1 INTRODUCTION Depuis des décennies, la Station Biologique de Roscoff suit la diversité de s communauté s planctonique s a u larg e de Roscoff, avec des prélèvements bimensuels sur les si tes "Estaca de" et "SOMLIT-Asta n" , au Nord -Es t de l 'Îl e de B atz. Plusi eurs mét hodes sont utilisées pour dénombrer les cellules , d ont la micro scopie o ptiqu e po ur les e sp èc es > 20 µm , et la cyt omé trie en fl ux p our les esp èces <20 µm*. La cy tom étrie en flu x permet de distinguer les groupes fonctionnels suivants : (i) les cyanobactéries du genre Synechococcus, (ii) les picoeucaryotes photosynthétiques, (iii) les nanoeucaryotes photosynthétiques (iv) les algues Cryptophytes (v) les bactéries et (vi) les virus marins Les données de diversité phytoplanctonique de Roscoff obtenues par microscopie optique on t déjà été bien étudiées par le laboratoire et ont m is en éviden ce u ne dynamiq ue saisonniè re t rès marquée avec des successions d’espèces au c ours de l’année (Caracciolo et al. 2022). Ce projet, focalisé sur les données obtenues par cytométrie en flux avait pour objectif : (1) d e fair e u n inventair e de s donnée s disponible s et d es protocol es utilis és po ur l es collecte r, ( 2) de détermi ner les dynamiq ues saisonniè res des principaux groupes fonctionnels distingués po ur le site SOMLIT- Ast an e t ( 3) de déter min er si les blooms saiso nni ers de Synecho coccus avaient changé de date au cours des deux dernières 20 ans de données Échantillonnage et analyse de la mer à la cellule Actuel Protocole 2 Anciens FACSCanto, FACSCan Flash frozen Sans Pluronic + Glutaraldéhyde (fixateur) + Pluronic (surfactant) Echantillonnage (Neomysis) Congélation (-20°C) Congélation (-80°C) Conservation Niskin bottle Picoeucaryotes Analyse des abondance s des group es taxonomiques Cytogramme Fluorescence Side Scatter (SSC) Synechococcus Bactéries Nanoeucaryotes + 5µl billes Polysciences fluoresbrite® Analyse (laboratoire) Microgouttelette chargée contenan t 1 seule cellule FACSort Détecteur et photomultiplicateur SSC : taille Fluorescence : naturelle ou fluorochrome Cytométrie en flux : Dynamique saisonnière au site SOMLIT-Astan 7 Trait de filet (eau de Roscoff) diatomées Synechococcus ? nanoeucaryotes photosynthétiques ? picoeucaryote photosynthétique ? © SBR 6 Cyanophage et Synechoccocus infectée © Sophie Le Panse, Plateforme MERIMAGE (SBR) 48°46'40.1"N 3°56'15.0"W 48°43'55.9"N 3°58'58.0"W 3 4 OUI Fig. 5. Variations saisonnières des abondances des 5 groupes fonctionnels sur la période d u 12/01/200 7 a u 18/12/201 9 (1 2 an s e t 1 1 mois ). Donné es issu es de la ba se PELAGO S, s ite SOMLIT-Astan surface. (d) Picoeucaryotes (e) Nanoeucaryotes (b) Bactéries (c) Cryptophytes (a) Synechococcus Pico : 0.2-2 µm Nano : 2 – 20 µm Micro : 20-200 µm *Phytoplancton → diversité de taille : 500 nm 5 8 Fig. 9. Variations saisonnières des abondances de virus HNA (2013- 2020), site SOMLIT-Astan surface. Intéractions virales Abondance virale (cellules/mL) Synechococcus est la cible de certains virus marins. Au site Astan, en surface, l'abondance des virus HNA (High Nucleic Acid content) qui ciblent Synechococcus, mais aussi des picoeucaryote s photosynthétiqu es (communicati on personnel le de AC Baudo ux) va rie de f açon saisonni ère, ave c un pi c en juin-juil let, pér iod e de développ ement des pico- et nanoeucaryotes. 500 nm 200 nm LIMITES & PERSPECTIVES → Biais potentiels dus au changement de protocole des données PELAGOS → Série temporelle courte : description possible, mais conclusions limitées → Échantillonnage tous les 15 jours insuffisant pour suivre les blooms d’organismes unicellulaires à cycle de vie court (de quelques heures à quelque s jours) De nombreuses pistes sont possibles pour explorer davantage cette communauté. Par exemple, des données de fluorescence et de PA R (Rayonnemen t Photosynthétiquemen t Actif ) son t disponible s su r l a ba se SOMLIT. Ces données pourraient révéler des changements physiologiques c hez