enoriega/GENIA-Term-Corpus · Datasets at Hugging Face

[ "C/EBP", "alpha", "is", "the", "major", "CCAAT/enhancer", "-binding", "protein", "(", "C/EBP", ")", "form", "binding", "to", "this", "site", "in", "nuclear", "extracts", "of", "U937", "cells", "." ]

[ "c/ebp", "alpha", "is", "the", "major", "ccaat/enhancer", "-binding", "protein", "(", "c/ebp", ")", "form", "binding", "to", "this", "site", "in", "nuclear", "extracts", "of", "u937", "cells", "." ]

[ "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_component", "I-cell_component", "O", "B-cell_line", "I-cell_line", "O" ]

[ "Point", "mutations", "of", "either", "the", "PU", ".", "1", "site", "or", "the", "C/EBP", "site", "that", "abolish", "the", "binding", "of", "the", "respective", "factors", "result", "in", "a", "significant", "decrease", "of", "GM-CSF", "receptor", "alpha", "promoter", "activity", "in", "myelomonocytic", "cells", "only", "." ]

[ "point", "mutations", "of", "either", "the", "pu", ".", "1", "site", "or", "the", "c/ebp", "site", "that", "abolish", "the", "binding", "of", "the", "respective", "factors", "result", "in", "a", "significant", "decrease", "of", "gm-csf", "receptor", "alpha", "promoter", "activity", "in", "myelomonocytic", "cells", "only", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O", "O" ]

[ "Furthermore", ",", "we", "demonstrate", "that", "in", "myeloid", "and", "B", "cell", "extracts", ",", "PU", ".", "1", "forms", "a", "novel", ",", "specific", ",", "more", "slowly", "migrating", "complex", "(", "PU-SF", ")", "when", "binding", "the", "GM-CSF", "receptor", "alpha", "promoter", "PU", ".", "1", "site", "." ]

[ "furthermore", ",", "we", "demonstrate", "that", "in", "myeloid", "and", "b", "cell", "extracts", ",", "pu", ".", "1", "forms", "a", "novel", ",", "specific", ",", "more", "slowly", "migrating", "complex", "(", "pu-sf", ")", "when", "binding", "the", "gm-csf", "receptor", "alpha", "promoter", "pu", ".", "1", "site", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_complex", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "O" ]

[ "This", "is", "the", "first", "demonstration", "of", "a", "specific", "interaction", "with", "PU", ".", "1", "on", "a", "myeloid", "PU", ".", "1", "binding", "site", "." ]

[ "this", "is", "the", "first", "demonstration", "of", "a", "specific", "interaction", "with", "pu", ".", "1", "on", "a", "myeloid", "pu", ".", "1", "binding", "site", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "O", "O" ]

[ "The", "novel", "complex", "is", "distinct", "from", "that", "described", "previously", "as", "binding", "to", "B", "cell", "enhancer", "sites", "and", "can", "be", "formed", "by", "addition", "of", "PU", ".", "1", "to", "extracts", "from", "certain", "nonmyeloid", "cell", "types", "which", "do", "not", "express", "PU", ".", "1", ",", "including", "T", "cells", "and", "epithelial", "cells", ",", "but", "not", "from", "erythroid", "cells", "." ]

[ "the", "novel", "complex", "is", "distinct", "from", "that", "described", "previously", "as", "binding", "to", "b", "cell", "enhancer", "sites", "and", "can", "be", "formed", "by", "addition", "of", "pu", ".", "1", "to", "extracts", "from", "certain", "nonmyeloid", "cell", "types", "which", "do", "not", "express", "pu", ".", "1", ",", "including", "t", "cells", "and", "epithelial", "cells", ",", "but", "not", "from", "erythroid", "cells", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O" ]

[ "Furthermore", ",", "we", "demonstrate", "that", "the", "PU-SF", "complex", "binds", "to", "PU", ".", "1", "sites", "found", "on", "a", "number", "of", "myeloid", "promoters", ",", "and", "its", "formation", "requires", "an", "intact", "PU", ".", "1", "site", "adjacent", "to", "a", "single-stranded", "region", "." ]

[ "furthermore", ",", "we", "demonstrate", "that", "the", "pu-sf", "complex", "binds", "to", "pu", ".", "1", "sites", "found", "on", "a", "number", "of", "myeloid", "promoters", ",", "and", "its", "formation", "requires", "an", "intact", "pu", ".", "1", "site", "adjacent", "to", "a", "single-stranded", "region", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_complex", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_family_or_group", "I-DNA_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Expression", "of", "PU", ".", "1", "in", "nonmyeloid", "cells", "can", "activate", "the", "GM-CSF", "receptor", "alpha", "promoter", "." ]

[ "expression", "of", "pu", ".", "1", "in", "nonmyeloid", "cells", "can", "activate", "the", "gm-csf", "receptor", "alpha", "promoter", "." ]

[ "O", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Deletion", "of", "the", "amino-terminal", "region", "of", "PU", ".", "1", "results", "in", "a", "failure", "to", "form", "the", "PU-SF", "complex", "and", "in", "a", "concomitant", "loss", "of", "transactivation", ",", "suggesting", "that", "formation", "of", "the", "PU-SF", "complex", "is", "of", "functional", "importance", "for", "the", "activity", "of", "the", "GM-CSF", "receptor", "alpha", "promoter", "." ]

[ "deletion", "of", "the", "amino-terminal", "region", "of", "pu", ".", "1", "results", "in", "a", "failure", "to", "form", "the", "pu-sf", "complex", "and", "in", "a", "concomitant", "loss", "of", "transactivation", ",", "suggesting", "that", "formation", "of", "the", "pu-sf", "complex", "is", "of", "functional", "importance", "for", "the", "activity", "of", "the", "gm-csf", "receptor", "alpha", "promoter", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-protein_domain_or_region", "I-protein_domain_or_region", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_complex", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_complex", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Finally", ",", "we", "demonstrate", "that", "C/EBP", "alpha", "can", "also", "active", "the", "GM-CSF", "receptor", "alpha", "promoter", "in", "nonmyeloid", "cells", "." ]

[ "finally", ",", "we", "demonstrate", "that", "c/ebp", "alpha", "can", "also", "active", "the", "gm-csf", "receptor", "alpha", "promoter", "in", "nonmyeloid", "cells", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O" ]

[ "(", "ABSTRACT", "TRUNCATED", "AT", "400", "WORDS", ")" ]

[ "(", "abstract", "truncated", "at", "400", "words", ")" ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "impaired", "transcription", "factor", "AP-1", "DNA", "binding", "activity", "in", "lymphocytes", "derived", "from", "subjects", "with", "some", "symptoms", "of", "premature", "aging", "." ]

[ "the", "impaired", "transcription", "factor", "ap-1", "dna", "binding", "activity", "in", "lymphocytes", "derived", "from", "subjects", "with", "some", "symptoms", "of", "premature", "aging", "." ]

[ "O", "B-other_name", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "O", "O", "B-multi_cell", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O" ]

[ "The", "study", "of", "human", "disorders", "known", "as", "premature", "aging", "syndromes", "may", "provide", "insight", "into", "the", "mechanisms", "of", "cellular", "senescence", "." ]

[ "the", "study", "of", "human", "disorders", "known", "as", "premature", "aging", "syndromes", "may", "provide", "insight", "into", "the", "mechanisms", "of", "cellular", "senescence", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O" ]

[ "The", "main", "feature", "of", "cellular", "senescence", "in", "vitro", "is", "cessation", "of", "cell", "proliferation", "." ]

[ "the", "main", "feature", "of", "cellular", "senescence", "in", "vitro", "is", "cessation", "of", "cell", "proliferation", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O" ]

[ "Down", "syndrome", "(", "DS", ")", "and", "neuronal", "ceroid-lypofuscinosis", "(", "NCL", ")", "are", "clinically", "characterized", "by", "the", "premature", "onset", "of", "numerous", "features", "normally", "associated", "with", "human", "aging", "." ]

[ "down", "syndrome", "(", "ds", ")", "and", "neuronal", "ceroid-lypofuscinosis", "(", "ncl", ")", "are", "clinically", "characterized", "by", "the", "premature", "onset", "of", "numerous", "features", "normally", "associated", "with", "human", "aging", "." ]

[ "B-other_name", "I-other_name", "O", "B-other_name", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "B-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O" ]

[ "Phytohemagglutinin", "stimulated", "lymphocytes", "derived", "from", "DS", "subjects", "showed", "a", "statistically", "significant", "diminished", "proliferation", "capacity", "in", "comparison", "with", "lymphocytes", "derived", "from", "NCL", "and", "healthy", "individuals", "." ]

[ "phytohemagglutinin", "stimulated", "lymphocytes", "derived", "from", "ds", "subjects", "showed", "a", "statistically", "significant", "diminished", "proliferation", "capacity", "in", "comparison", "with", "lymphocytes", "derived", "from", "ncl", "and", "healthy", "individuals", "." ]

