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온코크로스 분기보고서 (2026.03)
분 기 보 고 서

(제 12 기)

사업연도 2026년 01월 01일 부터
2026년 03월 31일 까지

금융위원회
한국거래소 귀중 2026 년 5 월 14 일

제출대상법인 유형 : 주권상장법인
면제사유발생 : 해당사항 없음

회 사 명 : 주식회사 온코크로스
대 표 이 사 : 김이랑 / 강지훈 (각자 대표이사)
본 점 소 재 지 : 서울특별시 송파구 법원로11길 7, 905호 (문정동, 문정현대지식산업센터 1-2)
(전 화) 02-867-9967
(홈페이지) http://www.oncocross.com
작 성 책 임 자 : (직 책) 상무이사 (성 명) 채희진
(전 화) 02-867-9967
목 차

【 대표이사 등의 확인 】 ----------------------- 1
I. 회사의 개요 ----------------------- 2
1. 회사의 개요 ----------------------- 2
2. 회사의 연혁 ----------------------- 3
3. 자본금 변동사항 ----------------------- 4
4. 주식의 총수 등 ----------------------- 4
5. 정관에 관한 사항 ----------------------- 5
II. 사업의 내용 ----------------------- 6
1. 사업의 개요 ----------------------- 6
2. 주요 제품 및 서비스 ----------------------- 8
3. 원재료 및 생산설비 ----------------------- 11
4. 매출 및 수주상황 ----------------------- 13
5. 위험관리 및 파생거래 ----------------------- 16
6. 주요계약 및 연구개발활동 ----------------------- 21
7. 기타 참고사항 ----------------------- 31
III. 재무에 관한 사항 ----------------------- 42
1. 요약재무정보 ----------------------- 42
2. 연결재무제표 ----------------------- 45
3. 연결재무제표 주석 ----------------------- 51
4. 재무제표 ----------------------- 78
5. 재무제표 주석 ----------------------- 83
6. 배당에 관한 사항 ----------------------- 109
7. 증권의 발행을 통한 자금조달에 관한 사항 ----------------------- 112
7-1. 증권의 발행을 통한 자금조달 실적 ----------------------- 112
7-2. 증권의 발행을 통해 조달된 자금의 사용실적 ----------------------- 115
8. 기타 재무에 관한 사항 ----------------------- 117
IV. 이사의 경영진단 및 분석의견 ----------------------- 123
V. 회계감사인의 감사의견 등 ----------------------- 124
1. 외부감사에 관한 사항 ----------------------- 124
2. 내부통제에 관한 사항 ----------------------- 125
VI. 이사회 등 회사의 기관에 관한 사항 ----------------------- 126
1. 이사회에 관한 사항 ----------------------- 126
2. 감사제도에 관한 사항 ----------------------- 126
3. 주주총회 등에 관한 사항 ----------------------- 126
VII. 주주에 관한 사항 ----------------------- 130
1. 최대주주 및 특수관계인의 주식소유 현황 ----------------------- 130
2. 최대주주의 주요경력 및 개요 ----------------------- 130
3. 최대주주의 변동내역 ----------------------- 131
4. 주식의 분포 ----------------------- 131
VIII. 임원 및 직원 등에 관한 사항 ----------------------- 133
1. 임원 및 직원 등의 현황 ----------------------- 133
2. 임원의 보수 등 ----------------------- 134
IX. 계열회사 등에 관한 사항 ----------------------- 135
X. 대주주 등과의 거래내용 ----------------------- 136
1. 최대주주등에 대한 신용공여 등 ----------------------- 136
2. 최대주주와의 자산양수도 등 ----------------------- 136
3. 대주주와의 영업거래 ----------------------- 136
4. 대주주 이외의 이해관계자와의 거래 ----------------------- 136
XI. 그 밖에 투자자 보호를 위하여 필요한 사항 ----------------------- 137
1. 공시내용 진행 및 변경사항 ----------------------- 137
2. 우발부채 등에 관한 사항 ----------------------- 137
3. 제재 등과 관련된 사항 ----------------------- 138
4. 작성기준일 이후 발생한 주요사항 등 기타사항 ----------------------- 138
XII. 상세표 ----------------------- 139
1. 연결대상 종속회사 현황(상세) ----------------------- 139
2. 계열회사 현황(상세) ----------------------- 139
3. 타법인출자 현황(상세) ----------------------- 140
【 전문가의 확인 】 ----------------------- 140
1. 전문가의 확인 ----------------------- 140
2. 전문가와의 이해관계 ----------------------- 140
1. 회사의 개요

회사의 개요는 기업공시서식 작성기준에 따라 분기보고서에 기재하지 않습니다.

