알지노믹스 분기보고서 (2025.09)
2. 주요 제품 및 서비스

가. RNA 치환효소 기술 (1) 기술의 정의 라이보자임(ribozyme)이란 효소 활성을 갖고 있는 RNA 분자를 말하며, RNA 치환효소(trans-splicing ribozyme)라고도 합니다. 미국 콜로라도대학교의 토머스 R. 체크 교수팀은 원생생물인 '테트라하이메나'의 rRNA의 스플라이싱 작용을 관찰하며 인트론(intron) RNA가 스스로를 절단하고 엑손(exon)을 연결하는 작용을 발견했고 이 사실을 국제학술지 '셀(Cell)'에 발표했습니다. 기존에는 생체 내에서 화학 반응을 촉진하는 역할을 단백질만 할 수 있다고 생각했으나, 1982년 라이보자임의 발견으로 RNA도 스스로 촉매 역할을 할 수 있다는 사실이 밝혀진 것입니다. 이로 인해 'RNA도 효소처럼 작용할 수 있다'는 새로운 개념이 확립되었고, 토머스 체크 교수는 1989년 노벨 화학상을 수상했습니다.라이보자임의 발견은 유전정보의 전달과 촉매 작용의 역할을 동시에 수행하는 물질의 개발 가능성을 열었고, 그 후속연구는 RNA 치환효소로 이어졌습니다. RNA 치환효소는 질환의 원인 또는 연관 표적 RNA를 특이적으로 인지 및 절단하여 유전자 발현을 낮춤과 동시에 치료용 RNA로의 치환을 통하여 치료용 유전자 발현을 표적 특이적으로 유도하는 RNA 편집/교정 모달리티 기술입니다.

출처: 내부자료

RNA 스플라이싱은 생명체에서 단백질을 만드는 과정에서 필수적으로 일어나는 자연적인 생명 현상입니다. 유전자(DNA)에서 전사된 RNA가 단백질로 만들어지기 전에 불필요한 부분(인트론)을 잘라내고 필요한 부분(엑손)만 연결하는 편집 과정을 의미합니다. 체내 RNA 스플라이싱 과정은 다양한 단백질과 RNA들의 복합체들의 순차적인 과정에 의해 이루어집니다.반면, 테트라하이메나는 불필요하다고 알려진 인트론이 자체적으로 독특한 구조를 형성하여 다른 단백질이나 RNA들의 도움 없이 스스로 스플라이싱 과정을 완성합니다.

테트라하이메나의 인트론은 group I intron으로 분류될 수 있으며, RNA 치환효소는 테트라하이메나의 group I intron 서열을 이용하여 표적 RNA를 편집·교정하기 위해 인공적으로 설계한 기술입니다. 자연적인 RNA 스플라이싱은 한 개의 RNA 내에서 편집이 일어나지만, RNA 치환효소는 서로 다른 두 개의 RNA를 이어 붙이는 하나의 분자가 2가지 기능을 나타내는 독특한 특성을 가집니다. 이러한 특성을 이용하여 질병의 원인이 되는 유전자를 RNA 수준에서 편집·교정하여 치료 목적에 적합하게 발전시킨 첨단 기술이라고 볼 수 있습니다.

(2) 기술의 특성당사는 RNA 치환효소 기반의 RNA 편집/교정 모달리티 플랫폼을 구축하였으며, 기존 DNA/RNA 기술의 장점은 유지하면서도 한계점을 극복할 수 있는 기술로 주목받고 있습니다.당사는 RNA mapping 기술과 RNA 치환효소 구조체 최적화를 통하여 효율성, 특이성 및 정확도를 향상시켰으며, off-target을 최소화하여, RNA 치환효소의 효율성 및 안전성을 치료제로써 활용 가능하도록 크게 향상시켰으며 다음과 같은 특징을 보유하고 있습니다.

구분	내용

질환 관련 RNA 특이적 표적	작은 분자나 항체 등이 표적하기 어려운 표적분자를 RNA 수준에서 표적하여 기존의 약물로는 효과적으로 결합하거나 조절하기 어려운 생체 내 표적 분자 또는 유전자(non-druggable target)의 표적이 가능

Dual Function	하나의 분자가 표적 RNA의 절단과 치료용 유전자로의 편집/교정을 동시에 수행하여 표적 유전자의 발현 감소 유도 및 치료 유전자 발현을 동시에 수행함으로써 매우 효율적으로 약물 활성을 나타냄