[ "B-protein_molecule", "O", "B-cell_type", "O", "O", "B-multi_cell", "I-multi_cell", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "O", "O", "B-other_name", "O", "B-multi_cell", "I-multi_cell", "O" ]

[ "We", "demonstrated", ",", "by", "applying", "the", "electrophoretic", "mobility", "shift", "assay", ",", "slightly", "impaired", "AP-1", "DNA", "binding", "activity", "in", "NCL", "lymphocytes", "and", "strong", "in", "DS", "ones", "." ]

[ "we", "demonstrated", ",", "by", "applying", "the", "electrophoretic", "mobility", "shift", "assay", ",", "slightly", "impaired", "ap-1", "dna", "binding", "activity", "in", "ncl", "lymphocytes", "and", "strong", "in", "ds", "ones", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O", "O", "B-other_name", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O" ]

[ "Our", "results", "showed", "that", "the", "same", "molecular", "mechanisms", "of", "proliferation", "cessation", "could", "exist", "in", "fibroblasts", "characterized", "by", "replicative", "senescence", "and", "in", "lymphocytes", "derived", "from", "individuals", "with", "premature", "aging", "syndromes", "(", "Down" ]

[ "our", "results", "showed", "that", "the", "same", "molecular", "mechanisms", "of", "proliferation", "cessation", "could", "exist", "in", "fibroblasts", "characterized", "by", "replicative", "senescence", "and", "in", "lymphocytes", "derived", "from", "individuals", "with", "premature", "aging", "syndromes", "(", "down" ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "B-cell_type", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "B-cell_type", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O", "B-other_name" ]

[ "Identification", "of", "a", "human", "LIM-Hox", "gene", ",", "hLH-2", ",", "aberrantly", "expressed", "in", "chronic", "myelogenous", "leukaemia", "and", "located", "on", "9q33-34", ".", "1", "." ]

[ "identification", "of", "a", "human", "lim-hox", "gene", ",", "hlh-2", ",", "aberrantly", "expressed", "in", "chronic", "myelogenous", "leukaemia", "and", "located", "on", "9q33-34", ".", "1", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-DNA_family_or_group", "I-DNA_family_or_group", "I-DNA_family_or_group", "O", "B-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O" ]

[ "We", "describe", "the", "isolation", "of", "human", "LH-2", ",", "a", "putative", "transcription", "factor", "containing", "two", "cysteine", "-rich", "regions", "(", "LIM", "domains", ")", "and", "a", "homeobox", "(", "Hox", ")", "DNA-binding", "domain", "." ]

[ "we", "describe", "the", "isolation", "of", "human", "lh-2", ",", "a", "putative", "transcription", "factor", "containing", "two", "cysteine", "-rich", "regions", "(", "lim", "domains", ")", "and", "a", "homeobox", "(", "hox", ")", "dna-binding", "domain", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "O", "B-amino_acid_monomer", "O", "O", "O", "B-protein_domain_or_region", "I-protein_domain_or_region", "O", "O", "O", "B-protein_domain_or_region", "I-protein_domain_or_region", "I-protein_domain_or_region", "I-protein_domain_or_region", "I-protein_domain_or_region", "I-protein_domain_or_region", "O" ]

[ "High", "levels", "of", "hLH-2", "expression", "were", "observed", "in", "all", "cases", "of", "chronic", "myelogenous", "leukaemia", "(", "CML", ")", "tested", ",", "regardless", "of", "disease", "status", "." ]

[ "high", "levels", "of", "hlh-2", "expression", "were", "observed", "in", "all", "cases", "of", "chronic", "myelogenous", "leukaemia", "(", "cml", ")", "tested", ",", "regardless", "of", "disease", "status", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O", "B-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "hLH-2", "was", "mapped", "to", "chromosome", "9Q33-34", ".", "1", ",", "in", "the", "same", "region", "as", "the", "reciprocal", "translocation", "that", "creates", "the", "BCR-ABL", "chimera", "of", "the", "Philadelphia", "chromosome", "(", "Ph'", ")", ",", "the", "hallmark", "of", "CML", ";", "hLH-2", "was", "retained", "on", "the", "derivative", "9", "chromosome", "and", "is", "therefore", "centromeric", "of", "c-ABL", "." ]

[ "hlh-2", "was", "mapped", "to", "chromosome", "9q33-34", ".", "1", ",", "in", "the", "same", "region", "as", "the", "reciprocal", "translocation", "that", "creates", "the", "bcr-abl", "chimera", "of", "the", "philadelphia", "chromosome", "(", "ph'", ")", ",", "the", "hallmark", "of", "cml", ";", "hlh-2", "was", "retained", "on", "the", "derivative", "9", "chromosome", "and", "is", "therefore", "centromeric", "of", "c-abl", "." ]

[ "B-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "B-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "O", "B-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_molecule", "I-DNA_molecule", "I-DNA_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "O" ]

[ "The", "proximity", "of", "hLH-2", "to", "the", "breakpoint", "on", "chromosome", "9", "raises", "the", "possibility", "of", "cis-activation", "by", "the", "t", "(", "9", ";", "22", ")", "(", "q34", ";", "q11", ")", "translocation", "." ]

[ "the", "proximity", "of", "hlh-2", "to", "the", "breakpoint", "on", "chromosome", "9", "raises", "the", "possibility", "of", "cis-activation", "by", "the", "t", "(", "9", ";", "22", ")", "(", "q34", ";", "q11", ")", "translocation", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_molecule", "I-DNA_molecule", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O" ]

[ "In", "addition", "to", "finding", "hLH-2", "expression", "in", "all", "cases", "of", "CML", ",", "expression", "was", "observed", "in", "lymphoid", "malignancies", "and", "myeloid", "cell", "lines", ",", "but", "not", "in", "primary", "cases", "of", "acute", "myelogenous", "leukaemia", "." ]

[ "in", "addition", "to", "finding", "hlh-2", "expression", "in", "all", "cases", "of", "cml", ",", "expression", "was", "observed", "in", "lymphoid", "malignancies", "and", "myeloid", "cell", "lines", ",", "but", "not", "in", "primary", "cases", "of", "acute", "myelogenous", "leukaemia", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "B-cell_line", "I-cell_line", "I-cell_line", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O" ]

[ "The", "role", "of", "hLH-2", "in", "the", "development", "or", "progression", "of", "leukaemia", "is", "not", "known", "." ]

[ "the", "role", "of", "hlh-2", "in", "the", "development", "or", "progression", "of", "leukaemia", "is", "not", "known", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "O", "O", "O", "O" ]

[ "However", ",", "hLH-2", "may", "prove", "useful", "as", "a", "marker", "of", "CML", "for", "monitoring", "residual", "disease", "." ]

[ "however", ",", "hlh-2", "may", "prove", "useful", "as", "a", "marker", "of", "cml", "for", "monitoring", "residual", "disease", "." ]

[ "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O" ]

[ "Differential", "effects", "of", "protein", "kinase", "C", "inhibitors", "on", "fibronectin", "-induced", "interleukin-beta", "gene", "transcription", ",", "protein", "synthesis", "and", "secretion", "in", "human", "monocytic", "cells", "." ]

[ "differential", "effects", "of", "protein", "kinase", "c", "inhibitors", "on", "fibronectin", "-induced", "interleukin-beta", "gene", "transcription", ",", "protein", "synthesis", "and", "secretion", "in", "human", "monocytic", "cells", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "B-cell_type", "I-cell_type", "O" ]

[ "Human", "monocytic", "cells", "express", "interleukin-1beta", "(", "IL-1beta", ")", "when", "stimulated", "with", "the", "extracellular", "matrix", "glycoprotein", ",", "fibronectin", "(", "FN", ")", "." ]

[ "human", "monocytic", "cells", "express", "interleukin-1beta", "(", "il-1beta", ")", "when", "stimulated", "with", "the", "extracellular", "matrix", "glycoprotein", ",", "fibronectin", "(", "fn", ")", "." ]

[ "B-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "O" ]

[ "Protein", "kinase", "C", "(", "PKC", ")", "activation", "is", "considered", "important", "for", "this", "process", ";", "however", ",", "the", "metabolic", "steps", "at", "which", "PKC", "acts", "upon", "to", "mediate", "the", "FN", "-induced", "IL-1beta", "response", "remain", "unclear", "." ]

[ "protein", "kinase", "c", "(", "pkc", ")", "activation", "is", "considered", "important", "for", "this", "process", ";", "however", ",", "the", "metabolic", "steps", "at", "which", "pkc", "acts", "upon", "to", "mediate", "the", "fn", "-induced", "il-1beta", "response", "remain", "unclear", "." ]

[ "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O" ]

