吕宋，以保存大明遗脉，但是遭到了刘国轩和冯锡范等人的反对，打消了攻取吕宋的念头，转头降清。明郑曾有三次机会可以间质吕宋，把制海权推进菲律宾群岛，却因为第一次不能，第二次不想，第三次不敢，永远的失去了机会。
南洋.
广南国.
郑经在三藩起事时出兵西进，后因战事不利撤退，若干将领四散海外，礼武镇总兵杨彦迪率兵眷三千余人投奔广南国，二镇总兵周云隆率一队船在舟山，房锡鹏也有一支船队在浙江乌洋，黄进在琉球。
杨彦迪被广南国安置在今越南南部同奈省、巴地头顿省一带，他本人对此不满，率兵移居今前江省美湫市一带，他的部将陈上川则按照广南国的安排，定居同奈省、巴地头顿省一带。这只华人的后裔以明乡人之名传后世。明清之际移居越南的明国遗民，通常怀有强烈的民族情节，著明服装、戴明儒巾，保持明朝特色，标榜自身的“明朝人”身份，以中华正统文化的继承者自居。朱姓的明帝国灭亡，而「海上明朝」不灭。
柬埔寨.
鉴于日本对鹿皮的需求，郑氏政权开始寻求从海外收购鹿皮并转出口到日本，尤其当暹罗更倾向于荷兰人合作时，郑氏政权更迫切需要柬埔寨的鹿皮，并设法将荷兰人赶出此项贸易。因当时柬埔寨受广南国掌控，1667年郑氏政权便派出约600位士兵，与广东海盗商人彪爷（冼彪）合作，宣称以柬埔寨国王的名义，杀死了约1000位居住在湄公河一带的广南人，冼彪后来更袭击了当地的荷兰商馆，让郑氏政权得以军事同盟为基础，建立与柬埔寨的贸易关系。
争议.
政权性质.
明朝正朔说.
根据史载，明郑于自始自终皆奉南明为正朔、尊永历帝为帝，并以封国自居，即使永历帝于1662年遭吴三桂擒杀后，郑氏依然持续使用「永历」为年号直至1683年灭国为止。郑成功受封明朝爵位「延平王」，于对内正式文告中均皆谨守其藩王的身份自称「本藩」（Pun Poin；Pumpuan；）；据现存的诸多明郑外交文书中亦可见，郑成功代表明郑与外国往来交涉时一贯自称为「大明招讨大将军国姓」，而明郑往后的统治者亦一直沿称「招讨大将军世子」，从未自称「本王」、「国王」等；而荷方则称郑成功为「国姓爷阁下」，表明他们也认定郑家是隶属于明朝的官员。陕西博物馆藏有一尊永历三十三年（1679年）铸造的明郑火炮，炮身后部铸有3行隶书与篆书铭文：「钦命招讨大将军总统使世子、大明永历己未仲秋吉旦造、藩前督造守备曾懋德」，其中「招讨大将军总统使世子」即郑经。
同时，明郑亦长期优待礼遇明朝宗室，征台后即接鲁王世子朱弘桓、益王朱怡镐、泸溪王朱慈爌、舒城王朱慈𤌄、巴东王朱尊江、乐安王朱俊、奉南王朱熺、鲁王公主朱氏姊妹等多名宗室渡海。永历十七年（1663年），继位的郑经也迎宁靖王朱术桂到台湾，于承天府府署（今台南市赤崁楼）旁的西定坊建立宁靖王府邸，并供岁禄。郑成功尚未攻台时曾获永历帝特准设置六官方便施政，并可委任官职，武官最高许达一品，文职可达六部主事。每逢有册封重要官员的仪式，明郑必会请宁靖王等明朝宗室在旁观礼以维持宗藩体统。面对满清，明郑始终以「大明中兴」、「反清复明」或「反满复汉」为其政治愿景，并在台湾推广认同明朝的儒学教育，一直保持著流亡政权的统治姿态。1683年，郑克塽便是以「延平王」的身份向施琅投降，其降表中载明缴纳「延平王金印」及「招讨大将军金印」各一。故此许多学者将1949年退守台湾后的中华民国政府类比为郑氏政权，因为他们都在中国大陆战败而转进台湾，同时也都宣称将以台湾作为复兴基地以便在未来「反攻大陆」。
厦门大学陈孔立、集美大学林东杰等中国学者认为明郑效忠于南明，一直坚持反清复明信念，期间更曾为光复南明而支持三藩之乱毅然西征，一度收复闽粤大片领土，故其应属南明正朔而非独立政权。
自立政权说.