표적 RNA 발현 조직 특이적 치료 유전자 발현 유도	RNA 치환효소는 높은 특이성을 기반으로 표적 RNA를 발현하는 세포/조직 특이적 편집/교정을 통해 조직 특이적 치료 유전자 발현을 유도표적 RNA가 없는 비표적 세포/조직에서 작동하지 않기에, 불필요한 치료 유전자 발현을 유도하지 않아 치료 유전자의 비특이적 발현에 의한 부작용 최소화

치료 유전자 발현 조절	표적 RNA 발현양에 비례하여 치료 유전자 발현을 유도함으로써 불필요한 치료 유전자의 과발현을 유도하지 않음. 치료 유전자인 정상 유전자의 과발현으로 인한 독성 및 다른 질환이 발생하는 경우, 자연적인 세포 내(endogenous cellular) RNA 발현 수준을 유지함으로써, 부작용의 최소화가 가능

지속적인 발현 양 조절	라이보자임 RNA를 발현하는 DNA 바이러스 벡터를 전달체(delivery vehicle)로 사용하여 세포내에서 치료제인 라이보자임 RNA를 지속적으로 발현이 가능

돌연변이 유전자 보정/유전독성 최소화	RNA 수준에서 유전자의 편집/교정으로 유전독성(genome toxicity) 유발 가능성이 없으며, DNA 교정 기술에서 혹여나 발생할 수 있는 DNA 교정 오류로 인한 영속적인 게놈(genome) 변화의 우려가 없음

높은 효과성(High Performance)	외부 단백질 또는 세포 내에 내재해 있는 세포 내 기구(cellular machinery)를 이용하지 않고 RNA 자체 기전으로 작동하여 매우 효과적이며 안전적으로 작용 가능

모듈화된 설계(Modular Engineering)	표적 RNA를 인지하는 부위 및 편집/교정에 사용되는 치료용 유전자를 손쉽게 교체 가능하며, 이를 통해 다양한 질환에 적용이 가능하며, 이미징/theranostics/세포치료제 등 다양한 분야로의 활용 가능

다양한 돌연변이 표적	돌연변이 발생 부위 앞쪽을 표적하여 하나의 치료제로 다양한 돌연변이를 편집/교정 및 치료 가능

(3) 기술의 활용당사는 RNA 치환효소를 활용한 신약개발 프로세스를 구축하여 운용하고 있으며, 신약개발 타겟 선정부터 물질 최적화, 비임상·임상시험까지의 신약개발 전주기에 걸친 체계적인 개발을 통해 신약 후보물질 도출을 진행중에 있습니다. 타겟 적응증이 결정되면, RNA mapping 기술을 통해 표적 RNA에 대하여 가장 높은 편집·교정 효율을 나타내는 타겟 사이트를 발굴하여 표적 특이 RNA 치환효소를 도출하고, RNA 치환효소 구조체를 최적화하는 과정을 거칩니다. 이후 벡터 최적화 과정을 통해 해당 RNA 치환효소의 편집·교정 효율을 높이고 특이적으로 작용할 수 있도록 하며, RNA 치환효소를 타겟 세포에 전달하는 역할을 하는 전달체인 바이러스 벡터를 스크리닝하여 최종적으로 후보물질을 도출합니다.

출처: 내부자료

현재 개발중인 신약개발 파이프라인은 「Ⅱ. 사업의 내용 - 2. 주요 제품 및 서비스 - 나. 주요 제품 등의 현황」을 참고하시기 바랍니다.

(4) 기술의 확장 : 원형 RNA 플랫폼 당사는 RNA 치환효소의 자체 작동 기전을 응용하여 원형 RNA를 생성할 수 있는 신규 플랫폼을 도출하였습니다. 당사가 독자적으로 개발한 원형 RNA 기술은 다음과 같은 특징을 보유하고 있습니다.

구분	내용

안정성	선형 RNA는 양쪽 끝이 노출되어 있어 체내 효소에 의해 쉽게 분해되는 반면, 원형 RNA는 끝이 연결된 고리 형태이므로 안정적으로 오래 지속됨

안전성	적은 양만 투여해도 오랫동안 효능을 발휘할 수 있어, 불필요한 면역반응을 줄이고 부작용을 최소화함

효율성	원형 RNA는 단백질 생산을 시작하고 끝내는 지점이 가까이 위치하므로, 단백질 생산을 담당하는 소기관인 리보솜이 여러번 작용할 수 있음. 이로 인해 같은 시간 동안 더 많은 양의 단백질을 효율적으로 생산할 수 있음