[ "We", "performed", "an", "analysis", "of", "the", "mechanisms", "by", "which", "two", "PKC", "inhibitors", ",", "Calphostin", "C", "and", "Staurosporine", ",", "prevent", "the", "FN", "-induced", "IL-1beta", "response", "." ]

[ "we", "performed", "an", "analysis", "of", "the", "mechanisms", "by", "which", "two", "pkc", "inhibitors", ",", "calphostin", "c", "and", "staurosporine", ",", "prevent", "the", "fn", "-induced", "il-1beta", "response", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "B-other_organic_compound", "I-other_organic_compound", "O", "B-other_organic_compound", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "O" ]

[ "Both", "inhibitors", "blocked", "the", "secretion", "of", "IL-1beta", "protein", "into", "the", "media", "of", "peripheral", "blood", "mononuclear", "cells", "exposed", "to", "FN", "." ]

[ "both", "inhibitors", "blocked", "the", "secretion", "of", "il-1beta", "protein", "into", "the", "media", "of", "peripheral", "blood", "mononuclear", "cells", "exposed", "to", "fn", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "B-protein_molecule", "O" ]

[ "Immunoprecipitation", "analysis", "revealed", "that", "unde3r", "these", "circumstances", ",", "Calphostin", "C", "inhibited", "the", "production", "of", "IL-1beta", "protein", ",", "whereas", "Staurosporine", "allowed", "protein", "production", ",", "but", "inhibited", "its", "secretion", "." ]

[ "immunoprecipitation", "analysis", "revealed", "that", "unde3r", "these", "circumstances", ",", "calphostin", "c", "inhibited", "the", "production", "of", "il-1beta", "protein", ",", "whereas", "staurosporine", "allowed", "protein", "production", ",", "but", "inhibited", "its", "secretion", "." ]

[ "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_organic_compound", "I-other_organic_compound", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "B-other_organic_compound", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "To", "determine", "the", "mechanisms", "responsible", "for", "these", "differences", ",", "we", "turned", "to", "human", "U937", "promonocytic", "cells", "." ]

[ "to", "determine", "the", "mechanisms", "responsible", "for", "these", "differences", ",", "we", "turned", "to", "human", "u937", "promonocytic", "cells", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_line", "I-cell_line", "I-cell_line", "I-cell_line", "O" ]

[ "U937", "cells", "transfected", "with", "the", "human", "full-length", "IL-1beta", "promoter", "connected", "to", "a", "luciferase", "reporter", "gene", "were", "submitted", "to", "transcription", "assays", ",", "Northern", "blotting", ",", "and", "DNA", "electrophoresis", "mobility", "gel", "shift", "assays", "." ]

[ "u937", "cells", "transfected", "with", "the", "human", "full-length", "il-1beta", "promoter", "connected", "to", "a", "luciferase", "reporter", "gene", "were", "submitted", "to", "transcription", "assays", ",", "northern", "blotting", ",", "and", "dna", "electrophoresis", "mobility", "gel", "shift", "assays", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O" ]

[ "These", "studies", "revealed", "that", "Calphostin", "C", "inhibited", "the", "nuclear", "translocation", "of", "the", "transcription", "factor", "activator", "protein-1", "(", "AP-1", ")", "which", "is", "considered", "necessary", "for", "FN", "induction", "of", "IL-1beta", "gene", "transcription", ",", "and", "prevented", "the", "transcription", "of", "the", "IL-1beta", "gene", "." ]

[ "these", "studies", "revealed", "that", "calphostin", "c", "inhibited", "the", "nuclear", "translocation", "of", "the", "transcription", "factor", "activator", "protein-1", "(", "ap-1", ")", "which", "is", "considered", "necessary", "for", "fn", "induction", "of", "il-1beta", "gene", "transcription", ",", "and", "prevented", "the", "transcription", "of", "the", "il-1beta", "gene", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-other_organic_compound", "I-other_organic_compound", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O" ]

[ "In", "contrast", ",", "Staurosporine", "alone", "induced", "AP-1", "translocation", "and", "stimulation", "of", "the", "gene", "." ]

[ "in", "contrast", ",", "staurosporine", "alone", "induced", "ap-1", "translocation", "and", "stimulation", "of", "the", "gene", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-other_organic_compound", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "B-other_name", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Overall", ",", "our", "data", "indicate", "that", "Calphostin", "C", "prevents", "the", "transcription", "of", "the", "IL-1beta", "gene", "thereby", "inhibiting", "protein", "synthesis", "." ]

[ "overall", ",", "our", "data", "indicate", "that", "calphostin", "c", "prevents", "the", "transcription", "of", "the", "il-1beta", "gene", "thereby", "inhibiting", "protein", "synthesis", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_organic_compound", "I-other_organic_compound", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O" ]

[ "Based", "on", "the", "high", "specificity", "of", "this", "compound", "for", "PKC", ",", "we", "conclude", "that", "PKC", "is", "necessary", "for", "FN", "-induced", "IL-1beta", "protein", "production", "." ]

[ "based", "on", "the", "high", "specificity", "of", "this", "compound", "for", "pkc", ",", "we", "conclude", "that", "pkc", "is", "necessary", "for", "fn", "-induced", "il-1beta", "protein", "production", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O" ]

[ "In", "contrast", ",", "Staurosporine", "prevented", "secretion", "of", "IL-1beta", "by", "unknown", "mechanisms" ]

[ "in", "contrast", ",", "staurosporine", "prevented", "secretion", "of", "il-1beta", "by", "unknown", "mechanisms" ]

[ "O", "O", "O", "B-other_organic_compound", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-other_name", "I-other_name" ]

[ "Chlorinated", "dibenzo-p-dioxins", "and", "dibenzofurans", "and", "the", "human", "immune", "system", "." ]

[ "chlorinated", "dibenzo-p-dioxins", "and", "dibenzofurans", "and", "the", "human", "immune", "system", "." ]

[ "B-other_organic_compound", "I-other_organic_compound", "O", "B-other_organic_compound", "O", "O", "B-body_part", "I-body_part", "I-body_part", "O" ]

[ "1", ".", "Blood", "cell", "receptors", "in", "volunteers", "with", "moderately", "increased", "body", "burdens", "." ]

[ "1", ".", "blood", "cell", "receptors", "in", "volunteers", "with", "moderately", "increased", "body", "burdens", "." ]

[ "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "B-multi_cell", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Using", "monoclonal", "antibodies", "(", "mAbs", ")", "and", "flow", "cytometry", ",", "we", "studied", "a", "variety", "of", "surface", "receptors", "on", "lymphocyte", "subpopulations", "of", "workers", "with", "moderately", "increased", "body", "burdens", "of", "2", ",", "3", ",", "7", ",", "8-tetrachlorodibenzo-p-dioxin", "(", "TCDD", ")", "and", "of", "other", "polychlorinated", "dibenzo-p-dioxins", "and", "dibenzofurans", "(", "PCDD/PCDF", ")", ",", "expressed", "here", "as", "International-Toxicity", "Equivalencies", "(", "I-TE", ")", "." ]

[ "using", "monoclonal", "antibodies", "(", "mabs", ")", "and", "flow", "cytometry", ",", "we", "studied", "a", "variety", "of", "surface", "receptors", "on", "lymphocyte", "subpopulations", "of", "workers", "with", "moderately", "increased", "body", "burdens", "of", "2", ",", "3", ",", "7", ",", "8-tetrachlorodibenzo-p-dioxin", "(", "tcdd", ")", "and", "of", "other", "polychlorinated", "dibenzo-p-dioxins", "and", "dibenzofurans", "(", "pcdd/pcdf", ")", ",", "expressed", "here", "as", "international-toxicity", "equivalencies", "(", "i-te", ")", "." ]

[ "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "B-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_organic_compound", "I-other_organic_compound", "I-other_organic_compound", "I-other_organic_compound", "I-other_organic_compound", "I-other_organic_compound", "I-other_organic_compound", "O", "B-other_organic_compound", "O", "O", "O", "O", "B-other_organic_compound", "I-other_organic_compound", "O", "B-other_organic_compound", "O", "B-other_organic_compound", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "B-other_name", "O", "O" ]

[ "The", "hypothesis", "to", "be", "tested", "was", "whether", "or", "not", "humans", "exhibit", "a", "similar", "susceptibility", "to", "PCDDs/PCDFs", "with", "respect", "to", "the", "surface", "receptors", "found", "previously", "to", "respond", "to", "small", "doses", "of", "2", ",", "3", ",", "7", ",", "8-tetrachlorodibenzo-p-dioxin", "(", "TCDD", ")", "in", "Callithrix", "jacchus", "." ]