1. 연결대상 종속회사 개황(연결재무제표를 작성하는 주권상장법인이 사업보고서, 분기ㆍ반기보고서를 제출하는 경우에 한함)연결대상 종속회사 현황(요약)

(단위 : 사)

구분	연결대상회사수	주요종속회사수

기초	증가	감소	기말

상장	-	-	-	-	-

비상장	1	-	-	1	1

합계	1	-	-	1	1

※상세 현황은 '상세표-1. 연결대상 종속회사 현황(상세)' 참조

1-1. 연결대상회사의 변동내용

구 분	자회사	사 유

신규연결	-	-

-	-

연결제외	-	-

-	-

중소기업 등 해당 여부

중소기업 해당 여부	해당

벤처기업 해당 여부	해당

중견기업 해당 여부	미해당

(1) 중소기업 해당 여부(2) 벤처기업 해당 여부

회사의 주권상장(또는 등록ㆍ지정) 및 특례상장에 관한 사항

주권상장(또는 등록ㆍ지정)현황	주권상장(또는 등록ㆍ지정)일자	특례상장 유형

코스닥시장 상장	2024년 12월 18일	기술성장기업의 코스닥시장 상장
2. 회사의 연혁

회사의 연혁은 기업공시서식 작성기준에 따라 분기보고서에 기재하지 않습니다.

경영진 및 감사의 중요한 변동

변동일자	주총종류	선임	임기만료또는 해임

신규	재선임

2021년 06월 22일	임시주총	-	사내이사 김이랑	-

2021년 10월 05일	임시주총	사외이사 류재용	-	사내이사 채희진(사임)

2022년 08월 16일	-	-	-	사외이사 류재용(사임)

2023년 03월 31일	정기주총	-	사내이사 박승현 사내이사 김형찬 사외이사 권용욱 감사 조한국	-

2024년 03월 29일	정기주총	-	사내이사 김이랑	-

2025년 03월 28일	정기주총	사내이사 강지훈사내이사 채희진	-	사내이사 박승현(사임)사내이사 김형찬(사임)

2026년 03월 27일	정기주총	사외이사 이병하	감사 조한국	사외이사 권용욱
3. 자본금 변동사항

기업공시서식 작성기준에 따라 분기보고서에 기재하지 않습니다.
4. 주식의 총수 등

가. 주식의 총수 현황

(기준일 : 2026년 03월 31일 ) (단위 : 주, %)

구 분	주식의 종류	비고

보통주식	종류주식	합계

Ⅰ. 발행할 주식의 총수	25,000,000	25,000,000	50,000,000	-

Ⅱ. 현재까지 발행한 주식의 총수	12,195,957	2,163,461	14,359,418	-

Ⅲ. 현재까지 감소한 주식의 총수	-	2,163,461	2,163,461	-

1. 감자	-	-	-	-

2. 이익소각	-	-	-	-

3. 상환주식의 상환	-	-	-	-

4. 기타	-	2,163,461	2,163,461	-

Ⅳ. 발행주식의 총수 (Ⅱ-Ⅲ)	12,195,957	-	12,195,957	-

Ⅴ. 자기주식수	-	-	-	-

Ⅵ. 유통주식수 (Ⅳ-Ⅴ)	12,195,957	-	12,195,957	-

Ⅶ. 자기주식 보유비율	-	-	-	-

나. 자기주식 취득 및 처분 현황 보고서 작성기준일 현재 해당사항 없습니다.

다. 자기주식 직접 취득ㆍ처분 현황 보고서 작성기준일 현재 해당사항 없습니다.