원형 RNA를 생성하는 기술은 크게 세 가지로 분류됩니다. ① 화학적 반응으로 RNA 양 말단을 접합하는 방법, ② RNA 연결 효소를 이용해 양 말단을 접합하는 방법, ③ 라이보자임 기술을 이용하여 RNA가 스스로 원형 RNA를 생성하는 방법이 주로 사용되고 있습니다.이 중 ③ 라이보자임 기술을 이용한 원형 RNA 생성 기술이 앞서 개발되고 있으나, 해당 기술은 원형화에 사용된 일부 서열이 최종적으로 완성된 원형 RNA에 남게 되는 한계점이 있습니다.당사의 RNA 치환효소 기반 자가환형화 RNA 기술은 RNA 치환효소가 자기 자신을 표적하여 자체 기전을 통해 원형 RNA를 생성하는 방식입니다. 불필요한 외부 서열이 남지 않는 원형 RNA를 생성할 수 있어, 기존 기술의 한계점을 극복한 것으로 평가받고 있습니다.

출처: 내부자료

이처럼 당사가 보유한 원형 RNA 플랫폼은 기존의 선형 RNA와 라이보자임 기반 원형 RNA 생성 기술을 보완하고 발전시킨 기술입니다. 높은 안정성, 단백질 발현 효율을 기반으로 RNA 치료제 및 백신 등의 개발에 활용될 것으로 주목받고 있습니다.

나. 주요 제품 등의 현황당사는 First in Class 혁신신약의 개발을 위해 플랫폼 기술인 RNA 치환효소 기반 RNA 편집·교정 기술을 이용하여 RNA 치환기술에 의한 치료효과의 유도가 가능한 적응증에 대해 연구개발을 진행하고 있습니다.당사의 주요 파이프라인 개발 현황은 아래와 같습니다.

(1) RZ-001 항암 유전자치료제 (가) 작동 기전RZ-001은 암의 원인 또는 암에서 과발현되는 유전자의 RNA를 표적하여 발현을 낮춤과 동시에 항암 효과를 일으킬 수 있는 항암 유전자 RNA로 치환하여 항암 효과를 유도합니다. 표적 RNA 발현 세포/조직 특이적으로 작동하여 암세포 특이적 항암 RNA 발현을 통한 항암능 발휘로 암 특이성 및 정상세포에 대한 안전성을 확보합니다. 90% 이상의 암세포에서 발현되는 텔로머라제(Telomerase)의 주요 구성요소인 hTERT(human telomerase reverse transcriptase) RNA를 표적하는 RNA 치환효소 기반 항암 유전자치료제이며, 생체 내 전달을 위해 아데노바이러스 5 혈청형 (Adenovirus type 5)을 사용합니다.

출처: 내부자료

(나) 개발 배경1) 교모세포종 치료제교모세포종은 여전히 Best-in-Class 치료제가 부재한 미충족 의료수요가 매우 큰 암종입니다. 현재 표준치료로는 수술 이후 방사선 및 TMZ 기반의 보조요법이 사용되지만, MGMT 프로모터가 메틸화되지 않은 환자군에서는 TMZ 효과가 현저히 낮은 것으로 알려져 있습니다. 그럼에도 불구하고, 치료 옵션의 부재로 인해, MGMT 비메틸화 환자군에서도 여전히 TMZ가 사용되고 있으며, 이에 해당하는 환자는 전체 교모세포종 환자의 약 40~70%에 달합니다. 이에 따라 TMZ 불응 환자군을 위한 새로운 치료 옵션 개발이 시급한 상황입니다.당사는 이종이식(xenograft) 마우스 뇌암 동소이식(orthotopic) 모델에서 RZ-001의 종양내(intratumoral) 단회 투여 전임상 효력 시험에서 용량 상관적 종양성장 억제 항암 효능과 생존율 증가 효과를 확인하였습니다.기존 교모세포종 치료제인 테모달(Temodar, Temozolomide) 저항성 재발 환자유래 이종이식(PDX, Patient-Derived Xenograft) 마우스 모델에서 용량 상관적인 생존율 증가 항암 효능을 확인하여 기존 치료제 대비 우수한 항암 효능을 확인하였으며, GLP(Good Laboratory Practice) 독성 및 생체 내 분포 평가 수행으로 안전성 데이터를 확보하였습니다. 한국 식약처 및 미국 FDA로부터 임상 1/2a상 승인을 받았으며 미국 FDA로부터 패스트트랙과 희귀의약품 지정을 받은 바 있습니다. 국내 임상 유효성 및 안전성 데이터 확보 후 한국을 포함한 미국으로의 임상시험 확장을 계획하고 있습니다.또한, 미국 FDA로부터 교모세포종 환자 대상의 동정적 사용(EAP, Expanded Access Program) 승인을 받아, 적절한 치료제가 없어 치료를 포기할 상황의 환자들에게 새로운 치료 옵션을 제공하기 위해 진행중입니다.