[ "the", "hypothesis", "to", "be", "tested", "was", "whether", "or", "not", "humans", "exhibit", "a", "similar", "susceptibility", "to", "pcdds/pcdfs", "with", "respect", "to", "the", "surface", "receptors", "found", "previously", "to", "respond", "to", "small", "doses", "of", "2", ",", "3", ",", "7", ",", "8-tetrachlorodibenzo-p-dioxin", "(", "tcdd", ")", "in", "callithrix", "jacchus", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-multi_cell", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_organic_compound", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_organic_compound", "I-other_organic_compound", "I-other_organic_compound", "I-other_organic_compound", "I-other_organic_compound", "I-other_organic_compound", "I-other_organic_compound", "O", "B-other_organic_compound", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O" ]

[ "These", "are", ":", "helper-inducer", "(", "memory", ")", "T", "cells", "(", "CD4+CD45R0+CD45RA-CD29highCD11a+", ")", ",", "CD20+", "B", "cells", ",", "and", "cytotoxic", "T", "cells", "(", "CD8+CD56+/CD57+", ")", "." ]

[ "these", "are", ":", "helper-inducer", "(", "memory", ")", "t", "cells", "(", "cd4+cd45r0+cd45ra-cd29highcd11a+", ")", ",", "cd20+", "b", "cells", ",", "and", "cytotoxic", "t", "cells", "(", "cd8+cd56+/cd57+", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "B-cell_type", "I-cell_type", "O", "B-cell_type", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "O", "B-cell_type", "O", "O" ]

[ "Furthermore", ",", "68", "triple-labellings", "with", "mAbs", "were", "performed", "on", "the", "cells", "of", "each", "volunteer", "to", "possibly", "generate", "further", "hypotheses", "." ]

[ "furthermore", ",", "68", "triple-labellings", "with", "mabs", "were", "performed", "on", "the", "cells", "of", "each", "volunteer", "to", "possibly", "generate", "further", "hypotheses", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-multi_cell", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "It", "was", "evaluated", "whether", "any", "of", "the", "variables", "might", "be", "used", "as", "a", "biomarker", "of", "effects", "for", "this", "class", "of", "compounds", "." ]

[ "it", "was", "evaluated", "whether", "any", "of", "the", "variables", "might", "be", "used", "as", "a", "biomarker", "of", "effects", "for", "this", "class", "of", "compounds", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "There", "were", "two", "main", "goals", ":", "(", "1", ")", "to", "evaluate", "whether", "workers", "with", "a", "moderately", "increased", "PCDD/PCDF", "-body", "burden", "[", "25-140", "ppt", "TCDD", "or", "104-522", "ppt", "I-TE", "in", "blood", "fat", "]", "exhibit", "changes", "in", "the", "surface", "receptors", "of", "white", "blood", "cells", ",", "as", "observed", "in", "previous", "studies", "in", "non-human", "primates", ",", "and", "(", "2", ")", "to", "clarify", "whether", "persons", "at", "the", "upper", "range", "[", "10-23", "ppt", "TCDD", "or", "30-90", "ppt", "I-TE", "in", "blood", "fat", "]", "of", "the", "body", "burden", "reference", "values", "of", "a", "not", "particularly", "exposed", "population", "show", "detectable", "deviations", "in", "these", "immunological", "variables", ",", "when", "compared", "with", "persons", "at", "the", "lower", "and", "medium", "range", "[", "1-3", "ppt", "TCDD", "or", "9-29", "ppt", "I-TE", "]", "of", "these", "body", "burden", "reference", "values", "." ]

[ "there", "were", "two", "main", "goals", ":", "(", "1", ")", "to", "evaluate", "whether", "workers", "with", "a", "moderately", "increased", "pcdd/pcdf", "-body", "burden", "[", "25-140", "ppt", "tcdd", "or", "104-522", "ppt", "i-te", "in", "blood", "fat", "]", "exhibit", "changes", "in", "the", "surface", "receptors", "of", "white", "blood", "cells", ",", "as", "observed", "in", "previous", "studies", "in", "non-human", "primates", ",", "and", "(", "2", ")", "to", "clarify", "whether", "persons", "at", "the", "upper", "range", "[", "10-23", "ppt", "tcdd", "or", "30-90", "ppt", "i-te", "in", "blood", "fat", "]", "of", "the", "body", "burden", "reference", "values", "of", "a", "not", "particularly", "exposed", "population", "show", "detectable", "deviations", "in", "these", "immunological", "variables", ",", "when", "compared", "with", "persons", "at", "the", "lower", "and", "medium", "range", "[", "1-3", "ppt", "tcdd", "or", "9-29", "ppt", "i-te", "]", "of", "these", "body", "burden", "reference", "values", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-multi_cell", "O", "O", "O", "O", "B-other_organic_compound", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_organic_compound", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O", "B-lipid", "I-lipid", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-multi_cell", "I-multi_cell", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_organic_compound", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O", "B-lipid", "I-lipid", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_organic_compound", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O" ]

[ "Regression", "analysis", "of", "our", "data", "revealed", "slight", "trends", "for", "some", "of", "the", "biomarkers", "(", "e", ".", "g", ".", "CD45R0+", ")", "." ]

[ "regression", "analysis", "of", "our", "data", "revealed", "slight", "trends", "for", "some", "of", "the", "biomarkers", "(", "e", ".", "g", ".", "cd45r0+", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "O", "O" ]

[ "With", "one", "exception", ",", "these", "were", "all", "increases", "." ]

[ "with", "one", "exception", ",", "these", "were", "all", "increases", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "None", "of", "the", "alterations", "observed", "are", "of", "medical", "relevance", "." ]

[ "none", "of", "the", "alterations", "observed", "are", "of", "medical", "relevance", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "slight", "increase", "in", "the", "percentage", "of", "CD4+CD45R0+", "cells", "remained", "significant", "even", "after", "covariant", "analysis", "taking", "age-related", "changes", "into", "account", "." ]

[ "the", "slight", "increase", "in", "the", "percentage", "of", "cd4+cd45r0+", "cells", "remained", "significant", "even", "after", "covariant", "analysis", "taking", "age-related", "changes", "into", "account", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Altogether", ",", "the", "data", "do", "not", "provide", "any", "evidence", "to", "support", "an", "assumption", "that", "moderately", "increased", "body", "burdens", "of", "PCDDs/PCDFs", "in", "adults", "induce", "decreases", "in", "the", "cellular", "components", "of", "the", "human", "immune", "system", "." ]

[ "altogether", ",", "the", "data", "do", "not", "provide", "any", "evidence", "to", "support", "an", "assumption", "that", "moderately", "increased", "body", "burdens", "of", "pcdds/pcdfs", "in", "adults", "induce", "decreases", "in", "the", "cellular", "components", "of", "the", "human", "immune", "system", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "B-other_organic_compound", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_component", "I-cell_component", "O", "O", "B-body_part", "I-body_part", "I-body_part", "O" ]

[ "Adult", "humans", "certainly", "are", "less", "susceptible", "to", "this", "action", "of", "PCDDs/PCDFs", "than", "adolescent", "Callithrix", "jacchus" ]

[ "adult", "humans", "certainly", "are", "less", "susceptible", "to", "this", "action", "of", "pcdds/pcdfs", "than", "adolescent", "callithrix", "jacchus" ]

[ "B-multi_cell", "B-multi_cell", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_organic_compound", "O", "B-other_name", "B-other_name", "I-other_name" ]

[ "T-helper-cell", "determinants", "in", "protein", "antigens", "are", "preferentially", "located", "in", "cysteine-rich", "antigen", "segments", "resistant", "to", "proteolytic", "cleavage", "by", "cathepsin", "B", ",", "L", ",", "and", "D", "." ]

[ "t-helper-cell", "determinants", "in", "protein", "antigens", "are", "preferentially", "located", "in", "cysteine-rich", "antigen", "segments", "resistant", "to", "proteolytic", "cleavage", "by", "cathepsin", "b", ",", "l", ",", "and", "d", "." ]

[ "B-protein_domain_or_region", "I-protein_domain_or_region", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "B-protein_domain_or_region", "I-protein_domain_or_region", "I-protein_domain_or_region", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "We", "report", "on", "a", "computer", "algorithm", "capable", "of", "predicting", "the", "location", "of", "T-helper-cell", "epitopes", "in", "protein", "antigen", "(", "Ag", ")", "by", "analysing", "the", "Ag", "amino", "acid", "sequence", "." ]

[ "we", "report", "on", "a", "computer", "algorithm", "capable", "of", "predicting", "the", "location", "of", "t-helper-cell", "epitopes", "in", "protein", "antigen", "(", "ag", ")", "by", "analysing", "the", "ag", "amino", "acid", "sequence", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_domain_or_region", "I-protein_domain_or_region", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "B-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "B-protein_domain_or_region", "I-protein_domain_or_region", "I-protein_domain_or_region", "O" ]