明郑政权虽则貌似对明宗室礼遇尊崇，但实质上相对于郑氏家族的核心权力，流寓台湾的明朝宗室却无甚政治权力。郑氏在永历帝驾崩之后并未拥立其他宗室亲王为帝或监国，政权决策圈亦未纳入领有岁禄的宁靖王朱术桂、鲁王世子朱弘桓等人，实际权力完全纯粹落于招讨大将军一人，自身郑氏族人更得以成为统治核心内部；综观郑氏的作为，有许多方面并未遵守郡王家族应有的封建地位。按照法理，郑氏仅有郑成功本人接受过永历帝的册封而封王，其子郑经与其孙郑克塽则从未也无从得到任何明朝皇帝的册封；然而，郑经却在郑成功薨殂之后，擅自自称「世藩」继承王爵并统治东宁；中年后，郑经更要求东宁士庶向自己「称臣」，并册封长子郑克臧为摄政世子，此等举动被文人沈光文以「郑锦僭王」等字句批评。郑经死后，郑克塽借由政变登基，不仅自行晋封「潮王」，郑克塽亦擅行皇帝职权，分别以「武」、「文」二字追谥祖、父二辈。除追谥之外，王族郑聪、郑克壆等人及重臣刘国轩、冯锡范等人皆得到公爵、侯爵或伯爵等不同等级的爵位。此外，郑经曾留下「建国东宁」、「别立乾坤」等语焉不详之语句，对此，当代学者各持有不一样的解读；究其根本，实因奉明朝正朔永历年号的郑氏，如果正式称帝，将会有窜夺大明正统之虞。因而仅依郑成功于南明永历九年四月（1655年）敕封为延平王的郡王爵位，始终以「王」自居。
早于郑成功征台之时，南明内部便亦有出现过异议声音，当时不少明遗均担心郑成功不再致力反清复明，反而于台湾据地为王；郑成功的老师钱谦益亦认为郑既以台湾为根据地，恢复中原则更无希望。当中批评最严厉应属南明另一名将张煌言，虽然郑成功宣称攻台是为了安置文武百官的家眷，但张煌言认为从未听说将辎重与眷属安置外国，又能经营中原的先例，直言此举「暴师半载，使壮士涂肝脑于火轮、宿将碎肢体于沙碛，生既非智，死亦非忠」。随后永历帝于云南被满清大军压境、兵临城下，但郑成功其时竟因忙于伐荷征台而未能出兵救援，此事令张往后终身怨恨郑成功，至死仍无法原谅—张即使于鲁王病逝解散军队后，宁可冒著被清廷捕杀的生命危险匿藏浙江，仍至死不肯渡台投靠郑成功，而最终更亦因此被清廷逮获族诛。郑经退守台湾后，虽然仍奉南明的永历正朔，使用永历年号和「招讨大将军」的印信，但政权本质与郑成功时代显然不同，更于1664年8月改名「东宁」，俨然以独立王国的姿态出现，外交上更曾自行与英国东印度公司签订通商条约，条约中尊称国名为「台湾王国」或「福尔摩沙王国」、郑经为「国王（King）」及「陛下（Your Majesty）」、明郑人民为其「臣民（King's person）」，展显出郑氏事实上对内对外的宰制权，足见英日诸国将南台湾视为一个独立国家进行贸易往来。
美国学者丹尼·罗伊（Denny Roy）认为明朝已经灭亡、台湾不受清朝统治，所以明郑是独立政权。学者陈春生亦认为，郑氏政府虽是明朝的延续，但其在台湾实际上已成为一个独立自主的国家。
版图.