라. 자기주식 신탁계약 체결ㆍ해지 이행현황 보고서 작성기준일 현재 해당사항 없습니다.

마. 자기주식 보유현황 보고서 작성기준일 현재 해당사항 없습니다.

바. 종류주식(명칭) 발행현황 보고서 작성기준일 현재 해당사항 없습니다.

사. 발행 이후 전환권 행사 보고서 작성기준일 현재 해당사항 없습니다.
5. 정관에 관한 사항

회사의 정관에 관한 사항은 기업공시서식 작성기준에 따라 분기보고서에 기재하지 않습니다.
1. 사업의 개요

당사는 전통적인 신약 개발 방식에 요구되는 장기간의 시간과 막대한 연구비 및 이에 따른 리스크로 인해 신약 개발의 효율성이 저하되고 있다는 문제의식에서 출발하여, 신약개발의 효율성을 높이기 위해 AI 플랫폼 개발에 집중해 왔습니다.

당사는 국내 최초로 약물 투여 또는 질병 발생에 따른 유전자 발현 데이터(전사체, Transcriptome) 변화를 AI로 분석하여 최적의 질병과 치료제를 매칭하여 주는 RAPTOR AI를 개발, 운용하고 있습니다. RAPTOR AI는 약물의 최적 적응증 또는 병용 약물을 스크리닝하고, 질병에서의 유망한 치료 약물 및 타겟을 탐색하는 것을 목적으로 개발된 플랫폼입니다. 제약사들의 신약 개발에 RAPTOR AI를 활용함으로써, 임상시험을 목적에 둔 약제나 임상시험을 진행 중인 약제에 대하여 원개발 적응증과는 차별화된 적응증을 도출하여 약물의 가치를 극대화시키며, 이미 특허가 만료된 약제의 경우 최적의 병용 약제를 발굴하고 후속 특허를 등록시킴으로써 특허로 보호받는 기간을 연장시킬 수 있습니다. 또한 이미 비임상 단계는 대부분 완료한 약물들을 이용해서 적응증을 도출하므로 시판까지의 기간 역시 약물 구조를 디자인하는 AI 신약개발회사보다 월등히 짧다는 장점을 가지고 있습니다.

최근 당사는 전사체 데이터에 더하여, 생체 내에서 실질적인 기능을 수행하는 단백질 데이터를 통합하여 단백체(Proteome) 레이어를 추가하여 ‘RAPTOR AI v2.0’으로 고도화하는 연구개발을 수행하고 있습니다. 이를 통해 소분자 화합 중심의 기존 분석 서비스에서, 차세대 신약 시장의 핵심인 ADC(항체-약물 접합체) 및 TPD(표적 단백질 분해제) 등 새로운 모달리티(Modality)까지 분석 대상을 확장함으로써 신약개발 업체의 수요에 대응하고 있습니다.

또한 당사는 전사체 기반 AI 플랫폼 고도화와 더불어 단백체(Proteomics) 분석 역량을 B2B 서비스로 브랜드화 한 ‘Neo Omics’를 통해 사업 영역을 확장하고 있습니다. 유전체나 전사체 수준에서 파악하기 어려운 실제 단백질의 활성 변화를 추적하는 Neo Omics 서비스는 제약사의 R 과정에서 보다 정밀한 약물 반응성 예측과 바이오마커 발굴을 지원합니다. 아울러 국내 주요 병원 등과의 협력을 확대하기 위해 협력 협약(MOU) 등 협약 체결을 추진하고 있으며, 확보되는 임상정보 및 관련 데이터를 디지털화하는 디지털 바이오뱅킹(Digital Bio Banking) 기반의 데이터·코호트 구축을 추진하고 있습니다.

당사는 RAPTOR AI와 더불어 암의 조기 진단과 발생부위 진단을 보조하는 ONCOfind AI 및 항암신약 연구를 보조하는 ONCO-RAPTOR AI의 연구개발과 사업화를 위한 노력도 진행하고 있습니다.