[ "The", "algorithm", "was", "constructed", "with", "the", "aim", "of", "identifying", "segments", "in", "Ag", "which", "are", "resistant", "to", "proteolytic", "degradation", "by", "the", "enzymes", "cathepsin", "B", ",", "L", ",", "and", "D", "." ]

[ "the", "algorithm", "was", "constructed", "with", "the", "aim", "of", "identifying", "segments", "in", "ag", "which", "are", "resistant", "to", "proteolytic", "degradation", "by", "the", "enzymes", "cathepsin", "b", ",", "l", ",", "and", "d", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "These", "are", "prominent", "enzymes", "in", "the", "endocytic", "pathway", "through", "which", "soluble", "protein", "Ag", "enter", "APC", ",", "and", "resistant", "segments", "in", "Ag", "may", ",", "therefore", ",", "be", "expected", "to", "contain", "more", "T-cell", "determinants", "than", "susceptible", "segments", "." ]

[ "these", "are", "prominent", "enzymes", "in", "the", "endocytic", "pathway", "through", "which", "soluble", "protein", "ag", "enter", "apc", ",", "and", "resistant", "segments", "in", "ag", "may", ",", "therefore", ",", "be", "expected", "to", "contain", "more", "t-cell", "determinants", "than", "susceptible", "segments", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "B-protein_family_or_group", "O", "B-protein_complex", "O", "O", "B-protein_domain_or_region", "I-protein_domain_or_region", "O", "B-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_domain_or_region", "I-protein_domain_or_region", "O", "B-protein_domain_or_region", "I-protein_domain_or_region", "O" ]

[ "From", "information", "available", "in", "the", "literature", "on", "the", "substrate", "specificity", "of", "the", "three", "enzymes", ",", "it", "is", "clear", "that", "a", "cysteine", "is", "not", "accepted", "in", "any", "of", "the", "S2", ",", "S1", ",", "S1'", ",", "and", "S2'", "subsites", "of", "cathepsin", "B", "and", "L", ",", "and", "not", "in", "the", "S1", "and", "S1'", "subsites", "of", "cathepsin", "D", "." ]

[ "from", "information", "available", "in", "the", "literature", "on", "the", "substrate", "specificity", "of", "the", "three", "enzymes", ",", "it", "is", "clear", "that", "a", "cysteine", "is", "not", "accepted", "in", "any", "of", "the", "s2", ",", "s1", ",", "s1'", ",", "and", "s2'", "subsites", "of", "cathepsin", "b", "and", "l", ",", "and", "not", "in", "the", "s1", "and", "s1'", "subsites", "of", "cathepsin", "d", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-amino_acid_monomer", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_domain_or_region", "O", "B-protein_domain_or_region", "O", "O", "B-protein_domain_or_region", "I-protein_domain_or_region", "O" ]

[ "Moreover", ",", "we", "have", "noticed", "that", "cysteine", "-containing", "T-cell", "determinants", "in", "a", "number", "of", "protein", "Ag", "are", "particularly", "rich", "in", "the", "amino", "acids", "alanine", ",", "glycine", ",", "lysine", ",", "leucine", ",", "serine", ",", "threonine", ",", "and", "valine", "." ]

[ "moreover", ",", "we", "have", "noticed", "that", "cysteine", "-containing", "t-cell", "determinants", "in", "a", "number", "of", "protein", "ag", "are", "particularly", "rich", "in", "the", "amino", "acids", "alanine", ",", "glycine", ",", "lysine", ",", "leucine", ",", "serine", ",", "threonine", ",", "and", "valine", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-amino_acid_monomer", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "B-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "O", "B-amino_acid_monomer", "I-amino_acid_monomer", "B-amino_acid_monomer", "O", "B-amino_acid_monomer", "O", "B-amino_acid_monomer", "O", "B-amino_acid_monomer", "O", "B-amino_acid_monomer", "O", "B-amino_acid_monomer", "O", "O", "B-amino_acid_monomer", "O" ]

[ "By", "searching", "protein", "Ag", "for", "clusters", "of", "amino", "acids", "containing", "cysteine", "and", "two", "of", "the", "other", "amino", "acids", "we", "were", "able", "to", "predict", "17", "out", "of", "23", "empirically", "known", "T-cell", "determinants", "in", "the", "Ag", "with", "a", "relatively", "low", "number", "of", "false", "(", "positive", ")", "predictions", "." ]

[ "by", "searching", "protein", "ag", "for", "clusters", "of", "amino", "acids", "containing", "cysteine", "and", "two", "of", "the", "other", "amino", "acids", "we", "were", "able", "to", "predict", "17", "out", "of", "23", "empirically", "known", "t-cell", "determinants", "in", "the", "ag", "with", "a", "relatively", "low", "number", "of", "false", "(", "positive", ")", "predictions", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "B-amino_acid_monomer", "I-amino_acid_monomer", "O", "B-amino_acid_monomer", "O", "O", "O", "O", "O", "B-amino_acid_monomer", "I-amino_acid_monomer", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_domain_or_region", "I-protein_domain_or_region", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Furthermore", ",", "we", "present", "a", "new", "principle", "for", "searching", "Ag", "for", "potential", "amphipatic", "alpha-helical", "protein", "segments", "." ]

[ "furthermore", ",", "we", "present", "a", "new", "principle", "for", "searching", "ag", "for", "potential", "amphipatic", "alpha-helical", "protein", "segments", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "O", "O", "B-protein_domain_or_region", "I-protein_domain_or_region", "I-protein_domain_or_region", "I-protein_domain_or_region", "O" ]

[ "Such", "segments", "accord", "well", "with", "empirically", "known", "T-cell", "determinants", "and", "our", "algorithm", "produces", "a", "lower", "number", "of", "false", "positive", "predictions", "than", "the", "principle", "based", "on", "discrete", "Fourier", "transformations", "previously", "described", "." ]

[ "such", "segments", "accord", "well", "with", "empirically", "known", "t-cell", "determinants", "and", "our", "algorithm", "produces", "a", "lower", "number", "of", "false", "positive", "predictions", "than", "the", "principle", "based", "on", "discrete", "fourier", "transformations", "previously", "described", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_domain_or_region", "I-protein_domain_or_region", "O", "O", "B-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O" ]

[ "Paternal", "expression", "of", "WT1", "in", "human", "fibroblasts", "and", "lymphocytes", "." ]

[ "paternal", "expression", "of", "wt1", "in", "human", "fibroblasts", "and", "lymphocytes", "." ]

[ "B-other_name", "I-other_name", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O", "B-cell_type", "O" ]

[ "The", "Wilms'", "tumor", "suppressor", "gene", "(", "WT1", ")", "was", "previously", "identified", "as", "being", "imprinted", ",", "with", "frequent", "maternal", "expression", "in", "human", "placentae", "and", "fetal", "brains", "." ]

[ "the", "wilms'", "tumor", "suppressor", "gene", "(", "wt1", ")", "was", "previously", "identified", "as", "being", "imprinted", ",", "with", "frequent", "maternal", "expression", "in", "human", "placentae", "and", "fetal", "brains", "." ]

[ "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "B-body_part", "I-body_part", "O", "B-body_part", "I-body_part", "O" ]

[ "We", "examined", "the", "allele-specific", "expression", "of", "WT1", "in", "cultured", "human", "fibroblasts", "from", "15", "individuals", "." ]

[ "we", "examined", "the", "allele-specific", "expression", "of", "wt1", "in", "cultured", "human", "fibroblasts", "from", "15", "individuals", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "B-multi_cell", "O" ]

[ "Seven", "of", "15", "fibroblast", "lines", "were", "heterozygous", "for", "polymorphic", "alleles", ",", "and", "the", "expression", "patterns", "were", "variable", ",", "i", ".", "e", ".", ",", "equal", ",", "unequal", "or", "monoallelic", "paternal", "expression", "in", "three", ",", "two", "and", "two", "cases", ",", "respectively", "." ]

[ "seven", "of", "15", "fibroblast", "lines", "were", "heterozygous", "for", "polymorphic", "alleles", ",", "and", "the", "expression", "patterns", "were", "variable", ",", "i", ".", "e", ".", ",", "equal", ",", "unequal", "or", "monoallelic", "paternal", "expression", "in", "three", ",", "two", "and", "two", "cases", ",", "respectively", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-cell_line", "I-cell_line", "O", "O", "O", "B-DNA_family_or_group", "I-DNA_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Exclusive", "paternal", "expression", "of", "WT1", "was", "also", "shown", "in", "non-cultured", "peripheral", "lymphocytes", "from", "the", "latter", "two", "individuals", "." ]

[ "exclusive", "paternal", "expression", "of", "wt1", "was", "also", "shown", "in", "non-cultured", "peripheral", "lymphocytes", "from", "the", "latter", "two", "individuals", "." ]