早于明太祖祖训即有提到不征之国，要求后世不可征服内容中的藩属国，其中台湾列属藩属国中的小琉球。荷兰东印度公司为设立贸易据点而殖民福尔摩沙大员（今台南市安平区）之时，明帝国对其举动无表异议甚至支持，亦证明台湾并非其所认为的领土。中央研究院院士杜正胜与曹永和称：「明朝虽实施海禁，但台湾不只明朝不管，甚至也不属任何国家管辖，所以走私船早在当时就在基隆、安平与淡水会合明朝、日本与西班牙、葡萄牙与荷兰的商船。...根据荷兰史料，当时东印度公司指挥官莱尔森于1622年到福州谈判，明朝官员为了劝诱他们撤出澎湖，建议他们到澎湖以东，一座不属于明朝的岛屿，也就是台湾，间接同意明朝船只到大员（今安平）与之通商。...当时明朝官员向莱尔森说：「你不知道大员怎么去，我们派船带你去」。这段史料，显见明朝福建官员知道台湾，却不把台湾当作属地。而同样年代，明代的史料记载的是，官员软硬兼施，并请海商李旦居中协调，荷兰的新任长官宋克，才在1624年拆除澎湖城堡的建材，搭乘热兰遮城号商船，来到大员上岸，宋克也成为荷兰建立台湾政权的首任长官，他也在大员建立热兰遮城。」明郑时期的郑经也曾经自认东宁从来不内属中土，而是另新辟的海外领土。
清世宗雍正帝更称：「台湾地方，自古未属中国，皇考（指康熙皇帝）圣略神威，拓入版图。」，乾隆年间《重修福建台湾府志》序言：「台湾……然自宋元以前不登经传。至明季而后，始有荷兰屯聚……迨康熙癸未，始入版图，改隶郡邑。」卷二又写道：“台湾府，古荒服地，先是，未隶中国版图。」故由清朝皇帝的皇家藏书以及地方官府的方志而知，清人认知台湾在清朝之前不属于中国，而是1684年（康熙二十三年）才纳入中国版图。明末清初学者查继佐在《东山国语》叙述：「台湾，洋夷也，独用夏以变夷。」也未将台湾视为中华文化圈的一部分。
而郑成功为中国收复台湾的说法，来自20世纪初历史著作《台湾通史》所载一封郑成功-{致}-荷兰东印度公司末代大员长官揆一的劝降书：“...然台湾者，中国之土地也，久为贵国所踞。今余既来索，则地当归我，珍瑶不急之物悉听而归。……”，不见于任何明清文献，后来经历史学家考证认为此文是连横所杜撰，陈昭瑛认为是连横从江日升《台湾外记》所记「此地非尔所有，乃前太师练兵之所。今藩主前来，是复其故土。」改写。荷兰语史料文献《热兰遮城日志》全文节录郑成功的劝降信和公告，提到郑成功是以台湾、澎湖应在中国政府的统治之下，土地是其父郑芝龙借给荷兰公司为由，要求归还其父故土。
另一方面，郑成功在出征台湾之前，所发表的文告表示：「本藩矢志恢复，切念中兴，恐孤岛之难居，..冒波涛，欲辟不服之区，暂寄军旅，养晦待时，非为贪恋海外，茍延安乐。」，有「不服之区」、「海外」之说，其子郑经亦认为台湾是反清复明的基地，「远在海外，与中国版图渺不相涉」。。
历史定位.
对当今所谓「台湾问题」与台海现状持不同政治立场的学者，虽然立论的基础并不完全一样，却不约而同地对明郑这个短暂的政权有著极高的评价。中华民国于1950年《海天孤愤：郑成功复国史纪评》一书作者黄天健则强调他「恢复中原」的志向、以及对明朝坚决效忠的国族情怀，而中华人民共和国于1955年《郑成功》一书作者方白盛赞郑成功是驱赶「红毛番」的民族英雄；再者；第三，中华民国于1985年〈渡海〉一文作者林浊水则认为郑氏政权是台湾历史上的第一个独立王国。2016年，多个台湾原住民团体于台南火车站前，称对原住民族来说，郑成功却是开启族人不断被外来政权殖民与压迫的历史命运。
纪念.
地名.
自今南台湾许多地名或古地名只要是有「镇」、「冲」、「营」等军事单位之名称的，绝大多数都与明郑有关。如：
参考资料.
书籍.
（按照作者姓氏汉语拼音的顺序排列）
史料.
（按照作者姓氏汉语拼音的顺序排列）