현재 당사는 해당 플랫폼을 바탕으로 다수의 국내외 제약회사들과 신약을 공동 연구하거나, 이들에게 당사 AI 신약개발 플랫폼을 이용한 분석 결과를 공유함으로써 신약개발에 새로운 접근법을 제공하고 있습니다.

당사의 매출은 AI 플랫폼을 기반으로 파트너 제약회사가 보유, 개발하고 있는 신약 후보물질의 개발 과정에서 최적 적응증 선정(Indication selection) 또는 적응증 확장(Indication expansion) 등의 역할을 수행하며 수익을 창출하는 AI 플랫폼 기반 분석 서비스 매출 등으로 구성됩니다.
3. 원재료 및 생산설비

가. 주요 매입현황 및 원재료 가격 변동 추이

당사의 주요 영업활동은 AI 플랫폼을 통한 분석서비스로서 제품 제조를 위한 별도의 원재료 매입, 생산 및 생산설비에 관한 해당사항이 없습니다. 다만, 당사는 AI 플랫폼을 통한 결과물에 대한 검증을 목적으로 연구용역의 수행, 연구시약 및 연구소모품을 매입하고 있으며, 관련 매입액은 모두 비용으로 처리하고 있습니다.

(단위 : 천원)

매입유형	제12기(2026년 1분기)	제11기(2025년)	제10기(2024년)	총합계

시험비	57,157	43,703	115,973	216,833

위탁 및 공동연구개발비	491,445	1,693,077	1,109,538	3,294,060

시약 및 소모품 등	279,298	269,806	274,251	823,355

기술료	111,324	-	111,324

기타(원가포함)	390,520	1,178,814	1,453,700	3,023,034

총합계	1,218,420	3,296,724	2,953,462	7,468,606

당사의 주요 매입처 중 당사와 특수관계가 있는 법인은 없습니다. 당사는 시장에 판매를 위한 원재료 매입이 아닌, 분석서비스 결과물에 대한 검증을 위한 원재료를 매입하고 있으며, 이는 그 검증 단계의 설계와 목적에 따라 다양한 사항을 충족할 수 있는 가공작업을 통해 생산하고 있습니다. 따라서 원재료 가격은 매번 동일한 기준으로 매입이 발생되지 않아 해당사항 기재를 생략합니다.

나. 생산설비

당사의 주요 영업활동은 AI 플랫폼을 통한 분석서비스로서 제품 제조를 위한 별도의 생산 및 생산설비에 관해서는 해당사항이 없으며, 검증용 시료 생산과 관련해서는 위탁개발생산업체(Contract Development and Manufacturing Organization; CDMO)를 활용하고 있습니다. 다만, 당사의 영업활동과 관련된 보유하는 유형자산에 관한 사항은 다음과 같습니다.

(기준일 : 2026년 3월 31일 기준) (단위 : 천원)

계정과목	자산명	사용부서	취득원가	당기말

시설장치	인테리어 외	전 부서	543,978	338,390

시설장치 소계	543,978	338,390

실험용장비	LC-MS/MS 장비 외	전 부서	3,309,446	2,549,683

실험용장비 소계	3,309,446	2,549,683

비품	노트북 외	전 부서	578,552	176,583

비품 소계	578,552	176,583

유형자산 합계	4,431,976	3,064,656

주) 상기 유형자산 내역은 국고보조금으로 구입한 자산도 포함되어 있습니다.
4. 매출 및 수주상황

가. 매출 실적

당사의 매출은 AI 신약개발 플랫폼을 활용하여 타 제약회사의 분석서비스를 제공하는 유형의 매출로 이루어집니다.

당사의 최근 3사업연도 매출은 다음과 같습니다.

(단위 : 천원)

매출유형	품목	제12기 (2026년 1분기)	제11기(2025년)	제10기(2024년)

서비스	용역	수출	-	-	-

내수	167,267	370,461	1,072,200

소계	167,267	370,461	1,072,200

합 계	수출	-	-	-

내수	167,267	370,461	1,072,200

합계	167,267	370,461	1,072,200

(주) 해당 계약들의 비밀유지조항에 따라 개별 과제별 금액은 표기하지 않고 전체 합산 금액만 표기합니다. 단, 현재 수취한 금액은 모두 반환 의무가 없는 금액입니다.