[ "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "allele-specific", "expression", "profiles", "of", "other", "imprinted", "genes", ",", "IGF2", "and", "H19", ",", "on", "human", "chromosome", "11", "were", "constant", "and", "consistent", "with", "those", "in", "other", "tissues", "." ]

[ "the", "allele-specific", "expression", "profiles", "of", "other", "imprinted", "genes", ",", "igf2", "and", "h19", ",", "on", "human", "chromosome", "11", "were", "constant", "and", "consistent", "with", "those", "in", "other", "tissues", "." ]

[ "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "B-DNA_family_or_group", "I-DNA_family_or_group", "O", "B-DNA_domain_or_region", "O", "B-DNA_domain_or_region", "O", "O", "B-DNA_molecule", "I-DNA_molecule", "I-DNA_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Our", "unexpected", "observations", "of", "paternal", "or", "biallelic", "expression", "of", "WT1", "in", "fibroblasts", "and", "lymphocytes", ",", "together", "with", "the", "previous", "findings", "of", "maternal", "or", "biallelic", "expression", "in", "placentae", "and", "brains", ",", "suggest", "that", "the", "allele-specific", "regulatory", "system", "of", "WT1", "is", "unique", "and", "may", "be", "controlled", "by", "a", "putative", "tissue-", "and", "individual-specific", "modifier", "." ]

[ "our", "unexpected", "observations", "of", "paternal", "or", "biallelic", "expression", "of", "wt1", "in", "fibroblasts", "and", "lymphocytes", ",", "together", "with", "the", "previous", "findings", "of", "maternal", "or", "biallelic", "expression", "in", "placentae", "and", "brains", ",", "suggest", "that", "the", "allele-specific", "regulatory", "system", "of", "wt1", "is", "unique", "and", "may", "be", "controlled", "by", "a", "putative", "tissue-", "and", "individual-specific", "modifier", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-cell_type", "O", "B-cell_type", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-body_part", "O", "B-body_part", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O" ]

[ "YM268", "increases", "the", "glucose", "uptake", ",", "cell", "differentiation", ",", "and", "mRNA", "expression", "of", "glucose", "transporter", "in", "3T3-L1", "adipocytes", "." ]

[ "ym268", "increases", "the", "glucose", "uptake", ",", "cell", "differentiation", ",", "and", "mrna", "expression", "of", "glucose", "transporter", "in", "3t3-l1", "adipocytes", "." ]

[ "B-other_organic_compound", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "B-protein_complex", "I-protein_complex", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O" ]

[ "The", "purpose", "of", "this", "study", "was", "to", "examine", "the", "effects", "of", "bis", "[", "4-", "[", "2", ",", "4-dioxo-5-thiazolidinyl", ")", "methyl", "]", "phenyl", "]", "methane", "(", "YM-268", ")", ",", "a", "thiazolidinedione", "derivative", ",", "on", "glucose", "uptake", ",", "adipocyte", "differentiation", "through", "peroxisome", "proliferator-activated", "receptor", "gamma", "(", "PPARgamma", ")", ",", "and", "phosphatidylinositol", "3-kinase", "(", "PI", "3-kinase", ")", "activity", "in", "cultured", "cells", "." ]

[ "the", "purpose", "of", "this", "study", "was", "to", "examine", "the", "effects", "of", "bis", "[", "4-", "[", "2", ",", "4-dioxo-5-thiazolidinyl", ")", "methyl", "]", "phenyl", "]", "methane", "(", "ym-268", ")", ",", "a", "thiazolidinedione", "derivative", ",", "on", "glucose", "uptake", ",", "adipocyte", "differentiation", "through", "peroxisome", "proliferator-activated", "receptor", "gamma", "(", "ppargamma", ")", ",", "and", "phosphatidylinositol", "3-kinase", "(", "pi", "3-kinase", ")", "activity", "in", "cultured", "cells", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_organic_compound", "I-other_organic_compound", "I-other_organic_compound", "I-other_organic_compound", "I-other_organic_compound", "I-other_organic_compound", "I-other_organic_compound", "I-other_organic_compound", "I-other_organic_compound", "I-other_organic_compound", "I-other_organic_compound", "I-other_organic_compound", "I-other_organic_compound", "O", "B-other_organic_compound", "O", "O", "O", "B-other_organic_compound", "I-other_organic_compound", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "B-cell_type", "O", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "O", "O", "B-cell_line", "I-cell_line", "O" ]

[ "YM268", "and", "pioglitazone", "dose-dependently", "increased", "the", "2-deoxyglucose", "uptake", "in", "3T3-L1", "cells", "." ]

[ "ym268", "and", "pioglitazone", "dose-dependently", "increased", "the", "2-deoxyglucose", "uptake", "in", "3t3-l1", "cells", "." ]

[ "B-other_organic_compound", "O", "B-other_organic_compound", "O", "O", "O", "B-carbohydrate", "O", "O", "B-cell_line", "I-cell_line", "O" ]

[ "YM268", "facilitated", "the", "insulin-stimulated", "triglyceride", "accumulation", "in", "3T3-L1", "adipocytes", "and", "increased", "the", "mRNA", "expression", "of", "fatty", "acid-binding", "protein", "." ]

[ "ym268", "facilitated", "the", "insulin-stimulated", "triglyceride", "accumulation", "in", "3t3-l1", "adipocytes", "and", "increased", "the", "mrna", "expression", "of", "fatty", "acid-binding", "protein", "." ]

[ "B-other_organic_compound", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O" ]

[ "YM268", ",", "with", "and", "without", "insulin", ",", "increased", "the", "mRNA", "expression", "of", "glucose", "transporter", "isoforms", "such", "as", "GLUT1", "and", "GLUT4", ",", "indicating", "enhancement", "of", "adipocyte", "differentiation", "." ]

[ "ym268", ",", "with", "and", "without", "insulin", ",", "increased", "the", "mrna", "expression", "of", "glucose", "transporter", "isoforms", "such", "as", "glut1", "and", "glut4", ",", "indicating", "enhancement", "of", "adipocyte", "differentiation", "." ]

[ "B-other_organic_compound", "O", "O", "O", "O", "B-peptide", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "B-protein_complex", "I-protein_complex", "O", "O", "O", "B-protein_complex", "O", "B-protein_complex", "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "O", "O" ]

[ "Additionally", ",", "YM268", "and", "pioglitazone", "showed", "activity", "of", "the", "PPARgamma", "ligand", ",", "a", "member", "of", "the", "nuclear", "receptor", "superfamily", "responsible", "for", "adipogenesis", "." ]

[ "additionally", ",", "ym268", "and", "pioglitazone", "showed", "activity", "of", "the", "ppargamma", "ligand", ",", "a", "member", "of", "the", "nuclear", "receptor", "superfamily", "responsible", "for", "adipogenesis", "." ]

[ "O", "O", "B-other_organic_compound", "O", "B-other_organic_compound", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "O", "B-other_name", "O" ]

[ "To", "examine", "the", "possible", "involvement", "of", "the", "increased", "activity", "of", "PI", "3-kinase", "in", "YM268", "-stimulated", "glucose", "uptake", ",", "the", "enzyme", "activity", "was", "estimated", "by", "measuring", "the", "phosphatidylinositol-3", ",", "4", ",", "5-trisphosphate", "(", "PI-3", ",", "4", ",", "5-P3", ")", "concentration", "in", "human", "monocytic", "cells", "." ]

[ "to", "examine", "the", "possible", "involvement", "of", "the", "increased", "activity", "of", "pi", "3-kinase", "in", "ym268", "-stimulated", "glucose", "uptake", ",", "the", "enzyme", "activity", "was", "estimated", "by", "measuring", "the", "phosphatidylinositol-3", ",", "4", ",", "5-trisphosphate", "(", "pi-3", ",", "4", ",", "5-p3", ")", "concentration", "in", "human", "monocytic", "cells", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "B-other_organic_compound", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_organic_compound", "I-other_organic_compound", "I-other_organic_compound", "I-other_organic_compound", "I-other_organic_compound", "O", "B-other_organic_compound", "I-other_organic_compound", "I-other_organic_compound", "I-other_organic_compound", "I-other_organic_compound", "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "O" ]

[ "Insulin", "dose-dependently", "increased", "the", "PI-3", ",", "4", ",", "5-P3", "production", "but", "YM268", "had", "no", "significant", "effect", "on", "the", "insulin", "-dependent", "and", "-independent", "PI", "3-kinase", "activation", "." ]

[ "insulin", "dose-dependently", "increased", "the", "pi-3", ",", "4", ",", "5-p3", "production", "but", "ym268", "had", "no", "significant", "effect", "on", "the", "insulin", "-dependent", "and", "-independent", "pi", "3-kinase", "activation", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-other_organic_compound", "I-other_organic_compound", "I-other_organic_compound", "I-other_organic_compound", "I-other_organic_compound", "O", "O", "B-other_organic_compound", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "These", "results", "indicate", "that", "the", "mechanism", "by", "which", "YM268", "increased", "glucose", "uptake", ",", "may", "be", "accounted", "for", "in", "part", "by", "the", "enhancement", "of", "GLUT1", "and", "GLUT4", "expression", "through", "PPARgamma", "activation", "." ]