2) 간세포암 치료제간세포암종은 환자의 전신 상태, 간 기능, 종양 특성을 종합적으로 고려하여 BCLC 병기로 분류되며, 각 병기별로 권장되는 1차 치료 옵션이 존재합니다. RZ-001은 현재 BCLC 병기 B에서 D에 해당하는 환자군을 목표로 개발 중입니다.당사는 이종이식 마우스 간암 모델에서 RZ-001의 정맥 내(intravenous) 또는 종양 내 단회 투여 전임상 효력 시험에서 용량 상관적 종양성장 억제 항암 효능과 인간화 마우스 간암 모델에서 종양 내 면역세포 침윤(immune cell infiltration) 유도 효과를 확인하였습니다.

(다) 연구개발 현황RZ-001은 항암 효력 및 안전성 데이터를 기반으로 한국 식약처 및 미국 FDA로부터면역항암제 병용 요법에 대하여 임상 1b/2a상 승인을 받았으며, 미국 FDA로부터 희귀의약품과 패스트트랙 지정을 받은 바 있습니다. RZ-001과 면역항암제 병용 임상은 국내 임상 1b/2a상이 진행 중이며 환자 모집 및 투약이 진행되고 있습니다. 국내 임상 유효성 및 안전성 데이터 확보 후 한국을 포함한 미국으로의 임상시험 확장을 계획하고 있습니다.RZ-001은 대다수의 암세포에서 발현되는 텔로머라제 mRNA를 표적하기에 하나의 물질로 다양한 암종으로의 적응증 확대가 가능합니다. 현재 기타 암 질환으로 적응증 확장을 위한 전임상 연구를 진행하고 있으며, 전임상 효능 및 안전성 데이터 구축을 기반으로 임상시험계획 제출하고 임상 단계에 진입할 계획입니다.한편, 당사는 2024년 중소벤처기업부 주관 창업성장기술개발사업에 선정되어 텔로머라제 발현 암종을 대상으로 한 국책과제를 수행하였으며, RZ-001에 의한 높은 항암 효력을 나타내는 암종을 대상으로 전임상 시험을 계획 중에 있습니다. (2) RZ-003 알츠하이머병 유전자치료제(가) 작동 기전RZ-003은 알츠하이머 질환에서 주요 인자로 알려지고 있는 아포지단백 E(Apolipoprotein E, APOE)의 유전형질 중, 위험인자(risk factor)로 알려진 아포지단백 E4(APOE4) 유전자 RNA를 표적하여 이로운 인자(benefit factor)로 알려진 아포지단백 E2(APOE2) 또는 아포지단백 E3ch(APOE3ch) 등으로 편집/교정하여 치료 효과를 유도하는 치료제입니다. 생체 내 전달을 위해 아데노-부속 바이러스(Adeno-Associated Virus, AAV)를 사용하고 있습니다.

출처: 내부자료(나) 개발 배경

현재 알츠하이머 치료제 시장은 증상 완화를 목적으로 한 약물 중심으로 구성되어 있으며, 아직까지 의미 있는 시장이 형성되지 못한 상황입니다. 특히, 질병이 진행되기 이전 단계를 타깃하는 근원 치료제는 전무한 상황입니다.RZ-003은 알츠하이머의 강력한 유전적 위험인자로 알려진 APOE4 유전자를 보유한 환자군을 주요 타깃으로 하며, 이는 초기 단계 알츠하이머 환자의 약 40%를 차지합니다. 당사는 기존 치료제가 커버하지 못하는 환자를 포함하는 First-in-Class 신약 개발을 목표로 하고 있습니다. (다) 연구개발 현황APOE RNA 특이 표적 트랜스-스플라이싱 라이보자임 구조체 최적화를 통한 후보물질 도출 단계에 있습니다.