나. 사업화 경로 등(1) 판매조직

당사는 현재 AI 플랫폼을 활용한 분석서비스 제공과 공동연구개발을 주요 목표로 하고 있으므로, 단순 판매보다는 대학병원과의 협력 시스템 구축 및 국내외 제약사와의 공동연구개발 비즈니스 모델 마련을 중심으로 활동하고 있습니다.

이에 당사의 판매조직은 사업기획실 산하 전략기획팀과 사업개발팀으로 구성되어 있습니다. 전략기획팀은 당사의 사업 전략 수립, 시장 분석 및 신규 비즈니스 기회 발굴을 담당하고, 사업개발팀은 국내외 제약사 및 바이오텍과의 공동연구개발, 기술이전(License-out) 및 협력사업 추진을 담당하며, 이를 통해 당사의 파이프라인 및 서비스 확장을 지원합니다.

【 판매 조직도 】(2) 사업전략

온코크로스는 전사체(Transcriptome) 기반 AI 기술을 활용하여 신약개발 효율성을 극대화하는 바이오텍 기업입니다. 자체 개발한 RAPTOR AI™ 플랫폼을 통해 약물과 질환 간의 연관성을 분석하고, 기존 약물의 적응증 확장 및 새로운 치료기회를 발굴하는 것을 핵심 전략으로 삼고 있습니다. 이를 통해 임상 실패 위험을 줄이고, 개발 비용과 기간을 단축하는 혁신적인 신약개발 모델을 구축하고자 합니다.

회사의 사업전략은 플랫폼 고도화, 전략적 제휴 확대 그리고 파이프라인 강화의 세 가지 축으로 구성됩니다. 첫째, 플랫폼 고도화 측면에서 온코크로스는 환자 기반 전사체 정보에 단백체(Proteomics) 등 다중 오믹스 데이터를 더해 통합 분석하여 AI 예측의 정확도와 해석 가능성을 향상시키고 있습니다. Neo Omics를 통해 생성되는 단백체 데이터 및 Bioinformatics 인사이트는 약물 작용기전(MoA) 규명과 바이오마커 발굴을 가속화하여 플랫폼 기반 사업의 확장에 기여합니다. 또한 병원·연구기관과의 협력을 통해 임상/오믹스 데이터를 표준화·축적하는 디지털 바이오뱅킹 플랫폼을 개발하여, 진단/예후/치료반응 예측 AI 모델 개발 및 데이터 기반 서비스로 연결하고자 합니다. 특히 희귀질환 및 난치성 질환 등 미충족 의료수요가 높은 분야에 적용 범위를 넓히고 있습니다. 둘째, 전략적 제휴를 통해 주요 제약사와 협업을 강화하고 있습니다. 다양한 국내 제약사와 공동연구 및 적응증 확장 프로젝트를 진행하며, 이를 기반으로 글로벌 제약사와의 기술이전 및 공동개발을 추진하고 있습니다. 셋째, AI 기반으로 발굴된 후보물질 중 일부를 자체 파이프라인으로 내재화하여 임상 진입을 모색하고, 플랫폼과 데이터(Neo Omics/디지털 바이오뱅킹)를 비즈니스 모델로 확장함으로써 수익구조의 다각화를 도모하고 있습니다.

당사는 “We Make Drugs Work”라는 미션 아래, AI 기술을 통해 신약개발의 성공률을 높이고 환자 접근성이 낮은 치료제 영역을 개척하는 것을 목표로 하고 있습니다. 이를 위해 회사는 데이터 품질 고도화, 임상 예측 정확도 향상, 글로벌 파트너십 강화, 그리고 재무 안정성 확보를 핵심 과제로 추진하고 있습니다.

궁극적으로 온코크로스는 ‘Data-to-Drug’ 기반의 신약개발 혁신 플랫폼 기업으로 성장하여, 인공지능 신약개발 분야의 국내 선도 기업에서 글로벌 시장을 주도하는 기업으로 도약하고자 합니다.