[ "these", "results", "indicate", "that", "the", "mechanism", "by", "which", "ym268", "increased", "glucose", "uptake", ",", "may", "be", "accounted", "for", "in", "part", "by", "the", "enhancement", "of", "glut1", "and", "glut4", "expression", "through", "ppargamma", "activation", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_organic_compound", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_complex", "O", "B-protein_complex", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O" ]

[ "The", "interleukin", "2", "CD28-responsive", "complex", "contains", "at", "least", "three", "members", "of", "the", "NF", "kappa", "B", "family", ":", "c-Rel", ",", "p50", ",", "and", "p65", "." ]

[ "the", "interleukin", "2", "cd28-responsive", "complex", "contains", "at", "least", "three", "members", "of", "the", "nf", "kappa", "b", "family", ":", "c-rel", ",", "p50", ",", "and", "p65", "." ]

[ "O", "B-protein_complex", "I-protein_complex", "I-protein_complex", "I-protein_complex", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "B-protein_molecule", "O" ]

[ "Optimal", "activation", "of", "T", "cells", "requires", "at", "least", "two", "signals", "." ]

[ "optimal", "activation", "of", "t", "cells", "requires", "at", "least", "two", "signals", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "One", "signal", "can", "be", "delivered", "by", "the", "antigen-specific", "T-cell", "receptor", ",", "and", "the", "second", "signal", "is", "provided", "by", "the", "costimulatory", "molecule", "(", "s", ")", "delivered", "by", "the", "antigen-presenting", "cell", "." ]

[ "one", "signal", "can", "be", "delivered", "by", "the", "antigen-specific", "t-cell", "receptor", ",", "and", "the", "second", "signal", "is", "provided", "by", "the", "costimulatory", "molecule", "(", "s", ")", "delivered", "by", "the", "antigen-presenting", "cell", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O" ]

[ "CD28", "is", "a", "T-cell", "surface", "molecule", "and", "stimulation", "through", "this", "protein", "plays", "an", "important", "role", "in", "delivering", "the", "second", "activation", "signal", "." ]

[ "cd28", "is", "a", "t-cell", "surface", "molecule", "and", "stimulation", "through", "this", "protein", "plays", "an", "important", "role", "in", "delivering", "the", "second", "activation", "signal", "." ]

[ "B-protein_molecule", "O", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O" ]

[ "In", "this", "report", ",", "we", "show", "that", "in", "human", "peripheral", "blood", "T", "cells", ",", "CD28", "-mediated", "signal", "transduction", "involves", "the", "rel", "family", "proteins", "--", "c-Rel", ",", "p50", ",", "and", "p65", "." ]

[ "in", "this", "report", ",", "we", "show", "that", "in", "human", "peripheral", "blood", "t", "cells", ",", "cd28", "-mediated", "signal", "transduction", "involves", "the", "rel", "family", "proteins", "--", "c-rel", ",", "p50", ",", "and", "p65", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "B-protein_molecule", "O" ]

[ "Treatment", "of", "peripheral", "blood", "T", "cells", "with", "phorbol", "12-myristate", "13-acetate", "(", "PMA", ")", "and", "anti-CD28", "monoclonal", "antibody", "(", "mAb", ")", "results", "in", "augmentation", "of", "nuclear", "c-Rel", ",", "p50", ",", "and", "p65", ",", "and", "this", "augmentation", "can", "occur", "in", "the", "presence", "of", "the", "immunosuppressant", "cyclosporin", "A", "." ]

[ "treatment", "of", "peripheral", "blood", "t", "cells", "with", "phorbol", "12-myristate", "13-acetate", "(", "pma", ")", "and", "anti-cd28", "monoclonal", "antibody", "(", "mab", ")", "results", "in", "augmentation", "of", "nuclear", "c-rel", ",", "p50", ",", "and", "p65", ",", "and", "this", "augmentation", "can", "occur", "in", "the", "presence", "of", "the", "immunosuppressant", "cyclosporin", "a", "." ]

[ "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "O", "B-other_organic_compound", "I-other_organic_compound", "I-other_organic_compound", "O", "B-other_organic_compound", "O", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "B-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_organic_compound", "B-other_organic_compound", "I-other_organic_compound", "O" ]

[ "It", "is", "also", "shown", "in", "this", "report", "that", ",", "in", "response", "to", "PMA/anti-CD28", "mAb", "or", "anti-CD3/anti-CD28", "mAb", ",", "c-Rel", ",", "p50", ",", "and", "p65", "are", "associated", "with", "CD28", "-responsive", "element", "present", "in", "the", "promoter", "of", "the", "human", "interleukin", "2", "gene", "." ]

[ "it", "is", "also", "shown", "in", "this", "report", "that", ",", "in", "response", "to", "pma/anti-cd28", "mab", "or", "anti-cd3/anti-cd28", "mab", ",", "c-rel", ",", "p50", ",", "and", "p65", "are", "associated", "with", "cd28", "-responsive", "element", "present", "in", "the", "promoter", "of", "the", "human", "interleukin", "2", "gene", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O" ]

[ "The", "functional", "significance", "of", "c-Rel", "involvement", "in", "the", "CD28", "-responsive", "complex", "is", "demonstrated", "by", "transient", "transfection", "analysis", ",", "where", "cotransfection", "of", "c-Rel", "augments", "the", "level", "of", "expression", "of", "a", "chloramphenicol", "acetyltransferase", "reporter", "gene", "linked", "to", "the", "CD28", "-responsive", "element", "." ]

[ "the", "functional", "significance", "of", "c-rel", "involvement", "in", "the", "cd28", "-responsive", "complex", "is", "demonstrated", "by", "transient", "transfection", "analysis", ",", "where", "cotransfection", "of", "c-rel", "augments", "the", "level", "of", "expression", "of", "a", "chloramphenicol", "acetyltransferase", "reporter", "gene", "linked", "to", "the", "cd28", "-responsive", "element", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "B-DNA_family_or_group", "I-DNA_family_or_group", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O" ]

[ "PGG-glucan", ",", "a", "soluble", "beta-", "(", "1", ",", "3", ")", "-glucan", ",", "enhances", "the", "oxidative", "burst", "response", ",", "microbicidal", "activity", ",", "and", "activates", "an", "NF-kappa", "B", "-like", "factor", "in", "human", "PMN", ":", "evidence", "for", "a", "glycosphingolipid", "beta-", "(", "1", ",", "3", ")", "-glucan", "receptor", "." ]

[ "pgg-glucan", ",", "a", "soluble", "beta-", "(", "1", ",", "3", ")", "-glucan", ",", "enhances", "the", "oxidative", "burst", "response", ",", "microbicidal", "activity", ",", "and", "activates", "an", "nf-kappa", "b", "-like", "factor", "in", "human", "pmn", ":", "evidence", "for", "a", "glycosphingolipid", "beta-", "(", "1", ",", "3", ")", "-glucan", "receptor", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-carbohydrate", "I-carbohydrate", "I-carbohydrate", "I-carbohydrate", "I-carbohydrate", "I-carbohydrate", "I-carbohydrate", "I-carbohydrate", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "B-protein_complex", "I-protein_complex", "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "O", "O", "B-carbohydrate", "I-carbohydrate", "I-carbohydrate", "I-carbohydrate", "I-carbohydrate", "I-carbohydrate", "I-carbohydrate", "I-carbohydrate", "O", "O" ]

[ "PGG-Glucan", ",", "a", "soluble", "beta-", "(", "1", ",", "6", ")", "-branched", "beta-", "(", "1", ",", "3", ")", "-linked", "glucose", "homopolymer", "derived", "from", "the", "cell", "wall", "of", "the", "yeast", "Saccharomyces", "cerevisiae", ",", "is", "an", "immunomodulator", "which", "enhances", "leukocyte", "anti-infective", "activity", "and", "enhances", "myeloid", "and", "megakaryocyte", "progenitor", "proliferation", "." ]

[ "pgg-glucan", ",", "a", "soluble", "beta-", "(", "1", ",", "6", ")", "-branched", "beta-", "(", "1", ",", "3", ")", "-linked", "glucose", "homopolymer", "derived", "from", "the", "cell", "wall", "of", "the", "yeast", "saccharomyces", "cerevisiae", ",", "is", "an", "immunomodulator", "which", "enhances", "leukocyte", "anti-infective", "activity", "and", "enhances", "myeloid", "and", "megakaryocyte", "progenitor", "proliferation", "." ]