(3) RZ-004 유전성 망막색소변성증 유전자치료제(가) 작동 기전RZ-004는 광수용체 세포(photoreceptor cell, PR)에서 특이적으로 발현하는 로돕신(rhodopsin, RHO) 돌연변이 유전자의 RNA를 표적하여 돌연변이 유전자의 발현을 낮춤과 동시에 정상 로돕신 RNA로 편집·교정하여 치료 효과를 유도하는 치료제입니다. RNA 치환효소 자체 기전을 통해 표적 RNA의 세포 내 발현양에 따른 치료용 정상 단백질 발현을 유도하여 정상 로돕신 단백질의 과 발현에 의한 독성 유도가 없으며 표적 RNA 발현 조직 특이적으로 치료용 단백질의 표적 특이적 발현 유도를 통한 안전성을 확보하였습니다. 생체 내 전달을 위해 아데노-부속 바이러스 5 혈청형을 사용하고 있습니다.

출처: 내부자료(나) 개발 배경

망막색소변성증은 점진적으로 시력을 상실하게 되는 진행성 유전성 망막질환으로, 현재까지 의미있는 치료제가 존재하지 않는 미충족 시장입니다. RHO는 유전 양상에 따라 상염색체 우성, 상염색체 열성, X-연관 유전 등으로 구분되며, 이 중 상염색체 우성 망막색소변성증(AdRP)은 전체 환자의 약 15~20%를 차지합니다. AdRP 환자군 내에서 RHO 유전자는 약 30.7%로 가장 높은 비중을 차지하고 있습니다. RHO 유전자는 현재까지 150개 이상의 변이 타입이 보고되고 있어, 단일 교정 기반 치료 접근으로는 다양한 환자군을 포괄하기 어렵습니다. (다) 연구개발 현황

RZ-004는 멀티 RNA 교정 플랫폼 기반의 치료제로, 다양한 RHO 유전자 돌연변이를 동시에 타깃할 수 있는 기술적 차별성을 보유하고 있습니다. 이를 통해 복잡한 변이 스펙트럼을 가진 AdRP 환자군을 단일 치료제로 폭넓게 적용할 수 있다는 강점을 가지고 있습니다. 돌연변이 인간 로돕신 유전자가 도입된 질환 마우스 모델을 활용하여 단회 망막하 투여(sub-retinal injection)에 의한 시력 회복 효과를 확인한 바 있으며, 전임상 시험 결과를 바탕으로 호주 연방의약품관리국(Therapeutic Goods Administration, TGA)에서 임상 1/2a상 IND 승인을 받았습니다.

(4) 유전성 난청 치료제 (가) 개발 배경당사는 일라이 릴리(Eli Lilly) 사와 2025년 5월 13일 총 계약규모 1.9조 원 규모의 희귀 난청질환 RNA 편집 치료제의 연구협력 및 라이센스 계약을 체결하였습니다.일라이 릴리는 미국 NYSE에 상장된 글로벌 제약회사로, 비만, 당뇨 등 대사질환 영역에서 RNA 치료제를 도입하면서 그 시장성을 확인하고 관련 분야 연구개발에 대한 투자를 확대하는 기업입니다. 2022년에는 유전성 난청 질환 시장 내 지위를 확보하기 위하여 난청질환 전문 유전자치료제 개발사인 Akouos사를 인수하여 난청질환 유전자치료제의 임상개발 인프라를 확보하였으며, 그후 생리학적인 특징을 고려하여 난청 유전질환의 기전적 강점이 있는 라이보자임 플랫폼 기반 RNA 편집/교정 치료물질 확보를 위하여 동사와 기술이전 계약을 체결한 것입니다. 양사는 협업을 통해 유전성 난청질환에 대한 RNA 편집 치료제의 발굴 및 개발을 추진하며, 알지노믹스는 초기 연구개발(R)을 수행하고, 릴리는 후속 개발 및 상업화를 담당할 계획입니다. (나) 연구개발 현황상세 현황은 양사간 체결된 비밀유지계약에 따라 비공개합니다.

다. 제품별 매출실적(단위: 백만원)

매출유형	품목	제9기 3분기(2025년 3분기)	제8기(2024년)	제7기(2023년)

건수	금액	비중	건수	금액	비중	건수	금액	비중

기술이전	유전성 난청 치료제	수출	1	7,002	99%	-	-	-	-	-	-

내수	-	-	-	-	-	-	-	-	-

계	1	7,002	99%	-	-	-	-	-	-

연구용역 등	RZ-003	수출	1	88	1%

내수	-	-	-

계	1	88	1%

RZ-004	수출	-	-	-	-	-	-	1	78	54%

내수	-	-	-	-	-	-	-	-	-

계	-	-	-	-	-	-	1	78	54%

RZ-005	수출	-	-	-	-	-	-	1	66	46%

내수	-	-	-	-	-	-	-	-	-

계	-	-	-	-	-	-	1	66	46%

합 계	2	7,090	100%	-	-	-	2	144	100%