[ "B-carbohydrate", "O", "O", "B-carbohydrate", "I-carbohydrate", "I-carbohydrate", "I-carbohydrate", "I-carbohydrate", "I-carbohydrate", "I-carbohydrate", "I-carbohydrate", "I-carbohydrate", "I-carbohydrate", "I-carbohydrate", "I-carbohydrate", "I-carbohydrate", "I-carbohydrate", "I-carbohydrate", "I-carbohydrate", "I-carbohydrate", "O", "O", "O", "B-cell_component", "I-cell_component", "O", "O", "B-mono_cell", "B-mono_cell", "I-mono_cell", "O", "O", "O", "B-other_name", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Incubation", "of", "human", "whole", "blood", "with", "PGG-Glucan", "significantly", "enhanced", "the", "oxidative", "burst", "response", "of", "subsequently", "isolated", "blood", "leukocytes", "to", "both", "soluble", "and", "particulate", "activators", "in", "a", "dose-dependent", "manner", ",", "and", "increased", "leukocyte", "microbicidal", "activity", "." ]

[ "incubation", "of", "human", "whole", "blood", "with", "pgg-glucan", "significantly", "enhanced", "the", "oxidative", "burst", "response", "of", "subsequently", "isolated", "blood", "leukocytes", "to", "both", "soluble", "and", "particulate", "activators", "in", "a", "dose-dependent", "manner", ",", "and", "increased", "leukocyte", "microbicidal", "activity", "." ]

[ "O", "O", "B-tissue", "I-tissue", "I-tissue", "O", "B-carbohydrate", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "B-other_name", "B-other_name", "I-other_name", "O" ]

[ "No", "evidence", "for", "inflammatory", "cytokine", "production", "was", "obtained", "under", "these", "conditions", "." ]

[ "no", "evidence", "for", "inflammatory", "cytokine", "production", "was", "obtained", "under", "these", "conditions", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-other_name", "B-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Electrophoretic", "mobility", "shift", "assays", "demonstrated", "that", "PGG-Glucan", "induced", "the", "activation", "of", "an", "NF-kappaB", "-like", "nuclear", "transcription", "factor", "in", "purified", "human", "neutrophils", "." ]

[ "electrophoretic", "mobility", "shift", "assays", "demonstrated", "that", "pgg-glucan", "induced", "the", "activation", "of", "an", "nf-kappab", "-like", "nuclear", "transcription", "factor", "in", "purified", "human", "neutrophils", "." ]

[ "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O", "O", "B-carbohydrate", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_complex", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "O" ]

[ "The", "binding", "of", "3", "H-", "PGG-Glucan", "to", "human", "leukocyte", "membranes", "was", "specific", ",", "concentration-dependent", ",", "saturable", ",", "and", "high", "affinity", "(", "Kd", "approximately", "6", "nM", ")", "." ]

[ "the", "binding", "of", "3", "h-", "pgg-glucan", "to", "human", "leukocyte", "membranes", "was", "specific", ",", "concentration-dependent", ",", "saturable", ",", "and", "high", "affinity", "(", "kd", "approximately", "6", "nm", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-carbohydrate", "B-carbohydrate", "O", "B-cell_component", "I-cell_component", "I-cell_component", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "A", "monoclonal", "antibody", "specific", "to", "the", "glycosphingolipid", "lactosylceramide", "was", "able", "to", "inhibit", "activation", "of", "the", "NF-kappaB", "-like", "factor", "by", "PGG-Glucan", ",", "and", "ligand", "binding", "data", ",", "including", "polysaccharide", "specificity", ",", "suggested", "that", "the", "PGG-Glucan", "binding", "moiety", "was", "lactosylceramide", "." ]

[ "a", "monoclonal", "antibody", "specific", "to", "the", "glycosphingolipid", "lactosylceramide", "was", "able", "to", "inhibit", "activation", "of", "the", "nf-kappab", "-like", "factor", "by", "pgg-glucan", ",", "and", "ligand", "binding", "data", ",", "including", "polysaccharide", "specificity", ",", "suggested", "that", "the", "pgg-glucan", "binding", "moiety", "was", "lactosylceramide", "." ]

[ "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "B-lipid", "B-lipid", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_complex", "O", "O", "O", "B-carbohydrate", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-carbohydrate", "O", "O", "O", "O", "O", "B-carbohydrate", "O", "O", "O", "B-lipid", "O" ]

[ "These", "results", "indicate", "that", "PGG-Glucan", "enhances", "neutrophil", "anti-microbial", "functions", "and", "that", "interaction", "between", "this", "beta-glucan", "and", "human", "neutrophils", "is", "mediated", "by", "the", "glycosphingolipid", "lactosylceramide", "present", "at", "the", "cell", "surface", "." ]

[ "these", "results", "indicate", "that", "pgg-glucan", "enhances", "neutrophil", "anti-microbial", "functions", "and", "that", "interaction", "between", "this", "beta-glucan", "and", "human", "neutrophils", "is", "mediated", "by", "the", "glycosphingolipid", "lactosylceramide", "present", "at", "the", "cell", "surface", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-carbohydrate", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "B-carbohydrate", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "O", "O", "B-lipid", "B-lipid", "O", "O", "O", "B-cell_component", "I-cell_component", "O" ]

[ "IL-12", "induces", "IFN", "regulating", "factor-1", "(", "IRF-1", ")", "gene", "expression", "in", "human", "NK", "and", "T", "cells", "." ]

[ "il-12", "induces", "ifn", "regulating", "factor-1", "(", "irf-1", ")", "gene", "expression", "in", "human", "nk", "and", "t", "cells", "." ]

[ "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O" ]

[ "IL-12", "is", "a", "critical", "immunoregulatory", "cytokine", "that", "promotes", "cell-mediated", "immune", "responses", "and", "the", "differentiation", "of", "naive", "CD4+", "cells", "to", "Th1", "cells", ";", "however", ",", "relatively", "few", "IL-12", "target", "genes", "have", "been", "identified", "." ]

[ "il-12", "is", "a", "critical", "immunoregulatory", "cytokine", "that", "promotes", "cell-mediated", "immune", "responses", "and", "the", "differentiation", "of", "naive", "cd4+", "cells", "to", "th1", "cells", ";", "however", ",", "relatively", "few", "il-12", "target", "genes", "have", "been", "identified", "." ]

[ "B-protein_molecule", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "To", "better", "clarify", "the", "molecular", "basis", "of", "IL-12", "action", ",", "we", "set", "out", "to", "characterize", "genes", "up-regulated", "by", "IL-12", ",", "first", "by", "contrasting", "IL-12", "-and", "IFN", "-alpha-inducible", "genes", "." ]

[ "to", "better", "clarify", "the", "molecular", "basis", "of", "il-12", "action", ",", "we", "set", "out", "to", "characterize", "genes", "up-regulated", "by", "il-12", ",", "first", "by", "contrasting", "il-12", "-and", "ifn", "-alpha-inducible", "genes", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_family_or_group", "O", "O", "O" ]

[ "We", "identified", "several", "genes", "up-regulated", "by", "IL-12", ",", "namely", ",", "MIP-1alpha", ",", "MIP-1beta", ",", "IL-1RA", ",", "and", "IFN", "regulatory", "factor-1", "(", "IRF-1", ")", "." ]

[ "we", "identified", "several", "genes", "up-regulated", "by", "il-12", ",", "namely", ",", "mip-1alpha", ",", "mip-1beta", ",", "il-1ra", ",", "and", "ifn", "regulatory", "factor-1", "(", "irf-1", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "B-protein_molecule", "O", "O" ]

[ "IRF-1", "is", "a", "transcription", "factor", "regulated", "by", "IFNs", "that", "is", "also", "essential", "for", "Th1", "responses", "." ]

[ "irf-1", "is", "a", "transcription", "factor", "regulated", "by", "ifns", "that", "is", "also", "essential", "for", "th1", "responses", "." ]

[ "B-protein_molecule", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "O", "O" ]

[ "We", "demonstrated", "that", "IL-12", "directly", "up-regulates", "IRF-1", "to", "the", "same", "extent", "as", "IFN-alpha", "in", "normal", "human", "T", "cells", "and", "in", "NK", "cells", "." ]

[ "we", "demonstrated", "that", "il-12", "directly", "up-regulates", "irf-1", "to", "the", "same", "extent", "as", "ifn-alpha", "in", "normal", "human", "t", "cells", "and", "in", "nk", "cells", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-other_name", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O" ]

[ "We", "showed", "that", "IL-12", "had", "a", "direct", "effect", "on", "IRF-1", ",", "an", "effect", "not", "mediated", "indirectly", "by", "the", "induction", "of", "IFN-gamma", "production", "." ]

[ "we", "showed", "that", "il-12", "had", "a", "direct", "effect", "on", "irf-1", ",", "an", "effect", "not", "mediated", "indirectly", "by", "the", "induction", "of", "ifn-gamma", "production", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O" ]